NM_022814 // RefSeq // Mus musculus sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1 (Svep1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000042850 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:58042442:58206596:-1 gene:ENSMUSG00000028369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AF206329 // GenBank // Mus musculus polydom protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AK136952 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430006B19 product:polydomain protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000047252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:58036009:58181436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0
NM_001290486 // RefSeq // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 1 (Lpar1), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NM_010336 // RefSeq // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 1 (Lpar1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NM_172989 // RefSeq // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 1 (Lpar1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000055018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:58435255:58553357:-1 gene:ENSMUSG00000038668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000107570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:58435255:58499403:-1 gene:ENSMUSG00000038668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000107571 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:58435255:58553311:-1 gene:ENSMUSG00000038668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000107574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:58435255:58553628:-1 gene:ENSMUSG00000038668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000107575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:58435255:58553553:-1 gene:ENSMUSG00000038668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC025425 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:29102 IMAGE:5009055), complete cds. // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// U48235 // GenBank // Mus musculus putative G protein-coupled receptor Rec1.3 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// U70622 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor (vzg-1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_146920 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 267 (Olfr267), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000059608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:58784779:58785720:-1 gene:ENSMUSG00000043385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC127983 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 267, mRNA (cDNA clone MGC:157545 IMAGE:40135361), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:58784779:58785720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_025968 // RefSeq // Mus musculus prostaglandin reductase 1 (Ptgr1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000030069 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:58965439:58987119:-1 gene:ENSMUSG00000028378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC014865 // GenBank // Mus musculus prostaglandin reductase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6495 IMAGE:2648051), complete cds. // chr4 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// CT010267 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F0851D for gene Ltb4dh, Leukotriene B4 12-hydroxydehydrogenase; complete cds, incl. stopcodon. // chr4 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:58966653:58998471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
XM_006538421 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus expressed sequence AI481877 (AI481877), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000107547 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:59043753:59138983:-1 gene:ENSMUSG00000038598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000122832 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:59081132:59111113:-1 gene:ENSMUSG00000038598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// AK135748 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420410H05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 96 // 60 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:59043867:59099411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 53 // 23 // 24 // 0
ENSMUST00000118446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:59162268:59163156:-1 gene:ENSMUSG00000082978 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000013080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:59117926:59163156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001163288 // RefSeq // Mus musculus sushi domain containing 1 (Susd1), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000040166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:59314683:59438633:-1 gene:ENSMUSG00000038578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000107544 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:59314754:59438633:-1 gene:ENSMUSG00000038578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC157977 // GenBank // Mus musculus predicted gene, OTTMUSG00000007332, mRNA (cDNA clone MGC:189951 IMAGE:9088138), complete cds. // chr4 // 90 // 86 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:59368535:59412377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000013064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:59292174:59354424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001013577 // RefSeq // Mus musculus INTS3 and NABP interacting protein (Inip), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095063 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:4:59769637:59783866:-1 gene:ENSMUSG00000038544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:59771297:59783808:-1 gene:ENSMUSG00000038544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC116204 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110054O05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143498 IMAGE:40090152), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC116205 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110054O05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143499 IMAGE:40090155), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000128548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:59774088:59783838:-1 gene:ENSMUSG00000038544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSMUST00000143756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:59772372:59801589:-1 gene:ENSMUSG00000038544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// AK005245 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500015C05 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK012023 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610312O17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT047511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000133015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:59889986:59894924:-1 gene:ENSMUSG00000073843 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK153620 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630023F22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021053 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 46, member 2 (Slc46a2), mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000030081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:59905126:59915056:-1 gene:ENSMUSG00000028386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF148145 // GenBank // Mus musculus putative thymic stromal co-transporter TSCOT mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC140962 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 46, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:175923 IMAGE:9055574), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:59899446:59923918:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_008648 // RefSeq // Mus musculus major urinary protein 4 (Mup4), mRNA. // chr4 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENSMUST00000075973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:59956804:59960710:-1 gene:ENSMUSG00000041333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC012227 // GenBank // Mus musculus major urinary protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:18534 IMAGE:4190774), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// EU882229 // GenBank // Mus musculus major urinary protein 1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// M16358 // GenBank // Mouse major urinary protein IV (MUP IV) mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000022671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:59957865:59960599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0
NM_008649 // RefSeq // Mus musculus major urinary protein 5 (Mup5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000082287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:61831319:61835233:-1 gene:ENSMUSG00000058523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC132310 // GenBank // Mus musculus major urinary protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:163941 IMAGE:40130587), complete cds. // chr4 // 75 // 87 // 15 // 20 // 0 /// BC132312 // GenBank // Mus musculus major urinary protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:163943 IMAGE:40130589), complete cds. // chr4 // 75 // 87 // 15 // 20 // 0 /// EU882233 // GenBank // Mus musculus major urinary protein 18 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// M16360 // GenBank // Mouse major urinary protein V (MUP V) mRNA, complete cds. // chr4 // 78 // 100 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:61831075:61835122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1
NM_001009550 // RefSeq // Mus musculus major urinary protein 21 (Mup21), mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000077719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:62147932:62150863:-1 gene:ENSMUSG00000066153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 79 // 14 // 15 // 0 /// EU882236 // GenBank // Mus musculus major urinary protein 26 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000041629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:62147952:62150752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0
NM_153504 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 183 (Rnf183), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:62427542:62434726:-1 gene:ENSMUSG00000063851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107455 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:62427540:62435252:-1 gene:ENSMUSG00000063851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC025512 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 183, mRNA (cDNA clone MGC:38073 IMAGE:5252940), complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:62427987:62477186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_024257 // RefSeq // Mus musculus haloacid dehalogenase-like hydrolase domain containing 3 (Hdhd3), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:62499008:62502276:-1 gene:ENSMUSG00000038422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003491 // GenBank // Mus musculus haloacid dehalogenase-like hydrolase domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:6931 IMAGE:2811559), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:62499182:62499937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
ENSMUST00000137448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:62509169:62519881:-1 gene:ENSMUSG00000028393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// BC018236 // GenBank // Mus musculus aminolevulinate, delta-, dehydratase, mRNA (cDNA clone MGC:18970 IMAGE:3992605), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NM_001276446 // RefSeq // Mus musculus aminolevulinate, delta-, dehydratase (Alad), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1 /// NM_008525 // RefSeq // Mus musculus aminolevulinate, delta-, dehydratase (Alad), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// XM_006537639 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aminolevulinate, delta-, dehydratase (Alad), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1 /// ENSMUST00000030090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:62509169:62519918:-1 gene:ENSMUSG00000028393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1 /// ENSMUST00000107444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:62509169:62519894:-1 gene:ENSMUSG00000028393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1 /// AK002300 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610007L13 product:aminolevulinate, delta-, dehydratase, full insert sequence. // chr4 // 82 // 82 // 31 // 38 // 1 /// BC055930 // GenBank // Mus musculus aminolevulinate, delta-, dehydratase, mRNA (cDNA clone MGC:68347 IMAGE:4207420), complete cds. // chr4 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// GENSCAN00000041612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:62509249:62517331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1
NM_021498 // RefSeq // Mus musculus polymerase (DNA directed), epsilon 3 (p17 subunit) (Pole3), mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:62522649:62525068:-1 gene:ENSMUSG00000028394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000128100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:62522649:62525068:-1 gene:ENSMUSG00000028394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000129930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:62524335:62525038:-1 gene:ENSMUSG00000028394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 93 // 48 // 14 // 15 // 0 /// AF230806 // GenBank // Mus musculus NF-YB-like protein mRNA, complete cds. // chr4 // 79 // 61 // 15 // 19 // 0 /// BC024996 // GenBank // Mus musculus polymerase (DNA directed), epsilon 3 (p17 subunit), mRNA (cDNA clone MGC:30997 IMAGE:5253060), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:62523944:62524996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT047586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 93 // 48 // 14 // 15 // 0
NM_007443 // RefSeq // Mus musculus alpha 1 microglobulin/bikunin (Ambp), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030041 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:63143275:63154173:-1 gene:ENSMUSG00000028356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC021660 // GenBank // Mus musculus alpha 1 microglobulin/bikunin, mRNA (cDNA clone MGC:14070 IMAGE:4193922), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D28812 // GenBank // Mus musculus mRNA for polyprotein precursor, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:63143375:63154055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_010616 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 12 (Kif12), mRNA. // chr4 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// XM_006537638 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin family member 12 (Kif12), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000030042 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:63165637:63172131:-1 gene:ENSMUSG00000028357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000124739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:63167729:63171189:-1 gene:ENSMUSG00000028357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 29 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000131760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:63165634:63172046:-1 gene:ENSMUSG00000028357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000154234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:63169407:63171730:-1 gene:ENSMUSG00000028357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 23 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000156618 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:63167477:63170797:-1 gene:ENSMUSG00000028357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 25 // 12 // 12 // 0 /// BC022225 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 12, mRNA (cDNA clone MGC:19162 IMAGE:4222522), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000018601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:63165245:63206837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 21 // 48 // 1
ENSMUST00000102861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:63607089:63622416:-1 gene:ENSMUSG00000058935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000102862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:63607089:63622428:-1 gene:ENSMUSG00000058935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BC048618 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700018C11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58695 IMAGE:6742642), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_177371 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 15 (Tnfsf15), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000062246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:63727084:63745113:-1 gene:ENSMUSG00000050395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF520786 // GenBank // Mus musculus TNF superfamily ligand TL1A (Tnfsf15) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// AY764130 // GenBank // Mus musculus vascular endothelial growth inhibitor (Tnfsf15) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC138207 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 15, mRNA (cDNA clone MGC:169831 IMAGE:8861226), complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC138208 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 15, mRNA (cDNA clone MGC:169832 IMAGE:8861227), complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC096494 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 15, mRNA (cDNA clone MGC:106290 IMAGE:30740802), complete cds. // chr4 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// GENSCAN00000018602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:63669351:63751776:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_009403 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 8 (Tnfsf8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030047 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:63831308:63861347:-1 gene:ENSMUSG00000028362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC117093 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:151470 IMAGE:40126412), complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC117097 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:151474 IMAGE:40126416), complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// L09754 // GenBank // Mus musculus Cd30 ligand mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:63832939:63861059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000107372 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:63959785:64020725:-1 gene:ENSMUSG00000028364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_011607 // RefSeq // Mus musculus tenascin C (Tnc), mRNA. // chr4 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENSMUST00000030056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:63959785:64020725:-1 gene:ENSMUSG00000028364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000107377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:63959785:64047015:-1 gene:ENSMUSG00000028364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// D90343 // GenBank // Mus musculus mRNA for tenascin, complete cds. // chr4 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// BC117979 // GenBank // Mus musculus tenascin C, mRNA (cDNA clone MGC:144208 IMAGE:40099589), complete cds. // chr4 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// BC117980 // GenBank // Mus musculus tenascin C, mRNA (cDNA clone MGC:144209 IMAGE:40099596), complete cds. // chr4 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:63917120:64020600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000121364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:64856926:64858139:-1 gene:ENSMUSG00000081941 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:64856920:64885084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_019514 // RefSeq // Mus musculus astrotactin 2 (Astn2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_207109 // RefSeq // Mus musculus astrotactin 2 (Astn2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000068214 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:65380803:66404611:-1 gene:ENSMUSG00000028373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000084496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:65380803:66404483:-1 gene:ENSMUSG00000028373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF116573 // GenBank // Mus musculus astrotactin2 (Astn2) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// XM_006538106 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus astrotactin 2 (Astn2), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AK172987 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0634 protein. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:65794479:66119305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSMUST00000117940 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:67518306:67518932:-1 gene:ENSMUSG00000080815 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000002169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:67518306:67518932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_019967 // RefSeq // Mus musculus bone morphogenic protein/retinoic acid inducible neural specific 1 (Brinp1), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000030036 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:68761514:68954397:-1 gene:ENSMUSG00000028351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000156773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:68795954:68841407:-1 gene:ENSMUSG00000028351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// AB060589 // GenBank // Mus musculus BRINP mRNA for BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein (BRINP), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// AF202896 // GenBank // Mus musculus DBCCR1 (DBCCR1) mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 60 // 19 // 21 // 0 /// BC048789 // GenBank // Mus musculus deleted in bladder cancer 1 (human), mRNA (cDNA clone IMAGE:6494212), complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// BC079630 // GenBank // Mus musculus deleted in bladder cancer 1 (human), mRNA (cDNA clone MGC:90661 IMAGE:5694980), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:68788786:68845895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0
NM_019641 // RefSeq // Mus musculus stathmin 1 (Stmn1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000030636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134468320:134473843:1 gene:ENSMUSG00000028832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000105867 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134468409:134473664:1 gene:ENSMUSG00000028832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:69925630:69926079:-1 gene:ENSMUSG00000046341 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// AB064953 // GenBank // Mus musculus mRNA for stathmin, complete cds. // chr4 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// BC010581 // GenBank // Mus musculus stathmin 1, mRNA (cDNA clone MGC:6962 IMAGE:3154091), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC031831 // GenBank // Mus musculus stathmin 1, mRNA (cDNA clone MGC:25093 IMAGE:4500926), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC054396 // GenBank // Mus musculus stathmin 1, mRNA (cDNA clone MGC:62596 IMAGE:6492045), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000105868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134469742:134473499:1 gene:ENSMUSG00000028832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000022575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:69925630:69932599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134468610:134473403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0
ENSMUST00000120465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:69954166:69955276:-1 gene:ENSMUSG00000084342 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000022576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:69954166:69981920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_145990 // RefSeq // Mus musculus CDK5 regulatory subunit associated protein 2 (Cdk5rap2), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// XM_006537750 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CDK5 regulatory subunit associated protein 2 (Cdk5rap2), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 97 // 76 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000076541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:70223023:70410418:-1 gene:ENSMUSG00000039298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000138561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:70238350:70264680:-1 gene:ENSMUSG00000039298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000144099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:70216856:70410443:-1 gene:ENSMUSG00000039298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC086696 // GenBank // Mus musculus CDK5 regulatory subunit associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:115759 IMAGE:30691910), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// BC110364 // GenBank // Mus musculus CDK5 regulatory subunit associated protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5388385), partial cds. // chr4 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// BC027761 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5353378, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1 /// GENSCAN00000022566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:70250327:70380481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:70184995:70245784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
ENSMUST00000120944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:70248636:70249373:-1 gene:ENSMUSG00000080902 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr4 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000022571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:70248636:70249373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_172694 // RefSeq // Mus musculus multiple EGF-like-domains 9 (Megf9), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000037881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:70461826:70534995:-1 gene:ENSMUSG00000039270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000107359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:70427065:70534928:-1 gene:ENSMUSG00000039270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK122378 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0818 protein. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088994 // GenBank // Mus musculus multiple EGF-like-domains 9, mRNA (cDNA clone MGC:115796 IMAGE:6734479), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC138128 // GenBank // Mus musculus multiple EGF-like-domains 9, mRNA (cDNA clone MGC:169752 IMAGE:8861147), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC138129 // GenBank // Mus musculus multiple EGF-like-domains 9, mRNA (cDNA clone MGC:169753 IMAGE:8861148), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:70433080:70463376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
XM_006543857 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102634852 (LOC102634852), mRNA. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000084489 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:71755643:71757965:-1 gene:ENSMUSG00000066141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:71675002:71757924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001199270 // RefSeq // Mus musculus aldolase 1 A, retrogene 1 (Aldoart1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000078617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:72850583:72852634:-1 gene:ENSMUSG00000059343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000179234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:72850583:72852632:-1 gene:ENSMUSG00000059343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// EF662061 // GenBank // Mus musculus aldolase A retroprotein 1 (Aldoart1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000022866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:72851310:72852569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001013393 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11487 (Gm11487), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000084480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:73401032:73405072:-1 gene:ENSMUSG00000066137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000022873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:73401173:73422488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000120048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:73422145:73423319:-1 gene:ENSMUSG00000082566 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:73401173:73422488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
ENSMUST00000117277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:73497615:73498477:-1 gene:ENSMUSG00000081871 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
NM_001017427 // RefSeq // Mus musculus RAS and EF hand domain containing (Rasef), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006537926 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS and EF hand domain containing (Rasef), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// XM_006537927 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS and EF hand domain containing (Rasef), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000058292 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:73714579:73790602:-1 gene:ENSMUSG00000043003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000102837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:73714579:73790709:-1 gene:ENSMUSG00000043003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// AK132691 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921529M08 product:hypothetical Ras GTPase superfamily/Ras small GTPase, Rab type containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC030882 // GenBank HTC // Mus musculus RAS and EF hand domain containing, mRNA (cDNA clone IMAGE:4460126), with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// BC125539 // GenBank // Mus musculus RAS and EF hand domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:159242 IMAGE:40130054), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC137774 // GenBank // Mus musculus RAS and EF hand domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:169398 IMAGE:8860793), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000022872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:73727565:73762962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 21 // 21 // 0
XM_006537926 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS and EF hand domain containing (Rasef), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:73769795:73810740:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027104 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310002L09 gene (2310002L09Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NM_027981 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310002L09 gene (2310002L09Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:73939371:73950846:-1 gene:ENSMUSG00000028396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000095023 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:73941579:73950845:-1 gene:ENSMUSG00000028396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC115483 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144293 IMAGE:40100595), complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BC115484 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144294 IMAGE:40100599), complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:73872342:73950645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NM_025849 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 261 (Tmem261), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:75277354:75278305:-1 gene:ENSMUSG00000028398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006432 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700027K24 product:inferred: RIKEN cDNA 3110001D03 gene / putative [Mus musculus], full insert sequence. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC022621 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3110001D03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:31180 IMAGE:4192355), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083950 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:75280626:75280755:-1 gene:ENSMUSG00000065884 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT047754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000174920 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:82061112:82061221:-1 gene:ENSMUSG00000092661 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001113209 // RefSeq // Mus musculus nuclear factor I/B (Nfib), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001113210 // RefSeq // Mus musculus nuclear factor I/B (Nfib), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001286127 // RefSeq // Mus musculus nuclear factor I/B (Nfib), transcript variant 4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001286131 // RefSeq // Mus musculus nuclear factor I/B (Nfib), transcript variant 5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_008687 // RefSeq // Mus musculus nuclear factor I/B (Nfib), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:82290173:82505308:-1 gene:ENSMUSG00000008575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:82290176:82505308:-1 gene:ENSMUSG00000008575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:82290173:82505770:-1 gene:ENSMUSG00000008575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
BC066147 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310067E19 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30462141). // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_009887 // RefSeq // Mus musculus cerberus 1 homolog (Xenopus laevis) (Cer1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:82881751:82885148:-1 gene:ENSMUSG00000038192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF031896 // GenBank // Mus musculus cerberus-related 1 (Cerr1) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AF035579 // GenBank // Mus musculus cerberus homolog (Cer-1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC132431 // GenBank // Mus musculus cerberus 1 homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:164062 IMAGE:40130708), complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC145993 // GenBank // Mus musculus cerberus 1 homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:175880 IMAGE:40131296), complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006537585 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cerberus 1 homolog (Xenopus laevis) (Cer1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000044417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:82882606:83020843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_027238 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 39B (Ttc39b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 39B (Ttc39b), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000102823 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:83220300:83324255:-1 gene:ENSMUSG00000038172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC020085 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 39B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4013480), complete cds. // chr4 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// BC151021 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 39B, mRNA (cDNA clone MGC:183934 IMAGE:9087934), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000082775 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:76274344:76274450:-1 gene:ENSMUSG00000064709 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000083017 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:83285804:83285910:-1 gene:ENSMUSG00000096801 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000083287 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:153576488:153576594:-1 gene:ENSMUSG00000065221 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT047898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT066182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT074431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001290527 // RefSeq // Mus musculus PC4 and SFRS1 interacting protein 1 (Psip1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NM_133948 // RefSeq // Mus musculus PC4 and SFRS1 interacting protein 1 (Psip1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000030207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:83455680:83486459:-1 gene:ENSMUSG00000028484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000107214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:83461871:83486453:-1 gene:ENSMUSG00000028484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000107215 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:83461871:83486458:-1 gene:ENSMUSG00000028484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AF339083 // GenBank // Mus musculus lens epithelium-derived growth factor b (mLedgfb) mRNA, complete cds. // chr4 // 82 // 63 // 14 // 17 // 0 /// BC043079 // GenBank // Mus musculus PC4 and SFRS1 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:57990 IMAGE:6400529), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC052177 // GenBank // Mus musculus PC4 and SFRS1 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:59472 IMAGE:6512126), complete cds. // chr4 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// AF339082 // GenBank // Mus musculus lens epithelium-derived growth factor a (Ledgfa) mRNA, complete cds. // chr4 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// AK139598 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020006B12 product:PC4 and SFRS1 interacting protein 1, full insert sequence. // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000044424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:83457019:83485788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
ENSMUST00000082672 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:83527628:83527768:-1 gene:ENSMUSG00000064606 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT047916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NONMMUT047947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000026590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:85176474:85232112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000082753 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:86043394:86043494:-1 gene:ENSMUSG00000064687 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT047961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001081096 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 154, member A (Fam154a), mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000030216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:86444641:86558303:-1 gene:ENSMUSG00000028492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000133793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:86479008:86557995:-1 gene:ENSMUSG00000028492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000151481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:86444641:86539117:-1 gene:ENSMUSG00000028492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK049262 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330017P09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000139694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:86481549:86558328:-1 gene:ENSMUSG00000028492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// AK076898 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930543A14 product:RIKEN cDNA 4930500O09 gene, full insert sequence. // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000010486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:86444814:86521424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT047970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT047971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_173400 // RefSeq // Mus musculus HAUS augmin-like complex, subunit 6 (Haus6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000070607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:86578855:86612055:-1 gene:ENSMUSG00000038047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000128381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:86585027:86612055:-1 gene:ENSMUSG00000038047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK173206 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1574 protein. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC068237 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6230416J20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:96558 IMAGE:30550558), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:86580787:86634934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NR_028545 // RefSeq // Mus musculus small Cajal body-specific RNA 8 (Scarna8), guide RNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000158333 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:86586453:86586583:-1 gene:ENSMUSG00000088958 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:86580787:86634934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_007408 // RefSeq // Mus musculus perilipin 2 (Plin2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006537557 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus perilipin 2 (Plin2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:86656565:86670060:-1 gene:ENSMUSG00000028494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000140382 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:86661934:86669768:-1 gene:ENSMUSG00000028494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000147097 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:86660121:86665725:-1 gene:ENSMUSG00000028494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000149700 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:86661934:86669560:-1 gene:ENSMUSG00000028494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AY035850 // GenBank // Mus musculus C57BL/6J adipose differentiation-related protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AY035851 // GenBank // Mus musculus DBA/2J adipose differentiation-related protein mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// BC054766 // GenBank // Mus musculus adipose differentiation related protein, mRNA (cDNA clone MGC:64802 IMAGE:6414796), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// M93275 // GenBank // Mouse adipose differentiation related protein (ADFP) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:86648499:86671127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_025760 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 2 (Ptplad2), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:88412930:88438926:-1 gene:ENSMUSG00000028497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK039602 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330070G19 product:RIKEN cDNA 4933428I03 gene, full insert sequence. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC020155 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:28334 IMAGE:4016383), complete cds. // chr4 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// ENSMUST00000132493 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:88396144:88438915:-1 gene:ENSMUSG00000028497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// ENSMUST00000151280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:88410341:88438928:-1 gene:ENSMUSG00000028497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// XM_006538189 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 2 (Ptplad2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// XM_006538190 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 2 (Ptplad2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// GENSCAN00000003782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88414264:88478836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_010510 // RefSeq // Mus musculus interferon beta 1, fibroblast (Ifnb1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055671 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88522025:88522774:-1 gene:ENSMUSG00000048806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119395 // GenBank // Mus musculus interferon beta 1, fibroblast, mRNA (cDNA clone MGC:155711 IMAGE:8734144), complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC119397 // GenBank // Mus musculus interferon beta 1, fibroblast, mRNA (cDNA clone MGC:155713 IMAGE:8734146), complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000003824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88522226:88558245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_206975 // RefSeq // Mus musculus interferon alpha 14 (Ifna14), mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000102808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88571229:88571798:-1 gene:ENSMUSG00000095896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC120722 // GenBank // Mus musculus interferon, alpha 14, mRNA (cDNA clone MGC:155959 IMAGE:40129645), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC125321 // GenBank // Mus musculus interferon, alpha 14, mRNA (cDNA clone MGC:159024 IMAGE:40129836), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000003819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88571229:88571798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_010507 // RefSeq // Mus musculus interferon alpha 9 (Ifna9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000102807 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88591813:88592385:-1 gene:ENSMUSG00000095270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88580193:88598070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 90 // 19 // 21 // 1
NM_177361 // RefSeq // Mus musculus interferon alpha 12 (Ifna12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000102806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88602580:88603376:-1 gene:ENSMUSG00000073811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY190046 // GenBank // Mus musculus interferon alpha-12 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC104352 // GenBank // Mus musculus interferon alpha 12, mRNA (cDNA clone MGC:129420 IMAGE:40049569), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC104353 // GenBank // Mus musculus interferon alpha 12, mRNA (cDNA clone MGC:129421 IMAGE:40049571), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
NM_198663 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence C87499 (C87499), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053304 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88627320:88634259:-1 gene:ENSMUSG00000038330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107142 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:88629188:88634191:-1 gene:ENSMUSG00000038330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000156062 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:88628898:88634142:-1 gene:ENSMUSG00000038330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC053719 // GenBank // Mus musculus expressed sequence C87499, mRNA (cDNA clone MGC:60825 IMAGE:30053512), complete cds. // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NR_027385 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence C87499 (C87499), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSMUST00000107143 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:88627320:88634211:-1 gene:ENSMUSG00000038330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSMUST00000134155 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:88628169:88634411:-1 gene:ENSMUSG00000038330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000003810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88602739:88630115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_177347 // RefSeq // Mus musculus interferon alpha 13 (Ifna13), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000072734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:88643641:88644459:-1 gene:ENSMUSG00000063376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000105149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:88643641:88644459:-1 gene:ENSMUSG00000063376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AY190047 // GenBank // Mus musculus interferon alpha-13 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC120724 // GenBank // Mus musculus interferon alpha 13, mRNA (cDNA clone MGC:155961 IMAGE:40129647), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC120750 // GenBank // Mus musculus interferon alpha 13, mRNA (cDNA clone MGC:155987 IMAGE:40129673), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000003827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88643816:88676856:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
NM_206867 // RefSeq // Mus musculus interferon alpha 16 (Ifna16), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000105148 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88675915:88676924:-1 gene:ENSMUSG00000078355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88643816:88676856:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_010503 // RefSeq // Mus musculus interferon alpha 2 (Ifna2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000105147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88682881:88683912:-1 gene:ENSMUSG00000078354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000003801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88683207:88683779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_008336 // RefSeq // Mus musculus interferon alpha B (Ifnab), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000071378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88690302:88691359:-1 gene:ENSMUSG00000100079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000096059 // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC116862 // GenBank // Mus musculus interferon alpha B, mRNA (cDNA clone MGC:151239 IMAGE:40126181), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC116864 // GenBank // Mus musculus interferon alpha B, mRNA (cDNA clone MGC:151241 IMAGE:40126183), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000003821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88690655:88691227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_172871 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 9 (Klhl9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88718292:88722465:-1 gene:ENSMUSG00000070923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094556 // GenBank // Mus musculus kelch-like 9 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:106634 IMAGE:6811241), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000141816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:88755195:88755590:-1 gene:ENSMUSG00000085473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK144774 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730031P11 product:hypothetical EGF-like domain containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000057837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:88867882:88868379:-1 gene:ENSMUSG00000054351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK016108 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930553M12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177348 // RefSeq // Mus musculus interferon epsilon (Ifne), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88879538:88880201:-1 gene:ENSMUSG00000045364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY190044 // GenBank // Mus musculus interferon epsilon-1 (Ifne1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104376 // GenBank // Mus musculus interferon epsilon, mRNA (cDNA clone MGC:129462 IMAGE:40050053), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104377 // GenBank // Mus musculus interferon epsilon, mRNA (cDNA clone MGC:129463 IMAGE:40050054), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88879601:88880179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NR_029747 // RefSeq // Mus musculus microRNA 31 (Mir31), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083474 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:88910557:88910662:-1 gene:ENSMUSG00000065408 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-31 // miRBase Micro RNA Database // MI0000579 Mus musculus miR-31 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001040654 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (Cdkn2a), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_009877 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (Cdkn2a), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:89274471:89282192:-1 gene:ENSMUSG00000044303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107131 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:89274541:89294653:-1 gene:ENSMUSG00000044303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AF044335 // GenBank // Mus musculus strain BALB/cAnPt cyclin dependent kinase inhibitor p16INK4a (Cdkn2a) mRNA, complete cds. // chr4 // 85 // 82 // 23 // 27 // 0 /// AF044336 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2N cyclin dependent kinase inhibitor p16INK4a (Cdkn2a) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// BC058190 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, mRNA (cDNA clone MGC:68189 IMAGE:5342027), complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// EU071702 // GenBank // Mus musculus mitochondrial smARF variant (Cdkn2a) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr4 // 90 // 30 // 9 // 10 // 0 /// L76092 // GenBank // Mus musculus p19 ARF protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// L76150 // GenBank // Mus musculus CDK4 and CDK6 inhibitor protein (p16ink4a) mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 82 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:89274735:89282111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 58 // 18 // 19 // 0
NM_007670 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 2B (p15, inhibits CDK4) (Cdkn2b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:89306289:89311032:-1 gene:ENSMUSG00000073802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF059567 // GenBank // Mus musculus cyclin dependent kinase inhibitor 2B (Cdkn2b) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC002010 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 2B (p15, inhibits CDK4), mRNA (cDNA clone MGC:5793 IMAGE:3495097), complete cds. // chr4 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:89306716:89357515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
GENSCAN00000033925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:90856802:90857398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NR_033611 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12669 (Gm12669), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000061216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:91805349:91806561:-1 gene:ENSMUSG00000049494 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000122162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:91805547:91806555:-1 gene:ENSMUSG00000100863 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene gene:ENSMUSG00000049494 // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC033506 // GenBank // Mus musculus glutaredoxin 3, mRNA (cDNA clone MGC:35818 IMAGE:2651132), complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000004661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:91805547:91852669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
GENSCAN00000004656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:92106868:92373348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0
NM_027034 // RefSeq // Mus musculus IZUMO family member 3 (Izumo3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107108 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:4:92144329:92147221:-1 gene:ENSMUSG00000028533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143542 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:92144338:92147234:-1 gene:ENSMUSG00000028533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099579 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30920314. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006503377 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IZUMO family member 3 (Izumo3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000004656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:92106868:92373348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_138593 // RefSeq // Mus musculus La ribonucleoprotein domain family, member 7 (Larp7), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006543873 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12666 (Gm12666), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:127536954:127553348:-1 gene:ENSMUSG00000027968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000123179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:92190744:92191749:-1 gene:ENSMUSG00000066107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC020127 // GenBank HTC // Mus musculus La ribonucleoprotein domain family, member 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:4018019). // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000004656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:92106868:92373348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000051563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:127536954:127555290:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000121098 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:93265413:93266288:-1 gene:ENSMUSG00000082325 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000048049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:93265372:93266288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_026954 // RefSeq // Mus musculus tumor suppressor candidate 1 (Tusc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:93334138:93335511:-1 gene:ENSMUSG00000054000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY546089 // GenBank // Mus musculus tumor suppressor candidate 1 (Tusc1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:93306023:93335420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000082916 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:93545150:93545277:-1 gene:ENSMUSG00000064850 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT048107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_026368 // RefSeq // Mus musculus caspase activity and apoptosis inhibitor 1 (Caap1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006503341 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus caspase activity and apoptosis inhibitor 1 (Caap1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000030313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:94500081:94556796:-1 gene:ENSMUSG00000028578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK013385 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810468G19 product:RIKEN cDNA 5830433M19 gene, full insert sequence. // chr4 // 75 // 46 // 9 // 12 // 0 /// BC020067 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830433M19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28232 IMAGE:3991510), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006503340 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus caspase activity and apoptosis inhibitor 1 (Caap1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// XR_376346 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus caspase activity and apoptosis inhibitor 1 (Caap1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr4 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENSMUST00000153294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:94549696:94556766:-1 gene:ENSMUSG00000028578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AK046647 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430219F03 product:RIKEN cDNA 5830433M19 gene, full insert sequence. // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000043557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:94501025:94590052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
NM_175305 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 19 (Lrrc19), mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:94636653:94650144:-1 gene:ENSMUSG00000049799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:94636653:94650116:-1 gene:ENSMUSG00000049799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC061228 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:74377 IMAGE:30314668), complete cds. // chr4 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// AK165421 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F520011D01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000043555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:94638224:94643373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000145411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:95029963:95048370:-1 gene:ENSMUSG00000052767 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK086407 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930026C10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AK140425 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B730047E09 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONMMUT048159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT048161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_010591 // RefSeq // Mus musculus jun proto-oncogene (Jun), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:95049034:95052222:-1 gene:ENSMUSG00000052684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC002081 // GenBank // Mus musculus Jun oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:6246 IMAGE:3493248), complete cds. // chr4 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC021888 // GenBank // Mus musculus Jun oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:11557 IMAGE:3156091), complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC055887 // GenBank HTC // Mus musculus Jun oncogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4945230), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC094032 // GenBank // Mus musculus Jun oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:102516 IMAGE:4936392), complete cds. // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// J04115 // GenBank // Mouse c-jun protein oncogene mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:95039162:95108614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSMUST00000187014 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:95401978:95402790:-1 gene:ENSMUSG00000100129 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_045776 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9530080O11 gene (9530080O11Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000137239 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:95959715:95967655:-1 gene:ENSMUSG00000044125 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT048188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_145548 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 13 (Cyp2j13), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006502936 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 13 (Cyp2j13), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:96042660:96077540:-1 gene:ENSMUSG00000028571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000097973 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:96045231:96077524:-1 gene:ENSMUSG00000028571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:96045231:96077546:-1 gene:ENSMUSG00000028571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC016446 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 13, mRNA (cDNA clone MGC:25927 IMAGE:4235131), complete cds. // chr4 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0 /// BC024451 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 13, mRNA (cDNA clone IMAGE:4974905), complete cds. // chr4 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// AK162358 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230020L18 product:cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 13, full insert sequence. // chr4 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000025714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:96045450:96354195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_001100182 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 12 (Cyp2j12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006503069 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 12 (Cyp2j12), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000097972 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:96099573:96141138:-1 gene:ENSMUSG00000081225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000121694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:96099318:96141152:-1 gene:ENSMUSG00000081225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:96045450:96354195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001004141 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 11 (Cyp2j11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000015368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:96294508:96348662:-1 gene:ENSMUSG00000066097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC080831 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 11, mRNA (cDNA clone MGC:91118 IMAGE:30469795), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:96045450:96354195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_010008 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 6 (Cyp2j6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006502721 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 6 (Cyp2j6), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000030303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:96516138:96553661:-1 gene:ENSMUSG00000052914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC050832 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 6, mRNA (cDNA clone MGC:59342 IMAGE:6514145), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U62295 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 monooxygenase (CYP2J6) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// AK078893 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130001H23 product:cytochrome P450, 2j6, full insert sequence. // chr4 // 71 // 78 // 15 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:96372126:96591345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_028979 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 9 (Cyp2j9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006503443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 9 (Cyp2j9), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006503444 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 9 (Cyp2j9), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:96568429:96591578:-1 gene:ENSMUSG00000015224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF336850 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 CYP2J9 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC119556 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 9, mRNA (cDNA clone MGC:141274 IMAGE:40057469), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000126509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:96576292:96591578:-1 gene:ENSMUSG00000015224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// AK033961 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330128L06 product:cytochrome P450, 2j9, full insert sequence. // chr4 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// AK037031 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930101F21 product:cytochrome P450, 2j9, full insert sequence. // chr4 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000025713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:96372126:96591345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_010007 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 5 (Cyp2j5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000030299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:96628773:96664154:-1 gene:ENSMUSG00000052520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC021624 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:13729 IMAGE:4161995), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// U62294 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 monooxygenase (CYP2J5) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:96639160:96690265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001081284 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12695 (Gm12695), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006503262 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12695 (Gm12695), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000107071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:96723647:96785186:-1 gene:ENSMUSG00000078639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:96723887:96770945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000086672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:97182840:97183166:-1 gene:ENSMUSG00000066990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK132939 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930526E24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT048207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XR_376434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12696 (Gm12696), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000122361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:97521428:97522332:-1 gene:ENSMUSG00000084159 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:97521428:97522332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_172872 // RefSeq // Mus musculus KN motif and ankyrin repeat domains 4 (Kank4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000102790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:98754898:98817537:-1 gene:ENSMUSG00000035407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC060737 // GenBank // Mus musculus KN motif and ankyrin repeat domains 4, mRNA (cDNA clone MGC:67672 IMAGE:4191502), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000017481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:98760368:98802745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
XR_104920 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA I0C0044D17 gene (I0C0044D17Rik), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097964 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:98818475:98823840:-1 gene:ENSMUSG00000073794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:98819815:98820324:-1 gene:ENSMUSG00000073794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145435 // GenBank HTC // Mus musculus morula whole body morula cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I0C0044D17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:98807178:98820324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_001290636 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 7 (Dock7), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 51 // 51 // 0 /// NM_026082 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 7 (Dock7), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 51 // 51 // 0 /// ENSMUST00000030286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:98936675:99120860:-1 gene:ENSMUSG00000028556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 51 // 51 // 0 /// ENSMUST00000075836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:98936665:99120915:-1 gene:ENSMUSG00000028556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 51 // 51 // 0 /// ENSMUST00000124466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:98936857:99023390:-1 gene:ENSMUSG00000028556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 67 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000127417 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:98936857:98973169:-1 gene:ENSMUSG00000028556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 17 // 17 // 0 /// BC024917 // GenBank // Mus musculus dedicator of cytokinesis 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:3256655), partial cds. // chr4 // 100 // 26 // 14 // 14 // 0 /// BC086672 // GenBank // Mus musculus dedicator of cytokinesis 7, mRNA (cDNA clone MGC:100160 IMAGE:30647593), complete cds. // chr4 // 100 // 56 // 30 // 30 // 0 /// XR_376342 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 7 (Dock7), transcript variant X12, misc_RNA. // chr4 // 30 // 30 // 16 // 54 // 1 /// GENSCAN00000017469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:98937258:99014461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000119478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:99103060:99103778:-1 gene:ENSMUSG00000081733 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000017471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:99061657:99116119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
ENSMUST00000117528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:99520052:99520466:-1 gene:ENSMUSG00000080803 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT048285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0
ENSMUST00000118044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:100567108:100568048:-1 gene:ENSMUSG00000081553 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000097954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:101020298:101020696:-1 gene:ENSMUSG00000073789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK149896 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530102J04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK157058 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830116B19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000157926 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:101103588:101103650:-1 gene:ENSMUSG00000088551 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT048331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_146145 // RefSeq // Mus musculus Janus kinase 1 (Jak1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006502813 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Janus kinase 1 (Jak1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:101152367:101265282:-1 gene:ENSMUSG00000028530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:101152764:101258472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0
NR_029537 // RefSeq // Mus musculus microRNA 101a (Mir101a), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NR_040708 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E130102H24 gene (E130102H24Rik), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000083517 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:101346945:101347027:-1 gene:ENSMUSG00000065451 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000144604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:101346531:101356248:-1 gene:ENSMUSG00000086782 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-101a // miRBase Micro RNA Database // MI0000148 Mus musculus miR-101a stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT048343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT048344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001033790 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA B020004J07 gene (B020004J07Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000084386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:101835134:101838139:-1 gene:ENSMUSG00000035201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000106919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:101834969:101844023:-1 gene:ENSMUSG00000035201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC147376 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B020004J07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182579 IMAGE:9056473), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// BC147377 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B020004J07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182577 IMAGE:9056471), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:101835371:101837950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
XR_376472 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C130073F10 gene (C130073F10Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// XR_401852 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C130073F10 gene (C130073F10Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000051043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:101890020:101893789:-1 gene:ENSMUSG00000046133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK081744 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130073F10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:101883403:101896747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
ENSMUST00000118151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:102046568:102049127:-1 gene:ENSMUSG00000082264 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000012400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:102046568:102049081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
NM_001290648 // RefSeq // Mus musculus insulin-like 5 (Insl5), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_011831 // RefSeq // Mus musculus insulin-like 5 (Insl5), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000084382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:103017872:103026737:-1 gene:ENSMUSG00000066090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:103018114:103026842:-1 gene:ENSMUSG00000066090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AF054842 // GenBank // Mus musculus relaxin/insulin-like factor variant a mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AF054843 // GenBank // Mus musculus relaxin/insulin-like factor variant b mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AF076971 // GenBank // Mus musculus relaxin/insulin-like protein (Zins3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF133817 // GenBank // Mus musculus insulin-like peptide INSL5 (Insl5) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC010968 // GenBank // Mus musculus insulin-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:13722 IMAGE:4217383), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:103006540:103103274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001163494 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4921539E11 gene (4921539E11Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_027612 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4921539E11 gene (4921539E11Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:103230445:103290863:-1 gene:ENSMUSG00000028520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000097944 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:103235183:103290863:-1 gene:ENSMUSG00000028520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:103230445:103290863:-1 gene:ENSMUSG00000028520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK161421 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930568A22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC107404 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921539E11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130412 IMAGE:40058776), complete cds. // chr4 // 91 // 74 // 21 // 23 // 0 /// BC107405 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921539E11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130413 IMAGE:40058778), complete cds. // chr4 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:103230970:103259259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0
NM_001290645 // RefSeq // Mus musculus complement component 8, alpha polypeptide (C8a), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NM_146148 // RefSeq // Mus musculus complement component 8, alpha polypeptide (C8a), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000048947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:104815679:104876398:-1 gene:ENSMUSG00000035031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000064873 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:104815683:104876383:-1 gene:ENSMUSG00000035031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000106808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:104815679:104876395:-1 gene:ENSMUSG00000035031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AB077295 // GenBank // Mus musculus C8a mRNA for complement component 8 alpha subunit, complete cds, strain:BALB/c. // chr4 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// AB077296 // GenBank // Mus musculus C8a mRNA for complement component 8 alpha subunit, complete cds, strain:DBA/2J. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AB077297 // GenBank // Mus musculus C8a mRNA for complement component 8 alpha subunit, complete cds, strain:MSM/Ms. // chr4 // 76 // 86 // 19 // 25 // 0 /// AB077298 // GenBank // Mus musculus C8a mRNA for complement component 8 alpha subunit, complete cds, strain:Mae/Stm. // chr4 // 78 // 93 // 21 // 27 // 0 /// BC027748 // GenBank // Mus musculus complement component 8, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:29381 IMAGE:5052412), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:104820274:104908087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_178143 // RefSeq // Mus musculus protein kinase, AMP-activated, alpha 2 catalytic subunit (Prkaa2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:105029874:105109890:-1 gene:ENSMUSG00000028518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK044030 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830082D05 product:5-AMP-ACTIVATED PROTEIN KINASE, CATALYTIC ALPHA-2 CHAIN (EC 2.7.1.-) (AMPK ALPHA-2 CHAIN) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC138565 // GenBank // Mus musculus protein kinase, AMP-activated, alpha 2 catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:170190 IMAGE:8861585), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC138566 // GenBank // Mus musculus protein kinase, AMP-activated, alpha 2 catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:170191 IMAGE:8861586), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FJ588504 // GenBank // Mus musculus AMP-activated protein kinase alpha-2 variant B mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:105036092:105051969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000118507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:105374454:105374946:-1 gene:ENSMUSG00000081819 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT048455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_153565 // RefSeq // Mus musculus proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 (Pcsk9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000049507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:106442329:106464329:-1 gene:ENSMUSG00000044254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY273821 // GenBank // Mus musculus convertase subtilisin precursor, mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC038085 // GenBank // Mus musculus proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mRNA (cDNA clone MGC:47409 IMAGE:4502199), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:106443346:106463910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_080458 // RefSeq // Mus musculus Bartter syndrome, infantile, with sensorineural deafness (Barttin) (Bsnd), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000054472 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:106483456:106492283:-1 gene:ENSMUSG00000025418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF391088 // GenBank // Mus musculus barttin (Bsnd) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// AY373833 // GenBank // Mus musculus barttin mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// BC038287 // GenBank // Mus musculus Bartter syndrome, infantile, with sensorineural deafness (Barttin), mRNA (cDNA clone MGC:47291 IMAGE:4221532), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:106485046:106492041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000148907 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:106498816:106506335:-1 gene:ENSMUSG00000085933 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000177702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:106499048:106503105:-1 gene:ENSMUSG00000085933 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// AK028711 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732441L20 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006543868 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 61 (Tmem61), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000035729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:106499015:106536264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT048481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_183182 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC055111 (BC055111), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XR_376321 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC055111 (BC055111), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000067387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:106590909:106617241:-1 gene:ENSMUSG00000054362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000106788 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:106591310:106617238:-1 gene:ENSMUSG00000054362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC055111 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC055111, mRNA (cDNA clone MGC:58608 IMAGE:6706604), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000189032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:106590909:106617238:-1 gene:ENSMUSG00000054362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:106589317:106617219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_001126487 // RefSeq // Mus musculus maestro heat-like repeat family member 7 (Mroh7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000106770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:106680417:106727930:-1 gene:ENSMUSG00000047502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000134160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:106680424:106710031:-1 gene:ENSMUSG00000047502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000135000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:106680424:106708548:-1 gene:ENSMUSG00000047502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 70 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000145044 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:106708490:106727976:-1 gene:ENSMUSG00000047502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 23 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000145374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:106680637:106709715:-1 gene:ENSMUSG00000047502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// AK134749 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330548H13 product:hypothetical ARM repeat fold containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 70 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:106665656:106721479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0
NM_025590 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 11 (Acot11), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000065253 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:106747235:106804998:-1 gene:ENSMUSG00000034853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000102762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:106744555:106799846:-1 gene:ENSMUSG00000034853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000140541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:106747391:106771556:-1 gene:ENSMUSG00000034853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000144809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:106753714:106755960:-1 gene:ENSMUSG00000034853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AF416923 // GenBank // Mus musculus brown fat inducible thioesterase 2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC042492 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 11, mRNA (cDNA clone MGC:25974 IMAGE:4240966), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006503181 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acyl-CoA thioesterase 11 (Acot11), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// GENSCAN00000023486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:106748329:106886488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1
NM_025617 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII) N-terminal and central domain containing 2 (Tceanc2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:107134155:107178547:-1 gene:ENSMUSG00000028619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029985 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 42 (Lrrc42), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:107233514:107253532:-1 gene:ENSMUSG00000028617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000137837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:107233517:107243527:-1 gene:ENSMUSG00000028617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000144176 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:107233939:107239753:-1 gene:ENSMUSG00000028617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AK169814 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430026P15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC027203 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 42, mRNA (cDNA clone MGC:12118 IMAGE:3710091), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC031894 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 42, mRNA (cDNA clone MGC:38930 IMAGE:5362699), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:107224270:107255687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_019872 // RefSeq // Mus musculus DMRT-like family B with proline-rich C-terminal, 1 (Dmrtb1), mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000069271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:107676292:107684230:-1 gene:ENSMUSG00000028610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000131776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:107676290:107683580:-1 gene:ENSMUSG00000028610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000131508 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:107676904:107680960:-1 gene:ENSMUSG00000028610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AF020191 // GenBank // Mus musculus proline-rich protein 13 mRNA, partial cds. // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000021547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:107677005:107699911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT048541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_172609 // RefSeq // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 22 homolog (yeast) (Tomm22), mRNA. // chr4 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:79670861:79672862:1 gene:ENSMUSG00000022427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSMUST00000154610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:107760025:107760465:-1 gene:ENSMUSG00000084874 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056920 // GenBank // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 22 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:66499 IMAGE:6819748), complete cds. // chr4 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// AK008133 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010005P07 product:MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR TOM22 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// ENSMUST00000127292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:79671091:79672680:1 gene:ENSMUSG00000022427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000008795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:79659189:79672291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:107760025:107760465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:33138547:33154430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XR_401905 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor, opposite strand 2 (Lrp8os2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_401909 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor, opposite strand 2 (Lrp8os2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000097930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:107806033:107810948:-1 gene:ENSMUSG00000073779 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK140147 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230314M03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150323 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:107810808:107823010:-1 gene:ENSMUSG00000073779 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense gene:ENSMUSG00000085153 // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XR_401907 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor, opposite strand 2 (Lrp8os2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000188737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:107806033:107823022:-1 gene:ENSMUSG00000073779 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSMUST00000030352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:107827917:107830844:-1 gene:ENSMUSG00000028612 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// ENSMUST00000142425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:107827896:107830844:-1 gene:ENSMUSG00000028612 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK019589 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930430J20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONMMUT048556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT048557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_009949 // RefSeq // Mus musculus carnitine palmitoyltransferase 2 (Cpt2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030345 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:107903981:107923610:-1 gene:ENSMUSG00000028607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106719 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:107907631:107923545:-1 gene:ENSMUSG00000028607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000131644 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:107908220:107923588:-1 gene:ENSMUSG00000028607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC138514 // GenBank // Mus musculus carnitine palmitoyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:170139 IMAGE:8861534), complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC145859 // GenBank // Mus musculus carnitine palmitoyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:175746 IMAGE:40131162), complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// U01163 // GenBank // Mus musculus 129SV carnitine palmitoyltransferase II mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106720 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:107903983:107923560:-1 gene:ENSMUSG00000028607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000021546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:107904232:107923466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_011327 // RefSeq // Mus musculus sterol carrier protein 2, liver (Scp2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030340 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:108043839:108118532:-1 gene:ENSMUSG00000028603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108091004:108118395:-1 gene:ENSMUSG00000028603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000149106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108087012:108118504:-1 gene:ENSMUSG00000028603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC018384 // GenBank // Mus musculus sterol carrier protein 2, liver, mRNA (cDNA clone MGC:11534 IMAGE:3710340), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034613 // GenBank // Mus musculus sterol carrier protein 2, liver, mRNA (cDNA clone MGC:29961 IMAGE:5123611), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// M91458 // GenBank // Mus musculus sterol-carrier protein X mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000135379 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:108044835:108118476:-1 gene:ENSMUSG00000028603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000143340 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108091313:108144994:-1 gene:ENSMUSG00000028603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000021557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108044750:108118447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001167936 // RefSeq // Mus musculus zyg-11 family member A, cell cycle regulator (Zyg11a), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006502976 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zyg-11 family member A, cell cycle regulator (Zyg11a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000043793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:108181934:108217922:-1 gene:ENSMUSG00000034645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000106690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108181934:108217897:-1 gene:ENSMUSG00000034645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108181738:108205302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001033634 // RefSeq // Mus musculus zyg-ll family member B, cell cycle regulator (Zyg11b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000043616 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:108229724:108301096:-1 gene:ENSMUSG00000034636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC117977 // GenBank // Mus musculus zyg-ll homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:144201 IMAGE:40099428), complete cds. // chr4 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// BC117978 // GenBank // Mus musculus zyg-ll homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:144202 IMAGE:40099429), complete cds. // chr4 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// BC139383 // GenBank // Mus musculus zyg-ll homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:171010 IMAGE:8862405), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC139384 // GenBank // Mus musculus zyg-ll homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:171011 IMAGE:8862406), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AK162646 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830141H14 product:hypothetical Leucine-rich repeat containing protein, full insert sequence. // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000021565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108236004:108311203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
NM_001099303 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 159, member A (Fam159a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:108367777:108383349:-1 gene:ENSMUSG00000059816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_376335 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 159, member A (Fam159a), transcript variant X3, misc_RNA. // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// XM_006503239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 159, member A (Fam159a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000021550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108345851:108383343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_024198 // RefSeq // Mus musculus glutathione peroxidase 7 (Gpx7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:108400390:108406961:-1 gene:ENSMUSG00000028597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000184609 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:108400849:108406724:-1 gene:ENSMUSG00000028597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// BC003228 // GenBank // Mus musculus glutathione peroxidase 7, mRNA (cDNA clone MGC:6581 IMAGE:3483448), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108400834:108406677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0
AK139207 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730068I03 product:hypothetical Phospholipase A2 containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_183300 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 9 (Zfyve9), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000042185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:108639259:108723876:-1 gene:ENSMUSG00000034557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000106657 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:108637466:108780798:-1 gene:ENSMUSG00000034557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000106658 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:108637466:108780503:-1 gene:ENSMUSG00000034557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC058416 // GenBank // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:6819584), partial cds. // chr4 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// DQ303413 // GenBank // Mus musculus zinc finger FYVE domain-containing protein 9 splice variant Z2.1 (Zfyve9) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC046341 // GenBank // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:6477813), partial cds. // chr4 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// BC038255 // GenBank // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:5011916), partial cds. // chr4 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000004444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108660565:108723876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000021552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108639259:108657007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0
