NM_207023 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 120 (Tas2r120), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132656957:132657844:1 gene:ENSMUSG00000059382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207026 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 124 (Tas2r124), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132754730:132755659:1 gene:ENSMUSG00000060412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199153 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 102 (Tas2r102), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000069268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132762131:132763174:1 gene:ENSMUSG00000056901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207021 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 117 (Tas2r117), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000068302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132802818:132803975:1 gene:ENSMUSG00000058349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC132206 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 117, mRNA (cDNA clone MGC:163837 IMAGE:40130483), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC132208 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 117, mRNA (cDNA clone MGC:163839 IMAGE:40130485), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_207025 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 123 (Tas2r123), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132847142:132848143:1 gene:ENSMUSG00000057381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:132778017:132910609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_053212 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 116 (Tas2r116), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132855438:132856355:1 gene:ENSMUSG00000030194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199155 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 110 (Tas2r110), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000082014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132868008:132869009:1 gene:ENSMUSG00000062952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_207018 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 113 (Tas2r113), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132893011:132893940:1 gene:ENSMUSG00000056926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207027 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 125 (Tas2r125), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000076119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132909651:132910587:1 gene:ENSMUSG00000059410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC107190 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 125, mRNA (cDNA clone MGC:130081 IMAGE:40050840), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC107191 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 125, mRNA (cDNA clone MGC:130082 IMAGE:40050841), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_207029 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 129 (Tas2r129), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132951102:132952064:1 gene:ENSMUSG00000063762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000021793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:133092045:133092566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0
NM_001163445 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2700089E24 gene (2700089E24Rik), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000100864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:133105239:133107750:1 gene:ENSMUSG00000072704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AK170805 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630201H01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NR_073368 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2700089E24 gene (2700089E24Rik), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NM_001271583 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2700089E24 gene (2700089E24Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT059142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000187237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:133105290:133110899:1 gene:ENSMUSG00000072704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONMMUT059141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000186945 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:133105492:133106741:1 gene:ENSMUSG00000072704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000191462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:133105256:133110897:1 gene:ENSMUSG00000072704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_027784 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5530400C23 gene (5530400C23Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000048459 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:6:133292216:133295790:1 gene:ENSMUSG00000055594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000021790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:133309930:133312039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_007961 // RefSeq // Mus musculus ets variant 6 (Etv6), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505514 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ets variant gene 6 (TEL oncogene) (Etv6), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000081028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:134035700:134270158:1 gene:ENSMUSG00000030199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000111963 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:134035700:134270158:1 gene:ENSMUSG00000030199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000164648 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:134035969:134248284:1 gene:ENSMUSG00000030199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// AK155150 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630204E23 product:ets variant gene 6 (TEL oncogene), full insert sequence. // chr6 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC052163 // GenBank // Mus musculus ets variant gene 6 (TEL oncogene), mRNA (cDNA clone MGC:59361 IMAGE:6513848), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// Y07915 // GenBank // M.musculus mRNA for TEL protein. // chr6 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1
NM_025778 // RefSeq // Mus musculus BCL2-like 14 (apoptosis facilitator) (Bcl2l14), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000032321 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:134396318:134438736:1 gene:ENSMUSG00000030200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000111960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:134414428:134438115:1 gene:ENSMUSG00000030200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000163589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:134398640:134438724:1 gene:ENSMUSG00000030200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC025541 // GenBank // Mus musculus BCL2-like 14 (apoptosis facilitator), mRNA (cDNA clone MGC:38086 IMAGE:5253808), complete cds. // chr6 // 81 // 64 // 17 // 21 // 0 /// ENSMUST00000142612 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:134414465:134428505:1 gene:ENSMUSG00000030200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// AK035707 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530094F19 product:weakly similar to APOPTOSIS REGULATOR BCL-G SHORT FORM [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000019880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:134415603:134432906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0
NM_001170479 // RefSeq // Mus musculus loss of heterozygosity, 12, chromosomal region 1 homolog (human) (Loh12cr1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NM_026371 // RefSeq // Mus musculus loss of heterozygosity, 12, chromosomal region 1 homolog (human) (Loh12cr1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000062755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:134640940:134711184:1 gene:ENSMUSG00000042992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000166591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:134639627:134711183:1 gene:ENSMUSG00000042992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC023059 // GenBank // Mus musculus loss of heterozygosity, 12, chromosomal region 1 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:35658 IMAGE:5355560), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:134640768:134710271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_177687 // RefSeq // Mus musculus cAMP responsive element binding protein-like 2 (Crebl2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000046303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:134830154:134858931:1 gene:ENSMUSG00000032652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000111937 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:134830255:134856160:1 gene:ENSMUSG00000032652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// BC109358 // GenBank // Mus musculus cAMP responsive element binding protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:130380 IMAGE:40057562), complete cds. // chr6 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// BC109359 // GenBank // Mus musculus cAMP responsive element binding protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:130381 IMAGE:40057564), complete cds. // chr6 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// ENSMUST00000145643 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:134830228:134849594:1 gene:ENSMUSG00000032652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
ENSMUST00000067327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:134920401:134925513:1 gene:ENSMUSG00000003031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC014296 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mRNA (cDNA clone MGC:14079 IMAGE:4193493), complete cds. // chr6 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// CT010382 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D0953D for gene Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B (P27); complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// U09968 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor p27kip1 mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// U10440 // GenBank // Mus musculus G1 cyclin-Cdk protein kinase inhibitor p27 mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// NM_009875 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 1B (Cdkn1b), mRNA. // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSMUST00000003115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:134920401:134925513:1 gene:ENSMUSG00000003031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// AK162146 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420438J11 product:cyclin-dependent kinase inhibitor 1B (P27), full insert sequence. // chr6 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:134920920:134922074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_009875 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 1B (Cdkn1b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000003115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:134920401:134925513:1 gene:ENSMUSG00000003031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:134920401:134925513:1 gene:ENSMUSG00000003031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK154276 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630014G02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001109914 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein L domain containing 1 (Apold1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:134982001:134986836:1 gene:ENSMUSG00000090698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:134926868:134984325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181444 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member A (Gprc5a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506038 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member A (Gprc5a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000050104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:135065651:135084709:1 gene:ENSMUSG00000046733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC036173 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member A, mRNA (cDNA clone MGC:37603 IMAGE:4989149), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC039217 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member A, mRNA (cDNA clone MGC:31202 IMAGE:4205657), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:135056567:135083833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_028982 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 8430419L09 gene (8430419L09Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:135197977:135236242:1 gene:ENSMUSG00000030207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC137674 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 8430419L09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169298 IMAGE:8860693), complete cds. // chr6 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// BC137676 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 8430419L09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169300 IMAGE:8860695), complete cds. // chr6 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:135197977:135244955:1 gene:ENSMUSG00000030207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:135198065:135234972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK039348 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330029H11 product:hypothetical Quinoprotein alcohol dehydrogenase structure containing protein, full insert sequence. // chr6 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1
ENSMUST00000083253 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:135584192:135584306:1 gene:ENSMUSG00000065187 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT059206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000157253 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:136281227:136281416:1 gene:ENSMUSG00000087878 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000118247 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:136383838:136384837:1 gene:ENSMUSG00000083916 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:136384232:136387109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT059224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000157784 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:136417812:136417896:1 gene:ENSMUSG00000088409 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// NONMMUT059225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0
XM_006506390 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus activating transcription factor 7 interacting protein (Atf7ip), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000032335 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:136518802:136611038:1 gene:ENSMUSG00000030213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT059236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_177688 // RefSeq // Mus musculus H2A histone family, member J (H2afj), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000074556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:136808244:136810070:1 gene:ENSMUSG00000060032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC024397 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member J, mRNA (cDNA clone MGC:36202 IMAGE:5055276), complete cds. // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC099606 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member J, mRNA (cDNA clone MGC:118637 IMAGE:1383389), complete cds. // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
XM_006506266 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC049715 (BC049715), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000163640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:136839764:136840507:1 gene:ENSMUSG00000047515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AK044622 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930027N24 product:hypothetical NAD(P)-binding Rossmann-fold domains structure containing protein, full insert sequence. // chr6 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// NM_178776 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC049715 (BC049715), mRNA. // chr6 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// XM_006506261 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC049715 (BC049715), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// XM_006506264 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC049715 (BC049715), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENSMUST00000052702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:136828843:136840536:1 gene:ENSMUSG00000047515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// BC049715 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC049715, mRNA (cDNA clone MGC:58672 IMAGE:6741857), complete cds. // chr6 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// AK147870 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270073A20 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000005555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:136839764:136840507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT059247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_011499 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine kinase receptor associated protein (Strap), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006505831 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/threonine kinase receptor associated protein (Strap), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:137735078:137751932:1 gene:ENSMUSG00000030224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF096285 // GenBank // Mus musculus serine-threonine kinase receptor-associated protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// BC141076 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase receptor associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:176037 IMAGE:9055688), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// BC145342 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase receptor associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:178906 IMAGE:9053898), complete cds. // chr6 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000005558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:137695978:137749437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 27 // 38 // 1
NM_172733 // RefSeq // Mus musculus 2-deoxyribose-5-phosphate aldolase homolog (C. elegans) (Dera), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506041 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 2-deoxyribose-5-phosphate aldolase homolog (C. elegans) (Dera), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000087675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:137754542:137837891:1 gene:ENSMUSG00000030225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016218 // GenBank // Mus musculus 2-deoxyribose-5-phosphate aldolase homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:28759 IMAGE:4484163), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006506040 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 2-deoxyribose-5-phosphate aldolase homolog (C. elegans) (Dera), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// AK034347 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330181A19 product:hypothetical Deoxyribose-phosphate aldolase containing protein, full insert sequence. // chr6 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// AK030961 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830470O22 product:similar to Putative deoxyribose-phosphate aldolase (EC 4.1.2.4) (Phosphodeoxyriboaldolase) (Deoxyriboaldolase) (DERA) [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000003767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:137772233:137798456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_019946 // RefSeq // Mus musculus microsomal glutathione S-transferase 1 (Mgst1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000008684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:138140316:138156755:1 gene:ENSMUSG00000008540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118091 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:138141586:138156612:1 gene:ENSMUSG00000008540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000120230 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:138141370:138156559:1 gene:ENSMUSG00000008540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000120302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:138140599:138156384:1 gene:ENSMUSG00000008540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000120939 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:138140528:138156605:1 gene:ENSMUSG00000008540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000140932 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:138140571:138156742:1 gene:ENSMUSG00000008540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AF159050 // GenBank // Mus musculus microsomal glutathione S-transferase (Gst) mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// BC009155 // GenBank // Mus musculus microsomal glutathione S-transferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6549 IMAGE:2655738), complete cds. // chr6 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:138093701:138154084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_007605 // RefSeq // Mus musculus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 3 (Capza3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000043797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:140041557:140042778:1 gene:ENSMUSG00000041791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049620 // GenBank // Mus musculus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:58333 IMAGE:6770504), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// D87471 // GenBank // Mus musculus mRNA for gsg3, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:140041677:140050985:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000083948 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:140319630:140319733:1 gene:ENSMUSG00000065882 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000037432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:140444963:140452833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC006653 // GenBank // Mus musculus hypothetical protein LOC620031, mRNA (cDNA clone MGC:7817 IMAGE:3500159), complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
BC005705 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC005705, mRNA (cDNA clone MGC:11898 IMAGE:3598523), complete cds. // chr6 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0
NM_018779 // RefSeq // Mus musculus phosphodiesterase 3A, cGMP inhibited (Pde3a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000043259 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:141249269:141505940:1 gene:ENSMUSG00000041741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF099187 // GenBank // Mus musculus cGMP-inhibited phosphodiesterase (PDE3A) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK004638 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1200007J10 product:phosphodiesterase 3A, cGMP inhibited, full insert sequence. // chr6 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// AK052374 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330042O15 product:phosphodiesterase 3A, cGMP inhibited, full insert sequence. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK164864 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930030E20 product:phosphodiesterase 3A, cGMP inhibited, full insert sequence. // chr6 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// BC138265 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 3A, cGMP inhibited, mRNA (cDNA clone MGC:169889 IMAGE:8861284), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC138266 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 3A, cGMP inhibited, mRNA (cDNA clone MGC:169890 IMAGE:8861285), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// XM_006506979 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphodiesterase 3A, cGMP inhibited (Pde3a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1 /// GENSCAN00000054039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:141437931:141498893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NR_033555 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10400 (Gm10400), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY512955 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0956B04 unknown mRNA. // chr6 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NM_001177772 // RefSeq // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 1c1 (Slco1c1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_021471 // RefSeq // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 1c1 (Slco1c1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000032362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:141524386:141570177:1 gene:ENSMUSG00000030235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000135562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:141524386:141569720:1 gene:ENSMUSG00000030235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK161010 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4022446N14 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AY007379 // GenBank // Mus musculus organic anion transporter 2 (Oatp2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC078456 // GenBank // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 1c1, mRNA (cDNA clone MGC:90655 IMAGE:30360663), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:141519813:141576167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0
NM_020495 // RefSeq // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 1b2 (Slco1b2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000042812 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:141629518:141686646:1 gene:ENSMUSG00000030236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB031959 // GenBank // Mus musculus mRNA for liver transporter lst-1, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF250912 // GenBank // Mus musculus liver-specific transporter-1 (Slc21A6) mRNA, partial cds. // chr6 // 85 // 41 // 11 // 13 // 0
NM_010491 // RefSeq // Mus musculus islet amyloid polypeptide (Iapp), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:142298423:142303961:1 gene:ENSMUSG00000041681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027527 // GenBank // Mus musculus islet amyloid polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:41171 IMAGE:1379049), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M25389 // GenBank // Mouse islet amyloid polypeptide mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000141583 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:142298447:142299066:1 gene:ENSMUSG00000041681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT059339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_183165 // RefSeq // Mus musculus pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1 (Pyroxd1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506954 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1 (Pyroxd1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006506955 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1 (Pyroxd1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000041852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:142345654:142363257:1 gene:ENSMUSG00000041671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123289 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:142346936:142357520:1 gene:ENSMUSG00000041671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000137098 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:142345678:142362051:1 gene:ENSMUSG00000041671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC027061 // GenBank // Mus musculus pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:38601 IMAGE:5355217), complete cds. // chr6 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:142298849:142362002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_025872 // RefSeq // Mus musculus golgi transport 1 homolog B (S. cerevisiae) (Golt1b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506980 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus golgi transport 1 homolog B (S. cerevisiae) (Golt1b), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000032372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:142387221:142403858:1 gene:ENSMUSG00000030245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK009991 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310061A22 product:CGI-141 PROTEIN (SIMILAR TO CGI-141 PROTEIN) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC085246 // GenBank // Mus musculus golgi transport 1 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:102411 IMAGE:30458855), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006506981 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus golgi transport 1 homolog B (S. cerevisiae) (Golt1b), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000146508 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:142387253:142401710:1 gene:ENSMUSG00000030245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:142387433:142418801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT059346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001242345 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA B230216G23 gene (B230216G23Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506966 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA B230216G23 gene (B230216G23Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:142413441:142419730:1 gene:ENSMUSG00000071112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123209 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:142414521:142419730:1 gene:ENSMUSG00000071112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000126521 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:142413833:142418571:1 gene:ENSMUSG00000071112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000141548 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:142414012:142419730:1 gene:ENSMUSG00000071112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK045625 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230216G23 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT059349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONMMUT059350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT059351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000045745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:142387433:142418801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NR_037679 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5330439B14 gene (5330439B14Rik), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147438 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5330439B14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182186 IMAGE:9056080), complete cds. // chr6 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC147456 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5330439B14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182204 IMAGE:9056098), complete cds. // chr6 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT059362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_009908 // RefSeq // Mus musculus cytidine monophospho-N-acetylneuraminic acid synthetase (Cmas), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000032419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:142756686:142775714:1 gene:ENSMUSG00000030282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000133248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:142756754:142770590:1 gene:ENSMUSG00000030282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 88 // 50 // 14 // 16 // 0 /// AK087150 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030030D16 product:cytidine monophospho-N-acetylneuraminic acid synthetase, full insert sequence. // chr6 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC031500 // GenBank // Mus musculus cytidine monophospho-N-acetylneuraminic acid synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:27736 IMAGE:2647633), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC063776 // GenBank // Mus musculus cytidine monophospho-N-acetylneuraminic acid synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:70211 IMAGE:6398450), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSMUST00000144920 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:142756764:142772734:1 gene:ENSMUSG00000030282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// ENSMUST00000146643 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:142769966:142771334:1 gene:ENSMUSG00000030282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000008158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:142756773:142775340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT059364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NR_045707 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 7457 (Gm7457), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:142814231:142833494:1 gene:ENSMUSG00000072683 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029250 // RefSeq // Mus musculus ethanolamine kinase 1 (Etnk1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000032413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:143167230:143208542:1 gene:ENSMUSG00000030275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK031560 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030452M24 product:ETHANOLAMINE KINASE (EC 2.7.1.82) (EKI) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// AK051039 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030059C18 product:ETHANOLAMINE KINASE (EC 2.7.1.82) (EKI) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// XM_006507011 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ethanolamine kinase 1 (Etnk1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// XM_006507012 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ethanolamine kinase 1 (Etnk1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// AK164928 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030028B01 product:ethanolamine kinase 1, full insert sequence. // chr6 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000008221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:143171252:143198181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NR_027803 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 474, expressed (D6Ertd474e), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000100817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:143245893:143297272:1 gene:ENSMUSG00000072679 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:143245888:143295708:1 gene:ENSMUSG00000072679 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000159793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:143245888:143249112:1 gene:ENSMUSG00000072679 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000161174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:143245893:143296073:1 gene:ENSMUSG00000072679 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONMMUT059386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT059388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT059387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONMMUT059389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NR_003625 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700073E17 gene (1700073E17Rik), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:145390308:145392049:1 gene:ENSMUSG00000087204 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000148424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:145391426:145392166:1 gene:ENSMUSG00000087204 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000152419 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:145387597:145392240:1 gene:ENSMUSG00000087204 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049631 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700073E17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6771135). // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:145391426:145391893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
NM_009449 // RefSeq // Mus musculus tubulin, alpha 3B (Tuba3b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000087445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:145615757:145621479:1 gene:ENSMUSG00000067338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC050769 // GenBank // Mus musculus tubulin, alpha 3B, mRNA (cDNA clone MGC:58314 IMAGE:6771187), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// M13443 // GenBank // Mouse alpha-tubulin isotype M-alpha-7 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000024624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:145611632:145621387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// AK006344 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700025I19 product:tubulin alpha 7, full insert sequence. // chr6 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
NM_027760 // RefSeq // Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family (N-terminal) member 8 (Rassf8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000032388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:145808383:145817584:1 gene:ENSMUSG00000030259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000111704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:145746748:145821079:1 gene:ENSMUSG00000030259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:145750571:145815188:1 gene:ENSMUSG00000030259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AF424737 // GenBank // Mus musculus carcinoma associated protein-like protein (Hoj1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK031980 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330521L19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// BC115779 // GenBank // Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family (N-terminal) member 8, mRNA (cDNA clone MGC:144731 IMAGE:40105476), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC117546 // GenBank // Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family (N-terminal) member 8, mRNA (cDNA clone MGC:144732 IMAGE:40105479), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XR_389906 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102641079 (LOC102641079), transcript variant X2, ncRNA. // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000053852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:145808460:145860553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000058538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:145819944:145821074:1 gene:ENSMUSG00000030259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000045110 // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000111704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:145746748:145821079:1 gene:ENSMUSG00000030259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC025009 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5041748. // chr6 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// NONMMUT059478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_010656 // RefSeq // Mus musculus sarcospan (Sspn), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506917 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sarcospan (Sspn), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000032383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:145934122:145965223:1 gene:ENSMUSG00000030255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111701 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:145953429:145965223:1 gene:ENSMUSG00000030255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000111702 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:145931641:145965223:1 gene:ENSMUSG00000030255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC021484 // GenBank // Mus musculus sarcospan, mRNA (cDNA clone MGC:36063 IMAGE:5344514), complete cds. // chr6 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// U02487 // GenBank // Mus musculus LAF putative membrane protein (KRAG) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:145934174:145961495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_026218 // RefSeq // Mus musculus FGFR1 oncogene partner 2 (Fgfr1op2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000067404 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:146577859:146599198:1 gene:ENSMUSG00000040242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000111663 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:146577859:146599198:1 gene:ENSMUSG00000040242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC028876 // GenBank // Mus musculus FGFR1 oncogene partner 2, mRNA (cDNA clone MGC:25495 IMAGE:4504364), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000058245 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:146577921:146592865:1 gene:ENSMUSG00000040242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_025315 // RefSeq // Mus musculus mediator complex subunit 21 (Med21), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:146642547:146650602:1 gene:ENSMUSG00000030291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075077 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:146647160:146650602:1 gene:ENSMUSG00000030291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000125539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:146642547:146650602:1 gene:ENSMUSG00000030291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000134387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:146642581:146650602:1 gene:ENSMUSG00000030291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC012286 // GenBank // Mus musculus mediator complex subunit 21, mRNA (cDNA clone MGC:19430 IMAGE:3493056), complete cds. // chr6 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// BC096641 // GenBank HTC // Mus musculus mediator complex subunit 21, mRNA (cDNA clone IMAGE:578041), with apparent retained intron. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000111650 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:146642580:146649533:1 gene:ENSMUSG00000030291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT059515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_172734 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine kinase 38 like (Stk38l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006507027 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/threonine kinase 38 like (Stk38l), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006507030 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/threonine kinase 38 like (Stk38l), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000001675 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:146724995:146778812:1 gene:ENSMUSG00000001630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY223819 // GenBank // Mus musculus putative serine/threonine kinase NDRB mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000033234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:146758472:146783274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 70 // 5 // 7 // 0
