NM_030717 // RefSeq // Mus musculus lactamase, beta (Lactb), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:66955393:66975484:-1 gene:ENSMUSG00000032370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF317900 // GenBank // Mus musculus serine beta lactamase-like protein LACT-1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC046293 // GenBank // Mus musculus lactamase, beta, mRNA (cDNA clone MGC:54450 IMAGE:6484767), complete cds. // chr9 // 79 // 93 // 22 // 28 // 0 /// BC147809 // GenBank // Mus musculus lactamase, beta, mRNA (cDNA clone MGC:182912 IMAGE:9087526), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:66955675:66975391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001081242 // RefSeq // Mus musculus talin 2 (Tln2), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 60 // 60 // 0 /// ENSMUST00000039662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:67221138:67539392:-1 gene:ENSMUSG00000052698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 58 // 58 // 0 /// ENSMUST00000040025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:67217087:67559703:-1 gene:ENSMUSG00000052698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 60 // 60 // 0 /// AK029828 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931402J01 product:talin 2, full insert sequence. // chr9 // 100 // 52 // 34 // 34 // 0 /// AK166970 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0025P16 product:Talin 2 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 14 // 9 // 9 // 0 /// BC079896 // GenBank // Mus musculus talin 2, mRNA (cDNA clone MGC:100340 IMAGE:30544295), complete cds. // chr9 // 98 // 68 // 43 // 44 // 0 /// BC158057 // GenBank // Mus musculus talin 2, mRNA (cDNA clone MGC:189857 IMAGE:9007357), complete cds. // chr9 // 95 // 89 // 55 // 58 // 0 /// GENSCAN00000055018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:67221390:67397647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 58 // 58 // 0
NR_029576 // RefSeq // Mus musculus microRNA 190a (Mir190a), microRNA. // chr9 // 76 // 89 // 19 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102424 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:67236651:67236735:-1 gene:ENSMUSG00000076379 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-190a // miRBase Micro RNA Database // MI0000232 Mus musculus miR-190 stem-loop // chr9 // 76 // 89 // 19 // 25 // 0 /// NONMMUT069702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT069703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 76 // 89 // 19 // 25 // 0
XR_405799 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102633151 (LOC102633151), ncRNA. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000068526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:9:67758712:67760208:-1 gene:ENSMUSG00000055125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK147236 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain UNDEFINED_CELL_LINE cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1000I18 product:hypothetical Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000186205 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:67758713:67760230:-1 gene:ENSMUSG00000055125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001163143 // RefSeq // Mus musculus C2 calcium-dependent domain containing 4A (C2cd4a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000054500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:67830532:67832330:-1 gene:ENSMUSG00000047990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000028538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:67830755:67835044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_022378 // RefSeq // Mus musculus forkhead box B1 (Foxb1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:69757710:69760940:-1 gene:ENSMUSG00000059246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC111908 // GenBank // Mus musculus forkhead box B1, mRNA (cDNA clone MGC:130499 IMAGE:40045942), complete cds. // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// U90538 // GenBank // Mus musculus winged-helix protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:69759269:69771065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_028087 // RefSeq // Mus musculus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type (Gcnt3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006511465 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type (Gcnt3), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000034751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:70031496:70038088:-1 gene:ENSMUSG00000032226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY039027 // GenBank // Mus musculus core 2 beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase II mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC018297 // GenBank // Mus musculus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type, mRNA (cDNA clone MGC:18826 IMAGE:4208500), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// EF202835 // GenBank // Mus musculus mucus-type core 2 beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:70033971:70035284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_029784 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 81, member A (Fam81a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006511550 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 81, member A (Fam81a), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006511551 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 81, member A (Fam81a), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:70089310:70141578:-1 gene:ENSMUSG00000032224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK135091 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430583H17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// BC025646 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 81, member A, mRNA (cDNA clone MGC:38269 IMAGE:5324986), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:70090767:70162687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NM_007630 // RefSeq // Mus musculus cyclin B2 (Ccnb2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:70407689:70421554:-1 gene:ENSMUSG00000032218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC008247 // GenBank // Mus musculus cyclin B2, mRNA (cDNA clone MGC:11566 IMAGE:3156950), complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// CT010286 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836H1151D for gene Ccnb2, Cyclin B2; complete cds, incl. stopcodon. // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:70403727:70519611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_033604 // RefSeq // Mus musculus ring finger 111 (Rnf111), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000034739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:70425429:70503725:-1 gene:ENSMUSG00000032217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000113595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:70425430:70503354:-1 gene:ENSMUSG00000032217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AF330197 // GenBank // Mus musculus Arkadia (Arkadia) mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// BC011463 // GenBank // Mus musculus ring finger 111, mRNA (cDNA clone IMAGE:3499642), partial cds. // chr9 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC069835 // GenBank // Mus musculus ring finger 111, mRNA (cDNA clone MGC:76599 IMAGE:30094289), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK035242 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530004L21 product:arkadia, full insert sequence. // chr9 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// AK171932 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830020E13 product:ring finger 111, full insert sequence. // chr9 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000021033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:70403727:70519611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
ENSMUST00000083236 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:70521598:70521704:-1 gene:ENSMUSG00000094366 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONMMUT069869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_172772 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 63, member B (Fam63b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:70599014:70657174:-1 gene:ENSMUSG00000042444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:70592361:70657046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_172772 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 63, member B (Fam63b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006511117 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 63, member B (Fam63b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000049031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:70599014:70657174:-1 gene:ENSMUSG00000042444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK046623 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430210G19 product:hypothetical Serine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC058683 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B230380D07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:76380 IMAGE:6834871), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC069845 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B230380D07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3156136), partial cds. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:70592361:70657046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_008280 // RefSeq // Mus musculus lipase, hepatic (Lipc), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006510817 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipase, hepatic (Lipc), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// XM_006510818 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipase, hepatic (Lipc), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000034731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:70798129:70934808:-1 gene:ENSMUSG00000032207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK158360 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930107H09 product:lipase, hepatic, full insert sequence. // chr9 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// AY228765 // GenBank // Mus musculus hepatic lipase (Lipc) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// BC021841 // GenBank // Mus musculus lipase, hepatic, mRNA (cDNA clone MGC:30258 IMAGE:5124139), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC094050 // GenBank // Mus musculus lipase, hepatic, mRNA (cDNA clone MGC:102533 IMAGE:5135403), complete cds. // chr9 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:70798267:70838833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_001164793 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide M (Polr2m), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_178602 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide M (Polr2m), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:71478437:71485935:-1 gene:ENSMUSG00000032199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163972 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:71478471:71484958:-1 gene:ENSMUSG00000032199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC018502 // GenBank // Mus musculus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate-like 1A, mRNA (cDNA clone MGC:27744 IMAGE:2649742), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062199 // GenBank // Mus musculus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate-like 1A, mRNA (cDNA clone MGC:70228 IMAGE:4013916), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:71479397:71485905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AK220531 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4185 protein. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026599 // RefSeq // Mus musculus cingulin-like 1 (Cgnl1), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// XM_006511395 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cingulin-like 1 (Cgnl1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000072899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:71626509:71771602:-1 gene:ENSMUSG00000032232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000121322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:71626509:71771602:-1 gene:ENSMUSG00000032232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000122065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:71629211:71771560:-1 gene:ENSMUSG00000032232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// AB186125 // GenBank // Mus musculus JACOP mRNA for junction-associated coiled-coil protein, complete cds. // chr9 // 88 // 89 // 36 // 41 // 0 /// BC031499 // GenBank // Mus musculus cingulin-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3500574), complete cds. // chr9 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// BC139006 // GenBank // Mus musculus cingulin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:170633 IMAGE:8862028), complete cds. // chr9 // 97 // 83 // 37 // 38 // 0 /// BC158061 // GenBank // Mus musculus cingulin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:189861 IMAGE:9007361), complete cds. // chr9 // 87 // 83 // 33 // 38 // 0 /// XM_006511396 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cingulin-like 1 (Cgnl1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1 /// GENSCAN00000020113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:71629260:71658456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 43 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000020116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:71682140:71748062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1
AK137815 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130017F12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00007734 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT069947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081153 // RefSeq // Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006510928 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000075245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:73480870:73933567:-1 gene:ENSMUSG00000062151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000184666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:73479422:73968966:-1 gene:ENSMUSG00000062151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:73505620:73758677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001081153 // RefSeq // Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006510928 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000075245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:73480870:73933567:-1 gene:ENSMUSG00000062151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000184666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:73479422:73968966:-1 gene:ENSMUSG00000062151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:73505620:73758677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001081153 // RefSeq // Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510928 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:73480870:73933567:-1 gene:ENSMUSG00000062151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:73479422:73968966:-1 gene:ENSMUSG00000062151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:73505620:73758677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081153 // RefSeq // Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006510928 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000075245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:73480870:73933567:-1 gene:ENSMUSG00000062151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000184666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:73479422:73968966:-1 gene:ENSMUSG00000062151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:73505620:73758677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001081153 // RefSeq // Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510928 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:73480870:73933567:-1 gene:ENSMUSG00000062151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:73479422:73968966:-1 gene:ENSMUSG00000062151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081153 // RefSeq // Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006510928 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000075245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:73480870:73933567:-1 gene:ENSMUSG00000062151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000184666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:73479422:73968966:-1 gene:ENSMUSG00000062151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC030416 // GenBank // Mus musculus unc-13 homolog C (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:5366834), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000049001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:73505620:73758677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1
NM_015806 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 6 (Mapk6), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_027418 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 6 (Mapk6), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000049355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:75386904:75410005:-1 gene:ENSMUSG00000042688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000168937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:75386902:75409359:-1 gene:ENSMUSG00000042688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AF132850 // GenBank // Mus musculus extracellular signal-regulated kinase 3 mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// BC048779 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:54586 IMAGE:6315375), complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC052420 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:63457 IMAGE:5702905), complete cds. // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC100385 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:117918 IMAGE:30732053), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000172946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:75393734:75409996:-1 gene:ENSMUSG00000042688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AK044752 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930039J04 product:mitogen-activated protein kinase 6, full insert sequence. // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000031487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:75388052:75409988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000181896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:75441122:75441652:-1 gene:ENSMUSG00000097298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK137986 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130057D12 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016963 // RefSeq // Mus musculus tropomodulin 3 (Tmod3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000072232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:75497796:75559657:-1 gene:ENSMUSG00000058587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF177172 // GenBank // Mus musculus tropomodulin 3 (Tmod3) mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// AF237630 // GenBank // Mus musculus ubiquitous tropomodulin U-Tmod mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// BC082595 // GenBank // Mus musculus tropomodulin 3, mRNA (cDNA clone MGC:100154 IMAGE:30645500), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:75498616:75532551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0
NM_001164790 // RefSeq // Mus musculus secretogranin III (Scg3), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_009130 // RefSeq // Mus musculus secretogranin III (Scg3), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006510881 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus secretogranin III (Scg3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:75643264:75683996:-1 gene:ENSMUSG00000032181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC024785 // GenBank // Mus musculus secretogranin III, mRNA (cDNA clone MGC:36181 IMAGE:5362975), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U02982 // GenBank // Mus musculus secretogranin III (SgIII) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:75643826:75684228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000182463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:75693653:75694659:-1 gene:ENSMUSG00000098232 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000031477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:75693653:75697405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
ENSMUST00000175284 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:75970944:75971027:-1 gene:ENSMUSG00000093025 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT070075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_205844 // RefSeq // Mus musculus GDNF family receptor alpha like (Gfral), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000074880 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:76164102:76213657:-1 gene:ENSMUSG00000059383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000184693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:76164102:76213657:-1 gene:ENSMUSG00000059383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AY457637 // GenBank // Mus musculus GDNF receptor alpha-like protein splice variant A (Gral) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr9 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// AY457638 // GenBank // Mus musculus GDNF receptor alpha-like protein splice variant B (Gral) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr9 // 90 // 88 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:76164805:76210215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0
NM_198962 // RefSeq // Mus musculus hypocretin (orexin) receptor 2 (Hcrtr2), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006511265 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hypocretin (orexin) receptor 2 (Hcrtr2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000063140 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:76225880:76323611:-1 gene:ENSMUSG00000032360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:76229954:76323856:-1 gene:ENSMUSG00000032360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AY336084 // GenBank // Mus musculus orexin receptor type-2a mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AY336085 // GenBank // Mus musculus orexin receptor type-2b mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC140957 // GenBank // Mus musculus hypocretin (orexin) receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:175918 IMAGE:9055569), complete cds. // chr9 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:76230500:76323504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001045518 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 83, member B (Fam83b), mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006510952 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 83, member B (Fam83b), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000098546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:76490705:76545804:-1 gene:ENSMUSG00000032358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000183437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:76490054:76567116:-1 gene:ENSMUSG00000032358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC120577 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 83, member B, mRNA (cDNA clone MGC:155814 IMAGE:40129500), complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC120579 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 83, member B, mRNA (cDNA clone MGC:155816 IMAGE:40129502), complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:76455772:76504274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 58 // 20 // 21 // 0
ENSMUST00000122553 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:76773232:76773524:-1 gene:ENSMUSG00000084502 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr9 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0 /// NONMMUT070088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0
NM_012033 // RefSeq // Mus musculus tubulointerstitial nephritis antigen (Tinag), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000034911 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:76951693:77045794:-1 gene:ENSMUSG00000032357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000184897 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:76951693:77045749:-1 gene:ENSMUSG00000032357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF153366 // GenBank // Mus musculus tubulo-interstitial nephritis antigen mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC010745 // GenBank // Mus musculus tubulointerstitial nephritis antigen, mRNA (cDNA clone MGC:18306 IMAGE:4239192), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000014573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:76951897:77049510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1
NM_001146048 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 1 (Lrrc1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_172528 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 1 (Lrrc1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:77430980:77544095:-1 gene:ENSMUSG00000032352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000183873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:77430823:77544870:-1 gene:ENSMUSG00000032352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000184531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:77431074:77448686:-1 gene:ENSMUSG00000032352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AK220166 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4018 protein. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC087542 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:90936 IMAGE:4934980), complete cds. // chr9 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000183734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:77448692:77544850:-1 gene:ENSMUSG00000032352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// AK051043 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030059I21 product:hypothetical Leucine-rich repeat, typical subtype containing protein, full insert sequence. // chr9 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000014572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:77451560:77468834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001081490 // RefSeq // Mus musculus f-box protein 9 (Fbxo9), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_023605 // RefSeq // Mus musculus f-box protein 9 (Fbxo9), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000001402 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:78081502:78109065:-1 gene:ENSMUSG00000001366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000085311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:78081499:78108656:-1 gene:ENSMUSG00000001366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159099 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78095513:78108604:-1 gene:ENSMUSG00000001366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AK018482 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030401P18 product:Mus musculus, Similar to F-box only protein 9, clone MGC:28077 IMAGE:3710611, mRNA, complete cds, full insert sequence. // chr9 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// BC020074 // GenBank // Mus musculus f-box protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:28077 IMAGE:3710611), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000162451 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78085698:78087636:-1 gene:ENSMUSG00000001366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78081980:78100329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NR_030687 // RefSeq // Mus musculus RNA, 7SK, nuclear (Rn7sk), small nuclear RNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000083103 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:78175303:78175633:-1 gene:ENSMUSG00000065037 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT070124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001111286 // RefSeq // Mus musculus oocyte maturation, alpha (Omt2a), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000085308 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:78312304:78313447:-1 gene:ENSMUSG00000066463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000166056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:78312004:78314016:-1 gene:ENSMUSG00000066463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000173608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78312004:78314001:-1 gene:ENSMUSG00000066463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NM_001164523 // RefSeq // Mus musculus oocyte maturation, alpha (Omt2a), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// ENSMUST00000113376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:78311972:78314797:-1 gene:ENSMUSG00000066463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// GENSCAN00000027035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78312616:78341916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
ENSMUST00000095071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:78321299:78322357:-1 gene:ENSMUSG00000090802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_025274 // RefSeq // Mus musculus developmental pluripotency associated 5A (Dppa5a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000071991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:78367052:78368177:-1 gene:ENSMUSG00000060461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AF490349 // GenBank // Mus musculus DPPA5 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC092353 // GenBank // Mus musculus developmental pluripotency associated 5A, mRNA (cDNA clone MGC:106348 IMAGE:30730511), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC092354 // GenBank // Mus musculus developmental pluripotency associated 5A, mRNA (cDNA clone MGC:106349 IMAGE:30732471), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC095979 // GenBank // Mus musculus developmental pluripotency associated 5A, mRNA (cDNA clone MGC:106350 IMAGE:30732937), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000027040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78347324:78389242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0
NM_026480 // RefSeq // Mus musculus oocyte expressed protein (Ooep), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034900 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:78376109:78378725:-1 gene:ENSMUSG00000032346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB283026 // GenBank // Mus musculus Sddr mRNA for stem cell-derived differentiation regulator, complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC062245 // GenBank // Mus musculus oocyte expressed protein homolog (dog), mRNA (cDNA clone MGC:73547 IMAGE:3470921), complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// DQ238107 // GenBank // Mus musculus oocyte and embryo specific protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78347324:78389242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSMUST00000119091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78388901:78389467:-1 gene:ENSMUSG00000083032 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT070139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000171096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:78394956:78396158:-1 gene:ENSMUSG00000090724 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK016017 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930542C12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78390933:78396158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0
NM_173386 // RefSeq // Mus musculus Mab-21 domain containing 1 (Mb21d1), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034898 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:78431337:78443237:-1 gene:ENSMUSG00000032344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000070742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:78430526:78443204:-1 gene:ENSMUSG00000032344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78431789:78442885:-1 gene:ENSMUSG00000032344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC044854 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E330016A19 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4916599), complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC052196 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E330016A19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:59605 IMAGE:6510706), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC145651 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E330016A19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175538 IMAGE:40130954), complete cds. // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC145653 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E330016A19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175540 IMAGE:40130956), complete cds. // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// KC294567 // GenBank // Mus musculus cyclic GMP-AMP synthase mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78435325:78442841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
NM_010106 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 (Eef1a1), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000042235 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:78478449:78481724:-1 gene:ENSMUSG00000037742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000129380 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78478684:78479716:-1 gene:ENSMUSG00000037742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC050124 // GenBank HTC // Mus musculus eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30028883), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr9 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC083069 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:103271 IMAGE:6310448), complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC095965 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:106401 IMAGE:6310404), complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC108391 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:118397 IMAGE:30242277), complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// M22432 // GenBank // Mus musculus protein synthesis elongation factor Tu (eEF-Tu, eEf-1-alpha) mRNA, complete cds. // chr9 // 80 // 77 // 8 // 10 // 0 /// BC092276 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:103212 IMAGE:3490007), complete cds. // chr9 // 70 // 77 // 7 // 10 // 0 /// GENSCAN00000027028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78478734:78480654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 85 // 85 // 11 // 13 // 1
GENSCAN00000030346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78767208:78786001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1
NR_045336 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10635 (Gm10635), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00007749 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009945 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIa 2 (Cox7a2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000034881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:79755241:79759853:-1 gene:ENSMUSG00000032330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF037371 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIa-L precursor (Cox7al) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr9 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// BC010979 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit VIIa 2, mRNA (cDNA clone MGC:13864 IMAGE:4217409), complete cds. // chr9 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0
NM_133718 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 30A (Tmem30a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:79768943:79793430:-1 gene:ENSMUSG00000032328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:79768943:79793507:-1 gene:ENSMUSG00000032328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC018367 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 30A, mRNA (cDNA clone MGC:19378 IMAGE:2648510), complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC018491 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 30A, mRNA (cDNA clone MGC:27752 IMAGE:2651602), complete cds. // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XR_379454 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 30A (Tmem30a), transcript variant X1, misc_RNA. // chr9 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// ENSMUST00000153815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:79772552:79793430:-1 gene:ENSMUSG00000032328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// AK161096 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732425G09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSMUST00000130419 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:79776854:79793430:-1 gene:ENSMUSG00000032328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000020485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:79745710:79793795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_022016 // RefSeq // Mus musculus interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 (Impg1), mRNA. // chrUn // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006511328 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 (Impg1), transcript variant X1, mRNA. // chrUn // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000085289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:80313330:80465438:-1 gene:ENSMUSG00000032343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000113250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:80313995:80465481:-1 gene:ENSMUSG00000032343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000185068 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:80383535:80465438:-1 gene:ENSMUSG00000032343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// AF229929 // GenBank // Mus musculus sialoprotein associated with cones and rods SPACR mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AF266478 // GenBank // Mus musculus IPM 150 proteoglycan mRNA, complete cds. // chrUn // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC022970 // GenBank // Mus musculus interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mRNA (cDNA clone MGC:35847 IMAGE:5366008), complete cds. // chrUn // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:80314371:80345615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000020486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:80359978:80449208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_010482 // RefSeq // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1B (Htr1b), mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:81631343:81632615:-1 gene:ENSMUSG00000049511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000183482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:81628291:81633828:-1 gene:ENSMUSG00000049511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC119129 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1B, mRNA (cDNA clone MGC:155445 IMAGE:8733878), complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC131951 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1B, mRNA (cDNA clone MGC:163582 IMAGE:40130228), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:81631392:81636033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_148941 // RefSeq // Mus musculus elongation of very long chain fatty acids (FEN1/Elo2, SUR4/Elo3, yeast)-like 4 (Elovl4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034796 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:83778692:83806252:-1 gene:ENSMUSG00000032262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF277093 // GenBank // Mus musculus Elovl4 mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC037030 // GenBank // Mus musculus elongation of very long chain fatty acids (FEN1/Elo2, SUR4/Elo3, yeast)-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:47132 IMAGE:4503493), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000183614 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:83780663:83806277:-1 gene:ENSMUSG00000032262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000022552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:83780540:83790207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000189949 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:84973053:84976515:-1 gene:ENSMUSG00000099779 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000039497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:84970402:84976036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0
NM_001160378 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 46, member A (Fam46a), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001160379 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 46, member A (Fam46a), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:85320439:85327124:-1 gene:ENSMUSG00000032265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:85320439:85327348:-1 gene:ENSMUSG00000032265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001160378 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 46, member A (Fam46a), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001160379 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 46, member A (Fam46a), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:85320439:85327124:-1 gene:ENSMUSG00000032265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:85320439:85327348:-1 gene:ENSMUSG00000032265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:85324457:85326912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083772 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:85772351:85772480:-1 gene:ENSMUSG00000065706 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT070305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XR_379678 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9330154J02 gene (9330154J02Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 82 // 41 // 9 // 11 // 0 /// ENSMUST00000069896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:85820241:85843285:-1 gene:ENSMUSG00000056031 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK034076 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330154J02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XR_405901 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9330154J02 gene (9330154J02Rik), misc_RNA. // chr9 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// AK042778 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730023O05 product:hypothetical Proline-rich region containing protein, full insert sequence. // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// ENSMUST00000185960 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:85820302:85844323:-1 gene:ENSMUSG00000056031 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000189191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:85820241:85844131:-1 gene:ENSMUSG00000056031 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT070306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000187891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:85821526:85843284:-1 gene:ENSMUSG00000056031 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSMUST00000117532 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:86316141:86316684:-1 gene:ENSMUSG00000083731 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:86242999:86316616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_027394 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2C binding protein (Ube2cbp), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006511432 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2C binding protein (Ube2cbp), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000034986 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:86307306:86464950:-1 gene:ENSMUSG00000032415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000121189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:86307742:86464950:-1 gene:ENSMUSG00000032415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC115686 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2C binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:144619 IMAGE:40104268), complete cds. // chr9 // 87 // 89 // 27 // 31 // 0 /// BC115687 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2C binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:144620 IMAGE:40104269), complete cds. // chr9 // 87 // 89 // 27 // 31 // 0
NM_199316 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 162 (Cep162), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000093802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:87189577:87255536:-1 gene:ENSMUSG00000056919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000144137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:87225721:87255288:-1 gene:ENSMUSG00000056919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC064713 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 4922501C03 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30248844), with apparent retained intron. // chr9 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC150998 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4922501C03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183911 IMAGE:9087911), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC151006 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4922501C03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183919 IMAGE:9087919), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC151104 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4922501C03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:184017 IMAGE:9088017), complete cds. // chr9 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:87192716:87253988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_023814 // RefSeq // Mus musculus T-box18 (Tbx18), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:87702800:87731260:-1 gene:ENSMUSG00000032419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF306666 // GenBank // Mus musculus T-box transcription factor TBX18 (Tbx18) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC145691 // GenBank // Mus musculus T-box18, mRNA (cDNA clone MGC:175578 IMAGE:40130994), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:87715523:87730844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000039889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:87705221:87713562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_001289595 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 40 (Slc25a40), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NM_001289596 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 40 (Slc25a40), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NM_178766 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 40 (Slc25a40), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// XR_376693 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 25, member 40 (Slc25a40), transcript variant X5, misc_RNA. // chr9 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:8422850:8454790:1 gene:ENSMUSG00000054099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000170496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:8422988:8454790:1 gene:ENSMUSG00000054099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// AK044260 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930004C23 product:similar to Mitochondrial carrier family protein [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// BC083103 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 40, mRNA (cDNA clone MGC:103255 IMAGE:30726859), complete cds. // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:88280369:88281190:-1 gene:ENSMUSG00000100337 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000018306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:88274977:88281196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000122754 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:88526679:88526794:-1 gene:ENSMUSG00000084703 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 73 // 100 // 22 // 30 // 0 /// NONMMUT070344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 73 // 100 // 22 // 30 // 0
NM_153509 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence AF529169 (AF529169), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:89587216:89623125:-1 gene:ENSMUSG00000039313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF529169 // GenBank // Mus musculus DD1 protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC113792 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AF529169, mRNA (cDNA clone MGC:132936 IMAGE:40061557), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000191465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:89591101:89603391:-1 gene:ENSMUSG00000039313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000011640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:89591103:89603342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_025360 // RefSeq // Mus musculus transmembrane emp24 domain containing 3 (Tmed3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:89699205:89705068:-1 gene:ENSMUSG00000032353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK212102 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0123N22, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000058488, based on BLAT search. // chr9 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AK217166 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0140O08, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000058488, based on BLAT search. // chr9 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC023338 // GenBank // Mus musculus transmembrane emp24 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:30992 IMAGE:5253777), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:89691342:89704889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_207260 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 34C (Ankrd34c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060700 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:89728249:89738475:-1 gene:ENSMUSG00000047606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137642 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 34C, mRNA (cDNA clone MGC:169266 IMAGE:8860661), complete cds. // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC137643 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 34C, mRNA (cDNA clone MGC:169267 IMAGE:8860662), complete cds. // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000185470 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:89728469:89738445:-1 gene:ENSMUSG00000047606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:89728682:89730286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NR_029570 // RefSeq // Mus musculus microRNA 184 (Mir184), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083662 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:89802260:89802328:-1 gene:ENSMUSG00000065596 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-184 // miRBase Micro RNA Database // MI0000226 Mus musculus miR-184 stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000085248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:90091665:90114715:-1 gene:ENSMUSG00000062270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// AK220441 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4002 protein. // chr9 // 75 // 67 // 6 // 8 // 0 /// NM_001039147 // RefSeq // Mus musculus mortality factor 4 like 1 (Morf4l1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// ENSMUST00000190377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:90091671:90114640:-1 gene:ENSMUSG00000062270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_194334 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 2B (Tbc1d2b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_379443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TBC1 domain family, member 2B (Tbc1d2b), transcript variant X1, misc_RNA. // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000041767 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:90202027:90270769:-1 gene:ENSMUSG00000037410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:90205027:90253377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_009573 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein of the cerebellum 1 (Zic1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:91358058:91365768:-1 gene:ENSMUSG00000032368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK141883 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130050I01 product:Zic family member 1 (odd-paired homolog, Drosophila), full insert sequence. // chr9 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC050889 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein of the cerebellum 1, mRNA (cDNA clone MGC:63273 IMAGE:6418777), complete cds. // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC060247 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein of the cerebellum 1, mRNA (cDNA clone MGC:67128 IMAGE:6813617), complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC063247 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein of the cerebellum 1, mRNA (cDNA clone MGC:62379 IMAGE:5694793), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// D32167 // GenBank // Mus musculus zic mRNA for Zic protein, complete cds. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000065360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:91360500:91365810:-1 gene:ENSMUSG00000032368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000050166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:91355089:91366962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001033145 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1190002N15 gene (1190002N15Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000113028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:94517864:94538081:-1 gene:ENSMUSG00000045414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// AK139920 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020037P20 product:E1A binding protein p400, full insert sequence. // chr9 // 95 // 43 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:94474142:94575388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 41 // 41 // 19 // 46 // 1
NM_018763 // RefSeq // Mus musculus carbohydrate sulfotransferase 2 (Chst2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000036267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:95399292:95406722:-1 gene:ENSMUSG00000033350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB011451 // GenBank // Mus musculus mRNA for N-acetylglucosamine-6-O-sulfotransferase, complete cds. // chr9 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// AB011452 // GenBank // Mus musculus mRNA for N-acetylglucosamine-6-O-sulfotransferase, complete cds. // chr9 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC051963 // GenBank // Mus musculus carbohydrate sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:62233 IMAGE:5707543), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:95404699:95500819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_001114977 // RefSeq // Mus musculus U2 snRNP-associated SURP domain containing (U2surp), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_026476 // RefSeq // Mus musculus U2 snRNP-associated SURP domain containing (U2surp), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000078374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:95460978:95511996:-1 gene:ENSMUSG00000032407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000079659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:95456898:95511894:-1 gene:ENSMUSG00000032407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC068265 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610101N10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:60797 IMAGE:30022109), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000191213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:95461354:95511995:-1 gene:ENSMUSG00000032407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:95404699:95500819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_001033210 // RefSeq // Mus musculus plastin 1 (I-isoform) (Pls1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006510748 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus plastin 1 (I-isoform) (Pls1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// ENSMUST00000093800 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:95752642:95845286:-1 gene:ENSMUSG00000049493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK133070 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930566L05 product:Plastin 1 (I isoform) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC139068 // GenBank // Mus musculus plastin 1 (I-isoform), mRNA (cDNA clone MGC:170695 IMAGE:8862090), complete cds. // chr9 // 87 // 89 // 27 // 31 // 0 /// BC139069 // GenBank // Mus musculus plastin 1 (I-isoform), mRNA (cDNA clone MGC:170696 IMAGE:8862091), complete cds. // chr9 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:95706740:95795831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1
ENSMUST00000178038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:95855552:95858320:-1 gene:ENSMUSG00000096655 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC053441 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700065D16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:59498 IMAGE:6332684), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_073361 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700065D16 gene (1700065D16Rik), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr9 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// XM_006511488 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700065D16 gene (1700065D16Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000189348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:95855421:95857871:-1 gene:ENSMUSG00000096655 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000190890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:95855420:95858322:-1 gene:ENSMUSG00000096655 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:95855418:95857517:-1 gene:ENSMUSG00000096655 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr9 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT070505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_173415 // RefSeq // Mus musculus nyctalopin (Nyx), mRNA. // chr9 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0 /// XM_006527611 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nyctalopin (Nyx), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0 /// ENSMUST00000050434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:13466110:13489313:1 gene:ENSMUSG00000051228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0 /// AY114303 // GenBank // Mus musculus nyctalopin (Nyx) mRNA, complete cds. // chr9 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0 /// BC035244 // GenBank // Mus musculus nyctalopin, mRNA (cDNA clone MGC:38926 IMAGE:5362608), complete cds. // chr9 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0 /// BC048381 // GenBank // Mus musculus nyctalopin, mRNA (cDNA clone MGC:56805 IMAGE:5362608), complete cds. // chr9 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0
NM_007502 // RefSeq // Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 3 polypeptide (Atp1b3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006510784 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 3 polypeptide (Atp1b3), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000034983 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:96332655:96364442:-1 gene:ENSMUSG00000032412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AK148495 // GenBank HTC // Mus musculus adult pancreas islet cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C820011C18 product:ATPase, Na+/K+ transporting, beta 3 polypeptide, full insert sequence. // chr9 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// BC079916 // GenBank // Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 3 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:105161 IMAGE:30665138), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// U59761 // GenBank // Mus musculus Na+,K+-ATPase beta 3 subunit (ATP1B3) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000016434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:96333524:96351701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
ENSMUST00000070500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:96435784:96437434:-1 gene:ENSMUSG00000056418 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AK050822 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030022H06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC035950 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC043934, mRNA (cDNA clone MGC:31404 IMAGE:4456300), complete cds. // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC043934 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC043934, mRNA (cDNA clone MGC:49691 IMAGE:4456300), complete cds. // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000185694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:96435783:96438138:-1 gene:ENSMUSG00000056418 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:96436995:96440315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_011279 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 7 (Rnf7), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000057500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:96470937:96478675:-1 gene:ENSMUSG00000051234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AF092877 // GenBank // Mus musculus zinc RING finger protein SAG mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC011127 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:4194107), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_053268 // RefSeq // Mus musculus RAS p21 protein activator 2 (Rasa2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:96539300:96631617:-1 gene:ENSMUSG00000032413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:96546282:96631536:-1 gene:ENSMUSG00000032413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AB056433 // GenBank // Mus musculus gap1m mRNA for GAP1m, complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006510777 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS p21 protein activator 2 (Rasa2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000144376 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:96556591:96572043:-1 gene:ENSMUSG00000032413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK082530 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230059J02 product:RAS p21 protein activator 2, full insert sequence. // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:96543473:96631493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
ENSMUST00000132060 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:96747281:96752727:-1 gene:ENSMUSG00000040433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:96747479:96752693:-1 gene:ENSMUSG00000040433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AK053135 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030011O05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000064445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:96994049:97018764:-1 gene:ENSMUSG00000046997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000162307 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:96943485:96984195:-1 gene:ENSMUSG00000046997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// AF403039 // GenBank // Mus musculus SPRY domain-containing SOCS box protein SSB-4 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// AK083698 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030068E18 product:SPRY DOMAIN-CONTAINING SOCS BOX PROTEIN SSB-4 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// BC023083 // GenBank // Mus musculus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:37159 IMAGE:4953500), complete cds. // chr9 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000055433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:96943482:97018843:-1 gene:ENSMUSG00000046997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// BC094332 // GenBank // Mus musculus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:106512 IMAGE:6817091), complete cds. // chr9 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// NM_145134 // RefSeq // Mus musculus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 (Spsb4), mRNA. // chr9 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// BC055705 // GenBank // Mus musculus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:66725 IMAGE:6412566), complete cds. // chr9 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// NONMMUT070574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0
NM_138756 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 36 (Slc25a36), mRNA. // chr9 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000035024 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:97075565:97084470:-1 gene:ENSMUSG00000032449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000085206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:97074961:97111157:-1 gene:ENSMUSG00000032449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// AK037383 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130013B19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
NM_030219 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 42 (Trim42), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:97349562:97369958:-1 gene:ENSMUSG00000032451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:97349739:97369844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_022319 // RefSeq // Mus musculus calsyntenin 2 (Clstn2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006511334 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calsyntenin 2 (Clstn2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000035027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:97444395:98033181:-1 gene:ENSMUSG00000032452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC063058 // GenBank // Mus musculus calsyntenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:66905 IMAGE:5705591), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000162295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:97453257:98032983:-1 gene:ENSMUSG00000032452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// AK048369 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130053D20 product:calsyntenin 2, full insert sequence. // chr9 // 48 // 48 // 19 // 40 // 1 /// GENSCAN00000036278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:97454540:97484370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000036273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:97502041:97623247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
ENSMUST00000061643 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:98186527:98187153:-1 gene:ENSMUSG00000046995 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK011970 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610303G11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_029444 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930579K19 gene (4930579K19Rik), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:98562960:98563611:-1 gene:ENSMUSG00000051074 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AK077474 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730419C05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 88 // 81 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:98562229:98563592:-1 gene:ENSMUSG00000051074 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_025485 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S22 (Mrps22), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000035034 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:98588730:98601660:-1 gene:ENSMUSG00000032459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC021882 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S22, mRNA (cDNA clone IMAGE:3588473), partial cds. // chr9 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC051198 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S22, mRNA (cDNA clone MGC:62894 IMAGE:1396237), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC037653 // GenBank HTC // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S22, mRNA (cDNA clone IMAGE:5363790), with apparent retained intron. // chr9 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000003099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:98588831:98601713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000190150 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:98595176:98601645:-1 gene:ENSMUSG00000032459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENSMUST00000187390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:98873064:98873916:-1 gene:ENSMUSG00000100839 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NR_003248 // RefSeq // Mus musculus forkhead box L2, opposite strand (Foxl2os), long non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000181706 // ENSEMBL // ensembl_havana_lincrna:known chromosome:GRCm38:9:98949781:98955299:-1 gene:ENSMUSG00000097072 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT070626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001080776 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1123 (Gm1123), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000076730 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:99006790:99035715:-1 gene:ENSMUSG00000044860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB262662 // GenBank // Mus musculus CLSP mRNA for CAR-like soluble protein, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC114986 // GenBank // Mus musculus gene model 1123, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:141177 IMAGE:40056015), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC115956 // GenBank // Mus musculus gene model 1123, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:141178 IMAGE:40056016), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:99003521:99105683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_029094 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol 3-kinase, catalytic, beta polypeptide (Pik3cb), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000035037 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:99036654:99140087:-1 gene:ENSMUSG00000032462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000136965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:99038401:99139925:-1 gene:ENSMUSG00000032462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC127073 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol 3-kinase, catalytic, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:150132 IMAGE:40110218), complete cds. // chr9 // 95 // 83 // 18 // 19 // 0 /// AK165230 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F420013G16 product:phosphatidylinositol 3-kinase, catalytic, beta polypeptide, full insert sequence. // chr9 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// GENSCAN00000026156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:99003521:99105683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1
NM_001244762 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6432 (Gm6432), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000178051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:99229376:99237239:-1 gene:ENSMUSG00000096316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000188555 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:99229468:99236370:-1 gene:ENSMUSG00000096316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:99182342:99236347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0
NM_177775 // RefSeq // Mus musculus extended synaptotagmin-like protein 3 (Esyt3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000042158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:99309963:99358518:-1 gene:ENSMUSG00000037681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC118967 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 62, member C, mRNA (cDNA clone MGC:144066 IMAGE:40097262), complete cds. // chr9 // 98 // 85 // 40 // 41 // 0 /// ENSMUST00000186626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:99319569:99322703:-1 gene:ENSMUSG00000037681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 92 // 27 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000187520 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:99319613:99325010:-1 gene:ENSMUSG00000037681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 27 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000026145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:99311641:99358389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0
NM_008624 // RefSeq // Mus musculus muscle and microspikes RAS (Mras), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006510826 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus muscle and microspikes RAS (Mras), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035045 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:99385420:99437381:-1 gene:ENSMUSG00000032470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028768 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 8 (Armc8), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000035043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:99478372:99568899:-1 gene:ENSMUSG00000032468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC038866 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:47965 IMAGE:1230321), complete cds. // chr9 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// NM_001166138 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 8 (Armc8), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 57 // 57 // 26 // 46 // 1 /// BC030311 // GenBank HTC // Mus musculus armadillo repeat containing 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:5369232), with apparent retained intron. // chr9 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// GENSCAN00000026147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:99495862:99537755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 63 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000185524 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:99518804:99568649:-1 gene:ENSMUSG00000032468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 24 // 46 // 1 /// ENSMUST00000186049 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:99518804:99568667:-1 gene:ENSMUSG00000032468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 22 // 46 // 1
NM_011440 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 14 (Sox14), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000054819 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:99874106:99876170:-1 gene:ENSMUSG00000053747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000183065 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:99874220:99875655:-1 gene:ENSMUSG00000053747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC044735 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 14, mRNA (cDNA clone IMAGE:5116317), partial cds. // chr9 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BC055767 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 14, mRNA (cDNA clone IMAGE:6412399), partial cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:99874962:99879145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000122880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:100465708:100486385:-1 gene:ENSMUSG00000044244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC148190 // GenBank HTC // Mus musculus interleukin 20 receptor beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:40053005). // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NM_001033543 // RefSeq // Mus musculus interleukin 20 receptor beta (Il20rb), mRNA. // chr9 // 91 // 91 // 42 // 46 // 1 /// ENSMUST00000098458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:100457719:100486788:-1 gene:ENSMUSG00000044244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 91 // 91 // 42 // 46 // 1 /// ENSMUST00000136606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:100457721:100466875:-1 gene:ENSMUSG00000044244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 54 // 54 // 25 // 46 // 1 /// ENSMUST00000152756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:100459077:100470609:-1 gene:ENSMUSG00000044244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 63 // 63 // 29 // 46 // 1 /// AK137306 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630003B22 product:similar to IL20R-beta [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1
NM_001033543 // RefSeq // Mus musculus interleukin 20 receptor beta (Il20rb), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:100457719:100486788:-1 gene:ENSMUSG00000044244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:100465708:100486385:-1 gene:ENSMUSG00000044244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:100457721:100466875:-1 gene:ENSMUSG00000044244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:100459077:100470609:-1 gene:ENSMUSG00000044244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK137306 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630003B22 product:similar to IL20R-beta [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC148190 // GenBank HTC // Mus musculus interleukin 20 receptor beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:40053005). // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001101483 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member G2 (Slc35g2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:9:100552188:100571090:-1 gene:ENSMUSG00000070287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:100552378:100581241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000011098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:101042703:101077298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
XM_356179 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 5161 (Gm5161), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000075243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:101448501:101449353:-1 gene:ENSMUSG00000061486 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:101438777:101449342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001168296 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor B1 (Ephb1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_173447 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor B1 (Ephb1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000035129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:101922128:102354693:-1 gene:ENSMUSG00000032537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000085169 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:101922571:102354693:-1 gene:ENSMUSG00000032537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC057301 // GenBank // Mus musculus Eph receptor B1, mRNA (cDNA clone MGC:66513 IMAGE:6821724), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000149800 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:102039192:102354693:-1 gene:ENSMUSG00000032537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// AK039530 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330055I17 product:Eph receptor B1, full insert sequence. // chr9 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000034626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:101923486:102042386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
AK082061 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130099E04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK137058 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430056M06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081122 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 63 (Cep63), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006511746 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centrosomal protein 63 (Cep63), transcript variant X8, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000093791 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:102586578:102626124:-1 gene:ENSMUSG00000032534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// KC211185 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 centrosomal protein 63 (Cep63) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000162655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:102586591:102626534:-1 gene:ENSMUSG00000032534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000162960 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:102590399:102621964:-1 gene:ENSMUSG00000032534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// AK143341 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330010B05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// BC048718 // GenBank // Mus musculus centrosomal protein 63, mRNA (cDNA clone IMAGE:6335224), complete cds. // chr9 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000034612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:102593746:102626031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000083532 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:103011417:103011520:-1 gene:ENSMUSG00000065466 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT070751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_009275 // RefSeq // Mus musculus signal recognition particle receptor, B subunit (Srprb), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000035157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:103188032:103202137:-1 gene:ENSMUSG00000032553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC003798 // GenBank // Mus musculus signal recognition particle receptor, B subunit, mRNA (cDNA clone MGC:6065 IMAGE:3490766), complete cds. // chr9 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// U17343 // GenBank // Mus musculus signal recognition particle receptor beta subunit mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000163567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:103189090:103202129:-1 gene:ENSMUSG00000032553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// ENSMUST00000166836 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:103190208:103230307:-1 gene:ENSMUSG00000090639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000003184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:103190208:103230216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_027918 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1300017J02 gene (1300017J02Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000035163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:103250521:103288297:-1 gene:ENSMUSG00000033688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000123530 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:103250624:103288224:-1 gene:ENSMUSG00000033688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000151073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:103250522:103256753:-1 gene:ENSMUSG00000033688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000154357 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:103251837:103266225:-1 gene:ENSMUSG00000033688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 29 // 9 // 10 // 0 /// BC021390 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1300017J02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:29253 IMAGE:5054320), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000150524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:103270793:103288297:-1 gene:ENSMUSG00000033688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// AK076237 // GenBank HTC // Mus musculus 14 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4432406L21 product:weakly similar to INHIBITOR OF CARBONIC ANHYDRASE PRECURSOR [Sus scrofa], full insert sequence. // chr9 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// GENSCAN00000003235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:103232110:103288223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
NM_001002896 // RefSeq // Mus musculus beaded filament structural protein 2, phakinin (Bfsp2), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006511627 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus beaded filament structural protein 2, phakinin (Bfsp2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124310 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:103424920:103480420:-1 gene:ENSMUSG00000032556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000136636 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:103424924:103449096:-1 gene:ENSMUSG00000032556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC062815 // GenBank // Mus musculus beaded filament structural protein 2, phakinin, mRNA (cDNA clone IMAGE:582139), complete cds. // chr9 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC068172 // GenBank // Mus musculus beaded filament structural protein 2, phakinin, mRNA (cDNA clone MGC:92996 IMAGE:30550909), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:103415797:103480436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_025692 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-like modifier activating enzyme 5 (Uba5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_379771 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin-like modifier activating enzyme 5 (Uba5), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000035166 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104046599:104063134:-1 gene:ENSMUSG00000032557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000140768 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104049584:104063063:-1 gene:ENSMUSG00000032557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000144195 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104047650:104056983:-1 gene:ENSMUSG00000032557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// BC019764 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-like modifier activating enzyme 5, mRNA (cDNA clone MGC:25431 IMAGE:3989119), complete cds. // chr9 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104047603:104063762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_145700 // RefSeq // Mus musculus atypical chemokine receptor 4 (Ackr4), mRNA. // chr9 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000050139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:9:104084157:104102560:-1 gene:ENSMUSG00000079355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript gene:ENSMUSG00000041748 // chr9 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000076147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104098141:104126933:-1 gene:ENSMUSG00000079355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// AF306532 // GenBank // Mus musculus chemokine receptor CCR11 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 46 // 18 // 18 // 0 /// AK040316 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430086E16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// AY072796 // GenBank // Mus musculus chemokine receptor CCX CKR mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 64 // 23 // 25 // 0 /// AY072938 // GenBank // Mus musculus chemokine receptor CCX CKR mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr9 // 92 // 64 // 23 // 25 // 0 /// BC140999 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:175960 IMAGE:9055611), complete cds. // chr9 // 96 // 59 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000188000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104098272:104103019:-1 gene:ENSMUSG00000079355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104098694:104105487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// AK029108 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732493F04 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000191199 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104182034:104186935:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000053612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104149413:104234957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000188425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104164782:104168018:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1 /// NONMMUT070786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104189068:104201951:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104149413:104234957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104189068:104201951:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104149413:104234957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000185503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104189068:104201951:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000053612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104149413:104234957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104189068:104201951:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104192483:104200483:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104149413:104234957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104189068:104201951:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104196023:104203347:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104189068:104201951:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104196023:104203347:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104192483:104200483:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000185503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104189068:104201951:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000188592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104196023:104203347:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000189103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104192483:104200483:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104149413:104234957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104189068:104201951:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104196023:104203347:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104149413:104234957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104192483:104200483:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000185503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104189068:104201951:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000188592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104196023:104203347:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104149413:104234957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104196023:104203347:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104149413:104234957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104149413:104234957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163026 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000035170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:104151282:104262930:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AB490693 // GenBank // Mus musculus RME-8 mRNA for receptor mediated endocytosis-8, complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000186788 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:104152317:104246827:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000189299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:104237521:104262903:-1 gene:ENSMUSG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000053612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:104149413:104234957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0
NM_029385 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16 (Nudt16), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035179 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:105129332:105131805:-1 gene:ENSMUSG00000032565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC064048 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16, mRNA (cDNA clone MGC:73567 IMAGE:574013), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006511845 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16 (Nudt16), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000186925 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:105130207:105131773:-1 gene:ENSMUSG00000032565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000186933 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:105129673:105131780:-1 gene:ENSMUSG00000032565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:105129673:105131780:-1 gene:ENSMUSG00000032565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:105124272:105131850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_028562 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700080E11 gene (1700080E11Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035180 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:105143342:105145092:-1 gene:ENSMUSG00000032566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC048436 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700080E11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58122 IMAGE:6773931), complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// FJ211595 // GenBank // Mus musculus testis specific expressed protein 8 (Tseg8) mRNA, complete cds. // chr9 // 89 // 66 // 17 // 19 // 0 /// ENSMUST00000190661 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:105144312:105145076:-1 gene:ENSMUSG00000032566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:105143440:105144928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_026063 // RefSeq // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 2 (Uqcc2), mRNA. // chr9 // 33 // 100 // 8 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025045 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:27122663:27133916:-1 gene:ENSMUSG00000024208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 100 // 8 // 24 // 0 /// BC030629 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900010M23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41028 IMAGE:1054665), complete cds. // chr9 // 33 // 100 // 8 // 24 // 0 /// XM_006524821 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 2 (Uqcc2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// ENSMUST00000118613 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:27122670:27133629:-1 gene:ENSMUSG00000024208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// ENSMUST00000145148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27122668:27133623:-1 gene:ENSMUSG00000024208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// ENSMUST00000187229 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:105545437:105545827:-1 gene:ENSMUSG00000101464 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:105545433:105555919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_001102607 // RefSeq // Mus musculus collagen, type VI, alpha 6 (Col6a6), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000098441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:105687809:105828160:-1 gene:ENSMUSG00000043719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000166431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:105689417:105828085:-1 gene:ENSMUSG00000043719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:105709076:105758759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001102607 // RefSeq // Mus musculus collagen, type VI, alpha 6 (Col6a6), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NM_172927 // RefSeq // Mus musculus collagen, type VI, alpha 6 (Col6a6), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006511733 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collagen, type VI, alpha 6 (Col6a6), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:105774112:105809648:-1 gene:ENSMUSG00000043719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000098441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:105687809:105828160:-1 gene:ENSMUSG00000043719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000166431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:105689417:105828085:-1 gene:ENSMUSG00000043719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC150695 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E330026B02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183606 IMAGE:9087606), complete cds. // chr9 // 81 // 84 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:105759982:105786291:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_001167923 // RefSeq // Mus musculus collagen, type VI, alpha 5 (Col6a5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:105858668:105960643:-1 gene:ENSMUSG00000091345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:105875694:105881806:-1 gene:ENSMUSG00000091345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000190193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:105856078:105960643:-1 gene:ENSMUSG00000091345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:105858510:105948392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001167923 // RefSeq // Mus musculus collagen, type VI, alpha 5 (Col6a5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000165165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:105858668:105960643:-1 gene:ENSMUSG00000091345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000190193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:105856078:105960643:-1 gene:ENSMUSG00000091345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000022120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:105858510:105948392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
NM_026763 // RefSeq // Mus musculus collagen, type VI, alpha 4 (Col6a4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000121963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:105990461:106096783:-1 gene:ENSMUSG00000032572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB370265 // GenBank // Mus musculus Dvwa mRNA for double von Willebrand factor A domains, complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000149207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:105989454:105998322:-1 gene:ENSMUSG00000032572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// AK159050 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K530044N24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000022130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:105990779:106149948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT070816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONMMUT070817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_026447 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1M (Ppm1m), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_198931 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1M (Ppm1m), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000076258 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106194172:106198942:-1 gene:ENSMUSG00000020253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000136431 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:106194947:106196888:-1 gene:ENSMUSG00000020253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000140761 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106194172:106199275:-1 gene:ENSMUSG00000020253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB474373 // GenBank // Mus musculus ppm1m mRNA for protein phosphatase 2C eta-2, complete cds. // chr9 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// AK046387 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230378O15 product:CDNA FLJ32332 FIS, CLONE PROST2005121, WEAKLY SIMILAR TO PROBABLE PROTEIN PHOSPHATASE 2C T23F11.1 (EC 3.1.3.16) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AY332616 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2C eta mRNA, complete cds. // chr9 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106191922:106203349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001276442 // RefSeq // Mus musculus aminoacylase 1 (Acy1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_025371 // RefSeq // Mus musculus aminoacylase 1 (Acy1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000024031 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106432981:106438319:-1 gene:ENSMUSG00000023262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC005631 // GenBank // Mus musculus aminoacylase 1, mRNA (cDNA clone MGC:11593 IMAGE:3964138), complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSMUST00000187324 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106434720:106436381:-1 gene:ENSMUSG00000023262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 93 // 48 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000189097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106432984:106438177:-1 gene:ENSMUSG00000023262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000190803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106434965:106438202:-1 gene:ENSMUSG00000023262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000190972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:106435096:106438319:-1 gene:ENSMUSG00000023262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000022123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106433081:106437722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_001159652 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 62 (Gpr62), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:106463962:106465938:-1 gene:ENSMUSG00000091735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106464651:106465727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONMMUT070850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONMMUT070851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
GENSCAN00000022116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106525152:106562367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0
NM_026645 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing F3 (Iqcf3), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000062917 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106543386:106561631:-1 gene:ENSMUSG00000023577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC049549 // GenBank // Mus musculus IQ motif containing F3, mRNA (cDNA clone MGC:58130 IMAGE:6774389), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// DQ153247 // GenBank // Mus musculus testis-specific IQ motif containing protein 2 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000186668 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:106543795:106561629:-1 gene:ENSMUSG00000023577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1 /// GENSCAN00000022116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106525152:106562367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
NM_026090 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing F4 (Iqcf4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000085111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106568319:106570996:-1 gene:ENSMUSG00000041009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048652 // GenBank // Mus musculus IQ motif containing F4, mRNA (cDNA clone MGC:58792 IMAGE:6772797), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC061014 // GenBank // Mus musculus IQ motif containing F4, mRNA (cDNA clone MGC:74119 IMAGE:6770556), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ153246 // GenBank // Mus musculus testis-specific IQ motif containing protein 1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT070857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_001160353 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 2 (Grm2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023959 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:9:106643117:106656080:-1 gene:ENSMUSG00000023192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC115866 // GenBank // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 2, mRNA (cDNA clone MGC:141474 IMAGE:40081345), complete cds. // chr9 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// AK034263 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330170I02 product:similar to METABOTROPIC GLUTAMATE RECEPTOR 2 PRECURSOR [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENSMUST00000189020 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:106644885:106656082:-1 gene:ENSMUSG00000023192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000022104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106645018:106652766:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000188527 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:106643095:106648103:-1 gene:ENSMUSG00000023192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_030730 // RefSeq // Mus musculus RAD54 like 2 (S. cerevisiae) (Rad54l2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000046502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106688082:106789194:-1 gene:ENSMUSG00000040661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT070862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0
