NM_013549 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 2, H2aa1 (Hist2h2aa1), mRNA. // chr3 // 85 // 95 // 34 // 40 // 0 /// NM_175662 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 2, H2ac (Hist2h2ac), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_178212 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 2, H2aa2 (Hist2h2aa2), mRNA. // chr3 // 85 // 95 // 34 // 40 // 0 /// ENSMUST00000074976 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96239749:96240276:-1 gene:ENSMUSG00000063954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 95 // 34 // 40 // 0 /// ENSMUST00000078756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96245497:96246082:1 gene:ENSMUSG00000064220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 95 // 34 // 40 // 0 /// ENSMUST00000090779 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96245554:96248509:1 gene:ENSMUSG00000070392 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 85 // 95 // 34 // 40 // 0 /// ENSMUST00000090782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96220361:96220880:-1 gene:ENSMUSG00000068855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000091708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:51202688:51203065:-1 gene:ENSMUSG00000091383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 93 // 30 // 39 // 0 /// BC010564 // GenBank // Mus musculus histone cluster 2, H2aa1, mRNA (cDNA clone MGC:5956 IMAGE:3582122), complete cds. // chr3 // 80 // 95 // 32 // 40 // 0 /// BC062255 // GenBank // Mus musculus histone cluster 2, H2aa1, mRNA (cDNA clone MGC:73680 IMAGE:1448126), complete cds. // chr3 // 85 // 95 // 34 // 40 // 0 /// BC089519 // GenBank // Mus musculus histone cluster 2, H2aa1, mRNA (cDNA clone MGC:107211 IMAGE:6771160), complete cds. // chr3 // 85 // 95 // 34 // 40 // 0 /// BC117094 // GenBank // Mus musculus histone cluster 2, H2ac, mRNA (cDNA clone MGC:151471 IMAGE:40126413), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC117096 // GenBank // Mus musculus histone cluster 2, H2ac, mRNA (cDNA clone MGC:151473 IMAGE:40126415), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC147778 // GenBank // Mus musculus histone cluster 2, H2aa1, mRNA (cDNA clone MGC:182884 IMAGE:9087498), complete cds. // chr3 // 85 // 95 // 34 // 40 // 0 /// BC147781 // GenBank // Mus musculus histone cluster 2, H2aa1, mRNA (cDNA clone MGC:182887 IMAGE:9087501), complete cds. // chr3 // 85 // 95 // 34 // 40 // 0 /// NM_001177544 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2ao (Hist1h2ao), mRNA. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// NM_175659 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2ah (Hist1h2ah), mRNA. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// NM_175660 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2ab (Hist1h2ab), mRNA. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// NM_175661 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2af (Hist1h2af), mRNA. // chr3 // 54 // 98 // 22 // 41 // 0 /// NM_178182 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2ai (Hist1h2ai), mRNA. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// NM_178185 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2ap (Hist1h2ap), mRNA. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// NM_178186 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2ag (Hist1h2ag), mRNA. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// NM_178187 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2ae (Hist1h2ae), mRNA. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// NM_178188 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2ad (Hist1h2ad), mRNA. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// NM_178189 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2ac (Hist1h2ac), mRNA. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// XM_006516820 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 11336 (Gm11336), partial mRNA. // chr3 // 61 // 74 // 19 // 31 // 0 /// ENSMUST00000070124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:21716422:21716814:1 gene:ENSMUSG00000071516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// ENSMUST00000073261 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:23533906:23534304:1 gene:ENSMUSG00000061991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 98 // 22 // 41 // 0 /// ENSMUST00000074752 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:21753435:21753827:-1 gene:ENSMUSG00000063021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 93 // 21 // 39 // 0 /// ENSMUST00000078369 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:23751126:23751598:1 gene:ENSMUSG00000061615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// ENSMUST00000081342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:21833026:21833507:-1 gene:ENSMUSG00000094777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// ENSMUST00000090776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:23574470:23574932:1 gene:ENSMUSG00000071478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// ENSMUST00000091710 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:13:21721457:21721808:-1 gene:ENSMUSG00000080076 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 56 // 93 // 22 // 39 // 0 /// ENSMUST00000091741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:22042460:22042944:-1 gene:ENSMUSG00000069301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// ENSMUST00000091742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:22035164:22035568:-1 gene:ENSMUSG00000069302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// ENSMUST00000091745 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:21810465:21810944:1 gene:ENSMUSG00000094248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// ENSMUST00000102969 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:23570662:23571121:-1 gene:ENSMUSG00000069272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// ENSMUST00000171127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:23683449:23683924:-1 gene:ENSMUSG00000069270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC058544 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ae, mRNA (cDNA clone MGC:69663 IMAGE:5711765), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC062251 // GenBank // Mus musculus similar to histone 2a, mRNA (cDNA clone MGC:73635 IMAGE:1224905), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC065803 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ag, mRNA (cDNA clone MGC:73771 IMAGE:1263745), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC076498 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ae, mRNA (cDNA clone MGC:90847 IMAGE:5713252), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC090402 // GenBank // Mus musculus similar to histone 2a, mRNA (cDNA clone MGC:103288 IMAGE:5150365), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC099406 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ai, mRNA (cDNA clone MGC:117571 IMAGE:30789778), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC110626 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ao, mRNA (cDNA clone MGC:130139 IMAGE:40051841), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC116373 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ai, mRNA (cDNA clone MGC:144310 IMAGE:40100893), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC119295 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ad, mRNA (cDNA clone MGC:155611 IMAGE:8734044), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC119297 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ad, mRNA (cDNA clone MGC:155613 IMAGE:8734046), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC125011 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2af, mRNA (cDNA clone MGC:130140 IMAGE:40051842), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC127164 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ai, mRNA (cDNA clone MGC:156429 IMAGE:40100895), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC133661 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ao, mRNA (cDNA clone MGC:130141 IMAGE:40051853), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC134370 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ah, mRNA (cDNA clone MGC:161779 IMAGE:40100857), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC139479 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ah, mRNA (cDNA clone MGC:171106 IMAGE:8862501), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// BC146008 