NM_027453 // RefSeq // Mus musculus basic transcription factor 3-like 4 (Btf3l4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006503385 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus basic transcription factor 3-like 4 (Btf3l4), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// XM_006503390 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus basic transcription factor 3-like 4 (Btf3l4), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000102742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:108814295:108833614:-1 gene:ENSMUSG00000028568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000164855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:108847399:108848619:-1 gene:ENSMUSG00000090551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK042682 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730015C16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013876 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 11 (Rnf11), mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030284 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:109451098:109476675:-1 gene:ENSMUSG00000028557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC010299 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:11412 IMAGE:3155804), complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC028255 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:40706 IMAGE:4972336), complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000064167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:109452899:109476983:-1 gene:ENSMUSG00000028557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// AB024427 // GenBank // Mus musculus mRNA for Sid1669p, complete cds. // chr4 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// ENSMUST00000145980 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:109454284:109484728:-1 gene:ENSMUSG00000028557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// GENSCAN00000004505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:109454251:109515284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_001199090 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930522H14 gene (4930522H14Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_026291 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930522H14 gene (4930522H14Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:109505365:109531204:-1 gene:ENSMUSG00000060491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000102725 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:109505337:109531297:-1 gene:ENSMUSG00000060491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125547 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930522H14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159250 IMAGE:40130062), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC125549 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930522H14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159252 IMAGE:40130064), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:109454251:109515284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_007671 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 2C (p18, inhibits CDK4) (Cdkn2c), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502698 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 2C (p18, inhibits CDK4) (Cdkn2c), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000063531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:109660876:109665372:-1 gene:ENSMUSG00000028551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097921 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:109660876:109667189:-1 gene:ENSMUSG00000028551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK157209 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830206M16 product:cyclin-dependent kinase inhibitor 2C (p18, inhibits CDK4), full insert sequence. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC027026 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 2C (p18, inhibits CDK4), mRNA (cDNA clone MGC:36118 IMAGE:5374670), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U19596 // GenBank // Mus musculus Cdk4 and Cdk6 inhibitor p18 protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AK087461 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130217A19 product:cyclin-dependent kinase inhibitor 2C (p18, inhibits CDK4), full insert sequence. // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT048682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000122724 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:111427818:111427933:-1 gene:ENSMUSG00000084673 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000122587 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:111988650:111988958:-1 gene:ENSMUSG00000084536 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT048734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_177864 // RefSeq // Mus musculus selection and upkeep of intraepithelial T cells 9 (Skint9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:112385969:112433985:-1 gene:ENSMUSG00000049972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF494907 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J skint 9 isoform a precursor (Skint9) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:112302136:112471655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSMUST00000083384 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:112590772:112590878:-1 gene:ENSMUSG00000096564 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177668 // RefSeq // Mus musculus selection and upkeep of intraepithelial T cells 10 (Skint10), mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000060327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:112711147:112774825:-1 gene:ENSMUSG00000048766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000068851 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:112769662:112774866:-1 gene:ENSMUSG00000048766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// AK040044 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430049M06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// EF494905 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J skint 10 isoform a precursor (Skint10) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// EF494906 // GenBank // Mus musculus strain FVB/NJ skint 10 isoform a precursor (Skint10) mRNA, complete cds. // chr4 // 64 // 76 // 14 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:112745431:112765169:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
NM_010799 // RefSeq // Mus musculus multiple inositol polyphosphate histidine phosphatase 1 (Minpp1), mRNA. // chr4 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:32485769:32515370:1 gene:ENSMUSG00000024896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// ENSMUST00000117562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:112978465:112979813:-1 gene:ENSMUSG00000082678 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF046908 // GenBank // Mus musculus multiple inositol polyphosphate phosphatase (Mipp) mRNA, complete cds. // chr4 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// BC021437 // GenBank // Mus musculus multiple inositol polyphosphate histidine phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:29059 IMAGE:5039704), complete cds. // chr4 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// AK042453 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630093A20 product:multiple inositol polyphosphate histidine phosphatase 1, full insert sequence. // chr4 // 71 // 50 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000014626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:32485941:32514369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:112955075:113094686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_008593 // RefSeq // Mus musculus forkhead box D2 (Foxd2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068654 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:114906282:114908873:-1 gene:ENSMUSG00000055210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF023915 // GenBank // Mus musculus forkhead 2 (Mf2) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:114907343:114908821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_015758 // RefSeq // Mus musculus forkhead box E3 (Foxe3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050940 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:114925147:114926013:-1 gene:ENSMUSG00000044518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB601886 // GenBank // Mus musculus domesticus Foxe3 mRNA for Forkhead box E3, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC141057 // GenBank // Mus musculus forkhead box E3, mRNA (cDNA clone MGC:176018 IMAGE:9055669), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:114925147:114926013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025647 // RefSeq // Mus musculus cytidine monophosphate (UMP-CMP) kinase 1 (Cmpk1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000030491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:114959336:114987241:-1 gene:ENSMUSG00000028719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AK161967 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430590A15 product:UMP-CMP kinase (EC 2.7.4.14) (Cytidylate kinase) (Deoxycytidylate kinase) (Cytidine monophosphate kinase) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr4 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// BC017684 // GenBank // Mus musculus cytidine monophosphate (UMP-CMP) kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:18911 IMAGE:4241782), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000133066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:114963111:114987149:-1 gene:ENSMUSG00000028719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// AK077534 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730439H01 product:UMP-CMP KINASE homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// GENSCAN00000029363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:114961714:114987325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_001003947 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily x, polypeptide 1 (Cyp4x1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000051400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:115108682:115133977:-1 gene:ENSMUSG00000047155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000106545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115106323:115134281:-1 gene:ENSMUSG00000047155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000029361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:115119435:115133977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000121884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115138568:115156506:-1 gene:ENSMUSG00000081823 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 92 // 86 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:115138640:115156381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 86 // 11 // 12 // 0
NM_007822 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 14 (Cyp4a14), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006502724 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 14 (Cyp4a14), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000030487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:115486200:115496142:-1 gene:ENSMUSG00000028715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC089609 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 14, mRNA (cDNA clone IMAGE:30118053). // chr4 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// XM_006502723 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 14 (Cyp4a14), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:115487143:115497317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_007823 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp4b1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:115624725:115647709:-1 gene:ENSMUSG00000028713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135569 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115624725:115640428:-1 gene:ENSMUSG00000028713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000145841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115625646:115641899:-1 gene:ENSMUSG00000028713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK078882 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030612O11 product:cytochrome P450, subfamily IV B, polypeptide 1, full insert sequence. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC008996 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily b, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:11502 IMAGE:3967680), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// D50834 // GenBank // Mus musculus mRNA for CYP4B1 (renal cytochrome P450), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:115625045:115636388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_029196 // RefSeq // Mus musculus testis expressed 38 (Tex38), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:4:115779834:115781018:-1 gene:ENSMUSG00000044556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC152479 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40049791. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ468007 // GenBank // Mus musculus testis highly expressed protein 4 (Theg4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025641 // RefSeq // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein (Uqcrh), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000078676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116066965:116075071:-1 gene:ENSMUSG00000063882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000134760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116066965:116075034:-1 gene:ENSMUSG00000063882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK011734 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610041P16 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC011388 // GenBank // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein, mRNA (cDNA clone MGC:11643 IMAGE:3597862), complete cds. // chr4 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// ENSMUST00000050580 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:116066965:116075031:-1 gene:ENSMUSG00000063882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// ENSMUST00000142468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116066966:116070078:-1 gene:ENSMUSG00000063882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// NONMMUT048809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000006990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:115998487:116074969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// NONMMUT048810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_026547 // RefSeq // Mus musculus leucine rich adaptor protein 1 (Lurap1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116132406:116144609:-1 gene:ENSMUSG00000028701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147058 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1520402A15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182175 IMAGE:9056069), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC147059 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1520402A15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182143 IMAGE:9056037), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC147737 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1520402A15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182792 IMAGE:9056686), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC147750 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1520402A15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182805 IMAGE:9056699), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006503350 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich adaptor protein 1 (Lurap1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// ENSMUST00000135982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116137520:116151338:-1 gene:ENSMUSG00000028701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116137313:116144494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT048824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_133681 // RefSeq // Mus musculus tetraspanin 1 (Tspan1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116161869:116167600:-1 gene:ENSMUSG00000028699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000143426 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116163308:116167601:-1 gene:ENSMUSG00000028699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC003448 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 1, mRNA (cDNA clone MGC:6538 IMAGE:2654254), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000154534 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116163332:116164833:-1 gene:ENSMUSG00000028699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000006980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116163232:116200952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_001042743 // RefSeq // Mus musculus microtubule associated serine/threonine kinase 2 (Mast2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_008641 // RefSeq // Mus musculus microtubule associated serine/threonine kinase 2 (Mast2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006502834 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus microtubule associated serine/threonine kinase 2 (Mast2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000003908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116306762:116463922:-1 gene:ENSMUSG00000003810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000106484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116306762:116463751:-1 gene:ENSMUSG00000003810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000106485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:116306763:116464183:-1 gene:ENSMUSG00000003810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000106486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:116306763:116464183:-1 gene:ENSMUSG00000003810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB093264 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0807 protein. // chr4 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// BC060703 // GenBank // Mus musculus microtubule associated serine/threonine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:67101 IMAGE:6412811), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U02313 // GenBank // Mus musculus MAST205 protein kinase mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000006957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116306815:116328031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_177670 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 69 (Tmem69), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006503007 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 69 (Tmem69), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000069674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116552955:116555935:-1 gene:ENSMUSG00000055900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000106478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:116551633:116555936:-1 gene:ENSMUSG00000055900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000129201 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:116551905:116553115:-1 gene:ENSMUSG00000055900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 91 // 30 // 10 // 11 // 0 /// BC106178 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 69, mRNA (cDNA clone MGC:118424 IMAGE:6512571), complete cds. // chr4 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// NONMMUT048845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 91 // 30 // 10 // 11 // 0
NR_029450 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C530005A16 gene (C530005A16Rik), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116589733:116597630:-1 gene:ENSMUSG00000085408 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK039789 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330108I19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK164083 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530005A16 product:cytochrome c oxidase subunit VIIb, full insert sequence. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT048847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_025962 // RefSeq // Mus musculus methylmalonic aciduria cblC type, with homocystinuria (Mmachc), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030453 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116702279:116708406:-1 gene:ENSMUSG00000028690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116704389:116708288:-1 gene:ENSMUSG00000028690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AK084194 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230007E24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC054756 // GenBank // Mus musculus methylmalonic aciduria cblC type, with homocystinuria, mRNA (cDNA clone MGC:64799 IMAGE:6411797), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116703457:116707066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_146256 // RefSeq // Mus musculus 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like (Hpdl), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055436 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116819904:116821707:-1 gene:ENSMUSG00000043155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034099 // GenBank // Mus musculus 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like, mRNA (cDNA clone MGC:31514 IMAGE:4489103), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116820147:116821262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NR_024078 // RefSeq // Mus musculus BTB (POZ) domain containing 19 (Btbd19), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000097915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:117119877:117122385:-1 gene:ENSMUSG00000073771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117120651:117122359:-1 gene:ENSMUSG00000073771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000153924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117119219:117122330:-1 gene:ENSMUSG00000073771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK141215 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330011E08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183310 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:117120175:117125618:-1 gene:ENSMUSG00000073771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_013807 // RefSeq // Mus musculus polo-like kinase 3 (Plk3), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000076859 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:117128655:117133963:-1 gene:ENSMUSG00000028680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000126135 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117128655:117133944:-1 gene:ENSMUSG00000028680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000147730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117128657:117133799:-1 gene:ENSMUSG00000028680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC031180 // GenBank // Mus musculus polo-like kinase 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:37578 IMAGE:4988360), complete cds. // chr4 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC063051 // GenBank // Mus musculus polo-like kinase 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:66660 IMAGE:5718130), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:117128987:117133864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000082608 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:117154093:117154162:-1 gene:ENSMUSG00000064542 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT048901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 93 // 13 // 27 // 0
NR_028524 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 38A (Snord38a), small nucleolar RNA. // chr4 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000083746 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:117154514:117154584:-1 gene:ENSMUSG00000065680 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000140226 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117154391:117156084:-1 gene:ENSMUSG00000047675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000144051 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117154510:117156069:-1 gene:ENSMUSG00000047675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT048903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0
ENSMUST00000082817 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:117155186:117155289:-1 gene:ENSMUSG00000064751 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140226 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117154391:117156084:-1 gene:ENSMUSG00000047675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NR_030704 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 55 (Snord55), small nucleolar RNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174939 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:117155770:117155848:-1 gene:ENSMUSG00000092680 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// X97586 // GenBank // M.musculus small nucleolar RNA U39. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033774 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1661 (Gm1661), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001145637 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1661 (Gm1661), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006503207 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1661 (Gm1661), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XR_376329 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1661 (Gm1661), transcript variant X3, misc_RNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000077500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:117215193:117251917:-1 gene:ENSMUSG00000060268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000165128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:117213333:117251917:-1 gene:ENSMUSG00000060268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC147060 // GenBank // Mus musculus non-protein coding RNA 82, mRNA (cDNA clone MGC:182174 IMAGE:9056068), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC147061 // GenBank // Mus musculus non-protein coding RNA 82, mRNA (cDNA clone MGC:182141 IMAGE:9056035), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:117213515:117237841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_029416 // RefSeq // Mus musculus Kruppel-like factor 17 (Klf17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006543880 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Kruppel-like factor 17 (Klf17), mRNA. // chr4 // 92 // 57 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000062747 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:117757836:117765648:-1 gene:ENSMUSG00000048626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// AF508984 // GenBank // Mus musculus germ cell specific zinc finger protein (Gzf) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC064748 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like factor 17, mRNA (cDNA clone MGC:76539 IMAGE:30476790), complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000017191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:117759107:117765545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_026344 // RefSeq // Mus musculus DPH2 homolog (S. cerevisiae) (Dph2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:117888643:117892032:-1 gene:ENSMUSG00000028540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000139332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117888907:117892020:-1 gene:ENSMUSG00000028540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000183773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117888916:117892023:-1 gene:ENSMUSG00000028540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC031124 // GenBank // Mus musculus DPH2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:36241 IMAGE:5029876), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000126554 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117891078:117891986:-1 gene:ENSMUSG00000028540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:117889552:117891856:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_146152 // RefSeq // Mus musculus importin 13 (Ipo13), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XR_376308 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus importin 13 (Ipo13), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// ENSMUST00000036156 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:117894486:117914999:-1 gene:ENSMUSG00000033365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000134752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117894486:117900662:-1 gene:ENSMUSG00000033365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 26 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000153918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117900955:117903867:-1 gene:ENSMUSG00000033365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 91 // 26 // 10 // 11 // 0 /// AK129200 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0724 protein. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC031823 // GenBank // Mus musculus importin 13, mRNA (cDNA clone MGC:18698 IMAGE:4188768), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000017179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:117894395:117914371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
NM_001284192 // RefSeq // Mus musculus artemin (Artn), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK166013 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730029G20 product:artemin, full insert sequence. // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC104328 // GenBank // Mus musculus artemin, mRNA (cDNA clone IMAGE:40045211), complete cds. // chr4 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC104329 // GenBank // Mus musculus artemin, mRNA (cDNA clone IMAGE:40045216), complete cds. // chr4 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// NM_001284191 // RefSeq // Mus musculus artemin (Artn), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NM_001284193 // RefSeq // Mus musculus artemin (Artn), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// NM_009711 // RefSeq // Mus musculus artemin (Artn), transcript variant 4, mRNA. // chr4 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// ENSMUST00000070816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:117926162:117929763:-1 gene:ENSMUSG00000028539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// ENSMUST00000097913 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117926163:117929497:-1 gene:ENSMUSG00000028539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_001161823 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 4A (Kdm4a), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NM_172382 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 4A (Kdm4a), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// XM_006503011 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 4A (Kdm4a), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000050288 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:118142043:118179946:-1 gene:ENSMUSG00000033326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000097911 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118136959:118179654:-1 gene:ENSMUSG00000033326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000106403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118137006:118179978:-1 gene:ENSMUSG00000033326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000106406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118136957:118180043:-1 gene:ENSMUSG00000033326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AK129187 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0677 protein. // chr4 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// BC028866 // GenBank // Mus musculus jumonji domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:28562 IMAGE:4207552), complete cds. // chr4 // 97 // 86 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000017177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118138230:118309824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0
NM_011213 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, F (Ptprf), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000049074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118208213:118291405:-1 gene:ENSMUSG00000033295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000123484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118208989:118217680:-1 gene:ENSMUSG00000033295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000124758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118209010:118236016:-1 gene:ENSMUSG00000033295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000150096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118209005:118236445:-1 gene:ENSMUSG00000033295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// AF300943 // GenBank // Mus musculus tyrosine phosphatase LAR (Ptprf) mRNA, complete cds. // chr4 // 81 // 89 // 25 // 31 // 0 /// BC057166 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, F, mRNA (cDNA clone IMAGE:4949338), partial cds. // chr4 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118138230:118309824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
NM_198170 // RefSeq // Mus musculus seizure threshold 2 (Szt2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000075406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118362743:118409273:-1 gene:ENSMUSG00000033253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000183402 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118362747:118374274:-1 gene:ENSMUSG00000033253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// AK032181 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430407N22 product:inferred: KIAA0467 protein {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr4 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// AK129152 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0467 protein. // chr4 // 78 // 97 // 29 // 37 // 0 /// FJ998170 // GenBank // Mus musculus SZT2 (Szt2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000017176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118363328:118407772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
NM_198170 // RefSeq // Mus musculus seizure threshold 2 (Szt2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118362743:118409273:-1 gene:ENSMUSG00000033253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ998170 // GenBank // Mus musculus SZT2 (Szt2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198170 // RefSeq // Mus musculus seizure threshold 2 (Szt2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118362743:118409273:-1 gene:ENSMUSG00000033253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ998170 // GenBank // Mus musculus SZT2 (Szt2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118363328:118407772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198170 // RefSeq // Mus musculus seizure threshold 2 (Szt2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000075406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118362743:118409273:-1 gene:ENSMUSG00000033253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FJ998170 // GenBank // Mus musculus SZT2 (Szt2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118363328:118407772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_198170 // RefSeq // Mus musculus seizure threshold 2 (Szt2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000075406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118362743:118409273:-1 gene:ENSMUSG00000033253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000136737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118389133:118389933:-1 gene:ENSMUSG00000033253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// FJ998170 // GenBank // Mus musculus SZT2 (Szt2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000017176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118363328:118407772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_198170 // RefSeq // Mus musculus seizure threshold 2 (Szt2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000075406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118362743:118409273:-1 gene:ENSMUSG00000033253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FJ998170 // GenBank // Mus musculus SZT2 (Szt2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118363328:118407772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_023223 // RefSeq // Mus musculus cell division cycle 20 (Cdc20), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000006565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118432901:118437352:-1 gene:ENSMUSG00000006398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000183942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118433105:118436578:-1 gene:ENSMUSG00000006398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// AB045313 // GenBank // Mus musculus mmCdc20 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AF312208 // GenBank // Mus musculus cell cycle protein P55CDC (Cdc20) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AK029424 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833434E23 product:cell division cycle 20 homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr4 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC003215 // GenBank // Mus musculus cell division cycle 20 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:7111 IMAGE:3157842), complete cds. // chr4 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118432963:118457471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0
NM_001122949 // RefSeq // Mus musculus myeloproliferative leukemia virus oncogene (Mpl), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_001285496 // RefSeq // Mus musculus myeloproliferative leukemia virus oncogene (Mpl), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_010823 // RefSeq // Mus musculus myeloproliferative leukemia virus oncogene (Mpl), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000006556 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118443272:118457457:-1 gene:ENSMUSG00000006389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102671 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118442415:118457513:-1 gene:ENSMUSG00000006389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000106375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118443429:118457450:-1 gene:ENSMUSG00000006389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000168404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:118442417:118457495:-1 gene:ENSMUSG00000006389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF360122 // GenBank // Mus musculus c-mpl-II mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC146613 // GenBank // Mus musculus myeloproliferative leukemia virus oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:165154 IMAGE:40039147), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_001285497 // RefSeq // Mus musculus myeloproliferative leukemia virus oncogene (Mpl), transcript variant 4, mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000017175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118432963:118457471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_011587 // RefSeq // Mus musculus tyrosine kinase with immunoglobulin-like and EGF-like domains 1 (Tie1), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000047421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118471191:118490061:-1 gene:ENSMUSG00000033191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000153286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118478032:118489793:-1 gene:ENSMUSG00000033191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 50 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000184261 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:118471191:118489755:-1 gene:ENSMUSG00000033191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AK051512 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130054B12 product:tyrosine kinase receptor 1, full insert sequence. // chr4 // 100 // 50 // 24 // 24 // 0 /// BC046452 // GenBank // Mus musculus tyrosine kinase with immunoglobulin-like and EGF-like domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:51375 IMAGE:4195879), complete cds. // chr4 // 98 // 94 // 44 // 45 // 0 /// BC057004 // GenBank // Mus musculus tyrosine kinase with immunoglobulin-like and EGF-like domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:67018 IMAGE:6831929), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// BC060182 // GenBank // Mus musculus tyrosine kinase with immunoglobulin-like and EGF-like domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:63223 IMAGE:6831929), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// X80764 // GenBank // M.musculus TIE1 mRNA. // chr4 // 98 // 98 // 46 // 47 // 0 /// GENSCAN00000017190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118471521:118497642:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0
NM_026789 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 65 (Wdr65), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000071972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118554551:118620777:-1 gene:ENSMUSG00000028730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000081921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:118554696:118620405:-1 gene:ENSMUSG00000028730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC062805 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110020C03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:73552 IMAGE:1478343), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118541582:118620405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_026789 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 65 (Wdr65), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000071972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118554551:118620777:-1 gene:ENSMUSG00000028730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000081921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:118554696:118620405:-1 gene:ENSMUSG00000028730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118541582:118620405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000117414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118672609:118673522:-1 gene:ENSMUSG00000086521 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118672609:118673522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0
NM_146713 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1342 (Olfr1342), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118689476:118690450:-1 gene:ENSMUSG00000043383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119161 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1342, mRNA (cDNA clone MGC:155477 IMAGE:8733910), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118689503:118690450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207152 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1338 (Olfr1338), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000084315 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118753595:118754536:-1 gene:ENSMUSG00000095218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC130245 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1338, mRNA (cDNA clone MGC:161305 IMAGE:40142324), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118753595:118782583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011870 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1329 (Olfr1329), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000071979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118916524:118917465:-1 gene:ENSMUSG00000096705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000054670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118916524:118934846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_146399 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1328 (Olfr1328), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118933899:118934840:-1 gene:ENSMUSG00000096368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC106978 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1328, mRNA (cDNA clone MGC:129205 IMAGE:40042180), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC148290 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1328, mRNA (cDNA clone MGC:171113 IMAGE:40042169), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118916524:118934846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000155069 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118954274:118954919:-1 gene:ENSMUSG00000073765 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK142602 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730006F09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000128998 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119054790:119069111:-1 gene:ENSMUSG00000066060 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK084134 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130098J21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT049174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001145936 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 691 (Zfp691), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NM_183140 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 691 (Zfp691), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052715 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119169513:119173856:-1 gene:ENSMUSG00000045268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119169513:119174195:-1 gene:ENSMUSG00000045268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC108395 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 691, mRNA (cDNA clone MGC:118413 IMAGE:30138157), complete cds. // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NM_001145935 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 691 (Zfp691), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// ENSMUST00000179290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:119169516:119173856:-1 gene:ENSMUSG00000045268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_029198 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930538K18 gene (4930538K18Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006503455 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930538K18 gene (4930538K18Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006503456 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930538K18 gene (4930538K18Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000030394 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119205107:119218217:-1 gene:ENSMUSG00000028642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC048569 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930538K18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58586 IMAGE:6705687), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:119205674:119214840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_026494 // RefSeq // Mus musculus phosphopantothenoylcysteine synthetase (Ppcs), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006502638 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphopantothenoylcysteine synthetase (Ppcs), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000030385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119418530:119422420:-1 gene:ENSMUSG00000028636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000106316 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:119418530:119422376:-1 gene:ENSMUSG00000028636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000140641 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:119418530:119422358:-1 gene:ENSMUSG00000028636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// BC021894 // GenBank // Mus musculus phosphopantothenoylcysteine synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:27872 IMAGE:3494382), complete cds. // chr4 // 93 // 94 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000054674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:119418970:119422470:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
NM_177572 // RefSeq // Mus musculus ribosomal modification protein rimK-like family member A (Rimkla), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000049994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119465283:119492628:-1 gene:ENSMUSG00000048899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126728 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:119474549:119492509:-1 gene:ENSMUSG00000048899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 83 // 46 // 10 // 12 // 0 /// BC057371 // GenBank // Mus musculus ribosomal modification protein rimK-like family member A, mRNA (cDNA clone MGC:67300 IMAGE:6835897), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT049202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 83 // 46 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000054657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:119457116:119517728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
ENSMUST00000079611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119530308:119538769:-1 gene:ENSMUSG00000087385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000149305 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:119531436:119535245:-1 gene:ENSMUSG00000087385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC064115 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AA415398, mRNA (cDNA clone MGC:73851 IMAGE:3417656), complete cds. // chr4 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC076608 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AA415398, mRNA (cDNA clone MGC:100084 IMAGE:30625085), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000137671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:119531663:119539130:-1 gene:ENSMUSG00000087385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONMMUT049208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT049209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_008191 // RefSeq // Mus musculus guanylate cyclase activator 2b (retina) (Guca2b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119656607:119658954:-1 gene:ENSMUSG00000032978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:119656607:119658781:-1 gene:ENSMUSG00000032978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC024373 // GenBank // Mus musculus guanylate cyclase activator 2b (retina), mRNA (cDNA clone MGC:36015 IMAGE:4971289), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U67800 // GenBank // Mus musculus uroguanylin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U90727 // GenBank // Mus musculus uroguanylin mRNA, complete cds. // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:119656792:119658855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_194060 // RefSeq // Mus musculus forkhead box O6 (Foxo6), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102656 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:120267079:120287349:-1 gene:ENSMUSG00000052135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086628 // GenBank // Mus musculus forkhead box O6, mRNA (cDNA clone MGC:73469 IMAGE:6810803), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:120267917:120287252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_016748 // RefSeq // Mus musculus cytidine 5-triphosphate synthase (Ctps), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006503225 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytidine 5-triphosphate synthase (Ctps), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000030381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:120539868:120570276:-1 gene:ENSMUSG00000028633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000140891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:120541969:120548101:-1 gene:ENSMUSG00000028633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC006698 // GenBank // Mus musculus cytidine 5-triphosphate synthase, mRNA (cDNA clone MGC:5946 IMAGE:3498717), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U49350 // GenBank // Mus musculus CTP synthetase mRNA, complete cds. // chr4 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// GENSCAN00000037159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:120540595:120567415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
NM_001081142 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily Q, member 4 (Kcnq4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006503255 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily Q, member 4 (Kcnq4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000030376 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:120696138:120747248:-1 gene:ENSMUSG00000028631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000129478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:120715251:120748612:-1 gene:ENSMUSG00000028631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AK163659 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B830028J01 product:potassium voltage-gated channel, subfamily Q, member 4, full insert sequence. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000000599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:120697894:120747176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001048168 // RefSeq // Mus musculus nuclear transcription factor-Y gamma (Nfyc), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// ENSMUST00000118902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:120757438:120831572:-1 gene:ENSMUSG00000032897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
NR_029716 // RefSeq // Mus musculus microRNA 30c-1 (Mir30c-1), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000083556 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:120769534:120769622:-1 gene:ENSMUSG00000065490 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-30c-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000547 Mus musculus miR-30c-1 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT049249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_029602 // RefSeq // Mus musculus microRNA 30e (Mir30e), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000083475 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:120772606:120772697:-1 gene:ENSMUSG00000065409 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// mmu-mir-30e // miRBase Micro RNA Database // MI0000259 Mus musculus miR-30e stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT049250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001160043 // RefSeq // Mus musculus exonuclease 5 (Exo5), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_028457 // RefSeq // Mus musculus exonuclease 5 (Exo5), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:120921196:120925005:-1 gene:ENSMUSG00000028629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000156836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:120922269:120925017:-1 gene:ENSMUSG00000028629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000177880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:120921202:120925005:-1 gene:ENSMUSG00000028629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC023360 // GenBank // Mus musculus defects in morphology 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:32508 IMAGE:5064775), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:120921545:120922666:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_001005788 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 69 (Zfp69), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000106280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:120930137:120951699:-1 gene:ENSMUSG00000064141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000106281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:120930353:120949434:-1 gene:ENSMUSG00000064141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000130702 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:120931306:120947816:-1 gene:ENSMUSG00000064141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC066020 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 69, mRNA (cDNA clone MGC:90136 IMAGE:5717218), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:120930353:120951935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_133716 // RefSeq // Mus musculus small ArfGAP 2 (Smap2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006503379 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small ArfGAP 2 (Smap2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// XM_006503380 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small ArfGAP 2 (Smap2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000043200 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:120968317:121017247:-1 gene:ENSMUSG00000032870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000151615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:120971890:120975708:-1 gene:ENSMUSG00000032870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC052413 // GenBank // Mus musculus stromal membrane-associated GTPase-activating protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:63445 IMAGE:5720177), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:120969539:121016851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
NM_172700 // RefSeq // Mus musculus zinc metallopeptidase, STE24 (Zmpste24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000058754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:121059237:121098241:-1 gene:ENSMUSG00000043207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY029194 // GenBank // Mus musculus Zmpste24 mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// BC138578 // GenBank // Mus musculus zinc metallopeptidase, STE24 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:170203 IMAGE:8861598), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:121060996:121097999:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000143768 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:121068132:121077738:-1 gene:ENSMUSG00000043207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000157689 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:121075798:121075922:-1 gene:ENSMUSG00000088314 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK079998 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530043O15 product:inferred: CAAX PRENYL PROTEASE 1 HOMOLOG (EC 3.4.24.-) (PRENYL PROTEIN-SPECIFIC ENDOPROTEASE 1). [Human] {Homo, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000157543 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:121083986:121084149:-1 gene:ENSMUSG00000088168 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONMMUT049262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_001081312 // RefSeq // Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 2 (Tmco2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:121105651:121109226:-1 gene:ENSMUSG00000078577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:121105737:121215071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001081013 // RefSeq // Mus musculus rearranged L-myc fusion sequence (Rlf), mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006502656 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus rearranged L-myc fusion sequence (Rlf), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000056635 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:121145885:121215084:-1 gene:ENSMUSG00000049878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000168615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:121145373:121188534:-1 gene:ENSMUSG00000049878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK162649 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830143C15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AK132452 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732419A12 product:similar to Zinc finger protein Rlf (Rearranged L-myc fusion gene protein) (Zn-15 related protein) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000000595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:121105737:121215071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001033791 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12888 (Gm12888), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000097905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:121316316:121324917:-1 gene:ENSMUSG00000073764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000000600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:121234297:121551526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
ENSMUST00000120383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:122582700:122604894:-1 gene:ENSMUSG00000081377 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000046599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:122522821:122604905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0
NM_029662 // RefSeq // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 2A (Mfsd2a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:122946850:122961188:-1 gene:ENSMUSG00000028655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000152308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:122946850:122961152:-1 gene:ENSMUSG00000028655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC046793 // GenBank // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:61288 IMAGE:5717701), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC060526 // GenBank // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:67496 IMAGE:5707105), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:122947241:122961033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
AK081449 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130018J17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_019489 // RefSeq // Mus musculus peptidylprolyl isomerase E (cyclophilin E) (Ppie), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123127115:123139951:-1 gene:ENSMUSG00000028651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000126558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123127701:123139025:-1 gene:ENSMUSG00000028651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000136466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123127320:123136898:-1 gene:ENSMUSG00000028651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// AF182825 // GenBank // Mus musculus cyclophilin-33 (Cyp33) mRNA, partial cds. // chr4 // 78 // 74 // 18 // 23 // 0 /// BC045154 // GenBank // Mus musculus peptidylprolyl isomerase E (cyclophilin E), mRNA (cDNA clone MGC:54434 IMAGE:6468589), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000137778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123136402:123139930:-1 gene:ENSMUSG00000028651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000024700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123127378:123146288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_001256019 // RefSeq // Mus musculus bone morphogenetic protein 8a (Bmp8a), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_007558 // RefSeq // Mus musculus bone morphogenetic protein 8a (Bmp8a), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000040496 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:123312645:123343252:-1 gene:ENSMUSG00000032726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123312645:123342803:-1 gene:ENSMUSG00000032726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC052168 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 8a, mRNA (cDNA clone MGC:59383 IMAGE:6334507), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// M97017 // GenBank // Mus musculus osteogenic protein-2 (OP-2) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123307354:123317217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_022033 // RefSeq // Mus musculus 3-oxoacid CoA transferase 2A (Oxct2a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000102640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123321875:123323634:-1 gene:ENSMUSG00000076436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AB022180 // GenBank // Mus musculus mRNA for Scot-t1, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AB045847 // GenBank // Mus musculus TISP10 mRNA, complete cds, increased in spermiogenesis. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC137887 // GenBank // Mus musculus 3-oxoacid CoA transferase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:169511 IMAGE:8860906), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC137888 // GenBank // Mus musculus 3-oxoacid CoA transferase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:169512 IMAGE:8860907), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000024705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123322024:123342708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001030274 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5 (Ndufs5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000030401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123712710:123718202:-1 gene:ENSMUSG00000028648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000106206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123712710:123718186:-1 gene:ENSMUSG00000028648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000106207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123712710:123716326:-1 gene:ENSMUSG00000028648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000137312 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123712869:123718181:-1 gene:ENSMUSG00000028648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC081434 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:101979 IMAGE:6412214), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000013837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123712822:123750164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_023423 // RefSeq // Mus musculus akirin 1 (Akirin1), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000102636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123734559:123750345:-1 gene:ENSMUSG00000023075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC003291 // GenBank // Mus musculus akirin 1, mRNA (cDNA clone MGC:7743 IMAGE:3498569), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
AK131743 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700057D05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00005463 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_401999 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102633765 (LOC102633765), transcript variant X1, ncRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:123902129:123903634:-1 gene:ENSMUSG00000054304 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147505 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9056423. // chr4 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONMMUT049335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000181410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:123917504:123918022:-1 gene:ENSMUSG00000096969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK015982 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930535I16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000053604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:124609931:124610803:-1 gene:ENSMUSG00000051219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK013916 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3100002H09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026031 // RefSeq // Mus musculus UTP11-like, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, (yeast) (Utp11l), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000030738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:124678160:124693600:-1 gene:ENSMUSG00000028907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000153088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:124678797:124693534:-1 gene:ENSMUSG00000028907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC043139 // GenBank HTC // Mus musculus UTP11-like, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:6822266), with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC061074 // GenBank // Mus musculus UTP11-like, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:74187 IMAGE:6706808), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:124678903:124693502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_001007573 // RefSeq // Mus musculus mannosidase, endo-alpha-like (Maneal), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000064444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:124855239:124862171:-1 gene:ENSMUSG00000042763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC065047 // GenBank // Mus musculus gene model 50, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:86147 IMAGE:5694626), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006502923 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mannosidase, endo-alpha-like (Maneal), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000005161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:124856603:124862167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_175223 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, light intermediate polypeptide 1 (Dnali1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:125055338:125065703:-1 gene:ENSMUSG00000042707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK006256 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700023A09 product:DJ423B22.5 (AXONEMAL DYNEIN LIGHT CHAIN (HP28)) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC118619 // GenBank // Mus musculus dynein, axonemal, light intermediate polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:148228 IMAGE:40107304), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC122552 // GenBank // Mus musculus dynein, axonemal, light intermediate polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:148227 IMAGE:40107303), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:125056589:125065598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_153159 // RefSeq // Mus musculus zinc finger CCCH type containing 12A (Zc3h12a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000036188 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:125118423:125127840:-1 gene:ENSMUSG00000042677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000131685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:125120094:125122520:-1 gene:ENSMUSG00000042677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// AK152518 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830077O08 product:DJ423B22.1 (Novel protein similar to KIAA0323, KIAA0615 and C.elegans C30F12.1) (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 93 // 45 // 13 // 14 // 0 /// AY920404 // GenBank // Mus musculus MCP-1 treatment-induced protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC036563 // GenBank // Mus musculus zinc finger CCCH type containing 12A, mRNA (cDNA clone MGC:41320 IMAGE:5254681), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK163109 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530087M13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// GENSCAN00000004982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:125113760:125127000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_146153 // RefSeq // Mus musculus thyroid hormone receptor associated protein 3 (Thrap3), mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000080919 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126164082:126202760:-1 gene:ENSMUSG00000043962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000151728 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126178774:126202612:-1 gene:ENSMUSG00000043962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC026580 // GenBank // Mus musculus thyroid hormone receptor associated protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4954840), complete cds. // chr4 // 90 // 77 // 9 // 10 // 0 /// BC092239 // GenBank // Mus musculus thyroid hormone receptor associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:116673 IMAGE:30659321), complete cds. // chr4 // 85 // 85 // 11 // 13 // 1 /// XR_376314 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thyroid hormone receptor associated protein 3 (Thrap3), transcript variant X4, misc_RNA. // chr4 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// NONMMUT049456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000122555 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:126201175:126201277:-1 gene:ENSMUSG00000084504 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT049462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
AK037283 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130003F07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000128188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126316052:126321467:-1 gene:ENSMUSG00000042558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000133068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126318151:126321361:-1 gene:ENSMUSG00000042558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000151191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126316047:126321369:-1 gene:ENSMUSG00000042558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC023177 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylhydrolase like 2, mRNA (cDNA clone MGC:36922 IMAGE:4945959), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC045203 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylhydrolase like 2, mRNA (cDNA clone MGC:49420 IMAGE:5376002), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NM_133883 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylhydrolase like 2 (Adprhl2), mRNA. // chr4 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// ENSMUST00000102617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126316047:126321703:-1 gene:ENSMUSG00000042558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// NONMMUT049469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000051853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126316573:126321670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// BC024957 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4954529, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_011902 // RefSeq // Mus musculus tektin 2 (Tekt2), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000030658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:126322123:126325199:-1 gene:ENSMUSG00000028845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000102616 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126322121:126325688:-1 gene:ENSMUSG00000028845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000131113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126324340:126325643:-1 gene:ENSMUSG00000028845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000156139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126323708:126325630:-1 gene:ENSMUSG00000028845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// AB027138 // GenBank // Mus musculus mRNA for Tektin-t, complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// BC008140 // GenBank // Mus musculus tektin 2, mRNA (cDNA clone MGC:5692 IMAGE:3582971), complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000051840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126322206:126324958:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0
NM_153403 // RefSeq // Mus musculus argonaute RISC catalytic subunit 1 (Ago1), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000097888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126435012:126468583:-1 gene:ENSMUSG00000041530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000127800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126438321:126461782:-1 gene:ENSMUSG00000041530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000176315 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:126439503:126459207:-1 gene:ENSMUSG00000041530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// AB081471 // GenBank // Mus musculus mRNA for Piwi/Argonaute family protein meIF2C1, complete cds. // chr4 // 89 // 90 // 33 // 37 // 0 /// BC129914 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2C, 1, mRNA (cDNA clone MGC:150309 IMAGE:40111808), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000051832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126327706:126463916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 83 // 34 // 41 // 1
NM_153177 // RefSeq // Mus musculus argonaute RISC catalytic subunit 4 (Ago4), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// XM_006503481 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus argonaute RISC catalytic subunit 4 (Ago4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 97 // 80 // 35 // 36 // 0 /// XM_006503482 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus argonaute RISC catalytic subunit 4 (Ago4), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 97 // 71 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000084289 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126489541:126533472:-1 gene:ENSMUSG00000042500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// AB081474 // GenBank // Mus musculus mRNA for Piwi/Argonaute family protein meIF2C4, complete cds. // chr4 // 92 // 87 // 36 // 39 // 0 /// BC096023 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2C, 4, mRNA (cDNA clone MGC:106644 IMAGE:30607807), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// XM_006503483 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus argonaute RISC catalytic subunit 4 (Ago4), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 64 // 64 // 29 // 45 // 1 /// GENSCAN00000051843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126476721:126533833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 33 // 33 // 0
NM_198960 // RefSeq // Mus musculus transcription factor AP-2, epsilon (Tfap2e), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000048194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126716006:126736240:-1 gene:ENSMUSG00000042477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY325902 // GenBank // Mus musculus AP-2 epsilon mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126716513:126735967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_011986 // RefSeq // Mus musculus neurochondrin (Ncdn), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006503119 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurochondrin (Ncdn), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000030637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126743750:126753409:-1 gene:ENSMUSG00000028833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000106116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126744731:126753427:-1 gene:ENSMUSG00000028833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000127079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126744731:126753438:-1 gene:ENSMUSG00000028833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC017126 // GenBank // Mus musculus neurochondrin, mRNA (cDNA clone MGC:27571 IMAGE:4485839), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126744835:126753545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001114399 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, MYM-type 4 (Zmym4), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000106108 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126861939:126968135:-1 gene:ENSMUSG00000042446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000135003 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126861939:126923148:-1 gene:ENSMUSG00000042446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126864110:126967854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NM_008120 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, alpha 4 (Gja4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053753 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:127311421:127314039:-1 gene:ENSMUSG00000050234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF216832 // GenBank // Mus musculus gap junction channel subunit protein connexin37 (Gja4) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC056613 // GenBank // Mus musculus gap junction protein, alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:68218 IMAGE:4971608), complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:127311967:127316520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001160012 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, beta 3 (Gjb3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_008126 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, beta 3 (Gjb3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000046532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:127325235:127330844:-1 gene:ENSMUSG00000042367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000106091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:127325235:127329161:-1 gene:ENSMUSG00000042367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024387 // GenBank // Mus musculus gap junction protein, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:36138 IMAGE:4983869), complete cds. // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// X63099 // GenBank // M.musculus mRNA for connexin31. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_008127 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, beta 4 (Gjb4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502770 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gap junction protein, beta 4 (Gjb4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000060419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:127351086:127354081:-1 gene:ENSMUSG00000046623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:127351086:127354081:-1 gene:ENSMUSG00000046623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132468 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732437N22 product:gap junction membrane channel protein beta 4, full insert sequence. // chr4 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC064060 // GenBank // Mus musculus gap junction protein, beta 4, mRNA (cDNA clone MGC:73616 IMAGE:1498230), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:127336925:127352146:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_010291 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, beta 5 (Gjb5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000046498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:127354809:127358181:-1 gene:ENSMUSG00000042357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011148 // GenBank // Mus musculus gap junction protein, beta 5, mRNA (cDNA clone MGC:18579 IMAGE:4207506), complete cds. // chr4 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// M91236 // GenBank // Mouse connexin 31.1 (Cx31.1) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000017319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:127355534:127386729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001134733 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence CK137956 (CK137956), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:127927592:127970951:-1 gene:ENSMUSG00000028813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147529 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence CK137956, mRNA (cDNA clone MGC:182825 IMAGE:9087439), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:127928003:127970756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_027036 // RefSeq // Mus musculus high-mobility group box 4 (Hmgb4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:128260212:128260957:-1 gene:ENSMUSG00000048686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061030 // GenBank // Mus musculus high-mobility group box 4, mRNA (cDNA clone MGC:74137 IMAGE:6775221), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:128260228:128260773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_177758 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and SCAN domains 20 (Zscan20), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006503134 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and SCAN domains 20 (Zscan20), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000084276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:128583539:128589962:-1 gene:ENSMUSG00000061894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097877 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:128583547:128610098:-1 gene:ENSMUSG00000061894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000135309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:128585375:128610042:-1 gene:ENSMUSG00000061894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// BC065079 // GenBank // Mus musculus zinc finger and SCAN domains 20, mRNA (cDNA clone MGC:86037 IMAGE:6825639), complete cds. // chr4 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// BC076602 // GenBank // Mus musculus zinc finger and SCAN domains 20, mRNA (cDNA clone MGC:100097 IMAGE:30611085), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000003757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:128585604:128592506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0
NM_205823 // RefSeq // Mus musculus toll-like receptor 12 (Tlr12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:128615446:128618619:-1 gene:ENSMUSG00000062545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510705 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 12 (Tlr12) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY531552 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 11 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC131921 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 12, mRNA (cDNA clone MGC:163552 IMAGE:40130198), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:128603093:128618455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001081098 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 362 (Zfp362), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000071108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:128773104:128794888:-1 gene:ENSMUSG00000028799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000106072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:128773088:128806045:-1 gene:ENSMUSG00000028799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000170934 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:128777084:128806045:-1 gene:ENSMUSG00000028799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC147222 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 362, mRNA (cDNA clone MGC:182385 IMAGE:9056279), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC147223 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 362, mRNA (cDNA clone MGC:182387 IMAGE:9056281), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC150964 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 362, mRNA (cDNA clone MGC:183875 IMAGE:9087875), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:128774521:128815808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_001033189 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence C77080 (C77080), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_001285865 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence C77080 (C77080), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NM_001285866 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence C77080 (C77080), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NM_001285867 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence C77080 (C77080), transcript variant 4, mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000052602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129219578:129248443:-1 gene:ENSMUSG00000050390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000097873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129219578:129239174:-1 gene:ENSMUSG00000050390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106051 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129219578:129227911:-1 gene:ENSMUSG00000050390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000145261 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:129225360:129261404:-1 gene:ENSMUSG00000050390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 35 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000146376 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:129225383:129227480:-1 gene:ENSMUSG00000050390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000006225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129221711:129239096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0
NM_009030 // RefSeq // Mus musculus retinoblastoma binding protein 4 (Rbbp4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129307100:129335370:-1 gene:ENSMUSG00000057236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138568 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:170193 IMAGE:8861588), complete cds. // chr4 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// BC138570 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:170195 IMAGE:8861590), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// U35141 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma-binding protein (mRbAp48) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129310092:129335233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_028603 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 8a (Zbtb8a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006537019 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 8a (Zbtb8a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129353628:129378116:-1 gene:ENSMUSG00000028807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC017614 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 8a, mRNA (cDNA clone MGC:27680 IMAGE:4912757), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129354172:129417767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_153541 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 8b (Zbtb8b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000053042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:129425765:129440818:-1 gene:ENSMUSG00000048485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000106046 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129425765:129440853:-1 gene:ENSMUSG00000048485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC023839 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 8b, mRNA (cDNA clone MGC:38362 IMAGE:5344921), complete cds. // chr4 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000124364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129429145:129440820:-1 gene:ENSMUSG00000048485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// AK163989 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330039F04 product:zinc finger and BTB domain containing 8, full insert sequence. // chr4 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// GENSCAN00000006233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129427513:129433271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
NM_080442 // RefSeq // Mus musculus testis-specific serine kinase 3 (Tssk3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006537012 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis-specific serine kinase 3 (Tssk3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000000421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129489014:129491022:-1 gene:ENSMUSG00000000411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF201734 // GenBank // Mus musculus testis specific serine kinase-3 (Tssk-3) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AF298901 // GenBank // Mus musculus testis-specific serine/threonine kinase 3b (Tssk3b) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048470 // GenBank // Mus musculus testis-specific serine kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:58221 IMAGE:6772177), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK005983 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700014N07 product:serine/threonine kinase 22C (spermiogenesis associated), full insert sequence. // chr4 // 61 // 92 // 14 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129489071:129490606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_182783 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 167, member B (Fam167b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:129576815:129578549:-1 gene:ENSMUSG00000050493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000142699 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:129576815:129577457:-1 gene:ENSMUSG00000050493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC030183 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 167, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5054849), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT049649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000006212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129577065:129585497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_018799 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit I (Eif3i), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000102593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129591960:129600648:-1 gene:ENSMUSG00000028798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000135055 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:129593526:129600599:-1 gene:ENSMUSG00000028798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AF188297 // GenBank // Mus musculus TGF-beta receptor binding protein (Trip1) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// AF271072 // GenBank // Mus musculus TGF-beta receptor interacting protein 1 mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC029625 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit I, mRNA (cDNA clone MGC:25806 IMAGE:4037852), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSMUST00000136843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129593329:129595768:-1 gene:ENSMUSG00000028798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// GENSCAN00000021882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129592997:129622763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT049650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_198026 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing C (Iqcc), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006503044 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IQ motif containing C (Iqcc), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000046675 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129615126:129619099:-1 gene:ENSMUSG00000040795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC031493 // GenBank // Mus musculus IQ motif containing C, mRNA (cDNA clone IMAGE:3665627). // chr4 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// ENSMUST00000131559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129617342:129619076:-1 gene:ENSMUSG00000040795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000021882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129592997:129622763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_008468 // RefSeq // Mus musculus karyopherin (importin) alpha 6 (Kpna6), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000003828 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:129647484:129662479:-1 gene:ENSMUSG00000003731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129643980:129672767:-1 gene:ENSMUSG00000003731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AF020773 // GenBank // Mus musculus importin alpha S2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC004833 // GenBank // Mus musculus karyopherin (importin) alpha 6, mRNA (cDNA clone MGC:6524 IMAGE:2651272), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// CT010260 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836E1151D for gene Kpna6, Karyopherin (importin) alpha 6; complete cds, incl. stopcodon. // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146215 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129654304:129656726:-1 gene:ENSMUSG00000003731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000021894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129647992:129661434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_199305 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 39b (Tmem39b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006503046 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 39b (Tmem39b), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129676355:129696838:-1 gene:ENSMUSG00000053730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129676355:129696796:-1 gene:ENSMUSG00000053730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000137640 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:129691968:129696620:-1 gene:ENSMUSG00000053730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000147668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129692044:129696744:-1 gene:ENSMUSG00000053730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 83 // 40 // 10 // 12 // 0 /// BC037095 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 39b, mRNA (cDNA clone IMAGE:5343373). // chr4 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// BC049790 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 39b, mRNA (cDNA clone MGC:59407 IMAGE:6336036), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129676566:129752498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_011317 // RefSeq // Mus musculus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1 (Khdrbs1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XR_390162 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1 (Khdrbs1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000066257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129713819:129742296:-1 gene:ENSMUSG00000028790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC002051 // GenBank // Mus musculus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:6063 IMAGE:3490667), complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// U17046 // GenBank // Mus musculus p62 ras-GAP associated phosphoprotein mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 68 // 22 // 23 // 0 /// U17961 // GenBank // Mus musculus p62 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// NR_045036 // RefSeq // Mus musculus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1 (Khdrbs1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// ENSMUST00000129342 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129703164:129742297:-1 gene:ENSMUSG00000028790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// GENSCAN00000021901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129676566:129752498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
ENSMUST00000122147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129761628:129761916:-1 gene:ENSMUSG00000080944 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT049678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001034872 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 853 (Gm853), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006537002 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 853 (Gm853), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006537003 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 853 (Gm853), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006537008 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 853 (Gm853), transcript variant X8, mRNA. // chr4 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000023884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:130209109:130222401:-1 gene:ENSMUSG00000023120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC147394 // GenBank // Mus musculus gene model 853, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182575 IMAGE:9056469), complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC147395 // GenBank // Mus musculus gene model 853, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182564 IMAGE:9056458), complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC172060 // GenBank // Mus musculus gene model 853, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:198765 IMAGE:9054346), complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:130218264:130221753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0
NM_001253386 // RefSeq // Mus musculus serine incorporator 2 (Serinc2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_172702 // RefSeq // Mus musculus serine incorporator 2 (Serinc2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006536985 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine incorporator 2 (Serinc2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000105996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:130253495:130275586:-1 gene:ENSMUSG00000023232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000120126 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:130253899:130279205:-1 gene:ENSMUSG00000023232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122374 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:130253495:130275218:-1 gene:ENSMUSG00000023232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000146478 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:130263028:130275532:-1 gene:ENSMUSG00000023232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000154846 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:130263643:130275545:-1 gene:ENSMUSG00000023232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 33 // 9 // 10 // 0 /// BC031720 // GenBank // Mus musculus serine incorporator 2, mRNA (cDNA clone MGC:25877 IMAGE:4209575), complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:130253930:130286786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000097865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:130308162:130308674:-1 gene:ENSMUSG00000073752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139439 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830084F11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_390180 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638454 (LOC102638454), ncRNA. // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_153160 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 17 (Zcchc17), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// XM_006503258 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 17 (Zcchc17), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000134159 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:130315383:130359943:-1 gene:ENSMUSG00000028772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000149755 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:130316695:130344859:-1 gene:ENSMUSG00000028772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// AY253297 // GenBank // Mus musculus LDC4 mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// BC018382 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 17, mRNA (cDNA clone MGC:25446 IMAGE:4215774), complete cds. // chr4 // 89 // 95 // 17 // 19 // 0 /// BC049231 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 17, mRNA (cDNA clone MGC:54941 IMAGE:4161178), complete cds. // chr4 // 89 // 95 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000021890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:130316647:130354177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
GENSCAN00000018338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:131508961:131526951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0
NM_013622 // RefSeq // Mus musculus opioid receptor, delta 1 (Oprd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538628 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus opioid receptor, delta 1 (Oprd1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000056336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132110726:132144486:-1 gene:ENSMUSG00000050511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137958 // GenBank // Mus musculus opioid receptor, delta 1, mRNA (cDNA clone MGC:169582 IMAGE:8860977), complete cds. // chr4 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC137969 // GenBank // Mus musculus opioid receptor, delta 1, mRNA (cDNA clone MGC:169593 IMAGE:8860988), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// L06322 // GenBank // Mus musculus delta-opioid receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// L11064 // GenBank // Mouse delta opioid receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132113527:132144385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000085181 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:132186290:132212091:-1 gene:ENSMUSG00000040025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000102570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132186750:132212105:-1 gene:ENSMUSG00000040025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC014797 // GenBank // Mus musculus YTH domain family 2, mRNA (cDNA clone MGC:11691 IMAGE:3962417), complete cds. // chr4 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC028994 // GenBank // Mus musculus YTH domain family 2, mRNA (cDNA clone MGC:36628 IMAGE:5355331), complete cds. // chr4 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NM_145393 // RefSeq // Mus musculus YTH domain family 2 (Ythdf2), mRNA. // chr4 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000152796 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132184912:132212303:-1 gene:ENSMUSG00000040025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000017017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132186924:132212281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0