NM_030730 // RefSeq // Mus musculus RAD54 like 2 (S. cerevisiae) (Rad54l2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000046502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106688082:106789194:-1 gene:ENSMUSG00000040661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC133714 // GenBank // Mus musculus RAD54 like 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:161371 IMAGE:40143565), complete cds. // chr9 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000037253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106692716:106754086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0
ENSMUST00000055843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106880918:106887428:-1 gene:ENSMUSG00000074102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000045365 // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000098424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:106880929:106882289:-1 gene:ENSMUSG00000074102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC057609 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6400417, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr9 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
NM_175402 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 15B (Rbm15b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106880918:106887428:-1 gene:ENSMUSG00000074102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000045365 // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052180 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 15B, mRNA (cDNA clone MGC:59501 IMAGE:6332977), complete cds. // chr9 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106883250:106886967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153413 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cyto-kinesis 3 (Dock3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000044532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:106892834:107231909:-1 gene:ENSMUSG00000039716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// AY145302 // GenBank // Mus musculus modifier of cell adhesion mRNA, complete cds. // chr9 // 98 // 100 // 52 // 53 // 0 /// ENSMUST00000167053 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:107051116:107231868:-1 gene:ENSMUSG00000039716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 17 // 17 // 9 // 53 // 1 /// ENSMUST00000171095 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:106893106:106913154:-1 gene:ENSMUSG00000039716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 19 // 19 // 10 // 53 // 1 /// AK172930 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0299 protein. // chr9 // 17 // 17 // 9 // 53 // 1 /// GENSCAN00000037261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:106895394:107149487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 43 // 43 // 0
NM_019720 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b-561 domain containing 2 (Cyb561d2), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006511776 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome b-561 domain containing 2 (Cyb561d2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000041459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107539011:107541865:-1 gene:ENSMUSG00000037190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF131206 // GenBank // Mus musculus 101F6 protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC027212 // GenBank // Mus musculus cytochrome b-561 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:25578 IMAGE:3993231), complete cds. // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000037242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107539882:107541175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000180865 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:9:107558810:107568412:-1 gene:ENSMUSG00000097099 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000181099 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:9:107562850:107568415:-1 gene:ENSMUSG00000097099 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK044848 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130007O15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC094226 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6849439. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONMMUT070899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT070901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
XM_003688868 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine-rich single-pass membrane protein 2 (Lsmem2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006544440 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine-rich single-pass membrane protein 2 (Lsmem2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006544441 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine-rich single-pass membrane protein 2 (Lsmem2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107593369:107605077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_008138 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting 2 (Gnai2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107614138:107635342:-1 gene:ENSMUSG00000032562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK160186 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310075M19 product:guanine nucleotide binding protein, alpha inhibiting 2, full insert sequence. // chr9 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC006695 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3583047), partial cds. // chr9 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// BC065159 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting 2, mRNA (cDNA clone MGC:90102 IMAGE:5717305), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// M13963 // GenBank // Mouse inhibitory G protein of adenylate cyclase, alpha chain mRNA, complete cds. // chr9 // 80 // 77 // 16 // 20 // 0 /// XM_006511637 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting 2 (Gnai2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// BC037130 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4912684), complete cds. // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000037246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107615635:107635217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// S71213 // GenBank // G protein Gi2 alpha [mice, CBA/J, cochlea, mRNA Partial, 1548 nt]. // chr9 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
NM_008140 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha transducing 1 (Gnat1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000010205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107674477:107679592:-1 gene:ENSMUSG00000034837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC022793 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha transducing 1, mRNA (cDNA clone MGC:27622 IMAGE:4505478), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC051412 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha transducing 1, mRNA (cDNA clone MGC:58940 IMAGE:6490986), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC058810 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha transducing 1, mRNA (cDNA clone MGC:65291 IMAGE:6490797), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107675888:107705542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_011349 // RefSeq // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F (Sema3f), mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000080560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:107681502:107710475:-1 gene:ENSMUSG00000034684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AF080090 // GenBank // Mus musculus semaphorin IV isoform b mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 86 // 33 // 36 // 0 /// AF080091 // GenBank // Mus musculus semaphorin IV isoform a mRNA, complete cds. // chr9 // 91 // 79 // 30 // 33 // 0 /// BC010976 // GenBank // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F, mRNA (cDNA clone MGC:13813 IMAGE:4219060), complete cds. // chr9 // 92 // 86 // 33 // 36 // 0 /// AK140340 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430210F12 product:sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3 F, full insert sequence. // chr9 // 76 // 76 // 32 // 42 // 1 /// GENSCAN00000023834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107675888:107705542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 81 // 81 // 34 // 42 // 1 /// AK172610 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830219E14 product:sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3 F, full insert sequence. // chr9 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1
NM_011251 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 6 (Rbm6), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NM_029169 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 6 (Rbm6), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000035201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:107773559:107872724:-1 gene:ENSMUSG00000032582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000183032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:107773563:107872821:-1 gene:ENSMUSG00000032582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC026129 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:13760 IMAGE:3982861), complete cds. // chr9 // 86 // 91 // 18 // 21 // 0 /// XM_006511653 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 6 (Rbm6), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1 /// ENSMUST00000181986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:107773567:107872763:-1 gene:ENSMUSG00000032582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1 /// GENSCAN00000023856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107777450:107852595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
ENSMUST00000182445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:107868841:107873237:-1 gene:ENSMUSG00000032582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:107853322:107872421:-1 gene:ENSMUSG00000032582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK029954 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932410M19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT070925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026597 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 212, member A (Fam212a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:107984227:107985879:-1 gene:ENSMUSG00000042106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000175914 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:107984633:107985632:-1 gene:ENSMUSG00000042106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 82 // 44 // 9 // 11 // 0 /// BC115538 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6230427J02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144382 IMAGE:40101503), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:107984267:107985747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_146226 // RefSeq // Mus musculus acylpeptide hydrolase (Apeh), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006511723 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acylpeptide hydrolase (Apeh), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006511724 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acylpeptide hydrolase (Apeh), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 53 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000081309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108085417:108094480:-1 gene:ENSMUSG00000032590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC025494 // GenBank // Mus musculus acylpeptide hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:38101 IMAGE:5310043), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// BC034199 // GenBank // Mus musculus acylpeptide hydrolase, mRNA (cDNA clone IMAGE:4986562), partial cds. // chr9 // 100 // 37 // 16 // 16 // 0 /// AK041271 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530096D22 product:weakly similar to ACYLAMINO-ACID-RELEASING ENZYME (EC 3.4.19.1) (ACYL-PEPTIDE HYDROLASE) (APH) (ACYLAMINOACYL-PEPTIDASE) [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr9 // 72 // 72 // 31 // 43 // 1 /// GENSCAN00000023835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108085572:108094446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0
NM_007567 // RefSeq // Mus musculus bassoon (Bsn), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000035208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:108096022:108190384:-1 gene:ENSMUSG00000032589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000124763 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:108096023:108110413:-1 gene:ENSMUSG00000032589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// GENSCAN00000023837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108102838:108126739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0
NM_133986 // RefSeq // Mus musculus T cell leukemia translocation altered gene (Tcta), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006511620 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T cell leukemia translocation altered gene (Tcta), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000044725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108302959:108305951:-1 gene:ENSMUSG00000039461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019397 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia translocation altered gene, mRNA (cDNA clone MGC:25540 IMAGE:3672301), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT070961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0
NM_001135198 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 36 (Ccdc36), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006511763 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 36 (Ccdc36), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// XM_006511765 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 36 (Ccdc36), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// XM_006511766 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 36 (Ccdc36), transcript variant X7, mRNA. // chr9 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000076592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108403642:108428484:-1 gene:ENSMUSG00000047220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC058624 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 36, mRNA (cDNA clone IMAGE:5716219), partial cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_030075 // RefSeq // Mus musculus kelch domain containing 8B (Klhdc8b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006511857 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch domain containing 8B (Klhdc8b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000035232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108447658:108452377:-1 gene:ENSMUSG00000032609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// AK087143 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030029M19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// AK154428 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630031A04 product:hypothetical Kelch motif/Kelch repeat containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC048918 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 8B, mRNA (cDNA clone MGC:56870 IMAGE:6309434), complete cds. // chr9 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// BC060089 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 8B, mRNA (cDNA clone IMAGE:6401045). // chr9 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000023830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108448289:108451092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT070967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr9 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0
NM_023247 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, assembly factor 3 (Ndufaf3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108565866:108567342:-1 gene:ENSMUSG00000070283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF235017 // GenBank // Mus musculus 2P1 protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027513 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4733401H18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41068 IMAGE:5118121), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK014634 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4733401H18 product:NUCLEAR PROTEIN E3-3 ORF1 homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr9 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108565959:108566927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_031392 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 6 (Wdr6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000068700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108572313:108578670:-1 gene:ENSMUSG00000066357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB041854 // GenBank // Mus musculus wdp122 mRNA for WD-repeat protein p122, complete cds. // chr9 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// AF348591 // GenBank // Mus musculus WD repeat protein WDR6 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC035951 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:4506719), complete cds. // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC050894 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 6, mRNA (cDNA clone MGC:63325 IMAGE:5708880), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC054367 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 6, mRNA (cDNA clone MGC:62549 IMAGE:5346943), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108572950:108597564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
XR_379773 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prolyl 4-hydroxylase, transmembrane (endoplasmic reticulum) (P4htm), transcript variant X1, misc_RNA. // chr9 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NM_028944 // RefSeq // Mus musculus prolyl 4-hydroxylase, transmembrane (endoplasmic reticulum) (P4htm), mRNA. // chr9 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// ENSMUST00000006853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108578826:108597600:-1 gene:ENSMUSG00000006675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// BC111871 // GenBank // Mus musculus prolyl 4-hydroxylase, transmembrane (endoplasmic reticulum), mRNA (cDNA clone MGC:130597 IMAGE:40057593), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// AK161992 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720433L13 product:hypothetical EF-Hand-like/Calcium-binding EF-hand containing protein, full insert sequence. // chr9 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// AK038927 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230076F11 product:RIKEN cDNA 4933406E20 gene, full insert sequence. // chr9 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000023862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108572950:108597564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_011790 // RefSeq // Mus musculus ariadne homolog 2 (Drosophila) (Arih2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006511729 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ariadne homolog 2 (Drosophila) (Arih2), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000013338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108602942:108649380:-1 gene:ENSMUSG00000064145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC051998 // GenBank // Mus musculus ariadne homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:62314 IMAGE:6400287), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC052422 // GenBank // Mus musculus ariadne homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:63426 IMAGE:6400287), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AF124664 // GenBank // Mus musculus UbcM4 interacting protein 48 mRNA, complete cds. // chr9 // 82 // 82 // 9 // 11 // 1 /// AJ130975 // GenBank // Mus musculus mRNA for Ariadne-2 protein. // chr9 // 82 // 82 // 9 // 11 // 1 /// AK045012 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130019F02 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr9 // 82 // 82 // 9 // 11 // 1 /// GENSCAN00000023852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108605082:108644277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
ENSMUST00000083740 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:108738752:108738858:-1 gene:ENSMUSG00000065674 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr9 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONMMUT070990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
ENSMUST00000160217 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:109057933:109074071:-1 gene:ENSMUSG00000025646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF319574 // GenBank // Mus musculus 3-5 exonuclease Trex1 (Trex1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC011133 // GenBank // Mus musculus three prime repair exonuclease 1, mRNA (cDNA clone MGC:18819 IMAGE:4206812), complete cds. // chr9 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:109057936:109074097:-1 gene:ENSMUSG00000025646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 89 // 89 // 34 // 38 // 1 /// NM_001012236 // RefSeq // Mus musculus three prime repair exonuclease 1 (Trex1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// NM_011637 // RefSeq // Mus musculus three prime repair exonuclease 1 (Trex1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// ENSMUST00000061973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:109057933:109059734:-1 gene:ENSMUSG00000049734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// ENSMUST00000112053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:109057938:109059251:-1 gene:ENSMUSG00000049734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// AF151106 // GenBank // Mus musculus 3-5 exonuclease TREX1 mRNA, complete cds. // chr9 // 66 // 66 // 25 // 38 // 1 /// GENSCAN00000016480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109057977:109082342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1
XM_006512422 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102640028 (LOC102640028), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:109093844:109097796:-1 gene:ENSMUSG00000025644 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK083067 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530042I03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// AK142995 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030030L16 product:hypothetical Proline-rich region profile/Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177069 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 21 (Fbxw21), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000054925 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:109139454:109162041:-1 gene:ENSMUSG00000047237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120329 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:109142363:109162021:-1 gene:ENSMUSG00000047237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000142715 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:109143278:109148118:-1 gene:ENSMUSG00000047237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AK135949 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420440J21 product:Similar to F-box protein FBX12 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC099397 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E330009P21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117557 IMAGE:30936381), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109139500:109339622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 96 // 20 // 26 // 0
NM_177598 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 13 (Fbxw13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006512033 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 13 (Fbxw13), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061456 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:109179227:109195975:-1 gene:ENSMUSG00000049314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000173549 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:109181526:109195520:-1 gene:ENSMUSG00000049314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000173606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:109179227:109195975:-1 gene:ENSMUSG00000049314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC119542 // GenBank // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:141227 IMAGE:40056515), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC127237 // GenBank // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:157442 IMAGE:40056507), complete cds. // chr9 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109139500:109339622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 72 // 89 // 18 // 25 // 0
NM_001008428 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 20 (Fbxw20), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000079548 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:109217432:109234754:-1 gene:ENSMUSG00000061701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000125706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:109220343:109234733:-1 gene:ENSMUSG00000061701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// AK135785 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420416E20 product:similar to F-box only protein 12 [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 94 // 74 // 16 // 17 // 0 /// BC085247 // GenBank // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 12, mRNA (cDNA clone MGC:103250 IMAGE:30477089), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109139500:109339622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 82 // 74 // 14 // 17 // 0
NM_001014395 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 22 (Fbxw22), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000080626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:109378411:109404296:-1 gene:ENSMUSG00000070324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_177070 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 16 (Fbxw16), mRNA. // chr9 // 67 // 54 // 14 // 21 // 0 /// ENSMUST00000084984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:109432319:109449140:-1 gene:ENSMUSG00000074062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 67 // 54 // 14 // 21 // 0 /// BC100319 // GenBank // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 16, mRNA (cDNA clone MGC:117551 IMAGE:30940137), complete cds. // chr9 // 67 // 54 // 14 // 21 // 0 /// NM_177703 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 19 (Fbxw19), mRNA. // chr9 // 54 // 54 // 21 // 39 // 1 /// ENSMUST00000076617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:109478570:109495875:-1 gene:ENSMUSG00000074061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 54 // 54 // 21 // 39 // 1 /// XM_006512082 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 19 (Fbxw19), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1 /// GENSCAN00000016472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109378895:109526041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 18 // 39 // 1 /// AK085629 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630049A02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1
NM_199036 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 15 (Fbxw15), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000056745 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:109552604:109568262:-1 gene:ENSMUSG00000074060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// DQ067445 // GenBank // Mus musculus early ovarian protein-1 (Eop1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC099378 // GenBank // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:117507 IMAGE:30936553), complete cds. // chr9 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000016471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109535036:109623633:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_001013776 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 24 (Fbxw24), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000073962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:109601117:109626059:-1 gene:ENSMUSG00000062275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GQ418172 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c ovarian specific protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109535036:109623633:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSMUST00000103823 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:19319686:19319795:1 gene:ENSMUSG00000095529 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000179918 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:60174317:60174426:1 gene:ENSMUSG00000094901 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000102440 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:82408458:82408543:1 gene:ENSMUSG00000076395 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 48 // 100 // 10 // 21 // 0 /// NONMMUT025793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT032519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT024376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 48 // 100 // 10 // 21 // 0
NM_001033794 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 18 (Fbxw18), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000098359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:109676734:109702700:-1 gene:ENSMUSG00000074059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC139081 // GenBank // Mus musculus expressed sequence C85627, mRNA (cDNA clone MGC:170708 IMAGE:8862103), complete cds. // chr9 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109671956:109789454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_198674 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 26 (Fbxw26), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000071917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:109717566:109746089:-1 gene:ENSMUSG00000059547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006512170 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 26 (Fbxw26), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1
NR_033215 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3000002C10 gene (3000002C10Rik), non-coding RNA. // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000125451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:109830176:109832706:-1 gene:ENSMUSG00000070282 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000133495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:109830374:109831381:-1 gene:ENSMUSG00000070282 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000144161 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:109827943:109832702:-1 gene:ENSMUSG00000070282 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061210 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30250313, containing frame-shift errors. // chr9 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000014051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109830374:109831381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_009921 // RefSeq // Mus musculus cathelicidin antimicrobial peptide (Camp), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:109847375:109849456:-1 gene:ENSMUSG00000038357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC120752 // GenBank // Mus musculus cathelicidin antimicrobial peptide, mRNA (cDNA clone MGC:155989 IMAGE:40129675), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC120754 // GenBank // Mus musculus cathelicidin antimicrobial peptide, mRNA (cDNA clone MGC:155991 IMAGE:40129677), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// U43409 // GenBank // Mus musculus cathelin related antimicrobial peptide, mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:109847435:109849434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
ENSMUST00000082943 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:110121680:110121805:-1 gene:ENSMUSG00000064877 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONMMUT071060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
ENSMUST00000168137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110372048:110375430:-1 gene:ENSMUSG00000091102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK134160 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830462I19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081043 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 23 (Ptpn23), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110385089:110408210:-1 gene:ENSMUSG00000036057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110385253:110408117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_177771 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 18 (Klhl18), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000068025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:110425928:110476694:-1 gene:ENSMUSG00000054792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000111933 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:110425928:110462480:-1 gene:ENSMUSG00000054792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000111934 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:110425928:110476689:-1 gene:ENSMUSG00000054792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000149190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:110425928:110476590:-1 gene:ENSMUSG00000054792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000150173 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:110437362:110447077:-1 gene:ENSMUSG00000054792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AK044774 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930041K15 product:CDNA FLJ13703 FIS, CLONE PLACE2000246, WEAKLY SIMILAR TO RING CANAL PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC025563 // GenBank // Mus musculus kelch-like 18 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:36415 IMAGE:5322893), complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110428631:110476594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_026012 // RefSeq // Mus musculus neurotrophin receptor associated death domain (Nradd), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006512241 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurotrophin receptor associated death domain (Nradd), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000035069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110621137:110624393:-1 gene:ENSMUSG00000032491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF534394 // GenBank // Mus musculus death domain containing membrane protein NRADD (Nradd) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC039808 // GenBank // Mus musculus neurotrophin receptor associated death domain, mRNA (cDNA clone MGC:48230 IMAGE:1547029), complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC069856 // GenBank // Mus musculus neurotrophin receptor associated death domain, mRNA (cDNA clone MGC:78037 IMAGE:6491606), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110621421:110639863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_183276 // RefSeq // Mus musculus neurobeachin-like 2 (Nbeal2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// ENSMUST00000130024 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:110625043:110638617:-1 gene:ENSMUSG00000056724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000131017 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:110625043:110632051:-1 gene:ENSMUSG00000056724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 39 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000133191 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:110624789:110654161:-1 gene:ENSMUSG00000056724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// ENSMUST00000149089 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:110638318:110645368:-1 gene:ENSMUSG00000056724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 20 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000167320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110624789:110654161:-1 gene:ENSMUSG00000056724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// BC157956 // GenBank // Mus musculus neurobeachin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:189784 IMAGE:9007284), complete cds. // chr9 // 98 // 100 // 55 // 56 // 0 /// BC172118 // GenBank // Mus musculus neurobeachin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:198823 IMAGE:9054404), complete cds. // chr9 // 98 // 98 // 54 // 55 // 0 /// GENSCAN00000014039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110621421:110639863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000028685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110641411:110653947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 18 // 10 // 10 // 0
NM_001083935 // RefSeq // Mus musculus parathyroid hormone 1 receptor (Pth1r), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NM_001083936 // RefSeq // Mus musculus parathyroid hormone 1 receptor (Pth1r), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NM_011199 // RefSeq // Mus musculus parathyroid hormone 1 receptor (Pth1r), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006511986 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus parathyroid hormone 1 receptor (Pth1r), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000006005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110722088:110742610:-1 gene:ENSMUSG00000032492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000166716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110722088:110743686:-1 gene:ENSMUSG00000032492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC013446 // GenBank // Mus musculus parathyroid hormone 1 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:18447 IMAGE:4241234), complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC051981 // GenBank // Mus musculus parathyroid hormone 1 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:62276 IMAGE:6402767), complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110722254:110733640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_146260 // RefSeq // Mus musculus transmembrane inner ear (Tmie), mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006512007 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane inner ear (Tmie), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000050958 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:110865711:110880113:-1 gene:ENSMUSG00000049555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF481143 // GenBank // Mus musculus putative integral membrane protein TMIE (Tmie) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC138840 // GenBank // Mus musculus transmembrane inner ear, mRNA (cDNA clone MGC:170467 IMAGE:8861862), complete cds. // chr9 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0 /// BC141124 // GenBank // Mus musculus transmembrane inner ear, mRNA (cDNA clone MGC:176085 IMAGE:9055736), complete cds. // chr9 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000028682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:110866860:110873891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0
AK134015 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830408C04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_011562 // RefSeq // Mus musculus teratocarcinoma-derived growth factor 1 (Tdgf1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000035075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110939610:110946158:-1 gene:ENSMUSG00000032494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC052646 // GenBank // Mus musculus teratocarcinoma-derived growth factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:60569 IMAGE:30029798), complete cds. // chr9 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// M87321 // GenBank // Mouse cripto gene mRNA, complete cds. // chr9 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0 /// AK163969 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330018M09 product:teratocarcinoma-derived growth factor, full insert sequence. // chr9 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1
XM_006512112 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus receptor transporter protein 3 (Rtp3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC150678 // GenBank // Mus musculus receptor transporter protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:183589 IMAGE:9087589), complete cds. // chr9 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// NM_153100 // RefSeq // Mus musculus receptor transporter protein 3 (Rtp3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// BC112903 // GenBank // Mus musculus receptor transporter protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:118000 IMAGE:4196964), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// ENSMUST00000084922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:110985871:110989611:-1 gene:ENSMUSG00000066319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// AY562227 // GenBank // Mus musculus receptor transporting protein 3 (Rtp3) mRNA, complete cds. // chr9 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_017466 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor-like 2 (Ccrl2), mRNA. // chr9 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:111054835:111057270:-1 gene:ENSMUSG00000043953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AB009384 // GenBank // Mus musculus mRNA for L-CCR, complete cds. // chr9 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// AF030185 // GenBank // Mus musculus putative beta chemokine receptor (E01) mRNA, complete cds. // chr9 // 75 // 86 // 18 // 24 // 0 /// AF316576 // GenBank // Mus musculus putative beta chemokine receptor (E01) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC038631 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:47919 IMAGE:1347006), complete cds. // chr9 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// CT010248 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D0751D for gene Ccrl2, Chemokine (C-C motif) receptor-like 2; complete cds, incl. stopcodon. // chr9 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// XM_006512186 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor-like 2 (Ccrl2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000028694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:111048805:111075505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_016853 // RefSeq // Mus musculus src homology three (SH3) and cysteine rich domain (Stac), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000035083 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:111561437:111690348:-1 gene:ENSMUSG00000032502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107325 // GenBank // Mus musculus src homology three (SH3) and cysteine rich domain, mRNA (cDNA clone MGC:130287 IMAGE:40054255), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC107326 // GenBank // Mus musculus src homology three (SH3) and cysteine rich domain, mRNA (cDNA clone MGC:130288 IMAGE:40054256), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// D86639 // GenBank // Mus musculus mRNA for stac, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161995 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:111561437:111690225:-1 gene:ENSMUSG00000032502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// GENSCAN00000028690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:111534337:111635085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NR_029823 // RefSeq // Mus musculus microRNA 128-2 (Mir128-2), microRNA. // chr9 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000083507 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:112118632:112118715:-1 gene:ENSMUSG00000065441 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-128-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000726 Mus musculus miR-128-2 stem-loop // chr9 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// NONMMUT071120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0
XM_006512408 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain-containing protein 36A-like (LOC102631503), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_486266 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4921528I07 gene (4921528I07Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000072612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:114276683:114317028:-1 gene:ENSMUSG00000064299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// AK077029 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932416M14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// XM_006512411 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4921528I07 gene (4921528I07Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000046566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114238913:114304649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// GENSCAN00000046569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114130985:114191425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_019922 // RefSeq // Mus musculus cartilage associated protein (Crtap), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000084881 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:114375134:114390675:-1 gene:ENSMUSG00000032431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:114375150:114378221:-1 gene:ENSMUSG00000032431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AK198132 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0127D14, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000035004, based on BLAT search. // chr9 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// BC049890 // GenBank // Mus musculus cartilage associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:54548 IMAGE:6306169), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114375529:114390599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0
NM_009916 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 4 (Ccr4), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006511933 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 4 (Ccr4), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:114490316:114496544:-1 gene:ENSMUSG00000047898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC117041 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:151418 IMAGE:40126360), complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC119171 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:155487 IMAGE:8733920), complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// U15208 // GenBank // Mus musculus chemokine receptor mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 74 // 23 // 25 // 0 /// X90862 // GenBank // M.musculus mRNA for c-c chemokine receptor-4. // chr9 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// XM_006511932 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 4 (Ccr4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// GENSCAN00000046563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114491913:114492995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0
NM_001042503 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 71 (Trim71), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:114507133:114564369:-1 gene:ENSMUSG00000079259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ005956 // GenBank // Mus musculus LIN41 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114512645:114563117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000024431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114629007:114648035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
NM_001252479 // RefSeq // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 7 (Cmtm7), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000084867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:114756837:114781993:-1 gene:ENSMUSG00000032436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC038633 // GenBank // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:47938 IMAGE:1066813), complete cds. // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NM_133978 // RefSeq // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 7 (Cmtm7), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000035009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:114756837:114781993:-1 gene:ENSMUSG00000032436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// AF188504 // GenBank // Mus musculus LNV (Lnv) mRNA, complete cds. // chr9 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// AY241869 // GenBank // Mus musculus chemokine-like factor superfamily 7 mRNA, complete cds. // chr9 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// AK040123 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430066G09 product:LNV homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr9 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114755559:114797426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_027294 // RefSeq // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 8 (Cmtm8), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000047013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:114789345:114844152:-1 gene:ENSMUSG00000041012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY243513 // GenBank // Mus musculus chemokine-like factor superfamily member 8 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC027554 // GenBank // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:41386 IMAGE:1382818), complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AK137729 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930118E22 product:chemokine-like factor super family 8, full insert sequence. // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000024445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114755559:114797426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_175380 // RefSeq // Mus musculus glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like (Gpd1l), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000084853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:114903346:114933879:-1 gene:ENSMUSG00000050627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000129305 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:114900438:114909076:-1 gene:ENSMUSG00000050627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000146623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:114899341:114933987:-1 gene:ENSMUSG00000050627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK050572 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920001L03 product:similar to GLYCEROL-3-PHOSPHATE DEHYDROGENASE [NAD+], CYTOPLASMIC (EC 1.1.1.8) (GPD-C) (GPDH-C) [Fugu rubripes], full insert sequence. // chr9 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// BC051522 // GenBank HTC // Mus musculus glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:1477343), with apparent retained intron. // chr9 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// BC138976 // GenBank // Mus musculus glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:170603 IMAGE:8861998), complete cds. // chr9 // 96 // 66 // 22 // 23 // 0 /// BC138980 // GenBank // Mus musculus glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:170607 IMAGE:8862002), complete cds. // chr9 // 96 // 66 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:114902255:114960773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0
NM_024222 // RefSeq // Mus musculus STT3, subunit of the oligosaccharyltransferase complex, homolog B (S. cerevisiae) (Stt3b), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000035010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:115242607:115310421:-1 gene:ENSMUSG00000032437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC013054 // GenBank // Mus musculus STT3, subunit of the oligosaccharyltransferase complex, homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:3585599), partial cds. // chr9 // 86 // 41 // 12 // 14 // 0 /// BC052433 // GenBank // Mus musculus STT3, subunit of the oligosaccharyltransferase complex, homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:64679 IMAGE:6837097), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:115243965:115310439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000075898 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:115437700:115438581:-1 gene:ENSMUSG00000074034 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:115437700:115438581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000082810 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:115626600:115626718:-1 gene:ENSMUSG00000094630 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT071252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_009371 // RefSeq // Mus musculus transforming growth factor, beta receptor II (Tgfbr2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NM_029575 // RefSeq // Mus musculus transforming growth factor, beta receptor II (Tgfbr2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000035014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:116087698:116175363:-1 gene:ENSMUSG00000032440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000061101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:116087698:116175363:-1 gene:ENSMUSG00000032440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// AF406755 // GenBank // Mus musculus TGF-beta type II receptor protein mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 67 // 27 // 28 // 0 /// AK053793 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130308L18 product:transforming growth factor, beta receptor II, full insert sequence. // chr9 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// S69114 // GenBank // Mus musculus type II transforming growth factor-beta receptor mRNA, complete cds. // chr9 // 78 // 64 // 21 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:116090378:116175037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// D32072 // GenBank // Mus musculus mRNA for TGF-b type II receptor isoform, complete cds. // chr9 // 79 // 79 // 33 // 42 // 1
XM_006512413 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, CW type with PWWP domain 2 (Zcwpw2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006512414 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, CW type with PWWP domain 2 (Zcwpw2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC104378 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CW type with PWWP domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:129466 IMAGE:40050114), complete cds. // chr9 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// ENSMUST00000111769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:117876000:118013998:-1 gene:ENSMUSG00000032443 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// AK015254 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930430K04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// ENSMUST00000191100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:117911996:118014160:-1 gene:ENSMUSG00000032443 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// NONMMUT071305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0
NM_026442 // RefSeq // Mus musculus COX assembly mitochondrial protein 1 (Cmc1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000044220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:118064529:118150196:-1 gene:ENSMUSG00000039163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC048547 // GenBank // Mus musculus COX assembly mitochondrial protein homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:6590111), partial cds. // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC056653 // GenBank // Mus musculus COX assembly mitochondrial protein homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:67651 IMAGE:5068125), complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0
NM_001293648 // RefSeq // Mus musculus phospholipase C, delta 1 (Plcd1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_019676 // RefSeq // Mus musculus phospholipase C, delta 1 (Plcd1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NR_121571 // RefSeq // Mus musculus phospholipase C, delta 1 (Plcd1), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006511984 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase C, delta 1 (Plcd1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XR_379860 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase C, delta 1 (Plcd1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000010804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119071527:119093496:-1 gene:ENSMUSG00000010660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF133125 // GenBank // Mus musculus phospholipase C delta-1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC015249 // GenBank // Mus musculus phospholipase C, delta 1, mRNA (cDNA clone MGC:18330 IMAGE:4241580), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC025798 // GenBank // Mus musculus phospholipase C, delta 1, mRNA (cDNA clone MGC:35909 IMAGE:5068610), complete cds. // chr9 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// JN635596 // GenBank // Mus musculus phospholipase C delta 1 Lf mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// U85711 // GenBank // Mus musculus phospholipase C delta-1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119071802:119088179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_146230 // RefSeq // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acyltransferase 1B (Acaa1b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000010795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:119148023:119157093:-1 gene:ENSMUSG00000010651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AY273812 // GenBank // Mus musculus 3-ketoacyl-CoA thiolase B mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC019882 // GenBank // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acyltransferase 1B, mRNA (cDNA clone MGC:29978 IMAGE:5123887), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// XM_006512113 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acetyl-Coenzyme A acyltransferase 1B (Acaa1b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1 /// XM_006512116 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acetyl-Coenzyme A acyltransferase 1B (Acaa1b), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
NM_001037749 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 14 (Slc22a14), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000093775 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:119169455:119190407:-1 gene:ENSMUSG00000070280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000152061 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:119169668:119173652:-1 gene:ENSMUSG00000070280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000170400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119169456:119365553:-1 gene:ENSMUSG00000070280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC100471 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 14, mRNA (cDNA clone MGC:118292 IMAGE:30917628), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000028311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119165346:119209060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
NM_133980 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 13 (Slc22a13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000084797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119193002:119209105:-1 gene:ENSMUSG00000074028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF529220 // GenBank // Mus musculus organic cation transporter-like 3 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC021449 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 13, mRNA (cDNA clone MGC:29241 IMAGE:5044564), complete cds. // chr9 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000028311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119165346:119209060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
NR_033303 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 13b, pseudogene (Slc22a13b-ps), non-coding RNA. // chr9 // 94 // 77 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000173185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:119220488:119231692:-1 gene:ENSMUSG00000092212 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr9 // 94 // 77 // 16 // 17 // 0 /// AK079093 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330176C04 product:hypothetical General substrate transporters containing protein, full insert sequence. // chr9 // 94 // 77 // 16 // 17 // 0 /// BC147282 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9330176C04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182462 IMAGE:9056356), complete cds. // chr9 // 93 // 64 // 13 // 14 // 0 /// BC147283 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9330176C04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182449 IMAGE:9056343), complete cds. // chr9 // 93 // 64 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119220830:119231692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
NM_133985 // RefSeq // Mus musculus oxidative-stress responsive 1 (Oxsr1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NR_045693 // RefSeq // Mus musculus oxidative-stress responsive 1 (Oxsr1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000040853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:119238432:119322427:-1 gene:ENSMUSG00000036737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000128880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:119240670:119322322:-1 gene:ENSMUSG00000036737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000143728 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:119242768:119264772:-1 gene:ENSMUSG00000036737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// BC060645 // GenBank // Mus musculus oxidative-stress responsive 1, mRNA (cDNA clone MGC:79215 IMAGE:6852021), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000028303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119241142:119322074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0
NM_010851 // RefSeq // Mus musculus myeloid differentiation primary response gene 88 (Myd88), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035092 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:119335934:119340041:-1 gene:ENSMUSG00000032508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000150837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:119335946:119340002:-1 gene:ENSMUSG00000032508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC005591 // GenBank // Mus musculus myeloid differentiation primary response gene 88, mRNA (cDNA clone MGC:5902 IMAGE:3482246), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC051075 // GenBank // Mus musculus myeloid differentiation primary response gene 88, mRNA (cDNA clone IMAGE:6315380). // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058787 // GenBank // Mus musculus myeloid differentiation primary response gene 88, mRNA (cDNA clone MGC:65269 IMAGE:6309465), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ790885 // GenBank // Mus musculus mutant MyD88-Poc mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// DQ790886 // GenBank // Mus musculus mutant MyD88-Lkd mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// U84409 // GenBank // Mus musculus IL-1 receptor related protein MyD88 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119337356:119339959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001253860 // RefSeq // Mus musculus sodium channel, voltage-gated, type V, alpha (Scn5a), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NM_021544 // RefSeq // Mus musculus sodium channel, voltage-gated, type V, alpha (Scn5a), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000065196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119483408:119562678:-1 gene:ENSMUSG00000032511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000117911 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:119483410:119579016:-1 gene:ENSMUSG00000032511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120420 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:119484324:119579016:-1 gene:ENSMUSG00000032511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119485578:119588919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_001205321 // RefSeq // Mus musculus sodium channel, voltage-gated, type X, alpha (Scn10a), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_009134 // RefSeq // Mus musculus sodium channel, voltage-gated, type X, alpha (Scn10a), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000084787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119608456:119719032:-1 gene:ENSMUSG00000034533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY538273 // GenBank // Mus musculus tetrodotoxin resistant sodium channel Nav1.8 (Scn10a) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK135787 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420416G14 product:sodium channel, voltage-gated, type X, alpha polypeptide, full insert sequence. // chr9 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000014917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119613521:119710189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_011887 // RefSeq // Mus musculus sodium channel, voltage-gated, type XI, alpha (Scn11a), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000070617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119753763:119825456:-1 gene:ENSMUSG00000034115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB031389 // GenBank // Mus musculus mRNA for voltage-gated sodium channel alpha subunit NaT/Scn11a, complete cds. // chr9 // 85 // 96 // 23 // 27 // 0 /// AF118044 // GenBank // Mus musculus voltage-gated sodium channel NaN (Scn11a) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119754250:119819995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_009987 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X3-C motif) receptor 1 (Cx3cr1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:120048693:120068282:-1 gene:ENSMUSG00000052336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119901616:120068283:-1 gene:ENSMUSG00000052336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC012653 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X3-C) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:13785 IMAGE:4017224), complete cds. // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_028976 // RefSeq // Mus musculus golgi reassembly stacking protein 1 (Gorasp1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000035099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:119925673:119937558:-1 gene:ENSMUSG00000032513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC012251 // GenBank // Mus musculus golgi reassembly stacking protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:19028 IMAGE:4166619), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119926996:119937517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_011724 // RefSeq // Mus musculus xin actin-binding repeat containing 1 (Xirp1), mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000111635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:120013755:120023598:-1 gene:ENSMUSG00000079243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AF051945 // GenBank // Mus musculus Xin mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC117959 // GenBank // Mus musculus xin actin-binding repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:144145 IMAGE:40098186), complete cds. // chr9 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC117960 // GenBank // Mus musculus xin actin-binding repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:144146 IMAGE:40098187), complete cds. // chr9 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:119972240:120045796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
AK076698 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930415L07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_105330 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5922 (Gm5922), transcript variant X1, misc_RNA. // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// XR_380000 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5922 (Gm5922), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:120135367:120135789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// KnowTID_00007842 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT071388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000082463 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:9:120791465:120791785:-1 gene:ENSMUSG00000064397 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT071403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001284508 // RefSeq // Mus musculus cholecystokinin (Cck), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_031161 // RefSeq // Mus musculus cholecystokinin (Cck), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// XM_006511928 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cholecystokinin (Cck), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121489825:121495689:-1 gene:ENSMUSG00000032532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC028487 // GenBank // Mus musculus cholecystokinin, mRNA (cDNA clone MGC:41001 IMAGE:1400830), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000002854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:121490068:121494530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 49 // 16 // 17 // 0
NM_026915 // RefSeq // Mus musculus lysozyme-like 4 (Lyzl4), mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006512247 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lysozyme-like 4 (Lyzl4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:121577843:121641566:-1 gene:ENSMUSG00000032530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000125075 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:121584087:121641526:-1 gene:ENSMUSG00000032530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 44 // 13 // 14 // 0 /// AY572449 // GenBank // Mus musculus lysozyme-like protein 4 (Lyc4) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC024932 // GenBank // Mus musculus lysozyme-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:28166 IMAGE:3985345), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000120918 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:121577849:121642096:-1 gene:ENSMUSG00000032530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// AK007412 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810009N24 product:similar to LYC4 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000002920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:121578025:121584472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0
NM_001164562 // RefSeq // Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homolog C (S. cerevisiae) (Sec22c), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_178677 // RefSeq // Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homolog C (S. cerevisiae) (Sec22c), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006512042 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homolog C (S. cerevisiae) (Sec22c), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006512044 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homolog C (S. cerevisiae) (Sec22c), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000078547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121680047:121705029:-1 gene:ENSMUSG00000061536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000111560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:121683022:121705465:-1 gene:ENSMUSG00000061536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000132733 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:121688198:121690473:-1 gene:ENSMUSG00000061536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000139193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:121684551:121704979:-1 gene:ENSMUSG00000061536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC046289 // GenBank // Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homolog C (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:54833 IMAGE:6469221), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:121684658:121693045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_029095 // RefSeq // Mus musculus hedgehog acyltransferase-like (Hhatl), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NR_027967 // RefSeq // Mus musculus hedgehog acyltransferase-like (Hhatl), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006512379 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hedgehog acyltransferase-like (Hhatl), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006512380 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hedgehog acyltransferase-like (Hhatl), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000035110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121784016:121792507:-1 gene:ENSMUSG00000032523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000163981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121784022:121791036:-1 gene:ENSMUSG00000032523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AK157924 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930008J10 product:hypothetical Membrane bound O-acyl transferase, MBOAT/Arginase/agmatinase/formiminoglutamase containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC024464 // GenBank // Mus musculus hedgehog acyltransferase-like, mRNA (cDNA clone MGC:37329 IMAGE:4975643), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006512382 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hedgehog acyltransferase-like (Hhatl), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// GENSCAN00000034779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:121784116:121852587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
AY028387 // GenBank // Mus musculus clone 10 unknown mRNA. // chr9 // 91 // 79 // 10 // 11 // 0 /// BC132371 // GenBank // Mus musculus HIG1 domain family, member 1A, mRNA (cDNA clone MGC:164002 IMAGE:40130648), complete cds. // chr9 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// NM_019814 // RefSeq // Mus musculus HIG1 domain family, member 1A (Higd1a), mRNA. // chr9 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// ENSMUST00000060251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121848560:121858000:-1 gene:ENSMUSG00000038412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NM_010012 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 8, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp8b1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000062474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:121914356:121916305:-1 gene:ENSMUSG00000050445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF090317 // GenBank // Mus musculus sterol 12-alpha hydroxylase CYP8B1 (Cyp8b1) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC010973 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 8, subfamily b, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:13797 IMAGE:4161038), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC010974 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 8, subfamily b, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:13798 IMAGE:4162964), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC049969 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 8, subfamily b, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:59021 IMAGE:4158774), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:121914762:121916264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AK079907 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530001C04 product:cytochrome P450, 8b1, sterol 12 alpha-hydrolase, full insert sequence. // chr9 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0
NM_001289558 // RefSeq // Mus musculus protein O-linked mannose beta 1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2 (Pomgnt2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_001289559 // RefSeq // Mus musculus protein O-linked mannose beta 1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2 (Pomgnt2), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001289560 // RefSeq // Mus musculus protein O-linked mannose beta 1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2 (Pomgnt2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_153540 // RefSeq // Mus musculus protein O-linked mannose beta 1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2 (Pomgnt2), transcript variant 4, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006512046 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein O-linked mannose beta 1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2 (Pomgnt2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000084743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121981606:121996026:-1 gene:ENSMUSG00000066235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC025056 // GenBank // Mus musculus expressed sequence C85492, mRNA (cDNA clone MGC:36955 IMAGE:4947177), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC030931 // GenBank // Mus musculus expressed sequence C85492, mRNA (cDNA clone MGC:31712 IMAGE:4914234), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:121981971:121983713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_001271873 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 10 (Ano10), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_133979 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 10 (Ano10), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006511911 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anoctamin 10 (Ano10), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006511916 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anoctamin 10 (Ano10), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:122175879:122294374:-1 gene:ENSMUSG00000037949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK043011 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730047M10 product:CDNA FLJ10375 FIS, CLONE NT2RM2001950 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK054163 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230024F15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// AK079622 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330079O04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK138414 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230098E02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC099688 // GenBank // Mus musculus anoctamin 10, mRNA (cDNA clone MGC:106272 IMAGE:6313494), complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:122205921:122348475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000180685 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:9:122306130:122310928:-1 gene:ENSMUSG00000097572 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK143364 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330016A15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// KnowTID_00007852 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173364 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 445 (Zfp445), mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000056467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:122851914:122862128:-1 gene:ENSMUSG00000047036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AY341877 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 445 mRNA, complete cds. // chr9 // 91 // 72 // 21 // 23 // 0 /// BC099896 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 445, mRNA (cDNA clone MGC:102211 IMAGE:30545532), complete cds. // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC099930 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 445, mRNA (cDNA clone MGC:107357 IMAGE:30058096), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:122837818:122862128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_025419 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1110059G10 gene (1110059G10Rik), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035154 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:122945089:122951000:-1 gene:ENSMUSG00000032551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118422 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:122947535:122950953:-1 gene:ENSMUSG00000032551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK012115 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610511H23 product:similar to RIKEN CDNA 1110059G10 GENE [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0 /// BC034133 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110059G10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:31735 IMAGE:4921846), complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK140383 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B630007D16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000033020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:122947894:122950912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT071506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
AK016980 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933429E06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133974 // RefSeq // Mus musculus CUB domain containing protein 1 (Cdcp1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000039229 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:123170824:123216038:-1 gene:ENSMUSG00000035498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000148158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:123173064:123178106:-1 gene:ENSMUSG00000035498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC085253 // GenBank // Mus musculus CUB domain containing protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:102289 IMAGE:5347122), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:123180763:123215999:-1 gene:ENSMUSG00000035498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr9 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// AK035674 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530085A06 product:Similar to CUB domain containing protein 1, full insert sequence. // chr9 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:123173503:123215909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001002267 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 158 (Tmem158), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:123259058:123260789:-1 gene:ENSMUSG00000054871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB114272 // GenBank // Mus musculus mbbp mRNA for BINP binding protein p40BBP, complete cds. // chr9 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC139427 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 158, mRNA (cDNA clone MGC:171054 IMAGE:8862449), complete cds. // chr9 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC139428 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 158, mRNA (cDNA clone MGC:171055 IMAGE:8862450), complete cds. // chr9 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:123259685:123260545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000040960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:123636122:123678885:-1 gene:ENSMUSG00000036814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AJ428067 // GenBank // Mus musculus mRNA for X transporter protein 3 similar 1 (Xtrp3s1 gene). // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_139142 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 20A (Slc6a20a), mRNA. // chr9 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// BC118933 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 20A, mRNA (cDNA clone MGC:143558 IMAGE:40090800), complete cds. // chr9 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// ENSMUST00000170591 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:9:123656269:123678782:-1 gene:ENSMUSG00000036814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// ENSMUST00000171647 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:123636996:123678806:-1 gene:ENSMUSG00000036814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// GENSCAN00000004923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:123636996:123687877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1
NM_033322 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper transcription factor-like 1 (Lztfl1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000026274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:123697012:123717625:-1 gene:ENSMUSG00000025245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000098258 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:9:123697012:123712624:-1 gene:ENSMUSG00000025245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000165754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:123694416:123717625:-1 gene:ENSMUSG00000025245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000166097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:123697012:123717528:-1 gene:ENSMUSG00000025245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr9 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// AK147312 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1012D21 product:leucine zipper transcription factor-like 1, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC026840 // GenBank // Mus musculus leucine zipper transcription factor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:28486 IMAGE:4165152), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001110253 // RefSeq // Mus musculus FYVE and coiled-coil domain containing 1 (Fyco1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_148925 // RefSeq // Mus musculus FYVE and coiled-coil domain containing 1 (Fyco1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000084715 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:123789886:123851566:-1 gene:ENSMUSG00000025241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000167595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:123789510:123851899:-1 gene:ENSMUSG00000025241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000184082 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:123830013:123851881:-1 gene:ENSMUSG00000025241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// AK081259 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030034C12 product:similar to FYVE AND COILED-COIL DOMAIN CONTAINING 1 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr9 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000004960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:123815224:123843513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0
NM_011798 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C motif) receptor 1 (Xcr1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182350 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:9:123852315:123862029:-1 gene:ENSMUSG00000060509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC141368 // GenBank // Mus musculus chemokine (C motif) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:176330 IMAGE:9055981), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC141369 // GenBank // Mus musculus chemokine (C motif) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:176331 IMAGE:9055982), complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000004966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:123855679:123856695:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_009912 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 1 (Ccr1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:123962126:123968692:-1 gene:ENSMUSG00000025804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011092 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:18743 IMAGE:3992755), complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_007718 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 1-like 1 (Ccr1l1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:123976949:123978408:-1 gene:ENSMUSG00000064039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127143 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:156358 IMAGE:40051964), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC128466 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:156359 IMAGE:40051965), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:123977338:123978408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000082387 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:1:68:1 gene:ENSMUSG00000064336 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:1-68, tRNA-Phe // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082388 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:70:1024:1 gene:ENSMUSG00000064337 gene_biotype:Mt_rRNA transcript_biotype:Mt_rRNA // chrM // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:70-1024, s-rRNA // chrM // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT071573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrM // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT071574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrM // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000082389 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:1025:1093:1 gene:ENSMUSG00000064338 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:1025-1093, tRNA-Val // chrM // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT071576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000082390 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:1094:2675:1 gene:ENSMUSG00000064339 gene_biotype:Mt_rRNA transcript_biotype:Mt_rRNA // chrM // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC052873 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30031607. // chrM // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:1094-2675, 16S ribosomal RNA // chrM // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT071577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrM // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT071578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrM // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT071581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrM // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// AK138995 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530052O07 product:NADH dehydrogenase subunit 1 (EC 1.6.5.3) (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrM // 82 // 82 // 18 // 22 // 1 /// GU332588 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c clone 3 antisense RNA, complete sequence; mitochondrial. // chrM // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
ENSMUST00000082391 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:2676:2750:1 gene:ENSMUSG00000064340 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK138995 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530052O07 product:NADH dehydrogenase subunit 1 (EC 1.6.5.3) (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrM // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:2676-2750, tRNA-Leu // chrM // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT071578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrM // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT071582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000082392 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:2751:3707:1 gene:ENSMUSG00000064341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000082393 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:3706:3774:1 gene:ENSMUSG00000064342 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AK138995 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530052O07 product:NADH dehydrogenase subunit 1 (EC 1.6.5.3) (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrM // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NC_005089 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 1, Mitochondrion [Mus musculus] // chrM // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:3706-3774, tRNA-Ile // chrM // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT071578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrM // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NONMMUT071583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000082395 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:3845:3913:1 gene:ENSMUSG00000064344 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK139000 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530057D15 product:NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 (EC 1.6.5.3) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrM // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:3845-3913, tRNA-Met // chrM // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT071585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000082396 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:3914:4951:1 gene:ENSMUSG00000064345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK139000 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530057D15 product:NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 (EC 1.6.5.3) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrM // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// AK153847 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920021L11 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chrM // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK167184 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0037M17 product:NADH dehydrogenase subunit 2 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrM // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NC_005089 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 2, Mitochondrion [Mus musculus] // chrM // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000082402 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:5328:6872:1 gene:ENSMUSG00000064351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117219 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:22588103:22589647:-1 gene:ENSMUSG00000083563 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrM // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:24615706:24616197:-1 gene:ENSMUSG00000101249 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrM // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NC_005089 // GenBank // cytochrome c oxidase subunit I, Mitochondrion [Mus musculus] // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrM // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT036058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chrM // 76 // 100 // 19 // 25 // 0
ENSMUST00000082405 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:7013:7696:1 gene:ENSMUSG00000064354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF378830 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit II (Cox2) mRNA, complete cds; mitochondrial gene for mitochondrial product. // chrM // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:22587291:22587962:-1 gene:ENSMUSG00000083863 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrM // 60 // 86 // 15 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:24614885:24615565:-1 gene:ENSMUSG00000102070 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrM // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00000407 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chrM // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NC_005089 // GenBank // cytochrome c oxidase subunit II, Mitochondrion [Mus musculus] // chrM // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrM // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT036057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chrM // 60 // 86 // 15 // 25 // 0
ENSMUST00000082406 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:7700:7764:1 gene:ENSMUSG00000064355 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:7700-7764, tRNA-Lys // chrM // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT071593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000082409 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:8607:9390:1 gene:ENSMUSG00000064358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 100 // 22 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000082410 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:9391:9458:1 gene:ENSMUSG00000064359 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 39 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082411 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:9459:9806:1 gene:ENSMUSG00000064360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 100 // 39 // 25 // 25 // 0 /// AK139029 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530086A05 product:NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 (EC 1.6.5.3) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrM // 100 // 39 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:24612775:24613119:-1 gene:ENSMUSG00000101939 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrM // 96 // 39 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:24613189:24613971:-1 gene:ENSMUSG00000101111 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrM // 100 // 22 // 14 // 14 // 0 /// NC_005089 // GenBank // cytochrome c oxidase subunit III, Mitochondrion [Mus musculus] // chrM // 100 // 22 // 14 // 14 // 0 /// NC_005089 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 3, Mitochondrion [Mus musculus] // chrM // 100 // 39 // 25 // 25 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:9391-9458, tRNA-Gly // chrM // 100 // 39 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 39 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082410 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:9391:9458:1 gene:ENSMUSG00000064359 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:9391-9458, tRNA-Gly // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082411 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:9459:9806:1 gene:ENSMUSG00000064360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139029 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530086A05 product:NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 (EC 1.6.5.3) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:24612775:24613119:-1 gene:ENSMUSG00000101939 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrM // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NC_005089 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 3, Mitochondrion [Mus musculus] // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082412 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:9808:9875:1 gene:ENSMUSG00000064361 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:9808-9875, tRNA-Arg // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082414 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:10167:11544:1 gene:ENSMUSG00000064363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 100 // 40 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000084013 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:9877:10173:1 gene:ENSMUSG00000065947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:24612407:24612700:-1 gene:ENSMUSG00000067736 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrM // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187714 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:24611535:24612410:-1 gene:ENSMUSG00000100131 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrM // 92 // 29 // 11 // 12 // 0 /// BC050862 // GenBank HTC // Mus musculus lactation elevated 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6508207), **** WARNING: chimeric clone ****. // chrM // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NC_005089 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 4L, Mitochondrion [Mus musculus] // chrM // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// NC_005089 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 4, Mitochondrion [Mus musculus] // chrM // 100 // 40 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000082415 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:11546:11612:1 gene:ENSMUSG00000064364 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:11546-11612, tRNA-His // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082416 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:11613:11671:1 gene:ENSMUSG00000064365 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000082417 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:11671:11741:1 gene:ENSMUSG00000064366 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:11613-11671, tRNA-Ser // chrM // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:11671-11741, tRNA-Leu // chrM // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT071598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT071599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 48 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000082418 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:11742:13565:1 gene:ENSMUSG00000064367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NC_005089 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 5, Mitochondrion [Mus musculus] // chrM // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC081549 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4910858, partial cds. // chrM // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
ENSMUST00000082421 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:14145:15288:1 gene:ENSMUSG00000064370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC055952 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4484770, **** WARNING: chimeric clone ****. // chrM // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NC_005089 // GenBank // cytochrome b, Mitochondrion [Mus musculus] // chrM // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// X57779 // GenBank // M.musculus mRNA for mitochondrial gene for cytochrome b. // chrM // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// AK131866 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010016D17 product:Cytochrome b homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrM // 70 // 100 // 14 // 20 // 0
ENSMUST00000082422 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:15289:15355:1 gene:ENSMUSG00000064371 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:15289-15355, tRNA-Thr // chrM // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT071603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000082394 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:3772:3842:-1 gene:ENSMUSG00000064343 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:c3842-3772, tRNA-Gln // chrM // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT071584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000082398 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:5018:5086:-1 gene:ENSMUSG00000064347 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:c5086-5018, tRNA-Ala // chrM // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT071587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000082399 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:5089:5159:-1 gene:ENSMUSG00000064348 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:c5159-5089, tRNA-Asn // chrM // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT071588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000082400 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:5192:5257:-1 gene:ENSMUSG00000064349 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:c5257-5192, tRNA-Cys // chrM // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT071589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000082401 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:5260:5326:-1 gene:ENSMUSG00000064350 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:c5326-5260, tRNA-Tyr // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082403 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:6870:6938:-1 gene:ENSMUSG00000064352 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:c6938-6870, tRNA-Ser // chrM // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT071591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AF188286 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 9 (Bmp9) mRNA, complete cds. // chrM // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// BC104337 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40049146. // chrM // 87 // 92 // 20 // 23 // 0
