NM_008731 // RefSeq // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y2 (Npy2r), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:82538383:82548084:-1 gene:ENSMUSG00000028004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:82538386:82548052:-1 gene:ENSMUSG00000028004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000182831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:82539949:82547960:-1 gene:ENSMUSG00000028004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC104490 // GenBank // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y2, mRNA (cDNA clone MGC:124241 IMAGE:40047004), complete cds. // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC104733 // GenBank // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y2, mRNA (cDNA clone MGC:124244 IMAGE:40047010), complete cds. // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC104734 // GenBank // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y2, mRNA (cDNA clone MGC:124242 IMAGE:40047007), complete cds. // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// D86238 // GenBank // Mus musculus mRNA for neuropeptideY-Y2 receptor, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001205099 // RefSeq // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y2 (Npy2r), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// ENSMUST00000182181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:82539949:82547960:-1 gene:ENSMUSG00000028004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:82540321:82541466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001277170 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 46 (Rbm46), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501852 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 46 (Rbm46), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501853 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 46 (Rbm46), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000048647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:82837228:82876483:-1 gene:ENSMUSG00000033882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000182637 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:82837815:82866647:-1 gene:ENSMUSG00000033882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000182818 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:82837818:82866647:-1 gene:ENSMUSG00000033882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:82792976:82866636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_023624 // RefSeq // Mus musculus lecithin-retinol acyltransferase (phosphatidylcholine-retinol-O-acyltransferase) (Lrat), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029632 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:82892579:82903973:-1 gene:ENSMUSG00000028003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF255061 // GenBank // Mus musculus lecithin retinol acyltransferase mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC141375 // GenBank // Mus musculus lecithin-retinol acyltransferase (phosphatidylcholine-retinol-O-acyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:176337 IMAGE:9055988), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC141378 // GenBank // Mus musculus lecithin-retinol acyltransferase (phosphatidylcholine-retinol-O-acyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:176340 IMAGE:9055991), complete cds. // chr3 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_181849 // RefSeq // Mus musculus fibrinogen beta chain (Fgb), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000048246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:83042247:83049803:-1 gene:ENSMUSG00000033831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC031715 // GenBank // Mus musculus fibrinogen, B beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:25856 IMAGE:4195310), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:83041355:83049761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000047876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:83125276:83129246:-1 gene:ENSMUSG00000074517 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140333 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430203B04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011905 // RefSeq // Mus musculus toll-like receptor 2 (Tlr2), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000029623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:83836273:83841767:-1 gene:ENSMUSG00000027995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF124741 // GenBank // Mus musculus Toll-like receptor 2 (Tlr2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF165189 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 2 (Tlr2) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// AF185284 // GenBank // Mus musculus Toll-like receptor 2 (Tlr2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AF216289 // GenBank // Mus musculus Toll-like receptor 2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AY179346 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC014693 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:11394 IMAGE:3966249), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:83823097:83963975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_172681 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D930015E06 gene (D930015E06Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000052342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:83898287:84040161:-1 gene:ENSMUSG00000033767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK028803 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732457K01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// AK137619 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830168I15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC029771 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D930015E06 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4947647), partial cds. // chr3 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// BC062940 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D930015E06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:86126 IMAGE:6842400), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000026797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:83823097:83963975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_029797 // RefSeq // Mus musculus meiotic nuclear divisions 1 homolog (S. cerevisiae) (Mnd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_030680 // RefSeq // Mus musculus Mnd1 retrotransposed pseudogene (Mnd1-ps), non-coding RNA. // chr3 // 75 // 96 // 18 // 24 // 0 /// XM_006502261 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus meiotic nuclear divisions 1 homolog (S. cerevisiae) (Mnd1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000047368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:84087934:84155786:-1 gene:ENSMUSG00000033752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027741 // GenBank // Mus musculus meiotic nuclear divisions 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:29216 IMAGE:5035682), complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:14:9886026:9886629:1 gene:ENSMUSG00000089686 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 70 // 80 // 14 // 20 // 0 /// GENSCAN00000026795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:84088068:84159560:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001033301 // RefSeq // Mus musculus FH2 domain containing 1 (Fhdc1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_001205355 // RefSeq // Mus musculus FH2 domain containing 1 (Fhdc1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000091002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:84444035:84479491:-1 gene:ENSMUSG00000041842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000107689 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:84444038:84480429:-1 gene:ENSMUSG00000041842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK173244 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1727 protein. // chr3 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC042779 // GenBank // Mus musculus FH2 domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3708729), complete cds. // chr3 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC137632 // GenBank // Mus musculus FH2 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:169256 IMAGE:8860651), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AK162493 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530018N03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000026788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:84426781:84486003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_001040461 // RefSeq // Mus musculus dual endothelin 1/angiotensin II receptor 1 (Dear1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC141214 // GenBank // Mus musculus dual endothelin 1/angiotensin II receptor 1 homolog (rat), mRNA (cDNA clone MGC:176175 IMAGE:9055826), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// DQ009865 // GenBank // Mus musculus endothelin 1/angiotensin II receptor (Dear) mRNA, complete cds. // chr3 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
BC086805 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30538112. // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// AK212440 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0124P06, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000069152, based on BLAT search. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172682 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 160, member A1 (Fam160a1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000094148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:85660065:85741389:-1 gene:ENSMUSG00000051000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000118408 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:85660063:85746266:-1 gene:ENSMUSG00000051000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000119077 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:85660063:85722474:-1 gene:ENSMUSG00000051000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000126445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:85660061:85673988:-1 gene:ENSMUSG00000051000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// AK076386 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732483E04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// BC043298 // GenBank HTC // Mus musculus family with sequence similarity 160, member A1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5400741), containing frame-shift errors. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:85672185:85741252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000055081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:85660965:85669784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_177130 // RefSeq // Mus musculus glycosyltransferase 28 domain containing 2 (Glt28d2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000033643 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:85869849:85887516:-1 gene:ENSMUSG00000031286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC119772 // GenBank // Mus musculus glycosyltransferase 28 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:148218 IMAGE:40107197), complete cds. // chr3 // 91 // 55 // 10 // 11 // 0 /// BC121823 // GenBank // Mus musculus glycosyltransferase 28 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:148217 IMAGE:40107196), complete cds. // chr3 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0
NM_001001650 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 48 (Prss48), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501618 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 48 (Prss48), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000061343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:85993810:86002491:-1 gene:ENSMUSG00000049013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC116378 // GenBank // Mus musculus gene model 1019, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:144362 IMAGE:40101288), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC116379 // GenBank // Mus musculus gene model 1019, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:144363 IMAGE:40101289), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501619 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 48 (Prss48), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// XM_006501620 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 48 (Prss48), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000055065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:85984731:86021305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NR_004417 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box U73A (Snord73a), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083050 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:86138791:86138858:-1 gene:ENSMUSG00000064984 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082456 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:86140618:86140688:-1 gene:ENSMUSG00000064390 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_004418 // RefSeq // Mus musculus U73B small nuclear RNA (Rnu73b), small nuclear RNA. // chr3 // 58 // 96 // 14 // 24 // 0 /// NONMMUT043713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_011839 // RefSeq // Mus musculus mab-21-like 2 (C. elegans) (Mab21l2), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:86545581:86548283:-1 gene:ENSMUSG00000057777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF126427 // GenBank // Mus musculus MAB21L2 (Mab21l2) mRNA, complete cds. // chr3 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// AF149877 // GenBank // Mus musculus mab-21 homolog MAB21L2 (Mab21l2) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// BC046628 // GenBank // Mus musculus mab-21-like 2 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:54650 IMAGE:6493460), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_007639 // RefSeq // Mus musculus CD1d1 antigen (Cd1d1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006500958 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD1d1 antigen (Cd1d1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000029717 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:86995834:86999441:-1 gene:ENSMUSG00000028076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000063869 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:86995834:86999309:-1 gene:ENSMUSG00000028076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000132131 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:86998118:86998954:-1 gene:ENSMUSG00000028076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 86 // 64 // 6 // 7 // 0 /// BC055902 // GenBank // Mus musculus CD1d1 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:68265 IMAGE:4917095), complete cds. // chr3 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// M63695 // GenBank // Mouse CD1.1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
GENSCAN00000052772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87022934:87023883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
NM_001170985 // RefSeq // Mus musculus kin of IRRE like (Drosophila) (Kirrel), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NM_130867 // RefSeq // Mus musculus kin of IRRE like (Drosophila) (Kirrel), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000041732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:87084628:87174550:-1 gene:ENSMUSG00000041734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000107618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:87078601:87174747:-1 gene:ENSMUSG00000041734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000159976 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:87078593:87174700:-1 gene:ENSMUSG00000041734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AF480411 // GenBank // Mus musculus NEPH1 (Neph1) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// AY017368 // GenBank // Mus musculus NEPH1 (Neph1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// AY243095 // GenBank // Mus musculus NEPH1 (Neph1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC023765 // GenBank // Mus musculus kin of IRRE like (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:38329 IMAGE:5343720), complete cds. // chr3 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87083144:87098595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0
NM_030707 // RefSeq // Mus musculus Fc receptor-like S, scavenger receptor (Fcrls), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000090986 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:87250758:87263599:-1 gene:ENSMUSG00000015852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB028174 // GenBank // Mus musculus MMAN-g mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF302046 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin scavenger receptor IgSR mRNA, complete cds. // chr3 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// AF329486 // GenBank // Mus musculus IFGP2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AY506556 // GenBank // Mus musculus Fc receptor-like protein 2 scavenger isoform (Fcrh2) mRNA, complete cds. // chr3 // 76 // 96 // 19 // 25 // 0 /// AY506557 // GenBank // Mus musculus Fc receptor-like protein 2 immunoglobulin short isoform (Fcrh2) mRNA, complete cds. // chr3 // 76 // 65 // 13 // 17 // 0 /// BC016551 // GenBank // Mus musculus Fc receptor-like S, scavenger receptor, mRNA (cDNA clone MGC:28009 IMAGE:3602803), complete cds. // chr3 // 76 // 96 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87246256:87295395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_028971 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 71 (Lrrc71), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006502205 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 71 (Lrrc71), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:87736923:87748623:-1 gene:ENSMUSG00000023084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000174208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:87745252:87748594:-1 gene:ENSMUSG00000023084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000174381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:87737895:87748625:-1 gene:ENSMUSG00000023084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK016993 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933430H15 product:hypothetical Leucine rich repeat, ribonuclease inhibitor type containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006502206 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 71 (Lrrc71), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 97 // 97 // 29 // 30 // 1 /// AK029569 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4922502E07 product:hypothetical Leucine rich repeat, ribonuclease inhibitor type containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87739075:87795144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1
NM_001033124 // RefSeq // Mus musculus neurotrophic tyrosine kinase, receptor, type 1 (Ntrk1), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:87778244:87795162:-1 gene:ENSMUSG00000028072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87739075:87795144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_033573 // RefSeq // Mus musculus papillary renal cell carcinoma (translocation-associated) (Prcc), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006502397 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus papillary renal cell carcinoma (translocation-associated) (Prcc), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000005015 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:87858900:87885608:-1 gene:ENSMUSG00000004895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF273750 // GenBank // Mus musculus strain 129/Ola papillary renal cell carcinoma-associated protein (Prcc) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC027831 // GenBank // Mus musculus papillary renal cell carcinoma (translocation-associated), mRNA (cDNA clone IMAGE:5320904), partial cds. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC052072 // GenBank // Mus musculus papillary renal cell carcinoma (translocation-associated), mRNA (cDNA clone MGC:62479 IMAGE:5717482), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC082784 // GenBank // Mus musculus papillary renal cell carcinoma (translocation-associated), mRNA (cDNA clone MGC:91016 IMAGE:4191155), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87859260:87885342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_001109758 // RefSeq // Mus musculus brevican (Bcan), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NM_007529 // RefSeq // Mus musculus brevican (Bcan), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006500935 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus brevican (Bcan), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000090971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:87987531:88000356:-1 gene:ENSMUSG00000004892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052032 // GenBank // Mus musculus brevican, mRNA (cDNA clone MGC:62387 IMAGE:5695027), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:87987872:87997835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_144897 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein A-I binding protein (Apoa1bp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501517 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus apolipoprotein A-I binding protein (Apoa1bp), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000029708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88056523:88058495:-1 gene:ENSMUSG00000028070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AJ344092 // GenBank // Mus musculus mRNA for apoA-I binding protein (AIBP gene). // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AY566271 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein A-I binding protein mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC058362 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein A-I binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:66720 IMAGE:6819459), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88056574:88058490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_172526 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 24 (Ttc24), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000050258 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:88069410:88078304:-1 gene:ENSMUSG00000051036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000064550 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:88069813:88072060:-1 gene:ENSMUSG00000051036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// AK076743 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930428B22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// BC055114 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 24, mRNA (cDNA clone IMAGE:6773460), complete cds. // chr3 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// BC147554 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 24, mRNA (cDNA clone MGC:182651 IMAGE:9056545), complete cds. // chr3 // 93 // 77 // 25 // 27 // 0 /// BC147555 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 24, mRNA (cDNA clone MGC:182652 IMAGE:9056546), complete cds. // chr3 // 93 // 77 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88070027:88075704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0
NM_021375 // RefSeq // Mus musculus Rhesus blood group-associated B glycoprotein (Rhbg), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006501826 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rhesus blood group-associated B glycoprotein (Rhbg), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000163277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88245195:88287210:-1 gene:ENSMUSG00000001417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000165196 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:88243380:88287210:-1 gene:ENSMUSG00000001417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171887 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:88242874:88254709:-1 gene:ENSMUSG00000001417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF193808 // GenBank // Mus musculus Rh type B glycoprotein (Rhbg) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AY254685 // GenBank // Mus musculus Rhesus associated B glycoprotein (Rhbg) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC029236 // GenBank // Mus musculus Rhesus blood group-associated B glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:35874 IMAGE:4218889), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// FJ387503 // GenBank // Mus musculus SSTK-interacting protein/Rhesus blood group-associated B glycoprotein chimeric protein variant A mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88214255:88254646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
NM_029801 // RefSeq // Mus musculus TSSK6 activating co-chaperone (Tsacc), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000010682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:88282760:88296838:-1 gene:ENSMUSG00000010538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107556 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:88282757:88296999:-1 gene:ENSMUSG00000010538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC107298 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700021C14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130252 IMAGE:40053153), complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000123536 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88294924:88296896:-1 gene:ENSMUSG00000010538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONMMUT043858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_024246 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 79 (Tmem79), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006502124 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 79 (Tmem79), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006502125 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 79 (Tmem79), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000001456 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:88328655:88334504:-1 gene:ENSMUSG00000001420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88329047:88334454:-1 gene:ENSMUSG00000001420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000107553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88329046:88334268:-1 gene:ENSMUSG00000001420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK010144 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310074C17 product:hypothetical Glutamine amidotransferase class-II containing protein, full insert sequence. // chr3 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC003309 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 79, mRNA (cDNA clone MGC:6976 IMAGE:3154669), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88329719:88333639:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_001037939 // RefSeq // Mus musculus bone gamma carboxyglutamate protein (Bglap), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000128732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88383827:88384464:-1 gene:ENSMUSG00000074483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_025928 // RefSeq // Mus musculus polyamine-modulated factor 1 (Pmf1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006501922 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polyamine-modulated factor 1 (Pmf1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// XM_006501924 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polyamine-modulated factor 1 (Pmf1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XR_375567 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polyamine-modulated factor 1 (Pmf1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000056370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88394143:88410316:-1 gene:ENSMUSG00000028066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF348509 // GenBank // Mus musculus polyamine modulated factor-1S mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF348510 // GenBank // Mus musculus polyamine modulated factor-1L mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC037139 // GenBank // Mus musculus polyamine-modulated factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:46783 IMAGE:4952550), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049223 // GenBank // Mus musculus polyamine-modulated factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:54477 IMAGE:3257320), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88394531:88421125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001145876 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 44 (Slc25a44), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001145877 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 44 (Slc25a44), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_001281795 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 44 (Slc25a44), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NM_178696 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 44 (Slc25a44), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88410498:88425139:-1 gene:ENSMUSG00000050144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88410498:88425139:-1 gene:ENSMUSG00000050144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC012234 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 44, mRNA (cDNA clone MGC:19319 IMAGE:4191504), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC052771 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 44, mRNA (cDNA clone MGC:56884 IMAGE:6310271), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88394531:88421125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_016899 // RefSeq // Mus musculus RAB25, member RAS oncogene family (Rab25), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000008745 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:88542029:88548300:-1 gene:ENSMUSG00000008601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000131775 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:88542309:88548249:-1 gene:ENSMUSG00000008601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000141371 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88542676:88543514:-1 gene:ENSMUSG00000008601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AB232620 // GenBank // Mus musculus Rab25 mRNA for Rab25, complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AF119675 // GenBank // Mus musculus small GTP-binding protein RAB25 (Rab25) mRNA, complete cds. // chr3 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC006624 // GenBank // Mus musculus RAB25, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:11604 IMAGE:3968810), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000149724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88544642:88548282:-1 gene:ENSMUSG00000008601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000035146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88542243:88548075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_031248 // RefSeq // Mus musculus late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 2 (Lamtor2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:88549819:88553024:-1 gene:ENSMUSG00000028062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000119002 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:88549820:88552859:-1 gene:ENSMUSG00000028062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88549821:88552893:-1 gene:ENSMUSG00000028062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC031816 // GenBank // Mus musculus roadblock domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:19316 IMAGE:4189054), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000145548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88549819:88551094:-1 gene:ENSMUSG00000028062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// ENSMUST00000145172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88552230:88553074:-1 gene:ENSMUSG00000028062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// AK008185 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010011E17 product:mitogen activated protein binding protein interacting protein, full insert sequence. // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONMMUT043875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_026528 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2700060E02 gene (2700060E02Rik), mRNA. // chr3 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSMUST00000022341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:14:19811402:19823823:-1 gene:ENSMUSG00000021807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSMUST00000098952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88576245:88577208:-1 gene:ENSMUSG00000074479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK162433 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430026H22 product:CLE7 homolog [Gallus gallus], full insert sequence. // chr3 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// BC023932 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5324423, containing frame-shift errors. // chr3 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// BC048357 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700060E02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:54465 IMAGE:3979120), complete cds. // chr3 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// BC096571 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700060E02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106958 IMAGE:963861), complete cds. // chr3 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:14:19812083:19823515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 93 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88576407:88577141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_181817 // RefSeq // Mus musculus relaxin family peptide receptor 4 (Rxfp4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063119 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:88651898:88653142:-1 gene:ENSMUSG00000049741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY288422 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 100 (Gpr100) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY633765 // GenBank // Mus musculus relaxin-3/INSL7 receptor 2 (GPCR142) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107269 // GenBank // Mus musculus relaxin family peptide receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:130215 IMAGE:40052601), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88649316:88653142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
AK089708 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830010A05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018804 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin XI (Syt11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000090945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:88744701:88772599:-1 gene:ENSMUSG00000068923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000107503 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:88744700:88752051:-1 gene:ENSMUSG00000068923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000107505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:88744700:88775164:-1 gene:ENSMUSG00000068923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000183267 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:88747472:88762384:-1 gene:ENSMUSG00000068923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AB026808 // GenBank // Mus musculus mRNA for synaptotagmin XI, complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC025207 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin XI, mRNA (cDNA clone MGC:32353 IMAGE:5030173), complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC054526 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin XI, mRNA (cDNA clone MGC:62226 IMAGE:5698412), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:88745223:88772324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 42 // 9 // 10 // 0
NM_001083807 // RefSeq // Mus musculus RUN and SH3 domain containing 1 (Rusc1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NM_001083808 // RefSeq // Mus musculus RUN and SH3 domain containing 1 (Rusc1), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NM_028188 // RefSeq // Mus musculus RUN and SH3 domain containing 1 (Rusc1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000052539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89083981:89093363:-1 gene:ENSMUSG00000041263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000090929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89083981:89093363:-1 gene:ENSMUSG00000041263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000166687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89083981:89090031:-1 gene:ENSMUSG00000041263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC052081 // GenBank HTC // Mus musculus RUN and SH3 domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6404352), containing frame-shift errors. // chr3 // 96 // 68 // 22 // 23 // 0 /// BC056360 // GenBank // Mus musculus RUN and SH3 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:73483 IMAGE:6816267), complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC057034 // GenBank // Mus musculus RUN and SH3 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:67218 IMAGE:5687517), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// AK155528 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630312L17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// GENSCAN00000035143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89084482:89092473:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_001253751 // RefSeq // Mus musculus farnesyl diphosphate synthetase (Fdps), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_134469 // RefSeq // Mus musculus farnesyl diphosphate synthetase (Fdps), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000081848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89093592:89101967:-1 gene:ENSMUSG00000059743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 81 // 12 // 13 // 0 /// AF309508 // GenBank // Mus musculus farnesyl pyrophosphate synthase (Fpps) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// BC048497 // GenBank // Mus musculus farnesyl diphosphate synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:58339 IMAGE:6531586), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// BC087886 // GenBank // Mus musculus farnesyl diphosphate synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:107162 IMAGE:6595030), complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// CT010365 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B0753D for gene Fdps, Farnesyl diphosphate synthetase; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// GENSCAN00000035123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89093643:89101099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NONMMUT043931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008227 // RefSeq // Mus musculus hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated K+ 3 (Hcn3), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89146074:89160196:-1 gene:ENSMUSG00000028051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000132156 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89148732:89151232:-1 gene:ENSMUSG00000028051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC039156 // GenBank // Mus musculus hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated K+ 3, mRNA (cDNA clone MGC:25272 IMAGE:4511289), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC138319 // GenBank // Mus musculus hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated K+ 3, mRNA (cDNA clone MGC:169944 IMAGE:8861339), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC138321 // GenBank // Mus musculus hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated K+ 3, mRNA (cDNA clone MGC:169946 IMAGE:8861341), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89147599:89160059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NR_030579 // RefSeq // Mus musculus microRNA 92b (Mir92b), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102300 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:89227116:89227198:-1 gene:ENSMUSG00000076255 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-92b // miRBase Micro RNA Database // MI0005521 Mus musculus miR-92b stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT043951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001162425 // RefSeq // Mus musculus ephrin A1 (Efna1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_010107 // RefSeq // Mus musculus ephrin A1 (Efna1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029566 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89271733:89279645:-1 gene:ENSMUSG00000027954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000118587 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:89271736:89281142:-1 gene:ENSMUSG00000027954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000118860 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:89271740:89279641:-1 gene:ENSMUSG00000027954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC002046 // GenBank // Mus musculus ephrin A1, mRNA (cDNA clone MGC:6040 IMAGE:3484518), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U26188 // GenBank // Mus musculus B61 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// U90662 // GenBank // Mus musculus ligand B61 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000035125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89259811:89279542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_010108 // RefSeq // Mus musculus ephrin A3 (Efna3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006500988 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ephrin A3 (Efna3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006500989 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ephrin A3 (Efna3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000029673 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89313899:89322965:-1 gene:ENSMUSG00000028039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89315859:89321631:-1 gene:ENSMUSG00000028039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC107002 // GenBank // Mus musculus ephrin A3, mRNA (cDNA clone MGC:129301 IMAGE:40045387), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125003 // GenBank // Mus musculus ephrin A3, mRNA (cDNA clone MGC:129300 IMAGE:40045386), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89315437:89322833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_007910 // RefSeq // Mus musculus ephrin A4 (Efna4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89333390:89338028:-1 gene:ENSMUSG00000028040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U90663 // GenBank // Mus musculus ligand LERK-4 mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// AK144085 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G130205G22 product:ephrin A4, full insert sequence. // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000035122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89333060:89337950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_016904 // RefSeq // Mus musculus CDC28 protein kinase 1b (Cks1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:89415472:89418383:-1 gene:ENSMUSG00000028044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000107422 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:89415557:89418017:-1 gene:ENSMUSG00000028044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000183484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89415844:89418219:-1 gene:ENSMUSG00000028044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 77 // 54 // 10 // 13 // 0 /// AB025409 // GenBank // Mus musculus mRNA for sid1334p, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC076579 // GenBank // Mus musculus CDC28 protein kinase 1b, mRNA (cDNA clone MGC:99840 IMAGE:6846517), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89379526:89418213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_009602 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 2 (neuronal) (Chrnb2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006500916 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 2 (neuronal) (Chrnb2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89753448:89764632:-1 gene:ENSMUSG00000027950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF145286 // GenBank // Mus musculus neuronal nicotinic acetylcholine receptor beta 2 subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF299083 // GenBank // Mus musculus neuronal nicotinic acetylcholine receptor beta 2 subunit (Chrnb2) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// AY574267 // GenBank // Mus musculus neuronal nicotinic acetylcholine receptor beta2 subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// BC065103 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 2 (neuronal), mRNA (cDNA clone MGC:86043 IMAGE:6838257), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK081254 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030030P04 product:cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 2 (neuronal), full insert sequence. // chr3 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// GENSCAN00000054934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89757100:89766665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000038450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89767511:89773240:-1 gene:ENSMUSG00000042579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC106127 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3982291. // chr3 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC063049 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6825508, partial cds. // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// BC080683 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6490203. // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT043998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT044000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT044001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT044002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT044003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_010559 // RefSeq // Mus musculus interleukin 6 receptor, alpha (Il6ra), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000029559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89869324:89913162:-1 gene:ENSMUSG00000027947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// X51976 // GenBank // Mouse mRNA for IL-6 receptor with 3 IAP-LTR insertion. // chr3 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89876805:89913039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001081182 // RefSeq // Mus musculus ATPase, class I, type 8B, member 2 (Atp8b2), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006501714 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase, class I, type 8B, member 2 (Atp8b2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000069805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89939481:89960629:-1 gene:ENSMUSG00000060671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:89939481:89963508:-1 gene:ENSMUSG00000060671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163354 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89939489:89953365:-1 gene:ENSMUSG00000060671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000166347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89940156:89963279:-1 gene:ENSMUSG00000060671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000168276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:89940849:89963508:-1 gene:ENSMUSG00000060671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000170696 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:89954270:89959554:-1 gene:ENSMUSG00000060671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// AK173107 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1137 protein. // chr3 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000054945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:89941153:89997978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000083111 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:89967999:89968163:-1 gene:ENSMUSG00000065045 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030080 // RefSeq // Mus musculus cAMP responsive element binding protein 3-like 4 (Creb3l4), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XM_006502314 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cAMP responsive element binding protein 3-like 4 (Creb3l4), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 96 // 60 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029547 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90237500:90243512:-1 gene:ENSMUSG00000027938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000107369 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90237570:90243143:-1 gene:ENSMUSG00000027938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AB047647 // GenBank // Mus musculus TISP40alpha mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// AB052779 // GenBank // Mus musculus mJAL mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AB182651 // GenBank // Mus musculus Tisp40beta mRNA for spermatid specific transcription factor, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AB182652 // GenBank // Mus musculus Tisp40alpha mRNA for spermatid specific transcription factor, complete cds. // chr3 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// AF287260 // GenBank // Mus musculus Attaches to Cre (Atce1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// AY049978 // GenBank // Mus musculus ATCE1 (Atce1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// BC022605 // GenBank // Mus musculus cAMP responsive element binding protein 3-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:31125 IMAGE:4164994), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90237731:90242832:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0
NM_011988 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 3 (Slc27a3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000029541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90385239:90389927:-1 gene:ENSMUSG00000027932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000132041 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:90385241:90389664:-1 gene:ENSMUSG00000027932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000144572 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:90385239:90389938:-1 gene:ENSMUSG00000027932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000153978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:90387435:90388981:-1 gene:ENSMUSG00000027932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 90 // 33 // 9 // 10 // 0 /// AK131156 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mFLJ00207 protein. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC060052 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5695251), partial cds. // chr3 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC141134 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:176095 IMAGE:9055746), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90385357:90389790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_145540 // RefSeq // Mus musculus integrator complex subunit 3 (Ints3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_178876 // RefSeq // Mus musculus integrator complex subunit 3 (Ints3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90391380:90433636:-1 gene:ENSMUSG00000027933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000071488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:90391380:90433636:-1 gene:ENSMUSG00000027933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AK040147 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430070A22 product:hypothetical Glycine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// AK048350 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130052A06 product:HYPOTHETICAL 50.9 KDA PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// BC055344 // GenBank // Mus musculus integrator complex subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:65702 IMAGE:6827687), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90392028:90457077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_008727 // RefSeq // Mus musculus natriuretic peptide receptor 1 (Npr1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501114 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus natriuretic peptide receptor 1 (Npr1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// XR_375494 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus natriuretic peptide receptor 1 (Npr1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000029540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90450591:90465866:-1 gene:ENSMUSG00000027931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC110659 // GenBank // Mus musculus natriuretic peptide receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:117511 IMAGE:30847317), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// J05504 // GenBank // Mouse guanylate cyclase/atrial natriuretic factor receptor mRNA, complete cds. // chr3 // 80 // 93 // 20 // 25 // 0 /// L31932 // GenBank // Mus musculus natriuretic peptide receptor A (NprA) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90457321:90465503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_011309 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A1 (S100a1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000060738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90511034:90514392:-1 gene:ENSMUSG00000044080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107340 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:90511037:90514278:-1 gene:ENSMUSG00000044080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF087687 // GenBank // Mus musculus calcium-binding protein S100A1 mRNA, complete cds. // chr3 // 83 // 89 // 20 // 24 // 0 /// BC005590 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A1, mRNA (cDNA clone MGC:11425 IMAGE:3964547), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000083145 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:90560556:90560702:-1 gene:ENSMUSG00000065079 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT044058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001281852 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A9 (calgranulin B) (S100a9), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_009114 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein A9 (calgranulin B) (S100a9), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000069960 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:90692632:90695711:-1 gene:ENSMUSG00000056071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:90692632:90695721:-1 gene:ENSMUSG00000056071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC027635 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein A9 (calgranulin B), mRNA (cDNA clone MGC:41215 IMAGE:1332797), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M83219 // GenBank // Mus musculus intracellular calcium-binding protein (MRP14) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90694686:90726007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
GENSCAN00000013568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:90878749:90888706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_008508 // RefSeq // Mus musculus loricrin (Lor), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:92080271:92083142:-1 gene:ENSMUSG00000043165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058223 // GenBank // Mus musculus loricrin, mRNA (cDNA clone MGC:68287 IMAGE:6307099), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M34398 // GenBank // Mouse loricrin mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175424 // RefSeq // Mus musculus proline rich 9 (Prr9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92122204:92123947:-1 gene:ENSMUSG00000056270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027042 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope-like proline-rich 1 (Lelp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92134994:92142754:-1 gene:ENSMUSG00000027927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015762 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930511M18 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT044069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_009265 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 1B (Sprr1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000062160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92436809:92438779:-1 gene:ENSMUSG00000048455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC119288 // GenBank // Mus musculus small proline-rich protein 1B, mRNA (cDNA clone MGC:155604 IMAGE:8734037), complete cds. // chr3 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// BC119290 // GenBank // Mus musculus small proline-rich protein 1B, mRNA (cDNA clone MGC:155606 IMAGE:8734039), complete cds. // chr3 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0
NM_001204427 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 3 (Sprr3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_011478 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 3 (Sprr3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000058142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:92456502:92458720:-1 gene:ENSMUSG00000045539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC125629 // GenBank // Mus musculus small proline-rich protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:159332 IMAGE:40130144), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:92456819:92457535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_009264 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 1A (Sprr1a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000054599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:92483952:92485895:-1 gene:ENSMUSG00000050359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC027534 // GenBank // Mus musculus small proline-rich protein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:41213 IMAGE:1362548), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:92484258:92500493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_173070 // RefSeq // Mus musculus small proline-rich protein 4 (Sprr4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92500263:92500493:-1 gene:ENSMUSG00000045566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY158996 // GenBank // Mus musculus SPRR4 (Sprr4) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107019 // GenBank // Mus musculus small proline-rich protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:129389 IMAGE:40049167), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:92484258:92500493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008412 // RefSeq // Mus musculus involucrin (Ivl), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501046 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus involucrin (Ivl), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92570912:92573715:-1 gene:ENSMUSG00000049128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC152326 // GenBank // Mus musculus involucrin, mRNA (cDNA clone MGC:161215 IMAGE:40141142), complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// GENSCAN00000050307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:92571350:92583473:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_008574 // RefSeq // Mus musculus sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein (Smcp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92583880:92588997:-1 gene:ENSMUSG00000074435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC055104 // GenBank // Mus musculus sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein, mRNA (cDNA clone MGC:58310 IMAGE:6773089), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061167 // GenBank // Mus musculus sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein, mRNA (cDNA clone MGC:74304 IMAGE:6771333), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M29603 // GenBank // Mus musculus sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:92584213:92604536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001166172 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 6A (Lce6a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502318 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus late cornified envelope 6A (Lce6a), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502319 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus late cornified envelope 6A (Lce6a), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502320 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus late cornified envelope 6A (Lce6a), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:92620081:92621660:-1 gene:ENSMUSG00000086848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000170676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92620085:92621180:-1 gene:ENSMUSG00000086848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK019072 // GenBank HTC // Mus musculus adult male stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2210420J11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025984 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1A1 (Lce1a1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000074142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92646532:92648307:-1 gene:ENSMUSG00000057609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC108406 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30287033. // chr3 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC146002 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 1A1, mRNA (cDNA clone MGC:175889 IMAGE:40131305), complete cds. // chr3 // 91 // 48 // 10 // 11 // 0
NM_026822 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1B (Lce1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000029531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92655650:92656926:-1 gene:ENSMUSG00000027923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC069979 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30287537. // chr3 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// BC132596 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 1B, mRNA (cDNA clone MGC:164227 IMAGE:40130873), complete cds. // chr3 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// BC132598 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 1B, mRNA (cDNA clone MGC:164229 IMAGE:40130875), complete cds. // chr3 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_028625 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1A2 (Lce1a2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000029530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92668613:92670315:-1 gene:ENSMUSG00000068890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC062142 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30287569. // chr3 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC080817 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30292245. // chr3 // 88 // 67 // 7 // 8 // 0
NM_027137 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1D (Lce1d), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000029524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92685499:92687210:-1 gene:ENSMUSG00000068890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000078658 // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC145864 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 1D, mRNA (cDNA clone MGC:175751 IMAGE:40131167), complete cds. // chr3 // 79 // 67 // 11 // 14 // 0 /// BC145866 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 1D, mRNA (cDNA clone MGC:175753 IMAGE:40131169), complete cds. // chr3 // 79 // 67 // 11 // 14 // 0
NM_026811 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1E (Lce1e), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000090867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92707401:92709074:-1 gene:ENSMUSG00000068889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026394 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1F (Lce1f), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000047153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92718685:92720350:-1 gene:ENSMUSG00000042124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_025413 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1G (Lce1g), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:92750148:92752338:-1 gene:ENSMUSG00000027919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_026335 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1H (Lce1h), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000051521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92763215:92765065:-1 gene:ENSMUSG00000049593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_029667 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1I (Lce1i), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000090866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92777210:92778899:-1 gene:ENSMUSG00000068888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001281499 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1J (Lce1j), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000107304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92789050:92789469:-1 gene:ENSMUSG00000068887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000186525 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:92788840:92790514:-1 gene:ENSMUSG00000068887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001254760 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1K (Lce1k), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000179917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92806291:92807891:-1 gene:ENSMUSG00000095870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_028629 // RefSeq // Mus musculus keratinocyte expressed, proline-rich (Kprp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:92823074:92827247:-1 gene:ENSMUSG00000059832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC141372 // GenBank // Mus musculus keratinocyte expressed, proline-rich, mRNA (cDNA clone MGC:176334 IMAGE:9055985), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000050286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:92823768:92825741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_028628 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1L (Lce1l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92849949:92851286:-1 gene:ENSMUSG00000046676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:92850030:92869374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001039594 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 3A (Lce3a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000067318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:92925291:92926230:-1 gene:ENSMUSG00000054325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC100538 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 3A, mRNA (cDNA clone MGC:118457 IMAGE:30288561), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000083731 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:92962008:92962116:-1 gene:ENSMUSG00000065665 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT044083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_028798 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich C-terminal 1 (Crct1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:93014205:93015687:-1 gene:ENSMUSG00000027913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107301 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:93014519:93015669:-1 gene:ENSMUSG00000027913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC060280 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich C-terminal 1, mRNA (cDNA clone MGC:69983 IMAGE:30290660), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93014390:93015767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_025420 // RefSeq // Mus musculus late cornified envelope 1M (Lce1m), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93017807:93019060:-1 gene:ENSMUSG00000027912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC109181 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 1M, mRNA (cDNA clone MGC:129452 IMAGE:40049866), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC109182 // GenBank // Mus musculus late cornified envelope 1M, mRNA (cDNA clone MGC:129453 IMAGE:40049867), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000055957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93433215:93433766:-1 gene:ENSMUSG00000057829 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000102083 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:93433197:93433305:-1 gene:ENSMUSG00000076037 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000050295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93433215:93433813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT044089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001007222 // RefSeq // Mus musculus TD and POZ domain containing 2 (Tdpoz2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000178358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93651571:93652663:-1 gene:ENSMUSG00000096860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC141104 // GenBank // Mus musculus TD and POZ domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:176065 IMAGE:9055716), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000046344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:93651581:93652651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_148949 // RefSeq // Mus musculus TD and POZ domain containing 1 (Tdpoz1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000094413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:93669333:93671569:-1 gene:ENSMUSG00000094084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000181541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:93669340:93676310:-1 gene:ENSMUSG00000094084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AF290198 // GenBank // Mus musculus TDPOZ1 (Tdpoz1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC125302 // GenBank // Mus musculus TD and POZ domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:159005 IMAGE:40129817), complete cds. // chr3 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// BC125304 // GenBank // Mus musculus TD and POZ domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:159007 IMAGE:40129819), complete cds. // chr3 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0
NM_016901 // RefSeq // Mus musculus ornithine decarboxylase antizyme 3 (Oaz3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94433390:94436616:-1 gene:ENSMUSG00000028141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AB045835 // GenBank // Mus musculus TISP15 mRNA, complete cds, increased in spermiogenesis. // chr3 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// AF175297 // GenBank // Mus musculus ornithine decarboxylase antizyme 3 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000191506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:94433166:94436616:-1 gene:ENSMUSG00000028141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94433511:94436631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_025506 // RefSeq // Mus musculus regulatory subunit of type II PKA R-subunit (RIIa) domain containing 1 (Riiad1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501880 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus regulatory subunit of type II PKA R-subunit (RIIa) domain containing 1 (Riiad1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:94464983:94473591:-1 gene:ENSMUSG00000028139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94464985:94480341:-1 gene:ENSMUSG00000028139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000184619 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94467754:94472922:-1 gene:ENSMUSG00000028139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0 /// AK019569 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930407A15 product:RIKEN cDNA 2310007A19 gene, full insert sequence. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC107021 // GenBank // Mus musculus non-protein coding RNA 166, mRNA (cDNA clone MGC:129400 IMAGE:40049310), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT044111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001082484 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin family member 27 (Snx27), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NM_029721 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin family member 27 (Snx27), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006502258 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexin family member 27 (Snx27), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:94497544:94582716:-1 gene:ENSMUSG00000028136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000107281 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:94502057:94562032:-1 gene:ENSMUSG00000028136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000107283 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:94499313:94582549:-1 gene:ENSMUSG00000028136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000140176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94519110:94561795:-1 gene:ENSMUSG00000028136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 93 // 39 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000143860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94501127:94582679:-1 gene:ENSMUSG00000028136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000050928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94501224:94582549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_001293728 // RefSeq // Mus musculus tuftelin 1 (Tuft1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// NM_011656 // RefSeq // Mus musculus tuftelin 1 (Tuft1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006501307 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tuftelin 1 (Tuft1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000006123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:94612757:94658871:-1 gene:ENSMUSG00000005968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000107277 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:94612996:94658800:-1 gene:ENSMUSG00000005968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000107279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94612759:94658872:-1 gene:ENSMUSG00000005968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// AF047704 // GenBank // Mus musculus tuftelin mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// BC019213 // GenBank // Mus musculus tuftelin 1, mRNA (cDNA clone MGC:29083 IMAGE:5064658), complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000050918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94604408:94658784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 88 // 15 // 17 // 1
NM_001037711 // RefSeq // Mus musculus cingulin (Cgn), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// NM_001293727 // RefSeq // Mus musculus cingulin (Cgn), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000107272 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:94760069:94786463:-1 gene:ENSMUSG00000068876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000107273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:94760069:94786492:-1 gene:ENSMUSG00000068876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// BC052941 // GenBank // Mus musculus cingulin, mRNA (cDNA clone MGC:60728 IMAGE:30021945), complete cds. // chr3 // 82 // 92 // 9 // 11 // 0 /// BC108378 // GenBank // Mus musculus cingulin, mRNA (cDNA clone MGC:118157 IMAGE:30736765), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000050913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94761360:94779987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_008945 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 4 (Psmb4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000005923 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:94884093:94886961:-1 gene:ENSMUSG00000005779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000133412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94884898:94886862:-1 gene:ENSMUSG00000005779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000134133 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94884322:94884843:-1 gene:ENSMUSG00000005779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000136143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:94884917:94886745:-1 gene:ENSMUSG00000005779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC008241 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 4, mRNA (cDNA clone MGC:6540 IMAGE:2654421), complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// U65636 // GenBank // Mus musculus beta proteasome subunit (Lmp3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:94884428:94886908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT044128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000083018 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:95090625:95090709:-1 gene:ENSMUSG00000064952 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083112 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:32225653:32225737:1 gene:ENSMUSG00000094251 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSMUST00000175128 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:32221970:32222054:1 gene:ENSMUSG00000094382 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONMMUT044156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT036685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONMMUT036686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_027206 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 2 (Tnfaip8l2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502040 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 2 (Tnfaip8l2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000013851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95139521:95142360:-1 gene:ENSMUSG00000013707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC055879 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:68091 IMAGE:3669700), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC094616 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:106944 IMAGE:573953), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95139996:95144813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_019914 // RefSeq // Mus musculus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 11 (Mllt11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501800 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 11 (Mllt11), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AB000733 // GenBank // Mus musculus mRNA for AF1q, complete cds. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC022963 // GenBank // Mus musculus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 11, mRNA (cDNA clone MGC:35902 IMAGE:5365628), complete cds. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// U95498 // GenBank // Mus musculus AF1q mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000065482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95219135:95228677:-1 gene:ENSMUSG00000053192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001024841 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 128 (Gm128), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000090815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:95236920:95241598:-1 gene:ENSMUSG00000068860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB690575 // GenBank // Mus musculus pmis1 mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// BC092540 // GenBank // Mus musculus gene model 128, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:107307 IMAGE:6742207), complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000107197 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:95237107:95241598:-1 gene:ENSMUSG00000068860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000050917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95239842:95240981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_001168356 // RefSeq // Mus musculus BCL2/adenovirus E1B 19kD interacting protein like (Bnipl), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_134253 // RefSeq // Mus musculus BCL2/adenovirus E1B 19kD interacting protein like (Bnipl), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000098871 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95241295:95251049:-1 gene:ENSMUSG00000028115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000107195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95241271:95251193:-1 gene:ENSMUSG00000028115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125515 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:95243060:95251148:-1 gene:ENSMUSG00000028115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000137250 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:95241825:95251136:-1 gene:ENSMUSG00000028115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC005659 // GenBank // Mus musculus BCL2/adenovirus E1B 19kD interacting protein like, mRNA (cDNA clone MGC:8103 IMAGE:3588701), complete cds. // chr3 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC006585 // GenBank // Mus musculus BCL2/adenovirus E1B 19kD interacting protein like, mRNA (cDNA clone IMAGE:3587103), partial cds. // chr3 // 80 // 50 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000050902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95242728:95281623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_173347 // RefSeq // Mus musculus prune homolog (Drosophila) (Prune), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000015855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95253674:95282076:-1 gene:ENSMUSG00000015711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF051908 // GenBank // Mus musculus PRUNEM1 mRNA, complete cds. // chr3 // 87 // 83 // 13 // 15 // 0 /// BC057546 // GenBank // Mus musculus prune homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:66516 IMAGE:6416282), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC058635 // GenBank // Mus musculus prune homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:73446 IMAGE:5698271), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000050902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95242728:95281623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_001085383 // RefSeq // Mus musculus annexin A9 (Anxa9), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_023628 // RefSeq // Mus musculus annexin A9 (Anxa9), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XR_375584 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus annexin A9 (Anxa9), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000015846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95296096:95307176:-1 gene:ENSMUSG00000015702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95296096:95306804:-1 gene:ENSMUSG00000015702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:95296298:95306804:-1 gene:ENSMUSG00000015702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC062140 // GenBank // Mus musculus annexin A9, mRNA (cDNA clone MGC:69997 IMAGE:30290956), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95296790:95308218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000098867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:95307672:95315117:-1 gene:ENSMUSG00000093424 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense gene:ENSMUSG00000074414 // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK144859 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730044K14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000177599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95410346:95411207:-1 gene:ENSMUSG00000096177 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000050912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95410238:95411200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_144899 // RefSeq // Mus musculus ADAMTS-like 4 (Adamtsl4), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006501370 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ADAMTS-like 4 (Adamtsl4), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501371 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ADAMTS-like 4 (Adamtsl4), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000015994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95676204:95687858:-1 gene:ENSMUSG00000015850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000117782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95676201:95687917:-1 gene:ENSMUSG00000015850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AY158701 // GenBank // Mus musculus thrombospondin repeat protein 1 (Tsrc1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC016215 // GenBank // Mus musculus ADAMTS-like 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:4482484), complete cds. // chr3 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// BC117925 // GenBank // Mus musculus ADAMTS-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:144087 IMAGE:40097608), complete cds. // chr3 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000039077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95676833:95704613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 21 // 21 // 0
NM_027541 // RefSeq // Mus musculus PRP3 pre-mRNA processing factor 3 homolog (yeast) (Prpf3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006502081 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PRP3 pre-mRNA processing factor 3 homolog (yeast) (Prpf3), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XR_375581 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PRP3 pre-mRNA processing factor 3 homolog (yeast) (Prpf3), transcript variant X6, misc_RNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000015892 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95830124:95855885:-1 gene:ENSMUSG00000015748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95847443:95853632:-1 gene:ENSMUSG00000015748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000161476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95830622:95855753:-1 gene:ENSMUSG00000015748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC006782 // GenBank // Mus musculus PRP3 pre-mRNA processing factor 3 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:6414 IMAGE:3589226), complete cds. // chr3 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95830618:95849574:-1 gene:ENSMUSG00000015748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// BC040787 // GenBank HTC // Mus musculus PRP3 pre-mRNA processing factor 3 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:4976429), with apparent retained intron. // chr3 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000039072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95830819:95853588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001033302 // RefSeq // Mus musculus circadian associated repressor of transcription (Ciart), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006501374 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 129 (Gm129), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000036418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95878505:95882231:-1 gene:ENSMUSG00000038550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000159739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95878503:95882205:-1 gene:ENSMUSG00000038550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000161994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95880673:95882074:-1 gene:ENSMUSG00000038550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// AK156084 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830007I07 product:hypothetical Proline-rich region profile/Serine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC132471 // GenBank // Mus musculus gene model 129, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:164102 IMAGE:40130748), complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// BC138510 // GenBank // Mus musculus gene model 129, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:170135 IMAGE:8861530), complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000161866 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:95878804:95882251:-1 gene:ENSMUSG00000038550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
XM_006501376 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC028528 (BC028528), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501378 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC028528 (BC028528), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000036360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95883958:95891955:-1 gene:ENSMUSG00000038543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000090476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95883954:95892005:-1 gene:ENSMUSG00000038543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000171519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:95884973:95891930:-1 gene:ENSMUSG00000038543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF534879 // GenBank // Mus musculus L259 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC028528 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC028528, mRNA (cDNA clone MGC:41379 IMAGE:1366537), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000145949 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95887959:95891951:-1 gene:ENSMUSG00000038543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// ENSMUST00000133611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:95888446:95891981:-1 gene:ENSMUSG00000038543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000039080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95862752:95891930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_011797 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 14 (Car14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000036181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95897768:95904691:-1 gene:ENSMUSG00000038526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000147962 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:95899740:95904685:-1 gene:ENSMUSG00000038526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AB005450 // GenBank // Mus musculus mRNA for CA XIV, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC046995 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 14, mRNA (cDNA clone MGC:54680 IMAGE:6491779), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95898146:95919129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0
GENSCAN00000039059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95963981:95964376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_023320 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family O member 1 (Plekho1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000015889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95988429:95996001:-1 gene:ENSMUSG00000015745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000123006 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:95988819:95995668:-1 gene:ENSMUSG00000015745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000130043 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:95989395:95995722:-1 gene:ENSMUSG00000015745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000143485 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:95991468:95995866:-1 gene:ENSMUSG00000015745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// AF168675 // GenBank // Mus musculus TNF intracellular domain-interacting protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC117003 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family O member 1, mRNA (cDNA clone MGC:151380 IMAGE:40126322), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC125441 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family O member 1, mRNA (cDNA clone MGC:159144 IMAGE:40129956), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC056630 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5034194, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000039084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95988929:96057774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_013841 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 45 (yeast) (Vps45), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000015891 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:95999832:96058466:-1 gene:ENSMUSG00000015747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC012691 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 45 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:13945 IMAGE:4038142), complete cds. // chr3 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// BC058528 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 45 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:66987 IMAGE:5718352), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// U66865 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting homolog (VPS45) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000131281 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96045091:96057830:-1 gene:ENSMUSG00000015747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// AK083678 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030064N02 product:vacuolar protein sorting 45 (yeast), full insert sequence. // chr3 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000039084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:95988929:96057774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_026975 // RefSeq // Mus musculus bolA-like 1 (E. coli) (Bola1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502013 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus bolA-like 1 (E. coli) (Bola1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000016087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96196588:96197586:-1 gene:ENSMUSG00000015943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107099 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96196588:96198489:-1 gene:ENSMUSG00000015943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027558 // GenBank // Mus musculus bolA-like 1 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:41403 IMAGE:1477943), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000177442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96196863:96219709:-1 gene:ENSMUSG00000015943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// JX420286 // GenBank // Mus musculus clone bola1-k2-4 chimeric ETn/MusD-bola1 transcript mRNA sequence; and endogenous virus ETn/MusD, complete sequence. // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000039073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96196863:96197240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000167403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96238108:96239127:-1 gene:ENSMUSG00000081058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC015270 // GenBank // Mus musculus histone cluster 2, H3c2, mRNA (cDNA clone MGC:18559 IMAGE:4240748), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_033596 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 2, H4 (Hist2h4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171473 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96261682:96263311:-1 gene:ENSMUSG00000091405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051566 // GenBank HTC // Mus musculus histone cluster 2, H4, mRNA (cDNA clone IMAGE:1446370). // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC057955 // GenBank // Mus musculus histone cluster 2, H4, mRNA (cDNA clone MGC:65490 IMAGE:5359141), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96262993:96263304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_001579 // RefSeq // Mus musculus telomerase RNA component (Terc), telomerase RNA. // chr3 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000082862 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:96414437:96414859:-1 gene:ENSMUSG00000064796 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT044277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT044280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
NM_001256180 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC107364 (BC107364), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000093126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96433788:96452306:-1 gene:ENSMUSG00000046317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// NM_001256181 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC107364 (BC107364), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// ENSMUST00000098841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96433788:96452306:-1 gene:ENSMUSG00000046317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// BC107364 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC107364, mRNA (cDNA clone MGC:130342 IMAGE:40056165), complete cds. // chr3 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NR_040409 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15441 (Gm15441), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96555765:96557815:-1 gene:ENSMUSG00000074398 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96555788:96566801:-1 gene:ENSMUSG00000074398 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000160818 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96606659:96629820:-1 gene:ENSMUSG00000045327 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NR_003619 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 6330549D23 gene (6330549D23Rik), non-coding RNA. // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSMUST00000059190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96606662:96629819:-1 gene:ENSMUSG00000045327 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001162925 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 17 (Nudt17), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_030094 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 17 (Nudt17), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96705892:96708560:-1 gene:ENSMUSG00000028100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000171249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96705892:96708560:-1 gene:ENSMUSG00000028100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK031193 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930426N04 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// BC115559 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 17, mRNA (cDNA clone MGC:144415 IMAGE:40101853), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96706369:96708519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT044313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr3 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000083735 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:96724265:96724400:-1 gene:ENSMUSG00000065669 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163496 // RefSeq // Mus musculus CD160 antigen (Cd160), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001163497 // RefSeq // Mus musculus CD160 antigen (Cd160), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NM_018767 // RefSeq // Mus musculus CD160 antigen (Cd160), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047702 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96800155:96814521:-1 gene:ENSMUSG00000038304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96798763:96829351:-1 gene:ENSMUSG00000038304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000165991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96798763:96829351:-1 gene:ENSMUSG00000038304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF060982 // GenBank // Mus musculus natural killer cell BY55 precursor, mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC021596 // GenBank // Mus musculus CD160 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:35946 IMAGE:5098004), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006501703 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD160 antigen (Cd160), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96800603:96827427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_026229 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 89 (Gpr89), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XR_375569 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 89 (Gpr89), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000029738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96868281:96905346:-1 gene:ENSMUSG00000028096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000139599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96882519:96897436:-1 gene:ENSMUSG00000028096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000146645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96868591:96892923:-1 gene:ENSMUSG00000028096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000154750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96882519:96905312:-1 gene:ENSMUSG00000028096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC010729 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 89, mRNA (cDNA clone MGC:11666 IMAGE:3708143), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96871388:96905223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
