NM_027960 // RefSeq // Mus musculus dipeptidase 3 (Dpep3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000034371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105973520:105979419:-1 gene:ENSMUSG00000031898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF488553 // GenBank // Mus musculus putative membrane-bound dipeptidase-3 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC051148 // GenBank // Mus musculus dipeptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:58568 IMAGE:6704315), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000050126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105973440:105979291:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0
ENSMUST00000083297 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:105988501:105988631:-1 gene:ENSMUSG00000065231 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000149057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105988499:105991750:-1 gene:ENSMUSG00000053687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000150001 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105987747:105991722:-1 gene:ENSMUSG00000053687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK089165 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630001K14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK089251 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630105G17 product:ferritin heavy chain, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT066988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_028038 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 28 (Ddx28), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000058579 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:106009621:106011882:-1 gene:ENSMUSG00000045538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC120556 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 28, mRNA (cDNA clone MGC:155793 IMAGE:40129479), complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC120582 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 28, mRNA (cDNA clone MGC:155819 IMAGE:40129505), complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106009802:106012460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
NM_176838 // RefSeq // Mus musculus epithelial splicing regulatory protein 2 (Esrp2), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000115979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:106130319:106136974:-1 gene:ENSMUSG00000084128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000131020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:106132815:106134724:-1 gene:ENSMUSG00000084128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000146940 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:106132225:106136813:-1 gene:ENSMUSG00000084128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000150527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:106133802:106135096:-1 gene:ENSMUSG00000084128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 89 // 28 // 8 // 9 // 0 /// BC031444 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 35b, mRNA (cDNA clone MGC:25913 IMAGE:4222237), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000139559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:106133268:106134128:-1 gene:ENSMUSG00000084128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000050131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106104771:106136767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT066999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT067000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001007567 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 7, member 6 opposite strand (Slc7a6os), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006531281 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 7, member 6 opposite strand (Slc7a6os), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 89 // 66 // 17 // 19 // 0 /// ENSMUST00000035925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:106200438:106210933:-1 gene:ENSMUSG00000033106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK171806 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830011P17 product:Metalloproteinase (Fragment) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr8 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC054118 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 7, member 6 opposite strand, mRNA (cDNA clone MGC:60796 IMAGE:30021749), complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AK134626 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330504J10 product:similar to Proteinase-related protein [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// AK171156 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630228H03 product:weakly similar to Proteinase-related protein [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000050122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106201022:106211153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_021491 // RefSeq // Mus musculus sphingomyelin phosphodiesterase 3, neutral (Smpd3), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000067512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:106252548:106337988:-1 gene:ENSMUSG00000031906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC043077 // GenBank // Mus musculus sphingomyelin phosphodiesterase 3, neutral, mRNA (cDNA clone MGC:57983 IMAGE:5721118), complete cds. // chr8 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC046980 // GenBank // Mus musculus sphingomyelin phosphodiesterase 3, neutral, mRNA (cDNA clone MGC:54521 IMAGE:6399438), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106255259:106379516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
AK136274 // GenBank HTC // Mus musculus adult male eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7530406K02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00007365 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONMMUT067025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_020271 // RefSeq // Mus musculus pyridoxal (pyridoxine, vitamin B6) phosphatase (Pdxp), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000089378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78913919:78919517:1 gene:ENSMUSG00000022436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000068221 // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000134703 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:78899667:78919032:1 gene:ENSMUSG00000022436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AY366300 // GenBank // Mus musculus pyridoxal phosphate phosphatase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_145412 // RefSeq // Mus musculus CTF8, chromosome transmission fidelity factor 8 (Chtf8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000175940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:106883894:106893215:-1 gene:ENSMUSG00000046691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000176090 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:106886045:106893515:-1 gene:ENSMUSG00000046691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 38 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000176437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:106885946:106893591:-1 gene:ENSMUSG00000046691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000176515 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:106886122:106893601:-1 gene:ENSMUSG00000046691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000177068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:106883863:106893593:-1 gene:ENSMUSG00000046691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC023107 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830457O10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28104 IMAGE:3966700), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000169312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:106883890:106893593:-1 gene:ENSMUSG00000046691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1
NM_139229 // RefSeq // Mus musculus component of oligomeric golgi complex 8 (Cog8), mRNA. // chr8 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000095517 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:107046289:107056689:-1 gene:ENSMUSG00000031916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC094654 // GenBank // Mus musculus component of oligomeric golgi complex 8, mRNA (cDNA clone MGC:101922 IMAGE:6853777), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:107046295:107056684:-1 gene:ENSMUSG00000031916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NM_026513 // RefSeq // Mus musculus peptide deformylase (mitochondrial) (Pdf), mRNA. // chr8 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000048475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:107047114:107056655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_025458 // RefSeq // Mus musculus transmembrane emp24 protein transport domain containing 6 (Tmed6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:107061484:107065644:-1 gene:ENSMUSG00000031919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086923 // GenBank // Mus musculus transmembrane emp24 protein transport domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:107643 IMAGE:6760985), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:107061594:107065611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_008706 // RefSeq // Mus musculus NAD(P)H dehydrogenase, quinone 1 (Nqo1), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000003947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:107388225:107403206:-1 gene:ENSMUSG00000003849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC004579 // GenBank // Mus musculus NAD(P)H dehydrogenase, quinone 1, mRNA (cDNA clone MGC:6066 IMAGE:3586888), complete cds. // chr8 // 81 // 90 // 22 // 27 // 0 /// CT010284 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836H0851D for gene Nqo1, NAD(P)H dehydrogenase, quinone 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr8 // 85 // 67 // 17 // 20 // 0 /// U12961 // GenBank // Mus musculus NAD(P)H:menadione oxidoreductase (Nmo1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:107388819:107403072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_010817 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 7 (Psmd7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000044106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:107580381:107588482:-1 gene:ENSMUSG00000039067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC130014 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 7, mRNA (cDNA clone MGC:161167 IMAGE:40140405), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// M64641 // GenBank // Mouse Mov-34 protein mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK217500 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0142A01, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000044106, based on BLAT search. // chr8 // 71 // 48 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000046021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:107580884:107588673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
AK013705 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900056M07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056393 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2600009P04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6852282), partial cds. // chr8 // 75 // 80 // 15 // 20 // 0
AK015021 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4922502B01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002928 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1943 (Gm1943), non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC037184 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 70, mRNA (cDNA clone IMAGE:3487121), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC061236 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 70, mRNA (cDNA clone IMAGE:6704575), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001081402 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 70 (Wdr70), mRNA. // chr8 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// ENSMUST00000045766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:7873055:8099209:-1 gene:ENSMUSG00000039828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// GENSCAN00000049350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109250689:109340864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// KnowTID_00007374 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// KnowTID_00007375 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT067122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 80 // 97 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:8010200:8099143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NM_178380 // RefSeq // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 38 (Dhx38), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000042601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:109548017:109565601:-1 gene:ENSMUSG00000037993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC046557 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 38, mRNA (cDNA clone MGC:51405 IMAGE:4511193), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109548399:109562766:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_017370 // RefSeq // Mus musculus haptoglobin (Hp), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:109575130:109579172:-1 gene:ENSMUSG00000031722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138872 // GenBank // Mus musculus haptoglobin, mRNA (cDNA clone MGC:170499 IMAGE:8861894), complete cds. // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// M96827 // GenBank // C57BL/6J ob/ob haptoglobin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109575271:109624443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
AK122215 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0174 protein. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC039052 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2400003C14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:6464 IMAGE:2631157), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_028018 // RefSeq // Mus musculus increased sodium tolerance 1 homolog (yeast) (Ist1), mRNA. // chr8 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000034164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:109671322:109693294:-1 gene:ENSMUSG00000031729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// BC017605 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2400003C14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:27639 IMAGE:4507347), complete cds. // chr8 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// AK161899 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330548N18 product:Putative MAPK activating protein homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000037695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109672448:109705803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_001080930 // RefSeq // Mus musculus ataxin 1-like (Atxn1l), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:109726451:109737739:-1 gene:ENSMUSG00000069895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109731565:109737702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
GENSCAN00000037697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109750993:109752264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENSMUST00000122558 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:109840588:109840689:-1 gene:ENSMUSG00000084507 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT067143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_028584 // RefSeq // Mus musculus MARVEL (membrane-associating) domain containing 3 (Marveld3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:109952911:109962203:-1 gene:ENSMUSG00000001672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:109959625:109962053:-1 gene:ENSMUSG00000001672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// NM_212447 // RefSeq // Mus musculus MARVEL (membrane-associating) domain containing 3 (Marveld3), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1 /// ENSMUST00000001722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:109947914:109962168:-1 gene:ENSMUSG00000001672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1 /// BC025851 // GenBank // Mus musculus MARVEL (membrane-associating) domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:31035 IMAGE:5249917), complete cds. // chr8 // 58 // 58 // 23 // 40 // 1 /// GENSCAN00000037686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109954131:109974296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 43 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000037692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109948025:109948648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 30 // 11 // 12 // 0 /// NONMMUT067158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0
NM_011998 // RefSeq // Mus musculus carbohydrate (chondroitin 6/keratan) sulfotransferase 4 (Chst4), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:110029075:110039334:-1 gene:ENSMUSG00000035930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AF109155 // GenBank // Mus musculus L-selectin ligand sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr8 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// BC057886 // GenBank // Mus musculus carbohydrate (chondroitin 6/keratan) sulfotransferase 4, mRNA (cDNA clone MGC:68188 IMAGE:4987327), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110012147:110054948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_007586 // RefSeq // Mus musculus calbindin 2 (Calb2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000003754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:110142539:110168206:-1 gene:ENSMUSG00000003657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC017646 // GenBank // Mus musculus calbindin 2, mRNA (cDNA clone MGC:28989 IMAGE:4527074), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK032171 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430407E14 product:calbindin 2, full insert sequence. // chr8 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110125913:110157303:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001135100 // RefSeq // Mus musculus interleukin 34 (Il34), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_029646 // RefSeq // Mus musculus interleukin 34 (Il34), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531481 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 34 (Il34), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006531482 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 34 (Il34), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006531483 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 34 (Il34), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000076846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:110741840:110805903:-1 gene:ENSMUSG00000031750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000150680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:110741840:110805872:-1 gene:ENSMUSG00000031750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016254 // GenBank // Mus musculus interleukin 34, mRNA (cDNA clone MGC:28891 IMAGE:4912097), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// EU636995 // GenBank // Mus musculus interleukin 34 isoform 1 precursor, mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// EU636996 // GenBank // Mus musculus interleukin 34 isoform 2 precursor, mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000020783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110741456:110805962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_133953 // RefSeq // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 3 (Sf3b3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000042012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:110810492:110846803:-1 gene:ENSMUSG00000033732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC011412 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:11945 IMAGE:3600115), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC025491 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5252985). // chr8 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC042580 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:36502 IMAGE:5367372), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC139015 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:170642 IMAGE:8862037), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC139016 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:170643 IMAGE:8862038), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK046845 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B830028B07 product:Splicing factor 3B subunit 3, full insert sequence. // chr8 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000020785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110810941:110844532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_172283 // RefSeq // Mus musculus fucokinase (Fuk), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_052009 // RefSeq // Mus musculus fucokinase (Fuk), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000041382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:110882463:110902459:-1 gene:ENSMUSG00000033703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK131165 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mFLJ00241 protein. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AY223865 // GenBank // Mus musculus L-fucose kinase (Fuk) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC037698 // GenBank // Mus musculus fucokinase, mRNA (cDNA clone MGC:47125 IMAGE:4190449), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110882967:110899914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_007916 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 19a (Ddx19a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000040416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:110974996:110997800:-1 gene:ENSMUSG00000015023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC011270 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 19a, mRNA (cDNA clone MGC:18475 IMAGE:3674608), complete cds. // chr8 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// L25125 // GenBank // Mouse RNA helicase and RNA-dependent ATPase from the DEAD box family mRNA, complete cds. // chr8 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000173183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:110980473:110997770:-1 gene:ENSMUSG00000015023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// GENSCAN00000020775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110976029:110997723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1
NM_001190786 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 19b (Ddx19b), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// NM_001190800 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 19b (Ddx19b), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NM_172284 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 19b (Ddx19b), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000040241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:111003188:111027764:-1 gene:ENSMUSG00000033658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000065784 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:111006659:111031751:-1 gene:ENSMUSG00000033658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// AK033235 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030471P14 product:ATP-DEPENDENT RNA HELICASE DDX19 (DEAD-BOX PROTEIN 19) (DEAD-BOX RNA HELICASE DEAD5) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// BC025594 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 19b, mRNA (cDNA clone MGC:36422 IMAGE:5342859), complete cds. // chr8 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000020780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111008250:111024572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_009149 // RefSeq // Mus musculus golgi apparatus protein 1 (Glg1), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000003404 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:111157898:111259216:-1 gene:ENSMUSG00000003316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164283 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:111157565:111259200:-1 gene:ENSMUSG00000003316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000168741 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:111157525:111177776:-1 gene:ENSMUSG00000003316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000169020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:111154421:111259216:-1 gene:ENSMUSG00000003316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC010595 // GenBank HTC // Mus musculus golgi apparatus protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3964526), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC021306 // GenBank // Mus musculus golgi apparatus protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:29292 IMAGE:4239405), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111139041:111259196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_029005 // RefSeq // Mus musculus mixed lineage kinase domain-like (Mlkl), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006531442 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mixed lineage kinase domain-like (Mlkl), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000056157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:111311797:111338177:-1 gene:ENSMUSG00000012519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000120432 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:111311800:111338177:-1 gene:ENSMUSG00000012519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC023755 // GenBank // Mus musculus mixed lineage kinase domain-like, mRNA (cDNA clone MGC:38580 IMAGE:5354568), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111309804:111333752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_178086 // RefSeq // Mus musculus fatty acid 2-hydroxylase (Fa2h), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000038475 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:111345141:111393824:-1 gene:ENSMUSG00000033579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000162463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:111347470:111393818:-1 gene:ENSMUSG00000033579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK033736 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130601C02 product:similar to FATTY ACID HYDROXYLASE (UNKNOWN) (PROTEIN FOR MGC:4282) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AY660882 // GenBank // Mus musculus strain FVB/N fatty acid 2-hydroxylase (Fa2h) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC128080 // GenBank // Mus musculus fatty acid 2-hydroxylase, mRNA (cDNA clone MGC:148207 IMAGE:40104374), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC128081 // GenBank // Mus musculus fatty acid 2-hydroxylase, mRNA (cDNA clone MGC:148208 IMAGE:40104375), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:111345135:111366477:-1 gene:ENSMUSG00000033579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111346442:111482118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
NM_001170742 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 59 (Wdr59), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NM_001170743 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 59 (Wdr59), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_176923 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 59 (Wdr59), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:111448784:111522107:-1 gene:ENSMUSG00000031959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000038193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:111448784:111522107:-1 gene:ENSMUSG00000031959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC066082 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 59, mRNA (cDNA clone MGC:91308 IMAGE:30355918), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// EF011622 // GenBank // Mus musculus CDW12/WDR59 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111485090:111521981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000020765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111346442:111482118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_027570 // RefSeq // Mus musculus lactate dehydrogenase D (Ldhd), mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// XM_006531183 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lactate dehydrogenase D (Ldhd), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000070004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:111626271:111630374:-1 gene:ENSMUSG00000031958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000173521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:111625503:111630335:-1 gene:ENSMUSG00000031958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// AY092768 // GenBank // Mus musculus D-lactate dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 77 // 32 // 33 // 0 /// BC039155 // GenBank // Mus musculus lactate dehydrogenase D, mRNA (cDNA clone MGC:25982 IMAGE:4242682), complete cds. // chr8 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// BC055443 // GenBank // Mus musculus lactate dehydrogenase D, mRNA (cDNA clone MGC:65322 IMAGE:4235345), complete cds. // chr8 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000173909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:111623785:111628587:-1 gene:ENSMUSG00000031958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 42 // 42 // 18 // 43 // 1 /// AK037996 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130070E22 product:hypothetical FAD linked oxidase, C-terminal containing protein, full insert sequence. // chr8 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1 /// GENSCAN00000005824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111613920:111677108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT067237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr8 // 42 // 42 // 18 // 43 // 1
NM_025583 // RefSeq // Mus musculus chymotrypsinogen B1 (Ctrb1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:111686510:111691010:-1 gene:ENSMUSG00000031957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC061083 // GenBank // Mus musculus chymotrypsinogen B1, mRNA (cDNA clone MGC:74198 IMAGE:30316047), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111686587:111690992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001198839 // RefSeq // Mus musculus breast cancer anti-estrogen resistance 1 (Bcar1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 97 // 80 // 31 // 32 // 0 /// NM_009954 // RefSeq // Mus musculus breast cancer anti-estrogen resistance 1 (Bcar1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 97 // 73 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000166232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:111710485:111743849:-1 gene:ENSMUSG00000031955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 73 // 28 // 29 // 0 /// BC057578 // GenBank // Mus musculus breast cancer anti-estrogen resistance 1, mRNA (cDNA clone MGC:67051 IMAGE:6401186), complete cds. // chr8 // 97 // 73 // 28 // 29 // 0 /// U28151 // GenBank // Mus musculus Crk-associated substrate (p130Cas) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 70 // 27 // 28 // 0 /// U48853 // GenBank // Mus musculus Crk-associated substrate (Cas-b) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 63 // 24 // 25 // 0 /// AK079554 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230062C04 product:v-crk-associated tyrosine kinase substrate, full insert sequence. // chr8 // 60 // 75 // 18 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111710882:111732050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 63 // 24 // 25 // 0
NM_011801 // RefSeq // Mus musculus craniofacial development protein 1 (Cfdp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:111768473:111854310:-1 gene:ENSMUSG00000031954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB010828 // GenBank // Mus musculus mRNA for BCNT, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC005589 // GenBank // Mus musculus craniofacial development protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:11431 IMAGE:3964401), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111840354:111854207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_025781 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 170 (Tmem170), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006531291 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 170 (Tmem170), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000034431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:111864898:111876675:-1 gene:ENSMUSG00000031953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK007926 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810061K06 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 95 // 86 // 18 // 19 // 0 /// BC139377 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 170, mRNA (cDNA clone MGC:171004 IMAGE:8862399), complete cds. // chr8 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// BC145964 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 170, mRNA (cDNA clone MGC:175851 IMAGE:40131267), complete cds. // chr8 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111869550:111876848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_019950 // RefSeq // Mus musculus carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 5 (Chst5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:111889135:111910199:-1 gene:ENSMUSG00000031952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF176840 // GenBank // Mus musculus intestine N-acetylglucosamine 6-O-sulfotransferase (I-GlcNAc-6-ST) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033321 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 231 (Tmem231), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:111912018:111933791:-1 gene:ENSMUSG00000031951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC100402 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932417I16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118144 IMAGE:30106220), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC132428 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932417I16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:164059 IMAGE:40130705), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC132430 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932417I16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:164061 IMAGE:40130707), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111889799:111936736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
XM_006531075 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenosine deaminase, tRNA-specific 1 (Adat1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531076 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenosine deaminase, tRNA-specific 1 (Adat1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// XM_006531077 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenosine deaminase, tRNA-specific 1 (Adat1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000139820 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:111970865:111992302:-1 gene:ENSMUSG00000031949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AF192375 // GenBank // Mus musculus adenosine deaminase acting on tRNA 1 (mADAT1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// BC019976 // GenBank // Mus musculus adenosine deaminase, tRNA-specific 1, mRNA (cDNA clone MGC:28961 IMAGE:4458235), complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NM_013925 // RefSeq // Mus musculus adenosine deaminase, tRNA-specific 1 (Adat1), mRNA. // chr8 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// ENSMUST00000034427 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:111966908:111992302:-1 gene:ENSMUSG00000031949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// XM_006531078 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenosine deaminase, tRNA-specific 1 (Adat1), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// ENSMUST00000120457 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:111971553:111990412:-1 gene:ENSMUSG00000031949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// GENSCAN00000005815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111968406:112008352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
NM_001130868 // RefSeq // Mus musculus lysyl-tRNA synthetase (Kars), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_001286384 // RefSeq // Mus musculus lysyl-tRNA synthetase (Kars), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_053092 // RefSeq // Mus musculus lysyl-tRNA synthetase (Kars), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:111993444:112011323:-1 gene:ENSMUSG00000031948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000093120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:111993440:112011288:-1 gene:ENSMUSG00000031948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000164470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:111993444:112011266:-1 gene:ENSMUSG00000031948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC027356 // GenBank // Mus musculus lysyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:37041 IMAGE:4950333), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC035324 // GenBank // Mus musculus lysyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:6923 IMAGE:2811286), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC036289 // GenBank // Mus musculus lysyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:7105 IMAGE:3157706), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111968406:112008352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
BC038884 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610007P22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:48205 IMAGE:1516275), complete cds. // chr8 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// NM_001163718 // RefSeq // Mus musculus TSR3 20S rRNA accumulation (Tsr3), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NM_026676 // RefSeq // Mus musculus TSR3 20S rRNA accumulation (Tsr3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25240170:25242798:1 gene:ENSMUSG00000015126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// BC027751 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610007P22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:29196 IMAGE:5011894), complete cds. // chr8 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// BC089019 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610007P22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:113771 IMAGE:30551363), complete cds. // chr8 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:112216060:112236891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25240253:25242661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
ENSMUST00000157633 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:113528510:113528671:-1 gene:ENSMUSG00000088258 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONMMUT067272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_172466 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 18 (Adamts18), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006530796 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 18 (Adamts18), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006530797 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 18 (Adamts18), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:113697126:113848615:-1 gene:ENSMUSG00000053399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC094674 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 18, mRNA (cDNA clone MGC:102254 IMAGE:30548647), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK035797 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630005B22 product:a disintegrin-like and metalloprotease (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 18, full insert sequence. // chr8 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000027522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:113734795:113781217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSMUST00000083156 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:115591170:115591273:-1 gene:ENSMUSG00000065090 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025577 // RefSeq // Mus musculus avian musculoaponeurotic fibrosarcoma (v-maf) AS42 oncogene homolog (Maf), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:115701435:115707794:-1 gene:ENSMUSG00000055435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000069009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:115682942:115707096:-1 gene:ENSMUSG00000055435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// AK132165 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3321401C13 product:avian musculoaponeurotic fibrosarcoma (v-maf) AS42 oncogene homolog, full insert sequence. // chr8 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// AK151738 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830035O05 product:avian musculoaponeurotic fibrosarcoma (v-maf) AS42 oncogene homolog, full insert sequence. // chr8 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000054647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:115694712:115706863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AY560005 // GenBank // Mus musculus c-Maf long form mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_029441 // RefSeq // Mus musculus chromodomain protein, Y chromosome-like 2 (Cdyl2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000109102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:116568724:116732991:-1 gene:ENSMUSG00000031758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK006509 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700029M19 product:weakly similar to TESTIS-SPECIFIC CHROMODOMAIN Y-LIKE PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AY273799 // GenBank // Mus musculus chromodomain Y-like protein 2 (Cdyl2) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// BC058956 // GenBank // Mus musculus chromodomain protein, Y chromosome-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:66754 IMAGE:5690642), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:116575129:116605535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000098379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:116764144:116765479:-1 gene:ENSMUSG00000074072 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK015516 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930466O16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_027103 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700030J22 gene (1700030J22Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:116969599:116978943:-1 gene:ENSMUSG00000031847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049630 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700030J22 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6770898), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC100501 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700030J22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118345 IMAGE:30917058), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC137750 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700030J22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169374 IMAGE:8860769), complete cds. // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC137751 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700030J22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169375 IMAGE:8860770), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000025219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:116971137:116973661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_026572 // RefSeq // Mus musculus glycine cleavage system protein H (aminomethyl carrier) (Gcsh), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000040484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:116981810:116993537:-1 gene:ENSMUSG00000034424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK003189 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1100001L02 product:weakly similar to GLYCINE CLEAVAGE SYSTEM H PROTEIN, MITOCHONDRIAL PRECURSOR [Bos taurus], full insert sequence. // chr8 // 80 // 71 // 8 // 10 // 0 /// BC014745 // GenBank // Mus musculus glycine cleavage system protein H (aminomethyl carrier), mRNA (cDNA clone MGC:25958 IMAGE:4239181), complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000025207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:116982629:117082455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_029686 // RefSeq // Mus musculus polycystic kidney disease 1 like 2 (Pkd1l2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000098375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:116995679:117082449:-1 gene:ENSMUSG00000034416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000109093 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:116995679:117082449:-1 gene:ENSMUSG00000034416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000162080 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:117009323:117024095:-1 gene:ENSMUSG00000034416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AK131811 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810008A02 product:polycystic kidney disease 1 like 2, full insert sequence. // chr8 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AY164484 // GenBank // Mus musculus polycystic kidney disease 1-like 2 (Pkd1l2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000025207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:116982629:117082455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0
NM_028725 // RefSeq // Mus musculus short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 (Sdr42e1), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531408 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 (Sdr42e1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000037955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:117661399:117671547:-1 gene:ENSMUSG00000034308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:117661402:117673689:-1 gene:ENSMUSG00000034308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000174450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:117663333:117673689:-1 gene:ENSMUSG00000034308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC038819 // GenBank // Mus musculus short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:47020 IMAGE:3668862), complete cds. // chr8 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000039798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:117662716:117684892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_026758 // RefSeq // Mus musculus M phase phosphoprotein 6 (Mphosph6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000034303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:117791645:117801929:-1 gene:ENSMUSG00000031843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC008161 // GenBank // Mus musculus M phase phosphoprotein 6, mRNA (cDNA clone MGC:11701 IMAGE:3964232), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC069961 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5036929, partial cds. // chr8 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000082867 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:118426493:118426599:-1 gene:ENSMUSG00000064801 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175185 // RefSeq // Mus musculus hydroxysteroid dehydrogenase like 1 (Hsdl1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531393 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hydroxysteroid dehydrogenase like 1 (Hsdl1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000036049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:119561979:119575200:-1 gene:ENSMUSG00000034189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK150638 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830013A08 product:Steroid dehydrogenase-like protein homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC065074 // GenBank // Mus musculus hydroxysteroid dehydrogenase like 1, mRNA (cDNA clone MGC:86138 IMAGE:6809862), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006531399 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hydroxysteroid dehydrogenase like 1 (Hsdl1), transcript variant X7, mRNA. // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119564039:119570970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_021441 // RefSeq // Mus musculus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, C (Taf1c), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006530821 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, C (Taf1c), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006530823 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, C (Taf1c), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000093099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:119597975:119605222:-1 gene:ENSMUSG00000031832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000147964 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:119597975:119605222:-1 gene:ENSMUSG00000031832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC058383 // GenBank // Mus musculus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, C, mRNA (cDNA clone MGC:66914 IMAGE:6811470), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// Y09974 // GenBank // M.musculus mRNA for TAFI95. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119598611:119604888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
NM_025734 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 4 (Kcng4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531290 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 4 (Kcng4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000061828 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:119623854:119635680:-1 gene:ENSMUSG00000045246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000164382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:119623854:119635346:-1 gene:ENSMUSG00000045246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AF450109 // GenBank // Mus musculus voltage-gated potassium channel subunit Kv6.3 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC043936 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:49736 IMAGE:4504272), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119625649:119633635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_028883 // RefSeq // Mus musculus TBC/LysM associated domain containing 1 (Tldc1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000049156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:119760587:119778416:-1 gene:ENSMUSG00000034105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC030874 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4632415K11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:31327 IMAGE:4224306), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK038974 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230080K19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000019679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119761714:119774330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_028071 // RefSeq // Mus musculus coactosin-like 1 (Dictyostelium) (Cotl1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:119809225:119840579:-1 gene:ENSMUSG00000031827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000168698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:119809225:119840522:-1 gene:ENSMUSG00000031827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK007994 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810074P22 product:RIKEN cDNA 1810074P22 gene, full insert sequence. // chr8 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AK157694 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830305F01 product:coactosin-like 1 (Dictyostelium), full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC010249 // GenBank // Mus musculus coactosin-like 1 (Dictyostelium), mRNA (cDNA clone MGC:6997 IMAGE:3155195), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC011068 // GenBank // Mus musculus coactosin-like 1 (Dictyostelium), mRNA (cDNA clone MGC:7089 IMAGE:3157387), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// CT010261 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F0151D for gene Cotl1, Coactosin-like 1 (Dictyostelium); complete cds, incl. stopcodon. // chr8 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT067418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000019666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119810245:119840400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_133967 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 7 (Zdhhc7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034280 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:120081095:120101482:-1 gene:ENSMUSG00000031823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000124044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:120085222:120088075:-1 gene:ENSMUSG00000031823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000141886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:120085412:120088268:-1 gene:ENSMUSG00000031823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 89 // 28 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000150444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:120082403:120086835:-1 gene:ENSMUSG00000031823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AY166673 // GenBank // Mus musculus GABA-A receptor-associated membrane protein 2 (Gramp2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC013467 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:18844 IMAGE:4218025), complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC075666 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:99992 IMAGE:30605163), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:120082540:120092535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001033980 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 92, member B (Fam92b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:120166397:120177466:-1 gene:ENSMUSG00000042269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000135567 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:120171740:120177427:-1 gene:ENSMUSG00000042269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC147233 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 92, member B, mRNA (cDNA clone MGC:182389 IMAGE:9056283), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC147234 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 92, member B, mRNA (cDNA clone MGC:182375 IMAGE:9056269), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XR_387753 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 92, member B (Fam92b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000153177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:120167386:120177363:-1 gene:ENSMUSG00000042269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:120166572:120219924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// NONMMUT067430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
XR_405308 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700016A09 gene (1700016A09Rik), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006008 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700016A09 product:hypothetical Arginine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178856 // RefSeq // Mus musculus GINS complex subunit 2 (Psf2 homolog) (Gins2), mRNA. // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000034278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:120578633:120589304:-1 gene:ENSMUSG00000031821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:120578633:120588980:-1 gene:ENSMUSG00000031821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000155609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:120581544:120586208:-1 gene:ENSMUSG00000031821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC082565 // GenBank // Mus musculus GINS complex subunit 2 (Psf2 homolog), mRNA (cDNA clone MGC:105165 IMAGE:30551463), complete cds. // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000126094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:120582155:120589034:-1 gene:ENSMUSG00000031821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:120581686:120598800:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_197988 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1190005I06 gene (1190005I06Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:120608602:120634492:-1 gene:ENSMUSG00000043687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144417 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:120608935:120634363:-1 gene:ENSMUSG00000043687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000180677 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:120608801:120647632:-1 gene:ENSMUSG00000043687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC027666 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1190005I06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41566 IMAGE:1245153), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181333 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:120608786:120668079:-1 gene:ENSMUSG00000097919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:120608800:120634354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_133765 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 31 (Fbxo31), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:121549440:121578806:-1 gene:ENSMUSG00000052934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133765 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 31 (Fbxo31), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:121549440:121578806:-1 gene:ENSMUSG00000052934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180979 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:121553999:121559099:-1 gene:ENSMUSG00000052934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC026929 // GenBank // Mus musculus F-box protein 31, mRNA (cDNA clone MGC:30486 IMAGE:4194857), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:121552223:121578755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_080855 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 14 (Zcchc14), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000046386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:121598703:121652901:-1 gene:ENSMUSG00000061410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000134212 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:121608585:121628610:-1 gene:ENSMUSG00000061410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// AB030244 // GenBank // Mus musculus mRNA for M-BDG29, complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK122315 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0579 protein. // chr8 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC132449 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 14, mRNA (cDNA clone MGC:164080 IMAGE:40130726), complete cds. // chr8 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// BC137853 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 14, mRNA (cDNA clone MGC:169477 IMAGE:8860872), complete cds. // chr8 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// XM_006530668 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 14 (Zcchc14), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// GENSCAN00000056328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:121602276:121634388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT067481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000082708 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:121666628:121666706:-1 gene:ENSMUSG00000064642 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT067485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_011404 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 5 (Slc7a5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000045557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:121881150:121907694:-1 gene:ENSMUSG00000040010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC026131 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:13766 IMAGE:4188854), complete cds. // chr8 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// AB017189 // GenBank // Mus musculus mRNA for 4F2/CD98 light chain, complete cds. // chr8 // 73 // 100 // 24 // 33 // 0 /// AB023409 // GenBank // Mus musculus mRNA for L-type amino acid transporter 1, complete cds. // chr8 // 73 // 100 // 24 // 33 // 0 /// GENSCAN00000056317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:121796547:121907606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1
NM_007608 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 5a, mitochondrial (Car5a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000057653 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:121916126:121944904:-1 gene:ENSMUSG00000025317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000151462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:121918054:121927474:-1 gene:ENSMUSG00000025317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC030174 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 5a, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:29144 IMAGE:5051543), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:121916364:121944793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_133202 // RefSeq // Mus musculus thyrotropin releasing hormone receptor 2 (Trhr2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:122356967:122360746:-1 gene:ENSMUSG00000039079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF283762 // GenBank // Mus musculus mouse-thyrotropin-releasing hormone receptor 2 (TRH-R2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117988 // GenBank // Mus musculus thyrotropin releasing hormone receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:144635 IMAGE:40104412), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122357111:122360699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_007806 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b-245, alpha polypeptide (Cyba), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530649 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome b-245, alpha polypeptide (Cyba), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000017604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122424772:122432940:-1 gene:ENSMUSG00000006519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC026791 // GenBank // Mus musculus cytochrome b-245, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:25560 IMAGE:3980538), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC060635 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6849113, containing frame-shift errors. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// EU791539 // GenBank // Mus musculus p22phox mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122424878:122432867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_138656 // RefSeq // Mus musculus mevalonate (diphospho) decarboxylase (Mvd), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NR_028354 // RefSeq // Mus musculus mevalonate (diphospho) decarboxylase (Mvd), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000006692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122433596:122443422:-1 gene:ENSMUSG00000006517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC008526 // GenBank // Mus musculus mevalonate (diphospho) decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:6640 IMAGE:3495424), complete cds. // chr8 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122434095:122460614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1
NM_013914 // RefSeq // Mus musculus snail family zinc finger 3 (Snai3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531074 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus snail homolog 3 (Drosophila) (Snai3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000006762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122454206:122460692:-1 gene:ENSMUSG00000006587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF133714 // GenBank // Mus musculus snail-related zinc finger protein SMUC (Smuc) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF195655 // GenBank // Mus musculus snail-related protein 2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC100724 // GenBank // Mus musculus snail homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:124019 IMAGE:40045286), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC100726 // GenBank // Mus musculus snail homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:124018 IMAGE:40045284), complete cds. // chr8 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// BC100727 // GenBank // Mus musculus snail homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:124017 IMAGE:40045283), complete cds. // chr8 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122434095:122460614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001033142 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 166 (Rnf166), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531336 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 166 (Rnf166), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000014614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:122466147:122476064:-1 gene:ENSMUSG00000014470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000148780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122468009:122475688:-1 gene:ENSMUSG00000014470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC131924 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 166, mRNA (cDNA clone MGC:163555 IMAGE:40130201), complete cds. // chr8 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC132281 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 166, mRNA (cDNA clone MGC:163912 IMAGE:40130558), complete cds. // chr8 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AK165700 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630004K11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122467169:122470538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001037298 // RefSeq // Mus musculus piezo-type mechanosensitive ion channel component 1 (Piezo1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006530957 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus piezo-type mechanosensitive ion channel component 1 (Piezo1), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000067252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122481698:122551329:-1 gene:ENSMUSG00000014444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000128383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122481982:122499885:-1 gene:ENSMUSG00000014444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000148497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122485924:122498204:-1 gene:ENSMUSG00000014444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000156333 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:122481712:122499886:-1 gene:ENSMUSG00000014444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK129095 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0233 protein. // chr8 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// HQ215520 // GenBank // Mus musculus piezo1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000011825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122481982:122527913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001037298 // RefSeq // Mus musculus piezo-type mechanosensitive ion channel component 1 (Piezo1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530957 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus piezo-type mechanosensitive ion channel component 1 (Piezo1), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122481698:122551329:-1 gene:ENSMUSG00000014444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122481982:122499885:-1 gene:ENSMUSG00000014444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156333 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:122481712:122499886:-1 gene:ENSMUSG00000014444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// HQ215520 // GenBank // Mus musculus piezo1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122481982:122527913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037298 // RefSeq // Mus musculus piezo-type mechanosensitive ion channel component 1 (Piezo1), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530957 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus piezo-type mechanosensitive ion channel component 1 (Piezo1), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122481698:122551329:-1 gene:ENSMUSG00000014444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// HQ215520 // GenBank // Mus musculus piezo1 mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122481982:122499885:-1 gene:ENSMUSG00000014444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSMUST00000156333 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:122481712:122499886:-1 gene:ENSMUSG00000014444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122481982:122527913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083146 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:122520568:122520674:-1 gene:ENSMUSG00000065080 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009698 // RefSeq // Mus musculus adenine phosphoribosyl transferase (Aprt), mRNA. // chr8 // 100 // 56 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000006764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122574637:122576907:-1 gene:ENSMUSG00000006589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 24 // 24 // 0 /// AB033539 // GenBank // Mus musculus aprt mRNA for adenine phosphoribosyl transferase, complete cds. // chr8 // 100 // 47 // 20 // 20 // 0 /// AB033540 // GenBank // Mus musculus aprt mRNA for adenine phosphoribosyl transferase, complete cds. // chr8 // 100 // 47 // 20 // 20 // 0 /// BC005667 // GenBank // Mus musculus adenine phosphoribosyl transferase, mRNA (cDNA clone MGC:11749 IMAGE:3152733), complete cds. // chr8 // 100 // 56 // 24 // 24 // 0 /// M11310 // GenBank // Mouse adenine phosphoribosyltransferase (APRT), complete cds. // chr8 // 86 // 100 // 37 // 43 // 0 /// GENSCAN00000011752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122574885:122611338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 51 // 51 // 22 // 43 // 1
NM_016722 // RefSeq // Mus musculus galactosamine (N-acetyl)-6-sulfate sulfatase (Galns), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000015171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122578238:122611487:-1 gene:ENSMUSG00000015027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF111346 // GenBank // Mus musculus N-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase (Galns) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC004002 // GenBank // Mus musculus galactosamine (N-acetyl)-6-sulfate sulfatase, mRNA (cDNA clone MGC:7547 IMAGE:3492664), complete cds. // chr8 // 79 // 93 // 22 // 28 // 0 /// NM_001193645 // RefSeq // Mus musculus galactosamine (N-acetyl)-6-sulfate sulfatase (Galns), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_006531177 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus galactosamine (N-acetyl)-6-sulfate sulfatase (Galns), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000011752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122574885:122611338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001007462 // RefSeq // Mus musculus poly(A)binding protein nuclear 1-like (Pabpn1l), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093059 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:122619471:122622739:-1 gene:ENSMUSG00000069867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC141316 // GenBank // Mus musculus poly(A)binding protein nuclear-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:176277 IMAGE:9055928), complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC141317 // GenBank // Mus musculus poly(A)binding protein nuclear-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:176278 IMAGE:9055929), complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC145634 // GenBank // Mus musculus poly(A)binding protein nuclear-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:179210 IMAGE:9054202), complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122619811:122624318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001109873 // RefSeq // Mus musculus core-binding factor, runt domain, alpha subunit 2, translocated to, 3 (human) (Cbfa2t3), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_009824 // RefSeq // Mus musculus core-binding factor, runt domain, alpha subunit 2, translocated to, 3 (human) (Cbfa2t3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_177289 // RefSeq // Mus musculus core-binding factor, runt domain, alpha subunit 2, translocated to, 3 (human) (Cbfa2t3), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081379 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 11 (Ankrd11), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NR_037865 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 11 (Ankrd11), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000098333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122884151:122915987:-1 gene:ENSMUSG00000035569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000098334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122883337:122974793:-1 gene:ENSMUSG00000035569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000172906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122883822:122974793:-1 gene:ENSMUSG00000035569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC059876 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:6810694), partial cds. // chr8 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// BC158043 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 11, mRNA (cDNA clone MGC:189972 IMAGE:9088159), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC172141 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 11, mRNA (cDNA clone MGC:198846 IMAGE:9054811), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK164512 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330018C23 product:Nasopharyngeal carcinoma susceptibility protein LZ16 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// GENSCAN00000011761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122870605:122915987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000174833 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122906063:122974773:-1 gene:ENSMUSG00000035569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC068270 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:30009418), complete cds. // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NM_001081379 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 11 (Ankrd11), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NR_037865 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 11 (Ankrd11), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000098334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122883337:122974793:-1 gene:ENSMUSG00000035569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENSMUST00000172906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122883822:122974793:-1 gene:ENSMUSG00000035569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// AK138711 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430020J22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// BC158043 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 11, mRNA (cDNA clone MGC:189972 IMAGE:9088159), complete cds. // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// BC172141 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 11, mRNA (cDNA clone MGC:198846 IMAGE:9054811), complete cds. // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT067561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000083981 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:122982837:122982943:-1 gene:ENSMUSG00000065915 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONMMUT067567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_145606 // RefSeq // Mus musculus charged multivesicular body protein 1A (Chmp1a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000000759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:123204264:123212760:-1 gene:ENSMUSG00000000743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC010524 // GenBank // Mus musculus chromatin modifying protein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:7846 IMAGE:3500937), complete cds. // chr8 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// BC023807 // GenBank // Mus musculus chromatin modifying protein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:38563 IMAGE:5354266), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC036138 // GenBank // Mus musculus chromatin modifying protein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:37244 IMAGE:4972627), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC036152 // GenBank // Mus musculus chromatin modifying protein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:37400 IMAGE:4977509), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000166768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:123232255:123236206:-1 gene:ENSMUSG00000033594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK220503 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4138 protein. // chr8 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC139310 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:170937 IMAGE:8862332), complete cds. // chr8 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC139311 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:170938 IMAGE:8862333), complete cds. // chr8 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NM_030176 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 2-like (Spata2l), mRNA. // chr8 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// ENSMUST00000098327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:123232258:123236209:-1 gene:ENSMUSG00000033594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// GENSCAN00000011806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123233268:123235820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0
BC113756 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, mRNA (cDNA clone MGC:130515 IMAGE:40047695), complete cds. // chr8 // 91 // 85 // 10 // 11 // 0 /// D10049 // GenBank // Mus musculus mRNA for melanoma antigen, complete cds, endogenous ecotropic murine leukemia provirus region. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GU441834 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c endogenous ecotropic murine leukemia virus truncated envelope glycoprotein mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// U63133 // GenBank // Mus musculus C-type ecotropic endogenous retrovirus, complete mRNA sequence. // chr8 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
U63133 // GenBank // Mus musculus C-type ecotropic endogenous retrovirus, complete mRNA sequence. // chr8 // 36 // 100 // 8 // 22 // 0
NM_001170975 // RefSeq // Mus musculus dysbindin (dystrobrevin binding protein 1) domain containing 1 (Dbndd1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_028146 // RefSeq // Mus musculus dysbindin (dystrobrevin binding protein 1) domain containing 1 (Dbndd1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531388 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dysbindin (dystrobrevin binding protein 1) domain containing 1 (Dbndd1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006531389 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dysbindin (dystrobrevin binding protein 1) domain containing 1 (Dbndd1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000176155 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:123505687:123515463:-1 gene:ENSMUSG00000031970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000177240 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:123505687:123515390:-1 gene:ENSMUSG00000031970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC046622 // GenBank // Mus musculus dysbindin (dystrobrevin binding protein 1) domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:54448 IMAGE:6389902), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_001170976 // RefSeq // Mus musculus dysbindin (dystrobrevin binding protein 1) domain containing 1 (Dbndd1), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000176286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:123504718:123515455:-1 gene:ENSMUSG00000031970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000051136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123506681:123515452:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000083959 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:16471813:16471931:1 gene:ENSMUSG00000065893 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000179195 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:123554060:123554178:-1 gene:ENSMUSG00000094265 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONMMUT060053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONMMUT067618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENSMUST00000179185 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:123584535:123584653:-1 gene:ENSMUSG00000093960 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT067636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NR_046144 // RefSeq // Mus musculus nuclear encoded rRNA 5S 136 (n-R5s136), ribosomal RNA. // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000179080 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:123599861:123599979:-1 gene:ENSMUSG00000096037 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT067645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000093696 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:123601572:123601680:-1 gene:ENSMUSG00000094541 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000175042 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:123623637:123623745:-1 gene:ENSMUSG00000095723 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONMMUT067646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONMMUT067659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NM_028536 // RefSeq // Mus musculus centriole, cilia and spindle associated protein (Ccsap), mRNA. // chr8 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034452 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:123840831:123859530:-1 gene:ENSMUSG00000031971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000122421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:123840844:123860209:-1 gene:ENSMUSG00000031971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AK086180 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930010O07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC024705 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700054N08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30605 IMAGE:3668303), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC036300 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700054N08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:25105 IMAGE:4501054), complete cds. // chr8 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0
NM_001272041 // RefSeq // Mus musculus actin, alpha 1, skeletal muscle (Acta1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_009606 // RefSeq // Mus musculus actin, alpha 1, skeletal muscle (Acta1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:123891767:123894736:-1 gene:ENSMUSG00000031972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC014877 // GenBank // Mus musculus actin, alpha 1, skeletal muscle, mRNA (cDNA clone MGC:18923 IMAGE:3587657), complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// M12866 // GenBank // Mouse skeletal muscle actin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123892009:123893697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
NM_172288 // RefSeq // Mus musculus nucleoporin 133 (Nup133), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530964 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin 133 (Nup133), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000044795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:123897123:123949265:-1 gene:ENSMUSG00000039509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC023915 // GenBank // Mus musculus nucleoporin 133, mRNA (cDNA clone MGC:38205 IMAGE:5323157), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC026845 // GenBank // Mus musculus nucleoporin 133, mRNA (cDNA clone MGC:25929 IMAGE:4235408), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK040528 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430105D21 product:nucleoporin 133, full insert sequence. // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000051133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123899374:123949176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_019552 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 10 (Abcb10), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006531201 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 10 (Abcb10), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000075578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:123952459:123983122:-1 gene:ENSMUSG00000031974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF266284 // GenBank // Mus musculus ABC transporter mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC046818 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:61220 IMAGE:5702696), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC053020 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:62224 IMAGE:5702696), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC054793 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:65607 IMAGE:6833785), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123954308:123982813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_133966 // RefSeq // Mus musculus TAF5-like RNA polymerase II, p300/CBP-associated factor (PCAF)-associated factor (Taf5l), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530546 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TAF5-like RNA polymerase II, p300/CBP-associated factor (PCAF)-associated factor (Taf5l), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:123996318:124021008:-1 gene:ENSMUSG00000038697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:123996318:124021309:-1 gene:ENSMUSG00000038697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK033477 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030217F08 product:PCAF ASSOCIATED FACTOR 65 BETA (PUTATIVE TRANSCRIPTION FACTOR) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK154832 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630108G12 product:TAF5-like RNA polymerase II, p300/CBP-associated factor (PCAF)-associated factor, full insert sequence. // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC013550 // GenBank // Mus musculus TAF5-like RNA polymerase II, p300/CBP-associated factor (PCAF)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:19341 IMAGE:4222283), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123997309:124016793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_171824 // RefSeq // Mus musculus piggyBac transposable element derived 5 (Pgbd5), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:124369049:124433936:-1 gene:ENSMUSG00000050751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128312 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:124371869:124375546:-1 gene:ENSMUSG00000050751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000136892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:124370023:124393216:-1 gene:ENSMUSG00000050751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140012 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:124369053:124434338:-1 gene:ENSMUSG00000050751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000172566 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:124369049:124439658:-1 gene:ENSMUSG00000050751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC094384 // GenBank // Mus musculus piggyBac transposable element derived 5, mRNA (cDNA clone MGC:106643 IMAGE:30606749), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124370491:124384608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_007428 // RefSeq // Mus musculus angiotensinogen (serpin peptidase inhibitor, clade A, member 8) (Agt), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000063278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:124556534:124569706:-1 gene:ENSMUSG00000031980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC019496 // GenBank // Mus musculus angiotensinogen (serpin peptidase inhibitor, clade A, member 8), mRNA (cDNA clone MGC:28582 IMAGE:4211501), complete cds. // chr8 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC028877 // GenBank // Mus musculus angiotensinogen (serpin peptidase inhibitor, clade A, member 8), mRNA (cDNA clone MGC:19077 IMAGE:4194190), complete cds. // chr8 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC054387 // GenBank // Mus musculus angiotensinogen (serpin peptidase inhibitor, clade A, member 8), mRNA (cDNA clone MGC:62541 IMAGE:6477694), complete cds. // chr8 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124556930:124564551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_175149 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310022B05 gene (2310022B05Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:124635766:124663369:-1 gene:ENSMUSG00000031983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058626 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310022B05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:73467 IMAGE:6401577), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124622275:124663183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_145607 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 13 (Ttc13), mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000041614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:124671335:124721972:-1 gene:ENSMUSG00000037300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000117624 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:124671335:124721964:-1 gene:ENSMUSG00000037300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000118134 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:124671335:124721983:-1 gene:ENSMUSG00000037300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// BC017545 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 13, mRNA (cDNA clone IMAGE:4910561), complete cds. // chr8 // 92 // 55 // 24 // 26 // 0 /// BC079851 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 13, mRNA (cDNA clone MGC:105232 IMAGE:6401930), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000127167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:124707981:124721981:-1 gene:ENSMUSG00000037300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// AK051200 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130015I23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// GENSCAN00000038414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124667943:124721962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 77 // 35 // 36 // 0
NM_001081120 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 89, member A (Fam89a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000055257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:124740257:124751809:-1 gene:ENSMUSG00000043068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC115734 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 89, member A, mRNA (cDNA clone MGC:144868 IMAGE:40106966), complete cds. // chr8 // 74 // 82 // 17 // 23 // 0 /// BC115819 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 89, member A, mRNA (cDNA clone MGC:144869 IMAGE:40106968), complete cds. // chr8 // 74 // 82 // 17 // 23 // 0 /// GENSCAN00000038431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124741044:124751785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_025615 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2810004N23 gene (2810004N23Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:124839355:124863029:-1 gene:ENSMUSG00000031984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK013989 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110004G14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC023675 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810004N23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35729 IMAGE:5354472), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK166963 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0025L02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000038432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124830641:124862972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// BC020419 // GenBank HTC // Mus musculus SET domain containing 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:3588694), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr8 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_198103 // RefSeq // Mus musculus exocyst complex component 8 (Exoc8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000098312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:124890300:124897705:-1 gene:ENSMUSG00000074030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC057052 // GenBank // Mus musculus exocyst complex component 8, mRNA (cDNA clone MGC:67332 IMAGE:6822067), complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124895476:124897626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT067707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT067708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_053207 // RefSeq // Mus musculus egl-9 family hypoxia-inducible factor 1 (Egln1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:124908596:124949254:-1 gene:ENSMUSG00000031987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC006903 // GenBank // Mus musculus EGL nine homolog 1 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:11947 IMAGE:3600175), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124910708:124949824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NM_001081337 // RefSeq // Mus musculus signal-induced proliferation-associated 1 like 2 (Sipa1l2), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000108775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:125418063:125492710:-1 gene:ENSMUSG00000001995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// BC058408 // GenBank // Mus musculus signal-induced proliferation-associated 1 like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6812418), partial cds. // chr8 // 100 // 48 // 22 // 22 // 0 /// BC072593 // GenBank // Mus musculus signal-induced proliferation-associated 1 like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6412997), partial cds. // chr8 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC150682 // GenBank // Mus musculus signal-induced proliferation-associated 1 like 2, mRNA (cDNA clone MGC:183593 IMAGE:9087593), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000017543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:125421881:125492596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 37 // 37 // 0
NM_175561 // RefSeq // Mus musculus pecanex-like 2 (Drosophila) (Pcnxl2), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 64 // 64 // 0 /// ENSMUST00000047239 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:125751508:125898317:-1 gene:ENSMUSG00000060212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 64 // 64 // 0 /// ENSMUST00000119305 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:125751511:125774128:-1 gene:ENSMUSG00000060212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 26 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000120589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:125751509:125839850:-1 gene:ENSMUSG00000060212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 59 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000131127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:125837607:125898317:-1 gene:ENSMUSG00000060212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 47 // 32 // 32 // 0 /// AK087907 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330039K12 product:weakly similar to PECANEX 1 [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 59 // 40 // 40 // 0 /// BC132334 // GenBank // Mus musculus pecanex-like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40130611), partial cds. // chr8 // 96 // 40 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:125752139:125785518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 25 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000017554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:125807965:125898293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 53 // 36 // 36 // 0
NM_001159907 // RefSeq // Mus musculus predicted gene, 17296 (Gm17296), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006530818 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene, 17296 (Gm17296), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000170518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:126426652:126475065:-1 gene:ENSMUSG00000090290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:126426972:126475149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0
NM_001164598 // RefSeq // Mus musculus interferon regulatory factor 2 binding protein 2 (Irf2bp2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:126588296:126593986:-1 gene:ENSMUSG00000051495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:126591113:126607121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000083703 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:126944847:126944980:-1 gene:ENSMUSG00000065637 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172762 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 34 (Rbm34), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006531182 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 34 (Rbm34), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XR_387758 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 34 (Rbm34), transcript variant X2, misc_RNA. // chr8 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000045994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:126947175:126971079:-1 gene:ENSMUSG00000033931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC141278 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 34, mRNA (cDNA clone MGC:176239 IMAGE:9055890), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AK136464 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030602D02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// AK038729 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230057J15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000016257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:126950574:126971039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT067796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
GENSCAN00000016256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:126988080:127040632:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
BC025186 // GenBank // Mus musculus predicted gene, ENSMUSG00000053531, mRNA (cDNA clone MGC:32466 IMAGE:5044645), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006544380 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus putative uncharacterized protein ENSP00000383309-like (LOC102637403), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK042098 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630057N24 product:hypothetical Arginine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029061 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 7 (Ccdc7), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006531447 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 7 (Ccdc7), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000095158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:128980019:129065517:-1 gene:ENSMUSG00000025808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000125112 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:128980101:129065488:-1 gene:ENSMUSG00000025808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 86 // 18 // 19 // 0 /// AY854152 // GenBank // Mus musculus testis-specific antigen mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001197041 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 7 (Ccdc7), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// ENSMUST00000108747 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:129045477:129065492:-1 gene:ENSMUSG00000025808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// EF100607 // GenBank // Mus musculus putative cancer/testis antigen mRNA, complete cds. // chr8 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
ENSMUST00000151376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3000922:3002330:1 gene:ENSMUSG00000091028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000178348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3004457:3005194:1 gene:ENSMUSG00000096385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000099047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3020155:3021593:1 gene:ENSMUSG00000095547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000143083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3013140:3014344:1 gene:ENSMUSG00000096519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000179272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3018753:3020891:1 gene:ENSMUSG00000095547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
ENSMUST00000179272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3018753:3020891:1 gene:ENSMUSG00000095547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0
ENSMUST00000099046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3023547:3025218:1 gene:ENSMUSG00000095186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000178348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3004457:3005194:1 gene:ENSMUSG00000096385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
ENSMUST00000179982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3027523:3028728:1 gene:ENSMUSG00000095891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000177969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3037111:3038316:1 gene:ENSMUSG00000096201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
ENSMUST00000178641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3034599:3035805:1 gene:ENSMUSG00000096736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000155807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3036877:3037848:1 gene:ENSMUSG00000096201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// ENSMUST00000177969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3037111:3038316:1 gene:ENSMUSG00000096201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 100 // 12 // 27 // 0 /// ENSMUST00000179982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3027523:3028728:1 gene:ENSMUSG00000095891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 30 // 100 // 8 // 27 // 0
NM_026303 // RefSeq // Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 8 (E. coli) (Alkbh8), mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006509879 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 8 (E. coli) (Alkbh8), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000053407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3335478:3387050:1 gene:ENSMUSG00000025899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000165105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3338445:3385842:1 gene:ENSMUSG00000025899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AK041810 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630039P16 product:hypothetical RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif) containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// AK160783 // GenBank HTC // Mus musculus 14, 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3221401H22 product:Hypothetical Generic methyl-transferase/SAM homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// BC050863 // GenBank // Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 8 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:59488 IMAGE:6329366), complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AK032374 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430529E09 product:4930562C03RIK PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// GENSCAN00000011506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:3259867:3393280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 81 // 81 // 30 // 37 // 1