ENSMUST00000082419 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:13552:14070:-1 gene:ENSMUSG00000064368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK138272 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230051L08 product:NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 (EC 1.6.5.3) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrM // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC071253 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4975091, **** WARNING: chimeric clone ****. // chrM // 68 // 68 // 15 // 22 // 1 /// NC_005089 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 6, Mitochondrion [Mus musculus] // chrM // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT071600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrM // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000082420 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:14071:14139:-1 gene:ENSMUSG00000064369 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:c14139-14071, tRNA-Glu // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082423 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:15356:15422:-1 gene:ENSMUSG00000064372 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NC_005089 // GenBank // gi|34538597|ref|NC_005089.1|:c15422-15356, tRNA-Pro // chrM // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT071604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrM // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_177363 // RefSeq // Mus musculus T cell-interacting, activating receptor on myeloid cells 1 (Tarm1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006539979 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T cell-interacting, activating receptor on myeloid cells 1 (Tarm1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006539982 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T cell-interacting, activating receptor on myeloid cells 1 (Tarm1), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000065703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:3489079:3502465:-1 gene:ENSMUSG00000053338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// DQ973493 // GenBank // Mus musculus Oscar-like transcript-2 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:3487012:3515611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_001013813 // RefSeq // Mus musculus mastermind like 2 (Drosophila) (Maml2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK040022 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430045K06 product:hypothetical Type I antifreeze protein containing protein, full insert sequence. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC053388 // GenBank // Mus musculus mastermind like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:60867 IMAGE:30054622), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000004596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:13298064:13299807:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// KnowTID_00007856 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT071569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_207175 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 239 (Olfr239), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000112165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:33199062:33200009:1 gene:ENSMUSG00000093884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC127988 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 239, mRNA (cDNA clone MGC:157556 IMAGE:40135639), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC134364 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 239, mRNA (cDNA clone MGC:157557 IMAGE:40135640), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000041161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33199053:33200009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001277957 // RefSeq // Mus musculus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, A (Taf1a), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001277958 // RefSeq // Mus musculus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, A (Taf1a), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001277959 // RefSeq // Mus musculus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, A (Taf1a), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_021466 // RefSeq // Mus musculus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, A (Taf1a), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000097043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:183388981:183409353:1 gene:ENSMUSG00000072258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK040747 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530022L03 product:TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, A, full insert sequence. // chr1 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// BC061106 // GenBank // Mus musculus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, A, mRNA (cDNA clone MGC:74226 IMAGE:6595990), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC138425 // GenBank // Mus musculus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, A, mRNA (cDNA clone MGC:170050 IMAGE:8861445), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:183390924:183439294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_030175 // RefSeq // Mus musculus hedgehog interacting protein-like 2 (Hhipl2), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006535603 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hedgehog interacting protein-like 2 (Hhipl2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006535604 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hedgehog interacting protein-like 2 (Hhipl2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000065900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:183418503:183437053:1 gene:ENSMUSG00000053461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AK019671 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930507C10 product:similar to CDNA FLJ13840 FIS, CLONE THYRO1000783, MODERATELY SIMILAR TO XENOPUS LAEVIS TAIL-SPECIFIC THYROID HORMONE UP-REGULATED (GENE 5) MRNA [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC034362 // GenBank // Mus musculus hedgehog interacting protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:27771 IMAGE:3154701), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:183390924:183439294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1
NM_001030293 // RefSeq // Mus musculus sprouty homolog 3 (Drosophila) (Spry3), mRNA. // chrX_GL456233_random // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000076951 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:GRCm38:GL456233.1:101352:106395:-1 gene:ENSMUSG00000061654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX_GL456233_random // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132135 // GenBank // Mus musculus sprouty homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:163766 IMAGE:40130412), complete cds. // chrX_GL456233_random // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// BC132137 // GenBank // Mus musculus sprouty homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:163768 IMAGE:40130414), complete cds. // chrX_GL456233_random // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// NONMMUT074738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX_GL456233_random // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_153523 // RefSeq // Mus musculus 2-cell-stage, variable group, member 3 (Tcstv3), mRNA. // chr13 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000178349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:120317567:120318076:1 gene:ENSMUSG00000095821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AF067060 // GenBank // Mus musculus clone L3 variable group of 2-cell-stage gene family mRNA, complete cds. // chr13 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// BC125501 // GenBank // Mus musculus 2-cell-stage, variable group, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:159204 IMAGE:40130016), complete cds. // chr13 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// BC125503 // GenBank // Mus musculus 2-cell-stage, variable group, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:159206 IMAGE:40130018), complete cds. // chr13 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// GENSCAN00000028381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:120313188:120318076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001037925 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC147527 (BC147527), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006517732 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC147527 (BC147527), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000081558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:120308146:120308649:1 gene:ENSMUSG00000094796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC147527 // GenBank // Mus musculus similar to 2-cell-stage, variable group, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:182625 IMAGE:9056519), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC147545 // GenBank // Mus musculus similar to 2-cell-stage, variable group, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:182642 IMAGE:9056536), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:120308146:120308649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000079524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:120240670:120241158:1 gene:ENSMUSG00000063846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AF067063 // GenBank // Mus musculus clone L2 uniform group of 2-cell-stage gene family mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000179455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:119828089:119828678:-1 gene:ENSMUSG00000094237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 71 // 54 // 10 // 14 // 0 /// AF067064 // GenBank // Mus musculus clone L5 uniform group of 2-cell-stage gene family mRNA, complete cds. // chr13 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// BC117098 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AF067063, mRNA (cDNA clone MGC:151475 IMAGE:40126417), complete cds. // chr13 // 71 // 54 // 10 // 14 // 0 /// BC117100 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AF067063, mRNA (cDNA clone MGC:151477 IMAGE:40126419), complete cds. // chr13 // 71 // 54 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:119828167:119837220:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000028378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:120222482:120241212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_027861 // RefSeq // Mus musculus BRO1 domain and CAAX motif containing (Brox), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000057062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:183276342:183297008:-1 gene:ENSMUSG00000046836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC030340 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610010K06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:40682 IMAGE:3498026), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001278218 // RefSeq // Mus musculus dispatched homolog 1 (Drosophila) (Disp1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001278219 // RefSeq // Mus musculus dispatched homolog 1 (Drosophila) (Disp1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001278220 // RefSeq // Mus musculus dispatched homolog 1 (Drosophila) (Disp1), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_026866 // RefSeq // Mus musculus dispatched homolog 1 (Drosophila) (Disp1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000003035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:183086264:183221529:-1 gene:ENSMUSG00000030768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:183086270:183147461:-1 gene:ENSMUSG00000030768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK004521 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1190008H24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY150577 // GenBank // Mus musculus dispatched (Disp) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY150698 // GenBank // Mus musculus dispatched A mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC043102 // GenBank // Mus musculus dispatched homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:58022 IMAGE:6406376), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC059225 // GenBank // Mus musculus dispatched homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:66645 IMAGE:6406376), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:183086289:183135860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC085271 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC085271, mRNA (cDNA clone MGC:103372 IMAGE:30146389), complete cds. // chr1 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0 /// GENSCAN00000012867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:183205547:183206416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_177389 // RefSeq // Mus musculus melanoma inhibitory activity 3 (Mia3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// ENSMUST00000069922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:183326725:183369529:-1 gene:ENSMUSG00000056050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// AK044749 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930039G15 product:weakly similar to NPIP-LIKE PROTEIN (FRAGMENT) [Cercopithecus aethiops], full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// GENSCAN00000012865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:183325840:183369529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 100 // 57 // 58 // 0
NM_020279 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 28 (Ccl28), mRNA. // chr13 // 91 // 91 // 40 // 44 // 1 /// XM_006517727 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 28 (Ccl28), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 91 // 91 // 40 // 44 // 1 /// ENSMUST00000099241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:119623819:119654354:1 gene:ENSMUSG00000074715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 91 // 91 // 40 // 44 // 1 /// BC040510 // GenBank // Mus musculus, clone IMAGE:4973001, mRNA. // chr13 // 91 // 91 // 40 // 44 // 1 /// BC055864 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 28, mRNA (cDNA clone MGC:67995 IMAGE:4240191), complete cds. // chr13 // 91 // 91 // 40 // 44 // 1 /// AF220238 // GenBank // Mus musculus CC chemokine CCL28 (ScyA28) mRNA, complete cds. // chr13 // 66 // 66 // 29 // 44 // 1 /// AK014821 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921506E08 product:small inducible cytokine A28, full insert sequence. // chr13 // 91 // 100 // 40 // 44 // 0 /// GENSCAN00000028367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:119623873:119685379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1
ENSMUST00000179905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:13:120263191:120264364:1 gene:ENSMUSG00000095071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 72 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000181748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:13:120263114:120264517:1 gene:ENSMUSG00000095071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// AF067061 // GenBank // Mus musculus clone L8 variable group of 2-cell-stage gene family mRNA, complete cds. // chr13 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// AF067062 // GenBank // Mus musculus clone L4 variable group of 2-cell-stage gene family mRNA, complete cds. // chr13 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// BC115951 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AF067061, mRNA (cDNA clone MGC:141038 IMAGE:40049464), complete cds. // chr13 // 92 // 72 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000028370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:120258534:120264317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 67 // 11 // 12 // 0
ENSMUST00000118680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:5859717:5861540:1 gene:ENSMUSG00000081486 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:5869686:5871506:-1 gene:ENSMUSG00000083939 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:5832555:5861540:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:5869683:5871470:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021431 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 11 (Nudt11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000103007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:6047453:6055110:1 gene:ENSMUSG00000073295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AK036077 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630032L23 product:nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 10, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY152853 // GenBank // Mus musculus diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase type 3 (Nudt11) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC071274 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 11, mRNA (cDNA clone MGC:78376 IMAGE:6331160), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000101968 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:6106891:6107009:1 gene:ENSMUSG00000075918 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT071682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001040459 // RefSeq // Mus musculus shroom family member 4 (Shroom4), mRNA. // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527549 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus shroom family member 4 (Shroom4), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000089520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:6577286:6637448:1 gene:ENSMUSG00000068270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000103005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:6399854:6633837:1 gene:ENSMUSG00000068270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AK173129 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1202 protein. // chrX // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// BC151022 // GenBank // Mus musculus shroom family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:183935 IMAGE:9087935), complete cds. // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// DQ435686 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J KIAA1202 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// DQ435687 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c KIAA1202 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000143641 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:6415742:6583540:1 gene:ENSMUSG00000068270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000016345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:6494198:6633717:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 69 // 24 // 25 // 0
NM_177914 // RefSeq // Mus musculus diacylglycerol kinase kappa (Dgkk), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000067410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:6779306:6948362:1 gene:ENSMUSG00000062393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000145302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:6873484:6948363:1 gene:ENSMUSG00000062393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC075627 // GenBank // Mus musculus diacylglycerol kinase kappa, mRNA (cDNA clone MGC:92983 IMAGE:6852516), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:6866200:6944724:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001042542 // RefSeq // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 4 (Akap4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NM_009651 // RefSeq // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 4 (Akap4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000057101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7067519:7078609:1 gene:ENSMUSG00000050089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000115750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7067520:7078604:1 gene:ENSMUSG00000050089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000115751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:7068213:7078591:1 gene:ENSMUSG00000050089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC130271 // GenBank // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:161363 IMAGE:40143193), complete cds. // chrX // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// U07423 // GenBank // Mus musculus major fibrous sheath protein mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// U10341 // GenBank // Mus musculus major 80,000 Mr fibrous sheath component (Fsc1) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7054626:7133639:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// AK016930 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933426G17 product:A kinase anchor protein 4, full insert sequence. // chrX // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NR_026741 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 14379 (Gm14379), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128858 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7375925:7378042:1 gene:ENSMUSG00000087252 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029473 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 3F, opposite strand (Ppp1r3fos), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144719 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7573600:7581015:1 gene:ENSMUSG00000039545 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7574492:7578415:1 gene:ENSMUSG00000039545 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK019695 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930524L23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009305 // RefSeq // Mus musculus synaptophysin (Syp), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000069520 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7638471:7653256:1 gene:ENSMUSG00000031144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000128890 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:7638722:7644294:1 gene:ENSMUSG00000031144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000137515 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7639761:7644242:1 gene:ENSMUSG00000031144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000150572 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7639305:7644283:1 gene:ENSMUSG00000031144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// BC014823 // GenBank // Mus musculus synaptophysin, mRNA (cDNA clone MGC:25678 IMAGE:4507116), complete cds. // chrX // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC115644 // GenBank // Mus musculus synaptophysin, mRNA (cDNA clone IMAGE:40103057), partial cds. // chrX // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000149795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7638638:7647369:1 gene:ENSMUSG00000031144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// AK034291 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330174D21 product:synaptophysin, full insert sequence. // chrX // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// GENSCAN00000033509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7638711:7667690:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001290624 // RefSeq // Mus musculus prickle homolog 3 (Drosophila) (Prickle3), mRNA. // chrX // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527652 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prickle homolog 3 (Drosophila) (Prickle3), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000033485 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7657260:7667958:1 gene:ENSMUSG00000031145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000123172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7662763:7667953:1 gene:ENSMUSG00000031145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000129662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:7658533:7668186:1 gene:ENSMUSG00000031145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK083704 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030068I23 product:LIM only 6, full insert sequence. // chrX // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC032173 // GenBank HTC // Mus musculus prickle homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5151571), containing frame-shift errors. // chrX // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// BC049258 // GenBank // Mus musculus prickle homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:55089 IMAGE:5250488), complete cds. // chrX // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7638711:7667690:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_173747 // RefSeq // Mus musculus G patch domain and KOW motifs (Gpkow), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000049896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7697131:7710262:1 gene:ENSMUSG00000031148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC092224 // GenBank // Mus musculus G patch domain and KOW motifs, mRNA (cDNA clone MGC:116648 IMAGE:30355916), complete cds. // chrX // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// BC120679 // GenBank // Mus musculus G patch domain and KOW motifs, mRNA (cDNA clone MGC:155916 IMAGE:40129602), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC125335 // GenBank // Mus musculus G patch domain and KOW motifs, mRNA (cDNA clone MGC:159038 IMAGE:40129850), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000033499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7697226:7708245:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 85 // 85 // 11 // 13 // 1
NM_138602 // RefSeq // Mus musculus PRA1 domain family 2 (Praf2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000033489 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7728439:7731064:1 gene:ENSMUSG00000031149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF229636 // GenBank // Mus musculus DXImx39e protein (DXImx39e) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC064757 // GenBank // Mus musculus PRA1 domain family 2, mRNA (cDNA clone MGC:76556 IMAGE:30056020), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000121084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7752130:7752414:1 gene:ENSMUSG00000082617 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000033504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7749784:7752414:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_008423 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Shal-related family, member 1 (Kcnd1), mRNA. // chrX // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000009875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7822289:7838280:1 gene:ENSMUSG00000009731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK033805 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230112B12 product:potassium voltage-gated channel, Shal-related family, member 1, full insert sequence. // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC139325 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Shal-related family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:170952 IMAGE:8862347), complete cds. // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC139327 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Shal-related family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:170954 IMAGE:8862349), complete cds. // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// M64226 // GenBank // Mouse potassium channel protein (mShal) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7823843:7882517:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 88 // 88 // 29 // 33 // 1
NM_138606 // RefSeq // Mus musculus proviral integration site 2 (Pim2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000033495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7878302:7883432:1 gene:ENSMUSG00000031155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000145177 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:7878618:7881402:1 gene:ENSMUSG00000031155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// BC027376 // GenBank // Mus musculus proviral integration site 2, mRNA (cDNA clone MGC:37188 IMAGE:4954711), complete cds. // chrX // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// L41495 // GenBank // Mus musculus protein-serine/threonine kinase (pim-2) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000126715 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7878262:7880322:1 gene:ENSMUSG00000031155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// AK043570 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830008N09 product:proviral integration site 2, full insert sequence. // chrX // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// ENSMUST00000190448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:7878306:7883428:1 gene:ENSMUSG00000031155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT071750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7823843:7882517:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 70 // 70 // 16 // 23 // 1
NM_011591 // RefSeq // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 17b (Timm17b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006527581 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 17b (Timm17b), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000033498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7899357:7908351:1 gene:ENSMUSG00000031158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000146406 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:7899671:7906330:1 gene:ENSMUSG00000031158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// ENSMUST00000150541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7906114:7906970:1 gene:ENSMUSG00000031158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AF106621 // GenBank // Mus musculus mitochondrial inner membrane translocase component Tim17b mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK151396 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830029A08 product:translocator of inner mitochondrial membrane 17b, full insert sequence. // chrX // 80 // 38 // 8 // 10 // 0 /// BC008275 // GenBank // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 17b, mRNA (cDNA clone MGC:6564 IMAGE:2811777), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000033494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7899444:7906576:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000086274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:7909542:7909927:1 gene:ENSMUSG00000073290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK138187 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230027I11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013892 // RefSeq // Mus musculus proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 inhibitor (Pcsk1n), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000041096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7919822:7924410:1 gene:ENSMUSG00000039278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF181560 // GenBank // Mus musculus proSAAS gene, complete cds. // chrX // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// AF293356 // GenBank // Mus musculus IA4 mRNA, complete cds. // chrX // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// BC012263 // GenBank // Mus musculus proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 inhibitor, mRNA (cDNA clone MGC:19107 IMAGE:4207854), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7919931:7923103:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000119726 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:8047229:8047399:1 gene:ENSMUSG00000068243 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000018357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:8047229:8047399:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT071756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NR_003632 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6787 (Gm6787), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:8097087:8106701:1 gene:ENSMUSG00000086404 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:8105294:8106113:1 gene:ENSMUSG00000081042 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chrX // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONMMUT071761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NR_033561 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 3, opposite strand (Rbm3os), long non-coding RNA. // chrX // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000124018 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:8145429:8147964:1 gene:ENSMUSG00000055188 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// NONMMUT071766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chrX // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
NM_172479 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 38, member 5 (Slc38a5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006527580 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 38, member 5 (Slc38a5), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000033512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:8271381:8280179:1 gene:ENSMUSG00000031170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000115590 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:8271642:8280174:1 gene:ENSMUSG00000031170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000115591 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:8271151:8280179:1 gene:ENSMUSG00000031170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AK158125 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930032P09 product:Amino acid transporter system N2 homolog, full insert sequence. // chrX // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC058856 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 38, member 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:6435136), partial cds. // chrX // 92 // 42 // 12 // 13 // 0 /// BC152401 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 38, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:173142 IMAGE:40057282), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000018356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:8256105:8279853:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 84 // 25 // 26 // 0
NM_199064 // RefSeq // Mus musculus synovial sarcoma, X member B, breakpoint 10 (Ssxb10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000103003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:8327424:8336237:1 gene:ENSMUSG00000068219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AY244801 // GenBank // Mus musculus SSXB10 protein (Ssxb10) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000119961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:8654465:8654824:1 gene:ENSMUSG00000082496 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:8654465:8654824:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_199063 // RefSeq // Mus musculus synovial sarcoma, X breakpoint 9 (Ssx9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000103001 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:8748432:8754587:1 gene:ENSMUSG00000035371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AY244795 // GenBank // Mus musculus SSXB4 protein (Ssxb4) mRNA, complete cds. // chrX // 75 // 100 // 12 // 16 // 0
XM_006527643 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synovial sarcoma, X member B, breakpoint 5 (Ssxb5), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// NM_199319 // RefSeq // Mus musculus synovial sarcoma, X member B, breakpoint 5 (Ssxb5), mRNA. // chrX // 91 // 91 // 10 // 11 // 1 /// ENSMUST00000089370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:8803691:8809386:1 gene:ENSMUSG00000071816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 91 // 91 // 10 // 11 // 1 /// AY244796 // GenBank // Mus musculus SSXB5 protein (Ssxb5) mRNA, complete cds. // chrX // 82 // 82 // 9 // 11 // 1
NR_045448 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA B630019K06 gene (B630019K06Rik), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064196 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:8892382:8894964:1 gene:ENSMUSG00000052364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC055780 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B630019K06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67565 IMAGE:6403722), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:8892758:8893759:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001038697 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5635 (Gm5635), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000097029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:9063015:9063861:1 gene:ENSMUSG00000072249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000056463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9063167:9063697:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
NM_001270700 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930402K13 gene (4930402K13Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059967 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:9104562:9106342:1 gene:ENSMUSG00000045797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9104674:9105921:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000126259 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:9123467:9123979:1 gene:ENSMUSG00000087021 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9123353:9139070:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173414 // RefSeq // Mus musculus LanC lantibiotic synthetase component C-like 3 (bacterial) (Lancl3), mRNA. // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000069763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:9199902:9268085:1 gene:ENSMUSG00000047344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC115944 // GenBank // Mus musculus LanC lantibiotic synthetase component C-like 3 (bacterial), mRNA (cDNA clone IMAGE:40060880), complete cds. // chrX // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000056451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9236807:9265685:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 43 // 13 // 13 // 0
NM_023500 // RefSeq // Mus musculus Kell blood group precursor (McLeod phenotype) homolog (Xk), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000015486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:9272756:9313250:1 gene:ENSMUSG00000015342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF155511 // GenBank // Mus musculus KX antigen (Xk) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// AY534248 // GenBank // Mus musculus XK-related protein 1 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC027097 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5012421, containing frame-shift errors. // chrX // 88 // 70 // 14 // 16 // 0 /// BC125618 // GenBank // Mus musculus Kell blood group precursor (McLeod phenotype) homolog, mRNA (cDNA clone MGC:159321 IMAGE:40130133), complete cds. // chrX // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// BC125620 // GenBank // Mus musculus Kell blood group precursor (McLeod phenotype) homolog, mRNA (cDNA clone MGC:159323 IMAGE:40130135), complete cds. // chrX // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000083221 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:9317819:9317976:1 gene:ENSMUSG00000065155 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 73 // 100 // 11 // 15 // 0 /// NONMMUT071800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 73 // 100 // 11 // 15 // 0
NM_026096 // RefSeq // Mus musculus huntingtin interacting protein M (Hypm), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:9846928:9847508:1 gene:ENSMUSG00000040456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049569 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700054O13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58166 IMAGE:6772969), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC059721 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700054O13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:74185 IMAGE:6742451), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9846944:9847384:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_029229 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930557A04 gene (4930557A04Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:9849703:9850255:1 gene:ENSMUSG00000048994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9849751:9850137:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_001290728 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin-like 5 (Sytl5), transcript variant 2, mRNA. // chrUn // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// NM_177704 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin-like 5 (Sytl5), transcript variant 1, mRNA. // chrUn // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// XM_006527605 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptotagmin-like 5 (Sytl5), transcript variant X2, mRNA. // chrUn // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000067529 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:9885622:9994543:1 gene:ENSMUSG00000054453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000086165 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:9885622:9994543:1 gene:ENSMUSG00000054453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// AB098160 // GenBank // Mus musculus slp5 mRNA for synaptotagmin-like protein 5, complete cds. // chrUn // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// AB098161 // GenBank // Mus musculus slp5 mRNA for synaptotagmin-like protein 5 delta 5S-I, complete cds. // chrUn // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// BC150158 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:161245 IMAGE:40141504), complete cds. // chrUn // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// BC150480 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:161246 IMAGE:40141505), complete cds. // chrUn // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000038087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9983507:9994543:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 55 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9904854:9943181:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 34 // 34 // 16 // 47 // 1
ENSMUST00000115528 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:10252367:10316864:1 gene:ENSMUSG00000031173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC024893 // GenBank // Mus musculus ornithine transcarbamylase, mRNA (cDNA clone MGC:28946 IMAGE:4196455), complete cds. // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// M17030 // GenBank // Mouse ornithine transcarbamylase mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NM_008769 // RefSeq // Mus musculus ornithine transcarbamylase (Otc), mRNA. // chrX // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// ENSMUST00000049910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:10252305:10321024:1 gene:ENSMUSG00000031173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// GENSCAN00000038101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:10214661:10450005:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_019634 // RefSeq // Mus musculus tetraspanin 7 (Tspan7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527583 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetraspanin 7 (Tspan7), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000076354 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:10485158:10596605:1 gene:ENSMUSG00000058254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115526 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:10485158:10596605:1 gene:ENSMUSG00000058254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:10485158:10596605:1 gene:ENSMUSG00000058254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF052492 // GenBank // Mus musculus cell surface glycoprotein A15 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC026516 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 7, mRNA (cDNA clone MGC:31684 IMAGE:4911317), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC058603 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 7, mRNA (cDNA clone MGC:65238 IMAGE:6529011), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D26483 // GenBank // Mus musculus mRNA for PE31/TALLA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:10556830:10605714:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001166635 // RefSeq // Mus musculus Mid1 interacting protein 1 (gastrulation specific G12-like (zebrafish)) (Mid1ip1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_026524 // RefSeq // Mus musculus Mid1 interacting protein 1 (gastrulation specific G12-like (zebrafish)) (Mid1ip1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000008179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:10717390:10719690:1 gene:ENSMUSG00000008035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:10717390:10719690:1 gene:ENSMUSG00000008035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY263385 // GenBank // Mus musculus Mid1-interacting G12-like protein (Mig12) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC004014 // GenBank // Mus musculus Mid1 interacting protein 1 (gastrulation specific G12-like (zebrafish)), mRNA (cDNA clone MGC:7591 IMAGE:3493803), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC010778 // GenBank // Mus musculus Mid1 interacting protein 1 (gastrulation specific G12-like (zebrafish)), mRNA (cDNA clone MGC:18710 IMAGE:4215464), complete cds. // chrX // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC052899 // GenBank // Mus musculus Mid1 interacting protein 1 (gastrulation specific G12-like (zebrafish)), mRNA (cDNA clone MGC:60438 IMAGE:30059356), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:10713809:10718778:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000083891 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:11850484:11850590:1 gene:ENSMUSG00000065825 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT071847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_027439 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal accessory protein 2 (Atp6ap2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:12587801:12617049:1 gene:ENSMUSG00000031007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB192471 // GenBank // Mus musculus mRNA for renin/prorenin receptor, complete cds. // chrX // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC014706 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal accessory protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:25985 IMAGE:4457079), complete cds. // chrX // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// ENSMUST00000137277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:12587801:12596581:1 gene:ENSMUSG00000031007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000013682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:12564786:12615873:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001272033 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AA414768 (AA414768), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000121924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:12936872:12938128:1 gene:ENSMUSG00000083307 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:12936965:12938128:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_009481 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 9, X chromosome (Usp9x), mRNA. // chrX // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000089302 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:13071514:13173328:1 gene:ENSMUSG00000031010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000139764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:13071514:13122161:1 gene:ENSMUSG00000031010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 36 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000169594 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:13071498:13123449:1 gene:ENSMUSG00000031010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 40 // 17 // 17 // 0 /// AK028443 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4631404M21 product:ubiquitin specific protease 9, X chromosome, full insert sequence. // chrX // 100 // 36 // 15 // 15 // 0 /// DQ086491 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific protease 9 SSSRF- isoform (Usp9x) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// U67874 // GenBank // Mus musculus fat facets homolog (Fam) mRNA, complete cds. // chrX // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000028873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:13094082:13189675:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 34 // 34 // 0
NM_173415 // RefSeq // Mus musculus nyctalopin (Nyx), mRNA. // chrX // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// XM_006527611 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nyctalopin (Nyx), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000050434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:13466110:13489313:1 gene:ENSMUSG00000051228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AY114303 // GenBank // Mus musculus nyctalopin (Nyx) mRNA, complete cds. // chrX // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC035244 // GenBank // Mus musculus nyctalopin, mRNA (cDNA clone MGC:38926 IMAGE:5362608), complete cds. // chrX // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC048381 // GenBank // Mus musculus nyctalopin, mRNA (cDNA clone MGC:56805 IMAGE:5362608), complete cds. // chrX // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT071894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 89 // 35 // 8 // 9 // 0
NM_011823 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 34 (Gpr34), mRNA. // chrX // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527625 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 34 (Gpr34), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000041708 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:13632089:13640856:1 gene:ENSMUSG00000040229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000096492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:13632769:13640858:1 gene:ENSMUSG00000040229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// DQ103764 // GenBank // Mus musculus G-protein-coupled receptor (GPR34) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// DQ103765 // GenBank // Mus musculus G-protein-coupled receptor (GPR34) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// DQ103766 // GenBank // Mus musculus G-protein-coupled receptor (GPR34) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 94 // 52 // 15 // 16 // 0 /// DQ103767 // GenBank // Mus musculus G-protein-coupled receptor (GPR34) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
NM_175669 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 82 (Gpr82), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:13661363:13667433:1 gene:ENSMUSG00000047678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116704 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 82, mRNA (cDNA clone MGC:144689 IMAGE:40104936), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// FJ789815 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 82 variant 2 (Gpr82) mRNA, 5 UTR, alternatively spliced. // chrX // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001039941 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 8 (Cypt8), mRNA. // chrX // 77 // 87 // 20 // 26 // 0 /// NM_025738 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 1 (Cypt1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000024026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:16522872:16523688:1 gene:ENSMUSG00000023257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000115422 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:16522869:16523689:1 gene:ENSMUSG00000023257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF463502 // GenBank // Mus musculus basic protein CKT1R3 (Ckt1r3) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AM040457 // GenBank // Mus musculus mRNA for cysteine-rich perinuclear theca protein 8 (Cypt8 gene). // chrX // 77 // 87 // 20 // 26 // 0 /// BC061079 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 6, mRNA (cDNA clone MGC:74194 IMAGE:6773161), complete cds. // chrX // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NM_001039943 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 7 (Cypt7), mRNA. // chrX // 73 // 87 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:16028704:16523166:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSMUST00000118846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:16610252:16611426:1 gene:ENSMUSG00000083288 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_173740 // RefSeq // Mus musculus monoamine oxidase A (Maoa), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000026013 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:16619698:16687818:1 gene:ENSMUSG00000025037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC029100 // GenBank // Mus musculus monoamine oxidase A, mRNA (cDNA clone MGC:27811 IMAGE:3481702), complete cds. // chrX // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:16618740:16707307:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 76 // 76 // 25 // 33 // 1
ENSMUST00000083308 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:17325315:17325418:1 gene:ENSMUSG00000065242 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_488332 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 5755 (Gm5755), mRNA. // chrX // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSMUST00000118222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:17626257:17627076:1 gene:ENSMUSG00000083140 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000121905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:17912982:17913818:-1 gene:ENSMUSG00000096235 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000152394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:17880670:17881506:-1 gene:ENSMUSG00000096716 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000021419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:17622570:17627081:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:17880667:17885178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:17912979:17917490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_028568 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 21 (Dusp21), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:18145857:18146701:1 gene:ENSMUSG00000025043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048605 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 21, mRNA (cDNA clone MGC:58664 IMAGE:6741358), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:18145949:18146518:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_009483 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 6A (Kdm6a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000044484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:18162575:18279936:1 gene:ENSMUSG00000037369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000052368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:18162575:18279936:1 gene:ENSMUSG00000037369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK164248 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030040F11 product:ubiquitously transcribed tetratricopeptide repeat gene, X chromosome, full insert sequence. // chrX // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// BC053433 // GenBank // Mus musculus ubiquitously transcribed tetratricopeptide repeat gene, X chromosome, mRNA (cDNA clone MGC:59425 IMAGE:6516368), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000130978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:18162648:18258968:1 gene:ENSMUSG00000037369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// AK080370 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630079C23 product:ubiquitously transcribed tetratricopeptide repeat gene, X chromosome, full insert sequence. // chrX // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000034197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:18262280:18314200:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000034199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:18207166:18254801:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000014873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:19112780:19113085:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_021715 // RefSeq // Mus musculus carbohydrate (N-acetylglucosamino) sulfotransferase 7 (Chst7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:20059560:20097521:1 gene:ENSMUSG00000037347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB040710 // GenBank // Mus musculus mRNA for N-acetylglucosamine-6-O-sulfotransferase, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB046929 // GenBank // Mus musculus mC6ST-2 mRNA for chondroitin 6-sulfotransferase-2, complete cds. // chrX // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// BC019204 // GenBank // Mus musculus carbohydrate (N-acetylglucosamino) sulfotransferase 7, mRNA (cDNA clone MGC:29368 IMAGE:5041967), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:20059716:20061170:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 89 // 35 // 8 // 9 // 0
ENSMUST00000117894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:20339299:20339704:1 gene:ENSMUSG00000087415 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000019779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:20339300:20377732:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 62 // 8 // 8 // 0
NM_001289684 // RefSeq // Mus musculus jade family PHD finger 3 (Jade3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_199317 // RefSeq // Mus musculus jade family PHD finger 3 (Jade3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006527640 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus jade family PHD finger 3 (Jade3), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000043693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:20460527:20517896:1 gene:ENSMUSG00000037315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000115384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:20425688:20519939:1 gene:ENSMUSG00000037315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000136093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:20425788:20494586:1 gene:ENSMUSG00000037315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 95 // 54 // 18 // 19 // 0 /// AK077755 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730598B06 product:MYELOBLAST KIAA0215 [Homo sapiens], full insert sequence. // chrX // 84 // 54 // 16 // 19 // 0 /// BC130270 // GenBank // Mus musculus PHD finger protein 16, mRNA (cDNA clone MGC:161361 IMAGE:40143164), complete cds. // chrX // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:20460524:20517896:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 28 // 28 // 0
NM_009060 // RefSeq // Mus musculus regucalcin (Rgn), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023832 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:20549787:20562089:1 gene:ENSMUSG00000023070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC012710 // GenBank // Mus musculus regucalcin, mRNA (cDNA clone MGC:14006 IMAGE:4210374), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D86217 // GenBank // Mus musculus mRNA for regucalcin, complete cds. // chrX // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// U28937 // GenBank // Mus musculus senescence marker protein-30 (SMP30) mRNA, complete cds. // chrX // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:20550379:20561559:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_145628 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 11 (Usp11), mRNA. // chrX // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006527623 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin specific peptidase 11 (Usp11), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000033383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:20703906:20720539:1 gene:ENSMUSG00000031066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000127294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:20703934:20713153:1 gene:ENSMUSG00000031066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 91 // 26 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000149960 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:20711825:20720537:1 gene:ENSMUSG00000031066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// AK220478 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4085 protein. // chrX // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// BC005470 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 11, mRNA (cDNA clone MGC:6649 IMAGE:3496607), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000137101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:20703960:20717685:1 gene:ENSMUSG00000031066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 60 // 60 // 25 // 42 // 1 /// AK049053 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230095K20 product:weakly similar to UBIQUITIN CARBOXYL-TERMINAL HYDROLASE 11 (EC 3.1.2.15) (UBIQUITIN THIOLESTERASE 11) (UBIQUITIN-SPECIFIC PROCESSING PROTEASE 11) (DEUBIQUITINATING ENZYME 11) [Homo sapiens], full insert sequence. // chrX // 60 // 60 // 25 // 42 // 1 /// GENSCAN00000019770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:20658347:20719900:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001044384 // RefSeq // Mus musculus tissue inhibitor of metalloproteinase 1 (Timp1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001294280 // RefSeq // Mus musculus tissue inhibitor of metalloproteinase 1 (Timp1), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NM_011593 // RefSeq // Mus musculus tissue inhibitor of metalloproteinase 1 (Timp1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000009530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:20870221:20874735:1 gene:ENSMUSG00000001131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115342 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:20870166:20874733:1 gene:ENSMUSG00000001131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC008107 // GenBank // Mus musculus tissue inhibitor of metalloproteinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:7143 IMAGE:3158222), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034260 // GenBank // Mus musculus tissue inhibitor of metalloproteinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6151 IMAGE:3158222), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051260 // GenBank // Mus musculus tissue inhibitor of metalloproteinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:60566 IMAGE:30056565), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M17243 // GenBank // Mouse TPA-S1 protein mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// X04684 // GenBank // Mouse mRNA for growth-responsive gene 16C8 from embryo fibroblasts. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001085393 // RefSeq // Mus musculus sperm acrosome associated 5 (Spaca5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:21068406:21077963:1 gene:ENSMUSG00000037167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:21068488:21147355:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000072593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:21115820:21121192:1 gene:ENSMUSG00000062814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:21118372:21121192:1 gene:ENSMUSG00000062814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY244804 // GenBank // Mus musculus SSXA1 protein (Ssxa1) mRNA, partial cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB618486 // GenBank // Mus musculus Ssxa mRNA for Ssxa protein, complete cds. // chrX // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000022912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:21068488:21147355:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_045668 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 5124 (Gm5124), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127554 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:21360865:21364622:1 gene:ENSMUSG00000051537 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137827 // GenBank // Mus musculus predicted gene, EG331392, mRNA (cDNA clone MGC:169451 IMAGE:8860846), complete cds. // chrX // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000132683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:21360940:21363022:1 gene:ENSMUSG00000051537 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chrX // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000022908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:21360940:21393674:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_007429 // RefSeq // Mus musculus angiotensin II receptor, type 2 (Agtr2), mRNA. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000089188 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:21484544:21489164:1 gene:ENSMUSG00000068122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003811 // GenBank // Mus musculus angiotensin II receptor, type 2, mRNA (cDNA clone MGC:6108 IMAGE:3497420), complete cds. // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// U04828 // GenBank // Mus musculus Balb/c angiotensin II type 2 receptor mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:21484143:21487220:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000119554 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:21504054:21505466:1 gene:ENSMUSG00000081641 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020049 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 14 (Slc6a14), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000033414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:21714896:21742355:1 gene:ENSMUSG00000031089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB033285 // GenBank // Mus musculus mCATB0+ mRNA for colonic system B0+ amino acid transporter, complete cds. // chrX // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AF161714 // GenBank // Mus musculus amino acid transporter B0+ (ATB0+) mRNA, complete cds. // chrX // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// AF320226 // GenBank // Mus musculus Na+ and Cl- coupled neutral and basic amino acid transporter ATB0,+ (Atb0,+) mRNA, complete cds. // chrX // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC129908 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 14, mRNA (cDNA clone MGC:150294 IMAGE:40111716), complete cds. // chrX // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// BC129909 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 14, mRNA (cDNA clone MGC:150295 IMAGE:40111717), complete cds. // chrX // 97 // 91 // 30 // 31 // 0
ENSMUST00000082751 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:22434414:22434516:1 gene:ENSMUSG00000064685 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT072024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NR_033731 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 2, pseudogene 7 (Ppp1r2-ps7), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:22461729:22462337:1 gene:ENSMUSG00000052025 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000185057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:22461632:22462394:1 gene:ENSMUSG00000052025 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:22461729:22462283:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
ENSMUST00000082725 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:22861936:22862045:1 gene:ENSMUSG00000064659 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONMMUT072029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
NM_001034864 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4907 (Gm4907), mRNA. // chrX // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000116614 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:23882553:23907607:1 gene:ENSMUSG00000068113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// ENSMUST00000163718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:23892784:23907497:1 gene:ENSMUSG00000068113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000033842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:23906265:23907497:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 52 // 11 // 11 // 0
AK157371 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830212M01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONMMUT072046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chrX // 76 // 100 // 19 // 25 // 0
ENSMUST00000130207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:35801197:35802429:1 gene:ENSMUSG00000085107 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:35801197:35802429:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000157222 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:35838127:35838401:1 gene:ENSMUSG00000087847 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009947 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 11 (Dock11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000033419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:35888832:36076562:1 gene:ENSMUSG00000031093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000115264 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:36041238:36076227:1 gene:ENSMUSG00000031093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 23 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000115266 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:35947397:36076556:1 gene:ENSMUSG00000031093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 47 // 47 // 0 /// AB116935 // GenBank // Mus musculus Zizimin2/DOCK11 mRNA for DOCK180-related Cdc42 guanine nucleotide exchange factor, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// GENSCAN00000052572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:35881158:36016911:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 53 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:36032336:36101593:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 25 // 13 // 13 // 0
NM_133990 // RefSeq // Mus musculus interleukin 13 receptor, alpha 1 (Il13ra1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000033418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:36112110:36171259:1 gene:ENSMUSG00000017057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC021472 // GenBank // Mus musculus interleukin 13 receptor, alpha 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5343388), partial cds. // chrX // 100 // 53 // 19 // 19 // 0 /// BC052425 // GenBank // Mus musculus interleukin 13 receptor, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:63442 IMAGE:6835500), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC059939 // GenBank // Mus musculus interleukin 13 receptor, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:67822 IMAGE:6477224), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// S80963 // GenBank // Mus musculus IL-13 receptor alpha chain (NR4) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:36112194:36168906:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_028325 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 12 (Zcchc12), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006541402 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 12 (Zcchc12), transcript variant X8, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:36195946:36199158:1 gene:ENSMUSG00000036699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000115256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:36195986:36199157:1 gene:ENSMUSG00000036699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115257 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:36195959:36199157:1 gene:ENSMUSG00000036699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// ENSMUST00000115258 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:36195904:36199150:1 gene:ENSMUSG00000036699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY466375 // GenBank // Mus musculus smad-interacting zinc finger protein (Sizn) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC049071 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:61184 IMAGE:5701407), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC055714 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:66778 IMAGE:6415226), complete cds. // chrX // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_028894 // RefSeq // Mus musculus LON peptidase N-terminal domain and ring finger 3 (Lonrf3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000016383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:36328353:36362341:1 gene:ENSMUSG00000016239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC120688 // GenBank // Mus musculus LON peptidase N-terminal domain and ring finger 3, mRNA (cDNA clone MGC:155925 IMAGE:40129611), complete cds. // chrX // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC120690 // GenBank // Mus musculus LON peptidase N-terminal domain and ring finger 3, mRNA (cDNA clone MGC:155927 IMAGE:40129613), complete cds. // chrX // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:36328604:36361919:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 86 // 86 // 18 // 21 // 1
NM_016783 // RefSeq // Mus musculus progesterone receptor membrane component 1 (Pgrmc1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:36598206:36606079:1 gene:ENSMUSG00000006373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF042491 // GenBank // Mus musculus putative membrane associated progesterone receptor component mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC006016 // GenBank // Mus musculus progesterone receptor membrane component 1, mRNA (cDNA clone MGC:5817 IMAGE:3591536), complete cds. // chrX // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:36598287:36604891:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000118173 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:36668217:36669013:1 gene:ENSMUSG00000081281 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000052578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:36634366:36669016:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000082596 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:36776619:36776705:1 gene:ENSMUSG00000064530 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT072136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_019668 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2A (Ube2a), mRNA. // chrX // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006541382 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2A (Ube2a), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000016452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:36874358:36884215:1 gene:ENSMUSG00000016308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF089812 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme HR6A mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// AF383148 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme HR6A mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// AK163966 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330016D11 product:ubiquitin-conjugating enzyme E2A, RAD6 homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chrX // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// BC026053 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2A, RAD6 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:13793 IMAGE:4012075), complete cds. // chrX // 96 // 87 // 26 // 27 // 0
NM_173779 // RefSeq // Mus musculus sosondowah ankyrin repeat domain family member D (Sowahd), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060057 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:37048845:37050418:1 gene:ENSMUSG00000044400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107372 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 58, mRNA (cDNA clone MGC:130350 IMAGE:40056413), complete cds. // chrX // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC107373 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 58, mRNA (cDNA clone MGC:130351 IMAGE:40056414), complete cds. // chrX // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_025937 // RefSeq // Mus musculus NFKB activating protein (Nkap), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000016553 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:37126795:37150746:1 gene:ENSMUSG00000016409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000152906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:37136416:37141869:1 gene:ENSMUSG00000016409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// AY388959 // GenBank // Mus musculus nuclear NF-kappaB activating protein mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC026774 // GenBank // Mus musculus NFKB activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:25785 IMAGE:4019392), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:37126996:37147965:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 100 // 43 // 13 // 13 // 0
NM_153503 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 113A1 (Rnf113a1), mRNA. // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000046433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:37191245:37192467:1 gene:ENSMUSG00000036537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC024906 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 113A1, mRNA (cDNA clone MGC:27877 IMAGE:3495576), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:37173713:37192417:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000082763 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:37667233:37667376:-1 gene:ENSMUSG00000064697 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083154 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:37499317:37499459:1 gene:ENSMUSG00000065088 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083805 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:37632205:37632347:-1 gene:ENSMUSG00000065739 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008955 // RefSeq // Mus musculus reproductive homeobox 6 (Rhox6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000006362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:37826910:37829857:1 gene:ENSMUSG00000006200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000181916 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:MG4214_PATCH:37827360:37830307:1 gene:ENSMUSG00000097200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF017453 // GenBank // Mus musculus homeobox protein PSX mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC099477 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox 6, mRNA (cDNA clone MGC:117692 IMAGE:30790014), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// DQ058643 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox on X chromosome 6 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000033573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:37822367:37839362:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// GENSCAN00000056927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4214_PATCH:37822817:37839812:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_001024850 // RefSeq // Mus musculus reproductive homeobox 10 (Rhox10), mRNA. // chrX // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000115150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:38066475:38071691:1 gene:ENSMUSG00000053909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC100366 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox 10, mRNA (cDNA clone MGC:117768 IMAGE:30524902), complete cds. // chrX // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC132474 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox 10, mRNA (cDNA clone MGC:164105 IMAGE:40130751), complete cds. // chrX // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC132500 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox 10, mRNA (cDNA clone MGC:164131 IMAGE:40130777), complete cds. // chrX // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// DQ058647 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox on X chromosome 10 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:38066597:38071641:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 75 // 23 // 24 // 0
NM_001185002 // RefSeq // Mus musculus reproductive homeobox 13 (Rhox13), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152730 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:38121219:38129967:1 gene:ENSMUSG00000050197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:38121119:38129861:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_001079513 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 33 (Zbtb33), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_020256 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 33 (Zbtb33), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:38189793:38197046:1 gene:ENSMUSG00000048047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:38189812:38194684:1 gene:ENSMUSG00000048047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000131124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:38189834:38194068:1 gene:ENSMUSG00000048047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AF097416 // GenBank // Mus musculus zinc finger transcription factor Kaiso mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC025136 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 33, mRNA (cDNA clone IMAGE:3981085), partial cds. // chrX // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC138647 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 33, mRNA (cDNA clone MGC:170272 IMAGE:8861667), complete cds. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC138648 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 33, mRNA (cDNA clone MGC:170273 IMAGE:8861668), complete cds. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:38169383:38194232:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_001290389 // RefSeq // Mus musculus ATPase, (Na+)/K+ transporting, beta 4 polypeptide (Atp1b4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_133690 // RefSeq // Mus musculus ATPase, (Na+)/K+ transporting, beta 4 polypeptide (Atp1b4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000016471 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:38316184:38336769:1 gene:ENSMUSG00000016327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000115134 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:38316184:38336769:1 gene:ENSMUSG00000016327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF348324 // GenBank // Mus musculus X,K-ATPase beta-m subunit (ATP1B4) mRNA, alternatively spliced product A, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF348325 // GenBank // Mus musculus X,K-ATPase beta-m subunit (ATP1B4) mRNA, alternatively spliced product B, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC137923 // GenBank // Mus musculus ATPase, (Na+)/K+ transporting, beta 4 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:169547 IMAGE:8860942), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC137924 // GenBank // Mus musculus ATPase, (Na+)/K+ transporting, beta 4 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:169548 IMAGE:8860943), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:38316267:38333722:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_183126 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 6030498E09 gene (6030498E09Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000050744 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:38772671:38962686:1 gene:ENSMUSG00000051361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000168144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:38958084:38959555:1 gene:ENSMUSG00000051361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 5 // 5 // 0
NM_001039368 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide K (Polr2k), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_023127 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide K (Polr2k), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006537451 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4-like (LOC100862456), mRNA. // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:36174033:36177010:1 gene:ENSMUSG00000045996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:38969817:38969990:1 gene:ENSMUSG00000080896 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:36174010:36177007:1 gene:ENSMUSG00000045996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028543 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide K, mRNA (cDNA clone MGC:41431 IMAGE:3468916), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:38958084:38969993:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:36167304:36216860:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001077712 // RefSeq // Mus musculus stromal antigen 2 (Stag2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NM_001290713 // RefSeq // Mus musculus stromal antigen 2 (Stag2), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_021465 // RefSeq // Mus musculus stromal antigen 2 (Stag2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000069619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:42150701:42277185:1 gene:ENSMUSG00000025862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000115072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:42149412:42277175:1 gene:ENSMUSG00000025862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000115073 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:42149317:42277185:1 gene:ENSMUSG00000025862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK168899 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days pregnant adult female amnion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920063B05 product:stromal antigen 2, full insert sequence. // chrX // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000054609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:42188144:42271337:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000101619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:42526585:42529330:1 gene:ENSMUSG00000005696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron gene:ENSMUSG00000073231 // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK149319 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930024C03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083688 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:43254046:43254235:1 gene:ENSMUSG00000065622 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT072262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001195271 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 362 (Gm362), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:43590989:43593530:1 gene:ENSMUSG00000078320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:43591160:43592974:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026841 // RefSeq // Mus musculus proline rich 32 (Prr32), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:45090904:45092791:1 gene:ENSMUSG00000037086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:45081908:45092644:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_028514 // RefSeq // Mus musculus actin-related protein T1 (Actrt1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:46329007:46330345:1 gene:ENSMUSG00000046615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116431 // GenBank // Mus musculus actin-related protein T1, mRNA (cDNA clone MGC:144637 IMAGE:40104427), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116432 // GenBank // Mus musculus actin-related protein T1, mRNA (cDNA clone MGC:144638 IMAGE:40104435), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:46329110:46330240:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
ENSMUST00000121923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:47471808:47472812:1 gene:ENSMUSG00000083094 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000055936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:47337027:47637909:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 100 // 14 // 15 // 0
ENSMUST00000121552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:47724528:47726413:1 gene:ENSMUSG00000082894 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:47724569:47724835:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// NONMMUT072301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_177215 // RefSeq // Mus musculus oculocerebrorenal syndrome of Lowe (Ocrl), mRNA. // chrX // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000001202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:47912387:47965868:1 gene:ENSMUSG00000001173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000115013 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:47960289:47965763:1 gene:ENSMUSG00000001173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 23 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000115020 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:47912438:47957092:1 gene:ENSMUSG00000001173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000142719 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:47912455:47957075:1 gene:ENSMUSG00000001173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 67 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000154732 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:47938391:47948233:1 gene:ENSMUSG00000001173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 19 // 9 // 9 // 0 /// AK047906 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130020P08 product:similar to LOWE OCULOCEREBRORENAL SYNDROME PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chrX // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// BC054840 // GenBank // Mus musculus oculocerebrorenal syndrome of Lowe, mRNA (cDNA clone IMAGE:6489597), complete cds. // chrX // 100 // 23 // 11 // 11 // 0 /// BC068146 // GenBank // Mus musculus oculocerebrorenal syndrome of Lowe, mRNA (cDNA clone MGC:93022 IMAGE:30533468), complete cds. // chrX // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000000702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:47905402:48040076:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 71 // 71 // 34 // 48 // 1
NM_028773 // RefSeq // Mus musculus SAM and SH3 domain containing 3 (Sash3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000033427 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:48146436:48161565:1 gene:ENSMUSG00000031101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC064734 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1200013B08 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30074434). // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:48146661:48160256:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
ENSMUST00000082872 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:48230286:48230444:1 gene:ENSMUSG00000064806 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178782 // RefSeq // Mus musculus BCL6 co-repressor-like 1 (Bcorl1), mRNA. // chrX // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006541499 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BCL6 co-repressor-like 1 (Bcorl1), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000037596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:48343770:48408049:1 gene:ENSMUSG00000036959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000114972 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:48361620:48406709:1 gene:ENSMUSG00000036959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:48341358:48408049:1 gene:ENSMUSG00000036959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000156042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:48361537:48379308:1 gene:ENSMUSG00000036959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AK081004 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930011H20 product:hypothetical Ankyrin-repeat containing protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000000682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:48361577:48410517:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_011228 // RefSeq // Mus musculus RAB33A, member RAS oncogene family (Rab33a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006541443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB33A, member of RAS oncogene family (Rab33a), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000033430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:48519285:48530232:1 gene:ENSMUSG00000031104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB232628 // GenBank // Mus musculus Rab33A mRNA for Rab33A, complete cds. // chrX // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC104390 // GenBank // Mus musculus RAB33A, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:129488 IMAGE:40050293), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC104391 // GenBank // Mus musculus RAB33A, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:129489 IMAGE:40050296), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// D83279 // GenBank // Mus musculus mRNA for small GTP-binding protein S10, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:48519601:48532769:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 89 // 69 // 16 // 18 // 0
NM_173376 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein, X-linked 2 (Rbmx2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000033433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:48695004:48710723:1 gene:ENSMUSG00000031107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC026976 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein, X-linked 2, mRNA (cDNA clone MGC:36482 IMAGE:5361950), complete cds. // chrX // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:48695188:48710069:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000000687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:48711529:48712686:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_001081123 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 36 (Arhgap36), mRNA. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006541553 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho GTPase activating protein 36 (Arhgap36), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006541554 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho GTPase activating protein 36 (Arhgap36), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000042444 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:49470577:49500242:1 gene:ENSMUSG00000036198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000114904 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:49470450:49500244:1 gene:ENSMUSG00000036198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000130558 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:49463945:49496508:1 gene:ENSMUSG00000036198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AB073967 // GenBank // Mus musculus rho-gap mRNA for Rho-GTPase-activating protein like protein, complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC090672 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1100001E04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:116588 IMAGE:30941825), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC145645 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1100001E04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175532 IMAGE:40130948), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:49493330:49498759:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_207240 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1320 (Olfr1320), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:49683504:49684463:1 gene:ENSMUSG00000071764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:49683474:49684463:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000119776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:51043963:51044819:1 gene:ENSMUSG00000082556 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:51028236:51059682:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NR_045367 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A630012P03 gene (A630012P03Rik), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:52575843:52619047:1 gene:ENSMUSG00000055110 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:52575843:52619047:1 gene:ENSMUSG00000055110 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034059 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 160 (Ccdc160), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006541511 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 160 (Ccdc160), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000101588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:52791200:52799468:1 gene:ENSMUSG00000073207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138946 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330534C20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170573 IMAGE:8861968), complete cds. // chrX // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC138947 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330534C20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170574 IMAGE:8861969), complete cds. // chrX // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_013556 // RefSeq // Mus musculus hypoxanthine guanine phosphoribosyl transferase (Hprt), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:52988137:53021659:1 gene:ENSMUSG00000025630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC004686 // GenBank // Mus musculus hypoxanthine guanine phosphoribosyl transferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6197 IMAGE:3500885), complete cds. // chrX // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// BC083145 // GenBank // Mus musculus hypoxanthine guanine phosphoribosyl transferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:103149 IMAGE:30445781), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// J00423 // GenBank // Mouse hypoxanthine phosphoribosyltransferase (hprt) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:52999055:53058105:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_028671 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 122, member C (Fam122c), mRNA. // chrX // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006541548 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 122, member C (Fam122c), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:53273424:53301501:1 gene:ENSMUSG00000036013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000124137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:53273424:53331185:1 gene:ENSMUSG00000036013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK015288 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930432H15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC147640 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 122, member C, mRNA (cDNA clone MGC:182736 IMAGE:9056630), complete cds. // chrX // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC147646 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 122, member C, mRNA (cDNA clone MGC:182742 IMAGE:9056636), complete cds. // chrX // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC172114 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 122, member C, mRNA (cDNA clone MGC:198819 IMAGE:9054400), complete cds. // chrX // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000186314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:53273433:53331185:1 gene:ENSMUSG00000036013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:53269580:53315166:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSMUST00000120713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:53314533:53315166:1 gene:ENSMUSG00000081145 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000046154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:53269580:53315166:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 91 // 85 // 10 // 11 // 0 /// NONMMUT072478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NR_034074 // RefSeq // Mus musculus embryonic testis differentiation (Etd), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:53434918:53443576:1 gene:ENSMUSG00000060967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY134667 // GenBank // Mus musculus ETD mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048661 // GenBank // Mus musculus embryonic testis differentiation, mRNA (cDNA clone MGC:58819 IMAGE:6773570), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_028375 // RefSeq // Mus musculus CAAX box 1C (Cxx1c), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000063384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:53608032:53608432:1 gene:ENSMUSG00000051851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// BC031701 // GenBank // Mus musculus CAAX box 1 homolog C (human), mRNA (cDNA clone MGC:25692 IMAGE:3594379), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:53608046:53622285:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NONMMUT072484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 100 // 62 // 8 // 8 // 0
XM_006535359 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930502E18 gene (4930502E18Rik), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000069209 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:53724826:53738441:1 gene:ENSMUSG00000055555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC115663 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930502E18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144576 IMAGE:40103303), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC115664 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930502E18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144577 IMAGE:40103304), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:53724958:53737857:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000002328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:54081353:54104335:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 76 // 76 // 13 // 17 // 1
NM_027510 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3830403N18 gene (3830403N18Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006528278 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 3830403N18 gene (3830403N18Rik), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000033458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:56136572:56153498:1 gene:ENSMUSG00000031125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_030139 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 449 (Zfp449), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000101560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:56346400:56365674:1 gene:ENSMUSG00000073176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC082594 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 449, mRNA (cDNA clone MGC:100193 IMAGE:30642886), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC145936 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 449, mRNA (cDNA clone MGC:175823 IMAGE:40131239), complete cds. // chrX // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC145938 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 449, mRNA (cDNA clone MGC:175825 IMAGE:40131241), complete cds. // chrX // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:56309736:56394024:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NR_028086 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 6330419J24 gene (6330419J24Rik), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000068106 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:56374610:56377799:1 gene:ENSMUSG00000054850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC052359 // GenBank // Mus musculus non-protein coding RNA 86, mRNA (cDNA clone MGC:58509 IMAGE:6585408), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT005153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