NM_001081651 // RefSeq // Mus musculus RAB42, member RAS oncogene family (Rab42), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132302197:132303385:-1 gene:ENSMUSG00000089687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB232642 // GenBank // Mus musculus Rab43 mRNA for Rab43, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK035722 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530096D07 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC132060 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9530096D07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163691 IMAGE:40130337), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132062 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9530096D07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163693 IMAGE:40130339), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132302262:132303337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NR_028513 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 73b (Snora73b), small nucleolar RNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000083419 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:132352322:132352526:-1 gene:ENSMUSG00000065353 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT049855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NR_028512 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 73a (Snora73a), small nucleolar RNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000082453 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:132352775:132352979:-1 gene:ENSMUSG00000064387 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000141090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132351934:132352933:-1 gene:ENSMUSG00000085241 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT049852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT049856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_026039 // RefSeq // Mus musculus mediator complex subunit 18 (Med18), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132458731:132463921:-1 gene:ENSMUSG00000066042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC068306 // GenBank // Mus musculus mediator of RNA polymerase II transcription, subunit 18 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:76540 IMAGE:30043405), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// AK137887 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130034N17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// ENSMUST00000123604 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:132459955:132463331:-1 gene:ENSMUSG00000066042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132459560:132462937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NM_144907 // RefSeq // Mus musculus sestrin 2 (Sesn2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030724 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132492032:132510501:-1 gene:ENSMUSG00000028893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC005672 // GenBank // Mus musculus sestrin 2, mRNA (cDNA clone MGC:11758 IMAGE:3153129), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132493716:132511068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_007512 // RefSeq // Mus musculus ATPase inhibitory factor 1 (Atpif1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538502 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase inhibitory factor 1 (Atpif1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067496 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132530555:132533659:-1 gene:ENSMUSG00000054428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152993 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:132530555:132533488:-1 gene:ENSMUSG00000054428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AF002718 // GenBank // Mus musculus ATPase inhibitor (IF1) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// AK152389 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830067M06 product:ATPase inhibitor, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012680 // GenBank // Mus musculus ATPase inhibitory factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:13893 IMAGE:4217188), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000145795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132532488:132533595:-1 gene:ENSMUSG00000054428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// AK161394 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930539E21 product:ATPase inhibitor, full insert sequence. // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000017011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132530682:132533568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONMMUT049868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSMUST00000083689 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:132547104:132547207:-1 gene:ENSMUSG00000065623 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_201368 // RefSeq // Mus musculus X Kell blood group precursor related family member 8 homolog (Xkr8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006538988 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus X Kell blood group precursor related family member 8 homolog (Xkr8), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000045550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132724897:132732546:-1 gene:ENSMUSG00000037752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000143642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132730904:132732483:-1 gene:ENSMUSG00000037752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AY534254 // GenBank // Mus musculus XK-related protein 8 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC057035 // GenBank // Mus musculus X Kell blood group precursor related family member 8 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:67219 IMAGE:5698137), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000150104 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132728506:132732528:-1 gene:ENSMUSG00000037752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000048065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132727855:132732465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT049881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT049880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_133888 // RefSeq // Mus musculus sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B (Smpdl3b), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000030709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132732966:132757252:-1 gene:ENSMUSG00000028885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC009087 // GenBank // Mus musculus sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B, mRNA (cDNA clone MGC:6556 IMAGE:2810972), complete cds. // chr4 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132733394:132753965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
NM_001033308 // RefSeq // Mus musculus thymocyte selection associated family member 2 (Themis2), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000045154 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132781843:132796387:-1 gene:ENSMUSG00000037731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC013712 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC013712, mRNA (cDNA clone IMAGE:3155889), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC151122 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC013712, mRNA (cDNA clone MGC:184035 IMAGE:9088035), complete cds. // chr4 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// BC151126 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC013712, mRNA (cDNA clone MGC:184039 IMAGE:9088039), complete cds. // chr4 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132780543:132796353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_001290725 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 8 (Ppp1r8), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_146154 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 8 (Ppp1r8), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030702 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132826929:132843169:-1 gene:ENSMUSG00000028882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132827827:132843123:-1 gene:ENSMUSG00000028882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000131725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132830391:132843124:-1 gene:ENSMUSG00000028882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC025479 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 8, mRNA (cDNA clone MGC:38560 IMAGE:5354224), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132828968:132832975:-1 gene:ENSMUSG00000028882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132827853:132925255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_133887 // RefSeq // Mus musculus syntaxin 12 (Stx12), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132853501:132884509:-1 gene:ENSMUSG00000028879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB019211 // GenBank // Mus musculus mRNA for syntaxin 12, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC010669 // GenBank // Mus musculus syntaxin 12, mRNA (cDNA clone MGC:6471 IMAGE:2645010), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132857046:132863260:-1 gene:ENSMUSG00000028879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// AK132618 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833427E08 product:syntaxin 12, full insert sequence. // chr4 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000048108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132827853:132925255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001163792 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 76, member A (Fam76a), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_145553 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 76, member A (Fam76a), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000030696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132899213:132922558:-1 gene:ENSMUSG00000028878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000097856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132900251:132922493:-1 gene:ENSMUSG00000028878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC008163 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 76, member A, mRNA (cDNA clone MGC:11672 IMAGE:3709256), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132827853:132925255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1
ENSMUST00000105911 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133209340:133211857:-1 gene:ENSMUSG00000049649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC138248 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:169872 IMAGE:8861267), complete cds. // chr4 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// BC138250 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:169874 IMAGE:8861269), complete cds. // chr4 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// D21062 // GenBank // Mus musculus GPCR21 mRNA for G protein-coupled receptor, complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_008154 // RefSeq // Mus musculus G-protein coupled receptor 3 (Gpr3), mRNA. // chr4 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000052090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133210367:133212536:-1 gene:ENSMUSG00000049649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
ENSMUST00000142039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133253098:133263087:-1 gene:ENSMUSG00000028860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC005623 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:7008 IMAGE:3155535), complete cds. // chr4 // 78 // 100 // 28 // 36 // 0 /// NM_031393 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin-like 1 (Sytl1), mRNA. // chr4 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// XM_006538920 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptotagmin-like 1 (Sytl1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// ENSMUST00000030674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133253090:133263113:-1 gene:ENSMUSG00000028860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// ENSMUST00000105908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133253090:133263087:-1 gene:ENSMUSG00000028860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// AB050741 // GenBank // Mus musculus slp1 mRNA for synaptotagmin-like protein 1, complete cds. // chr4 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// GENSCAN00000048062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133253169:133364416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1
NM_001081156 // RefSeq // Mus musculus TMF1-regulated nuclear protein 1 (Trnp1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539155 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TMF1-regulated nuclear protein 1 (Trnp1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000123169 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:133491118:133497719:-1 gene:ENSMUSG00000056596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000125541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133491100:133498550:-1 gene:ENSMUSG00000056596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY142705 // GenBank // Mus musculus mexneurin precursor, mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC049168 // GenBank // Mus musculus TMF1-regulated nuclear protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:57108 IMAGE:6491759), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133497786:133498457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT049930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AK009004 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2300002D11 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
AK051860 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230011M17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010948 // RefSeq // Mus musculus nuclear distribution gene C homolog (Aspergillus) (Nudc), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000030665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133532542:133545996:-1 gene:ENSMUSG00000028851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000148612 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:133534228:133535927:-1 gene:ENSMUSG00000028851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0 /// BC011253 // GenBank // Mus musculus nuclear distribution gene C homolog (Aspergillus), mRNA (cDNA clone MGC:19328 IMAGE:4207838), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133532748:133545885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0
NM_018754 // RefSeq // Mus musculus stratifin (Sfn), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000057311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133600556:133602168:-1 gene:ENSMUSG00000047281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AF058798 // GenBank // Mus musculus 14-3-3 protein sigma mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// AF152893 // GenBank // Mus musculus 14-3-3 protein sigma (Mme1) mRNA, complete cds. // chr4 // 80 // 91 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000027903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133601023:133670327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1
NM_001017968 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 18 (Zdhhc18), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_390766 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 18 (Zdhhc18), transcript variant X6, misc_RNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000084238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133605299:133633469:-1 gene:ENSMUSG00000037553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000135999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133608669:133615567:-1 gene:ENSMUSG00000037553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AY668950 // GenBank // Mus musculus DHHC-containing protein 18 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// XM_006539018 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 18 (Zdhhc18), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// XM_006539019 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 18 (Zdhhc18), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENSMUST00000138639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133613316:133615342:-1 gene:ENSMUSG00000037553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000027903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133601023:133670327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// BC039799 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:1429343, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
XM_006539332 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 13213 (Gm13213), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006539333 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 13213 (Gm13213), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_620107 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 13213 (Gm13213), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000119668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133638210:133638683:-1 gene:ENSMUSG00000083885 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000027903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133601023:133670327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0
NM_001080819 // RefSeq // Mus musculus AT rich interactive domain 1A (SWI-like) (Arid1a), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000008024 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:133679941:133756769:-1 gene:ENSMUSG00000007880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000105897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:133679008:133753611:-1 gene:ENSMUSG00000007880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000145664 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:133679008:133753611:-1 gene:ENSMUSG00000007880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// AF268912 // GenBank // Mus musculus Osa1 nuclear protein mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 91 // 39 // 42 // 0 /// BC082554 // GenBank // Mus musculus AT rich interactive domain 1A (SWI-like), mRNA (cDNA clone MGC:96305 IMAGE:30622048), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000138473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133689487:133753982:-1 gene:ENSMUSG00000007880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1 /// AK142143 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230050O08 product:AT rich interactive domain 1A (Swi1 like), full insert sequence. // chr4 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1 /// GENSCAN00000027908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133680331:133753611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// BC079591 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 4121402D02 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6406949), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0
ENSMUST00000122606 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:133797582:133797719:-1 gene:ENSMUSG00000084555 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT049948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_145833 // RefSeq // Mus musculus lin-28 homolog A (C. elegans) (Lin28a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539317 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lin-28 homolog A (C. elegans) (Lin28a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000051674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134003330:134018841:-1 gene:ENSMUSG00000050966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176897 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:134007948:134018382:-1 gene:ENSMUSG00000050966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AF521097 // GenBank // Mus musculus RNA-binding protein LIN-28 (Lin-28) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC068304 // GenBank // Mus musculus lin-28 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:76512 IMAGE:30432006), complete cds. // chr4 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134006105:134018741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_013706 // RefSeq // Mus musculus CD52 antigen (Cd52), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000000696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134093536:134095082:-1 gene:ENSMUSG00000000682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC027495 // GenBank // Mus musculus CD52 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:40993 IMAGE:1396480), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// M55561 // GenBank // Mouse phosphatidylinositol-linked antigen (pB7) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134093615:134102309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 73 // 16 // 19 // 0
NM_080559 // RefSeq // Mus musculus SH3 domain binding glutamic acid-rich protein-like 3 (Sh3bgrl3), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134127406:134128789:-1 gene:ENSMUSG00000028843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105879 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:134127413:134128739:-1 gene:ENSMUSG00000028843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000136408 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134127840:134128737:-1 gene:ENSMUSG00000028843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC008110 // GenBank // Mus musculus SH3 domain binding glutamic acid-rich protein-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:7192 IMAGE:3481987), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT049974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000027906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134127741:134215317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_144527 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 85 (Cep85), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000040271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134129858:134187112:-1 gene:ENSMUSG00000037443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000121566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134129866:134186981:-1 gene:ENSMUSG00000037443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000137388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134156097:134187085:-1 gene:ENSMUSG00000037443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000141384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134164112:134187085:-1 gene:ENSMUSG00000037443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// AK010621 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410030J07 product:endogenous sequence related to the Duplan murine retrovirus, full insert sequence. // chr4 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC031729 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 21, mRNA (cDNA clone MGC:25753 IMAGE:3992639), complete cds. // chr4 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000126014 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134132232:134139277:-1 gene:ENSMUSG00000037443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// NONMMUT049978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000027906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134127741:134215317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1
NM_001080712 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 7534 (Gm7534), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134190804:134203004:-1 gene:ENSMUSG00000073747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539111 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7534 (Gm7534), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134127741:134215317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001081047 // RefSeq // Mus musculus connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1 (Cnksr1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000030645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134228041:134238399:-1 gene:ENSMUSG00000028841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000124181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134232467:134235939:-1 gene:ENSMUSG00000028841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000144504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134228049:134238339:-1 gene:ENSMUSG00000028841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000145998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134230425:134233154:-1 gene:ENSMUSG00000028841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// BC113805 // GenBank // Mus musculus connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mRNA (cDNA clone MGC:132970 IMAGE:40062208), complete cds. // chr4 // 88 // 95 // 37 // 42 // 0 /// BC113956 // GenBank // Mus musculus connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mRNA (cDNA clone MGC:132971 IMAGE:40062209), complete cds. // chr4 // 88 // 95 // 37 // 42 // 0 /// NONMMUT049983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000027889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134217152:134238420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1
NM_024215 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 593 (Zfp593), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030644 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134243289:134245592:-1 gene:ENSMUSG00000028840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000129183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134243307:134245542:-1 gene:ENSMUSG00000028840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003465 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 593, mRNA (cDNA clone MGC:6505 IMAGE:2648747), complete cds. // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134244789:134245503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT049984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001099296 // RefSeq // Mus musculus glycine/arginine rich protein 1 (Grrp1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006539197 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycine/arginine rich protein 1 (Grrp1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006539198 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycine/arginine rich protein 1 (Grrp1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006539200 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycine/arginine rich protein 1 (Grrp1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000060050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:134251110:134254106:-1 gene:ENSMUSG00000050105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000138366 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:134251706:134253023:-1 gene:ENSMUSG00000050105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC048704 // GenBank // Mus musculus glycine/arginine rich protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:59432 IMAGE:6330338), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134251350:134265092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_019578 // RefSeq // Mus musculus exostoses (multiple)-like 1 (Extl1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000030643 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134356372:134372558:-1 gene:ENSMUSG00000028838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000132387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134360548:134383850:-1 gene:ENSMUSG00000028838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 80 // 42 // 12 // 15 // 0 /// ENSMUST00000142730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134362705:134365424:-1 gene:ENSMUSG00000028838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 82 // 31 // 9 // 11 // 0 /// AF224461 // GenBank // Mus musculus multiple exostoses-like 1 protein (Extl1) mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// BC120890 // GenBank // Mus musculus exostoses (multiple)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:141418 IMAGE:40061413), complete cds. // chr4 // 91 // 92 // 30 // 33 // 0 /// BC120891 // GenBank // Mus musculus exostoses (multiple)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:141419 IMAGE:40061414), complete cds. // chr4 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000027898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134357648:134371718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT050001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 82 // 31 // 9 // 11 // 0
NM_029100 // RefSeq // Mus musculus selenoprotein N, 1 (Sepn1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000060435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134537892:134552166:-1 gene:ENSMUSG00000050989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC043665 // GenBank // Mus musculus selenoprotein N, 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5012596), complete cds. // chr4 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000027901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134539616:134552239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
NM_207237 // RefSeq // Mus musculus mannosidase, alpha, class 1C, member 1 (Man1c1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006538757 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mannosidase, alpha, class 1C, member 1 (Man1c1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000038628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:134561690:134704290:-1 gene:ENSMUSG00000037306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134561690:134704290:-1 gene:ENSMUSG00000037306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC067023 // GenBank // Mus musculus mannosidase, alpha, class 1C, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:91324 IMAGE:6848230), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000176606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134567889:134703767:-1 gene:ENSMUSG00000037306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// AK141122 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230059A18 product:mannosidase, alpha, class 1C, member 1, full insert sequence. // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134563706:134576055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134578286:134703469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_145554 // RefSeq // Mus musculus low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 (Ldlrap1), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000037828 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134744735:134768024:-1 gene:ENSMUSG00000037295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000148479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134746576:134750107:-1 gene:ENSMUSG00000037295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// AK169675 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430007B04 product:Similar to LDL receptor adaptor protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr4 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC021467 // GenBank // Mus musculus low density lipoprotein receptor adaptor protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:29272 IMAGE:5067154), complete cds. // chr4 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC066808 // GenBank // Mus musculus low density lipoprotein receptor adaptor protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:76516 IMAGE:30055031), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC067411 // GenBank // Mus musculus low density lipoprotein receptor adaptor protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:76754 IMAGE:30092248), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134747052:134767900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT050018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0
NM_027935 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 50A (Tmem50a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134897849:134915024:-1 gene:ENSMUSG00000028822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105863 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134898391:134915015:-1 gene:ENSMUSG00000028822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC094256 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 50A, mRNA (cDNA clone MGC:106467 IMAGE:6820666), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539182 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 50A (Tmem50a), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134901038:134913183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC031727 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3992920, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_013885 // RefSeq // Mus musculus chloride intracellular channel 4 (mitochondrial) (Clic4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000037099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135213969:135272814:-1 gene:ENSMUSG00000037242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF102578 // GenBank // Mus musculus intracellular chloride channel protein (Clic) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC046384 // GenBank // Mus musculus chloride intracellular channel 4 (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:51372 IMAGE:3155573), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// BC052890 // GenBank // Mus musculus chloride intracellular channel 4 (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:60540 IMAGE:30056606), complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000120974 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135290366:135290675:-1 gene:ENSMUSG00000087270 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000120372 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135403189:135403656:-1 gene:ENSMUSG00000081136 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000038724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:135370569:135403515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 58 // 6 // 7 // 0
NM_022980 // RefSeq // Mus musculus regulator of calcineurin 3 (Rcan3), mRNA. // chr4 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// ENSMUST00000030606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135412308:135433853:-1 gene:ENSMUSG00000059713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// ENSMUST00000156635 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135418443:135433823:-1 gene:ENSMUSG00000059713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 82 // 52 // 14 // 17 // 0 /// AF237888 // GenBank // Mus musculus Down syndrome candidate region 1-like protein 2 (Dscr1l2) mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 64 // 19 // 21 // 0 /// BC059001 // GenBank // Mus musculus regulator of calcineurin 3, mRNA (cDNA clone MGC:69596 IMAGE:6847734), complete cds. // chr4 // 92 // 76 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132654 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:135412308:135425267:-1 gene:ENSMUSG00000059713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000038719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:135416420:135425408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 64 // 18 // 21 // 0
NM_001013756 // RefSeq // Mus musculus grainyhead-like 3 (Drosophila) (Grhl3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000105855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135541888:135573630:-1 gene:ENSMUSG00000037188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC089372 // GenBank // Mus musculus grainyhead-like 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:102260 IMAGE:30607679), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006538759 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus grainyhead-like 3 (Drosophila) (Grhl3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// GENSCAN00000038730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:135542659:135573730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000119054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135756218:135756695:-1 gene:ENSMUSG00000082743 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT050071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_026383 // RefSeq // Mus musculus proline-rich nuclear receptor coactivator 2 (Pnrc2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030436 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135870918:135873850:-1 gene:ENSMUSG00000028675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC006598 // GenBank // Mus musculus proline-rich nuclear receptor coactivator 2, mRNA (cDNA clone MGC:11707 IMAGE:3965195), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011942 // RefSeq // Mus musculus lysophospholipase 2 (Lypla2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000067567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135968224:135972626:-1 gene:ENSMUSG00000028670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000105852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135968224:135971929:-1 gene:ENSMUSG00000028670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000145350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135968764:135972588:-1 gene:ENSMUSG00000028670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000156948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135968701:135970470:-1 gene:ENSMUSG00000028670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// AB009653 // GenBank // Mus musculus mRNA for lysophospholipase II, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC068120 // GenBank // Mus musculus lysophospholipase 2, mRNA (cDNA clone MGC:93028 IMAGE:5714650), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:135968398:135987264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1
NM_013736 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 3 (Tceb3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030427 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136003368:136021763:-1 gene:ENSMUSG00000028668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB025015 // GenBank // Mus musculus mRNA for elongin A, complete cds. // chr4 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC049885 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:54593 IMAGE:5387774), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136005616:136021625:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_133872 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 1A (Kdm1a), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000046846 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:136550848:136602308:-1 gene:ENSMUSG00000036940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000105847 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:136550544:136602687:-1 gene:ENSMUSG00000036940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000116273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136550540:136602723:-1 gene:ENSMUSG00000036940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000155354 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:136555235:136568607:-1 gene:ENSMUSG00000036940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000170979 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:136558532:136577158:-1 gene:ENSMUSG00000036940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 19 // 19 // 0 /// BC059885 // GenBank // Mus musculus amine oxidase (flavin containing) domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:69806 IMAGE:6815975), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000147886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:136555207:136561501:-1 gene:ENSMUSG00000036940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// GENSCAN00000003360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136550848:136570576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 63 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136572218:136602585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000119037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:136608840:136609806:-1 gene:ENSMUSG00000083054 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136609470:136609805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
NM_001290753 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor B2 (Ephb2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NM_010142 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor B2 (Ephb2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000059287 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:136653608:136835956:-1 gene:ENSMUSG00000028664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000105845 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136647539:136835988:-1 gene:ENSMUSG00000028664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000105846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:136654646:136835843:-1 gene:ENSMUSG00000028664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000156558 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:136661463:136694040:-1 gene:ENSMUSG00000028664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 32 // 11 // 12 // 0 /// BC043088 // GenBank // Mus musculus Eph receptor B2, mRNA (cDNA clone MGC:58004 IMAGE:6418088), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// L25890 // GenBank // Mus musculus Nuk receptor tyrosine kinase mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 89 // 29 // 33 // 0 /// GENSCAN00000007433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136655322:136699864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0
NM_009777 // RefSeq // Mus musculus complement component 1, q subcomponent, beta polypeptide (C1qb), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000046384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136880129:136886187:-1 gene:ENSMUSG00000036905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC067001 // GenBank // Mus musculus complement component 1, q subcomponent, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:90036 IMAGE:5715633), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// M22531 // GenBank // Mouse complement C1q B chain mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// M36293 // GenBank // Mouse complement component subunit Clq B-chain mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136880289:136885330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK003067 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0910001E01 product:complement component 1, q subcomponent, beta polypeptide, full insert sequence. // chr4 // 70 // 80 // 14 // 20 // 0
NM_007574 // RefSeq // Mus musculus complement component 1, q subcomponent, C chain (C1qc), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538503 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus complement component 1, q subcomponent, C chain (C1qc), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000046332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136889804:136893065:-1 gene:ENSMUSG00000036896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC043945 // GenBank // Mus musculus complement component 1, q subcomponent, C chain, mRNA (cDNA clone MGC:49503 IMAGE:4972540), complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC054443 // GenBank // Mus musculus complement component 1, q subcomponent, C chain, mRNA (cDNA clone MGC:62657 IMAGE:6475447), complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC075724 // GenBank // Mus musculus complement component 1, q subcomponent, C chain, mRNA (cDNA clone MGC:78204 IMAGE:3675763), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136890043:136893841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0
NM_007572 // RefSeq // Mus musculus complement component 1, q subcomponent, alpha polypeptide (C1qa), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000046285 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136895917:136898803:-1 gene:ENSMUSG00000036887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC002086 // GenBank // Mus musculus complement component 1, q subcomponent, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:6262 IMAGE:3592169), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136896154:136916838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_007939 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor A8 (Epha8), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000030420 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136929419:136956816:-1 gene:ENSMUSG00000028661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// U72207 // GenBank // Mus musculus Eph-and Elk-related kinase (eek) mRNA, complete cds. // chr4 // 82 // 94 // 28 // 34 // 0 /// GENSCAN00000007428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136931048:136956747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_198248 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 40 (Zbtb40), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006538764 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 40 (Zbtb40), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000049583 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136979732:137048695:-1 gene:ENSMUSG00000060862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC059177 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 40, mRNA (cDNA clone MGC:62412 IMAGE:6410689), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136964988:137018720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_009861 // RefSeq // Mus musculus cell division cycle 42 (Cdc42), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000051477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:137319696:137357720:-1 gene:ENSMUSG00000006699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK150563 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830012B19 product:cell division cycle 42 homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr4 // 86 // 74 // 12 // 14 // 0 /// BC064792 // GenBank // Mus musculus cell division cycle 42 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:76717 IMAGE:30105331), complete cds. // chr4 // 88 // 89 // 15 // 17 // 0 /// U37720 // GenBank // Mus musculus CDC42 mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 95 // 17 // 18 // 0 /// NM_001243769 // RefSeq // Mus musculus cell division cycle 42 (Cdc42), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// ENSMUST00000030417 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:137321762:137357699:-1 gene:ENSMUSG00000006699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// L78075 // GenBank // Mus musculus cdc42b (Cdc42) mRNA, complete cds. // chr4 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1 /// GENSCAN00000007402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:137317642:137336079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0
NM_001126318 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13011 (Gm13011), mRNA. // chr4 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// ENSMUST00000024200 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:4:137401554:137409791:-1 gene:ENSMUSG00000078520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000007400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:137401628:137430499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
NM_026419 // RefSeq // Mus musculus chymotrypsin-like elastase family, member 3B (Cela3b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000102522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:137420999:137430540:-1 gene:ENSMUSG00000023433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC061066 // GenBank // Mus musculus elastase 3, pancreatic, mRNA (cDNA clone MGC:74178 IMAGE:30309250), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000007400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:137401628:137430499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001033979 // RefSeq // Mus musculus low density lipoprotein receptor A domain containing 2 (Ldlrad2), mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// XM_006539013 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus low density lipoprotein receptor A domain containing 2 (Ldlrad2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:137571151:137581956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0
NM_026880 // RefSeq // Mus musculus PTEN induced putative kinase 1 (Pink1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000030536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138313412:138326307:-1 gene:ENSMUSG00000028756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000105816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138313409:138316426:-1 gene:ENSMUSG00000028756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000105817 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138313919:138326240:-1 gene:ENSMUSG00000028756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AB053476 // GenBank // Mus musculus PINK1 mRNA for PTEN induced putative kinase 1, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF316872 // GenBank // Mus musculus protein kinase BRPK mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC044743 // GenBank // Mus musculus PTEN induced putative kinase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3491669), partial cds. // chr4 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// BC067066 // GenBank // Mus musculus PTEN induced putative kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:91364 IMAGE:30542123), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138313956:138326219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_028176 // RefSeq // Mus musculus cytidine deaminase (Cda), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138338528:138367992:-1 gene:ENSMUSG00000028755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138338424:138343649:-1 gene:ENSMUSG00000028755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC050114 // GenBank // Mus musculus cytidine deaminase, mRNA (cDNA clone MGC:60919 IMAGE:6433052), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT050204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000008915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138338884:138396470:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001081672 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 43, member B (Fam43b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138394092:138396528:-1 gene:ENSMUSG00000078235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138338884:138396470:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029401 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5B1 (Vwa5b1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006539241 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5B1 (Vwa5b1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000030533 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138565360:138624012:-1 gene:ENSMUSG00000028753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000105812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138581630:138635884:-1 gene:ENSMUSG00000028753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 61 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000133319 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138600144:138606999:-1 gene:ENSMUSG00000028753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000137206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138571046:138581083:-1 gene:ENSMUSG00000028753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// BC132477 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5B1, mRNA (cDNA clone MGC:164108 IMAGE:40130754), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC137851 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5B1, mRNA (cDNA clone MGC:169475 IMAGE:8860870), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC144974 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053522, containing frame-shift errors. // chr4 // 86 // 100 // 38 // 44 // 0 /// GENSCAN00000029319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138569067:138654333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0
NM_001285928 // RefSeq // Mus musculus UBX domain protein 10 (Ubxn10), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NM_001285930 // RefSeq // Mus musculus UBX domain protein 10 (Ubxn10), transcript variant 4, mRNA. // chr4 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// NM_178671 // RefSeq // Mus musculus UBX domain protein 10 (Ubxn10), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000105809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138718838:138724856:-1 gene:ENSMUSG00000043621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000105810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138718538:138737167:-1 gene:ENSMUSG00000043621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138718538:138725265:-1 gene:ENSMUSG00000043621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC027099 // GenBank // Mus musculus UBX domain protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:32424 IMAGE:5041000), complete cds. // chr4 // 71 // 52 // 12 // 17 // 0 /// NM_001285929 // RefSeq // Mus musculus UBX domain protein 10 (Ubxn10), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// ENSMUST00000135156 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138731877:138737136:-1 gene:ENSMUSG00000043621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// NONMMUT050217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_012045 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A2, group IIF (Pla2g2f), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000030526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138750533:138757626:-1 gene:ENSMUSG00000028749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF166099 // GenBank // Mus musculus group IIF secreted phospholipase A2 (Pla2g2f) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// BC125567 // GenBank // Mus musculus phospholipase A2, group IIF, mRNA (cDNA clone MGC:159270 IMAGE:40130082), complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138746749:138762511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000157269 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:138827376:138827476:-1 gene:ENSMUSG00000087894 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT050226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_028453 // RefSeq // Mus musculus OTU domain containing 3 (Otud3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006539206 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus OTU domain containing 3 (Otud3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000097830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138895379:138913945:-1 gene:ENSMUSG00000041161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XR_390782 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus OTU domain containing 3 (Otud3), transcript variant X4, misc_RNA. // chr4 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000029334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138895738:138913827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
NM_021358 // RefSeq // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 6 (Htr6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006538579 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 6 (Htr6), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000068036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:139061409:139074789:-1 gene:ENSMUSG00000028747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000105802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:139061108:139075570:-1 gene:ENSMUSG00000028747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF134158 // GenBank // Mus musculus serotonin 6 receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC116652 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:144682 IMAGE:40104888), complete cds. // chr4 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// BC116653 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:144683 IMAGE:40104889), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:139061420:139085620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_008675 // RefSeq // Mus musculus neuroblastoma, suppression of tumorigenicity 1 (Nbl1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006538624 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuroblastoma, suppression of tumorigenicity 1 (Nbl1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:139082284:139092993:-1 gene:ENSMUSG00000041120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000132940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:139083207:139092106:-1 gene:ENSMUSG00000041120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// BC099856 // GenBank // Mus musculus neuroblastoma, suppression of tumorigenicity 1, mRNA (cDNA clone MGC:123431 IMAGE:40039759), complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC099857 // GenBank // Mus musculus neuroblastoma, suppression of tumorigenicity 1, mRNA (cDNA clone MGC:123432 IMAGE:40039762), complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC099858 // GenBank // Mus musculus neuroblastoma, suppression of tumorigenicity 1, mRNA (cDNA clone MGC:123429 IMAGE:40039757), complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC107810 // GenBank // Mus musculus neuroblastoma, suppression of tumorigenicity 1, mRNA (cDNA clone MGC:123430 IMAGE:40039758), complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// D50263 // GenBank // Mus musculus DAN mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONMMUT050238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000029335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:139061420:139085620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NR_033543 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 16287 (Gm16287), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:139175405:139180655:-1 gene:ENSMUSG00000073739 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT050246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145384 // RefSeq // Mus musculus PQ loop repeat containing 2 (Pqlc2), mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000053862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:139298528:139310708:-1 gene:ENSMUSG00000028744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000105801 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:139298530:139310678:-1 gene:ENSMUSG00000028744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000139840 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:139294029:139310685:-1 gene:ENSMUSG00000028744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000141007 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:139301310:139310637:-1 gene:ENSMUSG00000028744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000172747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:139298530:139310665:-1 gene:ENSMUSG00000028744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// BC019216 // GenBank // Mus musculus PQ loop repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:29170 IMAGE:5065163), complete cds. // chr4 // 88 // 89 // 29 // 33 // 0 /// BC025609 // GenBank // Mus musculus PQ loop repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:38094 IMAGE:5309871), complete cds. // chr4 // 93 // 73 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:139298803:139306606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000117963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:139345300:139346180:-1 gene:ENSMUSG00000080708 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
NM_011039 // RefSeq // Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030508 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:139737062:139833528:-1 gene:ENSMUSG00000028736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000174681 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:139740676:139833007:-1 gene:ENSMUSG00000028736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AF254422 // GenBank // Mus musculus paired box transcription factor PAX7 (Pax7) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:139740787:139832775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
NM_173427 // RefSeq // Mus musculus kelch domain containing 7A (Klhdc7a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000105031 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:139960220:139968026:-1 gene:ENSMUSG00000078234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:139964385:139967634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_198610 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 21 (Igsf21), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000039331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:140026846:140246784:-1 gene:ENSMUSG00000040972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC055811 // GenBank // Mus musculus immunoglobin superfamily, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:67646 IMAGE:6414125), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:140010749:140230211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1
AK030056 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932418N15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_153106 // RefSeq // Mus musculus peptidyl arginine deiminase, type VI (Padi6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000038749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:140727355:140742643:-1 gene:ENSMUSG00000040935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000130267 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:140735701:140741647:-1 gene:ENSMUSG00000040935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// AF529423 // GenBank // Mus musculus ICR arginine deiminase-like protein mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC053724 // GenBank // Mus musculus peptidyl arginine deiminase, type VI, mRNA (cDNA clone MGC:60752 IMAGE:30051727), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:140722507:140774180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_011061 // RefSeq // Mus musculus peptidyl arginine deiminase, type IV (Padi4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000026381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:140745865:140774236:-1 gene:ENSMUSG00000025330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB013850 // GenBank // Mus musculus mRNA for peptidylarginine deiminase type IV, complete cds. // chr4 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000137516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:140752286:140757925:-1 gene:ENSMUSG00000025330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// ENSMUST00000143019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:140755903:140761777:-1 gene:ENSMUSG00000025330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// AK084904 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430007M12 product:peptidyl arginine deiminase, type IV, full insert sequence. // chr4 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000047356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:140722507:140774180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_011060 // RefSeq // Mus musculus peptidyl arginine deiminase, type III (Padi3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000026377 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:140785365:140810648:-1 gene:ENSMUSG00000025328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000172098 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:140785369:140804022:-1 gene:ENSMUSG00000025328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AB013849 // GenBank // Mus musculus mRNA for peptidylarginine deiminase type III, complete cds. // chr4 // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// AK220522 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4171 protein. // chr4 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:140786401:140845651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_011059 // RefSeq // Mus musculus peptidyl arginine deiminase, type I (Padi1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000026378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:140812983:140845778:-1 gene:ENSMUSG00000025329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB013848 // GenBank // Mus musculus mRNA for peptidylarginine deiminase type I, complete cds. // chr4 // 81 // 100 // 26 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:140786401:140845651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1
AK049864 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630004L07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001146307 // RefSeq // Mus musculus chloride channel Ka (Clcnka), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// NM_024412 // RefSeq // Mus musculus chloride channel Ka (Clcnka), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000042617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141384610:141398724:-1 gene:ENSMUSG00000033770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000105790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141384610:141398204:-1 gene:ENSMUSG00000033770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000133676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141395119:141398574:-1 gene:ENSMUSG00000033770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// AF124848 // GenBank // Mus musculus putative basolateral cTAL chloride channel ClC-Ka mRNA, complete cds. // chr4 // 83 // 93 // 33 // 40 // 0 /// AY373832 // GenBank // Mus musculus chloride channel CLCK1 (Clcnk1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// BC037077 // GenBank // Mus musculus chloride channel Ka, mRNA (cDNA clone MGC:46804 IMAGE:5042736), complete cds. // chr4 // 76 // 95 // 31 // 41 // 0 /// ENSMUST00000150334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141391396:141394827:-1 gene:ENSMUSG00000033770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1 /// GENSCAN00000047344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141384901:141415295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0
NM_019701 // RefSeq // Mus musculus chloride channel Kb (Clcnkb), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006539068 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chloride channel Kb (Clcnkb), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000006378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141404353:141416014:-1 gene:ENSMUSG00000006216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000105788 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141404353:141416014:-1 gene:ENSMUSG00000006216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AF124847 // GenBank // Mus musculus putative basolateral mTAL chloride channel ClC-Ka mRNA, complete cds. // chr4 // 84 // 95 // 31 // 37 // 0 /// AK146876 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920067P16 product:chloride channel Kb, full insert sequence. // chr4 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// BC019983 // GenBank // Mus musculus chloride channel Kb, mRNA (cDNA clone MGC:28502 IMAGE:4188062), complete cds. // chr4 // 85 // 100 // 33 // 39 // 0 /// XM_006544491 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chloride channel protein ClC-Kb-like (LOC102642166), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1 /// GENSCAN00000047344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141384901:141415295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0
NM_001033374 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 694 (Gm694), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000094544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141432672:141436105:-1 gene:ENSMUSG00000070637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147054 // GenBank // Mus musculus gene model 694, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182162 IMAGE:9056056), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC147055 // GenBank // Mus musculus gene model 694, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182183 IMAGE:9056077), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141433029:141449716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_019763 // RefSeq // Mus musculus SPEN homolog, transcriptional regulator (Drosophila) (Spen), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000078886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141467890:141538449:-1 gene:ENSMUSG00000040761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000105786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141467890:141538597:-1 gene:ENSMUSG00000040761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB055980 // GenBank // Mus musculus MINT mRNA for Msx-2 interacting nuclear target protein, complete cds. // chr4 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0 /// AF156529 // GenBank // Mus musculus Msx2 interacting nuclear target protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AK137647 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930012G21 product:Msx2 interacting nuclear target protein, full insert sequence. // chr4 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// AK122402 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0929 protein. // chr4 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// ENSMUST00000152081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141521803:141538253:-1 gene:ENSMUSG00000040761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// BC094600 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6406543. // chr4 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000047355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141468906:141538502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_145987 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 82 (Tmem82), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000053263 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141614233:141618238:-1 gene:ENSMUSG00000043085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143154 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141613376:141618633:-1 gene:ENSMUSG00000043085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC025833 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 82, mRNA (cDNA clone MGC:37938 IMAGE:5125918), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000156246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141614237:141617981:-1 gene:ENSMUSG00000043085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// AK162322 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130003I11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// AK154809 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630107H17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000034491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141577830:141623648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001013780 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 34 (Slc25a34), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000038661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141618824:141623821:-1 gene:ENSMUSG00000040740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC089627 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 34, mRNA (cDNA clone MGC:107701 IMAGE:6758395), complete cds. // chr4 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// AK085913 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830027M14 product:Hypothetical mitochondrial energy transfer proteins, full insert sequence. // chr4 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// GENSCAN00000034491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141577830:141623648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NM_001033150 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 2 (Plekhm2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000030751 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:141625734:141664899:-1 gene:ENSMUSG00000028917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000084203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:141625734:141664118:-1 gene:ENSMUSG00000028917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000140223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141632467:141642195:-1 gene:ENSMUSG00000028917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000141844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141641317:141642762:-1 gene:ENSMUSG00000028917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// AK122386 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0842 protein. // chr4 // 93 // 95 // 38 // 41 // 0 /// GENSCAN00000034509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141626570:141644410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0
NM_001017966 // RefSeq // Mus musculus DNA-damage inducible protein 2 (Ddi2), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// NM_023544 // RefSeq // Mus musculus regulatory solute carrier protein, family 1, member 1 (Rsc1a1), mRNA. // chr4 // 100 // 48 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000102484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141677549:141723419:-1 gene:ENSMUSG00000078515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000105782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141683851:141685599:-1 gene:ENSMUSG00000040715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000177592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:141683563:141723419:-1 gene:ENSMUSG00000078515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000040715 // chr4 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// AK129015 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3032827, moderately similar to Homo sapiens regulatory solute carrier protein, family 1, member 1 (RSC1A1). // chr4 // 81 // 96 // 39 // 48 // 0 /// BC150752 // GenBank // Mus musculus regulatory solute carrier protein, family 1, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:183663 IMAGE:9087663), complete cds. // chr4 // 68 // 38 // 13 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141683851:141723194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 34 // 34 // 0
NM_172338 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 16 (Dnajc16), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000038014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141760189:141790891:-1 gene:ENSMUSG00000040697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK122407 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0962 protein. // chr4 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// AK154946 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630112G18 product:Hypothetical DnaJ N-terminal domain containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC046424 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 16, mRNA (cDNA clone MGC:51470 IMAGE:3989412), complete cds. // chr4 // 89 // 50 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000034513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141763519:141789055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_007919 // RefSeq // Mus musculus chymotrypsin-like elastase family, member 2A (Cela2a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000102481 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141814962:141826160:-1 gene:ENSMUSG00000058579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000127962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141814962:141819202:-1 gene:ENSMUSG00000058579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC026552 // GenBank // Mus musculus elastase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:36100 IMAGE:4990174), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000155826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141824952:141826001:-1 gene:ENSMUSG00000058579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// ENSMUST00000176781 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141814962:141846263:-1 gene:ENSMUSG00000062478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// AK160448 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810023J24 product:elastase 2, full insert sequence. // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000034502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141815038:141825982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// NONMMUT050374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001033875 // RefSeq // Mus musculus chymotrypsin C (caldecrin) (Ctrc), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000037059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:141838244:141846359:-1 gene:ENSMUSG00000062478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000105781 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141838239:141846283:-1 gene:ENSMUSG00000062478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000153282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141838239:141846357:-1 gene:ENSMUSG00000062478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC103715 // GenBank // Mus musculus chymotrypsin C (caldecrin), mRNA (cDNA clone MGC:107504 IMAGE:6430373), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC115516 // GenBank // Mus musculus chymotrypsin C (caldecrin), mRNA (cDNA clone MGC:144341 IMAGE:40101127), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC115517 // GenBank // Mus musculus chymotrypsin C (caldecrin), mRNA (cDNA clone MGC:144342 IMAGE:40101128), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000176781 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141814962:141846263:-1 gene:ENSMUSG00000062478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000034503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141834580:141846268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_025994 // RefSeq // Mus musculus EF hand domain containing 2 (Efhd2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141858142:141874920:-1 gene:ENSMUSG00000040659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC125303 // GenBank // Mus musculus EF hand domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:159006 IMAGE:40129818), complete cds. // chr4 // 80 // 77 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141859747:142023453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
ENSMUST00000123068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141962875:142015082:-1 gene:ENSMUSG00000051435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK045799 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230311F11 product:hypothetical Proline-rich region/Forkhead-associated (FHA) domain containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006538961 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus forkhead-associated (FHA) phosphopeptide binding domain 1 (Fhad1), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENSMUST00000105780 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:141890438:142015067:-1 gene:ENSMUSG00000051435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NM_177868 // RefSeq // Mus musculus forkhead-associated (FHA) phosphopeptide binding domain 1 (Fhad1), mRNA. // chr4 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// ENSMUST00000105779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:141890851:142011637:-1 gene:ENSMUSG00000051435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000034511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141859747:142023453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_145402 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 51 (Tmem51), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538713 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 51 (Tmem51), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// XM_006538714 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 51 (Tmem51), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// XM_006538715 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 51 (Tmem51), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000036572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:142030992:142084304:-1 gene:ENSMUSG00000040616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC003277 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 51, mRNA (cDNA clone MGC:7879 IMAGE:3582174), complete cds. // chr4 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:142031686:142037742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
NM_001081355 // RefSeq // Mus musculus PR domain containing 2, with ZNF domain (Prdm2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001256380 // RefSeq // Mus musculus PR domain containing 2, with ZNF domain (Prdm2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000105778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:143107391:143212705:-1 gene:ENSMUSG00000057637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000134791 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:143162080:143212709:-1 gene:ENSMUSG00000057637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 39 // 10 // 12 // 0 /// ENSMUST00000154280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:143162056:143194735:-1 gene:ENSMUSG00000057637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// BC151062 // GenBank // Mus musculus PR domain containing 2, with ZNF domain, mRNA (cDNA clone MGC:183975 IMAGE:9087975), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:143105848:143142142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0
NM_001256380 // RefSeq // Mus musculus PR domain containing 2, with ZNF domain (Prdm2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001290822 // RefSeq // Mus musculus podoplanin (Pdpn), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NM_010329 // RefSeq // Mus musculus podoplanin (Pdpn), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000030317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:143267431:143299564:-1 gene:ENSMUSG00000028583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000119654 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:143268346:143299463:-1 gene:ENSMUSG00000028583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000181012 // ENSEMBL // proj_havana:novel chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143268346:143299463:-1 gene:ENSMUSG00000096951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000181754 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143267431:143299564:-1 gene:ENSMUSG00000096951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC026551 // GenBank // Mus musculus podoplanin, mRNA (cDNA clone MGC:36068 IMAGE:4985288), complete cds. // chr4 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// M73748 // GenBank // Mouse OTS-8 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// M96645 // GenBank // Mouse glycoprotein 38 mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:143242024:143281400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000056898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143242024:143281400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_173773 // RefSeq // Mus musculus oogenesin 4 (Oog4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061277 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:143437164:143450324:-1 gene:ENSMUSG00000047799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073641 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:143437165:143450304:-1 gene:ENSMUSG00000047799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000180552 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143437164:143450324:-1 gene:ENSMUSG00000097153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180702 // ENSEMBL // proj_havana:known chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143437165:143450304:-1 gene:ENSMUSG00000097153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AY573564 // GenBank // Mus musculus oogensin 4 (Oog4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098485 // GenBank // Mus musculus oogenesin 4, mRNA (cDNA clone MGC:107441 IMAGE:30051767), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:143423280:143469435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143438646:143469435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSMUST00000119244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:143458378:143460538:-1 gene:ENSMUSG00000083930 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000181783 // ENSEMBL // proj_havana:known chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143458378:143460538:-1 gene:ENSMUSG00000097105 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT050436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:143423280:143469435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// GENSCAN00000056900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143438646:143469435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
XR_390928 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 13089 (Gm13089), misc_RNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:143696500:143702711:-1 gene:ENSMUSG00000070617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC053717 // GenBank HTC // Mus musculus predicted gene, OTTMUSG00000010333, mRNA (cDNA clone IMAGE:30045959), containing frame-shift errors. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:143673331:143699371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_201258 // RefSeq // Mus musculus oogenesin 3 (Oog3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000050933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:144157557:144162663:-1 gene:ENSMUSG00000050810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY573563 // GenBank // Mus musculus oogensin 3 (Oog3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC053700 // GenBank // Mus musculus oogenesin 3, mRNA (cDNA clone MGC:60746 IMAGE:30049894), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:144139184:144162606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_001085418 // RefSeq // Mus musculus preferentially expressed antigen in melanoma like 5 (Pramel5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000035757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:144270633:144280466:-1 gene:ENSMUSG00000036749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000105752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:144270635:144274027:-1 gene:ENSMUSG00000036749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// BC052827 // GenBank // Mus musculus preferentially expressed antigen in melanoma like 5, mRNA (cDNA clone MGC:60806 IMAGE:30033377), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:144271169:144274004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0
NM_001115077 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13125 (Gm13125), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000121109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:144372760:144377933:-1 gene:ENSMUSG00000073721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:144372760:144377933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_029948 // RefSeq // Mus musculus PRAME family member 12 (Pramef12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539284 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PRAME family member 12 (Pramef12), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000030326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:144391674:144408464:-1 gene:ENSMUSG00000028591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:144395056:144408417:-1 gene:ENSMUSG00000028591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK167683 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530028G23 product:hypothetical Leucine-rich repeat/Leucine-rich repeat, cysteine-containing/Somatotropin hormone containing protein, full insert sequence. // chr4 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC066168 // GenBank // Mus musculus PRAME family member 12, mRNA (cDNA clone MGC:76536 IMAGE:30474135), complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:144392604:144434754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_027056 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012P22 gene (1700012P22Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030323 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:144418189:144438772:-1 gene:ENSMUSG00000028589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099569 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012P22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118354 IMAGE:30918007), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116372 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012P22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144257 IMAGE:40100233), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC126971 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012P22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144256 IMAGE:40100231), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:144392604:144434754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000177649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:144453009:144453317:-1 gene:ENSMUSG00000095213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK079467 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A030010G24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000117079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:144545506:144548568:-1 gene:ENSMUSG00000082418 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT050461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001085536 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13178 (Gm13178), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539057 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 13178 (Gm13178), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:144703191:144721404:-1 gene:ENSMUSG00000041735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:144703191:144871175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001276465 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 13 D (yeast) (Vps13d), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001276502 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 13 D (yeast) (Vps13d), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:144972626:145190666:-1 gene:ENSMUSG00000020220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:144972622:145195005:-1 gene:ENSMUSG00000020220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:144972623:144974683:-1 gene:ENSMUSG00000020220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000073719 // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:144972626:145091950:-1 gene:ENSMUSG00000020220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC038488 // GenBank // Mus musculus, clone IMAGE:3672995, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001276465 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 13 D (yeast) (Vps13d), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 71 // 71 // 0 /// NM_001276502 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 13 D (yeast) (Vps13d), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 99 // 70 // 70 // 0 /// ENSMUST00000020441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:144972626:145190666:-1 gene:ENSMUSG00000020220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 69 // 69 // 0 /// ENSMUST00000036579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:144972622:145195005:-1 gene:ENSMUSG00000020220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 71 // 71 // 0 /// ENSMUST00000185113 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:144974596:145155486:-1 gene:ENSMUSG00000020220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 51 // 51 // 0 /// ENSMUST00000130704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:144972626:145091950:-1 gene:ENSMUSG00000020220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 32 // 32 // 23 // 71 // 1 /// GENSCAN00000039939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:144975137:145190592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 65 // 65 // 0
NM_011610 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1b (Tnfrsf1b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000030336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:145213463:145246870:-1 gene:ENSMUSG00000028599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000143055 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:145225416:145246870:-1 gene:ENSMUSG00000028599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// BC141405 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1b, mRNA (cDNA clone MGC:176367 IMAGE:9056018), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// M59378 // GenBank // Murine tumor necrosis factor I receptor (TNFR-1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// M60469 // GenBank // Mouse tumor necrosis factor receptor 2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:145215787:145246801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_009401 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 8 (Tnfrsf8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006538719 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 8 (Tnfrsf8), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000030339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:145267137:145315147:-1 gene:ENSMUSG00000028602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123027 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:145267139:145315164:-1 gene:ENSMUSG00000028602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK044269 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930004K17 product:tumor necrosis factor receptor superfamily, member 8, full insert sequence. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC130026 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:161195 IMAGE:40140833), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U25416 // GenBank // Mus musculus CD30 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:145268991:145315084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
XM_006543901 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 60S acidic ribosomal protein P1-like (LOC102634135), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000118238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:145469711:145470050:-1 gene:ENSMUSG00000087076 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000039930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:145469691:145470050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000177803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:145646771:145647115:-1 gene:ENSMUSG00000095517 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000019812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:145646771:145647133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000119875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:147194876:147195211:-1 gene:ENSMUSG00000082176 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:145844404:145844718:-1 gene:ENSMUSG00000083235 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119646 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:146480667:146480926:1 gene:ENSMUSG00000081998 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 60 // 77 // 12 // 20 // 0 /// GENSCAN00000002931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:147194894:147228847:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:145844404:145862456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_145078 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2610305D13 gene (2610305D13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000037565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:147611939:147642508:-1 gene:ENSMUSG00000066000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000105720 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:147611937:147642513:-1 gene:ENSMUSG00000066000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006535991 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2610305D13 gene (2610305D13Rik), partial mRNA. // chr4 // 71 // 88 // 10 // 14 // 0
NR_033639 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein S19, pseudogene 3 (Rps19-ps3), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000116174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:147821777:147822202:-1 gene:ENSMUSG00000080059 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:147821777:147936677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_198619 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 933 (Zfp933), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000105718 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:147822986:147848366:-1 gene:ENSMUSG00000059423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000135798 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:147826747:147848366:-1 gene:ENSMUSG00000059423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AK131865 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010013J15 product:similar to kruppel-related zinc finger protein F80-L [Mus musculus], full insert sequence. // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC058101 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810408P10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67181 IMAGE:6822264), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
NM_011929 // RefSeq // Mus musculus chloride channel 6 (Clcn6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XR_389860 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chloride channel 6 (Clcn6), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 98 // 87 // 40 // 41 // 0 /// ENSMUST00000030879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:148006134:148038813:-1 gene:ENSMUSG00000029016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000105711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:148006589:148038770:-1 gene:ENSMUSG00000029016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000137724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:148004259:148038821:-1 gene:ENSMUSG00000029016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AK220319 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0046 protein. // chr4 // 97 // 72 // 33 // 34 // 0 /// AK045787 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230311B16 product:chloride channel 6, full insert sequence. // chr4 // 32 // 32 // 15 // 47 // 1 /// ENSMUST00000134377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:148024435:148038763:-1 gene:ENSMUSG00000029016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1 /// GENSCAN00000036863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148006781:148038767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0
NM_009642 // RefSeq // Mus musculus angiotensin II, type I receptor-associated protein (Agtrap), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006544748 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus type-1 angiotensin II receptor-associated protein-like (LOC102641987), mRNA. // chr4 // 83 // 43 // 10 // 12 // 0 /// ENSMUST00000030865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148077061:148088031:-1 gene:ENSMUSG00000029007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF102548 // GenBank // Mus musculus AT1 receptor-associated protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC046820 // GenBank // Mus musculus angiotensin II, type I receptor-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:61372 IMAGE:6400135), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC057196 // GenBank // Mus musculus angiotensin II, type I receptor-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:68197 IMAGE:5249164), complete cds. // chr4 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// ENSMUST00000152323 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:148080517:148084776:-1 gene:ENSMUSG00000029007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000036864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148068031:148082686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_027426 // RefSeq // Mus musculus dorsal inhibitory axon guidance protein (Draxin), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000030862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148098437:148130698:-1 gene:ENSMUSG00000029005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB301918 // GenBank // Mus musculus mRNA for neucrin, complete cds. // chr4 // 86 // 72 // 18 // 21 // 0 /// AK086198 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930012M21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// BC060239 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610109H07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:77973 IMAGE:6853328), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148102470:148131038:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_001083342 // RefSeq // Mus musculus patched domain containing 2 (Ptchd2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001083342 // RefSeq // Mus musculus patched domain containing 2 (Ptchd2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_390748 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus patched domain containing 2 (Ptchd2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148240264:148287965:-1 gene:ENSMUSG00000041544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC070441 // GenBank // Mus musculus patched domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:99871 IMAGE:30535318), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC072569 // GenBank // Mus musculus patched domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:99434 IMAGE:5719275), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AB235901 // GenBank // Mus musculus mRNA for RNDEu-2, complete cds. // chr4 // 73 // 88 // 16 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148241256:148272401:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_027873 // RefSeq // Mus musculus UbiA prenyltransferase domain containing 1 (Ubiad1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148434495:148444771:-1 gene:ENSMUSG00000047719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC015303 // GenBank // Mus musculus UbiA prenyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:19220 IMAGE:4241204), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC071203 // GenBank // Mus musculus UbiA prenyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:78081 IMAGE:3667534), complete cds. // chr4 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// AK034787 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430038G21 product:Transitional EPITHELIA response protein homolog, full insert sequence. // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSMUST00000156686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:148436489:148444761:-1 gene:ENSMUSG00000047719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148436155:148448985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000082714 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:148443334:148443485:-1 gene:ENSMUSG00000064648 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK034787 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430038G21 product:Transitional EPITHELIA response protein homolog, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT050601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001039554 // RefSeq // Mus musculus angiopoietin-like 7 (Angptl7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006535966 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus angiopoietin-like 7 (Angptl7), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000030840 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148495183:148500460:-1 gene:ENSMUSG00000028989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC023373 // GenBank // Mus musculus angiopoietin-like 7, mRNA (cDNA clone MGC:32448 IMAGE:5043159), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148496155:148500289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_007745 // RefSeq // Mus musculus cortistatin (Cort), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:149125034:149126763:-1 gene:ENSMUSG00000028971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF013253 // GenBank // Mus musculus preprocortistatin (Cort) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000120596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:149142497:149143388:-1 gene:ENSMUSG00000080746 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:149128773:149307571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001081274 // RefSeq // Mus musculus phosphogluconate dehydrogenase (Pgd), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000084124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:149149991:149166707:-1 gene:ENSMUSG00000028961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC008646 // GenBank // Mus musculus phosphogluconate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:11617 IMAGE:3155147), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC011329 // GenBank // Mus musculus phosphogluconate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:18955 IMAGE:3984654), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC014793 // GenBank // Mus musculus phosphogluconate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:6994 IMAGE:3155100), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK161869 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330501P07 product:phosphogluconate dehydrogenase, full insert sequence. // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// ENSMUST00000156120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:149159927:149166771:-1 gene:ENSMUSG00000028961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000049400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:149128773:149307571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_027460 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 33 (Slc25a33), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000105686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:149744036:149774277:-1 gene:ENSMUSG00000028982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC011293 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 33, mRNA (cDNA clone MGC:19266 IMAGE:3989313), complete cds. // chr4 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:149744738:149774055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_001291004 // RefSeq // Mus musculus hexose-6-phosphate dehydrogenase (glucose 1-dehydrogenase) (H6pd), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_173371 // RefSeq // Mus musculus hexose-6-phosphate dehydrogenase (glucose 1-dehydrogenase) (H6pd), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:149979475:150009023:-1 gene:ENSMUSG00000028980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000084117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:149979475:150003130:-1 gene:ENSMUSG00000028980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC042677 // GenBank // Mus musculus hexose-6-phosphate dehydrogenase (glucose 1-dehydrogenase), mRNA (cDNA clone MGC:25861 IMAGE:4195793), complete cds. // chr4 // 83 // 83 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:149952310:149996362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_009802 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 6 (Car6), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000030817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:150187015:150201332:-1 gene:ENSMUSG00000028972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000105683 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:150187015:150198470:-1 gene:ENSMUSG00000028972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000126449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:150188239:150198203:-1 gene:ENSMUSG00000028972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000134648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:150187212:150196123:-1 gene:ENSMUSG00000028972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 94 // 49 // 16 // 17 // 0 /// AF079834 // GenBank // Mus musculus stress-inducible intra-cellular carbonic anhydrase isozyme VI mRNA, complete cds. // chr4 // 84 // 91 // 27 // 32 // 0 /// AF079835 // GenBank // Mus musculus secreted carbonic anhydrase isozyme VI precursor, mRNA, complete cds. // chr4 // 84 // 89 // 26 // 31 // 0 /// BC006726 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:3962014), partial cds. // chr4 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC055437 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 6, mRNA (cDNA clone MGC:65279 IMAGE:4190566), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:150187405:150201109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