NM_027059 // RefSeq // Mus musculus single-pass membrane protein with coiled-coil domains 2 (Smco2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006544104 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus single-pass membrane protein with coiled-coil domains 2 (Smco2), mRNA. // chr6 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000032433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:146850104:146871404:1 gene:ENSMUSG00000030292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000111634 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:146850104:146871406:1 gene:ENSMUSG00000030292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:146796120:146871345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_025620 // RefSeq // Mus musculus RAB15 effector protein (Rep15), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:147032537:147033518:1 gene:ENSMUSG00000040121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024344 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2210417D09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35727 IMAGE:4988964), complete cds. // chr6 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:147032665:147033357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
AK079835 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430079E08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081237 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 42 (Klhl42), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:147091379:147112778:1 gene:ENSMUSG00000040102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC037084 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:5101372), partial cds. // chr6 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// BC147633 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:182729 IMAGE:9056623), complete cds. // chr6 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC147636 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:182732 IMAGE:9056626), complete cds. // chr6 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC151064 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:183977 IMAGE:9087977), complete cds. // chr6 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC151065 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:183978 IMAGE:9087978), complete cds. // chr6 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC151068 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:183981 IMAGE:9087981), complete cds. // chr6 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC151076 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:183989 IMAGE:9087989), complete cds. // chr6 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:147091532:147104548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NR_033640 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E330012B07 gene (E330012B07Rik), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151979 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:147180244:147208285:1 gene:ENSMUSG00000085600 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025911 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 91 (Ccdc91), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006536095 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 91 (Ccdc91), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000032441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:147475871:147632612:1 gene:ENSMUSG00000030301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC006734 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 91, mRNA (cDNA clone MGC:7043 IMAGE:3156328), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC024946 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 91, mRNA (cDNA clone MGC:28290 IMAGE:4010938), complete cds. // chr6 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// BC049073 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 91, mRNA (cDNA clone MGC:61373 IMAGE:5707404), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:147507798:147623867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_178797 // RefSeq // Mus musculus fatty acyl CoA reductase 2 (Far2), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006507070 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fatty acyl CoA reductase 2 (Far2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000032443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:148047259:148176849:1 gene:ENSMUSG00000030303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:148047416:148182758:1 gene:ENSMUSG00000030303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC055759 // GenBank // Mus musculus fatty acyl CoA reductase 2, mRNA (cDNA clone MGC:67167 IMAGE:6809131), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:148105767:148175967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NR_003634 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein S4-like (Rps4l), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000071745 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:148354656:148355598:1 gene:ENSMUSG00000063171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:148354710:148388627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
XR_378198 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 3010003L21 gene (3010003L21Rik), misc_RNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000154673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:148944867:148947129:1 gene:ENSMUSG00000085355 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK076146 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3010003L21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC106181 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6334265. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000047953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:148944867:148947121:1 gene:ENSMUSG00000085355 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// NONMMUT059606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000087348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:149130170:149130710:1 gene:ENSMUSG00000067292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_025788 // RefSeq // Mus musculus nucleus accumbens associated 1, BEN and BTB (POZ) domain containing (Nacc1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006531294 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleus accumbens associated 1, BEN and BTB (POZ) domain containing (Nacc1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000001975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84670483:84687862:-1 gene:ENSMUSG00000001910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120260 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:149361686:149363147:1 gene:ENSMUSG00000081126 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC048157 // GenBank // Mus musculus nucleus accumbens associated 1, BEN and BTB (POZ) domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:61327 IMAGE:5697941), complete cds. // chr6 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC052706 // GenBank // Mus musculus nucleus accumbens associated 1, BEN and BTB (POZ) domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:64707 IMAGE:5702150), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC054800 // GenBank // Mus musculus nucleus accumbens associated 1, BEN and BTB (POZ) domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:65691 IMAGE:6850337), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:149331999:149362964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84662086:84677244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_010156 // RefSeq // Mus musculus sterile alpha motif domain containing 9-like (Samd9l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:3372257:3399571:-1 gene:ENSMUSG00000047735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:3319969:3377259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 75 // 64 // 12 // 16 // 0
NM_178899 // RefSeq // Mus musculus HEPACAM family member 2 (Hepacam2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006504957 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HEPACAM family member 2 (Hepacam2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504958 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HEPACAM family member 2 (Hepacam2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006504959 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HEPACAM family member 2 (Hepacam2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504960 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HEPACAM family member 2 (Hepacam2), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504961 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HEPACAM family member 2 (Hepacam2), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049985 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:3457089:3494594:-1 gene:ENSMUSG00000044156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000184466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:3457395:3487380:-1 gene:ENSMUSG00000044156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC096374 // GenBank // Mus musculus HEPACAM family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:106116 IMAGE:4483627), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:3389559:3487484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NR_030612 // RefSeq // Mus musculus microRNA 653 (Mir653), microRNA. // chr6 // 78 // 92 // 18 // 23 // 0 /// ENSMUST00000102402 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:3721301:3721385:-1 gene:ENSMUSG00000076357 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 78 // 92 // 18 // 23 // 0 /// mmu-mir-653 // miRBase Micro RNA Database // MI0005557 Mus musculus miR-653 stem-loop // chr6 // 78 // 92 // 18 // 23 // 0 /// NONMMUT055560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 78 // 92 // 18 // 23 // 0
NR_030250 // RefSeq // Mus musculus microRNA 489 (Mir489), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093599 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:3721897:3722003:-1 gene:ENSMUSG00000070107 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-489 // miRBase Micro RNA Database // MI0003476 Mus musculus miR-489 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009364 // RefSeq // Mus musculus tissue factor pathway inhibitor 2 (Tfpi2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:3962589:3968357:-1 gene:ENSMUSG00000029664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021639 // GenBank // Mus musculus tissue factor pathway inhibitor 2, mRNA (cDNA clone MGC:13885 IMAGE:4023742), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D50586 // GenBank // Mus musculus mRNA for PP5/TFPI2, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:3948406:3968356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_009748 // RefSeq // Mus musculus blocked early in transport 1 homolog (S. cerevisiae) (Bet1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000049166 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:4076899:4086972:-1 gene:ENSMUSG00000032757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF007552 // GenBank // Mus musculus Bet1p homolog (mbet1) mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC005572 // GenBank // Mus musculus blocked early in transport 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:11601 IMAGE:3967968), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504971 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus blocked early in transport 1 homolog (S. cerevisiae) (Bet1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000145696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:4081495:4086930:-1 gene:ENSMUSG00000032757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000150319 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:4080318:4086972:-1 gene:ENSMUSG00000032757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AK053940 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230003M19 product:blocked early in transport 1 homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000025198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:4063837:4103280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT055568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT055569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_011134 // RefSeq // Mus musculus paraoxonase 1 (Pon1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006505011 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus paraoxonase 1 (Pon1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000002663 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:5168090:5193946:-1 gene:ENSMUSG00000002588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000176945 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:5171783:5193784:-1 gene:ENSMUSG00000002588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000177159 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:5168495:5193784:-1 gene:ENSMUSG00000002588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC012706 // GenBank // Mus musculus paraoxonase 1, mRNA (cDNA clone MGC:13984 IMAGE:4158951), complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// U32684 // GenBank // Mus musculus serum paraoxonase (Pon) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U72636 // GenBank // Mus musculus paraoxonase (Pon1) mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:5168338:5188815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_173006 // RefSeq // Mus musculus paraoxonase 3 (Pon3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031773 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:5220852:5256286:-1 gene:ENSMUSG00000029759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000125686 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:5232394:5256235:-1 gene:ENSMUSG00000029759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000129344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:5220852:5256233:-1 gene:ENSMUSG00000029759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC005714 // GenBank // Mus musculus paraoxonase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3594399), complete cds. // chr6 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC099416 // GenBank // Mus musculus paraoxonase 3, mRNA (cDNA clone MGC:117584 IMAGE:30847745), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// L76193 // GenBank // Mus musculus paraoxonase-3 (Pon3) mRNA, complete cds. // chr6 // 85 // 90 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000156848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:5236433:5256214:-1 gene:ENSMUSG00000029759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// ENSMUST00000176948 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:5236876:5254866:-1 gene:ENSMUSG00000029759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000045867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:5208911:5256226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_183308 // RefSeq // Mus musculus paraoxonase 2 (Pon2), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000057792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:5264147:5298455:-1 gene:ENSMUSG00000032667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000123838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:5270173:5298330:-1 gene:ENSMUSG00000032667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// BC021887 // GenBank // Mus musculus paraoxonase 2, mRNA (cDNA clone MGC:11614 IMAGE:3154583), complete cds. // chr6 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// BC037140 // GenBank // Mus musculus paraoxonase 2, mRNA (cDNA clone MGC:46933 IMAGE:5027719), complete cds. // chr6 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// BC055896 // GenBank // Mus musculus paraoxonase 2, mRNA (cDNA clone MGC:68232 IMAGE:3482584), complete cds. // chr6 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// BC062200 // GenBank // Mus musculus paraoxonase 2, mRNA (cDNA clone MGC:70230 IMAGE:6399484), complete cds. // chr6 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// L48514 // GenBank // Mus musculus paraoxonase 2 (PON2) mRNA, complete cds. // chr6 // 73 // 72 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:5265321:5274444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// GENSCAN00000045861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:5276609:5298285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_013743 // RefSeq // Mus musculus pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 4 (Pdk4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000019721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:5483351:5496309:-1 gene:ENSMUSG00000019577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK004543 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1200002E01 product:pyruvate dehydrogenase kinase 4, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC026134 // GenBank // Mus musculus pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 4, mRNA (cDNA clone MGC:13840 IMAGE:4188580), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:5485449:5496162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
NM_009169 // RefSeq // Mus musculus split hand/foot malformation (ectrodactyly) type 1 (Shfm1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:6557294:6578658:-1 gene:ENSMUSG00000042541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK135462 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo female mullerian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6820424O05 product:split hand/foot deleted gene 1, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC023490 // GenBank // Mus musculus split hand/foot malformation (ectrodactyly) type 1, mRNA (cDNA clone MGC:31011 IMAGE:5251089), complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC058117 // GenBank // Mus musculus split hand/foot malformation (ectrodactyly) type 1, mRNA (cDNA clone MGC:69637 IMAGE:6412144), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U41626 // GenBank // Mus musculus deleted in split hand/split foot 1 homolog (Dss1) mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
ENSMUST00000083836 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:6924118:6924279:-1 gene:ENSMUSG00000065770 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT055666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001080127 // RefSeq // Mus musculus ribonucleic acid binding protein S1 (Rnps1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001080128 // RefSeq // Mus musculus ribonucleic acid binding protein S1 (Rnps1), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_009070 // RefSeq // Mus musculus ribonucleic acid binding protein S1 (Rnps1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000088512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24414675:24425895:1 gene:ENSMUSG00000034681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000115371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24414675:24425895:1 gene:ENSMUSG00000034681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000163717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24414675:24425895:1 gene:ENSMUSG00000034681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000178598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:7981829:7983430:-1 gene:ENSMUSG00000096403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC002061 // GenBank // Mus musculus ribonucleic acid binding protein S1, mRNA (cDNA clone MGC:6115 IMAGE:3485311), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC008089 // GenBank // Mus musculus ribonucleic acid binding protein S1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3586615), partial cds. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24364533:24439935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001037865 // RefSeq // Mus musculus collagen, type XXVIII, alpha 1 (Col28a1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006505034 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collagen, type XXVIII, alpha 1 (Col28a1), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000115537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:7997808:8192617:-1 gene:ENSMUSG00000068794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:7998482:8128182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
NM_026632 // RefSeq // Mus musculus replication protein A3 (Rpa3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000012627 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:8255936:8259173:-1 gene:ENSMUSG00000012483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AK088697 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430023O07 product:similar to REPLICATION PROTEIN A 14 KDA SUBUNIT (RP-A) (RF-A) (REPLICATION FACTOR-A PROTEIN 3) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// BC028489 // GenBank // Mus musculus replication protein A3, mRNA (cDNA clone MGC:41008 IMAGE:1448430), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT055695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000002276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:8242566:8267567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
ENSMUST00000161905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:8595743:8596989:-1 gene:ENSMUSG00000090234 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000169578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:8595738:8596988:-1 gene:ENSMUSG00000090407 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT055725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT055726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:8596452:8623973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NM_010886 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 4 (Ndufa4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000031637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:11900373:11907446:-1 gene:ENSMUSG00000029632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC011114 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 4, mRNA (cDNA clone MGC:7218 IMAGE:3483028), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// U59509 // GenBank // Mus musculus mlrq-like protein mRNA, partial cds. // chr6 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// XM_006505003 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 4 (Ndufa4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NR_003631 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6578 (Gm6578), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000080891 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:12099518:12109583:-1 gene:ENSMUSG00000057223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT055761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001164805 // RefSeq // Mus musculus thrombospondin, type I, domain containing 7A (Thsd7a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000046121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:12311610:12749253:-1 gene:ENSMUSG00000032625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000119581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:12317087:12749410:-1 gene:ENSMUSG00000032625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000122369 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:12317349:12419361:-1 gene:ENSMUSG00000032625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000172356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:12311610:12749253:-1 gene:ENSMUSG00000032625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK133324 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932433E03 product:Hypothetical protein GS164B05.1 in chromosome 7 (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:12216211:12504139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001013757 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor D and EGF domains (Vwde), mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000054530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:13185613:13224965:-1 gene:ENSMUSG00000079679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// BC076621 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor D and EGF domains, mRNA (cDNA clone IMAGE:30645657), complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// BC151200 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor D and EGF domains, mRNA (cDNA clone MGC:184099 IMAGE:9088088), complete cds. // chr6 // 100 // 55 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:13089624:13224863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0
NM_028990 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 168 (Tmem168), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006504952 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 168 (Tmem168), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031554 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:13580687:13608100:-1 gene:ENSMUSG00000029569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC007160 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 168, mRNA (cDNA clone MGC:7406 IMAGE:3488466), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC024911 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 168, mRNA (cDNA clone MGC:27964 IMAGE:3594306), complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000149123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:13580687:13608100:-1 gene:ENSMUSG00000029569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:13461458:13618420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_175312 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA B630005N14 gene (B630005N14Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:13625677:13677966:-1 gene:ENSMUSG00000042742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145708 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B630005N14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175595 IMAGE:40131011), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC145710 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B630005N14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175597 IMAGE:40131013), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:13628471:13664369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_145066 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 85 (Gpr85), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006505158 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 85 (Gpr85), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000060442 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:13834458:13839942:-1 gene:ENSMUSG00000048216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:13835077:13837241:-1 gene:ENSMUSG00000048216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000115492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:13835068:13838454:-1 gene:ENSMUSG00000048216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AK043090 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730054N22 product:G-protein coupled receptor, SREB2 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC026975 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 85, mRNA (cDNA clone MGC:38964 IMAGE:5363257), complete cds. // chr6 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC065154 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 85, mRNA (cDNA clone MGC:90042 IMAGE:6418997), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NR_024619 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2610001J05 gene (2610001J05Rik), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000139231 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:13867735:13871518:-1 gene:ENSMUSG00000052419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000155856 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:13869800:13871466:-1 gene:ENSMUSG00000052419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000185361 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:13870001:13871465:-1 gene:ENSMUSG00000052419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000185219 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:13869860:13871465:-1 gene:ENSMUSG00000052419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
GENSCAN00000022791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:14081328:14082815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
NM_080464 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3A (Ppp1r3a), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:14713822:14755274:-1 gene:ENSMUSG00000042717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC109007 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3A, mRNA (cDNA clone MGC:124391 IMAGE:40048493), complete cds. // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000022797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:14592576:14755525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_031198 // RefSeq // Mus musculus transcription factor EC (Tfec), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006505036 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor EC (Tfec), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000031533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:16833381:16898441:-1 gene:ENSMUSG00000029553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF077742 // GenBank // Mus musculus transcription factor TFEC mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC098494 // GenBank // Mus musculus transcription factor EC, mRNA (cDNA clone MGC:107474 IMAGE:6431607), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK157426 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830215O09 product:transcription factor EC, full insert sequence. // chr6 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
ENSMUST00000138170 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:17162079:17171746:-1 gene:ENSMUSG00000054556 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000139701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:17076261:17171833:-1 gene:ENSMUSG00000054556 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000166070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:17171389:17171810:-1 gene:ENSMUSG00000054556 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AK047082 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930018B01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_377360 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4876 (Gm4876), transcript variant X1, misc_RNA. // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// XR_377362 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4876 (Gm4876), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK163699 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930031I24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT055844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT055851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_023653 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 2 (Wnt2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006505045 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus wingless-related MMTV integration site 2 (Wnt2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000010941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:17988940:18030585:-1 gene:ENSMUSG00000010797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000156317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:17989215:18030410:-1 gene:ENSMUSG00000010797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC026373 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 2, mRNA (cDNA clone MGC:31115 IMAGE:4162686), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:17999748:18030287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_080285 // RefSeq // Mus musculus cortactin binding protein 2 (Cttnbp2), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000090601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:18366547:18514869:-1 gene:ENSMUSG00000000416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000146775 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:18366565:18434451:-1 gene:ENSMUSG00000000416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000148602 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:18366707:18514749:-1 gene:ENSMUSG00000000416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:18366478:18428231:-1 gene:ENSMUSG00000000416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK081137 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930091O06 product:CORTACTIN-BINDING PROTEIN 2 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC141407 // GenBank // Mus musculus cortactin binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:176369 IMAGE:9056020), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:18367342:18514735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000157206 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:21013112:21013242:-1 gene:ENSMUSG00000087831 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173007 // RefSeq // Mus musculus tetraspanin 12 (Tspan12), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031678 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:21771395:21852515:-1 gene:ENSMUSG00000029669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120965 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:21771395:21852088:-1 gene:ENSMUSG00000029669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000123116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:21795578:21851981:-1 gene:ENSMUSG00000029669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000134635 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:21799950:21851914:-1 gene:ENSMUSG00000029669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// BC065152 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 12, mRNA (cDNA clone MGC:90024 IMAGE:6808971), complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC068240 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 12, mRNA (cDNA clone MGC:25702 IMAGE:3674585), complete cds. // chr6 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:21767074:21866870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_013930 // RefSeq // Mus musculus aminoadipate-semialdehyde synthase (Aass), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000031707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:23072173:23132986:-1 gene:ENSMUSG00000029695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000138063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:23092283:23127580:-1 gene:ENSMUSG00000029695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 92 // 26 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000149864 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:23092283:23127612:-1 gene:ENSMUSG00000029695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 21 // 9 // 10 // 0 /// BC005420 // GenBank // Mus musculus aminoadipate-semialdehyde synthase, mRNA (cDNA clone MGC:5717 IMAGE:3600654), complete cds. // chr6 // 91 // 98 // 42 // 46 // 0 /// GENSCAN00000014204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23072972:23122722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0
ENSMUST00000096092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:23165338:23167413:-1 gene:ENSMUSG00000096702 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000096093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:23157986:23160061:-1 gene:ENSMUSG00000094300 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000164674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:50608637:50610709:1 gene:ENSMUSG00000092012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000168705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:50619822:50621885:-1 gene:ENSMUSG00000091981 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23165338:23167413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23157986:23160061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:50619813:50621885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:50608637:50610715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
ENSMUST00000096092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:23165338:23167413:-1 gene:ENSMUSG00000096702 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000096093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:23157986:23160061:-1 gene:ENSMUSG00000094300 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000164674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:50608637:50610709:1 gene:ENSMUSG00000092012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000168705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:50619822:50621885:-1 gene:ENSMUSG00000091981 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23165338:23167413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23157986:23160061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:50619813:50621885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:50608637:50610715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0