ENSMUST00000083022 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:3352657:3352786:1 gene:ENSMUSG00000064956 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027545 // RefSeq // Mus musculus CWF19-like 2, cell cycle control (S. pombe) (Cwf19l2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006509865 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CWF19-like 2, cell cycle control (S. pombe) (Cwf19l2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3404085:3479236:1 gene:ENSMUSG00000025898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC125483 // GenBank // Mus musculus CWF19-like 2, cell cycle control (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:159186 IMAGE:40129998), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC125485 // GenBank // Mus musculus CWF19-like 2, cell cycle control (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:159188 IMAGE:40130000), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK031423 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030429O15 product:RIKEN cDNA 3230401L03 gene, full insert sequence. // chr9 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// AK037905 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130061H03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// BC100536 // GenBank // Mus musculus CWF19-like 2, cell cycle control (S. pombe), mRNA (cDNA clone IMAGE:30291151). // chr9 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000011504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:3404098:3477960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_001033322 // RefSeq // Mus musculus guanylate cyclase 1, soluble, alpha 2 (Gucy1a2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000115733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:3532354:3897342:1 gene:ENSMUSG00000041624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK034879 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430053E15 product:GUANYLATE CYCLASE SOLUBLE, ALPHA-2 CHAIN (EC 4.6.1.2) (GCS-ALPHA-2) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr9 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000011505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:3532803:3823679:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
GENSCAN00000054082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:4059988:4215882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001164574 // RefSeq // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 3 (Kbtbd3), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NM_026962 // RefSeq // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 3 (Kbtbd3), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000049648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:4309743:4331721:1 gene:ENSMUSG00000025893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC027392 // GenBank // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:37189 IMAGE:4954712), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_145609 // RefSeq // Mus musculus Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 4 with coiled-coils (Msantd4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:4383535:4386861:1 gene:ENSMUSG00000041124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC014729 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 8430410K20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:25466 IMAGE:4461077), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:4383681:4385314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_009807 // RefSeq // Mus musculus caspase 1 (Casp1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000027015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:5298517:5307265:1 gene:ENSMUSG00000025888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC008152 // GenBank // Mus musculus caspase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6106 IMAGE:3583883), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// L03799 // GenBank // Mouse interleukin-1 beta convertase (IL-1bc) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// L28095 // GenBank // Mouse interleukin 1-beta converting enzyme, complete cds. // chr9 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// AK163069 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530009P10 product:caspase 1, full insert sequence. // chr9 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000018468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:5298717:5343633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_027924 // RefSeq // Mus musculus platelet-derived growth factor, D polypeptide (Pdgfd), mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006509887 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus platelet-derived growth factor, D polypeptide (Pdgfd), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000058692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:6168661:6378843:1 gene:ENSMUSG00000032006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000168039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:6168612:6377519:1 gene:ENSMUSG00000032006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AF335583 // GenBank // Mus musculus platelet-derived growth factor D mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC030896 // GenBank // Mus musculus platelet-derived growth factor, D polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:31518 IMAGE:4489485), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:6279770:6377020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000031991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:6588436:6594585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_029775 // RefSeq // Mus musculus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 5 (S. cerevisiae) (Dcun1d5), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006509889 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 5 (S. cerevisiae) (Dcun1d5), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:7184566:7207031:1 gene:ENSMUSG00000032002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC020089 // GenBank // Mus musculus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 5 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:28312 IMAGE:4013755), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC049641 // GenBank HTC // Mus musculus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 5 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:6623393). // chr9 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:7184327:7245574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_008607 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 13 (Mmp13), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000015394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:7272514:7283333:1 gene:ENSMUSG00000050578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC125320 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 13, mRNA (cDNA clone MGC:159023 IMAGE:40129835), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC125322 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 13, mRNA (cDNA clone MGC:159025 IMAGE:40129837), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:7272555:7358327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_010809 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 3 (Mmp3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000034497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:7445822:7455972:1 gene:ENSMUSG00000043613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC006725 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:11554 IMAGE:3962288), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:7445904:7509991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1
NM_032006 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 1a (interstitial collagenase) (Mmp1a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:7464141:7476869:1 gene:ENSMUSG00000043089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC117756 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 1a (interstitial collagenase), mRNA (cDNA clone MGC:143545 IMAGE:40090601), complete cds. // chr9 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:7445904:7509991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_019471 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 10 (Mmp10), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:7502352:7510238:1 gene:ENSMUSG00000047562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC130027 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 10, mRNA (cDNA clone MGC:161197 IMAGE:40140858), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// Y13185 // GenBank // Mus musculus mRNA for stromelysin-2. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:7445904:7509991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0
NM_008611 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 8 (Mmp8), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000018765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:7558429:7568486:1 gene:ENSMUSG00000005800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC042742 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 8, mRNA (cDNA clone MGC:51623 IMAGE:5032770), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// U96696 // GenBank // Mus musculus neutrophil collagenase MNC mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:7560381:7627627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001030289 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 27 (Mmp27), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006509858 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus matrix metallopeptidase 27 (Mmp27), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:7571458:7581393:1 gene:ENSMUSG00000101577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000070323 // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120900 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:7571396:7581415:1 gene:ENSMUSG00000070323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000151853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:9:7571458:7581391:1 gene:ENSMUSG00000070323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000152878 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:7571463:7581885:1 gene:ENSMUSG00000070323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK155813 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730225E01 product:similar to Matrix metalloproteinase-27 [Tupaia belangeri], full insert sequence. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK159182 // GenBank HTC // Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I420007I11 product:weakly similar to Matrix metalloproteinase-27 [Tupaia belangeri], full insert sequence. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:7560381:7627627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_013903 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 20 (enamelysin) (Mmp20), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:7628231:7674968:1 gene:ENSMUSG00000018620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF155933 // GenBank // Mus musculus matrix metalloproteinase-20 (Mmp20) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC152335 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 20 (enamelysin), mRNA (cDNA clone MGC:161334 IMAGE:40142709), complete cds. // chr9 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC152336 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 20 (enamelysin), mRNA (cDNA clone MGC:161335 IMAGE:40142712), complete cds. // chr9 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:7628253:7686423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
NM_010810 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 7 (Mmp7), mRNA. // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000018767 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:7692090:7699585:1 gene:ENSMUSG00000018623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC119057 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 7, mRNA (cDNA clone MGC:155373 IMAGE:8733806), complete cds. // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC120655 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 7, mRNA (cDNA clone MGC:155892 IMAGE:40129578), complete cds. // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// L36244 // GenBank // Mus musculus metalloproteinase matrilysin mRNA, complete cds. // chr9 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:7692135:7699500:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0
XM_006509888 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 123 (Tmem123), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000154371 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:7764165:7794328:1 gene:ENSMUSG00000050912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010292 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 123, mRNA (cDNA clone MGC:11759 IMAGE:3153174), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086319 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 123, mRNA (cDNA clone MGC:102366 IMAGE:5293409), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK166444 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930021D03 product:Weakly similar to PORIMIN (Fragment), full insert sequence. // chr9 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NM_133739 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 123 (Tmem123), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// ENSMUST00000052865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:7764041:7794333:1 gene:ENSMUSG00000050912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// ENSMUST00000136904 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:7764149:7791048:1 gene:ENSMUSG00000050912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NR_033618 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700128F08 gene (1700128F08Rik), non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000034483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:8221889:8241987:1 gene:ENSMUSG00000031998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_008829 // RefSeq // Mus musculus progesterone receptor (Pgr), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509848 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus progesterone receptor (Pgr), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000070463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:8900468:8965425:1 gene:ENSMUSG00000031870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000098986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:8900468:8965425:1 gene:ENSMUSG00000031870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000151080 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:8900419:8948607:1 gene:ENSMUSG00000031870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AK036862 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930019P03 product:PROGESTERONE RECEPTOR (PR) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC145807 // GenBank // Mus musculus progesterone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:175694 IMAGE:40131110), complete cds. // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// M68915 // GenBank // Mouse progesterone receptor (PR) mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000189181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:8899833:8968611:1 gene:ENSMUSG00000031870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:8894978:8965138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000104915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:8971791:8975773:1 gene:ENSMUSG00000078117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK082585 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230066H16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSMUST00000157451 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:9301391:9301452:1 gene:ENSMUSG00000088076 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000157514 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:152417262:152417324:1 gene:ENSMUSG00000088139 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 52 // 100 // 11 // 21 // 0 /// ENSMUST00000157782 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:10:92486818:92486879:1 gene:ENSMUSG00000088407 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1 /// NONMMUT067988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK040886 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530037M05 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 67 // 100 // 14 // 21 // 0 /// NONMMUT040528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr9 // 67 // 100 // 14 // 21 // 0 /// NONMMUT000017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// NONMMUT006847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1 /// NONMMUT037155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
GENSCAN00000013859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:11986786:12456616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NR_028271 // RefSeq // Mus musculus per-hexamer repeat gene 4 (Phxr4), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000071254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:13431361:13432736:1 gene:ENSMUSG00000031802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// X12806 // GenBank // Mouse Sp5 mRNA containing period repeat. // chr9 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0
NM_001013813 // RefSeq // Mus musculus mastermind like 2 (Drosophila) (Maml2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159294 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:13619990:13709388:1 gene:ENSMUSG00000031925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC053388 // GenBank // Mus musculus mastermind like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:60867 IMAGE:30054622), complete cds. // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NM_173776 // RefSeq // Mus musculus mastermind like 2 (Drosophila) (Maml2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000034401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:13621646:13707343:1 gene:ENSMUSG00000031925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000161245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:13662460:13707345:1 gene:ENSMUSG00000031925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000177755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:13662460:13709533:1 gene:ENSMUSG00000031925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000004563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:13674345:13706604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000004556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:13561585:13623971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XR_379137 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 76, member B (Fam76b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000129861 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:13827735:13831257:1 gene:ENSMUSG00000037808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000130106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:13836703:13840066:1 gene:ENSMUSG00000037808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000156680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:13827716:13846541:1 gene:ENSMUSG00000037808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC036328 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 76, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4951621), complete cds. // chr9 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000059579 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:13827716:13846541:1 gene:ENSMUSG00000037808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// BC043120 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 76, member B, mRNA (cDNA clone MGC:58047 IMAGE:6408908), complete cds. // chr9 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// BC050870 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 76, member B, mRNA (cDNA clone MGC:59521 IMAGE:6335538), complete cds. // chr9 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// NONMMUT068112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000004589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:13831064:13877458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_030261 // RefSeq // Mus musculus sestrin 3 (Sesn3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:14276301:14326138:1 gene:ENSMUSG00000032009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC132086 // GenBank // Mus musculus sestrin 3, mRNA (cDNA clone MGC:163717 IMAGE:40130363), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC138690 // GenBank // Mus musculus sestrin 3, mRNA (cDNA clone MGC:170317 IMAGE:8861712), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// KF543243 // GenBank // Mus musculus sestrin 3 (Sesn3) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:14276552:14325706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_023153 // RefSeq // Mus musculus CWC15 homolog (S. cerevisiae) (Cwc15), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000004200 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:14500617:14510577:1 gene:ENSMUSG00000004096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY842452 // GenBank // Mus musculus mouse embryonic development factor 1 (Ed1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC004726 // GenBank // Mus musculus CWC15 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:7896 IMAGE:3582653), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:14502828:14510329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
XR_379164 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10706 (Gm10706), transcript variant X1, misc_RNA. // chr9 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// ENSMUST00000128327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:14704642:14719058:1 gene:ENSMUSG00000074508 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK138480 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330033I04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT068143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_018736 // RefSeq // Mus musculus meiotic recombination 11 homolog A (S. cerevisiae) (Mre11a), mRNA. // chr9 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000034405 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:14784654:14834646:1 gene:ENSMUSG00000031928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000115632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:14784676:14837123:1 gene:ENSMUSG00000031928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000147305 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:14784702:14799620:1 gene:ENSMUSG00000031928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 27 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000147676 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:14797153:14811939:1 gene:ENSMUSG00000031928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// BC065144 // GenBank // Mus musculus meiotic recombination 11 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:86077 IMAGE:30627207), complete cds. // chr9 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// U58987 // GenBank // Mus musculus putative endo/exonuclease MmMre11a (MmMRE11) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// U60318 // GenBank // Mus musculus putative endo/exonuclease MmMre11b (MmMRE11) mRNA, alternative splicing product, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000005064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:14784454:14832767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0
NM_010287 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 83 (Gpr83), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:14860210:14870789:1 gene:ENSMUSG00000031932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000115624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:14860254:14870310:1 gene:ENSMUSG00000031932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// M80481 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor (GIR) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000133278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:14865340:14870789:1 gene:ENSMUSG00000031932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AK030359 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330401O04 product:PROBABLE G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR GPR72 PRECURSOR (GLUCOCORTICOID- INDUCED RECEPTOR) fragment, full insert sequence. // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000005148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:14859831:14868799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_026955 // RefSeq // Mus musculus V-set and transmembrane domain containing 5 (Vstm5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15239045:15259393:1 gene:ENSMUSG00000031937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC055786 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2200002K05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67571 IMAGE:6404797), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15252954:15258251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000083348 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:15313802:15313932:1 gene:ENSMUSG00000065282 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK161656 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730443E18 product:weakly similar to PNAS-104 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056964 // GenBank // Mus musculus Josephin domain containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6827717). // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082700 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:15315189:15315321:1 gene:ENSMUSG00000064634 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK161656 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730443E18 product:weakly similar to PNAS-104 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082863 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:15315522:15315595:1 gene:ENSMUSG00000064797 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056964 // GenBank // Mus musculus Josephin domain containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6827717). // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC056964 // GenBank // Mus musculus Josephin domain containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6827717). // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000083331 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:15316489:15316588:1 gene:ENSMUSG00000065265 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// AK083755 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030074P21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT056842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Sense No Exonic // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT068163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT068164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
NM_133214 // RefSeq // Mus musculus single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 (Smco4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510043 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 (Smco4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000045620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15505487:15545260:1 gene:ENSMUSG00000058173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15520846:15545257:1 gene:ENSMUSG00000058173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF197136 // GenBank // Mus musculus FN5 protein (Fn5) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK146267 // GenBank HTC // Mus musculus CRL-1722 L5178Y-R cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I730044H04 product:Similar to FN5 protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC017612 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC017612, mRNA (cDNA clone MGC:27676 IMAGE:4911985), complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000012966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15682902:15738378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_172289 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 4 (Slc36a4), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006510170 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 4 (Slc36a4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000061568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:15709739:15742384:1 gene:ENSMUSG00000043885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000115588 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:15709738:15738579:1 gene:ENSMUSG00000043885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AF453746 // GenBank // Mus musculus proton/amino acid transporter 4 (PAT4) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC115964 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:141261 IMAGE:40057255), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000012966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15682902:15738378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
GENSCAN00000040087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:17732568:17733933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
GENSCAN00000004724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:18022352:18022873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025844 // RefSeq // Mus musculus cysteine and histidine-rich domain (CHORD)-containing, zinc-binding protein 1 (Chordc1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006510547 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cysteine and histidine-rich domain (CHORD)-containing, zinc-binding protein 1 (Chordc1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000001825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18292267:18314000:1 gene:ENSMUSG00000001774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC018374 // GenBank // Mus musculus cysteine and histidine-rich domain (CHORD)-containing, zinc-binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:25941 IMAGE:4236535), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001033793 // RefSeq // Mus musculus upstream binding transcription factor, RNA polymerase I-like 1 (Ubtfl1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006510489 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus upstream binding transcription factor, RNA polymerase I-like 1 (Ubtfl1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000098973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18409094:18410742:1 gene:ENSMUSG00000074502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 45 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000164441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:18404418:18411502:1 gene:ENSMUSG00000074502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000169398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:18404420:18411325:1 gene:ENSMUSG00000074502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK163257 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020006M18 product:weakly similar to Upstream binding transcription factor, RNA polymerase I (Fragment) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC139141 // GenBank // Mus musculus upstream binding transcription factor, RNA polymerase I-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:170768 IMAGE:8862163), complete cds. // chr9 // 90 // 45 // 9 // 10 // 0 /// BC145822 // GenBank // Mus musculus upstream binding transcription factor, RNA polymerase I-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:175709 IMAGE:40131125), complete cds. // chr9 // 90 // 45 // 9 // 10 // 0
ENSMUST00000053326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18427543:18428806:1 gene:ENSMUSG00000074501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000004761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:18414259:18427920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_144934 // RefSeq // Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 3-like 2 (Mbd3l2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18443456:18446312:1 gene:ENSMUSG00000047508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF503920 // GenBank // Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 3-like protein 2 (Mbd3l2) mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC064744 // GenBank // Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 3-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:76526 IMAGE:30051497), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:18443599:18445067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_028557 // RefSeq // Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 3-like 1 (Mbd3l1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510639 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 3-like 1 (Mbd3l1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000069218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18478379:18485292:1 gene:ENSMUSG00000038691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK018931 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700095H13 product:METHYL-CPG BINDING DOMAIN PROTEIN 3-LIKE homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// AY038023 // GenBank // Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 3-like (Mbd3l) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC049738 // GenBank // Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 3-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:58755 IMAGE:6771508), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061034 // GenBank // Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 3-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:74141 IMAGE:6707322), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:18484581:18485141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_147067 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 829 (Olfr829), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18856627:18857592:1 gene:ENSMUSG00000051414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146566 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 830 (Olfr830), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000078861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18875329:18876276:1 gene:ENSMUSG00000062868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001011824 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 832 (Olfr832), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000060601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18944650:18945588:1 gene:ENSMUSG00000095957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001011823 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 834 (Olfr834), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000086492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18987990:18988928:1 gene:ENSMUSG00000095525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001012266 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 835 (Olfr835), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000059315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19035125:19036060:1 gene:ENSMUSG00000045204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_146564 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 836 (Olfr836), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000074986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19120957:19121911:1 gene:ENSMUSG00000059303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC106988 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 836, mRNA (cDNA clone MGC:129242 IMAGE:40043348), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC106989 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 836, mRNA (cDNA clone MGC:129243 IMAGE:40043350), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_146565 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 837 (Olfr837), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000071975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19136992:19137940:1 gene:ENSMUSG00000059731 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// BC140981 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 837, mRNA (cDNA clone MGC:175942 IMAGE:9055593), complete cds. // chr9 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
XM_006544414 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 7G2-like (LOC100503048), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000054106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19318536:19319465:1 gene:ENSMUSG00000049229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:19249282:19319465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_207145 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 845 (Olfr845), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000071259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19338459:19339400:1 gene:ENSMUSG00000061614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC127982 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 845, mRNA (cDNA clone MGC:157541 IMAGE:40135240), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_146527 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 849 (Olfr849), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19440915:19441853:1 gene:ENSMUSG00000052182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146905 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 851 (Olfr851), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19496750:19497688:1 gene:ENSMUSG00000052625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146524 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 855 (Olfr855), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19584511:19585502:1 gene:ENSMUSG00000043087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137820 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 855, mRNA (cDNA clone MGC:169444 IMAGE:8860839), complete cds. // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:19584539:19585477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172918 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 317 (Zfp317), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510274 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 317 (Zfp317), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006510286 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 317 (Zfp317), transcript variant X13, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000079042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19641224:19648048:1 gene:ENSMUSG00000057551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK030030 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932416G03 product:ZNF317-4 PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC059211 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 317, mRNA (cDNA clone MGC:66533 IMAGE:6417014), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:19626030:19648048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001012265 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 857 (Olfr857), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000077023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19712829:19713758:1 gene:ENSMUSG00000094678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_011001 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 58 (Olfr58), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000079660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19780283:19784064:1 gene:ENSMUSG00000058659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_146526 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 859 (Olfr859), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000086480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19808320:19809249:1 gene:ENSMUSG00000095448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_146339 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 77 (Olfr77), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19917229:19922510:1 gene:ENSMUSG00000051118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC046590 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 77, mRNA (cDNA clone MGC:54867 IMAGE:6309128), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146559 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 868 (Olfr868), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20098626:20101690:1 gene:ENSMUSG00000044106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146557 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 869 (Olfr869), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075717 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:20129101:20138089:1 gene:ENSMUSG00000058491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146903 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 871 (Olfr871), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000073122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20212207:20213353:1 gene:ENSMUSG00000061457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC119201 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 871, mRNA (cDNA clone MGC:155517 IMAGE:8733950), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC119203 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 871, mRNA (cDNA clone MGC:155519 IMAGE:8733952), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_146560 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 872 (Olfr872), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000086474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:20237162:20260913:1 gene:ENSMUSG00000066897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC120630 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 872, mRNA (cDNA clone MGC:155867 IMAGE:40129553), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC120632 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 872, mRNA (cDNA clone MGC:155869 IMAGE:40129555), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_146825 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 39 (Olfr39), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071725 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:20282351:20286648:1 gene:ENSMUSG00000059623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146561 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 873 (Olfr873), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20300129:20301190:1 gene:ENSMUSG00000049028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139140 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 873, mRNA (cDNA clone MGC:170767 IMAGE:8862162), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_172919 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 846 (Zfp846), mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XR_379117 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 846 (Zfp846), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000060063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20587891:20594471:1 gene:ENSMUSG00000058192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000115557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:20581325:20595192:1 gene:ENSMUSG00000058192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:20581525:20595194:1 gene:ENSMUSG00000058192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK008693 // GenBank HTC // Mus musculus adult male stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2210010B09 product:similar to KRUEPPEL-TYPE ZINC FINGER PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 82 // 73 // 18 // 22 // 0 /// BC139282 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2210010B09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170909 IMAGE:8862304), complete cds. // chr9 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0
NM_023371 // RefSeq // Mus musculus protein (peptidyl-prolyl cis/trans isomerase) NIMA-interacting 1 (Pin1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20652130:20666584:1 gene:ENSMUSG00000032171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC038254 // GenBank // Mus musculus protein (peptidyl-prolyl cis/trans isomerase) NIMA-interacting 1, mRNA (cDNA clone MGC:46812 IMAGE:4971446), complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:20651545:20663284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001030290 // RefSeq // Mus musculus retinol dehydrogenase 8 (Rdh8), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20818504:20826163:1 gene:ENSMUSG00000053773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:20818504:20831206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_023167 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L4 (Mrpl4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006510539 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L4 (Mrpl4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XR_379129 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L4 (Mrpl4), transcript variant X5, misc_RNA. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000003386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21002737:21008835:1 gene:ENSMUSG00000003299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB041599 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-3848, similar to Homo sapiens CGI-28 protein mRNA. // chr9 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// AB049634 // GenBank // Mus musculus MRPL4 mRNA for mitochondrial ribosomal protein L4 (L4mt), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK216490 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0138I19, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000065926, based on BLAT search. // chr9 // 82 // 35 // 9 // 11 // 0 /// BC039983 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L4, mRNA (cDNA clone MGC:49450 IMAGE:4952757), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC061095 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L4, mRNA (cDNA clone MGC:74213 IMAGE:6588836), complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006510541 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L4 (Mrpl4), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// GENSCAN00000040249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21002941:21008639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_010493 // RefSeq // Mus musculus intercellular adhesion molecule 1 (Icam1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21015960:21028797:1 gene:ENSMUSG00000037405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC008626 // GenBank // Mus musculus intercellular adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:6195 IMAGE:3588949), complete cds. // chr9 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// CT010246 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D0551D for gene Icam1, H1 histone family, member 0; complete cds, incl. stopcodon. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// CT010302 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B0452D for gene Icam1, H1 histone family, member 0; complete cds, incl. stopcodon. // chr9 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// M31585 // GenBank // Mouse (clone lambda-c5e) intercellular adhesion molecule 1 (ICAM-1) mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21022589:21030494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_023892 // RefSeq // Mus musculus intercellular adhesion molecule 4, Landsteiner-Wiener blood group (Icam4), mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000001040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21029373:21030531:1 gene:ENSMUSG00000001014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF296282 // GenBank // Mus musculus ICAM-4 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AF296283 // GenBank // Mus musculus ICAM-4S mRNA, complete cds. // chr9 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// AK019013 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810015M19 product:similar to LW GLYCOPROTEIN [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC116909 // GenBank // Mus musculus intercellular adhesion molecule 4, Landsteiner-Wiener blood group, mRNA (cDNA clone MGC:151286 IMAGE:40126228), complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC116913 // GenBank // Mus musculus intercellular adhesion molecule 4, Landsteiner-Wiener blood group, mRNA (cDNA clone MGC:151290 IMAGE:40126232), complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21022589:21030494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_008319 // RefSeq // Mus musculus intercellular adhesion molecule 5, telencephalin (Icam5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000019616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21032038:21039036:1 gene:ENSMUSG00000032174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC113140 // GenBank // Mus musculus intercellular adhesion molecule 5, telencephalin, mRNA (cDNA clone MGC:130520 IMAGE:40048010), complete cds. // chr9 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// U06483 // GenBank // Mus musculus BALB/c telencephalin precursor mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000040232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21032130:21038900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000135674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:21091755:21128393:1 gene:ENSMUSG00000086016 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK006986 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700084C06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONMMUT068283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_153583 // RefSeq // Mus musculus autophagy related 4D, cysteine peptidase (Atg4d), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006510184 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus autophagy related 4D, cysteine peptidase (Atg4d), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006510185 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus autophagy related 4D, cysteine peptidase (Atg4d), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000065005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21265299:21274368:1 gene:ENSMUSG00000002820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AK087258 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030040E19 product:weakly similar to PUTATIVE AUTOPHAGY-RELATED CYSTEINE ENDOPEPTIDASE [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC030861 // GenBank // Mus musculus autophagy-related 4D (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:31226 IMAGE:4208700), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC069851 // GenBank // Mus musculus autophagy-related 4D (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:78029 IMAGE:6490007), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21251887:21273436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_001199186 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 44, member 2 (Slc44a2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// NM_152808 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 44, member 2 (Slc44a2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000034697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21337828:21355025:1 gene:ENSMUSG00000057193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC031535 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 44, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:28233 IMAGE:3991609), complete cds. // chr9 // 95 // 96 // 42 // 44 // 0 /// BC023763 // GenBank HTC // Mus musculus solute carrier family 44, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5343822), containing frame-shift errors. // chr9 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1 /// AK036249 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630048H04 product:weakly similar to CTL2 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 41 // 41 // 19 // 46 // 1 /// AK043924 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830053D24 product:weakly similar to CTL2 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1 /// AK031021 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830496J19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1 /// GENSCAN00000040238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21337744:21420188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 87 // 40 // 46 // 1 /// NONMMUT068299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_021888 // RefSeq // Mus musculus queuine tRNA-ribosyltransferase 1 (Qtrt1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000002902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21411837:21420277:1 gene:ENSMUSG00000002825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB034632 // GenBank // Mus musculus tgt mRNA for tRNA-guanine transglycosylase, complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC044811 // GenBank // Mus musculus queuine tRNA-ribosyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:51622 IMAGE:5031330), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000040238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21337744:21420188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_001198794 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence AB124611 (AB124611), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_206536 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence AB124611 (AB124611), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076326 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:21526228:21545331:1 gene:ENSMUSG00000057191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000086361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:21526176:21545333:1 gene:ENSMUSG00000057191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000173769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:21526201:21545326:1 gene:ENSMUSG00000057191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AB124611 // GenBank // Mus musculus hide1 mRNA for HIDE1, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB124612 // GenBank // Mus musculus shide1 mRNA for sHIDE1, complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21526277:21588188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_178619 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810026J23 gene (1810026J23Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000062125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:21592722:21595970:1 gene:ENSMUSG00000048429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC057071 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810026J23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67446 IMAGE:5695590), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21592959:21593838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_001080940 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6484 (Gm6484), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000058777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21835510:21837346:1 gene:ENSMUSG00000047822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC038127 // GenBank // Mus musculus similar to hepatocellular carcinoma-associated gene TD26, mRNA (cDNA clone IMAGE:1067123). // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001164614 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 159 (Ccdc159), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_025977 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 159 (Ccdc159), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510553 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 159 (Ccdc159), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000006403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21927471:21935872:1 gene:ENSMUSG00000006241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000170304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21927471:21935872:1 gene:ENSMUSG00000006241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK016073 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930548O08 product:hypothetical ATP/GTP-binding site motif A (P-loop) containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC120702 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2510048L02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155939 IMAGE:40129625), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC120704 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2510048L02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155941 IMAGE:40129627), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21929093:21947947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001290299 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC018242 (BC018242), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_144935 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC018242 (BC018242), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000046371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:21937033:21948904:1 gene:ENSMUSG00000040563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AY438023 // GenBank // Mus musculus plasticity-related gene 4 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC018242 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC018242, mRNA (cDNA clone MGC:25492 IMAGE:4503683), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC023082 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC018242, mRNA (cDNA clone MGC:38688 IMAGE:5357160), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000188468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:21938453:21948017:1 gene:ENSMUSG00000040563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000190387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:21938274:21948907:1 gene:ENSMUSG00000040563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21929093:21947947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_025870 // RefSeq // Mus musculus SWIM type zinc finger 7 associated protein 1 (Swsap1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000053583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21955753:21958270:1 gene:ENSMUSG00000051238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001293650 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C substrate 80K-H (Prkcsh), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_008925 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C substrate 80K-H (Prkcsh), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000115331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22003035:22014219:1 gene:ENSMUSG00000003402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC009816 // GenBank // Mus musculus protein kinase C substrate 80K-H, mRNA (cDNA clone MGC:13908 IMAGE:4008182), complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NM_001293651 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C substrate 80K-H (Prkcsh), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 1 /// ENSMUST00000003493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22003035:22014219:1 gene:ENSMUSG00000003402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 1 /// U92794 // GenBank // Mus musculus alpha glucosidase II beta subunit mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 1 /// GENSCAN00000041338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:22003459:22013162:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_009922 // RefSeq // Mus musculus calponin 1 (Cnn1), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000001384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22099281:22109630:1 gene:ENSMUSG00000001349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC138863 // GenBank // Mus musculus calponin 1, mRNA (cDNA clone MGC:170490 IMAGE:8861885), complete cds. // chr9 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// BC138864 // GenBank // Mus musculus calponin 1, mRNA (cDNA clone MGC:170491 IMAGE:8861886), complete cds. // chr9 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// BC145446 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054004. // chr9 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// Z19542 // GenBank // M.musculus h1-calponin cDNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:22099356:22108231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001082532 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Y-like (Pigyl), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:22156846:22158358:1 gene:ENSMUSG00000010607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:22156946:22158325:1 gene:ENSMUSG00000010607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_001033813 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 872 (Zfp872), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000091508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22197067:22200624:1 gene:ENSMUSG00000074472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000178901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:22188168:22202123:1 gene:ENSMUSG00000074472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150971 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9530015I07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183884 IMAGE:9087884), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151175 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9530015I07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:184075 IMAGE:9088064), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001164624 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 809 (Zfp809), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NM_172763 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 809 (Zfp809), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NR_028420 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 809 (Zfp809), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006510188 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 809 (Zfp809), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000072465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22225714:22243197:1 gene:ENSMUSG00000057982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC099418 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 809, mRNA (cDNA clone MGC:117587 IMAGE:30525533), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK044107 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830091B21 product:weakly similar to CDNA FLJ12488 FIS, CLONE NT2RM2000735, MODERATELY SIMILAR TO ZINC FINGER PROTEIN 43 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:22204785:22270589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSMUST00000058868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22411577:22444677:1 gene:ENSMUSG00000036411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// AK160343 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530077C05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// BC039998 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9530077C05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:48244 IMAGE:3326047), complete cds. // chr9 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// BC054761 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9530077C05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:64745 IMAGE:6413638), complete cds. // chr9 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// XM_006510572 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9530077C05 gene (9530077C05Rik), transcript variant X8, mRNA. // chr9 // 58 // 58 // 23 // 40 // 1 /// AK170604 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630110C03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 58 // 58 // 23 // 40 // 1 /// GENSCAN00000041321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:22411479:22444230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0
NM_028472 // RefSeq // Mus musculus BMP-binding endothelial regulator (Bmper), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000071982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:23223076:23485202:1 gene:ENSMUSG00000031963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF454954 // GenBank // Mus musculus crossveinless-2 (Cv2) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY263358 // GenBank // Mus musculus BMP-binding endothelial regulator precursor protein (BMPER) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC066153 // GenBank // Mus musculus BMP-binding endothelial regulator, mRNA (cDNA clone MGC:76491 IMAGE:30098453), complete cds. // chr9 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0
NM_175678 // RefSeq // Mus musculus neuropeptide S receptor 1 (Npsr1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000059650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:24098018:24316398:1 gene:ENSMUSG00000043659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000133787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:24097996:24289892:1 gene:ENSMUSG00000043659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000154337 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:24300334:24314871:1 gene:ENSMUSG00000043659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000154644 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:24283433:24313343:1 gene:ENSMUSG00000043659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// AK041501 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630017K07 product:hypothetical Rhodopsin-like GPCR superfamily/G-protein coupled receptors family 1 profile containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AY299387 // GenBank // Mus musculus CCAP-like receptor mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:24280713:24302463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSMUST00000098926 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:24341657:24418709:1 gene:ENSMUSG00000074465 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK144276 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630005L12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT068364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039944 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 10 (Cypt10), mRNA. // chr9 // 84 // 81 // 21 // 25 // 0 /// NM_173412 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 4 (Cypt4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000053956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:24625185:24625827:1 gene:ENSMUSG00000047995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AM040459 // GenBank // Mus musculus mRNA for cysteine-rich perinuclear theca protein 10 (Cypt10 gene). // chr9 // 84 // 81 // 21 // 25 // 0 /// BC048530 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:6775142). // chr9 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// BC060952 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 4, mRNA (cDNA clone MGC:74040 IMAGE:6772242), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001039942 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 9 (Cypt9), mRNA. // chr9 // 64 // 81 // 16 // 25 // 0 /// AF463501 // GenBank // Mus musculus basic protein CKT1R2 (Ckt1r2) mRNA, complete cds. // chr9 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// AK005791 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700009B20 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 74 // 100 // 23 // 31 // 0 /// AM040458 // GenBank // Mus musculus mRNA for cysteine-rich perinuclear theca protein 9 (Cypt9 gene). // chr9 // 64 // 81 // 16 // 25 // 0 /// BC147783 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 4, mRNA (cDNA clone MGC:182888 IMAGE:9087502), complete cds. // chr9 // 66 // 94 // 19 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:24625216:24625677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 91 // 71 // 20 // 22 // 0 /// NONMMUT068372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr9 // 74 // 100 // 23 // 31 // 0
ENSMUST00000158106 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:24964536:24964669:1 gene:ENSMUSG00000088731 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001205367 // RefSeq // Mus musculus septin 7 (Sept7), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_009859 // RefSeq // Mus musculus septin 7 (Sept7), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006510191 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus septin 7 (Sept7), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006510192 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus septin 7 (Sept7), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000115272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:25252439:25308571:1 gene:ENSMUSG00000001833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000165594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:25252439:25308571:1 gene:ENSMUSG00000001833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK220447 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4020 protein. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC058587 // GenBank // Mus musculus septin 7, mRNA (cDNA clone MGC:68032 IMAGE:6529169), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK147986 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270128E08 product:septin 7, full insert sequence. // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000030811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:25241890:25329447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1
NM_026189 // RefSeq // Mus musculus endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 (Eepd1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006510556 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 (Eepd1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000040677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:25481547:25604110:1 gene:ENSMUSG00000036611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK173239 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1706 protein. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC025571 // GenBank // Mus musculus endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:35667 IMAGE:5323841), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:25588652:25603608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
NM_144543 // RefSeq // Mus musculus thymocyte nuclear protein 1 (Thyn1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:26999677:27007330:1 gene:ENSMUSG00000035443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB080370 // GenBank // Mus musculus mRNA for thymocyte protein mThy28, complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC016594 // GenBank // Mus musculus thymocyte nuclear protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:27728 IMAGE:2631627), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XR_379142 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thymocyte nuclear protein 1 (Thyn1), transcript variant X6, misc_RNA. // chr9 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// XM_006510691 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thymocyte nuclear protein 1 (Thyn1), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// AK021335 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730042P09 product:similar to MY005 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000044587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:27002037:27007204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_178113 // RefSeq // Mus musculus non-SMC condensin II complex, subunit D3 (Ncapd3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006510697 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus non-SMC condensin II complex, subunit D3 (Ncapd3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000073127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:27030175:27095311:1 gene:ENSMUSG00000035024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000086198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:27030175:27095311:1 gene:ENSMUSG00000035024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// BC033607 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B130055D15 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5400177), partial cds. // chr9 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// BC048190 // GenBank // Mus musculus non-SMC condensin II complex, subunit D3, mRNA (cDNA clone MGC:61361 IMAGE:6831876), complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// DQ340802 // GenBank // Mus musculus Jacobsen syndrome region 2 protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AK014555 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4632407J06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1 /// GENSCAN00000044586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:27035873:27094780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0
NM_001033323 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 9B (Igsf9b), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NM_001129787 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 9B (Igsf9b), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006510197 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 9B (Igsf9b), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006510203 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 9B (Igsf9b), transcript variant X10, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000115247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:9:27299228:27330135:1 gene:ENSMUSG00000034275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000133213 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:27299230:27334763:1 gene:ENSMUSG00000034275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC150882 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 9B, mRNA (cDNA clone IMAGE:9087793), complete cds. // chr9 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// BC150887 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 9B, mRNA (cDNA clone IMAGE:9087798), complete cds. // chr9 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000044584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:27271881:27345978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
NM_029299 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 19 (Spata19), mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:27396821:27401710:1 gene:ENSMUSG00000031991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AB120716 // GenBank // Mus musculus mRNA for SPERGEN-1, complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC049742 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 19, mRNA (cDNA clone MGC:58765 IMAGE:6771761), complete cds. // chr9 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// JX089334 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis-associated protein 19 (spata19) precursor RNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000044585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:27386288:27409694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_177906 // RefSeq // Mus musculus opioid binding protein/cell adhesion molecule-like (Opcml), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006510441 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus opioid binding protein/cell adhesion molecule-like (Opcml), transcript variant X8, mRNA. // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000073822 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:28403797:28921078:1 gene:ENSMUSG00000062257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000115243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:27790947:28925410:1 gene:ENSMUSG00000062257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK158538 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230009E18 product:Opioid binding protein/cell adhesion molecule precursor (OBCAM) (Opioid-binding cell adhesion molecule) (OPCML) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC076581 // GenBank // Mus musculus opioid binding protein/cell adhesion molecule-like, mRNA (cDNA clone MGC:99974 IMAGE:30542711), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:28856630:28903366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_028874 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 19 (Snx19), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000164099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:30427329:30466726:1 gene:ENSMUSG00000031993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AK014388 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3526401K03 product:similar to SORTING NEXIN 19 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// AK044307 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930006J18 product:similar to SORTING NEXIN 19 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK122231 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0254 protein. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC063262 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 19, mRNA (cDNA clone MGC:67155 IMAGE:6405897), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006509904 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexin 19 (Snx19), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// GENSCAN00000045805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:30427709:30449275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0
NM_013906 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 8 (Adamts8), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000068135 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:30942562:30962856:1 gene:ENSMUSG00000031994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000163037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:30943458:30963838:1 gene:ENSMUSG00000031994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AF175282 // GenBank // Mus musculus zinc metalloendopeptidase ADAMTS8 mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AK043875 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830044M22 product:a disintegrin-like and metalloprotease (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 8, full insert sequence. // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:30942837:30959381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_001115130 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 44 (Zbtb44), transcript variant a, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_172765 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 44 (Zbtb44), transcript variant b, mRNA. // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000115222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:31030644:31075879:1 gene:ENSMUSG00000047412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000167346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:31053296:31068755:1 gene:ENSMUSG00000047412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// BC037671 // GenBank // Mus musculus BTB (POZ) domain containing 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:4486273). // chr9 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:30976270:31083512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_001115130 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 44 (Zbtb44), transcript variant a, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_172765 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 44 (Zbtb44), transcript variant b, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:31030644:31075879:1 gene:ENSMUSG00000047412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080817 // RefSeq // Mus musculus PR domain containing 10 (Prdm10), mRNA. // chr9 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// XM_006510464 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PR domain containing 10 (Prdm10), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006510465 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PR domain containing 10 (Prdm10), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// XM_006510466 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PR domain containing 10 (Prdm10), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000074510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:31315107:31378543:1 gene:ENSMUSG00000042496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000117389 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:31280538:31330618:1 gene:ENSMUSG00000042496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 39 // 18 // 18 // 0 /// BC064128 // GenBank // Mus musculus PR domain containing 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:3975690), complete cds. // chr9 // 100 // 39 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000136144 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:31314727:31330607:1 gene:ENSMUSG00000042496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// AK164883 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930044B03 product:PR domain containing 10, full insert sequence. // chr9 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// GENSCAN00000048364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:31274898:31378543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0
GENSCAN00000008546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:31948377:31949031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_001168354 // RefSeq // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 1 (Kcnj1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_019659 // RefSeq // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 1 (Kcnj1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000047334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:32372418:32399192:1 gene:ENSMUSG00000041248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000172015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:32393985:32399192:1 gene:ENSMUSG00000041248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF012834 // GenBank // Mus musculus inwardly rectifying potassium channel ROMK-2 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AK085262 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630001P12 product:potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 1, full insert sequence. // chr9 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// BC020525 // GenBank // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:18350 IMAGE:4241262), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:32394144:32397460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0
NR_029475 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930581F22 gene (4930581F22Rik), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093873 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:35116728:35130922:1 gene:ENSMUSG00000070315 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT068565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT068564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONMMUT068572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONMMUT068569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_026130 // RefSeq // Mus musculus signal recognition particle receptor (docking protein) (Srpr), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000034541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:35211155:35217014:1 gene:ENSMUSG00000032042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC021839 // GenBank // Mus musculus signal recognition particle receptor (docking protein), mRNA (cDNA clone MGC:30275 IMAGE:4207633), complete cds. // chr9 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0
NM_028040 // RefSeq // Mus musculus RNA pseudouridylate synthase domain containing 4 (Rpusd4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034543 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:35267865:35275965:1 gene:ENSMUSG00000032044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC061256 // GenBank // Mus musculus RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:74412 IMAGE:30251586), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000130552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:35272291:35275210:1 gene:ENSMUSG00000032044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENSMUST00000146571 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:35272647:35273762:1 gene:ENSMUSG00000032044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000014653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:35267661:35275303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT068580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONMMUT068581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_006510514 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cell adhesion molecule-related/down-regulated by oncogenes (Cdon), transcript variant X8, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000084000 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:35474885:35475046:1 gene:ENSMUSG00000065934 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023292 // RefSeq // Mus musculus pseudouridine synthase 3 (Pus3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:35559460:35567401:1 gene:ENSMUSG00000032103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121246 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:35559466:35566839:1 gene:ENSMUSG00000032103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000135768 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:35558595:35567138:1 gene:ENSMUSG00000032103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF266505 // GenBank // Mus musculus pseudouridine synthase 3 (Pus3) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC029253 // GenBank // Mus musculus pseudouridine synthase 3, mRNA (cDNA clone MGC:35810 IMAGE:4187198), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:35564817:35570101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AK011488 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610020J05 product:similar to PSEUDOURIDINE SYNTHASE 3 [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001033421 // RefSeq // Mus musculus prostate and testis expressed 2 (Pate2), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000118254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:35669639:35672889:1 gene:ENSMUSG00000074452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000098906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:35570284:35690318:1 gene:ENSMUSG00000074452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// ENSMUST00000173488 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:35669651:35671415:1 gene:ENSMUSG00000074452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// AK136739 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230111I15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// AK144787 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730034J08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// NONMMUT068600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
XM_006544383 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9230113P08 gene (9230113P08Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000086108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:36257213:36257765:-1 gene:ENSMUSG00000066767 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000176049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:35908423:35910796:1 gene:ENSMUSG00000078934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000176153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:9:35908442:35909535:1 gene:ENSMUSG00000078934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:36255931:36258323:-1 gene:ENSMUSG00000066767 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 75 // 100 // 21 // 28 // 0 /// AK020345 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230113P08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:35908926:35909535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:36257213:36257765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT068604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONMMUT068608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 75 // 100 // 21 // 28 // 0
NM_001167586 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 7257 (Gm7257), mRNA. // chr9 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000041537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:36431884:36434938:1 gene:ENSMUSG00000023093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0
NM_001128510 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9513 (Gm9513), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000165591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:36475638:36477212:1 gene:ENSMUSG00000090710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// EU703629 // GenBank // Mus musculus secreted TFP/Ly-6/uPAR protein PATE-P mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000023403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:36475638:36477180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_007391 // RefSeq // Mus musculus acrosomal vesicle protein 1 (Acrv1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:36693220:36698843:1 gene:ENSMUSG00000032110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139101 // GenBank // Mus musculus acrosomal vesicle protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170728 IMAGE:8862123), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC139103 // GenBank // Mus musculus acrosomal vesicle protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170730 IMAGE:8862125), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// U31992 // GenBank // Mus musculus acrosomal protein mSP-10 (acrv1) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:36693254:36697365:1 gene:ENSMUSG00000032110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// AK030129 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932443O05 product:acrosomal vesicle protein 1, full insert sequence. // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONMMUT068612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:36587100:36698620:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_025464 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 218 (Tmem218), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510545 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 218 (Tmem218), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006510546 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 218 (Tmem218), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37208333:37223210:1 gene:ENSMUSG00000032121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK161115 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732443H14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034160 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 218, mRNA (cDNA clone MGC:35754 IMAGE:5049687), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37218267:37222613:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_175189 // RefSeq // Mus musculus hepatocyte cell adhesion molecule (Hepacam), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000051839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:37367368:37386572:1 gene:ENSMUSG00000046240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK158265 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930049D15 product:hypothetical Immunoglobulin-like/Immunoglobulin C-2 type/Immunoglobulin subtype/Ig-like domain profile containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC139057 // GenBank // Mus musculus hepatocyte cell adhesion molecule, mRNA (cDNA clone MGC:170684 IMAGE:8862079), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC139058 // GenBank // Mus musculus hepatocyte cell adhesion molecule, mRNA (cDNA clone MGC:170685 IMAGE:8862080), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37375441:37384811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_028783 // RefSeq // Mus musculus roundabout homolog 4 (Drosophila) (Robo4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000102895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:37402046:37414022:1 gene:ENSMUSG00000032125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000115046 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:37402033:37414021:1 gene:ENSMUSG00000032125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000115048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:37401897:37414023:1 gene:ENSMUSG00000032125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000156972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:37401897:37414019:1 gene:ENSMUSG00000032125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AF536772 // GenBank // Mus musculus roundabout-like protein ROBO4 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC020129 // GenBank // Mus musculus roundabout homolog 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:3978776), complete cds. // chr9 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// BC071193 // GenBank // Mus musculus roundabout homolog 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:78016 IMAGE:5060473), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AK030973 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830473A15 product:similar to MAGIC ROUNDABOUT [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1 /// GENSCAN00000024082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37402082:37413907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0
NM_146222 // RefSeq // Mus musculus Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 2 (Msantd2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006510232 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 2 (Msantd2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000048604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37489321:37524148:1 gene:ENSMUSG00000042138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024479 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC024479, mRNA (cDNA clone MGC:37388 IMAGE:4977181), complete cds. // chr9 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC066002 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC024479, mRNA (cDNA clone MGC:90123 IMAGE:5701381), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37489060:37523542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NM_020518 // RefSeq // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 2 (Vsig2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000002008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37539255:37544205:1 gene:ENSMUSG00000001943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC099457 // GenBank // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:117653 IMAGE:30789633), complete cds. // chr9 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// GENSCAN00000024083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37528221:37580748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_146882 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 874 (Olfr874), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37746136:37747068:1 gene:ENSMUSG00000063350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37739437:37750907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146749 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 875 (Olfr875), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37772637:37773640:1 gene:ENSMUSG00000058628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132237 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 875, mRNA (cDNA clone MGC:163868 IMAGE:40130514), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC138017 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 875, mRNA (cDNA clone MGC:169641 IMAGE:8861036), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_146883 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 876 (Olfr876), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37803889:37804936:1 gene:ENSMUSG00000066750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120726 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 876, mRNA (cDNA clone MGC:155963 IMAGE:40129649), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120732 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 876, mRNA (cDNA clone MGC:155969 IMAGE:40129655), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146417 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 877 (Olfr877), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37854820:37855755:1 gene:ENSMUSG00000066749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37854820:37867821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_146313 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 145 (Olfr145), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37897325:37898375:1 gene:ENSMUSG00000066748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137773 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 145, mRNA (cDNA clone MGC:169397 IMAGE:8860792), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146798 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 878 (Olfr878), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37918548:37919612:1 gene:ENSMUSG00000066747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119219 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 878, mRNA (cDNA clone MGC:155535 IMAGE:8733968), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119221 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 878, mRNA (cDNA clone MGC:155537 IMAGE:8733970), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37911236:37919588:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146418 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 881 (Olfr881), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37992492:37993439:1 gene:ENSMUSG00000060583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37992509:37993438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146419 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 883 (Olfr883), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38025808:38026737:1 gene:ENSMUSG00000094461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38025808:38026737:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146423 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 887 (Olfr887), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38084838:38085767:1 gene:ENSMUSG00000096167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38084838:38098381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146424 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 888 (Olfr888), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38108688:38109632:1 gene:ENSMUSG00000095527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38108703:38109632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146482 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 889 (Olfr889), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38115692:38116727:1 gene:ENSMUSG00000096356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38115798:38144081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146481 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 890 (Olfr890), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38143137:38144081:1 gene:ENSMUSG00000096409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38115798:38144081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000073577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38189727:38190652:1 gene:ENSMUSG00000058521 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0
NM_146336 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 893 (Olfr893), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38209052:38209993:1 gene:ENSMUSG00000093901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC130242 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 893, mRNA (cDNA clone MGC:161297 IMAGE:40142233), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38209412:38209993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_146868 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 894 (Olfr894), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38218818:38219766:1 gene:ENSMUSG00000070311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146806 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 143 (Olfr143), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38253419:38254360:1 gene:ENSMUSG00000094778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146875 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 895 (Olfr895), mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000093864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38268515:38269465:1 gene:ENSMUSG00000096427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC152319 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 895, mRNA (cDNA clone MGC:157573 IMAGE:40135771), complete cds. // chr9 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000042293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38262697:38292873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 53 // 71 // 8 // 15 // 0
GENSCAN00000042293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38262697:38292873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 75 // 70 // 12 // 16 // 0
NM_146870 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 25 (Olfr25), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000071449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38329492:38330559:1 gene:ENSMUSG00000058270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC125306 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 25, mRNA (cDNA clone MGC:159009 IMAGE:40129821), complete cds. // chr9 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// BC125308 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 25, mRNA (cDNA clone MGC:159011 IMAGE:40129823), complete cds. // chr9 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38329838:38330530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_146871 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 898 (Olfr898), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38349085:38350035:1 gene:ENSMUSG00000094588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127995 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 898, mRNA (cDNA clone MGC:157570 IMAGE:40135758), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38349343:38350035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_207552 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 250 (Olfr250), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38367548:38368543:1 gene:ENSMUSG00000049864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_146479 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 899 (Olfr899), mRNA. // chr9 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// BC104124 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 899, mRNA (cDNA clone MGC:123886 IMAGE:40044544), complete cds. // chr9 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// BC104125 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 899, mRNA (cDNA clone MGC:123887 IMAGE:40044545), complete cds. // chr9 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38367929:38368543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_207553 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 251 (Olfr251), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38377883:38378833:1 gene:ENSMUSG00000096757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_146874 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 900 (Olfr900), mRNA. // chr9 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// BC106986 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 900, mRNA (cDNA clone MGC:129240 IMAGE:40043276), complete cds. // chr9 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38378252:38378833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_146869 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 147 (Olfr147), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38401720:38403829:1 gene:ENSMUSG00000049098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38402885:38403829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001011806 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 901 (Olfr901), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000063716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38430284:38431219:1 gene:ENSMUSG00000052058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000042294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38430284:38431219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_146802 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 902 (Olfr902), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38448792:38449847:1 gene:ENSMUSG00000049334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145901 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 902, mRNA (cDNA clone MGC:175788 IMAGE:40131204), complete cds. // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_146801 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 904 (Olfr904), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38464043:38464975:1 gene:ENSMUSG00000094380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC146614 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 904, mRNA (cDNA clone MGC:165157 IMAGE:40040862), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_146804 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 905 (Olfr905), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38472745:38473681:1 gene:ENSMUSG00000096794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150476 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 905, mRNA (cDNA clone MGC:157497 IMAGE:40134740), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_146803 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 906 (Olfr906), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38488031:38488966:1 gene:ENSMUSG00000039962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146805 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 907 (Olfr907), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38498671:38499603:1 gene:ENSMUSG00000094810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146872 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 908 (Olfr908), mRNA. // chr9 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// ENSMUST00000075798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38516034:38516965:1 gene:ENSMUSG00000063732 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0