NM_008123 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, alpha 8 (Gja8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000062944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:96918863:96926020:-1 gene:ENSMUSG00000049908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC120513 // GenBank // Mus musculus gap junction protein, alpha 8, mRNA (cDNA clone MGC:155750 IMAGE:40129436), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC125569 // GenBank // Mus musculus gap junction protein, alpha 8, mRNA (cDNA clone MGC:159272 IMAGE:40130084), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GU363513 // GenBank // Mus musculus connexin 50 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GU363514 // GenBank // Mus musculus connexin 50 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GU363515 // GenBank // Mus musculus connexin 50 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96919022:96920344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_029933 // RefSeq // Mus musculus B cell CLL/lymphoma 9 (Bcl9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006502291 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B cell CLL/lymphoma 9 (Bcl9), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000046521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:97203662:97227364:-1 gene:ENSMUSG00000038256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000132266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:97210463:97214009:-1 gene:ENSMUSG00000038256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000166341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:97204628:97216507:-1 gene:ENSMUSG00000038256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY296061 // GenBank // Mus musculus BCL9 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC019641 // GenBank // Mus musculus B-cell CLL/lymphoma 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:3978840), complete cds. // chr3 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC137850 // GenBank // Mus musculus B-cell CLL/lymphoma 9, mRNA (cDNA clone MGC:169474 IMAGE:8860869), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000141861 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:97214484:97228330:-1 gene:ENSMUSG00000038256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000019292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:97204860:97227392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT044327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_146275 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1402 (Olfr1402), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:97410217:97411179:-1 gene:ENSMUSG00000051392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC108950 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1402, mRNA (cDNA clone MGC:123878 IMAGE:40044400), complete cds. // chr3 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC108951 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1402, mRNA (cDNA clone MGC:123879 IMAGE:40044401), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:97403386:97411179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_026539 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 1-like (Chd1l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006501961 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 1-like (Chd1l), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000029730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:97560742:97610203:-1 gene:ENSMUSG00000028089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC052385 // GenBank // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:57944 IMAGE:5703859), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC057567 // GenBank // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:66868 IMAGE:6415898), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC062966 // GenBank // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:64788 IMAGE:6415898), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000031631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:97562560:97610171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// AK048742 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230036F01 product:similar to CHROMODOMAIN-HELICASE-DNA-BINDING PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 65 // 65 // 30 // 46 // 1
NM_016966 // RefSeq // Mus musculus 3-phosphoglycerate dehydrogenase (Phgdh), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000065793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:98313170:98339990:-1 gene:ENSMUSG00000053398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC086668 // GenBank // Mus musculus 3-phosphoglycerate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:113796 IMAGE:30633243), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC110673 // GenBank // Mus musculus 3-phosphoglycerate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:117966 IMAGE:6311873), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000031637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:98313303:98339832:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
NM_008295 // RefSeq // Mus musculus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 5 (Hsd3b5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000044094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:98618636:98630309:-1 gene:ENSMUSG00000038092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC012715 // GenBank // Mus musculus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 5, mRNA (cDNA clone MGC:14041 IMAGE:4193717), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// L41519 // GenBank // Mus musculus 3-ketosteroid reductase (HSD3b5) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_153193 // RefSeq // Mus musculus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2 (Hsd3b2), mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000107021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:98711107:98724576:-1 gene:ENSMUSG00000063730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000107022 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:98709255:98724543:-1 gene:ENSMUSG00000063730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026757 // GenBank // Mus musculus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2, mRNA (cDNA clone MGC:30312 IMAGE:5136428), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC040397 // GenBank // Mus musculus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 2, mRNA (cDNA clone MGC:28628 IMAGE:4222081), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013821 // RefSeq // Mus musculus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 6 (Hsd3b6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000029463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:98805504:98814443:-1 gene:ENSMUSG00000027869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000170847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:98805505:98811108:-1 gene:ENSMUSG00000027869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// AB109387 // GenBank // Mus musculus 3beta-Hsd VI mRNA for 3beta-hydroxysteroid dehydrogenase VI, complete cds. // chr3 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// AF031170 // GenBank // Mus musculus 3beta-hydroxysteroid dehydrogenase isoform VI mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// AY046512 // GenBank // Mus musculus 3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase isomerase VI (Hsd3b6) mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// BC053501 // GenBank // Mus musculus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 6, mRNA (cDNA clone MGC:60535 IMAGE:30018625), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000045907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:98805860:98811046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0
NM_008293 // RefSeq // Mus musculus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1 (Hsd3b1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000029465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:98852194:98859766:-1 gene:ENSMUSG00000027871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000107016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:98852197:98859794:-1 gene:ENSMUSG00000027871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000149768 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:98852958:98859794:-1 gene:ENSMUSG00000027871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// BC052659 // GenBank // Mus musculus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:60646 IMAGE:30049155), complete cds. // chr3 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0 /// M58567 // GenBank // Mus musculus delta-5-3-beta-hydroxysteroid dehydrogenase/delta-5-> delta-4 isomerase (Hsd3b) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000045889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:98852552:98898852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_019545 // RefSeq // Mus musculus hydroxyacid oxidase 2 (Hao2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501730 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hydroxyacid oxidase 2 (Hao2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:98874577:98893239:-1 gene:ENSMUSG00000027870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF272947 // GenBank // Mus musculus long-chain L-2-hydroxy acid oxidase (hao2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC027754 // GenBank // Mus musculus hydroxyacid oxidase (glycolate oxidase) 3, mRNA (cDNA clone MGC:29258 IMAGE:5064100), complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:98852552:98898852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
ENSMUST00000083775 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:99113155:99113283:-1 gene:ENSMUSG00000065709 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175552 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 3 (Wdr3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000052120 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:100138180:100162407:-1 gene:ENSMUSG00000033285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC063100 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:70140 IMAGE:6332749), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000146989 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:100142499:100162407:-1 gene:ENSMUSG00000033285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// AK043557 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830007N20 product:similar to WD-REPEAT PROTEIN 3 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000029256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:100138687:100169251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001142952 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 46, member C (Fam46c), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006502212 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 46, member C (Fam46c), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000061455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:100468057:100489324:-1 gene:ENSMUSG00000044468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK015259 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930431B09 product:similar to DJ991C6.1 (NOVEL PROTEIN SIMILAR TO C. ELEGANS F55A12.9 (TR:P91086)) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 90 // 74 // 18 // 20 // 0 /// BC018793 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4913272, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC046309 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 46, member C, mRNA (cDNA clone IMAGE:6306854), partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120717 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 46, member C, mRNA (cDNA clone MGC:155954 IMAGE:40129640), complete cds. // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC120719 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 46, member C, mRNA (cDNA clone MGC:155956 IMAGE:40129642), complete cds. // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000018923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:100472263:100483430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0
NM_010763 // RefSeq // Mus musculus mannosidase, alpha, class 1A, member 2 (Man1a2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000008907 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:100562208:100685503:-1 gene:ENSMUSG00000008763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000130066 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:100620033:100684613:-1 gene:ENSMUSG00000008763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000133642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:100587910:100652592:-1 gene:ENSMUSG00000008763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC049121 // GenBank // Mus musculus mannosidase, alpha, class 1A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:61355 IMAGE:6813258), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC068192 // GenBank // Mus musculus mannosidase, alpha, class 1A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:67036 IMAGE:6813258), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// U03457 // GenBank // Mus musculus domesticus Balb/c clone 4 alpha-mannosidase mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// U03458 // GenBank // Mus musculus domesticus Balb/c clone 416 alpha-mannosidase mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:100545046:100596680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000018963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:100611817:100688306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSMUST00000151697 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:100947463:100952606:-1 gene:ENSMUSG00000033222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// NM_001013026 // RefSeq // Mus musculus transcription termination factor, RNA polymerase II (Ttf2), mRNA. // chr3 // 96 // 96 // 46 // 48 // 1 /// XM_006502150 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription termination factor, RNA polymerase II (Ttf2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1 /// ENSMUST00000076941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:100938860:100969663:-1 gene:ENSMUSG00000033222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 46 // 48 // 1 /// ENSMUST00000127357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:100946350:100969663:-1 gene:ENSMUSG00000033222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 75 // 75 // 36 // 48 // 1 /// AK078759 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030447N19 product:weakly similar to LODESTAR PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 75 // 75 // 36 // 48 // 1 /// BC087733 // GenBank // Mus musculus transcription termination factor, RNA polymerase II, mRNA (cDNA clone MGC:91160 IMAGE:30434981), complete cds. // chr3 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1 /// BC096625 // GenBank // Mus musculus transcription termination factor, RNA polymerase II, mRNA (cDNA clone MGC:106399 IMAGE:30109731), complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 46 // 48 // 1 /// GENSCAN00000018940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:100939968:100969647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1
NM_001099332 // RefSeq // Mus musculus CD101 antigen (Cd101), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001167906 // RefSeq // Mus musculus CD101 antigen (Cd101), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000147399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:100993530:101029556:-1 gene:ENSMUSG00000086564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000167086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:100993532:101022176:-1 gene:ENSMUSG00000086564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:100998075:101022176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_011197 // RefSeq // Mus musculus prostaglandin F2 receptor negative regulator (Ptgfrn), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000102694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:101040232:101110278:-1 gene:ENSMUSG00000027864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF152344 // GenBank // Mus musculus F2 alpha prostoglandin regulatory protein (FPRP) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// BC145713 // GenBank // Mus musculus prostaglandin F2 receptor negative regulator, mRNA (cDNA clone MGC:175600 IMAGE:40131016), complete cds. // chr3 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC145715 // GenBank // Mus musculus prostaglandin F2 receptor negative regulator, mRNA (cDNA clone MGC:175602 IMAGE:40131018), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:101043356:101099774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_172295 // RefSeq // Mus musculus mab-21-like 3 (C. elegans) (Mab21l3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000061831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:101813076:101836223:-1 gene:ENSMUSG00000044313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000118411 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:101813683:101848959:-1 gene:ENSMUSG00000044313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC037703 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC037703, mRNA (cDNA clone MGC:47256 IMAGE:4166596), complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:101749587:101835242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_001039371 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion/cation transporter), member 15 (Slc22a15), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000106928 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:101859924:101924393:-1 gene:ENSMUSG00000033147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000182130 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:101858954:101896870:-1 gene:ENSMUSG00000033147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000183255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:101863741:101924379:-1 gene:ENSMUSG00000033147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AK029695 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930477M19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// BC094925 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion/cation transporter), member 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:6433985). // chr3 // 81 // 72 // 17 // 21 // 0 /// XR_375524 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion/cation transporter), member 15 (Slc22a15), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// ENSMUST00000190824 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:101858930:101924449:-1 gene:ENSMUSG00000033147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:101860439:101924118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_011516 // RefSeq // Mus musculus synaptonemal complex protein 1 (Sycp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501227 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptonemal complex protein 1 (Sycp1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501229 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptonemal complex protein 1 (Sycp1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000029448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:102818499:102936100:-1 gene:ENSMUSG00000027855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137967 // GenBank // Mus musculus synaptonemal complex protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:169591 IMAGE:8860986), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:102831714:102955344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSMUST00000083774 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:102951949:102952113:-1 gene:ENSMUSG00000065708 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK010586 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410024N13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// ENSMUST00000090704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:103198226:103198975:-1 gene:ENSMUSG00000054379 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0 /// NONMMUT044533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000083095 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:103445697:103445800:-1 gene:ENSMUSG00000065029 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_174875 // RefSeq // Mus musculus autophagy related 4A, cysteine peptidase (Atg4a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:140956907:141164270:1 gene:ENSMUSG00000079418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000117271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:103644839:103646023:-1 gene:ENSMUSG00000087119 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC089500 // GenBank // Mus musculus autophagy-related 4A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:107179 IMAGE:30286094), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:103644833:103732378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:140965073:141163314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
ENSMUST00000169286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:103731680:103732553:-1 gene:ENSMUSG00000091115 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC027582 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC027582, mRNA (cDNA clone MGC:41739 IMAGE:1379952), complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:103731665:103732553:-1 gene:ENSMUSG00000091115 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133859 // RefSeq // Mus musculus olfactomedin-like 3 (Olfml3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:103733712:103738001:-1 gene:ENSMUSG00000027848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000154145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:103733700:103737968:-1 gene:ENSMUSG00000027848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC005485 // GenBank // Mus musculus olfactomedin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:7297 IMAGE:3485412), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:103735843:103778297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NR_030676 // RefSeq // Mus musculus putative homeodomain transcription factor 1, opposite strand (Phtf1os), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:103964536:103968581:-1 gene:ENSMUSG00000089998 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001159354 // RefSeq // Mus musculus membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 (Magi3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// NM_133853 // RefSeq // Mus musculus membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 (Magi3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000064371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:104013259:104220374:-1 gene:ENSMUSG00000052539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000121198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:3:104013625:104220103:-1 gene:ENSMUSG00000052539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000122303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:104016469:104220238:-1 gene:ENSMUSG00000052539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// AF213258 // GenBank // Mus musculus membrane-associated guanylate kinase-related MAGI-3 (Magi-3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000039718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:104014969:104219966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0
ENSMUST00000056145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:104350635:104366613:-1 gene:ENSMUSG00000022187 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK044520 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930018I15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// XR_401106 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5546 (Gm5546), misc_RNA. // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001025067 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 2 (Lrig2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006501544 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 2 (Lrig2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000046316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:104453984:104511856:-1 gene:ENSMUSG00000032913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AK155089 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630201D04 product:leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 2, full insert sequence. // chr3 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// BC094228 // GenBank // Mus musculus leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:106698 IMAGE:30362610), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC138422 // GenBank // Mus musculus leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:170047 IMAGE:8861442), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AK158022 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930017H15 product:leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 2, full insert sequence. // chr3 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1 /// GENSCAN00000003619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:104439268:104511691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0
NM_183224 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 19, member A3 (Fam19a3), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501607 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 19, member A3 (Fam19a3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000139783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:104767406:104777547:-1 gene:ENSMUSG00000055865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY325122 // GenBank // Mus musculus TAFA3 mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// BC118531 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 19, member A3, mRNA (cDNA clone MGC:143979 IMAGE:40095917), complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:104752727:104779653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001163440 // RefSeq // Mus musculus Moloney leukemia virus 10 (Mov10), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001163441 // RefSeq // Mus musculus Moloney leukemia virus 10 (Mov10), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_008619 // RefSeq // Mus musculus Moloney leukemia virus 10 (Mov10), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000002297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:104794836:104818242:-1 gene:ENSMUSG00000002227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000106774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:104794836:104818563:-1 gene:ENSMUSG00000002227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000106775 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:104794836:104818563:-1 gene:ENSMUSG00000002227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000166979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:104794836:104818563:-1 gene:ENSMUSG00000002227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000168015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:104794836:104818305:-1 gene:ENSMUSG00000002227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC053743 // GenBank // Mus musculus Moloney leukemia virus 10, mRNA (cDNA clone MGC:59369 IMAGE:6510959), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000003611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:104795149:104818072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0
NM_009797 // RefSeq // Mus musculus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 1 (Capza1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000086725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:105455971:105458829:1 gene:ENSMUSG00000067017 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 86 // 100 // 31 // 36 // 0 /// ENSMUST00000094028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:104822779:104864505:-1 gene:ENSMUSG00000070372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC016232 // GenBank // Mus musculus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:28790 IMAGE:4489604), complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC085506 // GenBank // Mus musculus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:102194 IMAGE:6817308), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:104824984:104850901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:105455983:105456843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// ENSMUST00000187390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:98873064:98873916:-1 gene:ENSMUSG00000100839 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 33 // 100 // 12 // 36 // 0 /// GENSCAN00000026155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:98873060:98873743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 28 // 81 // 8 // 29 // 0 /// GENSCAN00000031616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:37870270:37871113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 94 // 14 // 34 // 0
NM_009520 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 2B (Wnt2b), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:104944805:104961709:-1 gene:ENSMUSG00000027840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF070988 // GenBank // Mus musculus WNT13 protein precursor (Wnt13) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AK043566 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830008G12 product:WNT-2B PROTEIN PRECURSOR (WNT-13), full insert sequence. // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC119276 // GenBank // Mus musculus wingless related MMTV integration site 2b, mRNA (cDNA clone MGC:155592 IMAGE:8734025), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC119278 // GenBank // Mus musculus wingless related MMTV integration site 2b, mRNA (cDNA clone MGC:155594 IMAGE:8734027), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:104928793:104961472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0
NM_001163332 // RefSeq // Mus musculus CTTNBP2 N-terminal like (Cttnbp2nl), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NM_001163333 // RefSeq // Mus musculus CTTNBP2 N-terminal like (Cttnbp2nl), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NM_030249 // RefSeq // Mus musculus CTTNBP2 N-terminal like (Cttnbp2nl), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000077548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:105001915:105053146:-1 gene:ENSMUSG00000062127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000098763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:105001915:105052953:-1 gene:ENSMUSG00000062127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC003236 // GenBank // Mus musculus CTTNBP2 N-terminal like, mRNA (cDNA clone MGC:7720 IMAGE:3498078), complete cds. // chr3 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// AK051259 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130026C18 product:hypothetical protein, MGC:7720, full insert sequence. // chr3 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// EF410090 // GenBank // Mus musculus Accn1/Cttnbp2nl trans-spliced mRNA sequence. // chr3 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000003639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:105004650:105013346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0
NR_040759 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Shal-related family, member 3, opposite strand (Kcnd3os), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000130683 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:105448189:105452955:-1 gene:ENSMUSG00000074346 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:105441595:105451727:-1 gene:ENSMUSG00000074346 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AK018929 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700095B22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_017397 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 20 (Ddx20), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000090680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:105678270:105687574:-1 gene:ENSMUSG00000027905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF217000 // GenBank // Mus musculus DEAD-box corepressor DP103 alpha mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// AF217001 // GenBank // Mus musculus DEAD-box corepressor DP103 beta mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// AF220454 // GenBank // Mus musculus regulator of steroidogenic factor-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC125471 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 20, mRNA (cDNA clone MGC:159174 IMAGE:40129986), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC137721 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 20, mRNA (cDNA clone MGC:169345 IMAGE:8860740), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000132008 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:105681489:105687444:-1 gene:ENSMUSG00000027905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// AK050950 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030043D13 product:DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 20, full insert sequence. // chr3 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000024505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:105678550:105687427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0
NM_145541 // RefSeq // Mus musculus RAS-related protein-1a (Rap1a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006500907 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS-related protein-1a (Rap1a), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000090678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:105727267:105801330:-1 gene:ENSMUSG00000068798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC051419 // GenBank // Mus musculus RAS-related protein-1a, mRNA (cDNA clone MGC:58962 IMAGE:3494423), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC083128 // GenBank // Mus musculus RAS-related protein-1a, mRNA (cDNA clone MGC:102329 IMAGE:6438722), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_001033780 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA I830077J02 gene (I830077J02Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501647 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA I830077J02 gene (I830077J02Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// XM_006501648 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA I830077J02 gene (I830077J02Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000098758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:105925891:105932664:-1 gene:ENSMUSG00000074342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC147821 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA I830077J02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182924 IMAGE:9087538), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC147828 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA I830077J02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182931 IMAGE:9087545), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000126230 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:105927703:105932616:-1 gene:ENSMUSG00000074342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONMMUT044655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001200028 // RefSeq // Mus musculus primary cilia formation (Pifo), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_029604 // RefSeq // Mus musculus primary cilia formation (Pifo), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000010280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:105996957:106014646:-1 gene:ENSMUSG00000010136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000066319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:105996957:106001497:-1 gene:ENSMUSG00000010136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC049757 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700027A23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58817 IMAGE:6773491), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// HM237137 // GenBank // Mus musculus pitchfork short isoform mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// HM237138 // GenBank // Mus musculus pitchfork long isoform mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:105997131:106014605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
XM_006543807 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chitinase-like 5 (Chil5), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:3:106016965:106024916:-1 gene:ENSMUSG00000043873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000066537 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:106016919:106024911:-1 gene:ENSMUSG00000043873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// AB081756 // GenBank // Mus musculus bclp1, bclp2 mRNA for brain chitinase like protein 1, brain chitinase like protein 2, complete cds. // chr3 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// BC116403 // GenBank // Mus musculus chitinase like protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:144458 IMAGE:40102215), complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// XM_006502526 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chitinase-like 5 (Chil5), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// XM_006543809 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chitinase-like 5 (Chil5), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:106017132:106032814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC116402 // GenBank // Mus musculus chitinase like protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:144457 IMAGE:40102213), complete cds. // chr3 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC127175 // GenBank // Mus musculus chitinase like protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:156874 IMAGE:40102216), complete cds. // chr3 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0
NM_009892 // RefSeq // Mus musculus chitinase-like 3 (Chil3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000063062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:106147554:106167564:-1 gene:ENSMUSG00000040809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC061154 // GenBank // Mus musculus chitinase 3-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:74288 IMAGE:30298306), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// D87757 // GenBank // Mus musculus mRNA for ECF-L precursor, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// M94584 // GenBank // Mus musculus secretory protein precursor (Ym1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000024478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:106148544:106216459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1
NM_145126 // RefSeq // Mus musculus chitinase-like 4 (Chil4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000082219 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:106201490:106219507:-1 gene:ENSMUSG00000063779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY049765 // GenBank // Mus musculus secreted protein precursor Ym2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY065557 // GenBank // Mus musculus putative secretory protein precursor (Ym2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC130015 // GenBank // Mus musculus chitinase 3-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:161169 IMAGE:40140436), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:106148544:106216459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_178412 // RefSeq // Mus musculus chitinase-like 6 (Chil6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006501403 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chitinase-like 6 (Chil6), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006501404 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chitinase-like 6 (Chil6), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 95 // 64 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000029510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:106387388:106406182:-1 gene:ENSMUSG00000027902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC051070 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC051070, mRNA (cDNA clone MGC:58999 IMAGE:6308125), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:106387578:106408898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
AK137946 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130043G07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_033207 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2010016I18 gene (2010016I18Rik), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000164330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:106482013:106483437:-1 gene:ENSMUSG00000091575 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AK079963 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530028A13 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSMUST00000190356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:106481982:106485913:-1 gene:ENSMUSG00000091575 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000191570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:106482013:106483461:-1 gene:ENSMUSG00000091575 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000189683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:106482000:106483834:-1 gene:ENSMUSG00000091575 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT044670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_007651 // RefSeq // Mus musculus CD53 antigen (Cd53), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:106758861:106790149:-1 gene:ENSMUSG00000040747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC021310 // GenBank // Mus musculus CD53 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:29192 IMAGE:5010267), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052905 // GenBank // Mus musculus CD53 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:60405 IMAGE:30078163), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:106760804:106769102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_146489 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 266 (Olfr266), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:106821556:106822582:-1 gene:ENSMUSG00000043529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125352 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 266, mRNA (cDNA clone MGC:159055 IMAGE:40129867), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125354 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 266, mRNA (cDNA clone MGC:159057 IMAGE:40129869), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:106821607:106822554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001111143 // RefSeq // Mus musculus chymosin (Cym), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:107211293:107221732:-1 gene:ENSMUSG00000046213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147477 // GenBank // Mus musculus gene model 131, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182236 IMAGE:9056130), complete cds. // chr3 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC171994 // GenBank // Mus musculus gene model 131, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:198699 IMAGE:9054280), complete cds. // chr3 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107211363:107221706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001044382 // RefSeq // Mus musculus prokineticin 1 (Prok1), mRNA. // chr3 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501515 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prokineticin 1 (Prok1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000049852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:107235531:107239707:-1 gene:ENSMUSG00000070368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// BC042707 // GenBank // Mus musculus prokineticin 1, mRNA (cDNA clone MGC:51604 IMAGE:4975079), complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// BC117006 // GenBank // Mus musculus prokineticin 1, mRNA (cDNA clone MGC:151383 IMAGE:40126325), complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// BC117008 // GenBank // Mus musculus prokineticin 1, mRNA (cDNA clone MGC:151385 IMAGE:40126327), complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT044703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr3 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0
NM_001045807 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 15 (Rbm15), mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000061772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:107326110:107333289:-1 gene:ENSMUSG00000048109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK048987 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230088J01 product:similar to ONE TWENTY TWO PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK220162 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4257 protein. // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC120590 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:155827 IMAGE:40129513), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC137741 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:169365 IMAGE:8860760), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000009628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107324956:107333080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000122691 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:107415863:107416195:-1 gene:ENSMUSG00000084640 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT044712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_145922 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 4 (Kcnc4), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000009617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:107438303:107458898:-1 gene:ENSMUSG00000027895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC024837 // GenBank // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:38767 IMAGE:5358950), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107441394:107459951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_026261 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-like 4B (Ubl4b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:107553698:107555073:-1 gene:ENSMUSG00000055891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048443 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-like 4B, mRNA (cDNA clone MGC:58150 IMAGE:6775231), complete cds. // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC061071 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-like 4B, mRNA (cDNA clone MGC:74183 IMAGE:6774419), complete cds. // chr3 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107554376:107587802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_153563 // RefSeq // Mus musculus striatin interacting protein 1 (Strip1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000064759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:107612532:107631710:-1 gene:ENSMUSG00000014601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK122553 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1761 protein. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC023952 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 40, member A, mRNA (cDNA clone MGC:38111 IMAGE:5320305), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK035833 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630009A08 product:hypothetical Proline-rich region containing protein, full insert sequence. // chr3 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// GENSCAN00000006232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107613219:107631680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0
AK136832 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330112K21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_015459 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933431E20 gene (4933431E20Rik), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000131345 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:107888850:107896213:-1 gene:ENSMUSG00000086968 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000144591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:107890033:107895766:-1 gene:ENSMUSG00000086968 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000152663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:107891471:107895798:-1 gene:ENSMUSG00000086968 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:107892895:107895773:-1 gene:ENSMUSG00000086968 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// AK043835 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830038O11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONMMUT044730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000006259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107901506:107911249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1
NM_026672 // RefSeq // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 7 (Gstm7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006501971 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutathione S-transferase, mu 7 (Gstm7), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// XM_006501972 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutathione S-transferase, mu 7 (Gstm7), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000004137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:107926334:107931817:-1 gene:ENSMUSG00000004035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000106687 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:107926707:107931667:-1 gene:ENSMUSG00000004035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000106688 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:107926810:107931614:-1 gene:ENSMUSG00000004035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000124215 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:107929132:107931610:-1 gene:ENSMUSG00000004035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 53 // 14 // 16 // 0 /// BC051924 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 7, mRNA (cDNA clone MGC:62165 IMAGE:5692787), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000133947 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:107929063:107931579:-1 gene:ENSMUSG00000004035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000006247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107926891:107968895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_008184 // RefSeq // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 6 (Gstm6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000106683 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:107938962:107943362:-1 gene:ENSMUSG00000068762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000106684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:107938848:107943734:-1 gene:ENSMUSG00000068762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000106685 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:107938847:107943749:-1 gene:ENSMUSG00000068762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC031818 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 6, mRNA (cDNA clone MGC:19322 IMAGE:4196506), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AJ000413 // GenBank // Mus musculus mRNA for glutathione S-transferase class M5. // chr3 // 69 // 72 // 9 // 13 // 0 /// ENSMUST00000106680 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:107941818:107943715:-1 gene:ENSMUSG00000068762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// ENSMUST00000106681 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:107940994:107943413:-1 gene:ENSMUSG00000068762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// ENSMUST00000155926 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:107939106:107943383:-1 gene:ENSMUSG00000068762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// GENSCAN00000006247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107926891:107968895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_010359 // RefSeq // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 3 (Gstm3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000004136 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:107963696:107969283:-1 gene:ENSMUSG00000004038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC044927 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 3, mRNA (cDNA clone MGC:49522 IMAGE:5051815), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000006247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107926891:107968895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_008183 // RefSeq // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 2 (Gstm2), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000012348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:107981702:107986453:-1 gene:ENSMUSG00000040562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC037068 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 2, mRNA (cDNA clone MGC:46923 IMAGE:4990201), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// J04696 // GenBank // Mouse glutathione S-transferase class mu (GST5-5) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000006337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:107982049:107986393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_010358 // RefSeq // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 1 (Gstm1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006501017 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutathione S-transferase, mu 1 (Gstm1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000004140 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108012255:108017973:-1 gene:ENSMUSG00000058135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC003822 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 1, mRNA (cDNA clone MGC:6200 IMAGE:3600444), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// BC046758 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 1, mRNA (cDNA clone MGC:57915 IMAGE:5693552), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// BC091763 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase, mu 1, mRNA (cDNA clone MGC:103033 IMAGE:5102093), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// J03952 // GenBank // Mouse, glutathione transferase GT8.7 mRNA, complete cds. // chr3 // 82 // 79 // 9 // 11 // 0 /// J04632 // GenBank // Mouse glutathione S-transferase class mu (GST1-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000126593 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108014794:108017806:-1 gene:ENSMUSG00000058135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_010306 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting 3 (Gnai3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006501007 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting 3 (Gnai3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000000001 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108107280:108146146:-1 gene:ENSMUSG00000000001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC041107 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting 3, mRNA (cDNA clone MGC:46956 IMAGE:2648164), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108109422:108146005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_175470 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 61 (Gpr61), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_375520 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 61 (Gpr61), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000062028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108148321:108154882:-1 gene:ENSMUSG00000046793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000116284 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108148657:108154882:-1 gene:ENSMUSG00000046793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC116333 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 61, mRNA (cDNA clone MGC:144036 IMAGE:40096913), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC116334 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 61, mRNA (cDNA clone MGC:144037 IMAGE:40096914), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001081320 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b-561 domain containing 1 (Cyb561d1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_028061 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b-561 domain containing 1 (Cyb561d1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000065664 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108195771:108200834:-1 gene:ENSMUSG00000048796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000106654 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108198273:108200595:-1 gene:ENSMUSG00000048796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000106655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108195687:108200834:-1 gene:ENSMUSG00000048796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155099 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108195771:108201212:-1 gene:ENSMUSG00000048796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK005419 // GenBank HTC // Mus musculus adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1600010M23 product:RIKEN cDNA 1600010M23 gene, full insert sequence. // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC137590 // GenBank // Mus musculus cytochrome b-561 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:169214 IMAGE:8860609), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_008596 // RefSeq // Mus musculus synaptophysin-like 2 (Sypl2), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:108212266:108226599:-1 gene:ENSMUSG00000027887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000141387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108211472:108226648:-1 gene:ENSMUSG00000027887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000156371 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108217301:108226643:-1 gene:ENSMUSG00000027887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// AB010140 // GenBank // Mus musculus mRNA for mitsugumin29, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK052749 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630042E03 product:mitsugumin 29, full insert sequence. // chr3 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// BC030038 // GenBank // Mus musculus synaptophysin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:41202 IMAGE:1068035), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006501094 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptophysin-like 2 (Sypl2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000006237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108214536:108226417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000119163 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108239383:108239911:-1 gene:ENSMUSG00000083462 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT044760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NR_040560 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12522 (Gm12522), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000142833 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108379277:108383741:-1 gene:ENSMUSG00000074281 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001004177 // RefSeq // Mus musculus cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 (flamingo homolog, Drosophila) (Celsr2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// NM_017392 // RefSeq // Mus musculus cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 (flamingo homolog, Drosophila) (Celsr2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000090558 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108390851:108415552:-1 gene:ENSMUSG00000068740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000147251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108392222:108398951:-1 gene:ENSMUSG00000068740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// AB028499 // GenBank // Mus musculus mRNA for Flamingo 1, complete cds. // chr3 // 86 // 95 // 31 // 36 // 0 /// BC005499 // GenBank // Mus musculus cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 (flamingo homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:3488511), partial cds. // chr3 // 95 // 53 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108393007:108415494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
NM_001204979 // RefSeq // Mus musculus seryl-aminoacyl-tRNA synthetase (Sars), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NM_011319 // RefSeq // Mus musculus seryl-aminoacyl-tRNA synthetase (Sars), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000090553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108424865:108445198:-1 gene:ENSMUSG00000068739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000102625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108426612:108445169:-1 gene:ENSMUSG00000068739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000132467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108428231:108445143:-1 gene:ENSMUSG00000068739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000153499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108429350:108445209:-1 gene:ENSMUSG00000068739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// BC008612 // GenBank // Mus musculus seryl-aminoacyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:7162 IMAGE:3257101), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// M74012 // GenBank // Mus musculus transfer RNA-Ser synthetase (SERS) mRNA, partial cds. // chr3 // 94 // 47 // 17 // 18 // 0 /// AK147825 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270055D13 product:seryl-aminoacyl-tRNA synthetase 1, full insert sequence. // chr3 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1 /// GENSCAN00000024982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108426830:108445132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0
GENSCAN00000024987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108449111:108451566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006501413 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 5330417C22 gene (5330417C22Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000048012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:108458069:108536517:-1 gene:ENSMUSG00000040412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000106625 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:108455694:108536536:-1 gene:ENSMUSG00000040412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000106626 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:108458175:108536527:-1 gene:ENSMUSG00000040412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000185128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108458069:108536522:-1 gene:ENSMUSG00000040412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC051424 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5330417C22 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4502533), partial cds. // chr3 // 55 // 55 // 24 // 44 // 1 /// GENSCAN00000024989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108458400:108505171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0
NM_026198 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 167B (Tmem167b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000090546 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108556425:108562466:-1 gene:ENSMUSG00000068732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108556425:108562170:-1 gene:ENSMUSG00000068732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK155399 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630224D22 product:Protein x 013 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC050932 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 167B, mRNA (cDNA clone MGC:63285 IMAGE:6811263), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC055449 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 167B, mRNA (cDNA clone MGC:65337 IMAGE:3993993), complete cds. // chr3 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108558878:108562280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_029522 // RefSeq // Mus musculus G-protein signalling modulator 2 (AGS3-like, C. elegans) (Gpsm2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000029482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108678638:108722309:-1 gene:ENSMUSG00000027883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000145558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108701840:108711670:-1 gene:ENSMUSG00000027883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AY081187 // GenBank // Mus musculus Pins mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC021308 // GenBank // Mus musculus G-protein signalling modulator 2 (AGS3-like, C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:29185 IMAGE:5007832), complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108679579:108711311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
NM_011504 // RefSeq // Mus musculus syntaxin binding protein 3A (Stxbp3a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000102621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108793176:108840511:-1 gene:ENSMUSG00000027882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC062901 // GenBank // Mus musculus syntaxin binding protein 3A, mRNA (cDNA clone MGC:86097 IMAGE:6810254), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// D30798 // GenBank // Mus musculus mRNA for unc-18 homologue, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// U19521 // GenBank // Mus musculus vesicle transport protein (munc-18c) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// ENSMUST00000124782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108794428:108802534:-1 gene:ENSMUSG00000027882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// AK138769 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430058F15 product:syntaxin binding protein 3, full insert sequence. // chr3 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// ENSMUST00000150010 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108800112:108805731:-1 gene:ENSMUSG00000027882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// GENSCAN00000024979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108778660:108840468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_001165965 // RefSeq // Mus musculus fibronectin type III domain containing 7 (Fndc7), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_177091 // RefSeq // Mus musculus fibronectin type III domain containing 7 (Fndc7), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:108853678:108890008:-1 gene:ENSMUSG00000045326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000102620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:108855323:108890008:-1 gene:ENSMUSG00000045326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:108853678:108889706:-1 gene:ENSMUSG00000045326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC111898 // GenBank // Mus musculus fibronectin type III domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:132926 IMAGE:40061374), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK165075 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230037L02 product:hypothetical Fibronectin, type III/Serine-rich region profile/Fibronectin, type III-like fold containing protein, full insert sequence. // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108847816:108886519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000050914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:108940053:108940445:-1 gene:ENSMUSG00000051638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK005845 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700010M06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163567 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 102, member B (Fam102b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000046924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:108970997:109027273:-1 gene:ENSMUSG00000040339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000171143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:108970997:109027607:-1 gene:ENSMUSG00000040339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:108974378:109055758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1
ENSMUST00000051253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:110143685:110144011:-1 gene:ENSMUSG00000059857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000050836 // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133268 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:109780046:110144011:-1 gene:ENSMUSG00000059857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK053689 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130203P04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178891 // RefSeq // Mus musculus protein arginine N-methyltransferase 6 (Prmt6), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000106567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:110248549:110250998:-1 gene:ENSMUSG00000049300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// BC022899 // GenBank // Mus musculus protein arginine N-methyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:30554 IMAGE:5067159), complete cds. // chr3 // 82 // 72 // 23 // 28 // 0 /// NR_024139 // RefSeq // Mus musculus protein arginine N-methyltransferase 6 (Prmt6), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr3 // 67 // 67 // 26 // 39 // 1 /// ENSMUST00000168412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:110246109:110250998:-1 gene:ENSMUSG00000049300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 67 // 67 // 26 // 39 // 1 /// BC066221 // GenBank // Mus musculus protein arginine N-methyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:76783 IMAGE:30436952), complete cds. // chr3 // 56 // 56 // 22 // 39 // 1 /// GENSCAN00000047288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:110249835:110251139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000190378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:110246112:110250993:-1 gene:ENSMUSG00000049300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 26 // 39 // 1
XM_006502582 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leptin receptor gene-related protein-like (LOC102632213), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000055878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:113053889:113054284:-1 gene:ENSMUSG00000045952 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000022397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:113053889:113054263:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0
NM_001110505 // RefSeq // Mus musculus amylase 1, salivary (Amy1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_007446 // RefSeq // Mus musculus amylase 1, salivary (Amy1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000067980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:113555710:113577830:-1 gene:ENSMUSG00000074264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000106540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:113555953:113574762:-1 gene:ENSMUSG00000074264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000142505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:113562690:113574272:-1 gene:ENSMUSG00000074264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000172885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:113556149:113562018:-1 gene:ENSMUSG00000074264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC009121 // GenBank // Mus musculus amylase 1, salivary, mRNA (cDNA clone MGC:11568 IMAGE:3710941), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// V00720 // GenBank // Messenger RNA for mouse salivary alpha-amylase. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:113555984:113630054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_007901 // RefSeq // Mus musculus sphingosine-1-phosphate receptor 1 (S1pr1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:115710433:115715055:-1 gene:ENSMUSG00000045092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049094 // GenBank // Mus musculus sphingosine-1-phosphate receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:61190 IMAGE:6415920), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC051023 // GenBank // Mus musculus sphingosine-1-phosphate receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:54424 IMAGE:6494262), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_023214 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7 (Slc30a7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000067485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:115938973:116007406:-1 gene:ENSMUSG00000054414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF233322 // GenBank // Mus musculus zinc transporter like 2 (Zntl2) mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// AF529196 // GenBank // Mus musculus zinc transporter ZnT7 (Znt7) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC017136 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:27671 IMAGE:4911068), complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC050193 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:60465 IMAGE:30019802), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:115946349:116016519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
BC011159 // GenBank // Mus musculus vascular cell adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:18507 IMAGE:4206476), complete cds. // chr3 // 94 // 86 // 29 // 31 // 0 /// BC029823 // GenBank // Mus musculus vascular cell adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:36028 IMAGE:4196681), complete cds. // chr3 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// L08431 // GenBank // Mus musculus vascular cell adhesion molecule phosphatidylinositol-form mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 39 // 13 // 14 // 0 /// U12884 // GenBank // Mus musculus C57BL/6 vascular cell adhesion molecule-1 truncated form T-VCAM-1 (VCAM-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// NM_011693 // RefSeq // Mus musculus vascular cell adhesion molecule 1 (Vcam1), mRNA. // chr3 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSMUST00000029574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:116110020:116129688:-1 gene:ENSMUSG00000027962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// M84487 // GenBank // Mouse vascular cell adhesion molecule-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1 /// CT010373 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836C0653D for gene Vcam1, Vascular cell adhesion molecule 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr3 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// GENSCAN00000005717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:116110877:116128629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1
NM_022427 // RefSeq // Mus musculus G-protein coupled receptor 88 (Gpr88), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501858 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G-protein coupled receptor 88 (Gpr88), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000090473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:116249654:116253484:-1 gene:ENSMUSG00000068696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB042408 // GenBank // Mus musculus strg mRNA for striatum-specific G protein-coupled receptor, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC051941 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 88, mRNA (cDNA clone MGC:62186 IMAGE:5708059), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC157981 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 88, mRNA (cDNA clone MGC:189800 IMAGE:9007300), complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000005773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:116241475:116252660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_001080818 // RefSeq // Mus musculus CDC14 cell division cycle 14A (Cdc14a), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001173553 // RefSeq // Mus musculus CDC14 cell division cycle 14A (Cdc14a), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501419 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CDC14 cell division cycle 14A (Cdc14a), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006501420 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CDC14 cell division cycle 14A (Cdc14a), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000090464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:116272553:116424032:-1 gene:ENSMUSG00000033502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000106491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:116272553:116423986:-1 gene:ENSMUSG00000033502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC072644 // GenBank // Mus musculus CDC14 cell division cycle 14 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:100044 IMAGE:30356962), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000127704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:116326039:116424032:-1 gene:ENSMUSG00000033502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// AK048250 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130043F22 product:similar to CDC14A3 PHOSPHATASE [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// GENSCAN00000009586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:116321450:116354800:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
ENSMUST00000158435 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:116448389:116448564:-1 gene:ENSMUSG00000089060 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT044900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008246 // RefSeq // Mus musculus hippocampus abundant gene transcript 1 (Hiat1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006501030 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hippocampus abundant gene transcript 1 (Hiat1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:116631164:116662677:-1 gene:ENSMUSG00000089911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC118047 // GenBank // Mus musculus hippocampus abundant gene transcript 1, mRNA (cDNA clone MGC:144858 IMAGE:40106779), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// D88315 // GenBank // Mus musculus mRNA for tetracycline transporter-like protein, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000140672 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:116641902:116681260:-1 gene:ENSMUSG00000089911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000009607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:116631938:116651215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_023245 // RefSeq // Mus musculus palmdelphin (Palmd), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000040097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:116918256:116968987:-1 gene:ENSMUSG00000033377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000119557 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:116921858:116968858:-1 gene:ENSMUSG00000033377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF263246 // GenBank // Mus musculus PALML mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// AK136939 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330200H01 product:palmdelphin, full insert sequence. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AL391037 // GenBank // Mus musculus mRNA full length insert cDNA clone EUROIMAGE 1230249. // chr3 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC010193 // GenBank // Mus musculus palmdelphin, mRNA (cDNA clone MGC:7070 IMAGE:3156945), complete cds. // chr3 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000143611 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:116927280:116968986:-1 gene:ENSMUSG00000033377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NR_038029 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700061I17 gene (1700061I17Rik), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:117060517:117077765:-1 gene:ENSMUSG00000028009 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:116998961:117077136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_177664 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 3, Brigham & Womens Genetics 0562 expressed (D3Bwg0562e), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000061071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:117319145:117360876:-1 gene:ENSMUSG00000044667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000125664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:117321109:117360876:-1 gene:ENSMUSG00000044667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF541279 // GenBank // Mus musculus plasticity related gene 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AY266266 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c plasticity related gene 1 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AY266267 // GenBank // Mus musculus strain 129/J plasticity related gene 1 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC137701 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 3, Brigham & Womens Genetics 0562 expressed, mRNA (cDNA clone MGC:169325 IMAGE:8860720), complete cds. // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC137702 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 3, Brigham & Womens Genetics 0562 expressed, mRNA (cDNA clone MGC:169326 IMAGE:8860721), complete cds. // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC082323 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 3, Brigham & Womens Genetics 0562 expressed, mRNA (cDNA clone IMAGE:6850649). // chr3 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000053176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:117321906:117360248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_001190156 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 7 (Snx7), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_029655 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 7 (Snx7), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000029639 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:117781497:117868936:-1 gene:ENSMUSG00000028007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000167877 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:117782299:117868821:-1 gene:ENSMUSG00000028007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000169812 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:117781871:117868880:-1 gene:ENSMUSG00000028007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC087942 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 7, mRNA (cDNA clone MGC:107328 IMAGE:30303462), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:117832691:117868965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_019550 // RefSeq // Mus musculus polypyrimidine tract binding protein 2 (Ptbp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:119718742:119783388:-1 gene:ENSMUSG00000028134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF095718 // GenBank // Mus musculus RRM-type RNA-binding protein brPTB mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK033964 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330129J19 product:polypyrimidine tract binding protein 2, full insert sequence. // chr3 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC010255 // GenBank // Mus musculus polypyrimidine tract binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:11671 IMAGE:3709255), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK050624 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920023C19 product:polypyrimidine tract binding protein 2, full insert sequence. // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000039293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:119720603:119763399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000083750 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:120317884:120317989:-1 gene:ENSMUSG00000065684 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT044988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_145394 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 44, member 3 (Slc44a3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000039197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:121459529:121532344:-1 gene:ENSMUSG00000039865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC010552 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 44, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:7894 IMAGE:3582543), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC025548 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 44, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:38127 IMAGE:5320841), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:121506248:121532187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0
NR_036456 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A730020M07 gene (A730020M07Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NR_036457 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A730020M07 gene (A730020M07Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr3 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// ENSMUST00000050571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:121637145:121643485:-1 gene:ENSMUSG00000044522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NR_036458 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A730020M07 gene (A730020M07Rik), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONMMUT045037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_008991 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 3 (Abcd3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000029770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:121758909:121815302:-1 gene:ENSMUSG00000028127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC009119 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:6967 IMAGE:3154529), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 45 // 47 // 0 /// BC054446 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:62641 IMAGE:6477711), complete cds. // chr3 // 93 // 98 // 43 // 46 // 0 /// X89569 // GenBank // M.musculus mRNA for peroxisomal membrane protein 68. // chr3 // 96 // 55 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:121760232:121815118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 28 // 28 // 0
NM_001114665 // RefSeq // Mus musculus formin binding protein 1-like (Fnbp1l), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NM_153118 // RefSeq // Mus musculus formin binding protein 1-like (Fnbp1l), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000162409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:122538719:122619667:-1 gene:ENSMUSG00000039735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000162947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:122542105:122619553:-1 gene:ENSMUSG00000039735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// BC034510 // GenBank // Mus musculus formin binding protein 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:30506 IMAGE:4481144), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:122539971:122639590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 93 // 37 // 40 // 1
NM_133857 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 53 (Usp53), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000090379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:122933601:122984447:-1 gene:ENSMUSG00000039701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK040332 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430087K14 product:similar to Ubiquitin specific proteinase 53 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// AK140453 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B830035G11 product:weakly similar to Hypothetical ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family 2 containing protein [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// BC132339 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 53, mRNA (cDNA clone MGC:163970 IMAGE:40130616), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC145707 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 53, mRNA (cDNA clone MGC:175594 IMAGE:40131010), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK030317 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5031428M13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// BC022221 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 53, mRNA (cDNA clone IMAGE:4236151), partial cds. // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000051943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:122933722:122968732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NM_021503 // RefSeq // Mus musculus myozenin 2 (Myoz2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006501828 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myozenin 2 (Myoz2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029761 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:123006206:123034990:-1 gene:ENSMUSG00000028116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000141588 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:123013599:123034844:-1 gene:ENSMUSG00000028116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000143464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:123013599:123034969:-1 gene:ENSMUSG00000028116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AY013296 // GenBank // Mus musculus calcineurin-binding protein calsarcin-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BC024360 // GenBank // Mus musculus myozenin 2, mRNA (cDNA clone MGC:35862 IMAGE:5012436), complete cds. // chr3 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:123024043:123034951:-1 gene:ENSMUSG00000028116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// AK085927 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830030K03 product:myozenin 2, full insert sequence. // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000051944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:123006383:123034249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_080451 // RefSeq // Mus musculus synaptopodin 2 (Synpo2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006500925 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptopodin 2 (Synpo2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006500928 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptopodin 2 (Synpo2), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000051443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:123110964:123236147:-1 gene:ENSMUSG00000050315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000106426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:3:123076519:123236147:-1 gene:ENSMUSG00000050315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106427 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:123076519:123236147:-1 gene:ENSMUSG00000050315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC158045 // GenBank // Mus musculus synaptopodin 2, mRNA (cDNA clone MGC:189849 IMAGE:9007349), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139160 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:123076519:123112810:-1 gene:ENSMUSG00000050315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000051941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:123079719:123122942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NR_028573 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 24 (Snora24), small nucleolar RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_028574 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA host gene 8 (Snhg8), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174989 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:123507937:123508066:-1 gene:ENSMUSG00000092730 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00005186 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONMMUT045120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006502120 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700006A11 gene (1700006A11Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:124400990:124426039:-1 gene:ENSMUSG00000027973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC137977 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700006A11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169601 IMAGE:8860996), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:124401328:124503090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000047110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:124556352:124581091:-1 gene:ENSMUSG00000039174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:124573217:124581100:-1 gene:ENSMUSG00000039174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000180162 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:124556352:124581091:-1 gene:ENSMUSG00000039174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK005639 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700003H04 product:hypothetical PH domain-like structure containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK016589 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933400D22 product:hypothetical PH domain-like structure containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_015460 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700003H04 gene (1700003H04Rik), long non-coding RNA. // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000178485 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:124565891:124581091:-1 gene:ENSMUSG00000039174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000178953 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:124573218:124581091:-1 gene:ENSMUSG00000039174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// BC100480 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30917782. // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSMUST00000182285 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:125042259:125043275:-1 gene:ENSMUSG00000098033 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:125042259:125127339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
NM_011674 // RefSeq // Mus musculus UDP galactosyltransferase 8A (Ugt8a), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:125865359:125938550:-1 gene:ENSMUSG00000032854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK128994 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3026744, highly similar to 2-hydroxyacylsphingosine 1-beta-galactosyltransferase precursor (EC 2.4.1.45). // chr3 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC016885 // GenBank // Mus musculus UDP galactosyltransferase 8A, mRNA (cDNA clone MGC:18397 IMAGE:4223057), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// X92122 // GenBank // M.musculus mRNA coding for UDP-galactose ceramide-galactosyl transferase. // chr3 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:125856013:125915459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_138593 // RefSeq // Mus musculus La ribonucleoprotein domain family, member 7 (Larp7), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000029588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:127536954:127553348:-1 gene:ENSMUSG00000027968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000051563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:127536954:127555290:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
NM_027808 // RefSeq // Mus musculus alpha-kinase 1 (Alpk1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502104 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alpha-kinase 1 (Alpk1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XR_375582 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alpha-kinase 1 (Alpk1), transcript variant X9, misc_RNA. // chr3 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000029662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:127670932:127780513:-1 gene:ENSMUSG00000028028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:127670399:127780527:-1 gene:ENSMUSG00000028028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK173191 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1527 protein. // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:127660827:127687690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027808 // RefSeq // Mus musculus alpha-kinase 1 (Alpk1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502104 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alpha-kinase 1 (Alpk1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_375582 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alpha-kinase 1 (Alpk1), transcript variant X9, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:127670932:127780513:-1 gene:ENSMUSG00000028028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159720 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:127679520:127686340:-1 gene:ENSMUSG00000028028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:127670399:127780527:-1 gene:ENSMUSG00000028028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK173191 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1527 protein. // chr3 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:127660827:127687690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027808 // RefSeq // Mus musculus alpha-kinase 1 (Alpk1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502104 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alpha-kinase 1 (Alpk1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XR_375582 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alpha-kinase 1 (Alpk1), transcript variant X9, misc_RNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:127670932:127780513:-1 gene:ENSMUSG00000028028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:127670399:127780527:-1 gene:ENSMUSG00000028028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000161239 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:127724285:127780513:-1 gene:ENSMUSG00000028028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK041315 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530099G12 product:LYMPHOCYTE ALPHA-KINASE homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK173191 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1527 protein. // chr3 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:127691935:127751961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_145964 // RefSeq // Mus musculus adaptor-related protein complex 1 associated regulatory protein (Ap1ar), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000051737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:127807264:127837492:-1 gene:ENSMUSG00000074238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC002199 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC002199, mRNA (cDNA clone IMAGE:3489243), complete cds. // chr3 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// AK200436 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0134I24, strand:unspecified. // chr3 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// AK148810 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120449I18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000051576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:127808491:127817986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// BC085476 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA sequence BC002199, mRNA (cDNA clone IMAGE:6813431), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr3 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_027482 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5730508B09 gene (5730508B09Rik), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:127869688:127896323:-1 gene:ENSMUSG00000050549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC039568 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730508B09 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:1429515), partial cds. // chr3 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC116791 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730508B09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151168 IMAGE:40126110), complete cds. // chr3 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// BC116793 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730508B09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151170 IMAGE:40126112), complete cds. // chr3 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// BC144728 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053276. // chr3 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0
ENSMUST00000098624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:128953782:128955098:-1 gene:ENSMUSG00000074236 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000038126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:128953782:128955095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_010113 // RefSeq // Mus musculus epidermal growth factor (Egf), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:129677575:129755322:-1 gene:ENSMUSG00000028017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC017681 // GenBank // Mus musculus epidermal growth factor, mRNA (cDNA clone MGC:18573 IMAGE:4221592), complete cds. // chr3 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC060741 // GenBank // Mus musculus epidermal growth factor, mRNA (cDNA clone MGC:68182 IMAGE:4164289), complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC092277 // GenBank // Mus musculus epidermal growth factor, mRNA (cDNA clone MGC:102520 IMAGE:4240429), complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK157778 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130034N13 product:epidermal growth factor, full insert sequence. // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000022146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:129715635:129754964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000022164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:129678320:129711451:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001287224 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 3 (Lrit3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KF954709 // GenBank // Mus musculus LRIT3 (Lrit3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000179187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:129788291:129804030:-1 gene:ENSMUSG00000093865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENSMUST00000185462 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:129787881:129804030:-1 gene:ENSMUSG00000093865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:129788291:129830841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000188978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:129790930:129800521:-1 gene:ENSMUSG00000093865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_009102 // RefSeq // Mus musculus retinal pigment epithelium derived rhodopsin homolog (Rrh), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:129808577:129822505:-1 gene:ENSMUSG00000028012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000171313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:129804408:129822493:-1 gene:ENSMUSG00000028012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// AF012271 // GenBank // Mus musculus visual pigment-like receptor peropsin (Rrh) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 74 // 27 // 28 // 0 /// BC046288 // GenBank // Mus musculus retinal pigment epithelium derived rhodopsin homolog, mRNA (cDNA clone MGC:54766 IMAGE:6468540), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000022168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:129788291:129830841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1
NM_026578 // RefSeq // Mus musculus GAR1 ribonucleoprotein homolog (yeast) (Gar1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006501963 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GAR1 ribonucleoprotein homolog (yeast) (Gar1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029643 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:129824912:129831396:-1 gene:ENSMUSG00000028010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000143545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:129824919:129825674:-1 gene:ENSMUSG00000028010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000149071 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:129826843:129830932:-1 gene:ENSMUSG00000028010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC021873 // GenBank // Mus musculus GAR1 ribonucleoprotein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:28064 IMAGE:3709271), complete cds. // chr3 // 79 // 100 // 27 // 34 // 0 /// BC048685 // GenBank // Mus musculus GAR1 ribonucleoprotein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:59268 IMAGE:6510731), complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// ENSMUST00000134174 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:129824916:129829366:-1 gene:ENSMUSG00000028010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// NONMMUT045258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000022168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:129788291:129830841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001293644 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 109B (Ccdc109b), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_025779 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 109B (Ccdc109b), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029624 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:129914960:129970206:-1 gene:ENSMUSG00000027994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000146340 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:129917080:129969989:-1 gene:ENSMUSG00000027994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000153506 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:129914982:129970076:-1 gene:ENSMUSG00000027994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC049571 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 109B, mRNA (cDNA clone MGC:58175 IMAGE:6588325), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:129915109:129918813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0