NM_028462 // RefSeq // Mus musculus Fez family zinc finger 1 (Fezf1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006505174 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Fez family zinc finger 1 (Fezf1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006505175 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Fez family zinc finger 1 (Fezf1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000031709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:23245047:23248264:-1 gene:ENSMUSG00000029697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK014242 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110069A13 product:similar to ZINC FINGER PROTEIN FEZ [Xenopus laevis], full insert sequence. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC119565 // GenBank // Mus musculus Fez family zinc finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:141292 IMAGE:40057718), complete cds. // chr6 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// BC119566 // GenBank // Mus musculus Fez family zinc finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:141293 IMAGE:40057721), complete cds. // chr6 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23245737:23259961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_198251 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 133 (Rnf133), mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063548 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:23648869:23650305:-1 gene:ENSMUSG00000051956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115354 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:23648874:23650206:-1 gene:ENSMUSG00000051956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC116423 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 133, mRNA (cDNA clone MGC:144596 IMAGE:40103909), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC116424 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 133, mRNA (cDNA clone MGC:144597 IMAGE:40103912), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23648909:23650057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_027754 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 148 (Rnf148), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000104979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:23653898:23655136:-1 gene:ENSMUSG00000078179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY155440 // GenBank // Mus musculus goliath-related E3 ubiquitin ligase 3 (Greul3) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23654045:23654956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_207022 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 118 (Tas2r118), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:23969161:23970060:-1 gene:ENSMUSG00000043865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104401 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 118, mRNA (cDNA clone MGC:129507 IMAGE:40050472), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23969161:23969514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_019481 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 13 (sodium/sulfate symporters), member 1 (Slc13a1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006505139 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 13 (sodium/sulfate symporters), member 1 (Slc13a1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// XM_006505140 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 13 (sodium/sulfate symporters), member 1 (Slc13a1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000031713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:24088283:24168092:-1 gene:ENSMUSG00000029700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000174594 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:24088550:24108574:-1 gene:ENSMUSG00000029700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// AF199365 // GenBank // Mus musculus renal sodium sulfate cotransporter (Nas1), isoform 1 mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// AF199366 // GenBank // Mus musculus renal sodium sulfate cotransporter (Nas1), isoform 2 mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// AK005153 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500004P08 product:solute carrier family 13 (sodium/sulphate symporters), member 1, full insert sequence. // chr6 // 94 // 52 // 15 // 16 // 0 /// BC049981 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 13 (sodium/sulfate symporters), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:58898 IMAGE:5065026), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000023011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:24023432:24137111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_172535 // RefSeq // Mus musculus IQ motif and ubiquitin domain containing (Iqub), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052277 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:24444865:24515067:-1 gene:ENSMUSG00000046192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137937 // GenBank // Mus musculus IQ motif and ubiquitin domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:169561 IMAGE:8860956), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC137957 // GenBank // Mus musculus IQ motif and ubiquitin domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:169581 IMAGE:8860976), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:24446057:24505907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_026614 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 5 (Ndufa5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006505161 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 5 (Ndufa5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000023851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:24518666:24528013:-1 gene:ENSMUSG00000023089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000118558 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:24518666:24527570:-1 gene:ENSMUSG00000023089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000132588 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:24518666:24522866:-1 gene:ENSMUSG00000023089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000141274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:24518667:24527526:-1 gene:ENSMUSG00000023089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC028633 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 5, mRNA (cDNA clone MGC:41010 IMAGE:1247576), complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:24518723:24532854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONMMUT055969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001167745 // RefSeq // Mus musculus Wiskott-Aldrich syndrome-like (human) (Wasl), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NM_028459 // RefSeq // Mus musculus Wiskott-Aldrich syndrome-like (human) (Wasl), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:24613805:24665009:-1 gene:ENSMUSG00000029684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000041737 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:24632685:24664988:-1 gene:ENSMUSG00000029684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// BC055045 // GenBank // Mus musculus Wiskott-Aldrich syndrome-like (human), mRNA (cDNA clone MGC:62799 IMAGE:6489610), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:24616285:24637830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_177013 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 229A (Tmem229a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000127247 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:6:24951141:24956297:-1 gene:ENSMUSG00000048022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK161777 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5832434N19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147241 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6332401O19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182398 IMAGE:9056292), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC147242 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6332401O19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182393 IMAGE:9056287), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:24904897:24955753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0
NM_010338 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 37 (Gpr37), mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000054867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:25668607:25690729:-1 gene:ENSMUSG00000039904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AJ223305 // GenBank // Mus musculus mRNA for G-protein coupled receptor, complete CDS. // chr6 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AK053287 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130007J18 product:G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR 37, full insert sequence. // chr6 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// BC031918 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 37, mRNA (cDNA clone MGC:36067 IMAGE:5364562), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK044508 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930017K23 product:G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR 37, full insert sequence. // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000015175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:25669041:25689096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000003908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:25976812:25977081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 70 // 14 // 16 // 0
NR_030420 // RefSeq // Mus musculus microRNA 592 (Mir592), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102113 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:27936655:27936750:-1 gene:ENSMUSG00000076067 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146727 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:27934377:28135178:-1 gene:ENSMUSG00000024211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-592 // miRBase Micro RNA Database // MI0004127 Mus musculus miR-592 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000117943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:28361914:28363165:-1 gene:ENSMUSG00000083107 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:28361914:28383815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_028900 // RefSeq // Mus musculus golgi coiled coil 1 (Gcc1), mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000090511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:28416091:28421724:-1 gene:ENSMUSG00000029708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK016531 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932417P04 product:golgi coiled coil 1, full insert sequence. // chr6 // 90 // 67 // 18 // 20 // 0 /// BC066807 // GenBank // Mus musculus golgi coiled coil 1, mRNA (cDNA clone MGC:76506 IMAGE:30101518), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000064377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:28417829:28428390:-1 gene:ENSMUSG00000029708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:28417996:28421316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC021462 // GenBank // Mus musculus golgi coiled coil 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5054618), complete cds. // chr6 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0
NM_138682 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 4 (Lrrc4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000062304 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:28828133:28831747:-1 gene:ENSMUSG00000049939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF300458 // GenBank // Mus musculus brain tumor-associated protein MBAG1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC117833 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:143757 IMAGE:40092947), complete cds. // chr6 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// BC117834 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:143758 IMAGE:40092948), complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// DQ177325 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c leucine rich repeat-containing 4 protein (Lrrc4) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000013775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:28799332:28842233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1
ENSMUST00000082502 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:29113441:29113606:-1 gene:ENSMUSG00000064436 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133925 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 28 (Rbm28), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000007993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:29123573:29165006:-1 gene:ENSMUSG00000029701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000169214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:29125142:29155091:-1 gene:ENSMUSG00000029701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// BC018373 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 28, mRNA (cDNA clone MGC:12075 IMAGE:3708613), complete cds. // chr6 // 86 // 70 // 24 // 28 // 0 /// BC027123 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 28, mRNA (cDNA clone MGC:38664 IMAGE:5356457), complete cds. // chr6 // 81 // 65 // 21 // 26 // 0 /// BC040811 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 28, mRNA (cDNA clone MGC:49120 IMAGE:4015830), complete cds. // chr6 // 87 // 95 // 33 // 38 // 0 /// ENSMUST00000170473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:29156680:29160156:-1 gene:ENSMUSG00000029701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// ENSMUST00000170750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:29137579:29152850:-1 gene:ENSMUSG00000029701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// GENSCAN00000047123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:29125390:29164608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// NONMMUT056019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001029985 // RefSeq // Mus musculus kielin/chordin-like protein (Kcp), mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000078112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:29482037:29507952:-1 gene:ENSMUSG00000059022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000091391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:29482036:29507937:-1 gene:ENSMUSG00000059022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 76 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000101614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:29482037:29507950:-1 gene:ENSMUSG00000059022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000159479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:29482036:29495914:-1 gene:ENSMUSG00000059022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 37 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000159482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:29473162:29484144:-1 gene:ENSMUSG00000059022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 27 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000160181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:29497930:29502824:-1 gene:ENSMUSG00000059022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 18 // 9 // 9 // 0 /// AY884211 // GenBank // Mus musculus kielin/chordin-like protein (Kcp) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 37 // 37 // 0 /// BC059909 // GenBank // Mus musculus kielin/chordin-like protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:6825008), partial cds. // chr6 // 100 // 27 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000047116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:29473717:29507926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 84 // 39 // 41 // 0
XM_006505217 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700080G18 gene (1700080G18Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006956 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700080G18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00006270 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083409 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:30143801:30144127:-1 gene:ENSMUSG00000065343 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT056083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_029569 // RefSeq // Mus musculus microRNA 182 (Mir182), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102406 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:30165918:30165992:-1 gene:ENSMUSG00000076361 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:30165621:30208243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-182 // miRBase Micro RNA Database // MI0000224 Mus musculus miR-182 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029750 // RefSeq // Mus musculus microRNA 96 (Mir96), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083652 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:30169446:30169551:-1 gene:ENSMUSG00000065586 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:30165621:30208243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-96 // miRBase Micro RNA Database // MI0000583 Mus musculus miR-96 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030713 // RefSeq // Mus musculus microRNA 183 (Mir183), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000083685 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:30169668:30169737:-1 gene:ENSMUSG00000065619 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-183 // miRBase Micro RNA Database // MI0000225 Mus musculus miR-183 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT056086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
AK087191 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030033D05 product:weakly similar to DNA-BINDING PROTEIN [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_054073 // RefSeq // Mus musculus testis specific gene A13 (Tsga13), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006505392 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis specific gene A13 (Tsga13), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006505395 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis specific gene A13 (Tsga13), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000048580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:30896981:30915573:-1 gene:ENSMUSG00000039032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF294348 // GenBank // Mus musculus testis-specific A13 (Tsga13) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC125597 // GenBank // Mus musculus testis specific gene A13, mRNA (cDNA clone MGC:159300 IMAGE:40130112), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC125599 // GenBank // Mus musculus testis specific gene A13, mRNA (cDNA clone MGC:159302 IMAGE:40130114), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:30748857:30912292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_001135093 // RefSeq // Mus musculus Kruppel-like factor 14 (Klf14), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000101589 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:30956023:30959078:-1 gene:ENSMUSG00000073209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ534758 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like factor 14 (Klf14) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:30957720:30958697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NR_029744 // RefSeq // Mus musculus microRNA 29a (Mir29a), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083676 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:31062660:31062747:-1 gene:ENSMUSG00000065610 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-29a // miRBase Micro RNA Database // MI0000576 Mus musculus miR-29a stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029532 // RefSeq // Mus musculus microRNA 29b-1 (Mir29b-1), microRNA. // chr6 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000083670 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:31063017:31063097:-1 gene:ENSMUSG00000065604 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// mmu-mir-29b-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000143 Mus musculus miR-29b-1 stem-loop // chr6 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// NONMMUT056150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0
NR_110469 // RefSeq // Mus musculus long intergenic non-protein coding RNA, Trp53 induced transcript (Lincpint), transcript variant A, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_110470 // RefSeq // Mus musculus long intergenic non-protein coding RNA, Trp53 induced transcript (Lincpint), transcript variant B, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NR_110471 // RefSeq // Mus musculus long intergenic non-protein coding RNA, Trp53 induced transcript (Lincpint), transcript variant C, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000115107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:31165523:31218433:-1 gene:ENSMUSG00000044471 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB041803 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-1768. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KC860259 // GenBank // Mus musculus p53 induced noncoding transcript variant C lincRNA, complete sequence. // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000185982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:31166476:31218420:-1 gene:ENSMUSG00000044471 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000187876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:31093559:31218474:-1 gene:ENSMUSG00000044471 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000188611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:31166524:31218346:-1 gene:ENSMUSG00000044471 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT056160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0
NM_013723 // RefSeq // Mus musculus podocalyxin-like (Podxl), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000026698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:31519488:31563981:-1 gene:ENSMUSG00000025608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB028048 // GenBank // Mus musculus mRNA for podocalyxin-like protein 1, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF290209 // GenBank // Mus musculus podocalyxin (Podxl) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC052442 // GenBank // Mus musculus podocalyxin-like, mRNA (cDNA clone MGC:63348 IMAGE:6406610), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC054530 // GenBank // Mus musculus podocalyxin-like, mRNA (cDNA clone MGC:62258 IMAGE:6406610), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:31523022:31570583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_175750 // RefSeq // Mus musculus plexin A4 (Plxna4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000115096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:32144268:32588192:-1 gene:ENSMUSG00000029765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB073228 // GenBank // Mus musculus mRNA for plexin-A4, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC141298 // GenBank // Mus musculus plexin A4, mRNA (cDNA clone MGC:176259 IMAGE:9055910), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:32150489:32239653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000075773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:34726831:34726905:-1 gene:ENSMUSG00000060411 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// Z31359 // GenBank // M.musculus (Balb/C) HTx02 mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:34726672:34726906:-1 gene:ENSMUSG00000060411 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013366 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 91 (Wdr91), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006505252 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 91 (Wdr91), transcript variant X7, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000081214 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:34880426:34910876:-1 gene:ENSMUSG00000058486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000146968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:34880426:34910876:-1 gene:ENSMUSG00000058486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000149448 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:34904667:34910595:-1 gene:ENSMUSG00000058486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC043682 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 91, mRNA (cDNA clone IMAGE:5125154), partial cds. // chr6 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC055046 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 91, mRNA (cDNA clone MGC:62702 IMAGE:6488548), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:34880804:34921031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001025573 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2010107G12 gene (2010107G12Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006506134 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2010107G12 gene (2010107G12Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000044387 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:34945278:34977999:-1 gene:ENSMUSG00000029847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000144079 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:34953839:34979054:-1 gene:ENSMUSG00000029847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC075651 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010107G12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:99995 IMAGE:30541436), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006506135 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2010107G12 gene (2010107G12Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// ENSMUST00000147169 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:34948436:34955903:-1 gene:ENSMUSG00000029847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000051535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:34952499:34988394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_172892 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 13 (sodium/sulfate symporters), member 4 (Slc13a4), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000031868 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:35267957:35308131:-1 gene:ENSMUSG00000029843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC089161 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 13 (sodium/sulfate symporters), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:99960 IMAGE:30440173), complete cds. // chr6 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000122829 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:35286503:35308129:-1 gene:ENSMUSG00000029843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// ENSMUST00000155366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:35280320:35288174:-1 gene:ENSMUSG00000029843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// AK139428 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830077D04 product:solute carrier family 13 (sodium/sulfate symporters), member 4, full insert sequence. // chr6 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000051537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:35261328:35287886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0
NM_173375 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 180, member A (Fam180a), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000051176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:35312746:35326141:-1 gene:ENSMUSG00000047420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC064033 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC064033, mRNA (cDNA clone MGC:73523 IMAGE:851727), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:35313525:35328207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_008098 // RefSeq // Mus musculus myotrophin (Mtpn), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:35508906:35539888:-1 gene:ENSMUSG00000029840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC043084 // GenBank // Mus musculus myotrophin, mRNA (cDNA clone MGC:57998 IMAGE:6417343), complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC054811 // GenBank // Mus musculus myotrophin, mRNA (cDNA clone MGC:65591 IMAGE:6839739), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// U20290 // GenBank // Mus musculus V-1 protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000051530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:35512231:35539610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000101535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:36209620:36387851:-1 gene:ENSMUSG00000073154 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:36211987:36274356:-1 gene:ENSMUSG00000073154 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AK139997 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230035J22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161820 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:36268514:36388092:-1 gene:ENSMUSG00000073154 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// AK043142 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730059L13 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONMMUT056372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT056374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_008973 // RefSeq // Mus musculus pleiotrophin (Ptn), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006505757 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleiotrophin (Ptn), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000101534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:36715663:36811361:-1 gene:ENSMUSG00000029838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK161964 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430584E03 product:pleiotrophin, full insert sequence. // chr6 // 93 // 85 // 27 // 29 // 0 /// BC002064 // GenBank // Mus musculus pleiotrophin, mRNA (cDNA clone MGC:6148 IMAGE:3488877), complete cds. // chr6 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// BC061695 // GenBank // Mus musculus pleiotrophin, mRNA (cDNA clone MGC:65548 IMAGE:6313227), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// D90225 // GenBank // Mus musculus mRNA for OSF-1, complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// AK133835 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730441P16 product:pleiotrophin, full insert sequence. // chr6 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// GENSCAN00000012908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:36594524:36747131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_001081206 // RefSeq // Mus musculus diacylglycerol kinase, iota (Dgki), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000042075 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:36847156:37299637:-1 gene:ENSMUSG00000038665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000090314 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:36846981:37300184:-1 gene:ENSMUSG00000038665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000101532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:36846022:37299974:-1 gene:ENSMUSG00000038665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000138286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:36846981:37300184:-1 gene:ENSMUSG00000038665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000150300 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:36846981:37300184:-1 gene:ENSMUSG00000038665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000143046 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:36911467:37031028:-1 gene:ENSMUSG00000038665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// AK086550 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930036J18 product:DIACYLGLYCEROL KINASE, IOTA (EC 2.7.1.107) (DIGLYCERIDE KINASE) (DGK- IOTA) (DAG KINASE IOTA) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000040419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:36973899:37035568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0
NM_178661 // RefSeq // Mus musculus cAMP responsive element binding protein 3-like 2 (Creb3l2), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006544051 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 2-like (LOC102642579), mRNA. // chr6 // 80 // 69 // 20 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041093 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:37327255:37442146:-1 gene:ENSMUSG00000038648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC043466 // GenBank // Mus musculus cAMP responsive element binding protein 3-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:49250 IMAGE:5052843), complete cds. // chr6 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// BC138470 // GenBank // Mus musculus cAMP responsive element binding protein 3-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:170095 IMAGE:8861490), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC138471 // GenBank // Mus musculus cAMP responsive element binding protein 3-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:170096 IMAGE:8861491), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:37329493:37404397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_177200 // RefSeq // Mus musculus SV2 related protein homolog (rat)-like (Svopl), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006506273 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SV2 related protein homolog (rat)-like (Svopl), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000040486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:38015273:38046996:-1 gene:ENSMUSG00000029830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000096040 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:37983739:38046996:-1 gene:ENSMUSG00000029830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000172585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:37984512:38031089:-1 gene:ENSMUSG00000029830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000173428 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:38014818:38023287:-1 gene:ENSMUSG00000029830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 89 // 25 // 8 // 9 // 0 /// AK034997 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430071P14 product:weakly similar to ORGANIC CATION TRANSPORTER [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// BC058741 // GenBank // Mus musculus SV2 related protein homolog (rat)-like, mRNA (cDNA clone MGC:65540 IMAGE:6309979), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:38011209:38041615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000114908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:38048483:38109549:-1 gene:ENSMUSG00000038600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// AB050903 // GenBank // Mus musculus mRNA for a4 subunit isoform, complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// AF326316 // GenBank // Mus musculus H-ATPase accessory subunit a4 mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 87 // 39 // 41 // 0 /// AF435090 // GenBank // Mus musculus vacuolar proton translocating ATPase a4 isoform mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 96 // 41 // 45 // 0 /// BC046979 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit A4, mRNA (cDNA clone MGC:54824 IMAGE:6315485), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// NM_080467 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit A4 (Atp6v0a4), mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 45 // 47 // 1 /// ENSMUST00000040259 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:38048483:38124586:-1 gene:ENSMUSG00000038600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 96 // 45 // 47 // 1 /// GENSCAN00000029990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:38048990:38094054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 83 // 38 // 39 // 0
NM_194061 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D630045J12 gene (D630045J12Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000117556 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:38123174:38196593:-1 gene:ENSMUSG00000063455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000127925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:38126014:38147431:-1 gene:ENSMUSG00000063455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000144973 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:38126020:38147374:-1 gene:ENSMUSG00000063455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000149557 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:38137442:38194422:-1 gene:ENSMUSG00000063455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000169256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:38123176:38254009:-1 gene:ENSMUSG00000063455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// AK128948 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3007766. // chr6 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// AK129390 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1549 protein. // chr6 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:38117266:38199311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0
NM_172467 // RefSeq // Mus musculus zinc finger CCCH-type, antiviral 1-like (Zc3hav1l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:38287396:38299259:-1 gene:ENSMUSG00000047749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138180 // GenBank // Mus musculus zinc finger CCCH-type, antiviral 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:169804 IMAGE:8861199), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138181 // GenBank // Mus musculus zinc finger CCCH-type, antiviral 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:169805 IMAGE:8861200), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:38291869:38299240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000121946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:38542303:38546074:-1 gene:ENSMUSG00000081670 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001033171 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 2 (Klrg2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000096030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:38626660:38637239:-1 gene:ENSMUSG00000071537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK162933 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330058L18 product:hypothetical C-type lectin/C-type lectin domain profile containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006506711 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 2 (Klrg2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000029988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:38603279:38646696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_172893 // RefSeq // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 12 (Parp12), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000038398 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:39086410:39118349:-1 gene:ENSMUSG00000038507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC120733 // GenBank // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:155970 IMAGE:40129656), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC137645 // GenBank // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:169269 IMAGE:8860664), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:39087315:39118159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001033430 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 7A (Kdm7a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000002305 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:39136623:39206789:-1 gene:ENSMUSG00000042599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033430 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 7A (Kdm7a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000002305 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:39136623:39206789:-1 gene:ENSMUSG00000042599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000127036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:39142110:39154682:-1 gene:ENSMUSG00000042599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// AK035529 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530062A14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// BC145848 // GenBank // Mus musculus jumonji C domain-containing histone demethylase 1 homolog D (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:175735 IMAGE:40131151), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000042008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:39143211:39206634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0
NM_028123 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 3 (Slc37a3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506663 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 3 (Slc37a3), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506665 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 3 (Slc37a3), transcript variant X8, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000090243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:39334770:39377707:-1 gene:ENSMUSG00000029924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK012071 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610507O21 product:similar to TRANSMEMBRANE PROTEIN QUICKEN [Xenopus laevis], full insert sequence. // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC005744 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3599603), complete cds. // chr6 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// BC099673 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:106297 IMAGE:4936456), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC100391 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:30461613). // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006506660 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 3 (Slc37a3), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:39265508:39382215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
ENSMUST00000082966 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:39422289:39422419:-1 gene:ENSMUSG00000064900 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172477 // RefSeq // Mus musculus DENN/MADD domain containing 2A (Dennd2a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006505837 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DENN/MADD domain containing 2A (Dennd2a), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006505839 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DENN/MADD domain containing 2A (Dennd2a), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000036877 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:39462378:39557867:-1 gene:ENSMUSG00000038456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000149162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:39463253:39489166:-1 gene:ENSMUSG00000038456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000154149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:39497137:39557867:-1 gene:ENSMUSG00000038456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AK076686 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930414D16 product:weakly similar to tumor cell suppression protein HTS1 (fragment) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// BC145599 // GenBank // Mus musculus DENN/MADD domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:179173 IMAGE:9054165), complete cds. // chr6 // 97 // 86 // 31 // 32 // 0 /// BC150799 // GenBank // Mus musculus DENN/MADD domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:183710 IMAGE:9087710), complete cds. // chr6 // 97 // 86 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:39399225:39557658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000101492 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:40401375:40436135:-1 gene:ENSMUSG00000037172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK122457 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1147 protein. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175528 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E330009J07 gene (E330009J07Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000039008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40407500:40436133:-1 gene:ENSMUSG00000037172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000101492 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:40401375:40436135:-1 gene:ENSMUSG00000037172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// AK122457 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1147 protein. // chr6 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// AK145280 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930033K05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40406739:40436125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_026317 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 37 (Prss37), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031967 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40514824:40519508:-1 gene:ENSMUSG00000029909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC125467 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700016G05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159170 IMAGE:40129982), complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC125493 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700016G05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159196 IMAGE:40130008), complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000026632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40514931:40522945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_146382 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 461 (Olfr461), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:40544036:40544977:-1 gene:ENSMUSG00000068259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC143037 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 461, mRNA (cDNA clone MGC:148180 IMAGE:40042146), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40544036:40545620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001038604 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 5, member a (Clec5a), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_021364 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 5, member a (Clec5a), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:40576717:40585821:-1 gene:ENSMUSG00000029915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000101491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40574894:40585803:-1 gene:ENSMUSG00000029915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000129948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40577850:40585795:-1 gene:ENSMUSG00000029915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000177178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:40577960:40585790:-1 gene:ENSMUSG00000029915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AF139769 // GenBank // Mus musculus type II transmembrane protein MDL-1 (Mdl1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC104364 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 5, member a, mRNA (cDNA clone MGC:129446 IMAGE:40049817), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC104365 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 5, member a, mRNA (cDNA clone MGC:129447 IMAGE:40049818), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40579282:40585794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT056579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