NM_146873 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 911, pseudogene 1 (Olfr911-ps1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38523730:38524669:1 gene:ENSMUSG00000062621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127963 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 909, mRNA (cDNA clone MGC:157508 IMAGE:40134907), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146811 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 910 (Olfr910), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000073214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38537882:38539829:1 gene:ENSMUSG00000057444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_146810 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 912 (Olfr912), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38580244:38582211:1 gene:ENSMUSG00000060114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38539248:38582211:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001011523 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 913 (Olfr913), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000081095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38592803:38595161:1 gene:ENSMUSG00000059189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_146786 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 914 (Olfr914), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000057755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38606467:38607417:1 gene:ENSMUSG00000047050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000042300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38606707:38665195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
NM_001145957 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5A (Vwa5a), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NM_172767 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5A (Vwa5a), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000001544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:38718268:38743337:1 gene:ENSMUSG00000023186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000118144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:38718272:38742762:1 gene:ENSMUSG00000023186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000137972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:38736185:38741920:1 gene:ENSMUSG00000023186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AY366502 // GenBank // Mus musculus BCSC1 (Bcsc1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC004727 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5A, mRNA (cDNA clone MGC:6690 IMAGE:3582797), complete cds. // chr9 // 93 // 64 // 25 // 27 // 0 /// BC065153 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5A, mRNA (cDNA clone MGC:90083 IMAGE:6418714), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000042283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38719682:38741773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0
NM_146787 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 920 (Olfr920), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000074740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38752796:38756863:1 gene:ENSMUSG00000061039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_146782 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 921 (Olfr921), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510360 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 921 (Olfr921), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38773088:38776354:1 gene:ENSMUSG00000049926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC131918 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 921, mRNA (cDNA clone MGC:163549 IMAGE:40130195), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC131920 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 921, mRNA (cDNA clone MGC:163551 IMAGE:40130197), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146781 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 922 (Olfr922), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000051004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38815408:38816539:1 gene:ENSMUSG00000043911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC119109 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 922, mRNA (cDNA clone MGC:155425 IMAGE:8733858), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC125623 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 922, mRNA (cDNA clone MGC:159326 IMAGE:40130138), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38786560:38828646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_146816 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 923 (Olfr923), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38827615:38828682:1 gene:ENSMUSG00000044798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132247 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 923, mRNA (cDNA clone MGC:163878 IMAGE:40130524), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132249 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 923, mRNA (cDNA clone MGC:163880 IMAGE:40130526), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38786560:38828646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207560 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 924 (Olfr924), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38848116:38849042:1 gene:ENSMUSG00000062103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38848116:38849042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146441 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 933 (Olfr933), mRNA. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NM_146783 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 26 (Olfr26), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38975651:38976653:1 gene:ENSMUSG00000058515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000104874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38855060:38855990:1 gene:ENSMUSG00000047667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119155 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 933, mRNA (cDNA clone MGC:155471 IMAGE:8733904), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC119157 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 933, mRNA (cDNA clone MGC:155473 IMAGE:8733906), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC130238 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 26, mRNA (cDNA clone MGC:161287 IMAGE:40142117), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38975678:38976604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38855064:38855990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146815 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 926 (Olfr926), mRNA. // chr9 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38877126:38878176:1 gene:ENSMUSG00000064333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC120558 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 926, mRNA (cDNA clone MGC:155795 IMAGE:40129481), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC125490 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 926, mRNA (cDNA clone MGC:159193 IMAGE:40130005), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_146272 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 930 (Olfr930), mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38930173:38931099:1 gene:ENSMUSG00000063221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC119252 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 930, mRNA (cDNA clone MGC:155568 IMAGE:8734001), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC119254 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 930, mRNA (cDNA clone MGC:155570 IMAGE:8734003), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38930173:38931099:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_146441 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 933 (Olfr933), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38975651:38976653:1 gene:ENSMUSG00000058515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119155 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 933, mRNA (cDNA clone MGC:155471 IMAGE:8733904), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119157 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 933, mRNA (cDNA clone MGC:155473 IMAGE:8733906), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38975678:38976604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000040659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39074102:39075738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 71 // 14 // 15 // 0
NM_146829 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 27 (Olfr27), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39128167:39145072:1 gene:ENSMUSG00000049708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_010974 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 242 (Olfr242), mRNA. // chr9 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// X89693 // GenBank // M.musculus mRNA for TPCR56 protein. // chr9 // 65 // 68 // 11 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39144102:39145037:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146326 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 943 (Olfr943), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39166310:39185124:1 gene:ENSMUSG00000094970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39184180:39185124:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146507 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 944 (Olfr944), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39217359:39218294:1 gene:ENSMUSG00000096555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39217359:39218294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011812 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 951 (Olfr951), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000078531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39393793:39394737:1 gene:ENSMUSG00000094269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_146331 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 954 (Olfr954), mRNA. // chr9 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// ENSMUST00000080329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39461433:39462377:1 gene:ENSMUSG00000094745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39387477:39411984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39461433:39462377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0
NM_146331 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 954 (Olfr954), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39461433:39462377:1 gene:ENSMUSG00000094745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39461433:39462377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146505 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 148 (Olfr148), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39613544:39614560:1 gene:ENSMUSG00000048299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125353 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 148, mRNA (cDNA clone MGC:159056 IMAGE:40129868), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132239 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 148, mRNA (cDNA clone MGC:163870 IMAGE:40130516), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39609753:39617187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_146279 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 960 (Olfr960), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000077060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39623105:39624171:1 gene:ENSMUSG00000059867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC132468 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 960, mRNA (cDNA clone MGC:164099 IMAGE:40130745), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC132470 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 960, mRNA (cDNA clone MGC:164101 IMAGE:40130747), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000040660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39623476:39624075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_146504 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 961 (Olfr961), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000076548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39646724:39647672:1 gene:ENSMUSG00000059106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC127985 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 961, mRNA (cDNA clone MGC:157550 IMAGE:40135556), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39647073:39647672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_001011827 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 963 (Olfr963), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000073433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39669059:39669994:1 gene:ENSMUSG00000064110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000040642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39669404:39669994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
NM_001011859 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 965 (Olfr965), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000069342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39719229:39720167:1 gene:ENSMUSG00000095839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39719229:39720167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_146440 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 919 (Olfr919), mRNA. // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NM_146609 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 150 (Olfr150), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38697429:38698376:-1 gene:ENSMUSG00000056961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39736817:39737755:1 gene:ENSMUSG00000094353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011826 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 967 (Olfr967), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000069561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39750388:39751320:1 gene:ENSMUSG00000055820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000040670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39723961:39751320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_146826 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 969 (Olfr969), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39795377:39796312:1 gene:ENSMUSG00000094254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39795617:39796312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_146611 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 970 (Olfr970), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39819641:39820576:1 gene:ENSMUSG00000095774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39819641:39820576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146614 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 971 (Olfr971), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39839436:39840359:1 gene:ENSMUSG00000093934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39839436:39840359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146610 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 972 (Olfr972), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39873277:39874221:1 gene:ENSMUSG00000094449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39873277:39874221:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146613 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 229 (Olfr229), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000076802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39909805:39910728:1 gene:ENSMUSG00000095390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000043048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39909805:39943194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_147107 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 974 (Olfr974), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39942215:39943294:1 gene:ENSMUSG00000051493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC131914 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 974, mRNA (cDNA clone MGC:163545 IMAGE:40130191), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132593 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 974, mRNA (cDNA clone MGC:164224 IMAGE:40130870), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39909805:39943194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_147105 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 978 (Olfr978), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39993812:39994747:1 gene:ENSMUSG00000044292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39993881:39994747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_146286 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 981 (Olfr981), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:40022352:40023348:1 gene:ENSMUSG00000046678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120776 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 981, mRNA (cDNA clone MGC:156013 IMAGE:40129699), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120778 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 981, mRNA (cDNA clone MGC:156015 IMAGE:40129701), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40022746:40040526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NR_033613 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700001J11 gene (1700001J11Rik), non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000190330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:40050555:40053028:1 gene:ENSMUSG00000101963 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000043060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40050623:40052923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_146854 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 982 (Olfr982), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:40074297:40075262:1 gene:ENSMUSG00000049010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104306 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 982, mRNA (cDNA clone MGC:129254 IMAGE:40044025), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104307 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 982, mRNA (cDNA clone MGC:129255 IMAGE:40044030), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40060810:40092946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_029379 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 225 (Tmem225), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510665 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 225 (Tmem225), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000046333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:40148122:40150880:1 gene:ENSMUSG00000040541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116869 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700030E15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151246 IMAGE:40126188), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC116871 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700030E15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151248 IMAGE:40126190), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40148326:40150784:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000043053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40164633:40164959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_146615 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 986 (Olfr986), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000062229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:40187079:40188094:1 gene:ENSMUSG00000051095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC116768 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 986, mRNA (cDNA clone MGC:151145 IMAGE:40126087), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC116770 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 986, mRNA (cDNA clone MGC:151147 IMAGE:40126089), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000043049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40187117:40188055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0
NM_030713 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 202 (Zfp202), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:40192317:40213189:1 gene:ENSMUSG00000025602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:40192316:40213604:1 gene:ENSMUSG00000025602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168832 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:40192329:40213189:1 gene:ENSMUSG00000025602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF292648 // GenBank // Mus musculus zinc finger 202 m1 (Znf202) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF292649 // GenBank // Mus musculus zinc finger 202 m3 splice variant (Znf202) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC049772 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 202, mRNA (cDNA clone MGC:59258 IMAGE:6334069), complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006510714 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 202 (Zfp202), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000043079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40207293:40211869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_133733 // RefSeq // Mus musculus CXADR-like membrane protein (Clmp), mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510602 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CXADR-like membrane protein (Clmp), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:40686012:40785319:1 gene:ENSMUSG00000032024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB040490 // GenBank // Mus musculus asp5 mRNA for adipocyte-specific protein 5, complete cds. // chr9 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// AK018527 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030425E11 product:ADIPOCYTE-SPECIFIC PROTEIN 5 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// AY259213 // GenBank // Mus musculus CAR-like membrane protein (CLMP) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AY326421 // GenBank // Mus musculus adipocyte adhesion molecule mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC026447 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9030425E11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:31428 IMAGE:4459717), complete cds. // chr9 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:40774094:40782471:1 gene:ENSMUSG00000032024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000043062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40730993:40777223:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NR_028274 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 14D (Snord14d), small nucleolar RNA. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NR_028276 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 14C (Snord14c), small nucleolar RNA. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083424 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:40803995:40804080:1 gene:ENSMUSG00000095118 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101927 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:40803583:40803668:1 gene:ENSMUSG00000096263 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:40801276:40805199:1 gene:ENSMUSG00000015656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M13967 // GenBank // Mouse 4.5S RNA able to hybridize to mRNA and 18S rRNA. // chr9 // 54 // 96 // 13 // 24 // 0 /// NONMMUT068694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_028274 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 14D (Snord14d), small nucleolar RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_028276 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 14C (Snord14c), small nucleolar RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083424 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:40803995:40804080:1 gene:ENSMUSG00000095118 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101927 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:40803583:40803668:1 gene:ENSMUSG00000096263 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:40801276:40805199:1 gene:ENSMUSG00000015656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M13967 // GenBank // Mouse 4.5S RNA able to hybridize to mRNA and 18S rRNA. // chr9 // 58 // 96 // 14 // 24 // 0 /// NONMMUT068694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT068695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_028275 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 14E (Snord14e), small nucleolar RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082857 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:40804748:40804837:1 gene:ENSMUSG00000064791 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:40801276:40805199:1 gene:ENSMUSG00000015656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK038159 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130083C16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00007451 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178245 // RefSeq // Mus musculus brain specific homeobox (Bsx), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000067375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:40874127:40877972:1 gene:ENSMUSG00000054360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY233396 // GenBank // Mus musculus brain-specific homeodomain protein (Bsx) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC104386 // GenBank // Mus musculus brain specific homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:129478 IMAGE:40050191), complete cds. // chr9 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC104387 // GenBank // Mus musculus brain specific homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:129479 IMAGE:40050192), complete cds. // chr9 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// XM_006510308 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus brain specific homeobox (Bsx), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_006510309 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus brain specific homeobox (Bsx), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40871863:40877847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NR_029790 // RefSeq // Mus musculus microRNA 100 (Mir100), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000175270 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:41531425:41531504:1 gene:ENSMUSG00000093011 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-100 // miRBase Micro RNA Database // MI0000692 Mus musculus miR-100 stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT068719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT068723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_029726 // RefSeq // Mus musculus microRNA let7a-2 (Mirlet7a-2), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000175029 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:41536716:41536811:1 gene:ENSMUSG00000092770 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-let-7a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000557 Mus musculus let-7a-2 stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT068724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_015483 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2610203C20 gene (2610203C20Rik), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000098868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:41580741:41592827:1 gene:ENSMUSG00000074415 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000181214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:41579974:41592829:1 gene:ENSMUSG00000074415 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000181296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:41588494:41592737:1 gene:ENSMUSG00000074415 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000181955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:41581339:41592487:1 gene:ENSMUSG00000074415 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AK141402 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530002H21 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000188774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:41579494:41592826:1 gene:ENSMUSG00000074415 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT068727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT068728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT068731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT068734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NR_029822 // RefSeq // Mus musculus microRNA 125b-1 (Mir125b-1), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000175613 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:41581926:41582002:1 gene:ENSMUSG00000093354 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000185538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:41581908:41582283:1 gene:ENSMUSG00000100158 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-mir-125b-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000725 Mus musculus miR-125b-1 stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT068732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
AK153680 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630043H04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00007465 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023655 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 29 (Trim29), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:43310763:43336125:1 gene:ENSMUSG00000032013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC027353 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 29, mRNA (cDNA clone MGC:28195 IMAGE:3988926), complete cds. // chr9 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:43310876:43335172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_021424 // RefSeq // Mus musculus poliovirus receptor-related 1 (Pvrl1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000034510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:43744576:43807454:1 gene:ENSMUSG00000032012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF239762 // GenBank // Mus musculus nectin-1 delta mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF270977 // GenBank // Mus musculus nectin-1 alpha mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF297665 // GenBank // Mus musculus nectin-1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC060694 // GenBank // Mus musculus poliovirus receptor-related 1, mRNA (cDNA clone MGC:66906 IMAGE:6405088), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000050011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:43765636:43847424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
XR_405626 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 3898 (Gm3898), ncRNA. // chr9 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000180221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:43829963:43832516:1 gene:ENSMUSG00000096322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:43765636:43847424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0
NM_009382 // RefSeq // Mus musculus thymus cell antigen 1, theta (Thy1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114840 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:44043384:44048579:1 gene:ENSMUSG00000032011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY445633 // GenBank // Mus musculus CD90.1 mRNA, complete cds. // chr9 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0 /// BC054436 // GenBank // Mus musculus thymus cell antigen 1, theta, mRNA (cDNA clone MGC:62652 IMAGE:6312210), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:43997257:44047451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_023061 // RefSeq // Mus musculus melanoma cell adhesion molecule (Mcam), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:44134562:44142727:1 gene:ENSMUSG00000032135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000098852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:44134658:44142724:1 gene:ENSMUSG00000032135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000132490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:44136861:44139682:1 gene:ENSMUSG00000032135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// AB035508 // GenBank // Mus musculus mRNA for l-gicerin/MUC18, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB035509 // GenBank // Mus musculus mRNA for s-gicerin/MUC18, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC026985 // GenBank // Mus musculus melanoma cell adhesion molecule, mRNA (cDNA clone MGC:35823 IMAGE:5372497), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000149241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:44134469:44138934:1 gene:ENSMUSG00000032135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000054259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44134690:44142263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_001081369 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 153 (Ccdc153), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006510377 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 153 (Ccdc153), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000092426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44240677:44247306:1 gene:ENSMUSG00000070306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC038167 // GenBank HTC // Mus musculus coiled-coil domain containing 153, mRNA (cDNA clone IMAGE:3326572), with apparent retained intron. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44241007:44246885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
AK149266 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930006O16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010436 // RefSeq // Mus musculus H2A histone family, member X (H2afx), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:44334694:44336077:1 gene:ENSMUSG00000049932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC005468 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member X, mRNA (cDNA clone MGC:6616 IMAGE:3490058), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010336 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member X, mRNA (cDNA clone MGC:11561 IMAGE:3156946), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001293630 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 37 (glucose-6-phosphate transporter), member 4 (Slc37a4), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NM_001293631 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 37 (glucose-6-phosphate transporter), member 4 (Slc37a4), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NM_008063 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 37 (glucose-6-phosphate transporter), member 4 (Slc37a4), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000165839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44398176:44402963:1 gene:ENSMUSG00000032114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF080469 // GenBank // Mus musculus putative glycogen storage disease type 1b protein mRNA, complete cds. // chr9 // 79 // 80 // 19 // 24 // 0 /// BC075655 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 37 (glucose-6-phosphate transporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:96351 IMAGE:30542293), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44398474:44402468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000080911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44477924:44479733:1 gene:ENSMUSG00000060380 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT068853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030256 // RefSeq // Mus musculus B cell CLL/lymphoma 9-like (Bcl9l), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006510699 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B cell CLL/lymphoma 9-like (Bcl9l), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006510702 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B cell CLL/lymphoma 9-like (Bcl9l), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006510704 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B cell CLL/lymphoma 9-like (Bcl9l), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000074989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44499136:44510388:1 gene:ENSMUSG00000063382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AB128033 // GenBank // Mus musculus B9L mRNA for BCL9-related beta-catenin-binding protein, complete cds. // chr9 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// AK155681 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730201L05 product:DLNB11 protein homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 95 // 57 // 19 // 20 // 0 /// AY296058 // GenBank // Mus musculus BCL9-2 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC082304 // GenBank // Mus musculus B-cell CLL/lymphoma 9-like, mRNA (cDNA clone MGC:90769 IMAGE:6856460), complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000054267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44499524:44509783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
NM_001110826 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 6 (Ddx6), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NM_007841 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 6 (Ddx6), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NM_181324 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 6 (Ddx6), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000170489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44604892:44640731:1 gene:ENSMUSG00000032097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC021452 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 6, mRNA (cDNA clone MGC:29113 IMAGE:5043599), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// AK036648 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830145K21 product:DEAD (aspartate-glutamate-alanine-aspartate) box polypeptide 6, full insert sequence. // chr9 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// D50494 // GenBank // Mus musculus mRNA for RCK, complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000054265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44604619:44635858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
NM_013487 // RefSeq // Mus musculus CD3 antigen, delta polypeptide (Cd3d), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006509965 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD3 antigen, delta polypeptide (Cd3d), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44981793:44987052:1 gene:ENSMUSG00000032094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK042172 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630066F16 product:CD3 antigen, delta polypeptide, full insert sequence. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC062807 // GenBank // Mus musculus CD3 antigen, delta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:73593 IMAGE:1366111), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EF382667 // GenBank // Mus musculus CD3 antigen delta polypeptide (Cd3d) mRNA, complete cds. // chr9 // 83 // 89 // 20 // 24 // 0 /// HM536173 // GenBank // Mus musculus CD3 antigen delta polypeptide (CD3d) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// X02339 // GenBank // Mouse mRNA for T3 delta chain of T3/T-cell receptor glycoprotein. // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44984874:44986344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_007962 // RefSeq // Mus musculus myelin protein zero-like 2 (Mpzl2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006510000 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myelin protein zero-like 2 (Mpzl2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:45042425:45054015:1 gene:ENSMUSG00000032092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF030454 // GenBank // Mus musculus epithelial V-like antigen precursor (Eva) mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// BC015076 // GenBank // Mus musculus myelin protein zero-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:13828 IMAGE:4188907), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45034562:45049715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// AK033359 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430403M24 product:epithelial V-like antigen, full insert sequence. // chr9 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONMMUT068902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
ENSMUST00000093856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:45055188:45065169:1 gene:ENSMUSG00000070305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:45055209:45066464:1 gene:ENSMUSG00000070305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// AK155483 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630302L01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// BC132150 // GenBank // Mus musculus myelin protein zero-like 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:40130427), complete cds. // chr9 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// NM_001093749 // RefSeq // Mus musculus myelin protein zero-like 3 (Mpzl3), mRNA. // chr9 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// ENSMUST00000114664 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:45055186:45077436:1 gene:ENSMUSG00000070305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// EF102773 // GenBank // Mus musculus myelin protein zero-like protein 3 (Mpzl3) mRNA, complete cds. // chr9 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1 /// ENSMUST00000187113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:45059249:45065653:1 gene:ENSMUSG00000070305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT068905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000012220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45055243:45126304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1
NM_001005421 // RefSeq // Mus musculus adhesion molecule, interacts with CXADR antigen 1 (Amica1), mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006510382 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adhesion molecule, interacts with CXADR antigen 1 (Amica1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// XM_006510383 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adhesion molecule, interacts with CXADR antigen 1 (Amica1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// XM_006510385 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adhesion molecule, interacts with CXADR antigen 1 (Amica1), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// XM_006510386 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adhesion molecule, interacts with CXADR antigen 1 (Amica1), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000050020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:45079183:45108530:1 gene:ENSMUSG00000048534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AY093688 // GenBank // Mus musculus dendritic-cell specific protein Crea7 (Crea7) mRNA, complete cds. // chr9 // 88 // 89 // 29 // 33 // 0 /// BC050133 // GenBank // Mus musculus adhesion molecule, interacts with CXADR antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:61025 IMAGE:30023491), complete cds. // chr9 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510387 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adhesion molecule, interacts with CXADR antigen 1 (Amica1), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1 /// XM_006510388 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adhesion molecule, interacts with CXADR antigen 1 (Amica1), transcript variant X7, mRNA. // chr9 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1 /// GENSCAN00000012220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45055243:45126304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 17 // 37 // 1
NM_001014761 // RefSeq // Mus musculus sodium channel, voltage-gated, type II, beta (Scn2b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006510628 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sodium channel, voltage-gated, type II, beta (Scn2b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// XM_006510629 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sodium channel, voltage-gated, type II, beta (Scn2b), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000093855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:45117881:45130068:1 gene:ENSMUSG00000070304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000170998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:45117876:45130070:1 gene:ENSMUSG00000070304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB118947 // GenBank // Mus musculus SCN2B mRNA for sodium channel beta2 subunit, complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC092225 // GenBank // Mus musculus sodium channel, voltage-gated, type II, beta, mRNA (cDNA clone MGC:116602 IMAGE:6839081), complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45055243:45126304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001013390 // RefSeq // Mus musculus sodium channel, type IV, beta (Scn4b), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:45138437:45154152:1 gene:ENSMUSG00000046480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB118946 // GenBank // Mus musculus SCN4B mRNA for sodium channel beta4 subunit, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AY669079 // GenBank // Mus musculus voltage gated sodium channel beta 4 subunit (Scn4b) mRNA, complete cds. // chr9 // 85 // 77 // 17 // 20 // 0 /// BC139399 // GenBank // Mus musculus sodium channel, type IV, beta, mRNA (cDNA clone MGC:171026 IMAGE:8862421), complete cds. // chr9 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC139400 // GenBank // Mus musculus sodium channel, type IV, beta, mRNA (cDNA clone MGC:171027 IMAGE:8862422), complete cds. // chr9 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45142331:45150504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001013373 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 13 (Tmprss13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006510132 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protease, serine 13 (Tmprss13), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000034597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:45319100:45347581:1 gene:ENSMUSG00000037129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC085323 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 13, mRNA (cDNA clone MGC:103261 IMAGE:30734093), complete cds. // chr9 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45311630:45370450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_022004 // RefSeq // Mus musculus FXYD domain-containing ion transport regulator 6 (Fxyd6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:45370185:45396158:1 gene:ENSMUSG00000066705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB032010 // GenBank // Mus musculus plp mRNA for PLM-like protein, complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC051127 // GenBank // Mus musculus FXYD domain-containing ion transport regulator 6, mRNA (cDNA clone MGC:58114 IMAGE:6531451), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC042579 // GenBank // Mus musculus FXYD domain-containing ion transport regulator 6, mRNA (cDNA clone MGC:25545 IMAGE:3709336), complete cds. // chr9 // 55 // 80 // 11 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45389993:45455069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001081270 // RefSeq // Mus musculus Down syndrome cell adhesion molecule like 1 (Dscaml1), mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000034592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:45430293:45753164:1 gene:ENSMUSG00000032087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// BC096527 // GenBank // Mus musculus Down syndrome cell adhesion molecule-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5706696), partial cds. // chr9 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45628772:45753164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0
NM_001281934 // RefSeq // Mus musculus proprotein convertase subtilisin/kexin type 7 (Pcsk7), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NM_008794 // RefSeq // Mus musculus proprotein convertase subtilisin/kexin type 7 (Pcsk7), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// NR_104055 // RefSeq // Mus musculus proprotein convertase subtilisin/kexin type 7 (Pcsk7), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006510086 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proprotein convertase subtilisin/kexin type 7 (Pcsk7), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// XM_006510089 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proprotein convertase subtilisin/kexin type 7 (Pcsk7), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000039059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:45906569:45929692:1 gene:ENSMUSG00000035382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 95 // 36 // 37 // 0 /// BC006730 // GenBank // Mus musculus proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, mRNA (cDNA clone MGC:11587 IMAGE:3962441), complete cds. // chr9 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// U48830 // GenBank // Mus musculus subtilisin-like proprotein convertase-7 mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 90 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000046104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45909374:45928828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0
XR_379341 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A830035O19 gene (A830035O19Rik), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139379 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830035O19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009692 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein A-I (Apoa1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:46228580:46230466:1 gene:ENSMUSG00000032083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012253 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein A-I, mRNA (cDNA clone MGC:18650 IMAGE:4195624), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC019837 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein A-I, mRNA (cDNA clone MGC:29972 IMAGE:5123746), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC091745 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein A-I, mRNA (cDNA clone MGC:102525 IMAGE:5126143), complete cds. // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000132155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:46228721:46229973:1 gene:ENSMUSG00000032083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:46116952:46230402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_007468 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein A-IV (Apoa4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:46240696:46243459:1 gene:ENSMUSG00000032080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010769 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein A-IV, mRNA (cDNA clone MGC:18592 IMAGE:4240796), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC050149 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein A-IV, mRNA (cDNA clone MGC:60640 IMAGE:30013747), complete cds. // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// M64248 // GenBank // Mouse apolipoprotein A-IV (apoa-A) mRNA, complete cds. // chr9 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// M64249 // GenBank // Mouse apolipoprotein A-IV (apoa-4) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// M64250 // GenBank // Mouse apolipoprotein A-IV (apoa-4) mRNA, complete cds. // chr9 // 77 // 88 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:46241154:46270734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_080434 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein A-V (Apoa5), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:46269078:46271919:1 gene:ENSMUSG00000032079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:46268633:46271919:1 gene:ENSMUSG00000032079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF327059 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein A5 (ApoA5) mRNA, complete cds, alternative transcript. // chr9 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC011198 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein A-V, mRNA (cDNA clone MGC:18812 IMAGE:4196296), complete cds. // chr9 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:46241154:46270734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_011752 // RefSeq // Mus musculus ZPR1 zinc finger (Zpr1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034583 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:46273197:46281489:1 gene:ENSMUSG00000032078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114552 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:46273208:46281484:1 gene:ENSMUSG00000032078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000125239 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:46273289:46275789:1 gene:ENSMUSG00000032078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000156440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:46273064:46282643:1 gene:ENSMUSG00000032078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC021397 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 259, mRNA (cDNA clone MGC:29104 IMAGE:5067274), complete cds. // chr9 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// ENSMUST00000141763 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:46273632:46276737:1 gene:ENSMUSG00000032078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// AK170372 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630101H16 product:zinc finger protein 259, full insert sequence. // chr9 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000046101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:46273197:46281172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// U41287 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein (ZPR1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_146000 // RefSeq // Mus musculus BUD13 homolog (yeast) (Bud13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000074957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:46283008:46298783:1 gene:ENSMUSG00000032077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000138498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:46283008:46294099:1 gene:ENSMUSG00000032077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK051047 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030060M11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC025490 // GenBank // Mus musculus BUD13 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:38070 IMAGE:5252666), complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000124887 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:46288247:46298783:1 gene:ENSMUSG00000032077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000046095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:46283031:46298508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
NM_172921 // RefSeq // Mus musculus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 4 (Nxpe4), mRNA. // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// XM_006510313 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 4 (Nxpe4), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// XM_006510316 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 4 (Nxpe4), transcript variant X7, mRNA. // chr9 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// XM_006510323 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 4 (Nxpe4), transcript variant X14, mRNA. // chr9 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// XM_006510326 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 4 (Nxpe4), transcript variant X17, mRNA. // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000093853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:48362041:48400025:1 gene:ENSMUSG00000044229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AK048132 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130036J11 product:weakly similar to BRUSH BORDER 61.9 KDA PROTEIN PRECURSOR [Oryctolagus cuniculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC085195 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 55, member D, mRNA (cDNA clone MGC:115749 IMAGE:30693393), complete cds. // chr9 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC094249 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 55, member D, mRNA (cDNA clone MGC:106633 IMAGE:5720174), complete cds. // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000037143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:48431023:48439236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NR_026561 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 8884 (Gm8884), long non-coding RNA. // chr9 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// KnowTID_00007477 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONMMUT069007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000037126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:48453329:48462040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001004191 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5617 (Gm5617), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:48495345:48495964:1 gene:ENSMUSG00000042293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011344 // GenBank // Mus musculus predicted gene, EG434402, mRNA (cDNA clone MGC:5739 IMAGE:3481870), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_175482 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 28 (Usp28), mRNA. // chr9 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// ENSMUST00000047349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:48985385:49042517:1 gene:ENSMUSG00000032267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// BC066033 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 28, mRNA (cDNA clone MGC:91310 IMAGE:6835629), complete cds. // chr9 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// BC088733 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 28, mRNA (cDNA clone MGC:91169 IMAGE:30459522), complete cds. // chr9 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// GENSCAN00000055357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:48985481:49041549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_012039 // RefSeq // Mus musculus zw10 kinetochore protein (Zw10), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:49055581:49078772:1 gene:ENSMUSG00000032264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF003951 // GenBank // Mus musculus ZW10 homolog (MmZW10) mRNA, partial cds. // chr9 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC012435 // GenBank // Mus musculus ZW10 homolog (Drosophila), centromere/kinetochore protein, mRNA (cDNA clone MGC:11681 IMAGE:3711269), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC025107 // GenBank HTC // Mus musculus ZW10 homolog (Drosophila), centromere/kinetochore protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:3988141), containing frame-shift errors. // chr9 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:49055683:49097774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_177701 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4894 (Gm4894), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000067007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:49268572:49278783:1 gene:ENSMUSG00000054156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_010077 // RefSeq // Mus musculus dopamine receptor D2 (Drd2), mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006509996 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dopamine receptor D2 (Drd2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000075764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:49340662:49407214:1 gene:ENSMUSG00000032259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC105663 // GenBank // Mus musculus dopamine receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:124207 IMAGE:40046665), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC105664 // GenBank // Mus musculus dopamine receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:124208 IMAGE:40046668), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC105665 // GenBank // Mus musculus dopamine receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:124205 IMAGE:40046660), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC105666 // GenBank // Mus musculus dopamine receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:124206 IMAGE:40046662), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// X55674 // GenBank // M.musculus mRNA for D2A dopamine receptor. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:49288366:49407094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
ENSMUST00000068730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:49518336:49562944:1 gene:ENSMUSG00000079564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK017085 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933436I09 product:neural cell adhesion molecule, full insert sequence. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK036529 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830128D06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC049643 // GenBank // Mus musculus, clone IMAGE:6704545, mRNA. // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NR_029465 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11149 (Gm11149), long non-coding RNA. // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT069030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
AK002767 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610037B23 product:hypothetical Immunoglobulin and major histocompatibility complex domain containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC017624 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1600029D21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28780 IMAGE:4487871), complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC022950 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1600029D21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30370 IMAGE:5148408), complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_029639 // RefSeq // Mus musculus placenta expressed transcript 1 (Plet1), mRNA. // chr9 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000114474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:50494525:50505482:1 gene:ENSMUSG00000032068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// AY364436 // GenBank // Mus musculus placenta expressed transcript 1 mRNA, complete cds. // chr9 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// ENSMUST00000188047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:50494527:50501979:1 gene:ENSMUSG00000032068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC006958 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 1600029D21 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:2812622), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr9 // 73 // 73 // 16 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:50494563:50510800:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_013897 // RefSeq // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 8B (Timm8b), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000044051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:50603901:50605320:1 gene:ENSMUSG00000039016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AF196314 // GenBank // Mus musculus small zinc finger-like protein DDP2 (Ddp2) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AK004190 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110046L21 product:translocase of inner mitochondrial membrane 8 homolog b (yeast), full insert sequence. // chr9 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// BC029239 // GenBank // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 8 homolog b (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:35981 IMAGE:4237232), complete cds. // chr9 // 92 // 90 // 35 // 38 // 0 /// GENSCAN00000032123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:50558447:50605100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1
NM_001289784 // RefSeq // Mus musculus crystallin, alpha B (Cryab), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NM_001289785 // RefSeq // Mus musculus crystallin, alpha B (Cryab), transcript variant 4, mRNA. // chr9 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NM_009964 // RefSeq // Mus musculus crystallin, alpha B (Cryab), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509970 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, alpha B (Cryab), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:50752758:50756633:1 gene:ENSMUSG00000032060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC010768 // GenBank // Mus musculus crystallin, alpha B, mRNA (cDNA clone MGC:18591 IMAGE:4238233), complete cds. // chr9 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// CT010341 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G0752D for gene Cryab, Crystallin, alpha B; complete cds, incl. stopcodon. // chr9 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NM_001289782 // RefSeq // Mus musculus crystallin, alpha B (Cryab), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// BC094033 // GenBank // Mus musculus crystallin, alpha B, mRNA (cDNA clone MGC:102521 IMAGE:4934471), complete cds. // chr9 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// GENSCAN00000032110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:50753277:50756495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0
NM_198675 // RefSeq // Mus musculus ferredoxin-fold anticodon binding domain containing 1 (Fdxacb1), mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:50768236:50773348:1 gene:ENSMUSG00000037845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176619 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:50768238:50772669:1 gene:ENSMUSG00000037845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC116265 // GenBank // Mus musculus ferredoxin-fold anticodon binding domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:143843 IMAGE:40093898), complete cds. // chr9 // 90 // 88 // 26 // 29 // 0 /// ENSMUST00000176145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:50768251:50771591:1 gene:ENSMUSG00000037845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// ENSMUST00000176335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:50768445:50772643:1 gene:ENSMUSG00000037845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// BC116264 // GenBank // Mus musculus ferredoxin-fold anticodon binding domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:143842 IMAGE:40093896), complete cds. // chr9 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// ENSMUST00000177384 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:50770062:50771537:1 gene:ENSMUSG00000037845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000032107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:50768284:50830577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_133981 // RefSeq // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 9 (alpha 1,2 mannosyltransferase) (Alg9), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_045601 // RefSeq // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 9 (alpha 1,2 mannosyltransferase) (Alg9), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509901 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus asparagine-linked glycosylation 9 (alpha 1,2 mannosyltransferase) (Alg9), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509902 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus asparagine-linked glycosylation 9 (alpha 1,2 mannosyltransferase) (Alg9), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509903 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus asparagine-linked glycosylation 9 (alpha 1,2 mannosyltransferase) (Alg9), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034561 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:50775019:50843528:1 gene:ENSMUSG00000032059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000159576 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:50775367:50789515:1 gene:ENSMUSG00000032059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000162073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:50775305:50843542:1 gene:ENSMUSG00000032059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC021791 // GenBank // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 9 homolog (yeast, alpha 1,2 mannosyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:28731 IMAGE:4459738), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:50768284:50830577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_019493 // RefSeq // Mus musculus B cell translocation gene 4 (Btg4), mRNA. // chr9 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// XM_006510502 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B cell translocation gene 4 (Btg4), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000114431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:51116001:51119700:1 gene:ENSMUSG00000032056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AB050983 // GenBank // Mus musculus if5 mRNA for initiate factor 5, complete cds. // chr9 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// AJ005120 // GenBank // Mus musculus mRNA for PC3B protein. // chr9 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// AK161379 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930519D11 product:B-cell translocation gene 4, full insert sequence. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AK162122 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420428D17 product:B-cell translocation gene 4, full insert sequence. // chr9 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// BC066811 // GenBank // Mus musculus B-cell translocation gene 4, mRNA (cDNA clone MGC:76527 IMAGE:30475849), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:51100331:51119354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_011136 // RefSeq // Mus musculus POU domain, class 2, associating factor 1 (Pou2af1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:51213690:51240079:1 gene:ENSMUSG00000032053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058611 // GenBank // Mus musculus POU domain, class 2, associating factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:60585 IMAGE:30077096), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// U43788 // GenBank // Mus musculus Oct binding factor 1 (OBF-1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// Z54283 // GenBank // M.musculus mRNA for B-cell-specific coactivator BOB.1/OBF.1. // chr9 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:51212087:51238380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
XR_405684 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635638 (LOC102635638), transcript variant X3, ncRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:51280295:51280920:1 gene:ENSMUSG00000044694 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:51278513:51284210:1 gene:ENSMUSG00000044694 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000029849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:51656889:51683547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
NM_175535 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 20 (Arhgap20), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000065496 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:51765352:51853856:1 gene:ENSMUSG00000053199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000126567 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:51816013:51829397:1 gene:ENSMUSG00000053199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000130405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:51765660:51850651:1 gene:ENSMUSG00000053199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000149754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:51831772:51848649:1 gene:ENSMUSG00000053199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// AK129345 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1391 protein. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000146509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:51765345:51825685:1 gene:ENSMUSG00000053199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// AK046916 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930002G19 product:hypothetical Pleckstrin homology (PH) domain containing protein, full insert sequence. // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000039031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:51831639:51850399:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000029836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:51821065:51829542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001104616 // RefSeq // Mus musculus radixin (Rdx), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NM_001104617 // RefSeq // Mus musculus radixin (Rdx), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NM_009041 // RefSeq // Mus musculus radixin (Rdx), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000000590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:52047941:52088737:1 gene:ENSMUSG00000032050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000061352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:52047941:52075177:1 gene:ENSMUSG00000032050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000163153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:52047150:52088737:1 gene:ENSMUSG00000032050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC053417 // GenBank // Mus musculus radixin, mRNA (cDNA clone MGC:58329 IMAGE:6707873), complete cds. // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:52047259:52093559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
AK079417 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830163H01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC147413 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9830163H01 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:9056502). // chr9 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONMMUT069115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT069116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
XM_003945453 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor BTF3-like (LOC100048185), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006544418 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor BTF3-like (LOC100048185), mRNA. // chr9 // 39 // 100 // 11 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:52403258:52409954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000034550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:53264615:53280985:1 gene:ENSMUSG00000032048 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015742 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930510E17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_176846 // RefSeq // Mus musculus exophilin 5 (Exph5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000051014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:53301670:53377514:1 gene:ENSMUSG00000034584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB098163 // GenBank // Mus musculus slac2-b mRNA for synaptotagmin-like homologue lacking C2 domains-b, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC120905 // GenBank // Mus musculus exophilin 5, mRNA (cDNA clone MGC:141574 IMAGE:40087301), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000132410 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:53341084:53368955:1 gene:ENSMUSG00000034584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// AK046924 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930003G01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000043867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:53330659:53383872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT069134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_212445 // RefSeq // Mus musculus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2 (Kdelc2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006510574 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2 (Kdelc2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000037853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:53384023:53401867:1 gene:ENSMUSG00000034487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:53384100:53399812:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_029247 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930550C14 gene (4930550C14Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510654 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930550C14 gene (4930550C14Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006510655 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930550C14 gene (4930550C14Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000005262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:53405286:53432803:1 gene:ENSMUSG00000005131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK153618 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630022F21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC115638 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930550C14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144542 IMAGE:40102982), complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC115639 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930550C14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144543 IMAGE:40102983), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510660 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930550C14 gene (4930550C14Rik), transcript variant X9, mRNA. // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000043880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:53410033:53432563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001081152 // RefSeq // Mus musculus nuclear protein in the AT region (Npat), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000035850 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:53537047:53574342:1 gene:ENSMUSG00000033054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000043881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:53542335:53571262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
ENSMUST00000082688 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:53639977:53640105:1 gene:ENSMUSG00000064622 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028060 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member F2 (Slc35f2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006511460 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 35, member F2 (Slc35f2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000048670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:53771535:53818161:1 gene:ENSMUSG00000042195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC050202 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30005391, partial cds. // chr9 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC055843 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member F2, mRNA (cDNA clone MGC:67866 IMAGE:3991126), complete cds. // chr9 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000043874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:53794563:53816971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_025540 // RefSeq // Mus musculus sarcolipin (Sln), mRNA. // chr9 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000048485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:53850251:53853844:1 gene:ENSMUSG00000042045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AK009809 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310045A07 product:similar to SARCOLIPIN [Oryctolagus cuniculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028496 // GenBank // Mus musculus sarcolipin, mRNA (cDNA clone MGC:41044 IMAGE:1397989), complete cds. // chr9 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_177350 // RefSeq // Mus musculus gliomedin (Gldn), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000056740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:54286486:54341786:1 gene:ENSMUSG00000046167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF548022 // GenBank // Mus musculus olfactomedin-related protein (Crgl2) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC125025 // GenBank // Mus musculus gliomedin, mRNA (cDNA clone MGC:141337 IMAGE:40058551), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC125026 // GenBank // Mus musculus gliomedin, mRNA (cDNA clone MGC:141338 IMAGE:40058552), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54286524:54338816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_173778 // RefSeq // Mus musculus SH2 domain containing 7 (Sh2d7), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000060242 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:54538984:54545020:1 gene:ENSMUSG00000046460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000118413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54538988:54543654:1 gene:ENSMUSG00000046460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC116842 // GenBank // Mus musculus SH2 domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:151219 IMAGE:40126161), complete cds. // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC116844 // GenBank // Mus musculus SH2 domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:151221 IMAGE:40126163), complete cds. // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000034007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54534146:54543352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_029573 // RefSeq // Mus musculus isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) alpha (Idh3a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000167866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:54586511:54604661:1 gene:ENSMUSG00000032279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK003393 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110003P10 product:isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) alpha, full insert sequence. // chr9 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AK164038 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430024D24 product:isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) alpha, full insert sequence. // chr9 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC034273 // GenBank // Mus musculus isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) alpha, mRNA (cDNA clone MGC:19310 IMAGE:4166193), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC049956 // GenBank // Mus musculus isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) alpha, mRNA (cDNA clone MGC:58971 IMAGE:4212315), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC052208 // GenBank HTC // Mus musculus mRNA similar to isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) alpha (cDNA clone IMAGE:30027893). // chr9 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000033999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54586463:54603365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_021422 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 4 (Dnaja4), mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000070070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:54699559:54716315:1 gene:ENSMUSG00000032285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000120452 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54698873:54714761:1 gene:ENSMUSG00000032285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AB032401 // GenBank // Mus musculus mmDNAJA4 mRNA for mmDj4, complete cds. // chr9 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC022948 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:4219700), complete cds. // chr9 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC147484 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:182337 IMAGE:9056231), complete cds. // chr9 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// BC147486 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:182345 IMAGE:9056239), complete cds. // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000154690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54699514:54709336:1 gene:ENSMUSG00000032285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54691236:54714676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_001284507 // RefSeq // Mus musculus cellular retinoic acid binding protein I (Crabp1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NM_013496 // RefSeq // Mus musculus cellular retinoic acid binding protein I (Crabp1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:54764748:54773110:1 gene:ENSMUSG00000032291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC065787 // GenBank // Mus musculus cellular retinoic acid binding protein I, mRNA (cDNA clone MGC:73634 IMAGE:891192), complete cds. // chr9 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54757029:54789020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_022655 // RefSeq // Mus musculus iron responsive element binding protein 2 (Ireb2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000034843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:54863755:54912534:1 gene:ENSMUSG00000032293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC044665 // GenBank // Mus musculus iron responsive element binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:49573 IMAGE:2647641), complete cds. // chr9 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// XM_006511335 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus iron responsive element binding protein 2 (Ireb2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 73 // 73 // 32 // 44 // 1 /// GENSCAN00000046769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54862841:54946526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0
NM_177351 // RefSeq // Mus musculus hydroxylysine kinase 1 (Hykk), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000039742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:54917283:54949924:1 gene:ENSMUSG00000035878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC038618 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C630028N24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:47293 IMAGE:4221933), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54917312:54938164:1 gene:ENSMUSG00000035878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENSMUST00000125983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54917311:54931063:1 gene:ENSMUSG00000035878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// AK083218 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630028N24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// AK142509 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630003P12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// AK163926 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230063O16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54862841:54946526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_011966 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 4 (Psma4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034848 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:54950790:54958030:1 gene:ENSMUSG00000032301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000169008 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54950805:54955032:1 gene:ENSMUSG00000032301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000172407 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54950815:54956933:1 gene:ENSMUSG00000032301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AF060093 // GenBank // Mus musculus proteasome subunit C9 (Psma4) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC001982 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 4, mRNA (cDNA clone MGC:5640 IMAGE:3592024), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000153606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36609958:36610729:1 gene:ENSMUSG00000085172 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 58 // 87 // 15 // 26 // 0 /// ENSMUST00000171578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54950798:54956386:1 gene:ENSMUSG00000032301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// ENSMUST00000171900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54951104:54956299:1 gene:ENSMUSG00000032301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000046779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54952106:54957789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NM_176844 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 5 (Chrna5), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000093844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:54980880:55007779:1 gene:ENSMUSG00000035594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AY574264 // GenBank // Mus musculus neuronal nicotinic acetylcholine receptor alpha5 subunit mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC106839 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:124059 IMAGE:40045716), complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC106853 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:124168 IMAGE:40046382), complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// DQ318788 // GenBank // Mus musculus strain C57BL6/J nicotinic acetylcholine receptor alpha5 subunit (Chrna5) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54981616:55006575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000085754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:55326913:55438345:1 gene:ENSMUSG00000032313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC068128 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI118078, mRNA (cDNA clone MGC:92972 IMAGE:6835202), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NM_172923 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI118078 (AI118078), mRNA. // chr9 // 79 // 79 // 31 // 39 // 1 /// XM_006511160 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus expressed sequence AI118078 (AI118078), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// ENSMUST00000034862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:55326949:55438345:1 gene:ENSMUSG00000032313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 79 // 79 // 31 // 39 // 1
NM_027397 // RefSeq // Mus musculus insulin related protein 2 (islet 2) (Isl2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510756 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus insulin related protein 2 (islet 2) (Isl2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000034869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:55541148:55546180:1 gene:ENSMUSG00000032318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000164373 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:55541207:55546178:1 gene:ENSMUSG00000032318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000165302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:55542336:55544280:1 gene:ENSMUSG00000032318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC148307 // GenBank // Mus musculus insulin related protein 2 (islet 2), mRNA (cDNA clone IMAGE:40057769), complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000114290 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:55541207:55546180:1 gene:ENSMUSG00000032318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// BC120880 // GenBank // Mus musculus insulin related protein 2 (islet 2), mRNA (cDNA clone IMAGE:40057768), complete cds. // chr9 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENSMUST00000175950 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:55538672:55542570:1 gene:ENSMUSG00000032318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000046773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:55518606:55546029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NR_033529 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 7444 (Gm7444), non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000053536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:56027775:56029610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0
NM_011992 // RefSeq // Mus musculus reticulocalbin 2 (Rcn2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:56041857:56059077:1 gene:ENSMUSG00000032320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000144869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:56041885:56053135:1 gene:ENSMUSG00000032320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000147842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:56041845:56061882:1 gene:ENSMUSG00000032320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF049125 // GenBank // Mus musculus taipoxin-associated calcium binding protein 49 mRNA, complete cds. // chr9 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// BC132320 // GenBank // Mus musculus reticulocalbin 2, mRNA (cDNA clone MGC:163951 IMAGE:40130597), complete cds. // chr9 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC145668 // GenBank // Mus musculus reticulocalbin 2, mRNA (cDNA clone MGC:175555 IMAGE:40130971), complete cds. // chr9 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NM_001278274 // RefSeq // Mus musculus reticulocalbin 2 (Rcn2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000053528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:56042052:56058211:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_133777 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2S (Ube2s), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000079496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:4808155:4812351:-1 gene:ENSMUSG00000060860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK020143 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720465F12 product:UBIQUITIN CARRIER PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK154026 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430025J03 product:ubiquitin-conjugating enzyme E2S, full insert sequence. // chr9 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC012255 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2S, mRNA (cDNA clone MGC:6682 IMAGE:3581845), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC030171 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2S, mRNA (cDNA clone MGC:29152 IMAGE:5037250), complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC083323 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2S, mRNA (cDNA clone MGC:101982 IMAGE:5715696), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK145757 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0038D11 product:ubiquitin-conjugating enzyme E2S, full insert sequence. // chr9 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000043204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:4808155:4813006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:56417728:56438285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_139001 // RefSeq // Mus musculus chondroitin sulfate proteoglycan 4 (Cspg4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000035661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:56865104:56899870:1 gene:ENSMUSG00000032911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF352400 // GenBank // Mus musculus AN2/NG2 proteoglycan mRNA, complete cds. // chr9 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// AK052394 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430001H04 product:chondroitin sulfate proteoglycan 4, full insert sequence. // chr9 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// AK220559 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4232 protein. // chr9 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000035565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:56865190:56912717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_133976 // RefSeq // Mus musculus IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, homolog (yeast) (Imp3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:56937475:56938398:1 gene:ENSMUSG00000032288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC009145 // GenBank // Mus musculus IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:6463 IMAGE:2631069), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:56937507:56938061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0
NM_178374 // RefSeq // Mus musculus snurportin 1 (Snupn), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000068856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:56950878:56983206:1 gene:ENSMUSG00000055334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC049638 // GenBank // Mus musculus snurportin 1, mRNA (cDNA clone MGC:58397 IMAGE:6589249), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC061258 // GenBank // Mus musculus snurportin 1, mRNA (cDNA clone MGC:74414 IMAGE:30251661), complete cds. // chr9 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// XR_379433 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus snurportin 1 (Snupn), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// BC023317 // GenBank HTC // Mus musculus snurportin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3156126), with apparent retained intron. // chr9 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000035564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:56950825:56982973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_019651 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 9 (Ptpn9), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006511290 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 9 (Ptpn9), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:56994968:57062805:1 gene:ENSMUSG00000032290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF013490 // GenBank // Mus musculus protein-tyrosine phosphatase mRNA, complete cds. // chr9 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// BC053017 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 9, mRNA (cDNA clone MGC:62214 IMAGE:5708923), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:56995594:57061159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
AK053006 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930011H06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014398 // RefSeq // Mus musculus taste receptor cell gene 1 (Trcg1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006511269 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus taste receptor cell gene 1 (Trcg1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57236556:57249863:1 gene:ENSMUSG00000070298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY701870 // GenBank // Mus musculus taste receptor protein 1 (Trcg1) mRNA, complete cds. // chr9 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// AY701871 // GenBank // Mus musculus taste receptor protein 1 (Trcg1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr9 // 81 // 78 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57188198:57248563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
ENSMUST00000085711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57334128:57334754:1 gene:ENSMUSG00000066626 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000035562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57334128:57334754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_133982 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease P/MRP 25 subunit (Rpp25), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57504102:57505447:1 gene:ENSMUSG00000062309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC016085 // GenBank // Mus musculus ribonuclease P 25 subunit (human), mRNA (cDNA clone MGC:27591 IMAGE:4501535), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC083064 // GenBank // Mus musculus ribonuclease P 25 subunit (human), mRNA (cDNA clone MGC:102363 IMAGE:5367203), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_007747 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit Va (Cox5a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57521232:57532424:1 gene:ENSMUSG00000000088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034302 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit Va, mRNA (cDNA clone MGC:36114 IMAGE:5372849), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57521328:57531782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001166364 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 219, member B (Fam219b), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_175273 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 219, member B (Fam219b), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57537528:57543187:1 gene:ENSMUSG00000032305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57537528:57543187:1 gene:ENSMUSG00000032305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC111883 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310046O06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:132864 IMAGE:40060305), complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC112403 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310046O06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:132863 IMAGE:40060304), complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57537621:57540819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_022813 // RefSeq // Mus musculus secretory carrier membrane protein 2 (Scamp2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000045791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57560944:57588797:1 gene:ENSMUSG00000040188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF295402 // GenBank // Mus musculus secretory carrier membrane protein 2 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC003452 // GenBank // Mus musculus secretory carrier membrane protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:2655818). // chr9 // 78 // 90 // 21 // 27 // 0 /// BC014751 // GenBank // Mus musculus secretory carrier membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:25930 IMAGE:4235556), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57568594:57594872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_027895 // RefSeq // Mus musculus unc-51-like kinase 3 (Ulk3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XR_379456 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-51-like kinase 3 (Ulk3), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000053230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57589452:57596233:1 gene:ENSMUSG00000032308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC037093 // GenBank // Mus musculus unc-51-like kinase 3 (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:5325133), partial cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC039958 // GenBank HTC // Mus musculus unc-51-like kinase 3 (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:4238219), with apparent retained intron. // chr9 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BC151153 // GenBank // Mus musculus unc-51-like kinase 3 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:184058 IMAGE:9088047), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57568594:57594872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1
