NM_001005227 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1200 (Olfr1200), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000099811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:88767303:88768313:-1 gene:ENSMUSG00000075115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_146778 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1208 (Olfr1208), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:88896669:88897595:-1 gene:ENSMUSG00000075114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150697 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1208, mRNA (cDNA clone MGC:183608 IMAGE:9087608), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:88896669:88897595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146461 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1209 (Olfr1209), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099809 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:88909459:88910391:-1 gene:ENSMUSG00000075113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104269 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1209, mRNA (cDNA clone MGC:129175 IMAGE:40040821), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:88909459:88915071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001011804 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1211 (Olfr1211), mRNA. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000099808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:88929378:88930313:-1 gene:ENSMUSG00000075112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:88929378:88930076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
NM_146898 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1213 (Olfr1213), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000099806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:88972954:88973889:-1 gene:ENSMUSG00000089751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000168169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:88972954:88980257:-1 gene:ENSMUSG00000075111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000089751 // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000131574 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:88973670:88980251:-1 gene:ENSMUSG00000075111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// ENSMUST00000144908 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:88973453:88980227:-1 gene:ENSMUSG00000075111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
NM_146897 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1214 (Olfr1214), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000099804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:88987265:88988200:-1 gene:ENSMUSG00000075110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_146459 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1215 (Olfr1215), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127970 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1215, mRNA (cDNA clone MGC:157523 IMAGE:40135109), complete cds. // chr2 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89001348:89002286:-1 gene:ENSMUSG00000100016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146893 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1216 (Olfr1216), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099800 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89013127:89014062:-1 gene:ENSMUSG00000075107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89013127:89023881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_146901 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1217 (Olfr1217), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000099799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89023087:89024001:-1 gene:ENSMUSG00000101391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000075106 // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC132097 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1217, mRNA (cDNA clone MGC:163728 IMAGE:40130374), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC138391 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1217, mRNA (cDNA clone MGC:170016 IMAGE:8861411), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_146818 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1218 (Olfr1218), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89054489:89055424:-1 gene:ENSMUSG00000075105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89054489:89055283:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_146899 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1219 (Olfr1219), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89074154:89075089:-1 gene:ENSMUSG00000075104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89074154:89074969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146900 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1220 (Olfr1220), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099789 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89096990:89097925:-1 gene:ENSMUSG00000101480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000075096 // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC125363 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1220, mRNA (cDNA clone MGC:159066 IMAGE:40129878), complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC131900 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1220, mRNA (cDNA clone MGC:163531 IMAGE:40130177), complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89096990:89112390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_146902 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1221 (Olfr1221), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000099795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89111575:89112510:-1 gene:ENSMUSG00000075102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89096990:89112390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 59 // 74 // 10 // 17 // 0
NM_001011860 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1222 (Olfr1222), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000099794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:89124794:89125729:-1 gene:ENSMUSG00000075101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000137595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:89125079:89125731:-1 gene:ENSMUSG00000075101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NM_146892 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1223 (Olfr1223), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89144086:89145021:-1 gene:ENSMUSG00000075100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000099792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89156238:89157173:-1 gene:ENSMUSG00000075099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000043302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89156238:89157173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_146891 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1225 (Olfr1225), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145849 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1225, mRNA (cDNA clone MGC:175736 IMAGE:40131152), complete cds. // chr2 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89170275:89171210:-1 gene:ENSMUSG00000101918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89170275:89171090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146967 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1226 (Olfr1226), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000099790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89193100:89194032:-1 gene:ENSMUSG00000075097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC106781 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1226, mRNA (cDNA clone MGC:123542 IMAGE:40040933), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC106782 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1226, mRNA (cDNA clone MGC:123543 IMAGE:40040934), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000043321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89181728:89193912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_146971 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1228 (Olfr1228), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125451 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1228, mRNA (cDNA clone MGC:159154 IMAGE:40129966), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125453 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1228, mRNA (cDNA clone MGC:159156 IMAGE:40129968), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89248721:89249692:-1 gene:ENSMUSG00000099486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011761 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1229 (Olfr1229), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000099788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:89282139:89283157:-1 gene:ENSMUSG00000075095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000111549 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:89282196:89287954:-1 gene:ENSMUSG00000075095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC147797 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1229, mRNA (cDNA clone MGC:182900 IMAGE:9087514), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_146789 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1230 (Olfr1230), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89296351:89297268:-1 gene:ENSMUSG00000075094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC108937 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1230, mRNA (cDNA clone MGC:123493 IMAGE:40040283), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC108938 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1230, mRNA (cDNA clone MGC:123494 IMAGE:40040284), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89296351:89297268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146454 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1231 (Olfr1231), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89302649:89303590:-1 gene:ENSMUSG00000075093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89302649:89326070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_146323 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1232 (Olfr1232), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89325243:89326178:-1 gene:ENSMUSG00000075092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89302649:89326070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_146972 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1233 (Olfr1233), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099784 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89339383:89340300:-1 gene:ENSMUSG00000075091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC119149 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1233, mRNA (cDNA clone MGC:155465 IMAGE:8733898), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC119151 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1233, mRNA (cDNA clone MGC:155467 IMAGE:8733900), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89338535:89340300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0
NM_146973 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1234 (Olfr1234), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:89362483:89363427:-1 gene:ENSMUSG00000075090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:89362483:89364861:-1 gene:ENSMUSG00000075090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127132 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1234, mRNA (cDNA clone MGC:156328 IMAGE:40042541), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127133 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1234, mRNA (cDNA clone MGC:156329 IMAGE:40042542), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89362483:89363427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146790 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1238 (Olfr1238), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000099781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89406130:89407077:-1 gene:ENSMUSG00000075089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC128571 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1238, mRNA (cDNA clone MGC:157565 IMAGE:40135708), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89406130:89406969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0
NM_146970 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1239 (Olfr1239), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89417494:89418411:-1 gene:ENSMUSG00000075088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89417494:89418411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146808 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1240 (Olfr1240), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137782 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1240, mRNA (cDNA clone MGC:169406 IMAGE:8860801), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89439333:89440277:-1 gene:ENSMUSG00000099909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89439333:89440169:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_146455 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1241 (Olfr1241), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89482189:89483133:-1 gene:ENSMUSG00000075086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146968 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1242 (Olfr1242), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:89493294:89494346:-1 gene:ENSMUSG00000075085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111540 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:89493390:89498213:-1 gene:ENSMUSG00000075085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120865 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1242, mRNA (cDNA clone MGC:156102 IMAGE:40129788), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125386 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1242, mRNA (cDNA clone MGC:159089 IMAGE:40129901), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89493390:89494310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146969 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1243 (Olfr1243), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89527491:89528408:-1 gene:ENSMUSG00000075084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146788 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1245 (Olfr1245), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000099766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89574801:89575724:-1 gene:ENSMUSG00000100601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000075076 // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC138384 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1245, mRNA (cDNA clone MGC:170009 IMAGE:8861404), complete cds. // chr2 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// BC138385 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1245, mRNA (cDNA clone MGC:170010 IMAGE:8861405), complete cds. // chr2 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
NM_146792 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1246 (Olfr1246), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC138403 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1246, mRNA (cDNA clone MGC:170028 IMAGE:8861423), complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC138404 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1246, mRNA (cDNA clone MGC:170029 IMAGE:8861424), complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000191053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89590169:89591113:-1 gene:ENSMUSG00000100828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_146966 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1247 (Olfr1247), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006499573 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 1247 (Olfr1247), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000099771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:89609156:89610100:-1 gene:ENSMUSG00000075081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000111532 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:89609156:89614022:-1 gene:ENSMUSG00000075081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC125540 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1247, mRNA (cDNA clone MGC:159243 IMAGE:40130055), complete cds. // chr2 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// BC132105 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1247, mRNA (cDNA clone MGC:163736 IMAGE:40130382), complete cds. // chr2 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0
NM_146791 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1248 (Olfr1248), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC150718 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1248, mRNA (cDNA clone MGC:183629 IMAGE:9087629), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000186710 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89617267:89618190:-1 gene:ENSMUSG00000099356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000004273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89575352:89752718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001011796 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1249 (Olfr1249), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000099769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89629940:89630896:-1 gene:ENSMUSG00000075079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001011529 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1251 (Olfr1251), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC147159 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1251, mRNA (cDNA clone MGC:182580 IMAGE:9056474), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC147160 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1251, mRNA (cDNA clone MGC:182279 IMAGE:9056173), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000188085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89666928:89667884:-1 gene:ENSMUSG00000100323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_207568 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1252 (Olfr1252), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC125497 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1252, mRNA (cDNA clone MGC:159200 IMAGE:40130012), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC125499 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1252, mRNA (cDNA clone MGC:159202 IMAGE:40130014), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000187990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89721165:89722109:-1 gene:ENSMUSG00000100224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000004273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89575352:89752718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_146373 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1253 (Olfr1253), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000099765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89751870:89752826:-1 gene:ENSMUSG00000075075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_146476 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1254 (Olfr1254), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000099764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:89788406:89789350:-1 gene:ENSMUSG00000075074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000111523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:89788406:89793170:-1 gene:ENSMUSG00000075074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89788406:89789242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_146983 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1256 (Olfr1256), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000099763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:89835023:89835943:-1 gene:ENSMUSG00000075073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000111520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:89835023:89841133:-1 gene:ENSMUSG00000075073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89825380:89835598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 46 // 10 // 11 // 0
NM_010990 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 48 (Olfr48), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89844066:89844971:-1 gene:ENSMUSG00000075072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89844066:89844971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146341 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1259 (Olfr1259), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000090695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:89943184:89944113:-1 gene:ENSMUSG00000068806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:89943184:89944113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021368 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1264 (Olfr1264), mRNA. // chr2 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:90021138:90022064:-1 gene:ENSMUSG00000075069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90021138:90021944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_020515 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 140 (Olfr140), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:90051414:90052322:-1 gene:ENSMUSG00000075068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111506 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:90051414:90063594:-1 gene:ENSMUSG00000075068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90051414:90052202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_146342 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1269 (Olfr1269), mRNA. // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:90118667:90119596:-1 gene:ENSMUSG00000075067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000118957 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:90085530:90086459:-1 gene:ENSMUSG00000084336 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116956 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1269, mRNA (cDNA clone MGC:151333 IMAGE:40126275), complete cds. // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC116958 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1269, mRNA (cDNA clone MGC:151335 IMAGE:40126277), complete cds. // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NM_146343 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1265 (Olfr1265), mRNA. // chr2 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// ENSMUST00000080311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:90036921:90037850:1 gene:ENSMUSG00000059910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90118667:90139137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90085530:90086240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90035591:90037850:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0
ENSMUST00000117787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:90110468:90111391:-1 gene:ENSMUSG00000082574 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90087153:90111387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
NM_146342 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1269 (Olfr1269), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000099756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:90118667:90119596:-1 gene:ENSMUSG00000075067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC116956 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1269, mRNA (cDNA clone MGC:151333 IMAGE:40126275), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC116958 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1269, mRNA (cDNA clone MGC:151335 IMAGE:40126277), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90118667:90139137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_010980 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 32 (Olfr32), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006498908 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 32 (Olfr32), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000099755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:90138211:90139137:-1 gene:ENSMUSG00000075066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC119404 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 32, mRNA (cDNA clone MGC:155720 IMAGE:8734153), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC120653 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 32, mRNA (cDNA clone MGC:155890 IMAGE:40129576), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000004274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90118667:90139137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_146985 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1270 (Olfr1270), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:90149090:90150004:-1 gene:ENSMUSG00000075065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC119113 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1270, mRNA (cDNA clone MGC:155429 IMAGE:8733862), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC119115 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1270, mRNA (cDNA clone MGC:155431 IMAGE:8733864), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90149090:90150004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_146984 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 142 (Olfr142), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099752 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:90252069:90252986:-1 gene:ENSMUSG00000075063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90252069:90252986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146793 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1271 (Olfr1271), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000099751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:90265511:90266428:-1 gene:ENSMUSG00000075062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC106779 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1271, mRNA (cDNA clone MGC:123497 IMAGE:40040295), complete cds. // chr2 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// BC106780 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1271, mRNA (cDNA clone MGC:123514 IMAGE:40040533), complete cds. // chr2 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000004282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90265511:90266428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_146980 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1272 (Olfr1272), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:90281647:90282573:-1 gene:ENSMUSG00000075061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90281647:90282573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146975 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1273, pseudogene (Olfr1273-ps), mRNA. // chr2 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// ENSMUST00000117141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:90295935:90296859:-1 gene:ENSMUSG00000080809 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC104266 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1273, mRNA (cDNA clone MGC:129172 IMAGE:40040402), complete cds. // chr2 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// BC104267 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1273, mRNA (cDNA clone MGC:129173 IMAGE:40040403), complete cds. // chr2 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// BC126917 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1273, mRNA (cDNA clone MGC:140853 IMAGE:40040394), complete cds. // chr2 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0 /// GENSCAN00000004270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90295963:90296859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001135657 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, J (Ptprj), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NM_008982 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, J (Ptprj), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006543667 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta-like (LOC102641972), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000111493 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:90432889:90471336:-1 gene:ENSMUSG00000025314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000111495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:2:90429756:90479170:-1 gene:ENSMUSG00000025314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000168621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:90432889:90580647:-1 gene:ENSMUSG00000025314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY038891 // GenBank // Mus musculus PTPRJ mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AY039232 // GenBank // Mus musculus PTPRJ mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// D45212 // GenBank // Mus musculus mRNA for receptor-type tyrosine phosphatase, complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// DQ133576 // GenBank // Mus musculus PTPRJ (Ptprj) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000004275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:90424741:90478905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// D83204 // GenBank // Mus musculus mRNA, one isoform of PTP-RL9. // chr2 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1
XM_205095 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 13777 (Gm13777), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000118208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:91030778:91031122:-1 gene:ENSMUSG00000082108 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:91030778:91031122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT038431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_010168 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor II (F2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000028681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:91625320:91636414:-1 gene:ENSMUSG00000027249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000111335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:91625329:91636407:-1 gene:ENSMUSG00000027249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC013662 // GenBank // Mus musculus coagulation factor II, mRNA (cDNA clone MGC:18605 IMAGE:4196988), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// X52308 // GenBank // Mouse mRNA for prothrombin. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000153182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:91631173:91636395:-1 gene:ENSMUSG00000027249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// AK050056 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730009C05 product:coagulation factor II, full insert sequence. // chr2 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:91625433:91636396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001033451 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 408 (Zfp408), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099714 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:91643669:91649779:-1 gene:ENSMUSG00000075040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000111333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:91643688:91649791:-1 gene:ENSMUSG00000075040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000127702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:91648016:91649743:-1 gene:ENSMUSG00000075040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000145582 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:91647668:91649759:-1 gene:ENSMUSG00000075040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000155045 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:91646278:91648235:-1 gene:ENSMUSG00000075040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC145603 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 408, mRNA (cDNA clone MGC:179177 IMAGE:9054169), complete cds. // chr2 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// BC145604 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054170. // chr2 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000048863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:91644975:91649749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT038485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000099710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:91920528:91920928:-1 gene:ENSMUSG00000075036 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK138202 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230032E15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT038505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006498539 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus diacylglycerol kinase zeta (Dgkz), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// ENSMUST00000099709 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:91932824:91975864:-1 gene:ENSMUSG00000040479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// AK155719 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730209L11 product:hypothetical Glycine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:91930090:91981027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0
NM_011957 // RefSeq // Mus musculus cAMP responsive element binding protein 3-like 1 (Creb3l1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000028663 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:91982328:92024502:-1 gene:ENSMUSG00000027230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB017614 // GenBank // Mus musculus mRNA for OASIS protein, complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC016447 // GenBank // Mus musculus cAMP responsive element binding protein 3-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:25246 IMAGE:4921584), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:91982971:92002257:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_009963 // RefSeq // Mus musculus cryptochrome 2 (photolyase-like) (Cry2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000090559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:92403646:92434043:-1 gene:ENSMUSG00000068742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000111278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:92411260:92434036:-1 gene:ENSMUSG00000068742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AF156987 // GenBank // Mus musculus cryptochrome 2 (Cry2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AK041696 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630030K06 product:cryptochrome 2 (photolyase-like), full insert sequence. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC054794 // GenBank // Mus musculus cryptochrome 2 (photolyase-like), mRNA (cDNA clone MGC:65642 IMAGE:6834104), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC066799 // GenBank // Mus musculus cryptochrome 2 (photolyase-like), mRNA (cDNA clone MGC:76472 IMAGE:30103169), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000048861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:92411628:92434023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_211358 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member C1 (Slc35c1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000067631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:92452764:92459794:-1 gene:ENSMUSG00000049922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC031814 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member C1, mRNA (cDNA clone MGC:18816 IMAGE:4196818), complete cds. // chr2 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC116736 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member C1, mRNA (cDNA clone MGC:151113 IMAGE:40126055), complete cds. // chr2 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// BC119128 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member C1, mRNA (cDNA clone MGC:155444 IMAGE:8733877), complete cds. // chr2 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// NM_145832 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member C1 (Slc35c1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// ENSMUST00000125276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:92452767:92460538:-1 gene:ENSMUSG00000049922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// ENSMUST00000136718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:92458686:92459709:-1 gene:ENSMUSG00000049922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000048856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:92454215:92459198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0
NM_001177536 // RefSeq // Mus musculus PR domain containing 11 (Prdm11), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:92965151:93045571:-1 gene:ENSMUSG00000075028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:93012627:93046167:-1 gene:ENSMUSG00000075028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000178666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:92974906:93046144:-1 gene:ENSMUSG00000075028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:92984707:93046053:-1 gene:ENSMUSG00000075028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000130441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:93009973:93013910:-1 gene:ENSMUSG00000075028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK078754 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030443D09 product:PR-DOMAIN CONTAINING PROTEIN 11 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:92960016:93014954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_183180 // RefSeq // Mus musculus tetraspanin 18 (Tspan18), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006499474 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetraspanin 18 (Tspan18), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// XM_006499475 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetraspanin 18 (Tspan18), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// XM_006499476 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetraspanin 18 (Tspan18), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// XM_006499477 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetraspanin 18 (Tspan18), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000028646 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:93204247:93227786:-1 gene:ENSMUSG00000027217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:93201760:93334487:-1 gene:ENSMUSG00000027217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AK032765 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720430O15 product:CDNA FLJ14809 FIS, CLONE NT2RP4001822, WEAKLY SIMILAR TO PLATELET-ENDOTHELIAL TETRASPAN ANTIGEN 3 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// BC052169 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 18, mRNA (cDNA clone MGC:59405 IMAGE:6335221), complete cds. // chr2 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// GENSCAN00000046461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:93204375:93220231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0
NM_001033452 // RefSeq // Mus musculus 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase (non-functional)-like (Accsl), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000099690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:93855361:93869157:-1 gene:ENSMUSG00000075023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK142866 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930032I15 product:hypothetical 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase/Aminotransferase, class I and II containing protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AK163963 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330012K05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC141227 // GenBank // Mus musculus 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase homolog (Arabidopsis)(non-functional)-like, mRNA (cDNA clone MGC:176188 IMAGE:9055839), complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC145552 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054116. // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000129248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:93861778:93869157:-1 gene:ENSMUSG00000075023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// ENSMUST00000141561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:93861064:93864816:-1 gene:ENSMUSG00000075023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000005281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:93788688:93882889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000121653 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:93940299:93940878:-1 gene:ENSMUSG00000083009 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:93940299:93942232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001145034 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13889 (Gm13889), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099689 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:93955816:93957201:-1 gene:ENSMUSG00000087006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000075021 // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148314 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:93955810:93957049:-1 gene:ENSMUSG00000087006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:93956387:94089500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0
NR_029752 // RefSeq // Mus musculus microRNA 129-2 (Mir129-2), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000083577 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:94241364:94241453:-1 gene:ENSMUSG00000065511 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-mir-129-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000585 Mus musculus miR-129-2 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT038690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XR_374808 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E530001K10 gene (E530001K10Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000129661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:94251879:94264739:-1 gene:ENSMUSG00000075020 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK140370 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B530003A21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000134563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:94260966:94264758:-1 gene:ENSMUSG00000075020 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// AK089118 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E530001K10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XR_374809 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E530001K10 gene (E530001K10Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// XR_374810 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E530001K10 gene (E530001K10Rik), transcript variant X4, misc_RNA. // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// XR_374811 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E530001K10 gene (E530001K10Rik), transcript variant X5, misc_RNA. // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT038691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT038693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONMMUT038692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NR_030431 // RefSeq // Mus musculus microRNA 670 (Mir670), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102380 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:94261300:94261399:-1 gene:ENSMUSG00000076335 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-670 // miRBase Micro RNA Database // MI0004295 Mus musculus miR-670 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT038694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_183106 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 17 (Ttc17), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006500312 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 17 (Ttc17), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000055081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:94300767:94366597:-1 gene:ENSMUSG00000027194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000094801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:94327937:94406688:-1 gene:ENSMUSG00000027194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000111237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:94300767:94406679:-1 gene:ENSMUSG00000027194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000111238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:94300767:94406689:-1 gene:ENSMUSG00000027194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:94292141:94382819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
AK089391 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730021A14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_183106 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 17 (Ttc17), mRNA. // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// XM_006500312 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 17 (Ttc17), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000094801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:94327937:94406688:-1 gene:ENSMUSG00000027194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000111237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:94300767:94406679:-1 gene:ENSMUSG00000027194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000111238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:94300767:94406689:-1 gene:ENSMUSG00000027194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000005285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:94406231:94437992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_007466 // RefSeq // Mus musculus apoptosis inhibitor 5 (Api5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000028617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:94411682:94438136:-1 gene:ENSMUSG00000027193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC007133 // GenBank // Mus musculus apoptosis inhibitor 5, mRNA (cDNA clone MGC:5830 IMAGE:3594358), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// U35846 // GenBank // Mus musculus mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000144390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:94418263:94437968:-1 gene:ENSMUSG00000027193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// GENSCAN00000005285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:94406231:94437992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1
ENSMUST00000099683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:98666547:98667301:-1 gene:ENSMUSG00000075014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// AK172117 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830038K21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr2 // 56 // 100 // 10 // 18 // 0 /// AK089567 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830002E14 product:hypothetical Phenylalanine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr2 // 44 // 100 // 8 // 18 // 0
ENSMUST00000160037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:101562124:101649532:-1 gene:ENSMUSG00000027165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ112091 // GenBank // Mus musculus Rag1/Rag2/Nwc fusion protein (Rag1/Rag2/Nwc fusion) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009019 // RefSeq // Mus musculus recombination activating gene 1 (Rag1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000078494 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:101638282:101649501:-1 gene:ENSMUSG00000061311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK038144 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130081L05 product:recombination activating gene 1, full insert sequence. // chr2 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC138342 // GenBank // Mus musculus recombination activating gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:169967 IMAGE:8861362), complete cds. // chr2 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// M29475 // GenBank // Mouse recombination activating protein (RAG-1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:101641673:101644795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT038778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001290784 // RefSeq // Mus musculus low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 (Ldlrad3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_178886 // RefSeq // Mus musculus low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 (Ldlrad3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:101950203:102186385:-1 gene:ENSMUSG00000048058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:101950203:102186358:-1 gene:ENSMUSG00000048058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC138177 // GenBank // Mus musculus low density lipoprotein receptor class A domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:169801 IMAGE:8861196), complete cds. // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC138178 // GenBank // Mus musculus low density lipoprotein receptor class A domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:169802 IMAGE:8861197), complete cds. // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC145174 // GenBank // Mus musculus low density lipoprotein receptor class A domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:178733 IMAGE:9053725), complete cds. // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AK136473 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030613C17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000036463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:102053408:102119385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_020267 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 44 (Trim44), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102573 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:102300119:102400900:-1 gene:ENSMUSG00000027189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000144110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:102357443:102407828:-1 gene:ENSMUSG00000027189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000152929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:102304494:102400257:-1 gene:ENSMUSG00000027189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC039979 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 44, mRNA (cDNA clone IMAGE:4913543), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC045602 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 44, mRNA (cDNA clone IMAGE:4913543), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC098369 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 44, mRNA (cDNA clone MGC:102054 IMAGE:6830438), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:102304477:102400684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_010218 // RefSeq // Mus musculus four jointed box 1 (Drosophila) (Fjx1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099678 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:102449366:102452499:-1 gene:ENSMUSG00000075012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC051990 // GenBank // Mus musculus four jointed box 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:62298 IMAGE:5687527), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:102450236:102451588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_175094 // RefSeq // Mus musculus pyruvate dehydrogenase complex, component X (Pdhx), mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000011058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:103021075:103073513:-1 gene:ENSMUSG00000010914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000132449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:103033277:103073335:-1 gene:ENSMUSG00000010914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// BC061231 // GenBank // Mus musculus pyruvate dehydrogenase complex, component X, mRNA (cDNA clone MGC:74380 IMAGE:6532760), complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000111183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:103039619:103073462:-1 gene:ENSMUSG00000010914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// AK046020 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230334B18 product:similar to PYRUVATE DEHYDROGENASE PROTEIN X COMPONENT, MITOCHONDRIAL PRECURSOR (DIHYDROLIPOAMIDE DEHYDROGENASE-BINDING PROTEIN OF PYRUVATE DEHYDROGENASE COMPLEX) (E3-BINDING PROTEIN) (E3BP) (PROX) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000019108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:103022011:103042540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000153797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:103383979:103389042:-1 gene:ENSMUSG00000070794 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016548 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC016548, mRNA (cDNA clone IMAGE:3489202). // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000144657 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:103377643:103389044:-1 gene:ENSMUSG00000070794 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// BC096650 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:1400407. // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT038846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT038845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_009804 // RefSeq // Mus musculus catalase (Cat), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000028610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:103453849:103485160:-1 gene:ENSMUSG00000027187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY040626 // GenBank // Mus musculus mutant catalase (Cas1) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// BC013447 // GenBank // Mus musculus catalase, mRNA (cDNA clone MGC:18464 IMAGE:4241333), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// L25069 // GenBank // Mouse catalase mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 94 // 26 // 29 // 0 /// M62897 // GenBank // Mouse catalase mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:103454595:103485125:-1 gene:ENSMUSG00000027187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// GENSCAN00000019104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:103454756:103485640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000118308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:103843415:103843656:-1 gene:ENSMUSG00000082845 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 82 // 89 // 14 // 17 // 0 /// NONMMUT038877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 82 // 89 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000025409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:103843437:103881351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 69 // 84 // 11 // 16 // 0
ENSMUST00000056170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:2:103992495:104028308:-1 gene:ENSMUSG00000046085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK076716 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930420A19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XR_374842 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4931422A03 gene (4931422A03Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// XR_374845 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4931422A03 gene (4931422A03Rik), transcript variant X4, misc_RNA. // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// XR_400072 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4931422A03 gene (4931422A03Rik), transcript variant X4, misc_RNA. // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSMUST00000138867 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104025882:104028361:-1 gene:ENSMUSG00000046085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// AK016472 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931422A03 product:RIKEN cDNA 4931422A03 gene, full insert sequence. // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONMMUT038886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001033347 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D430041D05 gene (D430041D05Rik), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:104143073:104410334:-1 gene:ENSMUSG00000068373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104143073:104257400:-1 gene:ENSMUSG00000068373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT038890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000156278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104184987:104241183:-1 gene:ENSMUSG00000068373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK047363 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930053E03 product:weakly similar to G2 PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NM_001033347 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D430041D05 gene (D430041D05Rik), mRNA. // chr2 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENSMUST00000089726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:104143073:104410334:-1 gene:ENSMUSG00000068373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENSMUST00000141159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104143073:104257400:-1 gene:ENSMUSG00000068373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENSMUST00000136156 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104147047:104230568:-1 gene:ENSMUSG00000068373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// ENSMUST00000149165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104207666:104257984:-1 gene:ENSMUSG00000068373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000025397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:104148781:104257309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
AK136931 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330195I24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_177190 // RefSeq // Mus musculus t-complex 11 like 1 (Tcp11l1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000028597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:104679980:104712162:-1 gene:ENSMUSG00000027175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000111118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104678017:104712156:-1 gene:ENSMUSG00000027175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000137428 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104694559:104706467:-1 gene:ENSMUSG00000027175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC116926 // GenBank // Mus musculus t-complex 11 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:151303 IMAGE:40126245), complete cds. // chr2 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// BC116932 // GenBank // Mus musculus t-complex 11 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:151309 IMAGE:40126251), complete cds. // chr2 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000129792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104684780:104712169:-1 gene:ENSMUSG00000027175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// AK047525 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930083D07 product:weakly similar to CDNA FLJ11336 FIS, CLONE PLACE1010661, WEAKLY SIMILAR TO TESTIS-SPECIFIC PROTEIN PBS13 (DJ85M6.3) (SIMILAR TO TESTIS-SPECIFIC PROTEIN PBS13) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// GENSCAN00000028829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:104681565:104706518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_001033768 // RefSeq // Mus musculus protein (peptidyl-prolyl cis/trans isomerase) NIMA-interacting 1, retrogene 1 (Pin1rt1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006499488 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein (peptidyl-prolyl cis/trans isomerase) NIMA-interacting 1, retrogene 1 (Pin1rt1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000099659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:104713926:104716379:-1 gene:ENSMUSG00000074997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC147362 // GenBank // Mus musculus peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:182526 IMAGE:9056420), complete cds. // chr2 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// BC147363 // GenBank // Mus musculus peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:182545 IMAGE:9056439), complete cds. // chr2 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0
NM_144804 // RefSeq // Mus musculus DEP domain containing 7 (Depdc7), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000028595 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:104721784:104742878:-1 gene:ENSMUSG00000027173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC013499 // GenBank // Mus musculus DEP domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:19163 IMAGE:4222591), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:104721925:104732360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001123327 // RefSeq // Mus musculus glutamine and serine rich 1 (Qser1), mRNA. // chr2 // 100 // 98 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000117237 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:2:104754795:104816696:-1 gene:ENSMUSG00000074994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 53 // 53 // 0 /// GENSCAN00000028814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:104758465:104816760:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 50 // 50 // 0
NM_001123327 // RefSeq // Mus musculus glutamine and serine rich 1 (Qser1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117237 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:2:104754795:104816696:-1 gene:ENSMUSG00000074994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:104758465:104816760:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178695 // RefSeq // Mus musculus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 4 (transmembrane) (Prrg4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000028593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:104830741:104849876:-1 gene:ENSMUSG00000027171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK166405 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930010H19 product:Similar to transmembrane gamma-carboxyglutamic acid protein 4 precursor, full insert sequence. // chr2 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC099390 // GenBank // Mus musculus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 4 (transmembrane), mRNA (cDNA clone MGC:117538 IMAGE:30715383), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC115470 // GenBank // Mus musculus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 4 (transmembrane), mRNA (cDNA clone MGC:144278 IMAGE:40100436), complete cds. // chr2 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC151011 // GenBank // Mus musculus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 4 (transmembrane), mRNA (cDNA clone MGC:183924 IMAGE:9087924), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC151019 // GenBank // Mus musculus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 4 (transmembrane), mRNA (cDNA clone MGC:183932 IMAGE:9087932), complete cds. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000126824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104839335:104849493:-1 gene:ENSMUSG00000027171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000028824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:104830401:104853219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
AK137372 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630033E07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_145380 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit M (Eif3m), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000028592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:104999656:105017080:-1 gene:ENSMUSG00000027170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000111110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104999689:105017043:-1 gene:ENSMUSG00000027170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC005598 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit M, mRNA (cDNA clone MGC:11741 IMAGE:3969335), complete cds. // chr2 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// BC103795 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit M, mRNA (cDNA clone MGC:118449 IMAGE:30135815), complete cds. // chr2 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// BC116787 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit M, mRNA (cDNA clone MGC:151164 IMAGE:40126106), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC116789 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit M, mRNA (cDNA clone MGC:151166 IMAGE:40126108), complete cds. // chr2 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000028807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:105001209:105058762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000119148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:105031866:105032287:-1 gene:ENSMUSG00000083487 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:105001209:105058762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NR_015462 // RefSeq // Mus musculus Wilms tumor 1 homolog, opposite strand (Wt1os), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:105077895:105078107:-1 gene:ENSMUSG00000074987 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:105076538:105089817:-1 gene:ENSMUSG00000074987 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:105076845:105126510:-1 gene:ENSMUSG00000074987 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK031729 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030498F17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT038941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT038942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT038943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// WT1-AS // lncRNA Db // NR_015462.1 (mouse)mm9 chr2:104,916,695-104,966,667 // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009037 // RefSeq // Mus musculus reticulocalbin 1 (Rcn1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000006128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:105386291:105399319:-1 gene:ENSMUSG00000005973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000127019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:105386929:105395348:-1 gene:ENSMUSG00000005973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AK189501 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0149G09, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000006128, based on BLAT search. // chr2 // 80 // 31 // 8 // 10 // 0 /// BC049108 // GenBank // Mus musculus reticulocalbin 1, mRNA (cDNA clone MGC:61334 IMAGE:6414128), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// D13003 // GenBank // Mus musculus mRNA for reticulocalbin, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:105387919:105437469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_023876 // RefSeq // Mus musculus elongation protein 4 homolog (S. cerevisiae) (Elp4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000028588 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:105731448:105865982:-1 gene:ENSMUSG00000027167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000122965 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:105701027:105904564:-1 gene:ENSMUSG00000027167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000152272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:105792079:105814322:-1 gene:ENSMUSG00000027167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// AK168964 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920068A22 product:elongation protein 4 homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006500401 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus elongation protein 4 homolog (S. cerevisiae) (Elp4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000039389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:105782435:105911657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT038979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0
NM_008045 // RefSeq // Mus musculus follicle stimulating hormone beta (Fshb), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028533 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:107056140:107059656:-1 gene:ENSMUSG00000027120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061159 // GenBank // Mus musculus follicle stimulating hormone beta, mRNA (cDNA clone MGC:74296 IMAGE:30251083), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:107028554:107058957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_029790 // RefSeq // Mus musculus methyltransferase like 15 (Mettl15), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006500378 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methyltransferase like 15 (Mettl15), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006500380 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methyltransferase like 15 (Mettl15), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000081631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:109092297:109278290:-1 gene:ENSMUSG00000057234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147376 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:109092300:109278280:-1 gene:ENSMUSG00000057234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:109131572:109280748:-1 gene:ENSMUSG00000057234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC106186 // GenBank // Mus musculus methyltransferase 5 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:118452 IMAGE:30244889), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115926 // GenBank // Mus musculus methyltransferase 5 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:144720 IMAGE:40105262), complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC117549 // GenBank // Mus musculus methyltransferase 5 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:144719 IMAGE:40105259), complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:109125266:109191676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NR_033473 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13939 (Gm13939), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:109902396:109913319:-1 gene:ENSMUSG00000063751 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT039058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT039060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000121000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:110209178:110210165:-1 gene:ENSMUSG00000082512 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000050583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:110209275:110209652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_130452 // RefSeq // Mus musculus butyrobetaine (gamma), 2-oxoglutarate dioxygenase 1 (gamma-butyrobetaine hydroxylase) (Bbox1), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006498823 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus butyrobetaine (gamma), 2-oxoglutarate dioxygenase 1 (gamma-butyrobetaine hydroxylase) (Bbox1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000046233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:110262697:110305741:-1 gene:ENSMUSG00000041660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY033514 // GenBank // Mus musculus gamma-butyrobetaine 2-oxoglutarate dioxygenase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC019406 // GenBank // Mus musculus butyrobetaine (gamma), 2-oxoglutarate dioxygenase 1 (gamma-butyrobetaine hydroxylase), mRNA (cDNA clone MGC:30364 IMAGE:5134018), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000133608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:110292507:110314560:-1 gene:ENSMUSG00000041660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000050580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:110265454:110305632:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_026271 // RefSeq // Mus musculus fin bud initiation factor homolog (zebrafish) (Fibin), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:110360917:110363183:-1 gene:ENSMUSG00000074971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB236893 // GenBank // Mus musculus Fibin mRNA for Fibin, complete cds. // chr2 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AK012026 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610313K09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC027250 // GenBank // Mus musculus fin bud initiation factor homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:29048 IMAGE:3603588), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT039075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000050588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:110314516:110392093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000099624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:110596429:110596637:-1 gene:ENSMUSG00000074970 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// NONMMUT039080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001128103 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 3 (Ano3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006499262 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anoctamin 3 (Ano3), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000099623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:110655201:110950923:-1 gene:ENSMUSG00000074968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111019 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:110687971:110950372:-1 gene:ENSMUSG00000074968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK045930 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230324K02 product:HYPOTHETICAL 114.7 KDA PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:110658140:110697502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_001128103 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 3 (Ano3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:110655201:110950923:-1 gene:ENSMUSG00000074968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:110658140:110697502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026248 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930430A15 gene (4930430A15Rik), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006500082 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930430A15 gene (4930430A15Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000028577 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111193254:111229602:-1 gene:ENSMUSG00000027157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK016868 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933422A18 product:RIKEN cDNA 4930430A15 gene, full insert sequence. // chr2 // 94 // 53 // 17 // 18 // 0 /// BC125324 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930430A15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159027 IMAGE:40129839), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000142636 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:111162061:111205199:-1 gene:ENSMUSG00000027157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000020969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:111193446:111229412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0
NM_001011795 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1275 (Olfr1275), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000099620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111230853:111231791:-1 gene:ENSMUSG00000074966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC147155 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1275, mRNA (cDNA clone MGC:182284 IMAGE:9056178), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC147156 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1275, mRNA (cDNA clone MGC:182270 IMAGE:9056164), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_146396 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1277 (Olfr1277), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111269454:111270365:-1 gene:ENSMUSG00000074965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120803 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1277, mRNA (cDNA clone MGC:156040 IMAGE:40129726), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120805 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1277, mRNA (cDNA clone MGC:156042 IMAGE:40129728), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:111269454:111273681:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_146907 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1282 (Olfr1282), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000099618 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111335159:111336076:-1 gene:ENSMUSG00000096554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000020964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:111335159:111335725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NM_207254 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1286 (Olfr1286), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111420032:111420949:-1 gene:ENSMUSG00000096703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:111420032:111420598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001278787 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1290 (Olfr1290), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_001278788 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1290 (Olfr1290), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_146262 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1290 (Olfr1290), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000099616 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111489218:111490156:-1 gene:ENSMUSG00000095809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:111489218:111509178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000118137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:111508573:111509511:-1 gene:ENSMUSG00000094074 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_146885 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1294 (Olfr1294), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111537349:111538287:-1 gene:ENSMUSG00000102078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000094000 // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127976 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1294, mRNA (cDNA clone MGC:157532 IMAGE:40135176), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146403 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1295 (Olfr1295), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006499547 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 1295 (Olfr1295), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000111004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111564504:111565442:-1 gene:ENSMUSG00000101322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000074957 // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC125371 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1295, mRNA (cDNA clone MGC:159074 IMAGE:40129886), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC131912 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1295, mRNA (cDNA clone MGC:163543 IMAGE:40130189), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000117697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:111593073:111594011:-1 gene:ENSMUSG00000096690 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_146888 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1297 (Olfr1297), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000099612 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111621134:111622072:-1 gene:ENSMUSG00000094858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC104072 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1297, mRNA (cDNA clone MGC:123603 IMAGE:40041728), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC104073 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1297, mRNA (cDNA clone MGC:123604 IMAGE:40041729), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_146886 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1298 (Olfr1298), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000090322 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111645057:111645995:-1 gene:ENSMUSG00000096853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC126868 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1298, mRNA (cDNA clone MGC:123852 IMAGE:40044133), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC127217 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1298, mRNA (cDNA clone MGC:157420 IMAGE:40042024), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC127218 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1298, mRNA (cDNA clone MGC:157421 IMAGE:40042025), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_146402 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1303 (Olfr1303), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111813786:111814724:-1 gene:ENSMUSG00000093804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000121395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:111844262:111851838:-1 gene:ENSMUSG00000083059 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0
ENSMUST00000121395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:111844262:111851838:-1 gene:ENSMUSG00000083059 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_146401 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1305 (Olfr1305), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111872915:111873853:-1 gene:ENSMUSG00000074955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011803 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1306 (Olfr1306), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000099607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111911990:111912928:-1 gene:ENSMUSG00000096566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001011787 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1307 (Olfr1307), mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000099606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111944516:111945454:-1 gene:ENSMUSG00000094747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_207151 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1308 (Olfr1308), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000099605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111960109:111961071:-1 gene:ENSMUSG00000074952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC115949 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1308, mRNA (cDNA clone MGC:123833 IMAGE:40043972), complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_146447 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1309 (Olfr1309), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099604 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:111983134:111984096:-1 gene:ENSMUSG00000074951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128010 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1309, mRNA (cDNA clone MGC:157601 IMAGE:40136004), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146449 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1310 (Olfr1310), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:112008246:112009184:-1 gene:ENSMUSG00000100748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000074949 // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC119359 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1310, mRNA (cDNA clone MGC:155675 IMAGE:8734108), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_146274 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1311 (Olfr1311), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:112020914:112021852:-1 gene:ENSMUSG00000099763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000074948 // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127967 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1311, mRNA (cDNA clone MGC:157517 IMAGE:40135022), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:112020914:112042799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146362 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1312 (Olfr1312), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000099600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:112042077:112043030:-1 gene:ENSMUSG00000074947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000033673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:112020914:112042799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_207150 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1313 (Olfr1313), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:112071646:112072581:-1 gene:ENSMUSG00000074946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127964 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1313, mRNA (cDNA clone MGC:157511 IMAGE:40134976), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:112072427:112110917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_146450 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1314 (Olfr1314), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:112091761:112092699:-1 gene:ENSMUSG00000074945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146742 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1316 (Olfr1316), mRNA. // chr2 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// ENSMUST00000099596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:112129871:112130815:-1 gene:ENSMUSG00000074943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// ENSMUST00000118702 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:112110312:112111256:-1 gene:ENSMUSG00000082430 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:112129871:112130569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 91 // 24 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:112072427:112110917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_146742 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1316 (Olfr1316), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000099596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:112129871:112130815:-1 gene:ENSMUSG00000074943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000118702 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:112110312:112111256:-1 gene:ENSMUSG00000082430 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:112129871:112130569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:112072427:112110917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_172521 // RefSeq // Mus musculus NUT midline carcinoma, family member 1 (Nutm1), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSMUST00000043970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:112247948:112259291:-1 gene:ENSMUSG00000041358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC125332 // GenBank // Mus musculus nuclear protein in testis, mRNA (cDNA clone MGC:159035 IMAGE:40129847), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC125334 // GenBank // Mus musculus nuclear protein in testis, mRNA (cDNA clone MGC:159037 IMAGE:40129849), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:112248188:112256345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
AK136936 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330198L19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026519 // RefSeq // Mus musculus ER membrane protein complex subunit 4 (Emc4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000028551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:112363011:112368027:-1 gene:ENSMUSG00000027131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000153967 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:112363793:112368020:-1 gene:ENSMUSG00000027131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC051926 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 85, mRNA (cDNA clone MGC:62167 IMAGE:5710720), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_205783 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, muscarinic 5 (Chrm5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000099589 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:112479171:112480769:-1 gene:ENSMUSG00000074939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC120615 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, muscarinic 5, mRNA (cDNA clone MGC:155852 IMAGE:40129538), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000005925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:112479171:112480769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0
NM_011824 // RefSeq // Mus musculus gremlin 1 (Grem1), mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:113746164:113758646:-1 gene:ENSMUSG00000074934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF045801 // GenBank // Mus musculus gremlin mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// AF108189 // GenBank // Mus musculus DRM protein (DRM) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// BC015293 // GenBank // Mus musculus gremlin 1, mRNA (cDNA clone MGC:19137 IMAGE:4216669), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:113737860:113750154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_009162 // RefSeq // Mus musculus secretogranin V (Scg5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000024005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:113776362:113829121:-1 gene:ENSMUSG00000023236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK017481 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730403B16 product:secretory granule neuroendocrine protein 1, 7B2 protein, full insert sequence. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC029021 // GenBank // Mus musculus secretogranin V, mRNA (cDNA clone MGC:36177 IMAGE:5361810), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:113776801:113792087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
NM_181416 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 11A (Arhgap11a), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102545 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:113831546:113848656:-1 gene:ENSMUSG00000041219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000110947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:113833261:113848297:-1 gene:ENSMUSG00000041219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000110948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:113831492:113848661:-1 gene:ENSMUSG00000041219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:113831495:113848615:-1 gene:ENSMUSG00000041219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK129034 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0013 protein. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK137111 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430083A14 product:hypothetical RhoGAP domain/Rho GTPase-activating proteins domain profile/Rho GTPase activation protein containing protein, full insert sequence. // chr2 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// BC050875 // GenBank // Mus musculus Rho GTPase activating protein 11A, mRNA (cDNA clone MGC:59608 IMAGE:6511064), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:113805030:113868614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_010290 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, delta 2 (Gjd2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000090275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:114009601:114013619:-1 gene:ENSMUSG00000068615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058595 // GenBank // Mus musculus gap junction protein, delta 2, mRNA (cDNA clone MGC:68336 IMAGE:5364942), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:114011029:114013134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0
NM_009608 // RefSeq // Mus musculus actin, alpha, cardiac muscle 1 (Actc1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000090269 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:114047282:114052887:-1 gene:ENSMUSG00000068614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062138 // GenBank // Mus musculus actin, alpha, cardiac muscle 1, mRNA (cDNA clone MGC:69991 IMAGE:6516862), complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC100600 // GenBank // Mus musculus actin, alpha, cardiac muscle 1, mRNA (cDNA clone MGC:118715 IMAGE:6759093), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:114033257:114052031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
NM_001290788 // RefSeq // Mus musculus aquarius (Aqr), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_009702 // RefSeq // Mus musculus aquarius (Aqr), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000043160 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:114101170:114175339:-1 gene:ENSMUSG00000040383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000102543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:114105162:114175277:-1 gene:ENSMUSG00000040383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC042479 // GenBank // Mus musculus aquarius, mRNA (cDNA clone MGC:38967 IMAGE:5363276), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSMUST00000125460 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:114133368:114175246:-1 gene:ENSMUSG00000040383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// AK138700 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430016M05 product:aquarius, full insert sequence. // chr2 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// ENSMUST00000131785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:114152743:114175338:-1 gene:ENSMUSG00000040383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// AK077886 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030408H15 product:aquarius, full insert sequence. // chr2 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000018642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:114101439:114151572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_175466 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 770 (Zfp770), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006499264 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 770 (Zfp770), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000050668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:114193461:114201469:-1 gene:ENSMUSG00000040321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137653 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 770, mRNA (cDNA clone MGC:169277 IMAGE:8860672), complete cds. // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC137654 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 770, mRNA (cDNA clone MGC:169278 IMAGE:8860673), complete cds. // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_177411 // RefSeq // Mus musculus RAB5B, member RAS oncogene family (Rab5b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000000727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:128677193:128696268:-1 gene:ENSMUSG00000000711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:116527843:116528490:-1 gene:ENSMUSG00000081787 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB232594 // GenBank // Mus musculus Rab5B mRNA for Rab5B, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC137574 // GenBank // Mus musculus RAB5B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:169198 IMAGE:8860593), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC137575 // GenBank // Mus musculus RAB5B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:169199 IMAGE:8860594), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// X84239 // GenBank // M.musculus mRNA for rab5b protein. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK144551 // GenBank HTC // Mus musculus adult male intestinal mucosa cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630095F06 product:RAB5B, member RAS oncogene family, full insert sequence. // chr2 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000024042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:116527843:116567046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:128670517:128686910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_027759 // RefSeq // Mus musculus fibrous sheath-interacting protein 1 (Fsip1), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// XM_006500176 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibrous sheath-interacting protein 1 (Fsip1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// XM_006500180 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibrous sheath-interacting protein 1 (Fsip1), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// XR_374525 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibrous sheath-interacting protein 1 (Fsip1), transcript variant X7, misc_RNA. // chr2 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000028820 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:118244664:118256956:-1 gene:ENSMUSG00000027344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000028821 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:118204888:118256966:-1 gene:ENSMUSG00000027344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AF448787 // GenBank // Mus musculus fibrous sheath-interacting protein 1 mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 86 // 28 // 31 // 0 /// AK005924 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700012M13 product:RIKEN cDNA 1700012M13 gene, full insert sequence. // chr2 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// BC125024 // GenBank // Mus musculus fibrous sheath-interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:141229 IMAGE:40056533), complete cds. // chr2 // 89 // 78 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:118206384:118254835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000128601 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:118270233:118276169:-1 gene:ENSMUSG00000045339 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000171038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:118273020:118276001:-1 gene:ENSMUSG00000045339 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AK040510 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430104E16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT039269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:118256751:118296299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_201367 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 176 (Gpr176), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039160 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:118277110:118373419:-1 gene:ENSMUSG00000040133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC052037 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 176, mRNA (cDNA clone MGC:62396 IMAGE:5702597), complete cds. // chr2 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT039271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000005910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:118256751:118296299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_009273 // RefSeq // Mus musculus signal recognition particle 14 (Srp14), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000009693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:118475850:118479711:-1 gene:ENSMUSG00000009549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:118475861:118479648:-1 gene:ENSMUSG00000009549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:118475851:118478883:-1 gene:ENSMUSG00000009549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC021537 // GenBank // Mus musculus signal recognition particle 14, mRNA (cDNA clone MGC:36171 IMAGE:5353575), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// M29264 // GenBank // Mouse signal recognition particle subunit (SRP14) mRNA, complete cds. // chr2 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// XM_006499068 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus signal recognition particle 14 (Srp14), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000110862 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:118478565:118479635:-1 gene:ENSMUSG00000009549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:118476218:118479614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONMMUT039279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_138313 // RefSeq // Mus musculus BCL2 modifying factor (Bmf), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006498854 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BCL2 modifying factor (Bmf), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000090219 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:118528757:118549687:-1 gene:ENSMUSG00000040093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110859 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:118530232:118547559:-1 gene:ENSMUSG00000040093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000143583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:118531974:118544587:-1 gene:ENSMUSG00000040093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000154521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:118532055:118545316:-1 gene:ENSMUSG00000040093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK040622 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430110F10 product:BCL-2 MODIFYING FACTOR homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AY029253 // GenBank // Mus musculus Bcl-2 modifying factor (Bmf) mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// BC079650 // GenBank // Mus musculus BCL2 modifying factor, mRNA (cDNA clone MGC:90616 IMAGE:6847314), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT039285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT039286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001001982 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A430105I19 gene (A430105I19Rik), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_374437 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A430105I19 gene (A430105I19Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000059997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:118754158:118762661:-1 gene:ENSMUSG00000045838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000151270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:118757498:118762625:-1 gene:ENSMUSG00000045838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK040533 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430105I19 product:weakly similar to HYPOTHETICAL 59.7 KDA PROTEIN (DKFZP586M1019 PROTEIN) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC075684 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A430105I19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:96638 IMAGE:30611649), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:118751753:118762906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_199310 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 32 (Ccdc32), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000036470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:119017779:119029393:-1 gene:ENSMUSG00000039983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC023926 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 32, mRNA (cDNA clone MGC:38247 IMAGE:5324154), complete cds. // chr2 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSMUST00000110833 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119021805:119029377:-1 gene:ENSMUSG00000039983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// ENSMUST00000110834 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119021734:119029393:-1 gene:ENSMUSG00000039983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// AK040670 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530012E19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:119019026:119027375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0
NM_001033136 // RefSeq // Mus musculus regulator of microtubule dynamics 3 (Rmdn3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000094695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:119137001:119157034:-1 gene:ENSMUSG00000070730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC061186 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 82, member A2, mRNA (cDNA clone IMAGE:30276387), partial cds. // chr2 // 87 // 42 // 13 // 15 // 0 /// ENSMUST00000127965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119139056:119140875:-1 gene:ENSMUSG00000070730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// ENSMUST00000156332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119142418:119147436:-1 gene:ENSMUSG00000070730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000016883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:119137702:119156544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT039330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONMMUT039331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_139139 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 17 (Dnajc17), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000038439 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:119172500:119208795:-1 gene:ENSMUSG00000034278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC013487 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 17, mRNA (cDNA clone MGC:19126 IMAGE:4211118), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XR_374520 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 17 (Dnajc17), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// GENSCAN00000016887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:119172566:119186567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001290796 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14D (Ppp1r14d), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_028104 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14D (Ppp1r14d), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000076084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:119218119:119229906:-1 gene:ENSMUSG00000027317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110820 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119218140:119229865:-1 gene:ENSMUSG00000027317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF408400 // GenBank // Mus musculus GBPI-1 (Ppp1r14d) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr2 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AY179331 // GenBank // Mus musculus PKC-dependent PP1 inhibitor GBPI-2 (Gbpi) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr2 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC024547 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14D, mRNA (cDNA clone MGC:37622 IMAGE:4989982), complete cds. // chr2 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0