NM_001001451 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 138 (Tas2r138), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40612315:40613310:-1 gene:ENSMUSG00000058250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY916509 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 T2R138 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128016 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 138, mRNA (cDNA clone MGC:157613 IMAGE:40136088), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_139296 // RefSeq // Mus musculus monooxygenase, DBH-like 2 (Moxd2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40878794:40887494:-1 gene:ENSMUSG00000029885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB065134 // GenBank // Mus musculus mRNA for dopamine beta-hydroxylase-like, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40872013:40887494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_175020 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 58 (Prss58), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000063523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:40895262:40900387:-1 gene:ENSMUSG00000051936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK075754 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700020H15 product:hypothetical Serine proteases, trypsin family containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048599 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC048599, mRNA (cDNA clone MGC:58652 IMAGE:6740675), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40895362:40926227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_028550 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700074P13 gene (1700074P13Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006506687 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700074P13 gene (1700074P13Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506690 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700074P13 gene (1700074P13Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000031935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40920460:40940557:-1 gene:ENSMUSG00000029883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000122181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40920437:40940497:-1 gene:ENSMUSG00000029883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000136499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:40921784:40929740:-1 gene:ENSMUSG00000029883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// AK006951 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700074P13 product:hypothetical Serine proteases, trypsin family containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC061035 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700074P13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:74142 IMAGE:6774253), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000073642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:6:40948375:40951870:-1 gene:ENSMUSG00000063252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40940420:40961686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0
NM_001102660 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 2663 (Gm2663), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_023707 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810009J06 gene (1810009J06Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:40964772:40968427:1 gene:ENSMUSG00000094808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000166306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:40995822:40999479:-1 gene:ENSMUSG00000096525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132243 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810009J06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163874 IMAGE:40130520), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132245 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810009J06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163876 IMAGE:40130522), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40964789:40968332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40995928:40999459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023333 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2210010C04 gene (2210010C04Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031931 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:41030268:41035509:-1 gene:ENSMUSG00000029882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC061093 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2210010C04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:74211 IMAGE:30306963), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41031635:41035478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_001003405 // RefSeq // Mus musculus trypsin 5 (Try5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000064324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:41311233:41314711:-1 gene:ENSMUSG00000036938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AB009661 // GenBank // Mus musculus mRNA for TESP4, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC139220 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810049H19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170847 IMAGE:8862242), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC139223 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810049H19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170850 IMAGE:8862245), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000173916 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:41311288:41316841:-1 gene:ENSMUSG00000036938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 80 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41311277:41314695:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
NM_011645 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 3 (Prss3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000096003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:41373795:41377678:-1 gene:ENSMUSG00000071519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000011303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41373814:41377597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_022413 // RefSeq // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 6 (Trpv6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006506453 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 6 (Trpv6), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000031902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:41620621:41636405:-1 gene:ENSMUSG00000029868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB037373 // GenBank // Mus musculus CAT mRNA for calcium transporting protein homolog, complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// BC016101 // GenBank // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:27673 IMAGE:4911355), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK085123 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430040H23 product:epithelial calcium channel 2, full insert sequence. // chr6 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000011285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41621068:41648065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0
NM_001007572 // RefSeq // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 5 (Trpv5), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505768 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 5 (Trpv5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006505769 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 5 (Trpv5), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006505770 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 5 (Trpv5), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:41652770:41680723:-1 gene:ENSMUSG00000036899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC110554 // GenBank // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:129346 IMAGE:40047811), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC110555 // GenBank // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:129347 IMAGE:40047816), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41653130:41680655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_032540 // RefSeq // Mus musculus Kell blood group (Kel), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006506058 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Kell blood group (Kel), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// XR_377447 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Kell blood group (Kel), transcript variant X5, misc_RNA. // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031899 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:41686330:41704339:-1 gene:ENSMUSG00000029866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF252870 // GenBank // Mus musculus Kell protein (Kel) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC099961 // GenBank // Mus musculus Kell blood group, mRNA (cDNA clone MGC:107471 IMAGE:30035694), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41686447:41738911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_146576 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 459 (Olfr459), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:41771258:41772366:-1 gene:ENSMUSG00000045479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC116766 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 459, mRNA (cDNA clone MGC:151143 IMAGE:40126085), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120604 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 459, mRNA (cDNA clone MGC:155841 IMAGE:40129527), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41771353:41772174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001113327 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 131, member B (Fam131b), transcript variant b, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_001286584 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 131, member B (Fam131b), transcript variant c, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_029528 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 131, member B (Fam131b), transcript variant a, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031891 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:42315312:42324640:-1 gene:ENSMUSG00000029861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095974 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:42315313:42324592:-1 gene:ENSMUSG00000029861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:42315312:42324643:-1 gene:ENSMUSG00000029861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC115595 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 131, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:40102503), partial cds. // chr6 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42318159:42332022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000083272 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:42337677:42337783:-1 gene:ENSMUSG00000065206 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023580 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor A1 (Epha1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000073387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42358487:42373268:-1 gene:ENSMUSG00000029859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF131197 // GenBank // Mus musculus receptor tyrosine kinase EphA1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC071215 // GenBank // Mus musculus Eph receptor A1, mRNA (cDNA clone MGC:78130 IMAGE:4196138), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42358768:42373210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0
NM_146444 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 458 (Olfr458), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000090156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42460076:42461017:-1 gene:ENSMUSG00000068574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42460076:42461017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081301 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 455 (Olfr455), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:42538067:42539020:-1 gene:ENSMUSG00000071494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42538067:42597276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_203396 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 115, member E (Fam115e), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006506358 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 115, member E (Fam115e), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000069023 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:42587213:42597372:-1 gene:ENSMUSG00000018656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY528666 // GenBank // Mus musculus experimental autoimmune prostatitis antigen 2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42538067:42597276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000031879 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:42623019:42645254:-1 gene:ENSMUSG00000029851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK131169 // GenBank // Mus musculus mRNA for mFLJ00264 protein. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC011487 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 115, member C, mRNA (cDNA clone MGC:7793 IMAGE:3499593), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC008555 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 115, member C, mRNA (cDNA clone MGC:8252 IMAGE:3592166), complete cds. // chr6 // 69 // 91 // 22 // 32 // 0 /// ENSMUST00000131341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:42626410:42629440:-1 gene:ENSMUSG00000029851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// GENSCAN00000010962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42624364:42686944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1
NM_130869 // RefSeq // Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006505719 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:43303674:43309554:-1 gene:ENSMUSG00000029736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000172554 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:43303898:43307236:-1 gene:ENSMUSG00000029736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AY061761 // GenBank // Mus musculus newborn ovary homeodomain protein (Nobox) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC125280 // GenBank // Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:158983 IMAGE:40129795), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC125282 // GenBank // Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:158985 IMAGE:40129797), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006505718 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// GENSCAN00000002879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:43303955:43344148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_013861 // RefSeq // Mus musculus thiamine pyrophosphokinase (Tpk1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506218 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thiamine pyrophosphokinase (Tpk1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506219 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thiamine pyrophosphokinase (Tpk1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000067888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:43345001:43666278:-1 gene:ENSMUSG00000029735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:43345274:43666175:-1 gene:ENSMUSG00000029735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AB027568 // GenBank // Mus musculus mTPK1 mRNA for thiamin pyrophosphokinase, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK033192 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030456F22 product:thiamin pyrophosphokinase, full insert sequence. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK087844 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330028E04 product:thiamin pyrophosphokinase, full insert sequence. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC015246 // GenBank // Mus musculus thiamine pyrophosphokinase, mRNA (cDNA clone MGC:18314 IMAGE:4221866), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC023354 // GenBank // Mus musculus thiamine pyrophosphokinase, mRNA (cDNA clone MGC:31041 IMAGE:5253545), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:43487802:43767294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001253795 // RefSeq // Mus musculus TAR (HIV) RNA binding protein 2 (Tarbp2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// NM_009319 // RefSeq // Mus musculus TAR (HIV) RNA binding protein 2 (Tarbp2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// ENSMUST00000023813 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:102518459:102523676:1 gene:ENSMUSG00000023051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// ENSMUST00000100168 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:102518357:102523602:1 gene:ENSMUSG00000023051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// ENSMUST00000154948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:102518557:102523219:1 gene:ENSMUSG00000023051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 58 // 92 // 7 // 12 // 0 /// BC002028 // GenBank // Mus musculus TAR (HIV) RNA binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:5911 IMAGE:3489376), complete cds. // chr6 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// U79962 // GenBank // Mus musculus protamine-1 RNA binding protein (Prbp) mRNA, complete cds. // chr6 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// GENSCAN00000046199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:47432120:47441489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000007819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:102515504:102523342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0
XM_003945405 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A930035D04 gene (A930035D04Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006544052 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A930035D04 gene (A930035D04Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:47453776:47454320:-1 gene:ENSMUSG00000052241 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK044707 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930035D04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK080300 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630042M01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_004419 // RefSeq // Mus musculus RNA, Y1 small cytoplasmic, Ro-associated (Rny1), Y RNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000083767 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:47788069:47788180:-1 gene:ENSMUSG00000065701 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT056770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT056771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// Y_RNAs // lncRNA Db // Mouse Y RNA 1 sequence:Rny1 (gi|161333869|ref|NR_004419.1| Mus musculus RNA, Y1 small cytoplasmic, Ro-associated, small cytoplasmic RNA)mm9 chr6:47,738,069-47,738,179 // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_009787 // RefSeq // Mus musculus protein disulfide isomerase associated 4 (Pdia4), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006505450 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein disulfide isomerase associated 4 (Pdia4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000077290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:47796142:47813512:-1 gene:ENSMUSG00000025823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC141078 // GenBank // Mus musculus protein disulfide isomerase associated 4, mRNA (cDNA clone MGC:176039 IMAGE:9055690), complete cds. // chr6 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// J05186 // GenBank // Mouse protein disulfide isomerase-related protein (ERp72) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:47796488:47813304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0
XM_006505450 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein disulfide isomerase associated 4 (Pdia4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:47796488:47813304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_177882 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 786 (Zfp786), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506288 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 786 (Zfp786), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006506289 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 786 (Zfp786), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000058844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:47819266:47830867:-1 gene:ENSMUSG00000051499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143979 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:47821658:47830568:-1 gene:ENSMUSG00000051499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC138897 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 786, mRNA (cDNA clone MGC:170524 IMAGE:8861919), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:47819669:47836474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001081382 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 777 (Zfp777), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506671 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 777 (Zfp777), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506672 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 777 (Zfp777), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506674 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 777 (Zfp777), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506675 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 777 (Zfp777), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000095944 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:48024205:48048911:-1 gene:ENSMUSG00000071477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48024188:48048114:-1 gene:ENSMUSG00000071477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000148362 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:48029379:48044243:-1 gene:ENSMUSG00000071477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC066046 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2500002G23 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6813195). // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC150871 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 777, mRNA (cDNA clone MGC:183782 IMAGE:9087782), complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000020096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48024629:48044686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001163475 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 746 (Zfp746), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000073124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48062395:48086593:-1 gene:ENSMUSG00000057691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48063832:48120427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_027852 // RefSeq // Mus musculus retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 2 (Rarres2), mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506624 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 2 (Rarres2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000009425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48569698:48572670:-1 gene:ENSMUSG00000009281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC015275 // GenBank HTC // Mus musculus retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4212222), with apparent retained intron. // chr6 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC038914 // GenBank // Mus musculus retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 2, mRNA (cDNA clone MGC:49275 IMAGE:5100583), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48570063:48572267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0
NM_153175 // RefSeq // Mus musculus GTPase, IMAP family member 6 (Gimap6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:48701582:48708225:-1 gene:ENSMUSG00000047867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119315 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:48701583:48708213:-1 gene:ENSMUSG00000047867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126422 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:48703734:48708198:-1 gene:ENSMUSG00000047867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AF503921 // GenBank // Mus musculus immune-associated nucleotide 6 mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC028779 // GenBank // Mus musculus GTPase, IMAP family member 6, mRNA (cDNA clone MGC:41522 IMAGE:1196098), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48702183:48711288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT056830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_031247 // RefSeq // Mus musculus GTPase, IMAP family member 3 (Gimap3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48765089:48766519:-1 gene:ENSMUSG00000039264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AB164418 // GenBank // Mus musculus IAN4 mRNA for immune-associated nucleotide binding protein 4, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF337052 // GenBank // Mus musculus immunity-associated nucleotide 4 (Ian4) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr6 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC094914 // GenBank // Mus musculus GTPase, IMAP family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:107446 IMAGE:30074259), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT056841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSMUST00000090064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48939789:48940127:-1 gene:ENSMUSG00000068537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48939717:48955951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198102 // RefSeq // Mus musculus transformer 2 alpha homolog (Drosophila) (Tra2a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006505240 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transformer 2 alpha homolog (Drosophila) (Tra2a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000031841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:49243921:49264052:-1 gene:ENSMUSG00000029817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC023018 // GenBank HTC // Mus musculus transformer 2 alpha homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5369936), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// BC057448 // GenBank // Mus musculus transformer 2 alpha homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:65339 IMAGE:4016620), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC058764 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA G430041M01 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6490816), partial cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:49220145:49263873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
AB052758 // GenBank // Mus musculus mAWMS1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK005187 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500010G04 product:Transformer-2 protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK148552 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120402D06 product:MAWMS1 protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK005187 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500010G04 product:Transformer-2 protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// AK148552 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120402D06 product:MAWMS1 protein, full insert sequence. // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT056862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
ENSMUST00000177892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:50042395:50043657:-1 gene:ENSMUSG00000096611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK157913 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930007G17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00006305 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000101405 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:50200224:50261747:-1 gene:ENSMUSG00000029821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U42384 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor inducible gene 15 (FIN15) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007808 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c, somatic (Cycs), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000161401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:50562563:50566538:-1 gene:ENSMUSG00000063694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_027564 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4921507P07 gene (4921507P07Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006506605 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4921507P07 gene (4921507P07Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000031852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:50573302:50596632:-1 gene:ENSMUSG00000029828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC055110 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921507P07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58592 IMAGE:6705881), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000049760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:50565237:50591686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000096092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:23165338:23167413:-1 gene:ENSMUSG00000096702 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:23157986:23160061:-1 gene:ENSMUSG00000094300 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:50608637:50610709:1 gene:ENSMUSG00000092012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:50619822:50621885:-1 gene:ENSMUSG00000091981 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23165338:23167413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23157986:23160061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:50619813:50621885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:50608637:50610715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_021892 // RefSeq // Mus musculus neuropeptide VF precursor (Npvf), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:50650672:50654439:-1 gene:ENSMUSG00000029831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB040289 // GenBank // Mus musculus RFRP mRNA for RFamide-related peptide precursor, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF330058 // GenBank // Mus musculus neuropeptide NPVF precursor, mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116905 // GenBank // Mus musculus neuropeptide VF precursor, mRNA (cDNA clone MGC:151282 IMAGE:40126224), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116907 // GenBank // Mus musculus neuropeptide VF precursor, mRNA (cDNA clone MGC:151284 IMAGE:40126226), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:50649776:50652681:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000161723 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:50846524:50878079:-1 gene:ENSMUSG00000073072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_378202 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA G930045G22 gene (G930045G22Rik), misc_RNA. // chr6 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0 /// AK145307 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930045G22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 70 // 100 // 19 // 27 // 0 /// NONMMUT056897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:50845488:50898690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NR_029719 // RefSeq // Mus musculus microRNA 148a (Mir148a), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000083571 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:51269812:51269910:-1 gene:ENSMUSG00000065505 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// mmu-mir-148a // miRBase Micro RNA Database // MI0000550 Mus musculus miR-148a stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT056902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XR_403364 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642825 (LOC102642825), ncRNA. // chr6 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// AK030693 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5530400C07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_018773 // RefSeq // Mus musculus src family associated phosphoprotein 2 (Skap2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:51859166:52012549:-1 gene:ENSMUSG00000059182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB014485 // GenBank // Mus musculus mRNA for RA70, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF051324 // GenBank // Mus musculus Src-associated adaptor protein (Saps) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC003711 // GenBank // Mus musculus src family associated phosphoprotein 2, mRNA (cDNA clone MGC:5700 IMAGE:3599914), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK172297 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830114O03 product:src family associated phosphoprotein 2, full insert sequence. // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000050219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:51860007:51908021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
M22115 // GenBank // Mouse ERA-1-993 mRNA, complete cds, and alternate ERA-1-339 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_010449 // RefSeq // Mus musculus homeobox A1 (Hoxa1), mRNA. // chr6 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000000964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52155590:52158317:-1 gene:ENSMUSG00000029844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENSMUST00000120363 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:52155595:52158317:-1 gene:ENSMUSG00000029844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// BC138097 // GenBank // Mus musculus homeo box A1, mRNA (cDNA clone MGC:169721 IMAGE:8861116), complete cds. // chr6 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// BC138098 // GenBank // Mus musculus homeo box A1, mRNA (cDNA clone MGC:169722 IMAGE:8861117), complete cds. // chr6 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000027146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52156734:52166168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_010451 // RefSeq // Mus musculus homeobox A2 (Hoxa2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000014848 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52162511:52164831:-1 gene:ENSMUSG00000014704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117105 // GenBank // Mus musculus homeo box A2, mRNA (cDNA clone MGC:151482 IMAGE:40126424), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC117107 // GenBank // Mus musculus homeo box A2, mRNA (cDNA clone MGC:151484 IMAGE:40126426), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// M93292 // GenBank // Mouse homeobox protein (Hox1.11) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// M95599 // GenBank // Mus musculus homeobox-containing protein (Hox-1.11) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52156734:52166168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_010452 // RefSeq // Mus musculus homeobox A3 (Hoxa3), mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52169062:52213115:-1 gene:ENSMUSG00000079560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000134831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52172571:52183855:-1 gene:ENSMUSG00000079560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 25 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000142764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52199151:52213336:-1 gene:ENSMUSG00000079560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// AK051552 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130056F09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// BC096612 // GenBank // Mus musculus homeo box A3, mRNA (cDNA clone MGC:106040 IMAGE:6476230), complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128102 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:52163359:52213339:-1 gene:ENSMUSG00000101298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000079560 // chr6 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// GENSCAN00000027132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52169940:52172649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT056949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT056940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_008265 // RefSeq // Mus musculus homeobox A4 (Hoxa4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52189671:52191753:-1 gene:ENSMUSG00000000942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X13538 // GenBank // Murine mRNA for Hox-1.4 protein. // chr6 // 62 // 52 // 8 // 13 // 0 /// BC107172 // GenBank // Mus musculus homeo box A4, mRNA (cDNA clone MGC:130055 IMAGE:40044111), complete cds. // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52187369:52193149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_010453 // RefSeq // Mus musculus homeobox A5 (Hoxa5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52201754:52204587:-1 gene:ENSMUSG00000038253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011063 // GenBank // Mus musculus homeo box A5, mRNA (cDNA clone MGC:18622 IMAGE:3985274), complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// M28021 // GenBank // Mouse homeo domain protein (Hox 1.3) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// M36604 // GenBank // Mouse homeobox 1.3 protein mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52202581:52208624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_010454 // RefSeq // Mus musculus homeobox A6 (Hoxa6), mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000062829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52206288:52208722:-1 gene:ENSMUSG00000043219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC119105 // GenBank // Mus musculus homeo box A6, mRNA (cDNA clone MGC:155421 IMAGE:8733854), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC119107 // GenBank // Mus musculus homeo box A6, mRNA (cDNA clone MGC:155423 IMAGE:8733856), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52202581:52208624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0