NM_001136059 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 1, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp1a1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_009992 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 1, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp1a1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57697613:57703822:1 gene:ENSMUSG00000032315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC125440 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 1, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:159143 IMAGE:40129955), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC125444 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 1, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:159147 IMAGE:40129959), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57700091:57702879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_153799 // RefSeq // Mus musculus enhancer of mRNA decapping 3 homolog (S. cerevisiae) (Edc3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000043990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:57708540:57752499:1 gene:ENSMUSG00000038957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000142807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:57708567:57715980:1 gene:ENSMUSG00000038957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK090005 // GenBank HTC // Mus musculus submandibular gland CRL-1734 SCA-9 clone 15 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430056N18 product:hypothetical YjeF-like structure containing protein, full insert sequence. // chr9 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// BC031725 // GenBank // Mus musculus enhancer of mRNA decapping 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:25439 IMAGE:4017604), complete cds. // chr9 // 85 // 96 // 23 // 27 // 0 /// BC033484 // GenBank // Mus musculus enhancer of mRNA decapping 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:36552 IMAGE:4954674), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006511247 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus enhancer of mRNA decapping 3 homolog (S. cerevisiae) (Edc3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSMUST00000137245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:57708555:57751403:1 gene:ENSMUSG00000038957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000035554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57713398:57748495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001122873 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-like 7 (bone marrow stromal cell-derived) (Ubl7), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_027086 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-like 7 (bone marrow stromal cell-derived) (Ubl7), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000163329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57910986:57929968:1 gene:ENSMUSG00000055720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC016456 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-like 7 (bone marrow stromal cell-derived), mRNA (cDNA clone MGC:25506 IMAGE:4912715), complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC094047 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-like 7 (bone marrow stromal cell-derived), mRNA (cDNA clone MGC:103069 IMAGE:5253101), complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57898859:57929850:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_011352 // RefSeq // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), and GPI membrane anchor, (semaphorin) 7A (Sema7a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006510888 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), and GPI membrane anchor, (semaphorin) 7A (Sema7a), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000043059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57940113:57962864:1 gene:ENSMUSG00000038264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB017532 // GenBank // Mus musculus mRNA for msemK1p, complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF176670 // GenBank // Mus musculus GPI-anchored membrane protein CDw108 precursor (CDw108) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC057875 // GenBank // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), and GPI membrane anchor, (semaphorin) 7A, mRNA (cDNA clone MGC:68148 IMAGE:5319572), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57940151:58026852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
NM_019779 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 11, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp11a1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034874 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:58014671:58027023:1 gene:ENSMUSG00000032323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF195119 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 side chain cleavage enzyme 11a1 (Cyp11a) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC068264 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 11, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:60494 IMAGE:30014890), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK077945 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030456M03 product:cytochrome P450, 11a, cholesterol side chain cleavage, full insert sequence. // chr9 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// ENSMUST00000188116 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:58006411:58020742:1 gene:ENSMUSG00000032323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 29 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000028202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57940151:58026852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000188944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:58014997:58022386:1 gene:ENSMUSG00000032323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// ENSMUST00000188539 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:58017396:58025243:1 gene:ENSMUSG00000032323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NR_033522 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1600029O15 gene (1600029O15Rik), non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000178259 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:58208038:58208554:1 gene:ENSMUSG00000057818 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000179787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:58202897:58208808:1 gene:ENSMUSG00000057818 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_026942 // RefSeq // Mus musculus stomatin-like 1 (Stoml1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_028146 // RefSeq // Mus musculus stomatin-like 1 (Stoml1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006511403 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus stomatin-like 1 (Stoml1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:58253164:58262523:1 gene:ENSMUSG00000032333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK148324 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370091A19 product:stomatin-like 1, full insert sequence. // chr9 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// BC037074 // GenBank // Mus musculus stomatin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:46958 IMAGE:5037636), complete cds. // chr9 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:58253267:58261839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_176921 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 6030419C18 gene (6030419C18Rik), mRNA. // chr9 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:58488603:58499742:1 gene:ENSMUSG00000066607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AK047220 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930036P11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC096614 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6030419C18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106198 IMAGE:6468423), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:58490237:58499687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
AK132138 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110099E13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081192 // RefSeq // Mus musculus hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated K+ 4 (Hcn4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:58823512:58860955:1 gene:ENSMUSG00000032338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC158106 // GenBank // Mus musculus hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated K+ 4, mRNA (cDNA clone MGC:189995 IMAGE:9088182), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC158108 // GenBank // Mus musculus hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated K+ 4, mRNA (cDNA clone MGC:189996 IMAGE:9088183), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000025358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:58843494:58860763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_028121 // RefSeq // Mus musculus ADP-dependent glucokinase (Adpgk), mRNA. // chr9 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000026266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:59291572:59316199:1 gene:ENSMUSG00000025236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// AK037017 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930038M03 product:RIKEN cDNA 2610017G09 gene, full insert sequence. // chr9 // 100 // 39 // 15 // 15 // 0 /// AK204806 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0149K21, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000068923, based on BLAT search. // chr9 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// BC021526 // GenBank // Mus musculus ADP-dependent glucokinase, mRNA (cDNA clone MGC:38532 IMAGE:5353637), complete cds. // chr9 // 86 // 74 // 24 // 28 // 0 /// AK048904 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230080G04 product:RIKEN cDNA 2610017G09 gene, full insert sequence. // chr9 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000025334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59291634:59315282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0
NM_010421 // RefSeq // Mus musculus hexosaminidase A (Hexa), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:59539667:59565105:1 gene:ENSMUSG00000025232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC010755 // GenBank // Mus musculus hexosaminidase A, mRNA (cDNA clone MGC:18443 IMAGE:4225233), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U07631 // GenBank // Mus musculus B6/CBA beta-hexosaminidase (Hexa) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59539724:59564884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
AK132182 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3322401D19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173018 // RefSeq // Mus musculus myosin IXa (Myo9a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000135298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000136740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59779614:59804011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000019368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59809399:59925031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_173018 // RefSeq // Mus musculus myosin IXa (Myo9a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173018 // RefSeq // Mus musculus myosin IXa (Myo9a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59809399:59925031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173018 // RefSeq // Mus musculus myosin IXa (Myo9a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000128341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000135298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000136740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000019368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59809399:59925031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_173018 // RefSeq // Mus musculus myosin IXa (Myo9a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000135298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000136740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59809399:59925031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_173018 // RefSeq // Mus musculus myosin IXa (Myo9a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59871771:59885364:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59809399:59925031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173018 // RefSeq // Mus musculus myosin IXa (Myo9a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000128341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000130497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59905840:59910650:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000135298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000136740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:59750896:59928866:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000127933 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59907093:59912573:1 gene:ENSMUSG00000039585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000019368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59809399:59925031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1
NM_026235 // RefSeq // Mus musculus La ribonucleoprotein domain family, member 6 (Larp6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:60712989:60738801:1 gene:ENSMUSG00000034839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK035809 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630006B12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC090615 // GenBank // Mus musculus La ribonucleoprotein domain family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:115805 IMAGE:6809572), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:60713206:60738057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
XR_405728 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700036A12 gene (1700036A12Rik), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:60769602:60769955:1 gene:ENSMUSG00000095956 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006609 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700036A12 product:inferred: RIKEN cDNA 1700036A12 gene / putative [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190053 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:60743120:60770276:1 gene:ENSMUSG00000095956 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028283 // RefSeq // Mus musculus uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats (Uaca), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006511483 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats (Uaca), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000050183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:60794548:60880370:1 gene:ENSMUSG00000034485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AB030647 // GenBank // Mus musculus mRNA for nuclear membrane binding protein NUCLING, complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 39 // 42 // 0 /// AK148900 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120461E21 product:uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats, full insert sequence. // chr9 // 96 // 67 // 27 // 28 // 0 /// AK173203 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1561 protein. // chr9 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// BC042415 // GenBank // Mus musculus uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats, mRNA (cDNA clone MGC:28487 IMAGE:4165488), complete cds. // chr9 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// BC033470 // GenBank // Mus musculus uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats, mRNA (cDNA clone MGC:37093 IMAGE:4951775), complete cds. // chr9 // 95 // 95 // 40 // 42 // 1 /// GENSCAN00000047522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:60811732:60948466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0
FJ654110 // GenBank // Mus musculus strain ICR clone LI-C1(48H)-2 endogenous retrovirus U3 region, partial sequence. // chr9 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0
NM_176922 // RefSeq // Mus musculus integrin alpha 11 (Itga11), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000034774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:62677826:62783982:1 gene:ENSMUSG00000032243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000159012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:62677860:62777111:1 gene:ENSMUSG00000032243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AK054303 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330013I08 product:INTEGRIN ALPHA-11 PRECURSOR homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AY124460 // GenBank // Mus musculus a11 integrin (Itga11) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC058716 // GenBank // Mus musculus integrin alpha 11, mRNA (cDNA clone MGC:76390 IMAGE:6842988), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:62734542:62782699:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NM_001033175 // RefSeq // Mus musculus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 6 (Cln6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:62838785:62852006:1 gene:ENSMUSG00000032245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124984 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:62847033:62851162:1 gene:ENSMUSG00000032245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000138276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:62846015:62850711:1 gene:ENSMUSG00000032245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000141821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:62838792:62846018:1 gene:ENSMUSG00000032245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 83 // 43 // 10 // 12 // 0 /// BC144722 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053270. // chr9 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:62843808:62874873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_001102468 // RefSeq // Mus musculus calmodulin-like 4 (Calml4), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NM_138304 // RefSeq // Mus musculus calmodulin-like 4 (Calml4), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006511532 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calmodulin-like 4 (Calml4), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000034777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:62858104:62875918:1 gene:ENSMUSG00000032246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000163820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:62858104:62875918:1 gene:ENSMUSG00000032246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// AY061807 // GenBank // Mus musculus calmodulin-related protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC013541 // GenBank // Mus musculus calmodulin-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:19226 IMAGE:4241711), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC023475 // GenBank // Mus musculus calmodulin-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:31046 IMAGE:5042406), complete cds. // chr9 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// XM_006511529 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calmodulin-like 4 (Calml4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// XM_006511531 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calmodulin-like 4 (Calml4), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// AK146656 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920038P21 product:calmodulin-like 4, full insert sequence. // chr9 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000037390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:62843808:62874873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
ENSMUST00000082921 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:63027560:63027717:1 gene:ENSMUSG00000064855 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT069501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000175396 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:63442319:63442460:1 gene:ENSMUSG00000093137 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT069517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_025857 // RefSeq // Mus musculus alpha- and gamma-adaptin binding protein (Aagab), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000041551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:63602655:63641889:1 gene:ENSMUSG00000037257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC027311 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310007F21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28095 IMAGE:3964905), complete cds. // chr9 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:63597162:63640284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_145835 // RefSeq // Mus musculus lactase-like (Lctl), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006511102 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lactase-like (Lctl), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034969 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:64117147:64138118:1 gene:ENSMUSG00000032401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000118215 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:64121606:64138105:1 gene:ENSMUSG00000032401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000124020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:64117259:64138114:1 gene:ENSMUSG00000032401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000132018 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:64122035:64126926:1 gene:ENSMUSG00000032401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AF309072 // GenBank // Mus musculus Klotho-LPH related protein (Klph) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC030631 // GenBank // Mus musculus lactase-like, mRNA (cDNA clone MGC:41520 IMAGE:1195880), complete cds. // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:64117734:64133649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT069543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
NM_024212 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L4 (Rpl4), mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000034966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64173387:64178562:1 gene:ENSMUSG00000032399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC003459 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L4, mRNA (cDNA clone MGC:6283 IMAGE:2648518), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BC094036 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L4, mRNA (cDNA clone MGC:102584 IMAGE:5011554), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BC132321 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L4, mRNA (cDNA clone MGC:163952 IMAGE:40130598), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC132323 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L4, mRNA (cDNA clone MGC:163954 IMAGE:40130600), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:64173431:64178444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000083818 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:64175048:64175115:1 gene:ENSMUSG00000065752 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT069548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_028548 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 16A (Snord16a), small nucleolar RNA. // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000083895 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:64175423:64175521:1 gene:ENSMUSG00000094411 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT069549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000082984 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:64175873:64175942:1 gene:ENSMUSG00000064918 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT069550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000083425 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:64176661:64176759:1 gene:ENSMUSG00000095868 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT069551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000082580 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:64177123:64177193:1 gene:ENSMUSG00000064514 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT069552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_183316 // RefSeq // Mus musculus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 5 (Snapc5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64179297:64182684:1 gene:ENSMUSG00000032398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC028529 // GenBank // Mus musculus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:41384 IMAGE:1381169), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:64179088:64182270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// AK008302 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010103A03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 58 // 70 // 11 // 19 // 0 /// NONMMUT069553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 58 // 70 // 11 // 19 // 0
NM_033607 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin carboxyl-terminal esterase L4 (Uchl4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000039011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64235201:64236362:1 gene:ENSMUSG00000035337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB035420 // GenBank // Mus musculus uchl4 mRNA for ubiquitin c-terminal hydrolase isozyme L4, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF247358 // GenBank // Mus musculus ubiquitin C-terminal hydrolase L3 (Uchl3) mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 69 // 23 // 25 // 0 /// BC139440 // GenBank // Mus musculus ubiquitin carboxyl-terminal esterase L4, mRNA (cDNA clone MGC:171067 IMAGE:8862462), complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC139441 // GenBank // Mus musculus ubiquitin carboxyl-terminal esterase L4, mRNA (cDNA clone MGC:171068 IMAGE:8862463), complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:64235239:64235940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 56 // 18 // 20 // 0
NM_025372 // RefSeq // Mus musculus timeless interacting protein (Tipin), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006511337 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus timeless interacting protein (Tipin), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006511340 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus timeless interacting protein (Tipin), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64281607:64304792:1 gene:ENSMUSG00000032397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016211 // GenBank // Mus musculus timeless interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:27705 IMAGE:4924605), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:64239454:64304470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
AK158279 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930050D04 product:C-MYC promoter-binding protein IRLB homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 97 // 81 // 34 // 35 // 0 /// BC172087 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:198792 IMAGE:9054373, complete cds. // chr9 // 94 // 37 // 15 // 16 // 0 /// NM_001162917 // RefSeq // Mus musculus DENN/MADD domain containing 4A (Dennd4a), mRNA. // chr9 // 81 // 81 // 35 // 43 // 1 /// ENSMUST00000038890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64811340:64919667:1 gene:ENSMUSG00000053641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 81 // 81 // 35 // 43 // 1 /// AK051202 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130015O15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// GENSCAN00000046962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:64838834:64917095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1
NM_001162917 // RefSeq // Mus musculus DENN/MADD domain containing 4A (Dennd4a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64811340:64919667:1 gene:ENSMUSG00000053641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:64838834:64917095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001162917 // RefSeq // Mus musculus DENN/MADD domain containing 4A (Dennd4a), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64811340:64919667:1 gene:ENSMUSG00000053641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:64838834:64917095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001162917 // RefSeq // Mus musculus DENN/MADD domain containing 4A (Dennd4a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64811340:64919667:1 gene:ENSMUSG00000053641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK220476 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4082 protein. // chr9 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// NM_001162917 // RefSeq // Mus musculus DENN/MADD domain containing 4A (Dennd4a), mRNA. // chr9 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// ENSMUST00000038890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64811340:64919667:1 gene:ENSMUSG00000053641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// GENSCAN00000046962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:64838834:64917095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1
NM_001077631 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 9 (Vwa9), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NM_175153 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 9 (Vwa9), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000037504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64960937:64986974:1 gene:ENSMUSG00000034263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000170517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64960832:64986974:1 gene:ENSMUSG00000034263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC024913 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010321M09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28004 IMAGE:3602181), complete cds. // chr9 // 71 // 78 // 10 // 14 // 0
NM_008988 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin superfamily, DCC subclass, member 3 (Igdcc3), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:65141154:65185857:1 gene:ENSMUSG00000032394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF026465 // GenBank // Mus musculus putative neuronal cell adhesion molecule (Punc) mRNA, complete cds. // chr9 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// BC053057 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin superfamily, DCC subclass, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:62345 IMAGE:5698028), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC086481 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin superfamily, DCC subclass, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:103399 IMAGE:6505546), complete cds. // chr9 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65141415:65237989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_177460 // RefSeq // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 16 (Parp16), mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006511004 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 16 (Parp16), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// XM_006511005 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 16 (Parp16), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 93 // 43 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000069000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:65214690:65239219:1 gene:ENSMUSG00000032392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AK033791 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230110A18 product:hypothetical ADP-ribosylation structure containing protein, full insert sequence. // chr9 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// AK169866 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630001M20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC014731 // GenBank // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 16, mRNA (cDNA clone IMAGE:4486878), partial cds. // chr9 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0 /// BC055447 // GenBank // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 16, mRNA (cDNA clone MGC:65335 IMAGE:3594406), complete cds. // chr9 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65141415:65237989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1
NM_173385 // RefSeq // Mus musculus cartilage intermediate layer protein, nucleotide pyrophosphohydrolase (Cilp), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:65265180:65280605:1 gene:ENSMUSG00000042254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141382 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:65265823:65280535:1 gene:ENSMUSG00000042254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC058167 // GenBank // Mus musculus cartilage intermediate layer protein, nucleotide pyrophosphohydrolase, mRNA (cDNA clone IMAGE:4980735), partial cds. // chr9 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC080666 // GenBank // Mus musculus cartilage intermediate layer protein, nucleotide pyrophosphohydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:90919 IMAGE:4934956), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65267132:65290332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_016688 // RefSeq // Mus musculus programmed cell death 7 (Pdcd7), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:65346068:65359642:1 gene:ENSMUSG00000041837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF083929 // GenBank // Mus musculus ES18 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT069606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000046953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65346142:65377933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001033158 // RefSeq // Mus musculus RAS-like, family 12 (Rasl12), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000085453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:65398488:65412708:1 gene:ENSMUSG00000041696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC125036 // GenBank // Mus musculus RAS-like, family 12, mRNA (cDNA clone MGC:144440 IMAGE:40102054), complete cds. // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NM_001162923 // RefSeq // Mus musculus RAS-like, family 12 (Rasl12), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// ENSMUST00000165682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:65398488:65414853:1 gene:ENSMUSG00000041696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// AK163068 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530009A19 product:RAS-like, family 12, full insert sequence. // chr9 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65393418:65411156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_027134 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial methionyl-tRNA formyltransferase (Mtfmt), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XR_379453 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial methionyl-tRNA formyltransferase (Mtfmt), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000074792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:65435782:65453054:1 gene:ENSMUSG00000059183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000132966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:65435788:65452417:1 gene:ENSMUSG00000059183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC019509 // GenBank // Mus musculus mitochondrial methionyl-tRNA formyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:28710 IMAGE:4456981), complete cds. // chr9 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// XM_006511409 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial methionyl-tRNA formyltransferase (Mtfmt), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// ENSMUST00000140244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:65437025:65447277:1 gene:ENSMUSG00000059183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// ENSMUST00000130057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:65443541:65452125:1 gene:ENSMUSG00000059183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// GENSCAN00000046968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65435772:65452205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
NM_138584 // RefSeq // Mus musculus spastic paraplegia 21 homolog (human) (Spg21), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006511222 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spastic paraplegia 21 homolog (human) (Spg21), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:65460937:65488470:1 gene:ENSMUSG00000032388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK090017 // GenBank HTC // Mus musculus nullipotent stem cell CRL-2070 NE cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430060O14 product:BM-019 (GL010) (HYPOTHETICAL 35.0 KDA PROTEIN) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC099434 // GenBank // Mus musculus spastic paraplegia 21 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:117619 IMAGE:30714184), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC132377 // GenBank // Mus musculus spastic paraplegia 21 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:164008 IMAGE:40130654), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC132403 // GenBank // Mus musculus spastic paraplegia 21 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:164034 IMAGE:40130680), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65465288:65486949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NM_028030 // RefSeq // Mus musculus RNA binding protein with multiple splicing 2 (Rbpms2), mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// XM_006511455 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding protein with multiple splicing 2 (Rbpms2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// XM_006511456 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding protein with multiple splicing 2 (Rbpms2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000055844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:65630582:65660505:1 gene:ENSMUSG00000032387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000169003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:65629648:65660528:1 gene:ENSMUSG00000032387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// AK010301 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2400008B06 product:similar to RNA-BINDING PROTEIN WITH MULTIPLE SPLICING (RBP-MS) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC021788 // GenBank // Mus musculus RNA binding protein with multiple splicing 2, mRNA (cDNA clone MGC:28665 IMAGE:4236661), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000046952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65646324:65689225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
ENSMUST00000083453 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:65836353:65836465:1 gene:ENSMUSG00000065387 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT069628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_026515 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2810417H13 gene (2810417H13Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000045802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:65890237:65903266:1 gene:ENSMUSG00000040204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC021413 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810417H13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:29306 IMAGE:5006272), complete cds. // chr9 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// BC096393 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810417H13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106959 IMAGE:1397865), complete cds. // chr9 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000130308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:65890320:65893820:1 gene:ENSMUSG00000040204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// NONMMUT069631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr9 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
AK050877 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030028M11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Sense No Exonic // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Sense No Exonic // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082994 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:96671793:96671900:1 gene:ENSMUSG00000064928 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000083367 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:65900201:65900308:1 gene:ENSMUSG00000065301 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONMMUT024838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONMMUT069641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
NM_011149 // RefSeq // Mus musculus peptidylprolyl isomerase B (Ppib), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:66060169:66066629:1 gene:ENSMUSG00000032383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK128977 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3016614, moderately similar to Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B precursor (EC 5.2.1.8). // chr9 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// BC013061 // GenBank // Mus musculus peptidylprolyl isomerase B, mRNA (cDNA clone MGC:6241 IMAGE:3483267), complete cds. // chr9 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// M60456 // GenBank // Mouse cyclophilin mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// X58990 // GenBank // Mouse mCyP-S1 mRNA for cyclophilin CyP-S1. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65958541:66066417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_026635 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 96, member A (Fam96a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:66126611:66138955:1 gene:ENSMUSG00000032381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC005745 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 96, member A, mRNA (cDNA clone MGC:11942 IMAGE:3600028), complete cds. // chr9 // 86 // 92 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:66126847:66138434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_010019 // RefSeq // Mus musculus death-associated protein kinase 2 (Dapk2), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000034944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:66158223:66272242:1 gene:ENSMUSG00000032380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000132987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:66220747:66268950:1 gene:ENSMUSG00000032380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// AB018002 // GenBank // Mus musculus mRNA for Death-associated protein kinase 2, complete cds. // chr9 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// BC022165 // GenBank // Mus musculus death-associated protein kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:13742 IMAGE:4016911), complete cds. // chr9 // 92 // 97 // 33 // 36 // 0 /// GU109477 // GenBank // Mus musculus DAP-kinase-related protein 1 beta isoform (DAPK2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr9 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1 /// ENSMUST00000129442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:66158235:66222080:1 gene:ENSMUSG00000032380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// AK158082 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930027D02 product:death-associated kinase 2, full insert sequence. // chr9 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// GENSCAN00000043997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:66219767:66257322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1
NM_145617 // RefSeq // Mus musculus hect (homologous to the E6-AP (UBE3A) carboxyl terminus) domain and RCC1 (CHC1)-like domain (RLD) 1 (Herc1), mRNA. // chr9 // 100 // 99 // 84 // 84 // 0 /// ENSMUST00000042824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:66350526:66508775:1 gene:ENSMUSG00000038664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 83 // 83 // 0 /// ENSMUST00000135159 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:66451126:66464754:1 gene:ENSMUSG00000038664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 11 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000043987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:66371812:66508324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 71 // 71 // 0
NM_178396 // RefSeq // Mus musculus carbonic anyhydrase 12 (Car12), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000071889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:66713686:66766845:1 gene:ENSMUSG00000032373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000085420 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:66713730:66766842:1 gene:ENSMUSG00000032373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000123195 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:66713728:66747878:1 gene:ENSMUSG00000032373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000134829 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:66747710:66764317:1 gene:ENSMUSG00000032373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// BC031385 // GenBank // Mus musculus carbonic anyhydrase 12, mRNA (cDNA clone MGC:38624 IMAGE:5355557), complete cds. // chr9 // 85 // 93 // 23 // 27 // 0 /// BC035941 // GenBank // Mus musculus carbonic anyhydrase 12, mRNA (cDNA clone MGC:31022 IMAGE:3987392), complete cds. // chr9 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// ENSMUST00000152011 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:66713727:66754474:1 gene:ENSMUSG00000032373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// AK157977 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930013C23 product:carbonic anyhydrase 12, full insert sequence. // chr9 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000043989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:66713849:66754060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
ENSMUST00000098612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:66797039:66799074:1 gene:ENSMUSG00000074232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK149255 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930002H08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_026467 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein S27-like (Rps27l), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000040917 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:66946086:66949512:1 gene:ENSMUSG00000036781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000127896 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:66946091:66949514:1 gene:ENSMUSG00000036781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000143044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:66946355:66949516:1 gene:ENSMUSG00000036781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000147394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:66946166:66949468:1 gene:ENSMUSG00000036781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// BC058115 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein S27-like, mRNA (cDNA clone MGC:69594 IMAGE:6407738), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT069688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000055027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:66946291:66953149:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
ENSMUST00000157396 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:67104208:67104355:1 gene:ENSMUSG00000088021 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT069696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XR_379571 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102632690 (LOC102632690), transcript variant X1, ncRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK037358 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130010D05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081314 // RefSeq // Mus musculus C2 calcium-dependent domain containing 4B (C2cd4b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000171652 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:67759437:67760930:1 gene:ENSMUSG00000091956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC039571 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 148, member B, mRNA (cDNA clone MGC:48200 IMAGE:1515262), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:67759724:67760746:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT069754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 76 // 74 // 13 // 17 // 0
NM_177184 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 13C (yeast) (Vps13c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 83 // 83 // 0 /// XM_006511228 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vacuolar protein sorting 13C (yeast) (Vps13c), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 58 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000077879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:67840396:67995634:1 gene:ENSMUSG00000035284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 83 // 83 // 0 /// AB281675 // GenBank // Mus musculus Vps13c mRNA for chorein, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 83 // 83 // 0 /// AK129486 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA3021 protein. // chr9 // 19 // 19 // 16 // 83 // 1 /// GENSCAN00000028545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:67881323:67995389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 64 // 64 // 0
NM_001289916 // RefSeq // Mus musculus RAR-related orphan receptor alpha (Rora), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// NM_013646 // RefSeq // Mus musculus RAR-related orphan receptor alpha (Rora), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000034766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:68653786:69388246:1 gene:ENSMUSG00000032238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000113624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:69289682:69379809:1 gene:ENSMUSG00000032238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000174296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:68653891:69364494:1 gene:ENSMUSG00000032238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 28 // 12 // 12 // 0 /// BC003757 // GenBank // Mus musculus RAR-related orphan receptor alpha, mRNA (cDNA clone MGC:5892 IMAGE:3592667), complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// U53228 // GenBank // Mus musculus nuclear hormone receptor ROR-alpha isoform 1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// Y08640 // GenBank // M.musculus mRNA for nuclear orphan receptor ROR-alpha 4. // chr9 // 80 // 70 // 24 // 30 // 0 /// AK034375 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330184K03 product:RAR-related orphan receptor alpha, full insert sequence. // chr9 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:69337033:69431035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 63 // 63 // 27 // 43 // 1
NR_033299 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9530091C08 gene (9530091C08Rik), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK089550 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830001A07 product:hypothetical Microbodies C-terminal targeting signal containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK045567 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230211D20 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT069799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_145618 // RefSeq // Mus musculus interactor of little elongation complex ELL subunit 2 (Ice2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XR_379470 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NMDA receptor-regulated gene 2 (Narg2), transcript variant X4, misc_RNA. // chr9 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// XR_379471 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NMDA receptor-regulated gene 2 (Narg2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr9 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000034761 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:69397906:69433122:1 gene:ENSMUSG00000032235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000142743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:69397923:69432070:1 gene:ENSMUSG00000032235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000147558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:69416873:69427024:1 gene:ENSMUSG00000032235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AY244558 // GenBank // Mus musculus NARG2 (Narg2) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC018458 // GenBank // Mus musculus NMDA receptor-regulated gene 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3581964), complete cds. // chr9 // 88 // 43 // 14 // 16 // 0 /// BC068183 // GenBank // Mus musculus NMDA receptor-regulated gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:92962 IMAGE:30639735), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AK163917 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230053M02 product:NARG2 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1 /// GENSCAN00000013341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:69337033:69431035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1
NM_181072 // RefSeq // Mus musculus myosin IE (Myo1e), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006511445 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myosin IE (Myo1e), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:70207350:70400067:1 gene:ENSMUSG00000032220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK029145 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732497C06 product:MYOSIN-IC homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC051391 // GenBank // Mus musculus myosin IE, mRNA (cDNA clone MGC:58876 IMAGE:5053090), complete cds. // chr9 // 90 // 97 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:70297342:70398798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000083268 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:70475484:70475596:1 gene:ENSMUSG00000065202 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082987 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:70537814:70537921:1 gene:ENSMUSG00000064921 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025690 // RefSeq // Mus musculus SAFB-like, transcription modulator (Sltm), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NM_026337 // RefSeq // Mus musculus SAFB-like, transcription modulator (Sltm), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006511352 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SAFB-like, transcription modulator (Sltm), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000049263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:70542920:70592237:1 gene:ENSMUSG00000032212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// AF462146 // GenBank // Mus musculus modulator of estrogen induced transcription (Met) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 44 // 46 // 0 /// BC019992 // GenBank // Mus musculus SAFB-like, transcription modulator, mRNA (cDNA clone IMAGE:4206928), complete cds. // chr9 // 100 // 43 // 20 // 20 // 0 /// BC139202 // GenBank // Mus musculus SAFB-like, transcription modulator, mRNA (cDNA clone MGC:170829 IMAGE:8862224), complete cds. // chr9 // 96 // 98 // 43 // 45 // 0 /// BC145577 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054143. // chr9 // 95 // 93 // 41 // 43 // 0 /// AK082294 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230033L09 product:RIKEN cDNA 5730555F13 gene, full insert sequence. // chr9 // 33 // 33 // 15 // 46 // 1 /// GENSCAN00000021025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:70542656:70591687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 89 // 40 // 41 // 0
ENSMUST00000098589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:70656251:70657860:1 gene:ENSMUSG00000074213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK159631 // GenBank HTC // Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I420026E16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007399 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 10 (Adam10), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000067880 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:70678997:70780229:1 gene:ENSMUSG00000054693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000140205 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:70678997:70778382:1 gene:ENSMUSG00000054693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000144537 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:70679016:70748114:1 gene:ENSMUSG00000054693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AF011379 // GenBank // Mus musculus kuzbanian (mkuz) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:70679205:70751114:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0
NM_009022 // RefSeq // Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 1, subfamily A2 (Aldh1a2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:71215789:71296243:1 gene:ENSMUSG00000013584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC075704 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 1, subfamily A2, mRNA (cDNA clone MGC:76772 IMAGE:30471325), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:71215868:71292115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_008613 // RefSeq // Mus musculus meiosis-specific nuclear structural protein 1 (Mns1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000034746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:72438535:72459199:1 gene:ENSMUSG00000032221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000183809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:72438011:72448729:1 gene:ENSMUSG00000032221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 39 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000184604 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:72438526:72452742:1 gene:ENSMUSG00000032221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// AK013048 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810408J05 product:meiosis-specific nuclear structural protein 1, full insert sequence. // chr9 // 87 // 94 // 27 // 31 // 0 /// BC046624 // GenBank // Mus musculus meiosis-specific nuclear structural protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:54738 IMAGE:6314904), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// D14849 // GenBank // Mus musculus MNS1 mRNA for meiosis-specific nuclear structural protein 1, complete cds. // chr9 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000015283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:72438500:72458393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
AK087684 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330004G06 product:Hypothetical serine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:72693439:72747228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_175485 // RefSeq // Mus musculus protogenin homolog (Gallus gallus) (Prtg), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000055535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:72806874:72917291:1 gene:ENSMUSG00000036030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AY630257 // GenBank // Mus musculus shen-dan mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// DQ360114 // GenBank // Mus musculus protogenin precursor, mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000049019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:72842832:72945786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 79 // 79 // 33 // 42 // 1
NM_028116 // RefSeq // Mus musculus pygopus 1 (Pygo1), mRNA. // chr9 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000038489 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:72925645:72952181:1 gene:ENSMUSG00000034910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC116630 // GenBank // Mus musculus pygopus 1, mRNA (cDNA clone MGC:141251 IMAGE:40057035), complete cds. // chr9 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BC116631 // GenBank // Mus musculus pygopus 1, mRNA (cDNA clone MGC:141252 IMAGE:40057038), complete cds. // chr9 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:72842832:72945786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000178005 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:72969602:72969708:1 gene:ENSMUSG00000096559 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083215 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:74059339:74059457:1 gene:ENSMUSG00000095631 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT070018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001033500 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 72 (Wdr72), mRNA. // chr9 // 98 // 93 // 56 // 57 // 0 /// ENSMUST00000055879 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:74110356:74283203:1 gene:ENSMUSG00000044976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 93 // 56 // 57 // 0 /// ENSMUST00000098564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:74110356:74142880:1 gene:ENSMUSG00000044976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 41 // 25 // 25 // 0 /// BC145956 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 72, mRNA (cDNA clone IMAGE:40131259), complete cds. // chr9 // 100 // 34 // 21 // 21 // 0 /// BC145958 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 72, mRNA (cDNA clone IMAGE:40131261), complete cds. // chr9 // 100 // 34 // 21 // 21 // 0 /// AK052055 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230040E23 product:Hypothetical G-protein beta WD-40 repeats containing protein, full insert sequence. // chr9 // 33 // 33 // 20 // 61 // 1 /// ENSMUST00000184725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:74110404:74113679:1 gene:ENSMUSG00000044976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 15 // 15 // 9 // 61 // 1 /// BC095960 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5390014. // chr9 // 15 // 15 // 9 // 61 // 1 /// GENSCAN00000029465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:74126420:74230643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 27 // 61 // 1
ENSMUST00000122776 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:74362610:74362724:1 gene:ENSMUSG00000084725 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// NONMMUT070021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0
NM_008262 // RefSeq // Mus musculus one cut domain, family member 1 (Onecut1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:74861921:74891781:1 gene:ENSMUSG00000043013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024053 // GenBank // Mus musculus one cut domain, family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:36136 IMAGE:5101697), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U95945 // GenBank // Mus musculus hepatocyte nuclear factor 6 (HNF-6) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:74866484:74890360:1 gene:ENSMUSG00000043013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENSMUST00000160950 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:74848463:74891476:1 gene:ENSMUSG00000093662 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:74862297:74889598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK050237 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730029H04 product:one cut domain, family member 1, full insert sequence. // chr9 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT070033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT070037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001113283 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 214, member A (Fam214a), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NM_153584 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 214, member A (Fam214a), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// XR_379417 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 214, member A (Fam214a), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:74976111:75032468:1 gene:ENSMUSG00000034858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000170846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:74953053:75032468:1 gene:ENSMUSG00000034858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BC031353 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC031353, mRNA (cDNA clone MGC:38960 IMAGE:5363230), complete cds. // chr9 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0 /// BC032966 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC031353, mRNA (cDNA clone IMAGE:1246341), complete cds. // chr9 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000031488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:74960020:75056805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_010864 // RefSeq // Mus musculus myosin VA (Myo5a), mRNA. // chr9 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000123128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:75071188:75223688:1 gene:ENSMUSG00000034593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000123531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:75071565:75176557:1 gene:ENSMUSG00000034593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000136604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:75184184:75218484:1 gene:ENSMUSG00000034593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000136731 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:75071600:75218953:1 gene:ENSMUSG00000034593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000148144 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:75185994:75217993:1 gene:ENSMUSG00000034593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000155282 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:75071386:75218550:1 gene:ENSMUSG00000034593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// AK002362 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610009A05 product:myosin Va, full insert sequence. // chr9 // 93 // 33 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000031478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:75108223:75220327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
NM_001081322 // RefSeq // Mus musculus myosin VC (Myo5c), mRNA. // chr9 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// XM_006510937 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myosin VC (Myo5c), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// XM_006510938 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myosin VC (Myo5c), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 97 // 70 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000036555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:75232014:75305451:1 gene:ENSMUSG00000033590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// AK142326 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430001J06 product:Myosin Vc (Myosin 5C) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// BC003985 // GenBank // Mus musculus myosin VC, mRNA (cDNA clone IMAGE:3491290), complete cds. // chr9 // 93 // 33 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000031479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:75231772:75304082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0
NM_010313 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta 5 (Gnb5), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_138719 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta 5 (Gnb5), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NR_073186 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta 5 (Gnb5), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000076889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:75311395:75344964:1 gene:ENSMUSG00000032192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC016135 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta 5, mRNA (cDNA clone MGC:28984 IMAGE:4506201), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// L34290 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide regulatory protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// U69145 // GenBank // Mus musculus retinal-specific heterotrimeric GTP-binding protein beta subunit, G beta5L, mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:75311395:75344677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0
NM_013479 // RefSeq // Mus musculus Bcl2-like 10 (Bcl2l10), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:75347758:75351632:1 gene:ENSMUSG00000032191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF067660 // GenBank // Mus musculus Bcl-2 homolog (Diva) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF102501 // GenBank // Mus musculus Bcl-2 homolog (Boo) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC052690 // GenBank // Mus musculus Bcl2-like 10, mRNA (cDNA clone MGC:60542 IMAGE:30052580), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001039522 // RefSeq // Mus musculus Leo1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae) (Leo1), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000048937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:75441524:75466432:1 gene:ENSMUSG00000042487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC082540 // GenBank // Mus musculus Leo1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5719017), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC083358 // GenBank // Mus musculus Leo1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:102277 IMAGE:30625386), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:75430481:75466298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0
XM_006511431 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 2 (Lysmd2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC048545 // GenBank // Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:58518 IMAGE:6589154), complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NM_027309 // RefSeq // Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 2 (Lysmd2), mRNA. // chr9 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000034702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:75625732:75637773:1 gene:ENSMUSG00000032184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000031480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:75625438:75635721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_007555 // RefSeq // Mus musculus bone morphogenetic protein 5 (Bmp5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000012281 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:75775364:75900310:1 gene:ENSMUSG00000032179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC141283 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:176244 IMAGE:9055895), complete cds. // chr9 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// L41145 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 5 (BMP5) mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// AK160412 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500034B01 product:bone morphogenetic protein 5, full insert sequence. // chr9 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000004618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:75769433:75865079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000004615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:75873323:75894735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENSMUST00000183550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:77097191:77099390:1 gene:ENSMUSG00000099138 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:77097123:77098793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0
NM_172925 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 31 (Klhl31), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000057781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:77636500:77660127:1 gene:ENSMUSG00000044938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:77650004:77714297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0
NM_172925 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 31 (Klhl31), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000057781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:77636500:77660127:1 gene:ENSMUSG00000044938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT070102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_010295 // RefSeq // Mus musculus glutamate-cysteine ligase, catalytic subunit (Gclc), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000034905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:77754535:77794485:1 gene:ENSMUSG00000032350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC019374 // GenBank // Mus musculus glutamate-cysteine ligase, catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:30487 IMAGE:4195425), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// U85414 // GenBank // Mus musculus gamma-glutamylcysteine synthetase mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// U85498 // GenBank // Mus musculus glutamate-cysteine ligase catalytic subunit (GLCLC) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006510813 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate-cysteine ligase, catalytic subunit (Gclc), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// GENSCAN00000027029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:77750594:77802290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0
NM_134255 // RefSeq // Mus musculus ELOVL family member 5, elongation of long chain fatty acids (yeast) (Elovl5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006511399 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ELOVL family member 5, elongation of long chain fatty acids (yeast) (Elovl5), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006511400 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ELOVL family member 5, elongation of long chain fatty acids (yeast) (Elovl5), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006511401 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ELOVL family member 5, elongation of long chain fatty acids (yeast) (Elovl5), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000034904 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:77917364:77984519:1 gene:ENSMUSG00000032349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000133757 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:77921932:77979868:1 gene:ENSMUSG00000032349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 66 // 17 // 19 // 0 /// BC022911 // GenBank // Mus musculus ELOVL family member 5, elongation of long chain fatty acids (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:27526 IMAGE:4457285), complete cds. // chr9 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:77957149:77982808:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_008103 // RefSeq // Mus musculus glial cells missing homolog 1 (Drosophila) (Gcm1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000024104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:78051958:78065624:1 gene:ENSMUSG00000023333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC066866 // GenBank // Mus musculus glial cells missing homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:76737 IMAGE:30432193), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// D88612 // GenBank // Mus musculus mGCMa mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// U59876 // GenBank // Mus musculus glial cells missing gene homolog (mGCM1) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78053917:78069134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0
NM_001163780 // RefSeq // Mus musculus intestinal cell kinase (Ick), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_019987 // RefSeq // Mus musculus intestinal cell kinase (Ick), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000044551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:78113315:78172107:1 gene:ENSMUSG00000009828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000117330 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:78113300:78165413:1 gene:ENSMUSG00000009828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000118869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:78109192:78167938:1 gene:ENSMUSG00000009828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF225918 // GenBank // Mus musculus intestinal cell kinase (Ick) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AK133537 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5131401O18 product:intestinal cell kinase, full insert sequence. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC028863 // GenBank // Mus musculus intestinal cell kinase, mRNA (cDNA clone MGC:28949 IMAGE:4224269), complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000142402 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78155323:78170453:1 gene:ENSMUSG00000009828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000027034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78131471:78305417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_010357 // RefSeq // Mus musculus glutathione S-transferase, alpha 4 (Gsta4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:78191966:78209348:1 gene:ENSMUSG00000032348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK011841 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610110O09 product:glutathione S-transferase, alpha 4, full insert sequence. // chr9 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// BC012639 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase, alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:13725 IMAGE:3995378), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// L06047 // GenBank // Mus musculus glutathione transferase mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78131471:78305417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
BC115754 // GenBank // Mus musculus oocyte maturation, beta, mRNA (cDNA clone MGC:141126 IMAGE:40053349), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NM_205822 // RefSeq // Mus musculus oocyte maturation, beta (Omt2b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 1 /// ENSMUST00000043734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:78328030:78329620:1 gene:ENSMUSG00000038750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 1 /// ENSMUST00000187890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78328054:78329097:1 gene:ENSMUSG00000038750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000189243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78328182:78329444:1 gene:ENSMUSG00000038750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000187667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78327589:78329596:1 gene:ENSMUSG00000038750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 1 /// ENSMUST00000186336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78328054:78328564:1 gene:ENSMUSG00000038750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_001191044 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 43 (Ddx43), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006510731 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 43 (Ddx43), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:78395777:78423587:1 gene:ENSMUSG00000070291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78413549:78428783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_026658 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial translation optimization 1 homolog (S. cerevisiae) (Mto1), mRNA. // chr9 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:78448208:78474152:1 gene:ENSMUSG00000032342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// AF369902 // GenBank // Mus musculus MTO1 mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 90 // 33 // 36 // 0 /// ENSMUST00000148238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78448208:78474152:1 gene:ENSMUSG00000032342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 83 // 83 // 33 // 40 // 1 /// ENSMUST00000150850 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78448213:78450472:1 gene:ENSMUSG00000032342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// AK017573 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730419A02 product:mitochondrial translation optimization 1 homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr9 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// GENSCAN00000027031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78448297:78473885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0
NM_153098 // RefSeq // Mus musculus CD109 antigen (Cd109), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000093812 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:78615546:78716253:1 gene:ENSMUSG00000046186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AY083458 // GenBank // Mus musculus GPI-anchored alpha-2 macroglobulin-related protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC052443 // GenBank // Mus musculus CD109 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:63463 IMAGE:6406841), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// DQ832284 // GenBank // Mus musculus CD109 antigen precursor (Cd109) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000027033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78615882:78717179:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0
NM_175213 // RefSeq // Mus musculus meiosis-specific, MEI4 homolog (S. cerevisiae) (Mei4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057067 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:81863670:82027026:1 gene:ENSMUSG00000043289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC096613 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930486G11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106260 IMAGE:6469435), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_006511521 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus meiosis-specific, MEI4 homolog (S. cerevisiae) (Mei4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// AK082395 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230046E07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000189391 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:81863709:82026458:1 gene:ENSMUSG00000043289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSMUST00000189832 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:81863705:82206007:1 gene:ENSMUSG00000043289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000021023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:81890136:82053274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001168240 // RefSeq // Mus musculus interleukin-1 receptor-associated kinase 1 binding protein 1 (Irak1bp1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NM_022986 // RefSeq // Mus musculus interleukin-1 receptor-associated kinase 1 binding protein 1 (Irak1bp1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:82829806:82847020:1 gene:ENSMUSG00000032251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000113245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:82829540:82847687:1 gene:ENSMUSG00000032251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF093135 // GenBank // Mus musculus PLK interacting protein (Mmip) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC061099 // GenBank // Mus musculus interleukin-1 receptor-associated kinase 1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:74217 IMAGE:6742251), complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AJ242722 // GenBank // Mus musculus mRNA for partial AIP70 protein. // chr9 // 71 // 68 // 12 // 17 // 0 /// GENSCAN00000024773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:82846329:82855278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001110265 // RefSeq // Mus musculus Ttk protein kinase (Ttk), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// NM_001284272 // RefSeq // Mus musculus Ttk protein kinase (Ttk), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 97 // 85 // 38 // 39 // 0 /// NM_009445 // RefSeq // Mus musculus Ttk protein kinase (Ttk), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000070326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:83834718:83872386:1 gene:ENSMUSG00000038379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// M86377 // GenBank // Mouse esk kinase mRNA, complete cds. // chr9 // 93 // 96 // 41 // 44 // 0 /// BC058851 // GenBank // Mus musculus Ttk protein kinase, mRNA (cDNA clone MGC:60685 IMAGE:30023533), complete cds. // chr9 // 85 // 85 // 39 // 46 // 1 /// ENSMUST00000185913 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:83834690:83872389:1 gene:ENSMUSG00000038379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 85 // 38 // 39 // 0 /// ENSMUST00000186277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:83834741:83844427:1 gene:ENSMUSG00000038379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 35 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000188445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:83834689:83869493:1 gene:ENSMUSG00000038379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000022559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:83821777:83957586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1
XR_168460 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5919 (Gm5919), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK085082 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430034L15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_199195 // RefSeq // Mus musculus branched chain ketoacid dehydrogenase E1, beta polypeptide (Bckdhb), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:83925150:84124239:1 gene:ENSMUSG00000032263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK164531 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330026L20 product:branched chain ketoacid dehydrogenase E1, beta polypeptide, full insert sequence. // chr9 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC064099 // GenBank // Mus musculus branched chain ketoacid dehydrogenase E1, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:73769 IMAGE:1246285), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// L16992 // GenBank // Mus musculus branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase E1 beta-subunit mRNA sequence. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000188200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:84045887:84124239:1 gene:ENSMUSG00000032263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000189819 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:84035840:84124198:1 gene:ENSMUSG00000032263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 89 // 29 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000190166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:83948781:84124240:1 gene:ENSMUSG00000032263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000190637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:83925145:84124239:1 gene:ENSMUSG00000032263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000022556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:83987147:84017011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
ENSMUST00000083188 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:84649496:84649659:1 gene:ENSMUSG00000065122 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083340 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:85472734:85472869:1 gene:ENSMUSG00000065274 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT070302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001164792 // RefSeq // Mus musculus trophoblast glycoprotein (Tpbg), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NM_011627 // RefSeq // Mus musculus trophoblast glycoprotein (Tpbg), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000006559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:85842380:85847040:1 gene:ENSMUSG00000035274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000098500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:85842865:85847040:1 gene:ENSMUSG00000035274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC012713 // GenBank // Mus musculus trophoblast glycoprotein, mRNA (cDNA clone IMAGE:3673131), partial cds. // chr9 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// BC058198 // GenBank // Mus musculus trophoblast glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:68145 IMAGE:5353871), complete cds. // chr9 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:85840894:85845260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_001145968 // RefSeq // Mus musculus RWD domain containing 2A (Rwdd2a), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NM_001145969 // RefSeq // Mus musculus RWD domain containing 2A (Rwdd2a), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NM_027100 // RefSeq // Mus musculus RWD domain containing 2A (Rwdd2a), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:86572016:86574899:1 gene:ENSMUSG00000032417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000179212 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:86572053:86574840:1 gene:ENSMUSG00000032417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC115691 // GenBank // Mus musculus RWD domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:144625 IMAGE:40104313), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC115692 // GenBank // Mus musculus RWD domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:144626 IMAGE:40104314), complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000185566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:86571991:86574733:1 gene:ENSMUSG00000032417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:86572863:86574651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NR_045835 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A330041J22 gene (A330041J22Rik), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:86695460:86701253:1 gene:ENSMUSG00000087466 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178738 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 35 (Prss35), mRNA. // chrUn // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006511172 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 35 (Prss35), transcript variant X3, mRNA. // chrUn // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000036426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:86743649:86758443:1 gene:ENSMUSG00000033491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:86743649:86758272:1 gene:ENSMUSG00000033491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC075675 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 35, mRNA (cDNA clone MGC:99986 IMAGE:30547401), complete cds. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ223037 // GenBank // Mus musculus putative serine protease 35 mRNA, complete cds. // chrUn // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:86755179:86756408:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001037907 // RefSeq // Mus musculus ripply2 homolog (zebrafish) (Ripply2), mRNA. // chr9 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// ENSMUST00000058846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:87015537:87019917:1 gene:ENSMUSG00000047897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// AB212223 // GenBank // Mus musculus mRNA for Ripply2, complete cds. // chr9 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENSMUST00000188187 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:87015636:87019916:1 gene:ENSMUSG00000047897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:87015545:87127449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_024195 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b5 reductase 4 (Cyb5r4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000168529 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:87022014:87077774:1 gene:ENSMUSG00000032872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AK172252 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830110C05 product:NADPH cytochrome B5 oxidoreductase, full insert sequence. // chr9 // 86 // 78 // 6 // 7 // 0 /// BC025438 // GenBank // Mus musculus cytochrome b5 reductase 4, mRNA (cDNA clone MGC:29355 IMAGE:5038563), complete cds. // chr9 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
NM_001101482 // RefSeq // Mus musculus melanocortin 2 receptor accessory protein 2 (Mrap2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001177731 // RefSeq // Mus musculus melanocortin 2 receptor accessory protein 2 (Mrap2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006511173 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus melanocortin 2 receptor accessory protein 2 (Mrap2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000049457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:87144306:87184045:1 gene:ENSMUSG00000042761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:87144306:87184045:1 gene:ENSMUSG00000042761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000179313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:87144343:87184045:1 gene:ENSMUSG00000042761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:87168565:87182831:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
AK141776 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030062O11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011851 // RefSeq // Mus musculus 5 nucleotidase, ecto (Nt5e), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:88327197:88372092:1 gene:ENSMUSG00000032420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC119268 // GenBank // Mus musculus 5 nucleotidase, ecto, mRNA (cDNA clone MGC:155584 IMAGE:8734017), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC119270 // GenBank // Mus musculus 5 nucleotidase, ecto, mRNA (cDNA clone MGC:155586 IMAGE:8734019), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// L12059 // GenBank // Mus musculus ecto-5-nucleotidase (Cd73) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:88352044:88372432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000187166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:88327633:88367844:1 gene:ENSMUSG00000032420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// AK047143 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930026A07 product:5 nucleotidase, full insert sequence. // chr9 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
AK133266 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932427H20 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034906 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 43A (Trim43a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:88580891:88588819:1 gene:ENSMUSG00000090693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001170884 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 43B (Trim43b), mRNA. // chr9 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:89084624:89092835:-1 gene:ENSMUSG00000079162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NM_001177858 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 43C (Trim43c), mRNA. // chr9 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0 /// XM_006511358 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif-containing 43C (Trim43c), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 42 // 76 // 8 // 19 // 0 /// ENSMUST00000163255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:88839164:88848190:1 gene:ENSMUSG00000067399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189557 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:89084912:89092690:-1 gene:ENSMUSG00000079162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186363 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:88839309:88848184:1 gene:ENSMUSG00000067399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:89063655:89174939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000018301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:88525256:88600047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_011245 // RefSeq // Mus musculus RAS protein-specific guanine nucleotide-releasing factor 1 (Rasgrf1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 62 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000034912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:89909909:90026977:1 gene:ENSMUSG00000032356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 32 // 32 // 0 /// BC138682 // GenBank // Mus musculus RAS protein-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:170308 IMAGE:8861703), complete cds. // chr9 // 100 // 58 // 31 // 31 // 0 /// BC138683 // GenBank // Mus musculus RAS protein-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:170309 IMAGE:8861704), complete cds. // chr9 // 100 // 58 // 31 // 31 // 0 /// XR_379405 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS protein-specific guanine nucleotide-releasing factor 1 (Rasgrf1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 58 // 58 // 31 // 53 // 1 /// NM_001039655 // RefSeq // Mus musculus RAS protein-specific guanine nucleotide-releasing factor 1 (Rasgrf1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 47 // 47 // 25 // 53 // 1 /// ENSMUST00000034909 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:89909909:89915834:1 gene:ENSMUSG00000032356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 45 // 45 // 24 // 53 // 1 /// AF169826 // GenBank // Mus musculus RAS-guanine nucleotide releasing factor GRFbeta mRNA, complete cds. // chr9 // 45 // 45 // 24 // 53 // 1 /// ENSMUST00000189545 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:89909908:89915847:1 gene:ENSMUSG00000032356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 47 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:89940557:90026763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 45 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000122703 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:90315910:90316080:1 gene:ENSMUSG00000084652 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083947 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:90351995:90352171:1 gene:ENSMUSG00000065881 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT070398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_011636 // RefSeq // Mus musculus phospholipid scramblase 1 (Plscr1), mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// XM_006511052 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipid scramblase 1 (Plscr1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000093801 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:92249750:92272278:1 gene:ENSMUSG00000032369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// AF159593 // GenBank // Mus musculus phospholipid scramblase 1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// D78355 // GenBank // Mus musculus TRA1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC002017 // GenBank // Mus musculus phospholipid scramblase 1, mRNA (cDNA clone MGC:5827 IMAGE:3491904), complete cds. // chr9 // 60 // 83 // 9 // 15 // 0 /// AK008651 // GenBank HTC // Mus musculus adult male stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2200008O17 product:phospholipid scramblase 1, full insert sequence. // chr9 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// CT010236 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836C0151D for gene Plscr1, Phospholipid scramblase 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr9 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// ENSMUST00000187952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:92266295:92271977:1 gene:ENSMUSG00000032369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000186364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:92250342:92271975:1 gene:ENSMUSG00000032369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// GENSCAN00000013985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:92259247:92271588:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_001195084 // RefSeq // Mus musculus phospholipid scramblase 2 (Plscr2), transcript variant A, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_008880 // RefSeq // Mus musculus phospholipid scramblase 2 (Plscr2), transcript variant B, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006510858 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipid scramblase 2 (Plscr2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000034932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:92275602:92297731:1 gene:ENSMUSG00000032372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113044 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:92289572:92297731:1 gene:ENSMUSG00000032372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000180154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:92275602:92297752:1 gene:ENSMUSG00000032372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF015790 // GenBank // Mus musculus phospholipid scramblase 2 mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC002012 // GenBank // Mus musculus phospholipid scramblase 2, mRNA (cDNA clone MGC:5805 IMAGE:3490475), complete cds. // chr9 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC011299 // GenBank // Mus musculus phospholipid scramblase 2, mRNA (cDNA clone MGC:18362 IMAGE:3595010), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006510859 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipid scramblase 2 (Plscr2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000013979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:92275549:92368419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001033184 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700057G04 gene (1700057G04Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:92309377:92357876:1 gene:ENSMUSG00000074139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:92309408:92351071:1 gene:ENSMUSG00000074139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0 /// ENSMUST00000135182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:92351085:92357876:1 gene:ENSMUSG00000074139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000150594 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:92309377:92343683:1 gene:ENSMUSG00000074139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC147543 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700057G04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182640 IMAGE:9056534), complete cds. // chr9 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// ENSMUST00000185580 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:92343505:92357819:1 gene:ENSMUSG00000074139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// NONMMUT070432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0 /// NONMMUT070434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:92275549:92368419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_178711 // RefSeq // Mus musculus phospholipid scramblase 4 (Plscr4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:92457373:92492456:1 gene:ENSMUSG00000032377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000143866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:92457394:92485332:1 gene:ENSMUSG00000032377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AK035878 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630013D22 product:similar to PHOSPHOLIPID SCRAMBLASE 4 (PL SCRAMBLASE 4) (CA2+ DEPENDENT PHOSPHOLIPID SCRAMBLASE 4) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// AK079413 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830145G10 product:similar to PHOSPHOLIPID SCRAMBLASE 4 (PL SCRAMBLASE 4) (CA2+ DEPENDENT PHOSPHOLIPID SCRAMBLASE 4) (FRAGMENT) [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC052067 // GenBank // Mus musculus phospholipid scramblase 4, mRNA (cDNA clone MGC:62466 IMAGE:5708712), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:92390276:92509636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001142916 // RefSeq // Mus musculus procollagen lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 (Plod2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NM_011961 // RefSeq // Mus musculus procollagen lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 (Plod2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000070522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:92542223:92608428:1 gene:ENSMUSG00000032374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000160359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:92542264:92608420:1 gene:ENSMUSG00000032374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AF080572 // GenBank // Mus musculus lysyl hydroxylase isoform 2 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// BC021352 // GenBank // Mus musculus procollagen lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:29312 IMAGE:5007509), complete cds. // chr9 // 97 // 91 // 38 // 39 // 0 /// ENSMUST00000160142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:92573588:92591684:1 gene:ENSMUSG00000032374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1 /// GENSCAN00000013978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:92589129:92642485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 47 // 47 // 20 // 43 // 1 /// GENSCAN00000013981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:92548203:92585095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
ENSMUST00000082955 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:94284496:94284652:1 gene:ENSMUSG00000064889 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177909 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 9 (Slc9a9), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000033463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:94669909:95230445:1 gene:ENSMUSG00000031129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099942 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:107413 IMAGE:30103308), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC153825 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:164721 IMAGE:40093280), complete cds. // chr9 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// ENSMUST00000162870 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:94669932:94718846:1 gene:ENSMUSG00000031129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_198414 // RefSeq // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member IX (Paqr9), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:95559657:95568023:1 gene:ENSMUSG00000064225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY424298 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member IX (Paqr9) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:95559959:95561086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000079597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:95559657:95568023:1 gene:ENSMUSG00000064225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK083183 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630024D06 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT070487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSMUST00000083412 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:95624502:95624611:1 gene:ENSMUSG00000065346 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT070499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0