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ah, mRNA (cDNA clone MGC:175895 IMAGE:40131311), complete cds. // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// NM_178184 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2an (Hist1h2an), mRNA. // chr3 // 49 // 98 // 20 // 41 // 0 /// ENSMUST00000091751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:21786826:21787218:-1 gene:ENSMUSG00000069309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 49 // 98 // 20 // 41 // 0 /// BC117110 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ab, mRNA (cDNA clone MGC:151487 IMAGE:40126429), complete cds. // chr3 // 34 // 98 // 14 // 41 // 0 /// NM_010436 // RefSeq // Mus musculus H2A histone family, member X (H2afx), mRNA. // chr3 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// NM_178183 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2ak (Hist1h2ak), mRNA. // chr3 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1 /// NM_178213 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 2, H2ab (Hist2h2ab), mRNA. // chr3 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1 /// XM_006543080 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histone cluster 1, H2al (Hist1h2al), partial mRNA. // chr3 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// ENSMUST00000052686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:44334694:44336077:1 gene:ENSMUSG00000049932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// ENSMUST00000073115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96219865:96220308:1 gene:ENSMUSG00000063689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1 /// AK008124 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010005I09 product:H2A histone family, member X, full insert sequence. // chr3 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// AK077055 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932439K17 product:histone gene complex 2, full insert sequence. // chr3 // 60 // 60 // 25 // 42 // 1 /// BC005468 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member X, mRNA (cDNA clone MGC:6616 IMAGE:3490058), complete cds. // chr3 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// BC010336 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member X, mRNA (cDNA clone MGC:11561 IMAGE:3156946), complete cds. // chr3 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// BC055904 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4913108. // chr3 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// BC119335 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ak, mRNA (cDNA clone MGC:155651 IMAGE:8734084), complete cds. // chr3 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1 /// BC147161 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ad, mRNA (cDNA clone MGC:182295 IMAGE:9056189), complete cds. // chr3 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// BC147162 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2ad, mRNA (cDNA clone MGC:182309 IMAGE:9056203), complete cds. // chr3 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// NM_177688 // RefSeq // Mus musculus H2A histone family, member J (H2afj), mRNA. // chr3 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// ENSMUST00000074556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:136808244:136810070:1 gene:ENSMUSG00000060032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// ENSMUST00000118168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:13:23746166:23746499:-1 gene:ENSMUSG00000080999 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1 /// BC024397 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member J, mRNA (cDNA clone MGC:36202 IMAGE:5055276), complete cds. // chr3 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// BC099606 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member J, mRNA (cDNA clone MGC:118637 IMAGE:1383389), complete cds. // chr3 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NM_175658 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 1, H2aa (Hist1h2aa), mRNA. // chr3 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// ENSMUST00000072391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:23934462:23934851:1 gene:ENSMUSG00000060081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// BC107354 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2aa, mRNA (cDNA clone MGC:130330 IMAGE:40055855), complete cds. // chr3 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// BC107355 // GenBank // Mus musculus histone cluster 1, H2aa, mRNA (cDNA clone MGC:130331 IMAGE:40055860), complete cds. // chr3 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// GENSCAN00000039069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96220455:96220844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// BC064002 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6823756, partial cds. // chr3 // 85 // 95 // 34 // 40 // 0 /// BC080809 // GenBank // Mus musculus histone cluster 2, H3c1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6466339). // chr3 // 85 // 95 // 34 // 40 // 0 /// GENSCAN00000003061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:23683525:23683917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// GENSCAN00000003071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:23574471:23574863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// GENSCAN00000003115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:23751133:23751525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// GENSCAN00000003120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:23570716:23571108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// GENSCAN00000046902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:22035166:22035552:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// GENSCAN00000049102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:21753435:21753827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 93 // 21 // 39 // 0 /// GENSCAN00000049105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:21810467:21810859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// GENSCAN00000049109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:21716422:21716814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// GENSCAN00000049124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:21833083:21833475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 98 // 23 // 41 // 0 /// NONMMUT016571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 56 // 93 // 22 // 39 // 0 /// GENSCAN00000005556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:136808340:136808729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 93 // 12 // 39 // 0 /// GENSCAN00000049111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:21786826:21787218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 49 // 98 // 20 // 41 // 0 /// GENSCAN00000039057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96238531:96240250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 81 // 34 // 42 // 1 /// GENSCAN00000039065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96245581:96247296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 81 // 34 // 42 // 1 /// GENSCAN00000003088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:23531115:23534303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// GENSCAN00000019845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:51190515:51219967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// GENSCAN00000039074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96219916:96220308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1 /// GENSCAN00000054279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44327039:44335193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// AK146117 // GenBank HTC // Mus musculus TIB-55 BB88 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I730004H15 product:histone 1, H2ai, full insert sequence. // chr3 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// NONMMUT017492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 60 // 60 // 25 // 42 // 1 /// GENSCAN00000003098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:23745087:23746368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1 /// GENSCAN00000046911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:22041012:22042927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// GENSCAN00000038322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:23934462:23934851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1