NM_010455 // RefSeq // Mus musculus homeobox A7 (Hoxa7), mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505611 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus homeobox A7 (Hoxa7), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000048715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:52215623:52218573:-1 gene:ENSMUSG00000038236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000153280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52214491:52220393:-1 gene:ENSMUSG00000038236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// BC036986 // GenBank // Mus musculus homeo box A7, mRNA (cDNA clone IMAGE:4986801), complete cds. // chr6 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// BC131978 // GenBank // Mus musculus homeo box A7, mRNA (cDNA clone MGC:163609 IMAGE:40130255), complete cds. // chr6 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// BC132643 // GenBank // Mus musculus homeo box A7, mRNA (cDNA clone MGC:164274 IMAGE:40130920), complete cds. // chr6 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// M17192 // GenBank // Mouse homeodomain protein (Hox1.1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// XM_006505610 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus homeobox A7 (Hoxa7), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// ENSMUST00000134367 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:52215753:52218711:-1 gene:ENSMUSG00000038236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// ENSMUST00000140316 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:52216440:52217452:-1 gene:ENSMUSG00000038236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000027145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52215717:52226104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001277238 // RefSeq // Mus musculus homeobox A9 (Hoxa9), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NM_010456 // RefSeq // Mus musculus homeobox A9 (Hoxa9), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000048680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52223100:52227370:-1 gene:ENSMUSG00000038227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000114425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52224121:52226189:-1 gene:ENSMUSG00000038227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// AB005457 // GenBank // Mus musculus mRNA for Hoxa-9, complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AB005458 // GenBank // Mus musculus mRNA for Hoxa-9T, complete cds. // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// BC055059 // GenBank // Mus musculus homeo box A9, mRNA (cDNA clone MGC:62545 IMAGE:6529502), complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52215717:52226104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NR_029912 // RefSeq // Mus musculus microRNA 196b (Mir196b), microRNA. // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000083509 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:52230081:52230165:-1 gene:ENSMUSG00000065443 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000174115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52228247:52230532:-1 gene:ENSMUSG00000038227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000156540 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52224323:52230279:-1 gene:ENSMUSG00000038227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// mmu-mir-196b // miRBase Micro RNA Database // MI0001151 Mus musculus miR-196b stem-loop // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT056961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT056962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT056956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001122950 // RefSeq // Mus musculus homeobox A10 (Hoxa10), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NM_008263 // RefSeq // Mus musculus homeobox A10 (Hoxa10), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000125581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52231197:52234939:-1 gene:ENSMUSG00000000938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126402 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52231199:52233324:-1 gene:ENSMUSG00000000938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AK002670 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610025N02 product:homeo box A10, full insert sequence. // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC050839 // GenBank // Mus musculus homeo box A10, mRNA (cDNA clone MGC:59357 IMAGE:6511608), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L08757 // GenBank // Mus musculus homeobox protein (Hoxa10) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT056963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000027125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52232506:52245844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_010450 // RefSeq // Mus musculus homeobox A11 (Hoxa11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52242106:52245810:-1 gene:ENSMUSG00000038210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000131495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52242110:52245795:-1 gene:ENSMUSG00000038210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC119302 // GenBank // Mus musculus homeo box A11, mRNA (cDNA clone MGC:155618 IMAGE:8734051), complete cds. // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// U20370 // GenBank // Mus musculus homeobox protein (Hoxa11) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52232506:52245844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_145567 // RefSeq // Mus musculus 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase (Hibadh), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031788 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52546228:52640389:-1 gene:ENSMUSG00000029776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000155948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52546696:52630258:-1 gene:ENSMUSG00000029776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// AB051067 // GenBank // Mus musculus mRNA for 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC003914 // GenBank // Mus musculus 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:7270 IMAGE:3484897), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC036981 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4975622, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52531860:52640248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
GENSCAN00000027128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52531860:52640248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000082858 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:52639234:52639355:-1 gene:ENSMUSG00000064792 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AK148386 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370122F24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT056994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT056995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001168277 // RefSeq // Mus musculus JAZF zinc finger 1 (Jazf1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NM_173406 // RefSeq // Mus musculus JAZF zinc finger 1 (Jazf1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006505943 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus JAZF zinc finger 1 (Jazf1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006505944 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus JAZF zinc finger 1 (Jazf1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000074541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52768797:53068631:-1 gene:ENSMUSG00000063568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52768797:52778309:-1 gene:ENSMUSG00000063568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000136250 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52768797:52909620:-1 gene:ENSMUSG00000063568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AK050474 // GenBank HTC // Mus musculus adult pancreas islet cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C820002C15 product:hypothetical Zinc finger, C2H2 type containing protein, full insert sequence. // chr6 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// BC048577 // GenBank // Mus musculus JAZF zinc finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:58600 IMAGE:6706223), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52770204:52781098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_025817 // RefSeq // Mus musculus TLR4 interactor with leucine-rich repeats (Tril), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:53815466:53820830:-1 gene:ENSMUSG00000043496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC043099 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1200009O22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58019 IMAGE:6406165), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC059224 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1200009O22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:66627 IMAGE:6406165), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:53817806:53820235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_001289713 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase, vitellogenic-like (Cpvl), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001289714 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase, vitellogenic-like (Cpvl), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_027749 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase, vitellogenic-like (Cpvl), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506615 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxypeptidase, vitellogenic-like (Cpvl), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506621 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxypeptidase, vitellogenic-like (Cpvl), transcript variant X9, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006506622 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxypeptidase, vitellogenic-like (Cpvl), transcript variant X10, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000166545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:53873379:53978662:-1 gene:ENSMUSG00000052955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC137839 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase, vitellogenic-like, mRNA (cDNA clone MGC:169463 IMAGE:8860858), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC144966 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase, vitellogenic-like, mRNA (cDNA clone MGC:178522 IMAGE:9053514), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:53912503:53932847:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000056144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:53933841:53999326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NR_033635 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9130019P16 gene (9130019P16Rik), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000145111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:54269681:54430221:-1 gene:ENSMUSG00000073067 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT057046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT057047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_027268 // RefSeq // Mus musculus secernin 1 (Scrn1), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006506572 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus secernin 1 (Scrn1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000019268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:54505890:54566489:-1 gene:ENSMUSG00000019124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK129084 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0193 protein. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC023889 // GenBank // Mus musculus secernin 1, mRNA (cDNA clone MGC:38061 IMAGE:5252046), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// EF410099 // GenBank // Mus musculus Accn1/Scrn1 trans-spliced mRNA sequence. // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// ENSMUST00000124325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:54509108:54514817:-1 gene:ENSMUSG00000019124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// BC058619 // GenBank // Mus musculus secernin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5697080). // chr6 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000056149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:54509204:54593043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1
NM_001171007 // RefSeq // Mus musculus nucleotide-binding oligomerization domain containing 1 (Nod1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_172729 // RefSeq // Mus musculus nucleotide-binding oligomerization domain containing 1 (Nod1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000060655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:54923942:54972612:-1 gene:ENSMUSG00000038058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000168172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:54923942:54971661:-1 gene:ENSMUSG00000038058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AY160222 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 NOD1 (Nod1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC042670 // GenBank // Mus musculus nucleotide-binding oligomerization domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:27992 IMAGE:3597911), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:54924937:54949632:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_026637 // RefSeq // Mus musculus gamma-glutamyl cyclotransferase (Ggct), mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XR_377408 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-glutamyl cyclotransferase (Ggct), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000002874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:54985648:54992707:-1 gene:ENSMUSG00000002797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000131475 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:54982580:54992950:-1 gene:ENSMUSG00000002797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK050049 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730007A14 product:RIKEN cDNA A030007L17 gene, full insert sequence. // chr6 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// AK076404 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732497A20 product:RIKEN cDNA A030007L17 gene, full insert sequence. // chr6 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// BC080818 // GenBank // Mus musculus gamma-glutamyl cyclotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:91238 IMAGE:30286931), complete cds. // chr6 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000136527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:54986481:54992863:-1 gene:ENSMUSG00000002797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:54985858:54992835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT057080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0
NM_009349 // RefSeq // Mus musculus indolethylamine N-methyltransferase (Inmt), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000003569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:55170626:55175043:-1 gene:ENSMUSG00000003477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC013518 // GenBank // Mus musculus indolethylamine N-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:19191 IMAGE:4236077), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// M88694 // GenBank // Mus musculus thioether S-methyltransferase mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152720 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:55172763:55175014:-1 gene:ENSMUSG00000003477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:55170848:55174983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_009717 // RefSeq // Mus musculus neurogenic differentiation 6 (Neurod6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:55677818:55681263:-1 gene:ENSMUSG00000037984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087831 // GenBank // Mus musculus neurogenic differentiation 6, mRNA (cDNA clone MGC:90713 IMAGE:6411826), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U29086 // GenBank // Mus musculus neuronal helix-loop-helix protein NEX-1 (nex-1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:55678637:55679650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
GENSCAN00000000452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:56056007:56062915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_145958 // RefSeq // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 2 (Kbtbd2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006505844 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 2 (Kbtbd2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006505847 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 2 (Kbtbd2), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000114321 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:56777525:56797813:-1 gene:ENSMUSG00000059486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000114323 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:56777524:56797736:-1 gene:ENSMUSG00000059486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC022962 // GenBank // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:36672 IMAGE:5368323), complete cds. // chr6 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0 /// BC023724 // GenBank // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5347265), partial cds. // chr6 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000000439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:56778878:56789388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 48 // 20 // 21 // 0
NM_001166710 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 7 (Vmn1r7), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_134187 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 8 (Vmn1r8), mRNA. // chr6 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57035913:57037125:1 gene:ENSMUSG00000061208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176252 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57024106:57025324:-1 gene:ENSMUSG00000093696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF394951 // GenBank // Mus musculus vomeronasal receptor 1 B2 (V1rb2) mRNA, complete cds. // chr6 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57036221:57036877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 68 // 11 // 17 // 0
NM_134184 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 16 (Vmn1r16), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57322645:57323657:-1 gene:ENSMUSG00000093523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134171 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 17 (Vmn1r17), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000176395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57360452:57361431:-1 gene:ENSMUSG00000093411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57360467:57405245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1
NM_134181 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 18 (Vmn1r18), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57389580:57390666:-1 gene:ENSMUSG00000091382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132061 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C26, mRNA (cDNA clone MGC:163692 IMAGE:40130338), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138409 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C26, mRNA (cDNA clone MGC:170034 IMAGE:8861429), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175523 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1K (PP2C domain containing) (Ppm1k), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506083 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1K (PP2C domain containing) (Ppm1k), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// XR_377453 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1K (PP2C domain containing) (Ppm1k), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// ENSMUST00000042766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57506502:57535426:-1 gene:ENSMUSG00000037826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC092238 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1K (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone MGC:115965 IMAGE:30642218), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138473 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1K (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone MGC:170098 IMAGE:8861493), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC138474 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1K (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone MGC:170099 IMAGE:8861494), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006506082 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1K (PP2C domain containing) (Ppm1k), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000032515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57510718:57530447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_025574 // RefSeq // Mus musculus Pigy upstream reading frame (Pyurf), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57686576:57692078:-1 gene:ENSMUSG00000043162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC029232 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Y, mRNA (cDNA clone MGC:36287 IMAGE:4164517), complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK029193 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4831412O21 product:RIKEN cDNA 2610022G08 gene, full insert sequence. // chr6 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000032516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57689737:57692005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_134183 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 21 (Vmn1r21), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57843464:57844498:-1 gene:ENSMUSG00000058588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120799 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C28, mRNA (cDNA clone MGC:156036 IMAGE:40129722), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120801 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C28, mRNA (cDNA clone MGC:156038 IMAGE:40129724), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57843564:57844007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_134178 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 22 (Vmn1r22), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000177435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57899959:57901054:-1 gene:ENSMUSG00000093501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000031165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57900082:57900735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
NM_134179 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 23 (Vmn1r23), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000175817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57925842:57926838:-1 gene:ENSMUSG00000093376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_134173 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 24 (Vmn1r24), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000175716 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57955633:57956578:-1 gene:ENSMUSG00000093451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_053238 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 25 (Vmn1r25), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57978299:57979351:-1 gene:ENSMUSG00000094206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134172 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 26 (Vmn1r26), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000049694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:58008183:58009202:-1 gene:ENSMUSG00000048697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000176859 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:58048935:58049847:-1 gene:ENSMUSG00000093382 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_134436 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 27 (Vmn1r27), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000095862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:58215106:58216017:-1 gene:ENSMUSG00000071428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:58145166:58441348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1
NM_134177 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 30 (Vmn1r30), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000078890 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:58434842:58435894:-1 gene:ENSMUSG00000095670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC138075 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C22, mRNA (cDNA clone MGC:169699 IMAGE:8861094), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC138078 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C22, mRNA (cDNA clone MGC:169702 IMAGE:8861097), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_021432 // RefSeq // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 5 (Nap1l5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:58905234:58907126:-1 gene:ENSMUSG00000055430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC046332 // GenBank // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:54525 IMAGE:6491916), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:58906497:58907611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_153574 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 13, member A (Fam13a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000089860 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:58932090:59024549:-1 gene:ENSMUSG00000037709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000173193 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:58935585:59024340:-1 gene:ENSMUSG00000037709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000173712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:58983889:59024422:-1 gene:ENSMUSG00000037709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// BC080861 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 13, member A, mRNA (cDNA clone MGC:90575 IMAGE:30357292), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK087913 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330040C12 product:EST AI462012, full insert sequence. // chr6 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000013851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:58920558:59009387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT057178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0
NM_183183 // RefSeq // Mus musculus GPRIN family member 3 (Gprin3), mRNA. // chr6 // 85 // 79 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000051065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:59352461:59426290:-1 gene:ENSMUSG00000045441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AK173336 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA2027 protein. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC138149 // GenBank // Mus musculus GPRIN family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169773 IMAGE:8861168), complete cds. // chr6 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// BC138150 // GenBank // Mus musculus GPRIN family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169774 IMAGE:8861169), complete cds. // chr6 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000013852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:59353029:59355320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000013848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:59390224:59428490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
ENSMUST00000082870 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:59705746:59705874:-1 gene:ENSMUSG00000094183 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000083820 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:60071058:60071186:-1 gene:ENSMUSG00000095176 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000060147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:60396349:60403698:-1 gene:ENSMUSG00000046764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK080052 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530053G22 product:Hypothetical Lipocalins structure containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051224 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A530053G22 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3373233). // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK162060 // GenBank HTC // Mus musculus adult male adrenal gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7330401O03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONMMUT057193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT057194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001042451 // RefSeq // Mus musculus synuclein, alpha (Snca), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000114268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:60731573:60828996:-1 gene:ENSMUSG00000025889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AF033261 // GenBank // Mus musculus alpha-synuclein (Syn) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// AF044672 // GenBank // Mus musculus alpha-synuclein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// AF179273 // GenBank // Mus musculus alpha-synuclein mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC046764 // GenBank // Mus musculus synuclein, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:57921 IMAGE:5693785), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NM_009221 // RefSeq // Mus musculus synuclein, alpha (Snca), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// ENSMUST00000163779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:60731573:60829855:-1 gene:ENSMUSG00000025889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// AK014472 // GenBank HTC // Mus musculus 14 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4430402N11 product:synuclein, alpha, full insert sequence. // chr6 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000053508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:60781528:60848249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_001113734 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen family B, 16 (Mageb16), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_028025 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen family B, 16 (Mageb16), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052283 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:79623231:79671435:-1 gene:ENSMUSG00000046942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114016 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:X:79623231:79635582:-1 gene:ENSMUSG00000046942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC050207 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410003J06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:60956 IMAGE:30007513), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC115695 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410003J06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144648 IMAGE:40104521), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_033647 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen family B, 16, pseudogene 1 (Mageb16-ps1), non-coding RNA. // chr6 // 54 // 92 // 13 // 24 // 0 /// ENSMUST00000117991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:144555211:144556337:-1 gene:ENSMUSG00000082106 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 54 // 100 // 14 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:144555178:144556337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 75 // 62 // 12 // 16 // 0 /// GENSCAN00000050644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:79623687:79624778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:60769968:60771059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_019455 // RefSeq // Mus musculus hematopoietic prostaglandin D synthase (Hpgds), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031982 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:65117293:65144908:-1 gene:ENSMUSG00000029919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000170252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:65131980:65138271:-1 gene:ENSMUSG00000029919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC116735 // GenBank // Mus musculus prostaglandin D2 synthase 2, hematopoietic, mRNA (cDNA clone MGC:151112 IMAGE:40126054), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC116737 // GenBank // Mus musculus prostaglandin D2 synthase 2, hematopoietic, mRNA (cDNA clone MGC:151114 IMAGE:40126056), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// D82072 // GenBank // Mus musculus mRNA for glutathione-requiring prostaglandin D synthase, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506399 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hematopoietic prostaglandin D synthase (Hpgds), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000037735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:65128904:65173568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSMUST00000082457 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:65989640:65989739:-1 gene:ENSMUSG00000064391 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134170 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 32 (Vmn1r32), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079584 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:66552183:66559708:-1 gene:ENSMUSG00000062905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119596 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C15, mRNA (cDNA clone MGC:141379 IMAGE:40059150), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC119597 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C15, mRNA (cDNA clone MGC:141380 IMAGE:40059151), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:66552882:66553535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_134169 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 33 (Vmn1r33), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000079678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:66611582:66612617:-1 gene:ENSMUSG00000059375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000175988 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:66611448:66616062:-1 gene:ENSMUSG00000059375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC138428 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C14, mRNA (cDNA clone MGC:170053 IMAGE:8861448), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC138429 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C14, mRNA (cDNA clone MGC:170054 IMAGE:8861449), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_134167 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 35 (Vmn1r35), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000071414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:66678794:66679684:-1 gene:ENSMUSG00000060699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000036760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:66678794:66679429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0
NM_134166 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 36 (Vmn1r36), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000177072 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:66715902:66716930:-1 gene:ENSMUSG00000093764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000036777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:66715972:66716634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_134168 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 38 (Vmn1r38), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:66776144:66777179:-1 gene:ENSMUSG00000093632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000065878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:66894654:66896521:-1 gene:ENSMUSG00000053442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK087755 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330016D02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK159053 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K530045B21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONMMUT057272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_007836 // RefSeq // Mus musculus growth arrest and DNA-damage-inducible 45 alpha (Gadd45a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000043098 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:67035096:67037406:-1 gene:ENSMUSG00000036390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128617 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:67035579:67037186:-1 gene:ENSMUSG00000036390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000151958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:67035459:67037201:-1 gene:ENSMUSG00000036390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC011141 // GenBank // Mus musculus growth arrest and DNA-damage-inducible 45 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:18457 IMAGE:4035898), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L28177 // GenBank // Mouse Gadd45 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126194 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:67036371:67037377:-1 gene:ENSMUSG00000036390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:67035659:67042246:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_008354 // RefSeq // Mus musculus interleukin 12 receptor, beta 2 (Il12rb2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000018485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:67292018:67376188:-1 gene:ENSMUSG00000018341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC137745 // GenBank // Mus musculus interleukin 12 receptor, beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:169369 IMAGE:8860764), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// U64199 // GenBank // Mus musculus Il-12 receptor beta2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000117441 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:67291318:67339694:-1 gene:ENSMUSG00000018341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// AK040072 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430056E01 product:interleukin 12 receptor, beta 2, full insert sequence. // chr6 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// GENSCAN00000001155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:67292203:67415012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000178086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:67414431:67415012:-1 gene:ENSMUSG00000096086 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000001155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:67292203:67415012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_144548 // RefSeq // Mus musculus interleukin 23 receptor (Il23r), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118364 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:67422932:67491855:-1 gene:ENSMUSG00000049093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF461423 // GenBank // Mus musculus interleukin-23 receptor (IL-23R) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC112425 // GenBank // Mus musculus interleukin 23 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:132969 IMAGE:40062206), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:67423365:67491977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_020047 // RefSeq // Mus musculus tumor-associated calcium signal transducer 2 (Tacstd2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:67534059:67535822:-1 gene:ENSMUSG00000051397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117719 // GenBank // Mus musculus tumor-associated calcium signal transducer 2, mRNA (cDNA clone MGC:141612 IMAGE:40088161), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC117720 // GenBank // Mus musculus tumor-associated calcium signal transducer 2, mRNA (cDNA clone MGC:141613 IMAGE:40088163), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000001214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:67534753:67535706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000103328 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:68631963:68632430:-1 gene:ENSMUSG00000094420 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY129006 // GenBank // Mus musculus anti-human seminoprotein monoclonal antibody mRNA, complete cds. // chr6 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// BC015292 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:19136 IMAGE:4216659, complete cds. // chr6 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// BC128281 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin kappa chain complex, mRNA (cDNA clone MGC:150007 IMAGE:40099836), complete cds. // chr6 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// NONMMUT057323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// X63808 // GenBank // M.musculus mRNA for IgM V(k)MRB6. // chr6 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
ENSMUST00000103331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:68736302:68736583:-1 gene:ENSMUSG00000076530 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 62 // 52 // 8 // 13 // 0 /// AK157689 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830304C16 product:Ig kappa chain V-VI region XRPC 44 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183936 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:68736297:68736764:-1 gene:ENSMUSG00000098814 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT057324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000103333 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:68768568:68769103:-1 gene:ENSMUSG00000076532 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// AB022781 // GenBank // Mus musculus mRNA for IgG1 kappa light chain (V region), partial cds, cell_line:CRA5. // chr6 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// X59098 // GenBank // M.musculus mRNA (L14-2G9) for mRNA light chain V region. // chr6 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// X88903 // GenBank // M.musculus mRNA for variable light chain. // chr6 // 76 // 91 // 16 // 21 // 0 /// X53350 // GenBank // Mouse mRNA for the V(kappa) region from an anti-phosphatidyl choline producing hybridoma (NC6-C12). // chr6 // 70 // 100 // 16 // 23 // 0 /// L48663 // GenBank // Mus musculus (cell line C3H/F2-11) chromosome 6 anti-DNA antibody light chain mRNA. // chr6 // 39 // 100 // 9 // 23 // 0
ENSMUST00000103337 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:68910411:68910938:-1 gene:ENSMUSG00000076536 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AK157689 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830304C16 product:Ig kappa chain V-VI region XRPC 44 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// BC106160 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4022581, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// X05554 // GenBank // Mouse mRNA for X24 kappa immunoglobulin light chain. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000002568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:68910403:68910938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000103349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:69283794:69284319:-1 gene:ENSMUSG00000076548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NR_004434 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease P RNA-like 1 (Rprl1), RNase P RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000158050 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:69326844:69327170:-1 gene:ENSMUSG00000088675 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006544082 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642862 (LOC102642862), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000103355 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:69500254:69500545:-1 gene:ENSMUSG00000095633 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000002587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:69463186:69500786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000103357 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:69575977:69576500:-1 gene:ENSMUSG00000076556 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// L42274 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin light chain mRNA. // chr6 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000002577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:69544276:69598824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// M28250 // GenBank // Mouse rearranged light chain mRNA V-region (V-J5), partial cds. // chr6 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