NM_029620 // RefSeq // Mus musculus procollagen C-endopeptidase enhancer 2 (Pcolce2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000015498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:95637601:95698096:1 gene:ENSMUSG00000015354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000151210 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:95680306:95694683:1 gene:ENSMUSG00000015354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 77 // 39 // 10 // 13 // 0 /// AF352788 // GenBank // Mus musculus procollagen COOH-terminal proteinase enhancer protein 2 (Pcolce2) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC051174 // GenBank // Mus musculus procollagen C-endopeptidase enhancer 2, mRNA (cDNA clone MGC:56885 IMAGE:6310294), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:95692861:95695096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000037936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:95668945:95686840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0
NM_019864 // RefSeq // Mus musculus ataxia telangiectasia and Rad3 related (Atr), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000034980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:95857597:95951644:1 gene:ENSMUSG00000032409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AK142244 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330020L22 product:similar to FRAP-related protein (Protein kinase ATR) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 49 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000185473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:95857639:95904038:1 gene:ENSMUSG00000032409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 49 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:95857725:95910663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 43 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:95914952:96052809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 34 // 34 // 16 // 47 // 1
ENSMUST00000158460 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:95934613:95934790:1 gene:ENSMUSG00000089085 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:95933945:95935719:1 gene:ENSMUSG00000032409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011916 // RefSeq // Mus musculus 5-3 exoribonuclease 1 (Xrn1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000034981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:95954760:96053027:1 gene:ENSMUSG00000032410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AK163245 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020005H05 product:5-3 exoribonuclease 1, full insert sequence. // chr9 // 100 // 49 // 22 // 22 // 0 /// BC054108 // GenBank // Mus musculus 5-3 exoribonuclease 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30013883), partial cds. // chr9 // 98 // 98 // 43 // 44 // 0 /// D88026 // GenBank // Mus musculus mRNA for Dhm2 protein, complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// BC100578 // GenBank // Mus musculus 5-3 exoribonuclease 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30099301). // chr9 // 53 // 53 // 24 // 45 // 1 /// ENSMUST00000185633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:95954767:96057803:1 gene:ENSMUSG00000032410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000187175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:95954859:96053027:1 gene:ENSMUSG00000032410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000189612 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:95954832:96000394:1 gene:ENSMUSG00000032410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 49 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:95914952:96052809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000190665 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:95954862:96011865:1 gene:ENSMUSG00000032410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 53 // 53 // 24 // 45 // 1
ENSMUST00000085217 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:96119362:96180190:1 gene:ENSMUSG00000041440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC050033 // GenBank // Mus musculus glycerol kinase 5 (putative), mRNA (cDNA clone IMAGE:5328207), partial cds. // chr9 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// NM_177352 // RefSeq // Mus musculus glycerol kinase 5 (putative) (Gk5), mRNA. // chr9 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// ENSMUST00000122383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:96119375:96184608:1 gene:ENSMUSG00000041440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// ENSMUST00000129774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:96119432:96182810:1 gene:ENSMUSG00000041440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// BC116302 // GenBank // Mus musculus glycerol kinase 5 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:143928 IMAGE:40095102), complete cds. // chr9 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// BC116303 // GenBank // Mus musculus glycerol kinase 5 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:143929 IMAGE:40095106), complete cds. // chr9 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// GENSCAN00000016439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:96150462:96179069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
ENSMUST00000190473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:98301650:98302226:1 gene:ENSMUSG00000101452 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:98280179:98302231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_011254 // RefSeq // Mus musculus retinol binding protein 1, cellular (Rbp1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:98422961:98446575:1 gene:ENSMUSG00000046402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK011641 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610032L23 product:retinol binding protein 1, cellular, full insert sequence. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC018254 // GenBank // Mus musculus retinol binding protein 1, cellular, mRNA (cDNA clone MGC:6258 IMAGE:3498107), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// X60367 // GenBank // Mouse CRBPI mRNA for cellular retinol binding protein I (mCRBPI). // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091751 // GenBank // Mus musculus retinol binding protein 1, cellular, mRNA (cDNA clone MGC:102298 IMAGE:4022443), complete cds. // chr9 // 65 // 80 // 13 // 20 // 0 /// GENSCAN00000003089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:98424979:98444745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_009034 // RefSeq // Mus musculus retinol binding protein 2, cellular (Rbp2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000035029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:98490537:98509771:1 gene:ENSMUSG00000032454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK003312 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110002L02 product:retinol binding protein 2, cellular, full insert sequence. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC125551 // GenBank // Mus musculus retinol binding protein 2, cellular, mRNA (cDNA clone MGC:159254 IMAGE:40130066), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC125553 // GenBank // Mus musculus retinol binding protein 2, cellular, mRNA (cDNA clone MGC:159256 IMAGE:40130068), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// X74154 // GenBank // M.musculus CRBPII mRNA. // chr9 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// BC106846 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40045947. // chr9 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENSMUST00000187905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:98486166:98509651:1 gene:ENSMUSG00000032454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000189446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:98486115:98509781:1 gene:ENSMUSG00000032454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:98490610:98531404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// ENSMUST00000188779 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:98491697:98498858:1 gene:ENSMUSG00000032454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_015827 // RefSeq // Mus musculus coatomer protein complex, subunit beta 2 (beta prime) (Copb2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000035033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:98563731:98588382:1 gene:ENSMUSG00000032458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC006675 // GenBank // Mus musculus coatomer protein complex, subunit beta 2 (beta prime), mRNA (cDNA clone MGC:6378 IMAGE:3499585), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000003051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:98563644:98588140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0
NM_001134660 // RefSeq // Mus musculus proline rich 23A (Prr23a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000170349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:9:98842503:98843385:1 gene:ENSMUSG00000091080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:98834191:98865759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001134660 // RefSeq // Mus musculus proline rich 23A (Prr23a), mRNA. // chr9 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// NM_001134661 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6406 (Gm6406), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000071302 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:9:98856494:98857374:1 gene:ENSMUSG00000063058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000170349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:9:98842503:98843385:1 gene:ENSMUSG00000091080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:98834191:98865759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 100 // 22 // 30 // 0
NM_028033 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2410012M07 gene (2410012M07Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000167951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:98864767:98866583:1 gene:ENSMUSG00000090470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC128017 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410012M07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:157616 IMAGE:40136125), complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000026141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:98834191:98865759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_001033983 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 7420426K07 gene (7420426K07Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000098460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:98903119:98904622:1 gene:ENSMUSG00000074123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_012020 // RefSeq // Mus musculus forkhead box L2 (Foxl2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:98955607:98956847:1 gene:ENSMUSG00000050397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137811 // GenBank // Mus musculus forkhead box L2, mRNA (cDNA clone MGC:169435 IMAGE:8860830), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137812 // GenBank // Mus musculus forkhead box L2, mRNA (cDNA clone MGC:169436 IMAGE:8860831), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:98945015:98956788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001122851 // RefSeq // Mus musculus Fas apoptotic inhibitory molecule (Faim), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_011810 // RefSeq // Mus musculus Fas apoptotic inhibitory molecule (Faim), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000035038 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:98986373:99002021:1 gene:ENSMUSG00000032463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000112911 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:98986374:99001749:1 gene:ENSMUSG00000032463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// AF130367 // GenBank // Mus musculus Fas-apoptosis inhibitory molecule (Faim) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC079662 // GenBank // Mus musculus Fas apoptotic inhibitory molecule, mRNA (cDNA clone MGC:90708 IMAGE:30358320), complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK156341 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830017F10 product:Fas apoptotic inhibitory molecule, full insert sequence. // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// ENSMUST00000185472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:98991831:99001688:1 gene:ENSMUSG00000032463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000026159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:98990928:99001704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000186837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:98986407:98993238:1 gene:ENSMUSG00000032463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001165957 // RefSeq // Mus musculus NME/NM23 family member 9 (Nme9), mRNA. // chr9 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000163199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:99456207:99470932:1 gene:ENSMUSG00000046242 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000026161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:99422806:99494403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001077424 // RefSeq // Mus musculus alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase (A4gnt), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006511244 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase (A4gnt), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006511246 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase (A4gnt), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042553 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:99612502:99622367:1 gene:ENSMUSG00000037953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC115614 // GenBank // Mus musculus alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:144513 IMAGE:40102739), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC115615 // GenBank // Mus musculus alpha-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:144514 IMAGE:40102743), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:99613513:99667803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0
NM_001100451 // RefSeq // Mus musculus male-specific lethal 2 homolog (Drosophila) (Msl2), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:101074762:101104800:1 gene:ENSMUSG00000066415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK173208 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1585 protein. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189616 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:101074101:101101785:1 gene:ENSMUSG00000066415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000011079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:101100417:101102162:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000112841 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:101938481:101943219:1 gene:ENSMUSG00000057710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK079355 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630041A04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0
ENSMUST00000083173 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:102127888:102128005:1 gene:ENSMUSG00000065107 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr9 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT070724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_024291 // RefSeq // Mus musculus kyphoscoliosis peptidase (Ky), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006511647 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kyphoscoliosis peptidase (Ky), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000039390 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:102505750:102546239:1 gene:ENSMUSG00000035606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AJ293727 // GenBank // Mus musculus mRNA for Ky protein (muscle-specific protein). // chr9 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// AK047076 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930017C15 product:kyphoscoliosis, full insert sequence. // chr9 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:102521336:102528059:1 gene:ENSMUSG00000035606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000034622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:102497356:102542781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
ENSMUST00000188760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:102551632:102553132:1 gene:ENSMUSG00000101563 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:102548214:102570630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_181394 // RefSeq // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 13 (Anapc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006511806 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anaphase promoting complex subunit 13 (Anapc13), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006511807 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anaphase promoting complex subunit 13 (Anapc13), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000038673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:102626663:102634242:1 gene:ENSMUSG00000035048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC028526 // GenBank // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 13, mRNA (cDNA clone MGC:41303 IMAGE:3371464), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK007332 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810004D07 product:HYPOTHETICAL 8.5 KDA PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 56 // 100 // 10 // 18 // 0 /// ENSMUST00000186693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:102626679:102634242:1 gene:ENSMUSG00000035048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000188398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:102626324:102634250:1 gene:ENSMUSG00000035048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000190279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:102626296:102634425:1 gene:ENSMUSG00000035048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NR_033301 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5627 (Gm5627), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000178539 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:102739648:102756685:1 gene:ENSMUSG00000093812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KnowTID_00007577 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT070739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT070740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001042607 // RefSeq // Mus musculus receptor-like tyrosine kinase (Ryk), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_001284258 // RefSeq // Mus musculus receptor-like tyrosine kinase (Ryk), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_013649 // RefSeq // Mus musculus receptor-like tyrosine kinase (Ryk), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000035142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:102834972:102907953:1 gene:ENSMUSG00000032547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000175883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:102834917:102907542:1 gene:ENSMUSG00000032547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000176198 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:102834982:102908305:1 gene:ENSMUSG00000032547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC032275 // GenBank // Mus musculus receptor-like tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:40871 IMAGE:5370100), complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// L02210 // GenBank // Mus musculus tyrosine kinase-related protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// L21707 // GenBank // Mus musculus receptor tyrosine kinase (MRK) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// L38394 // GenBank // Mus Musculus receptor tyrosine kinase-related protein (ryk2) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// M98547 // GenBank // Mouse growth factor receptor (RYK) mRNA, complete cds. // chr9 // 88 // 89 // 30 // 34 // 0 /// GENSCAN00000003255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:102835056:102906961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0
NM_033314 // RefSeq // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 2a1 (Slco2a1), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000035148 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:103008002:103090451:1 gene:ENSMUSG00000032548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AF323958 // GenBank // Mus musculus prostaglandin transporter PGT mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC035200 // GenBank // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 2a1, mRNA (cDNA clone MGC:7145 IMAGE:3158233), complete cds. // chr9 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006511731 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 2a1 (Slco2a1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// ENSMUST00000188664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:103008499:103096002:1 gene:ENSMUSG00000032548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:103008620:103085879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NM_173781 // RefSeq // Mus musculus RAB6B, member RAS oncogene family (Rab6b), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006511736 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB6B, member RAS oncogene family (Rab6b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000035155 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:103111807:103185276:1 gene:ENSMUSG00000032549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB232597 // GenBank // Mus musculus Rab6B mRNA for Rab6B, complete cds. // chr9 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// BC060618 // GenBank // Mus musculus RAB6B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:77988 IMAGE:6406134), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000189134 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:103111787:103162657:1 gene:ENSMUSG00000032549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000003250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:103136308:103181246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_176979 // RefSeq // Mus musculus topoisomerase (DNA) II binding protein 1 (Topbp1), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006511707 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus topoisomerase (DNA) II binding protein 1 (Topbp1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000035164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:103305215:103350428:1 gene:ENSMUSG00000032555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK129104 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0259 protein. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC049797 // GenBank // Mus musculus topoisomerase (DNA) II binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:59448 IMAGE:6510112), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:103296197:103349916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000187540 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:103888009:103888402:1 gene:ENSMUSG00000100266 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_028721 // RefSeq // Mus musculus nephronophthisis 3 (adolescent) (Nphp3), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_172460 // RefSeq // Mus musculus nephronophthisis 3 (adolescent) (Nphp3), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 90 // 33 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000035167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:104002544:104043811:1 gene:ENSMUSG00000032558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000129819 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104002654:104153483:1 gene:ENSMUSG00000032558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK133217 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932418A05 product:Nephrocystin 3 splice variant (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AY259499 // GenBank // Mus musculus nephrocystin 3 (Nphp3) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr9 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC115724 // GenBank // Mus musculus nephronophthisis 3 (adolescent), mRNA (cDNA clone MGC:141550 IMAGE:40086844), complete cds. // chr9 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104031472:104046099:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000053630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104002781:104023584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 47 // 13 // 14 // 0
NM_175324 // RefSeq // Mus musculus acyl-Coenzyme A dehydrogenase family, member 11 (Acad11), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000047799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104063686:104127656:1 gene:ENSMUSG00000090150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000120854 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104063377:104127463:1 gene:ENSMUSG00000090150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// AK139918 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020037L14 product:hypothetical Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal/Acyl-CoA dehydrogenase, central domain/Acyl-CoA dehydrogenase, middle and N-terminal containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// BC045199 // GenBank // Mus musculus acyl-Coenzyme A dehydrogenase family, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:49288 IMAGE:5133197), complete cds. // chr9 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000053625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104072099:104097469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104108943:104131055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_028719 // RefSeq // Mus musculus copine IV (Cpne4), mRNA. // chr9 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// XM_006511840 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus copine IV (Cpne4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// XM_006511841 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus copine IV (Cpne4), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// XM_006511842 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus copine IV (Cpne4), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000057742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104569483:105034544:1 gene:ENSMUSG00000032564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000077190 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104569787:105034544:1 gene:ENSMUSG00000032564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// BC043087 // GenBank // Mus musculus copine IV, mRNA (cDNA clone MGC:58003 IMAGE:6417611), complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// BC063081 // GenBank // Mus musculus copine IV, mRNA (cDNA clone MGC:69723 IMAGE:6417611), complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000098443 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:104547286:104873070:1 gene:ENSMUSG00000032564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// AK016705 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933406O10 product:RIKEN cDNA 4933406O10 gene, full insert sequence. // chr9 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1 /// GENSCAN00000052054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104854397:104947935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NR_029549 // RefSeq // Mus musculus microRNA 135a-1 (Mir135a-1), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000083473 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:106154124:106154213:1 gene:ENSMUSG00000065407 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-135a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000161 Mus musculus miR-135a-1 stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT070826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_029896 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain containing 82 (Wdr82), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000020490 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106170928:106191136:1 gene:ENSMUSG00000020257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC157943 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain containing 82, mRNA (cDNA clone MGC:189778 IMAGE:9007278), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC157945 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain containing 82, mRNA (cDNA clone MGC:189780 IMAGE:9007280), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC158054 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain containing 82, mRNA (cDNA clone MGC:189856 IMAGE:9007356), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000190564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106176677:106186502:1 gene:ENSMUSG00000020257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000022117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106171219:106188625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NR_029526 // RefSeq // Mus musculus microRNA let7g (Mirlet7g), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000083506 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:106178840:106178927:1 gene:ENSMUSG00000065440 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-let-7g // miRBase Micro RNA Database // MI0000137 Mus musculus let-7g stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT070829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_011876 // RefSeq // Mus musculus twinfilin, actin-binding protein, homolog 2 (Drosophila) (Twf2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000024047 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106203108:106215389:1 gene:ENSMUSG00000023277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK002699 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610030E02 product:protein typrotein tyrosine kinase 9-like (A6-related protein), full insert sequence. // chr9 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AY267189 // GenBank // Mus musculus actin monomer-binding protein twinfilin-2 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC003338 // GenBank // Mus musculus twinfilin, actin-binding protein, homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:5705 IMAGE:3257230), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000187647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106203145:106212819:1 gene:ENSMUSG00000023277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 93 // 47 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000188650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106206798:106215387:1 gene:ENSMUSG00000023277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106206870:106214995:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000187944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106203137:106212256:1 gene:ENSMUSG00000023277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_031178 // RefSeq // Mus musculus toll-like receptor 9 (Tlr9), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000062241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106222598:106226883:1 gene:ENSMUSG00000045322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AB045181 // GenBank // Mus musculus Tlr9 mRNA for toll-like receptor 9, complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF314224 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 9 (Tlr9) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// AF348140 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 9 (Tlr9) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106222704:106226610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_027354 // RefSeq // Mus musculus POC1 centriolar protein homolog A (Chlamydomonas) (Poc1a), mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000072206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106281061:106349879:1 gene:ENSMUSG00000023345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AK081217 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030009B08 product:hypothetical Trp-Asp (WD) repeats circular profile containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// BC034901 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 51A, mRNA (cDNA clone MGC:41475 IMAGE:5255069), complete cds. // chr9 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// XM_006511830 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus POC1 centriolar protein homolog A (Chlamydomonas) (Poc1a), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// ENSMUST00000188660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106290839:106350521:1 gene:ENSMUSG00000023345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000191434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106281380:106349892:1 gene:ENSMUSG00000023345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106281604:106354726:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// ENSMUST00000189325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106300758:106349877:1 gene:ENSMUSG00000023345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_153459 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 7 (Dusp7), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000172306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106368632:106375724:1 gene:ENSMUSG00000053716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC010207 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 7, mRNA (cDNA clone MGC:11703 IMAGE:3964527), complete cds. // chr9 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106368837:106431449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_145620 // RefSeq // Mus musculus RRP9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast) (Rrp9), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000047721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106477269:106485424:1 gene:ENSMUSG00000041506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000123464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106475963:106481873:1 gene:ENSMUSG00000041506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000125630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106477318:106485416:1 gene:ENSMUSG00000041506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF368232 // GenBank // Mus musculus U3-55k protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC014703 // GenBank // Mus musculus RRP9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:25949 IMAGE:4237895), complete cds. // chr9 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// ENSMUST00000185336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106483854:106485422:1 gene:ENSMUSG00000041506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000022115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106477227:106515992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001146701 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing F1 (Iqcf1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NM_028843 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing F1 (Iqcf1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000085114 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106499992:106502249:1 gene:ENSMUSG00000066383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000164965 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106499967:106502244:1 gene:ENSMUSG00000066383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC049769 // GenBank // Mus musculus IQ motif containing F1, mRNA (cDNA clone MGC:58863 IMAGE:6774620), complete cds. // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000022115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106477227:106515992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_029300 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing F5 (Iqcf5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000085113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106514573:106516010:1 gene:ENSMUSG00000066382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC125546 // GenBank // Mus musculus IQ motif containing F5, mRNA (cDNA clone MGC:159249 IMAGE:40130061), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106477227:106515992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001015507 // RefSeq // Mus musculus Vpr (HIV-1) binding protein (Vprbp), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XR_379768 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Vpr (HIV-1) binding protein (Vprbp), transcript variant X4, misc_RNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106829069:106880438:1 gene:ENSMUSG00000040325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106821874:106880443:1 gene:ENSMUSG00000040325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106829069:106880992:1 gene:ENSMUSG00000040325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK122372 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0800 protein. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC065119 // GenBank // Mus musculus Vpr (HIV-1) binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:86055 IMAGE:6853519), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106815063:106879992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000082583 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:107096951:107097057:1 gene:ENSMUSG00000064517 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT070876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_009895 // RefSeq // Mus musculus cytokine inducible SH2-containing protein (Cish), mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:107296026:107301987:1 gene:ENSMUSG00000032578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC003783 // GenBank // Mus musculus cytokine inducible SH2-containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:6010 IMAGE:3487580), complete cds. // chr9 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// BC022178 // GenBank // Mus musculus cytokine inducible SH2-containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:14022 IMAGE:4193243), complete cds. // chr9 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// D31943 // GenBank // Mus musculus mRNA for cytokine inducible SH2-containing protein, complete cds. // chr9 // 90 // 72 // 19 // 21 // 0 /// ENSMUST00000168260 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:107296710:107302784:1 gene:ENSMUSG00000032578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// XM_006511635 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytokine inducible SH2-containing protein (Cish), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// ENSMUST00000165664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:107296907:107301943:1 gene:ENSMUSG00000032578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// AK086040 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830048B08 product:cytokine inducible SH2-containing protein, full insert sequence. // chr9 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000037255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107300003:107300900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
NM_175486 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 6430571L13 gene (6430571L13Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_379764 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 6430571L13 gene (6430571L13Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000042581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:107340602:107349683:1 gene:ENSMUSG00000037977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK043338 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730086M16 product:similar to G20 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC115775 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6430571L13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144888 IMAGE:40107115), complete cds. // chr9 // 79 // 70 // 15 // 19 // 0 /// BC116708 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6430571L13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144887 IMAGE:40107114), complete cds. // chr9 // 79 // 70 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000037244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107342350:107348025:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_019704 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 115 (Tmem115), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000010189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107533945:107538656:1 gene:ENSMUSG00000010045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF134238 // GenBank // Mus musculus PL6 protein (Pl6) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK164772 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730020H04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC019473 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 115, mRNA (cDNA clone MGC:28463 IMAGE:4161444), complete cds. // chr9 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107456020:107538393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_018879 // RefSeq // Mus musculus nitrogen permease regulator-like 2 (Nprl2), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XR_379769 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nitrogen permease regulator-like 2 (Nprl2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 86 // 58 // 18 // 21 // 0 /// ENSMUST00000010201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107542209:107545704:1 gene:ENSMUSG00000010057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF131207 // GenBank // Mus musculus G21 protein mRNA, complete cds. // chr9 // 88 // 92 // 29 // 33 // 0 /// BC026548 // GenBank // Mus musculus tumor suppressor candidate 4, mRNA (cDNA clone MGC:35941 IMAGE:5028027), complete cds. // chr9 // 88 // 92 // 29 // 33 // 0 /// GENSCAN00000037267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107541529:107545558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_053253 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, MYND domain containing 10 (Zmynd10), mRNA. // chr9 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// ENSMUST00000010188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107547310:107551319:1 gene:ENSMUSG00000010044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// BC052357 // GenBank // Mus musculus zinc finger, MYND domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:58376 IMAGE:6772144), complete cds. // chr9 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000037245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107547457:107564912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 87 // 31 // 33 // 0
NM_019742 // RefSeq // Mus musculus tumor suppressor candidate 2 (Tusc2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000010198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107563255:107566108:1 gene:ENSMUSG00000010054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF123387 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J Fus1 protein (Fus1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0
NM_010489 // RefSeq // Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 2 (Hyal2), mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// XM_006511645 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 2 (Hyal2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000010191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107569117:107572776:1 gene:ENSMUSG00000010047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// AF302843 // GenBank // Mus musculus strain C3H hyaluronidase HYAL2 (Hyal2) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// AF302844 // GenBank // Mus musculus strain Czech II hyaluronidase HYAL2 (Hyal2) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// AF422177 // GenBank // Mus musculus hyaluronidase 2 (Hyal2) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// AF535140 // GenBank // Mus musculus GPI-anchored cell-surface protein hyaluronidase 2 (Hyal2) mRNA, complete cds. // chr9 // 90 // 59 // 18 // 20 // 0 /// AJ000059 // GenBank // Mus musculus mRNA for lysosomal hyaluronidase, Hyal2. // chr9 // 92 // 71 // 22 // 24 // 0 /// AK087358 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030049H03 product:hyaluronidase 2, full insert sequence. // chr9 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// GENSCAN00000037237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107570150:107574454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0
NM_178020 // RefSeq // Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 3 (Hyal3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040059 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:107581296:107587359:1 gene:ENSMUSG00000036091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:107580818:107586832:1 gene:ENSMUSG00000036091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000149487 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:107584752:107586661:1 gene:ENSMUSG00000036091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// AF074489 // GenBank // Mus musculus hyaluronidase 3 (Hyal3) mRNA, complete cds. // chr9 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// AY048681 // GenBank // Mus musculus hyaluronidase 3 (Hyal3) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC018457 // GenBank // Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:27960 IMAGE:3592874), complete cds. // chr9 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107575857:107592555:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_025903 // RefSeq // Mus musculus interferon-related developmental regulator 2 (Ifrd2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000010192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107587718:107593038:1 gene:ENSMUSG00000010048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK166130 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730042B14 product:interferon-related developmental regulator 2, full insert sequence. // chr9 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC037434 // GenBank // Mus musculus interferon-related developmental regulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:46785 IMAGE:2651172), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000037249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107575857:107592555:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1
AK015717 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930506F14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107863567:107903002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_028369 // RefSeq // Mus musculus MON1 homolog A (yeast) (Mon1a), mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000035202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107888129:107903125:1 gene:ENSMUSG00000032583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// BC048852 // GenBank // Mus musculus MON1 homolog A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:54809 IMAGE:5148425), complete cds. // chr9 // 89 // 79 // 24 // 27 // 0 /// BC058717 // GenBank // Mus musculus MON1 homolog A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:61247 IMAGE:5704178), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000023832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107863567:107903002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 68 // 22 // 23 // 0
NM_001287261 // RefSeq // Mus musculus macrophage stimulating 1 receptor (c-met-related tyrosine kinase) (Mst1r), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// NM_009074 // RefSeq // Mus musculus macrophage stimulating 1 receptor (c-met-related tyrosine kinase) (Mst1r), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NR_109782 // RefSeq // Mus musculus macrophage stimulating 1 receptor (c-met-related tyrosine kinase) (Mst1r), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XR_379757 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus macrophage stimulating 1 receptor (c-met-related tyrosine kinase) (Mst1r), transcript variant X7, misc_RNA. // chr9 // 96 // 70 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000035203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107906889:107920383:1 gene:ENSMUSG00000032584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC141379 // GenBank // Mus musculus macrophage stimulating 1 receptor (c-met-related tyrosine kinase), mRNA (cDNA clone MGC:176341 IMAGE:9055992), complete cds. // chr9 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107907145:107983946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0
NM_026338 // RefSeq // Mus musculus actin-like 11 (Actl11), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:107928469:107932461:1 gene:ENSMUSG00000066368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115773 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921517D21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:141498 IMAGE:40085938), complete cds. // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000023864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107907145:107983946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_145621 // RefSeq // Mus musculus CaM kinase-like vesicle-associated (Camkv), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006511722 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CaM kinase-like vesicle-associated (Camkv), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XR_379765 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CaM kinase-like vesicle-associated (Camkv), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000035700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107935920:107949691:1 gene:ENSMUSG00000032936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK085143 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430043A01 product:similar to Calmodulin binding protein kinase [Fugu rubripes], full insert sequence. // chr9 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// BC017634 // GenBank // Mus musculus CaM kinase-like vesicle-associated, mRNA (cDNA clone MGC:28873 IMAGE:4527857), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC022169 // GenBank HTC // Mus musculus CaM kinase-like vesicle-associated, mRNA (cDNA clone IMAGE:3673685), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC111033 // GenBank // Mus musculus CaM kinase-like vesicle-associated, mRNA (cDNA clone MGC:118008 IMAGE:5368225), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000023864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107907145:107983946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_011634 // RefSeq // Mus musculus TRAF-interacting protein (Traip), mRNA. // chr9 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000049348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107950963:107972268:1 gene:ENSMUSG00000032586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC006929 // GenBank // Mus musculus TRAF-interacting protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:3156502), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC017374 // GenBank // Mus musculus TRAF-interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:13919 IMAGE:3990371), complete cds. // chr9 // 88 // 69 // 21 // 24 // 0 /// U77844 // GenBank // Mus musculus mTRIP (mTRIP) mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 69 // 22 // 24 // 0 /// XM_006511694 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TRAF-interacting protein (Traip), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// XM_006511695 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TRAF-interacting protein (Traip), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// GENSCAN00000023864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107907145:107983946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1
NM_177275 // RefSeq // Mus musculus adhesion molecule with Ig like domain 3 (Amigo3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085060 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:108053159:108055701:1 gene:ENSMUSG00000032593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB167510 // GenBank // Mus musculus ali 3 mRNA for Alivin 3, complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AY237004 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein AMIGO3 (Amigo3) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000023844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108053380:108054906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK129456 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1851 protein. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008243 // RefSeq // Mus musculus macrophage stimulating 1 (hepatocyte growth factor-like) (Mst1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006511640 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus macrophage stimulating 1 (hepatocyte growth factor-like) (Mst1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XR_379755 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus macrophage stimulating 1 (hepatocyte growth factor-like) (Mst1), transcript variant X6, misc_RNA. // chr9 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000035211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:108080436:108085027:1 gene:ENSMUSG00000032591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000160184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:108080483:108082314:1 gene:ENSMUSG00000032591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 92 // 36 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000162886 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:108080454:108084995:1 gene:ENSMUSG00000032591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC010551 // GenBank // Mus musculus macrophage stimulating 1 (hepatocyte growth factor-like), mRNA (cDNA clone MGC:18560 IMAGE:4195560), complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC051393 // GenBank // Mus musculus macrophage stimulating 1 (hepatocyte growth factor-like), mRNA (cDNA clone MGC:59032 IMAGE:5055055), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M74181 // GenBank // Mouse hepatocyte growth factor-like protein mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108080479:108084935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000181473 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:9:108104965:108118343:1 gene:ENSMUSG00000097227 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK154501 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630040L22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT070952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000035227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108290448:108296498:1 gene:ENSMUSG00000032606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC024050 // GenBank // Mus musculus nicolin 1, mRNA (cDNA clone MGC:35757 IMAGE:5133763), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NM_025449 // RefSeq // Mus musculus nicolin 1 (Nicn1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// GENSCAN00000023846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108290591:108301498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001013814 // RefSeq // Mus musculus aminomethyltransferase (Amt), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000035230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:108296870:108301535:1 gene:ENSMUSG00000032607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000160025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:108296853:108301571:1 gene:ENSMUSG00000032607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000160675 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:108296922:108299443:1 gene:ENSMUSG00000032607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 80 // 56 // 12 // 15 // 0 /// BC132277 // GenBank // Mus musculus aminomethyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:163908 IMAGE:40130554), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC132279 // GenBank // Mus musculus aminomethyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:163910 IMAGE:40130556), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108290591:108301498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_016802 // RefSeq // Mus musculus ras homolog gene family, member A (Rhoa), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006511633 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ras homolog gene family, member A (Rhoa), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000007959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108306205:108337939:1 gene:ENSMUSG00000007815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF014371 // GenBank // Mus musculus Rho family GTPase (ArhA) mRNA, complete cds. // chr9 // 83 // 71 // 10 // 12 // 0 /// AF178958 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c Rho family GTPase RhoA mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// AF178959 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 Rho family GTPase RhoA mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// AF178960 // GenBank // Mus musculus strain CD1 Rho family GTPase RhoA mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// AF178961 // GenBank // Mus musculus strain FVB/N Rho family GTPase RhoA mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// BC068115 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member A, mRNA (cDNA clone MGC:92988 IMAGE:6809149), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC096423 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member A, mRNA (cDNA clone MGC:103141 IMAGE:3590185), complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// JN971019 // GenBank // Mus musculus Ras family member A (Rhoa) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000023833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108327586:108340136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1
NM_008160 // RefSeq // Mus musculus glutathione peroxidase 1 (Gpx1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000082429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108339080:108340338:1 gene:ENSMUSG00000063856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK207021 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0106K23, strand:unspecified. // chr9 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC086649 // GenBank // Mus musculus glutathione peroxidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:113778 IMAGE:6819448), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108327586:108340136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_011678 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 4 (proto-oncogene) (Usp4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000035237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108347831:108392529:1 gene:ENSMUSG00000032612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AK220512 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4155 protein. // chr9 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// BC011341 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 4 (proto-oncogene), mRNA (cDNA clone MGC:18374 IMAGE:3661165), complete cds. // chr9 // 95 // 93 // 40 // 42 // 0 /// L00681 // GenBank // Mus musculus Unp mRNA, complete cds. // chr9 // 98 // 100 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000023855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108360029:108391837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0
NM_053216 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700102P08 gene (1700102P08Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006511628 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700102P08 gene (1700102P08Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108392834:108397763:1 gene:ENSMUSG00000032611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK007115 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700102P08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC061048 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700102P08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:74159 IMAGE:6770968), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108395301:108397458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000057265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108436482:108446085:1 gene:ENSMUSG00000050641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048562 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC048562, mRNA (cDNA clone MGC:58561 IMAGE:6703719), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108427681:108446387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_133744 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 71 (Ccdc71), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000061209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108460518:108465945:1 gene:ENSMUSG00000049305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK161396 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930542C24 product:hypothetical Lysine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr9 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// BC018518 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 71, mRNA (cDNA clone MGC:27735 IMAGE:2647509), complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108460561:108478062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 48 // 14 // 15 // 0
NM_008483 // RefSeq // Mus musculus laminin, beta 2 (Lamb2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000065014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108479862:108490530:1 gene:ENSMUSG00000052911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC026051 // GenBank // Mus musculus laminin, beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:13735 IMAGE:4036357), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108480226:108501956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_001168371 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 19 (Usp19), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001168372 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 19 (Usp19), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001168373 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 19 (Usp19), transcript variant 4, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_027804 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 19 (Usp19), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_145407 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 19 (Usp19), transcript variant 5, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000006854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108490676:108501697:1 gene:ENSMUSG00000006676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000085044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108490676:108502333:1 gene:ENSMUSG00000006676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000166103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108490676:108502333:1 gene:ENSMUSG00000006676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108490676:108502333:1 gene:ENSMUSG00000006676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC060613 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 19, mRNA (cDNA clone MGC:79175 IMAGE:6400986), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108480226:108501956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
AK083212 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630028H08 product:hypothetical Glutamine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// NM_001114119 // RefSeq // Mus musculus glutamine-rich 1 (Qrich1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// NM_175143 // RefSeq // Mus musculus glutamine-rich 1 (Qrich1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// XM_006511815 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamine-rich 1 (Qrich1), transcript variant X8, mRNA. // chr9 // 81 // 81 // 30 // 37 // 1 /// ENSMUST00000006851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108517087:108560167:1 gene:ENSMUSG00000006673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// ENSMUST00000112155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108517087:108560167:1 gene:ENSMUSG00000006673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// BC006738 // GenBank // Mus musculus glutamine-rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:7055 IMAGE:3156574), complete cds. // chr9 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// GENSCAN00000023868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108528610:108559438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0
NM_011830 // RefSeq // Mus musculus inosine 5-phosphate dehydrogenase 2 (Impdh2), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000081111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108560534:108565519:1 gene:ENSMUSG00000062867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:100030558:100032102:1 gene:ENSMUSG00000071041 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// BC010314 // GenBank // Mus musculus inosine 5-phosphate dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:6193 IMAGE:2646679), complete cds. // chr9 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// BC052671 // GenBank // Mus musculus inosine 5-phosphate dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:60597 IMAGE:30058399), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// M33934 // GenBank // Mouse IMP dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// M98333 // GenBank // Mus musculus IMP dehydrogenase (IMPD) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108560534:108565519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:100030558:100032102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0
NR_029577 // RefSeq // Mus musculus microRNA 191 (Mir191), microRNA. // chr9 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// mmu-mir-191 // miRBase Micro RNA Database // MI0000233 Mus musculus miR-191 stem-loop // chr9 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// NONMMUT070981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// NONMMUT070982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NR_029947 // RefSeq // Mus musculus microRNA 425 (Mir425), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083645 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:108568777:108568861:1 gene:ENSMUSG00000065579 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-425 // miRBase Micro RNA Database // MI0001447 Mus musculus miR-425 stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026378 // RefSeq // Mus musculus DALR anticodon binding domain containing 3 (Dalrd3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000019183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108569892:108572771:1 gene:ENSMUSG00000019039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC013483 // GenBank // Mus musculus DALR anticodon binding domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:18914 IMAGE:4242135), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000023843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108569911:108572670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000098384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108648840:108650953:1 gene:ENSMUSG00000074075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK139380 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830036F03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK155210 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630208N05 product:hypothetical Bipartite nuclear localization signal/Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr9 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0
NM_020520 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carnitine/acylcarnitine translocase), member 20 (Slc25a20), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000035222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108662098:108684641:1 gene:ENSMUSG00000032602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC029733 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carnitine/acylcarnitine translocase), member 20, mRNA (cDNA clone MGC:25786 IMAGE:4019406), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC052871 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carnitine/acylcarnitine translocase), member 20, mRNA (cDNA clone MGC:60486 IMAGE:30032324), complete cds. // chr9 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// AB017112 // GenBank // Mus musculus mCAC gene, complete cds. // chr9 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108662144:108746994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
NM_008924 // RefSeq // Mus musculus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type II alpha (Prkar2a), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000035220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108692143:108749512:1 gene:ENSMUSG00000032601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF533977 // GenBank // Mus musculus cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory chain mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC075623 // GenBank // Mus musculus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type II alpha, mRNA (cDNA clone MGC:99981 IMAGE:6854057), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC080276 // GenBank // Mus musculus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type II alpha, mRNA (cDNA clone MGC:90594 IMAGE:30354403), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108662144:108746994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
NM_030729 // RefSeq // Mus musculus NCK interacting protein with SH3 domain (Nckipsd), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006511861 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NCK interacting protein with SH3 domain (Nckipsd), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// XM_006511862 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NCK interacting protein with SH3 domain (Nckipsd), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000035218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108808380:108818366:1 gene:ENSMUSG00000032598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF130313 // GenBank // Mus musculus N-WASP binding protein WISH mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC064818 // GenBank // Mus musculus NCK interacting protein with SH3 domain, mRNA (cDNA clone MGC:69996 IMAGE:30292108), complete cds. // chr9 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108808346:108817745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_080437 // RefSeq // Mus musculus cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 3 (flamingo homolog, Drosophila) (Celsr3), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000024238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108826320:108852963:1 gene:ENSMUSG00000023473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AF427498 // GenBank // Mus musculus cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor (Celsr3) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108826320:108849479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0
NM_134420 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 26, member 6 (Slc26a6), mRNA. // chrUn // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000098376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108854037:108912558:1 gene:ENSMUSG00000023259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// AB099881 // GenBank // Mus musculus slc26a6 mRNA for anion exchange transporter, complete cds. // chrUn // 97 // 72 // 32 // 33 // 0 /// AF248494 // GenBank // Mus musculus anion transporter/exchanger-5 SLC26A6B (Slc26a6) mRNA, complete cds. // chrUn // 97 // 85 // 38 // 39 // 0 /// AK053088 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930048H02 product:similar to CHLORIDE-FORMATE EXCHANGER [Mus musculus], full insert sequence. // chrUn // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// AK163670 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B830048C12 product:solute carrier family 26, member 6, full insert sequence. // chrUn // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// AY032863 // GenBank // Mus musculus chloride-formate exchanger mRNA, complete cds. // chrUn // 97 // 85 // 38 // 39 // 0 /// AY049076 // GenBank // Mus musculus anion exchanger SLC26A6a mRNA, complete cds. // chrUn // 97 // 80 // 36 // 37 // 0 /// BC028856 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 26, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:25824 IMAGE:4165725), complete cds. // chrUn // 97 // 85 // 38 // 39 // 0 /// ENSMUST00000188557 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:108854697:108862143:1 gene:ENSMUSG00000023259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000016467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108854165:108915550:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 72 // 33 // 33 // 0
BC111913 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 89, mRNA (cDNA clone MGC:130558 IMAGE:40053443), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_027066 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 89 (Tmem89), mRNA. // chr9 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// ENSMUST00000026744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108914619:108915563:1 gene:ENSMUSG00000025652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// GENSCAN00000016467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108854165:108915550:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_025407 // RefSeq // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 1 (Uqcrc1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000026743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108936648:108949640:1 gene:ENSMUSG00000025651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC018405 // GenBank // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3589384), partial cds. // chr9 // 83 // 40 // 10 // 12 // 0 /// BC030064 // GenBank // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:41051 IMAGE:1400271), complete cds. // chr9 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC022926 // GenBank HTC // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3979720), with apparent retained intron. // chr9 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108936719:108949499:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_007738 // RefSeq // Mus musculus collagen, type VII, alpha 1 (Col7a1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 114 // 114 // 0 /// ENSMUST00000026740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108953745:108984875:1 gene:ENSMUSG00000025650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 114 // 114 // 0 /// ENSMUST00000112070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:108953586:108984875:1 gene:ENSMUSG00000025650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 114 // 114 // 0 /// ENSMUST00000126780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:108969693:108980215:1 gene:ENSMUSG00000025650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 37 // 42 // 42 // 0 /// BC061507 // GenBank // Mus musculus collagen, type VII, alpha 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5347384), partial cds. // chr9 // 98 // 36 // 40 // 41 // 0 /// U32107 // GenBank // Mus musculus type VII collagen (Col7a1) mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 100 // 108 // 114 // 0 /// GENSCAN00000016479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108953745:108986221:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 82 // 92 // 94 // 0
NM_145077 // RefSeq // Mus musculus urocortin 2 (Ucn2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108986163:108987164:1 gene:ENSMUSG00000049699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF331517 // GenBank // Mus musculus urocortin II mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025689 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 51 (Ccdc51), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006512209 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 51 (Ccdc51), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000026735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:109082496:109093363:1 gene:ENSMUSG00000025645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC098221 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 51, mRNA (cDNA clone MGC:106937 IMAGE:949536), complete cds. // chr9 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC116786 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 51, mRNA (cDNA clone MGC:151163 IMAGE:40126105), complete cds. // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC116788 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 51, mRNA (cDNA clone MGC:151165 IMAGE:40126107), complete cds. // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109082692:109092267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0
NM_172775 // RefSeq // Mus musculus plexin B1 (Plxnb1), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006512075 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus plexin B1 (Plxnb1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006512076 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus plexin B1 (Plxnb1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006512077 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus plexin B1 (Plxnb1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000072093 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:109095436:109119911:1 gene:ENSMUSG00000053646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AB072381 // GenBank // Mus musculus Plxnb1 mRNA for plexinB1, complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC026974 // GenBank HTC // Mus musculus plexin B1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5364076), with apparent retained intron. // chr9 // 100 // 34 // 13 // 13 // 0 /// BC150701 // GenBank // Mus musculus plexin B1, mRNA (cDNA clone MGC:183612 IMAGE:9087612), complete cds. // chr9 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000016473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109100078:109117944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0
NM_183136 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 8 (Spink8), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006512398 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 8 (Spink8), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055821 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:109816571:109826633:1 gene:ENSMUSG00000050074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000118732 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:109816627:109826628:1 gene:ENSMUSG00000050074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000154663 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:109812280:109820600:1 gene:ENSMUSG00000050074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC048588 // GenBank // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 8, mRNA (cDNA clone MGC:58632 IMAGE:6707477), complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// DQ437329 // GenBank // Mus musculus serine protease inhibitor Kazal type 8 (Spink8) mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109816762:109820700:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0
NM_007658 // RefSeq // Mus musculus cell division cycle 25A (Cdc25a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000094324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:109875579:109893888:1 gene:ENSMUSG00000032477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC046296 // GenBank // Mus musculus cell division cycle 25 homolog A (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:54695 IMAGE:6486343), complete cds. // chr9 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// U27323 // GenBank // Mus musculus Cdc25a (cdc25a) mRNA, complete cds. // chr9 // 75 // 85 // 21 // 28 // 0 /// AK142334 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430003F23 product:cell division cycle 25 homolog A (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr9 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// GENSCAN00000014050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109875990:109892219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000163190 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:110036742:110072705:1 gene:ENSMUSG00000032479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U08819 // GenBank // Mus musculus microtubule-associated protein 4 (MAP4) mRNA, partial cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109978869:110081742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_140969 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10615 (Gm10615), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110117703:110119916:1 gene:ENSMUSG00000074056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK133660 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330432K12 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166273 // RefSeq // Mus musculus chondroitin sulfate proteoglycan 5 (Cspg5), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NM_013884 // RefSeq // Mus musculus chondroitin sulfate proteoglycan 5 (Cspg5), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000035058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110243783:110262575:1 gene:ENSMUSG00000032482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AF133700 // GenBank // Mus musculus neuroglycan C mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// AF461090 // GenBank // Mus musculus chondroitin sulfate proteoglycan 5-I (Cspg5) mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0 /// AF461091 // GenBank // Mus musculus chondroitin sulfate proteoglycan 5-II (Cspg5) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// AF461092 // GenBank // Mus musculus chondroitin sulfate proteoglycan 5-III (Cspg5) mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// BC055736 // GenBank // Mus musculus chondroitin sulfate proteoglycan 5, mRNA (cDNA clone MGC:67000 IMAGE:6412504), complete cds. // chr9 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AK031799 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330400G05 product:chondroitin sulfate proteoglycan 5, full insert sequence. // chr9 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// AK053891 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130318K13 product:chondroitin sulfate proteoglycan 5, full insert sequence. // chr9 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// GENSCAN00000014043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110132117:110262221:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 71 // 71 // 27 // 38 // 1 /// NONMMUT071069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NM_001081381 // RefSeq // Mus musculus elongator acetyltransferase complex subunit 6 (Elp6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006512297 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus elongator acetyltransferase complex subunit 6 (Elp6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000068071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110305192:110322092:1 gene:ENSMUSG00000054836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC048732 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610002I17, mRNA (cDNA clone MGC:59622 IMAGE:6512688), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110305296:110320943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001001144 // RefSeq // Mus musculus SREBF chaperone (Scap), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NM_001103162 // RefSeq // Mus musculus SREBF chaperone (Scap), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006512083 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SREBF chaperone (Scap), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006512084 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SREBF chaperone (Scap), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000098350 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:110333356:110384946:1 gene:ENSMUSG00000032485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AK172912 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0199 protein. // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC070437 // GenBank // Mus musculus SREBF chaperone, mRNA (cDNA clone MGC:99872 IMAGE:30535805), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC072633 // GenBank // Mus musculus SREBF chaperone, mRNA (cDNA clone MGC:99913 IMAGE:6849461), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000014036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110353043:110384801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// BC011508 // GenBank HTC // Mus musculus SREBF chaperone, mRNA (cDNA clone IMAGE:3156282), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr9 // 92 // 28 // 12 // 13 // 0
NM_008694 // RefSeq // Mus musculus neutrophilic granule protein (Ngp), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:110419750:110423010:1 gene:ENSMUSG00000032484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK009649 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310036H10 product:neutrophilic granule protein, full insert sequence. // chr9 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC119403 // GenBank // Mus musculus neutrophilic granule protein, mRNA (cDNA clone MGC:155719 IMAGE:8734152), complete cds. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC119405 // GenBank // Mus musculus neutrophilic granule protein, mRNA (cDNA clone MGC:155721 IMAGE:8734154), complete cds. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// L37297 // GenBank // Mus musculus (clone B6) myeloid secondary granule protein mRNA. // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// U95002 // GenBank // Mus musculus myeloid bactenecin (F1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110419862:110422409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001081340 // RefSeq // Mus musculus SET domain containing 2 (Setd2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_379868 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SET domain containing 2 (Setd2), transcript variant X9, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000153838 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:110532597:110618633:1 gene:ENSMUSG00000044791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000156419 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:110561122:110567942:1 gene:ENSMUSG00000044791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000173288 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:110551296:110564612:1 gene:ENSMUSG00000044791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000173373 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:110547970:110618614:1 gene:ENSMUSG00000044791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000132532 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:110561204:110570735:1 gene:ENSMUSG00000044791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// AK014960 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921524K10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000014044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110546893:110617979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_028312 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 12 (Ccdc12), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000019803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110656503:110711590:1 gene:ENSMUSG00000019659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC026668 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:37643 IMAGE:5006213), complete cds. // chr9 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110656563:110711333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1
NM_010859 // RefSeq // Mus musculus myosin, light polypeptide 3 (Myl3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000079784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:110763646:110769804:1 gene:ENSMUSG00000059741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124267 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:110765861:110769736:1 gene:ENSMUSG00000059741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000136695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:110766156:110769671:1 gene:ENSMUSG00000059741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC061222 // GenBank // Mus musculus myosin, light polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:74371 IMAGE:30297023), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000153142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:110769001:110769794:1 gene:ENSMUSG00000059741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000028704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110757902:110769443:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// NONMMUT071086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_153099 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 42 (Prss42), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000035715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110798185:110803736:1 gene:ENSMUSG00000044664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB052292 // GenBank // Mus musculus mRNA for testis serine protease2, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC060984 // GenBank // Mus musculus testis serine protease 2, mRNA (cDNA clone MGC:74079 IMAGE:6774705), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110780713:110864517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_148940 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 44 (Prss44), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006512314 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 44 (Prss44), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 85 // 63 // 17 // 20 // 0 /// XM_006512315 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 44 (Prss44), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 90 // 63 // 18 // 20 // 0 /// XM_006512316 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 44 (Prss44), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000098345 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:110813994:110817999:1 gene:ENSMUSG00000032493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000141089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:110814027:110824523:1 gene:ENSMUSG00000032493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AB047758 // GenBank // Mus musculus mRNA for serine protease-like 1, complete cds. // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AB162857 // GenBank // Mus musculus TESSP-4 mRNA for testis specific serine protease 4, complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB047759 // GenBank // Mus musculus mRNA, serine protease-like gene spliced variant-2. // chr9 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000028696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110780713:110864517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_199471 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 43 (Prss43), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000077549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110826690:110831502:1 gene:ENSMUSG00000058398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110780713:110864517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_153172 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 45 (Prss45), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000011391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:110834588:110841313:1 gene:ENSMUSG00000047257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000146794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:110834588:110841313:1 gene:ENSMUSG00000047257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AF392062 // GenBank // Mus musculus trypsin-like protease p98 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107230 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC107230, mRNA (cDNA clone MGC:130165 IMAGE:40052042), complete cds. // chr9 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC107231 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC107230, mRNA (cDNA clone MGC:130166 IMAGE:40052043), complete cds. // chr9 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110780713:110864517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_183103 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 46 (Prss46), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119427 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:110849538:110856518:1 gene:ENSMUSG00000049719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000176403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:110844506:110856522:1 gene:ENSMUSG00000049719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC087878 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700112C13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107146 IMAGE:30284660), complete cds. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110780713:110864517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_146227 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 50 (Prss50), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006512099 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 50 (Prss50), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000051097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110857967:110864628:1 gene:ENSMUSG00000048752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF481144 // GenBank // Mus musculus TSP50 (Tsp50) mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC150686 // GenBank // Mus musculus testes-specific protease 50, mRNA (cDNA clone MGC:183597 IMAGE:9087597), complete cds. // chr9 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110780713:110864517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_028838 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 2 (Lrrc2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006512363 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 2 (Lrrc2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006512364 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 2 (Lrrc2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000035076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110951545:110984066:1 gene:ENSMUSG00000032495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110957822:110986981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
AK131745 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700061E17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000185439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:110986201:110987804:1 gene:ENSMUSG00000102060 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT071093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
XR_406047 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10030 (Gm10030), transcript variant X1, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_406049 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10030 (Gm10030), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000080872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:111004811:111006830:1 gene:ENSMUSG00000057802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// AK086953 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030015K02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_406050 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10030 (Gm10030), transcript variant X4, misc_RNA. // chr9 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_008522 // RefSeq // Mus musculus lactotransferrin (Ltf), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000035077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:111019292:111042766:1 gene:ENSMUSG00000032496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC006904 // GenBank // Mus musculus lactotransferrin, mRNA (cDNA clone MGC:11944 IMAGE:3600033), complete cds. // chr9 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// BC009662 // GenBank // Mus musculus lactotransferrin, mRNA (cDNA clone IMAGE:3485548), partial cds. // chr9 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// CT010339 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G0452D for gene Ltf, Lactotransferrin; complete cds, incl. stopcodon. // chr9 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// D88510 // GenBank // Mus musculus mRNA for lactoferrin, complete cds. // chr9 // 94 // 89 // 32 // 34 // 0 /// FJ538998 // GenBank // Mus musculus lactoferrin mRNA, complete cds. // chr9 // 91 // 89 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000028699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:111019326:111042182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_001164838 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 2 (Lrrfip2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 34 // 34 // 0 /// NM_027742 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 2 (Lrrfip2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 70 // 33 // 33 // 0 /// XM_006512281 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 2 (Lrrfip2), transcript variant X18, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// XM_006512287 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 2 (Lrrfip2), transcript variant X24, mRNA. // chr9 // 100 // 62 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000035078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:111118111:111225668:1 gene:ENSMUSG00000032497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000098340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:111118111:111225668:1 gene:ENSMUSG00000032497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 33 // 33 // 0 /// BC014761 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:25637 IMAGE:4217995), complete cds. // chr9 // 100 // 64 // 30 // 30 // 0 /// XM_006512286 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 2 (Lrrfip2), transcript variant X23, mRNA. // chr9 // 60 // 60 // 28 // 47 // 1 /// GENSCAN00000028684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:111141243:111224060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 30 // 30 // 0
NM_175266 // RefSeq // Mus musculus EPM2A (laforin) interacting protein 1 (Epm2aip1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000060711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:111271945:111279097:1 gene:ENSMUSG00000046785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000135807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:111271929:111279089:1 gene:ENSMUSG00000046785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC018474 // GenBank // Mus musculus EPM2A (laforin) interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:27780 IMAGE:3156440), complete cds. // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:111271961:111273781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0
NM_001164659 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 (Trank1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006512164 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 (Trank1), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XR_379872 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 (Trank1), transcript variant X8, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000078626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:111311739:111395774:1 gene:ENSMUSG00000062296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK048832 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230073N20 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000028689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:111298008:111403538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT071106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_001164659 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 (Trank1), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000078626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:111311739:111395774:1 gene:ENSMUSG00000062296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK129119 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0342 protein. // chr9 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC086653 // GenBank // Mus musculus lupus brain antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:113752 IMAGE:30536238), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006512164 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 (Trank1), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// XR_379872 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 (Trank1), transcript variant X8, misc_RNA. // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000028689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:111298008:111403538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_172928 // RefSeq // Mus musculus doublecortin-like kinase 3 (Dclk3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111879 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:111439081:111489608:1 gene:ENSMUSG00000032500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056929 // GenBank // Mus musculus doublecortin-like kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:66532 IMAGE:6816292), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// DQ286388 // GenBank // Mus musculus CLICK-I,II-related protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:111439265:111488670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000004465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:113509859:113531236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
XM_006512408 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain-containing protein 36A-like (LOC102631503), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_486266 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4921528I07 gene (4921528I07Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 75 // 96 // 18 // 24 // 0 /// ENSMUST00000072612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:114276683:114317028:-1 gene:ENSMUSG00000064299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 75 // 96 // 18 // 24 // 0 /// AK077029 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932416M14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 63 // 96 // 15 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114130985:114191425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_007535 // RefSeq // Mus musculus B cell leukemia/lymphoma 2 related protein A1c (Bcl2a1c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000066460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:114330135:114330578:1 gene:ENSMUSG00000053820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC120720 // GenBank // Mus musculus B-cell leukemia/lymphoma 2 related protein A1c, mRNA (cDNA clone MGC:155957 IMAGE:40129643), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000131898 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:114368416:114371164:1 gene:ENSMUSG00000074039 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK040958 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530051I10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC020150 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 4930520O04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4016483), with apparent retained intron. // chr9 // 79 // 90 // 15 // 19 // 0 /// NONMMUT071206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT071201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// NONMMUT071207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// NONMMUT071202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_009752 // RefSeq // Mus musculus galactosidase, beta 1 (Glb1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NR_108101 // RefSeq // Mus musculus galactosidase, beta 1 (Glb1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NR_108102 // RefSeq // Mus musculus galactosidase, beta 1 (Glb1), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000063042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:114401076:114474376:1 gene:ENSMUSG00000045594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK048460 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130062G03 product:galactosidase, beta 1, full insert sequence. // chr9 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// BC028875 // GenBank // Mus musculus galactosidase, beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:25403 IMAGE:4240285), complete cds. // chr9 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// M57734 // GenBank // Mouse beta-galactosidase (BGAL) gene, complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK042069 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630055M18 product:galactosidase, beta 1, full insert sequence. // chr9 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// AK034049 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330151I20 product:galactosidase, beta 1, full insert sequence. // chr9 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// AK167271 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0048K16 product:galactosidase, beta 1, full insert sequence. // chr9 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// GENSCAN00000046567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114401192:114491192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1
NM_001200002 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein with metallophosphoesterase domain (Tmppe), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:114401095:114411200:1 gene:ENSMUSG00000079260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114401192:114491192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