NM_145530 // RefSeq // Mus musculus ras homolog gene family, member V (Rhov), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:119269201:119271272:-1 gene:ENSMUSG00000034226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021307 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member V, mRNA (cDNA clone MGC:29297 IMAGE:5003249), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:119270044:119271123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NR_030683 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 14207 (Gm14207), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119321343:119325564:-1 gene:ENSMUSG00000074912 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119321187:119325543:-1 gene:ENSMUSG00000074912 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119321187:119326194:-1 gene:ENSMUSG00000074912 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT039350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT039351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT039352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026574 // RefSeq // Mus musculus INO80 homolog (S. cerevisiae) (Ino80), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000049920 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:119373042:119477687:-1 gene:ENSMUSG00000034154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000110808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119402709:119477613:-1 gene:ENSMUSG00000034154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// BC061495 // GenBank // Mus musculus INO80 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:4947143). // chr2 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:119355728:119412627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000027659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:119422599:119458195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// BC027035 // GenBank HTC // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14c, mRNA (cDNA clone IMAGE:5369833), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr2 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NM_172857 // RefSeq // Mus musculus exonuclease 3-5 domain containing 1 (Exd1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060009 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:119516505:119547627:-1 gene:ENSMUSG00000048647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000171024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:119516511:119541513:-1 gene:ENSMUSG00000048647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC092241 // GenBank // Mus musculus exonuclease 3-5 domain-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:113810 IMAGE:30670567), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC144750 // GenBank // Mus musculus exonuclease 3-5 domain-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:178306 IMAGE:9053298), complete cds. // chr2 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC150662 // GenBank // Mus musculus exonuclease 3-5 domain-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:183573 IMAGE:9087573), complete cds. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:119508885:119538853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0
NM_001042653 // RefSeq // Mus musculus Opa interacting protein 5 (Oip5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119609512:119618469:-1 gene:ENSMUSG00000072980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:119609971:119618469:-1 gene:ENSMUSG00000072980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC115883 // GenBank // Mus musculus Opa interacting protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:141621 IMAGE:40088361), complete cds. // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC116660 // GenBank // Mus musculus Opa interacting protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:141622 IMAGE:40088363), complete cds. // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONMMUT039366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_027175 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, assembly factor 1 (Ndufaf1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006500151 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, assembly factor 1 (Ndufaf1), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000028768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:119655451:119662798:-1 gene:ENSMUSG00000027305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000110801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119655446:119662820:-1 gene:ENSMUSG00000027305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000110802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119655446:119662821:-1 gene:ENSMUSG00000027305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC018422 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, assembly factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:27963 IMAGE:3593650), complete cds. // chr2 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:119655643:119660583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000082788 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:119740828:119740956:-1 gene:ENSMUSG00000064722 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT039379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
AK018123 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330405D24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:119872744:119878403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000120952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:119878069:119878403:-1 gene:ENSMUSG00000081056 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0
ENSMUST00000141511 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:120024807:120027453:-1 gene:ENSMUSG00000087458 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK016792 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933412K16 product:Jun N-terminal kinase binding protein 1, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT039396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006500537 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Sptbn5), mRNA. // chr2 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// ENSMUST00000110756 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:120061586:120072523:-1 gene:ENSMUSG00000074899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000134935 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:120076214:120085772:-1 gene:ENSMUSG00000074899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 18 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000156159 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:120046157:120057497:-1 gene:ENSMUSG00000074899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 31 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:120042099:120114648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 63 // 63 // 0
NM_133838 // RefSeq // Mus musculus EH-domain containing 4 (Ehd4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:120089175:120154606:-1 gene:ENSMUSG00000027293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:120122447:120154462:-1 gene:ENSMUSG00000027293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AF173639 // GenBank // Mus musculus EH domain containing protein MPAST2 (Past2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC007480 // GenBank // Mus musculus EH-domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:7570 IMAGE:3493227), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012272 // GenBank // Mus musculus EH-domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:19417 IMAGE:3485836), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:120125045:120154676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000027676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:120042099:120114648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_177845 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A2, group IVE (Pla2g4e), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006499770 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase A2, group IVE (Pla2g4e), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000090071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:120166412:120245335:-1 gene:ENSMUSG00000050211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000136845 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:120166412:120191214:-1 gene:ENSMUSG00000050211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// AB195277 // GenBank // Mus musculus Pla2g4e mRNA for cytosolic phospholipase A2 epsilon, complete cds. // chr2 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// BC060600 // GenBank HTC // Mus musculus phospholipase A2, group IVE, mRNA (cDNA clone IMAGE:5705456), with apparent retained intron. // chr2 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// BC137899 // GenBank // Mus musculus phospholipase A2, group IVE, mRNA (cDNA clone MGC:169523 IMAGE:8860918), complete cds. // chr2 // 92 // 95 // 36 // 39 // 0 /// ENSMUST00000127009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:120172173:120245082:-1 gene:ENSMUSG00000050211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 71 // 71 // 29 // 41 // 1 /// AK049063 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230096D22 product:hypothetical Lysophospholipase catalytic domain containing protein, full insert sequence. // chr2 // 71 // 71 // 29 // 41 // 1 /// GENSCAN00000027655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:120167833:120207219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0
NM_001024137 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A2, group IVD (Pla2g4d), mRNA. // chr2 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0 /// XM_006500413 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase A2, group IVD (Pla2g4d), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 97 // 81 // 34 // 35 // 0 /// XM_006500414 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase A2, group IVD (Pla2g4d), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 97 // 84 // 35 // 36 // 0 /// ENSMUST00000094665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:120265595:120289197:-1 gene:ENSMUSG00000070719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0 /// AB195276 // GenBank // Mus musculus Pla2g4d mRNA for cytosolic phospholipase A2 delta, complete cds. // chr2 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0 /// BC113160 // GenBank // Mus musculus phospholipase A2, group IVD, mRNA (cDNA clone MGC:132856 IMAGE:40060148), complete cds. // chr2 // 88 // 93 // 35 // 40 // 0 /// BC113770 // GenBank // Mus musculus phospholipase A2, group IVD, mRNA (cDNA clone MGC:132855 IMAGE:40060146), complete cds. // chr2 // 95 // 93 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000027668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:120266639:120403996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 70 // 70 // 30 // 43 // 1
NM_011743 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 106 (Zfp106), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006499039 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 106 (Zfp106), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000055241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:120506820:120563807:-1 gene:ENSMUSG00000027288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:120526263:120563814:-1 gene:ENSMUSG00000027288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC025424 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 106, mRNA (cDNA clone MGC:29071 IMAGE:4459713), complete cds. // chr2 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000171215 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:120509614:120539860:-1 gene:ENSMUSG00000027288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000055105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:120510086:120545901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AF060246 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 zinc finger protein 106 (Zfp106) mRNA, H3a-a allele, complete cds. // chr2 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
ENSMUST00000083149 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:120640711:120640835:-1 gene:ENSMUSG00000065083 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT039433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_026891 // RefSeq // Mus musculus congenital dyserythropoietic anemia, type I (human) (Cdan1), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000110700 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:120716522:120731518:-1 gene:ENSMUSG00000027284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000110701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:120716154:120731517:-1 gene:ENSMUSG00000027284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000148285 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:120718186:120850128:-1 gene:ENSMUSG00000027284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC117555 // GenBank // Mus musculus congenital dyserythropoietic anemia, type I (human), mRNA (cDNA clone MGC:144128 IMAGE:40098039), complete cds. // chr2 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000055106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:120718802:120731501:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK220258 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0847 protein. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_009461 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1 (Ubr1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XR_374439 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1 (Ubr1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000028728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:120860269:120970715:-1 gene:ENSMUSG00000027272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000133408 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:120945458:120970613:-1 gene:ENSMUSG00000027272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 89 // 19 // 8 // 9 // 0 /// AF061555 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-protein ligase E3-alpha (Ubr1) mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 44 // 47 // 0 /// AK162013 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720474A10 product:ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1, full insert sequence. // chr2 // 89 // 19 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000055107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:120862650:120970602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 35 // 35 // 0
NM_028799 // RefSeq // Mus musculus transglutaminase 5 (Tgm5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000028721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:121046111:121085841:-1 gene:ENSMUSG00000053675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC116266 // GenBank // Mus musculus transglutaminase 5, mRNA (cDNA clone MGC:143848 IMAGE:40094000), complete cds. // chr2 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// BC116267 // GenBank // Mus musculus transglutaminase 5, mRNA (cDNA clone MGC:143849 IMAGE:40094002), complete cds. // chr2 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:121044526:121087542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001160424 // RefSeq // Mus musculus transglutaminase 7 (Tgm7), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006499988 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transglutaminase 7 (Tgm7), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000110675 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:121093565:121109795:-1 gene:ENSMUSG00000079103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000055089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:121093589:121110018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_177846 // RefSeq // Mus musculus leucine carboxyl methyltransferase 2 (Lcmt2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:121128307:121140378:-1 gene:ENSMUSG00000074890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000110674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:121137598:121140653:-1 gene:ENSMUSG00000074890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK038626 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230051G17 product:similar to P21WAF1/CIP1 PROMOTER-INTERACTING PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:121138540:121140600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001290819 // RefSeq // Mus musculus zinc finger SCAN domains 29 (Zscan29), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NM_001290820 // RefSeq // Mus musculus zinc finger SCAN domains 29 (Zscan29), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000079024 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:121160681:121170268:-1 gene:ENSMUSG00000050619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000146243 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:121165141:121171125:-1 gene:ENSMUSG00000050619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000163766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:121160696:121171125:-1 gene:ENSMUSG00000050619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000110661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:121158273:121170268:-1 gene:ENSMUSG00000050619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:121160517:121170124:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_080459 // RefSeq // Mus musculus stereocilin (Strc), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000038389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:121363728:121380940:-1 gene:ENSMUSG00000033498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000129136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:121368403:121375031:-1 gene:ENSMUSG00000033498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// AF375593 // GenBank // Mus musculus stereocilin (Strc) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000055094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:121363976:121380862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0
NM_153075 // RefSeq // Mus musculus cation channel, sperm associated 2 (Catsper2), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006499082 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cation channel, sperm associated 2 (Catsper2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XM_006499083 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cation channel, sperm associated 2 (Catsper2), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// XM_006499084 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cation channel, sperm associated 2 (Catsper2), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:121394355:121413792:-1 gene:ENSMUSG00000033486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000154604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:121392631:121413609:-1 gene:ENSMUSG00000033486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// AF411816 // GenBank // Mus musculus putative ion channel protein CATSPER2 mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 95 // 33 // 36 // 0 /// BC034181 // GenBank HTC // Mus musculus cation channel, sperm associated 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4973163), with apparent retained intron. // chr2 // 96 // 61 // 22 // 23 // 0 /// BC132140 // GenBank // Mus musculus cation channel, sperm associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:163771 IMAGE:40130417), complete cds. // chr2 // 91 // 87 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000055095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:121394456:121406450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 42 // 15 // 16 // 0
NM_145973 // RefSeq // Mus musculus elongation factor RNA polymerase II-like 3 (Ell3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000028679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:121439010:121444278:-1 gene:ENSMUSG00000027246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000116432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:121439027:121442601:-1 gene:ENSMUSG00000027246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000140752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:121439059:121455837:-1 gene:ENSMUSG00000046110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000153866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:121439980:121441151:-1 gene:ENSMUSG00000027246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// AK139676 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020010F16 product:elongation factor RNA polymerase II-like 3, full insert sequence. // chr2 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC045151 // GenBank // Mus musculus elongation factor RNA polymerase II-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:54876 IMAGE:6313358), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT039494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000046391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:121439439:121456553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NM_008545 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family B, 3 (Mageb3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000104936 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:121953752:121956092:-1 gene:ENSMUSG00000074881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF311315 // GenBank // Mus musculus mageb3 protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// AF311316 // GenBank // Mus musculus mageb3 protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// AY099462 // GenBank // Mus musculus strain FVB/N MAGEB3 (Mageb3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// AY099463 // GenBank // Mus musculus strain C57B/6 MAGEB3 (Mageb3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// AY099464 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c MAGEB3 (Mageb3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// BC141002 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family B, 3, mRNA (cDNA clone MGC:175963 IMAGE:9055614), complete cds. // chr2 // 82 // 69 // 9 // 11 // 0
NM_145531 // RefSeq // Mus musculus spastic paraplegia 11 (Spg11), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XR_374438 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spastic paraplegia 11 (Spg11), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000036450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:122053520:122118386:-1 gene:ENSMUSG00000033396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000133145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:122093540:122118296:-1 gene:ENSMUSG00000033396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// AK049617 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530005A01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:122053880:122118314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_026251 // RefSeq // Mus musculus protein associated with topoisomerase II homolog 2 (yeast) (Patl2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006500083 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein associated with topoisomerase II homolog 2 (yeast) (Patl2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006500085 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein associated with topoisomerase II homolog 2 (yeast) (Patl2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// XM_006500086 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein associated with topoisomerase II homolog 2 (yeast) (Patl2), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// XR_374513 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein associated with topoisomerase II homolog 2 (yeast) (Patl2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr2 // 96 // 67 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000028665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:122120108:122186189:-1 gene:ENSMUSG00000027233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK010811 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410151F09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 95 // 61 // 21 // 22 // 0 /// BC145646 // GenBank // Mus musculus protein associated with topoisomerase II homolog 2 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:175533 IMAGE:40130949), complete cds. // chr2 // 77 // 86 // 24 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:122121156:122143686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT039535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 95 // 61 // 21 // 22 // 0
NM_177610 // RefSeq // Mus musculus dual oxidase 2 (Duox2), mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000053734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:122279247:122298165:-1 gene:ENSMUSG00000068452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC172138 // GenBank // Mus musculus dual oxidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:198843 IMAGE:9054808), complete cds. // chr2 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:122267938:122298165:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_025961 // RefSeq // Mus musculus glycine amidinotransferase (L-arginine:glycine amidinotransferase) (Gatm), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000028624 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:122594467:122611303:-1 gene:ENSMUSG00000027199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003879 // GenBank // Mus musculus glycine amidinotransferase (L-arginine:glycine amidinotransferase), mRNA (cDNA clone MGC:6646 IMAGE:3495871), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:122595497:122611216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001290993 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 4 (Slc30a4), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_011774 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 4 (Slc30a4), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000005952 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:122681233:122702639:-1 gene:ENSMUSG00000005802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000099457 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:122683398:122702663:-1 gene:ENSMUSG00000005802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AF003747 // GenBank // Mus musculus zinc transporter 4 (ZnT4) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC117997 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:143949 IMAGE:40095367), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:122656103:122728013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001162417 // RefSeq // Mus musculus myelin basic protein expression factor 2, repressor (Myef2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// NM_010852 // RefSeq // Mus musculus myelin basic protein expression factor 2, repressor (Myef2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// XM_006498883 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myelin basic protein expression factor 2, repressor (Myef2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// XR_374427 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myelin basic protein expression factor 2, repressor (Myef2), transcript variant X8, misc_RNA. // chr2 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000067780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:125087742:125123660:-1 gene:ENSMUSG00000027201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000110501 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:125086271:125123595:-1 gene:ENSMUSG00000027201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000152367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:125086568:125123626:-1 gene:ENSMUSG00000027201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
NM_007993 // RefSeq // Mus musculus fibrillin 1 (Fbn1), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 66 // 66 // 0 /// ENSMUST00000028633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:125300594:125506385:-1 gene:ENSMUSG00000027204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 66 // 66 // 0 /// ENSMUST00000103234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:125300627:125507993:-1 gene:ENSMUSG00000027204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 68 // 68 // 0 /// ENSMUST00000148272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:125389756:125506072:-1 gene:ENSMUSG00000027204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 15 // 10 // 10 // 0 /// AF007248 // GenBank // Mus musculus mutant fibrillin-1 (Fbn1) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 96 // 63 // 65 // 0 /// AK046621 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430209H23 product:fibrillin 1, full insert sequence. // chr2 // 100 // 15 // 10 // 10 // 0 /// L29454 // GenBank // Mouse fibrillin (Fbn-1) mRNA, complete cds. // chr2 // 84 // 100 // 57 // 68 // 0 /// U22493 // GenBank // Mus musculus fibrillin-1 (Fbn1) mRNA, complete cds. // chr2 // 91 // 97 // 60 // 66 // 0 /// GENSCAN00000042210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:125284751:125332427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 31 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:125334938:125389311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 31 // 31 // 0
NM_001081091 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 152 (Cep152), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XR_374548 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centrosomal protein 152 (Cep152), transcript variant X7, misc_RNA. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000089776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:125563088:125625113:-1 gene:ENSMUSG00000068394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK030816 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830412G04 product:hypothetical t-snare containing protein, full insert sequence. // chr2 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000031847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:125563400:125642061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0
NM_199022 // RefSeq // Mus musculus SHC (Src homology 2 domain containing) family, member 4 (Shc4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006499655 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SHC (Src homology 2 domain containing) family, member 4 (Shc4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_006499657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SHC (Src homology 2 domain containing) family, member 4 (Shc4), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000042246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:125627447:125723387:-1 gene:ENSMUSG00000035109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:125629065:125673502:-1 gene:ENSMUSG00000035109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000110480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:125627447:125673632:-1 gene:ENSMUSG00000035109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AY464564 // GenBank // Mus musculus rai-like protein RaLP mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC060643 // GenBank // Mus musculus SHC (Src homology 2 domain containing) family, member 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:6850749). // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AK031771 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6230417E10 product:Rai-like protein RaLP homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr2 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0
NM_177608 // RefSeq // Mus musculus SECIS binding protein 2-like (Secisbp2l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000053699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:125736986:125782870:-1 gene:ENSMUSG00000035093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC095939 // GenBank // Mus musculus SECIS binding protein 2-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4023466), complete cds. // chr2 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// BC141056 // GenBank // Mus musculus SECIS binding protein 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:176017 IMAGE:9055668), complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000139944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:125744775:125760314:-1 gene:ENSMUSG00000035093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// BC071239 // GenBank // Mus musculus SECIS binding protein 2-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:3584228), partial cds. // chr2 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// GENSCAN00000031857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:125721677:125783341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0
NM_029455 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 227, member B (Fam227b), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000110446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:125983483:126152004:-1 gene:ENSMUSG00000027209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000110448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:125983628:126151984:-1 gene:ENSMUSG00000027209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000156413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:126003151:126152004:-1 gene:ENSMUSG00000027209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000178118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:125983628:126146251:-1 gene:ENSMUSG00000027209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AK015893 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930525F21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// NONMMUT039636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_008230 // RefSeq // Mus musculus histidine decarboxylase (Hdc), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006498784 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histidine decarboxylase (Hdc), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000028838 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:126593667:126618678:-1 gene:ENSMUSG00000027360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF109137 // GenBank // Mus musculus histidine decarboxylase (Hdc) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC052833 // GenBank // Mus musculus histidine decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:60408 IMAGE:30044098), complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000138752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:126600234:126618661:-1 gene:ENSMUSG00000027360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// AK076384 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732480P20 product:histidine decarboxylase cluster, full insert sequence. // chr2 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000032672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:126593961:126618569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_023220 // RefSeq // Mus musculus signal peptide peptidase like 2A (Sppl2a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000028844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:126890391:126933235:-1 gene:ENSMUSG00000027366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000143700 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:126894264:126920345:-1 gene:ENSMUSG00000027366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 47 // 16 // 17 // 0 /// BC026578 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010106G01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:36779 IMAGE:5059823), complete cds. // chr2 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// ENSMUST00000125592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:126914874:126923688:-1 gene:ENSMUSG00000027366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000032681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:126894212:126933012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// AK051634 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130061D20 product:weakly similar to BRAIN CDNA, CLONE MNCB-3763, SIMILAR TO AC004410 FOS39554_1 (HOMO SAPIENS) [Mus musculus], full insert sequence. // chr2 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONMMUT039670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_144818 // RefSeq // Mus musculus non-SMC condensin I complex, subunit H (Ncaph), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000110387 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:127103809:127133954:-1 gene:ENSMUSG00000034906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC021499 // GenBank // Mus musculus non-SMC condensin I complex, subunit H, mRNA (cDNA clone MGC:38424 IMAGE:5346298), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC025060 // GenBank // Mus musculus non-SMC condensin I complex, subunit H, mRNA (cDNA clone MGC:36705 IMAGE:3673890), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000175885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:127103950:127133902:-1 gene:ENSMUSG00000034906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1 /// ENSMUST00000152806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:127103827:127114670:-1 gene:ENSMUSG00000034906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// AK045239 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130050I11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// GENSCAN00000032677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:127104221:127127717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0
NM_001163527 // RefSeq // Mus musculus inositol 1,4,5-triphosphate receptor interacting protein-like 1 (Itpripl1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_001163528 // RefSeq // Mus musculus inositol 1,4,5-triphosphate receptor interacting protein-like 1 (Itpripl1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:127140409:127143306:-1 gene:ENSMUSG00000074825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132773 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:127138772:127143442:-1 gene:ENSMUSG00000074825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000154021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:127140529:127142590:-1 gene:ENSMUSG00000074825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC130218 // GenBank // Mus musculus inositol 1,4,5-triphosphate receptor interacting protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:161225 IMAGE:40141227), complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:127139483:127148824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_198630 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810024B03 gene (1810024B03Rik), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006499777 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1810024B03 gene (1810024B03Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000056146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:127186355:127208280:-1 gene:ENSMUSG00000044145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC117065 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810024B03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151442 IMAGE:40126384), complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC119086 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810024B03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155402 IMAGE:8733835), complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:127186675:127187277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0
NM_025296 // RefSeq // Mus musculus cytosolic iron-sulfur protein assembly 1 (Ciao1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000003759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:127240938:127247816:-1 gene:ENSMUSG00000003662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000143575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:127242869:127246046:-1 gene:ENSMUSG00000003662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000172636 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:127245856:127247620:-1 gene:ENSMUSG00000003662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000174030 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:127242620:127247620:-1 gene:ENSMUSG00000003662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000174863 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:127242996:127247620:-1 gene:ENSMUSG00000003662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC004089 // GenBank // Mus musculus cytosolic iron-sulfur protein assembly 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:8301 IMAGE:3593736), complete cds. // chr2 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:127242797:127248285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
AK085278 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630004G21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138750 // RefSeq // Mus musculus prominin 2 (Prom2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_178047 // RefSeq // Mus musculus prominin 2 (Prom2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000028855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:127526473:127541467:-1 gene:ENSMUSG00000027376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000103214 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:127526955:127541385:-1 gene:ENSMUSG00000027376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF269062 // GenBank // Mus musculus prominin-2 mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// BC039212 // GenBank // Mus musculus prominin 2, mRNA (cDNA clone MGC:31164 IMAGE:4188940), complete cds. // chr2 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:127527951:127541320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_001111029 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 661 (Zfp661), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_028141 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 661 (Zfp661), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000077422 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:127575540:127584677:-1 gene:ENSMUSG00000034800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000110366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:127574662:127587094:-1 gene:ENSMUSG00000034800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000110368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:127575533:127584669:-1 gene:ENSMUSG00000034800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000164551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:127576935:127581508:-1 gene:ENSMUSG00000034800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC052876 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 661, mRNA (cDNA clone MGC:60741 IMAGE:30047253), complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
NM_001171187 // RefSeq // Mus musculus myelin and lymphocyte protein, T cell differentiation protein (Mal), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_010762 // RefSeq // Mus musculus myelin and lymphocyte protein, T cell differentiation protein (Mal), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:127634874:127656219:-1 gene:ENSMUSG00000027375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000028854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:127633226:127656695:-1 gene:ENSMUSG00000027375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC006826 // GenBank // Mus musculus myelin and lymphocyte protein, T-cell differentiation protein, mRNA (cDNA clone MGC:11470 IMAGE:3597561), complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000054333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:127628677:127656133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_145532 // RefSeq // Mus musculus mal, T cell differentiation protein-like (Mall), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:127704386:127729932:-1 gene:ENSMUSG00000027377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012256 // GenBank // Mus musculus mal, T-cell differentiation protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:19097 IMAGE:4205488), complete cds. // chr2 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000054340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:127705861:127729866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001291012 // RefSeq // Mus musculus nephronophthisis 1 (juvenile) homolog (human) (Nphp1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NM_001291013 // RefSeq // Mus musculus nephronophthisis 1 (juvenile) homolog (human) (Nphp1), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NM_016902 // RefSeq // Mus musculus nephronophthisis 1 (juvenile) homolog (human) (Nphp1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000028857 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:127740732:127788854:-1 gene:ENSMUSG00000027378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000110357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:127740736:127788897:-1 gene:ENSMUSG00000027378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// AF127180 // GenBank // Mus musculus nephrocystin (Nphp1) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 91 // 38 // 39 // 0 /// AF176210 // GenBank // Mus musculus nephrocystin (Nphp1) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 91 // 38 // 39 // 0 /// BC118953 // GenBank // Mus musculus nephronophthisis 1 (juvenile) homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:143781 IMAGE:40093235), complete cds. // chr2 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0 /// EF174553 // GenBank // Mus musculus nephrocystin 1 variant 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 92 // 88 // 35 // 38 // 0 /// GENSCAN00000054341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:127740916:127831745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0
NR_015476 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1500011K16 gene (1500011K16Rik), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000135091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:127791388:127792488:-1 gene:ENSMUSG00000051319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048556 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6600758. // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001113179 // RefSeq // Mus musculus budding uninhibited by benzimidazoles 1 homolog (S. cerevisiae) (Bub1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_009772 // RefSeq // Mus musculus budding uninhibited by benzimidazoles 1 homolog (S. cerevisiae) (Bub1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028858 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:127801122:127831865:-1 gene:ENSMUSG00000027379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF002823 // GenBank // Mus musculus mitotic checkpoint protein kinase (Bub1) mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC029116 // GenBank // Mus musculus budding uninhibited by benzimidazoles 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:18385 IMAGE:3671932), complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:127740916:127831745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NR_028590 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 14005 (Gm14005), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151427 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:128317289:128429349:-1 gene:ENSMUSG00000074813 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000154173 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:128317465:128429170:-1 gene:ENSMUSG00000074813 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT039731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT039732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NR_028591 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 14005 (Gm14005), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125354 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:128372107:128428893:-1 gene:ENSMUSG00000074813 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:128372106:128429186:-1 gene:ENSMUSG00000074813 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT039734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT039735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000122132 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:128557254:128558234:-1 gene:ENSMUSG00000082671 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_008569 // RefSeq // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 1 (Anapc1), mRNA. // chr2 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000014499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:128610104:128687391:-1 gene:ENSMUSG00000014355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000110333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:128642077:128687376:-1 gene:ENSMUSG00000014355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 28 // 28 // 0 /// AK054305 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330013L10 product:meiotic check point regulator, full insert sequence. // chr2 // 100 // 56 // 28 // 28 // 0 /// BC139002 // GenBank // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:170629 IMAGE:8862024), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// BC145492 // GenBank // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:179063 IMAGE:9054055), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000024366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:128612948:128686006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 66 // 33 // 33 // 0
NM_020594 // RefSeq // Mus musculus zinc finger CCCH type containing 8 (Zc3h8), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006499947 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger CCCH type containing 8 (Zc3h8), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000028866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:128926268:128944077:-1 gene:ENSMUSG00000027387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF061961 // GenBank // Mus musculus putative zinc finger protein FLIZ1 (Fliz1) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// AK132679 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921522B09 product:zinc finger CCCH type domain containing 8, full insert sequence. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC048687 // GenBank // Mus musculus zinc finger CCCH type containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:59281 IMAGE:6334861), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:128919617:128943924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0
ENSMUST00000099385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:128966593:128967725:-1 gene:ENSMUSG00000074807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:128967080:128967427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK012372 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2700044H17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181589 // RefSeq // Mus musculus cytoskeleton associated protein 2-like (Ckap2l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006500159 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytoskeleton associated protein 2-like (Ckap2l), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000052708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:129268210:129297212:-1 gene:ENSMUSG00000048327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK153766 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630079F21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC053443 // GenBank // Mus musculus cytoskeleton associated protein 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:59508 IMAGE:6333921), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:129269038:129297141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010554 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 alpha (Il1a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006498793 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 1 alpha (Il1a), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028882 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:129299610:129309972:-1 gene:ENSMUSG00000027399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M14639 // GenBank // Mouse interleukin-1 mRNA, partial cds. // chr2 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// X01450 // GenBank // Mouse mRNA for interleukin-1. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC003727 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:5780 IMAGE:3599550), complete cds. // chr2 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// XM_006498794 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 1 alpha (Il1a), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:129300711:129306605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000083123 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:129315329:129315479:-1 gene:ENSMUSG00000065057 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT039809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_008361 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 beta (Il1b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000028881 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:129364570:129371139:-1 gene:ENSMUSG00000027398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK224980 // GenBank // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN RMEP library, clone:F830203M10. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC011437 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 beta, mRNA (cDNA clone MGC:18555 IMAGE:3989461), complete cds. // chr2 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// M15131 // GenBank // Mouse interleukin 1-beta (IL-1-beta) mRNA, complete cds. // chr2 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000155994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:129369729:129371139:-1 gene:ENSMUSG00000027398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000024355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:129365029:129369751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC013644 // GenBank HTC // Mus musculus mRNA similar to replication initiation region protein (60kD) (cDNA clone IMAGE:4207753). // chr2 // 81 // 59 // 13 // 16 // 0 /// NONMMUT039816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_177653 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA F830045P16 gene (F830045P16Rik), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006499277 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA F830045P16 gene (F830045P16Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000050309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:129458359:129536602:-1 gene:ENSMUSG00000043727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:129414253:129499073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001286502 // RefSeq // Mus musculus prodynorphin (Pdyn), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_018863 // RefSeq // Mus musculus prodynorphin (Pdyn), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:129686565:129699833:-1 gene:ENSMUSG00000027400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:129688496:129698658:-1 gene:ENSMUSG00000027400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AF026537 // GenBank // Mus musculus prodynorphin mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF483510 // GenBank // Mus musculus strain ILS prodynorphin mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AF483511 // GenBank // Mus musculus strain ISS prodynorphin mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC137571 // GenBank // Mus musculus prodynorphin, mRNA (cDNA clone MGC:169195 IMAGE:8860590), complete cds. // chr2 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC137572 // GenBank // Mus musculus prodynorphin, mRNA (cDNA clone MGC:169196 IMAGE:8860591), complete cds. // chr2 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000025248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:129688001:129746675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
AK172566 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830215C05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004562 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT039842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019696 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase X 1 (M14 family) (Cpxm1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000028897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:130390775:130397574:-1 gene:ENSMUSG00000027408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF077738 // GenBank // Mus musculus metallocarboxypeptidase CPX-1 mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC003713 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase X 1 (M14 family), mRNA (cDNA clone MGC:5707 IMAGE:3593211), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:130390904:130397506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NR_040348 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930473A02 gene (4930473A02Rik), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:130543791:130563749:-1 gene:ENSMUSG00000060029 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:130543791:130563749:-1 gene:ENSMUSG00000060029 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT039884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_009732 // RefSeq // Mus musculus arginine vasopressin (Avp), mRNA. // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000046001 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:130580620:130582554:-1 gene:ENSMUSG00000037727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC051997 // GenBank // Mus musculus arginine vasopressin, mRNA (cDNA clone MGC:62313 IMAGE:5683720), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:130580677:130582529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001291027 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor family member 3 (Lzts3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NM_001291028 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor family member 3 (Lzts3), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NM_197945 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor family member 3 (Lzts3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006499504 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor family member 3 (Lzts3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000045761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:130632842:130642803:-1 gene:ENSMUSG00000037703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000089561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:130632839:130638095:-1 gene:ENSMUSG00000037703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000110260 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:130632839:130638095:-1 gene:ENSMUSG00000037703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// BC058280 // GenBank // Mus musculus ProSAPiP1 protein, mRNA (cDNA clone MGC:65567 IMAGE:6529102), complete cds. // chr2 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:130634766:130637956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0
NM_001081162 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 4, sodium bicarbonate transporter-like, member 11 (Slc4a11), mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006499607 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 4, sodium bicarbonate transporter-like, member 11 (Slc4a11), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000099362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:130684113:130697519:-1 gene:ENSMUSG00000074796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000144945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:130684113:130688565:-1 gene:ENSMUSG00000074796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC036154 // GenBank HTC // Mus musculus solute carrier family 4, sodium bicarbonate transporter-like, member 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:4977622), with apparent retained intron. // chr2 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC111884 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 4, sodium bicarbonate transporter-like, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:132862 IMAGE:40060299), complete cds. // chr2 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// ENSMUST00000134647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:130686577:130697469:-1 gene:ENSMUSG00000074796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// AK052665 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630017G07 product:weakly similar to BICARBONATE TRANSPORTER-RELATED PROTEIN BTR1 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:130684434:130688112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
AK166222 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830017N05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_011426 // RefSeq // Mus musculus sialic acid binding Ig-like lectin 1, sialoadhesin (Siglec1), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000028794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:131069220:131086765:-1 gene:ENSMUSG00000027322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000110226 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:131083573:131086765:-1 gene:ENSMUSG00000027322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000110227 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:131072054:131086765:-1 gene:ENSMUSG00000027322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// BC141335 // GenBank // Mus musculus sialic acid binding Ig-like lectin 1, sialoadhesin, mRNA (cDNA clone MGC:176296 IMAGE:9055947), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// BC141336 // GenBank // Mus musculus sialic acid binding Ig-like lectin 1, sialoadhesin, mRNA (cDNA clone MGC:176297 IMAGE:9055948), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// Z36233 // GenBank // M.musculus (C57Bl/6) mRNA for 16-domain form of sialoadhesin. // chr2 // 97 // 77 // 33 // 34 // 0 /// Z36234 // GenBank // M.musculus (C57Bl/6) mRNA for 3-domain form of sialoadhesin. // chr2 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000023665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:131068402:131086116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0
NM_027641 // RefSeq // Mus musculus sperm flagellar 1 (Spef1), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000028801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:131170261:131187282:-1 gene:ENSMUSG00000027329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:131170316:131175201:-1 gene:ENSMUSG00000027329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000127987 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:131171611:131174653:-1 gene:ENSMUSG00000027329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AY860964 // GenBank // Mus musculus SPEF1 (Spef1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC006046 // GenBank // Mus musculus sperm flagellar 1, mRNA (cDNA clone MGC:8192 IMAGE:3590641), complete cds. // chr2 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000023677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:131146875:131174673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_007682 // RefSeq // Mus musculus centromere protein B (Cenpb), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089510 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:131175182:131180067:-1 gene:ENSMUSG00000068267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC006628 // GenBank // Mus musculus centromere protein B, mRNA (cDNA clone MGC:11737 IMAGE:3968847), complete cds. // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC053333 // GenBank // Mus musculus centromere protein B, mRNA (cDNA clone MGC:58961 IMAGE:6399142), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC071269 // GenBank // Mus musculus centromere protein B, mRNA (cDNA clone MGC:78359 IMAGE:6333993), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC075733 // GenBank // Mus musculus centromere protein B, mRNA (cDNA clone MGC:78363 IMAGE:30286478), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:131178077:131179876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_178607 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 24 (Rnf24), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:131298064:131352881:-1 gene:ENSMUSG00000048911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110194 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:131298067:131328988:-1 gene:ENSMUSG00000048911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000165420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:131298065:131313314:-1 gene:ENSMUSG00000048911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000183902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:131302646:131352862:-1 gene:ENSMUSG00000048911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK015699 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930505A13 product:similar to HYPOTHETICAL 17.2 KDA PROTEIN (RING FINGER PROTEIN 24) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC096529 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 24, mRNA (cDNA clone MGC:106607 IMAGE:6406985), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:131303442:131322366:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_013460 // RefSeq // Mus musculus adrenergic receptor, alpha 1d (Adra1d), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000103184 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:131545850:131562283:-1 gene:ENSMUSG00000027335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:131527721:131597034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001166206 // RefSeq // Mus musculus endogenous retroviral sequence 3 (Erv3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006500201 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endogenous retroviral sequence 3 (Erv3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006500202 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endogenous retroviral sequence 3 (Erv3), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000040941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:131853678:131859747:-1 gene:ENSMUSG00000037482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC099428 // GenBank // Mus musculus endogenous retroviral sequence 3, mRNA (cDNA clone MGC:117611 IMAGE:30522905), complete cds. // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_018824 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 23 (nucleobase transporters), member 2 (Slc23a2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000028815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:132052496:132145108:-1 gene:ENSMUSG00000027340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000137910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:132060708:132067040:-1 gene:ENSMUSG00000027340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AB038145 // GenBank // Mus musculus mRNA for sodium-dependent vitamin C transporter SVCT2, complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AK122227 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0238 protein. // chr2 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// AY004874 // GenBank // Mus musculus sodium-dependent vitamin C transporter type 2 (Slc23a1) mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC050823 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 23 (nucleobase transporters), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:59295 IMAGE:6332451), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000127724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:132074834:132145108:-1 gene:ENSMUSG00000027340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// AK087175 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030032B14 product:solute carrier family 23 (nucleobase transporters), member 1, full insert sequence. // chr2 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// GENSCAN00000037268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:132000281:132094769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_001141971 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 230 (Tmem230), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// NM_027478 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 230 (Tmem230), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000028816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:132239492:132247807:-1 gene:ENSMUSG00000027341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000110163 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:132239492:132247769:-1 gene:ENSMUSG00000027341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000110164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:132239492:132247654:-1 gene:ENSMUSG00000027341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000180286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:132239494:132247788:-1 gene:ENSMUSG00000027341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// BC033429 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730494N06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:32373 IMAGE:5035633), complete cds. // chr2 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0 /// BC080755 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 5730494N06 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4948501), with apparent retained intron. // chr2 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
AK138039 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130075O06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:132507218:132513088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_175113 // RefSeq // Mus musculus tRNA methyltransferase 6 (Trmt6), mRNA. // chr2 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000039554 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:132804207:132816054:-1 gene:ENSMUSG00000037376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000152836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:132804207:132810635:-1 gene:ENSMUSG00000037376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// AK014359 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3300001M20 product:hypothetical S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases structure containing protein, full insert sequence. // chr2 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// BC049083 // GenBank // Mus musculus tRNA methyltransferase 6 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5706639), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC052648 // GenBank // Mus musculus tRNA methyltransferase 6 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:60804 IMAGE:30030801), complete cds. // chr2 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// XM_006500052 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tRNA methyltransferase 6 (Trmt6), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// ENSMUST00000147336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:132804207:132816055:-1 gene:ENSMUSG00000037376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// GENSCAN00000019621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:132805155:132815934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0
NM_177303 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat neuronal 4 (Lrrn4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000049787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:132868305:132880891:-1 gene:ENSMUSG00000043110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY325108 // GenBank // Mus musculus neuronal leucine rich repeat-4 mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:132869509:132879895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_198029 // RefSeq // Mus musculus fermitin family homolog 1 (Drosophila) (Fermt1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000038280 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:132904389:132945906:-1 gene:ENSMUSG00000027356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000134937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:132904389:132945629:-1 gene:ENSMUSG00000027356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK030947 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830467P10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr2 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC029093 // GenBank // Mus musculus fermitin family homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:3501459), complete cds. // chr2 // 67 // 41 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000019612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:132882172:132957823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 97 // 28 // 29 // 1
NM_010403 // RefSeq // Mus musculus hydroxyacid oxidase 1, liver (Hao1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000028704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:134497361:134554368:-1 gene:ENSMUSG00000027261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF104312 // GenBank // Mus musculus glycolate oxidase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119535 // GenBank // Mus musculus hydroxyacid oxidase 1, liver, mRNA (cDNA clone MGC:141210 IMAGE:40056371), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC119536 // GenBank // Mus musculus hydroxyacid oxidase 1, liver, mRNA (cDNA clone MGC:141211 IMAGE:40056372), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:134498257:134554332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000082510 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:136026151:136026251:-1 gene:ENSMUSG00000064444 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT040096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
BC099417 // GenBank // Mus musculus p21 (CDKN1A)-activated kinase 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:30931624), complete cds. // chr2 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// NM_172858 // RefSeq // Mus musculus p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 7 (Pak7), mRNA. // chr2 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSMUST00000035264 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:136081104:136387938:-1 gene:ENSMUSG00000039913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 1 /// ENSMUST00000077200 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:136081897:136387960:-1 gene:ENSMUSG00000039913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// AK079080 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330159N09 product:p21 (CDKN1A)-activated kinase 7, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 1 /// AY487425 // GenBank // Mus musculus p21-activated kinase 5 (Pak7) mRNA, complete cds. // chr2 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// GENSCAN00000023928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:136083221:136124303:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000121662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:136744146:136744615:-1 gene:ENSMUSG00000082849 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000054152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:136744146:136744358:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT040112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_013822 // RefSeq // Mus musculus jagged 1 (Jag1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000028735 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:137081456:137116644:-1 gene:ENSMUSG00000027276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF171092 // GenBank // Mus musculus Jagged1 (Jag1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC058675 // GenBank // Mus musculus jagged 1, mRNA (cDNA clone MGC:76404 IMAGE:6834418), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:137083024:137173501:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1
ENSMUST00000116122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:140073032:140073469:-1 gene:ENSMUSG00000080006 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:140073032:140088194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001081090 // RefSeq // Mus musculus ESF1, nucleolar pre-rRNA processing protein, homolog (S. cerevisiae) (Esf1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000046030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:140119883:140170564:-1 gene:ENSMUSG00000045624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC021330 // GenBank HTC // Mus musculus ESF1, nucleolar pre-rRNA processing protein, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:4511843), containing frame-shift errors. // chr2 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC032932 // GenBank // Mus musculus ESF1, nucleolar pre-rRNA processing protein, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:1529010), complete cds. // chr2 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// BC096029 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30609923. // chr2 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC150893 // GenBank // Mus musculus ESF1, nucleolar pre-rRNA processing protein, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:183804 IMAGE:9087804), complete cds. // chr2 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// BC157979 // GenBank // Mus musculus ESF1, nucleolar pre-rRNA processing protein, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189799 IMAGE:9007299), complete cds. // chr2 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:140114042:140168393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001033296 // RefSeq // Mus musculus sel-1 suppressor of lin-12-like 2 (C. elegans) (Sel1l2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XR_374453 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sel-1 suppressor of lin-12-like 2 (C. elegans) (Sel1l2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000122367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:140229855:140389704:-1 gene:ENSMUSG00000074764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC150948 // GenBank // Mus musculus sel-1 suppressor of lin-12-like 2 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:183859 IMAGE:9087859), complete cds. // chr2 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000024592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:140229722:140285824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1
ENSMUST00000083835 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:140440541:140440647:-1 gene:ENSMUSG00000065769 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001172160 // RefSeq // Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 (Flrt3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NM_178382 // RefSeq // Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 (Flrt3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000056760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:140659325:140671400:-1 gene:ENSMUSG00000051379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000110057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:140658198:140671469:-1 gene:ENSMUSG00000051379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// AK021255 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430047I10 product:fibronectin leucine rich transmembrane protein 3, full insert sequence. // chr2 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// AY495670 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6xCBA fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 (Flrt3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// BC052043 // GenBank // Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:62414 IMAGE:5702881), complete cds. // chr2 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000172544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:140650914:140671450:-1 gene:ENSMUSG00000051379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// AK045146 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130040E15 product:fibronectin leucine rich transmembrane protein 3, full insert sequence. // chr2 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
ENSMUST00000143227 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:141229670:141235426:-1 gene:ENSMUSG00000074763 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:141231984:141232370:-1 gene:ENSMUSG00000074763 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158168 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930037H19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081133 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 16B (Kif16b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006498813 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin family member 16B (Kif16b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000043589 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:142617474:142901531:-1 gene:ENSMUSG00000038844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB610968 // GenBank // Mus musculus Kif16b mRNA for kinesin superfamily protein 16B, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:142670144:142765341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:142833229:142902342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001291061 // RefSeq // Mus musculus beaded filament structural protein 1, in lens-CP94 (Bfsp1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_009751 // RefSeq // Mus musculus beaded filament structural protein 1, in lens-CP94 (Bfsp1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000028907 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:143826528:143863173:-1 gene:ENSMUSG00000027420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000099296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:143826528:143862943:-1 gene:ENSMUSG00000027420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AB003147 // GenBank // Mus musculus mRNA for lens fiber cell beaded-filament structure protein, complete cds. // chr2 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// BC057580 // GenBank // Mus musculus beaded filament structural protein 1, in lens-CP94, mRNA (cDNA clone MGC:67055 IMAGE:6412634), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:143826666:143862931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001033778 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5535 (Gm5535), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:144173150:144189290:-1 gene:ENSMUSG00000074758 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000166982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:144174315:144179086:-1 gene:ENSMUSG00000074758 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001199188 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 5 (Snx5), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NM_024225 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 5 (Snx5), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000028909 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:144250123:144270572:-1 gene:ENSMUSG00000027423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000110030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:144250123:144270906:-1 gene:ENSMUSG00000027423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK003091 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0910001N05 product:sorting nexin 5, full insert sequence. // chr2 // 92 // 39 // 11 // 12 // 0 /// AK169545 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630091C02 product:sorting nexin 5, full insert sequence. // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC002242 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 5, mRNA (cDNA clone MGC:7534 IMAGE:3492262), complete cds. // chr2 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000153033 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:144254794:144260762:-1 gene:ENSMUSG00000027423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000019208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:144196376:144261479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONMMUT040233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
ENSMUST00000083791 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:144261589:144261726:-1 gene:ENSMUSG00000065725 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT040234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_172859 // RefSeq // Mus musculus double zinc ribbon and ankyrin repeat domains 1 (Dzank1), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000081982 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:144470557:144527414:-1 gene:ENSMUSG00000037259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000124823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:144508823:144527364:-1 gene:ENSMUSG00000037259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 28 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000163701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:144470557:144527398:-1 gene:ENSMUSG00000037259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC089524 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330439K17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30249791), complete cds. // chr2 // 100 // 28 // 13 // 13 // 0 /// BC141156 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330439K17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:176117 IMAGE:9055768), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// BC145464 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330439K17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:179034 IMAGE:9054026), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000053700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:144474924:144525688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0
NM_015754 // RefSeq // Mus musculus retinoblastoma binding protein 9 (Rbbp9), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000028915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:144542265:144550869:-1 gene:ENSMUSG00000027428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000140340 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:144543821:144550790:-1 gene:ENSMUSG00000027428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC011107 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma binding protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:19260 IMAGE:3982875), complete cds. // chr2 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// BC050201 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma binding protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:60525 IMAGE:30013927), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC147814 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma binding protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:182917 IMAGE:9087531), complete cds. // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC147815 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma binding protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:182918 IMAGE:9087532), complete cds. // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AF039563 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma binding protein (Bog) mRNA, complete cds. // chr2 // 55 // 77 // 11 // 20 // 0 /// GENSCAN00000053694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:144543783:144550778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001037929 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 14092 (Gm14092), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:145550652:145554982:-1 gene:ENSMUSG00000074753 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_025820 // RefSeq // Mus musculus Crn, crooked neck-like 1 (Drosophila) (Crnkl1), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000001818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:145917479:145935014:-1 gene:ENSMUSG00000001767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC029187 // GenBank // Mus musculus Crn, crooked neck-like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:35710 IMAGE:3495255), complete cds. // chr2 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:145918424:145934604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
NM_023504 // RefSeq // Mus musculus NK2 homeobox 4 (Nkx2-4), mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006499301 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NK2 homeobox 4 (Nkx2-4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000067020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:147083316:147085445:-1 gene:ENSMUSG00000054160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF202039 // GenBank // Mus musculus homeobox transcription factor (Nkx2-4) mRNA, partial cds. // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK005620 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700001P03 product:similar to HOMEOBOX TRANSCRIPTION FACTOR (FRAGMENT) [Mus musculus], full insert sequence. // chr2 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:147083876:147148845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1
NM_001077632 // RefSeq // Mus musculus NK2 homeobox 2 (Nkx2-2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// NM_010919 // RefSeq // Mus musculus NK2 homeobox 2 (Nkx2-2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// XM_006498898 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NK2 homeobox 2 (Nkx2-2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// XM_006498900 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NK2 homeobox 2 (Nkx2-2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000067075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:147183083:147186404:-1 gene:ENSMUSG00000027434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:147177546:147186101:-1 gene:ENSMUSG00000027434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC138159 // GenBank // Mus musculus NK2 transcription factor related, locus 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169783 IMAGE:8861178), complete cds. // chr2 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// BC138160 // GenBank // Mus musculus NK2 transcription factor related, locus 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169784 IMAGE:8861179), complete cds. // chr2 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// U31566 // GenBank // Mus musculus homeodomain protein (Nkx-2.2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:147183995:147186018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
ENSMUST00000119242 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:147280603:147281084:-1 gene:ENSMUSG00000081971 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000038157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:147280701:147281084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 90 // 8 // 9 // 0
NM_001291065 // RefSeq // Mus musculus forkhead box A2 (Foxa2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_001291067 // RefSeq // Mus musculus forkhead box A2 (Foxa2), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NM_010446 // RefSeq // Mus musculus forkhead box A2 (Foxa2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047315 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:148042877:148046969:-1 gene:ENSMUSG00000037025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109964 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:148042877:148045948:-1 gene:ENSMUSG00000037025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// L10409 // GenBank // Mouse fork head related protein (HNF-3beta) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000172928 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:148043542:148046896:-1 gene:ENSMUSG00000037025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:148043514:148071504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_009378 // RefSeq // Mus musculus thrombomodulin (Thbd), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099270 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:148404466:148408188:-1 gene:ENSMUSG00000074743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019154 // GenBank // Mus musculus thrombomodulin, mRNA (cDNA clone MGC:29138 IMAGE:5065481), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// CT010375 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836C0953D for gene Thbd, Thrombomodulin; complete cds, incl. stopcodon. // chr2 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000001791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:148406213:148407946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_010740 // RefSeq // Mus musculus CD93 antigen (Cd93), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000099269 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:148436640:148443563:-1 gene:ENSMUSG00000027435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF081789 // GenBank // Mus musculus cell surface antigen AA4 (AA4) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT040378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_019632 // RefSeq // Mus musculus N-ethylmaleimide sensitive fusion protein attachment protein beta (Napb), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000028926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:148693985:148732467:-1 gene:ENSMUSG00000027438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000136513 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:148693985:148732413:-1 gene:ENSMUSG00000027438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC038362 // GenBank // Mus musculus N-ethylmaleimide sensitive fusion protein attachment protein beta, mRNA (cDNA clone MGC:36510 IMAGE:5368175), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC049874 // GenBank // Mus musculus N-ethylmaleimide sensitive fusion protein attachment protein beta, mRNA (cDNA clone MGC:54909 IMAGE:5360432), complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// X61455 // GenBank // M.musculus mRNA for I47 clone. // chr2 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000140647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:148706418:148732391:-1 gene:ENSMUSG00000027438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// AK078224 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430524F19 product:N-ethylmaleimide sensitive fusion protein attachment protein beta, full insert sequence. // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000001770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:148697396:148707224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_030059 // RefSeq // Mus musculus cystatin 11 (Cst11), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000028934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:148768609:148771497:-1 gene:ENSMUSG00000036958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF454373 // GenBank // Mus musculus cystatin-related epididymal spermatogenic protein 2 (Cres2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC100526 // GenBank // Mus musculus cystatin 11, mRNA (cDNA clone MGC:118388 IMAGE:30920256), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:148770272:148771403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_029960 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9230104L09 gene (9230104L09Rik), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000028937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:148846711:148850934:-1 gene:ENSMUSG00000027446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC104302 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9230104L09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:129250 IMAGE:40043696), complete cds. // chr2 // 83 // 86 // 20 // 24 // 0 /// BC104303 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9230104L09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:129251 IMAGE:40043697), complete cds. // chr2 // 83 // 86 // 20 // 24 // 0 /// ENSMUST00000149457 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:148846904:148865038:-1 gene:ENSMUSG00000027446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000001772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:148845940:148850880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
NM_009976 // RefSeq // Mus musculus cystatin C (Cst3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000028938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:148871722:148875576:-1 gene:ENSMUSG00000027447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000144845 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:148872848:148875692:-1 gene:ENSMUSG00000027447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0 /// AF311741 // GenBank // Mus musculus cystatin C precursor, mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// AF483486 // GenBank // Mus musculus strain ILS cystatin C mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// AF483487 // GenBank // Mus musculus strain ISS cystatin C mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// BC002072 // GenBank // Mus musculus cystatin C, mRNA (cDNA clone MGC:6210 IMAGE:3593373), complete cds. // chr2 // 81 // 91 // 17 // 21 // 0 /// M59470 // GenBank // Mouse cystatin C mRNA, complete cds. // chr2 // 76 // 91 // 16 // 21 // 0 /// AK212642 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0125K11, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000028938, based on BLAT search. // chr2 // 73 // 65 // 11 // 15 // 0 /// ENSMUST00000149691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:148872472:148875451:-1 gene:ENSMUSG00000027447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// GENSCAN00000001733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:148871832:148875377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0
XM_006500540 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 14129 (Gm14129), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000122436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:148927735:148931707:-1 gene:ENSMUSG00000081580 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:148895307:149003239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
XM_006500541 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cystatin-related protein 1-like (LOC102636921), mRNA. // chr2 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000081553 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:148990343:149003251:-1 gene:ENSMUSG00000063507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000109942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:148990343:149003251:-1 gene:ENSMUSG00000063507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000001741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:148895307:149003239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
ENSMUST00000099266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:149015732:149017237:-1 gene:ENSMUSG00000074739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AK133133 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930590N04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000001782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:149057113:149184612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
XM_006543693 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C530025M09 gene (C530025M09Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_400335 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C530025M09 gene (C530025M09Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:149830524:149831213:-1 gene:ENSMUSG00000074737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK082966 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530025M09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
ENSMUST00000119999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:150110582:150111576:-1 gene:ENSMUSG00000083055 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:150078511:150210641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
XM_006500531 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 14-like (LOC102633750), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:150254518:150255591:-1 gene:ENSMUSG00000074735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
ENSMUST00000122076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:150398256:150399399:-1 gene:ENSMUSG00000083964 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000055881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:150398256:150399399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001177550 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 442 (Zfp442), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000109916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:150407141:150451486:-1 gene:ENSMUSG00000068130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AB470967 // GenBank // Mus musculus ZIPO-II mRNA for zinc-finger protein in podocyte II, complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC023805 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 442, mRNA (cDNA clone MGC:38507 IMAGE:5352880), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000185796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:150407977:150411337:-1 gene:ENSMUSG00000068130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_001034900 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 345 (Zfp345), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000109914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:150470991:150485091:-1 gene:ENSMUSG00000074731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC150850 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 345, mRNA (cDNA clone MGC:183761 IMAGE:9087761), complete cds. // chr2 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// BC150852 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 345, mRNA (cDNA clone MGC:183763 IMAGE:9087763), complete cds. // chr2 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