ENSMUST00000103359 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:69607275:69607801:-1 gene:ENSMUSG00000096833 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// X75399 // GenBank // M.musculus VKPD1 gene for PD1 light chain variable region. // chr6 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// X72797 // GenBank // M.musculus VKD9D10 mRNA. // chr6 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// GENSCAN00000002569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:69607267:69619179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000103364 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:69726573:69727125:-1 gene:ENSMUSG00000076563 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC106172 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4984768, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:69700759:69734998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// X70262 // GenBank // M.musculus mRNA I (3B12-2) for autoantibodies (V-region light chain). // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000103365 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:69764523:69764992:-1 gene:ENSMUSG00000076564 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ078272 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin kappa light chain mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC002112 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin kappa chain complex, mRNA (cDNA clone MGC:6612 IMAGE:3488780), complete cds. // chr6 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// X13187 // GenBank // Mouse mRNA for anti-hPLAP-directed immunoglobulin E6-L chain. // chr6 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:69764498:69764992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB007986 // GenBank // Mus musculus mRNA for single chain antibody ScFv, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// D88411 // GenBank // Mus musculus mRNA for kappa light chain IgG1, partial cds, CRA4VL. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// X03385 // GenBank // Mouse mRNA for GAT (HP20) anti-idiotypic Ab2 Ig (k) light chain against public idiotopes GAT antigen = Glu(60)Ala(30)Tyr(10) co-polymer. // chr6 // 33 // 96 // 8 // 24 // 0 /// X03389 // GenBank // Mouse mRNA for GAT (HP25) anti-idiotypic Ab2 Ig (k) light chain against public idiotopes GAT antigen = Glu(60)Ala(30)Tyr(10) co-polymer. // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000103366 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:69775750:69776306:-1 gene:ENSMUSG00000094094 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// X14625 // GenBank // Murine nonfunctional MRL-RF33BL mRNA for IgM (kappa)-light chain V(kappa)23. // chr6 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// GENSCAN00000002578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:69775701:69815100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
ENSMUST00000103369 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:69858420:69858884:-1 gene:ENSMUSG00000095007 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000002581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:69858395:69858884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT057336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
ENSMUST00000103374 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70010949:70011673:-1 gene:ENSMUSG00000076573 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000103376 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70058632:70059199:-1 gene:ENSMUSG00000076575 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// K02793 // GenBank // Mouse Ig kappa active V-J region mRNA from PC-binding hybridoma HPCA97. // chr6 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0
ENSMUST00000103377 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70074024:70074584:-1 gene:ENSMUSG00000076576 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// X70424 // GenBank // M.musculus mRNA for monoclonal antibody light chain kappa. // chr6 // 67 // 100 // 16 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70073927:70106415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000103378 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70117061:70117617:-1 gene:ENSMUSG00000076577 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0 /// AJ005051 // GenBank // Mus musculus VSV-IND neutralising scFv antibody fragment generated from the germline precursor of antibody VI24. // chr6 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0 /// GQ984291 // GenBank // Mus musculus anti-FimA monoclonal antibody 123 immunoglobulin kappa light chain precursor, mRNA, complete cds. // chr6 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0 /// GENSCAN00000031269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70116946:70117617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000103380 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70143593:70143897:-1 gene:ENSMUSG00000094356 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000031276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70138437:70144161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 90 // 7 // 9 // 0 /// L48665 // GenBank // Mus musculus (cell line C3H/F2-12) chromosome 6 anti-DNA antibody light chain mRNA. // chr6 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0
ENSMUST00000103384 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70216858:70217421:-1 gene:ENSMUSG00000076583 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY486290 // GenBank // Mus musculus anti-human TNF F6 immunoglubulin light chain variable region mRNA, partial cds. // chr6 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// X75397 // GenBank // M.musculus VKPA1 gene for PA1 light chain variable region. // chr6 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// GENSCAN00000031274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70216833:70217421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000103387 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70314895:70315452:-1 gene:ENSMUSG00000076586 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AJ222611 // GenBank // mouse DNA, light chain of a recombinant single chain Fv against the human C3a receptor. // chr6 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// M28833 // GenBank // Mus musculus IgK chain (anti-Pseudomonas aeruginosa lipoprotein I antibody) mRNA, 5 end. // chr6 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// HE681449 // GenBank // Mus musculus mRNA for immunoglobulin fragment (IGL gene), strain BALB/c, segment VL, clone 1D9. // chr6 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70314744:70315452:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000103388 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70335841:70336479:-1 gene:ENSMUSG00000076587 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// L41881 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin kappa chain mRNA, complete cds. // chr6 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// M84430 // GenBank // Mouse rearranged light chain variable region gene sequence. // chr6 // 84 // 70 // 16 // 19 // 0 /// ENSMUST00000103379 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70138462:70139082:-1 gene:ENSMUSG00000076578 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// U68543 // GenBank // Mus musculus Ig single-chain antibody mRNA, complete cds. // chr6 // 63 // 70 // 12 // 19 // 0 /// V00810 // GenBank // M.musculus mRNA for mouse immunoglobulin kappa light chain. // chr6 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0 /// X76019 // GenBank // Mus musculus (BALB/c) Ig mRNA clones 248-21. // chr6 // 42 // 70 // 8 // 19 // 0 /// GENSCAN00000031252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70335816:70341448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// AF002242 // GenBank // Mus musculus anti-CD30 moab Ki-4 scFv mRNA, partial cds. // chr6 // 50 // 74 // 10 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70138437:70144161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 37 // 100 // 10 // 27 // 0
ENSMUST00000103392 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70386672:70387238:-1 gene:ENSMUSG00000076591 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70386515:70407004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000103393 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70406469:70406992:-1 gene:ENSMUSG00000094797 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// AJ222591 // GenBank // Mus musculus light chain of a recombinant single chain Fv against the human C3a receptor. // chr6 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// Y11589 // GenBank // Mus musculus mRNA for antibody light chain, clone library pYBM-AL6. // chr6 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// L48670 // GenBank // Mus musculus (cell line C3H/F2-21) chromosome 6 anti-DNA antibody light chain mRNA. // chr6 // 53 // 100 // 8 // 15 // 0 /// U59155 // GenBank // Mus musculus anti-DNA light chain (Vk19) mRNA, partial cds. // chr6 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0 /// GENSCAN00000031246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70386515:70407004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 93 // 10 // 14 // 0
GENSCAN00000031260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70457476:70458036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_009075 // RefSeq // Mus musculus ribose 5-phosphate isomerase A (Rpia), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000066134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:70765720:70792232:-1 gene:ENSMUSG00000053604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// L35034 // GenBank // Mus musculus ribose 5-phosphate isomerase (RPI) mRNA exons 1-6, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000129244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:70782080:70792003:-1 gene:ENSMUSG00000053604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// AK166785 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0013C19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000031280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70766554:70791948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_028825 // RefSeq // Mus musculus testis expressed 37 (Tex37), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506706 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed 37 (Tex37), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000063456 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:70913087:70918927:-1 gene:ENSMUSG00000051896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049736 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700011F03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58753 IMAGE:6771350), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70913264:70946757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
NM_001033929 // RefSeq // Mus musculus threonine synthase-like 2 (bacterial) (Thnsl2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NM_178413 // RefSeq // Mus musculus threonine synthase-like 2 (bacterial) (Thnsl2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000074241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:71128398:71144338:-1 gene:ENSMUSG00000054474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000160918 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:71128166:71144346:-1 gene:ENSMUSG00000054474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000170455 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:71131766:71144331:-1 gene:ENSMUSG00000054474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000170753 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:71128656:71131972:-1 gene:ENSMUSG00000054474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC025604 // GenBank // Mus musculus threonine synthase-like 2 (bacterial), mRNA (cDNA clone MGC:38040 IMAGE:5250319), complete cds. // chr6 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// BC051244 // GenBank // Mus musculus threonine synthase-like 2 (bacterial), mRNA (cDNA clone MGC:59076 IMAGE:4975661), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71128630:71141442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_001160127 // RefSeq // Mus musculus SET and MYND domain containing 1 (Smyd1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// NM_009762 // RefSeq // Mus musculus SET and MYND domain containing 1 (Smyd1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000074301 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:71213940:71262281:-1 gene:ENSMUSG00000055027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000114186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:71213942:71262253:-1 gene:ENSMUSG00000055027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC076601 // GenBank // Mus musculus SET and MYND domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:100109 IMAGE:30609878), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// U76373 // GenBank // Mus musculus skm-BOP1 (Bop) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 78 // 28 // 29 // 0 /// U76374 // GenBank // Mus musculus skm-BOP2 (Bop) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// U76371 // GenBank // Mus musculus t-BOP (Bop) mRNA, complete cds. // chr6 // 70 // 81 // 21 // 30 // 0 /// ENSMUST00000114188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:71215342:71322233:-1 gene:ENSMUSG00000055027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 76 // 76 // 28 // 37 // 1 /// GENSCAN00000044397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71215751:71262189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1
NM_024288 // RefSeq // Mus musculus required for meiotic nuclear division 5 homolog A (S. cerevisiae) (Rmnd5a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000002292 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:71388634:71440637:-1 gene:ENSMUSG00000002222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC050876 // GenBank // Mus musculus required for meiotic nuclear division 5 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:59617 IMAGE:6512227), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000149415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:71388887:71399293:-1 gene:ENSMUSG00000002222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000044385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71396837:71440139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_025430 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L35 (Mrpl35), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000065103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:71813003:71823810:-1 gene:ENSMUSG00000052962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC028750 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L35, mRNA (cDNA clone MGC:41050 IMAGE:1245736), complete cds. // chr6 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71787711:71823758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
AK146172 // GenBank HTC // Mus musculus CRL-1722 L5178Y-R cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I730029A14 product:Hypothetical PPR repeats containing protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 79 // 98 // 37 // 47 // 0 /// BC115434 // GenBank // Mus musculus pentatricopeptide repeat domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:143869 IMAGE:40094203), complete cds. // chr6 // 91 // 98 // 43 // 47 // 0 /// NM_027275 // RefSeq // Mus musculus pentatricopeptide repeat domain 3 (Ptcd3), mRNA. // chr6 // 98 // 98 // 47 // 48 // 1 /// XR_377490 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pentatricopeptide repeat domain 3 (Ptcd3), transcript variant X5, misc_RNA. // chr6 // 98 // 98 // 47 // 48 // 1 /// ENSMUST00000082094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:71880648:71908762:-1 gene:ENSMUSG00000063884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 98 // 98 // 47 // 48 // 1 /// AK032831 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720460B08 product:hypothetical PPR repeats containing protein, full insert sequence. // chr6 // 67 // 67 // 32 // 48 // 1 /// BC060687 // GenBank // Mus musculus pentatricopeptide repeat domain 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6415524), partial cds. // chr6 // 58 // 58 // 28 // 48 // 1 /// BC055844 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810422B04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4481020). // chr6 // 40 // 40 // 19 // 48 // 1 /// GENSCAN00000040947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71881153:71903515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 18 // 18 // 0
NM_153778 // RefSeq // Mus musculus atonal homolog 8 (Drosophila) (Atoh8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:72206177:72235577:-1 gene:ENSMUSG00000037621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB046527 // GenBank // Mus musculus okadin type I mRNA for putative bHLH transcription factor Okadin, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AB046528 // GenBank // Mus musculus okadin type II mRNA for putative bHLH transcription factor Okadin, complete cds. // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// AB049066 // GenBank // Mus musculus mRNA for bHLH factor Math6, complete cds. // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AY349615 // GenBank // Mus musculus bHLH transcription factor (Math6) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC023684 // GenBank // Mus musculus atonal homolog 8 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:38314 IMAGE:5343472), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72216689:72235164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_138592 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 39 (Usp39), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000070345 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:72318678:72345184:-1 gene:ENSMUSG00000056305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000154799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:72321300:72333368:-1 gene:ENSMUSG00000056305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC026983 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 39, mRNA (cDNA clone MGC:36658 IMAGE:5365862), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72318844:72345149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001080742 // RefSeq // Mus musculus vesicle-associated membrane protein 5 (Vamp5), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_016872 // RefSeq // Mus musculus vesicle-associated membrane protein 5 (Vamp5), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000074231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:72368049:72380468:-1 gene:ENSMUSG00000073002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:72368049:72380468:-1 gene:ENSMUSG00000073002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF035643 // GenBank // Mus musculus VAMP5 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AF119384 // GenBank // Mus musculus putative CAMP protein (Camp) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC086925 // GenBank // Mus musculus vesicle-associated membrane protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:107648 IMAGE:6758831), complete cds. // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC145146 // GenBank // Mus musculus vesicle-associated membrane protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:178705 IMAGE:9053697), complete cds. // chr6 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AK145137 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830050J02 product:vesicle-associated membrane protein 5, full insert sequence. // chr6 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72360583:72390476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_016794 // RefSeq // Mus musculus vesicle-associated membrane protein 8 (Vamp8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000059983 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:72385223:72390703:-1 gene:ENSMUSG00000050732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000142613 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:72385228:72389911:-1 gene:ENSMUSG00000050732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AF045661 // GenBank // Mus musculus vesicle associated membrane protein 8 (Vamp8) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// AF053724 // GenBank // Mus musculus endobrevin mRNA, complete cds. // chr6 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// BC012668 // GenBank // Mus musculus vesicle-associated membrane protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:13842 IMAGE:4205509), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC043928 // GenBank HTC // Mus musculus, vesicle-associated membrane protein 8, clone IMAGE:4222378, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT057429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72360583:72390476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
BC058360 // GenBank // Mus musculus methionine adenosyltransferase II, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:66705 IMAGE:6821781), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_145569 // RefSeq // Mus musculus methionine adenosyltransferase II, alpha (Mat2a), mRNA. // chr6 // 86 // 86 // 18 // 21 // 1 /// ENSMUST00000059472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:72432799:72439558:-1 gene:ENSMUSG00000053907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 86 // 18 // 21 // 1 /// AB070266 // GenBank // Mus musculus MAT2A mRNA for methionine adenosyltransferase II alpha subunit, complete cds. // chr6 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// BC003451 // GenBank // Mus musculus methionine adenosyltransferase II, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:6545 IMAGE:2655444), complete cds. // chr6 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// GENSCAN00000040951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72433292:72440076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
NM_009443 // RefSeq // Mus musculus trans-golgi network protein (Tgoln1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_009444 // RefSeq // Mus musculus trans-golgi network protein 2 (Tgoln2), mRNA. // chr6 // 81 // 76 // 21 // 26 // 0 /// ENSMUST00000070524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:72608432:72617000:-1 gene:ENSMUSG00000056429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK145212 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930020M22 product:Trans-Golgi network integral membrane protein 2 precursor (TGN38B), full insert sequence. // chr6 // 89 // 56 // 17 // 19 // 0 /// BC009143 // GenBank // Mus musculus trans-golgi network protein, mRNA (cDNA clone MGC:11627 IMAGE:3157708), complete cds. // chr6 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// BC141218 // GenBank // Mus musculus trans-golgi network protein, mRNA (cDNA clone MGC:176179 IMAGE:9055830), complete cds. // chr6 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// BC145542 // GenBank // Mus musculus trans-golgi network protein, mRNA (cDNA clone MGC:179113 IMAGE:9054105), complete cds. // chr6 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// CT010269 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F1051D for gene Tgoln1, Trans-golgi network protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// D50031 // GenBank // Mus musculus mRNA for TGN38A, complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// D50032 // GenBank // Mus musculus mRNA for TGN38B, complete cds. // chr6 // 81 // 76 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72610807:72616722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0
NM_019715 // RefSeq // Mus musculus potassium channel modulatory factor 1 (Kcmf1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000068697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:72841114:72899979:-1 gene:ENSMUSG00000055239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF143859 // GenBank // Mus musculus DEBT-91 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AK007070 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700094M07 product:POTASSIUM CHANNEL MODULATORY FACTOR homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 83 // 80 // 20 // 24 // 0 /// BC043330 // GenBank // Mus musculus potassium channel modulatory factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:49462 IMAGE:5249829), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72842869:72861925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001164669 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 6 (Dnah6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000064948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:73017606:73221631:-1 gene:ENSMUSG00000052861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000114040 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:73017609:73221651:-1 gene:ENSMUSG00000052861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000036297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72957376:73033237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// GENSCAN00000036302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:73035187:73225017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_001164669 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 6 (Dnah6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006506303 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 6 (Dnah6), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000064948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:73017606:73221631:-1 gene:ENSMUSG00000052861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000114038 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:73084178:73139005:-1 gene:ENSMUSG00000052861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000114040 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:73017609:73221651:-1 gene:ENSMUSG00000052861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK140479 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930008M23 product:Similar to dynein heavy chain at 16F homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:73035187:73225017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000083138 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:73141485:73141680:-1 gene:ENSMUSG00000065072 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001164669 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 6 (Dnah6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006506303 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 6 (Dnah6), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000064948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:73017606:73221631:-1 gene:ENSMUSG00000052861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000114040 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:73017609:73221651:-1 gene:ENSMUSG00000052861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK042554 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730004I20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:73035187:73225017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_025737 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931417E11 gene (4931417E11Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:73468573:73469667:-1 gene:ENSMUSG00000056197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048456 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931417E11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58181 IMAGE:6771342), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:73468647:73514383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
AK139520 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020002N07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00006336 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082556 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:76200118:76200278:-1 gene:ENSMUSG00000064490 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001161741 // RefSeq // Mus musculus regenerating islet-derived 3 delta (Reg3d), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NM_013893 // RefSeq // Mus musculus regenerating islet-derived 3 delta (Reg3d), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000089667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:78375874:78378865:-1 gene:ENSMUSG00000068341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000167492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:78375874:78378865:-1 gene:ENSMUSG00000068341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AB035204 // GenBank // Mus musculus mRNA for Reg III delta, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC113760 // GenBank // Mus musculus regenerating islet-derived 3 delta, mRNA (cDNA clone MGC:130575 IMAGE:40055351), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AB028625 // GenBank // Mus musculus INGAPrP mRNA for INGAP related protein, complete cds. // chr6 // 70 // 100 // 19 // 27 // 0
NM_011260 // RefSeq // Mus musculus regenerating islet-derived 3 gamma (Reg3g), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000032089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:78466269:78468872:-1 gene:ENSMUSG00000030017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000176650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:78466269:78468571:-1 gene:ENSMUSG00000030017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC061139 // GenBank // Mus musculus regenerating islet-derived 3 gamma, mRNA (cDNA clone MGC:74271 IMAGE:30298640), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D63361 // GenBank // Mus musculus mRNA for regIIIgamma protein, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT057500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:78451170:78497441:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_026490 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L19 (Mrpl19), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000032124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:81957851:81965958:-1 gene:ENSMUSG00000030045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000148025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:81962422:81965641:-1 gene:ENSMUSG00000030045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// AK141554 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630024D24 product:mitochondrial ribosomal protein L19, full insert sequence. // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC043921 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L19, mRNA (cDNA clone MGC:46768 IMAGE:5361515), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC061064 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L19, mRNA (cDNA clone MGC:74176 IMAGE:6535226), complete cds. // chr6 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:81961941:81965927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 70 // 17 // 19 // 0 /// AK018508 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030416F12 product:hypothetical Ribosomal protein L19 containing protein, full insert sequence. // chr6 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_013820 // RefSeq // Mus musculus hexokinase 2 (Hk2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006505606 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hexokinase 2 (Hk2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000000642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:82725025:82774454:-1 gene:ENSMUSG00000000628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000170833 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:82727310:82773363:-1 gene:ENSMUSG00000000628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC054472 // GenBank // Mus musculus hexokinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:62607 IMAGE:6465367), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:82727310:82773980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0
NM_011350 // RefSeq // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), TM domain, and short cytoplasmic domain (Sema4f), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000000641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:82911885:82939769:-1 gene:ENSMUSG00000000627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB021291 // GenBank // Mus musculus mRNA for semaphorin W, complete cds. // chr6 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC094567 // GenBank // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), TM domain, and short cytoplasmic domain, mRNA (cDNA clone MGC:106526 IMAGE:6834138), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC139232 // GenBank // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), TM domain, and short cytoplasmic domain, mRNA (cDNA clone MGC:170859 IMAGE:8862254), complete cds. // chr6 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// NM_001113481 // RefSeq // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), TM domain, and short cytoplasmic domain (Sema4f), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSMUST00000113982 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:6:82916375:82939769:-1 gene:ENSMUSG00000000627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000039677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:82887516:82939623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_001291799 // RefSeq // Mus musculus docking protein 1 (Dok1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_010070 // RefSeq // Mus musculus docking protein 1 (Dok1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000089651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83030934:83033471:-1 gene:ENSMUSG00000068335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000149918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83030940:83033468:-1 gene:ENSMUSG00000068335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC013066 // GenBank // Mus musculus docking protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:6661 IMAGE:3498170), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U78818 // GenBank // Mus musculus Abl- and p120 rasGAP-associated protein Dok (dok) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83031251:83034830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_009392 // RefSeq // Mus musculus T cell leukemia, homeobox 2 (Tlx2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000089641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83068591:83070143:-1 gene:ENSMUSG00000068327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000174674 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:83068324:83070225:-1 gene:ENSMUSG00000068327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC138240 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia, homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:169864 IMAGE:8861259), complete cds. // chr6 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// BC138241 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia, homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:169865 IMAGE:8861260), complete cds. // chr6 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// M75953 // GenBank // M.musculus homeobox containing protein (PMUR10F) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83067369:83070079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0
NM_023547 // RefSeq // Mus musculus INO80 complex subunit B (Ino80b), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83121828:83125029:-1 gene:ENSMUSG00000030034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113935 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83121765:83125431:-1 gene:ENSMUSG00000030034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000143814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83121765:83125431:-1 gene:ENSMUSG00000030034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC019383 // GenBank // Mus musculus INO80 complex subunit B, mRNA (cDNA clone MGC:30535 IMAGE:5010975), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC058788 // GenBank // Mus musculus INO80 complex subunit B, mRNA (cDNA clone MGC:65219 IMAGE:6440887), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83121828:83125068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_008638 // RefSeq // Mus musculus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NAD+ dependent), methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase (Mthfd2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006505697 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NAD+ dependent), methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase (Mthfd2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000005810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83305691:83317606:-1 gene:ENSMUSG00000005667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC019511 // GenBank // Mus musculus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NAD+ dependent), methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:28481 IMAGE:4164253), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// J04627 // GenBank // Mouse NAD-dependent methylenetetrahydrofolate dehydrogenase- methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83306646:83317529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_183138 // RefSeq // Mus musculus tet methylcytosine dioxygenase 3 (Tet3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000089622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83362373:83441675:-1 gene:ENSMUSG00000034832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// HQ423151 // GenBank // Mus musculus TET3 isoform 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// HQ423152 // GenBank // Mus musculus TET3 isoform 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// JX946278 // GenBank // Mus musculus strain 129/Ola Tet methylcytosine deoxygenase 3 isoform (Tet3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000186548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83368042:83456392:-1 gene:ENSMUSG00000034832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83368042:83506889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_183138 // RefSeq // Mus musculus tet methylcytosine dioxygenase 3 (Tet3), mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000056191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83398439:83441678:-1 gene:ENSMUSG00000034832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83362373:83441675:-1 gene:ENSMUSG00000034832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK046543 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430001J04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// HQ423151 // GenBank // Mus musculus TET3 isoform 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// HQ423152 // GenBank // Mus musculus TET3 isoform 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// JX946278 // GenBank // Mus musculus strain 129/Ola Tet methylcytosine deoxygenase 3 isoform (Tet3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000186548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83368042:83456392:-1 gene:ENSMUSG00000034832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000039687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83368042:83506889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_009610 // RefSeq // Mus musculus actin, gamma 2, smooth muscle, enteric (Actg2), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000075161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83512905:83536265:-1 gene:ENSMUSG00000059430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000121731 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83512912:83527990:-1 gene:ENSMUSG00000059430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000124933 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83519769:83526902:-1 gene:ENSMUSG00000059430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000141904 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83519763:83527491:-1 gene:ENSMUSG00000059430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000152029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83520683:83527810:-1 gene:ENSMUSG00000059430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// BC002042 // GenBank // Mus musculus actin, gamma 2, smooth muscle, enteric, mRNA (cDNA clone MGC:6022 IMAGE:3591323), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC049611 // GenBank // Mus musculus actin, gamma 2, smooth muscle, enteric, mRNA (cDNA clone MGC:58296 IMAGE:6773765), complete cds. // chr6 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// M26689 // GenBank // Mus musculus smooth muscle gamma actin mRNA, complete cds. // chr6 // 81 // 84 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83512985:83581719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_024239 // RefSeq // Mus musculus STAM binding protein (Stambp), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000068054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83543206:83572504:-1 gene:ENSMUSG00000006906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB010123 // GenBank // Mus musculus mRNA for AMSH, complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK220541 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4198 protein. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC003497 // GenBank // Mus musculus STAM binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:6953 IMAGE:3153829), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC006939 // GenBank // Mus musculus STAM binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:6839 IMAGE:2649718), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC025111 // GenBank // Mus musculus STAM binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:36212 IMAGE:4194332), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83512985:83581719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_016751 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member f (Clec4f), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000014686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83644542:83656187:-1 gene:ENSMUSG00000014542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC013647 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member f, mRNA (cDNA clone MGC:18808 IMAGE:4195561), complete cds. // chr6 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// D88577 // GenBank // Mus musculus mRNA for Kupffer cell receptor, complete cds. // chr6 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// ENSMUST00000137647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83645217:83656119:-1 gene:ENSMUSG00000014542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000039691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83600960:83695640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_144943 // RefSeq // Mus musculus CD207 antigen (Cd207), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000037882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83671207:83677857:-1 gene:ENSMUSG00000034783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AJ302711 // GenBank // Mus musculus mRNA for C type lectin (langerin gene). // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// AY026050 // GenBank // Mus musculus langerin mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// AY078415 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 langerin mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83600960:83695640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_009357 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 261 (Tex261), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006505886 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed gene 261 (Tex261), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006505887 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed gene 261 (Tex261), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000014892 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83768885:83775813:-1 gene:ENSMUSG00000014748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83770416:83775790:-1 gene:ENSMUSG00000014748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138192 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83773607:83775758:-1 gene:ENSMUSG00000014748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC003802 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 261, mRNA (cDNA clone MGC:6079 IMAGE:3486968), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83771187:83772475:-1 gene:ENSMUSG00000014748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000039676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83771188:83775723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT057647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
