NM_028017 // RefSeq // Mus musculus N-ethylmaleimide sensitive fusion protein attachment protein gamma (Napg), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000025474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:62977836:62999450:1 gene:ENSMUSG00000024581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000137849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:62977922:62982785:1 gene:ENSMUSG00000024581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000150267 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:62977901:62996932:1 gene:ENSMUSG00000024581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC026977 // GenBank // Mus musculus N-ethylmaleimide sensitive fusion protein attachment protein gamma, mRNA (cDNA clone MGC:38929 IMAGE:5362684), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000154563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:62985956:62991830:1 gene:ENSMUSG00000024581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// ENSMUST00000155440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:62986039:62994575:1 gene:ENSMUSG00000024581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000049833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:62983132:62996960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONMMUT032635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONMMUT032636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001014981 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 7 (Wdr7), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000072726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:63708695:63989760:1 gene:ENSMUSG00000040560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AK052730 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630037A10 product:hypothetical G-protein beta WD-40 repeats containing protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC125573 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 7, mRNA (cDNA clone MGC:159276 IMAGE:40130088), complete cds. // chr18 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// BC137785 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 7, mRNA (cDNA clone MGC:169409 IMAGE:8860804), complete cds. // chr18 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:63705521:63778316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_009182 // RefSeq // Mus musculus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 3 (St8sia3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000025477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:64254359:64276146:1 gene:ENSMUSG00000056812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000139622 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:64265996:64269979:1 gene:ENSMUSG00000056812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC075645 // GenBank // Mus musculus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:96295 IMAGE:30620472), complete cds. // chr18 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:64265487:64271796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 53 // 19 // 19 // 0
GENSCAN00000009768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:64288358:64290014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_194268 // RefSeq // Mus musculus one cut domain, family member 2 (Onecut2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000115145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:64340364:64398486:1 gene:ENSMUSG00000045991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000175965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:64340364:64398488:1 gene:ENSMUSG00000045991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY242995 // GenBank // Mus musculus transcription factor ONECUT2 (Oc2) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC103668 // GenBank // Mus musculus one cut domain, family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:124203 IMAGE:40046651), complete cds. // chr18 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:64340437:64343507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
AK153754 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630075J08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029600 // RefSeq // Mus musculus microRNA 122a (Mir122a), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000083468 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:65248861:65248926:1 gene:ENSMUSG00000065402 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-122 // miRBase Micro RNA Database // MI0000256 Mus musculus miR-122 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT032688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
AK089536 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730048M01 product:inferred: heart alpha-kinase [Mus musculus], full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT032689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_177028 // RefSeq // Mus musculus O-acyltransferase like (Oacyl), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006526013 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus O-acyltransferase like (Oacyl), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000115097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:65698268:65751537:1 gene:ENSMUSG00000046610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000117694 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:65698270:65751601:1 gene:ENSMUSG00000046610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC141265 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5330437I02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:176226 IMAGE:9055877), complete cds. // chr18 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// XM_006526015 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus O-acyltransferase like (Oacyl), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// XM_006526016 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus O-acyltransferase like (Oacyl), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000046219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:65691063:65763888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
NM_175012 // RefSeq // Mus musculus gastrin releasing peptide (Grp), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525886 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gastrin releasing peptide (Grp), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:65873494:65886578:1 gene:ENSMUSG00000024517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173530 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:65873484:65880258:1 gene:ENSMUSG00000024517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000173985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:65872820:65886579:1 gene:ENSMUSG00000024517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024515 // GenBank // Mus musculus gastrin releasing peptide, mRNA (cDNA clone MGC:37475 IMAGE:4984025), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000032171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:65873607:65904388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_021451 // RefSeq // Mus musculus phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 (Pmaip1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:66458604:66465550:1 gene:ENSMUSG00000024521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB041230 // GenBank // Mus musculus Noxa mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC050821 // GenBank // Mus musculus phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:59280 IMAGE:6517820), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_040528 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9926 (Gm9926), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003867 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024190 // RefSeq // Mus musculus charged multivesicular body protein 1B (Chmp1b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC002229 // GenBank // Mus musculus chromatin modifying protein 1B, mRNA (cDNA clone MGC:7497 IMAGE:3491354), complete cds. // chr18 // 84 // 71 // 21 // 25 // 0
NM_053261 // RefSeq // Mus musculus inositol (myo)-1(or 4)-monophosphatase 2 (Impa2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000025403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67289253:67319146:1 gene:ENSMUSG00000024525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF353730 // GenBank // Mus musculus myo-inositol monophosphatase 2 (Impa2) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC011093 // GenBank // Mus musculus inositol (myo)-1(or 4)-monophosphatase 2, mRNA (cDNA clone MGC:18988 IMAGE:4012163), complete cds. // chr18 // 81 // 100 // 26 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67299715:67318966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_007702 // RefSeq // Mus musculus cell death-inducing DNA fragmentation factor, alpha subunit-like effector A (Cidea), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67343564:67367794:1 gene:ENSMUSG00000024526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF041376 // GenBank // Mus musculus cell death activator CIDE-A (Cide-a) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC096649 // GenBank // Mus musculus cell death-inducing DNA fragmentation factor, alpha subunit-like effector A, mRNA (cDNA clone MGC:107013 IMAGE:1397772), complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67335309:67367523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_026473 // RefSeq // Mus musculus tubulin, beta 6 class V (Tubb6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000001513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67390717:67402748:1 gene:ENSMUSG00000001473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC008225 // GenBank // Mus musculus tubulin, beta 6, mRNA (cDNA clone MGC:6469 IMAGE:2631779), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67377782:67398098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_144867 // RefSeq // Mus musculus slowmo homolog 1 (Drosophila) (Slmo1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000025411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67464849:67480581:1 gene:ENSMUSG00000024530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC019561 // GenBank // Mus musculus slowmo homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:28728 IMAGE:4459623), complete cds. // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK038905 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230074A19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// AK044163 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830096K14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000020355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67471366:67483120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NM_134138 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 2 (Psmg2), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006525503 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 2 (Psmg2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XR_406677 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642159 (LOC102642159), ncRNA. // chr18 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000025418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67641599:67654162:1 gene:ENSMUSG00000024537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB031387 // GenBank // Mus musculus mRNA for Clast3 protein, complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC016606 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 2, mRNA (cDNA clone MGC:27732 IMAGE:2646038), complete cds. // chr18 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000020376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67644372:67668304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0
NM_001039088 // RefSeq // Mus musculus SEH1-like (S. cerevisiae (Seh1l), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NM_028112 // RefSeq // Mus musculus SEH1-like (S. cerevisiae (Seh1l), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67774876:67795461:1 gene:ENSMUSG00000079614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC027244 // GenBank // Mus musculus SEH1-like (S. cerevisiae, mRNA (cDNA clone MGC:27929 IMAGE:3584697), complete cds. // chr18 // 93 // 84 // 25 // 27 // 0 /// XM_006526278 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SEH1-like (S. cerevisiae (Seh1l), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// GENSCAN00000047813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67779205:67871765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_027556 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 192 (Cep192), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000025425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67800107:67885168:1 gene:ENSMUSG00000024542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AK158414 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930115A20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 92 // 28 // 12 // 13 // 0 /// BC024918 // GenBank HTC // Mus musculus centrosomal protein 192, mRNA (cDNA clone IMAGE:3603045), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr18 // 94 // 39 // 17 // 18 // 0 /// BC064462 // GenBank // Mus musculus centrosomal protein 192, mRNA (cDNA clone IMAGE:6822021), complete cds. // chr18 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67779205:67871765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 37 // 37 // 0
NM_027556 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 192 (Cep192), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67800107:67885168:1 gene:ENSMUSG00000024542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK158414 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930115A20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67779205:67871765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_027556 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 192 (Cep192), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67800107:67885168:1 gene:ENSMUSG00000024542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158414 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930115A20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67779205:67871765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013596 // RefSeq // Mus musculus melanocortin 5 receptor (Mc5r), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:68337603:68339711:1 gene:ENSMUSG00000007480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100720 // GenBank // Mus musculus melanocortin 5 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:124001 IMAGE:40045173), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100721 // GenBank // Mus musculus melanocortin 5 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:124000 IMAGE:40045171), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100722 // GenBank // Mus musculus melanocortin 5 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:123999 IMAGE:40045170), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100723 // GenBank // Mus musculus melanocortin 5 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:123998 IMAGE:40045167), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U08354 // GenBank // Mus musculus melanocortin-5 receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:68338713:68401905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0
XR_141356 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730085E03 gene (A730085E03Rik), misc_RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK080553 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730085E03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:69195704:69198951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000183237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:69256288:69257122:1 gene:ENSMUSG00000098060 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000053144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:69256442:69275566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_201362 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 68 (Ccdc68), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000043929 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:69925466:69969484:1 gene:ENSMUSG00000038903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000080050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:69925576:69969484:1 gene:ENSMUSG00000038903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// BC046343 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 68, mRNA (cDNA clone MGC:54896 IMAGE:6487853), complete cds. // chr18 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// ENSMUST00000151773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:69925426:69944044:1 gene:ENSMUSG00000038903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000010005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:69883853:69951402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_010773 // RefSeq // Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 2 (Mbd2), mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000074058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:70568189:70626131:1 gene:ENSMUSG00000024513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000114946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:70568334:70582912:1 gene:ENSMUSG00000024513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000127260 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:70580789:70622721:1 gene:ENSMUSG00000024513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000128555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:70617773:70625777:1 gene:ENSMUSG00000024513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AF072243 // GenBank // Mus musculus methyl-CpG binding protein MBD2 (Mbd2) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AF072245 // GenBank // Mus musculus testis specific methyl-CpG binding protein MBD2 (Mbd2) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// BC046607 // GenBank // Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:54585 IMAGE:6399206), complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT032935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000009996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:70568417:70630164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
ENSMUST00000082593 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:73611516:73611622:1 gene:ENSMUSG00000064527 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT032984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XR_386338 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9925 (Gm9925), ncRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_398078 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9925 (Gm9925), transcript variant X2, ncRNA. // chr18 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000066583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:74065102:74065584:1 gene:ENSMUSG00000053861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK036329 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630058G16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028868 // RefSeq // Mus musculus CXXC finger 1 (PHD domain) (Cxxc1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000025444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:74216131:74221491:1 gene:ENSMUSG00000024560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY099096 // GenBank // Mus musculus CpG binding protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC012261 // GenBank // Mus musculus CXXC finger 1 (PHD domain), mRNA (cDNA clone IMAGE:3501507), partial cds. // chr18 // 96 // 70 // 22 // 23 // 0 /// BC030938 // GenBank // Mus musculus CXXC finger 1 (PHD domain), mRNA (cDNA clone MGC:32130 IMAGE:3980339), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AK017941 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830420C16 product:CpG binding protein, full insert sequence. // chr18 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000056397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:74207495:74221205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT033019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_013594 // RefSeq // Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 1 (Mbd1), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006525706 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 1 (Mbd1), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000097530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:74268272:74282685:1 gene:ENSMUSG00000024561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK162858 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230058I09 product:methyl-CpG binding domain protein 1, full insert sequence. // chr18 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC069837 // GenBank // Mus musculus methyl-CpG binding domain protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:76676 IMAGE:30435760), complete cds. // chr18 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// AF072240 // GenBank // Mus musculus methyl-CpG binding protein MBD1 (Mbd1) mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// AK032535 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430584N06 product:methyl-CpG binding domain protein 1, full insert sequence. // chr18 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// AK166042 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730030F24 product:methyl-CpG binding domain protein 1, full insert sequence. // chr18 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// GENSCAN00000056420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:74268910:74300322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NR_029424 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 11 (Ccdc11), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000176435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:74283122:74359984:1 gene:ENSMUSG00000035394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC099500 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:117752 IMAGE:30932292), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC125572 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:159275 IMAGE:40130087), complete cds. // chr18 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BC125574 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:159277 IMAGE:40130089), complete cds. // chr18 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NM_028948 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 11 (Ccdc11), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSMUST00000114895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:74283090:74359986:1 gene:ENSMUSG00000035394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSMUST00000177101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:74283162:74300194:1 gene:ENSMUSG00000035394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000056393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:74304094:74400902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// GENSCAN00000056420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:74268910:74300322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
GENSCAN00000056393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:74304094:74400902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_177470 // RefSeq // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acyltransferase 2 (mitochondrial 3-oxoacyl-Coenzyme A thiolase) (Acaa2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000041053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:74779197:74806207:1 gene:ENSMUSG00000036880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC028901 // GenBank // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acyltransferase 2 (mitochondrial 3-oxoacyl-Coenzyme A thiolase), mRNA (cDNA clone MGC:18807 IMAGE:4195488), complete cds. // chr18 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:74779250:74837998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NR_028552 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 58B (Snord58b), small nucleolar RNA. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000082937 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:75001058:75001123:1 gene:ENSMUSG00000064871 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000083919 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:14:52069300:52069369:1 gene:ENSMUSG00000065853 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT020778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT020779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT033044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000082713 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:75001455:75001519:1 gene:ENSMUSG00000064647 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT033045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000082910 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:75001880:75001944:1 gene:ENSMUSG00000064844 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT033046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_006526079 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC031181 (BC031181), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// XM_006526080 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC031181 (BC031181), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000040284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:75005900:75009933:1 gene:ENSMUSG00000036299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK031999 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330535B16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AK077642 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730496F02 product:HYPOTHETICAL 8.0 KDA PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC016084 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC031181, mRNA (cDNA clone MGC:27590 IMAGE:4501468), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC027819 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC031181, mRNA (cDNA clone MGC:38129 IMAGE:5320851), complete cds. // chr18 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC031181 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC031181, mRNA (cDNA clone MGC:37580 IMAGE:4988367), complete cds. // chr18 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
NM_001042660 // RefSeq // Mus musculus SMAD family member 7 (Smad7), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000026999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:75367529:75395935:1 gene:ENSMUSG00000025880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000168918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:75368883:75395479:1 gene:ENSMUSG00000025880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000174411 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:75369976:75394365:1 gene:ENSMUSG00000025880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AF015260 // GenBank // Mus musculus Smad7 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC137638 // GenBank // Mus musculus MAD homolog 7 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169262 IMAGE:8860657), complete cds. // chr18 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:75368786:75394365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NR_045879 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10532 (Gm10532), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181913 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:18:75514645:75522806:1 gene:ENSMUSG00000097712 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145356 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 7C (Zbtb7c), mRNA. // chr18 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// XM_006525736 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 7C (Zbtb7c), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000058997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:75820178:76148561:1 gene:ENSMUSG00000044646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000167921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:76059458:76146443:1 gene:ENSMUSG00000044646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC018187 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 7C, mRNA (cDNA clone MGC:25876 IMAGE:4208891), complete cds. // chr18 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC070424 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 7C, mRNA (cDNA clone MGC:92939 IMAGE:6837447), complete cds. // chr18 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:76087289:76146332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001109743 // RefSeq // Mus musculus SKI family transcriptional corepressor 2 (Skor2), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000166956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:76856405:76900342:1 gene:ENSMUSG00000091519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB358976 // GenBank // Mus musculus mRNA for transcriptional corepressor Corl2, complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:76756217:76894155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_025409 // RefSeq // Mus musculus immediate early response 3 interacting protein 1 (Ier3ip1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000026487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:76930017:76941605:1 gene:ENSMUSG00000090000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000128679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:76930063:76939748:1 gene:ENSMUSG00000090000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000136800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:76930045:76941605:1 gene:ENSMUSG00000090000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC021512 // GenBank // Mus musculus immediate early response 3 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:35760 IMAGE:5351700), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000142456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:76930126:76971449:1 gene:ENSMUSG00000025421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// GENSCAN00000027832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:76929967:76970714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
ENSMUST00000142456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:76930126:76971449:1 gene:ENSMUSG00000025421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
NM_013666 // RefSeq // Mus musculus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 5 (St8sia5), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_153124 // RefSeq // Mus musculus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 5 (St8sia5), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006526431 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 5 (St8sia5), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000075290 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:77185979:77255320:1 gene:ENSMUSG00000025425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000079618 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:77185853:77255450:1 gene:ENSMUSG00000025425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC034855 // GenBank // Mus musculus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 5, mRNA (cDNA clone MGC:41119 IMAGE:5146703), complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:77246056:77254834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0
NM_172834 // RefSeq // Mus musculus lipoxygenase homology domains 1 (Loxhd1), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000035501 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:77307750:77382328:1 gene:ENSMUSG00000032818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000096547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:77281958:77442257:1 gene:ENSMUSG00000032818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000123166 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:77408702:77441886:1 gene:ENSMUSG00000032818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000123410 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:77375065:77442341:1 gene:ENSMUSG00000032818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 53 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000148341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:77332394:77410665:1 gene:ENSMUSG00000032818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// AK030047 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932417K07 product:HYPOTHETICAL 76.6 KDA PROTEIN homolog [Macaca fascicularis], full insert sequence. // chr18 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// FJ750876 // GenBank // Mus musculus LOXHD1 (Loxhd1) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000027834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:77328337:77431235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0
NM_172834 // RefSeq // Mus musculus lipoxygenase homology domains 1 (Loxhd1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:77281958:77442257:1 gene:ENSMUSG00000032818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ750876 // GenBank // Mus musculus LOXHD1 (Loxhd1) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123166 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:77408702:77441886:1 gene:ENSMUSG00000032818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000123410 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:77375065:77442341:1 gene:ENSMUSG00000032818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:77439563:77441869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NR_027978 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930465K10 gene (4930465K10Rik), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:77714210:77715449:1 gene:ENSMUSG00000056682 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC061021 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930465K10 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6774842), partial cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007505 // RefSeq // Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, alpha subunit 1 (Atp5a1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000026495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:77773729:77782869:1 gene:ENSMUSG00000025428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000114748 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:77773956:77782866:1 gene:ENSMUSG00000025428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000128073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:77778955:77781099:1 gene:ENSMUSG00000025428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 92 // 36 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000146869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:77779832:77781889:1 gene:ENSMUSG00000025428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// BC014854 // GenBank // Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, alpha subunit, isoform 1, mRNA (cDNA clone MGC:21588 IMAGE:4500893), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC055892 // GenBank // Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, alpha subunit, isoform 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4190189), partial cds. // chr18 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// L01062 // GenBank // Mouse ATP synthase alpha subunit, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000135678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:77773992:77782655:1 gene:ENSMUSG00000025428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// GENSCAN00000045201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:77774051:78014665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_013831 // RefSeq // Mus musculus proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2 (Pstpip2), mRNA. // chr18 // 94 // 94 // 61 // 65 // 1 /// ENSMUST00000114741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:77794545:77882007:1 gene:ENSMUSG00000025429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 94 // 61 // 65 // 1 /// BC002123 // GenBank // Mus musculus proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:6634 IMAGE:3494357), complete cds. // chr18 // 83 // 83 // 54 // 65 // 1 /// BC057654 // GenBank // Mus musculus proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:68010 IMAGE:4460817), complete cds. // chr18 // 94 // 94 // 61 // 65 // 1 /// CT010308 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836C0252D for gene Pstpip2, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2; complete cds, incl. stopcodon. // chr18 // 77 // 77 // 50 // 65 // 1 /// AK033996 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330137F11 product:proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2, full insert sequence. // chr18 // 38 // 38 // 25 // 65 // 1 /// AK163337 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020015K23 product:similar to Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 23 // 23 // 15 // 65 // 1 /// GENSCAN00000045201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:77774051:78014665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 83 // 83 // 54 // 65 // 1
NM_001195633 // RefSeq // Mus musculus ectopic P-granules autophagy protein 5 homolog (C. elegans) (Epg5), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000044622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:77938467:78035027:1 gene:ENSMUSG00000039840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AK028969 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732475F16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 95 // 47 // 20 // 21 // 0 /// AK122536 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1632 protein. // chr18 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000045201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:77774051:78014665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 62 // 28 // 45 // 1
ENSMUST00000164064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:78349754:78350701:1 gene:ENSMUSG00000090451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC158101 // GenBank // Mus musculus predicted gene, EG620155, mRNA (cDNA clone MGC:189886 IMAGE:9007386), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:78349793:78350365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000158108 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:78648128:78648287:1 gene:ENSMUSG00000088733 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// NONMMUT033176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0
AK048807 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230071H21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003889 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006526529 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription elongation factor 1 homolog (LOC102640717), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_386382 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus expressed sequence AA684185 (AA684185), misc_RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:80012635:80056216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
XM_006526529 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription elongation factor 1 homolog (LOC102640717), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_386382 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus expressed sequence AA684185 (AA684185), misc_RNA. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:80012635:80056216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
NM_053117 // RefSeq // Mus musculus par-6 family cell polarity regulator gamma (Pard6g), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006526527 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus par-6 family cell polarity regulator gamma (Pard6g), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000070219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:80046895:80119640:1 gene:ENSMUSG00000056214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF252290 // GenBank // Mus musculus PAR6A (Par6a) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AK163940 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230079H21 product:par-6 partitioning defective 6 homolog gamma (C. elegans), full insert sequence. // chr18 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// BC025623 // GenBank // Mus musculus par-6 partitioning defective 6 homolog gamma (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:38124 IMAGE:5320756), complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC037678 // GenBank // Mus musculus par-6 partitioning defective 6 homolog gamma (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:47087 IMAGE:3483559), complete cds. // chr18 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0
ENSMUST00000078739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:82338774:82339816:1 gene:ENSMUSG00000058625 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000030609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:82324128:82339816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
AK147472 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain UNDEFINED_CELL_LINE cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1049D24 product:hypothetical Proline-rich region profile/Alanine-rich region profile/Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181931 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:18:82692949:82706174:1 gene:ENSMUSG00000097141 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// KnowTID_00003893 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr18 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// KnowTID_00003894 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr18 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONMMUT033255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// AK144971 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830016F24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr18 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONMMUT033256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001177464 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 516 (Zfp516), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_183033 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 516 (Zfp516), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006526500 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 516 (Zfp516), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006526501 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 516 (Zfp516), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006526503 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 516 (Zfp516), transcript variant X6, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000071233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:82914632:83005314:1 gene:ENSMUSG00000058881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000171238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:82910879:83005314:1 gene:ENSMUSG00000058881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC023380 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 516, mRNA (cDNA clone IMAGE:5012282), complete cds. // chr18 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC053104 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 516, mRNA (cDNA clone MGC:62510 IMAGE:6406544), complete cds. // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:82955703:83001332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
AK135960 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420441M16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003899 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146090 // RefSeq // Mus musculus zinc binding alcohol dehydrogenase, domain containing 2 (Zadh2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:84088158:84097514:1 gene:ENSMUSG00000049090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025897 // GenBank // Mus musculus zinc binding alcohol dehydrogenase, domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5050433), complete cds. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC116427 // GenBank // Mus musculus zinc binding alcohol dehydrogenase, domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:144627 IMAGE:40104327), complete cds. // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC116428 // GenBank // Mus musculus zinc binding alcohol dehydrogenase, domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:144628 IMAGE:40104329), complete cds. // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:84088165:84203956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_173770 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 69, member C (Fam69c), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006526474 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 69, member C (Fam69c), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000052501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:84720242:84740436:1 gene:ENSMUSG00000047992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000161429 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:84720019:84730447:1 gene:ENSMUSG00000047992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 89 // 32 // 8 // 9 // 0 /// BC119040 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B230399E16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155356 IMAGE:8733789), complete cds. // chr18 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC119042 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B230399E16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155358 IMAGE:8733791), complete cds. // chr18 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000159800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:84720277:84739408:1 gene:ENSMUSG00000047992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENSMUST00000161033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:84720883:84730224:1 gene:ENSMUSG00000047992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:84723681:84755600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONMMUT033327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONMMUT033328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_025797 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b5 type A (microsomal) (Cyb5a), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025549 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:84851377:84879592:1 gene:ENSMUSG00000024646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000160180 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:84851338:84880401:1 gene:ENSMUSG00000024646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163083 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:84851879:84879862:1 gene:ENSMUSG00000024646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC024341 // GenBank // Mus musculus cytochrome b-5, mRNA (cDNA clone MGC:35713 IMAGE:4973059), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:84851407:84873582:1 gene:ENSMUSG00000024646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// ENSMUST00000159837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:84877601:84879864:1 gene:ENSMUSG00000024646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000009559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:84851479:84943497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONMMUT033335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONMMUT033337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_015798 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 15 (Fbxo15), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006526505 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box protein 15 (Fbxo15), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000037718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:84935158:84981376:1 gene:ENSMUSG00000034391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AF176530 // GenBank // Mus musculus F-box protein FBX15 mRNA, partial cds. // chr18 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:84952134:85123964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_144946 // RefSeq // Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 1 (Neto1), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526483 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 1 (Neto1), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_006526485 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 1 (Neto1), transcript variant X6, mRNA. // chr18 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000058829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:86394952:86501897:1 gene:ENSMUSG00000050321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF448840 // GenBank // Mus musculus neuropilin and tolloid like-1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AY138990 // GenBank // Mus musculus brain-specific transmembrane protein BTCL1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC051145 // GenBank // Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:58526 IMAGE:6590345), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006526480 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 1 (Neto1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// XM_006526481 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 1 (Neto1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000000172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:86461214:86499122:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 89 // 32 // 8 // 9 // 0
NM_172633 // RefSeq // Mus musculus cerebellin 2 precursor protein (Cbln2), mRNA. // chr18 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:86711110:86718283:1 gene:ENSMUSG00000024647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000122079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:86712065:86718281:1 gene:ENSMUSG00000024647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000122464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:86711520:86717589:1 gene:ENSMUSG00000024647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000169470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:86713048:86718283:1 gene:ENSMUSG00000024647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// AK042555 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730004O05 product:cerebellin 2 precursor protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BC055682 // GenBank // Mus musculus cerebellin 2 precursor protein, mRNA (cDNA clone MGC:66500 IMAGE:6412317), complete cds. // chr18 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:86716276:86716778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0
NM_175542 // RefSeq // Mus musculus rotatin (Rttn), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// XR_386369 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus rotatin (Rttn), transcript variant X6, misc_RNA. // chr18 // 100 // 71 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000023828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:88971790:89131013:1 gene:ENSMUSG00000023066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// AK032605 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430703L12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 35 // 17 // 17 // 0 /// AK141510 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530045K12 product:rotatin, full insert sequence. // chr18 // 27 // 27 // 13 // 49 // 1 /// GENSCAN00000055531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:88892902:89130923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 41 // 41 // 0
ENSMUST00000158383 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:90228899:90228962:1 gene:ENSMUSG00000089008 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT033388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_198295 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin-related transmembrane protein 3 (Tmx3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000025515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:90510154:90543267:1 gene:ENSMUSG00000024614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK048502 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130066O11 product:KIAA1830 PROTEIN (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// AK157865 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930001M20 product:hypothetical Thioredoxin type domain containing protein, full insert sequence. // chr18 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// AK050932 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030040K20 product:hypothetical Thioredoxin containing protein, full insert sequence. // chr18 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// GENSCAN00000044236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:90510323:90540196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NONMMUT033393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT033394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT033395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT033396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
GENSCAN00000022887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:3858155:3899805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_178722 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 438 (Zfp438), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000063989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:5210031:5334439:-1 gene:ENSMUSG00000050945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC096460 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 438, mRNA (cDNA clone MGC:106112 IMAGE:5374843), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK020518 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430091M14 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000034552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:5210640:5391163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT031326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_008448 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 5B (Kif5b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025083 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:6201002:6241523:-1 gene:ENSMUSG00000006740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000163210 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:6214569:6241470:-1 gene:ENSMUSG00000006740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000164426 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:6213446:6224029:-1 gene:ENSMUSG00000006740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000168031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:6203089:6214540:-1 gene:ENSMUSG00000006740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AK085221 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530024B08 product:KINESIN HEAVY CHAIN (FRAGMENT) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr18 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC090841 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 5B, mRNA (cDNA clone MGC:102147 IMAGE:30543821), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U86090 // GenBank // Mus musculus pancreatic beta-cell kinesin heavy chain mRNA, complete cds. // chr18 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:6181718:6241107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0
NM_007935 // RefSeq // Mus musculus enhancer of polycomb homolog 1 (Drosophila) (Epc1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// NM_027497 // RefSeq // Mus musculus enhancer of polycomb homolog 1 (Drosophila) (Epc1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000028100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:6435953:6490856:-1 gene:ENSMUSG00000024240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000115870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:18:6435951:6516108:-1 gene:ENSMUSG00000024240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// AF079765 // GenBank // Mus musculus enhancer of polycomb (Epc1) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// BC055805 // GenBank // Mus musculus enhancer of polycomb homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:6413718), complete cds. // chr18 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// BC060145 // GenBank // Mus musculus enhancer of polycomb homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:6413718), complete cds. // chr18 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// BC138622 // GenBank // Mus musculus enhancer of polycomb homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:170247 IMAGE:8861642), complete cds. // chr18 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// BC138623 // GenBank // Mus musculus enhancer of polycomb homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:170248 IMAGE:8861643), complete cds. // chr18 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:6408358:6466242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 25 // 39 // 1
NM_177595 // RefSeq // Mus musculus mohawk homeobox (Mkx), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000079788 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:6934966:7004780:-1 gene:ENSMUSG00000061013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC137728 // GenBank // Mus musculus mohawk homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:169352 IMAGE:8860747), complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188926 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:6936952:6992988:-1 gene:ENSMUSG00000061013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000034226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:6989302:7044148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_175245 // RefSeq // Mus musculus mitotic spindle organizing protein 1 (Mzt1), mRNA. // chr18 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSMUST00000042662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:14:99034544:99046136:-1 gene:ENSMUSG00000033186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// AK165798 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630079P09 product:Hypothetical arginine-rich region containing protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr18 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC117005 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410129H14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151382 IMAGE:40126324), complete cds. // chr18 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC117007 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410129H14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151384 IMAGE:40126326), complete cds. // chr18 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0
NM_001081393 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 4 (Armc4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000081275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:7088233:7297901:-1 gene:ENSMUSG00000061802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC158097 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:189991 IMAGE:9088178), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:7121382:7294611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001081393 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 4 (Armc4), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000081275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:7088233:7297901:-1 gene:ENSMUSG00000061802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC158097 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:189991 IMAGE:9088178), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:7121382:7294611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001081287 // RefSeq // Mus musculus membrane protein, palmitoylated 7 (MAGUK p55 subfamily member 7) (Mpp7), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526328 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane protein, palmitoylated 7 (MAGUK p55 subfamily member 7) (Mpp7), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:7347962:7626863:-1 gene:ENSMUSG00000057440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141108 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230053G20 product:Similar to membrane protein, palmitoylated 3 (MAGUK p55 subfamily member 3) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006526414 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/arginine repetitive matrix protein 1-like (LOC102637317), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK047780 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030036C03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153086 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, delta 4 (Gjd4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525809 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gap junction protein, delta 4 (Gjd4), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000041007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:9278607:9282809:-1 gene:ENSMUSG00000036855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137984 // GenBank // Mus musculus gap junction protein, delta 4, mRNA (cDNA clone MGC:169608 IMAGE:8861003), complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:9279982:9286692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_026484 // RefSeq // Mus musculus cyclin Y (Ccny), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006526198 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin Y (Ccny), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006526200 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin Y (Ccny), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000053917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:9314044:9450150:-1 gene:ENSMUSG00000024286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC023321 // GenBank // Mus musculus cyclin Y, mRNA (cDNA clone MGC:28252 IMAGE:3995040), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC035524 // GenBank // Mus musculus cyclin Y, mRNA (cDNA clone MGC:40707 IMAGE:4974858), complete cds. // chr18 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK014201 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110050L10 product:weakly similar to CYCLIN-BOX CARRYING PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000023579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:9316319:9373839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONMMUT031417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_007593 // RefSeq // Mus musculus centrin 1 (Cetn1), mRNA. // chr18 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:9615524:9619478:-1 gene:ENSMUSG00000050996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK076986 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930590H21 product:centrin 2, full insert sequence. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC048488 // GenBank // Mus musculus centrin 1, mRNA (cDNA clone MGC:58297 IMAGE:6775067), complete cds. // chr18 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC061155 // GenBank // Mus musculus centrin 1, mRNA (cDNA clone MGC:74289 IMAGE:6774850), complete cds. // chr18 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
XM_006543401 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 60S ribosomal protein L24-like (LOC102639220), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000171339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:9726197:9726670:-1 gene:ENSMUSG00000091285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:9726197:9726643:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0
NM_009071 // RefSeq // Mus musculus Rho-associated coiled-coil containing protein kinase 1 (Rock1), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000067947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:10064401:10181792:-1 gene:ENSMUSG00000024290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// U58512 // GenBank // Mus musculus Rho-associated, coiled-coil forming protein kinase p160 ROCK-1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AK149793 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530017K17 product:Rho-associated coiled-coil forming kinase 1, full insert sequence. // chr18 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000015614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:9996097:10145844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_134130 // RefSeq // Mus musculus abhydrolase domain containing 3 (Abhd3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_385966 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus abhydrolase domain containing 3 (Abhd3), transcript variant X1, misc_RNA. // chr18 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000002549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:10644413:10706696:-1 gene:ENSMUSG00000002475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117726 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:10644413:10706713:-1 gene:ENSMUSG00000002475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117828 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:10644411:10706771:-1 gene:ENSMUSG00000002475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144150 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:10644413:10658789:-1 gene:ENSMUSG00000002475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AF429302 // GenBank // Mus musculus lung alpha/beta hydrolase fold protein 3 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026770 // GenBank // Mus musculus abhydrolase domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:30497 IMAGE:4234600), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:10645057:10706691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_029547 // RefSeq // Mus musculus microRNA 133a-1 (Mir133a-1), microRNA. // chr18 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// ENSMUST00000083465 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:10782899:10782985:-1 gene:ENSMUSG00000065399 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-133a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000159 Mus musculus miR-133a-1 stem-loop // chr18 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// NONMMUT031465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0
NR_029781 // RefSeq // Mus musculus microRNA 1a-2 (Mir1a-2), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-1a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000652 Mus musculus miR-1a-2 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT031467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_008720 // RefSeq // Mus musculus Niemann-Pick type C1 (Npc1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:12189693:12236400:-1 gene:ENSMUSG00000024413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF003348 // GenBank // Mus musculus NPC1 (Npc1) mRNA, complete cds. // chr18 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// BC052437 // GenBank // Mus musculus Niemann Pick type C1, mRNA (cDNA clone MGC:63262 IMAGE:6405214), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC054539 // GenBank // Mus musculus Niemann Pick type C1, mRNA (cDNA clone MGC:62352 IMAGE:6405214), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:12190920:12236237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_001190371 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 29 (Ankrd29), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525813 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 29 (Ankrd29), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000118525 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:18:12252362:12305711:-1 gene:ENSMUSG00000057766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000122408 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:12254582:12305638:-1 gene:ENSMUSG00000057766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006525816 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 29 (Ankrd29), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// ENSMUST00000137948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:12252365:12271697:-1 gene:ENSMUSG00000057766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// AK162301 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030404I02 product:hypothetical Ankyrin/Ankyrin repeat profile/Ankyrin repeat region circular profile containing protein, full insert sequence. // chr18 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:12254594:12305631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000037329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:13126519:13131561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000083216 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:13209702:13209808:-1 gene:ENSMUSG00000096288 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONMMUT031533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_145492 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 521 (Zfp521), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000025288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:13687013:13972733:-1 gene:ENSMUSG00000024420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK131130 // GenBank // Mus musculus mRNA for mFLJ00107 protein. // chr18 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AY147406 // GenBank // Mus musculus ecotropic viral integration site 3 (Evi3) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC021376 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 521, mRNA (cDNA clone MGC:29358 IMAGE:5038671), complete cds. // chr18 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// BC023458 // GenBank HTC // Mus musculus zinc finger protein 521, mRNA (cDNA clone IMAGE:5006429), with apparent retained intron. // chr18 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:13816032:13891338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0
NM_199055 // RefSeq // Mus musculus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 9 (Chst9), mRNA. // chr18 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:15451924:15718046:-1 gene:ENSMUSG00000047161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:15451924:15760157:-1 gene:ENSMUSG00000047161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AB106879 // GenBank // Mus musculus mRNA for GalNAc 4-sulfotransferase 2, complete cds. // chr18 // 88 // 71 // 22 // 25 // 0 /// AK017407 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430438D01 product:similar to N-ACETYLGALACTOSAMINE 4-O-SULFOTRANSFERASE 2 GALNAC4ST-2 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC107361 // GenBank // Mus musculus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 9, mRNA (cDNA clone MGC:130338 IMAGE:40056052), complete cds. // chr18 // 83 // 69 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:15452263:15531008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0
NM_007664 // RefSeq // Mus musculus cadherin 2 (Cdh2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006525553 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cadherin 2 (Cdh2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025166 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:16588877:16809246:-1 gene:ENSMUSG00000024304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000115850 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:16589023:16670069:-1 gene:ENSMUSG00000024304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// AB008811 // GenBank // Mus musculus mRNA for N-cadherin, complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC022107 // GenBank // Mus musculus cadherin 2, mRNA (cDNA clone MGC:36119 IMAGE:5100313), complete cds. // chr18 // 90 // 88 // 27 // 30 // 0 /// M31131 // GenBank // Mouse neural cadherin (N-cadherin) mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:16590147:16672430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
ENSMUST00000121272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:16839317:16839957:-1 gene:ENSMUSG00000082608 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT031601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000008308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:16831710:16884968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NR_033607 // RefSeq // Mus musculus Riken cDNA 4921533I20 gene (4921533I20Rik), non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:17234775:17239957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// KnowTID_00003923 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT031610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT031611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001291809 // RefSeq // Mus musculus desmocollin 3 (Dsc3), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_007882 // RefSeq // Mus musculus desmocollin 3 (Dsc3), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000115848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:19960930:20002097:-1 gene:ENSMUSG00000059898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// Y11169 // GenBank // M.musculus mRNA for MDSC3 gene. // chr18 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:19956350:19989673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_013505 // RefSeq // Mus musculus desmocollin 2 (Dsc2), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000039247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:20030633:20059554:-1 gene:ENSMUSG00000024331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000075214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:20030633:20059478:-1 gene:ENSMUSG00000024331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000128464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:20031479:20059509:-1 gene:ENSMUSG00000024331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000155407 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:20031343:20038139:-1 gene:ENSMUSG00000024331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// BC057867 // GenBank // Mus musculus desmocollin 2, mRNA (cDNA clone MGC:68027 IMAGE:5327748), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// L33779 // GenBank // Mus musculus desmocollin type 2 (DSC2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr18 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000035643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:20026125:20059252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// AK029159 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732499D03 product:desmocollin 2, full insert sequence. // chr18 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0
NM_001291804 // RefSeq // Mus musculus desmocollin 1 (Dsc1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_013504 // RefSeq // Mus musculus desmocollin 1 (Dsc1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000038710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:20084703:20114773:-1 gene:ENSMUSG00000044322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK036893 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930022D13 product:desmocollin 1, full insert sequence. // chr18 // 96 // 68 // 26 // 27 // 0 /// BC109161 // GenBank // Mus musculus desmocollin 1, mRNA (cDNA clone MGC:129348 IMAGE:40047883), complete cds. // chr18 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:20085554:20136116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000035613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:20548587:20552491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
NM_019737 // RefSeq // Mus musculus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4-galactosyltransferase, polypeptide 6 (B4galt6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000070080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:20684599:20746404:-1 gene:ENSMUSG00000056124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF097158 // GenBank // Mus musculus UDP-Gal:glucosylceramide beta-1,4-galactosyltransferase mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF142674 // GenBank // Mus musculus beta-1,4-galactosyltransferase VI mRNA, complete cds. // chr18 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// BC011149 // GenBank // Mus musculus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4-galactosyltransferase, polypeptide 6, mRNA (cDNA clone MGC:19296 IMAGE:4037384), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:20682592:20695498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_029491 // RefSeq // Mus musculus trafficking protein particle complex 8 (Trappc8), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 72 // 34 // 34 // 0 /// NM_177038 // RefSeq // Mus musculus trafficking protein particle complex 8 (Trappc8), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000025177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:20817224:20896078:-1 gene:ENSMUSG00000033382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000097658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:20846145:20896078:-1 gene:ENSMUSG00000033382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 34 // 34 // 0 /// AK041615 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630024N23 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr18 // 28 // 28 // 13 // 47 // 1 /// GENSCAN00000035629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:20815707:20926178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000157924 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:20844447:20844592:-1 gene:ENSMUSG00000088549 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT031634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK162814 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130099J24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
NM_001033445 // RefSeq // Mus musculus GRB2 associated, regulator of MAPK1 (Garem), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:21127201:21300138:-1 gene:ENSMUSG00000042680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK220564 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4238 protein. // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000054837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:21127260:21171965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001081403 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 14 (Klhl14), mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:21550377:21652368:-1 gene:ENSMUSG00000042514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:21550379:21654718:-1 gene:ENSMUSG00000042514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_027616 // RefSeq // Mus musculus coiled coil domain containing 178 (Ccdc178), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000025160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:21810897:22171396:-1 gene:ENSMUSG00000024306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000115837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:21811298:22166476:-1 gene:ENSMUSG00000024306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// BC140993 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921528I01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175954 IMAGE:9055605), complete cds. // chr18 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// BC145066 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921528I01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178622 IMAGE:9053614), complete cds. // chr18 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// BC145069 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921528I01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178625 IMAGE:9053617), complete cds. // chr18 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000013865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:21949270:22150471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0
NM_199024 // RefSeq // Mus musculus nucleolar protein 4 (Nol4), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:22693634:23041653:-1 gene:ENSMUSG00000041923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164186 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:22694535:23040344:-1 gene:ENSMUSG00000041923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164893 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:22694524:23040078:-1 gene:ENSMUSG00000041923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK032191 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430409O06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:23038524:23040042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199024 // RefSeq // Mus musculus nucleolar protein 4 (Nol4), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526417 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102637872 (LOC102637872), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:22693634:23041653:-1 gene:ENSMUSG00000041923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:23041143:23092761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000115829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:23970975:23981555:-1 gene:ENSMUSG00000024274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC117067 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 397 opposite strand, mRNA (cDNA clone MGC:151444 IMAGE:40126386), complete cds. // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC117069 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 397 opposite strand, mRNA (cDNA clone MGC:151446 IMAGE:40126388), complete cds. // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK049082 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230097I24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr18 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// XM_006526395 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and SCAN domain containing 30 (Zscan30), transcript variant X5, mRNA. // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:23954700:24018087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_021559 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 191 (Zfp191), mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066497 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:24009702:24020810:-1 gene:ENSMUSG00000051469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153337 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:24013925:24020320:-1 gene:ENSMUSG00000051469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AF149093 // GenBank // Mus musculus zinc finger ZF-12 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// AY832930 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 191 (Znp191) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC011345 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 191, mRNA (cDNA clone MGC:19271 IMAGE:3992743), complete cds. // chr18 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC054832 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 191, mRNA (cDNA clone MGC:62583 IMAGE:6467818), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148525 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:24017971:24020370:-1 gene:ENSMUSG00000051469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_172625 // RefSeq // Mus musculus INO80 complex subunit C (Ino80c), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055012 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:24106374:24121835:-1 gene:ENSMUSG00000047989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000125169 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:24106378:24114913:-1 gene:ENSMUSG00000047989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000153360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:24104757:24121953:-1 gene:ENSMUSG00000047989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC060961 // GenBank // Mus musculus INO80 complex subunit C, mRNA (cDNA clone MGC:74050 IMAGE:6740719), complete cds. // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000141489 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:24104757:24121953:-1 gene:ENSMUSG00000047989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000055045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:24106527:24200533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NR_029573 // RefSeq // Mus musculus microRNA 187 (Mir187), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083598 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:24429110:24429170:-1 gene:ENSMUSG00000065532 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-187 // miRBase Micro RNA Database // MI0000229 Mus musculus miR-187 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT031714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_144861 // RefSeq // Mus musculus regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A (Rprd1a), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000046206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:24484962:24530204:-1 gene:ENSMUSG00000040446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC021395 // GenBank // Mus musculus regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, mRNA (cDNA clone MGC:29396 IMAGE:5067723), complete cds. // chr18 // 86 // 85 // 24 // 28 // 0 /// BC023084 // GenBank // Mus musculus regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, mRNA (cDNA clone MGC:36325 IMAGE:4946165), complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AK137068 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430060J10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// AK161533 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5031431K21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000055042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:24488182:24515417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_139143 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 39 (metal ion transporter), member 6 (Slc39a6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000070726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:24579881:24603817:-1 gene:ENSMUSG00000024270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000128106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:24596317:24599420:-1 gene:ENSMUSG00000024270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// AB071697 // GenBank // Mus musculus ermelin mRNA for endoplasmic reticulum membrane protein, complete cds. // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC054780 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (metal ion transporter), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:65579 IMAGE:6813896), complete cds. // chr18 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC055012 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (metal ion transporter), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:62673 IMAGE:6337369), complete cds. // chr18 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000154205 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:24582308:24603515:-1 gene:ENSMUSG00000024270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// GENSCAN00000055035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:24577929:24601630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000067987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:24709040:24709348:-1 gene:ENSMUSG00000054745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK020839 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930009H06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK040234 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430079P20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004361 // RefSeq // Mus musculus tubulin polyglutamylase complex subunit 2 (Tpgs2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_001142697 // RefSeq // Mus musculus tubulin polyglutamylase complex subunit 2 (Tpgs2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000115817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:25136037:25169007:-1 gene:ENSMUSG00000024269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC060253 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730494M16 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5694091), partial cds. // chr18 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// BC080777 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730494M16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:91164 IMAGE:30439612), complete cds. // chr18 // 69 // 80 // 11 // 16 // 0 /// NM_001142698 // RefSeq // Mus musculus tubulin polyglutamylase complex subunit 2 (Tpgs2), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// ENSMUST00000148255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:18:25127223:25168694:-1 gene:ENSMUSG00000024269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// AK160220 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610305M14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1 /// GENSCAN00000006901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:25138671:25168608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 92 // 65 // 12 // 13 // 0
ENSMUST00000151645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:25823581:25824357:-1 gene:ENSMUSG00000087121 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000006876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:25823572:25824357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// NONMMUT031745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0
GENSCAN00000018564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:31349481:31495850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_009308 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin IV (Syt4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:31437808:31447415:-1 gene:ENSMUSG00000024261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052738 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin IV, mRNA (cDNA clone IMAGE:6832499). // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC058208 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin IV, mRNA (cDNA clone MGC:65198 IMAGE:5361684), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:31349481:31495850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// U10355 // GenBank // Mus musculus BALB/c synaptotagmin 4 (syt4) mRNA, complete cds. // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_026165 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 46 (Slc25a46), mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526185 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 25, member 46 (Slc25a46), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006526186 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 25, member 46 (Slc25a46), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000060396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:31580168:31609902:-1 gene:ENSMUSG00000024259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC020087 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 46, mRNA (cDNA clone MGC:28937 IMAGE:3990909), complete cds. // chr18 // 83 // 80 // 20 // 24 // 0 /// AK161372 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930509H08 product:1200007B05Rik protein (TB1 protein homolog) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr18 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AK078383 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6530437D17 product:similar to TB1 PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000018560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:31583191:31619818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_026006 // RefSeq // Mus musculus SFT2 domain containing 3 (Sft2d3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000054984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:31909094:31911903:-1 gene:ENSMUSG00000044982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_026006 // RefSeq // Mus musculus SFT2 domain containing 3 (Sft2d3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:31909094:31911903:-1 gene:ENSMUSG00000044982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:31910600:31911238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0
NM_001025381 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 17 (Gpr17), mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000064016 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:31942997:31949636:-1 gene:ENSMUSG00000052229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC070439 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 17, mRNA (cDNA clone MGC:99918 IMAGE:30533246), complete cds. // chr18 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:31946989:31948008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0
NM_032394 // RefSeq // Mus musculus myosin VIIB (Myo7b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000134663 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:31959234:32036961:-1 gene:ENSMUSG00000024388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AF242411 // GenBank // Mus musculus myosin-VIIb mRNA, complete cds. // chr18 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// BC138338 // GenBank // Mus musculus myosin VIIB, mRNA (cDNA clone MGC:169963 IMAGE:8861358), complete cds. // chr18 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// BC138341 // GenBank // Mus musculus myosin VIIB, mRNA (cDNA clone MGC:169966 IMAGE:8861361), complete cds. // chr18 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000020241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:31959401:32020460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0
NM_001042767 // RefSeq // Mus musculus protein C (Proc), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NM_001042768 // RefSeq // Mus musculus protein C (Proc), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_008934 // RefSeq // Mus musculus protein C (Proc), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// NR_045173 // RefSeq // Mus musculus protein C (Proc), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr18 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525721 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein C (Proc), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000171765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:32123129:32139570:-1 gene:ENSMUSG00000024386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AF318182 // GenBank // Mus musculus anticoagulant protein C mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// BC013896 // GenBank // Mus musculus protein C, mRNA (cDNA clone MGC:13870 IMAGE:4211329), complete cds. // chr18 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// D10445 // GenBank // Mus musculus mRNA for protein C, complete cds. // chr18 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:32123230:32138174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
NM_001048207 // RefSeq // Mus musculus glycophorin C (Gypc), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526273 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycophorin C (Gypc), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000174000 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:32528325:32559980:-1 gene:ENSMUSG00000090523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000174459 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:32528322:32560034:-1 gene:ENSMUSG00000090523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY234183 // GenBank // Mus musculus glycophorin C mRNA, complete cds. // chr18 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC027408 // GenBank // Mus musculus glycophorin C, mRNA (cDNA clone MGC:37138 IMAGE:4952917), complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000029171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34125614:34164450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000157988 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:34188878:34188939:-1 gene:ENSMUSG00000096804 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT031891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NR_040534 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10548 (Gm10548), non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000097631 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:34207775:34221772:-1 gene:ENSMUSG00000073607 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000165672 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:34209799:34210070:-1 gene:ENSMUSG00000073607 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34209688:34247661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT031892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT031893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NR_040534 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10548 (Gm10548), non-coding RNA. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000097631 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:34207775:34221772:-1 gene:ENSMUSG00000073607 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AK132217 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3526401A09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT031892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_007874 // RefSeq // Mus musculus receptor accessory protein 5 (Reep5), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_385972 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus receptor accessory protein 5 (Reep5), transcript variant X1, misc_RNA. // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000006027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:34344889:34373415:-1 gene:ENSMUSG00000005873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY562233 // GenBank // Mus musculus receptor expression enhancing protein 5 (Reep5) mRNA, complete cds. // chr18 // 89 // 70 // 17 // 19 // 0 /// BC013052 // GenBank // Mus musculus receptor accessory protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:5997 IMAGE:3585290), complete cds. // chr18 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// U28168 // GenBank // Mus musculus GP106 mRNA, complete cds. // chr18 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34347119:34373519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
ENSMUST00000040506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:34442352:34506823:-1 gene:ENSMUSG00000036501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// AK029766 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930539C08 product:similar to GAP-LIKE PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// BC029030 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 13, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4951363), complete cds. // chr18 // 93 // 30 // 13 // 14 // 0 /// BC031465 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 13, member B, mRNA (cDNA clone MGC:25564 IMAGE:3981146), complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// XM_006525855 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 13, member B (Fam13b), transcript variant X8, mRNA. // chr18 // 65 // 65 // 30 // 46 // 1 /// AK084711 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330034P09 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr18 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// GENSCAN00000029177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34442642:34532352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0
NM_177773 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933408B17 gene (4933408B17Rik), transcript variant hypothetical protein LOC271508, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000056932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:34579846:34597468:-1 gene:ENSMUSG00000049357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000129566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:34579945:34597345:-1 gene:ENSMUSG00000049357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC172130 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054800. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34561524:34623621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_178347 // RefSeq // Mus musculus CDC23 cell division cycle 23 (Cdc23), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006526084 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CDC23 cell division cycle 23 (Cdc23), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000025228 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:34630951:34651735:-1 gene:ENSMUSG00000024370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000133162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:34636054:34651718:-1 gene:ENSMUSG00000024370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000133181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:34631683:34651735:-1 gene:ENSMUSG00000024370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK075948 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410024H11 product:CDC23 (cell division cycle 23, yeast, homolog), full insert sequence. // chr18 // 94 // 86 // 29 // 31 // 0 /// AK079681 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430012E21 product:similar to CELL DIVISION CYCLE PROTEIN 23 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 92 // 72 // 24 // 26 // 0 /// BC059013 // GenBank // Mus musculus CDC23 (cell division cycle 23, yeast, homolog), mRNA (cDNA clone MGC:69646 IMAGE:6813730), complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000136943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:34641383:34645319:-1 gene:ENSMUSG00000024370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000029175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34633146:34651707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_010280 // RefSeq // Mus musculus glial cell line derived neurotrophic factor family receptor alpha 3 (Gfra3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000025224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:34689903:34720387:-1 gene:ENSMUSG00000024366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB008833 // GenBank // Mus musculus mRNA for GFRalpha-3, complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF020305 // GenBank // Mus musculus glial cell line-derived neurotrophic factor family receptor alpha-3 (gfra-3) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AF036163 // GenBank // Mus musculus glial cell line-derived neurotrophic factor family receptor alpha 3 (gfra3) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF041842 // GenBank // Mus musculus glial cell line-derived neurotrophic factor family receptor alpha-3 (gfra3) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// AF051766 // GenBank // Mus musculus GDNF family receptor alpha 3 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC066202 // GenBank // Mus musculus glial cell line derived neurotrophic factor family receptor alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:76710 IMAGE:6430904), complete cds. // chr18 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34668034:34720220:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_009860 // RefSeq // Mus musculus cell division cycle 25C (Cdc25c), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000060710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:34732997:34751533:-1 gene:ENSMUSG00000044201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC004669 // GenBank // Mus musculus cell division cycle 25 homolog C (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:6032 IMAGE:3498846), complete cds. // chr18 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// L16926 // GenBank // Mus musculus cdc25 phosphatase mRNA, 5 end. // chr18 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// U15562 // GenBank // Mus musculus CDC25 (Cdc25) mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0
NM_144866 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation termination factor 1 (Etf1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000025218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:34902785:34932007:-1 gene:ENSMUSG00000024360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC013717 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation termination factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:18745 IMAGE:3992883), complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000030995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34904988:34970738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
NM_010481 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 9 (Hspa9), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000025217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:34937414:34954357:-1 gene:ENSMUSG00000024359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC052727 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:64668 IMAGE:6813991), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC057343 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:67041 IMAGE:6813991), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// D11089 // GenBank // Mus musculus mRNA for p66 mot1, complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// D17556 // GenBank // Mus musculus PBP74 mRNA for mitochondrial stress-70 protein, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000030995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34904988:34970738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1