NM_146193 // RefSeq // Mus musculus BTB (POZ) domain containing 1 (Btbd1), mRNA. // chr2 // 81 // 100 // 30 // 37 // 0 /// ENSMUST00000026093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:81792075:81829431:-1 gene:ENSMUSG00000025103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 100 // 30 // 37 // 0 /// ENSMUST00000121441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:150499466:150500845:-1 gene:ENSMUSG00000083325 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC031192 // GenBank // Mus musculus BTB (POZ) domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:37676 IMAGE:5043252), complete cds. // chr2 // 83 // 62 // 19 // 23 // 0 /// BC072618 // GenBank // Mus musculus BTB (POZ) domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:92985 IMAGE:6811133), complete cds. // chr2 // 81 // 100 // 30 // 37 // 0 /// BC087937 // GenBank // Mus musculus BTB (POZ) domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:107314 IMAGE:6705214), complete cds. // chr2 // 81 // 100 // 30 // 37 // 0 /// XM_006541322 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BTB (POZ) domain containing 1 (Btbd1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// GENSCAN00000007386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:81777754:81829391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 92 // 27 // 34 // 0 /// GENSCAN00000055899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:150499466:150500845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_027977 // RefSeq // Mus musculus adipocyte plasma membrane associated protein (Apmap), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006500198 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adipocyte plasma membrane associated protein (Apmap), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006500200 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adipocyte plasma membrane associated protein (Apmap), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000046399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:150583080:150608567:-1 gene:ENSMUSG00000033096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000126704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:150587121:150600254:-1 gene:ENSMUSG00000033096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AJ310638 // GenBank // Mus musculus mRNA for integral plasma membrane protein. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC055706 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310001A20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:66739 IMAGE:6403495), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:150583979:150608479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT040412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_080575 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA synthetase short-chain family member 1 (Acss1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000028944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:150618105:150668258:-1 gene:ENSMUSG00000027452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB046742 // GenBank // Mus musculus AceCS2 mRNA for acetyl-CoA synthetase 2, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC030930 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA synthetase short-chain family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:31687 IMAGE:4911679), complete cds. // chr2 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC092278 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA synthetase short-chain family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:102382 IMAGE:3710505), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:150619613:150668197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_054068 // RefSeq // Mus musculus visual system homeobox 1 homolog (zebrafish) (Vsx1), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000046095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:150680702:150689360:-1 gene:ENSMUSG00000033080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF391758 // GenBank // Mus musculus homeodomain protein RINX (Rinx) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF395732 // GenBank // Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK157311 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830210J18 product:visual system homeobox 1 homolog (zebrafish), full insert sequence. // chr2 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// AY056825 // GenBank // Mus musculus transcription factor VSX1 (Vsx1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC057647 // GenBank // Mus musculus visual system homeobox 1 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:67932 IMAGE:4511665), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC138456 // GenBank // Mus musculus visual system homeobox 1 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:170081 IMAGE:8861476), complete cds. // chr2 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// BC138460 // GenBank // Mus musculus visual system homeobox 1 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:170085 IMAGE:8861480), complete cds. // chr2 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:150673769:150688960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_207204 // RefSeq // Mus musculus ninein-like (Ninl), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENSMUST00000109896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:2:150934519:151009398:-1 gene:ENSMUSG00000068115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENSMUST00000124135 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:150937554:150952792:-1 gene:ENSMUSG00000068115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 22 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000128564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:150963462:151009332:-1 gene:ENSMUSG00000068115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 20 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000128627 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:150974123:151039382:-1 gene:ENSMUSG00000068115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 16 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000150595 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:150958559:150971080:-1 gene:ENSMUSG00000068115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 22 // 11 // 11 // 0 /// BC067071 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930519N13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:91335 IMAGE:30615484), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000149979 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:150966183:151009376:-1 gene:ENSMUSG00000068115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 16 // 16 // 8 // 51 // 1 /// GENSCAN00000055885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:150935248:150980180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 45 // 45 // 0
NM_026086 // RefSeq // Mus musculus N-acetylneuraminic acid phosphatase (Nanp), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000057074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:91236787:91238116:1 gene:ENSMUSG00000043346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000066640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:151029685:151039398:-1 gene:ENSMUSG00000053916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC018527 // GenBank // Mus musculus N-acetylneuraminic acid phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:27982 IMAGE:3596532), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC083086 // GenBank // Mus musculus N-acetylneuraminic acid phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:103377 IMAGE:6515732), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000012783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:91236811:91237557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000055900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:151030260:151039326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0
NM_198655 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4921509C19 gene (4921509C19Rik), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000080132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:151470542:151476153:-1 gene:ENSMUSG00000061525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001276400 // RefSeq // Mus musculus RAD21-like (S. pombe) (Rad21l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096439 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:151645404:151668533:-1 gene:ENSMUSG00000074704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:151645404:151668533:-1 gene:ENSMUSG00000074704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB574185 // GenBank // Mus musculus RAD21L mRNA for RAD21-like protein, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB602048 // GenBank // Mus musculus RAD21L mRNA for Rad21Like protein, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// HQ603828 // GenBank // Mus musculus RAD21L (Rad21l) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:151645404:151676772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001276400 // RefSeq // Mus musculus RAD21-like (S. pombe) (Rad21l), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000096439 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:151645404:151668533:-1 gene:ENSMUSG00000074704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000180195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:151645404:151668533:-1 gene:ENSMUSG00000074704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB574185 // GenBank // Mus musculus RAD21L mRNA for RAD21-like protein, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB602048 // GenBank // Mus musculus RAD21L mRNA for Rad21Like protein, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// HQ603828 // GenBank // Mus musculus RAD21L (Rad21l) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:151645404:151676772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
XR_400346 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930556L07 gene (4930556L07Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// XR_400347 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930556L07 gene (4930556L07Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000134422 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:151747578:151749978:-1 gene:ENSMUSG00000086800 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK016149 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930556L07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AK016389 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930593I08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT040498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT040499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT040496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// NONMMUT040497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// NONMMUT040495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001083921 // RefSeq // Mus musculus RanBP-type and C3HC4-type zinc finger containing 1 (Rbck1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_019705 // RefSeq // Mus musculus RanBP-type and C3HC4-type zinc finger containing 1 (Rbck1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000028964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152316334:152332653:-1 gene:ENSMUSG00000027466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109847 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152316334:152332412:-1 gene:ENSMUSG00000027466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000145889 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:152318312:152323498:-1 gene:ENSMUSG00000027466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AF124663 // GenBank // Mus musculus UbcM4 interacting protein 28 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC034555 // GenBank // Mus musculus RanBP-type and C3HC4-type zinc finger containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:19065 IMAGE:4192310), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000130165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:152316334:152322997:-1 gene:ENSMUSG00000027466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// BC032089 // GenBank HTC // Mus musculus RanBP-type and C3HC4-type zinc finger containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3598297), with apparent retained intron. // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000018529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:152316834:152337381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_175093 // RefSeq // Mus musculus tribbles homolog 3 (Drosophila) (Trib3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000040312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152337422:152344032:-1 gene:ENSMUSG00000032715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000123145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:152339748:152343988:-1 gene:ENSMUSG00000032715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 80 // 34 // 8 // 10 // 0 /// AF358868 // GenBank // Mus musculus TRB-3 mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC012955 // GenBank // Mus musculus tribbles homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:18731 IMAGE:3980838), complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:152338207:152344109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_001009948 // RefSeq // Mus musculus neurensin 2 (Nrsn2), mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006499310 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurensin 2 (Nrsn2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006499311 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurensin 2 (Nrsn2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006499312 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurensin 2 (Nrsn2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000079278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152368755:152376638:-1 gene:ENSMUSG00000059361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK140190 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230334P16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC088982 // GenBank // Mus musculus neurensin 2, mRNA (cDNA clone MGC:113772 IMAGE:5700110), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:152369501:152374509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_011438 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 12 (Sox12), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000063332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:152393614:152398046:-1 gene:ENSMUSG00000051817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000182625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152393611:152398063:-1 gene:ENSMUSG00000051817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC067019 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 12, mRNA (cDNA clone MGC:90023 IMAGE:6833848), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:152396754:152397698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_175126 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 3 (Zcchc3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000099207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152411955:152415027:-1 gene:ENSMUSG00000074682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC055755 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:67159 IMAGE:6412435), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000018520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:152413575:152414777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0
NM_001037933 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 23 (Defb23), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152459055:152464620:-1 gene:ENSMUSG00000074681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132568 // GenBank // Mus musculus defensin beta 23, mRNA (cDNA clone MGC:164199 IMAGE:40130845), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132570 // GenBank // Mus musculus defensin beta 23, mRNA (cDNA clone MGC:164201 IMAGE:40130847), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ012034 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 23 (Defb23) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:152459150:152464592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001002791 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 22 (Defb22), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028966 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152485663:152490138:-1 gene:ENSMUSG00000027468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139230 // GenBank // Mus musculus defensin beta 22, mRNA (cDNA clone MGC:170857 IMAGE:8862252), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145928 // GenBank // Mus musculus defensin beta 22, mRNA (cDNA clone MGC:175815 IMAGE:40131231), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ012033 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 22 (Defb22) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:152485724:152490111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001039120 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 26 (Defb26), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099205 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152507798:152511692:-1 gene:ENSMUSG00000074680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC139131 // GenBank // Mus musculus defensin beta 26, mRNA (cDNA clone MGC:170758 IMAGE:8862153), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ012037 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 26 (Defb26) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001001444 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 29 (Defb29), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152538714:152540098:-1 gene:ENSMUSG00000044249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF515626 // GenBank // Mus musculus beta defensin 29 precursor (Defb29) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC146010 // GenBank // Mus musculus defensin beta 29, mRNA (cDNA clone MGC:175897 IMAGE:40131313), complete cds. // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC146012 // GenBank // Mus musculus defensin beta 29, mRNA (cDNA clone MGC:175899 IMAGE:40131315), complete cds. // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:152539670:152580247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_145157 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 19 (Defb19), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000053180 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152576086:152580312:-1 gene:ENSMUSG00000050645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// AF532614 // GenBank // Mus musculus testis-specific beta-defensin-like protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// AY098993 // GenBank // Mus musculus testis-specific beta-defensin-like protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// BC049701 // GenBank // Mus musculus defensin beta 19, mRNA (cDNA clone MGC:58620 IMAGE:6707101), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// DQ012035 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 24 (Defb24) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000018511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:152539670:152580247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 19 // 19 // 9 // 48 // 1
NM_001037752 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 45 (Defb45), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000109834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152593191:152596482:-1 gene:ENSMUSG00000062124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY591384 // GenBank // Mus musculus beta defensin (DEFB27) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// DQ012038 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 27 (Defb27) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000131096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:152593191:152599399:-1 gene:ENSMUSG00000062124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONMMUT040534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// GENSCAN00000018539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:152593286:152604640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001039122 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 25 (Defb25), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152622356:152623053:-1 gene:ENSMUSG00000074678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132662 // GenBank // Mus musculus defensin beta 25, mRNA (cDNA clone MGC:164293 IMAGE:40130939), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// DQ012036 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 25 (Defb25) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_010226 // RefSeq // Mus musculus forkhead box S1 (Foxs1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000099200 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:152931898:152933208:-1 gene:ENSMUSG00000074676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC096604 // GenBank // Mus musculus forkhead box S1, mRNA (cDNA clone MGC:106097 IMAGE:5372625), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC131937 // GenBank // Mus musculus forkhead box S1, mRNA (cDNA clone MGC:163568 IMAGE:40130214), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC131939 // GenBank // Mus musculus forkhead box S1, mRNA (cDNA clone MGC:163570 IMAGE:40130216), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:152932142:152947161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_198617 // RefSeq // Mus musculus TSPY-like 3 (Tspyl3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000099194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:153222370:153225441:-1 gene:ENSMUSG00000074671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC058340 // GenBank // Mus musculus TSPY-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:58351 IMAGE:6590443), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_018807 // RefSeq // Mus musculus pleiomorphic adenoma gene-like 2 (Plagl2), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000056924 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:153227759:153241426:-1 gene:ENSMUSG00000051413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000109795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:153227772:153237908:-1 gene:ENSMUSG00000051413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AB051854 // GenBank // Mus musculus mRNA for PLAGL2, complete cds. // chr2 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// AK129087 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0198 protein. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK150243 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530147I02 product:pleiomorphic adenoma gene-like 2, full insert sequence. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC037664 // GenBank // Mus musculus pleiomorphic adenoma gene-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5401617), complete cds. // chr2 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC078453 // GenBank // Mus musculus pleiomorphic adenoma gene-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:90671 IMAGE:6405960), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001195390 // RefSeq // Mus musculus COMM domain containing 7 (Commd7), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NM_133850 // RefSeq // Mus musculus COMM domain containing 7 (Commd7), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006500478 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus COMM domain containing 7 (Commd7), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// XM_006500480 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus COMM domain containing 7 (Commd7), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000071852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:153616933:153632781:-1 gene:ENSMUSG00000056941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109782 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:153618834:153632740:-1 gene:ENSMUSG00000056941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000147822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:153618834:153632731:-1 gene:ENSMUSG00000056941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC092215 // GenBank // Mus musculus COMM domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:106613 IMAGE:6819383), complete cds. // chr2 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC094216 // GenBank // Mus musculus COMM domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:106614 IMAGE:6820900), complete cds. // chr2 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// XM_006500479 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus COMM domain containing 7 (Commd7), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000031501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:153619436:153632677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
NM_029599 // RefSeq // Mus musculus Sad1 and UNC84 domain containing 5 (Sun5), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006500375 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Sad1 and UNC84 domain containing 5 (Sun5), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000028982 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:153856188:153871084:-1 gene:ENSMUSG00000027480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000124414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:153861462:153871084:-1 gene:ENSMUSG00000027480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 83 // 47 // 15 // 18 // 0 /// ENSMUST00000129011 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:153865399:153871084:-1 gene:ENSMUSG00000027480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 95 // 55 // 20 // 21 // 0 /// AY307077 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis-related gene 4 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// FJ667498 // GenBank // Mus musculus SPAG4L-2 (Spag4l) mRNA, complete cds. // chr2 // 89 // 97 // 33 // 37 // 0 /// GENSCAN00000031499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:153860533:153867639:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT040595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 95 // 55 // 20 // 21 // 0
NM_009228 // RefSeq // Mus musculus syntrophin, acidic 1 (Snta1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000028991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:154376313:154408081:-1 gene:ENSMUSG00000027488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000109728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:154376313:154408099:-1 gene:ENSMUSG00000027488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC018546 // GenBank // Mus musculus syntrophin, acidic 1, mRNA (cDNA clone MGC:18480 IMAGE:3674921), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// U00677 // GenBank // Mus musculus alpha-syntrophin mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:154376816:154407971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0
NM_001291105 // RefSeq // Mus musculus E2F transcription factor 1 (E2f1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NM_007891 // RefSeq // Mus musculus E2F transcription factor 1 (E2f1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000000894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:154559634:154569720:-1 gene:ENSMUSG00000027490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000103145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:154559407:154569892:-1 gene:ENSMUSG00000027490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AF483514 // GenBank // Mus musculus strain ILS E2F1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// AF483515 // GenBank // Mus musculus strain ISS E2F1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC052160 // GenBank // Mus musculus E2F transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:59347 IMAGE:6330425), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// L21973 // GenBank // Mus musculus E2F1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:154560688:154569734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_021534 // RefSeq // Mus musculus peroxisomal membrane protein 4 (Pxmp4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:154585758:154603708:-1 gene:ENSMUSG00000000876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ271476 // GenBank // Mus musculus mRNA for PMP24 protein. // chr2 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC025796 // GenBank // Mus musculus peroxisomal membrane protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:35858 IMAGE:5100832), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK013793 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900075O18 product:peroxisomal membrane protein 4, full insert sequence. // chr2 // 60 // 80 // 12 // 20 // 0 /// XM_006499971 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peroxisomal membrane protein 4 (Pxmp4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000109703 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:154595246:154603688:-1 gene:ENSMUSG00000000876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK143785 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430108A16 product:peroxisomal membrane protein 4, full insert sequence. // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000003595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:154587829:154603872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000181369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:154612937:154613437:-1 gene:ENSMUSG00000097602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK015848 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930519P11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145231 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930024O13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 78 // 92 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:154613119:154614260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000184654 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:154769255:154769932:-1 gene:ENSMUSG00000098640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000185009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:154769255:154770030:-1 gene:ENSMUSG00000098640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:translated_processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:154749278:154770030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_026030 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 (beta) (Eif2s2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000099173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:154871410:154892935:-1 gene:ENSMUSG00000074656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000166171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:154871418:154892782:-1 gene:ENSMUSG00000074656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// BC003848 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 (beta), mRNA (cDNA clone MGC:6425 IMAGE:3594058), complete cds. // chr2 // 92 // 75 // 11 // 12 // 0 /// BC113766 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 (beta), mRNA (cDNA clone MGC:130606 IMAGE:40058503), complete cds. // chr2 // 90 // 63 // 9 // 10 // 0
ENSMUST00000116491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:155459501:155460892:-1 gene:ENSMUSG00000080237 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:155460407:155460892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0
NM_144786 // RefSeq // Mus musculus gamma-glutamyltransferase 7 (Ggt7), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000029131 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:155490379:155514848:-1 gene:ENSMUSG00000027603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000138033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:155494884:155499159:-1 gene:ENSMUSG00000027603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000148296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:155495953:155503133:-1 gene:ENSMUSG00000027603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 90 // 32 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000176117 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:155500765:155506954:-1 gene:ENSMUSG00000027603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// AK131175 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mFLJ00311 protein. // chr2 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// BC005772 // GenBank // Mus musculus gamma-glutamyltransferase 7, mRNA (cDNA clone MGC:12004 IMAGE:3602314), complete cds. // chr2 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:155490953:155514797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_145537 // RefSeq // Mus musculus ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 2 (Edem2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006498554 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 2 (Edem2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// XM_006498556 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 2 (Edem2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000040833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:155701677:155729475:-1 gene:ENSMUSG00000038312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000139868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:155708980:155716359:-1 gene:ENSMUSG00000038312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 91 // 31 // 10 // 11 // 0 /// BC008268 // GenBank // Mus musculus ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:6917 IMAGE:2811074), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000025482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:155702095:155729990:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NR_015528 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC029722 (BC029722), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000124586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:155817730:155819426:-1 gene:ENSMUSG00000074649 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027788 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 83, member C (Fam83c), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029143 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:155827548:155834854:-1 gene:ENSMUSG00000074647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC113190 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 83, member C, mRNA (cDNA clone MGC:133001 IMAGE:40062623), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC113797 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 83, member C, mRNA (cDNA clone MGC:133000 IMAGE:40062621), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:155829183:155930036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK017420 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5530400B04 product:hypothetical Phospholipase D/nuclease structure containing protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_008109 // RefSeq // Mus musculus growth differentiation factor 5 (Gdf5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:155941023:155945367:-1 gene:ENSMUSG00000038259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB259648 // GenBank // Mus musculus Gdf5 mRNA for growth differentiation factor 5, complete cds, allele:brp. // chr2 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC034546 // GenBank // Mus musculus growth differentiation factor 5, mRNA (cDNA clone MGC:18445 IMAGE:4190036), complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// U08337 // GenBank // Mus musculus CD-1 putative growth factor GDF5 (Gdf5) mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:155941364:155945055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001136556 // RefSeq // Mus musculus fer-1-like 4 (C. elegans) (Fer1l4), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:156019139:156052947:-1 gene:ENSMUSG00000013338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000138297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:156019140:156024876:-1 gene:ENSMUSG00000013338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK018656 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130402C12 product:RIKEN cDNA 9130402C12 gene, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000150538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:156019141:156036628:-1 gene:ENSMUSG00000013338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// XM_006500308 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fer-1-like 4 (C. elegans) (Fer1l4), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000025471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:156019260:156052149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0
NM_001136556 // RefSeq // Mus musculus fer-1-like 4 (C. elegans) (Fer1l4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006500308 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fer-1-like 4 (C. elegans) (Fer1l4), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000109611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:156019139:156052947:-1 gene:ENSMUSG00000013338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:156019260:156052149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_010911 // RefSeq // Mus musculus nitrogen fixation gene 1 (S. cerevisiae) (Nfs1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:156123639:156144186:-1 gene:ENSMUSG00000027618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC010586 // GenBank // Mus musculus nitrogen fixation gene 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:11683 IMAGE:3711352), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000125449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:156138507:156144153:-1 gene:ENSMUSG00000027618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// BC012651 // GenBank HTC // Mus musculus nitrogen fixation gene 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:4037591), with apparent retained intron. // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000025477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:156124264:156144116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_020255 // RefSeq // Mus musculus SCAN domain-containing 1 (Scand1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:156311847:156312704:-1 gene:ENSMUSG00000046229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF220501 // GenBank // Mus musculus PPARgamma cofactor 2 (Pgc2) mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK220179 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4092 protein. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010724 // GenBank // Mus musculus SCAN domain-containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:6945 IMAGE:2812488), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF106473 // GenBank // Mus musculus leucine-rich-domain inter-acting protein 1 (Leap1) mRNA, complete cds. // chr2 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:156311920:156319524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NR_024329 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2900097C17 gene (2900097C17Rik), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB041588 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-2630, similar to Mus musculus Gng3lg mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONMMUT040759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT024635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
AK133873 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730471H19 product:hypothetical ENV polyprotein (coat polyprotein)/F-MuLV receptor-binding containing protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000099141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:156856616:156857946:-1 gene:ENSMUSG00000074629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK015827 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930518I15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029983 // RefSeq // Mus musculus Src-like-adaptor 2 (Sla2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:156872457:156887078:-1 gene:ENSMUSG00000027636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:156872922:156887192:-1 gene:ENSMUSG00000027636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF287467 // GenBank // Mus musculus Src-like adaptor protein-2 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AF434990 // GenBank // Mus musculus Src-like adapter protein-2 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC052655 // GenBank // Mus musculus Src-like-adaptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:60811 IMAGE:30040401), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:156874420:156897235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_025853 // RefSeq // Mus musculus DSN1, MIND kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae) (Dsn1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000103129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:156995265:157007075:-1 gene:ENSMUSG00000027635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000103130 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:156995277:157007154:-1 gene:ENSMUSG00000027635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000146413 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:156997724:157007030:-1 gene:ENSMUSG00000027635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// AK139887 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020032E04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AK145373 // GenBank HTC // Mus musculus 1 cell embryo 1 cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I0C0028K22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC025079 // GenBank // Mus musculus DSN1, MIND kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:35705 IMAGE:3499844), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC046807 // GenBank // Mus musculus DSN1, MIND kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:61253 IMAGE:6829342), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000006719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:156992026:157078909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
FJ977045 // GenBank // Mus musculus suppressor of glucose by autophagy (Soga) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001164663 // RefSeq // Mus musculus suppressor of glucose, autophagy associated 1 (Soga1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// ENSMUST00000069098 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:157015799:157079254:-1 gene:ENSMUSG00000055485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:156992026:157078909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1
NM_001139516 // RefSeq // Mus musculus retinoblastoma-like 1 (p107) (Rbl1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// NM_011249 // RefSeq // Mus musculus retinoblastoma-like 1 (p107) (Rbl1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006499018 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus retinoblastoma-like 1 (p107) (Rbl1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:157145893:157204512:-1 gene:ENSMUSG00000027641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000124518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:157174986:157204526:-1 gene:ENSMUSG00000027641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// BC060124 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma-like 1 (p107), mRNA (cDNA clone MGC:76414 IMAGE:6408844), complete cds. // chr2 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0 /// U27177 // GenBank // Mus musculus p107 (p107) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// U27178 // GenBank // Mus musculus p68 (p107) mRNA, splice variant, complete cds. // chr2 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000154721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:157166978:157204534:-1 gene:ENSMUSG00000027641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 70 // 70 // 32 // 46 // 1 /// AK147064 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920096E10 product:retinoblastoma-like 1 (p107), full insert sequence. // chr2 // 70 // 70 // 32 // 46 // 1 /// GENSCAN00000006748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:157098013:157204455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 83 // 38 // 46 // 1
NM_001039557 // RefSeq // Mus musculus maestro heat-like repeat family member 8 (Mroh8), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143663 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:2:157208550:157279549:-1 gene:ENSMUSG00000074627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC150937 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4922505G16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183848 IMAGE:9087848), complete cds. // chr2 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:157210760:157233215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_016916 // RefSeq // Mus musculus bladder cancer associated protein homolog (human) (Blcap), mRNA. // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000088494 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:157556362:157566361:-1 gene:ENSMUSG00000067787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:157556362:157566337:-1 gene:ENSMUSG00000067787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// AB037891 // GenBank // Mus musculus mRNA for Bc10, complete cds. // chr2 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC026935 // GenBank // Mus musculus bladder cancer associated protein homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:25535 IMAGE:3597231), complete cds. // chr2 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC083339 // GenBank // Mus musculus bladder cancer associated protein homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:102074 IMAGE:6832329), complete cds. // chr2 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_029282 // RefSeq // Mus musculus TELO2 interacting protein 1 (Tti1), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:157981803:158028433:-1 gene:ENSMUSG00000027650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000109522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:157981812:158009362:-1 gene:ENSMUSG00000027650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000126541 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:157995280:158007212:-1 gene:ENSMUSG00000027650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AK128940 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3005702. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC053067 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610036D13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:62394 IMAGE:5698252), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:157991762:158009317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NM_009373 // RefSeq // Mus musculus transglutaminase 2, C polypeptide (Tgm2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000103122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:158116402:158146436:-1 gene:ENSMUSG00000037820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF076928 // GenBank // Mus musculus protein-glutamine gamma-glutamyltransferase (Tgm2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF114266 // GenBank // Mus musculus Gh/tissue transglutaminase (Tgm2) mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// BC016492 // GenBank // Mus musculus transglutaminase 2, C polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:6152 IMAGE:3256943), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M55154 // GenBank // Mouse transglutaminase (TGase) mRNA, complete cds. // chr2 // 78 // 96 // 21 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:158130380:158146366:-1 gene:ENSMUSG00000037820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// AK054108 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230019N23 product:transglutaminase 2, C polypeptide, full insert sequence. // chr2 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000003338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:158117801:158146300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001131021 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D630003M21 gene (D630003M21Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_177657 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D630003M21 gene (D630003M21Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_374459 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA D630003M21 gene (D630003M21Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000046944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:158195751:158229222:-1 gene:ENSMUSG00000037813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000103121 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:158182533:158229222:-1 gene:ENSMUSG00000037813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000169335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:158186158:158229222:-1 gene:ENSMUSG00000037813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC137959 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D630003M21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169583 IMAGE:8860978), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC137960 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D630003M21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169584 IMAGE:8860979), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:158157164:158224026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000083428 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:158356424:158356554:-1 gene:ENSMUSG00000065362 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK133696 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330440K08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr2 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:158353700:158356843:-1 gene:ENSMUSG00000085385 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0
ENSMUST00000083061 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:158358360:158358472:-1 gene:ENSMUSG00000064995 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:158355785:158361513:-1 gene:ENSMUSG00000085385 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000154242 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:158356022:158358464:-1 gene:ENSMUSG00000085385 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK040893 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530040I21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:158333196:158409338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT040863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
ENSMUST00000082471 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:158359798:158359929:-1 gene:ENSMUSG00000064405 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000149667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:158355785:158361513:-1 gene:ENSMUSG00000085385 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000154030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:158355765:158361522:-1 gene:ENSMUSG00000085385 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK040893 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530040I21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK079109 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430008C03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000188429 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:158359797:158359928:-1 gene:ENSMUSG00000100992 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT040855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT040860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT040865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000018665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:158333196:158409338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1
NM_001033411 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 826 (Gm826), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006499793 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 826 (Gm826), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000099127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:2:160311861:160327494:-1 gene:ENSMUSG00000074623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000109475 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:160311393:160313616:-1 gene:ENSMUSG00000074623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC147270 // GenBank // Mus musculus gene model 826, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182452 IMAGE:9056346), complete cds. // chr2 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BC147271 // GenBank // Mus musculus gene model 826, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182432 IMAGE:9056326), complete cds. // chr2 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// XM_006499794 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 826 (Gm826), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// ENSMUST00000138905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:160311744:160334162:-1 gene:ENSMUSG00000074623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONMMUT040918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_010658 // RefSeq // Mus musculus v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene family, protein B (avian) (Mafb), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099126 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:160363703:160367065:-1 gene:ENSMUSG00000074622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016434 // GenBank // Mus musculus v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene family, protein B (avian), mRNA (cDNA clone MGC:25341 IMAGE:4485468), complete cds. // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC038256 // GenBank // Mus musculus v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene family, protein B (avian), mRNA (cDNA clone MGC:47160 IMAGE:5097650), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L36435 // GenBank // Mus Musculus basic domain/leucine zipper transcription factor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000045328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:160365705:160366676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_001291145 // RefSeq // Mus musculus elastin microfibril interfacer 3 (Emilin3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_182840 // RefSeq // Mus musculus elastin microfibril interfacer 3 (Emilin3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:160906438:160912328:-1 gene:ENSMUSG00000050700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:160906437:160912317:-1 gene:ENSMUSG00000050700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC054738 // GenBank // Mus musculus elastin microfibril interfacer 3, mRNA (cDNA clone MGC:65705 IMAGE:6402350), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC057619 // GenBank // Mus musculus elastin microfibril interfacer 3, mRNA (cDNA clone MGC:67556 IMAGE:6402350), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:160907551:160912171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_173368 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 6 (Chd6), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006500185 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 6 (Chd6), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000039782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:160946978:161109022:-1 gene:ENSMUSG00000057133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000134178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:160983184:161109022:-1 gene:ENSMUSG00000057133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000138078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:161008034:161109075:-1 gene:ENSMUSG00000057133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// AK080892 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430201L14 product:DJ661I20.2 (NOVEL HELICASE C-TERMINAL DOMAIN AND SNF2 N-TERMINAL DOMAINS CONTAINING PROTEIN) (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 91 // 34 // 10 // 11 // 0 /// BC150806 // GenBank // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:183717 IMAGE:9087717), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000045314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:160949300:161058004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000121506 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:161254456:161255457:-1 gene:ENSMUSG00000081099 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000028661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:161254456:161284455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
ENSMUST00000157439 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:162816311:162816468:-1 gene:ENSMUSG00000088064 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000117318 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:162982255:162983261:-1 gene:ENSMUSG00000080962 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000055331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:162982255:162986078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_026630 // RefSeq // Mus musculus gametocyte specific factor 1-like (Gtsf1l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000094653 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:163087034:163087855:-1 gene:ENSMUSG00000070708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC048439 // GenBank // Mus musculus gametocyte specific factor 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:58132 IMAGE:6774366), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:163087106:163097785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_001205076 // RefSeq // Mus musculus junctophilin 2 (Jph2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_021566 // RefSeq // Mus musculus junctophilin 2 (Jph2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000017961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:163336242:163397949:-1 gene:ENSMUSG00000017817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:163336242:163397993:-1 gene:ENSMUSG00000017817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC022635 // GenBank // Mus musculus junctophilin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4207990). // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT040996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001205076 // RefSeq // Mus musculus junctophilin 2 (Jph2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_021566 // RefSeq // Mus musculus junctophilin 2 (Jph2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006499972 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus junctophilin 2 (Jph2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000017961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:163336242:163397949:-1 gene:ENSMUSG00000017817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000109425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:163336242:163397993:-1 gene:ENSMUSG00000017817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB024447 // GenBank // Mus musculus JP-2 mRNA for junctophilin type 2, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:163331186:163404827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_173397 // RefSeq // Mus musculus fat storage-inducing transmembrane protein 2 (Fitm2), mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000109418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:163466379:163472629:-1 gene:ENSMUSG00000048486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090994 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D930001I22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107602 IMAGE:6750721), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138522 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D930001I22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170147 IMAGE:8861542), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC138532 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D930001I22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170157 IMAGE:8861552), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT041003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NR_027970 // RefSeq // Mus musculus hepatic nuclear factor 4 alpha, opposite strand (Hnf4aos), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:163493807:163541720:-1 gene:ENSMUSG00000046840 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000141329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:163493807:163541720:-1 gene:ENSMUSG00000046840 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025862 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610008F07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:32474 IMAGE:5050923), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:163494194:163541692:-1 gene:ENSMUSG00000046840 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT041004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT041005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT041006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT041008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONMMUT041007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_012032 // RefSeq // Mus musculus serine incorporator 3 (Serinc3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006499616 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine incorporator 3 (Serinc3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000017851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:163623272:163645131:-1 gene:ENSMUSG00000017707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB029499 // GenBank // Mus musculus AIGP-1 mRNA for axotomy Induced glycoprotein 1, complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AF181684 // GenBank // Mus musculus membrane protein TMS-1 mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC011295 // GenBank // Mus musculus serine incorporator 3, mRNA (cDNA clone MGC:18455 IMAGE:3487943), complete cds. // chr2 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// BC022901 // GenBank // Mus musculus serine incorporator 3, mRNA (cDNA clone MGC:30210 IMAGE:5068196), complete cds. // chr2 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// BC029026 // GenBank // Mus musculus serine incorporator 3, mRNA (cDNA clone MGC:31028 IMAGE:5039323), complete cds. // chr2 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// L29441 // GenBank // Mus musculus mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK145604 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0020N08 product:tumor differentially expressed 1, full insert sequence. // chr2 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// BC058550 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5387787, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000037230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:163625441:163645036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001272052 // RefSeq // Mus musculus adenosine deaminase (Ada), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_007398 // RefSeq // Mus musculus adenosine deaminase (Ada), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000017841 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:163726584:163750239:-1 gene:ENSMUSG00000017697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF483480 // GenBank // Mus musculus strain ILS adenosine deaminase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AF483481 // GenBank // Mus musculus strain ISS adenosine deaminase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// CT010224 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A1251D for gene Ada, Adenosine deaminase; complete cds, incl. stopcodon. // chr2 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// CT010255 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836E0451D for gene Ada, Adenosine deaminase; complete cds, incl. stopcodon. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// M10319 // GenBank // Mouse adenosine deaminase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC002075 // GenBank // Mus musculus adenosine deaminase, mRNA (cDNA clone MGC:6222 IMAGE:3484465), complete cds. // chr2 // 71 // 86 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:163727560:163750320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_183023 // RefSeq // Mus musculus regulating synaptic membrane exocytosis 4 (Rims4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:163859751:163918683:-1 gene:ENSMUSG00000035226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY326955 // GenBank // Mus musculus RIM4 gamma mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:163863903:163882120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_025996 // RefSeq // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 34 (Tomm34), transcript variant Tom34b, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000018466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164053540:164071102:-1 gene:ENSMUSG00000018322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001291155 // RefSeq // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 34 (Tomm34), transcript variant Tom34a, mRNA. // chr2 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000109384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164053540:164071169:-1 gene:ENSMUSG00000018322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// BC018278 // GenBank // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 34, mRNA (cDNA clone MGC:18781 IMAGE:4187356), complete cds. // chr2 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000132602 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164053540:164065715:-1 gene:ENSMUSG00000018322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// AK144450 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630070F02 product:translocase of outer mitochondrial membrane 34, full insert sequence. // chr2 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000037220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164054403:164071039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_008435 // RefSeq // Mus musculus K+ voltage-gated channel, subfamily S, 1 (Kcns1), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045196 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164163619:164171113:-1 gene:ENSMUSG00000040164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF008573 // GenBank // Mus musculus potassium channel alpha subunit (Kv9.1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AK140377 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B530033P10 product:K+ voltage-gated channel, subfamily S, 1, full insert sequence. // chr2 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000037203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164164548:164168837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
NM_145369 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 5 (Wfdc5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_374434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP four-disulfide core domain 5 (Wfdc5), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164176327:164182742:-1 gene:ENSMUSG00000040154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000131974 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:164177467:164182598:-1 gene:ENSMUSG00000040154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AY669505 // GenBank // Mus musculus WAP1 precursor (Wfdc5) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC019734 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 5, mRNA (cDNA clone MGC:30767 IMAGE:3987617), complete cds. // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164178490:164182653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// NONMMUT041036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0
NM_138684 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 12 (Wfdc12), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164189231:164190608:-1 gene:ENSMUSG00000042845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF276975 // GenBank // Mus musculus single WAP motif protein 2 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC030939 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 12, mRNA (cDNA clone MGC:32134 IMAGE:4923469), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_183271 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 15A (Wfdc15a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000063251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164198863:164200130:-1 gene:ENSMUSG00000051769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC100423 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 15A, mRNA (cDNA clone MGC:118228 IMAGE:30919644), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001045554 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 15B (Wfdc15b), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_138685 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 15B (Wfdc15b), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006498957 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP four-disulfide core domain 15B (Wfdc15b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000018355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164214454:164221631:-1 gene:ENSMUSG00000018211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109376 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164214454:164221660:-1 gene:ENSMUSG00000018211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000164567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:164214455:164215583:-1 gene:ENSMUSG00000018211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF276974 // GenBank // Mus musculus single WAP motif protein 1 mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC061041 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 15B, mRNA (cDNA clone MGC:74150 IMAGE:6740598), complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164215114:164215469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_017390 // RefSeq // Mus musculus seminal vesicle secretory protein 2 (Svs2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164235929:164238466:-1 gene:ENSMUSG00000040132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164236528:164238264:-1 gene:ENSMUSG00000040132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK136679 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230022I16 product:seminal vesicle protein, secretion 2, full insert sequence. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC107275 // GenBank // Mus musculus seminal vesicle secretory protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:130221 IMAGE:40052650), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164236858:164238243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_173377 // RefSeq // Mus musculus seminal vesicle secretory protein 3B (Svs3b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000063132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164254363:164256640:-1 gene:ENSMUSG00000050383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_009300 // RefSeq // Mus musculus seminal vesicle secretory protein 4 (Svs4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000017142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164275952:164278459:-1 gene:ENSMUSG00000016998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC115604 // GenBank // Mus musculus seminal vesicle secretory protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:144503 IMAGE:40102636), complete cds. // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC115605 // GenBank // Mus musculus seminal vesicle secretory protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:144504 IMAGE:40102637), complete cds. // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_011414 // RefSeq // Mus musculus secretory leukocyte peptidase inhibitor (Slpi), mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000109367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164354070:164356507:-1 gene:ENSMUSG00000017002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000165980 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:164354162:164356067:-1 gene:ENSMUSG00000017002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// BC028509 // GenBank // Mus musculus secretory leukocyte peptidase inhibitor, mRNA (cDNA clone MGC:41142 IMAGE:1513866), complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// U73004 // GenBank // Mus musculus secretory leukocyte protease inhibitor mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// U88093 // GenBank // Mus musculus secretory leukocyte protease inhibitor mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// U94341 // GenBank // Mus musculus secretory leukoprotease inhibitor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000167427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164355595:164389095:-1 gene:ENSMUSG00000017002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000011982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164336807:164356272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001252563 // RefSeq // Mus musculus matrilin 4 (Matn4), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_013592 // RefSeq // Mus musculus matrilin 4 (Matn4), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000103103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164389393:164404614:-1 gene:ENSMUSG00000016995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000103104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164389393:164405160:-1 gene:ENSMUSG00000016995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000109358 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:164389393:164404612:-1 gene:ENSMUSG00000016995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 85 // 76 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109359 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:164389393:164404612:-1 gene:ENSMUSG00000016995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC036558 // GenBank // Mus musculus matrilin 4, mRNA (cDNA clone MGC:41103 IMAGE:1366191), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000154940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164393918:164404613:-1 gene:ENSMUSG00000016995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// AK160786 // GenBank HTC // Mus musculus 14, 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3221402P10 product:matrilin 4, full insert sequence. // chr2 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// GENSCAN00000011993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164377664:164396030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0
NM_011521 // RefSeq // Mus musculus syndecan 4 (Sdc4), mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000017153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164424247:164443186:-1 gene:ENSMUSG00000017009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000142909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164425900:164443887:-1 gene:ENSMUSG00000017009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC002312 // GenBank // Mus musculus syndecan 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:3592785), complete cds. // chr2 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC005679 // GenBank // Mus musculus syndecan 4, mRNA (cDNA clone MGC:11456 IMAGE:3154160), complete cds. // chr2 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// D89571 // GenBank // Mus musculus mRNA for ryudocan core protein, complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164426086:164443164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0
NM_001271575 // RefSeq // Mus musculus transformation related protein 53 target 5 (Trp53tg5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006500260 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transformation related protein 53 target 5 (Trp53tg5), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000017864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164470301:164473724:-1 gene:ENSMUSG00000017720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK007294 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700126L10 product:weakly similar to CLG01 (DJ453C12.5) (P53 RESPONSE ELEMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164471037:164473650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
XM_006500545 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/arginine repetitive matrix protein 2-like (LOC102638515), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145223 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930023N09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
NM_001177401 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kunitz type, 3 (Spint3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:164569695:164573459:-1 gene:ENSMUSG00000074596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164569821:164573295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033240 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 6A (Wfdc6a), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_001177848 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 6A (Wfdc6a), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006499076 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP four-disulfide core domain 6A (Wfdc6a), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000099096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164579519:164585177:-1 gene:ENSMUSG00000074595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000109342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164579519:164585447:-1 gene:ENSMUSG00000074595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC147597 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 6A, mRNA (cDNA clone MGC:182693 IMAGE:9056587), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC147615 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 6A, mRNA (cDNA clone MGC:182711 IMAGE:9056605), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000011952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164579558:164665535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_029325 // RefSeq // Mus musculus epididymal peptidase inhibitor (Eppin), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000103100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164588343:164593594:-1 gene:ENSMUSG00000017733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF346413 // GenBank // Mus musculus eppin mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048637 // GenBank // Mus musculus serine protease inhibitor-like, with Kunitz and WAP domains 1 (eppin), mRNA (cDNA clone MGC:58763 IMAGE:6771674), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164579558:164665535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001080550 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 8 (Wfdc8), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001276432 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 8 (Wfdc8), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006499674 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP four-disulfide core domain 8 (Wfdc8), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006499675 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP four-disulfide core domain 8 (Wfdc8), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000109338 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164597213:164613626:-1 gene:ENSMUSG00000070533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000109339 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:164596466:164613386:-1 gene:ENSMUSG00000070533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AY757956 // GenBank // Mus musculus WAP8C precursor (Wfdc8) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_001276431 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 8 (Wfdc8), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSMUST00000094351 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:164596458:164613626:-1 gene:ENSMUSG00000070533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// AY669506 // GenBank // Mus musculus WAP8 precursor (Wfdc8) mRNA, complete cds. // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164579558:164665535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001012723 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 16 (Wfdc16), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000109336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:164634707:164638796:-1 gene:ENSMUSG00000070530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY542488 // GenBank // Mus musculus WAP16 precursor (Wfdc16) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY542489 // GenBank // Mus musculus WAP16 precursor (Wfdc16) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC145970 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 16, mRNA (cDNA clone MGC:175857 IMAGE:40131273), complete cds. // chr2 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// BC145972 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 16, mRNA (cDNA clone MGC:175859 IMAGE:40131275), complete cds. // chr2 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0
NM_001160414 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 9 (Wfdc9), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006499984 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP four-disulfide core domain 9 (Wfdc9), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:164649787:164651763:-1 gene:ENSMUSG00000074594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164649631:164656583:-1 gene:ENSMUSG00000074594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001161806 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 11 (Wfdc11), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164662894:164674087:-1 gene:ENSMUSG00000078940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:164663037:164665535:-1 gene:ENSMUSG00000078940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164579558:164665535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000109328 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:164731180:164745931:-1 gene:ENSMUSG00000076434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// AK007299 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700127F16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr2 // 86 // 57 // 18 // 21 // 0 /// NM_027961 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 3 (Wfdc3), mRNA. // chr2 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1 /// XM_006500191 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP four-disulfide core domain 3 (Wfdc3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// XM_006500192 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP four-disulfide core domain 3 (Wfdc3), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// ENSMUST00000103096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:2:164731180:164743312:-1 gene:ENSMUSG00000076434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1 /// BC116847 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:151224 IMAGE:40126166), complete cds. // chr2 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1 /// BC116875 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:151252 IMAGE:40126194), complete cds. // chr2 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1 /// GENSCAN00000011978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164731472:164735662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 41 // 14 // 15 // 0
ENSMUST00000130227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164743565:164745931:-1 gene:ENSMUSG00000076434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006001 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700015L13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006500192 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP four-disulfide core domain 3 (Wfdc3), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000109328 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:164731180:164745931:-1 gene:ENSMUSG00000076434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK007299 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700127F16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_009394 // RefSeq // Mus musculus troponin C2, fast (Tnnc2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000103095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164777161:164779741:-1 gene:ENSMUSG00000017300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024390 // GenBank // Mus musculus troponin C2, fast, mRNA (cDNA clone MGC:36164 IMAGE:5026329), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000155443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164777944:164779967:-1 gene:ENSMUSG00000017300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164777302:164779665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT041094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
BC116354 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700020C07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144223 IMAGE:40099912), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_029370 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 25 (Spata25), mRNA. // chr2 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// ENSMUST00000017911 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164827382:164828537:-1 gene:ENSMUSG00000017767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// BC116355 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700020C07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144224 IMAGE:40099919), complete cds. // chr2 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// ENSMUST00000141411 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164826389:164828528:-1 gene:ENSMUSG00000017767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONMMUT041099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001082974 // RefSeq // Mus musculus neuralized-like 2 (Drosophila) (Neurl2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:164830732:164833456:-1 gene:ENSMUSG00000039873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164830872:164833440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
AK015392 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930445K14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// BC037706 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA F730014I05 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4164678). // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199027 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 335 (Zfp335), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000041361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:164891882:164911757:-1 gene:ENSMUSG00000039834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000183830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:164891882:164911757:-1 gene:ENSMUSG00000039834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC062921 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 335, mRNA (cDNA clone IMAGE:6848450), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC151013 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 335, mRNA (cDNA clone MGC:183926 IMAGE:9087926), complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC157954 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 335, mRNA (cDNA clone MGC:189940 IMAGE:9088127), complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC172135 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054805. // chr2 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:164892164:164940902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_144892 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor coactivator 5 (Ncoa5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000040381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:165000357:165034867:-1 gene:ENSMUSG00000039804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000121377 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:165000360:165034817:-1 gene:ENSMUSG00000039804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000122070 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:165000363:165034788:-1 gene:ENSMUSG00000039804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000153905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:165012997:165034829:-1 gene:ENSMUSG00000039804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 32 // 9 // 10 // 0 /// BC017152 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor coactivator 5, mRNA (cDNA clone MGC:28864 IMAGE:4511696), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000127545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:165010120:165034803:-1 gene:ENSMUSG00000039804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// GENSCAN00000011994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:165001582:165035085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT041120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_174988 // RefSeq // Mus musculus cadherin 22 (Cdh22), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000065438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:165111507:165234853:-1 gene:ENSMUSG00000053166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000138643 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:165112327:165181459:-1 gene:ENSMUSG00000053166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AB019618 // GenBank // Mus musculus mRNA for PB-Cadherin, complete cds. // chr2 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC112407 // GenBank // Mus musculus cadherin 22, mRNA (cDNA clone MGC:132879 IMAGE:40060660), complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// XM_006498535 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cadherin 22 (Cdh22), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// GENSCAN00000011990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:165112158:165181149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NM_001005425 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 663 (Zfp663), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:165351298:165360136:-1 gene:ENSMUSG00000056824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000103085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:165351297:165368729:-1 gene:ENSMUSG00000056824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:165354044:165368723:-1 gene:ENSMUSG00000056824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK141109 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230053H11 product:similar to Zinc finger protein 33b (Fragment) [Globicephala macrorhynchus], full insert sequence. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC067000 // GenBank // Mus musculus gene model 1008, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:86131 IMAGE:5705933), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:165353811:165359401:-1 gene:ENSMUSG00000056824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_178411 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 334 (Zfp334), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000103084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:165374264:165388259:-1 gene:ENSMUSG00000017667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC040388 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 334, mRNA (cDNA clone MGC:27911 IMAGE:3501307), complete cds. // chr2 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:165380082:165401894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_029021 // RefSeq // Mus musculus osteoclast stimulatory transmembrane protein (Ocstamp), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029213 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:165393760:165400405:-1 gene:ENSMUSG00000027670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC020160 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4833422F24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28100 IMAGE:3966086), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK032330 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430520H06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000035234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:165380082:165401894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_054055 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 3 (Slc13a3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:165405028:165473230:-1 gene:ENSMUSG00000018459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109279 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:165405295:165473230:-1 gene:ENSMUSG00000018459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AF306491 // GenBank // Mus musculus high-affinity Na+/dicarboxylate cotransporter NaDC3 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026803 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:28679 IMAGE:4238769), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:165406680:165475200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NM_001007581 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2810408M09 gene (2810408M09Rik), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000039007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:165490110:165493324:-1 gene:ENSMUSG00000039725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC085263 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810408M09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:102419 IMAGE:6395509), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000119751 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:166500273:166500768:-1 gene:ENSMUSG00000081123 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000175322 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:166655027:166655142:-1 gene:ENSMUSG00000093063 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT041233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033196 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, NFX1-type containing 1 (Znfx1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// NM_001291162 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, NFX1-type containing 1 (Znfx1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000048988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:167035793:167063015:-1 gene:ENSMUSG00000039501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000067584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:167035799:167043495:-1 gene:ENSMUSG00000039501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000128676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:167044117:167062716:-1 gene:ENSMUSG00000039501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000155281 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:167044032:167060425:-1 gene:ENSMUSG00000039501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 37 // 13 // 14 // 0 /// AK150223 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530145M12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 93 // 37 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000019176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:167036725:167065614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000121305 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:167087184:167087739:-1 gene:ENSMUSG00000081946 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000019178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:167087184:167087739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_008420 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shab-related subfamily, member 1 (Kcnb1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:167103378:167188799:-1 gene:ENSMUSG00000050556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC031776 // GenBank // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shab-related subfamily, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:25500 IMAGE:4507847), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051422 // GenBank // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shab-related subfamily, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:58936 IMAGE:6493266), complete cds. // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC061501 // GenBank // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shab-related subfamily, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:70282 IMAGE:4506061), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ646376 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel Kv2.1 transcript variant 1 (Kcnb1) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// M64228 // GenBank // Mouse potassium channel protein (Shab) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000019192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:167104353:167113752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_008968 // RefSeq // Mus musculus prostaglandin I2 (prostacyclin) synthase (Ptgis), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006498958 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prostaglandin I2 (prostacyclin) synthase (Ptgis), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000018113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:167202907:167240604:-1 gene:ENSMUSG00000017969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000088041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:167191805:167240589:-1 gene:ENSMUSG00000017969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AB001607 // GenBank // Mus musculus mRNA for prostacyclin synthase, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK048059 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130032H06 product:prostaglandin I2 (prostacyclin) synthase, full insert sequence. // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC062151 // GenBank // Mus musculus prostaglandin I2 (prostacyclin) synthase, mRNA (cDNA clone MGC:70035 IMAGE:6512164), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:167203324:167240420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0
NM_019835 // RefSeq // Mus musculus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4-galactosyltransferase, polypeptide 5 (B4galt5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000109221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:167298444:167349183:-1 gene:ENSMUSG00000017929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000133557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:167307610:167313900:-1 gene:ENSMUSG00000017929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000155623 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:167307610:167313855:-1 gene:ENSMUSG00000017929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AB004786 // GenBank // Mus musculus mbgt-5 mRNA for beta-1,4-galactosyltransferase V, complete cds. // chr2 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// AF142673 // GenBank // Mus musculus beta-1,4-galactosyltransferase V mRNA, complete cds. // chr2 // 89 // 82 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:167262206:167321511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_170756 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 2 (Spata2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000057627 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:167481133:167492887:-1 gene:ENSMUSG00000047030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000109211 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:167481433:167492845:-1 gene:ENSMUSG00000047030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AK122364 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0757 protein. // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC034597 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:38980 IMAGE:5363513), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000147051 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:167484520:167485830:-1 gene:ENSMUSG00000047030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000040468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:167483350:167495768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_023230 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 (Ube2v1), mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000109207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:167607638:167632095:-1 gene:ENSMUSG00000078923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_145538 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 189 (Tmem189), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000006587 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:167642608:167661556:-1 gene:ENSMUSG00000090213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000148262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:167643228:167689822:-1 gene:ENSMUSG00000090213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AK080983 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B830013O03 product:SIMILAR TO UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME E2 VARIANT 1 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC002270 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 189, mRNA (cDNA clone MGC:7660 IMAGE:3496088), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT041298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
XM_006500137 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 65, member C (Fam65c), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006500140 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 65, member C (Fam65c), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000099073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:167980166:168010618:-1 gene:ENSMUSG00000074577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000123782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:167980164:168010618:-1 gene:ENSMUSG00000074577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC130272 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 65, member C, mRNA (cDNA clone MGC:161365 IMAGE:40143210), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000040489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:167981227:168006276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_009628 // RefSeq // Mus musculus activity-dependent neuroprotective protein (Adnp), mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:168180986:168206922:-1 gene:ENSMUSG00000051149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000088001 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:168180986:168207112:-1 gene:ENSMUSG00000051149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000138667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:168180986:168230364:-1 gene:ENSMUSG00000093752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AK129214 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0784 protein. // chr2 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:168182047:168192826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// BC052455 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6410693, containing frame-shift errors. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC066203 // GenBank // Mus musculus activity-dependent neuroprotective protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:30090906). // chr2 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0
NM_001081134 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1 (Kcng1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006499538 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1 (Kcng1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:168261698:168269331:-1 gene:ENSMUSG00000074575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109191 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:168260117:168281132:-1 gene:ENSMUSG00000074575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147251 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:182408 IMAGE:9056302), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147252 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:182403 IMAGE:9056297), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147715 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:182860 IMAGE:9087474), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:168262380:168269242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK135602 // GenBank HTC // Mus musculus adult male adrenal gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7330401N19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004591 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT041357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009564 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 64 (Zfp64), mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// XM_006543714 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 64-like (LOC100502777), mRNA. // chr2 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000087971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:168925361:168955272:-1 gene:ENSMUSG00000027551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000109161 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:168934813:168955289:-1 gene:ENSMUSG00000027551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 39 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000109162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:168893331:168955587:-1 gene:ENSMUSG00000027551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// AK010444 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410007N05 product:zinc finger protein 64, full insert sequence. // chr2 // 100 // 39 // 15 // 15 // 0 /// BC004695 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 64, mRNA (cDNA clone MGC:5897 IMAGE:3498906), complete cds. // chr2 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// U49046 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein (Zfp64) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 76 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:168925660:169008980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// BC053457 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30007615, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr2 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// GENSCAN00000056472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:168893824:168912339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