XM_006539426 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein F-like (LOC102638183), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000136346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:150315177:150315436:-1 gene:ENSMUSG00000085787 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000047174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:150315177:150346989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT050706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT050707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_173774 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 45, member 1 (Slc45a1), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006538860 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 45, member 1 (Slc45a1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000037827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:150628572:150652174:-1 gene:ENSMUSG00000039838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000117997 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:150630047:150652097:-1 gene:ENSMUSG00000039838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AK134677 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330522A09 product:deleted in neuroblastoma 5, full insert sequence. // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000032483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:150629531:150706922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_009498 // RefSeq // Mus musculus vesicle-associated membrane protein 3 (Vamp3), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:151047300:151057953:-1 gene:ENSMUSG00000028955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC060045 // GenBank // Mus musculus vesicle-associated membrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:63303 IMAGE:5690213), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// U60961 // GenBank // Mus musculus vesicle-associated membrane protein cellubrevin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006538726 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vesicle-associated membrane protein 3 (Vamp3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// ENSMUST00000155446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:151050409:151057946:-1 gene:ENSMUSG00000028955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000032468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:151049927:151270252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONMMUT050751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001081557 // RefSeq // Mus musculus calmodulin binding transcription activator 1 (Camta1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538431 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calmodulin binding transcription activator 1 (Camta1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538445 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calmodulin binding transcription activator 1 (Camta1), transcript variant X15, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:151059526:151861746:-1 gene:ENSMUSG00000014592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:151059525:151861876:-1 gene:ENSMUSG00000014592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:150917322:151861669:-1 gene:ENSMUSG00000014592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150740 // GenBank // Mus musculus calmodulin binding transcription activator 1, mRNA (cDNA clone MGC:183651 IMAGE:9087651), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:151402197:151521209:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001145929 // RefSeq // Mus musculus THAP domain containing, apoptosis associated protein 3 (Thap3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_175152 // RefSeq // Mus musculus THAP domain containing, apoptosis associated protein 3 (Thap3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000036680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:151982639:151988997:-1 gene:ENSMUSG00000039759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000105665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:151982802:151988970:-1 gene:ENSMUSG00000039759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC094395 // GenBank // Mus musculus THAP domain containing, apoptosis associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:106590 IMAGE:5700290), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000146471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:151985459:151988980:-1 gene:ENSMUSG00000039759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000048271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:151983065:151988956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_172705 // RefSeq // Mus musculus PHD finger protein 13 (Phf13), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000055688 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:151989633:151996258:-1 gene:ENSMUSG00000047777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AY069976 // GenBank // Mus musculus PHD finger protein SPOC1 (Spoc1) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// BC029632 // GenBank // Mus musculus PHD finger protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:7829 IMAGE:3500487), complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// BC059282 // GenBank // Mus musculus PHD finger protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:68357 IMAGE:3500487), complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000048292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:151991553:152007804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 24 // 24 // 0
AK049812 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630001F15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133879 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 48 (Zbtb48), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006538447 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 48 (Zbtb48), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006538448 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 48 (Zbtb48), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000066715 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:152019774:152027661:-1 gene:ENSMUSG00000028952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000123696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152019776:152027671:-1 gene:ENSMUSG00000028952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000155389 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152019774:152027661:-1 gene:ENSMUSG00000028952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000156748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152021592:152026444:-1 gene:ENSMUSG00000028952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC005515 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 48, mRNA (cDNA clone MGC:7588 IMAGE:3493611), complete cds. // chr4 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// XR_390719 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 48 (Zbtb48), transcript variant X6, misc_RNA. // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000048287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:152019824:152027455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_031867 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 1, member 1 (Tas1r1), mRNA. // chr4 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// XM_006538473 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus taste receptor, type 1, member 1 (Tas1r1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 95 // 56 // 18 // 19 // 0 /// XM_006538474 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus taste receptor, type 1, member 1 (Tas1r1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 94 // 47 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000030792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:152027914:152038568:-1 gene:ENSMUSG00000028950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000147982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152027914:152038490:-1 gene:ENSMUSG00000028950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AF337040 // GenBank // Mus musculus candidate taste receptor T1R1 (T1r1) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// AY032622 // GenBank // Mus musculus taste receptor T1R1 mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 56 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:152028066:152038386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 56 // 18 // 19 // 0
NM_008237 // RefSeq // Mus musculus hairy and enhancer of split 3 (Drosophila) (Hes3), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538550 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hairy and enhancer of split 3 (Drosophila) (Hes3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006538554 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hairy and enhancer of split 3 (Drosophila) (Hes3), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006538555 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hairy and enhancer of split 3 (Drosophila) (Hes3), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006538557 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hairy and enhancer of split 3 (Drosophila) (Hes3), transcript variant X8, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006538560 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hairy and enhancer of split 3 (Drosophila) (Hes3), transcript variant X11, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:152285972:152291662:-1 gene:ENSMUSG00000028946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC116444 // GenBank // Mus musculus hairy and enhancer of split 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:144657 IMAGE:40104666), complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:152286269:152288060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_001099299 // RefSeq // Mus musculus adherens junction associated protein 1 (Ajap1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006538824 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adherens junction associated protein 1 (Ajap1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000105646 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:153373221:153482811:-1 gene:ENSMUSG00000039546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC147229 // GenBank // Mus musculus adherens junction associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:182386 IMAGE:9056280), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC147230 // GenBank // Mus musculus adherens junction associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:182379 IMAGE:9056273), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC147654 // GenBank // Mus musculus adherens junction associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:182829 IMAGE:9087443), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC147658 // GenBank // Mus musculus adherens junction associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:182833 IMAGE:9087447), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000149177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:153374231:153482179:-1 gene:ENSMUSG00000039546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000039810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:153400868:153432894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000039813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:153369140:153388028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
BC049688 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC049688, mRNA (cDNA clone IMAGE:6704757), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00005507 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT050842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007859 // RefSeq // Mus musculus DNA fragmentation factor, beta subunit (Dffb), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538517 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA fragmentation factor, beta subunit (Dffb), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000030893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:153964449:153975126:-1 gene:ENSMUSG00000029027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000133607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:153969130:153975051:-1 gene:ENSMUSG00000029027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 89 // 67 // 16 // 18 // 0 /// ENSMUST00000142671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:153972487:153975057:-1 gene:ENSMUSG00000029027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AB009377 // GenBank // Mus musculus mRNA for CAD, complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK036094 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630035I19 product:DNA fragmentation factor, 40 kD, beta subunit, full insert sequence. // chr4 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// BC053052 // GenBank // Mus musculus DNA fragmentation factor, beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:62326 IMAGE:6403143), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:153965370:153975338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001033455 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 27 (Ccdc27), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006538992 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 27 (Ccdc27), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000047207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:154026639:154042677:-1 gene:ENSMUSG00000039492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC150930 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 27, mRNA (cDNA clone MGC:183841 IMAGE:9087841), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC151167 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 27, mRNA (cDNA clone MGC:184067 IMAGE:9088056), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000024160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154023327:154114551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_026388 // RefSeq // Mus musculus transformation related protein 63 regulated like (Tprgl), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:154157485:154160666:-1 gene:ENSMUSG00000029030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000105639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:154158356:154160632:-1 gene:ENSMUSG00000029030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000134492 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:154158140:154160666:-1 gene:ENSMUSG00000029030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC019544 // GenBank // Mus musculus transformation related protein 63 regulated like, mRNA (cDNA clone MGC:28581 IMAGE:4211201), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006539129 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transformation related protein 63 regulated like (Tprgl), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XR_390779 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transformation related protein 63 regulated like (Tprgl), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENSMUST00000133165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:154159567:154160606:-1 gene:ENSMUSG00000029030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154158371:154187462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NR_045643 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5930403L14 gene (5930403L14Rik), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT050896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154633457:154637695:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_028513 // RefSeq // Mus musculus actin-related protein T2 (Actrt2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:154666433:154667867:-1 gene:ENSMUSG00000051276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052344 // GenBank // Mus musculus actin-related protein T2, mRNA (cDNA clone MGC:58123 IMAGE:6774723), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154666544:154667677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_025582 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 213, member B (Fam213b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:154896399:154899110:-1 gene:ENSMUSG00000029059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123513 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:154895504:154899038:-1 gene:ENSMUSG00000029059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000132281 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:154897335:154899135:-1 gene:ENSMUSG00000029059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AK012999 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810405K02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC030453 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810405K02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:40622 IMAGE:5401948), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154896571:154928029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_026395 // RefSeq // Mus musculus RER1 retention in endoplasmic reticulum 1 homolog (S. cerevisiae) (Rer1), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155074110:155086373:-1 gene:ENSMUSG00000029048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000149796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155074110:155086371:-1 gene:ENSMUSG00000029048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC029189 // GenBank // Mus musculus RER1 retention in endoplasmic reticulum 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:35656 IMAGE:4036721), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155074939:155082747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NM_011385 // RefSeq // Mus musculus ski sarcoma viral oncogene homolog (avian) (Ski), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000030917 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155154075:155222592:-1 gene:ENSMUSG00000029050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000084103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155154075:155222535:-1 gene:ENSMUSG00000029050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000129314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155154075:155188296:-1 gene:ENSMUSG00000029050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AF435852 // GenBank // Mus musculus Ski proto-oncogene (Ski) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 79 // 24 // 26 // 0 /// BC068305 // GenBank // Mus musculus ski sarcoma viral oncogene homolog (avian), mRNA (cDNA clone MGC:76530 IMAGE:30093626), complete cds. // chr4 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155145967:155161023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// GENSCAN00000010267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155200638:155235789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001039079 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C, zeta (Prkcz), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NM_008860 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C, zeta (Prkcz), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// XM_006538655 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein kinase C, zeta (Prkcz), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// XM_006538656 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein kinase C, zeta (Prkcz), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000103178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155260129:155345772:-1 gene:ENSMUSG00000029053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC072590 // GenBank // Mus musculus protein kinase C, zeta, mRNA (cDNA clone IMAGE:5697786). // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000117233 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155502316:155502706:-1 gene:ENSMUSG00000082429 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT050959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155502315:155502951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
AK155949 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830001N14 product:hypothetical Lysine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_011985 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 23 (Mmp23), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155650655:155653384:-1 gene:ENSMUSG00000029061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000130944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155652253:155653207:-1 gene:ENSMUSG00000029061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AF085742 // GenBank // Mus musculus CAMP metalloproteinase mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC107357 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 23, mRNA (cDNA clone MGC:130334 IMAGE:40055939), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC107358 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 23, mRNA (cDNA clone MGC:130335 IMAGE:40055946), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000156906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155650657:155652025:-1 gene:ENSMUSG00000029061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000008982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155650709:155661352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// NONMMUT050975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT050974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
ENSMUST00000082982 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:155720040:155720141:-1 gene:ENSMUSG00000064916 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT050984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000178987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:4:155732545:155734727:-1 gene:ENSMUSG00000096221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK005108 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500002C15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK080143 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530069A09 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK161750 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830450I24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_402272 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102636313 (LOC102636313), ncRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000178987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:4:155732545:155734727:-1 gene:ENSMUSG00000096221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK005108 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500002C15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK080143 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530069A09 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK161750 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830450I24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_147776 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 1 (Vwa1), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042196 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155768149:155774698:-1 gene:ENSMUSG00000042116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY030094 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor A-related protein (Warp) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// BC026919 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:30725 IMAGE:3982749), complete cds. // chr4 // 76 // 72 // 16 // 21 // 0 /// BC036166 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:37507 IMAGE:4985003), complete cds. // chr4 // 90 // 72 // 19 // 21 // 0 /// BC020136 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3994263), complete cds. // chr4 // 62 // 45 // 8 // 13 // 0 /// GENSCAN00000008947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155770328:155774502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT050993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
NM_001033394 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 88B (Tmem88b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000097742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155781591:155785874:-1 gene:ENSMUSG00000073680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC147318 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A230069A22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182468 IMAGE:9056362), complete cds. // chr4 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// BC147319 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A230069A22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182471 IMAGE:9056365), complete cds. // chr4 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// AK038855 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230069A22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONMMUT050996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
AK005805 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700010A01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000097740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155839492:155840178:-1 gene:ENSMUSG00000073679 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK007076 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700095D18 product:hypothetical RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif) containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031872 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 1, member 3 (Tas1r3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155859268:155863362:-1 gene:ENSMUSG00000029072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB049994 // GenBank // Mus musculus mRNA for taste receptor T1R3, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AF337039 // GenBank // Mus musculus candidate taste receptor T1R3 (T1r3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY032621 // GenBank // Mus musculus sweet taste receptor T1R3 (Sac) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// AF311386 // GenBank // Mus musculus putative sweet taste receptor type 1 member 3 (Tas1r3) mRNA, complete cds. // chr4 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000008930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155860186:155863334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_024472 // RefSeq // Mus musculus glycolipid transfer protein domain containing 1 (Gltpd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155864723:155869440:-1 gene:ENSMUSG00000029073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000105586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155865280:155869405:-1 gene:ENSMUSG00000029073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000151961 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155866366:155868818:-1 gene:ENSMUSG00000029073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC002216 // GenBank // Mus musculus glycolipid transfer protein domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:7473 IMAGE:3490501), complete cds. // chr4 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0
NM_080445 // RefSeq // Mus musculus UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 6 (B3galt6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000052185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155989466:155992649:-1 gene:ENSMUSG00000050796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY050569 // GenBank // Mus musculus beta-1,3-galactosyltransferase-6 (B3galt6) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// BC082998 // GenBank // Mus musculus UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 6, mRNA (cDNA clone MGC:91010 IMAGE:5011578), complete cds. // chr4 // 86 // 75 // 18 // 21 // 0 /// BC057933 // GenBank HTC // Mus musculus UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:5251787), with apparent retained intron. // chr4 // 73 // 54 // 11 // 15 // 0
NR_040563 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10560 (Gm10560), long non-coding RNA. // chr4 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// AK132218 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3526401B15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NR_029958 // RefSeq // Mus musculus microRNA 429 (Mir429), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083493 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:156053905:156053987:-1 gene:ENSMUSG00000065427 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:156052715:156059802:-1 gene:ENSMUSG00000086549 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048384 // GenBank // Mus musculus, clone IMAGE:6309403, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-429 // miRBase Micro RNA Database // MI0001642 Mus musculus miR-429 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029723 // RefSeq // Mus musculus microRNA 200a (Mir200a), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083466 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:156054896:156054985:-1 gene:ENSMUSG00000065400 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-200a // miRBase Micro RNA Database // MI0000554 Mus musculus miR-200a stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029587 // RefSeq // Mus musculus microRNA 200b (Mir200b), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000083615 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:156055674:156055763:-1 gene:ENSMUSG00000065549 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-200b // miRBase Micro RNA Database // MI0000243 Mus musculus miR-200b stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT051050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_021604 // RefSeq // Mus musculus agrin (Agrn), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006538496 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus agrin (Agrn), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000071248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:156165290:156185901:-1 gene:ENSMUSG00000041936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000105574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:156165290:156185901:-1 gene:ENSMUSG00000041936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000105575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:156165290:156185901:-1 gene:ENSMUSG00000041936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000180572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:156165778:156197488:-1 gene:ENSMUSG00000041936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000181062 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:156165294:156186107:-1 gene:ENSMUSG00000041936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AY914875 // GenBank // Mus musculus mini-agrin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 41 // 16 // 16 // 0 /// BC150703 // GenBank // Mus musculus agrin, mRNA (cDNA clone MGC:183614 IMAGE:9087614), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000008927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:156166496:156197420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0
ENSMUST00000161709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:3090769:3095074:1 gene:ENSMUSG00000091936 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
NM_009873 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase 6 (Cdk6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000042410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:3344312:3522225:1 gene:ENSMUSG00000040274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000165117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:3343893:3523218:1 gene:ENSMUSG00000040274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF132483 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c cyclin-dependent kinase 6 (Cdk6) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC119360 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:155676 IMAGE:8734109), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC120595 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:155832 IMAGE:40129518), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:3508660:3523122:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001042501 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 133, member B (Fam133b), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:3543844:3569810:1 gene:ENSMUSG00000058503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK161505 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933421N01 product:hypothetical Lysine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC027051 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830415L20 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5356840). // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC147310 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830415L20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182465 IMAGE:9056359), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC147311 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830415L20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182487 IMAGE:9056381), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK020011 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830415L20 product:5830415L20RIK PROTEIN, full insert sequence. // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:3543924:3569073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0 /// NONMMUT051096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// NONMMUT051097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 89 // 32 // 8 // 9 // 0
ENSMUST00000083110 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:3561154:3561273:1 gene:ENSMUSG00000065044 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONMMUT051099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
ENSMUST00000008451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:3571673:3584356:1 gene:ENSMUSG00000008307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000147801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:3571566:3584341:1 gene:ENSMUSG00000008307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156973 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:3580498:3584344:1 gene:ENSMUSG00000008307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AK007150 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700109H08 product:hypothetical EF-hand containing protein, full insert sequence. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC048606 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6741450), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC099581 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118394 IMAGE:30920581), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006503615 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700109H08 gene (1700109H08Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// XM_006503616 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700109H08 gene (1700109H08Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENSMUST00000125740 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:3575688:3584356:1 gene:ENSMUSG00000008307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:3575691:3582265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001293806 // RefSeq // Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 1 (Pex1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// NM_027777 // RefSeq // Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 1 (Pex1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000006061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:3596066:3637230:1 gene:ENSMUSG00000005907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000121291 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:3596066:3637232:1 gene:ENSMUSG00000005907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000142516 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:3596199:3605862:1 gene:ENSMUSG00000005907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 16 // 8 // 8 // 0 /// BC090845 // GenBank // Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:102188 IMAGE:6400629), complete cds. // chr5 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000143959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:3609619:3618117:1 gene:ENSMUSG00000005907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// AK087687 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330005K07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// GENSCAN00000033907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:3596389:3640471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// NONMMUT051106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1
NM_172879 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeats and death domain containing 1 (Lrrd1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006503580 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeats and death domain containing 1 (Lrrd1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// XM_006503581 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeats and death domain containing 1 (Lrrd1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000044039 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:3845173:3866596:1 gene:ENSMUSG00000040367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC141026 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932412H11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175987 IMAGE:9055638), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// BC145170 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932412H11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178729 IMAGE:9053721), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000033902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:3848352:3867507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0
NM_194462 // RefSeq // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein (yotiao) 9 (Akap9), mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 50 // 50 // 0 /// ENSMUST00000044492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:3928274:4080209:1 gene:ENSMUSG00000040407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000143365 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:3928178:3960989:1 gene:ENSMUSG00000040407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 18 // 9 // 9 // 0 /// BC024825 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5358477, with apparent retained intron. // chr5 // 89 // 18 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000030002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:4001405:4078053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:3928296:3992138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 27 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000120970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:4764834:4765647:1 gene:ENSMUSG00000083921 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000030004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:4759837:4802562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
NR_033499 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 8773 (Gm8773), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:5573952:5576203:1 gene:ENSMUSG00000073234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:5559464:5575704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK141701 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030031H17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000003252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:5798197:5799258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_006503604 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4921511H03 gene (4921511H03Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000088796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:7304125:7311491:1 gene:ENSMUSG00000040514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000159546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:7304146:7305809:1 gene:ENSMUSG00000040514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000160634 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:7304132:7307573:1 gene:ENSMUSG00000040514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AK014870 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921511H03 product:RIKEN cDNA 4921511H03 gene, full insert sequence. // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// AK133311 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932432G24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC049718 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921511H03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58687 IMAGE:6742354), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000118633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:7857108:7857847:1 gene:ENSMUSG00000081226 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000000127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:7857108:7857847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_054098 // RefSeq // Mus musculus STEAP family member 4 (Steap4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000115421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:7960472:7982213:1 gene:ENSMUSG00000012428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY029778 // GenBank // Mus musculus dudulin 4 mRNA, complete cds. // chr5 // 75 // 77 // 15 // 20 // 0 /// BC006651 // GenBank // Mus musculus STEAP family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:7814 IMAGE:3500056), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:7972677:7980569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_001080974 // RefSeq // Mus musculus sorcin (Sri), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_025618 // RefSeq // Mus musculus sorcin (Sri), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000003245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:8059342:8067726:1 gene:ENSMUSG00000003161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000088786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:8046078:8069379:1 gene:ENSMUSG00000003161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000148633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:8056527:8069151:1 gene:ENSMUSG00000003161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC065790 // GenBank // Mus musculus sorcin, mRNA (cDNA clone MGC:73647 IMAGE:948616), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006503527 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorcin (Sri), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// ENSMUST00000149420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:8056608:8064603:1 gene:ENSMUSG00000003161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// ENSMUST00000144265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:8056562:8059721:1 gene:ENSMUSG00000003161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000026400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:8063278:8077973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONMMUT051183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
ENSMUST00000121828 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:8055139:8055553:1 gene:ENSMUSG00000082867 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000026389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:8055139:8060613:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_001289595 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 40 (Slc25a40), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NM_001289596 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 40 (Slc25a40), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NM_178766 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 40 (Slc25a40), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// XR_376693 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 25, member 40 (Slc25a40), transcript variant X5, misc_RNA. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000066921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:8422850:8454790:1 gene:ENSMUSG00000054099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000170496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:8422988:8454790:1 gene:ENSMUSG00000054099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// AK044260 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930004C23 product:similar to Mitochondrial carrier family protein [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC083103 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 40, mRNA (cDNA clone MGC:103255 IMAGE:30726859), complete cds. // chr5 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000026396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:8422282:8453298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_011076 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 1A (Abcb1a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006503556 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 1A (Abcb1a), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047753 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:8660077:8748575:1 gene:ENSMUSG00000040584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000126846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:8719819:8748570:1 gene:ENSMUSG00000040584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// AK144907 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830001D23 product:ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 1A, full insert sequence. // chr5 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// AY864315 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c multidrug resistance protein 1a (Abcb1a) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// M30697 // GenBank // Mouse multidrug resistance protein (MDR) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// M33581 // GenBank // Mouse P-glycoprotein (mdr1a) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:8643908:8779521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_011075 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 1B (Abcb1b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000009058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:8798147:8866314:1 gene:ENSMUSG00000028970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC141363 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 1B, mRNA (cDNA clone MGC:176324 IMAGE:9055975), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC150811 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 1B, mRNA (cDNA clone MGC:183722 IMAGE:9087722), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// M14757 // GenBank // Mouse multidrug resistant protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK030328 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5031438E12 product:ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 1B, full insert sequence. // chr5 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// GENSCAN00000026393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:8805479:8865950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 73 // 15 // 16 // 0
NM_008830 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 4 (Abcb4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000003717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:8893721:8959225:1 gene:ENSMUSG00000042476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK050345 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730040C05 product:ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 4, full insert sequence. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC150687 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:183598 IMAGE:9087598), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// J03398 // GenBank // Mouse mdr gene encoding a multidrug resistance protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:8872211:8959175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001081029 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 243, mitochondrial (Tmem243), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000115365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:9100737:9118983:1 gene:ENSMUSG00000079659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK076719 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930420K17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC147127 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930420K17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182285 IMAGE:9056179), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147128 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930420K17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182293 IMAGE:9056187), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147812 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930420K17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182915 IMAGE:9087529), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147813 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930420K17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182916 IMAGE:9087530), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT051207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000038109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10054486:10117517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
GENSCAN00000038115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10558353:10559435:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000052587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11027876:11050621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 58 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11582687:11605452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 58 // 19 // 21 // 0 /// ENSMUST00000187545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:10235871:10236971:-1 gene:ENSMUSG00000100895 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 72 // 100 // 26 // 36 // 0 /// GENSCAN00000038118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10235994:10255416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 69 // 14 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11255905:11266326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 81 // 21 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11192523:11193470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 83 // 19 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10866044:10876369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11669745:11692647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11904706:11928598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11416364:11427015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
ENSMUST00000187545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:10235871:10236971:-1 gene:ENSMUSG00000100895 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10235994:10255416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 79 // 77 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11255905:11266326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 77 // 16 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11192523:11193470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 70 // 74 // 16 // 23 // 0 /// GENSCAN00000038112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10866044:10876369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000052587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11027876:11050621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000052590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11582687:11605452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000052591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11669745:11692647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000052597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11904706:11928598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000052598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11416364:11427015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
ENSMUST00000187545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:10235871:10236971:-1 gene:ENSMUSG00000100895 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11255905:11266326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 88 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11192523:11193470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10235994:10255416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 73 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000052585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11341487:11352089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000052587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11027876:11050621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000052590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11582687:11605452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000052591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11669745:11692647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000052596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11770567:11781108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000052597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11904706:11928598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSMUST00000187545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:10235871:10236971:-1 gene:ENSMUSG00000100895 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000038118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10235994:10255416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 76 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11255905:11266326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11192523:11193470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 93 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11027876:11050621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000052590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11582687:11605452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000052591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11669745:11692647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000052597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11904706:11928598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
ENSMUST00000187545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:10235871:10236971:-1 gene:ENSMUSG00000100895 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 75 // 100 // 27 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11255905:11266326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 83 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10235994:10255416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 72 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11192523:11193470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 86 // 20 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:13763657:13764367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 100 // 11 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11341487:11352089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 45 // 61 // 10 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11770567:11781108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 45 // 61 // 10 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11027876:11050621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11582687:11605452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11669745:11692647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11506120:11513235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11904706:11928598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
ENSMUST00000187545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:10235871:10236971:-1 gene:ENSMUSG00000100895 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 78 // 100 // 28 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11255905:11266326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 81 // 22 // 29 // 0 /// GENSCAN00000038118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10235994:10255416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 69 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11192523:11193470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 86 // 22 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11341487:11352089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 58 // 8 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11770567:11781108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 58 // 8 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10866044:10876369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11027876:11050621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11582687:11605452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11669745:11692647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11904706:11928598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11416364:11427015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
ENSMUST00000187545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:10235871:10236971:-1 gene:ENSMUSG00000100895 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 75 // 100 // 27 // 36 // 0 /// GENSCAN00000038118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10235994:10255416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 72 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11255905:11266326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 81 // 15 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11192523:11193470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 78 // 16 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11027876:11050621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11582687:11605452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11904706:11928598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11416364:11427015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000038112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:10866044:10876369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:11669745:11692647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_028882 // RefSeq // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3D (Sema3d), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000030868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:12383166:12588943:1 gene:ENSMUSG00000040254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC138131 // GenBank // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3D, mRNA (cDNA clone MGC:169755 IMAGE:8861150), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AK153839 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920017I03 product:sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3D, full insert sequence. // chr5 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// AK051165 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130008K01 product:SEMAPHORIN 3D PRECURSOR homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// AK134412 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030472C10 product:sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3D, full insert sequence. // chr5 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000052352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:12562358:12585302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0
NM_027650 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated glutamate (E)-rich protein 3 (Speer3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000124677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:13791619:13796820:1 gene:ENSMUSG00000067855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:13767274:13814425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1
ENSMUST00000166710 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:13811242:13814452:1 gene:ENSMUSG00000090793 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000038945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:13767274:13814425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_011348 // RefSeq // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E (Sema3e), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000073957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:14025317:14256689:1 gene:ENSMUSG00000063531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000130116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:14025276:14254314:1 gene:ENSMUSG00000063531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// AF034744 // GenBank // Mus musculus semaphorin M-SemaK mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// AK141295 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430022M07 product:sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E, full insert sequence. // chr5 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// BC057956 // GenBank // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E, mRNA (cDNA clone MGC:68023 IMAGE:5357516), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000049520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:14131430:14252790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0
NM_001110796 // RefSeq // Mus musculus piccolo (presynaptic cytomatrix protein) (Pclo), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NM_011995 // RefSeq // Mus musculus piccolo (presynaptic cytomatrix protein) (Pclo), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000030691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:14514918:14859115:1 gene:ENSMUSG00000061601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000182407 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:14514918:14795993:1 gene:ENSMUSG00000061601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000182426 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:14514993:14860184:1 gene:ENSMUSG00000061601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000182915 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:14680863:14796004:1 gene:ENSMUSG00000061601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// AB083477 // GenBank // Mus musculus Pclo mRNA for Piccolo, complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AB083478 // GenBank // Mus musculus Pclo mRNA for Piccolo, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:14515222:14609732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000049517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:14746243:14881244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 35 // 11 // 12 // 0
NM_001289458 // RefSeq // Mus musculus hepatocyte growth factor (Hgf), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NM_001289459 // RefSeq // Mus musculus hepatocyte growth factor (Hgf), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NM_001289461 // RefSeq // Mus musculus hepatocyte growth factor (Hgf), transcript variant 5, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NM_010427 // RefSeq // Mus musculus hepatocyte growth factor (Hgf), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000030683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:16553550:16619439:1 gene:ENSMUSG00000028864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AF042856 // GenBank // Mus musculus hepatocyte growth factor NK1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// BC119228 // GenBank // Mus musculus hepatocyte growth factor, mRNA (cDNA clone MGC:155544 IMAGE:8733977), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// D10212 // GenBank // Mus musculus mRNA for hepatocyte growth factor, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// D10213 // GenBank // Mus musculus mRNA for hepatocyte growth factor, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NM_001289460 // RefSeq // Mus musculus hepatocyte growth factor (Hgf), transcript variant 4, mRNA. // chr5 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1 /// AK082461 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230052L06 product:hepatocyte growth factor, full insert sequence. // chr5 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// GENSCAN00000006746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:16553928:16634596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0
NM_027609 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated glutamate (E)-rich protein 4f (Speer4f), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_106345 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 3495 (Gm3495), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// ENSMUST00000076099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:17476098:17480936:1 gene:ENSMUSG00000058643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000166086 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:17373208:17377788:1 gene:ENSMUSG00000091827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 69 // 19 // 22 // 0 /// BC116901 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated glutamate (E)-rich protein 4f, mRNA (cDNA clone MGC:151278 IMAGE:40126220), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC116903 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated glutamate (E)-rich protein 4f, mRNA (cDNA clone MGC:151280 IMAGE:40126222), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:17373285:17377668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000023160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:17476201:17480485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_001081143 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha transducing 3 (Gnat3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:17962621:18019834:1 gene:ENSMUSG00000028777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147449 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha transducing 3, mRNA (cDNA clone MGC:182197 IMAGE:9056091), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147466 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha transducing 3, mRNA (cDNA clone MGC:182214 IMAGE:9056108), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147839 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha transducing 3, mRNA (cDNA clone MGC:182942 IMAGE:9087556), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147841 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha transducing 3, mRNA (cDNA clone MGC:182944 IMAGE:9087558), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:17991319:18019668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000083029 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:20092615:20092718:1 gene:ENSMUSG00000096882 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT051364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000088514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:20539890:20540404:1 gene:ENSMUSG00000067798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AY512951 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0953D05 unknown mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_177601 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 60 (Tmem60), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115259 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:20882191:20886870:1 gene:ENSMUSG00000045435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027828 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 60, mRNA (cDNA clone MGC:38035 IMAGE:5249625), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NR_030699 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A630072M18 gene (A630072M18Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:20950989:20956398:1 gene:ENSMUSG00000101013 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT051392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONMMUT051394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_006535665 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-secretase activating protein (Gsap), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006535667 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-secretase activating protein (Gsap), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NM_175437 // RefSeq // Mus musculus gamma-secretase activating protein (Gsap), mRNA. // chr5 // 97 // 97 // 30 // 31 // 1 /// XM_006535669 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-secretase activating protein (Gsap), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// ENSMUST00000036031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:21186267:21291701:1 gene:ENSMUSG00000039934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 97 // 30 // 31 // 1 /// BC059054 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A530088I07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6821100), partial cds. // chr5 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// AK137494 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830114E12 product:Hypothetical eukaryotic thiol, full insert sequence. // chr5 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// BC022737 // GenBank // Mus musculus pigeon homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:4506923), partial cds. // chr5 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000038490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:21207265:21265154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_008013 // RefSeq // Mus musculus fibrinogen-like protein 2 (Fgl2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000035799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:21372642:21378374:1 gene:ENSMUSG00000039899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC028893 // GenBank // Mus musculus fibrinogen-like protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:19044 IMAGE:4189071), complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000038483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:21372717:21375960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_177869 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 185, member A (Fam185a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535731 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 185, member A (Fam185a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000056045 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:21424958:21482124:1 gene:ENSMUSG00000047221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:21434729:21480804:1 gene:ENSMUSG00000047221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC055342 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI847670, mRNA (cDNA clone MGC:65666 IMAGE:6810783), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153301 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:21425001:21434594:1 gene:ENSMUSG00000047221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// AK076256 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4631428I10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:21425168:21480444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_028977 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 17 (Lrrc17), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:21543527:21575900:1 gene:ENSMUSG00000039883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC030317 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 17, mRNA (cDNA clone MGC:40896 IMAGE:5372009), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:21560170:21599550:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_026034 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 10 (Armc10), mRNA. // chr5 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000072896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:21645879:21662694:1 gene:ENSMUSG00000038525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000095495 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:21646053:21662608:1 gene:ENSMUSG00000038525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC038487 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:46778 IMAGE:2812558), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC046281 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:54473 IMAGE:6395384), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC058573 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:65211 IMAGE:6487440), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000148873 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:21645813:21661616:1 gene:ENSMUSG00000038525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_028431 // RefSeq // Mus musculus peptidase (mitochondrial processing) beta (Pmpcb), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XR_389754 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peptidase (mitochondrial processing) beta (Pmpcb), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030882 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:21737141:21757152:1 gene:ENSMUSG00000029017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000125693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:21737141:21757152:1 gene:ENSMUSG00000029017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC087943 // GenBank // Mus musculus peptidase (mitochondrial processing) beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:30303695). // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:21696945:21757044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_011188 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 2 (Psmc2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:21785283:21803787:1 gene:ENSMUSG00000028932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC005462 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 2, mRNA (cDNA clone MGC:6418 IMAGE:3590739), complete cds. // chr5 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// U61283 // GenBank // Mus musculus 26S protease ATPase (mss1) mRNA, partial cds. // chr5 // 64 // 50 // 9 // 14 // 0 /// GENSCAN00000038473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:21786815:21803704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000084713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:21910931:21954014:1 gene:ENSMUSG00000073152 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK133143 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930599F03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONMMUT051426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001081231 // RefSeq // Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner-like 3 (Lhfpl3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_029990 // RefSeq // Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner-like 3 (Lhfpl3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK076730 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930422I12 product:RIKEN cDNA A930031L14 gene, full insert sequence. // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000043955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:23095638:23143961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
XM_006535830 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635566 (LOC102635566), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 68 // 68 // 0 /// XM_006535835 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638085 (LOC102638085), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 65 // 68 // 0 /// XM_006514360 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635990 (LOC102635990), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 29 // 29 // 20 // 68 // 1 /// ENSMUST00000171401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:82282116:82285278:-1 gene:ENSMUSG00000044581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 20 // 68 // 1 /// GENSCAN00000043941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:23309806:23339450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 68 // 68 // 0 /// GENSCAN00000005093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:82282534:82367883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 20 // 68 // 1 /// AK030006 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932415D10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 29 // 29 // 20 // 68 // 1 /// GENSCAN00000012154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:27969882:27976213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 22 // 22 // 15 // 68 // 1
NM_026984 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific methyltransferase 2E (Kmt2e), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000094962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:23434441:23504235:1 gene:ENSMUSG00000029004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000115128 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:23434449:23504235:1 gene:ENSMUSG00000029004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:23450266:23503047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_177323 // RefSeq // Mus musculus RAD50 interactor 1 (Rint1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006535809 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAD50 interactor 1 (Rint1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006535811 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAD50 interactor 1 (Rint1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000030852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:23787711:23820369:1 gene:ENSMUSG00000028999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000115113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:23787715:23820297:1 gene:ENSMUSG00000028999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:23787719:23820368:1 gene:ENSMUSG00000028999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK133789 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730415C03 product:Similar to RAD50-interacting protein 1 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC065059 // GenBank // Mus musculus RAD50 interactor 1, mRNA (cDNA clone MGC:86158 IMAGE:6401664), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC145267 // GenBank // Mus musculus RAD50 interactor 1, mRNA (cDNA clone MGC:178829 IMAGE:9053821), complete cds. // chr5 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// BC150745 // GenBank // Mus musculus RAD50 interactor 1, mRNA (cDNA clone MGC:183656 IMAGE:9087656), complete cds. // chr5 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:23787616:23819580:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_001161800 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 7 (Klhl7), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NM_026448 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 7 (Klhl7), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006535753 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch-like 7 (Klhl7), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:24100590:24161223:1 gene:ENSMUSG00000028986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000163409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:24100590:24161223:1 gene:ENSMUSG00000028986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK089072 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430038I23 product:CDNA FLJ31828 FIS, CLONE NT2RP6000109, WEAKLY SIMILAR TO RING CANAL PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 88 // 97 // 29 // 33 // 0 /// BC029154 // GenBank // Mus musculus kelch-like 7 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:37117 IMAGE:4952319), complete cds. // chr5 // 90 // 88 // 27 // 30 // 0 /// AK082520 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230059B01 product:hypothetical BTB/POZ domain containing protein, full insert sequence. // chr5 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// GENSCAN00000006104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24127674:24182476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
AK051462 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130050D22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153092 // RefSeq // Mus musculus nucleoporin like 2 (Nupl2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_389743 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin like 2 (Nupl2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000049887 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:24164963:24184013:1 gene:ENSMUSG00000048439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000115101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24165000:24182837:1 gene:ENSMUSG00000048439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AB067574 // GenBank // Mus musculus NLP-1 mRNA for nucleoporin-like protein-1 isoformT, complete cds. // chr5 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC033270 // GenBank // Mus musculus nucleoporin like 2, mRNA (cDNA clone MGC:25728 IMAGE:3981211), complete cds. // chr5 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24127674:24182476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
FJ654110 // GenBank // Mus musculus strain ICR clone LI-C1(48H)-2 endogenous retrovirus U3 region, partial sequence. // chr5 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0
NM_008713 // RefSeq // Mus musculus nitric oxide synthase 3, endothelial cell (Nos3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:24364810:24384474:1 gene:ENSMUSG00000028978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000115090 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:24364810:24384327:1 gene:ENSMUSG00000028978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC052636 // GenBank // Mus musculus nitric oxide synthase 3, endothelial cell, mRNA (cDNA clone MGC:58949 IMAGE:6530765), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U53142 // GenBank // Mus musculus endothelial constitutive nitric oxide synthase (ecNOS) cDNA, complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24365019:24383979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_183000 // RefSeq // Mus musculus acid-sensing (proton-gated) ion channel 3 (Asic3), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000049346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:24413451:24417834:1 gene:ENSMUSG00000038276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK028403 // GenBank HTC // Mus musculus 18 days pregnant adult female placenta and extra embryonic tissue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3830432N09 product:similar to PROTON GATED CATION CHANNEL DRASIC [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AY261387 // GenBank // Mus musculus proton gated cation channel DRASIC mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC054460 // GenBank HTC // Mus musculus amiloride-sensitive cation channel 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6494526). // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24413712:24417262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001253892 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 2 (Slc4a2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// NM_009207 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 2 (Slc4a2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006535655 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 2 (Slc4a2), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// XM_006535656 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 2 (Slc4a2), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000080067 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:24425232:24440950:1 gene:ENSMUSG00000028962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000115047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24428423:24440947:1 gene:ENSMUSG00000028962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000115049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24428208:24440947:1 gene:ENSMUSG00000028962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// BC054102 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:60692 IMAGE:30017310), complete cds. // chr5 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0 /// J04036 // GenBank // Mus musculus (clone p70ZN8) band 3-related protein mRNA, complete cds. // chr5 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000006087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24428250:24440752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0
XM_006535677 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (Agap3), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// NM_139153 // RefSeq // Mus musculus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (Agap3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1 /// ENSMUST00000024123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:24452177:24502047:1 gene:ENSMUSG00000023353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1 /// AF459091 // GenBank // Mus musculus MR1-interacting protein (Centg3) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1 /// NM_001256431 // RefSeq // Mus musculus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (Agap3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// XM_006535676 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (Agap3), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// AB078345 // GenBank // Mus musculus mRNA for spidin, complete cds. // chr5 // 43 // 43 // 17 // 40 // 1 /// BC031173 // GenBank // Mus musculus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4986863), complete cds. // chr5 // 43 // 43 // 17 // 40 // 1 /// GENSCAN00000006073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24451917:24501603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0
NM_133913 // RefSeq // Mus musculus chondroitin polymerizing factor 2 (Chpf2), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000088295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:24586744:24594395:1 gene:ENSMUSG00000038181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000121863 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:24586741:24592487:1 gene:ENSMUSG00000038181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AK122504 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1402 protein. // chr5 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// BC047275 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010209O12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:54971 IMAGE:6441739), complete cds. // chr5 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// GENSCAN00000006035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24588038:24592364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT051559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0
NR_003953 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700022A21 gene (1700022A21Rik), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000182745 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24647684:24648734:1 gene:ENSMUSG00000038165 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr5 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000182910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24645453:24648860:1 gene:ENSMUSG00000038165 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24647801:24709167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_016736 // RefSeq // Mus musculus negative regulator of ubiquitin-like proteins 1 (Nub1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006535755 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus negative regulator of ubiquitin-like proteins 1 (Nub1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000068825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:24685815:24710555:1 gene:ENSMUSG00000028954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF534114 // GenBank // Mus musculus NEDD8 ultimate buster-1 (Nub1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AK086301 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930019L13 product:NY-REN-18 antigen, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC037451 // GenBank // Mus musculus negative regulator of ubiquitin-like proteins 1, mRNA (cDNA clone MGC:46863 IMAGE:4018648), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// U27462 // GenBank // Mus musculus BS4 peptide mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000006115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24647801:24709167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1
XR_140695 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1500035N22 gene (1500035N22Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_402361 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642464 (LOC102642464), transcript variant X1, ncRNA. // chr5 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// XR_402362 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642464 (LOC102642464), transcript variant X2, ncRNA. // chr5 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// ENSMUST00000075081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:24985842:24998168:1 gene:ENSMUSG00000059631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK005363 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500035N22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_389784 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1500035N22 gene (1500035N22Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSMUST00000128569 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:25101458:25110109:1 gene:ENSMUSG00000043833 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015504 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930465D24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT051581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_026449 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 5 (Galntl5), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:25181460:25220297:1 gene:ENSMUSG00000028938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114965 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:25181502:25220295:1 gene:ENSMUSG00000028938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC145757 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:175644 IMAGE:40131060), complete cds. // chr5 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:25186204:25265381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_198621 // RefSeq // Mus musculus chaperonin containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 1 (Cct8l1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000045016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:25516067:25518021:1 gene:ENSMUSG00000038044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC050797 // GenBank // Mus musculus gene model 443, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:58709 IMAGE:6743432), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:25516289:25517977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001004365 // RefSeq // Mus musculus ARP3 actin-related protein 3B (Actr3b), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006535713 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ARP3 actin-related protein 3B (Actr3b), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000088244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:25760026:25850337:1 gene:ENSMUSG00000056367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000128727 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:25759997:25850342:1 gene:ENSMUSG00000056367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC053106 // GenBank // Mus musculus ARP3 actin-related protein 3 homolog B (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:5685374). // chr5 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// BC082279 // GenBank // Mus musculus ARP3 actin-related protein 3 homolog B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:91290 IMAGE:6332588), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000049884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:25760085:25849946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
AK047025 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930011P16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_008314 // RefSeq // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 5A (Htr5a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535631 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 5A (Htr5a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000036227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:27841947:27855086:1 gene:ENSMUSG00000039106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115911 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 5A, mRNA (cDNA clone MGC:144665 IMAGE:40104765), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC116654 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 5A, mRNA (cDNA clone MGC:144666 IMAGE:40104769), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000042621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:27817498:27851086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
XM_006535830 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635566 (LOC102635566), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 65 // 68 // 0 /// XM_006535835 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638085 (LOC102638085), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 68 // 68 // 0 /// XM_006514360 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635990 (LOC102635990), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 29 // 29 // 20 // 68 // 1 /// ENSMUST00000171401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:82282116:82285278:-1 gene:ENSMUSG00000044581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 20 // 68 // 1 /// GENSCAN00000043941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:23309806:23339450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 65 // 68 // 0 /// GENSCAN00000005093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:82282534:82367883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 20 // 68 // 1 /// AK030006 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932415D10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 29 // 29 // 20 // 68 // 1 /// GENSCAN00000012154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:27969882:27976213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 22 // 22 // 15 // 68 // 1
NM_153526 // RefSeq // Mus musculus insulin induced gene 1 (Insig1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000059155 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:28071363:28078662:1 gene:ENSMUSG00000045294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF527630 // GenBank // Mus musculus INSIG-1 membrane protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// BC132167 // GenBank // Mus musculus insulin induced gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:163798 IMAGE:40130444), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC132499 // GenBank // Mus musculus insulin induced gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:164130 IMAGE:40130776), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:28071438:28128605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1
NM_010134 // RefSeq // Mus musculus engrailed 2 (En2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:28165694:28172166:1 gene:ENSMUSG00000039095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L12705 // GenBank // Mouse engrailed protein (En-2) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:28166527:28170435:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000030920 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:28317202:28353664:1 gene:ENSMUSG00000048271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000090355 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:28317121:28352868:1 gene:ENSMUSG00000048271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK014289 // GenBank HTC // Mus musculus 14, 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3200001K10 product:hypothetical Glutamic acid-rich region containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_028234 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 33 (Rbm33), mRNA. // chr5 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// XM_006535733 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 33 (Rbm33), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// ENSMUST00000059644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:28317189:28419242:1 gene:ENSMUSG00000048271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// ENSMUST00000114884 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:28317177:28419244:1 gene:ENSMUSG00000048271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000012175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:28317368:28418806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_028234 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 33 (Rbm33), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006535733 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 33 (Rbm33), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000059644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:28317189:28419242:1 gene:ENSMUSG00000048271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000114884 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:28317177:28419244:1 gene:ENSMUSG00000048271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000133313 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:28410661:28414029:1 gene:ENSMUSG00000048271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000144967 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:28394632:28413677:1 gene:ENSMUSG00000048271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:28317368:28418806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1
NM_028234 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 33 (Rbm33), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:28317189:28419242:1 gene:ENSMUSG00000048271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114884 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:28317177:28419244:1 gene:ENSMUSG00000048271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK157642 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830229D24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033457 // RefSeq // Mus musculus nucleolar protein with MIF4G domain 1 (Nom1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006535741 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleolar protein with MIF4G domain 1 (Nom1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000001611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:29434664:29453506:1 gene:ENSMUSG00000001569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000146347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:29441318:29446355:1 gene:ENSMUSG00000001569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 92 // 39 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000016290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:29434678:29451203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NR_102704 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6083 (Gm6083), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000075518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:29538153:29538509:1 gene:ENSMUSG00000078182 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000016279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:29538153:29538509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_133907 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin protein ligase E3C (Ube3c), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:29569242:29676077:1 gene:ENSMUSG00000039000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120731 // GenBank // Mus musculus ubiquitin protein ligase E3C, mRNA (cDNA clone MGC:155968 IMAGE:40129654), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC137626 // GenBank // Mus musculus ubiquitin protein ligase E3C, mRNA (cDNA clone MGC:169250 IMAGE:8860645), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK045211 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130047N10 product:ubiquitin protein ligase E3C, full insert sequence. // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:29564869:29674569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001037941 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 6 (Dnajb6), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1 /// ENSMUST00000012734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:29735995:29757969:1 gene:ENSMUSG00000029131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// ENSMUST00000149553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:29754340:29757960:1 gene:ENSMUSG00000029131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