ENSMUST00000083970 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:34942644:34942713:-1 gene:ENSMUSG00000065904 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT031929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178005 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat transmembrane neuronal 2 (Lrrtm2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000091636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:35209011:35215024:-1 gene:ENSMUSG00000071862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY182027 // GenBank // Mus musculus leucine-rich repeat transmembrane neuronal 2 protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000030994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35212700:35214211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_030749 // RefSeq // Mus musculus endoplasmic reticulum chaperone SIL1 homolog (S. cerevisiae) (Sil1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006526365 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endoplasmic reticulum chaperone SIL1 homolog (S. cerevisiae) (Sil1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526366 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endoplasmic reticulum chaperone SIL1 homolog (S. cerevisiae) (Sil1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526367 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endoplasmic reticulum chaperone SIL1 homolog (S. cerevisiae) (Sil1), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000025215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:35266400:35498925:-1 gene:ENSMUSG00000024357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC016119 // GenBank // Mus musculus endoplasmic reticulum chaperone SIL1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:28789 IMAGE:4489217), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC016466 // GenBank // Mus musculus endoplasmic reticulum chaperone SIL1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:7902 IMAGE:3582798), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000031005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35266553:35342754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_011397 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 23 (nucleobase transporters), member 1 (Slc23a1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000025212 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:35614604:35627244:-1 gene:ENSMUSG00000024354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000150877 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:35619374:35627196:-1 gene:ENSMUSG00000024354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF058318 // GenBank // Mus musculus yolk sac permease-like molecule 3 (Yspl3) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC013528 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 23 (nucleobase transporters), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:19208 IMAGE:4238222), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35619405:35629790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_027222 // RefSeq // Mus musculus marginal zone B and B1 cell-specific protein 1 (Mzb1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:35647266:35649367:-1 gene:ENSMUSG00000024353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK088094 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430004A15 product:weakly similar to PROAPOPTOTIC CASPASE ADAPTOR PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC030674 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010001M09 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:1054160), partial cds. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC064044 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010001M09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:73549 IMAGE:875322), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GQ477351 // GenBank // Mus musculus plasma cell-induced ER protein 1 mRNA, complete cds. // chr18 // 71 // 84 // 15 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35647570:35662128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001270646 // RefSeq // Mus musculus proline rich basic protein 1 (Prob1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:35652167:35655187:-1 gene:ENSMUSG00000073600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190196 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:35650351:35655240:-1 gene:ENSMUSG00000073600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35647570:35662128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_027733 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 24 (Spata24), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// NM_029485 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 24 (Spata24), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// XM_006526248 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spermatogenesis associated 24 (Spata24), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:35656690:35662186:-1 gene:ENSMUSG00000024352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000096573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:35660017:35662186:-1 gene:ENSMUSG00000024352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// AK016341 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930583E11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// AY730532 // GenBank // Mus musculus TATA-binding protein-like factor-interacting protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// BC060950 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5133400G04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:74038 IMAGE:6773733), complete cds. // chr18 // 97 // 74 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000031002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35647570:35662128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 72 // 72 // 28 // 39 // 1
NM_029669 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 18 (Dnajc18), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526346 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 18 (Dnajc18), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:35671103:35703144:-1 gene:ENSMUSG00000024350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC026452 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:31436 IMAGE:4460764), complete cds. // chr18 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35675119:35703065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001033141 // RefSeq // Mus musculus endothelial cell surface expressed chemotaxis and apoptosis regulator (Ecscr), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000097618 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:35713086:35721491:-1 gene:ENSMUSG00000073599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000123973 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:35713760:35717290:-1 gene:ENSMUSG00000073599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000133064 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:35713086:35722356:-1 gene:ENSMUSG00000073599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000134656 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:35713273:35717290:-1 gene:ENSMUSG00000073599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// EU025067 // GenBank // Mus musculus ARIA (Aria) mRNA, complete cds. // chr18 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35705930:35722286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT031972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_001289591 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 173 (Tmem173), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001289592 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 173 (Tmem173), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_028261 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 173 (Tmem173), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006526283 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 173 (Tmem173), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000115728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:35733678:35740554:-1 gene:ENSMUSG00000024349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC046640 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 173, mRNA (cDNA clone MGC:49267 IMAGE:5067343), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// DQ910493 // GenBank // Mus musculus MPYS (Mpys) mRNA, Mpys-k allele, complete cds. // chr18 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// FJ222242 // GenBank // Mus musculus mitochondrial mediator of IRF3 activation (Mita) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr18 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35734505:35749250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_001167891 // RefSeq // Mus musculus neuregulin 2 (Nrg2), mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000115705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36027396:36197232:-1 gene:ENSMUSG00000060275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000115712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36017707:36197380:-1 gene:ENSMUSG00000060275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000115713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:36017707:36197380:-1 gene:ENSMUSG00000060275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525465 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuregulin 2 (Nrg2), transcript variant X5, mRNA. // chr18 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// XM_006525466 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuregulin 2 (Nrg2), transcript variant X6, mRNA. // chr18 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000042537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36017914:36059084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_026027 // RefSeq // Mus musculus prefoldin 1 (Pfdn1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:36403679:36454495:-1 gene:ENSMUSG00000024346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC024693 // GenBank // Mus musculus prefoldin 1, mRNA (cDNA clone MGC:19010 IMAGE:4020579), complete cds. // chr18 // 75 // 83 // 15 // 20 // 0 /// BC094627 // GenBank // Mus musculus prefoldin 1, mRNA (cDNA clone MGC:106967 IMAGE:1532309), complete cds. // chr18 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000042529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36404377:36454485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_010415 // RefSeq // Mus musculus heparin-binding EGF-like growth factor (Hbegf), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:36504929:36515805:-1 gene:ENSMUSG00000024486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089607 // GenBank // Mus musculus heparin-binding EGF-like growth factor, mRNA (cDNA clone MGC:107656 IMAGE:6751441), complete cds. // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// L07264 // GenBank // Mus musculus heparin-binding EGF-like growth factor precursor, mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AK052084 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230044K20 product:heparin binding epidermal growth factor-like growth factor, full insert sequence. // chr18 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000042519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36459572:36515513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_146085 // RefSeq // Mus musculus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 3 (Apbb3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006525861 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 3 (Apbb3), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000001415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:36671160:36679366:-1 gene:ENSMUSG00000006050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000001379 // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK171634 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830001J15 product:amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 3, full insert sequence. // chr18 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// BC024809 // GenBank // Mus musculus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:38710 IMAGE:5357681), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000042531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36671439:36678644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_172831 // RefSeq // Mus musculus Riken cDNA E230025N22 gene (E230025N22Rik), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006525913 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Riken cDNA E230025N22 gene (E230025N22Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000115682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:36684923:36695925:-1 gene:ENSMUSG00000044719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006525914 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Riken cDNA E230025N22 gene (E230025N22Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36685326:36696479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_009841 // RefSeq // Mus musculus CD14 antigen (Cd14), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:36725074:36726736:-1 gene:ENSMUSG00000051439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC057889 // GenBank // Mus musculus CD14 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:68190 IMAGE:4981093), complete cds. // chr18 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// CT010355 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A0253D for gene Cd14, CD14 antigen; complete cds, incl. stopcodon. // chr18 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK169880 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630002F16 product:CD14 antigen, full insert sequence. // chr18 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000042520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36725300:36726491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_010885 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 2 (Ndufa2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000014438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:36742332:36744557:-1 gene:ENSMUSG00000014294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF124786 // GenBank // Mus musculus NADH-ubiquinone oxidoreductase B8 subunit (Ndufa2) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr18 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC006815 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 2, mRNA (cDNA clone MGC:11399 IMAGE:3155763), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36742567:36744520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000124038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36763675:36766198:-1 gene:ENSMUSG00000044595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000155827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36763671:36766214:-1 gene:ENSMUSG00000044595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC034897 // GenBank // Mus musculus dead end homolog 1 (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:41452 IMAGE:3470697), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_173383 // RefSeq // Mus musculus dead end homolog 1 (zebrafish) (Dnd1), mRNA. // chr18 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// ENSMUST00000061522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:36763673:36766198:-1 gene:ENSMUSG00000044595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1 /// AY321066 // GenBank // Mus musculus dead end protein mRNA, complete cds. // chr18 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// GENSCAN00000042522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36764033:36783100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
NM_008214 // RefSeq // Mus musculus histidyl-tRNA synthetase (Hars), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000001416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:36766530:36783205:-1 gene:ENSMUSG00000001380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC020088 // GenBank // Mus musculus histidyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:28266 IMAGE:4008479), complete cds. // chr18 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// U39473 // GenBank // Mus musculus histidyl-tRNA synthetase mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// AK077437 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730408P20 product:histidyl tRNA synthetase, full insert sequence. // chr18 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// AK014253 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110073N04 product:HISTIDYL TRNA SYNTHETASE homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr18 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36764033:36783100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
ENSMUST00000097612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37008869:37020679:-1 gene:ENSMUSG00000073594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK139318 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830007O22 product:protocadherin alpha 11, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000180516 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:18:37159855:37178522:-1 gene:ENSMUSG00000097430 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK042845 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730030D03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001159275 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, ornithine transporter) member 2 (Slc25a2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37637378:37638723:-1 gene:ENSMUSG00000050304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF332006 // GenBank // Mus musculus mutant ornithine transporter 2 (Ornt2) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC114348 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, ornithine transporter) member 2, mRNA (cDNA clone MGC:130114 IMAGE:40051484), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC125010 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, ornithine transporter) member 2, mRNA (cDNA clone MGC:130113 IMAGE:40051483), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37637677:37638474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_175770 // RefSeq // Mus musculus TAF7 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf7), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000066272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:37640902:37644204:-1 gene:ENSMUSG00000051316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF144562 // GenBank // Mus musculus TFIID subunit TAFII55 mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// BC029673 // GenBank // Mus musculus TAF7 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:36036 IMAGE:5373242), complete cds. // chr18 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37642487:37647905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0
NM_175684 // RefSeq // Mus musculus FCH and double SH3 domains 1 (Fchsd1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006526001 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FCH and double SH3 domains 1 (Fchsd1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000043437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:37957434:37969774:-1 gene:ENSMUSG00000038524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000163131 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:37967639:37969769:-1 gene:ENSMUSG00000038524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000164222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:37967805:37969769:-1 gene:ENSMUSG00000038524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000166973 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:37965696:37967749:-1 gene:ENSMUSG00000038524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000168136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:37967640:37969757:-1 gene:ENSMUSG00000038524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC057367 // GenBank // Mus musculus FCH and double SH3 domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:67289 IMAGE:6827858), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000007152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37961243:37969726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
NM_001205336 // RefSeq // Mus musculus ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (Arap3), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NM_139206 // RefSeq // Mus musculus ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (Arap3), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000042944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37972624:37997574:-1 gene:ENSMUSG00000024451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AF469621 // GenBank // Mus musculus dual-specificity Rho- and Arf-GTPase activating protein 1 (Drag1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr18 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// AK053122 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030006K04 product:PHOSPHOINOSITIDE-BINDING PROTEINS homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// AK220486 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4097 protein. // chr18 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC068145 // GenBank // Mus musculus ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:93003 IMAGE:6856630), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AK036638 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830144J08 product:weakly similar to PHOSPHOINOSITIDE-BINDING PROTEINS [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// GENSCAN00000007139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37973172:37997106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
NM_029357 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 1 (Pcdh1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526321 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protocadherin 1 (Pcdh1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000057185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:38196694:38209762:-1 gene:ENSMUSG00000051375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:38196743:38211970:-1 gene:ENSMUSG00000051375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC040402 // GenBank // Mus musculus protocadherin 1, mRNA (cDNA clone MGC:28471 IMAGE:4162978), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027904 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700086O06 gene (1700086O06Rik), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181757 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:18:38238405:38250565:-1 gene:ENSMUSG00000097080 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017378 // RefSeq // Mus musculus protocadherin 12 (Pcdh12), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:38267092:38284401:-1 gene:ENSMUSG00000024440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK048100 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130034H07 product:protocadherin 12, full insert sequence. // chr18 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC127076 // GenBank // Mus musculus protocadherin 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:40110769), complete cds. // chr18 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:38268805:38284070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_011937 // RefSeq // Mus musculus glucosamine-6-phosphate deaminase 1 (Gnpda1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NR_028061 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 8615 (Gm8615), non-coding RNA. // chr18 // 94 // 86 // 29 // 31 // 0 /// ENSMUST00000025307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:149155446:149156081:-1 gene:ENSMUSG00000024437 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000063814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:18:38327558:38339003:-1 gene:ENSMUSG00000052102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000139885 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:38333189:38338909:-1 gene:ENSMUSG00000052102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000153291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:38328683:38332070:-1 gene:ENSMUSG00000052102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// AF088903 // GenBank // Mus musculus glucosamine-6-phosphate isomerase mRNA, complete cds. // chr18 // 78 // 100 // 28 // 36 // 0 /// AF160355 // GenBank // Mus musculus glucosamine-6-phosphate deaminase (Gnpda) mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC014800 // GenBank // Mus musculus glucosamine-6-phosphate deaminase 1, mRNA (cDNA clone MGC:25224 IMAGE:4220980), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000007136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:38328873:38338858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000050876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:149155446:149161310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_011898 // RefSeq // Mus musculus sprouty homolog 4 (Drosophila) (Spry4), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:38586268:38601268:-1 gene:ENSMUSG00000024427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB019280 // GenBank // Mus musculus mRNA for sprouty-4, complete cds. // chr18 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AF176906 // GenBank // Mus musculus sprouty 4 (Spry4) mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// BC050944 // GenBank // Mus musculus sprouty homolog 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:63237 IMAGE:6821944), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC057005 // GenBank // Mus musculus sprouty homolog 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:67021 IMAGE:6821944), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:38589806:38590708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
AK083375 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920025C15 product:hypothetical EGF-like domain containing protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023311 // RefSeq // Mus musculus Yip1 domain family, member 5 (Yipf5), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000025364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:40204865:40219399:-1 gene:ENSMUSG00000024487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC003317 // GenBank // Mus musculus Yip1 domain family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:7012 IMAGE:3155690), complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC055301 // GenBank // Mus musculus Yip1 domain family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:62578 IMAGE:6466806), complete cds. // chr18 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:40178280:40241676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NM_029942 // RefSeq // Mus musculus PRELI domain containing 2 (Prelid2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000070949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:41875696:41951194:-1 gene:ENSMUSG00000056671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK021193 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330008K14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC119251 // GenBank // Mus musculus PRELI domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:155567 IMAGE:8734000), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC120711 // GenBank // Mus musculus PRELI domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:155948 IMAGE:40129634), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC145035 // GenBank // Mus musculus PRELI domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:178591 IMAGE:9053583), complete cds. // chr18 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:41932332:41969922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001033426 // RefSeq // Mus musculus glutaredoxin, cysteine rich 2 (Grxcr2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000097591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:41986201:41999049:-1 gene:ENSMUSG00000073574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK158432 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930116E03 product:hypothetical Cytochrome c heme-binding site containing protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC147102 // GenBank // Mus musculus glutaredoxin, cysteine rich 2, mRNA (cDNA clone MGC:182261 IMAGE:9056155), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147103 // GenBank // Mus musculus glutaredoxin, cysteine rich 2, mRNA (cDNA clone MGC:182241 IMAGE:9056135), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:41989494:41999002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_027072 // RefSeq // Mus musculus PLAC8-like 1 (Plac8l1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:42178675:42196709:-1 gene:ENSMUSG00000059455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC110558 // GenBank // Mus musculus PLAC8-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:129406 IMAGE:40049443), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC110559 // GenBank // Mus musculus PLAC8-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:129407 IMAGE:40049451), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK005800 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700009N18 product:RIKEN cDNA 1700009N18 gene, full insert sequence. // chr18 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT032155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_134137 // RefSeq // Mus musculus leucyl-tRNA synthetase (Lars), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000097590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:42202350:42262122:-1 gene:ENSMUSG00000024493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC006060 // GenBank // Mus musculus leucyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3591521), complete cds. // chr18 // 83 // 55 // 15 // 18 // 0 /// BC052715 // GenBank // Mus musculus leucyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:63355 IMAGE:6836462), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:42202513:42247503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_181543 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 151 (Gpr151), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:42578020:42579652:-1 gene:ENSMUSG00000042816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK048591 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130082O03 product:hypothetical Rhodopsin-like GPCR superfamily containing protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AY351677 // GenBank // Mus musculus galanin receptor-like protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC120520 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 151, mRNA (cDNA clone MGC:155757 IMAGE:40129443), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC120526 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 151, mRNA (cDNA clone MGC:155763 IMAGE:40129449), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:42578343:42598983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000178200 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:43070300:43070406:-1 gene:ENSMUSG00000094137 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009468 // RefSeq // Mus musculus dihydropyrimidinase-like 3 (Dpysl3), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:43324288:43393377:-1 gene:ENSMUSG00000024501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000118043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:18:43324227:43373272:-1 gene:ENSMUSG00000024501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124207 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:43329691:43345964:-1 gene:ENSMUSG00000024501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// BC023003 // GenBank // Mus musculus dihydropyrimidinase-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:36106 IMAGE:5367381), complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_001136086 // RefSeq // Mus musculus dihydropyrimidinase-like 3 (Dpysl3), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// NM_001291455 // RefSeq // Mus musculus dihydropyrimidinase-like 3 (Dpysl3), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000121805 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:43320979:43438286:-1 gene:ENSMUSG00000024501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000013702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:43353869:43370149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000013707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:43324332:43352301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001256055 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit J2 (Eif3j2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// NM_144545 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit J1 (Eif3j1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENSMUST00000028668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:122028546:122056598:1 gene:ENSMUSG00000027236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENSMUST00000057110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:43475418:43477796:-1 gene:ENSMUSG00000043424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// BC006055 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit J, mRNA (cDNA clone IMAGE:3591077), complete cds. // chr18 // 100 // 65 // 34 // 34 // 0 /// BC080788 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit J, mRNA (cDNA clone MGC:91206 IMAGE:4166214), complete cds. // chr18 // 95 // 83 // 41 // 43 // 0 /// GENSCAN00000013711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:43476955:43499571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 65 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000046398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:121969094:122052098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 65 // 65 // 34 // 52 // 1
NM_001163637 // RefSeq // Mus musculus janus kinase and microtubule interacting protein 2 (Jakmip2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006526340 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus janus kinase and microtubule interacting protein 2 (Jakmip2), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000082254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:43531408:43687773:-1 gene:ENSMUSG00000024502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000013697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:43509619:43577509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0
NM_009258 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 3 (Spink3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:43728069:43737237:-1 gene:ENSMUSG00000024503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086887 // GenBank // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 3, mRNA (cDNA clone MGC:107555 IMAGE:6775994), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X06342 // GenBank // Mouse mRNA for prostatic secretory glycoprotein (p12) homologous to secretory protease inhibitor. // chr18 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC066214 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6431230, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001033280 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 94 (Gm94), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000096570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:43777196:43792878:-1 gene:ENSMUSG00000071858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147098 // GenBank // Mus musculus gene model 94, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182252 IMAGE:9056146), complete cds. // chr18 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BC147099 // GenBank // Mus musculus gene model 94, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182240 IMAGE:9056134), complete cds. // chr18 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BC171995 // GenBank // Mus musculus gene model 94, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:198700 IMAGE:9054281), complete cds. // chr18 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:43781210:43792842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001281470 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10267 (Gm10267), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000091916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:44156404:44159303:-1 gene:ENSMUSG00000069385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000181652 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:44156395:44159873:-1 gene:ENSMUSG00000069385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_183123 // RefSeq // Mus musculus serine protease inhibitor, Kazal type-like (Spinkl), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000066328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:44166358:44175073:-1 gene:ENSMUSG00000053729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EU234015 // GenBank // Mus musculus clone 2E10 LINE L1 ASL1/9530002K18Rik fusion mRNA sequence. // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001048217 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 11 (Spink11), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097587 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:44190045:44196177:-1 gene:ENSMUSG00000073573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147524 // GenBank // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 11, mRNA (cDNA clone MGC:182622 IMAGE:9056516), complete cds. // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC147541 // GenBank // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 11, mRNA (cDNA clone MGC:182638 IMAGE:9056532), complete cds. // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// DQ437331 // GenBank // Mus musculus serine protease inhibitor Kazal type 11 (Spink11) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK136658 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230019F13 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr18 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSMUST00000185266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:44190455:44192345:-1 gene:ENSMUSG00000073573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT032204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001085373 // RefSeq // Mus musculus mutated in colorectal cancers (Mcc), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 62 // 62 // 0 /// NM_001085374 // RefSeq // Mus musculus mutated in colorectal cancers (Mcc), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 58 // 58 // 0 /// XM_006526023 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mutated in colorectal cancers (Mcc), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 56 // 56 // 0 /// XM_006526024 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mutated in colorectal cancers (Mcc), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 56 // 56 // 0 /// ENSMUST00000089874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:44425061:44812182:-1 gene:ENSMUSG00000071856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 62 // 62 // 0 /// ENSMUST00000164666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:44425061:44662266:-1 gene:ENSMUSG00000071856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 58 // 58 // 0 /// GENSCAN00000012602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:44429371:44535384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 36 // 64 // 1
AK052308 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330025A21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
GENSCAN00000016918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:45090124:45147000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
ENSMUST00000097581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:45285833:45286108:-1 gene:ENSMUSG00000073569 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000016915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:45285833:45329143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
GENSCAN00000016908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:45506089:45525072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
NM_001170855 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 36 (Trim36), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NM_178872 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 36 (Trim36), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:46165302:46212607:-1 gene:ENSMUSG00000033949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:46165302:46198818:-1 gene:ENSMUSG00000033949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AB103063 // GenBank // Mus musculus haprin mRNA for acrosome RBCC protein, complete cds. // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AY251389 // GenBank // Mus musculus tripartite motif protein 36 (Trim36) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC058106 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 36, mRNA (cDNA clone MGC:67214 IMAGE:6836197), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46167413:46201157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NONMMUT032245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172627 // RefSeq // Mus musculus protein geranylgeranyltransferase type I, beta subunit (Pggt1b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525867 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein geranylgeranyltransferase type I, beta subunit (Pggt1b), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000025354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:46239949:46280850:-1 gene:ENSMUSG00000024477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048404 // GenBank // Mus musculus protein geranylgeranyltransferase type I, beta subunit, mRNA (cDNA clone IMAGE:6466017), complete cds. // chr18 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC141021 // GenBank // Mus musculus protein geranylgeranyltransferase type I, beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:175982 IMAGE:9055633), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK170240 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630036A02 product:Geranylgeranyl transferase type I beta subunit homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr18 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46241520:46280819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001160399 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 112 (Ccdc112), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000072835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:46282151:46311928:-1 gene:ENSMUSG00000071855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46287329:46311810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000046277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46355315:46356967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_045438 // RefSeq // Mus musculus motile sperm domain containing 4 (Mospd4), non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180618 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:46465215:46465790:-1 gene:ENSMUSG00000046487 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46465215:46485187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173423 // RefSeq // Mus musculus fem-1 homolog c (C.elegans) (Fem1c), mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000036226 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:46501746:46525971:-1 gene:ENSMUSG00000033319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK129440 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1785 protein. // chr18 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AY249189 // GenBank // Mus musculus FEM1C (Fem1c) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// BC138604 // GenBank // Mus musculus fem-1 homolog c (C.elegans), mRNA (cDNA clone MGC:170229 IMAGE:8861624), complete cds. // chr18 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// BC138605 // GenBank // Mus musculus fem-1 homolog c (C.elegans), mRNA (cDNA clone MGC:170230 IMAGE:8861625), complete cds. // chr18 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46505080:46525554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0
NM_173394 // RefSeq // Mus musculus toll-like receptor adaptor molecule 2 (Ticam2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525868 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus toll-like receptor adaptor molecule 2 (Ticam2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// ENSMUST00000070084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:46559155:46574533:-1 gene:ENSMUSG00000056130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB100441 // GenBank // Mus musculus mRNA for Toll-interleukin I receptor domain (TIR)-containing adaptor molecule (TICAM)-2, complete cds. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AY268050 // GenBank // Mus musculus TRIF-related adapter molecule TRAM (Tram) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AY275837 // GenBank // Mus musculus TIR domain-containing adapter protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099933 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor adaptor molecule 2, mRNA (cDNA clone MGC:107370 IMAGE:30017195), complete cds. // chr18 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036030 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:46560235:46597314:-1 gene:ENSMUSG00000033184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46560320:46597282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_025698 // RefSeq // Mus musculus transmembrane emp24 protein transport domain containing 7 (Tmed7), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:46585939:46597516:-1 gene:ENSMUSG00000033184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:46588032:46597535:-1 gene:ENSMUSG00000033184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000036030 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:46560235:46597314:-1 gene:ENSMUSG00000033184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46560320:46597282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_033037 // RefSeq // Mus musculus cysteine dioxygenase 1, cytosolic (Cdo1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_385971 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cysteine dioxygenase 1, cytosolic (Cdo1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000035804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:46713205:46728342:-1 gene:ENSMUSG00000033022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC013638 // GenBank // Mus musculus cysteine dioxygenase 1, cytosolic, mRNA (cDNA clone MGC:18800 IMAGE:4194939), complete cds. // chr18 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK011032 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2510030M07 product:cysteine dioxygenase 1, cytosolic, full insert sequence. // chr18 // 59 // 88 // 13 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46709719:46728142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_026217 // RefSeq // Mus musculus autophagy related 12 (Atg12), mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:46732417:46741579:-1 gene:ENSMUSG00000032905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AB066216 // GenBank // Mus musculus mRNA for Apg12, complete cds. // chr18 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC070470 // GenBank // Mus musculus autophagy-related 12 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:99425 IMAGE:30630196), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526187 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus autophagy related 12 (Atg12), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// AK039546 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330058M13 product:Apg12 (autophagy 12-like (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr18 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000046273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46734450:46744088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONMMUT032281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
GENSCAN00000009872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:47414465:47415361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000158279 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:49581696:49581849:-1 gene:ENSMUSG00000088904 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONMMUT032312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_026854 // RefSeq // Mus musculus DTW domain containing 2 (Dtwd2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526213 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DTW domain containing 2 (Dtwd2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:49696814:49755601:-1 gene:ENSMUSG00000024505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000139852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:49697473:49734106:-1 gene:ENSMUSG00000024505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC075693 // GenBank // Mus musculus DTW domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:30626776). // chr18 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC139347 // GenBank // Mus musculus DTW domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:170974 IMAGE:8862369), complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC139348 // GenBank // Mus musculus DTW domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:170975 IMAGE:8862370), complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC145609 // GenBank // Mus musculus DTW domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:179183 IMAGE:9054175), complete cds. // chr18 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NM_001170960 // RefSeq // Mus musculus DTW domain containing 2 (Dtwd2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// ENSMUST00000163590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:49696145:49755601:-1 gene:ENSMUSG00000024505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
ENSMUST00000183298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:50220071:50220815:-1 gene:ENSMUSG00000098058 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT032339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_026108 // RefSeq // Mus musculus haloacid dehalogenase-like hydrolase domain containing 1A (Hdhd1a), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000056460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:50567656:50568699:-1 gene:ENSMUSG00000048875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK007231 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700121L12 product:weakly similar to GS1 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// BC048447 // GenBank // Mus musculus haloacid dehalogenase-like hydrolase domain containing 1A, mRNA (cDNA clone MGC:58161 IMAGE:6705877), complete cds. // chr18 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000050773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:50567956:50568660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000082886 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:51254169:51254275:-1 gene:ENSMUSG00000095482 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT032348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000091905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:51865264:51865881:-1 gene:ENSMUSG00000069379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:51865264:51865881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000178926 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:52154501:52154607:-1 gene:ENSMUSG00000096863 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001286181 // RefSeq // Mus musculus lysyl oxidase (Lox), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NM_001286182 // RefSeq // Mus musculus lysyl oxidase (Lox), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NM_010728 // RefSeq // Mus musculus lysyl oxidase (Lox), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000025409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:52517238:52529708:-1 gene:ENSMUSG00000024529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000171470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:52516069:52529867:-1 gene:ENSMUSG00000024529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC018439 // GenBank // Mus musculus lysyl oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:11525 IMAGE:2655752), complete cds. // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// M65142 // GenBank // Mouse lysyl oxidase mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:52510243:52635174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_008908 // RefSeq // Mus musculus peptidylprolyl isomerase C (Ppic), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:53406341:53418007:-1 gene:ENSMUSG00000024538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC025861 // GenBank // Mus musculus peptidylprolyl isomerase C, mRNA (cDNA clone MGC:31015 IMAGE:5026674), complete cds. // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// M74227 // GenBank // Mouse cyclophilin C (cyp C) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:53406937:53417956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_178686 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 120 (Cep120), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000049811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:53681724:53744547:-1 gene:ENSMUSG00000048799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// AK038916 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230075C01 product:hypothetical C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB) structure containing protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// BC053439 // GenBank // Mus musculus centrosomal protein 120, mRNA (cDNA clone MGC:59487 IMAGE:6328829), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// AK044808 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130003A15 product:hypothetical C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB) structure containing protein, full insert sequence. // chr18 // 70 // 70 // 32 // 46 // 1 /// GENSCAN00000028715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:53683233:53755899:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0
ENSMUST00000174961 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:55622636:55622920:-1 gene:ENSMUSG00000092702 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// NONMMUT032420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0
ENSMUST00000182376 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:55745251:55746228:-1 gene:ENSMUSG00000098119 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177115 // RefSeq // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 3 (March3), mRNA. // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000035278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:56775852:56812019:-1 gene:ENSMUSG00000032656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000102912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:56761716:56925548:-1 gene:ENSMUSG00000032656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC107232 // GenBank // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 3, mRNA (cDNA clone MGC:130167 IMAGE:40052073), complete cds. // chr18 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC107233 // GenBank // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 3, mRNA (cDNA clone MGC:130168 IMAGE:40052074), complete cds. // chr18 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// XM_006526019 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 3 (March3), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENSMUST00000153044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:56803669:56925515:-1 gene:ENSMUSG00000032656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// AK036622 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830142M23 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr18 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000028555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:56793855:56812019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_029909 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C330018D20 gene (C330018D20Rik), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526348 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C330018D20 gene (C330018D20Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526349 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C330018D20 gene (C330018D20Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526350 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C330018D20 gene (C330018D20Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:56955833:56975368:-1 gene:ENSMUSG00000024592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000139243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:56957614:56975354:-1 gene:ENSMUSG00000024592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0
XR_397984 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10266 (Gm10266), misc_RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK029420 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833432L19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010181 // RefSeq // Mus musculus fibrillin 2 (Fbn2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 66 // 66 // 0 /// ENSMUST00000025497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:58008623:58209926:-1 gene:ENSMUSG00000024598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 66 // 66 // 0 /// AK082008 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130093P06 product:fibrillin 2, full insert sequence. // chr18 // 100 // 17 // 11 // 11 // 0 /// AK132163 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3302003G05 product:fibrillin 2, full insert sequence. // chr18 // 17 // 17 // 11 // 66 // 1 /// GENSCAN00000046358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:58010258:58162078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 58 // 58 // 0 /// AK053721 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130302C12 product:fibrillin 2, full insert sequence. // chr18 // 23 // 23 // 15 // 66 // 1
NM_001034859 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4841 (Gm4841), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000090260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:60268301:60273267:-1 gene:ENSMUSG00000068606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC150900 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:183811 IMAGE:9087811, complete cds. // chr18 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// AK156469 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830023A11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 53 // 100 // 8 // 15 // 0
NM_134133 // RefSeq // Mus musculus small integral membrane protein 3 (Smim3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525481 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small integral membrane protein 3 (Smim3), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006525482 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small integral membrane protein 3 (Smim3), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000042710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:60474193:60501983:-1 gene:ENSMUSG00000038059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF313412 // GenBank // Mus musculus putative small membrane protein NID67 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC012898 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010002N04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:19279 IMAGE:4013357), complete cds. // chr18 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0
NM_133363 // RefSeq // Mus musculus myozenin 3 (Myoz3), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000056533 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:60576316:60591788:-1 gene:ENSMUSG00000049173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF480442 // GenBank // Mus musculus calsarcin-3 mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// BC104046 // GenBank // Mus musculus myozenin 3, mRNA (cDNA clone MGC:123456 IMAGE:40040057), complete cds. // chr18 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// BC104047 // GenBank // Mus musculus myozenin 3, mRNA (cDNA clone MGC:123457 IMAGE:40040058), complete cds. // chr18 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60576350:60629833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
NM_008306 // RefSeq // Mus musculus N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1 (Ndst1), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006525674 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1 (Ndst1), transcript variant X8, mRNA. // chr18 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000169273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:60685978:60713389:-1 gene:ENSMUSG00000054008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AF049894 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate glucosaminyl N-deacetylase/N-sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// AF074926 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1 mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// BC066098 // GenBank // Mus musculus N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1, mRNA (cDNA clone MGC:90051 IMAGE:30533342), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC079561 // GenBank // Mus musculus N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1, mRNA (cDNA clone MGC:90719 IMAGE:30533342), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AK035642 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530080J05 product:N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1, full insert sequence. // chr18 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000036121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60685078:60713235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0
NM_201353 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, L-proline), member 7 (Slc6a7), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006525929 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, L-proline), member 7 (Slc6a7), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006525931 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, L-proline), member 7 (Slc6a7), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006525932 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, L-proline), member 7 (Slc6a7), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:60995381:61014199:-1 gene:ENSMUSG00000052026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC050103 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, L-proline), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:61029 IMAGE:30024098), complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC057070 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, L-proline), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:67444 IMAGE:5695483), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006525935 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, L-proline), member 7 (Slc6a7), transcript variant X7, mRNA. // chr18 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000035817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60996619:61010708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_009880 // RefSeq // Mus musculus caudal type homeobox 1 (Cdx1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:61018862:61036199:-1 gene:ENSMUSG00000024619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019986 // GenBank // Mus musculus caudal type homeo box 1, mRNA (cDNA clone MGC:28644 IMAGE:4224352), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M37163 // GenBank // Mouse Cdx-1 homeobox protein mRNA, complete cds. // chr18 // 72 // 72 // 13 // 18 // 0 /// GENSCAN00000035840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61019726:61036120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_134134 // RefSeq // Mus musculus HMG box domain containing 3 (Hmgxb3), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NM_178277 // RefSeq // Mus musculus HMG box domain containing 3 (Hmgxb3), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000091884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:61131279:61177050:-1 gene:ENSMUSG00000024622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// AB045322 // GenBank // Mus musculus brain cDNA clone MNCb-1436, similar to human mRNA for KIAA0194 gene. // chr18 // 91 // 92 // 40 // 44 // 0 /// BC066029 // GenBank // Mus musculus HMG box domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:91313 IMAGE:6417061), complete cds. // chr18 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// BC079580 // GenBank // Mus musculus HMG box domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:90618 IMAGE:5702202), complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// AK041866 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630042L21 product:hypothetical HMG1/2 (high mobility group) box containing protein, full insert sequence. // chr18 // 52 // 52 // 25 // 48 // 1 /// GENSCAN00000035830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61132140:61202379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0
NM_007885 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 26 (sulfate transporter), member 2 (Slc26a2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037603 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:61197222:61200369:-1 gene:ENSMUSG00000034320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000146409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:61192919:61211612:-1 gene:ENSMUSG00000034320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148829 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:61201705:61211380:-1 gene:ENSMUSG00000034320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AK165805 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630086M23 product:solute carrier family 26 (sulfate transporter), member 2, full insert sequence. // chr18 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC028345 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 26 (sulfate transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:14061 IMAGE:4014785), complete cds. // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// D42049 // GenBank // Mus musculus st-ob mRNA for sulfate transporter, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61132140:61202379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_133249 // RefSeq // Mus musculus peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 beta (Ppargc1b), mRNA. // chr18 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000063307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:61298510:61400400:-1 gene:ENSMUSG00000033871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000075299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:61298136:61400431:-1 gene:ENSMUSG00000033871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF453324 // GenBank // Mus musculus PPAR gamma coactivator-1beta protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC150699 // GenBank // Mus musculus peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 beta, mRNA (cDNA clone MGC:183610 IMAGE:9087610), complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61298683:61327275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NR_029879 // RefSeq // Mus musculus microRNA 378a (Mir378a), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-378a // miRBase Micro RNA Database // MI0000795 Mus musculus miR-378 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT032575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177828 // RefSeq // Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 37 (Arhgef37), mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006526028 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 37 (Arhgef37), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000171629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:61493794:61536536:-1 gene:ENSMUSG00000045094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AK030242 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933429F08 product:hypothetical Src homology 3 (SH3) domain profile/Dbl domain (dbl/cdc24 rhoGEF family)/Repeat in HS1/Cortactin/Src homology 3 (SH3) domain containing protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61494840:61538283:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
NR_029557 // RefSeq // Mus musculus microRNA 145a (Mir145a), microRNA. // chr18 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// ENSMUST00000083658 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:61647816:61647903:-1 gene:ENSMUSG00000065592 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-145a // miRBase Micro RNA Database // MI0000169 Mus musculus miR-145 stem-loop // chr18 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// NONMMUT032604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0
NR_029601 // RefSeq // Mus musculus microRNA 143 (Mir143), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083511 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:61649190:61649269:-1 gene:ENSMUSG00000065445 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-143 // miRBase Micro RNA Database // MI0000257 Mus musculus miR-143 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172832 // RefSeq // Mus musculus prenylcysteine oxidase 1 like (Pcyox1l), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025472 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:61696837:61707635:-1 gene:ENSMUSG00000024579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC060677 // GenBank // Mus musculus prenylcysteine oxidase 1 like, mRNA (cDNA clone MGC:66537 IMAGE:6404883), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000154763 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:61702884:61707635:-1 gene:ENSMUSG00000024579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000035818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61697312:61707581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_021296 // RefSeq // Mus musculus GrpE-like 2, mitochondrial (Grpel2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000062991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:61712440:61726331:-1 gene:ENSMUSG00000024580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK082983 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530028M24 product:GrpE-like 2, mitochondrial, full insert sequence. // chr18 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// BC068232 // GenBank // Mus musculus GrpE-like 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:96026 IMAGE:30533079), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC120747 // GenBank // Mus musculus GrpE-like 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:155984 IMAGE:40129670), complete cds. // chr18 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000035825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61715763:61726299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_178928 // RefSeq // Mus musculus actin filament associated protein 1-like 1 (Afap1l1), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000120472 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:61730261:61786702:-1 gene:ENSMUSG00000033032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000147278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:61730939:61786660:-1 gene:ENSMUSG00000033032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000154876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:61730261:61786611:-1 gene:ENSMUSG00000033032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// AK053714 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130301I04 product:UNKNOWN PROTEIN (FRAGMENT) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr18 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// BC138923 // GenBank // Mus musculus actin filament associated protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:170550 IMAGE:8861945), complete cds. // chr18 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000035826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61731287:61792167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1
NM_001164491 // RefSeq // Mus musculus actin binding LIM protein family, member 3 (Ablim3), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_198649 // RefSeq // Mus musculus actin binding LIM protein family, member 3 (Ablim3), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526012 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus actin binding LIM protein family, member 3 (Ablim3), transcript variant X8, mRNA. // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000049378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:61799395:61911824:-1 gene:ENSMUSG00000032735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000166783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:61799395:61911852:-1 gene:ENSMUSG00000032735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC060275 // GenBank // Mus musculus actin binding LIM protein family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:69876 IMAGE:6822626), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC094229 // GenBank // Mus musculus actin binding LIM protein family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:106450 IMAGE:30534236), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61801295:61890108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_007420 // RefSeq // Mus musculus adrenergic receptor, beta 2 (Adrb2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:62177817:62179959:-1 gene:ENSMUSG00000045730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC030346 // GenBank // Mus musculus adrenergic receptor, beta 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4987488), partial cds. // chr18 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC032883 // GenBank // Mus musculus adrenergic receptor, beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:41462 IMAGE:1349283), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:62080498:62192111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
AK034506 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330209C19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000055553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:62481875:62482129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_134136 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 38 (Fbxo38), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000048688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:62504069:62548743:-1 gene:ENSMUSG00000042211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AY267463 // GenBank // Mus musculus MoKA (Moka) mRNA, complete cds. // chr18 // 86 // 100 // 38 // 44 // 0 /// BC056348 // GenBank // Mus musculus F-box protein 38, mRNA (cDNA clone MGC:73480 IMAGE:5721407), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AK034761 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430032E06 product:similar to 5-HT RECEPTOR [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// GENSCAN00000055554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:62504702:62541008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0
NM_001001803 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 7 (putative) (Spink7), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526082 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 7 (putative) (Spink7), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000076194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:62592413:62596264:-1 gene:ENSMUSG00000060201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:62592268:62596264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001168423 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 13 (Spink13), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525460 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 13 (Spink13), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:62607539:62741387:-1 gene:ENSMUSG00000073551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:62607733:62608151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000048109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:62754790:62756347:-1 gene:ENSMUSG00000041789 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK020725 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330042I05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NR_037693 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2700046A07 gene (2700046A07Rik), long non-coding RNA. // chr18 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// ENSMUST00000067450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:62751674:62756315:-1 gene:ENSMUSG00000041789 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001039485 // RefSeq // Mus musculus piezo-type mechanosensitive ion channel component 2 (Piezo2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000047480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:63010213:63387183:-1 gene:ENSMUSG00000041482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000132576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:63019004:63027983:-1 gene:ENSMUSG00000041482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000137141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:63010216:63030312:-1 gene:ENSMUSG00000041482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC026614 // GenBank HTC // Mus musculus family with sequence similarity 38, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4976889), with apparent retained intron. // chr18 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC147606 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 38, member B, mRNA (cDNA clone MGC:182702 IMAGE:9056596), complete cds. // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// HQ215521 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J piezo2 mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// ENSMUST00000123322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:63019451:63033010:-1 gene:ENSMUSG00000041482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// AK031235 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930434P17 product:CDNA: FLJ23403 FIS, CLONE HEP18857 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000049826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:62997305:63152756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1
NM_001039485 // RefSeq // Mus musculus piezo-type mechanosensitive ion channel component 2 (Piezo2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:63010213:63387183:-1 gene:ENSMUSG00000041482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183217 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:63059718:63386457:-1 gene:ENSMUSG00000041482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// HQ215521 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J piezo2 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182233 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:63079595:63146802:-1 gene:ENSMUSG00000041482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// AK050232 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730029D16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000049826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:62997305:63152756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016792 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin-like 1 (Txnl1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000025476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:63662801:63692359:-1 gene:ENSMUSG00000024583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF052660 // GenBank // Mus musculus thioredoxin-related protein mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// BC061123 // GenBank // Mus musculus thioredoxin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:74249 IMAGE:6596299), complete cds. // chr18 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:63611606:63692173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
BC006746 // GenBank // Mus musculus ferrochelatase, mRNA (cDNA clone MGC:6205 IMAGE:3256604), complete cds. // chr18 // 94 // 92 // 33 // 35 // 0 /// M59288 // GenBank // Mus musculus ferrochelatase mRNA, 3 end. // chr18 // 87 // 79 // 26 // 30 // 0 /// M61215 // GenBank // Mus musculus ferrochelatase mRNA, complete cds. // chr18 // 86 // 95 // 31 // 36 // 0 /// NM_007998 // RefSeq // Mus musculus ferrochelatase (Fech), mRNA. // chr18 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// ENSMUST00000025484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:64456550:64489066:-1 gene:ENSMUSG00000024588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// GENSCAN00000009771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:64458083:64488946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1
NM_001142950 // RefSeq // Mus musculus asparaginyl-tRNA synthetase (Nars), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_027350 // RefSeq // Mus musculus asparaginyl-tRNA synthetase (Nars), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000025483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:64499665:64516557:-1 gene:ENSMUSG00000024587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC005473 // GenBank HTC // Mus musculus asparaginyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3591047), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr18 // 89 // 93 // 24 // 27 // 0 /// BC052849 // GenBank // Mus musculus asparaginyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:60759 IMAGE:30057822), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:64500518:64521533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_001001488 // RefSeq // Mus musculus ATPase, class I, type 8B, member 1 (Atp8b1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006526105 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase, class I, type 8B, member 1 (Atp8b1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000025482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:64528979:64661000:-1 gene:ENSMUSG00000039529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY506548 // GenBank // Mus musculus ATPase class I type 8B member 1 (Atp8b1) mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// BC117946 // GenBank // Mus musculus ATPase, class I, type 8B, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:144127 IMAGE:40098035), complete cds. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:64531340:64605378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
AK039675 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330084C13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001037294 // RefSeq // Mus musculus alpha-kinase 2 (Alpk2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000035548 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:65265529:65393887:-1 gene:ENSMUSG00000032845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000141250 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:65274743:65349534:-1 gene:ENSMUSG00000032845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AK132555 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4832401N10 product:heart alpha-kinase, full insert sequence. // chr18 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:65261273:65307321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000046226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:65418961:65419347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 89 // 86 // 16 // 18 // 0
ENSMUST00000157121 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:65907163:65907222:-1 gene:ENSMUSG00000087746 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013833 // RefSeq // Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:65934639:65939089:-1 gene:ENSMUSG00000024518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF001906 // GenBank // Mus musculus retinal homeobox protein (Rx) mRNA, complete cds. // chr18 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC024731 // GenBank // Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:35992 IMAGE:5366450), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058757 // GenBank // Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:68025 IMAGE:6492771), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U73177 // GenBank // Mus musculus paired-type homeobox (rax) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK053517 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130104K16 product:retina and anterior neural fold homeobox, full insert sequence. // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000032158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:65908719:65938787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// AK053732 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130303K03 product:retina and anterior neural fold homeobox, full insert sequence. // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_145493 // RefSeq // Mus musculus complexin 4 (Cplx4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:65955727:65970178:-1 gene:ENSMUSG00000024519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY264291 // GenBank // Mus musculus complexin IV mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC016082 // GenBank // Mus musculus complexin 4, mRNA (cDNA clone MGC:27587 IMAGE:4501240), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC029011 // GenBank // Mus musculus complexin 4, mRNA (cDNA clone MGC:38680 IMAGE:5357047), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:65950120:65970047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001172062 // RefSeq // Mus musculus lectin, mannose-binding, 1 (Lman1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_027400 // RefSeq // Mus musculus lectin, mannose-binding, 1 (Lman1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000048260 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:65980754:66002637:-1 gene:ENSMUSG00000041891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:65983207:66002621:-1 gene:ENSMUSG00000041891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143990 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:65993138:66022580:-1 gene:ENSMUSG00000041891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 86 // 50 // 12 // 14 // 0 /// ENSMUST00000150133 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:65993591:66019778:-1 gene:ENSMUSG00000041891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000155895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:65989026:65994888:-1 gene:ENSMUSG00000041891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC057165 // GenBank // Mus musculus lectin, mannose-binding, 1, mRNA (cDNA clone MGC:68089 IMAGE:4948301), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000144793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:65991151:65993660:-1 gene:ENSMUSG00000041891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000032164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:65983851:66002611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_178793 // RefSeq // Mus musculus collagen and calcium binding EGF domains 1 (Ccbe1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006526021 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collagen and calcium binding EGF domains 1 (Ccbe1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000061103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:66056855:66291788:-1 gene:ENSMUSG00000046318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000130300 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:66060967:66291838:-1 gene:ENSMUSG00000046318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC103803 // GenBank // Mus musculus collagen and calcium binding EGF domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:118667 IMAGE:30088062), complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// BC152322 // GenBank // Mus musculus collagen and calcium binding EGF domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:161179 IMAGE:40140631), complete cds. // chr18 // 97 // 81 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000146610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:66045302:66291446:-1 gene:ENSMUSG00000046318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1 /// AK087673 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330003A13 product:hypothetical EGF/Laminin structure containing protein, full insert sequence. // chr18 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// GENSCAN00000032161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:66061287:66088930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1
NR_030467 // RefSeq // Mus musculus microRNA 694 (Mir694), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102193 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:66219264:66219333:-1 gene:ENSMUSG00000076147 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-694 // miRBase Micro RNA Database // MI0004664 Mus musculus miR-694 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT032719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_016977 // RefSeq // Mus musculus melanocortin 4 receptor (Mc4r), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:66857715:66860472:-1 gene:ENSMUSG00000047259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116957 // GenBank // Mus musculus melanocortin 4 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:151334 IMAGE:40126276), complete cds. // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC116959 // GenBank // Mus musculus melanocortin 4 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:151336 IMAGE:40126278), complete cds. // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:66840886:66868886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_172630 // RefSeq // Mus musculus metallophosphoesterase 1 (Mppe1), mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525888 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus metallophosphoesterase 1 (Mppe1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525889 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus metallophosphoesterase 1 (Mppe1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525893 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus metallophosphoesterase 1 (Mppe1), transcript variant X6, mRNA. // chr18 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// XR_385988 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus metallophosphoesterase 1 (Mppe1), transcript variant X8, misc_RNA. // chr18 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000073054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67225530:67245830:-1 gene:ENSMUSG00000062526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC045146 // GenBank // Mus musculus metallophosphoesterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:54864 IMAGE:6306245), complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC086456 // GenBank // Mus musculus metallophosphoesterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:99965 IMAGE:4949311), complete cds. // chr18 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AK158446 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930117L23 product:metallophosphoesterase 1, full insert sequence. // chr18 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// AK172000 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830028G14 product:metallophosphoesterase 1, full insert sequence. // chr18 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000020372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67225702:67229745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0
NM_027130 // RefSeq // Mus musculus AFG3-like AAA ATPase 2 (Afg3l2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000025408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67404767:67449166:-1 gene:ENSMUSG00000024527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK009650 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310036I02 product:similar to AFG3-LIKE PROTEIN 2 (EC 3.4.24.-) (PARAPLEGIN-LIKE PROTEIN) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// BC036999 // GenBank // Mus musculus AFG3(ATPase family gene 3)-like 2 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:47048 IMAGE:5042649), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC043056 // GenBank // Mus musculus AFG3(ATPase family gene 3)-like 2 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:57959 IMAGE:6419521), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK080118 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530064L23 product:AFG3-LIKE PROTEIN 2 (EC 3.4.24.-) (PARAPLEGIN-LIKE PROTEIN) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// GENSCAN00000020368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67414036:67465485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
NM_176832 // RefSeq // Mus musculus spire homolog 1 (Drosophila) (Spire1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// NM_194355 // RefSeq // Mus musculus spire homolog 1 (Drosophila) (Spire1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000045105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67488209:67552721:-1 gene:ENSMUSG00000024533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000082243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67488213:67552777:-1 gene:ENSMUSG00000024533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000115050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67488209:67549173:-1 gene:ENSMUSG00000024533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// BC058320 // GenBank HTC // Mus musculus spire homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:6707422). // chr18 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// BC094375 // GenBank // Mus musculus spire homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:106458 IMAGE:30535423), complete cds. // chr18 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// AK145500 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0007K16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000020373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67491291:67548417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0
NM_001081073 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 76 (Cep76), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:67617397:67641336:-1 gene:ENSMUSG00000073542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK035879 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630013E05 product:CDNA FLJ12542 FIS, CLONE NT2RM4000534 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC119216 // GenBank // Mus musculus centrosomal protein 76, mRNA (cDNA clone MGC:155532 IMAGE:8733965), complete cds. // chr18 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC119218 // GenBank // Mus musculus centrosomal protein 76, mRNA (cDNA clone MGC:155534 IMAGE:8733967), complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67619234:67641889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001127177 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 2 (Ptpn2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_008977 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 2 (Ptpn2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025420 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:67665512:67724588:-1 gene:ENSMUSG00000024539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120934 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:67665511:67724573:-1 gene:ENSMUSG00000024539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000122412 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:67671212:67724595:-1 gene:ENSMUSG00000024539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000128169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:67675818:67690224:-1 gene:ENSMUSG00000024539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// BC008269 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 2, mRNA (cDNA clone MGC:12016 IMAGE:3602983), complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// M81477 // GenBank // Mouse cytoplasmic phosphotyrosine phosphatase mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:67672573:67724510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT032819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0
NM_001127177 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 2 (Ptpn2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153794 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 210, member A (Fam210a), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:68260187:68300333:-1 gene:ENSMUSG00000038121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152193 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:68275917:68300202:-1 gene:ENSMUSG00000038121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC038695 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933403F05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:48232 IMAGE:1548421), complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC095936 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933403F05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106264 IMAGE:3968496), complete cds. // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:68268719:68276213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001271716 // RefSeq // Mus musculus melanocortin 2 receptor (Mc2r), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001271717 // RefSeq // Mus musculus melanocortin 2 receptor (Mc2r), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_008560 // RefSeq // Mus musculus melanocortin 2 receptor (Mc2r), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:68406907:68429251:-1 gene:ENSMUSG00000045569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139210 // GenBank // Mus musculus melanocortin 2 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:170837 IMAGE:8862232), complete cds. // chr18 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// BC139211 // GenBank // Mus musculus melanocortin 2 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:170838 IMAGE:8862233), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:68407330:68408220:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
NR_038051 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930546C10 gene (4930546C10Rik), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:68944633:68950141:-1 gene:ENSMUSG00000024546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT032871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000082772 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:69777936:69778045:-1 gene:ENSMUSG00000064706 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT032912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_029346 // RefSeq // Mus musculus dynactin associated protein (Dynap), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:70240429:70244584:-1 gene:ENSMUSG00000024512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:70240968:70244382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000009974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:70267411:70276175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_007831 // RefSeq // Mus musculus deleted in colorectal carcinoma (Dcc), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000073379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:71258990:72351017:-1 gene:ENSMUSG00000060534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000114943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:71258738:72351069:-1 gene:ENSMUSG00000060534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000037279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:71211619:71603572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000083988 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:73533403:73533550:-1 gene:ENSMUSG00000065922 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053255 // RefSeq // Mus musculus elaC homolog 1 (E. coli) (Elac1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_385970 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus elaC homolog 1 (E. coli) (Elac1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000041138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:73735038:73754479:-1 gene:ENSMUSG00000036941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF308697 // GenBank // Mus musculus ELAC1 (Elac1) mRNA, complete cds. // chr18 // 82 // 68 // 14 // 17 // 0 /// AK018424 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430417G19 product:hypothetical Metallo-hydrolase/oxidoreductase structure containing protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000047439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:73738834:73754167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_145494 // RefSeq // Mus musculus malic enzyme 2, NAD(+)-dependent, mitochondrial (Me2), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006525496 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus malic enzyme 2, NAD(+)-dependent, mitochondrial (Me2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000025439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:73770040:73815392:-1 gene:ENSMUSG00000024556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC004709 // GenBank // Mus musculus malic enzyme 2, NAD(+)-dependent, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:6377 IMAGE:3499365), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:73770626:73797965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
NM_172632 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 4 (Mapk4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525902 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitogen-activated protein kinase 4 (Mapk4), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000091851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:73928486:74064929:-1 gene:ENSMUSG00000024558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000162863 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:73928486:74064392:-1 gene:ENSMUSG00000024558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC058942 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:66565 IMAGE:6821544), complete cds. // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC062911 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:73474 IMAGE:6821544), complete cds. // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC094564 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:6839524). // chr18 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000159162 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:73929213:74064922:-1 gene:ENSMUSG00000024558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000056418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:73930398:73937626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_001164355 // RefSeq // Mus musculus spindle and kinetochore associated complex subunit 1 (Ska1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_025581 // RefSeq // Mus musculus spindle and kinetochore associated complex subunit 1 (Ska1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000040188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:74195299:74207818:-1 gene:ENSMUSG00000036223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000177604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:74195299:74207818:-1 gene:ENSMUSG00000036223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC019940 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810433K01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28070 IMAGE:3709649), complete cds. // chr18 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// NONMMUT033018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0
NR_028560 // RefSeq // Mus musculus small Cajal body-specific RNA 17 (Scarna17), guide RNA. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000158064 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:74778391:74778469:-1 gene:ENSMUSG00000088689 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159000 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:11695267:11695342:1 gene:ENSMUSG00000089625 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT033942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000158610 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:74778561:74778700:-1 gene:ENSMUSG00000089235 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONMMUT033035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000102274 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:74910152:74910233:-1 gene:ENSMUSG00000076229 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT033041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_010720 // RefSeq // Mus musculus lipase, endothelial (Lipg), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006525692 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipase, endothelial (Lipg), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000066532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:74939322:74961263:-1 gene:ENSMUSG00000053846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF118768 // GenBank // Mus musculus endothelial lipase mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// BC020991 // GenBank // Mus musculus lipase, endothelial, mRNA (cDNA clone MGC:13719 IMAGE:3981856), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AK152161 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830052F11 product:lipase, endothelial, full insert sequence. // chr18 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// GENSCAN00000036740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:74910214:74981209:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
NM_201354 // RefSeq // Mus musculus CBP80/20-dependent translation initiation factor (Ctif), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006525968 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CBP80/20-dependent translation initiation factor (Ctif), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006525969 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CBP80/20-dependent translation initiation factor (Ctif), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000165559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:75431224:75697696:-1 gene:ENSMUSG00000052928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058104 // GenBank // Mus musculus gene model 672, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:67202 IMAGE:6833739), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:75562485:75637312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