AY702102 // GenBank // Mus musculus round spermatids protein STDP1 mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC116753 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AY702102, mRNA (cDNA clone MGC:151130 IMAGE:40126072), complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC117088 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AY702102, mRNA (cDNA clone MGC:151465 IMAGE:40126407), complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_009996 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 24, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp24a1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:170482708:170497145:-1 gene:ENSMUSG00000038567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC109139 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 24, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:129158 IMAGE:40039500), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC109140 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 24, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:129159 IMAGE:40039502), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// D49438 // GenBank // Mus musculus mRNA for 25-hydroxyvitamin D3 24-hydroxylase, complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// D89669 // GenBank // Mus musculus mRNA for vitamin D-24-hydroxylase, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:170485677:170500666:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NR_027825 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930470P17 gene (4930470P17Rik), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:2:170579418:170602017:-1 gene:ENSMUSG00000043583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175631 // RefSeq // Mus musculus cerebellin 4 precursor protein (Cbln4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000087950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:172036233:172043466:-1 gene:ENSMUSG00000067578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY134663 // GenBank // Mus musculus cerebellin 4 precursor, mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC094540 // GenBank // Mus musculus cerebellin 4 precursor protein, mRNA (cDNA clone MGC:106619 IMAGE:5708067), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC132025 // GenBank // Mus musculus cerebellin 4 precursor protein, mRNA (cDNA clone MGC:163656 IMAGE:40130302), complete cds. // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC132027 // GenBank // Mus musculus cerebellin 4 precursor protein, mRNA (cDNA clone MGC:163658 IMAGE:40130304), complete cds. // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:172031945:172042298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001291185 // RefSeq // Mus musculus aurora kinase A (Aurka), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_011497 // RefSeq // Mus musculus aurora kinase A (Aurka), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000028997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:172356196:172370506:-1 gene:ENSMUSG00000027496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000109139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:172356196:172370506:-1 gene:ENSMUSG00000027496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000109140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:172356190:172370535:-1 gene:ENSMUSG00000027496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF007817 // GenBank // Mus musculus IPL1 and aurora related kinase 1 mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// AY336976 // GenBank // Mus musculus serine/threonine protein kinase 6 mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 73 // 21 // 24 // 0 /// BC005425 // GenBank // Mus musculus aurora kinase A, mRNA (cDNA clone MGC:5804 IMAGE:3590706), complete cds. // chr2 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC014711 // GenBank // Mus musculus aurora kinase A, mRNA (cDNA clone MGC:11471 IMAGE:3968835), complete cds. // chr2 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// U69106 // GenBank // Mus musculus aurora-related kinase 1 (ARK1) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// U80932 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase Ayk1 (ayk1) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:172356692:172371903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
ENSMUST00000138288 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:172425804:172440560:-1 gene:ENSMUSG00000087633 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK047799 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030045O21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT041504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001039560 // RefSeq // Mus musculus glucosaminyl (N-acetyl) transferase family member 7 (Gcnt7), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006499996 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucosaminyl (N-acetyl) transferase family member 7 (Gcnt7), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000099060 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:172450313:172458596:-1 gene:ENSMUSG00000074569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000161334 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:172450314:172454742:-1 gene:ENSMUSG00000074569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// BC139073 // GenBank // Mus musculus glucosaminyl (N-acetyl) transferase family member 7, mRNA (cDNA clone MGC:170700 IMAGE:8862095), complete cds. // chr2 // 83 // 75 // 15 // 18 // 0 /// BC139076 // GenBank // Mus musculus glucosaminyl (N-acetyl) transferase family member 7, mRNA (cDNA clone MGC:170703 IMAGE:8862098), complete cds. // chr2 // 83 // 75 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000031686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:172449221:172454902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_007557 // RefSeq // Mus musculus bone morphogenetic protein 7 (Bmp7), mRNA. // chr2 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000009143 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:172868012:172940321:-1 gene:ENSMUSG00000008999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// BC010771 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:18610 IMAGE:4218495), complete cds. // chr2 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:172852854:172896938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001081387 // RefSeq // Mus musculus CCCTC-binding factor (zinc finger protein)-like (Ctcfl), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000094287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:173093609:173119525:-1 gene:ENSMUSG00000070495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000179693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:173093609:173119525:-1 gene:ENSMUSG00000070495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC151026 // GenBank // Mus musculus CCCTC-binding factor (zinc finger protein)-like, mRNA (cDNA clone MGC:183939 IMAGE:9087939), complete cds. // chr2 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// DQ153171 // GenBank // Mus musculus BORIS (Boris) mRNA, complete cds. // chr2 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// XM_006500005 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CCCTC-binding factor (zinc finger protein)-like (Ctcfl), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// GENSCAN00000031675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:173052581:173124302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_001139519 // RefSeq // Mus musculus Z-DNA binding protein 1 (Zbp1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NM_021394 // RefSeq // Mus musculus Z-DNA binding protein 1 (Zbp1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_374498 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Z-DNA binding protein 1 (Zbp1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000029018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:173206612:173218923:-1 gene:ENSMUSG00000027514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000109116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:173213735:173218910:-1 gene:ENSMUSG00000027514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000146802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:173206615:173218897:-1 gene:ENSMUSG00000027514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF136520 // GenBank // Mus musculus tumor stroma and activated macrophage protein DLM-1 (DLM-1) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC020033 // GenBank // Mus musculus Z-DNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:28261 IMAGE:4007636), complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:173162184:173241903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_022995 // RefSeq // Mus musculus prostate transmembrane protein, androgen induced 1 (Pmepa1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006499990 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prostate transmembrane protein, androgen induced 1 (Pmepa1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000036248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:173224458:173276533:-1 gene:ENSMUSG00000038400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139306 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:173228046:173276189:-1 gene:ENSMUSG00000038400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC069890 // GenBank // Mus musculus prostate transmembrane protein, androgen induced 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5007621), partial cds. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000124124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:173228211:173234722:-1 gene:ENSMUSG00000038400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:173162184:173241903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// BC069854 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5060298, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_027303 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 60 (Ankrd60), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000109112 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:173568704:173578198:-1 gene:ENSMUSG00000027517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000119453 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:2:173568666:173578365:-1 gene:ENSMUSG00000027517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001199955 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 60 (Ankrd60), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENSMUST00000147693 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:173572387:173578273:-1 gene:ENSMUSG00000027517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000055868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:173547609:173578341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000138925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:173793437:173847670:-1 gene:ENSMUSG00000085938 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000055877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:173789677:173794367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT041618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_040530 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10714 (Gm10714), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000131346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:174125038:174183918:-1 gene:ENSMUSG00000074555 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000166709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:174125560:174125888:-1 gene:ENSMUSG00000074555 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT041626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT041627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NR_029646 // RefSeq // Mus musculus microRNA 296 (Mir296), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000083587 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:174267047:174267125:-1 gene:ENSMUSG00000065521 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-296 // miRBase Micro RNA Database // MI0000394 Mus musculus miR-296 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT041629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_029649 // RefSeq // Mus musculus microRNA 298 (Mir298), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083476 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:174267504:174267585:-1 gene:ENSMUSG00000065410 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-298 // miRBase Micro RNA Database // MI0000398 Mus musculus miR-298 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT041630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000168292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:174330319:174346712:-1 gene:ENSMUSG00000090625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// AF085738 // GenBank // Mus musculus Sang mRNA, complete cds. // chr2 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0
NM_022325 // RefSeq // Mus musculus cathepsin Z (Ctsz), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000016400 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:174427493:174439039:-1 gene:ENSMUSG00000016256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF136277 // GenBank // Mus musculus cathepsin Z precursor (Ctsz) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF197479 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 cathepsin Z (Ctsz) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC008619 // GenBank // Mus musculus cathepsin Z, mRNA (cDNA clone MGC:5694 IMAGE:3588457), complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000025860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:174427872:174438898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_025531 // RefSeq // Mus musculus slowmo homolog 2 (Drosophila) (Slmo2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000016401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:174465067:174473081:-1 gene:ENSMUSG00000016257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000117442 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:174465585:174472898:-1 gene:ENSMUSG00000016257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000120822 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:174465694:174472934:-1 gene:ENSMUSG00000016257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC026968 // GenBank // Mus musculus slowmo homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:30391 IMAGE:4235395), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000141100 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:174469381:174472931:-1 gene:ENSMUSG00000016257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENSMUST00000147944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:174469172:174472891:-1 gene:ENSMUSG00000016257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000025856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:174465426:174489831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENSMUST00000121260 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:177085356:177085802:-1 gene:ENSMUSG00000082023 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000053247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:177035198:177085802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// NONMMUT041720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_006544481 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 120-like (LOC102641310), partial mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000121798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:177125463:177127709:-1 gene:ENSMUSG00000082765 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT041722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT041723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000081529 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:177919927:177925613:-1 gene:ENSMUSG00000074529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000108986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:177921431:177921815:-1 gene:ENSMUSG00000074529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001162922 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 931 (Zfp931), mRNA. // chr2 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// ENSMUST00000108923 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:178068490:178078476:-1 gene:ENSMUSG00000078861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000108924 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:178067695:178078425:-1 gene:ENSMUSG00000078861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// ENSMUST00000123265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:178068476:178078455:-1 gene:ENSMUSG00000078861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC002165 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810021G02 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3486069), partial cds. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC096373 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810021G02 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4502519). // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT041754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_177191 // RefSeq // Mus musculus synaptonemal complex protein 2 (Sycp2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000081134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:178345293:178407685:-1 gene:ENSMUSG00000060445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000132611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:178346119:178374930:-1 gene:ENSMUSG00000060445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// AK014411 // GenBank HTC // Mus musculus 18 days pregnant adult female placenta and extra embryonic tissue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3830402K23 product:similar to DJ551D2.4 (SYNAPTONEMAL COMPLEX PROTEIN 2) (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// DQ103262 // GenBank // Mus musculus synaptonemal complex protein 2 (Sycp2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000036951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:178346333:178409250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT041759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0
NM_001085501 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 3D (Ppp1r3d), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058678 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:178411206:178414472:-1 gene:ENSMUSG00000049999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:178413368:178414207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081092 // RefSeq // Mus musculus TAF4A RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf4a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000041618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:179912146:179976646:-1 gene:ENSMUSG00000039117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000154961 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:179922004:179929355:-1 gene:ENSMUSG00000039117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000131358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:179912152:179975559:-1 gene:ENSMUSG00000039117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// AK136225 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420484E20 product:TAF4A RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, full insert sequence. // chr2 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// BC026493 // GenBank HTC // Mus musculus TAF4A RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone IMAGE:4505179), with apparent retained intron. // chr2 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000041382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:179904551:179979428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_001081171 // RefSeq // Mus musculus laminin, alpha 5 (Lama5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 82 // 82 // 0 /// ENSMUST00000015791 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:180176373:180225859:-1 gene:ENSMUSG00000015647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 82 // 82 // 0 /// GENSCAN00000052702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:180176547:180225802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 73 // 73 // 0
NM_145851 // RefSeq // Mus musculus CDK5 and Abl enzyme substrate 2 (Cables2), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000108891 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:180258540:180273496:-1 gene:ENSMUSG00000038990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000136706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:180258543:180273463:-1 gene:ENSMUSG00000038990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AK050121 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730018E24 product:similar to CDK3-BINDING PROTEIN IK3-1 [Mus musculus], full insert sequence. // chr2 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// BC052789 // GenBank // Mus musculus CDK5 and Abl enzyme substrate 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:1399117), complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000052723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:180260043:180273455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// AY049712 // GenBank // Mus musculus ik3-2 mRNA, complete cds. // chr2 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
NM_173031 // RefSeq // Mus musculus RBBP8 N-terminal like (Rbbp8nl), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000038529 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:180277646:180289879:-1 gene:ENSMUSG00000038980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC066135 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC066135, mRNA (cDNA clone IMAGE:30014378). // chr2 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC172093 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054379. // chr2 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:180276252:180294445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_008093 // RefSeq // Mus musculus GATA binding protein 5 (Gata5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006500554 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GATA binding protein 5 (Gata5), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000015771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:180325133:180334699:-1 gene:ENSMUSG00000015627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC105653 // GenBank // Mus musculus GATA binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:124197 IMAGE:40046623), complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC105654 // GenBank // Mus musculus GATA binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:124196 IMAGE:40046622), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC105656 // GenBank HTC // Mus musculus GATA binding protein 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:40046620), with apparent retained intron. // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// U84725 // GenBank // Mus musculus GATA-5 cardiac transcription factor mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC105655 // GenBank // Mus musculus GATA binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:124195 IMAGE:40046621), complete cds. // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:180318168:180387861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_178254 // RefSeq // Mus musculus transcription factor-like 5 (basic helix-loop-helix) (Tcfl5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000037877 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:180621956:180642708:-1 gene:ENSMUSG00000038932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000161425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:180635254:180642589:-1 gene:ENSMUSG00000038932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AY234363 // GenBank // Mus musculus factor in the germline beta (Figlb) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC108399 // GenBank // Mus musculus transcription factor-like 5 (basic helix-loop-helix), mRNA (cDNA clone MGC:118431 IMAGE:6394526), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000131881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:180637466:180642347:-1 gene:ENSMUSG00000038932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// AK132721 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4922502L22 product:transcription factor-like 5 (basic helix-loop-helix), full insert sequence. // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000052721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:180622410:180642589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_080641 // RefSeq // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member e23 (Bhlhe23), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:180774381:180776900:-1 gene:ENSMUSG00000045493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF454760 // GenBank // Mus musculus basic helix-loop-helix transcriptional regulator beta4 (Bhlhb4) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC119208 // GenBank // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member e23, mRNA (cDNA clone MGC:155524 IMAGE:8733957), complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC119210 // GenBank // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member e23, mRNA (cDNA clone MGC:155526 IMAGE:8733959), complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:180776072:180776743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000148700 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:180818343:180824630:-1 gene:ENSMUSG00000074507 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK133152 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931404E12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_173761 // RefSeq // Mus musculus YTH domain family 1 (Ythdf1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:180904377:180920949:-1 gene:ENSMUSG00000038848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108876 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:180905370:180920949:-1 gene:ENSMUSG00000038848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK033241 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030473O16 product:DJ963E22.1 (NOVEL PROTEIN SIMILAR TO NY-REN-2 ANTIGEN) (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC061479 // GenBank // Mus musculus YTH domain family 1, mRNA (cDNA clone MGC:70052 IMAGE:6334535), complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC065050 // GenBank // Mus musculus YTH domain family 1, mRNA (cDNA clone MGC:86075 IMAGE:6418891), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:180881377:180920342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_015730 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 4 (Chrna4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006500551 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 4 (Chrna4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000067120 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:181022311:181039305:-1 gene:ENSMUSG00000027577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108851 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:181018380:181039187:-1 gene:ENSMUSG00000027577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000135766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:181029425:181039225:-1 gene:ENSMUSG00000027577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AF225912 // GenBank // Mus musculus nicotinic acetlycholine receptor alpha 4 subunit (Acra4) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AY574263 // GenBank // Mus musculus neuronal nicotinic acetylcholine receptor alpha4 subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC053013 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 4, mRNA (cDNA clone MGC:62206 IMAGE:5706867), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:181024754:181039073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_007906 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2 (Eef1a2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000055990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:181147653:181157014:-1 gene:ENSMUSG00000016349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC018235 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:25318 IMAGE:4504385), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// L26479 // GenBank // Mouse elongation factor-1 alpha (MS1) mRNA, complete cds. // chr2 // 82 // 90 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:181139182:181156015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_009184 // RefSeq // Mus musculus PTK6 protein tyrosine kinase 6 (Ptk6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000016511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:181193721:181202789:-1 gene:ENSMUSG00000038751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK154717 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630104G13 product:PTK6 protein tyrosine kinase 6, full insert sequence. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC125342 // GenBank // Mus musculus PTK6 protein tyrosine kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:159045 IMAGE:40129857), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC125344 // GenBank // Mus musculus PTK6 protein tyrosine kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:159047 IMAGE:40129859), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// U16805 // GenBank // Mus musculus Src-related intestinal kinase (sik) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:181195769:181212772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_011481 // RefSeq // Mus musculus src-related kinase lacking C-terminal regulatory tyrosine and N-terminal myristylation sites (Srms), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000016498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:181205562:181213185:-1 gene:ENSMUSG00000027579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC120633 // GenBank // Mus musculus src-related kinase lacking C-terminal regulatory tyrosine and N-terminal myristylation sites, mRNA (cDNA clone MGC:155870 IMAGE:40129556), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC125325 // GenBank // Mus musculus src-related kinase lacking C-terminal regulatory tyrosine and N-terminal myristylation sites, mRNA (cDNA clone MGC:159028 IMAGE:40129840), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// D26186 // GenBank // Mus musculus mRNA for tyrosine-specific protein kinase, complete cds. // chr2 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// D49427 // GenBank // Mus musculus srm mRNA for tyrosine kinase, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:181195769:181212772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_198169 // RefSeq // Mus musculus glucocorticoid modulatory element binding protein 2 (Gmeb2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000049032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:181251449:181288035:-1 gene:ENSMUSG00000038705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000130475 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:181255918:181287074:-1 gene:ENSMUSG00000038705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000141003 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:181255938:181288016:-1 gene:ENSMUSG00000038705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000141110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:181253785:181278082:-1 gene:ENSMUSG00000038705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK129319 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1269 protein. // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC059066 // GenBank // Mus musculus glucocorticoid modulatory element binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:69903 IMAGE:6825428), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000123148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:181254775:181256131:-1 gene:ENSMUSG00000038705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:181253783:181278079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
AK149129 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120486C10 product:stathmin-like 3, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009133 // RefSeq // Mus musculus stathmin-like 3 (Stmn3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000103045 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:181306459:181314500:-1 gene:ENSMUSG00000027581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB007912 // GenBank // Mus musculus mRNA for SCG10-related protein HiAT3, complete cds. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AF069708 // GenBank // Mus musculus SCG10-like-protein (Sclip) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC057017 // GenBank // Mus musculus stathmin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:67122 IMAGE:6818794), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK149129 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120486C10 product:stathmin-like 3, full insert sequence. // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000048420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:181306764:181316959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001164597 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 512B (Znf512b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006500650 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 512B (Znf512b), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000108789 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:181582103:181592803:-1 gene:ENSMUSG00000000823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000128553 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:181582105:181590920:-1 gene:ENSMUSG00000000823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000131866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:181588067:181589287:-1 gene:ENSMUSG00000000823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000132538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:181587117:181588740:-1 gene:ENSMUSG00000000823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000048408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:181569311:181599391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1
NM_172676 // RefSeq // Mus musculus sterile alpha motif domain containing 10 (Samd10), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:181595218:181599212:-1 gene:ENSMUSG00000038605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000183836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:181595221:181599198:-1 gene:ENSMUSG00000038605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052921 // GenBank // Mus musculus sterile alpha motif domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:56770 IMAGE:6311715), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000136249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:181596792:181597606:-1 gene:ENSMUSG00000038605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000048408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:181569311:181599391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONMMUT041945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_009236 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 18 (Sox18), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000054491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:181669836:181671640:-1 gene:ENSMUSG00000046470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC006612 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 18, mRNA (cDNA clone MGC:11476 IMAGE:3967084), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// L35032 // GenBank // Mouse HMG-box transcription factor (sox18) mRNA, complete cds. // chr2 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:181670203:181671521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0
NM_199023 // RefSeq // Mus musculus LKAAEAR motif containing 1 (IKAAEAR murine motif) (Lkaaear1), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006500654 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930526D03 gene (4930526D03Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006500656 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930526D03 gene (4930526D03Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006500660 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930526D03 gene (4930526D03Rik), transcript variant X7, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000052416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:181696793:181698442:-1 gene:ENSMUSG00000045794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000132409 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:181696796:181697416:-1 gene:ENSMUSG00000045794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC087873 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930526D03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107126 IMAGE:6740628), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000120868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:181724042:181724942:-1 gene:ENSMUSG00000082786 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:181724042:181727933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_013920 // RefSeq // Mus musculus hepatocyte nuclear factor 4, gamma (Hnf4g), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006530072 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hepatocyte nuclear factor 4, gamma (Hnf4g), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000017832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:3508030:3659775:1 gene:ENSMUSG00000017688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000108393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:3508030:3657844:1 gene:ENSMUSG00000017688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000108394 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:3634150:3658052:1 gene:ENSMUSG00000017688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC125519 // GenBank // Mus musculus hepatocyte nuclear factor 4, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:159222 IMAGE:40130034), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:3634260:3664310:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000091375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:3791897:3792295:1 gene:ENSMUSG00000069125 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:3791897:3939457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
AK029361 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833405F18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030708 // RefSeq // Mus musculus zinc finger homeodomain 4 (Zfhx4), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000026284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:5218554:5415855:1 gene:ENSMUSG00000025255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000175866 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:5218526:5413165:1 gene:ENSMUSG00000025255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000176383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:5241672:5415857:1 gene:ENSMUSG00000025255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB024499 // GenBank // Mus musculus zfh-4 mRNA for zinc-finger homeodomain protein 4, complete cds. // chr3 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:5241716:5413147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_008862 // RefSeq // Mus musculus protein kinase inhibitor, alpha (Pkia), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:7366604:7445366:1 gene:ENSMUSG00000027499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048244 // GenBank // Mus musculus protein kinase inhibitor, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:54726 IMAGE:6308831), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M63554 // GenBank // Mus musculus inhibitor protein of cAMP-dependent protein kinase, complete cds. // chr3 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONMMUT042024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000009620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:7366301:7442090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_173181 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, C2HC-type containing 1A (Zc2hc1a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000051064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:7503426:7553848:1 gene:ENSMUSG00000043542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK034783 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430037G21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 89 // 30 // 8 // 9 // 0 /// BC087731 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 164, member A, mRNA (cDNA clone MGC:90536 IMAGE:6850296), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT042027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 89 // 30 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000009627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:7508304:7551548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
GENSCAN00000007700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:8214330:8216346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 63 // 13 // 15 // 0
GENSCAN00000007653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:8283787:8329531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_025285 // RefSeq // Mus musculus stathmin-like 2 (Stmn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:8509527:8561604:1 gene:ENSMUSG00000027500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026538 // GenBank // Mus musculus stathmin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:35784 IMAGE:4981703), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK043202 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730069C18 product:stathmin-like 2, full insert sequence. // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:8541855:8561987:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_177660 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 10 (Zbtb10), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:9250602:9285333:1 gene:ENSMUSG00000069114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:9245371:9281033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NR_045710 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9833 (Gm9833), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000061419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:10088173:10092564:1 gene:ENSMUSG00000049230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC060946 // GenBank // Mus musculus myelin basic protein expression factor 2, repressor, mRNA (cDNA clone MGC:74034 IMAGE:6741255), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_025519 // RefSeq // Mus musculus charged multivesicular body protein 4C (Chmp4c), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029049 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:10366907:10391005:1 gene:ENSMUSG00000027536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK010707 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410062A16 product:weakly similar to HSPC134 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK166371 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930003C08 product:SNF7-3 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// BC115983 // GenBank // Mus musculus chromatin modifying protein 4C, mRNA (cDNA clone MGC:144773 IMAGE:40105850), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC117538 // GenBank // Mus musculus chromatin modifying protein 4C, mRNA (cDNA clone MGC:144772 IMAGE:40105849), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:10367032:10389973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001163328 // RefSeq // Mus musculus RALY RNA binding protein-like (Ralyl), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NM_001163329 // RefSeq // Mus musculus RALY RNA binding protein-like (Ralyl), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_001163330 // RefSeq // Mus musculus RALY RNA binding protein-like (Ralyl), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NM_178631 // RefSeq // Mus musculus RALY RNA binding protein-like (Ralyl), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530100 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RALY RNA binding protein-like (Ralyl), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000108372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:13946372:14182287:1 gene:ENSMUSG00000039717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000171075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:13946372:14182287:1 gene:ENSMUSG00000039717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AK079659 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330098D13 product:weakly similar to HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEINS C1/C2 (HNRNP C1 / HNRNP C2) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC052358 // GenBank // Mus musculus RALY RNA binding protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:58492 IMAGE:6534677), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006530102 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RALY RNA binding protein-like (Ralyl), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000003833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:14107178:14150682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_080852 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 12 (Slc7a12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037321 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:14480697:14505830:1 gene:ENSMUSG00000039710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120484 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:14480700:14505724:1 gene:ENSMUSG00000039710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000120801 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:14480773:14505724:1 gene:ENSMUSG00000039710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AB055005 // GenBank // Mus musculus Asc-2 mRNA for asc-type amino acid transporter 2, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007892 // RefSeq // Mus musculus E2F transcription factor 5 (E2f5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006530051 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus E2F transcription factor 5 (E2f5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:14578671:14606308:1 gene:ENSMUSG00000027552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000165922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:14578671:14606308:1 gene:ENSMUSG00000027552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC003220 // GenBank // Mus musculus E2F transcription factor 5, mRNA (cDNA clone MGC:6043 IMAGE:3482306), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:14533971:14605717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_024495 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 13 (Car13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:14641727:14663002:1 gene:ENSMUSG00000027555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF231123 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase XIII (Car13) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC064050 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 13, mRNA (cDNA clone MGC:73575 IMAGE:949505), complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000003855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:14641227:14739262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_007606 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 3 (Car3), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:14863538:14872351:1 gene:ENSMUSG00000027559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC011129 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 3, mRNA (cDNA clone MGC:18583 IMAGE:4195712), complete cds. // chr3 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// M27796 // GenBank // Mouse carbonic anhydrase III (CAIII) mRNA, complete cds. // chr3 // 82 // 80 // 23 // 28 // 0 /// AK075630 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110020O19 product:carbonic anhydrase 3, full insert sequence. // chr3 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000003846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:14863572:14883861:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// NONMMUT042155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_009801 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 2 (Car2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006530050 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carbonic anhydrase 2 (Car2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:14886426:14900769:1 gene:ENSMUSG00000027562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC055291 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 2, mRNA (cDNA clone MGC:62540 IMAGE:6479187), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// K00811 // GenBank // Mouse carbonic anhydrase isozyme II mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:14886385:14901120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_001145919 // RefSeq // Mus musculus YTH domain family 3 (Ythdf3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NM_172677 // RefSeq // Mus musculus YTH domain family 3 (Ythdf3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NR_027375 // RefSeq // Mus musculus YTH domain family 3 (Ythdf3), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000108345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:16183183:16217035:1 gene:ENSMUSG00000047213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000108346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:16183183:16217035:1 gene:ENSMUSG00000047213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC057158 // GenBank // Mus musculus YTH domain family 3, mRNA (cDNA clone MGC:67692 IMAGE:5348717), complete cds. // chr3 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC067040 // GenBank // Mus musculus YTH domain family 3, mRNA (cDNA clone MGC:90119 IMAGE:6853196), complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC067042 // GenBank // Mus musculus YTH domain family 3, mRNA (cDNA clone MGC:90053 IMAGE:6856248), complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:16183125:16225321:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0
NR_029814 // RefSeq // Mus musculus microRNA 124a-2 (Mir124a-2), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000175332 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:17795662:17795770:1 gene:ENSMUSG00000093073 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// mmu-mir-124-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000717 Mus musculus miR-124-2 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT042189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_029289 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich perinuclear theca 12 (Cypt12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:17948444:17948952:1 gene:ENSMUSG00000027564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:17948465:17948824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0
NM_021560 // RefSeq // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member e22 (Bhlhe22), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026120 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:18054174:18057517:1 gene:ENSMUSG00000025128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF218865 // GenBank // Mus musculus BETA3 mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// BC053007 // GenBank // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member e22, mRNA (cDNA clone MGC:62191 IMAGE:5686844), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006543761 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6369 (Gm6369), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000069626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:18533861:18534289:1 gene:ENSMUSG00000040217 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:18513102:18625853:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 74 // 16 // 17 // 0 /// NONMMUT042202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001163536 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 beta (Dnajc5b), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_001163537 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 beta (Dnajc5b), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_025489 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 beta (Dnajc5b), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000029132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:19508615:19610862:1 gene:ENSMUSG00000027606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000118735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:19530671:19610750:1 gene:ENSMUSG00000027606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000118968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:19508595:19610732:1 gene:ENSMUSG00000027606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000165693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:19531247:19610861:1 gene:ENSMUSG00000027606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC049579 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 beta, mRNA (cDNA clone MGC:58196 IMAGE:6772915), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000082660 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:19560253:19560416:1 gene:ENSMUSG00000096211 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT042217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001081281 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 55 (Trim55), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006535490 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif-containing 55 (Trim55), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000029139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:19644460:19691599:1 gene:ENSMUSG00000060913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK052918 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830041C10 product:hypothetical RING finger /B-box zinc finger domain containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000036205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:19666609:19683545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000036209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:19561518:19659946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
BC002189 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC002189, mRNA (cDNA clone MGC:7386 IMAGE:3487872), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000036197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:19768835:19769258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NR_027985 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4632415L05 gene (4632415L05Rik), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:19894886:19895962:1 gene:ENSMUSG00000048106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC023403 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4632415L05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30979 IMAGE:5252327), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT042218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_009210 // RefSeq // Mus musculus helicase-like transcription factor (Hltf), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// NR_105046 // RefSeq // Mus musculus helicase-like transcription factor (Hltf), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000002502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:20057811:20118490:1 gene:ENSMUSG00000002428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000128127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:20057820:20108521:1 gene:ENSMUSG00000002428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000143005 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:20057811:20117281:1 gene:ENSMUSG00000002428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// AF010600 // GenBank // Mus musculus TNF-response element binding protein mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 92 // 33 // 36 // 0 /// BC057116 // GenBank // Mus musculus helicase-like transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:64676 IMAGE:6408672), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC059240 // GenBank // Mus musculus helicase-like transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:67005 IMAGE:6408672), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// NR_105047 // RefSeq // Mus musculus helicase-like transcription factor (Hltf), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr3 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// ENSMUST00000145853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:20058291:20118476:1 gene:ENSMUSG00000002428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// GENSCAN00000043241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:20057351:20116724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 26 // 39 // 1
NM_026623 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 21 (Nudt21), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94017770:94037021:-1 gene:ENSMUSG00000031754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000117148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:21049565:21050248:1 gene:ENSMUSG00000039617 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC008270 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 21, mRNA (cDNA clone MGC:6310 IMAGE:2811199), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC090834 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 21, mRNA (cDNA clone MGC:102014 IMAGE:6855233), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:21049565:21050248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:93973167:94036892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_030732 // RefSeq // Mus musculus transducin (beta)-like 1X-linked receptor 1 (Tbl1xr1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000063988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:22076652:22216594:1 gene:ENSMUSG00000027630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF268195 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c IRA1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK029595 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930407K10 product:IRA1 protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006535581 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transducin (beta)-like 1X-linked receptor 1 (Tbl1xr1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// GENSCAN00000029159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:22185471:22268079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_030732 // RefSeq // Mus musculus transducin (beta)-like 1X-linked receptor 1 (Tbl1xr1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:22076652:22216594:1 gene:ENSMUSG00000027630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_004439 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease P RNA-like 2 (Rprl2), RNase P RNA. // chr3 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// ENSMUST00000157150 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:22251374:22251663:1 gene:ENSMUSG00000087775 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONMMUT042255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONMMUT042256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0
ENSMUST00000093715 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:24562074:24562180:1 gene:ENSMUSG00000070227 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT042272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000099182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:26331150:26332378:1 gene:ENSMUSG00000074664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AK044122 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830092H15 product:inferred: neuroligin I {Rattus norvegicus}, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT042311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT042312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_027583 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 16 (Spata16), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_029150 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 16 (Spata16), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000047005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:3:26637620:26983212:1 gene:ENSMUSG00000039335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000108305 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:3:26637650:26927479:1 gene:ENSMUSG00000039335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC100443 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 16, mRNA (cDNA clone MGC:118255 IMAGE:30920480), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC132205 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 16, mRNA (cDNA clone MGC:163836 IMAGE:40130482), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC132539 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 16, mRNA (cDNA clone MGC:164170 IMAGE:40130816), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:26850404:26983042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0
NM_178772 // RefSeq // Mus musculus neutral cholesterol ester hydrolase 1 (Nceh1), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000046515 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:27182965:27244958:1 gene:ENSMUSG00000027698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000129412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:27183004:27226300:1 gene:ENSMUSG00000027698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// AK128968 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3014215, weakly similar to Arylacetamide deacetylase (EC 3.1.1.-). // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC082569 // GenBank // Mus musculus arylacetamide deacetylase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:105251 IMAGE:30550100), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000091284 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:27183004:27284608:1 gene:ENSMUSG00000027698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// AK038691 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230055I01 product:Hypothetical Lipolytic enzymes/esterase/lipase/thioesterase family active site containing protein, full insert sequence. // chr3 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// ENSMUST00000140872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:27188441:27239584:1 gene:ENSMUSG00000027698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000046259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:27183078:27241818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_009425 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 10 (Tnfsf10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000046383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:27317028:27339665:1 gene:ENSMUSG00000039304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000174840 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:27317061:27342427:1 gene:ENSMUSG00000039304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK153581 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630004M21 product:tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 10, full insert sequence. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC138807 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:170434 IMAGE:8861829), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC138808 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:170435 IMAGE:8861830), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// U37522 // GenBank // Mus musculus TNF-related apoptosis inducing ligand TRAIL mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// AK144931 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830007J21 product:tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 10, full insert sequence. // chr3 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:27311529:27335667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_177330 // RefSeq // Mus musculus growth hormone secretagogue receptor (Ghsr), mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:27371351:27378010:1 gene:ENSMUSG00000051136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC120672 // GenBank // Mus musculus growth hormone secretagogue receptor, mRNA (cDNA clone MGC:155909 IMAGE:40129595), complete cds. // chr3 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC137882 // GenBank // Mus musculus growth hormone secretagogue receptor, mRNA (cDNA clone MGC:169506 IMAGE:8860901), complete cds. // chr3 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// XM_006535430 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus growth hormone secretagogue receptor (Ghsr), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// GENSCAN00000046248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:27371797:27374922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0
NM_001164056 // RefSeq // Mus musculus phospholipase D1 (Pld1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_008875 // RefSeq // Mus musculus phospholipase D1 (Pld1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000067757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:27984314:28133234:1 gene:ENSMUSG00000027695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:27938695:28133239:1 gene:ENSMUSG00000027695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000123539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:27984173:28132050:1 gene:ENSMUSG00000027695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000148827 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:28031262:28133362:1 gene:ENSMUSG00000027695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// AK136111 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420458G01 product:phospholipase D1, full insert sequence. // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC068144 // GenBank // Mus musculus phospholipase D1, mRNA (cDNA clone MGC:92966 IMAGE:30532470), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// U87868 // GenBank // Mus musculus phosphatidylcholine-specific phospholipase D1b (mPLD1) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:28011181:28131738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_031197 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 2 (Slc2a2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000029240 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:28697903:28728356:1 gene:ENSMUSG00000027690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000163536 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:28698017:28727476:1 gene:ENSMUSG00000027690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000169047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:28721517:28728327:1 gene:ENSMUSG00000027690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AK149532 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730032F11 product:solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 2, full insert sequence. // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC034675 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:25413 IMAGE:4236331), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:28695596:28754980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_177586 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 5A2 (Eif5a2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006535432 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 5A2 (Eif5a2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000060500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:28781311:28798846:1 gene:ENSMUSG00000050192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY205262 // GenBank // Mus musculus eukaryotic initiation factor 5A isoform II (Eif5a2) alternative mRNA A, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AY205263 // GenBank // Mus musculus eukaryotic initiation factor 5A isoform II (Eif5a2) alternative mRNA B, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AY205264 // GenBank // Mus musculus eukaryotic initiation factor 5A isoform II (Eif5a2) alternative mRNA C, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AY205265 // GenBank // Mus musculus eukaryotic initiation factor 5A isoform II (Eif5a2) alternative mRNA D, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC106843 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 5A2, mRNA (cDNA clone MGC:124092 IMAGE:40045849), complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC106844 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 5A2, mRNA (cDNA clone MGC:124093 IMAGE:40045850), complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000039014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:28782052:28794455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001033479 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1527 (Gm1527), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006535497 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1527 (Gm1527), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000099170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:28892617:28926724:1 gene:ENSMUSG00000074655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:31603376:31684655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:28898478:29080745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NR_030422 // RefSeq // Mus musculus microRNA 551b (Mir551b), microRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000102165 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:29416823:29416920:1 gene:ENSMUSG00000076120 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// mmu-mir-551b // miRBase Micro RNA Database // MI0004131 Mus musculus miR-551b stem-loop // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT042375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001289621 // RefSeq // Mus musculus myoneurin (Mynn), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_001289622 // RefSeq // Mus musculus myoneurin (Mynn), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_001289623 // RefSeq // Mus musculus myoneurin (Mynn), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NM_030557 // RefSeq // Mus musculus myoneurin (Mynn), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000047502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:30602087:30618492:1 gene:ENSMUSG00000037730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF349561 // GenBank // Mus musculus myoneurin mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC007477 // GenBank // Mus musculus myoneurin, mRNA (cDNA clone IMAGE:3592663), complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC065084 // GenBank // Mus musculus myoneurin, mRNA (cDNA clone MGC:86109 IMAGE:6848601), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000011036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:30602345:30616813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_001290510 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich repeats and IQ motif containing 4 (Lrriq4), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NM_026668 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich repeats and IQ motif containing 4 (Lrriq4), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006535533 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine-rich repeats and IQ motif containing 4 (Lrriq4), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000108265 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:30647886:30672299:1 gene:ENSMUSG00000027703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000108267 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:30644507:30672431:1 gene:ENSMUSG00000027703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000172350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:30645330:30672299:1 gene:ENSMUSG00000027703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC145806 // GenBank // Mus musculus leucine-rich repeats and IQ motif containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:175693 IMAGE:40131109), complete cds. // chr3 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:30648226:30672293:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_029489 // RefSeq // Mus musculus sterile alpha motif domain containing 7 (Samd7), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NR_028060 // RefSeq // Mus musculus sterile alpha motif domain containing 7 (Samd7), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:30746340:30767174:1 gene:ENSMUSG00000051860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000172593 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:30751045:30765495:1 gene:ENSMUSG00000051860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000174395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:30746293:30767166:1 gene:ENSMUSG00000051860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:30748316:30773172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_027016 // RefSeq // Mus musculus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (Sec62), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000029256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:30792876:30821263:1 gene:ENSMUSG00000027706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC048532 // GenBank // Mus musculus translocation protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6545004). // chr3 // 91 // 38 // 10 // 11 // 0 /// BC067202 // GenBank // Mus musculus SEC62 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:70047 IMAGE:6332701), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006535534 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (Sec62), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// GENSCAN00000011044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:30793348:30814353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_008857 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C, iota (Prkci), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000108249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:30995747:31052741:1 gene:ENSMUSG00000037643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000123971 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:31031722:31039397:1 gene:ENSMUSG00000037643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000130238 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:31005193:31034513:1 gene:ENSMUSG00000037643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 33 // 12 // 13 // 0 /// AK220517 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4165 protein. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC021630 // GenBank // Mus musculus protein kinase C, iota, mRNA (cDNA clone MGC:13807 IMAGE:3980628), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// D28577 // GenBank // Mus musculus mRNA for protein kinase C lambda, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:31018617:31068793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0
NM_008770 // RefSeq // Mus musculus claudin 11 (Cldn11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000046174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:31149946:31164324:1 gene:ENSMUSG00000037625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF124426 // GenBank // Mus musculus claudin-11 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC021659 // GenBank // Mus musculus claudin 11, mRNA (cDNA clone MGC:14055 IMAGE:4190031), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U19582 // GenBank // Mus musculus oligodendrocyte-specific protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:31097331:31163308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NR_027966 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930429B21 gene (4930429B21Rik), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:32364966:32370396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_008839 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol 3-kinase, catalytic, alpha polypeptide (Pik3ca), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006535409 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphatidylinositol 3-kinase, catalytic, alpha polypeptide (Pik3ca), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000029201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:32436151:32468486:1 gene:ENSMUSG00000027665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000108242 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:32436376:32466107:1 gene:ENSMUSG00000027665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000108243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:32397671:32466107:1 gene:ENSMUSG00000027665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC089038 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol 3-kinase, catalytic, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:115793 IMAGE:30692343), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC130228 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol 3-kinase, catalytic, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:161268 IMAGE:40141870), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// U03279 // GenBank // Mus musculus Balb/c phosphatidylinositol 3-kinase 110 kDa subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000008214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:32459863:32462831:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000008220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:32436206:32454616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0
NM_001161818 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 639 (Zfp639), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_144519 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 639 (Zfp639), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:32515295:32520685:1 gene:ENSMUSG00000027667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AY736186 // GenBank // Mus musculus transcriptional repressor ANC_2H01 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC003941 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 639, mRNA (cDNA clone MGC:7348 IMAGE:3487151), complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_019673 // RefSeq // Mus musculus actin-like 6A (Actl6a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006535503 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus actin-like 6A (Actl6a), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029214 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:32708546:32726968:1 gene:ENSMUSG00000027671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126144 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:32709164:32718656:1 gene:ENSMUSG00000027671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000153779 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:32718567:32726968:1 gene:ENSMUSG00000027671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AF041476 // GenBank // Mus musculus BAF53a (Baf53a) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC001994 // GenBank // Mus musculus actin-like 6A, mRNA (cDNA clone MGC:5731 IMAGE:3491205), complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC094498 // GenBank // Mus musculus actin-like 6A, mRNA (cDNA clone MGC:106356 IMAGE:4209491), complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:32710989:32726602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001013024 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 13 (isopeptidase T-3) (Usp13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006535554 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin specific peptidase 13 (isopeptidase T-3) (Usp13), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 97 // 76 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000072312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:32817546:32938071:1 gene:ENSMUSG00000056900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000108228 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:32817571:32933286:1 gene:ENSMUSG00000056900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000156769 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:32915003:32933294:1 gene:ENSMUSG00000056900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000172481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:32817711:32915033:1 gene:ENSMUSG00000056900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 97 // 69 // 28 // 29 // 0 /// BC090999 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 13 (isopeptidase T-3), mRNA (cDNA clone MGC:107670 IMAGE:6754549), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000036029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:32817711:32947968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 90 // 38 // 42 // 1
ENSMUST00000122716 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:33011958:33012114:1 gene:ENSMUSG00000084665 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT042460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001113188 // RefSeq // Mus musculus fragile X mental retardation gene 1, autosomal homolog (Fxr1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_001113189 // RefSeq // Mus musculus fragile X mental retardation gene 1, autosomal homolog (Fxr1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NM_008053 // RefSeq // Mus musculus fragile X mental retardation gene 1, autosomal homolog (Fxr1), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000001620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:34020079:34069342:1 gene:ENSMUSG00000027680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000167354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:34020079:34069342:1 gene:ENSMUSG00000027680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC019139 // GenBank // Mus musculus fragile X mental retardation gene 1, autosomal homolog, mRNA (cDNA clone MGC:29109 IMAGE:5041635), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AK049231 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330015E17 product:fragile X mental retardation gene 1, autosomal homolog, full insert sequence. // chr3 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// GENSCAN00000034422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:34020113:34069087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
ENSMUST00000172896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:34183307:34184192:1 gene:ENSMUSG00000092249 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT042502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_011443 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 2 (Sox2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000099151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:34650405:34652461:1 gene:ENSMUSG00000074637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC057574 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:67022 IMAGE:6413283), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// U31967 // GenBank // Mus musculus high mobility group box protein (sox2) mRNA, complete cds. // chr3 // 60 // 86 // 15 // 25 // 0
ENSMUST00000082900 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:35735373:35735477:1 gene:ENSMUSG00000064834 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT042580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000181445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:35863877:35864865:1 gene:ENSMUSG00000097713 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:35863877:35864945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
AK140083 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230207O21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029456 // RefSeq // Mus musculus methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1 (alpha), opposite strand (Mccc1os), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137198 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:35999833:36006907:1 gene:ENSMUSG00000086392 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000144118 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:35999913:36008828:1 gene:ENSMUSG00000086392 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK039056 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230091B22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000124469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:36000435:36025106:1 gene:ENSMUSG00000086392 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK036093 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630035A20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT042598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT042599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT042600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_028183 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810062G17 gene (1810062G17Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:36475937:36482299:1 gene:ENSMUSG00000027713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_172679 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4932438A13 gene (4932438A13Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:36863106:37053033:1 gene:ENSMUSG00000037270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152564 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:36869998:37053033:1 gene:ENSMUSG00000037270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:36873779:37052540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172679 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4932438A13 gene (4932438A13Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:36863106:37053033:1 gene:ENSMUSG00000037270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152564 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:36869998:37053033:1 gene:ENSMUSG00000037270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:36873779:37052540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000030555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:37077655:37078351:1 gene:ENSMUSG00000081705 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT042636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
NM_001008502 // RefSeq // Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 12 (human) (Bbs12), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_001255992 // RefSeq // Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 12 (human) (Bbs12), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_006535479 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 12 (human) (Bbs12), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000057975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:37312554:37321450:1 gene:ENSMUSG00000051444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000108121 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:37312556:37321453:1 gene:ENSMUSG00000051444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000004660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:37319066:37321186:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0
NM_001163511 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 5 (Spata5), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_021343 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 5 (Spata5), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029277 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:37420298:37579096:1 gene:ENSMUSG00000027722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000108112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:37419896:37579096:1 gene:ENSMUSG00000027722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000130674 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:37451721:37528356:1 gene:ENSMUSG00000027722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// AF049099 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated factor (SPAF) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC145302 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 5, mRNA (cDNA clone MGC:178864 IMAGE:9053856), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:37420341:37578928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_011896 // RefSeq // Mus musculus sprouty homolog 1 (Drosophila) (Spry1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000038569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:37639958:37644598:1 gene:ENSMUSG00000037211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000108107 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:37640080:37644598:1 gene:ENSMUSG00000037211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:37639947:37644598:1 gene:ENSMUSG00000037211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF176903 // GenBank // Mus musculus sprouty 1 (Spry1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC039139 // GenBank // Mus musculus sprouty homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:18307 IMAGE:3672353), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC053428 // GenBank // Mus musculus sprouty homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:59320 IMAGE:6506766), complete cds. // chr3 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC069914 // GenBank // Mus musculus sprouty homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:78167 IMAGE:5251876), complete cds. // chr3 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// XM_006535464 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sprouty homolog 1 (Drosophila) (Spry1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000004707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:37642610:37643551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0
NM_183221 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 4 (Drosophila) (Fat4), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000061260 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:38886940:39011985:1 gene:ENSMUSG00000046743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// DQ286572 // GenBank // Mus musculus Fat4 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000018425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:38991639:39010842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000018433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:38928426:38986467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000084011 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:39666288:39666447:1 gene:ENSMUSG00000065945 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT042708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_175515 // RefSeq // Mus musculus inturned planar cell polarity effector homolog (Drosophila) (Intu), mRNA. // chrUn // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000091186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:40540767:40704774:1 gene:ENSMUSG00000060798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC125523 // GenBank // Mus musculus inturned planar cell polarity effector homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:159226 IMAGE:40130038), complete cds. // chrUn // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// BC132387 // GenBank // Mus musculus inturned planar cell polarity effector homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:164018 IMAGE:40130664), complete cds. // chrUn // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// GENSCAN00000006314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:40531353:40725068:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 71 // 71 // 27 // 38 // 1
NM_178386 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 31 (Slc25a31), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000091184 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:40708855:40725593:1 gene:ENSMUSG00000069041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY550241 // GenBank // Mus musculus sperm flagellar energy carrier protein (Sfec) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC050810 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 31, mRNA (cDNA clone MGC:58785 IMAGE:6772660), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC139243 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 31, mRNA (cDNA clone MGC:170870 IMAGE:8862265), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC139245 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 31, mRNA (cDNA clone MGC:170872 IMAGE:8862267), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:40531353:40725068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1
NM_001040399 // RefSeq // Mus musculus La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Larp1b), mRNA. // chr3 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// XM_006500773 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Larp1b), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000048490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:40950631:40977793:1 gene:ENSMUSG00000037814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AK163348 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020017I05 product:hypothetical RNA-binding protein Lupus Lal/Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC025528 // GenBank // Mus musculus La ribonucleoprotein domain family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:38253 IMAGE:5324328), complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000027762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:40950144:41039091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
ENSMUST00000082993 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:40992693:40992850:1 gene:ENSMUSG00000064927 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT042764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001130184 // RefSeq // Mus musculus jade family PHD finger 1 (Jade1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_001130185 // RefSeq // Mus musculus jade family PHD finger 1 (Jade1), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NM_001130186 // RefSeq // Mus musculus jade family PHD finger 1 (Jade1), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_172303 // RefSeq // Mus musculus jade family PHD finger 1 (Jade1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006500784 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus jade family PHD finger 1 (Jade1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000026865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:41555734:41616862:1 gene:ENSMUSG00000025764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000163764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:41563383:41616862:1 gene:ENSMUSG00000025764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000168086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:41564880:41616862:1 gene:ENSMUSG00000025764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000170711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:41563751:41616862:1 gene:ENSMUSG00000025764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC020316 // GenBank // Mus musculus PHD finger protein 17, mRNA (cDNA clone MGC:31036 IMAGE:5250231), complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:41578722:41614003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_001098171 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 10 (Pcdh10), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NM_001098172 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 10 (Pcdh10), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// NM_011043 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 10 (Pcdh10), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000170695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:45378398:45423711:1 gene:ENSMUSG00000049100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000171554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:45378398:45399594:1 gene:ENSMUSG00000049100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// AF334801 // GenBank // Mus musculus OL-protocadherin isoform (Pcadh10) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr3 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// BC065695 // GenBank // Mus musculus protocadherin 10, mRNA (cDNA clone MGC:69612 IMAGE:6838316), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// U88549 // GenBank // Mus musculus OL-protocadherin mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// NM_001098170 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 10 (Pcdh10), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// ENSMUST00000166126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:45378398:45434566:1 gene:ENSMUSG00000049100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// GENSCAN00000025370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:45297455:45407383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000082645 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:45817736:45817898:1 gene:ENSMUSG00000064579 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT042913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083084 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:48954722:48954885:1 gene:ENSMUSG00000065018 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT042922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
AK030119 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932443G14 product:hypothetical PH domain-like structure containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XR_375475 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene, 20557 (Gm20557), misc_RNA. // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// KnowTID_00004711 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:49189960:49366391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSMUST00000083447 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:49658763:49658869:1 gene:ENSMUSG00000065381 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT042931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_009834 // RefSeq // Mus musculus CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae) (Ccrn4l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:51224447:51251644:1 gene:ENSMUSG00000023087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000144826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:51240206:51251624:1 gene:ENSMUSG00000023087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000167780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:51224470:51251631:1 gene:ENSMUSG00000023087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF183960 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c carbon catabolite repression 4 protein homolog (Ccr4) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF199491 // GenBank // Mus musculus NOCTURNIN (Nocturnin) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC139369 // GenBank // Mus musculus CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:170996 IMAGE:8862391), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC139370 // GenBank // Mus musculus CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:170997 IMAGE:8862392), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// U70139 // GenBank // Mus musculus probable nocturnin protein mRNA, partial cds. // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:51225104:51250532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NR_073429 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930577N17 gene (4930577N17Rik), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:51277571:51279805:1 gene:ENSMUSG00000087440 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT042973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONMMUT042974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_053089 // RefSeq // Mus musculus N(alpha)-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit (Naa15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000029303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:51416016:51475985:1 gene:ENSMUSG00000063273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AF237622 // GenBank // Mus musculus acetyltransferase Tubedown-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 82 // 77 // 27 // 33 // 0 /// AF510858 // GenBank // Mus musculus N-terminal aceyltransferase 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 41 // 43 // 0 /// BC030167 // GenBank // Mus musculus NMDA receptor-regulated gene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3674167), complete cds. // chr3 // 100 // 35 // 15 // 15 // 0 /// BC050017 // GenBank // Mus musculus NMDA receptor-regulated gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:60847 IMAGE:30020858), complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 41 // 43 // 0 /// AK172501 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830211D09 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// GENSCAN00000015846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:51416323:51472800:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT042982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
NM_016858 // RefSeq // Mus musculus RAB33B, member RAS oncogene family (Rab33b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000054387 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:51483966:51495905:1 gene:ENSMUSG00000027739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AB004665 // GenBank // Mus musculus mRNA for Rab33B, complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// AB232629 // GenBank // Mus musculus Rab33B mRNA for Rab33B, complete cds. // chr3 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC065076 // GenBank // Mus musculus RAB33B, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:86105 IMAGE:6815992), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:51484332:51493796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000099104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:51693771:51695090:1 gene:ENSMUSG00000074603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK137296 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530099E02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083136 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:51828912:51829028:1 gene:ENSMUSG00000065070 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT043011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_019739 // RefSeq // Mus musculus forkhead box O1 (Foxo1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000053764 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:52268337:52350109:1 gene:ENSMUSG00000044167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF114258 // GenBank // Mus musculus forkhead protein FKHR1 (Fkhr1) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// AF126056 // GenBank // Mus musculus forkhead protein FKHR (Fkhr) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000001034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:52268802:52346376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// NONMMUT043035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT043036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_175386 // RefSeq // Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner (Lhfp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:53041528:53261679:1 gene:ENSMUSG00000048332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:53041583:53261679:1 gene:ENSMUSG00000048332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC052079 // GenBank // Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner, mRNA (cDNA clone MGC:62497 IMAGE:6402782), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC095934 // GenBank // Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner, mRNA (cDNA clone MGC:106074 IMAGE:3154659), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000137954 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:53041559:53261675:1 gene:ENSMUSG00000048332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONMMUT043058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000053317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:53027183:53061830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_173382 // RefSeq // Mus musculus proline and serine rich 1 (Proser1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000058577 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:53463666:53481755:1 gene:ENSMUSG00000049504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC086674 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810046L04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:113792 IMAGE:30653602), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141418 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:53463932:53474179:1 gene:ENSMUSG00000049504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// AK161440 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930591M24 product:Similar to NT2RM4002189 protein (Fragment) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000053310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:53469385:53480641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NM_153156 // RefSeq // Mus musculus stomatin (Epb7.2)-like 3 (Stoml3), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:53488727:53508502:1 gene:ENSMUSG00000027744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB085692 // GenBank // Mus musculus sro mRNA for stomatin related olfactory protein SRO, complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC058224 // GenBank // Mus musculus stomatin (Epb7.2)-like 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6307495), partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC138667 // GenBank // Mus musculus stomatin (Epb7.2)-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:170293 IMAGE:8861688), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC138668 // GenBank // Mus musculus stomatin (Epb7.2)-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:170294 IMAGE:8861689), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000124702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:53488727:53498492:1 gene:ENSMUSG00000027744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000053312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:53497875:53510203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