AK155673 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730119A01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00005544 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031168 // RefSeq // Mus musculus interleukin 6 (Il6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:30013161:30019968:1 gene:ENSMUSG00000025746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK152189 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830054F08 product:interleukin 6, full insert sequence. // chr5 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// BC132458 // GenBank // Mus musculus interleukin 6, mRNA (cDNA clone MGC:164089 IMAGE:40130735), complete cds. // chr5 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC138766 // GenBank // Mus musculus interleukin 6, mRNA (cDNA clone MGC:170393 IMAGE:8861788), complete cds. // chr5 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// DQ788722 // GenBank // Mus musculus interleukin-6 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// J03783 // GenBank // Mouse interleukin 6 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:29972206:30019548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001167879 // RefSeq // Mus musculus GRB2 associated, regulator of MAPK1-like (Gareml), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058045 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:30105161:30118378:1 gene:ENSMUSG00000044576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC113782 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 59, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:40060782), complete cds. // chr5 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// BC113783 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 59, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:40060785), complete cds. // chr5 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30105292:30117287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001033460 // RefSeq // Mus musculus dynein regulatory complex subunit 1 (Drc1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000101448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:30281388:30366708:1 gene:ENSMUSG00000073102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC150863 // GenBank // Mus musculus gene model 1060, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:183774 IMAGE:9087774), complete cds. // chr5 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30281452:30366550:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006504170 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700001C02 gene (1700001C02Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000031078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:30466059:30484088:1 gene:ENSMUSG00000029182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000114743 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:30466084:30484067:1 gene:ENSMUSG00000029182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// BC060996 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700001C02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:74094 IMAGE:6743526), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000127815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30466047:30480906:1 gene:ENSMUSG00000029182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// AK006710 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700047H18 product:RIKEN cDNA 1700047H18 gene, full insert sequence. // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000049059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30466111:30484012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_010608 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 3 (Kcnk3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000066295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:30588170:30625270:1 gene:ENSMUSG00000049265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB008537 // GenBank // Mus musculus mRNA for cTBAK, complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AB013345 // GenBank // Mus musculus mRNA for cTBAK, complete cds. // chr5 // 86 // 81 // 19 // 22 // 0 /// AF065162 // GenBank // Mus musculus Kcnk3 channel mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30555605:30629902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_175675 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member F6 (Slc35f6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000062962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:30647933:30659731:1 gene:ENSMUSG00000029175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124474 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30648012:30658191:1 gene:ENSMUSG00000029175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000131978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30647976:30656100:1 gene:ENSMUSG00000029175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000143867 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30647967:30658191:1 gene:ENSMUSG00000029175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// AK077623 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730478O19 product:hypothetical Integral membrane protein, DUF6 containing protein, full insert sequence. // chr5 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// BC019457 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930471M23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28962 IMAGE:4458315), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30648022:30657849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT051721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_023047 // RefSeq // Mus musculus dihydropyrimidinase-like 5 (Dpysl5), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000088081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:30711894:30799369:1 gene:ENSMUSG00000029168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114729 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30711564:30799375:1 gene:ENSMUSG00000029168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF249295 // GenBank // Mus musculus collapsin response mediator protein 5 (Crmp5) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC065054 // GenBank // Mus musculus dihydropyrimidinase-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:63281 IMAGE:5709296), complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30721284:30802709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NM_133350 // RefSeq // Mus musculus microtubule-associated protein, RP/EB family, member 3 (Mapre3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006503623 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus microtubule-associated protein, RP/EB family, member 3 (Mapre3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006503624 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus microtubule-associated protein, RP/EB family, member 3 (Mapre3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:30814641:30866106:1 gene:ENSMUSG00000029166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000114724 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:30814754:30866059:1 gene:ENSMUSG00000029166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000146459 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30814733:30866059:1 gene:ENSMUSG00000029166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AF468005 // GenBank // Mus musculus microtubule-associated protein (EB3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC057918 // GenBank // Mus musculus microtubule-associated protein, RP/EB family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:65350 IMAGE:5134461), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000126284 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30853799:30863358:1 gene:ENSMUSG00000029166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000049065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30826611:30865196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_133918 // RefSeq // Mus musculus elastin microfibril interfacer 1 (Emilin1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:30913402:30921278:1 gene:ENSMUSG00000029163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000166839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30913739:30919703:1 gene:ENSMUSG00000029163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000172453 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30919921:30921049:1 gene:ENSMUSG00000029163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK138020 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130072K23 product:elastin microfibril interfacer 1, full insert sequence. // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC005481 // GenBank // Mus musculus elastin microfibril interfacer 1, mRNA (cDNA clone MGC:7278 IMAGE:3485057), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30890166:30931047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_008439 // RefSeq // Mus musculus ketohexokinase (Khk), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:30921556:30931246:1 gene:ENSMUSG00000029162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000117435 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:30921833:30931189:1 gene:ENSMUSG00000029162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000123885 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:30921893:30930793:1 gene:ENSMUSG00000029162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000133121 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30930614:30931245:1 gene:ENSMUSG00000029162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// BC013464 // GenBank // Mus musculus ketohexokinase, mRNA (cDNA clone MGC:18722 IMAGE:4235560), complete cds. // chr5 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30890166:30931047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT051737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
NM_021304 // RefSeq // Mus musculus abhydrolase domain containing 1 (Abhd1), mRNA. // chr5 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NR_003522 // RefSeq // Mus musculus abhydrolase domain containing 1 (Abhd1), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000006814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:30950106:30955089:1 gene:ENSMUSG00000006638 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000131757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30950066:30955091:1 gene:ENSMUSG00000006638 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30950089:30955089:1 gene:ENSMUSG00000006638 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF189764 // GenBank // Mus musculus alpha/beta hydrolase-1 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC013505 // GenBank // Mus musculus abhydrolase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:19172 IMAGE:4224364), complete cds. // chr5 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000138902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30953373:30954184:1 gene:ENSMUSG00000006638 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30950111:30955024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONMMUT051738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT051739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_053085 // RefSeq // Mus musculus transcription factor 23 (Tcf23), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006504095 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor 23 (Tcf23), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000006818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:30968677:30977018:1 gene:ENSMUSG00000006642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF142405 // GenBank // Mus musculus basic helix-loop-helix transcription factor OUT (Out) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC119346 // GenBank // Mus musculus transcription factor 23, mRNA (cDNA clone MGC:155662 IMAGE:8734095), complete cds. // chr5 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// BC120609 // GenBank // Mus musculus transcription factor 23, mRNA (cDNA clone MGC:155846 IMAGE:40129532), complete cds. // chr5 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// XM_006504096 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor 23 (Tcf23), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
AK042950 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730042M21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177677 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 gamma (Dnajc5g), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// XM_006503880 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 gamma (Dnajc5g), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000066544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:31108319:31112526:1 gene:ENSMUSG00000053856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BC089502 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 gamma, mRNA (cDNA clone MGC:107182 IMAGE:6774833), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000186481 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:31108307:31111739:1 gene:ENSMUSG00000053856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000190241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:31106285:31111984:1 gene:ENSMUSG00000053856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000191220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:31108317:31111843:1 gene:ENSMUSG00000053856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31108890:31116182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_021447 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 54 (Trim54), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000013771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:31116712:31137628:1 gene:ENSMUSG00000062077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000114637 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:31116734:31137630:1 gene:ENSMUSG00000062077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF294790 // GenBank // Mus musculus RING-finger protein MURF mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC107258 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 54, mRNA (cDNA clone MGC:130201 IMAGE:40052466), complete cds. // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC107259 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 54, mRNA (cDNA clone MGC:130202 IMAGE:40052471), complete cds. // chr5 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000008936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31116910:31137493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_144909 // RefSeq // Mus musculus glucokinase regulatory protein (Gckr), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006503881 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucokinase regulatory protein (Gckr), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000072228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:31297581:31327300:1 gene:ENSMUSG00000059434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC012412 // GenBank // Mus musculus glucokinase regulatory protein, mRNA (cDNA clone MGC:19300 IMAGE:4159892), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000008900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31297620:31327091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_172993 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 512 (Zfp512), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006503970 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 512 (Zfp512), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000076264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:31452436:31481749:1 gene:ENSMUSG00000062761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089160 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 512, mRNA (cDNA clone MGC:99957 IMAGE:5390706), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31448665:31488218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_026296 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930548H24 gene (4930548H24Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:31485859:31488476:1 gene:ENSMUSG00000029138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31448665:31488218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_133756 // RefSeq // Mus musculus GPN-loop GTPase 1 (Gpn1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006504162 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GPN-loop GTPase 1 (Gpn1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000076949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:31494741:31512903:1 gene:ENSMUSG00000064037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000133891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:31494794:31503530:1 gene:ENSMUSG00000064037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000146880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:31494767:31499282:1 gene:ENSMUSG00000064037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 80 // 36 // 8 // 10 // 0 /// BC020174 // GenBank // Mus musculus GPN-loop GTPase 1, mRNA (cDNA clone MGC:27619 IMAGE:4505118), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC096466 // GenBank // Mus musculus GPN-loop GTPase 1, mRNA (cDNA clone MGC:106124 IMAGE:3711417), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000131628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:31494752:31503024:1 gene:ENSMUSG00000064037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000008896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31494773:31510911:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT051772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_008037 // RefSeq // Mus musculus fos-like antigen 2 (Fosl2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:32136472:32157831:1 gene:ENSMUSG00000029135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK089371 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730016C03 product:fos-like antigen 2, full insert sequence. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AK145822 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530001P11 product:fos-like antigen 2, full insert sequence. // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC065131 // GenBank // Mus musculus fos-like antigen 2, mRNA (cDNA clone MGC:85989 IMAGE:30536144), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:32036986:32153189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
ENSMUST00000178449 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:32175099:32175205:1 gene:ENSMUSG00000096091 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT051820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001081407 // RefSeq // Mus musculus phospholipase B1 (Plb1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 99 // 145 // 145 // 0 /// NM_172147 // RefSeq // Mus musculus phospholipase B1 (Plb1), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 8 // 12 // 12 // 0 /// XM_006504049 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase B1 (Plb1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 143 // 143 // 0 /// ENSMUST00000101376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:32247351:32364356:1 gene:ENSMUSG00000029134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 99 // 145 // 145 // 0 /// ENSMUST00000101377 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:32232714:32364354:1 gene:ENSMUSG00000029134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 99 // 145 // 145 // 0 /// ENSMUST00000140191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:32354694:32364349:1 gene:ENSMUSG00000029134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 5 // 8 // 8 // 0 /// BC033606 // GenBank // Mus musculus phospholipase B1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5373588), complete cds. // chr5 // 100 // 8 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000144245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:32353569:32366520:1 gene:ENSMUSG00000029134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 8 // 8 // 12 // 147 // 1 /// GENSCAN00000001497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:32247500:32420972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 143 // 143 // 0
NM_001081407 // RefSeq // Mus musculus phospholipase B1 (Plb1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504049 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase B1 (Plb1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:32247351:32364356:1 gene:ENSMUSG00000029134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101377 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:32232714:32364354:1 gene:ENSMUSG00000029134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:32247500:32420972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081407 // RefSeq // Mus musculus phospholipase B1 (Plb1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504049 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase B1 (Plb1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000101376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:32247351:32364356:1 gene:ENSMUSG00000029134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000101377 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:32232714:32364354:1 gene:ENSMUSG00000029134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:32247500:32420972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_172707 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, catalytic subunit, beta isoform (Ppp1cb), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000015100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:32458974:32495523:1 gene:ENSMUSG00000014956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000131300 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:32459152:32517433:1 gene:ENSMUSG00000014956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000133568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:32478095:32485312:1 gene:ENSMUSG00000014956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 82 // 31 // 9 // 11 // 0 /// AK089067 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430038F13 product:protein phosphatase 1, catalytic subunit, beta isoform, full insert sequence. // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC046832 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, catalytic subunit, beta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:61405 IMAGE:6812937), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// M27073 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1 (dis2m2) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// XM_006503780 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, catalytic subunit, beta isoform (Ppp1cb), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// GENSCAN00000001444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:32437761:32594650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001205132 // RefSeq // Mus musculus Yamaguchi sarcoma viral (v-yes) oncogene homolog 1 (Yes1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_001205133 // RefSeq // Mus musculus Yamaguchi sarcoma viral (v-yes) oncogene homolog 1 (Yes1), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_009535 // RefSeq // Mus musculus Yamaguchi sarcoma viral (v-yes) oncogene homolog 1 (Yes1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000072311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:32611171:32687066:1 gene:ENSMUSG00000014932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000168707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:32611171:32687066:1 gene:ENSMUSG00000014932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC010594 // GenBank // Mus musculus Yamaguchi sarcoma viral (v-yes) oncogene homolog 1, mRNA (cDNA clone MGC:18632 IMAGE:3989783), complete cds. // chr5 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:32610928:32684759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
NM_011738 // RefSeq // Mus musculus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, eta polypeptide (Ywhah), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000019109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:33018816:33027966:1 gene:ENSMUSG00000018965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF077002 // GenBank // Mus musculus 14-3-3 ETA mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC008187 // GenBank // Mus musculus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, eta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:5765 IMAGE:3589806), complete cds. // chr5 // 92 // 86 // 11 // 12 // 0 /// BC061497 // GenBank // Mus musculus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, eta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:70263 IMAGE:4949445), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// D87661 // GenBank // Mus musculus mRNA for 14-3-3 eta, complete cds. // chr5 // 92 // 93 // 12 // 13 // 0 /// U57311 // GenBank // Mus musculus 14-3-3 eta protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000021274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:33019068:33027195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// AK167999 // GenBank HTC // Mus musculus CRL-1722 L5178Y-R cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I730046E06 product:tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, eta polypeptide, full insert sequence. // chr5 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
NM_019810 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 1 (Slc5a1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000011178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:33104219:33162872:1 gene:ENSMUSG00000011034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF163846 // GenBank // Mus musculus sodium-glucose cotransporter 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 89 // 28 // 32 // 0 /// AF208031 // GenBank // Mus musculus SGLT1 protein (Sglt1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AK085602 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630045H05 product:solute carrier family 5, member 1, full insert sequence. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC003845 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:6369 IMAGE:3497611), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:33126869:33161002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0
NM_021500 // RefSeq // Mus musculus macrophage erythroblast attacher (Maea), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006504041 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus macrophage erythroblast attacher (Maea), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:33335572:33373294:1 gene:ENSMUSG00000079562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF263247 // GenBank // Mus musculus erythroblast macrophage protein EMP mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AK075637 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110030D19 product:macrophage erythroblast attacher, full insert sequence. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC039054 // GenBank // Mus musculus macrophage erythroblast attacher, mRNA (cDNA clone MGC:6504 IMAGE:2648667), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC058687 // GenBank // Mus musculus macrophage erythroblast attacher, mRNA (cDNA clone MGC:73456 IMAGE:6411707), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:33317509:33414891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001081101 // RefSeq // Mus musculus UV stimulated scaffold protein A (Uvssa), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000087864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:33378696:33419754:1 gene:ENSMUSG00000037355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000131752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:33378696:33419754:1 gene:ENSMUSG00000037355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000153980 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:33378549:33410519:1 gene:ENSMUSG00000037355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AK028507 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4632410K16 product:RIKEN cDNA 4933407H18 gene, full insert sequence. // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC137803 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933407H18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169427 IMAGE:8860822), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC144920 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933407H18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178476 IMAGE:9053468), complete cds. // chr5 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000185821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:33378772:33419754:1 gene:ENSMUSG00000037355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:33317509:33414891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
XR_402415 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9903 (Gm9903), misc_RNA. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000181102 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:5:33629925:33632092:1 gene:ENSMUSG00000097271 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK040173 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430072H19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KnowTID_00005551 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT051873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AK132920 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930516K01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001985 // RefSeq // Mus musculus N-acetyltransferase 8-like (Nat8l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000056355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:33995984:34005916:1 gene:ENSMUSG00000048142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC075616 // GenBank // Mus musculus N-acetyltransferase 8-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:5717159), complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000046918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:33996865:34001147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_001243123 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 193, member A (Fam193a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000094867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:34426337:34485747:1 gene:ENSMUSG00000037210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 79 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000180376 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:34369933:34486456:1 gene:ENSMUSG00000037210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC099925 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC037112, mRNA (cDNA clone MGC:106708 IMAGE:30653351), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000046927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:34370206:34476102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 88 // 38 // 43 // 1
NM_207277 // RefSeq // Mus musculus Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 1 (Msantd1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006504013 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 1 (Msantd1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000050535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:34915915:34923839:1 gene:ENSMUSG00000051246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC116928 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A930005I04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151305 IMAGE:40126247), complete cds. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC116930 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A930005I04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151307 IMAGE:40126249), complete cds. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006504011 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 1 (Msantd1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// XM_006504012 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 1 (Msantd1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:34660289:34923564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_019447 // RefSeq // Mus musculus hepatocyte growth factor activator (Hgfac), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006504031 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hepatocyte growth factor activator (Hgfac), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006504033 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hepatocyte growth factor activator (Hgfac), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000030985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:35041553:35048436:1 gene:ENSMUSG00000029102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF099017 // GenBank // Mus musculus hepatocyte growth factor activator (HGFA) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF224724 // GenBank // Mus musculus hepatocyte growth factor activator HGFA mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC019376 // GenBank // Mus musculus hepatocyte growth factor activator, mRNA (cDNA clone MGC:30305 IMAGE:5134851), complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:34964875:35048339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_007418 // RefSeq // Mus musculus adrenergic receptor, alpha 2c (Adra2c), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000049545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:35278566:35281761:1 gene:ENSMUSG00000045318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:35278618:35282163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_010445 // RefSeq // Mus musculus H6 homeobox 1 (Hmx1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000087674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:35389117:35392861:1 gene:ENSMUSG00000067438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000172923 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:35389108:35399730:1 gene:ENSMUSG00000067438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AF009367 // GenBank // Mus musculus homeobox containing nuclear transcriptional factor Hmx1 (hmx1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006503745 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus H6 homeobox 1 (Hmx1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000029548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:35359308:35426370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000119494 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:35554184:35555971:1 gene:ENSMUSG00000083907 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:35554889:35555806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_027373 // RefSeq // Mus musculus actin filament associated protein 1 (Afap1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000064571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:35893319:36003923:1 gene:ENSMUSG00000029094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000141824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:35913082:35996024:1 gene:ENSMUSG00000029094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AK129483 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA3018 protein. // chr5 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// AK162225 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420461J18 product:Hypothetical PH domain profile/pleckstrin homology (Fragment), full insert sequence. // chr5 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC050814 // GenBank // Mus musculus actin filament associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:58832 IMAGE:6773872), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:35928663:35951034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000030763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:35961746:35999878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0
NM_175249 // RefSeq // Mus musculus prosaposin-like 1 (Psapl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052224 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:36204021:36206568:1 gene:ENSMUSG00000043430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024478 // RefSeq // Mus musculus GrpE-like 1, mitochondrial (Grpel1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:36464998:36474080:1 gene:ENSMUSG00000029198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139561 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020004L23 product:GrpE-like 1, mitochondrial, full insert sequence. // chr5 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC002284 // GenBank // Mus musculus GrpE-like 1, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:8152 IMAGE:3589725), complete cds. // chr5 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:36465194:36471402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0
NM_025725 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 96 (Ccdc96), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:36484588:36488172:1 gene:ENSMUSG00000050677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125034 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 96, mRNA (cDNA clone MGC:144000 IMAGE:40096237), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:36484652:36486406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
AK087716 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330010H09 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_172994 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma (Ppp2r2c), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006503971 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma (Ppp2r2c), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000031003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:36868513:36955078:1 gene:ENSMUSG00000029120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY348866 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2 regulatory subunit B gamma isoform mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC059811 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2 (formerly 2A), regulatory subunit B (PR 52), gamma isoform, mRNA (cDNA clone MGC:69568 IMAGE:6849535), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:36920596:36959592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_178394 // RefSeq // Mus musculus janus kinase and microtubule interacting protein 1 (Jakmip1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504172 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus janus kinase and microtubule interacting protein 1 (Jakmip1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000043794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:37050857:37125299:1 gene:ENSMUSG00000063646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121010 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:37085370:37148001:1 gene:ENSMUSG00000063646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000137019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:37047473:37104875:1 gene:ENSMUSG00000063646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0 /// BC138646 // GenBank // Mus musculus janus kinase and microtubule interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170271 IMAGE:8861666), complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC138649 // GenBank // Mus musculus janus kinase and microtubule interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170274 IMAGE:8861669), complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000174629 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:37085370:37148001:1 gene:ENSMUSG00000063646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000017697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:37061519:37232841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000094840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:37185897:37193023:1 gene:ENSMUSG00000070823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK138476 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330031J02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504226 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1043 (Gm1043), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// XM_006504230 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1043 (Gm1043), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// XM_006504231 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1043 (Gm1043), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000017697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:37061519:37232841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001136058 // RefSeq // Mus musculus collapsin response mediator protein 1 (Crmp1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_007765 // RefSeq // Mus musculus collapsin response mediator protein 1 (Crmp1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:37245792:37292132:1 gene:ENSMUSG00000029121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000114158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:37242080:37292131:1 gene:ENSMUSG00000029121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AB006714 // GenBank // Mus musculus mRNA for dihydropyrimidinase related protein 1, complete cds. // chr5 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// BC031738 // GenBank // Mus musculus collapsin response mediator protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:25290 IMAGE:4505284), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC065046 // GenBank // Mus musculus collapsin response mediator protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:86090 IMAGE:5686818), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// U72875 // GenBank // Mus musculus collapsin response mediator 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:37242145:37291208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_145920 // RefSeq // Mus musculus Ellis van Creveld syndrome 2 (Evc2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000056365 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:37338499:37425055:1 gene:ENSMUSG00000050248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000101258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:37338608:37387764:1 gene:ENSMUSG00000050248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 51 // 21 // 21 // 0 /// AB083066 // GenBank // Mus musculus LBN mRNA for limbin, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// AK044977 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130017E20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 51 // 21 // 21 // 0 /// BC037473 // GenBank // Mus musculus Ellis van Creveld syndrome 2 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:47318 IMAGE:4237472), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC064473 // GenBank // Mus musculus Ellis van Creveld syndrome 2 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:70212 IMAGE:3156380), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000017696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:37407986:37424676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000017712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:37338548:37395638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 59 // 23 // 24 // 0
NM_001081106 // RefSeq // Mus musculus cytokine-like 1 (Cytl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000073554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:37735519:37739820:1 gene:ENSMUSG00000062329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK076770 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930443F05 product:similar to CYTOKINE-LIKE PROTEIN C17 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC063103 // GenBank // Mus musculus cytokine-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30294033), partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC116224 // GenBank // Mus musculus cytokine-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:143622 IMAGE:40091368), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC116225 // GenBank // Mus musculus cytokine-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:143623 IMAGE:40091369), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// EF108311 // GenBank // Mus musculus cytokine-like protein C17 (Cytl1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:37735548:37814067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_025480 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 128 (Tmem128), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000087511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:38260185:38269622:1 gene:ENSMUSG00000067365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000119047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:38260384:38267907:1 gene:ENSMUSG00000067365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// AK076679 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930412E13 product:RIKEN cDNA 2810021O14 gene, full insert sequence. // chr5 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// BC025197 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 128, mRNA (cDNA clone MGC:30988 IMAGE:5251991), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC060969 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 128, mRNA (cDNA clone MGC:74059 IMAGE:6704414), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC110310 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 128, mRNA (cDNA clone MGC:117995 IMAGE:5325405), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006504046 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 128 (Tmem128), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// ENSMUST00000128025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:38260387:38265390:1 gene:ENSMUSG00000067365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000027299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:38224676:38302894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_172709 // RefSeq // Mus musculus otopetrin 1 (Otop1), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:38275972:38304209:1 gene:ENSMUSG00000051596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000114099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:38277404:38304208:1 gene:ENSMUSG00000051596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF548337 // GenBank // Mus musculus otopetrin 1a (Otop1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK041023 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530062M05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000185357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:38277404:38304217:1 gene:ENSMUSG00000051596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187863 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:38286023:38303377:1 gene:ENSMUSG00000051596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:38224676:38302894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_013503 // RefSeq // Mus musculus dopamine receptor D5 (Drd5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:38319509:38322310:1 gene:ENSMUSG00000039358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138059 // GenBank // Mus musculus dopamine receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:169683 IMAGE:8861078), complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC138060 // GenBank // Mus musculus dopamine receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:169684 IMAGE:8861079), complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:38319666:38321102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000082485 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:38546458:38546593:1 gene:ENSMUSG00000064419 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025854 // RefSeq // Mus musculus corepressor interacting with RBPJ, 1 (Cir1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000058615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:73283105:73312701:-1 gene:ENSMUSG00000041777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000118681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:40328438:40329427:1 gene:ENSMUSG00000082938 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006543656 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus corepressor interacting with RBPJ, 1 (Cir1), mRNA. // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// BC012219 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 1700023B02 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4206431), with apparent retained intron. // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// BC099444 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 1700023B02 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30848739), with apparent retained intron. // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000028479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:40328609:40329427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:73284360:73312488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:97948350:97949679:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSMUST00000087332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:42067960:42216798:1 gene:ENSMUSG00000067285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK035725 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530096H18 product:itchy, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_376929 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 16223 (Gm16223), transcript variant X1, ncRNA. // chr5 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// XR_376930 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 16223 (Gm16223), transcript variant X2, ncRNA. // chr5 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// GENSCAN00000047757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:42036506:42080964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NONMMUT002567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
AK076499 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833430A08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT052109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_172274 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 2A (Cc2d2a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006503936 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 2A (Cc2d2a), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000048150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:43662379:43740972:1 gene:ENSMUSG00000039765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000125866 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:43689031:43740972:1 gene:ENSMUSG00000039765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000142303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:43672289:43689101:1 gene:ENSMUSG00000039765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000156034 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:43672289:43703929:1 gene:ENSMUSG00000039765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 34 // 13 // 13 // 0 /// BC032290 // GenBank // Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:40866 IMAGE:5369681), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000127355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:43696582:43717017:1 gene:ENSMUSG00000039765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// AK043145 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730060A01 product:KIAA1345 PROTEIN (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// GENSCAN00000035791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:43665157:43744335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_009763 // RefSeq // Mus musculus bone marrow stromal cell antigen 1 (Bst1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000101237 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:43818893:43843247:1 gene:ENSMUSG00000029082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000118126 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:43821502:43843247:1 gene:ENSMUSG00000029082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000126976 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:43818886:43825404:1 gene:ENSMUSG00000029082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AK164028 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430019G14 product:bone marrow stromal cell antigen 1, full insert sequence. // chr5 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// D31788 // GenBank // Mus musculus BST-1 mRNA for bone marrow stromal cell antigen 1, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// L32812 // GenBank // Mouse antigen (BP-3) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:43837272:43842242:1 gene:ENSMUSG00000029082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000035774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:43818968:43847198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONMMUT052112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_007646 // RefSeq // Mus musculus CD38 antigen (Cd38), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000030964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:43868809:43912375:1 gene:ENSMUSG00000029084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC046312 // GenBank // Mus musculus CD38 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:54696 IMAGE:6310453), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// CT010386 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836E0553D for gene Cd38, CD38 antigen; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// L11332 // GenBank // Mus musculus lymphocyte diffentiation antigen CD38 homologue mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:43903808:43910343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
ENSMUST00000177915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:43917320:43918222:1 gene:ENSMUSG00000093859 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000035781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:43913173:43936761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
XR_376932 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 16401 (Gm16401), ncRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:44100442:44102513:1 gene:ENSMUSG00000072962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141347 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430036J15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK149205 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120492P10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
AY512950 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0950C06 unknown mRNA. // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NR_073013 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930431F12 gene (4930431F12Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000079389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:44966583:44967867:1 gene:ENSMUSG00000062496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:44967790:44967867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT052149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001163317 // RefSeq // Mus musculus clarin 2 (Clrn2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000053250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:45453751:45464149:1 gene:ENSMUSG00000049530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147370 // GenBank // Mus musculus clarin 2, mRNA (cDNA clone MGC:182540 IMAGE:9056434), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147371 // GenBank // Mus musculus clarin 2, mRNA (cDNA clone MGC:182538 IMAGE:9056432), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147726 // GenBank // Mus musculus clarin 2, mRNA (cDNA clone MGC:182781 IMAGE:9056675), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147731 // GenBank // Mus musculus clarin 2, mRNA (cDNA clone MGC:182786 IMAGE:9056680), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:45453145:45463964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_024434 // RefSeq // Mus musculus leucine aminopeptidase 3 (Lap3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000046122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:45493374:45512674:1 gene:ENSMUSG00000039682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000137699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:45493504:45500736:1 gene:ENSMUSG00000039682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// AF334160 // GenBank // Mus musculus leucine aminopeptidase (Lap) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC016536 // GenBank // Mus musculus leucine aminopeptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:27841 IMAGE:3488469), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// CT010237 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836C0251D for gene Lap3, Leucine aminopeptidase 3; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// CT010301 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B0352D for gene Lap3, Leucine aminopeptidase 3; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:45493460:45512070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_025895 // RefSeq // Mus musculus mediator complex subunit 28 (Med28), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000015948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:45521007:45525495:1 gene:ENSMUSG00000015804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000118833 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:45520317:45525599:1 gene:ENSMUSG00000015804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000119579 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:45520307:45525598:1 gene:ENSMUSG00000015804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000156481 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:45520221:45529276:1 gene:ENSMUSG00000015804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC024941 // GenBank // Mus musculus mediator of RNA polymerase II transcription, subunit 28 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:28341 IMAGE:4017146), complete cds. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000139586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:45522139:45525178:1 gene:ENSMUSG00000015804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000039143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:45520326:45525350:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// NONMMUT052158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_019438 // RefSeq // Mus musculus non-SMC condensin I complex, subunit G (Ncapg), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XR_376815 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus non-SMC condensin I complex, subunit G (Ncapg), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000117396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:45669922:45700544:1 gene:ENSMUSG00000015880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000134309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:45676013:45700125:1 gene:ENSMUSG00000015880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 73 // 33 // 33 // 0 /// AJ237585 // GenBank // Mus musculus mRNA for hypothetical protein expressed in thymocytes (clone MFT.M05.13/MTA.B10.066), partial. // chr5 // 100 // 73 // 33 // 33 // 0 /// BC137834 // GenBank // Mus musculus non-SMC condensin I complex, subunit G, mRNA (cDNA clone MGC:169458 IMAGE:8860853), complete cds. // chr5 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// BC144960 // GenBank // Mus musculus non-SMC condensin I complex, subunit G, mRNA (cDNA clone MGC:178516 IMAGE:9053508), complete cds. // chr5 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000134090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:45692050:45696930:1 gene:ENSMUSG00000015880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1 /// AK138026 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130073J10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1 /// GENSCAN00000039144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:45663660:45699962:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// NONMMUT052169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1
AK015432 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930449I04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0
ENSMUST00000121537 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:46414344:46414616:1 gene:ENSMUSG00000067321 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000027874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:46414344:46414616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT052179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NR_029798 // RefSeq // Mus musculus microRNA 218-1 (Mir218-1), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083669 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:48223942:48224051:1 gene:ENSMUSG00000065603 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-218-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000700 Mus musculus miR-218-1 stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025755 // RefSeq // Mus musculus PARK2 co-regulated-like (Pacrgl), mRNA. // chr5 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// XM_006504060 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PARK2 co-regulated-like (Pacrgl), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// ENSMUST00000030968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:48372392:48388756:1 gene:ENSMUSG00000029089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// BC018481 // GenBank // Mus musculus PARK2 co-regulated-like, mRNA (cDNA clone MGC:27815 IMAGE:3482169), complete cds. // chr5 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// XM_006504061 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PARK2 co-regulated-like (Pacrgl), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000051978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:48347408:48386501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
ENSMUST00000079568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:48924116:48924491:1 gene:ENSMUSG00000057577 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 58 // 100 // 7 // 12 // 0 /// NONMMUT052215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000021537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:50232533:50342456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
GENSCAN00000044494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:51052381:51052698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_011435 // RefSeq // Mus musculus superoxide dismutase 3, extracellular (Sod3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:52363946:52371405:1 gene:ENSMUSG00000072941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC010975 // GenBank // Mus musculus superoxide dismutase 3, extracellular, mRNA (cDNA clone MGC:13799 IMAGE:3983917), complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// U38261 // GenBank // Mus musculus extracellular superoxide dismutase (SOD3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_025951 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta (Pi4k2b), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NM_028744 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta (Pi4k2b), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000031081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:52741587:52769344:1 gene:ENSMUSG00000029186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000031082 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:52741610:52768289:1 gene:ENSMUSG00000029186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000131526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:52741606:52751513:1 gene:ENSMUSG00000029186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 91 // 26 // 10 // 11 // 0 /// AF411321 // GenBank // Mus musculus type II phosphatidylinositol 4-kinase beta isoform mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// AY148879 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 90 // 35 // 38 // 0 /// BC062144 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta, mRNA (cDNA clone MGC:70005 IMAGE:6335661), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000047151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:52741719:52775513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0
NM_024213 // RefSeq // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 4 (Anapc4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031072 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:52834015:52867797:1 gene:ENSMUSG00000029176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000144574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:52834126:52866733:1 gene:ENSMUSG00000029176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK166061 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730032M12 product:anaphase promoting complex subunit 4, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC016237 // GenBank // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:28819 IMAGE:4504779), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024870 // GenBank // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:37013 IMAGE:4949079), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:52787467:52866619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_011402 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 34 (sodium phosphate), member 2 (Slc34a2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000094787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:53049353:53071664:1 gene:ENSMUSG00000029188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000168667 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:53058156:53070772:1 gene:ENSMUSG00000029188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000170523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:53038082:53061401:1 gene:ENSMUSG00000029188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 32 // 8 // 9 // 0 /// AF081499 // GenBank // Mus musculus type IIb Na/phosphate-cotransporter (Npt2b) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC096369 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 34 (sodium phosphate), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:106363 IMAGE:3962784), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000147243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:53049353:53066300:1 gene:ENSMUSG00000029188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// AK164786 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730032F06 product:solute carrier family 34 (sodium phosphate), member 2, full insert sequence. // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000034418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:53049204:53069630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001145433 // RefSeq // Mus musculus small integral membrane protein 20 (Smim20), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121042 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:53267106:53283510:1 gene:ENSMUSG00000061461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:53267106:53278487:1 gene:ENSMUSG00000061461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:53267178:53278539:1 gene:ENSMUSG00000061461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000154268 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:53277118:53278015:1 gene:ENSMUSG00000061461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AK007474 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810013D10 product:weakly similar to HYPOTHETICAL 9.7 KDA PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000137185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:53267120:53268567:1 gene:ENSMUSG00000061461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT052320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000034408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:53244092:53314730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
AY512934 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:C0815B01 unknown mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_144517 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 19 (Tbc1d19), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006504065 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TBC1 domain family, member 19 (Tbc1d19), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006504066 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TBC1 domain family, member 19 (Tbc1d19), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// XR_376821 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TBC1 domain family, member 19 (Tbc1d19), transcript variant X4, misc_RNA. // chr5 // 97 // 70 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000037337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:53809627:53904380:1 gene:ENSMUSG00000039178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AK217135 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0140M11, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000037337, based on BLAT search. // chr5 // 91 // 26 // 10 // 11 // 0 /// BC020138 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 19, mRNA (cDNA clone MGC:28154 IMAGE:3983701), complete cds. // chr5 // 93 // 95 // 38 // 41 // 0 /// GENSCAN00000034409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:53809760:53893149:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 49 // 21 // 21 // 0
NM_001081103 // RefSeq // Mus musculus stromal interaction molecule 2 (Stim2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071083 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:53998565:54119592:1 gene:ENSMUSG00000039156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000117661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:53998417:54121057:1 gene:ENSMUSG00000039156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152812 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:54105368:54119933:1 gene:ENSMUSG00000039156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC137881 // GenBank // Mus musculus stromal interaction molecule 2, mRNA (cDNA clone MGC:169505 IMAGE:8860900), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC145001 // GenBank // Mus musculus stromal interaction molecule 2, mRNA (cDNA clone MGC:178557 IMAGE:9053549), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:54075295:54118749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AK142275 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330027B15 product:stromal interaction molecule 2, full insert sequence. // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NR_038045 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10440 (Gm10440), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00005585 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133905 // RefSeq // Mus musculus PAP associated domain containing 4 (Papd4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000048702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:93147400:93192283:-1 gene:ENSMUSG00000042167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000122385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:55624188:55625593:1 gene:ENSMUSG00000083902 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC016629 // GenBank // Mus musculus PAP associated domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:11800 IMAGE:3595512), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006517513 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PAP associated domain containing 4 (Papd4), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// GENSCAN00000004265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:55588764:55625593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:93147591:93255986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_028260 // RefSeq // Mus musculus IMP1 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae) (Immp1l), mRNA. // chr5 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// ENSMUST00000037499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:105904638:105965558:1 gene:ENSMUSG00000042670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// ENSMUST00000153583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:57608567:57609067:1 gene:ENSMUSG00000051116 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AK012181 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610528O17 product:DJ1137O17.1 (SIMILAR TO PUTATIVE MITOCHONDRIAL INNER MEMBRANE PROTEASE SUBNUNIT 2) (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// BC008259 // GenBank // Mus musculus IMP1 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:6290 IMAGE:2649406), complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// BC081433 // GenBank // Mus musculus IMP1 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:101970 IMAGE:6814816), complete cds. // chr5 // 85 // 81 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:57608567:57609067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT052356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT052357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:105929268:105965332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001122758 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 7 (Pcdh7), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// NM_018764 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 7 (Pcdh7), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504025 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protocadherin 7 (Pcdh7), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 95 // 57 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000068110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:57718021:57729465:1 gene:ENSMUSG00000029108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000094783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:57718021:58129351:1 gene:ENSMUSG00000029108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// AB006758 // GenBank // Mus musculus Pcdh7 mRNA for BH-protocadherin-a, complete cds. // chr5 // 92 // 70 // 24 // 26 // 0 /// AK165115 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330015M05 product:protocadherin 7, full insert sequence. // chr5 // 92 // 35 // 12 // 13 // 0 /// BC131967 // GenBank // Mus musculus protocadherin 7, mRNA (cDNA clone MGC:163598 IMAGE:40130244), complete cds. // chr5 // 88 // 43 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000015362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:57719105:57821381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000168425 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:59053599:59054552:1 gene:ENSMUSG00000094696 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:59053599:59054552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_019468 // RefSeq // Mus musculus glucose-6-phosphate dehydrogenase 2 (G6pd2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:61808884:61810425:1 gene:ENSMUSG00000089992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120827 // GenBank // Mus musculus glucose-6-phosphate dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:156064 IMAGE:40129750), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137684 // GenBank // Mus musculus glucose-6-phosphate dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:169308 IMAGE:8860703), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:61808884:61810425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170705 // RefSeq // Mus musculus death domain containing 1 (Dthd1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000170704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:62813823:62888308:1 gene:ENSMUSG00000090326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:62813881:62888282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_177006 // RefSeq // Mus musculus NACHT and WD repeat domain containing 2 (Nwd2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000159584 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:63649451:63810546:1 gene:ENSMUSG00000090061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000162166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:63649340:63800647:1 gene:ENSMUSG00000090061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK034089 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330155K08 product:hypothetical P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases structure containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000160066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:63649103:63793387:1 gene:ENSMUSG00000090061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// AK033855 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330102G19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// GENSCAN00000031662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:63696524:63808303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_029554 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 0610040J01 gene (0610040J01Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000081747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:63812495:63899619:1 gene:ENSMUSG00000060512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC004797 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610040J01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:8120 IMAGE:3589105), complete cds. // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000031655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:63855365:63898864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_025700 // RefSeq // Mus musculus phosphoglucomutase 1 (Pgm1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006504056 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphoglucomutase 1 (Pgm1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006504057 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphoglucomutase 1 (Pgm1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000087324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:64092936:64128355:1 gene:ENSMUSG00000029171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK014332 // GenBank HTC // Mus musculus 14, 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3230402E02 product:hypothetical Phosphoglucomutase, first 3 domains structure containing protein, full insert sequence. // chr5 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC052762 // GenBank // Mus musculus phosphoglucomutase 1, mRNA (cDNA clone MGC:59600 IMAGE:6510389), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:64039910:64160471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_026667 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 114, member A1 (Fam114a1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:64970071:65041874:1 gene:ENSMUSG00000029185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC027235 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 114, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:28011 IMAGE:3603083), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC110359 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 114, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:117924 IMAGE:5325099), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:64979698:65051405:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_153391 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 19 (Wdr19), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000041892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:65199696:65260415:1 gene:ENSMUSG00000037890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK052303 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330023L08 product:hypothetical G-protein beta WD-40 repeats containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// AK129413 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1638 protein. // chr5 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AK166172 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830003J21 product:Hypothetical G-protein beta WD-40 repeats containing protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 83 // 50 // 15 // 18 // 0 /// AY029258 // GenBank // Mus musculus WD repeat membrane protein mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC046432 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 19, mRNA (cDNA clone IMAGE:4980622), complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// BC060134 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 19, mRNA (cDNA clone IMAGE:6410176). // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC082301 // GenBank HTC // Mus musculus WD repeat domain 19, mRNA (cDNA clone IMAGE:6409561), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK043836 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830038O22 product:hypothetical G-protein beta WD-40 repeats containing protein, full insert sequence. // chr5 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// GENSCAN00000038273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:65206423:65258910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
AF165171 // GenBank // Mus musculus betaKlotho protein putative truncated isoform mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// KC810035 // GenBank // Mus musculus klotho beta transcript variant 1 (Klb) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NM_031180 // RefSeq // Mus musculus klotho beta (Klb), mRNA. // chr5 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// ENSMUST00000031096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:65348386:65384003:1 gene:ENSMUSG00000029195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// AF165170 // GenBank // Mus musculus betaKlotho protein mRNA, complete cds. // chr5 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// AF178429 // GenBank // Mus musculus betaKlotho protein putative polymorphic isoform mRNA, complete cds. // chr5 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// BC138008 // GenBank // Mus musculus klotho beta, mRNA (cDNA clone MGC:169632 IMAGE:8861027), complete cds. // chr5 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// BC138010 // GenBank // Mus musculus klotho beta, mRNA (cDNA clone MGC:169634 IMAGE:8861029), complete cds. // chr5 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// GENSCAN00000038276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:65348499:65410886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_024471 // RefSeq // Mus musculus lipoic acid synthetase (Lias), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000031101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:65391497:65410693:1 gene:ENSMUSG00000029199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000122026 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:65391541:65408950:1 gene:ENSMUSG00000029199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000126036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65391564:65395612:1 gene:ENSMUSG00000029199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AB057731 // GenBank // Mus musculus mLIP1 mRNA for lipoic acid synthase, complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC002141 // GenBank // Mus musculus lipoic acid synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:7254 IMAGE:3484559), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000139847 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65391546:65396183:1 gene:ENSMUSG00000029199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// ENSMUST00000127519 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65397542:65399918:1 gene:ENSMUSG00000029199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// GENSCAN00000038276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:65348499:65410886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1 /// NONMMUT052490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NM_016786 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2K (Ube2k), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65537352:65595047:1 gene:ENSMUSG00000029203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000122141 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:65537300:65596393:1 gene:ENSMUSG00000029203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000131873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65537277:65595711:1 gene:ENSMUSG00000029203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000142407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:65537233:65598988:1 gene:ENSMUSG00000029203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB011081 // GenBank // Mus musculus mRNA for huntingtin interacting protein-2, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC002013 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2K (UBC1 homolog, yeast), mRNA (cDNA clone MGC:5809 IMAGE:3496393), complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC085311 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2K (UBC1 homolog, yeast), mRNA (cDNA clone MGC:103385 IMAGE:30148009), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000146799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65591596:65595145:1 gene:ENSMUSG00000029203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001024917 // RefSeq // Mus musculus NEDD4 binding protein 2 (N4bp2), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000087264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:65764120:65826650:1 gene:ENSMUSG00000037795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000113738 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65763521:65830108:1 gene:ENSMUSG00000037795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000138239 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65764120:65817284:1 gene:ENSMUSG00000037795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:65786133:65878894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0
NM_001081105 // RefSeq // Mus musculus ras homolog gene family, member H (Rhoh), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000031106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:65863569:65896700:1 gene:ENSMUSG00000029204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK138090 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130090D17 product:ras homolog gene family, member H, full insert sequence. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC094937 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member H, mRNA (cDNA clone MGC:107531 IMAGE:30075117), complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:65892389:65892964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0
NM_001081104 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9 (Chrna9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006503947 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9 (Chrna9), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000031108 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:65967124:65977326:1 gene:ENSMUSG00000029205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000153624 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:65934928:65971238:1 gene:ENSMUSG00000029205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AY095483 // GenBank // Mus musculus nicotinic acetylcholine receptor alpha 9 subunit (Chrna9) mRNA, partial cds. // chr5 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000030958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:65966981:65977247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_027602 // RefSeq // Mus musculus NOL1/NOP2/Sun domain family, member 7 (Nsun7), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504105 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NOL1/NOP2/Sun domain family, member 7 (Nsun7), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000031109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:66260125:66298016:1 gene:ENSMUSG00000029206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000065530 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:66259912:66297062:1 gene:ENSMUSG00000029206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000113720 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:66260312:66298016:1 gene:ENSMUSG00000029206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000131585 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:66261159:66298016:1 gene:ENSMUSG00000029206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC115878 // GenBank // Mus musculus NOL1/NOP2/Sun domain family, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:141647 IMAGE:40088737), complete cds. // chr5 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// BC116658 // GenBank // Mus musculus NOL1/NOP2/Sun domain family, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:141648 IMAGE:40088738), complete cds. // chr5 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:66260929:66296019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_011670 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin carboxy-terminal hydrolase L1 (Uchl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000031131 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:66676098:66687231:1 gene:ENSMUSG00000029223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000176015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:66676893:66687229:1 gene:ENSMUSG00000029223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB025313 // GenBank // Mus musculus UCH-L1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF172334 // GenBank // Mus musculus ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase PGP9.5 (Uch-L1) mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// AK170728 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630116G18 product:ubiquitin carboxy-terminal hydrolase L1, full insert sequence. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC039177 // GenBank // Mus musculus ubiquitin carboxy-terminal hydrolase L1, mRNA (cDNA clone MGC:25237 IMAGE:4506229), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:66676290:66686928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0
ENSMUST00000121056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:66890364:66890884:1 gene:ENSMUSG00000082420 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000030956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:66831885:66890884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
NM_178651 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 9 (Slc30a9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000113676 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:67306955:67355336:1 gene:ENSMUSG00000029221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000162372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:67306955:67358565:1 gene:ENSMUSG00000029221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AK033990 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330134J17 product:HUEL-LIKE PROTEIN (FRAGMENT) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// AY682914 // GenBank // Mus musculus GRIP1-associated coactivator 63 mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// BC141008 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:175969 IMAGE:9055620), complete cds. // chr5 // 94 // 92 // 32 // 34 // 0 /// ENSMUST00000161169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:67332118:67353355:1 gene:ENSMUSG00000029221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1 /// AK149549 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730036F23 product:solute carrier family 30 (zinc transporter), member 9, full insert sequence. // chr5 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1 /// GENSCAN00000045621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:67263763:67358180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1
NR_015582 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C330024D21 gene (C330024D21Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NR_110363 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C330024D21 gene (C330024D21Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AK169807 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430026D16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// KnowTID_00005602 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// KnowTID_00005603 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// KnowTID_00005604 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT052603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT052604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT052605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:67466914:67467246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001033415 // RefSeq // Mus musculus shisa homolog 3 (Xenopus laevis) (Shisa3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000087241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:67607883:67613992:1 gene:ENSMUSG00000050010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC120534 // GenBank // Mus musculus shisa homolog 3 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:155771 IMAGE:40129457), complete cds. // chr5 // 83 // 61 // 19 // 23 // 0 /// BC120536 // GenBank // Mus musculus shisa homolog 3 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:155773 IMAGE:40129459), complete cds. // chr5 // 83 // 61 // 19 // 23 // 0 /// ENSMUST00000142843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:67607969:67623552:1 gene:ENSMUSG00000050010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// AK085772 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830007B15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// GENSCAN00000045619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:67608408:67611475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0
NM_001018019 // RefSeq // Mus musculus glutaredoxin, cysteine rich 1 (Grxcr1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000094715 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:68031835:68166398:1 gene:ENSMUSG00000068082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000172955 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:68110442:68166398:1 gene:ENSMUSG00000068082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AY616753 // GenBank // Mus musculus glutaredoxin cysteine-rich 1 protein (Grxcr1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147268 // GenBank // Mus musculus glutaredoxin, cysteine rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:182434 IMAGE:9056328), complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC147269 // GenBank // Mus musculus glutaredoxin, cysteine rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:182438 IMAGE:9056332), complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:68031906:68166271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0
ENSMUST00000063197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:69461151:69461741:1 gene:ENSMUSG00000043484 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000051382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:69461151:69461741:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0
NM_008069 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit beta 1 (Gabrb1), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006503736 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit beta 1 (Gabrb1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000031122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:71699932:72138389:1 gene:ENSMUSG00000029212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC130258 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:161338 IMAGE:40142758), complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC157920 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:189850 IMAGE:9007350), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U14418 // GenBank // Mus musculus GABA-benzodiazepine receptor beta-1 subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:72047310:72130268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_153389 // RefSeq // Mus musculus ATPase, class V, type 10D (Atp10d), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NR_003966 // RefSeq // Mus musculus ATPase, class V, type 10D (Atp10d), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000126664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:72203329:72298775:1 gene:ENSMUSG00000046808 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000136350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:72264644:72298775:1 gene:ENSMUSG00000046808 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000146393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:72280047:72298762:1 gene:ENSMUSG00000046808 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AK133052 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930564C02 product:ATPase, Class V, type 10D, full insert sequence. // chr5 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC029551 // GenBank // Mus musculus ATPase, class V, type 10D, mRNA (cDNA clone IMAGE:5066937), complete cds. // chr5 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC141328 // GenBank // Mus musculus ATPase, class V, type 10D, mRNA (cDNA clone MGC:176289 IMAGE:9055940), complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000094710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:72280047:72298761:1 gene:ENSMUSG00000046808 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000031019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:72227669:72297246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_001081205 // RefSeq // Mus musculus NIPA-like domain containing 1 (Nipal1), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000087212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:72647796:72671078:1 gene:ENSMUSG00000067219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC125447 // GenBank // Mus musculus NIPA-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40129962), complete cds. // chr5 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC125449 // GenBank // Mus musculus NIPA-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40129964), complete cds. // chr5 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:72657018:72707163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
NM_001113423 // RefSeq // Mus musculus SLAIN motif family, member 2 (Slain2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_153567 // RefSeq // Mus musculus SLAIN motif family, member 2 (Slain2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000143829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:72914625:72978829:1 gene:ENSMUSG00000036087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000144843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:72914304:72978829:1 gene:ENSMUSG00000036087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000145939 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:72948499:72974702:1 gene:ENSMUSG00000036087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// BC038019 // GenBank // Mus musculus SLAIN motif family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:47019 IMAGE:3597423), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:72932824:72995764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_173403 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 4 (Slc10a4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000031127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:73006904:73014683:1 gene:ENSMUSG00000029219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC132529 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:164160 IMAGE:40130806), complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// BC138048 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:169672 IMAGE:8861067), complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000040688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:73007067:73012347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
XR_377016 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102637887 (LOC102637887), transcript variant X1, ncRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XR_377017 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102637887 (LOC102637887), transcript variant X2, ncRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000040681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:73240497:73392140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 58 // 10 // 11 // 0 /// NONMMUT052724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT052725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT052726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_181323 // RefSeq // Mus musculus cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog (S. cerevisiae) (Cwh43), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006503950 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog (S. cerevisiae) (Cwh43), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// XM_006503951 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog (S. cerevisiae) (Cwh43), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 94 // 50 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000031040 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:73406076:73453435:1 gene:ENSMUSG00000029154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000138429 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:73418068:73431970:1 gene:ENSMUSG00000029154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// BC016523 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C130090K23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:27925 IMAGE:3584006), complete cds. // chr5 // 91 // 89 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000065543 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:73406228:73453276:1 gene:ENSMUSG00000029154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// GENSCAN00000040696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:73398946:73453096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0