DQ284430 // GenBank // Mus musculus spermatocyte-specific marker protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT033103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONMMUT033104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
GENSCAN00000019064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:76223944:76224183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XR_386365 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7276 (Gm7276), misc_RNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000097520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:77185006:77186257:-1 gene:ENSMUSG00000073532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AK158289 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930101C16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001164504 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 165 (Rnf165), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026494 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:77456110:77565136:-1 gene:ENSMUSG00000025427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000182153 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:77466737:77565050:-1 gene:ENSMUSG00000025427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 86 // 52 // 12 // 14 // 0 /// ENSMUST00000182348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:77468321:77505117:-1 gene:ENSMUSG00000025427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000182805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:77462893:77467148:-1 gene:ENSMUSG00000025427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000182024 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:77458685:77565147:-1 gene:ENSMUSG00000025427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000027825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:77462332:77493677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT033148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000182294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:77562093:77564609:-1 gene:ENSMUSG00000025427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC080318 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6853468. // chr18 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONMMUT033150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178670 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 8030462N17 gene (8030462N17Rik), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:77633281:77714010:-1 gene:ENSMUSG00000047466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK139552 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020004F09 product:Hypothetical prenyl group binding site homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC120889 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 8030462N17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:141408 IMAGE:40060928), complete cds. // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006526428 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 8030462N17 gene (8030462N17Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000027838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:77635139:77674608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_146089 // RefSeq // Mus musculus HAUS augmin-like complex, subunit 1 (Haus1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526432 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HAUS augmin-like complex, subunit 1 (Haus1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006526433 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HAUS augmin-like complex, subunit 1 (Haus1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000048192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:77757567:77767780:-1 gene:ENSMUSG00000041840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC024400 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:36238 IMAGE:5026575), complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:77757703:77767749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
XR_105954 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA F830208F22 gene (F830208F22Rik), misc_RNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000125396 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:77793259:77796390:-1 gene:ENSMUSG00000073529 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000143732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:77793259:77796743:-1 gene:ENSMUSG00000073529 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK156688 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830037L18 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT033158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT033159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0
NM_001101038 // RefSeq // Mus musculus sialic acid binding Ig-like lectin 15 (Siglec15), mRNA. // chr18 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// XM_006526516 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sialic acid binding Ig-like lectin 15 (Siglec15), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000170760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:78043614:78057395:-1 gene:ENSMUSG00000091055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AY971517 // GenBank // Mus musculus SIGLEC-I mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:78035292:78057268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0
NM_053099 // RefSeq // Mus musculus SET binding protein 1 (Setbp1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025430 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:78750380:79109391:-1 gene:ENSMUSG00000024548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000161465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:78750380:79109391:-1 gene:ENSMUSG00000024548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC080865 // GenBank // Mus musculus SET binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:90748 IMAGE:30531988), complete cds. // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:79080977:79087015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0
NM_175028 // RefSeq // Mus musculus ADNP homeobox 2 (Adnp2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000066743 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:80126311:80151482:-1 gene:ENSMUSG00000053950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC064672 // GenBank // Mus musculus ADNP homeobox 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4911893), partial cds. // chr18 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000015867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:80125496:80146035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_199197 // RefSeq // Mus musculus ribosome binding factor A (Rbfa), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:80192265:80200658:-1 gene:ENSMUSG00000024570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC064066 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110032A13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:73646 IMAGE:935634), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:80175309:80200549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
AK036053 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630030N07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001190373 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 2 (Kcng2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000077962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:80294546:80364254:-1 gene:ENSMUSG00000059852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000184574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:80322679:80363336:-1 gene:ENSMUSG00000059852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000015885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:80295629:80296505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000015909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:80322431:80323135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0
NM_026295 // RefSeq // Mus musculus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) phosphatase, subunit 1 (Ctdp1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526525 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) phosphatase, subunit 1 (Ctdp1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006526526 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) phosphatase, subunit 1 (Ctdp1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000036229 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:80407959:80469695:-1 gene:ENSMUSG00000033323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC053435 // GenBank // Mus musculus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) phosphatase, subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:59442 IMAGE:6394578), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:80382539:80469546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001201569 // RefSeq // Mus musculus ATPase, class II, type 9B (Atp9b), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_015805 // RefSeq // Mus musculus ATPase, class II, type 9B (Atp9b), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000091790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:80734143:80934058:-1 gene:ENSMUSG00000024566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AB206122 // GenBank // Mus musculus MMR mRNA for macrophage MHC receptor, complete cds. // chr18 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// AF155913 // GenBank // Mus musculus putative E1-E2 ATPase mRNA, complete cds. // chr18 // 90 // 81 // 26 // 29 // 0 /// BC079626 // GenBank // Mus musculus ATPase, class II, type 9B, mRNA (cDNA clone MGC:90680 IMAGE:30536500), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK044331 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930007M15 product:ATPas, class II, type 9B, full insert sequence. // chr18 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000000369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:80736013:80831241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0
NM_178280 // RefSeq // Mus musculus sal-like 3 (Drosophila) (Sall3), mRNA. // chr18 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:80966376:80986578:-1 gene:ENSMUSG00000024565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC128071 // GenBank HTC // Mus musculus sal-like 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40098357), with apparent retained intron. // chr18 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// X97581 // GenBank // M.musculus mRNA for spalt transcription factor. // chr18 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:80959302:80974989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000157374 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:82355977:82356106:-1 gene:ENSMUSG00000087999 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0 /// NONMMUT033246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0
NM_008082 // RefSeq // Mus musculus galanin receptor 1 (Galr1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:82392496:82406777:-1 gene:ENSMUSG00000024553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:82393693:82406150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0
NM_177832 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 236 (Zfp236), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000171071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:82593593:82692883:-1 gene:ENSMUSG00000041258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000182122 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:82597155:82692734:-1 gene:ENSMUSG00000041258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000183048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:82597155:82692734:-1 gene:ENSMUSG00000041258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000183324 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:82595476:82617750:-1 gene:ENSMUSG00000041258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC138187 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 236, mRNA (cDNA clone MGC:169811 IMAGE:8861206), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC145180 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053731. // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:82597633:82725927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000157518 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:83355199:83355364:-1 gene:ENSMUSG00000088143 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081300 // RefSeq // Mus musculus teashirt zinc finger family member 1 (Tshz1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000060303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:84011627:84086404:-1 gene:ENSMUSG00000046982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000175783 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:84012082:84086390:-1 gene:ENSMUSG00000046982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC058264 // GenBank // Mus musculus teashirt zinc finger family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:65389 IMAGE:6488400), complete cds. // chr18 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000035882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:84013027:84019766:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_001033341 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 407 (Zfp407), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000125763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:84207704:84589504:-1 gene:ENSMUSG00000048410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000143597 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:84279820:84412420:-1 gene:ENSMUSG00000048410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// AK132276 // GenBank HTC // Mus musculus 18 days pregnant adult female placenta and extra embryonic tissue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3830420H14 product:weakly similar to Zinc finger protein (Fragment) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// XM_006526469 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 407 (Zfp407), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONMMUT033315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000035911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:84336349:84351963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001033341 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 407 (Zfp407), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526469 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 407 (Zfp407), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526470 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 407 (Zfp407), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:84207704:84589504:-1 gene:ENSMUSG00000048410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK032536 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430585N13 product:weakly similar to CDNA FLJ31726 FIS, CLONE NT2RI2006735, WEAKLY SIMILAR TO NEOFELIS NEBULOSA STRAIN NNEX ZINC FINGER PROTEIN ZFX GENE (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:84541648:84562986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177450 // RefSeq // Mus musculus carnosine dipeptidase 1 (metallopeptidase M20 family) (Cndp1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XR_386374 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carnosine dipeptidase 1 (metallopeptidase M20 family) (Cndp1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr18 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000070139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:84610509:84650084:-1 gene:ENSMUSG00000056162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000145981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:84628691:84650046:-1 gene:ENSMUSG00000056162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// AK165706 // GenBank HTC // Mus musculus adult male intestinal mucosa cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630007G19 product:carnosine dipeptidase 1 (metallopeptidase M20 family), full insert sequence. // chr18 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// BC043305 // GenBank // Mus musculus carnosine dipeptidase 1 (metallopeptidase M20 family), mRNA (cDNA clone MGC:49227 IMAGE:5040944), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000130579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:84630859:84649946:-1 gene:ENSMUSG00000056162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// AK165500 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F530205H05 product:carnosine dipeptidase 1 (metallopeptidase M20 family), full insert sequence. // chr18 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// GENSCAN00000035880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:84601724:84640278:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NM_001289531 // RefSeq // Mus musculus CNDP dipeptidase 2 (metallopeptidase M20 family) (Cndp2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_023149 // RefSeq // Mus musculus CNDP dipeptidase 2 (metallopeptidase M20 family) (Cndp2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000025546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:84667470:84685633:-1 gene:ENSMUSG00000024644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000168419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:84667470:84681996:-1 gene:ENSMUSG00000024644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB046738 // GenBank // Mus musculus mRNA for MNCb-1930 protein, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC005532 // GenBank // Mus musculus CNDP dipeptidase 2 (metallopeptidase M20 family), mRNA (cDNA clone MGC:7671 IMAGE:3496319), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:84659425:84681897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1
ENSMUST00000162318 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:84719004:84720775:-1 gene:ENSMUSG00000089760 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141732 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030046N08 product:hypothetical Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT033326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083812 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:84742162:84742317:-1 gene:ENSMUSG00000065746 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT033330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_025969 // RefSeq // Mus musculus tranlocase of inner mitochondrial membrane 21 (Timm21), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000025547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:84947294:84951524:-1 gene:ENSMUSG00000024645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AK029037 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732483I17 product:RIKEN cDNA 2700002I20 gene, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC034297 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034H14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30349 IMAGE:4511762), complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
GENSCAN00000009541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:85715931:85716657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_019425 // RefSeq // Mus musculus glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 (Gnpnat1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006519273 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 (Gnpnat1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006519274 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 (Gnpnat1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006519275 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 (Gnpnat1), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000046191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:14:45376334:45388802:-1 gene:ENSMUSG00000037722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC031116 // GenBank // Mus musculus glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:35936 IMAGE:5065641), complete cds. // chr18 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:86242965:86276360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:14:45350833:45415059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
GENSCAN00000007644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:86926156:86926684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
GENSCAN00000007665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:87474188:87536931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
AK031929 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330500I05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018821 // RefSeq // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 6 (Socs6), mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000070116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:88865169:88894322:-1 gene:ENSMUSG00000056153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000123826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:88868174:88894216:-1 gene:ENSMUSG00000056153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 90 // 77 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000125362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:88868495:88894352:-1 gene:ENSMUSG00000056153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// AF121907 // GenBank // Mus musculus cytokine inducible SH2-containing protein CIS4 (Cis4) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// BC017597 // GenBank // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 6, mRNA (cDNA clone MGC:27562 IMAGE:4482828), complete cds. // chr18 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// BC085245 // GenBank // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 6, mRNA (cDNA clone MGC:102463 IMAGE:30444479), complete cds. // chr18 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// BC094443 // GenBank // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 6, mRNA (cDNA clone MGC:102462 IMAGE:4017254), complete cds. // chr18 // 89 // 69 // 8 // 9 // 0
ENSMUST00000059118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:89293502:89297229:-1 gene:ENSMUSG00000043498 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK033982 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330132A10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098197 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9330132A10 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30363771). // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_001039173 // RefSeq // Mus musculus docking protein 6 (Dok6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000097495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:89301082:89769528:-1 gene:ENSMUSG00000073514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB221044 // GenBank // Mus musculus Dok-6 mRNA for downstream of tyrosine kinases 6, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC138955 // GenBank // Mus musculus docking protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:170582 IMAGE:8861977), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC138957 // GenBank // Mus musculus docking protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:170584 IMAGE:8861979), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000160328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:89470148:89560069:-1 gene:ENSMUSG00000073514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// AK140422 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B730041C18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000055525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:89379456:89598791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
ENSMUST00000182270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:89943353:89944312:-1 gene:ENSMUSG00000098126 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:89768476:89944002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
GENSCAN00000044234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:90014482:90019006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
XR_168609 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC101056141 (LOC101056141), misc_RNA. // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK007267 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700124I24 product:cytochrome c oxidase, subunit VI a, polypeptide 1, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// KnowTID_00004035 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT033411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000024128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3205618:3206073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
NM_172252 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L21 (Mrpl21), mRNA. // chr19 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000025743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:3283060:3291201:1 gene:ENSMUSG00000024829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// BC028768 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L21, mRNA (cDNA clone MGC:41352 IMAGE:1282313), complete cds. // chr19 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000025745 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:3282901:3292837:1 gene:ENSMUSG00000024829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
NM_013495 // RefSeq // Mus musculus carnitine palmitoyltransferase 1a, liver (Cpt1a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006531657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carnitine palmitoyltransferase 1a, liver (Cpt1a), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000025835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:3323301:3385732:1 gene:ENSMUSG00000024900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF017175 // GenBank // Mus musculus liver carnitine palmitoyltransferase I mRNA, partial cds. // chr19 // 92 // 100 // 35 // 38 // 0 /// AK050213 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730027G07 product:carnitine palmitoyltransferase 1, liver, full insert sequence. // chr19 // 100 // 50 // 19 // 19 // 0 /// BC038395 // GenBank // Mus musculus carnitine palmitoyltransferase 1a, liver, mRNA (cDNA clone MGC:6510 IMAGE:2649352), complete cds. // chr19 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// BC046383 // GenBank // Mus musculus carnitine palmitoyltransferase 1a, liver, mRNA (cDNA clone MGC:51402 IMAGE:4160676), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// BC054791 // GenBank // Mus musculus carnitine palmitoyltransferase 1a, liver, mRNA (cDNA clone MGC:65581 IMAGE:6832731), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// D49472 // GenBank // Mus musculus CPT I mRNA for acyltransferase, complete cds. // chr19 // 91 // 92 // 32 // 35 // 0 /// GENSCAN00000024124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3327513:3407110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 89 // 34 // 38 // 1
ENSMUST00000101958 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:3490309:3490413:1 gene:ENSMUSG00000075908 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028077 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810055G02 gene (1810055G02Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:3708333:3717881:1 gene:ENSMUSG00000035372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC019471 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810055G02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28461 IMAGE:4161022), complete cds. // chr19 // 79 // 94 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3698429:3740753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 93 // 48 // 14 // 15 // 0
NM_028545 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700055N04 gene (1700055N04Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006531842 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700055N04 gene (1700055N04Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006531844 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700055N04 gene (1700055N04Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000179433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:3958645:3972103:1 gene:ENSMUSG00000037263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000189124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:3958806:3972102:1 gene:ENSMUSG00000037263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000026433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3963839:4006849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001177438 // RefSeq // Mus musculus aldehyde dehydrogenase 3 family, member B2 (Aldh3b2), mRNA. // chr19 // 82 // 100 // 28 // 34 // 0 /// NM_028545 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700055N04 gene (1700055N04Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006531842 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700055N04 gene (1700055N04Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006531844 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700055N04 gene (1700055N04Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000143380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:3972328:3981645:1 gene:ENSMUSG00000075296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 82 // 100 // 28 // 34 // 0 /// ENSMUST00000179433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:3958645:3972103:1 gene:ENSMUSG00000037263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000189124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:3958806:3972102:1 gene:ENSMUSG00000037263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000026433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3963839:4006849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_028545 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700055N04 gene (1700055N04Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006531842 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700055N04 gene (1700055N04Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006531844 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700055N04 gene (1700055N04Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000179433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:3958645:3972103:1 gene:ENSMUSG00000037263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000189124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:3958806:3972102:1 gene:ENSMUSG00000037263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000026433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3963839:4006849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000025794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:19:3965900:3970438:1 gene:ENSMUSG00000037263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000179433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:3958645:3972103:1 gene:ENSMUSG00000037263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_028545 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700055N04 gene (1700055N04Rik), mRNA. // chr19 // 94 // 94 // 16 // 17 // 1 /// XM_006544757 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 3 member B1-like (LOC102643082), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 94 // 94 // 16 // 17 // 1 /// ENSMUST00000189124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:3958806:3972102:1 gene:ENSMUSG00000037263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001177438 // RefSeq // Mus musculus aldehyde dehydrogenase 3 family, member B2 (Aldh3b2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000143380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:3972328:3981645:1 gene:ENSMUSG00000075296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000026433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3963839:4006849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1
NM_027857 // RefSeq // Mus musculus aspartoacylase (aminoacylase) 3 (Acy3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531835 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aspartoacylase (aminoacylase) 3 (Acy3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000054030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:3986661:3990007:1 gene:ENSMUSG00000024866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF356878 // GenBank // Mus musculus aspartoacylase-3 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF356879 // GenBank // Mus musculus aspartoacylase-3 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AF375479 // GenBank // Mus musculus hepatitis C virus core-binding protein 1 (HCBP1) mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// AK143782 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430107N01 product:Aspartoacylase 2 (EC 3.5.1.15) (Aminoacylase-3) (ACY-3) (Acylase III) (Hepatitis C virus core-binding protein 1) (HCBP1), full insert sequence. // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AY169234 // GenBank // Mus musculus acylase III mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC010795 // GenBank // Mus musculus aspartoacylase (aminoacylase) 3, mRNA (cDNA clone MGC:18858 IMAGE:4221711), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3963839:4006849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001001320 // RefSeq // Mus musculus T-box 10 (Tbx10), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_011533 // RefSeq // Mus musculus T-box 10 (Tbx10), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000041871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:3992752:3999511:1 gene:ENSMUSG00000037477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY229976 // GenBank // Mus musculus transcription factor TBX10 (Tbx10) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY542280 // GenBank // Mus musculus transcription factor TBX10 splice variant (Tbx10) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC109150 // GenBank // Mus musculus T-box 10, mRNA (cDNA clone MGC:129316 IMAGE:40046608), complete cds. // chr19 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC109151 // GenBank // Mus musculus T-box 10, mRNA (cDNA clone MGC:129317 IMAGE:40046618), complete cds. // chr19 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3963839:4006849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NM_025529 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 8 (Nudt8), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:4000580:4002103:1 gene:ENSMUSG00000024869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122924 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:4000631:4002101:1 gene:ENSMUSG00000024869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000155405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:4000626:4005816:1 gene:ENSMUSG00000024869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC056443 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 8, mRNA (cDNA clone MGC:66887 IMAGE:6822891), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3963839:4006849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_206973 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 152 (Gpr152), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4139799:4145738:1 gene:ENSMUSG00000044724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181548 // ENSEMBL // proj_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4139798:4145737:1 gene:ENSMUSG00000097905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099681 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 152, mRNA (cDNA clone MGC:106042 IMAGE:6494327), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4142462:4153722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4142461:4153721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_016933 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, C polypeptide-associated protein (Ptprcap), mRNA. // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000061086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:4154606:4156751:1 gene:ENSMUSG00000045826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180710 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4154605:4156750:1 gene:ENSMUSG00000097132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// BC013273 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, C polypeptide-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:13941 IMAGE:4208992), complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC100560 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, C polypeptide-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:118627 IMAGE:832557), complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// D10105 // GenBank // Mus musculus mRNA for LSM, complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// U03856 // GenBank // Mus musculus Balb/c CD45-associated protein (cd45-ap) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4154816:4156513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000056887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4154815:4156512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
NM_031868 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, catalytic subunit, alpha isoform (Ppp1ca), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000046094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4192158:4195419:1 gene:ENSMUSG00000040385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000180575 // ENSEMBL // proj_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4192157:4195418:1 gene:ENSMUSG00000096994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK158681 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230052J23 product:protein phosphatase 1, catalytic subunit, alpha isoform, full insert sequence. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC014828 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, catalytic subunit, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:25955 IMAGE:4239005), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U25809 // GenBank // Mus musculus serine/threonine protein phosphatase type 1 alpha mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4192217:4195092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4192216:4195091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_027196 // RefSeq // Mus musculus polymerase (DNA-directed), delta 4 (Pold4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4231899:4233631:1 gene:ENSMUSG00000024854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180621 // ENSEMBL // proj_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4231898:4233630:1 gene:ENSMUSG00000097508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF515709 // GenBank // Mus musculus small subunit DNA polymerase delta p12 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK170469 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630104N12 product:polymerase (DNA-directed), delta 4, full insert sequence. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC028520 // GenBank // Mus musculus polymerase (DNA-directed), delta 4, mRNA (cDNA clone MGC:41275 IMAGE:1400386), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4232092:4233563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4232091:4233562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XR_388312 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9430078G10 gene (9430078G10Rik), misc_RNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK137104 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430078G10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4395320:4398641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001162946 // RefSeq // Mus musculus pyruvate carboxylase (Pcx), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NM_008797 // RefSeq // Mus musculus pyruvate carboxylase (Pcx), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000068004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4510472:4621752:1 gene:ENSMUSG00000024892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000113825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4594319:4621752:1 gene:ENSMUSG00000024892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC055030 // GenBank // Mus musculus pyruvate carboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:62648 IMAGE:5053475), complete cds. // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// L09192 // GenBank // Mus musculus pyruvate carboxylase mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000026430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4601371:4610765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 41 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4617478:4621288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0
NM_021287 // RefSeq // Mus musculus spectrin beta, non-erythrocytic 2 (Sptbn2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006531703 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spectrin beta, non-erythrocytic 2 (Sptbn2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000008991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4711208:4752353:1 gene:ENSMUSG00000067889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AK138560 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330064E06 product:Beta-spectrin 2 (Fragment) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr19 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// BC079860 // GenBank // Mus musculus spectrin beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:99874 IMAGE:6834745), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000026435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4712422:4751728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0
NM_025717 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 4B (Rbm4b), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006531824 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 4B (Rbm4b), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006531826 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 4B (Rbm4b), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000036744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:4756571:4765940:1 gene:ENSMUSG00000033760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000183332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:4761396:4767065:1 gene:ENSMUSG00000033760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC019488 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 4B, mRNA (cDNA clone MGC:28959 IMAGE:4457936), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000182200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:4756581:4764130:1 gene:ENSMUSG00000033760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// ENSMUST00000182821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:4756543:4762876:1 gene:ENSMUSG00000033760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// AK160796 // GenBank HTC // Mus musculus 14, 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3222404A07 product:RNA binding motif protein 4, full insert sequence. // chr19 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// GENSCAN00000026444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4755596:4762638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_207268 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 87 (Ccdc87), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4839366:4842528:1 gene:ENSMUSG00000067872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145660 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 87, mRNA (cDNA clone MGC:175547 IMAGE:40130963), complete cds. // chr19 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4839482:4842049:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
AF197480 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 cathepsin F (Ctsf) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// BC115438 // GenBank // Mus musculus cathepsin F, mRNA (cDNA clone IMAGE:40094670), partial cds. // chr19 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// NM_019861 // RefSeq // Mus musculus cathepsin F (Ctsf), mRNA. // chr19 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1 /// ENSMUST00000119694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4855129:4860912:1 gene:ENSMUSG00000083282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1 /// AF136280 // GenBank // Mus musculus cathepsin F precursor (CTSF) mRNA, complete cds. // chr19 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// BC058758 // GenBank // Mus musculus cathepsin F, mRNA (cDNA clone MGC:65237 IMAGE:6492834), complete cds. // chr19 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// AK165416 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F520010E07 product:cathepsin F, full insert sequence. // chr19 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000026460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4855268:4860829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
AK015959 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930533O14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025553 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L11 (Mrpl11), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531821 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L11 (Mrpl11), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4962306:4966995:1 gene:ENSMUSG00000024902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB049639 // GenBank // Mus musculus MRPL11 mRNA for mitochondrial ribosomal protein L11 (L11mt), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC046750 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L11, mRNA (cDNA clone MGC:61171 IMAGE:5692108), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4959711:4964779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_007854 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 29 (nucleoside transporters), member 2 (Slc29a2), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006531663 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 29 (nucleoside transporters), member 2 (Slc29a2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// XM_006531664 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 29 (nucleoside transporters), member 2 (Slc29a2), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5024006:5031971:1 gene:ENSMUSG00000024891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AF183397 // GenBank // Mus musculus equilibrative nitrobenzylthioinosine-insensitive nucleoside transporter ENT2 (Ent2) mRNA, complete cds. // chr19 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// BC048958 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 29 (nucleoside transporters), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:57100 IMAGE:6491511), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// X86682 // GenBank // M.musculus mRNA for nucleolar protein, HNP36. // chr19 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5024249:5055238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NM_175383 // RefSeq // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 1 (B3gnt1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5038826:5041134:1 gene:ENSMUSG00000047379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK083857 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130027A05 product:similar to N-ACETYLLACTOSAMINIDE BETA-1,3-N-ACETYLGLUCOSAMINYLTRANSFERASE (EC 2.4.1.149) (POLY-N-ACETYLLACTOSAMINE EXTENSION ENZYME) (N-ACETYLGLUCOSAMINYLTRANSFERASE) (IGNT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC069927 // GenBank // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:78207 IMAGE:4010980), complete cds. // chr19 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5024249:5055238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_134155 // RefSeq // Mus musculus breast cancer metastasis-suppressor 1 (Brms1), mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531623 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus breast cancer metastasis-suppressor 1 (Brms1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000116567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5041404:5049917:1 gene:ENSMUSG00000080268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AF233580 // GenBank // Mus musculus breast metastasis suppressor 1-like protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC003485 // GenBank // Mus musculus breast cancer metastasis-suppressor 1, mRNA (cDNA clone MGC:6927 IMAGE:2811430), complete cds. // chr19 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC016108 // GenBank // Mus musculus breast cancer metastasis-suppressor 1, mRNA (cDNA clone MGC:27693 IMAGE:4921658), complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531624 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus breast cancer metastasis-suppressor 1 (Brms1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000011877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5024249:5055238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_145495 // RefSeq // Mus musculus Ras and Rab interactor 1 (Rin1), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5050808:5057071:1 gene:ENSMUSG00000024883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC011277 // GenBank // Mus musculus Ras and Rab interactor 1, mRNA (cDNA clone MGC:12160 IMAGE:3711198), complete cds. // chr19 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5024249:5055238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1
NM_054042 // RefSeq // Mus musculus CD248 antigen, endosialin (Cd248), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5068078:5070637:1 gene:ENSMUSG00000056481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF378758 // GenBank // Mus musculus tumor endothelial marker 1 precursor (Tem1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF388572 // GenBank // Mus musculus endosialin (Tem1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC046318 // GenBank // Mus musculus CD248 antigen, endosialin, mRNA (cDNA clone MGC:54878 IMAGE:6314798), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128295 // GenBank // Mus musculus CD248 antigen, endosialin, mRNA (cDNA clone IMAGE:40103856), partial cds. // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5068126:5070423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_026553 // RefSeq // Mus musculus Yip1 interacting factor homolog A (S. cerevisiae) (Yif1a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5088538:5092879:1 gene:ENSMUSG00000024875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC011117 // GenBank // Mus musculus Yip1 interacting factor homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:18791 IMAGE:4190535), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5088718:5092448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
AK020208 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030455F02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024717 // RefSeq // Mus musculus galactose-3-O-sulfotransferase 3 (Gal3st3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000061169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5298331:5308738:1 gene:ENSMUSG00000047658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC066996 // GenBank // Mus musculus galactose-3-O-sulfotransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:90145 IMAGE:5707267), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5302586:5344153:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_139301 // RefSeq // Mus musculus cation channel, sperm associated 1 (Catsper1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006531708 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cation channel, sperm associated 1 (Catsper1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000043380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5335741:5344153:1 gene:ENSMUSG00000038498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF407332 // GenBank // Mus musculus sperm ion channel mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000011856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5302586:5344153:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
NM_027236 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1A domain containing (Eif1ad), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5366813:5371511:1 gene:ENSMUSG00000024841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC024640 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1A domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:28430 IMAGE:4038046), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK083659 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030060P04 product:hypothetical Nucleic acid-binding proteins structure containing protein, full insert sequence. // chr19 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5368190:5370085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT033544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NR_033224 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D330050I16 gene (D330050I16Rik), long non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT033549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001256515 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI837181 (AI837181), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_134149 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI837181 (AI837181), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5425157:5427313:1 gene:ENSMUSG00000047423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:5425157:5427313:1 gene:ENSMUSG00000047423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC017542 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI837181, mRNA (cDNA clone MGC:28869 IMAGE:4526963), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024516 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI837181, mRNA (cDNA clone MGC:37477 IMAGE:4984074), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U64690 // GenBank // Mus musculus WF-3 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010235 // RefSeq // Mus musculus fos-like antigen 1 (Fosl1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5447703:5455945:1 gene:ENSMUSG00000024912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC052917 // GenBank // Mus musculus fos-like antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:60604 IMAGE:30063479), complete cds. // chr19 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// U34245 // GenBank // Mus musculus fos-related antigen-1 (Fra-1) mRNA, complete cds. // chr19 // 86 // 78 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5447951:5455308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0
NM_007687 // RefSeq // Mus musculus cofilin 1, non-muscle (Cfl1), mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000116560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5490485:5494029:1 gene:ENSMUSG00000056201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC046225 // GenBank // Mus musculus cofilin 1, non-muscle, mRNA (cDNA clone MGC:57897 IMAGE:5691650), complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC058726 // GenBank // Mus musculus cofilin 1, non-muscle, mRNA (cDNA clone MGC:63415 IMAGE:5715707), complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC094357 // GenBank // Mus musculus cofilin 1, non-muscle, mRNA (cDNA clone MGC:106530 IMAGE:6820355), complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// D00472 // GenBank // Mus musculus mRNA for cofilin, complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000011855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5490600:5493493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0
AK007900 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810058N15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004038 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033448 // RefSeq // Mus musculus adaptor-related protein complex 5, beta 1 subunit (Ap5b1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000096318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5568074:5571261:1 gene:ENSMUSG00000049562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147482 // GenBank // Mus musculus gene model 962, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182334 IMAGE:9056228), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5568458:5571184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_026616 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease H2, subunit C (Rnaseh2c), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:5601873:5603439:1 gene:ENSMUSG00000024925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000127071 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5601887:5602867:1 gene:ENSMUSG00000024925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000133953 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5602410:5602934:1 gene:ENSMUSG00000024925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000136226 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:5602235:5602938:1 gene:ENSMUSG00000024925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000155639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5601975:5602932:1 gene:ENSMUSG00000024925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF346604 // GenBank // Mus musculus AYP1 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC024333 // GenBank // Mus musculus ribonuclease H2, subunit C, mRNA (cDNA clone MGC:35633 IMAGE:5040687), complete cds. // chr19 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5601909:5602395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT033578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_009045 // RefSeq // Mus musculus v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (avian) (Rela), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531694 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (avian) (Rela), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000025867 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:5637483:5648130:1 gene:ENSMUSG00000024927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003818 // GenBank // Mus musculus v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (avian), mRNA (cDNA clone MGC:6177 IMAGE:3489295), complete cds. // chr19 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC094053 // GenBank // Mus musculus v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (avian), mRNA (cDNA clone MGC:102574 IMAGE:3157927), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// DQ020177 // GenBank // Mus musculus NF-kB RelA splice variant 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// M61909 // GenBank // Mouse transcription factor p65 (NF-kappa-B p65) mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5637835:5647416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_022012 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 11 (Map3k11), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006527545 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 11 (Map3k11), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000004156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5689131:5702862:1 gene:ENSMUSG00000004054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC047152 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 11, mRNA (cDNA clone MGC:54514 IMAGE:6476975), complete cds. // chr19 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC095963 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 11, mRNA (cDNA clone MGC:106147 IMAGE:5400993), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5690247:5702344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_010609 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 7 (Kcnk7), mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000052448 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:5704367:5707101:1 gene:ENSMUSG00000024936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AB015729 // GenBank // Mus musculus dpkch3 mRNA for double-pore K channel 3, complete cds. // chr19 // 82 // 76 // 23 // 28 // 0 /// AF012324 // GenBank // Mus musculus neuromuscular two P domain potassium channel (KNOT1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// AF110521 // GenBank // Mus musculus two pore domain K+ channel subunit mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// BC106993 // GenBank // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:129259 IMAGE:40044182), complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// XM_006531665 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 7 (Kcnk7), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1 /// GENSCAN00000011858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5704476:5707016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 81 // 29 // 30 // 0
XR_388303 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FERM domain containing 8, opposite strand (Frmd8os), misc_RNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000135347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5848508:5851372:1 gene:ENSMUSG00000043488 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK009639 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310035N23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GU266552 // GenBank // Mus musculus cell-line C3H/10T1/2 MGT-16 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000187697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5845623:5851388:1 gene:ENSMUSG00000043488 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr19 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT033640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_134154 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 45 (Slc25a45), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006531622 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 25, member 45 (Slc25a45), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:5877817:5885766:1 gene:ENSMUSG00000024818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000125114 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:5877817:5885766:1 gene:ENSMUSG00000024818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000136833 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:5878628:5880596:1 gene:ENSMUSG00000024818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000141362 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:5878656:5884485:1 gene:ENSMUSG00000024818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000145200 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:5877808:5884884:1 gene:ENSMUSG00000024818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000155697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5877826:5885766:1 gene:ENSMUSG00000024818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC037680 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 45, mRNA (cDNA clone MGC:47212 IMAGE:3481846), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5878655:5884991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
AK149403 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730006E09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013859 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, HIT domain containing 2 (Znhit2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6061192:6062472:1 gene:ENSMUSG00000075227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF119498 // GenBank // Mus musculus C11orf5 (FON) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019440 // GenBank // Mus musculus zinc finger, HIT domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:30359 IMAGE:5125922), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC092256 // GenBank // Mus musculus zinc finger, HIT domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:103147 IMAGE:5102003), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6061227:6062426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001111317 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC048609 (BC048609), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531786 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC048609 (BC048609), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:19:6080033:6080788:1 gene:ENSMUSG00000047733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000149347 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:6080033:6080785:1 gene:ENSMUSG00000047733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK076800 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930470L04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6080143:6080704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0
NM_026410 // RefSeq // Mus musculus cell division cycle associated 5 (Cdca5), mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6084983:6091777:1 gene:ENSMUSG00000024791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000152528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6085827:6091777:1 gene:ENSMUSG00000024791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000156961 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6085751:6091777:1 gene:ENSMUSG00000024791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AK016305 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930578L05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 90 // 70 // 19 // 21 // 0 /// BC029626 // GenBank // Mus musculus cell division cycle associated 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:3157167), complete cds. // chr19 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC052904 // GenBank // Mus musculus cell division cycle associated 5, mRNA (cDNA clone MGC:60440 IMAGE:30065848), complete cds. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT033662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT033663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_001009546 // RefSeq // Mus musculus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 1 (Naaladl1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000044451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6105782:6115792:1 gene:ENSMUSG00000054999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6105798:6115555:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_025605 // RefSeq // Mus musculus late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 1 (Lamtor1), mRNA. // chr19 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:101905837:101911901:1 gene:ENSMUSG00000030842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6152715:6153200:1 gene:ENSMUSG00000083458 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC020142 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2400001E08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28061 IMAGE:3709051), complete cds. // chr19 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC092062 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2400001E08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:102412 IMAGE:4024506), complete cds. // chr19 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// BC096412 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2400001E08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106973 IMAGE:5255882), complete cds. // chr19 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC126973 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2400001E08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144270 IMAGE:40100355), complete cds. // chr19 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6152664:6153200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:101905999:101911365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
NM_001165919 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700123I01 gene (1700123I01Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531819 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700123I01 gene (1700123I01Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000113528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:6184467:6224225:1 gene:ENSMUSG00000024786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025699 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:6184388:6224219:1 gene:ENSMUSG00000024786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// AK007250 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700123I01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6195680:6227602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_130453 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein hormone alpha 2 (Gpha2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6226380:6227768:1 gene:ENSMUSG00000024784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6226388:6227768:1 gene:ENSMUSG00000024784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF260740 // GenBank // Mus musculus cysteine knot protein (Zsig51) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC062804 // GenBank // Mus musculus glycoprotein hormone alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:73534 IMAGE:1224990), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC132274 // GenBank // Mus musculus glycoprotein hormone alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:163905 IMAGE:40130551), complete cds. // chr19 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC132562 // GenBank // Mus musculus glycoprotein hormone alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:164193 IMAGE:40130839), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6195680:6227602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_194348 // RefSeq // Mus musculus autophagy related 2A (Atg2a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000045351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6241668:6262335:1 gene:ENSMUSG00000024773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000145600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6245465:6262295:1 gene:ENSMUSG00000024773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// BC063264 // GenBank // Mus musculus ATG2 autophagy related 2 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:67349 IMAGE:6409527), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000151079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6256371:6259619:1 gene:ENSMUSG00000024773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1 /// AK043938 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830054M12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1 /// GENSCAN00000024628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6241638:6261837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0
NR_029830 // RefSeq // Mus musculus microRNA 194-2 (Mir194-2), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000083648 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:6264643:6264728:1 gene:ENSMUSG00000065582 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-194-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000733 Mus musculus miR-194-2 stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT033683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_029720 // RefSeq // Mus musculus microRNA 192 (Mir192), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083589 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:6264844:6264932:1 gene:ENSMUSG00000065523 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-192 // miRBase Micro RNA Database // MI0000551 Mus musculus miR-192 stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010119 // RefSeq // Mus musculus EH-domain containing 1 (Ehd1), mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6276725:6300096:1 gene:ENSMUSG00000024772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000165797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6276925:6281392:1 gene:ENSMUSG00000024772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000171203 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6294181:6297877:1 gene:ENSMUSG00000024772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// AF099186 // GenBank // Mus musculus EH domain-containing protein EHD1 mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// AF173156 // GenBank // Mus musculus MPAST1 (Past1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// AK088980 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430034G05 product:EH-domain containing 1, full insert sequence. // chr19 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AK172669 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830226P21 product:EH-domain containing 1, full insert sequence. // chr19 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BC043332 // GenBank // Mus musculus EH-domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:49473 IMAGE:4981832), complete cds. // chr19 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// BC054828 // GenBank // Mus musculus EH-domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:62614 IMAGE:5042951), complete cds. // chr19 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6276664:6298598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0
NM_001033342 // RefSeq // Mus musculus CDC42 binding protein kinase gamma (DMPK-like) (Cdc42bpg), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000025681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6306456:6325652:1 gene:ENSMUSG00000024769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000024649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6306716:6324573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0
NM_011224 // RefSeq // Mus musculus muscle glycogen phosphorylase (Pygm), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000035269 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6384399:6398459:1 gene:ENSMUSG00000032648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AF124787 // GenBank // Mus musculus muscle glycogen phosphorylase (Pygm) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC012961 // GenBank // Mus musculus muscle glycogen phosphorylase, mRNA (cDNA clone MGC:13713 IMAGE:3989941), complete cds. // chr19 // 95 // 100 // 37 // 39 // 0 /// ENSMUST00000113483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6384415:6398448:1 gene:ENSMUSG00000032648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 85 // 85 // 33 // 39 // 1 /// GENSCAN00000024638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6384479:6398194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0
NM_001166370 // RefSeq // Mus musculus tRNA methyltransferase 11-2 (Trmt112), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// NM_026306 // RefSeq // Mus musculus tRNA methyltransferase 11-2 (Trmt112), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000088257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6909698:6911049:1 gene:ENSMUSG00000038812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000116551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6909747:6911028:1 gene:ENSMUSG00000038812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// BC016191 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610038D11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:27564 IMAGE:4483787), complete cds. // chr19 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// BC087959 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610038D11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107638 IMAGE:6766768), complete cds. // chr19 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0
NM_001285453 // RefSeq // Mus musculus BCL2-associated agonist of cell death (Bad), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NM_007522 // RefSeq // Mus musculus BCL2-associated agonist of cell death (Bad), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6941861:6951898:1 gene:ENSMUSG00000024959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113423 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:6942501:6951893:1 gene:ENSMUSG00000024959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000145463 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:6950767:6951874:1 gene:ENSMUSG00000024959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC006762 // GenBank // Mus musculus BCL2-associated agonist of cell death, mRNA (cDNA clone MGC:6058 IMAGE:3257589), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L37296 // GenBank // Mus musculus (clone 41510) BAD protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113426 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:6942323:6951892:1 gene:ENSMUSG00000024959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSMUST00000141410 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:6942879:6951252:1 gene:ENSMUSG00000024959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_134147 // RefSeq // Mus musculus MACRO domain containing 1 (Macrod1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006526562 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MACRO domain containing 1 (Macrod1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000040261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:7056768:7198061:1 gene:ENSMUSG00000036278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC008653 // GenBank // Mus musculus MACRO domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:11843 IMAGE:3597023), complete cds. // chr19 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006526564 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MACRO domain containing 1 (Macrod1), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// XM_006526565 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MACRO domain containing 1 (Macrod1), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000030714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7056891:7074367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000030717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7188463:7197950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
XR_105990 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 5730409K12 gene (5730409K12Rik), misc_RNA. // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK134852 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430404K14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000158343 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:7246709:7246812:1 gene:ENSMUSG00000096774 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT033739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_054048 // RefSeq // Mus musculus REST corepressor 2 (Rcor2), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000066646 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:7268301:7275225:1 gene:ENSMUSG00000024968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000113369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:7269764:7275224:1 gene:ENSMUSG00000024968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000140442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:7267325:7270144:1 gene:ENSMUSG00000024968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC055719 // GenBank // Mus musculus REST corepressor 2, mRNA (cDNA clone MGC:66834 IMAGE:6415591), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000134167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:7270952:7271769:1 gene:ENSMUSG00000024968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000030703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7268974:7274657:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_175381 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2700081O15 gene (2700081O15Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000159346 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:7420419:7422324:1 gene:ENSMUSG00000053080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000159348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:7417625:7425904:1 gene:ENSMUSG00000053080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000160561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:7421028:7425540:1 gene:ENSMUSG00000053080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC059063 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700081O15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:69897 IMAGE:6825195), complete cds. // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC096638 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700081O15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106440 IMAGE:6825382), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000191580 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:7420409:7422672:1 gene:ENSMUSG00000053080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000030716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7404017:7423106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001163505 // RefSeq // Mus musculus atlastin GTPase 3 (Atl3), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_146091 // RefSeq // Mus musculus atlastin GTPase 3 (Atl3), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:7494438:7538608:1 gene:ENSMUSG00000024759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000170373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:7494040:7538608:1 gene:ENSMUSG00000024759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC017138 // GenBank // Mus musculus atlastin GTPase 3, mRNA (cDNA clone MGC:28761 IMAGE:4485115), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK170550 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630107J16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// GENSCAN00000030708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7468664:7585666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001164634 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 8 (Slc22a8), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_001164635 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 8 (Slc22a8), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_031194 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 8 (Slc22a8), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526787 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 8 (Slc22a8), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000010251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8591254:8611834:1 gene:ENSMUSG00000063796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000170817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8591254:8611834:1 gene:ENSMUSG00000063796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF078869 // GenBank // Mus musculus reduced in osteosclerosis transporter (Roct) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC014762 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 8, mRNA (cDNA clone MGC:25962 IMAGE:4239544), complete cds. // chr19 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8593907:8610277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_008766 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 6 (Slc22a6), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000010250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8617996:8628299:1 gene:ENSMUSG00000024650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC021647 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:13982 IMAGE:4163278), complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// U52842 // GenBank // Mus musculus kidney-specific transport protein mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8618296:8626211:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_001112697 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, muscarinic 1, CNS (Chrm1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_007698 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, muscarinic 1, CNS (Chrm1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000035444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:8664005:8681567:1 gene:ENSMUSG00000032773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000163785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8664005:8683587:1 gene:ENSMUSG00000032773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC094242 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, muscarinic 1, CNS, mRNA (cDNA clone MGC:106529 IMAGE:5686074), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000177197 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:8663789:8678154:1 gene:ENSMUSG00000032773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000048730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8677933:8679315:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000082787 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:8723993:8724064:1 gene:ENSMUSG00000064721 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000180819 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726441:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000181422 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726442:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AK051045 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030060F23 product:Mus musculus U22 snoRNA host gene (UHG) gene, complete sequence, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT033789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT033790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT033791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// SNHG1 // lncRNA Db // mm9 chr19:8,797,977-8,800,816 // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000083458 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:8724251:8724325:1 gene:ENSMUSG00000065392 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000181422 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726442:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT033790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT033792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// SNHG1 // lncRNA Db // mm9 chr19:8,797,977-8,800,816 // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000083347 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:8724531:8724602:1 gene:ENSMUSG00000065281 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180819 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726441:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181422 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726442:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK051045 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030060F23 product:Mus musculus U22 snoRNA host gene (UHG) gene, complete sequence, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// SNHG1 // lncRNA Db // mm9 chr19:8,797,977-8,800,816 // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083346 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:8724868:8724943:1 gene:ENSMUSG00000065280 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180819 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726441:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181422 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726442:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK051045 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030060F23 product:Mus musculus U22 snoRNA host gene (UHG) gene, complete sequence, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// SNHG1 // lncRNA Db // mm9 chr19:8,797,977-8,800,816 // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083444 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:8725092:8725156:1 gene:ENSMUSG00000065378 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000180819 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726441:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000181422 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726442:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK051045 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030060F23 product:Mus musculus U22 snoRNA host gene (UHG) gene, complete sequence, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT033789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT033790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT033795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// SNHG1 // lncRNA Db // mm9 chr19:8,797,977-8,800,816 // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000083848 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:8725341:8725409:1 gene:ENSMUSG00000065782 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000180819 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726441:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK051045 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030060F23 product:Mus musculus U22 snoRNA host gene (UHG) gene, complete sequence, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT033789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT033796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// SNHG1 // lncRNA Db // mm9 chr19:8,797,977-8,800,816 // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000083371 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:8725594:8725660:1 gene:ENSMUSG00000065305 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181422 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726442:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// SNHG1 // lncRNA Db // mm9 chr19:8,797,977-8,800,816 // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_004445 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 22 (Snord22), small nucleolar RNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083153 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:8725866:8725991:1 gene:ENSMUSG00000065087 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180819 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726441:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181422 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:8723496:8726442:1 gene:ENSMUSG00000097188 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK051045 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030060F23 product:Mus musculus U22 snoRNA host gene (UHG) gene, complete sequence, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// SNHG1 // lncRNA Db // mm9 chr19:8,797,977-8,800,816 // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134139 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 74 (Wdr74), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006526554 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 74 (Wdr74), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000049424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8735839:8740623:1 gene:ENSMUSG00000042729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC019968 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 74, mRNA (cDNA clone MGC:28494 IMAGE:4167260), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC024478 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 74, mRNA (cDNA clone MGC:37386 IMAGE:4977054), complete cds. // chr19 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8735842:8755068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_025791 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 223 (Tmem223), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000010248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8770996:8772475:1 gene:ENSMUSG00000010097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000075043 // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000184970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:8757107:8772456:1 gene:ENSMUSG00000010097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC066781 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 223, mRNA (cDNA clone MGC:74193 IMAGE:30380072), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000048717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8757232:8772340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001098237 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 3 (Zbtb3), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_133759 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 3 (Zbtb3), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527420 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 3 (Zbtb3), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000172175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8802530:8804854:1 gene:ENSMUSG00000071661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC119186 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:155502 IMAGE:8733935), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC119188 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:155504 IMAGE:8733937), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8803025:8804581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
AK032708 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720407D17 product:hypothetical Glutamic acid-rich region/SAP domain containing protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// DQ000354 // GenBank // Mus musculus MLF1 associated nuclear protein (Manp) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_001081196 // RefSeq // Mus musculus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like 2 (Hnrnpul2), mRNA. // chr19 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// ENSMUST00000096753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8819401:8834142:1 gene:ENSMUSG00000071659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// GENSCAN00000048720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8820282:8831535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
NM_001013019 // RefSeq // Mus musculus LRRN4 C-terminal like (Lrrn4cl), mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006527321 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus LRRN4 C-terminal like (Lrrn4cl), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000096257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8850785:8853909:1 gene:ENSMUSG00000071656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK158268 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930049F21 product:hypothetical Fibronectin, type III/Fibronectin, type III-like fold containing protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// BC107244 // GenBank // Mus musculus LRRN4 C-terminal like, mRNA (cDNA clone MGC:130183 IMAGE:40052213), complete cds. // chr19 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// BC107245 // GenBank // Mus musculus LRRN4 C-terminal like, mRNA (cDNA clone MGC:130184 IMAGE:40052216), complete cds. // chr19 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT033821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0
NM_146093 // RefSeq // Mus musculus UBX domain protein 1 (Ubxn1), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000096255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8871643:8875663:1 gene:ENSMUSG00000071655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000166407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8871559:8875655:1 gene:ENSMUSG00000071655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK015468 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930455J02 product:hypothetical Ubiquitin-associated domain containing protein, full insert sequence. // chr19 // 80 // 89 // 20 // 25 // 0 /// BC006701 // GenBank // Mus musculus UBX domain protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:6696 IMAGE:3583916), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8841213:8875571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_176843 // RefSeq // Mus musculus integrator complex subunit 5 (Ints5), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8892987:8897890:1 gene:ENSMUSG00000071652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC039214 // GenBank // Mus musculus integrator complex subunit 5, mRNA (cDNA clone MGC:31173 IMAGE:4191047), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8893015:8915734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001293621 // RefSeq // Mus musculus alpha glucosidase 2 alpha neutral subunit (Ganab), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_008060 // RefSeq // Mus musculus alpha glucosidase 2 alpha neutral subunit (Ganab), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000096246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8898090:8916663:1 gene:ENSMUSG00000071650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK122201 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0088 protein. // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC094437 // GenBank // Mus musculus alpha glucosidase 2 alpha neutral subunit, mRNA (cDNA clone MGC:117128 IMAGE:30682580), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC117888 // GenBank // Mus musculus alpha glucosidase 2 alpha neutral subunit, mRNA (cDNA clone MGC:144011 IMAGE:40096413), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC117889 // GenBank // Mus musculus alpha glucosidase 2 alpha neutral subunit, mRNA (cDNA clone MGC:144012 IMAGE:40096414), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC128069 // GenBank // Mus musculus alpha glucosidase 2 alpha neutral subunit, mRNA (cDNA clone MGC:144013 IMAGE:40096428), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U92793 // GenBank // Mus musculus alpha glucosidase II alpha subunit mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK047454 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930066E17 product:alpha glucosidase 2, alpha neutral subunit, full insert sequence. // chr19 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8893015:8915734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_144872 // RefSeq // Mus musculus echinoderm microtubule associated protein like 3 (Eml3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000096241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8929694:8941563:1 gene:ENSMUSG00000071647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC022146 // GenBank // Mus musculus echinoderm microtubule associated protein like 3, mRNA (cDNA clone MGC:37888 IMAGE:5101626), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC023878 // GenBank // Mus musculus echinoderm microtubule associated protein like 3, mRNA (cDNA clone MGC:38588 IMAGE:5354867), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000023129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8930300:8951655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0
NM_197993 // RefSeq // Mus musculus terminal uridylyl transferase 1, U6 snRNA-specific (Tut1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000096239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8953850:8966207:1 gene:ENSMUSG00000071645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC023900 // GenBank // Mus musculus terminal uridylyl transferase 1, U6 snRNA-specific, mRNA (cDNA clone MGC:38144 IMAGE:5321265), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC025499 // GenBank // Mus musculus terminal uridylyl transferase 1, U6 snRNA-specific, mRNA (cDNA clone MGC:38113 IMAGE:5320398), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK138418 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230098K01 product:hypothetical RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)/Zn-finger, U1-like/Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile containing protein, full insert sequence. // chr19 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000023134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8953940:8984838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000052248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:8967041:8978479:1 gene:ENSMUSG00000071644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000135025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:8972404:8978479:1 gene:ENSMUSG00000071644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
NM_001039959 // RefSeq // Mus musculus AHNAK nucleoprotein (desmoyokin) (Ahnak), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 58 // 28 // 28 // 0 /// NM_001286518 // RefSeq // Mus musculus AHNAK nucleoprotein (desmoyokin) (Ahnak), transcript variant 4, mRNA. // chr19 // 100 // 63 // 30 // 30 // 0 /// NM_009643 // RefSeq // Mus musculus AHNAK nucleoprotein (desmoyokin) (Ahnak), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// NR_104460 // RefSeq // Mus musculus AHNAK nucleoprotein (desmoyokin) (Ahnak), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr19 // 100 // 63 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000092955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8989284:9076919:1 gene:ENSMUSG00000069833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 58 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000092956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8989284:9019195:1 gene:ENSMUSG00000069833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// AK045184 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130044C16 product:hypothetical PDZ domain (also known as DHR or GLGF) containing protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 40 // 19 // 19 // 0 /// BC028439 // GenBank // Mus musculus AHNAK nucleoprotein (desmoyokin), mRNA (cDNA clone IMAGE:1246244), complete cds. // chr19 // 100 // 52 // 25 // 25 // 0 /// AK134304 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030404D02 product:Hypothetical PDZ domain (Fragment) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr19 // 27 // 27 // 13 // 48 // 1 /// GENSCAN00000023128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8999799:9068802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000142025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:9135157:9279175:1 gene:ENSMUSG00000024658 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AK048878 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230078J11 product:weakly similar to prostatic steroid-binding protein chain C1 precursor [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr19 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// NONMMUT033849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_006527538 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus secretoglobin family 2A member 2-like (LOC102639117), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000179814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:9847562:9852808:1 gene:ENSMUSG00000096872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:9847616:9871927:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
ENSMUST00000102415 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:9855319:9855422:1 gene:ENSMUSG00000076370 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010239 // RefSeq // Mus musculus ferritin heavy chain 1 (Fth1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NR_073181 // RefSeq // Mus musculus ferritin heavy chain 1 (Fth1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000025563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:9982703:9985092:1 gene:ENSMUSG00000024661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC011096 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3968914, containing frame-shift errors. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC012314 // GenBank // Mus musculus ferritin heavy chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:19422 IMAGE:3488821), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// J03941 // GenBank // Mouse ferritin heavy chain (MFH) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000056628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:9925090:9984942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// AK170912 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630209G10 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC026454 // GenBank HTC // Mus musculus DAZ associated protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4460956), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK089251 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630105G17 product:ferritin heavy chain, full insert sequence. // chr19 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
NM_021890 // RefSeq // Mus musculus fatty acid desaturase 3 (Fads3), mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000115995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10041548:10059671:1 gene:ENSMUSG00000024664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC071266 // GenBank HTC // Mus musculus fatty acid desaturase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:30291213), with apparent retained intron. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006527247 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fatty acid desaturase 3 (Fads3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// XM_006527248 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fatty acid desaturase 3 (Fads3), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000056643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10015134:10057936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1