NM_207209 // RefSeq // Mus musculus Sec24 related gene family, member B (S. cerevisiae) (Sec24b), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000001079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:129982759:130060907:-1 gene:ENSMUSG00000001052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000165873 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:129990412:130040863:-1 gene:ENSMUSG00000001052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000165889 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:130007385:130040833:-1 gene:ENSMUSG00000001052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 16 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000168644 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:130007411:130041139:-1 gene:ENSMUSG00000001052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 16 // 8 // 8 // 0 /// BC046776 // GenBank // Mus musculus Sec24 related gene family, member B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:61181 IMAGE:5706007), complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// BC057355 // GenBank // Mus musculus Sec24 related gene family, member B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:67201 IMAGE:6833698), complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000022148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:129983628:130061082:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// NONMMUT045267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 16 // 8 // 8 // 0
NM_025509 // RefSeq // Mus musculus oligosaccharyltransferase complex subunit (Ostc), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000043937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:130695921:130709444:-1 gene:ENSMUSG00000041084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC021935 // GenBank // Mus musculus oligosaccharyltransferase complex subunit, mRNA (cDNA clone MGC:35748 IMAGE:5149713), complete cds. // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:130699911:130709450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001287581 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L34 (Rpl34), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// NM_026724 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L34 (Rpl34), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000062601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:130726831:130730337:-1 gene:ENSMUSG00000062006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC058118 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L34, mRNA (cDNA clone MGC:69661 IMAGE:5683990), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
AK040169 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430072C10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// KnowTID_00005200 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT045293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_008212 // RefSeq // Mus musculus hydroxyacyl-Coenzyme A dehydrogenase (Hadh), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:131233419:131272101:-1 gene:ENSMUSG00000027984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC064712 // GenBank // Mus musculus hydroxyacyl-Coenzyme A dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:74293 IMAGE:30303218), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// D29639 // GenBank // Mus musculus embryonal carcinoma cell mRNA for 3-hydroxyacyl CoA dehydrogenase, complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSMUST00000152427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:131245101:131272024:-1 gene:ENSMUSG00000027984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// AK148481 // GenBank HTC // Mus musculus adult pancreas islet cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C820008L07 product:L-3-hydroxyacyl-Coenzyme A dehydrogenase, short chain, full insert sequence. // chr3 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000042595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:131234169:131252048:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
XR_375583 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily u, polypeptide 1 (Cyp2u1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 96 // 69 // 23 // 24 // 0 /// AK018458 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430436A10 product:weakly similar to RAT CYTOCHROME P-450B TYPE E (FRAGMENT) [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr3 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// AK041477 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630013N17 product:weakly similar to RAT CYTOCHROME P-450B TYPE E (FRAGMENT) [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr3 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NM_027816 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily u, polypeptide 1 (Cyp2u1), mRNA. // chr3 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// ENSMUST00000106337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:131290491:131303227:-1 gene:ENSMUSG00000027983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// GENSCAN00000042611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:131284392:131316319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1
NM_028943 // RefSeq // Mus musculus sphingomyelin synthase 2 (Sgms2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006502194 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sphingomyelin synthase 2 (Sgms2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006502196 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sphingomyelin synthase 2 (Sgms2), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000090246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:131318985:131344933:-1 gene:ENSMUSG00000050931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126569 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:131342110:131344940:-1 gene:ENSMUSG00000050931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// BC117782 // GenBank // Mus musculus sphingomyelin synthase 2, mRNA (cDNA clone MGC:143669 IMAGE:40092081), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:131327569:131342223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_007926 // RefSeq // Mus musculus aminoacyl tRNA synthetase complex-interacting multifunctional protein 1 (Aimp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:132660498:132683879:-1 gene:ENSMUSG00000028029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC002054 // GenBank // Mus musculus small inducible cytokine subfamily E, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:6083 IMAGE:3496254), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U10118 // GenBank // Mus musculus endothelial-monocyte activating polypeptide II mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:132644414:132677368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000054105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:133116432:133137302:-1 gene:ENSMUSG00000040969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000147041 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:133112278:133234889:-1 gene:ENSMUSG00000040969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK052594 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630002B10 product:inferred: hypothetical protein {Macaca fascicularis}, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK052650 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630013G24 product:hypothetical Src homology 3 (SH3) domain profile/Repeat in HS1/Cortactin/Src homology 3 (SH3) domain containing protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000045931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:133116440:133197260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_029953 // RefSeq // Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 38 (Arhgef38), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070741 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:133159509:133234889:-1 gene:ENSMUSG00000040969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:133159535:133234889:-1 gene:ENSMUSG00000040969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049886 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130221D24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:54810 IMAGE:5387778), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147041 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:133112278:133234889:-1 gene:ENSMUSG00000040969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSMUST00000161932 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:133172880:133234949:-1 gene:ENSMUSG00000040969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// AK020284 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130221D24 product:hypothetical Dbl domain (dbl/cdc24 rhoGEF family) containing protein, full insert sequence. // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:133116440:133197260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
AK129389 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1546 protein. // chr3 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC031159 // GenBank // Mus musculus tet oncogene family member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4977050), complete cds. // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC040785 // GenBank // Mus musculus tet oncogene family member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4977050), complete cds. // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// DQ079067 // GenBank // Mus musculus Ayu17-449 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NM_001040400 // RefSeq // Mus musculus tet methylcytosine dioxygenase 2 (Tet2), mRNA. // chr3 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// ENSMUST00000098603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:133463679:133544390:-1 gene:ENSMUSG00000040943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// GU079949 // GenBank // Mus musculus tet oncogene 2 (Tet2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000045981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:133466737:133516239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_025902 // RefSeq // Mus musculus CDGSH iron sulfur domain 2 (Cisd2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:135406412:135423925:-1 gene:ENSMUSG00000028165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AM162549 // GenBank // Mus musculus mRNA for hypothetical protein (Noxp70 gene). // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058279 // GenBank // Mus musculus CDGSH iron sulfur domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:67650 IMAGE:6528467), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120988 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:135410012:135423407:-1 gene:ENSMUSG00000028165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// AK005301 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500026J14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:135408801:135423361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001033350 // RefSeq // Mus musculus B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 (Bank1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006501486 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 (Bank1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000041577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:136053363:136326046:-1 gene:ENSMUSG00000037922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AY178734 // GenBank // Mus musculus AVIEF mRNA, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC026932 // GenBank // Mus musculus B-cell scaffold protein with ankyrin repeats 1, mRNA (cDNA clone MGC:25762 IMAGE:4008261), complete cds. // chr3 // 82 // 89 // 28 // 34 // 0 /// EU051378 // GenBank // Mus musculus B-cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 delta 2 transcript variant (Bank1) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// BC116328 // GenBank // Mus musculus B-cell scaffold protein with ankyrin repeats 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40096648), complete cds. // chr3 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// AK041071 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530080F20 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr3 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000007236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:136229934:136325939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:136064066:136100587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0
NM_177665 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4861 (Gm4861), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:137550045:137552622:-1 gene:ENSMUSG00000055138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_037975 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5105 (Gm5105), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:138048761:138067388:-1 gene:ENSMUSG00000049349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138030723:138057326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001163457 // RefSeq // Mus musculus microsomal triglyceride transfer protein (Mttp), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_008642 // RefSeq // Mus musculus microsomal triglyceride transfer protein (Mttp), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000029805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:138089855:138131377:-1 gene:ENSMUSG00000028158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000098580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:138089855:138143388:-1 gene:ENSMUSG00000028158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC012686 // GenBank // Mus musculus microsomal triglyceride transfer protein, mRNA (cDNA clone MGC:13921 IMAGE:4163901), complete cds. // chr3 // 81 // 95 // 29 // 36 // 0 /// EU553486 // GenBank // Mus musculus microsomal triglyceride transfer protein B mRNA, complete cds. // chr3 // 80 // 92 // 28 // 35 // 0 /// L47970 // GenBank // Mus musculus microsomal triglyceride transfer protein mRNA, complete cds. // chr3 // 78 // 95 // 28 // 36 // 0 /// GENSCAN00000051765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138072307:138131300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
NM_001163385 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930579F01 gene (4930579F01Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000012186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:138164135:138186713:-1 gene:ENSMUSG00000012042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC150693 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183604 IMAGE:9087604), complete cds. // chr3 // 76 // 68 // 13 // 17 // 0 /// XM_006501945 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930579F01 gene (4930579F01Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// XM_006501946 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930579F01 gene (4930579F01Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000035158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138173522:138186229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_175224 // RefSeq // Mus musculus methionyl aminopeptidase 1 (Metap1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000029804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:138458960:138489382:-1 gene:ENSMUSG00000005813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK129054 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0094 protein. // chr3 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC096469 // GenBank // Mus musculus methionyl aminopeptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:106257 IMAGE:3603051), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138465653:138500094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_001040690 // RefSeq // Mus musculus RAP1, GTP-GDP dissociation stimulator 1 (Rap1gds1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_001286759 // RefSeq // Mus musculus RAP1, GTP-GDP dissociation stimulator 1 (Rap1gds1), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_145544 // RefSeq // Mus musculus RAP1, GTP-GDP dissociation stimulator 1 (Rap1gds1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000029796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:138925906:139075199:-1 gene:ENSMUSG00000028149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000098574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:138925906:139075199:-1 gene:ENSMUSG00000028149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC011279 // GenBank // Mus musculus RAP1, GTP-GDP dissociation stimulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:18981 IMAGE:4008751), complete cds. // chr3 // 88 // 89 // 28 // 32 // 0 /// AK154852 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630109K18 product:RAP1, GTP-GDP dissociation stimulator 1, full insert sequence. // chr3 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// AK158465 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930118I19 product:RAP1, GTP-GDP dissociation stimulator 1, full insert sequence. // chr3 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000035164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:138912690:139069436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
XM_143595 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4862 (Gm4862), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000170405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:139128334:139128771:-1 gene:ENSMUSG00000090801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006543831 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoside diphosphate kinase B-like (LOC102641423), mRNA. // chr3 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:139128295:139147262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000020296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:140116506:140117917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0
ENSMUST00000178845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:140839107:140839637:-1 gene:ENSMUSG00000095465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:140839035:140988520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_008811 // RefSeq // Mus musculus pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2 (Pdha2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:141210004:141212355:-1 gene:ENSMUSG00000047674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100460 // GenBank // Mus musculus pyruvate dehydrogenase E1 alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:118279 IMAGE:30918688), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// M76728 // GenBank // Mouse pyruvate dehydrogenase (pdha-2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:141210570:141211736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000083196 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:142772972:142773076:-1 gene:ENSMUSG00000065130 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT045562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_011828 // RefSeq // Mus musculus heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 (Hs2st1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501450 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 (Hs2st1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000043325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:144431103:144570181:-1 gene:ENSMUSG00000040151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000160690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:144453963:144569881:-1 gene:ENSMUSG00000040151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// AF060178 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate 2-sulfotransferase (Hs2st) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AF169243 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate 2-O-sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC025443 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:29399 IMAGE:5068428), complete cds. // chr3 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// BC059008 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:69621 IMAGE:6849136), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:144434488:144471199:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
ENSMUST00000083026 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:144586825:144586952:-1 gene:ENSMUSG00000064960 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001282037 // RefSeq // Mus musculus SH3-domain GRB2-like B1 (endophilin) (Sh3glb1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_019464 // RefSeq // Mus musculus SH3-domain GRB2-like B1 (endophilin) (Sh3glb1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XM_006501716 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH3-domain GRB2-like B1 (endophilin) (Sh3glb1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// XM_006501718 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH3-domain GRB2-like B1 (endophilin) (Sh3glb1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000163279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:144688844:144720323:-1 gene:ENSMUSG00000037062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AF263364 // GenBank // Mus musculus endophilin B1a mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AF272946 // GenBank // Mus musculus endophilin B1b mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC024362 // GenBank // Mus musculus SH3-domain GRB2-like B1 (endophilin), mRNA (cDNA clone MGC:35926 IMAGE:5031296), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// DQ205686 // GenBank // Mus musculus endophilin B1 testis variant mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// NM_001282042 // RefSeq // Mus musculus SH3-domain GRB2-like B1 (endophilin) (Sh3glb1), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 80 // 80 // 32 // 40 // 1 /// GENSCAN00000004897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:144691425:144714156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0
NM_009899 // RefSeq // Mus musculus chloride channel calcium activated 1 (Clca1), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// XM_006500965 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chloride channel calcium activated 1 (Clca1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000029932 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:144729677:144760977:-1 gene:ENSMUSG00000056025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000059091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:144729916:144760841:-1 gene:ENSMUSG00000056025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// AF047838 // GenBank // Mus musculus calcium-sensitive chloride conductance protein-1 (mCLCA1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// AF052746 // GenBank // Mus musculus chloride channel CaCC mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0 /// AK137904 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130037K01 product:chloride channel calcium activated 1, full insert sequence. // chr3 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// BC010260 // GenBank // Mus musculus chloride channel calcium activated 1, mRNA (cDNA clone MGC:11678 IMAGE:3710379), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC132342 // GenBank // Mus musculus chloride channel calcium activated 1, mRNA (cDNA clone MGC:163973 IMAGE:40130619), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC145057 // GenBank // Mus musculus chloride channel calcium activated 1, mRNA (cDNA clone MGC:178613 IMAGE:9053605), complete cds. // chr3 // 89 // 83 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000004872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:144730612:144760722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1
NM_030601 // RefSeq // Mus musculus chloride channel calcium activated 2 (Clca2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000029929 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:144796559:144819494:-1 gene:ENSMUSG00000028262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF108501 // GenBank // Mus musculus Ca(2+)-sensitive chloride channel 2 (Cacc) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// BC008147 // GenBank // Mus musculus chloride channel calcium activated 2, mRNA (cDNA clone MGC:5738 IMAGE:3583804), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF115852 // GenBank // Mus musculus endothelial chloride channel (Clca2) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 88 // 15 // 17 // 1 /// XM_006502346 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chloride channel calcium activated 2 (Clca2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// GENSCAN00000004948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:144797479:144819469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 88 // 15 // 17 // 1
NM_139148 // RefSeq // Mus musculus chloride channel calcium activated 4 (Clca4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000159989 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:144822623:144849357:-1 gene:ENSMUSG00000037033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY008277 // GenBank // Mus musculus calcium-activated chloride channel CLCA4 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:144822777:144837698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_207208 // RefSeq // Mus musculus chloride channel calcium activated 6 (Clca6), mRNA. // chr3 // 57 // 79 // 13 // 23 // 0 /// ENSMUST00000029923 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:144952480:144975045:-1 gene:ENSMUSG00000068547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 79 // 13 // 23 // 0 /// ENSMUST00000075496 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:144952675:144975011:-1 gene:ENSMUSG00000068547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 69 // 12 // 20 // 0 /// AY560902 // GenBank // Mus musculus calcium activated chloride channel (CLCA6) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 55 // 76 // 12 // 22 // 0 /// AY560903 // GenBank // Mus musculus calcium activated chloride channel variant (CLCA6) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 60 // 69 // 12 // 20 // 0 /// GENSCAN00000004914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:144861826:144875001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000004958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:144879379:144975011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 86 // 15 // 25 // 0
NM_001033199 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI747448 (AI747448), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000098549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:144910921:144932529:-1 gene:ENSMUSG00000074195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC139088 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI747448, mRNA (cDNA clone MGC:170715 IMAGE:8862110), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC139089 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI747448, mRNA (cDNA clone MGC:170716 IMAGE:8862111), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// JN652132 // GenBank // Mus musculus strain C53/129 chloride channel calcium activated 7 (Clca7) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000004958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:144879379:144975011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 80 // 8 // 12 // 0
NM_017474 // RefSeq // Mus musculus chloride channel calcium activated 3 (Clca3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501444 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chloride channel calcium activated 3 (Clca3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000029919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:145004537:145032776:-1 gene:ENSMUSG00000028255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB017156 // GenBank // Mus musculus gob-5 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC028343 // GenBank // Mus musculus chloride channel calcium activated 3, mRNA (cDNA clone MGC:13795 IMAGE:4217548), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC116318 // GenBank // Mus musculus chloride channel calcium activated 3, mRNA (cDNA clone MGC:143984 IMAGE:40095991), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC116319 // GenBank // Mus musculus chloride channel calcium activated 3, mRNA (cDNA clone MGC:143985 IMAGE:40095992), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:144995188:145032745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_178697 // RefSeq // Mus musculus chloride channel calcium activated 5 (Clca5), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006501432 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chloride channel calcium activated 5 (Clca5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006501434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chloride channel calcium activated 5 (Clca5), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:145070265:145099104:-1 gene:ENSMUSG00000036960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK035512 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530058K19 product:similar to CALCIUM-ACTIVATED CHLORIDE CHANNEL-2 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AY161007 // GenBank // Mus musculus chloride channel (Clca5) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC096379 // GenBank // Mus musculus chloride channel calcium activated 5, mRNA (cDNA clone MGC:106131 IMAGE:5317084), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:145039236:145098964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
NM_010516 // RefSeq // Mus musculus cysteine rich protein 61 (Cyr61), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000029846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:145646971:145649985:-1 gene:ENSMUSG00000028195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC066019 // GenBank // Mus musculus cysteine rich protein 61, mRNA (cDNA clone MGC:90137 IMAGE:5716887), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M32490 // GenBank // Mouse Cyr61 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:145647666:145649792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
NM_172864 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 63 (Wdr63), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000160285 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:146040526:146108130:-1 gene:ENSMUSG00000043020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC132106 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 63, mRNA (cDNA clone MGC:163737 IMAGE:40130383), complete cds. // chr3 // 93 // 75 // 28 // 30 // 0 /// BC132108 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 63, mRNA (cDNA clone MGC:163739 IMAGE:40130385), complete cds. // chr3 // 93 // 75 // 28 // 30 // 0 /// BC158119 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 63, mRNA (cDNA clone MGC:189892 IMAGE:9007392), complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000003199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:146072306:146121786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000084003 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:146116102:146116254:-1 gene:ENSMUSG00000065937 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_033542 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10636 (Gm10636), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// KnowTID_00005218 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_019957 // RefSeq // Mus musculus deoxyribonuclease II beta (Dnase2b), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006501763 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus deoxyribonuclease II beta (Dnase2b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:146580985:146596612:-1 gene:ENSMUSG00000028185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF128888 // GenBank // Mus musculus deoxyribonuclease DLAD mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC075661 // GenBank // Mus musculus deoxyribonuclease II beta, mRNA (cDNA clone MGC:100000 IMAGE:30606058), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:146550475:146593001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_027617 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 1 (Spata1), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006502090 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spermatogenesis associated 1 (Spata1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:146457203:146499753:-1 gene:ENSMUSG00000028188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093951 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:146485411:146495115:-1 gene:ENSMUSG00000028188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000123421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:146469626:146483525:-1 gene:ENSMUSG00000028188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC055056 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6492855), complete cds. // chr3 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// BC139279 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:170906 IMAGE:8862301), complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC139280 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:170907 IMAGE:8862302), complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006502095 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spermatogenesis associated 1 (Spata1), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// GENSCAN00000003414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:146465880:146483442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0
NM_027371 // RefSeq // Mus musculus ribosome production factor 1 homolog (S. cerevisiae) (Rpf1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000029838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:146506348:146521423:-1 gene:ENSMUSG00000028187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC056165 // GenBank // Mus musculus brix domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:66768 IMAGE:5694049), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC089369 // GenBank // Mus musculus brix domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:102255 IMAGE:30550759), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NM_027332 // RefSeq // Mus musculus ribosome production factor 1 homolog (S. cerevisiae) (Rpf1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1 /// XM_006502051 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribosome production factor 1 homolog (S. cerevisiae) (Rpf1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1 /// GENSCAN00000003353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:146487186:146521396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0
XM_006502224 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930503B20 gene (4930503B20Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AK015617 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930483N21 product:similar to DNAJ-LIKE PROTEIN [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr3 // 96 // 66 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049703 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:146645193:146651317:-1 gene:ENSMUSG00000090202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// ENSMUST00000124931 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:146646092:146682410:-1 gene:ENSMUSG00000048652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// ENSMUST00000125965 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:146645195:146685592:-1 gene:ENSMUSG00000048652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// ENSMUST00000147113 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:3:146646103:146682522:-1 gene:ENSMUSG00000048652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// AK015685 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930503B20 product:similar to DNAJ-LIKE PROTEIN [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr3 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// BC048658 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930503B20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58806 IMAGE:6773189), complete cds. // chr3 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// GENSCAN00000003409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:146646286:146651151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0
NM_001081298 // RefSeq // Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000106128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:148815586:148954635:-1 gene:ENSMUSG00000028184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006502443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), transcript variant X21, mRNA. // chr3 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// GENSCAN00000026011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:148817174:148859540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1
NM_001081298 // RefSeq // Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006502443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), transcript variant X21, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000106128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:148815586:148954635:-1 gene:ENSMUSG00000028184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK084598 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330020C12 product:LATROPHILIN-2 (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:148817174:148859540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT045703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001081298 // RefSeq // Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006502443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), transcript variant X21, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000106128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:148815586:148954635:-1 gene:ENSMUSG00000028184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:148817174:148859540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001081298 // RefSeq // Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006502443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), transcript variant X21, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000106128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:148815586:148954635:-1 gene:ENSMUSG00000028184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001081298 // RefSeq // Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), transcript variant X21, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:148815586:148954635:-1 gene:ENSMUSG00000028184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:148817174:148859540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081298 // RefSeq // Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), transcript variant X21, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:148815586:148954635:-1 gene:ENSMUSG00000028184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081298 // RefSeq // Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus latrophilin 2 (Lphn2), transcript variant X21, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:148888941:148989316:-1 gene:ENSMUSG00000028184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:148815586:148954635:-1 gene:ENSMUSG00000028184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK142828 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930024F02 product:weakly similar to Calcium-independent alpha-latrotoxin receptor 3 precursor [Mus musculus], full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK142023 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230005H17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:148889246:148931947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
AK048842 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230074J23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000093950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:149221693:149225745:-1 gene:ENSMUSG00000070342 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:149221687:149225745:-1 gene:ENSMUSG00000070342 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK029623 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930415C24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133871 // RefSeq // Mus musculus interferon-induced protein 44 (Ifi44), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029671 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:151730922:151749910:-1 gene:ENSMUSG00000028037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:151732426:151749882:-1 gene:ENSMUSG00000028037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC111882 // GenBank // Mus musculus interferon-induced protein 44, mRNA (cDNA clone MGC:132861 IMAGE:40060245), complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000133888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:151745693:151749947:-1 gene:ENSMUSG00000028037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// AK085407 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630022O22 product:inferred: microtubule associated protein 44 {Mus musculus}, full insert sequence. // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT045755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000025087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:151732380:151770024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONMMUT045756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSMUST00000046739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:151759641:151762906:-1 gene:ENSMUSG00000039146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_031367 // RefSeq // Mus musculus interferon-induced protein 44 like (Ifi44l), mRNA. // chr3 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// AF336221 // GenBank // Mus musculus minor histocompatibility antigen precursor (H28) mRNA, H28c allele, complete cds. // chr3 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// BC024930 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 28, mRNA (cDNA clone MGC:28370 IMAGE:4020690), complete cds. // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:151732380:151770024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0
NM_008966 // RefSeq // Mus musculus prostaglandin F receptor (Ptgfr), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:151798918:151837630:-1 gene:ENSMUSG00000028036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000106126 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:151801344:151836023:-1 gene:ENSMUSG00000028036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// AB094411 // GenBank // Mus musculus fp mRNA for prostaglandin F2alpha receptor, complete cds. // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AK014673 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833409N04 product:prostaglandin F receptor, full insert sequence. // chr3 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// BC064794 // GenBank // Mus musculus prostaglandin F receptor, mRNA (cDNA clone MGC:76739 IMAGE:30429190), complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// D17433 // GenBank // Mus musculus mRNA for prostaglandin F receptor, complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000025077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:151801624:151835869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000157372 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:151926348:151926409:-1 gene:ENSMUSG00000087997 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT045760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_025926 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 4 (Dnajb4), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_027287 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 4 (Dnajb4), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000029669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:152185081:152210019:-1 gene:ENSMUSG00000028035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:152183955:152193803:-1 gene:ENSMUSG00000028035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000144950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:152183982:152210083:-1 gene:ENSMUSG00000028035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000153355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:152193377:152210057:-1 gene:ENSMUSG00000028035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr3 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// BC017161 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:28967 IMAGE:4481022), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT045771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000006367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:152165501:152193587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NM_199465 // RefSeq // Mus musculus nexilin (Nexn), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006501991 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nexilin (Nexn), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006501992 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nexilin (Nexn), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502000 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nexilin (Nexn), transcript variant X11, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000046045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:152236986:152266320:-1 gene:ENSMUSG00000039103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK136097 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420455O21 product:nexilin, full insert sequence. // chr3 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC052878 // GenBank // Mus musculus nexilin, mRNA (cDNA clone MGC:60702 IMAGE:30046316), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// HQ179982 // GenBank // Mus musculus nexilin alpha mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// HQ179983 // GenBank // Mus musculus nexilin beta mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// HQ179984 // GenBank // Mus musculus nexilin gamma mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006502001 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nexilin (Nexn), transcript variant X12, mRNA. // chr3 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:152237654:152271226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001162375 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 73, member A (Fam73a), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NM_174868 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 73, member A (Fam73a), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000068243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:152273459:152340407:-1 gene:ENSMUSG00000054942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000073089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:152273459:152340407:-1 gene:ENSMUSG00000054942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC098205 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 73, member A, mRNA (cDNA clone MGC:106580 IMAGE:6409928), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC138328 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 73, member A, mRNA (cDNA clone MGC:169953 IMAGE:8861348), complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC138329 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 73, member A, mRNA (cDNA clone MGC:169954 IMAGE:8861349), complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// AK044739 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930038D06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000006317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:152276635:152337824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_001081277 // RefSeq // Mus musculus adenylate kinase 5 (Ak5), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006501441 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenylate kinase 5 (Ak5), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 94 // 55 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000045262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:152462815:152668140:-1 gene:ENSMUSG00000039058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AB060081 // GenBank // Mus musculus AK5 mRNA for adenylate kinase isozyme 5, complete cds. // chr3 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000006331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:152605848:152704435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_012028 // RefSeq // Mus musculus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 5 (St6galnac5), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000044278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:152817081:152982246:-1 gene:ENSMUSG00000039037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB028840 // GenBank // Mus musculus ST6GalNAc V mRNA for GalNAc alpha-2, 6-sialyltransferase V, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB030836 // GenBank // Mus musculus ST6GalNAc V mRNA for GD1 alpha synthase, complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC055737 // GenBank // Mus musculus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 5, mRNA (cDNA clone MGC:67025 IMAGE:6415191), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:152814336:152846661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NR_045801 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5730460C07 gene (5730460C07Rik), long non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000081193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:153789305:153792087:-1 gene:ENSMUSG00000062046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000083804 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:153911610:153911690:-1 gene:ENSMUSG00000065738 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007382 // RefSeq // Mus musculus acyl-Coenzyme A dehydrogenase, medium chain (Acadm), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000072697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:153922357:153944632:-1 gene:ENSMUSG00000062908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC013498 // GenBank // Mus musculus acyl-Coenzyme A dehydrogenase, medium chain, mRNA (cDNA clone MGC:19161 IMAGE:4222450), complete cds. // chr3 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// U07159 // GenBank // Mus musculus medium-chain acyl-CoA dehydrogenase (Acadm) mRNA, complete cds. // chr3 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// ENSMUST00000156310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:153936311:153944467:-1 gene:ENSMUSG00000062908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENSMUST00000137161 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:153938295:153944442:-1 gene:ENSMUSG00000062908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// ENSMUST00000150070 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:153936365:153944446:-1 gene:ENSMUSG00000062908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000045847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:153922744:153944425:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT045854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001168358 // RefSeq // Mus musculus tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog (S. cerevisiae) (Tyw3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_172474 // RefSeq // Mus musculus tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog (S. cerevisiae) (Tyw3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000052774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:154577199:154597095:-1 gene:ENSMUSG00000047583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000122976 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:154587555:154597104:-1 gene:ENSMUSG00000047583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000170461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:154576520:154597098:-1 gene:ENSMUSG00000047583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC086686 // GenBank // Mus musculus tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:113806 IMAGE:30680486), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC087879 // GenBank // Mus musculus tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:107147 IMAGE:6533208), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC141040 // GenBank // Mus musculus tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:176001 IMAGE:9055652), complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:154587028:154597083:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_177066 // RefSeq // Mus musculus TNNI3 interacting kinase (Tnni3k), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064076 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:154786302:155055407:-1 gene:ENSMUSG00000040086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143410 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:154786302:155055407:-1 gene:ENSMUSG00000040086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AY526095 // GenBank // Mus musculus cardiac ankyrin repeat kinase isoform 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY526096 // GenBank // Mus musculus cardiac ankyrin repeat kinase isoform 2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC139368 // GenBank // Mus musculus TNNI3 interacting kinase, mRNA (cDNA clone MGC:170995 IMAGE:8862390), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC139394 // GenBank // Mus musculus TNNI3 interacting kinase, mRNA (cDNA clone MGC:171021 IMAGE:8862416), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:154863349:155003927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_029330 // RefSeq // Mus musculus fucose-1-phosphate guanylyltransferase (Fpgt), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006502233 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fucose-1-phosphate guanylyltransferase (Fpgt), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000066568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:155084921:155093378:-1 gene:ENSMUSG00000053870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC110551 // GenBank // Mus musculus fucose-1-phosphate guanylyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:129332 IMAGE:40047377), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC110552 // GenBank // Mus musculus fucose-1-phosphate guanylyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:129333 IMAGE:40047378), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:155086616:155093356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0
ENSMUST00000083873 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:155788365:155788468:-1 gene:ENSMUSG00000065807 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT045878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
AK016239 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930566N20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSMUST00000177876 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:157237225:157237331:-1 gene:ENSMUSG00000094982 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT045905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_145953 // RefSeq // Mus musculus cystathionase (cystathionine gamma-lyase) (Cth), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000118539 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:157894248:157925077:-1 gene:ENSMUSG00000028179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY083352 // GenBank // Mus musculus cystathionine gamma-lyase (Cse) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC019483 // GenBank // Mus musculus cystathionase (cystathionine gamma-lyase), mRNA (cDNA clone MGC:28655 IMAGE:4235178), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:157888465:157925030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_001081358 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 7 (Lrrc7), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001291452 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 7 (Lrrc7), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_001291453 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 7 (Lrrc7), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006501504 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 7 (Lrrc7), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:158084439:158562221:-1 gene:ENSMUSG00000028176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC138450 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:170075 IMAGE:8861470), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:158152630:158401484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000101953 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:3:159916255:159916361:-1 gene:ENSMUSG00000075903 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT045939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_054089 // RefSeq // Mus musculus trimethylguanosine synthase homolog (S. cerevisiae) (Tgs1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006537558 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus trimethylguanosine synthase homolog (S. cerevisiae) (Tgs1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000052712 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:3574875:3616619:1 gene:ENSMUSG00000028233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF389908 // GenBank // Mus musculus PIMT (Pimt) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC075728 // GenBank // Mus musculus trimethylguanosine synthase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:78321 IMAGE:6513964), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:3585452:3626372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_001111096 // RefSeq // Mus musculus Yamaguchi sarcoma viral (v-yes-1) oncogene homolog (Lyn), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NM_010747 // RefSeq // Mus musculus Yamaguchi sarcoma viral (v-yes-1) oncogene homolog (Lyn), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000041377 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:3678115:3791613:1 gene:ENSMUSG00000042228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000103010 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:3678127:3791612:1 gene:ENSMUSG00000042228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC003253 // GenBank // Mus musculus Yamaguchi sarcoma viral (v-yes-1) oncogene homolog, mRNA (cDNA clone MGC:6187 IMAGE:3500419), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// BC031547 // GenBank // Mus musculus Yamaguchi sarcoma viral (v-yes-1) oncogene homolog, mRNA (cDNA clone MGC:18545 IMAGE:3589207), complete cds. // chr4 // 85 // 87 // 11 // 13 // 0 /// BC157998 // GenBank // Mus musculus Yamaguchi sarcoma viral (v-yes-1) oncogene homolog, mRNA (cDNA clone MGC:191114 IMAGE:9007404), complete cds. // chr4 // 92 // 80 // 11 // 12 // 0 /// M57696 // GenBank // Mouse lyn A protein tyrosine kinase (lynA) mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 73 // 10 // 11 // 0 /// M57697 // GenBank // Mouse lyn B protein tyrosine kinase (lynB) mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 73 // 10 // 11 // 0 /// M64608 // GenBank // Mouse lyn protein mRNA, complete cds. // chr4 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NR_028126 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 6330407A03 gene (6330407A03Rik), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK052165 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330002C20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_026534 // RefSeq // Mus musculus UBX domain protein 2B (Ubxn2b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029907 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:6191098:6221688:1 gene:ENSMUSG00000028243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB120715 // GenBank // Mus musculus mRNA for p37, complete cds. // chr4 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// BC076632 // GenBank // Mus musculus UBX domain protein 2B, mRNA (cDNA clone MGC:100195 IMAGE:30637967), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:6176211:6216074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
ENSMUST00000117807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:6539561:6540306:1 gene:ENSMUSG00000081388 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000043458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:6539803:6540306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
NM_021518 // RefSeq // Mus musculus RAB2A, member RAS oncogene family (Rab2a), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000060232 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:8535644:8607778:1 gene:ENSMUSG00000047187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB232585 // GenBank // Mus musculus Rab2A mRNA for Rab2A, complete cds. // chr4 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// BC058382 // GenBank // Mus musculus RAB2A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:66912 IMAGE:6820798), complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// XM_006538126 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB2A, member RAS oncogene family (Rab2a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
NM_001277149 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 7 (Chd7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:8690921:8866810:1 gene:ENSMUSG00000041235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:8691365:8867659:1 gene:ENSMUSG00000041235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:8800692:8866655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001277149 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 7 (Chd7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000039267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:8690921:8866810:1 gene:ENSMUSG00000041235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000051558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:8691365:8867659:1 gene:ENSMUSG00000041235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:8800692:8866655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001277149 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 7 (Chd7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:8690921:8866810:1 gene:ENSMUSG00000041235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:8691365:8867659:1 gene:ENSMUSG00000041235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:8840322:8844721:1 gene:ENSMUSG00000041235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:8800692:8866655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001277149 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 7 (Chd7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000039267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:8690921:8866810:1 gene:ENSMUSG00000041235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000051558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:8691365:8867659:1 gene:ENSMUSG00000041235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000020607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:8800692:8866655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001277149 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 7 (Chd7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000039267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:8690921:8866810:1 gene:ENSMUSG00000041235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000051558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:8691365:8867659:1 gene:ENSMUSG00000041235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000170391 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:8751438:8867224:1 gene:ENSMUSG00000041235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000020607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:8800692:8866655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000082782 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:9210003:9210108:1 gene:ENSMUSG00000075958 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT046119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_013526 // RefSeq // Mus musculus growth differentiation factor 6 (Gdf6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057613 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:9844372:9862345:1 gene:ENSMUSG00000051279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC141339 // GenBank // Mus musculus growth differentiation factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:176300 IMAGE:9055951), complete cds. // chr4 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// BC141340 // GenBank // Mus musculus growth differentiation factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:176301 IMAGE:9055952), complete cds. // chr4 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000004463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:9843494:9913815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSMUST00000121818 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:10813543:10814728:1 gene:ENSMUSG00000083997 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_026005 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2610301B20 gene (2610301B20Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006538200 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2610301B20 gene (2610301B20Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000080517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:10874498:10899421:1 gene:ENSMUSG00000059482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000101504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:10874568:10899425:1 gene:ENSMUSG00000059482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000156124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:10874565:10898073:1 gene:ENSMUSG00000059482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 93 // 71 // 14 // 15 // 0 /// BC058777 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610301B20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67853 IMAGE:5397173), complete cds. // chr4 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// ENSMUST00000131437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:10874525:10893469:1 gene:ENSMUSG00000059482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1
ENSMUST00000121003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:11133327:11133608:1 gene:ENSMUSG00000083025 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:11133327:11133608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033275 // RefSeq // Mus musculus glucoside xylosyltransferase 1 (Gxylt1), mRNA. // chr4 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XR_390709 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 11821 (Gm11821), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_401557 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 11821 (Gm11821), misc_RNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000049484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:93239742:93275161:-1 gene:ENSMUSG00000036197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000057896 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:93244455:93275151:-1 gene:ENSMUSG00000036197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000117335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:11400346:11401324:1 gene:ENSMUSG00000081884 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC141302 // GenBank // Mus musculus glycosyltransferase 8 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:176263 IMAGE:9055914), complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC171972 // GenBank // Mus musculus glycosyltransferase 8 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:198677 IMAGE:9054258), complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:93213206:93275081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:11400091:11405536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001081183 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1110037F02 gene (1110037F02Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000055372 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:11485958:11527621:1 gene:ENSMUSG00000040720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000059914 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:11485958:11550684:1 gene:ENSMUSG00000040720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000108307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:11486043:11550684:1 gene:ENSMUSG00000040720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AK170075 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630014O15 product:MSTP054 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 93 // 76 // 26 // 28 // 0 /// BC033309 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110037F02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30537 IMAGE:5024976), complete cds. // chr4 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:11486043:11563648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
NM_001081183 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1110037F02 gene (1110037F02Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059914 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:11485958:11550684:1 gene:ENSMUSG00000040720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:11486043:11550684:1 gene:ENSMUSG00000040720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:11486043:11563648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081183 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1110037F02 gene (1110037F02Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059914 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:11485958:11550684:1 gene:ENSMUSG00000040720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:11486043:11550684:1 gene:ENSMUSG00000040720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028830 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110037F02 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5124026), complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:11486043:11563648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001039556 // RefSeq // Mus musculus RAD54 homolog B (S. cerevisiae) (Rad54b), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000070755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:11558972:11615805:1 gene:ENSMUSG00000078773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000178725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:11595893:11606144:1 gene:ENSMUSG00000078773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// BC057604 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E130016E03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67261 IMAGE:6416213), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NM_001256145 // RefSeq // Mus musculus RAD54 homolog B (S. cerevisiae) (Rad54b), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// ENSMUST00000095145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:4:11558942:11585744:1 gene:ENSMUSG00000078773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000009199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:11579734:11629085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
NM_010276 // RefSeq // Mus musculus GTP binding protein (gene overexpressed in skeletal muscle) (Gem), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:11705807:11714752:1 gene:ENSMUSG00000028214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000108304 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:11704457:11714752:1 gene:ENSMUSG00000028214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC029668 // GenBank // Mus musculus GTP binding protein (gene overexpressed in skeletal muscle), mRNA (cDNA clone MGC:36072 IMAGE:5368352), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// U10551 // GenBank // Mus musculus Gem GTPase (gem) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:11705914:11713753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_019753 // RefSeq // Mus musculus cadherin 17 (Cdh17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000029871 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:11758147:11817895:1 gene:ENSMUSG00000028217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF177669 // GenBank // Mus musculus liver-intestine cadherin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC042891 // GenBank // Mus musculus cadherin 17, mRNA (cDNA clone MGC:35913 IMAGE:4208360), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// D87912 // GenBank // Mus musculus mRNA for BILL-cadherin, complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// ENSMUST00000108303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:11758193:11811486:1 gene:ENSMUSG00000028217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// AK089791 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830021K11 product:cadherin 17, full insert sequence. // chr4 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// GENSCAN00000009216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:11737103:11817074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_198957 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 12 B2 (Rbm12b2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000063839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:12089441:12096243:1 gene:ENSMUSG00000052137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000095143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:12089439:12095922:1 gene:ENSMUSG00000052137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 63 // 4 // 5 // 0 /// AK169895 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630003B21 product:Hypothetical RNA-binding region RNP-1 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC080741 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C430048L16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:91091 IMAGE:30461213), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC137620 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C430048L16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169244 IMAGE:8860639), complete cds. // chr4 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000044343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:12089372:12099562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NONMMUT046237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
ENSMUST00000117060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:12125290:12127252:1 gene:ENSMUSG00000081593 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000044350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:12125290:12127110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000083889 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:12812706:12812812:1 gene:ENSMUSG00000065823 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT046248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001171801 // RefSeq // Mus musculus triple QxxK/R motif containing (Triqk), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_173746 // RefSeq // Mus musculus triple QxxK/R motif containing (Triqk), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:12906838:12980873:1 gene:ENSMUSG00000055963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000156536 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:12917967:12981070:1 gene:ENSMUSG00000055963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000183345 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:12906858:12983553:1 gene:ENSMUSG00000055963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ351292 // GenBank // Mus musculus triqk mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:12962963:12980518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_028264 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 55A (Tmem55a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:14864076:14915176:1 gene:ENSMUSG00000028221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC021435 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 55A, mRNA (cDNA clone MGC:29334 IMAGE:5029766), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:14845398:14950735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_181401 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 64 (Tmem64), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000062684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:15265831:15286753:1 gene:ENSMUSG00000043252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC030341 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 64, mRNA (cDNA clone MGC:40684 IMAGE:3661112), complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:15265952:15284853:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_009788 // RefSeq // Mus musculus calbindin 1 (Calb1), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:15881264:15908064:1 gene:ENSMUSG00000028222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000136266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:15881266:15895777:1 gene:ENSMUSG00000028222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// BC016421 // GenBank // Mus musculus calbindin 1, mRNA (cDNA clone MGC:25386 IMAGE:4527000), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// M21531 // GenBank // Mus musculus calbindin (PCD-29) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// M23663 // GenBank // Mouse calbindin (Calb1) mRNA, 3 end. // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000037193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:15880109:15904763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_013752 // RefSeq // Mus musculus nibrin (Nbn), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029879 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:15957925:15992589:1 gene:ENSMUSG00000028224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000149069 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:15957967:15981554:1 gene:ENSMUSG00000028224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AB016988 // GenBank // Mus musculus mRNA for Nibrin, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// AF076687 // GenBank // Mus musculus nibrin (Nbn) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF092840 // GenBank // Mus musculus nibrin mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC044773 // GenBank // Mus musculus nibrin, mRNA (cDNA clone MGC:51369 IMAGE:5067851), complete cds. // chr4 // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// BC055061 // GenBank // Mus musculus nibrin, mRNA (cDNA clone MGC:62605 IMAGE:6528890), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:15952219:15989999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
NM_013927 // RefSeq // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel beta 3 (Cngb3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000102999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:19280850:19510623:1 gene:ENSMUSG00000056494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AJ243572 // GenBank // Mus musculus mRNA for cyclic nucleotide-gated channel subunit CNG6 (CNG6 gene). // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000000660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:19300323:19426735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0
NM_025476 // RefSeq // Mus musculus regulator of microtubule dynamics 1 (Rmdn1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000029888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:19575207:19606932:1 gene:ENSMUSG00000028229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000108253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:19575162:19598654:1 gene:ENSMUSG00000028229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// BC025158 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 82, member B, mRNA (cDNA clone MGC:35752 IMAGE:4023319), complete cds. // chr4 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// BC096046 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 82, member B, mRNA (cDNA clone MGC:106865 IMAGE:1397855), complete cds. // chr4 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000000656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:19586763:19601646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 44 // 15 // 16 // 0 /// AK029450 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833439G18 product:similar to CGI-90 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0
NM_028746 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 7, (cationic amino acid transporter, y+ system) member 13 (Slc7a13), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035890 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:19818725:19842218:1 gene:ENSMUSG00000041052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB072352 // GenBank // Mus musculus AGT1 mRNA for aspartate/glutamate transporter 1, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC014684 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 7, (cationic amino acid transporter, y+ system) member 13, mRNA (cDNA clone MGC:25939 IMAGE:4236308), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK165403 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F520005C17 product:solute carrier family 7, (cationic amino acid transporter, y+ system) member 13, full insert sequence. // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:19681310:19867542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_015767 // RefSeq // Mus musculus tocopherol (alpha) transfer protein (Ttpa), mRNA. // chrUn // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000098244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:20008428:20030785:1 gene:ENSMUSG00000073988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000117632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:20008357:20030785:1 gene:ENSMUSG00000073988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000121491 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:20008007:20030470:1 gene:ENSMUSG00000073988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000125799 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:20007938:20021312:1 gene:ENSMUSG00000073988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 91 // 58 // 10 // 11 // 0 /// BC026882 // GenBank // Mus musculus tocopherol (alpha) transfer protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:3990597), partial cds. // chrUn // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// BC099868 // GenBank // Mus musculus tocopherol (alpha) transfer protein, mRNA (cDNA clone MGC:123473 IMAGE:40040166), complete cds. // chrUn // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC099869 // GenBank // Mus musculus tocopherol (alpha) transfer protein, mRNA (cDNA clone MGC:123474 IMAGE:40040167), complete cds. // chrUn // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC099870 // GenBank // Mus musculus tocopherol (alpha) transfer protein, mRNA (cDNA clone MGC:123475 IMAGE:40040169), complete cds. // chrUn // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000031112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:20020486:20073528:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_010281 // RefSeq // Mus musculus gamma-glutamyl hydrolase (Ggh), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000098242 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:20042052:20066750:1 gene:ENSMUSG00000073987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF051102 // GenBank // Mus musculus gamma glutamyl hydrolase precursor, mRNA, complete cds. // chr4 // 82 // 100 // 27 // 33 // 0 /// BC009809 // GenBank // Mus musculus gamma-glutamyl hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:13786 IMAGE:4223953), complete cds. // chr4 // 80 // 91 // 24 // 30 // 0 /// BC150898 // GenBank // Mus musculus gamma-glutamyl hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:183809 IMAGE:9087809), complete cds. // chr4 // 81 // 94 // 25 // 31 // 0 /// XM_006537619 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-glutamyl hydrolase (Ggh), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// AF051103 // GenBank // Mus musculus gamma-glutamyl hydrolase precursor, mRNA, nuclear gene encoding lysosomal protein, complete cds. // chr4 // 80 // 91 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:20020486:20073528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
NM_015767 // RefSeq // Mus musculus tocopherol (alpha) transfer protein (Ttpa), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000098244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:20008428:20030785:1 gene:ENSMUSG00000073988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000117632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:20008357:20030785:1 gene:ENSMUSG00000073988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000121491 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:20008007:20030470:1 gene:ENSMUSG00000073988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC026882 // GenBank // Mus musculus tocopherol (alpha) transfer protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:3990597), partial cds. // chr4 // 77 // 88 // 17 // 22 // 0 /// BC043705 // GenBank // Mus musculus tocopherol (alpha) transfer protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:5355136), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172687 // RefSeq // Mus musculus coenzyme Q3 homolog, methyltransferase (yeast) (Coq3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006537808 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coenzyme Q3 homolog, methyltransferase (yeast) (Coq3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029909 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:21879673:21912162:1 gene:ENSMUSG00000028247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC060960 // GenBank // Mus musculus coenzyme Q3 homolog, methyltransferase (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:74049 IMAGE:30312962), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:21879688:21910639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000029908 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:21931331:21994751:1 gene:ENSMUSG00000028246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000123319 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:21931333:21950877:1 gene:ENSMUSG00000028246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000123481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:21931357:21996839:1 gene:ENSMUSG00000028246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000124440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:21931329:21994146:1 gene:ENSMUSG00000028246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// AK082464 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230053C20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0 /// BC059864 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6230409E13 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6417471), complete cds. // chr4 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// NM_175234 // RefSeq // Mus musculus failed axon connections homolog (Drosophila) (Faxc), mRNA. // chr4 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1 /// GENSCAN00000014705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:21931564:21959628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// GENSCAN00000014711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:21982331:22019902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
ENSMUST00000117908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:22519628:22520027:1 gene:ENSMUSG00000081810 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000014713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:22502646:22519921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT046429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_026742 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, assembly factor 4 (Ndufaf4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000029925 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:24898083:24905001:1 gene:ENSMUSG00000028261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000146721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:24898131:24903505:1 gene:ENSMUSG00000028261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC028764 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110007M04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41246 IMAGE:1195846), complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT046471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT046470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NM_030733 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 63 (Gpr63), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538383 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 63 (Gpr63), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006538384 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 63 (Gpr63), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000038920 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:24973419:25009233:1 gene:ENSMUSG00000040372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:25007446:25048242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000121989 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:25307830:25308523:1 gene:ENSMUSG00000083737 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158068 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9088166. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000118918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:28353783:28354789:1 gene:ENSMUSG00000082703 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:28308489:28354789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000119094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:28612326:28612742:1 gene:ENSMUSG00000081011 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:28612326:28644479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT046525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
ENSMUST00000118175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:32207148:32208092:1 gene:ENSMUSG00000083564 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001109661 // RefSeq // Mus musculus BTB and CNC homology 2 (Bach2), mRNA. // chr4 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:32238804:32586104:1 gene:ENSMUSG00000040270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000149201 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:32239077:32501636:1 gene:ENSMUSG00000040270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000171600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:32417435:32586108:1 gene:ENSMUSG00000040270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// BC099420 // GenBank // Mus musculus BTB and CNC homology 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:30938371), complete cds. // chr4 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// BC131642 // GenBank // Mus musculus BTB and CNC homology 2, mRNA (cDNA clone MGC:150077 IMAGE:40109815), complete cds. // chr4 // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037416 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:32238950:32581199:1 gene:ENSMUSG00000040270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 32 // 42 // 1 /// D86604 // GenBank // Mus musculus mRNA for Bach protein 2, complete cds. // chr4 // 97 // 76 // 31 // 32 // 0 /// NONMMUT046574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000028157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:32529220:32580296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1
AK051661 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130062J21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081392 // RefSeq // Mus musculus midasin homolog (yeast) (Mdn1), mRNA. // chr4 // 100 // 99 // 103 // 103 // 0 /// ENSMUST00000071642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:32657119:32775207:1 gene:ENSMUSG00000058006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 99 // 103 // 103 // 0 /// ENSMUST00000150934 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:32722936:32731480:1 gene:ENSMUSG00000058006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 11 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000178134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:32657119:32775217:1 gene:ENSMUSG00000058006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 99 // 103 // 103 // 0 /// AK144722 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730026N24 product:hypothetical AAA ATPase containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 26 // 27 // 27 // 0 /// AY512920 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:C0339F02 unknown mRNA. // chr4 // 100 // 11 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000028146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:32657251:32774139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 81 // 81 // 0
NM_175364 // RefSeq // Mus musculus LYR motif containing 2 (Lyrm2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000062802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:32800253:32801383:1 gene:ENSMUSG00000045854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// BC028533 // GenBank // Mus musculus LYR motif containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:41400 IMAGE:1446940), complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000135833 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:32800279:32801559:1 gene:ENSMUSG00000045854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// NONMMUT046605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_027491 // RefSeq // Mus musculus Ras-related GTP binding D (Rragd), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000029946 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:32983155:33022180:1 gene:ENSMUSG00000028278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000098190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:32983037:33022180:1 gene:ENSMUSG00000028278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000136792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:33005196:33018818:1 gene:ENSMUSG00000028278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// BC038137 // GenBank // Mus musculus Ras-related GTP binding D, mRNA (cDNA clone IMAGE:1349177), partial cds. // chr4 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000084747 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:32983454:33022180:1 gene:ENSMUSG00000028278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// AF490406 // GenBank // Mus musculus hypothetical GTP-binding protein RAGD (Ragd) mRNA, partial cds. // chr4 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// GENSCAN00000040223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:32983463:33018798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0
NM_019586 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2J 1 (Ube2j1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:33031528:33045199:1 gene:ENSMUSG00000028277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000124992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:33031416:33052363:1 gene:ENSMUSG00000028277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000135924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:33036728:33052363:1 gene:ENSMUSG00000028277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC024623 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2, J1, mRNA (cDNA clone MGC:25635 IMAGE:4217620), complete cds. // chr4 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:33032685:33096581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_008075 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) C receptor, subunit rho 1 (Gabrr1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006537612 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) C receptor, subunit rho 1 (Gabrr1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006537613 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) C receptor, subunit rho 1 (Gabrr1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000029947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:33132521:33163588:1 gene:ENSMUSG00000028280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF024620 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid receptor rho1 subunit mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:33133499:33173499:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_177774 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 12 (Srsf12), mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XM_006537958 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 12 (Srsf12), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000067864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:33208991:33233340:1 gene:ENSMUSG00000054679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:33209263:33231293:1 gene:ENSMUSG00000054679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:33225773:33231160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0
NM_011884 // RefSeq // Mus musculus RNA guanylyltransferase and 5-phosphatase (Rngtt), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006537889 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA guanylyltransferase and 5-phosphatase (Rngtt), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 96 // 68 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:33310328:33500914:1 gene:ENSMUSG00000028274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000108153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:33310311:33502614:1 gene:ENSMUSG00000028274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000155397 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:33324898:33339177:1 gene:ENSMUSG00000028274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AF025653 // GenBank // Mus musculus mRNA capping enzyme (MCE) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// AF034568 // GenBank // Mus musculus RNA guanylyltransferase (Mce1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC043657 // GenBank // Mus musculus RNA guanylyltransferase and 5-phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:49072 IMAGE:5343539), complete cds. // chr4 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// XM_006537890 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA guanylyltransferase and 5-phosphatase (Rngtt), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1 /// GENSCAN00000040220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:33310461:33500401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0
NM_181730 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) I polypeptide D (Polr1d), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// ENSMUST00000110557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:147077346:147111361:1 gene:ENSMUSG00000029642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// ENSMUST00000122336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:34354043:34354423:1 gene:ENSMUSG00000062554 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC002025 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) I polypeptide D, mRNA (cDNA clone MGC:5906 IMAGE:3591169), complete cds. // chr4 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// BC024394 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) I polypeptide D, mRNA (cDNA clone MGC:36184 IMAGE:4987975), complete cds. // chr4 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// BC087884 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) I polypeptide D, mRNA (cDNA clone MGC:107156 IMAGE:6772717), complete cds. // chr4 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// NM_009087 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) I polypeptide D (Polr1d), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// ENSMUST00000050970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:147077050:147079086:1 gene:ENSMUSG00000029642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// D86609 // GenBank // Mus musculus mRNA for RPA16, complete cds. // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000030371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:34354043:34354423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT046647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000132230 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:34550951:34562769:1 gene:ENSMUSG00000028291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NM_001007589 // RefSeq // Mus musculus akirin 2 (Akirin2), mRNA. // chr4 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// BC082305 // GenBank HTC // Mus musculus akirin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:30354830), with apparent retained intron. // chr4 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_006538051 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus akirin 2 (Akirin2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// ENSMUST00000084299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:34550937:34566908:1 gene:ENSMUSG00000028291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONMMUT046654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:34543903:34571045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_181406 // RefSeq // Mus musculus arginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Rars2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006537548 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus arginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Rars2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000029968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:34614957:34660167:1 gene:ENSMUSG00000028292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000141519 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:34647712:34656177:1 gene:ENSMUSG00000028292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 91 // 28 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000142045 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:34614974:34660163:1 gene:ENSMUSG00000028292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AK166986 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0026M22 product:arginyl-tRNA synthetase-like, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC024878 // GenBank // Mus musculus arginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:28202 IMAGE:3989666), complete cds. // chr4 // 79 // 100 // 31 // 39 // 0 /// GENSCAN00000030372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:34622252:34660070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 41 // 16 // 16 // 0
NM_009889 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein hormones, alpha subunit (Cga), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006537586 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycoprotein hormones, alpha subunit (Cga), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000029975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:34893779:34907370:1 gene:ENSMUSG00000028298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108130 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:34893788:34907178:1 gene:ENSMUSG00000028298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AF307151 // GenBank // Mus musculus molossinus glycoprotein hormone alpha-subunit mRNA, complete cds. // chr4 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// BC087926 // GenBank // Mus musculus glycoprotein hormones, alpha subunit, mRNA (cDNA clone MGC:107283 IMAGE:30251641), complete cds. // chr4 // 78 // 92 // 18 // 23 // 0 /// J00643 // GenBank // Mus musculus thyrotropin alpha subunit (Tsha) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135871 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:34893788:34907132:1 gene:ENSMUSG00000028298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000013307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:34891995:34907468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_199157 // RefSeq // Mus musculus interferon kappa (Ifnk), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058595 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:35152056:35154005:1 gene:ENSMUSG00000042993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099376 // GenBank // Mus musculus interferon kappa, mRNA (cDNA clone MGC:117503 IMAGE:30713338), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:35152074:35177312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