AK132634 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833439C01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004722 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000054741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:54021164:54058537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_019995 // RefSeq // Mus musculus suppressor of Ty 20 (Supt20), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000029315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:54692823:54728762:1 gene:ENSMUSG00000095832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 23 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000170552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:54693105:54716837:1 gene:ENSMUSG00000027751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// AF139179 // GenBank // Mus musculus p38 interacting protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// AK083379 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920025L24 product:transcription factor (p38 interacting protein), full insert sequence. // chr3 // 100 // 58 // 28 // 28 // 0 /// BC052702 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 3, ERATO Doi 300, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:64649 IMAGE:6400922), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006501804 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus suppressor of Ty 20 (Supt20), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 96 // 96 // 46 // 48 // 1 /// XM_006501809 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus suppressor of Ty 20 (Supt20), transcript variant X9, mRNA. // chr3 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1 /// GENSCAN00000022806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:54678546:54733516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 77 // 37 // 48 // 1
NM_019483 // RefSeq // Mus musculus SMAD family member 9 (Smad9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501728 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SMAD family member 9 (Smad9), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:54755582:54801257:1 gene:ENSMUSG00000027796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF175408 // GenBank // Mus musculus SMAD8 protein (Smad8) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// AY145520 // GenBank // Mus musculus SMAD8 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC119141 // GenBank // Mus musculus MAD homolog 9 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:155457 IMAGE:8733890), complete cds. // chr3 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000022804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:54735584:54797501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_028937 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2 (Sohlh2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000029369 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:55182028:55209957:1 gene:ENSMUSG00000027794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC120917 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2, mRNA (cDNA clone MGC:143735 IMAGE:40092728), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC120918 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2, mRNA (cDNA clone MGC:143736 IMAGE:40092729), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// DQ086115 // GenBank // Mus musculus testis and ovary bHLH (Tohlh2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000022814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:55116986:55258193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1
ENSMUST00000082652 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:55305317:55305423:1 gene:ENSMUSG00000064586 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT043112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000082970 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:55548446:55548552:1 gene:ENSMUSG00000064904 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT043130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_010750 // RefSeq // Mus musculus mab-21-like 1 (C. elegans) (Mab21l1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000075422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:55782510:55785285:1 gene:ENSMUSG00000056947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF040945 // GenBank // Mus musculus cell fate specification homolog MAB21L1 (Mab21l1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AF228913 // GenBank // Mus musculus MAB21L1 (Mab21l1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC014750 // GenBank // Mus musculus mab-21-like 1 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:25223 IMAGE:4526962), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:55780428:55784073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_145539 // RefSeq // Mus musculus transmembrane 4 superfamily member 4 (Tm4sf4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029377 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:57425314:57441677:1 gene:ENSMUSG00000027801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC010814 // GenBank // Mus musculus transmembrane 4 superfamily member 4, mRNA (cDNA clone MGC:19127 IMAGE:4211816), complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:57409936:57441091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0
NM_001113413 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 13 (Rnf13), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NM_011883 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 13 (Rnf13), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501457 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 13 (Rnf13), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000041826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:57736066:57835233:1 gene:ENSMUSG00000036503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AF037205 // GenBank // Mus musculus RING zinc finger protein (Rzf) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// AF037206 // GenBank // Mus musculus RING zinc finger protein (Rzf) mRNA, alternatively spliced product, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// BC058182 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:68150 IMAGE:5324040), complete cds. // chr3 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// XM_006501459 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 13 (Rnf13), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// AK034135 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330159A06 product:ring finger protein 13, full insert sequence. // chr3 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// AK082296 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230033M15 product:ring finger protein 13, full insert sequence. // chr3 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// GENSCAN00000038244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:57791725:57841266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_001081229 // RefSeq // Mus musculus TSC22 domain family, member 2 (Tsc22d2), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006502130 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TSC22 domain family, member 2 (Tsc22d2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000099090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:58415689:58466787:1 gene:ENSMUSG00000027806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC117998 // GenBank // Mus musculus TSC22 domain family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:143927 IMAGE:40095084), complete cds. // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// EU004151 // GenBank // Mus musculus TSC22D2 isoform 4 (Tsc22d2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AK132430 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4632423D15 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000038243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:58415698:58460268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001040396 // RefSeq // Mus musculus selenoprotein T (Selt), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000107924 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:58576636:58593133:1 gene:ENSMUSG00000075700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC019970 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810407C02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28960 IMAGE:4458171), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BC038867 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810407C02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:47969 IMAGE:1547418), complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// BC132453 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810407C02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:164084 IMAGE:40130730), complete cds. // chr3 // 94 // 77 // 16 // 17 // 0 /// BC138424 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810407C02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170049 IMAGE:8861444), complete cds. // chr3 // 94 // 77 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000125815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:58576698:58588812:1 gene:ENSMUSG00000075700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// GENSCAN00000038233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:58585268:58609300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000094228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:59778096:59838612:1 gene:ENSMUSG00000074589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK015427 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930449A18 product:hypothetical alpha/beta-Hydrolases structure containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006502494 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene, 16527 (Gm16527), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// XM_006502495 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene, 16527 (Gm16527), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// GENSCAN00000041237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:59667102:60040079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_177661 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C130079G13 gene (C130079G13Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000049476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:59925214:59937949:1 gene:ENSMUSG00000036951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:59667102:60040079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NR_037189 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9696 (Gm9696), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000094227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:59952309:59973594:1 gene:ENSMUSG00000070465 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000191541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:59959360:59972482:1 gene:ENSMUSG00000070465 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000041237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:59667102:60040079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001128091 // RefSeq // Mus musculus arylacetamide deacetylase-like 2 (Aadacl2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:60006743:60025420:1 gene:ENSMUSG00000091376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147724 // GenBank // Mus musculus arylacetamide deacetylase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:182779 IMAGE:9056673), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147728 // GenBank // Mus musculus arylacetamide deacetylase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:182783 IMAGE:9056677), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:59667102:60040079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_023383 // RefSeq // Mus musculus arylacetamide deacetylase (esterase) (Aadac), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:60031763:60040160:1 gene:ENSMUSG00000027761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000151605 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:60031876:60036084:1 gene:ENSMUSG00000027761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC019999 // GenBank // Mus musculus arylacetamide deacetylase (esterase), mRNA (cDNA clone MGC:28468 IMAGE:4162194), complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC054823 // GenBank // Mus musculus arylacetamide deacetylase (esterase), mRNA (cDNA clone MGC:62575 IMAGE:4162038), complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:59667102:60040079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT043260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_032400 // RefSeq // Mus musculus succinate receptor 1 (Sucnr1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:60081869:60087566:1 gene:ENSMUSG00000027762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF295367 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor GPR91 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC096665 // GenBank // Mus musculus succinate receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:106957 IMAGE:1365839), complete cds. // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0
NM_008772 // RefSeq // Mus musculus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 1 (P2ry1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:61002795:61008979:1 gene:ENSMUSG00000027765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK033660 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130210N15 product:P2Y PURINOCEPTOR 1, full insert sequence. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC138634 // GenBank // Mus musculus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 1, mRNA (cDNA clone MGC:170259 IMAGE:8861654), complete cds. // chr3 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// BC138635 // GenBank // Mus musculus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 1, mRNA (cDNA clone MGC:170260 IMAGE:8861655), complete cds. // chr3 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// U22829 // GenBank // Mus musculus P2Y purinoceptor mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NM_001282016 // RefSeq // Mus musculus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 1 (P2ry1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:60926078:61004563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_028712 // RefSeq // Mus musculus RAP2B, member of RAS oncogene family (Rap2b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:61364507:61368703:1 gene:ENSMUSG00000036894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC032168 // GenBank // Mus musculus RAP2B, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:35620 IMAGE:5354704), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC046528 // GenBank // Mus musculus RAP2B, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:51355 IMAGE:5149751), complete cds. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001081295 // RefSeq // Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 26 (Arhgef26), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000079300 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:62338344:62462221:1 gene:ENSMUSG00000036885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161057 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:62419668:62460212:1 gene:ENSMUSG00000036885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000159746 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:62341101:62380991:1 gene:ENSMUSG00000036885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSMUST00000163008 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:62338999:62379719:1 gene:ENSMUSG00000036885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000020813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:62217958:62460346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001289462 // RefSeq // Mus musculus membrane metallo endopeptidase (Mme), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// NM_001289463 // RefSeq // Mus musculus membrane metallo endopeptidase (Mme), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NM_008604 // RefSeq // Mus musculus membrane metallo endopeptidase (Mme), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// XM_006501095 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane metallo endopeptidase (Mme), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000029400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:63295872:63382231:1 gene:ENSMUSG00000027820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// BC034092 // GenBank // Mus musculus membrane metallo endopeptidase, mRNA (cDNA clone MGC:31469 IMAGE:4483558), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// AK052088 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230045D07 product:membrane metallo endopeptidase, full insert sequence. // chr3 // 44 // 44 // 21 // 48 // 1 /// GENSCAN00000016574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:63280772:63380349:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 28 // 48 // 1
NM_001033300 // RefSeq // Mus musculus guanine monophosphate synthetase (Gmps), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029405 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:63976106:64022579:1 gene:ENSMUSG00000027823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC138411 // GenBank // Mus musculus guanine monphosphate synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:170036 IMAGE:8861431), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC138412 // GenBank // Mus musculus guanine monphosphate synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:170037 IMAGE:8861432), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:63980747:64016734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_019918 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 1 (Vmn2r1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006501757 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal 2, receptor 1 (Vmn2r1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// XM_006501758 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal 2, receptor 1 (Vmn2r1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// XM_006501760 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal 2, receptor 1 (Vmn2r1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// XR_375553 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal 2, receptor 1 (Vmn2r1), transcript variant X7, misc_RNA. // chr3 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// XR_375555 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal 2, receptor 1 (Vmn2r1), transcript variant X9, misc_RNA. // chr3 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000029406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:64081642:64105458:1 gene:ENSMUSG00000027824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AB267725 // GenBank // Mus musculus V2Rx mRNA for pheromone receptor V2Rx, complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// AF053986 // GenBank // Mus musculus tissue-type vomeronasal neurons putative pheromone receptor V2R2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:64081642:64105458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000102245 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:65432137:65432246:1 gene:ENSMUSG00000095094 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 63 // 100 // 15 // 24 // 0 /// NONMMUT027119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 63 // 100 // 15 // 24 // 0
NM_153807 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA synthetase family member 2 (Acsf2), mRNA. // chr3 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000103164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94557102:94601871:-1 gene:ENSMUSG00000076435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000131852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:65393337:65395184:1 gene:ENSMUSG00000048916 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000155122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94570291:94601769:-1 gene:ENSMUSG00000076435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 81 // 50 // 13 // 16 // 0 /// BC018371 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA synthetase family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:25878 IMAGE:4210220), complete cds. // chr3 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// BC063269 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA synthetase family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:68317 IMAGE:4159843), complete cds. // chr3 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:65393355:65395184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94558307:94563753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000035437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94569295:94601752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 66 // 18 // 21 // 0
NM_178892 // RefSeq // Mus musculus TCDD-inducible poly(ADP-ribose) polymerase (Tiparp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000047906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:65528410:65555145:1 gene:ENSMUSG00000034640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000154094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:65546040:65552632:1 gene:ENSMUSG00000034640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC003919 // GenBank // Mus musculus TCDD-inducible poly(ADP-ribose) polymerase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3485144). // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC068173 // GenBank // Mus musculus TCDD-inducible poly(ADP-ribose) polymerase, mRNA (cDNA clone MGC:92987 IMAGE:30616032), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000130705 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:65528460:65547597:1 gene:ENSMUSG00000034640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000026568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:65523241:65553565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT043361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000014750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:65613469:65871936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001037923 // RefSeq // Mus musculus leucine, glutamate and lysine rich 1 (Lekr1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:65666228:65686179:1 gene:ENSMUSG00000074579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107848 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:65666235:65684224:1 gene:ENSMUSG00000074579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NM_001166659 // RefSeq // Mus musculus leucine, glutamate and lysine rich 1 (Lekr1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000161534 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:65666282:65773285:1 gene:ENSMUSG00000074579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000161794 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:65666246:65739695:1 gene:ENSMUSG00000074579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENSMUST00000161851 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:65666317:65728551:1 gene:ENSMUSG00000074579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:65613469:65871936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001166659 // RefSeq // Mus musculus leucine, glutamate and lysine rich 1 (Lekr1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501846 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine, glutamate and lysine rich 1 (Lekr1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000177434 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:65684053:65831159:1 gene:ENSMUSG00000074579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:65613469:65871936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_008987 // RefSeq // Mus musculus pentraxin related gene (Ptx3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:66219910:66225805:1 gene:ENSMUSG00000027832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC022176 // GenBank // Mus musculus pentraxin related gene, mRNA (cDNA clone MGC:13999 IMAGE:4012053), complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:66220062:66225205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000036628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:66686276:66694535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001039543 // RefSeq // Mus musculus myeloid leukemia factor 1 (Mlf1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_010801 // RefSeq // Mus musculus myeloid leukemia factor 1 (Mlf1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000061322 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:67374148:67400003:1 gene:ENSMUSG00000048416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000077916 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:67374097:67399998:1 gene:ENSMUSG00000048416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000126628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:67374143:67395299:1 gene:ENSMUSG00000048416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AF009515 // GenBank // Mus musculus hematopoietic lineage switch 7 (HLS7) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// AF100171 // GenBank // Mus musculus myelodysplasia/myeloid leukemia factor 1 (Mlf1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC027526 // GenBank // Mus musculus myeloid leukemia factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:41163 IMAGE:1495721), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:67374616:67399807:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_138591 // RefSeq // Mus musculus G elongation factor, mitochondrial 1 (Gfm1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000077271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:67430096:67476529:1 gene:ENSMUSG00000027774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000160529 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:67456479:67474804:1 gene:ENSMUSG00000027774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000161009 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:67430116:67458805:1 gene:ENSMUSG00000027774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// AF315511 // GenBank // Mus musculus elongation factor G (Efg) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr3 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// AK033214 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030465C11 product:G elongation factor, full insert sequence. // chr3 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// BC013093 // GenBank // Mus musculus G elongation factor, mitochondrial 1, mRNA (cDNA clone MGC:7961 IMAGE:3584730), complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC031772 // GenBank // Mus musculus G elongation factor, mitochondrial 1, mRNA (cDNA clone MGC:25967 IMAGE:4239980), complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:67430239:67457974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000036631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:67462239:67474850:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_025813 // RefSeq // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 1 (Mfsd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:67582768:67604231:1 gene:ENSMUSG00000027775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK075859 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310002C18 product:CDNA FLJ14153 FIS, CLONE NT2RM1000092, WEAKLY SIMILAR TO MULTIDRUG RESISTANCE PROTEIN 2 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC024891 // GenBank // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:28238 IMAGE:3992247), complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000036637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:67576340:67594397:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_177585 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing J (Iqcj), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:67892220:68056593:1 gene:ENSMUSG00000051777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:68040729:68056593:1 gene:ENSMUSG00000051777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_001113419 // RefSeq // Mus musculus predicted gene, 21949 (Gm21949), mRNA. // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// EU163409 // GenBank // Mus musculus schwannomin interacting protein 1 isoform IQCJ (Schip-1-IQCJ) mRNA, complete cds. // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000025561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:67966578:68049402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000183142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:68333197:68333777:1 gene:ENSMUSG00000098151 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:68333511:68333780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
AK147301 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1010M15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000052689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:68841702:68870451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_001167996 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1110032F04 gene (1110032F04Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:68869586:68872163:1 gene:ENSMUSG00000046999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:68841702:68870451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSMUST00000083646 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:69009756:69009853:1 gene:ENSMUSG00000065580 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_029529 // RefSeq // Mus musculus microRNA 15b (Mir15b), microRNA. // chr3 // 70 // 80 // 14 // 20 // 0 /// NONMMUT043426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-15b // miRBase Micro RNA Database // MI0000140 Mus musculus miR-15b stem-loop // chr3 // 70 // 80 // 14 // 20 // 0 /// NONMMUT043427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 70 // 80 // 14 // 20 // 0
NR_029735 // RefSeq // Mus musculus microRNA 16-2 (Mir16-2), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000083672 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:69009902:69009996:1 gene:ENSMUSG00000065606 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-16-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000566 Mus musculus miR-16-2 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT043428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_027843 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 14 (Arl14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000183126 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:69222419:69223618:1 gene:ENSMUSG00000098207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC104368 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 14, mRNA (cDNA clone MGC:129454 IMAGE:40049874), complete cds. // chr3 // 89 // 67 // 16 // 18 // 0 /// BC104369 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 14, mRNA (cDNA clone MGC:129455 IMAGE:40049875), complete cds. // chr3 // 89 // 67 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:69185489:69223100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_178726 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1 (formerly 2C)-like (Ppm1l), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:69316861:69560802:1 gene:ENSMUSG00000027784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AK028275 // GenBank HTC // Mus musculus 14, 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3222401G13 product:hypothetical Protein phosphatase 2C domain containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AY184801 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2C epsilon mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// BC096031 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1 (formerly 2C)-like, mRNA (cDNA clone MGC:106606 IMAGE:6837066), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:69548979:69553099:1 gene:ENSMUSG00000027784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000052666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:69541922:69553174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
NM_001018031 // RefSeq // Mus musculus otolin 1 homolog (zebrafish) (Otol1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053013 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:70007613:70028708:1 gene:ENSMUSG00000027788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC150904 // GenBank // Mus musculus gene model 414, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:183815 IMAGE:9087815), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// DQ002405 // GenBank // Mus musculus otolin-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:70018539:70103328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
GENSCAN00000040138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:70351909:70439767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
ENSMUST00000183150 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:71859185:71860149:1 gene:ENSMUSG00000098189 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT043473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_009250 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade I, member 1 (Serpini1), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000029423 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:75557547:75643495:1 gene:ENSMUSG00000027834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000161776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:75557547:75616709:1 gene:ENSMUSG00000027834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC006776 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade I, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:6413 IMAGE:3588856), complete cds. // chr3 // 92 // 81 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:75557578:75616201:1 gene:ENSMUSG00000027834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// AK164355 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130065I20 product:serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade I, member 1, full insert sequence. // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000040556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:75613098:75861306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_001253719 // RefSeq // Mus musculus follistatin-like 5 (Fstl5), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NM_178673 // RefSeq // Mus musculus follistatin-like 5 (Fstl5), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000038364 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:76074270:76710019:1 gene:ENSMUSG00000034098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000160261 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:76075583:76708636:1 gene:ENSMUSG00000034098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000162471 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:76593550:76707549:1 gene:ENSMUSG00000034098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AF374460 // GenBank // Mus musculus SPIG2-A mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC075640 // GenBank // Mus musculus follistatin-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:100015 IMAGE:30545529), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000159686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:76074559:76546338:1 gene:ENSMUSG00000034098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// AK140611 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930050H09 product:ollistatin-like 5, full insert sequence. // chr3 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000040560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:76162610:76536364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000082759 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:79196374:79196477:1 gene:ENSMUSG00000064693 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001142953 // RefSeq // Mus musculus predicted gene, 17359 (Gm17359), mRNA. // chr3 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENSMUST00000164216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:79345376:79464129:1 gene:ENSMUSG00000091685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
XR_140605 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930589L23 gene (4930589L23Rik), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000091023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:79568192:79572580:1 gene:ENSMUSG00000068957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK016374 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930589L23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_026352 // RefSeq // Mus musculus peptidylprolyl isomerase D (cyclophilin D) (Ppid), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006501943 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peptidylprolyl isomerase D (cyclophilin D) (Ppid), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// XM_006501944 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peptidylprolyl isomerase D (cyclophilin D) (Ppid), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000029382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:79591365:79603650:1 gene:ENSMUSG00000027804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000161460 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:79591342:79603276:1 gene:ENSMUSG00000027804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC011499 // GenBank // Mus musculus peptidylprolyl isomerase D (cyclophilin D), mRNA (cDNA clone MGC:6702 IMAGE:3584183), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC019778 // GenBank // Mus musculus peptidylprolyl isomerase D (cyclophilin D), mRNA (cDNA clone MGC:25799 IMAGE:4035785), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000045010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:79591473:79603119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1
NM_029482 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930579G24 gene (4930579G24Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:79629079:79632817:1 gene:ENSMUSG00000027811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK016321 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930579G24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// BC096378 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 4930579G24 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5323999), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:79629177:79631284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0
NM_133187 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 198, member B (Fam198b), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501984 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 198, member B (Fam198b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:79885930:79946278:1 gene:ENSMUSG00000027955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:79884533:79946280:1 gene:ENSMUSG00000027955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC056975 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110032E23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:66815 IMAGE:6827227), complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// EU797522 // GenBank // Mus musculus Ened (Ened) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK053058 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930036N18 product:Hypothetical basic protein I-19 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_177662 // RefSeq // Mus musculus cathepsin O (Ctso), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029649 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:81932601:81956725:1 gene:ENSMUSG00000028015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK143683 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430009H11 product:cathepsin O, full insert sequence. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC098219 // GenBank // Mus musculus cathepsin O, mRNA (cDNA clone MGC:106906 IMAGE:1066724), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000143307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:81932643:81943001:1 gene:ENSMUSG00000028015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// AK040071 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430056C07 product:cathepsin O, full insert sequence. // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000015082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:81921025:81958907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONMMUT043592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_021370 // RefSeq // Mus musculus acid-sensing (proton-gated) ion channel family member 5 (Asic5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501823 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acid-sensing (proton-gated) ion channel family member 5 (Asic5), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000029641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:81996922:82021233:1 gene:ENSMUSG00000028008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000107736 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:81999461:82021228:1 gene:ENSMUSG00000028008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK038321 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130095J21 product:amiloride-sensitive sodium channel, full insert sequence. // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:81996951:82022422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_001081230 // RefSeq // Mus musculus microtubule-associated protein 9 (Map9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501276 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus microtubule-associated protein 9 (Map9), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000091014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:82358072:82395268:1 gene:ENSMUSG00000033900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:82359050:82447288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_133862 // RefSeq // Mus musculus fibrinogen gamma chain (Fgg), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006502421 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibrinogen gamma chain (Fgg), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000048486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:83007859:83015053:1 gene:ENSMUSG00000033860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC019506 // GenBank // Mus musculus fibrinogen, gamma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:28531 IMAGE:4193631), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC019828 // GenBank // Mus musculus fibrinogen, gamma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:29970 IMAGE:5123696), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:82995193:83014343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_001111048 // RefSeq // Mus musculus fibrinogen alpha chain (Fga), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 98 // 96 // 47 // 48 // 0 /// NM_010196 // RefSeq // Mus musculus fibrinogen alpha chain (Fga), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENSMUST00000029630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:83026153:83033615:1 gene:ENSMUSG00000028001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENSMUST00000166581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:83026153:83033615:1 gene:ENSMUSG00000028001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 96 // 47 // 48 // 0 /// BC005467 // GenBank // Mus musculus fibrinogen, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:6605 IMAGE:3487861), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:83026215:83033410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 92 // 45 // 46 // 0
NM_001111048 // RefSeq // Mus musculus fibrinogen alpha chain (Fga), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_010196 // RefSeq // Mus musculus fibrinogen alpha chain (Fga), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:83026153:83033615:1 gene:ENSMUSG00000028001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000166581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:83026153:83033615:1 gene:ENSMUSG00000028001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:83026215:83033410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016784 // RefSeq // Mus musculus pleiotropic regulator 1, PRL1 homolog (Arabidopsis) (Plrg1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:83055532:83072289:1 gene:ENSMUSG00000027998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000122128 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:83055555:83072172:1 gene:ENSMUSG00000027998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// ENSMUST00000150268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:83055522:83072355:1 gene:ENSMUSG00000027998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF044334 // GenBank // Mus musculus pleiotropic regulator 1 (PLRG1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC006750 // GenBank // Mus musculus pleiotropic regulator 1, PRL1 homolog (Arabidopsis), mRNA (cDNA clone MGC:12092 IMAGE:3709134), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:83055646:83114683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000016375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:83274614:83356467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:83228324:83274230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_009144 // RefSeq // Mus musculus secreted frizzled-related protein 2 (Sfrp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:83766321:83774316:1 gene:ENSMUSG00000027996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:83766565:83770143:1 gene:ENSMUSG00000027996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AF017989 // GenBank // Mus musculus secreted apoptosis related protein 1 (Sarp1) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC014722 // GenBank // Mus musculus secreted frizzled-related protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:25299 IMAGE:4487469), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D50462 // GenBank // Mus musculus SDF5 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// U88567 // GenBank // Mus musculus secreted frizzled related protein sFRP-2 (Sfrp2) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// XM_006501183 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus secreted frizzled-related protein 2 (Sfrp2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:83766542:83773422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_207278 // RefSeq // Mus musculus tigger transposable element derived 4 (Tigd4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:84593574:84597032:1 gene:ENSMUSG00000047819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177260 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 154 (Tmem154), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000107682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:84666192:84704575:1 gene:ENSMUSG00000056498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000129417 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:84666370:84685555:1 gene:ENSMUSG00000056498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC096432 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 154, mRNA (cDNA clone MGC:106178 IMAGE:5390573), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC113174 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 154, mRNA (cDNA clone MGC:132893 IMAGE:40060792), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC113175 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 154, mRNA (cDNA clone MGC:132894 IMAGE:40060793), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000128344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:84690223:84692544:1 gene:ENSMUSG00000056498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// ENSMUST00000134890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:84666210:84685665:1 gene:ENSMUSG00000056498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// AK171510 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730224L19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000020758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:84684067:84701408:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONMMUT043666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
AK157515 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830220I02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_144896 // RefSeq // Mus musculus PET112 homolog (S. cerevisiae) (Pet112), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006501329 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PET112 homolog (S. cerevisiae) (Pet112), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000029726 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:85574195:85654158:1 gene:ENSMUSG00000028085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000107672 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:85574119:85646579:1 gene:ENSMUSG00000028085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000107674 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:85574127:85652833:1 gene:ENSMUSG00000028085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000127348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:85574119:85655622:1 gene:ENSMUSG00000028085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK053978 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230008K18 product:hypothetical Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase B subunit containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK166231 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830020L13 product:PET112-like (yeast), full insert sequence. // chr3 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC005709 // GenBank // Mus musculus PET112-like (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:11629 IMAGE:3157973), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:85601893:85619318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_019814 // RefSeq // Mus musculus HIG1 domain family, member 1A (Higd1a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000054148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:85915783:85916070:1 gene:ENSMUSG00000044330 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000060251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:121848560:121858000:-1 gene:ENSMUSG00000038412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB253941 // GenBank // Mus musculus Higd1a mRNA for Higd1a, complete cds. // chr3 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// AF141312 // GenBank // Mus musculus hypoxia induced gene 1 (Hig1) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AY028387 // GenBank // Mus musculus clone 10 unknown mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC021594 // GenBank // Mus musculus HIG1 domain family, member 1A, mRNA (cDNA clone MGC:35918 IMAGE:5148784), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC090259 // GenBank // Mus musculus HIG1 domain family, member 1A, mRNA (cDNA clone MGC:102448 IMAGE:5060413), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC132371 // GenBank // Mus musculus HIG1 domain family, member 1A, mRNA (cDNA clone MGC:164002 IMAGE:40130648), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC151191 // GenBank // Mus musculus HIG1 domain family, member 1A, mRNA (cDNA clone MGC:169929 IMAGE:8861324), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:121784116:121852587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000055066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:85915783:85928373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001082414 // RefSeq // Mus musculus SH3 domain protein D19 (Sh3d19), mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// XM_006501546 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH3 domain protein D19 (Sh3d19), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006501547 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH3 domain protein D19 (Sh3d19), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006501549 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH3 domain protein D19 (Sh3d19), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000107664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:86084434:86130522:1 gene:ENSMUSG00000028082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000182666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:86070915:86130526:1 gene:ENSMUSG00000028082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC031117 // GenBank // Mus musculus SH3 domain protein D19, mRNA (cDNA clone MGC:35968 IMAGE:5064197), complete cds. // chr3 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// D89677 // GenBank // Mus musculus SH3d19 mRNA for SH3 domain protein D19, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// XM_006501551 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH3 domain protein D19 (Sh3d19), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 33 // 33 // 15 // 45 // 1 /// GENSCAN00000055060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:86076606:86126711:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 33 // 33 // 0
ENSMUST00000083913 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:86100534:86100655:1 gene:ENSMUSG00000065847 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT043708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001077687 // RefSeq // Mus musculus LPS-responsive beige-like anchor (Lrba), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 52 // 52 // 0 /// NM_001077688 // RefSeq // Mus musculus LPS-responsive beige-like anchor (Lrba), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 56 // 56 // 0 /// NM_030695 // RefSeq // Mus musculus LPS-responsive beige-like anchor (Lrba), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 55 // 55 // 0 /// ENSMUST00000107635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:86224690:86782693:1 gene:ENSMUSG00000028080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 55 // 55 // 0 /// AF187731 // GenBank // Mus musculus LBA (Lba) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 95 // 53 // 57 // 0 /// AF188506 // GenBank // Mus musculus LBA isoform beta (Lbabeta) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 93 // 53 // 56 // 0 /// AF188507 // GenBank // Mus musculus LBA isoform gamma (Lbagamma) mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 87 // 49 // 52 // 0 /// GENSCAN00000052781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:86603440:86781661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 22 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000055067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:86281760:86448214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000083830 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:86364457:86364625:1 gene:ENSMUSG00000065764 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK038965 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230079I08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT043720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000082933 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:86384247:86384353:1 gene:ENSMUSG00000064867 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONMMUT043722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
ENSMUST00000082938 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:86930743:86930902:1 gene:ENSMUSG00000064872 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007640 // RefSeq // Mus musculus CD1d2 antigen (Cd1d2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NR_038188 // RefSeq // Mus musculus CD1d2 antigen (Cd1d2), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000041920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:86986586:86989533:1 gene:ENSMUSG00000041750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// M63697 // GenBank // Mouse CD1.2 mRNA, complete cds. // chr3 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// NM_001289449 // RefSeq // Mus musculus CD1d2 antigen (Cd1d2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// BC057149 // GenBank // Mus musculus CD1d2 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:68264 IMAGE:5328694), complete cds. // chr3 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// GENSCAN00000052770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:86982631:86993499:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_009690 // RefSeq // Mus musculus CD5 antigen-like (Cd5l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000015998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:87357881:87371074:1 gene:ENSMUSG00000015854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF011428 // GenBank // Mus musculus AIM mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF018268 // GenBank // Mus musculus Sp-alpha mRNA, complete cds. // chr3 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// AF018269 // GenBank // Mus musculus Sp-alpha mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC006799 // GenBank // Mus musculus CD5 antigen-like, mRNA (cDNA clone MGC:11455 IMAGE:3152586), complete cds. // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC094459 // GenBank // Mus musculus CD5 antigen-like, mRNA (cDNA clone MGC:102526 IMAGE:4161650), complete cds. // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87311046:87401909:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_183222 // RefSeq // Mus musculus Fc receptor-like 5 (Fcrl5), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:87435885:87457836:1 gene:ENSMUSG00000048031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000166297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:87435885:87457836:1 gene:ENSMUSG00000048031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000178261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:87435885:87457836:1 gene:ENSMUSG00000048031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AY158090 // GenBank // Mus musculus BXMAS1-like protein 2 mRNA, complete cds. // chr3 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// AY506558 // GenBank // Mus musculus Fc receptor-like protein 3 (Fcrh3) mRNA, complete cds. // chr3 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC137997 // GenBank // Mus musculus Fc receptor-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:169621 IMAGE:8861016), complete cds. // chr3 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// BC137998 // GenBank // Mus musculus Fc receptor-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:169622 IMAGE:8861017), complete cds. // chr3 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// NM_001113238 // RefSeq // Mus musculus Fc receptor-like 5 (Fcrl5), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87436354:87457645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
XM_006502499 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ets variant gene 3-like (Etv3l), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006502500 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ets variant gene 3-like (Etv3l), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006502501 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ets variant gene 3-like (Etv3l), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006543771 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ets variant gene 3-like (Etv3l), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87554759:87556081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0
NM_011832 // RefSeq // Mus musculus insulin receptor-related receptor (Insrr), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006501453 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus insulin receptor-related receptor (Insrr), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:87796951:87816101:1 gene:ENSMUSG00000005640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000107582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:87797094:87816052:1 gene:ENSMUSG00000005640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000166771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:87796965:87805105:1 gene:ENSMUSG00000005640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// AB007135 // GenBank // Mus musculus IRR mRNA for insulin receptor-related receptor, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// AK081512 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130025G13 product:insulin receptor-related receptor, full insert sequence. // chr3 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// BC137855 // GenBank // Mus musculus insulin receptor-related receptor, mRNA (cDNA clone MGC:169479 IMAGE:8860874), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000010967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87797424:87853929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0
NM_001025571 // RefSeq // Mus musculus SH2 domain protein 2A (Sh2d2a), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_021309 // RefSeq // Mus musculus SH2 domain protein 2A (Sh2d2a), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000029709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:87846755:87855722:1 gene:ENSMUSG00000028071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000107581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:87846755:87855722:1 gene:ENSMUSG00000028071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF203343 // GenBank // Mus musculus RIBP (Ribp) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC034847 // GenBank // Mus musculus SH2 domain protein 2A, mRNA (cDNA clone MGC:41076 IMAGE:3327113), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// U69490 // GenBank // Mus musculus p56lck-associated adapter protein Lad mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 76 // 23 // 25 // 0 /// AK037818 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130052G10 product:SH2 domain protein 2A, full insert sequence. // chr3 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_177663 // RefSeq // Mus musculus interferon stimulated exonuclease gene 20-like 2 (Isg20l2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000055984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:87930314:87940686:1 gene:ENSMUSG00000048039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC098326 // GenBank // Mus musculus interferon stimulated exonuclease gene 20-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:90787 IMAGE:5720443), complete cds. // chr3 // 90 // 91 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87931484:87939351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
NM_007759 // RefSeq // Mus musculus cellular retinoic acid binding protein II (Crabp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000005019 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:87948666:87953376:1 gene:ENSMUSG00000004885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC018397 // GenBank // Mus musculus cellular retinoic acid binding protein II, mRNA (cDNA clone MGC:6212 IMAGE:3588770), complete cds. // chr3 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// M35523 // GenBank // Mouse cellular retinoic acid-binding protein (CRABP-II) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENSMUST00000163040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:87952144:87952985:1 gene:ENSMUSG00000004885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87948841:87980030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_016701 // RefSeq // Mus musculus nestin (Nes), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000090973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:87971093:87980451:1 gene:ENSMUSG00000004891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000159830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:87971078:87973391:1 gene:ENSMUSG00000004891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000160694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:87971129:87980451:1 gene:ENSMUSG00000004891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF076623 // GenBank // Mus musculus intermediate filament protein nestin (Nes) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// AK012622 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2700098C24 product:nestin, full insert sequence. // chr3 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// BC060693 // GenBank // Mus musculus nestin, mRNA (cDNA clone MGC:66854 IMAGE:6410072), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC062893 // GenBank // Mus musculus nestin, mRNA (cDNA clone MGC:63382 IMAGE:6405026), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87948841:87980030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_001286857 // RefSeq // Mus musculus G patch domain containing 4 (Gpatch4), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_025663 // RefSeq // Mus musculus G patch domain containing 4 (Gpatch4), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000166021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88043108:88055993:1 gene:ENSMUSG00000028069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NM_001110809 // RefSeq // Mus musculus G patch domain containing 4 (Gpatch4), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1 /// ENSMUST00000029707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88043108:88055990:1 gene:ENSMUSG00000028069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1 /// BC019490 // GenBank // Mus musculus G patch domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:28443 IMAGE:4039649), complete cds. // chr3 // 81 // 81 // 34 // 42 // 1 /// AK078828 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430437K04 product:hypothetical D111/G-patch domain containing protein, full insert sequence. // chr3 // 40 // 40 // 17 // 42 // 1 /// BC002265 // GenBank // Mus musculus G patch domain containing 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:3495364). // chr3 // 40 // 40 // 17 // 42 // 1 /// GENSCAN00000010974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88051211:88055729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT043768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 40 // 40 // 17 // 42 // 1
NM_001033484 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing GTPase activating protein 3 (Iqgap3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000071812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88082051:88121048:1 gene:ENSMUSG00000028068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AK142260 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330023N06 product:hypothetical Ras GTPase-activating protein containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 44 // 17 // 17 // 0 /// AK162700 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930101K02 product:weakly similar to IQGAP3 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 96 // 59 // 22 // 23 // 0 /// BC151102 // GenBank // Mus musculus IQ motif containing GTPase activating protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:184015 IMAGE:9088015), complete cds. // chr3 // 95 // 97 // 36 // 38 // 0 /// GENSCAN00000011022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88082056:88120276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0
NM_133665 // RefSeq // Mus musculus myocyte enhancer factor 2D (Mef2d), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000001455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:88142372:88172086:1 gene:ENSMUSG00000001419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000107558 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:88142572:88168655:1 gene:ENSMUSG00000001419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107559 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:88142572:88168655:1 gene:ENSMUSG00000001419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000119251 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:88142416:88169930:1 gene:ENSMUSG00000001419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000139153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88162960:88168785:1 gene:ENSMUSG00000001419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC011070 // GenBank // Mus musculus myocyte enhancer factor 2D, mRNA (cDNA clone MGC:19437 IMAGE:3497896), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000010983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88133230:88168353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT043776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000001455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:88142372:88172086:1 gene:ENSMUSG00000001419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC040217 // GenBank // Mus musculus myocyte enhancer factor 2D, mRNA (cDNA clone IMAGE:5360114). // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC106167 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4196941. // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT043780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NR_029817 // RefSeq // Mus musculus microRNA 9-1 (Mir9-1), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// mmu-mir-9-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000720 Mus musculus miR-9-1 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT043797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT043799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_178246 // RefSeq // Mus musculus Smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) (Smg5), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// XM_006501346 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) (Smg5), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 55 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000001451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88336260:88362337:1 gene:ENSMUSG00000001415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// BC024683 // GenBank // Mus musculus Smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:30464 IMAGE:3992000), complete cds. // chr3 // 88 // 55 // 23 // 26 // 0 /// BC048378 // GenBank // Mus musculus Smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:4192637). // chr3 // 95 // 45 // 20 // 21 // 0 /// BC066787 // GenBank // Mus musculus Smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:30429643). // chr3 // 94 // 66 // 29 // 31 // 0 /// BC100408 // GenBank // Mus musculus Smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:118167 IMAGE:30734268), complete cds. // chr3 // 100 // 55 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88336424:88361108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 38 // 38 // 0
NM_198410 // RefSeq // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member VI (Paqr6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000147948 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:88364584:88368033:1 gene:ENSMUSG00000041423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000147991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:88364589:88368541:1 gene:ENSMUSG00000041423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000149640 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88364591:88367243:1 gene:ENSMUSG00000041423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// AY424295 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member VI (Paqr6) mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// BC120512 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member VI, mRNA (cDNA clone MGC:155749 IMAGE:40129435), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC125428 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member VI, mRNA (cDNA clone MGC:159131 IMAGE:40129943), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000123200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88364593:88365802:1 gene:ENSMUSG00000041423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// GENSCAN00000010968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88365053:88367963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT043864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_001029890 // RefSeq // Mus musculus mex3 homolog A (C. elegans) (Mex3a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:88532395:88541396:1 gene:ENSMUSG00000074480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88525487:88537181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_033526 // RefSeq // Mus musculus ubiquilin 4 (Ubqln4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000008748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88553716:88569725:1 gene:ENSMUSG00000008604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB040050 // GenBank // Mus musculus mRNA for UBIN, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK160578 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410164A15 product:UBIN (Ataxin-1 ubiquitin-like interacting protein) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BC017686 // GenBank // Mus musculus ubiquilin 4, mRNA (cDNA clone MGC:19200 IMAGE:4236887), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88553805:88568233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
NM_025448 // RefSeq // Mus musculus signal sequence receptor, beta (Ssr2), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006501878 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus signal sequence receptor, beta (Ssr2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000035785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88579671:88588397:1 gene:ENSMUSG00000041355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK005340 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500032E05 product:signal sequence receptor, beta, full insert sequence. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC010214 // GenBank // Mus musculus signal sequence receptor, beta, mRNA (cDNA clone MGC:6370 IMAGE:3497894), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88579880:88646863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_028814 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2810403A07 gene (2810403A07Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88685794:88712933:1 gene:ENSMUSG00000028060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK173057 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0907 protein. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC006621 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810403A07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7130 IMAGE:3158104), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK083018 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530033N14 product:RIKEN cDNA 2810403A07 gene (KH-domain structure containing protein), full insert sequence. // chr3 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000035141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88685850:88737489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000157979 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:88693930:88694057:1 gene:ENSMUSG00000088604 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT043892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001242372 // RefSeq // Mus musculus gon-4-like (C.elegans) (Gon4l), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_027389 // RefSeq // Mus musculus gon-4-like (C.elegans) (Gon4l), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000081695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88837016:88910098:1 gene:ENSMUSG00000054199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000090942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88837016:88910098:1 gene:ENSMUSG00000054199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000107498 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:88835231:88910103:1 gene:ENSMUSG00000054199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000035142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88835152:88909387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000082804 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:88862919:88863080:1 gene:ENSMUSG00000064738 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083302 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:88906510:88906628:1 gene:ENSMUSG00000065236 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138679 // RefSeq // Mus musculus ash1 (absent, small, or homeotic)-like (Drosophila) (Ash1l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000090933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88965812:89079373:1 gene:ENSMUSG00000028053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000186583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88950622:89079375:1 gene:ENSMUSG00000028053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88965912:89077082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF247132 // GenBank // Mus musculus putative chromatin remodeling factor mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000035119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89116724:89145573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001099779 // RefSeq // Mus musculus pyruvate kinase liver and red blood cell (Pklr), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_013631 // RefSeq // Mus musculus pyruvate kinase liver and red blood cell (Pklr), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000047111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89136142:89146594:1 gene:ENSMUSG00000041237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000107482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:89136572:89146784:1 gene:ENSMUSG00000041237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC152327 // GenBank // Mus musculus pyruvate kinase liver and red blood cell, mRNA (cDNA clone MGC:161216 IMAGE:40141144), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// D63764 // GenBank // Mus musculus mRNA for pyruvate kinase, complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89116724:89145573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0
XM_006501981 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 189, member B (Fam189b), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000041913 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89183203:89189291:1 gene:ENSMUSG00000032657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117278 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:89183633:89189288:1 gene:ENSMUSG00000032657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000119707 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:89183641:89189295:1 gene:ENSMUSG00000032657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000126115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89184229:89185769:1 gene:ENSMUSG00000032657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000127982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89183580:89189290:1 gene:ENSMUSG00000032657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89183204:89189289:1 gene:ENSMUSG00000032657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC088990 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110013L07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:115773 IMAGE:6402466), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89183727:89208622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001077411 // RefSeq // Mus musculus glucosidase, beta, acid (Gba), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NM_008094 // RefSeq // Mus musculus glucosidase, beta, acid (Gba), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NR_122037 // RefSeq // Mus musculus glucosidase, beta, acid (Gba), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006500998 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucosidase, beta, acid (Gba), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 96 // 66 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000077367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89202928:89208679:1 gene:ENSMUSG00000028048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000167998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89202940:89208681:1 gene:ENSMUSG00000028048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC006663 // GenBank // Mus musculus glucosidase, beta, acid, mRNA (cDNA clone MGC:6201 IMAGE:3498551), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// M24119 // GenBank // Mouse glucocerebrosidase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89183727:89208622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
NM_013605 // RefSeq // Mus musculus mucin 1, transmembrane (Muc1), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000041142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89229057:89233381:1 gene:ENSMUSG00000042784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89231471:89233197:1 gene:ENSMUSG00000042784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 90 // 32 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000146844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89231239:89232082:1 gene:ENSMUSG00000042784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// BC005441 // GenBank // Mus musculus mucin 1, transmembrane, mRNA (cDNA clone MGC:6062 IMAGE:3601782), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// M84683 // GenBank // Mus musculus episialin (Muc1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89229120:89233098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_025327 // RefSeq // Mus musculus keratinocyte associated protein 2 (Krtcap2), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006501872 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratinocyte associated protein 2 (Krtcap2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89245966:89249906:1 gene:ENSMUSG00000042747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000126691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89245966:89247193:1 gene:ENSMUSG00000042747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000168900 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:89246434:89249709:1 gene:ENSMUSG00000042747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// BC031492 // GenBank // Mus musculus keratinocyte associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:27828 IMAGE:3485092), complete cds. // chr3 // 85 // 84 // 22 // 26 // 0 /// BC043030 // GenBank // Mus musculus keratinocyte associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:57908 IMAGE:5693076), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000132818 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89248867:89249722:1 gene:ENSMUSG00000042747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000035117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89246840:89249691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT043955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT043956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_026767 // RefSeq // Mus musculus dolichyl-phosphate mannosyltransferase polypeptide 3 (Dpm3), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501982 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dolichyl-phosphate mannosyltransferase polypeptide 3 (Dpm3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89266552:89267077:1 gene:ENSMUSG00000042737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89259358:89267077:1 gene:ENSMUSG00000042737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89266639:89267079:1 gene:ENSMUSG00000042737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC037761 // GenBank HTC // Mus musculus dolichyl-phosphate mannosyltransferase polypeptide 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:1511119), with apparent retained intron. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000135144 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89315439:89318907:1 gene:ENSMUSG00000086389 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140090 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230209I18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000180791 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:3:89337850:89347831:1 gene:ENSMUSG00000097004 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132440 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4731419I09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000098929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89353629:89354898:1 gene:ENSMUSG00000074467 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK144906 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830001D04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006502502 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DC-STAMP domain containing 2 (Dcst2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006502503 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DC-STAMP domain containing 2 (Dcst2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_283860 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DC-STAMP domain containing 2 (Dcst2), transcript variant X11, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89365400:89377451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NR_040404 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15417 (Gm15417), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89394290:89398779:1 gene:ENSMUSG00000074466 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_040403 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15417 (Gm15417), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000145400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89391850:89398224:1 gene:ENSMUSG00000074466 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000152143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89391970:89398224:1 gene:ENSMUSG00000074466 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000153969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89395996:89398146:1 gene:ENSMUSG00000074466 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONMMUT043977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONMMUT043980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT043981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_026784 // RefSeq // Mus musculus phosphomevalonate kinase (Pmvk), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_027348 // RefSeq // Mus musculus phosphomevalonate kinase (Pmvk), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000029564 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89459118:89469013:1 gene:ENSMUSG00000027952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107410 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:89459331:89469004:1 gene:ENSMUSG00000027952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000184515 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:89459571:89469006:1 gene:ENSMUSG00000027952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC028659 // GenBank // Mus musculus phosphomevalonate kinase, mRNA (cDNA clone MGC:41584 IMAGE:1247653), complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89464254:89468650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0
NM_080466 // RefSeq // Mus musculus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 3 (Kcnn3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89520164:89667761:1 gene:ENSMUSG00000000794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF357241 // GenBank // Mus musculus small-conductance calcium-activated potassium channel SK3 (SK3) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC106769 // GenBank // Mus musculus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:123421 IMAGE:40039722), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC106770 // GenBank // Mus musculus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:123422 IMAGE:40039723), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89553640:89667381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
AY112699 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2Q (Ube2q) mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 89 // 28 // 31 // 0 /// BC082275 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2Q (putative) 1, mRNA (cDNA clone MGC:90946 IMAGE:6310111), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NM_027315 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2Q (putative) 1 (Ube2q1), mRNA. // chr3 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// ENSMUST00000038356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89773609:89783997:1 gene:ENSMUSG00000042572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// AY945937 // GenBank // Mus musculus galactosyl transferase-associated protein mRNA, complete cds. // chr3 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// AK165198 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E970036J08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// GENSCAN00000054954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89767084:89821437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// NONMMUT044004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_172530 // RefSeq // Mus musculus src homology 2 domain-containing transforming protein E (She), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000050401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89831370:89858834:1 gene:ENSMUSG00000046280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC109363 // GenBank // Mus musculus src homology 2 domain-containing transforming protein E, mRNA (cDNA clone MGC:130415 IMAGE:40058814), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC109362 // GenBank // Mus musculus src homology 2 domain-containing transforming protein E, mRNA (cDNA clone MGC:130414 IMAGE:40058813), complete cds. // chr3 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89831504:89854714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_028567 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700094D03 gene (1700094D03Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90062796:90068347:1 gene:ENSMUSG00000027942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000078667 // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK148512 // GenBank HTC // Mus musculus adult pancreas islet cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C820015H22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC048560 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700094D03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58558 IMAGE:6703545), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001287086 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933434E20 gene (4933434E20Rik), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NM_001287087 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933434E20 gene (4933434E20Rik), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NM_025762 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933434E20 gene (4933434E20Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSMUST00000160640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90052814:90063341:1 gene:ENSMUSG00000027942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NR_030543 // RefSeq // Mus musculus microRNA 190b (Mir190b), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000104803 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:90070020:90070099:1 gene:ENSMUSG00000077996 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-190b // miRBase Micro RNA Database // MI0005478 Mus musculus miR-190b stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT044022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001293748 // RefSeq // Mus musculus tropomyosin 3, gamma (Tpm3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000121503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:90072649:90092130:1 gene:ENSMUSG00000027940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF317223 // GenBank // Mus musculus tropomyosin 3 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// U04541 // GenBank // Mus musculus alpha-tropomyosin slow mRNA, complete cds. // chr3 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0
NM_029937 // RefSeq // Mus musculus nucleoporin 210-like (Nup210l), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006502304 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin 210-like (Nup210l), transcript variant X12, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000029548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90104132:90212017:1 gene:ENSMUSG00000027939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006502298 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin 210-like (Nup210l), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// GENSCAN00000054936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90104167:90144398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000082996 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:90126535:90126666:1 gene:ENSMUSG00000064930 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT044032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_029937 // RefSeq // Mus musculus nucleoporin 210-like (Nup210l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502298 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin 210-like (Nup210l), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502304 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin 210-like (Nup210l), transcript variant X12, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90104132:90212017:1 gene:ENSMUSG00000027939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90151123:90225583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029937 // RefSeq // Mus musculus nucleoporin 210-like (Nup210l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502298 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin 210-like (Nup210l), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90104132:90212017:1 gene:ENSMUSG00000027939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90151123:90225583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029937 // RefSeq // Mus musculus nucleoporin 210-like (Nup210l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006502298 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin 210-like (Nup210l), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000029548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90104132:90212017:1 gene:ENSMUSG00000027939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000054938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90151123:90225583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_001293741 // RefSeq // Mus musculus RAB13, member RAS oncogene family (Rab13), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_026677 // RefSeq // Mus musculus RAB13, member RAS oncogene family (Rab13), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000065418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90220787:90225969:1 gene:ENSMUSG00000027935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000107373 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:90213695:90226385:1 gene:ENSMUSG00000027935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AB232608 // GenBank // Mus musculus Rab13 mRNA for Rab13, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC027214 // GenBank // Mus musculus RAB13, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:25544 IMAGE:3709140), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90151123:90225583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
NM_206924 // RefSeq // Mus musculus jumping translocation breakpoint (Jtb), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029546 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90231597:90235838:1 gene:ENSMUSG00000027937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119304 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:90231612:90235544:1 gene:ENSMUSG00000027937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000157045 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:90231634:90235419:1 gene:ENSMUSG00000027937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AB016490 // GenBank // Mus musculus mJTB mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC008139 // GenBank // Mus musculus jumping translocation breakpoint, mRNA (cDNA clone MGC:5746 IMAGE:3582930), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:90232047:90234002:1 gene:ENSMUSG00000027937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000054956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90231958:90235539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT044036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT044037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_013901 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1 (Slc39a1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000015467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90248172:90253612:1 gene:ENSMUSG00000052310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC005474 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:6744 IMAGE:3591856), complete cds. // chr3 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// BC132461 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:164092 IMAGE:40130738), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// BC138459 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:170084 IMAGE:8861479), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_201407 // RefSeq // Mus musculus DENN/MADD domain containing 4B (Dennd4b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006501356 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DENN/MADD domain containing 4B (Dennd4b), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006501358 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DENN/MADD domain containing 4B (Dennd4b), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000098914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90266514:90280669:1 gene:ENSMUSG00000042404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000129564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:90265185:90280669:1 gene:ENSMUSG00000042404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000156358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:90267461:90275644:1 gene:ENSMUSG00000042404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// AK122294 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0476 protein. // chr3 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// AY512564 // GenBank // Mus musculus brain specific protein 4 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC066102 // GenBank // Mus musculus DENN/MADD domain containing 4B, mRNA (cDNA clone MGC:90021 IMAGE:30531856), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC151194 // GenBank // Mus musculus DENN/MADD domain containing 4B, mRNA (cDNA clone MGC:184093 IMAGE:9088082), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90254406:90279922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_139304 // RefSeq // Mus musculus GATA zinc finger domain containing 2B (Gatad2b), mRNA. // chr3 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000049382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90341654:90358120:1 gene:ENSMUSG00000042390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AF411837 // GenBank // Mus musculus transcription repressor p66 mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// AK041594 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630023K01 product:similar to TRANSCRIPTION REPRESSOR P66 [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC130262 // GenBank // Mus musculus GATA zinc finger domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:161344 IMAGE:40142858), complete cds. // chr3 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// AK141586 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630035H22 product:Transcription repressor p66 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// AK173113 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1150 protein. // chr3 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000054948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90341666:90371856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_026374 // RefSeq // Mus musculus interleukin enhancer binding factor 2 (Ilf2), mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000001042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90476201:90488379:1 gene:ENSMUSG00000001016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AK135449 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo female mullerian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6820422F23 product:interleukin enhancer binding factor 2, full insert sequence. // chr3 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// BC004033 // GenBank // Mus musculus interleukin enhancer binding factor 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3495516), partial cds. // chr3 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// BC024718 // GenBank // Mus musculus interleukin enhancer binding factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:30414 IMAGE:5012365), complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AK031892 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330441H14 product:interleukin enhancer binding factor 2, full insert sequence. // chr3 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// AK044885 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130010B06 product:interleukin enhancer binding factor 2, full insert sequence. // chr3 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// AK161126 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732454M05 product:interleukin enhancer binding factor 2, full insert sequence. // chr3 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000013567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90469616:90487619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0
NM_009113 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A13 (S100a13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000048138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90514435:90524581:1 gene:ENSMUSG00000042312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC005687 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A13, mRNA (cDNA clone MGC:11475 IMAGE:3155915), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// X99921 // GenBank // M.musculus mRNA for S100 calcium-binding protein A13. // chr3 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000013587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90514874:90528215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
NM_001163525 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A14 (S100a14), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001163526 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A14 (S100a14), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_025393 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A14 (S100a14), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90526849:90528837:1 gene:ENSMUSG00000042306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000167598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90526849:90528837:1 gene:ENSMUSG00000042306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132637 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833440I19 product:S100 calcium binding protein A14, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025607 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A14, mRNA (cDNA clone MGC:35763 IMAGE:5151924), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001195760 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A2 (S100a2), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000179550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90590247:90591508:1 gene:ENSMUSG00000094018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006501848 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus S100 calcium binding protein A2 (S100a2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000013566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90568068:90595497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0
