ENSMUST00000107253 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:94954226:94961349:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000107254 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:94954170:94961349:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000140294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954160:94955703:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000140331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954160:94957148:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000142311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954108:94956529:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000145472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954195:94956391:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 41 // 16 // 16 // 0 /// BC075717 // GenBank // Mus musculus regulatory factor X, 5 (influences HLA class II expression), mRNA (cDNA clone IMAGE:4481720), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// NM_017395 // RefSeq // Mus musculus regulatory factor X, 5 (influences HLA class II expression) (Rfx5), mRNA. // chr3 // 85 // 85 // 33 // 39 // 1 /// XM_006501698 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus regulatory factor X, 5 (influences HLA class II expression) (Rfx5), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 82 // 82 // 32 // 39 // 1 /// ENSMUST00000029772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:94955015:94961561:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 85 // 33 // 39 // 1 /// ENSMUST00000137088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954108:94961561:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// ENSMUST00000144132 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954135:94961349:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// ENSMUST00000148803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954201:94961346:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 82 // 82 // 32 // 39 // 1 /// BC051965 // GenBank // Mus musculus regulatory factor X, 5 (influences HLA class II expression), mRNA (cDNA clone MGC:62238 IMAGE:5702640), complete cds. // chr3 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// XM_006501697 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus regulatory factor X, 5 (influences HLA class II expression) (Rfx5), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// ENSMUST00000107255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954763:94959606:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// ENSMUST00000107260 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954075:94959496:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// ENSMUST00000147237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954384:94956795:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 51 // 51 // 20 // 39 // 1 /// AF209854 // GenBank // Mus musculus regulator factor X 5 (Rfx5) mRNA, complete cds. // chr3 // 69 // 69 // 27 // 39 // 1 /// BC118948 // GenBank // Mus musculus regulatory factor X, 5 (influences HLA class II expression), mRNA (cDNA clone MGC:143714 IMAGE:40092396), complete cds. // chr3 // 69 // 69 // 27 // 39 // 1 /// BC118949 // GenBank // Mus musculus regulatory factor X, 5 (influences HLA class II expression), mRNA (cDNA clone MGC:143715 IMAGE:40092397), complete cds. // chr3 // 69 // 69 // 27 // 39 // 1 /// ENSMUST00000132393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954478:94956327:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1 /// ENSMUST00000142708 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94955471:94956802:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1 /// ENSMUST00000145031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954527:94956358:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1 /// ENSMUST00000152869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94954109:94956313:1 gene:ENSMUSG00000005774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1 /// NONMMUT044135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000050901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94955034:95005940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 25 // 39 // 1