ENSMUST00000117931 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:35436214:35436781:1 gene:ENSMUSG00000083851 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:35436400:35436790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
NM_001081095 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700009N14 gene (1700009N14Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:39450295:39451776:1 gene:ENSMUSG00000028287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC050973 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 1700009N14 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6773859). // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC116915 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700009N14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151292 IMAGE:40126234), complete cds. // chr4 // 65 // 63 // 11 // 17 // 0 /// BC116917 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700009N14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151294 IMAGE:40126236), complete cds. // chr4 // 65 // 63 // 11 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:39450736:39451446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000119228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:39823430:39824348:1 gene:ENSMUSG00000083271 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:39823951:39824268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_007386 // RefSeq // Mus musculus aconitase 1 (Aco1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000102973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:40143081:40198338:1 gene:ENSMUSG00000028405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// BC005454 // GenBank // Mus musculus aconitase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6247 IMAGE:3494686), complete cds. // chr4 // 83 // 93 // 33 // 40 // 0 /// GENSCAN00000041133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:40163749:40197667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0
NR_045265 // RefSeq // Mus musculus topoisomerase I binding, arginine/serine-rich, opposite strand (Toporsos), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000129758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:40269569:40270940:1 gene:ENSMUSG00000028407 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:40269617:40270142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT046771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001166009 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 215 (Tmem215), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_177175 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 215 (Tmem215), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:40472180:40477168:1 gene:ENSMUSG00000046593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:40473130:40475653:1 gene:ENSMUSG00000046593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC144984 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 215, mRNA (cDNA clone MGC:178540 IMAGE:9053532), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC148227 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 215, mRNA (cDNA clone MGC:161185 IMAGE:40140720), complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC148284 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 215, mRNA (cDNA clone MGC:161186 IMAGE:40140721), complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001164671 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1 (Dnaja1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// NM_001164672 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1 (Dnaja1), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// NM_008298 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1 (Dnaja1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000030118 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:40722480:40734964:1 gene:ENSMUSG00000028410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000164233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:40722922:40737149:1 gene:ENSMUSG00000028410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0
NM_001164671 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1 (Dnaja1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_001164672 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1 (Dnaja1), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NR_029594 // RefSeq // Mus musculus microRNA 207 (Mir207), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083518 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:40722917:40722995:1 gene:ENSMUSG00000065452 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000129204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:40722922:40733900:1 gene:ENSMUSG00000028410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000137246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:40722930:40731759:1 gene:ENSMUSG00000028410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000164233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:40722922:40737149:1 gene:ENSMUSG00000028410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000125442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:40722945:40728164:1 gene:ENSMUSG00000028410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// mmu-mir-207 // miRBase Micro RNA Database // MI0000250 Mus musculus miR-207 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011463 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 4 (Spink4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:40920052:40931395:1 gene:ENSMUSG00000028415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117048 // GenBank // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 4, mRNA (cDNA clone MGC:151425 IMAGE:40126367), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117050 // GenBank // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 4, mRNA (cDNA clone MGC:151427 IMAGE:40126369), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// Y11505 // GenBank // M.musculus mRNA for Mpgc60 protein. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132943 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:40920054:40925044:1 gene:ENSMUSG00000028415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT046800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_029814 // RefSeq // Mus musculus charged multivesicular body protein 5 (Chmp5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000030128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:40948407:40965303:1 gene:ENSMUSG00000028419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK003313 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110002L21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AK147058 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days pregnant adult female amnion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920092E08 product:Apoptosis-related protein PNAS-2 (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC006947 // GenBank // Mus musculus chromatin modifying protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:6559 IMAGE:2811290), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC058756 // GenBank // Mus musculus chromatin modifying protein 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:6493295). // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000008390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:40952411:41024873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONMMUT046803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001290448 // RefSeq // Mus musculus nuclear transcription factor, X-box binding 1 (Nfx1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NM_001290449 // RefSeq // Mus musculus nuclear transcription factor, X-box binding 1 (Nfx1), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NM_023739 // RefSeq // Mus musculus nuclear transcription factor, X-box binding 1 (Nfx1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006538319 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear transcription factor, X-box binding 1 (Nfx1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000030133 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:40970906:41013871:1 gene:ENSMUSG00000028423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000091614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:40970906:41012608:1 gene:ENSMUSG00000028423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000098143 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:40970906:41025993:1 gene:ENSMUSG00000028423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF223576 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich protein NFX-1 mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC053709 // GenBank // Mus musculus nuclear transcription factor, X-box binding 1, mRNA (cDNA clone MGC:60455 IMAGE:30052746), complete cds. // chr4 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000008390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:40952411:41024873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_026275 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2R 2 (Ube2r2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000040008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:41135743:41193380:1 gene:ENSMUSG00000036241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK007517 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810015O10 product:UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME E2-32 KDA COMPLEMENTING (EC 6.3.2.19) (UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE) (UBIQUITIN CARRIER PROTEIN) (E2-CDC34) homolog [Oryctolagus cuniculus], full insert sequence. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC011112 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2R 2, mRNA (cDNA clone MGC:19259 IMAGE:3982808), complete cds. // chr4 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000129874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:41182920:41190823:1 gene:ENSMUSG00000036241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000008380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41136070:41190824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENSMUST00000083939 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:41303158:41303272:1 gene:ENSMUSG00000065873 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025539 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 2 (Nudt2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006538165 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 2 (Nudt2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030154 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:41465151:41480926:1 gene:ENSMUSG00000028443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC025153 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 2, mRNA (cDNA clone MGC:35745 IMAGE:4236805), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41464332:41480562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NR_045726 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 219, member A, opposite strand (Fam219aos), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:41517437:41518929:1 gene:ENSMUSG00000036162 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175138 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, intermediate chain 1 (Dnaic1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000102963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:41569775:41638158:1 gene:ENSMUSG00000061322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000143198 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:41631644:41638158:1 gene:ENSMUSG00000061322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// BC138785 // GenBank // Mus musculus dynein, axonemal, intermediate chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:170412 IMAGE:8861807), complete cds. // chr4 // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// BC138787 // GenBank // Mus musculus dynein, axonemal, intermediate chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:170414 IMAGE:8861809), complete cds. // chr4 // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// GENSCAN00000008389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41594361:41637971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0
AK139008 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530060M13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK006699 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700045I11 product:hypothetical Threonine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSMUST00000068158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:42735545:42845996:1 gene:ENSMUSG00000054885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000107984 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:42735912:42846248:1 gene:ENSMUSG00000054885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AK016301 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930578G10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XR_390497 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638670 (LOC102638670), transcript variant X1, ncRNA. // chr4 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// XR_392655 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930578G10 gene (4930578G10Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr4 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// XR_392659 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930578G10 gene (4930578G10Rik), transcript variant X7, misc_RNA. // chr4 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// XR_392662 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930578G10 gene (4930578G10Rik), transcript variant X10, misc_RNA. // chr4 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// ENSMUST00000145453 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:42735545:42767287:1 gene:ENSMUSG00000054885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// AK006581 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700031K17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// NONMMUT046920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
XM_006537811 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus expressed sequence N28178 (N28178), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006537814 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus expressed sequence N28178 (N28178), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000069184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:42917270:42944752:1 gene:ENSMUSG00000036062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000107975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:42916694:42944752:1 gene:ENSMUSG00000036062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107976 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:42917251:42944752:1 gene:ENSMUSG00000036062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000138425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:42933919:42939513:1 gene:ENSMUSG00000036062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// AK122428 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1045 protein. // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC057092 // GenBank // Mus musculus expressed sequence N28178, mRNA (cDNA clone MGC:73464 IMAGE:5703966), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000124380 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:42917334:42940357:1 gene:ENSMUSG00000036062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// GENSCAN00000041965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:42933620:42939601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_026088 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700022I11 gene (1700022I11Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:42969946:42974326:1 gene:ENSMUSG00000028451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:42969946:42983640:1 gene:ENSMUSG00000028451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// AK132843 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930435I17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// ENSMUST00000190902 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:42969934:42971488:1 gene:ENSMUSG00000028451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000041970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:42945735:42974174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_011571 // RefSeq // Mus musculus testis specific protein kinase 1 (Tesk1), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000060864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43441939:43448064:1 gene:ENSMUSG00000028458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000138981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43443321:43447794:1 gene:ENSMUSG00000028458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// AB003494 // GenBank // Mus musculus mRNA for testis-specific protein kinase 1, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC099699 // GenBank // Mus musculus testis specific protein kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:106523 IMAGE:6821934), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000126350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43444575:43445380:1 gene:ENSMUSG00000028458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// ENSMUST00000137178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43444708:43445817:1 gene:ENSMUSG00000028458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// ENSMUST00000156810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43444950:43446011:1 gene:ENSMUSG00000028458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000041968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43443435:43447497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT046971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001037913 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 107 (Ccdc107), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006538139 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 107 (Ccdc107), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000030181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43493362:43495921:1 gene:ENSMUSG00000028461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43493389:43495921:1 gene:ENSMUSG00000028461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000127324 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43493377:43493810:1 gene:ENSMUSG00000028461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000137113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43493417:43495871:1 gene:ENSMUSG00000028461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000140005 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43493417:43495864:1 gene:ENSMUSG00000028461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43479378:43493930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_172866 // RefSeq // Mus musculus RGP1 retrograde golgi transport homolog (S. cerevisiae) (Rgp1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43578958:43583130:1 gene:ENSMUSG00000028468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000107886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43578715:43587487:1 gene:ENSMUSG00000028468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000117140 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:43578735:43587485:1 gene:ENSMUSG00000028468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43578954:43580923:1 gene:ENSMUSG00000028468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000141612 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43579737:43580919:1 gene:ENSMUSG00000028468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 82 // 37 // 9 // 11 // 0 /// BC086614 // GenBank // Mus musculus RGP1 retrograde golgi transport homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:90542 IMAGE:30533256), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43578462:43583083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT046996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// NONMMUT046998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 82 // 37 // 9 // 11 // 0
AK044156 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830095J16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027511 // RefSeq // Mus musculus histidine rich carboxyl terminus 1 (Hrct1), mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000095109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43727188:43728639:1 gene:ENSMUSG00000071001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK014425 // GenBank HTC // Mus musculus 18 days pregnant adult female placenta and extra embryonic tissue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3830408D24 product:hypothetical Histidine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC080752 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5029674. // chr4 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0
NR_033355 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5430416O09 gene (5430416O09Rik), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43730034:43734534:1 gene:ENSMUSG00000028475 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147344 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5430416O09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182524 IMAGE:9056418), complete cds. // chr4 // 79 // 56 // 11 // 14 // 0 /// BC147345 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5430416O09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182517 IMAGE:9056411), complete cds. // chr4 // 79 // 56 // 11 // 14 // 0 /// NONMMUT047016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019473 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 155 (Olfr155), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:43854292:43855463:1 gene:ENSMUSG00000071000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43851565:43855270:1 gene:ENSMUSG00000071000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC130252 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 155, mRNA (cDNA clone MGC:161319 IMAGE:40142475), complete cds. // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43854311:43855270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_016678 // RefSeq // Mus musculus reversion-inducing-cysteine-rich protein with kazal motifs (Reck), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006538086 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus reversion-inducing-cysteine-rich protein with kazal motifs (Reck), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000030198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43875530:43944806:1 gene:ENSMUSG00000028476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000128463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43875530:43944745:1 gene:ENSMUSG00000028476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AB006960 // GenBank // Mus musculus mRECK mRNA, complete cds. // chr4 // 82 // 96 // 37 // 45 // 0 /// BC132197 // GenBank // Mus musculus reversion-inducing-cysteine-rich protein with kazal motifs, mRNA (cDNA clone MGC:163828 IMAGE:40130474), complete cds. // chr4 // 93 // 89 // 39 // 42 // 0 /// BC138065 // GenBank // Mus musculus reversion-inducing-cysteine-rich protein with kazal motifs, mRNA (cDNA clone MGC:169689 IMAGE:8861084), complete cds. // chr4 // 93 // 89 // 39 // 42 // 0 /// GENSCAN00000040049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43875606:43977623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 70 // 32 // 33 // 0
NM_027450 // RefSeq // Mus musculus GLI pathogenesis-related 2 (Glipr2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43957401:43979118:1 gene:ENSMUSG00000028480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107855 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:43957692:43979118:1 gene:ENSMUSG00000028480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC031750 // GenBank // Mus musculus GLI pathogenesis-related 2, mRNA (cDNA clone MGC:28417 IMAGE:4037002), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43875606:43977623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001002787 // RefSeq // Mus musculus calicin (Ccin), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43983483:43985423:1 gene:ENSMUSG00000070999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC150949 // GenBank // Mus musculus calicin, mRNA (cDNA clone MGC:183860 IMAGE:9087860), complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC150952 // GenBank // Mus musculus calicin, mRNA (cDNA clone MGC:183863 IMAGE:9087863), complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43983595:43985361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NR_040414 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 12504 (Gm12504), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000120860 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:44121893:44124123:1 gene:ENSMUSG00000084274 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000148026 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:44123238:44123543:1 gene:ENSMUSG00000084274 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000040055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:44123238:44123543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT047032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_010790 // RefSeq // Mus musculus maternal embryonic leucine zipper kinase (Melk), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000045607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:44300876:44364675:1 gene:ENSMUSG00000035683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000125708 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:44303568:44318070:1 gene:ENSMUSG00000035683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 26 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000137703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:44302667:44325693:1 gene:ENSMUSG00000035683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 39 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000137759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:44303568:44324268:1 gene:ENSMUSG00000035683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 34 // 13 // 13 // 0 /// BC085276 // GenBank // Mus musculus maternal embryonic leucine zipper kinase, mRNA (cDNA clone MGC:102507 IMAGE:30443236), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// L76158 // GenBank // Mus musculus protein kinase PK38 (PK38) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000040060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:44303609:44363887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000107823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:44907202:44931362:1 gene:ENSMUSG00000035649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000126968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:44925995:44931362:1 gene:ENSMUSG00000035649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000147272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:44923118:44932215:1 gene:ENSMUSG00000035649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC054405 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:6494345), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_138590 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 7 (Zcchc7), mRNA. // chr4 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// XM_006537986 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 7 (Zcchc7), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENSMUST00000107824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:44756568:44932203:1 gene:ENSMUSG00000035649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// XM_006537985 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 7 (Zcchc7), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT047070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT047074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000035188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:44884526:44952804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XR_401581 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700055D18 gene (1700055D18Rik), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000095105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45012830:45014399:1 gene:ENSMUSG00000070997 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK042394 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630087P21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000186030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45011687:45015406:1 gene:ENSMUSG00000070997 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001081172 // RefSeq // Mus musculus FERM and PDZ domain containing 1 (Frmpd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000044773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45184906:45285936:1 gene:ENSMUSG00000035615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000107804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45203925:45285936:1 gene:ENSMUSG00000035615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000134280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45184875:45261900:1 gene:ENSMUSG00000035615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// BC158060 // GenBank // Mus musculus FERM and PDZ domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:189860 IMAGE:9007360), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45193495:45285830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
AK016397 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930596A03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000083388 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:45548743:45548849:1 gene:ENSMUSG00000065322 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT047108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033412 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 829 (Gm829), mRNA. // chr4 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000146622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:45683589:45723338:1 gene:ENSMUSG00000073860 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123741 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45683589:45692938:1 gene:ENSMUSG00000073860 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONMMUT047112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_028270 // RefSeq // Mus musculus aldehyde dehydrogenase 1 family, member B1 (Aldh1b1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:45799022:45804604:1 gene:ENSMUSG00000035561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC020001 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase 1 family, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:28561 IMAGE:4207479), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC086768 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase 1 family, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:101971 IMAGE:6808412), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198660 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230008N13 gene (E230008N13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000127261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45909567:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000149903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890852:45950767:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000178561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45950774:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK053981 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230008N13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_198660 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230008N13 gene (E230008N13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000127261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45909567:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890852:45950767:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45950774:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK053981 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230008N13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45891707:46034516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198660 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230008N13 gene (E230008N13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000127261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45909567:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000149903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890852:45950767:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000178561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45950774:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK053981 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230008N13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000012984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45891707:46034516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_198660 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230008N13 gene (E230008N13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000127261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45909567:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000149903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890852:45950767:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000178561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45950774:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK053981 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230008N13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45891707:46034516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_198660 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230008N13 gene (E230008N13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890852:45950767:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45950774:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45891707:46034516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198660 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230008N13 gene (E230008N13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000149903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890852:45950767:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000178561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45950774:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45891707:46034516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_198660 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230008N13 gene (E230008N13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890852:45950767:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45914369:45921936:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45950774:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45891707:46034516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198660 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230008N13 gene (E230008N13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890852:45950767:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45950774:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198660 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230008N13 gene (E230008N13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000149903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890852:45950767:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000178561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45950774:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45891707:46034516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_198660 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230008N13 gene (E230008N13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000149903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890852:45950767:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000178561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45950774:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45891707:46034516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_198660 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230008N13 gene (E230008N13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890852:45950767:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45950774:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK137596 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830163L10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45891707:46034516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198660 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230008N13 gene (E230008N13Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45890852:45950767:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45890303:45950774:1 gene:ENSMUSG00000035539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK137596 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830163L10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001290475 // RefSeq // Mus musculus tudor domain containing 7 (Tdrd7), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_146142 // RefSeq // Mus musculus tudor domain containing 7 (Tdrd7), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006537518 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tudor domain containing 7 (Tdrd7), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006537519 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tudor domain containing 7 (Tdrd7), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000102929 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:45972233:46034761:1 gene:ENSMUSG00000035517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000107777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45965334:46034761:1 gene:ENSMUSG00000035517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC029689 // GenBank // Mus musculus tudor domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:36668 IMAGE:5367741), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45891707:46034516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
AK158474 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930119H24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_021883 // RefSeq // Mus musculus tropomodulin 1 (Tmod1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107773 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:46038935:46116032:1 gene:ENSMUSG00000028328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC106849 // GenBank // Mus musculus tropomodulin 1, mRNA (cDNA clone MGC:124125 IMAGE:40046092), complete cds. // chr4 // 85 // 96 // 23 // 27 // 0 /// BC106850 // GenBank // Mus musculus tropomodulin 1, mRNA (cDNA clone MGC:124126 IMAGE:40046093), complete cds. // chr4 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// XM_006537772 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tropomodulin 1 (Tmod1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// ENSMUST00000128689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:46077127:46099708:1 gene:ENSMUSG00000028328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// AK132878 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930480L01 product:tropomodulin 1, full insert sequence. // chr4 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:46050710:46103942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
NM_001033201 // RefSeq // Mus musculus nuclear cap binding protein subunit 1 (Ncbp1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000030014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:46138613:46172403:1 gene:ENSMUSG00000028330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000133286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:46165196:46171979:1 gene:ENSMUSG00000028330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 27 // 13 // 13 // 0 /// AK166458 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930024D22 product:80 kDa nuclear cap binding protein (NCBP 80 kDa subunit) (CBP80) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 100 // 48 // 23 // 23 // 0 /// BC138898 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AU014645, mRNA (cDNA clone MGC:170525 IMAGE:8861920), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000012990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:46133934:46172006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 65 // 30 // 31 // 0
NM_183298 // RefSeq // Mus musculus forkhead box E1 (Foxe1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:46343609:46346412:1 gene:ENSMUSG00000070990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:46327296:46345309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082476 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:46495155:46495285:1 gene:ENSMUSG00000064410 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT047149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
AK145002 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830022P11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// BC046553 // GenBank HTC // Mus musculus v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian), mRNA (cDNA clone IMAGE:5340777). // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// BC051162 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5249345, partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK033592 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130020O15 product:ENV PROTEIN homolog [Mouse mammary tumor virus], full insert sequence. // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// AK145153 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930005B02 product:Notch gene homolog 4 (Drosophila), full insert sequence. // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT057316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
BC005685 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC005685, mRNA (cDNA clone IMAGE:3154990), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
NM_172693 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12 (Galnt12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000045041 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:47091909:47123070:1 gene:ENSMUSG00000039774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000107744 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:47091923:47123043:1 gene:ENSMUSG00000039774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB175680 // GenBank // Mus musculus mpp-GalNAc-T12 mRNA for UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC025639 // GenBank HTC // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:5322763), with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC056425 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12, mRNA (cDNA clone MGC:66556 IMAGE:5716909), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000051923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:47091973:47122577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_015743 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor subfamily 4, group A, member 3 (Nr4a3), mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:48045153:48086445:1 gene:ENSMUSG00000028341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000133539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:48051248:48056739:1 gene:ENSMUSG00000028341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 41 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000153369 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:48049114:48086447:1 gene:ENSMUSG00000028341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// AF191211 // GenBank // Mus musculus orphan nuclear receptor TEC long isoform (Tec) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// AF191212 // GenBank // Mus musculus orphan nuclear receptor TECdeltaC short isoform (Tec) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 41 // 16 // 16 // 0 /// BC068150 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor subfamily 4, group A, member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:30534822). // chr4 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000022964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:48049915:48083352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0
NM_026343 // RefSeq // Mus musculus syntaxin 17 (Stx17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000064765 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:48124935:48182231:1 gene:ENSMUSG00000061455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000107720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:48124926:48186507:1 gene:ENSMUSG00000061455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000107721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:48124915:48185911:1 gene:ENSMUSG00000061455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC028639 // GenBank // Mus musculus syntaxin 17, mRNA (cDNA clone MGC:41250 IMAGE:1243532), complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_001281977 // RefSeq // Mus musculus inversin (Invs), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_001281978 // RefSeq // Mus musculus inversin (Invs), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_010569 // RefSeq // Mus musculus inversin (Invs), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006537627 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inversin (Invs), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006537636 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inversin (Invs), transcript variant X11, mRNA. // chr4 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000030029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:48279802:48431954:1 gene:ENSMUSG00000028344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000143433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:48279826:48427351:1 gene:ENSMUSG00000028344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AF034860 // GenBank // Mus musculus Inv (inv) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// AK041671 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630029E03 product:inversin, full insert sequence. // chr4 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0 /// BC126929 // GenBank // Mus musculus inversin, mRNA (cDNA clone MGC:141481 IMAGE:40081431), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:48376950:48427712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
NM_021436 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 1 (Tmeff1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:48585174:48663131:1 gene:ENSMUSG00000028347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000123476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:48585365:48662085:1 gene:ENSMUSG00000028347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:48585551:48662470:1 gene:ENSMUSG00000028347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141720 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:48636934:48660239:1 gene:ENSMUSG00000028347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AJ400622 // GenBank // Mus musculus partial mRNA for tomoregulin-1 (M7365) (TR-1 gene). // chr4 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// BC023714 // GenBank HTC // Mus musculus transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5346408), with apparent retained intron. // chr4 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// BC057598 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:67249 IMAGE:6401547), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:48638865:48661447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_026509 // RefSeq // Mus musculus muscle-related coiled-coil protein (Murc), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:48663514:48673502:1 gene:ENSMUSG00000028348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089601 // GenBank // Mus musculus muscle-related coiled-coil protein, mRNA (cDNA clone MGC:107637 IMAGE:6788090), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU487254 // GenBank // Mus musculus muscle-restricted coiled-coil protein (Murc) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000022953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:48663622:48673883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_178756 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E130309F12 gene (E130309F12Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000076670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:49059282:49340259:1 gene:ENSMUSG00000063446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK087439 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130118N02 product:weakly similar to DJ846F13.1 (PHOSPHATIDIC ACID PHOSPHATASE TYPE 2C) (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// AY345342 // GenBank // Mus musculus plasticity-related protein 3 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// BC096762 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E130309F12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107402 IMAGE:30094664), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// AK220568 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4247 protein. // chr4 // 83 // 83 // 15 // 18 // 1 /// ENSMUST00000151692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:49059456:49302269:1 gene:ENSMUSG00000063446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// AK053451 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130018O13 product:hypothetical Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase containing protein, full insert sequence. // chr4 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// GENSCAN00000011215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:49282241:49336727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
ENSMUST00000121981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:49342248:49342578:1 gene:ENSMUSG00000096476 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:49342248:49351137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 74 // 79 // 14 // 19 // 0
ENSMUST00000117128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:49412307:49412637:1 gene:ENSMUSG00000094082 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000011213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:49412307:49412630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001289901 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 189 (Zfp189), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_145547 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 189 (Zfp189), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006537846 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 189 (Zfp189), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000042964 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:49521176:49531517:1 gene:ENSMUSG00000039634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000107696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:49521217:49531517:1 gene:ENSMUSG00000039634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC021326 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 189, mRNA (cDNA clone MGC:29268 IMAGE:5065942), complete cds. // chr4 // 84 // 93 // 21 // 25 // 0 /// BC087833 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 189, mRNA (cDNA clone MGC:66706 IMAGE:5708354), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:49520141:49533418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSMUST00000156384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:51216678:51228821:1 gene:ENSMUSG00000039555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// NM_001162865 // RefSeq // Mus musculus cylicin, basic protein of sperm head cytoskeleton 2 (Cylc2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// ENSMUST00000041392 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:51216678:51230272:1 gene:ENSMUSG00000039555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// ENSMUST00000166749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:51216678:51229928:1 gene:ENSMUSG00000039555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:51190362:51251118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000121199 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:52240903:52241522:1 gene:ENSMUSG00000083539 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000055058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:52220505:52327792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_008017 // RefSeq // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 2 (Smc2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:52439243:52488260:1 gene:ENSMUSG00000028312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117280 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:52439243:52488260:1 gene:ENSMUSG00000028312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142227 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:52439269:52458574:1 gene:ENSMUSG00000028312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC021847 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4017041, containing frame-shift errors. // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC094380 // GenBank // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 2, mRNA (cDNA clone MGC:106610 IMAGE:30543190), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:52390470:52486655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NM_026652 // RefSeq // Mus musculus topoisomerase I binding, arginine/serine-rich like (Toporsl), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029995 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:52596274:52612430:1 gene:ENSMUSG00000028314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:52607206:52612427:1 gene:ENSMUSG00000028314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC120821 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930547C10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:156058 IMAGE:40129744), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC120823 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930547C10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:156060 IMAGE:40129746), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:52610109:52650699:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000120435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:52821488:52822117:1 gene:ENSMUSG00000081975 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT047274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_146858 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 275 (Olfr275), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:52825399:52826358:1 gene:ENSMUSG00000089717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:52793568:52826358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_146607 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 270 (Olfr270), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:52970623:52971567:1 gene:ENSMUSG00000070983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:52970629:52971567:1 gene:ENSMUSG00000070983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127971 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 270, mRNA (cDNA clone MGC:157524 IMAGE:40135114), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:52968746:52971567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_028529 // RefSeq // Mus musculus nipsnap homolog 3A (C. elegans) (Nipsnap3a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000015386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:52989272:53000847:1 gene:ENSMUSG00000015242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107666 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:52989418:53001162:1 gene:ENSMUSG00000015242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:53000264:53000846:1 gene:ENSMUSG00000015242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000188045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:52989284:53000854:1 gene:ENSMUSG00000015242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:52979712:53000374:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT047277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
NM_025623 // RefSeq // Mus musculus nipsnap homolog 3B (C. elegans) (Nipsnap3b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006538174 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nipsnap homolog 3B (C. elegans) (Nipsnap3b), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000015391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:53011880:53022060:1 gene:ENSMUSG00000015247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:53011950:53021576:1 gene:ENSMUSG00000015247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AF353623 // GenBank // Mus musculus NIPSNAP-related protein mRNA, complete cds. // chr4 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// BC019505 // GenBank // Mus musculus nipsnap homolog 3A (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:28483 IMAGE:4164310), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:53011790:53023847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
XM_006537532 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 44, member 1 (Slc44a1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006537533 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 44, member 1 (Slc44a1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:53440671:53567818:1 gene:ENSMUSG00000028412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141895 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130057D21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONMMUT047303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0
NM_009317 // RefSeq // Mus musculus T cell acute lymphocytic leukemia 2 (Tal2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:53779705:53788712:1 gene:ENSMUSG00000028417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC110625 // GenBank // Mus musculus T-cell acute lymphocytic leukemia 2, mRNA (cDNA clone MGC:130117 IMAGE:40051579), complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_028053 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 38B (Tmem38b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:53826045:53862019:1 gene:ENSMUSG00000028420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000144167 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:53840470:53854332:1 gene:ENSMUSG00000028420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0 /// AB261159 // GenBank // Mus musculus mg33b mRNA for Mitsugumin33B, complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC011072 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 38B, mRNA (cDNA clone MGC:18939 IMAGE:3978742), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:53826057:53847844:1 gene:ENSMUSG00000028420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:53840627:53877819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONMMUT047314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_028053 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 38B (Tmem38b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000030127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:53826045:53862019:1 gene:ENSMUSG00000028420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000083953 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:53860652:53860770:1 gene:ENSMUSG00000065887 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT047316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_172867 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 462 (Zfp462), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006537924 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 462 (Zfp462), transcript variant X10, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000030131 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:55011366:55081358:1 gene:ENSMUSG00000060206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000079605 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:55011480:55081330:1 gene:ENSMUSG00000060206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000098070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:54947976:55083563:1 gene:ENSMUSG00000060206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC099692 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 462, mRNA (cDNA clone IMAGE:30737693), partial cds. // chr4 // 93 // 47 // 14 // 15 // 0 /// DQ355518 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 462 (Zfp462) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:55007563:55080873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_009011 // RefSeq // Mus musculus RAD23b homolog (S. cerevisiae) (Rad23b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:55350043:55392237:1 gene:ENSMUSG00000028426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000156263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:55350090:55381116:1 gene:ENSMUSG00000028426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC027747 // GenBank // Mus musculus RAD23b homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:29174 IMAGE:4459657), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC068193 // GenBank // Mus musculus RAD23b homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:67089 IMAGE:6813997), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:55350050:55368574:1 gene:ENSMUSG00000028426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK084917 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430011I09 product:RAD23b homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000007923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:55350362:55389997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT047350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSMUST00000135987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:55563265:55599296:1 gene:ENSMUSG00000066176 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY512912 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:H4062G06 unknown mRNA. // chr4 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONMMUT047363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000181745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:56740070:56741377:1 gene:ENSMUSG00000096930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006907 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700066N11 product:actin-like 7b, full insert sequence. // chr4 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0
NM_009611 // RefSeq // Mus musculus actin-like 7a (Actl7a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:56743413:56744925:1 gene:ENSMUSG00000070979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB023063 // GenBank // Mus musculus mRNA for t-ACTIN 2, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF113519 // GenBank // Mus musculus actin-like-7-alpha protein (Actl7a) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049610 // GenBank // Mus musculus actin-like 7a, mRNA (cDNA clone MGC:58295 IMAGE:6741507), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:56743475:56744797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001081420 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 206, member A (Fam206a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000045368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:56802349:56809601:1 gene:ENSMUSG00000038827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000131520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:56802352:56809601:1 gene:ENSMUSG00000038827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000147763 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:56802618:56805947:1 gene:ENSMUSG00000038827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC026590 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC026590, mRNA (cDNA clone MGC:37261 IMAGE:4973099), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC048548 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC026590, mRNA (cDNA clone MGC:58524 IMAGE:6590165), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC062190 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC026590, mRNA (cDNA clone IMAGE:30244293), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000152638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:56802345:56804625:1 gene:ENSMUSG00000038827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// AK043588 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830010O17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000038001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:56800455:56806171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONMMUT047383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENSMUST00000082661 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:56913642:56913767:1 gene:ENSMUSG00000064595 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONMMUT047396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
ENSMUST00000098065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:57717657:57856922:1 gene:ENSMUSG00000038729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:57568179:57896982:1 gene:ENSMUSG00000089945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:57742095:57896982:1 gene:ENSMUSG00000038729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:57568330:57854584:1 gene:ENSMUSG00000089945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150412 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:57637823:57894718:1 gene:ENSMUSG00000089945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:57678192:57801649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK077020 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932411M01 product:A kinase (PRKA) anchor protein 2, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF064781 // GenBank // Mus musculus clone pEN70 unknown mRNA, partial cds. // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NM_001099323 // RefSeq // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 16 (Zkscan16), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000107554 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:4:58943628:58958355:1 gene:ENSMUSG00000038630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:58946151:58964690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NM_025277 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 10 (Gng10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000041160 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:59035088:59041903:1 gene:ENSMUSG00000038607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000126507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:59035772:59041903:1 gene:ENSMUSG00000038607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000174664 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:59003210:59041888:1 gene:ENSMUSG00000092345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC023670 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 10, mRNA (cDNA clone MGC:29414 IMAGE:5031104), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC055434 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 10, mRNA (cDNA clone MGC:65216 IMAGE:3994982), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:59035238:59039352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// NONMMUT047479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_011673 // RefSeq // Mus musculus UDP-glucose ceramide glucosyltransferase (Ugcg), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:59189257:59222833:1 gene:ENSMUSG00000028381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK138848 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430090L12 product:UDP-glucose ceramide glucosyltransferase, full insert sequence. // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC050828 // GenBank // Mus musculus UDP-glucose ceramide glucosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:59317 IMAGE:6512920), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// D89866 // GenBank // Mus musculus mRNA for ceramide glucosyltransferase, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000133996 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:59189558:59212203:1 gene:ENSMUSG00000028381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:59181291:59220393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000052502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:59549154:59549625:1 gene:ENSMUSG00000046145 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// AK006094 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700018M17 product:hypothetical Proline-rich region containing protein, full insert sequence. // chr4 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONMMUT047504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024255 // RefSeq // Mus musculus hydroxysteroid dehydrogenase like 2 (Hsdl2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006538277 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hydroxysteroid dehydrogenase like 2 (Hsdl2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000030078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:59581563:59618689:1 gene:ENSMUSG00000028383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000107528 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:59581645:59618688:1 gene:ENSMUSG00000028383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000128792 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:59594310:59601476:1 gene:ENSMUSG00000028383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// AY725196 // GenBank // Mus musculus hydroxysteroid dehydrogenase-like 2 protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC002211 // GenBank // Mus musculus hydroxysteroid dehydrogenase like 2, mRNA (cDNA clone MGC:7467 IMAGE:3490303), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:59588497:59627812:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0
NM_172468 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin family member 30 (Snx30), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000030080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:59805840:59904737:1 gene:ENSMUSG00000028385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000143185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:59884780:59894554:1 gene:ENSMUSG00000028385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000145199 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:59884694:59900533:1 gene:ENSMUSG00000028385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// BC099674 // GenBank // Mus musculus sorting nexin family member 30, mRNA (cDNA clone MGC:106086 IMAGE:4950374), complete cds. // chr4 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:59833665:59898148:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
ENSMUST00000178292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:60677683:60680431:1 gene:ENSMUSG00000094743 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// GENSCAN00000022663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:60676046:60680814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// NONMMUT047537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// NONMMUT047538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
ENSMUST00000118437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:61608292:61610983:1 gene:ENSMUSG00000082065 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000009739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:61606644:61611366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT047545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000120085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:61797482:61800237:1 gene:ENSMUSG00000090090 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000153865 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:61783123:61801286:1 gene:ENSMUSG00000081207 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XR_390613 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102640145 (LOC102640145), transcript variant X1, ncRNA. // chr4 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// XR_390614 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102640145 (LOC102640145), transcript variant X2, ncRNA. // chr4 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// ENSMUST00000098035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:60838256:60839649:1 gene:ENSMUSG00000094948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// GENSCAN00000009746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:61797482:61800047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT047548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT047549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT047551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT047552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT047553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000009741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:60839237:61166154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0
NM_001290518 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 31, member 2 (Slc31a2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_025286 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 31, member 2 (Slc31a2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000084530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:62286449:62298411:1 gene:ENSMUSG00000066152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:62291547:62297477:1 gene:ENSMUSG00000066152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000107468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:62262562:62297355:1 gene:ENSMUSG00000066152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC029183 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 31, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:35783 IMAGE:4502064), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC099447 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 31, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:117640 IMAGE:30715212), complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000041626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:62286569:62297143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0
NM_175090 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 31, member 1 (Slc31a1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000084526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:62360727:62391769:1 gene:ENSMUSG00000066150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122092 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:62385501:62391769:1 gene:ENSMUSG00000066150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC034674 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 31, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:28108 IMAGE:3968084), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058227 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 31, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:65329 IMAGE:6309323), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC065147 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 31, member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6409525), partial cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:62385667:62388799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_027297 // RefSeq // Mus musculus PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast) (Prpf4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000084524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:62408797:62426990:1 gene:ENSMUSG00000066148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC051639 // GenBank // Mus musculus PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:6392917), partial cds. // chr4 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC106089 // GenBank // Mus musculus PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:117717 IMAGE:30715403), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC125529 // GenBank // Mus musculus PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:159232 IMAGE:40130044), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC125531 // GenBank // Mus musculus PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:159234 IMAGE:40130046), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:62408875:62423411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// AK031219 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930430M20 product:U4/U6 SNRNP 60 KDA PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_138653 // RefSeq // Mus musculus B-box and SPRY domain containing (Bspry), mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000030088 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:62480053:62497298:1 gene:ENSMUSG00000028392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000107449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:62480053:62497298:1 gene:ENSMUSG00000028392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000132237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:62480089:62486419:1 gene:ENSMUSG00000028392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC139079 // GenBank // Mus musculus B-box and SPRY domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:170706 IMAGE:8862101), complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC139080 // GenBank // Mus musculus B-box and SPRY domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:170707 IMAGE:8862102), complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC145535 // GenBank // Mus musculus B-box and SPRY domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:179106 IMAGE:9054098), complete cds. // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// XM_006537676 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B-box and SPRY domain containing (Bspry), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:62480093:62496593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_177607 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933430I17 gene (4933430I17Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000062145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:62525369:62547993:1 gene:ENSMUSG00000058046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC116650 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933430I17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:141616 IMAGE:40088336), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:62538920:62547762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0
NM_028326 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 618 (Zfp618), mRNA. // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006538290 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 618 (Zfp618), transcript variant X12, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030043 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:62965573:63115748:1 gene:ENSMUSG00000028358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000064814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:62965574:63134030:1 gene:ENSMUSG00000028358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000107415 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:62965573:63139708:1 gene:ENSMUSG00000028358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK012848 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810031P15 product:hypothetical Zinc finger, C2H2 type containing protein, full insert sequence. // chr4 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:63114945:63133845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000018592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:63072390:63104929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NR_030477 // RefSeq // Mus musculus microRNA 455 (Mir455), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093594 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:63256851:63256932:1 gene:ENSMUSG00000070102 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-455 // miRBase Micro RNA Database // MI0004679 Mus musculus miR-455 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008768 // RefSeq // Mus musculus orosomucoid 1 (Orm1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000030044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:63344560:63348163:1 gene:ENSMUSG00000039196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK138985 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530046M03 product:orosomucoid 1, full insert sequence. // chr4 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// BC012725 // GenBank // Mus musculus orosomucoid 1, mRNA (cDNA clone MGC:14080 IMAGE:4162961), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// CT010399 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G0453D for gene Orm1, Orosomucoid 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr4 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// M27008 // GenBank // Mouse alpha-1 acid glycoprotein (Agp-1B) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:63344598:63359330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1
NM_013623 // RefSeq // Mus musculus orosomucoid 3 (Orm3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006537666 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus orosomucoid 3 (Orm3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000006687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:63356162:63359511:1 gene:ENSMUSG00000028359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC141235 // GenBank // Mus musculus orosomucoid 3, mRNA (cDNA clone MGC:176196 IMAGE:9055847), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC145559 // GenBank // Mus musculus orosomucoid 3, mRNA (cDNA clone MGC:179131 IMAGE:9054123), complete cds. // chr4 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// BC145560 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054125. // chr4 // 86 // 96 // 19 // 22 // 0 /// XM_006537667 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus orosomucoid 3 (Orm3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// GENSCAN00000018603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:63344598:63359330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 83 // 18 // 19 // 0
NM_011016 // RefSeq // Mus musculus orosomucoid 2 (Orm2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000075341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:63362449:63365878:1 gene:ENSMUSG00000061540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC057985 // GenBank // Mus musculus orosomucoid 2, mRNA (cDNA clone MGC:68161 IMAGE:5126236), complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// M27009 // GenBank // Mouse alpha-1 acid glycoprotein (Agp-2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000018598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:63362487:63365765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XR_104863 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus AT-hook transcription factor, opposite strand (Aknaos), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:63381358:63394018:1 gene:ENSMUSG00000086953 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK017104 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933437N03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT047613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000141428 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:63979854:64149924:1 gene:ENSMUSG00000073821 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK033210 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030463A06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT047634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_021362 // RefSeq // Mus musculus pregnancy-associated plasma protein A (Pappa), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000084501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:65124174:65357509:1 gene:ENSMUSG00000028370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000050401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:65110301:65351725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0
NM_001161782 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 32 (Trim32), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_053084 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 32 (Trim32), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538235 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif-containing 32 (Trim32), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000050850 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:65604986:65616238:1 gene:ENSMUSG00000051675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:65604986:65616238:1 gene:ENSMUSG00000051675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF347694 // GenBank // Mus musculus putative oncogene Trim32 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034104 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 32, mRNA (cDNA clone MGC:31538 IMAGE:4502346), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT047663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000083217 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:66544061:66544193:1 gene:ENSMUSG00000065151 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONMMUT047671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
ENSMUST00000082828 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:68182532:68182702:1 gene:ENSMUSG00000064762 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONMMUT047679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
ENSMUST00000083881 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:69110671:69110777:1 gene:ENSMUSG00000065815 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT047687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000119005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:69853947:69854684:1 gene:ENSMUSG00000085627 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000022561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:69853947:69854684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000118903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:70047157:70048205:1 gene:ENSMUSG00000082368 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:69992641:70048234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0
NM_001163732 // RefSeq // Mus musculus FERM domain containing 3 (Frmd3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NM_172869 // RefSeq // Mus musculus FERM domain containing 3 (Frmd3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000084474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:74013444:74189928:1 gene:ENSMUSG00000049122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000098006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:74013442:74202214:1 gene:ENSMUSG00000049122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC112419 // GenBank // Mus musculus FERM domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:132930 IMAGE:40061426), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC113795 // GenBank // Mus musculus FERM domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:132931 IMAGE:40061428), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC118964 // GenBank // Mus musculus FERM domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:144049 IMAGE:40097059), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000018479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:74046640:74187906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0
NM_001172095 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 4C (Kdm4c), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NM_144787 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 4C (Kdm4c), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006538352 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 4C (Kdm4c), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000030102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:74251936:74405860:1 gene:ENSMUSG00000028397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000077851 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:74242497:74405860:1 gene:ENSMUSG00000028397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// BC020180 // GenBank // Mus musculus jumonji domain containing 2C, mRNA (cDNA clone MGC:27702 IMAGE:4923943), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// BC042424 // GenBank // Mus musculus jumonji domain containing 2C, mRNA (cDNA clone MGC:38691 IMAGE:5357211), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000156065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:74262809:74331560:1 gene:ENSMUSG00000028397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1 /// AK048092 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130034B06 product:SIMILAR TO GENE AMPLIFIED IN SQUAMOUS CELL CARCINOMA 1 [Mus musculus], full insert sequence. // chr4 // 38 // 38 // 18 // 48 // 1 /// GENSCAN00000018477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:74246175:74404997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0
ENSMUST00000121853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:79327708:79328456:1 gene:ENSMUSG00000083496 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:79327708:79328456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001282014 // RefSeq // Mus musculus tyrosinase-related protein 1 (Tyrp1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001282015 // RefSeq // Mus musculus tyrosinase-related protein 1 (Tyrp1), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_031202 // RefSeq // Mus musculus tyrosinase-related protein 1 (Tyrp1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006537784 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tyrosinase-related protein 1 (Tyrp1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000006151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:80834230:80851718:1 gene:ENSMUSG00000005994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000102831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:80834307:80851719:1 gene:ENSMUSG00000005994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000133655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:80834123:80837684:1 gene:ENSMUSG00000005994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000133932 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:80846588:80851000:1 gene:ENSMUSG00000005994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AK190783 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0103M15, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000006151, based on BLAT search. // chr4 // 89 // 28 // 8 // 9 // 0 /// BC076598 // GenBank // Mus musculus tyrosinase-related protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:96635 IMAGE:30613975), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:80820199:80953937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_026821 // RefSeq // Mus musculus leucine rich adaptor protein 1-like (Lurap1l), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000055922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:80910646:80955628:1 gene:ENSMUSG00000048706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC021501 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 4, Brigham & Womens Genetics 0951 expressed, mRNA (cDNA clone MGC:38429 IMAGE:5346437), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC030404 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 4, Brigham & Womens Genetics 0951 expressed, mRNA (cDNA clone MGC:40727 IMAGE:5354204), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:80820199:80953937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XR_390672 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635467 (LOC102635467), transcript variant X1, ncRNA. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XR_390673 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635467 (LOC102635467), transcript variant X2, ncRNA. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000144875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:81743146:81746701:1 gene:ENSMUSG00000087540 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK085025 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430026D02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139225 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730074L22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT047848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001081012 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 171 (Ccdc171), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006537992 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 171 (Ccdc171), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:83525545:83864670:1 gene:ENSMUSG00000052407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000125077 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:83525639:83864585:1 gene:ENSMUSG00000052407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AK039282 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330015D16 product:weakly similar to HYPOTHETICAL 71.7 KDA PROTEIN [Macaca fascicularis], full insert sequence. // chr4 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC039810 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930473A06 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3328211), complete cds. // chr4 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000044403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:83535891:83663825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_029967 // RefSeq // Mus musculus ADAMTS-like 1 (Adamtsl1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006538378 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ADAMTS-like 1 (Adamtsl1), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006538381 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ADAMTS-like 1 (Adamtsl1), transcript variant X8, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000107177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:86276766:86428382:1 gene:ENSMUSG00000066113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000107178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:86053915:86428382:1 gene:ENSMUSG00000066113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000141889 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:86053928:86428385:1 gene:ENSMUSG00000066113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC116295 // GenBank // Mus musculus ADAMTS-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40094971), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC116296 // GenBank // Mus musculus ADAMTS-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40094972), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:86374743:86426951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1
NM_178376 // RefSeq // Mus musculus Ras-related GTP binding A (Rraga), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000091064 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:86575668:86577285:1 gene:ENSMUSG00000070934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048245 // GenBank // Mus musculus Ras-related GTP binding A, mRNA (cDNA clone MGC:54966 IMAGE:6311881), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:86557272:86576860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_184088 // RefSeq // Mus musculus DENN/MADD domain containing 4C (Dennd4c), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000045512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:86748555:86830167:1 gene:ENSMUSG00000038024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000082026 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:86748555:86850603:1 gene:ENSMUSG00000038024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000142837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:86774255:86849055:1 gene:ENSMUSG00000038024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC146602 // GenBank // Mus musculus DENN/MADD domain containing 4C, mRNA (cDNA clone MGC:144204 IMAGE:40099465), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:86774255:86814391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000051034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:86819086:86844981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
NM_001290541 // RefSeq // Mus musculus alkaline ceramidase 2 (Acer2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_139306 // RefSeq // Mus musculus alkaline ceramidase 2 (Acer2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000045224 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:86874396:86920875:1 gene:ENSMUSG00000038007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000084433 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:86874414:86920875:1 gene:ENSMUSG00000038007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF282864 // GenBank // Mus musculus cancer related gene-liver 1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AY312515 // GenBank // Mus musculus alkaline ceramidase 2 (Acer2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC059819 // GenBank // Mus musculus alkaline ceramidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:69583 IMAGE:6839525), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_001290543 // RefSeq // Mus musculus alkaline ceramidase 2 (Acer2), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// ENSMUST00000128712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:86874414:86932491:1 gene:ENSMUSG00000038007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000051028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:86885499:86954752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
ENSMUST00000135874 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:86930691:86934822:1 gene:ENSMUSG00000038007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC051923 // GenBank // Mus musculus N-acylsphingosine amidohydrolase 3-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:5708748). // chr4 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
NM_001081184 // RefSeq // Mus musculus focadhesin (Focad), mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000097992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88094630:88411006:1 gene:ENSMUSG00000038368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000159342 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:88121299:88411004:1 gene:ENSMUSG00000038368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// XM_006537885 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus focadhesin (Focad), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 60 // 60 // 27 // 45 // 1 /// ENSMUST00000107148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:88345367:88411009:1 gene:ENSMUSG00000038368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 40 // 40 // 18 // 45 // 1 /// AK122556 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1797 protein. // chr4 // 38 // 38 // 17 // 45 // 1 /// ENSMUST00000161058 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:88094645:88183044:1 gene:ENSMUSG00000038368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1 /// AK164030 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430021L16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1 /// GENSCAN00000003793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88130179:88243062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 22 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000003818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88328477:88409439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 47 // 21 // 21 // 0
NR_030478 // RefSeq // Mus musculus microRNA 491 (Mir491), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093569 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:88122040:88122125:1 gene:ENSMUSG00000070077 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-491 // miRBase Micro RNA Database // MI0004680 Mus musculus miR-491 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008333 // RefSeq // Mus musculus interferon alpha 11 (Ifna11), mRNA. // chr4 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0
NM_010505 // RefSeq // Mus musculus interferon alpha 5 (Ifna5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000102804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88835525:88836094:1 gene:ENSMUSG00000096682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC120910 // GenBank // Mus musculus interferon alpha 5, mRNA (cDNA clone MGC:143599 IMAGE:40091152), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC120911 // GenBank // Mus musculus interferon alpha 5, mRNA (cDNA clone MGC:143600 IMAGE:40091153), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000034523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88835525:88836094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_010504 // RefSeq // Mus musculus interferon alpha 4 (Ifna4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:88841861:88842421:1 gene:ENSMUSG00000070904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116217 // GenBank // Mus musculus interferon alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:143607 IMAGE:40091191), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC119349 // GenBank // Mus musculus interferon alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:155665 IMAGE:8734098), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC119351 // GenBank // Mus musculus interferon alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:155667 IMAGE:8734100), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:88841861:88845617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_024433 // RefSeq // Mus musculus methylthioadenosine phosphorylase (Mtap), mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000058030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:89137122:89181081:1 gene:ENSMUSG00000062937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// AB056100 // GenBank // Mus musculus mtap mRNA for methylthioadenosine phosphorylase, complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// BC003858 // GenBank // Mus musculus methylthioadenosine phosphorylase, mRNA (cDNA clone MGC:6590 IMAGE:3485422), complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:89033602:89217816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1
ENSMUST00000121213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:89216864:89217816:1 gene:ENSMUSG00000083881 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000034528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:89033602:89217816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_175647 // RefSeq // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor like family A1 (Dmrta1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:89688198:89694772:1 gene:ENSMUSG00000043753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF542047 // GenBank // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor 4 (Dmrt4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137613 // GenBank // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor like family A1, mRNA (cDNA clone MGC:169237 IMAGE:8860632), complete cds. // chr4 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:89688309:89692277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_153102 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 352 (Zfp352), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000080541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:90223625:90225280:1 gene:ENSMUSG00000070902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000107129 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:90218820:90225702:1 gene:ENSMUSG00000070902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF290196 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 352 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:90223631:90334505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 52 // 8 // 12 // 0