NM_146094 // RefSeq // Mus musculus fatty acid desaturase 1 (Fads1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000010807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10182888:10196870:1 gene:ENSMUSG00000010663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB072976 // GenBank // Mus musculus D5D mRNA for delta-5 desaturase, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC022139 // GenBank // Mus musculus fatty acid desaturase 1, mRNA (cDNA clone MGC:37858 IMAGE:5100199), complete cds. // chr19 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC026831 // GenBank // Mus musculus fatty acid desaturase 1, mRNA (cDNA clone MGC:25963 IMAGE:4239695), complete cds. // chr19 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC026848 // GenBank // Mus musculus fatty acid desaturase 1, mRNA (cDNA clone MGC:19089 IMAGE:4196030), complete cds. // chr19 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC063053 // GenBank // Mus musculus fatty acid desaturase 1, mRNA (cDNA clone MGC:66685 IMAGE:5696722), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// KF987079 // GenBank // Mus musculus domesticus fatty acid desaturase 1 (Fads1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AK080706 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930006B21 product:fatty acid desaturase 1, full insert sequence. // chr19 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000056650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10137621:10196597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000081739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10199189:10202382:1 gene:ENSMUSG00000064032 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10198368:10202384:1 gene:ENSMUSG00000064032 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK029975 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932411N02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT033870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000127878 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10204218:10207818:1 gene:ENSMUSG00000036372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 82 // 52 // 9 // 11 // 0 /// BC085316 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810006K21 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30439806). // chr19 // 82 // 52 // 9 // 11 // 0 /// BC024923 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810006K21 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3990436), complete cds. // chr19 // 62 // 100 // 13 // 21 // 0 /// NONMMUT033873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 82 // 52 // 9 // 11 // 0
AB026804 // GenBank // Mus musculus mRNA for synaptotagmin VII, complete cds. // chr19 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// AB075900 // GenBank // Mus musculus mRNA for Synaptotagmin VIIbeta, complete cds. // chr19 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// AB075901 // GenBank // Mus musculus mRNA for synaptotagmin VIIgamma, complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// BC139806 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin VII, mRNA (cDNA clone MGC:161769 IMAGE:40046580), complete cds. // chr19 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// NM_173068 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin VII (Syt7), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 88 // 88 // 36 // 41 // 1 /// ENSMUST00000169121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10389090:10453181:1 gene:ENSMUSG00000024743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 88 // 88 // 36 // 41 // 1 /// NM_018801 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin VII (Syt7), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 61 // 61 // 25 // 41 // 1 /// NM_173067 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin VII (Syt7), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1 /// ENSMUST00000073899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10389090:10453181:1 gene:ENSMUSG00000024743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 61 // 61 // 25 // 41 // 1 /// ENSMUST00000076968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10389090:10453181:1 gene:ENSMUSG00000024743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1 /// GENSCAN00000056638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10283960:10448444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
NM_001164272 // RefSeq // Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 7 (Cpsf7), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// NM_172302 // RefSeq // Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 7 (Cpsf7), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006527121 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 7 (Cpsf7), transcript variant X6, mRNA. // chr19 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000038379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10525244:10547735:1 gene:ENSMUSG00000034820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK165330 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430013P17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC038812 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730453I16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:46982 IMAGE:4506179), complete cds. // chr19 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// AK044306 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930006J15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000056634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10500233:10542678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0
NM_001282064 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b561 family, member A3 (Cyb561a3), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_001282067 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b561 family, member A3 (Cyb561a3), transcript variant 4, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_201351 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b561 family, member A3 (Cyb561a3), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526935 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome b561 family, member A3 (Cyb561a3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006526939 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome b561 family, member A3 (Cyb561a3), transcript variant X5, mRNA. // chr19 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000168445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10577454:10588548:1 gene:ENSMUSG00000034445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC065078 // GenBank // Mus musculus cytochrome b, ascorbate dependent 3, mRNA (cDNA clone MGC:86114 IMAGE:6817093), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001282065 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b561 family, member A3 (Cyb561a3), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// AK040692 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530015N18 product:hypothetical Cytochrome b561/Cytochrome b561 / ferric reductase transmembrane containing protein, full insert sequence. // chr19 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000056630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10582313:10589202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT033905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_015735 // RefSeq // Mus musculus damage specific DNA binding protein 1 (Ddb1), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10605625:10629813:1 gene:ENSMUSG00000024740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB026432 // GenBank // Mus musculus mRNA for XPE UV-damaged DNA binding factor, complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF159853 // GenBank // Mus musculus damage-specific DNA binding protein 1 (DDB1) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC009661 // GenBank // Mus musculus damage specific DNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:6603 IMAGE:3487617), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AJ416426 // GenBank // Mus musculus mRNA for damaged-DNA recognition protein 1 (Ddb1 gene). // chr19 // 38 // 93 // 10 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10605706:10629162:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_027913 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor C and EGF domains (Vwce), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000055115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10634233:10665210:1 gene:ENSMUSG00000043789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC030181 // GenBank HTC // Mus musculus von Willebrand factor C and EGF domains, mRNA (cDNA clone IMAGE:5050759), with apparent retained intron. // chr19 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// BC043473 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor C and EGF domains, mRNA (cDNA clone MGC:49353 IMAGE:5346280), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000056649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10634474:10664701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0
NM_181403 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 37C (yeast) (Vps37c), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526574 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vacuolar protein sorting 37C (yeast) (Vps37c), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000087951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10688815:10714419:1 gene:ENSMUSG00000048832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK030717 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730409F24 product:weakly similar to LD39545P [Drosophila melanogaster], full insert sequence. // chr19 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// BC025865 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 37C (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:32338 IMAGE:5029143), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10706216:10714207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NR_027805 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A430093F15 gene (A430093F15Rik), long non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087947 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:10740951:10786034:1 gene:ENSMUSG00000067577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// BC064125 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A430093F15 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3825659). // chr19 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSMUST00000186052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10785352:10786036:1 gene:ENSMUSG00000067577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000186596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:10740947:10786043:1 gene:ENSMUSG00000067577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188480 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:10740960:10785677:1 gene:ENSMUSG00000067577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000189565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10781915:10786039:1 gene:ENSMUSG00000067577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_023044 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 15, member 3 (Slc15a3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025646 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:10842544:10857915:1 gene:ENSMUSG00000024737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000138263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10842895:10859362:1 gene:ENSMUSG00000024737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF121080 // GenBank // Mus musculus cAMP inducible 1 protein (Ci1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC051940 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 15, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:62183 IMAGE:5717926), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10843021:10857784:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_009962 // RefSeq // Mus musculus prostaglandin D2 receptor 2 (Ptgdr2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526695 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 44 (Gpr44), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// XM_006526696 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 44 (Gpr44), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000037261 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:10937160:10942511:1 gene:ENSMUSG00000034117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB109092 // GenBank // Mus musculus crth2 mRNA for prostaglandin D2 receptor CRTH2, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC111906 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 44, mRNA (cDNA clone MGC:130436 IMAGE:40039170), complete cds. // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000017167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10934906:10941269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
XM_986941 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 4A (Ms4a4a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000188995 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:11375523:11392790:1 gene:ENSMUSG00000101389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT033923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000017153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11377051:11586934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONMMUT033924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_029499 // RefSeq // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 4C (Ms4a4c), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006527250 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 4C (Ms4a4c), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// XM_006527251 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 4C (Ms4a4c), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000072729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11407661:11427246:1 gene:ENSMUSG00000024675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000119366 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:11414841:11426468:1 gene:ENSMUSG00000024675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// AF237914 // GenBank // Mus musculus MS4A4C protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC027496 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 4C, mRNA (cDNA clone MGC:41005 IMAGE:1383416), complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// CT010170 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B0150D for gene Ms4a4c, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 4C; complete cds, incl. stopcodon. // chr19 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// AB026045 // GenBank // Mus musculus mRNA for MS4A9, complete cds. // chr19 // 57 // 91 // 12 // 21 // 0
NM_001166376 // RefSeq // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6C (Ms4a6c), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NM_028595 // RefSeq // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6C (Ms4a6c), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000165310 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11469366:11482192:1 gene:ENSMUSG00000079419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF237910 // GenBank // Mus musculus MS4A6C protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC062247 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6C, mRNA (cDNA clone MGC:73569 IMAGE:1550331), complete cds. // chr19 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// XM_006527381 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6C (Ms4a6c), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// XM_006527382 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6C (Ms4a6c), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENSMUST00000187462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11469425:11472736:1 gene:ENSMUSG00000079419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_027209 // RefSeq // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6B (Ms4a6b), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:11518559:11530403:1 gene:ENSMUSG00000024677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000161157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11518566:11531254:1 gene:ENSMUSG00000024677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000163078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11516512:11531256:1 gene:ENSMUSG00000024677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF237909 // GenBank // Mus musculus MS4A6B protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC027425 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6B, mRNA (cDNA clone MGC:35625 IMAGE:3984299), complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000161283 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11521671:11527417:1 gene:ENSMUSG00000024677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000017153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11377051:11586934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_025658 // RefSeq // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 4D (Ms4a4d), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000025581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11536801:11558467:1 gene:ENSMUSG00000024678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF237915 // GenBank // Mus musculus MS4A4D protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC069842 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 4D, mRNA (cDNA clone MGC:77996 IMAGE:30446709), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000087884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11569449:11573112:1 gene:ENSMUSG00000067555 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr19 // 94 // 80 // 15 // 16 // 0
ENSMUST00000157685 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:11695041:11695179:1 gene:ENSMUSG00000088310 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT033941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NR_028560 // RefSeq // Mus musculus small Cajal body-specific RNA 17 (Scarna17), guide RNA. // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000158064 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:74778391:74778469:-1 gene:ENSMUSG00000088689 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159000 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:11695267:11695342:1 gene:ENSMUSG00000089625 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT033942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033283 // RefSeq // Mus musculus oocyte secreted protein 3 (Oosp3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000069760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11697055:11711858:1 gene:ENSMUSG00000055933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC141228 // GenBank // Mus musculus gene model 97, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:176189 IMAGE:9055840), complete cds. // chr19 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// ENSMUST00000119053 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:11697078:11711874:1 gene:ENSMUSG00000055933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// GENSCAN00000017149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11697099:11763257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_008118 // RefSeq // Mus musculus gastric intrinsic factor (Gif), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11747554:11763447:1 gene:ENSMUSG00000024682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC118519 // GenBank // Mus musculus gastric intrinsic factor, mRNA (cDNA clone MGC:144768 IMAGE:40105765), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// L24191 // GenBank // Mus musculus intrinsic factor mRNA, complete cds. // chr19 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11697099:11763257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_025606 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L16 (Mrpl16), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:11770415:11774944:1 gene:ENSMUSG00000024683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB049643 // GenBank // Mus musculus MRPL16 mRNA for mitochondrial ribosomal protein L16 (L16mt), complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC029009 // GenBank HTC // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L16, mRNA (cDNA clone IMAGE:5361223), with apparent retained intron. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC044721 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L16, mRNA (cDNA clone MGC:54427 IMAGE:6476049), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11770470:11777320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0
NM_146410 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1420 (Olfr1420), mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:11895999:11897050:1 gene:ENSMUSG00000060878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC120832 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1420, mRNA (cDNA clone MGC:156069 IMAGE:40129755), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11896455:11962982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_172635 // RefSeq // Mus musculus protein associated with topoisomerase II homolog 1 (yeast) (Patl1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006526946 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein associated with topoisomerase II homolog 1 (yeast) (Patl1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000061618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:11912399:11945096:1 gene:ENSMUSG00000046139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC047458 // GenBank HTC // Mus musculus protein associated with topoisomerase II homolog 1 (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:3978942), with apparent retained intron. // chr19 // 91 // 89 // 29 // 32 // 0 /// BC058941 // GenBank // Mus musculus protein associated with topoisomerase II homolog 1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:66563 IMAGE:6825758), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000047776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11896455:11962982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1
NM_001033174 // RefSeq // Mus musculus oxysterol binding protein (Osbp), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527439 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus oxysterol binding protein (Osbp), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000025590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:11965844:11994105:1 gene:ENSMUSG00000024687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK132663 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921514G13 product:Oxysterol-binding protein 1 homolog [Oryctolagus cuniculus], full insert sequence. // chr19 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11965941:12012490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_146414 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1431 (Olfr1431), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000072316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:12209568:12210506:1 gene:ENSMUSG00000094133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC133710 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1431, mRNA (cDNA clone MGC:161299 IMAGE:40142241), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000047791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12175654:12210506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_146686 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 235 (Olfr235), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000073507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:12268163:12269241:1 gene:ENSMUSG00000060049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC132238 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 232, mRNA (cDNA clone MGC:163869 IMAGE:40130515), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC132388 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 232, mRNA (cDNA clone MGC:164019 IMAGE:40130665), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12238523:12269170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000047785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12273513:12274553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
NM_146685 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1433 (Olfr1433), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_207626 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1434 (Olfr1434), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000087814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12279854:12283988:1 gene:ENSMUSG00000095640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC132136 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1434, mRNA (cDNA clone MGC:163767 IMAGE:40130413), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC138096 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1433, mRNA (cDNA clone MGC:169720 IMAGE:8861115), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC147691 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1434, mRNA (cDNA clone MGC:182770 IMAGE:9056664), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC147692 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1434, mRNA (cDNA clone MGC:182771 IMAGE:9056665), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000047801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12283293:12298371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_146684 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1440 (Olfr1440), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12394265:12395212:1 gene:ENSMUSG00000046650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125000 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1440, mRNA (cDNA clone IMAGE:40043008), partial cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12394562:12403642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
NM_146683 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1441 (Olfr1441), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12422265:12423352:1 gene:ENSMUSG00000050815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145847 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1441, mRNA (cDNA clone MGC:175734 IMAGE:40131150), complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12422311:12423267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019540 // RefSeq // Mus musculus pore forming protein-like (Pfpl), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12427905:12432110:1 gene:ENSMUSG00000040065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF250839 // GenBank // Mus musculus EPCS50 mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC052215 // GenBank // Mus musculus pore forming protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:60502 IMAGE:30020114), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12428387:12430495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_010821 // RefSeq // Mus musculus macrophage expressed gene 1 (Mpeg1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12460779:12465284:1 gene:ENSMUSG00000046805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC129843 // GenBank // Mus musculus macrophage expressed gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:150002 IMAGE:40095576), complete cds. // chr19 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC129844 // GenBank // Mus musculus macrophage expressed gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:150003 IMAGE:40095579), complete cds. // chr19 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000047773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12461201:12463342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_026640 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 111, member A (Fam111a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12573523:12589762:1 gene:ENSMUSG00000024691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:12568198:12589768:1 gene:ENSMUSG00000024691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:12568198:12589760:1 gene:ENSMUSG00000024691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC038020 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4632417K18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:46762 IMAGE:3599082), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019638 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4632417K18 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4010556), partial cds. // chr19 // 73 // 44 // 8 // 11 // 0
NM_001013762 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4952 (Gm4952), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001167907 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4952 (Gm4952), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000092931 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:12600016:12628251:1 gene:ENSMUSG00000071633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:12599974:12626873:1 gene:ENSMUSG00000071633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12596409:12651631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_145935 // RefSeq // Mus musculus glycine-N-acyltransferase (Glyat), mRNA. // chr19 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000044976 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:12633308:12653249:1 gene:ENSMUSG00000063683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000119960 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:12633533:12653911:1 gene:ENSMUSG00000063683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000123173 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:12639492:12650424:1 gene:ENSMUSG00000063683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// AK143803 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430110M01 product:glycine-N-acyltransferase, full insert sequence. // chr19 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// BC010799 // GenBank // Mus musculus glycine-N-acyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:18871 IMAGE:4234793), complete cds. // chr19 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// BC015294 // GenBank // Mus musculus glycine-N-acyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:19155 IMAGE:4220471), complete cds. // chr19 // 90 // 88 // 26 // 29 // 0 /// BC024434 // GenBank // Mus musculus glycine-N-acyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:37254 IMAGE:4972912), complete cds. // chr19 // 95 // 61 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000157069 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:12633515:12648510:1 gene:ENSMUSG00000063683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000047783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12596409:12651631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
ENSMUST00000083958 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:12665255:12665361:1 gene:ENSMUSG00000065892 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr19 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT033968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0
NM_146697 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1442 (Olfr1442), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000057924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12674179:12675243:1 gene:ENSMUSG00000044441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC119095 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1442, mRNA (cDNA clone MGC:155411 IMAGE:8733844), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC119097 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1442, mRNA (cDNA clone MGC:155413 IMAGE:8733846), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000047784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12674225:12675145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_146698 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1443 (Olfr1443), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000049724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12678166:12683843:1 gene:ENSMUSG00000045030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC065104 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1443, mRNA (cDNA clone MGC:86049 IMAGE:6841907), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000047780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12686451:12687992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 76 // 12 // 13 // 0
NM_134152 // RefSeq // Mus musculus leupaxin (Lpxn), mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006526576 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leupaxin (Lpxn), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000025601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12798606:12833807:1 gene:ENSMUSG00000024696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AB053936 // GenBank // Mus musculus LPXN mRNA for leupaxin, complete cds. // chr19 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// AB071194 // GenBank // Mus musculus mRNA for leupaxin, complete cds. // chr19 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// AK077085 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933402K05 product:LEUPAXIN (FRAGMENT) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC026563 // GenBank // Mus musculus leupaxin, mRNA (cDNA clone MGC:36312 IMAGE:5065405), complete cds. // chr19 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12798667:12833354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000164001 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:12846866:12847204:1 gene:ENSMUSG00000091014 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC158067 // GenBank // Mus musculus predicted gene, EG383436, mRNA (cDNA clone IMAGE:9007366). // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000189517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:12846682:12847424:1 gene:ENSMUSG00000091014 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12846866:12847207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_146702 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1444 (Olfr1444), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12861742:12862771:1 gene:ENSMUSG00000046272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC119059 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1444, mRNA (cDNA clone MGC:155375 IMAGE:8733808), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC125619 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1444, mRNA (cDNA clone MGC:159322 IMAGE:40130134), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12861777:12877663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_146699 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1445 (Olfr1445), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12883855:12884855:1 gene:ENSMUSG00000045126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138186 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1445, mRNA (cDNA clone MGC:169810 IMAGE:8861205), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12883883:12884827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146303 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1449 (Olfr1449), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12934737:12935684:1 gene:ENSMUSG00000049498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC133705 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1449, mRNA (cDNA clone MGC:157547 IMAGE:40135405), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12934740:12935684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146371 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1450 (Olfr1450), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000082006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12953591:12954568:1 gene:ENSMUSG00000062892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12952849:13094917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_146705 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1451 (Olfr1451), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12998988:12999920:1 gene:ENSMUSG00000046913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000099644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13016225:13017149:1 gene:ENSMUSG00000074985 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_146692 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1454 (Olfr1454), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073732 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13063413:13064336:1 gene:ENSMUSG00000094986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146302 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1461 (Olfr1461), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000053772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13165016:13165954:1 gene:ENSMUSG00000045883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13158200:13165954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_146693 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1462 (Olfr1462), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000076832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13190669:13191592:1 gene:ENSMUSG00000094721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC128026 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1462, mRNA (cDNA clone MGC:157634 IMAGE:40136583), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001011840 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1463 (Olfr1463), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000064102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13234252:13235184:1 gene:ENSMUSG00000096365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_146694 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1466 (Olfr1466), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13341760:13342692:1 gene:ENSMUSG00000096485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146691 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1467 (Olfr1467), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000054687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13364630:13365556:1 gene:ENSMUSG00000049015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13364630:13365556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_146695 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1469 (Olfr1469), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13410571:13411500:1 gene:ENSMUSG00000063777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13410571:13411500:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207132 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1471 (Olfr1471), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000096203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13445014:13445958:1 gene:ENSMUSG00000096320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000010436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13445014:13445958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001011842 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1474 (Olfr1474), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000096202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13470972:13471916:1 gene:ENSMUSG00000096273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13471098:13530622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 75 // 11 // 12 // 0
NM_146696 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1477 (Olfr1477), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000096201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13500546:13503292:1 gene:ENSMUSG00000071629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_207575 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1480 (Olfr1480), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13529675:13530622:1 gene:ENSMUSG00000095484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13471098:13530622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146291 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1484 (Olfr1484), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000074180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13585306:13586253:1 gene:ENSMUSG00000096289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13585306:13586253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_146636 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1487 (Olfr1487), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000076856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13619164:13620111:1 gene:ENSMUSG00000094846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13619164:13620111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_146635 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1489 (Olfr1489), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000053113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13633113:13634054:1 gene:ENSMUSG00000045678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001011832 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1490 (Olfr1490), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13654446:13655396:1 gene:ENSMUSG00000061387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13654431:13727213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_146345 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1491 (Olfr1491), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13704829:13705788:1 gene:ENSMUSG00000051156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128268 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1491, mRNA (cDNA clone MGC:149920 IMAGE:40043876), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13654431:13727213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
GENSCAN00000010434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13654431:13727213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 48 // 84 // 10 // 21 // 0
NM_146990 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1494 (Olfr1494), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000051768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13749108:13750055:1 gene:ENSMUSG00000050865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC104099 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1494, mRNA (cDNA clone MGC:123731 IMAGE:40043096), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC104100 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1494, mRNA (cDNA clone MGC:123732 IMAGE:40043097), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC106804 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1494, mRNA (cDNA clone MGC:123672 IMAGE:40042568), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000010454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13749108:13750055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_146344 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1495 (Olfr1495), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13768307:13769395:1 gene:ENSMUSG00000047207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125566 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1495, mRNA (cDNA clone MGC:159269 IMAGE:40130081), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137879 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1495, mRNA (cDNA clone MGC:169503 IMAGE:8860898), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13768344:13781567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_146989 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1496 (Olfr1496), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13780548:13781614:1 gene:ENSMUSG00000048356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137878 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1496, mRNA (cDNA clone MGC:169502 IMAGE:8860897), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13768344:13781567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146797 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1502 (Olfr1502), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000074221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13861795:13862745:1 gene:ENSMUSG00000056858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC106810 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1502, mRNA (cDNA clone MGC:123715 IMAGE:40042985), complete cds. // chr19 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// BC150832 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1505, mRNA (cDNA clone MGC:183743 IMAGE:9087743), complete cds. // chr19 // 78 // 100 // 29 // 37 // 0 /// NM_001011850 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1505 (Olfr1505), mRNA. // chr19 // 65 // 100 // 24 // 37 // 0 /// ENSMUST00000076614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13877457:13878253:1 gene:ENSMUSG00000058078 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 50 // 76 // 14 // 28 // 0 /// ENSMUST00000081520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13918942:13920044:1 gene:ENSMUSG00000062314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 65 // 100 // 24 // 37 // 0 /// BC106809 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1502, mRNA (cDNA clone IMAGE:40042984). // chr19 // 46 // 76 // 13 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13861795:13862745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000056735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13919136:13942573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 66 // 78 // 19 // 29 // 0 /// NONMMUT033988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 44 // 49 // 8 // 18 // 0
ENSMUST00000076614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13877457:13878253:1 gene:ENSMUSG00000058078 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// BC106809 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1502, mRNA (cDNA clone IMAGE:40042984). // chr19 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// NONMMUT033988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_001011850 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1505 (Olfr1505), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000081520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13918942:13920044:1 gene:ENSMUSG00000062314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000056735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13919136:13942573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 86 // 64 // 6 // 7 // 0
GENSCAN00000031592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:16022373:16025720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_008139 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha q polypeptide (Gnaq), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000025541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:16132831:16387463:1 gene:ENSMUSG00000024639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC057583 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha q polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:67083 IMAGE:6408959), complete cds. // chr19 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// M55412 // GenBank // Mouse G alpha q subunit mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000170229 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:16133296:16316527:1 gene:ENSMUSG00000024639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000031583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:16293491:16406185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_008137 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha 14 (Gna14), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:16435667:16610818:1 gene:ENSMUSG00000024697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC027015 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha 14, mRNA (cDNA clone MGC:36137 IMAGE:5375817), complete cds. // chr19 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// M80631 // GenBank // Mouse G protein alpha subunit (GNA-14) mRNA, complete cds. // chr19 // 90 // 70 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:16598043:16609530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0
AK015803 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930516E05 product:hypothetical Gram-positive cocci surface protein anchoring hexapeptide containing protein, full insert sequence. // chr19 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_181348 // RefSeq // Mus musculus prune homolog 2 (Drosophila) (Prune2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000087689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:16956118:17223932:1 gene:ENSMUSG00000039126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK165913 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730018I05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000050357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:16988124:17021543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000050370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:17110910:17139847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_181348 // RefSeq // Mus musculus prune homolog 2 (Drosophila) (Prune2), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000087689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:16956118:17223932:1 gene:ENSMUSG00000039126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AK172939 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0367 protein. // chr19 // 92 // 71 // 23 // 25 // 0 /// BC094224 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A230083H22 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6848636), complete cds. // chr19 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// GQ403051 // GenBank // Mus musculus neuronal protein mRNA, complete cds. // chr19 // 84 // 71 // 21 // 25 // 0 /// BC095978 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A230083H22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106167 IMAGE:30726642), complete cds. // chr19 // 71 // 60 // 15 // 21 // 0 /// AK163576 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230388L24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000050379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:17168285:17208333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_019437 // RefSeq // Mus musculus riboflavin kinase (Rfk), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:17394043:17401349:1 gene:ENSMUSG00000024712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:17394568:17399858:1 gene:ENSMUSG00000024712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC033521 // GenBank // Mus musculus riboflavin kinase, mRNA (cDNA clone MGC:35594 IMAGE:4527980), complete cds. // chr19 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC051021 // GenBank // Mus musculus riboflavin kinase, mRNA (cDNA clone MGC:54435 IMAGE:6315425), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000050362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:17393982:17399603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000102348 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:17928111:17928226:1 gene:ENSMUSG00000076303 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT034061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
GENSCAN00000043670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:18565220:18565492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
NM_145497 // RefSeq // Mus musculus nicotinamide riboside kinase 1 (Nmrk1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006526949 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nicotinamide riboside kinase 1 (Nmrk1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000042392 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:18631950:18651927:1 gene:ENSMUSG00000037847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000159572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:18631950:18652194:1 gene:ENSMUSG00000037847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK050579 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920004J08 product:weakly similar to URIDINE KINASE [Brachydanio rerio], full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC016495 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC016495, mRNA (cDNA clone MGC:25909 IMAGE:4221437), complete cds. // chr19 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENSMUST00000161080 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:18631959:18641229:1 gene:ENSMUSG00000037847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// ENSMUST00000162446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:18631962:18637299:1 gene:ENSMUSG00000037847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000043658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:18641386:18653675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONMMUT034066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_026120 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2410127L17 gene (2410127L17Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006527293 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2410127L17 gene (2410127L17Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// XM_006544411 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UPF0586 protein C9orf41 homolog (LOC102638361), mRNA. // chr19 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:18670780:18704788:1 gene:ENSMUSG00000024726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000182917 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:78820638:78821838:-1 gene:ENSMUSG00000059422 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0 /// BC043335 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410127L17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:49519 IMAGE:5030742), complete cds. // chr19 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// BC092281 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410127L17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:102344 IMAGE:4950426), complete cds. // chr19 // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// GENSCAN00000030345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:78820638:78821840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:18664672:18704121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:61666151:61667143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 68 // 25 // 28 // 0
ENSMUST00000055792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:18713236:18718428:1 gene:ENSMUSG00000047044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000062753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:18713193:18718428:1 gene:ENSMUSG00000047044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC020125 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D030056L22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28164 IMAGE:3985075), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_153417 // RefSeq // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 6 (Trpm6), mRNA. // chr19 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000040489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:18749983:18892510:1 gene:ENSMUSG00000024727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// AK080899 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430202L17 product:similar to CHANNEL-KINASE 2 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// AY135644 // GenBank // Mus musculus transient receptor potential cation channel 6/channel-kinase 2 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// XM_006526952 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 6 (Trpm6), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// GENSCAN00000029853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:18827371:18902866:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000043664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:18758437:18823524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1
NR_045817 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1500015L24 gene (1500015L24Rik), long non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000179640 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:20405288:20422787:1 gene:ENSMUSG00000094732 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// KnowTID_00004064 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT034098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT034099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// NONMMUT034101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0
NM_013467 // RefSeq // Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 1, subfamily A1 (Aldh1a1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000087638 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:20601961:20643462:1 gene:ENSMUSG00000053279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC054386 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 1, subfamily A1, mRNA (cDNA clone MGC:62611 IMAGE:6477503), complete cds. // chr19 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// M74570 // GenBank // Mouse aldehyde dehydrogenase II mRNA, complete cds. // chr19 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:20602012:20642966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_146096 // RefSeq // Mus musculus abhydrolase domain containing 17B (Abhd17b), mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:21653309:21685637:1 gene:ENSMUSG00000047368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC032261 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 108, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5376430), complete cds. // chr19 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AK050879 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030029D01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000048833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:21671536:21737733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONMMUT034154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_001033759 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 2 (Tmem2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_031997 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 2 (Tmem2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006527487 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 2 (Tmem2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:21778342:21858327:1 gene:ENSMUSG00000024754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000096194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:21778342:21858327:1 gene:ENSMUSG00000024754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC019745 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:30634 IMAGE:3675225), complete cds. // chr19 // 75 // 55 // 12 // 16 // 0 /// BC076570 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:100229 IMAGE:6830791), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC089353 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:102198 IMAGE:6410437), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:21801862:21835630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_008492 // RefSeq // Mus musculus lactate dehydrogenase B (Ldhb), mRNA. // chr19 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// ENSMUST00000032373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:142490249:142507957:-1 gene:ENSMUSG00000030246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// ENSMUST00000060477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:21938079:21938384:1 gene:ENSMUSG00000045104 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 90 // 32 // 9 // 10 // 0 /// BC046755 // GenBank // Mus musculus lactate dehydrogenase B, mRNA (cDNA clone MGC:57911 IMAGE:5693226), complete cds. // chr19 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// BC087888 // GenBank // Mus musculus lactate dehydrogenase B, mRNA (cDNA clone IMAGE:30282331), complete cds. // chr19 // 76 // 55 // 13 // 17 // 0 /// BC148214 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40044723. // chr19 // 69 // 42 // 9 // 13 // 0 /// ENSMUST00000134191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:142495568:142507805:-1 gene:ENSMUSG00000030246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// ENSMUST00000130817 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:142490251:142507921:-1 gene:ENSMUSG00000030246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000038804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:21937380:21938384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:142490437:142512269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 82 // 90 // 23 // 28 // 0 /// NONMMUT034174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 90 // 32 // 9 // 10 // 0
NR_029591 // RefSeq // Mus musculus microRNA 204 (Mir204), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000083573 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:22750600:22750679:1 gene:ENSMUSG00000065507 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-204 // miRBase Micro RNA Database // MI0000247 Mus musculus miR-204 stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT034188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
AK164996 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130111H10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_386610 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102636896 (LOC102636896), transcript variant X1, ncRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_386612 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102636896 (LOC102636896), transcript variant X3, ncRNA. // chr19 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XR_398290 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102636896 (LOC102636896), transcript variant X2, ncRNA. // chr19 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000142712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:23134900:23135717:1 gene:ENSMUSG00000044387 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK019121 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410071A13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010638 // RefSeq // Mus musculus Kruppel-like factor 9 (Klf9), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:23141226:23166911:1 gene:ENSMUSG00000033863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138724 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like factor 9, mRNA (cDNA clone MGC:170351 IMAGE:8861746), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC138725 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like factor 9, mRNA (cDNA clone MGC:170352 IMAGE:8861747), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// CT010185 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D0450D for gene Bteb1, Basic transcription element binding protein 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr19 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// Y14296 // GenBank // Mus musculus mRNA for BTEB-1 transcription factor. // chr19 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000023808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:23111872:23164912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
ENSMUST00000182307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:23666591:23667583:1 gene:ENSMUSG00000098010 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:23666625:23667463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_025364 // RefSeq // Mus musculus SAP domain containing ribonucleoprotein (Sarnp), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006513952 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SAP domain containing ribonucleoprotein (Sarnp), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000056396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:23675844:23676712:1 gene:ENSMUSG00000051255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000105230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:128821771:128877638:1 gene:ENSMUSG00000078427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK212934 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0126J16, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000056396, based on BLAT search. // chr19 // 94 // 47 // 15 // 16 // 0 /// BC027510 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110005A23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41057 IMAGE:1382354), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC157909 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110005A23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:189924 IMAGE:9088111), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC158023 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110005A23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:189829 IMAGE:9007329), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC172063 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110005A23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:198768 IMAGE:9054349), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000023807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:23675848:23676480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_028208 // RefSeq // Mus musculus protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 (Ptar1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527361 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 (Ptar1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006527362 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 (Ptar1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:23687400:23721129:1 gene:ENSMUSG00000074925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK015225 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930428J16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000023818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:23687460:23778547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000067077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:23723279:23725034:1 gene:ENSMUSG00000054178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK085249 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530050H15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177034 // RefSeq // Mus musculus amyloid beta (A4) precursor protein binding, family A, member 1 (Apba1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:23758876:23949597:1 gene:ENSMUSG00000024897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK032261 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430513E09 product:amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family A, member 1, full insert sequence. // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC141181 // GenBank // Mus musculus amyloid beta (A4) precursor protein binding, family A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:176142 IMAGE:9055793), complete cds. // chr19 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:23904677:23945781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000178667 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:24064793:24066452:1 gene:ENSMUSG00000096796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK006227 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700021P04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KnowTID_00004088 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AK013505 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900009I07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_183160 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 252 (Tmem252), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:24674008:24679661:1 gene:ENSMUSG00000048572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087877 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E030010A14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107144 IMAGE:30302311), complete cds. // chr19 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000031407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:24674069:24681320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_028785 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cytokinesis 8 (Dock8), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 50 // 50 // 0 /// XM_006527436 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dedicator of cytokinesis 8 (Dock8), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 48 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:24999529:25202432:1 gene:ENSMUSG00000052085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 50 // 50 // 0 /// AK018051 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830472H07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 85 // 25 // 11 // 13 // 0 /// AK038285 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130092O13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 48 // 25 // 25 // 0 /// BC141358 // GenBank // Mus musculus dedicator of cytokinesis 8, mRNA (cDNA clone MGC:176319 IMAGE:9055970), complete cds. // chr19 // 98 // 96 // 49 // 50 // 0 /// AK035336 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530019D10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 17 // 17 // 9 // 52 // 1 /// GENSCAN00000025808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:24988323:25201732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 45 // 45 // 0
NM_181404 // RefSeq // Mus musculus KN motif and ankyrin repeat domains 1 (Kank1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006526584 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus KN motif and ankyrin repeat domains 1 (Kank1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526588 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus KN motif and ankyrin repeat domains 1 (Kank1), transcript variant X5, mRNA. // chr19 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000049400 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:25236975:25434496:1 gene:ENSMUSG00000032702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000146647 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:25406699:25425984:1 gene:ENSMUSG00000032702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// AK020911 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930031B09 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// BC050250 // GenBank // Mus musculus KN motif and ankyrin repeat domains 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6392285), complete cds. // chr19 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// BC058673 // GenBank // Mus musculus KN motif and ankyrin repeat domains 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6830605), complete cds. // chr19 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC079563 // GenBank // Mus musculus KN motif and ankyrin repeat domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:90826 IMAGE:30535512), complete cds. // chr19 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:25408600:25465050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0
NM_177360 // RefSeq // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor 3 (Dmrt3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:25610537:25623920:1 gene:ENSMUSG00000042372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF541936 // GenBank // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor 3 (Dmrt3) mRNA, complete cds. // chr19 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC052041 // GenBank // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:62407 IMAGE:6404988), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:25610799:25611527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_145831 // RefSeq // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor 2 (Dmrt2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526982 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor 2 (Dmrt2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// XM_006526983 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor 2 (Dmrt2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000053068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:25672420:25679010:1 gene:ENSMUSG00000048138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF539811 // GenBank // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor 2 (Dmrt2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:25646895:25678724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001033407 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 815 (Gm815), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000099536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:26885925:26888639:1 gene:ENSMUSG00000074913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147433 // GenBank // Mus musculus gene model 815, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182592 IMAGE:9056486), complete cds. // chr19 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// BC172065 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054351. // chr19 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0
NM_183179 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily V, member 2 (Kcnv2), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527067 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium channel, subfamily V, member 2 (Kcnv2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000056708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:27322588:27337179:1 gene:ENSMUSG00000047298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY238939 // GenBank // Mus musculus Kv8.2 modulatory voltage-dependent potassium channel (Kcnv2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC039042 // GenBank // Mus musculus potassium channel, subfamily V, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:38990 IMAGE:5363843), complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:27316604:27333923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NR_027987 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C030016D13 gene (C030016D13Rik), long non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094907 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30021652. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004091 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000050632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:27994886:28033945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_028922 // RefSeq // Mus musculus phosphatidic acid phosphatase type 2 domain containing 2 (Ppapdc2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:28963953:28966811:1 gene:ENSMUSG00000040105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK016572 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932443D16 product:hypothetical PA-phosphatase related phosphoesterase containing protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052412 // GenBank // Mus musculus phosphatidic acid phosphatase type 2 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:64622 IMAGE:5720146), complete cds. // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NR_045687 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9895 (Gm9895), long non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KnowTID_00004092 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// KnowTID_00004093 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// KnowTID_00004094 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT034351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT034352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT034353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT034354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29064637:29139921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT034355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_021525 // RefSeq // Mus musculus RNA terminal phosphate cyclase-like 1 (Rcl1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527245 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA terminal phosphate cyclase-like 1 (Rcl1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000064393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:29101375:29143843:1 gene:ENSMUSG00000024785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC004574 // GenBank // Mus musculus RNA terminal phosphate cyclase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:6408 IMAGE:3586632), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006527246 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA terminal phosphate cyclase-like 1 (Rcl1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29064637:29139921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NR_029778 // RefSeq // Mus musculus microRNA 101b (Mir101b), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083622 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:29135279:29135375:1 gene:ENSMUSG00000065556 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-101b // miRBase Micro RNA Database // MI0000649 Mus musculus miR-101b stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK052181 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330004B08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004095 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001048177 // RefSeq // Mus musculus Janus kinase 2 (Jak2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_008413 // RefSeq // Mus musculus Janus kinase 2 (Jak2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526714 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Janus kinase 2 (Jak2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006526715 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Janus kinase 2 (Jak2), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000025705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:29251828:29313080:1 gene:ENSMUSG00000024789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000065796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:29251828:29313080:1 gene:ENSMUSG00000024789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC054807 // GenBank // Mus musculus Janus kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:64772 IMAGE:6838318), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC059834 // GenBank // Mus musculus Janus kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:69632 IMAGE:6838318), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// L16956 // GenBank // Mouse protein-tyrosine kinase (Jak2) mRNA, complete cds. // chr19 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29262238:29324454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_021893 // RefSeq // Mus musculus CD274 antigen (Cd274), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000016640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:29367455:29388095:1 gene:ENSMUSG00000016496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF233517 // GenBank // Mus musculus PD-1-ligand precursor, mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF317088 // GenBank // Mus musculus B7-H1 protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC066841 // GenBank // Mus musculus CD274 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:76638 IMAGE:30101931), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GQ904196 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J PD-L1 (Cd274) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29372468:29385946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_021396 // RefSeq // Mus musculus programmed cell death 1 ligand 2 (Pdcd1lg2), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:29410919:29471157:1 gene:ENSMUSG00000016498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF142780 // GenBank // Mus musculus butyrophilin-like protein (Btdc) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK141111 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230055L10 product:programmed cell death 1 ligand 2, full insert sequence. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC104138 // GenBank // Mus musculus programmed cell death 1 ligand 2, mRNA (cDNA clone MGC:124039 IMAGE:40045578), complete cds. // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC104139 // GenBank // Mus musculus programmed cell death 1 ligand 2, mRNA (cDNA clone MGC:124040 IMAGE:40045580), complete cds. // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29416552:29489093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001081319 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C030046E11 gene (C030046E11Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XR_386465 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C030046E11 gene (C030046E11Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000043610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:29522282:29606829:1 gene:ENSMUSG00000038658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000162492 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:29533236:29604200:1 gene:ENSMUSG00000038658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000160221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:29522382:29581489:1 gene:ENSMUSG00000038658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// AK156653 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830035C04 product:BA207C16.1 (Novel protein similar to C. elegans R06F6.8 (Sw:Q09417)) (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29558791:29604149:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_029993 // RefSeq // Mus musculus melan-A (Mlana), mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:29697921:29708448:1 gene:ENSMUSG00000024806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC111114 // GenBank // Mus musculus melan-A, mRNA (cDNA clone MGC:130556 IMAGE:40053172), complete cds. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29699755:29708297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001164724 // RefSeq // Mus musculus interleukin 33 (Il33), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_133775 // RefSeq // Mus musculus interleukin 33 (Il33), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000025724 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:29945790:29960704:1 gene:ENSMUSG00000024810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000120388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:29925114:29960718:1 gene:ENSMUSG00000024810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000177518 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:29925132:29958975:1 gene:ENSMUSG00000024810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// AK020353 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230117N10 product:SIMILAR TO GLYCOGENIN 2 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr19 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// AY905582 // GenBank // Mus musculus interleukin-33 (Il33) mRNA, complete cds. // chr19 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// BC003847 // GenBank // Mus musculus interleukin 33, mRNA (cDNA clone MGC:6424 IMAGE:3593927), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// HQ176370 // GenBank // Mus musculus interleukin 33 (IL-33) mRNA, partial cds. // chr19 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000144528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:29925115:29952077:1 gene:ENSMUSG00000024810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000025036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29939274:29959041:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NM_025741 // RefSeq // Mus musculus tumor protein D52-like 3 (Trpd52l3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:30003790:30006020:1 gene:ENSMUSG00000024815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125314 // GenBank // Mus musculus tumor protein D52-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:159017 IMAGE:40129829), complete cds. // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC125316 // GenBank // Mus musculus tumor protein D52-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:159019 IMAGE:40129831), complete cds. // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_144873 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-like, containing PHD and RING finger domains 2 (Uhrf2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000025739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:30030513:30093722:1 gene:ENSMUSG00000024817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000123773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:30089056:30093722:1 gene:ENSMUSG00000024817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AB116653 // GenBank // Mus musculus NIRF mRNA for Np95-like ring finger protein, complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AF274047 // GenBank // Mus musculus nuclear zinc finger protein Np97 (Uhrf2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC060241 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-like, containing PHD and RING finger domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:59403 IMAGE:6334856), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000137368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:30030513:30081519:1 gene:ENSMUSG00000024817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// AK080925 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430210O11 product:ubiquitin-like, containing PHD and RING finger domains 2, full insert sequence. // chr19 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// ENSMUST00000134518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:30030513:30058812:1 gene:ENSMUSG00000024817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000025028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:30025699:30092864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_010776 // RefSeq // Mus musculus mannose-binding lectin (protein C) 2 (Mbl2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:30232928:30239685:1 gene:ENSMUSG00000024863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC010760 // GenBank // Mus musculus mannose-binding lectin (protein C) 2, mRNA (cDNA clone MGC:18500 IMAGE:4212216), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D11440 // GenBank // Mus musculus mRNA for Ra-reactive factor P28a subunit, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:30192078:30239524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_031249 // RefSeq // Mus musculus cleavage stimulation factor, 3 pre-RNA subunit 2, tau (Cstf2t), mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000066039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:31082841:31086590:1 gene:ENSMUSG00000053536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF322194 // GenBank // Mus musculus variant polyadenylation protein CSTF-64 (Cstf2t) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC026995 // GenBank // Mus musculus cleavage stimulation factor, 3 pre-RNA subunit 2, tau, mRNA (cDNA clone MGC:35607 IMAGE:5373155), complete cds. // chr19 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:31039676:31084964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NM_001081074 // RefSeq // Mus musculus APOBEC1 complementation factor (A1cf), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000075838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:31868761:31949406:1 gene:ENSMUSG00000052595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AY566862 // GenBank // Mus musculus APOBEC-1 stimulating protein (Asp) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// AY566863 // GenBank // Mus musculus APOBEC-1 stimulating protein (Asp) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// AY566864 // GenBank // Mus musculus truncated APOBEC-1 stimulating protein (Asp) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC089622 // GenBank // Mus musculus APOBEC1 complementation factor, mRNA (cDNA clone MGC:107689 IMAGE:6760455), complete cds. // chr19 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000014635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:31893100:31947510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000014629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:32071907:32074929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
NR_033198 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2700046G09 gene (2700046G09Rik), long non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181612 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:32389216:32391184:1 gene:ENSMUSG00000097787 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK170065 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630014G09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT034462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010799 // RefSeq // Mus musculus multiple inositol polyphosphate histidine phosphatase 1 (Minpp1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000025827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:32485769:32515370:1 gene:ENSMUSG00000024896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AF046908 // GenBank // Mus musculus multiple inositol polyphosphate phosphatase (Mipp) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001201470 // RefSeq // Mus musculus 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 2 (Papss2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NM_011864 // RefSeq // Mus musculus 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 2 (Papss2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000025833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:32620005:32667187:1 gene:ENSMUSG00000024899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF052453 // GenBank // Mus musculus ATP sulfurylase/APS kinase 2 mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// AF085144 // GenBank // Mus musculus ATP sulfurylase/APS kinase 2 (Atpsk2) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// BC090997 // GenBank // Mus musculus 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 2, mRNA (cDNA clone MGC:107653 IMAGE:30121331), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000014618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:32604385:32665567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1
AK045001 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130018L04 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AK087678 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330003N13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 80 // 60 // 12 // 15 // 0 /// BC150968 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B430203M17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183880 IMAGE:9087880), complete cds. // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT034483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT034484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_172527 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 15 (Nudt15), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006518794 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 15 (Nudt15), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:33822908:33825071:1 gene:ENSMUSG00000037603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000043813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:14:73519864:73548242:-1 gene:ENSMUSG00000033405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000121169 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:58108060:58108572:1 gene:ENSMUSG00000053472 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC060962 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 15, mRNA (cDNA clone MGC:74051 IMAGE:30302091), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_399790 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus probable 8-oxo-dGTP diphosphatase NUDT15-like (LOC102642647), misc_RNA. // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000003935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:58108060:58108572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:33822908:33825071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_026334 // RefSeq // Mus musculus lipase, gastric (Lipf), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:33961187:33976810:1 gene:ENSMUSG00000024768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC061067 // GenBank // Mus musculus lipase, gastric, mRNA (cDNA clone MGC:74179 IMAGE:30301084), complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:33943502:33976698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_001205349 // RefSeq // Mus musculus lipase, family member K (Lipk), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_172837 // RefSeq // Mus musculus lipase, family member K (Lipk), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000054260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:34008254:34047903:1 gene:ENSMUSG00000024771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC037229 // GenBank HTC // Mus musculus lipase, family member K, mRNA (cDNA clone IMAGE:3662956), containing frame-shift errors. // chr19 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// BC055815 // GenBank // Mus musculus lipase, family member K, mRNA (cDNA clone MGC:67675 IMAGE:4011597), complete cds. // chr19 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:34006589:34047015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_027340 // RefSeq // Mus musculus lipase, family member N (Lipn), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006527333 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipase, family member N (Lipn), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:34067358:34084918:1 gene:ENSMUSG00000024770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000126710 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:34067378:34073627:1 gene:ENSMUSG00000024770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000148821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:34067529:34081158:1 gene:ENSMUSG00000024770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// AK008974 // GenBank HTC // Mus musculus adult male stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2210418G03 product:hypothetical alpha/beta-Hydrolases structure containing protein, full insert sequence. // chr19 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000023495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:34069426:34083586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_023903 // RefSeq // Mus musculus lipase, family member M (Lipm), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527466 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipase, family member M (Lipm), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000025685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:34100943:34122687:1 gene:ENSMUSG00000056078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK019504 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4632427C23 product:weakly similar to BA304I5.1 (NOVEL LIPASE) (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC031933 // GenBank // Mus musculus lipase, family member M, mRNA (cDNA clone MGC:25790 IMAGE:4020396), complete cds. // chr19 // 86 // 97 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:34097061:34121396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NM_007987 // RefSeq // Mus musculus Fas (TNF receptor superfamily member 6) (Fas), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:34290659:34327770:1 gene:ENSMUSG00000024778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061160 // GenBank // Mus musculus Fas (TNF receptor superfamily member 6), mRNA (cDNA clone MGC:74297 IMAGE:30302649), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ846748 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J Fas mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// M83649 // GenBank // Mus musculus Fas antigen mRNA, complete cds. // chr19 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// DQ846749 // GenBank // Mus musculus strain SEG/Pas Fas mRNA, complete cds. // chr19 // 65 // 92 // 15 // 23 // 0 /// GENSCAN00000023517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:34299832:34327324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_008332 // RefSeq // Mus musculus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 (Ifit2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526706 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 (Ifit2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:34550710:34576419:1 gene:ENSMUSG00000045932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC050835 // GenBank // Mus musculus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2, mRNA (cDNA clone MGC:59353 IMAGE:6513417), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U43085 // GenBank // Mus musculus glucocorticoid-attenuated response gene 39 (GARG-39) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000023510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:34543968:34574474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT034526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_010501 // RefSeq // Mus musculus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 (Ifit3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000102825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:34583531:34588731:1 gene:ENSMUSG00000074896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC003804 // GenBank // Mus musculus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, mRNA (cDNA clone MGC:6081 IMAGE:3487345), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC089563 // GenBank // Mus musculus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, mRNA (cDNA clone MGC:107331 IMAGE:30317428), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// L32974 // GenBank // Mouse interferon-inducible protein homologue mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001005858 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA I830012O16 gene (I830012O16Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000076249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:34607970:34613401:1 gene:ENSMUSG00000062488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AK151442 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830030D11 product:Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 (IFIT-3) (Glucocorticoid-attenuated response gene 49 protein) (GARG-49) (IRG2) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr19 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0
NM_008331 // RefSeq // Mus musculus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 (Ifit1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000102824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:34640871:34650009:1 gene:ENSMUSG00000034459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC003768 // GenBank // Mus musculus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mRNA (cDNA clone MGC:5959 IMAGE:3496673), complete cds. // chr19 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// U43084 // GenBank // Mus musculus glucocorticoid-attenuated response gene 16 (GARG-16) mRNA, complete cds. // chr19 // 75 // 67 // 12 // 16 // 0
ENSMUST00000157587 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:34796178:34796338:1 gene:ENSMUSG00000088212 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK019493 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4632412I06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_183046 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 20B (Kif20b), mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000087341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:34922358:34975731:1 gene:ENSMUSG00000024795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AK049225 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330014J10 product:M-phase phosphoprotein 1, full insert sequence. // chr19 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// AY259532 // GenBank // Mus musculus M-phase phosphoprotein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// BC048954 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 20B, mRNA (cDNA clone IMAGE:6487429), partial cds. // chr19 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// BC151061 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 20B, mRNA (cDNA clone MGC:183974 IMAGE:9087974), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// BC172148 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 20B, mRNA (cDNA clone MGC:198853 IMAGE:9054818), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000041758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:34904868:34975570:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0
NM_019428 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease P/MRP 30 subunit (Rpp30), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XR_386495 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribonuclease P/MRP 30 subunit (Rpp30), transcript variant X1, misc_RNA. // chr19 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:36083716:36104772:1 gene:ENSMUSG00000024800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK004137 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110037D03 product:ribonuclease P/MRP 30kDa subunit (human), full insert sequence. // chr19 // 80 // 100 // 28 // 35 // 0 /// BC034329 // GenBank // Mus musculus ribonuclease P/MRP 30 subunit (human), mRNA (cDNA clone IMAGE:5010429), partial cds. // chr19 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// BC062146 // GenBank // Mus musculus ribonuclease P/MRP 30 subunit (human), mRNA (cDNA clone MGC:70012 IMAGE:6518236), complete cds. // chr19 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// U95123 // GenBank // Mus musculus RNaseP protein p30 (Rpp30) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:36083737:36104445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1
GENSCAN00000000320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:36357835:36370225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000000316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:36404445:36405657:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001163635 // RefSeq // Mus musculus tankyrase, TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose polymerase 2 (Tnks2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:36834232:36893477:1 gene:ENSMUSG00000024811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:36834538:36919300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001080706 // RefSeq // Mus musculus BTAF1 RNA polymerase II, B-TFIID transcription factor-associated, (Mot1 homolog, S. cerevisiae) (Btaf1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000099494 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:36926079:37012752:1 gene:ENSMUSG00000040565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB287295 // GenBank // Mus musculus TAF170 mRNA for TBP-associated factor 170, complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// AK141888 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130053C05 product:BTAF1 protein (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// GENSCAN00000049710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:36940791:37011404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0
NM_027314 // RefSeq // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 5 (March5), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000024078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:37207543:37222139:1 gene:ENSMUSG00000023307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000128530 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:37217190:37221977:1 gene:ENSMUSG00000023307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// BC064752 // GenBank // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 5, mRNA (cDNA clone MGC:76546 IMAGE:30049608), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC107215 // GenBank // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 5, mRNA (cDNA clone MGC:130122 IMAGE:40051628), complete cds. // chr19 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1 /// BC132455 // GenBank // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 5, mRNA (cDNA clone MGC:164086 IMAGE:40130732), complete cds. // chr19 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1 /// BC132457 // GenBank // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 5, mRNA (cDNA clone MGC:164088 IMAGE:40130734), complete cds. // chr19 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1 /// GENSCAN00000049705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:37207124:37221506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
NM_010615 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 11 (Kif11), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000012587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:37376403:37421859:1 gene:ENSMUSG00000012443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC060670 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 11, mRNA (cDNA clone MGC:62512 IMAGE:6406754), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000049691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:37374692:37420390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0
NM_008245 // RefSeq // Mus musculus hematopoietically expressed homeobox (Hhex), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000025944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:37434810:37440731:1 gene:ENSMUSG00000024986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000128184 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:37436739:37440672:1 gene:ENSMUSG00000024986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC057986 // GenBank // Mus musculus hematopoietically expressed homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:68214 IMAGE:5124938), complete cds. // chr19 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000049693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:37434870:37439805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0
NM_175353 // RefSeq // Mus musculus exocyst complex component 6 (Exoc6), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000066439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:37550418:37683245:1 gene:ENSMUSG00000053799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// AK082881 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430002C19 product:SEC15 homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr19 // 97 // 78 // 35 // 36 // 0 /// BC025616 // GenBank // Mus musculus exocyst complex component 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:5253301), partial cds. // chr19 // 100 // 35 // 16 // 16 // 0 /// BC026859 // GenBank // Mus musculus exocyst complex component 6, mRNA (cDNA clone MGC:30428 IMAGE:2631201), complete cds. // chr19 // 95 // 96 // 42 // 44 // 0 /// GENSCAN00000049699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:37550465:37645619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 54 // 54 // 25 // 46 // 1