XM_006544571 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein DDX26B-like (LOC102638573), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000101552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:56524742:56525432:1 gene:ENSMUSG00000073173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_172780 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 6 (Slc9a6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000077741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:56609854:56664230:1 gene:ENSMUSG00000060681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000114784 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:56609856:56663841:1 gene:ENSMUSG00000060681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000144068 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:56609757:56633579:1 gene:ENSMUSG00000060681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC130221 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:161237 IMAGE:40141414), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:56631086:56661448:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000002005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:56607115:56628503:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENSMUST00000096431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:56963325:56980352:1 gene:ENSMUSG00000053852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 38 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136396 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:56894372:57001558:1 gene:ENSMUSG00000053852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000145035 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:56968120:56980359:1 gene:ENSMUSG00000053852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 18 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000153784 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:56872543:56980369:1 gene:ENSMUSG00000053852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 60 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000154818 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:56870163:56980337:1 gene:ENSMUSG00000053852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 58 // 38 // 38 // 0 /// BC132476 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 112, mRNA (cDNA clone MGC:164107 IMAGE:40130753), complete cds. // chrX // 100 // 35 // 23 // 23 // 0 /// BC132480 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 112, mRNA (cDNA clone MGC:164111 IMAGE:40130757), complete cds. // chrX // 100 // 35 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:56889910:56970817:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 97 // 48 // 30 // 31 // 0
ENSMUST00000136396 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:56894372:57001558:1 gene:ENSMUSG00000053852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000153784 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:56872543:56980369:1 gene:ENSMUSG00000053852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000154818 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:56870163:56980337:1 gene:ENSMUSG00000053852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:56889910:56970817:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 65 // 16 // 17 // 0
NM_009766 // RefSeq // Mus musculus bombesin-like receptor 3 (Brs3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527759 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus bombesin-like receptor 3 (Brs3), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000033464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:57043074:57048758:1 gene:ENSMUSG00000031130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC106961 // GenBank // Mus musculus bombesin-like receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:129146 IMAGE:40039080), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC106962 // GenBank // Mus musculus bombesin-like receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:129147 IMAGE:40039081), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:57043245:57047357:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_028242 // RefSeq // Mus musculus HIV TAT specific factor 1 (Htatsf1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NM_029371 // RefSeq // Mus musculus HIV TAT specific factor 1 (Htatsf1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006528298 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HIV TAT specific factor 1 (Htatsf1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000088652 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:57053615:57067183:1 gene:ENSMUSG00000067873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC037711 // GenBank // Mus musculus HIV TAT specific factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:47290 IMAGE:4221465), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000114751 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:57053583:57057206:1 gene:ENSMUSG00000067873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// ENSMUST00000134785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:57053898:57057204:1 gene:ENSMUSG00000067873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// AK012522 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2700077B20 product:novel isoform of TAT-SF1 [Homo sapiens], full insert sequence. // chrX // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// AK139853 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020029J04 product:unclassifiable, full insert sequence. // chrX // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000009437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:57053310:57066854:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 77 // 22 // 23 // 0
NM_133251 // RefSeq // Mus musculus vestigial like 1 homolog (Drosophila) (Vgll1), mRNA. // chrX // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006527876 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vestigial like 1 homolog (Drosophila) (Vgll1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006527877 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vestigial like 1 homolog (Drosophila) (Vgll1), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:57088106:57106540:1 gene:ENSMUSG00000031131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:57089312:57105529:1 gene:ENSMUSG00000031131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:57089374:57106540:1 gene:ENSMUSG00000031131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AB036708 // GenBank // Mus musculus mRNA for vestigial-related factor, complete cds. // chrX // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK146118 // GenBank HTC // Mus musculus CRL-1722 L5178Y-R cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I730004J11 product:vestigial like 1 homolog (Drosophila), full insert sequence. // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC144928 // GenBank // Mus musculus vestigial like 1 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:178484 IMAGE:9053476), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC145949 // GenBank // Mus musculus vestigial like 1 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:175836 IMAGE:40131252), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:57092273:57104176:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 90 // 74 // 18 // 20 // 0
NM_011616 // RefSeq // Mus musculus CD40 ligand (Cd40lg), mRNA. // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:57212143:57224042:1 gene:ENSMUSG00000031132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC119225 // GenBank // Mus musculus CD40 ligand, mRNA (cDNA clone MGC:155541 IMAGE:8733974), complete cds. // chrX // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// EU274582 // GenBank // Mus musculus CD40 ligand (Cd40lg) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:57212155:57223587:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000082977 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:57989473:57989579:1 gene:ENSMUSG00000093905 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT072557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_023774 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930550L24 gene (4930550L24Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:58911461:58920304:1 gene:ENSMUSG00000046180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118305 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:58909360:58920304:1 gene:ENSMUSG00000046180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF319984 // GenBank // Mus musculus mage-k1 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC087920 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930550L24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107266 IMAGE:30281980), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:58802044:58919845:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_007979 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor IX (F9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000033477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:59999464:60030759:1 gene:ENSMUSG00000031138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000006400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:59956585:60029441:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000083197 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:60257552:60257658:1 gene:ENSMUSG00000094896 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT072591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001271548 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 715 (Gm715), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:60548019:60548849:1 gene:ENSMUSG00000082226 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:60548019:60548849:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000152669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:60557728:60807993:1 gene:ENSMUSG00000067835 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY512909 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:H8256C04 unknown mRNA. // chrX // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONMMUT072594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006528355 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4988 (Gm4988), mRNA. // chrX // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:61247574:61292116:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001018087 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper, down-regulated in cancer 1 (Ldoc1), mRNA. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075983 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:61709497:61710955:1 gene:ENSMUSG00000057615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK137057 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430056I03 product:similar to LDOC1 protein (Leucine zipper protein down-regulated in cancer cells) [Homo sapiens], full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052689 // GenBank // Mus musculus leucine zipper, down-regulated in cancer 1, mRNA (cDNA clone MGC:60754 IMAGE:30053634), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_007917 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4E (Eif4e), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000029803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:138526191:138557599:1 gene:ENSMUSG00000028156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000120925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:61785381:61786032:1 gene:ENSMUSG00000050900 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// BC010759 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4E, mRNA (cDNA clone MGC:18497 IMAGE:4216609), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC085087 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4E, mRNA (cDNA clone MGC:103177 IMAGE:6438419), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M61731 // GenBank // Mus musculus translation initiation factor 4E (eIF-4E) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000042977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:61785381:61785809:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 56 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138524386:138555504:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 53 // 53 // 19 // 36 // 1
NM_001199996 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933402E13 gene (4933402E13Rik), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001199997 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933402E13 gene (4933402E13Rik), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000051414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:62287142:62292078:1 gene:ENSMUSG00000045330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:62283499:62292078:1 gene:ENSMUSG00000045330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC132156 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933402E13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163787 IMAGE:40130433), complete cds. // chrX // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
XR_406348 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4931400O07 gene (4931400O07Rik), misc_RNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:62467991:62468812:1 gene:ENSMUSG00000031194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK016421 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931400O07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:62446502:62468705:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
NM_027512 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3830417A13 gene (3830417A13Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:64173548:64178778:1 gene:ENSMUSG00000031179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC068255 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3830417A13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:61011 IMAGE:30021331), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151996 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:64174348:64177507:1 gene:ENSMUSG00000031179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000003881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:64081177:64178352:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENSMUST00000083969 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:64800511:64800616:1 gene:ENSMUSG00000065903 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT072641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_027302 // RefSeq // Mus musculus cancer/testis antigen 2 (Ctag2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:65047644:65049014:1 gene:ENSMUSG00000031181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049681 // GenBank // Mus musculus cancer/testis antigen 2, mRNA (cDNA clone MGC:58551 IMAGE:6703247), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:65047685:65114472:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001161431 // RefSeq // Mus musculus SLIT and NTRK-like family, member 2 (Slitrk2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NM_198863 // RefSeq // Mus musculus SLIT and NTRK-like family, member 2 (Slitrk2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006528016 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SLIT and NTRK-like family, member 2 (Slitrk2), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000036043 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:66653007:66656488:1 gene:ENSMUSG00000036790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000166241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:66649318:66661393:1 gene:ENSMUSG00000036790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC111888 // GenBank // Mus musculus SLIT and NTRK-like family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:132873 IMAGE:40060548), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC112406 // GenBank // Mus musculus SLIT and NTRK-like family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:132874 IMAGE:40060552), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:66653905:66656445:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000007622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:66649044:66653368:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001161431 // RefSeq // Mus musculus SLIT and NTRK-like family, member 2 (Slitrk2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_198863 // RefSeq // Mus musculus SLIT and NTRK-like family, member 2 (Slitrk2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000166241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:66649318:66661393:1 gene:ENSMUSG00000036790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT072653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000157083 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:66728415:66728553:1 gene:ENSMUSG00000087708 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT072655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000117526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:66763382:66764574:1 gene:ENSMUSG00000084074 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_008032 // RefSeq // Mus musculus AF4/FMR2 family, member 2 (Aff2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000033532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:69360294:69868037:1 gene:ENSMUSG00000031189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000143097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:69360700:69785176:1 gene:ENSMUSG00000031189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 36 // 14 // 14 // 0 /// AJ001549 // GenBank // Mus musculus mRNA for FMR2 protein. // chrX // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// AJ748649 // GenBank // Mus musculus partial mRNA for fragile X mental retardation protein 2 homolog (Fmr2 gene). // chrX // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000151662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:69856695:69866777:1 gene:ENSMUSG00000031189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// AK051081 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030066H24 product:fragile X mental retardation 2 homolog, full insert sequence. // chrX // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// GENSCAN00000032664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:69698805:69867831:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 97 // 74 // 28 // 29 // 0
NM_001098842 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6812 (Gm6812), mRNA. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_029316 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700020N15 gene (1700020N15Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074894 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:68892375:68893053:-1 gene:ENSMUSG00000056815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075654 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:69945300:69945978:1 gene:ENSMUSG00000059690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049765 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6774351, partial cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:68892515:68893007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:69945346:69945838:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_026787 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1110012L19 gene (1110012L19Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000053981 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:70385877:70389417:1 gene:ENSMUSG00000045237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC024574 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110012L19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:37675 IMAGE:5042031), complete cds. // chrX // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000122134 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:70400497:70401063:1 gene:ENSMUSG00000081199 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:70400476:70401461:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT072723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
XM_001474528 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 16441 (Gm16441), mRNA. // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138176 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:70426311:70427234:-1 gene:ENSMUSG00000086989 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000154310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:70513048:70513995:1 gene:ENSMUSG00000087325 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:70420716:70488061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:70500395:70519515:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
ENSMUST00000117225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:70770867:70771471:1 gene:ENSMUSG00000083406 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT072740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:70756916:70771070:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_001081354 // RefSeq // Mus musculus mastermind-like domain containing 1 (Mamld1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_001256048 // RefSeq // Mus musculus mastermind-like domain containing 1 (Mamld1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006528111 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mastermind-like domain containing 1 (Mamld1), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000082088 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:71050256:71156056:1 gene:ENSMUSG00000059401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:71050256:71154717:1 gene:ENSMUSG00000059401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC157923 // GenBank // Mus musculus mastermind-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:189909 IMAGE:9088096), complete cds. // chrX // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC157989 // GenBank // Mus musculus mastermind-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:191112 IMAGE:9007403), complete cds. // chrX // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC172017 // GenBank // Mus musculus mastermind-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:198722 IMAGE:9054303), complete cds. // chrX // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK090190 // GenBank HTC // Mus musculus 21 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630014P10 product:CG1/XAP80 PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrX // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:71117529:71159516:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_010340 // RefSeq // Mus musculus G-protein-coupled receptor 50 (Gpr50), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527827 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G-protein-coupled receptor 50 (Gpr50), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000070449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:71663667:71669257:1 gene:ENSMUSG00000056380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF065145 // GenBank // Mus musculus melatonin-related receptor (Gpr50) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137982 // GenBank // Mus musculus G-protein-coupled receptor 50, mRNA (cDNA clone MGC:169606 IMAGE:8861001), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:71663792:71668089:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_027801 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1141 (Gm1141), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000101495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:71932438:71940870:1 gene:ENSMUSG00000073130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000154780 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:71928816:71936389:1 gene:ENSMUSG00000073130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC147557 // GenBank // Mus musculus gene model 1141, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182826 IMAGE:9087440), complete cds. // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC150928 // GenBank // Mus musculus gene model 1141, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:183839 IMAGE:9087839), complete cds. // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:71816590:71940335:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_001081135 // RefSeq // Mus musculus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 3 (transmembrane) (Prrg3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006527924 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 3 (transmembrane) (Prrg3), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006527926 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 3 (transmembrane) (Prrg3), transcript variant X4, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:71962982:71972722:1 gene:ENSMUSG00000033361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000170096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:71962625:71970110:1 gene:ENSMUSG00000033361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137616 // GenBank // Mus musculus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 3 (transmembrane), mRNA (cDNA clone MGC:169240 IMAGE:8860635), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137619 // GenBank // Mus musculus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 3 (transmembrane), mRNA (cDNA clone MGC:169243 IMAGE:8860638), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:71962624:71966651:1 gene:ENSMUSG00000033361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000021269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:71965846:72009515:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NR_003243 // RefSeq // Mus musculus fetal and adult testis expressed 1 (Fate1), non-coding RNA. // chrX // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENSMUST00000066116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:71972986:71989046:1 gene:ENSMUSG00000053593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENSMUST00000114569 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:71981522:71989046:1 gene:ENSMUSG00000053593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// ENSMUST00000137031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:71983205:71988768:1 gene:ENSMUSG00000053593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// BC115805 // GenBank // Mus musculus fetal and adult testis expressed 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40106989). // chrX // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONMMUT072766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_007724 // RefSeq // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel alpha 2 (Cnga2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006527762 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclic nucleotide gated channel alpha 2 (Cnga2), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000006020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:71991849:72010218:1 gene:ENSMUSG00000005864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC048775 // GenBank // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:54771 IMAGE:6310696), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:71965846:72009515:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_020280 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family A, 4 (Magea4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527884 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus melanoma antigen, family A, 4 (Magea4), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048675 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:72222017:72222964:1 gene:ENSMUSG00000033343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104088 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family A, 4, mRNA (cDNA clone MGC:123681 IMAGE:40042624), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC104089 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family A, 4, mRNA (cDNA clone MGC:123682 IMAGE:40042626), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:72203964:72222964:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083265 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:72611803:72611909:1 gene:ENSMUSG00000065199 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001290435 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit theta (Gabrq), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_020488 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit theta (Gabrq), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000033711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:72825436:72838544:1 gene:ENSMUSG00000031344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000114553 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:72825178:72842602:1 gene:ENSMUSG00000031344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF189260 // GenBank // Mus musculus GABA-A receptor theta subunit (Theta) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK038859 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230069E17 product:gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit theta, full insert sequence. // chrX // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC119074 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit theta, mRNA (cDNA clone MGC:155390 IMAGE:8733823), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC119076 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit theta, mRNA (cDNA clone MGC:155392 IMAGE:8733825), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:72825456:72870098:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000140655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:72869367:72870098:1 gene:ENSMUSG00000090089 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:72869367:72870265:1 gene:ENSMUSG00000090089 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116353 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family A, 9, mRNA (cDNA clone MGC:144222 IMAGE:40099901), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:72825456:72870098:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010941 // RefSeq // Mus musculus NAD(P) dependent steroid dehydrogenase-like (Nsdhl), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033715 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:72918557:72958514:1 gene:ENSMUSG00000031349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF100198 // GenBank // Mus musculus putative NAD(P)H steroid dehydrogenase mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC019945 // GenBank // Mus musculus NAD(P) dependent steroid dehydrogenase-like, mRNA (cDNA clone MGC:28204 IMAGE:3989811), complete cds. // chrX // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC052834 // GenBank // Mus musculus NAD(P) dependent steroid dehydrogenase-like, mRNA (cDNA clone MGC:60526 IMAGE:30048305), complete cds. // chrX // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// KF356400 // GenBank // Mus musculus strain KK/HlJ NAD(P)-dependent steroid dehydrogenase-like protein (Nsdhl) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// KF356401 // GenBank // Mus musculus strain I/LnJ NAD(P)-dependent steroid dehydrogenase-like protein (Nsdhl) mRNA, complete cds. // chrX // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:72926336:72957614:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001109043 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 185 (Zfp185), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NM_009549 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 185 (Zfp185), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000114546 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:72987360:73031543:1 gene:ENSMUSG00000031351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000164800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:72987339:73031543:1 gene:ENSMUSG00000031351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC039772 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 185, mRNA (cDNA clone MGC:49126 IMAGE:4191053), complete cds. // chrX // 97 // 85 // 33 // 34 // 0 /// EF494744 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 185 (Zfp185) mRNA, complete cds. // chrX // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// U46687 // GenBank // Mus musculus P1-A mRNA, complete cds. // chrX // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// GENSCAN00000026086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:72994690:73021102:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 55 // 22 // 22 // 0
NM_153169 // RefSeq // Mus musculus paraneoplastic antigen MA3 (Pnma3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000060418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:73064787:73068191:1 gene:ENSMUSG00000046287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC036726 // GenBank // Mus musculus paraneoplastic antigen MA3, mRNA (cDNA clone MGC:40840 IMAGE:5368858), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_007978 // RefSeq // Mus musculus factor 8-associated gene A (F8a), mRNA. // chrX // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:73228291:73230795:1 gene:ENSMUSG00000078317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF299331 // GenBank // Mus musculus huntingtin-associated protein HAP40 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC131938 // GenBank // Mus musculus factor 8-associated gene A, mRNA (cDNA clone MGC:163569 IMAGE:40130215), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC131940 // GenBank // Mus musculus factor 8-associated gene A, mRNA (cDNA clone MGC:163571 IMAGE:40130217), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// M83118 // GenBank // Mus musculus factor VIII-associated protein (f8a) mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:73228316:73229461:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 59 // 16 // 17 // 0
NM_001160229 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 275 (Zfp275), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_031494 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 275 (Zfp275), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000033731 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:73342621:73359080:1 gene:ENSMUSG00000031365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000114499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:73342621:73359080:1 gene:ENSMUSG00000031365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC138002 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 275, mRNA (cDNA clone MGC:169626 IMAGE:8861021), complete cds. // chrX // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC138003 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 275, mRNA (cDNA clone MGC:169627 IMAGE:8861022), complete cds. // chrX // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:73335366:73394379:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 41 // 13 // 13 // 0
NM_009566 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 92 (Zfp92), mRNA. // chrX // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XR_386920 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 92 (Zfp92), transcript variant X2, misc_RNA. // chrX // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:73411096:73426998:1 gene:ENSMUSG00000031374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// U47104 // GenBank // Mus musculus kruppel-type zinc finger protein (Zfp92) mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000086470 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:73411560:73428385:1 gene:ENSMUSG00000031374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 68 // 68 // 23 // 34 // 1 /// BC096436 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 92, mRNA (cDNA clone MGC:106388 IMAGE:30478238), complete cds. // chrX // 68 // 68 // 23 // 34 // 1
NM_029352 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 9 (Dusp9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019701 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:73639419:73643514:1 gene:ENSMUSG00000031383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY316312 // GenBank // Mus musculus dual-specificity MAP kinase phosphatase-4 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100309 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 9, mRNA (cDNA clone MGC:117521 IMAGE:30787409), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC004738 // GenBank HTC // Mus musculus mRNA similar to dual specificity phosphatase 9 (cDNA clone IMAGE:3501447). // chrX // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:73583727:73642409:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_007435 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 1 (Abcd1), mRNA. // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000002084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:73716597:73738534:1 gene:ENSMUSG00000031378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000114461 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:73716740:73731432:1 gene:ENSMUSG00000031378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// AK153589 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630008G12 product:ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 1, full insert sequence. // chrX // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// BC011273 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:11515 IMAGE:3710503), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC079840 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:90740 IMAGE:6810147), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:73717031:73737531:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000158198 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:73752674:73752796:1 gene:ENSMUSG00000088823 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT072813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_019684 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich protein specific kinase 3 (Srpk3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000002081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:73774405:73778925:1 gene:ENSMUSG00000002007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000136664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:73774405:73778925:1 gene:ENSMUSG00000002007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF043288 // GenBank // Mus musculus muscle-specific serine kinase 1 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK004696 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1200011B22 product:serine/threonine kinase 23, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC120883 // GenBank // Mus musculus serine/arginine-rich protein specific kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:141310 IMAGE:40057934), complete cds. // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC120884 // GenBank // Mus musculus serine/arginine-rich protein specific kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:141311 IMAGE:40057937), complete cds. // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:73774379:73775648:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000052213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:73775958:73778688:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 56 // 17 // 18 // 0
ENSMUST00000082602 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:73809417:73809481:1 gene:ENSMUSG00000064536 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008106 // RefSeq // Mus musculus opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive (color blindness, deutan) (Opn1mw), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74127464:74150760:1 gene:ENSMUSG00000031394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000101457 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:74127466:74150751:1 gene:ENSMUSG00000031394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000127445 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:74138421:74150756:1 gene:ENSMUSG00000031394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000135307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74127481:74143549:1 gene:ENSMUSG00000031394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 88 // 59 // 14 // 16 // 0 /// AF011389 // GenBank // Mus musculus green cone pigment (GCP) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF190672 // GenBank // Mus musculus green opsin mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC014826 // GenBank // Mus musculus opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive (color blindness, deutan), mRNA (cDNA clone MGC:25229 IMAGE:4507311), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000123401 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74137903:74150756:1 gene:ENSMUSG00000031394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000052185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74127507:74150656:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_031379 // RefSeq // Mus musculus transketolase-like 1 (Tktl1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000010127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74177259:74208500:1 gene:ENSMUSG00000031397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF285571 // GenBank // Mus musculus transketolase-like 1 (Tktl1) mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC113768 // GenBank // Mus musculus transketolase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:132800 IMAGE:40058456), complete cds. // chrX // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74177290:74207846:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_007927 // RefSeq // Mus musculus emerin (Emd), mRNA. // chrX // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000002029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74254687:74257887:1 gene:ENSMUSG00000001964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000096424 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:74254752:74257361:1 gene:ENSMUSG00000001964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000119197 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:74254810:74261005:1 gene:ENSMUSG00000001964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000152288 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74254816:74257323:1 gene:ENSMUSG00000001964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC132131 // GenBank // Mus musculus emerin, mRNA (cDNA clone MGC:163762 IMAGE:40130408), complete cds. // chrX // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC132133 // GenBank // Mus musculus emerin, mRNA (cDNA clone MGC:163764 IMAGE:40130410), complete cds. // chrX // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// U73902 // GenBank // Mus musculus emerin (Sta) mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088313 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:74254830:74261548:1 gene:ENSMUSG00000001964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENSMUST00000129516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74254761:74255685:1 gene:ENSMUSG00000001964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000052181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74253588:74261401:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NR_002899 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 70 (Snora70), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000083047 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:74272484:74272620:1 gene:ENSMUSG00000064981 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74271837:74272806:1 gene:ENSMUSG00000008682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000158377 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:13:62384918:62385052:1 gene:ENSMUSG00000089002 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 73 // 88 // 16 // 22 // 0 /// NONMMUT072848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT017887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 73 // 88 // 16 // 22 // 0
KnowTID_00007924 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT072859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK046078 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230340J04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_138607 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 50, member A (Fam50a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000114160 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74313033:74320149:1 gene:ENSMUSG00000001962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000138242 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74313126:74320134:1 gene:ENSMUSG00000001962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC026128 // GenBank HTC // Mus musculus family with sequence similarity 50, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:4006659), **** WARNING: chimeric clone ****. // chrX // 89 // 93 // 24 // 27 // 0 /// BC125297 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 50, member A, mRNA (cDNA clone MGC:159000 IMAGE:40129812), complete cds. // chrX // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74297182:74343542:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_008883 // RefSeq // Mus musculus plexin A3 (Plxna3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006527903 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus plexin A3 (Plxna3), transcript variant X4, mRNA. // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000004326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74329066:74344689:1 gene:ENSMUSG00000031398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000154062 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74332457:74344683:1 gene:ENSMUSG00000031398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC093482 // GenBank // Mus musculus plexin A3, mRNA (cDNA clone MGC:118733 IMAGE:30945372), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// D86950 // GenBank // Mus musculus mRNA for plexin 3, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74297182:74343542:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000121811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74486589:74487421:1 gene:ENSMUSG00000082707 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74486772:74487421:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT072880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000121459 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74504015:74504402:1 gene:ENSMUSG00000083768 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT072882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74504063:74569371:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
ENSMUST00000118711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74566958:74567706:1 gene:ENSMUSG00000085066 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74504063:74569371:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_146398 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1325 (Olfr1325), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74594328:74595275:1 gene:ENSMUSG00000051706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026126 // RefSeq // Mus musculus FUN14 domain containing 2 (Fundc2), mRNA. // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:75382399:75396459:1 gene:ENSMUSG00000031198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY234858 // GenBank // Mus musculus HCBP6-like protein mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC049566 // GenBank // Mus musculus FUN14 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:58159 IMAGE:6742356), complete cds. // chrX // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC061464 // GenBank // Mus musculus FUN14 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:66875 IMAGE:6819539), complete cds. // chrX // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000123540 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:75387102:75394328:1 gene:ENSMUSG00000031198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 73 // 37 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000041841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:75382433:75411825:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT072908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 73 // 37 // 8 // 11 // 0
NM_011692 // RefSeq // Mus musculus von Hippel-Lindau binding protein 1 (Vbp1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000033540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:75514299:75534942:1 gene:ENSMUSG00000031197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// U96760 // GenBank // Mus musculus von Hippel-Lindau binding protein homolog (vbp-1) mRNA, complete cds. // chrX // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:75514225:75563340:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
ENSMUST00000117092 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:75723672:75724126:1 gene:ENSMUSG00000081996 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000010634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:75705442:75764405:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT072925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000122186 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:75915216:75916526:1 gene:ENSMUSG00000083544 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:75874030:75916405:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000121081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:76196108:76198742:1 gene:ENSMUSG00000082827 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001013760 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4937 (Gm4937), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:76264304:76267738:1 gene:ENSMUSG00000071738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK133378 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933402E19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 76 // 100 // 19 // 25 // 0
ENSMUST00000117727 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:76347394:76348353:1 gene:ENSMUSG00000083333 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127031 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family A, 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:40049194), partial cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:76347394:76357164:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// NONMMUT072953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033799 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930428D18 gene (4930428D18Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006528213 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930428D18 gene (4930428D18Rik), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000101419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:76393350:76397979:1 gene:ENSMUSG00000073085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000178974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:76393452:76397888:1 gene:ENSMUSG00000073085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC147626 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930428D18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182722 IMAGE:9056616), complete cds. // chrX // 85 // 77 // 17 // 20 // 0 /// BC147629 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930428D18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182725 IMAGE:9056619), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC172110 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930428D18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:198815 IMAGE:9054396), complete cds. // chrX // 65 // 77 // 13 // 20 // 0
NM_020601 // RefSeq // Mus musculus transducin (beta)-like 1 X-linked (Tbl1x), mRNA. // chrX // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000088217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:77511013:77662983:1 gene:ENSMUSG00000025246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000133893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:77511214:77659743:1 gene:ENSMUSG00000025246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AK036996 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930034E22 product:transducin (beta)-like 1, full insert sequence. // chrX // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC043105 // GenBank // Mus musculus transducin (beta)-like 1 X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:58025 IMAGE:6406579), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000032450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:77641450:77673746:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 63 // 63 // 22 // 35 // 1
ENSMUST00000157653 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:77579487:77579659:1 gene:ENSMUSG00000088278 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// NONMMUT072973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 90 // 80 // 18 // 20 // 0
NM_001085544 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 14744 (Gm14744), mRNA. // chrX // 86 // 100 // 32 // 37 // 0 /// NM_027768 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5430402E10 gene (5430402E10Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000063127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:77919786:77925062:-1 gene:ENSMUSG00000044121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000114039 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:77864758:77870033:1 gene:ENSMUSG00000079522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 86 // 100 // 32 // 37 // 0 /// ENSMUST00000118262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:77988363:77992734:1 gene:ENSMUSG00000082635 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 84 // 84 // 26 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:77917441:77951619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// GENSCAN00000032454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:77864813:77889323:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// GENSCAN00000032446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:77988363:77995900:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
NM_001126321 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 14743 (Gm14743), mRNA. // chrX // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000088198 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:78186777:78192292:1 gene:ENSMUSG00000067679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:78240462:78245921:-1 gene:ENSMUSG00000079519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:78186827:78238177:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:78241294:78245911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NM_001177966 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930480E11 gene (4930480E11Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:78369643:78371128:1 gene:ENSMUSG00000035651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116859 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930480E11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151236 IMAGE:40126178), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC116861 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930480E11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151238 IMAGE:40126180), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:78369671:78370855:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000118391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:78390705:78391224:1 gene:ENSMUSG00000084019 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:78390705:78416454:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_001164739 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 47, member C (Fam47c), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:78737763:78739401:1 gene:ENSMUSG00000078315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115971 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 47, member A, mRNA (cDNA clone MGC:144831 IMAGE:40106467), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:78737814:78739106:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000121113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:78785747:78786855:1 gene:ENSMUSG00000082912 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT072998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_138751 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 47 (Tmem47), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:81070716:81097872:1 gene:ENSMUSG00000025666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000171953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:81070705:81095731:1 gene:ENSMUSG00000025666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC019751 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 47, mRNA (cDNA clone MGC:30953 IMAGE:4020610), complete cds. // chrX // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:81070698:81094776:1 gene:ENSMUSG00000025666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// AK031346 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030410I10 product:hypothetical Proline-rich region containing protein, full insert sequence. // chrX // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:81070956:81281321:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENSMUST00000082847 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:82187682:82187781:1 gene:ENSMUSG00000064781 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028046 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1600014K23 gene (1600014K23Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:85249679:85270288:1 gene:ENSMUSG00000035491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK005459 // GenBank HTC // Mus musculus adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1600014K23 product:weakly similar to ferritin heavy chain 2 (fragment) [Sus scrofa domestica], full insert sequence. // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC049727 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1600014K23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58731 IMAGE:6770312), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:85239396:85270161:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_025729 // RefSeq // Mus musculus TGF-beta activated kinase 1/MAP3K7 binding protein 3 (Tab3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000048250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:85574022:85634469:1 gene:ENSMUSG00000035476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000137438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:85574034:85614193:1 gene:ENSMUSG00000035476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC139024 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:170651 IMAGE:8862046), complete cds. // chrX // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC139025 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:170652 IMAGE:8862047), complete cds. // chrX // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:85609483:85676847:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_001163539 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5430427O19 gene (5430427O19Rik), mRNA. // chrX // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000113976 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:85870354:85891499:1 gene:ENSMUSG00000025058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC115576 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5430427O19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144455 IMAGE:40102201), complete cds. // chrX // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC115577 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5430427O19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144456 IMAGE:40102202), complete cds. // chrX // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000051056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:85887830:85888726:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_028554 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated multipass transmembrane protein 3 (Samt3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:86044199:86047313:1 gene:ENSMUSG00000035454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:85965258:86047205:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_007430 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor subfamily 0, group B, member 1 (Nr0b1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026036 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:86191764:86195947:1 gene:ENSMUSG00000025056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U41568 // GenBank // Mus musculus nuclear hormone receptor Ahch (Ahch) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:86191654:86195595:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 90 // 84 // 19 // 21 // 0
ENSMUST00000119460 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:86316083:86318696:1 gene:ENSMUSG00000082461 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:86270712:86272356:1 gene:ENSMUSG00000083830 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:86255941:86271326:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000083813 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:88192617:88192723:1 gene:ENSMUSG00000065747 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 57 // 100 // 17 // 30 // 0 /// NONMMUT073104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 57 // 100 // 17 // 30 // 0
XM_111973 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SMEK homolog 3, suppressor of mek1 (Dictyostelium), pseudogene (Smek3-ps), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151416 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:88729828:88732272:1 gene:ENSMUSG00000086142 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:88729873:88732272:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000121467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:90063063:90063818:1 gene:ENSMUSG00000083508 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000036755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:90063063:90063821:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 82 // 13 // 14 // 0 /// NONMMUT073124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 94 // 100 // 16 // 17 // 0
XM_003945604 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC101055749 (LOC101055749), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125932 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:91155168:91155791:1 gene:ENSMUSG00000059972 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:91105754:91155726:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001256004 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 5071 (Gm5071), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006528069 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 5071 (Gm5071), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000063726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:91392500:91393534:1 gene:ENSMUSG00000094861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000101396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:91480126:91481160:1 gene:ENSMUSG00000096072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000104922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:91931946:91932980:-1 gene:ENSMUSG00000078123 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000021867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:91480126:91481160:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000021870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:91345736:91393534:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000055510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:91931946:91932980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001256004 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 5071 (Gm5071), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006528069 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 5071 (Gm5071), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000063726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:91392500:91393534:1 gene:ENSMUSG00000094861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000101396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:91480126:91481160:1 gene:ENSMUSG00000096072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000104922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:91931946:91932980:-1 gene:ENSMUSG00000078123 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:91480126:91481160:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:91345736:91393534:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000055510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:91931946:91932980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_141933 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus melanoma antigen family B, 17, pseudogene (Mageb17-ps), mRNA. // chrX // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000117902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:91625395:91626313:1 gene:ENSMUSG00000081960 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000055513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:91624136:91626477:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NM_001034103 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5941 (Gm5941), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000096371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:92489949:92490681:1 gene:ENSMUSG00000071726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000118752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:92593809:92595368:1 gene:ENSMUSG00000080737 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:92490028:93028207:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000083332 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:93251474:93251606:1 gene:ENSMUSG00000065266 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007492 // RefSeq // Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), mRNA. // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000046565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:93286529:93298357:1 gene:ENSMUSG00000035277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:93286522:93298357:1 gene:ENSMUSG00000035277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB006103 // GenBank // Mus musculus mRNA for Arx homeoprotein, complete cds. // chrX // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC052033 // GenBank // Mus musculus aristaless related homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:62389 IMAGE:5707995), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:93183319:93304732:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000121255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:93638614:93638884:1 gene:ENSMUSG00000087255 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:93638615:93638884:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177546 // RefSeq // Mus musculus phosphate cytidylyltransferase 1, choline, beta isoform (Pcyt1b), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_211138 // RefSeq // Mus musculus phosphate cytidylyltransferase 1, choline, beta isoform (Pcyt1b), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527985 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphate cytidylyltransferase 1, choline, beta isoform (Pcyt1b), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000045898 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:93675102:93749951:1 gene:ENSMUSG00000035246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000113933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:93654863:93749951:1 gene:ENSMUSG00000035246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AY189949 // GenBank // Mus musculus CTP:phosphocholine cytidylyltransferase b2 (Pcyt1b) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AY189950 // GenBank // Mus musculus CTP:phosphocholine cytidylyltransferase b3 (Pcyt1b) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC048917 // GenBank // Mus musculus phosphate cytidylyltransferase 1, choline, beta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:56867 IMAGE:6309383), complete cds. // chrX // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:93701241:93737608:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NR_028320 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AU015836 (AU015836), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000121565 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:93968659:93975470:1 gene:ENSMUSG00000081044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000149545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:93968674:93975470:1 gene:ENSMUSG00000081044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// ENSMUST00000120624 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:93969796:93975071:1 gene:ENSMUSG00000081044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000163458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:93968682:93969658:1 gene:ENSMUSG00000081044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000055936 // chrX // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// BC141215 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AU015836, mRNA (cDNA clone MGC:176176 IMAGE:9055827), complete cds. // chrX // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
GENSCAN00000007852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:93981069:93983726:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000117321 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:94615800:94616125:1 gene:ENSMUSG00000080974 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000036884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:94615800:94616069:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT073209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 83 // 100 // 15 // 18 // 0
NM_008179 // RefSeq // Mus musculus G1 to S phase transition 2 (Gspt2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:94636069:94638559:1 gene:ENSMUSG00000071723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB003503 // GenBank // Mus musculus mRNA for Guanine Nucleotide Regulatory Protein, complete cds. // chrX // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC117825 // GenBank // Mus musculus G1 to S phase transition 2, mRNA (cDNA clone MGC:143748 IMAGE:40092874), complete cds. // chrX // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC117826 // GenBank // Mus musculus G1 to S phase transition 2, mRNA (cDNA clone MGC:143749 IMAGE:40092877), complete cds. // chrX // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000137033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:94636076:94643244:1 gene:ENSMUSG00000071723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// AK050859 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030026K16 product:G1 to phase transition 2, full insert sequence. // chrX // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:94636257:94638155:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001081473 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, X-linked, duplicated B (Zxdb), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// NR_003292 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, X-linked, duplicated A (Zxda), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000101388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:94724569:94730187:1 gene:ENSMUSG00000073062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000117281 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:94795563:94798183:-1 gene:ENSMUSG00000073060 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 98 // 92 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000036876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:94795563:94798183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 98 // 92 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000036883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:94724675:94727296:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 98 // 92 // 44 // 45 // 0
ENSMUST00000117813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:94789717:94790346:1 gene:ENSMUSG00000082964 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:94789717:94790349:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000044653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:95554327:95597647:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
NM_001034907 // RefSeq // Mus musculus zinc finger CCCH-type containing 12B (Zc3h12b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006528154 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger CCCH-type containing 12B (Zc3h12b), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// XM_006528156 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger CCCH-type containing 12B (Zc3h12b), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000082183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:95899033:95928230:1 gene:ENSMUSG00000035045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000150123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:95711678:95924758:1 gene:ENSMUSG00000035045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AK134628 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330504O21 product:similar to DJ423B22.1 (Novel protein similar to KIAA0323, KIAA0615 and C.elegans C30F12.1) (Fragment) [Homo sapiens], full insert sequence. // chrX // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000145362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:95899120:95932637:1 gene:ENSMUSG00000035045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000044652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:95899096:95927970:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NM_010833 // RefSeq // Mus musculus moesin (Msn), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000117399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:96096042:96168552:1 gene:ENSMUSG00000031207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC003474 // GenBank // Mus musculus moesin, mRNA (cDNA clone IMAGE:2650358), partial cds. // chrX // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC047366 // GenBank // Mus musculus moesin, mRNA (cDNA clone MGC:25427 IMAGE:3711212), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000149985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:96096057:96154039:1 gene:ENSMUSG00000031207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// AK031171 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930420P08 product:moesin, full insert sequence. // chrX // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000044659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:96130604:96166634:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000147681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:96239966:96243636:1 gene:ENSMUSG00000078122 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NR_030718 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA F630028O10 gene (F630028O10Rik), long non-coding RNA. // chrX // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// ENSMUST00000133125 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:96239926:96243636:1 gene:ENSMUSG00000078122 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONMMUT073256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT073255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_001033361 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 15-like (Pgr15l), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:97072596:97082104:1 gene:ENSMUSG00000031212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC111868 // GenBank HTC // Mus musculus G protein-coupled receptor 15-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:40056557), with apparent retained intron. // chrX // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:97076221:97078375:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000117712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:97826379:97827105:1 gene:ENSMUSG00000081923 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:97645430:97826837:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_013476 // RefSeq // Mus musculus androgen receptor (Ar), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000052837 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:98149721:98323215:1 gene:ENSMUSG00000046532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M37890 // GenBank // Mus musculus domesticus strain C57BL/6J androgen receptor mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// X59411 // GenBank // Mouse mRNA for Tfm androgen receptor (inactive). // chrX // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:97941770:98319137:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_199018 // RefSeq // Mus musculus START domain containing 8 (Stard8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527998 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus START domain containing 8 (Stard8), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:99042581:99074728:1 gene:ENSMUSG00000031216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000127361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:99068608:99070444:1 gene:ENSMUSG00000031216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC013223 // GenBank HTC // Mus musculus START domain containing 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:4023042). // chrX // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC034186 // GenBank // Mus musculus START domain containing 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:4974909), partial cds. // chrX // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC062944 // GenBank // Mus musculus START domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:77980 IMAGE:30357177), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:99052881:99073200:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_010110 // RefSeq // Mus musculus ephrin B1 (Efnb1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000052839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:99136130:99148991:1 gene:ENSMUSG00000031217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000151750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:99138131:99147230:1 gene:ENSMUSG00000031217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC006797 // GenBank // Mus musculus ephrin B1, mRNA (cDNA clone MGC:11458 IMAGE:2648527), complete cds. // chrX // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC021656 // GenBank // Mus musculus ephrin B1, mRNA (cDNA clone MGC:14047 IMAGE:3602195), complete cds. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// U12983 // GenBank // Mus musculus cek5 receptor ligand mRNA, complete cds. // chrX // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000007245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:99136886:99158467:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_001081283 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 28 (Tmem28), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:99821021:99848790:1 gene:ENSMUSG00000071719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:99726646:99847680:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NR_030525 // RefSeq // Mus musculus microRNA 676 (Mir676), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102443 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:100381097:100381185:1 gene:ENSMUSG00000076398 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-676 // miRBase Micro RNA Database // MI0005003 Mus musculus miR-676 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163191 // RefSeq // Mus musculus OTU domain containing 6A (Otud6a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:100429013:100429885:1 gene:ENSMUSG00000051582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC153817 // GenBank // Mus musculus OTU domain containing 6A, mRNA (cDNA clone MGC:130539 IMAGE:40050367), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:100427652:100429885:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008784 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin (CD79A) binding protein 1 (Igbp1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:100494291:100516125:1 gene:ENSMUSG00000031221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC089567 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin (CD79A) binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:107340 IMAGE:30297519), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK186364 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0137B16, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000033570, based on BLAT search. // chrX // 57 // 52 // 8 // 14 // 0 /// ENSMUST00000144881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:100494355:100499397:1 gene:ENSMUSG00000031221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// AK141470 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530029N17 product:immunoglobulin (CD79A) binding protein 1, full insert sequence. // chrX // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000006048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:100494366:100515705:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK037993 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130069N07 product:immunoglobulin (CD79A) binding protein 1, full insert sequence. // chrX // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001114084 // RefSeq // Mus musculus diacylglycerol O-acyltransferase 2-like 6 (Dgat2l6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006528241 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus diacylglycerol O-acyltransferase 2-like 6 (Dgat2l6), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006528242 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus diacylglycerol O-acyltransferase 2-like 6 (Dgat2l6), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000037541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:100524841:100546144:1 gene:ENSMUSG00000067597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000140551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:100524838:100545891:1 gene:ENSMUSG00000067597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK079438 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930021F22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chrX // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006528243 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus diacylglycerol O-acyltransferase 2-like 6 (Dgat2l6), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:100524836:100545600:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT073312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
NM_001081136 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA wax alcohol acyltransferase 1 (Awat1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000096361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:100572251:100578205:1 gene:ENSMUSG00000015665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC147680 // GenBank // Mus musculus diacylglycerol O-acyltransferase 2-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:182759 IMAGE:9056653), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC147683 // GenBank // Mus musculus diacylglycerol O-acyltransferase 2-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:182762 IMAGE:9056656), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC147829 // GenBank // Mus musculus diacylglycerol O-acyltransferase 2-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:182932 IMAGE:9087546), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC147832 // GenBank // Mus musculus diacylglycerol O-acyltransferase 2-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:182935 IMAGE:9087549), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000006103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:100567465:100585285:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_008446 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 4 (Kif4), mRNA. // chrX // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006527856 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin family member 4 (Kif4), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000048962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:100625737:100727214:1 gene:ENSMUSG00000034311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC050946 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:63305 IMAGE:6822283), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// D12646 // GenBank // Mus musculus kif4 mRNA for microtubule-based motor protein KIF4, complete cds. // chrX // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:100625940:100726659:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000158580 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:101005821:101005883:1 gene:ENSMUSG00000089205 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000158214 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:101005896:101005959:1 gene:ENSMUSG00000088839 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 94 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000119126 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101062260:101063058:1 gene:ENSMUSG00000081943 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000006065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:101062291:101063064:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_018789 // RefSeq // Mus musculus forkhead box O4 (Foxo4), mRNA. // chrX // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000062000 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:101254528:101260873:1 gene:ENSMUSG00000042903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000138437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101254821:101259233:1 gene:ENSMUSG00000042903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000150558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101254567:101256435:1 gene:ENSMUSG00000042903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// AB032770 // GenBank // Mus musculus afx mRNA for forkhead protein, complete cds. // chrX // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// AF114260 // GenBank // Mus musculus forkhead protein AFXH (Afxh) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC099460 // GenBank // Mus musculus forkhead box O4, mRNA (cDNA clone IMAGE:30716262), complete cds. // chrX // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// BC139275 // GenBank // Mus musculus forkhead box O4, mRNA (cDNA clone MGC:170902 IMAGE:8862297), complete cds. // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC139304 // GenBank // Mus musculus forkhead box O4, mRNA (cDNA clone MGC:170931 IMAGE:8862326), complete cds. // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000006019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:101231141:101260814:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_021521 // RefSeq // Mus musculus mediator complex subunit 12 (Med12), mRNA. // chrX // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000087948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:101274260:101297465:1 gene:ENSMUSG00000079487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000087956 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:101274260:101297465:1 gene:ENSMUSG00000079487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000117203 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:101274229:101297465:1 gene:ENSMUSG00000079487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000117706 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:101274030:101297465:1 gene:ENSMUSG00000079487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000132269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101293134:101296067:1 gene:ENSMUSG00000079487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 16 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000148846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101286024:101297465:1 gene:ENSMUSG00000079487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 44 // 22 // 22 // 0 /// AF071310 // GenBank // Mus musculus OPA-containing protein 1 mRNA, complete cds. // chrX // 93 // 90 // 42 // 45 // 0 /// BC057085 // GenBank // Mus musculus mediator of RNA polymerase II transcription, subunit 12 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:5719350), complete cds. // chrX // 100 // 44 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:101274261:101326893:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 42 // 42 // 0
NM_172932 // RefSeq // Mus musculus neuroligin 3 (Nlgn3), mRNA. // chrX // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000065858 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:101299210:101325963:1 gene:ENSMUSG00000031302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101295839:101321348:1 gene:ENSMUSG00000096056 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000118111 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:101299168:101325963:1 gene:ENSMUSG00000031302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000151528 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:101299194:101325963:1 gene:ENSMUSG00000031302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC069040 // GenBank HTC // Mus musculus neuroligin 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5697995), with apparent retained intron. // chrX // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC150773 // GenBank // Mus musculus neuroligin 3, mRNA (cDNA clone MGC:183684 IMAGE:9087684), complete cds. // chrX // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000130555 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:101299175:101318675:1 gene:ENSMUSG00000031302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// AK173182 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1480 protein. // chrX // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:101274261:101326893:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NM_008124 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, beta 1 (Gjb1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:101377273:101385629:1 gene:ENSMUSG00000047797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119080 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101376378:101385629:1 gene:ENSMUSG00000047797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101383736:101385629:1 gene:ENSMUSG00000047797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK134742 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330544D22 product:gap junction membrane channel protein beta 1, full insert sequence. // chrX // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC026833 // GenBank // Mus musculus gap junction protein, beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:6217 IMAGE:3483365), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M63802 // GenBank // Mus musculus connexin 32 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// X84215 // GenBank // M.musculus mRNA for gap junction protein. // chrX // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000006021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:101384168:101385019:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_013712 // RefSeq // Mus musculus integrin beta 1 binding protein 2 (Itgb1bp2), mRNA. // chrX // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000033674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:101449088:101453541:1 gene:ENSMUSG00000031312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AF140691 // GenBank // Mus musculus melusin mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC030035 // GenBank // Mus musculus integrin beta 1 binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:41122 IMAGE:1346742), complete cds. // chrX // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000143946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101452111:101453144:1 gene:ENSMUSG00000031312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// GENSCAN00000029727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:101437209:101453365:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// NONMMUT073358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
XM_006528366 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 8030474K03 gene (8030474K03Rik), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000149761 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101794686:101798640:1 gene:ENSMUSG00000046774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000151231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:101794656:101798638:1 gene:ENSMUSG00000046774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000163399 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101794656:101798638:1 gene:ENSMUSG00000046774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK033245 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030474K03 product:hypothetical Type I antifreeze protein containing protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC100492 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30915948. // chrX // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000145887 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:101796681:101798642:1 gene:ENSMUSG00000046774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// NONMMUT073382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT073383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 94 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000144397 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:102050851:102071966:1 gene:ENSMUSG00000079481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158124 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930032O14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000120254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:102655659:102657063:1 gene:ENSMUSG00000080899 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:102651787:102656709:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001039116 // RefSeq // Mus musculus DMRT-like family C1b (Dmrtc1b), mRNA. // chrX // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000101324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:102707865:102715209:1 gene:ENSMUSG00000073027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000113609 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:102711177:102715209:1 gene:ENSMUSG00000073027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000118842 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:102711177:102715209:1 gene:ENSMUSG00000073027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// DQ316775 // GenBank // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor 8.2 isoform a (Dmrt8.2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// DQ316776 // GenBank // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor 8.2 isoform b (Dmrt8.2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// DQ316777 // GenBank // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor 8.2 isoform c (Dmrt8.2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC150829 // GenBank // Mus musculus DMRT-like family C1b, mRNA (cDNA clone MGC:183740 IMAGE:9087740), complete cds. // chrX // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// GENSCAN00000006869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:102711177:102714774:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
XM_003085258 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus poly(A) binding protein, cytoplasmic 1-like 2B, pseudogene (Pabpc1l2b-ps), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:103013698:103014387:1 gene:ENSMUSG00000084842 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:103066668:103067180:-1 gene:ENSMUSG00000086524 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000006806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103012773:103014387:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103066548:103068162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007674 // RefSeq // Mus musculus caudal type homeobox 4 (Cdx4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033689 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:103321398:103330592:1 gene:ENSMUSG00000031326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141681 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030020K18 product:caudal type homeo box 4, full insert sequence. // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC119158 // GenBank // Mus musculus caudal type homeo box 4, mRNA (cDNA clone MGC:155474 IMAGE:8733907), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// L08061 // GenBank // Mus musculus homeobox protein (cdx 4) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103321560:103413414:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_009767 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich hydrophobic domain 1 (Chic1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006527760 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cysteine-rich hydrophobic domain 1 (Chic1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000116547 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:103356476:103396092:1 gene:ENSMUSG00000031327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC132322 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich hydrophobic domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:163953 IMAGE:40130599), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC138730 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich hydrophobic domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:170357 IMAGE:8861752), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103321560:103413414:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_009767 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich hydrophobic domain 1 (Chic1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000116547 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:103356476:103396092:1 gene:ENSMUSG00000031327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009440 // RefSeq // Mus musculus testis specific X-linked gene (Tsx), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006527940 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis specific X-linked gene (Tsx), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:103414467:103424580:1 gene:ENSMUSG00000031329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048493 // GenBank // Mus musculus testis specific X-linked gene, mRNA (cDNA clone MGC:58316 IMAGE:6705048), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// HQ433544 // GenBank // Mus musculus testes specific x-linked transcript e (Tsx) long non-coding RNA, complete sequence. // chrX // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103414426:103422105:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// HQ433541 // GenBank // Mus musculus testes specific x-linked transcript b (Tsx) long non-coding RNA, complete sequence. // chrX // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENSMUST00000120661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:103597771:103598336:1 gene:ENSMUSG00000080796 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103597716:103598336:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_029158 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 13 (Zcchc13), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033692 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:103630586:103631670:1 gene:ENSMUSG00000031330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145772 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 13, mRNA (cDNA clone MGC:175659 IMAGE:40131075), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC145774 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 13, mRNA (cDNA clone MGC:175661 IMAGE:40131077), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103623514:103631185:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_001081189 // RefSeq // Mus musculus uracil phosphoribosyltransferase (FUR1) homolog (S. cerevisiae) (Uprt), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087867 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:104482818:104507490:1 gene:ENSMUSG00000073016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147845 // GenBank // Mus musculus uracil phosphoribosyltransferase (FUR1) homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:182948 IMAGE:9087562), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147853 // GenBank // Mus musculus uracil phosphoribosyltransferase (FUR1) homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:182956 IMAGE:9087570), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:104476422:104506262:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081189 // RefSeq // Mus musculus uracil phosphoribosyltransferase (FUR1) homolog (S. cerevisiae) (Uprt), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000087867 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:104482818:104507490:1 gene:ENSMUSG00000073016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147845 // GenBank // Mus musculus uracil phosphoribosyltransferase (FUR1) homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:182948 IMAGE:9087562), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147853 // GenBank // Mus musculus uracil phosphoribosyltransferase (FUR1) homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:182956 IMAGE:9087570), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:104476422:104506262:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 86 // 23 // 24 // 0
NM_053201 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family E, 1 (Magee1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:105120378:105123927:1 gene:ENSMUSG00000031227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF319978 // GenBank // Mus musculus mage-e1 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC059039 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family E, 1, mRNA (cDNA clone MGC:69784 IMAGE:6812964), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:105120893:105123367:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_173436 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 2 (Cypt2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000041758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:105499772:105500639:1 gene:ENSMUSG00000090132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF463499 // GenBank // Mus musculus basic protein CKT1 (Ckt1) mRNA, complete cds. // chrX // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// BC060953 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 2, mRNA (cDNA clone MGC:74041 IMAGE:6774045), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000032044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:105499792:105500505:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_030614 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor 16 (Fgf16), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:105764279:105774939:1 gene:ENSMUSG00000031230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB049219 // GenBank // Mus musculus Fgf16 mRNA for fibroblast growth factor 16, complete cds. // chrX // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AF292104 // GenBank // Mus musculus FGF-16 protein mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC132641 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor 16, mRNA (cDNA clone MGC:164272 IMAGE:40130918), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC137993 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor 16, mRNA (cDNA clone MGC:169617 IMAGE:8861012), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:105753345:105794703:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 85 // 22 // 23 // 0