ENSMUST00000116078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:91037900:91038273:1 gene:ENSMUSG00000079962 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT048072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000119935 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:91156682:91157287:1 gene:ENSMUSG00000081876 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:91156694:91160092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 63 // 13 // 15 // 0 /// NONMMUT048073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000117778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:91365379:91365939:1 gene:ENSMUSG00000083377 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC002007 // GenBank // Mus musculus non-metastatic cells 6, protein expressed in (nucleoside-diphosphate kinase), mRNA (cDNA clone MGC:5784 IMAGE:3593804), complete cds. // chr4 // 32 // 93 // 8 // 25 // 0 /// NONMMUT048086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:91363391:91365755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENSMUST00000121966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:93802333:93802590:1 gene:ENSMUSG00000073797 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:93793025:93802590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT048111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000158052 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:94487883:94487983:1 gene:ENSMUSG00000088677 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT048140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000094969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:94556546:94557078:1 gene:ENSMUSG00000070900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK015743 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930510I22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001290568 // RefSeq // Mus musculus intraflagellar transport 74 (Ift74), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 59 // 32 // 32 // 0 /// NM_026319 // RefSeq // Mus musculus intraflagellar transport 74 (Ift74), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// XM_006503324 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus intraflagellar transport 74 (Ift74), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 50 // 50 // 0 /// XM_006503325 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus intraflagellar transport 74 (Ift74), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 50 // 50 // 0 /// XM_006503327 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus intraflagellar transport 74 (Ift74), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 48 // 48 // 0 /// XM_006503328 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus intraflagellar transport 74 (Ift74), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 50 // 50 // 0 /// ENSMUST00000030311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:94614491:94693229:1 gene:ENSMUSG00000028576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// ENSMUST00000107104 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:94614491:94664698:1 gene:ENSMUSG00000028576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000152289 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:94679180:94686970:1 gene:ENSMUSG00000028576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 22 // 12 // 12 // 0 /// AK006492 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700029H06 product:CAPILLARY MORPHOGENESIS PROTEIN-1 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 100 // 63 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000043568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:94651108:94686936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 27 // 27 // 0
NM_001290549 // RefSeq // Mus musculus endothelial-specific receptor tyrosine kinase (Tek), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NM_001290551 // RefSeq // Mus musculus endothelial-specific receptor tyrosine kinase (Tek), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// NM_013690 // RefSeq // Mus musculus endothelial-specific receptor tyrosine kinase (Tek), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000071168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:94739518:94874682:1 gene:ENSMUSG00000006386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000073939 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:94739289:94874976:1 gene:ENSMUSG00000006386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000102798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:94739300:94874939:1 gene:ENSMUSG00000006386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC050824 // GenBank // Mus musculus endothelial-specific receptor tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:59299 IMAGE:6333576), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// D13738 // GenBank // Mus musculus mRNA for receptor tyrosine kinase, complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 41 // 46 // 0 /// GENSCAN00000037182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:94777799:94906474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0
ENSMUST00000083811 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:95524044:95524204:1 gene:ENSMUSG00000065745 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000184022 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:96917020:96917083:1 gene:ENSMUSG00000098261 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082949 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:98275725:98275838:1 gene:ENSMUSG00000064883 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT048245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XR_376450 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 0610025J13 gene (0610025J13Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_376451 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 0610025J13 gene (0610025J13Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XR_376453 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 0610025J13 gene (0610025J13Rik), transcript variant X4, misc_RNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000131516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:98321448:98331791:1 gene:ENSMUSG00000046683 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:98321448:98331791:1 gene:ENSMUSG00000046683 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK002663 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610025J13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000131324 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:98321398:98322850:1 gene:ENSMUSG00000046683 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONMMUT048246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT048248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:98258500:98338969:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONMMUT048247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSMUST00000102339 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:98661637:98661732:1 gene:ENSMUSG00000076294 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081202 // RefSeq // Mus musculus LINE-1 type transposase domain containing 1 (L1td1), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000152889 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:98726734:98733644:1 gene:ENSMUSG00000087166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000173659 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:98733203:98738116:1 gene:ENSMUSG00000087166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000154279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:98726748:98738480:1 gene:ENSMUSG00000087166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// AB211064 // GenBank // Mus musculus ECAT11 mRNA for ES cell associated transcript 11, complete cds. // chr4 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:98722622:98759682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_146144 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 1 (Usp1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000030289 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:98923810:98935543:1 gene:ENSMUSG00000028560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000091358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:98923879:98935543:1 gene:ENSMUSG00000028560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// BC018179 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptdiase 1, mRNA (cDNA clone MGC:25528 IMAGE:3585191), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// BC020007 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptdiase 1, mRNA (cDNA clone MGC:25559 IMAGE:3980469), complete cds. // chr4 // 90 // 77 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000017466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:98926505:98934805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_013913 // RefSeq // Mus musculus angiopoietin-like 3 (Angptl3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000030280 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:99030954:99038065:1 gene:ENSMUSG00000028553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000136091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:99033179:99037959:1 gene:ENSMUSG00000028553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 93 // 48 // 14 // 15 // 0 /// AF162224 // GenBank // Mus musculus angiopoietin-related protein 3 (Angptl3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC019491 // GenBank // Mus musculus angiopoietin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:28584 IMAGE:4211688), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK163595 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430112G08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// ENSMUST00000125546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:99033203:99046111:1 gene:ENSMUSG00000028553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// AK040679 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530014E19 product:angiopoietin-like 3, full insert sequence. // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000017478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:99018697:99050480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONMMUT048268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
XR_401827 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102643030 (LOC102643030), transcript variant X2, ncRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XR_401830 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102643030 (LOC102643030), transcript variant X5, ncRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK154974 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630113I08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000094955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:99295900:99297258:1 gene:ENSMUSG00000070891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK046412 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230380O10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_010425 // RefSeq // Mus musculus forkhead box D3 (Foxd3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087285 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:99656299:99658622:1 gene:ENSMUSG00000067261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF067421 // GenBank // Mus musculus HNF3/forkhead homolog 2 (Foxd3) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// U41047 // GenBank // Mus musculus transcription factor Genesis mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:99656625:99658034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
NM_001081264 // RefSeq // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 6 (alpha-1,3,-glucosyltransferase) (Alg6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006503157 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus asparagine-linked glycosylation 6 (alpha-1,3,-glucosyltransferase) (Alg6), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000097961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:99715665:99763460:1 gene:ENSMUSG00000073792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000107004 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:99715676:99752885:1 gene:ENSMUSG00000073792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC044875 // GenBank HTC // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 6 homolog (yeast, alpha-1,3,-glucosyltransferase), mRNA (cDNA clone IMAGE:4912331), with apparent retained intron. // chr4 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC050854 // GenBank // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 6 homolog (yeast, alpha-1,3,-glucosyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:59434 IMAGE:6332345), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000144805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:99715665:99762311:1 gene:ENSMUSG00000073792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 97 // 97 // 28 // 29 // 1 /// BC080867 // GenBank // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 6 homolog (yeast, alpha-1,3,-glucosyltransferase), mRNA (cDNA clone IMAGE:30362997). // chr4 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// ENSMUST00000139799 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:99715676:99753076:1 gene:ENSMUSG00000073792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_145549 // RefSeq // Mus musculus EF-hand calcium binding domain 7 (Efcab7), mRNA. // chrUn // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:99831394:99912610:1 gene:ENSMUSG00000073791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000136874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:99909580:99912788:1 gene:ENSMUSG00000073791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// AK143777 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430107C06 product:hypothetical Calcium-binding EF-hand/EF-Hand-like containing protein, full insert sequence. // chrUn // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// AK220422 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1799 protein. // chrUn // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// BC020077 // GenBank // Mus musculus EF-hand calcium binding domain 7, mRNA (cDNA clone MGC:28352 IMAGE:4018470), complete cds. // chrUn // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC112327 // GenBank // Mus musculus EF-hand calcium binding domain 7, mRNA (cDNA clone MGC:118010 IMAGE:5362489), complete cds. // chrUn // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:99831394:99991068:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
ENSMUST00000122529 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:99909797:99909878:1 gene:ENSMUSG00000084478 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 52 // 72 // 12 // 23 // 0 /// NONMMUT048308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 72 // 12 // 23 // 0
NM_028132 // RefSeq // Mus musculus phosphoglucomutase 2 (Pgm2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000058351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:99929414:99987294:1 gene:ENSMUSG00000025791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000102783 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:99955744:99987294:1 gene:ENSMUSG00000025791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// BC008527 // GenBank // Mus musculus phosphoglucomutase 2, mRNA (cDNA clone MGC:6642 IMAGE:3495694), complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC086490 // GenBank // Mus musculus phosphoglucomutase 2, mRNA (cDNA clone MGC:102347 IMAGE:30435602), complete cds. // chr4 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:99831394:99991068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_013845 // RefSeq // Mus musculus receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 1 (Ror1), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000039630 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:100095791:100444765:1 gene:ENSMUSG00000035305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AB010383 // GenBank // Mus musculus mRNA for Ror1, complete cds. // chr4 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// BC095933 // GenBank // Mus musculus receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:2655257), complete cds. // chr4 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// BC138794 // GenBank // Mus musculus receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:170421 IMAGE:8861816), complete cds. // chr4 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// BC138810 // GenBank // Mus musculus receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:170437 IMAGE:8861832), complete cds. // chr4 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// XM_006503120 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 1 (Ror1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// XM_006503121 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 1 (Ror1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// GENSCAN00000042813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:100401389:100412148:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001033773 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative) (Ube2u), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000092730 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:100478867:100550145:1 gene:ENSMUSG00000069733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000133493 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:100478849:100550147:1 gene:ENSMUSG00000069733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC150880 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mRNA (cDNA clone MGC:183791 IMAGE:9087791), complete cds. // chr4 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC150888 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mRNA (cDNA clone MGC:183799 IMAGE:9087799), complete cds. // chr4 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC172031 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mRNA (cDNA clone MGC:198736 IMAGE:9054317), complete cds. // chr4 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:100479182:100511457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0
NM_198037 // RefSeq // Mus musculus cache domain containing 1 (Cachd1), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:100776675:101004544:1 gene:ENSMUSG00000028532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000097955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:100776675:101029220:1 gene:ENSMUSG00000028532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK046646 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430218L07 product:hypothetical Cache domain/von Willebrand factor type A domain containing protein, full insert sequence. // chr4 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// BC058676 // GenBank // Mus musculus cache domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:76350 IMAGE:6834428), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC080313 // GenBank // Mus musculus cache domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6854599), partial cds. // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AK129397 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1573 protein. // chr4 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:100856317:101003100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_183024 // RefSeq // Mus musculus ribonucleoprotein, PTB-binding 2 (Raver2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000038463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:101068983:101152370:1 gene:ENSMUSG00000035275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC055329 // GenBank // Mus musculus ribonucleoprotein, PTB-binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:65671 IMAGE:6835616), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000106955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:101068983:101135356:1 gene:ENSMUSG00000035275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// AK040404 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430091O22 product:hypothetical RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif) containing protein, full insert sequence. // chr4 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// GENSCAN00000017231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:101069114:101150478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000083345 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:101271143:101271306:1 gene:ENSMUSG00000065279 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001177602 // RefSeq // Mus musculus adenylate kinase 4 (Ak4), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NM_001177604 // RefSeq // Mus musculus adenylate kinase 4 (Ak4), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// NM_001177605 // RefSeq // Mus musculus adenylate kinase 4 (Ak4), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// NM_009647 // RefSeq // Mus musculus adenylate kinase 4 (Ak4), transcript variant 4, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// XM_006502684 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenylate kinase 4 (Ak4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006502685 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenylate kinase 4 (Ak4), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000102780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:101419277:101466995:1 gene:ENSMUSG00000028527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000106945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:101419319:101466995:1 gene:ENSMUSG00000028527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000106946 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:101419289:101466995:1 gene:ENSMUSG00000028527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC086663 // GenBank // Mus musculus adenylate kinase 3-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:113780 IMAGE:30649610), complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_175036 // RefSeq // Mus musculus leptin receptor overlapping transcript (Leprot), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000030254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:101647718:101659364:1 gene:ENSMUSG00000035212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000106927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:101647793:101659364:1 gene:ENSMUSG00000035212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC004744 // GenBank // Mus musculus leptin receptor overlapping transcript, mRNA (cDNA clone MGC:6694 IMAGE:3583760), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC010289 // GenBank // Mus musculus leptin receptor overlapping transcript, mRNA (cDNA clone MGC:11607 IMAGE:2651399), complete cds. // chr4 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0
XR_376473 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12800 (Gm12800), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XR_401856 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12800 (Gm12800), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XR_401857 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12800 (Gm12800), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XR_401858 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12800 (Gm12800), transcript variant X3, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000075999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:101909121:101911908:1 gene:ENSMUSG00000037028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001085516 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12794 (Gm12794), mRNA. // chr4 // 89 // 60 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000052027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:101940407:101943183:1 gene:ENSMUSG00000070890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 60 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000012397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:101940407:101943183:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 60 // 8 // 9 // 0
NM_025909 // RefSeq // Mus musculus OMA1 homolog, zinc metallopeptidase (S. cerevisiae) (Oma1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006503301 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus OMA1 homolog, zinc metallopeptidase (S. cerevisiae) (Oma1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006503302 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus OMA1 homolog, zinc metallopeptidase (S. cerevisiae) (Oma1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000035780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:103313812:103366443:1 gene:ENSMUSG00000035069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000143399 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:103324484:103328889:1 gene:ENSMUSG00000035069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// AK076209 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3930401E05 product:similar to RIKEN CDNA 2010001O09 GENE [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC016238 // GenBank // Mus musculus OMA1 homolog, zinc metallopeptidase (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:28820 IMAGE:4504835), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006503303 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus OMA1 homolog, zinc metallopeptidase (S. cerevisiae) (Oma1), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// ENSMUST00000133178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:103328908:103371868:1 gene:ENSMUSG00000035069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000037100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:103263985:103366185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
ENSMUST00000118427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:103940959:103941941:1 gene:ENSMUSG00000081696 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:103920993:103941858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
AK034350 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330181H08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY512949 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0934D10 unknown mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080555 // RefSeq // Mus musculus phosphatidic acid phosphatase type 2B (Ppap2b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000064139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:105157347:105232764:1 gene:ENSMUSG00000028517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC005558 // GenBank // Mus musculus phosphatidic acid phosphatase type 2B, mRNA (cDNA clone MGC:11705 IMAGE:3964817), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:105157825:105275632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
ENSMUST00000119885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:106098924:106099282:1 gene:ENSMUSG00000082768 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:105997591:106134313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_183225 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 24 (Usp24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 68 // 68 // 0 /// ENSMUST00000094933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:106316234:106441322:1 gene:ENSMUSG00000028514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 68 // 68 // 0 /// ENSMUST00000165709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:106316213:106441317:1 gene:ENSMUSG00000028514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 68 // 68 // 0 /// ENSMUST00000106798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:106316220:106360883:1 gene:ENSMUSG00000028514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 18 // 18 // 12 // 68 // 1 /// AK045043 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130021E18 product:hypothetical Ubiquitin-associated domain containing protein, full insert sequence. // chr4 // 18 // 18 // 12 // 68 // 1 /// GENSCAN00000035727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:106315738:106441874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 98 // 90 // 60 // 61 // 0
NM_183225 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 24 (Usp24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:106316234:106441322:1 gene:ENSMUSG00000028514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:106316213:106441317:1 gene:ENSMUSG00000028514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053272 // RefSeq // Mus musculus 24-dehydrocholesterol reductase (Dhcr24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000047973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:106561038:106589113:1 gene:ENSMUSG00000034926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY039762 // GenBank // Mus musculus 3-beta-hydroxysterol delta-24 reductase mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC019797 // GenBank // Mus musculus 24-dehydrocholesterol reductase, mRNA (cDNA clone MGC:30547 IMAGE:5054108), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:106560085:106586765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_177667 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 22 (Ttc22), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000047922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:106622432:106640189:1 gene:ENSMUSG00000034919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC132162 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 22, mRNA (cDNA clone MGC:163793 IMAGE:40130439), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:106622551:106639461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001083887 // RefSeq // Mus musculus prolyl-tRNA synthetase (mitochondrial)(putative) (Pars2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_001285783 // RefSeq // Mus musculus prolyl-tRNA synthetase (mitochondrial)(putative) (Pars2), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_001285784 // RefSeq // Mus musculus prolyl-tRNA synthetase (mitochondrial)(putative) (Pars2), transcript variant 4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_172272 // RefSeq // Mus musculus prolyl-tRNA synthetase (mitochondrial)(putative) (Pars2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:106651106:106655282:1 gene:ENSMUSG00000043572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:106651098:106655280:1 gene:ENSMUSG00000043572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC038817 // GenBank // Mus musculus prolyl-tRNA synthetase (mitochondrial)(putative), mRNA (cDNA clone MGC:47008 IMAGE:3256949), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:106653131:106654558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000047620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:106733889:106748292:1 gene:ENSMUSG00000034871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY168619 // GenBank // Mus musculus pancreatic beta cell protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC024426 // GenBank // Mus musculus family with sequence simliarity 151, member A, mRNA (cDNA clone MGC:37208 IMAGE:4971419), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC024430 // GenBank // Mus musculus family with sequence simliarity 151, member A, mRNA (cDNA clone MGC:37236 IMAGE:4972368), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC026682 // GenBank // Mus musculus family with sequence simliarity 151, member A, mRNA (cDNA clone MGC:37700 IMAGE:5065146), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK166736 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0007P10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000023475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:106733962:106748269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_172873 // RefSeq // Mus musculus CUB domain containing protein 2 (Cdcp2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006503087 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CUB domain containing protein 2 (Cdcp2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000062495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:107096891:107107748:1 gene:ENSMUSG00000047636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:107097708:107113125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001081272 // RefSeq // Mus musculus low density lipoprotein receptor class A domain containing 1 (Ldlrad1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006503241 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus low density lipoprotein receptor class A domain containing 1 (Ldlrad1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000094916 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:107209180:107218060:1 gene:ENSMUSG00000070877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006503246 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus low density lipoprotein receptor class A domain containing 1 (Ldlrad1), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// XM_006503248 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus low density lipoprotein receptor class A domain containing 1 (Ldlrad1), transcript variant X8, mRNA. // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000023488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:107178729:107217914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_028355 // RefSeq // Mus musculus NDC1 transmembrane nucleoporin (Ndc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006503423 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NDC1 transmembrane nucleoporin (Ndc1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000030357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:107367880:107414333:1 gene:ENSMUSG00000028614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000125342 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:107368052:107411150:1 gene:ENSMUSG00000028614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000132950 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:107381462:107390292:1 gene:ENSMUSG00000028614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000139560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:107367784:107416346:1 gene:ENSMUSG00000028614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000149366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:107367915:107416323:1 gene:ENSMUSG00000028614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 97 // 90 // 34 // 35 // 0 /// BC021337 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 48, mRNA (cDNA clone MGC:29369 IMAGE:5042118), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// DQ141695 // GenBank // Mus musculus NDC1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// NONMMUT048531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000023478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:107367780:107453903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 22 // 39 // 1
NM_001282737 // RefSeq // Mus musculus mago-nashi homolog, proliferation-associated (Drosophila) (Magoh), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:107879755:107887424:1 gene:ENSMUSG00000028609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000141376 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:107882990:107887387:1 gene:ENSMUSG00000028609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AF007862 // GenBank // Mus musculus mm-Mago mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AF035939 // GenBank // Mus musculus Magoh mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC018176 // GenBank // Mus musculus mago-nashi homolog, proliferation-associated (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:5808 IMAGE:3587774), complete cds. // chr4 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:107879858:107896948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
ENSMUST00000124190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108010017:108013526:1 gene:ENSMUSG00000008932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// BC054455 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 1 (glutamate transporter), member 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:6492122), complete cds. // chr4 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// NM_146255 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 1 (glutamate transporter), member 7 (Slc1a7), mRNA. // chr4 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// ENSMUST00000106713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:107968332:108013532:1 gene:ENSMUSG00000008932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// BC030400 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 1 (glutamate transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:40736 IMAGE:5363389), complete cds. // chr4 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// XM_006503088 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 1 (glutamate transporter), member 7 (Slc1a7), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// XM_006503089 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 1 (glutamate transporter), member 7 (Slc1a7), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// GENSCAN00000021563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:107968576:108012449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0
NM_027250 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase assembly factor 7 (Coa7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108328156:108338683:1 gene:ENSMUSG00000048351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0 /// ENSMUST00000131656 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:108328140:108341544:1 gene:ENSMUSG00000048351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108328153:108338451:1 gene:ENSMUSG00000048351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000141423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108328178:108338178:1 gene:ENSMUSG00000048351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK081388 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130013D06 product:RIKEN cDNA 2010305A19 gene, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012391 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010305A19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:8003 IMAGE:3585966), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000147054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108328189:108332643:1 gene:ENSMUSG00000048351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000021548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108328185:108338571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONMMUT048582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_175472 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 11 (Zcchc11), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000043368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:108459426:108559415:1 gene:ENSMUSG00000034610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000097925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108460010:108559421:1 gene:ENSMUSG00000034610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000155068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108479081:108524350:1 gene:ENSMUSG00000034610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// AK031299 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030404K05 product:hypothetical Zn-finger, CCHC type/PAP/25A-associated domain/PAP/25A core domain/Zinc finger CCHC-type profile/Zn-finger, C2H2 type containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// BC150791 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:183702 IMAGE:9087702), complete cds. // chr4 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108478964:108542932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 42 // 13 // 14 // 0
ENSMUST00000083365 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:108498044:108498146:1 gene:ENSMUSG00000065299 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT048590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_011015 // RefSeq // Mus musculus origin recognition complex, subunit 1 (Orc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006502854 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus origin recognition complex, subunit 1 (Orc1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000102744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:108579454:108614833:1 gene:ENSMUSG00000028587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AB190255 // GenBank // Mus musculus Orc1l mRNA for origin recognition complex subunit 1 isoform B, complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// AJ003133 // GenBank // Mus musculus mRNA for ORC1-related protein, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC015073 // GenBank // Mus musculus origin recognition complex, subunit 1-like (S.cereviaiae), mRNA (cDNA clone MGC:13780 IMAGE:3995330), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108588687:108614475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0
NM_177045 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 1B (Cc2d1b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_376325 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 1B (Cc2d1b), transcript variant X4, misc_RNA. // chr4 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000030320 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:108619940:108634123:1 gene:ENSMUSG00000028582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108626048:108634105:1 gene:ENSMUSG00000028582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000134844 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:108623563:108634123:1 gene:ENSMUSG00000028582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC055068 // GenBank // Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 1B, mRNA (cDNA clone IMAGE:30034492), partial cds. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC062883 // GenBank // Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 1B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5697123). // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC125517 // GenBank // Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 1B, mRNA (cDNA clone MGC:159220 IMAGE:40130032), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC137743 // GenBank // Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 1B, mRNA (cDNA clone MGC:169367 IMAGE:8860762), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108619907:108633299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_025334 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin domain containing 12 (endoplasmic reticulum) (Txndc12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000030296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:108834601:108862127:1 gene:ENSMUSG00000028567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY548113 // GenBank // Mus musculus endoplasmic reticulum protein ERp19 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC006857 // GenBank // Mus musculus thioredoxin domain containing 12 (endoplasmic reticulum), mRNA (cDNA clone MGC:6460 IMAGE:2615934), complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0
NM_029571 // RefSeq // Mus musculus KTI12 homolog, chromatin associated (S. cerevisiae) (Kti12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:108847785:108849413:1 gene:ENSMUSG00000073775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC021493 // GenBank // Mus musculus KTI12 homolog, chromatin associated (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:38391 IMAGE:5345710), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108847891:108848946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_023537 // RefSeq // Mus musculus RAB3B, member RAS oncogene family (Rab3b), mRNA. // chr4 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000003502 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108890290:108941188:1 gene:ENSMUSG00000003411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000106650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:108879063:108943324:1 gene:ENSMUSG00000003411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000106651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:108879200:108941185:1 gene:ENSMUSG00000003411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AB232588 // GenBank // Mus musculus Rab3B mRNA for Rab3B, complete cds. // chr4 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// AF312036 // GenBank // Mus musculus small GTP binding protein Rab3B mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// BC051918 // GenBank // Mus musculus RAB3B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:62156 IMAGE:5691723), complete cds. // chr4 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// BC057173 // GenBank // Mus musculus RAB3B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:67925 IMAGE:4989309), complete cds. // chr4 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:108914878:108940813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_007983 // RefSeq // Mus musculus Fas-associated factor 1 (Faf1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000102724 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:109676588:109963960:1 gene:ENSMUSG00000010517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC065098 // GenBank // Mus musculus Fas-associated factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:86078 IMAGE:30362116), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// U39643 // GenBank // Mus musculus FAF1 mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 95 // 38 // 40 // 0 /// ENSMUST00000155204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:109840785:109925378:1 gene:ENSMUSG00000010517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// GENSCAN00000045280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:109717920:109898081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1
NM_172296 // RefSeq // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor like family A2 (Dmrta2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000061187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:109978053:109983687:1 gene:ENSMUSG00000047143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY145837 // GenBank // Mus musculus doublesex- and mab-3-related transcription factor 5 (Dmrt5) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:109972707:109984140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_026279 // RefSeq // Mus musculus BEN domain containing 5 (Bend5), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_033793 // RefSeq // Mus musculus BEN domain containing 5 (Bend5), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_376343 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BEN domain containing 5 (Bend5), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000030274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:111415006:111460298:1 gene:ENSMUSG00000028545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:111433319:111459927:1 gene:ENSMUSG00000028545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000129760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:111415088:111459920:1 gene:ENSMUSG00000028545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC051512 // GenBank // Mus musculus BEN domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:63027 IMAGE:1383740), complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// XM_006503323 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BEN domain containing 5 (Bend5), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENSMUST00000139876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:111433197:111460296:1 gene:ENSMUSG00000028545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000053422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:111415175:111459907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT048715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_178786 // RefSeq // Mus musculus selection and upkeep of intraepithelial T cells 4 (Skint4), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000106564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:112081470:112168076:1 gene:ENSMUSG00000055960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000106566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:112081470:112168076:1 gene:ENSMUSG00000055960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK028550 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4632428J11 product:hypothetical Immunoglobulin subtype/Immunoglobulin V-type/Ig-like domain profile/Immunoglobulin-like containing protein, full insert sequence. // chr4 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// EF494897 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J skint 4 isoform a precursor (Skint4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// EF494898 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J skint 4 isoform b precursor (Skint4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// XM_006503165 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus selection and upkeep of intraepithelial T cells 4 (Skint4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1 /// ENSMUST00000069769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:112072639:112167396:1 gene:ENSMUSG00000055960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// ENSMUST00000106565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:112072016:112167386:1 gene:ENSMUSG00000055960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1
NM_001102474 // RefSeq // Mus musculus selection and upkeep of intraepithelial T cells 3 (Skint3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NM_177578 // RefSeq // Mus musculus selection and upkeep of intraepithelial T cells 3 (Skint3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006502889 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus selection and upkeep of intraepithelial T cells 3 (Skint3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000038455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:112232245:112300468:1 gene:ENSMUSG00000070868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000170945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:112232245:112300468:1 gene:ENSMUSG00000070868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EF494894 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J skint 3 isoform a precursor (Skint3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// EF494895 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J skint 3 isoform b precursor (Skint3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// EF494896 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J skint 3 isoform c precursor (Skint3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:111927242:112277750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001166027 // RefSeq // Mus musculus selection and upkeep of intraepithelial T cells 11 (Skint11), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NM_177669 // RefSeq // Mus musculus selection and upkeep of intraepithelial T cells 11 (Skint11), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000079915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:114163384:114245028:1 gene:ENSMUSG00000057977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000164297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:114163384:114245028:1 gene:ENSMUSG00000057977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// EU099309 // GenBank // Mus musculus skint 11 isoform a precursor (Skint11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
NM_001085549 // RefSeq // Mus musculus TraB domain containing 2B (Trabd2b), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006503277 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TraB domain containing 2B (Trabd2b), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006503278 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TraB domain containing 2B (Trabd2b), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094894 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:114406724:114615098:1 gene:ENSMUSG00000070867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:114406818:114416432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001085549 // RefSeq // Mus musculus TraB domain containing 2B (Trabd2b), mRNA. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_006503276 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TraB domain containing 2B (Trabd2b), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000094894 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:114406724:114615098:1 gene:ENSMUSG00000070867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:114569039:114610194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NR_033617 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12830 (Gm12830), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:4:114821722:114856166:1 gene:ENSMUSG00000055198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:114789666:114846777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000083113 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:114987964:114988061:1 gene:ENSMUSG00000065047 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK080459 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730020A08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT048768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT048769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001287388 // RefSeq // Mus musculus T cell acute lymphocytic leukemia 1 (Tal1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_011527 // RefSeq // Mus musculus T cell acute lymphocytic leukemia 1 (Tal1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006502915 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T cell acute lymphocytic leukemia 1 (Tal1), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000030489 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115056426:115071755:1 gene:ENSMUSG00000028717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000136946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115057438:115063570:1 gene:ENSMUSG00000028717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000161601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:115057811:115071228:1 gene:ENSMUSG00000028717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000162489 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:115059508:115070469:1 gene:ENSMUSG00000028717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC063060 // GenBank // Mus musculus T-cell acute lymphocytic leukemia 1, mRNA (cDNA clone MGC:67020 IMAGE:6826611), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// M59764 // GenBank // Murine helix-loop-helix protein mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:114999329:115068725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_177406 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 12a (Cyp4a12a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000084343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:115299046:115332815:1 gene:ENSMUSG00000066071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC014721 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 12a, mRNA (cDNA clone MGC:25972 IMAGE:4240359), complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// BC025936 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 12a, mRNA (cDNA clone MGC:37794 IMAGE:5097698), complete cds. // chr4 // 88 // 89 // 14 // 16 // 0 /// BC026582 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 12a, mRNA (cDNA clone MGC:37206 IMAGE:4971335), complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// BC031141 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 12a, mRNA (cDNA clone MGC:37246 IMAGE:4972684), complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// BC033924 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 12a, mRNA (cDNA clone MGC:37891 IMAGE:5101821), complete cds. // chr4 // 88 // 89 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000029344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:115299128:115363118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1
NM_172306 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 12B (Cyp4a12b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000094887 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:115411624:115439034:1 gene:ENSMUSG00000078597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC060945 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 12B, mRNA (cDNA clone MGC:74033 IMAGE:30304458), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:115411683:115438225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1
ENSMUST00000136112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115480800:115481276:1 gene:ENSMUSG00000086724 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:115480968:115481243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
AB017785 // GenBank // Mus musculus cyp4A10 homolog mRNA for pBS4A5, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// AB018421 // GenBank // Mus musculus CYP4A10 mRNA for cytochrome P-450, complete cds. // chr4 // 88 // 67 // 7 // 8 // 0 /// BC010747 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 10, mRNA (cDNA clone MGC:18335 IMAGE:4242518), complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC051049 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 10, mRNA (cDNA clone MGC:58977 IMAGE:4234581), complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NM_010011 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 10 (Cyp4a10), mRNA. // chr4 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// ENSMUST00000058785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:115518264:115533649:1 gene:ENSMUSG00000066072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// ENSMUST00000094886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115518288:115533646:1 gene:ENSMUSG00000066072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_001252539 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 31 (Cyp4a31), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NM_201640 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 31 (Cyp4a31), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000030480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115563698:115579013:1 gene:ENSMUSG00000028712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000030486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:115563649:115579015:1 gene:ENSMUSG00000028712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000126645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115563684:115571088:1 gene:ENSMUSG00000028712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC013476 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 31, mRNA (cDNA clone MGC:18880 IMAGE:4237837), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000029352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:115564305:115578104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0
NM_175308 // RefSeq // Mus musculus MOB kinase activator 3C (Mob3c), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000030477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:115828092:115836185:1 gene:ENSMUSG00000028709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000144839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115828097:115831711:1 gene:ENSMUSG00000028709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000148409 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115828658:115831541:1 gene:ENSMUSG00000028709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// BC099740 // GenBank // Mus musculus MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 2C (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:30747126), partial cds. // chr4 // 82 // 96 // 18 // 22 // 0 /// BC137587 // GenBank // Mus musculus MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 2C (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:169211 IMAGE:8860606), complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// BC137589 // GenBank // Mus musculus MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 2C (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:169213 IMAGE:8860608), complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:115785051:115878184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
NM_001039124 // RefSeq // Mus musculus kinocilin (Kncn), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000097918 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:115884400:115887964:1 gene:ENSMUSG00000073774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC132034 // GenBank // Mus musculus kinocilin, mRNA (cDNA clone MGC:163665 IMAGE:40130311), complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC132036 // GenBank // Mus musculus kinocilin, mRNA (cDNA clone MGC:163667 IMAGE:40130313), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC145375 // GenBank // Mus musculus kinocilin, mRNA (cDNA clone MGC:178941 IMAGE:9053933), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// DQ235452 // GenBank // Mus musculus kinocilin (kino) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000128222 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:115885873:115889526:1 gene:ENSMUSG00000073774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:115884738:115887726:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT048800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
XM_006543876 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 6430628N08 gene (6430628N08Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:115890665:115899227:1 gene:ENSMUSG00000034185 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:115890666:115899227:1 gene:ENSMUSG00000034185 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK018292 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430628N08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:115898006:115898539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_153521 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 41 (Lrrc41), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030471 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116075269:116097043:1 gene:ENSMUSG00000028703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK028000 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1190001F19 product:MUF1 PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC007169 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 41, mRNA (cDNA clone IMAGE:3491421), partial cds. // chr4 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC022976 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 41, mRNA (cDNA clone MGC:38941 IMAGE:5362925), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK085717 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730026A16 product:weakly similar to MUF1 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 67 // 77 // 16 // 24 // 0 /// ENSMUST00000154274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116075463:116083056:1 gene:ENSMUSG00000028703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// AK163171 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730064D04 product:MUF1 protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000006953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116075475:116096542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_181585 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol 3 kinase, regulatory subunit, polypeptide 3 (p55) (Pik3r3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116221661:116303056:1 gene:ENSMUSG00000028698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000106490 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:116221696:116299841:1 gene:ENSMUSG00000028698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC053102 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol 3 kinase, regulatory subunit, polypeptide 3 (p55), mRNA (cDNA clone MGC:62506 IMAGE:6405534), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116205103:116299832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
ENSMUST00000121683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116448788:116449204:1 gene:ENSMUSG00000082592 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT048843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_008389 // RefSeq // Mus musculus IAP promoted placental gene (Ipp), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006502810 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IAP promoted placental gene (Ipp), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006502811 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IAP promoted placental gene (Ipp), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116507552:116538243:1 gene:ENSMUSG00000028696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000106479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:116507549:116538235:1 gene:ENSMUSG00000028696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AF285178 // GenBank // Mus musculus actin-binding protein MIPP mRNA, complete cds. // chr4 // 82 // 88 // 23 // 28 // 0 /// X58523 // GenBank // Mouse MIPP mRNA for a placenta-expressed gene. // chr4 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116510572:116600018:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_029868 // RefSeq // Mus musculus GC-rich promoter binding protein 1-like 1 (Gpbp1l1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006503484 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GC-rich promoter binding protein 1-like 1 (Gpbp1l1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000030460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116557658:116593882:1 gene:ENSMUSG00000034042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC031428 // GenBank // Mus musculus GC-rich promoter binding protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:28375 IMAGE:4021073), complete cds. // chr4 // 80 // 88 // 12 // 15 // 0 /// BC066034 // GenBank // Mus musculus GC-rich promoter binding protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:90065 IMAGE:6836605), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000106475 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116558079:116593036:1 gene:ENSMUSG00000034042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// GENSCAN00000006954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116510572:116600018:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
ENSMUST00000083251 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:116674153:116674262:1 gene:ENSMUSG00000065185 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT048863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_011034 // RefSeq // Mus musculus peroxiredoxin 1 (Prdx1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000135573 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116685544:116700822:1 gene:ENSMUSG00000028691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC083348 // GenBank // Mus musculus peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:102122 IMAGE:5710010), complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// BC086648 // GenBank // Mus musculus peroxiredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:63356 IMAGE:6819164), complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// D16142 // GenBank // Mus musculus mRNA for MSP23, complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// D21252 // GenBank // Mus musculus OSF-3 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000015315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116677970:116699256:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 57 // 7 // 8 // 0
NM_146151 // RefSeq // Mus musculus testis-specific kinase 2 (Tesk2), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006503008 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis-specific kinase 2 (Tesk2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000045542 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116720948:116804242:1 gene:ENSMUSG00000033985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000106456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116741683:116804102:1 gene:ENSMUSG00000033985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000142529 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116771763:116802263:1 gene:ENSMUSG00000033985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 41 // 16 // 16 // 0 /// BC019149 // GenBank // Mus musculus testis-specific kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:29168 IMAGE:5053345), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC029766 // GenBank // Mus musculus testis-specific kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:36540 IMAGE:4947564), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000106459 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116720969:116805956:1 gene:ENSMUSG00000033985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// AK053368 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130012E07 product:testis-specific kinase 2, full insert sequence. // chr4 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// GENSCAN00000015340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116709017:116803312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 26 // 39 // 1
NM_001029912 // RefSeq // Mus musculus zinc finger SWIM-type containing 5 (Zswim5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000044823 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116877376:116989264:1 gene:ENSMUSG00000033948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK016928 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933426E21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AK122519 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1511 protein. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116950860:116987333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_175244 // RefSeq // Mus musculus HECT domain containing 3 (Hectd3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000050067 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:116995317:117005277:1 gene:ENSMUSG00000046861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC024415 // GenBank // Mus musculus HECT domain containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4981502), complete cds. // chr4 // 79 // 31 // 11 // 14 // 0 /// BC070411 // GenBank // Mus musculus HECT domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:99441 IMAGE:5706209), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000155267 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:116998537:117000322:1 gene:ENSMUSG00000046861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1 /// GENSCAN00000015331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116995403:117115795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 89 // 40 // 45 // 1
NM_008958 // RefSeq // Mus musculus patched homolog 2 (Ptch2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000030443 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:117096075:117115383:1 gene:ENSMUSG00000028681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000137209 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117105238:117108514:1 gene:ENSMUSG00000028681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000144620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117096096:117115383:1 gene:ENSMUSG00000028681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AB010833 // GenBank // Mus musculus ptch2 mRNA, complete cds. // chr4 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// BC058397 // GenBank // Mus musculus patched homolog 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6832070), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000015331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:116995403:117115795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0
NM_175030 // RefSeq // Mus musculus Tctex1 domain containing 4 (Tctex1d4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:117126813:117128738:1 gene:ENSMUSG00000047671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134074 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117126794:117128336:1 gene:ENSMUSG00000047671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000144269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117127174:117128515:1 gene:ENSMUSG00000047671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC115474 // GenBank // Mus musculus Tctex1 domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:144282 IMAGE:40100473), complete cds. // chr4 // 71 // 68 // 12 // 17 // 0 /// GENSCAN00000015338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:117127982:117128641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000129783 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117145257:117148637:1 gene:ENSMUSG00000033872 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:117145257:117149126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
ENSMUST00000118674 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:117148923:117149126:1 gene:ENSMUSG00000070834 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000015316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:117145257:117149126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT048899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000093716 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:117189942:117190057:1 gene:ENSMUSG00000095676 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK154548 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630046N03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT048911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000180137 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:117202528:117202643:1 gene:ENSMUSG00000094405 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT048914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000179427 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:117210844:117210959:1 gene:ENSMUSG00000096280 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT048915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000017184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:117724412:117725980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
ENSMUST00000157678 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:118164078:118164181:1 gene:ENSMUSG00000088303 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONMMUT048962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_026601 // RefSeq // Mus musculus hydroxypyruvate isomerase homolog (E. coli) (Hyi), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// NR_003946 // RefSeq // Mus musculus hydroxypyruvate isomerase homolog (E. coli) (Hyi), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000006562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:118360014:118362744:1 gene:ENSMUSG00000006395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000106393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118359999:118362744:1 gene:ENSMUSG00000006395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC024619 // GenBank // Mus musculus hydroxypyruvate isomerase homolog (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:25684 IMAGE:4923664), complete cds. // chr4 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// ENSMUST00000132882 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118361322:118362495:1 gene:ENSMUSG00000006395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// ENSMUST00000179719 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118359999:118361294:1 gene:ENSMUSG00000006395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// AK090361 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630064M05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000017187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118360033:118362556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT048964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
XM_006503272 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2610528J11 gene (2610528J11Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000030261 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118527243:118530228:1 gene:ENSMUSG00000028536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK012175 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610528J11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC022764 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610528J11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:32151 IMAGE:4925508), complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106367 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118526999:118529855:1 gene:ENSMUSG00000028536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_026932 // RefSeq // Mus musculus EBNA1 binding protein 2 (Ebna1bp2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118620799:118627776:1 gene:ENSMUSG00000028729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118621226:118625618:1 gene:ENSMUSG00000028729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// ENSMUST00000147373 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118621160:118624192:1 gene:ENSMUSG00000028729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC054723 // GenBank // Mus musculus EBNA1 binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:64740 IMAGE:5695176), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062876 // GenBank // Mus musculus EBNA1 binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:86074 IMAGE:5686021), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000130219 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118620848:118621931:1 gene:ENSMUSG00000028729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// ENSMUST00000149837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118620850:118621662:1 gene:ENSMUSG00000028729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118620932:118626372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_146315 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 62 (Olfr62), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118665519:118666466:1 gene:ENSMUSG00000043698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104295 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 62, mRNA (cDNA clone MGC:129225 IMAGE:40042931), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118665519:118666466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146853 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1341 (Olfr1341), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000061215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118709409:118710347:1 gene:ENSMUSG00000046790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118709409:118715004:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_146304 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1340 (Olfr1340), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000094834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118726249:118727196:1 gene:ENSMUSG00000070821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC106795 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1340, mRNA (cDNA clone MGC:123648 IMAGE:40042190), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC126867 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1340, mRNA (cDNA clone MGC:123701 IMAGE:40042921), complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118726432:118727196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
NM_146852 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1339 (Olfr1339), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094832 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118734531:118735478:1 gene:ENSMUSG00000070820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118734531:118735478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011856 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1331 (Olfr1331), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000094831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:118868783:118869736:1 gene:ENSMUSG00000073769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000106360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118864658:118869736:1 gene:ENSMUSG00000073769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000054685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118868783:118869736:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_146334 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1330 (Olfr1330), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118893085:118894032:1 gene:ENSMUSG00000073768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC108943 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1330, mRNA (cDNA clone MGC:123702 IMAGE:40042936), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118893085:118894032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133892 // RefSeq // Mus musculus L-amino acid oxidase 1 (Lao1), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:118961578:118968912:1 gene:ENSMUSG00000024903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000142457 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118965375:118968083:1 gene:ENSMUSG00000024903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// AB034801 // GenBank // Mus musculus mLAO mRNA for L-amino acid oxidase, complete cds. // chr4 // 79 // 83 // 19 // 24 // 0 /// BC017599 // GenBank // Mus musculus L-amino acid oxidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:27574 IMAGE:4487137), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118951932:118968556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
ENSMUST00000122207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:118987014:118988019:1 gene:ENSMUSG00000082143 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:118978165:118988019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
NM_011400 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 1 (Slc2a1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006502908 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 1 (Slc2a1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030398 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119108711:119137330:1 gene:ENSMUSG00000028645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000134105 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:119108804:119132563:1 gene:ENSMUSG00000028645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000144329 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:119108859:119132572:1 gene:ENSMUSG00000028645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000174372 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:119108955:119136446:1 gene:ENSMUSG00000028645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC055340 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:65673 IMAGE:6808315), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// M22998 // GenBank // Mouse facilitated glucose transport protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// M23384 // GenBank // Mouse glucose transporter 1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:119108955:119155295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_001038998 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 23 (Ccdc23), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NM_024462 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 23 (Ccdc23), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000097908 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:119195496:119201298:1 gene:ENSMUSG00000028643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000106345 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:119195407:119201298:1 gene:ENSMUSG00000028643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119195306:119201298:1 gene:ENSMUSG00000028643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// BC002274 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 23, mRNA (cDNA clone MGC:7676 IMAGE:3496493), complete cds. // chr4 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// GENSCAN00000054678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:119195908:119200983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0
NM_001038590 // RefSeq // Mus musculus claudin 19 (Cldn19), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NM_153105 // RefSeq // Mus musculus claudin 19 (Cldn19), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000084309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119255414:119259855:1 gene:ENSMUSG00000066058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094823 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119255509:119262438:1 gene:ENSMUSG00000066058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AF486651 // GenBank // Mus musculus claudin 19 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC114989 // GenBank // Mus musculus claudin 19, mRNA (cDNA clone MGC:141195 IMAGE:40056185), complete cds. // chr4 // 82 // 67 // 18 // 22 // 0 /// BC115827 // GenBank // Mus musculus claudin 19, mRNA (cDNA clone MGC:141194 IMAGE:40056184), complete cds. // chr4 // 82 // 67 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:119255573:119258970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0
NM_001014900 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, MYND domain containing 12 (Zmynd12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000094819 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119422814:119453988:1 gene:ENSMUSG00000070806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY959941 // GenBank // Mus musculus MYND domain containing 12 protein mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC147552 // GenBank // Mus musculus zinc finger, MYND domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:182649 IMAGE:9056543), complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC147553 // GenBank // Mus musculus zinc finger, MYND domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:182650 IMAGE:9056544), complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC147848 // GenBank // Mus musculus zinc finger, MYND domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:182951 IMAGE:9087565), complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC147851 // GenBank // Mus musculus zinc finger, MYND domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:182954 IMAGE:9087568), complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSMUST00000134147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:119422872:119450321:1 gene:ENSMUSG00000070806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// ENSMUST00000129150 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:119444720:119467444:1 gene:ENSMUSG00000070806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000054656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:119431100:119453688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT049201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENSMUST00000117835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:119520990:119521366:1 gene:ENSMUSG00000084379 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000054689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:119520990:119521366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT049206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000178059 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:119528000:119528106:1 gene:ENSMUSG00000094494 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT049207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_008190 // RefSeq // Mus musculus guanylate cyclase activator 2a (guanylin) (Guca2a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000024015 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119637704:119639471:1 gene:ENSMUSG00000023247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK075814 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010007F09 product:GUANYLIN PRECURSOR, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC012640 // GenBank // Mus musculus guanylate cyclase activator 2a (guanylin), mRNA (cDNA clone MGC:13734 IMAGE:4219424), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// L05516 // GenBank // Mouse guanylin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M95175 // GenBank // Mouse guanylin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:119637751:119639275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 85 // 74 // 17 // 20 // 0
ENSMUST00000084306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:119733796:119736768:1 gene:ENSMUSG00000028634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000078582 // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK029093 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732490P15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0
NM_010657 // RefSeq // Mus musculus human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 (Hivep3), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000106307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:119814495:120138045:1 gene:ENSMUSG00000028634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000166542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:120094489:120134557:1 gene:ENSMUSG00000028634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// L07911 // GenBank // Mouse Ig kappa chain recombination and transcription enhancer, DNA binding protein (Rc-1) mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 49 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:120094489:120148869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0
NM_007902 // RefSeq // Mus musculus endothelin 2 (Edn2), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:120161206:120167360:1 gene:ENSMUSG00000028635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC037042 // GenBank // Mus musculus endothelin 2, mRNA (cDNA clone MGC:47472 IMAGE:4512195), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:120161510:120166730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_177570 // RefSeq // Mus musculus schlafen like 1 (Slfnl1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006502881 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus schlafen like 1 (Slfnl1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000062990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:120532231:120536661:1 gene:ENSMUSG00000047518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC117545 // GenBank // Mus musculus schlafen like 1, mRNA (cDNA clone MGC:144755 IMAGE:40105640), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC118052 // GenBank // Mus musculus schlafen like 1, mRNA (cDNA clone MGC:144754 IMAGE:40105639), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:120533154:120536520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_019563 // RefSeq // Mus musculus Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4 (Cited4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000094814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:120666572:120667820:1 gene:ENSMUSG00000070803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF143369 // GenBank // Mus musculus msg1-related protein 2 (Mrg2) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// BC132360 // GenBank // Mus musculus Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4, mRNA (cDNA clone MGC:163991 IMAGE:40130637), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC132362 // GenBank // Mus musculus Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4, mRNA (cDNA clone MGC:163993 IMAGE:40130639), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC025116 // GenBank // Mus musculus Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:3670674), complete cds. // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// BC080723 // GenBank // Mus musculus Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5326372), complete cds. // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000000604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:120648244:120678619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_007741 // RefSeq // Mus musculus collagen, type IX, alpha 2 (Col9a2), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000030372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:121039385:121055322:1 gene:ENSMUSG00000028626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC029697 // GenBank // Mus musculus collagen, type IX, alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:36115 IMAGE:5355825), complete cds. // chr4 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:121039050:121054795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082613 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:121134657:121134975:1 gene:ENSMUSG00000064547 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023865 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9530002B09 gene (9530002B09Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:122689275:122705129:1 gene:ENSMUSG00000023263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF319955 // GenBank // Mus musculus AUMP (Aump) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY077734 // GenBank // Mus musculus palmitoyl protein thioesterase-like protein (Vpp1) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_008506 // RefSeq // Mus musculus v-myc myelocytomatosis viral oncogene homolog, lung carcinoma derived (avian) (Mycl), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502820 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus v-myc myelocytomatosis viral oncogene homolog, lung carcinoma derived (avian) (Mycl), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006502821 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus v-myc myelocytomatosis viral oncogene homolog, lung carcinoma derived (avian) (Mycl), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000030407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:122996099:123002485:1 gene:ENSMUSG00000028654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106252 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:122995944:123002485:1 gene:ENSMUSG00000028654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC053059 // GenBank // Mus musculus v-myc myelocytomatosis viral oncogene homolog 1, lung carcinoma derived (avian), mRNA (cDNA clone MGC:62356 IMAGE:5704829), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC089346 // GenBank // Mus musculus v-myc myelocytomatosis viral oncogene homolog 1, lung carcinoma derived (avian), mRNA (cDNA clone MGC:102165 IMAGE:6810905), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:122996070:123000515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_025873 // RefSeq // Mus musculus tRNA isopentenyltransferase 1 (Trit1), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XR_376339 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tRNA isopentenyltransferase 1 (Trit1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000102649 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123016597:123054949:1 gene:ENSMUSG00000028653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000141855 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123048756:123054203:1 gene:ENSMUSG00000028653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000147165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123016597:123054949:1 gene:ENSMUSG00000028653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC019812 // GenBank // Mus musculus tRNA isopentenyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:30541 IMAGE:5042856), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC051040 // GenBank // Mus musculus tRNA isopentenyltransferase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4015446), partial cds. // chr4 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000024706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123016610:123054292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_007559 // RefSeq // Mus musculus bone morphogenetic protein 8b (Bmp8b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000002457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123105165:123126091:1 gene:ENSMUSG00000002384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC137890 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 8b, mRNA (cDNA clone MGC:169514 IMAGE:8860909), complete cds. // chr4 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// U39545 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 8B (Bmp8b) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000151850 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123119324:123132099:1 gene:ENSMUSG00000002384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// AK038590 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230048H15 product:bone morphogenetic protein 8b, full insert sequence. // chr4 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// GENSCAN00000024715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123120092:123124537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT049301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr4 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_022033 // RefSeq // Mus musculus 3-oxoacid CoA transferase 2A (Oxct2a), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// NM_181859 // RefSeq // Mus musculus 3-oxoacid CoA transferase 2B (Oxct2b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000102640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123321875:123323634:-1 gene:ENSMUSG00000076436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// ENSMUST00000102648 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123116266:123118000:1 gene:ENSMUSG00000076438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AB022180 // GenBank // Mus musculus mRNA for Scot-t1, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// AB045847 // GenBank // Mus musculus TISP10 mRNA, complete cds, increased in spermiogenesis. // chr4 // 95 // 56 // 19 // 20 // 0 /// AB049996 // GenBank // Mus musculus mRNA for Scot-t2, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC113758 // GenBank // Mus musculus 3-oxoacid CoA transferase 2B, mRNA (cDNA clone MGC:130507 IMAGE:40047052), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC137887 // GenBank // Mus musculus 3-oxoacid CoA transferase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:169511 IMAGE:8860906), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// BC137888 // GenBank // Mus musculus 3-oxoacid CoA transferase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:169512 IMAGE:8860907), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123113812:123117851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123322024:123342708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 89 // 29 // 32 // 0
NM_174998 // RefSeq // Mus musculus hippocalcin-like 4 (Hpcal4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123183227:123194701:1 gene:ENSMUSG00000046093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123183239:123191513:1 gene:ENSMUSG00000046093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000126995 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123183499:123188798:1 gene:ENSMUSG00000046093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000152194 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123183729:123190744:1 gene:ENSMUSG00000046093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// AB079893 // GenBank // Mus musculus NVP-2 mRNA for neural visinin-like protein 2, complete cds. // chr4 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC138631 // GenBank // Mus musculus hippocalcin-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:170256 IMAGE:8861651), complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC138632 // GenBank // Mus musculus hippocalcin-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:170257 IMAGE:8861652), complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000024697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123188722:123190855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001085502 // RefSeq // Mus musculus 5-nucleotidase, cytosolic IA (Nt5c1a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_376310 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 5-nucleotidase, cytosolic IA (Nt5c1a), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123201504:123216275:1 gene:ENSMUSG00000054958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147308 // GenBank // Mus musculus 5-nucleotidase, cytosolic IA, mRNA (cDNA clone MGC:182488 IMAGE:9056382), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147309 // GenBank // Mus musculus 5-nucleotidase, cytosolic IA, mRNA (cDNA clone MGC:182484 IMAGE:9056378), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147730 // GenBank // Mus musculus 5-nucleotidase, cytosolic IA, mRNA (cDNA clone MGC:182785 IMAGE:9056679), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147733 // GenBank // Mus musculus 5-nucleotidase, cytosolic IA, mRNA (cDNA clone MGC:182788 IMAGE:9056682), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123201558:123219883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013905 // RefSeq // Mus musculus hairy/enhancer-of-split related with YRPW motif-like (Heyl), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000040821 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123233556:123249875:1 gene:ENSMUSG00000032744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000127172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123239757:123245989:1 gene:ENSMUSG00000032744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AB093590 // GenBank // Mus musculus hesr3 mRNA for hairy and enhance of split related 3, complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AF172288 // GenBank // Mus musculus hairy-related transcription factor 3 (Hrt3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC130263 // GenBank // Mus musculus hairy/enhancer-of-split related with YRPW motif-like, mRNA (cDNA clone MGC:161346 IMAGE:40142873), complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AK165078 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330001E23 product:hairy/enhancer-of-split related with YRPW motif-like, full insert sequence. // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENSMUST00000151870 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123233853:123240659:1 gene:ENSMUSG00000032744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000024718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123233867:123254983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT049304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000118690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123258046:123258904:1 gene:ENSMUSG00000083720 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000024704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123258046:123258904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000082624 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:13:46767520:46767649:-1 gene:ENSMUSG00000064558 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 80 // 97 // 24 // 30 // 0 /// ENSMUST00000082721 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:123291344:123291474:1 gene:ENSMUSG00000064655 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000083844 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:123293152:123293282:1 gene:ENSMUSG00000065778 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// ENSMUST00000083321 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:45746895:45747025:1 gene:ENSMUSG00000065255 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 65 // 100 // 20 // 31 // 0 /// NONMMUT017347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 80 // 97 // 24 // 30 // 0 /// NONMMUT049307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT049308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// NONMMUT000811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 65 // 100 // 20 // 31 // 0