ENSMUST00000073391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:37685581:37693398:1 gene:ENSMUSG00000062432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC151098 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:184011 IMAGE:9088011), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC151106 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:184019 IMAGE:9088019), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:37685680:37693307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_007811 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 26, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp26a1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:37697808:37701528:1 gene:ENSMUSG00000024987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF115769 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 retinoic acid metabolizing enzyme P450RA mRNA, complete cds. // chr19 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// BC012673 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 26, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:13860 IMAGE:4210893), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:37697910:37701351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000031620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:37784266:37786442:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 71 // 70 // 10 // 14 // 0
GENSCAN00000031616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:37870270:37871113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0
NM_001164362 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 55 (Cep55), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_028760 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 55 (Cep55), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000116506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38055040:38073498:1 gene:ENSMUSG00000024989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38055042:38074425:1 gene:ENSMUSG00000024989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK012311 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2700032M20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// BC031396 // GenBank // Mus musculus centrosomal protein 55, mRNA (cDNA clone MGC:37048 IMAGE:4950530), complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NM_028293 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 55 (Cep55), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// ENSMUST00000096096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38055025:38074425:1 gene:ENSMUSG00000024989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// GENSCAN00000031618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:38023431:38073498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000082712 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:38071929:38072053:1 gene:ENSMUSG00000064646 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT034637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_181748 // RefSeq // Mus musculus free fatty acid receptor 4 (Ffar4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000067098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38097079:38114263:1 gene:ENSMUSG00000054200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB115769 // GenBank // Mus musculus mRNA for G-protein-coupled receptor GT01, complete cds. // chr19 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// AY288424 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 120 (Gpr120) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC053698 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 120, mRNA (cDNA clone MGC:62870 IMAGE:6529120), complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:38097127:38114004:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001170959 // RefSeq // Mus musculus phosphodiesterase 6C, cGMP specific, cone, alpha prime (Pde6c), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NM_033614 // RefSeq // Mus musculus phosphodiesterase 6C, cGMP specific, cone, alpha prime (Pde6c), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006526605 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphodiesterase 6C, cGMP specific, cone, alpha prime (Pde6c), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 54 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38132781:38183947:1 gene:ENSMUSG00000024992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000112329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38132781:38183947:1 gene:ENSMUSG00000024992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AF411063 // GenBank // Mus musculus cGMP phosphodiesterase 6c (Pde6c) mRNA, complete cds. // chr19 // 98 // 92 // 43 // 44 // 0 /// BC027050 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 6C, cGMP specific, cone, alpha prime, mRNA (cDNA clone MGC:38745 IMAGE:5358611), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000031607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:38153490:38206945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 46 // 22 // 22 // 0
NM_020278 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich repeat LGI family, member 1 (Lgi1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000087252 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:38264782:38308939:1 gene:ENSMUSG00000067242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF246818 // GenBank // Mus musculus leucine-rich glioma-inactivated 1 protein precursor, (Lgi1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// AK045443 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230120H06 product:leucine-rich, glioma inactivated 1, full insert sequence. // chr19 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC066090 // GenBank // Mus musculus leucine-rich repeat LGI family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:65622 IMAGE:6839091), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_175507 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member G1 (Slc35g1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38395980:38405607:1 gene:ENSMUSG00000044026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137663 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 20, mRNA (cDNA clone MGC:169287 IMAGE:8860682), complete cds. // chr19 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC137664 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 20, mRNA (cDNA clone MGC:169288 IMAGE:8860683), complete cds. // chr19 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// AK030517 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330425C20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:38396115:38403378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_145952 // RefSeq // Mus musculus TBC1D12: TBC1 domain family, member 12 (Tbc1d12), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006526847 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TBC1D12: TBC1 domain family, member 12 (Tbc1d12), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000037302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38836579:38919923:1 gene:ENSMUSG00000048720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC033574 // GenBank // Mus musculus TBC1D12: TBC1 domain family, member 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:5323306), complete cds. // chr19 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC138056 // GenBank // Mus musculus TBC1D12: TBC1 domain family, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:169680 IMAGE:8861075), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC138057 // GenBank // Mus musculus TBC1D12: TBC1 domain family, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:169681 IMAGE:8861076), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC145129 // GenBank // Mus musculus TBC1D12: TBC1 domain family, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:178685 IMAGE:9053677), complete cds. // chr19 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:38837004:38973901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
NM_008234 // RefSeq // Mus musculus helicase, lymphoid specific (Hells), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006526699 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus helicase, lymphoid specific (Hells), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006526700 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus helicase, lymphoid specific (Hells), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 59 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025965 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:38930915:38971051:1 gene:ENSMUSG00000025001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000127968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:38943689:38950475:1 gene:ENSMUSG00000025001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000145051 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:38931174:38943914:1 gene:ENSMUSG00000025001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 27 // 11 // 11 // 0 /// AF155210 // GenBank // Mus musculus proliferation associated SNF2-like protein (Pasg) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC020056 // GenBank // Mus musculus helicase, lymphoid specific, mRNA (cDNA clone IMAGE:3673500), complete cds. // chr19 // 100 // 39 // 16 // 16 // 0 /// BC100394 // GenBank // Mus musculus helicase, lymphoid specific, mRNA (cDNA clone MGC:118052 IMAGE:30480539), complete cds. // chr19 // 93 // 100 // 38 // 41 // 0 /// U25691 // GenBank // Mus musculus lymphocyte specific helicase mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000018292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:38837004:38973901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 73 // 73 // 30 // 41 // 1
GENSCAN00000018287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:38979383:39003288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0
NM_028089 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 55 (Cyp2c55), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527355 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 55 (Cyp2c55), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000025966 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:39007019:39042693:1 gene:ENSMUSG00000025002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY206875 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 (Cyp2c55) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC010824 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 55, mRNA (cDNA clone MGC:19149 IMAGE:4219121), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:39007046:39042198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_028191 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 65 (Cyp2c65), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000087236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:39061015:39093944:1 gene:ENSMUSG00000067231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AY227733 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 2C65 (Cyp2c65) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC117531 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 65, mRNA (cDNA clone MGC:144817 IMAGE:40106344), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC118514 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 65, mRNA (cDNA clone MGC:144816 IMAGE:40106342), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000018289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:39061030:39093504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001011707 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 66 (Cyp2c66), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000087234 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:39113898:39186756:1 gene:ENSMUSG00000067229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AY227734 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 2C66 (Cyp2c66) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC147819 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 66, mRNA (cDNA clone MGC:182922 IMAGE:9087536), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC147824 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 66, mRNA (cDNA clone MGC:182927 IMAGE:9087541), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000018286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:39113929:39186630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_007815 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 29 (Cyp2c29), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006526636 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 29 (Cyp2c29), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000003137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:39287074:39330699:1 gene:ENSMUSG00000003053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000176624 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:39269405:39330648:1 gene:ENSMUSG00000003053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000177087 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:39287074:39330713:1 gene:ENSMUSG00000003053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK139760 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020015I11 product:cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 29, full insert sequence. // chr19 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC019908 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 29, mRNA (cDNA clone MGC:29964 IMAGE:5123631), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// D17674 // GenBank // Mus musculus mRNA for cytochrome P-450, complete cds. // chr19 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:39240132:39330433:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_010003 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 39 (Cyp2c39), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000025968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:39510862:39568529:1 gene:ENSMUSG00000025003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AF047726 // GenBank // Mus musculus CYP2C39 (Cyp2c39) mRNA, complete cds. // chr19 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0 /// BC139290 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 39, mRNA (cDNA clone MGC:170917 IMAGE:8862312), complete cds. // chr19 // 71 // 93 // 10 // 14 // 0 /// BC139291 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 39, mRNA (cDNA clone MGC:170918 IMAGE:8862313), complete cds. // chr19 // 71 // 93 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000018284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:39502341:39568194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
NM_010001 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2. subfamily c, polypeptide 37 (Cyp2c37), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000049178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:39992424:40012243:1 gene:ENSMUSG00000042248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF047542 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 (Cyp2c37) mRNA, complete cds. // chr19 // 58 // 100 // 11 // 19 // 0 /// BC057912 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2. subfamily c, polypeptide 37, mRNA (cDNA clone MGC:68185 IMAGE:5052873), complete cds. // chr19 // 58 // 100 // 11 // 19 // 0 /// GENSCAN00000027006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:39992440:40011908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
NM_001167875 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 50 (Cyp2c50), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// NM_134144 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 50 (Cyp2c50), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000068094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:40089688:40113950:1 gene:ENSMUSG00000054827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000080171 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:40089696:40113950:1 gene:ENSMUSG00000054827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY206873 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 (Cyp2c50) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC011222 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 50, mRNA (cDNA clone MGC:19081 IMAGE:4195223), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC051050 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 50, mRNA (cDNA clone MGC:58989 IMAGE:5052536), complete cds. // chr19 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// NM_001167877 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 50 (Cyp2c50), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// ENSMUST00000124391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:40089735:40092322:1 gene:ENSMUSG00000054827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// GENSCAN00000026987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:40089700:40113615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000027000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:40191013:40194415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0
AK053322 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130009M23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006527525 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 2B (Cc2d2b), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000016714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:40741851:40827358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 58 // 58 // 23 // 40 // 1
XM_006527525 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 2B (Cc2d2b), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// GENSCAN00000016714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:40741851:40827358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000119316 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:40831308:40848009:1 gene:ENSMUSG00000025010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120057 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:40831279:40848572:1 gene:ENSMUSG00000025010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC117559 // GenBank // Mus musculus cyclin J, mRNA (cDNA clone MGC:118445 IMAGE:6517343), complete cds. // chr19 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC120921 // GenBank // Mus musculus cyclin J, mRNA (cDNA clone MGC:143777 IMAGE:40093200), complete cds. // chr19 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NM_172839 // RefSeq // Mus musculus cyclin J (Ccnj), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// ENSMUST00000025983 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:40831279:40848572:1 gene:ENSMUSG00000025010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// BC120922 // GenBank // Mus musculus cyclin J, mRNA (cDNA clone MGC:143778 IMAGE:40093202), complete cds. // chr19 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONMMUT034705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:40832020:40857465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NM_028319 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 518A (Zfp518a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:40894705:40917947:1 gene:ENSMUSG00000049164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138382 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 518, mRNA (cDNA clone MGC:170007 IMAGE:8861402), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138383 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 518, mRNA (cDNA clone MGC:170008 IMAGE:8861403), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:40876318:40925939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001043228 // RefSeq // Mus musculus deoxynucleotidyltransferase, terminal (Dntt), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_009345 // RefSeq // Mus musculus deoxynucleotidyltransferase, terminal (Dntt), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000051806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41029275:41059523:1 gene:ENSMUSG00000025014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000112200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41029275:41059523:1 gene:ENSMUSG00000025014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF316014 // GenBank // Mus musculus terminal deoxynucleotidyl transferase long isoform (Tdt) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF316015 // GenBank // Mus musculus terminal deoxynucleotidyl transferase short isoform (Tdt) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK039804 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430003C20 product:deoxynucleotidyltransferase, terminal, full insert sequence. // chr19 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000016718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41029439:41055870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_028615 // RefSeq // Mus musculus developmental pluripotency associated 2 (Dppa2), mRNA. // chr19 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// ENSMUST00000057038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41459813:41460718:1 gene:ENSMUSG00000044065 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000097175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:48310477:48319723:1 gene:ENSMUSG00000072419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// AF490346 // GenBank // Mus musculus DPPA2 mRNA, complete cds. // chr19 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// AK145760 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0038J17 product:developmental pluripotency associated 2, full insert sequence. // chr19 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// AY561246 // GenBank // Mus musculus pluripotent embryonic stem cell-related protein (Phsecrg2) mRNA, complete cds. // chr19 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// BC137768 // GenBank // Mus musculus developmental pluripotency associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:169392 IMAGE:8860787), complete cds. // chr19 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// ENSMUST00000117190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:122592984:122594068:1 gene:ENSMUSG00000084196 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 21 // 100 // 8 // 38 // 0 /// GENSCAN00000016717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41459813:41460718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000004509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:177843350:178275277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1 /// GENSCAN00000015829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:48283818:48317401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
NM_172154 // RefSeq // Mus musculus ligand dependent nuclear receptor corepressor (Lcor), mRNA. // chr19 // 100 // 58 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000067795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41482645:41562246:1 gene:ENSMUSG00000025019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000163929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41549639:41559781:1 gene:ENSMUSG00000025019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 58 // 26 // 26 // 0 /// AB076079 // GenBank // Mus musculus mlr2 mRNA for transcription factor MLR2, complete cds. // chr19 // 100 // 76 // 34 // 34 // 0 /// AK129442 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1795 protein. // chr19 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// BC090652 // GenBank // Mus musculus ligand dependent nuclear receptor corepressor, mRNA (cDNA clone MGC:116013 IMAGE:30657664), complete cds. // chr19 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// BC099938 // GenBank // Mus musculus ligand dependent nuclear receptor corepressor, mRNA (cDNA clone MGC:107398 IMAGE:30085146), complete cds. // chr19 // 98 // 91 // 40 // 41 // 0 /// AK077424 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730406F04 product:KIAA1795 PROTEIN (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 56 // 56 // 25 // 45 // 1 /// GENSCAN00000016706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41533958:41559280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 29 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000172371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41582370:41586536:1 gene:ENSMUSG00000090673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145489 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0005G13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41568887:41586536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000099454 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:41593363:41596158:1 gene:ENSMUSG00000074873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116839 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI606181, mRNA (cDNA clone IMAGE:40126158). // chr19 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
NM_008043 // RefSeq // Mus musculus frequently rearranged in advanced T cell lymphomas (Frat1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// U58974 // GenBank // Mus musculus proto-oncogene Frat1 (Frat1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_023740 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 16 (Zdhhc16), mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527404 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 16 (Zdhhc16), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006527405 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 16 (Zdhhc16), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// XM_006527406 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 16 (Zdhhc16), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000026154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41933472:41944095:1 gene:ENSMUSG00000025157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF176814 // GenBank // Mus musculus Abl-philin 2 mRNA, complete cds. // chr19 // 90 // 94 // 27 // 30 // 0 /// AK005255 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500015N03 product:PP3774 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK218025 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0143M08, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000026154, based on BLAT search. // chr19 // 90 // 31 // 9 // 10 // 0 /// BC010835 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:19358 IMAGE:4239913), complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41937608:41943614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0
NM_145500 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin domain containing 1 (Ubtd1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526997 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin domain containing 1 (Ubtd1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000026170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41981763:42034641:1 gene:ENSMUSG00000025171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC016129 // GenBank // Mus musculus ubiquitin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:28905 IMAGE:4920477), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41990972:42033974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_020033 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 2 (stretch responsive muscle) (Ankrd2), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006527234 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 2 (stretch responsive muscle) (Ankrd2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000026172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:42036038:42045110:1 gene:ENSMUSG00000025172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB076256 // GenBank // Mus musculus arpp mRNA for ankyrin-repeat PEST sequence and proline-rich region protein, complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC138760 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 2 (stretch responsive muscle), mRNA (cDNA clone MGC:170387 IMAGE:8861782), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC138761 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 2 (stretch responsive muscle), mRNA (cDNA clone MGC:170388 IMAGE:8861783), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42036048:42048407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_026152 // RefSeq // Mus musculus 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase 1 (Hoga1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000081714 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:42045832:42070953:1 gene:ENSMUSG00000025176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000167381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:42045851:42060344:1 gene:ENSMUSG00000025176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// BC016430 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610010D20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:25926 IMAGE:4235003), complete cds. // chr19 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// ENSMUST00000172244 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:42045792:42070365:1 gene:ENSMUSG00000025176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000038761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42059471:42070337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_025752 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933411K16 gene (4933411K16Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:42052248:42053627:1 gene:ENSMUSG00000090369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049703 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933411K16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58627 IMAGE:6707366), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42052432:42053346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_145501 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol 4-kinase type 2 alpha (Pi4k2a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000066778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:42090435:42122218:1 gene:ENSMUSG00000025178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC110363 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol 4-kinase type 2 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:118011 IMAGE:5346917), complete cds. // chr19 // 85 // 97 // 28 // 33 // 0 /// XR_386524 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphatidylinositol 4-kinase type 2 alpha (Pi4k2a), transcript variant X1, misc_RNA. // chr19 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// AK165136 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330027H01 product:phosphatidylinositol 4-kinase type 2 alpha, full insert sequence. // chr19 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000038750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42090502:42118147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_183195 // RefSeq // Mus musculus MARVEL (membrane-associating) domain containing 1 (Marveld1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000061111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:42147400:42151703:1 gene:ENSMUSG00000044345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000184186 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:42147708:42151462:1 gene:ENSMUSG00000044345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK081212 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030005I21 product:HYPOTHETICAL 18.9 KDA PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC054384 // GenBank // Mus musculus MARVEL (membrane-associating) domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:62793 IMAGE:6475446), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
BC089359 // GenBank HTC // Mus musculus predicted gene, EG628994, mRNA (cDNA clone IMAGE:30612144), with apparent retained intron. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004116 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001141983 // RefSeq // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 7B (Golga7b), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_027694 // RefSeq // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 7B (Golga7b), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006527342 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 7B (Golga7b), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// XM_006527343 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 7B (Golga7b), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000087123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:42255739:42270348:1 gene:ENSMUSG00000042532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000122375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:42247574:42270348:1 gene:ENSMUSG00000042532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC049116 // GenBank // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 7B, mRNA (cDNA clone MGC:61365 IMAGE:6811056), complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42228455:42267168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENSMUST00000102368 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:42274964:42275062:1 gene:ENSMUSG00000076323 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT034764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_177464 // RefSeq // Mus musculus R3H domain and coiled-coil containing 1 like (R3hcc1l), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000026188 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:42518759:42592343:1 gene:ENSMUSG00000025184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC038935 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 19, ERATO Doi 386, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:47047 IMAGE:5035077), complete cds. // chr19 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// XM_006527182 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus R3H domain and coiled-coil containing 1 like (R3hcc1l), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// ENSMUST00000160107 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:42518798:42591010:1 gene:ENSMUSG00000025184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// ENSMUST00000162238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:42581161:42584771:1 gene:ENSMUSG00000025184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// AK037718 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130040N02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000038742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42562566:42586169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT034775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_031396 // RefSeq // Mus musculus cyclin M1 (Cnnm1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000165311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:43440436:43497212:1 gene:ENSMUSG00000025189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF202994 // GenBank // Mus musculus ancient conserved domain protein 1 (Acdp1) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// DQ885890 // GenBank // Mus musculus cyclin-like protein 1 mRNA, complete cds. // chr19 // 89 // 82 // 24 // 27 // 0 /// EF041508 // GenBank // Mus musculus strain MF1 ancient conserved domain protein 1 mRNA, complete cds. // chr19 // 90 // 88 // 26 // 29 // 0 /// XM_006527483 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin M1 (Cnnm1), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000022201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:43440445:43496916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_008699 // RefSeq // Mus musculus NK2 homeobox 3 (Nkx2-3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:43612325:43615892:1 gene:ENSMUSG00000044220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF202036 // GenBank // Mus musculus homeobox transcription factor NKX2-3 (Nkx2-3) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC072614 // GenBank // Mus musculus NK2 transcription factor related, locus 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:99908 IMAGE:6807512), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// Y11117 // GenBank // M.musculus mRNA for Nkx2-3 gene. // chr19 // 82 // 44 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000031288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:43612501:43629180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_053103 // RefSeq // Mus musculus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7 (Entpd7), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000081079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:43689672:43733697:1 gene:ENSMUSG00000025192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK007446 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810012B13 product:lysosomal apyrase-like 2, full insert sequence. // chr19 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC137709 // GenBank // Mus musculus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7, mRNA (cDNA clone MGC:169333 IMAGE:8860728), complete cds. // chr19 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// BC137717 // GenBank // Mus musculus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7, mRNA (cDNA clone MGC:169341 IMAGE:8860736), complete cds. // chr19 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// ENSMUST00000144314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:43689840:43722574:1 gene:ENSMUSG00000025192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// AK166220 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830017H07 product:ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase, full insert sequence. // chr19 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000031308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:43699129:43730260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AF288221 // GenBank // Mus musculus LALP1 mRNA, complete cds. // chr19 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0
NM_001113562 // RefSeq // Mus musculus cutC copper transporter homolog (E.coli) (Cutc), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NM_025530 // RefSeq // Mus musculus cutC copper transporter homolog (E.coli) (Cutc), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000026199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:43752996:43768631:1 gene:ENSMUSG00000025193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000112047 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:43753098:43768638:1 gene:ENSMUSG00000025193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000123564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:43764873:43768638:1 gene:ENSMUSG00000025193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000153295 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:43753137:43768238:1 gene:ENSMUSG00000025193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC026775 // GenBank // Mus musculus cutC copper transporter homolog (E.coli), mRNA (cDNA clone MGC:25524 IMAGE:3582902), complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT034807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:43758784:43837557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_013806 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 2 (Abcc2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000026208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:43782192:43840740:1 gene:ENSMUSG00000025194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF227274 // GenBank // Mus musculus canalicular multispecific organic anion transporter cMOAT mRNA, complete cds. // chr19 // 88 // 97 // 29 // 33 // 0 /// AF282772 // GenBank // Mus musculus strain AKR/J sub-family C member 2 ATP-binding cassette protein (Abcc2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF282773 // GenBank // Mus musculus strain C57L/J sub-family C member 2 ATP-binding cassette protein (Abcc2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:43758784:43837557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1
NR_033472 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10768 (Gm10768), long non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:43782192:43840740:1 gene:ENSMUSG00000025194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:43838803:43840728:1 gene:ENSMUSG00000025194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000074828 // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK006995 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700084K02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// KnowTID_00004120 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024450 // RefSeq // Mus musculus stearoyl-coenzyme A desaturase 3 (Scd3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000026220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:44203288:44244016:1 gene:ENSMUSG00000025202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF272037 // GenBank // Mus musculus fatty acid desaturase (Scd3) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// XM_006527129 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus stearoyl-coenzyme A desaturase 3 (Scd3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// BC118033 // GenBank // Mus musculus stearoyl-coenzyme A desaturase 3, mRNA (cDNA clone MGC:144864 IMAGE:40106893), complete cds. // chr19 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// BC118045 // GenBank // Mus musculus stearoyl-coenzyme A desaturase 3, mRNA (cDNA clone MGC:144865 IMAGE:40106896), complete cds. // chr19 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// XM_006543461 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acyl-CoA desaturase-like (LOC102641835), mRNA. // chr19 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_009128 // RefSeq // Mus musculus stearoyl-Coenzyme A desaturase 2 (Scd2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000026221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:44293676:44306864:1 gene:ENSMUSG00000025203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC040384 // GenBank // Mus musculus stearoyl-Coenzyme A desaturase 2, mRNA (cDNA clone MGC:25381 IMAGE:3155869), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// M26270 // GenBank // Mouse stearoyl-CoA desaturase (SCD2) mRNA, complete cds. // chr19 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44294388:44303200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000133314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:44333092:44334723:1 gene:ENSMUSG00000050195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AY430080 // GenBank // Mus musculus stearoyl-CoA desaturase-4 mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// BC038322 // GenBank // Mus musculus stearoyl-coenzyme A desaturase 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:1479917), complete cds. // chr19 // 79 // 48 // 11 // 14 // 0 /// NM_183216 // RefSeq // Mus musculus stearoyl-coenzyme A desaturase 4 (Scd4), mRNA. // chr19 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// ENSMUST00000058856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:44333092:44346743:1 gene:ENSMUSG00000050195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// BC141234 // GenBank // Mus musculus stearoyl-coenzyme A desaturase 4, mRNA (cDNA clone MGC:176195 IMAGE:9055846), complete cds. // chr19 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// GENSCAN00000031289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44333883:44363670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_011720 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 8B (Wnt8b), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000041163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:44493472:44514273:1 gene:ENSMUSG00000036961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF130349 // GenBank // Mus musculus Wnt8B protein precursor (Wnt8B) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC119544 // GenBank // Mus musculus wingless related MMTV integration site 8b, mRNA (cDNA clone MGC:141243 IMAGE:40056929), complete cds. // chr19 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44506403:44512082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_176958 // RefSeq // Mus musculus hypoxia-inducible factor 1, alpha subunit inhibitor (Hif1an), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000040455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:44562850:44576274:1 gene:ENSMUSG00000036450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK043636 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830014H24 product:FACTOR INHIBITING HIF1 (UNKNOWN) (PROTEIN FOR MGC:12605) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC130013 // GenBank // Mus musculus hypoxia-inducible factor 1, alpha subunit inhibitor, mRNA (cDNA clone MGC:161165 IMAGE:40140349), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000131032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:44562850:44563952:1 gene:ENSMUSG00000036450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// AK084960 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430019K11 product:similar to FACTOR INHIBITING HIF1 (UNKNOWN) (PROTEIN FOR MGC:12605) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000031291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44562878:44571158:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_011037 // RefSeq // Mus musculus paired box 2 (Pax2), mRNA. // chr19 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// XM_006526758 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus paired box 2 (Pax2), transcript variant X10, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000004340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:44757394:44837871:1 gene:ENSMUSG00000004231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000174490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:44756045:44837851:1 gene:ENSMUSG00000004231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC148232 // GenBank // Mus musculus paired box gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:161328 IMAGE:40142573), complete cds. // chr19 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC150484 // GenBank // Mus musculus paired box gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:161329 IMAGE:40142579), complete cds. // chr19 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000173346 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:44759915:44818554:1 gene:ENSMUSG00000004231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// GENSCAN00000008127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44734664:44836091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
GENSCAN00000008150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44851293:44931336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
NM_001081225 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 178, member A (Fam178a), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000096053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:44931119:44983787:1 gene:ENSMUSG00000036097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK031688 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030490K01 product:BA108L7.8 (NOVEL PROTEIN (TRANSLATION OF CDNA FLJ10512 (EM:AK001374))) (CDNA FLJ10512 FIS, CLONE NT2RP2000658) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC150999 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 178, member A, mRNA (cDNA clone MGC:183912 IMAGE:9087912), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC157937 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 178, member A, mRNA (cDNA clone MGC:189930 IMAGE:9088117), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC172097 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 178, member A, mRNA (cDNA clone MGC:198802 IMAGE:9054383), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44935058:45001997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AK147742 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270016J15 product:MYST histone acetyltransferase 2, full insert sequence. // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001081225 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 178, member A (Fam178a), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000096053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:44931119:44983787:1 gene:ENSMUSG00000036097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC060679 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 178, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:6405823), complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC150999 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 178, member A, mRNA (cDNA clone MGC:183912 IMAGE:9087912), complete cds. // chr19 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC157937 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 178, member A, mRNA (cDNA clone MGC:189930 IMAGE:9088117), complete cds. // chr19 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC172097 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 178, member A, mRNA (cDNA clone MGC:198802 IMAGE:9054383), complete cds. // chr19 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// AK031688 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030490K01 product:BA108L7.8 (NOVEL PROTEIN (TRANSLATION OF CDNA FLJ10512 (EM:AK001374))) (CDNA FLJ10512 FIS, CLONE NT2RP2000658) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONMMUT034860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000008177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44935058:45001997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// AK147742 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270016J15 product:MYST histone acetyltransferase 2, full insert sequence. // chr19 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
ENSMUST00000083225 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:44945022:44945128:1 gene:ENSMUSG00000065159 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT034859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_153796 // RefSeq // Mus musculus progressive external ophthalmoplegia 1 (human) (Peo1), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527003 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus progressive external ophthalmoplegia 1 (human) (Peo1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000026227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:45006558:45012762:1 gene:ENSMUSG00000025209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK054159 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230024E16 product:progressive external ophthalmoplegia 1 (human), full insert sequence. // chr19 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AY059385 // GenBank // Mus musculus twinkle mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr19 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC034909 // GenBank // Mus musculus progressive external ophthalmoplegia 1 (human), mRNA (cDNA clone IMAGE:1380959), complete cds. // chr19 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC071195 // GenBank // Mus musculus progressive external ophthalmoplegia 1 (human), mRNA (cDNA clone MGC:78024 IMAGE:5100486), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:45007277:45011904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// AK132439 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4731419D06 product:progressive external ophthalmoplegia 1 (human), full insert sequence. // chr19 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001130525 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor 2 (Lzts2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001130526 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor 2 (Lzts2), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_145503 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor 2 (Lzts2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:45015176:45027104:1 gene:ENSMUSG00000035342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000178087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:45018135:45027104:1 gene:ENSMUSG00000035342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000179108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:45015210:45027104:1 gene:ENSMUSG00000035342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK129446 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1813 protein. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC014695 // GenBank // Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor 2, mRNA (cDNA clone MGC:7094 IMAGE:3157493), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC092263 // GenBank // Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor 2, mRNA (cDNA clone MGC:102330 IMAGE:2654420), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006527005 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor 2 (Lzts2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000008125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:45021429:45026485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
NM_001178012 // RefSeq // Mus musculus sideroflexin 3 (Sfxn3), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_001178013 // RefSeq // Mus musculus sideroflexin 3 (Sfxn3), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NM_053197 // RefSeq // Mus musculus sideroflexin 3 (Sfxn3), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527496 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sideroflexin 3 (Sfxn3), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000062213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:45047576:45056383:1 gene:ENSMUSG00000025212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000084493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:45047576:45056383:1 gene:ENSMUSG00000025212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000111954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:45047576:45056383:1 gene:ENSMUSG00000025212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AF325262 // GenBank // Mus musculus sideroflexin 3 (Sfxn3) mRNA, complete cds. // chr19 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// AK089985 // GenBank HTC // Mus musculus RCB-0545 OHTA cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430044L04 product:sideroflexin 3, full insert sequence. // chr19 // 84 // 76 // 16 // 19 // 0 /// BC012208 // GenBank // Mus musculus sideroflexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:18958 IMAGE:3985155), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:45047335:45078967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_178929 // RefSeq // Mus musculus Kazal-type serine peptidase inhibitor domain 1 (Kazald1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526568 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Kazal-type serine peptidase inhibitor domain 1 (Kazald1), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000026234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:45076139:45079289:1 gene:ENSMUSG00000025213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:45075241:45079289:1 gene:ENSMUSG00000025213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK155095 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630201H03 product:similar to FKSG28 (FKSG40) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC115642 // GenBank // Mus musculus Kazal-type serine peptidase inhibitor domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:144546 IMAGE:40103018), complete cds. // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000008155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:45047335:45078967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0
NM_021901 // RefSeq // Mus musculus T cell leukemia, homeobox 1 (Tlx1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000026236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:45150680:45156943:1 gene:ENSMUSG00000025215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC018246 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia, homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:19305 IMAGE:4164519), complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:45150916:45156116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_172639 // RefSeq // Mus musculus deleted in primary ciliary dyskinesia (Dpcd), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:45560615:45578279:1 gene:ENSMUSG00000041035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK037566 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130026N14 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC027559 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5330431N19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41405 IMAGE:1493971), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:45571616:45577575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT034898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000181820 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:45998137:46013386:1 gene:ENSMUSG00000097690 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK015708 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930505N22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT034918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Sense No Exonic // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_176785 // RefSeq // Mus musculus Hermansky-Pudlak syndrome 6 (Hps6), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:46003478:46006173:1 gene:ENSMUSG00000074811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF536239 // GenBank // Mus musculus ruby-eye protein (Hps6) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034055 // GenBank // Mus musculus Hermansky-Pudlak syndrome 6, mRNA (cDNA clone MGC:31055 IMAGE:3673655), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46003626:46006043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001039351 // RefSeq // Mus musculus nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1 (Nolc1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_001039352 // RefSeq // Mus musculus nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1 (Nolc1), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_001039353 // RefSeq // Mus musculus nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1 (Nolc1), transcript variant 4, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_053086 // RefSeq // Mus musculus nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1 (Nolc1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000165017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:46075863:46085528:1 gene:ENSMUSG00000015176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC003244 // GenBank HTC // Mus musculus nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3498349), with apparent retained intron. // chr19 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC050104 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30029042, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr19 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// BC023295 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3491793, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr19 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000020067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46056591:46084170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1
NM_007703 // RefSeq // Mus musculus elongation of very long chain fatty acids (FEN1/Elo2, SUR4/Elo3, yeast)-like 3 (Elovl3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526624 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus elongation of very long chain fatty acids (FEN1/Elo2, SUR4/Elo3, yeast)-like 3 (Elovl3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000043739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:46131897:46135307:1 gene:ENSMUSG00000038754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC016468 // GenBank // Mus musculus elongation of very long chain fatty acids (FEN1/Elo2, SUR4/Elo3, yeast)-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:18360 IMAGE:4196583), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// U97107 // GenBank // Mus musculus membrane glycoprotein CIG30 (Cig30) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46132106:46134802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK004901 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1300004I20 product:elongation of very long chain fatty acids (FEN1/Elo2, SUR4/Elo3, yeast)-like 3, full insert sequence. // chr19 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_133694 // RefSeq // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 15 (Fbxl15), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:46328184:46330446:1 gene:ENSMUSG00000025226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:46328187:46330445:1 gene:ENSMUSG00000025226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC016499 // GenBank // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:25449 IMAGE:4221584), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46328474:46330291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NR_030468 // RefSeq // Mus musculus microRNA 146b (Mir146b), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000093619 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:46342762:46342870:1 gene:ENSMUSG00000070127 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// mmu-mir-146b // miRBase Micro RNA Database // MI0004665 Mus musculus miR-146b stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT034942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_029186 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 180 (Tmem180), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000086969 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:46356880:46375252:1 gene:ENSMUSG00000025227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:46341121:46375252:1 gene:ENSMUSG00000025227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000137143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:46366734:46375252:1 gene:ENSMUSG00000025227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000142994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:46356935:46375252:1 gene:ENSMUSG00000025227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC026385 // GenBank HTC // Mus musculus transmembrane protein 180, mRNA (cDNA clone IMAGE:4187305), with apparent retained intron. // chr19 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC058746 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 180, mRNA (cDNA clone MGC:65552 IMAGE:6399588), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46366386:46374714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000083270 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:46359036:46359144:1 gene:ENSMUSG00000065204 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT034945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_053100 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 8 (Trim8), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527488 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif-containing 8 (Trim8), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000026008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:46501648:46516444:1 gene:ENSMUSG00000025034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF281047 // GenBank // Mus musculus domesticus glioblastoma-expressed RING finger protein GERP mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// BC152343 // GenBank // Mus musculus tripartite motif protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:164719 IMAGE:40093266), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC152344 // GenBank // Mus musculus tripartite motif protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:164720 IMAGE:40093269), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46397103:46515666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
NM_053196 // RefSeq // Mus musculus sideroflexin 2 (Sfxn2), mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006527492 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sideroflexin 2 (Sfxn2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// XR_386525 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sideroflexin 2 (Sfxn2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr19 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:46573365:46596898:1 gene:ENSMUSG00000025036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AF325261 // GenBank // Mus musculus sideroflexin 2 (Sfxn2) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// BC019808 // GenBank // Mus musculus sideroflexin 2, mRNA (cDNA clone MGC:30418 IMAGE:5043343), complete cds. // chr19 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// XR_386526 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sideroflexin 2 (Sfxn2), transcript variant X4, misc_RNA. // chr19 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// AK034875 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430052L19 product:sideroflexin 2, full insert sequence. // chr19 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// AK149277 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930009H07 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// GENSCAN00000008773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46582503:46594771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_025563 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2010012O05 gene (2010012O05Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000074912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:46689906:46703382:1 gene:ENSMUSG00000062376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC027506 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010012O05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41041 IMAGE:1514880), complete cds. // chr19 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46689948:46740568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_020577 // RefSeq // Mus musculus arsenic (+3 oxidation state) methyltransferase (As3mt), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000003655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:46707443:46741095:1 gene:ENSMUSG00000003559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF166383 // GenBank // Mus musculus methyltransferase (Cyt19) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// AK009814 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310045H08 product:methyltransferase Cyt19, full insert sequence. // chr19 // 90 // 97 // 27 // 30 // 0 /// BC145663 // GenBank // Mus musculus arsenic (+3 oxidation state) methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:175550 IMAGE:40130966), complete cds. // chr19 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// GENSCAN00000008820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46689948:46740568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_001102471 // RefSeq // Mus musculus cyclin M2 (Cnnm2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NM_033569 // RefSeq // Mus musculus cyclin M2 (Cnnm2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000077666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:46761596:46878795:1 gene:ENSMUSG00000064105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000099373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:46761596:46878795:1 gene:ENSMUSG00000064105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF216961 // GenBank // Mus musculus ancient conserved domain protein 2 (Acdp2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC038027 // GenBank HTC // Mus musculus cyclin M2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3984868), with apparent retained intron. // chr19 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// BC052513 // GenBank // Mus musculus cyclin M2, mRNA (cDNA clone IMAGE:1365353), complete cds. // chr19 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// GQ225745 // GenBank // Mus musculus cyclin-like protein 2 (Clp2) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0 /// XM_006527489 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin M2 (Cnnm2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// XM_006527490 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin M2 (Cnnm2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000008796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46843563:46878042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0
NM_146100 // RefSeq // Mus musculus internexin neuronal intermediate filament protein, alpha (Ina), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000037636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:47014698:47025327:1 gene:ENSMUSG00000034336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK144917 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830002N06 product:internexin neuronal intermediate filament protein, alpha, full insert sequence. // chr19 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC018383 // GenBank // Mus musculus internexin neuronal intermediate filament protein, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:25352 IMAGE:4502421), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// L36390 // GenBank // Mus musculus (clone pMNF-66) 66 kDa neurofilament protein NF-66 mRNA, complete cds. // chr19 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47014755:47024023:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000037636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:47014698:47025327:1 gene:ENSMUSG00000034336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK144917 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830002N06 product:internexin neuronal intermediate filament protein, alpha, full insert sequence. // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_177342 // RefSeq // Mus musculus TAF5 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf5), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000026027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47067748:47083479:1 gene:ENSMUSG00000025049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47067669:47130810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_011053 // RefSeq // Mus musculus programmed cell death 11 (Pdcd11), mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000072141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47090766:47131143:1 gene:ENSMUSG00000025047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// AF055668 // GenBank // Mus musculus apoptosis-linked gene 4, deltaC form (Alg-4) mRNA, partial cds. // chr19 // 91 // 30 // 10 // 11 // 0 /// BC070468 // GenBank // Mus musculus programmed cell death 11, mRNA (cDNA clone MGC:99418 IMAGE:30628812), complete cds. // chr19 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC094244 // GenBank HTC // Mus musculus programmed cell death 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:5697609), with apparent retained intron. // chr19 // 46 // 46 // 17 // 37 // 1 /// GENSCAN00000008786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47067669:47130810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1
NM_001163480 // RefSeq // Mus musculus neuralized homolog 1A (Drosophila) (Neurl1a), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NM_021360 // RefSeq // Mus musculus neuralized homolog 1A (Drosophila) (Neurl1a), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000111807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47228843:47259440:1 gene:ENSMUSG00000006435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000111808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47178820:47259440:1 gene:ENSMUSG00000006435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AF400063 // GenBank // Mus musculus neuralized 1 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// AF401228 // GenBank // Mus musculus neuralized (Neurl) mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 79 // 25 // 27 // 0 /// BC058386 // GenBank // Mus musculus neuralized homolog 1A (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:66919 IMAGE:6831952), complete cds. // chr19 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC099702 // GenBank // Mus musculus neuralized homolog 1A (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:106438 IMAGE:6825751), complete cds. // chr19 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// AK046382 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230378F24 product:neuralized homolog (Drosophila), full insert sequence. // chr19 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000008770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47206208:47257655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// Y15160 // GenBank // Mus musculus mRNA homologous to protein encoded by Drosophila neuralized gene. // chr19 // 91 // 65 // 20 // 22 // 0
AK082436 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230050L11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001164639 // RefSeq // Mus musculus STE20-like kinase (Slk), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NM_009289 // RefSeq // Mus musculus STE20-like kinase (Slk), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000026043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:47579678:47645246:1 gene:ENSMUSG00000025060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000051691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:47580019:47642455:1 gene:ENSMUSG00000025060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// AF039574 // GenBank // Mus musculus serine/threonine protein kinase mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 91 // 37 // 39 // 0 /// AF112855 // GenBank // Mus musculus Ste20-related kinase SMAK (SMAK) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// AK122218 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0204 protein. // chr19 // 98 // 95 // 40 // 41 // 0 /// BC131674 // GenBank // Mus musculus STE20-like kinase (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:150209 IMAGE:40110915), complete cds. // chr19 // 94 // 84 // 34 // 36 // 0 /// BC131675 // GenBank // Mus musculus STE20-like kinase (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:150210 IMAGE:40110921), complete cds. // chr19 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000043960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47579447:47642093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0
NM_026377 // RefSeq // Mus musculus SWI5 dependent recombination repair 1 (Sfr1), mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47731756:47735588:1 gene:ENSMUSG00000025066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AB597963 // GenBank // Mus musculus Sfr1 mRNA for DNA repair protein Sfr1, complete cds. // chr19 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// BC024403 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330577E15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:36300 IMAGE:5003059), complete cds. // chr19 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// GENSCAN00000043973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47724519:47735018:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 35 // 10 // 11 // 0
NM_010362 // RefSeq // Mus musculus glutathione S-transferase omega 1 (Gsto1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:47854970:47864790:1 gene:ENSMUSG00000025068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC085165 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase omega 1, mRNA (cDNA clone MGC:109672 IMAGE:30359900), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// U80819 // GenBank // Mus musculus glutathione-S-transferase homolog mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000130157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:47855083:47855725:1 gene:ENSMUSG00000025068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000043977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47851225:47864450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_026619 // RefSeq // Mus musculus glutathione S-transferase omega 2 (Gsto2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NM_030051 // RefSeq // Mus musculus glutathione S-transferase omega 2 (Gsto2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000056159 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:47865767:47886324:1 gene:ENSMUSG00000025069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:47865545:47886324:1 gene:ENSMUSG00000025069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000135016 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:47870262:47884704:1 gene:ENSMUSG00000025069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AK019582 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930425C18 product:similar to BA127L20.1 (NOVEL GLUTATHIONE-S-TRANSFERASE) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 91 // 69 // 20 // 22 // 0 /// BC030371 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase omega 2, mRNA (cDNA clone MGC:40895 IMAGE:5371983), complete cds. // chr19 // 90 // 66 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000043974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47870559:47886189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_001163267 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 147 (Ccdc147), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000066308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47937712:48035379:1 gene:ENSMUSG00000046585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC147530 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 147, mRNA (cDNA clone MGC:182627 IMAGE:9056521), complete cds. // chr19 // 86 // 100 // 31 // 36 // 0 /// BC147540 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 147, mRNA (cDNA clone MGC:182637 IMAGE:9056531), complete cds. // chr19 // 86 // 100 // 31 // 36 // 0 /// BC150978 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 147, mRNA (cDNA clone MGC:183891 IMAGE:9087891), complete cds. // chr19 // 86 // 100 // 31 // 36 // 0 /// BC150979 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 147, mRNA (cDNA clone MGC:183892 IMAGE:9087892), complete cds. // chr19 // 86 // 100 // 31 // 36 // 0 /// GENSCAN00000043970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47962004:48065533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000043968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47909893:47955653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_025696 // RefSeq // Mus musculus sortilin-related VPS10 domain containing receptor 3 (Sorcs3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000078880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:48206025:48805505:1 gene:ENSMUSG00000063434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF276314 // GenBank // Mus musculus VPS10 domain receptor (SorCS3) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:48660469:48803686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000180885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:51792226:51792602:1 gene:ENSMUSG00000097719 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:51792180:51792602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT035035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_008386 // RefSeq // Mus musculus insulin I (Ins1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:52264323:52265456:1 gene:ENSMUSG00000035804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK007482 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810013J24 product:INSULIN 1 PRECURSOR, full insert sequence. // chr19 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC098468 // GenBank // Mus musculus insulin I, mRNA (cDNA clone MGC:107382 IMAGE:6432765), complete cds. // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC145868 // GenBank // Mus musculus insulin I, mRNA (cDNA clone MGC:175755 IMAGE:40131171), complete cds. // chr19 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC145870 // GenBank // Mus musculus insulin I, mRNA (cDNA clone MGC:175757 IMAGE:40131173), complete cds. // chr19 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000007967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:52264624:52264950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0
NM_001164099 // RefSeq // Mus musculus adducin 3 (gamma) (Add3), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NM_001164100 // RefSeq // Mus musculus adducin 3 (gamma) (Add3), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NM_001164101 // RefSeq // Mus musculus adducin 3 (gamma) (Add3), transcript variant 4, mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NM_001277100 // RefSeq // Mus musculus adducin 3 (gamma) (Add3), transcript variant 5, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NM_013758 // RefSeq // Mus musculus adducin 3 (gamma) (Add3), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000025999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:53143997:53247399:1 gene:ENSMUSG00000025026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000050096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:53142756:53247399:1 gene:ENSMUSG00000025026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000111741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:53140445:53247399:1 gene:ENSMUSG00000025026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AF100424 // GenBank // Mus musculus gamma-1 adducin (Addl) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr19 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// AF100425 // GenBank // Mus musculus gamma-2 adducin (Addl) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr19 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// BC037116 // GenBank // Mus musculus adducin 3 (gamma), mRNA (cDNA clone MGC:46880 IMAGE:4506748), complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:53216872:53245290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 66 // 22 // 23 // 0
NM_001085390 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 5 (Dusp5), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:53529109:53542431:1 gene:ENSMUSG00000034765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:53517137:53577398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_007790 // RefSeq // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 3 (Smc3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000025930 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:53600398:53645833:1 gene:ENSMUSG00000024974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF047601 // GenBank // Mus musculus SMCD (SmcD) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF141294 // GenBank // Mus musculus bamacan (Bam) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC057345 // GenBank // Mus musculus structural maintenace of chromosomes 3, mRNA (cDNA clone MGC:67063 IMAGE:6811961), complete cds. // chr19 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC062935 // GenBank // Mus musculus structural maintenace of chromosomes 3, mRNA (cDNA clone MGC:76382 IMAGE:6838083), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000031465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:53599988:53634185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_001170847 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 20 (Rbm20), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000095969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:53677306:53843763:1 gene:ENSMUSG00000043639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000161856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:53843210:53867080:1 gene:ENSMUSG00000043639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000164202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:53677306:53867080:1 gene:ENSMUSG00000043639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC038663 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 20, mRNA (cDNA clone IMAGE:5366157), partial cds. // chr19 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000031461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:53813219:53883543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
AK030989 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830477H05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001168505 // RefSeq // Mus musculus soc-2 (suppressor of clear) homolog (C. elegans) (Shoc2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_019658 // RefSeq // Mus musculus soc-2 (suppressor of clear) homolog (C. elegans) (Shoc2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:53944876:54033268:1 gene:ENSMUSG00000024976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000169861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:53944306:54033268:1 gene:ENSMUSG00000024976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF068921 // GenBank // Mus musculus Ras-binding protein SUR-8 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC026364 // GenBank // Mus musculus soc-2 (suppressor of clear) homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:31051 IMAGE:4014650), complete cds. // chr19 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC049775 // GenBank // Mus musculus soc-2 (suppressor of clear) homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:59289 IMAGE:6515905), complete cds. // chr19 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC083060 // GenBank // Mus musculus soc-2 (suppressor of clear) homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:102442 IMAGE:5356514), complete cds. // chr19 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// AK077798 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830476F20 product:soc-2 (suppressor of clear) homolog (C. elegans), full insert sequence. // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000031452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:54026461:54047612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_007417 // RefSeq // Mus musculus adrenergic receptor, alpha 2a (Adra2a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:54045182:54048982:1 gene:ENSMUSG00000033717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138531 // GenBank // Mus musculus adrenergic receptor, alpha 2a, mRNA (cDNA clone MGC:170156 IMAGE:8861551), complete cds. // chr19 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
NM_027976 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA synthetase long-chain family member 5 (Acsl5), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// XM_006527178 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acyl-CoA synthetase long-chain family member 5 (Acsl5), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000043150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:55253369:55296627:1 gene:ENSMUSG00000024981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// AK006541 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700030F05 product:fatty acid Coenzyme A ligase, long chain 5, full insert sequence. // chr19 // 100 // 44 // 20 // 20 // 0 /// BC031544 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA synthetase long-chain family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:18968 IMAGE:3987201), complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000001604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:55243839:55295513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 76 // 76 // 34 // 45 // 1
AK142601 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730005F07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KnowTID_00004140 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT035151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_007611 // RefSeq // Mus musculus caspase 7 (Casp7), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000026062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:56397129:56442344:1 gene:ENSMUSG00000025076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC005428 // GenBank // Mus musculus caspase 7, mRNA (cDNA clone MGC:5872 IMAGE:3600155), complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// CT010348 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836H0452D for gene Casp7, Caspase 7; complete cds, incl. stopcodon. // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// D86353 // GenBank // Mus musculus mRNA for Mch3, complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// Y13088 // GenBank // M.musculus mRNA for caspase-7. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT035165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0 /// U67321 // GenBank // Mus musculus Lice2 cysteine protease (Lice2) mRNA, complete cds. // chr19 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:56397460:56441095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
BC051054 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9930023K05 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5036631), complete cds. // chr19 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// BC090250 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9930023K05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:99964 IMAGE:6485933), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_001164263 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family S member 1 (Plekhs1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NM_172641 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family S member 1 (Plekhs1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_006527021 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family S member 1 (Plekhs1), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000039666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:56461637:56486729:1 gene:ENSMUSG00000035818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000178590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:56461637:56486729:1 gene:ENSMUSG00000035818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_006527022 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family S member 1 (Plekhs1), transcript variant X5, mRNA. // chr19 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000040161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:56478423:56521445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_025811 // RefSeq // Mus musculus NHL repeat containing 2 (Nhlrc2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:56548261:56598846:1 gene:ENSMUSG00000025078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC095956 // GenBank // Mus musculus NHL repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:106284 IMAGE:5330002), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC138190 // GenBank // Mus musculus NHL repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:169814 IMAGE:8861209), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC138191 // GenBank // Mus musculus NHL repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:169815 IMAGE:8861210), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:56548683:56597512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_007419 // RefSeq // Mus musculus adrenergic receptor, beta 1 (Adrb1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:56722372:56724862:1 gene:ENSMUSG00000035283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC140970 // GenBank // Mus musculus adrenergic receptor, beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:175931 IMAGE:9055582), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147435 // GenBank // Mus musculus adrenergic receptor, beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:182135 IMAGE:9056029), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:56722372:56723772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK131796 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700122L01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_172840 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 2 (Vwa2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527090 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 2 (Vwa2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// XM_006527091 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 2 (Vwa2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000026068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:56874249:56912078:1 gene:ENSMUSG00000025082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK145058 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830033I23 product:VWA-like domains, matrilins and collagens, full insert sequence. // chr19 // 79 // 93 // 22 // 28 // 0 /// BC115868 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:141475 IMAGE:40081354), complete cds. // chr19 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC116636 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:141476 IMAGE:40081359), complete cds. // chr19 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:56831109:56910887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_145505 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 160, member B1 (Fam160b1), mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000036407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:57361009:57389594:1 gene:ENSMUSG00000033478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC023048 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 160, member B1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5360554), complete cds. // chr19 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// BC062949 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 160, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:77957 IMAGE:6839812), complete cds. // chr19 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000040172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:57291177:57386576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 88 // 88 // 37 // 42 // 1 /// BC029699 // GenBank HTC // Mus musculus expressed sequence AI450540, mRNA (cDNA clone IMAGE:5359258), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr19 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1
NM_181415 // RefSeq // Mus musculus attractin like 1 (Atrnl1), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527052 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus attractin like 1 (Atrnl1), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000077282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:57611034:58133338:1 gene:ENSMUSG00000054843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK050882 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030029G14 product:weakly similar to DJ741H3.1.2 (ATTRACTIN (WITH DIPEPTIDYLPEPTIDASE IV ACTIVITY) MEMBRANE BOUND ISOFORM (KIAA0548)) (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// AK133232 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932419N02 product:attractin like protein, full insert sequence. // chr19 // 86 // 45 // 12 // 14 // 0 /// AY688677 // GenBank // Mus musculus attractin-like protein (Atrnl) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC050020 // GenBank // Mus musculus attractin like 1, mRNA (cDNA clone MGC:51490 IMAGE:4019027), complete cds. // chr19 // 86 // 68 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:57611354:57732807:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
AK037606 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130029G22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_029372 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 172 (Ccdc172), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000069419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:58512002:58553085:1 gene:ENSMUSG00000025090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049707 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700011F14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58650 IMAGE:6740418), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:58510092:58572796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_026925 // RefSeq // Mus musculus pancreatic lipase (Pnlip), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000057270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:58670365:58681786:1 gene:ENSMUSG00000046008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK007357 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810007A24 product:PANCREATIC TRIGLYCERIDE LIPASE (FRAGMENT) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr19 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AY387690 // GenBank // Mus musculus pancreatic triglyceride lipase mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC061061 // GenBank // Mus musculus pancreatic lipase, mRNA (cDNA clone MGC:74173 IMAGE:30316303), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:58670539:58681727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_018874 // RefSeq // Mus musculus pancreatic lipase related protein 1 (Pnliprp1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000048644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:58728887:58744169:1 gene:ENSMUSG00000042179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF061274 // GenBank // Mus musculus pancreatic lipase related protein 1 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC068266 // GenBank // Mus musculus pancreatic lipase related protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6434448), partial cds. // chr19 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC090985 // GenBank // Mus musculus pancreatic lipase related protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:107271 IMAGE:30315884), complete cds. // chr19 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:58699064:58769709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0
NM_011128 // RefSeq // Mus musculus pancreatic lipase-related protein 2 (Pnliprp2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:58759723:58777533:1 gene:ENSMUSG00000025091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094923 // GenBank // Mus musculus pancreatic lipase-related protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:107493 IMAGE:6431510), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M30687 // GenBank // Mouse cytotoxic T lymphocyte lipase mRNA, complete cds. // chr19 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:58699064:58769709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_178689 // RefSeq // Mus musculus enolase 4 (Eno4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000054280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:58943425:58971419:1 gene:ENSMUSG00000048029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC023285 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6430537H07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30738 IMAGE:3984456), complete cds. // chr19 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:58943457:58955557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:58957511:58970161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0
XR_398526 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930442E04 gene (4930442E04Rik), transcript variant X1, ncRNA. // chr19 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// AK015359 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930442E04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// KnowTID_00004153 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONMMUT035273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_207261 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 18 (Kcnk18), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:59219648:59237370:1 gene:ENSMUSG00000040901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY325301 // GenBank // Mus musculus two-pore-domain potassium channel TRESK mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AY542902 // GenBank // Mus musculus 2P K ion channel TRESK mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC127136 // GenBank // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:156339 IMAGE:40045157), complete cds. // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC127137 // GenBank // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:156340 IMAGE:40045158), complete cds. // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:59219324:59293916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_172523 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 2 (Slc18a2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000026084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:59260878:59296012:1 gene:ENSMUSG00000025094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AJ555564 // GenBank // Mus musculus mRNA for vesicular monoamine transporter 2 (slc18a2 gene). // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC078449 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:90556 IMAGE:5705966), complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:59219324:59293916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1
NM_010132 // RefSeq // Mus musculus empty spiracles homeobox 2 (Emx2), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006526657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus empty spiracles homeobox 2 (Emx2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000062216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:59458372:59465357:1 gene:ENSMUSG00000043969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174353 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:59459519:59465353:1 gene:ENSMUSG00000043969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AY117415 // GenBank // Mus musculus empty spiracles-like protein 2 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:59451455:59464047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NR_026942 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E330013P04 gene (E330013P04Rik), long non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000065383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:60144675:60162591:1 gene:ENSMUSG00000053117 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK163106 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530084M19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENSMUST00000190409 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:60144704:60153089:1 gene:ENSMUSG00000053117 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// ENSMUST00000190698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:60151294:60157305:1 gene:ENSMUSG00000053117 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:60112131:60191972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONMMUT035298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSMUST00000061046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:60226334:60227678:1 gene:ENSMUSG00000043623 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006543471 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4933412A08 gene (4933412A08Rik), mRNA. // chr19 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// AK016784 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933412A08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONMMUT035302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_178421 // RefSeq // Mus musculus nanos homolog 1 (Drosophila) (Nanos1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000088237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:60755987:60759913:1 gene:ENSMUSG00000072437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB095029 // GenBank // Mus musculus nanos1 mRNA, complete cds. // chr19 // 82 // 42 // 9 // 11 // 0 /// BC085512 // GenBank // Mus musculus nanos homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:102288 IMAGE:6849859), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AK138619 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330077C15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001167829 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 45, member A (Fam45a), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_026437 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 45, member A (Fam45a), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:60811611:60836227:1 gene:ENSMUSG00000024993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128357 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:60811585:60830864:1 gene:ENSMUSG00000024993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000148577 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:60811611:60822406:1 gene:ENSMUSG00000024993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC013514 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810055E12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:19185 IMAGE:4235293), complete cds. // chr19 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000119633 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:60811591:60836227:1 gene:ENSMUSG00000024993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// ENSMUST00000147049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:60811596:60818439:1 gene:ENSMUSG00000024993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000025495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:60793117:60835002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONMMUT035327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_018869 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor kinase 5 (Grk5), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006526698 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor kinase 5 (Grk5), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000003313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:60889749:61092553:1 gene:ENSMUSG00000003228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF040746 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor kinase 5 (GRK5) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC019379 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor kinase 5, mRNA (cDNA clone MGC:30358 IMAGE:5116510), complete cds. // chr19 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000025493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:60966115:61093071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1