ENSMUST00000180393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:114515697:114516424:1 gene:ENSMUSG00000097821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK048065 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130032M10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000046559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114563467:114564330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146229 // RefSeq // Mus musculus dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1 (Dync1li1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:114688790:114724302:1 gene:ENSMUSG00000032435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC023347 // GenBank // Mus musculus dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:32416 IMAGE:5040044), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AK082950 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530020B06 product:DYNEIN LIGHT INTERMEDIATE CHAIN 1 homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114688882:114723365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
BC005774 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:12006 IMAGE:3602466, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026036 // RefSeq // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 6 (Cmtm6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:114731203:114749343:1 gene:ENSMUSG00000032434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY241868 // GenBank // Mus musculus chemokine-like factor superfamily 6 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027248 // GenBank // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:27767 IMAGE:2811938), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114731236:114746576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000150678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:114780100:114782257:1 gene:ENSMUSG00000052724 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK042275 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630077M18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT071215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AK144086 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G130205P11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AK016943 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933427C01 product:hypothetical Arginine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000024443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:115405269:115434985:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0
NM_028638 // RefSeq // Mus musculus glutamate decarboxylase-like 1 (Gadl1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006512318 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate decarboxylase-like 1 (Gadl1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006512319 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate decarboxylase-like 1 (Gadl1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000069651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:115909455:116076176:1 gene:ENSMUSG00000056880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119291 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:115909455:116041216:1 gene:ENSMUSG00000056880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000121770 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:115937142:116074347:1 gene:ENSMUSG00000056880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC052327 // GenBank // Mus musculus glutamate decarboxylase-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6313667), partial cds. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006512320 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate decarboxylase-like 1 (Gadl1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:115872410:115966404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSMUST00000173358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:117402979:117404342:1 gene:ENSMUSG00000092504 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// NONMMUT071294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0
NM_001164789 // RefSeq // Mus musculus eomesodermin homolog (Xenopus laevis) (Eomes), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_010136 // RefSeq // Mus musculus eomesodermin homolog (Xenopus laevis) (Eomes), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000035020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:118478344:118486132:1 gene:ENSMUSG00000032446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000111763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:118478212:118485366:1 gene:ENSMUSG00000032446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150633 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:118478861:118482757:1 gene:ENSMUSG00000032446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// AB031037 // GenBank // Mus musculus mRNA for Tbr2, complete cds. // chr9 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// AK043327 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730085J21 product:eomesodermin homolog (Xenopus laevis), full insert sequence. // chr9 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// BC094319 // GenBank // Mus musculus eomesodermin homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:106424 IMAGE:5721456), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AK134951 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430526G07 product:eomesodermin homolog (Xenopus laevis), full insert sequence. // chr9 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// GENSCAN00000046539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:118478660:118560920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_018748 // RefSeq // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 4 (Golga4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006512196 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 4 (Golga4), transcript variant X10, mRNA. // chr9 // 100 // 54 // 26 // 26 // 0 /// XR_379873 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 4 (Golga4), transcript variant X11, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XR_379874 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 4 (Golga4), transcript variant X12, misc_RNA. // chr9 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000084820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:118506318:118582522:1 gene:ENSMUSG00000038708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AF051357 // GenBank // Mus musculus golgi autoantigen golgin subtype a4 (Golga4) mRNA, complete cds. // chr9 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// BC053000 // GenBank // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:6406207), partial cds. // chr9 // 100 // 38 // 18 // 18 // 0 /// AK172292 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830113L12 product:golgi autoantigen, golgin subfamily a, 4, full insert sequence. // chr9 // 19 // 19 // 9 // 48 // 1 /// GENSCAN00000046539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:118478660:118560920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:118565548:118607119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1
NM_133721 // RefSeq // Mus musculus integrin alpha 9 (Itga9), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000044165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:118606690:118901003:1 gene:ENSMUSG00000039115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:118711657:118897723:1 gene:ENSMUSG00000039115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AK139690 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020011E01 product:integrin alpha 9, full insert sequence. // chr9 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC150824 // GenBank // Mus musculus integrin alpha 9, mRNA (cDNA clone MGC:183735 IMAGE:9087735), complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NM_001113514 // RefSeq // Mus musculus integrin alpha 9 (Itga9), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000028300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:118622502:118707681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:118765638:118850860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
NM_133710 // RefSeq // Mus musculus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase-like (Ctdspl), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000073109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:118926453:119043998:1 gene:ENSMUSG00000047409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000172464 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:118926862:119040649:1 gene:ENSMUSG00000047409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000174841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:118929867:119033628:1 gene:ENSMUSG00000047409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC094289 // GenBank // Mus musculus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase-like, mRNA (cDNA clone MGC:106333 IMAGE:4986338), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000174132 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:119033001:119040909:1 gene:ENSMUSG00000047409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// AK142857 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930031A22 product:CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase-like, full insert sequence. // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000028297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:118926862:119071247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NR_029742 // RefSeq // Mus musculus microRNA 26a-1 (Mir26a-1), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083579 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:119031796:119031885:1 gene:ENSMUSG00000065513 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-26a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000573 Mus musculus miR-26a-1 stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177117 // RefSeq // Mus musculus deleted in lung and esophageal cancer 1 (Dlec1), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006512158 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus deleted in lung and esophageal cancer 1 (Dlec1), transcript variant X7, mRNA. // chr9 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000055775 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:119102509:119134692:1 gene:ENSMUSG00000038060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000124213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:119102478:119125295:1 gene:ENSMUSG00000038060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000137047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:119119654:119144280:1 gene:ENSMUSG00000038060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140326 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:119102478:119148246:1 gene:ENSMUSG00000038060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000165231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119102478:119147694:1 gene:ENSMUSG00000038060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AK045848 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230314N17 product:similar to DELETED IN LUNG AND ESOPHAGEAL CANCER 1 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// BC145278 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053832. // chr9 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119102515:119147694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000093527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119159161:119161669:1 gene:ENSMUSG00000074029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK156945 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830109D05 product:hypothetical Histidine-rich region profile/MutS III containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_130864 // RefSeq // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acyltransferase 1A (Acaa1a), mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// XM_006511923 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acetyl-Coenzyme A acyltransferase 1A (Acaa1a), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000039784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:119341294:119350299:1 gene:ENSMUSG00000036138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000175743 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:119341515:119350033:1 gene:ENSMUSG00000036138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000176397 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:119341515:119350033:1 gene:ENSMUSG00000036138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000176796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:119341414:119350298:1 gene:ENSMUSG00000036138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// AY273811 // GenBank // Mus musculus 3-ketoacyl-CoA thiolase A mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC012400 // GenBank // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acyltransferase 1A, mRNA (cDNA clone MGC:7090 IMAGE:3157389), complete cds. // chr9 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000177463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:119341047:119347783:1 gene:ENSMUSG00000036138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// GENSCAN00000028302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119341515:119350033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_001033209 // RefSeq // Mus musculus xylulokinase homolog (H. influenzae) (Xylb), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NM_001199568 // RefSeq // Mus musculus xylulokinase homolog (H. influenzae) (Xylb), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006511909 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus xylulokinase homolog (H. influenzae) (Xylb), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000039610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119357381:119393797:1 gene:ENSMUSG00000035769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC080743 // GenBank // Mus musculus xylulokinase homolog (H. influenzae), mRNA (cDNA clone IMAGE:30470832), partial cds. // chr9 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC138244 // GenBank // Mus musculus xylulokinase homolog (H. influenzae), mRNA (cDNA clone MGC:169868 IMAGE:8861263), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC138247 // GenBank // Mus musculus xylulokinase homolog (H. influenzae), mRNA (cDNA clone MGC:169871 IMAGE:8861266), complete cds. // chr9 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000028299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119357606:119433461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1
NM_007397 // RefSeq // Mus musculus activin receptor IIB (Acvr2b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006511925 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus activin receptor IIB (Acvr2b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000035093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119402444:119433501:1 gene:ENSMUSG00000061393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000165044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119402501:119433501:1 gene:ENSMUSG00000061393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK137432 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630058O11 product:activin receptor IIB, full insert sequence. // chr9 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// BC106189 // GenBank // Mus musculus activin receptor IIB, mRNA (cDNA clone MGC:118477 IMAGE:30240596), complete cds. // chr9 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// M84120 // GenBank // Mouse activin receptor (ActR IIB) mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000028299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119357606:119433461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_001172136 // RefSeq // Mus musculus endo/exonuclease (5-3), endonuclease G-like (Exog), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_172456 // RefSeq // Mus musculus endo/exonuclease (5-3), endonuclease G-like (Exog), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006512015 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endo/exonuclease (5-3), endonuclease G-like (Exog), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000035094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119444923:119465517:1 gene:ENSMUSG00000042787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000164213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119444951:119464230:1 gene:ENSMUSG00000042787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC064730 // GenBank // Mus musculus endonuclease G-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30009410), partial cds. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC119024 // GenBank // Mus musculus endo/exonuclease (5-3), endonuclease G-like, mRNA (cDNA clone MGC:155340 IMAGE:8733773), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119444988:119462837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_026236 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 48 (Wdr48), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006512246 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 48 (Wdr48), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000036561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119894895:119926579:1 gene:ENSMUSG00000032512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK122511 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1449 protein. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC048155 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 48, mRNA (cDNA clone MGC:61205 IMAGE:5698339), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC062967 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 48, mRNA (cDNA clone MGC:64692 IMAGE:6835444), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK035864 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630012C05 product:hypothetical Trp-Asp (WD) repeats profile/Trp-Asp (WD) repeats circular profile/G-protein beta WD-40 repeats containing protein, full insert sequence. // chr9 // 83 // 83 // 33 // 40 // 1 /// BC021348 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3991696, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr9 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1 /// GENSCAN00000014921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119895224:119925606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
NM_028735 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 21A (Ttc21a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000035100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:119937606:119967793:1 gene:ENSMUSG00000032514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000159128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:119937635:119967053:1 gene:ENSMUSG00000032514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:119937636:119962676:1 gene:ENSMUSG00000032514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AK133304 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932431P04 product:Hypothetical tetratricopeptide repeat homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK163163 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730057N22 product:Hypothetical tetratricopeptide repeat homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// BC133699 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 21A, mRNA (cDNA clone MGC:156869 IMAGE:40098338), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// DQ011665 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat-containing hedgehog modulator 2 (Thm2) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119939146:119967674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_007720 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 8 (Ccr8), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:120092133:120094906:1 gene:ENSMUSG00000042262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC101966 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 8, mRNA (cDNA clone MGC:123958 IMAGE:40044931), complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC101967 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 8, mRNA (cDNA clone MGC:123959 IMAGE:40044932), complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC103566 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 8, mRNA (cDNA clone MGC:123960 IMAGE:40044933), complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC103567 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 8, mRNA (cDNA clone MGC:123961 IMAGE:40044935), complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:120093833:120094882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000083107 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:120128780:120128935:1 gene:ENSMUSG00000065041 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT071384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000082446 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:120129351:120129553:1 gene:ENSMUSG00000064380 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002902 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 62 (Snora62), small nucleolar RNA. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000082991 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:120130415:120130563:1 gene:ENSMUSG00000064925 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0
GENSCAN00000014916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:120246910:120316836:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_026892 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1B (Eif1b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000007139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:120492606:120495327:1 gene:ENSMUSG00000006941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC030319 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1B, mRNA (cDNA clone MGC:40900 IMAGE:5372299), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC033505 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1B, mRNA (cDNA clone MGC:36534 IMAGE:4209443), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:120486214:120566542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
GENSCAN00000014931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:120486214:120566542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_178676 // RefSeq // Mus musculus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 (Entpd3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:120539818:120568318:1 gene:ENSMUSG00000041608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY376710 // GenBank // Mus musculus nucleoside triphosphate diphosphohydrolase-3 (Entpd3) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AY714060 // GenBank // Mus musculus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 (Entpd3) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC079871 // GenBank // Mus musculus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3, mRNA (cDNA clone MGC:105163 IMAGE:6831925), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:120486214:120566542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_025974 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L14 (Rpl14), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000165532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:120571517:120574653:1 gene:ENSMUSG00000025794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NR_073359 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5830454E08 gene (5830454E08Rik), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:120577346:120578072:1 gene:ENSMUSG00000052658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100520 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830454E08 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30919715). // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011703 // RefSeq // Mus musculus vasoactive intestinal peptide receptor 1 (Vipr1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000035115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:121642716:121672954:1 gene:ENSMUSG00000032528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF266282 // GenBank // Mus musculus vasoactive intestinal peptide receptor type 1 (Vipr1) mRNA, complete cds. // chr9 // 81 // 87 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:121633431:121681186:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
NM_011703 // RefSeq // Mus musculus vasoactive intestinal peptide receptor 1 (Vipr1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:121642716:121672954:1 gene:ENSMUSG00000032528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026794 // RefSeq // Mus musculus differentially expressed in B16F10 1 (Deb1), mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121710389:121712921:1 gene:ENSMUSG00000032526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AK078209 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430511E04 product:RIKEN cDNA 1110020I04 gene, full insert sequence. // chr9 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC027548 // GenBank // Mus musculus differentially expressed in B16F10 1, mRNA (cDNA clone MGC:41296 IMAGE:1532650), complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AK049702 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530043B20 product:RIKEN cDNA 1110020I04 gene, full insert sequence. // chr9 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// AK085962 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830034O20 product:RIKEN cDNA 1110020I04 gene, full insert sequence. // chr9 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// NONMMUT071431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONMMUT071432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// GENSCAN00000034785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:121693857:121767769:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001166644 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 651 (Zfp651), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006512144 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 651 (Zfp651), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000093772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121760033:121771742:1 gene:ENSMUSG00000013419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC030045 // GenBank HTC // Mus musculus zinc finger protein 651, mRNA (cDNA clone IMAGE:1054711), with apparent retained intron. // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000034785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:121693857:121767769:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_028202 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 40 (Klhl40), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006512296 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch-like 40 (Klhl40), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000098272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121777607:121783819:1 gene:ENSMUSG00000074001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC125576 // GenBank // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:159279 IMAGE:40130091), complete cds. // chr9 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// BC137889 // GenBank // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:169513 IMAGE:8860908), complete cds. // chr9 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000034787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:121777776:121783399:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 65 // 19 // 20 // 0
NM_001276719 // RefSeq // Mus musculus atypical chemokine receptor 2 (Ackr2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_021609 // RefSeq // Mus musculus atypical chemokine receptor 2 (Ackr2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006512203 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus atypical chemokine receptor 2 (Ackr2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000050327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121898464:121911064:1 gene:ENSMUSG00000044534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC113146 // GenBank // Mus musculus chemokine binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:130576 IMAGE:40055448), complete cds. // chr9 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0 /// Y12879 // GenBank // M.musculus mRNA for beta-chemokine receptor D6. // chr9 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0
NR_033553 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700048O20 gene (1700048O20Rik), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121938135:121947014:1 gene:ENSMUSG00000043773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC059052 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6818969, partial cds. // chr9 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// AK006734 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700048O20 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001199927 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 198, member A (Fam198a), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NM_177743 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 198, member A (Fam198a), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006512132 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 198, member A (Fam198a), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000043011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121950988:121980208:1 gene:ENSMUSG00000038233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK050223 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730027P07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC113767 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C730027P07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130602 IMAGE:40058404), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:121926428:121978432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_026179 // RefSeq // Mus musculus abhydrolase domain containing 5 (Abhd5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000035128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:122351730:122379825:1 gene:ENSMUSG00000032540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000156520 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:122351608:122381524:1 gene:ENSMUSG00000032540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000175973 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:122351732:122377932:1 gene:ENSMUSG00000032540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AK152717 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830083B12 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC037063 // GenBank // Mus musculus abhydrolase domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:46776 IMAGE:4985992), complete cds. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000111497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:122351730:122381524:1 gene:ENSMUSG00000032540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000034768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:122350040:122379602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NR_029819 // RefSeq // Mus musculus microRNA 138-1 (Mir138-1), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000083480 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:122682876:122682974:1 gene:ENSMUSG00000065414 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:122682832:122696825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// mmu-mir-138-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000722 Mus musculus miR-138-1 stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT071483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001199736 // RefSeq // Mus musculus testis and ovary specific PAZ domain containing 1 (Topaz1), mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000178679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:122747346:122802074:1 gene:ENSMUSG00000094985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// HM631980 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J topaz 1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT071487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000033028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:122747346:122834976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001013405 // RefSeq // Mus musculus T cell activation inhibitor, mitochondrial (Tcaim), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006512172 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T cell activation inhibitor, mitochondrial (Tcaim), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000052740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:122805539:122836334:1 gene:ENSMUSG00000046603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000136274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:122805596:122836327:1 gene:ENSMUSG00000046603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC080690 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 9, ERATO Doi 402, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:91156 IMAGE:30111134), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000149659 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:122805561:122811859:1 gene:ENSMUSG00000046603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000033028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:122747346:122834976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONMMUT071489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001177505 // RefSeq // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 7 (Zkscan7), mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000063980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:122888471:122896124:1 gene:ENSMUSG00000063488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC119591 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 167, mRNA (cDNA clone MGC:141368 IMAGE:40058904), complete cds. // chr9 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// BC042569 // GenBank HTC // Mus musculus zinc finger protein 167, mRNA (cDNA clone IMAGE:3994925), with apparent retained intron. // chr9 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:122886890:122912992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_006512420 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 660-like (LOC102639251), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009544 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 105 (Zfp105), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_379866 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 105 (Zfp105), transcript variant X1, misc_RNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000051667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:122923072:122931028:1 gene:ENSMUSG00000057895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148851 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:122923099:122929678:1 gene:ENSMUSG00000057895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AF045565 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 105 (Zfp105) mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC052165 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 105, mRNA (cDNA clone MGC:59371 IMAGE:6515711), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:122920459:122933489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_010620 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 15 (Kif15), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000040717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:122951081:123018725:1 gene:ENSMUSG00000036768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK050821 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030022H04 product:kinesin 15, full insert sequence. // chr9 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// BC060710 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 15, mRNA (cDNA clone MGC:67256 IMAGE:6409082), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000033046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:122958737:123066873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_001164823 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 42 (Tmem42), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NM_025339 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 42 (Tmem42), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006512206 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 42 (Tmem42), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000084733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:123021326:123023490:1 gene:ENSMUSG00000066233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049583 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 42, mRNA (cDNA clone MGC:58206 IMAGE:6742203), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:122958737:123066873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_177911 // RefSeq // Mus musculus transglutaminase 4 (prostate) (Tgm4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006512168 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transglutaminase 4 (prostate) (Tgm4), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000026893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:123034741:123067561:1 gene:ENSMUSG00000025787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF486627 // GenBank // Mus musculus experimental autoimmune prostatitis antigen 1 (Eapa1) mRNA, complete cds. // chr9 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// BC141297 // GenBank // Mus musculus transglutaminase 4 (prostate), mRNA (cDNA clone MGC:176258 IMAGE:9055909), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC145622 // GenBank // Mus musculus transglutaminase 4 (prostate), mRNA (cDNA clone MGC:179198 IMAGE:9054190), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000128572 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:123040432:123049035:1 gene:ENSMUSG00000025787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000033046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:122958737:123066873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_011606 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 3, member b (Clec3b), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000026890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:123150946:123157430:1 gene:ENSMUSG00000025784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC035043 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 3, member b, mRNA (cDNA clone MGC:41135 IMAGE:1313548), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U08595 // GenBank // Mus musculus tetranectin mRNA, complete cds. // chr9 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:123112832:123157147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_153168 // RefSeq // Mus musculus leucyl-tRNA synthetase, mitochondrial (Lars2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006511907 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucyl-tRNA synthetase, mitochondrial (Lars2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000038863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:123366940:123462664:1 gene:ENSMUSG00000035202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AJ428066 // GenBank // Mus musculus mRNA for leucyl-tRNA synthetase (Kiaa0028 gene). // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC080303 // GenBank // Mus musculus leucyl-tRNA synthetase, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:90750 IMAGE:5695617), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC111892 // GenBank // Mus musculus leucyl-tRNA synthetase, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:132906 IMAGE:40060998), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC112412 // GenBank // Mus musculus leucyl-tRNA synthetase, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:132905 IMAGE:40060997), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC138206 // GenBank // Mus musculus leucyl-tRNA synthetase, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:169830 IMAGE:8861225), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC145982 // GenBank // Mus musculus leucyl-tRNA synthetase, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:175869 IMAGE:40131285), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000033014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:123310351:123461678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0
NM_013860 // RefSeq // Mus musculus LIM domains containing 1 (Limd1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000026269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:123478701:123521548:1 gene:ENSMUSG00000025239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK083970 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130070L13 product:LIM DOMAINS CONTAINING PROTEIN 1 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC056449 // GenBank // Mus musculus LIM domains containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:66994 IMAGE:5703026), complete cds. // chr9 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:123469424:123519243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_030692 // RefSeq // Mus musculus SAC1 (suppressor of actin mutations 1, homolog)-like (S. cerevisiae) (Sacm1l), mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000026270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:123529882:123592598:1 gene:ENSMUSG00000025240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AJ245720 // GenBank // Mus musculus mRNA for suppressor of actin mutations (SAC1 gene). // chr9 // 95 // 95 // 40 // 42 // 0 /// AK122390 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0851 protein. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC005489 // GenBank // Mus musculus SAC1 (suppressor of actin mutations 1, homolog)-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:3486559), partial cds. // chr9 // 78 // 52 // 18 // 23 // 0 /// BC117752 // GenBank // Mus musculus SAC1 (suppressor of actin mutations 1, homolog)-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:143539 IMAGE:40090556), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// BC117753 // GenBank // Mus musculus SAC1 (suppressor of actin mutations 1, homolog)-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:143540 IMAGE:40090558), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000033017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:123529890:123590148:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0
NM_030712 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 6 (Cxcr6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:123806477:123811754:1 gene:ENSMUSG00000048521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF301018 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 chemokine receptor CXCR6 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AF305709 // GenBank // Mus musculus putative chemokine receptor mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC096491 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:106340 IMAGE:30748222), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:123809915:123810991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_009914 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 3 (Ccr3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006512424 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 3 (Ccr3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000039171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:124021971:124031689:1 gene:ENSMUSG00000035448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC108967 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:124265 IMAGE:40047217), complete cds. // chr9 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC108968 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:124266 IMAGE:40047218), complete cds. // chr9 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_009917 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 5 (Ccr5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111442 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:124121543:124127182:1 gene:ENSMUSG00000079227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC103574 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:124081 IMAGE:40045779), complete cds. // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC103586 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:124083 IMAGE:40045781), complete cds. // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC103587 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:124082 IMAGE:40045780), complete cds. // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// D83648 // GenBank // Mus musculus mRNA for C-C chemokine receptor 5, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U47036 // GenBank // Mus musculus MIP-1 alpha receptor mRNA, complete cds. // chr9 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// X94151 // GenBank // M.musculus mRNA for MIP-1 alpha receptor 2. // chr9 // 63 // 64 // 10 // 16 // 0 /// GENSCAN00000004928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:124068736:124125426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000048921 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:3133847:3199782:-1 gene:ENSMUSG00000042360 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK015306 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930433N12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000011497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:3495833:3496959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_026276 // RefSeq // Mus musculus aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase (Aasdhppt), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000051589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:4294793:4309494:-1 gene:ENSMUSG00000025894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK088977 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430034F01 product:similar to HSPC223 (ALPHA-AMINOADIPIC SEMIALDEHYDE DEHYDROGENASE-PHOSPHOPANTETHEINYL TRANSFERASE) (HYPOTHETICAL 35.8 KDA PROTEIN) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC030043 // GenBank // Mus musculus aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase, mRNA (cDNA clone MGC:41368 IMAGE:1348651), complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC038013 // GenBank // Mus musculus aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase, mRNA (cDNA clone MGC:47091 IMAGE:3497754), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC049851 // GenBank // Mus musculus aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase, mRNA (cDNA clone MGC:54928 IMAGE:3481972), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:4228812:4310441:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_027942 // RefSeq // Mus musculus DDI1, DNA-damage inducible 1, homolog 1 (S. cerevisiae) (Ddi1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:6265028:6266547:-1 gene:ENSMUSG00000047619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:6265141:6266367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083448 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:6706342:6706446:-1 gene:ENSMUSG00000065382 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032007 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 1b (interstitial collagenase) (Mmp1b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000047888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:7368239:7388047:-1 gene:ENSMUSG00000041620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:7367781:7389519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_007465 // RefSeq // Mus musculus baculoviral IAP repeat-containing 2 (Birc2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000074246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:7818236:7835255:-1 gene:ENSMUSG00000057367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC033480 // GenBank // Mus musculus baculoviral IAP repeat-containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4946907). // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC145985 // GenBank // Mus musculus baculoviral IAP repeat-containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:175872 IMAGE:40131288), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L49433 // GenBank // Mus musculus TNFR2-TRAF signalling complex protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U88909 // GenBank // Mus musculus inhibitor of apoptosis protein 2 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000190341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:7818227:7837057:-1 gene:ENSMUSG00000057367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:7783937:7834478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
ENSMUST00000054878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:7836687:7837064:-1 gene:ENSMUSG00000057367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000049742 // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK021182 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330006D17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189935 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:7835748:7837063:-1 gene:ENSMUSG00000057367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000191248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:7834784:7836805:-1 gene:ENSMUSG00000057367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_007464 // RefSeq // Mus musculus baculoviral IAP repeat-containing 3 (Birc3), mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// XM_006509831 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus baculoviral IAP repeat-containing 3 (Birc3), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// XM_006509832 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus baculoviral IAP repeat-containing 3 (Birc3), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000013949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:7848699:7873024:-1 gene:ENSMUSG00000032000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000115672 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:7855815:7872983:-1 gene:ENSMUSG00000032000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// BC011338 // GenBank // Mus musculus baculoviral IAP repeat-containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:18386 IMAGE:3661563), complete cds. // chr9 // 92 // 67 // 11 // 12 // 0 /// U88908 // GenBank // Mus musculus inhibitor of apoptosis protein 1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// AK156097 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830007P19 product:baculoviral IAP repeat-containing 3, full insert sequence. // chr9 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1
NM_199017 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9230110C19 gene (9230110C19Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509860 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9230110C19 gene (9230110C19Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006509861 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9230110C19 gene (9230110C19Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000065291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:8021672:8042823:-1 gene:ENSMUSG00000053070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC115525 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9230110C19 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40101253), complete cds. // chr9 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// BC133669 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9230110C19 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40101258), complete cds. // chr9 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// BC127165 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9230110C19 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40101251), complete cds. // chr9 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:8013702:8033036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_006509863 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence AK129341 (AK129341), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006509864 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence AK129341 (AK129341), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000037397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:8076633:8134294:-1 gene:ENSMUSG00000040729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK129341 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1377 protein. // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC119072 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AK129341, mRNA (cDNA clone MGC:155388 IMAGE:8733821), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC120489 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AK129341, mRNA (cDNA clone MGC:155726 IMAGE:40129412), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:8071614:8130311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_027823 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 42 (Arhgap42), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000093893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:8994329:9239101:-1 gene:ENSMUSG00000050730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC137891 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9030420J04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169515 IMAGE:8860910), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC137892 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9030420J04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169516 IMAGE:8860911), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000182617 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:9011238:9239101:-1 gene:ENSMUSG00000050730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// AK082857 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330044B16 product:weakly similar to GRAF PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000042085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:8983799:9121753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000183182 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:9147356:9239026:-1 gene:ENSMUSG00000050730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK018520 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030420J04 product:RIKEN cDNA 9030420J04 gene, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_027823 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 42 (Arhgap42), mRNA. // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENSMUST00000093893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:8994329:9239101:-1 gene:ENSMUSG00000050730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENSMUST00000182617 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:9011238:9239101:-1 gene:ENSMUSG00000050730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// AK082857 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330044B16 product:weakly similar to GRAF PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// BC137891 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9030420J04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169515 IMAGE:8860910), complete cds. // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// BC137892 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9030420J04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169516 IMAGE:8860911), complete cds. // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000042093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:9155089:9238779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001033359 // RefSeq // Mus musculus contactin 5 (Cntn5), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// NM_001170787 // RefSeq // Mus musculus contactin 5 (Cntn5), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006509869 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus contactin 5 (Cntn5), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006509870 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus contactin 5 (Cntn5), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000074133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:9661363:10419090:-1 gene:ENSMUSG00000039488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000160216 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:9660969:10904775:-1 gene:ENSMUSG00000039488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000162484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:9660891:10904726:-1 gene:ENSMUSG00000039488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000179049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:9661363:10419090:-1 gene:ENSMUSG00000039488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000006784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:9970503:10056697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// GENSCAN00000042087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:9661293:9800603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1
GENSCAN00000006786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:10285083:10285460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000004533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:13711138:13727478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_028013 // RefSeq // Mus musculus endonuclease domain containing 1 (Endod1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000167549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:14353990:14381242:-1 gene:ENSMUSG00000037419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC019813 // GenBank // Mus musculus endonuclease domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:30931 IMAGE:4017632), complete cds. // chr9 // 93 // 45 // 13 // 14 // 0 /// BC096490 // GenBank // Mus musculus endonuclease domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:106270 IMAGE:6439018), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:14356682:14380970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0
NM_173433 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 4D (Kdm4d), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006510271 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 4D (Kdm4d), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000058796 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:14462548:14500482:-1 gene:ENSMUSG00000053914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000115647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:14463210:14500400:-1 gene:ENSMUSG00000053914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK155227 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630210A12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:14463028:14464560:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_001081395 // RefSeq // Mus musculus angiomotin-like 1 (Amotl1), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510666 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus angiomotin-like 1 (Amotl1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000013220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:14541966:14615000:-1 gene:ENSMUSG00000013076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:14541966:14615006:-1 gene:ENSMUSG00000013076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK016526 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932416D09 product:B-MOTIN (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC151000 // GenBank // Mus musculus angiomotin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:183913 IMAGE:9087913), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC151004 // GenBank // Mus musculus angiomotin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:183917 IMAGE:9087917), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC151007 // GenBank // Mus musculus angiomotin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:183920 IMAGE:9087920), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:14547792:14666450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_177905 // RefSeq // Mus musculus piwi-like RNA-mediated gene silencing 4 (Piwil4), mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000076946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:14702358:14740733:-1 gene:ENSMUSG00000036912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000115644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:14701778:14740721:-1 gene:ENSMUSG00000036912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// AB258534 // GenBank // Mus musculus piwiL4 mRNA for PiwiL4, complete cds. // chr9 // 98 // 91 // 41 // 42 // 0 /// XM_006510433 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus piwi-like RNA-mediated gene silencing 4 (Piwil4), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 57 // 57 // 26 // 46 // 1 /// ENSMUST00000115643 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:14701779:14718473:-1 gene:ENSMUSG00000036912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 22 // 46 // 1 /// AK143022 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030042M20 product:similar to Hypothetical protein FLJ39518 (piwi) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 46 // 46 // 21 // 46 // 1 /// ENSMUST00000136399 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:14696230:14705070:-1 gene:ENSMUSG00000036912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// AK033746 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230101H05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// GENSCAN00000005131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:14702358:14740733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0
NM_010242 // RefSeq // Mus musculus fucosyltransferase 4 (Fut4), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:14748459:14752122:-1 gene:ENSMUSG00000049307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC137588 // GenBank // Mus musculus fucosyltransferase 4, mRNA (cDNA clone MGC:169212 IMAGE:8860607), complete cds. // chr9 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000005088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:14750695:14751996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_029306 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012B09 gene (1700012B09Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_379134 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700012B09 gene (1700012B09Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000060330 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:14758191:14771030:-1 gene:ENSMUSG00000031927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK005890 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700012B09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC092535 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012B09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107243 IMAGE:6773440), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000188350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:14756593:14771013:-1 gene:ENSMUSG00000031927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000191047 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:14758191:14771013:-1 gene:ENSMUSG00000031927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_019683 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 49 (Ankrd49), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510503 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 49 (Ankrd49), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:14780209:14782964:-1 gene:ENSMUSG00000031931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF028722 // GenBank // Mus musculus fetal globin inducing factor mRNA, complete cds. // chr9 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// BC019777 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 49, mRNA (cDNA clone MGC:25252 IMAGE:3969390), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:14781150:14782869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000161469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:14845365:14845712:-1 gene:ENSMUSG00000059658 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr9 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NM_010798 // RefSeq // Mus musculus macrophage migration inhibitory factor (Mif), mRNA. // chr9 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:75859353:75860250:-1 gene:ENSMUSG00000033307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:29965218:29965565:-1 gene:ENSMUSG00000083669 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 73 // 60 // 11 // 15 // 0 /// BC024895 // GenBank // Mus musculus macrophage migration inhibitory factor, mRNA (cDNA clone MGC:18483 IMAGE:3978685), complete cds. // chr9 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// BC086928 // GenBank // Mus musculus macrophage migration inhibitory factor, mRNA (cDNA clone MGC:107654 IMAGE:6762214), complete cds. // chr9 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// BC100605 // GenBank // Mus musculus macrophage migration inhibitory factor, mRNA (cDNA clone MGC:118720 IMAGE:30118109), complete cds. // chr9 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// L10613 // GenBank // Mus musculus glycosylation-inhibiting factor mRNA, complete cds. // chr9 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:14845365:14845712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000039620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:75859477:75860168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000010205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:29965218:29965565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 60 // 11 // 15 // 0
NM_019482 // RefSeq // Mus musculus pannexin 1 (Panx1), mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000056755 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:15005785:15045478:-1 gene:ENSMUSG00000031934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000164273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:15005161:15045478:-1 gene:ENSMUSG00000031934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000169288 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:15010086:15043797:-1 gene:ENSMUSG00000031934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 29 // 8 // 9 // 0 /// AF207817 // GenBank // Mus musculus putative gap junction protein pannexin (Panx1) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// BC049074 // GenBank // Mus musculus pannexin 1, mRNA (cDNA clone MGC:61251 IMAGE:6809247), complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// EU446265 // GenBank // Mus musculus truncated pannexin 1 (Panx1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15006138:15045037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_001164797 // RefSeq // Mus musculus hephaestin-like 1 (Hephl1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000159985 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:15051841:15112108:-1 gene:ENSMUSG00000031936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15053618:15090970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_144933 // RefSeq // Mus musculus mediator complex subunit 17 (Med17), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000034411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15260352:15279867:-1 gene:ENSMUSG00000031935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC020185 // GenBank // Mus musculus mediator complex subunit 17, mRNA (cDNA clone MGC:28830 IMAGE:4505959), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15262227:15279793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_145712 // RefSeq // Mus musculus melatonin receptor 1B (Mtnr1b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057920 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:15862667:15874460:-1 gene:ENSMUSG00000050901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:15824528:15874556:-1 gene:ENSMUSG00000050901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB377276 // GenBank // Mus musculus Mtnr1b mRNA for melatonin receptor 1b, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY145850 // GenBank // Mus musculus Mel1b melatonin receptor mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104324 // GenBank // Mus musculus melatonin receptor 1B, mRNA (cDNA clone MGC:129286 IMAGE:40044921), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104325 // GenBank // Mus musculus melatonin receptor 1B, mRNA (cDNA clone MGC:129287 IMAGE:40044928), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15862667:15892908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001080814 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510374 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15910205:16378231:-1 gene:ENSMUSG00000074505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15914999:15947568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC117744 // GenBank // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40090417), complete cds. // chr9 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// NM_001080814 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), mRNA. // chr9 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// XM_006510374 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000082170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15910205:16378231:-1 gene:ENSMUSG00000074505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// XM_006510375 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000000978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15953240:16107119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000012964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15914999:15947568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001080814 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510374 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510375 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15910205:16378231:-1 gene:ENSMUSG00000074505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15953240:16107119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080814 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006510374 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006510375 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000082170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15910205:16378231:-1 gene:ENSMUSG00000074505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15953240:16107119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AK084245 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230012P12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NM_001080814 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), mRNA. // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// XM_006510374 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// XM_006510375 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// ENSMUST00000082170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15910205:16378231:-1 gene:ENSMUSG00000074505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15953240:16107119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001080814 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510374 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510375 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15910205:16378231:-1 gene:ENSMUSG00000074505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15953240:16107119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001080814 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15910205:16378231:-1 gene:ENSMUSG00000074505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510375 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15953240:16107119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080814 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15910205:16378231:-1 gene:ENSMUSG00000074505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:15953240:16107119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080814 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), mRNA. // chr9 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000082170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15910205:16378231:-1 gene:ENSMUSG00000074505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000000968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:16202018:16290416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_001080814 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 3 (Drosophila) (Fat3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:15910205:16378231:-1 gene:ENSMUSG00000074505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:16305377:16388402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028279 // RefSeq // Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2 (Naalad2), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// XM_006510622 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2 (Naalad2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000001826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:18323021:18392123:-1 gene:ENSMUSG00000043943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000166825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:9:18323020:18386036:-1 gene:ENSMUSG00000043943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000172171 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:18321951:18397538:-1 gene:ENSMUSG00000043943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// AK133611 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330415C22 product:N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2, full insert sequence. // chr9 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// AY243507 // GenBank // Mus musculus NAAG-peptidase II mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 93 // 37 // 38 // 0 /// BC108995 // GenBank // Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:124348 IMAGE:40047859), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// BC108996 // GenBank // Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:124349 IMAGE:40047860), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000004723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:18323434:18385874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0
NM_028935 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 558 (Zfp558), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510618 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 558 (Zfp558), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510619 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 558 (Zfp558), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510621 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 558 (Zfp558), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:18456192:18473559:-1 gene:ENSMUSG00000074500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:18455575:18478263:-1 gene:ENSMUSG00000074500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AK016584 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932704I17 product:weakly similar to CDNA FLJ30932 FIS, CLONE FEBRA2006942, MODERATELY SIMILAR TO ZINC FINGER PROTEIN 33A [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// BC048749 // GenBank HTC // Mus musculus zinc finger protein 558, mRNA (cDNA clone IMAGE:6770808). // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000004722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:18455305:18474994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_028935 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 558 (Zfp558), mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006510618 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 558 (Zfp558), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006510619 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 558 (Zfp558), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006510621 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 558 (Zfp558), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000034647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:18456192:18473559:-1 gene:ENSMUSG00000074500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000159596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:18455575:18478263:-1 gene:ENSMUSG00000074500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:18459657:18478268:-1 gene:ENSMUSG00000074500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK016584 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932704I17 product:weakly similar to CDNA FLJ30932 FIS, CLONE FEBRA2006942, MODERATELY SIMILAR TO ZINC FINGER PROTEIN 33A [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC048749 // GenBank HTC // Mus musculus zinc finger protein 558, mRNA (cDNA clone IMAGE:6770808). // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
XM_006544413 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mucin 16 (Muc16), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18495455:18512885:-1 gene:ENSMUSG00000032134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK003577 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110008I14 product:hypothetical SEA domain containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:18495518:18674530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146606 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 24 (Olfr24), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18754656:18755709:-1 gene:ENSMUSG00000054141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC125621 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 24, mRNA (cDNA clone MGC:159324 IMAGE:40130136), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137822 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 24, mRNA (cDNA clone MGC:169446 IMAGE:8860841), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:18754692:18755306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_146605 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 828 (Olfr828), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000104914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18815354:18816292:-1 gene:ENSMUSG00000078116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000086496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18932467:18945092:-1 gene:ENSMUSG00000066914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0
ENSMUST00000086493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:18970289:18970557:-1 gene:ENSMUSG00000066912 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONMMUT068209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146567 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 843 (Olfr843), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19248357:19249463:-1 gene:ENSMUSG00000048391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138386 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 843, mRNA (cDNA clone MGC:170011 IMAGE:8861406), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138387 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 843, mRNA (cDNA clone MGC:170012 IMAGE:8861407), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146282 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 846 (Olfr846), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19360415:19361356:-1 gene:ENSMUSG00000058692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC134375 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 846, mRNA (cDNA clone MGC:161790 IMAGE:40135046), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:19360415:19361353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146525 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 847 (Olfr847), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000079620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19374941:19375879:-1 gene:ENSMUSG00000059821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000020445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:19374941:19537928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_146523 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 850 (Olfr850), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19477301:19478248:-1 gene:ENSMUSG00000094535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146906 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 853 (Olfr853), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19537011:19537928:-1 gene:ENSMUSG00000051160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:19374941:19537928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0
NM_146522 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 854 (Olfr854), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19566435:19567382:-1 gene:ENSMUSG00000095667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_033621 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 856, pseudogene 1 (Olfr856-ps1), non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146528 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 860 (Olfr860), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19845623:19849747:-1 gene:ENSMUSG00000066905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120862 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 860, mRNA (cDNA clone MGC:156099 IMAGE:40129785), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137831 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 860, mRNA (cDNA clone MGC:169455 IMAGE:8860850), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146562 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 862 (Olfr862), mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000073765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:19883309:19884343:-1 gene:ENSMUSG00000063842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC120769 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 862, mRNA (cDNA clone MGC:156006 IMAGE:40129692), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC125340 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 862, mRNA (cDNA clone MGC:159043 IMAGE:40129855), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_146558 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 866 (Olfr866), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000062248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20026959:20028035:-1 gene:ENSMUSG00000050803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC119369 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 866, mRNA (cDNA clone MGC:155685 IMAGE:8734118), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC137762 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 866, mRNA (cDNA clone MGC:169386 IMAGE:8860781), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000035877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:19941980:20100358:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_001011748 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 867 (Olfr867), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20054466:20055461:-1 gene:ENSMUSG00000044454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146904 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 870 (Olfr870), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000086476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20170634:20171569:-1 gene:ENSMUSG00000066899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000158891 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:20209207:20209351:-1 gene:ENSMUSG00000089516 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONMMUT068218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_146563 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 18 (Olfr18), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510079 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 18 (Olfr18), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000086473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20313892:20336094:-1 gene:ENSMUSG00000066896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120866 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 18, mRNA (cDNA clone MGC:156103 IMAGE:40129789), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120868 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 18, mRNA (cDNA clone MGC:156105 IMAGE:40129791), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:20100881:20529344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001004190 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 560 (Zfp560), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000068079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:20345136:20385177:-1 gene:ENSMUSG00000045519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC141211 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 560, mRNA (cDNA clone MGC:176172 IMAGE:9055823), complete cds. // chr9 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:20100881:20529344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001082485 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 266 (Zfp266), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001135019 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 266 (Zfp266), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000068296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20499065:20521408:-1 gene:ENSMUSG00000060510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000174462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:20495068:20521417:-1 gene:ENSMUSG00000060510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC089552 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730601F06 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30250869). // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT068240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000035875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:20100881:20529344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_173777 // RefSeq // Mus musculus olfactomedin 2 (Olfm2), mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510293 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactomedin 2 (Olfm2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006510294 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactomedin 2 (Olfm2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20667986:20728219:-1 gene:ENSMUSG00000032172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC115981 // GenBank // Mus musculus olfactomedin 2, mRNA (cDNA clone MGC:144795 IMAGE:40106192), complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC117536 // GenBank // Mus musculus olfactomedin 2, mRNA (cDNA clone MGC:144796 IMAGE:40106193), complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:20668107:20701626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0
NM_016919 // RefSeq // Mus musculus collagen, type V, alpha 3 (Col5a3), mRNA. // chr9 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// XM_006510488 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collagen, type V, alpha 3 (Col5a3), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 62 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000004201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:20770050:20815067:-1 gene:ENSMUSG00000004098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// ENSMUST00000145974 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:20782794:20815067:-1 gene:ENSMUSG00000004098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 63 // 43 // 43 // 0 /// AB040491 // GenBank // Mus musculus asp6 mRNA for adipocyte-specific protein 6, complete cds. // chr9 // 95 // 63 // 41 // 43 // 0 /// AF176645 // GenBank // Mus musculus collagen type V alpha 3 chain mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// BC138417 // GenBank // Mus musculus collagen, type V, alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:170042 IMAGE:8861437), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 66 // 66 // 0 /// BC138419 // GenBank // Mus musculus collagen, type V, alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:170044 IMAGE:8861439), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 66 // 66 // 0 /// GENSCAN00000035892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:20770835:20814953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 85 // 57 // 58 // 0
NM_145154 // RefSeq // Mus musculus angiopoietin-like 6 (Angptl6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000043726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:20873809:20879727:-1 gene:ENSMUSG00000038742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB054065 // GenBank // Mus musculus mRNA for AGF, complete cds. // chr9 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC025904 // GenBank // Mus musculus angiopoietin-like 6, mRNA (cDNA clone MGC:32467 IMAGE:5049765), complete cds. // chr9 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:20875107:20878594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0
NM_016876 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit G (Eif3g), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000004206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20894352:20898600:-1 gene:ENSMUSG00000070319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF108214 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3 p42 subunit (Eif3p42) mRNA, complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC008511 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit G, mRNA (cDNA clone MGC:5726 IMAGE:3592537), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// U70733 // GenBank // Mus musculus translation initiation factor eIF3-p44 mRNA, complete cds. // chr9 // 69 // 96 // 18 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:20894629:20929129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_010333 // RefSeq // Mus musculus sphingosine-1-phosphate receptor 2 (S1pr2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:20965952:20976793:-1 gene:ENSMUSG00000043895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC096760 // GenBank // Mus musculus sphingosine-1-phosphate receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:107350 IMAGE:30042746), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:20967472:20973032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001103168 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, GATA-like protein 1 (Zglp1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21062393:21067093:-1 gene:ENSMUSG00000079681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ286956 // GenBank // Mus musculus GATA-like protein 1 (Glp1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21039209:21073506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001039824 // RefSeq // Mus musculus ferredoxin 1-like (Fdx1l), mRNA. // chr9 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// NR_038081 // RefSeq // Mus musculus Raver1-Fdx1l readthrough (Raver1-fdx1l), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000010348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21067520:21073514:-1 gene:ENSMUSG00000079677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// AY275472 // GenBank // Mus musculus RAVER1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC061189 // GenBank // Mus musculus ferredoxin 1-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:6588940), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK220434 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1978 protein. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21039209:21073506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_027911 // RefSeq // Mus musculus ribonucleoprotein, PTB-binding 1 (Raver1), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NR_038081 // RefSeq // Mus musculus Raver1-Fdx1l readthrough (Raver1-fdx1l), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000115487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21074168:21091988:-1 gene:ENSMUSG00000010205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY275472 // GenBank // Mus musculus RAVER1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC043698 // GenBank // Mus musculus ribonucleoprotein, PTB-binding 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5321966), partial cds. // chr9 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC058271 // GenBank // Mus musculus ribonucleoprotein, PTB-binding 1, mRNA (cDNA clone MGC:68351 IMAGE:6490833), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC108392 // GenBank // Mus musculus ribonucleoprotein, PTB-binding 1, mRNA (cDNA clone MGC:118403 IMAGE:6393833), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK220434 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1978 protein. // chr9 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21075350:21153172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_001205312 // RefSeq // Mus musculus tyrosine kinase 2 (Tyk2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_018793 // RefSeq // Mus musculus tyrosine kinase 2 (Tyk2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510494 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tyrosine kinase 2 (Tyk2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000001036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21104069:21127346:-1 gene:ENSMUSG00000032175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AF173032 // GenBank // Mus musculus tyrosine kinase TYK2 (Tyk2) mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC053021 // GenBank HTC // Mus musculus tyrosine kinase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5709138), containing frame-shift errors. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC094240 // GenBank // Mus musculus tyrosine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:106666 IMAGE:30610201), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21075350:21153172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_016742 // RefSeq // Mus musculus cell division cycle 37 (Cdc37), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006509967 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cell division cycle 37 (Cdc37), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000019615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21138541:21149906:-1 gene:ENSMUSG00000019471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC060079 // GenBank // Mus musculus cell division cycle 37 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:61246 IMAGE:5714770), complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// U43076 // GenBank // Mus musculus cdc37 homolog mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21075350:21153172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_016679 // RefSeq // Mus musculus kelch-like ECH-associated protein 1 (Keap1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000164812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21229730:21239332:-1 gene:ENSMUSG00000003308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC055732 // GenBank // Mus musculus kelch-like ECH-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:66976 IMAGE:6404252), complete cds. // chr9 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// NM_001110305 // RefSeq // Mus musculus kelch-like ECH-associated protein 1 (Keap1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// NM_001110306 // RefSeq // Mus musculus kelch-like ECH-associated protein 1 (Keap1), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1 /// NM_001110307 // RefSeq // Mus musculus kelch-like ECH-associated protein 1 (Keap1), transcript variant 4, mRNA. // chr9 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// ENSMUST00000049567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21229730:21239332:-1 gene:ENSMUSG00000003308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// AB020063 // GenBank // Mus musculus Keap1 mRNA, complete cds. // chr9 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// AK142272 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330026I06 product:kelch-like ECH-associated protein 1, full insert sequence. // chr9 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// BC006729 // GenBank // Mus musculus kelch-like ECH-associated protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3155716), partial cds. // chr9 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000040254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21230702:21237709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 56 // 19 // 20 // 0
NM_053190 // RefSeq // Mus musculus sphingosine-1-phosphate receptor 5 (S1pr5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122088 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:21242912:21248443:-1 gene:ENSMUSG00000045087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012232 // GenBank // Mus musculus sphingosine-1-phosphate receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:18797 IMAGE:4194177), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21243926:21250017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_145416 // RefSeq // Mus musculus KRI1 homolog (S. cerevisiae) (Kri1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000038671 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:21273457:21287969:-1 gene:ENSMUSG00000035047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000183503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:21281995:21287969:-1 gene:ENSMUSG00000035047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000184326 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:21273636:21287953:-1 gene:ENSMUSG00000035047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000184615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:21281035:21287956:-1 gene:ENSMUSG00000035047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// BC021438 // GenBank // Mus musculus KRI1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:29361 IMAGE:5039543), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 35 // 38 // 0 /// ENSMUST00000183912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:21278953:21287969:-1 gene:ENSMUSG00000035047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// AK051997 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230033C05 product:similar to CDNA FLJ12949 FIS, CLONE NT2RP2005336, WEAKLY SIMILAR TO TRICHOHYALIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// GENSCAN00000040258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21273921:21322255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_009878 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 2D (p19, inhibits CDK4) (Cdkn2d), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006509968 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 2D (p19, inhibits CDK4) (Cdkn2d), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21288463:21291209:-1 gene:ENSMUSG00000096472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK140808 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130030I19 product:cyclin-dependent kinase inhibitor 2D (p19, inhibits CDK4), full insert sequence. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK144737 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730028I03 product:cyclin-dependent kinase inhibitor 2D (p19, inhibits CDK4), full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC013898 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 2D (p19, inhibits CDK4), mRNA (cDNA clone MGC:14043 IMAGE:4020283), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// U19597 // GenBank // Mus musculus Cdk4 and Cdk6 inhibitor p19 protein mRNA, complete cds. // chr9 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// U20497 // GenBank // Mus musculus p19 protein mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21273921:21322255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001110300 // RefSeq // Mus musculus adaptor protein complex AP-1, mu 2 subunit (Ap1m2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_009678 // RefSeq // Mus musculus adaptor protein complex AP-1, mu 2 subunit (Ap1m2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000003397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21295457:21312333:-1 gene:ENSMUSG00000003309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000115433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21295457:21312333:-1 gene:ENSMUSG00000003309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF067146 // GenBank // Mus musculus clathrin adaptor medium chain protein MU1B (Mu1b) mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// AK082674 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230082G12 product:adaptor protein complex AP-1, mu 2 subunit, full insert sequence. // chr9 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC003704 // GenBank // Mus musculus adaptor protein complex AP-1, mu 2 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:5661 IMAGE:3488231), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21273921:21322255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0
NR_029585 // RefSeq // Mus musculus microRNA 199a-1 (Mir199a-1), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000083613 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:21496495:21496564:-1 gene:ENSMUSG00000065547 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// mmu-mir-199a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000241 Mus musculus miR-199a-1 stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT068310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_010744 // RefSeq // Mus musculus transmembrane emp24 domain containing 1 (Tmed1), mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21507380:21510186:-1 gene:ENSMUSG00000032180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC016568 // GenBank HTC // Mus musculus transmembrane emp24 domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:2609517), with apparent retained intron. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC138498 // GenBank // Mus musculus transmembrane emp24 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:170123 IMAGE:8861518), complete cds. // chr9 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC138499 // GenBank // Mus musculus transmembrane emp24 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:170124 IMAGE:8861519), complete cds. // chr9 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC006715 // GenBank // Mus musculus transmembrane emp24 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:6969 IMAGE:3154568), complete cds. // chr9 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000040237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21508173:21510173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_001205158 // RefSeq // Mus musculus Yip1 domain family, member 2 (Yipf2), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_138303 // RefSeq // Mus musculus Yip1 domain family, member 2 (Yipf2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NR_038062 // RefSeq // Mus musculus Yip1 domain family, member 2 (Yipf2), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21588709:21592831:-1 gene:ENSMUSG00000032182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000078572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21588709:21592831:-1 gene:ENSMUSG00000032182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000180365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21588709:21592831:-1 gene:ENSMUSG00000032182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC002282 // GenBank // Mus musculus Yip1 domain family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:7695 IMAGE:3497525), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC003289 // GenBank // Mus musculus Yip1 domain family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:7908 IMAGE:3583087), complete cds. // chr9 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// NM_001205157 // RefSeq // Mus musculus Yip1 domain family, member 2 (Yipf2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// GENSCAN00000040241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21589647:21592558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0
NM_026282 // RefSeq // Mus musculus SPC24, NDC80 kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae) (Spc24), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_379132 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SPC24, NDC80 kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae) (Spc24), transcript variant X1, misc_RNA. // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000098942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21755442:21760286:-1 gene:ENSMUSG00000074476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC086683 // GenBank // Mus musculus SPC24, NDC80 kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:113798 IMAGE:30676712), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC098472 // GenBank HTC // Mus musculus SPC24, NDC80 kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:6433573), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr9 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// BC116238 // GenBank // Mus musculus SPC24, NDC80 kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:143655 IMAGE:40091783), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC116239 // GenBank // Mus musculus SPC24, NDC80 kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:143656 IMAGE:40091784), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_145611 // RefSeq // Mus musculus KN motif and ankyrin repeat domains 2 (Kank2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000034717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21766773:21798546:-1 gene:ENSMUSG00000032194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC010245 // GenBank // Mus musculus KN motif and ankyrin repeat domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:12143 IMAGE:3710765), complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1