ENSMUST00000082721 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:123291344:123291474:1 gene:ENSMUSG00000064655 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// ENSMUST00000083844 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:123293152:123293282:1 gene:ENSMUSG00000065778 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000082624 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:13:46767520:46767649:-1 gene:ENSMUSG00000064558 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 65 // 100 // 20 // 31 // 0 /// ENSMUST00000083321 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:45746895:45747025:1 gene:ENSMUSG00000065255 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0 /// NONMMUT049307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// NONMMUT049308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT017347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 65 // 100 // 20 // 31 // 0 /// NONMMUT000811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0
ENSMUST00000124290 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123787874:123811498:1 gene:ENSMUSG00000043333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC115494 // GenBank // Mus musculus rhomboid, veinlet-like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40100896), complete cds. // chr4 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// BC115495 // GenBank // Mus musculus rhomboid, veinlet-like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40100897), complete cds. // chr4 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// AK162292 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030006F14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NM_183163 // RefSeq // Mus musculus rhomboid, veinlet-like 2 (Drosophila) (Rhbdl2), mRNA. // chr4 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// ENSMUST00000053202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:123787875:123829904:1 gene:ENSMUSG00000043333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
XM_003945383 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC101056089 (LOC101056089), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000097896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:123859679:123863165:1 gene:ENSMUSG00000073761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK133427 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933427I04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123790364:123861002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
ENSMUST00000133445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123920907:123929971:1 gene:ENSMUSG00000028646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000155757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123917474:123936993:1 gene:ENSMUSG00000028646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB017616 // GenBank // Mus musculus YGR163w mRNA homologue, complete cds. // chr4 // 80 // 86 // 20 // 25 // 0 /// BC005417 // GenBank // Mus musculus Ras-related GTP binding C, mRNA (cDNA clone MGC:5703 IMAGE:3495022), complete cds. // chr4 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC037732 // GenBank // Mus musculus Ras-related GTP binding C, mRNA (cDNA clone IMAGE:4500927). // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC071245 // GenBank // Mus musculus Ras-related GTP binding C, mRNA (cDNA clone IMAGE:5099391), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_017475 // RefSeq // Mus musculus Ras-related GTP binding C (Rragc), mRNA. // chr4 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000030399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123917446:123936997:1 gene:ENSMUSG00000028646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// XM_006503232 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras-related GTP binding C (Rragc), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// ENSMUST00000155454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123921282:123935546:1 gene:ENSMUSG00000028646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000013841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123917534:123950259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NR_045819 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933407E24 gene (4933407E24Rik), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:124569190:124574645:1 gene:ENSMUSG00000073759 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONMMUT049376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011141 // RefSeq // Mus musculus POU domain, class 3, transcription factor 1 (Pou3f1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:124656807:124660655:1 gene:ENSMUSG00000090125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:124657707:124659056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_029157 // RefSeq // Mus musculus splicing factor 3a, subunit 3 (Sf3a3), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000030734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:124714776:124732460:1 gene:ENSMUSG00000028902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC009141 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3a, subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:11648 IMAGE:3598647), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC092058 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3a, subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:103282 IMAGE:4017388), complete cds. // chr4 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// ENSMUST00000154712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:124714883:124718727:1 gene:ENSMUSG00000028902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// AK015776 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930512K19 product:SPLICING FACTOR 3A SUBUNIT 3 (SPLICEOSOME ASSOCIATED PROTEIN 61) (SAP 61) (SF3A60), full insert sequence. // chr4 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000005063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:124714895:124800821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NR_030479 // RefSeq // Mus musculus microRNA 697 (Mir697), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102316 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:124731694:124731802:1 gene:ENSMUSG00000076271 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-697 // miRBase Micro RNA Database // MI0004681 Mus musculus miR-697 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008385 // RefSeq // Mus musculus inositol polyphosphate-5-phosphatase B (Inpp5b), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006502808 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inositol polyphosphate-5-phosphatase B (Inpp5b), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000094782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:124741850:124801511:1 gene:ENSMUSG00000028894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000184454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:124741872:124801505:1 gene:ENSMUSG00000028894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF040094 // GenBank // Mus musculus inositol polyphosphate 5-phosphatase II (INPP5P) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK004601 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1200004L23 product:inositol polyphosphate-5-phosphatase, 75 kDa, full insert sequence. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AY007563 // GenBank // Mus musculus inositol polyphosphate 5-phosphatase II isoform mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC028864 // GenBank // Mus musculus inositol polyphosphate-5-phosphatase B, mRNA (cDNA clone MGC:25218 IMAGE:4457437), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:124714895:124800821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_008636 // RefSeq // Mus musculus metal response element binding transcription factor 1 (Mtf1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006502830 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus metal response element binding transcription factor 1 (Mtf1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006502831 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus metal response element binding transcription factor 1 (Mtf1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:124802549:124849800:1 gene:ENSMUSG00000028890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000106193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:124802104:124849379:1 gene:ENSMUSG00000028890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY260849 // GenBank // Mus musculus Fl-A7 metal response element-binding transcription factor 1 mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 70 // 17 // 19 // 0 /// BC017679 // GenBank // Mus musculus metal response element binding transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:18436 IMAGE:4210829), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:124804711:124844343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_153566 // RefSeq // Mus musculus yrdC domain containing (E.coli) (Yrdc), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:124850679:124855242:1 gene:ENSMUSG00000028889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000173434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:124851895:124854718:1 gene:ENSMUSG00000028889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AY283537 // GenBank // Mus musculus ischemia/reperfusion inducible protein mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// BC023823 // GenBank // Mus musculus yrdC domain containing (E.coli), mRNA (cDNA clone MGC:38336 IMAGE:5343817), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000144851 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:124851351:124854478:1 gene:ENSMUSG00000028889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000005106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:124850775:124854547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_177671 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor A10 (Epha10), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000059343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:124880899:124886930:1 gene:ENSMUSG00000028876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116991 // GenBank // Mus musculus Eph receptor A10, mRNA (cDNA clone MGC:151368 IMAGE:40126310), complete cds. // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC119084 // GenBank // Mus musculus Eph receptor A10, mRNA (cDNA clone MGC:155400 IMAGE:8733833), complete cds. // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NM_001256432 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor A10 (Epha10), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// XM_006503027 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Eph receptor A10 (Epha10), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// XM_006503028 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Eph receptor A10 (Epha10), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// XR_376312 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Eph receptor A10 (Epha10), transcript variant X3, misc_RNA. // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000004981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:124881875:124915728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001256432 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor A10 (Epha10), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000149146 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:124885799:124917800:1 gene:ENSMUSG00000028876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006503027 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Eph receptor A10 (Epha10), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000004981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:124881875:124915728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_138683 // RefSeq // Mus musculus R-spondin homolog (Xenopus laevis) (Rspo1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:124986430:125009099:1 gene:ENSMUSG00000028871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB016768 // GenBank // Mus musculus mRNA for thrombospondin type 1 domain, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC138831 // GenBank // Mus musculus R-spondin homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:170458 IMAGE:8861853), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC138833 // GenBank // Mus musculus R-spondin homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:170460 IMAGE:8861855), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:124991333:125008545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0
NM_145552 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein-like 2 (nucleolar) (Gnl2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006503030 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanine nucleotide binding protein-like 2 (nucleolar) (Gnl2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// XM_006503031 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanine nucleotide binding protein-like 2 (nucleolar) (Gnl2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// XM_006503033 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanine nucleotide binding protein-like 2 (nucleolar) (Gnl2), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000030684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:125029992:125055376:1 gene:ENSMUSG00000028869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000136910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:125030058:125041244:1 gene:ENSMUSG00000028869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// BC003262 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein-like 2 (nucleolar), mRNA (cDNA clone MGC:7863 IMAGE:3501393), complete cds. // chr4 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// U69600 // GenBank // Mus musculus testicular antigen mRNA, partial cds. // chr4 // 73 // 94 // 22 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:125016532:125055336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0
NM_175246 // RefSeq // Mus musculus Smad nuclear interacting protein 1 (Snip1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000052183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:125066672:125074042:1 gene:ENSMUSG00000050213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000145733 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:125066702:125071301:1 gene:ENSMUSG00000050213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// BC064067 // GenBank // Mus musculus Smad nuclear interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:73648 IMAGE:949686), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:125066753:125072930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT049416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0
NM_001081097 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor, ionotropic, kainate 3 (Grik3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000030676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:125490700:125714173:1 gene:ENSMUSG00000001985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000051836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:125605530:125708316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_025544 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S15 (Mrps15), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030675 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126046925:126055532:1 gene:ENSMUSG00000028861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB049947 // GenBank // Mus musculus MRPS15 mRNA for mitochondrial ribosomal protein S15, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC029193 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S15, mRNA (cDNA clone MGC:35744 IMAGE:4457237), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC055861 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S15, mRNA (cDNA clone MGC:67971 IMAGE:3587953), complete cds. // chr4 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// ENSMUST00000138739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126046977:126051965:1 gene:ENSMUSG00000028861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// AK140877 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130054J19 product:mitochondrial ribosomal protein S15, full insert sequence. // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000051851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126047070:126065557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_172701 // RefSeq // Mus musculus organic solute carrier partner 1 (Oscp1), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006503034 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus organic solute carrier partner 1 (Oscp1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// XR_406206 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102643079 (LOC102643079), ncRNA. // chr4 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000035497 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126058565:126092195:1 gene:ENSMUSG00000042616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000143712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126064950:126088441:1 gene:ENSMUSG00000042616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// AB286960 // GenBank // Mus musculus OSCP1 mRNA for organic solute carrier protein 1 isoform, complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC045150 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810007P19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:54797 IMAGE:6309923), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XR_376313 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus organic solute carrier partner 1 (Oscp1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr4 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// GENSCAN00000051841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126073828:126088438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0
NM_001163266 // RefSeq // Mus musculus U7 snRNP-specific Sm-like protein LSM10 (Lsm10), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_138721 // RefSeq // Mus musculus U7 snRNP-specific Sm-like protein LSM10 (Lsm10), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006502686 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus U7 snRNP-specific Sm-like protein LSM10 (Lsm10), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006502687 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus U7 snRNP-specific Sm-like protein LSM10 (Lsm10), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000055575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126096623:126098584:1 gene:ENSMUSG00000050188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126096660:126098132:1 gene:ENSMUSG00000050188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000179323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:126096653:126098581:1 gene:ENSMUSG00000050188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC024543 // GenBank // Mus musculus U7 snRNP-specific Sm-like protein LSM10, mRNA (cDNA clone MGC:37605 IMAGE:4989202), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026476 // GenBank // Mus musculus U7 snRNP-specific Sm-like protein LSM10, mRNA (cDNA clone MGC:31519 IMAGE:4489522), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126097853:126139028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001145827 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine kinase 40 (Stk40), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_028800 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine kinase 40 (Stk40), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006503442 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/threonine kinase 40 (Stk40), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000094761 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126103972:126141029:1 gene:ENSMUSG00000042608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000116286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:126103957:126141028:1 gene:ENSMUSG00000042608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000139188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126118272:126128968:1 gene:ENSMUSG00000042608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000139524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126104001:126125111:1 gene:ENSMUSG00000042608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 82 // 31 // 9 // 11 // 0 /// AY336057 // GenBank // Mus musculus Ser/Thr-like protein kinase lyk4 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC046981 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 40, mRNA (cDNA clone MGC:54920 IMAGE:6478265), complete cds. // chr4 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000051842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126097853:126139028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1
ENSMUST00000052876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126147744:126149874:1 gene:ENSMUSG00000050212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000106150 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126148532:126149865:1 gene:ENSMUSG00000050212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC029204 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 176, member B, mRNA (cDNA clone MGC:36197 IMAGE:3964022), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NM_172145 // RefSeq // Mus musculus eva-1 homolog B (C. elegans) (Eva1b), mRNA. // chr4 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// ENSMUST00000106152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126148003:126149875:1 gene:ENSMUSG00000050212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// AK186422 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0137E13, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000052876, based on BLAT search. // chr4 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000051849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126145691:126149663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_013718 // RefSeq // Mus musculus trafficking protein particle complex 3 (Trappc3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126262325:126275883:1 gene:ENSMUSG00000028847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF041433 // GenBank // Mus musculus bet3 (Bet3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK168518 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920029D06 product:trafficking protein particle complex 3, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003736 // GenBank // Mus musculus trafficking protein particle complex 3, mRNA (cDNA clone MGC:5818 IMAGE:3490979), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126262400:126273475:1 gene:ENSMUSG00000028847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000051838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126256476:126275261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_199473 // RefSeq // Mus musculus collagen, type VIII, alpha 2 (Col8a2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126286793:126314330:1 gene:ENSMUSG00000056174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC065148 // GenBank // Mus musculus collagen, type VIII, alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:86011 IMAGE:30355747), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC080317 // GenBank // Mus musculus collagen, type VIII, alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:90765 IMAGE:6853989), complete cds. // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000051837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126301228:126312298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000140080 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126323599:126325237:1 gene:ENSMUSG00000087394 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK146848 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920064F16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_175554 // RefSeq // Mus musculus claspin (Clspn), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006503124 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus claspin (Clspn), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126556935:126593903:1 gene:ENSMUSG00000042489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC050848 // GenBank // Mus musculus claspin homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:59414 IMAGE:6507692), complete cds. // chr4 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126557114:126592762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001013755 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5730409E04Rik gene (5730409E04Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001145950 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5730409E04Rik gene (5730409E04Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126609818:126614371:1 gene:ENSMUSG00000073755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:126609854:126614371:1 gene:ENSMUSG00000073755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126604506:126612373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_011970 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 2 (Psmb2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:126677630:126709714:1 gene:ENSMUSG00000028837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000150372 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126677704:126707762:1 gene:ENSMUSG00000028837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AF060090 // GenBank // Mus musculus proteasome subunit C7-I (Psmb2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC008265 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 2, mRNA (cDNA clone MGC:6558 IMAGE:2811010), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000130737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:126677679:126687285:1 gene:ENSMUSG00000028837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// AK164463 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230045B15 product:proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 2, full insert sequence. // chr4 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126677755:126687159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:126704305:126709586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001285885 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, MYM-type 6 (Zmym6), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NM_001285887 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, MYM-type 6 (Zmym6), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NM_001285888 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, MYM-type 6 (Zmym6), transcript variant 4, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NM_177462 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, MYM-type 6 (Zmym6), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NR_104366 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, MYM-type 6 (Zmym6), transcript variant 5, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000046751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:127077383:127124370:1 gene:ENSMUSG00000042408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000094713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:127077397:127124372:1 gene:ENSMUSG00000042408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000151461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:127077442:127107644:1 gene:ENSMUSG00000042408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// AK082594 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230067J07 product:weakly similar to ZNF258 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// BC140958 // GenBank // Mus musculus zinc finger, MYM-type 6, mRNA (cDNA clone MGC:175919 IMAGE:9055570), complete cds. // chr4 // 93 // 83 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:127056569:127124177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_001099319 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12942 (Gm12942), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000094712 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:127126046:127129644:1 gene:ENSMUSG00000070737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000106097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:127123691:127129644:1 gene:ENSMUSG00000070737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000017324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:127126089:127129020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC032280 // GenBank // Mus musculus zinc finger, MYM-type 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:5401755), partial cds. // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT049542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_030252 // RefSeq // Mus musculus small integral membrane protein 12 (Smim12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:127243784:127247809:1 gene:ENSMUSG00000042380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147067 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC003266, mRNA (cDNA clone MGC:182176 IMAGE:9056070), complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC147068 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC003266, mRNA (cDNA clone MGC:182180 IMAGE:9056074), complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001281955 // RefSeq // Mus musculus CUB and Sushi multiple domains 2 (Csmd2), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 73 // 73 // 0 /// ENSMUST00000144298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:127988044:128419617:1 gene:ENSMUSG00000028804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 96 // 35 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000184063 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:128058962:128567656:1 gene:ENSMUSG00000028804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 69 // 69 // 0 /// ENSMUST00000129619 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:127987857:128339657:1 gene:ENSMUSG00000028804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 17 // 17 // 13 // 78 // 1 /// ENSMUST00000148247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:128477154:128501177:1 gene:ENSMUSG00000028804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 10 // 10 // 8 // 78 // 1 /// AK046385 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230378I17 product:hypothetical Sushi domain / SCR repeat / CCP module/ CUB domain containing protein, full insert sequence. // chr4 // 17 // 17 // 13 // 78 // 1 /// GENSCAN00000003751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:128378891:128566011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 56 // 56 // 0 /// GENSCAN00000003758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:128269548:128375388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 13 // 13 // 10 // 78 // 1
NM_001009819 // RefSeq // Mus musculus alpha 1,3-galactosyltransferase 2 (isoglobotriaosylceramide synthase) (A3galt2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006536962 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alpha 1,3-galactosyltransferase 2 (isoglobotriaosylceramide synthase) (A3galt2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006536963 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alpha 1,3-galactosyltransferase 2 (isoglobotriaosylceramide synthase) (A3galt2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000030585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:128759258:128769298:1 gene:ENSMUSG00000028794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000106077 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:128755364:128768588:1 gene:ENSMUSG00000028794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AY491982 // GenBank // Mus musculus iGb3 synthase mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000006304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:128759952:128767672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_178110 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 62 (Trim62), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:128883588:128911328:1 gene:ENSMUSG00000041000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049095 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 62, mRNA (cDNA clone MGC:61406 IMAGE:6416690), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:128883580:128903565:1 gene:ENSMUSG00000041000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// AK048725 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230023D16 product:similar to CDNA FLJ10759 FIS, CLONE NT2RP3004617, WEAKLY SIMILAR TO ZINC-BINDING PROTEIN A33 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:128884170:128909586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001033966 // RefSeq // Mus musculus adenylate kinase 2 (Ak2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NM_016895 // RefSeq // Mus musculus adenylate kinase 2 (Ak2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000030583 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:128993224:129008401:1 gene:ENSMUSG00000028792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102604 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:128993224:129011529:1 gene:ENSMUSG00000028792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000152762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:128993353:129008229:1 gene:ENSMUSG00000028792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// AB020202 // GenBank // Mus musculus mRNA for adenylate kinase isozyme 2, complete cds. // chr4 // 79 // 85 // 22 // 28 // 0 /// BC008610 // GenBank // Mus musculus adenylate kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:5699 IMAGE:3584786), complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000141982 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:128991958:129002257:1 gene:ENSMUSG00000028792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000006258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:128993344:129084190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONMMUT049593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_029219 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 19B (Rnf19b), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:129058271:129085735:1 gene:ENSMUSG00000028793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000097874 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:129058814:129084526:1 gene:ENSMUSG00000028793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000152565 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:129058409:129080549:1 gene:ENSMUSG00000028793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000168461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:129058271:129084526:1 gene:ENSMUSG00000028793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK015966 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930534K13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 92 // 39 // 12 // 13 // 0 /// BC117807 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 19B, mRNA (cDNA clone IMAGE:40092318), partial cds. // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000130803 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:129078971:129085886:1 gene:ENSMUSG00000028793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// GENSCAN00000006258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:128993344:129084190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
NM_001290706 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 54 (Tmem54), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_025452 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 54 (Tmem54), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_133881 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 54 (Tmem54), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000030575 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:129105574:129111626:1 gene:ENSMUSG00000028786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000030577 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:129105601:129111517:1 gene:ENSMUSG00000028786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106064 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129105548:129111626:1 gene:ENSMUSG00000028786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000148979 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:129106869:129110544:1 gene:ENSMUSG00000028786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// BC019563 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 54, mRNA (cDNA clone MGC:28617 IMAGE:4219997), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129104307:129111262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_027402 // RefSeq // Mus musculus fibronectin type III domain containing 5 (Fndc5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129136999:129144593:1 gene:ENSMUSG00000001334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ401376 // GenBank // Mus musculus mRNA for peroxisomal protein (PeP gene). // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC109183 // GenBank // Mus musculus fibronectin type III domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:129464 IMAGE:40050064), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC109184 // GenBank // Mus musculus fibronectin type III domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:129465 IMAGE:40050065), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129137079:129142778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_134151 // RefSeq // Mus musculus tyrosyl-tRNA synthetase (Yars), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000106054 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129189760:129219607:1 gene:ENSMUSG00000028811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000133992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129197115:129210578:1 gene:ENSMUSG00000028811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000137591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129212696:129218663:1 gene:ENSMUSG00000028811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC013552 // GenBank // Mus musculus tyrosyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:19350 IMAGE:4236514), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// BC022143 // GenBank // Mus musculus tyrosyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:37882 IMAGE:5101324), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// BC026615 // GenBank // Mus musculus tyrosyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:37380 IMAGE:4976999), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129190016:129218541:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_023485 // RefSeq // Mus musculus syncoilin (Sync), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129287617:129308559:1 gene:ENSMUSG00000001333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000146448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129287631:129307363:1 gene:ENSMUSG00000001333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// AK160756 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110018I03 product:syncoilin, full insert sequence. // chr4 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// AK166916 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0022P09 product:syncoilin, full insert sequence. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC106855 // GenBank // Mus musculus syncoilin, mRNA (cDNA clone MGC:124230 IMAGE:40046886), complete cds. // chr4 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// FJ752162 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 syncoilin isoform 2 (Sync) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// FJ752164 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 syncoilin isoform 1 (Sync) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129287739:129306503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0
ENSMUST00000082679 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:129458351:129458490:1 gene:ENSMUSG00000064613 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT049635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_133889 // RefSeq // Mus musculus BSD domain containing 1 (Bsdc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000048162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129461581:129488498:1 gene:ENSMUSG00000040859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000138013 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:129461836:129466990:1 gene:ENSMUSG00000040859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000145168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129471873:129473912:1 gene:ENSMUSG00000040859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000154368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129461684:129466978:1 gene:ENSMUSG00000040859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC021480 // GenBank // Mus musculus BSD domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5344303), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC049111 // GenBank // Mus musculus BSD domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:61423 IMAGE:6415574), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000131741 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129461684:129470174:1 gene:ENSMUSG00000040859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// AK084857 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430003C02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000006217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129461695:129487277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_010807 // RefSeq // Mus musculus MARCKS-like 1 (Marcksl1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000062356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129513581:129515985:1 gene:ENSMUSG00000047945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC006757 // GenBank // Mus musculus MARCKS-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:6254 IMAGE:3257582), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0
NM_001164745 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase 4a2 (Ptp4a2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// NM_008974 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase 4a2 (Ptp4a2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// XM_006502863 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase 4a2 (Ptp4a2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000030578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129820221:129849978:1 gene:ENSMUSG00000028788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000165853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:129820708:129850003:1 gene:ENSMUSG00000028788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// AK160163 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810010N23 product:protein tyrosine phosphatase 4a2, full insert sequence. // chr4 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// BC086794 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase 4a2, mRNA (cDNA clone MGC:102154 IMAGE:6811716), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC087551 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase 4a2, mRNA (cDNA clone MGC:103400 IMAGE:6329297), complete cds. // chr4 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
ENSMUST00000097869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:129855071:129856710:1 gene:ENSMUSG00000073753 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK155946 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830001M15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083834 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:129895573:129895724:1 gene:ENSMUSG00000065768 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006503506 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SPOC domain containing 1 (Spocd1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006503507 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SPOC domain containing 1 (Spocd1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006503508 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SPOC domain containing 1 (Spocd1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000084263 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:129947721:129957115:1 gene:ENSMUSG00000028784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128007 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:129947547:129953562:1 gene:ENSMUSG00000028784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000021895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129899093:129972173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_026441 // RefSeq // Mus musculus penta-EF hand domain containing 1 (Pef1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:130107556:130128134:1 gene:ENSMUSG00000028779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118199 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:130102558:130128135:1 gene:ENSMUSG00000028779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019191 // GenBank // Mus musculus penta-EF hand domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:29333 IMAGE:5029503), complete cds. // chr4 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:130120658:130127482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_010174 // RefSeq // Mus musculus fatty acid binding protein 3, muscle and heart (Fabp3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000070435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:86731754:86732409:-1 gene:ENSMUSG00000056366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// ENSMUST00000070532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:130308595:130315463:1 gene:ENSMUSG00000028773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC002082 // GenBank // Mus musculus fatty acid binding protein 3, muscle and heart, mRNA (cDNA clone MGC:6249 IMAGE:3485639), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089542 // GenBank // Mus musculus fatty acid binding protein 3, muscle and heart, mRNA (cDNA clone MGC:107282 IMAGE:30300963), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U02883 // GenBank // Mus musculus Balb/c mammary-derived growth inhibitor (MDGI) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:86731987:86732388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:130308778:130315225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NR_028565 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 85 (Snord85), small nucleolar RNA. // chr4 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// ENSMUST00000083262 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:130749634:130749706:1 gene:ENSMUSG00000065196 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF357332 // GenBank // Mus musculus clone MBII-251 C/D box snoRNA, partial sequence. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT049742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0
XR_402061 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638516 (LOC102638516), ncRNA. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082550 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:130766331:130766413:1 gene:ENSMUSG00000093793 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// ENSMUST00000083856 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:130775741:130775823:1 gene:ENSMUSG00000095119 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// NONMMUT049744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// NONMMUT049746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0
NM_011520 // RefSeq // Mus musculus syndecan 3 (Sdc3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000070478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:130792537:130826319:1 gene:ENSMUSG00000025743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC054795 // GenBank // Mus musculus syndecan 3, mRNA (cDNA clone MGC:65603 IMAGE:6834272), complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// BC059031 // GenBank // Mus musculus syndecan 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6811435), partial cds. // chr4 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// BC062093 // GenBank // Mus musculus syndecan 3, mRNA (cDNA clone MGC:69616 IMAGE:5705893), complete cds. // chr4 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// U52826 // GenBank // Mus musculus syndecan-3 mRNA, complete cds. // chr4 // 53 // 48 // 8 // 15 // 0 /// ENSMUST00000140623 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:130816845:130822250:1 gene:ENSMUSG00000025743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// AK045898 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230319K02 product:SYNDECAN-3 PRECURSOR (SYND3) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr4 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000018352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:130809668:130822809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT049753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0
NM_010769 // RefSeq // Mus musculus matrilin 1, cartilage matrix protein (Matn1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:130944385:130955475:1 gene:ENSMUSG00000040533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC047140 // GenBank // Mus musculus matrilin 1, cartilage matrix protein, mRNA (cDNA clone MGC:54621 IMAGE:6315509), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:130944424:130970542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000030743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:131885208:131901706:1 gene:ENSMUSG00000028911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000129966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:131873816:131892144:1 gene:ENSMUSG00000028911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 91 // 26 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000134943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:131884295:131897834:1 gene:ENSMUSG00000028911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 94 // 42 // 17 // 18 // 0 /// BC019437 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 4 (SRp75), mRNA (cDNA clone MGC:30385 IMAGE:4018178), complete cds. // chr4 // 89 // 86 // 33 // 37 // 0 /// BC026944 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 4 (SRp75), mRNA (cDNA clone MGC:30919 IMAGE:4016087), complete cds. // chr4 // 90 // 93 // 36 // 40 // 0 /// NM_020587 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 4 (Srsf4), mRNA. // chr4 // 86 // 86 // 37 // 43 // 1 /// ENSMUST00000053819 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:131873617:131901706:1 gene:ENSMUSG00000028911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 37 // 43 // 1 /// GENSCAN00000017014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:131873764:131901072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 27 // 43 // 1
NM_001201367 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 200B (Tmem200b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:131921771:131923140:1 gene:ENSMUSG00000070720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:131921771:131922625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000094662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:132074697:132076992:1 gene:ENSMUSG00000070717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK044726 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930037D12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025579 // RefSeq // Mus musculus TAF12 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006539106 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TAF12 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf12), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000030731 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132274375:132295766:1 gene:ENSMUSG00000028899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000105963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132274416:132292712:1 gene:ENSMUSG00000028899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK139748 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020014N15 product:TAF12 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, full insert sequence. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC019668 // GenBank // Mus musculus TAF12 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:30438 IMAGE:3493047), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132270128:132292662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NR_029412 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 16A (Snora16a), small nucleolar RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083163 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:132309465:132309600:1 gene:ENSMUSG00000065097 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FM991911 // GenBank // Mus musculus A16 snoRNA, strain C57BL/6J. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT049834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_034050 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 44 (Snora44), small nucleolar RNA. // chr4 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000082670 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:132309941:132310069:1 gene:ENSMUSG00000064604 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000128131 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132309818:132310995:1 gene:ENSMUSG00000086290 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT049837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT049838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000083015 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:132310240:132310369:1 gene:ENSMUSG00000064949 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000126380 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132308693:132310759:1 gene:ENSMUSG00000086290 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000182826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132310187:132311024:1 gene:ENSMUSG00000086290 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT049833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT049839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT049840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000082805 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:132442034:132442127:1 gene:ENSMUSG00000064739 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT049861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001081211 // RefSeq // Mus musculus platelet-activating factor receptor (Ptafr), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000070690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132564067:132582683:1 gene:ENSMUSG00000056529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132579301:132580326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_011284 // RefSeq // Mus musculus replication protein A2 (Rpa2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102561 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132768335:132778752:1 gene:ENSMUSG00000028884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D00812 // GenBank // Mus musculus mRNA for 30-kDa subunit of replication protein A, complete cds. // chr4 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC004578 // GenBank // Mus musculus replication protein A2, mRNA (cDNA clone MGC:6146 IMAGE:3586727), complete cds. // chr4 // 72 // 89 // 18 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132768376:132774235:1 gene:ENSMUSG00000028884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// ENSMUST00000133415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132768635:132772119:1 gene:ENSMUSG00000028884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// AK011530 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610024F01 product:replication protein A2, full insert sequence. // chr4 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000048109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132757365:132777874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT049883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
AK142202 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330011K04 product:hypothetical EGF-like domain, subtype 2 containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132884763:132886626:1 gene:ENSMUSG00000083816 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT049891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_010208 // RefSeq // Mus musculus Gardner-Rasheed feline sarcoma viral (Fgr) oncogene homolog (Fgr), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006538544 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Gardner-Rasheed feline sarcoma viral (Fgr) oncogene homolog (Fgr), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006538545 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Gardner-Rasheed feline sarcoma viral (Fgr) oncogene homolog (Fgr), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:132974102:133001910:1 gene:ENSMUSG00000028874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000138179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:132977116:133000767:1 gene:ENSMUSG00000028874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000171223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:132977116:133000767:1 gene:ENSMUSG00000028874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AK036476 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830114P17 product:Gardner-Rasheed feline sarcoma viral (Fgr) oncogene homolog, full insert sequence. // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC057863 // GenBank // Mus musculus Gardner-Rasheed feline sarcoma viral (Fgr) oncogene homolog, mRNA (cDNA clone MGC:68179 IMAGE:5317449), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:132969523:133000343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000181522 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:4:133085474:133089146:1 gene:ENSMUSG00000097088 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_402090 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642613 (LOC102642613), ncRNA. // chr4 // 52 // 84 // 11 // 21 // 0 /// KnowTID_00005327 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00005328 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT049904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY512921 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:C0627A08 unknown mRNA. // chr4 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0
AK158167 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930037G02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 90 // 70 // 19 // 21 // 0 /// AY140896 // GenBank // Mus musculus endogenous defective Murine leukemia virus LI-12 truncated pol/envelope fusion protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC066867 // GenBank // Mus musculus similar to Retrovirus-related POL polyprotein (Endonuclease), mRNA (cDNA clone MGC:76738 IMAGE:30462835), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK040896 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530041D01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 75 // 40 // 9 // 12 // 0 /// FJ654132 // GenBank // Mus musculus strain ICR clone SGT19-10 endogenous retrovirus U3 region, partial sequence. // chr4 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// AY140895 // GenBank // Mus musculus endogenous defective Murine leukemia virus LI-8 gag protein mRNA, complete cds. // chr4 // 54 // 93 // 15 // 28 // 0
NM_153423 // RefSeq // Mus musculus WAS protein family, member 2 (Wasf2), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000084241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133130505:133199756:1 gene:ENSMUSG00000028868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000105912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133176371:133196504:1 gene:ENSMUSG00000028868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000138831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133130540:133185095:1 gene:ENSMUSG00000028868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AY135643 // GenBank // Mus musculus WAVE2 mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// BC051488 // GenBank // Mus musculus WAS protein family, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:1378735), partial cds. // chr4 // 94 // 46 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133176483:133195874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0
NM_027152 // RefSeq // Mus musculus CD164 sialomucin-like 2 (Cd164l2), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133220810:133224555:1 gene:ENSMUSG00000028865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133221448:133224555:1 gene:ENSMUSG00000028865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC111824 // GenBank // Mus musculus CD164 sialomucin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:130580 IMAGE:40055637), complete cds. // chr4 // 67 // 62 // 12 // 18 // 0 /// ENSMUST00000134713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133221534:133224242:1 gene:ENSMUSG00000028865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// AK158529 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230007M06 product:hypothetical CD164 related protein containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT049913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000048072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133211763:133223751:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONMMUT049914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr4 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_016693 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 6 (Map3k6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133240818:133252929:1 gene:ENSMUSG00000028862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000134895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133250849:133252928:1 gene:ENSMUSG00000028862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AB021861 // GenBank // Mus musculus ASK2 mRNA for apoptosis signal-regulating kinase 2, complete cds. // chr4 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// BC120565 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:155802 IMAGE:40129488), complete cds. // chr4 // 82 // 93 // 23 // 28 // 0 /// BC125577 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:159280 IMAGE:40130092), complete cds. // chr4 // 82 // 93 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133241089:133252869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0
NM_175307 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 46, member B (Fam46b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133480132:133487938:1 gene:ENSMUSG00000046694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC038001 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 46, member B, mRNA (cDNA clone MGC:47481 IMAGE:4913445), complete cds. // chr4 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133480303:133487103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_001083916 // RefSeq // Mus musculus keratinocyte differentiation factor 1 (Kdf1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_133707 // RefSeq // Mus musculus keratinocyte differentiation factor 1 (Kdf1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133518992:133530790:1 gene:ENSMUSG00000037600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133519055:133530785:1 gene:ENSMUSG00000037600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121797 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:133519083:133530787:1 gene:ENSMUSG00000037600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158383 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930111O08 product:Similar to TATA box binding protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC006890 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810019J16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:11921 IMAGE:3599314), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133527974:133530369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_011850 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2 (Nr0b2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133553376:133556536:1 gene:ENSMUSG00000037583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY360323 // GenBank // Mus musculus strain PERA/Ei nuclear receptor subfamily 0 group B member 2 (Nr0b2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AY360324 // GenBank // Mus musculus strain I/LnJ nuclear receptor subfamily 0 group B member 2 (Nr0b2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC019540 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:28536 IMAGE:4193866), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133553425:133556236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_172876 // RefSeq // Mus musculus G patch domain containing 3 (Gpatch3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000030662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133574745:133584243:1 gene:ENSMUSG00000028850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000154648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133579704:133583010:1 gene:ENSMUSG00000028850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// XM_006543891 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G patch domain containing 3 (Gpatch3), mRNA. // chr4 // 67 // 48 // 10 // 15 // 0 /// BC096468 // GenBank // Mus musculus G patch domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:106307 IMAGE:3665952), complete cds. // chr4 // 61 // 100 // 19 // 31 // 0 /// BC121828 // GenBank // Mus musculus G patch domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:148230 IMAGE:40107316), complete cds. // chr4 // 57 // 90 // 16 // 28 // 0 /// BC121829 // GenBank // Mus musculus G patch domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:148229 IMAGE:40107315), complete cds. // chr4 // 57 // 90 // 16 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133580651:133583832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000048102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133574760:133579960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0
NM_001290742 // RefSeq // Mus musculus GPN-loop GTPase 2 (Gpn2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_133884 // RefSeq // Mus musculus GPN-loop GTPase 2 (Gpn2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133584362:133591735:1 gene:ENSMUSG00000028848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000105899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133584419:133591490:1 gene:ENSMUSG00000028848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000148909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:133584428:133586181:1 gene:ENSMUSG00000028848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC018407 // GenBank // Mus musculus GPN-loop GTPase 2, mRNA (cDNA clone MGC:25437 IMAGE:4015340), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133584459:133589907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
AF285579 // GenBank // Mus musculus testis protein TEX17 (Tex17) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000105884 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:134053838:134058996:1 gene:ENSMUSG00000049410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134034923:134092407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
BC080727 // GenBank // Mus musculus predicted gene, 434166, mRNA (cDNA clone IMAGE:6493658). // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_019641 // RefSeq // Mus musculus stathmin 1 (Stmn1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134468320:134473843:1 gene:ENSMUSG00000028832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000105867 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134468409:134473664:1 gene:ENSMUSG00000028832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:69925630:69926079:-1 gene:ENSMUSG00000046341 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// AB064953 // GenBank // Mus musculus mRNA for stathmin, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC010581 // GenBank // Mus musculus stathmin 1, mRNA (cDNA clone MGC:6962 IMAGE:3154091), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC031831 // GenBank // Mus musculus stathmin 1, mRNA (cDNA clone MGC:25093 IMAGE:4500926), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC054396 // GenBank // Mus musculus stathmin 1, mRNA (cDNA clone MGC:62596 IMAGE:6492045), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000105868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134469742:134473499:1 gene:ENSMUSG00000028832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000022575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:69925630:69932599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000027890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134468610:134473403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0
NM_001081099 // RefSeq // Mus musculus clathrin heavy chain linker domain containing 1 (Clhc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000105866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134510999:134523927:1 gene:ENSMUSG00000078521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138271 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610002D18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169895 IMAGE:8861290), complete cds. // chr4 // 62 // 100 // 16 // 26 // 0
NM_011270 // RefSeq // Mus musculus Rh blood group, D antigen (Rhd), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000030627 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134864536:134896172:1 gene:ENSMUSG00000028825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000136163 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134879810:134890306:1 gene:ENSMUSG00000028825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// AB015189 // GenBank // Mus musculus mRNA for Rh blood group protein, complete cds, strain: C57BL-10SnJ. // chr4 // 86 // 90 // 24 // 28 // 0 /// AB015190 // GenBank // Mus musculus mRNA for Rh blood group protein, complete cds, strain: BFM-2MsfB6C3FI. // chr4 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// AF047827 // GenBank // Mus musculus Rh-like protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF057524 // GenBank // Mus musculus membrane protein Rh30 (Rhl) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF069311 // GenBank // Mus musculus Rhesus blood group protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK166030 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730029O19 product:Rhesus blood group CE and D, full insert sequence. // chr4 // 88 // 81 // 22 // 25 // 0 /// BC145805 // GenBank // Mus musculus Rh blood group, D antigen, mRNA (cDNA clone MGC:175692 IMAGE:40131108), complete cds. // chr4 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000038736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134879906:134897146:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_026780 // RefSeq // Mus musculus SYF2 homolog, RNA splicing factor (S. cerevisiae) (Syf2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:134930898:134937548:1 gene:ENSMUSG00000028821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY033432 // GenBank // Mus musculus GCIP-interacting protein p29 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051484 // GenBank // Mus musculus SYF2 homolog, RNA splicing factor (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:62940 IMAGE:1380946), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134931010:134936078:1 gene:ENSMUSG00000028821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// ENSMUST00000156334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:134930902:134935049:1 gene:ENSMUSG00000028821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:134914573:134937938:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_019732 // RefSeq // Mus musculus runt related transcription factor 3 (Runx3), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006538506 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus runt related transcription factor 3 (Runx3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000056977 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135120652:135177990:1 gene:ENSMUSG00000070691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000119564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135152496:135176181:1 gene:ENSMUSG00000070691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AF155880 // GenBank // Mus musculus transcription factor AML2/CBFA3 (Cbfa3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:135104194:135175832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_030189 // RefSeq // Mus musculus sperm tail PG rich repeat containing 1 (Stpg1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006539286 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sperm tail PG rich repeat containing 1 (Stpg1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// XM_006539288 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sperm tail PG rich repeat containing 1 (Stpg1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000063707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135495987:135537803:1 gene:ENSMUSG00000028801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000123221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135495977:135533990:1 gene:ENSMUSG00000028801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK015061 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930403G18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000153891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135494790:135519349:1 gene:ENSMUSG00000028801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000038721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:135506409:135536653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT050058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NR_015613 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700029M20 gene (1700029M20Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NR_027909 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700029M20 gene (1700029M20Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000134416 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135626774:135628485:1 gene:ENSMUSG00000086788 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135626655:135630198:1 gene:ENSMUSG00000086788 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000166316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:135626818:135628485:1 gene:ENSMUSG00000086788 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC059720 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700029M20 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6705769). // chr4 // 86 // 52 // 12 // 14 // 0 /// NONMMUT050065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONMMUT050066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// NONMMUT050067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT050069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT050068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_174851 // RefSeq // Mus musculus interferon lambda receptor 1 (Ifnlr1), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000074408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135686287:135708181:1 gene:ENSMUSG00000062157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AY184376 // GenBank // Mus musculus class II cytokine receptor 12 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// BC057856 // GenBank // Mus musculus interleukin 28 receptor alpha, mRNA (cDNA clone MGC:67648 IMAGE:5036481), complete cds. // chr4 // 90 // 91 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000003399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:135686542:135713119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
NM_178257 // RefSeq // Mus musculus interleukin 22 receptor, alpha 1 (Il22ra1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102546 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135728172:135752140:1 gene:ENSMUSG00000037157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY103454 // GenBank // Mus musculus interleukin-22 receptor alpha chain mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC140972 // GenBank // Mus musculus interleukin 22 receptor, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:175933 IMAGE:9055584), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC140973 // GenBank // Mus musculus interleukin 22 receptor, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:175934 IMAGE:9055585), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:135728220:135751365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_178257 // RefSeq // Mus musculus interleukin 22 receptor, alpha 1 (Il22ra1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001085509 // RefSeq // Mus musculus myomesin family, member 3 (Myom3), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006538852 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myomesin family, member 3 (Myom3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 97 // 85 // 32 // 33 // 0 /// XR_390746 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myomesin family, member 3 (Myom3), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000105854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135759715:135815564:1 gene:ENSMUSG00000037139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000145304 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135798190:135815564:1 gene:ENSMUSG00000037139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1 /// GENSCAN00000003367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:135762520:135814419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0
NM_001284196 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 10 (Srsf10), transcript variant 4, mRNA. // chr4 // 82 // 61 // 9 // 11 // 0 /// NM_010178 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 10 (Srsf10), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 82 // 61 // 9 // 11 // 0 /// ENSMUST00000030438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135855878:135868382:1 gene:ENSMUSG00000028676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000097844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135855747:135865815:1 gene:ENSMUSG00000028676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 56 // 8 // 10 // 0 /// ENSMUST00000102544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135855747:135868382:1 gene:ENSMUSG00000028676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 56 // 8 // 10 // 0 /// ENSMUST00000105853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135855747:135865815:1 gene:ENSMUSG00000028676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 56 // 8 // 10 // 0 /// ENSMUST00000126641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135855747:135869908:1 gene:ENSMUSG00000028676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 78 // 12 // 14 // 0 /// AF042383 // GenBank // Mus musculus TLS-associated protein with SR repeats mRNA, complete cds. // chr4 // 82 // 61 // 9 // 11 // 0 /// BC043060 // GenBank // Mus musculus FUS interacting protein (serine-arginine rich) 1, mRNA (cDNA clone MGC:57963 IMAGE:6419883), complete cds. // chr4 // 80 // 56 // 8 // 10 // 0
NM_009924 // RefSeq // Mus musculus cannabinoid receptor 2 (macrophage) (Cnr2), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135911818:135920207:1 gene:ENSMUSG00000062585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000097843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135895394:135920207:1 gene:ENSMUSG00000062585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC024052 // GenBank // Mus musculus cannabinoid receptor 2 (macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:36085 IMAGE:5098695), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_024243 // RefSeq // Mus musculus fucosidase, alpha-L- 1, tissue (Fuca1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135920735:135940311:1 gene:ENSMUSG00000028673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC003235 // GenBank // Mus musculus fucosidase, alpha-L- 1, tissue, mRNA (cDNA clone MGC:7702 IMAGE:3497631), complete cds. // chr4 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:135920804:135939214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_008254 // RefSeq // Mus musculus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A lyase (Hmgcl), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006538563 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A lyase (Hmgcl), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000030432 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:135946448:135962617:1 gene:ENSMUSG00000028672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000134135 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135946465:135960908:1 gene:ENSMUSG00000028672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000148613 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135959727:135962617:1 gene:ENSMUSG00000028672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AK132035 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900054C16 product:3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A lyase, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC025440 // GenBank // Mus musculus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A lyase, mRNA (cDNA clone MGC:29242 IMAGE:5049759), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151879 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135948530:135958749:1 gene:ENSMUSG00000028672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000003379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:135946481:135967859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
ENSMUST00000121866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:135997523:135997887:1 gene:ENSMUSG00000083852 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000003348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:135991594:135997887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_008321 // RefSeq // Mus musculus inhibitor of DNA binding 3 (Id3), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000008016 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136143497:136145392:1 gene:ENSMUSG00000007872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC145871 // GenBank // Mus musculus inhibitor of DNA binding 3, mRNA (cDNA clone MGC:175758 IMAGE:40131174), complete cds. // chr4 // 85 // 74 // 17 // 20 // 0 /// BC145873 // GenBank // Mus musculus inhibitor of DNA binding 3, mRNA (cDNA clone MGC:175760 IMAGE:40131176), complete cds. // chr4 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// M60523 // GenBank // Mouse helix-loop-helix protein (Id related) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151001 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:136143864:136144716:1 gene:ENSMUSG00000007872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONMMUT050099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT050100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_177733 // RefSeq // Mus musculus E2F transcription factor 2 (E2f2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006538854 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus E2F transcription factor 2 (E2f2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000061721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136172394:136196057:1 gene:ENSMUSG00000018983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK157322 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830211C05 product:E2F transcription factor 2, full insert sequence. // chr4 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// BC062101 // GenBank // Mus musculus E2F transcription factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:69659 IMAGE:6848237), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000149750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:136180783:136186807:1 gene:ENSMUSG00000018983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000003315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136172781:136193037:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT050103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001008232 // RefSeq // Mus musculus ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (Asap3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136206365:136245216:1 gene:ENSMUSG00000036995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085250 // GenBank // Mus musculus ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:102639 IMAGE:30730459), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136206519:136243545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_011542 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII), 3 (Tcea3), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000102533 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136247952:136274898:1 gene:ENSMUSG00000001604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000136812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:136247729:136271304:1 gene:ENSMUSG00000001604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000143942 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:136247973:136264484:1 gene:ENSMUSG00000001604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// AJ223472 // GenBank // Mus musculus mRNA for transcription elongation factor TFIIS.h. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC010807 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor A (SII), 3, mRNA (cDNA clone MGC:18902 IMAGE:4240584), complete cds. // chr4 // 90 // 91 // 28 // 31 // 0 /// D83387 // GenBank // Mus musculus SII-K1 mRNA for tissue-specific transcription factor S-II, complete cds. // chr4 // 90 // 85 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136248049:136340028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// D00926 // GenBank // Mus musculus mRNA for transcription factor S-II-related protein, partial cds. // chr4 // 85 // 59 // 17 // 20 // 0
NM_009557 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 46 (Zfp46), mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000069195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136286067:136293942:1 gene:ENSMUSG00000051351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000130658 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:136286104:136290248:1 gene:ENSMUSG00000051351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC006587 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 46, mRNA (cDNA clone MGC:6166 IMAGE:3587306), complete cds. // chr4 // 88 // 50 // 14 // 16 // 0 /// BC092398 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 46, mRNA (cDNA clone IMAGE:6417617), partial cds. // chr4 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// M98502 // GenBank // Mus musculus protein encoding twelve zinc finger proteins (pMLZ-4) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000144217 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:136284683:136290327:1 gene:ENSMUSG00000051351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENSMUST00000084593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:136462250:136463977:1 gene:ENSMUSG00000066178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK031509 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030445D17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
ENSMUST00000046647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136610437:136613226:1 gene:ENSMUSG00000036921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048442 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930549C01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58147 IMAGE:6704947), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001243262 // RefSeq // Mus musculus lactamase, beta-like 1 (Lactbl1), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000178843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:136622621:136639110:1 gene:ENSMUSG00000070683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC029684 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC029684, mRNA (cDNA clone IMAGE:5363965), partial cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC028950 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC029684, mRNA (cDNA clone IMAGE:5363310), partial cds. // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000007422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:136616527:136638084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_009523 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 4 (Wnt4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000045747 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:137277489:137299726:1 gene:ENSMUSG00000036856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC101962 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 4, mRNA (cDNA clone MGC:123964 IMAGE:40044945), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC103560 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 4, mRNA (cDNA clone MGC:123962 IMAGE:40044943), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC103561 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 4, mRNA (cDNA clone MGC:123963 IMAGE:40044944), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC103562 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 4, mRNA (cDNA clone MGC:123965 IMAGE:40044946), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// M89797 // GenBank // Mouse Wnt-4 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK012727 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810012H16 product:WNT-4 PROTEIN PRECURSOR, full insert sequence. // chr4 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:137277680:137296779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_009523 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 4 (Wnt4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045747 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:137277489:137299726:1 gene:ENSMUSG00000036856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027063 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700013G24 gene (1700013G24Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:137453284:137455461:1 gene:ENSMUSG00000041399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:137447591:137455396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_008305 // RefSeq // Mus musculus perlecan (heparan sulfate proteoglycan 2) (Hspg2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 98 // 98 // 0 /// XM_006538574 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus perlecan (heparan sulfate proteoglycan 2) (Hspg2), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 64 // 64 // 0 /// ENSMUST00000030547 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:137468769:137570630:1 gene:ENSMUSG00000028763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 98 // 98 // 0 /// ENSMUST00000171332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:137468803:137570629:1 gene:ENSMUSG00000028763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 98 // 98 // 0 /// GENSCAN00000007392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:137468862:137565890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 91 // 91 // 0 /// M77174 // GenBank // Mouse perlecan mRNA, complete cds. // chr4 // 83 // 86 // 70 // 84 // 0
NM_199307 // RefSeq // Mus musculus endothelin converting enzyme 1 (Ece1), mRNA. // chr4 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// XM_006538765 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endothelin converting enzyme 1 (Ece1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000102518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:137862237:137965229:1 gene:ENSMUSG00000057530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// ENSMUST00000151110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:137913471:137935387:1 gene:ENSMUSG00000057530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// AK163790 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130028N03 product:endothelin converting enzyme 1, full insert sequence. // chr4 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// BC060648 // GenBank // Mus musculus endothelin converting enzyme 1, mRNA (cDNA clone MGC:79193 IMAGE:6854311), complete cds. // chr4 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// GENSCAN00000008929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:137870391:138105725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 90 // 36 // 40 // 1
NM_001099631 // RefSeq // Mus musculus SH2 domain containing 5 (Sh2d5), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000105823 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:138250464:138261332:1 gene:ENSMUSG00000045349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000105824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:138250403:138261332:1 gene:ENSMUSG00000045349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124239 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:138250413:138257279:1 gene:ENSMUSG00000045349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000139033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138250423:138255690:1 gene:ENSMUSG00000045349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 93 // 45 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000154421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138256735:138259111:1 gene:ENSMUSG00000045349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// BC036961 // GenBank // Mus musculus SH2 domain containing 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:4505120), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// DQ832275 // GenBank // Mus musculus vascular SH2 domain-containing protein (Sh2d5) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138214106:138311983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_001190978 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 17 (Kif17), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_010623 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 17 (Kif17), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030539 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138262232:138301492:1 gene:ENSMUSG00000028758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000105818 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:138250435:138301967:1 gene:ENSMUSG00000028758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000105820 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138262499:138287162:1 gene:ENSMUSG00000028758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000105821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138262472:138301382:1 gene:ENSMUSG00000028758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AB008867 // GenBank // Mus musculus MmKIF17 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK046890 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930001E07 product:Kinesin Superfamily Protein 17, full insert sequence. // chr4 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AK122506 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1405 protein. // chr4 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000008920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138214106:138311983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_007838 // RefSeq // Mus musculus dolichyl-di-phosphooligosaccharide-protein glycotransferase (Ddost), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000030538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138304730:138312628:1 gene:ENSMUSG00000028757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC068132 // GenBank // Mus musculus dolichyl-di-phosphooligosaccharide-protein glycotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:93009 IMAGE:6808198), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// D89063 // GenBank // Mus musculus mRNA for oligosaccharyltransferase, complete cds. // chr4 // 82 // 92 // 27 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138214106:138311983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1
ENSMUST00000062902 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:138395198:138397714:1 gene:ENSMUSG00000046109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB041806 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-2457. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_026689 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ubiquitin ligase activator of NFKB 1 (Mul1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006539134 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ubiquitin ligase activator of NFKB 1 (Mul1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000044058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138434671:138442265:1 gene:ENSMUSG00000041241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000105813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138434677:138442262:1 gene:ENSMUSG00000041241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000105815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138434723:138439011:1 gene:ENSMUSG00000041241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC019516 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ubiquitin ligase activator of NFKB 1, mRNA (cDNA clone MGC:28945 IMAGE:4163969), complete cds. // chr4 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// EU935009 // GenBank // Mus musculus E3 ubiquitin ligase (Gide) mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000008912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138434760:138456788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_025451 // RefSeq // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 1 (Camk2n1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000050918 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138454314:138460123:1 gene:ENSMUSG00000046447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY523601 // GenBank // Mus musculus CaMKII inhibitor protein alpha mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138434760:138456788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_008868 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A2, group IIC (Pla2g2c), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:138725325:138744575:1 gene:ENSMUSG00000028750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138724792:138746132:1 gene:ENSMUSG00000028750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124660 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:138725325:138743694:1 gene:ENSMUSG00000028750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC029347 // GenBank // Mus musculus phospholipase A2, group IIC, mRNA (cDNA clone MGC:18412 IMAGE:4234596), complete cds. // chr4 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// U18119 // GenBank // Mus musculus testis-specific low molecular weight phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138731585:138743762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_011109 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A2, group IID (Pla2g2d), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006538657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase A2, group IID (Pla2g2d), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000030528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138775735:138782046:1 gene:ENSMUSG00000041202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000105806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138777894:138781125:1 gene:ENSMUSG00000041202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AF112983 // GenBank // Mus musculus group IID secretory phospholipase A2 (Pla2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AF124374 // GenBank // Mus musculus group IID secreted phospholipase A2 (Pla2a2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AF169407 // GenBank // Mus musculus phospholipase A2 (Splash) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF169408 // GenBank // Mus musculus non-secreted phospholipase A2 (Splash) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK004232 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110051K23 product:phospholipase A2, group IID, full insert sequence. // chr4 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// BC111806 // GenBank // Mus musculus phospholipase A2, group IID, mRNA (cDNA clone MGC:130437 IMAGE:40039182), complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138775814:138780393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_012044 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A2, group IIE (Pla2g2e), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138877942:138882817:1 gene:ENSMUSG00000028751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000105803 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:138877971:138882522:1 gene:ENSMUSG00000028751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000105804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:138879360:138882817:1 gene:ENSMUSG00000028751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF112984 // GenBank // Mus musculus secretory phospholipase A2 (Pla2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF166098 // GenBank // Mus musculus group IIE secreted phospholipase A2 (Pla2g2e) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC027524 // GenBank // Mus musculus phospholipase A2, group IIE, mRNA (cDNA clone MGC:41157 IMAGE:1533423), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138880311:138882557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_025786 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 186 (Rnf186), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000116094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:138967112:138968360:1 gene:ENSMUSG00000070661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011492 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 186, mRNA (cDNA clone MGC:19106 IMAGE:4207836), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:138967313:139058516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_025337 // RefSeq // Mus musculus aldo-keto reductase family 7, member A5 (aflatoxin aldehyde reductase) (Akr7a5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000073787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:139310744:139318426:1 gene:ENSMUSG00000028743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF525358 // GenBank // Mus musculus aldo-keto reductase (Akr7a5) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC031857 // GenBank // Mus musculus aldo-keto reductase family 7, member A5 (aflatoxin aldehyde reductase), mRNA (cDNA clone MGC:30557 IMAGE:5124841), complete cds. // chr4 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// XR_390721 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aldo-keto reductase family 7, member A5 (aflatoxin aldehyde reductase) (Akr7a5), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000029324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:139310842:139318253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001205173 // RefSeq // Mus musculus intermediate filament family orphan 2 (Iffo2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// NM_183148 // RefSeq // Mus musculus intermediate filament family orphan 2 (Iffo2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000040023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:139531689:139620379:1 gene:ENSMUSG00000041025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000123827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:139530548:139617082:1 gene:ENSMUSG00000041025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000174078 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:139574720:139620382:1 gene:ENSMUSG00000041025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// BC027170 // GenBank // Mus musculus intermediate filament family orphan 2, mRNA (cDNA clone MGC:36549 IMAGE:4952810), complete cds. // chr4 // 84 // 73 // 27 // 32 // 0 /// XM_006538691 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus intermediate filament family orphan 2 (Iffo2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 70 // 70 // 31 // 44 // 1 /// ENSMUST00000178644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:139603186:139662691:1 gene:ENSMUSG00000094439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 64 // 64 // 28 // 44 // 1 /// GENSCAN00000006625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:139593616:139616433:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0