NM_178387 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 18 (Spata18), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006504154 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spermatogenesis associated 18 (Spata18), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000041422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:73651380:73679096:1 gene:ENSMUSG00000029155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000071077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:73651380:73679484:1 gene:ENSMUSG00000029155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:73657535:73679482:1 gene:ENSMUSG00000029155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000178631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:73651380:73679096:1 gene:ENSMUSG00000029155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC050799 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:6743872), partial cds. // chr5 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:73651586:73680121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000152787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:74032274:74039996:1 gene:ENSMUSG00000086234 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:74032269:74032845:1 gene:ENSMUSG00000086234 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AK007184 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700112M01 product:RIKEN cDNA 4933411J23 gene, full insert sequence. // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AK016772 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933411J23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_377028 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102634225 (LOC102634225), transcript variant X1, ncRNA. // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT052740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_015531 // RefSeq // Mus musculus differentiation antagonizing non-protein coding RNA (Dancr), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000066220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:74093060:74095405:1 gene:ENSMUSG00000053656 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:74093083:74094336:1 gene:ENSMUSG00000053656 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000132389 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:74093060:74094336:1 gene:ENSMUSG00000053656 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000120364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:74093077:74094337:1 gene:ENSMUSG00000053656 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT052750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT052753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT052752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_026878 // RefSeq // Mus musculus RAS-like, family 11, member B (Rasl11b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000051937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:74195288:74199481:1 gene:ENSMUSG00000049907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK004534 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1190017B18 product:RAS-like, family 11, member B, full insert sequence. // chr5 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// BC008101 // GenBank // Mus musculus RAS-like, family 11, member B, mRNA (cDNA clone MGC:7064 IMAGE:3156762), complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC083068 // GenBank // Mus musculus RAS-like, family 11, member B, mRNA (cDNA clone MGC:103217 IMAGE:6308926), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000183995 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:74195445:74196290:1 gene:ENSMUSG00000049907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000044183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:74186332:74198579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NR_045866 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6116 (Gm6116), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000101121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:74949194:74966368:1 gene:ENSMUSG00000072874 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT052778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_133256 // RefSeq // Mus musculus GS homeobox 2 (Gsx2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:75075601:75077893:1 gene:ENSMUSG00000035946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160104 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:75075464:75077625:1 gene:ENSMUSG00000035946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// S79041 // GenBank // Mus musculus genomic screen homeobox protein 2 (Gsh-2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:75075761:75077306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_001122733 // RefSeq // Mus musculus kit oncogene (Kit), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NM_021099 // RefSeq // Mus musculus kit oncogene (Kit), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000005815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:75574955:75656722:1 gene:ENSMUSG00000005672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000144270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:75574916:75656722:1 gene:ENSMUSG00000005672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000148993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:75645697:75652856:1 gene:ENSMUSG00000005672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// AY536430 // GenBank // Mus musculus proto-oncogene c-kit (Kit) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// AY536431 // GenBank // Mus musculus mutant proto-oncogene c-kit (Kit) mRNA, complete cds. // chr5 // 98 // 91 // 41 // 42 // 0 /// BC052457 // GenBank // Mus musculus kit oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:63313 IMAGE:6830637), complete cds. // chr5 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// BC075716 // GenBank // Mus musculus kit oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:78140 IMAGE:3673641), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// EF472963 // GenBank // Mus musculus strain CD1 KIT oncogene (Kit) mRNA, complete cds. // chr5 // 90 // 22 // 9 // 10 // 0 /// X65997 // GenBank // M.musculus c-kit mRNA for truncated tyrosine-kinase. // chr5 // 93 // 30 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000053874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:75606947:75654545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0
NM_011626 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 165 (Tmem165), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:76183880:76209245:1 gene:ENSMUSG00000029234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76204120:76206033:1 gene:ENSMUSG00000029234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC141081 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 165, mRNA (cDNA clone MGC:176042 IMAGE:9055693), complete cds. // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// M23568 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein precursor, mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000130842 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:76199117:76204655:1 gene:ENSMUSG00000029234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000138544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76199445:76205155:1 gene:ENSMUSG00000029234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000025601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76194186:76208586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
XR_402585 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7467 (Gm7467), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185173 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76304876:76305527:1 gene:ENSMUSG00000098449 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK142576 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630044J09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76297123:76305400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00005616 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199032 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 135 (Cep135), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535027 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centrosomal protein 135 (Cep135), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XR_389279 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centrosomal protein 135 (Cep135), transcript variant X8, misc_RNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000049060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:76591714:76646465:1 gene:ENSMUSG00000036403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121979 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76588701:76646466:1 gene:ENSMUSG00000036403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76588698:76644908:1 gene:ENSMUSG00000036403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK137244 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530065N05 product:hypothetical TIMP-like OB-fold containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC062951 // GenBank // Mus musculus centrosomal protein 135, mRNA (cDNA clone MGC:86039 IMAGE:6852711), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535025 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centrosomal protein 135 (Cep135), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// XR_389278 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centrosomal protein 135 (Cep135), transcript variant X7, misc_RNA. // chr5 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// GENSCAN00000025574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76591759:76670490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000086909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:76656512:76658355:1 gene:ENSMUSG00000036377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000072855 // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
XM_006535001 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C530008M17 gene (C530008M17Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76657721:76790136:1 gene:ENSMUSG00000036377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK013453 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810489J07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 58 // 96 // 14 // 24 // 0 /// ENSMUST00000121160 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:76752368:76873330:1 gene:ENSMUSG00000036377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000128112 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:76657683:76840881:1 gene:ENSMUSG00000036377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONMMUT052846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000120818 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:76809988:76842589:1 gene:ENSMUSG00000036377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000121851 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:76840619:76842591:1 gene:ENSMUSG00000036377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015929 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930529A19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AK016430 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931405B09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NM_001163793 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C530008M17 gene (C530008M17Rik), mRNA. // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSMUST00000120639 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:76840599:76873545:1 gene:ENSMUSG00000036377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSMUST00000163347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:76840599:76873554:1 gene:ENSMUSG00000036377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001163793 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C530008M17 gene (C530008M17Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006535001 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C530008M17 gene (C530008M17Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006535006 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C530008M17 gene (C530008M17Rik), transcript variant X8, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120639 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:76840599:76873545:1 gene:ENSMUSG00000036377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000121160 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:76752368:76873330:1 gene:ENSMUSG00000036377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000163347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:76840599:76873554:1 gene:ENSMUSG00000036377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76822267:76870677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000101090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:76928368:76928845:1 gene:ENSMUSG00000072852 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK009722 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310040G07 product:hypothetical Homeodomain-like containing protein, full insert sequence. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000145897 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76928608:76947758:1 gene:ENSMUSG00000072852 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000054547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76928372:77007512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT052860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_025939 // RefSeq // Mus musculus phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoribosylaminoimidazole, succinocarboxamide synthetase (Paics), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006535182 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoribosylaminoimidazole, succinocarboxamide synthetase (Paics), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000031160 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:76951307:76967505:1 gene:ENSMUSG00000029247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000117536 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76951368:76967313:1 gene:ENSMUSG00000029247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000120912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76951348:76967509:1 gene:ENSMUSG00000029247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// BC018153 // GenBank // Mus musculus phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoribosylaminoimidazole, succinocarboxamide synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:25530 IMAGE:3586809), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC052691 // GenBank // Mus musculus phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoribosylaminoimidazole, succinocarboxamide synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:64678 IMAGE:5707686), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000054547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76928372:77007512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1
NM_025691 // RefSeq // Mus musculus signal recognition particle 72 (Srp72), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000101087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:76974683:76999937:1 gene:ENSMUSG00000036323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000120550 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:76974707:76998816:1 gene:ENSMUSG00000036323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000141873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76984095:76995146:1 gene:ENSMUSG00000036323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000150661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76974721:76980590:1 gene:ENSMUSG00000036323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 90 // 26 // 9 // 10 // 0 /// AK164641 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530009O16 product:similar to CaM kinase II isoform [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000054547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76928372:77007512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 82 // 31 // 38 // 1
NM_206935 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 9 (Arl9), mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535050 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 9 (Arl9), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000071199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:77004055:77009478:1 gene:ENSMUSG00000063820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134197 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:77006472:77010606:1 gene:ENSMUSG00000063820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000054547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76928372:77007512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1
XM_006535219 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700023E05 gene (1700023E05Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000031161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:77016023:77061522:1 gene:ENSMUSG00000029248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117880 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:77016023:77061529:1 gene:ENSMUSG00000029248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC053422 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700023E05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58670 IMAGE:6741654), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:77016152:77061312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_011263 // RefSeq // Mus musculus RE1-silencing transcription factor (Rest), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:77265491:77286432:1 gene:ENSMUSG00000029249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:77266196:77286432:1 gene:ENSMUSG00000029249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB024496 // GenBank // Mus musculus NRSF/REST mRNA for neural-restrictive silencer factor nrsf/rest, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC127065 // GenBank // Mus musculus RE1-silencing transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:150099 IMAGE:40110015), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ644039 // GenBank // Mus musculus REST splice variant 4 (Rest) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// JN019832 // GenBank // Mus musculus REST4 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000054559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:77227803:77282984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_153798 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide B (Polr2b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:77310147:77349324:1 gene:ENSMUSG00000029250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC038472 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide B, mRNA (cDNA clone MGC:47046 IMAGE:5026936), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:77313153:77349169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000083301 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:80893654:80893756:1 gene:ENSMUSG00000065235 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT052899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000120716 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:84123313:84123591:1 gene:ENSMUSG00000079067 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000100472 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:133965020:133967893:-1 gene:ENSMUSG00000003038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// BC083085 // GenBank // Mus musculus high mobility group nucleosomal binding domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:103384 IMAGE:6516041), complete cds. // chr5 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// GENSCAN00000053755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:84123313:84123591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NONMMUT052957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
ENSMUST00000082621 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:85829627:85829787:1 gene:ENSMUSG00000064555 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT052964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000082925 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:86079766:86079935:1 gene:ENSMUSG00000064859 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT052967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_172881 // RefSeq // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B35 (Ugt2b35), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000031186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:87000860:87011674:1 gene:ENSMUSG00000035811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC113789 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B35, mRNA (cDNA clone MGC:132947 IMAGE:40061872), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86997303:87053332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_001286015 // RefSeq // Mus musculus casein alpha s1 (Csn1s1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NM_001286016 // RefSeq // Mus musculus casein alpha s1 (Csn1s1), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// NM_007784 // RefSeq // Mus musculus casein alpha s1 (Csn1s1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000094641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:87666224:87682573:1 gene:ENSMUSG00000070702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC002101 // GenBank // Mus musculus casein alpha s1, mRNA (cDNA clone MGC:6587 IMAGE:3484624), complete cds. // chr5 // 90 // 94 // 27 // 30 // 0 /// BC003859 // GenBank // Mus musculus casein alpha s1, mRNA (cDNA clone MGC:6596 IMAGE:3486384), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC006024 // GenBank // Mus musculus casein alpha s1, mRNA (cDNA clone MGC:6423 IMAGE:3592625), complete cds. // chr5 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC008278 // GenBank // Mus musculus casein alpha s1, mRNA (cDNA clone MGC:6321 IMAGE:2812523), complete cds. // chr5 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC040246 // GenBank // Mus musculus casein alpha s1, mRNA (cDNA clone MGC:6493 IMAGE:2647887), complete cds. // chr5 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// M36780 // GenBank // Mouse alpha-casein mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// AK052808 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730019F13 product:casein alpha, full insert sequence. // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000019355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87667247:87681100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC040091 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3985444, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_007785 // RefSeq // Mus musculus casein alpha s2-like A (Csn1s2a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000076379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:87774567:87788797:1 gene:ENSMUSG00000061937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC139326 // GenBank // Mus musculus casein alpha s2-like A, mRNA (cDNA clone MGC:170953 IMAGE:8862348), complete cds. // chr5 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// D10215 // GenBank // Mus musculus mRNA for gamma-casein, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87753216:87786757:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 50 // 14 // 16 // 0
NM_009973 // RefSeq // Mus musculus casein alpha s2-like B (Csn1s2b), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000072539 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:87808082:87824426:1 gene:ENSMUSG00000061388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000101057 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:87808124:87818403:1 gene:ENSMUSG00000061388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000113279 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:87808123:87824417:1 gene:ENSMUSG00000061388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// BC002084 // GenBank // Mus musculus casein alpha s2-like B, mRNA (cDNA clone MGC:6256 IMAGE:3489886), complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK052789 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730003B11 product:casein delta, full insert sequence. // chr5 // 47 // 61 // 9 // 19 // 0 /// AK142683 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730048M03 product:casein delta, full insert sequence. // chr5 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000019363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87809909:87845324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001163551 // RefSeq // Mus musculus proline rich 27 (Prr27), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_028648 // RefSeq // Mus musculus proline rich 27 (Prr27), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000002310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:87825697:87846386:1 gene:ENSMUSG00000002240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000101056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:87825686:87846386:1 gene:ENSMUSG00000002240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC103787 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930432K09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118299 IMAGE:30919261), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_003652 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 7337 (Gm7337), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180954 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:87850518:87851642:1 gene:ENSMUSG00000067156 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000181439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:87850359:87853013:1 gene:ENSMUSG00000067156 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147596 // GenBank // Mus musculus odontogenic, ameloblast asssociated, mRNA (cDNA clone MGC:182692 IMAGE:9056586), complete cds. // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC147623 // GenBank // Mus musculus odontogenic, ameloblast asssociated, mRNA (cDNA clone MGC:182719 IMAGE:9056613), complete cds. // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000019352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87850518:87892516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_027128 // RefSeq // Mus musculus odontogenic, ameloblast asssociated (Odam), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000113274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:87885695:87892745:1 gene:ENSMUSG00000009580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000129757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:87885029:87894174:1 gene:ENSMUSG00000009580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC132394 // GenBank // Mus musculus odontogenic, ameloblast asssociated, mRNA (cDNA clone MGC:164025 IMAGE:40130671), complete cds. // chr5 // 96 // 73 // 26 // 27 // 0 /// BC132396 // GenBank // Mus musculus odontogenic, ameloblast asssociated, mRNA (cDNA clone MGC:164027 IMAGE:40130673), complete cds. // chr5 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// EF113909 // GenBank // Mus musculus odontogenic ameloblast-associated protein precursor (Odam) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000019352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87850518:87892516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1
BC037156 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC037156, mRNA (cDNA clone IMAGE:4168546). // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// JQ408704 // GenBank // Mus musculus strain FVB/N follicular dendritic cell secreted peptide (FDC-SP) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87910637:87913068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000069773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:87963485:87966349:1 gene:ENSMUSG00000055961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051076 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC051076, mRNA (cDNA clone IMAGE:6313269), partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87957622:87964844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
XM_006535293 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2310003L06 gene (2310003L06Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000007601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:87969459:87972870:1 gene:ENSMUSG00000007457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK009122 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310003L06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534843 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus submaxillary gland androgen regulated protein 3A (Smr3a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000005642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87970659:87979103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000187738 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:87969517:88008277:1 gene:ENSMUSG00000100704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_027631 // RefSeq // Mus musculus calcium binding protein, spermatid specific 1 (Cabs1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000008051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:87979439:87981544:1 gene:ENSMUSG00000007907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049750 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931407G18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58799 IMAGE:6773045), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87979492:87980667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001252679 // RefSeq // Mus musculus submaxillary gland androgen regulated protein 2 (Smr2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NM_001252680 // RefSeq // Mus musculus submaxillary gland androgen regulated protein 2 (Smr2), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NM_001252681 // RefSeq // Mus musculus submaxillary gland androgen regulated protein 2 (Smr2), transcript variant 4, mRNA. // chr5 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// BC111829 // GenBank // Mus musculus submaxillary gland androgen regulated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:130573 IMAGE:40055208), complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// U82376 // GenBank // Mus musculus MSG2beta salivary protein (Vcs2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// U82378 // GenBank // Mus musculus MSG2delta salivary protein (Vcs2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// U82379 // GenBank // Mus musculus MSG2epsilon salivary protein (Vcs2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// U82380 // GenBank // Mus musculus MSG2alpha salivary protein (Vcs2) precursor, mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// NM_021289 // RefSeq // Mus musculus submaxillary gland androgen regulated protein 2 (Smr2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// ENSMUST00000087043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:88086556:88109053:1 gene:ENSMUSG00000029281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// U82377 // GenBank // Mus musculus MSG2gamma salivary protein (Vcs2) mRNA, complete cds. // chr5 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// GENSCAN00000005630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:88027596:88108896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
NM_008644 // RefSeq // Mus musculus proline rich, lacrimal 1 (Prol1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000170832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:88317312:88328817:1 gene:ENSMUSG00000064156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF247816 // GenBank // Mus musculus mucin cell adhesion molecule MucCam mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BC021158 // GenBank // Mus musculus mucin 10, submandibular gland salivary mucin, mRNA (cDNA clone IMAGE:4191854), partial cds. // chr5 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// BC042902 // GenBank // Mus musculus mucin 10, submandibular gland salivary mucin, mRNA (cDNA clone MGC:25326 IMAGE:4924369), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// U37531 // GenBank // Mus musculus mucin apoprotein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BC021401 // GenBank // Mus musculus mucin 10, submandibular gland salivary mucin, mRNA (cDNA clone MGC:29112 IMAGE:4166946), complete cds. // chr5 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1
NM_027793 // RefSeq // Mus musculus amelotin (Amtn), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:88376108:88385916:1 gene:ENSMUSG00000029282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:88376304:88451546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_009664 // RefSeq // Mus musculus ameloblastin (Ambn), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:88456011:88468527:1 gene:ENSMUSG00000029288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC087927 // GenBank // Mus musculus ameloblastin, mRNA (cDNA clone MGC:107285 IMAGE:30504437), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U65021 // GenBank // Mus musculus ameloblastin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_017468 // RefSeq // Mus musculus enamelin (Enam), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:88487982:88506049:1 gene:ENSMUSG00000029286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC115848 // GenBank // Mus musculus enamelin, mRNA (cDNA clone MGC:141030 IMAGE:40048943), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// U82698 // GenBank // Mus musculus enamelin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:88488716:88504683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_023054 // RefSeq // Mus musculus UTP3, small subunit (SSU) processome component, homolog (S. cerevisiae) (Utp3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000090413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:88554483:88556083:1 gene:ENSMUSG00000070697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF155362 // GenBank // Mus musculus charged amino acid rich leucine zipper factor-1 (Crl-1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF271213 // GenBank // Mus musculus disrupter of silencing SAS10 (Sas10) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC022994 // GenBank // Mus musculus UTP3, small subunit (SSU) processome component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:36780 IMAGE:5371012), complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000005618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:88554614:88556023:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0
NM_026735 // RefSeq // Mus musculus MOB kinase activator 1B (Mob1b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000006424 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:88720871:88757989:1 gene:ENSMUSG00000006262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113229 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:88720855:88762058:1 gene:ENSMUSG00000006262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC104402 // GenBank // Mus musculus MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 1A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:129510 IMAGE:40050502), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC104403 // GenBank // Mus musculus MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 1A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:129511 IMAGE:40050503), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000125171 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:88720977:88750009:1 gene:ENSMUSG00000006262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// AK003346 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110003E08 product:weakly similar to CELL CYCLE ASSOCIATED PROTEIN MOB1-1 [Trypanosoma brucei], full insert sequence. // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// ENSMUST00000155298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:88720855:88747350:1 gene:ENSMUSG00000006262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// AK045695 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230306A03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONMMUT053011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_007832 // RefSeq // Mus musculus deoxycytidine kinase (Dck), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:88764996:88783281:1 gene:ENSMUSG00000029366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052004 // GenBank // Mus musculus deoxycytidine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:62327 IMAGE:6401517), complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC060062 // GenBank // Mus musculus deoxycytidine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:57942 IMAGE:5703508), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:88765256:88781317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_133192 // RefSeq // Mus musculus neuropeptide FF receptor 2 (Npffr2), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:89527429:89583740:1 gene:ENSMUSG00000035528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF236084 // GenBank // Mus musculus G-protein-coupled receptor 74 mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// AF330054 // GenBank // Mus musculus neuropeptide NPFF receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000056191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:89567816:89583466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
BC085272 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:103401 IMAGE:30145536, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NR_045618 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9958 (Gm9958), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:90367204:90368487:1 gene:ENSMUSG00000054945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009654 // RefSeq // Mus musculus albumin (Alb), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:90460889:90476603:1 gene:ENSMUSG00000029368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AJ011413 // GenBank // Mus musculus mRNA for serum albumin. // chr5 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC024643 // GenBank // Mus musculus albumin, mRNA (cDNA clone MGC:27522 IMAGE:4242076), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC049971 // GenBank // Mus musculus albumin, mRNA (cDNA clone MGC:59023 IMAGE:4161986), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:90460935:90488127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_007423 // RefSeq // Mus musculus alpha fetoprotein (Afp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000042755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:90490714:90508907:1 gene:ENSMUSG00000054932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC066206 // GenBank // Mus musculus alpha fetoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:76732 IMAGE:30469872), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:90490781:90519639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
NM_145146 // RefSeq // Mus musculus afamin (Afm), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000113179 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:90518932:90553543:1 gene:ENSMUSG00000029369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000128740 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:90518949:90549057:1 gene:ENSMUSG00000029369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AJ011080 // GenBank // Mus musculus mRNA for alpha-albumin protein. // chr5 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC100597 // GenBank // Mus musculus afamin, mRNA (cDNA clone MGC:118711 IMAGE:6767654), complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC026681 // GenBank // Mus musculus afamin, mRNA (cDNA clone IMAGE:5064401), partial cds. // chr5 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// GENSCAN00000002662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:90522145:90559232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001252661 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5830473C10 gene (5830473C10Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XR_389286 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 5830473C10 gene (5830473C10Rik), transcript variant X8, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XR_389287 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 5830473C10 gene (5830473C10Rik), transcript variant X9, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000094615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:90561209:90597906:1 gene:ENSMUSG00000070690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:90564197:90584996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_009141 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 5 (Cxcl5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:90759299:90761625:1 gene:ENSMUSG00000029371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK044397 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930010L22 product:small inducible cytokine B subfamily, member 5, full insert sequence. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC024392 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 5, mRNA (cDNA clone MGC:36180 IMAGE:4976854), complete cds. // chr5 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// U27267 // GenBank // Mus musculus LIX precursor, mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT053065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_023785 // RefSeq // Mus musculus pro-platelet basic protein (Ppbp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:90768518:90770060:1 gene:ENSMUSG00000029372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB042817 // GenBank // Mus musculus mRNA for chemokine subfamily B Cys-X-Cys, complete cds. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// AF219112 // GenBank // Mus musculus thymus chemokine 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF278700 // GenBank // Mus musculus thymus chemokine 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC127043 // GenBank // Mus musculus pro-platelet basic protein, mRNA (cDNA clone MGC:149962 IMAGE:40053104), complete cds. // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC127044 // GenBank // Mus musculus pro-platelet basic protein, mRNA (cDNA clone MGC:149963 IMAGE:40053105), complete cds. // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_019932 // RefSeq // Mus musculus platelet factor 4 (Pf4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:90772435:90773381:1 gene:ENSMUSG00000029373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB017491 // GenBank // Mus musculus Pf4 mRNA for platelet factor 4, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC061111 // GenBank // Mus musculus platelet factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:74232 IMAGE:30280161), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_203320 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 3 (Cxcl3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000031326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:90786103:90788086:1 gene:ENSMUSG00000029379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY311403 // GenBank // Mus musculus dendritic cell inflammatory protein-1 precursor (Dcip1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC117014 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 3, mRNA (cDNA clone MGC:151391 IMAGE:40126333), complete cds. // chr5 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// BC117016 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 3, mRNA (cDNA clone MGC:151393 IMAGE:40126335), complete cds. // chr5 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000002682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:90786171:90872740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_011339 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 15 (Cxcl15), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000031322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:90794534:90803067:1 gene:ENSMUSG00000029375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF082859 // GenBank // Mus musculus lungkine mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC061138 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 15, mRNA (cDNA clone MGC:74270 IMAGE:30298837), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_008176 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 1 (Cxcl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:90891241:90893115:1 gene:ENSMUSG00000029380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC037997 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5321155), partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132502 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 1, mRNA (cDNA clone MGC:164133 IMAGE:40130779), complete cds. // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC132504 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 1, mRNA (cDNA clone MGC:164135 IMAGE:40130781), complete cds. // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// J04596 // GenBank // Mouse platelet-derived growth factor-inducible KC protein mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:90891311:90891793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_009140 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 2 (Cxcl2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000075433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:90903899:90905909:1 gene:ENSMUSG00000058427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC119511 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 2, mRNA (cDNA clone MGC:141145 IMAGE:40055368), complete cds. // chr5 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// BC119512 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 2, mRNA (cDNA clone MGC:141146 IMAGE:40055369), complete cds. // chr5 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000005680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:90903945:91020264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_026788 // RefSeq // Mus musculus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2-like (Mthfd2l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000071652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:90931196:91021360:1 gene:ENSMUSG00000029376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_389288 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2-like (Mthfd2l), transcript variant X4, misc_RNA. // chr5 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1 /// GENSCAN00000005680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:90903945:91020264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1
NM_053087 // RefSeq // Mus musculus epithelial mitogen (Epgn), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000041516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:91027464:91035215:1 gene:ENSMUSG00000035020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ291391 // GenBank // Mus musculus mRNA for Epigen protein. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC119291 // GenBank // Mus musculus epithelial mitogen, mRNA (cDNA clone MGC:155607 IMAGE:8734040), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC119293 // GenBank // Mus musculus epithelial mitogen, mRNA (cDNA clone MGC:155609 IMAGE:8734042), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC145041 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053589. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:91027074:91033973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_007950 // RefSeq // Mus musculus epiregulin (Ereg), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:91074617:91093649:1 gene:ENSMUSG00000029377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027838 // GenBank // Mus musculus epiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:36144 IMAGE:5325124), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// D30782 // GenBank // Mus musculus mRNA for epiregulin, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:91073799:91094477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_009704 // RefSeq // Mus musculus amphiregulin (Areg), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:91139615:91148432:1 gene:ENSMUSG00000029378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC009138 // GenBank // Mus musculus amphiregulin, mRNA (cDNA clone MGC:11536 IMAGE:3597695), complete cds. // chr5 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// CT010320 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D0552D for gene Areg, Amphiregulin; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// D12648 // GenBank // Mus musculus mRNA for schwannoma-derived growth factor, complete cds. // chr5 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:91134757:91197031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_145562 // RefSeq // Mus musculus prostate androgen-regulated mucin-like protein 1 (Parm1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000040576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:91517615:91626894:1 gene:ENSMUSG00000034981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK078943 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130213B05 product:CASTRATION INDUCED PROSTATIC APOPTOSIS RELATED PROTEIN-1, (CIPAR-1) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC006604 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130213B05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:11719 IMAGE:3966312), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EF564364 // GenBank // Mus musculus prostatic androgen-repressed message-1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000005683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:91562723:91623017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000005685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:91504178:91520210:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NR_028429 // RefSeq // Mus musculus THAP domain containing 6 (Thap6), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015967 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930534K21 product:RIKEN cDNA 4930534K21 gene, full insert sequence. // chr5 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONMMUT053089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000026857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:91962384:91973716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
AK076382 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732478G01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0
AK046413 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230381E03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019490 // RefSeq // Mus musculus USO1 vesicle docking factor (Uso1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000031355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:92137938:92202794:1 gene:ENSMUSG00000029407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC016069 // GenBank // Mus musculus USO1 homolog, vesicle docking protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:27548 IMAGE:4480992), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AK172425 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830207B07 product:vesicle docking protein, full insert sequence. // chr5 // 54 // 54 // 26 // 48 // 1 /// GENSCAN00000026859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:92147278:92223343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 32 // 48 // 1
NM_175096 // RefSeq // Mus musculus starch binding domain 1 (Stbd1), mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:92603051:92606579:1 gene:ENSMUSG00000047963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AK021293 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530019K15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// BC118615 // GenBank // Mus musculus starch binding domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:148232 IMAGE:40107322), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC118661 // GenBank // Mus musculus starch binding domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:148231 IMAGE:40107321), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:92603109:92605669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT053115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0
GENSCAN00000003420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:93003830:93038117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000180541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:93044720:93048430:1 gene:ENSMUSG00000097198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK034152 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330159N05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000157615 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:93073861:93073996:1 gene:ENSMUSG00000088240 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009818 // RefSeq // Mus musculus septin 11 (Sept11), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006535108 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus septin 11 (Sept11), transcript variant X11, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000074733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:93093457:93174958:1 gene:ENSMUSG00000058013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC031456 // GenBank // Mus musculus septin 11, mRNA (cDNA clone MGC:28420 IMAGE:4037515), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC062206 // GenBank // Mus musculus septin 11, mRNA (cDNA clone MGC:70304 IMAGE:5150858), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC064466 // GenBank // Mus musculus septin 11, mRNA (cDNA clone MGC:69905 IMAGE:6825549), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006535098 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus septin 11 (Sept11), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// XR_389284 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus septin 11 (Sept11), transcript variant X12, misc_RNA. // chr5 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// AK171368 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730047D14 product:Similar to SEPTIN6 type II homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// GENSCAN00000003439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:93130722:93168689:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_029363 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2010109A12 gene (2010109A12Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031330 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:93206518:93213475:1 gene:ENSMUSG00000029384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK047232 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930037N10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT053153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSMUST00000130183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:93267639:93276225:1 gene:ENSMUSG00000029385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000149329 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:93268708:93273485:1 gene:ENSMUSG00000029385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// U95826 // GenBank // Mus musculus cyclin G2 mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 59 // 20 // 22 // 0 /// NM_007635 // RefSeq // Mus musculus cyclin G2 (Ccng2), mRNA. // chr5 // 76 // 76 // 28 // 37 // 1 /// ENSMUST00000031331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:93267257:93276231:1 gene:ENSMUSG00000029385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 31 // 37 // 1 /// ENSMUST00000121127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:93268314:93276224:1 gene:ENSMUSG00000029385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 28 // 37 // 1 /// AF005885 // GenBank // Mus musculus cyclin G2 mRNA, complete cds. // chr5 // 70 // 70 // 26 // 37 // 1 /// BC088980 // GenBank // Mus musculus cyclin G2, mRNA (cDNA clone MGC:113793 IMAGE:5686564), complete cds. // chr5 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1 /// GENSCAN00000003417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:93267032:93274997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1
ENSMUST00000083912 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:95867334:95867440:1 gene:ENSMUSG00000094471 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018866 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 13 (Cxcl13), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:95956928:95961067:1 gene:ENSMUSG00000023078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF030636 // GenBank // Mus musculus CXC chemokine (angie2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AF044196 // GenBank // Mus musculus B lymphocyte chemoattractant BLC mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012965 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 13, mRNA (cDNA clone MGC:13851 IMAGE:4217539), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:95956971:95964414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001039084 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L1 (Mrpl1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NM_053158 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L1 (Mrpl1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006535292 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L1 (Mrpl1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000036437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:96210115:96266709:1 gene:ENSMUSG00000029486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000117766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:96209493:96266727:1 gene:ENSMUSG00000029486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000121477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:96210144:96239684:1 gene:ENSMUSG00000029486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// AB049632 // GenBank // Mus musculus MRPL1 mRNA for mitochondrial ribosomal protein L1 (L1mt), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// BC061042 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L1, mRNA (cDNA clone MGC:74152 IMAGE:6706599), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:96223754:96264337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0
NM_175473 // RefSeq // Mus musculus Fraser syndrome 1 homolog (human) (Fras1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 74 // 74 // 0 /// ENSMUST00000036019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:96373955:96784728:1 gene:ENSMUSG00000034687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 74 // 74 // 0 /// AJ489280 // GenBank // Mus musculus mRNA for Fras1 protein. // chr5 // 92 // 100 // 68 // 74 // 0 /// GENSCAN00000050699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:96510327:96781771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 68 // 68 // 0
NM_013470 // RefSeq // Mus musculus annexin A3 (Anxa3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:96793385:96845968:1 gene:ENSMUSG00000029484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK013850 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900093L22 product:annexin A3, full insert sequence. // chr5 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC090634 // GenBank // Mus musculus annexin A3, mRNA (cDNA clone MGC:116584 IMAGE:30942562), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC141167 // GenBank // Mus musculus annexin A3, mRNA (cDNA clone MGC:176128 IMAGE:9055779), complete cds. // chr5 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// CT010280 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836H0151D for gene Anxa3, Annexin A3; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// AK169423 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days pregnant adult female amnion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920196B18 product:annexin A3, full insert sequence. // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000050698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:96799282:96845560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
ENSMUST00000082616 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:96907632:96907825:1 gene:ENSMUSG00000064550 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080708 // RefSeq // Mus musculus BMP2 inducible kinase (Bmp2k), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000035635 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:96997689:97091867:1 gene:ENSMUSG00000034663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY050249 // GenBank // Mus musculus BMP-2 inducible kinase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006534788 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BMP2 inducible kinase (Bmp2k), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// ENSMUST00000112974 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:96997689:97069649:1 gene:ENSMUSG00000034663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// AK046752 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B630007K10 product:Bmp2-inducible kinase, full insert sequence. // chr5 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// GENSCAN00000038689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:97014327:97080688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
ENSMUST00000182555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:98153181:98154176:1 gene:ENSMUSG00000098073 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:98128503:98170113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0
NM_029947 // RefSeq // Mus musculus PR domain containing 8 (Prdm8), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:98180869:98187448:1 gene:ENSMUSG00000035456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC141020 // GenBank // Mus musculus PR domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:175981 IMAGE:9055632), complete cds. // chr5 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// AK050852 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030026C19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// GENSCAN00000034311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:98183291:98186642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT053223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_001277268 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor 5 (Fgf5), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_010203 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor 5 (Fgf5), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:98254184:98277030:1 gene:ENSMUSG00000029337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB016516 // GenBank // Mus musculus mRNA for FGF-5S, complete cds. // chr5 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC071227 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor 5, mRNA (cDNA clone MGC:78182 IMAGE:30443152), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M30643 // GenBank // Mouse fibroblast growth factor-5 (Fgf5) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_006534790 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibroblast growth factor 5 (Fgf5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000034301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:98234339:98306906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
XM_006535279 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700007G11 gene (1700007G11Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000080333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:98329354:98801910:1 gene:ENSMUSG00000057816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK005711 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700007G11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC049770 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700007G11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58865 IMAGE:6774684), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_389294 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700007G11 gene (1700007G11Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr5 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// GENSCAN00000034302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:98329354:98359534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// AK015228 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930428O21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONMMUT053594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_173404 // RefSeq // Mus musculus bone morphogenetic protein 3 (Bmp3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:98854439:98880960:1 gene:ENSMUSG00000029335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK035299 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530011L11 product:BONE MORPHOGENETIC PROTEIN-3 (FRAGMENT) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC117749 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:143536 IMAGE:40090489), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:98848574:98879862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
AK136433 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030204C09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000031274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:99682999:99685034:1 gene:ENSMUSG00000029331 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015871 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930522N08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONMMUT053256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000046721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:99979061:99979663:1 gene:ENSMUSG00000035364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK015886 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930524J08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026421 // RefSeq // Mus musculus enolase-phosphatase 1 (Enoph1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_027990 // RefSeq // Mus musculus enolase-phosphatase 1 (Enoph1), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535190 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus enolase-phosphatase 1 (Enoph1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000169390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:100039994:100068762:1 gene:ENSMUSG00000029326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC021429 // GenBank // Mus musculus enolase-phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:29163 IMAGE:5030617), complete cds. // chr5 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// NM_001163035 // RefSeq // Mus musculus enolase-phosphatase 1 (Enoph1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// XM_006535189 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus enolase-phosphatase 1 (Enoph1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// ENSMUST00000031268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:100039994:100068762:1 gene:ENSMUSG00000029326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// GENSCAN00000021127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:100054940:100067935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
AK081324 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130005N09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_026826 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S18C (Mrps18c), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000016977 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:100798627:100804471:1 gene:ENSMUSG00000016833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000112898 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:100798737:100804461:1 gene:ENSMUSG00000016833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000112901 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:100798747:100804471:1 gene:ENSMUSG00000016833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK088290 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430010G06 product:similar to MITOCHONDRIAL 28S RIBOSOMAL PROTEIN S18-1 (MRP-S18-1) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC028442 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S18C, mRNA (cDNA clone MGC:41331 IMAGE:1196057), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000140296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:100798743:100799689:1 gene:ENSMUSG00000016833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// AK139193 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730063F13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// NONMMUT053316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
ENSMUST00000092990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:100846364:100899102:1 gene:ENSMUSG00000029314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112887 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:100846130:100899099:1 gene:ENSMUSG00000029314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK030171 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933408F15 product:hypothetical Phospholipid and glycerol acyltransferase (from motifs_6.msf) containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC096769 // GenBank // Mus musculus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 9, mRNA (cDNA clone MGC:107456 IMAGE:30101305), complete cds. // chr5 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// BC138228 // GenBank // Mus musculus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 9, mRNA (cDNA clone MGC:169852 IMAGE:8861247), complete cds. // chr5 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// BC145669 // GenBank // Mus musculus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 9, mRNA (cDNA clone MGC:175556 IMAGE:40130972), complete cds. // chr5 // 91 // 76 // 20 // 22 // 0 /// NM_172715 // RefSeq // Mus musculus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 9 (Agpat9), mRNA. // chr5 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// ENSMUST00000031255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:100846219:100899099:1 gene:ENSMUSG00000029314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// GENSCAN00000019552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:100891643:100897828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000021110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:100846808:100890015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
NM_173370 // RefSeq // Mus musculus CDP-diacylglycerol synthase 1 (Cds1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:101765130:101823858:1 gene:ENSMUSG00000029330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000132213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:101806548:101821447:1 gene:ENSMUSG00000029330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AF533367 // GenBank // Mus musculus CDP-diacylglycerol synthase 1 (Cds1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC026505 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4507928, containing frame-shift errors. // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC055292 // GenBank // Mus musculus CDP-diacylglycerol synthase 1, mRNA (cDNA clone MGC:62814 IMAGE:6491596), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:101765373:101823616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_011204 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13 (Ptpn13), mRNA. // chr5 // 98 // 94 // 47 // 48 // 0 /// XM_006534839 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13 (Ptpn13), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 97 // 61 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000048957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:103425192:103598359:1 gene:ENSMUSG00000034573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 98 // 94 // 47 // 48 // 0 /// AK143394 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330025N13 product:protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, full insert sequence. // chr5 // 100 // 29 // 15 // 15 // 0 /// BC057205 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, mRNA (cDNA clone IMAGE:5328644), complete cds. // chr5 // 100 // 37 // 19 // 19 // 0 /// D28529 // GenBank // Mus musculus mRNA for protein tyrosine phosphatase DPZPTP, complete cds. // chr5 // 93 // 57 // 27 // 29 // 0 /// D83966 // GenBank // Mus musculus mRNA for protein tyrosine phosphatase, complete cds. // chr5 // 89 // 92 // 42 // 47 // 0 /// GENSCAN00000042192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:103544671:103603901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 49 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:103521959:103542424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 18 // 9 // 9 // 0
NM_001080798 // RefSeq // Mus musculus AF4/FMR2 family, member 1 (Aff1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_133919 // RefSeq // Mus musculus AF4/FMR2 family, member 1 (Aff1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006534801 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus AF4/FMR2 family, member 1 (Aff1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:103754573:103855322:1 gene:ENSMUSG00000029313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:103754162:103855322:1 gene:ENSMUSG00000029313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085290 // GenBank // Mus musculus AF4/FMR2 family, member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5348125). // chr5 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0
ENSMUST00000179033 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:103898879:103898985:1 gene:ENSMUSG00000095133 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT053414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_010080 // RefSeq // Mus musculus dentin sialophosphoprotein (Dspp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:104170712:104180127:1 gene:ENSMUSG00000053268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC129802 // GenBank // Mus musculus dentin sialophosphoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:124498 IMAGE:40049023), complete cds. // chr5 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// U67916 // GenBank // Mus musculus dentin sialophosphoprotein precursor (DSPP) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116172 // GenBank // Mus musculus dentin sialophosphoprotein, mRNA (cDNA clone IMAGE:40049020), complete cds. // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:104119523:104178610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_016779 // RefSeq // Mus musculus dentin matrix protein 1 (Dmp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534766 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dentin matrix protein 1 (Dmp1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000066708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:104202617:104214102:1 gene:ENSMUSG00000029307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC113753 // GenBank // Mus musculus dentin matrix protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:130441 IMAGE:40039844), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// U65020 // GenBank // Mus musculus dentin matrix protein 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:104207097:104212971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_008318 // RefSeq // Mus musculus integrin binding sialoprotein (Ibsp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:104299171:104311469:1 gene:ENSMUSG00000029306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC045143 // GenBank // Mus musculus integrin binding sialoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:54706 IMAGE:6391115), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L20232 // GenBank // Mus musculus bone sialoprotein (IBSP) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// L23801 // GenBank // Mus musculus sialoprotein II mRNA, complete cds with repeats. // chr5 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:104301166:104310573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_053172 // RefSeq // Mus musculus matrix extracellular phosphoglycoprotein with ASARM motif (bone) (Mepe), mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000066207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:104325329:104338611:1 gene:ENSMUSG00000053863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// AF298661 // GenBank // Mus musculus osteoregulin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// AF314964 // GenBank // Mus musculus matrix extracellular phosphoglycoprotein precursor (Mepe) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// BC119162 // GenBank // Mus musculus matrix extracellular phosphoglycoprotein with ASARM motif (bone), mRNA (cDNA clone MGC:155478 IMAGE:8733911), complete cds. // chr5 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// AK158330 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930104E24 product:Osteoregulin homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 73 // 70 // 19 // 26 // 0
NM_001166581 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC005561 (BC005561), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000096452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:104508352:104522383:1 gene:ENSMUSG00000079065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:104517614:104522383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000178720 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:104936651:104936757:1 gene:ENSMUSG00000096561 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT053474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AK044970 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130016L16 product:hypothetical Zn-finger, CCHC type/Zinc finger CCHC-type profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033550 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 8 family, member B (Lrrc8b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000112707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:105415775:105486189:1 gene:ENSMUSG00000070639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC138877 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 8 family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:170504 IMAGE:8861899), complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC138878 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 8 family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:170505 IMAGE:8861900), complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_133897 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 8 family, member C (Lrrc8c), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067924 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:105519388:105613018:1 gene:ENSMUSG00000054720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:105558858:105606872:1 gene:ENSMUSG00000054720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AB081508 // GenBank // Mus musculus mRNA for AD158, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC025473 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 8 family, member C, mRNA (cDNA clone MGC:36625 IMAGE:5353064), complete cds. // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC026572 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 8 family, member C, mRNA (cDNA clone MGC:36378 IMAGE:4988595), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:105606502:105608772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
XR_389465 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA D830014E11 gene (D830014E11Rik), transcript variant X4, misc_RNA. // chr5 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000134605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:105824511:105832435:1 gene:ENSMUSG00000046079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000140081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:105732230:105832436:1 gene:ENSMUSG00000046079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AK085824 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830014E11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_389464 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA D830014E11 gene (D830014E11Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONMMUT053513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000137795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:106906738:106906980:1 gene:ENSMUSG00000067047 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT053556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001079873 // RefSeq // Mus musculus bromodomain, testis-specific (Brdt), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// NM_054054 // RefSeq // Mus musculus bromodomain, testis-specific (Brdt), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006534729 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus bromodomain, testis-specific (Brdt), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006534731 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus bromodomain, testis-specific (Brdt), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000031215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:107331159:107387058:1 gene:ENSMUSG00000029279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000112677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:107331175:107350741:1 gene:ENSMUSG00000029279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// AB208640 // GenBank // Mus musculus Brdt mRNA for bromodomain-containing protein, complete cds. // chr5 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// AF358660 // GenBank // Mus musculus bromodomain-containing female sterile homeotic-like protein (Fsrg3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000162804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:107359837:107386361:1 gene:ENSMUSG00000029279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1 /// GENSCAN00000004157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:107288463:107378526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT053572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1
ENSMUST00000082620 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:107401319:107401437:1 gene:ENSMUSG00000064554 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT053577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001001804 // RefSeq // Mus musculus epoxide hydrolase 4 (Ephx4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006535056 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus epoxide hydrolase 4 (Ephx4), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006535057 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus epoxide hydrolase 4 (Ephx4), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000049146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:107403496:107430035:1 gene:ENSMUSG00000033805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000159968 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:107402736:107413620:1 gene:ENSMUSG00000033805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000161452 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:107405785:107413588:1 gene:ENSMUSG00000033805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000161246 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:107403775:107413528:1 gene:ENSMUSG00000033805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000004161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:107403551:107429891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0
NM_027599 // RefSeq // Mus musculus lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B (Lpcat2b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000166599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:107431549:107435039:1 gene:ENSMUSG00000033794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC139095 // GenBank // Mus musculus acyltransferase like 1B, mRNA (cDNA clone MGC:170722 IMAGE:8862117), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC139096 // GenBank // Mus musculus acyltransferase like 1B, mRNA (cDNA clone MGC:170723 IMAGE:8862118), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000004159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:107432807:107434357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_001255991 // RefSeq // Mus musculus BTB (POZ) domain containing 8 (Btbd8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000094541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:107437997:107491628:1 gene:ENSMUSG00000070632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000162298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:107452156:107471351:1 gene:ENSMUSG00000070632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONMMUT053581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000004136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:107437997:107471043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONMMUT053580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001276397 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2B (Ube2d2b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:107830099:107831776:1 gene:ENSMUSG00000063447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082519 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:107904555:107904648:1 gene:ENSMUSG00000064453 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140659 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:107904114:107908050:1 gene:ENSMUSG00000058558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000117916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:108002260:108002486:1 gene:ENSMUSG00000084855 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT053612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:108002138:108106945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NM_028481 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 18 (Ccdc18), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006535251 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 18 (Ccdc18), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006535252 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 18 (Ccdc18), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000047677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:108132914:108232947:1 gene:ENSMUSG00000056531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK040158 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430070P16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// AK040607 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430108L15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC082598 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 18, mRNA (cDNA clone MGC:100177 IMAGE:30641632), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:108148945:108278665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_026106 // RefSeq // Mus musculus down-regulator of transcription 1 (Dr1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:108268897:108280526:1 gene:ENSMUSG00000029265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC013461 // GenBank // Mus musculus down-regulator of transcription 1, mRNA (cDNA clone MGC:18680 IMAGE:4222118), complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:108148945:108278665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001081234 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class G (Pigg), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:108312609:108348233:1 gene:ENSMUSG00000029263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000118910 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:108312636:108348238:1 gene:ENSMUSG00000029263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000119014 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:108312609:108349355:1 gene:ENSMUSG00000029263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:108312925:108348050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000100944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:108369858:108378239:1 gene:ENSMUSG00000072769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK031816 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330405H19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141638 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630049E18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK165889 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730014J15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT053640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK165889 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730014J15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008806 // RefSeq // Mus musculus phosphodiesterase 6B, cGMP, rod receptor, beta polypeptide (Pde6b), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000031456 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:108388391:108431743:1 gene:ENSMUSG00000029491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000130448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:108430377:108432397:1 gene:ENSMUSG00000029491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000134865 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:108388426:108431667:1 gene:ENSMUSG00000029491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// BC058803 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 6B, cGMP, rod receptor, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone IMAGE:6493884), partial cds. // chr5 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// BC062209 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 6B, cGMP, rod receptor, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone IMAGE:5369125), complete cds. // chr5 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// BC129923 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 6B, cGMP, rod receptor, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:150321 IMAGE:40111882), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000032601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:108418082:108430753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT053642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0
NM_172716 // RefSeq // Mus musculus polycomb group ring finger 3 (Pcgf3), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000046975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:108461232:108506976:1 gene:ENSMUSG00000033623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000138264 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:108461313:108486171:1 gene:ENSMUSG00000033623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 81 // 47 // 13 // 16 // 0 /// BC049266 // GenBank // Mus musculus polycomb group ring finger 3, mRNA (cDNA clone MGC:55128 IMAGE:5371040), complete cds. // chr5 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// XM_006535208 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polycomb group ring finger 3 (Pcgf3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// ENSMUST00000112597 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:108461232:108489224:1 gene:ENSMUSG00000033623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// AK033609 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130201A12 product:hypothetical RING finger containing protein, full insert sequence. // chr5 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONMMUT053648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 81 // 47 // 13 // 16 // 0
NM_054071 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor receptor-like 1 (Fgfrl1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000013633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:108694229:108706950:1 gene:ENSMUSG00000008090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF321300 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor receptor 5 beta precursor (Fgfr5) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058745 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:67931 IMAGE:6439421), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_001164259 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor receptor-like 1 (Fgfrl1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// ENSMUST00000112560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:108694229:108706950:1 gene:ENSMUSG00000008090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// AF321301 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor receptor 5 gamma precursor (Fgfr5) mRNA, complete cds. // chr5 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000032585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:108703297:108729956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
AK149882 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530025F05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001104627 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 16 (Vmn2r16), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000165180 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:109330381:109364481:1 gene:ENSMUSG00000092080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:109330381:109340663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
NM_001104628 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 17 (Vmn2r17), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171841 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:109420013:109453387:1 gene:ENSMUSG00000091879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001104628 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 17 (Vmn2r17), mRNA. // chr5 // 94 // 90 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000171841 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:109420013:109453387:1 gene:ENSMUSG00000091879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 90 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:109428420:109454380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 70 // 13 // 14 // 0
ENSMUST00000147631 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:110110351:110127418:1 gene:ENSMUSG00000023284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC007165 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A830023I12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7438 IMAGE:3489445), complete cds. // chr5 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// NM_001163996 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 605 (Zfp605), mRNA. // chr5 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENSMUST00000112528 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:110110092:110129794:1 gene:ENSMUSG00000023284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENSMUST00000144089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110110336:110127460:1 gene:ENSMUSG00000023284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// AK051473 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130051M04 product:nucleophosmin 1, full insert sequence. // chr5 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// ENSMUST00000086686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110112052:110129102:1 gene:ENSMUSG00000023284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_008146 // RefSeq // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 3 (Golga3), mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000031477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:110176879:110223201:1 gene:ENSMUSG00000029502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000112512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:110176701:110226470:1 gene:ENSMUSG00000029502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// BC053002 // GenBank // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 3, mRNA (cDNA clone MGC:62158 IMAGE:5709074), complete cds. // chr5 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// D78270 // GenBank // Mus musculus Mea-2 mRNA for male-enhanced antigen-2, complete cds. // chr5 // 96 // 94 // 44 // 46 // 0 /// ENSMUST00000125380 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110176897:110188413:1 gene:ENSMUSG00000029502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// GENSCAN00000009151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110135616:110221905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 39 // 39 // 0 /// AK030450 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330413L04 product:golgi autoantigen, golgin subfamily a, 3, full insert sequence. // chr5 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// NONMMUT053751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1
NM_001253814 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and LEM domain containing 2 (Ankle2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_027922 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and LEM domain containing 2 (Ankle2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000031474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110231004:110256651:1 gene:ENSMUSG00000029501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000086674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110231004:110256651:1 gene:ENSMUSG00000029501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AK043925 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830053G03 product:hypothetical LEM domain structure containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// BC065071 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and LEM domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:76358 IMAGE:6410033), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110231237:110259029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
AK038433 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230010G09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000129007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:110521162:110525980:1 gene:ENSMUSG00000048215 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110521131:110522122:1 gene:ENSMUSG00000048215 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK041600 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630023P12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142879 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110521095:110525126:1 gene:ENSMUSG00000048215 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT053770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT053771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONMMUT053769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001122639 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9 (Galnt9), transcript variant B, mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// NM_198306 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9 (Galnt9), transcript variant A, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NR_104449 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9 (Galnt9), transcript variant C, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000040001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110544345:110621382:1 gene:ENSMUSG00000033316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000165856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110603505:110621382:1 gene:ENSMUSG00000033316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// BC054061 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9, mRNA (cDNA clone MGC:63144 IMAGE:5056396), complete cds. // chr5 // 96 // 64 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110572199:110600213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000009194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110602231:110648057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 25 // 44 // 1
NM_027156 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 51 (Ddx51), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:110653451:110660496:1 gene:ENSMUSG00000029504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000136629 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110653546:110655145:1 gene:ENSMUSG00000029504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC060646 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 51, mRNA (cDNA clone MGC:79178 IMAGE:6853826), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110653488:110657518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000178031 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:110757085:110757191:1 gene:ENSMUSG00000096238 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT053784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_016681 // RefSeq // Mus musculus checkpoint kinase 2 (Chek2), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006535068 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus checkpoint kinase 2 (Chek2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// XM_006535069 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus checkpoint kinase 2 (Chek2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006535073 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus checkpoint kinase 2 (Chek2), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000066160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110840017:110874133:1 gene:ENSMUSG00000029521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AF086905 // GenBank // Mus musculus protein kinase Chk2 (Chk2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC056617 // GenBank // Mus musculus CHK2 checkpoint homolog (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:68017 IMAGE:4977960), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110841213:110873566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0
NM_001267622 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 28 (Ttc28), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006534846 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 28 (Ttc28), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000040111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110879803:111289779:1 gene:ENSMUSG00000033209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000156290 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110879803:111289780:1 gene:ENSMUSG00000033209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AK122427 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1043 protein. // chr5 // 91 // 72 // 30 // 33 // 0 /// BC046779 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 28, mRNA (cDNA clone MGC:61312 IMAGE:5719497), complete cds. // chr5 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000042899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:111205672:111286547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000042893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:111013525:111201690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
NR_030482 // RefSeq // Mus musculus microRNA 701 (Mir701), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102208 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:111004144:111004252:1 gene:ENSMUSG00000076163 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-701 // miRBase Micro RNA Database // MI0004685 Mus musculus miR-701 stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001267622 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 28 (Ttc28), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110879803:111289779:1 gene:ENSMUSG00000033209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156290 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110879803:111289780:1 gene:ENSMUSG00000033209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC002262 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 28, mRNA (cDNA clone MGC:7623 IMAGE:3495045), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001267622 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 28 (Ttc28), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110879803:111289779:1 gene:ENSMUSG00000033209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156290 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110879803:111289780:1 gene:ENSMUSG00000033209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019640 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol transfer protein, beta (Pitpnb), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000086635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:111330763:111388359:1 gene:ENSMUSG00000050017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC034676 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol transfer protein, beta, mRNA (cDNA clone MGC:25322 IMAGE:4481685), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// U46934 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol transfer protein beta isoform mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:111300980:111387071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