NM_177030 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006510422 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006510424 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21800184:21852635:-1 gene:ENSMUSG00000032198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK129348 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1395 protein. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC037714 // GenBank HTC // Mus musculus dedicator of cytokinesis 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:4211395), with apparent retained intron. // chr9 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_177030 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510422 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21800184:21852635:-1 gene:ENSMUSG00000032198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK010755 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410095B20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK129348 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1395 protein. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145109 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830046A08 product:Dedicator of cytokinesis protein 6 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177030 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510422 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21800184:21852635:-1 gene:ENSMUSG00000032198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK010755 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410095B20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK129348 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1395 protein. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145109 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830046A08 product:Dedicator of cytokinesis protein 6 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177030 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510422 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21800184:21852635:-1 gene:ENSMUSG00000032198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK010755 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410095B20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK129348 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1395 protein. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145109 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830046A08 product:Dedicator of cytokinesis protein 6 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177030 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510422 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21800184:21852635:-1 gene:ENSMUSG00000032198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK010755 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410095B20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK129348 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1395 protein. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145109 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830046A08 product:Dedicator of cytokinesis protein 6 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177030 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510422 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21800184:21852635:-1 gene:ENSMUSG00000032198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK049320 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330023D02 product:weakly similar to CDNA FLJ30839 FIS, CLONE FEBRA2002429 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK129348 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1395 protein. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145109 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830046A08 product:Dedicator of cytokinesis protein 6 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177030 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006510422 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000034728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21800184:21852635:-1 gene:ENSMUSG00000032198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK049320 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330023D02 product:weakly similar to CDNA FLJ30839 FIS, CLONE FEBRA2002429 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK129348 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1395 protein. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK145109 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830046A08 product:Dedicator of cytokinesis protein 6 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_177030 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510422 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21800184:21852635:-1 gene:ENSMUSG00000032198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK049320 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330023D02 product:weakly similar to CDNA FLJ30839 FIS, CLONE FEBRA2002429 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK129348 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1395 protein. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145109 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830046A08 product:Dedicator of cytokinesis protein 6 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177030 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510422 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21800184:21852635:-1 gene:ENSMUSG00000032198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK129348 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1395 protein. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145109 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830046A08 product:Dedicator of cytokinesis protein 6 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK049320 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330023D02 product:weakly similar to CDNA FLJ30839 FIS, CLONE FEBRA2002429 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177030 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510422 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21800184:21852635:-1 gene:ENSMUSG00000032198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK049320 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330023D02 product:weakly similar to CDNA FLJ30839 FIS, CLONE FEBRA2002429 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// AK129348 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1395 protein. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145109 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830046A08 product:Dedicator of cytokinesis protein 6 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK080190 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530078P09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_177030 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), mRNA. // chr9 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// XM_006510422 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// ENSMUST00000034728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21800184:21852635:-1 gene:ENSMUSG00000032198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// AK049320 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330023D02 product:weakly similar to CDNA FLJ30839 FIS, CLONE FEBRA2002429 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// AK129348 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1395 protein. // chr9 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// AK145109 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830046A08 product:Dedicator of cytokinesis protein 6 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// GENSCAN00000040242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21756177:21852588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_031874 // RefSeq // Mus musculus RAB3D, member RAS oncogene family (Rab3d), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000115351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:21907491:21918192:-1 gene:ENSMUSG00000019066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:21907510:21918139:-1 gene:ENSMUSG00000019066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:21914892:21918089:-1 gene:ENSMUSG00000019066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AB232590 // GenBank // Mus musculus Rab3D mRNA for Rab3D, complete cds. // chr9 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AF263365 // GenBank // Mus musculus Rab3D (rab3d) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC010779 // GenBank // Mus musculus RAB3D, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:18711 IMAGE:4216156), complete cds. // chr9 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC020010 // GenBank // Mus musculus RAB3D, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:6707 IMAGE:3584902), complete cds. // chr9 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// M89777 // GenBank // Mus musculus GTP-binding protein (Rab3D) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000119055 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:21908642:21918117:-1 gene:ENSMUSG00000019066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21910484:21915932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
AK014010 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110006E17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21955576:21956949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_010149 // RefSeq // Mus musculus erythropoietin receptor (Epor), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509997 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus erythropoietin receptor (Epor), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000006397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21958899:21963576:-1 gene:ENSMUSG00000006235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK010968 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2510015H03 product:erythropoietin receptor, full insert sequence. // chr9 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC046282 // GenBank // Mus musculus erythropoietin receptor, mRNA (cDNA clone MGC:54669 IMAGE:6438591), complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// J04843 // GenBank // Mouse erythropoietin receptor (EPO-R) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21959059:21963431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_023622 // RefSeq // Mus musculus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3 (Rgl3), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_006510612 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3 (Rgl3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000045726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21971527:21989453:-1 gene:ENSMUSG00000040146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AF237669 // GenBank // Mus musculus RalGDS-like protein 3 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// AF239661 // GenBank // Mus musculus RalGDS-related effector protein of M-Ras mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AK165023 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130305F06 product:ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3, full insert sequence. // chr9 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// AK165746 // GenBank HTC // Mus musculus adult male gall bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630048A03 product:ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3, full insert sequence. // chr9 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// AK131140 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mFLJ00153 protein. // chr9 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// GENSCAN00000041342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21971891:21989544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0
NM_001163787 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 151 (Ccdc151), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_029939 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 151 (Ccdc151), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000044926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21989871:22002634:-1 gene:ENSMUSG00000039632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000115336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:21989871:22002634:-1 gene:ENSMUSG00000039632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC057069 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 151, mRNA (cDNA clone MGC:67419 IMAGE:5690884), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK021166 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330001K17 product:RIKEN cDNA C330001K17 gene, full insert sequence. // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000041343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:21990126:22002474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_010487 // RefSeq // Mus musculus ELAV (embryonic lethal, abnormal vision, Drosophila)-like 3 (Hu antigen C) (Elavl3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000003501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22015005:22052023:-1 gene:ENSMUSG00000003410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC052097 // GenBank // Mus musculus ELAV (embryonic lethal, abnormal vision, Drosophila)-like 3 (Hu antigen C), mRNA (cDNA clone MGC:62534 IMAGE:5695543), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U29148 // GenBank // Mus musculus RNA-binding protein mHuC-L mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK090281 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630034I07 product:ELAV (embryonic lethal, abnormal vision, Drosophila)-like 3 (Hu antigen C), full insert sequence. // chr9 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000041319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:22018503:22036845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_177318 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 653 (Zfp653), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000043922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22055460:22071345:-1 gene:ENSMUSG00000038895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000179605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22055460:22071345:-1 gene:ENSMUSG00000038895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK046492 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230398G18 product:similar to HYPOTHETICAL 67.2 KDA PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY072705 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein Zip67 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC038037 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 653, mRNA (cDNA clone MGC:47124 IMAGE:4190337), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK171735 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830008A08 product:Zinc finger protein Zip67 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000041341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:22055716:22071341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001253897 // RefSeq // Mus musculus ECSIT homolog (Drosophila) (Ecsit), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001253898 // RefSeq // Mus musculus ECSIT homolog (Drosophila) (Ecsit), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_012029 // RefSeq // Mus musculus ECSIT homolog (Drosophila) (Ecsit), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000098937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22072246:22085427:-1 gene:ENSMUSG00000066839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000177967 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:22073492:22085427:-1 gene:ENSMUSG00000066839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 45 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000179422 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:22072246:22085402:-1 gene:ENSMUSG00000066839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000180180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:22072246:22085438:-1 gene:ENSMUSG00000066839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF182510 // GenBank // Mus musculus ECSIT mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC004583 // GenBank // Mus musculus ECSIT homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:8059 IMAGE:3587327), complete cds. // chr9 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// BC016424 // GenBank // Mus musculus ECSIT homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:25219 IMAGE:4924678), complete cds. // chr9 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// GENSCAN00000041340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:22072324:22094326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0
NM_170777 // RefSeq // Mus musculus elongation factor 1 homolog (ELF1, S. cerevisiae) (Elof1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000013966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22112990:22117148:-1 gene:ENSMUSG00000013822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000166335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22112989:22114169:-1 gene:ENSMUSG00000013822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019870 // GenBank // Mus musculus elongation factor 1 homolog (ELF1, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:29916 IMAGE:5123727), complete cds. // chr9 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC024488 // GenBank // Mus musculus elongation factor 1 homolog (ELF1, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:37411 IMAGE:4981209), complete cds. // chr9 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC056225 // GenBank // Mus musculus elongation factor 1 homolog (ELF1, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:62670 IMAGE:5150539), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027981 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810064F22 gene (1810064F22Rik), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000188595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:22206781:22213860:-1 gene:ENSMUSG00000090925 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT068336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000187399 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:22196963:22213839:-1 gene:ENSMUSG00000090925 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_181419 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 599 (Zfp599), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086281 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:22247430:22259895:-1 gene:ENSMUSG00000062794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC050092 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC050092, mRNA (cDNA clone MGC:60727 IMAGE:30019042), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_145612 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 810 (Zfp810), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22276748:22307638:-1 gene:ENSMUSG00000066829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC005471 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 810, mRNA (cDNA clone MGC:6652 IMAGE:3496918), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:22280411:22330500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NR_033622 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6607 (Gm6607), non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// KnowTID_00007638 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT068344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT068345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_028390 // RefSeq // Mus musculus anillin, actin binding protein (Anln), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006510581 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anillin, actin binding protein (Anln), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006510582 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anillin, actin binding protein (Anln), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000040912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22331214:22389206:-1 gene:ENSMUSG00000036777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC030489 // GenBank // Mus musculus anillin, actin binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:40907 IMAGE:5373071), complete cds. // chr9 // 100 // 66 // 31 // 31 // 0 /// BC032164 // GenBank // Mus musculus anillin, actin binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:38439 IMAGE:5346703), complete cds. // chr9 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// GENSCAN00000041330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:22333050:22397494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 34 // 34 // 0
NM_018739 // RefSeq // Mus musculus retinitis pigmentosa 9 (human) (Rp9), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:22448311:22468356:-1 gene:ENSMUSG00000032239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048480 // GenBank // Mus musculus retinitis pigmentosa 9 homolog (human), mRNA (cDNA clone IMAGE:6773036). // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC096578 // GenBank // Mus musculus retinitis pigmentosa 9 (human), mRNA (cDNA clone IMAGE:2937105), complete cds. // chr9 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC115549 // GenBank // Mus musculus retinitis pigmentosa 9 (human), mRNA (cDNA clone MGC:144397 IMAGE:40101700), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC115550 // GenBank // Mus musculus retinitis pigmentosa 9 (human), mRNA (cDNA clone MGC:144398 IMAGE:40101701), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// D78255 // GenBank // Mus musculus mRNA for PAP-1, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK147912 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270093P14 product:retinitis pigmentosa 9 homolog (human), full insert sequence. // chr9 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:22448656:22468201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000184937 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:22772751:22772835:-1 gene:ENSMUSG00000098940 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 67 // 81 // 14 // 21 // 0
XM_006510296 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dpy-19-like 1 (C. elegans) (Dpy19l1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000142064 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:24411778:24503140:-1 gene:ENSMUSG00000043067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000152480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:24412051:24423959:-1 gene:ENSMUSG00000043067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AK143845 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430204K01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_172920 // RefSeq // Mus musculus dpy-19-like 1 (C. elegans) (Dpy19l1), mRNA. // chr9 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// ENSMUST00000115277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:24411776:24487914:-1 gene:ENSMUSG00000043067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// ENSMUST00000170356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:24411803:24503140:-1 gene:ENSMUSG00000043067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// GENSCAN00000041117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:24414267:24453988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001166207 // RefSeq // Mus musculus dpy-19-like 2 (C. elegans) (Dpy19l2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_379122 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dpy-19-like 2 (C. elegans) (Dpy19l2), transcript variant X4, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:24557048:24696293:-1 gene:ENSMUSG00000085576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:24668192:24696163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001205085 // RefSeq // Mus musculus T-box 20 (Tbx20), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NM_020496 // RefSeq // Mus musculus T-box 20 (Tbx20), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000166018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:24740256:24774303:-1 gene:ENSMUSG00000031965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// AF260557 // GenBank // Mus musculus T-box transcription factor (Tbx12) mRNA, complete cds. // chr9 // 90 // 83 // 26 // 29 // 0 /// AF306667 // GenBank // Mus musculus T-box transcription factor TBX20 (Tbx20) mRNA, complete cds. // chr9 // 93 // 86 // 28 // 30 // 0 /// NM_194263 // RefSeq // Mus musculus T-box 20 (Tbx20), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// ENSMUST00000052946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:24720812:24774303:-1 gene:ENSMUSG00000031965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// AK052155 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330001G23 product:T-box 20, full insert sequence. // chr9 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// GENSCAN00000041111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:24725452:24805424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1
GENSCAN00000041119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:24826343:24826777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
NM_020586 // RefSeq // Mus musculus HERPUD family member 2 (Herpud2), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000008573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:25108130:25151781:-1 gene:ENSMUSG00000008429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC029691 // GenBank // Mus musculus HERPUD family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:35886 IMAGE:5375603), complete cds. // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC043693 // GenBank // Mus musculus HERPUD family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:49314 IMAGE:5150485), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:25101363:25156167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
NM_001113323 // RefSeq // Mus musculus galactosidase, beta 1 like 3 (Glb1l3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006510591 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus galactosidase, beta 1 like 3 (Glb1l3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006510594 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus galactosidase, beta 1 like 3 (Glb1l3), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000034448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:26817953:26860823:-1 gene:ENSMUSG00000031966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC132200 // GenBank // Mus musculus galactosidase, beta 1 like 3, mRNA (cDNA clone MGC:163831 IMAGE:40130477), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC132202 // GenBank // Mus musculus galactosidase, beta 1 like 3, mRNA (cDNA clone MGC:163833 IMAGE:40130479), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000054405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:26818181:26912454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 87 // 34 // 39 // 1
XM_006510459 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1110 (Gm1110), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006510460 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1110 (Gm1110), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006510461 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1110 (Gm1110), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006510462 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1110 (Gm1110), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 97 // 85 // 33 // 34 // 0 /// XM_006510463 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1110 (Gm1110), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000115261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:26879567:26923081:-1 gene:ENSMUSG00000079644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK136683 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230022M14 product:hypothetical Glycoside hydrolase, family 35/Galactose-binding like containing protein, full insert sequence. // chr9 // 96 // 60 // 23 // 24 // 0 /// DQ664197 // GenBank // Mus musculus beta-galactosidase-like protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000054405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:26818181:26912454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 20 // 40 // 1
NM_178027 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 26 homolog B (yeast) (Vps26b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:27004503:27030094:-1 gene:ENSMUSG00000031988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049180 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 26 homolog B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:54784 IMAGE:6314347), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052721 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 26 homolog B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:64627 IMAGE:6809853), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062972 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 26 homolog B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:79230 IMAGE:6809878), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK165539 // GenBank HTC // Mus musculus brain CRL-1443 BC3H1 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430001E19 product:Weakly similar to VPS26 protein homolog (RIKEN cDNA 1810012I05) (Hypothetical protein) (Fragment) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000044592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:27009891:27024202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_023277 // RefSeq // Mus musculus junction adhesion molecule 3 (Jam3), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006510715 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus junction adhesion molecule 3 (Jam3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:27097385:27155421:-1 gene:ENSMUSG00000031990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC024357 // GenBank // Mus musculus junction adhesion molecule 3, mRNA (cDNA clone MGC:35813 IMAGE:4973185), complete cds. // chr9 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000167074 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:27100668:27155418:-1 gene:ENSMUSG00000031990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// AK160648 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810043I24 product:junction adhesion molecule 3, full insert sequence. // chr9 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// AK017692 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730470H08 product:junction cell adhesion molecule 3, full insert sequence. // chr9 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000044575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:27098366:27155366:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_001024139 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 15 (Adamts15), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006510212 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 15 (Adamts15), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006510214 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 15 (Adamts15), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000065112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:30899155:30922452:-1 gene:ENSMUSG00000033453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC094677 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 15, mRNA (cDNA clone MGC:102272 IMAGE:30619053), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:30902015:30922237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
XR_406555 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10700 (Gm10700), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK084540 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330013J16 product:inferred: ADAM-TS 8 PRECURSOR (EC 3.4.24.-) (A DISINTEGRIN AND METALLOPROTEINASE WITH THROMBOSPONDIN MOTIFS 8), full insert sequence. // chr9 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// NONMMUT068477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0
AK046026 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230334K19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011176 // RefSeq // Mus musculus suppression of tumorigenicity 14 (colon carcinoma) (St14), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006510098 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus suppression of tumorigenicity 14 (colon carcinoma) (St14), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006510100 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus suppression of tumorigenicity 14 (colon carcinoma) (St14), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000034478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:31089402:31131853:-1 gene:ENSMUSG00000031995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000123557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:31106151:31131796:-1 gene:ENSMUSG00000031995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// AF042822 // GenBank // Mus musculus epithin mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// BC005496 // GenBank // Mus musculus suppression of tumorigenicity 14 (colon carcinoma), mRNA (cDNA clone MGC:7395 IMAGE:3488059), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000148789 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:31099404:31131796:-1 gene:ENSMUSG00000031995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// AK085410 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630022P10 product:suppression of tumorigenicity 14 (colon carcinoma), full insert sequence. // chr9 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// GENSCAN00000048367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:31095531:31131626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0
NM_001102456 // RefSeq // Mus musculus amyloid beta (A4) precursor-like protein 2 (Aplp2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_009691 // RefSeq // Mus musculus amyloid beta (A4) precursor-like protein 2 (Aplp2), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000079758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:31149557:31211815:-1 gene:ENSMUSG00000031996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AK088391 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430014K10 product:amyloid beta (A4) precursor-like protein 2, full insert sequence. // chr9 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// BC051999 // GenBank // Mus musculus amyloid beta (A4) precursor-like protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:62315 IMAGE:5716148), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// M97216 // GenBank // Mus musculus DNA-binding protein mRNA, complete cds. // chr9 // 88 // 60 // 21 // 24 // 0 /// U15571 // GenBank // Mus musculus amyloid precursor-like protein 2 isoform 751, (APLP2) gene, complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_001102455 // RefSeq // Mus musculus amyloid beta (A4) precursor-like protein 2 (Aplp2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1 /// ENSMUST00000072634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:31149557:31211815:-1 gene:ENSMUSG00000031996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1 /// BC052396 // GenBank // Mus musculus amyloid beta (A4) precursor-like protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:63464 IMAGE:5719918), complete cds. // chr9 // 88 // 88 // 35 // 40 // 1 /// GENSCAN00000048362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:31150871:31211727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0
NM_144936 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 45b (Tmem45b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:31426199:31464238:-1 gene:ENSMUSG00000041737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC018222 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 45b, mRNA (cDNA clone MGC:25912 IMAGE:4221959), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026654 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 45b, mRNA (cDNA clone MGC:37581 IMAGE:4988382), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:31426845:31452239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_013800 // RefSeq // Mus musculus BarH-like homeobox 2 (Barx2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000116615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:31846044:31913462:-1 gene:ENSMUSG00000032033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC012684 // GenBank // Mus musculus BarH-like homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:13916 IMAGE:3980774), complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// L77900 // GenBank // Mus Musculus Barx2 mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:31846789:31869083:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_010605 // RefSeq // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 5 (Kcnj5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006510040 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 5 (Kcnj5), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:32314783:32344237:-1 gene:ENSMUSG00000032034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC104330 // GenBank // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:129304 IMAGE:40045462), complete cds. // chr9 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC104331 // GenBank // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:129305 IMAGE:40045465), complete cds. // chr9 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC114976 // GenBank // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:140987 IMAGE:40045466), complete cds. // chr9 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// U33631 // GenBank // Mus musculus G-protein-gated inwardly rectifying K+ channel GIRK4 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000008548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:32312546:32322981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_008026 // RefSeq // Mus musculus Friend leukemia integration 1 (Fli1), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510007 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Friend leukemia integration 1 (Fli1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006510008 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Friend leukemia integration 1 (Fli1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006510009 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Friend leukemia integration 1 (Fli1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000016231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:32422204:32541595:-1 gene:ENSMUSG00000016087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000183767 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:32428059:32542861:-1 gene:ENSMUSG00000016087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 52 // 13 // 15 // 0 /// AK083900 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130057B15 product:Friend leukemia integration 1, full insert sequence. // chr9 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC138791 // GenBank // Mus musculus Friend leukemia integration 1, mRNA (cDNA clone MGC:170418 IMAGE:8861813), complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC138792 // GenBank // Mus musculus Friend leukemia integration 1, mRNA (cDNA clone MGC:170419 IMAGE:8861814), complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// X59421 // GenBank // Mouse Fli-1 mRNA for retroviral integration site. // chr9 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:32413509:32482985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0
NM_009178 // RefSeq // Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 4 (St3gal4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006510108 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 4 (St3gal4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006510109 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 4 (St3gal4), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006510110 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 4 (St3gal4), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:35046579:35116810:-1 gene:ENSMUSG00000032038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB061305 // GenBank // Mus musculus mRNA for sialyltransferase, complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC011121 // GenBank // Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 4, mRNA (cDNA clone MGC:6096 IMAGE:3497996), complete cds. // chr9 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// BC050773 // GenBank // Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 4, mRNA (cDNA clone MGC:58327 IMAGE:6587379), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// D28941 // GenBank // Mus musculus mRNA for alpha-2,3-sialyltransferase, complete cds. // chr9 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// X95809 // GenBank // Mus musculus mRNA for Gal beta 1,4(3) GlcNAc alpha 2,3-sialyltransferase. // chr9 // 71 // 71 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:35047433:35121722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1
NM_027030 // RefSeq // Mus musculus decapping enzyme, scavenger (Dcps), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034539 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:35124408:35176061:-1 gene:ENSMUSG00000032040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000119847 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:35124412:35176059:-1 gene:ENSMUSG00000032040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY040775 // GenBank // Mus musculus histidine triad protein member 5 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC016273 // GenBank // Mus musculus decapping enzyme, scavenger, mRNA (cDNA clone MGC:28987 IMAGE:4511427), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000155139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:35126307:35175993:-1 gene:ENSMUSG00000032040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000014654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:35124572:35194268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_013932 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 25 (Ddx25), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034612 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:35541847:35558528:-1 gene:ENSMUSG00000032101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF142630 // GenBank // Mus musculus gonadotropin-regulated testicular RNA helicase mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC024852 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 25, mRNA (cDNA clone MGC:36004 IMAGE:5358404), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061130 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 25, mRNA (cDNA clone MGC:74260 IMAGE:6774579), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:35541998:35562079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_029762 // RefSeq // Mus musculus hydrolethalus syndrome 1 (Hyls1), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:35560820:35570398:-1 gene:ENSMUSG00000050555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK013896 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3010015K02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC035953 // GenBank // Mus musculus hydrolethalus syndrome 1, mRNA (cDNA clone MGC:31682 IMAGE:4911163), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132547 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:35564458:35570097:-1 gene:ENSMUSG00000050555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK083607 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030053O13 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT068597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSMUST00000121769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:35574112:35574400:-1 gene:ENSMUSG00000086984 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000014655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:35574110:35574400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000184601 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:35589081:35589350:-1 gene:ENSMUSG00000094676 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:35589078:35686336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020264 // RefSeq // Mus musculus prostate and testis expressed 4 (Pate4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000034610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:35607093:35611935:-1 gene:ENSMUSG00000032099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF134204 // GenBank // Mus musculus caltrin mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// BC120764 // GenBank // Mus musculus prostate and testis expressed 4, mRNA (cDNA clone MGC:156001 IMAGE:40129687), complete cds. // chr9 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC120766 // GenBank // Mus musculus prostate and testis expressed 4, mRNA (cDNA clone MGC:156003 IMAGE:40129689), complete cds. // chr9 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:35589078:35686336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_001199953 // RefSeq // Mus musculus predicted gene, 17252 (Gm17252), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000170021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:35685079:35687371:-1 gene:ENSMUSG00000091215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000183567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:35685425:35687390:-1 gene:ENSMUSG00000091215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// AK033745 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230101G17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_026593 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D730048I06 gene (D730048I06Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:35788050:35790112:-1 gene:ENSMUSG00000032108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027498 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D730048I06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41011 IMAGE:3465762), complete cds. // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_029863 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9230110F15 gene (9230110F15Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006510675 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9230110F15 gene (9230110F15Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000054175 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:35838329:35844150:-1 gene:ENSMUSG00000047980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
KnowTID_00007647 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT068602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_006544383 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9230113P08 gene (9230113P08Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:36257213:36257765:-1 gene:ENSMUSG00000066767 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000176049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:35908423:35910796:1 gene:ENSMUSG00000078934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:9:35908442:35909535:1 gene:ENSMUSG00000078934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:36255931:36258323:-1 gene:ENSMUSG00000066767 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK020345 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230113P08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:35908926:35909535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 78 // 72 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:36257213:36257765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT068604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONMMUT068608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001033783 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5615 (Gm5615), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098900 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:36532397:36541963:-1 gene:ENSMUSG00000074448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033325 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A630095E13 gene (A630095E13Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006510268 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A630095E13 gene (A630095E13Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000093868 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:36635754:36638602:-1 gene:ENSMUSG00000070313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000184611 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:36635754:36638602:-1 gene:ENSMUSG00000070313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000184901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:36635756:36643376:-1 gene:ENSMUSG00000070313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AK042477 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630095E13 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT068609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_007691 // RefSeq // Mus musculus checkpoint kinase 1 (Chek1), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:36708482:36726658:-1 gene:ENSMUSG00000032113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000172702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:36708482:36726374:-1 gene:ENSMUSG00000032113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000173534 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:36710157:36725868:-1 gene:ENSMUSG00000032113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000173963 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:36710157:36725868:-1 gene:ENSMUSG00000032113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000174105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:36709440:36726585:-1 gene:ENSMUSG00000032113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000174794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:36713744:36722745:-1 gene:ENSMUSG00000032113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0 /// AF016583 // GenBank // Mus musculus checkpoint kinase Chk1 (Chk1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC100386 // GenBank // Mus musculus checkpoint kinase 1 homolog (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:117928 IMAGE:30481390), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT068613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000023397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:36710335:36793281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_008408 // RefSeq // Mus musculus STT3, subunit of the oligosaccharyltransferase complex, homolog A (S. cerevisiae) (Stt3a), mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000120381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:36729344:36767679:-1 gene:ENSMUSG00000032116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000128270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:36752330:36767619:-1 gene:ENSMUSG00000032116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AK129027 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3037288, highly similar to Oligosaccharyl transferase STT3 subunit homolog. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC037612 // GenBank // Mus musculus STT3, subunit of the oligosaccharyltransferase complex, homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:46919 IMAGE:5353797), complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC085313 // GenBank // Mus musculus STT3, subunit of the oligosaccharyltransferase complex, homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:102531 IMAGE:30443880), complete cds. // chr9 // 94 // 89 // 32 // 34 // 0 /// L34260 // GenBank // Mus musculus integral membrane protein 1 (Itm1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:36710335:36793281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1
NM_001199494 // RefSeq // Mus musculus etoposide induced 2.4 mRNA (Ei24), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_007915 // RefSeq // Mus musculus etoposide induced 2.4 mRNA (Ei24), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000115086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:36779159:36797356:-1 gene:ENSMUSG00000062762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000163192 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:36779159:36797273:-1 gene:ENSMUSG00000062762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000184235 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:36785614:36790270:-1 gene:ENSMUSG00000062762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000184395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:36785605:36797020:-1 gene:ENSMUSG00000062762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// U41751 // GenBank // Mus musculus EI24 (EI24) mRNA, complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSMUST00000183430 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:36782783:36786013:-1 gene:ENSMUSG00000062762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000023397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:36710335:36793281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1
GENSCAN00000023398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:36804401:36834301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001145960 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 2 (Slc37a2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NM_020258 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 2 (Slc37a2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000115068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:37229149:37255738:-1 gene:ENSMUSG00000032122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000161114 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:37230316:37255414:-1 gene:ENSMUSG00000032122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000162018 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:37230512:37235154:-1 gene:ENSMUSG00000032122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 34 // 15 // 15 // 0 /// AF121081 // GenBank // Mus musculus cAMP inducible 2 protein (Ci2) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// AK030881 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830440L08 product:solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 2, full insert sequence. // chr9 // 100 // 34 // 15 // 15 // 0 /// BC063326 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:74230 IMAGE:30301217), complete cds. // chr9 // 97 // 82 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37231428:37364033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 70 // 70 // 31 // 44 // 1
NM_001081429 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 15 (Ccdc15), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510342 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 15 (Ccdc15), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000037275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37275835:37348392:-1 gene:ENSMUSG00000034303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK164955 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130002I02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// AK051119 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030074L19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// BC032924 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:1445881). // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37231428:37364033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001164767 // RefSeq // Mus musculus roundabout homolog 3 (Drosophila) (Robo3), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006510106 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus roundabout homolog 3 (Drosophila) (Robo3), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034643 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:37416045:37430134:-1 gene:ENSMUSG00000032128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000115038 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:37416045:37433163:-1 gene:ENSMUSG00000032128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170512 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:37416162:37430134:-1 gene:ENSMUSG00000032128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF060570 // GenBank // Mus musculus rig-1 protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:37416045:37422603:-1 gene:ENSMUSG00000032128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AK031746 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6230401F16 product:retinoblastoma inhibiting gene 1, full insert sequence. // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37416251:37460548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_022029 // RefSeq // Mus musculus neurogranin (Nrgn), mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000065668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:37544492:37552904:-1 gene:ENSMUSG00000053310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061102 // GenBank // Mus musculus neurogranin, mRNA (cDNA clone MGC:74221 IMAGE:6590375), complete cds. // chr9 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC138511 // GenBank // Mus musculus neurogranin, mRNA (cDNA clone MGC:170136 IMAGE:8861531), complete cds. // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC138513 // GenBank // Mus musculus neurogranin, mRNA (cDNA clone MGC:170138 IMAGE:8861533), complete cds. // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000182070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:37544954:37546138:-1 gene:ENSMUSG00000053310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 67 // 48 // 8 // 12 // 0 /// NONMMUT068647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 67 // 48 // 8 // 12 // 0
NM_011449 // RefSeq // Mus musculus sperm autoantigenic protein 17 (Spa17), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510123 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sperm autoantigenic protein 17 (Spa17), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000002013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37603295:37613720:-1 gene:ENSMUSG00000001948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK005571 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700000E13 product:sperm autoantigenic protein 17, full insert sequence. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC059727 // GenBank // Mus musculus sperm autoantigenic protein 17, mRNA (cDNA clone MGC:74268 IMAGE:6775177), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_172454 // RefSeq // Mus musculus pannexin 3 (Panx3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000011262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:37659902:37669222:-1 gene:ENSMUSG00000011118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:37664221:37669173:-1 gene:ENSMUSG00000011118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC052822 // GenBank // Mus musculus pannexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:60761 IMAGE:30058169), complete cds. // chr9 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37649358:37669055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_030553 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 160 (Olfr160), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000104875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:37711348:37712277:-1 gene:ENSMUSG00000061165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC130240 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 160, mRNA (cDNA clone MGC:161291 IMAGE:40142140), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NM_207664 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 151 (Olfr151), mRNA. // chr9 // 42 // 100 // 8 // 19 // 0 /// BC138117 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 151, mRNA (cDNA clone MGC:169741 IMAGE:8861136), complete cds. // chr9 // 42 // 100 // 8 // 19 // 0 /// BC138118 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 151, mRNA (cDNA clone MGC:169742 IMAGE:8861137), complete cds. // chr9 // 42 // 100 // 8 // 19 // 0 /// GENSCAN00000024074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37711348:37712163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0
NM_207664 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 151 (Olfr151), mRNA. // chr9 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// BC138117 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 151, mRNA (cDNA clone MGC:169741 IMAGE:8861136), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// BC138118 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 151, mRNA (cDNA clone MGC:169742 IMAGE:8861137), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000024071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:37730053:37730867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000083686 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:37822586:37822784:-1 gene:ENSMUSG00000065620 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146478 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 891 (Olfr891), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38179871:38180821:-1 gene:ENSMUSG00000045528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146785 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 915 (Olfr915), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146784 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 916 (Olfr916), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000081196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38657458:38658390:-1 gene:ENSMUSG00000094701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001011864 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 917 (Olfr917), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000076542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38664913:38665842:-1 gene:ENSMUSG00000063225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_146375 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 918 (Olfr918), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38672504:38673481:-1 gene:ENSMUSG00000046150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38672504:38673442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146440 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 919 (Olfr919), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38697429:38698376:-1 gene:ENSMUSG00000056961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146442 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 934 (Olfr934), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38982110:38983042:-1 gene:ENSMUSG00000057424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38982110:38983042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146746 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 935 (Olfr935), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:38994507:38995433:-1 gene:ENSMUSG00000059595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:38994507:38995433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146747 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 146 (Olfr146), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39018559:39019619:-1 gene:ENSMUSG00000058820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132188 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 146, mRNA (cDNA clone MGC:163819 IMAGE:40130465), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132190 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 146, mRNA (cDNA clone MGC:163821 IMAGE:40130467), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39018619:39019539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207139 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 936 (Olfr936), mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000178303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39046614:39047549:-1 gene:ENSMUSG00000095194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000040674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39046614:39047417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_146439 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 937 (Olfr937), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39059729:39060664:-1 gene:ENSMUSG00000094182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39059729:39060592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_146438 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 938 (Olfr938), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39077698:39078816:-1 gene:ENSMUSG00000048501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125399 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 938, mRNA (cDNA clone MGC:159102 IMAGE:40129914), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125401 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 938, mRNA (cDNA clone MGC:159104 IMAGE:40129916), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39077796:39078743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207665 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1537 (Olfr1537), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000073248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39237487:39238431:-1 gene:ENSMUSG00000096109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000040673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39237487:39238422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_146506 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 945 (Olfr945), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39257720:39258682:-1 gene:ENSMUSG00000063380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128004 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 945, mRNA (cDNA clone MGC:157590 IMAGE:40135946), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39257720:39258679:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_033620 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 947, pseudogene 1 (Olfr947-ps1), non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC051435 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 947, pseudogene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6313445). // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39284296:39319612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1
NM_001011756 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 948 (Olfr948), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000076516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39318647:39319612:-1 gene:ENSMUSG00000057349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000040647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39284296:39319612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_146503 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 952 (Olfr952), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000073895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39426093:39427148:-1 gene:ENSMUSG00000058856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC150723 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 952, mRNA (cDNA clone MGC:183634 IMAGE:9087634), complete cds. // chr9 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39426125:39426829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
NM_207141 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 955 (Olfr955), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000073946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39469780:39470724:-1 gene:ENSMUSG00000063176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC150723 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 952, mRNA (cDNA clone MGC:183634 IMAGE:9087634), complete cds. // chr9 // 76 // 100 // 22 // 29 // 0 /// NM_146503 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 952 (Olfr952), mRNA. // chr9 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0 /// ENSMUST00000073895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39426093:39427148:-1 gene:ENSMUSG00000058856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 100 // 20 // 29 // 0 /// NM_146438 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 938 (Olfr938), mRNA. // chr9 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// ENSMUST00000056499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39077698:39078816:-1 gene:ENSMUSG00000048501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// BC125399 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 938, mRNA (cDNA clone MGC:159102 IMAGE:40129914), complete cds. // chr9 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// BC125401 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 938, mRNA (cDNA clone MGC:159104 IMAGE:40129916), complete cds. // chr9 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39469780:39470484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39426125:39426829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 100 // 20 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39077796:39078743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0
NM_146830 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 44 (Olfr44), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39484204:39493988:-1 gene:ENSMUSG00000062649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39484307:39485251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146745 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 957 (Olfr957), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39510783:39511718:-1 gene:ENSMUSG00000095322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39510783:39511718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146330 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 958 (Olfr958), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39549928:39550869:-1 gene:ENSMUSG00000050853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC148230 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 958, mRNA (cDNA clone MGC:161295 IMAGE:40142225), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39549931:39550518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_146508 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 959 (Olfr959), mRNA. // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000079178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39572260:39573314:-1 gene:ENSMUSG00000059366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC120617 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 959, mRNA (cDNA clone MGC:155854 IMAGE:40129540), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC120619 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 959, mRNA (cDNA clone MGC:155856 IMAGE:40129542), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39571101:39573023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 85 // 42 // 11 // 13 // 0
NM_001199556 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AW551984 (AW551984), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NM_178737 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AW551984 (AW551984), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// XM_006510304 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus expressed sequence AW551984 (AW551984), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000042485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:39587396:39604124:-1 gene:ENSMUSG00000038112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000119722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:39587510:39603687:-1 gene:ENSMUSG00000038112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000141370 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:39599658:39604403:-1 gene:ENSMUSG00000038112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 19 // 9 // 9 // 0 /// BC061211 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AW551984, mRNA (cDNA clone MGC:74355 IMAGE:30250574), complete cds. // chr9 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000040654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39589046:39600822:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0
ENSMUST00000055796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39686044:39686942:-1 gene:ENSMUSG00000044107 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_207138 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 149 (Olfr149), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000082027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39701793:39702822:-1 gene:ENSMUSG00000062121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC141260 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 149, mRNA (cDNA clone MGC:176221 IMAGE:9055872), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39686029:39702767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_146612 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 968 (Olfr968), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39771772:39772798:-1 gene:ENSMUSG00000095903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39771854:39772798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146828 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 975 (Olfr975), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39949837:39950769:-1 gene:ENSMUSG00000043331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39949837:39950700:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146367 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 976 (Olfr976), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510348 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 976 (Olfr976), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:39954257:39957069:-1 gene:ENSMUSG00000047352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK135940 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420439I05 product:olfactory receptor 976, full insert sequence. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC119350 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 976, mRNA (cDNA clone MGC:155666 IMAGE:8734099), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120621 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 976, mRNA (cDNA clone MGC:155858 IMAGE:40129544), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39955989:39956858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000043080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:39973879:39974748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NM_147108 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 979 (Olfr979), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:40000206:40001250:-1 gene:ENSMUSG00000059473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116754 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 979, mRNA (cDNA clone MGC:151131 IMAGE:40126073), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116756 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 979, mRNA (cDNA clone MGC:151133 IMAGE:40126075), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40000290:40001156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_147106 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 980 (Olfr980), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:40006015:40006947:-1 gene:ENSMUSG00000060254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116814 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 980, mRNA (cDNA clone MGC:151191 IMAGE:40126133), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119187 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 980, mRNA (cDNA clone MGC:155503 IMAGE:8733936), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40006015:40006878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_146827 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 983 (Olfr983), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:40092017:40093558:-1 gene:ENSMUSG00000044205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146608 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 984 (Olfr984), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:40100544:40101488:-1 gene:ENSMUSG00000045812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40100544:40101248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_146855 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 985 (Olfr985), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000060345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:40126924:40128039:-1 gene:ENSMUSG00000049073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC138430 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 985, mRNA (cDNA clone MGC:170055 IMAGE:8861450), complete cds. // chr9 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0 /// BC138431 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 985, mRNA (cDNA clone MGC:170056 IMAGE:8861451), complete cds. // chr9 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40127024:40127608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
NM_001081121 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931429I11 gene (4931429I11Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006510598 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4931429I11 gene (4931429I11Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510599 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4931429I11 gene (4931429I11Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510600 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4931429I11 gene (4931429I11Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:40894849:40964118:-1 gene:ENSMUSG00000032023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40895539:40911208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40915485:40965893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_001281954 // RefSeq // Mus musculus cytotoxic and regulatory T cell molecule (Crtam), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_019465 // RefSeq // Mus musculus cytotoxic and regulatory T cell molecule (Crtam), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:40972798:41004586:-1 gene:ENSMUSG00000032021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000180384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:40972799:41004628:-1 gene:ENSMUSG00000032021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000180872 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:40972753:40984467:-1 gene:ENSMUSG00000032021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// AF001104 // GenBank // Mus musculus class I MHC-restricted T cell associated molecule (CRTAM) mRNA, complete cds. // chr9 // 80 // 94 // 24 // 30 // 0 /// AK163744 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930098P10 product:cytotoxic and regulatory T cell molecule, full insert sequence. // chr9 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// BC117716 // GenBank // Mus musculus cytotoxic and regulatory T cell molecule, mRNA (cDNA clone MGC:141607 IMAGE:40088099), complete cds. // chr9 // 81 // 84 // 22 // 27 // 0 /// ENSMUST00000188848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:40972796:41004586:-1 gene:ENSMUSG00000032021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:40973513:41012868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000082975 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:41339436:41339541:-1 gene:ENSMUSG00000064909 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT068713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
AK146450 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920003L04 product:hypothetical Myb DNA-binding domain containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00007653 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011436 // RefSeq // Mus musculus sortilin-related receptor, LDLR class A repeats-containing (Sorl1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000060989 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:41964720:42124297:-1 gene:ENSMUSG00000049313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// AB015790 // GenBank // Mus musculus mRNA for LR11, complete cds. // chr9 // 81 // 98 // 39 // 48 // 0 /// AF031816 // GenBank // Mus musculus hybrid receptor gp250 precursor, mRNA, partial cds. // chr9 // 87 // 92 // 39 // 45 // 0 /// AK088154 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430005C19 product:sortilin-related receptor, LDLR class A repeats-containing, full insert sequence. // chr9 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1 /// GENSCAN00000050269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:41968603:42124113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0
NM_172769 // RefSeq // Mus musculus sterol-C5-desaturase (fungal ERG3, delta-5-desaturase) homolog (S. cerevisae) (Sc5d), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510253 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sterol-C5-desaturase (fungal ERG3, delta-5-desaturase) homolog (S. cerevisae) (Sc5d), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000052725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:42254177:42264300:-1 gene:ENSMUSG00000032018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000169609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:42254733:42264200:-1 gene:ENSMUSG00000032018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AB016248 // GenBank // Mus musculus C5D mRNA for sterol-C5-desaturase, complete cds. // chr9 // 83 // 83 // 20 // 24 // 0 /// AK043825 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830037K02 product:sterol-C5-desaturase (fungal ERG3, delta-5-desaturase) homolog (S. cerevisae), full insert sequence. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC024132 // GenBank // Mus musculus sterol-C5-desaturase (fungal ERG3, delta-5-desaturase) homolog (S. cerevisae), mRNA (cDNA clone MGC:37898 IMAGE:5101986), complete cds. // chr9 // 90 // 72 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000050261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:42255342:42264305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_009347 // RefSeq // Mus musculus tectorin alpha (Tecta), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006510150 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tectorin alpha (Tecta), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006510153 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tectorin alpha (Tecta), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 50 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000042190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:42329622:42399929:-1 gene:ENSMUSG00000037705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000159603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:42329619:42343994:-1 gene:ENSMUSG00000037705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 38 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000160940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:42329695:42399727:-1 gene:ENSMUSG00000037705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// AK136719 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230101K20 product:tectorin alpha, full insert sequence. // chr9 // 94 // 38 // 17 // 18 // 0 /// BC138426 // GenBank // Mus musculus tectorin alpha, mRNA (cDNA clone MGC:170051 IMAGE:8861446), complete cds. // chr9 // 98 // 98 // 46 // 47 // 0 /// BC171953 // GenBank // Mus musculus tectorin alpha, mRNA (cDNA clone MGC:198658 IMAGE:9054239), complete cds. // chr9 // 98 // 98 // 46 // 47 // 0 /// X99805 // GenBank // Mus musculus mRNA for alpha tectorin. // chr9 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// GENSCAN00000050270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:42326691:42450003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0
NM_175481 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor, ionotropic, kainate 4 (Grik4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006509942 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate receptor, ionotropic, kainate 4 (Grik4), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000034515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:42520412:42808699:-1 gene:ENSMUSG00000032017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000114865 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:42518135:42944493:-1 gene:ENSMUSG00000032017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC118010 // GenBank // Mus musculus glutamate receptor, ionotropic, kainate 4, mRNA (cDNA clone MGC:144024 IMAGE:40096690), complete cds. // chr9 // 95 // 93 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000050266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:42520829:42553561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 26 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000050271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:42562909:42746325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 51 // 51 // 22 // 43 // 1
AK035675 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530085L02 product:similar to spermatid-specific protein T1 [Loligo pealeii], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:42562909:42746325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_027144 // RefSeq // Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 12 (Arhgef12), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000072767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:42963843:43105486:-1 gene:ENSMUSG00000059495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000165665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:42963842:43105718:-1 gene:ENSMUSG00000059495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// AF467766 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide exchange factor (Larg) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000050034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:42967762:43106380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 71 // 31 // 32 // 0
NM_001034863 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 136 (Tmem136), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:43108653:43116570:-1 gene:ENSMUSG00000048503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK128910 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH2023684. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC139046 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 136, mRNA (cDNA clone MGC:170673 IMAGE:8862068), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC139047 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 136, mRNA (cDNA clone MGC:170674 IMAGE:8862069), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:43111320:43145318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_011139 // RefSeq // Mus musculus POU domain, class 2, transcription factor 3 (Pou2f3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000034513 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:43123939:43210369:-1 gene:ENSMUSG00000032015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000176636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:43124540:43205755:-1 gene:ENSMUSG00000032015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// L14677 // GenBank // Mus musculus Epoc-1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000050026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:43111320:43145318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_178644 // RefSeq // Mus musculus OAF homolog (Drosophila) (Oaf), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:43221278:43239816:-1 gene:ENSMUSG00000032014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025514 // GenBank // Mus musculus OAF homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:38098 IMAGE:5309953), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC026022 // GenBank // Mus musculus OAF homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:37810 IMAGE:5098241), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC028824 // GenBank // Mus musculus OAF homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:37800 IMAGE:5097873), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC034836 // GenBank // Mus musculus OAF homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:37934 IMAGE:5125217), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:43222574:43239573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
AK138823 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430086B14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00007662 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000056328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:44110781:44113504:-1 gene:ENSMUSG00000053128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000162126 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:44066327:44113500:-1 gene:ENSMUSG00000053128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// AK085078 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430033O10 product:RING FINGER PROTEIN WITH LEUCINE ZIPPER RNF26 (RESERVED) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// ENSMUST00000185479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44066327:44113500:-1 gene:ENSMUSG00000053128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
ENSMUST00000180670 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:9:44123768:44134485:-1 gene:ENSMUSG00000097617 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK143007 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030032N08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_140937 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10687 (Gm10687), misc_RNA. // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// XR_405632 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10687 (Gm10687), misc_RNA. // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT068826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT068829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// KnowTID_00007666 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// KnowTID_00007667 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT068827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT068828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_007619 // RefSeq // Mus musculus Casitas B-lineage lymphoma (Cbl), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006509964 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Casitas B-lineage lymphoma (Cbl), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000037644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44149262:44234046:-1 gene:ENSMUSG00000034342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK085140 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430042L22 product:Casitas B-lineage lymphoma, full insert sequence. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC125285 // GenBank // Mus musculus Casitas B-lineage lymphoma, mRNA (cDNA clone MGC:158988 IMAGE:40129800), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44151445:44233888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
AF334612 // GenBank // Mus musculus natrium-phosphate cotransporter IIa C-terminal-associated protein 2 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_133226 // RefSeq // Mus musculus PDZ domain containing 3 (Pdzd3), mRNA. // chr9 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000034618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44247312:44251464:-1 gene:ENSMUSG00000032105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000054273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44248201:44287453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001163742 // RefSeq // Mus musculus NLR family member X1 (Nlrx1), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_001163743 // RefSeq // Mus musculus NLR family member X1 (Nlrx1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_178420 // RefSeq // Mus musculus NLR family member X1 (Nlrx1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44252713:44268491:-1 gene:ENSMUSG00000032109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000168499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44252713:44268599:-1 gene:ENSMUSG00000032109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000169651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44252713:44268187:-1 gene:ENSMUSG00000032109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC050054 // GenBank // Mus musculus NLR family member X1, mRNA (cDNA clone MGC:60725 IMAGE:30012053), complete cds. // chr9 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// AK145780 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0042L12 product:Hypothetical P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases structure containing protein (Fragment), full insert sequence. // chr9 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000054273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44248201:44287453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_172162 // RefSeq // Mus musculus histone H4 transcription factor (Hinfp), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44295673:44305671:-1 gene:ENSMUSG00000032119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC029091 // GenBank // Mus musculus histone H4 transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:27746 IMAGE:2651006), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// CT010239 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836C0651D for gene AA589481, Expressed sequence AA589481; complete cds, incl. stopcodon. // chr9 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44290845:44306788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_027909 // RefSeq // Mus musculus C2 calcium-dependent domain containing 2-like (C2cd2l), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000065080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44309237:44320282:-1 gene:ENSMUSG00000032120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK122237 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0285 protein. // chr9 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC056612 // GenBank // Mus musculus C2 calcium-dependent domain containing 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:65445 IMAGE:4952570), complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC060156 // GenBank // Mus musculus C2 calcium-dependent domain containing 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:64682 IMAGE:6810220), complete cds. // chr9 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// AK039220 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230109H15 product:hypothetical C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB) structure containing protein, full insert sequence. // chr9 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000054285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44311056:44319888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001110251 // RefSeq // Mus musculus hydroxymethylbilane synthase (Hmbs), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_013551 // RefSeq // Mus musculus hydroxymethylbilane synthase (Hmbs), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44336350:44344228:-1 gene:ENSMUSG00000032126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44336350:44342381:-1 gene:ENSMUSG00000032126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK028234 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810449A07 product:hydroxymethylbilane synthase, full insert sequence. // chr9 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// AK184386 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0129M13, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000065269, based on BLAT search. // chr9 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC003861 // GenBank // Mus musculus hydroxymethylbilane synthase, mRNA (cDNA clone MGC:6604 IMAGE:3487642), complete cds. // chr9 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// AK158160 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930036J03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000054270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44336672:44342053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT068842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_027889 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 11 (yeast) (Vps11), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44348106:44361670:-1 gene:ENSMUSG00000032127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK032484 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430563F09 product:VACUOLAR PROTEIN SORTING PROTEIN 11 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK047228 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930037H14 product:RIKEN cDNA 1200011A11 gene, full insert sequence. // chr9 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AK162897 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230101H05 product:vacuolar protein sorting 11 (yeast), full insert sequence. // chr9 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// BC029004 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 11 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:38813 IMAGE:5360111), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44348420:44361631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_021789 // RefSeq // Mus musculus trafficking protein particle complex 4 (Trappc4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510523 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus trafficking protein particle complex 4 (Trappc4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// ENSMUST00000034623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44403761:44407548:-1 gene:ENSMUSG00000032112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF233340 // GenBank // Mus musculus synbindin mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK005276 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500017G03 product:synbindin, full insert sequence. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC038898 // GenBank // Mus musculus trafficking protein particle complex 4, mRNA (cDNA clone MGC:49061 IMAGE:5401311), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44404020:44407301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK053710 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130220E24 product:synbindin, full insert sequence. // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_201372 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 84 (Ccdc84), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006510473 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 84 (Ccdc84), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// XR_379123 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 84 (Ccdc84), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000053286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44410160:44418003:-1 gene:ENSMUSG00000043923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AK052757 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630044F24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// BC096560 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 84, mRNA (cDNA clone MGC:106805 IMAGE:1527981), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC116877 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 84, mRNA (cDNA clone MGC:151254 IMAGE:40126196), complete cds. // chr9 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC116879 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 84, mRNA (cDNA clone MGC:151256 IMAGE:40126198), complete cds. // chr9 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC144713 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053261. // chr9 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44410438:44441045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1
NM_001033469 // RefSeq // Mus musculus forkhead box R1 (Foxr1), mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000098837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44434234:44440868:-1 gene:ENSMUSG00000074397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44410438:44441045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_009476 // RefSeq // Mus musculus uroplakin 2 (Upk2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44452716:44454767:-1 gene:ENSMUSG00000041523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104260 // GenBank // Mus musculus uroplakin 2, mRNA (cDNA clone MGC:129164 IMAGE:40039813), complete cds. // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC104261 // GenBank // Mus musculus uroplakin 2, mRNA (cDNA clone MGC:129165 IMAGE:40039814), complete cds. // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// DQ358978 // GenBank // Mus musculus uroplakin 2 mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// U08030 // GenBank // Mus musculus uroplakin II (mup2) mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44452973:44454706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
AK034734 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430030B22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_007551 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 5 (Cxcr5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44511788:44526421:-1 gene:ENSMUSG00000047880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44511788:44556391:-1 gene:ENSMUSG00000047880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC064059 // GenBank // Mus musculus chemochine (C-X-C motif) receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:73612 IMAGE:1366773), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44513234:44526378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
XM_006509932 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin homology-like domain, family B, member 1 (Phldb1), transcript variant X26, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000082724 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:44736813:44736947:-1 gene:ENSMUSG00000064658 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT068871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_145985 // RefSeq // Mus musculus archain 1 (Arcn1), mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000034607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:44741564:44767845:-1 gene:ENSMUSG00000032096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC017124 // GenBank // Mus musculus archain 1, mRNA (cDNA clone MGC:27546 IMAGE:4480874), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC023728 // GenBank // Mus musculus archain 1, mRNA (cDNA clone MGC:36622 IMAGE:5351777), complete cds. // chr9 // 83 // 80 // 10 // 12 // 0 /// BC033387 // GenBank // Mus musculus archain 1, mRNA (cDNA clone MGC:36506 IMAGE:5368060), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC034754 // GenBank // Mus musculus archain 1, mRNA (cDNA clone MGC:36344 IMAGE:4954556), complete cds. // chr9 // 83 // 80 // 10 // 12 // 0 /// BC083152 // GenBank // Mus musculus archain 1, mRNA (cDNA clone MGC:102316 IMAGE:30461105), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_027865 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 25 (Tmem25), mRNA. // chr9 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// XM_006510604 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 25 (Tmem25), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000002100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:44793776:44799307:-1 gene:ENSMUSG00000002032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000114705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:44793776:44799242:-1 gene:ENSMUSG00000002032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000132020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:44793776:44799242:-1 gene:ENSMUSG00000002032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// BC060057 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 25, mRNA (cDNA clone MGC:64798 IMAGE:5696102), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// BC060243 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 25, mRNA (cDNA clone MGC:66738 IMAGE:5696102), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000054289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44794975:44798733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0
NM_138951 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 36 (Ttc36), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44799400:44802951:-1 gene:ENSMUSG00000039438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC021608 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 36, mRNA (cDNA clone MGC:37838 IMAGE:5099426), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC021613 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 36, mRNA (cDNA clone MGC:37912 IMAGE:5102393), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC024432 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 36, mRNA (cDNA clone MGC:37247 IMAGE:4972715), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC026825 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 36, mRNA (cDNA clone MGC:25970 IMAGE:4240199), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44799471:44802819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001081049 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific methyltransferase 2A (Kmt2a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000002095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44803355:44881274:-1 gene:ENSMUSG00000002028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000114689 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:44803355:44881296:-1 gene:ENSMUSG00000002028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000128768 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:44841563:44881296:-1 gene:ENSMUSG00000002028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000152241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:44822735:44848184:-1 gene:ENSMUSG00000002028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 58 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000054290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44807902:44853006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0