XR_403769 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7443 (Gm7443), misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_046063 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10445 (Gm10445), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// KnowTID_00006353 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT057670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001034902 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5878 (Gm5878), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000113802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:85111416:85126125:-1 gene:ENSMUSG00000072952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85103432:85126304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_011467 // RefSeq // Mus musculus sepiapterin reductase (Spr), mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000045986 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85133678:85137766:-1 gene:ENSMUSG00000033735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000174286 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:85134098:85137762:-1 gene:ENSMUSG00000033735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 65 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000174769 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:85133687:85137756:-1 gene:ENSMUSG00000033735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// AK004941 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1300008E05 product:sepiapterin reductase, full insert sequence. // chr6 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// BC010400 // GenBank // Mus musculus sepiapterin reductase, mRNA (cDNA clone MGC:13710 IMAGE:4219245), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC054423 // GenBank // Mus musculus sepiapterin reductase, mRNA (cDNA clone MGC:62620 IMAGE:4985039), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85134098:85137745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 70 // 13 // 14 // 0
ENSMUST00000059034 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:85234380:85333419:-1 gene:ENSMUSG00000033720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AF325264 // GenBank // Mus musculus sideroflexin 5 (Sfxn5) precursor RNA, partial cds. // chr6 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// AK043706 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830022I08 product:sideroflexin 5, full insert sequence. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NM_178639 // RefSeq // Mus musculus sideroflexin 5 (Sfxn5), mRNA. // chr6 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// ENSMUST00000045846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85213051:85333422:-1 gene:ENSMUSG00000033720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// ENSMUST00000148179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85268714:85333406:-1 gene:ENSMUSG00000033720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000048506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85215669:85333415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001003955 // RefSeq // Mus musculus RAB11 family interacting protein 5 (class I) (Rab11fip5), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_177466 // RefSeq // Mus musculus RAB11 family interacting protein 5 (class I) (Rab11fip5), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:85334963:85374634:-1 gene:ENSMUSG00000051343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC141380 // GenBank // Mus musculus RAB11 family interacting protein 5 (class I), mRNA (cDNA clone IMAGE:9055993), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85337023:85374528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_001001160 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 41 (Fbxo41), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001289674 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 41 (Fbxo41), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_001289675 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 41 (Fbxo41), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000159062 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85469574:85502994:-1 gene:ENSMUSG00000047013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000161078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85469578:85502886:-1 gene:ENSMUSG00000047013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000161546 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85469580:85502858:-1 gene:ENSMUSG00000047013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC070445 // GenBank // Mus musculus F-box protein 41, mRNA (cDNA clone MGC:91304 IMAGE:30536738), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85472551:85501529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NM_020596 // RefSeq // Mus musculus early growth response 4 (Egr4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:85511131:85513589:-1 gene:ENSMUSG00000071341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85511640:85513397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_023493 // RefSeq // Mus musculus camello-like 5 (Cml5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85817221:85820972:-1 gene:ENSMUSG00000079494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024605 // GenBank // Mus musculus camello-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:25942 IMAGE:4236653), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85817293:85817976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_023455 // RefSeq // Mus musculus N-acetyltransferase 8 (GCN5-related, putative) (Nat8), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_006506535 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetyltransferase 8 (GCN5-related, putative) (Nat8), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000032073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85830388:85832082:-1 gene:ENSMUSG00000030004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF163317 // GenBank // Mus musculus putative N-acetyltransferase Camello 4 (cml4) mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// BC019517 // GenBank // Mus musculus camello-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:28664 IMAGE:4236543), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85830466:85831149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_053096 // RefSeq // Mus musculus camello-like 2 (Cml2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000045008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85865422:85869158:-1 gene:ENSMUSG00000033634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF163315 // GenBank // Mus musculus putative N-acetyltransferase Camello 2 (cml2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC039773 // GenBank // Mus musculus camello-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:49548 IMAGE:4193874), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_029331 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019G17 gene (1700019G17Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006506718 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700019G17 gene (1700019G17Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000095757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85899051:85904884:-1 gene:ENSMUSG00000068299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC029200 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019G17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35619 IMAGE:3501234), complete cds. // chr6 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// XM_006506720 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700019G17 gene (1700019G17Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 75 // 75 // 15 // 20 // 1 /// NM_001145895 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019G17 gene (1700019G17Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1 /// ENSMUST00000159755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:6:85899051:85902533:-1 gene:ENSMUSG00000068299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
NM_023160 // RefSeq // Mus musculus camello-like 1 (Cml1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85910154:85915687:-1 gene:ENSMUSG00000057103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF163314 // GenBank // Mus musculus putative N-acetyltransferase Camello 1 (cml1) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC010796 // GenBank // Mus musculus camello-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:18864 IMAGE:4223199), complete cds. // chr6 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000172982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85910162:85915666:-1 gene:ENSMUSG00000057103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT057721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSMUST00000162660 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:85932681:85933379:-1 gene:ENSMUSG00000089634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000009436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85915753:85933349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
NM_028099 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 11 (RNA/RNP complex 1-interacting) (Dusp11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006506654 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dual specificity phosphatase 11 (RNA/RNP complex 1-interacting) (Dusp11), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000032071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85942268:85961667:-1 gene:ENSMUSG00000030002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000156821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85949715:85953942:-1 gene:ENSMUSG00000030002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// BC028640 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 11 (RNA/RNP complex 1-interacting), mRNA (cDNA clone IMAGE:1244949), complete cds. // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// BC067028 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 11 (RNA/RNP complex 1-interacting), mRNA (cDNA clone MGC:90050 IMAGE:30364073), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000134793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85955064:85961607:-1 gene:ENSMUSG00000030002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// ENSMUST00000151394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85954962:85961667:-1 gene:ENSMUSG00000030002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000009443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85938596:85961535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_025823 // RefSeq // Mus musculus prenylcysteine oxidase 1 (Pcyox1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000032065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:86386006:86397150:-1 gene:ENSMUSG00000029998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000153723 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:86391786:86397143:-1 gene:ENSMUSG00000029998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// BC028308 // GenBank // Mus musculus prenylcysteine oxidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:27832 IMAGE:3486530), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:86388713:86397084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_011865 // RefSeq // Mus musculus poly(rC) binding protein 1 (Pcbp1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000053015 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:86524492:86526321:-1 gene:ENSMUSG00000051695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF073936 // GenBank // Mus musculus WW domain binding protein 17 mRNA, partial sequence. // chr6 // 80 // 53 // 8 // 10 // 0 /// AF139894 // GenBank // Mus musculus RNA-binding protein alpha-CP1 (Pcbp1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK002433 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610009O08 product:poly(rC) binding protein 1, full insert sequence. // chr6 // 78 // 95 // 14 // 18 // 0 /// BC004793 // GenBank // Mus musculus poly(rC) binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:5645 IMAGE:3588737), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC069915 // GenBank // Mus musculus poly(rC) binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:78172 IMAGE:3673570), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000009432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:86524845:86527096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
NM_010751 // RefSeq // Mus musculus MAX dimerization protein 1 (Mxd1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000001184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:86647044:86669159:-1 gene:ENSMUSG00000001156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC034860 // GenBank // Mus musculus MAX dimerization protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:41165 IMAGE:1448816), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// CT010233 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B1051D for gene Mad, Max dimerization protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// L38926 // GenBank // Mus musculus Mad protein mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// U20614 // GenBank // Mus musculus Mad protein (mad) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK036504 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830122C05 product:Max dimerization protein, full insert sequence. // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000009402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:86650871:86833504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1
AK157959 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930012A22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_011818 // RefSeq // Mus musculus germ cell-less homolog 1 (Drosophila) (Gmcl1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006506056 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus germ cell-less homolog 1 (Drosophila) (Gmcl1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// XR_377446 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus germ cell-less homolog 1 (Drosophila) (Gmcl1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000001185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:86691768:86733378:-1 gene:ENSMUSG00000001157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF163665 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/J germ cell-less protein (Gcl) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AF186095 // GenBank // Mus musculus germ cell-less 1 protein (Gcl-1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AF282322 // GenBank // Mus musculus germ cell-less (Gcl) mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// BC054767 // GenBank // Mus musculus germ cell-less homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:64780 IMAGE:6414943), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:86720210:86733240:-1 gene:ENSMUSG00000001157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// AK132788 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930402K19 product:germ cell-less homolog (Drosophila), full insert sequence. // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000009402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:86650871:86833504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_054041 // RefSeq // Mus musculus anthrax toxin receptor 1 (Antxr1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006506564 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anthrax toxin receptor 1 (Antxr1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000042025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:87133854:87335775:-1 gene:ENSMUSG00000033420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF378762 // GenBank // Mus musculus tumor endothelial marker 8 precursor (Tem8) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK013005 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810405N18 product:similar to ANTRAX TOXIN RECEPTOR PRECURSOR (TUMOR ENDOTHELIAL MARKER 8) [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BC094544 // GenBank // Mus musculus anthrax toxin receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:106504 IMAGE:6406827), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK031465 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030436P19 product:ANTRAX TOXIN RECEPTOR PRECURSOR (TUMOR ENDOTHELIAL MARKER 8) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// XM_006506565 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anthrax toxin receptor 1 (Antxr1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// AK048637 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130091A15 product:ANTRAX TOXIN RECEPTOR PRECURSOR (TUMOR ENDOTHELIAL MARKER 8) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// GENSCAN00000053795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87122716:87335442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NM_025466 // RefSeq // Mus musculus gastrokine 1 (Gkn1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:87345653:87350915:-1 gene:ENSMUSG00000030050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY456960 // GenBank // Mus musculus foveolin precursor (Fov) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC099446 // GenBank // Mus musculus gastrokine 1, mRNA (cDNA clone MGC:117639 IMAGE:30521253), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC132540 // GenBank // Mus musculus gastrokine 1, mRNA (cDNA clone MGC:164171 IMAGE:40130817), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC132542 // GenBank // Mus musculus gastrokine 1, mRNA (cDNA clone MGC:164173 IMAGE:40130819), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000053775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87346275:87350872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_026860 // RefSeq // Mus musculus gastrokine 3 (Gkn3), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000032127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:87383268:87388935:-1 gene:ENSMUSG00000030048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC116955 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1190003M12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151332 IMAGE:40126274), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GU220566 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 gastrokine 3 (Gkn3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000053789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87380235:87388805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_021381 // RefSeq // Mus musculus prokineticin receptor 1 (Prokr1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000050887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:87578593:87590701:-1 gene:ENSMUSG00000049409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF236082 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor GPR73 (Gpr73) mRNA, complete cds. // chr6 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// AF487278 // GenBank // Mus musculus prokineticin receptor 1 (Pkr1) mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC059003 // GenBank // Mus musculus prokineticin receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:69599 IMAGE:6848525), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87581220:87588861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_024251 // RefSeq // Mus musculus aprataxin and PNKP like factor (Aplf), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aprataxin and PNKP like factor (Aplf), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000065997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:87628429:87672168:-1 gene:ENSMUSG00000030051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC002179 // GenBank // Mus musculus aprataxin and PNKP like factor, mRNA (cDNA clone MGC:7351 IMAGE:3487226), complete cds. // chr6 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// NM_001170489 // RefSeq // Mus musculus aprataxin and PNKP like factor (Aplf), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// ENSMUST00000032130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:87628429:87672168:-1 gene:ENSMUSG00000030051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// AK078805 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430407G10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000053780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87629994:87722177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
GENSCAN00000053780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87629994:87722177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_133934 // RefSeq // Mus musculus ISY1 splicing factor homolog (S. cerevisiae) (Isy1), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000089497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:87818447:87838759:-1 gene:ENSMUSG00000030056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK173116 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1160 protein. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC020103 // GenBank // Mus musculus ISY1 splicing factor homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:28047 IMAGE:3673446), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC037695 // GenBank // Mus musculus ISY1 splicing factor homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:47236 IMAGE:4009615), complete cds. // chr6 // 86 // 90 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87819096:87838646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000161787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:87948464:87948877:-1 gene:ENSMUSG00000068689 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87948464:87948679:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
NM_198622 // RefSeq // Mus musculus H1 histone family, member X (H1fx), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000056403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:87980421:87981637:-1 gene:ENSMUSG00000044927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048709 // GenBank // Mus musculus H1 histone family, member X, mRNA (cDNA clone MGC:59453 IMAGE:6513403), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87980502:87983025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 82 // 65 // 14 // 17 // 0
NM_001293652 // RefSeq // Mus musculus RAB7, member RAS oncogene family (Rab7), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_001293653 // RefSeq // Mus musculus RAB7, member RAS oncogene family (Rab7), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// NM_001293654 // RefSeq // Mus musculus RAB7, member RAS oncogene family (Rab7), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// NM_001293655 // RefSeq // Mus musculus RAB7, member RAS oncogene family (Rab7), transcript variant 5, mRNA. // chr6 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// NM_009005 // RefSeq // Mus musculus RAB7, member RAS oncogene family (Rab7), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000113598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:87999117:88045017:-1 gene:ENSMUSG00000079477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000113600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:87999106:88045270:-1 gene:ENSMUSG00000079477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK057671 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH2000981, highly similar to RAS-RELATED PROTEIN RAB-7. // chr6 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// BC004597 // GenBank // Mus musculus RAB7, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:6009 IMAGE:3584891), complete cds. // chr6 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// BC086793 // GenBank // Mus musculus RAB7, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:102153 IMAGE:6414012), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000113596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:87999805:88045245:-1 gene:ENSMUSG00000079477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1
ENSMUST00000151901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:6:88222602:88225678:-1 gene:ENSMUSG00000047046 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156018 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:88222606:88223639:-1 gene:ENSMUSG00000047046 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK006579 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700031F10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC099573 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30918873. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000044105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:88223762:88245084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_023060 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific (Eefsec), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000165242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:88257334:88446539:-1 gene:ENSMUSG00000033216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF268871 // GenBank // Mus musculus MJ0495-like protein SelB mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF283518 // GenBank // Mus musculus elongation factor sec mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// AK087501 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130307A03 product:eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific, full insert sequence. // chr6 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC024915 // GenBank // Mus musculus eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific, mRNA (cDNA clone MGC:29017 IMAGE:3158026), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC099675 // GenBank // Mus musculus eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific, mRNA (cDNA clone MGC:106140 IMAGE:5011896), complete cds. // chr6 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:88258201:88378849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_001278671 // RefSeq // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 12 (Kbtbd12), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120933 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:88547340:88627442:-1 gene:ENSMUSG00000033182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184878 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:88547340:88618501:-1 gene:ENSMUSG00000033182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:88576646:88618846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001278671 // RefSeq // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 12 (Kbtbd12), mRNA. // chr6 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000038804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:88617436:88627445:-1 gene:ENSMUSG00000033182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120933 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:88547340:88627442:-1 gene:ENSMUSG00000033182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000184591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:88613751:88627448:-1 gene:ENSMUSG00000033182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC139158 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:170785 IMAGE:8862180), complete cds. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC139160 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:170787 IMAGE:8862182), complete cds. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK016973 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933428M03 product:RIKEN cDNA 4833415F11 gene, full insert sequence. // chr6 // 67 // 69 // 12 // 18 // 0 /// GENSCAN00000044110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:88576646:88618846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_030251 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and BTB (POZ) domain containing 1 (Abtb1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506791 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and BTB (POZ) domain containing 1 (Abtb1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006506795 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and BTB (POZ) domain containing 1 (Abtb1), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000032169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:88835915:88841935:-1 gene:ENSMUSG00000030083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB053477 // GenBank // Mus musculus BPOZ mRNA for BPOZ, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK155432 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630227H10 product:ankyrin repeat and BTB (POZ) domain containing 1, full insert sequence. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK220208 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mFLJ00331 protein. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC003234 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and BTB (POZ) domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:7237 IMAGE:3483893), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK089474 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730037C22 product:ankyrin repeat and BTB (POZ) domain containing 1, full insert sequence. // chr6 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000044098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:88836246:88843657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_008564 // RefSeq // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 2 mitotin (S. cerevisiae) (Mcm2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000058011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:88883475:88898780:-1 gene:ENSMUSG00000002870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF004105 // GenBank // Mus musculus BM28 homolog mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC055318 // GenBank // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 2 mitotin (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:65689 IMAGE:5696348), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// D86725 // GenBank // Mus musculus mRNA for mMCM2, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:88884000:88898650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NR_033190 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 839 (Gm839), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000079186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:89211165:89216237:-1 gene:ENSMUSG00000060416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147089 // GenBank // Mus musculus gene model 839, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182259 IMAGE:9056153), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147090 // GenBank // Mus musculus gene model 839, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182258 IMAGE:9056152), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:89212250:89250609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_008881 // RefSeq // Mus musculus plexin A1 (Plxna1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000049845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:89319015:89357717:-1 gene:ENSMUSG00000030084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000163139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:89316316:89362613:-1 gene:ENSMUSG00000030084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC138023 // GenBank // Mus musculus plexin A1, mRNA (cDNA clone MGC:169647 IMAGE:8861042), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// D86948 // GenBank // Mus musculus mRNA for plexin 1, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:89319376:89357645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000089423 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCm38:6:89698717:89699563:-1 gene:ENSMUSG00000100686 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene gene:ENSMUSG00000068235 // chr6 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSMUST00000173545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:89698719:89699517:-1 gene:ENSMUSG00000100128 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene gene:ENSMUSG00000068235 // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT057924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000174619 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:89805008:89805992:-1 gene:ENSMUSG00000092237 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_053221 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 42 (Vmn1r42), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:89844518:89845615:-1 gene:ENSMUSG00000068232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125372 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, A6, mRNA (cDNA clone MGC:159075 IMAGE:40129887), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053220 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 43 (Vmn1r43), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:89869513:89870502:-1 gene:ENSMUSG00000068231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125364 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, A5, mRNA (cDNA clone MGC:159067 IMAGE:40129879), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132284 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, A5, mRNA (cDNA clone MGC:163915 IMAGE:40130561), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011684 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 45 (Vmn1r45), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000054202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:89931649:89940507:-1 gene:ENSMUSG00000044248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// Y12724 // GenBank // Mus musculus mRNA for pheromone receptor 2. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_053218 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 48 (Vmn1r48), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000073415 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90035933:90036841:-1 gene:ENSMUSG00000057592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_011911 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1, receptor 49 (Vmn1r49), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90072086:90073018:-1 gene:ENSMUSG00000095932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF132114 // GenBank // Mus musculus vomeronasal receptor VRi2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053226 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 53 (Vmn1r53), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90223317:90224438:-1 gene:ENSMUSG00000057697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125605 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, B3, mRNA (cDNA clone MGC:159308 IMAGE:40130120), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132002 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, B3, mRNA (cDNA clone MGC:163633 IMAGE:40130279), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027928 // RefSeq // Mus musculus carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 13 (Chst13), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000070890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:90308351:90325185:-1 gene:ENSMUSG00000056643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:90308968:90325162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_173775 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 37 (Ccdc37), mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// XM_006506100 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 37 (Ccdc37), transcript variant X7, mRNA. // chr6 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// XR_377455 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 37 (Ccdc37), transcript variant X9, misc_RNA. // chr6 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000062750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:90403736:90428432:-1 gene:ENSMUSG00000048794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000153843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:90403738:90428787:-1 gene:ENSMUSG00000048794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000165673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:90403736:90428480:-1 gene:ENSMUSG00000048794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// AK048790 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230069K22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// BC047211 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 37, mRNA (cDNA clone MGC:56972 IMAGE:6392183), complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0 /// BC079632 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 37, mRNA (cDNA clone MGC:90884 IMAGE:5693354), complete cds. // chr6 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000043785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:90403879:90427489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0
NM_001134383 // RefSeq // Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 1 (Iqsec1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NM_001134384 // RefSeq // Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 1 (Iqsec1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006505983 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 1 (Iqsec1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006505984 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 1 (Iqsec1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006505987 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 1 (Iqsec1), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006505992 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 1 (Iqsec1), transcript variant X10, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000101151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:90659598:90810123:-1 gene:ENSMUSG00000034312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000101153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:90659598:90716529:-1 gene:ENSMUSG00000034312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC026481 // GenBank // Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4503056), partial cds. // chr6 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000189881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:90662346:90716529:-1 gene:ENSMUSG00000034312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:90658148:90763822:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0