NM_031873 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 1, member 2 (Tas1r2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000030510 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:139653538:139670280:1 gene:ENSMUSG00000028738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000166773 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:139653549:139669855:1 gene:ENSMUSG00000028738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AF337041 // GenBank // Mus musculus candidate taste receptor T1R2 (T1r2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY032623 // GenBank // Mus musculus sweet taste receptor T1R2 mRNA, complete cds. // chr4 // 67 // 77 // 16 // 24 // 0 /// BC137740 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 1, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:169364 IMAGE:8860759), complete cds. // chr4 // 74 // 74 // 17 // 23 // 0 /// BC144879 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 1, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:178435 IMAGE:9053427), complete cds. // chr4 // 74 // 74 // 17 // 23 // 0 /// ENSMUST00000178644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:139603186:139662691:1 gene:ENSMUSG00000094439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000006686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:139653569:139669796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_173867 // RefSeq // Mus musculus regulator of chromosome condensation 2 (Rcc2), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000038893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:140701473:140723220:1 gene:ENSMUSG00000040945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000071169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:140700541:140723220:1 gene:ENSMUSG00000040945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000138808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:140701473:140710470:1 gene:ENSMUSG00000040945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC086666 // GenBank // Mus musculus regulator of chromosome condensation 2, mRNA (cDNA clone MGC:109698 IMAGE:30634817), complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:140702157:140721204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0
NM_008812 // RefSeq // Mus musculus peptidyl arginine deiminase, type II (Padi2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006534676 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peptidyl arginine deiminase, type II (Padi2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000030765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:140906344:140952586:1 gene:ENSMUSG00000028927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000148160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:140924159:140932787:1 gene:ENSMUSG00000028927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// BC040350 // GenBank // Mus musculus peptidyl arginine deiminase, type II, mRNA (cDNA clone MGC:18700 IMAGE:4192742), complete cds. // chr4 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0 /// BC049947 // GenBank // Mus musculus peptidyl arginine deiminase, type II, mRNA (cDNA clone MGC:58948 IMAGE:3600978), complete cds. // chr4 // 84 // 94 // 27 // 32 // 0 /// D16580 // GenBank // Mus musculus mRNA for peptidylarginine deiminase, complete cds. // chr4 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0 /// AK168685 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920045A07 product:peptidyl arginine deiminase, type II, full insert sequence. // chr4 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1 /// GENSCAN00000047351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:140904359:140952563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000082509 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:140918684:140918799:1 gene:ENSMUSG00000064443 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT050303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023374 // RefSeq // Mus musculus succinate dehydrogenase complex, subunit B, iron sulfur (Ip) (Sdhb), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000010007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:140961203:140979193:1 gene:ENSMUSG00000009863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC013509 // GenBank // Mus musculus succinate dehydrogenase complex, subunit B, iron sulfur (Ip), mRNA (cDNA clone MGC:19177 IMAGE:4225025), complete cds. // chr4 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// BC051934 // GenBank // Mus musculus succinate dehydrogenase complex, subunit B, iron sulfur (Ip), mRNA (cDNA clone MGC:62176 IMAGE:5688898), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000125780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:140961403:140974297:1 gene:ENSMUSG00000009863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// ENSMUST00000129181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:140961401:140976796:1 gene:ENSMUSG00000009863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:140961405:140979102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_177867 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 21 (Spata21), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000051907 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141088333:141112760:1 gene:ENSMUSG00000045004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000181353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141103985:141111546:1 gene:ENSMUSG00000045004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC112427 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 21, mRNA (cDNA clone MGC:132962 IMAGE:40062127), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC113132 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 21, mRNA (cDNA clone MGC:132961 IMAGE:40062125), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141091111:141112652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000181450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:141115660:141118087:1 gene:ENSMUSG00000097620 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AK132662 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921514A10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000187076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141115660:141118087:1 gene:ENSMUSG00000097620 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_172518 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 42 (Fbxo42), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141147913:141204062:1 gene:ENSMUSG00000028920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000146768 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141147922:141195212:1 gene:ENSMUSG00000028920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC058667 // GenBank // Mus musculus F-box protein 42, mRNA (cDNA clone MGC:76409 IMAGE:6410012), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141162679:141200564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_001081174 // RefSeq // Mus musculus REM2 and RAB-like small GTPase 1 (Rsg1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000097813 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141213956:141220148:1 gene:ENSMUSG00000073733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000125175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141214445:141218674:1 gene:ENSMUSG00000073733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC147765 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330545A04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182876 IMAGE:9087490), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC147767 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330545A04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182878 IMAGE:9087492), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XR_390787 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus REM2 and RAB-like small GTPase 1 (Rsg1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000047348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141213405:141238057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT050316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NM_172520 // RefSeq // Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19 (Arhgef19), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006538704 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19 (Arhgef19), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006538706 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19 (Arhgef19), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006538707 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19 (Arhgef19), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000006618 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141242869:141257564:1 gene:ENSMUSG00000028919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC060376 // GenBank // Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19, mRNA (cDNA clone MGC:67707 IMAGE:5340007), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141246204:141256879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0
NM_010139 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor A2 (Epha2), mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000006614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141301240:141329384:1 gene:ENSMUSG00000006445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC140960 // GenBank // Mus musculus Eph receptor A2, mRNA (cDNA clone MGC:175921 IMAGE:9055572), complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// U07634 // GenBank // Mus musculus receptor-protein tyrosine kinase (eck) mRNA, complete cds. // chr4 // 74 // 89 // 25 // 34 // 0 /// XM_006538528 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Eph receptor A2 (Epha2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// ENSMUST00000149002 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141316913:141320901:1 gene:ENSMUSG00000006445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000047349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141301353:141383647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 82 // 82 // 31 // 38 // 1
NM_001085513 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 131, member C (Fam131c), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000006380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141368220:141384175:1 gene:ENSMUSG00000006218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147048 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 131, member C, mRNA (cDNA clone MGC:182182 IMAGE:9056076), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147049 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 131, member C, mRNA (cDNA clone MGC:182177 IMAGE:9056071), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141301353:141383647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_013868 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein family, member 7 (cardiovascular) (Hspb7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141420779:141425311:1 gene:ENSMUSG00000006221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF155909 // GenBank // Mus musculus cardiovascular heat shock protein mRNA, complete cds. // chr4 // 80 // 60 // 12 // 15 // 0 /// BC089584 // GenBank // Mus musculus heat shock protein family, member 7 (cardiovascular), mRNA (cDNA clone MGC:107591 IMAGE:6755510), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC046993 // GenBank // Mus musculus heat shock protein family, member 7 (cardiovascular), mRNA (cDNA clone IMAGE:6478663), partial cds. // chr4 // 63 // 76 // 12 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141420582:141424058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NR_030695 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA B330016D10 gene (B330016D10Rik), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:141546189:141547892:1 gene:ENSMUSG00000048406 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT050341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONMMUT050342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT050344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NR_033566 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI507597 (AI507597), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141614354:141615604:1 gene:ENSMUSG00000073731 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000144017 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:141614026:141615604:1 gene:ENSMUSG00000073731 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT050347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT050348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT050349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001081408 // RefSeq // Mus musculus agmatine ureohydrolase (agmatinase) (Agmat), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_390785 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus agmatine ureohydrolase (agmatinase) (Agmat), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000038161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:141746672:141759263:1 gene:ENSMUSG00000040706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC037459 // GenBank // Mus musculus agmatine ureohydrolase (agmatinase), mRNA (cDNA clone IMAGE:4162243), partial cds. // chr4 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC115693 // GenBank // Mus musculus agmatine ureohydrolase (agmatinase), mRNA (cDNA clone MGC:144633 IMAGE:40104399), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:141747005:141759071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NR_027137 // RefSeq // Mus musculus Tmem51 opposite strand 1 (Tmem51os1), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139653 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:142084856:142088077:1 gene:ENSMUSG00000073728 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000141769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:142084298:142088099:1 gene:ENSMUSG00000073728 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000150202 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:142084340:142088052:1 gene:ENSMUSG00000073728 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000153023 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:142083972:142088059:1 gene:ENSMUSG00000073728 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK153738 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630066K19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT050392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT050393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT050394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT050395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000119886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:143152572:143153030:1 gene:ENSMUSG00000081838 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:143152573:143156125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT050424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001162983 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 38 (Lrrc38), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:143349757:143371032:1 gene:ENSMUSG00000028584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181564 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143349757:143371032:1 gene:ENSMUSG00000097351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_406763 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 38 (Lrrc38), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// XM_006544862 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 38 (Lrrc38), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:143350169:143370017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000056901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143350169:143370017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_031377 // RefSeq // Mus musculus preferentially expressed antigen in melanoma-like 1 (Pramel1), mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006544868 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus preferentially expressed antigen in melanoma-like 1 (Pramel1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000037419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:143394428:143400160:1 gene:ENSMUSG00000041805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181019 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143394428:143400160:1 gene:ENSMUSG00000097880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF285578 // GenBank // Mus musculus preferentially expressed antigen in melanoma-like protein (Pramel1) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC131995 // GenBank // Mus musculus preferentially expressed antigen in melanoma-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:163626 IMAGE:40130272), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC132399 // GenBank // Mus musculus preferentially expressed antigen in melanoma-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:164030 IMAGE:40130676), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006544869 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus preferentially expressed antigen in melanoma-like 1 (Pramel1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:143396659:143413041:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000056893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143396659:143413041:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_172877 // RefSeq // Mus musculus PRAME family member 8 (Pramef8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:143412987:143421091:1 gene:ENSMUSG00000046862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000059790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:143412426:143421091:1 gene:ENSMUSG00000046862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:143413009:143417669:1 gene:ENSMUSG00000046862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000180614 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143412987:143421091:1 gene:ENSMUSG00000097778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000180619 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143412426:143421091:1 gene:ENSMUSG00000097778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181314 // ENSEMBL // proj_havana:known chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143413009:143417669:1 gene:ENSMUSG00000097778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC056931 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4732496O08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:66535 IMAGE:6816019), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001007579 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC080695 (BC080695), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000105765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:143551700:143573797:1 gene:ENSMUSG00000070618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000105774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:143567475:143573798:1 gene:ENSMUSG00000070618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000180918 // ENSEMBL // proj_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143527062:143573797:1 gene:ENSMUSG00000097856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000181763 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:MG4136_PATCH:143567475:143573798:1 gene:ENSMUSG00000097856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC080695 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC080695, mRNA (cDNA clone MGC:91106 IMAGE:30458858), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001007077 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13023 (Gm13023), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000085144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:143789352:143795575:1 gene:ENSMUSG00000066031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000149739 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:143789365:143794759:1 gene:ENSMUSG00000066031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000139978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:143789364:143795292:1 gene:ENSMUSG00000066031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// GENSCAN00000023309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:143726001:143795312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 58 // 8 // 11 // 0 /// NONMMUT050446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_177571 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13103 (Gm13103), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000094522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:143846497:143853637:1 gene:ENSMUSG00000029451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000133334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:144404868:144406301:1 gene:ENSMUSG00000028590 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK021319 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530049N12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// NONMMUT050457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_198662 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9430007A20 gene (9430007A20Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:144519822:144529353:1 gene:ENSMUSG00000028593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:144519886:144522520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000118978 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:144587244:144588632:1 gene:ENSMUSG00000070610 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000039928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:144587244:144588632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001081248 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13177 (Gm13177), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094510 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:144613707:144623398:1 gene:ENSMUSG00000070609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:144613707:144623833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0
NM_001014397 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13154 (Gm13154), mRNA. // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000081742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:147553339:147585198:1 gene:ENSMUSG00000065999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000105739 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:145585166:145625345:1 gene:ENSMUSG00000078502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000119718 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:145585203:145625341:1 gene:ENSMUSG00000078502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// NM_001014397 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13154 (Gm13154), mRNA. // chr4 // 57 // 67 // 8 // 14 // 0 /// ENSMUST00000081742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:147553339:147585198:1 gene:ENSMUSG00000065999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 67 // 8 // 14 // 0
NM_001103158 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13242 (Gm13242), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000105738 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:145670685:145704441:1 gene:ENSMUSG00000058186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000180014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:145696161:145702640:1 gene:ENSMUSG00000058186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
XR_391035 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 91-like (LOC102638055), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000123460 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:145868794:145899975:1 gene:ENSMUSG00000078500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000148762 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:147305674:147333734:1 gene:ENSMUSG00000078498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000166629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:145899900:145899962:1 gene:ENSMUSG00000078500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000166764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:147332407:147332469:1 gene:ENSMUSG00000078498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001177545 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 600 (Zfp600), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_001177546 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 600 (Zfp600), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000092750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:146157690:146198755:1 gene:ENSMUSG00000066007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000168483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:146156824:146198749:1 gene:ENSMUSG00000066007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001083918 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13139 (Gm13139), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000084149 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:147132038:147180579:1 gene:ENSMUSG00000067916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
AK158167 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930037G02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 59 // 76 // 13 // 22 // 0 /// AY140896 // GenBank // Mus musculus endogenous defective Murine leukemia virus LI-12 truncated pol/envelope fusion protein mRNA, complete cds. // chr4 // 54 // 97 // 15 // 28 // 0 /// BC066867 // GenBank // Mus musculus similar to Retrovirus-related POL polyprotein (Endonuclease), mRNA (cDNA clone MGC:76738 IMAGE:30462835), complete cds. // chr4 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// AK040896 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530041D01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 67 // 52 // 10 // 15 // 0 /// AY140895 // GenBank // Mus musculus endogenous defective Murine leukemia virus LI-8 gag protein mRNA, complete cds. // chr4 // 55 // 100 // 16 // 29 // 0 /// FJ654132 // GenBank // Mus musculus strain ICR clone SGT19-10 endogenous retrovirus U3 region, partial sequence. // chr4 // 54 // 97 // 15 // 28 // 0
ENSMUST00000063704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:147507600:147513420:1 gene:ENSMUSG00000078496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000105721 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:147492417:147513486:1 gene:ENSMUSG00000078496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NM_001039209 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13152 (Gm13152), mRNA. // chr4 // 71 // 52 // 10 // 14 // 0
ENSMUST00000104964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:147540218:147543500:1 gene:ENSMUSG00000078160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK054210 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230030L05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0
NM_001014397 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13154 (Gm13154), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535993 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 813-like (LOC100862460), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// XM_006535997 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 813-like (LOC100862460), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// XM_006539001 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 13154 (Gm13154), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// XM_006539004 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 13154 (Gm13154), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006539005 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 13154 (Gm13154), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000081742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:147553339:147585198:1 gene:ENSMUSG00000065999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:147553339:147582941:1 gene:ENSMUSG00000065999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_010244 // RefSeq // Mus musculus Friend virus susceptibility 1 (Fv1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094481 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:147868979:147870358:1 gene:ENSMUSG00000070583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052897 // GenBank HTC // Mus musculus Friend virus susceptibility 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30060270). // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029841 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2510039O18 gene (2510039O18Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006535980 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2510039O18 gene (2510039O18Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000103232 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:147940895:147947314:1 gene:ENSMUSG00000044496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK153761 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630078E21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AK173332 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA2013 protein. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC012878 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2510039O18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:19317 IMAGE:4190292), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:147941025:147946910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0
NM_001287348 // RefSeq // Mus musculus natriuretic peptide type B (Nppb), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_008726 // RefSeq // Mus musculus natriuretic peptide type B (Nppb), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000103231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:147985788:147987205:1 gene:ENSMUSG00000029019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061165 // GenBank // Mus musculus natriuretic peptide precursor type B, mRNA (cDNA clone MGC:74302 IMAGE:30279172), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006538627 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus natriuretic peptide type B (Nppb), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:147985976:147987061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_008725 // RefSeq // Mus musculus natriuretic peptide type A (Nppa), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000103230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148000722:148002079:1 gene:ENSMUSG00000041616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089615 // GenBank // Mus musculus natriuretic peptide precursor type A, mRNA (cDNA clone MGC:107674 IMAGE:6755676), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KC526925 // GenBank // Mus musculus natriuretic peptide precursor A variant NPPA-M1 (Nppa) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148000835:148001728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// KC526926 // GenBank // Mus musculus natriuretic peptide precursor A variant NPPA-M2 (Nppa) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// KC526927 // GenBank // Mus musculus natriuretic peptide precursor A variant NPPA-M3 (Nppa) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001161798 // RefSeq // Mus musculus 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (Mthfr), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_010840 // RefSeq // Mus musculus 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (Mthfr), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NR_027809 // RefSeq // Mus musculus 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (Mthfr), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000069604 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148041191:148059551:1 gene:ENSMUSG00000029009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000097788 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:148039077:148056206:1 gene:ENSMUSG00000029009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000152498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:148041287:148059551:1 gene:ENSMUSG00000029009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000156113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:148052678:148059548:1 gene:ENSMUSG00000029009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC051017 // GenBank // Mus musculus 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase, mRNA (cDNA clone MGC:54647 IMAGE:6308248), complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC052466 // GenBank // Mus musculus 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase, mRNA (cDNA clone MGC:63414 IMAGE:6834886), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148041597:148055588:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_176848 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 2 (Fbxo2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148160621:148166424:1 gene:ENSMUSG00000041556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140175 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230327J22 product:F-box only protein 2, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC046586 // GenBank // Mus musculus F-box protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:54895 IMAGE:6487759), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148160690:148230394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_020009 // RefSeq // Mus musculus mechanistic target of rapamycin (serine/threonine kinase) (Mtor), mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 58 // 58 // 0 /// ENSMUST00000103221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148448611:148557683:1 gene:ENSMUSG00000028991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 58 // 58 // 0 /// AF152838 // GenBank // Mus musculus FKBP-rapamycin-associated protein FRAP mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 98 // 55 // 58 // 0 /// AK158715 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230305B11 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr4 // 100 // 61 // 36 // 36 // 0 /// AK172584 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830216D04 product:FK506 binding protein 12-rapamycin associated protein 1, full insert sequence. // chr4 // 100 // 32 // 19 // 19 // 0 /// BC112904 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein 12-rapamycin associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:118056 IMAGE:6465126), complete cds. // chr4 // 100 // 98 // 58 // 58 // 0 /// GENSCAN00000036843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148452271:148492251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148507619:148530809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 14 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000049393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148533763:148556860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 19 // 19 // 0
NM_009272 // RefSeq // Mus musculus spermidine synthase (Srm), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000006611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148591503:148594619:1 gene:ENSMUSG00000006442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000152701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:148591918:148594199:1 gene:ENSMUSG00000006442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// BC005566 // GenBank // Mus musculus spermidine synthase, mRNA (cDNA clone MGC:11495 IMAGE:3966710), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// L19311 // GenBank // Mouse spermidine synthase mRNA, complete cds. // chr4 // 86 // 95 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000049387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148558468:148614521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
XM_006535941 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 572 (Gm572), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// XM_006535943 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 572 (Gm572), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// XM_006538817 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 572 (Gm572), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// NM_001085505 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 572 (Gm572), mRNA. // chr4 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// ENSMUST00000105698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148643317:148671572:1 gene:ENSMUSG00000070577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000049434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148654870:148670959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_001159344 // RefSeq // Mus musculus castor zinc finger 1 (Casz1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// NM_027195 // RefSeq // Mus musculus castor zinc finger 1 (Casz1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000094464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148804429:148945129:1 gene:ENSMUSG00000028977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000122222 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148804429:148954889:1 gene:ENSMUSG00000028977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// BC075673 // GenBank // Mus musculus castor homolog 1, zinc finger (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:30549707). // chr4 // 100 // 69 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000139806 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:148933114:148940511:1 gene:ENSMUSG00000028977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1 /// AK138981 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530041J12 product:DJ734G22.1.1 (Novel protein (FLJ20321) (Isoform 1)) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1 /// BC035954 // GenBank // Mus musculus castor homolog 1, zinc finger (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:4911231), complete cds. // chr4 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1 /// GENSCAN00000049424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148898820:148952571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 40 // 40 // 0
NONMMUT050613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
AK052616 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630005H08 product:Hypothetical zinc finger, full insert sequence. // chr4 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NM_001159344 // RefSeq // Mus musculus castor zinc finger 1 (Casz1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// ENSMUST00000122222 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:148804429:148954889:1 gene:ENSMUSG00000028977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// BC035954 // GenBank // Mus musculus castor homolog 1, zinc finger (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:4911231), complete cds. // chr4 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// GENSCAN00000049424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:148898820:148952571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1
NM_001025296 // RefSeq // Mus musculus DNA fragmentation factor, alpha subunit (Dffa), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_010044 // RefSeq // Mus musculus DNA fragmentation factor, alpha subunit (Dffa), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:149104146:149120647:1 gene:ENSMUSG00000028974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AB009375 // GenBank // Mus musculus mRNA for ICAD-L, complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AB009376 // GenBank // Mus musculus mRNA for ICAD-S, complete cds. // chr4 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// BC058213 // GenBank // Mus musculus DNA fragmentation factor, alpha subunit, mRNA (cDNA clone MGC:68183 IMAGE:5367607), complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000103216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:149104146:149118870:1 gene:ENSMUSG00000028974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// NR_104263 // RefSeq // Mus musculus DNA fragmentation factor, alpha subunit (Dffa), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr4 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000049389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:149104251:149119291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_026963 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper and CTNNBIP1 domain containing (Lzic), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006539153 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine zipper and CTNNBIP1 domain containing (Lzic), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030842 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:149485294:149496668:1 gene:ENSMUSG00000028990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC023174 // GenBank // Mus musculus leucine zipper and CTNNBIP1 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:37142 IMAGE:4952948), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// DQ058008 // GenBank // Mus musculus leucine zipper and ICAT homologous domain protein (Lzic) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// XM_006539152 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine zipper and CTNNBIP1 domain containing (Lzic), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000141293 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:149485231:149488150:1 gene:ENSMUSG00000028990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// AK161071 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4731401I04 product:leucine zipper and CTNNBIP1 domain containing, full insert sequence. // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000049419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:149478603:149496138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001141930 // RefSeq // Mus musculus catenin beta interacting protein 1 (Ctnnbip1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NM_023465 // RefSeq // Mus musculus catenin beta interacting protein 1 (Ctnnbip1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:149518236:149566437:1 gene:ENSMUSG00000028988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000105692 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:149545117:149564508:1 gene:ENSMUSG00000028988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AB021261 // GenBank // Mus musculus mRNA for beta-catenin-interacting protein ICAT, complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC038253 // GenBank // Mus musculus catenin beta interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:46802 IMAGE:4974951), complete cds. // chr4 // 81 // 70 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:149534174:149566226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0
NM_001290989 // RefSeq // Mus musculus calsyntenin 1 (Clstn1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NM_023051 // RefSeq // Mus musculus calsyntenin 1 (Clstn1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000039144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:149586638:149647899:1 gene:ENSMUSG00000039953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000105691 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:149586468:149648899:1 gene:ENSMUSG00000039953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// BC053843 // GenBank // Mus musculus calsyntenin 1, mRNA (cDNA clone MGC:54504 IMAGE:6315355), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000047194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:149606056:149647564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000082864 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:149817732:149817840:1 gene:ENSMUSG00000064798 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT050682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NR_029751 // RefSeq // Mus musculus microRNA 34a (Mir34a), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083559 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:150068454:150068555:1 gene:ENSMUSG00000065493 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-34a // miRBase Micro RNA Database // MI0000584 Mus musculus miR-34a stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177366 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 157 (Gpr157), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006538922 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 157 (Gpr157), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000094451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:150087365:150105927:1 gene:ENSMUSG00000047875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK089429 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730027I11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC117996 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 157, mRNA (cDNA clone MGC:143975 IMAGE:40095824), complete cds. // chr4 // 89 // 70 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:150087754:150102409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_019741 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 5 (Slc2a5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006539075 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 5 (Slc2a5), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:150119283:150144169:1 gene:ENSMUSG00000028976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000132426 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:150139352:150142253:1 gene:ENSMUSG00000028976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000136610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:150128946:150140039:1 gene:ENSMUSG00000028976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000151504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:150139553:150142838:1 gene:ENSMUSG00000028976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AF161071 // GenBank // Mus musculus fructose transporter GLUT5 mRNA, complete cds. // chr4 // 83 // 80 // 20 // 24 // 0 /// BC023500 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:32452 IMAGE:5043284), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:150120736:150143231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NM_001085529 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 7 (Slc2a7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:150148972:150168482:1 gene:ENSMUSG00000062064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:150148972:150168482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000080149 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:150243486:150248873:1 gene:ENSMUSG00000063524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK186626 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0138B14, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000018441, based on BLAT search. // chr4 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// BC056611 // GenBank // Mus musculus enolase 1, alpha non-neuron, mRNA (cDNA clone MGC:68413 IMAGE:4948983), complete cds. // chr4 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// NM_023119 // RefSeq // Mus musculus enolase 1, alpha non-neuron (Eno1), mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// XM_006538525 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus enolase 1, alpha non-neuron (Eno1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// ENSMUST00000080926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:150236952:150248879:1 gene:ENSMUSG00000063524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// BC039179 // GenBank // Mus musculus enolase 1, alpha non-neuron, mRNA (cDNA clone MGC:25104 IMAGE:4501041), complete cds. // chr4 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// BC083334 // GenBank // Mus musculus enolase 1, alpha non-neuron, mRNA (cDNA clone MGC:102044 IMAGE:6414729), complete cds. // chr4 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
NM_001085492 // RefSeq // Mus musculus arginine glutamic acid dipeptide (RE) repeats (Rere), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006537085 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus arginine glutamic acid dipeptide (RE) repeats (Rere), transcript variant X11, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// XM_006539136 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus arginine glutamic acid dipeptide (RE) repeats (Rere), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006539146 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus arginine glutamic acid dipeptide (RE) repeats (Rere), transcript variant X11, mRNA. // chr4 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// XM_006539147 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus arginine glutamic acid dipeptide (RE) repeats (Rere), transcript variant X12, mRNA. // chr4 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000105680 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:150488393:150621962:1 gene:ENSMUSG00000039852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000105682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:150281646:150621966:1 gene:ENSMUSG00000039852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC145182 // GenBank // Mus musculus arginine glutamic acid dipeptide (RE) repeats, mRNA (cDNA clone IMAGE:9053733), complete cds. // chr4 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// AK122287 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0458 protein. // chr4 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// GENSCAN00000032481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:150595459:150621643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 45 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:150406340:150518288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0
NM_133753 // RefSeq // Mus musculus ERBB receptor feedback inhibitor 1 (Errfi1), mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:150855073:150868887:1 gene:ENSMUSG00000028967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:150853919:150868892:1 gene:ENSMUSG00000028967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK212670 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0125L18, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000030811, based on BLAT search. // chr4 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC005546 // GenBank // Mus musculus ERBB receptor feedback inhibitor 1, mRNA (cDNA clone MGC:6714 IMAGE:3585640), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC057646 // GenBank // Mus musculus ERBB receptor feedback inhibitor 1, mRNA (cDNA clone MGC:67908 IMAGE:4194124), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:150865148:150867502:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000082542 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:150964735:150964894:1 gene:ENSMUSG00000064476 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT050744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011910 // RefSeq // Mus musculus urotensin 2 (Uts2), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:150997097:151001810:1 gene:ENSMUSG00000028963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AF172175 // GenBank // Mus musculus urotensin II precursor, mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// AY065984 // GenBank // Mus musculus urotensin-II mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC107299 // GenBank // Mus musculus urotensin 2, mRNA (cDNA clone MGC:130253 IMAGE:40053156), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC107300 // GenBank // Mus musculus urotensin 2, mRNA (cDNA clone MGC:130254 IMAGE:40053161), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:150997076:151000778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
XR_406167 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102631977 (LOC102631977), transcript variant X1, ncRNA. // chr4 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// AK020331 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230110K08 product:hypothetical HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain (A+T-hook) containing protein, full insert sequence. // chr4 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// KnowTID_00005350 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT050772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033352 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 21 (Klhl21), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097773 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:152008803:152017680:1 gene:ENSMUSG00000073700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC141158 // GenBank // Mus musculus kelch-like 21 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:176119 IMAGE:9055770), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC141159 // GenBank // Mus musculus kelch-like 21 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:176120 IMAGE:9055771), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:152008943:152015628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_008236 // RefSeq // Mus musculus hairy and enhancer of split 2 (Drosophila) (Hes2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:152158867:152162469:1 gene:ENSMUSG00000028940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152159549:152160600:1 gene:ENSMUSG00000028940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC138112 // GenBank // Mus musculus hairy and enhancer of split 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169736 IMAGE:8861131), complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006538549 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hairy and enhancer of split 2 (Drosophila) (Hes2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:152159669:152178659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_178406 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 153 (Gpr153), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000055754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152279012:152285337:1 gene:ENSMUSG00000042804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000105650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152274232:152285337:1 gene:ENSMUSG00000042804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000105651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:152274362:152285337:1 gene:ENSMUSG00000042804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC029098 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 153, mRNA (cDNA clone MGC:28925 IMAGE:3481871), complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC037650 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 153, mRNA (cDNA clone MGC:47166 IMAGE:5151632), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:152279125:152283589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NM_133788 // RefSeq // Mus musculus isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (Icmt), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// NR_037908 // RefSeq // Mus musculus isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (Icmt), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000048892 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:152297227:152307121:1 gene:ENSMUSG00000039662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000151372 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152297304:152307120:1 gene:ENSMUSG00000039662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// BC057132 // GenBank // Mus musculus isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase, mRNA (cDNA clone IMAGE:6827580), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// BC110695 // GenBank // Mus musculus isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:118506 IMAGE:6842587), complete cds. // chr4 // 94 // 78 // 30 // 32 // 0 /// ENSMUST00000125617 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152297656:152300754:1 gene:ENSMUSG00000039662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 44 // 44 // 18 // 41 // 1 /// GENSCAN00000048307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:152297374:152303204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 39 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT050794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 44 // 44 // 18 // 41 // 1
NM_001277113 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L22 (Rpl22), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// NM_001277114 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L22 (Rpl22), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NM_009079 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L22 (Rpl22), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NR_102291 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L22 (Rpl22), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NR_102292 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L22 (Rpl22), transcript variant 5, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000139685 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:152325867:152334071:1 gene:ENSMUSG00000028936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000142735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152325742:152332476:1 gene:ENSMUSG00000028936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// BC021344 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L22, mRNA (cDNA clone MGC:29121 IMAGE:4190569), complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// BC096390 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L22, mRNA (cDNA clone MGC:106868 IMAGE:1179671), complete cds. // chr4 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000188151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:152325869:152334070:1 gene:ENSMUSG00000028936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT050802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001081376 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 5 (Chd5), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NM_029216 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 5 (Chd5), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000005175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152338887:152390181:1 gene:ENSMUSG00000005045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000030775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:152338651:152390194:1 gene:ENSMUSG00000005045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000124423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152372142:152390181:1 gene:ENSMUSG00000005045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000164662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:152338651:152390194:1 gene:ENSMUSG00000005045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// BC098195 // GenBank // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:6847152), complete cds. // chr4 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000048304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:152338952:152387466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0
NM_153424 // RefSeq // Mus musculus nephronophthisis 4 (juvenile) homolog (human) (Nphp4), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000056567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152484370:152563047:1 gene:ENSMUSG00000039577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000081393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:152478142:152563183:1 gene:ENSMUSG00000039577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000142027 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:152476706:152563049:1 gene:ENSMUSG00000039577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AF537131 // GenBank // Mus musculus nephronophthisis 4 (Nphp4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AY118229 // GenBank // Mus musculus nephrocystin-4 (Nphp4) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// BC138370 // GenBank // Mus musculus nephronophthisis 4 (juvenile) homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:169995 IMAGE:8861390), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:152533955:152570523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NR_033138 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 833 (Gm833), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000143133 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:152697540:152700515:1 gene:ENSMUSG00000073699 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC147046 // GenBank // Mus musculus gene model 833, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182153 IMAGE:9056047), complete cds. // chr4 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC147047 // GenBank // Mus musculus gene model 833, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182147 IMAGE:9056041), complete cds. // chr4 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT050818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001163019 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A430005L14 gene (A430005L14Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NM_175287 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A430005L14 gene (A430005L14Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000058393 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:153957237:153961925:1 gene:ENSMUSG00000047613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000105645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:153957237:153961918:1 gene:ENSMUSG00000047613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000141493 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:153957266:153961511:1 gene:ENSMUSG00000047613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000147826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:153957266:153961803:1 gene:ENSMUSG00000047613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// BC052148 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A430005L14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58612 IMAGE:6706797), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000139967 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:153957255:153960066:1 gene:ENSMUSG00000047613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONMMUT050844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_177673 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 104 (Cep104), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000047497 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:153975194:154008732:1 gene:ENSMUSG00000039523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000183790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:153988467:154008732:1 gene:ENSMUSG00000039523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 54 // 22 // 22 // 0 /// AK129163 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0562 protein. // chr4 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// BC046331 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC046331, mRNA (cDNA clone MGC:54921 IMAGE:6485859), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000024158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:153978983:154007302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0
NM_201226 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 47 (Lrrc47), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:154011803:154021512:1 gene:ENSMUSG00000029028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000142794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:154017414:154019070:1 gene:ENSMUSG00000029028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000169622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:154011731:154021513:1 gene:ENSMUSG00000029028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC094573 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 47, mRNA (cDNA clone MGC:106431 IMAGE:30354494), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC138462 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 47, mRNA (cDNA clone MGC:170087 IMAGE:8861482), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC138463 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 47, mRNA (cDNA clone MGC:170088 IMAGE:8861483), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000167947 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:154018953:154020891:1 gene:ENSMUSG00000029028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000024165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154011816:154019876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT050847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_021499 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 8 (Wdr8), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XR_390776 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat containing, antisense to Trp73 (Wrap73), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:154142372:154156816:1 gene:ENSMUSG00000029029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000142665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:154142409:154156816:1 gene:ENSMUSG00000029029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AB034911 // GenBank // Mus musculus DD57 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AK160331 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330120I09 product:WD repeat domain 8, full insert sequence. // chr4 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// ENSMUST00000146734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:154151692:154155280:1 gene:ENSMUSG00000029029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// GENSCAN00000024166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154142445:154156680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0
NM_001162977 // RefSeq // Mus musculus multiple EGF-like-domains 6 (Megf6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:154170730:154275713:1 gene:ENSMUSG00000057751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC027243 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3496488, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001162977 // RefSeq // Mus musculus multiple EGF-like-domains 6 (Megf6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006538827 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus multiple EGF-like-domains 6 (Megf6), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000030897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:154170730:154275713:1 gene:ENSMUSG00000057751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000152159 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:154237525:154271739:1 gene:ENSMUSG00000057751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154237718:154274297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC027243 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3496488, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001162977 // RefSeq // Mus musculus multiple EGF-like-domains 6 (Megf6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538827 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus multiple EGF-like-domains 6 (Megf6), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:154170730:154275713:1 gene:ENSMUSG00000057751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152159 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:154237525:154271739:1 gene:ENSMUSG00000057751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:154249296:154252217:1 gene:ENSMUSG00000057751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154237718:154274297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001162977 // RefSeq // Mus musculus multiple EGF-like-domains 6 (Megf6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538827 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus multiple EGF-like-domains 6 (Megf6), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:154170730:154275713:1 gene:ENSMUSG00000057751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152159 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:154237525:154271739:1 gene:ENSMUSG00000057751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154237718:154274297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001162977 // RefSeq // Mus musculus multiple EGF-like-domains 6 (Megf6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006538827 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus multiple EGF-like-domains 6 (Megf6), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:154170730:154275713:1 gene:ENSMUSG00000057751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000152159 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:154237525:154271739:1 gene:ENSMUSG00000057751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK185070 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0132I06, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000030897, based on BLAT search. // chr4 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000024169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154237718:154274297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000181143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:154336127:154349918:1 gene:ENSMUSG00000097871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK140029 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230104I21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT050882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_172878 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 34 (Ttc34), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000050220 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:154856200:154867125:1 gene:ENSMUSG00000046637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC068299 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B230396O12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:76433 IMAGE:30094917), complete cds. // chr4 // 82 // 93 // 23 // 28 // 0 /// XM_006538865 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 34 (Ttc34), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// XM_006538866 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 34 (Ttc34), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// ENSMUST00000137684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:154860552:154861637:1 gene:ENSMUSG00000046637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000010309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154838737:154865783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
NM_010419 // RefSeq // Mus musculus hairy and enhancer of split 5 (Drosophila) (Hes5), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:154960923:154962371:1 gene:ENSMUSG00000048001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:154960971:154961406:1 gene:ENSMUSG00000048001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC099863 // GenBank // Mus musculus hairy and enhancer of split 5 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:123443 IMAGE:40039952), complete cds. // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC099864 // GenBank // Mus musculus hairy and enhancer of split 5 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:123442 IMAGE:40039951), complete cds. // chr4 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// BC099865 // GenBank // Mus musculus hairy and enhancer of split 5 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:123441 IMAGE:40039949), complete cds. // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC103539 // GenBank // Mus musculus hairy and enhancer of split 5 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:123440 IMAGE:40039948), complete cds. // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000010285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:154960996:154961675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000097750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155042046:155045422:1 gene:ENSMUSG00000073686 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK144422 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630065F20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001042407 // RefSeq // Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 10 (Pex10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000103180 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155067016:155072433:1 gene:ENSMUSG00000029047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000123395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155067054:155068881:1 gene:ENSMUSG00000029047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000125432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155067057:155072181:1 gene:ENSMUSG00000029047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155067059:155069116:1 gene:ENSMUSG00000029047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC147304 // GenBank // Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 10, mRNA (cDNA clone MGC:182478 IMAGE:9056372), complete cds. // chr4 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC147305 // GenBank // Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 10, mRNA (cDNA clone MGC:182480 IMAGE:9056374), complete cds. // chr4 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155067059:155068023:1 gene:ENSMUSG00000029047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155016416:155071773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONMMUT050928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001159637 // RefSeq // Mus musculus NAD kinase (Nadk), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_138671 // RefSeq // Mus musculus NAD kinase (Nadk), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155562378:155590997:1 gene:ENSMUSG00000029063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000105612 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:155582495:155591001:1 gene:ENSMUSG00000029063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000105613 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155563700:155591001:1 gene:ENSMUSG00000029063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000152297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155586777:155589620:1 gene:ENSMUSG00000029063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// AK164862 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930030A09 product:Putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase (EC 2.7.1.23) (Poly(P)/ATP NAD kinase) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC004012 // GenBank // Mus musculus NAD kinase, mRNA (cDNA clone MGC:7589 IMAGE:3493623), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155563792:155589475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK150421 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830007D19 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr4 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_177186 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member E2 (Slc35e2), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006538953 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 35, member E2 (Slc35e2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000043829 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155601611:155620090:1 gene:ENSMUSG00000042202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000105608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155601416:155623340:1 gene:ENSMUSG00000042202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000118607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155601944:155619319:1 gene:ENSMUSG00000042202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// BC058728 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A530082C11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:73489 IMAGE:6407259), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT050970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000008967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155609998:155649784:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_178699 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA B930041F14 gene (B930041F14Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099265 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:155694342:155696481:1 gene:ENSMUSG00000074738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026899 // RefSeq // Mus musculus Ssu72 RNA polymerase II CTD phosphatase homolog (yeast) (Ssu72), mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000030905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155704800:155733879:1 gene:ENSMUSG00000029038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000105595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155705135:155732189:1 gene:ENSMUSG00000029038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC016544 // GenBank // Mus musculus Ssu72 RNA polymerase II CTD phosphatase homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:27889 IMAGE:3497878), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000008916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155728354:155733574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NR_027971 // RefSeq // Mus musculus ATPase family, AAA domain containing 3A, opposite strand (Atad3aos), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_027972 // RefSeq // Mus musculus ATPase family, AAA domain containing 3A, opposite strand (Atad3aos), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000067628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155761192:155762260:1 gene:ENSMUSG00000054514 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000150777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155761221:155763560:1 gene:ENSMUSG00000054514 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT050990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT050991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_207678 // RefSeq // Mus musculus cyclin L2 (Ccnl2), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000030944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155812489:155824543:1 gene:ENSMUSG00000029068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000126346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155813497:155824303:1 gene:ENSMUSG00000029068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000129850 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155812519:155821872:1 gene:ENSMUSG00000029068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 95 // 59 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000139066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155812501:155824543:1 gene:ENSMUSG00000029068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY337018 // GenBank // Mus musculus cyclin L2 variant YLJ002 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC023747 // GenBank // Mus musculus cyclin L2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5353815). // chr4 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// BC132295 // GenBank // Mus musculus cyclin L2, mRNA (cDNA clone MGC:163926 IMAGE:40130572), complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// U37351 // GenBank // Mus musculus Paneth cell enhanced expression PCEE mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 41 // 13 // 14 // 0 /// AK029033 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732483F24 product:CYCLIN ANIA-6B (1810019L15RIK PROTEIN) (FRAGMENT) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr4 // 95 // 59 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000008960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155812528:155832992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
NM_028020 // RefSeq // Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 3-like (Cpsf3l), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006539195 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 3-like (Cpsf3l), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000030901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155869546:155889103:1 gene:ENSMUSG00000029034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000120794 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:155869546:155888685:1 gene:ENSMUSG00000029034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000134678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155869546:155888699:1 gene:ENSMUSG00000029034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000156460 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155869615:155886919:1 gene:ENSMUSG00000029034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// BC008240 // GenBank // Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 3-like, mRNA (cDNA clone MGC:11978 IMAGE:3601302), complete cds. // chr4 // 83 // 51 // 15 // 18 // 0 /// BC011155 // GenBank // Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 3-like, mRNA (cDNA clone MGC:19086 IMAGE:4195656), complete cds. // chr4 // 82 // 94 // 27 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155871214:155888685:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
NM_001039157 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2J 2 (Ube2j2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// NM_001039158 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2J 2 (Ube2j2), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// NM_001284312 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2J 2 (Ube2j2), transcript variant 5, mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// NM_021402 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2J 2 (Ube2j2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000024056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155943850:155959604:1 gene:ENSMUSG00000023286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000166489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:155943831:155959604:1 gene:ENSMUSG00000023286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// XM_006538536 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2J 2 (Ube2j2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_026125 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 132, member A (Fam132a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000024338 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:155962318:155966629:1 gene:ENSMUSG00000023571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000127222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155965097:155966621:1 gene:ENSMUSG00000023571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000149558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:155964561:155965182:1 gene:ENSMUSG00000023571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC026939 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 132, member A, mRNA (cDNA clone MGC:25716 IMAGE:3966551), complete cds. // chr4 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// DQ002404 // GenBank // Mus musculus C1qTNF12 (C1qtnf12) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:155962579:155966502:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT051027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT051028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0
NM_011659 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4 (Tnfrsf4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006538725 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4 (Tnfrsf4), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000030952 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:156013843:156016612:1 gene:ENSMUSG00000029075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:156013856:156016599:1 gene:ENSMUSG00000029075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC139239 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:170866 IMAGE:8862261), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC139266 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:170893 IMAGE:8862288), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:156013874:156016432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT051033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001220499 // RefSeq // Mus musculus ring finger 223 (Rnf223), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000097730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:156130513:156133415:1 gene:ENSMUSG00000073672 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK137636 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930005F22 product:hypothetical Zn-finger, RING/Zinc finger RING-type profile containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:156069079:156132937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT051057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028097 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 68 (Tmem68), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538268 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 68 (Tmem68), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XR_390344 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 68 (Tmem68), transcript variant X4, misc_RNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000029891 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:3549041:3574853:-1 gene:ENSMUSG00000028232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000154922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:3549041:3574809:-1 gene:ENSMUSG00000028232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK088600 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430021C22 product:RIKEN cDNA 2010300G19 gene, full insert sequence. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC016240 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 68, mRNA (cDNA clone MGC:28839 IMAGE:4506688), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:3550475:3578770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000068663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:3806635:3808751:-1 gene:ENSMUSG00000055216 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK034690 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430025C20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT045981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_026147 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein S20 (Rps20), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000103009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:3834473:3835488:-1 gene:ENSMUSG00000028234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:3831334:3835665:-1 gene:ENSMUSG00000028234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC011323 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein S20, mRNA (cDNA clone MGC:7167 IMAGE:3257215), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC090389 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein S20, mRNA (cDNA clone MGC:102408 IMAGE:3482252), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_406472 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4997 (Gm4997), misc_RNA. // chr4 // 40 // 89 // 10 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:3834470:3835233:-1 gene:ENSMUSG00000028234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000013954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:3834501:3857496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT045984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
NM_020021 // RefSeq // Mus musculus Moloney sarcoma oncogene (Mos), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:3870657:3872105:-1 gene:ENSMUSG00000078365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137690 // GenBank // Mus musculus Moloney sarcoma oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:169314 IMAGE:8860709), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC145745 // GenBank // Mus musculus Moloney sarcoma oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:175632 IMAGE:40131048), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:3870783:3900794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_181989 // RefSeq // Mus musculus short chain dehydrogenase/reductase family 16C, member 5 (Sdr16c5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040925 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:3995936:4019663:-1 gene:ENSMUSG00000028236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK136508 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130011N19 product:Short chain dehydrogenase reductase 9, full insert sequence. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AY277588 // GenBank // Mus musculus short chain dehydrogenase reductase 9 (Scdr9) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104134 // GenBank // Mus musculus short chain dehydrogenase/reductase family 16C, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:124012 IMAGE:40045268), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104135 // GenBank // Mus musculus short chain dehydrogenase/reductase family 16C, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:124013 IMAGE:40045269), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:4005497:4076897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001080710 // RefSeq // Mus musculus short chain dehydrogenase/reductase family 16C, member 6 (Sdr16c6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006537894 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus short chain dehydrogenase/reductase family 16C, member 6 (Sdr16c6), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000095151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:4055929:4076931:-1 gene:ENSMUSG00000071019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000108383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:4055931:4077522:-1 gene:ENSMUSG00000071019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC125450 // GenBank // Mus musculus short chain dehydrogenase/reductase family 16C, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:159153 IMAGE:40129965), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC125452 // GenBank // Mus musculus short chain dehydrogenase/reductase family 16C, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:159155 IMAGE:40129967), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000001848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:4005497:4076897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0
NM_001002927 // RefSeq // Mus musculus preproenkephalin (Penk), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:4133531:4138477:-1 gene:ENSMUSG00000045573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:4134112:4138819:-1 gene:ENSMUSG00000045573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// BC049766 // GenBank // Mus musculus preproenkephalin 1, mRNA (cDNA clone MGC:58856 IMAGE:6774387), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M13227 // GenBank // Mouse enkephalin mRNA. // chr4 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// M55181 // GenBank // Mouse spermatogenic-specific proenkephalin mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:4133839:4138143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_001277919 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11780 (Gm11780), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000136880 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:4528204:4528719:-1 gene:ENSMUSG00000085155 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:4528204:4528719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_177730 // RefSeq // Mus musculus inositol monophosphatase domain containing 1 (Impad1), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000084949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:4762484:4793355:-1 gene:ENSMUSG00000066324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC048776 // GenBank // Mus musculus inositol monophosphatase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:54785 IMAGE:6439769), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC138209 // GenBank // Mus musculus inositol monophosphatase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:169833 IMAGE:8861228), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC145952 // GenBank // Mus musculus inositol monophosphatase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:175839 IMAGE:40131255), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:4723951:4793094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_007824 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 7, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp7a1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006537603 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 7, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp7a1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:6265612:6275631:-1 gene:ENSMUSG00000028240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC130261 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 7, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:161343 IMAGE:40142789), complete cds. // chr4 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:6268212:6290069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
AK033377 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430417B06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0 /// NONMMUT046046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_007592 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 8 (Car8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000066674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:8143362:8239041:-1 gene:ENSMUSG00000041261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC010773 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 8, mRNA (cDNA clone MGC:18643 IMAGE:4216498), complete cds. // chr4 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// EU234006 // GenBank // Mus musculus clone ASL1-Car8 LINE L1 ASL1/Car8 fusion mRNA sequence. // chr4 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// X61397 // GenBank // Mouse mRNA for carbonic anhydrase-related polypeptide. // chr4 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:8169631:8204456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// GENSCAN00000020629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:8220548:8276533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
ENSMUST00000116110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:8166894:8167353:-1 gene:ENSMUSG00000079993 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000020627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:8166979:8167353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 90 // 15 // 18 // 0
ENSMUST00000118311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:8456166:8456498:-1 gene:ENSMUSG00000082151 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006543834 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 11810 (Gm11810), mRNA. // chr4 // 67 // 100 // 10 // 15 // 0 /// NONMMUT046092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000082764 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:9695645:9695807:-1 gene:ENSMUSG00000064698 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT046140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_004448 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930448K20 gene (4930448K20Rik), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000120570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:9916638:9917635:-1 gene:ENSMUSG00000082843 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000182072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:9915965:9917397:-1 gene:ENSMUSG00000082843 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// AK005798 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700009K09 product:similar to GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE DEHYDROGENASE (FRAGMENT) [Canis familiaris], full insert sequence. // chr4 // 60 // 87 // 12 // 20 // 0
U15647 // GenBank // Mus musculus (ORF 1) and reverse transcriptase (ORF 2) genes, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSMUST00000119515 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:10438815:10439743:-1 gene:ENSMUSG00000084215 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000034822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:10438815:10439743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_175175 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family F (with FYVE domain) member 2 (Plekhf2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:10988662:11007676:-1 gene:ENSMUSG00000049969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC016134 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family F (with FYVE domain) member 2, mRNA (cDNA clone MGC:28979 IMAGE:4503757), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC039276 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family F (with FYVE domain) member 2, mRNA (cDNA clone MGC:36376 IMAGE:4987735), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001085493 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6 (Ndufaf6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006538355 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6 (Ndufaf6), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// XM_006538356 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6 (Ndufaf6), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006538357 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6 (Ndufaf6), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000058183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:11051045:11076204:-1 gene:ENSMUSG00000050323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000124607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:11059073:11076149:-1 gene:ENSMUSG00000050323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 89 // 56 // 16 // 18 // 0 /// ENSMUST00000126468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:11051213:11076149:-1 gene:ENSMUSG00000050323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// BC048539 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310030N02 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6539873). // chr4 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000154122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:11062052:11076183:-1 gene:ENSMUSG00000050323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000009230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:11016403:11110580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000118393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:11649647:11650499:-1 gene:ENSMUSG00000084046 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:11646458:11653606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSMUST00000098260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:11979560:11981265:-1 gene:ENSMUSG00000073995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132816 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930417D02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145947 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 26, member 7 (Slc26a7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000042221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:14502430:14621805:-1 gene:ENSMUSG00000040569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000138042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:14505289:14516369:-1 gene:ENSMUSG00000040569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000149633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:14565480:14621497:-1 gene:ENSMUSG00000040569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AF345194 // GenBank // Mus musculus anion exchanger (Slc26a7) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC026928 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 26, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:30955 IMAGE:4020760), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000021678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:14442987:14621384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0
NM_028499 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 69 (Lrrc69), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006538295 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 69 (Lrrc69), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006538296 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 69 (Lrrc69), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006538297 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 69 (Lrrc69), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000023917 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:14623620:14796060:-1 gene:ENSMUSG00000023151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000108276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:14665754:14796052:-1 gene:ENSMUSG00000023151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000143565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:14665754:14756845:-1 gene:ENSMUSG00000023151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AK006601 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700034K16 product:hypothetical Leucine-rich repeat/Leucine-rich repeat, typical subtype containing protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:14769306:14826372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_152812 // RefSeq // Mus musculus OTU domain containing 6B (Otud6b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000117268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:14809498:14826587:-1 gene:ENSMUSG00000040550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000151012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:14810046:14826395:-1 gene:ENSMUSG00000040550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AK011203 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2600013N14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// BC031474 // GenBank // Mus musculus OTU domain containing 6B, mRNA (cDNA clone MGC:27712 IMAGE:2599116), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC087552 // GenBank // Mus musculus OTU domain containing 6B, mRNA (cDNA clone MGC:103361 IMAGE:6331952), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_178617 // RefSeq // Mus musculus N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 (Necab1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:14952245:15149131:-1 gene:ENSMUSG00000040536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:14954929:15149794:-1 gene:ENSMUSG00000040536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK050307 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730036B16 product:NEURONAL CALCIUM BINDING PROTEIN NECAB1 homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AY278200 // GenBank // Mus musculus EF-hand calcium binding protein 1 (Efcbp1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC067055 // GenBank // Mus musculus N-terminal EF-hand calcium binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:91360 IMAGE:30545678), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:14960717:15062197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_026172 // RefSeq // Mus musculus 2,4-dienoyl CoA reductase 1, mitochondrial (Decr1), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000029877 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:15917240:15945507:-1 gene:ENSMUSG00000028223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC046972 // GenBank // Mus musculus 2,4-dienoyl CoA reductase 1, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:54470 IMAGE:6469277), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// CT010405 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836H0753D for gene Decr1, 2,4-dienoyl CoA reductase 1, mitochondrial; complete cds, incl. stopcodon. // chr4 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:15919035:15945351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0