NM_009850 // RefSeq // Mus musculus CD3 antigen, gamma polypeptide (Cd3g), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000002101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:44969572:44980431:-1 gene:ENSMUSG00000002033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:44969754:44970820:-1 gene:ENSMUSG00000002033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000160886 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:44973620:44980431:-1 gene:ENSMUSG00000002033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC027528 // GenBank // Mus musculus CD3 antigen, gamma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:41180 IMAGE:1494674), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// EF474453 // GenBank // Mus musculus CD3 antigen gamma polypeptide (Cd3g) mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// GU456630 // GenBank // Mus musculus CD3 antigen gamma polypeptide (Cd3g) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// Y00635 // GenBank // Murine mRNA for T3 gamma glycoprotein. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M58149 // GenBank // Mouse T3/T cell antigen receptor T3-gamma subunit mRNA, complete cds. // chr9 // 73 // 85 // 16 // 22 // 0 /// AK133993 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830401A15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000012221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44970708:44980320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT068897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_007648 // RefSeq // Mus musculus CD3 antigen, epsilon polypeptide (Cd3e), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509966 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD3 antigen, epsilon polypeptide (Cd3e), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102832 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:44998743:45009590:-1 gene:ENSMUSG00000032093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC145926 // GenBank // Mus musculus CD3 antigen, epsilon polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:175813 IMAGE:40131229), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC145954 // GenBank // Mus musculus CD3 antigen, epsilon polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:175841 IMAGE:40131257), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// EF474454 // GenBank // Mus musculus CD3 antigen epsilon polypeptide (Cd3e) mRNA, complete cds. // chr9 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// GU456631 // GenBank // Mus musculus CD3 antigen epsilon polypeptide (Cd3e) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// J02990 // GenBank // Mouse mRNA for T-cell receptor, T3-epsilon glycoprotein. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:44999531:45009396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT068898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NR_033547 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10684 (Gm10684), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000098827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:45107176:45135606:-1 gene:ENSMUSG00000074385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT068907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_145403 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 4 (Tmprss4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:45172726:45204092:-1 gene:ENSMUSG00000032091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000163237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:45173305:45204060:-1 gene:ENSMUSG00000032091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000165263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:45173305:45203976:-1 gene:ENSMUSG00000032091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000170069 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:45172727:45204090:-1 gene:ENSMUSG00000032091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AY043240 // GenBank // Mus musculus channel-activating protease 2 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC021368 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 4, mRNA (cDNA clone MGC:29209 IMAGE:5030266), complete cds. // chr9 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:45174797:45180653:-1 gene:ENSMUSG00000032091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45158980:45204323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_008348 // RefSeq // Mus musculus interleukin 10 receptor, alpha (Il10ra), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034594 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:45253837:45269149:-1 gene:ENSMUSG00000032089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000176222 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:45254527:45269146:-1 gene:ENSMUSG00000032089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000176808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:45253840:45269149:-1 gene:ENSMUSG00000032089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// L12120 // GenBank // Mouse interleukin-10 receptor (Il10r) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45255530:45281455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000179911 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:45634706:45634812:-1 gene:ENSMUSG00000096202 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT068922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001081373 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 164 (Cep164), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000117194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:45766946:45828691:-1 gene:ENSMUSG00000043987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000132430 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:45778410:45802667:-1 gene:ENSMUSG00000043987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 19 // 19 // 0 /// BC066145 // GenBank // Mus musculus centrosomal protein 164, mRNA (cDNA clone IMAGE:30437501), complete cds. // chr9 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// BC027092 // GenBank HTC // Mus musculus centrosomal protein 164, mRNA (cDNA clone IMAGE:5359612). // chr9 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// GENSCAN00000012190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45768258:45823727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 93 // 36 // 37 // 0
BC027092 // GenBank HTC // Mus musculus centrosomal protein 164, mRNA (cDNA clone IMAGE:5359612). // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001081373 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 164 (Cep164), mRNA. // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSMUST00000117194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:45766946:45828691:-1 gene:ENSMUSG00000043987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSMUST00000132430 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:45778410:45802667:-1 gene:ENSMUSG00000043987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000012190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45768258:45823727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSMUST00000182691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:45835929:45836935:-1 gene:ENSMUSG00000098194 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000012201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45835929:45836935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_011526 // RefSeq // Mus musculus transgelin (Tagln), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:45929628:45936058:-1 gene:ENSMUSG00000032085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003795 // GenBank // Mus musculus transgelin, mRNA (cDNA clone MGC:6045 IMAGE:3600413), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// L41154 // GenBank // Mus musculus SM22 alpha mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// U36588 // GenBank // Mus musculus SM22 alpha mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45930371:45931761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_008775 // RefSeq // Mus musculus platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform 1b, subunit 2 (Pafah1b2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510084 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform 1b, subunit 2 (Pafah1b2), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006510085 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform 1b, subunit 2 (Pafah1b2), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000172450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:45965311:45984871:-1 gene:ENSMUSG00000003131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK012116 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610511I01 product:platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform 1b, alpha2 subunit, full insert sequence. // chr9 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// BC002037 // GenBank // Mus musculus platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform 1b, alpha2 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:5963 IMAGE:3486003), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC056211 // GenBank // Mus musculus platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform 1b, alpha2 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:60672 IMAGE:30012448), complete cds. // chr9 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// U57747 // GenBank // Mus musculus platelet-activating factor acetylhydrolase isoform Ib beta subunit mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:45968688:45999078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
D00925 // GenBank // Mus musculus mRNA for transcription factor S-II-related proteins, complete cds. // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001289755 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein C-III (Apoc3), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001289756 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein C-III (Apoc3), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001289833 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein C-III (Apoc3), transcript variant 4, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_023114 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein C-III (Apoc3), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509953 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus apolipoprotein C-III (Apoc3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000034586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:46233051:46235299:-1 gene:ENSMUSG00000032081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118649 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:46233198:46235636:-1 gene:ENSMUSG00000032081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000121916 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:46232933:46235260:-1 gene:ENSMUSG00000032081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC021776 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein C-III, mRNA (cDNA clone MGC:28546 IMAGE:4196708), complete cds. // chr9 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// ENSMUST00000145672 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:46234437:46235469:-1 gene:ENSMUSG00000032081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:46233223:46234713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
ENSMUST00000156612 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:46242621:46243529:-1 gene:ENSMUSG00000074373 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK143344 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330010G03 product:hypothetical Ankyrin/Leucine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT068954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_183104 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931429L15 gene (4931429L15Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510651 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4931429L15 gene (4931429L15Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000159565 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:46303361:46319986:-1 gene:ENSMUSG00000056617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000172280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:46304021:46311587:-1 gene:ENSMUSG00000056617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000046107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:46299050:46315823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000082739 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:46630113:46630219:-1 gene:ENSMUSG00000064673 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT068965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000046094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:46713814:46714158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NR_046048 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10677 (Gm10677), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT068993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030069 // RefSeq // Mus musculus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 2 (Nxpe2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510693 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 2 (Nxpe2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006510695 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 2 (Nxpe2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000034527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:48318006:48340898:-1 gene:ENSMUSG00000032028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC140955 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 55, member B, mRNA (cDNA clone MGC:175916 IMAGE:9055567), complete cds. // chr9 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135457 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:48319144:48340834:-1 gene:ENSMUSG00000032028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// XM_006510696 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 2 (Nxpe2), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:48284572:48375560:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_024233 // RefSeq // Mus musculus REX2, RNA exonuclease 2 homolog (S. cerevisiae) (Rexo2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509934 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus REX2, RNA exonuclease 2 homolog (S. cerevisiae) (Rexo2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:48468514:48480611:-1 gene:ENSMUSG00000032026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC003445 // GenBank // Mus musculus REX2, RNA exonuclease 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:6864 IMAGE:2651110), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509935 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus REX2, RNA exonuclease 2 homolog (S. cerevisiae) (Rexo2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// AK090202 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630016I10 product:SIMILAR TO SMALL FRAGMENT NUCLEASE homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000037128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:48468817:48495250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_144948 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 7 (Rbm7), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NR_037589 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 7 (Rbm7), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000170000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:48488709:48495330:-1 gene:ENSMUSG00000042396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF458961 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 7 (Rbm7) mRNA, complete cds. // chr9 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// BC054774 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:65655 IMAGE:6807637), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC116931 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:151308 IMAGE:40126250), complete cds. // chr9 // 94 // 76 // 15 // 16 // 0 /// BC119038 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:155354 IMAGE:8733787), complete cds. // chr9 // 94 // 76 // 15 // 16 // 0
NM_001033324 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 16 (Zbtb16), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:48654311:48835945:-1 gene:ENSMUSG00000066687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK040211 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430077H20 product:zinc finger protein 145, full insert sequence. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC138775 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:170402 IMAGE:8861797), complete cds. // chr9 // 80 // 77 // 16 // 20 // 0 /// Z47205 // GenBank // M.musculus PLZF gene. // chr9 // 80 // 77 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:48657142:48665317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_001099644 // RefSeq // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3A (Htr3a), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_013561 // RefSeq // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3A (Htr3a), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000003826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:48899214:48911099:-1 gene:ENSMUSG00000032269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF513221 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine receptor 3A short splice variant (Htr3a) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AY605711 // GenBank // Mus musculus serotonin-gated ion channel subunit A short splice variant (Htr3a) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr9 // 76 // 81 // 19 // 25 // 0 /// BC144799 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3A, mRNA (cDNA clone MGC:178355 IMAGE:9053347), complete cds. // chr9 // 86 // 90 // 24 // 28 // 0 /// BC145743 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3A, mRNA (cDNA clone MGC:175630 IMAGE:40131046), complete cds. // chr9 // 82 // 90 // 23 // 28 // 0 /// M74425 // GenBank // Mouse serotonin-gated ion channel (5HT3) mRNA, complete cds. // chr9 // 82 // 90 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:48899692:48910965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_020274 // RefSeq // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3B (Htr3b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000008734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:48935008:48964990:-1 gene:ENSMUSG00000008590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF155045 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine 3 receptor B subunit precursor, mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC046990 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3B, mRNA (cDNA clone MGC:54539 IMAGE:6309747), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:48935900:48972327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000055350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:49047602:49048294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172922 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and kinase domain containing 1 (Ankk1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:49415222:49427021:-1 gene:ENSMUSG00000032257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC145078 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and kinase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:178634 IMAGE:9053626), complete cds. // chr9 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:49415640:49426955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_172770 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 12 (Ttc12), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000055096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:49436963:49486225:-1 gene:ENSMUSG00000040219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC056616 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 12, mRNA (cDNA clone MGC:67683 IMAGE:4974294), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000146666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:49457578:49486215:-1 gene:ENSMUSG00000040219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// AK076457 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833406G21 product:hypothetical TPR repeat/Microbodies C-terminal targeting signal containing protein, full insert sequence. // chr9 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// GENSCAN00000055346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:49438401:49571904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 89 // 39 // 44 // 1
ENSMUST00000114476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:49517506:49798922:-1 gene:ENSMUSG00000039542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// BC011310 // GenBank // Mus musculus neural cell adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:12077 IMAGE:3708650), complete cds. // chr9 // 93 // 65 // 26 // 28 // 0 /// NM_001081445 // RefSeq // Mus musculus neural cell adhesion molecule 1 (Ncam1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 81 // 81 // 35 // 43 // 1 /// NM_001113204 // RefSeq // Mus musculus neural cell adhesion molecule 1 (Ncam1), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 81 // 81 // 35 // 43 // 1 /// NM_010875 // RefSeq // Mus musculus neural cell adhesion molecule 1 (Ncam1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 77 // 77 // 33 // 43 // 1 /// XM_006510058 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neural cell adhesion molecule 1 (Ncam1), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 84 // 84 // 36 // 43 // 1 /// ENSMUST00000166811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:49504361:49798729:-1 gene:ENSMUSG00000039542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 79 // 79 // 34 // 43 // 1 /// GENSCAN00000055346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:49438401:49571904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 70 // 70 // 30 // 43 // 1
ENSMUST00000178565 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:49825869:49825975:-1 gene:ENSMUSG00000094255 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT069040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_011220 // RefSeq // Mus musculus 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase (Pts), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:50521618:50528641:-1 gene:ENSMUSG00000032067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF043225 // GenBank // Mus musculus 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase (Pts) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC019660 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4500975. // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC029013 // GenBank // Mus musculus 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase, mRNA (cDNA clone MGC:36014 IMAGE:5357873), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510101 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase (Pts), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK160842 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3526402B21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000032103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:50522213:50528636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_133217 // RefSeq // Mus musculus beta-carotene oxygenase 2 (Bco2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006510045 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus beta-carotene oxygenase 2 (Bco2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006510047 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus beta-carotene oxygenase 2 (Bco2), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000119103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:50533087:50555181:-1 gene:ENSMUSG00000032066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AJ290392 // GenBank // Mus musculus mRNA for b,b-carotene-9,10-dioxygenase (b-diox-II gene). // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC107006 // GenBank // Mus musculus beta-carotene oxygenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:129322 IMAGE:40046913), complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// BC107007 // GenBank // Mus musculus beta-carotene oxygenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:129323 IMAGE:40046914), complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:50533406:50550702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0
NM_025687 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 12 (Tex12), mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000034568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:50557148:50561268:-1 gene:ENSMUSG00000032065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AF285582 // GenBank // Mus musculus testis protein TEX12 (Tex12) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC048458 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 12, mRNA (cDNA clone MGC:58186 IMAGE:6775116), complete cds. // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC061081 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 12, mRNA (cDNA clone MGC:74196 IMAGE:6773183), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_025848 // RefSeq // Mus musculus succinate dehydrogenase complex, subunit D, integral membrane protein (Sdhd), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:50596338:50603849:-1 gene:ENSMUSG00000000171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145731 // GenBank // Mus musculus succinate dehydrogenase complex, subunit D, integral membrane protein, mRNA (cDNA clone MGC:175618 IMAGE:40131034), complete cds. // chr9 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC145733 // GenBank // Mus musculus succinate dehydrogenase complex, subunit D, integral membrane protein, mRNA (cDNA clone MGC:175620 IMAGE:40131036), complete cds. // chr9 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000034564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:50739691:50746521:-1 gene:ENSMUSG00000032062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027409 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310030G06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35700 IMAGE:4035256), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:50636425:50746473:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_024441 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 2 (Hspb2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:50751072:50752354:-1 gene:ENSMUSG00000038086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC064051 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:73576 IMAGE:948723), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_001164708 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 2 (Hspb2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000032115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:50751279:50752270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0
NM_001033534 // RefSeq // Mus musculus layilin (Layn), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000098782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:51056780:51077094:-1 gene:ENSMUSG00000060594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC139816 // GenBank // Mus musculus layilin, mRNA (cDNA clone MGC:161835 IMAGE:40140447), complete cds. // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:51057296:51076970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000170947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:51081313:51102078:-1 gene:ENSMUSG00000032057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK014780 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833427G06 product:hypothetical Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site containing protein, full insert sequence. // chr9 // 76 // 86 // 19 // 25 // 0 /// BC048587 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4833427G06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58631 IMAGE:6707436), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK132837 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930432O12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 73 // 76 // 16 // 22 // 0
NR_029654 // RefSeq // Mus musculus microRNA 34c (Mir34c), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083653 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:51103034:51103110:-1 gene:ENSMUSG00000065587 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-34c // miRBase Micro RNA Database // MI0000403 Mus musculus miR-34c stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029655 // RefSeq // Mus musculus microRNA 34b (Mir34b), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083558 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:51103562:51103645:-1 gene:ENSMUSG00000065492 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-34b // miRBase Micro RNA Database // MI0000404 Mus musculus miR-34b stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027217 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810046K07 gene (1810046K07Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006510588 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1810046K07 gene (1810046K07Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000039959 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:51289686:51328917:-1 gene:ENSMUSG00000036027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000181366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:51290444:51312669:-1 gene:ENSMUSG00000036027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC120857 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810046K07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:156094 IMAGE:40129780), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120859 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810046K07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:156096 IMAGE:40129782), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:51290047:51312663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NR_033560 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 20, opposite strand (Arhgap20os), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000125400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:51839507:51875803:-1 gene:ENSMUSG00000074354 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000130086 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:51840372:51875788:-1 gene:ENSMUSG00000074354 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000142579 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:51839515:51875885:-1 gene:ENSMUSG00000074354 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000152203 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:51832814:51875886:-1 gene:ENSMUSG00000074354 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// AK135715 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420405M03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONMMUT069100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT069099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000039029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:51874753:51876323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_007996 // RefSeq // Mus musculus ferredoxin 1 (Fdx1), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:51943307:51963533:-1 gene:ENSMUSG00000032051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC099518 // GenBank // Mus musculus ferredoxin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30847319), partial cds. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC132173 // GenBank // Mus musculus ferredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:163804 IMAGE:40130450), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC132175 // GenBank // Mus musculus ferredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:163806 IMAGE:40130452), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// D43689 // GenBank // Mus musculus mRNA for adrenodoxin, complete cds, clone MF1-1. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// D43690 // GenBank // Mus musculus mRNA for adrenodoxin, complete cds, clone MF41-1. // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// L29123 // GenBank // Mus musculus adrenodoxin mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006510006 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ferredoxin 1 (Fdx1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// AK148115 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370022H24 product:ferredoxin 1, full insert sequence. // chr9 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// AK054524 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330036N16 product:ferredoxin 1, full insert sequence. // chr9 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000039052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:51943535:51963467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT069112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001162921 // RefSeq // Mus musculus zinc finger CCCH type containing 12C (Zc3h12c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:52111985:52168111:-1 gene:ENSMUSG00000035164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:52115406:52132335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001162921 // RefSeq // Mus musculus zinc finger CCCH type containing 12C (Zc3h12c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:52111985:52168111:-1 gene:ENSMUSG00000035164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:52138739:52172900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001286641 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI593442 (AI593442), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// NM_178906 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI593442 (AI593442), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000098768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:52673044:52679429:-1 gene:ENSMUSG00000078307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// AK033979 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330131O08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 96 // 55 // 26 // 27 // 0 /// BC109328 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI593442, mRNA (cDNA clone MGC:130101 IMAGE:40051267), complete cds. // chr9 // 100 // 20 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000039034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:52677676:52689661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 20 // 9 // 10 // 0 /// NONMMUT069127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1
NM_029936 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 10 (Ddx10), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006510684 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 10 (Ddx10), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000065630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:53098454:53248112:-1 gene:ENSMUSG00000053289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC080729 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 10, mRNA (cDNA clone MGC:91294 IMAGE:6504816), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000043886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:53054092:53264786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
NM_007499 // RefSeq // Mus musculus ataxia telangiectasia mutated (Atm), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// ENSMUST00000118282 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:53439149:53536740:-1 gene:ENSMUSG00000034218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// BC138525 // GenBank // Mus musculus ataxia telangiectasia mutated homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:170150 IMAGE:8861545), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// U43678 // GenBank // Mus musculus ataxia telangiectasia gene homolog (Atm) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// GENSCAN00000043875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:53439746:53531748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 48 // 48 // 0
AK053272 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130003O13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_144784 // RefSeq // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acetyltransferase 1 (Acat1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034547 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:53580522:53610382:-1 gene:ENSMUSG00000032047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC024763 // GenBank // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acetyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:39067 IMAGE:5365469), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:53582545:53610275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0
NM_175562 // RefSeq // Mus musculus RAB39, member RAS oncogene family (Rab39), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000068449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:53684110:53706232:-1 gene:ENSMUSG00000055069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB232635 // GenBank // Mus musculus Rab39A mRNA for Rab39A, complete cds. // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AK041076 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530080P16 product:weakly similar to RAS-RELATED PROTEIN RAB-39 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC049787 // GenBank // Mus musculus RAB39, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:59389 IMAGE:6511404), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_177769 // RefSeq // Mus musculus ELMO/CED-12 domain containing 1 (Elmod1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000048409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:53911460:53975301:-1 gene:ENSMUSG00000041986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000166580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:53911460:53936834:-1 gene:ENSMUSG00000041986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC120566 // GenBank // Mus musculus ELMO domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40129489), partial cds. // chr9 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC144963 // GenBank // Mus musculus ELMO domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:178519 IMAGE:9053511), complete cds. // chr9 // 88 // 79 // 23 // 26 // 0 /// AK164094 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530013I15 product:hypothetical Engulfment and cell motility, ELM containing protein, full insert sequence. // chr9 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// GENSCAN00000034012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:53895878:53976098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_001033535 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 3 (Tnfaip8l3), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000098760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:54025606:54068411:-1 gene:ENSMUSG00000074345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC118003 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:141255 IMAGE:40057108), complete cds. // chr9 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// BC119769 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:141254 IMAGE:40057107), complete cds. // chr9 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0
NM_007810 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 19, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp19a1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:54165937:54193442:-1 gene:ENSMUSG00000032274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK143323 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330007H14 product:cytochrome P450, family 19, subfamily a, polypeptide 1, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC103670 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 19, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:124251 IMAGE:40047093), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC104489 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 19, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:124252 IMAGE:40047095), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// D00659 // GenBank // Mus musculus CYP mRNA for aromatase P450, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54084274:54193356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NR_045805 // RefSeq // Mus musculus gliomedin, opposite strand (Gldnos), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000149237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54268578:54301570:-1 gene:ENSMUSG00000074343 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT069186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_172771 // RefSeq // Mus musculus Dmx-like 2 (Dmxl2), mRNA. // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000118163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:54365158:54501626:-1 gene:ENSMUSG00000041268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000123709 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:54365260:54445420:-1 gene:ENSMUSG00000041268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000154092 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54365164:54381893:-1 gene:ENSMUSG00000041268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC023075 // GenBank // Mus musculus Dmx-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5361628), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000118600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54366111:54501496:-1 gene:ENSMUSG00000041268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONMMUT069187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54366418:54502079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_172771 // RefSeq // Mus musculus Dmx-like 2 (Dmxl2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000118163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:54365158:54501626:-1 gene:ENSMUSG00000041268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000118600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54366111:54501496:-1 gene:ENSMUSG00000041268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000123709 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:54365260:54445420:-1 gene:ENSMUSG00000041268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000127880 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:54415645:54474183:-1 gene:ENSMUSG00000041268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000144736 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54423173:54501571:-1 gene:ENSMUSG00000041268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 39 // 16 // 16 // 0 /// AK173043 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0856 protein. // chr9 // 100 // 59 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000154092 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:54365164:54381893:-1 gene:ENSMUSG00000041268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1 /// GENSCAN00000034002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54366418:54502079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT069187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
NM_019686 // RefSeq // Mus musculus calcium and integrin binding family member 2 (Cib2), mRNA. // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000041901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:54544794:54560218:-1 gene:ENSMUSG00000037493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB016080 // GenBank // Mus musculus mRNA for calcium binding protein Kip 2, complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC005739 // GenBank // Mus musculus calcium and integrin binding family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:11420 IMAGE:3599342), complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54545463:54560018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
NM_053178 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA synthetase bubblegum family member 1 (Acsbg1), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006511588 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acyl-CoA synthetase bubblegum family member 1 (Acsbg1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:54604877:54661870:-1 gene:ENSMUSG00000032281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB050554 // GenBank // Mus musculus lpd mRNA for lipidosis-related protein Lipidosin, complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC057322 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA synthetase bubblegum family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:66839 IMAGE:6832261), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:54605391:54628710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_145229 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence AY074887 (AY074887), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:54950230:54950998:-1 gene:ENSMUSG00000044820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY074887 // GenBank // Mus musculus cleft palate-related protein 1 (Mcpr1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119353 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AY074887, mRNA (cDNA clone MGC:155669 IMAGE:8734102), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC120606 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AY074887, mRNA (cDNA clone MGC:155843 IMAGE:40129529), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_148944 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 4 (Chrnb4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006510757 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 4 (Chrnb4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:55028156:55048544:-1 gene:ENSMUSG00000035200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF492840 // GenBank // Mus musculus nicotinic acetylcholine receptor beta4 subunit (Chrnb4) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY574269 // GenBank // Mus musculus neuronal nicotinic acetylcholine receptor beta4 subunit mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC138851 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 4, mRNA (cDNA clone MGC:170478 IMAGE:8861873), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:55030105:55048495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_145615 // RefSeq // Mus musculus electron transferring flavoprotein, alpha polypeptide (Etfa), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000034866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:55454508:55512243:-1 gene:ENSMUSG00000032314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC003432 // GenBank // Mus musculus electron transferring flavoprotein, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:6481 IMAGE:2646522), complete cds. // chr9 // 94 // 89 // 15 // 16 // 0 /// BC096645 // GenBank // Mus musculus electron transferring flavoprotein, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:106846 IMAGE:1245213), complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000046782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:55454724:55512069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1
NM_001081341 // RefSeq // Mus musculus S phase cyclin A-associated protein in the ER (Scaper), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000037408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:55549883:55919605:-1 gene:ENSMUSG00000034007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC157959 // GenBank // Mus musculus S phase cyclin A-associated protein in the ER, mRNA (cDNA clone MGC:189786 IMAGE:9007286), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC158062 // GenBank // Mus musculus S phase cyclin A-associated protein in the ER, mRNA (cDNA clone MGC:189978 IMAGE:9088165), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC172119 // GenBank // Mus musculus S phase cyclin A-associated protein in the ER, mRNA (cDNA clone MGC:198824 IMAGE:9054405), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC172151 // GenBank // Mus musculus S phase cyclin A-associated protein in the ER, mRNA (cDNA clone MGC:198856 IMAGE:9054821), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:55577295:55816809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000053519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:55838120:55913680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000082538 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:55555622:55555712:-1 gene:ENSMUSG00000064472 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_183111 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930563M21 gene (Rfpl3s), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006511523 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930563M21 gene (Rfpl3s), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006511524 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930563M21 gene (Rfpl3s), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000060468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:55962589:55980914:-1 gene:ENSMUSG00000050702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:55962743:55991309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_019793 // RefSeq // Mus musculus tetraspanin 3 (Tspan3), mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000034876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:56135885:56161070:-1 gene:ENSMUSG00000032324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// AB072450 // GenBank // Mus musculus tspan-3 mRNA for tetraspanin, complete cds. // chr9 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// AF133427 // GenBank // Mus musculus tetraspanin TM4-A homolog mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// AF242591 // GenBank // Mus musculus tetraspanin mRNA, complete cds. // chr9 // 93 // 83 // 27 // 29 // 0 /// AK053325 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130009O03 product:transmembrane 4 superfamily member 8, full insert sequence. // chr9 // 90 // 57 // 18 // 20 // 0 /// AK089494 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730039P20 product:transmembrane 4 superfamily member 8, full insert sequence. // chr9 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC043072 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 3, mRNA (cDNA clone MGC:57977 IMAGE:6404165), complete cds. // chr9 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000053533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:56136643:56163034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0
NM_172924 // RefSeq // Mus musculus pseudopodium-enriched atypical kinase 1 (Peak1), mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000061552 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:56205129:56418067:-1 gene:ENSMUSG00000074305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000188142 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:56201126:56244065:-1 gene:ENSMUSG00000074305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000053524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:56227087:56260642:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0
NM_198673 // RefSeq // Mus musculus outer dense fiber of sperm tails 3-like 1 (Odf3l1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006511248 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus outer dense fiber of sperm tails 3-like 1 (Odf3l1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006511249 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus outer dense fiber of sperm tails 3-like 1 (Odf3l1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006511250 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus outer dense fiber of sperm tails 3-like 1 (Odf3l1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000055036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:56848659:56851963:-1 gene:ENSMUSG00000045620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK142219 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330014A03 product:weakly similar to Shippo 1 [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC049697 // GenBank // Mus musculus outer dense fiber of sperm tails 3-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:58606 IMAGE:6706514), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:56848810:56852584:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_175483 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 33 (Snx33), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:56917200:56928371:-1 gene:ENSMUSG00000032733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC096472 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 33, mRNA (cDNA clone MGC:106212 IMAGE:3501525), complete cds. // chr9 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000035570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:56918451:56926783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NR_045886 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10658 (Gm10658), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:57056630:57071807:-1 gene:ENSMUSG00000074284 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_045886 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10658 (Gm10658), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000128125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:57056630:57071807:-1 gene:ENSMUSG00000074284 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000135527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:57057203:57071966:-1 gene:ENSMUSG00000074284 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK085949 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830032I05 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT069272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT069273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT069271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_025417 // RefSeq // Mus musculus COMM domain containing 4 (Commd4), mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XR_379436 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus COMM domain containing 4 (Commd4), transcript variant X4, misc_RNA. // chr9 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000065358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57155041:57158299:-1 gene:ENSMUSG00000032299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC033438 // GenBank // Mus musculus COMM domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:28257 IMAGE:3995599), complete cds. // chr9 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// BC037364 // GenBank // Mus musculus COMM domain containing 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:1349712), partial cds. // chr9 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// BC049222 // GenBank // Mus musculus COMM domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:54487 IMAGE:2649359), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC055798 // GenBank // Mus musculus COMM domain containing 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:6413235), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57144130:57178589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_028820 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700017B05 gene (1700017B05Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006511516 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700017B05 gene (1700017B05Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000034846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57252322:57262599:-1 gene:ENSMUSG00000032300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK080676 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830081I21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 76 // 58 // 16 // 21 // 0 /// BC118527 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700017B05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144191 IMAGE:40098810), complete cds. // chr9 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// BC150963 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700017B05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183874 IMAGE:9087874), complete cds. // chr9 // 89 // 50 // 16 // 18 // 0 /// BC150965 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700017B05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183876 IMAGE:9087876), complete cds. // chr9 // 89 // 50 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000035567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57253962:57299565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
NM_020270 // RefSeq // Mus musculus secretory carrier membrane protein 5 (Scamp5), mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006511318 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus secretory carrier membrane protein 5 (Scamp5), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000046587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57441328:57468024:-1 gene:ENSMUSG00000040722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AF241833 // GenBank // Mus musculus secretory carrier membrane protein 5 mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// BC018613 // GenBank // Mus musculus secretory carrier membrane protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:27646 IMAGE:4511417), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57433710:57451986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
NM_025837 // RefSeq // Mus musculus mannose phosphate isomerase (Mpi), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510769 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mannose phosphate isomerase (Mpi), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006510772 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mannose phosphate isomerase (Mpi), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000034856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:57544256:57552763:-1 gene:ENSMUSG00000032306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:57548257:57552266:-1 gene:ENSMUSG00000032306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AF244360 // GenBank // Mus musculus phosphomannose isomerase mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC009068 // GenBank // Mus musculus mannose phosphate isomerase, mRNA (cDNA clone MGC:6520 IMAGE:2650791), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC051163 // GenBank // Mus musculus mannose phosphate isomerase, mRNA (cDNA clone MGC:56772 IMAGE:6466145), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC057612 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6401366, with apparent retained intron. // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XM_006510770 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mannose phosphate isomerase (Mpi), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000035557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57544720:57561055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_146223 // RefSeq // Mus musculus complexin 3 (Cplx3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57600019:57606281:-1 gene:ENSMUSG00000039714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY264290 // GenBank // Mus musculus complexin III mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC016632 // GenBank // Mus musculus complexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:21420 IMAGE:4500804), complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC024854 // GenBank // Mus musculus complexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:38804 IMAGE:5359915), complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC033343 // GenBank // Mus musculus complexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:38887 IMAGE:5361914), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57602237:57606144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_199222 // RefSeq // Mus musculus lectin, mannose-binding 1 like (Lman1l), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000044937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:57607085:57620774:-1 gene:ENSMUSG00000056271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000093832 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:57607085:57620774:-1 gene:ENSMUSG00000056271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB211986 // GenBank // Mus musculus slamp mRNA for sublingual acinar membrane protein, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC020188 // GenBank // Mus musculus lectin, mannose-binding 1 like, mRNA (cDNA clone MGC:28923 IMAGE:4925160), complete cds. // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006511093 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lectin, mannose-binding 1 like (Lman1l), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000035563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57607148:57620670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_007783 // RefSeq // Mus musculus c-src tyrosine kinase (Csk), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006510803 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus c-src tyrosine kinase (Csk), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57626647:57645653:-1 gene:ENSMUSG00000032312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK137297 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530099L19 product:c-src tyrosine kinase, full insert sequence. // chr9 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC018394 // GenBank // Mus musculus c-src tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:25873 IMAGE:4206879), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC052006 // GenBank // Mus musculus c-src tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:62329 IMAGE:5685297), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC095962 // GenBank HTC // Mus musculus c-src tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone IMAGE:5400767), with apparent retained intron. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// U05247 // GenBank // Mus musculus c-Src kinase (Csk) mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// XM_006510804 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus c-src tyrosine kinase (Csk), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000035558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57627321:57654329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_009993 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 1, subfamily a, polypeptide 2 (Cyp1a2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57676937:57683655:-1 gene:ENSMUSG00000032310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC018298 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 1, subfamily a, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:18574 IMAGE:4196676), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC054827 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 1, subfamily a, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:62745 IMAGE:5054733), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57677228:57693764:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_007713 // RefSeq // Mus musculus CDC-like kinase 3 (Clk3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006510739 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CDC-like kinase 3 (Clk3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000065330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:57750711:57765860:-1 gene:ENSMUSG00000032316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF033565 // GenBank // Mus musculus cdc2/CDC28-like protein kinase 3 (Clk3) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK009908 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310050J23 product:CDC-like kinase 3, full insert sequence. // chr9 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC085084 // GenBank // Mus musculus CDC-like kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:103028 IMAGE:6309020), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_006510740 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CDC-like kinase 3 (Clk3), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000035555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:57750945:57810480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1
NM_001195431 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin superfamily containing leucine-rich repeat (Islr), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_012043 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin superfamily containing leucine-rich repeat (Islr), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:58156265:58159221:-1 gene:ENSMUSG00000037206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:58156265:58158554:-1 gene:ENSMUSG00000037206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AB024538 // GenBank // Mus musculus Islr(immunoglobulin superfamily containing leucine-rich repeat) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC006602 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin superfamily containing leucine-rich repeat, mRNA (cDNA clone MGC:11409 IMAGE:3966024), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:58156936:58158246:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_010729 // RefSeq // Mus musculus lysyl oxidase-like 1 (Loxl1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000061799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:58287723:58313212:-1 gene:ENSMUSG00000032334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF357006 // GenBank // Mus musculus lysyl oxidase-like 1 (Loxl1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC003973 // GenBank // Mus musculus lysyl oxidase-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3488791), partial cds. // chr9 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// BC037999 // GenBank // Mus musculus lysyl oxidase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:46960 IMAGE:5251968), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC098243 // GenBank // Mus musculus lysyl oxidase-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5147246), complete cds. // chr9 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// U79144 // GenBank // Mus musculus lysyl oxidase-2 (Lox2) mRNA, partial cds. // chr9 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000028198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:58290682:58312886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NM_028854 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 21 (Tbc1d21), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000040217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:58359804:58370369:-1 gene:ENSMUSG00000036244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC100468 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:118289 IMAGE:30916687), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC132329 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:163960 IMAGE:40130606), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC138332 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:169957 IMAGE:8861352), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC145239 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:178799 IMAGE:9053791), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC145240 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053792. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:58350816:58379389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_133983 // RefSeq // Mus musculus CD276 antigen (Cd276), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:58524300:58540941:-1 gene:ENSMUSG00000035914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000165365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:58524302:58555132:-1 gene:ENSMUSG00000035914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK031354 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030411F23 product:COSTIMULATORY MOLECULE homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AY190318 // GenBank // Mus musculus B7-H3 (B7h3) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC019436 // GenBank // Mus musculus CD276 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:25700 IMAGE:3674228), complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC056608 // GenBank // Mus musculus CD276 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:62674 IMAGE:6397680), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// DQ832276 // GenBank // Mus musculus CD276 antigen precursor (Cd276) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:58510397:58560859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_001042752 // RefSeq // Mus musculus neogenin (Neo1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_008684 // RefSeq // Mus musculus neogenin (Neo1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000068664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:58874679:59036441:-1 gene:ENSMUSG00000032340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK084609 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330021F23 product:neogenin, full insert sequence. // chr9 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// BC054540 // GenBank // Mus musculus neogenin, mRNA (cDNA clone MGC:62354 IMAGE:6406007), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:58881828:58933288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_175325 // RefSeq // Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 4 (human) (Bbs4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000026265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:59321966:59353508:-1 gene:ENSMUSG00000025235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC145771 // GenBank // Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 4 (human), mRNA (cDNA clone MGC:175658 IMAGE:40131074), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC145773 // GenBank // Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 4 (human), mRNA (cDNA clone MGC:175660 IMAGE:40131076), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59322870:59362596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_019927 // RefSeq // Mus musculus ariadne ubiquitin-conjugating enzyme E2 binding protein homolog 1 (Drosophila) (Arih1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006511140 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ariadne ubiquitin-conjugating enzyme E2 binding protein homolog 1 (Drosophila) (Arih1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026264 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59393113:59486618:-1 gene:ENSMUSG00000025234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165322 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:59393294:59486347:-1 gene:ENSMUSG00000025234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000171975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:59388258:59486614:-1 gene:ENSMUSG00000025234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC038034 // GenBank // Mus musculus ariadne ubiquitin-conjugating enzyme E2 binding protein homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:47121 IMAGE:4035861), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC057680 // GenBank // Mus musculus ariadne ubiquitin-conjugating enzyme E2 binding protein homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:68355 IMAGE:3498094), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000168497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59425736:59486056:-1 gene:ENSMUSG00000025234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000025360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59393294:59462751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_178388 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 202 (Tmem202), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006511500 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 202 (Tmem202), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006511501 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 202 (Tmem202), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000055345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:59518686:59525501:-1 gene:ENSMUSG00000049526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK008510 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010301L01 product:hexosaminidase A, full insert sequence. // chr9 // 87 // 58 // 13 // 15 // 0 /// AK015202 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930425N13 product:ADULT MALE SMALL INTESTINE CDNA, RIKEN FULL-LENGTH ENRICHED LIBRARY, CLONE:2010301L01, FULL INSERT SEQUENCE homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0 /// BC049695 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 202, mRNA (cDNA clone MGC:58594 IMAGE:6705996), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132482 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 202, mRNA (cDNA clone MGC:164113 IMAGE:40130759), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC138196 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 202, mRNA (cDNA clone MGC:169820 IMAGE:8861215), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001172068 // RefSeq // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 8 (Senp8), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001172069 // RefSeq // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 8 (Senp8), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001172070 // RefSeq // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 8 (Senp8), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001172071 // RefSeq // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 8 (Senp8), transcript variant 5, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_027838 // RefSeq // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 8 (Senp8), transcript variant 4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000051039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:59734259:59750649:-1 gene:ENSMUSG00000051705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000163586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:59734259:59750649:-1 gene:ENSMUSG00000051705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000177963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:59734259:59750649:-1 gene:ENSMUSG00000051705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC037443 // GenBank // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 8, mRNA (cDNA clone MGC:47098 IMAGE:3599077), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000139070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:59766717:59767203:-1 gene:ENSMUSG00000087239 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000025329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59766712:59767203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001040426 // RefSeq // Mus musculus thrombospondin, type I, domain containing 4 (Thsd4), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000034829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:59969719:60141220:-1 gene:ENSMUSG00000032289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000098660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:59966931:60511035:-1 gene:ENSMUSG00000032289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000171654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:59966931:60497126:-1 gene:ENSMUSG00000032289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 43 // 43 // 0 /// AK138976 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530040J24 product:PLACE2000373 protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 91 // 49 // 49 // 0 /// BC139329 // GenBank // Mus musculus thrombospondin, type I, domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:170956 IMAGE:8862351), complete cds. // chr9 // 97 // 65 // 34 // 35 // 0 /// NM_172444 // RefSeq // Mus musculus thrombospondin, type I, domain containing 4 (Thsd4), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 67 // 67 // 36 // 54 // 1 /// GENSCAN00000019375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:59972396:60105610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000063858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:60821855:60838200:-1 gene:ENSMUSG00000052143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK042649 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730013H24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000098658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:61370797:61372193:-1 gene:ENSMUSG00000074256 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK155694 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730205C23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099575 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30919567. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187131 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:61370878:61371627:-1 gene:ENSMUSG00000074256 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018853 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein, large, P1 (Rplp1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000008036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:61913284:61914538:-1 gene:ENSMUSG00000007892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058685 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein, large, P1, mRNA (cDNA clone MGC:58068 IMAGE:6410847), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091747 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein, large, P1, mRNA (cDNA clone MGC:103132 IMAGE:2655117), complete cds. // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC092088 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein, large, P1, mRNA (cDNA clone MGC:103133 IMAGE:5102711), complete cds. // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC092536 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein, large, P1, mRNA (cDNA clone MGC:107272 IMAGE:6774435), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U29402 // GenBank // Mus musculus acidic ribosomal phosphoprotein P1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK203941 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0146M06, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000008036, based on BLAT search. // chr9 // 73 // 44 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000055007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:61913324:61948233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// BC092282 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4934583, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_024245 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 23 (Kif23), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000034815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:61917280:61946799:-1 gene:ENSMUSG00000032254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AK013939 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110001D19 product:kinesin superfamily protein 23, full insert sequence. // chr9 // 96 // 58 // 27 // 28 // 0 /// BC028559 // GenBank HTC // Mus musculus kinesin family member 23, mRNA (cDNA clone IMAGE:1380191), with apparent retained intron. // chr9 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// BC047273 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 23, mRNA (cDNA clone MGC:54492 IMAGE:6440797), complete cds. // chr9 // 93 // 96 // 43 // 46 // 0 /// AK076271 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4632406J10 product:kinesin-like 5 (mitotic kinesin-like protein 1), full insert sequence. // chr9 // 46 // 46 // 22 // 48 // 1 /// GENSCAN00000055007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:61913324:61948233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 35 // 35 // 0
NM_028748 // RefSeq // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member V (Paqr5), mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000034817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:61953738:62026856:-1 gene:ENSMUSG00000032278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113990 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:61956046:61976573:-1 gene:ENSMUSG00000032278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// AK052776 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630049G09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AY424294 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member V (Paqr5) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC054855 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member V, mRNA (cDNA clone IMAGE:6529053), partial cds. // chr9 // 87 // 72 // 20 // 23 // 0 /// BC100516 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member V, mRNA (cDNA clone MGC:118370 IMAGE:30919009), complete cds. // chr9 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000135050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:61953481:62026801:-1 gene:ENSMUSG00000032278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000055009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:61956046:62048515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_033320 // RefSeq // Mus musculus glucuronyl C5-epimerase (Glce), mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:62057248:62070606:-1 gene:ENSMUSG00000032252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// AF325532 // GenBank // Mus musculus heparin/heparan sulfate:glucuronic acid C5 epimerase mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// AF330049 // GenBank // Mus musculus D-glucuronyl C5-epimerase mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// BC094587 // GenBank // Mus musculus glucuronyl C5-epimerase, mRNA (cDNA clone MGC:106654 IMAGE:30618522), complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185675 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:62057248:62122610:-1 gene:ENSMUSG00000032252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000186514 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:62060011:62070840:-1 gene:ENSMUSG00000032252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000055001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:62060011:62122710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0
NM_025721 // RefSeq // Mus musculus sperm equatorial segment protein 1 (Spesp1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000056949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:62270729:62282179:-1 gene:ENSMUSG00000046846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC050754 // GenBank // Mus musculus sperm equatorial segment protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:58184 IMAGE:6773961), complete cds. // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000054998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:62240170:62282062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_175484 // RefSeq // Mus musculus coronin, actin binding protein, 2B (Coro2b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006511097 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coronin, actin binding protein, 2B (Coro2b), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000048043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:62419492:62537044:-1 gene:ENSMUSG00000041729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000164246 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:62427936:62510498:-1 gene:ENSMUSG00000041729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC062649 // GenBank // Mus musculus coronin, actin binding protein, 2B, mRNA (cDNA clone MGC:69712 IMAGE:6416110), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:62421282:62538046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1
NM_010193 // RefSeq // Mus musculus feminization 1 homolog b (C. elegans) (Fem1b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:62791832:62811648:-1 gene:ENSMUSG00000032244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB022863 // GenBank // Mus musculus mt-Fem mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// AF064448 // GenBank // Mus musculus sex-determination protein homolog Fem1b mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AF178633 // GenBank // Mus musculus FEM-1-like death receptor binding protein mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// AK154060 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430031F01 product:feminization 1 homolog b (C. elegans), full insert sequence. // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC068236 // GenBank // Mus musculus feminization 1 homolog b (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:96251 IMAGE:30544277), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:62796093:62821058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_019663 // RefSeq // Mus musculus protein inhibitor of activated STAT 1 (Pias1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000098651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:62880077:62980879:-1 gene:ENSMUSG00000032405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF077950 // GenBank // Mus musculus protein inhibitor of activated STAT protein PIAS1 mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// BC051417 // GenBank // Mus musculus protein inhibitor of activated STAT 1, mRNA (cDNA clone MGC:58893 IMAGE:6515027), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AK153871 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430001M22 product:protein inhibitor of activated STAT 1, full insert sequence. // chr9 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000037392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:62881968:62999137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0
NM_001163755 // RefSeq // Mus musculus SKI family transcriptional corepressor 1 (Skor1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// NM_001163757 // RefSeq // Mus musculus SKI family transcriptional corepressor 1 (Skor1), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// NM_001163758 // RefSeq // Mus musculus SKI family transcriptional corepressor 1 (Skor1), transcript variant 4, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NM_172446 // RefSeq // Mus musculus SKI family transcriptional corepressor 1 (Skor1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006510909 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SKI family transcriptional corepressor 1 (Skor1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055281 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:63138176:63146980:-1 gene:ENSMUSG00000022245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000116613 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:63138170:63148961:-1 gene:ENSMUSG00000022245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:63138170:63147011:-1 gene:ENSMUSG00000022245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// AB185113 // GenBank // Mus musculus mRNA for transcriptional corepressor Corl1, complete cds. // chr9 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// BC138063 // GenBank // Mus musculus ladybird homeobox 1 homolog (Drosophila) corepressor 1, mRNA (cDNA clone MGC:169687 IMAGE:8861082), complete cds. // chr9 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000037386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:63138871:63247405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0
AK020716 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230106F01 product:MITOGEN ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 5 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// AK166137 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730044F23 product:mitogen activated protein kinase kinase 5, full insert sequence. // chr9 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// BC013697 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:3666559), complete cds. // chr9 // 95 // 42 // 18 // 19 // 0 /// BC028260 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase 5, mRNA (cDNA clone MGC:40633 IMAGE:5067818), complete cds. // chr9 // 95 // 91 // 39 // 41 // 0 /// NM_011840 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase 5 (Map2k5), mRNA. // chr9 // 96 // 96 // 43 // 45 // 1 /// ENSMUST00000034920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:63163769:63377902:-1 gene:ENSMUSG00000058444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 96 // 43 // 45 // 1 /// AB019374 // GenBank // Mus musculus mRNA for MEK5, complete cds. // chr9 // 93 // 93 // 42 // 45 // 1 /// AK013856 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3000002B10 product:mitogen activated protein kinase kinase 5, full insert sequence. // chr9 // 42 // 42 // 19 // 45 // 1
NM_008542 // RefSeq // Mus musculus SMAD family member 6 (Smad6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006510823 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SMAD family member 6 (Smad6), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000041029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:63953076:64022059:-1 gene:ENSMUSG00000036867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF010133 // GenBank // Mus musculus Smad6 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC047280 // GenBank // Mus musculus MAD homolog 6 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:54743 IMAGE:6477199), complete cds. // chr9 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000144323 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:63954009:64016987:-1 gene:ENSMUSG00000036867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000018867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:63953524:64022424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT069534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_008927 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase 1 (Map2k1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006511196 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase 1 (Map2k1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000005066 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:64185770:64253631:-1 gene:ENSMUSG00000004936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000152535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:64187289:64195678:-1 gene:ENSMUSG00000004936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// BC054754 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:64764 IMAGE:6411664), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// L02526 // GenBank // Mouse protein kinase (MEK) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:64186685:64232577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_144813 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 1 (Slc24a1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006511003 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 1 (Slc24a1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000037798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64922861:64951607:-1 gene:ENSMUSG00000034452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC016094 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:27617 IMAGE:4504496), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC044859 // GenBank HTC // Mus musculus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5363577), with apparent retained intron. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:64922134:64949476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_021345 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 1 (Ptplad1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000036615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:64986985:65021717:-1 gene:ENSMUSG00000033629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC031755 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:25483 IMAGE:4488391), complete cds. // chr9 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// BC057023 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:67176 IMAGE:6813640), complete cds. // chr9 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// XM_006511324 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 1 (Ptplad1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000046945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65005566:65021543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 91 // 33 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000046961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:64988453:65002533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000101817 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:65196572:65196687:-1 gene:ENSMUSG00000095738 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT069598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT069599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NR_002852 // RefSeq // Mus musculus RNA, U5G small nuclear (Rnu5g), small nuclear RNA. // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000093721 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:65201726:65201841:-1 gene:ENSMUSG00000095892 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_028974 // RefSeq // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 13 (Kbtbd13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:65388684:65391652:-1 gene:ENSMUSG00000054978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65390276:65391652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178933 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 51, beta subunit (Slc51b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000065894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:65412753:65422773:-1 gene:ENSMUSG00000053862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY279396 // GenBank // Mus musculus organic solute transporter beta mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC115606 // GenBank // Mus musculus organic solute transporter beta, mRNA (cDNA clone MGC:144505 IMAGE:40102690), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC115607 // GenBank // Mus musculus organic solute transporter beta, mRNA (cDNA clone MGC:144506 IMAGE:40102691), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65412797:65415257:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0
XM_006511595 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730067D02 gene (A730067D02Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006511596 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730067D02 gene (A730067D02Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006511597 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730067D02 gene (A730067D02Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006544402 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730067D02 gene (A730067D02Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006544405 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730067D02 gene (A730067D02Rik), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XR_379562 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730067D02 gene (A730067D02Rik), transcript variant X7, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000061766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:65501453:65516999:-1 gene:ENSMUSG00000066510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65495292:65580192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AK172714 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830304I05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153119 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family O member 2 (Plekho2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006510749 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family O member 2 (Plekho2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// XM_006510750 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family O member 2 (Plekho2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006510751 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family O member 2 (Plekho2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000068944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:65554386:65580040:-1 gene:ENSMUSG00000050721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC028908 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family O member 2, mRNA (cDNA clone MGC:30448 IMAGE:3668775), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65495292:65580192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
XM_001476757 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 10144 (Gm10144), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65600067:65600273:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_172536 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 609 (Zfp609), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000159109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:65692391:65827564:-1 gene:ENSMUSG00000040524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC058943 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 609, mRNA (cDNA clone IMAGE:5715947), partial cds. // chr9 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC150683 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 609, mRNA (cDNA clone MGC:183594 IMAGE:9087594), complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65696148:65737020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0
NM_001170907 // RefSeq // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 4 (Trip4), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// NM_019797 // RefSeq // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 4 (Trip4), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006511301 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 4 (Trip4), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000117083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:65833156:65885056:-1 gene:ENSMUSG00000032386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000119245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:65831759:65908676:-1 gene:ENSMUSG00000032386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000122410 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:65831136:65885055:-1 gene:ENSMUSG00000032386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000179395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:65828930:65908794:-1 gene:ENSMUSG00000032386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// AF197574 // GenBank // Mus musculus ASC-1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// AF539614 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor coactivator ASC-1 testis specific form mRNA, complete cds; alternatively sliced. // chr9 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// BC021316 // GenBank // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 4, mRNA (cDNA clone MGC:29162 IMAGE:5027899), complete cds. // chr9 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:65827656:65887091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0
NM_001025612 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 22 (Snx22), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:66065176:66069731:-1 gene:ENSMUSG00000039452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138950 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 22, mRNA (cDNA clone MGC:170577 IMAGE:8861972), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC138951 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 22, mRNA (cDNA clone MGC:170578 IMAGE:8861973), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006511260 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexin 22 (Snx22), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000043982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:66067101:66124765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_019727 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 1 (Snx1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034946 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:66088133:66124886:-1 gene:ENSMUSG00000032382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000137542 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:66097406:66126587:-1 gene:ENSMUSG00000032382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// AB019214 // GenBank // Mus musculus mSNX1 mRNA for sorting nexin 1, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF154120 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 1 (Snx1) mRNA, complete cds. // chr9 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// BC066044 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 1, mRNA (cDNA clone MGC:90087 IMAGE:6807363), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC066189 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 1, mRNA (cDNA clone MGC:76660 IMAGE:30471747), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000139872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:66096559:66101698:-1 gene:ENSMUSG00000032382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000043982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:66067101:66124765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT069652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 92 // 39 // 11 // 12 // 0
ENSMUST00000122488 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:66360641:66360742:-1 gene:ENSMUSG00000084437 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT069660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_175206 // RefSeq // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 22 (Fbxl22), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000056890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:66508459:66514593:-1 gene:ENSMUSG00000050503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC100535 // GenBank // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 22, mRNA (cDNA clone MGC:118438 IMAGE:30138645), complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:66511643:66514553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_177583 // RefSeq // Mus musculus anterior pharynx defective 1b homolog (C. elegans) (Aph1b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000034934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:66775202:66795490:-1 gene:ENSMUSG00000032375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000113730 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:66779193:66795376:-1 gene:ENSMUSG00000032375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000168309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:66775209:66795436:-1 gene:ENSMUSG00000032375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK162585 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630038B02 product:similar to Gamma-secretase subunit APH-1B [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC079659 // GenBank // Mus musculus anterior pharynx defective 1b homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:90603 IMAGE:6853991), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000055013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:66784518:66803279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
NM_026674 // RefSeq // Mus musculus anterior pharynx defective 1c homolog (C. elegans) (Aph1c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000169282 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:66814994:66834726:-1 gene:ENSMUSG00000053040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC050923 // GenBank // Mus musculus anterior pharynx defective 1c homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:63261 IMAGE:6410104), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC063254 // GenBank // Mus musculus anterior pharynx defective 1c homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:66727 IMAGE:6410104), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006511398 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anterior pharynx defective 1c homolog (C. elegans) (Aph1c), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// ENSMUST00000057261 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:66819284:66834648:-1 gene:ENSMUSG00000053040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// AB197123 // GenBank // Mus musculus APH-1b mRNA for anterior pharynx defective 1b putative splice variant, complete cds. // chr9 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// GENSCAN00000055022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:66819294:66919633:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1
NM_173413 // RefSeq // Mus musculus RAB8B, member RAS oncogene family (Rab8b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000041139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:66843672:66919705:-1 gene:ENSMUSG00000036943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC059208 // GenBank // Mus musculus RAB8B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:66509 IMAGE:6405462), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC157974 // GenBank // Mus musculus RAB8B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:189796 IMAGE:9007296), complete cds. // chr9 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// XM_006511115 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB8B, member RAS oncogene family (Rab8b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// AB232601 // GenBank // Mus musculus Rab8B mRNA for Rab8B, complete cds. // chr9 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// NONMMUT069683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 73 // 61 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000055022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:66819294:66919633:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1