ENSMUST00000092094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:61183890:61183955:1 gene:ENSMUSG00000069475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AB010317 // GenBank // Mus musculus mRNA for mszf72, partial cds. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT035357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000101978 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:3136984:3137090:-1 gene:ENSMUSG00000093983 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT033403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_009212 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin mu binding protein 2 (Ighmbp2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000025751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:3260925:3283017:-1 gene:ENSMUSG00000024831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000119292 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:3260924:3282979:-1 gene:ENSMUSG00000024831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000154537 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:3264818:3282980:-1 gene:ENSMUSG00000024831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// L10075 // GenBank // Mouse DNA-binding protein (Smbp-2) mRNA, complete cds. // chr19 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC133681 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin mu binding protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40110117), complete cds. // chr19 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3261432:3283145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_010253 // RefSeq // Mus musculus galanin (Gal), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:3409919:3414472:-1 gene:ENSMUSG00000024907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC044055 // GenBank // Mus musculus galanin, mRNA (cDNA clone MGC:54666 IMAGE:6476459), complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3410095:3414112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_008513 // RefSeq // Mus musculus low density lipoprotein receptor-related protein 5 (Lrp5), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000025856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:3584828:3686556:-1 gene:ENSMUSG00000024913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000177294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:3584836:3615792:-1 gene:ENSMUSG00000024913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 56 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000177330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:3584831:3686561:-1 gene:ENSMUSG00000024913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AF064984 // GenBank // Mus musculus low-density lipoprotein receptor-related protein 5 (Lrp5) mRNA, complete cds. // chr19 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// AF077847 // GenBank // Mus musculus LDL receptor member LR3 mRNA, complete cds. // chr19 // 98 // 96 // 45 // 46 // 0 /// BC011374 // GenBank // Mus musculus low density lipoprotein receptor-related protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:11611 IMAGE:3154246), complete cds. // chr19 // 94 // 100 // 45 // 48 // 0 /// ENSMUST00000176867 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:3621671:3686564:-1 gene:ENSMUSG00000024913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 38 // 38 // 18 // 48 // 1 /// AK081025 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930069L06 product:low density lipoprotein receptor-related protein 5, full insert sequence. // chr19 // 38 // 38 // 18 // 48 // 1 /// GENSCAN00000024126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3585030:3686442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0
NM_001271443 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 8 (Ndufs8), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_001271444 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 8 (Ndufs8), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_144870 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 8 (Ndufs8), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000075092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:3908870:3912717:-1 gene:ENSMUSG00000059734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC086766 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:101957 IMAGE:6820786), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC021616 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:37950 IMAGE:5132866), complete cds. // chr19 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3896114:3932090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_026316 // RefSeq // Mus musculus aldehyde dehydrogenase 3 family, member B1 (Aldh3b1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000051803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:3913493:3929761:-1 gene:ENSMUSG00000024885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF362571 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase ALDH3B1 mRNA, partial cds. // chr19 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// AK154723 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630104J22 product:aldehyde dehydrogenase 3 family, member B1, full insert sequence. // chr19 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC046597 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase 3 family, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:54873 IMAGE:6312211), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:3896114:3932090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0
AK079024 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230112C19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_013541 // RefSeq // Mus musculus glutathione S-transferase, pi 1 (Gstp1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000169613 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:4035407:4037921:-1 gene:ENSMUSG00000060803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000180480 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4035407:4037921:-1 gene:ENSMUSG00000097830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC002048 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase, pi 1, mRNA (cDNA clone MGC:6054 IMAGE:3593257), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC061109 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase, pi 1, mRNA (cDNA clone MGC:74229 IMAGE:30322194), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000026452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4035473:4059651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000056883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4035473:4059651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_144869 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC021614 (BC021614), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006544895 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC021614 (BC021614), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000076451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4057478:4059295:-1 gene:ENSMUSG00000058216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000180628 // ENSEMBL // proj_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4057478:4059295:-1 gene:ENSMUSG00000097663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC021614 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC021614, mRNA (cDNA clone MGC:37914 IMAGE:5102505), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC034269 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC021614, mRNA (cDNA clone MGC:19096 IMAGE:4196879), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000188771 // ENSEMBL // proj_havana:known chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4057477:4059446:-1 gene:ENSMUSG00000097663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000189808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:4057477:4059446:-1 gene:ENSMUSG00000058216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4035473:4059651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000056883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4035473:4059651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000082466 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:4078298:4078512:-1 gene:ENSMUSG00000064400 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000181407 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4078298:4078512:-1 gene:ENSMUSG00000097846 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT033456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_144532 // RefSeq // Mus musculus calcium binding protein 4 (Cabp4), mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000025761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4135425:4139609:-1 gene:ENSMUSG00000024842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000181080 // ENSEMBL // proj_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4135424:4139608:-1 gene:ENSMUSG00000097687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// AK171863 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830015G01 product:calcium binding protein 4, full insert sequence. // chr19 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// AY039218 // GenBank // Mus musculus calcium-binding protein CaBP4 mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 94 // 14 // 15 // 0 /// BC049263 // GenBank // Mus musculus calcium binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:55118 IMAGE:5366999), complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000026429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4135987:4139556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000056878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4135986:4139555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0
NM_134148 // RefSeq // Mus musculus carnosine synthase 1 (Carns1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006531618 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carnosine synthase 1 (Carns1), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006531619 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carnosine synthase 1 (Carns1), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000167055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4164324:4175479:-1 gene:ENSMUSG00000075289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000181869 // ENSEMBL // proj_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4164323:4175478:-1 gene:ENSMUSG00000097064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK129347 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1394 protein. // chr19 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC023699 // GenBank // Mus musculus ATP-grasp domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:38381 IMAGE:5345551), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4165338:4190809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000056890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4165337:4190808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_011237 // RefSeq // Mus musculus RAD9 homolog A (Rad9a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000025740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4195198:4201603:-1 gene:ENSMUSG00000024824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000181329 // ENSEMBL // proj_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4195197:4201602:-1 gene:ENSMUSG00000097909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF045663 // GenBank // Mus musculus radio-resistance/chemo-resistance/cell cycle checkpoint control protein (Rad9) mRNA, complete cds. // chr19 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// AK219932 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0150C20, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000025740, based on BLAT search. // chr19 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// BC082556 // GenBank // Mus musculus RAD9 homolog (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:100350 IMAGE:30538342), complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4195987:4216032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// GENSCAN00000056884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG153_PATCH:4195986:4216031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1
NM_198113 // RefSeq // Mus musculus slingshot homolog 3 (Drosophila) (Ssh3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006531751 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus slingshot homolog 3 (Drosophila) (Ssh3), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000037992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4261668:4269172:-1 gene:ENSMUSG00000034616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4261673:4269172:-1 gene:ENSMUSG00000034616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB099289 // GenBank // Mus musculus mSSH-3L mRNA for slingshot-3L, complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC028922 // GenBank // Mus musculus slingshot homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:25738 IMAGE:3987714), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK038981 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230081G01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// AK171514 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730225C15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000026432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4262354:4282970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_026720 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 13 family, member D (Ankrd13d), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000056888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:4270180:4283135:-1 gene:ENSMUSG00000005986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000163858 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:4270182:4283137:-1 gene:ENSMUSG00000005986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000167215 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:4280646:4283033:-1 gene:ENSMUSG00000005986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000169653 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:4279466:4283137:-1 gene:ENSMUSG00000005986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000170283 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:4272623:4281011:-1 gene:ENSMUSG00000005986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 89 // 30 // 8 // 9 // 0 /// AK155698 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730205M13 product:weakly similar to ANKRD13 protein [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// BC058982 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 13 family, member D, mRNA (cDNA clone MGC:67375 IMAGE:5685059), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4262354:4282970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_007485 // RefSeq // Mus musculus ras homolog gene family, member D (Rhod), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048197 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:4425459:4439432:-1 gene:ENSMUSG00000041845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117462 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:4425667:4439421:-1 gene:ENSMUSG00000041845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC047989 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member D, mRNA (cDNA clone MGC:59250 IMAGE:6333308), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// D89821 // GenBank // Mus musculus mRNA for RhoM, complete cds. // chr19 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4426089:4510735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_134164 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin XII (Syt12), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000059295 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:4445908:4477447:-1 gene:ENSMUSG00000049303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB062804 // GenBank // Mus musculus Syt XII mRNA for synaptotagmin XII, complete cds. // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AK046627 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430212A09 product:SYNAPTOTAGMIN XII, full insert sequence. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC116846 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin XII, mRNA (cDNA clone MGC:151223 IMAGE:40126165), complete cds. // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC116848 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin XII, mRNA (cDNA clone MGC:151225 IMAGE:40126167), complete cds. // chr19 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4426089:4510735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
ENSMUST00000048482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4496790:4498583:-1 gene:ENSMUSG00000042041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021951 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010003K11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:37907 IMAGE:5102159), complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSMUST00000053597 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:4611792:4615502:-1 gene:ENSMUSG00000045045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC023036 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:36464 IMAGE:5358628), complete cds. // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC023156 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:36545 IMAGE:4951386), complete cds. // chr19 // 84 // 68 // 16 // 19 // 0 /// DQ078786 // GenBank // Mus musculus synaptic adhesion-like molecule 3 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NM_153388 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 4 (Lrfn4), mRNA. // chr19 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// ENSMUST00000113822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:4611785:4615667:-1 gene:ENSMUSG00000045045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000026438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4612077:4614504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NM_023131 // RefSeq // Mus musculus RCE1 homolog, prenyl protein peptidase (S. cerevisiae) (Rce1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4622551:4625617:-1 gene:ENSMUSG00000024889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC004060 // GenBank // Mus musculus RCE1 homolog, prenyl protein peptidase (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:8174 IMAGE:3590170), complete cds. // chr19 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC048686 // GenBank HTC // Mus musculus RCE1 homolog, prenyl protein peptidase (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:6334919), containing frame-shift errors. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4623007:4651570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NM_001033447 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 960 (Gm960), mRNA. // chr19 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// XM_006531779 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 960 (Gm960), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000096325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4648317:4698315:-1 gene:ENSMUSG00000071691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000177696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4625841:4698668:-1 gene:ENSMUSG00000071691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// AK134945 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430524H14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531780 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 960 (Gm960), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 79 // 79 // 33 // 42 // 1 /// XM_006531781 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 960 (Gm960), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 79 // 79 // 33 // 42 // 1 /// GENSCAN00000026450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4623007:4651570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1
AK039613 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330073E07 product:hypothetical Glycine-rich region profile/Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr19 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_016892 // RefSeq // Mus musculus copper chaperone for superoxide dismutase (Ccs), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000037246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4825366:4839322:-1 gene:ENSMUSG00000034108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF121906 // GenBank // Mus musculus copper chaperone for superoxide dismutase mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AF173379 // GenBank // Mus musculus copper chaperone for superoxide dismutase (Ccsd) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC026938 // GenBank // Mus musculus copper chaperone for superoxide dismutase, mRNA (cDNA clone MGC:25793 IMAGE:4024140), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4787369:4834386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// BC039799 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:1429343, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr19 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_013456 // RefSeq // Mus musculus actinin alpha 3 (Actn3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000006626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:4861223:4877909:-1 gene:ENSMUSG00000006457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000138811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:4861223:4863558:-1 gene:ENSMUSG00000006457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// AF093775 // GenBank // Mus musculus alpha-actinin 3 (Actn3) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC111890 // GenBank // Mus musculus actinin alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:132876 IMAGE:40060598), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000026445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4861345:4877854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001033128 // RefSeq // Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 1 (human) (Bbs1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006531788 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 1 (human) (Bbs1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000053506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4886898:4906627:-1 gene:ENSMUSG00000006464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK161343 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930430O13 product:Bardet-Biedl syndrome 1 homolog (human), full insert sequence. // chr19 // 94 // 50 // 17 // 18 // 0 /// AK168901 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920063I24 product:Bardet-Biedl syndrome 1 homolog (human), full insert sequence. // chr19 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// GENSCAN00000026461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4890672:4906638:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_133803 // RefSeq // Mus musculus dipeptidylpeptidase 3 (Dpp3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006531854 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dipeptidylpeptidase 3 (Dpp3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000025851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4907229:4928287:-1 gene:ENSMUSG00000063904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK039975 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430037M23 product:similar to DIPEPTIDYL-PEPTIDASE III (EC 3.4.14.4) (DPP III) (DIPEPTIDYL AMINOPEPTIDASE III) (DIPEPTIDYL ARYLAMIDASE III) [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC004600 // GenBank // Mus musculus dipeptidylpeptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:7966 IMAGE:3584924), complete cds. // chr19 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// BC066817 // GenBank // Mus musculus dipeptidylpeptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:76563 IMAGE:30429618), complete cds. // chr19 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// AK041330 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630002D19 product:similar to DIPEPTIDYLPEPTIDASE III [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000026458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4907622:4941911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_153553 // RefSeq // Mus musculus neuronal PAS domain protein 4 (Npas4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006531721 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuronal PAS domain protein 4 (Npas4), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000056129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:4984355:4989971:-1 gene:ENSMUSG00000045903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB049835 // GenBank // Mus musculus mRNA for bHLH-PAS type transcription factor NXF, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK032607 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430703N12 product:bHLH-PAS type transcription factor NXF, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY730724 // GenBank // Mus musculus limbic-enhanced PAS protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC129861 // GenBank // Mus musculus neuronal PAS domain protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:150095 IMAGE:40110003), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:4985068:4989816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001001885 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 151A (Tmem151a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000077066 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:5079330:5085531:-1 gene:ENSMUSG00000061451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC072634 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 151A, mRNA (cDNA clone MGC:99916 IMAGE:6850125), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000140389 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:5071035:5085487:-1 gene:ENSMUSG00000061451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSMUST00000151413 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:5071854:5085487:-1 gene:ENSMUSG00000061451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5081770:5085372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_009920 // RefSeq // Mus musculus cornichon homolog 2 (Drosophila) (Cnih2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531652 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cornichon homolog 2 (Drosophila) (Cnih2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000025805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5092871:5098418:-1 gene:ENSMUSG00000024873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB006191 // GenBank // Mus musculus mRNA for cornichon-like protein, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC103797 // GenBank // Mus musculus cornichon homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:118475 IMAGE:30134114), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137585 // GenBank // Mus musculus cornichon homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169209 IMAGE:8860604), complete cds. // chr19 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC137586 // GenBank // Mus musculus cornichon homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169210 IMAGE:8860605), complete cds. // chr19 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5093668:5132742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_029576 // RefSeq // Mus musculus RAB1B, member RAS oncogene family (Rab1b), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531855 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB1B, member RAS oncogene family (Rab1b), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5099207:5106996:-1 gene:ENSMUSG00000024870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB232584 // GenBank // Mus musculus Rab1B mRNA for Rab1B, complete cds. // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC016408 // GenBank // Mus musculus RAB1B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:25456 IMAGE:4242206), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5093668:5132742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_153129 // RefSeq // Mus musculus phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 (Pacs1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000025786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5133688:5273119:-1 gene:ENSMUSG00000024855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AK171969 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830023A05 product:phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, full insert sequence. // chr19 // 95 // 88 // 40 // 42 // 0 /// BC034670 // GenBank // Mus musculus phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4950455), complete cds. // chr19 // 100 // 54 // 26 // 26 // 0 /// BC062886 // GenBank // Mus musculus phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:86018 IMAGE:5706409), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000011870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5134910:5295394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 94 // 45 // 48 // 1
NM_030109 // RefSeq // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 2 (Sf3b2), mRNA. // chr19 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000025774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5273923:5295455:-1 gene:ENSMUSG00000024853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// BC026365 // GenBank HTC // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3662632), with apparent retained intron. // chr19 // 100 // 37 // 16 // 16 // 0 /// BC049118 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:61326 IMAGE:6812422), complete cds. // chr19 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000011870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5134910:5295394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NONMMUT033539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 95 // 44 // 18 // 19 // 0
NM_028623 // RefSeq // Mus musculus cystatin E/M (Cst6), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000025764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5344705:5349574:-1 gene:ENSMUSG00000024846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC061036 // GenBank // Mus musculus cystatin E/M, mRNA (cDNA clone MGC:74143 IMAGE:6770352), complete cds. // chr19 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000011859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5348030:5349334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 87 // 71 // 13 // 15 // 0
NM_001038231 // RefSeq // Mus musculus barrier to autointegration factor 1 (Banf1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_001286608 // RefSeq // Mus musculus barrier to autointegration factor 1 (Banf1), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_011793 // RefSeq // Mus musculus barrier to autointegration factor 1 (Banf1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NR_104482 // RefSeq // Mus musculus barrier to autointegration factor 1 (Banf1), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr19 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000025762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5364641:5366645:-1 gene:ENSMUSG00000024844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5364641:5366347:-1 gene:ENSMUSG00000024844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AB025349 // GenBank // Mus musculus L2BP1/BAF mRNA for LAP2 binding protein 1, complete cds. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF037080 // GenBank // Mus musculus BAF (BAF) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC003709 // GenBank // Mus musculus barrier to autointegration factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:5684 IMAGE:3599828), complete cds. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK189231 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0148F22, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000025762, based on BLAT search. // chr19 // 62 // 46 // 8 // 13 // 0 /// GENSCAN00000011871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5360014:5366440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_016882 // RefSeq // Mus musculus squamous cell carcinoma antigen recognized by T cells 1 (Sart1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000044207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5377523:5388703:-1 gene:ENSMUSG00000039148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AB014721 // GenBank // Mus musculus mRNA for mSART-1(806), complete cds. // chr19 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AF129931 // GenBank // Mus musculus hypoxia associated factor (Haf) mRNA, complete cds. // chr19 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// BC028823 // GenBank // Mus musculus squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 1, mRNA (cDNA clone MGC:37798 IMAGE:5097832), complete cds. // chr19 // 95 // 95 // 38 // 40 // 0 /// BC051394 // GenBank // Mus musculus squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 1, mRNA (cDNA clone MGC:59155 IMAGE:5097832), complete cds. // chr19 // 95 // 95 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000011853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5380117:5402526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
XM_006543433 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis specific 10 interacting protein (Tsga10ip), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000044527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5390049:5394401:-1 gene:ENSMUSG00000039330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AK019010 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810013N20 product:similar to CDNA FLJ32880 FIS, CLONE TESTI2004122 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5380117:5402526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0
XM_006543434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome b-c1 complex subunit 9-like (LOC102633050), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000050339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:5415565:5415759:-1 gene:ENSMUSG00000051133 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5415565:5424714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT033555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_198616 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 85B (Ccdc85b), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000179549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5456789:5457397:-1 gene:ENSMUSG00000095098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// BC058411 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 85B, mRNA (cDNA clone MGC:67311 IMAGE:5710206), complete cds. // chr19 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NM_001243307 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 85B (Ccdc85b), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// GENSCAN00000011881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5456789:5457397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0
NM_009985 // RefSeq // Mus musculus cathepsin W (Ctsw), mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000025844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5465240:5468498:-1 gene:ENSMUSG00000024910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AF014941 // GenBank // Mus musculus lymphopain mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006531660 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cathepsin W (Ctsw), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// XR_388249 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cathepsin W (Ctsw), transcript variant X3, misc_RNA. // chr19 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// GENSCAN00000011839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5465341:5468483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
NM_001024560 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 32 (Snx32), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531706 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexin 32 (Snx32), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_388254 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexin 32 (Snx32), transcript variant X3, misc_RNA. // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000070172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5495278:5510489:-1 gene:ENSMUSG00000056185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK037118 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930118N08 product:cofilin 1, non-muscle, full insert sequence. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK143441 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E530004D05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048922 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 32, mRNA (cDNA clone MGC:56901 IMAGE:6311864), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_388255 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexin 32 (Snx32), transcript variant X4, misc_RNA. // chr19 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5495595:5503727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_023781 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700020D05 gene (1700020D05Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF319980 // GenBank // Mus musculus mage-g2 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC049585 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700020D05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58208 IMAGE:6772543), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5502767:5503787:-1 gene:ENSMUSG00000100937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5495595:5503727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_019935 // RefSeq // Mus musculus OVO homolog-like 1 (Drosophila) (Ovol1), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531675 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus OVO homolog-like 1 (Drosophila) (Ovol1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000025861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5549137:5560575:-1 gene:ENSMUSG00000024922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF134804 // GenBank // Mus musculus clone skin16 putative zinc finger transcription factor OVO1 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AF134805 // GenBank // Mus musculus clone skin4 putative zinc finger transcription factor OVO1 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC021411 // GenBank // Mus musculus OVO homolog-like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:29182 IMAGE:5006712), complete cds. // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5550958:5564385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_144868 // RefSeq // Mus musculus pecanex-like 3 (Drosophila) (Pcnxl3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000068169 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5664640:5688149:-1 gene:ENSMUSG00000054874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000113615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:5664635:5688908:-1 gene:ENSMUSG00000054874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000145270 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:5673292:5684669:-1 gene:ENSMUSG00000054874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000146638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5664638:5673947:-1 gene:ENSMUSG00000054874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// AF237953 // GenBank // Mus musculus pecanex-like 3 (Pcnxl3) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AK220471 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4073 protein. // chr19 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000135119 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5683741:5688695:-1 gene:ENSMUSG00000054874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// AK171516 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730225G04 product:pecanex-like 3 (Drosophila), full insert sequence. // chr19 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000011838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5651416:5688149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000160852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5728088:5731713:-1 gene:ENSMUSG00000079478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_020491 // RefSeq // Mus musculus Sjogrens syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog (human) (Sssca1), mRNA. // chr19 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// ENSMUST00000025885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:5730303:5731721:-1 gene:ENSMUSG00000079478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// ENSMUST00000159693 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:5730307:5731732:-1 gene:ENSMUSG00000079478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// ENSMUST00000160141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5730307:5731660:-1 gene:ENSMUSG00000079478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// AB012865 // GenBank // Mus musculus mRNA for C184S protein, complete cds. // chr19 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// BC021593 // GenBank // Mus musculus Sjogrens syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:35891 IMAGE:5102521), complete cds. // chr19 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// ENSMUST00000162976 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:5730411:5731475:-1 gene:ENSMUSG00000079478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// AB012727 // GenBank // Mus musculus C184L-22 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5730369:5731694:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONMMUT033584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
AK135161 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6530437L22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004169 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023912 // RefSeq // Mus musculus SCY1-like 1 (S. cerevisiae) (Scyl1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000025890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5758427:5771401:-1 gene:ENSMUSG00000024941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF276514 // GenBank // Mus musculus 105-kDa kinase-like protein mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// AK144134 // GenBank HTC // Mus musculus Leydig cells CRL-2065 MLTC-1 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430032F05 product:SCY1-like 1 (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC034519 // GenBank // Mus musculus SCY1-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:18927 IMAGE:3672524), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// HM856325 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 SCY1-like 1 splice variant 13 (Scyl1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// HM856326 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 SCY1-like 1 splice variant 15 (Scyl1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000011852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5758572:5785457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_026169 // RefSeq // Mus musculus FERM domain containing 8 (Frmd8), mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000025728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:5849702:5875274:-1 gene:ENSMUSG00000024816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000145026 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5865184:5873430:-1 gene:ENSMUSG00000024816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 92 // 33 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000155227 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:5865270:5875239:-1 gene:ENSMUSG00000024816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// BC004765 // GenBank // Mus musculus FERM domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:7037 IMAGE:3156148), complete cds. // chr19 // 94 // 86 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5852621:5874794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_198634 // RefSeq // Mus musculus tigger transposable element derived 3 (Tigd3), mRNA. // chr19 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000055911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5891139:5894107:-1 gene:ENSMUSG00000044390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC053500 // GenBank // Mus musculus tigger transposable element derived 3, mRNA (cDNA clone MGC:60957 IMAGE:30007514), complete cds. // chr19 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// BC055784 // GenBank // Mus musculus tigger transposable element derived 3, mRNA (cDNA clone MGC:67569 IMAGE:6404652), complete cds. // chr19 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5887682:5912772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
NM_026772 // RefSeq // Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 2 (Cdc42ep2), mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000055458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5917556:5924816:-1 gene:ENSMUSG00000045664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC034884 // GenBank // Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 2, mRNA (cDNA clone MGC:41323 IMAGE:5257253), complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5918031:5918675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
NM_198650 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 20 (Slc22a20), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000041827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:5970234:5986143:-1 gene:ENSMUSG00000037451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY194118 // GenBank // Mus musculus OAT1-like organic anion transporter mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC046588 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 20, mRNA (cDNA clone MGC:54868 IMAGE:6309674), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006531785 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 20 (Slc22a20), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AK053009 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930013K24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000024633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5947704:6029597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001110504 // RefSeq // Mus musculus calpain 1 (Capn1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_007600 // RefSeq // Mus musculus calpain 1 (Capn1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000025891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5988546:6015247:-1 gene:ENSMUSG00000024942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000164843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:5988546:6015825:-1 gene:ENSMUSG00000024942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AF021847 // GenBank // Mus musculus micromolar calcium activated neutral protease large subunit (Canp1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AF084459 // GenBank // Mus musculus calpain I large subunit (Capn1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC026138 // GenBank // Mus musculus calpain 1, mRNA (cDNA clone MGC:13886 IMAGE:4218148), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC050276 // GenBank // Mus musculus calpain 1, mRNA (cDNA clone MGC:31745 IMAGE:4923347), complete cds. // chr19 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000024633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:5947704:6029597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1
NM_026246 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L49 (Mrpl49), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000007482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6053630:6057751:-1 gene:ENSMUSG00000007338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028956 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L49, mRNA (cDNA clone MGC:35661 IMAGE:5368499), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6054836:6057736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_133678 // RefSeq // Mus musculus SAC3 domain containing 1 (Sac3d1), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000113533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6116004:6118586:-1 gene:ENSMUSG00000024790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC144812 // GenBank // Mus musculus SAC3 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:178368 IMAGE:9053360), complete cds. // chr19 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// BC145789 // GenBank // Mus musculus SAC3 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:175676 IMAGE:40131092), complete cds. // chr19 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// AJ131957 // GenBank // Mus musculus mRNA for SHD-1 protein. // chr19 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// GENSCAN00000024650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6116094:6118586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_019722 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 2 (Arl2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6134383:6141406:-1 gene:ENSMUSG00000024944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000134821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6134374:6141140:-1 gene:ENSMUSG00000024944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF143680 // GenBank // Mus musculus arf-like protein 2 (ARL2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC060259 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:69604 IMAGE:5709669), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000123193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6137470:6138160:-1 gene:ENSMUSG00000024944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000024659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6134667:6141101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT033671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_198168 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, beta (Ppp2r5b), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6227765:6235872:-1 gene:ENSMUSG00000024777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC026670 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B (B56), beta isoform, mRNA (cDNA clone IMAGE:5007577), partial cds. // chr19 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC058977 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B (B56), beta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:67305 IMAGE:5687054), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6228384:6236392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_009203 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion/cation transporter), member 12 (Slc22a12), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000113451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6535845:6543019:-1 gene:ENSMUSG00000061742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000129698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6536065:6541549:-1 gene:ENSMUSG00000061742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// AB005451 // GenBank // Mus musculus mRNA for RST, complete cds. // chr19 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// AK142580 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630047K05 product:solute carrier family 22 (organic anion/cation transporter), member 12, full insert sequence. // chr19 // 96 // 69 // 23 // 24 // 0 /// BC035927 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion/cation transporter), member 12, mRNA (cDNA clone MGC:18370 IMAGE:4242354), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// ENSMUST00000126142 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:6537737:6542711:-1 gene:ENSMUSG00000061742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// GENSCAN00000024626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6536129:6542752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000137184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6530789:6531788:-1 gene:ENSMUSG00000052188 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr19 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000149574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6530711:6532011:-1 gene:ENSMUSG00000052188 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK045662 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230219I01 product:neurexin II, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT033713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT033714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// NONMMUT033715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT033716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_019924 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein S6 kinase, polypeptide 4 (Rps6ka4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000025903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6829085:6840601:-1 gene:ENSMUSG00000024952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000170516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6829085:6840601:-1 gene:ENSMUSG00000024952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF074714 // GenBank // Mus musculus mitogen- and stress-activated protein kinase-2 (mMSK2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC012964 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein S6 kinase, polypeptide 4, mRNA (cDNA clone MGC:13790 IMAGE:4160873), complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6814436:6858139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_001081291 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 88B (Ccdc88b), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006527465 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 88B (Ccdc88b), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000113440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6844623:6858211:-1 gene:ENSMUSG00000047810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC151001 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 88B, mRNA (cDNA clone MGC:183914 IMAGE:9087914), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC151009 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 88B, mRNA (cDNA clone MGC:183922 IMAGE:9087922), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC157946 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 88B, mRNA (cDNA clone MGC:189935 IMAGE:9088122), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6814436:6858139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001039494 // RefSeq // Mus musculus testis expressed 40 (Tex40), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6922426:6925380:-1 gene:ENSMUSG00000050623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048452 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019N12 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6774066), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC061075 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019N12 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6742738), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC172038 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054324. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC172041 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054327. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6922551:6932891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK132184 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3322402C04 product:potassium channel, subfamily K, member 4, full insert sequence. // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_008431 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 4 (Kcnk4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526716 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 4 (Kcnk4), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006526717 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 4 (Kcnk4), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006526718 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 4 (Kcnk4), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6925710:6934515:-1 gene:ENSMUSG00000024957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF056492 // GenBank // Mus musculus TRAAK K+ channel subunit mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC119784 // GenBank // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:144821 IMAGE:40106379), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6922551:6932891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001290349 // RefSeq // Mus musculus phospholipase C, beta 3 (Plcb3), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_008874 // RefSeq // Mus musculus phospholipase C, beta 3 (Plcb3), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006526766 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase C, beta 3 (Plcb3), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6953714:6969759:-1 gene:ENSMUSG00000024960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK220180 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4098 protein. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC035928 // GenBank // Mus musculus phospholipase C, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:18404 IMAGE:4235343), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// U43144 // GenBank // Mus musculus phospholipase C beta3 mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// AK047029 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930012F06 product:phospholipase C, beta 3, full insert sequence. // chr19 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000030721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6954096:6970881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001166368 // RefSeq // Mus musculus FK506 binding protein 2 (Fkbp2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_008020 // RefSeq // Mus musculus FK506 binding protein 2 (Fkbp2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526673 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FK506 binding protein 2 (Fkbp2), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526675 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FK506 binding protein 2 (Fkbp2), transcript variant X5, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6977741:6980440:-1 gene:ENSMUSG00000056629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6977741:6980461:-1 gene:ENSMUSG00000056629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC031824 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:18470 IMAGE:4196363), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC053692 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:62645 IMAGE:6395841), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6977873:6979865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001185164 // RefSeq // Mus musculus vascular endothelial growth factor B (Vegfb), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_011697 // RefSeq // Mus musculus vascular endothelial growth factor B (Vegfb), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6982473:6987651:-1 gene:ENSMUSG00000024962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000130048 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6982473:6987629:-1 gene:ENSMUSG00000024962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC046303 // GenBank // Mus musculus vascular endothelial growth factor B, mRNA (cDNA clone MGC:54627 IMAGE:6492277), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// U43836 // GenBank // Mus musculus VEGF-related factor mvrf186 precursor mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U43837 // GenBank // Mus musculus VEGF-related factor mvrf167 precursor mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// U48800 // GenBank // Mus musculus vascular endothelial growth factor B precursor (VEGF-B) mRNA, complete cds. // chr19 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// U52820 // GenBank // Mus musculus vascular endothelial growth factor B 186 (VEGF-B) precursor, mRNA, complete cds. // chr19 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6985383:6995718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_020566 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 4 (Dnajc4), mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527237 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 4 (Dnajc4), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 4 (Dnajc4), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000025915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6987911:6992503:-1 gene:ENSMUSG00000024963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000179118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6987911:6992272:-1 gene:ENSMUSG00000024963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AF036875 // GenBank // Mus musculus multiple endocrine neoplasia type 1 candidate protein number 18 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BC049281 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:54531 IMAGE:4989485), complete cds. // chr19 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// AK164466 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230048B13 product:DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 4, full insert sequence. // chr19 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000030720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6985383:6995718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1
NM_026675 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 22 (Nudt22), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006527315 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 22 (Nudt22), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000041686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:6993018:6996037:-1 gene:ENSMUSG00000037349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6993019:6994884:-1 gene:ENSMUSG00000037349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000180765 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:6993018:6996117:-1 gene:ENSMUSG00000037349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC019768 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 22, mRNA (cDNA clone MGC:30295 IMAGE:5124658), complete cds. // chr19 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6985383:6995718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
BC025119 // GenBank // Mus musculus fermitin family homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:36836 IMAGE:4190760), complete cds. // chr19 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC032204 // GenBank // Mus musculus fermitin family homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:38286 IMAGE:5342463), complete cds. // chr19 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC066803 // GenBank // Mus musculus fermitin family homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:76489 IMAGE:30043017), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NM_153795 // RefSeq // Mus musculus fermitin family homolog 3 (Drosophila) (Fermt3), mRNA. // chr19 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// ENSMUST00000040772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:6998958:7019469:-1 gene:ENSMUSG00000024965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// GENSCAN00000030725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:6999341:7018825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
NM_016737 // RefSeq // Mus musculus stress-induced phosphoprotein 1 (Stip1), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:7020696:7040026:-1 gene:ENSMUSG00000024966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC003794 // GenBank // Mus musculus stress-induced phosphoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:6035 IMAGE:3590457), complete cds. // chr19 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// U27830 // GenBank // Mus musculus mSTI1 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK134171 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830466A11 product:stress-induced phosphoprotein 1, full insert sequence. // chr19 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7021099:7039747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_201411 // RefSeq // Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 1 (Flrt1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006527169 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 1 (Flrt1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006527171 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 1 (Flrt1), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000113383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:7092014:7105729:-1 gene:ENSMUSG00000047787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY495668 // GenBank // Mus musculus strain C57BL fibronectin leucine rich transmembrane protein 1 (Flrt1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC070403 // GenBank // Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:99411 IMAGE:5696478), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC111879 // GenBank // Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:132829 IMAGE:40059728), complete cds. // chr19 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC112383 // GenBank // Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:132828 IMAGE:40059727), complete cds. // chr19 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC138214 // GenBank // Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:169838 IMAGE:8861233), complete cds. // chr19 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7095156:7097180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_134150 // RefSeq // Mus musculus OTU domain, ubiquitin aldehyde binding 1 (Otub1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:7198202:7206316:-1 gene:ENSMUSG00000024767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123594 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:7198210:7206234:-1 gene:ENSMUSG00000024767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000142085 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:7199711:7205775:-1 gene:ENSMUSG00000024767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// BC022575 // GenBank // Mus musculus OTU domain, ubiquitin aldehyde binding 1, mRNA (cDNA clone MGC:31052 IMAGE:5005025), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:7199741:7204419:-1 gene:ENSMUSG00000024767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// ENSMUST00000127241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:7199540:7200464:-1 gene:ENSMUSG00000024767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000030711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7199042:7217512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT033736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_007750 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIIa (Cox8a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000039758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:7215158:7217616:-1 gene:ENSMUSG00000035885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC120708 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit VIIIa, mRNA (cDNA clone MGC:155945 IMAGE:40129631), complete cds. // chr19 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// BC120710 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit VIIIa, mRNA (cDNA clone MGC:155947 IMAGE:40129633), complete cds. // chr19 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// U37721 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIII precursor (Cox8l) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NM_027643 // RefSeq // Mus musculus N(alpha)-acetyltransferase 40, NatD catalytic subunit, homolog (S. cerevisiae) (Naa40), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:7225668:7241222:-1 gene:ENSMUSG00000024764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK162625 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830116K03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC020020 // GenBank // Mus musculus N-acetyltransferase 11, mRNA (cDNA clone MGC:29013 IMAGE:3156924), complete cds. // chr19 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC058212 // GenBank // Mus musculus N-acetyltransferase 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:5366039), complete cds. // chr19 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7227950:7237337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_001080388 // RefSeq // Mus musculus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 2 (Mark2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001080389 // RefSeq // Mus musculus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 2 (Mark2), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001080390 // RefSeq // Mus musculus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 2 (Mark2), transcript variant 4, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_007928 // RefSeq // Mus musculus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 2 (Mark2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:7275396:7341819:-1 gene:ENSMUSG00000024969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033139 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI846148 (AI846148), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001167831 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI846148 (AI846148), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// XM_006527314 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus expressed sequence AI846148 (AI846148), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:7356464:7383026:-1 gene:ENSMUSG00000024970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC125249 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI846148, mRNA (cDNA clone MGC:132815 IMAGE:40059530), complete cds. // chr19 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7354715:7382801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_019516 // RefSeq // Mus musculus lectin, galactose binding, soluble 12 (Lgals12), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527220 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lectin, galactose binding, soluble 12 (Lgals12), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006527221 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lectin, galactose binding, soluble 12 (Lgals12), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000079902 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:7596714:7607103:-1 gene:ENSMUSG00000024972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000099729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:7596661:7607178:-1 gene:ENSMUSG00000024972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:7596660:7607193:-1 gene:ENSMUSG00000024972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF223223 // GenBank // Mus musculus galectin-12 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF244978 // GenBank // Mus musculus galectin-12 mRNA, variant a, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// AF244979 // GenBank // Mus musculus galectin-12 mRNA, variant b, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC030890 // GenBank // Mus musculus lectin, galactose binding, soluble 12, mRNA (cDNA clone MGC:31479 IMAGE:4485119), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7598025:7606730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0
NM_144785 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 19 (Slc22a19), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:7673061:7711310:-1 gene:ENSMUSG00000024757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000138317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:7682277:7711279:-1 gene:ENSMUSG00000024757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AF529221 // GenBank // Mus musculus putative organic anion transporter 5 mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AK052752 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630043A20 product:solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 19, full insert sequence. // chr19 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC021384 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:29260 IMAGE:5064542), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7674189:7711193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0
NM_146232 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 26 (Slc22a26), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000065634 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:7781980:7802667:-1 gene:ENSMUSG00000053303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000120522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:7781041:7802578:-1 gene:ENSMUSG00000053303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// AJ132857 // GenBank // Mus musculus mRNA for putative integral membrane transport protein. // chr19 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// BC014805 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC014805, mRNA (cDNA clone MGC:25980 IMAGE:4242162), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:7727182:7926579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NM_134256 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22, member 27 (Slc22a27), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000075619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:7864388:7966027:-1 gene:ENSMUSG00000067656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000182102 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:7864388:7966000:-1 gene:ENSMUSG00000067656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AB056442 // GenBank // Mus musculus OAT6RP mRNA for mOAT6-related protein, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AB056443 // GenBank // Mus musculus mOAT6 mRNA for organic anion transporter 6, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000102182 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:7959530:7959638:-1 gene:ENSMUSG00000076136 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT033765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_172776 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22. member 29 (Slc22a29), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000113298 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:8160165:8218899:-1 gene:ENSMUSG00000075044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000140910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:8160304:8218900:-1 gene:ENSMUSG00000075044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000149182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:8160474:8218839:-1 gene:ENSMUSG00000075044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// AF536195 // GenBank // Mus musculus putative organic anion transporter 6b mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr19 // 94 // 89 // 16 // 17 // 0 /// AF536196 // GenBank // Mus musculus putative organic anion transporter 6c mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC126952 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D630002G06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143567 IMAGE:40090863), complete cds. // chr19 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
NM_177002 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22, member 30 (Slc22a30), mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000064507 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:8335374:8405060:-1 gene:ENSMUSG00000052562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000096269 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:8335371:8405111:-1 gene:ENSMUSG00000052562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC050265 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C730048C13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:54808 IMAGE:5044850), complete cds. // chr19 // 83 // 67 // 5 // 6 // 0 /// AK057654 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH2000665, moderately similar to Rattus norvegicus mRNA for putative integral membrane transport protein (UST1r). // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001161413 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 3 (activators of dibasic and neutral amino acid transport), member 2 (Slc3a2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NM_008577 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 3 (activators of dibasic and neutral amino acid transport), member 2 (Slc3a2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006526731 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 3 (activators of dibasic and neutral amino acid transport), member 2 (Slc3a2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526732 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 3 (activators of dibasic and neutral amino acid transport), member 2 (Slc3a2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000010239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8706882:8713897:-1 gene:ENSMUSG00000010095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000170157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8706882:8723369:-1 gene:ENSMUSG00000010095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AB023408 // GenBank // Mus musculus mRNA for 4F2 heavy chain, complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC065173 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 3 (activators of dibasic and neutral amino acid transport), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:90093 IMAGE:6415269), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// U25708 // GenBank // Mus musculus CD98 heavy chain mRNA, complete cds. // chr19 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8707723:8713747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0
NM_026325 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 179B (Tmem179b), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_028419 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 179B (Tmem179b), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000010249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8772522:8774467:-1 gene:ENSMUSG00000003680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000079437 // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087914 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810059G22 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30311959). // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC116961 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 179B, mRNA (cDNA clone MGC:151338 IMAGE:40126280), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC116963 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 179B, mRNA (cDNA clone MGC:151340 IMAGE:40126282), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NR_028418 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 179B (Tmem179b), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr19 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8772673:8798596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT033808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_026329 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide G (Polr2g), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000096261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8793129:8798557:-1 gene:ENSMUSG00000071662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC005580 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide G, mRNA (cDNA clone MGC:11735 IMAGE:3968561), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC055278 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide G, mRNA (cDNA clone MGC:66872 IMAGE:5699685), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8772673:8798596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_010316 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 3 (Gng3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8836929:8839246:-1 gene:ENSMUSG00000071658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC029680 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 3, mRNA (cDNA clone MGC:36069 IMAGE:5365311), complete cds. // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8838143:8838652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
NM_001160356 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI462493 (AI462493), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000096253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8880016:8880933:-1 gene:ENSMUSG00000071654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY941793 // GenBank // Mus musculus putative eIF2 alpha kinase associated protein mRNA, complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC029863 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI462493, mRNA (cDNA clone MGC:36861 IMAGE:4460168), complete cds. // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8880467:8880825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NR_027866 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5730408K05 gene (5730408K05Rik), long non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093658 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:8888538:8888685:-1 gene:ENSMUSG00000070167 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT033822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT033823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_009073 // RefSeq // Mus musculus rod outer segment membrane protein 1 (Rom1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000096242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:8927382:8929356:-1 gene:ENSMUSG00000071648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC014827 // GenBank // Mus musculus rod outer segment membrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:25373 IMAGE:4527997), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:8927669:8929173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
AK133601 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330413D18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011681 // RefSeq // Mus musculus secretoglobin, family 1A, member 1 (uteroglobin) (Scgb1a1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025554 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:9083636:9087958:-1 gene:ENSMUSG00000024653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027518 // GenBank // Mus musculus secretoglobin, family 1A, member 1 (uteroglobin), mRNA (cDNA clone MGC:41130 IMAGE:1434396), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L04503 // GenBank // Mus musculus uteroglogin mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X67702 // GenBank // M.musculus mRNA for clara cell 10kD (CC10) protein. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025610 // RefSeq // Mus musculus asparaginase like 1 (Asrgl1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000049948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:9109868:9135636:-1 gene:ENSMUSG00000024654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK010381 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410004D18 product:ASPARAGINASE-LIKE SPERM AUTOANTIGEN homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr19 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC016106 // GenBank // Mus musculus asparaginase like 1, mRNA (cDNA clone MGC:27691 IMAGE:4921265), complete cds. // chr19 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:9073862:9184116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
ENSMUST00000142025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:9135157:9279175:1 gene:ENSMUSG00000024658 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000023130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:9273804:9284164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// AK048878 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230078J11 product:weakly similar to prostatic steroid-binding protein chain C1 precursor [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr19 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONMMUT033849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_016692 // RefSeq // Mus musculus inner centromere protein (Incenp), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006526707 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inner centromere protein (Incenp), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006526709 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inner centromere protein (Incenp), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000025562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:9872297:9899533:-1 gene:ENSMUSG00000024660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB100432 // GenBank // Mus musculus INCENP mRNA for inner centromere protein-A, complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AB100433 // GenBank // Mus musculus INCENP mRNA for inner centromere protein-B, complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AF117610 // GenBank // Mus musculus inner centromere protein INCENP (Incenp) mRNA, complete cds. // chr19 // 86 // 100 // 31 // 36 // 0 /// BC052414 // GenBank // Mus musculus inner centromere protein, mRNA (cDNA clone MGC:64694 IMAGE:6401188), complete cds. // chr19 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:9872677:9899459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_011913 // RefSeq // Mus musculus bestrophin 1 (Best1), mRNA. // chr19 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000117346 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:9985174:10001633:-1 gene:ENSMUSG00000037418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AY450427 // GenBank // Mus musculus vitelliform macular dystrophy 2 (Vmd2) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// BC139060 // GenBank // Mus musculus bestrophin 1, mRNA (cDNA clone MGC:170687 IMAGE:8862082), complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC139061 // GenBank // Mus musculus bestrophin 1, mRNA (cDNA clone MGC:170688 IMAGE:8862083), complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:9985386:9997532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_019699 // RefSeq // Mus musculus fatty acid desaturase 2 (Fads2), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000025567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10064164:10101503:-1 gene:ENSMUSG00000024665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// AF126798 // GenBank // Mus musculus delta-6 fatty acid desaturase mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// BC057189 // GenBank // Mus musculus fatty acid desaturase 2, mRNA (cDNA clone MGC:68002 IMAGE:5137343), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// AK031337 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030408J16 product:fatty acid desaturase 2, full insert sequence. // chr19 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// GENSCAN00000056648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10064263:10118210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0
NM_001271614 // RefSeq // Mus musculus flap structure specific endonuclease 1 (Fen1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001271615 // RefSeq // Mus musculus flap structure specific endonuclease 1 (Fen1), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_007999 // RefSeq // Mus musculus flap structure specific endonuclease 1 (Fen1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:10199138:10204068:-1 gene:ENSMUSG00000024742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000116542 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10199138:10203943:-1 gene:ENSMUSG00000024742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000142241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10199142:10203894:-1 gene:ENSMUSG00000024742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10199132:10204169:-1 gene:ENSMUSG00000024742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010203 // GenBank // Mus musculus flap structure specific endonuclease 1, mRNA (cDNA clone MGC:7137 IMAGE:3158176), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027295 // GenBank // Mus musculus flap structure specific endonuclease 1, mRNA (cDNA clone MGC:28169 IMAGE:3985840), complete cds. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// L26320 // GenBank // Mouse flap endonuclease-1 (FEN-1) mRNA, complete cds. // chr19 // 76 // 84 // 16 // 21 // 0
NM_001033481 // RefSeq // Mus musculus myelin regulatory factor (Myrf), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526933 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myelin regulatory factor (Myrf), transcript variant X7, mRNA. // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000088013 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10208272:10240748:-1 gene:ENSMUSG00000036098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK141695 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030026I12 product:Bests macular dystrophy related protein (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC157942 // GenBank // Mus musculus gene model 98, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:189777 IMAGE:9007277), complete cds. // chr19 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// ENSMUST00000186056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10209704:10240745:-1 gene:ENSMUSG00000036098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000186854 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:10210300:10217528:-1 gene:ENSMUSG00000036098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000189897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:10210385:10240604:-1 gene:ENSMUSG00000036098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000190922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10209305:10240748:-1 gene:ENSMUSG00000036098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10210385:10230381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_198114 // RefSeq // Mus musculus diacylglycerol lipase, alpha (Dagla), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000039327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:10245265:10304877:-1 gene:ENSMUSG00000035735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000125567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10245268:10304857:-1 gene:ENSMUSG00000035735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSMUST00000156361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10253330:10256871:-1 gene:ENSMUSG00000035735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AY275376 // GenBank // Mus musculus neural stem cell-derived dendrite regulator (Nsddr) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// BC148308 // GenBank // Mus musculus diacylglycerol lipase, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:171133 IMAGE:40061146), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000056637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10247664:10271588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONMMUT033875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0
NM_001111140 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 10B (Lrrc10b), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10455371:10457447:-1 gene:ENSMUSG00000090291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10456437:10457315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_133689 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 32 (Ppp1r32), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006527299 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 32 (Ppp1r32), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10474257:10482897:-1 gene:ENSMUSG00000035179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY032666 // GenBank // Mus musculus IIIG9 long form mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC118523 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930579J09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144717 IMAGE:40105249), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10472385:10483521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0
BC038924 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610038F07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5373931), complete cds. // chr19 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC048913 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610038F07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5366046), complete cds. // chr19 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// BC060090 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610038F07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:61338 IMAGE:5698361), complete cds. // chr19 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// BC085277 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610038F07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:103055 IMAGE:30441476), complete cds. // chr19 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NM_025333 // RefSeq // Mus musculus succinate dehydrogenase complex assembly factor 2 (Sdhaf2), mRNA. // chr19 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// ENSMUST00000025570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10500513:10525209:-1 gene:ENSMUSG00000024668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1
NM_028411 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 138 (Tmem138), mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10570478:10577362:-1 gene:ENSMUSG00000024666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC058237 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 138, mRNA (cDNA clone MGC:68068 IMAGE:6307765), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC107026 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 138, mRNA (cDNA clone MGC:129472 IMAGE:40050148), complete cds. // chr19 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC132574 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 138, mRNA (cDNA clone MGC:164205 IMAGE:40130851), complete cds. // chr19 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// BC132578 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 138, mRNA (cDNA clone MGC:164209 IMAGE:40130855), complete cds. // chr19 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// XM_006527375 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 138 (Tmem138), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// AK007197 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700113I01 product:RIKEN cDNA 1700113I01 gene, full insert sequence. // chr19 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// GENSCAN00000056646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10551760:10575367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1
NM_145496 // RefSeq // Mus musculus dihydroxyacetone kinase 2 homolog (yeast) (Dak), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006526941 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dihydroxyacetone kinase 2 homolog (yeast) (Dak), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000037678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10592200:10604258:-1 gene:ENSMUSG00000034371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK138956 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530029H04 product:weakly similar to Dihydroxyacetone kinase [Thermoanaerobacter tengcongensis], full insert sequence. // chr19 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC021917 // GenBank // Mus musculus dihydroxyacetone kinase 2 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:28742 IMAGE:4481611), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK171418 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730212C20 product:weakly similar to Dihydroxyacetone kinase [Thermoanaerobacter tengcongensis], full insert sequence. // chr19 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// GENSCAN00000056627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10592628:10604170:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0
NM_021453 // RefSeq // Mus musculus pepsinogen 5, group I (Pga5), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000025647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10668957:10678071:-1 gene:ENSMUSG00000024738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF240776 // GenBank // Mus musculus pepsinogen F (Pepf) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC119523 // GenBank // Mus musculus pepsinogen 5, group I, mRNA (cDNA clone MGC:141182 IMAGE:40056066), complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10666616:10677971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0
NM_007650 // RefSeq // Mus musculus CD5 antigen (Cd5), mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006526621 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD5 antigen (Cd5), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000025571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:10718143:10738974:-1 gene:ENSMUSG00000024669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC011258 // GenBank // Mus musculus CD5 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:18786 IMAGE:4188683), complete cds. // chr19 // 89 // 95 // 32 // 36 // 0 /// M15177 // GenBank // Mouse lymphocyte differentiation antigen Ly-1 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// U65961 // GenBank // Mus musculus CD5.1 mRNA, complete cds. // chr19 // 87 // 79 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10717422:10726594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0
AK155789 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730221H19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133804 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 132A (Tmem132a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006527503 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 132A (Tmem132a), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000025645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:10857822:10869940:-1 gene:ENSMUSG00000024736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000120524 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:10857834:10869778:-1 gene:ENSMUSG00000024736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC006896 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 132A, mRNA (cDNA clone MGC:11927 IMAGE:3599652), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000056632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10858108:10874478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_009580 // RefSeq // Mus musculus zona pellucida glycoprotein 1 (Zp1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000025641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:10914289:10920632:-1 gene:ENSMUSG00000024734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000168708 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:10914287:10916298:-1 gene:ENSMUSG00000024734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// BC100347 // GenBank // Mus musculus zona pellucida glycoprotein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30934268). // chr19 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC125613 // GenBank // Mus musculus zona pellucida glycoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:159316 IMAGE:40130128), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC125615 // GenBank // Mus musculus zona pellucida glycoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:159318 IMAGE:40130130), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U20448 // GenBank // Mus musculus ZP1 precursor (Zp-1) mRNA, complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000017148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10914323:10920575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_023731 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 86 (Ccdc86), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025639 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:10941481:10949266:-1 gene:ENSMUSG00000024732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000133836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:10941481:10947332:-1 gene:ENSMUSG00000024732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AK078455 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720480F16 product:BRAIN CDNA, CLONE MNCB-4327 (FRAGMENT) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC043326 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 86, mRNA (cDNA clone MGC:49413 IMAGE:5374087), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// DQ501252 // GenBank // Mus musculus cyclon mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AK016771 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933411H20 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10943170:10993188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001034898 // RefSeq // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 15 (Ms4a15), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000087923 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:10978307:10993250:-1 gene:ENSMUSG00000067571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147202 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 15, mRNA (cDNA clone MGC:182356 IMAGE:9056250), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC172010 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 15, mRNA (cDNA clone MGC:198715 IMAGE:9054296), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10943170:10993188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
NR_102366 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AW112010 (AW112010), long non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:19:11047617:11050566:-1 gene:ENSMUSG00000075010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EF660528 // GenBank // Mus musculus small secreted protein interferon-induced mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT033918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 62 // 52 // 8 // 13 // 0 /// GENSCAN00000017161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10997291:11092077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_022430 // RefSeq // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 8A (Ms4a8a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11067471:11081102:-1 gene:ENSMUSG00000024730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF237906 // GenBank // Mus musculus strain FVB/N MS4A8B protein mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AY039038 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2J MS4a8B protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC042719 // GenBank // Mus musculus, membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 8A, clone IMAGE:4207474, mRNA, partial cds. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AB026044 // GenBank // Mus musculus mRNA for MS4A8, complete cds. // chr19 // 58 // 93 // 15 // 26 // 0 /// AK172700 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830301O14 product:membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 8A, full insert sequence. // chr19 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:10997291:11092077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// ENSMUST00000187859 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11075571:11081102:-1 gene:ENSMUSG00000024730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_027058 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700017D01 gene (1700017D01Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527324 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700017D01 gene (1700017D01Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000025635 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11096816:11130876:-1 gene:ENSMUSG00000024729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11096937:11116466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
ENSMUST00000078770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11139664:11165320:-1 gene:ENSMUSG00000024728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180678 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:11139664:11165306:-1 gene:ENSMUSG00000024728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181284 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:11139664:11159178:-1 gene:ENSMUSG00000024728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000181567 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:11139664:11165306:-1 gene:ENSMUSG00000024728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC048529 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700025F22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58442 IMAGE:6774736), complete cds. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC061241 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700025F22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:74394 IMAGE:6743876), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198224 // RefSeq // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 13 (Ms4a13), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000073380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11169418:11196723:-1 gene:ENSMUSG00000057240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF544402 // GenBank // Mus musculus testis-expressed transmembrane-4 protein Tetm4.2 (Ms4a13) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC089483 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 13, mRNA (cDNA clone MGC:107131 IMAGE:6772390), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000188464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11169419:11196737:-1 gene:ENSMUSG00000057240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