ENSMUST00000122729 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:105819883:105820065:1 gene:ENSMUSG00000084678 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025379 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIb (Cox7b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000033582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:106015700:106022450:1 gene:ENSMUSG00000031231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC024350 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIb, mRNA (cDNA clone MGC:35766 IMAGE:4987472), complete cds. // chrX // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC089538 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIb, mRNA (cDNA clone MGC:107263 IMAGE:6533206), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000155377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:106019391:106021958:1 gene:ENSMUSG00000031231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONMMUT073620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001109757 // RefSeq // Mus musculus ATPase, Cu++ transporting, alpha polypeptide (Atp7a), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NM_009726 // RefSeq // Mus musculus ATPase, Cu++ transporting, alpha polypeptide (Atp7a), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000055941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:106027322:106124926:1 gene:ENSMUSG00000033792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000113557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:106027276:106124917:1 gene:ENSMUSG00000033792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AB007134 // GenBank // Mus musculus mRNA for Cu++-tranporting P-type ATPase, complete cds. // chrX // 98 // 94 // 43 // 44 // 0 /// BC141395 // GenBank // Mus musculus ATPase, Cu++ transporting, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:176357 IMAGE:9056008), complete cds. // chrX // 93 // 96 // 42 // 45 // 0 /// U03434 // GenBank // Mus musculus putative Cu++-transporting P-type ATPase mRNA, complete cds. // chrX // 93 // 98 // 43 // 46 // 0 /// U71091 // GenBank // Mus musculus Menkes disease gene product (Mnk) mRNA, complete cds. // chrX // 95 // 94 // 42 // 44 // 0 /// GENSCAN00000032051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:106025047:106124615:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 39 // 39 // 0
NM_205820 // RefSeq // Mus musculus toll-like receptor 13 (Tlr13), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528078 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus toll-like receptor 13 (Tlr13), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006528079 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus toll-like receptor 13 (Tlr13), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000040065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:106143229:106160493:1 gene:ENSMUSG00000033777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510706 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 13 (Tlr13) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117913 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 13, mRNA (cDNA clone MGC:144069 IMAGE:40097310), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC117914 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 13, mRNA (cDNA clone MGC:144070 IMAGE:40097311), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:106156782:106159634:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_008828 // RefSeq // Mus musculus phosphoglycerate kinase 1 (Pgk1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000081593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:106187100:106203699:1 gene:ENSMUSG00000062070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000085735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:10898566:10900296:-1 gene:ENSMUSG00000066632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// ENSMUST00000091117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:58102609:58104269:-1 gene:ENSMUSG00000069008 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// ENSMUST00000135949 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:106187163:106203661:1 gene:ENSMUSG00000062070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// BC083355 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:102158 IMAGE:6828087), complete cds. // chrX // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC108372 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:118097 IMAGE:5060103), complete cds. // chrX // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// M15668 // GenBank // Mus musculus X chromosome-linked phosphoglycerate kinase (pgk-1) mRNA, complete cds. // chrX // 94 // 87 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:106189201:106203672:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:58074253:58104247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:10866835:10900241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 53 // 20 // 20 // 0
XM_006528102 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5127 (Gm5127), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000101296 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:106583186:106709862:1 gene:ENSMUSG00000073010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// AK044840 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130007I08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chrX // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NM_001033541 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5127 (Gm5127), mRNA. // chrX // 78 // 78 // 29 // 37 // 1 /// ENSMUST00000101297 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:106583186:106710557:1 gene:ENSMUSG00000073010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 78 // 78 // 29 // 37 // 1
NM_175271 // RefSeq // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 4 (Lpar4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:106920625:106933900:1 gene:ENSMUSG00000049929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069178 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6835578, containing frame-shift errors. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC138893 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:170520 IMAGE:8861915), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC138894 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:170521 IMAGE:8861916), complete cds. // chrX // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_172435 // RefSeq // Mus musculus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 10 (P2ry10), mRNA. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006528340 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 10 (P2ry10), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000053375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:107089278:107104974:1 gene:ENSMUSG00000050921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000118666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:107089234:107104974:1 gene:ENSMUSG00000050921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000150494 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:107088492:107104970:1 gene:ENSMUSG00000050921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK038124 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130080H11 product:PUTATIVE PURINERGIC RECEPTOR P2Y10 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chrX // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC053707 // GenBank // Mus musculus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 10, mRNA (cDNA clone MGC:60872 IMAGE:30072257), complete cds. // chrX // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:107102461:107103447:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
NM_001122595 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A630033H20 gene (A630033H20Rik), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001122596 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A630033H20 gene (A630033H20Rik), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_175442 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A630033H20 gene (A630033H20Rik), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:107149615:107173657:1 gene:ENSMUSG00000054293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:107149454:107171427:1 gene:ENSMUSG00000054293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000147521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:107148927:107171401:1 gene:ENSMUSG00000054293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000167673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:107148927:107173661:1 gene:ENSMUSG00000054293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000180182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:107149454:107173661:1 gene:ENSMUSG00000054293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000044257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:107171036:107172094:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NR_033580 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933401B06 gene (4933401B06Rik), non-coding RNA. // chrX // 85 // 54 // 11 // 13 // 0 /// ENSMUST00000139758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:107542591:107543745:1 gene:ENSMUSG00000055700 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chrX // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000142024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:107542582:107543800:1 gene:ENSMUSG00000055700 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000000379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:107542648:107543745:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_001163104 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 46, member D (Fam46d), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001271008 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 46, member D (Fam46d), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527936 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 46, member D (Fam46d), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527937 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 46, member D (Fam46d), transcript variant X4, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101292 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:107792590:107872909:1 gene:ENSMUSG00000073007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:107816572:107872909:1 gene:ENSMUSG00000073007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:107870314:107890521:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_019989 // RefSeq // Mus musculus SH3-binding domain glutamic acid-rich protein like (Sh3bgrl), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:109095365:109162471:1 gene:ENSMUSG00000031246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034161 // GenBank // Mus musculus SH3-binding domain glutamic acid-rich protein like, mRNA (cDNA clone MGC:35895 IMAGE:4954986), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC043055 // GenBank // Mus musculus SH3-binding domain glutamic acid-rich protein like, mRNA (cDNA clone MGC:57957 IMAGE:6418767), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:109095509:109197873:1 gene:ENSMUSG00000031246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000035847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:109088036:109198726:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001037917 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6377 (Gm6377), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060013 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:109196758:109200439:1 gene:ENSMUSG00000048621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139259 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:109196756:109198578:1 gene:ENSMUSG00000048621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000133614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:109095509:109197873:1 gene:ENSMUSG00000031246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000035847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:109088036:109198726:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_008901 // RefSeq // Mus musculus POU domain, class 3, transcription factor 4 (Pou3f4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078229 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:110814280:110817207:1 gene:ENSMUSG00000056854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086670 // GenBank // Mus musculus POU domain, class 3, transcription factor 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:30640228). // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138657 // GenBank // Mus musculus POU domain, class 3, transcription factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:170282 IMAGE:8861677), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145919 // GenBank // Mus musculus POU domain, class 3, transcription factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:175806 IMAGE:40131222), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:110814465:110815550:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026134 // RefSeq // Mus musculus cylicin, basic protein of sperm head cytoskeleton 1 (Cylc1), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:111110458:111123874:1 gene:ENSMUSG00000073001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:110940835:111168693:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_031382 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 16 (Tex16), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:112093520:112127326:1 gene:ENSMUSG00000034555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000130247 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:112093496:112127326:1 gene:ENSMUSG00000034555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF285573 // GenBank // Mus musculus testis protein TEX16 (Tex16) mRNA, complete cds. // chrX // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC132332 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 16, mRNA (cDNA clone MGC:163963 IMAGE:40130609), complete cds. // chrX // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:111898534:112122454:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000119106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:112302196:112302467:1 gene:ENSMUSG00000082669 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_001038231 // RefSeq // Mus musculus barrier to autointegration factor 1 (Banf1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// NM_001286608 // RefSeq // Mus musculus barrier to autointegration factor 1 (Banf1), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// NM_011793 // RefSeq // Mus musculus barrier to autointegration factor 1 (Banf1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// ENSMUST00000025762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5364641:5366645:-1 gene:ENSMUSG00000024844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// ENSMUST00000170010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5364641:5366347:-1 gene:ENSMUSG00000024844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// AB025349 // GenBank // Mus musculus L2BP1/BAF mRNA for LAP2 binding protein 1, complete cds. // chrX // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// AF037080 // GenBank // Mus musculus BAF (BAF) mRNA, complete cds. // chrX // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// BC003709 // GenBank // Mus musculus barrier to autointegration factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:5684 IMAGE:3599828), complete cds. // chrX // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:112302240:112354252:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 91 // 20 // 21 // 0 /// NONMMUT073699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5360014:5366440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 38 // 91 // 8 // 21 // 0
NM_001168590 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2010106E10 gene (2010106E10Rik), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_026333 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2010106E10 gene (2010106E10Rik), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000026602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:112495274:112558343:1 gene:ENSMUSG00000025528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113412 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:112495275:112558333:1 gene:ENSMUSG00000025528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC139480 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010106E10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:171107 IMAGE:8862502), complete cds. // chrX // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC139481 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010106E10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:171108 IMAGE:8862503), complete cds. // chrX // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:112512432:112557969:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 90 // 36 // 9 // 10 // 0
ENSMUST00000122805 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:112615301:112631910:1 gene:ENSMUSG00000025529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000151972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:112600526:112626073:1 gene:ENSMUSG00000025529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AK038956 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230078I01 product:weakly similar to ZINC FINGER TRANSCRIPTION FACTOR [Homo sapiens], full insert sequence. // chrX // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NM_177747 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 711 (Zfp711), mRNA. // chrX // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// ENSMUST00000113409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:112600526:112635062:1 gene:ENSMUSG00000025529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// ENSMUST00000071814 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:112604274:112635070:1 gene:ENSMUSG00000025529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// XM_006528398 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 711 (Zfp711), transcript variant X6, mRNA. // chrX // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000008850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:112614901:112633556:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_001290477 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 4 (Klhl4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001290478 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 4 (Klhl4), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NM_172781 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 4 (Klhl4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000040504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:114474333:114560829:1 gene:ENSMUSG00000025597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000113370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:114474520:114560698:1 gene:ENSMUSG00000025597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000113371 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:114474333:114560829:1 gene:ENSMUSG00000025597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000133447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:114474604:114560508:1 gene:ENSMUSG00000025597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC141251 // GenBank // Mus musculus kelch-like 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:176212 IMAGE:9055863), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC099954 // GenBank // Mus musculus kelch-like 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:107454 IMAGE:30081872), complete cds. // chrX // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000025238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:114474424:114559490:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_001276396 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal like 1 (Ube2dnl1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000059509 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:114905012:114905941:1 gene:ENSMUSG00000050435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001081661 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal like 2 (Ube2dnl2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000062695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:114907582:114908510:1 gene:ENSMUSG00000047079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:114826093:114908468:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000119458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:114989150:114989608:1 gene:ENSMUSG00000083971 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000025244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:114989150:114989608:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000082617 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:116345732:116345895:1 gene:ENSMUSG00000064551 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT073739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001033471 // RefSeq // Mus musculus CPX chromosome region, candidate 1 (Cpxcr1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101269 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:116448944:116478783:1 gene:ENSMUSG00000072995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147520 // GenBank // Mus musculus CPX chromosome region, candidate 1, mRNA (cDNA clone MGC:182618 IMAGE:9056512), complete cds. // chrX // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC147548 // GenBank // Mus musculus CPX chromosome region, candidate 1, mRNA (cDNA clone MGC:182645 IMAGE:9056539), complete cds. // chrX // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000157893 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:116748842:116748956:1 gene:ENSMUSG00000088518 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT073741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000129517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:116886881:116887183:1 gene:ENSMUSG00000043295 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000035542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:116886893:116889233:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
NM_001102665 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 14920 (Gm14920), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122050 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:120312748:120313095:-1 gene:ENSMUSG00000083616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:117014757:117015104:1 gene:ENSMUSG00000067441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:120291108:120313095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:117014631:117285262:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_153109 // RefSeq // Mus musculus TGFB-induced factor homeobox 2-like, X-linked 1 (Tgif2lx1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000072518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:118427227:118428256:1 gene:ENSMUSG00000100194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000063242 // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000073857 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:118479708:118480737:-1 gene:ENSMUSG00000100133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000061283 // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF434662 // GenBank // Mus musculus testis expressed homeobox mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC111833 // GenBank // Mus musculus TGFB-induced factor homeobox 2-like, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:130458 IMAGE:40041012), complete cds. // chrX // 78 // 74 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000023647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:118479927:118596079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 90 // 65 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:118422930:118428037:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 91 // 74 // 21 // 23 // 0
ENSMUST00000120650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:119413252:119413989:1 gene:ENSMUSG00000081587 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000019890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:119413252:119413599:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 64 // 9 // 9 // 0
NM_053114 // RefSeq // Mus musculus poly(A) binding protein, cytoplasmic 5 (Pabpc5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000040961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:119927196:119930165:1 gene:ENSMUSG00000034732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:119927225:119930009:1 gene:ENSMUSG00000034732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC107362 // GenBank // Mus musculus poly(A) binding protein, cytoplasmic 5, mRNA (cDNA clone MGC:130340 IMAGE:40056131), complete cds. // chrX // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC107363 // GenBank // Mus musculus poly(A) binding protein, cytoplasmic 5, mRNA (cDNA clone MGC:130341 IMAGE:40056132), complete cds. // chrX // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000019889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:119927990:119929135:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000120258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:120114974:120115829:1 gene:ENSMUSG00000084172 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001271809 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 11 X-linked (Pcdh11x), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_001271810 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 11 X-linked (Pcdh11x), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NR_073451 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 11 X-linked (Pcdh11x), transcript variant 3, non-coding RNA. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NR_073452 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 11 X-linked (Pcdh11x), transcript variant 4, non-coding RNA. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000050239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:120290259:120906344:1 gene:ENSMUSG00000034755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000113358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:120290259:120910619:1 gene:ENSMUSG00000034755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:120290403:120906344:1 gene:ENSMUSG00000034755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000155223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:120401364:120906344:1 gene:ENSMUSG00000034755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC126930 // GenBank // Mus musculus protocadherin 11 X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:141524 IMAGE:40086368), complete cds. // chrX // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:120364786:120417660:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000118719 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:120957711:120958884:1 gene:ENSMUSG00000083275 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000119642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:122347613:122347948:1 gene:ENSMUSG00000083537 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000036650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:122347688:122347900:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT073783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000133704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:122452368:122452670:1 gene:ENSMUSG00000086452 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000036652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:122452413:122452796:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// NONMMUT073784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001033241 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 382 (Gm382), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000096332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:127039972:127063986:1 gene:ENSMUSG00000062791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:127060194:127063946:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NR_003646 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4921511C20 gene (4921511C20Rik), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:127394293:127395898:1 gene:ENSMUSG00000049815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:127393819:127395849:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000121299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:128261411:128267924:1 gene:ENSMUSG00000081739 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000009493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:128261659:128262846:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_009730 // RefSeq // Mus musculus attractin (Atrn), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000028781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:130906495:131030333:1 gene:ENSMUSG00000027312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF116897 // GenBank // Mus musculus mahogany protein mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF119821 // GenBank // Mus musculus attractin (Mgca) mRNA, complete cds. // chrX // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC141054 // GenBank // Mus musculus attractin, mRNA (cDNA clone MGC:176015 IMAGE:9055666), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000023669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:130906561:131025941:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 77 // 84 // 20 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:128548333:128738588:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_172493 // RefSeq // Mus musculus diaphanous homolog 2 (Drosophila) (Diap2), mRNA. // chrX // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000037854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:129749805:130461197:1 gene:ENSMUSG00000034480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113320 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:129749976:130465834:1 gene:ENSMUSG00000034480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:129749796:130328857:1 gene:ENSMUSG00000034480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000167619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:129749742:130465831:1 gene:ENSMUSG00000034480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AB713187 // GenBank // Mus musculus Diap2 mRNA for mDia3 isoform, complete cds. // chrX // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AY312280 // GenBank // Mus musculus DIA3 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000127577 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:129749742:130180471:1 gene:ENSMUSG00000034480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// AK153986 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430019G02 product:Diaphanous homolog 2 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrX // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// GENSCAN00000054983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:129921976:130188714:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 15 // 15 // 0
NM_022322 // RefSeq // Mus musculus tenomodulin (Tnmd), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000033602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:133850980:133865577:1 gene:ENSMUSG00000031250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB055422 // GenBank // Mus musculus mRNA for ChM1L, complete cds. // chrX // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AF191768 // GenBank // Mus musculus myodulin mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AF219993 // GenBank // Mus musculus tenomodulin mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AF291655 // GenBank // Mus musculus chondromodulin-IB mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC006919 // GenBank // Mus musculus tenomodulin, mRNA (cDNA clone MGC:11975 IMAGE:3601223), complete cds. // chrX // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC049944 // GenBank // Mus musculus tenomodulin, mRNA (cDNA clone MGC:58886 IMAGE:2811628), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:133858485:133869749:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// GENSCAN00000011281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:133851207:133856963:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001083895 // RefSeq // Mus musculus sushi-repeat-containing protein, X-linked 2 (Srpx2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_026838 // RefSeq // Mus musculus sushi-repeat-containing protein, X-linked 2 (Srpx2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:133908426:133931814:1 gene:ENSMUSG00000031253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113304 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:133908448:133932446:1 gene:ENSMUSG00000031253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AF393640 // GenBank // Mus musculus sushi-repeat containing protein mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC028307 // GenBank // Mus musculus sushi-repeat-containing protein, X-linked 2, mRNA (cDNA clone MGC:27843 IMAGE:3488526), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:133910647:133931466:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_028947 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 13A (Arl13a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000064476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:134187501:134208028:1 gene:ENSMUSG00000052549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC100522 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 13A, mRNA (cDNA clone MGC:118383 IMAGE:30920038), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134201707:134213798:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 59 // 15 // 16 // 0
NM_026239 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 35 (Tmem35), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:134295225:134305969:1 gene:ENSMUSG00000033578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC042623 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 35, mRNA (cDNA clone MGC:35663 IMAGE:5369317), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC050880 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 35, mRNA (cDNA clone MGC:63276 IMAGE:5690508), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134294596:134404878:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000094550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134489370:134490143:1 gene:ENSMUSG00000070641 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000035762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134489558:134490370:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT073893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001202500 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 4 (Armcx4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124226 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:134686519:134696757:1 gene:ENSMUSG00000049804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134646897:134696415:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027870 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 3 (Armcx3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// ENSMUST00000081834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:134756595:134761425:1 gene:ENSMUSG00000049047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// ENSMUST00000086880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134756607:134760106:1 gene:ENSMUSG00000049047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000086884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134756647:134761455:1 gene:ENSMUSG00000049047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// BC011101 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 3, mRNA (cDNA clone MGC:19426 IMAGE:3490748), complete cds. // chrX // 100 // 59 // 35 // 35 // 0 /// BC051113 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 3, mRNA (cDNA clone MGC:58973 IMAGE:5249601), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 53 // 53 // 0 /// GENSCAN00000024546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:128016957:128042279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 24 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000032780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:54311281:54347593:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 36 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134757220:134761229:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 49 // 29 // 29 // 0
XM_006528654 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus preferentially expressed antigen in melanoma-like (Pramel), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:135270853:135274214:1 gene:ENSMUSG00000082071 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:135270853:135274214:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_001098222 // RefSeq // Mus musculus basic helix-loop-helix domain containing, class B9 (Bhlhb9), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_198161 // RefSeq // Mus musculus basic helix-loop-helix domain containing, class B9 (Bhlhb9), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:135885853:135891081:1 gene:ENSMUSG00000072964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:135885851:135891078:1 gene:ENSMUSG00000072964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC059871 // GenBank // Mus musculus basic helix-loop-helix domain containing, class B9, mRNA (cDNA clone MGC:69734 IMAGE:6809364), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:135889041:135890660:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AK173236 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1701 protein. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_029823 // RefSeq // Mus musculus adipocyte-related X-chromosome expressed sequence 2 (Arxes2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000058119 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:135993824:135995355:1 gene:ENSMUSG00000048040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK013740 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900062L11 product:MICROSOMAL SIGNAL PEPTIDASE 23 KDA SUBUNIT (EC 3.4.-.-) (SPASE 22 KDA SUBUNIT) (SPC22/23) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrX // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// BC030351 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900062L11 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5365902). // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_029541 // RefSeq // Mus musculus adipocyte-related X-chromosome expressed sequence 1 (Arxes1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136033367:136034946:1 gene:ENSMUSG00000048355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011712 // RefSeq // Mus musculus WW domain binding protein 5 (Wbp5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000048687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136245079:136247139:1 gene:ENSMUSG00000042712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000113115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136245683:136247139:1 gene:ENSMUSG00000042712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// AY459189 // GenBank // Mus musculus Slfn8 interacting protein mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC007478 // GenBank // Mus musculus WW domain binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:7478 IMAGE:3490650), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// U92454 // GenBank // Mus musculus WW domain binding protein 5 mRNA, partial cds. // chrX // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000055278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:136245099:136250972:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 47 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000083785 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:136277505:136277623:1 gene:ENSMUSG00000065719 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000120785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136328299:136329071:1 gene:ENSMUSG00000083470 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT073987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000122107 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136340181:136340668:1 gene:ENSMUSG00000084216 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000055295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:136340181:136340668:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_177749 // RefSeq // Mus musculus killer cell immunoglobulin-like receptor, three domains, long cytoplasmic tail, 1 (Kir3dl1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000113105 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:136518013:136534309:1 gene:ENSMUSG00000031424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY130461 // GenBank // Mus musculus KIR3DL1 (Kir3dl1) mRNA, complete cds. // chrX // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// AY530782 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 KIR-like receptor 1 precursor KIRL1.1 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY530783 // GenBank // Mus musculus strain CBA/J KIR-like receptor 1 precursor KIRL1.1 mRNA, complete cds. // chrX // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// BC141012 // GenBank // Mus musculus killer cell immunoglobulin-like receptor, three domains, long cytoplasmic tail, 1, mRNA (cDNA clone MGC:175973 IMAGE:9055624), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000113104 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:136517999:136534061:1 gene:ENSMUSG00000031424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// AY152727 // GenBank // Mus musculus killer immunoglobulin receptor-like protein 1 (Krl1) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 1
NM_146236 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 1 (Tceal1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528517 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 1 (Tceal1), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136707982:136711478:1 gene:ENSMUSG00000049536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011290 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:18752 IMAGE:4010035), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083157 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:102312 IMAGE:5376199), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
AK084423 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230044C07 product:Hypothetical cysteine-rich region containing protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_033324 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC065397 (BC065397), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000134066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136742976:136803355:1 gene:ENSMUSG00000087368 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000145620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136765607:136803364:1 gene:ENSMUSG00000087368 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC065397 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC065397, mRNA (cDNA clone IMAGE:3419134). // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT074014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chrX // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001290561 // RefSeq // Mus musculus proteolipid protein (myelin) 1 (Plp1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_001290562 // RefSeq // Mus musculus proteolipid protein (myelin) 1 (Plp1), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_011123 // RefSeq // Mus musculus proteolipid protein (myelin) 1 (Plp1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000033800 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136822671:136839733:1 gene:ENSMUSG00000031425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000113085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136822790:136837798:1 gene:ENSMUSG00000031425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC027010 // GenBank // Mus musculus proteolipid protein (myelin) 1, mRNA (cDNA clone MGC:39031 IMAGE:5364736), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// M14674 // GenBank // Mouse myelin proteolipid protein (PLP) mRNA, complete cds. // chrX // 77 // 69 // 17 // 22 // 0 /// M15442 // GenBank // Mouse myelin proteolipid protein mRNA, complete cds. // chrX // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// M16472 // GenBank // Mouse proteolipid protein variant DM-20 mRNA, complete cds. // chrX // 83 // 56 // 15 // 18 // 0 /// M20752 // GenBank // Mouse myelin proteolipid protein (PLP) mRNA with a 74 bp deletion, complete cds. // chrX // 89 // 59 // 17 // 19 // 0 /// ENSMUST00000125644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136831162:136832592:1 gene:ENSMUSG00000031425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000055281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:136819850:136833511:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_027067 // RefSeq // Mus musculus H2B histone family, member M (H2bfm), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:136927325:136928376:1 gene:ENSMUSG00000048155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117076 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700014N06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151453 IMAGE:40126395), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117080 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700014N06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151457 IMAGE:40126399), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:136927364:136930737:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001035509 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 18 (Zcchc18), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NM_001035510 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 18 (Zcchc18), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NM_025893 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 18 (Zcchc18), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000033804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136993298:136998472:1 gene:ENSMUSG00000031428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000101227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136993159:136996116:1 gene:ENSMUSG00000031428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000113067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136993155:136996378:1 gene:ENSMUSG00000031428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// BC017627 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 18, mRNA (cDNA clone MGC:28822 IMAGE:4505033), complete cds. // chrX // 100 // 68 // 27 // 27 // 0
NM_146261 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 199, X-linked (Fam199x), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:137049594:137082503:1 gene:ENSMUSG00000042595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC031748 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC031748, mRNA (cDNA clone MGC:19245 IMAGE:3672969), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:137056860:137075650:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000118843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:137111340:137112882:1 gene:ENSMUSG00000082011 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT074039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000083161 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:137150815:137150933:1 gene:ENSMUSG00000065095 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT074042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_030688 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 receptor accessory protein-like 2 (Il1rapl2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000075471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:137651720:138846624:1 gene:ENSMUSG00000059203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000113063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:137570608:138846946:1 gene:ENSMUSG00000059203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF284437 // GenBank // Mus musculus TIGIRR-1 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119274 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 receptor accessory protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:155590 IMAGE:8734023), complete cds. // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC120555 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 receptor accessory protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:155792 IMAGE:40129478), complete cds. // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006528588 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 1 receptor accessory protein-like 2 (Il1rapl2), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// AJ277831 // GenBank // Mus musculus mRNA for IL1RAPL-2 related protein. // chrX // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// ENSMUST00000130879 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:137571019:138506311:1 gene:ENSMUSG00000059203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// AK039155 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230103D10 product:interkeukin 1 receptor accessory protein-like 2, full insert sequence. // chrX // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000023416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:138779985:138846624:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_013724 // RefSeq // Mus musculus Nik related kinase (Nrk), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000064937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:138914430:139009092:1 gene:ENSMUSG00000052854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000113052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:138914431:139010532:1 gene:ENSMUSG00000052854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000131829 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:138914431:139009804:1 gene:ENSMUSG00000052854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB020741 // GenBank // Mus musculus NRK mRNA for NIK-related kinase, complete cds. // chrX // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AB035267 // GenBank // Mus musculus NESK mRNA for Nck-interacting kinase-like embryo specific kinase, complete cds. // chrX // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC139029 // GenBank // Mus musculus Nik related kinase, mRNA (cDNA clone MGC:170656 IMAGE:8862051), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC139031 // GenBank // Mus musculus Nik related kinase, mRNA (cDNA clone MGC:170658 IMAGE:8862053), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:138954424:139009617:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NM_029174 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930513O06 gene (4930513O06Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006528616 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930513O06 gene (4930513O06Rik), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006528617 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930513O06 gene (4930513O06Rik), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000033625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:139086243:139093405:1 gene:ENSMUSG00000031270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XR_406452 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4933428M09 gene (4933428M09Rik), misc_RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:139179228:139181009:1 gene:ENSMUSG00000042525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK016974 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933428M09 product:hypothetical Aspartic acid-rich region/Glutamic acid-rich region containing protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:139090699:139180878:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_011635 // RefSeq // Mus musculus tumor rejection antigen P1A (Trap1a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000054534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:139333683:139338169:1 gene:ENSMUSG00000051257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC051644 // GenBank // Mus musculus tumor rejection antigen P1A, mRNA (cDNA clone MGC:60563 IMAGE:30022193), complete cds. // chrX // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// M36387 // GenBank // Mouse tumor rejection antigen P815A mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:139329585:139337042:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 44 // 11 // 12 // 0
NM_175326 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D330045A20 gene (D330045A20Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000046763 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:139480367:139554582:1 gene:ENSMUSG00000042498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:139480371:139554582:1 gene:ENSMUSG00000042498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC112416 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D330045A20 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40061081), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC113128 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D330045A20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:132912 IMAGE:40061080), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:139480496:139553524:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_001254761 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 128 (Rnf128), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_023270 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 128 (Rnf128), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:139610620:139673145:1 gene:ENSMUSG00000031438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113027 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:139563316:139673138:1 gene:ENSMUSG00000031438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000113029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:139611367:139671741:1 gene:ENSMUSG00000031438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// AF426411 // GenBank // Mus musculus zinc ring finger-containing protein GRAIL mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AY112656 // GenBank // Mus musculus E3 ubiquitin ligase (Greul1) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC010477 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 128, mRNA (cDNA clone MGC:19395 IMAGE:3154433), complete cds. // chrX // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:139642309:139671868:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
NM_001081499 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 8B (Tbc1d8b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000096313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:139684996:139753405:1 gene:ENSMUSG00000042473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000123430 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:139736172:139745243:1 gene:ENSMUSG00000042473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 89 // 50 // 16 // 18 // 0 /// BC147581 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 8B, mRNA (cDNA clone MGC:182677 IMAGE:9056571), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC151057 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 8B, mRNA (cDNA clone MGC:183970 IMAGE:9087970), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:139719701:139775213:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_016675 // RefSeq // Mus musculus claudin 2 (Cldn2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:139800828:139811386:1 gene:ENSMUSG00000047230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC015252 // GenBank // Mus musculus claudin 2, mRNA (cDNA clone MGC:18348 IMAGE:4223446), complete cds. // chrX // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// BC085494 // GenBank // Mus musculus claudin 2, mRNA (cDNA clone MGC:102077 IMAGE:5686202), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006528489 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus claudin 2 (Cldn2), transcript variant X4, mRNA. // chrX // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:139808708:139812820:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_177921 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230019M04 gene (E230019M04Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000044806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:140062879:140106797:1 gene:ENSMUSG00000042433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC119078 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E230019M04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155394 IMAGE:8733827), complete cds. // chrX // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// BC120495 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E230019M04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155732 IMAGE:40129418), complete cds. // chrX // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// XM_006528580 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E230019M04 gene (E230019M04Rik), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// GENSCAN00000033722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:140049764:140081680:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 80 // 80 // 16 // 20 // 1
NM_177750 // RefSeq // Mus musculus FERM and PDZ domain containing 3 (Frmpd3), mRNA. // chrX // 95 // 49 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000044702 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:140381971:140394540:1 gene:ENSMUSG00000042425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 58 // 26 // 26 // 0 /// BC117734 // GenBank // Mus musculus FERM and PDZ domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:143471 IMAGE:40089821), complete cds. // chrX // 95 // 49 // 21 // 22 // 0 /// BC117735 // GenBank // Mus musculus FERM and PDZ domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:143472 IMAGE:40089822), complete cds. // chrX // 95 // 49 // 21 // 22 // 0 /// BC129957 // GenBank // Mus musculus FERM and PDZ domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:156390 IMAGE:40089827), complete cds. // chrX // 95 // 49 // 21 // 22 // 0 /// BC129958 // GenBank // Mus musculus FERM and PDZ domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:156391 IMAGE:40089829), complete cds. // chrX // 95 // 49 // 21 // 22 // 0 /// XM_006528547 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FERM and PDZ domain containing 3 (Frmpd3), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 49 // 49 // 22 // 45 // 1 /// XM_006528656 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FERM and PDZ domain-containing protein 3-like (LOC101055948), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 42 // 42 // 19 // 45 // 1 /// ENSMUST00000141660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:140367494:140393895:1 gene:ENSMUSG00000042425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 36 // 36 // 16 // 45 // 1 /// GENSCAN00000040030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:140419009:140434275:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 24 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000040010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:140358299:140412090:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 53 // 53 // 24 // 45 // 1
NM_021463 // RefSeq // Mus musculus phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1 (Prps1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000033809 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:140456613:140476140:1 gene:ENSMUSG00000031432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AB025048 // GenBank // Mus musculus mRNA for Sid6061p, complete cds. // chrX // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// BC054772 // GenBank // Mus musculus phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1, mRNA (cDNA clone MGC:65724 IMAGE:6415720), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000040014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:140456742:140475261:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_011845 // RefSeq // Mus musculus midline 2 (Mid2), mRNA. // chrX // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006528524 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus midline 2 (Mid2), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006528525 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus midline 2 (Mid2), transcript variant X4, mRNA. // chrX // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000112988 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:140665072:140763995:1 gene:ENSMUSG00000000266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:140664956:140767715:1 gene:ENSMUSG00000000266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000112993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:140678028:140767715:1 gene:ENSMUSG00000000266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF196480 // GenBank // Mus musculus RING finger protein (Fxy2) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:140678052:140763881:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_026103 // RefSeq // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 1 (Vsig1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NM_030181 // RefSeq // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 1 (Vsig1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000033806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:140907608:140939472:1 gene:ENSMUSG00000031430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000127629 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:140923189:140938233:1 gene:ENSMUSG00000031430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC048589 // GenBank // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6707496). // chrX // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC120675 // GenBank // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:155912 IMAGE:40129598), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC125278 // GenBank // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:158981 IMAGE:40129793), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC145050 // GenBank // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:178606 IMAGE:9053598), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// DQ007336 // GenBank // Mus musculus glycoprotein A34 precursor, mRNA, complete cds. // chrX // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000040009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:140907678:140938056:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_174875 // RefSeq // Mus musculus autophagy related 4A, cysteine peptidase (Atg4a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000112971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:140956907:141164270:1 gene:ENSMUSG00000079418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000117271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:103644839:103646023:-1 gene:ENSMUSG00000087119 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC089500 // GenBank // Mus musculus autophagy-related 4A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:107179 IMAGE:30286094), complete cds. // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:103644833:103732378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000040026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:140965073:141163314:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_001163155 // RefSeq // Mus musculus collagen, type IV, alpha 5 (Col4a5), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// NM_007736 // RefSeq // Mus musculus collagen, type IV, alpha 5 (Col4a5), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 98 // 57 // 57 // 0 /// ENSMUST00000112930 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:141475410:141689180:1 gene:ENSMUSG00000031274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 98 // 57 // 57 // 0 /// ENSMUST00000112931 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:141475385:141689234:1 gene:ENSMUSG00000031274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// ENSMUST00000130732 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:141630124:141689234:1 gene:ENSMUSG00000031274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 38 // 22 // 22 // 0 /// AB041350 // GenBank // Mus musculus Col4a5 mRNA for type IV collagen alpha 5 chain, complete cds. // chrX // 100 // 97 // 56 // 56 // 0 /// BC043317 // GenBank // Mus musculus collagen, type IV, alpha 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:5343761), complete cds. // chrX // 95 // 36 // 20 // 21 // 0 /// BC082788 // GenBank // Mus musculus collagen, type IV, alpha 5, mRNA (cDNA clone MGC:91198 IMAGE:5343488), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 56 // 56 // 0 /// GENSCAN00000032707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:141537608:141715331:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 76 // 44 // 44 // 0
ENSMUST00000117647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:142412755:142412967:1 gene:ENSMUSG00000071680 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:142412755:142412967:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT074133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT074134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000121341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:142425327:142425536:1 gene:ENSMUSG00000081365 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT074135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030523 // RefSeq // Mus musculus microRNA 652 (Mir652), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102057 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:142739000:142739097:1 gene:ENSMUSG00000076011 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-652 // miRBase Micro RNA Database // MI0004965 Mus musculus miR-652 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT074141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001040434 // RefSeq // Mus musculus retrotransposon gag domain containing 1 (Rgag1), mRNA. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000165829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:143099594:143104297:1 gene:ENSMUSG00000085584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:143099594:143162059:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001195579 // RefSeq // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5, opposite strand (Trpc5os), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528665 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 15070 (Gm15070), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528666 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 15070 (Gm15070), transcript variant X4, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:144456581:144477066:1 gene:ENSMUSG00000072934 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:144470681:144477063:1 gene:ENSMUSG00000072934 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:144473885:144474217:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000117232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:144847683:144848283:1 gene:ENSMUSG00000084303 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001033795 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 16 (Zcchc16), mRNA. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006528952 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 16 (Zcchc16), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000096301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:145119501:145121258:1 gene:ENSMUSG00000071679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000112843 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:144688907:145122411:1 gene:ENSMUSG00000071679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK136928 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330190I03 product:hypothetical Zn-finger, CCHC type/Zinc finger CCHC-type profile containing protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138958 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:170585 IMAGE:8861980), complete cds. // chrX // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC138959 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:170586 IMAGE:8861981), complete cds. // chrX // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000049662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:145119584:145120498:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000122042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:146932685:146934254:1 gene:ENSMUSG00000084061 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:146898151:147064988:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 36 // 8 // 8 // 0
NR_029956 // RefSeq // Mus musculus microRNA 448 (Mir448), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083516 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:147158210:147158321:1 gene:ENSMUSG00000065450 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-448 // miRBase Micro RNA Database // MI0001638 Mus musculus miR-448 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT074219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000116523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:147720978:147722892:1 gene:ENSMUSG00000080250 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT074228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
NM_001102446 // RefSeq // Mus musculus aminolevulinic acid synthase 2, erythroid (Alas2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NM_009653 // RefSeq // Mus musculus aminolevulinic acid synthase 2, erythroid (Alas2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000066337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:150547375:150570638:1 gene:ENSMUSG00000025270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000112715 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:150547459:150570622:1 gene:ENSMUSG00000025270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC024575 // GenBank // Mus musculus aminolevulinic acid synthase 2, erythroid, mRNA (cDNA clone IMAGE:5054102), complete cds. // chrX // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// BC150870 // GenBank // Mus musculus aminolevulinic acid synthase 2, erythroid, mRNA (cDNA clone MGC:183781 IMAGE:9087781), complete cds. // chrX // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// M63244 // GenBank // Mus musculus amino levulinate synthase mRNA, complete cds. // chrX // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// GENSCAN00000048235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:150552164:150570491:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 80 // 27 // 28 // 0
NM_008001 // RefSeq // Mus musculus FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1 (Fgd1), mRNA. // chrX // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000026296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:151047170:151089521:1 gene:ENSMUSG00000025265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000112685 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:151046150:151089521:1 gene:ENSMUSG00000025265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 79 // 37 // 37 // 0 /// BC004838 // GenBank // Mus musculus FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:2648348), complete cds. // chrX // 90 // 45 // 19 // 21 // 0 /// BC011462 // GenBank // Mus musculus FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:18423 IMAGE:3674293), complete cds. // chrX // 98 // 96 // 44 // 45 // 0 /// U22325 // GenBank // Mus musculus faciogenital dysplasis (Fgd1) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// AK162865 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230065D12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// GENSCAN00000048220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:151046699:151088908:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 87 // 41 // 41 // 0
ENSMUST00000117169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:151165725:151166109:1 gene:ENSMUSG00000081625 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:151165725:151172876:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_001271678 // RefSeq // Mus musculus WNK lysine deficient protein kinase 3 (Wnk3), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001271679 // RefSeq // Mus musculus WNK lysine deficient protein kinase 3 (Wnk3), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:151198140:151318309:1 gene:ENSMUSG00000041245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:151198140:151315128:1 gene:ENSMUSG00000041245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000184392 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:151198078:151315186:1 gene:ENSMUSG00000041245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000184730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:151198078:151315186:1 gene:ENSMUSG00000041245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// JQ247189 // GenBank // Mus musculus WNK lysine deficient protein kinase 3 isoform 18b (Wnk3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// JQ247190 // GenBank // Mus musculus WNK lysine deficient protein kinase 3 isoform 18a (Wnk3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:151224993:151403324:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_198105 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 120, member C (Fam120c), mRNA. // chrX // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000073364 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:151344175:151471842:1 gene:ENSMUSG00000025262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000125924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:151344175:151471842:1 gene:ENSMUSG00000025262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY150024 // GenBank // Mus musculus unknown variant mRNA; alternatively spliced. // chrX // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC137973 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 120, member C, mRNA (cDNA clone MGC:169597 IMAGE:8860992), complete cds. // chrX // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC171940 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 120, member C, mRNA (cDNA clone MGC:198645 IMAGE:9054226), complete cds. // chrX // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006528776 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 120, member C (Fam120c), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000017237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:151429795:151469730:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000017250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:151224993:151403324:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
ENSMUST00000082482 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:151384494:151384643:1 gene:ENSMUSG00000064416 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT074349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSMUST00000093707 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:151777671:151777789:1 gene:ENSMUSG00000070219 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT074356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029732 // RefSeq // Mus musculus microRNA let7f-2 (Mirlet7f-2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000083668 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:151912346:151912428:1 gene:ENSMUSG00000065602 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// mmu-let-7f-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000563 Mus musculus let-7f-2 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT074367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NR_029753 // RefSeq // Mus musculus microRNA 98 (Mir98), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000083602 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:151913214:151913321:1 gene:ENSMUSG00000065536 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// mmu-mir-98 // miRBase Micro RNA Database // MI0000586 Mus musculus miR-98 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT074368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000117933 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:151945368:151946367:1 gene:ENSMUSG00000082778 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000017242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:151820371:152004329:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_016763 // RefSeq // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 10 (Hsd17b10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026289 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:152001845:152004442:1 gene:ENSMUSG00000025260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112617 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:152001845:152004442:1 gene:ENSMUSG00000025260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152003397:152004442:1 gene:ENSMUSG00000025260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000151200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152002149:152004442:1 gene:ENSMUSG00000025260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF233685 // GenBank // Mus musculus 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 10/short chain L-3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (Hsd17b10/Schad) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC027517 // GenBank // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 10, mRNA (cDNA clone MGC:41111 IMAGE:3376098), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U96116 // GenBank // Mus musculus amyloid beta-peptide binding protein (ERAB) mRNA, complete cds. // chrX // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:151820371:152004329:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 96 // 25 // 26 // 0
NM_019710 // RefSeq // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 1A (Smc1a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:152016428:152062694:1 gene:ENSMUSG00000041133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF047600 // GenBank // Mus musculus chromosome segregation protein SmcB (SmcB) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC131667 // GenBank // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 1A, mRNA (cDNA clone MGC:150198 IMAGE:40110822), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000145518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152016428:152036212:1 gene:ENSMUSG00000041133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// BC055477 // GenBank // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 1A, mRNA (cDNA clone IMAGE:4234634), partial cds. // chrX // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000017243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:152016532:152061809:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001005475 // RefSeq // Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 2 (Iqsec2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NM_001114664 // RefSeq // Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 2 (Iqsec2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000096275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:152178964:152225236:1 gene:ENSMUSG00000041115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000112604 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:152144272:152225236:1 gene:ENSMUSG00000041115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112605 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:152144272:152225236:1 gene:ENSMUSG00000041115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000168786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:152144268:152225235:1 gene:ENSMUSG00000041115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// AB275281 // GenBank // Mus musculus mRNA for ARF6 guanine nucleotide exchange factor IQArfGEF, complete cds. // chrX // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:152203011:152273074:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
NM_013668 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 5C (Kdm5c), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000082177 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:152233272:152273772:1 gene:ENSMUSG00000025332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000112584 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:152233020:152273768:1 gene:ENSMUSG00000025332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000112588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:152233229:152274535:1 gene:ENSMUSG00000025332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000154938 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152233254:152246751:1 gene:ENSMUSG00000025332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AF127245 // GenBank // Mus musculus Smcx (Smcx) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK081369 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130011J04 product:selected mouse cDNA on the X, full insert sequence. // chrX // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC043096 // GenBank // Mus musculus jumonji, AT rich interactive domain 1C (Rbp2 like), mRNA (cDNA clone MGC:58015 IMAGE:6405943), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC054550 // GenBank // Mus musculus jumonji, AT rich interactive domain 1C (Rbp2 like), mRNA (cDNA clone MGC:62410 IMAGE:6405943), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:152203011:152273074:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000140208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152489661:152491860:-1 gene:ENSMUSG00000087569 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000146697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152490434:152491575:-1 gene:ENSMUSG00000087569 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000151942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152432762:152433903:1 gene:ENSMUSG00000087235 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000152262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152432477:152434676:1 gene:ENSMUSG00000087235 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC016624 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4501052. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:152491021:152513734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_010951 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 143 (Gpr143), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000026383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:152781986:152808646:1 gene:ENSMUSG00000025333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000151819 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152781921:152795615:1 gene:ENSMUSG00000025333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 93 // 47 // 13 // 14 // 0 /// BC119384 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 143, mRNA (cDNA clone MGC:155700 IMAGE:8734133), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC137813 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 143, mRNA (cDNA clone MGC:169437 IMAGE:8860832), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// U63918 // GenBank // Mus musculus ocular albanism 1 protein (OA1) mRNA, complete cds. // chrX // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// ENSMUST00000139310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152782018:152790920:1 gene:ENSMUSG00000025333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// AK033060 // GenBank HTC // Mus musculus adult male eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7530427O11 product:mouse homolog of human ocular albinism 1 (Nettleship-Falls), full insert sequence. // chrX // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000003904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:152782043:152798680:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT074420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 93 // 47 // 13 // 14 // 0 /// NONMMUT074421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001137547 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific protease 51 (Usp51), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:153006469:153009416:1 gene:ENSMUSG00000067215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:153006915:153024778:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001034894 // RefSeq // Mus musculus forkhead box R2 (Foxr2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528905 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus forkhead box R2 (Foxr2), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000096265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:153118786:153132861:1 gene:ENSMUSG00000071665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:153126897:153132861:1 gene:ENSMUSG00000071665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:153130135:153131043:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001004154 // RefSeq // Mus musculus Ras-related GTP binding B (Rragb), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006528849 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras-related GTP binding B (Rragb), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006528850 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras-related GTP binding B (Rragb), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006528851 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras-related GTP binding B (Rragb), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XR_387085 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras-related GTP binding B (Rragb), transcript variant X4, misc_RNA. // chrX // 96 // 70 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000039720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:153139981:153171943:1 gene:ENSMUSG00000041658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000144175 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:153139987:153153187:1 gene:ENSMUSG00000041658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// BC069180 // GenBank // Mus musculus Ras-related GTP binding B, mRNA (cDNA clone MGC:69750 IMAGE:6810543), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC070407 // GenBank // Mus musculus Ras-related GTP binding B, mRNA (cDNA clone MGC:95567 IMAGE:6808979), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:153140132:153175813:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 58 // 19 // 19 // 0
NM_173780 // RefSeq // Mus musculus Kruppel-like factor 8 (Klf8), mRNA. // chrX // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// XM_006528855 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Kruppel-like factor 8 (Klf8), transcript variant X4, mRNA. // chrX // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000039545 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:153359613:153395797:1 gene:ENSMUSG00000041649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000112574 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:153237748:153396132:1 gene:ENSMUSG00000041649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// BC070442 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like factor 8, mRNA (cDNA clone MGC:99920 IMAGE:30535488), complete cds. // chrX // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:153325614:153414519:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 38 // 38 // 15 // 40 // 1
NM_018798 // RefSeq // Mus musculus ubiquilin 2 (Ubqln2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060714 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:153498227:153501570:1 gene:ENSMUSG00000050148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF177346 // GenBank // Mus musculus PLIC-2 mRNA, complete cds. // chrX // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// BC053022 // GenBank // Mus musculus ubiquilin 2, mRNA (cDNA clone MGC:62228 IMAGE:5708544), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:153498454:153500370:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_173367 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 3 (Cypt3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000056754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:153558593:153559429:1 gene:ENSMUSG00000048573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000112573 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:153558593:153559423:1 gene:ENSMUSG00000048573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AF463500 // GenBank // Mus musculus basic protein CKT1R1 (Ckt1r1) mRNA, complete cds. // chrX // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// BC048527 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 3, mRNA (cDNA clone MGC:58437 IMAGE:6772990), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000032362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:153558613:153559299:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_001005370 // RefSeq // Mus musculus spindlin family, member 2C (Spin2c), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528868 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spindlin family, member 2C (Spin2c), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000049999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:153832293:153834243:1 gene:ENSMUSG00000046550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123264 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:153832241:153833523:1 gene:ENSMUSG00000046550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC068162 // GenBank // Mus musculus spindlin family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:93001 IMAGE:30358613), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:153783277:153833966:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_029199 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated multipass transmembrane protein 4 (Samt4), mRNA. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:154482002:154484682:1 gene:ENSMUSG00000025051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:154405196:154484568:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000082884 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:154711258:154711365:1 gene:ENSMUSG00000064818 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT074447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000122420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:154774453:154775438:1 gene:ENSMUSG00000082197 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000015103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:154774489:154775046:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 73 // 79 // 11 // 15 // 0
ENSMUST00000083907 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:154979339:154979448:1 gene:ENSMUSG00000094976 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT074448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000082990 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:155046610:155046719:1 gene:ENSMUSG00000096247 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT074449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000120127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:155155195:155156188:1 gene:ENSMUSG00000083823 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_019736 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 9 (Acot9), mRNA. // chrX // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000026324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:155262443:155297654:1 gene:ENSMUSG00000025287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000131332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:155262505:155297646:1 gene:ENSMUSG00000025287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC021763 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 9, mRNA (cDNA clone MGC:30213 IMAGE:4458575), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000112542 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:155624775:156345887:1 gene:ENSMUSG00000055109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK028243 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900052M09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_033598 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930503H13 gene (4930503H13Rik), non-coding RNA. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000118320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:156539151:156540120:1 gene:ENSMUSG00000082612 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK015689 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930503H13 product:weakly similar to CDNA FLJ20514 FIS, CLONE KAT09756 (HYPOTHETICAL 28.6 KDA PROTEIN) (SIMILAR TO HYPOTHETICAL PROTEIN FLJ20514) [Homo sapiens], full insert sequence. // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000053715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:156515819:156539873:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000158717 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:157053955:157054118:1 gene:ENSMUSG00000089342 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// NONMMUT074474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 87 // 60 // 13 // 15 // 0
NM_001081667 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 34 (Klhl34), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:157818435:157820369:1 gene:ENSMUSG00000047485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:157818435:157820369:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000120024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:158150096:158151179:1 gene:ENSMUSG00000082076 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000053373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:158129568:158150992:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 75 // 11 // 12 // 0
NM_025437 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1A, X-linked (Eif1ax), mRNA. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000087143 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:159372178:159389928:1 gene:ENSMUSG00000067194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK134827 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330579O12 product:eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-linked, full insert sequence. // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC027284 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:29011 IMAGE:3156134), complete cds. // chrX // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:159372400:159385413:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_001081124 // RefSeq // Mus musculus MAP7 domain containing 2 (Map7d2), mRNA. // chrX // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000043151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:159459125:159498583:1 gene:ENSMUSG00000041020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112471 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:159414572:159498757:1 gene:ENSMUSG00000041020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000145142 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:159446008:159490778:1 gene:ENSMUSG00000041020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// AK030316 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5031428K02 product:similar to CDNA FLJ14503 FIS, CLONE NT2RM1000252, WEAKLY SIMILAR TO H.SAPIENS E-MAP-115 MRNA [Homo sapiens], full insert sequence. // chrX // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// AK043342 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730087E14 product:RIKEN cDNA 5330432J06 gene, full insert sequence. // chrX // 86 // 38 // 12 // 14 // 0 /// ENSMUST00000112470 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:159459125:159486623:1 gene:ENSMUSG00000041020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// AK019929 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330432J06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// GENSCAN00000021908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:159414697:159496284:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 76 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000175157 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:159449277:159449385:1 gene:ENSMUSG00000092898 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONMMUT074522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
NM_001033472 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A830080D01 gene (A830080D01Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006528901 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A830080D01 gene (A830080D01Rik), transcript variant X4, mRNA. // chrX // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000057180 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:159532719:159592394:1 gene:ENSMUSG00000044150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000112464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:159532668:159593081:1 gene:ENSMUSG00000044150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:159547227:159569807:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 58 // 21 // 21 // 0
NM_001163085 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 15 (Map3k15), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:159988433:160123351:1 gene:ENSMUSG00000031303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:160094296:160122614:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000021910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:160036321:160091784:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSMUST00000121310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:160036321:160036818:1 gene:ENSMUSG00000082810 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:160036321:160091784:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 15 // 15 // 0
NM_011302 // RefSeq // Mus musculus retinoschisis (X-linked, juvenile) 1 (human) (Rs1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000033650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:160768013:160799663:1 gene:ENSMUSG00000031293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000112368 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:160768180:160794853:1 gene:ENSMUSG00000031293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// AF073780 // GenBank // Mus musculus X-linked juvenile retinoschisis protein (Xlrs1) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF084561 // GenBank // Mus musculus X-linked juvenile retinoschisis precursor (Rs1) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC046422 // GenBank // Mus musculus retinoschisis (X-linked, juvenile) 1 (human), mRNA (cDNA clone MGC:51377 IMAGE:5401012), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:160748656:160794671:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001103367 // RefSeq // Mus musculus retinoic acid induced 2 (Rai2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NM_198409 // RefSeq // Mus musculus retinoic acid induced 2 (Rai2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:161717627:161779496:1 gene:ENSMUSG00000043518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112338 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:161717069:161779494:1 gene:ENSMUSG00000043518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC061184 // GenBank // Mus musculus retinoic acid induced 2, mRNA (cDNA clone MGC:74324 IMAGE:30300326), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000084009 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:162114238:162114341:1 gene:ENSMUSG00000065943 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT074573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000119454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:162351596:162353876:1 gene:ENSMUSG00000082625 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000033783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:162296527:162353876:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// NONMMUT074577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_009031 // RefSeq // Mus musculus retinoblastoma binding protein 7 (Rbbp7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000033720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:162760402:162779092:1 gene:ENSMUSG00000031353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000112327 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:162760421:162778756:1 gene:ENSMUSG00000031353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000138791 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:162761066:162772230:1 gene:ENSMUSG00000031353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// BC003785 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma binding protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:6013 IMAGE:3600013), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// U35142 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma-binding protein (mRbAp46) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000112326 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:162760462:162775895:1 gene:ENSMUSG00000031353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// AK132101 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110007C20 product:retinoblastoma binding protein 7, full insert sequence. // chrX // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// GENSCAN00000033768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:162761143:162778416:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
ENSMUST00000121443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:162844838:162845523:1 gene:ENSMUSG00000084022 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_020626 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 27 (Tmem27), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000015545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:164090187:164118859:1 gene:ENSMUSG00000015401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:164088830:164118860:1 gene:ENSMUSG00000015401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF178085 // GenBank // Mus musculus collectrin mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049912 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 27, mRNA (cDNA clone MGC:54532 IMAGE:4973401), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141818 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:164092189:164118214:1 gene:ENSMUSG00000015401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:164088783:164118352:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_027153 // RefSeq // Mus musculus pirin (Pir), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:164269431:164373011:1 gene:ENSMUSG00000031379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000145412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:164269371:164369112:1 gene:ENSMUSG00000031379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC024062 // GenBank // Mus musculus pirin, mRNA (cDNA clone MGC:37739 IMAGE:5067536), complete cds. // chrX // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000129296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:164269547:164344659:1 gene:ENSMUSG00000031379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// AK082922 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430020E23 product:PIRIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrX // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSMUST00000123343 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:164269573:164309777:1 gene:ENSMUSG00000031379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// AK090023 // GenBank HTC // Mus musculus brain CRL-1443 BC3H1 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430064M09 product:PIRIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrX // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000049153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:164271636:164372565:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 71 // 19 // 20 // 0