AK138421 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230099F01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00005680 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081235 // RefSeq // Mus musculus meningioma 1 (Mn1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000094463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:111417442:111457033:1 gene:ENSMUSG00000070576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK142207 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330012F13 product:BK437G10B.1 (Meningioma (Disrupted in balanced translocation) 1) (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000042885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:111399029:111440295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_015546 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C130026L21 gene (C130026L21Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000064930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:111581422:111587945:1 gene:ENSMUSG00000052848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC094571 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C130026L21 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30359051). // chr5 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AK165050 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230013C06 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONMMUT053813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT053814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_023695 // RefSeq // Mus musculus crystallin, beta B1 (Crybb1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006534753 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, beta B1 (Crybb1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006534754 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, beta B1 (Crybb1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006534755 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, beta B1 (Crybb1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:112255815:112269585:1 gene:ENSMUSG00000029343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000112375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112255874:112269502:1 gene:ENSMUSG00000029343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000131673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112255845:112269457:1 gene:ENSMUSG00000029343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// AF106853 // GenBank // Mus musculus beta-B1 crystallin mRNA, complete cds. // chr5 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// BC029012 // GenBank // Mus musculus crystallin, beta B1, mRNA (cDNA clone MGC:35800 IMAGE:5358714), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK076443 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4832436C18 product:BETA-B1 CRYSTALLIN (3110006K12RIK PROTEIN) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 59 // 100 // 17 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112258328:112315734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_009419 // RefSeq // Mus musculus protein-tyrosine sulfotransferase 2 (Tpst2), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006534849 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein-tyrosine sulfotransferase 2 (Tpst2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006534850 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein-tyrosine sulfotransferase 2 (Tpst2), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XR_389265 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein-tyrosine sulfotransferase 2 (Tpst2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr5 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000031287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:112276691:112315361:1 gene:ENSMUSG00000029344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000071455 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112276707:112315355:1 gene:ENSMUSG00000029344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF049890 // GenBank // Mus musculus tyrosylprotein sulfotransferase-2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC003721 // GenBank // Mus musculus protein-tyrosine sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:5752 IMAGE:3494892), complete cds. // chr5 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000134071 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112276704:112309032:1 gene:ENSMUSG00000029344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// AK149379 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730003F03 product:protein-tyrosine sulfotransferase 2, full insert sequence. // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000022739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112258328:112315734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_018783 // RefSeq // Mus musculus tuftelin interacting protein 11 (Tfip11), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031288 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:112326358:112338073:1 gene:ENSMUSG00000029345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF290474 // GenBank // Mus musculus tuftelin-interacting protein 39 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC017682 // GenBank // Mus musculus tuftelin interacting protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:18684 IMAGE:4239713), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112327971:112337341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_138646 // RefSeq // Mus musculus Hermansky-Pudlak syndrome 4 homolog (human) (Hps4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000035279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:112343095:112378414:1 gene:ENSMUSG00000042328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112359 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112343083:112378414:1 gene:ENSMUSG00000042328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000133708 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112343095:112378414:1 gene:ENSMUSG00000042328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK081489 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130020P05 product:similar to BK1048E9.4 (NOVEL PROTEIN) (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY043415 // GenBank // Mus musculus light ear protein (le) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC063055 // GenBank // Mus musculus Hermansky-Pudlak syndrome 4 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:66795 IMAGE:5701206), complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112359458:112378130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_001177504 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6588 (Gm6588), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:112449426:112451738:1 gene:ENSMUSG00000072722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112449589:112450974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083439 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:113044144:113044252:1 gene:ENSMUSG00000065373 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT053891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001033428 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 211 (Tmem211), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000086615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:113226909:113239263:1 gene:ENSMUSG00000066964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC147409 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 211, mRNA (cDNA clone MGC:182603 IMAGE:9056497), complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC147410 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 211, mRNA (cDNA clone MGC:182602 IMAGE:9056496), complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC172062 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 211, mRNA (cDNA clone MGC:198767 IMAGE:9054348), complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// XM_006535020 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 211 (Tmem211), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000020222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:113230633:113238276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NONMMUT053924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012726 // RefSeq // Mus musculus activator of yeast meiotic promoters 1 (Aym1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:113357294:113357821:1 gene:ENSMUSG00000053873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF069744 // GenBank // Mus musculus AYM1 (Aym1) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC145860 // GenBank // Mus musculus activator of yeast meiotic promoters 1, mRNA (cDNA clone MGC:175747 IMAGE:40131163), complete cds. // chr5 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// BC145862 // GenBank // Mus musculus activator of yeast meiotic promoters 1, mRNA (cDNA clone MGC:175749 IMAGE:40131165), complete cds. // chr5 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
NM_177292 // RefSeq // Mus musculus WSC domain containing 2 (Wscd2), mRNA. // chrUn // 100 // 82 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000094452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:113490447:113589725:1 gene:ENSMUSG00000063430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 82 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000181294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:113570919:113589718:1 gene:ENSMUSG00000063430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrUn // 100 // 31 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000181650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:113490752:113554584:1 gene:ENSMUSG00000063430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrUn // 100 // 51 // 25 // 25 // 0 /// AK049685 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530024P05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrUn // 100 // 51 // 25 // 25 // 0 /// AK173026 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0789 protein. // chrUn // 100 // 43 // 21 // 21 // 0 /// BC147280 // GenBank // Mus musculus WSC domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:182458 IMAGE:9056352), complete cds. // chrUn // 100 // 35 // 17 // 17 // 0 /// BC147281 // GenBank // Mus musculus WSC domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:182430 IMAGE:9056324), complete cds. // chrUn // 100 // 35 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000180565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:113549985:113556509:1 gene:ENSMUSG00000063430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrUn // 43 // 43 // 21 // 49 // 1 /// GENSCAN00000020203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:113550935:113588145:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 59 // 29 // 29 // 0
NM_001010825 // RefSeq // Mus musculus FIC domain containing (Ficd), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530285 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FIC domain containing (Ficd), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000065698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:113735782:113740600:1 gene:ENSMUSG00000053334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:113735744:113739142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_025526 // RefSeq // Mus musculus IscU iron-sulfur cluster scaffold homolog (E. coli) (Iscu), mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000026937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:113772748:113778288:1 gene:ENSMUSG00000025825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000112312 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:113772803:113778273:1 gene:ENSMUSG00000025825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// AK039834 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430015M20 product:ISCU2 (UNKNOWN) (PROTEIN FOR MGC:20315) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC048409 // GenBank // Mus musculus IscU iron-sulfur cluster scaffold homolog (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:57075 IMAGE:6484953), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BC096049 // GenBank // Mus musculus IscU iron-sulfur cluster scaffold homolog (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:106935 IMAGE:3466271), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000134881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:113773025:113777945:1 gene:ENSMUSG00000025825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
NM_001033202 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 30 (Usp30), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114100333:114123506:1 gene:ENSMUSG00000029592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK078164 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330590F17 product:hypothetical Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family 2 containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC038606 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 30, mRNA (cDNA clone IMAGE:4911968), partial cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK162153 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420441D12 product:ubiquitin specific protease 30, full insert sequence. // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000016950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114102393:114121788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_133904 // RefSeq // Mus musculus acetyl-Coenzyme A carboxylase beta (Acacb), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// XM_006530114 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acetyl-Coenzyme A carboxylase beta (Acacb), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 51 // 51 // 0 /// XM_006530115 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acetyl-Coenzyme A carboxylase beta (Acacb), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 48 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:114165518:114250755:1 gene:ENSMUSG00000042010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// ENSMUST00000102582 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:114146535:114250761:1 gene:ENSMUSG00000042010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// ENSMUST00000143276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114199779:114250759:1 gene:ENSMUSG00000042010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 74 // 40 // 40 // 0 /// AK147463 // GenBank HTC // Mus musculus 14 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1047P08 product:acetyl-Coenzyme A carboxylase beta, full insert sequence. // chr5 // 100 // 74 // 40 // 40 // 0 /// AY451394 // GenBank // Mus musculus acetyl-CoA carboxylase 2 (Acacb) mRNA, complete cds. // chr5 // 98 // 96 // 51 // 52 // 0 /// GENSCAN00000016934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114176144:114249620:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 49 // 49 // 0
NM_001164573 // RefSeq // Mus musculus myosin 1H (Myo1h), mRNA. // chr5 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114356815:114364576:1 gene:ENSMUSG00000066952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000169347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:114314941:114364576:1 gene:ENSMUSG00000066952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// AF426467 // GenBank // Mus musculus myosin-1h (Myo1h) mRNA, partial cds. // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC144867 // GenBank // Mus musculus myosin 1H, mRNA (cDNA clone MGC:178423 IMAGE:9053415), complete cds. // chr5 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// BC144870 // GenBank // Mus musculus myosin 1H, mRNA (cDNA clone MGC:178426 IMAGE:9053418), complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC144872 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053420. // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000124316 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:114314941:114362208:1 gene:ENSMUSG00000066952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENSMUST00000128379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114357406:114359735:1 gene:ENSMUSG00000066952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000016935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114347493:114363061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_054093 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin protein ligase E3B (Ube3b), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000074002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114380628:114421168:1 gene:ENSMUSG00000029577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000130169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114380826:114421168:1 gene:ENSMUSG00000029577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF244362 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-protein ligase UBE3B (Ube3b) mRNA, 5UTR and complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// BC023956 // GenBank // Mus musculus ubiquitin protein ligase E3B, mRNA (cDNA clone MGC:38138 IMAGE:5321098), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC034059 // GenBank // Mus musculus ubiquitin protein ligase E3B, mRNA (cDNA clone MGC:31117 IMAGE:4163877), complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC096743 // GenBank // Mus musculus ubiquitin protein ligase E3B, mRNA (cDNA clone MGC:102217 IMAGE:30549276), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114386899:114419669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
XM_006530401 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 222, member A (Fam222a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000043650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114568016:114613220:1 gene:ENSMUSG00000041930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC057022 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC057022, mRNA (cDNA clone MGC:67174 IMAGE:6813454), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130983 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:114568017:114594678:1 gene:ENSMUSG00000041930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114601935:114612106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT053983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_006530509 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus trichoplein, keratin filament binding (Tchp), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000124242 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114707864:114722327:1 gene:ENSMUSG00000002486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC043048 // GenBank // Mus musculus trichoplein, keratin filament binding, mRNA (cDNA clone MGC:57948 IMAGE:5704036), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_029992 // RefSeq // Mus musculus trichoplein, keratin filament binding (Tchp), mRNA. // chr5 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000094441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114707760:114722327:1 gene:ENSMUSG00000002486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_006530510 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus trichoplein, keratin filament binding (Tchp), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// ENSMUST00000112199 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:114714961:114722327:1 gene:ENSMUSG00000002486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// BC047930 // GenBank // Mus musculus trichoplein, keratin filament binding, mRNA (cDNA clone IMAGE:5400265), complete cds. // chr5 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// ENSMUST00000131679 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:114714635:114719689:1 gene:ENSMUSG00000002486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114705958:114728227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_026718 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 13a (Ankrd13a), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000102578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114774677:114805822:1 gene:ENSMUSG00000041870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000129001 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114795743:114806200:1 gene:ENSMUSG00000041870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000137519 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:114786045:114803611:1 gene:ENSMUSG00000041870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC049187 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 13a, mRNA (cDNA clone IMAGE:6485405), partial cds. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC061692 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 13a, mRNA (cDNA clone MGC:65328 IMAGE:6308996), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC108413 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 13a, mRNA (cDNA clone MGC:118502 IMAGE:6487251), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000140604 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:114774945:114806200:1 gene:ENSMUSG00000041870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000016955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114774846:114804424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_011854 // RefSeq // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase-like 2 (Oasl2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000031542 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114896936:114912234:1 gene:ENSMUSG00000029561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000124716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114901353:114911220:1 gene:ENSMUSG00000029561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000144064 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114897742:114912226:1 gene:ENSMUSG00000029561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114897001:114899846:1 gene:ENSMUSG00000029561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// AF068835 // GenBank // Mus musculus 54 kDa oligoadenylate synthetase-like protein p540ASL mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// BC034361 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:6269 IMAGE:2646375), complete cds. // chr5 // 74 // 89 // 23 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114897665:114911367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0
XM_006530467 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2210016L21 gene (2210016L21Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114942158:114949783:1 gene:ENSMUSG00000029559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114945805:114947784:1 gene:ENSMUSG00000029559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000140090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114942231:114946217:1 gene:ENSMUSG00000029559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC031162 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2210016L21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:37433 IMAGE:4982352), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114942210:114946846:1 gene:ENSMUSG00000029559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000147743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114942204:114946880:1 gene:ENSMUSG00000029559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114942208:114947997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT054012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_029012 // RefSeq // Mus musculus signal peptide peptidase 3 (Sppl3), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115011137:115098790:1 gene:ENSMUSG00000029550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115094757:115098256:1 gene:ENSMUSG00000029550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC078437 // GenBank // Mus musculus signal peptide peptidase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5685712), complete cds. // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC086646 // GenBank // Mus musculus signal peptide peptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:100275 IMAGE:6817386), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:115072500:115097197:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_026504 // RefSeq // Mus musculus coenzyme Q5 homolog, methyltransferase (yeast) (Coq5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000040421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115279666:115296972:1 gene:ENSMUSG00000041733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000129024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115283648:115296309:1 gene:ENSMUSG00000041733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC052345 // GenBank // Mus musculus coenzyme Q5 homolog, methyltransferase (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:58137 IMAGE:6585618), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:115272183:115296261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_025573 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 9 (Srsf9), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_036616 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 9 (Srsf9), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031513 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115327177:115333080:1 gene:ENSMUSG00000029538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000142318 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115328640:115332650:1 gene:ENSMUSG00000029538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000144000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115327656:115333009:1 gene:ENSMUSG00000029538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000149510 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:115330578:115333009:1 gene:ENSMUSG00000029538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// BC012217 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine rich 9, mRNA (cDNA clone MGC:7233 IMAGE:3483731), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:115327309:115332719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_026933 // RefSeq // Mus musculus TP53 regulated inhibitor of apoptosis 1 (Triap1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031508 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115341225:115343569:1 gene:ENSMUSG00000029535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC030325 // GenBank // Mus musculus TP53 regulated inhibitor of apoptosis 1, mRNA (cDNA clone MGC:40935 IMAGE:5375395), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U61156 // GenBank // Mus musculus WF-1 mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_007475 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein, large, P0 (Rplp0), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000086519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115559467:115563727:1 gene:ENSMUSG00000067274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC003833 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:6264 IMAGE:3600590), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// BC087887 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:107165 IMAGE:6594755), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// BC089496 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:107166 IMAGE:30254142), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// BC099384 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:117525 IMAGE:30843295), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// BC011106 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:18649 IMAGE:3982438), complete cds. // chr5 // 73 // 69 // 8 // 11 // 0 /// BC011291 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:18924 IMAGE:3588342), complete cds. // chr5 // 73 // 69 // 8 // 11 // 0 /// ENSMUST00000156359 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:115559537:115562555:1 gene:ENSMUSG00000067274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// GENSCAN00000016679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:115559835:115563444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
NM_198163 // RefSeq // Mus musculus RAB35, member RAS oncogene family (Rab35), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006530500 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB35, member RAS oncogene family (Rab35), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115631929:115647736:1 gene:ENSMUSG00000029518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000138885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115632141:115646119:1 gene:ENSMUSG00000029518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AB232631 // GenBank // Mus musculus Rab35 mRNA for Rab35, complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC030941 // GenBank // Mus musculus RAB35, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:4923902). // chr5 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC056466 // GenBank // Mus musculus RAB35, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:67236 IMAGE:5717246), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:115632147:115645761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000036821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:116821454:116821886:1 gene:ENSMUSG00000041512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK019794 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930569F06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001033311 // RefSeq // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 10 (Vsig10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086464 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:117319292:117353111:1 gene:ENSMUSG00000066894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111967 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:117319266:117355005:1 gene:ENSMUSG00000066894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147182 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:117323646:117354997:1 gene:ENSMUSG00000066894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140339 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430210E20 product:hypothetical Immunoglobulin-like/Immunoglobulin C-2 type/Immunoglobulin subtype/Glutamic acid-rich region profile/Ig-like domain profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:117319443:117377552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033311 // RefSeq // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 10 (Vsig10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000086464 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:117319292:117353111:1 gene:ENSMUSG00000066894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111967 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:117319266:117355005:1 gene:ENSMUSG00000066894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000147182 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:117323646:117354997:1 gene:ENSMUSG00000066894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK140339 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430210E20 product:hypothetical Immunoglobulin-like/Immunoglobulin C-2 type/Immunoglobulin subtype/Glutamic acid-rich region profile/Ig-like domain profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:117319443:117377552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033311 // RefSeq // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 10 (Vsig10), mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000111967 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:117319266:117355005:1 gene:ENSMUSG00000066894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000139026 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:117349910:117355005:1 gene:ENSMUSG00000066894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000147182 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:117323646:117354997:1 gene:ENSMUSG00000066894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK140339 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430210E20 product:hypothetical Immunoglobulin-like/Immunoglobulin C-2 type/Immunoglobulin subtype/Glutamic acid-rich region profile/Ig-like domain profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC023744 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC023744, mRNA (cDNA clone IMAGE:5353663), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000086464 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:117319292:117353111:1 gene:ENSMUSG00000066894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000052110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:117319443:117377552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_021539 // RefSeq // Mus musculus WD repeat and SOCS box-containing 2 (Wsb2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000031309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:117357304:117378601:1 gene:ENSMUSG00000029364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC055100 // GenBank // Mus musculus WD repeat and SOCS box-containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:58219 IMAGE:6589250), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF072881 // GenBank // Mus musculus SOCS box-containing WD protein SWiP-2 (Swip2) mRNA, complete cds. // chr5 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1 /// ENSMUST00000111959 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:117363522:117377807:1 gene:ENSMUSG00000029364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// AF033188 // GenBank // Mus musculus WSB-2 mRNA, complete cds. // chr5 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// AK136416 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030014K01 product:WD repeat and SOCS box-containing 2, full insert sequence. // chr5 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// GENSCAN00000052110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:117319443:117377552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1
NM_001114545 // RefSeq // Mus musculus kinase suppressor of ras 2 (Ksr2), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 50 // 50 // 0 /// ENSMUST00000073347 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:117414000:117555942:1 gene:ENSMUSG00000061578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 46 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180430 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:117414000:117775003:1 gene:ENSMUSG00000061578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 50 // 50 // 0 /// BC150883 // GenBank // Mus musculus kinase suppressor of ras 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:9087794), complete cds. // chr5 // 96 // 46 // 24 // 25 // 0 /// BC150890 // GenBank // Mus musculus kinase suppressor of ras 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:9087801), complete cds. // chr5 // 96 // 46 // 24 // 25 // 0 /// DQ531035 // GenBank // Mus musculus kinase suppressor of ras 2 (Ksr2) mRNA, complete cds. // chr5 // 98 // 83 // 44 // 45 // 0 /// XM_006530394 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinase suppressor of ras 2 (Ksr2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 54 // 54 // 29 // 54 // 1 /// GENSCAN00000052103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:117684712:117781408:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:117414009:117507220:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 17 // 54 // 1
NM_008712 // RefSeq // Mus musculus nitric oxide synthase 1, neuronal (Nos1), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000086451 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:117842186:117954364:1 gene:ENSMUSG00000029361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000102557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:117867114:117953909:1 gene:ENSMUSG00000029361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000142742 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:117841850:117958840:1 gene:ENSMUSG00000029361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000171055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:117867119:117953813:1 gene:ENSMUSG00000029361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC066101 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30533636, containing frame-shift errors. // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// D14552 // GenBank // Mus musculus domesticus mRNA for nitric oxide synthase, complete cds. // chr5 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:117893040:118061679:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1
NM_145564 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 21 (Fbxo21), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000035579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:117976770:118010191:1 gene:ENSMUSG00000032898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC021871 // GenBank // Mus musculus F-box protein 21, mRNA (cDNA clone MGC:28066 IMAGE:3709413), complete cds. // chr5 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:117893040:118061679:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
ENSMUST00000031305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:118065360:118069710:1 gene:ENSMUSG00000029360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015338 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930438M06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0
NM_007545 // RefSeq // Mus musculus harakiri, BCL2 interacting protein (contains only BH3 domain) (Hrk), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:118169748:118189478:1 gene:ENSMUSG00000046607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D83698 // GenBank // Mus musculus DP5 mRNA for neuronal death protein, complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000184679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:118164648:118184828:1 gene:ENSMUSG00000046607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001081236 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2410131K14 gene (2410131K14Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:118245227:118266093:1 gene:ENSMUSG00000032840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK010791 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410131K14 product:CDNA: FLJ21415 FIS, CLONE COL04030 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC104372 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410131K14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:129458 IMAGE:40049898), complete cds. // chr5 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// BC104373 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410131K14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:129459 IMAGE:40049899), complete cds. // chr5 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:118245348:118261183:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000119191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:118502840:118503317:1 gene:ENSMUSG00000082365 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT054178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:118490497:118519082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_172424 // RefSeq // Mus musculus mediator complex subunit 13-like (Med13l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000100816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:118560719:118765435:1 gene:ENSMUSG00000018076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY338464 // GenBank // Mus musculus thyroid hormone receptor-associated protein complex 240 kDa component-like mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC040283 // GenBank HTC // Mus musculus mediator complex subunit 13-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4953676), with apparent retained intron. // chr5 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// BC049985 // GenBank HTC // Mus musculus mediator complex subunit 13-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:5369287), with apparent retained intron. // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:118715879:118762833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_011535 // RefSeq // Mus musculus T-box 3 (Tbx3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NM_198052 // RefSeq // Mus musculus T-box 3 (Tbx3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000018748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:119671018:119684724:1 gene:ENSMUSG00000018604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000079719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:119670669:119684561:1 gene:ENSMUSG00000018604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000121021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:119670862:119684724:1 gene:ENSMUSG00000018604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000145647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:119675445:119680630:1 gene:ENSMUSG00000018604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// BC096551 // GenBank // Mus musculus T-box 3, mRNA (cDNA clone MGC:106457 IMAGE:30547736), complete cds. // chr5 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// AK031708 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030495B01 product:T-box 3, full insert sequence. // chr5 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// GENSCAN00000002513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:119672058:119688874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 51 // 17 // 18 // 0
NM_011537 // RefSeq // Mus musculus T-box 5 (Tbx5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006530278 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T-box 5 (Tbx5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006530280 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T-box 5 (Tbx5), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006530281 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T-box 5 (Tbx5), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006530282 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T-box 5 (Tbx5), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000018407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:119834663:119885218:1 gene:ENSMUSG00000018263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF140427 // GenBank // Mus musculus t-box transcription factor (Tbx5) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC090639 // GenBank // Mus musculus T-box 5, mRNA (cDNA clone MGC:115922 IMAGE:30548234), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:119827279:119862078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
ENSMUST00000082683 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:120064335:120064443:1 gene:ENSMUSG00000064617 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028762 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 19 (Rbm19), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:120116510:120197979:1 gene:ENSMUSG00000029594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC025619 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 19, mRNA (cDNA clone MGC:36403 IMAGE:5320947), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034010 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 19, mRNA (cDNA clone MGC:18721 IMAGE:4225239), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120113782:120145922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_008499 // RefSeq // Mus musculus LIM homeobox protein 5 (Lhx5), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120431770:120441223:1 gene:ENSMUSG00000029595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC057585 // GenBank // Mus musculus LIM homeobox protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:67105 IMAGE:6414270), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U61155 // GenBank // Mus musculus LIM/homeodomain protein (Lhx5) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120431805:120452158:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_145565 // RefSeq // Mus musculus serine dehydratase (Sds), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006530298 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine dehydratase (Sds), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000066540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120476531:120483932:1 gene:ENSMUSG00000029597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120480363:120480888:1 gene:ENSMUSG00000029597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC021605 // GenBank // Mus musculus serine dehydratase, mRNA (cDNA clone MGC:37795 IMAGE:5097741), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC021950 // GenBank // Mus musculus serine dehydratase, mRNA (cDNA clone MGC:37901 IMAGE:5102037), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000111898 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120478886:120480687:1 gene:ENSMUSG00000029597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120479081:120483778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// NONMMUT054249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0
NM_001177594 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 8 (sodium/lithium/calcium exchanger), member B1 (Slc8b1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_001177595 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 8 (sodium/lithium/calcium exchanger), member B1 (Slc8b1), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_133221 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 8 (sodium/lithium/calcium exchanger), member B1 (Slc8b1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000068326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120511168:120534024:1 gene:ENSMUSG00000032754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000076051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120511252:120534020:1 gene:ENSMUSG00000032754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111889 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120513143:120533057:1 gene:ENSMUSG00000032754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111890 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120511235:120534019:1 gene:ENSMUSG00000032754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF261233 // GenBank // Mus musculus sodium/calcium exchanger protein mRNA, complete cds. // chr5 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// BC043689 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:49300 IMAGE:5137181), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120513177:120530449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_029408 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing D (Iqcd), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000069259 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120589016:120607114:1 gene:ENSMUSG00000029601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000094391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120589023:120607113:1 gene:ENSMUSG00000029601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125429 // GenBank // Mus musculus IQ motif containing D, mRNA (cDNA clone MGC:159132 IMAGE:40129944), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC137644 // GenBank // Mus musculus IQ motif containing D, mRNA (cDNA clone MGC:169268 IMAGE:8860663), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120599984:120606985:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_028041 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54 (Ddx54), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000031598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:120613130:120628590:1 gene:ENSMUSG00000029599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AF319547 // GenBank // Mus musculus ATP-dependent RNA-helicase (Ddx) mRNA, Ddx-RV allele, complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC043699 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54, mRNA (cDNA clone MGC:49350 IMAGE:5344158), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC062920 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54, mRNA (cDNA clone IMAGE:6833349), partial cds. // chr5 // 91 // 91 // 40 // 44 // 1 /// GENSCAN00000016488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120609950:120627292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0
NM_001281999 // RefSeq // Mus musculus RAS protein activator like 1 (GAP1 like) (Rasal1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// NM_013832 // RefSeq // Mus musculus RAS protein activator like 1 (GAP1 like) (Rasal1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006530208 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS protein activator like 1 (GAP1 like) (Rasal1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// XM_006530213 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS protein activator like 1 (GAP1 like) (Rasal1), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000031606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120648822:120679597:1 gene:ENSMUSG00000029602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000156722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120649188:120679597:1 gene:ENSMUSG00000029602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// AF086714 // GenBank // Mus musculus rasGAP-activating-like protein mRNA, complete cds. // chr5 // 98 // 93 // 41 // 42 // 0 /// BC005418 // GenBank // Mus musculus RAS protein activator like 1 (GAP1 like), mRNA (cDNA clone MGC:5710 IMAGE:3488024), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006530211 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS protein activator like 1 (GAP1 like) (Rasal1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 49 // 49 // 22 // 45 // 1 /// GENSCAN00000016497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120649470:120679028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0
NM_145153 // RefSeq // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1F (Oas1f), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120847367:120857986:1 gene:ENSMUSG00000053765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123431 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120848372:120857862:1 gene:ENSMUSG00000053765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// AF481733 // GenBank // Mus musculus 2-5olygoadenylate synthetase 1F (Oas1f) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116433 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1F, mRNA (cDNA clone MGC:144639 IMAGE:40104472), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC116434 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1F, mRNA (cDNA clone MGC:144640 IMAGE:40104473), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120812701:120859619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001159934 // RefSeq // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1H (Oas1h), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// NM_145228 // RefSeq // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1H (Oas1h), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000072476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120861421:120873512:1 gene:ENSMUSG00000001168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000171820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:120861422:120873503:1 gene:ENSMUSG00000001168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// AB067530 // GenBank // Mus musculus oasl6 mRNA for 2,5-oligoadenylate synthetase-like 6, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006530327 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1H (Oas1h), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// GENSCAN00000016485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120861454:120867180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000046001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120870919:120872946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
NM_133893 // RefSeq // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1D (Oas1d), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000044224 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120914536:120921652:1 gene:ENSMUSG00000032623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AB067532 // GenBank // Mus musculus oasl8 mRNA for 2,5-oligoadenylate synthetase-like 8, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AY055829 // GenBank // Mus musculus 2-5olygoadenylate synthetase 1D (Oas1d) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC052835 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1D, mRNA (cDNA clone MGC:60744 IMAGE:30048758), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120914884:120921065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000082907 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:121205010:121205143:1 gene:ENSMUSG00000064841 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK141707 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030035O16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONMMUT054275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_181421 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15800 (Gm15800), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000042614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:121220219:121368573:1 gene:ENSMUSG00000042744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000119892 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:121220219:121368577:1 gene:ENSMUSG00000042744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128514 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:121286833:121305034:1 gene:ENSMUSG00000042744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000148368 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:121291273:121299449:1 gene:ENSMUSG00000042744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AK137099 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430075C07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:121220472:121366605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_181421 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15800 (Gm15800), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:121220219:121368573:1 gene:ENSMUSG00000042744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100769 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:121305730:121324823:1 gene:ENSMUSG00000042744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000119892 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:121220219:121368577:1 gene:ENSMUSG00000042744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC072559 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AU042671, mRNA (cDNA clone IMAGE:5685802), partial cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:121220472:121366605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_181421 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15800 (Gm15800), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000042614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:121220219:121368573:1 gene:ENSMUSG00000042744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000119892 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:121220219:121368577:1 gene:ENSMUSG00000042744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC051044 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AU042671, mRNA (cDNA clone IMAGE:3985812), complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:121220472:121366605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1
NM_001289543 // RefSeq // Mus musculus BRCA1 associated protein (Brap), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NM_001289544 // RefSeq // Mus musculus BRCA1 associated protein (Brap), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NM_028227 // RefSeq // Mus musculus BRCA1 associated protein (Brap), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:121660563:121687248:1 gene:ENSMUSG00000029458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000111765 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:121660869:121687245:1 gene:ENSMUSG00000029458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127703 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:121666526:121687248:1 gene:ENSMUSG00000029458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000140996 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:121660574:121687243:1 gene:ENSMUSG00000029458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AF321920 // GenBank // Mus musculus BRAP2 variant 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AF321921 // GenBank // Mus musculus BRAP2 variant 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC038490 // GenBank // Mus musculus BRCA1 associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:47099 IMAGE:3599718), complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:121656155:121814445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_175474 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 109, member A (Fam109a), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:121849028:121854599:1 gene:ENSMUSG00000044134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC120681 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 109, member A, mRNA (cDNA clone MGC:155918 IMAGE:40129604), complete cds. // chr5 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC120683 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 109, member A, mRNA (cDNA clone MGC:155920 IMAGE:40129606), complete cds. // chr5 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC095929 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A230106M15 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:2649239). // chr5 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONMMUT054321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0
NM_001042489 // RefSeq // Mus musculus hydrogen voltage-gated channel 1 (Hvcn1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_028752 // RefSeq // Mus musculus hydrogen voltage-gated channel 1 (Hvcn1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006530471 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hydrogen voltage-gated channel 1 (Hvcn1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// XM_006530473 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hydrogen voltage-gated channel 1 (Hvcn1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000072602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:122209729:122242297:1 gene:ENSMUSG00000064267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000100747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:122210134:122242297:1 gene:ENSMUSG00000064267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC021548 // GenBank // Mus musculus hydrogen voltage-gated channel 1, mRNA (cDNA clone MGC:27682 IMAGE:4913027), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000143560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:122209909:122238510:1 gene:ENSMUSG00000064267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// ENSMUST00000145854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:122206804:122233540:1 gene:ENSMUSG00000064267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000042945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:122219910:122240672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_177242 // RefSeq // Mus musculus PTC7 protein phosphatase homolog (S. cerevisiae) (Pptc7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530384 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PTC7 protein phosphatase homolog (S. cerevisiae) (Pptc7), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000053426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:122284365:122324281:1 gene:ENSMUSG00000038582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119015 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:122295772:122322340:1 gene:ENSMUSG00000038582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK162261 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420488I19 product:T-cell activation protein phosphatase 2C homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC068149 // GenBank // Mus musculus PTC7 protein phosphatase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93006 IMAGE:30537082), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:122284669:122320874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_019805 // RefSeq // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 7 (Anapc7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000031422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:122422444:122444912:1 gene:ENSMUSG00000029466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000122010 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:122421693:122444912:1 gene:ENSMUSG00000029466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF076607 // GenBank // Mus musculus prediabetic NOD sera-reactive autoantigen mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 97 // 29 // 33 // 0 /// BC006635 // GenBank // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 7, mRNA (cDNA clone MGC:7204 IMAGE:3482261), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000119792 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:122422481:122443434:1 gene:ENSMUSG00000029466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// AK049968 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630034H22 product:anaphase-promoting complex subunit 7, full insert sequence. // chr5 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// GENSCAN00000042938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:122372609:122443993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_030564 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 34 (Rnf34), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:122850188:122868945:1 gene:ENSMUSG00000029474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF434815 // GenBank // Mus musculus phafin 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC004042 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 34, mRNA (cDNA clone MGC:7670 IMAGE:3496314), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK166565 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I0C0028L11 product:ring finger protein 34, full insert sequence. // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:122866802:122868227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NR_045820 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A930024E05 gene (A930024E05Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000148466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:122989354:122998345:1 gene:ENSMUSG00000056735 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT054385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT054384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONMMUT054386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_175423 // RefSeq // Mus musculus ORAI calcium release-activated calcium modulator 1 (Orai1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530116 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ORAI calcium release-activated calcium modulator 1 (Orai1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000051016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:123015074:123030156:1 gene:ENSMUSG00000049686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000121652 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:123015074:123030450:1 gene:ENSMUSG00000049686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB271214 // GenBank // Mus musculus Orai1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC023149 // GenBank // Mus musculus ORAI calcium release-activated calcium modulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:28390 IMAGE:4022503), complete cds. // chr5 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:122992723:123029680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
XR_402946 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6444 (Gm6444), misc_RNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123066242:123066699:1 gene:ENSMUSG00000080836 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_019435 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 11 (Ndufb11), mRNA. // chr5 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSMUST00000116621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:20615326:20617619:-1 gene:ENSMUSG00000031059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// BC027265 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 11, mRNA (cDNA clone MGC:27951 IMAGE:3589704), complete cds. // chr5 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// BC096047 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:1515391), partial cds. // chr5 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123066296:123066616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000019764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:20615419:20617960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
AK016534 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932422M17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001040398 // RefSeq // Mus musculus SET domain containing 1B (Setd1b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:123142957:123167410:1 gene:ENSMUSG00000038384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100731 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123142193:123149981:1 gene:ENSMUSG00000038384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123142193:123167435:1 gene:ENSMUSG00000038384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123142193:123167410:1 gene:ENSMUSG00000038384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141316 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430027B02 product:hypothetical RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)/Proline-rich region profile/Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile/Alanine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123142957:123166006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001040398 // RefSeq // Mus musculus SET domain containing 1B (Setd1b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000056053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:123142957:123167410:1 gene:ENSMUSG00000038384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000163030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123142193:123167435:1 gene:ENSMUSG00000038384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000174836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123142193:123167410:1 gene:ENSMUSG00000038384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000173221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123162709:123165162:1 gene:ENSMUSG00000038384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// AK140234 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230362P03 product:weakly similar to Mll protein (Fragment) [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000017533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123142957:123166006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
NM_026000 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 9 (Psmd9), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000100729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:123228190:123250131:1 gene:ENSMUSG00000029440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC051930 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 9, mRNA (cDNA clone MGC:62172 IMAGE:6403128), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC060245 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:66876 IMAGE:6819088, complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000133386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123228190:123245268:1 gene:ENSMUSG00000029440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// AK145487 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0004N19 product:proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 9, full insert sequence. // chr5 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000017527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123228307:123248498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_029850 // RefSeq // Mus musculus B cell CLL/lymphoma 7A (Bcl7a), mRNA. // chr5 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:123344448:123374082:1 gene:ENSMUSG00000029438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000120593 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:123343834:123374082:1 gene:ENSMUSG00000029438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// BC017640 // GenBank // Mus musculus B-cell CLL/lymphoma 7A, mRNA (cDNA clone MGC:28969 IMAGE:4482250), complete cds. // chr5 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// BC038481 // GenBank // Mus musculus B-cell CLL/lymphoma 7A, mRNA (cDNA clone MGC:47407 IMAGE:4501205), complete cds. // chr5 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// BC046777 // GenBank // Mus musculus B-cell CLL/lymphoma 7A, mRNA (cDNA clone MGC:61344 IMAGE:5709511), complete cds. // chr5 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117971 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123344500:123360278:1 gene:ENSMUSG00000029438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// AK157720 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130008D23 product:B-cell CLL/lymphoma 7A, full insert sequence. // chr5 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// GENSCAN00000017523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123322442:123395346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1
ENSMUST00000083257 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:123360832:123361000:1 gene:ENSMUSG00000065191 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONMMUT054431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
NM_133917 // RefSeq // Mus musculus MLX interacting protein (Mlxip), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// NM_177582 // RefSeq // Mus musculus MLX interacting protein (Mlxip), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 66 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000068237 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:123394800:123457932:1 gene:ENSMUSG00000038342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000111596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:123394798:123446896:1 gene:ENSMUSG00000038342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 66 // 31 // 31 // 0 /// AY968204 // GenBank // Mus musculus MondoA mRNA, complete cds. // chr5 // 98 // 87 // 40 // 41 // 0 /// BC137770 // GenBank // Mus musculus MLX interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:169394 IMAGE:8860789), complete cds. // chr5 // 100 // 57 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000135961 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123446039:123457929:1 gene:ENSMUSG00000038342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 32 // 32 // 15 // 47 // 1 /// GENSCAN00000017520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123437930:123453513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0
NM_001033461 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 43 (Lrrc43), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_001289821 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 43 (Lrrc43), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_001289822 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 43 (Lrrc43), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// ENSMUST00000094327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:123489325:123508205:1 gene:ENSMUSG00000063409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000121444 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:123489327:123508198:1 gene:ENSMUSG00000063409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC150919 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 43, mRNA (cDNA clone MGC:183830 IMAGE:9087830), complete cds. // chr5 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// GENSCAN00000017519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123489330:123504443:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
NM_198611 // RefSeq // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4 (B3gnt4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006530311 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4 (B3gnt4), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// XM_006530312 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4 (B3gnt4), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// XM_006530313 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4 (B3gnt4), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000031384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:123510460:123511882:1 gene:ENSMUSG00000029431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY037786 // GenBank // Mus musculus beta1,3 N-acetylglucosaminyltransferase-4 (B3gnt4) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC114987 // GenBank // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mRNA (cDNA clone MGC:141201 IMAGE:40056240), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC115755 // GenBank // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mRNA (cDNA clone MGC:141202 IMAGE:40056241), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000017524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123510574:123511626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
NM_001042421 // RefSeq // Mus musculus kinetochore associated 1 (Kntc1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// XM_006530250 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinetochore associated 1 (Kntc1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 56 // 56 // 0 /// ENSMUST00000031366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:123749726:123821593:1 gene:ENSMUSG00000029414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// GENSCAN00000017515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123753869:123823794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 48 // 48 // 0
NM_026603 // RefSeq // Mus musculus density-regulated protein (Denr), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:123907175:123928832:1 gene:ENSMUSG00000023106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC043922 // GenBank // Mus musculus density-regulated protein, mRNA (cDNA clone MGC:46763 IMAGE:5373203), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000166233 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123907489:123927133:1 gene:ENSMUSG00000023106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000021444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123897428:123927294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001134767 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 62 (Ccdc62), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006530256 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 62 (Ccdc62), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000094320 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:123930689:123968909:1 gene:ENSMUSG00000061882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000165148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:123930689:123969895:1 gene:ENSMUSG00000061882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000166129 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123927418:123938388:1 gene:ENSMUSG00000061882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000169898 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123946386:123954515:1 gene:ENSMUSG00000061882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// XM_006530265 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 62 (Ccdc62), transcript variant X11, mRNA. // chr5 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// XM_006530266 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 62 (Ccdc62), transcript variant X12, mRNA. // chr5 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// XM_006530263 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 62 (Ccdc62), transcript variant X9, mRNA. // chr5 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000021449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123930699:123966889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_145070 // RefSeq // Mus musculus huntingtin interacting protein 1 related (Hip1r), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000000939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:123973628:124003211:1 gene:ENSMUSG00000000915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF221713 // GenBank // Mus musculus huntingtin interacting protein 1 related mRNA, complete cds. // chr5 // 90 // 94 // 28 // 31 // 0 /// BC065101 // GenBank // Mus musculus huntingtin interacting protein 1 related, mRNA (cDNA clone MGC:86079 IMAGE:30535741), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123973763:124002165:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
NM_144509 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 6 interacting protein 4 (Arl6ip4), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:124116099:124118196:1 gene:ENSMUSG00000029404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122394 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:124116122:124118096:1 gene:ENSMUSG00000029404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000145667 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:124116679:124118034:1 gene:ENSMUSG00000029404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// AB035383 // GenBank // Mus musculus mRNA for SRp25 nuclear protein, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC063748 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 6 interacting protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:66735 IMAGE:6819350), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124093114:124119289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001134717 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2810006K23 gene (2810006K23Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NM_028310 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2810006K23 gene (2810006K23Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077376 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:124328098:124341844:1 gene:ENSMUSG00000047635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000111477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:124328089:124340122:1 gene:ENSMUSG00000047635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC046909 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810006K23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:57020 IMAGE:6466378), complete cds. // chr5 // 94 // 55 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000021435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124338759:124340872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0
NM_029532 // RefSeq // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein 35 (U11/U12) (Snrnp35), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006530494 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein 35 (U11/U12) (Snrnp35), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// XM_006530495 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein 35 (U11/U12) (Snrnp35), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000031349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:124483134:124491124:1 gene:ENSMUSG00000029402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000111453 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124483458:124491107:1 gene:ENSMUSG00000029402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// BC043031 // GenBank // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein 35 (U11/U12), mRNA (cDNA clone MGC:57912 IMAGE:5693273), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC058361 // GenBank // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein 35 (U11/U12), mRNA (cDNA clone MGC:66719 IMAGE:5693273), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK018232 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330548G22 product:hypothetical RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif) containing protein, full insert sequence. // chr5 // 72 // 78 // 13 // 18 // 0 /// GENSCAN00000021424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124490126:124490860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0
NM_181410 // RefSeq // Mus musculus general transcription factor IIH, polypeptide 3 (Gtf2h3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000031333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:124579140:124597680:1 gene:ENSMUSG00000029387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000126466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124579166:124592627:1 gene:ENSMUSG00000029387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000153436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124583847:124595596:1 gene:ENSMUSG00000029387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// BC017515 // GenBank // Mus musculus general transcription factor IIH, polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:27612 IMAGE:4504077), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000142746 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124590379:124596587:1 gene:ENSMUSG00000029387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1 /// AK017176 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5033417D07 product:GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR IIH, POLYPEPTIDE 3 (34KD SUBUNIT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// GENSCAN00000021432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124583964:124721803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1
NM_011596 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit A2 (Atp6v0a2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK032909 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720470P11 product:T-cell expressing clone j6, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC112905 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit A2, mRNA (cDNA clone MGC:118073 IMAGE:3670722), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_019536 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 10 (Dnah10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:124725085:124834308:1 gene:ENSMUSG00000038011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124725164:124834125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_019536 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 10 (Dnah10), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000058440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:124725085:124834308:1 gene:ENSMUSG00000038011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124725164:124834125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019536 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 10 (Dnah10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000058440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:124725085:124834308:1 gene:ENSMUSG00000038011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000141137 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:124731391:124834303:1 gene:ENSMUSG00000038011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124725164:124834125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0
NM_019536 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 10 (Dnah10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:124725085:124834308:1 gene:ENSMUSG00000038011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141137 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:124731391:124834303:1 gene:ENSMUSG00000038011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124725164:124834125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019536 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 10 (Dnah10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:124725085:124834308:1 gene:ENSMUSG00000038011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141137 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:124731391:124834303:1 gene:ENSMUSG00000038011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK147443 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain UNDEFINED_CELL_LINE cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1042K09 product:weakly similar to Gamma dynein heavy chain (Fragment) [Drosophila eugracilis], full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124725164:124834125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000141533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124862764:124902693:1 gene:ENSMUSG00000079215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK035022 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430074L14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001081750 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 664 (Zfp664), mRNA. // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000111417 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:124862691:124888630:1 gene:ENSMUSG00000079215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000130616 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124863039:124885307:1 gene:ENSMUSG00000079215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT054511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001081750 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 664 (Zfp664), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111417 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:124862691:124888630:1 gene:ENSMUSG00000079215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000134473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124884569:124888630:1 gene:ENSMUSG00000079215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC096550 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 664, mRNA (cDNA clone MGC:106717 IMAGE:30550168), complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONMMUT054515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK194040 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0114C02, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000060669, based on BLAT search. // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSMUST00000036109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:125003447:125012547:1 gene:ENSMUSG00000037962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC053444 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 101, member A, mRNA (cDNA clone MGC:59527 IMAGE:6336076), complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000145946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:125010113:125011492:1 gene:ENSMUSG00000037962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// GENSCAN00000008747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124991342:125011605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// NONMMUT054520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
ENSMUST00000100700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:125389322:125390554:1 gene:ENSMUSG00000072612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132914 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930513I04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029752 // RefSeq // Mus musculus Bri3 binding protein (Bri3bp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006504327 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Bri3 binding protein (Bri3bp), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000049040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:125441568:125460872:1 gene:ENSMUSG00000037905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC039941 // GenBank // Mus musculus Bri3 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:49542 IMAGE:4011957), complete cds. // chr5 // 89 // 67 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000008738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:125441662:125454753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_030210 // RefSeq // Mus musculus acetoacetyl-CoA synthetase (Aacs), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000031445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:125475814:125517412:1 gene:ENSMUSG00000029482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000144361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:125506149:125512737:1 gene:ENSMUSG00000029482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// AB054122 // GenBank // Mus musculus mRNA for acetoacetyl-CoA synthetase, complete cds. // chr5 // 84 // 95 // 31 // 37 // 0 /// AB056114 // GenBank // Mus musculus mRNA for acetoacetyl-coenzyme a synthetase, complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// BC026817 // GenBank // Mus musculus acetoacetyl-CoA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:28651 IMAGE:4235112), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000008737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:125467349:125516353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0
NM_001190352 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 132B (Tmem132b), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:125532387:125792583:1 gene:ENSMUSG00000070498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000184422 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:125622488:125698773:1 gene:ENSMUSG00000070498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:125608069:125675997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_001190352 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 132B (Tmem132b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:125532387:125792583:1 gene:ENSMUSG00000070498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:125749157:125788068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001190352 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 132B (Tmem132b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:125532387:125792583:1 gene:ENSMUSG00000070498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:125749157:125788068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_175432 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 132C (Tmem132c), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:127241808:127565793:1 gene:ENSMUSG00000034324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:127538260:127564866:1 gene:ENSMUSG00000034324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000132592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:127541626:127564866:1 gene:ENSMUSG00000034324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AK163356 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020022J18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:127529472:127564090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
XM_006504309 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycosyltransferase 1 domain containing 1 (Glt1d1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000134529 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:127657033:127689871:1 gene:ENSMUSG00000049971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 80 // 43 // 12 // 15 // 0 /// ENSMUST00000137157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:127632262:127691902:1 gene:ENSMUSG00000049971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// AK050379 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730041M17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NM_177005 // RefSeq // Mus musculus glycosyltransferase 1 domain containing 1 (Glt1d1), mRNA. // chr5 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1 /// ENSMUST00000118139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:127632262:127708754:1 gene:ENSMUSG00000049971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1 /// XM_006504310 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycosyltransferase 1 domain containing 1 (Glt1d1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// GENSCAN00000026876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:127632284:127707024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
NM_175284 // RefSeq // Mus musculus frizzled homolog 10 (Drosophila) (Fzd10), mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000117102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:128600844:128604093:1 gene:ENSMUSG00000081683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF310970 // GenBank // Mus musculus frizzled-10 like protein mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// AK052950 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930002J18 product:FRIZZLED 10 PRECURSOR (FRIZZLED-10) (FZ-10) (HFZ10) (FZE7) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AY509002 // GenBank // Mus musculus strain CD1 frizzled 10 (Fz10) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC117759 // GenBank // Mus musculus frizzled homolog 10 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:143562 IMAGE:40090826), complete cds. // chr5 // 73 // 45 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000004594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:128601218:128602966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0
NM_021311 // RefSeq // Mus musculus piwi-like RNA-mediated gene silencing 1 (Piwil1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000086056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:128736246:128755474:1 gene:ENSMUSG00000029423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AB032604 // GenBank // Mus musculus mRNA for MIWI, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AF438405 // GenBank // Mus musculus MIWI mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC066846 // GenBank // Mus musculus piwi-like homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:30476139), partial cds. // chr5 // 95 // 48 // 19 // 20 // 0 /// BC129857 // GenBank // Mus musculus piwi-like homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:150072 IMAGE:40109791), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// BC129858 // GenBank // Mus musculus piwi-like homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:150073 IMAGE:40109793), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// EF196092 // GenBank // Mus musculus MIWI mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000004561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:128739047:128754309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0
NM_009391 // RefSeq // Mus musculus RAN, member RAS oncogene family (Ran), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000031383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:129020069:129024323:1 gene:ENSMUSG00000029430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000111343 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:129020272:129024323:1 gene:ENSMUSG00000029430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// AF159256 // GenBank // Mus musculus Lps/Ran GTPase (lps(d)) mRNA, complete cds. // chr5 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// AK002436 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610009O11 product:RAN, member RAS oncogene family, full insert sequence. // chr5 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1 /// AK012268 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2700022F11 product:RAN, member RAS oncogene family, full insert sequence. // chr5 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// BC014829 // GenBank // Mus musculus RAN, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:18932 IMAGE:3968440), complete cds. // chr5 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1 /// BC083356 // GenBank // Mus musculus RAN, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:102166 IMAGE:6818977), complete cds. // chr5 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1 /// L32751 // GenBank // Mouse (clone M1) GTPase (Ran) mRNA, complete cds. // chr5 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_001081342 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 133 (Gpr133), mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000056617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:129096750:129204599:1 gene:ENSMUSG00000044017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// BC151161 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 133, mRNA (cDNA clone MGC:184061 IMAGE:9088050), complete cds. // chr5 // 96 // 98 // 43 // 45 // 0 /// BC157994 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 133, mRNA (cDNA clone MGC:189807 IMAGE:9007307), complete cds. // chr5 // 91 // 98 // 41 // 45 // 0 /// BC158001 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 133, mRNA (cDNA clone MGC:189810 IMAGE:9007310), complete cds. // chr5 // 96 // 98 // 43 // 45 // 0 /// GENSCAN00000043159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:129128823:129237823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 31 // 31 // 0
NM_172276 // RefSeq // Mus musculus splicing factor, suppressor of white-apricot homolog (Drosophila) (Sfswap), mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000053737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:129501231:129571383:1 gene:ENSMUSG00000029439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// AK170748 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630118G10 product:splicing factor, arginine/serine-rich 8, full insert sequence. // chr5 // 100 // 22 // 10 // 10 // 0 /// BC057314 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:6831144), partial cds. // chr5 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// BC058689 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 8, mRNA (cDNA clone MGC:65672 IMAGE:6807331), complete cds. // chr5 // 100 // 39 // 18 // 18 // 0 /// BC039967 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:4482716). // chr5 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// BC025219 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5006904, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr5 // 93 // 30 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000043170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:129481054:129574279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 35 // 46 // 1
NM_011846 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 17 (Mmp17), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031390 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:129584169:129608875:1 gene:ENSMUSG00000029436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB021224 // GenBank // Mus musculus mRNA for membrane-type-4 matrix metalloproteinase, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC051917 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 17, mRNA (cDNA clone MGC:62154 IMAGE:5716458), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000177802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:129596626:129602451:1 gene:ENSMUSG00000029436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000043156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:129584293:129608619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_008095 // RefSeq // Mus musculus glioblastoma amplified sequence (Gbas), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_377051 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glioblastoma amplified sequence (Gbas), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XR_377054 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glioblastoma amplified sequence (Gbas), transcript variant X5, misc_RNA. // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000086046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:129725063:129758327:1 gene:ENSMUSG00000029432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC055893 // GenBank // Mus musculus glioblastoma amplified sequence, mRNA (cDNA clone MGC:68220 IMAGE:4023066), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000124342 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:129725099:129758250:1 gene:ENSMUSG00000029432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// XM_006504279 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glioblastoma amplified sequence (Gbas), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000043152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:129725145:129757143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000186265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:129725099:129758250:1 gene:ENSMUSG00000029432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1
NM_009838 // RefSeq // Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 6a (zeta) (Cct6a), mRNA. // chrUn // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:129787439:129845820:1 gene:ENSMUSG00000029447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC018459 // GenBank // Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 6a (zeta), mRNA (cDNA clone MGC:11850 IMAGE:3597455), complete cds. // chrUn // 82 // 79 // 18 // 22 // 0 /// BC069917 // GenBank // Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 6a (zeta), mRNA (cDNA clone MGC:78183 IMAGE:6394714), complete cds. // chrUn // 85 // 96 // 23 // 27 // 0 /// BC094352 // GenBank // Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 6a (zeta), mRNA (cDNA clone MGC:106678 IMAGE:6809215), complete cds. // chrUn // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:129787439:129845820:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000083370 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:129789539:129789673:1 gene:ENSMUSG00000065304 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT054659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000122826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:129852511:129862798:1 gene:ENSMUSG00000025538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000128722 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:129852874:129864050:1 gene:ENSMUSG00000025538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000137357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:129852874:129863432:1 gene:ENSMUSG00000025538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000153063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:129852511:129862798:1 gene:ENSMUSG00000025538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC119480 // GenBank // Mus musculus sulfatase modifying factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:141062 IMAGE:40050522), complete cds. // chr5 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// NM_026445 // RefSeq // Mus musculus sulfatase modifying factor 2 (Sumf2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// ENSMUST00000171300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:129846990:129863951:1 gene:ENSMUSG00000025538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// GENSCAN00000043154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:129847023:129858391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_183088 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, BED-type containing 5 (Zbed5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000041466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:129895723:129903623:1 gene:ENSMUSG00000034173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC137610 // GenBank // Mus musculus SCAN domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:169234 IMAGE:8860629), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_026916 // RefSeq // Mus musculus nuclear protein transcriptional regulator 1 like (Nupr1l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006504493 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear protein transcriptional regulator 1 like (Nupr1l), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AK016320 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930579G22 product:RIKEN cDNA 4930579G22 gene, full insert sequence. // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC100444 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930579G22 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30919544). // chr5 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000178355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:129908568:129910396:1 gene:ENSMUSG00000095789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// AK135384 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo female mullerian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6820411H02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_007761 // RefSeq // Mus musculus calcitonin gene-related peptide-receptor component protein (Crcp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:130029290:130060789:1 gene:ENSMUSG00000025532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156729 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:130029343:130059932:1 gene:ENSMUSG00000025532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// AF028242 // GenBank // Mus musculus CGRP-receptor component protein mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF118271 // GenBank // Mus musculus calcitonin gene-related peptide receptor component protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012676 // GenBank // Mus musculus calcitonin gene-related peptide-receptor component protein, mRNA (cDNA clone MGC:13877 IMAGE:3989860), complete cds. // chr5 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:130029281:130059854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001130476 // RefSeq // Mus musculus protein-tyrosine sulfotransferase 1 (Tpst1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_013837 // RefSeq // Mus musculus protein-tyrosine sulfotransferase 1 (Tpst1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:130079370:130135729:1 gene:ENSMUSG00000034118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000118993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:130073326:130135729:1 gene:ENSMUSG00000034118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF038008 // GenBank // Mus musculus tyrosylprotein sulfotransferase-1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012666 // GenBank // Mus musculus protein-tyrosine sulfotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:13837 IMAGE:4035106), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// CT010202 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F1150D for gene Tpst1, RIKEN cDNA 2210412B16 gene; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000003281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:130101691:130131140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_172509 // RefSeq // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 7 (Kctd7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040616 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:130144861:130155806:1 gene:ENSMUSG00000034110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144467 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:130145104:130152494:1 gene:ENSMUSG00000034110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000144878 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:130144924:130148170:1 gene:ENSMUSG00000034110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC139070 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:170697 IMAGE:8862092), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC141201 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:176162 IMAGE:9055813), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT054678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000003289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:130145083:130241298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001081394 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 248 (Tmem248), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_027854 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 248 (Tmem248), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:130219744:130243765:1 gene:ENSMUSG00000053094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000111298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:130222335:130243765:1 gene:ENSMUSG00000053094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC033455 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610007L01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28353 IMAGE:4018584), complete cds. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:130145083:130241298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_021371 // RefSeq // Mus musculus calneuron 1 (Caln1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:130448012:130840636:1 gene:ENSMUSG00000060371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000111288 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:130448801:130840645:1 gene:ENSMUSG00000060371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AK081011 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930036H09 product:calneuron 1, full insert sequence. // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC057129 // GenBank // Mus musculus calneuron 1, mRNA (cDNA clone MGC:63247 IMAGE:6811387), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC058963 // GenBank // Mus musculus calneuron 1, mRNA (cDNA clone MGC:66918 IMAGE:6811387), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NM_181045 // RefSeq // Mus musculus calneuron 1 (Caln1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000086029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:130369476:130840174:1 gene:ENSMUSG00000060371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// AF282251 // GenBank // Mus musculus calneuron 1 (Caln1) mRNA, complete cds. // chr5 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// XM_006504371 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calneuron 1 (Caln1), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// XM_006504374 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calneuron 1 (Caln1), transcript variant X9, mRNA. // chr5 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NM_030719 // RefSeq // Mus musculus GATS protein-like 2 (Gatsl2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000016088 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:134099711:134144343:1 gene:ENSMUSG00000015944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:134134958:134137546:1 gene:ENSMUSG00000015944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC094613 // GenBank // Mus musculus opposite strand transcription unit to Stag3, mRNA (cDNA clone MGC:106455 IMAGE:6856325), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:134119534:134144125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENSMUST00000016088 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:134099711:134144343:1 gene:ENSMUSG00000015944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026208 // GenBank // Mus musculus opposite strand transcription unit to Stag3, mRNA (cDNA clone IMAGE:1344619). // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079672 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30532862. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT054758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT054759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