XM_006527505 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 12 (Ms4a12), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527508 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 12 (Ms4a12), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000186228 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:11215010:11230540:-1 gene:ENSMUSG00000101031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11175450:11230540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_007641 // RefSeq // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 1 (Ms4a1), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000169159 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11249675:11266241:-1 gene:ENSMUSG00000024673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK166571 // GenBank HTC // Mus musculus 1 cell embryo 1 cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I0C0030E07 product:membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 1, full insert sequence. // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC028322 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:36191 IMAGE:4503841), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// CT010253 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836E0251D for gene Ms4a1, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr19 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// M62541 // GenBank // Mouse CD20 cell surface protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK143824 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430201D22 product:membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 1, full insert sequence. // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// ENSMUST00000185851 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11250877:11254684:-1 gene:ENSMUSG00000024673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11251665:11283793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// ENSMUST00000187379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11253990:11266145:-1 gene:ENSMUSG00000024673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_006527509 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 14 (Ms4a14), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000187467 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:11301249:11314454:-1 gene:ENSMUSG00000099398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11301494:11333353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_026835 // RefSeq // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6D (Ms4a6d), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11586604:11604849:-1 gene:ENSMUSG00000024679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000125291 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:11586987:11593155:-1 gene:ENSMUSG00000024679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000135351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11587964:11593015:-1 gene:ENSMUSG00000024679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000155669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11586980:11593373:-1 gene:ENSMUSG00000024679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AF237911 // GenBank // Mus musculus MS4A6D protein mRNA, complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AY039037 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2J MS4a6D protein mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC018331 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6D, mRNA (cDNA clone MGC:25712 IMAGE:3964037), complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC029738 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6D, mRNA (cDNA clone MGC:25778 IMAGE:4016611), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AB026047 // GenBank // Mus musculus mRNA for MS4A11, complete cds. // chr19 // 40 // 96 // 10 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11589697:11603355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_133246 // RefSeq // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 3 (Ms4a3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11629499:11640834:-1 gene:ENSMUSG00000024681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF280401 // GenBank // Mus musculus MS4a3 mRNA, partial cds. // chr19 // 88 // 63 // 15 // 17 // 0 /// AF321128 // GenBank // Mus musculus hematopoietic-specific transmembrane-4 protein (Htm4) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AY184359 // GenBank // Mus musculus HTm4 mRNA, complete cds. // chr19 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// BC117013 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:151390 IMAGE:40126332), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC117015 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:151392 IMAGE:40126334), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC144853 // GenBank // Mus musculus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:178409 IMAGE:9053401), complete cds. // chr19 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000186023 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11629496:11640805:-1 gene:ENSMUSG00000024681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000190642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11631902:11640851:-1 gene:ENSMUSG00000024681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11617473:11691017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001037634 // RefSeq // Mus musculus oocyte secreted protein 2 (Oosp2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006526945 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus oocyte secreted protein 2 (Oosp2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000121793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11647280:11660559:-1 gene:ENSMUSG00000055895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000135994 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:11647279:11660516:-1 gene:ENSMUSG00000055895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC099498 // GenBank // Mus musculus placenta-specific 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:117750 IMAGE:30931566), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11617473:11691017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_133353 // RefSeq // Mus musculus oocyte secreted protein 1 (Oosp1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000048214 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:11667460:11691150:-1 gene:ENSMUSG00000041857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000139158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:11667673:11691034:-1 gene:ENSMUSG00000041857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// AB050982 // GenBank // Mus musculus if3 mRNA for initiate factor 3, complete cds. // chr19 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AB086437 // GenBank // Mus musculus IF3 2 mRNA for initiate factor 3 2, complete cds. // chr19 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// AF420487 // GenBank // Mus musculus oocyte-secreted protein 1 precursor (Oosp1) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC100313 // GenBank // Mus musculus oocyte secreted protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:117530 IMAGE:30936071), complete cds. // chr19 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186557 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:11667535:11691028:-1 gene:ENSMUSG00000041857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000017152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11617473:11691017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_146936 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1417 (Olfr1417), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000061235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:11828077:11829024:-1 gene:ENSMUSG00000048292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC148189 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1417, mRNA (cDNA clone MGC:130142 IMAGE:40051854), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC153816 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1417, mRNA (cDNA clone MGC:123729 IMAGE:40043087), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11800972:11856032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 90 // 91 // 18 // 20 // 0
NM_001011524 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1418 (Olfr1418), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000079875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:11854930:11856001:-1 gene:ENSMUSG00000060556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC150977 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1418, mRNA (cDNA clone MGC:183890 IMAGE:9087890), complete cds. // chr19 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11800972:11856032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 67 // 75 // 4 // 6 // 0
GENSCAN00000017160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11868686:11874657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011775 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1419 (Olfr1419), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:11870146:11871305:-1 gene:ENSMUSG00000067545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147200 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1419, mRNA (cDNA clone MGC:182350 IMAGE:9056244), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147201 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1419, mRNA (cDNA clone MGC:182370 IMAGE:9056264), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11868686:11874657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000054711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:11877615:11878358:-1 gene:ENSMUSG00000051548 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000017155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:11877615:11878358:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_146680 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1423 (Olfr1423), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12035808:12036740:-1 gene:ENSMUSG00000067529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12016992:12036605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_146681 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1424 (Olfr1424), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000087830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12058809:12059750:-1 gene:ENSMUSG00000067528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000047807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12058809:12074564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
NM_001011853 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1425 (Olfr1425), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000087828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12073695:12074633:-1 gene:ENSMUSG00000067526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_146809 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1426 (Olfr1426), mRNA. // chr19 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// ENSMUST00000112952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12087612:12091847:-1 gene:ENSMUSG00000044994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// BC058600 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1426, mRNA (cDNA clone MGC:67787 IMAGE:6390368), complete cds. // chr19 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// NM_146681 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1424 (Olfr1424), mRNA. // chr19 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0 /// ENSMUST00000087830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12058809:12059750:-1 gene:ENSMUSG00000067528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12058809:12074564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12087855:12088724:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 62 // 84 // 16 // 26 // 0
NM_146809 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1426 (Olfr1426), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12087612:12091847:-1 gene:ENSMUSG00000044994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058600 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1426, mRNA (cDNA clone MGC:67787 IMAGE:6390368), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146679 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1427 (Olfr1427), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12098702:12099639:-1 gene:ENSMUSG00000067525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127962 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1427, mRNA (cDNA clone MGC:157506 IMAGE:40134881), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12098702:12099502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_146678 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1428 (Olfr1428), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12108600:12109544:-1 gene:ENSMUSG00000067524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119441 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1428, mRNA (cDNA clone MGC:140907 IMAGE:40042424), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12108600:12109544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146682 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 76 (Olfr76), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12119653:12120700:-1 gene:ENSMUSG00000067522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138072 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 76, mRNA (cDNA clone MGC:169696 IMAGE:8861091), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138073 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 76, mRNA (cDNA clone MGC:169697 IMAGE:8861092), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// Y15525 // GenBank // Mus musculus mRNA for V8 olfactory receptor protein. // chr19 // 70 // 80 // 14 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12119721:12120674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000180978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:12228624:12229538:-1 gene:ENSMUSG00000067520 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr19 // 81 // 96 // 22 // 27 // 0 /// XM_006543463 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 5A1-like (LOC102642491), partial mRNA. // chr19 // 71 // 61 // 12 // 17 // 0 /// GENSCAN00000047788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12166138:12167055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12228519:12229511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 81 // 93 // 21 // 26 // 0
XM_006543463 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 5A1-like (LOC102642491), partial mRNA. // chr19 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000180978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:12228624:12229538:-1 gene:ENSMUSG00000067520 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12166138:12167055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12228519:12229511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_146688 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 262 (Olfr262), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:12240721:12241659:-1 gene:ENSMUSG00000067519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146687 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1436 (Olfr1436), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000087812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12298183:12299130:-1 gene:ENSMUSG00000067513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC127991 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1436, mRNA (cDNA clone MGC:157562 IMAGE:40135681), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000047777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12321783:12335717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_172442 // RefSeq // Mus musculus deltex 4 homolog (Drosophila) (Dtx4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12466341:12501996:-1 gene:ENSMUSG00000039982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058647 // GenBank // Mus musculus deltex 4 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:76397 IMAGE:6405881), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12469476:12494912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000047787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12528754:12530418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_146704 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1446 (Olfr1446), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12889615:12890658:-1 gene:ENSMUSG00000057817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119061 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1446, mRNA (cDNA clone MGC:155377 IMAGE:8733810), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137821 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1446, mRNA (cDNA clone MGC:169445 IMAGE:8860840), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12888908:12901769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0
NM_146703 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1447 (Olfr1447), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12900759:12901861:-1 gene:ENSMUSG00000060303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC125359 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1447, mRNA (cDNA clone MGC:159062 IMAGE:40129874), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC132255 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1447, mRNA (cDNA clone MGC:163886 IMAGE:40130532), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_146701 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1448 (Olfr1448), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:12919363:12920307:-1 gene:ENSMUSG00000048456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:12919363:12920307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146700 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1453 (Olfr1453), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13027404:13028327:-1 gene:ENSMUSG00000094755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000087769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13078821:13079335:-1 gene:ENSMUSG00000067482 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT033981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_146575 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1457 (Olfr1457), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000075170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13094693:13095646:-1 gene:ENSMUSG00000061637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000076729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13102379:13103284:-1 gene:ENSMUSG00000062844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13102379:13103302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_146689 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1459 (Olfr1459), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000078299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13145643:13146743:-1 gene:ENSMUSG00000057503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC138407 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1459, mRNA (cDNA clone MGC:170032 IMAGE:8861427), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC138408 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1459, mRNA (cDNA clone MGC:170033 IMAGE:8861428), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000082890 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:13301001:13301107:-1 gene:ENSMUSG00000064824 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT033982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001011841 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1465 (Olfr1465), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000080142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13313360:13314283:-1 gene:ENSMUSG00000062199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_146690 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1472 (Olfr1472), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000077501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13453571:13454515:-1 gene:ENSMUSG00000095189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000010448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13453571:13463494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_146301 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1475 (Olfr1475), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000080801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13479252:13480196:-1 gene:ENSMUSG00000096708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_146741 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1497 (Olfr1497), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000061993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13794665:13795609:-1 gene:ENSMUSG00000044040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13794665:13815588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NM_146796 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1499 (Olfr1499), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13814607:13815658:-1 gene:ENSMUSG00000045395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132138 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1499, mRNA (cDNA clone MGC:163769 IMAGE:40130415), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13794665:13815588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_001011831 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1500 (Olfr1500), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13827435:13828459:-1 gene:ENSMUSG00000054526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB053162 // GenBank // Mus musculus mRNA for olfactory receptor, partial cds. // chr19 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// BC150926 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1500, mRNA (cDNA clone MGC:183837 IMAGE:9087837), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13827459:13849560:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_146633 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1501 (Olfr1501), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13838224:13839171:-1 gene:ENSMUSG00000057270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13827459:13849560:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146634 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1504 (Olfr1504), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:13887221:13888305:-1 gene:ENSMUSG00000059105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137835 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1504, mRNA (cDNA clone MGC:169459 IMAGE:8860854), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:13877672:13910236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011600 // RefSeq // Mus musculus transducin-like enhancer of split 4, homolog of Drosophila E(spl) (Tle4), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006526911 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transducin-like enhancer of split 4, homolog of Drosophila E(spl) (Tle4), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 80 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000052011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:14448072:14597983:-1 gene:ENSMUSG00000024642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000167776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:14448150:14598051:-1 gene:ENSMUSG00000024642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// AF229633 // GenBank // Mus musculus groucho-related protein 4 (Grg4) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// AK017548 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730411M05 product:TRANSDUCIN-LIKE ENHANCER PROTEIN 4 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 28 // 28 // 13 // 46 // 1 /// GENSCAN00000056730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:14449734:14635712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0
ENSMUST00000122726 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:14718358:14718480:-1 gene:ENSMUSG00000084675 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT033997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000161707 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:15905130:15909712:-1 gene:ENSMUSG00000024640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000162416 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:15915009:15947337:-1 gene:ENSMUSG00000024640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// AF259674 // GenBank // Mus musculus phosphoserine aminotransferase mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 77 // 25 // 27 // 0 /// BC005657 // GenBank // Mus musculus phosphoserine aminotransferase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3710326), complete cds. // chr19 // 83 // 34 // 10 // 12 // 0 /// NM_177420 // RefSeq // Mus musculus phosphoserine aminotransferase 1 (Psat1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1 /// ENSMUST00000025542 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:15904678:15925059:-1 gene:ENSMUSG00000024640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1 /// BC004827 // GenBank // Mus musculus phosphoserine aminotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6462 IMAGE:2616298), complete cds. // chr19 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// NM_001205339 // RefSeq // Mus musculus phosphoserine aminotransferase 1 (Psat1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// XM_006526571 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphoserine aminotransferase 1 (Psat1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// ENSMUST00000162053 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:15905127:15924622:-1 gene:ENSMUSG00000024640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// GENSCAN00000031600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:15906046:15984880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
NM_198019 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 78 (Cep78), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006526826 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centrosomal protein 78 (Cep78), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000047704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:15955774:15984989:-1 gene:ENSMUSG00000041491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK050870 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030027P05 product:weakly similar to IP63 PROTEIN [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK160295 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730599I05 product:Similar to IP63 protein, full insert sequence. // chr19 // 93 // 47 // 13 // 14 // 0 /// BC070400 // GenBank // Mus musculus centrosomal protein 78, mRNA (cDNA clone MGC:95481 IMAGE:5694341), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC071270 // GenBank // Mus musculus centrosomal protein 78, mRNA (cDNA clone IMAGE:6516987). // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:15906046:15984880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_173028 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 13A (yeast) (Vps13a), mRNA. // chr19 // 100 // 99 // 72 // 72 // 0 /// ENSMUST00000068156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:16616763:16780822:-1 gene:ENSMUSG00000046230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 99 // 72 // 72 // 0 /// AB115421 // GenBank // Mus musculus CHAC mRNA for chorein, complete cds, transcript A. // chr19 // 99 // 99 // 71 // 72 // 0 /// AK135983 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420443P19 product:Similar to chorea acanthocytosis (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 100 // 23 // 17 // 17 // 0 /// BC027255 // GenBank HTC // Mus musculus vacuolar protein sorting 13A (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:3592188), with apparent retained intron. // chr19 // 95 // 26 // 18 // 19 // 0 /// BC096768 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 13A (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:30062967). // chr19 // 100 // 29 // 21 // 21 // 0 /// BC145012 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053560. // chr19 // 100 // 99 // 72 // 72 // 0 /// AK036913 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930023P20 product:similar to CHOREIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 19 // 19 // 14 // 73 // 1 /// GENSCAN00000031581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:16610633:16768506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 58 // 58 // 0
NM_008023 // RefSeq // Mus musculus forkhead box B2 (Foxb2), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000072915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:16872316:16873830:-1 gene:ENSMUSG00000056829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC115976 // GenBank // Mus musculus forkhead box B2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40105285), complete cds. // chr19 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC139476 // GenBank // Mus musculus forkhead box B2, mRNA (cDNA clone MGC:171103 IMAGE:8862498), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC139477 // GenBank // Mus musculus forkhead box B2, mRNA (cDNA clone MGC:171104 IMAGE:8862499), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:16872354:16900124:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001136484 // RefSeq // Mus musculus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1, core 2 (Gcnt1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NM_010265 // RefSeq // Mus musculus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1, core 2 (Gcnt1), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_173442 // RefSeq // Mus musculus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1, core 2 (Gcnt1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:17326143:17339568:-1 gene:ENSMUSG00000038843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:17326141:17356667:-1 gene:ENSMUSG00000038843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// D87332 // GenBank // Mus musculus mRNA for beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, complete cds. // chr19 // 80 // 76 // 20 // 25 // 0 /// BC039126 // GenBank // Mus musculus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1, core 2, mRNA (cDNA clone MGC:11452 IMAGE:3154671), complete cds. // chr19 // 72 // 76 // 18 // 25 // 0 /// D87333 // GenBank // Mus musculus mRNA for beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, complete cds. // chr19 // 71 // 64 // 15 // 21 // 0 /// U19265 // GenBank // Mus musculus core2-GlcNAc-transferase (C2-GnT) mRNA, complete cds. // chr19 // 67 // 64 // 14 // 21 // 0
AK041805 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630039F22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
ENSMUST00000102350 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:17891959:17892051:-1 gene:ENSMUSG00000076305 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT034060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_017375 // RefSeq // Mus musculus osteoclast stimulating factor 1 (Ostf1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:18579328:18631789:-1 gene:ENSMUSG00000024725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000156908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:18580992:18631740:-1 gene:ENSMUSG00000024725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC060986 // GenBank // Mus musculus osteoclast stimulating factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:74081 IMAGE:30300544), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000138860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:18593601:18631718:-1 gene:ENSMUSG00000024725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONMMUT034063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
ENSMUST00000082849 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:20033504:20033635:-1 gene:ENSMUSG00000064783 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT034089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_010730 // RefSeq // Mus musculus annexin A1 (Anxa1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025561 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:20373428:20390944:-1 gene:ENSMUSG00000024659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164587 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:20379659:20390651:-1 gene:ENSMUSG00000024659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC002289 // GenBank // Mus musculus annexin A1, mRNA (cDNA clone MGC:8173 IMAGE:3590168), complete cds. // chr19 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC004594 // GenBank // Mus musculus annexin A1, mRNA (cDNA clone MGC:8074 IMAGE:3587973), complete cds. // chr19 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// CT009771 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A0450D for gene Anxa1, RIKEN cDNA C430014K04 gene; complete cds, incl. stopcodon. // chr19 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// CT010298 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A1252D for gene Anxa1, RIKEN cDNA C430014K04 gene; complete cds, incl. stopcodon. // chr19 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// EU684130 // GenBank // Mus musculus strain SEG/Pas annexin A1 (Anxa1) mRNA, complete cds. // chr19 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:20369006:20415563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
ENSMUST00000053717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:20586074:20586757:-1 gene:ENSMUSG00000047168 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:20586074:20586757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AK149560 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730037M02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004204 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011921 // RefSeq // Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 1, subfamily A7 (Aldh1a7), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000025656 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:20692953:20727562:-1 gene:ENSMUSG00000024747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC046315 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 1, subfamily A7, mRNA (cDNA clone MGC:54619 IMAGE:6314273), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC139412 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 1, subfamily A7, mRNA (cDNA clone MGC:171039 IMAGE:8862434), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC139413 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 1, subfamily A7, mRNA (cDNA clone MGC:171040 IMAGE:8862435), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// U96401 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase Ahd-2-like mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000006979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:20693463:20727512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0
NM_028953 // RefSeq // Mus musculus transmembrane channel-like gene family 1 (Tmc1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000039500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:20783458:20954202:-1 gene:ENSMUSG00000024749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AF417579 // GenBank // Mus musculus transmembrane channel-like protein 1 (Tmc1) mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// AK077146 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933413C08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// AK016832 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933416G09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// GENSCAN00000048823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:20826476:20938293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 43 // 43 // 19 // 44 // 1
ENSMUST00000038830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:21597312:21652976:-1 gene:ENSMUSG00000035171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000179553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:21597701:21652800:-1 gene:ENSMUSG00000035171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// BC023385 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110059E24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30990 IMAGE:5253886), complete cds. // chr19 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// AK016266 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930570K09 product:weakly similar to CDNA FLJ32509 FIS, CLONE SMINT1000054 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// ENSMUST00000179768 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:21598325:21652917:-1 gene:ENSMUSG00000035171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
AK046642 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430216N15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK087605 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230024B12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001252684 // RefSeq // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 5 (Smc5), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001252685 // RefSeq // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 5 (Smc5), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_153808 // RefSeq // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 5 (Smc5), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000087556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:23206441:23273897:-1 gene:ENSMUSG00000024943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK161254 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921536F04 product:SMC5 structural maintenance of chromosomes 5-like 1 (yeast), full insert sequence. // chr19 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC007174 // GenBank // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 5, mRNA (cDNA clone MGC:7569 IMAGE:3493165), complete cds. // chr19 // 78 // 62 // 14 // 18 // 0 /// BC038345 // GenBank // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 5, mRNA (cDNA clone MGC:30442 IMAGE:3596405), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK122321 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0594 protein. // chr19 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000023825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:23165938:23273818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_174857 // RefSeq // Mus musculus MAM domain containing 2 (Mamdc2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527345 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MAM domain containing 2 (Mamdc2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000036069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:23302609:23448322:-1 gene:ENSMUSG00000033207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC042773 // GenBank // Mus musculus MAM domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:51491 IMAGE:4019075), complete cds. // chr19 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// AK004794 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1200015L10 product:weakly similar to THYROID HORMONE-INDUCED PROTEIN B PRECURSOR [Xenopus laevis], full insert sequence. // chr19 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000023822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:23303207:23386957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
ENSMUST00000035849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:23558760:23652812:-1 gene:ENSMUSG00000033053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC049563 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700028P14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58154 IMAGE:6771302), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:23588920:23606106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001114174 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 189, member A2 (Fam189a2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_386486 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 189, member A2 (Fam189a2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000096164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:23972751:24031019:-1 gene:ENSMUSG00000071604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527157 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 189, member A2 (Fam189a2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:23973425:24030937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001198985 // RefSeq // Mus musculus tight junction protein 2 (Tjp2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_011597 // RefSeq // Mus musculus tight junction protein 2 (Tjp2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006526904 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tight junction protein 2 (Tjp2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006526905 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tight junction protein 2 (Tjp2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006526906 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tight junction protein 2 (Tjp2), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000099558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:24094523:24225026:-1 gene:ENSMUSG00000024812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF113005 // GenBank // Mus musculus tight junction protein ZO-2 mRNA, complete cds. // chr19 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC034677 // GenBank // Mus musculus tight junction protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:19398 IMAGE:3155078), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC039924 // GenBank // Mus musculus tight junction protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:49069 IMAGE:3155079), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:24095425:24146890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000081333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:24261453:24280605:-1 gene:ENSMUSG00000059363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 93 // 83 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000123684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:24261501:24280568:-1 gene:ENSMUSG00000059363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC058533 // GenBank // Mus musculus frataxin, mRNA (cDNA clone IMAGE:6820110), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC125337 // GenBank // Mus musculus frataxin, mRNA (cDNA clone MGC:159040 IMAGE:40129852), complete cds. // chr19 // 93 // 78 // 13 // 14 // 0 /// BC132337 // GenBank // Mus musculus frataxin, mRNA (cDNA clone MGC:163968 IMAGE:40130614), complete cds. // chr19 // 93 // 78 // 13 // 14 // 0 /// U95736 // GenBank // Mus musculus frataxin mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 83 // 14 // 15 // 0 /// NM_008044 // RefSeq // Mus musculus frataxin (Fxn), mRNA. // chr19 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// GENSCAN00000031409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:24261903:24280565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_008846 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type 1 beta (Pip5k1b), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025800 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:24294794:24555872:-1 gene:ENSMUSG00000024867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000112673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:24294794:24555842:-1 gene:ENSMUSG00000024867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC034864 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type 1 beta, mRNA (cDNA clone MGC:41200 IMAGE:3326897), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// D86176 // GenBank // Mus musculus mRNA for phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type I-alpha, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AF048695 // GenBank // Mus musculus type I alpha phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase variant (Pip5ka) mRNA, complete cds. // chr19 // 38 // 86 // 9 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:24289711:24384398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000031415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:24388443:24445575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_026520 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 122, member A (Fam122a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:24476502:24477356:-1 gene:ENSMUSG00000074922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AK010777 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410124L17 product:RIKEN cDNA 2900009I07 gene, full insert sequence. // chr19 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// BC028637 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 122, member A, mRNA (cDNA clone MGC:41223 IMAGE:1248203), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083062 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 122, member A, mRNA (cDNA clone MGC:103073 IMAGE:5361132), complete cds. // chr19 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000031411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:24476502:24477356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
AK143465 // GenBank HTC // Mus musculus 8 cells embryo 8 cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E860004J03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_175013 // RefSeq // Mus musculus phosphoglucomutase 5 (Pgm5), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000129127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:24816231:24861652:-1 gene:ENSMUSG00000041731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000133692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:24684551:24763078:-1 gene:ENSMUSG00000041731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000150339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:24816130:24861687:-1 gene:ENSMUSG00000041731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// AK076484 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833423B07 product:BA395L14.5 (NOVEL PHOSPHOGLUCOMUTASE LIKE PROTEIN) (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// BC115937 // GenBank // Mus musculus phosphoglucomutase 5, mRNA (cDNA clone MGC:143461 IMAGE:40089650), complete cds. // chr19 // 71 // 47 // 12 // 17 // 0 /// ENSMUST00000047666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:24683016:24861855:-1 gene:ENSMUSG00000041731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1 /// GENSCAN00000025791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:24811991:24861789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000031419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:24703410:24740036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_008022 // RefSeq // Mus musculus forkhead box D4 (Foxd4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:24898965:24901309:-1 gene:ENSMUSG00000051490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138432 // GenBank // Mus musculus forkhead box D4, mRNA (cDNA clone MGC:170057 IMAGE:8861452), complete cds. // chr19 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC138434 // GenBank // Mus musculus forkhead box D4, mRNA (cDNA clone MGC:170059 IMAGE:8861454), complete cds. // chr19 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000025806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:24884827:24961531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_146097 // RefSeq // Mus musculus COBW domain containing 1 (Cbwd1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NR_033744 // RefSeq // Mus musculus COBW domain containing 1 (Cbwd1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000025815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:24919916:24961616:-1 gene:ENSMUSG00000024878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC018472 // GenBank // Mus musculus COBW domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:28027 IMAGE:3661842), complete cds. // chr19 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC053745 // GenBank // Mus musculus COBW domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:59411 IMAGE:6505520), complete cds. // chr19 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:24884827:24961531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NR_034047 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 19 (Snora19), small nucleolar RNA. // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NR_037245 // RefSeq // Mus musculus microRNA 3084 (Mir3084), microRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NR_105743 // RefSeq // Mus musculus microRNA mir-3084-2 (Mir3084-2), microRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000082962 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:60774330:60774461:-1 gene:ENSMUSG00000095530 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083233 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:24942236:24942367:-1 gene:ENSMUSG00000095097 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-3084-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0014047 Mus musculus miR-3084-1 stem-loop // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// mmu-mir-3084-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0020958 Mus musculus miR-3084-2 stem-loop // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT034254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// NONMMUT035323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT035324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083700 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:25166085:25166216:-1 gene:ENSMUSG00000065634 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000025797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:25335068:25347205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0
ENSMUST00000082909 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:25453960:25454063:-1 gene:ENSMUSG00000064843 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000122640 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:26260369:26260493:-1 gene:ENSMUSG00000084589 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr19 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONMMUT034275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
BC052686 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 19, Brigham & Womens Genetics 1357 expressed, mRNA (cDNA clone IMAGE:30073963), complete cds. // chr19 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NM_177474 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 19, Brigham & Womens Genetics 1357 expressed (D19Bwg1357e), mRNA. // chr19 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// ENSMUST00000076219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:27388702:27429820:-1 gene:ENSMUSG00000041360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// AK172872 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0020 protein. // chr19 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// AK031451 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030434H13 product:hypothetical Pumilio-family RNA binding domains (aka PUM-HD, Pumilio homology domain) containing protein, full insert sequence. // chr19 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:27386577:27456500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// BC034540 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3499584, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr19 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENSMUST00000162022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:28258851:28680077:-1 gene:ENSMUSG00000052942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000087473 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:28742159:28742551:-1 gene:ENSMUSG00000067351 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000010111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:28742159:28742551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000179171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:28893042:28911879:-1 gene:ENSMUSG00000064202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000095556 // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF087578 // GenBank // Mus musculus antisense product of high-affinity glutamate transporter EAAC1 and EAAC2 (ASEC1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_021299 // RefSeq // Mus musculus adenylate kinase 3 (Ak3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:29020833:29047961:-1 gene:ENSMUSG00000024782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK007618 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810027K10 product:adenylate kinase 3 alpha like, full insert sequence. // chr19 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC016432 // GenBank // Mus musculus adenylate kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:25636 IMAGE:4217820), complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC019174 // GenBank // Mus musculus adenylate kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:29159 IMAGE:5007578), complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC024871 // GenBank // Mus musculus adenylate kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:6970 IMAGE:3154594), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC058191 // GenBank // Mus musculus adenylate kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:67766 IMAGE:5340253), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527222 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenylate kinase 3 (Ak3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000010160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29022826:29047829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_013754 // RefSeq // Mus musculus insulin-like 6 (Insl6), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:29321344:29325356:-1 gene:ENSMUSG00000050957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF143807 // GenBank // Mus musculus INSL protein precursor, mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC028752 // GenBank // Mus musculus insulin-like 6, mRNA (cDNA clone MGC:41123 IMAGE:1329516), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_011272 // RefSeq // Mus musculus relaxin 1 (Rln1), mRNA. // chr19 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044143 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:29331707:29334670:-1 gene:ENSMUSG00000039097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:29331170:29334552:-1 gene:ENSMUSG00000039097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK028199 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610528L14 product:relaxin, full insert sequence. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC132654 // GenBank // Mus musculus relaxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:164285 IMAGE:40130931), complete cds. // chr19 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC132656 // GenBank // Mus musculus relaxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:164287 IMAGE:40130933), complete cds. // chr19 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// Z27088 // GenBank // M.musculus (Swiss) rlx mRNA for relaxin precursor. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29331820:29334596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_172836 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9930021J03 gene (9930021J03Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000175726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:19:29714402:29805507:-1 gene:ENSMUSG00000046138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000175764 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:29715313:29753600:-1 gene:ENSMUSG00000046138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000177155 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:29715575:29805989:-1 gene:ENSMUSG00000046138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// BC125582 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9930021J03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159285 IMAGE:40130097), complete cds. // chr19 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000010157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29716008:29723428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT034388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 44 // 44 // 17 // 39 // 1
NM_172836 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9930021J03 gene (9930021J03Rik), mRNA. // chr19 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// XM_006527075 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9930021J03 gene (9930021J03Rik), transcript variant X8, mRNA. // chr19 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// XM_006527076 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9930021J03 gene (9930021J03Rik), transcript variant X9, mRNA. // chr19 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// ENSMUST00000177155 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:29715575:29805989:-1 gene:ENSMUSG00000046138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// AK051413 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130047A11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000175726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:19:29714402:29805507:-1 gene:ENSMUSG00000046138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29731233:29805874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0
NM_177721 // RefSeq // Mus musculus RAN binding protein 6 (Ranbp6), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000099525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:29808108:29812974:-1 gene:ENSMUSG00000074909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC056759 // GenBank // Mus musculus RAN binding protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:59399 IMAGE:6518485), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC139395 // GenBank // Mus musculus RAN binding protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:171022 IMAGE:8862417), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC139396 // GenBank // Mus musculus RAN binding protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:171023 IMAGE:8862418), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:29809633:29812950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_138595 // RefSeq // Mus musculus glycine decarboxylase (Gldc), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000025778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:30098449:30175418:-1 gene:ENSMUSG00000024827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AK139929 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020039B21 product:glycine decarboxylase, full insert sequence. // chr19 // 94 // 75 // 34 // 36 // 0 /// BC017135 // GenBank // Mus musculus glycine decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:27650 IMAGE:4511573), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000025007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:30098967:30158774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0
GENSCAN00000024992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:30531570:30549379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 78 // 16 // 18 // 0
NM_010051 // RefSeq // Mus musculus dickkopf homolog 1 (Xenopus laevis) (Dkk1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:30545863:30549665:-1 gene:ENSMUSG00000024868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF030433 // GenBank // Mus musculus Dickkopf-1 (mdkk-1) mRNA, complete cds. // chr19 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// BC050189 // GenBank // Mus musculus dickkopf homolog 1 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:60609 IMAGE:30022799), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// JN966751 // GenBank // Mus musculus dickkopf-like protein 1 (DKK1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:30531570:30549379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001013833 // RefSeq // Mus musculus protein kinase, cGMP-dependent, type I (Prkg1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 98 // 96 // 44 // 45 // 0 /// NM_011160 // RefSeq // Mus musculus protein kinase, cGMP-dependent, type I (Prkg1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// XM_006526768 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein kinase, cGMP-dependent, type I (Prkg1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 98 // 91 // 42 // 43 // 0 /// ENSMUST00000065067 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:30567551:31765033:-1 gene:ENSMUSG00000052920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 98 // 96 // 44 // 45 // 0 /// ENSMUST00000073581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:30568547:31664370:-1 gene:ENSMUSG00000052920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// AF084547 // GenBank // Mus musculus cGMP-dependent protein kinase type Ib (Prkg1b) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// BC113162 // GenBank // Mus musculus protein kinase, cGMP-dependent, type I, mRNA (cDNA clone MGC:132849 IMAGE:40060049), complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000024999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:30554517:30624894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 26 // 26 // 12 // 47 // 1
NR_033643 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6642 (Gm6642), non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC096400 // GenBank // Mus musculus predicted gene, EG625995, mRNA (cDNA clone IMAGE:849489). // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_026487 // RefSeq // Mus musculus ATPase family, AAA domain containing 1 (Atad1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527313 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase family, AAA domain containing 1 (Atad1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000070210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:32672563:32712298:-1 gene:ENSMUSG00000013662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC029085 // GenBank // Mus musculus ATPase family, AAA domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:29031 IMAGE:3593451), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC043051 // GenBank // Mus musculus ATPase family, AAA domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:57951 IMAGE:5708377), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK044925 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130012F14 product:FNP001 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// AK075685 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1190001H13 product:FNP001homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000014612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:32674244:32695898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000044823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:32698440:32706996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_001146342 // RefSeq // Mus musculus renalase, FAD-dependent amine oxidase (Rnls), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NM_001167818 // RefSeq // Mus musculus renalase, FAD-dependent amine oxidase (Rnls), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000096114 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:33137747:33392265:-1 gene:ENSMUSG00000071573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000163093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:33137747:33392295:-1 gene:ENSMUSG00000071573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC052355 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6530404N21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58369 IMAGE:6770333), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// DQ788834 // GenBank // Mus musculus putative renalase mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000044834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:33138122:33423006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1
NM_001013770 // RefSeq // Mus musculus lipase, member O1 (Lipo1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006527164 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipase, member O1 (Lipo1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000025694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:33555167:33761951:-1 gene:ENSMUSG00000024766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000112508 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:33555160:33590308:-1 gene:ENSMUSG00000024766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC052506 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI747699, mRNA (cDNA clone IMAGE:1245563), complete cds. // chr19 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// EU234002 // GenBank // Mus musculus clone 61E LINE L1 ASL1 fusion mRNA sequence. // chr19 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_024204 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 22 (Ankrd22), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:34122549:34166053:-1 gene:ENSMUSG00000024774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000159887 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:34122925:34160860:-1 gene:ENSMUSG00000024774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000160474 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:34122925:34154917:-1 gene:ENSMUSG00000024774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC003460 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 22, mRNA (cDNA clone MGC:6812 IMAGE:2648395), complete cds. // chr19 // 80 // 89 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:34123461:34145731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_007392 // RefSeq // Mus musculus actin, alpha 2, smooth muscle, aorta (Acta2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526606 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus actin, alpha 2, smooth muscle, aorta (Acta2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000039631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:34241090:34255336:-1 gene:ENSMUSG00000035783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC064800 // GenBank // Mus musculus actin, alpha 2, smooth muscle, aorta, mRNA (cDNA clone MGC:76776 IMAGE:30054569), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK002886 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610041G09 product:actin, alpha 2, smooth muscle, aorta, full insert sequence. // chr19 // 44 // 93 // 11 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:34241667:34252553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000102345 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:34395647:34395755:-1 gene:ENSMUSG00000076300 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009890 // RefSeq // Mus musculus cholesterol 25-hydroxylase (Ch25h), mRNA. // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:34473786:34475135:-1 gene:ENSMUSG00000050370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF059213 // GenBank // Mus musculus cholesterol 25-hydroxylase mRNA, complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC039919 // GenBank // Mus musculus cholesterol 25-hydroxylase, mRNA (cDNA clone MGC:49475 IMAGE:4953185), complete cds. // chr19 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:34474230:34475126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001111100 // RefSeq // Mus musculus lysosomal acid lipase A (Lipa), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_021460 // RefSeq // Mus musculus lysosomal acid lipase A (Lipa), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000049572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:34492318:34527474:-1 gene:ENSMUSG00000024781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000178114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:34492318:34527474:-1 gene:ENSMUSG00000024781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC058564 // GenBank // Mus musculus lysosomal acid lipase A, mRNA (cDNA clone MGC:68126 IMAGE:6441278), complete cds. // chr19 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// Z31689 // GenBank // M.musculus (C57 Black/6X CBA) LAL mRNA for lysosomal acid lipase. // chr19 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:34493980:34524842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_053217 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2010002M12 gene (2010002M12Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000087357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:34617051:34640743:-1 gene:ENSMUSG00000067297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000112463 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:34617049:34629810:-1 gene:ENSMUSG00000067297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC138202 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010002M12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169826 IMAGE:8861221), complete cds. // chr19 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_172838 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 12 (Slc16a12), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006527079 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 12 (Slc16a12), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000009522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:34668403:34747289:-1 gene:ENSMUSG00000009378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC111902 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 12, mRNA (cDNA clone MGC:132980 IMAGE:40062303), complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC113803 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 12, mRNA (cDNA clone MGC:132981 IMAGE:40062304), complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:34657668:34677377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_001114339 // RefSeq // Mus musculus pantothenate kinase 1 (Pank1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_023792 // RefSeq // Mus musculus pantothenate kinase 1 (Pank1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:34810894:34879455:-1 gene:ENSMUSG00000033610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000112460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:34810895:34877917:-1 gene:ENSMUSG00000033610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF200357 // GenBank // Mus musculus pantothenate kinase 1 beta (panK1beta) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF347700 // GenBank // Mus musculus pantothenate kinase 1 alpha (Pank1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC023496 // GenBank // Mus musculus pantothenate kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:32495 IMAGE:5054239), complete cds. // chr19 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:34812296:34844243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0
NR_029783 // RefSeq // Mus musculus microRNA 107 (Mir107), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000083660 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:34820687:34820773:-1 gene:ENSMUSG00000065594 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// mmu-mir-107 // miRBase Micro RNA Database // MI0000684 Mus musculus miR-107 stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT034534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XR_398351 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A830019P07 gene (A830019P07Rik), transcript variant X4, misc_RNA. // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XR_398352 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A830019P07 gene (A830019P07Rik), transcript variant X5, misc_RNA. // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000178904 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:35835221:35924578:-1 gene:ENSMUSG00000094707 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK080606 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830019P07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XR_398348 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A830019P07 gene (A830019P07Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// XR_398350 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A830019P07 gene (A830019P07Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONMMUT034546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT034547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT034548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0
NM_008315 // RefSeq // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 7 (Htr7), mRNA. // chr19 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// XM_006526704 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 7 (Htr7), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000099505 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:35960315:36057373:-1 gene:ENSMUSG00000024798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000164639 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:35958734:36057340:-1 gene:ENSMUSG00000024798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000164781 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:35958734:36057360:-1 gene:ENSMUSG00000024798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000165215 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:35958734:36057360:-1 gene:ENSMUSG00000024798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000166074 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:35958745:36057368:-1 gene:ENSMUSG00000024798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000170360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:35959820:36057507:-1 gene:ENSMUSG00000024798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 96 // 71 // 26 // 27 // 0 /// BC116986 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 7, mRNA (cDNA clone MGC:151363 IMAGE:40126305), complete cds. // chr19 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:35969305:35970000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 34 // 13 // 13 // 0
NM_013468 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 1 (cardiac muscle) (Ankrd1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000025718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:36111965:36119844:-1 gene:ENSMUSG00000024803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF041847 // GenBank // Mus musculus cardiac ankyrin repeat protein MCARP mRNA, complete cds. // chr19 // 89 // 87 // 24 // 27 // 0 /// BC037138 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 1 (cardiac muscle), mRNA (cDNA clone MGC:46879 IMAGE:4953125), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000000338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:36112707:36119781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
AK144011 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F530104D19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_016854 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3C (Ppp1r3c), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000087321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:36731737:36736653:-1 gene:ENSMUSG00000067279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC052769 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3C, mRNA (cDNA clone MGC:56747 IMAGE:6306564), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC054739 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3C, mRNA (cDNA clone MGC:64785 IMAGE:6402654), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// U89924 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1 binding protein PTG mRNA, complete cds. // chr19 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000049690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:36733415:36805611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_028263 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor binding protein 3 (Fgfbp3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000057337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:36917550:36919615:-1 gene:ENSMUSG00000047632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC055778 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:67563 IMAGE:6403098), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT034597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0
NM_001099634 // RefSeq // Mus musculus myoferlin (Myof), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 54 // 54 // 0 /// ENSMUST00000041475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:37899036:38043577:-1 gene:ENSMUSG00000048612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 54 // 54 // 0 /// ENSMUST00000172095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:37899036:38043577:-1 gene:ENSMUSG00000048612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 54 // 54 // 0 /// AK086107 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930006D18 product:hypothetical C2 domain/C2-domain profile containing protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 48 // 27 // 27 // 0 /// BC150790 // GenBank // Mus musculus myoferlin, mRNA (cDNA clone MGC:183701 IMAGE:9087701), complete cds. // chr19 // 96 // 98 // 53 // 55 // 0 /// AK041571 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630021K08 product:MYOFERLIN (FER-1 LIKE PROTEIN 3) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 25 // 25 // 14 // 56 // 1 /// AK031666 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030476O14 product:similar to MYOFERLIN (FER-1 LIKE PROTEIN 3) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 21 // 21 // 12 // 56 // 1 /// GENSCAN00000031623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:37876850:38006018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 44 // 44 // 0
ENSMUST00000092265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38051884:38054528:-1 gene:ENSMUSG00000069554 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000181592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:38051774:38054528:-1 gene:ENSMUSG00000069554 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK153279 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830134H01 product:hypothetical Histidine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr19 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// NONMMUT034635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001159487 // RefSeq // Mus musculus retinol binding protein 4, plasma (Rbp4), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_011255 // RefSeq // Mus musculus retinol binding protein 4, plasma (Rbp4), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38116620:38125321:-1 gene:ENSMUSG00000024990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000112335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38116620:38124811:-1 gene:ENSMUSG00000024990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC031809 // GenBank // Mus musculus retinol binding protein 4, plasma, mRNA (cDNA clone MGC:19321 IMAGE:4193984), complete cds. // chr19 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// BC093529 // GenBank // Mus musculus retinol binding protein 4, plasma, mRNA (cDNA clone MGC:102597 IMAGE:5135440), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// U63146 // GenBank // Mus musculus retinol binding protein (RBP) mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 65 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:38116862:38124629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
NM_001081075 // RefSeq // Mus musculus FRA10AC1 homolog (human) (Fra10ac1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006527334 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FRA10AC1 homolog (human) (Fra10ac1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006527335 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FRA10AC1 homolog (human) (Fra10ac1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000067167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38188481:38224138:-1 gene:ENSMUSG00000054237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK017666 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730455O13 product:RIKEN cDNA 5730455O13 gene, full insert sequence. // chr19 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
AK039310 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330019P12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_398369 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635358 (LOC102635358), ncRNA. // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK038608 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230050B13 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// KnowTID_00004234 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_021315 // RefSeq // Mus musculus nucleolar complex associated 3 homolog (S. cerevisiae) (Noc3l), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XR_386499 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleolar complex associated 3 homolog (S. cerevisiae) (Noc3l), transcript variant X1, misc_RNA. // chr19 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000025963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:38788128:38819237:-1 gene:ENSMUSG00000024999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AB077991 // GenBank // Mus musculus mRNA for AD24, complete cds. // chr19 // 89 // 98 // 39 // 44 // 0 /// BC031132 // GenBank // Mus musculus nucleolar complex associated 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:37198 IMAGE:4954951), complete cds. // chr19 // 91 // 100 // 41 // 45 // 0 /// GENSCAN00000018280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:38789545:38820742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 32 // 32 // 0
NM_010002 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 38 (Cyp2c38), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000035488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:39389556:39463075:-1 gene:ENSMUSG00000032808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF047725 // GenBank // Mus musculus CYP2C38 (Cyp2c38) mRNA, partial cds. // chr19 // 61 // 90 // 11 // 18 // 0 /// BC150721 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 38, mRNA (cDNA clone MGC:183632 IMAGE:9087632), complete cds. // chr19 // 61 // 90 // 11 // 18 // 0 /// GENSCAN00000018282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:39390931:39463054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0
NM_001024719 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 67 (Cyp2c67), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000067328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:39608842:39649051:-1 gene:ENSMUSG00000062624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC092260 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 67, mRNA (cDNA clone MGC:102487 IMAGE:5132591), complete cds. // chr19 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// BC106142 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 67, mRNA (cDNA clone MGC:118068 IMAGE:5051946), complete cds. // chr19 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000018297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:39609077:39626262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
NM_001039555 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 68 (Cyp2c68), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006527177 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 68 (Cyp2c68), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000099472 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:39688834:39741054:-1 gene:ENSMUSG00000074882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC019468 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 68, mRNA (cDNA clone MGC:28459 IMAGE:4160492), complete cds. // chr19 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0
NM_206537 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 54 (Cyp2c54), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:40037941:40073811:-1 gene:ENSMUSG00000067225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:40038237:40073811:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AY206874 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 (Cyp2c54) mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_145499 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 70 (Cyp2c70), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000051846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:40153353:40187286:-1 gene:ENSMUSG00000060613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000171604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:40164393:40187286:-1 gene:ENSMUSG00000060613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// AY227736 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 2C70 (Cyp2c70) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC016494 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 70, mRNA (cDNA clone MGC:25882 IMAGE:4210859), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC022151 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 70, mRNA (cDNA clone MGC:37922 IMAGE:5102845), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC023894 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 70, mRNA (cDNA clone MGC:38103 IMAGE:5310164), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC025822 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 70, mRNA (cDNA clone MGC:37864 IMAGE:5100453), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC034831 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 70, mRNA (cDNA clone MGC:37769 IMAGE:5097081), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:40153576:40183986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000068439 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:40221173:40271616:-1 gene:ENSMUSG00000055044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NM_016861 // RefSeq // Mus musculus PDZ and LIM domain 1 (elfin) (Pdlim1), mRNA. // chr19 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// AF053367 // GenBank // Mus musculus carboxyl terminal LIM domain protein (Clim1) mRNA, complete cds. // chr19 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// BC004809 // GenBank // Mus musculus PDZ and LIM domain 1 (elfin), mRNA (cDNA clone MGC:5634 IMAGE:3588132), complete cds. // chr19 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
AK132080 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3010085J16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008528 // RefSeq // Mus musculus B cell linker (Blnk), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000054769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:40928927:40994535:-1 gene:ENSMUSG00000061132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000117695 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:40928927:40994148:-1 gene:ENSMUSG00000061132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// AB015290 // GenBank // Mus musculus mRNA for BASH, complete cds. // chr19 // 97 // 90 // 34 // 35 // 0 /// AF068182 // GenBank // Mus musculus B cell linker protein BLNK mRNA, complete cds. // chr19 // 86 // 95 // 32 // 37 // 0 /// BC059785 // GenBank // Mus musculus B-cell linker, mRNA (cDNA clone MGC:67755 IMAGE:5339723), complete cds. // chr19 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// Y17159 // GenBank // Mus musculus mRNA for SH2-containing leukocyte protein 65. // chr19 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// ENSMUST00000134568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:40964605:40994535:-1 gene:ENSMUSG00000061132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1 /// GENSCAN00000016713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:40929173:40973208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT034714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1
NM_153520 // RefSeq // Mus musculus oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein (Opalin), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000087176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41062474:41077113:-1 gene:ENSMUSG00000050121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK078150 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330578K17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC060980 // GenBank // Mus musculus oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein, mRNA (cDNA clone MGC:74075 IMAGE:6533846), complete cds. // chr19 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41058560:41077165:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_011904 // RefSeq // Mus musculus tolloid-like 2 (Tll2), mRNA. // chr19 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// XM_006527092 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tolloid-like 2 (Tll2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// XM_006527094 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tolloid-like 2 (Tll2), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000025986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41083981:41206774:-1 gene:ENSMUSG00000025013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000169941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41083981:41206774:-1 gene:ENSMUSG00000025013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// AF073526 // GenBank // Mus musculus tolloid-like-2 protein (Tll2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC132537 // GenBank // Mus musculus tolloid-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:164168 IMAGE:40130814), complete cds. // chr19 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// BC145132 // GenBank // Mus musculus tolloid-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:178688 IMAGE:9053680), complete cds. // chr19 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// XM_006527095 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tolloid-like 2 (Tll2), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1 /// GENSCAN00000016710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41084182:41151520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0
NM_133352 // RefSeq // Mus musculus transmembrane 9 superfamily member 3 (Tm9sf3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000025989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41210842:41264004:-1 gene:ENSMUSG00000025016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF269151 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein TM9SF3 (Tm9sf3) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41217344:41263854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_031376 // RefSeq // Mus musculus phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 (Pik3ap1), mRNA. // chr19 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// XM_006527472 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 (Pik3ap1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000059672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41274218:41385070:-1 gene:ENSMUSG00000025017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// AF293806 // GenBank // Mus musculus B cell phosphoinositide 3-kinase adaptor mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC006052 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3590885, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr19 // 85 // 50 // 17 // 20 // 0 /// BC113141 // GenBank // Mus musculus phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:130516 IMAGE:40047744), complete cds. // chr19 // 91 // 85 // 31 // 34 // 0 /// AK170925 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630210C04 product:phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1, full insert sequence. // chr19 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// AK172670 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830227C09 product:phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1, full insert sequence. // chr19 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// GENSCAN00000016708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41281935:41397998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 80 // 31 // 32 // 0
NM_015748 // RefSeq // Mus musculus slit homolog 1 (Drosophila) (Slit1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000025993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:41600259:41743665:-1 gene:ENSMUSG00000025020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000166496 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:41600451:41743492:-1 gene:ENSMUSG00000025020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000169141 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:41600257:41743492:-1 gene:ENSMUSG00000025020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000171586 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:41646103:41743486:-1 gene:ENSMUSG00000025020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// AF144627 // GenBank // Mus musculus SLIT1 (Slit1) mRNA, complete cds. // chr19 // 86 // 100 // 32 // 37 // 0 /// BC057131 // GenBank // Mus musculus slit homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:63234 IMAGE:6827560), complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC062091 // GenBank // Mus musculus slit homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:67195 IMAGE:6827560), complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000016709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41591938:41614865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000038745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41616665:41802027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1
NM_001163495 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 19 (Arhgap19), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_027667 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 19 (Arhgap19), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000026150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:41766588:41802047:-1 gene:ENSMUSG00000025154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000163265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41766591:41802084:-1 gene:ENSMUSG00000025154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000176266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:41769800:41781336:-1 gene:ENSMUSG00000025154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000177495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:41769994:41802047:-1 gene:ENSMUSG00000025154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC086680 // GenBank // Mus musculus Rho GTPase activating protein 19, mRNA (cDNA clone MGC:113725 IMAGE:30670200), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC139195 // GenBank // Mus musculus Rho GTPase activating protein 19, mRNA (cDNA clone MGC:170822 IMAGE:8862217), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41616665:41802027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1
NM_177603 // RefSeq // Mus musculus frequently rearranged in advanced T cell lymphomas 2 (Frat2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000059231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41845978:41848132:-1 gene:ENSMUSG00000047604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC034214 // GenBank // Mus musculus frequently rearranged in advanced T-cell lymphomas 2, mRNA (cDNA clone MGC:37615 IMAGE:4989784), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC085510 // GenBank // Mus musculus frequently rearranged in advanced T-cell lymphomas 2, mRNA (cDNA clone MGC:102239 IMAGE:5718518), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41847057:41847911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
NM_199447 // RefSeq // Mus musculus ribosomal RNA processing 12 homolog (S. cerevisiae) (Rrp12), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006526555 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribosomal RNA processing 12 homolog (S. cerevisiae) (Rrp12), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// XM_006526556 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribosomal RNA processing 12 homolog (S. cerevisiae) (Rrp12), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000038677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41862852:41896153:-1 gene:ENSMUSG00000035049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK122346 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0690 protein. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC056232 // GenBank // Mus musculus ribosomal RNA processing 12 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:60855 IMAGE:30060906), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC062977 // GenBank // Mus musculus ribosomal RNA processing 12 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:79164 IMAGE:6853905), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000038764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41863207:41896077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_025644 // RefSeq // Mus musculus exosome component 1 (Exosc1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006527257 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus exosome component 1 (Exosc1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000075280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41922980:41933314:-1 gene:ENSMUSG00000034321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC024423 // GenBank // Mus musculus exosome component 1, mRNA (cDNA clone MGC:36572 IMAGE:5010850), complete cds. // chr19 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// NM_001164561 // RefSeq // Mus musculus exosome component 1 (Exosc1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// ENSMUST00000112123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:41922980:41933314:-1 gene:ENSMUSG00000034321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// AK006333 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700025F01 product:RIKEN cDNA 2610312F07 gene, full insert sequence. // chr19 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// AK012015 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610312F07 product:3-5 EXORIBONUCLEASE CSL4 HOMOLOG (EC 3.1.13.-) (CGI-108) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr19 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000038758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:41923982:41933282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0
NM_198108 // RefSeq // Mus musculus MORN repeat containing 4 (Morn4), mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000051772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:42074939:42086370:-1 gene:ENSMUSG00000049670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC057060 // GenBank HTC // Mus musculus MORN repeat containing 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5685582). // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42076107:42078550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_027106 // RefSeq // Mus musculus arginine vasopressin-induced 1 (Avpi1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000018965 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:42123273:42129059:-1 gene:ENSMUSG00000018821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027646 // GenBank // Mus musculus arginine vasopressin-induced 1, mRNA (cDNA clone MGC:41363 IMAGE:1344413), complete cds. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000161873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:42124779:42128989:-1 gene:ENSMUSG00000018821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42120440:42138967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_018780 // RefSeq // Mus musculus secreted frizzled-related sequence protein 5 (Sfrp5), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000018966 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:42197971:42202252:-1 gene:ENSMUSG00000018822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF117759 // GenBank // Mus musculus secreted frizzled-related protein 5 (Sfrp5) mRNA, complete cds. // chr19 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// BC032921 // GenBank // Mus musculus secreted frizzled-related sequence protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:41101 IMAGE:1395864), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42198685:42202011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_145123 // RefSeq // Mus musculus cartilage acidic protein 1 (Crtac1), mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000048630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:42283037:42431783:-1 gene:ENSMUSG00000042401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AJ421516 // GenBank // Mus musculus mRNA for CRTAC1-B protein (CRTAC1 gene). // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC024472 // GenBank // Mus musculus cartilage acidic protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:37356 IMAGE:4976509), complete cds. // chr19 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42268311:42414134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_001164311 // RefSeq // Mus musculus lysyl oxidase-like 4 (Loxl4), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_053083 // RefSeq // Mus musculus lysyl oxidase-like 4 (Loxl4), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC053925 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6311688, partial cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001164311 // RefSeq // Mus musculus lysyl oxidase-like 4 (Loxl4), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_053083 // RefSeq // Mus musculus lysyl oxidase-like 4 (Loxl4), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527297 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lysyl oxidase-like 4 (Loxl4), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000026190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:42593982:42612813:-1 gene:ENSMUSG00000025185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000164786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:42595106:42612813:-1 gene:ENSMUSG00000025185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000171432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:42595334:42608531:-1 gene:ENSMUSG00000025185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF338440 // GenBank // Mus musculus lysyl oxidase-related protein C (LoxC) mRNA, complete cds. // chr19 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// BC068307 // GenBank // Mus musculus lysyl oxidase-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:76593 IMAGE:30059745), complete cds. // chr19 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42595334:42605284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
XM_006527410 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 2 (Pyroxd2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 97 // 81 // 38 // 39 // 0 /// AK038414 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230005M18 product:hypothetical FAD/NAD(P)-binding domain structure containing protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 52 // 25 // 25 // 0 /// BC144951 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4833409A17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178507 IMAGE:9053499), complete cds. // chr19 // 80 // 83 // 32 // 40 // 0 /// NM_029011 // RefSeq // Mus musculus pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 2 (Pyroxd2), mRNA. // chr19 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1 /// ENSMUST00000076505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:42725858:42752775:-1 gene:ENSMUSG00000060224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1 /// AK154222 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630010H23 product:hypothetical Phytoene dehydrogenase-related protein containing protein, full insert sequence. // chr19 // 54 // 54 // 26 // 48 // 1 /// BC140971 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4833409A17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175932 IMAGE:9055583), complete cds. // chr19 // 67 // 67 // 32 // 48 // 1 /// AK014668 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833409A17 product:hypothetical FAD/NAD(P)-binding domain structure containing protein, full insert sequence. // chr19 // 40 // 40 // 19 // 48 // 1 /// GENSCAN00000022212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42717165:42790945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 60 // 60 // 29 // 48 // 1
NM_001081257 // RefSeq // Mus musculus heparanase 2 (Hpse2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006527214 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heparanase 2 (Hpse2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527215 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heparanase 2 (Hpse2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000099428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:42788947:43388311:-1 gene:ENSMUSG00000074852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC158131 // GenBank // Mus musculus similar to Heparanase-2 (Hpa2), mRNA (cDNA clone MGC:190011 IMAGE:9088198), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC158133 // GenBank // Mus musculus similar to Heparanase-2 (Hpa2), mRNA (cDNA clone MGC:190012 IMAGE:9088199), complete cds. // chr19 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// BC158136 // GenBank // Mus musculus similar to Heparanase-2 (Hpa2), mRNA (cDNA clone MGC:190014 IMAGE:9088201), complete cds. // chr19 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// GENSCAN00000022205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:42896364:43029894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
GENSCAN00000022194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:43278623:43278988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0