NM_010216 // RefSeq // Mus musculus c-fos induced growth factor (Figf), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006528701 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus c-fos induced growth factor (Figf), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000033751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:164373378:164402650:1 gene:ENSMUSG00000031380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC080770 // GenBank // Mus musculus c-fos induced growth factor, mRNA (cDNA clone MGC:91248 IMAGE:30286444), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D89628 // GenBank // Mus musculus mRNA for vascular endothelial growth factor D, complete cds. // chrX // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// ENSMUST00000124851 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:164391243:164400780:1 gene:ENSMUSG00000031380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// BC062809 // GenBank // Mus musculus c-fos induced growth factor, mRNA (cDNA clone IMAGE:864338), complete cds. // chrX // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:164385834:164402170:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_026853 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 11 (Asb11), mRNA. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006528970 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 11 (Asb11), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006528974 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 11 (Asb11), transcript variant X5, mRNA. // chrX // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000033755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:164438058:164459164:1 gene:ENSMUSG00000031382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000036858 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:164436994:164459170:1 gene:ENSMUSG00000031382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF398972 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat-containing SOCS box protein 11 (Asb11) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC064047 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:73562 IMAGE:864428), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000134085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:164437010:164446997:1 gene:ENSMUSG00000031382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// AK078851 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030022F06 product:ankyrin repeat and SOCS box-containing protein 11, full insert sequence. // chrX // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000049158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:164422646:164539664:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONMMUT074631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_027027 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 9 (Asb9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000033756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:164506327:164539752:1 gene:ENSMUSG00000031384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF398970 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat-containing SOCS box protein 9 (Asb9) mRNA, complete cds. // chrX // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// BC061038 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:74146 IMAGE:6703903), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:164422646:164539664:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001146081 // RefSeq // Mus musculus Fanconi anemia, complementation group B (Fancb), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006528832 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Fanconi anemia, complementation group B (Fancb), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000057150 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:164980712:164997272:1 gene:ENSMUSG00000047757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000101082 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:164980592:164997269:1 gene:ENSMUSG00000047757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000167446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:164980592:164997269:1 gene:ENSMUSG00000047757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC022692 // GenBank // Mus musculus Fanconi anemia, complementation group B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4456807), complete cds. // chrX // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC083151 // GenBank // Mus musculus Fanconi anemia, complementation group B, mRNA (cDNA clone MGC:103245 IMAGE:30460698), complete cds. // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC100430 // GenBank // Mus musculus Fanconi anemia, complementation group B, mRNA (cDNA clone IMAGE:6532272), partial cds. // chrX // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// NM_175027 // RefSeq // Mus musculus Fanconi anemia, complementation group B (Fancb), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000049149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:164982524:164997184:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_146238 // RefSeq // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 8 (Gemin8), mRNA. // chrX // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// ENSMUST00000056410 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:166170454:166190512:1 gene:ENSMUSG00000040621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// ENSMUST00000087169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:166170495:166190510:1 gene:ENSMUSG00000040621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000119938 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:167776261:167777556:1 gene:ENSMUSG00000084378 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000034962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:167776303:167777070:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_006529016 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5-like (LOC102635760), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000122339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:168546009:168546341:1 gene:ENSMUSG00000084014 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:168527099:168546341:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000119987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:169368189:169370003:1 gene:ENSMUSG00000081137 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chrX // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// BC022960 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC022960, mRNA (cDNA clone IMAGE:5364905), partial cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:169368189:169370012:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
ENSMUST00000120800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:179612622:179613567:-1 gene:ENSMUSG00000083410 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 30 // 100 // 8 // 27 // 0 /// AK145530 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0011B01 product:hypothetical DeoxyUTP pyrophosphatase/Aspartyl protease, retroviral-type family profile/Peptidase aspartic/Peptidase aspartic, active site containing protein, full insert sequence. // chrX // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// KnowTID_00007895 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chrX // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// KnowTID_00007985 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chrX // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// NONMMUT071655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// NONMMUT072104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 81 // 100 // 22 // 27 // 0
NM_010850 // RefSeq // Mus musculus myc-like oncogene, s-myc protein (Mycs), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000058404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:5466898:5469265:-1 gene:ENSMUSG00000044597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC117074 // GenBank // Mus musculus myc-like oncogene, s-myc protein, mRNA (cDNA clone MGC:151451 IMAGE:40126393), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC120777 // GenBank // Mus musculus myc-like oncogene, s-myc protein, mRNA (cDNA clone MGC:156014 IMAGE:40129700), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:5467729:5469000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000118680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:5859717:5861540:1 gene:ENSMUSG00000081486 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:5869686:5871506:-1 gene:ENSMUSG00000083939 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:5832555:5861540:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:5869683:5871470:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001166433 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AU022751 (AU022751), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000117544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:6081219:6083419:-1 gene:ENSMUSG00000073294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC100377 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AU022751, mRNA (cDNA clone MGC:117813 IMAGE:30938251), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_001033211 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AU022751 (AU022751), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// ENSMUST00000101698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:6081219:6083419:-1 gene:ENSMUSG00000073294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// GENSCAN00000016347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:6081553:6083322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 74 // 25 // 26 // 0
NM_001031664 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 10 (Nudt10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000103006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:6168696:6173015:-1 gene:ENSMUSG00000073293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC055771 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 10, mRNA (cDNA clone MGC:67346 IMAGE:6404994), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_009757 // RefSeq // Mus musculus bone morphogenetic protein 15 (Bmp15), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024049 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:6314107:6320721:-1 gene:ENSMUSG00000023279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF082348 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 15 precursor (Bmp15) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC055363 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:60557 IMAGE:30051425), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:6295919:6320363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_183015 // RefSeq // Mus musculus cyclin B3 (Ccnb3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000056725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:6979652:7030936:-1 gene:ENSMUSG00000051592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000115752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:6979652:7041619:-1 gene:ENSMUSG00000051592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ555464 // GenBank // Mus musculus mRNA for cyclin B3 (Ccnb3 gene), splice variant 1. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132411 // GenBank // Mus musculus cyclin B3, mRNA (cDNA clone MGC:164042 IMAGE:40130688), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC138355 // GenBank // Mus musculus cyclin B3, mRNA (cDNA clone MGC:169980 IMAGE:8861375), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:6980251:7030886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001243762 // RefSeq // Mus musculus chloride channel 5 (Clcn5), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_016691 // RefSeq // Mus musculus chloride channel 5 (Clcn5), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000004428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7153810:7188714:-1 gene:ENSMUSG00000004317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000115746 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:7159469:7319233:-1 gene:ENSMUSG00000004317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000154382 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7160177:7188673:-1 gene:ENSMUSG00000004317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AF134117 // GenBank // Mus musculus chloride channel 5 (Clcn5) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC036347 // GenBank // Mus musculus chloride channel 5, mRNA (cDNA clone MGC:35965 IMAGE:3989812), complete cds. // chrX // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// XM_006527564 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chloride channel 5 (Clcn5), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// ENSMUST00000128319 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:7171199:7319358:-1 gene:ENSMUSG00000004317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// AK034356 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330181N07 product:chloride channel 5, full insert sequence. // chrX // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7159729:7263522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NR_030495 // RefSeq // Mus musculus microRNA 500 (Mir500), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093600 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:7237683:7237774:-1 gene:ENSMUSG00000070108 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// mmu-mir-500 // miRBase Micro RNA Database // MI0004702 Mus musculus miR-500 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT071702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_030496 // RefSeq // Mus musculus microRNA 501 (Mir501), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102296 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:7241243:7241351:-1 gene:ENSMUSG00000076251 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-501 // miRBase Micro RNA Database // MI0004703 Mus musculus miR-501 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029851 // RefSeq // Mus musculus microRNA 362 (Mir362), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093592 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:7241982:7242046:-1 gene:ENSMUSG00000070100 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-362 // miRBase Micro RNA Database // MI0000763 Mus musculus miR-362 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_029574 // RefSeq // Mus musculus microRNA 188 (Mir188), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083464 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:7247989:7248056:-1 gene:ENSMUSG00000065398 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-188 // miRBase Micro RNA Database // MI0000230 Mus musculus miR-188 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030242 // RefSeq // Mus musculus microRNA 532 (Mir532), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093630 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:7248402:7248497:-1 gene:ENSMUSG00000070139 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-532 // miRBase Micro RNA Database // MI0003206 Mus musculus miR-532 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019461 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 27, X chromosome (Usp27x), mRNA. // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000115744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7372591:7375830:-1 gene:ENSMUSG00000046269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000178293 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7371276:7375826:-1 gene:ENSMUSG00000046269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000191497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:7371276:7375826:-1 gene:ENSMUSG00000046269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7373545:7376612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000157852 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:7547348:7547480:-1 gene:ENSMUSG00000088477 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138603 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 22 (Ccdc22), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000033483 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7593809:7605517:-1 gene:ENSMUSG00000031143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000126170 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7558602:7605381:-1 gene:ENSMUSG00000039556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AF229637 // GenBank // Mus musculus DXImx40e protein (DXImx40e) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC011195 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 22, mRNA (cDNA clone MGC:18697 IMAGE:4188459), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000144674 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7593810:7597279:-1 gene:ENSMUSG00000031143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// BC057686 // GenBank HTC // Mus musculus coiled-coil domain containing 22, mRNA (cDNA clone IMAGE:3711445), with apparent retained intron. // chrX // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// AK164582 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430019A04 product:protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3F, full insert sequence. // chrX // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7594054:7605293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 85 // 85 // 29 // 34 // 1
NM_018832 // RefSeq // Mus musculus MAGI family member, X-linked (Magix), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NR_037581 // RefSeq // Mus musculus MAGI family member, X-linked (Magix), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000115695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7674626:7681089:-1 gene:ENSMUSG00000031147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000130287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7673164:7681251:-1 gene:ENSMUSG00000031147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AF229645 // GenBank // Mus musculus Pdz-containing protein (Pdzx) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC099459 // GenBank // Mus musculus MAGI family member, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:117659 IMAGE:30847792), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC132580 // GenBank // Mus musculus MAGI family member, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:164211 IMAGE:40130857), complete cds. // chrX // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC132582 // GenBank // Mus musculus MAGI family member, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:164213 IMAGE:40130859), complete cds. // chrX // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7674902:7688497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 64 // 17 // 18 // 0
NM_207202 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 120 (Ccdc120), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033490 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7731714:7741341:-1 gene:ENSMUSG00000031150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC139064 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 120, mRNA (cDNA clone MGC:170691 IMAGE:8862086), complete cds. // chrX // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7732619:7739978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_181548 // RefSeq // Mus musculus ES cell-expressed Ras (Eras), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527636 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ES cell-expressed Ras (Eras), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000033500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7924276:7928607:-1 gene:ENSMUSG00000031160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB093573 // GenBank // Mus musculus ERas mRNA for small GTPase protein E-Ras, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC119277 // GenBank // Mus musculus ES cell-expressed Ras, mRNA (cDNA clone MGC:155593 IMAGE:8734026), complete cds. // chrX // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC119281 // GenBank // Mus musculus ES cell-expressed Ras, mRNA (cDNA clone MGC:155597 IMAGE:8734030), complete cds. // chrX // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_001130416 // RefSeq // Mus musculus histone deacetylase 6 (Hdac6), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_010413 // RefSeq // Mus musculus histone deacetylase 6 (Hdac6), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000033501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:7930122:7947889:-1 gene:ENSMUSG00000031161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000115642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7930120:7947889:-1 gene:ENSMUSG00000031161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000137499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7930124:7947838:-1 gene:ENSMUSG00000031161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000145675 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:7931359:7947889:-1 gene:ENSMUSG00000031161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF006603 // GenBank // Mus musculus histone deacetylase mHDA2 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC041105 // GenBank // Mus musculus histone deacetylase 6, mRNA (cDNA clone MGC:46887 IMAGE:5352032), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7930469:7950726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_008089 // RefSeq // Mus musculus GATA binding protein 1 (Gata1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:7959260:7967910:-1 gene:ENSMUSG00000031162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052653 // GenBank // Mus musculus GATA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:60652 IMAGE:30039400), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:7956913:8008740:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_027227 // RefSeq // Mus musculus glyoxalase domain containing 5 (Glod5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006527699 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glyoxalase domain containing 5 (Glod5), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000033503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:8004200:8018492:-1 gene:ENSMUSG00000031163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061027 // GenBank // Mus musculus glyoxalase domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:74134 IMAGE:30312868), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_009515 // RefSeq // Mus musculus Wiskott-Aldrich syndrome homolog (human) (Was), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000033505 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:8081453:8090498:-1 gene:ENSMUSG00000031165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000146029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:8086271:8088765:-1 gene:ENSMUSG00000031165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// U29673 // GenBank // Mus musculus Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U42471 // GenBank // Mus musculus Wiscott-Aldrich Syndrome protein homolog (N-3AP1) mRNA, complete cds. // chrX // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// U54788 // GenBank // Mus musculus Wiskott-Aldrich Syndrome Protein (WASP) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000018375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:8081934:8175833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_001166437 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 25 (Tbc1d25), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_172478 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 25 (Tbc1d25), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039892 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:8154472:8176181:-1 gene:ENSMUSG00000039201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000133093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:8154483:8175958:-1 gene:ENSMUSG00000039201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000143984 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:8154491:8175891:-1 gene:ENSMUSG00000039201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000172020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:8154472:8176181:-1 gene:ENSMUSG00000039201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC060178 // GenBank // Mus musculus ornithine aminotransferase-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6827865), partial cds. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC128566 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 25, mRNA (cDNA clone MGC:157455 IMAGE:40094900), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:8081934:8175833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_007898 // RefSeq // Mus musculus phenylalkylamine Ca2+ antagonist (emopamil) binding protein (Ebp), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033509 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:8185329:8193512:-1 gene:ENSMUSG00000031168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC004620 // GenBank // Mus musculus phenylalkylamine Ca2+ antagonist (emopamil) binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:5940 IMAGE:3585323), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC004703 // GenBank // Mus musculus phenylalkylamine Ca2+ antagonist (emopamil) binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:7785 IMAGE:3499265), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000140011 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:8185331:8187174:-1 gene:ENSMUSG00000031168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000143223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:8186748:8193400:-1 gene:ENSMUSG00000031168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000018377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:8185610:8227457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001001450 // RefSeq // Mus musculus synovial sarcoma, X member B, breakpoint 2 (Ssxb2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NM_001134226 // RefSeq // Mus musculus synovial sarcoma, X member B, breakpoint 2 (Ssxb2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// ENSMUST00000023931 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:8454345:8461726:-1 gene:ENSMUSG00000023165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// ENSMUST00000103000 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:8454345:8461726:-1 gene:ENSMUSG00000023165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// AY244793 // GenBank // Mus musculus SSXB2 protein (Ssxb2) mRNA, complete cds. // chrX // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// BC048441 // GenBank // Mus musculus synovial sarcoma, X member B, breakpoint 2, mRNA (cDNA clone MGC:58138 IMAGE:6773922), complete cds. // chrX // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// BC089478 // GenBank // Mus musculus synovial sarcoma, X member B, breakpoint 2, mRNA (cDNA clone MGC:107123 IMAGE:6743842), complete cds. // chrX // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// GENSCAN00000018365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:8454930:8460905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
ENSMUST00000089374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:8583404:8591816:-1 gene:ENSMUSG00000079701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC087939 // GenBank // Mus musculus synovial sarcoma, X member B, breakpoint 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6772235), partial cds. // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NM_198898 // RefSeq // Mus musculus synovial sarcoma, X member B, breakpoint 3 (Ssxb3), mRNA. // chrX // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// XM_006527632 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synovial sarcoma, X member B, breakpoint 3 (Ssxb3), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// ENSMUST00000089379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:8583544:8589246:-1 gene:ENSMUSG00000079701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// AY244794 // GenBank // Mus musculus SSXB3 protein (Ssxb3) mRNA, complete cds. // chrX // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// BC132618 // GenBank // Mus musculus synovial sarcoma, X member B, breakpoint 3, mRNA (cDNA clone MGC:164249 IMAGE:40130895), complete cds. // chrX // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// BC132644 // GenBank // Mus musculus synovial sarcoma, X member B, breakpoint 3, mRNA (cDNA clone MGC:164275 IMAGE:40130921), complete cds. // chrX // 86 // 86 // 12 // 14 // 1
ENSMUST00000117771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:8941590:8942183:-1 gene:ENSMUSG00000081381 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONMMUT071796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000018368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:8941590:8942186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 68 // 68 // 25 // 37 // 1
ENSMUST00000119858 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:9327749:9328108:-1 gene:ENSMUSG00000083670 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 72 // 100 // 13 // 18 // 0 /// GENSCAN00000056452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9327758:9328108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 67 // 100 // 12 // 18 // 0
NM_007807 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b-245, beta polypeptide (Cybb), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000015484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:9435252:9469324:-1 gene:ENSMUSG00000015340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000164685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:9446925:9469269:-1 gene:ENSMUSG00000015340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC071229 // GenBank // Mus musculus cytochrome b-245, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:78187 IMAGE:4979804), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FJ168469 // GenBank // Mus musculus Nox2 (Cybb) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// U43384 // GenBank // Mus musculus gp91phox (Cybb) mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9438217:9469250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_025975 // RefSeq // Mus musculus dynein light chain Tctex-type 3 (Dynlt3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:9654267:9663003:-1 gene:ENSMUSG00000031176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:9656009:9659630:-1 gene:ENSMUSG00000031176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000154091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:9656276:9663003:-1 gene:ENSMUSG00000031176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK134558 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330411P21 product:t-complex-associated-testis-expressed 1-like, full insert sequence. // chrX // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC030032 // GenBank // Mus musculus dynein light chain Tctex-type 3, mRNA (cDNA clone MGC:41029 IMAGE:1332100), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527694 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein light chain Tctex-type 3 (Dynlt3), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000140019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:9656338:9657357:-1 gene:ENSMUSG00000031176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT071809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000056448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9572016:9662898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONMMUT071810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001290728 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin-like 5 (Sytl5), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 90 // 45 // 45 // 0 /// NM_177704 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin-like 5 (Sytl5), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// XM_006527605 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptotagmin-like 5 (Sytl5), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENSMUST00000067529 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:9885622:9994543:1 gene:ENSMUSG00000054453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENSMUST00000086165 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:9885622:9994543:1 gene:ENSMUSG00000054453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 45 // 45 // 0 /// AB098160 // GenBank // Mus musculus slp5 mRNA for synaptotagmin-like protein 5, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// AB098161 // GenBank // Mus musculus slp5 mRNA for synaptotagmin-like protein 5 delta 5S-I, complete cds. // chrX // 100 // 90 // 45 // 45 // 0 /// BC150158 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:161245 IMAGE:40141504), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// BC150480 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:161246 IMAGE:40141505), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// GENSCAN00000038089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9948812:9974848:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 62 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000056437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:9904854:9943181:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 28 // 28 // 14 // 50 // 1
NM_016911 // RefSeq // Mus musculus sushi-repeat-containing protein (Srpx), mRNA. // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044789 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:10037977:10117682:-1 gene:ENSMUSG00000090084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115543 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:10038907:10117605:-1 gene:ENSMUSG00000090084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000115544 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:10038556:10117709:-1 gene:ENSMUSG00000090084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AB028049 // GenBank // Mus musculus drs-1 mRNA for sushi-repeat-containing protein, complete cds. // chrX // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AB028050 // GenBank // Mus musculus drs-2 mRNA for sushi-repeat-containing protein, complete cds. // chrX // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC022572 // GenBank // Mus musculus sushi-repeat-containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:31012 IMAGE:3993025), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:10038917:10075310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000118521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:10696932:10697364:-1 gene:ENSMUSG00000081308 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000038088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:10684540:10697364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 89 // 60 // 8 // 9 // 0 /// NONMMUT071825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000180511 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:X:10707176:10717242:-1 gene:ENSMUSG00000097444 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK047551 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930087C06 product:unclassifiable, full insert sequence. // chrX // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// AK138241 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230044A09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chrX // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
ENSMUST00000122269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:10865077:10865633:-1 gene:ENSMUSG00000081680 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT071831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000119489 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:11020515:11021007:-1 gene:ENSMUSG00000083419 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:11020512:11020778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000119630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:12456886:12457230:-1 gene:ENSMUSG00000081461 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000013676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:12454042:12457230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
ENSMUST00000060108 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:12654879:12673668:-1 gene:ENSMUSG00000044148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC051146 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810030O07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6595287). // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC137660 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810030O07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169284 IMAGE:8860679), complete cds. // chrX // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:12655861:12673541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
AJ319753 // GenBank // Mus musculus mRNA for putative Mc2 protein. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00007997 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083879 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:13215698:13215809:-1 gene:ENSMUSG00000065813 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT071887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000118975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:13377866:13378678:-1 gene:ENSMUSG00000080818 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_026119 // RefSeq // Mus musculus mediator complex subunit 4 (Med4), mRNA. // chrX // 58 // 100 // 7 // 12 // 0 /// ENSMUST00000022705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:14:73510049:73518545:1 gene:ENSMUSG00000022109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 58 // 100 // 7 // 12 // 0 /// BC024950 // GenBank // Mus musculus mediator of RNA polymerase II transcription, subunit 4 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:28939 IMAGE:3992287), complete cds. // chrX // 58 // 100 // 7 // 12 // 0 /// GENSCAN00000028864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:13377866:13384912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000002551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:14:73486360:73518066:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
NR_033171 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 2, pseudogene 9 (Ppp1r2-ps9), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000173100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:15110832:15111380:-1 gene:ENSMUSG00000045217 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chrX // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000173852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:15110585:15111466:-1 gene:ENSMUSG00000045217 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK015065 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930403L05 product:weakly similar to phosphoprotein phosphatase inhibitor 2 [Oryctolagus cuniculus], full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC100448 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930403L05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118260 IMAGE:30918995), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC132484 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930403L05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:164115 IMAGE:40130761), complete cds. // chrX // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BC132486 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930403L05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:164117 IMAGE:40130763), complete cds. // chrX // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:15110832:15206119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENSMUST00000093745 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:15685285:15685391:-1 gene:ENSMUSG00000070258 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000093728 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:15896663:15896769:-1 gene:ENSMUSG00000070240 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172778 // RefSeq // Mus musculus monoamine oxidase B (Maob), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000040820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:16709282:16817366:-1 gene:ENSMUSG00000040147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000163344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:16718256:16817275:-1 gene:ENSMUSG00000040147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000168613 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:16710039:16817275:-1 gene:ENSMUSG00000040147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC113182 // GenBank // Mus musculus monoamine oxidase B, mRNA (cDNA clone MGC:132955 IMAGE:40061991), complete cds. // chrX // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC113788 // GenBank // Mus musculus monoamine oxidase B, mRNA (cDNA clone MGC:132954 IMAGE:40061990), complete cds. // chrX // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000173143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:16740130:16817320:-1 gene:ENSMUSG00000040147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000023169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:16710039:16746503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 59 // 20 // 20 // 0
NM_010883 // RefSeq // Mus musculus Norrie disease (pseudoglioma) (human) (Ndp), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:16885521:16911774:-1 gene:ENSMUSG00000040138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC090623 // GenBank // Mus musculus Norrie disease (pseudoglioma) (human), mRNA (cDNA clone MGC:115809 IMAGE:6807800), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_028916 // RefSeq // Mus musculus EF-hand domain (C-terminal) containing 2 (Efhc2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000026014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:17132049:17319368:-1 gene:ENSMUSG00000025038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC120659 // GenBank // Mus musculus EF-hand domain (C-terminal) containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:155896 IMAGE:40129582), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC125625 // GenBank // Mus musculus EF-hand domain (C-terminal) containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:159328 IMAGE:40130140), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:17132265:17246916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
XM_488332 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 5755 (Gm5755), mRNA. // chrX // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000118222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:17626257:17627076:1 gene:ENSMUSG00000083140 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000121905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:17912982:17913818:-1 gene:ENSMUSG00000096235 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000152394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:17880670:17881506:-1 gene:ENSMUSG00000096716 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000021419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:17622570:17627081:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:17880667:17885178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:17912979:17917490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000083134 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:18323444:18323562:-1 gene:ENSMUSG00000065068 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175228 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930578C19 gene (4930578C19Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527708 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930578C19 gene (4930578C19Rik), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000044188 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:18418427:18461371:-1 gene:ENSMUSG00000037358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:18414881:18461397:-1 gene:ENSMUSG00000037358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK163928 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230064N22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC118515 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930578C19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144770 IMAGE:40105826), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:18413476:18461262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NR_029806 // RefSeq // Mus musculus microRNA 221 (Mir221), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083488 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:19146294:19146388:-1 gene:ENSMUSG00000065422 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-221 // miRBase Micro RNA Database // MI0000709 Mus musculus miR-221 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029807 // RefSeq // Mus musculus microRNA 222 (Mir222), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083537 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:19146893:19146971:-1 gene:ENSMUSG00000065471 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-222 // miRBase Micro RNA Database // MI0000710 Mus musculus miR-222 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_106025 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC100503338 (LOC100503338), ncRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000143129 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:19156981:19167232:-1 gene:ENSMUSG00000073274 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK170409 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630102L10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XR_406297 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC100503338 (LOC100503338), transcript variant X2, ncRNA. // chrX // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONMMUT071951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000089246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:19479420:19481319:-1 gene:ENSMUSG00000068149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC049702 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC049702, mRNA (cDNA clone MGC:58623 IMAGE:6707281), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000082464 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:20614523:20614695:-1 gene:ENSMUSG00000064398 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019435 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 11 (Ndufb11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000116621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:20615326:20617619:-1 gene:ENSMUSG00000031059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC027265 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 11, mRNA (cDNA clone MGC:27951 IMAGE:3589704), complete cds. // chrX // 93 // 100 // 14 // 15 // 0
ENSMUST00000083380 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:20800332:20800436:-1 gene:ENSMUSG00000065314 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT071984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001110780 // RefSeq // Mus musculus synapsin I (Syn1), transcript variant b, mRNA. // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_013680 // RefSeq // Mus musculus synapsin I (Syn1), transcript variant a, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000081893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:20860515:20920918:-1 gene:ENSMUSG00000037217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000115345 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:20860511:20921004:-1 gene:ENSMUSG00000037217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC022954 // GenBank // Mus musculus synapsin I, mRNA (cDNA clone MGC:35985 IMAGE:5368098), complete cds. // chrX // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:20861474:20871208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:20907348:20920789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AF085809 // GenBank // Mus musculus synapsin Ib (SynI) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_008823 // RefSeq // Mus musculus complement factor properdin (Cfp), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_386872 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus complement factor properdin (Cfp), transcript variant X1, misc_RNA. // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000001156 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:20925454:20931555:-1 gene:ENSMUSG00000001128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC132369 // GenBank // Mus musculus complement factor properdin, mRNA (cDNA clone MGC:164000 IMAGE:40130646), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC138306 // GenBank // Mus musculus complement factor properdin, mRNA (cDNA clone MGC:169931 IMAGE:8861326), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:20925594:20931454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_007922 // RefSeq // Mus musculus ELK1, member of ETS oncogene family (Elk1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000009550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:20933395:20950608:-1 gene:ENSMUSG00000009406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC054474 // GenBank // Mus musculus ELK1, member of ETS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:60658 IMAGE:30045506), complete cds. // chrX // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// X87257 // GenBank // M.musculus mRNA for elk1 protein. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:20935450:20965487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001013387 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 182 (Zfp182), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001111076 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 182 (Zfp182), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:21029589:21061986:-1 gene:ENSMUSG00000054737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:21028939:21062003:-1 gene:ENSMUSG00000054737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115334 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:21028943:21062052:-1 gene:ENSMUSG00000054737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC063066 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 182, mRNA (cDNA clone MGC:67278 IMAGE:6822685), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133186 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:21031589:21062316:-1 gene:ENSMUSG00000054737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000022911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:21015125:21062649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_183185 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 300 (Zfp300), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006527627 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 300 (Zfp300), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000040667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:21079174:21089229:-1 gene:ENSMUSG00000031079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000139060 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:21084250:21089527:-1 gene:ENSMUSG00000031079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// ENSMUST00000154299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:21083942:21088986:-1 gene:ENSMUSG00000031079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONMMUT072004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONMMUT072005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
ENSMUST00000129885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:22438876:22439418:-1 gene:ENSMUSG00000085073 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:22439107:22449462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT072025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT072026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000118300 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:23957702:23958934:-1 gene:ENSMUSG00000090102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:23957702:23958934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000134724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:24407179:24418902:-1 gene:ENSMUSG00000098485 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_024461 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810037I17 gene (1810037I17Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:122924242:122926194:1 gene:ENSMUSG00000054091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:29564014:29564208:-1 gene:ENSMUSG00000086691 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC002135 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810037I17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7243 IMAGE:3484100), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086913 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810037I17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107621 IMAGE:30121587), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535349 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 2036 (Gm2036), mRNA. // chrX // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:122924460:122926957:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSMUST00000083097 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:36409610:36409707:-1 gene:ENSMUSG00000065031 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081956 // RefSeq // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 17B (Akap17b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000051906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:36608314:36645395:-1 gene:ENSMUSG00000059708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000133980 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:36611879:36645096:-1 gene:ENSMUSG00000059708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000052564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:36610973:36624320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
ENSMUST00000047486 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:36848550:36874111:-1 gene:ENSMUSG00000006423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// BC021479 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C330007P06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:38347 IMAGE:5344198), complete cds. // chrX // 73 // 85 // 8 // 11 // 0
NM_029891 // RefSeq // Mus musculus NF-kappaB repressing factor (Nkrf), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057093 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:36887540:36902899:-1 gene:ENSMUSG00000044149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138828 // GenBank // Mus musculus NF-kappaB repressing factor, mRNA (cDNA clone MGC:170455 IMAGE:8861850), complete cds. // chrX // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC138829 // GenBank // Mus musculus NF-kappaB repressing factor, mRNA (cDNA clone MGC:170456 IMAGE:8861851), complete cds. // chrX // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000009821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:36888555:36903001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NR_002900 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 69 (Snora69), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000083708 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:37082912:37083042:-1 gene:ENSMUSG00000065642 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_026573 // RefSeq // Mus musculus UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast) (Upf3b), mRNA. // chrX // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:37091678:37110322:-1 gene:ENSMUSG00000036572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000130324 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:37095676:37104523:-1 gene:ENSMUSG00000036572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000133481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:37097450:37110322:-1 gene:ENSMUSG00000036572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// BC058761 // GenBank HTC // Mus musculus UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:6491218), with apparent retained intron. // chrX // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// BC117769 // GenBank // Mus musculus UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:143582 IMAGE:40091025), complete cds. // chrX // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// BC117770 // GenBank // Mus musculus UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:143583 IMAGE:40091027), complete cds. // chrX // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000009818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:37090452:37110231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_001033785 // RefSeq // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 14 (Akap14), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000046557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:37150698:37168842:-1 gene:ENSMUSG00000036551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147265 // GenBank // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 14, mRNA (cDNA clone MGC:182428 IMAGE:9056322), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147494 // GenBank // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 14, mRNA (cDNA clone MGC:182421 IMAGE:9056315), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:37150795:37164080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_019443 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 1 (Ndufa1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000016571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:37187588:37191163:-1 gene:ENSMUSG00000016427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC024364 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 1, mRNA (cDNA clone MGC:35935 IMAGE:5031206), complete cds. // chrX // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// CT010398 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G0253D for gene Ndufa1, NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 1; complete cds, incl. stopcodon. // chrX // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// Y07708 // GenBank // M.musculus mRNA for NADH dehydrogenase. // chrX // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
NM_001033234 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9 (Gm9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000101636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:37209348:37211041:-1 gene:ENSMUSG00000073243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC048624 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6743829. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:37209927:37218222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001025084 // RefSeq // Mus musculus reproductive homeobox 1 (Rhox1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006541387 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus reproductive homeobox 1 (Rhox1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115210 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:37213804:37222258:-1 gene:ENSMUSG00000071773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// DQ058638 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox on X chromosome 1 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:37209927:37218222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
ENSMUST00000117421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:37676370:37683431:-1 gene:ENSMUSG00000081195 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 86 // 67 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:37599806:37700408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_001004193 // RefSeq // Mus musculus reproductive homeobox 8 (Rhox8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:37874778:37878944:-1 gene:ENSMUSG00000064137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180817 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:MG4214_PATCH:37875228:37879394:-1 gene:ENSMUSG00000097126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY329370 // GenBank // Mus musculus TOX (Tox) mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC139098 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox 8, mRNA (cDNA clone MGC:170725 IMAGE:8862120), complete cds. // chrX // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// DQ058645 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox on X chromosome 8 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:37848723:37878881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000056926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4214_PATCH:37849623:37933819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_023894 // RefSeq // Mus musculus reproductive homeobox 9 (Rhox9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000089062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:37899097:37901770:-1 gene:ENSMUSG00000068048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000170643 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:37899097:37901704:-1 gene:ENSMUSG00000068048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000180665 // ENSEMBL // proj_havana:novel chromosome:GRCm38:MG4214_PATCH:37899547:37902154:-1 gene:ENSMUSG00000097436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000181131 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:MG4214_PATCH:37899547:37902220:-1 gene:ENSMUSG00000097436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF201698 // GenBank // Mus musculus homeobox protein GPBOX (Gpbox) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC099451 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox 9, mRNA (cDNA clone MGC:117644 IMAGE:30716051), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC099963 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox 9, mRNA (cDNA clone MGC:107479 IMAGE:30083999), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// DQ058646 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox on X chromosome 9 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001243943 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930525M21 gene (4930525M21Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006541513 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930525M21 gene (4930525M21Rik), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006541514 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930525M21 gene (4930525M21Rik), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006541515 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930525M21 gene (4930525M21Rik), transcript variant X4, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000089286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:38013173:38018815:-1 gene:ENSMUSG00000068173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000184432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:38013908:38018815:-1 gene:ENSMUSG00000068173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000099234 // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001034856 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930430D24 gene (4930430D24Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000089060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:38038199:38043114:-1 gene:ENSMUSG00000098348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000068046 // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000184452 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:38038199:38043114:-1 gene:ENSMUSG00000098348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000184977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:38038282:38039809:-1 gene:ENSMUSG00000098348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// BC147535 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930430D24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182632 IMAGE:9056526), complete cds. // chrX // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// BC147539 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930430D24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182636 IMAGE:9056530), complete cds. // chrX // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:38038347:38047500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 67 // 14 // 14 // 0
NM_198598 // RefSeq // Mus musculus reproductive homeobox 11 (Rhox11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:38076594:38085141:-1 gene:ENSMUSG00000051038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049711 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox 11, mRNA (cDNA clone MGC:58663 IMAGE:6741333), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ058648 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox on X chromosome 11 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:38076620:38090035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 81 // 20 // 21 // 0
NM_001025083 // RefSeq // Mus musculus reproductive homeobox 12 (Rhox12), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096453 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:38104077:38110907:-1 gene:ENSMUSG00000071766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:38104178:38108143:-1 gene:ENSMUSG00000071766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000183737 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:38105577:38110787:-1 gene:ENSMUSG00000071766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC132522 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox 12, mRNA (cDNA clone MGC:164153 IMAGE:40130799), complete cds. // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC132548 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox 12, mRNA (cDNA clone MGC:164179 IMAGE:40130825), complete cds. // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// DQ058649 // GenBank // Mus musculus reproductive homeobox on X chromosome 12 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001289727 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 255A (Tmem255a), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_001289728 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 255A (Tmem255a), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_172930 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 255A (Tmem255a), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000066498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:38197306:38252439:-1 gene:ENSMUSG00000036502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000089054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:38197306:38252439:-1 gene:ENSMUSG00000036502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000089056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:38196573:38252429:-1 gene:ENSMUSG00000036502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000139358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:38215285:38252401:-1 gene:ENSMUSG00000036502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 94 // 52 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000155848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:38197306:38252439:-1 gene:ENSMUSG00000036502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC062956 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 70, member A, mRNA (cDNA clone MGC:86163 IMAGE:30550174), complete cds. // chrX // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:38199492:38252301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 70 // 70 // 23 // 33 // 1
NM_021550 // RefSeq // Mus musculus C1GALT1-specific chaperone 1 (C1galt1c1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:38630785:38635087:-1 gene:ENSMUSG00000048970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB030184 // GenBank // Mus musculus mRNA, complete cds, clone:1-44. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AB091728 // GenBank // Mus musculus C1Gal-T2 mRNA for UDP-galactose:N-acetylgalactosaminealpha-peptide beta1,3-galactosyltransferase, complete cds. // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AY159320 // GenBank // Mus musculus core 1 beta3-galactosyltransferase-specific molecular chaperone (Cosmc) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC029909 // GenBank // Mus musculus C1GALT1-specific chaperone 1, mRNA (cDNA clone MGC:35856 IMAGE:3154812), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:38631167:38647135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000082595 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:39305377:39305481:-1 gene:ENSMUSG00000064529 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT072190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000119811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:40000782:40001210:-1 gene:ENSMUSG00000082005 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:40000782:40081727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000118669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:40007137:40008588:-1 gene:ENSMUSG00000083174 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000118988 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:41248575:41250133:1 gene:ENSMUSG00000081880 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000122239 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:41741657:41742963:-1 gene:ENSMUSG00000081918 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT072213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT072214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 73 // 38 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000031221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:41742703:41757442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
ENSMUST00000121100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:41923255:41923827:-1 gene:ENSMUSG00000080798 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:41923243:41947861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_175539 // RefSeq // Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 12-like 2 (Dcaf12l2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000115057 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:44365458:44368342:-1 gene:ENSMUSG00000050926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK076436 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4832423I21 product:DKFZP434O125 protein, full insert sequence. // chrX // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:44366601:44368995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 89 // 64 // 16 // 18 // 0
NM_001190718 // RefSeq // Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 12-like 1 (Dcaf12l1), transcript variant B, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_178739 // RefSeq // Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 12-like 1 (Dcaf12l1), transcript variant A, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060481 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:44786570:44790197:-1 gene:ENSMUSG00000045284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000115056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:44786570:44790161:-1 gene:ENSMUSG00000045284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC068319 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 40B, mRNA (cDNA clone MGC:76797 IMAGE:30431243), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:44788414:44789919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000118479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:45786326:45786560:-1 gene:ENSMUSG00000084158 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:45786281:46259443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT072284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 96 // 77 // 23 // 24 // 0
ENSMUST00000082530 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:45795361:45795467:-1 gene:ENSMUSG00000064464 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT072285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000078326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:46455887:46456294:-1 gene:ENSMUSG00000063816 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000044673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:46455887:46456294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT072294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000122176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:47380433:47381334:-1 gene:ENSMUSG00000083499 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT072296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_013912 // RefSeq // Mus musculus apelin (Apln), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:48025146:48034853:-1 gene:ENSMUSG00000037010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB023494 // GenBank // Mus musculus mRNA for preproapelin, complete cds. // chrX // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC020015 // GenBank // Mus musculus apelin, mRNA (cDNA clone MGC:27819 IMAGE:3483588), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// DQ832282 // GenBank // Mus musculus apelin (Apln) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019680 // RefSeq // Mus musculus E74-like factor 4 (ets domain transcription factor) (Elf4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006541527 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus E74-like factor 4 (ets domain transcription factor) (Elf4), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:48411049:48463132:-1 gene:ENSMUSG00000031103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:48411046:48454169:-1 gene:ENSMUSG00000031103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:48416658:48463132:-1 gene:ENSMUSG00000031103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// AF016714 // GenBank // Mus musculus myeloid elf-1-like factor (Mef) mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AK155709 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730207I09 product:E74-like factor 4 (ets domain transcription factor), full insert sequence. // chrX // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:48414663:48447736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
AK084896 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430006M22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181751 // RefSeq // Mus musculus G-protein coupled receptor 119 (Gpr119), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006541488 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G-protein coupled receptor 119 (Gpr119), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:48667979:48674478:-1 gene:ENSMUSG00000051209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB233291 // GenBank // Mus musculus Gpr119 mRNA for G protein-coupled receptor 119, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY288423 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 119 (Gpr119) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115557 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 119, mRNA (cDNA clone MGC:144413 IMAGE:40101841), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115558 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 119, mRNA (cDNA clone MGC:144414 IMAGE:40101842), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:48673251:48674258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000119619 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:48889879:48890175:-1 gene:ENSMUSG00000081526 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT072337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:48844853:48890085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_207631 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1321 (Olfr1321), mRNA. // chrX // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:49726973:49727932:-1 gene:ENSMUSG00000067971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC119046 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1321, mRNA (cDNA clone MGC:155362 IMAGE:8733795), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC119381 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1321, mRNA (cDNA clone MGC:155697 IMAGE:8734130), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:49726973:49728001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001011794 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1322 (Olfr1322), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070304 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:49885469:49886401:-1 gene:ENSMUSG00000056281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146390 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1323 (Olfr1323), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:50009306:50010235:-1 gene:ENSMUSG00000050504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:50009306:50013028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_146292 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1324 (Olfr1324), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:50425496:50426494:-1 gene:ENSMUSG00000048173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119382 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1324, mRNA (cDNA clone MGC:155698 IMAGE:8734131), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120627 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1324, mRNA (cDNA clone MGC:155864 IMAGE:40129550), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:50411197:50493041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 91 // 92 // 21 // 23 // 0
NM_001190332 // RefSeq // Mus musculus FERM domain containing 7 (Frmd7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006541505 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FERM domain containing 7 (Frmd7), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000060650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:50895180:50942710:-1 gene:ENSMUSG00000036131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 72 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000164311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:50895180:50942710:-1 gene:ENSMUSG00000036131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 68 // 32 // 32 // 0 /// BC147257 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:182417 IMAGE:9056311, complete cds. // chrX // 90 // 45 // 19 // 21 // 0 /// BC147258 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:182418 IMAGE:9056312, complete cds. // chrX // 95 // 45 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:50895180:50937934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 57 // 27 // 27 // 0
NM_172413 // RefSeq // Mus musculus RAP2C, member of RAS oncogene family (Rap2c), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:51003912:51018018:-1 gene:ENSMUSG00000050029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC027363 // GenBank // Mus musculus RAP2C, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:36337 IMAGE:4951566), complete cds. // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC050056 // GenBank // Mus musculus RAP2C, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:60845 IMAGE:30016070), complete cds. // chrX // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// BC064814 // GenBank // Mus musculus RAP2C, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:69961 IMAGE:6513822), complete cds. // chrX // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC094890 // GenBank // Mus musculus RAP2C, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:106641 IMAGE:30649398), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:51015005:51017898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT072404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_134163 // RefSeq // Mus musculus muscleblind-like 3 (Drosophila) (Mbnl3), mRNA. // chrX // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000041495 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:51120080:51146415:-1 gene:ENSMUSG00000036109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000114875 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:51117269:51205832:-1 gene:ENSMUSG00000036109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000114876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:51120080:51205990:-1 gene:ENSMUSG00000036109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000136404 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:51120489:51164674:-1 gene:ENSMUSG00000036109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000148116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:51120885:51139366:-1 gene:ENSMUSG00000036109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// AB077700 // GenBank // Mus musculus mRNA for mCHCR, complete cds. // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AF466292 // GenBank // Mus musculus Cys3His CCG1-required (Chcr) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC057157 // GenBank // Mus musculus muscleblind-like 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:67899 IMAGE:5348959), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:51124930:51295881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001077202 // RefSeq // Mus musculus heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 2 (Hs6st2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NM_001290467 // RefSeq // Mus musculus heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 2 (Hs6st2), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// NM_001290468 // RefSeq // Mus musculus heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 2 (Hs6st2), transcript variant 4, mRNA. // chrX // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NM_015819 // RefSeq // Mus musculus heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 2 (Hs6st2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// XM_006541519 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 2 (Hs6st2), transcript variant X4, mRNA. // chrX // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000088172 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:51387212:51681703:-1 gene:ENSMUSG00000062184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000114871 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:51387212:51681856:-1 gene:ENSMUSG00000062184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// AB024565 // GenBank // Mus musculus mRNA for heparan sulfate 6-sulfotransferase 2, complete cds. // chrX // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// BC063327 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:74252 IMAGE:6531439), complete cds. // chrX // 96 // 74 // 25 // 26 // 0
NM_031388 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 26 (Usp26), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000069509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:51753959:51801144:-1 gene:ENSMUSG00000055780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:51753959:51801233:-1 gene:ENSMUSG00000055780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF285570 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific protease (Usp26) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC125454 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 26, mRNA (cDNA clone MGC:159157 IMAGE:40129969), complete cds. // chrX // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC132154 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 26, mRNA (cDNA clone MGC:163785 IMAGE:40130431), complete cds. // chrX // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_028851 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700080O16 gene (1700080O16Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:51968695:51972772:-1 gene:ENSMUSG00000031118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:51968892:51971047:-1 gene:ENSMUSG00000031118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC109337 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700080O16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130196 IMAGE:40052428), complete cds. // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC109338 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700080O16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130197 IMAGE:40052437), complete cds. // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:51968953:51975781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_008150 // RefSeq // Mus musculus glypican 4 (Gpc4), mRNA. // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:52053021:52165252:-1 gene:ENSMUSG00000031119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC006622 // GenBank // Mus musculus glypican 4, mRNA (cDNA clone MGC:11506 IMAGE:3967797), complete cds. // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// X83577 // GenBank // M.musculus mRNA for K-glypican. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 1 /// GENSCAN00000048390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:52053521:52097438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 67 // 22 // 22 // 0
NM_016697 // RefSeq // Mus musculus glypican 3 (Gpc3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006541429 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glypican 3 (Gpc3), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000069360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:52272426:52613921:-1 gene:ENSMUSG00000055653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000114857 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:52387664:52613950:-1 gene:ENSMUSG00000055653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AF185614 // GenBank // Mus musculus glypican-3 (Gpc3) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK077942 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030455O07 product:glypican 3, full insert sequence. // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC036126 // GenBank // Mus musculus glypican 3, mRNA (cDNA clone MGC:35964 IMAGE:4973409), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:52374272:52439015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NR_030497 // RefSeq // Mus musculus microRNA 717 (Mir717), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102259 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:52422407:52422515:-1 gene:ENSMUSG00000076214 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-717 // miRBase Micro RNA Database // MI0004704 Mus musculus miR-717 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029853 // RefSeq // Mus musculus microRNA 363 (Mir363), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093598 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:52741693:52741767:-1 gene:ENSMUSG00000070106 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-363 // miRBase Micro RNA Database // MI0000765 Mus musculus miR-363 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029748 // RefSeq // Mus musculus microRNA 92-2 (Mir92-2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000083679 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:52741838:52741928:-1 gene:ENSMUSG00000065613 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-mir-92a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000580 Mus musculus miR-92a-2 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT072447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_029715 // RefSeq // Mus musculus microRNA 19b-2 (Mir19b-2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000083539 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:52741983:52742066:-1 gene:ENSMUSG00000065473 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-mir-19b-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000546 Mus musculus miR-19b-2 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT072448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_030273 // RefSeq // Mus musculus microRNA 20b (Mir20b), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102087 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:52742113:52742192:-1 gene:ENSMUSG00000076041 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-20b // miRBase Micro RNA Database // MI0003536 Mus musculus miR-20b stem-loop // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT072449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_029657 // RefSeq // Mus musculus microRNA 106a (Mir106a), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000083522 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:52742503:52742567:-1 gene:ENSMUSG00000065456 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// mmu-mir-106a // miRBase Micro RNA Database // MI0000406 Mus musculus miR-106a stem-loop // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT072451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000117574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:52782694:52783016:-1 gene:ENSMUSG00000081843 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000046151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:52782694:52796686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT072459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NR_030498 // RefSeq // Mus musculus microRNA 450b (Mir450b), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102095 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:53047997:53048078:-1 gene:ENSMUSG00000076050 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-450b // miRBase Micro RNA Database // MI0004705 Mus musculus miR-450b stem-loop // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT072462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_029963 // RefSeq // Mus musculus microRNA 450-1 (Mir450-1), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000083552 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:53048154:53048244:-1 gene:ENSMUSG00000065486 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// mmu-mir-450a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0001653 Mus musculus miR-450a-1 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT072463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NR_030274 // RefSeq // Mus musculus microRNA 450-2 (Mir450-2), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000102444 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:53048299:53048367:-1 gene:ENSMUSG00000076399 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// mmu-mir-450a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0003537 Mus musculus miR-450a-2 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT072464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NR_030264 // RefSeq // Mus musculus microRNA 542 (Mir542), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102186 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:53049403:53049487:-1 gene:ENSMUSG00000076140 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-542 // miRBase Micro RNA Database // MI0003522 Mus musculus miR-542 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029776 // RefSeq // Mus musculus microRNA 351 (Mir351), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_038184 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C430049B03 gene (C430049B03Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_038185 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C430049B03 gene (C430049B03Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083569 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:53053255:53053353:-1 gene:ENSMUSG00000065503 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-351 // miRBase Micro RNA Database // MI0000643 Mus musculus miR-351 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030275 // RefSeq // Mus musculus microRNA 503 (Mir503), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_038184 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C430049B03 gene (C430049B03Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_038185 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C430049B03 gene (C430049B03Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000102168 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:53053984:53054054:-1 gene:ENSMUSG00000076122 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-mir-503 // miRBase Micro RNA Database // MI0003538 Mus musculus miR-503 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT072466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT072467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT072470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_029756 // RefSeq // Mus musculus microRNA 322 (Mir322), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_038184 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C430049B03 gene (C430049B03Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_038185 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C430049B03 gene (C430049B03Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083484 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:53054255:53054349:-1 gene:ENSMUSG00000065418 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-322 // miRBase Micro RNA Database // MI0000590 Mus musculus miR-322 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019538 // RefSeq // Mus musculus placental specific protein 1 (Plac1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006541524 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus placental specific protein 1 (Plac1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006541525 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus placental specific protein 1 (Plac1), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000074861 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:53069995:53240111:-1 gene:ENSMUSG00000061082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000114843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:53069996:53114530:-1 gene:ENSMUSG00000061082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:53070172:53209724:-1 gene:ENSMUSG00000061082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// AF234653 // GenBank // Mus musculus PLAC1 (Plac1) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF250838 // GenBank // Mus musculus EPCS26 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145876 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530011F21 product:placental specific protein 1, full insert sequence. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC051666 // GenBank // Mus musculus placental specific protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:60406 IMAGE:30017089), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:53070310:53070831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
NM_001290514 // RefSeq // Mus musculus motile sperm domain containing 1 (Mospd1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_027409 // RefSeq // Mus musculus motile sperm domain containing 1 (Mospd1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000023836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:53345021:53370502:-1 gene:ENSMUSG00000023074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000096447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:53345008:53370502:-1 gene:ENSMUSG00000023074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC018329 // GenBank // Mus musculus motile sperm domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:25548 IMAGE:3962906), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC100442 // GenBank // Mus musculus motile sperm domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:118254 IMAGE:30501889), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001018063 // RefSeq // Mus musculus CAAX box 1B (Cxx1b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_024170 // RefSeq // Mus musculus CAAX box 1A (Cxx1a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000088778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:53669177:53670408:-1 gene:ENSMUSG00000067924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000088779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:53642488:53643682:-1 gene:ENSMUSG00000067925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003436 // GenBank // Mus musculus CAAX box 1 homolog A (human), mRNA (cDNA clone MGC:6789 IMAGE:2647372), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC029838 // GenBank // Mus musculus CAAX box 1 homolog B (human), mRNA (cDNA clone MGC:36270 IMAGE:3967024), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:53669957:53670298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_001018063 // RefSeq // Mus musculus CAAX box 1B (Cxx1b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_024170 // RefSeq // Mus musculus CAAX box 1A (Cxx1a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000088778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:53669177:53670408:-1 gene:ENSMUSG00000067924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000088779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:53642488:53643682:-1 gene:ENSMUSG00000067925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC003436 // GenBank // Mus musculus CAAX box 1 homolog A (human), mRNA (cDNA clone MGC:6789 IMAGE:2647372), complete cds. // chrX // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC029838 // GenBank // Mus musculus CAAX box 1 homolog B (human), mRNA (cDNA clone MGC:36270 IMAGE:3967024), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:53643280:53667886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000046142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:53669957:53670298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
XR_389568 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus expressed sequence AW822252 (AW822252), transcript variant X4, ncRNA. // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XR_389569 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus expressed sequence AW822252 (AW822252), transcript variant X5, ncRNA. // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XR_406323 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus expressed sequence AW822252 (AW822252), transcript variant X1, ncRNA. // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000188573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:53713699:53716772:-1 gene:ENSMUSG00000085998 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001200013 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700013H16 gene (1700013H16Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000067940 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:53742901:53757831:-1 gene:ENSMUSG00000054727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006535361 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700013H16 gene (1700013H16Rik), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 97 // 97 // 30 // 31 // 1 /// GENSCAN00000002337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:53740368:53757144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NM_001009549 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 36, C3H type-like 3 (Zfp36l3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:53774048:53776394:-1 gene:ENSMUSG00000059334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY661338 // GenBank // Mus musculus ZFP36L3 (Zfp36l3) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:53774068:53776245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001291748 // RefSeq // Mus musculus X-linked lymphocyte-regulated (Xlr), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000067782 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:53777118:53797706:-1 gene:ENSMUSG00000054626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NM_001291747 // RefSeq // Mus musculus X-linked lymphocyte-regulated (Xlr), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 73 // 73 // 8 // 11 // 1 /// NM_011725 // RefSeq // Mus musculus X-linked lymphocyte-regulated (Xlr), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 73 // 73 // 8 // 11 // 1 /// ENSMUST00000067763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:53783748:53797696:-1 gene:ENSMUSG00000054626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 73 // 73 // 8 // 11 // 1 /// ENSMUST00000114810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:53783748:53797696:-1 gene:ENSMUSG00000054626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 73 // 73 // 8 // 11 // 1 /// BC005560 // GenBank // Mus musculus X-linked lymphocyte-regulated complex, mRNA (cDNA clone MGC:11553 IMAGE:3965533), complete cds. // chrX // 73 // 73 // 8 // 11 // 1 /// GENSCAN00000002330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:53795769:53796212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 55 // 6 // 6 // 0
ENSMUST00000120608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:53883611:53884420:-1 gene:ENSMUSG00000080968 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000002331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:53883611:53907701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006528350 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102639227 (LOC102639227), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000002036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:55874854:55895420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000002024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:55951167:56156393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
ENSMUST00000120850 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:56155528:56156393:-1 gene:ENSMUSG00000082253 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000002024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:55951167:56156393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT072516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT072517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001033423 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 773 (Gm773), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101561 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:56189827:56212881:-1 gene:ENSMUSG00000073177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126937 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:56193653:56212881:-1 gene:ENSMUSG00000073177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC147685 // GenBank // Mus musculus gene model 773, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182764 IMAGE:9056658), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC147688 // GenBank // Mus musculus gene model 773, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182767 IMAGE:9056661), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000002030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:56197470:56211657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001033372 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 648 (Gm648), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006528046 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 648 (Gm648), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// XM_006528047 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 648 (Gm648), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000081133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:56543874:56549606:-1 gene:ENSMUSG00000064016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC147598 // GenBank // Mus musculus gene model 648, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182694 IMAGE:9056588), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// BC147617 // GenBank // Mus musculus gene model 648, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182713 IMAGE:9056607), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:56544066:56592223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 71 // 71 // 15 // 21 // 1
NM_146234 // RefSeq // Mus musculus membrane magnesium transporter 1 (Mmgt1), mRNA. // chrX // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059899 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:56585512:56598069:-1 gene:ENSMUSG00000061273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK163269 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020007N17 product:weakly similar to CG15168 protein (RE09053p) [Drosophila melanogaster], full insert sequence. // chrX // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// BC032271 // GenBank // Mus musculus membrane magnesium transporter 1, mRNA (cDNA clone MGC:40705 IMAGE:4954726), complete cds. // chrX // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// EU069461 // GenBank // Mus musculus membrane magnesium transporter 1 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_177293 // RefSeq // Mus musculus MAP7 domain containing 3 (Mtap7d3), mRNA. // chrX // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006528088 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MAP7 domain containing 3 (Mtap7d3), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000114766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:56797858:56822326:-1 gene:ENSMUSG00000067878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000135542 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:56809655:56822314:-1 gene:ENSMUSG00000067878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// AK049164 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330009J20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// BC096764 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30017194. // chrX // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC118963 // GenBank // Mus musculus MAP7 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:143941 IMAGE:40095274), complete cds. // chrX // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:56799267:56827958:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NM_001166623 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein, X chromosome (Rbmx), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NM_011252 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein, X chromosome (Rbmx), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000098470 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:57386030:57393036:-1 gene:ENSMUSG00000031134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000114726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:57386362:57393036:-1 gene:ENSMUSG00000031134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000114730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:57386358:57392962:-1 gene:ENSMUSG00000031134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000143310 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:57386916:57393020:-1 gene:ENSMUSG00000031134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// BC003710 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein, X chromosome, mRNA (cDNA clone MGC:5688 IMAGE:3599678), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NR_029425 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein, X chromosome (Rbmx), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrX // 84 // 84 // 16 // 19 // 1 /// ENSMUST00000140384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:57383530:57392981:-1 gene:ENSMUSG00000031134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// GENSCAN00000009422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:57336856:57391675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 68 // 68 // 13 // 19 // 1