AK053742 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130306E15 product:hypothetical Manganese-dependent inorganic pyrophosphatase structure containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000122780 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:134204469:134204756:1 gene:ENSMUSG00000084729 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONMMUT054764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
ENSMUST00000102365 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:134448574:134448672:1 gene:ENSMUSG00000076320 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT054780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_020022 // RefSeq // Mus musculus replication factor C (activator 1) 2 (Rfc2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:134582690:134598328:1 gene:ENSMUSG00000023104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC004812 // GenBank // Mus musculus replication factor C (activator 1) 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3588300), partial cds. // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC023028 // GenBank // Mus musculus replication factor C (activator 1) 2, mRNA (cDNA clone MGC:35852 IMAGE:5374851), complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC099370 // GenBank // Mus musculus replication factor C (activator 1) 2, mRNA (cDNA clone MGC:117486 IMAGE:30937690), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:134582630:134597959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
XR_403005 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10369 (Gm10369), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100641 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:134676490:134680145:1 gene:ENSMUSG00000072573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK142429 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530003P12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009902 // RefSeq // Mus musculus claudin 3 (Cldn3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000094245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:134986214:134987472:1 gene:ENSMUSG00000070473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF087821 // GenBank // Mus musculus claudin-3 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AF095905 // GenBank // Mus musculus CPETR2 (Cpetr2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK006514 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700029O03 product:claudin 3, full insert sequence. // chr5 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC012650 // GenBank // Mus musculus claudin 3, mRNA (cDNA clone MGC:13769 IMAGE:4217040), complete cds. // chr5 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000043591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:134986445:134987104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NM_025362 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 30 (Dnajc30), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000071263 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135064202:135065862:1 gene:ENSMUSG00000061118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF412026 // GenBank // Mus musculus Williams-Beuren syndrome critical region protein 18 (Wbscr18) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC039656 // GenBank // Mus musculus Williams-Beuren syndrome chromosome region 18 homolog (human), mRNA (cDNA clone IMAGE:5148191), partial cds. // chr5 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// BC060999 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 30, mRNA (cDNA clone MGC:74098 IMAGE:30312175), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_013763 // RefSeq // Mus musculus transducin (beta)-like 2 (Tbl2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000005508 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135149686:135159821:1 gene:ENSMUSG00000005374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000139565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135149686:135157583:1 gene:ENSMUSG00000005374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000152013 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:135152718:135157621:1 gene:ENSMUSG00000005374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000153183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135149657:135163873:1 gene:ENSMUSG00000005374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF097523 // GenBank // Mus musculus transducin beta-like 2 (Tbl2) mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC039273 // GenBank // Mus musculus transducin (beta)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:35984 IMAGE:5051833), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC048185 // GenBank // Mus musculus transducin (beta)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:61173 IMAGE:6827496), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135149738:135159682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_009745 // RefSeq // Mus musculus B cell CLL/lymphoma 7B (Bcl7b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031692 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135168283:135181855:1 gene:ENSMUSG00000029681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000111188 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:135168412:135181831:1 gene:ENSMUSG00000029681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC011471 // GenBank // Mus musculus B-cell CLL/lymphoma 7B, mRNA (cDNA clone MGC:18340 IMAGE:3660754), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000111187 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135168389:135173448:1 gene:ENSMUSG00000029681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// ENSMUST00000145329 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135179582:135181125:1 gene:ENSMUSG00000029681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// AK160439 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810009C18 product:B-cell CLL/lymphoma 7B, full insert sequence. // chr5 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000043582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135168507:135245035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONMMUT054817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_011714 // RefSeq // Mus musculus bromodomain adjacent to zinc finger domain, 1B (Baz1b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000002825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135187264:135246129:1 gene:ENSMUSG00000002748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF084480 // GenBank // Mus musculus Williams-Beuren syndrome deletion transcript 9 homolog (Wbscr9) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// BC141399 // GenBank // Mus musculus bromodomain adjacent to zinc finger domain, 1B, mRNA (cDNA clone MGC:176361 IMAGE:9056012), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000043582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135168507:135245035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0
NM_178240 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 50 (Trim50), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135353296:135368005:1 gene:ENSMUSG00000053388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111180 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:135353295:135367654:1 gene:ENSMUSG00000053388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY081947 // GenBank // Mus musculus tripartite motif protein 50 (Trim50) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC130022 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 50, mRNA (cDNA clone MGC:161187 IMAGE:40140742), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135353296:135367654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146002 // RefSeq // Mus musculus rhomboid domain containing 2 (Rhbdd2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000043707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135632618:135646376:1 gene:ENSMUSG00000039917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000136748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135632654:135646448:1 gene:ENSMUSG00000039917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC018360 // GenBank // Mus musculus rhomboid domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:18730 IMAGE:3980676), complete cds. // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000084599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135636532:135644527:1 gene:ENSMUSG00000039917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// ENSMUST00000129134 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:135632723:135636545:1 gene:ENSMUSG00000039917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// AK161545 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330403E08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// BC053091 // GenBank HTC // Mus musculus rhomboid domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5709466), with apparent retained intron. // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000043584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135613022:135636373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONMMUT054834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_008617 // RefSeq // Mus musculus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (Mdh2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000019323 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135778480:135790391:1 gene:ENSMUSG00000019179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000138101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135778662:135790398:1 gene:ENSMUSG00000019179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC023482 // GenBank // Mus musculus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:31009 IMAGE:5251192), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M16229 // GenBank // Mouse mitochondrial malate dehydrogenase (mMDH) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000130795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135778677:135784614:1 gene:ENSMUSG00000019179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000043577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135778736:135840458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT054842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_013560 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 1 (Hspb1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000005077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135887919:135889563:1 gene:ENSMUSG00000004951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000109187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:45078498:45079127:-1 gene:ENSMUSG00000078915 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111155 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:135888018:135889561:1 gene:ENSMUSG00000004951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC018257 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:6141 IMAGE:3498180), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC099463 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:117667 IMAGE:30848584), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// U03560 // GenBank // Mus musculus heat shock protein HSP27 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0 /// U03561 // GenBank // Mus musculus heat shock protein HSP27 internal deletion variant b mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// U03562 // GenBank // Mus musculus heat shock protein HSP27 internal deletion variant c mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:45078498:45079127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135888059:135902507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1
NM_011776 // RefSeq // Mus musculus zona pellucida glycoprotein 3 (Zp3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000005073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135980099:135988624:1 gene:ENSMUSG00000004948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000131563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135980168:135987292:1 gene:ENSMUSG00000004948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// BC099465 // GenBank // Mus musculus zona pellucida glycoprotein 3, mRNA (cDNA clone MGC:117669 IMAGE:30939089), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC100745 // GenBank // Mus musculus zona pellucida glycoprotein 3, mRNA (cDNA clone MGC:124056 IMAGE:40045702), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC103583 // GenBank // Mus musculus zona pellucida glycoprotein 3, mRNA (cDNA clone MGC:124058 IMAGE:40045704), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC103584 // GenBank // Mus musculus zona pellucida glycoprotein 3, mRNA (cDNA clone MGC:124057 IMAGE:40045703), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC103585 // GenBank // Mus musculus zona pellucida glycoprotein 3, mRNA (cDNA clone MGC:124055 IMAGE:40045701), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M20026 // GenBank // Mouse zona pellucida sperm-binding protein ZP3 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135980134:136032487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_175309 // RefSeq // Mus musculus uroplakin 3B (Upk3b), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000062606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:136038496:136045303:1 gene:ENSMUSG00000042985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY233463 // GenBank // Mus musculus uroplakin IIIb mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// BC061224 // GenBank // Mus musculus uroplakin 3B, mRNA (cDNA clone IMAGE:30297822), partial cds. // chr5 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// BC120594 // GenBank // Mus musculus uroplakin 3B, mRNA (cDNA clone MGC:155831 IMAGE:40129517), complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC137742 // GenBank // Mus musculus uroplakin 3B, mRNA (cDNA clone MGC:169366 IMAGE:8860761), complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136038802:136044094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0
NM_011293 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide J (Polr2j), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:136116631:136122947:1 gene:ENSMUSG00000039771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111129 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:136116702:136122936:1 gene:ENSMUSG00000039771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC042939 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide J, mRNA (cDNA clone MGC:54637 IMAGE:6476299), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D85818 // GenBank // Mus musculus mRNA for RNA polymerase II subuunit RPB14, complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000111127 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:136116631:136122723:1 gene:ENSMUSG00000039771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000020262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136093066:136122777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_028070 // RefSeq // Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 4 (E. coli) (Alkbh4), mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504503 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 4 (E. coli) (Alkbh4), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000041100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:136136154:136141612:1 gene:ENSMUSG00000039754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000100568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:136138781:136141615:1 gene:ENSMUSG00000039754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:136136158:136140778:1 gene:ENSMUSG00000039754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000143229 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:136136202:136140503:1 gene:ENSMUSG00000039754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// AK008083 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010004B12 product:hypothetical 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC022729 // GenBank // Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 4 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:31580 IMAGE:4505097), complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136634 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:136136146:136140512:1 gene:ENSMUSG00000039754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001085387 // RefSeq // Mus musculus myosin, light chain 10, regulatory (Myl10), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_021611 // RefSeq // Mus musculus myosin, light chain 10, regulatory (Myl10), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000005611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:136693146:136701094:1 gene:ENSMUSG00000005474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// X65979 // GenBank // M.musculus PLRLC-A mRNA for myosin light chain 2 (partial). // chr5 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// X65981 // GenBank // Mus musculus PLRLC-C mRNA for myosin light chain 2. // chr5 // 86 // 97 // 24 // 28 // 0 /// AK006422 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700027I08 product:myosin light chain 2, precursor lymphocyte-specific, full insert sequence. // chr5 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000020252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136670610:136700953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONMMUT054881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_026073 // RefSeq // Mus musculus intraflagellar transport 22 (Ift22), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000008131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:136908150:136913244:1 gene:ENSMUSG00000007987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK160464 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010009N03 product:RAB, member of RAS oncogene family-like 5, full insert sequence. // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC009150 // GenBank // Mus musculus RAB, member of RAS oncogene family-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:6877 IMAGE:2651447), complete cds. // chr5 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136887790:136912973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_021719 // RefSeq // Mus musculus claudin 15 (Cldn15), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000001790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:136967869:136975844:1 gene:ENSMUSG00000001739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:136966616:136975858:1 gene:ENSMUSG00000001739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC023428 // GenBank // Mus musculus claudin 15, mRNA (cDNA clone MGC:30978 IMAGE:5250004), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:136973954:136975013:1 gene:ENSMUSG00000001739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136918653:136974916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
ENSMUST00000131667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:136997386:136999294:1 gene:ENSMUSG00000087244 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504540 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 2-acylglycerol O-acyltransferase 2-A-like (LOC102632711), mRNA. // chr5 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONMMUT054901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136997963:137032839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
ENSMUST00000182608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137002002:137005547:1 gene:ENSMUSG00000098131 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT054902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001039385 // RefSeq // Mus musculus VGF nerve growth factor inducible (Vgf), mRNA. // chr5 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504435 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus VGF nerve growth factor inducible (Vgf), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006504440 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus VGF nerve growth factor inducible (Vgf), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000041543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137030295:137033351:1 gene:ENSMUSG00000037428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC085134 // GenBank // Mus musculus VGF nerve growth factor inducible, mRNA (cDNA clone MGC:115754 IMAGE:6734388), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC138553 // GenBank // Mus musculus VGF nerve growth factor inducible, mRNA (cDNA clone MGC:170178 IMAGE:8861573), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// BC138554 // GenBank // Mus musculus VGF nerve growth factor inducible, mRNA (cDNA clone MGC:170179 IMAGE:8861574), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000186451 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137030364:137033028:1 gene:ENSMUSG00000037428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 56 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000190827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137026392:137033351:1 gene:ENSMUSG00000037428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136997963:137032839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT054905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001290010 // RefSeq // Mus musculus acetylcholinesterase (Ache), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_009599 // RefSeq // Mus musculus acetylcholinesterase (Ache), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504548 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acetylcholinesterase (Ache), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000024099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137288277:137294466:1 gene:ENSMUSG00000023328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085934 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137288284:137294460:1 gene:ENSMUSG00000023328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137288285:137292348:1 gene:ENSMUSG00000023328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AY389983 // GenBank // Mus musculus stress-associated acetylcholinesterase readthough variant AChE-R (Ache) mRNA, partial sequence. // chr5 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// BC046327 // GenBank // Mus musculus acetylcholinesterase, mRNA (cDNA clone MGC:54443 IMAGE:6468980), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU623420 // GenBank // Mus musculus acetylcholinesterase (Ache) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// XR_377142 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acetylcholinesterase (Ache), transcript variant X5, misc_RNA. // chr5 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137290034:137294238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_027356 // RefSeq // Mus musculus UFM1-specific peptidase 1 (Ufsp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137294629:137295665:1 gene:ENSMUSG00000051502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC016577 // GenBank // Mus musculus UFM1-specific peptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:27927 IMAGE:3584484), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087958 // GenBank // Mus musculus UFM1-specific peptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:107633 IMAGE:6751787), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137294499:137295443:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_031408 // RefSeq // Mus musculus GRB10 interacting GYF protein 1 (Gigyf1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000031727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137518880:137527934:1 gene:ENSMUSG00000029714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// AY176042 // GenBank // Mus musculus Grb10 interacting GYF protein 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 45 // 49 // 0 /// GENSCAN00000010354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137518368:137525704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0
NM_031404 // RefSeq // Mus musculus actin-like 6B (Actl6b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137553557:137569557:1 gene:ENSMUSG00000029712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000136088 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:137553517:137563204:1 gene:ENSMUSG00000029712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000136565 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:137553539:137565778:1 gene:ENSMUSG00000029712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000139395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137553520:137569582:1 gene:ENSMUSG00000029712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB075226 // GenBank // Mus musculus mRNA for actin-related protein mArpNalpha, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC049539 // GenBank // Mus musculus actin-like 6B, mRNA (cDNA clone MGC:58100 IMAGE:6534039), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK141089 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230047M17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000010399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137553635:137587104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// NONMMUT054929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001289507 // RefSeq // Mus musculus transferrin receptor 2 (Tfr2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// NM_001289509 // RefSeq // Mus musculus transferrin receptor 2 (Tfr2), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// NM_001289511 // RefSeq // Mus musculus transferrin receptor 2 (Tfr2), transcript variant 4, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// NM_015799 // RefSeq // Mus musculus transferrin receptor 2 (Tfr2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// XM_006504591 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transferrin receptor 2 (Tfr2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000031729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137569851:137587481:1 gene:ENSMUSG00000029716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// AF207741 // GenBank // Mus musculus transferrin receptor 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// AF222895 // GenBank // Mus musculus transferrin receptor 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 87 // 37 // 39 // 0 /// BC013654 // GenBank // Mus musculus transferrin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:18814 IMAGE:4196597), complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000010399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137553635:137587104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 29 // 45 // 1
XR_403023 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7285 (Gm7285), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000010363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137601593:137602176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 64 // 8 // 9 // 0
NM_027242 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 35 (Ppp1r35), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504615 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 35 (Ppp1r35), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006504616 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 35 (Ppp1r35), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000031739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137778904:137780110:1 gene:ENSMUSG00000029725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126126 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:137778849:137779762:1 gene:ENSMUSG00000029725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000152298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137779544:137780110:1 gene:ENSMUSG00000029725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC052497 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010007H12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:62925 IMAGE:1429227), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137778994:137780027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONMMUT054951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001005426 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CW type with PWWP domain 1 (Zcwpw1), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_006504584 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, CW type with PWWP domain 1 (Zcwpw1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006504585 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, CW type with PWWP domain 1 (Zcwpw1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000035852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137787798:137822621:1 gene:ENSMUSG00000037108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000128946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137799418:137811612:1 gene:ENSMUSG00000037108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000141642 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:137810829:137822321:1 gene:ENSMUSG00000037108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// BC071186 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CW type with PWWP domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:76794 IMAGE:30107853), complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137795521:137822467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
NM_013478 // RefSeq // Mus musculus alpha-2-glycoprotein 1, zinc (Azgp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000035390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137981521:137990233:1 gene:ENSMUSG00000037053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY248694 // GenBank // Mus musculus zinc-alpha-2-glycoprotein 1 (Azgp1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC061646 // GenBank // Mus musculus alpha-2-glycoprotein 1, zinc, mRNA (cDNA clone MGC:68029 IMAGE:5100216), complete cds. // chr5 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// D21059 // GenBank // Mus musculus mRNA for Zn-alpha2-glycoprotein, complete cds. // chr5 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137981560:137989881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
XM_006544856 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sperm motility kinase 3C (Smok3c), partial mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000110967 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:138053194:138066537:1 gene:ENSMUSG00000075598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000178402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:138064253:138065767:1 gene:ENSMUSG00000075598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000055776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138064313:138085105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0
NM_029869 // RefSeq // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 1 (Zkscan1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NM_133906 // RefSeq // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 1 (Zkscan1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000019660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:138085084:138107822:1 gene:ENSMUSG00000029729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000066617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:138085084:138107822:1 gene:ENSMUSG00000029729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138092640:138104491:1 gene:ENSMUSG00000029729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000110963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:138085120:138104492:1 gene:ENSMUSG00000029729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AK131148 // GenBank // Mus musculus mRNA for mFLJ00187 protein. // chr5 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// BC052441 // GenBank // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:63357 IMAGE:6406518), complete cds. // chr5 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138093010:138139209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_178612 // RefSeq // Mus musculus canopy 4 homolog (zebrafish) (Cnpy4), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000110934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:138187485:138193918:1 gene:ENSMUSG00000036968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK011474 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610019P18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 85 // 87 // 22 // 26 // 0 /// BC086647 // GenBank // Mus musculus canopy 4 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:113765 IMAGE:6818372), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC094672 // GenBank // Mus musculus canopy 4 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:102237 IMAGE:30633103), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000110932 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:138189917:138192597:1 gene:ENSMUSG00000036968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// ENSMUST00000130126 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138190112:138192151:1 gene:ENSMUSG00000036968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000055793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138187606:138192901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_177878 // RefSeq // Mus musculus metallo-beta-lactamase domain containing 1 (Mblac1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:138194314:138195621:1 gene:ENSMUSG00000049285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC038925 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC038925, mRNA (cDNA clone MGC:49416 IMAGE:5374241), complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138194398:138195180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_001081108 // RefSeq // Mus musculus late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4 (Lamtor4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062067 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:138255608:138259395:1 gene:ENSMUSG00000050552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138255831:138259398:1 gene:ENSMUSG00000050552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC144958 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0910001L09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178514 IMAGE:9053506), complete cds. // chr5 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138255801:138259137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT054971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_016964 // RefSeq // Mus musculus stromal antigen 3 (Stag3), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006504596 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus stromal antigen 3 (Stag3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000048028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:138280526:138312393:1 gene:ENSMUSG00000036928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000159483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138280526:138312390:1 gene:ENSMUSG00000036928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000161113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138280509:138312393:1 gene:ENSMUSG00000036928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000162245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138280544:138312393:1 gene:ENSMUSG00000036928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AK145898 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530012K17 product:stromal antigen 3, full insert sequence. // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC139010 // GenBank // Mus musculus stromal antigen 3, mRNA (cDNA clone MGC:170637 IMAGE:8862032), complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// BC139011 // GenBank // Mus musculus stromal antigen 3, mRNA (cDNA clone MGC:170638 IMAGE:8862033), complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000055788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138281968:138312044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
XM_006544021 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein PVRIG-like (LOC102640920), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000055775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138342008:138361736:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
ENSMUST00000100526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:138363719:138388287:1 gene:ENSMUSG00000075591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK133132 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930590L15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0
ENSMUST00000177701 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:138378591:138378697:1 gene:ENSMUSG00000093932 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT054985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_183025 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A430033K04 gene (A430033K04Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000069862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:138622859:138648903:1 gene:ENSMUSG00000056014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK039936 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430033K04 product:similar to MSZF59-1 (FRAGMENT) [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC055299 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A430033K04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:62828 IMAGE:6492709), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000032590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:138622859:138640823:1 gene:ENSMUSG00000056014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// AK009353 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310015D09 product:weakly similar to Zinc finger protein 248 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// AK131916 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310030I19 product:weakly similar to KRAB protein domain (Fragment) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// GENSCAN00000055777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138610739:138658911:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001195128 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5294 (Gm5294), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504717 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5294 (Gm5294), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:138820080:138821619:1 gene:ENSMUSG00000094504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138806176:138848012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000100518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:138995056:139000576:1 gene:ENSMUSG00000075585 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK147342 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1016E23 product:hypothetical Proline-rich region profile/Alanine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138995056:139000577:1 gene:ENSMUSG00000075585 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081265 // RefSeq // Mus musculus HEAT repeat containing 2 (Heatr2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000026975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:139150223:139186510:1 gene:ENSMUSG00000025857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC053401 // GenBank // Mus musculus HEAT repeat containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:30047784), complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC147492 // GenBank // Mus musculus HEAT repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:182395 IMAGE:9056289), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC158066 // GenBank // Mus musculus HEAT repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:189865 IMAGE:9007365), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139150247:139185646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001163316 // RefSeq // Mus musculus golgi to ER traffic protein 4 homolog (S. cerevisiae) (Get4), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NM_026269 // RefSeq // Mus musculus golgi to ER traffic protein 4 homolog (S. cerevisiae) (Get4), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// XR_377160 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus golgi to ER traffic protein 4 homolog (S. cerevisiae) (Get4), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000026976 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139252324:139270051:1 gene:ENSMUSG00000025858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000110878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139253511:139269329:1 gene:ENSMUSG00000025858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000130326 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:139252370:139267141:1 gene:ENSMUSG00000025858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000138508 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:139253497:139267234:1 gene:ENSMUSG00000025858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC019557 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110007L15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28477 IMAGE:4163641), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139252465:139269069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
NM_001160265 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily w, polypeptide 1 (Cyp2w1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006504719 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily w, polypeptide 1 (Cyp2w1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504721 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily w, polypeptide 1 (Cyp2w1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000031521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:139352617:139357033:1 gene:ENSMUSG00000029541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139352647:139357302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_033147 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D830046C22 gene (D830046C22Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:139378220:139379259:1 gene:ENSMUSG00000044197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000021206 // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC147358 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D830046C22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182532 IMAGE:9056426), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC147359 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D830046C22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182544 IMAGE:9056438), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000137254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139377742:139380054:1 gene:ENSMUSG00000044197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000188655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139377697:139380053:1 gene:ENSMUSG00000044197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001038703 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 146 (Gpr146), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_030258 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 146 (Gpr146), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000051293 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139380581:139396415:1 gene:ENSMUSG00000044197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000100514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139389785:139396414:1 gene:ENSMUSG00000044197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC003323 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 146, mRNA (cDNA clone MGC:7035 IMAGE:3156060), complete cds. // chr5 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_177000 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C130050O18 gene (C130050O18Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006504711 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C130050O18 gene (C130050O18Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000052176 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:139406387:139415618:1 gene:ENSMUSG00000044092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000163940 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:139405280:139415621:1 gene:ENSMUSG00000044092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC100320 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C130050O18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117558 IMAGE:30843170), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504708 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C130050O18 gene (C130050O18Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// ENSMUST00000164078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139406465:139415623:1 gene:ENSMUSG00000044092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// AK170398 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630102C16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// GENSCAN00000027941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139392445:139415264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_029771 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled estrogen receptor 1 (Gper1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006504757 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled estrogen receptor 1 (Gper1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000066211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139423151:139427800:1 gene:ENSMUSG00000053647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000173364 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:139423280:139425889:1 gene:ENSMUSG00000053647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 80 // 37 // 8 // 10 // 0 /// BC138598 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled estrogen receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:170223 IMAGE:8861618), complete cds. // chr5 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// BC138616 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled estrogen receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:170241 IMAGE:8861636), complete cds. // chr5 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139425902:139427029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT055029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 80 // 37 // 8 // 10 // 0
NM_013702 // RefSeq // Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504668 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UNC homeobox (Uncx), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000031523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:139543898:139548176:1 gene:ENSMUSG00000029546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139543494:139548179:1 gene:ENSMUSG00000029546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF247550 // GenBank // Mus musculus UNC4 protein mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC051973 // GenBank // Mus musculus UNC homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:62254 IMAGE:5718115), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174792 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:139543898:139545268:1 gene:ENSMUSG00000029546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK082472 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230053I05 product:Unc4.1 homeobox (C. elegans), full insert sequence. // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139543994:139547774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_010757 // RefSeq // Mus musculus v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene family, protein K (avian) (Mafk), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000018287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139791513:139802653:1 gene:ENSMUSG00000018143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139797514:139802331:1 gene:ENSMUSG00000018143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC014295 // GenBank // Mus musculus v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene family, protein K (avian), mRNA (cDNA clone MGC:14027 IMAGE:4189276), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D42124 // GenBank // Mus musculus mRNA for MafK, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U01036 // GenBank // Mus musculus erythroid transcription factor NF-E2 subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000151577 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139791534:139799500:1 gene:ENSMUSG00000018143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139798049:139800519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT055038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000082760 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:139844930:139845250:1 gene:ENSMUSG00000064694 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT055042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_175522 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III, extracellular 1 (Elfn1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504703 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III, extracellular 1 (Elfn1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000050519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:139907943:139974711:1 gene:ENSMUSG00000048988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC059029 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III, extracellular 1, mRNA (cDNA clone MGC:69764 IMAGE:6811341), complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_133916 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit B (Eif3b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000100507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:140419305:140443358:1 gene:ENSMUSG00000056076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC007175 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit B, mRNA (cDNA clone IMAGE:3493441), partial cds. // chr5 // 92 // 95 // 33 // 36 // 0 /// BC023767 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit B, mRNA (cDNA clone MGC:38325 IMAGE:5343631), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC031704 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit B, mRNA (cDNA clone MGC:25599 IMAGE:4023277), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC051065 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit B, mRNA (cDNA clone MGC:59168 IMAGE:5343631), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000043843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140419361:140494075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0
XM_006504777 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin-like protein KIF19-like (LOC101055939), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140419361:140494075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_021528 // RefSeq // Mus musculus carbohydrate sulfotransferase 12 (Chst12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000043050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:140505550:140525724:1 gene:ENSMUSG00000036599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:140505575:140524153:1 gene:ENSMUSG00000036599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC003201 // GenBank // Mus musculus carbohydrate sulfotransferase 12, mRNA (cDNA clone MGC:8034 IMAGE:3586766), complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140523620:140524879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_008494 // RefSeq // Mus musculus LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase (Lfng), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000031555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:140607341:140615543:1 gene:ENSMUSG00000029570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// AF015768 // GenBank // Mus musculus lunatic fringe (lunatic-fringe) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// BC115680 // GenBank // Mus musculus LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:144610 IMAGE:40104178), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// BC138600 // GenBank // Mus musculus LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:170225 IMAGE:8861620), complete cds. // chr5 // 97 // 85 // 32 // 33 // 0 /// BC138601 // GenBank // Mus musculus LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:170226 IMAGE:8861621), complete cds. // chr5 // 97 // 85 // 32 // 33 // 0 /// U94351 // GenBank // Mus musculus lunatic fringe precursor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140607416:140617091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0
AK051890 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230015O06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173405 // RefSeq // Mus musculus archaelysin family metallopeptidase 1 (Amz1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000060918 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:140724127:140753310:1 gene:ENSMUSG00000050022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120630 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:140735526:140754691:1 gene:ENSMUSG00000050022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK170176 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630025C11 product:Hypothetical neutral zinc metallopeptidases, full insert sequence. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC129841 // GenBank // Mus musculus archaelysin family metallopeptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:149994 IMAGE:40090727), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC129842 // GenBank // Mus musculus archaelysin family metallopeptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:149995 IMAGE:40090729), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140741284:140752495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_177879 // RefSeq // Mus musculus sidekick homolog 1 (chicken) (Sdk1), mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000074546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:141856787:142213194:1 gene:ENSMUSG00000039683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000085774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:141241490:142215586:1 gene:ENSMUSG00000039683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000145908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:141373654:141955329:1 gene:ENSMUSG00000039683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 19 // 9 // 9 // 0 /// AK030635 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330440E10 product:hypothetical Immunoglobulin and major histocompatibility complex domain/Immunoglobulin C-2 type/Immunoglobulin subtype containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 19 // 9 // 9 // 0 /// AY353236 // GenBank // Mus musculus sidekick 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// BC060237 // GenBank // Mus musculus sidekick homolog 1 (chicken), mRNA (cDNA clone IMAGE:6853259), partial cds. // chr5 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// BC138453 // GenBank // Mus musculus sidekick homolog 1 (chicken), mRNA (cDNA clone MGC:170078 IMAGE:8861473), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000009360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:142031528:142219682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:141919598:142008872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 26 // 26 // 12 // 47 // 1
ENSMUST00000182990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:142283106:142284069:1 gene:ENSMUSG00000097947 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT055102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_199068 // RefSeq // Mus musculus forkhead box K1 (Foxk1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000072837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:142401497:142462014:1 gene:ENSMUSG00000056493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L26507 // GenBank // Mouse myocyte nuclear factor (MNF) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// U95016 // GenBank // Mus musculus myocyte nuclear factor-beta (MNF-b) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000009381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:142401524:142477486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_172725 // RefSeq // Mus musculus adaptor-related protein complex 5, zeta 1 subunit (Ap5z1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000038699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:142463931:142478715:1 gene:ENSMUSG00000039623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099419 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C330006K01 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30848366), complete cds. // chr5 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// AK129135 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0415 protein. // chr5 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000009381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:142401524:142477486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1
NM_178398 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 (Wipi2), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006504751 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 (Wipi2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000036872 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:142629542:142670588:1 gene:ENSMUSG00000029578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000110778 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:142629593:142667487:1 gene:ENSMUSG00000029578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 82 // 31 // 32 // 0 /// BC044894 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2, mRNA (cDNA clone MGC:25928 IMAGE:4235237), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000153936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:142629591:142662709:1 gene:ENSMUSG00000029578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 54 // 54 // 21 // 39 // 1 /// AK043857 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830041P05 product:hypothetical TolB, C-terminal domain structure containing protein, full insert sequence. // chr5 // 44 // 44 // 17 // 39 // 1 /// GENSCAN00000009383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:142610757:142666972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 85 // 33 // 39 // 1
NM_146257 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 29 (nucleoside transporters), member 4 (Slc29a4), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006504706 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 29 (nucleoside transporters), member 4 (Slc29a4), transcript variant X1, mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000058418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:142702101:142722490:1 gene:ENSMUSG00000050822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC025599 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 29 (nucleoside transporters), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:38048 IMAGE:5250967), complete cds. // chrUn // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000009376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:142705367:142721490:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
NM_007984 // RefSeq // Mus musculus fascin homolog 1, actin bundling protein (Strongylocentrotus purpuratus) (Fscn1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:142960343:142973185:1 gene:ENSMUSG00000029581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135293 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:142970085:142971989:1 gene:ENSMUSG00000029581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000137552 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:142963250:142971953:1 gene:ENSMUSG00000029581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000139131 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:142964533:142970674:1 gene:ENSMUSG00000029581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000150622 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:142962953:142970552:1 gene:ENSMUSG00000029581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC052408 // GenBank // Mus musculus fascin homolog 1, actin bundling protein (Strongylocentrotus purpuratus), mRNA (cDNA clone MGC:63367 IMAGE:5716179), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L33726 // GenBank // Mus musculus fascin (Fscn1) mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000129306 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:142960843:142972170:1 gene:ENSMUSG00000029581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000028915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:142960449:142972098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_177880 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933411G11Rik gene (4933411G11Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006504716 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4933411G11Rik gene (4933411G11Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000031574 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:143181017:143205075:1 gene:ENSMUSG00000029586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000159781 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:143181484:143204416:1 gene:ENSMUSG00000029586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// BC115568 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933411G11Rik gene, mRNA (cDNA clone MGC:144444 IMAGE:40102090), complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// BC115569 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933411G11Rik gene, mRNA (cDNA clone MGC:144445 IMAGE:40102091), complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// XM_006504715 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4933411G11Rik gene (4933411G11Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// GENSCAN00000028919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143192331:143204166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_001289589 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 12 (Zfp12), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_001289590 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 12 (Zfp12), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_177681 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 12 (Zfp12), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000032591 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:143235174:143248834:1 gene:ENSMUSG00000029587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000075916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:143235247:143247956:1 gene:ENSMUSG00000029587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000077485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:143235163:143247948:1 gene:ENSMUSG00000029587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000160195 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:143240039:143244630:1 gene:ENSMUSG00000029587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 90 // 31 // 9 // 10 // 0 /// BC053080 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 12, mRNA (cDNA clone MGC:62453 IMAGE:5702966), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC059836 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 12, mRNA (cDNA clone MGC:69641 IMAGE:5697949), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
AK053723 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130302K05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
AK144491 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630078L21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// NONMMUT055153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_144915 // RefSeq // Mus musculus diacylglycerol lipase, beta (Daglb), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006504699 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus diacylglycerol lipase, beta (Daglb), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:143464493:143504414:1 gene:ENSMUSG00000039206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000145651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:143472947:143504442:1 gene:ENSMUSG00000039206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK081509 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130025A20 product:hypothetical alpha/beta-Hydrolases structure containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC016105 // GenBank // Mus musculus diacylglycerol lipase, beta, mRNA (cDNA clone MGC:27690 IMAGE:4921222), complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143464682:143501479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_001163548 // RefSeq // Mus musculus cytohesin 3 (Cyth3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NM_011182 // RefSeq // Mus musculus cytohesin 3 (Cyth3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000110727 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:143651241:143708256:1 gene:ENSMUSG00000018001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000116456 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:143622447:143710250:1 gene:ENSMUSG00000018001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AB013470 // GenBank // Mus musculus CLM3-A mRNA for cytohesin 3, complete cds. // chr5 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// AF084221 // GenBank // Mus musculus general receptor of phosphoinositides 1 (Grp1) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// BC035296 // GenBank // Mus musculus cytohesin 3, mRNA (cDNA clone MGC:28114 IMAGE:3969080), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143594588:143707905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
NM_013557 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1 (Eif2ak1), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000100487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:143817788:143904256:1 gene:ENSMUSG00000029613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY033898 // GenBank // Mus musculus heme-regulated eIF2 alpha kinase (Hri) mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC028923 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:25260 IMAGE:4164417), complete cds. // chrUn // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC111035 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:118066 IMAGE:5357121), complete cds. // chrUn // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000140013 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:143817831:143880479:1 gene:ENSMUSG00000029613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrUn // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// AK032508 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430574E03 product:EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2 ALPHA KINASE 1 (EC 2.7.1.-) (HEME-REGULATED EUKARYOTIC INITIATION FACTOR EIF-2-ALPHA KINASE) (HEME-REGULATED INHIBITOR) (HRI) (HEME-CONTROLLED REPRESSOR) (HCR) (HEMIN-SENSITIVE INITIATION FACTOR-2 ALPHA KINASE) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrUn // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000008317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143871863:143889626:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AF028808 // GenBank // Mus musculus hemin-sensitive initiation factor 2 alpha kinase mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
XM_006544024 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas) (Rsph10b), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000031618 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:143933035:143946401:1 gene:ENSMUSG00000075569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000166847 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:143933062:143985719:1 gene:ENSMUSG00000075569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000169758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:143937083:143946398:1 gene:ENSMUSG00000075569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// AK015903 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930526H21 product:hypothetical MORN motif containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143937083:143985628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0
NM_001081109 // RefSeq // Mus musculus lemur tyrosine kinase 2 (Lmtk2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000041804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:144100436:144188204:1 gene:ENSMUSG00000038970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB288872 // GenBank // Mus musculus aatyk2 mRNA for apoptosis-associated tyrosine kinase 2, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:144123229:144186229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_010800 // RefSeq // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member a15 (Bhlha15), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060747 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:144190286:144194441:1 gene:ENSMUSG00000052271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF049660 // GenBank // Mus musculus mMist1 (Mist1) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC011486 // GenBank // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member a15, mRNA (cDNA clone MGC:19046 IMAGE:4189225), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC094061 // GenBank // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member a15, mRNA (cDNA clone MGC:102506 IMAGE:4165423), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:144191072:144191665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001163709 // RefSeq // Mus musculus brain protein I3 (Bri3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// NM_018772 // RefSeq // Mus musculus brain protein I3 (Bri3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000056578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:144255234:144264574:1 gene:ENSMUSG00000047843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000110695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:144244437:144264395:1 gene:ENSMUSG00000047843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// AF106967 // GenBank // Mus musculus I3 protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// BC095955 // GenBank // Mus musculus brain protein I3, mRNA (cDNA clone MGC:106358 IMAGE:5328625), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XR_377192 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus brain protein I3 (Bri3), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1 /// ENSMUST00000155491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:144255225:144446757:1 gene:ENSMUSG00000047843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1 /// AK049027 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230092P09 product:brain protein I3, full insert sequence. // chr5 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1 /// GENSCAN00000008321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:144255378:144264141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 85 // 15 // 17 // 0
NM_016789 // RefSeq // Mus musculus neuronal pentraxin 2 (Nptx2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:144545887:144557478:1 gene:ENSMUSG00000059991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF049124 // GenBank // Mus musculus neuronal pentraxin 2 (Nptx2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC026054 // GenBank // Mus musculus neuronal pentraxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:13847 IMAGE:4038070), complete cds. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:144525851:144556394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001081362 // RefSeq // Mus musculus transformation/transcription domain-associated protein (Trrap), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038980 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:144771089:144859751:1 gene:ENSMUSG00000045482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:144771089:144859776:1 gene:ENSMUSG00000045482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:144768794:144859778:1 gene:ENSMUSG00000045482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132925 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:144785525:144859776:1 gene:ENSMUSG00000045482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK135094 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430585F01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024064 // GenBank HTC // Mus musculus transformation/transcription domain-associated protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:5067676), with apparent retained intron. // chr5 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// ENSMUST00000138589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:144857276:144859343:1 gene:ENSMUSG00000045482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_027069 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700018F24 gene (1700018F24Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000031624 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145042990:145045681:1 gene:ENSMUSG00000029620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK006086 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700018F24 product:hypothetical Ras GEF structure containing protein, full insert sequence. // chr5 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// BC147518 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700018F24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182616 IMAGE:9056510), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// BC147521 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700018F24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182619 IMAGE:9056513), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
NM_019767 // RefSeq // Mus musculus actin related protein 2/3 complex, subunit 1A (Arpc1a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145083830:145108761:1 gene:ENSMUSG00000029621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000124379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:145084100:145097228:1 gene:ENSMUSG00000029621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 37 // 9 // 11 // 0 /// ENSMUST00000127694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:145083906:145108756:1 gene:ENSMUSG00000029621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AB024984 // GenBank // Mus musculus Sid329 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK003986 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110030K07 product:actin related protein 2/3 complex, subunit 1A (41 kDa), full insert sequence. // chr5 // 80 // 50 // 12 // 15 // 0 /// BC001988 // GenBank // Mus musculus actin related protein 2/3 complex, subunit 1A, mRNA (cDNA clone MGC:5680 IMAGE:3485409), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000142276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:145104273:145108592:1 gene:ENSMUSG00000029621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000052959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145091183:145127756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_023142 // RefSeq // Mus musculus actin related protein 2/3 complex, subunit 1B (Arpc1b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000085679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145114215:145129699:1 gene:ENSMUSG00000029622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF162768 // GenBank // Mus musculus actin-related protein complex 1b (Arpc1b) mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 88 // 13 // 14 // 0 /// BC092051 // GenBank // Mus musculus actin related protein 2/3 complex, subunit 1B, mRNA (cDNA clone MGC:102425 IMAGE:3668682), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// BC003441 // GenBank // Mus musculus actin related protein 2/3 complex, subunit 1B, mRNA (cDNA clone MGC:6293 IMAGE:2650641), complete cds. // chr5 // 64 // 88 // 9 // 14 // 0 /// BC010275 // GenBank // Mus musculus actin related protein 2/3 complex, subunit 1B, mRNA (cDNA clone MGC:8155 IMAGE:3589768), complete cds. // chr5 // 64 // 88 // 9 // 14 // 0 /// ENSMUST00000138900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:145123974:145126932:1 gene:ENSMUSG00000029622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// BC044779 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5319988, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr5 // 91 // 69 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000052959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145091183:145127756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1
NM_001167944 // RefSeq // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 5 (Zkscan5), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_016683 // RefSeq // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 5 (Zkscan5), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006504822 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 5 (Zkscan5), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000031601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:145204668:145221750:1 gene:ENSMUSG00000055991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000085671 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145204562:145221750:1 gene:ENSMUSG00000055991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000161896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:145205123:145218562:1 gene:ENSMUSG00000055991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000162168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:145207604:145218426:1 gene:ENSMUSG00000055991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC060248 // GenBank // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 5, mRNA (cDNA clone MGC:67150 IMAGE:5715760), complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// U62907 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 95 (Zfp95) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145205301:145291159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001083958 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 655 (Zfp655), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// NM_028298 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 655 (Zfp655), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:145231754:145237246:1 gene:ENSMUSG00000007812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000167316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:145231723:145247302:1 gene:ENSMUSG00000007812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// BC060660 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 655, mRNA (cDNA clone MGC:79235 IMAGE:30355779), complete cds. // chr5 // 96 // 68 // 24 // 25 // 0 /// BC061032 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 655, mRNA (cDNA clone IMAGE:30295601), complete cds. // chr5 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// BC062945 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 655, mRNA (cDNA clone MGC:86092 IMAGE:30357186), complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145205301:145291159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
NM_001081431 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and SCAN domain containing 25 (Zscan25), mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000094116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:145283343:145291469:1 gene:ENSMUSG00000070420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC150878 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 498, mRNA (cDNA clone MGC:183789 IMAGE:9087789), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC151110 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 498, mRNA (cDNA clone MGC:184023 IMAGE:9088023), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000052950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145205301:145291159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_001100180 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 57 (Cyp3a57), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006504849 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 57 (Cyp3a57), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006504850 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 57 (Cyp3a57), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000079268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145345287:145390512:1 gene:ENSMUSG00000070419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000174696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:145345279:145390512:1 gene:ENSMUSG00000070419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006504851 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 57 (Cyp3a57), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// XM_006504852 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 57 (Cyp3a57), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// GENSCAN00000052951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145345347:145409821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NM_153599 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase 8 (Cdk8), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000031640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:146231288:146302874:1 gene:ENSMUSG00000029635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000159615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:146294910:146302819:1 gene:ENSMUSG00000029635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000161181 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:146231250:146302831:1 gene:ENSMUSG00000029635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000162494 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:146231230:146302874:1 gene:ENSMUSG00000029635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC025046 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:4952234). // chr5 // 73 // 55 // 8 // 11 // 0 /// ENSMUST00000161652 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:146231288:146292744:1 gene:ENSMUSG00000029635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// GENSCAN00000012170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:146231693:146301701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NM_145155 // RefSeq // Mus musculus WAS protein family, member 3 (Wasf3), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006504834 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAS protein family, member 3 (Wasf3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000016143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:146384985:146472411:1 gene:ENSMUSG00000029636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000110600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:146384985:146435471:1 gene:ENSMUSG00000029636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AF454703 // GenBank // Mus musculus WAVE3 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC027038 // GenBank // Mus musculus WAS protein family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:38989 IMAGE:5363785), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:146435335:146558737:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
NM_026864 // RefSeq // Mus musculus RAS-like, family 11, member A (Rasl11a), mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:146845071:146847726:1 gene:ENSMUSG00000029641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// BC118009 // GenBank // Mus musculus RAS-like, family 11, member A, mRNA (cDNA clone MGC:144485 IMAGE:40102480), complete cds. // chr5 // 89 // 95 // 31 // 35 // 0 /// GENSCAN00000032720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:146844242:146847475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0
NM_025652 // RefSeq // Mus musculus general transcription factor III A (Gtf3a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000132102 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:146948705:146955606:1 gene:ENSMUSG00000016503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000133296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:146950007:146955603:1 gene:ENSMUSG00000016503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:146948698:146955603:1 gene:ENSMUSG00000016503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000146511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:146948657:146955614:1 gene:ENSMUSG00000016503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK011845 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610111I01 product:weakly similar to TRANSCRIPTION FACTOR IIIA (FRAGMENT) [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// BC032292 // GenBank // Mus musculus general transcription factor III A, mRNA (cDNA clone MGC:40923 IMAGE:5374268), complete cds. // chr5 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0 /// BC057966 // GenBank // Mus musculus general transcription factor III A, mRNA (cDNA clone IMAGE:4983926), partial cds. // chr5 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// BC064891 // GenBank HTC // Mus musculus general transcription factor III A, mRNA (cDNA clone IMAGE:1226894). // chr5 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:146935909:146955535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_009087 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) I polypeptide D (Polr1d), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000050970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:147077050:147079086:1 gene:ENSMUSG00000029642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// D86609 // GenBank // Mus musculus mRNA for RPA16, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000032731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:147078560:147078910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 67 // 9 // 10 // 0
NM_008178 // RefSeq // Mus musculus GS homeobox 1 (Gsx1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000065382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:147188696:147190947:1 gene:ENSMUSG00000053129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137769 // GenBank // Mus musculus GS homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:169393 IMAGE:8860788), complete cds. // chr5 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// U21224 // GenBank // Mus musculus homeobox Gsh-1 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:147188890:147190154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_008814 // RefSeq // Mus musculus pancreatic and duodenal homeobox 1 (Pdx1), mRNA. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000085591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:147269959:147278008:1 gene:ENSMUSG00000029644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC103572 // GenBank // Mus musculus pancreatic and duodenal homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:124050 IMAGE:40045668), complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC103581 // GenBank // Mus musculus pancreatic and duodenal homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:124047 IMAGE:40045664), complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC103582 // GenBank // Mus musculus pancreatic and duodenal homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:124049 IMAGE:40045666), complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC105642 // GenBank // Mus musculus pancreatic and duodenal homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:124048 IMAGE:40045665), complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// X74342 // GenBank // M.musculus mRNA for IPF1 protein. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:147270239:147295511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000078052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:147408982:147409359:1 gene:ENSMUSG00000057157 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000032730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:147408982:147409359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000032725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:147409981:147410250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_025624 // RefSeq // Mus musculus proteasome maturation protein (Pomp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XR_400995 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proteasome maturation protein-like (LOC102642709), misc_RNA. // chr5 // 75 // 89 // 12 // 16 // 0 /// ENSMUST00000031654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:147860628:147875778:1 gene:ENSMUSG00000029649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK132041 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900085E01 product:HSPC036 protein (Hypothetical protein) (Voltage-gated K channel beta subunit 4.1) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 88 // 94 // 15 // 17 // 0 /// BC027016 // GenBank // Mus musculus proteasome maturation protein, mRNA (cDNA clone MGC:35726 IMAGE:5375452), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK044283 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930005H19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// GENSCAN00000050736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:147860689:147875531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
NM_009663 // RefSeq // Mus musculus arachidonate 5-lipoxygenase activating protein (Alox5ap), mRNA. // chr5 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:149265058:149288045:1 gene:ENSMUSG00000060063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// AK075967 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2510003D12 product:arachidonate 5-lipoxygenase activating protein, full insert sequence. // chr5 // 75 // 97 // 21 // 28 // 0 /// BC026209 // GenBank // Mus musculus arachidonate 5-lipoxygenase activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:41698 IMAGE:1349819), complete cds. // chr5 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:149265113:149318070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
ENSMUST00000173310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:149368476:149430682:1 gene:ENSMUSG00000092327 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000147034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:149367636:149393596:1 gene:ENSMUSG00000075529 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000148010 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:149369048:149386317:1 gene:ENSMUSG00000075529 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000148375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:149369046:149376734:1 gene:ENSMUSG00000075529 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AK138849 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430091A01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// BC028471 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA sequence BC028471, mRNA (cDNA clone IMAGE:1328084), with apparent retained intron. // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AK030804 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830407M18 product:RIKEN cDNA 6330406I15 gene, full insert sequence. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT055415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT055414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT055416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT055417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_029464 // RefSeq // Mus musculus testis expressed 26 (Tex26), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006504944 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed 26 (Tex26), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:149439706:149470620:1 gene:ENSMUSG00000029660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK161244 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921506D05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC120819 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930588N13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:156056 IMAGE:40129742), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC144997 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053545. // chr5 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// BC144999 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930588N13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178555 IMAGE:9053547), complete cds. // chr5 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// XM_006504945 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed 26 (Tex26), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// XM_006504946 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed 26 (Tex26), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000050888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:149411978:149469868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001081204 // RefSeq // Mus musculus beta-3-glucosyltransferase (B3glct), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000100404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:149678230:149762599:1 gene:ENSMUSG00000051950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000159581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:149753942:149760607:1 gene:ENSMUSG00000051950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000161388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:149739532:149751135:1 gene:ENSMUSG00000051950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// AB253762 // GenBank // Mus musculus b3Glc-T mRNA for beta1,3glucosyltransferase, complete cds. // chr5 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// NONMMUT055432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000050878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:149678337:149824738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
NM_172887 // RefSeq // Mus musculus furry homolog (Drosophila) (Fry), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 64 // 64 // 0 /// XM_006504932 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus furry homolog (Drosophila) (Fry), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 63 // 63 // 0 /// ENSMUST00000087204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:150259930:150497752:1 gene:ENSMUSG00000056602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 64 // 64 // 0 /// AK086708 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930046M03 product:WUGSC:H_2G3A.1 PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 32 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:150269904:150496425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 60 // 60 // 0
AK041221 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530092L01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081001 // RefSeq // Mus musculus breast cancer 2 (Brca2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NM_009765 // RefSeq // Mus musculus breast cancer 2 (Brca2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006504906 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus breast cancer 2 (Brca2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XR_377265 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus breast cancer 2 (Brca2), transcript variant X4, misc_RNA. // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000044620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:150522630:150569746:1 gene:ENSMUSG00000041147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AK164598 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430026M19 product:breast cancer 2, full insert sequence. // chr5 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC059904 // GenBank // Mus musculus breast cancer 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6822886), complete cds. // chr5 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// U65594 // GenBank // Mus musculus BRCA2 (Brca2) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// U82270 // GenBank // Mus musculus breast cancer susceptibility (Brca2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// U89652 // GenBank // Mus musculus breast cancer susceptibility (BRCA2) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:150522600:150569511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0
NM_175310 // RefSeq // Mus musculus PDS5, regulator of cohesion maintenance, homolog B (S. cerevisiae) (Pds5b), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000016569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:150673739:150810690:1 gene:ENSMUSG00000034021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000038900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:150673827:150810667:1 gene:ENSMUSG00000034021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000110486 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:150756303:150797424:1 gene:ENSMUSG00000034021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// AK041682 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630029M15 product:weakly similar to 49J10.1.2 (ANDROGEN-INDUCED PROSTATE PROLIFERATIVE SHUTOFF ASSOCIATED PROTEIN, ISOFORM 2) (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// AY102267 // GenBank // Mus musculus androgen-induced prostate proliferative shutoff associated protein AS3 mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// BC096539 // GenBank // Mus musculus PDS5, regulator of cohesion maintenance, homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:106532 IMAGE:6405163), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000040520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:150716422:150808081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0
AB010088 // GenBank // Mus musculus mRNA for secreted isoform of Klotho protein, complete cds. // chr5 // 96 // 67 // 23 // 24 // 0 /// NM_013823 // RefSeq // Mus musculus klotho (Kl), mRNA. // chr5 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// ENSMUST00000078856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:150952607:150993809:1 gene:ENSMUSG00000058488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// AB005141 // GenBank // Mus musculus klotho mRNA, complete cds. // chr5 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// BC138258 // GenBank // Mus musculus klotho, mRNA (cDNA clone MGC:169882 IMAGE:8861277), complete cds. // chr5 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// BC138259 // GenBank // Mus musculus klotho, mRNA (cDNA clone MGC:169883 IMAGE:8861278), complete cds. // chr5 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// GENSCAN00000004653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:150979418:150994304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0
NM_001166835 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 79 (Vmn1r79), mRNA. // chr5 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// NM_001167534 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 2 (Vmn1r2), mRNA. // chr5 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// NM_001167535 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 3 (Vmn1r3), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NM_001167539 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, 238 (Vmn1r238), mRNA. // chr5 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSMUST00000062811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:12176193:12177113:1 gene:ENSMUSG00000096735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000105159 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:3184382:3185305:-1 gene:ENSMUSG00000095982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000105160 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:3172083:3173006:1 gene:ENSMUSG00000094798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// ENSMUST00000165255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:3122492:3123412:-1 gene:ENSMUSG00000091539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// BC145887 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, G10-like, mRNA (cDNA clone MGC:175774 IMAGE:40131190), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONMMUT051077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0