NM_011311 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A4 (S100a4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501177 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus S100 calcium binding protein A4 (S100a4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006501178 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus S100 calcium binding protein A4 (S100a4), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000001046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90603770:90606044:1 gene:ENSMUSG00000001020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:90603771:90606045:1 gene:ENSMUSG00000001020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000142476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:90604911:90605833:1 gene:ENSMUSG00000001020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// BC051214 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A4, mRNA (cDNA clone MGC:63025 IMAGE:1383390), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC094635 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A4, mRNA (cDNA clone MGC:106827 IMAGE:1248264), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// D00208 // GenBank // Mus musculus mRNA for pEL98 protein, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// Z36947 // GenBank // Murine retrovirus RNA containing parts of mts1 of IAP-LTR and gag-region gene. // chr3 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// NONMMUT044061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000013582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90601785:90611654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_011312 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A5 (S100a5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501179 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus S100 calcium binding protein A5 (S100a5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501181 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus S100 calcium binding protein A5 (S100a5), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000001049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90609810:90611780:1 gene:ENSMUSG00000001023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107329 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:90608523:90611780:1 gene:ENSMUSG00000001023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF087469 // GenBank // Mus musculus S100A5 calcium-binding mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC117108 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A5, mRNA (cDNA clone MGC:151485 IMAGE:40126427), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90601785:90611654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_011313 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A6 (calcyclin) (S100a6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000001051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90612894:90614414:1 gene:ENSMUSG00000001025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF549497 // GenBank // Mus musculus MC3T3-E1 calcyclin mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC003832 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A6 (calcyclin), mRNA (cDNA clone MGC:6260 IMAGE:3490662), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC010774 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A6 (calcyclin), mRNA (cDNA clone MGC:18644 IMAGE:4219642), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// M37761 // GenBank // Mouse calcyclin mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// X52278 // GenBank // Mouse 5B10 mRNA for calcyclin. // chr3 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// X66449 // GenBank // M.musculus mRNA for calcyclin. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90613071:90614322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_199422 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A7A (S100a7a), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501631 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus S100 calcium binding protein A7A (S100a7a), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006501632 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus S100 calcium binding protein A7A (S100a7a), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000079286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90654302:90658130:1 gene:ENSMUSG00000063767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AY465109 // GenBank // Mus musculus S100 calcium-binding protein A15 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AY582964 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A7 (S100A7) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC107307 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A7A, mRNA (cDNA clone MGC:130261 IMAGE:40053247), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC107308 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A7A, mRNA (cDNA clone MGC:130262 IMAGE:40053248), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90654141:90686596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_013650 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A8 (calgranulin A) (S100a8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000069927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90669071:90670034:1 gene:ENSMUSG00000056054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078629 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A8 (calgranulin A), mRNA (cDNA clone MGC:73590 IMAGE:864657), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M83218 // GenBank // Mus musculus intracellular calcium-binding protein (MRP8) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90654141:90686596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0
NM_001165968 // RefSeq // Mus musculus peptidoglycan recognition protein 4 (Pglyrp4), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_207263 // RefSeq // Mus musculus peptidoglycan recognition protein 4 (Pglyrp4), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000047745 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90726911:90740514:1 gene:ENSMUSG00000042250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000169698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90726906:90741517:1 gene:ENSMUSG00000042250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY518699 // GenBank // Mus musculus peptidoglycan recognition protein I beta mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC120840 // GenBank // Mus musculus peptidoglycan recognition protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:156077 IMAGE:40129763), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC144902 // GenBank // Mus musculus peptidoglycan recognition protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:178458 IMAGE:9053450), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90726952:90740462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_207247 // RefSeq // Mus musculus peptidoglycan recognition protein 3 (Pglyrp3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000047660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:92014583:92031582:1 gene:ENSMUSG00000042244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY518698 // GenBank // Mus musculus peptidoglycan recognition protein I alpha mRNA, complete cds. // chr3 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// BC128291 // GenBank // Mus musculus peptidoglycan recognition protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:150021 IMAGE:40102537), complete cds. // chr3 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:92024567:92031563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000090872 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:3:92288569:92289251:1 gene:ENSMUSG00000074445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY158986 // GenBank // Mus musculus SPRR2A (Sprr2a) mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// BC051122 // GenBank // Mus musculus mRNA similar to small proline-rich protein 2A (cDNA clone IMAGE:6531041). // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC056231 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6531007, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC099393 // GenBank // Mus musculus hypothetical protein LOC100042514, mRNA (cDNA clone MGC:117544 IMAGE:30790331), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_011469 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 2B (Sprr2b), mRNA. // chr3 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000061038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92316705:92318085:1 gene:ENSMUSG00000050092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// AY158987 // GenBank // Mus musculus SPRR2B (Sprr2b) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// BC132518 // GenBank // Mus musculus small proline-rich protein 2B, mRNA (cDNA clone MGC:164149 IMAGE:40130795), complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
NM_011470 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 2D (Sprr2d), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000047477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:92339140:92340873:1 gene:ENSMUSG00000042212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY158988 // GenBank // Mus musculus SPRR2D (Sprr2d) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_011471 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 2E (Sprr2e), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000068399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92352143:92353449:1 gene:ENSMUSG00000055030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY158989 // GenBank // Mus musculus SPRR2E (Sprr2e) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_011472 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 2F (Sprr2f), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92365187:92366442:1 gene:ENSMUSG00000050635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY158990 // GenBank // Mus musculus SPRR2F (Sprr2f) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_003548 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 2G (Sprr2g), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92373915:92375229:1 gene:ENSMUSG00000046203 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AY158991 // GenBank // Mus musculus SPRR2G (Sprr2g) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189634 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:92373915:92375229:1 gene:ENSMUSG00000046203 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011474 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 2H (Sprr2h), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92385685:92387324:1 gene:ENSMUSG00000046259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY158992 // GenBank // Mus musculus SPRR2H (Sprr2h) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011475 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 2I (Sprr2i), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000047264 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:92407991:92409271:1 gene:ENSMUSG00000042157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY158993 // GenBank // Mus musculus SPRR2I (Sprr2i) mRNA, complete cds. // chr3 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0
NR_003185 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 2J, pseudogene (Sprr2j-ps), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92418087:92419396:1 gene:ENSMUSG00000027925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY158994 // GenBank // Mus musculus SPRR2J (Sprr2j) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_011477 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 2K (Sprr2k), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:92432582:92433925:1 gene:ENSMUSG00000054215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY158995 // GenBank // Mus musculus SPRR2K (Sprr2k) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_028622 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1C (Lce1c), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000047055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92679247:92680918:1 gene:ENSMUSG00000042092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_025501 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 3B (Lce3b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000046234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92932979:92934098:1 gene:ENSMUSG00000042031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC059084 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30290065, partial cds. // chr3 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// BC115788 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 3B, mRNA (cDNA clone MGC:144697 IMAGE:40105038), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC115817 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 3B, mRNA (cDNA clone MGC:144696 IMAGE:40105036), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
NM_033175 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 3C (Lce3c), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000055375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92944486:92945730:1 gene:ENSMUSG00000045475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AF176515 // GenBank // Mus musculus EIG3 protein (Eig3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC119239 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 3C, mRNA (cDNA clone MGC:155555 IMAGE:8733988), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// BC120669 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 3C, mRNA (cDNA clone MGC:155906 IMAGE:40129592), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// BC069978 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30293190, partial cds. // chr3 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0
NM_001254725 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 3E (Lce3e), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000098886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:92967061:92968281:1 gene:ENSMUSG00000074433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001018079 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 3F (Lce3f), mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000090863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92992226:92993425:1 gene:ENSMUSG00000068885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK009081 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310002A05 product:EIG3 (EIG3 PROTEIN), full insert sequence. // chr3 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC060281 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 3F, mRNA (cDNA clone MGC:69990 IMAGE:30288382), complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0
NM_001034860 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4858 (Gm4858), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NM_001177694 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4858 (Gm4858), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000179064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93073567:93074633:1 gene:ENSMUSG00000096879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0
NM_001081200 // RefSeq // Mus musculus cornulin (Crnn), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501621 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cornulin (Crnn), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93144787:93149471:1 gene:ENSMUSG00000078657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93146812:93152340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001013804 // RefSeq // Mus musculus filaggrin family member 2 (Flg2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000098884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93200210:93220793:1 gene:ENSMUSG00000049133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// GU322425 // GenBank // Mus musculus filaggrin-2 (FLG2) mRNA, partial cds. // chr3 // 81 // 81 // 13 // 16 // 1 /// GENSCAN00000050289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93200210:93203272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000050285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93234981:93236323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 65 // 10 // 11 // 0
NM_009100 // RefSeq // Mus musculus repetin (Rptn), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000045912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:93393699:93399442:1 gene:ENSMUSG00000041984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93345169:93398718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001163098 // RefSeq // Mus musculus trichohyalin (Tchh), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93442330:93449077:1 gene:ENSMUSG00000052415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93442330:93489573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_027762 // RefSeq // Mus musculus trichohyalin-like 1 (Tchhl1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93468754:93471980:1 gene:ENSMUSG00000027908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93442330:93489573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_009112 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A10 (calpactin) (S100a10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:93555080:93564643:1 gene:ENSMUSG00000041959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000170612 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:93560727:93564450:1 gene:ENSMUSG00000041959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// BC025044 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A10 (calpactin), mRNA (cDNA clone MGC:36182 IMAGE:4949465), complete cds. // chr3 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// M16465 // GenBank // Mouse calpactin I light chain (p11) mRNA, complete cds. // chr3 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// ENSMUST00000148400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:93555163:93561505:1 gene:ENSMUSG00000041959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93555053:93571858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONMMUT044093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001007222 // RefSeq // Mus musculus TD and POZ domain containing 2 (Tdpoz2), mRNA. // chr3 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// ENSMUST00000090853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:93773000:93774142:1 gene:ENSMUSG00000068879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000159355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94242464:94243470:-1 gene:ENSMUSG00000089893 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000178358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93651571:93652663:-1 gene:ENSMUSG00000096860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// BC141104 // GenBank // Mus musculus TD and POZ domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:176065 IMAGE:9055716), complete cds. // chr3 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94236702:94243464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93773035:93774117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93651581:93652651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0
NM_001177694 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4858 (Gm4858), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NM_207272 // RefSeq // Mus musculus TD and POZ domain containing 4 (Tdpoz4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93796398:93797510:1 gene:ENSMUSG00000060256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115626 // GenBank // Mus musculus TD and POZ domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:144527 IMAGE:40102845), complete cds. // chr3 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NM_001034860 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4858 (Gm4858), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENSMUST00000179064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93073567:93074633:1 gene:ENSMUSG00000096879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93796554:93797510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93581862:93629596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000050287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93073521:93100697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0
NM_207271 // RefSeq // Mus musculus TD and POZ domain containing 3 (Tdpoz3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93826020:93827117:1 gene:ENSMUSG00000058005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94236702:94237799:-1 gene:ENSMUSG00000089689 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94236702:94243464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93826020:93827117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000142178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94310136:94326034:1 gene:ENSMUSG00000028145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AK014834 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921507I02 product:weakly similar to C-TERMINAL MODULATOR PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 90 // 67 // 18 // 20 // 0 /// BC134396 // GenBank // Mus musculus thioesterase superfamily member 4, mRNA (cDNA clone MGC:161830 IMAGE:40136254), complete cds. // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NM_029431 // RefSeq // Mus musculus thioesterase superfamily member 4 (Them4), mRNA. // chr3 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000049822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:94310089:94332540:1 gene:ENSMUSG00000028145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000151753 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94310130:94318170:1 gene:ENSMUSG00000028145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// AK139993 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230034K14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000046325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94310217:94334558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT044100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_025416 // RefSeq // Mus musculus thioesterase superfamily member 5 (Them5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:94342099:94347352:1 gene:ENSMUSG00000028148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128907 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94343405:94347350:1 gene:ENSMUSG00000028148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK003517 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110007B02 product:RIKEN cDNA 1110007B02 gene, full insert sequence. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC046437 // GenBank // Mus musculus thioesterase superfamily member 5, mRNA (cDNA clone MGC:51458 IMAGE:3969280), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94342259:94377493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_177250 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat and Ig domain containing 4 (Lingo4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:94398517:94404501:1 gene:ENSMUSG00000044505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117866 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat and Ig domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:143954 IMAGE:40095465), complete cds. // chr3 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC117867 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat and Ig domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:143955 IMAGE:40095468), complete cds. // chr3 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// AK042286 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630078J04 product:hypothetical Cysteine-rich flanking region, C-terminal/Leucine-rich repeat/Leucine-rich repeat, typical subtype containing protein, full insert sequence. // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94384376:94403613:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_028307 // RefSeq // Mus musculus tudor and KH domain containing protein (Tdrkh), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000045245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:94413318:94431491:1 gene:ENSMUSG00000041912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000166032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:94413296:94432633:1 gene:ENSMUSG00000041912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC031886 // GenBank HTC // Mus musculus tudor and KH domain containing protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:5365523), with apparent retained intron. // chr3 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC049363 // GenBank // Mus musculus tudor and KH domain containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:57093 IMAGE:6490411), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC057030 // GenBank // Mus musculus tudor and KH domain containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:67203 IMAGE:6833743), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94422828:94432334:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_019414 // RefSeq // Mus musculus selenium binding protein 2 (Selenbp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000090848 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:94693556:94704413:1 gene:ENSMUSG00000068877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000131650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94693647:94699973:1 gene:ENSMUSG00000068877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000173849 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:94693569:94704216:1 gene:ENSMUSG00000068877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000173981 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:94693568:94698125:1 gene:ENSMUSG00000068877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000174223 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:94693659:94698132:1 gene:ENSMUSG00000068877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 50 // 8 // 9 // 0 /// BC024106 // GenBank // Mus musculus selenium binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:35927 IMAGE:5096831), complete cds. // chr3 // 67 // 100 // 12 // 18 // 0 /// ENSMUST00000132162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94693566:94699583:1 gene:ENSMUSG00000068877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// ENSMUST00000174377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94693648:94704170:1 gene:ENSMUSG00000068877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// GENSCAN00000050921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94696844:94704216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0
NM_009150 // RefSeq // Mus musculus selenium binding protein 1 (Selenbp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000090839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:94933056:94944758:1 gene:ENSMUSG00000068874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000134202 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94933120:94944745:1 gene:ENSMUSG00000068874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000140757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94933056:94944745:1 gene:ENSMUSG00000068874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000145551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94933159:94938075:1 gene:ENSMUSG00000068874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000153720 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94933120:94944733:1 gene:ENSMUSG00000068874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// BC011202 // GenBank // Mus musculus selenium binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:18519 IMAGE:4209393), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000139949 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94933066:94939699:1 gene:ENSMUSG00000068874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// NONMMUT044133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000050899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94936747:94944568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
ENSMUST00000082656 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:95099500:95099606:1 gene:ENSMUSG00000064590 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016712 // RefSeq // Mus musculus tropomodulin 4 (Tmod4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000005769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95124514:95129209:1 gene:ENSMUSG00000005628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107227 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95124515:95129205:1 gene:ENSMUSG00000005628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000130545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95126204:95128744:1 gene:ENSMUSG00000005628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000131597 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95124476:95127653:1 gene:ENSMUSG00000005628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000149898 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95127653:95129208:1 gene:ENSMUSG00000005628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AF177174 // GenBank // Mus musculus tropomodulin 4 (Tmod4) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC068020 // GenBank // Mus musculus tropomodulin 4, mRNA (cDNA clone MGC:70018 IMAGE:30291625), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95125555:95129110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_153121 // RefSeq // Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1 (Lysmd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000066386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95134088:95139518:1 gene:ENSMUSG00000053769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000180321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:93927004:93929102:-1 gene:ENSMUSG00000094935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC024838 // GenBank // Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:38837 IMAGE:5360726), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC100548 // GenBank // Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:118528 IMAGE:5717642), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC138476 // GenBank // Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:170101 IMAGE:8861496), complete cds. // chr3 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// BC145725 // GenBank // Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:175612 IMAGE:40131028), complete cds. // chr3 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:93927990:93928670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0
NM_007802 // RefSeq // Mus musculus cathepsin K (Ctsk), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000015664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:95499286:95509362:1 gene:ENSMUSG00000028111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC046320 // GenBank // Mus musculus cathepsin K, mRNA (cDNA clone MGC:54691 IMAGE:6390854), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// X94444 // GenBank // M.musculus mRNA for preprocathepsin K. // chr3 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95428415:95508922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_001267695 // RefSeq // Mus musculus cathepsin S (Ctss), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_021281 // RefSeq // Mus musculus cathepsin S (Ctss), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000015667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95526786:95556400:1 gene:ENSMUSG00000038642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000116304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:95526786:95556403:1 gene:ENSMUSG00000038642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF038546 // GenBank // Mus musculus cathepsin S precursor, mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 94 // 27 // 30 // 0 /// BC002125 // GenBank // Mus musculus cathepsin S, mRNA (cDNA clone MGC:6643 IMAGE:3495719), complete cds. // chr3 // 80 // 94 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95530412:95617471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001026212 // RefSeq // Mus musculus endosulfine alpha (Ensa), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// NM_019561 // RefSeq // Mus musculus endosulfine alpha (Ensa), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000037983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:95624980:95630493:1 gene:ENSMUSG00000038619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000058230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:95624980:95632102:1 gene:ENSMUSG00000038619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// BC058802 // GenBank // Mus musculus endosulfine alpha, mRNA (cDNA clone MGC:65240 IMAGE:6475839), complete cds. // chr3 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// BC059724 // GenBank // Mus musculus endosulfine alpha, mRNA (cDNA clone MGC:74239 IMAGE:6773379), complete cds. // chr3 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000039085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95625120:95660823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_008562 // RefSeq // Mus musculus myeloid cell leukemia sequence 1 (Mcl1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:95658721:95663176:1 gene:ENSMUSG00000038612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:95658857:95660823:1 gene:ENSMUSG00000038612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK144229 // GenBank HTC // Mus musculus bladder RCB-0544 MBT-2 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430135F24 product:myeloid cell leukemia sequence 1, full insert sequence. // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC003839 // GenBank // Mus musculus myeloid cell leukemia sequence 1, mRNA (cDNA clone MGC:6351 IMAGE:3491015), complete cds. // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC005427 // GenBank // Mus musculus myeloid cell leukemia sequence 1, mRNA (cDNA clone MGC:5839 IMAGE:3493739), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC021638 // GenBank // Mus musculus myeloid cell leukemia sequence 1, mRNA (cDNA clone MGC:13884 IMAGE:4190996), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GU182318 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 myeloid cell leukemia sequence 1 (Mcl1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// U35623 // GenBank // Mus musculus EAT/MCL-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501088 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myeloid cell leukemia sequence 1 (Mcl1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000039085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95625120:95660823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000039061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95983010:95986593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_181409 // RefSeq // Mus musculus myotubularin related protein 11 (Mtmr11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006501154 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myotubularin related protein 11 (Mtmr11), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:96162004:96171718:1 gene:ENSMUSG00000045934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000129925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96162085:96171718:1 gene:ENSMUSG00000045934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000147245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96162004:96171717:1 gene:ENSMUSG00000045934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000154955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96162589:96171718:1 gene:ENSMUSG00000045934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// BC051083 // GenBank // Mus musculus myotubularin related protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:59008 IMAGE:6486043), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000039068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96086871:96177166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_153053 // RefSeq // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 4 (Sf3b4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000076372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96172332:96177564:1 gene:ENSMUSG00000068856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC024418 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:36564 IMAGE:4982610), complete cds. // chr3 // 88 // 80 // 7 // 8 // 0 /// BC026567 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:36369 IMAGE:4982239), complete cds. // chr3 // 88 // 80 // 7 // 8 // 0 /// BC085273 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:103360 IMAGE:30144329), complete cds. // chr3 // 88 // 80 // 7 // 8 // 0
NM_022030 // RefSeq // Mus musculus synaptic vesicle glycoprotein 2 a (Sv2a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96181151:96195521:1 gene:ENSMUSG00000038486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK122360 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0736 protein. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC046587 // GenBank // Mus musculus synaptic vesicle glycoprotein 2 a, mRNA (cDNA clone MGC:54512 IMAGE:6493509), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96184986:96193916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_178214 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 2, H2be (Hist2h2be), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000090781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96221119:96223738:1 gene:ENSMUSG00000068854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC047137 // GenBank // Mus musculus histone cluster 2, H2be, mRNA (cDNA clone MGC:54965 IMAGE:6311571), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058562 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6389884. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175666 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 2, H2bb (Hist2h2bb), mRNA. // chr3 // 76 // 65 // 13 // 17 // 0 /// ENSMUST00000051089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96269721:96279001:1 gene:ENSMUSG00000050936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000177113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96269752:96270132:1 gene:ENSMUSG00000050936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC019122 // GenBank // Mus musculus histone cluster 2, H2bb, mRNA (cDNA clone MGC:29103 IMAGE:5003093), complete cds. // chr3 // 78 // 69 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000039062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96269752:96278163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0
ENSMUST00000083374 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:96422733:96422897:1 gene:ENSMUSG00000095513 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT044281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_006502518 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102632901 (LOC102632901), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_375875 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102632901 (LOC102632901), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK136676 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230022C05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004819 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027126 // RefSeq // Mus musculus hemochromatosis type 2 (juvenile) (human homolog) (Hfe2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502036 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hemochromatosis type 2 (juvenile) (human homolog) (Hfe2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000049208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96525185:96529216:1 gene:ENSMUSG00000038403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC022603 // GenBank // Mus musculus hemochromatosis type 2 (juvenile) (human homolog), mRNA (cDNA clone IMAGE:4161813), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96526515:96528690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001009935 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin interacting protein (Txnip), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_023719 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin interacting protein (Txnip), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000049093 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96557960:96561857:1 gene:ENSMUSG00000038393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000074519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96557957:96561883:1 gene:ENSMUSG00000038393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF173681 // GenBank // Mus musculus thioredoxin interacting factor mRNA, complete cds. // chr3 // 86 // 82 // 24 // 28 // 0 /// AF282826 // GenBank // Mus musculus thioredoxin interacting factor (Vdup1) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 71 // 21 // 24 // 0 /// AK192038 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0107K20, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000049093, based on BLAT search. // chr3 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC011212 // GenBank // Mus musculus thioredoxin interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:18703 IMAGE:4193517), complete cds. // chr3 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0 /// BC031850 // GenBank // Mus musculus thioredoxin interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:25534 IMAGE:3591421), complete cds. // chr3 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000019295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96558236:96560529:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_001024851 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 34A (Ankrd34a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96596636:96599775:1 gene:ENSMUSG00000049097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052924 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 34A, mRNA (cDNA clone IMAGE:6391322), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147489 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 34A, mRNA (cDNA clone MGC:182823 IMAGE:9087437), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC150865 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 34A, mRNA (cDNA clone MGC:183776 IMAGE:9087776), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000019302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96597140:96602865:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001163170 // RefSeq // Mus musculus Lix1-like (Lix1l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000062058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96601133:96625352:1 gene:ENSMUSG00000049288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96611441:96643980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_001102407 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 8a (Rbm8a), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_025875 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 8a (Rbm8a), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000048915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96629928:96633779:1 gene:ENSMUSG00000038374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC020086 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 8a, mRNA (cDNA clone MGC:29053 IMAGE:3671644), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC058376 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 8a, mRNA (cDNA clone MGC:66879 IMAGE:5709938), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// KF051021 // GenBank // Mus musculus RNA-binding protein 8A (Y14/RBM8) mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000019275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96611441:96643980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_001081053 // RefSeq // Mus musculus integrin, alpha 10 (Itga10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96645584:96664519:1 gene:ENSMUSG00000090210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000119365 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96645584:96664513:1 gene:ENSMUSG00000090210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC115770 // GenBank // Mus musculus integrin, alpha 10, mRNA (cDNA clone MGC:141495 IMAGE:40085898), complete cds. // chr3 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000137564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96635474:96653101:1 gene:ENSMUSG00000028102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000019299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96645635:96663030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK041957 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630048L14 product:inferred: integrin alpha 10 subunit {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr3 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001081139 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 35 (Ankrd35), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006501256 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 35 (Ankrd35), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000048427 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96670131:96690468:1 gene:ENSMUSG00000038354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000122960 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96670327:96691009:1 gene:ENSMUSG00000038354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// BC138276 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 35, mRNA (cDNA clone MGC:169900 IMAGE:8861295), complete cds. // chr3 // 75 // 86 // 9 // 12 // 0 /// BC145228 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 35, mRNA (cDNA clone MGC:178788 IMAGE:9053780), complete cds. // chr3 // 75 // 86 // 9 // 12 // 0 /// BC145750 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 35, mRNA (cDNA clone MGC:175637 IMAGE:40131053), complete cds. // chr3 // 75 // 86 // 9 // 12 // 0 /// BC157973 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 35, mRNA (cDNA clone MGC:189795 IMAGE:9007295), complete cds. // chr3 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000019288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96670411:96705115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
NM_026406 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 115 (Rnf115), mRNA. // chr3 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// XM_006501947 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 115 (Rnf115), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000029740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96727611:96791155:1 gene:ENSMUSG00000028098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC023113 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 115, mRNA (cDNA clone MGC:28329 IMAGE:4015975), complete cds. // chr3 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// NONMMUT044316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001271628 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, alpha 5 (Gja5), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_008121 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, alpha 5 (Gja5), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:97032416:97053634:1 gene:ENSMUSG00000057123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC053054 // GenBank // Mus musculus gap junction membrane channel protein alpha 5, mRNA (cDNA clone MGC:62338 IMAGE:6401526), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK038780 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230062H11 product:gap junction membrane channel protein alpha 5, full insert sequence. // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96928743:97061104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_019800 // RefSeq // Mus musculus acid phosphatase 6, lysophosphatidic (Acp6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_375565 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acid phosphatase 6, lysophosphatidic (Acp6), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000090759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:97158777:97176574:1 gene:ENSMUSG00000028093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:97159103:97168310:1 gene:ENSMUSG00000028093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AB030038 // GenBank // Mus musculus mRNA for mPACPL1, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF216223 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidic acid phosphatase mRNA, complete cds. // chr3 // 85 // 77 // 17 // 20 // 0 /// BC047276 // GenBank // Mus musculus acid phosphatase 6, lysophosphatidic, mRNA (cDNA clone MGC:54556 IMAGE:6487551), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000133965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:97159103:97167049:1 gene:ENSMUSG00000028093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:97159168:97176468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_011342 // RefSeq // Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homolog B (S. cerevisiae) (Sec22b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000029476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:97901190:97923276:1 gene:ENSMUSG00000027879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000130778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:97901216:97921851:1 gene:ENSMUSG00000027879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC009024 // GenBank // Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:5885 IMAGE:3481731), complete cds. // chr3 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// U91538 // GenBank // Mus musculus vesicle trafficking protein sec22b mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000122288 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:97901227:97915211:1 gene:ENSMUSG00000027879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// AK134215 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830480I06 product:SEC22 vesicle trafficking protein-like 1 (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr3 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// ENSMUST00000130620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:97901225:97907664:1 gene:ENSMUSG00000027879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000031641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:97901346:97921270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT044355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001033779 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5544 (Gm5544), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000098828 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:97930173:97967018:1 gene:ENSMUSG00000074388 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_010928 // RefSeq // Mus musculus notch 2 (Notch2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000079812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:98013538:98150367:1 gene:ENSMUSG00000027878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK157200 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830206H20 product:Notch gene homolog 2 (Drosophila), full insert sequence. // chr3 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// D32210 // GenBank // Mus musculus (Notch2) mRNA, complete cds. // chr3 // 86 // 97 // 30 // 35 // 0 /// GENSCAN00000031632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:98013699:98147444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_027665 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 30 (Adam30), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:98160812:98163173:1 gene:ENSMUSG00000043468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AY190760 // GenBank // Mus musculus strain ICR ADAM30 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC113152 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 30, mRNA (cDNA clone MGC:132802 IMAGE:40059344), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC113762 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 30, mRNA (cDNA clone MGC:132801 IMAGE:40059342), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:98160853:98214456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_026328 // RefSeq // Mus musculus regenerating islet-derived family, member 4 (Reg4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:98222156:98236748:1 gene:ENSMUSG00000027876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019465 // GenBank // Mus musculus regenerating islet-derived family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:28598 IMAGE:4216795), complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:98224774:98303271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_008256 // RefSeq // Mus musculus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 2 (Hmgcs2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000090746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:98280435:98310738:1 gene:ENSMUSG00000027875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC014714 // GenBank // Mus musculus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 2, mRNA (cDNA clone MGC:25633 IMAGE:4216637), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC024744 // GenBank // Mus musculus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 2, mRNA (cDNA clone MGC:29975 IMAGE:5123821), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000120541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:98280435:98310732:1 gene:ENSMUSG00000027875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// GENSCAN00000031649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:98224774:98303271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_172863 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 697 (Zfp697), mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501474 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 697 (Zfp697), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501478 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 697 (Zfp697), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000056096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:98382481:98431948:1 gene:ENSMUSG00000050064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000178372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:98382548:98431707:1 gene:ENSMUSG00000050064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AK086791 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030001J01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC092534 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 697, mRNA (cDNA clone MGC:107223 IMAGE:30249621), complete cds. // chr3 // 84 // 76 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:98425317:98428630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT044371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0
NM_009323 // RefSeq // Mus musculus T-box 15 (Tbx15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000029462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:99253760:99354259:1 gene:ENSMUSG00000027868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000150756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:99296510:99316240:1 gene:ENSMUSG00000027868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 87 // 38 // 13 // 15 // 0 /// AF041822 // GenBank // Mus musculus T-box transcription factor (Tbx15) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// AK137458 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830004L16 product:T-box 15, full insert sequence. // chr3 // 81 // 79 // 25 // 31 // 0 /// AY662679 // GenBank // Mus musculus T-box transcription factor Tbx15 (Tbx15) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// AF013282 // GenBank // Mus musculus putative transcriptional regulator (MmTbx14) mRNA, partial cds. // chr3 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000045892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:99308778:99337130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 18 // 39 // 1
NM_028892 // RefSeq // Mus musculus sperm associated antigen 17 (Spag17), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENSMUST00000164539 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:99885417:100143322:1 gene:ENSMUSG00000027867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// AY555275 // GenBank // Mus musculus PF6-like protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 40 // 20 // 20 // 0 /// AY792594 // GenBank // Mus musculus PF6 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000029248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:99965078:100123957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 38 // 38 // 0
NM_010269 // RefSeq // Mus musculus ganglioside-induced differentiation-associated-protein 2 (Gdap2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_104341 // RefSeq // Mus musculus ganglioside-induced differentiation-associated-protein 2 (Gdap2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501001 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ganglioside-induced differentiation-associated-protein 2 (Gdap2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029459 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:100162381:100206981:1 gene:ENSMUSG00000027865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000106997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:100162518:100202470:1 gene:ENSMUSG00000027865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK082958 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530023H18 product:ganglioside-induced differentiation-associated-protein 2, full insert sequence. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC025070 // GenBank // Mus musculus ganglioside-induced differentiation-associated-protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:36796 IMAGE:3710712), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:100170000:100205819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000082639 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:100303288:100303364:1 gene:ENSMUSG00000064573 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT044411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
ENSMUST00000121385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:100413560:100414575:1 gene:ENSMUSG00000081440 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XR_375897 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12474 (Gm12474), transcript variant X2, ncRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XR_375898 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12474 (Gm12474), transcript variant X3, ncRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000122898 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:100489664:100523920:1 gene:ENSMUSG00000053957 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK053462 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130019M14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XR_401058 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12474 (Gm12474), transcript variant X1, ncRNA. // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// XR_375900 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12474 (Gm12474), transcript variant X5, ncRNA. // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// XR_375901 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12474 (Gm12474), transcript variant X6, ncRNA. // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_178594 // RefSeq // Mus musculus V-set domain containing T cell activation inhibitor 1 (Vtcn1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000054791 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:100825459:100895679:1 gene:ENSMUSG00000051076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY280973 // GenBank // Mus musculus immune costimulatory protein B7-H4 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AY322147 // GenBank // Mus musculus B7S1 mRNA, complete cds. // chr3 // 80 // 71 // 16 // 20 // 0 /// AY346099 // GenBank // Mus musculus T cell costimulatory molecule B7x mRNA, complete cds. // chr3 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// BC032925 // GenBank // Mus musculus V-set domain containing T cell activation inhibitor 1, mRNA (cDNA clone MGC:41287 IMAGE:1477676), complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:100856229:100891812:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_001165953 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 45 (Trim45), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NM_194343 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 45 (Trim45), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000037409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:100922475:100934011:1 gene:ENSMUSG00000033233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000094048 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:100922202:100931702:1 gene:ENSMUSG00000033233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000134993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:100922917:100931700:1 gene:ENSMUSG00000033233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000163914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:100922493:100934010:1 gene:ENSMUSG00000033233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC057358 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 45, mRNA (cDNA clone MGC:67212 IMAGE:6835531), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_001165952 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 45 (Trim45), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// ENSMUST00000106980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:100922493:100936925:1 gene:ENSMUSG00000033233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// GENSCAN00000018948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:100922298:100931579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_207205 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 3 (Igsf3), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000043983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:101377125:101463060:1 gene:ENSMUSG00000042035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK084011 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130076D11 product:hypothetical Immunoglobulin and major histocompatibility complex domain/Immunoglobulin-like/Immunoglobulin subtype containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC052892 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:60704 IMAGE:30055632), complete cds. // chr3 // 93 // 83 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:101424660:101460037:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_178777 // RefSeq // Mus musculus nescient helix loop helix 2 (Nhlh2), mRNA. // chr3 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// XM_006501113 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nescient helix loop helix 2 (Nhlh2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000066187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:102010145:102015492:1 gene:ENSMUSG00000048540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// AK082728 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230098D16 product:nescient helix loop helix 2, full insert sequence. // chr3 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// BC058413 // GenBank // Mus musculus nescient helix loop helix 2, mRNA (cDNA clone MGC:67330 IMAGE:6816900), complete cds. // chr3 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0
NM_009814 // RefSeq // Mus musculus calsequestrin 2 (Casq2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000029454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:102086415:102146514:1 gene:ENSMUSG00000027861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000159521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:102125814:102145348:1 gene:ENSMUSG00000027861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000164123 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:102086639:102145331:1 gene:ENSMUSG00000027861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000165540 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:102086546:102146514:1 gene:ENSMUSG00000027861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF068244 // GenBank // Mus musculus cardiac calsequestrin mRNA, complete cds. // chr3 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// BC092229 // GenBank // Mus musculus calsequestrin 2, mRNA (cDNA clone MGC:115896 IMAGE:30603069), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC137668 // GenBank // Mus musculus calsequestrin 2, mRNA (cDNA clone MGC:169292 IMAGE:8860687), complete cds. // chr3 // 87 // 86 // 27 // 31 // 0 /// BC140959 // GenBank // Mus musculus calsequestrin 2, mRNA (cDNA clone MGC:175920 IMAGE:9055571), complete cds. // chr3 // 87 // 86 // 27 // 31 // 0 /// U91483 // GenBank // Mus musculus cardiac calsequestrin mRNA, complete cds. // chr3 // 87 // 83 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:102086639:102145430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_001112698 // RefSeq // Mus musculus nerve growth factor (Ngf), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NM_013609 // RefSeq // Mus musculus nerve growth factor (Ngf), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501110 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nerve growth factor (Ngf), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000035952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:102469928:102521013:1 gene:ENSMUSG00000027859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000106925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:102469928:102521013:1 gene:ENSMUSG00000027859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M14805 // GenBank // Mouse nerve growth factor beta (beta-NGF) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M35075 // GenBank // Mouse nerve growth factor (NGF) precursor mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:102493586:102521753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001243132 // RefSeq // Mus musculus tetraspanin 2 (Tspan2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_027533 // RefSeq // Mus musculus tetraspanin 2 (Tspan2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:102734529:102772292:1 gene:ENSMUSG00000027858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000119902 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:102735215:102769205:1 gene:ENSMUSG00000027858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AK020982 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230119D02 product:hypothetical CD9/CD37/CD63 antigens containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// BC007185 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 2, mRNA (cDNA clone MGC:8230 IMAGE:3591472), complete cds. // chr3 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:102734997:102775934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
NM_025679 // RefSeq // Mus musculus suppressor of IKBKE 1 (Sike1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:102995728:103003914:1 gene:ENSMUSG00000027854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000119450 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:102995795:103002194:1 gene:ENSMUSG00000027854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC004090 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730470L24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:8302 IMAGE:3593790), complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000151065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:102995730:102999251:1 gene:ENSMUSG00000027854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// AK038295 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130093L21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// AK134305 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030404E18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000048155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:102995809:103064357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001161854 // RefSeq // Mus musculus cold shock domain containing E1, RNA binding (Csde1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_144901 // RefSeq // Mus musculus cold shock domain containing E1, RNA binding (Csde1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:103020546:103058189:1 gene:ENSMUSG00000068823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK145351 // GenBank HTC // Mus musculus morula whole body morula cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I0C0020L20 product:UNR protein homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC016898 // GenBank // Mus musculus cold shock domain containing E1, RNA binding, mRNA (cDNA clone MGC:19174 IMAGE:4224466), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC029058 // GenBank // Mus musculus cold shock domain containing E1, RNA binding, mRNA (cDNA clone MGC:36972 IMAGE:4947555), complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC029688 // GenBank // Mus musculus cold shock domain containing E1, RNA binding, mRNA (cDNA clone MGC:36669 IMAGE:5367783), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC031404 // GenBank // Mus musculus cold shock domain containing E1, RNA binding, mRNA (cDNA clone MGC:36342 IMAGE:4953772), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC062097 // GenBank // Mus musculus cold shock domain containing E1, RNA binding, mRNA (cDNA clone MGC:69648 IMAGE:6833505), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC055072 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30033604, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr3 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000048155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:102995809:103064357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_010937 // RefSeq // Mus musculus neuroblastoma ras oncogene (Nras), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501118 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuroblastoma ras oncogene (Nras), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000029445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:103058339:103067914:1 gene:ENSMUSG00000027852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000128264 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:103058903:103067906:1 gene:ENSMUSG00000027852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK010412 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410005F23 product:NEUROBLASTOMA RAS ONCOGENE homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC051443 // GenBank // Mus musculus neuroblastoma ras oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:60543 IMAGE:30061371), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC058755 // GenBank // Mus musculus neuroblastoma ras oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:65255 IMAGE:6475312), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// CT010359 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A0753D for gene Nras, Neuroblastoma ras oncogene; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000048155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:102995809:103064357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001033303 // RefSeq // Mus musculus adenosine monophosphate deaminase 1 (Ampd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501400 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenosine monophosphate deaminase 1 (Ampd1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501401 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenosine monophosphate deaminase 1 (Ampd1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000090715 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:103074014:103099714:1 gene:ENSMUSG00000070385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000155034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:103074022:103099714:1 gene:ENSMUSG00000070385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000177250 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:103094450:103099706:1 gene:ENSMUSG00000070385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000048150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:103074096:103099698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001079830 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 33 (Trim33), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_053170 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 33 (Trim33), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000029444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:103279293:103358768:1 gene:ENSMUSG00000033014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000106860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:103279293:103358768:1 gene:ENSMUSG00000033014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AY458590 // GenBank // Mus musculus transcriptional intermediary factor 1 gamma (Tif1g) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC043471 // GenBank HTC // Mus musculus tripartite motif protein 33, mRNA (cDNA clone IMAGE:5249453), containing frame-shift errors. // chr3 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000048143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:103279879:103353909:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0
NM_001142959 // RefSeq // Mus musculus BCLl2-like 15 (Bcl2l15), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_001142960 // RefSeq // Mus musculus BCLl2-like 15 (Bcl2l15), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000062945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:103832601:103838648:1 gene:ENSMUSG00000044165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027668 // GenBank // Mus musculus BCLl2-like 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:1247650), partial cds. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC117780 // GenBank // Mus musculus BCLl2-like 15, mRNA (cDNA clone MGC:143663 IMAGE:40091931), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC117781 // GenBank // Mus musculus BCLl2-like 15, mRNA (cDNA clone MGC:143664 IMAGE:40091934), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC128505 // GenBank // Mus musculus BCLl2-like 15, mRNA (cDNA clone MGC:156855 IMAGE:40091935), complete cds. // chr3 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// BC128506 // GenBank // Mus musculus BCLl2-like 15, mRNA (cDNA clone MGC:156856 IMAGE:40091936), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AF014453 // GenBank // Mus musculus murine retrovirus readthrough RNA sequence. // chr3 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:3:103832771:103854618:1 gene:ENSMUSG00000044165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000039711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:103809945:103847065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_009196 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 1 (Slc16a1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000046212 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:104638668:104658462:1 gene:ENSMUSG00000032902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF058055 // GenBank // Mus musculus monocarboxylate transporter 1 (mMCT1) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC014777 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:5796 IMAGE:3499773), complete cds. // chr3 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:104642756:104655722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_027982 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1J (Ppm1j), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006502122 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1J (Ppm1j), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006502123 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1J (Ppm1j), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000002298 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:104781056:104786018:1 gene:ENSMUSG00000002228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY184802 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2C zeta mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// BC117498 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1J, mRNA (cDNA clone MGC:144853 IMAGE:40106734), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC121788 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1J, mRNA (cDNA clone MGC:144852 IMAGE:40106732), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:104781087:104785852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_001291859 // RefSeq // Mus musculus ras homolog gene family, member C (Rhoc), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_007484 // RefSeq // Mus musculus ras homolog gene family, member C (Rhoc), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000002303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:104789011:104794459:1 gene:ENSMUSG00000002233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:104789034:104794344:1 gene:ENSMUSG00000002233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000176347 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:104789058:104794051:1 gene:ENSMUSG00000002233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC004627 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member C, mRNA (cDNA clone MGC:5971 IMAGE:3585988), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:104791897:104794043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_029228 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930564D02 gene (4930564D02Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006502231 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930564D02 gene (4930564D02Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000070584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:105066844:105078806:1 gene:ENSMUSG00000051788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001163356 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 212, member B (Fam212b), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NM_175398 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 212, member B (Fam212b), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000066610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:105704599:105720842:1 gene:ENSMUSG00000048458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000098273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:105705458:105718156:1 gene:ENSMUSG00000048458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC052371 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6530418L21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58959 IMAGE:6491043), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_027025 // RefSeq // Mus musculus adenosine A3 receptor (Adora3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000010279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:105870907:105924036:1 gene:ENSMUSG00000074344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC038878 // GenBank // Mus musculus adenosine A3 receptor, mRNA (cDNA clone IMAGE:1448868). // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:105916762:105928098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0
NM_001174169 // RefSeq // Mus musculus adenosine A3 receptor (Adora3), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NM_009631 // RefSeq // Mus musculus adenosine A3 receptor (Adora3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000000574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:105904423:105908928:1 gene:ENSMUSG00000000562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000164730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:105870858:105908353:1 gene:ENSMUSG00000000562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC100416 // GenBank // Mus musculus adenosine A3 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:118217 IMAGE:30916707), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000024493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:105904800:105907895:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_007696 // RefSeq // Mus musculus oviductal glycoprotein 1 (Ovgp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000573 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:105973711:105987423:1 gene:ENSMUSG00000074340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY521455 // GenBank // Mus musculus oviduct-specific glycoprotein (OGP) mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC137995 // GenBank // Mus musculus oviductal glycoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:169619 IMAGE:8861014), complete cds. // chr3 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// D32137 // GenBank // Mus musculus MOGP mRNA for oviduct-specific glycoprotein, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:105974083:105986115:1 gene:ENSMUSG00000074340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000167642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:105959503:105984600:1 gene:ENSMUSG00000000561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// AK163839 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130075K15 product:Methylosome protein 50 (MEP50 protein), full insert sequence. // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:105973816:105984790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000024496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:106091003:106132017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023186 // RefSeq // Mus musculus chitinase, acidic 1 (Chia1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000079132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:106113229:106132120:1 gene:ENSMUSG00000062778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000139086 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:106113390:106128931:1 gene:ENSMUSG00000062778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AF290003 // GenBank // Mus musculus acidic mammalian chitinase precursor, mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC011134 // GenBank // Mus musculus chitinase, acidic, mRNA (cDNA clone MGC:18771 IMAGE:4165150), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC034548 // GenBank // Mus musculus chitinase, acidic, mRNA (cDNA clone MGC:19045 IMAGE:4189080), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// DQ349202 // GenBank // Mus musculus acidic chitinase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// EF094027 // GenBank // Mus musculus acidic chitinase mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:106091003:106132017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_008418 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 3 (Kcna3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000052718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:107036162:107038129:1 gene:ENSMUSG00000047959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC132349 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:163980 IMAGE:40130626), complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// BC137667 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169291 IMAGE:8860686), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107028898:107038009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
NR_033498 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI504432 (AI504432), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:107039504:107054347:1 gene:ENSMUSG00000056145 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107039498:107105604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000060946 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:107090880:107098401:1 gene:ENSMUSG00000050179 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK088812 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430026I03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107039498:107105604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_008417 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 2 (Kcna2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004837 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081140 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 10 (Kcna10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055064 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:107183056:107195721:1 gene:ENSMUSG00000042861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137828 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:169452 IMAGE:8860847), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137829 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:169453 IMAGE:8860848), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158036 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:189839 IMAGE:9007339), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107194079:107195590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026774 // RefSeq // Mus musculus late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 5 (Lamtor5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000145735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:107278858:107284079:1 gene:ENSMUSG00000087260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC028547 // GenBank // Mus musculus hepatitis B virus x interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:41446 IMAGE:1513442), complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107260670:107304515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
NM_007441 // RefSeq // Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000014747 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:107595031:107605776:1 gene:ENSMUSG00000014603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U96109 // GenBank // Mus musculus proline-rich transcription factor ALX3 (Alx3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107595176:107605079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_133867 // RefSeq // Mus musculus EPS8-like 3 (Eps8l3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000037375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:107877230:107892899:1 gene:ENSMUSG00000040600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AY074932 // GenBank // Mus musculus epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 related protein 3 (Eps8R3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC014734 // GenBank // Mus musculus ESP8-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:25893 IMAGE:4218079), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000006305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107876648:107892749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0
NM_010360 // RefSeq // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 5 (Gstm5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000004134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:107895821:107898686:1 gene:ENSMUSG00000004032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000167387 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:107895954:107898549:1 gene:ENSMUSG00000004032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000167523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:107895836:107898575:1 gene:ENSMUSG00000004032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000169365 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:107896247:107898678:1 gene:ENSMUSG00000004032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000170058 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:107895846:107898686:1 gene:ENSMUSG00000004032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000172247 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:107895941:107898345:1 gene:ENSMUSG00000004032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC008206 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 5, mRNA (cDNA clone MGC:11497 IMAGE:3154170), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U24428 // GenBank // Mus musculus mu-class glutathione s-transferase (mGSTM5) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000006298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107895732:107898991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000138778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:107979632:107979868:1 gene:ENSMUSG00000049231 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000006256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107979632:107979871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT044745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000082635 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:108034026:108034156:1 gene:ENSMUSG00000064569 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_401131 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12500 (Gm12500), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000070502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:108085976:108088009:1 gene:ENSMUSG00000056411 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK083112 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630015B10 product:weakly similar to GLYCOPROTEIN [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000186471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108085584:108088011:1 gene:ENSMUSG00000056411 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_011967 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 5 (Psma5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000090569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108256926:108279974:1 gene:ENSMUSG00000068749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK160530 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410002O12 product:proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 5, full insert sequence. // chr3 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
NM_001271599 // RefSeq // Mus musculus sortilin 1 (Sort1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NM_019972 // RefSeq // Mus musculus sortilin 1 (Sort1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000102632 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108284091:108361511:1 gene:ENSMUSG00000068747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000135636 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108345821:108357870:1 gene:ENSMUSG00000068747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// AF175279 // GenBank // Mus musculus neurotensin receptor 3 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC056343 // GenBank // Mus musculus sortilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:73925 IMAGE:5704346), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000006263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108284141:108348809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108351631:108387395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_026831 // RefSeq // Mus musculus myosin binding protein H-like (Mybphl), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000090563 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108364911:108380056:1 gene:ENSMUSG00000068745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC089625 // GenBank // Mus musculus myosin binding protein H-like, mRNA (cDNA clone MGC:107699 IMAGE:6756382), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC132636 // GenBank // Mus musculus myosin binding protein H-like, mRNA (cDNA clone MGC:164267 IMAGE:40130913), complete cds. // chr3 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC132638 // GenBank // Mus musculus myosin binding protein H-like, mRNA (cDNA clone MGC:164269 IMAGE:40130915), complete cds. // chr3 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108351631:108387395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000158563 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:108441330:108441453:1 gene:ENSMUSG00000089188 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONMMUT044777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
ENSMUST00000029485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108537541:108544723:1 gene:ENSMUSG00000027886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC100493 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30916097. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC116223 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700013F07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143621 IMAGE:40091335), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000138210 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108537534:108543081:1 gene:ENSMUSG00000027886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000024981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108518985:108544647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONMMUT044783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr3 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_025444 // RefSeq // Mus musculus TAF13 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf13), mRNA. // chr3 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000143054 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108571699:108583222:1 gene:ENSMUSG00000048100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC021447 // GenBank // Mus musculus TAF13 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:29419 IMAGE:5050736), complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000056292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108571699:108582069:1 gene:ENSMUSG00000048100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1
NM_177859 // RefSeq // Mus musculus AKNA domain containing 1 (Aknad1), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006501608 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus AKNA domain containing 1 (Aknad1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006501609 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus AKNA domain containing 1 (Aknad1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000123556 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108744393:108775297:1 gene:ENSMUSG00000049565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000133931 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:3:108739658:108782296:1 gene:ENSMUSG00000049565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK029552 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921525H12 product:weakly similar to HYPOTHETICAL 44.5 KDA PROTEIN [Macaca fascicularis], full insert sequence. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK135678 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420403C08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006501610 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus AKNA domain containing 1 (Aknad1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// XM_006501611 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus AKNA domain containing 1 (Aknad1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108751672:108775541:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_001078646 // RefSeq // Mus musculus HEN1 methyltransferase homolog 1 (Arabidopsis) (Henmt1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_025723 // RefSeq // Mus musculus HEN1 methyltransferase homolog 1 (Arabidopsis) (Henmt1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000059946 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108940084:108960676:1 gene:ENSMUSG00000045662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000098680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108940114:108959321:1 gene:ENSMUSG00000045662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000106586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108940500:108960773:1 gene:ENSMUSG00000045662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC099408 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921515J06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117573 IMAGE:30935249), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC116413 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40103032. // chr3 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// AK014900 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921515J06 product:hypothetical S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases structure containing protein, full insert sequence. // chr3 // 74 // 84 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108940338:108960338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_029054 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 54 (Slc25a54), mRNA. // chr3 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// XM_006502213 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 25, member 54 (Slc25a54), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:109080469:109116687:1 gene:ENSMUSG00000027880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000159926 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:109080499:109116582:1 gene:ENSMUSG00000027880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// BC147589 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930443G12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182685 IMAGE:9056579), complete cds. // chr3 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC147621 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930443G12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182717 IMAGE:9056611), complete cds. // chr3 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC172107 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054393. // chr3 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:109080545:109116512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_172685 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, phosphate carrier), member 24 (Slc25a24), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000029477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:109123149:109168457:1 gene:ENSMUSG00000040322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000140786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:109123162:109158540:1 gene:ENSMUSG00000040322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC055369 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, phosphate carrier), member 24, mRNA (cDNA clone MGC:60830 IMAGE:30055307), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:109123205:109166510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000083938 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:109863780:109863885:1 gene:ENSMUSG00000065872 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007729 // RefSeq // Mus musculus collagen, type XI, alpha 1 (Col11a1), mRNA. // chr3 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// XM_006500969 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collagen, type XI, alpha 1 (Col11a1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// ENSMUST00000092155 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:114030540:114220718:1 gene:ENSMUSG00000027966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// ENSMUST00000123619 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:114030540:114108324:1 gene:ENSMUSG00000027966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 24 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000184978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:114165278:114219317:1 gene:ENSMUSG00000027966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 34 // 23 // 23 // 0 /// AK133478 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5031408M01 product:procollagen, type XI, alpha 1, full insert sequence. // chr3 // 100 // 34 // 23 // 23 // 0 /// AK140136 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230310P07 product:procollagen, type XI, alpha 1, full insert sequence. // chr3 // 100 // 13 // 9 // 9 // 0 /// BC052161 // GenBank // Mus musculus collagen, type XI, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:59348 IMAGE:6393164), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 66 // 66 // 0 /// GENSCAN00000021958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:113696724:114218827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 79 // 53 // 54 // 0
NM_001286750 // RefSeq // Mus musculus olfactomedin 3 (Olfm3), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NM_153157 // RefSeq // Mus musculus olfactomedin 3 (Olfm3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_153458 // RefSeq // Mus musculus olfactomedin 3 (Olfm3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000051309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:115080965:115125256:1 gene:ENSMUSG00000027965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000081752 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:114904078:115125722:1 gene:ENSMUSG00000027965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000149158 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:114904635:115120974:1 gene:ENSMUSG00000027965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 52 // 14 // 16 // 0 /// AF442824 // GenBank // Mus musculus optimedin form B mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF442825 // GenBank // Mus musculus optimedin form A mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC112422 // GenBank // Mus musculus olfactomedin 3, mRNA (cDNA clone MGC:132951 IMAGE:40061966), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// BC113129 // GenBank // Mus musculus olfactomedin 3, mRNA (cDNA clone MGC:132952 IMAGE:40061967), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:115081057:115122857:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000064809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:115715150:115716727:1 gene:ENSMUSG00000052769 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK038322 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130095K04 product:hypothetical Proline-rich region containing protein, full insert sequence. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT044872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010022 // RefSeq // Mus musculus dihydrolipoamide branched chain transacylase E2 (Dbt), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000000349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:116513070:116549976:1 gene:ENSMUSG00000000340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC055890 // GenBank // Mus musculus dihydrolipoamide branched chain transacylase E2, mRNA (cDNA clone MGC:68184 IMAGE:4242586), complete cds. // chr3 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// L42996 // GenBank // Mus musculus nuclear-encoded mitochondrial acyltransferase mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:116507952:116548200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_027321 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 39 (Lrrc39), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 30 // 30 // 0 /// NM_175413 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 39 (Lrrc39), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// XM_006500862 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 39 (Lrrc39), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000029573 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:116562978:116583134:1 gene:ENSMUSG00000027961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000123785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:116562973:116573112:1 gene:ENSMUSG00000027961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 70 // 30 // 30 // 0 /// XM_006500860 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 39 (Lrrc39), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 79 // 79 // 34 // 43 // 1 /// BC119529 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 39, mRNA (cDNA clone MGC:141189 IMAGE:40056120), complete cds. // chr3 // 81 // 81 // 35 // 43 // 1 /// BC119530 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 39, mRNA (cDNA clone MGC:141190 IMAGE:40056121), complete cds. // chr3 // 81 // 81 // 35 // 43 // 1 /// GENSCAN00000009605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:116565808:116579976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0
NM_001289568 // RefSeq // Mus musculus spindle assembly 6 homolog (C. elegans) (Sass6), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001289571 // RefSeq // Mus musculus spindle assembly 6 homolog (C. elegans) (Sass6), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_028349 // RefSeq // Mus musculus spindle assembly 6 homolog (C. elegans) (Sass6), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000029571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:116595008:116630984:1 gene:ENSMUSG00000027959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK013338 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810453L12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// AK145076 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830037I07 product:hypothetical Borrelia outer surface lipoprotein containing protein, full insert sequence. // chr3 // 81 // 94 // 26 // 32 // 0 /// BC050110 // GenBank // Mus musculus spindle assembly 6 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:61030 IMAGE:30024366), complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000009596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:116602298:116628814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_001113478 // RefSeq // Mus musculus ferric-chelate reductase 1 (Frrs1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_009146 // RefSeq // Mus musculus ferric-chelate reductase 1 (Frrs1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006501184 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ferric-chelate reductase 1 (Frrs1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000040260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:116878227:116903750:1 gene:ENSMUSG00000033386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC027770 // GenBank // Mus musculus ferric-chelate reductase 1, mRNA (cDNA clone MGC:36179 IMAGE:5344922), complete cds. // chr3 // 87 // 97 // 26 // 30 // 0 /// D50464 // GenBank // Mus musculus SDR2 mRNA, complete cds. // chr3 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// XM_006501185 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ferric-chelate reductase 1 (Frrs1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// GENSCAN00000009590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:116867642:116902416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0