NR_002903 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 61 (Snord61), small nucleolar RNA. // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000083176 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:57391449:57391519:-1 gene:ENSMUSG00000065110 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001033360 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 101 (Gpr101), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:57496668:57503757:-1 gene:ENSMUSG00000036357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC139013 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 101, mRNA (cDNA clone MGC:170640 IMAGE:8862035), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC139014 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 101, mRNA (cDNA clone MGC:170641 IMAGE:8862036), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// DQ198079 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 101 (Gpr101) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:57500253:57521335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT072548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000082794 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:58357952:58358058:-1 gene:ENSMUSG00000064728 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT072560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_030574 // RefSeq // Mus musculus microRNA 504 (Mir504), microRNA. // chrX // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000093602 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:59097658:59097736:-1 gene:ENSMUSG00000070110 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// mmu-mir-504 // miRBase Micro RNA Database // MI0005515 Mus musculus miR-504 stem-loop // chrX // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// NONMMUT072570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 96 // 93 // 26 // 27 // 0
NM_001289730 // RefSeq // Mus musculus mcf.2 transforming sequence (Mcf2), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_001289731 // RefSeq // Mus musculus mcf.2 transforming sequence (Mcf2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_133197 // RefSeq // Mus musculus mcf.2 transforming sequence (Mcf2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527749 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mcf.2 transforming sequence (Mcf2), transcript variant X8, mRNA. // chrX // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:60055959:60147643:-1 gene:ENSMUSG00000031139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000063507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:60055956:60179089:-1 gene:ENSMUSG00000031139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000101531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:60055956:60147700:-1 gene:ENSMUSG00000031139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AB052945 // GenBank // Mus musculus mRNA for Mcf2 proto-oncogene protein, complete cds. // chrX // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// AB101616 // GenBank // Mus musculus mRNA for Mcf2 proto-oncogene protein, complete cds. // chrX // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// AB244989 // GenBank // Mus musculus molossinus Dbl mRNA, complete cds. // chrX // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// BC125435 // GenBank // Mus musculus mcf.2 transforming sequence, mRNA (cDNA clone MGC:159138 IMAGE:40129950), complete cds. // chrX // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:60059781:60158602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 61 // 61 // 20 // 33 // 1
NR_030499 // RefSeq // Mus musculus microRNA 505 (Mir505), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000093573 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:60394403:60394492:-1 gene:ENSMUSG00000070081 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-505 // miRBase Micro RNA Database // MI0004706 Mus musculus miR-505 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000118749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:60706270:60707063:-1 gene:ENSMUSG00000083463 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000022452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:60706270:60707151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_009237 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 3 (Sox3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000135107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:60891366:60893430:-1 gene:ENSMUSG00000045179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB108674 // GenBank // Mus musculus Sox3 mRNA for transcriptional factor SOX3, complete cds. // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:60892078:60907104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000152421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:60906712:60907167:-1 gene:ENSMUSG00000086577 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:60892078:60907104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 87 // 96 // 20 // 23 // 0
ENSMUST00000118822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:60971990:60972714:-1 gene:ENSMUSG00000081323 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:60971938:60972516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000117124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:63034194:63035106:-1 gene:ENSMUSG00000082965 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:62775585:63034616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSMUST00000119230 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:64047554:64047906:-1 gene:ENSMUSG00000083346 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT072636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT072637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:64046598:64047906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
NM_178740 // RefSeq // Mus musculus SLIT and NTRK-like family, member 4 (Slitrk4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000069926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:64264885:64276996:-1 gene:ENSMUSG00000046699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:64269777:64276979:-1 gene:ENSMUSG00000046699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC117890 // GenBank // Mus musculus SLIT and NTRK-like family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:144017 IMAGE:40096585), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC117891 // GenBank // Mus musculus SLIT and NTRK-like family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:144018 IMAGE:40096591), complete cds. // chrX // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000156121 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:64272728:64275822:-1 gene:ENSMUSG00000046699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000003872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:64195198:64277113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000117722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:64750401:64751258:-1 gene:ENSMUSG00000082269 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:64750487:64751163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 86 // 17 // 18 // 0
ENSMUST00000033525 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:66303361:66304224:-1 gene:ENSMUSG00000031182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015402 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930447F04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
NR_030154 // RefSeq // Mus musculus microRNA 471 (Mir471), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093596 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:66792595:66792661:-1 gene:ENSMUSG00000070104 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-471 // miRBase Micro RNA Database // MI0002406 Mus musculus miR-471 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030147 // RefSeq // Mus musculus microRNA 463 (Mir463), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093570 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:66799223:66799297:-1 gene:ENSMUSG00000070078 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-463 // miRBase Micro RNA Database // MI0002398 Mus musculus miR-463 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030153 // RefSeq // Mus musculus microRNA 470 (Mir470), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000093565 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:66813951:66814025:-1 gene:ENSMUSG00000070073 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-470 // miRBase Micro RNA Database // MI0002405 Mus musculus miR-470 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT072669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_030149 // RefSeq // Mus musculus microRNA 465 (Mir465), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000093563 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:66839052:66839125:-1 gene:ENSMUSG00000070071 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// mmu-mir-465a // miRBase Micro RNA Database // MI0002400 Mus musculus miR-465a stem-loop // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT072674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000120916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:66969223:66970659:-1 gene:ENSMUSG00000080795 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:66942347:66970497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// NONMMUT072677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000119380 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:67169613:67170230:-1 gene:ENSMUSG00000081598 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:67078779:67256452:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_025763 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933436I01 gene (4933436I01Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:67919864:67921450:-1 gene:ENSMUSG00000025288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125317 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933436I01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159020 IMAGE:40129832), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC138016 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933436I01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169640 IMAGE:8861035), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:67919962:67921412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NR_029588 // RefSeq // Mus musculus microRNA 201 (Mir201), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083470 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:67988096:67988161:-1 gene:ENSMUSG00000065404 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-201 // miRBase Micro RNA Database // MI0000244 Mus musculus miR-201 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030265 // RefSeq // Mus musculus microRNA 547 (Mir547), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102051 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:67988374:67988451:-1 gene:ENSMUSG00000076005 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-547 // miRBase Micro RNA Database // MI0003523 Mus musculus miR-547 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006544573 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 4910 (Gm4910), mRNA. // chrX // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000119605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:68315952:68316317:-1 gene:ENSMUSG00000082202 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000031212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:68315952:68316317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT072690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
NR_033481 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10474 (Gm10474), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181533 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:X:68667514:68678399:-1 gene:ENSMUSG00000096946 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000158552 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:68684148:68684275:-1 gene:ENSMUSG00000089177 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001098842 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6812 (Gm6812), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_029316 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700020N15 gene (1700020N15Rik), mRNA. // chrX // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000074894 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:68892375:68893053:-1 gene:ENSMUSG00000056815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000075654 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:69945300:69945978:1 gene:ENSMUSG00000059690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC049765 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6774351, partial cds. // chrX // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:68892515:68893007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000032670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:69945346:69945838:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 88 // 65 // 15 // 17 // 0
ENSMUST00000083755 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:68949564:68949684:-1 gene:ENSMUSG00000065689 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT072703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_010498 // RefSeq // Mus musculus iduronate 2-sulfatase (Ids), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000101509 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:70343069:70365084:-1 gene:ENSMUSG00000035847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000130519 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:70351070:70361091:-1 gene:ENSMUSG00000035847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// L07921 // GenBank // Mus musculus iduronate sulfatase (Ids) mRNA, complete cds. // chrX // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// X75636 // GenBank // M.musculus mRNA for iduronato sulfatase. // chrX // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// GENSCAN00000032663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:70088100:70365272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 88 // 88 // 29 // 33 // 1
NM_001033807 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930567H17 gene (4930567H17Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000092405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:70393901:70394740:-1 gene:ENSMUSG00000073141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:70545558:70546385:1 gene:ENSMUSG00000082652 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:70545646:70546302:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000032668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:70393984:70394652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001033328 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC023829 (BC023829), mRNA. // chrX // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:70459753:70477180:-1 gene:ENSMUSG00000073139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000114630 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:70460959:70477180:-1 gene:ENSMUSG00000073139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 67 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000134954 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:70462923:70477142:-1 gene:ENSMUSG00000073139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 93 // 45 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000154400 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:70461054:70470179:-1 gene:ENSMUSG00000073139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// BC138670 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC023829, mRNA (cDNA clone MGC:170296 IMAGE:8861691), complete cds. // chrX // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC145368 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC023829, mRNA (cDNA clone MGC:178934 IMAGE:9053926), complete cds. // chrX // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT072728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 93 // 45 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000032661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:70420716:70488061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
ENSMUST00000118400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:70539310:70539846:-1 gene:ENSMUSG00000083119 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_017369 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon (Gabre), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000064780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:72255999:72274803:-1 gene:ENSMUSG00000031340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000148499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:72261368:72269763:-1 gene:ENSMUSG00000031340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000153740 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:72268968:72274803:-1 gene:ENSMUSG00000031340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AF189263 // GenBank // Mus musculus GABA-A receptor epsilon-like subunit (Epsilon) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK079258 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530062C16 product:GABA-A RECEPTOR EPSILON-LIKE SUBUNIT homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrX // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000021262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:72257452:72275948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT072770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NR_029808 // RefSeq // Mus musculus microRNA 224 (Mir224), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083608 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:72261031:72261112:-1 gene:ENSMUSG00000065542 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-224 // miRBase Micro RNA Database // MI0000711 Mus musculus miR-224 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029974 // RefSeq // Mus musculus microRNA 452 (Mir452), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093629 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:72262224:72262308:-1 gene:ENSMUSG00000070138 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-452 // miRBase Micro RNA Database // MI0001734 Mus musculus miR-452 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001085506 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen family A, 10 (Magea10), mRNA. // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000088481 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:72381870:72386858:-1 gene:ENSMUSG00000043453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:72382409:72396548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_008067 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit alpha 3 (Gabra3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000055966 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:72432681:72656186:-1 gene:ENSMUSG00000031343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000114554 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:72434575:72656848:-1 gene:ENSMUSG00000031343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000137517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:72501194:72656246:-1 gene:ENSMUSG00000031343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// BC119317 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:155633 IMAGE:8734066), complete cds. // chrX // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// BC120686 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:155923 IMAGE:40129609), complete cds. // chrX // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// M86568 // GenBank // Mouse GABA-A receptor alpha-3 subunit mRNA, complete cds. // chrX // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:72434649:72509287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT072773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 100 // 33 // 11 // 11 // 0
NM_019405 // RefSeq // Mus musculus centrin 2 (Cetn2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033713 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:72913704:72916856:-1 gene:ENSMUSG00000031347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000114550 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:72913704:72917993:-1 gene:ENSMUSG00000031347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000114551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:72913532:72918411:-1 gene:ENSMUSG00000031347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK151033 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830020N07 product:centrin 2, full insert sequence. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC013545 // GenBank // Mus musculus centrin 2, mRNA (cDNA clone MGC:19232 IMAGE:4242430), complete cds. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000152200 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:72914908:72918284:-1 gene:ENSMUSG00000031347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:72914204:72916822:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001100461 // RefSeq // Mus musculus paraneoplastic antigen family 5 (Pnma5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528116 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus paraneoplastic antigen family 5 (Pnma5), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:73034319:73037103:-1 gene:ENSMUSG00000050424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:73033981:73037103:-1 gene:ENSMUSG00000050424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011907 // RefSeq // Mus musculus three prime repair exonuclease 2 (Trex2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:73433705:73435344:-1 gene:ENSMUSG00000031372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF151108 // GenBank // Mus musculus 3-5 exonuclease TREX2 mRNA, complete cds. // chrX // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC104384 // GenBank // Mus musculus three prime repair exonuclease 2, mRNA (cDNA clone MGC:129476 IMAGE:40050180), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC104385 // GenBank // Mus musculus three prime repair exonuclease 2, mRNA (cDNA clone MGC:129477 IMAGE:40050181), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:73433929:73453058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_028633 // RefSeq // Mus musculus HAUS augmin-like complex, subunit 7 (Haus7), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NM_207104 // RefSeq // Mus musculus HAUS augmin-like complex, subunit 7 (Haus7), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033737 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:73437315:73459044:-1 gene:ENSMUSG00000031371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000077243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:73437315:73459044:-1 gene:ENSMUSG00000031371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131140 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:73437317:73447279:-1 gene:ENSMUSG00000031371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AY029337 // GenBank // Mus musculus UCH37-interacting protein 1 (Uip1) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC025464 // GenBank // Mus musculus UCHL5 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:38478 IMAGE:5351961), complete cds. // chrX // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:73433929:73453058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_012060 // RefSeq // Mus musculus B cell receptor associated protein 31 (Bcap31), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006528048 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B cell receptor associated protein 31 (Bcap31), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000002091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:73686178:73716175:-1 gene:ENSMUSG00000002015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC002106 // GenBank // Mus musculus B-cell receptor-associated protein 31, mRNA (cDNA clone MGC:6599 IMAGE:3486784), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:73686557:73714884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_001029868 // RefSeq // Mus musculus PDZ domain containing 4 (Pdzd4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000002080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:73793359:73824969:-1 gene:ENSMUSG00000002006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC056462 // GenBank // Mus musculus PDZ domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:67228 IMAGE:5703229), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_001290540 // RefSeq // Mus musculus PDZ domain containing 4 (Pdzd4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// ENSMUST00000114438 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:73793359:73824969:-1 gene:ENSMUSG00000002006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// AK084004 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130075J17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chrX // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000052190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:73794382:73829204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT072821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONMMUT072822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_008478 // RefSeq // Mus musculus L1 cell adhesion molecule (L1cam), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000066576 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:73854672:73869804:-1 gene:ENSMUSG00000031391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102871 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:73853955:73880834:-1 gene:ENSMUSG00000031391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000114430 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:73853778:73869905:-1 gene:ENSMUSG00000031391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC056988 // GenBank // Mus musculus L1 cell adhesion molecule, mRNA (cDNA clone MGC:66909 IMAGE:6822217), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// X12875 // GenBank // Mouse mRNA for neural cell adhesion molecule L1 (N-CAM L1). // chrX // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:73855035:73869804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_008224 // RefSeq // Mus musculus host cell factor C1 (Hcfc1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033761 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:73942792:73966357:-1 gene:ENSMUSG00000031386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114372 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:73942797:73966351:-1 gene:ENSMUSG00000031386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128136 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:73942795:73949253:-1 gene:ENSMUSG00000031386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC053742 // GenBank // Mus musculus host cell factor C1, mRNA (cDNA clone MGC:59358 IMAGE:6509535), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:73916959:73966003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001081979 // RefSeq // Mus musculus methyl CpG binding protein 2 (Mecp2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NM_010788 // RefSeq // Mus musculus methyl CpG binding protein 2 (Mecp2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74035288:74085690:-1 gene:ENSMUSG00000031393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000100750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74026592:74085638:-1 gene:ENSMUSG00000031393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123362 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:74035289:74085609:-1 gene:ENSMUSG00000031393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000140399 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:74035670:74085609:-1 gene:ENSMUSG00000031393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000170481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:74026828:74135363:-1 gene:ENSMUSG00000031393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF158181 // GenBank // Mus musculus methyl CpG binding protein 2 (Mecp2) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027153 // GenBank // Mus musculus methyl CpG binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:35595 IMAGE:4948925), complete cds. // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74035417:74085586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001126488 // RefSeq // Mus musculus testis expressed 28 (Tex28), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:74150944:74167838:-1 gene:ENSMUSG00000062564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74150944:74167838:-1 gene:ENSMUSG00000062564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74160944:74161678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001290421 // RefSeq // Mus musculus filamin, alpha (Flna), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NM_010227 // RefSeq // Mus musculus filamin, alpha (Flna), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000033699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74223541:74246555:-1 gene:ENSMUSG00000031328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000101454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:74223463:74246534:-1 gene:ENSMUSG00000031328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000114299 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:74223461:74249820:-1 gene:ENSMUSG00000031328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000130007 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:74223789:74246364:-1 gene:ENSMUSG00000031328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000144429 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74223461:74246398:-1 gene:ENSMUSG00000031328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC151024 // GenBank // Mus musculus filamin, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:183937 IMAGE:9087937), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000052186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74223790:74246436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 98 // 45 // 45 // 0
NM_001172154 // RefSeq // Mus musculus deoxyribonuclease 1-like 1 (Dnase1l1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NM_027109 // RefSeq // Mus musculus deoxyribonuclease 1-like 1 (Dnase1l1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000019232 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74273217:74281736:-1 gene:ENSMUSG00000019088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000075821 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74273218:74282337:-1 gene:ENSMUSG00000019088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// BC023246 // GenBank // Mus musculus deoxyribonuclease 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:28442 IMAGE:4039470), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// DQ116784 // GenBank // Mus musculus DNase X mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// XM_006528272 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus deoxyribonuclease 1-like 1 (Dnase1l1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// ENSMUST00000114189 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:74273319:74281598:-1 gene:ENSMUSG00000019088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// ENSMUST00000128763 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74274368:74276846:-1 gene:ENSMUSG00000019088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000052182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74273569:74277176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 44 // 15 // 16 // 0 /// NONMMUT072849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_025410 // RefSeq // Mus musculus L antigen family, member 3 (Lage3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000015433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74352161:74353618:-1 gene:ENSMUSG00000015289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000114152 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:74352162:74353575:-1 gene:ENSMUSG00000015289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000114153 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:74351276:74353594:-1 gene:ENSMUSG00000015289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// AK134624 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330504E21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC027305 // GenBank // Mus musculus L antigen family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:28273 IMAGE:4009230), complete cds. // chrX // 58 // 92 // 7 // 12 // 0
NM_008062 // RefSeq // Mus musculus glucose-6-phosphate dehydrogenase X-linked (G6pdx), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000004327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74409483:74429194:-1 gene:ENSMUSG00000031400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000143521 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:74410859:74428876:-1 gene:ENSMUSG00000031400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// BC075663 // GenBank // Mus musculus glucose-6-phosphate dehydrogenase X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:96429 IMAGE:30603864), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74385340:74428358:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 85 // 85 // 17 // 20 // 1
ENSMUST00000059880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74570639:74571574:-1 gene:ENSMUSG00000043715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74570639:74571328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000083925 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:74713767:74713873:-1 gene:ENSMUSG00000065859 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT072888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_181584 // RefSeq // Mus musculus growth factor receptor bound protein 2-associated protein 3 (Gab3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000037374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:74988521:75084905:-1 gene:ENSMUSG00000032750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000114104 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:74988704:75084757:-1 gene:ENSMUSG00000032750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY057988 // GenBank // Mus musculus GAB3 mRNA, complete cds. // chrX // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC141240 // GenBank // Mus musculus growth factor receptor bound protein 2-associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:176201 IMAGE:9055852), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000129495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:74988706:75085458:-1 gene:ENSMUSG00000032750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// ENSMUST00000114109 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:74966843:75084905:-1 gene:ENSMUSG00000032750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:74988720:75085241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AK039787 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330108G10 product:growth factor receptor bound protein 2-associated protein 3, full insert sequence. // chrX // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
ENSMUST00000084001 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:74997577:74997683:-1 gene:ENSMUSG00000065935 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033786 // RefSeq // Mus musculus small integral membrane protein 9 (Smim9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000101433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:75146056:75163753:-1 gene:ENSMUSG00000073094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000141041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:75149121:75163770:-1 gene:ENSMUSG00000073094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000165080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:75146234:75161620:-1 gene:ENSMUSG00000073094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// NONMMUT072906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001161373 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor VIII (F8), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001161374 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor VIII (F8), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_007977 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor VIII (F8), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006527790 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coagulation factor VIII (F8), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033539 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:75172715:75382316:-1 gene:ENSMUSG00000031196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000114085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:75172719:75380041:-1 gene:ENSMUSG00000031196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC138347 // GenBank // Mus musculus coagulation factor VIII, mRNA (cDNA clone MGC:169972 IMAGE:8861367), complete cds. // chrX // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC145245 // GenBank // Mus musculus coagulation factor VIII, mRNA (cDNA clone MGC:178805 IMAGE:9053797), complete cds. // chrX // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// L05573 // GenBank // Mus domesticus coagulation factor VIII mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:75235117:75366062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
XR_168592 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus non-histone chromosomal protein HMG-14-like (LOC101055894), misc_RNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_406360 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus non-histone chromosomal protein HMG-14-like (LOC101055894), misc_RNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:75475232:75475523:-1 gene:ENSMUSG00000048709 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:75475232:75499949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT072916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_175122 // RefSeq // Mus musculus RAB39B, member RAS oncogene family (Rab39b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033545 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:75572046:75578231:-1 gene:ENSMUSG00000031202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB232636 // GenBank // Mus musculus Rab39B mRNA for Rab39B, complete cds. // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC050853 // GenBank // Mus musculus RAB39B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:59427 IMAGE:6517891), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052472 // GenBank // Mus musculus RAB39B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:63405 IMAGE:6833461), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:75574581:75578007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
XM_006528376 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 14710 (Gm14710), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000146082 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:76153331:76162605:-1 gene:ENSMUSG00000084831 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:76141295:76162374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 91 // 61 // 10 // 11 // 0
ENSMUST00000119393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:76538909:76539538:-1 gene:ENSMUSG00000081175 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:76538909:76539456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT072956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001101585 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 6927 (Gm6927), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528230 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 6927 (Gm6927), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000145498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:77674836:77675435:-1 gene:ENSMUSG00000087152 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000032455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:77674814:77705971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000120309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:77717052:77717983:-1 gene:ENSMUSG00000081358 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:77716977:77718027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 80 // 48 // 8 // 10 // 0 /// NONMMUT072975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
NM_016979 // RefSeq // Mus musculus protein kinase, X-linked (Prkx), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006527909 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein kinase, X-linked (Prkx), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000036333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:77761411:77796278:-1 gene:ENSMUSG00000035725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK034681 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430023P19 product:putative serine/threonine kinase, full insert sequence. // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK154447 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630034H07 product:protein kinase, X-linked, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC006875 // GenBank // Mus musculus protein kinase, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:11638 IMAGE:3596013), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114044 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:77771455:77795972:-1 gene:ENSMUSG00000035725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// AK039088 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230094I17 product:putative serine/threonine kinase, full insert sequence. // chrX // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000032438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:77764129:77853480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_017471 // RefSeq // Mus musculus probasin (Pbsn), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000000003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:77837901:77853623:-1 gene:ENSMUSG00000000003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000114041 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:77837902:77853530:-1 gene:ENSMUSG00000000003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AF005204 // GenBank // Mus musculus probasin mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK137501 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830120G21 product:probasin, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001085544 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 14744 (Gm14744), mRNA. // chrX // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NM_027768 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5430402E10 gene (5430402E10Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000063127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:77919786:77925062:-1 gene:ENSMUSG00000044121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114039 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:77864758:77870033:1 gene:ENSMUSG00000079522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSMUST00000118262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:77988363:77992734:1 gene:ENSMUSG00000082635 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:77917441:77951619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:77864813:77889323:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:77988363:77995900:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_008754 // RefSeq // Mus musculus odorant binding protein IA (Obp1a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000088201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:78085505:78091374:-1 gene:ENSMUSG00000067684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC125514 // GenBank // Mus musculus odorant binding protein Ia, mRNA (cDNA clone MGC:159217 IMAGE:40130029), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC125516 // GenBank // Mus musculus odorant binding protein Ia, mRNA (cDNA clone MGC:159219 IMAGE:40130031), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:78086298:78091322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
AK132212 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3426406K10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000032445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:78549167:78549523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
ENSMUST00000157710 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:78550746:78550879:-1 gene:ENSMUSG00000088335 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT072990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000121507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:78655785:78656739:-1 gene:ENSMUSG00000082664 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:78655880:78656320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 67 // 11 // 12 // 0
ENSMUST00000119613 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:78855408:78858281:-1 gene:ENSMUSG00000083258 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000038406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:78855408:78858281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006528359 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 16462 (Gm16462), mRNA. // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:79164751:79547072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001099307 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 7173 (Gm7173), mRNA. // chrX // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000101410 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:79482568:79517285:-1 gene:ENSMUSG00000073077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// XM_006528235 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7173 (Gm7173), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000038405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:79164751:79547072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
NM_001113734 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen family B, 16 (Mageb16), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NM_028025 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen family B, 16 (Mageb16), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000052283 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:79623231:79671435:-1 gene:ENSMUSG00000046942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000114016 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:79623231:79635582:-1 gene:ENSMUSG00000046942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// BC050207 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410003J06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:60956 IMAGE:30007513), complete cds. // chrX // 94 // 80 // 33 // 35 // 0 /// NR_033647 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen family B, 16, pseudogene 1 (Mageb16-ps1), non-coding RNA. // chrX // 63 // 68 // 19 // 30 // 0 /// ENSMUST00000117991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:144555211:144556337:-1 gene:ENSMUSG00000082106 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 67 // 68 // 20 // 30 // 0 /// BC115695 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410003J06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144648 IMAGE:40104521), complete cds. // chrX // 82 // 82 // 36 // 44 // 1 /// GENSCAN00000049667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:144555178:144556337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 86 // 48 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000050644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:79623687:79624778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:60769968:60771059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 30 // 30 // 0
NM_173435 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930595M18 gene (4930595M18Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080083 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:81419575:81458121:-1 gene:ENSMUSG00000060673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC131910 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930595M18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163541 IMAGE:40130187), complete cds. // chrX // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC132591 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930595M18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:164222 IMAGE:40130868), complete cds. // chrX // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:81419610:81493337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000082806 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:82401091:82401227:-1 gene:ENSMUSG00000064740 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT073023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:82400725:82401172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_021898 // RefSeq // Mus musculus testis specific gene A8 (Tsga8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049420 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:83486678:83487924:-1 gene:ENSMUSG00000035522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB032764 // GenBank // Mus musculus halap-X mRNA for haploid specific alanine-rich acidic protein, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:83486785:83508700:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_001033492 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family B, 4 (Mageb4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000096378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:86250256:86305093:-1 gene:ENSMUSG00000035427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000113969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:86250254:86256219:-1 gene:ENSMUSG00000035427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000119697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:86299922:86301328:-1 gene:ENSMUSG00000082033 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 92 // 59 // 22 // 24 // 0 /// BC150912 // GenBank // Mus musculus expressed sequence CN716893, mRNA (cDNA clone MGC:183823 IMAGE:9087823), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// BC172073 // GenBank // Mus musculus expressed sequence CN716893, mRNA (cDNA clone MGC:198778 IMAGE:9054359), complete cds. // chrX // 95 // 90 // 35 // 37 // 0 /// GENSCAN00000051051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:86250751:86252421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 68 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:86299922:86301328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 59 // 22 // 24 // 0
NM_001033492 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family B, 4 (Mageb4), mRNA. // chrX // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:86250256:86305093:-1 gene:ENSMUSG00000035427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:86250254:86256219:-1 gene:ENSMUSG00000035427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:86299922:86301328:-1 gene:ENSMUSG00000082033 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC150912 // GenBank // Mus musculus expressed sequence CN716893, mRNA (cDNA clone MGC:183823 IMAGE:9087823), complete cds. // chrX // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC172073 // GenBank // Mus musculus expressed sequence CN716893, mRNA (cDNA clone MGC:198778 IMAGE:9054359), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000051051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:86250751:86252421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000051052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:86299922:86301328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000117228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:86327903:86328935:-1 gene:ENSMUSG00000083977 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000051039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:86327943:86328935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 54 // 14 // 15 // 0
ENSMUST00000118274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:86398204:86399244:-1 gene:ENSMUSG00000082450 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000051044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:86398204:86444738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000083824 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:86406128:86406246:-1 gene:ENSMUSG00000065758 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrX // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT073082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_001160403 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 receptor accessory protein-like 1 (Il1rapl1), mRNA. // chrX // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000078875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:86747242:87890235:-1 gene:ENSMUSG00000052372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113964 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:86769118:88115645:-1 gene:ENSMUSG00000052372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113966 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:86740870:88115645:-1 gene:ENSMUSG00000052372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC119580 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 receptor accessory protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:141334 IMAGE:40058380), complete cds. // chrX // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// XM_006528100 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 1 receptor accessory protein-like 1 (Il1rapl1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000029382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:86747242:86788604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 42 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000119203 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:88897696:88898506:-1 gene:ENSMUSG00000082847 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000009137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:88898084:88898491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 89 // 16 // 17 // 0
ENSMUST00000117284 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:89281118:89282171:-1 gene:ENSMUSG00000083923 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:89280399:89282171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_008821 // RefSeq // Mus musculus plasmacytoma expressed transcript 2 (Pet2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000113959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:89403848:89409689:-1 gene:ENSMUSG00000035395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000113960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:89403848:89409689:-1 gene:ENSMUSG00000035395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC138080 // GenBank // Mus musculus plasmacytoma expressed transcript 2, mRNA (cDNA clone MGC:169704 IMAGE:8861099), complete cds. // chrX // 88 // 85 // 15 // 17 // 0 /// M95564 // GenBank // Mus musculus protein PC326 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000118038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:89802319:89806126:-1 gene:ENSMUSG00000083253 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:89802290:89807207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001033880 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930415L06 gene (4930415L06Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:89930098:89932852:-1 gene:ENSMUSG00000035387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150985 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932429P05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183898 IMAGE:9087898), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC150987 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932429P05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183900 IMAGE:9087900), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:89930148:89932553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
ENSMUST00000121568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:90744546:90745062:-1 gene:ENSMUSG00000084289 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000021865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:90744651:90810747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 7 // 7 // 0
NM_001205268 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 14781 (Gm14781), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_028847 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family B, 5 (Mageb5), mRNA. // chrX // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000078469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:91632194:91635671:1 gene:ENSMUSG00000064129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000082048 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:91779544:91783018:-1 gene:ENSMUSG00000061392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC116773 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family B, 5, mRNA (cDNA clone MGC:151150 IMAGE:40126092), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC116775 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family B, 5, mRNA (cDNA clone MGC:151152 IMAGE:40126094), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000118585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:91887301:91889565:-1 gene:ENSMUSG00000083994 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000055515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:91831098:91889565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
NM_001256004 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 5071 (Gm5071), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 72 // 72 // 0 /// XM_006528069 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 5071 (Gm5071), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 72 // 72 // 0 /// ENSMUST00000063726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:91392500:91393534:1 gene:ENSMUSG00000094861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 99 // 100 // 71 // 72 // 0 /// ENSMUST00000101396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:91480126:91481160:1 gene:ENSMUSG00000096072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 99 // 100 // 71 // 72 // 0 /// ENSMUST00000104922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:91931946:91932980:-1 gene:ENSMUSG00000078123 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 72 // 72 // 0 /// GENSCAN00000021867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:91480126:91481160:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 99 // 100 // 71 // 72 // 0 /// GENSCAN00000021870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:91345736:91393534:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 99 // 100 // 71 // 72 // 0 /// GENSCAN00000055510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:91931946:91932980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 72 // 72 // 0
NM_173783 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen family B, 18 (Mageb18), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000088137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:92119201:92120771:-1 gene:ENSMUSG00000067649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000113955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:92118879:92599572:-1 gene:ENSMUSG00000067649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116801 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen family B, 18, mRNA (cDNA clone MGC:151178 IMAGE:40126120), complete cds. // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC137691 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen family B, 18, mRNA (cDNA clone MGC:169315 IMAGE:8860710), complete cds. // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000055517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:92119651:92121367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_008892 // RefSeq // Mus musculus polymerase (DNA directed), alpha 1 (Pola1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006527907 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (DNA directed), alpha 1 (Pola1), transcript variant X4, mRNA. // chrX // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000006856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:93304767:93632155:-1 gene:ENSMUSG00000006678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK037836 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130053I24 product:DNA polymerase alpha 1, 180 kDa, full insert sequence. // chrX // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC138047 // GenBank // Mus musculus polymerase (DNA directed), alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:169671 IMAGE:8861066), complete cds. // chrX // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// D13543 // GenBank // Mus musculus POLA1 mRNA for DNA polymerase alpha catalytic subunit, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// D17384 // GenBank // Mus musculus mRNA for DNA polymerase alpha catalytic subunit p180, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:93539329:93626658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 56 // 20 // 20 // 0
NM_145630 // RefSeq // Mus musculus pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 3 (Pdk3), mRNA. // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000045748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:93764607:93832201:-1 gene:ENSMUSG00000035232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC008126 // GenBank // Mus musculus pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 3, mRNA (cDNA clone MGC:6383 IMAGE:3500763), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// CT010338 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G0352D for gene Pdk3, Pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 3; complete cds, incl. stopcodon. // chrX // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:93738705:93962195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
ENSMUST00000117999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:93920295:93921962:-1 gene:ENSMUSG00000082728 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:93738705:93962195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000044989 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:94355053:94366777:-1 gene:ENSMUSG00000043549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000113902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:94357156:94366028:-1 gene:ENSMUSG00000043549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000113903 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:94355872:94365733:-1 gene:ENSMUSG00000043549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC115707 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932442L08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:141327 IMAGE:40058141), complete cds. // chrX // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// XM_006544593 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4932442L08 gene (4932442L08Rik), mRNA. // chrX // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// GENSCAN00000007853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:94339903:94353641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 25 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000119908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:94546963:94547569:-1 gene:ENSMUSG00000081796 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT073206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 94 // 15 // 15 // 0
XM_006528363 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus splicing factor U2AF 65 kDa subunit-like (LOC102640468), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000118127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:94772619:94774034:-1 gene:ENSMUSG00000082776 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000036880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:94772616:94779297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000121899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:94774978:94775677:-1 gene:ENSMUSG00000081418 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:94772616:94779297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001081473 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, X-linked, duplicated B (Zxdb), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_003292 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, X-linked, duplicated A (Zxda), non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:94724569:94730187:1 gene:ENSMUSG00000073062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117281 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:94795563:94798183:-1 gene:ENSMUSG00000073060 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:94795563:94798183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:94724675:94727296:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000142240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:94997439:94998683:-1 gene:ENSMUSG00000087522 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:94997391:94998917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178753 // RefSeq // Mus musculus spindlin family, member 4 (Spin4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:95022510:95026682:-1 gene:ENSMUSG00000071722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027796 // GenBank // Mus musculus spindlin family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:38206 IMAGE:5323183), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:95016856:95130961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_175179 // RefSeq // Mus musculus APC membrane recruitment 1 (Amer1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000084535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:95420318:95444872:-1 gene:ENSMUSG00000050332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC053442 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 123, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:6333717), partial cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:95381863:95444887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_080858 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 12 (Asb12), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528277 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 12 (Asb12), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000033549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:95470201:95478129:-1 gene:ENSMUSG00000031204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF403040 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain-containing SOCS box protein Asb-12 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107257 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:130200 IMAGE:40052462), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:95470336:95471658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000096366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:95732586:95733265:-1 gene:ENSMUSG00000071721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_152822 // RefSeq // Mus musculus LAS1-like (S. cerevisiae) (Las1l), mRNA. // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000079987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:95935335:95956913:-1 gene:ENSMUSG00000057421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113864 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:95935335:95956913:-1 gene:ENSMUSG00000057421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000126605 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:95940691:95956886:-1 gene:ENSMUSG00000057421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC141155 // GenBank // Mus musculus LAS1-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:176116 IMAGE:9055767), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000139717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:95949435:95956962:-1 gene:ENSMUSG00000057421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// AK163919 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230057M08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// BC004735 // GenBank // Mus musculus LAS1-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:3498767). // chrX // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// AK089160 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E530018O14 product:hypothetical Las1-like containing protein, full insert sequence. // chrX // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000044665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:95929933:95956848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_177789 // RefSeq // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 4 (Vsig4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006528077 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 4 (Vsig4), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000050707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:96247203:96293438:-1 gene:ENSMUSG00000044206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000146830 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:96249950:96293412:-1 gene:ENSMUSG00000044206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// BC025105 // GenBank // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:36211 IMAGE:4162875), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT073258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000044664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:96224122:96367919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
ENSMUST00000117289 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:96885509:96887873:-1 gene:ENSMUSG00000082735 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:96885756:96887873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 80 // 53 // 8 // 10 // 0 /// NONMMUT073261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000118319 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:96966257:96966648:-1 gene:ENSMUSG00000081606 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 79 // 100 // 11 // 14 // 0 /// NONMMUT073264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT073265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 79 // 100 // 11 // 14 // 0
NM_001161432 // RefSeq // Mus musculus ectodysplasin A2 receptor (Eda2r), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_175540 // RefSeq // Mus musculus ectodysplasin A2 receptor (Eda2r), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000037353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:97333840:97377216:-1 gene:ENSMUSG00000034457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113832 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:97337138:97377150:-1 gene:ENSMUSG00000034457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000126609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:97341546:97377172:-1 gene:ENSMUSG00000034457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AK080072 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530057A22 product:Similar to X-linked Ectodisplasin A Receptor (human), full insert sequence. // chrX // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC106845 // GenBank // Mus musculus ectodysplasin A2 isoform receptor, mRNA (cDNA clone MGC:124099 IMAGE:40045945), complete cds. // chrX // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_001161433 // RefSeq // Mus musculus ectodysplasin A2 receptor (Eda2r), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// ENSMUST00000126283 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:97337791:97377216:-1 gene:ENSMUSG00000034457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000049904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:97338826:97358023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NM_052976 // RefSeq // Mus musculus oligophrenin 1 (Ophn1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000033560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:98554277:98890985:-1 gene:ENSMUSG00000031214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:98558251:98890781:-1 gene:ENSMUSG00000031214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000142267 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:98732392:98890985:-1 gene:ENSMUSG00000031214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC004845 // GenBank // Mus musculus oligophrenin 1, mRNA (cDNA clone MGC:6513 IMAGE:2650009), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006528346 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus oligophrenin 1 (Ophn1), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// ENSMUST00000125150 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:98712199:98891025:-1 gene:ENSMUSG00000031214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// ENSMUST00000147805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:98712427:98890985:-1 gene:ENSMUSG00000031214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// AK039304 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330019G01 product:oligophrenin 1, full insert sequence. // chrX // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000007241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:98513900:98915178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000119692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:99081401:99082402:-1 gene:ENSMUSG00000083310 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000007258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:99081401:99117011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NR_033544 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 14812 (Gm14812), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156494 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:99405331:99443797:-1 gene:ENSMUSG00000073051 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001290395 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA wax alcohol acyltransferase 2 (Awat2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_177746 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA wax alcohol acyltransferase 2 (Awat2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006528027 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acyl-CoA wax alcohol acyltransferase 2 (Awat2), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000033567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:100402221:100412587:-1 gene:ENSMUSG00000031220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000147103 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:100402226:100442717:-1 gene:ENSMUSG00000031220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY611031 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 clone 1 wax synthase mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY611032 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 clone 2 wax synthase mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC138085 // GenBank // Mus musculus diacylglycerol O-acyltransferase 2-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:169709 IMAGE:8861104), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC138086 // GenBank // Mus musculus diacylglycerol O-acyltransferase 2-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:169710 IMAGE:8861105), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006528029 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acyl-CoA wax alcohol acyltransferase 2 (Awat2), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000040607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:100402786:100412646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NM_020621 // RefSeq // Mus musculus pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 4 (P2ry4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:100590154:100594869:-1 gene:ENSMUSG00000044359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119206 // GenBank // Mus musculus pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 4, mRNA (cDNA clone MGC:155522 IMAGE:8733955), complete cds. // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC120511 // GenBank // Mus musculus pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 4, mRNA (cDNA clone MGC:155748 IMAGE:40129434), complete cds. // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:100593205:100594290:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000144643 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:100622883:100625938:-1 gene:ENSMUSG00000015668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_028303 // RefSeq // Mus musculus PDZ domain containing 11 (Pdzd11), mRNA. // chrX // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// XM_006528299 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PDZ domain containing 11 (Pdzd11), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// ENSMUST00000015812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:100622886:100626568:-1 gene:ENSMUSG00000015668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// ENSMUST00000059099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:100622908:100625935:-1 gene:ENSMUSG00000015668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000151548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:100623377:100626271:-1 gene:ENSMUSG00000015668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// BC004608 // GenBank // Mus musculus PDZ domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:7978 IMAGE:3585336), complete cds. // chrX // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// XM_006528300 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PDZ domain containing 11 (Pdzd11), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// AK032327 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430520D04 product:unclassifiable, full insert sequence. // chrX // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000006076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:100623393:100625374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 66 // 20 // 21 // 0
ENSMUST00000149206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:100736983:100740929:-1 gene:ENSMUSG00000085314 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158152 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930036A03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT073321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001167997 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 11 (Tex11), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NM_031384 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 11 (Tex11), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000009814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:100838648:101059639:-1 gene:ENSMUSG00000009670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000113716 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:100877882:101059667:-1 gene:ENSMUSG00000009670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000113718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:100838648:101059667:-1 gene:ENSMUSG00000009670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF285572 // GenBank // Mus musculus testis protein TEX11 (Tex11) mRNA, complete cds. // chrX // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC116709 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 11, mRNA (cDNA clone MGC:144025 IMAGE:40096708), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:100836644:101039097:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 15 // 15 // 0
NM_007515 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 3 (Slc7a3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000073927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:101079222:101085372:-1 gene:ENSMUSG00000031297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000101362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:101079221:101085352:-1 gene:ENSMUSG00000031297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000113710 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101079222:101086020:-1 gene:ENSMUSG00000031297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000138162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101079210:101085405:-1 gene:ENSMUSG00000031297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK141558 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630025H07 product:solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 3, full insert sequence. // chrX // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC050195 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:60697 IMAGE:30010078), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// U70859 // GenBank // Mus musculus cationic amino acid transporter (CAT3) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:101067648:101084240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000157489 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:101141433:101141552:-1 gene:ENSMUSG00000088114 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033362 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 614 (Gm614), mRNA. // chrX // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000101358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:101261376:101263992:-1 gene:ENSMUSG00000090141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000117736 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:101261405:101269023:-1 gene:ENSMUSG00000092463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000125656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101261376:101263975:-1 gene:ENSMUSG00000090141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC048573 // GenBank // Mus musculus gene model 614, (NCBI), mRNA (cDNA clone IMAGE:6706054). // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC147523 // GenBank // Mus musculus gene model 614, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182621 IMAGE:9056515), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147537 // GenBank // Mus musculus gene model 614, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182634 IMAGE:9056528), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:101261405:101268169:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_009910 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 3 (Cxcr3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:101731535:101734269:-1 gene:ENSMUSG00000050232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB003174 // GenBank // Mus musculus mRNA for interferon-inducible protein 10 receptor, complete cds. // chrX // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AF045146 // GenBank // Mus musculus chemokine receptor CXCR3 mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC096626 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:106368 IMAGE:30749408), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:101731951:101737536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
XR_387015 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102634296 (LOC102634296), transcript variant X3, misc_RNA. // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000056225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:101791225:101793308:-1 gene:ENSMUSG00000045010 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000124577 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101790053:101793263:-1 gene:ENSMUSG00000045010 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// XM_006528370 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102634296 (LOC102634296), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// ENSMUST00000147742 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:101790348:101792334:-1 gene:ENSMUSG00000045010 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// GENSCAN00000029736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:101791575:101821816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT073378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT073381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT073379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
NM_001278534 // RefSeq // Mus musculus retrotransposon gag domain containing 4 (Rgag4), mRNA. // chrX // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000113631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:102066544:102071196:-1 gene:ENSMUSG00000049191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000119076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:102066544:102071304:-1 gene:ENSMUSG00000049191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC132391 // GenBank // Mus musculus retrotransposon gag domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:164022 IMAGE:40130668), complete cds. // chrX // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// BC137795 // GenBank // Mus musculus retrotransposon gag domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:169419 IMAGE:8860814), complete cds. // chrX // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000188731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:102066544:102071304:-1 gene:ENSMUSG00000049191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:102004844:102070862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
NM_146235 // RefSeq // Mus musculus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency complementation group 6 like (Ercc6l), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056904 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:102141716:102157091:-1 gene:ENSMUSG00000051220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY172688 // GenBank // Mus musculus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency complementation group 6 C-like (Ercc6l) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC004701 // GenBank // Mus musculus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency complementation group 6 - like, mRNA (cDNA clone IMAGE:3499003), complete cds. // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC037660 // GenBank // Mus musculus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency complementation group 6 - like, mRNA (cDNA clone MGC:47180 IMAGE:5354271), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK081756 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130074G22 product:hypothetical Tetratricopeptide repeat (TPR) structure containing protein, full insert sequence. // chrX // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:102143179:102156975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_027382 // RefSeq // Mus musculus histone deacetylase 8 (Hdac8), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528275 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histone deacetylase 8 (Hdac8), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000087916 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:102284639:102505359:-1 gene:ENSMUSG00000067567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000154872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:102405647:102505081:-1 gene:ENSMUSG00000067567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC061257 // GenBank // Mus musculus histone deacetylase 8, mRNA (cDNA clone MGC:74413 IMAGE:30251620), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XR_386929 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histone deacetylase 8 (Hdac8), transcript variant X3, misc_RNA. // chrX // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000137785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:102414345:102505345:-1 gene:ENSMUSG00000067567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000148481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:102407602:102505146:-1 gene:ENSMUSG00000067567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// AK034511 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330209K13 product:HISTONE DEACETYLASE 8 (FRAGMENT) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chrX // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:102425141:102505064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_028496 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700031F05 gene (1700031F05Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006528310 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700031F05 gene (1700031F05Rik), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006528311 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700031F05 gene (1700031F05Rik), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000048061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:102859186:102866353:-1 gene:ENSMUSG00000032894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000124592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:102859186:102867971:-1 gene:ENSMUSG00000032894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_011931 // RefSeq // Mus musculus ring finger and WD repeat domain 2 (Rfwd2), mRNA. // chrX // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// ENSMUST00000076894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:159232326:159347580:1 gene:ENSMUSG00000040782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// ENSMUST00000133472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:103163110:103165407:-1 gene:ENSMUSG00000048949 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 98 // 100 // 44 // 45 // 0 /// AF151110 // GenBank // Mus musculus constitutive photomorphogenic protein (Cop1) mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// BC082804 // GenBank // Mus musculus ring finger and WD repeat domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:90569 IMAGE:6852010), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// BC158002 // GenBank // Mus musculus ring finger and WD repeat domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:189811 IMAGE:9007311), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// GENSCAN00000006843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103163110:103165407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000007015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:159232438:159418239:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 97 // 69 // 30 // 31 // 0 /// BC034695 // GenBank HTC // Mus musculus G-rich RNA sequence binding factor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3584046), **** WARNING: chimeric clone ****. // chrX // 58 // 58 // 26 // 45 // 1
NM_008671 // RefSeq // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 2 (Nap1l2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:103184176:103186640:-1 gene:ENSMUSG00000082229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115708 // GenBank // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:141324 IMAGE:40058104), complete cds. // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC115761 // GenBank // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:141323 IMAGE:40058103), complete cds. // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103184928:103186310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NR_001463 // RefSeq // Mus musculus inactive X specific transcripts (Xist), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000127786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:103460506:103483217:-1 gene:ENSMUSG00000086503 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153883 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:103460375:103466667:-1 gene:ENSMUSG00000086503 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chrX // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC051222 // GenBank // Mus musculus inactive X specific transcripts, mRNA (cDNA clone IMAGE:3371631), partial cds. // chrX // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NR_001570 // RefSeq // Mus musculus inactive X specific transcripts (Xist), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chrX // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT073455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT073465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// Xist // lncRNA Db // Mouse_NR_001463.3mm9 chrX:100,655,712-100,678,572 // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONMMUT073456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT073459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT073461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSMUST00000062642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:103525325:103526330:-1 gene:ENSMUSG00000043661 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC147695 // GenBank // Mus musculus predicted gene, ENSMUSG00000043661, mRNA (cDNA clone MGC:182774 IMAGE:9056668), complete cds. // chrX // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103525495:103557613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT073487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NR_030558 // RefSeq // Mus musculus microRNA 421 (Mir421), microRNA. // chrX // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// ENSMUST00000083575 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:103572915:103572999:-1 gene:ENSMUSG00000065509 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-421 // miRBase Micro RNA Database // MI0005496 Mus musculus miR-421 stem-loop // chrX // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// NONMMUT073497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 83 // 92 // 19 // 23 // 0
NR_030418 // RefSeq // Mus musculus microRNA 374b (Mir374b), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102314 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:103573060:103573154:-1 gene:ENSMUSG00000076269 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-374b // miRBase Micro RNA Database // MI0004125 Mus musculus miR-374b stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009197 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 2 (Slc16a2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042664 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:103697414:103821965:-1 gene:ENSMUSG00000033965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148684 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:103706384:103734188:-1 gene:ENSMUSG00000033965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000171837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:103699851:103706454:-1 gene:ENSMUSG00000033965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AB265788 // GenBank // Mus musculus slc16a2 mRNA for solute carrier family 16 member 2, complete cds. // chrX // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AF045692 // GenBank // Mus musculus X-linked PEST-containing transporter (Xpct) mRNA, complete cds. // chrX // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC080678 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:91081 IMAGE:6313495), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC096587 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:106394 IMAGE:3992886), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103699747:103724638:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_011276 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein, LIM domain interacting (Rlim), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527918 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein, LIM domain interacting (Rlim), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000070705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:103957163:103981284:-1 gene:ENSMUSG00000056537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000121153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:103957163:103981284:-1 gene:ENSMUSG00000056537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF069992 // GenBank // Mus musculus LIM domain interacting RING finger protein (R-lim) mRNA, complete cds. // chrX // 89 // 68 // 17 // 19 // 0 /// BC012960 // GenBank // Mus musculus ring finger protein, LIM domain interacting, mRNA (cDNA clone MGC:13712 IMAGE:4193003), complete cds. // chrX // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000135101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:103977795:103981284:-1 gene:ENSMUSG00000056537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000027488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103962491:104001182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT073524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSMUST00000082942 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:104001373:104001479:-1 gene:ENSMUSG00000064876 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT073525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001077354 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence C77370 (C77370), mRNA. // chrX // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056502 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:104083714:104201144:-1 gene:ENSMUSG00000046449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000087879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:104077435:104201117:-1 gene:ENSMUSG00000046449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:104077434:104201185:-1 gene:ENSMUSG00000046449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// AK054513 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330035D01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// DQ975302 // GenBank // Mus musculus KIAA2022 long isoform mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// DQ975303 // GenBank // Mus musculus KIAA2022 short isoform mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:104083190:104088959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NR_030430 // RefSeq // Mus musculus microRNA 672 (Mir672), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102331 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:104116175:104116274:-1 gene:ENSMUSG00000076286 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-672 // miRBase Micro RNA Database // MI0004258 Mus musculus miR-672 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009592 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 7 (Abcb7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000033695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:104280657:104413846:-1 gene:ENSMUSG00000031333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC151037 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:183950 IMAGE:9087950), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000027475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:104284043:104339319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
NM_175358 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 15 (Zdhhc15), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000042070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:104536969:104671064:-1 gene:ENSMUSG00000033906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000053467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:104544858:104670799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NM_053206 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family E, 2 (Magee2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:104854952:104857267:-1 gene:ENSMUSG00000031224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094361 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family E, 2, mRNA (cDNA clone MGC:106785 IMAGE:6829915), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132640 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family E, 2, mRNA (cDNA clone MGC:164271 IMAGE:40130917), complete cds. // chrX // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// BC138210 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family E, 2, mRNA (cDNA clone MGC:169834 IMAGE:8861229), complete cds. // chrX // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000053462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:104855472:104857043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
GENSCAN00000053464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:105151911:105165361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NR_029910 // RefSeq // Mus musculus microRNA 384 (Mir384), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083565 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:105344282:105344369:-1 gene:ENSMUSG00000065499 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-384 // miRBase Micro RNA Database // MI0001146 Mus musculus miR-384 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029759 // RefSeq // Mus musculus microRNA 325 (Mir325), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083491 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:105379082:105379179:-1 gene:ENSMUSG00000065425 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-325 // miRBase Micro RNA Database // MI0000597 Mus musculus miR-325 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009530 // RefSeq // Mus musculus alpha thalassemia/mental retardation syndrome X-linked homolog (human) (Atrx), mRNA. // chrX // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// XR_386919 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alpha thalassemia/mental retardation syndrome X-linked homolog (human) (Atrx), transcript variant X15, misc_RNA. // chrX // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000113573 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:105797615:105929397:-1 gene:ENSMUSG00000031229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000134507 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:105876960:105929350:-1 gene:ENSMUSG00000031229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000150914 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:105876960:105929370:-1 gene:ENSMUSG00000031229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// AF026032 // GenBank // Mus musculus ATRX protein (Atrx) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000032058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:105800175:105919179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 95 // 35 // 35 // 0
NM_001001176 // RefSeq // Mus musculus TAF9B RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf9b), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001167988 // RefSeq // Mus musculus TAF9B RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf9b), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000055497 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:106206883:106219901:-1 gene:ENSMUSG00000047242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:106206883:106221158:-1 gene:ENSMUSG00000047242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC066223 // GenBank // Mus musculus TAF9B RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:76785 IMAGE:30468965), complete cds. // chrX // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000134547 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:106218340:106220750:-1 gene:ENSMUSG00000047242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000032048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:106208494:106252407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001033424 // RefSeq // Mus musculus fibronectin type III domain containing 3C2 (Fnd3c2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000091282 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:106235246:106255376:-1 gene:ENSMUSG00000073012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:106208494:106252407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