AK085134 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430042D16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK144961 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830015F12 product:nibrin, full insert sequence. // chr4 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONMMUT046302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_138952 // RefSeq // Mus musculus receptor (TNFRSF)-interacting serine-threonine kinase 2 (Ripk2), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:16122733:16163647:-1 gene:ENSMUSG00000041135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000183871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:16122741:16163643:-1 gene:ENSMUSG00000041135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF461040 // GenBank // Mus musculus receptor-interacting protein 2 (Rip2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF487539 // GenBank // Mus musculus protein kinase RICK (Ripk2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC025611 // GenBank // Mus musculus receptor (TNFRSF)-interacting serine-threonine kinase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5257869), partial cds. // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC069878 // GenBank // Mus musculus receptor (TNFRSF)-interacting serine-threonine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:78084 IMAGE:5316066), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:16122928:16163396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000082685 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:16861689:16861794:-1 gene:ENSMUSG00000064619 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006538390 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclic nucleotide binding domain containing 1 (Cnbd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137780 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:18860454:19122526:-1 gene:ENSMUSG00000073991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:18758347:18907110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
XM_006538390 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclic nucleotide binding domain containing 1 (Cnbd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000137780 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:18860454:19122526:-1 gene:ENSMUSG00000073991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:19051896:19122486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_027769 // RefSeq // Mus musculus copine III (Cpne3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000029885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:19519254:19570108:-1 gene:ENSMUSG00000028228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC090632 // GenBank // Mus musculus copine III, mRNA (cDNA clone MGC:115992 IMAGE:30620886), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:19549575:19570083:-1 gene:ENSMUSG00000028228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// AK017357 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430428M23 product:copine III, full insert sequence. // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000000652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:19523184:19558138:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_001276292 // RefSeq // Mus musculus WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 (Wwp1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NM_177327 // RefSeq // Mus musculus WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 (Wwp1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NR_074089 // RefSeq // Mus musculus WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 (Wwp1), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NR_074090 // RefSeq // Mus musculus WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 (Wwp1), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr4 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000035982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:19609673:19678448:-1 gene:ENSMUSG00000041058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000108246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:19608303:19708993:-1 gene:ENSMUSG00000041058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC026829 // GenBank // Mus musculus WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1, mRNA (cDNA clone MGC:28572 IMAGE:4209397), complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC150812 // GenBank // Mus musculus WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1, mRNA (cDNA clone MGC:183723 IMAGE:9087723), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000000643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:19606412:19678414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0 /// AK082346 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230039M24 product:hypothetical WW domain/WW/Rsp5/WWP domain/C2 domain/C2-domain profile/WW/rsp5/WWP domain profile/C2 calcium/lipid-binding domain, CaLB containing protein, full insert sequence. // chr4 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_175406 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit D2 (Atp6v0d2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000029900 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:19876841:19922605:-1 gene:ENSMUSG00000028238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB088358 // GenBank // Mus musculus Atp6Vod2 mRNA for proton-translocating ATPase d subunit isoform d2, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AY145896 // GenBank // Mus musculus vacuolar proton-translocating ATPase d subunit d2 isoform mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AY517482 // GenBank // Mus musculus putative osteoclast-specific vacuolar ATP synthase mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087899 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit D2, mRNA (cDNA clone MGC:107216 IMAGE:30504725), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:19878219:19882123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_172987 // RefSeq // Mus musculus Na+/K+ transporting ATPase interacting 3 (Nkain3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102998 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:20243842:20778866:-1 gene:ENSMUSG00000055761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK049776 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530048M05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// BC075683 // GenBank // Mus musculus Na+/K+ transporting ATPase interacting 3, mRNA (cDNA clone MGC:100103 IMAGE:30613986), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF058052 // GenBank // Mus musculus NKAIN3 transcript variant 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// EF058053 // GenBank // Mus musculus NKAIN3 transcript variant 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// EF058054 // GenBank // Mus musculus NKAIN3 transcript variant 3 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// NM_001290410 // RefSeq // Mus musculus Na+/K+ transporting ATPase interacting 3 (Nkain3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// ENSMUST00000119374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:20118874:20778567:-1 gene:ENSMUSG00000055761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001080771 // RefSeq // Mus musculus PR domain containing 13 (Prdm13), mRNA. // chr4 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// XM_006537805 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PR domain containing 13 (Prdm13), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006537806 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PR domain containing 13 (Prdm13), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000076206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:21677481:21685783:-1 gene:ENSMUSG00000040478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// ENSMUST00000095141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:21677481:21685963:-1 gene:ENSMUSG00000040478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000144160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:21677480:21685963:-1 gene:ENSMUSG00000040478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000149516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:21679747:21685781:-1 gene:ENSMUSG00000040478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000139568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:21682312:21685845:-1 gene:ENSMUSG00000040478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// AK149252 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930001O19 product:PR domain containing 13, full insert sequence. // chr4 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000025227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:21678224:21685654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0
NM_029840 // RefSeq // Mus musculus thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese)-like domain containing 3 (Tstd3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:21757382:21767212:-1 gene:ENSMUSG00000028251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008899 // RefSeq // Mus musculus POU domain, class 3, transcription factor 2 (Pou3f2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:22482780:22488366:-1 gene:ENSMUSG00000095139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008899 // RefSeq // Mus musculus POU domain, class 3, transcription factor 2 (Pou3f2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:22482780:22488366:-1 gene:ENSMUSG00000095139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:22477708:22498874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000123729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:22928167:22938435:-1 gene:ENSMUSG00000028244 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK006362 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700025O08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT046434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000108214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:24612554:24800890:-1 gene:ENSMUSG00000040387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:24612554:24851124:-1 gene:ENSMUSG00000040387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139161 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730053L13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000130085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:24962330:24967083:-1 gene:ENSMUSG00000046219 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:24966372:24967449:-1 gene:ENSMUSG00000046219 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AK048707 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230012O17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_401511 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C230012O17 gene (C230012O17Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENSMUST00000133431 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:24960790:24966616:-1 gene:ENSMUSG00000046219 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// AK044654 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930029O14 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK153752 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630073G08 product:hypothetical Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT046473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT046474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_021318 // RefSeq // Mus musculus four and a half LIM domains 5 (Fhl5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:25199908:25242876:-1 gene:ENSMUSG00000028259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:25199908:25242876:-1 gene:ENSMUSG00000028259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF083394 // GenBank // Mus musculus LIM-only protein ACT mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC048473 // GenBank // Mus musculus four and a half LIM domains 5, mRNA (cDNA clone MGC:58227 IMAGE:6770515), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:25199978:25216670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
NM_026194 // RefSeq // Mus musculus UFM1 specific ligase 1 (Ufl1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006538203 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UFM1 specific ligase 1 (Ufl1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000038705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:25250147:25281763:-1 gene:ENSMUSG00000040359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// ENSMUST00000102994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:25248605:25281821:-1 gene:ENSMUSG00000040359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000132558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:25269149:25281748:-1 gene:ENSMUSG00000040359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 92 // 31 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000142949 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:25248600:25281760:-1 gene:ENSMUSG00000040359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC058809 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810074P20 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6491288), partial cds. // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC132195 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810074P20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163826 IMAGE:40130472), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// BC138153 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810074P20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169777 IMAGE:8861172), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000006704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:25250470:25271129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000083106 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:25566660:25566822:-1 gene:ENSMUSG00000065040 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083861 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:55303420:55303581:-1 gene:ENSMUSG00000065795 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010243 // RefSeq // Mus musculus fucosyltransferase 9 (Fut9), mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000084770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:25609332:25800146:-1 gene:ENSMUSG00000055373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AB015426 // GenBank // Mus musculus Fut9 mRNA for alpha1,3-fucosyltransferase IX, complete cds. // chr4 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// AK032177 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430407H24 product:fucosyltransferase 9, full insert sequence. // chr4 // 85 // 42 // 11 // 13 // 0 /// AK033607 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130026C15 product:fucosyltransferase 9, full insert sequence. // chr4 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// AK049122 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330004C19 product:fucosyltransferase 9, full insert sequence. // chr4 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000108199 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:25618898:25800244:-1 gene:ENSMUSG00000055373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// BC116874 // GenBank // Mus musculus fucosyltransferase 9, mRNA (cDNA clone MGC:151251 IMAGE:40126193), complete cds. // chr4 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// BC116876 // GenBank // Mus musculus fucosyltransferase 9, mRNA (cDNA clone MGC:151253 IMAGE:40126195), complete cds. // chr4 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
ENSMUST00000083114 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:25819671:25819773:-1 gene:ENSMUSG00000065048 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000122165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:25867989:25868455:-1 gene:ENSMUSG00000084018 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:25866317:25868455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_172865 // RefSeq // Mus musculus mannosidase, endo-alpha (Manea), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000041374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:26324506:26346891:-1 gene:ENSMUSG00000040520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000133105 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:26328045:26340895:-1 gene:ENSMUSG00000040520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC067076 // GenBank // Mus musculus mannosidase, endo-alpha, mRNA (cDNA clone MGC:91328 IMAGE:30628555), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:26327651:26340891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000120523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:26501443:26501659:-1 gene:ENSMUSG00000081985 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000003586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:26501489:26536306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT046508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000102473 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:30701949:30702057:-1 gene:ENSMUSG00000093947 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000118491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:30701973:30702535:-1 gene:ENSMUSG00000082949 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 61 // 100 // 20 // 33 // 0 /// NONMMUT046545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT046546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 61 // 100 // 20 // 33 // 0
ENSMUST00000083119 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:31174909:31175012:-1 gene:ENSMUSG00000065053 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT046549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000122491 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:31998624:31998741:-1 gene:ENSMUSG00000084440 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0 /// NONMMUT046567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0
AK144923 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830004C14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_010289 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, alpha 10 (Gja10), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056517 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:32600644:32602760:-1 gene:ENSMUSG00000051056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:32586289:32615670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001034867 // RefSeq // Mus musculus peptidase M20 domain containing 2 (Pm20d2), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000098181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:33174230:33189433:-1 gene:ENSMUSG00000054659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000119167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:33181620:33189737:-1 gene:ENSMUSG00000054659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// AK145296 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930039M01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 93 // 76 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:33174326:33189380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0
NM_001033225 // RefSeq // Mus musculus proline-rich nuclear receptor coactivator 1 (Pnrc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:33245423:33248510:-1 gene:ENSMUSG00000040128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK160284 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730463C12 product:proline-rich nuclear receptor coactivator 1, full insert sequence. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC038496 // GenBank HTC // Mus musculus, Similar to proline rich 2, clone IMAGE:4215504, mRNA. // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000040225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:33233270:33286238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001290443 // RefSeq // Mus musculus sperm acrosome associated 1 (Spaca1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NM_026293 // RefSeq // Mus musculus sperm acrosome associated 1 (Spaca1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:34028314:34050191:-1 gene:ENSMUSG00000028264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000084734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:34024874:34050039:-1 gene:ENSMUSG00000028264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000108148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:34024876:34041040:-1 gene:ENSMUSG00000028264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// BC048388 // GenBank // Mus musculus sperm acrosome associated 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6311591), complete cds. // chr4 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// BC147079 // GenBank // Mus musculus sperm acrosome associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:182146 IMAGE:9056040), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC147080 // GenBank // Mus musculus sperm acrosome associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:182145 IMAGE:9056039), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:34028398:34049996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000121908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:34389394:34389847:-1 gene:ENSMUSG00000082649 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT046650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:34380278:34417428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_011895 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35 (CMP-sialic acid transporter), member 1 (Slc35a1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000029970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:34663257:34687438:-1 gene:ENSMUSG00000028293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000124456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:34674979:34687255:-1 gene:ENSMUSG00000028293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000126033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:34669498:34683369:-1 gene:ENSMUSG00000028293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000151549 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:34663893:34683462:-1 gene:ENSMUSG00000028293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC012252 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35 (CMP-sialic acid transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:18789 IMAGE:4190458), complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// AK184584 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0130L20, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000029970, based on BLAT search. // chr4 // 62 // 41 // 8 // 13 // 0 /// GENSCAN00000030360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:34668734:34683421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
NM_001033255 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 136 (Gm136), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000095129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:34743784:34756263:-1 gene:ENSMUSG00000071015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC147519 // GenBank // Mus musculus gene model 136, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182617 IMAGE:9056511), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC147522 // GenBank // Mus musculus gene model 136, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182620 IMAGE:9056514), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:34743856:34756011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_013889 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 292 (Zfp292), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006537978 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 292 (Zfp292), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000047950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:34803113:34882960:-1 gene:ENSMUSG00000039967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000098163 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:34803113:34882930:-1 gene:ENSMUSG00000039967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:34795244:34886945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_178061 // RefSeq // Mus musculus MOB kinase activator 3B (Mob3b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006537753 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MOB kinase activator 3B (Mob3b), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:34949074:35157484:-1 gene:ENSMUSG00000073910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178061 // RefSeq // Mus musculus MOB kinase activator 3B (Mob3b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006537753 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MOB kinase activator 3B (Mob3b), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000102975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:34949074:35157484:-1 gene:ENSMUSG00000073910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000155725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:35083600:35157484:-1 gene:ENSMUSG00000073910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK087285 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030042D21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC020028 // GenBank // Mus musculus MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 2B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:28259 IMAGE:4007373), complete cds. // chr4 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// XM_006537755 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MOB kinase activator 3B (Mob3b), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001081343 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3110043O21 gene (3110043O21Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006538294 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 3110043O21 gene (3110043O21Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000084724 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:35191285:35226123:-1 gene:ENSMUSG00000028300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108126 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:35191287:35225834:-1 gene:ENSMUSG00000028300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000108127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:35191287:35225880:-1 gene:ENSMUSG00000028300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC026738 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3110043O21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:25598 IMAGE:4020832), complete cds. // chr4 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC076612 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3110043O21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:100148 IMAGE:30638238), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:35212423:35226175:-1 gene:ENSMUSG00000028300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000013319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:35192882:35218857:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONMMUT046706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSMUST00000121343 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:36003238:36004179:-1 gene:ENSMUSG00000082169 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:36003832:36048722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001165999 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat and Ig domain containing 2 (Lingo2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_390321 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat and Ig domain containing 2 (Lingo2), transcript variant X9, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000145615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:36715820:36951744:-1 gene:ENSMUSG00000045083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139458 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830089B11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125128 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:36951100:36951747:-1 gene:ENSMUSG00000045083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT046727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT046733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSMUST00000083410 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:39259631:39259794:-1 gene:ENSMUSG00000065344 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT046747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000118573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:39895208:39896162:-1 gene:ENSMUSG00000084220 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000041146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:39895163:40002707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 81 // 13 // 16 // 1
NM_134097 // RefSeq // Mus musculus topoisomerase I binding, arginine/serine-rich (Topors), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:40259601:40269850:-1 gene:ENSMUSG00000036822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB072395 // GenBank // Mus musculus p53BP3 mRNA for p53-binding protein-3, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AB104865 // GenBank // Mus musculus Topors mRNA for topoisomerase 1-binding RING finger protein, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC040797 // GenBank // Mus musculus topoisomerase I binding, arginine/serine-rich, mRNA (cDNA clone MGC:49530 IMAGE:3492178), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:40260181:40263078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001033305 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 6 (Ndufb6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:40270591:40279421:-1 gene:ENSMUSG00000071014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:40270665:40279409:-1 gene:ENSMUSG00000071014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC147062 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 6, mRNA (cDNA clone MGC:182159 IMAGE:9056053), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC147063 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 6, mRNA (cDNA clone MGC:182165 IMAGE:9056059), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:40272508:40279337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_021535 // RefSeq // Mus musculus smu-1 suppressor of mec-8 and unc-52 homolog (C. elegans) (Smu1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000030117 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:40736542:40757923:-1 gene:ENSMUSG00000028409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000150574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:40754376:40757831:-1 gene:ENSMUSG00000028409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AB044414 // GenBank // Mus musculus mRNA, complete cds, clone:10+7T-20. // chr4 // 89 // 95 // 31 // 35 // 0 /// BC057446 // GenBank // Mus musculus smu-1 suppressor of mec-8 and unc-52 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:65229 IMAGE:3155760), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000130503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:40743584:40757883:-1 gene:ENSMUSG00000028409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1 /// AK011140 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2600001O03 product:RIKEN cDNA 2610203K23 gene, full insert sequence. // chr4 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// GENSCAN00000041152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:40737297:40764417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0
NM_025498 // RefSeq // Mus musculus presenilin enhancer 2 homolog (C. elegans) (Psenen), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000043898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:30561868:30563184:-1 gene:ENSMUSG00000036835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000121600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:40775259:40775564:-1 gene:ENSMUSG00000056412 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// BC024347 // GenBank // Mus musculus presenilin enhancer 2 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:35751 IMAGE:4984284), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC081443 // GenBank // Mus musculus presenilin enhancer 2 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:102026 IMAGE:6814799), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000041149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:40775259:40812860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_022305 // RefSeq // Mus musculus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4- galactosyltransferase, polypeptide 1 (B4galt1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006537620 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4- galactosyltransferase, polypeptide 1 (B4galt1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000030121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:40804602:40854005:-1 gene:ENSMUSG00000028413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:40809154:40854005:-1 gene:ENSMUSG00000028413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AK029474 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833443M22 product:UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4-galactosyltransferase, polypeptide 1, full insert sequence. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC053006 // GenBank // Mus musculus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4- galactosyltransferase, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:62188 IMAGE:5698356), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D00314 // GenBank // Mus musculus mRNA for N-acetylglucosamine beta1-4 galactosyl transferase, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// J03880 // GenBank // Mouse UDP-galactose:N-acetylglucosamine galactosyltransferase, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:40775259:40812860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001171739 // RefSeq // Mus musculus BCL2-associated athanogene 1 (Bag1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_009736 // RefSeq // Mus musculus BCL2-associated athanogene 1 (Bag1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000030125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:40936401:40948243:-1 gene:ENSMUSG00000028416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000108089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:40936398:40948281:-1 gene:ENSMUSG00000028416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF022223 // GenBank // Mus musculus Bcl-2-binding protein (BAG-1) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC003722 // GenBank // Mus musculus BCL2-associated athanogene 1, mRNA (cDNA clone MGC:5757 IMAGE:3495306), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC069918 // GenBank // Mus musculus BCL2-associated athanogene 1, mRNA (cDNA clone MGC:78184 IMAGE:4979705), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC093509 // GenBank // Mus musculus BCL2-associated athanogene 1, mRNA (cDNA clone MGC:103175 IMAGE:4978330), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000189377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:40936399:40948294:-1 gene:ENSMUSG00000028416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000191273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:40936399:40948294:-1 gene:ENSMUSG00000028416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:40936587:40950922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_007473 // RefSeq // Mus musculus aquaporin 7 (Aqp7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006537560 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aquaporin 7 (Aqp7), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000030136 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:41033074:41048139:-1 gene:ENSMUSG00000028427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000054945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:41033074:41045448:-1 gene:ENSMUSG00000028427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000149517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:41035135:41036310:-1 gene:ENSMUSG00000028427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// AB010100 // GenBank // Mus musculus mRNA for aquaporin 7, complete cds. // chr4 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AB056091 // GenBank // Mus musculus mRNA for aquaporin adipose, complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC022223 // GenBank // Mus musculus aquaporin 7, mRNA (cDNA clone MGC:18363 IMAGE:4242417), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000144201 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:41034893:41040967:-1 gene:ENSMUSG00000028427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000008377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41027114:41064369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_016689 // RefSeq // Mus musculus aquaporin 3 (Aqp3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000055327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:41092722:41098183:-1 gene:ENSMUSG00000028435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000154722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:41093782:41094448:-1 gene:ENSMUSG00000028435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AB019039 // GenBank // Mus musculus mRNA for aquaporin 3, complete cds. // chr4 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// AF104416 // GenBank // Mus musculus aquaporin-3 mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC027400 // GenBank // Mus musculus aquaporin 3, mRNA (cDNA clone MGC:35966 IMAGE:4951027), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41093534:41124212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_139236 // RefSeq // Mus musculus nucleolar protein family 6 (RNA-associated) (Nol6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000030138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:41114427:41124455:-1 gene:ENSMUSG00000028430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF361077 // GenBank // Mus musculus nucleolar RNA-associated protein alpha mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AF361078 // GenBank // Mus musculus nucleolar RNA-associated protein beta mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// AK089138 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E530013P13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// AK153714 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630057J17 product:nucleolar protein family 6 (RNA-associated), full insert sequence. // chr4 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC019981 // GenBank // Mus musculus nucleolar protein family 6 (RNA-associated), mRNA (cDNA clone IMAGE:4035854), complete cds. // chr4 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC021856 // GenBank // Mus musculus nucleolar protein family 6 (RNA-associated), mRNA (cDNA clone IMAGE:5123646), complete cds. // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC059820 // GenBank // Mus musculus nucleolar protein family 6 (RNA-associated), mRNA (cDNA clone MGC:69585 IMAGE:6827596), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41093534:41124212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_026872 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-associated protein 2 (Ubap2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:41194316:41275135:-1 gene:ENSMUSG00000028433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000108068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:41194313:41275144:-1 gene:ENSMUSG00000028433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF276965 // GenBank // Mus musculus lingerer protein-1 (lig-1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC007179 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:7679 IMAGE:3496608), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41195151:41251630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_026893 // RefSeq // Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 12 (Dcaf12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006538228 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 12 (Dcaf12), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006538229 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 12 (Dcaf12), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006538231 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 12 (Dcaf12), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000030145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:41291300:41314889:-1 gene:ENSMUSG00000028436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK078036 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330400A18 product:hypothetical Trp-Asp repeat (WD-repeat) structure containing protein, full insert sequence. // chr4 // 84 // 70 // 16 // 19 // 0 /// BC023852 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 40A, mRNA (cDNA clone MGC:38451 IMAGE:5346910), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41293056:41314565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_024241 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 24 (Kif24), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006537549 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin family member 24 (Kif24), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006537550 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin family member 24 (Kif24), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000030148 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:41391611:41464848:-1 gene:ENSMUSG00000028438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000108055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:41390745:41464840:-1 gene:ENSMUSG00000028438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000154175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:41413548:41464840:-1 gene:ENSMUSG00000028438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AK016916 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933425J19 product:Kinesin Super family Protein 24, full insert sequence. // chr4 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AK135307 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720467J08 product:kinesin family member 24, full insert sequence. // chr4 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC067395 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 24, mRNA (cDNA clone MGC:76523 IMAGE:30460089), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41392112:41446931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001085515 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI464131 (AI464131), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054920 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:41495604:41503076:-1 gene:ENSMUSG00000046312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137640 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI464131, mRNA (cDNA clone MGC:169264 IMAGE:8860659), complete cds. // chr4 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// BC140956 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI464131, mRNA (cDNA clone MGC:175917 IMAGE:9055568), complete cds. // chr4 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000008382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41497478:41527395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_027147 // RefSeq // Mus musculus energy homeostasis associated (Enho), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000127306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:41638144:41640324:-1 gene:ENSMUSG00000028445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021944 // GenBank // Mus musculus energy homeostasis associated, mRNA (cDNA clone IMAGE:5097248), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK004381 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110065P19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000008384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41638612:41664276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONMMUT046854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001136056 // RefSeq // Mus musculus ciliary neurotrophic factor receptor (Cntfr), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_016673 // RefSeq // Mus musculus ciliary neurotrophic factor receptor (Cntfr), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006537598 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ciliary neurotrophic factor receptor (Cntfr), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000102961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:41657498:41695442:-1 gene:ENSMUSG00000028444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000102962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:41657498:41697040:-1 gene:ENSMUSG00000028444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB154246 // GenBank // Mus musculus cntfr mRNA for CNTF receptor alpha subunit, complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AF068615 // GenBank // Mus musculus ciliary neurotrophic factor receptor alpha precursor (Cntfr) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC046974 // GenBank // Mus musculus ciliary neurotrophic factor receptor, mRNA (cDNA clone MGC:54584 IMAGE:6389656), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC050928 // GenBank // Mus musculus ciliary neurotrophic factor receptor, mRNA (cDNA clone MGC:61332 IMAGE:6415187), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XR_390311 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ciliary neurotrophic factor receptor (Cntfr), transcript variant X5, misc_RNA. // chr4 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// GENSCAN00000008384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41638612:41664276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_027278 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease P/MRP 25 subunit-like (Rpp25l), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:41712033:41713534:-1 gene:ENSMUSG00000036114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC047068 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810432D09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:32232 IMAGE:5009034), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41666017:41733279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_016890 // RefSeq // Mus musculus dynactin 3 (Dctn3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000030158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:41714798:41723170:-1 gene:ENSMUSG00000028447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000147120 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:41719768:41723137:-1 gene:ENSMUSG00000028447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// AF098508 // GenBank // Mus musculus dynactin light chain (P24) mRNA, complete cds. // chr4 // 86 // 80 // 24 // 28 // 0 /// BC061120 // GenBank // Mus musculus dynactin 3, mRNA (cDNA clone MGC:74246 IMAGE:6774742), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NM_001159565 // RefSeq // Mus musculus dynactin 3 (Dctn3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// ENSMUST00000171641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:41714798:41723163:-1 gene:ENSMUSG00000028447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// GENSCAN00000008363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41666017:41733279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1
NM_001017362 // RefSeq // Mus musculus AT rich interactive domain 3C (BRIGHT-like) (Arid3c), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001252622 // RefSeq // Mus musculus AT rich interactive domain 3C (BRIGHT-like) (Arid3c), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006538102 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus AT rich interactive domain 3C (BRIGHT-like) (Arid3c), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000084698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:41724139:41730286:-1 gene:ENSMUSG00000066224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000150809 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:41724139:41730286:-1 gene:ENSMUSG00000066224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000171251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:41723836:41731142:-1 gene:ENSMUSG00000066224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC141237 // GenBank // Mus musculus AT rich interactive domain 3C (BRIGHT-like), mRNA (cDNA clone MGC:176198 IMAGE:9055849), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC145563 // GenBank // Mus musculus AT rich interactive domain 3C (BRIGHT-like), mRNA (cDNA clone MGC:179136 IMAGE:9054128), complete cds. // chr4 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000008363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:41666017:41733279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
AK015513 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930466F19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177785 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC049635 (BC049635), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:42868004:42874203:-1 gene:ENSMUSG00000050141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:42868203:42874195:-1 gene:ENSMUSG00000050141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000134400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:42871482:42873721:-1 gene:ENSMUSG00000050141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC049635 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC049635, mRNA (cDNA clone MGC:58387 IMAGE:6774793), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000144112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:42871688:42874234:-1 gene:ENSMUSG00000050141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:42868509:42882491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT046927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_009503 // RefSeq // Mus musculus valosin containing protein (Vcp), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000030164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:42979963:43000507:-1 gene:ENSMUSG00000028452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000120233 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:104345829:104348234:-1 gene:ENSMUSG00000083327 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// BC043053 // GenBank // Mus musculus valosin containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:57954 IMAGE:6418662), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC049114 // GenBank // Mus musculus valosin containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:61308 IMAGE:6810751), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000027472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:104345829:104348234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:42980529:43025073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_020035 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class O (Pigo), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006538114 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class O (Pigo), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006538115 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class O (Pigo), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000067481 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:43017635:43025819:-1 gene:ENSMUSG00000028454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000098109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43017635:43025756:-1 gene:ENSMUSG00000028454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB038560 // GenBank // Mus musculus mRNA for Pig-o, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC092394 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class O, mRNA (cDNA clone MGC:102056 IMAGE:30534262), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC141058 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class O, mRNA (cDNA clone MGC:176019 IMAGE:9055670), complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000149333 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:43017635:43025080:-1 gene:ENSMUSG00000028454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// GENSCAN00000041973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:42980529:43025073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_001162381 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 166, member B (Fam166b), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_177377 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 166, member B (Fam166b), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43427019:43429134:-1 gene:ENSMUSG00000042788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43427183:43429089:-1 gene:ENSMUSG00000042788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000107929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43427140:43429089:-1 gene:ENSMUSG00000042788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000149676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43427588:43429089:-1 gene:ENSMUSG00000042788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000171134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:43427076:43429117:-1 gene:ENSMUSG00000042788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43427183:43429089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0
NM_019436 // RefSeq // Mus musculus suppression inducing transmembrane adaptor 1 (Sit1), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030180 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43482081:43483734:-1 gene:ENSMUSG00000028460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000123526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43482187:43483222:-1 gene:ENSMUSG00000028460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC064055 // GenBank // Mus musculus suppression inducing transmembrane adaptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:73589 IMAGE:576098), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT046976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NR_001460 // RefSeq // Mus musculus RNA component of mitochondrial RNAase P (Rmrp), RNase MRP RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000157463 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:43492788:43493058:-1 gene:ENSMUSG00000088088 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011602 // RefSeq // Mus musculus talin 1 (Tln1), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 57 // 57 // 0 /// XM_006537771 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus talin 1 (Tln1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000030187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43531519:43562422:-1 gene:ENSMUSG00000028465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 57 // 57 // 0 /// BC121787 // GenBank // Mus musculus talin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40096795), complete cds. // chr4 // 96 // 46 // 26 // 27 // 0 /// BC150810 // GenBank // Mus musculus talin 1, mRNA (cDNA clone MGC:183721 IMAGE:9087721), complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 53 // 55 // 0 /// GENSCAN00000041940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43531960:43556750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 53 // 53 // 0
NM_001099314 // RefSeq // Mus musculus microseminoprotein, prostate associated (Msmp), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43583216:43584494:-1 gene:ENSMUSG00000078719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43583313:43584268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001007463 // RefSeq // Mus musculus sperm associated antigen 8 (Spag8), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_001290462 // RefSeq // Mus musculus sperm associated antigen 8 (Spag8), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XR_390330 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sperm associated antigen 8 (Spag8), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000084646 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:43651335:43653552:-1 gene:ENSMUSG00000066196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000107870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43651676:43653594:-1 gene:ENSMUSG00000066196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149575 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:43651335:43652159:-1 gene:ENSMUSG00000066196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// AY769082 // GenBank // Mus musculus sperm associated antigen 8-like protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC150868 // GenBank // Mus musculus sperm associated antigen 8, mRNA (cDNA clone MGC:183779 IMAGE:9087779), complete cds. // chr4 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0
NM_175517 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 221, member B (Fam221b), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43659622:43669141:-1 gene:ENSMUSG00000043633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC119804 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930412F15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:148243 IMAGE:40107542), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC122881 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930412F15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:148244 IMAGE:40107552), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43663096:43669145:-1 gene:ENSMUSG00000043633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// AK038644 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230052E09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000041951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43659655:43667514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_019485 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 70 (Olfr70), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000055545 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43695000:43700807:-1 gene:ENSMUSG00000050215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC046311 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 70, mRNA (cDNA clone MGC:54515 IMAGE:6307520), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000041947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43693739:43706566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 25 // 43 // 1
NM_019486 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 71 (Olfr71), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000055401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:43705628:43706566:-1 gene:ENSMUSG00000046450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000107862 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43705628:43710231:-1 gene:ENSMUSG00000046450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC141882 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 71, mRNA (cDNA clone MGC:156323 IMAGE:40041946), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC141892 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 71, mRNA (cDNA clone MGC:165163 IMAGE:40041948), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43693739:43706566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_019476 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 159 (Olfr159), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053931 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43770050:43771009:-1 gene:ENSMUSG00000044801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43727467:43771009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NR_033638 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 29, pseudogene 1 (Olfr29-ps1), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43781381:43782328:-1 gene:ENSMUSG00000081420 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_019473 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 155 (Olfr155), mRNA. // chr4 // 58 // 96 // 14 // 24 // 0 /// NM_019476 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 159 (Olfr159), mRNA. // chr4 // 63 // 96 // 15 // 24 // 0 /// ENSMUST00000053931 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43770050:43771009:-1 gene:ENSMUSG00000044801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 96 // 15 // 24 // 0 /// ENSMUST00000095108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:43854292:43855463:1 gene:ENSMUSG00000071000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 96 // 14 // 24 // 0 /// ENSMUST00000107860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:43851565:43855270:1 gene:ENSMUSG00000071000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 96 // 14 // 24 // 0 /// BC130252 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 155, mRNA (cDNA clone MGC:161319 IMAGE:40142475), complete cds. // chr4 // 70 // 80 // 14 // 20 // 0 /// GENSCAN00000041939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43781489:43782328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43727467:43771009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43854311:43855270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 96 // 14 // 24 // 0
NM_019474 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 156 (Olfr156), mRNA. // chr4 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000079465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43820403:43821359:-1 gene:ENSMUSG00000059448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// BC101957 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 156, mRNA (cDNA clone MGC:123977 IMAGE:40044987), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// BC101961 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 156, mRNA (cDNA clone MGC:123974 IMAGE:40044981), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// BC103551 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 156, mRNA (cDNA clone MGC:123976 IMAGE:40044986), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// BC104727 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 156, mRNA (cDNA clone MGC:123975 IMAGE:40044983), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0
NM_019475 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 157 (Olfr157), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000079234 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:43835532:43836488:-1 gene:ENSMUSG00000059101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// BC137911 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 157, mRNA (cDNA clone MGC:169535 IMAGE:8860930), complete cds. // chr4 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC137912 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 157, mRNA (cDNA clone MGC:169536 IMAGE:8860931), complete cds. // chr4 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:43835532:43836488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000157907 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:44081289:44081400:-1 gene:ENSMUSG00000088532 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT047029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000118271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:44752277:44753125:-1 gene:ENSMUSG00000080916 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NM_001080965 // RefSeq // Mus musculus aurora kinase C (Aurkc), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 50 // 100 // 7 // 14 // 0 /// NM_001080966 // RefSeq // Mus musculus aurora kinase C (Aurkc), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 50 // 100 // 7 // 14 // 0 /// NM_020572 // RefSeq // Mus musculus aurora kinase C (Aurkc), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 50 // 100 // 7 // 14 // 0 /// ENSMUST00000086248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:6995443:7002945:1 gene:ENSMUSG00000070837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 100 // 7 // 14 // 0 /// AF054620 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase AIE1 (Aie1) mRNA, complete cds. // chr4 // 64 // 100 // 9 // 14 // 0 /// BC064780 // GenBank // Mus musculus aurora kinase C, mRNA (cDNA clone MGC:76648 IMAGE:30476803), complete cds. // chr4 // 50 // 100 // 7 // 14 // 0 /// GENSCAN00000040059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:44730242:44753125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 71 // 9 // 10 // 0
NM_001163283 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 5 (Zbtb5), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_001163284 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 5 (Zbtb5), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_173399 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 5 (Zbtb5), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000055028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:44991242:45012394:-1 gene:ENSMUSG00000049657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000107817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:44992981:45012412:-1 gene:ENSMUSG00000049657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000180217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:44991245:45012412:-1 gene:ENSMUSG00000049657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY635051 // GenBank // Mus musculus transcription factor ZNF-POZ mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// BC054551 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:62416 IMAGE:6400036), complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC057545 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:66508 IMAGE:6405028), complete cds. // chr4 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_001024142 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 10 (Fbxo10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000052236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:45034247:45084604:-1 gene:ENSMUSG00000048232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000140008 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45034248:45062004:-1 gene:ENSMUSG00000048232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// AK153358 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830148H03 product:F-box only protein 10, full insert sequence. // chr4 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// BC094565 // GenBank // Mus musculus F-box protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:107720 IMAGE:6836944), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// AK142389 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430034C13 product:F-box only protein 10, full insert sequence. // chr4 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1 /// GENSCAN00000035205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45035908:45108033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
NM_001099675 // RefSeq // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 5 homolog (yeast) (Tomm5), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001134646 // RefSeq // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 5 homolog (yeast) (Tomm5), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45105395:45108108:-1 gene:ENSMUSG00000078713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:45105212:45108108:-1 gene:ENSMUSG00000078713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45105212:45108038:-1 gene:ENSMUSG00000078713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:45105208:45108114:-1 gene:ENSMUSG00000078713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45035908:45108033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_025513 // RefSeq // Mus musculus exosome component 3 (Exosc3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:45316613:45320629:-1 gene:ENSMUSG00000028322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000130843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45317489:45320604:-1 gene:ENSMUSG00000028322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000143111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45316794:45320336:-1 gene:ENSMUSG00000028322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 80 // 36 // 8 // 10 // 0 /// ENSMUST00000152056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45316954:45342732:-1 gene:ENSMUSG00000028322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AK012689 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810008H01 product:APOPTOSIS-RELATED PROTEIN PNAS-3 (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// BC023669 // GenBank // Mus musculus exosome component 3, mRNA (cDNA clone MGC:29324 IMAGE:5012335), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC054085 // GenBank // Mus musculus exosome component 3, mRNA (cDNA clone MGC:62946 IMAGE:3371550), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45316827:45320606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT047091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 80 // 36 // 8 // 10 // 0
NM_001009949 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 51 (Slc25a51), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107796 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:45395923:45408761:-1 gene:ENSMUSG00000045973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000116341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:45395923:45408766:-1 gene:ENSMUSG00000045973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45399241:45408760:-1 gene:ENSMUSG00000045973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AK156168 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830010G03 product:Mitochondrial carrier triple repeat 1 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK164726 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630038L12 product:Mitochondrial carrier triple repeat 1 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC089000 // GenBank // Mus musculus mitochondrial carrier triple repeat 1, mRNA (cDNA clone MGC:115765 IMAGE:6418170), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_018741 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein-like 1 (Igfbpl1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044297 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:45809468:45826923:-1 gene:ENSMUSG00000035551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB006141 // GenBank // Mus musculus mRNA for IGFBP-like protein, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051960 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:62230 IMAGE:5710646), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000145102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:45813007:45816363:-1 gene:ENSMUSG00000035551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// AK013339 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810453O06 product:IGFBP-like protein, full insert sequence. // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000035184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:45807952:45826793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT047117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT047118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_173033 // RefSeq // Mus musculus thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese)-like domain containing 2 (Tstd2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006537967 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese)-like domain containing 2 (Tstd2), transcript variant X8, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:46115732:46138438:-1 gene:ENSMUSG00000035495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107772 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:46114746:46138475:-1 gene:ENSMUSG00000035495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC057893 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC057893, mRNA (cDNA clone MGC:67667 IMAGE:4978941), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSMUST00000160008 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:46123405:46138413:-1 gene:ENSMUSG00000035495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// AK165359 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430110L01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:46116845:46132181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_029086 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5830415F09 gene (5830415F09Rik), mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538326 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 5830415F09 gene (5830415F09Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XR_390347 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 5830415F09 gene (5830415F09Rik), transcript variant X4, misc_RNA. // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:46379864:46389437:-1 gene:ENSMUSG00000028331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000086563 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:46376979:46389423:-1 gene:ENSMUSG00000028331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:46376505:46389418:-1 gene:ENSMUSG00000028331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK052584 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530049P16 product:hypothetical Uncharacterized protein family UPF0066 (VIRR) containing protein, full insert sequence. // chr4 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC092543 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830415F09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107342 IMAGE:30315335), complete cds. // chr4 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// XM_006538324 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 5830415F09 gene (5830415F09Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000012988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:46347740:46403993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_053149 // RefSeq // Mus musculus hemogen (Hemgn), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000071096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:46393989:46413506:-1 gene:ENSMUSG00000028332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000107764 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:46393989:46404236:-1 gene:ENSMUSG00000028332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF269248 // GenBank // Mus musculus hemogen mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK006588 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700034A16 product:hemogen, full insert sequence. // chr4 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// AY699986 // GenBank // Mus musculus negative differentiation regulator mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC050798 // GenBank // Mus musculus hemogen, mRNA (cDNA clone MGC:58715 IMAGE:6743819), complete cds. // chr4 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:46347740:46403993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_198664 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 2 (Tbc1d2), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000084621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:46604390:46650209:-1 gene:ENSMUSG00000039813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:46632580:46650209:-1 gene:ENSMUSG00000039813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// AK041359 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630005A06 product:hypothetical Pleckstrin homology (PH) domain containing protein, full insert sequence. // chr4 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:46605761:46702141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001081141 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) B receptor, 2 (Gabbr2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000107749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:46662318:46991873:-1 gene:ENSMUSG00000039809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK132744 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4922504O20 product:Gamma-aminobutyric acid type B receptor (Fragment), full insert sequence. // chr4 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// GENSCAN00000012996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:46715989:46852192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// GENSCAN00000013000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:46605761:46702141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
ENSMUST00000135777 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:47008316:47010781:-1 gene:ENSMUSG00000048824 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC028561 // GenBank // Mus musculus gene model 568, (NCBI), mRNA (cDNA clone IMAGE:1380536), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT047163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001024136 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6 (Anks6), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006538335 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6 (Anks6), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006538337 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6 (Anks6), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000084616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:47015689:47057306:-1 gene:ENSMUSG00000066191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000107747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:47015669:47057306:-1 gene:ENSMUSG00000066191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC060663 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:30356260). // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC072562 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:5707611), complete cds. // chr4 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// XM_006538338 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6 (Anks6), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000051929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:46989940:47057280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1
NM_019998 // RefSeq // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 2 (alpha-1,3-mannosyltransferase) (Alg2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044148 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:47469833:47474333:-1 gene:ENSMUSG00000039740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB161357 // GenBank // Mus musculus mRNA for mannosyltransferase, complete cds. // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC051951 // GenBank // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 2 homolog (yeast, alpha-1,3-mannosyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:62207 IMAGE:5686826), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052411 // GenBank // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 2 homolog (yeast, alpha-1,3-mannosyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:64642 IMAGE:5720077), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:47471559:47474286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_029572 // RefSeq // Mus musculus endoplasmic reticulum protein 44 (Erp44), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006538341 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endoplasmic reticulum protein 44 (Erp44), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000030028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:48193323:48279558:-1 gene:ENSMUSG00000028343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK151497 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830031A10 product:thioredoxin domain containing 4 (endoplasmic reticulum), full insert sequence. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK172973 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0573 protein. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC019558 // GenBank // Mus musculus thioredoxin domain containing 4 (endoplasmic reticulum), mRNA (cDNA clone MGC:28524 IMAGE:4192664), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:48192632:48257783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_172304 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 10 (Tex10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006537955 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed gene 10 (Tex10), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000030030 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:48430858:48473459:-1 gene:ENSMUSG00000028345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000155905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:48430858:48468924:-1 gene:ENSMUSG00000028345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000164866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:48430956:48473422:-1 gene:ENSMUSG00000028345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK141288 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430021H21 product:Nbla10363 protein homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC006867 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:3595167), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC151176 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 10, mRNA (cDNA clone MGC:184076 IMAGE:9088065), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC151177 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 10, mRNA (cDNA clone MGC:184077 IMAGE:9088066), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:48430970:48541159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
ENSMUST00000175499 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:48762851:48762962:-1 gene:ENSMUSG00000093240 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145368 // RefSeq // Mus musculus acyl-coenzyme A amino acid N-acyltransferase 2 (Acnat2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000081541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:49379840:49408151:-1 gene:ENSMUSG00000060317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000107698 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:4:49379920:49383576:-1 gene:ENSMUSG00000060317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// BC010829 // GenBank // Mus musculus acyl-coenzyme A amino acid N-acyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:19156 IMAGE:4220620), complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000011240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:49380114:49383548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
NM_001164565 // RefSeq // Mus musculus acyl-coenzyme A amino acid N-acyltransferase 1 (Acnat1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000095086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:49447109:49451137:-1 gene:ENSMUSG00000070985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000107697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:49447105:49451134:-1 gene:ENSMUSG00000070985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// DQ469311 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA:N-acyltransferase 1 (Acnat1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000011226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:49447329:49486424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_007519 // RefSeq // Mus musculus bile acid-Coenzyme A: amino acid N-acyltransferase (Baat), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000043056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:49489422:49506557:-1 gene:ENSMUSG00000039653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000166036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:49489820:49503120:-1 gene:ENSMUSG00000039653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// U95215 // GenBank // Mus musculus bile acid CoA: amino acid N-acyltransferase (Baat) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:49489820:49503120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_178603 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L50 (Mrpl50), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:49512596:49521093:-1 gene:ENSMUSG00000044018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK002686 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610027L12 product:similar to MITOCHONDRIAL 39S RIBOSOMAL PROTEIN L50 (MRP-L50) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC021318 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L50, mRNA (cDNA clone MGC:29213 IMAGE:5035369), complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:49514190:49515912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_025944 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 246 (Tmem246), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:49584506:49597876:-1 gene:ENSMUSG00000039611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC013800 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810432L12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:6846 IMAGE:2650271), complete cds. // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:49582836:49587166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001033351 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor ionotropic, NMDA3A (Grin3a), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001276355 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor ionotropic, NMDA3A (Grin3a), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006537914 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate receptor ionotropic, NMDA3A (Grin3a), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000076674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:49661611:49845549:-1 gene:ENSMUSG00000039579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000093859 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:49661611:49845549:-1 gene:ENSMUSG00000039579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000131797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:49769635:49845744:-1 gene:ENSMUSG00000039579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AK044171 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830097C19 product:similar to IONOTROPIC GLUTAMATE RECEPTOR NMDA subunit NR3A[Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr4 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:49681436:49740443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001004025 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 3, regulatory subunit B, alpha isoform (calcineurin B, type II) (Ppp3r2), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:49678747:49682024:-1 gene:ENSMUSG00000028310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_146824 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 273 (Olfr273), mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000051520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:52855514:52856572:-1 gene:ENSMUSG00000049648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000107670 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:52855558:52858466:-1 gene:ENSMUSG00000049648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC125463 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 273, mRNA (cDNA clone MGC:159166 IMAGE:40129978), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC125465 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 273, mRNA (cDNA clone MGC:159168 IMAGE:40129980), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000054750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:52855558:52856511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_146839 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 272 (Olfr272), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:52910833:52911794:-1 gene:ENSMUSG00000051593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:52910833:52919172:-1 gene:ENSMUSG00000051593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128006 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 272, mRNA (cDNA clone MGC:157594 IMAGE:40135971), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:52910833:52911786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000121614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:52935430:52936381:-1 gene:ENSMUSG00000082216 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:52935430:52936281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_013454 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 1 (Abca1), mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000030010 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:53030787:53159895:-1 gene:ENSMUSG00000015243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000054759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:53033943:53159522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 43 // 43 // 0
NR_033139 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI427809 (AI427809), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_033140 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI427809 (AI427809), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000098075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:53261893:53262547:-1 gene:ENSMUSG00000086712 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA gene:ENSMUSG00000073854 // chr4 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000123127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:53261356:53270232:-1 gene:ENSMUSG00000086712 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147516 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI427809, mRNA (cDNA clone MGC:182614 IMAGE:9056508), complete cds. // chr4 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// BC147547 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI427809, mRNA (cDNA clone MGC:182644 IMAGE:9056538), complete cds. // chr4 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// NONMMUT047288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT047289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000117914 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:53791070:53791456:-1 gene:ENSMUSG00000084403 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
AK132941 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930526N04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000118617 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:55408956:55409307:-1 gene:ENSMUSG00000084404 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// NONMMUT047353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0
NM_010637 // RefSeq // Mus musculus Kruppel-like factor 4 (gut) (Klf4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000107619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:55527143:55532466:-1 gene:ENSMUSG00000003032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000132746 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:55530712:55532453:-1 gene:ENSMUSG00000003032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// BC010301 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like factor 4 (gut), mRNA (cDNA clone MGC:11479 IMAGE:3156339), complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// JF277566 // GenBank // Mus musculus Krueppel-like factor 4 mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 47 // 8 // 9 // 0 /// U20344 // GenBank // Mus musculus gut-enriched Kruppel-like factor GKLF mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 74 // 13 // 14 // 0 /// U70662 // GenBank // Mus musculus epithelial zinc-finger protein EZF (Zie) mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000007929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:55486653:55565838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_025271 // RefSeq // Mus musculus actin-like 7b (Actl7b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000095080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:56740005:56741443:-1 gene:ENSMUSG00000070980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB023062 // GenBank // Mus musculus mRNA for t-ACTIN 1, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AF113520 // GenBank // Mus musculus actin-like-7-beta protein (Actl7b) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116815 // GenBank // Mus musculus actin-like 7b, mRNA (cDNA clone MGC:151192 IMAGE:40126134), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC116817 // GenBank // Mus musculus actin-like 7b, mRNA (cDNA clone MGC:151194 IMAGE:40126136), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:56740100:56741356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_026079 // RefSeq // Mus musculus inhibitor of kappa light polypeptide enhancer in B cells, kinase complex-associated protein (Ikbkap), mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000030140 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:56749680:56802331:-1 gene:ENSMUSG00000028431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000150002 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:56751015:56763330:-1 gene:ENSMUSG00000028431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr4 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// AF140786 // GenBank // Mus musculus IKK-complex-associated protein IKAP mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 95 // 34 // 38 // 0 /// AF367244 // GenBank // Mus musculus Ikap (Ikbkap) mRNA, complete cds. // chr4 // 87 // 95 // 33 // 38 // 0 /// AF387811 // GenBank // Mus musculus IKAP (Ikbkap) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 98 // 36 // 39 // 0 /// BC035529 // GenBank // Mus musculus inhibitor of kappa light polypeptide enhancer in B-cells, kinase complex-associated protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:5365773). // chr4 // 92 // 30 // 11 // 12 // 0 /// BC052387 // GenBank // Mus musculus inhibitor of kappa light polypeptide enhancer in B-cells, kinase complex-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:64628 IMAGE:5705589), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// BC054468 // GenBank // Mus musculus inhibitor of kappa light polypeptide enhancer in B-cells, kinase complex-associated protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:4501529), complete cds. // chr4 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000038004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:56752238:56800124:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0
XR_390322 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 245 (Tmem245), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000155625 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:56885616:56947424:-1 gene:ENSMUSG00000055296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK052826 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730040F13 product:hypothetical metalthio containing protein, full insert sequence. // chr4 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// NM_175518 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 245 (Tmem245), mRNA. // chr4 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSMUST00000068792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:56866923:56947437:-1 gene:ENSMUSG00000055296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1 /// ENSMUST00000107609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:56880247:56947411:-1 gene:ENSMUSG00000055296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSMUST00000125082 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:56879876:56937897:-1 gene:ENSMUSG00000055296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// ENSMUST00000132816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:56879876:56923458:-1 gene:ENSMUSG00000055296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// GENSCAN00000006149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:56880247:56947411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1
NR_029789 // RefSeq // Mus musculus microRNA 32 (Mir32), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083610 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:56895229:56895298:-1 gene:ENSMUSG00000065544 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-32 // miRBase Micro RNA Database // MI0000691 Mus musculus miR-32 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001142965 // RefSeq // Mus musculus ferric-chelate reductase 1 like (Frrs1l), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000053681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:4:56957173:56990391:-1 gene:ENSMUSG00000045589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000128276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:56960136:56990136:-1 gene:ENSMUSG00000045589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr4 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:56962988:56990271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_019427 // RefSeq // Mus musculus erythrocyte protein band 4.1-like 4b (Epb4.1l4b), mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000030142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:57061726:57143437:-1 gene:ENSMUSG00000028434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AB032366 // GenBank // Mus musculus Ehm2 mRNA, complete cds. // chr4 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// AK144315 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630018E22 product:erythrocyte protein band 4.1-like 4b, full insert sequence. // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// XM_006538087 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus erythrocyte protein band 4.1-like 4b (Epb4.1l4b), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// ENSMUST00000095076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:56991972:57143437:-1 gene:ENSMUSG00000028434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// XM_006538089 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus erythrocyte protein band 4.1-like 4b (Epb4.1l4b), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:57016413:57060126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:57063105:57154419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_011207 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538096 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538097 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538099 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:57190841:57301837:-1 gene:ENSMUSG00000038764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK035295 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530011I20 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:57194285:57322483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011207 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538096 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538097 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538099 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:57190841:57301837:-1 gene:ENSMUSG00000038764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:57194285:57322483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011207 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538096 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538097 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538099 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:57190841:57301837:-1 gene:ENSMUSG00000038764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:57194285:57322483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_011207 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538096 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538097 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538099 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:57190841:57301837:-1 gene:ENSMUSG00000038764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:57218347:57222054:-1 gene:ENSMUSG00000038764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:57194285:57322483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011207 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538096 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538097 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006538099 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 (Ptpn3), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:57190841:57301837:-1 gene:ENSMUSG00000038764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006543852 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12538 (Gm12538), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000120064 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:57413711:57414196:-1 gene:ENSMUSG00000081540 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:57413711:57414196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000154462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:57757739:57763901:-1 gene:ENSMUSG00000073846 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK153685 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630046I20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT047438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000063816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:57908483:57916297:-1 gene:ENSMUSG00000052117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC030929 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D630039A03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:31685 IMAGE:4911378), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC095953 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D630039A03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106277 IMAGE:5043405), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:57910100:57920659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_011660 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin 1 (Txn1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000030051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:57943373:57956411:-1 gene:ENSMUSG00000028367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC010756 // GenBank // Mus musculus thioredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:18460 IMAGE:4216106), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_026132 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin domain containing 8 (Txndc8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006538201 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thioredoxin domain containing 8 (Txndc8), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006538202 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thioredoxin domain containing 8 (Txndc8), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000102897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:57984027:58009124:-1 gene:ENSMUSG00000038709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:57984029:58000310:-1 gene:ENSMUSG00000038709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000154540 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:57984027:58009025:-1 gene:ENSMUSG00000038709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AY495589 // GenBank // Mus musculus Trx6 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC049564 // GenBank // Mus musculus thioredoxin domain containing 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:6744062), partial cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC116763 // GenBank // Mus musculus thioredoxin domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:151140 IMAGE:40126082), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116765 // GenBank // Mus musculus thioredoxin domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:151142 IMAGE:40126084), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC144839 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053387. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:57972950:58009104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1