NM_029425 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4833424O15 gene (4833424O15Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000039564 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:117575360:117689507:1 gene:ENSMUSG00000033342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000106473 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:117575227:117689507:1 gene:ENSMUSG00000033342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY512657 // GenBank // Mus musculus plasticity-related 5 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC031879 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4833424O15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30408 IMAGE:4527789), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006502235 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4833424O15 gene (4833424O15Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000053187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:117616051:117746669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NR_029551 // RefSeq // Mus musculus microRNA 137 (Mir137), microRNA. // chr3 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// ENSMUST00000083635 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:118433843:118433944:1 gene:ENSMUSG00000065569 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180593 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:118433797:118514627:1 gene:ENSMUSG00000097311 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:118430324:118433959:1 gene:ENSMUSG00000097311 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-137 // miRBase Micro RNA Database // MI0000163 Mus musculus miR-137 stem-loop // chr3 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// NONMMUT044947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0
AK051312 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130032N22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_170778 // RefSeq // Mus musculus dihydropyrimidine dehydrogenase (Dpyd), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000039177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:118562129:119432918:1 gene:ENSMUSG00000033308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC039699 // GenBank // Mus musculus dihydropyrimidine dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:47313 IMAGE:4235971), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000126254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:118562130:118799119:1 gene:ENSMUSG00000033308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1 /// ENSMUST00000150950 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:118562177:118783279:1 gene:ENSMUSG00000033308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1 /// AK145094 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830041E09 product:dihydropyrimidine dehydrogenase, full insert sequence. // chr3 // 24 // 24 // 11 // 45 // 1 /// AK149426 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730009C01 product:dihydropyrimidine dehydrogenase, full insert sequence. // chr3 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1 /// GENSCAN00000020821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:118519981:118966624:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 19 // 45 // 1
AK156232 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830012P10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024178 // RefSeq // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 14 (Alg14), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:121291817:121362011:1 gene:ENSMUSG00000039887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC002278 // GenBank // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 14 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:7683 IMAGE:3496897), complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AK017354 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430428G01 product:weakly similar to probable glycosyl transferase [Schizosaccharomyces pombe], full insert sequence. // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000037840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:121306123:121361786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
AK046933 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930004O10 product:weakly similar to SUPER CYSTEINE RICH PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_028044 // RefSeq // Mus musculus calponin 3, acidic (Cnn3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000029773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:121426541:121458205:1 gene:ENSMUSG00000053931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK179383 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0110C23, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000054495, based on BLAT search. // chr3 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// AK180041 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0112K24, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000054495, based on BLAT search. // chr3 // 94 // 52 // 15 // 16 // 0 /// BC055711 // GenBank // Mus musculus calponin 3, acidic, mRNA (cDNA clone MGC:66767 IMAGE:6415164), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC085268 // GenBank // Mus musculus calponin 3, acidic, mRNA (cDNA clone MGC:103066 IMAGE:6487559), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:121426772:121457426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:98604276:98614425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 71 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:8872211:8959175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001033814 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930432M17 gene (4930432M17Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000098646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:121671317:121682835:1 gene:ENSMUSG00000074248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_010171 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor III (F3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:121723537:121735052:1 gene:ENSMUSG00000028128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC016397 // GenBank // Mus musculus coagulation factor III, mRNA (cDNA clone MGC:6154 IMAGE:3584897), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC024886 // GenBank // Mus musculus coagulation factor III, mRNA (cDNA clone MGC:18513 IMAGE:3591823), complete cds. // chr3 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// CT010367 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B0953D for gene F3, Coagulation factor III; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 89 // 67 // 16 // 18 // 0 /// M26071 // GenBank // Mouse tissue factor (mtf) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M57896 // GenBank // Mouse tissue factor mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:121723715:121734239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_153806 // RefSeq // Mus musculus deoxynucleotidyltransferase, terminal, interacting protein 2 (Dnttip2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000035776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:122274414:122285269:1 gene:ENSMUSG00000039756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC028305 // GenBank // Mus musculus deoxynucleotidyltransferase, terminal, interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:27716 IMAGE:2609541), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:122274328:122285150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_013867 // RefSeq // Mus musculus breast cancer anti-estrogen resistance 3 (Bcar3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006501557 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus breast cancer anti-estrogen resistance 3 (Bcar3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006501558 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus breast cancer anti-estrogen resistance 3 (Bcar3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501559 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus breast cancer anti-estrogen resistance 3 (Bcar3), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000029766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:122419780:122530180:1 gene:ENSMUSG00000028121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF179566 // GenBank // Mus musculus p130Cas-binding protein AND34-1 (And34) mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// AK165396 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F520002K22 product:breast cancer anti-estrogen resistance 3, full insert sequence. // chr3 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC023930 // GenBank // Mus musculus breast cancer anti-estrogen resistance 3, mRNA (cDNA clone MGC:36007 IMAGE:5324365), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000051935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:122516117:122538491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000051957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:122466833:122513357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
XM_006501481 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphodiesterase 5A, cGMP-specific (Pde5a), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 98 // 93 // 41 // 42 // 0 /// AF541937 // GenBank // Mus musculus cGMP-binding/cGMP-specific phosphodiesterase mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 96 // 41 // 43 // 0 /// AK031275 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030400N17 product:CGMP-BINDING CGMP SPECIFIC PHOSPHODIESTERASE (FRAGMENT) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr3 // 100 // 24 // 11 // 11 // 0 /// BC119137 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 5A, cGMP-specific, mRNA (cDNA clone MGC:155453 IMAGE:8733886), complete cds. // chr3 // 98 // 93 // 41 // 42 // 0 /// BC120486 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 5A, cGMP-specific, mRNA (cDNA clone MGC:155723 IMAGE:40129409), complete cds. // chr3 // 95 // 93 // 40 // 42 // 0 /// NM_153422 // RefSeq // Mus musculus phosphodiesterase 5A, cGMP-specific (Pde5a), mRNA. // chr3 // 93 // 93 // 42 // 45 // 1 /// ENSMUST00000066728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:122729158:122859374:1 gene:ENSMUSG00000053965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 93 // 42 // 45 // 1 /// GENSCAN00000051961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:122772225:122795020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1
NM_007980 // RefSeq // Mus musculus fatty acid binding protein 2, intestinal (Fabp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:122895072:122899506:1 gene:ENSMUSG00000023057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY523818 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J intestinal fatty acid binding protein 2 (Fabp2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AY523819 // GenBank // Mus musculus strain C3H/HeJBir intestinal fatty acid binding protein 2 (Fabp2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC013457 // GenBank // Mus musculus fatty acid binding protein 2, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:18570 IMAGE:4218050), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M65034 // GenBank // Mouse Fabpi mRNA, complete CDS. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:122871992:122915603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_024461 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810037I17 gene (1810037I17Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000106429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:122924242:122926194:1 gene:ENSMUSG00000054091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC002135 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810037I17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7243 IMAGE:3484100), complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC086913 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810037I17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107621 IMAGE:30121587), complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_027135 // RefSeq // Mus musculus Sec24 related gene family, member D (S. cerevisiae) (Sec24d), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000047923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:123267496:123365635:1 gene:ENSMUSG00000039234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC049257 // GenBank // Mus musculus Sec24 related gene family, member D (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:55088 IMAGE:5150771), complete cds. // chr3 // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// BC057981 // GenBank // Mus musculus SEC24 related gene family, member D (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5039553), partial cds. // chr3 // 81 // 91 // 34 // 42 // 0 /// BC067020 // GenBank // Mus musculus Sec24 related gene family, member D (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:86025 IMAGE:6847085), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000026331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:123265760:123364961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0
NM_008939 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 12 neurotrypsin (motopsin) (Prss12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000029603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:123446913:123506602:1 gene:ENSMUSG00000027978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC031429 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 12 neurotrypsin (motopsin), mRNA (cDNA clone MGC:18371 IMAGE:3665834), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// D89871 // GenBank // Mus musculus mRNA for serine protease, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000026345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:123447159:123489638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
XM_006543829 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9372 (Gm9372), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:124292074:124292505:1 gene:ENSMUSG00000090474 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:124266982:124292505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146140 // RefSeq // Mus musculus translocation associated membrane protein 1-like 1 (Tram1l1), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:124321037:124323260:1 gene:ENSMUSG00000044528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC024829 // GenBank // Mus musculus translocation associated membrane protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:38776 IMAGE:5359105), complete cds. // chr3 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// BC027120 // GenBank // Mus musculus translocation associated membrane protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:38777 IMAGE:5359106), complete cds. // chr3 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000082981 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:124410655:124410764:1 gene:ENSMUSG00000064915 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT045134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_173451 // RefSeq // Mus musculus arylsulfatase J (Arsj), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000093976 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:126363827:126440374:1 gene:ENSMUSG00000046561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC117813 // GenBank // Mus musculus arylsulfatase J, mRNA (cDNA clone MGC:143729 IMAGE:40092671), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000003054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:126343529:126380507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NR_030403 // RefSeq // Mus musculus microRNA 302b (Mir302b), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000102297 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:127545228:127545301:1 gene:ENSMUSG00000076252 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-302b // miRBase Micro RNA Database // MI0003716 Mus musculus miR-302b stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT045191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_030404 // RefSeq // Mus musculus microRNA 302c (Mir302c), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000083548 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:127545363:127545430:1 gene:ENSMUSG00000065482 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-302c // miRBase Micro RNA Database // MI0003717 Mus musculus miR-302c stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT045192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_029653 // RefSeq // Mus musculus microRNA 302a (Mir302a), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000083618 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:127545496:127545564:1 gene:ENSMUSG00000065552 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-mir-302a // miRBase Micro RNA Database // MI0000402 Mus musculus miR-302a stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT045193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_030405 // RefSeq // Mus musculus microRNA 302d (Mir302d), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000083513 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:127545624:127545689:1 gene:ENSMUSG00000065447 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-302d // miRBase Micro RNA Database // MI0003718 Mus musculus miR-302d stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT045194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_030268 // RefSeq // Mus musculus microRNA 367 (Mir367), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083479 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:127545733:127545807:1 gene:ENSMUSG00000065413 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-367 // miRBase Micro RNA Database // MI0003531 Mus musculus miR-367 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_197997 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, GRF-type containing 1 (Zgrf1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502111 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930422G04 gene (4930422G04Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000043108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:127553489:127618021:1 gene:ENSMUSG00000051278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079891 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930422G04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30543277). // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006502111 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930422G04 gene (4930422G04Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC085187 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930422G04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30685321), complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NM_197997 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, GRF-type containing 1 (Zgrf1), mRNA. // chr3 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// ENSMUST00000043108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:127553489:127618021:1 gene:ENSMUSG00000051278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// BC079891 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930422G04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30543277). // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// BC082599 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 4930422G04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30655569), with apparent retained intron. // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// AY512952 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0953H07 unknown mRNA. // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000051571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:127556214:127616803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_197997 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, GRF-type containing 1 (Zgrf1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006502114 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930422G04 gene (4930422G04Rik), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000043108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:127553489:127618021:1 gene:ENSMUSG00000051278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK156938 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830108K21 product:Hypothetical P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases structure containing protein (Fragment), full insert sequence. // chr3 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// BC030185 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930422G04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5068638), complete cds. // chr3 // 80 // 28 // 8 // 10 // 0 /// BC079891 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930422G04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30543277). // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC082599 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 4930422G04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30655569), with apparent retained intron. // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006502111 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930422G04 gene (4930422G04Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000051571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:127556214:127616803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1
NM_009718 // RefSeq // Mus musculus neurogenin 2 (Neurog2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029587 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:127633136:127635631:1 gene:ENSMUSG00000027967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC055743 // GenBank // Mus musculus neurogenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:67057 IMAGE:6808442), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000098625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:128038694:128040661:1 gene:ENSMUSG00000074237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK156352 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830017K20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083314 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:128540372:128540480:1 gene:ENSMUSG00000065248 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT045221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_033594 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5712 (Gm5712), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_130450 // RefSeq // Mus musculus ELOVL family member 6, elongation of long chain fatty acids (yeast) (Elovl6), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000071402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:129532386:129638495:1 gene:ENSMUSG00000041220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// AB072039 // GenBank // Mus musculus FAE mRNA for fatty acyl elongase, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// AY053453 // GenBank // Mus musculus long-chain fatty-acyl elongase (Lce) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC051041 // GenBank // Mus musculus ELOVL family member 6, elongation of long chain fatty acids (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:59098 IMAGE:4012676), complete cds. // chr3 // 94 // 73 // 15 // 16 // 0 /// BC098492 // GenBank // Mus musculus ELOVL family member 6, elongation of long chain fatty acids (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:107467 IMAGE:30091954), complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// BC100576 // GenBank // Mus musculus ELOVL family member 6, elongation of long chain fatty acids (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:118673 IMAGE:30097278), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// AF480860 // GenBank // Mus musculus myelination associated SUR4-like protein (Masr) mRNA, complete cds. // chr3 // 73 // 68 // 11 // 15 // 0
NM_007686 // RefSeq // Mus musculus complement component factor i (Cfi), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000077918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:129836739:129875328:1 gene:ENSMUSG00000058952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC150751 // GenBank // Mus musculus complement component factor i, mRNA (cDNA clone MGC:183662 IMAGE:9087662), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U47810 // GenBank // Mus musculus complement factor I mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:129836764:129875138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001286948 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A2, group XIIA (Pla2g12a), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NM_023196 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A2, group XIIA (Pla2g12a), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NM_183423 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A2, group XIIA (Pla2g12a), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NR_104611 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A2, group XIIA (Pla2g12a), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000029629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:129878622:129895821:1 gene:ENSMUSG00000027999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000061165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:129881184:129895821:1 gene:ENSMUSG00000027999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// AY007381 // GenBank // Mus musculus strain AKR group XII-1 phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr3 // 77 // 81 // 23 // 30 // 0 /// AY007382 // GenBank // Mus musculus strain AKR group XII-2 phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// BC026812 // GenBank // Mus musculus phospholipase A2, group XIIA, mRNA (cDNA clone MGC:25458 IMAGE:4456431), complete cds. // chr3 // 85 // 73 // 23 // 27 // 0 /// BC051117 // GenBank // Mus musculus phospholipase A2, group XIIA, mRNA (cDNA clone MGC:58884 IMAGE:6306803), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:129878719:129894956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// BC055051 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6493563, with apparent retained intron. // chr3 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1
NM_009811 // RefSeq // Mus musculus caspase 6 (Casp6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:129901425:129914103:1 gene:ENSMUSG00000027997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000152622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:129910462:129913601:1 gene:ENSMUSG00000027997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC002022 // GenBank // Mus musculus caspase 6, mRNA (cDNA clone MGC:5873 IMAGE:3491126), complete cds. // chr3 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000137314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:129901458:129908744:1 gene:ENSMUSG00000027997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000022156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:129896117:129913573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONMMUT045261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001163587 // RefSeq // Mus musculus ethanolamine phosphate phospholyase (Etnppl), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_027907 // RefSeq // Mus musculus ethanolamine phosphate phospholyase (Etnppl), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000072271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:130617569:130635750:1 gene:ENSMUSG00000019232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163620 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:130617693:130634677:1 gene:ENSMUSG00000019232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000166187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:130617448:130634809:1 gene:ENSMUSG00000019232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC043680 // GenBank // Mus musculus alanine-glyoxylate aminotransferase 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:49277 IMAGE:5101568), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058592 // GenBank // Mus musculus alanine-glyoxylate aminotransferase 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:67856 IMAGE:5363337), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:130617693:130632988:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001289477 // RefSeq // Mus musculus 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 1 (Papss1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NM_001289478 // RefSeq // Mus musculus 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 1 (Papss1), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_001289479 // RefSeq // Mus musculus 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 1 (Papss1), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_011863 // RefSeq // Mus musculus 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 1 (Papss1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000029666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:131564768:131643670:1 gene:ENSMUSG00000028032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC066055 // GenBank // Mus musculus 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 1, mRNA (cDNA clone MGC:91299 IMAGE:6833756), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// U34883 // GenBank // Mus musculus ATP sulfurylase/APS kinase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000042592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:131595715:131626706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1
NM_020265 // RefSeq // Mus musculus dickkopf homolog 2 (Xenopus laevis) (Dkk2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:132085292:132180293:1 gene:ENSMUSG00000028031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC096448 // GenBank // Mus musculus dickkopf homolog 2 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:106139 IMAGE:6389874), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027927 // RefSeq // Mus musculus integrator complex subunit 12 (Ints12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:133091840:133110988:1 gene:ENSMUSG00000028016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC023801 // GenBank // Mus musculus integrator complex subunit 12, mRNA (cDNA clone MGC:38517 IMAGE:5353058), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC046996 // GenBank // Mus musculus integrator complex subunit 12, mRNA (cDNA clone MGC:54983 IMAGE:6494551), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000160036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:133091938:133101406:1 gene:ENSMUSG00000028016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENSMUST00000160669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:133100387:133107085:1 gene:ENSMUSG00000028016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// AK038713 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230056J18 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000045922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:133090883:133109419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT045342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001004367 // RefSeq // Mus musculus CXXC finger 4 (Cxxc4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000181904 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:134236491:134262090:1 gene:ENSMUSG00000044365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC082332 // GenBank // Mus musculus CXXC finger 4, mRNA (cDNA clone MGC:90862 IMAGE:30537505), complete cds. // chr3 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501561 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CXXC finger 4 (Cxxc4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// XM_006501566 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CXXC finger 4 (Cxxc4), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// ENSMUST00000166288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:134236820:134258231:1 gene:ENSMUSG00000044365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// BC067052 // GenBank // Mus musculus CXXC finger 4, mRNA (cDNA clone MGC:86040 IMAGE:30619087), complete cds. // chr3 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// GENSCAN00000019971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:134199899:134240829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1
NM_021382 // RefSeq // Mus musculus tachykinin receptor 3 (Tacr3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:134829007:134934581:1 gene:ENSMUSG00000028172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF233341 // GenBank // Mus musculus neurokinin-3 receptor mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC066845 // GenBank // Mus musculus tachykinin receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:76644 IMAGE:30436441), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:134846574:134861394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000019980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:134929895:134932442:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000019976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:134944699:134963525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000102411 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:135147408:135147513:1 gene:ENSMUSG00000076366 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT045375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_173762 // RefSeq // Mus musculus centromere protein E (Cenpe), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000062893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:135212563:135273540:1 gene:ENSMUSG00000045328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AY493378 // GenBank // Mus musculus centromere associated protein-E (Cenpe) mRNA, complete cds. // chr3 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000015696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:135212659:135314009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0
NM_001172055 // RefSeq // Mus musculus 3-hydroxybutyrate dehydrogenase, type 2 (Bdh2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_027208 // RefSeq // Mus musculus 3-hydroxybutyrate dehydrogenase, type 2 (Bdh2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000029817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:135281292:135304426:1 gene:ENSMUSG00000028167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000120397 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:135281221:135304426:1 gene:ENSMUSG00000028167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000154869 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:135288658:135304423:1 gene:ENSMUSG00000028167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000171974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:135281221:135304426:1 gene:ENSMUSG00000028167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK007603 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810026B04 product:OXIDOREDUCTASE UCPA homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC036998 // GenBank // Mus musculus 3-hydroxybutyrate dehydrogenase, type 2, mRNA (cDNA clone MGC:46989 IMAGE:5041996), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:135212659:135314009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
ENSMUST00000062127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:135727338:135728738:1 gene:ENSMUSG00000045520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK042285 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630078I01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001293622 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 3, catalytic subunit, alpha isoform (Ppp3ca), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// NM_008913 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 3, catalytic subunit, alpha isoform (Ppp3ca), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000056758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:136670770:136935779:1 gene:ENSMUSG00000028161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000070198 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:136670124:136937727:1 gene:ENSMUSG00000028161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// BC096652 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 3, catalytic subunit, alpha isoform, mRNA (cDNA clone IMAGE:1514916), complete cds. // chr3 // 90 // 29 // 9 // 10 // 0 /// BC138612 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 3, catalytic subunit, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:170237 IMAGE:8861632), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// J05479 // GenBank // Mouse calcineurin catalytic subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:136776012:136923410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
ENSMUST00000083972 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:137067892:137067998:1 gene:ENSMUSG00000065906 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT045440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001163522 // RefSeq // Mus musculus endomucin (Emcn), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NM_016885 // RefSeq // Mus musculus endomucin (Emcn), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000119475 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:137341143:137431069:1 gene:ENSMUSG00000054690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000122064 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:137341067:137432185:1 gene:ENSMUSG00000054690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AB034693 // GenBank // Mus musculus mRNA for endomucin-1, complete cds. // chr3 // 93 // 80 // 26 // 28 // 0 /// AF060883 // GenBank // Mus musculus endomucin mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0 /// BC003706 // GenBank // Mus musculus endomucin, mRNA (cDNA clone MGC:5673 IMAGE:3485788), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000128985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:137341090:137421912:1 gene:ENSMUSG00000054690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// AK145825 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530003F17 product:endomucin, full insert sequence. // chr3 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// GENSCAN00000051783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:137361050:137422353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_030143 // RefSeq // Mus musculus DNA-damage-inducible transcript 4-like (Ddit4l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:137623672:137628333:1 gene:ENSMUSG00000046818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165845 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:137624037:137626174:1 gene:ENSMUSG00000046818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AF327512 // GenBank // Mus musculus SMHS1 (Smhs1) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// AF335325 // GenBank // Mus musculus RTP801-like protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC038131 // GenBank // Mus musculus DNA-damage-inducible transcript 4-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:5254530), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC147181 // GenBank // Mus musculus DNA-damage-inducible transcript 4-like, mRNA (cDNA clone MGC:182315 IMAGE:9056209), complete cds. // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC147182 // GenBank // Mus musculus DNA-damage-inducible transcript 4-like, mRNA (cDNA clone MGC:182326 IMAGE:9056220), complete cds. // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000167564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:137621612:137625399:1 gene:ENSMUSG00000046818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000051770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:137618676:137626456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT045446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_019920 // RefSeq // Mus musculus late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3 (Lamtor3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000168345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:137918526:137928765:1 gene:ENSMUSG00000091512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000179862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:104949176:104950441:-1 gene:ENSMUSG00000094685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// AF082526 // GenBank // Mus musculus MEK binding partner 1 (Mp1) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// AK031303 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030404P08 product:mitogen-activated protein kinase kinase 1 interacting protein 1, full insert sequence. // chr3 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// BC016417 // GenBank // Mus musculus MAPK scaffold protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:5756 IMAGE:3158151), complete cds. // chr3 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// BC083155 // GenBank // Mus musculus MAPK scaffold protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:103121 IMAGE:5339040), complete cds. // chr3 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:104949915:104960532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
XM_006502556 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102634333 (LOC102634333), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000163080 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:138065052:138081506:1 gene:ENSMUSG00000090066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000051769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138064804:138070412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_009626 // RefSeq // Mus musculus alcohol dehydrogenase 7 (class IV), mu or sigma polypeptide (Adh7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006500920 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alcohol dehydrogenase 7 (class IV), mu or sigma polypeptide (Adh7), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000090171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:138217823:138233382:1 gene:ENSMUSG00000055301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF331802 // GenBank // Mus musculus C57BL/6J alcohol dehydrogenase class 4 (Adh4) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF331803 // GenBank // Mus musculus C3HeB/FeJ alcohol dehydrogenase class 4 (Adh4) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 97 // 28 // 32 // 0 /// BC047267 // GenBank // Mus musculus alcohol dehydrogenase 7 (class IV), mu or sigma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:54684 IMAGE:6310424), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// U20257 // GenBank // Mus musculus class IV alcohol dehydrogenase (Adh-3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XM_006500921 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alcohol dehydrogenase 7 (class IV), mu or sigma polypeptide (Adh7), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000035156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138198870:138261708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_007409 // RefSeq // Mus musculus alcohol dehydrogenase 1 (class I) (Adh1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000004232 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:138277494:138290698:1 gene:ENSMUSG00000074207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000159159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:138277651:138290698:1 gene:ENSMUSG00000074207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC013477 // GenBank // Mus musculus alcohol dehydrogenase 1 (class I), mRNA (cDNA clone MGC:18885 IMAGE:4238555), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC054467 // GenBank // Mus musculus alcohol dehydrogenase 1 (class I), mRNA (cDNA clone MGC:62537 IMAGE:6530906), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000161799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:138277645:138280952:1 gene:ENSMUSG00000074207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// ENSMUST00000162032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:138260991:138282781:1 gene:ENSMUSG00000074207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000035176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138277719:138329218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_026945 // RefSeq // Mus musculus alcohol dehydrogenase 6A (class V) (Adh6a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000013455 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:138313286:138330415:1 gene:ENSMUSG00000053054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000106247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:138313286:138331134:1 gene:ENSMUSG00000053054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK028114 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010001M05 product:ADH5A homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC130016 // GenBank // Mus musculus alcohol dehydrogenase 6A (class V), mRNA (cDNA clone MGC:161171 IMAGE:40140468), complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138277719:138329218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000157127 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:138343138:138343296:1 gene:ENSMUSG00000087752 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132485 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732457G07 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006502557 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alcohol dehydrogenase 6B (class V) (Adh6b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006543822 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alcohol dehydrogenase 6B (class V) (Adh6b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000090166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:138352378:138358861:1 gene:ENSMUSG00000074206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK142824 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930023O07 product:weakly similar to Alcohol dehydrogenase alpha chain (EC 1.1.1.1) (ADH3) [Coturnix coturnix japonica], full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138342859:138359154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_033581 // RefSeq // Mus musculus alcohol dehydrogenase 6 (class V), pseudogene 1 (Adh6-ps1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000171054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:138374121:138388291:1 gene:ENSMUSG00000090306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_011996 // RefSeq // Mus musculus alcohol dehydrogenase 4 (class II), pi polypeptide (Adh4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000013458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:138415495:138430892:1 gene:ENSMUSG00000037797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000161312 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:138415487:138424028:1 gene:ENSMUSG00000037797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// AJ245750 // GenBank // Mus musculus mRNA for alcohol dehydrogenase II (Adh2 gene). // chr3 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC100729 // GenBank // Mus musculus alcohol dehydrogenase 4 (class II), pi polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:124029 IMAGE:40045447), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC100730 // GenBank // Mus musculus alcohol dehydrogenase 4 (class II), pi polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:124030 IMAGE:40045448), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC100736 // GenBank // Mus musculus alcohol dehydrogenase 4 (class II), pi polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:124028 IMAGE:40045445), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138411695:138463549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_001288578 // RefSeq // Mus musculus alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide (Adh5), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_007410 // RefSeq // Mus musculus alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide (Adh5), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000005964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:138443093:138455499:1 gene:ENSMUSG00000028138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062879 // GenBank // Mus musculus alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:86026 IMAGE:5691327), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC090978 // GenBank // Mus musculus alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:107163 IMAGE:30313517), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000160201 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:138443170:138447939:1 gene:ENSMUSG00000028138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000035154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138411695:138463549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT045488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_007917 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4E (Eif4e), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000029803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:138526191:138557599:1 gene:ENSMUSG00000028156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
AK133004 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930550E05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138524386:138555504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0
GENSCAN00000035178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138598616:138624377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_198659 // RefSeq // Mus musculus sperm tail PG rich repeat containing 2 (Stpg2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000062306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:139205893:139710299:1 gene:ENSMUSG00000047940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000106239 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:139205694:139709610:1 gene:ENSMUSG00000047940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC138108 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B930007M17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169732 IMAGE:8861127), complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC138109 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B930007M17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169733 IMAGE:8861128), complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// XM_006501628 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sperm tail PG rich repeat containing 2 (Stpg2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// XR_375536 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sperm tail PG rich repeat containing 2 (Stpg2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr3 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// GENSCAN00000020297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:139205899:139321373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_001293561 // RefSeq // Mus musculus unc-5 homolog C (C. elegans) (Unc5c), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_009472 // RefSeq // Mus musculus unc-5 homolog C (C. elegans) (Unc5c), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000075282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:141465574:141829469:1 gene:ENSMUSG00000059921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000106236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:141465564:141834924:1 gene:ENSMUSG00000059921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000130636 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:141465599:141829421:1 gene:ENSMUSG00000059921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000142762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:141465671:141830538:1 gene:ENSMUSG00000059921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC115772 // GenBank // Mus musculus unc-5 homolog C (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:141501 IMAGE:40085998), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// U72634 // GenBank // Mus musculus rostral cerebellar malformation protein (rcm) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000056236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:141677944:141828572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
AF422243 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 5 (Gbp5) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AF487898 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 5a (Gbp5) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr3 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// AK087083 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030025M22 product:weakly similar to GUANYLATE BINDING PROTEIN 5 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// BC058555 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:67761 IMAGE:5293575), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_153564 // RefSeq // Mus musculus guanylate binding protein 5 (Gbp5), mRNA. // chr3 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000090127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:142496934:142522344:1 gene:ENSMUSG00000040264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// AK035481 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530054H01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000001223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:142477228:142637493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_010259 // RefSeq // Mus musculus guanylate binding protein 2b (Gbp2b), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006544774 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interferon-induced guanylate-binding protein 1-like (LOC102643136), mRNA. // chr3 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000029936 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:142594847:142619179:1 gene:ENSMUSG00000040264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000028269 // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// EF494422 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 1 (Gbp1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// M63961 // GenBank // Mouse interferon-gamma inducible protein (mag-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 75 // 89 // 24 // 32 // 0 /// BC108990 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:124334 IMAGE:40047769), complete cds. // chr3 // 70 // 83 // 21 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:142477228:142637493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1
NM_001083312 // RefSeq // Mus musculus guanylate binding protein 7 (Gbp7), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_145545 // RefSeq // Mus musculus guanylate binding protein 7 (Gbp7), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000045097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:142530342:142550083:1 gene:ENSMUSG00000040253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000171263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:142530338:142550083:1 gene:ENSMUSG00000040253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC010229 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:6385 IMAGE:3501441), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000001223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:142477228:142637493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
NM_010260 // RefSeq // Mus musculus guanylate binding protein 2 (Gbp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000165774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:142620602:142638008:1 gene:ENSMUSG00000028270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000169572 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:142620635:142630585:1 gene:ENSMUSG00000028270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 92 // 36 // 11 // 12 // 0 /// AF077007 // GenBank // Mus musculus interferon-induced guanylate binding protein GBP-2 (Gbp2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF109168 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 2 (Gbp2) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// BC011336 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:18544 IMAGE:3494311), complete cds. // chr3 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// BC032882 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:41173 IMAGE:1230883), complete cds. // chr3 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// BC049141 // GenBank HTC // Mus musculus guanylate binding protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3992217), containing frame-shift errors. // chr3 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// CT010249 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D0851D for gene Gbp2, Guanylate nucleotide binding protein 2; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// M63961 // GenBank // Mouse interferon-gamma inducible protein (mag-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000001223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:142477228:142637493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
NM_145546 // RefSeq // Mus musculus general transcription factor IIB (Gtf2b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000029938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:142765226:142783603:1 gene:ENSMUSG00000028271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC016637 // GenBank // Mus musculus general transcription factor IIB, mRNA (cDNA clone MGC:6859 IMAGE:2650779), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000001237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:142765272:142783329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_053102 // RefSeq // Mus musculus selenoprotein (Sep15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:144570426:144597680:1 gene:ENSMUSG00000037072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106211 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:144570693:144597661:1 gene:ENSMUSG00000037072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000144859 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:144570304:144597257:1 gene:ENSMUSG00000037072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AF288740 // GenBank // Mus musculus 15 kDa selenoprotein (Sep15) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC019792 // GenBank // Mus musculus selenoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:30351 IMAGE:5003585), complete cds. // chr3 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000004922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:144570725:144596954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT045631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_027770 // RefSeq // Mus musculus collagen, type XXIV, alpha 1 (Col24a1), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 57 // 57 // 0 /// ENSMUST00000029848 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:145292472:145552011:1 gene:ENSMUSG00000028197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 57 // 57 // 0 /// BC139134 // GenBank // Mus musculus collagen, type XXIV, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:170761 IMAGE:8862156), complete cds. // chr3 // 93 // 97 // 52 // 56 // 0 /// DQ157748 // GenBank // Mus musculus alpha 1 type XXIV collagen (Col24a1) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 98 // 53 // 57 // 0 /// GENSCAN00000003172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:145456534:145518743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 21 // 21 // 12 // 58 // 1
NM_001081094 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, HIT type 6 (Znhit6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006501436 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, HIT type 6 (Znhit6), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// XR_375523 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, HIT type 6 (Znhit6), transcript variant X5, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000098534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:145576208:145605245:1 gene:ENSMUSG00000074182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC147498 // GenBank // Mus musculus zinc finger, HIT type 6, mRNA (cDNA clone MGC:182466 IMAGE:9056360), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC150966 // GenBank // Mus musculus zinc finger, HIT type 6, mRNA (cDNA clone MGC:183878 IMAGE:9087878), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC150967 // GenBank // Mus musculus zinc finger, HIT type 6, mRNA (cDNA clone MGC:183879 IMAGE:9087879), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC151198 // GenBank // Mus musculus zinc finger, HIT type 6, mRNA (cDNA clone MGC:184097 IMAGE:9088086), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK010555 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410019A14 product:weakly similar to SEROLOGICALLY DEFINED BREAST CANCER ANTIGEN NY-BR-75 (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 52 // 74 // 12 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:145576368:145602873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_026993 // RefSeq // Mus musculus dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 (Ddah1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000029845 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:145758675:145894277:1 gene:ENSMUSG00000028194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000120310 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:145760748:145893266:1 gene:ENSMUSG00000028194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC034505 // GenBank // Mus musculus dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1, mRNA (cDNA clone MGC:30267 IMAGE:5134831), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000127193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:145810479:145889295:1 gene:ENSMUSG00000028194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// BC060266 // GenBank HTC // Mus musculus dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5698949), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr3 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:145843327:145853420:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_009740 // RefSeq // Mus musculus B cell leukemia/lymphoma 10 (Bcl10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000029842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:145924378:145934283:1 gene:ENSMUSG00000028191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF057701 // GenBank // Mus musculus CIPER protein (Ciper) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF134396 // GenBank // Mus musculus CARD-like apoptotic protein (Clap) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC024379 // GenBank // Mus musculus B-cell leukemia/lymphoma 10, mRNA (cDNA clone MGC:36096 IMAGE:4976147), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF100339 // GenBank // Mus musculus CARD containing molecule enhancing NF-kB mRNA, complete cds. // chr3 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// AF127387 // GenBank // Mus musculus CARD-containing proapoptotic protein ME10 (Me10) mRNA, complete cds. // chr3 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// BC172007 // GenBank // Mus musculus B-cell leukemia/lymphoma 10, mRNA (cDNA clone MGC:198712 IMAGE:9054293), complete cds. // chr3 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// BC172009 // GenBank // Mus musculus B-cell leukemia/lymphoma 10, mRNA (cDNA clone MGC:198714 IMAGE:9054295), complete cds. // chr3 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// GENSCAN00000003132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:145924459:145943870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_001166064 // RefSeq // Mus musculus synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans) (Syde2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000039517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:145987870:146021720:1 gene:ENSMUSG00000036863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:145977413:146032658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_134160 // RefSeq // Mus musculus mucolipin 3 (Mcoln3), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XM_006501081 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mucolipin 3 (Mcoln3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006501082 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mucolipin 3 (Mcoln3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000039450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:146121672:146141806:1 gene:ENSMUSG00000036853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AF475086 // GenBank // Mus musculus mucolipin-3 (Mcoln3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AY083531 // GenBank // Mus musculus mucolipin 3 (Mcoln3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC106856 // GenBank // Mus musculus mucolipin 3, mRNA (cDNA clone MGC:124245 IMAGE:40047039), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC106857 // GenBank // Mus musculus mucolipin 3, mRNA (cDNA clone MGC:124246 IMAGE:40047042), complete cds. // chr3 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:146123790:146170132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 83 // 33 // 40 // 1
NM_001005846 // RefSeq // Mus musculus mucolipin 2 (Mcoln2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_026656 // RefSeq // Mus musculus mucolipin 2 (Mcoln2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006501970 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mucolipin 2 (Mcoln2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// XR_375570 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mucolipin 2 (Mcoln2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr3 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000011152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:146149833:146195513:1 gene:ENSMUSG00000011008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000098524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:146150174:146195512:1 gene:ENSMUSG00000011008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF503575 // GenBank // Mus musculus mucolipin-2 (Mcoln2) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// AY083532 // GenBank // Mus musculus mucolipin 2 (Mcoln2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC029847 // GenBank // Mus musculus mucolipin 2, mRNA (cDNA clone MGC:35629 IMAGE:3967456), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:146171799:146202454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_022983 // RefSeq // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 3 (Lpar3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:146220961:146286214:1 gene:ENSMUSG00000036832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF293845 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor (Edg7) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC125460 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:159163 IMAGE:40129975), complete cds. // chr3 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC125462 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:159165 IMAGE:40129977), complete cds. // chr3 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_001293672 // RefSeq // Mus musculus chitobiase, di-N-acetyl- (Ctbs), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_028836 // RefSeq // Mus musculus chitobiase, di-N-acetyl- (Ctbs), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029840 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:146450493:146465771:1 gene:ENSMUSG00000028189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000061937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:146450470:146465849:1 gene:ENSMUSG00000028189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// DQ100384 // GenBank // Mus musculus di-N-acetylchitobiase (Ctbs) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:146450502:146464090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000118280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:146499890:146505547:1 gene:ENSMUSG00000068523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_009474 // RefSeq // Mus musculus urate oxidase (Uox), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029837 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:146597077:146632305:1 gene:ENSMUSG00000028186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000121133 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:146597165:146630647:1 gene:ENSMUSG00000028186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000138921 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:146597166:146612443:1 gene:ENSMUSG00000028186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC019771 // GenBank // Mus musculus urate oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:30311 IMAGE:5136328), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M27695 // GenBank // Mouse urate oxidase mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:146603454:146630607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_027594 // RefSeq // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 7 (Ttll7), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000038090 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:146852367:146940256:1 gene:ENSMUSG00000036745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000106134 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:146894176:146979751:1 gene:ENSMUSG00000036745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:146852367:146982750:1 gene:ENSMUSG00000036745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK014905 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921517B04 product:hypothetical Tubulin-tyrosine ligase containing protein, full insert sequence. // chr3 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:146888579:146928177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_027594 // RefSeq // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 7 (Ttll7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000037942 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:146944047:146984009:1 gene:ENSMUSG00000036745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:146852367:146982750:1 gene:ENSMUSG00000036745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138274 // GenBank // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:169898 IMAGE:8861293), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138275 // GenBank // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:169899 IMAGE:8861294), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106134 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:146894176:146979751:1 gene:ENSMUSG00000036745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// GENSCAN00000003398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:146944011:146971199:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
XM_006502566 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 60S ribosomal protein L29-like (LOC102632402), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000019164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:149198964:149229982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
AK132813 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930415L20 product:hypothetical Glutamic acid-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_376226 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5149 (Gm5149), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// XR_376228 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5149 (Gm5149), transcript variant X3, misc_RNA. // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// XR_401361 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5149 (Gm5149), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT045729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000019166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:149332160:149347535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_133222 // RefSeq // Mus musculus EGF, latrophilin seven transmembrane domain containing 1 (Eltd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000046977 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:151437887:151545086:1 gene:ENSMUSG00000039167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000129283 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:151500071:151507497:1 gene:ENSMUSG00000039167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AF385682 // GenBank // Mus musculus ETL1 mRNA, complete cds. // chr3 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC017134 // GenBank // Mus musculus EGF, latrophilin seven transmembrane domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:27649 IMAGE:4511572), complete cds. // chr3 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:151469631:151517621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000025073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:151905198:151959730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000181854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:152165374:152166488:1 gene:ENSMUSG00000097293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK052598 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630002J18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONMMUT002567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001076676 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 33 (Usp33), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001252486 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 33 (Usp33), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_133247 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 33 (Usp33), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000026507 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:152346478:152393612:1 gene:ENSMUSG00000025437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:152346489:152393330:1 gene:ENSMUSG00000025437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF383174 // GenBank // Mus musculus pVHL-interacting deubiquitinating enzyme 1 (Vdu1) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AK122442 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1097 protein. // chr3 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000123237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:152346512:152371905:1 gene:ENSMUSG00000025437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AK047530 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930083N20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:152344941:152393837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_025758 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 17 (Asb17), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:153844209:153855082:1 gene:ENSMUSG00000038997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF425641 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain-containing SOCS box protein ASB17 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC049572 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 17, mRNA (cDNA clone MGC:58178 IMAGE:6773716), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK164225 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030019C17 product:ankyrin repeat and SOCS box-containing protein 17, full insert sequence. // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000045832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:153762626:153853541:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
XM_006501491 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 44, member 5 (Slc44a5), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000144677 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:154257474:154271722:1 gene:ENSMUSG00000028360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC068154 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 44, member 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:30535162), complete cds. // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NM_001081263 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 44, member 5 (Slc44a5), mRNA. // chr3 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// ENSMUST00000089948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:153973436:154271722:1 gene:ENSMUSG00000028360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// BC086641 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 44, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:99452 IMAGE:6417957), complete cds. // chr3 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:154221491:154319401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_175176 // RefSeq // Mus musculus glutamate rich 3 (Erich3), mRNA. // chr3 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000051862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:154711133:154749012:1 gene:ENSMUSG00000042943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000172865 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:154664096:154757527:1 gene:ENSMUSG00000042943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 66 // 22 // 23 // 0 /// BC138236 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC007180, mRNA (cDNA clone MGC:169860 IMAGE:8861255), complete cds. // chr3 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// BC145840 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4922501L14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175727 IMAGE:40131143), complete cds. // chr3 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000038339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:154684288:154797345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000082831 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:155092018:155092128:1 gene:ENSMUSG00000064765 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT045875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000023093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:155491727:155548540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000082576 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:157365998:157366104:1 gene:ENSMUSG00000064510 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029572 // RefSeq // Mus musculus microRNA 186 (Mir186), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083497 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:157544279:157544349:1 gene:ENSMUSG00000065431 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-186 // miRBase Micro RNA Database // MI0000228 Mus musculus miR-186 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011196 // RefSeq // Mus musculus prostaglandin E receptor 3 (subtype EP3) (Ptger3), mRNA. // chr3 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501138 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prostaglandin E receptor 3 (subtype EP3) (Ptger3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000041175 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:157566892:157644758:1 gene:ENSMUSG00000040016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:157566900:157644756:1 gene:ENSMUSG00000040016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC058742 // GenBank // Mus musculus prostaglandin E receptor 3 (subtype EP3), mRNA (cDNA clone MGC:68155 IMAGE:6309451), complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// D10204 // GenBank // Mus musculus mRNA for prostaglandin E receptor, EP3 subtype, complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// D13321 // GenBank // Mus musculus mRNA for prostaglandin E receptor EP3 subtype, complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// D17406 // GenBank // Mus musculus mRNA for prostaglandin E receptor EP3 subtype, complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// XM_006501140 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prostaglandin E receptor 3 (subtype EP3) (Ptger3), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
XR_376285 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1810013D15 gene (1810013D15Rik), transcript variant X1, ncRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:157925271:157926879:1 gene:ENSMUSG00000028177 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000148898 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:157925269:157927147:1 gene:ENSMUSG00000028177 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK007475 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810013D15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONMMUT045916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT045917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AK157542 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830222A02 product:hypothetical Ankyrin containing protein, full insert sequence. // chr3 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC065088 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 13c, mRNA (cDNA clone IMAGE:6850672), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001013806 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 13c (Ankrd13c), mRNA. // chr3 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// ENSMUST00000040787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:157947466:158006833:1 gene:ENSMUSG00000039988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// ENSMUST00000164582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:157947414:158005910:1 gene:ENSMUSG00000039988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// BC138991 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 13c, mRNA (cDNA clone MGC:170618 IMAGE:8862013), complete cds. // chr3 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// BC138992 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 13c, mRNA (cDNA clone MGC:170619 IMAGE:8862014), complete cds. // chr3 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// XM_006501652 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 13c (Ankrd13c), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000020911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:157947527:158005870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_001289524 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 40 (Lrrc40), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_024194 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 40 (Lrrc40), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000072080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:158036662:158068478:1 gene:ENSMUSG00000063052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000131518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:158036729:158051837:1 gene:ENSMUSG00000063052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000150525 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:158036702:158067089:1 gene:ENSMUSG00000063052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC002279 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 40, mRNA (cDNA clone MGC:7689 IMAGE:3497400), complete cds. // chr3 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// NM_001289525 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 40 (Lrrc40), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// ENSMUST00000156597 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:158036700:158067089:1 gene:ENSMUSG00000063052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000000415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:158052764:158066218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000020924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:158036472:158048538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
NM_001172092 // RefSeq // Mus musculus DEP domain containing 1a (Depdc1a), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NM_001172093 // RefSeq // Mus musculus DEP domain containing 1a (Depdc1a), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// NM_029523 // RefSeq // Mus musculus DEP domain containing 1a (Depdc1a), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006502257 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEP domain containing 1a (Depdc1a), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 67 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000029825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:159495451:159529576:1 gene:ENSMUSG00000028175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000106041 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:159495458:159529459:1 gene:ENSMUSG00000028175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 89 // 39 // 40 // 0 /// ENSMUST00000120272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:159495433:159529955:1 gene:ENSMUSG00000028175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC005799 // GenBank // Mus musculus DEP domain containing 1a, mRNA (cDNA clone IMAGE:3707876), complete cds. // chr3 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// BC023934 // GenBank // Mus musculus DEP domain containing 1a, mRNA (cDNA clone MGC:36607 IMAGE:5342167), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000014880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:57878854:57881316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000008455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:159363664:159623150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 51 // 51 // 23 // 45 // 1
NM_029987 // RefSeq // Mus musculus retinal pigment epithelium 65 (Rpe65), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006501166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus retinal pigment epithelium 65 (Rpe65), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:159599233:159624799:1 gene:ENSMUSG00000028174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF410461 // GenBank // Mus musculus RPE65 (Rpe65) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC130028 // GenBank // Mus musculus retinal pigment epithelium 65, mRNA (cDNA clone MGC:161199 IMAGE:40140883), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:159363664:159623150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_026582 // RefSeq // Mus musculus wntless homolog (Drosophila) (Wls), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NR_037590 // RefSeq // Mus musculus wntless homolog (Drosophila) (Wls), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501964 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus wntless homolog (Drosophila) (Wls), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:159839737:159935833:1 gene:ENSMUSG00000028173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK044810 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130003K07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC018381 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 177, mRNA (cDNA clone MGC:25946 IMAGE:4237619), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC075615 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 177, mRNA (cDNA clone MGC:92992 IMAGE:5703610), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK031444 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030432I20 product:Putative NFkB activating protein homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// AK159977 // GenBank HTC // Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I420041M04 product:Putative NFkB activating protein homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// GENSCAN00000008459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:159895082:159931637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000158662 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:4567203:4567335:-1 gene:ENSMUSG00000089287 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT041983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000029803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:4890062:4890754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_027048 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700008P02 gene (1700008P02Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000091364 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:6615418:6620443:-1 gene:ENSMUSG00000069118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000122220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:142570508:142570946:1 gene:ENSMUSG00000081125 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:142538480:142570984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:7046130:7193123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_008371 // RefSeq // Mus musculus interleukin 7 (Il7), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530054 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 7 (Il7), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000168269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:7572077:7613427:-1 gene:ENSMUSG00000040329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK041403 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630007F02 product:interleukin 7, full insert sequence. // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC110553 // GenBank // Mus musculus interleukin 7, mRNA (cDNA clone MGC:129342 IMAGE:40047584), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AK052452 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430026C11 product:interleukin 7, full insert sequence. // chr3 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// AK042009 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630052B02 product:interleukin 7, full insert sequence. // chr3 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// AK139858 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020029M05 product:interleukin 7, full insert sequence. // chr3 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000009633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:7572355:7694579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
XR_106108 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 5330432E05 gene (5330432E05Rik), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK030563 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330432E05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NR_033512 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6194 (Gm6194), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NM_145538 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 189 (Tmem189), mRNA. // chr3 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// ENSMUST00000006587 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:167642608:167661556:-1 gene:ENSMUSG00000090213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// ENSMUST00000148262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:167643228:167689822:-1 gene:ENSMUSG00000090213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// AK080983 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B830013O03 product:SIMILAR TO UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME E2 VARIANT 1 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// BC002270 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 189, mRNA (cDNA clone MGC:7660 IMAGE:3496088), complete cds. // chr3 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// GENSCAN00000007689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:8462225:8463036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT041298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr3 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0
ENSMUST00000182857 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:8615275:8616504:-1 gene:ENSMUSG00000098047 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:8564582:8616504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1
NM_010423 // RefSeq // Mus musculus hairy/enhancer-of-split related with YRPW motif 1 (Hey1), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:8663362:8667039:-1 gene:ENSMUSG00000040289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF151521 // GenBank // Mus musculus hairy and enhancer of split related-1 (Hesr-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF172286 // GenBank // Mus musculus hairy-related transcription factor 1 (Hrt1) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// AF176423 // GenBank // Mus musculus cardiovascular helix-loop-helix factor 2 mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// AF232241 // GenBank // Mus musculus HES-related repressor protein 2 HERP2 mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// BC086635 // GenBank // Mus musculus hairy/enhancer-of-split related with YRPW motif 1, mRNA (cDNA clone MGC:105186 IMAGE:6809680), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:8664496:8667874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_025434 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S28 (Mrps28), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000042148 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:8802146:8923918:-1 gene:ENSMUSG00000040269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC028530 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S28, mRNA (cDNA clone MGC:41385 IMAGE:1381263), complete cds. // chr3 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:8882235:8923796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_133218 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 704 (Zfp704), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000041124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:9427011:9610085:-1 gene:ENSMUSG00000040209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AF292939 // GenBank // Mus musculus glucocorticoid-induced gene 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 90 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:9438787:9504165:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// BC083106 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5316638, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr3 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0
GENSCAN00000014828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:9968194:9984563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 1
NM_001030305 // RefSeq // Mus musculus peripheral myelin protein 2 (Pmp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:10179851:10183885:-1 gene:ENSMUSG00000052468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC099520 // GenBank // Mus musculus peripheral myelin protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:117795 IMAGE:30848207), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK030155 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933402K11 product:MYELIN P2 PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:10122484:10197164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_011598 // RefSeq // Mus musculus fatty acid binding protein 9, testis (Fabp9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:10193626:10197222:-1 gene:ENSMUSG00000027528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048437 // GenBank // Mus musculus fatty acid binding protein 9, testis, mRNA (cDNA clone MGC:58128 IMAGE:6773242), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:10122484:10197164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// AK030155 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933402K11 product:MYELIN P2 PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
BC002148 // GenBank // Mus musculus fatty acid binding protein 4, adipocyte, mRNA (cDNA clone MGC:7265 IMAGE:3484864), complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// BC018558 // GenBank HTC // Mus musculus mRNA similar to fatty acid binding protein 4, adipocyte (cDNA clone IMAGE:3670866). // chr3 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// CT010390 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F0253D for gene Fabp4, Fatty acid binding protein 4, adipocyte; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// K02109 // GenBank // Mouse 3T3-L1 lipid binding protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// NM_024406 // RefSeq // Mus musculus fatty acid binding protein 4, adipocyte (Fabp4), mRNA. // chr3 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1 /// ENSMUST00000029041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:10204347:10208576:-1 gene:ENSMUSG00000062515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1 /// BC054426 // GenBank // Mus musculus fatty acid binding protein 4, adipocyte, mRNA (cDNA clone MGC:62546 IMAGE:5029359), complete cds. // chr3 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1 /// XM_006530048 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fatty acid binding protein 4, adipocyte (Fabp4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1 /// GENSCAN00000014827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:10205187:10212356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0
NM_029310 // RefSeq // Mus musculus fatty acid binding protein 12 (Fabp12), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530096 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fatty acid binding protein 12 (Fabp12), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530097 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fatty acid binding protein 12 (Fabp12), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// XM_006530099 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fatty acid binding protein 12 (Fabp12), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000029043 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:10244209:10301183:-1 gene:ENSMUSG00000027530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117917 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:10245918:10254252:-1 gene:ENSMUSG00000027530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000172126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:10245919:10254225:-1 gene:ENSMUSG00000027530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC030910 // GenBank // Mus musculus fatty acid binding protein 12, mRNA (cDNA clone MGC:31586 IMAGE:4505673), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// EU733649 // GenBank // Mus musculus intracellular fatty acid-binding protein FABP12 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000119761 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:10245951:10301174:-1 gene:ENSMUSG00000027530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// GENSCAN00000014836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:10246002:10252309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000118410 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:10313954:10331439:-1 gene:ENSMUSG00000027531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF042730 // GenBank // Mus musculus lithium-sensitive myo-inositol monophosphatase A1 (IMPA1) mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// BC049080 // GenBank // Mus musculus inositol (myo)-1(or 4)-monophosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:61322 IMAGE:6419835), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_018864 // RefSeq // Mus musculus inositol (myo)-1(or 4)-monophosphatase 1 (Impa1), mRNA. // chr3 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// XM_006530077 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inositol (myo)-1(or 4)-monophosphatase 1 (Impa1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// ENSMUST00000065938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:10313540:10331439:-1 gene:ENSMUSG00000027531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// BC055722 // GenBank // Mus musculus inositol (myo)-1(or 4)-monophosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:66859 IMAGE:6413389), complete cds. // chr3 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// XM_006530079 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inositol (myo)-1(or 4)-monophosphatase 1 (Impa1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000014826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:10267195:10331430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001010834 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 5 (Slc10a5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000078748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:10331734:10335656:-1 gene:ENSMUSG00000058921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY825925 // GenBank // Mus musculus SLC10A5 (Slc10a5) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC141377 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:176339 IMAGE:9055990), complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000014837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:10334294:10351296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001127191 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 16 (Snx16), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_029068 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 16 (Snx16), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:10417819:10440124:-1 gene:ENSMUSG00000027534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000099223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:10417819:10440124:-1 gene:ENSMUSG00000027534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC019424 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 16, mRNA (cDNA clone MGC:30420 IMAGE:5052234), complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:10419127:10530530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
GENSCAN00000030218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:11008846:11015163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NR_040751 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10745 (Gm10745), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004925 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT042124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006530088 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1810022K09 gene (1810022K09Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000108365 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:14606289:14611221:-1 gene:ENSMUSG00000078784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC115807 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810022K09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144786 IMAGE:40106016), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001083957 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 1 (Car1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NM_009799 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 1 (Car1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000094365 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:14766217:14778459:-1 gene:ENSMUSG00000027556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000181860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:14766216:14808365:-1 gene:ENSMUSG00000027556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC011223 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 1, mRNA (cDNA clone MGC:18584 IMAGE:4208180), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC110681 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 1, mRNA (cDNA clone MGC:118082 IMAGE:4984216), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC132432 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 1, mRNA (cDNA clone MGC:164063 IMAGE:40130709), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// BC132434 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 1, mRNA (cDNA clone MGC:164065 IMAGE:40130711), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// M32452 // GenBank // Mouse carbonic anhydrase I (CAI) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0
ENSMUST00000181423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:14802356:14802574:-1 gene:ENSMUSG00000097790 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000003828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:14767362:14802583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// NONMMUT042153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
NM_001076679 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9733 (Gm9733), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:15296551:15332302:-1 gene:ENSMUSG00000078783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ055452 // GenBank // Mus musculus SIRP beta 1 like 2 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:15233834:15426405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