NM_001007580 // RefSeq // Mus musculus fibronectin type III domain containing 3C1 (Fndc3c1), mRNA. // chrX // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000039447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:106420041:106485274:-1 gene:ENSMUSG00000033737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC076625 // GenBank // Mus musculus fibronectin type III domain containing 3C1, mRNA (cDNA clone MGC:100196 IMAGE:30641582), complete cds. // chrX // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC085176 // GenBank // Mus musculus fibronectin type III domain containing 3C1, mRNA (cDNA clone MGC:100347 IMAGE:30626050), complete cds. // chrX // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// DQ192038 // GenBank // Mus musculus fibronectin domain-containing protein 3c (Fndc3c) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000044252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:106420460:106578839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 67 // 67 // 14 // 21 // 1
NM_001281859 // RefSeq // Mus musculus cysteinyl leukotriene receptor 1 (Cysltr1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_001281862 // RefSeq // Mus musculus cysteinyl leukotriene receptor 1 (Cysltr1), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NM_021476 // RefSeq // Mus musculus cysteinyl leukotriene receptor 1 (Cysltr1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000113480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:106574346:106603679:-1 gene:ENSMUSG00000052821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB044087 // GenBank // Mus musculus mRNA for CysLT1, complete cds. // chrX // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AF205830 // GenBank // Mus musculus cysteinyl leukotriene D4 receptor mRNA, complete cds. // chrX // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// AF263370 // GenBank // Mus musculus leukotriene D4 receptor mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC027102 // GenBank // Mus musculus cysteinyl leukotriene receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:32281 IMAGE:5012266), complete cds. // chrX // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000082619 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:106587481:106587642:-1 gene:ENSMUSG00000064553 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT073629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000083799 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:106649913:106650019:-1 gene:ENSMUSG00000065733 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199468 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 5 (Zcchc5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062010 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:106837082:106840644:-1 gene:ENSMUSG00000047686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC064821 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:70164 IMAGE:30139133), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:106837352:106839654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
NM_008409 // RefSeq // Mus musculus integral membrane protein 2A (Itm2a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000033591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:107397099:107403376:-1 gene:ENSMUSG00000031239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC031420 // GenBank // Mus musculus integral membrane protein 2A, mRNA (cDNA clone MGC:18323 IMAGE:3668557), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// L38971 // GenBank // Mus musculus (E25) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:107397891:107444594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_025921 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2610002M06 gene (2610002M06Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:107782751:107816334:-1 gene:ENSMUSG00000031242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016070 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610002M06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:27551 IMAGE:4481241), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000191183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:107787837:107794149:-1 gene:ENSMUSG00000031242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000000405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:107776890:107816599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001033252 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 732 (Gm732), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000101290 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:107945735:107948436:-1 gene:ENSMUSG00000073006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000155294 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:107946876:107948465:-1 gene:ENSMUSG00000073006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// BC147603 // GenBank // Mus musculus gene model 732, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182699 IMAGE:9056593), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC147609 // GenBank // Mus musculus gene model 732, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182705 IMAGE:9056599), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:107945755:107947164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000178160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:108664004:108664891:-1 gene:ENSMUSG00000093916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:108663998:108743789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000150434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:108737016:108834348:-1 gene:ENSMUSG00000063663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK136767 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330003I22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001081477 // RefSeq // Mus musculus bromodomain and WD repeat domain containing 3 (Brwd3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000041866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:108742568:108834372:-1 gene:ENSMUSG00000063663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000144521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:108742568:108834372:-1 gene:ENSMUSG00000063663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000150434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:108737016:108834348:-1 gene:ENSMUSG00000063663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK042444 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630092E20 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chrX // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// ENSMUST00000134434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:108803352:108834340:-1 gene:ENSMUSG00000063663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// AK050539 // GenBank HTC // Mus musculus adult pancreas islet cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C820012K02 product:hypothetical Trp-Asp (WD) repeats profile/Trp-Asp (WD) repeats circular profile/G-protein beta WD-40 repeats containing protein, full insert sequence. // chrX // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// GENSCAN00000035844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:108750106:108908009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 74 // 31 // 31 // 0
NM_016710 // RefSeq // Mus musculus high-mobility group nucleosome binding domain 5 (Hmgn5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000033597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:109004534:109013404:-1 gene:ENSMUSG00000031245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB018374 // GenBank // Mus musculus GARP45 mRNA, complete cds. // chrX // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// AF213454 // GenBank // Mus musculus nucleosome binding protein NBP-45 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC021626 // GenBank // Mus musculus nucleosome binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:13759 IMAGE:4219308), complete cds. // chrX // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// BC083087 // GenBank // Mus musculus nucleosome binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:103386 IMAGE:6518798), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:109005109:109013266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
ENSMUST00000082640 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:109023356:109023462:-1 gene:ENSMUSG00000064574 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT073676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
ENSMUST00000083973 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:110622832:110623022:-1 gene:ENSMUSG00000065907 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT073687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSMUST00000038472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:111569933:111697079:-1 gene:ENSMUSG00000034551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000113422 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:111569931:111697079:-1 gene:ENSMUSG00000034551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK034060 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330152L17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001080549 // RefSeq // Mus musculus highly divergent homeobox (Hdx), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001290459 // RefSeq // Mus musculus highly divergent homeobox (Hdx), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000038472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:111569933:111697079:-1 gene:ENSMUSG00000034551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113422 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:111569931:111697079:-1 gene:ENSMUSG00000034551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC116300 // GenBank // Mus musculus highly divergent homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:143925 IMAGE:40095063), complete cds. // chrX // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC116301 // GenBank // Mus musculus highly divergent homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:143926 IMAGE:40095064), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:111596839:111847765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_028655 // RefSeq // Mus musculus spermidine/spermine N1-acetyl transferase-like 1 (Satl1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000026601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:112384305:112406779:-1 gene:ENSMUSG00000025527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124335 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:112384303:112405822:-1 gene:ENSMUSG00000025527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138009 // GenBank // Mus musculus spermidine/spermine N1-acetyl transferase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:169633 IMAGE:8861028), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138011 // GenBank // Mus musculus spermidine/spermine N1-acetyl transferase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:169635 IMAGE:8861030), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006528411 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spermidine/spermine N1-acetyl transferase-like 1 (Satl1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000008823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:112384459:112461967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_181579 // RefSeq // Mus musculus premature ovarian failure 1B (Pof1b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006528406 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus premature ovarian failure 1B (Pof1b), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000039887 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:112638431:112698651:-1 gene:ENSMUSG00000034607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000008835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:112643051:112715324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_018818 // RefSeq // Mus musculus choroidermia (Chm), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_387043 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus choroidermia (Chm), transcript variant X5, misc_RNA. // chrX // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:113040593:113185517:-1 gene:ENSMUSG00000025531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000113388 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:113040595:113185517:-1 gene:ENSMUSG00000025531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF218084 // GenBank // Mus musculus choroideremia protein (Chm) mRNA, complete cds. // chrX // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC047461 // GenBank // Mus musculus choroidermia, mRNA (cDNA clone MGC:30553 IMAGE:5067077), complete cds. // chrX // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000135821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:113062531:113185509:-1 gene:ENSMUSG00000025531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AK035956 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630020M15 product:choroidermia, full insert sequence. // chrX // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000008812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:113043444:113145592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NR_029849 // RefSeq // Mus musculus microRNA 361 (Mir361), microRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083576 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:113074824:113074893:-1 gene:ENSMUSG00000065510 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-361 // miRBase Micro RNA Database // MI0000761 Mus musculus miR-361 stem-loop // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT073719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000120046 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:114774319:114774757:-1 gene:ENSMUSG00000083561 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000025245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:114774319:114774636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000158845 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:115373841:115373964:-1 gene:ENSMUSG00000089470 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT073733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSMUST00000118182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:115458894:115459894:-1 gene:ENSMUSG00000081034 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000053817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:115458894:115511093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000120803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:117663894:117664882:-1 gene:ENSMUSG00000083602 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:117663875:117664819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
AK165166 // GenBank HTC // Mus musculus 8 cells embryo 8 cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E860014G09 product:hypothetical Zn-finger, CCHC type/Retroviral nucleocapsid protein Gag/Retroviral GAG p10 protein/Zinc finger CCHC-type profile/Retroviral matrix protein/Retrovirus capsid, N-terminal core/Retrovirus capsid, C-terminal containing protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_153109 // RefSeq // Mus musculus TGFB-induced factor homeobox 2-like, X-linked 1 (Tgif2lx1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000072518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:118427227:118428256:1 gene:ENSMUSG00000100194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000063242 // chrX // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSMUST00000073857 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:118479708:118480737:-1 gene:ENSMUSG00000100133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000061283 // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF434662 // GenBank // Mus musculus testis expressed homeobox mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC111833 // GenBank // Mus musculus TGFB-induced factor homeobox 2-like, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:130458 IMAGE:40041012), complete cds. // chrX // 67 // 64 // 14 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:118479927:118596079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:118422930:118428037:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_138742 // RefSeq // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 3 (Nap1l3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000079490 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:122394565:122397401:-1 gene:ENSMUSG00000055733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC020176 // GenBank // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:27624 IMAGE:4505496), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC027045 // GenBank // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:38984 IMAGE:5363560), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:122395385:122397973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001100616 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 121 (Vmn2r121), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000094491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:124127339:124135910:-1 gene:ENSMUSG00000072049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000023141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:124129826:124283937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_177705 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4932411N23 gene (4932411N23Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000081074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:126812462:126815868:-1 gene:ENSMUSG00000058670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC117864 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932411N23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143950 IMAGE:40095418), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC117865 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932411N23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143951 IMAGE:40095419), complete cds. // chrX // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:126813325:126815480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
NM_001281537 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930412D23 gene (4930412D23Rik), mRNA. // chrX // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000052500 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:127721182:127736554:-1 gene:ENSMUSG00000043569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 79 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:127721207:127721845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000118379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:131847887:131850073:-1 gene:ENSMUSG00000082117 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// XM_006528653 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4994 (Gm4994), mRNA. // chrX // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000007749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:131847887:131860556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSMUST00000121012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:132888108:132889159:-1 gene:ENSMUSG00000083177 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:132888367:132898544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001105245 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 19 (Pcdh19), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001105246 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 19 (Pcdh19), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000060309 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:133587610:133685893:-1 gene:ENSMUSG00000051323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000149154 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:133582876:133688987:-1 gene:ENSMUSG00000051323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:133582863:133688993:-1 gene:ENSMUSG00000051323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC118529 // GenBank // Mus musculus protocadherin 19, mRNA (cDNA clone MGC:144175 IMAGE:40098492), complete cds. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:133587988:133656060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:133675210:133723651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_019656 // RefSeq // Mus musculus tetraspanin 6 (Tspan6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000087557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:133891068:133898429:-1 gene:ENSMUSG00000067377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000176641 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:133894521:133898294:-1 gene:ENSMUSG00000067377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000176718 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:133892702:133898294:-1 gene:ENSMUSG00000067377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// AF053454 // GenBank // Mus musculus tetraspan TM4SF (Tspan-6) mRNA, complete cds. // chrX // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// BC003733 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 6, mRNA (cDNA clone MGC:5801 IMAGE:3590862), complete cds. // chrX // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC110314 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 6, mRNA (cDNA clone MGC:117923 IMAGE:5344878), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:133892194:133902058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_172203 // RefSeq // Mus musculus NADPH oxidase 1 (Nox1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:134086421:134111854:-1 gene:ENSMUSG00000031257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000113275 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:134087054:134111765:-1 gene:ENSMUSG00000031257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000159259 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:134087146:134111708:-1 gene:ENSMUSG00000031257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF539799 // GenBank // Mus musculus NADPH oxidase 1 alpha mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134087146:134099895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_183319 // RefSeq // Mus musculus X Kell blood group precursor related X linked (Xkrx), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:134149043:134161928:-1 gene:ENSMUSG00000031258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY534249 // GenBank // Mus musculus XK-related protein 2 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC150896 // GenBank // Mus musculus X Kell blood group precursor related X linked, mRNA (cDNA clone MGC:183807 IMAGE:9087807), complete cds. // chrX // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC150897 // GenBank // Mus musculus X Kell blood group precursor related X linked, mRNA (cDNA clone MGC:183808 IMAGE:9087808), complete cds. // chrX // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// XM_006528568 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus X Kell blood group precursor related X linked (Xkrx), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000011269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134150053:134157658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_001167994 // RefSeq // Mus musculus TRM2 tRNA methyltransferase 2B (Trmt2b), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_001167995 // RefSeq // Mus musculus TRM2 tRNA methyltransferase 2B (Trmt2b), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// NM_172540 // RefSeq // Mus musculus TRM2 tRNA methyltransferase 2B (Trmt2b), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000087540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:134262488:134276984:-1 gene:ENSMUSG00000067369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000087541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:134223095:134276982:-1 gene:ENSMUSG00000067369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000113252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134223100:134276920:-1 gene:ENSMUSG00000067369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134222339:134276982:-1 gene:ENSMUSG00000067369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000145066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134223096:134276927:-1 gene:ENSMUSG00000067369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK129030 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3037897, weakly similar to Homo sapiens HpaII tiny fragments locus 9C (HTF9C). // chrX // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// BC056937 // GenBank // Mus musculus TRM2 tRNA methyltransferase 2 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:66583 IMAGE:5716144), complete cds. // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_028958 // RefSeq // Mus musculus TAF7-like RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf7l), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006528611 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TAF7-like RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf7l), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006528612 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TAF7-like RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf7l), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006528614 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TAF7-like RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf7l), transcript variant X5, mRNA. // chrX // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000009740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:134460118:134476490:-1 gene:ENSMUSG00000009596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113223 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:134460558:134474993:-1 gene:ENSMUSG00000009596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// AF285574 // GenBank // Mus musculus TBP-associated factor II Q (Taf2q) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC106854 // GenBank // Mus musculus TAF7-like RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:124181 IMAGE:40046501), complete cds. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000131311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134469874:134474988:-1 gene:ENSMUSG00000009596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000035770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134460621:134476476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_013898 // RefSeq // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 8A1 (Timm8a1), mRNA. // chrX // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000052902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:11609257:11610438:1 gene:ENSMUSG00000045455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000054213 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:134537256:134541865:-1 gene:ENSMUSG00000048007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB031055 // GenBank // Mus musculus DDP1 mRNA for deafness dystonia protein 1, complete cds. // chrX // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// AF150081 // GenBank // Mus musculus small zinc finger-like protein (Ddp1) mRNA, complete cds. // chrX // 94 // 47 // 15 // 16 // 0 /// BC004796 // GenBank // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 8 homolog a1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:6730 IMAGE:3588797), complete cds. // chrX // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// BC094631 // GenBank // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 8 homolog a1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:107000 IMAGE:3419065), complete cds. // chrX // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:11609298:11609591:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 29 // 10 // 10 // 0
NM_013482 // RefSeq // Mus musculus Bruton agammaglobulinemia tyrosine kinase (Btk), mRNA. // chrX // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006528484 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Bruton agammaglobulinemia tyrosine kinase (Btk), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000033617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:134542336:134583140:-1 gene:ENSMUSG00000031264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000113213 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:134542370:134583128:-1 gene:ENSMUSG00000031264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000132664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134549221:134583140:-1 gene:ENSMUSG00000031264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// BC053392 // GenBank // Mus musculus Bruton agammaglobulinemia tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:60523 IMAGE:30075322), complete cds. // chrX // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// L08967 // GenBank // Mus musculus B cell cytoplasmic tyrosine kinase (BPK) mRNA, complete cds. // chrX // 89 // 97 // 33 // 37 // 0 /// L10627 // GenBank // Mus musculus mRNA sequence. // chrX // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// L29788 // GenBank // Mouse Bruton agammaglobulinemia tyrosine kinase (Btk) mRNA, complete cds. // chrX // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000035764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134542736:134582932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 82 // 31 // 31 // 0
NM_013463 // RefSeq // Mus musculus galactosidase, alpha (Gla), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000033621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:134588149:134601125:-1 gene:ENSMUSG00000031266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK164231 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030025F19 product:galactosidase, alpha, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC009021 // GenBank // Mus musculus galactosidase, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:12086 IMAGE:3708950), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// U34071 // GenBank // Mus musculus alpha-galactosidase A mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// U50716 // GenBank // Mus musculus alpha-galactosidase A mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134585432:134600931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 72 // 20 // 21 // 0
ENSMUST00000137737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134625058:134625744:-1 gene:ENSMUSG00000085226 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000035760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134625019:134626064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
AK087866 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330033D12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007578 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 6 (Armcx6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528554 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 6 (Armcx6), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:134748463:134751417:-1 gene:ENSMUSG00000050394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113194 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134748461:134751331:-1 gene:ENSMUSG00000050394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC027264 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 6, mRNA (cDNA clone MGC:27863 IMAGE:3492516), complete cds. // chrX // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126075 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:134750150:134751361:-1 gene:ENSMUSG00000050394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSMUST00000150465 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:134749970:134751347:-1 gene:ENSMUSG00000050394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONMMUT073910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONMMUT073911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_175446 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, matrin type 1 (Zmat1), mRNA. // chrX // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:134971375:135009209:-1 gene:ENSMUSG00000052676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134971372:135009185:-1 gene:ENSMUSG00000052676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000141849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134972777:134978628:-1 gene:ENSMUSG00000052676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000151252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134972943:134981434:-1 gene:ENSMUSG00000052676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AK046974 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930008K04 product:weakly similar to KIAA1789 PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chrX // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// AK133258 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932425E17 product:hypothetical Zn-finger, C2H2 type/Zn-finger, U1-like/Zinc finger C2H2 type domain profile/Lysine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC067022 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B930008K04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6848103), partial cds. // chrX // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134972697:134992417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_025355 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 6 (Tceal6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000033783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:135208687:135210687:-1 gene:ENSMUSG00000031409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC087890 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 6, mRNA (cDNA clone MGC:107171 IMAGE:6533845), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_130888 // RefSeq // Mus musculus nuclear RNA export factor 7 (Nxf7), mRNA. // chrX // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000033784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:135579787:135593855:-1 gene:ENSMUSG00000031410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000113163 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:135579555:135598777:-1 gene:ENSMUSG00000031410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000137977 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:135579555:135588980:-1 gene:ENSMUSG00000031410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000150900 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:135588443:135598758:-1 gene:ENSMUSG00000031410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 83 // 28 // 10 // 12 // 0 /// AB178901 // GenBank // Mus musculus NXF7 mRNA for nuclear export factor 7, complete cds. // chrX // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// AY260550 // GenBank // Mus musculus nuclear RNA export factor 7 (Nxf7) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000127202 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:135584380:135586133:-1 gene:ENSMUSG00000031410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// GENSCAN00000011408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:135571766:135592415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 65 // 65 // 28 // 43 // 1
NM_029459 // RefSeq // Mus musculus preferentially expressed antigen in melanoma (Prame), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:135613144:135615805:-1 gene:ENSMUSG00000031411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:135613002:135627705:-1 gene:ENSMUSG00000031411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:135613144:135665501:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_027952 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700008I05 gene (1700008I05Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000078605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:135654698:135693790:-1 gene:ENSMUSG00000058252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC141320 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700008I05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:176281 IMAGE:9055932), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC141322 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700008I05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:176283 IMAGE:9055934), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:135613144:135665501:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_030106 // RefSeq // Mus musculus thymosin beta 15a (Tmsb15a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528628 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thymosin beta 15a (Tmsb15a), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// XM_006528629 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thymosin beta 15a (Tmsb15a), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// ENSMUST00000073674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:135718667:135720673:-1 gene:ENSMUSG00000060726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113154 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:135718667:135725261:-1 gene:ENSMUSG00000060726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK028086 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700080C03 product:similar to THYMOSIN BETA-LIKE PROTEIN [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chrX // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:135686264:135735045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_009749 // RefSeq // Mus musculus brain expressed X-linked 2 (Bex2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000049130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136066564:136068236:-1 gene:ENSMUSG00000042750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF097439 // GenBank // Mus musculus brain expressed X-linked protein 2 (Bex2) mRNA, complete cds. // chrX // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// BC027529 // GenBank // Mus musculus brain expressed X-linked 2, mRNA (cDNA clone MGC:41182 IMAGE:5058536), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:136066813:136068440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
NM_001024141 // RefSeq // Mus musculus nuclear RNA export factor 3 (Nxf3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006528530 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear RNA export factor 3 (Nxf3), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006528532 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear RNA export factor 3 (Nxf3), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// XM_006528536 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear RNA export factor 3 (Nxf3), transcript variant X7, mRNA. // chrX // 100 // 49 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000080929 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136072099:136085255:-1 gene:ENSMUSG00000057000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000138878 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136079613:136085242:-1 gene:ENSMUSG00000057000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// AB178899 // GenBank // Mus musculus NXF3 mRNA for nuclear export factor 3, complete cds. // chrX // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000011380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:136073260:136102511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 79 // 31 // 31 // 0
NM_001168578 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 8 (Tceal8), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_025703 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 8 (Tceal8), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000060101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136170081:136172342:-1 gene:ENSMUSG00000051579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136170885:136172216:-1 gene:ENSMUSG00000051579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000163584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:136168984:136172251:-1 gene:ENSMUSG00000051579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC027269 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 8, mRNA (cDNA clone MGC:27945 IMAGE:3588435), complete cds. // chrX // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_177919 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 5 (Tceal5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006528576 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 5 (Tceal5), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000066819 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136200948:136203876:-1 gene:ENSMUSG00000054034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000131510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136201650:136203732:-1 gene:ENSMUSG00000054034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 47 // 9 // 9 // 0 /// BC100415 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:118216 IMAGE:6535676), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC115460 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:144258 IMAGE:40100235), complete cds. // chrX // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// BC115461 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor A (SII)-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:144259 IMAGE:40100237), complete cds. // chrX // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000151592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136201618:136203637:-1 gene:ENSMUSG00000054034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// GENSCAN00000011382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:136152816:136203417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_009052 // RefSeq // Mus musculus brain expressed gene 1 (Bex1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000058125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136213972:136215513:-1 gene:ENSMUSG00000050071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000113120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136213973:136215443:-1 gene:ENSMUSG00000050071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF051347 // GenBank // Mus musculus REX-3 mRNA, complete cds. // chrX // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// AF097438 // GenBank // Mus musculus brain expressed X-linked protein 1 (Bex1) mRNA, complete cds. // chrX // 77 // 100 // 10 // 13 // 0 /// BC058805 // GenBank HTC // Mus musculus brain expressed gene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6493139), with apparent retained intron. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC061179 // GenBank // Mus musculus brain expressed gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:74319 IMAGE:6531808), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC089464 // GenBank // Mus musculus brain expressed gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:107097 IMAGE:6594252), complete cds. // chrX // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// ENSMUST00000113118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136214013:136215484:-1 gene:ENSMUSG00000050071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 69 // 100 // 9 // 13 // 0 /// NONMMUT073984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 100 // 77 // 10 // 10 // 0
NM_177748 // RefSeq // Mus musculus killer cell immunoglobulin-like receptor, three domains, long cytoplasmic tail, 2 (Kir3dl2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000072125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:136448107:136469041:-1 gene:ENSMUSG00000057439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000113108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136448107:136544056:-1 gene:ENSMUSG00000057439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF548540 // GenBank // Mus musculus killer immunoglobulin-like receptor-like 2 (Kirl2) mRNA, variant 1, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF548541 // GenBank // Mus musculus killer immunoglobulin-like receptor-like 2 (Kirl2) mRNA, variant 2, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AY530784 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 KIR-like receptor 2 precursor KIRL2.1 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000055300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:136438946:136469036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 77 // 10 // 10 // 0
NM_010297 // RefSeq // Mus musculus glycine receptor, alpha 4 subunit (Glra4), mRNA. // chrX // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// XM_006528507 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycine receptor, alpha 4 subunit (Glra4), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000018739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136757674:136780141:-1 gene:ENSMUSG00000018595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000154833 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136767005:136780141:-1 gene:ENSMUSG00000018595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// AF462147 // GenBank // Mus musculus glycine receptor alpha 4 subunit (Glra4) mRNA, complete cds. // chrX // 94 // 72 // 29 // 31 // 0 /// AK085727 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730029F11 product:glycine receptor, alpha 4 subunit, full insert sequence. // chrX // 91 // 81 // 32 // 35 // 0 /// BC110630 // GenBank // Mus musculus glycine receptor, alpha 4 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:130223 IMAGE:40052661), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// DQ109809 // GenBank // Mus musculus glycine receptor alpha4 subunit (Glra4) mRNA, complete cds. // chrX // 97 // 86 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000055285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:136750576:136781758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 97 // 88 // 37 // 38 // 0
NM_176971 // RefSeq // Mus musculus RAB9B, member RAS oncogene family (Rab9b), mRNA. // chrX // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000058814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136858147:136868755:-1 gene:ENSMUSG00000043463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB232603 // GenBank // Mus musculus Rab9B mRNA for Rab9B, complete cds. // chrX // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC107383 // GenBank // Mus musculus RAB9B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:130383 IMAGE:40057619), complete cds. // chrX // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_001080967 // RefSeq // Mus musculus thymosin beta 15b2 (Tmsb15b2), mRNA. // chrX // 85 // 65 // 11 // 13 // 0 /// NM_207267 // RefSeq // Mus musculus thymosin beta 15b like (Tmsb15l), mRNA. // chrX // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000069803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136955265:136958025:-1 gene:ENSMUSG00000089996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 79 // 70 // 11 // 14 // 0 /// ENSMUST00000127404 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:136954988:136976869:-1 gene:ENSMUSG00000072955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000180194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:136955445:136975497:-1 gene:ENSMUSG00000072955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000089996 // chrX // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// BC096054 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930488E11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106799 IMAGE:3373135), complete cds. // chrX // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// NM_001081983 // RefSeq // Mus musculus thymosin beta 15b1 (Tmsb15b1), mRNA. // chrX // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// ENSMUST00000113071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136974022:136976874:-1 gene:ENSMUSG00000089768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// GENSCAN00000055286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:136955375:136983590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_001082412 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 53 (Slc25a53), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001114179 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 53 (Slc25a53), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528598 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 25, member 53 (Slc25a53), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528599 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 25, member 53 (Slc25a53), transcript variant X4, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056674 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:136982894:136993057:-1 gene:ENSMUSG00000044348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 83 // 48 // 10 // 12 // 0 /// ENSMUST00000113069 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:136981116:137038300:-1 gene:ENSMUSG00000044348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:136981122:137038278:-1 gene:ENSMUSG00000044348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000129807 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:136983036:136993089:-1 gene:ENSMUSG00000044348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000171738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:136981122:136993032:-1 gene:ENSMUSG00000044348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:136955375:136983590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
ENSMUST00000119238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:137103889:137104722:-1 gene:ENSMUSG00000084086 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:137103889:137104233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
XM_006528498 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus extraembryonic, spermatogenesis, homeobox 1 (Esx1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000113066 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:137115397:137120171:-1 gene:ENSMUSG00000023443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF004211 // GenBank // Mus musculus paired-like homeodomain containing protein (Etx) mRNA, complete cds. // chrX // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// AF017734 // GenBank // Mus musculus paired-like homeobox (Epx) mRNA, transcript B, complete cds. // chrX // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NM_007957 // RefSeq // Mus musculus extraembryonic, spermatogenesis, homeobox 1 (Esx1), mRNA. // chrX // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENSMUST00000074698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:137115397:137120326:-1 gene:ENSMUSG00000023443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// AF085715 // GenBank // Mus musculus homeobox protein SPX1 mRNA, complete cds. // chrX // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// AF017735 // GenBank // Mus musculus paired-like homeobox (Epx) mRNA, transcript A, complete cds. // chrX // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000055294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:137115550:137157786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
ENSMUST00000118089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:137203615:137206763:-1 gene:ENSMUSG00000082955 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:137198378:137204578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 68 // 14 // 15 // 0
NM_026469 // RefSeq // Mus musculus testis expressed 13A (Tex13a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:138208165:138209580:-1 gene:ENSMUSG00000071686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:138208195:138209427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177920 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 7 (Serpina7), mRNA. // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:139079257:139085215:-1 gene:ENSMUSG00000031271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY575783 // GenBank // Mus musculus thyroxine-binding globulin (TBG) mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// BC132100 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:163731 IMAGE:40130377), complete cds. // chrX // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:139079257:139085217:-1 gene:ENSMUSG00000031271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// GENSCAN00000023409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:139080285:139083701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000118789 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:139676087:139677489:-1 gene:ENSMUSG00000082018 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
NM_001037915 // RefSeq // Mus musculus ripply1 homolog (zebrafish) (Ripply1), mRNA. // chrX // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// ENSMUST00000101217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:139779549:139782353:-1 gene:ENSMUSG00000072945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB212222 // GenBank // Mus musculus mRNA for Ripply1, complete cds. // chrX // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:139779712:139802492:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_031381 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 13 (Tex13), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044179 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:140808307:140813433:-1 gene:ENSMUSG00000042386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF285576 // GenBank // Mus musculus testis protein TEX13 (Tex13) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116863 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 13, mRNA (cDNA clone MGC:151240 IMAGE:40126182), complete cds. // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC119125 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 13, mRNA (cDNA clone MGC:155441 IMAGE:8733874), complete cds. // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000132970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:140809268:140810852:-1 gene:ENSMUSG00000042386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AK016637 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933403J23 product:unclassifiable, full insert sequence. // chrX // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONMMUT074099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSMUST00000116438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:140821938:140822523:-1 gene:ENSMUSG00000082165 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000040013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:140811456:140859058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NM_001164177 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 10 (Psmd10), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_016883 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 10 (Psmd10), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033805 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:140948429:140956689:-1 gene:ENSMUSG00000031429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000112978 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:140948429:140956728:-1 gene:ENSMUSG00000031429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB022022 // GenBank // Mus musculus mRNA for gankyrin, complete cds. // chrX // 80 // 71 // 16 // 20 // 0 /// BC026931 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 10, mRNA (cDNA clone MGC:25570 IMAGE:3987112), complete cds. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC056196 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 10, mRNA (cDNA clone MGC:60512 IMAGE:30019985), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:140949141:140956643:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_053185 // RefSeq // Mus musculus collagen, type IV, alpha 6 (Col4a6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000101205 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:141165403:141474076:-1 gene:ENSMUSG00000031273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000137051 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:141186191:141207602:-1 gene:ENSMUSG00000031273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 35 // 16 // 16 // 0 /// AB041351 // GenBank // Mus musculus Col4a6 mRNA for type IV collagen alpha 6 chain, complete cds. // chrX // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// AK090269 // GenBank HTC // Mus musculus adult male vesicular gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630031L05 product:procollagen, type IV, alpha 6, full insert sequence. // chrX // 94 // 35 // 15 // 16 // 0 /// BC057648 // GenBank // Mus musculus collagen, type IV, alpha 6, mRNA (cDNA clone MGC:67937 IMAGE:3500535), complete cds. // chrX // 100 // 67 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:141165964:141200265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 39 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:141200948:141269106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_010572 // RefSeq // Mus musculus insulin receptor substrate 4 (Irs4), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067841 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:141710998:141725263:-1 gene:ENSMUSG00000054667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC060235 // GenBank // Mus musculus insulin receptor substrate 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:6853161). // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150782 // GenBank // Mus musculus insulin receptor substrate 4, mRNA (cDNA clone MGC:183693 IMAGE:9087693), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:141721548:141725198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000115986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:141870135:141870401:-1 gene:ENSMUSG00000085466 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:141856070:141870404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT074121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT074122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001007576 // RefSeq // Mus musculus guanylate cyclase 2f (Gucy2f), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006528841 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanylate cyclase 2f (Gucy2f), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000042530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:142081160:142196931:-1 gene:ENSMUSG00000042282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AY651761 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 guanylate cyclase 2F mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC115714 // GenBank // Mus musculus guanylate cyclase 2f, mRNA (cDNA clone MGC:141488 IMAGE:40085764), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000032700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:142155154:142190370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000032702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:142060846:142134020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 55 // 22 // 22 // 0
NM_021487 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 1-like, pseudogene (Kcne1l), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:142304752:142306294:-1 gene:ENSMUSG00000090122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028942 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:35864 IMAGE:5363239), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:142305594:142316116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000117247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:142533439:142533870:-1 gene:ENSMUSG00000081750 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:142533439:142533735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT074138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_019496 // RefSeq // Mus musculus Alport syndrome, mental retardation, midface hypoplasia and elliptocytosis chromosomal region gene 1 (Ammecr1), mRNA. // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000041317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:142851146:142966728:-1 gene:ENSMUSG00000042225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:142855533:142938907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_001114385 // RefSeq // Mus musculus chordin-like 1 (Chrdl1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NM_031258 // RefSeq // Mus musculus chordin-like 1 (Chrdl1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000063029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:143285674:143390099:-1 gene:ENSMUSG00000031283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000074660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:143297174:143394184:-1 gene:ENSMUSG00000031283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000112878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:143285684:143394262:-1 gene:ENSMUSG00000031283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000166406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:143297176:143393896:-1 gene:ENSMUSG00000031283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// AF296451 // GenBank // Mus musculus ventroptin-beta mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// AF305714 // GenBank // Mus musculus neuralin mRNA, complete cds. // chrX // 95 // 61 // 21 // 22 // 0 /// AF321853 // GenBank // Mus musculus ventroptin-alpha mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// BC066832 // GenBank // Mus musculus chordin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:76607 IMAGE:30102312), complete cds. // chrX // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000000740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:143275073:143345413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_007603 // RefSeq // Mus musculus calpain 6 (Capn6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000087316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:143802231:143827414:-1 gene:ENSMUSG00000067276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC052167 // GenBank // Mus musculus calpain 6, mRNA (cDNA clone MGC:59382 IMAGE:6517565), complete cds. // chrX // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:143803644:143820460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_009428 // RefSeq // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5 (Trpc5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040184 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:144381671:144688180:-1 gene:ENSMUSG00000041710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF029983 // GenBank // Mus musculus transient receptor potential protein 5 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AF060107 // GenBank // Mus musculus trp-related protein 5 (Trp5) mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC112972 // GenBank // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:124500 IMAGE:40049027), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000148240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:144418675:144688003:-1 gene:ENSMUSG00000041710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK038531 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230027D19 product:transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5, full insert sequence. // chrX // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000049673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:144382498:144425745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_178358 // RefSeq // Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner-like 1 (Lhfpl1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528800 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner-like 1 (Lhfpl1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006528801 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner-like 1 (Lhfpl1), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006528804 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner-like 1 (Lhfpl1), transcript variant X5, mRNA. // chrX // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000040084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:145290359:145348950:-1 gene:ENSMUSG00000041700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY253666 // GenBank // Mus musculus HMGIC fusion-partner-like protein mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC051434 // GenBank // Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:58969 IMAGE:6389932), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001290274 // RefSeq // Mus musculus angiomotin (Amot), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000138187 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:145451868:145487094:-1 gene:ENSMUSG00000041688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AF461135 // GenBank // Mus musculus angiomotin mRNA, complete cds. // chrX // 84 // 89 // 27 // 32 // 0 /// BC057638 // GenBank // Mus musculus angiomotin, mRNA (cDNA clone MGC:67773 IMAGE:2631191), complete cds. // chrX // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// NM_153319 // RefSeq // Mus musculus angiomotin (Amot), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSMUST00000112835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:145446425:145505144:-1 gene:ENSMUSG00000041688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// ENSMUST00000112836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:145446425:145487639:-1 gene:ENSMUSG00000041688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSMUST00000125271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:145446425:145487046:-1 gene:ENSMUSG00000041688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSMUST00000143610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:145475720:145505181:-1 gene:ENSMUSG00000041688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000037773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:145450001:145493535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 89 // 89 // 32 // 36 // 1
ENSMUST00000122039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:145601837:145602301:-1 gene:ENSMUSG00000100104 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene gene:ENSMUSG00000051428 // chrX // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// ENSMUST00000178481 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCm38:X:145601811:145602253:-1 gene:ENSMUSG00000100498 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene gene:ENSMUSG00000051428 // chrX // 92 // 93 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000037770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:145601837:145602301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 86 // 100 // 12 // 14 // 0
ENSMUST00000119275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:146599751:146600958:-1 gene:ENSMUSG00000081718 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:146523023:146600982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_008356 // RefSeq // Mus musculus interleukin 13 receptor, alpha 2 (Il13ra2), mRNA. // chrX // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// XM_006528707 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 13 receptor, alpha 2 (Il13ra2), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000033646 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:147383476:147429192:-1 gene:ENSMUSG00000031289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000112827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:147383478:147403832:-1 gene:ENSMUSG00000031289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// BC003723 // GenBank // Mus musculus interleukin 13 receptor, alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:5761 IMAGE:3486223), complete cds. // chrX // 100 // 73 // 30 // 30 // 0 /// EF219410 // GenBank // Mus musculus IL-13 receptor alpha2 soluble splice variant (il13ra2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrX // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// U65747 // GenBank // Mus musculus IL-13 receptor alpha 2 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000023743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:147388167:147398674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 37 // 37 // 15 // 41 // 1
NM_053230 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 41 (Vmn1r41), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000089417 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:89746479:89747414:1 gene:ENSMUSG00000094586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000127465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:147452748:147453707:-1 gene:ENSMUSG00000067262 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// NM_053226 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 53 (Vmn1r53), mRNA. // chrX // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// ENSMUST00000076086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90223317:90224438:-1 gene:ENSMUSG00000057697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// BC125605 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, B3, mRNA (cDNA clone MGC:159308 IMAGE:40130120), complete cds. // chrX // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// BC132002 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, B3, mRNA (cDNA clone MGC:163633 IMAGE:40130279), complete cds. // chrX // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// GENSCAN00000023740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:147403811:147453089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 30 // 30 // 11 // 37 // 1 /// GENSCAN00000055931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:89612941:89835570:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 30 // 30 // 11 // 37 // 1
ENSMUST00000112739 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCm38:X:150222363:150223336:-1 gene:ENSMUSG00000102094 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene gene:ENSMUSG00000048592 // chrX // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000182340 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:150222366:150223335:-1 gene:ENSMUSG00000048592 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chrX // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000182652 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:150220716:150226021:-1 gene:ENSMUSG00000048592 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC083100 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30477090, containing frame-shift errors. // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001164683 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 29 (Tmem29), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001164684 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 29 (Tmem29), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:150397773:150441137:-1 gene:ENSMUSG00000041353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:150397773:150459150:-1 gene:ENSMUSG00000041353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000119124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:150707021:150707615:-1 gene:ENSMUSG00000082961 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000048227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:150706343:150707361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
AK143525 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E970012G11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001168600 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein-like 3 (nucleolar)-like (Gnl3l), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_198110 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein-like 3 (nucleolar)-like (Gnl3l), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000026297 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:150983141:151017322:-1 gene:ENSMUSG00000025266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000112691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:150983141:151017322:-1 gene:ENSMUSG00000025266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000154393 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:150997274:151017322:-1 gene:ENSMUSG00000025266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC057033 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein-like 3 (nucleolar)-like, mRNA (cDNA clone MGC:67208 IMAGE:6834283), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079653 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein-like 3 (nucleolar)-like, mRNA (cDNA clone MGC:90757 IMAGE:6843880), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:150924504:151014628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_001164578 // RefSeq // Mus musculus TSR2 20S rRNA accumulation (Tsr2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_175146 // RefSeq // Mus musculus TSR2 20S rRNA accumulation (Tsr2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NR_028392 // RefSeq // Mus musculus TSR2 20S rRNA accumulation (Tsr2), transcript variant 3, non-coding RNA. // chrX // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000026295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:151087095:151096543:-1 gene:ENSMUSG00000025264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112683 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:151087094:151096543:-1 gene:ENSMUSG00000025264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000166010 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:151089481:151096543:-1 gene:ENSMUSG00000025264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC049668 // GenBank // Mus musculus TSR2, 20S rRNA accumulation, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:58494 IMAGE:6535058), complete cds. // chrX // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000166689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:151089692:151096523:-1 gene:ENSMUSG00000025264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:151090280:151096509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT074332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chrX // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENSMUST00000082590 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:151261918:151262021:-1 gene:ENSMUSG00000064524 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// NONMMUT074338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 83 // 100 // 10 // 12 // 0
ENSMUST00000175942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:151291974:151344846:-1 gene:ENSMUSG00000084771 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AK038885 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230072E10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC025887 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A230072E10 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5252967). // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT074339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000082731 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:151539700:151539805:-1 gene:ENSMUSG00000064665 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT074351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000117825 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:151761943:151762658:-1 gene:ENSMUSG00000083379 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT074355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000017241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:151762211:151803968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
NM_025660 // RefSeq // Mus musculus RIB43A domain with coiled-coils 1 (Ribc1), mRNA. // chrX // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006528966 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIB43A domain with coiled-coils 1 (Ribc1), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000026288 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:152004582:152016295:-1 gene:ENSMUSG00000025257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC050755 // GenBank // Mus musculus RIB43A domain with coiled-coils 1, mRNA (cDNA clone MGC:58188 IMAGE:6772058), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:152004915:152009708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_029836 // RefSeq // Mus musculus TSPY-like 2 (Tspyl2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000044509 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:152336855:152342425:-1 gene:ENSMUSG00000041096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000149685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152336852:152342425:-1 gene:ENSMUSG00000041096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000178165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152339301:152341844:-1 gene:ENSMUSG00000041096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// AY273809 // GenBank // Mus musculus CASK interacting nucleosome assembly protein mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC030334 // GenBank HTC // Mus musculus TSPY-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5400992), containing frame-shift errors. // chrX // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC054393 // GenBank // Mus musculus TSPY-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:62815 IMAGE:6491672), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000138918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152336852:152342425:-1 gene:ENSMUSG00000041096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// BC043694 // GenBank HTC // Mus musculus TSPY-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5249457), with apparent retained intron. // chrX // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000003905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:152337417:152340173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_027543 // RefSeq // Mus musculus G-protein coupled receptor 173 (Gpr173), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528983 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G-protein coupled receptor 173 (Gpr173), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000070316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:152343598:152368704:-1 gene:ENSMUSG00000056679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC043021 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 173, mRNA (cDNA clone MGC:57890 IMAGE:5686241), complete cds. // chrX // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC096520 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 173, mRNA (cDNA clone MGC:106533 IMAGE:5720034), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137840 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:152367016:152368704:-1 gene:ENSMUSG00000056679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// BC057636 // GenBank HTC // Mus musculus G-protein coupled receptor 173, mRNA (cDNA clone IMAGE:2864800), with apparent retained intron. // chrX // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT074405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrX // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000120079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:152544253:152545155:-1 gene:ENSMUSG00000083948 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT074417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:152544976:152551362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_001290684 // RefSeq // Mus musculus shroom family member 2 (Shroom2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NM_001290685 // RefSeq // Mus musculus shroom family member 2 (Shroom2), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 93 // 38 // 14 // 15 // 0 /// NM_001290686 // RefSeq // Mus musculus shroom family member 2 (Shroom2), transcript variant 4, mRNA. // chrX // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// NM_001290687 // RefSeq // Mus musculus shroom family member 2 (Shroom2), transcript variant 5, mRNA. // chrX // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// NM_172441 // RefSeq // Mus musculus shroom family member 2 (Shroom2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000062317 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:152609992:152769465:-1 gene:ENSMUSG00000045180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000101141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:152609509:152769461:-1 gene:ENSMUSG00000045180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000137217 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:152609992:152644543:-1 gene:ENSMUSG00000045180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 93 // 38 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000152746 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:152612528:152673240:-1 gene:ENSMUSG00000045180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// DQ358971 // GenBank // Mus musculus Apxl protein mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 70 // 27 // 28 // 0 /// EF071946 // GenBank // Mus musculus SHROOM2 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:152612528:152695821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000083065 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:152923453:152923760:-1 gene:ENSMUSG00000064999 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chrX // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// NONMMUT074423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
NM_023788 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family H, 1 (Mageh1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000051484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:153036166:153037575:-1 gene:ENSMUSG00000047238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF319981 // GenBank // Mus musculus mage-h1 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC051935 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family H, 1, mRNA (cDNA clone MGC:62177 IMAGE:5714800), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058380 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family H, 1, mRNA (cDNA clone MGC:66895 IMAGE:6820349), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC060080 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family H, 1, mRNA (cDNA clone MGC:64641 IMAGE:5714800), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK000896 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone HEMBA1000910, weakly similar to MELANOMA-ASSOCIATED ANTIGEN B1. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:153036682:153092771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSMUST00000122032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:153403090:153404070:-1 gene:ENSMUSG00000080743 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000082775 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:76274344:76274450:-1 gene:ENSMUSG00000064709 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000083017 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:83285804:83285910:-1 gene:ENSMUSG00000096801 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000083287 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:153576488:153576594:-1 gene:ENSMUSG00000065221 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT047898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT066182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT074431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_175429 // RefSeq // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 12b (Kctd12b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006528778 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 12b (Kctd12b), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000039424 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:153685154:153696280:-1 gene:ENSMUSG00000041633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:153685154:153696391:-1 gene:ENSMUSG00000041633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC064459 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 12b, mRNA (cDNA clone MGC:69858 IMAGE:6821736), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:153688813:153689691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000083714 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:153915116:153915215:-1 gene:ENSMUSG00000065648 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT074440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000120072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:154226501:154227099:-1 gene:ENSMUSG00000083978 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:154226531:154227099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT074443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001256259 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930524N10 gene (4930524N10Rik), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000082357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:154339225:154343392:-1 gene:ENSMUSG00000059663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001037167 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated multipass transmembrane protein 2 (Samt2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000101137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:154575228:154579360:-1 gene:ENSMUSG00000072888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000121013 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:154635551:154639147:1 gene:ENSMUSG00000084367 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrX // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// NM_001256259 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930524N10 gene (4930524N10Rik), mRNA. // chrX // 57 // 97 // 16 // 28 // 0 /// ENSMUST00000082357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:154339225:154343392:-1 gene:ENSMUSG00000059663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 57 // 97 // 16 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:154575306:154640985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 41 // 11 // 12 // 0
NM_020019 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family A, 6 (Magea6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000076986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:154924012:154926115:-1 gene:ENSMUSG00000063728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000112562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:154924012:154935987:-1 gene:ENSMUSG00000063728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC109339 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family A, 6, mRNA (cDNA clone MGC:130207 IMAGE:40052528), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC116902 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family A, 6, mRNA (cDNA clone MGC:151279 IMAGE:40126221), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:154924081:154925058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_020017 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family A, 3 (Magea3), mRNA. // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000079867 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:154948543:154949505:-1 gene:ENSMUSG00000094196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AY438669 // GenBank // Mus musculus MAGEA3 (Magea3) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC119064 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family A, 3, mRNA (cDNA clone MGC:155380 IMAGE:8733813), complete cds. // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC119066 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family A, 3, mRNA (cDNA clone MGC:155382 IMAGE:8733815), complete cds. // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:154948543:154949505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_020017 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family A, 3 (Magea3), mRNA. // chrX // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NM_020020 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family A, 8 (Magea8), mRNA. // chrX // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// XM_006528728 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus melanoma antigen, family A, 8 (Magea8), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000070141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:154985775:154995850:-1 gene:ENSMUSG00000079350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000079867 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:154948543:154949505:-1 gene:ENSMUSG00000094196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// AY438669 // GenBank // Mus musculus MAGEA3 (Magea3) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// BC119064 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family A, 3, mRNA (cDNA clone MGC:155380 IMAGE:8733813), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// BC119066 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family A, 3, mRNA (cDNA clone MGC:155382 IMAGE:8733815), complete cds. // chrX // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:154948543:154949505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 61 // 22 // 22 // 0
NM_020018 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family A, 5 (Magea5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000169540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:155053061:155061553:-1 gene:ENSMUSG00000079349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_006528984 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700042B14 gene (1700042B14Rik), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000076671 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:155124917:155128412:-1 gene:ENSMUSG00000057402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// AK006680 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700042B14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrX // 91 // 58 // 10 // 11 // 0 /// BC100353 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700042B14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117726 IMAGE:30933439), complete cds. // chrX // 100 // 58 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000154056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:155150952:155151311:-1 gene:ENSMUSG00000045694 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XR_406472 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4997 (Gm4997), misc_RNA. // chrX // 60 // 100 // 9 // 15 // 0 /// GENSCAN00000001948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:155150952:155151245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT074451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001291865 // RefSeq // Mus musculus spermidine/spermine N1-acetyl transferase 1 (Sat1), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NM_009121 // RefSeq // Mus musculus spermidine/spermine N1-acetyl transferase 1 (Sat1), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000026318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:155213132:155216449:-1 gene:ENSMUSG00000025283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000112551 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:155213315:155216345:-1 gene:ENSMUSG00000025283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000150046 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:155213306:155216332:-1 gene:ENSMUSG00000025283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000152463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:155213132:155216449:-1 gene:ENSMUSG00000025283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC058696 // GenBank // Mus musculus spermidine/spermine N1-acetyl transferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:61376 IMAGE:6820169), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// L10244 // GenBank // Mouse spermidine/spermine N1-acetyltransferase (SSAT) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000144428 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:155304199:155305749:-1 gene:ENSMUSG00000052157 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:155304397:155338362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000123915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:155336792:155338474:-1 gene:ENSMUSG00000025289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AK165551 // GenBank HTC // Mus musculus B cells CRL-1702 WEHI 231 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430003P20 product:peroxiredoxin 4, full insert sequence. // chrX // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// NM_016764 // RefSeq // Mus musculus peroxiredoxin 4 (Prdx4), mRNA. // chrX // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// XM_006528909 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peroxiredoxin 4 (Prdx4), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// ENSMUST00000026328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:155323918:155338467:-1 gene:ENSMUSG00000025289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// BC003349 // GenBank // Mus musculus peroxiredoxin 4, mRNA (cDNA clone MGC:5869 IMAGE:3481827), complete cds. // chrX // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// BC019578 // GenBank // Mus musculus peroxiredoxin 4, mRNA (cDNA clone MGC:30277 IMAGE:2654429), complete cds. // chrX // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// U96746 // GenBank // Mus musculus antioxidant enzyme AOE372 mRNA, complete cds. // chrX // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// XM_006528910 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peroxiredoxin 4 (Prdx4), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// ENSMUST00000130349 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:155328446:155340754:-1 gene:ENSMUSG00000025289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000001955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:155304397:155338362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_001093750 // RefSeq // Mus musculus patched domain containing 1 (Ptchd1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001093750 // RefSeq // Mus musculus patched domain containing 1 (Ptchd1), mRNA. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006528793 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus patched domain containing 1 (Ptchd1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006528794 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus patched domain containing 1 (Ptchd1), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000038665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:155573455:155623325:-1 gene:ENSMUSG00000041552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC116312 // GenBank // Mus musculus patched domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:143952 IMAGE:40095445), complete cds. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC116313 // GenBank // Mus musculus patched domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:143953 IMAGE:40095446), complete cds. // chrX // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170236 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:155573541:155623118:-1 gene:ENSMUSG00000041552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000001937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:155573541:155606623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000001962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:155621654:155908514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
ENSMUST00000082543 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:156455999:156456095:-1 gene:ENSMUSG00000064477 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT074470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000118798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:156679335:156679803:-1 gene:ENSMUSG00000083573 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT074471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_011077 // RefSeq // Mus musculus phosphate regulating endopeptidase homolog, X-linked (Phex), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000079945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:157162075:157415286:-1 gene:ENSMUSG00000057457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000138396 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:157220405:157415312:-1 gene:ENSMUSG00000057457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 67 // 32 // 32 // 0 /// BC137925 // GenBank // Mus musculus phosphate regulating gene with homologies to endopeptidases on the X chromosome (hypophosphatemia, vitamin D resistant rickets), mRNA (cDNA clone MGC:169549 IMAGE:8860944), complete cds. // chrX // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// BC137926 // GenBank // Mus musculus phosphate regulating gene with homologies to endopeptidases on the X chromosome (hypophosphatemia, vitamin D resistant rickets), mRNA (cDNA clone MGC:169550 IMAGE:8860945), complete cds. // chrX // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// EF194891 // GenBank // Mus musculus PHEX (Phex) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// U49908 // GenBank // Mus musculus X-linked hypophosphatemia protein (Hyp) mRNA, complete cds. // chrX // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// U73910 // GenBank // Mus musculus metalloendopeptidase homolog (Phex) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// U75646 // GenBank // Mus musculus Pex protein mRNA, complete cds. // chrX // 98 // 92 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000048515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:157149910:157414732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 85 // 85 // 41 // 48 // 1
ENSMUST00000122049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:157612689:157613121:-1 gene:ENSMUSG00000081222 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT074485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000118619 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:157650704:157651299:-1 gene:ENSMUSG00000081505 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_177751 // RefSeq // Mus musculus connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2 (Cnksr2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000026750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:157821436:158043294:-1 gene:ENSMUSG00000025658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AK141544 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630016C23 product:connector enhancer of KSR2, full insert sequence. // chrX // 92 // 59 // 24 // 26 // 0 /// BC043093 // GenBank // Mus musculus connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2, mRNA (cDNA clone MGC:58012 IMAGE:6405389), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC060716 // GenBank // Mus musculus connector enhancer of kinase suppressor of Ras 2, mRNA (cDNA clone MGC:67575 IMAGE:6405389), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000112513 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:157832743:158043294:-1 gene:ENSMUSG00000025658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 91 // 91 // 40 // 44 // 1 /// GENSCAN00000048517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:157945156:158026980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000048520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:157823621:157927029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 55 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000120855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:159584783:159585058:-1 gene:ENSMUSG00000082693 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000021902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:159584783:159628215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_008810 // RefSeq // Mus musculus pyruvate dehydrogenase E1 alpha 1 (Pdha1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000033662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:160122209:160138413:-1 gene:ENSMUSG00000031299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000126440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:160129288:160138309:-1 gene:ENSMUSG00000031299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// BC007142 // GenBank // Mus musculus pyruvate dehydrogenase E1 alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:6172 IMAGE:3600605), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M76727 // GenBank // Mouse pyruvate dehydrogenase (pdha-1) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000156531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:160127291:160128965:-1 gene:ENSMUSG00000031299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000022248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:160123783:160225111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
ENSMUST00000118775 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:160269701:160269963:-1 gene:ENSMUSG00000082500 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:160239987:160269963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT074542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_011147 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase with EF hand calcium-binding domain 1 (Ppef1), mRNA. // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006528830 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase with EF hand calcium-binding domain 1 (Ppef1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000071204 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:160623094:160719972:-1 gene:ENSMUSG00000062168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000135856 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:160641864:160735765:-1 gene:ENSMUSG00000062168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AK141939 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130069D01 product:similar to Serine/threonine protein phosphatase with EF-hands-1 (EC 3.1.3.16) (PPEF-1) (Protein phosphatase with EF calcium-binding domain) (PPEF) (DRES10) (Fragment) [Mus musculus], full insert sequence. // chrX // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000022247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:160623504:160720682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001024624 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase-like 5 (Cdkl5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000087104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:160784308:160994702:-1 gene:ENSMUSG00000031292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000022254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:160808305:160903934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
NM_001001496 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, alpha 6 (Gja6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000069417 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:160902116:160907052:-1 gene:ENSMUSG00000055691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC117760 // GenBank // Mus musculus gap junction protein, alpha 6, mRNA (cDNA clone MGC:143563 IMAGE:40090837), complete cds. // chrX // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000120823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:161485567:161486485:-1 gene:ENSMUSG00000081845 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:161367781:161486337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_001081052 // RefSeq // Mus musculus Nance-Horan syndrome (human) (Nhs), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001290526 // RefSeq // Mus musculus Nance-Horan syndrome (human) (Nhs), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006528765 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Nance-Horan syndrome (human) (Nhs), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006528766 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Nance-Horan syndrome (human) (Nhs), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000081569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:161836815:162159388:-1 gene:ENSMUSG00000059493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000087085 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:161833296:162159730:-1 gene:ENSMUSG00000059493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC147632 // GenBank // Mus musculus Nance-Horan syndrome (human), mRNA (cDNA clone MGC:182728 IMAGE:9056622), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC158016 // GenBank // Mus musculus Nance-Horan syndrome (human), mRNA (cDNA clone MGC:189822 IMAGE:9007322), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC172134 // GenBank // Mus musculus Nance-Horan syndrome (human), mRNA (cDNA clone MGC:198839 IMAGE:9054804), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:161836815:161885578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 66 // 19 // 19 // 0