AK081501 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130021O09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010324 // RefSeq // Mus musculus glutamate oxaloacetate transaminase 1, soluble (Got1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026196 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:43499752:43524605:-1 gene:ENSMUSG00000025190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000132504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:43500315:43504796:-1 gene:ENSMUSG00000025190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000133325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:43500021:43515865:-1 gene:ENSMUSG00000025190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC002057 // GenBank // Mus musculus glutamate oxaloacetate transaminase 1, soluble, mRNA (cDNA clone MGC:6100 IMAGE:3489628), complete cds. // chr19 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// J02623 // GenBank // Mouse cytosolic aspartate aminotransferase isoenzyme mRNA, complete cds, clone pmcAspAT-1. // chr19 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:43500418:43524455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_145156 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 28 (Slc25a28), mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000046038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:43663822:43674881:-1 gene:ENSMUSG00000040414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AF377993 // GenBank // Mus musculus MRS3/4 (Mrs3/4) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr19 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// AF377994 // GenBank // Mus musculus MRS3/4 (Mrs3/4) mRNA, partial cds; alternatively spliced. // chr19 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC023172 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 28, mRNA (cDNA clone IMAGE:4949779), complete cds. // chr19 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// BC025908 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 28, mRNA (cDNA clone MGC:32461 IMAGE:5043992), complete cds. // chr19 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XR_386475 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 25, member 28 (Slc25a28), transcript variant X3, misc_RNA. // chr19 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000031301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:43664126:43674766:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_144874 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase assembly protein 15 (Cox15), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000045562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:43733254:43753000:-1 gene:ENSMUSG00000040018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC011509 // GenBank // Mus musculus COX15 homolog, cytochrome c oxidase assembly protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:18952 IMAGE:3981950), complete cds. // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:43736721:43752911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_028029 // RefSeq // Mus musculus dynamin binding protein (Dnmbp), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000026209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:43847967:43912392:-1 gene:ENSMUSG00000025195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY383729 // GenBank // Mus musculus TUBA mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006527352 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynamin binding protein (Dnmbp), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// AK129261 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1010 protein. // chr19 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// GENSCAN00000031305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:43848093:43890462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_030703 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase N, polypeptide 1 (Cpn1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026210 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:43956307:43986556:-1 gene:ENSMUSG00000025196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB021969 // GenBank // Mus musculus mRNA for carboxypeptidase N, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF326477 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase N small subunit mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC014692 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase N, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:25883 IMAGE:4211169), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000131882 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:43962000:43968693:-1 gene:ENSMUSG00000025196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// AK033629 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130203L14 product:carboxypeptidase N, polypeptide 1, 50kD, full insert sequence. // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000031296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:43921017:43998228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_001001446 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 44 (Cyp2c44), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001167905 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 44 (Cyp2c44), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000026211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:44005022:44029247:-1 gene:ENSMUSG00000025197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC025819 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 44, mRNA (cDNA clone MGC:37835 IMAGE:5099385), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC026766 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 44, mRNA (cDNA clone MGC:25860 IMAGE:4195655), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC034834 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 44, mRNA (cDNA clone MGC:37849 IMAGE:5099935), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44005441:44029187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001081077 // RefSeq // Mus musculus CWF19-like 1, cell cycle control (S. pombe) (Cwf19l1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527363 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CWF19-like 1, cell cycle control (S. pombe) (Cwf19l1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006527365 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CWF19-like 1, cell cycle control (S. pombe) (Cwf19l1), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000026218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:44108644:44135876:-1 gene:ENSMUSG00000025200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK088543 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430019O03 product:hypothetical HIT-like structure containing protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC037640 // GenBank // Mus musculus CWF19-like 1, cell cycle control (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:47159 IMAGE:5096937), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44110516:44192274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_028607 // RefSeq // Mus musculus biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 2 (Bloc1s2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000079033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:44139266:44146446:-1 gene:ENSMUSG00000057506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000183232 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:52619754:52620185:1 gene:ENSMUSG00000025201 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC065806 // GenBank // Mus musculus biogenesis of lysosome-related organelles complex-1, subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:73814 IMAGE:1547643), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000159853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:132284453:132284809:1 gene:ENSMUSG00000089808 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 72 // 76 // 18 // 25 // 0 /// XM_006543539 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 7241 (Gm7241), mRNA. // chr19 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// AK171921 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830019L03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// GENSCAN00000006994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:52619754:52620185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:132214113:132284809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000031292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44110516:44192274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONMMUT034833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_181422 // RefSeq // Mus musculus polycystic kidney disease 2-like 1 (Pkd2l1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006527143 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polycystic kidney disease 2-like 1 (Pkd2l1), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XR_386483 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polycystic kidney disease 2-like 1 (Pkd2l1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr19 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000042026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:44147637:44192442:-1 gene:ENSMUSG00000037578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000161357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:44147638:44192442:-1 gene:ENSMUSG00000037578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB290927 // GenBank // Mus musculus PKD2L1 mRNA for polycystic kidney disease 2-like 1, complete cds. // chr19 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// AF271381 // GenBank // Mus musculus polycystin-L (Pkdl) mRNA, complete cds. // chr19 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// BC046386 // GenBank // Mus musculus polycystic kidney disease 2-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3968901), partial cds. // chr19 // 75 // 63 // 15 // 20 // 0 /// BC116297 // GenBank // Mus musculus polycystic kidney disease 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:143920 IMAGE:40094997), complete cds. // chr19 // 83 // 94 // 25 // 30 // 0 /// BC116323 // GenBank // Mus musculus polycystic kidney disease 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:144003 IMAGE:40096335), complete cds. // chr19 // 83 // 94 // 25 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44110516:44192274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
NM_009127 // RefSeq // Mus musculus stearoyl-Coenzyme A desaturase 1 (Scd1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000041331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:44394451:44407709:-1 gene:ENSMUSG00000037071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF509567 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c stearoyl-coenzyme A desaturase 1 (Scd1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// AF509570 // GenBank // Mus musculus strain C3H/He stearoyl-coenzyme A desaturase 1 (Scd1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC007474 // GenBank // Mus musculus stearoyl-Coenzyme A desaturase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6427 IMAGE:3599932), complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC055453 // GenBank // Mus musculus stearoyl-Coenzyme A desaturase 1, mRNA (cDNA clone MGC:65342 IMAGE:4458907), complete cds. // chr19 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// CT010171 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B0250D for gene Scd1, Stearoyl-Coenzyme A desaturase 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr19 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// CT010332 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F0452D for gene Scd1, Stearoyl-Coenzyme A desaturase 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr19 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000031307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44367050:44422188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_001033343 // RefSeq // Mus musculus Sec31 homolog B (S. cerevisiae) (Sec31b), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063632 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:44516957:44545864:-1 gene:ENSMUSG00000051984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:44517207:44545847:-1 gene:ENSMUSG00000051984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:44517309:44543779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_053164 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L43 (Mrpl43), mRNA. // chr19 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:45005014:45006442:-1 gene:ENSMUSG00000025208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// AB049657 // GenBank // Mus musculus bMRP36a mRNA for mitochondrial ribosomal protein bMRP36a, complete cds. // chr19 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// BC048733 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L43, mRNA (cDNA clone MGC:59624 IMAGE:6512868), complete cds. // chr19 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:45005699:45006394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0
NM_010691 // RefSeq // Mus musculus ladybird homeobox homolog 1 (Drosophila) (Lbx1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:45232684:45235812:-1 gene:ENSMUSG00000025216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB108497 // GenBank // Mus musculus Lbx1 mRNA for Lbx1, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119177 // GenBank // Mus musculus ladybird homeobox homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:155493 IMAGE:8733926), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120586 // GenBank // Mus musculus ladybird homeobox homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:155823 IMAGE:40129509), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X90829 // GenBank // M.musculus mRNA for transcription factor, Lbx1. // chr19 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:45233734:45263063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020032 // RefSeq // Mus musculus polymerase (DNA directed), lambda (Poll), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:45552275:45560531:-1 gene:ENSMUSG00000025218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF176099 // GenBank // Mus musculus DNA polymerase lambda (Pol lambda) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK133087 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930570O16 product:polymerase (DNA directed), lambda, full insert sequence. // chr19 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// BC004767 // GenBank // Mus musculus polymerase (DNA directed), lambda, mRNA (cDNA clone MGC:7039 IMAGE:3156259), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:45552806:45566783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_008723 // RefSeq // Mus musculus nucleoplasmin 3 (Npm3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_002702 // RefSeq // Mus musculus nucleoplasmin 3, pseudogene 1 (Npm3-ps1), non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000070215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:45747734:45749591:-1 gene:ENSMUSG00000056209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000119728 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85076192:85076719:1 gene:ENSMUSG00000081669 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC048491 // GenBank // Mus musculus nucleoplasmin 3, mRNA (cDNA clone MGC:58307 IMAGE:6704326), complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// U64450 // GenBank // Mus musculus nucleophosmin/nucleoplasmin-3 (Npm3) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000144165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:45748543:45749549:-1 gene:ENSMUSG00000056209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000020072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:45748171:45749556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85076291:85076719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT034907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_198296 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9130011E15 gene (9130011E15Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// XM_006527344 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9130011E15 gene (9130011E15Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// XR_386511 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9130011E15 gene (9130011E15Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr19 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000045396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:45818144:45998488:-1 gene:ENSMUSG00000039901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// AK159765 // GenBank HTC // Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I420030I04 product:hypothetical ARM repeat fold containing protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// BC046389 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130011E15 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5342921), partial cds. // chr19 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// BC048392 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130011E15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:56938 IMAGE:6315135), complete cds. // chr19 // 97 // 65 // 29 // 30 // 0 /// BC058989 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130011E15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67441 IMAGE:5694925), complete cds. // chr19 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:45877644:45987343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0
NM_008852 // RefSeq // Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000026259 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:46135685:46148326:-1 gene:ENSMUSG00000025229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF005772 // GenBank // Mus musculus homeobox protein Pitx3 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC120844 // GenBank // Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:156081 IMAGE:40129767), complete cds. // chr19 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// BC137810 // GenBank // Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:169434 IMAGE:8860829), complete cds. // chr19 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000020056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46136018:46195500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
ENSMUST00000185278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:46348899:46350302:-1 gene:ENSMUSG00000099655 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr19 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000189008 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:46348201:46350302:-1 gene:ENSMUSG00000099655 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46348795:46349424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_016860 // RefSeq // Mus musculus ARP1 actin-related protein 1A, centractin alpha (Actr1a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000040270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:46376814:46395735:-1 gene:ENSMUSG00000025228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB010297 // GenBank // Mus musculus mRNA for actin-related protein 1 alpha-isoform, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC007131 // GenBank // Mus musculus ARP1 actin-related protein 1 homolog A, centractin alpha (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:5816 IMAGE:3599656), complete cds. // chr19 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000020061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46378367:46395677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
BC024694 // GenBank // Mus musculus tripartite motif protein 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:3668270), partial cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019718 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 3 (Arl3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527223 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 3 (Arl3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000026009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:46531109:46573085:-1 gene:ENSMUSG00000025035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF143241 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like protein 3 (Arl3) mRNA, complete cds. // chr19 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// BC042941 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:54558 IMAGE:6493571), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46519086:46558381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_007809 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 17, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp17a1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:46667165:46672974:-1 gene:ENSMUSG00000003555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC064793 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 17, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:76726 IMAGE:30436278), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M64863 // GenBank // Mouse cytochrome P450 17-alpha hydroxylse/C17-20 lyase mRNA, complete cds. // chr19 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:46667325:46680398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
AK083199 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630026L07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158670 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230049K13 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT034967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027654 // RefSeq // Mus musculus polycomb group ring finger 6 (Pcgf6), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XR_386510 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polycomb group ring finger 6 (Pcgf6), transcript variant X6, misc_RNA. // chr19 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000026032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47033619:47050845:-1 gene:ENSMUSG00000025050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB047007 // GenBank // Mus musculus mMBLR mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC016195 // GenBank // Mus musculus polycomb group ring finger 6, mRNA (cDNA clone MGC:27578 IMAGE:4488614), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC089460 // GenBank // Mus musculus polycomb group ring finger 6, mRNA (cDNA clone MGC:106622 IMAGE:30632537), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK132448 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732406K22 product:ring finger protein 134, full insert sequence. // chr19 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// GENSCAN00000008801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47029765:47054221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0
AK086428 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930027P08 product:programmed cell death protein 11, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133746 // RefSeq // Mus musculus calcium homeostasis modulator 2 (Calhm2), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:47131823:47138294:-1 gene:ENSMUSG00000033033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC019197 // GenBank // Mus musculus calcium homeostasis modulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:29220 IMAGE:5037829), complete cds. // chr19 // 78 // 82 // 18 // 23 // 0 /// ENSMUST00000140512 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:19:47105353:47138294:-1 gene:ENSMUSG00000033033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// AK036961 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930030P21 product:programmed cell death protein 11, full insert sequence. // chr19 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// BC096564 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:875618, partial cds. // chr19 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000008808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47132757:47135903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
NM_001081271 // RefSeq // Mus musculus calcium homeostasis modulator 1 (Calhm1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47141035:47144174:-1 gene:ENSMUSG00000079258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47141035:47144174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000178630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47151609:47157764:-1 gene:ENSMUSG00000094219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47151609:47179231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000169692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47170469:47171134:-1 gene:ENSMUSG00000091230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47151609:47179231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001164717 // RefSeq // Mus musculus SH3 and PX domains 2A (Sh3pxd2a), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_008018 // RefSeq // Mus musculus SH3 and PX domains 2A (Sh3pxd2a), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47260174:47464411:-1 gene:ENSMUSG00000053617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47260174:47464411:-1 gene:ENSMUSG00000053617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK009333 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310014D11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT034983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001164717 // RefSeq // Mus musculus SH3 and PX domains 2A (Sh3pxd2a), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NM_008018 // RefSeq // Mus musculus SH3 and PX domains 2A (Sh3pxd2a), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000081619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47260174:47464411:-1 gene:ENSMUSG00000053617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000111800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:47260174:47464411:-1 gene:ENSMUSG00000053617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AK085227 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530025L04 product:five SH3 domains, full insert sequence. // chr19 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// BC118022 // GenBank // Mus musculus SH3 and PX domains 2A, mRNA (cDNA clone MGC:144076 IMAGE:40097448), complete cds. // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47266987:47472591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_001290825 // RefSeq // Mus musculus collagen, type XVII, alpha 1 (Col17a1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// NM_007732 // RefSeq // Mus musculus collagen, type XVII, alpha 1 (Col17a1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 98 // 53 // 53 // 0 /// XM_006526629 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collagen, type XVII, alpha 1 (Col17a1), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 69 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000026045 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:47646344:47692094:-1 gene:ENSMUSG00000025064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// ENSMUST00000086923 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:47646344:47692094:-1 gene:ENSMUSG00000025064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 98 // 53 // 53 // 0 /// BC125031 // GenBank // Mus musculus collagen, type XVII, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:141544 IMAGE:40086689), complete cds. // chr19 // 94 // 98 // 50 // 53 // 0 /// BC125032 // GenBank // Mus musculus collagen, type XVII, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:141545 IMAGE:40086691), complete cds. // chr19 // 98 // 98 // 52 // 53 // 0 /// L08407 // GenBank // Mus musculus collagen type XVII mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 98 // 51 // 53 // 0 /// GENSCAN00000043958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47643925:47695821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 42 // 42 // 0
NM_027559 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526532 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:47737561:47837382:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161832 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:47737606:47763580:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162657 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:47737606:47763580:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107403 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 19, ERATO Doi 652, expressed, mRNA (cDNA clone IMAGE:40058745). // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XR_386434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X5, misc_RNA. // chr19 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000043972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47751698:47782355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_027559 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526532 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_386434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X5, misc_RNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:47752996:47763588:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:47737561:47837382:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161832 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:47737606:47763580:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162657 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:47737606:47763580:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107403 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 19, ERATO Doi 652, expressed, mRNA (cDNA clone IMAGE:40058745). // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47751698:47782355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027559 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526532 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_386434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X5, misc_RNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:47752996:47763588:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:47737561:47837382:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161832 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:47737606:47763580:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162657 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:47737606:47763580:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107403 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 19, ERATO Doi 652, expressed, mRNA (cDNA clone IMAGE:40058745). // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027559 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_386434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X5, misc_RNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:47737561:47837382:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47751698:47782355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027559 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526532 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_386434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X5, misc_RNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:19:47737561:47837382:-1 gene:ENSMUSG00000044948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:47751698:47782355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000071866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:50030124:50030735:-1 gene:ENSMUSG00000062083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000055761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:50019603:50030735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0
ENSMUST00000083209 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:51239690:51239796:-1 gene:ENSMUSG00000065143 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_036590 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700001K23 gene (1700001K23Rik), long non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK005607 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700001K23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONMMUT035052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000086887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:53371566:53371766:-1 gene:ENSMUSG00000067085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC030170 // GenBank // Mus musculus Max interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5036699), partial cds. // chr19 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0
NM_172429 // RefSeq // Mus musculus survival motor neuron domain containing 1 (Smndc1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006527440 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus survival motor neuron domain containing 1 (Smndc1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// XM_006527441 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus survival motor neuron domain containing 1 (Smndc1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000025997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:53379214:53390573:-1 gene:ENSMUSG00000025024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC058779 // GenBank // Mus musculus survival motor neuron domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:68042 IMAGE:6312831), complete cds. // chr19 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000180667 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:19:53444014:53447314:-1 gene:ENSMUSG00000097636 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK146072 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530028F09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004262 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004263 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004264 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// NONMMUT035063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0
NM_008149 // RefSeq // Mus musculus glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial (Gpam), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000061856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:55069734:55099451:-1 gene:ENSMUSG00000024978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// AK047295 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930046K04 product:glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial, full insert sequence. // chr19 // 100 // 81 // 38 // 38 // 0 /// BC019201 // GenBank // Mus musculus glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:29133 IMAGE:5041120), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// BC082776 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4165513, containing frame-shift errors. // chr19 // 100 // 36 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000001634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:55070930:55099657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 70 // 33 // 33 // 0 /// M77003 // GenBank // Mouse glycerol-3-phosphate acyltransferase mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 94 // 41 // 44 // 0
AK157500 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830219M05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004277 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081076 // RefSeq // Mus musculus guanylate cyclase 2g (Gucy2g), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006527383 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanylate cyclase 2g (Gucy2g), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006527384 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanylate cyclase 2g (Gucy2g), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000069183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:55198297:55241236:-1 gene:ENSMUSG00000055523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AY395631 // GenBank // Mus musculus guanylyl cyclase receptor G (Gucy2g) mRNA, complete cds. // chr19 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000001639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:55202952:55241236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 83 // 34 // 35 // 0
NM_018831 // RefSeq // Mus musculus DNA cross-link repair 1A, PSO2 homolog (S. cerevisiae) (Dclre1a), mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000182058 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:56529169:56547155:-1 gene:ENSMUSG00000025077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000182276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:56529169:56548222:-1 gene:ENSMUSG00000025077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000183143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:56529167:56548147:-1 gene:ENSMUSG00000025077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF241240 // GenBank // Mus musculus SNM1 protein (SNM1) mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// AK029794 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930564M16 product:DNA cross-link repair 1A, PSO2 homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC072667 // GenBank // Mus musculus DNA cross-link repair 1A, PSO2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:99424 IMAGE:30629417), complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC076617 // GenBank // Mus musculus DNA cross-link repair 1A, PSO2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:30635464), partial cds. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:56529502:56547150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000086830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:56754999:56755346:-1 gene:ENSMUSG00000067063 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:56754999:56755346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_170757 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 186 (Ccdc186), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000076085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:56790963:56813683:-1 gene:ENSMUSG00000035173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000118592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:56787481:56822190:-1 gene:ENSMUSG00000035173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000135666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:56790531:56795155:-1 gene:ENSMUSG00000035173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000140184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:56800039:56822190:-1 gene:ENSMUSG00000035173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr19 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// AF349751 // GenBank // Mus musculus oocyte-testis gene 1 (Otg1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:56770480:56813629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_026208 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019N19 gene (1700019N19Rik), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527296 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700019N19 gene (1700019N19Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:58785803:58794461:-1 gene:ENSMUSG00000026931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000166692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:58785996:58793283:-1 gene:ENSMUSG00000026931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC049561 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019N19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58152 IMAGE:6773246), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:58785996:58792790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_175199 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 12A (Hspa12a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006527378 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heat shock protein 12A (Hspa12a), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000066285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:58795751:58860984:-1 gene:ENSMUSG00000025092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK087732 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330013L02 product:hypothetical Actin-like ATPase domain structure containing protein, full insert sequence. // chr19 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AY196789 // GenBank // Mus musculus HSPA12A protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC030362 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 12A, mRNA (cDNA clone MGC:40846 IMAGE:5369051), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK165073 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230037G17 product:heat shock 70kDa protein 12A, full insert sequence. // chr19 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// AK006867 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700063D12 product:hypothetical Actin-like ATPase domain structure containing protein, full insert sequence. // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000046432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:58799361:58873232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001114312 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930506M07 gene (4930506M07Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XR_386512 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930506M07 gene (4930506M07Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr19 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000047511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:58973358:59076069:-1 gene:ENSMUSG00000041362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC030338 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930506M07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:40679 IMAGE:2599101), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// EF055486 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J shootin1 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// NM_175172 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930506M07 gene (4930506M07Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 90 // 90 // 36 // 40 // 1 /// ENSMUST00000163821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:58973358:59076069:-1 gene:ENSMUSG00000041362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 90 // 90 // 36 // 40 // 1 /// AK015721 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930506M07 product:hypothetical M protein containing protein, full insert sequence. // chr19 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1 /// AK039224 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330001C14 product:RIKEN cDNA 4930506M07 gene, full insert sequence. // chr19 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1 /// GENSCAN00000046429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:58974986:59075512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0
NM_009501 // RefSeq // Mus musculus ventral anterior homeobox 1 (Vax1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526916 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ventral anterior homeobox 1 (Vax1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000172821 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:59166187:59170056:-1 gene:ENSMUSG00000006270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF064554 // GenBank // Mus musculus ventral anterior homeobox-containing protein 1 (Vax1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC111818 // GenBank // Mus musculus ventral anterior homeobox containing gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:130490 IMAGE:40044698), complete cds. // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:59166187:59170008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001033222 // RefSeq // Mus musculus PDZ domain containing 8 (Pdzd8), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000099274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:59296084:59345780:-1 gene:ENSMUSG00000074746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC141370 // GenBank // Mus musculus PDZ domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:176332 IMAGE:9055983), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC141371 // GenBank // Mus musculus PDZ domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:176333 IMAGE:9055984), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:59344715:59394133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001033172 // RefSeq // Mus musculus RAB11 family interacting protein 2 (class I) (Rab11fip2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001164367 // RefSeq // Mus musculus RAB11 family interacting protein 2 (class I) (Rab11fip2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000051996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:59903696:59943364:-1 gene:ENSMUSG00000040022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000170819 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:19:59906916:59943000:-1 gene:ENSMUSG00000040022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000171986 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:19:59902884:59943654:-1 gene:ENSMUSG00000040022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC139380 // GenBank // Mus musculus RAB11 family interacting protein 2 (class I), mRNA (cDNA clone MGC:171007 IMAGE:8862402), complete cds. // chr19 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC139419 // GenBank // Mus musculus RAB11 family interacting protein 2 (class I), mRNA (cDNA clone MGC:171046 IMAGE:8862441), complete cds. // chr19 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XR_386520 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB11 family interacting protein 2 (class I) (Rab11fip2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr19 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// XR_386521 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB11 family interacting protein 2 (class I) (Rab11fip2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr19 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:59906916:59943000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_029648 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 204, member A (Fam204a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000065286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:60198586:60226697:-1 gene:ENSMUSG00000057858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC048505 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 19, ERATO Doi 737, expressed, mRNA (cDNA clone IMAGE:6772689). // chr19 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC061459 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 19, ERATO Doi 737, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:66619 IMAGE:6829614), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:60194709:60221296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_201615 // RefSeq // Mus musculus prolactin releasing hormone receptor (Prlhr), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006527057 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prolactin releasing hormone receptor (Prlhr), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000051277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:60466733:60468304:-1 gene:ENSMUSG00000045052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125649 // GenBank // Mus musculus prolactin releasing hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:159352 IMAGE:40130164), complete cds. // chr19 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// BC125651 // GenBank // Mus musculus prolactin releasing hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:159354 IMAGE:40130166), complete cds. // chr19 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// AY338238 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 10 (Gpr10) mRNA, complete cds. // chr19 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_001172096 // RefSeq // Mus musculus CDK2 associated, cullin domain 1 (Cacul1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_001172097 // RefSeq // Mus musculus CDK2 associated, cullin domain 1 (Cacul1), transcript variant 3, mRNA. // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_030197 // RefSeq // Mus musculus CDK2 associated, cullin domain 1 (Cacul1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000081790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:60524696:60581023:-1 gene:ENSMUSG00000033417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000111460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:60524696:60581023:-1 gene:ENSMUSG00000033417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000166712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:60524696:60581023:-1 gene:ENSMUSG00000033417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC026363 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700078E11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:31024 IMAGE:4223313), complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:60533823:60606558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_010123 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit A (Eif3a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000025955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:60761116:60790693:-1 gene:ENSMUSG00000024991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AK082006 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130093N16 product:EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 SUBUNIT 10 (EIF-3 THETA) (EIF3 P167) (EIF3 P180) (EIF3 P185) (P162 PROTEIN) (CENTROSOMIN) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr19 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// U14172 // GenBank // Mus musculus p162 protein mRNA, complete cds. // chr19 // 91 // 100 // 40 // 44 // 0 /// GENSCAN00000025500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:60762081:60791078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0
NM_053198 // RefSeq // Mus musculus sideroflexin 4 (Sfxn4), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006527499 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sideroflexin 4 (Sfxn4), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000080806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:60837277:60861427:-1 gene:ENSMUSG00000063698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000124921 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:19:60838758:60861424:-1 gene:ENSMUSG00000063698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000135808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:60838748:60861479:-1 gene:ENSMUSG00000063698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF325263 // GenBank // Mus musculus sideroflexin 4 (Sfxn4) mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// BC058211 // GenBank // Mus musculus sideroflexin 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5365403), partial cds. // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC089535 // GenBank // Mus musculus sideroflexin 4, mRNA (cDNA clone MGC:107253 IMAGE:6589805), complete cds. // chr19 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// XM_006527501 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sideroflexin 4 (Sfxn4), transcript variant X5, mRNA. // chr19 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// XM_006527500 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sideroflexin 4 (Sfxn4), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_007452 // RefSeq // Mus musculus peroxiredoxin 3 (Prdx3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:60864051:60874556:-1 gene:ENSMUSG00000024997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC005626 // GenBank // Mus musculus peroxiredoxin 3, mRNA (cDNA clone MGC:11532 IMAGE:3963113), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// M28723 // GenBank // Mus musculus housekeeping-type protein (MER5) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:60838045:60883341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
ENSMUST00000158269 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:61013417:61013545:-1 gene:ENSMUSG00000088894 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000093750 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:19:61164365:61164481:-1 gene:ENSMUSG00000070263 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001177513 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 7102 (Gm7102), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000180168 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:61174686:61176309:-1 gene:ENSMUSG00000094649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000025489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:61175459:61186767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_009970 // RefSeq // Mus musculus colony stimulating factor 2 receptor, alpha, low-affinity (granulocyte-macrophage) (Csf2ra), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526632 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus colony stimulating factor 2 receptor, alpha, low-affinity (granulocyte-macrophage) (Csf2ra), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000076046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:61224402:61228418:-1 gene:ENSMUSG00000059326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK135114 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430599N18 product:colony stimulating factor 2 receptor, alpha, low-affinity (granulocyte-macrophage), full insert sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M85078 // GenBank // Mus musculus granulocyte-macrophage colony stimulating factor receptor low-affinity subunit mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150696 // GenBank // Mus musculus colony stimulating factor 2 receptor, alpha, low-affinity (granulocyte-macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:183607 IMAGE:9087607), complete cds. // chr19 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// EF114317 // GenBank // Mus musculus granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor alpha-chain deletion isoform (Csf2ra) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// EF114318 // GenBank // Mus musculus granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor alpha-chain truncated isoform (Csf2ra) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000025491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:61213970:61237050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001159649 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte transmembrane adaptor 1 (Lax1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_172842 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte transmembrane adaptor 1 (Lax1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000169295 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:133679091:133690108:-1 gene:ENSMUSG00000051998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY090785 // GenBank // Mus musculus membrane associated adaptor protein LAX mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC042765 // GenBank // Mus musculus lymphocyte transmembrane adaptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:51509 IMAGE:4188712), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:133679778:133753281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// ENSMUST00000189524 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:133680470:133690086:-1 gene:ENSMUSG00000051998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_010998 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 55 (Olfr55), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000112168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:33176416:33177363:1 gene:ENSMUSG00000094891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_001199062 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4461 (Gm4461), mRNA. // chr17 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// ENSMUST00000112162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:33215261:33216351:-1 gene:ENSMUSG00000096169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// GENSCAN00000041190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33176407:33177363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000041184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33215395:33254810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
NM_001278218 // RefSeq // Mus musculus dispatched homolog 1 (Drosophila) (Disp1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001278219 // RefSeq // Mus musculus dispatched homolog 1 (Drosophila) (Disp1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001278220 // RefSeq // Mus musculus dispatched homolog 1 (Drosophila) (Disp1), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_026866 // RefSeq // Mus musculus dispatched homolog 1 (Drosophila) (Disp1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000003035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:183086264:183221529:-1 gene:ENSMUSG00000030768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000171366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:183086270:183147461:-1 gene:ENSMUSG00000030768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY150577 // GenBank // Mus musculus dispatched (Disp) mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// AY150698 // GenBank // Mus musculus dispatched A mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC043102 // GenBank // Mus musculus dispatched homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:58022 IMAGE:6406376), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC059225 // GenBank // Mus musculus dispatched homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:66645 IMAGE:6406376), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK004521 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1190008H24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// GENSCAN00000012869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:183086289:183135860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000062934 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:3118685:3227806:1 gene:ENSMUSG00000050530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000091505 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:3118413:3227252:1 gene:ENSMUSG00000050530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// AK077831 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930405N04 product:expressed sequence AA409679, full insert sequence. // chr2 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_001081161 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 171, member A1 (Fam171a1), mRNA. // chr2 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENSMUST00000072955 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:3114224:3227250:1 gene:ENSMUSG00000050530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// ENSMUST00000115099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:3118382:3227806:1 gene:ENSMUSG00000050530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// BC138175 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 171, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:169799 IMAGE:8861194), complete cds. // chr2 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// GENSCAN00000002158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:3170589:3226510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_030063 // RefSeq // Mus musculus acyl-Coenzyme A binding domain containing 7 (Acbd7), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:2:3336168:3340993:1 gene:ENSMUSG00000026644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:3336086:3340771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
BC119608 // GenBank // Mus musculus per-hexamer repeat gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:141431 IMAGE:40061632), complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC119609 // GenBank // Mus musculus per-hexamer repeat gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:141432 IMAGE:40061635), complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// X12809 // GenBank // Mouse period repetitive mRNA (lambda Sp34). // chr2 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// NONMMUT035382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_177647 // RefSeq // Mus musculus cerebral dopamine neurotrophic factor (Cdnf), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000036350 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:3513065:3526376:1 gene:ENSMUSG00000039496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000132566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:3513884:3523900:1 gene:ENSMUSG00000039496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000140610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:3513030:3523822:1 gene:ENSMUSG00000039496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC110560 // GenBank // Mus musculus arginine-rich, mutated in early stage tumors-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:129430 IMAGE:40049634), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:3515860:3523989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000120117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:3686362:3687430:1 gene:ENSMUSG00000081070 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NM_001005767 // RefSeq // Mus musculus presenilin associated, rhomboid-like (Parl), mRNA. // chr2 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// ENSMUST00000048642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:20279820:20302387:-1 gene:ENSMUSG00000033918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// ENSMUST00000136252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20279820:20302345:-1 gene:ENSMUSG00000033918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// BC083153 // GenBank // Mus musculus presenilin associated, rhomboid-like, mRNA (cDNA clone MGC:103256 IMAGE:30728006), complete cds. // chr2 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// GENSCAN00000039318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20279974:20302327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// GENSCAN00000002150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:3686783:3736093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1
AK140403 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B730015P05 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175400 // RefSeq // Mus musculus selenophosphate synthetase 1 (Sephs1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006497309 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus selenophosphate synthetase 1 (Sephs1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:4881564:4910557:1 gene:ENSMUSG00000026662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000115019 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:4882245:4908137:1 gene:ENSMUSG00000026662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000140045 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:4884384:4905533:1 gene:ENSMUSG00000026662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// AK053638 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130116J10 product:SELENOPHOSPHATE SYNTHETASE , HUMAN SELENIUM DONOR PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC065165 // GenBank // Mus musculus selenophosphate synthetase 1, mRNA (cDNA clone MGC:90031 IMAGE:6417054), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC066037 // GenBank // Mus musculus selenophosphate synthetase 1, mRNA (cDNA clone MGC:76356 IMAGE:6405661), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:4884413:4906795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_010726 // RefSeq // Mus musculus phytanoyl-CoA hydroxylase (Phyh), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:4919019:4938730:1 gene:ENSMUSG00000026664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF023463 // GenBank // Mus musculus peroxisomal phytanoyl-CoA alpha-hydroxylase (PAHX) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC002018 // GenBank // Mus musculus phytanoyl-CoA hydroxylase, mRNA (cDNA clone MGC:5835 IMAGE:3489939), complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// D88670 // GenBank // Mus musculus mRNA for LN1, complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000146933 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:4919080:4929014:1 gene:ENSMUSG00000026664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000027844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:4909868:4951165:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
XM_006497572 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 13194 (Gm13194), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000142299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:4942174:4942484:1 gene:ENSMUSG00000086670 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT035447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000027844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:4909868:4951165:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_028804 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 3 (Ccdc3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:5137776:5230878:1 gene:ENSMUSG00000026676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058616 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:57889 IMAGE:5686139), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:5137934:5143223:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_016918 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 5 (Nudt5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:5845019:5871895:1 gene:ENSMUSG00000025817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000127116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:5845253:5864448:1 gene:ENSMUSG00000025817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000179748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:5845034:5868736:1 gene:ENSMUSG00000025817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF222786 // GenBank // Mus musculus nudix hydrolase (NudT5) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC004571 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 5, mRNA (cDNA clone MGC:8023 IMAGE:3586340), complete cds. // chr2 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC049595 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 5, mRNA (cDNA clone MGC:58247 IMAGE:6774692), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000128604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:5848135:5861235:1 gene:ENSMUSG00000025817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000007724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:5851294:5868198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// NONMMUT035477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
AY512940 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:H4071G10 unknown mRNA. // chr2 // 77 // 96 // 20 // 26 // 0
NM_001081132 // RefSeq // Mus musculus UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast) (Upf2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006497488 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast) (Upf2), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 42 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000060092 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:5951469:6056703:1 gene:ENSMUSG00000043241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000128200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:6023339:6056698:1 gene:ENSMUSG00000043241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 23 // 23 // 0 /// BC138358 // GenBank // Mus musculus UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:169983 IMAGE:8861378), complete cds. // chr2 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// BC138359 // GenBank // Mus musculus UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:169984 IMAGE:8861379), complete cds. // chr2 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000056572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:5973469:6057514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0
NR_033470 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10857 (Gm10857), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_033471 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10857 (Gm10857), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080548 // RefSeq // Mus musculus USP6 N-terminal like (Usp6nl), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_181399 // RefSeq // Mus musculus USP6 N-terminal like (Usp6nl), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006497568 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus USP6 N-terminal like (Usp6nl), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000042503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:6352733:6443494:1 gene:ENSMUSG00000039046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000114937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:6322667:6446390:1 gene:ENSMUSG00000039046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000132391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:6322772:6421012:1 gene:ENSMUSG00000039046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC051184 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6466270, containing frame-shift errors. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:6367885:6441742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NR_024257 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930412O13 gene (4930412O13Rik), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000026889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:9881252:9883921:1 gene:ENSMUSG00000025783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:9882636:9883335:1 gene:ENSMUSG00000025783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:9880884:9890058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
GENSCAN00000047610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:9880884:9890058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
XR_373994 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 13262 (Gm13262), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// XR_399507 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 13262 (Gm13262), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// ENSMUST00000149014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:9906178:9914678:1 gene:ENSMUSG00000075534 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK143820 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430115D03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK049866 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630004M23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_025280 // RefSeq // Mus musculus antigenic determinant of rec-A protein (Kin), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000042512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:10080624:10092806:1 gene:ENSMUSG00000037262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000142599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:10080593:10091819:1 gene:ENSMUSG00000037262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AK132548 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4831427J19 product:antigenic determinant of rec-A protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC028860 // GenBank // Mus musculus antigenic determinant of rec-A protein, mRNA (cDNA clone MGC:18413 IMAGE:3673830), complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// BC058169 // GenBank // Mus musculus antigenic determinant of rec-A protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:5026202), partial cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// X58472 // GenBank // Mouse KIN17 mRNA for kin17 protein. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:10078516:10092517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC099685 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30481754, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr2 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0
NM_172471 // RefSeq // Mus musculus inter-alpha (globulin) inhibitor H5 (Itih5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000026886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:10153571:10256529:1 gene:ENSMUSG00000025780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK077381 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430408M01 product:RIKEN cDNA 5430408M01 gene, full insert sequence. // chr2 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// BC043314 // GenBank // Mus musculus inter-alpha (globulin) inhibitor H5, mRNA (cDNA clone MGC:49315 IMAGE:5150581), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC062196 // GenBank // Mus musculus inter-alpha (globulin) inhibitor H5, mRNA (cDNA clone MGC:70205 IMAGE:3490706), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:10234408:10251583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000021094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:10153149:10212676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NR_030469 // RefSeq // Mus musculus microRNA 669b (Mir669b), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000102172 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:10467790:10467886:1 gene:ENSMUSG00000076126 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// mmu-mir-669b // miRBase Micro RNA Database // MI0004666 Mus musculus miR-669b stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT035602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NR_030150 // RefSeq // Mus musculus microRNA 466 (Mir466), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000093591 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:10507918:10507990:1 gene:ENSMUSG00000070099 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// mmu-mir-466a // miRBase Micro RNA Database // MI0002401 Mus musculus miR-466a stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT035690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_030473 // RefSeq // Mus musculus microRNA 669c (Mir669c), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000084675 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:10509296:10509404:1 gene:ENSMUSG00000076118 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-669c // miRBase Micro RNA Database // MI0004673 Mus musculus miR-669c stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT035693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_030474 // RefSeq // Mus musculus microRNA 297b (Mir297b), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000102268 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:10511667:10511775:1 gene:ENSMUSG00000076222 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// mmu-mir-297b // miRBase Micro RNA Database // MI0004674 Mus musculus miR-297b stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT035700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
AK157560 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830223I07 product:hypothetical Cysteine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr2 // 72 // 96 // 18 // 25 // 0
ENSMUST00000120205 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:11090879:11091764:1 gene:ENSMUSG00000081693 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT035725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
AK153745 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630069G11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:11521996:11539389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_008367 // RefSeq // Mus musculus interleukin 2 receptor, alpha chain (Il2ra), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000028111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:11642792:11693191:1 gene:ENSMUSG00000026770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC114437 // GenBank // Mus musculus interleukin 2 receptor, alpha chain, mRNA (cDNA clone MGC:130561 IMAGE:40054387), complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// K02891 // GenBank // Mouse interleukin 2 receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// M30856 // GenBank // Mouse interleukin 2 receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 81 // 90 // 22 // 27 // 0 /// M54934 // GenBank // Mouse interleukin 2 receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:11672986:11686471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENSMUST00000064229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:13557848:13560324:1 gene:ENSMUSG00000052389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK089231 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630050F06 product:hypothetical FAD/NAD(P)-binding domain structure containing protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011701 // RefSeq // Mus musculus vimentin (Vim), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000028062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:13573952:13582826:1 gene:ENSMUSG00000026728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000148248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:13579384:13582478:1 gene:ENSMUSG00000026728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000155605 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:13574322:13578604:1 gene:ENSMUSG00000026728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// BC089335 // GenBank // Mus musculus vimentin, mRNA (cDNA clone MGC:102095 IMAGE:6415629), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// M24849 // GenBank // Mouse vimentin mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// M26251 // GenBank // Mouse mRNA encoding vimentin, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000053113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:13557863:13597523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
NM_001081310 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 236 (Tmem236), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000077517 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:14174524:14221971:1 gene:ENSMUSG00000061531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:14174590:14179630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000017576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:14198389:14219436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
NM_008625 // RefSeq // Mus musculus mannose receptor, C type 1 (Mrc1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000028045 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:14229414:14332057:1 gene:ENSMUSG00000026712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC141338 // GenBank // Mus musculus mannose receptor, C type 1, mRNA (cDNA clone MGC:176299 IMAGE:9055950), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:14229513:14331175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_001012305 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 12 (Slc39a12), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006497481 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 12 (Slc39a12), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000082290 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:14388399:14494977:1 gene:ENSMUSG00000036949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000114731 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:14388316:14494975:1 gene:ENSMUSG00000036949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC089362 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 12, mRNA (cDNA clone MGC:102235 IMAGE:30628112), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC113764 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 12, mRNA (cDNA clone MGC:132806 IMAGE:40059402), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC113765 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 12, mRNA (cDNA clone MGC:132807 IMAGE:40059404), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:14389321:14622167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_029466 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 5B (Arl5b), mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000069870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:15055282:15082456:1 gene:ENSMUSG00000017418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:15055287:15076277:1 gene:ENSMUSG00000017418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 84 // 83 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000129509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:15068169:15076584:1 gene:ENSMUSG00000017418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr2 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC066810 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 5B, mRNA (cDNA clone MGC:76520 IMAGE:30111114), complete cds. // chr2 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000017562 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:15049395:15078371:1 gene:ENSMUSG00000017418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// AK045310 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130064K02 product:similar to ADP-RIBOSYLATION FACTOR-LIKE PROTEIN 5 [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr2 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// GENSCAN00000044442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:15052846:15082043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
ENSMUST00000121188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:15396750:15397716:1 gene:ENSMUSG00000082632 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000044443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:15612737:15898413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// KC836882 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J Diet1 (Diet1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000146205 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:16042126:16150806:1 gene:ENSMUSG00000075520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:15925024:16307130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KC836882 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J Diet1 (Diet1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026162 // RefSeq // Mus musculus plexin domain containing 2 (Plxdc2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000028081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:16356304:16755839:1 gene:ENSMUSG00000026748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000114702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:16357117:16751857:1 gene:ENSMUSG00000026748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000114703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:16356887:16751689:1 gene:ENSMUSG00000026748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126173 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:16638696:16751690:1 gene:ENSMUSG00000026748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// AF378761 // GenBank // Mus musculus tumor endothelial marker 7-related precursor (Tem7R) mRNA, complete cds. // chr2 // 89 // 82 // 25 // 28 // 0 /// BC057881 // GenBank // Mus musculus plexin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:67933 IMAGE:5349869), complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:16486014:16748532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
ENSMUST00000083030 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:18158687:18158791:1 gene:ENSMUSG00000064964 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT035934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_007552 // RefSeq // Mus musculus Bmi1 polycomb ring finger oncogene (Bmi1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006497311 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Bmi1 polycomb ring finger oncogene (Bmi1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000028071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:18677018:18686629:1 gene:ENSMUSG00000026739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000051929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:18680372:18686130:1 gene:ENSMUSG00000026739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// BC053708 // GenBank // Mus musculus Bmi1 polycomb ring finger oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:60636 IMAGE:30074540), complete cds. // chr2 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC056384 // GenBank // Mus musculus Bmi1 polycomb ring finger oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:73913 IMAGE:6854104), complete cds. // chr2 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// M64279 // GenBank // Mouse B cell-specific Mo-MLV integration site 1 (bmi-1) mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
NM_001001334 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC061194 (BC061194), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:18699023:18750413:1 gene:ENSMUSG00000037708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173763 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:2:18699084:18732034:1 gene:ENSMUSG00000037708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC049634 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC061194, mRNA (cDNA clone IMAGE:6774548), complete cds. // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:18695155:18764217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000119424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:18758984:18759764:1 gene:ENSMUSG00000081139 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT035964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NR_024323 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930426L09 gene (4930426L09Rik), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:18998343:18999801:1 gene:ENSMUSG00000026736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081083 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 3 (Armc3), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001271563 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 3 (Armc3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001271564 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 3 (Armc3), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001271565 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 3 (Armc3), transcript variant 4, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000049255 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:19199302:19310241:1 gene:ENSMUSG00000037683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000114640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:19199302:19310241:1 gene:ENSMUSG00000037683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC145005 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:178561 IMAGE:9053553), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC145013 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:178569 IMAGE:9053561), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC150688 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:183599 IMAGE:9087599), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000054360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:19285798:19310126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000054369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:19188820:19280687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1
NM_029619 // RefSeq // Mus musculus methionine sulfoxide reductase B2 (Msrb2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006497563 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methionine sulfoxide reductase B2 (Msrb2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000023856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:19371636:19394976:1 gene:ENSMUSG00000023094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:19371668:19393320:1 gene:ENSMUSG00000023094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000153289 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:19371841:19394264:1 gene:ENSMUSG00000023094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC021619 // GenBank // Mus musculus methionine sulfoxide reductase B2, mRNA (cDNA clone MGC:38012 IMAGE:5150285), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006497561 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methionine sulfoxide reductase B2 (Msrb2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// XM_006497562 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methionine sulfoxide reductase B2 (Msrb2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT035989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONMMUT035990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000054363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:19371683:19388629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_018809 // RefSeq // Mus musculus pancreas specific transcription factor, 1a (Ptf1a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:19445663:19447501:1 gene:ENSMUSG00000026735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB035675 // GenBank // Mus musculus PTF1p48 mRNA for pancreas transcription factor1 p48 subunit, complete cds. // chr2 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC132505 // GenBank // Mus musculus pancreas specific transcription factor, 1a, mRNA (cDNA clone MGC:164136 IMAGE:40130782), complete cds. // chr2 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// BC138507 // GenBank // Mus musculus pancreas specific transcription factor, 1a, mRNA (cDNA clone MGC:170132 IMAGE:8861527), complete cds. // chr2 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000054357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:19429297:19447166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
ENSMUST00000149577 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:19452470:19454995:1 gene:ENSMUSG00000056329 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK007425 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810010K12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:19451828:19453151:1 gene:ENSMUSG00000056329 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// KnowTID_00004312 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT035996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004311 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT035995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_027715 // RefSeq // Mus musculus OTU domain containing 1 (Otud1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052168 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:19657752:19660583:1 gene:ENSMUSG00000043415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:19655765:19659426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000083710 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:19934863:19934953:1 gene:ENSMUSG00000065644 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT036007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
AK034486 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330199F12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083319 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:20280519:20280625:1 gene:ENSMUSG00000065253 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT036014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_033225 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13375 (Gm13375), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158585 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230018M07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126967 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:20969054:20969997:1 gene:ENSMUSG00000075514 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT036042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT036043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK048278 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130046B21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_177588 // RefSeq // Mus musculus threonine synthase-like 1 (bacterial) (Thnsl1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000054591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:21205724:21215009:1 gene:ENSMUSG00000048550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000138965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:21205759:21213279:1 gene:ENSMUSG00000048550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC027743 // GenBank // Mus musculus threonine synthase-like 1 (bacterial), mRNA (cDNA clone IMAGE:5037172), partial cds. // chr2 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC090667 // GenBank // Mus musculus threonine synthase-like 1 (bacterial), mRNA (cDNA clone MGC:113800 IMAGE:30686917), complete cds. // chr2 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC117854 // GenBank // Mus musculus threonine synthase-like 1 (bacterial), mRNA (cDNA clone MGC:143872 IMAGE:40094242), complete cds. // chr2 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// NM_001001297 // RefSeq // Mus musculus threonine synthase-like 1 (bacterial) (Thnsl1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// ENSMUST00000102951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:21205787:21214308:1 gene:ENSMUSG00000048550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// ENSMUST00000102952 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:21205739:21214376:1 gene:ENSMUSG00000048550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// GENSCAN00000048920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:21211437:21213680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0
NM_001004761 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 158 (Gpr158), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000055946 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:21367542:21830547:1 gene:ENSMUSG00000045967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000155760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:21367567:21811688:1 gene:ENSMUSG00000045967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AK086256 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930016K15 product:hypothetical EGF/Laminin structure containing protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:21610818:21827693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
AK157551 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830223A20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00004314 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT036054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_148413 // RefSeq // Mus musculus myosin IIIA (Myo3a), mRNA. // chrUn // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000044749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:22227503:22618252:1 gene:ENSMUSG00000025716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000138863 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:22558215:22618247:1 gene:ENSMUSG00000025716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000153002 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:22241057:22407454:1 gene:ENSMUSG00000025716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// AY101368 // GenBank // Mus musculus myosin IIIA (Myo3a) mRNA, complete cds. // chrUn // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000045716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:22323557:22619623:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 65 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000135792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:22755984:22762273:1 gene:ENSMUSG00000085353 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000169209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:22761972:22762241:1 gene:ENSMUSG00000085353 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT036064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT036065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT036066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_013771 // RefSeq // Mus musculus YME1-like 1 (S. cerevisiae) (Yme1l1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000028117 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:23156369:23199260:1 gene:ENSMUSG00000026775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AF090430 // GenBank // Mus musculus ATP-dependent metalloprotease FtsH1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// AY136286 // GenBank // Mus musculus clone 24A metalloprotease (Yme1l1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// BC007128 // GenBank // Mus musculus YME1-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:5753 IMAGE:3591123), complete cds. // chr2 // 95 // 95 // 39 // 41 // 0 /// ENSMUST00000125004 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:23156518:23177068:1 gene:ENSMUSG00000026775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// AK032273 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430514D04 product:YME1-like 1 (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr2 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1 /// GENSCAN00000049506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:23154956:23202582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT036091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr2 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1
NM_027635 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931423N10 gene (4931423N10Rik), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000028113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:23207476:23267129:1 gene:ENSMUSG00000026774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114505 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:23207497:23264632:1 gene:ENSMUSG00000026774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_006498328 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4931423N10 gene (4931423N10Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_008752 // RefSeq // Mus musculus neurexophilin 2 (Nxph2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:23321246:23401973:1 gene:ENSMUSG00000069132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC106863 // GenBank // Mus musculus neurexophilin 2, mRNA (cDNA clone MGC:124297 IMAGE:40047329), complete cds. // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC106864 // GenBank // Mus musculus neurexophilin 2, mRNA (cDNA clone MGC:124298 IMAGE:40047331), complete cds. // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:23363204:23400423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_027163 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 family, member 8 (Il1f8), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000028363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:24153161:24160519:1 gene:ENSMUSG00000026985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY071842 // GenBank // Mus musculus IL-1F8 (IL1F8) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC119517 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 family, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:141156 IMAGE:40055701), complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000117058 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:24178834:24180317:1 gene:ENSMUSG00000083116 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_153511 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 family, member 9 (Il1f9), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000057567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:24186476:24193568:1 gene:ENSMUSG00000044103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK156687 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830037I23 product:interleukin 1 family, member 9, full insert sequence. // chr2 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// AY071843 // GenBank // Mus musculus IL-1F9 (IL1F9) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC116227 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 family, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:143635 IMAGE:40091521), complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC116228 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 family, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:143636 IMAGE:40091522), complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:24179994:24281372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1
NM_019450 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 family, member 6 (Il1f6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:24215418:24225702:1 gene:ENSMUSG00000026984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:24215505:24225525:1 gene:ENSMUSG00000026984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AF200493 // GenBank // Mus musculus interleukin-1 homolog 1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AF206697 // GenBank // Mus musculus interleukin-1 epsilon (Il1e) mRNA, complete cds. // chr2 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// BC117102 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:151479 IMAGE:40126421), complete cds. // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC117104 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:151481 IMAGE:40126423), complete cds. // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:24179994:24281372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_153077 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 family, member 10 (Il1f10), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:24291196:24293820:1 gene:ENSMUSG00000046845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY071844 // GenBank // Mus musculus IL-1F10 (IL1F10) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107311 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 family, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:130267 IMAGE:40053322), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107312 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 family, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:130268 IMAGE:40053325), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026021 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, MYND domain containing 19 (Zmynd19), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000028350 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:24949792:24962075:1 gene:ENSMUSG00000026974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000148042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:24950210:24959266:1 gene:ENSMUSG00000026974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// AJ409151 // GenBank // Mus musculus mRNA for melanin concentrating hormone receptor interacting zinc finger protein, (mizip gene), splice variant 1. // chr2 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// BC027321 // GenBank // Mus musculus zinc finger, MYND domain containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:28938 IMAGE:3990966), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:24933604:24972010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_025980 // RefSeq // Mus musculus Notch-regulated ankyrin repeat protein (Nrarp), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000104999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:25180758:25183339:1 gene:ENSMUSG00000078202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY046077 // GenBank // Mus musculus ankyrin-repeat protein Nrarp mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048088 // GenBank // Mus musculus Notch-regulated ankyrin repeat protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:6439916), complete cds. // chr2 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC069891 // GenBank // Mus musculus Notch-regulated ankyrin repeat protein, mRNA (cDNA clone MGC:78108 IMAGE:5391567), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:25181111:25186222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000082985 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:2:25208623:25208727:1 gene:ENSMUSG00000064919 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT036176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026624 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 166, member A (Fam166a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006498269 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 166, member A (Fam166a), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000028346 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:25218745:25222280:1 gene:ENSMUSG00000026969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000139988 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:25221358:25222280:1 gene:ENSMUSG00000026969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr2 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC061039 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 166, member A, mRNA (cDNA clone MGC:74147 IMAGE:6704633), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:25218801:25222171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT036179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr2 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
NM_176834 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 208 (Rnf208), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060818 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:25242938:25244262:1 gene:ENSMUSG00000044628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:25242929:25244261:1 gene:ENSMUSG00000044628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC030073 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 208, mRNA (cDNA clone MGC:41319 IMAGE:5254639), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:25241412:25244093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0
NM_177344 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 203 (Tmem203), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000104998 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:25255439:25256292:1 gene:ENSMUSG00000078201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC022606 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C730025P13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:31129 IMAGE:4165766), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:25255670:25256080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_175286 // RefSeq // Mus musculus taperin (Tprn), mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:25262618:25269885:1 gene:ENSMUSG00000048707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC047927 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C430004E15 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4985483). // chr2 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// BC089508 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C430004E15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107193 IMAGE:6589951), complete cds. // chr2 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:25262688:25269418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0