XM_006535486 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5150 (Gm5150), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000108347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:15948070:16006332:-1 gene:ENSMUSG00000078780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// DQ055451 // GenBank // Mus musculus SIRP beta 1 like 1 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000022237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:15948073:16006322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000177874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:17230637:17230976:-1 gene:ENSMUSG00000095827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC172000 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:198705 IMAGE:9054286, complete cds. // chr3 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// KnowTID_00004927 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT042180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:17212974:17230976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSMUST00000099198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:17783514:17786898:-1 gene:ENSMUSG00000074674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141414 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530009H23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007825 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 7, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp7b1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000035625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:18071950:18243338:-1 gene:ENSMUSG00000039519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC038810 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 7, subfamily b, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:46910 IMAGE:5098739), complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// U36993 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 Cyp7b1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:18072457:18137428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_028840 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 1 (Armc1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006543732 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus armadillo repeat containing 1 (Armc1), mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:19132146:19163065:-1 gene:ENSMUSG00000027599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK034483 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330198P08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// BC021451 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:29418 IMAGE:5043872), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC051067 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:58968 IMAGE:5250606), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:19058164:19157654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_205769 // RefSeq // Mus musculus corticotropin releasing hormone (Crh), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:19693401:19695396:-1 gene:ENSMUSG00000049796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116921 // GenBank // Mus musculus corticotropin releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:151298 IMAGE:40126240), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC119036 // GenBank // Mus musculus corticotropin releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:155352 IMAGE:8733785), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000036201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:19693913:19694476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0
NM_013755 // RefSeq // Mus musculus glycogenin (Gyg), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000118015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:20122084:20155317:-1 gene:ENSMUSG00000019528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000178328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:20122087:20155096:-1 gene:ENSMUSG00000019528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000184552 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:20122147:20155069:-1 gene:ENSMUSG00000019528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF114031 // GenBank // Mus musculus glycogenin-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// BC029903 // GenBank // Mus musculus glycogenin, mRNA (cDNA clone MGC:35999 IMAGE:4487769), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:20122691:20125902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000043226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:20137564:20173232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_007753 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase A3, mast cell (Cpa3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000001921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:20215617:20242181:-1 gene:ENSMUSG00000001865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// J05118 // GenBank // Mouse mast cell carboxypeptidase A mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000043239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:20182889:20242171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_029706 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase B1 (tissue) (Cpb1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000011607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:20248264:20275733:-1 gene:ENSMUSG00000011463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC138759 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase B1 (tissue), mRNA (cDNA clone MGC:170386 IMAGE:8861781), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC138762 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase B1 (tissue), mRNA (cDNA clone MGC:170389 IMAGE:8861784), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:20249651:20275650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
NM_175086 // RefSeq // Mus musculus angiotensin II receptor, type 1b (Agtr1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:20314473:20367177:-1 gene:ENSMUSG00000054988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:20314897:20367124:-1 gene:ENSMUSG00000054988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC109153 // GenBank // Mus musculus angiotensin II receptor, type 1b, mRNA (cDNA clone MGC:129325 IMAGE:40046982), complete cds. // chr3 // 79 // 76 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000043237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:20315361:20403512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
XM_006543762 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642487 (LOC102642487), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK021294 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530019O13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:22060699:22081977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// KnowTID_00004937 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT042251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006543734 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006543735 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006543736 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006543738 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006543734 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006543735 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006543736 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006543738 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK012899 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810043G22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// NONMMUT042263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:23869637:24180771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000029044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:23801213:23846674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_006543734 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006543735 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006543736 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006543738 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:23869637:24180771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:24334560:24495074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_006543734 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001163387 // RefSeq // Mus musculus neuroligin 1 (Nlgn1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 96 // 62 // 22 // 23 // 0 /// NM_138666 // RefSeq // Mus musculus neuroligin 1 (Nlgn1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006535417 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuroligin 1 (Nlgn1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006535419 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuroligin 1 (Nlgn1), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000075054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:25431811:26133734:-1 gene:ENSMUSG00000063887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:25431811:26133734:-1 gene:ENSMUSG00000063887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 54 // 19 // 20 // 0 /// AK122433 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1070 protein. // chr3 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// BC005523 // GenBank // Mus musculus neuroligin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3494913), complete cds. // chr3 // 89 // 24 // 8 // 9 // 0 /// BC098461 // GenBank // Mus musculus neuroligin 1, mRNA (cDNA clone MGC:107366 IMAGE:30099449), complete cds. // chr3 // 95 // 54 // 19 // 20 // 0 /// AK083116 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630015D03 product:SIMILAR TO NEUROLIGIN 1 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1 /// GENSCAN00000029379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:25298471:25456647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 27 // 9 // 10 // 0
NM_173182 // RefSeq // Mus musculus fibronectin type III domain containing 3B (Fndc3b), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000046157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:27416162:27710439:-1 gene:ENSMUSG00000039286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AB098596 // GenBank // Mus musculus fad104 mRNA for FAD104, complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// AY234860 // GenBank // Mus musculus HCV NS5A-binding protein 37 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC067389 // GenBank // Mus musculus fibronectin type III domain containing 3B, mRNA (cDNA clone MGC:76422 IMAGE:30431862), complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// DQ192037 // GenBank // Mus musculus fibronectin domain-containing protein 3b (Fndc3b) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK045099 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130032G09 product:hypothetical Glycine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr3 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000046254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:27419291:27500036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
AK157051 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830115K12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001164437 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 212 (Tmem212), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006535431 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 212 (Tmem212), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000058077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:27866066:27896368:-1 gene:ENSMUSG00000043164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119391 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E030011K20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155707 IMAGE:8734140), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119393 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E030011K20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155709 IMAGE:8734142), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_025904 // RefSeq // Mus musculus Yae1 domain containing 1 (Yae1d1), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000094335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:28764234:28765364:-1 gene:ENSMUSG00000070522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000099735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:17986640:17993351:-1 gene:ENSMUSG00000075054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC048453 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1600012F09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58173 IMAGE:6595060), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC083111 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1600012F09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:102410 IMAGE:5329860), complete cds. // chr3 // 66 // 100 // 19 // 29 // 0 /// AK030455 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330414I06 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000012207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:17989380:17993306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:28764710:28765360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT016509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_021442 // RefSeq // Mus musculus MDS1 and EVI1 complex locus (Mecom), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000173022 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:30236569:30509487:-1 gene:ENSMUSG00000027684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000173411 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:30014974:30509733:-1 gene:ENSMUSG00000027684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// AK036948 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930029D17 product:myelodysplasia syndrome 1 homolog (human), full insert sequence. // chr3 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// XM_006535387 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MDS1 and EVI1 complex locus (Mecom), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// ENSMUST00000172697 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:29965456:30509822:-1 gene:ENSMUSG00000027684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// ENSMUST00000173899 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:29963074:30509514:-1 gene:ENSMUSG00000027684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONMMUT042387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
XR_400716 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10258 (Gm10258), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000091270 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:30267825:30269947:-1 gene:ENSMUSG00000069074 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY512924 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:H4072H12 unknown mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083427 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:30595346:30595757:-1 gene:ENSMUSG00000065361 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK005488 // GenBank HTC // Mus musculus adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1600017P15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// NONMMUT042399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// NONMMUT042400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_029690 // RefSeq // Mus musculus actin related protein T3 (Actrt3), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047630 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:30597073:30599939:-1 gene:ENSMUSG00000037737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC107277 // GenBank // Mus musculus actin related protein M1, mRNA (cDNA clone MGC:130225 IMAGE:40052700), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC107278 // GenBank // Mus musculus actin related protein M1, mRNA (cDNA clone MGC:130226 IMAGE:40052701), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:30597834:30599945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_027941 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 34 (Lrrc34), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000029252 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:30624267:30647869:-1 gene:ENSMUSG00000027702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC100519 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 34, mRNA (cDNA clone MGC:118377 IMAGE:30919449), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC116420 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 34, mRNA (cDNA clone MGC:144586 IMAGE:40103399), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// JF934738 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c spermatogenesis associated SPATA34 (SPATA34) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000011042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:30624699:30645304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0
XR_389644 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 31 (Lrrc31), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000126658 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:30679058:30691300:-1 gene:ENSMUSG00000074653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000108263 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:30682680:30699843:-1 gene:ENSMUSG00000074653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// AK136409 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030008F08 product:hypothetical Leucine-rich repeat/Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype containing protein, full insert sequence. // chr3 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:30679040:30697232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000180833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:30793138:30793560:-1 gene:ENSMUSG00000097786 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK016981 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933429H19 product:hypothetical TonB-dependent receptor protein containing protein, full insert sequence. // chr3 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// ENSMUST00000187361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:30792577:30793564:-1 gene:ENSMUSG00000097786 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001165954 // RefSeq // Mus musculus polyhomeotic-like 3 (Drosophila) (Phc3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001165955 // RefSeq // Mus musculus polyhomeotic-like 3 (Drosophila) (Phc3), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001165956 // RefSeq // Mus musculus polyhomeotic-like 3 (Drosophila) (Phc3), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_153421 // RefSeq // Mus musculus polyhomeotic-like 3 (Drosophila) (Phc3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:30899295:30969415:-1 gene:ENSMUSG00000037652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:30899371:30969401:-1 gene:ENSMUSG00000037652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172861 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 14 (Slc7a14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006535472 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 14 (Slc7a14), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000091259 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:31202910:31310378:-1 gene:ENSMUSG00000069072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK163358 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020023E05 product:hypothetical Amino acid permease-associated region/Amino acid/polyamine transporter I containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// BC061928 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 14, mRNA (cDNA clone MGC:67673 IMAGE:5359765), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000108245 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:31222720:31258394:-1 gene:ENSMUSG00000069072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// GENSCAN00000012749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:31199229:31257869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
NM_009517 // RefSeq // Mus musculus zinc finger matrin type 3 (Zmat3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:32334798:32365678:-1 gene:ENSMUSG00000027663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000168566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:32334796:32365620:-1 gene:ENSMUSG00000027663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF012923 // GenBank // Mus musculus p53-inducible zinc finger protein (Wig-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// BC138740 // GenBank // Mus musculus zinc finger matrin type 3, mRNA (cDNA clone MGC:170367 IMAGE:8861762), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC138742 // GenBank // Mus musculus zinc finger matrin type 3, mRNA (cDNA clone MGC:170369 IMAGE:8861764), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:32341484:32361159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001195074 // RefSeq // Mus musculus potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3 (Kcnmb3), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000164954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:32472321:32491969:-1 gene:ENSMUSG00000091091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_029017 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L47 (Mrpl47), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XR_406586 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642663 (LOC102642663), ncRNA. // chr3 // 90 // 42 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000043966 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:32725397:32737147:-1 gene:ENSMUSG00000037531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000153564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:32727575:32732613:-1 gene:ENSMUSG00000037531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0 /// BC029173 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L47, mRNA (cDNA clone IMAGE:4954230), partial cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC087953 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L47, mRNA (cDNA clone MGC:107600 IMAGE:30119240), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT042456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0 /// AK009257 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310009O10 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr3 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// GENSCAN00000008229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:32730014:32737383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
AK014764 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833424P18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:32730014:32737383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000060997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:34005017:34005463:-1 gene:ENSMUSG00000044434 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NM_025821 // RefSeq // Mus musculus calcium regulated heat stable protein 1 (Carhsp1), mRNA. // chr3 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// XM_006522347 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium regulated heat stable protein 1 (Carhsp1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// ENSMUST00000008537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:8658587:8672153:-1 gene:ENSMUSG00000008393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// AF414101 // GenBank // Mus musculus calcineurin substrate CRHSP-24 mRNA, complete cds. // chr3 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// AK003926 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110025O06 product:CALCIUM-REGULATED HEAT STABLE PROTEIN CRHSP-24 homolog [Rattus sp], full insert sequence. // chr3 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// BC011225 // GenBank // Mus musculus calcium regulated heat stable protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:19027 IMAGE:4166353), complete cds. // chr3 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// BC086754 // GenBank // Mus musculus calcium regulated heat stable protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:101919 IMAGE:6812962), complete cds. // chr3 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000034441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:34005017:34005619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000041361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:8660941:8783806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
NM_001286972 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19 (Dnajc19), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 93 // 74 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000117223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:34077434:34081262:-1 gene:ENSMUSG00000027679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0 /// BC024335 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19, mRNA (cDNA clone MGC:35659 IMAGE:4974988), complete cds. // chr3 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0 /// NM_001026211 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19 (Dnajc19), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1 /// NM_026332 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19 (Dnajc19), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1 /// ENSMUST00000011029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:34056020:34081312:-1 gene:ENSMUSG00000027679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// ENSMUST00000108195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:34077285:34081321:-1 gene:ENSMUSG00000027679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1 /// AK076602 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921531D08 product:weakly similar to CG7394 PROTEIN [Drosophila melanogaster], full insert sequence. // chr3 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// NM_001286973 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19 (Dnajc19), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NR_040748 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6639 (Gm6639), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004956 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT042573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:35576620:35699951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001205361 // RefSeq // Mus musculus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 1 (S. cerevisiae) (Dcun1d1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// NM_001205362 // RefSeq // Mus musculus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 1 (S. cerevisiae) (Dcun1d1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// NM_033623 // RefSeq // Mus musculus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 1 (S. cerevisiae) (Dcun1d1), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000108182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:35892978:35932966:-1 gene:ENSMUSG00000027708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000121632 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:3:35893506:35930074:-1 gene:ENSMUSG00000027708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000178098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:35892105:35932334:-1 gene:ENSMUSG00000027708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// AF198092 // GenBank // Mus musculus RP42 mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 58 // 10 // 11 // 0 /// AK139845 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020029C19 product:RP42 (Testis derived transcript 3) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// BC037431 // GenBank // Mus musculus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:47081 IMAGE:2648141), complete cds. // chr3 // 82 // 58 // 9 // 11 // 0
NM_023644 // RefSeq // Mus musculus methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1 (alpha) (Mccc1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000029259 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:35959839:36000678:-1 gene:ENSMUSG00000027709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000131161 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:35975796:35989932:-1 gene:ENSMUSG00000027709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000140010 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:35984986:36000641:-1 gene:ENSMUSG00000027709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000144266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:35959312:36000609:-1 gene:ENSMUSG00000027709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000148922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:35973890:35995879:-1 gene:ENSMUSG00000027709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// AF310338 // GenBank // Mus musculus 3-methylcrotonyl-CoA carboxylase alpha subunit (Mcca) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AK160184 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310058B18 product:methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1 (alpha), full insert sequence. // chr3 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// BC021382 // GenBank // Mus musculus methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1 (alpha), mRNA (cDNA clone MGC:29417 IMAGE:5042993), complete cds. // chr3 // 92 // 97 // 35 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:35960013:36050749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 79 // 31 // 39 // 1
NM_178418 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 144B (Ccdc144b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000062056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:36007247:36053547:-1 gene:ENSMUSG00000047696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000166644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:36010660:36053532:-1 gene:ENSMUSG00000047696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC050811 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 144B, mRNA (cDNA clone MGC:58791 IMAGE:6772771), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000133450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:36015245:36053532:-1 gene:ENSMUSG00000047696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// AK133178 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931421J02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000009334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:35960013:36050749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_198192 // RefSeq // Mus musculus pyroglutamylated RFamide peptide receptor (Qrfpr), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000091227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:36179424:36222275:-1 gene:ENSMUSG00000058400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000122174 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:36179424:36222275:-1 gene:ENSMUSG00000058400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// AB109631 // GenBank // Mus musculus AQ27 mRNA for QRFP receptor, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC096610 // GenBank // Mus musculus pyroglutamylated RFamide peptide receptor, mRNA (cDNA clone MGC:106068 IMAGE:5357699), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000142552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:36187805:36222180:-1 gene:ENSMUSG00000058400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// AK043649 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830015G12 product:QRFP receptor homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000009369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:36179889:36189734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
NM_009673 // RefSeq // Mus musculus annexin A5 (Anxa5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029266 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:36448925:36475843:-1 gene:ENSMUSG00000027712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003716 // GenBank // Mus musculus annexin A5, mRNA (cDNA clone MGC:5730 IMAGE:3488901), complete cds. // chr3 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// D63423 // GenBank // Mus musculus mRNA for annexin V, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U29396 // GenBank // Mus musculus annexin V (Anx5) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:36423977:36465556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_009828 // RefSeq // Mus musculus cyclin A2 (Ccna2), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000029270 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:36564866:36572150:-1 gene:ENSMUSG00000027715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000147380 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:36565978:36571927:-1 gene:ENSMUSG00000027715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC052730 // GenBank // Mus musculus cyclin A2, mRNA (cDNA clone MGC:64686 IMAGE:6816226), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000145309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:36570451:36571964:-1 gene:ENSMUSG00000027715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000009339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:36566537:36613285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1
NM_027810 // RefSeq // Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 7 (human) (Bbs7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006535536 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 7 (human) (Bbs7), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000040148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:36573142:36613389:-1 gene:ENSMUSG00000037325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000108155 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:36574871:36613285:-1 gene:ENSMUSG00000037325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000108156 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:36573142:36613477:-1 gene:ENSMUSG00000037325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF521645 // GenBank // Mus musculus BBS7 (Bbs7) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC031505 // GenBank // Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 7 (human), mRNA (cDNA clone MGC:27874 IMAGE:3494587), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSMUST00000129671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:36609337:36613389:-1 gene:ENSMUSG00000037325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// AK018389 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430406N16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000009339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:36566537:36613285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT042621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_019510 // RefSeq // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 3 (Trpc3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000029271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:36620482:36690167:-1 gene:ENSMUSG00000027716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AF190645 // GenBank // Mus musculus receptor-activated cation channel TRP3 (trp3) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 88 // 35 // 36 // 0 /// AK163714 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930046B21 product:transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 3, full insert sequence. // chr3 // 100 // 22 // 9 // 9 // 0 /// BC108989 // GenBank // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:124333 IMAGE:40047766), complete cds. // chr3 // 79 // 80 // 26 // 33 // 0 /// FJ207475 // GenBank // Mus musculus strain CBA transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 (Trpc3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 78 // 78 // 25 // 32 // 0 /// FJ207476 // GenBank // Mus musculus strain CBA transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 splice variant c (Trpc3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 76 // 71 // 22 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:36621255:36677522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0
NM_008366 // RefSeq // Mus musculus interleukin 2 (Il2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:37120523:37125959:-1 gene:ENSMUSG00000027720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF065914 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J interleukin-2 precursor (Il2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF065915 // GenBank // Mus musculus strain A/J interleukin-2 precursor (Il2) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AF065916 // GenBank // Mus musculus strain NOD/LtJ interleukin-2 precursor (Il2) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AY147902 // GenBank // Mus musculus strain C3HeB/FeJ interleukin 2 (Il2) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC116845 // GenBank // Mus musculus interleukin 2, mRNA (cDNA clone MGC:151222 IMAGE:40126164), complete cds. // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC116873 // GenBank // Mus musculus interleukin 2, mRNA (cDNA clone MGC:151250 IMAGE:40126192), complete cds. // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// K02292 // GenBank // Mouse interleukin-2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// U41505 // GenBank // Mus musculus interleukin-2 (IL-2) mRNA, strain-specific CZECHII/Ei allele, partial cds. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:37121104:37125906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_001291041 // RefSeq // Mus musculus interleukin 21 (Il21), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_021782 // RefSeq // Mus musculus interleukin 21 (Il21), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:37222759:37232618:-1 gene:ENSMUSG00000027718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161015 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:37225337:37232565:-1 gene:ENSMUSG00000027718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AF254070 // GenBank // Mus musculus interleukin 21 (Il21) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY428162 // GenBank // Mus musculus interleukin 21 (Il21) mRNA, complete cds. // chr3 // 79 // 56 // 11 // 14 // 0 /// DQ645418 // GenBank // Mus musculus interleukin-21 isoform mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC125414 // GenBank // Mus musculus interleukin 21, mRNA (cDNA clone MGC:159117 IMAGE:40129929), complete cds. // chr3 // 74 // 76 // 14 // 19 // 0 /// BC125416 // GenBank // Mus musculus interleukin 21, mRNA (cDNA clone MGC:159119 IMAGE:40129931), complete cds. // chr3 // 74 // 76 // 14 // 19 // 0
NM_145825 // RefSeq // Mus musculus centrin 4 (Cetn4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000071400 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:37307749:37312446:-1 gene:ENSMUSG00000045031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000075537 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:37308760:37312420:-1 gene:ENSMUSG00000045031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000102955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:37308622:37312446:-1 gene:ENSMUSG00000045031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000140956 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:37308622:37312446:-1 gene:ENSMUSG00000045031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AF362367 // GenBank // Mus musculus centrin 4 mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// BC060991 // GenBank // Mus musculus centrin 4, mRNA (cDNA clone MGC:74087 IMAGE:6742836), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// AK090064 // GenBank HTC // Mus musculus bladder RCB-0544 MBT-2 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430087M20 product:weakly similar to CENTRIN (FRAGMENT) [Micromonas pusilla], full insert sequence. // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
XR_389695 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibroblast growth factor 2, opposite strand (Fgf2os), transcript variant X3, misc_RNA. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000153785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:37335332:37349740:-1 gene:ENSMUSG00000054779 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK044415 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930011G24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_400770 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibroblast growth factor 2, opposite strand (Fgf2os), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// XR_400771 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibroblast growth factor 2, opposite strand (Fgf2os), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT042653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198657 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5148 (Gm5148), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000079755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:3:37714190:37724410:-1 gene:ENSMUSG00000058174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000099128 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:37714326:37724490:-1 gene:ENSMUSG00000058174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000108105 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:37714198:37724329:-1 gene:ENSMUSG00000058174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// AK039231 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330001L23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// AK045832 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230313H22 product:ribosomal protein S23, full insert sequence. // chr3 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000094300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:38452079:38455557:-1 gene:ENSMUSG00000044864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156038 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:38449651:38483091:-1 gene:ENSMUSG00000044864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// AK220375 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1223 protein. // chr3 // 90 // 64 // 26 // 29 // 0 /// BC145902 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 50, mRNA (cDNA clone MGC:175789 IMAGE:40131205), complete cds. // chr3 // 79 // 42 // 15 // 19 // 0 /// NM_001167883 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 50 (Ankrd50), mRNA. // chr3 // 84 // 84 // 38 // 45 // 1 /// ENSMUST00000120875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:38449261:38484844:-1 gene:ENSMUSG00000044864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 38 // 45 // 1 /// GENSCAN00000041904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:38449822:38483169:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT042696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000102430 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:38558109:38558214:-1 gene:ENSMUSG00000076385 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT042698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:38525493:38564794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
ENSMUST00000082891 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:39635964:39636082:-1 gene:ENSMUSG00000093952 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT042706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NR_040445 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700017G19 gene (1700017G19Rik), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000035860 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:40504867:40522912:-1 gene:ENSMUSG00000037884 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_028140 // RefSeq // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 8 (Mfsd8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_375454 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 8 (Mfsd8), transcript variant X3, misc_RNA. // chr3 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000026859 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:40818070:40846885:-1 gene:ENSMUSG00000025759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:40826933:40846694:-1 gene:ENSMUSG00000025759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC113183 // GenBank // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:132950 IMAGE:40061891), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC113790 // GenBank // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:132949 IMAGE:40061889), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:40819985:40855225:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NR_045380 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034I23 gene (1700034I23Rik), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_045392 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10731 (Gm10731), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:3:40900196:40902543:-1 gene:ENSMUSG00000074619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181171 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:40854676:40855123:-1 gene:ENSMUSG00000074620 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC117739 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034I23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143484 IMAGE:40090015), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:40819985:40855225:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:40873003:40902438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_045380 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034I23 gene (1700034I23Rik), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000099123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:3:40900196:40902543:-1 gene:ENSMUSG00000074619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_027558 // RefSeq // Mus musculus progesterone receptor membrane component 2 (Pgrmc2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:41066326:41083046:-1 gene:ENSMUSG00000049940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:41068627:41082994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
AY512943 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0437F02 unknown mRNA. // chr3 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONMMUT042772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001101479 // RefSeq // Mus musculus poly(A) binding protein, cytoplasmic 4-like (Pabpc4l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000166505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:46442197:46447941:-1 gene:ENSMUSG00000090919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:46446095:46447207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000016964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:47230603:47344747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
AK155972 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830002K18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// KnowTID_00005073 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT042921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NR_003617 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700018B24 gene (1700018B24Rik), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:48605732:48609101:-1 gene:ENSMUSG00000037910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061086 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700018B24 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6772715). // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:48608743:48687413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
GENSCAN00000041247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:49381331:49436646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_130448 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 18 (Pcdh18), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:49743296:49757316:-1 gene:ENSMUSG00000037892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF416735 // GenBank // Mus musculus protocadherin 18 precursor, mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// AK014140 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110038E07 product:protocadherin 18, full insert sequence. // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC052198 // GenBank // Mus musculus protocadherin 18, mRNA (cDNA clone MGC:59619 IMAGE:6512513), complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:49744607:49756843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_025523 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1, subcomplex unknown, 1 (Ndufc1), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000038108 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:51404677:51408988:-1 gene:ENSMUSG00000037152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000145572 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:51405480:51407477:-1 gene:ENSMUSG00000037152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AK028011 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1190008I04 product:NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1, subcomplex unknown, 1, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC092141 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1, subcomplex unknown, 1, mRNA (cDNA clone MGC:106656 IMAGE:6814605), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000135602 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:51405472:51408664:-1 gene:ENSMUSG00000037152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONMMUT042981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000015841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:51403066:51408930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONMMUT042980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_080793 // RefSeq // Mus musculus SET domain containing (lysine methyltransferase) 7 (Setd7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000037141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:51515319:51560878:-1 gene:ENSMUSG00000037111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF448509 // GenBank // Mus musculus histone H3-K4 methyltransferase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC050190 // GenBank // Mus musculus SET domain containing (lysine methyltransferase) 7, mRNA (cDNA clone MGC:60961 IMAGE:30007831), complete cds. // chr3 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:51521307:51627722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001004176 // RefSeq // Mus musculus mastermind like 3 (Drosophila) (Maml3), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000118075 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:51689437:51796535:-1 gene:ENSMUSG00000061143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000121440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:51687611:52104891:-1 gene:ENSMUSG00000061143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// AB553633 // GenBank // Mus musculus Mam-2 mRNA for mastermind-2, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// AK157983 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930013H05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// BC085318 // GenBank // Mus musculus mastermind like 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:102626 IMAGE:30435466), complete cds. // chr3 // 96 // 68 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:51689973:51701786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000001043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:51851331:51858527:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0
AK154541 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630045J19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026225 // RefSeq // Mus musculus component of oligomeric golgi complex 6 (Cog6), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000036665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:52982123:53017223:-1 gene:ENSMUSG00000027742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AK004100 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110034O16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 26 // 11 // 11 // 0 /// AK045223 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130048O22 product:weakly similar to LD06894P [Drosophila melanogaster], full insert sequence. // chr3 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AK048986 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230088D01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 92 // 62 // 24 // 26 // 0 /// BC025427 // GenBank // Mus musculus component of oligomeric golgi complex 6, mRNA (cDNA clone MGC:29276 IMAGE:2649589), complete cds. // chr3 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// BC071236 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4459881, partial cds. // chr3 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// GENSCAN00000053327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:52980157:53017198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0
NM_172862 // RefSeq // Mus musculus Fras1 related extracellular matrix protein 2 (Frem2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000091137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:53513939:53657355:-1 gene:ENSMUSG00000037016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB236662 // GenBank // Mus musculus Frem2 mRNA for Fras1 related extracellular matrix protein 2, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:53516532:53559662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_026435 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-fold modifier 1 (Ufm1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026435 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-fold modifier 1 (Ufm1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000146598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:53855212:53863830:-1 gene:ENSMUSG00000027746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000148338 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:53857822:53863689:-1 gene:ENSMUSG00000027746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 93 // 71 // 14 // 15 // 0 /// BC061065 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-fold modifier 1, mRNA (cDNA clone MGC:74177 IMAGE:6594260), complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000029309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:53857943:53863762:-1 gene:ENSMUSG00000027746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// ENSMUST00000122330 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:53858811:53863766:-1 gene:ENSMUSG00000027746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// ENSMUST00000152414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:53859616:53863762:-1 gene:ENSMUSG00000027746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// NONMMUT043080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0 /// NONMMUT043081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
ENSMUST00000178832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:54713176:54714353:-1 gene:ENSMUSG00000094487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY512944 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0524D04 unknown mRNA. // chr3 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_133231 // RefSeq // Mus musculus regulatory factor X-associated protein (Rfxap), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000044373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:54803115:54807791:-1 gene:ENSMUSG00000036615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000182246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:54804221:54805766:-1 gene:ENSMUSG00000036615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// AF335512 // GenBank // Mus musculus regulatory factor X-associated protein (Rfxap) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC019935 // GenBank // Mus musculus regulatory factor X-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:32426 IMAGE:5041039), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:54803776:54807594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT043104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0
NM_177854 // RefSeq // Mus musculus serine rich and transmembrane domain containing 1 (Sertm1), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:54897071:54915887:-1 gene:ENSMUSG00000056306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:54897068:54915031:-1 gene:ENSMUSG00000056306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC058995 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6030405A18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67500 IMAGE:5708109), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_007628 // RefSeq // Mus musculus cyclin A1 (Ccna1), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006500955 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin A1 (Ccna1), transcript variant X8, mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000029368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:55045469:55055055:-1 gene:ENSMUSG00000027793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC120518 // GenBank // Mus musculus cyclin A1, mRNA (cDNA clone MGC:155755 IMAGE:40129441), complete cds. // chr3 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// BC125436 // GenBank // Mus musculus cyclin A1, mRNA (cDNA clone MGC:159139 IMAGE:40129951), complete cds. // chr3 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// X84311 // GenBank // M.musculus mRNA for cyclin A1. // chr3 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:55045592:55113773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 74 // 21 // 23 // 0
XM_006502493 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC101056032 (LOC101056032), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AK029719 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930504G24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:55373745:55403019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT043114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_030595 // RefSeq // Mus musculus neurobeachin (Nbea), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 57 // 57 // 0 /// XM_006501525 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurobeachin (Nbea), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 100 // 58 // 33 // 33 // 0 /// XM_006501526 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurobeachin (Nbea), transcript variant X8, mRNA. // chr3 // 100 // 53 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000029374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:55625205:56183701:-1 gene:ENSMUSG00000027799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 57 // 57 // 0 /// AK043125 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730058H13 product:neurobeachin, full insert sequence. // chr3 // 100 // 32 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000051090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:55852265:56183235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:55597954:55665741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 18 // 18 // 10 // 57 // 1
AK156875 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830104G03 product:hypothetical Bipartite nuclear localization signal/Lysine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0
NM_008536 // RefSeq // Mus musculus transmembrane 4 superfamily member 1 (Tm4sf1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501080 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane 4 superfamily member 1 (Tm4sf1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000029376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:57287064:57301919:-1 gene:ENSMUSG00000027800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000171384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:57285611:57294889:-1 gene:ENSMUSG00000027800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AK134603 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330445I03 product:transmembrane 4 superfamily member 1, full insert sequence. // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC083073 // GenBank // Mus musculus transmembrane 4 superfamily member 1, mRNA (cDNA clone MGC:102554 IMAGE:6337376), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// L15429 // GenBank // Mus musculus L6 antigen mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// L15443 // GenBank // Mus musculus L6 antigen mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:57234442:57301673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001168281 // RefSeq // Mus musculus WW domain containing transcription regulator 1 (Wwtr1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_133784 // RefSeq // Mus musculus WW domain containing transcription regulator 1 (Wwtr1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000029380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:57455649:57575828:-1 gene:ENSMUSG00000027803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120977 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:57455782:57575910:-1 gene:ENSMUSG00000027803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC004640 // GenBank // Mus musculus WW domain containing transcription regulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:7084 IMAGE:3157246), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC014727 // GenBank // Mus musculus WW domain containing transcription regulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:25480 IMAGE:4487316), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:57458926:57477554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0
NM_175095 // RefSeq // Mus musculus COMM domain containing 2 (Commd2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000041954 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:57646359:57651708:-1 gene:ENSMUSG00000036513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000160959 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:57642904:57651693:-1 gene:ENSMUSG00000036513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC062098 // GenBank // Mus musculus COMM domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6844498), partial cds. // chr3 // 87 // 79 // 13 // 15 // 0 /// BC100390 // GenBank // Mus musculus COMM domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:117962 IMAGE:6439921), complete cds. // chr3 // 89 // 95 // 16 // 18 // 0 /// BC119316 // GenBank // Mus musculus COMM domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:155632 IMAGE:8734065), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC119318 // GenBank // Mus musculus COMM domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:155634 IMAGE:8734067), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006501690 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus COMM domain containing 2 (Commd2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// GENSCAN00000023750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:57625705:57651653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NM_001033349 // RefSeq // Mus musculus ankrin repeat and ubiquitin domain containing 1 (Ankub1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:3:57666485:57692537:-1 gene:ENSMUSG00000074591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501463 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 410 (Gm410), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:57657437:57692346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
GENSCAN00000038223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:57717927:57718289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 88 // 4 // 7 // 0
NM_019410 // RefSeq // Mus musculus profilin 2 (Pfn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066882 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:57841895:57847564:-1 gene:ENSMUSG00000027805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:57841905:57847145:-1 gene:ENSMUSG00000027805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK164145 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630004L04 product:profilin 2, full insert sequence. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC024363 // GenBank // Mus musculus profilin 2, mRNA (cDNA clone MGC:35930 IMAGE:5059568), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120289 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:57844670:57847489:-1 gene:ENSMUSG00000027805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000122210 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:57843108:57845878:-1 gene:ENSMUSG00000027805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:57842932:57848299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_008828 // RefSeq // Mus musculus phosphoglycerate kinase 1 (Pgk1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000081593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:106187100:106203699:1 gene:ENSMUSG00000062070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000085735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:10898566:10900296:-1 gene:ENSMUSG00000066632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000091117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:58102609:58104269:-1 gene:ENSMUSG00000069008 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000135949 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:106187163:106203661:1 gene:ENSMUSG00000062070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// BC083355 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:102158 IMAGE:6828087), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC108372 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:118097 IMAGE:5060103), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// M15668 // GenBank // Mus musculus X chromosome-linked phosphoglycerate kinase (pgk-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:106189201:106203672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:58074253:58104247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:10866835:10900241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0
NM_030685 // RefSeq // Mus musculus stress-associated endoplasmic reticulum protein 1 (Serp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:58521969:58525873:-1 gene:ENSMUSG00000027808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB041655 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-2442, similar to Rattus norvegicus SERP1 mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC002114 // GenBank // Mus musculus stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:6615 IMAGE:3489738), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081262 // RefSeq // Mus musculus glutamate rich 6 (Erich6), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000041115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:58616300:58637207:-1 gene:ENSMUSG00000070471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK133299 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932431H17 product:hypothetical Glutamic acid-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006501709 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 194, member A (Fam194a), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000038235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:58614675:58630750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_009174 // RefSeq // Mus musculus seven in absentia 2 (Siah2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000070368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:58674938:58692400:-1 gene:ENSMUSG00000036432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058400 // GenBank // Mus musculus seven in absentia 2, mRNA (cDNA clone MGC:67119 IMAGE:5701212), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:58665470:58714455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENSMUST00000157527 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:58978855:58979026:-1 gene:ENSMUSG00000088152 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173398 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 171 (Gpr171), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:59096448:59101821:-1 gene:ENSMUSG00000050075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC024054 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 171, mRNA (cDNA clone MGC:36313 IMAGE:5068166), complete cds. // chr3 // 82 // 76 // 18 // 22 // 0
NR_045641 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA F630111L10 gene (F630111L10Rik), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK170843 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630203P21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT043249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT043250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_032399 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 87 (Gpr87), mRNA. // chr3 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000056898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:59179006:59180085:-1 gene:ENSMUSG00000051431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// AF295366 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor GPR87 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// BC125653 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 87, mRNA (cDNA clone MGC:159356 IMAGE:40130168), complete cds. // chr3 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// BC125655 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 87, mRNA (cDNA clone MGC:159358 IMAGE:40130170), complete cds. // chr3 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:59179006:59180085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0
NM_028808 // RefSeq // Mus musculus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 13 (P2ry13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000040622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:59207896:59210882:-1 gene:ENSMUSG00000036362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119043 // GenBank // Mus musculus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 13, mRNA (cDNA clone MGC:155359 IMAGE:8733792), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_027571 // RefSeq // Mus musculus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 12 (P2ry12), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000050360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:59216271:59262831:-1 gene:ENSMUSG00000036353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000170388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:59216360:59220259:-1 gene:ENSMUSG00000036353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC027381 // GenBank // Mus musculus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 12, mRNA (cDNA clone MGC:36953 IMAGE:4947057), complete cds. // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000006354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:59217209:59224947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001162884 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 10 (Igsf10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501466 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 10 (Igsf10), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000039419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:59316735:59344256:-1 gene:ENSMUSG00000036334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:59318466:59388562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001162884 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 10 (Igsf10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501466 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 10 (Igsf10), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000039419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:59316735:59344256:-1 gene:ENSMUSG00000036334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000006390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:59318466:59388562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001162884 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 10 (Igsf10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501466 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 10 (Igsf10), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:59316735:59344256:-1 gene:ENSMUSG00000036334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK143421 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330033K05 product:Bone specific CMF608 homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr3 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000006390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:59318466:59388562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000006374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:59473604:59618835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 95 // 17 // 21 // 0
XM_888144 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5709 (Gm5709), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000177879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:59602453:59635733:-1 gene:ENSMUSG00000095128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000006374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:59473604:59618835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000030581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:61328843:61329166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000066298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:61362250:61365951:-1 gene:ENSMUSG00000053706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK046664 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430305J03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK033940 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330121J05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028136 // RefSeq // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36 (Dhx36), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:62470039:62507004:-1 gene:ENSMUSG00000027770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF448804 // GenBank // Mus musculus DEAD/H box polypeptide 36 protein (Ddx36) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC033407 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36, mRNA (cDNA clone IMAGE:5012726), partial cds. // chr3 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// BC138061 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36, mRNA (cDNA clone MGC:169685 IMAGE:8861080), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:62470562:62506905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_177346 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 149 (Gpr149), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006501322 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 149 (Gpr149), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000058535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:62529077:62605140:-1 gene:ENSMUSG00000043441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000149007 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:62594808:62602774:-1 gene:ENSMUSG00000043441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC119599 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 149, mRNA (cDNA clone IMAGE:40059198), partial cds. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:62530536:62604447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000016579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:63173106:63232505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_177856 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E130311K13 gene (E130311K13Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:63914684:63929472:-1 gene:ENSMUSG00000048581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC125500 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E130311K13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159203 IMAGE:40130015), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC132160 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E130311K13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163791 IMAGE:40130437), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:63926817:63929391:-1 gene:ENSMUSG00000048581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENSMUST00000162448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:63924017:63929391:-1 gene:ENSMUSG00000048581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:63847794:63964190:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONMMUT043310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001272035 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 33 (acetyl-CoA transporter), member 1 (Slc33a1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_015728 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 33 (acetyl-CoA transporter), member 1 (Slc33a1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029402 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:63942330:63964768:-1 gene:ENSMUSG00000027822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000160883 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:63942414:63964372:-1 gene:ENSMUSG00000027822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000161659 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:63933507:63964666:-1 gene:ENSMUSG00000027822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AB016795 // GenBank // Mus musculus mRNA for acetyl-CoA transporter, complete cds. // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC005616 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 33 (acetyl-CoA transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:6986 IMAGE:3154886), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC054395 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 33 (acetyl-CoA transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:62603 IMAGE:6492236), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC063104 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 33 (acetyl-CoA transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:70254 IMAGE:5042025), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:63847794:63964190:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSMUST00000175971 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:64339565:64357724:-1 gene:ENSMUSG00000091967 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr3 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// GENSCAN00000048615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:64339565:64358827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
ENSMUST00000050123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:64715707:64844765:-1 gene:ENSMUSG00000062200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000161972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:64690660:64844765:-1 gene:ENSMUSG00000062200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK030224 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933425M15 product:similar to PUTATIVE PHEROMONE RECEPTOR V2R2, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NR_003962 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor, pseudogene 11 (Vmn2r-ps11), non-coding RNA. // chr3 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// ENSMUST00000177146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:64632863:64844743:-1 gene:ENSMUSG00000097538 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_026155 // RefSeq // Mus musculus signal sequence receptor, gamma (Ssr3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:65379655:65392623:-1 gene:ENSMUSG00000027828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011111 // GenBank // Mus musculus signal sequence receptor, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:18930 IMAGE:3965897), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// CT010172 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B0450D for gene Ssr3, Signal sequence receptor, gamma; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000119896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:65382030:65392553:-1 gene:ENSMUSG00000027828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// AK029353 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833403D03 product:TRANSLOCON-ASSOCIATED PROTEIN, GAMMA SUBUNIT (TRAP-GAMMA) (SIGNAL SEQUENCE RECEPTOR GAMMA SUBUNIT) (SSR-GAMMA) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000139785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:65381680:65383381:-1 gene:ENSMUSG00000027828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:65383569:65392708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT043347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NR_027955 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931440P22 gene (4931440P22Rik), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:65527523:65529379:-1 gene:ENSMUSG00000074580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK136269 // GenBank HTC // Mus musculus adult male eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7530401I03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK171113 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630225C08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONMMUT043359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONMMUT043360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083396 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:65771511:65771617:-1 gene:ENSMUSG00000065330 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT043364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_145820 // RefSeq // Mus musculus ventricular zone expressed PH domain-containing 1 (Veph1), mRNA. // chr3 // 98 // 91 // 42 // 43 // 0 /// XM_006502142 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ventricular zone expressed PH domain-containing 1 (Veph1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 98 // 85 // 39 // 40 // 0 /// ENSMUST00000029419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:66053558:66296837:-1 gene:ENSMUSG00000027831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 91 // 42 // 43 // 0 /// ENSMUST00000107837 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:66056637:66136438:-1 gene:ENSMUSG00000027831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 55 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000182815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:66243998:66296748:-1 gene:ENSMUSG00000027831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// AB085187 // GenBank // Mus musculus Veph-A mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 83 // 37 // 39 // 0 /// AB085189 // GenBank // Mus musculus Veph-B mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 55 // 25 // 26 // 0 /// AK164725 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630038J18 product:Veph-A protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// BC128271 // GenBank // Mus musculus ventricular zone expressed PH domain homolog 1 (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:149983 IMAGE:40059997), complete cds. // chr3 // 95 // 79 // 35 // 37 // 0 /// GENSCAN00000014748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:66041684:66121311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 26 // 26 // 12 // 47 // 1 /// GENSCAN00000014761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:66128830:66217994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1
ENSMUST00000082588 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:66088109:66088261:-1 gene:ENSMUSG00000064522 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 85 // 45 // 11 // 13 // 0 /// NONMMUT043377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 85 // 45 // 11 // 13 // 0
NM_016753 // RefSeq // Mus musculus latexin (Lxn), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000058981 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:67457998:67463926:-1 gene:ENSMUSG00000047557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000160827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:67458001:67461634:-1 gene:ENSMUSG00000047557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC115521 // GenBank // Mus musculus latexin, mRNA (cDNA clone MGC:144352 IMAGE:40101205), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC115522 // GenBank // Mus musculus latexin, mRNA (cDNA clone MGC:144353 IMAGE:40101207), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// D88769 // GenBank // Mus musculus mRNA for latexin, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000160202 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:67461061:67463782:-1 gene:ENSMUSG00000047557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001164763 // RefSeq // Mus musculus retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 1 (Rarres1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054825 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:67478972:67515523:-1 gene:ENSMUSG00000049404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:67478886:67515523:-1 gene:ENSMUSG00000049404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:67479337:67549365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
GENSCAN00000025554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:67606466:67616100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 73 // 10 // 11 // 0
GENSCAN00000025566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:67619703:67628523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000166328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:68867917:68870266:-1 gene:ENSMUSG00000091272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK033123 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030441M13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025863 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 59 (Trim59), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:69035288:69044755:-1 gene:ENSMUSG00000034317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136512 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:69036837:69044715:-1 gene:ENSMUSG00000034317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC006700 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 59, mRNA (cDNA clone MGC:6680 IMAGE:3501285), complete cds. // chr3 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// BC025430 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 59, mRNA (cDNA clone MGC:29290 IMAGE:4017983), complete cds. // chr3 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:69037841:69044715:-1 gene:ENSMUSG00000034317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:69036794:69044524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_008467 // RefSeq // Mus musculus karyopherin (importin) alpha 4 (Kpna4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000029353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:69067149:69127113:-1 gene:ENSMUSG00000027782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000127497 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:69094715:69126630:-1 gene:ENSMUSG00000027782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// AF020771 // GenBank // Mus musculus importin alpha Q1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// BC026821 // GenBank // Mus musculus karyopherin (importin) alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:19244 IMAGE:3672708), complete cds. // chr3 // 97 // 95 // 36 // 37 // 0 /// BC052162 // GenBank // Mus musculus karyopherin (importin) alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:59350 IMAGE:6510795), complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 37 // 39 // 0 /// CT010281 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836H0251D for gene Kpna4, Karyopherin (importin) alpha 4; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000052687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:69076699:69126654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000183259 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:69566451:69567464:-1 gene:ENSMUSG00000098006 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_020026 // RefSeq // Mus musculus UDP-GalNAc:betaGlcNAc beta 1,3-galactosaminyltransferase, polypeptide 1 (B3galnt1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:69574186:69598861:-1 gene:ENSMUSG00000043300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003835 // GenBank // Mus musculus UDP-GalNAc:betaGlcNAc beta 1,3-galactosaminyltransferase, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:6335 IMAGE:3486016), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000091052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:69716986:69717393:-1 gene:ENSMUSG00000068969 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000040155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:69716986:69717393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT043460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001164210 // RefSeq // Mus musculus serine palmitoyltransferase, small subunit B (Sptssb), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001286959 // RefSeq // Mus musculus serine palmitoyltransferase, small subunit B (Sptssb), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_133675 // RefSeq // Mus musculus serine palmitoyltransferase, small subunit B (Sptssb), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000051239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:69819538:69859896:-1 gene:ENSMUSG00000043461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000171529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:69819538:69859896:-1 gene:ENSMUSG00000043461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF365876 // GenBank // Mus musculus ADMP mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC022628 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110032A04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:31205 IMAGE:4206004), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001081137 // RefSeq // Mus musculus sucrase isomaltase (alpha-glucosidase) (Sis), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000094190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:72888560:72966866:-1 gene:ENSMUSG00000027790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000167334 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:72888557:72967863:-1 gene:ENSMUSG00000027790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// EU937530 // GenBank // Mus musculus sucrase-isomaltase mRNA, complete cds. // chr3 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// GENSCAN00000020434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:72888990:73008313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 70 // 32 // 33 // 0
NM_198864 // RefSeq // Mus musculus SLIT and NTRK-like family, member 3 (Slitrk3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:73048126:73056943:-1 gene:ENSMUSG00000048304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC066059 // GenBank // Mus musculus SLIT and NTRK-like family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:90025 IMAGE:6844461), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:73048495:73051434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_009738 // RefSeq // Mus musculus butyrylcholinesterase (Bche), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:73635808:73708415:-1 gene:ENSMUSG00000027792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000133690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:73648416:73708242:-1 gene:ENSMUSG00000027792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AK052200 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330006P10 product:butyrylcholinesterase, full insert sequence. // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC099977 // GenBank // Mus musculus butyrylcholinesterase, mRNA (cDNA clone MGC:107651 IMAGE:6751601), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// M99492 // GenBank // Mouse butyrylcholinesterase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_172515 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, B-box domain containing (Zbbx), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// XM_006501257 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, B-box domain containing (Zbbx), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000039269 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:75037918:75143730:-1 gene:ENSMUSG00000034151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000107775 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:75078562:75143772:-1 gene:ENSMUSG00000034151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000107776 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:75061361:75143703:-1 gene:ENSMUSG00000034151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:75037907:75143772:-1 gene:ENSMUSG00000034151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000124618 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:75112153:75165034:-1 gene:ENSMUSG00000034151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// BC050789 // GenBank // Mus musculus zinc finger, B-box domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:58617 IMAGE:6706914), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// BC100435 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC050789, mRNA (cDNA clone IMAGE:30918612). // chr3 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:75037963:75179532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0
NM_026460 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade I, member 2 (Serpini2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039047 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:75242370:75270078:-1 gene:ENSMUSG00000034139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF251276 // GenBank // Mus musculus serine protease inhibitor 14 (Spi14) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC098466 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade I, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:107377 IMAGE:6433250), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:75238101:75481687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
XM_006502498 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 49 (Wdr49), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:75238101:75481687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT043496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0
XM_006502498 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 49 (Wdr49), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000178270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:75396868:75451818:-1 gene:ENSMUSG00000095162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:75238101:75481687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_019745 // RefSeq // Mus musculus programmed cell death 10 (Pdcd10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000161137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:75516490:75556856:-1 gene:ENSMUSG00000027835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001291069 // RefSeq // Mus musculus golgi integral membrane protein 4 (Golim4), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_175193 // RefSeq // Mus musculus golgi integral membrane protein 4 (Golim4), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000038563 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:75876383:75956929:-1 gene:ENSMUSG00000034109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000117242 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:75876183:75956949:-1 gene:ENSMUSG00000034109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000167078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:75877659:75956937:-1 gene:ENSMUSG00000034109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// BC086642 // GenBank // Mus musculus golgi integral membrane protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:113742 IMAGE:6836803), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// BC089354 // GenBank // Mus musculus golgi integral membrane protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:102202 IMAGE:6837211), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000131987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:75899227:75956908:-1 gene:ENSMUSG00000034109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// AK149286 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930011E23 product:golgi phosphoprotein 4, full insert sequence. // chr3 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// GENSCAN00000040558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:75862127:75921385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000164923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:78891864:78892451:-1 gene:ENSMUSG00000091361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000032873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:78891864:78892589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001099624 // RefSeq // Mus musculus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2 (Rapgef2), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006502252 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2 (Rapgef2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006502254 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2 (Rapgef2), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000118100 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:79062516:79144977:-1 gene:ENSMUSG00000062232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000118340 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:79062528:79145875:-1 gene:ENSMUSG00000062232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AB093228 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0313 protein. // chr3 // 100 // 63 // 30 // 30 // 0 /// BC067056 // GenBank // Mus musculus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:30545886), partial cds. // chr3 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000032869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:79064120:79126897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0
NM_001162999 // RefSeq // Mus musculus folliculin interacting protein 2 (Fnip2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000076136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:79455971:79567679:-1 gene:ENSMUSG00000061175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000133154 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:79455974:79567796:-1 gene:ENSMUSG00000061175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000149475 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:79456887:79466205:-1 gene:ENSMUSG00000061175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000154645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:79459593:79500522:-1 gene:ENSMUSG00000061175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK052684 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630023B12 product:inferred: KIAA1450 protein {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr3 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AK122512 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1450 protein. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:79459663:79518191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_212452 // RefSeq // Mus musculus relaxin/insulin-like family peptide receptor 1 (Rxfp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000078527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:79641611:79737794:-1 gene:ENSMUSG00000034009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000182491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:79644112:79737880:-1 gene:ENSMUSG00000034009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AY509975 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 7 (Lgr7) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000183040 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:79655293:79667853:-1 gene:ENSMUSG00000034009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// AK054129 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230022G02 product:LEUCINE-RICH REPEAT-CONTAINING G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR 7 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// GENSCAN00000045028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:79644716:79683193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
NM_027495 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 144 (Tmem144), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006502057 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 144 (Tmem144), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000029568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:79813153:79842662:-1 gene:ENSMUSG00000027956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000168038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:79813148:79841729:-1 gene:ENSMUSG00000027956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// BC018493 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 144, mRNA (cDNA clone MGC:27961 IMAGE:3593194), complete cds. // chr3 // 94 // 92 // 33 // 35 // 0 /// XR_375577 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 144 (Tmem144), transcript variant X5, misc_RNA. // chr3 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1
NM_001281969 // RefSeq // Mus musculus glycine receptor, beta subunit (Glrb), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_010298 // RefSeq // Mus musculus glycine receptor, beta subunit (Glrb), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006501006 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycine receptor, beta subunit (Glrb), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029654 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:80843599:80913660:-1 gene:ENSMUSG00000028020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000107743 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:80855629:80913528:-1 gene:ENSMUSG00000028020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000132330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:80862110:80913589:-1 gene:ENSMUSG00000028020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000135043 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:80843599:80913614:-1 gene:ENSMUSG00000028020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC037605 // GenBank // Mus musculus glycine receptor, beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:46752 IMAGE:5361798), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U09399 // GenBank // Mus musculus domesticus glycine receptor beta subunit precursor (glrb) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 81 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:80844964:80882784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000069880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:81921268:81924463:-1 gene:ENSMUSG00000056023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK045605 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230215A15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019911 // RefSeq // Mus musculus tryptophan 2,3-dioxygenase (Tdo2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:81957090:81975750:-1 gene:ENSMUSG00000028011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000151089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:81958724:81964083:-1 gene:ENSMUSG00000028011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AB476989 // GenBank // Mus musculus tdo variant1 mRNA for putative tryptophan 2,3-dioxygenase variant1, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AB476990 // GenBank // Mus musculus tdo variant2 mRNA for putative tryptophan 2,3-dioxygenase variant2, complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC018390 // GenBank // Mus musculus tryptophan 2,3-dioxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:25811 IMAGE:4159877), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U24493 // GenBank // Mouse tryptophan-2,3-dioxygenase (TDO) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:81961338:81993586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001161796 // RefSeq // Mus musculus guanylate cyclase 1, soluble, beta 3 (Gucy1b3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_017469 // RefSeq // Mus musculus guanylate cyclase 1, soluble, beta 3 (Gucy1b3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000029635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:82032004:82074711:-1 gene:ENSMUSG00000028005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF020339 // GenBank // Mus musculus soluble guanylate cyclase beta-1 subunit (GC-S-beta-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// AF297083 // GenBank // Mus musculus soluble guanylyl cyclase beta 1 subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC050945 // GenBank // Mus musculus guanylate cyclase 1, soluble, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:63324 IMAGE:6822142), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC056995 // GenBank // Mus musculus guanylate cyclase 1, soluble, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:66964 IMAGE:6822142), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:82037890:82074574:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
AF297082 // GenBank // Mus musculus soluble guanylyl cyclase alpha 1 subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC094310 // GenBank // Mus musculus guanylate cyclase 1, soluble, alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:90653 IMAGE:6838836), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NM_021896 // RefSeq // Mus musculus guanylate cyclase 1, soluble, alpha 3 (Gucy1a3), mRNA. // chr3 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSMUST00000048976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:82092428:82145877:-1 gene:ENSMUSG00000033910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// BC057327 // GenBank // Mus musculus guanylate cyclase 1, soluble, alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:66907 IMAGE:6825960), complete cds. // chr3 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// AK031305 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030404P15 product:guanylate cyclase 1, soluble, alpha 3, full insert sequence. // chr3 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000015074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:82094695:82134110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0