NM_018815 // RefSeq // Mus musculus nucleoporin 210 (Nup210), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006506400 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin 210 (Nup210), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000032179 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:91013068:91116829:-1 gene:ENSMUSG00000030091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000113509 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:91013070:91116819:-1 gene:ENSMUSG00000030091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000142951 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:91013070:91055384:-1 gene:ENSMUSG00000030091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0 /// AF113751 // GenBank // Mus musculus nuclear pore membrane glycoprotein POM210 mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 39 // 42 // 0 /// BC052468 // GenBank // Mus musculus nucleoporin 210, mRNA (cDNA clone MGC:63418 IMAGE:6835038), complete cds. // chr6 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000022764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:90984060:91116784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0
GENSCAN00000022755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91320575:91362844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_009527 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 7A (Wnt7a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032180 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:91363981:91411363:-1 gene:ENSMUSG00000030093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049093 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 7A, mRNA (cDNA clone MGC:61336 IMAGE:6415801), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC057586 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 7A, mRNA (cDNA clone MGC:67108 IMAGE:6415801), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M89801 // GenBank // Mouse Wnt-7a mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000022756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91365849:91423928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_133928 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4 (Chchd4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000040835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:91464276:91473423:-1 gene:ENSMUSG00000034203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK012745 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810014D17 product:HYPOTHETICAL 15.5 KDA PROTEIN, full insert sequence. // chr6 // 83 // 52 // 10 // 12 // 0 /// BC019405 // GenBank // Mus musculus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:30422 IMAGE:5066665), complete cds. // chr6 // 78 // 100 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91465015:91474913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_009531 // RefSeq // Mus musculus xeroderma pigmentosum, complementation group C (Xpc), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000032182 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:91489305:91515884:-1 gene:ENSMUSG00000030094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000150279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:91492273:91515884:-1 gene:ENSMUSG00000030094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// AB071144 // GenBank // Mus musculus Xpc mRNA for xeroderma pigmentosum group C protein, complete cds. // chr6 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// BC052725 // GenBank // Mus musculus xeroderma pigmentosum, complementation group C, mRNA (cDNA clone MGC:64651 IMAGE:6812198), complete cds. // chr6 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// U27398 // GenBank // Mus musculus xeroderma pigmentosum group C (mXPC) mRNA, complete cds. // chr6 // 85 // 89 // 28 // 33 // 0 /// U40005 // GenBank // Mus musculus xeroderma pigmentosum group C (XPC) mRNA, partial cds. // chr6 // 73 // 41 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000022752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91490057:91513420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0
NM_001159507 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor interacting protein 2 (Grip2), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506104 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate receptor interacting protein 2 (Grip2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006506105 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate receptor interacting protein 2 (Grip2), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000159684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:91763448:91807318:-1 gene:ENSMUSG00000030098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000161566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:91783657:91807393:-1 gene:ENSMUSG00000030098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000162293 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:91761509:91827250:-1 gene:ENSMUSG00000030098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000162300 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:91761509:91807456:-1 gene:ENSMUSG00000030098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91763448:91822855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_025578 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S25 (Mrps25), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:92169525:92184033:-1 gene:ENSMUSG00000014551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC022953 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S25, mRNA (cDNA clone MGC:30559 IMAGE:5126320), complete cds. // chr6 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// ENSMUST00000134132 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:92178313:92183971:-1 gene:ENSMUSG00000014551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:92175022:92183973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT058012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_030081 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 20 (Zfyve20), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506769 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 20 (Zfyve20), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000014694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:92186712:92214925:-1 gene:ENSMUSG00000014550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000124635 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:92189841:92199725:-1 gene:ENSMUSG00000014550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000141332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:92190383:92201628:-1 gene:ENSMUSG00000014550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// BC017622 // GenBank // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 20, mRNA (cDNA clone IMAGE:4483981), partial cds. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC031135 // GenBank // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 20, mRNA (cDNA clone MGC:37205 IMAGE:4971294), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC049106 // GenBank // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 20, mRNA (cDNA clone MGC:61215 IMAGE:6412839), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:92189310:92243879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_009426 // RefSeq // Mus musculus thyrotropin releasing hormone (Trh), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000006046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:92242061:92244650:-1 gene:ENSMUSG00000005892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC053493 // GenBank // Mus musculus thyrotropin releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:60687 IMAGE:30010395), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// X59387 // GenBank // Mouse mRNA for a preprothyrotropin-releasing hormone. // chr6 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:92189310:92243879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_175314 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 9 (Adamts9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:92772699:92943492:-1 gene:ENSMUSG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:92772702:92901441:-1 gene:ENSMUSG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175314 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 9 (Adamts9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:92772699:92943492:-1 gene:ENSMUSG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:92772702:92901441:-1 gene:ENSMUSG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:92663142:92816684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175314 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 9 (Adamts9), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:92772699:92943492:-1 gene:ENSMUSG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000125490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:92793010:92860145:-1 gene:ENSMUSG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000167391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:92772702:92901441:-1 gene:ENSMUSG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK030699 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5530401L07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000130314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:92845594:92860155:-1 gene:ENSMUSG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// AK173146 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1312 protein. // chr6 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000041719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:92663142:92816684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000023874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:92849280:92956678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_175314 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 9 (Adamts9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:92772699:92943492:-1 gene:ENSMUSG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:92772702:92901441:-1 gene:ENSMUSG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:92849280:92956678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000113438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:92772699:92943492:-1 gene:ENSMUSG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_175314 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 9 (Adamts9), mRNA. // chr6 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// ENSMUST00000167391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:92772702:92901441:-1 gene:ENSMUSG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// GENSCAN00000023874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:92849280:92956678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
NM_008377 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 1 (Lrig1), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000032105 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:94604529:94700158:-1 gene:ENSMUSG00000030029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 98 // 93 // 40 // 41 // 0 /// ENSMUST00000101126 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:94604536:94700137:-1 gene:ENSMUSG00000030029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000141014 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:94625034:94680630:-1 gene:ENSMUSG00000030029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// BC141300 // GenBank // Mus musculus leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:176261 IMAGE:9055912), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// BC145623 // GenBank // Mus musculus leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:179199 IMAGE:9054191), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 33 // 33 // 0 /// D78572 // GenBank // Mus musculus mRNA for membrane glycoprotein, complete cds. // chr6 // 98 // 93 // 40 // 41 // 0 /// ENSMUST00000150811 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:94626450:94655525:-1 gene:ENSMUSG00000030029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1 /// GENSCAN00000007997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:94605759:94678707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000157970 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:94826781:94826923:-1 gene:ENSMUSG00000088595 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_033559 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence AY512915 (AY512915), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:95276692:95333978:-1 gene:ENSMUSG00000068180 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159751 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:95313235:95333971:-1 gene:ENSMUSG00000068180 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:95290577:95333993:-1 gene:ENSMUSG00000068180 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:95255726:95333991:-1 gene:ENSMUSG00000068180 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:95327437:95333977:-1 gene:ENSMUSG00000068180 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY512915 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0286E12 unknown mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONMMUT058105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:95312654:95500967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NR_003643 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700123L14 gene (1700123L14Rik), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000090061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:96164497:96166243:-1 gene:ENSMUSG00000072878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:96164739:96179481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_177233 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 19, member A4 (Fam19a4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506284 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 19, member A4 (Fam19a4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506286 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 19, member A4 (Fam19a4), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000089295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:96831209:97060411:-1 gene:ENSMUSG00000046500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY325123 // GenBank // Mus musculus TAFA4 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC089490 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 19, member A4, mRNA (cDNA clone MGC:107151 IMAGE:30504398), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:96843724:96908523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_175313 // RefSeq // Mus musculus EGF domain-specific O-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) transferase (Eogt), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006505258 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EGF domain-specific O-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) transferase (Eogt), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006505259 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EGF domain-specific O-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) transferase (Eogt), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000054344 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:97110024:97149182:-1 gene:ENSMUSG00000035245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC046414 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA A130022J15 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4014436), containing frame-shift errors. // chr6 // 86 // 62 // 18 // 21 // 0 /// BC048939 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A130022J15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:57001 IMAGE:6439908), complete cds. // chr6 // 90 // 88 // 27 // 30 // 0 /// XR_377399 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EGF domain-specific O-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) transferase (Eogt), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// ENSMUST00000135187 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:97111972:97148883:-1 gene:ENSMUSG00000035245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000017666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:97112060:97120882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0
NM_001081111 // RefSeq // Mus musculus TATA element modulatory factor 1 (Tmf1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000095664 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:97155266:97179124:-1 gene:ENSMUSG00000030059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000124173 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:97155266:97179037:-1 gene:ENSMUSG00000030059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC150931 // GenBank // Mus musculus TATA element modulatory factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:183842 IMAGE:9087842), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000017680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:97155354:97217849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000083794 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:97162817:97162947:-1 gene:ENSMUSG00000065728 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT058125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001081157 // RefSeq // Mus musculus leiomodin 3 (fetal) (Lmod3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006506270 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leiomodin 3 (fetal) (Lmod3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000095655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:97238528:97252780:-1 gene:ENSMUSG00000044086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC127157 // GenBank // Mus musculus leiomodin 3 (fetal), mRNA (cDNA clone MGC:156399 IMAGE:40091077), complete cds. // chr6 // 86 // 94 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:97244693:97252571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000082790 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:97547438:97547567:-1 gene:ENSMUSG00000064724 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083083 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:97572076:97572238:-1 gene:ENSMUSG00000065017 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT058140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_025829 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4E member 3 (Eif4e3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000032151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:99625135:99666771:-1 gene:ENSMUSG00000093661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY628329 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor-3 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC027014 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4E member 3, mRNA (cDNA clone MGC:35709 IMAGE:5369891), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000155466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:99257484:99666797:-1 gene:ENSMUSG00000030068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// AK035794 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630004O19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// AK137373 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630033I20 product:nuclear receptor subfamily 2, group C, member 2, full insert sequence. // chr6 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_019743 // RefSeq // Mus musculus RING1 and YY1 binding protein (Rybp), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000101118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:100228566:100287441:-1 gene:ENSMUSG00000072872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AF101779 // GenBank // Mus musculus Ring1 interactor RYBP mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC053016 // GenBank // Mus musculus RING1 and YY1 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:62213 IMAGE:6406584), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC080287 // GenBank // Mus musculus RING1 and YY1 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:90662 IMAGE:6410301), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC138324 // GenBank // Mus musculus RING1 and YY1 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:169949 IMAGE:8861344), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC138325 // GenBank // Mus musculus RING1 and YY1 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:169950 IMAGE:8861345), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000048568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:100232173:100288081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_181590 // RefSeq // Mus musculus SHQ1 homolog (S. cerevisiae) (Shq1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000113312 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:100573081:100671157:-1 gene:ENSMUSG00000035378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000162776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:100662839:100671133:-1 gene:ENSMUSG00000035378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000170667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:100573082:100671157:-1 gene:ENSMUSG00000035378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000089245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:100573083:100671139:-1 gene:ENSMUSG00000035378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// BC052657 // GenBank // Mus musculus SHQ1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:60739 IMAGE:30042589), complete cds. // chr6 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// GENSCAN00000048562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:100573266:100649559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000048579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:100663273:100671061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_018884 // RefSeq // Mus musculus PDZ domain containing RING finger 3 (Pdzrn3), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506404 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PDZ domain containing RING finger 3 (Pdzrn3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// XM_006506405 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PDZ domain containing RING finger 3 (Pdzrn3), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000075994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:101149609:101377897:-1 gene:ENSMUSG00000035357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000124884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:101156973:101355010:-1 gene:ENSMUSG00000035357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// AF127084 // GenBank // Mus musculus semaphorin cytoplasmic domain-associated protein 3A (Semcap3) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// AF127085 // GenBank // Mus musculus semaphorin cytoplasmic domain-associated protein 3B (Semcap3) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// BC010329 // GenBank // Mus musculus PDZ domain containing RING finger 3, mRNA (cDNA clone MGC:11956 IMAGE:3600603), complete cds. // chr6 // 83 // 62 // 15 // 18 // 0 /// HM560981 // GenBank // Mus musculus PDZ domain containing RING finger 3A (Pdzrn3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000151175 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:101179878:101377342:-1 gene:ENSMUSG00000035357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000041529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:101150512:101185876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_008779 // RefSeq // Mus musculus contactin 3 (Cntn3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006505727 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus contactin 3 (Cntn3), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000032159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:102163306:102464667:-1 gene:ENSMUSG00000030075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// L01991 // GenBank // Mus musculus TAFG-1-like neuronal glycoprotein (PCS) mRNA, complete cds. // chr6 // 98 // 100 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000034762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:102094405:102337370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 34 // 34 // 0
NM_010028 // RefSeq // Mus musculus DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 3, X-linked (Ddx3x), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:13280970:13294052:1 gene:ENSMUSG00000000787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC067210 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4022322, partial cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U42386 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor inducible gene 14 (FIN14) mRNA, complete cds. // chr6 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
NM_008370 // RefSeq // Mus musculus interleukin 5 receptor, alpha (Il5ra), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006505619 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 5 receptor, alpha (Il5ra), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000167925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:106711975:106745109:-1 gene:ENSMUSG00000005364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC125374 // GenBank // Mus musculus interleukin 5 receptor, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:159077 IMAGE:40129889), complete cds. // chr6 // 89 // 75 // 24 // 27 // 0 /// BC145043 // GenBank // Mus musculus interleukin 5 receptor, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:178599 IMAGE:9053591), complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// D90205 // GenBank // Mus musculus mRNA for interleukin-5 receptor, complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000018962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:106729774:106744336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
NM_145937 // RefSeq // Mus musculus sulfatase modifying factor 1 (Sumf1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sulfatase modifying factor 1 (Sumf1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000032191 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:108107028:108185582:-1 gene:ENSMUSG00000030101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC026981 // GenBank // Mus musculus sulfatase modifying factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:39076 IMAGE:5365580), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506444 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sulfatase modifying factor 1 (Sumf1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENSMUST00000167338 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:108108476:108185556:-1 gene:ENSMUSG00000030101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// ENSMUST00000172188 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:108108476:108185556:-1 gene:ENSMUSG00000030101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000005291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:108142910:108185556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
AK136460 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030421H22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_045986 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5031434C07 gene (5031434C07Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NR_045987 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5031434C07 gene (5031434C07Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000053559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:112285857:112288837:-1 gene:ENSMUSG00000044574 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000188014 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:112285593:112288836:-1 gene:ENSMUSG00000044574 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT058374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT058375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_175525 // RefSeq // Mus musculus ssu-2 homolog (C. elegans) (Ssu2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000060847 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:112359324:112388023:-1 gene:ENSMUSG00000034387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC116438 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D630042P16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144651 IMAGE:40104565), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC116439 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D630042P16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144652 IMAGE:40104566), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006506108 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ssu-2 homolog (C. elegans) (Ssu2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENSMUST00000143134 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:112368740:112377727:-1 gene:ENSMUSG00000034387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// AK054244 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330001L02 product:similar to FLS485 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000028059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:112369696:112393559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_001081147 // RefSeq // Mus musculus oxytocin receptor (Oxtr), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006505724 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus oxytocin receptor (Oxtr), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:112473684:112489808:-1 gene:ENSMUSG00000049112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:112477074:112489797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000179221 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:112592967:112593073:-1 gene:ENSMUSG00000094026 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080448 // RefSeq // Mus musculus SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 3 (Srgap3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:112717971:112947266:-1 gene:ENSMUSG00000030257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113169 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:112717974:112946754:-1 gene:ENSMUSG00000030257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF481964 // GenBank // Mus musculus brain stress early protein (Gbi) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC069855 // GenBank // Mus musculus SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5025980). // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177763 // RefSeq // Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner-like protein 4 (Lhfpl4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162280 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:113168090:113195384:-1 gene:ENSMUSG00000042873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085130 // GenBank // Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner-like protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:65621 IMAGE:5704741), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113173728:113194223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000083375 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:113035843:113035934:-1 gene:ENSMUSG00000065309 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 85 // 72 // 11 // 13 // 0 /// NONMMUT058388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 85 // 72 // 11 // 13 // 0
NM_178373 // RefSeq // Mus musculus cell death-inducing DFFA-like effector c (Cidec), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:113424636:113435756:-1 gene:ENSMUSG00000030278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000113089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:113424634:113435760:-1 gene:ENSMUSG00000030278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000113091 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:113425557:113434764:-1 gene:ENSMUSG00000030278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000133348 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:113428511:113434613:-1 gene:ENSMUSG00000030278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC099676 // GenBank // Mus musculus cell death-inducing DFFA-like effector c, mRNA (cDNA clone MGC:106221 IMAGE:5043221), complete cds. // chr6 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0 /// M61737 // GenBank // M.musculus adipocyte-specific mRNA, partial cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113425562:113434487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001289699 // RefSeq // Mus musculus proline-rich transmembrane protein 3 (Prrt3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_001289700 // RefSeq // Mus musculus proline-rich transmembrane protein 3 (Prrt3), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_172487 // RefSeq // Mus musculus proline-rich transmembrane protein 3 (Prrt3), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006505843 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline-rich transmembrane protein 3 (Prrt3), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000101059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:113494095:113501818:-1 gene:ENSMUSG00000045009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AK031947 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330505P20 product:similar to BRAIN PROTEIN [Macaca fascicularis], full insert sequence. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC058349 // GenBank // Mus musculus proline-rich transmembrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:66596 IMAGE:5695444), complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AK045678 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230302A06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// AK045491 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230206N24 product:inferred: unnamed protein product {Macaca fascicularis}, full insert sequence. // chr6 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// GENSCAN00000045688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113494291:113498259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_175101 // RefSeq // Mus musculus ER membrane protein complex subunit 3 (Emc3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032425 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:113514874:113531638:-1 gene:ENSMUSG00000030286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK200024 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0133C04, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000032425, based on BLAT search. // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC004641 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 111, mRNA (cDNA clone MGC:7080 IMAGE:3157147), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000154605 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:113519792:113520909:-1 gene:ENSMUSG00000030286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000045702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113515903:113531482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT058431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_027633 // RefSeq // Mus musculus Fancd2 opposite strand (Fancd2os), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506607 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Fancd2 opposite strand (Fancd2os), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000035870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:113596762:113600715:-1 gene:ENSMUSG00000033963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000125139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:113596761:113600715:-1 gene:ENSMUSG00000033963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC042706 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931417G12 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4971596), partial cds. // chr6 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC049660 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931417G12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58468 IMAGE:6742399), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113597507:113598112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_024206 // RefSeq // Mus musculus SEC13 homolog (S. cerevisiae) (Sec13), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000032440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:113728067:113740743:-1 gene:ENSMUSG00000030298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC002128 // GenBank // Mus musculus SEC13 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:6737 IMAGE:3590767), complete cds. // chr6 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113728350:113797151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_080639 // RefSeq // Mus musculus tissue inhibitor of metalloproteinase 4 (Timp4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000032462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:115245616:115251849:-1 gene:ENSMUSG00000030317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF282730 // GenBank // Mus musculus tissue inhibitor of metalloproteinases TIMP4 (Timp4) mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0 /// BC064046 // GenBank // Mus musculus tissue inhibitor of metalloproteinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:73561 IMAGE:875422), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK040814 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530026O08 product:tissue inhibitor of metalloproteinase 4, full insert sequence. // chr6 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// GENSCAN00000040976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:115246286:115251778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_001101431 // RefSeq // Mus musculus makorin, ring finger protein 2, opposite strand (Mkrn2os), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000088962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:115583544:115592549:-1 gene:ENSMUSG00000068011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000112957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:115585122:115592576:-1 gene:ENSMUSG00000068011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:115585347:115592491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
ENSMUST00000119165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:115638250:115639059:-1 gene:ENSMUSG00000081805 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
NR_028546 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 7A (Snora7a), small nucleolar RNA. // chr6 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000082629 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:115807975:115808114:-1 gene:ENSMUSG00000064563 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_006505859 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand calcium binding domain 12 (Efcab12), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000032468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:115810729:115838412:-1 gene:ENSMUSG00000030321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000124531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:115810896:115838412:-1 gene:ENSMUSG00000030321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000184428 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:115810896:115838412:-1 gene:ENSMUSG00000030321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC060267 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC060267, mRNA (cDNA clone MGC:69711 IMAGE:6416099), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000022382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:115810978:115853767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_026376 // RefSeq // Mus musculus plexin D1 (Plxnd1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000015511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:115954811:115995005:-1 gene:ENSMUSG00000030123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AY688678 // GenBank // Mus musculus plexin D1 (Plxnd1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000022389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:115955740:115994805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0
NM_146446 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 215 (Olfr215), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:116581938:116583031:-1 gene:ENSMUSG00000050654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125561 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 215, mRNA (cDNA clone MGC:159264 IMAGE:40130076), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125563 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 215, mRNA (cDNA clone MGC:159266 IMAGE:40130078), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:116582012:116582944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026057 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 422 (Zfp422), mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000057540 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:116624904:116628922:-1 gene:ENSMUSG00000059878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000079749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:116624016:116628999:-1 gene:ENSMUSG00000059878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_178045 // RefSeq // Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 4 (Rassf4), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XM_006505866 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 4 (Rassf4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000035842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:116633008:116673836:-1 gene:ENSMUSG00000042129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AK160584 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410190O20 product:Ras association (RalGDS/AF-6) domain family 4, full insert sequence. // chr6 // 93 // 80 // 26 // 28 // 0 /// BC023245 // GenBank // Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:27537 IMAGE:4459337), complete cds. // chr6 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// BC060709 // GenBank // Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:67158 IMAGE:6409692), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000022375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:116638238:116716577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1
NM_178768 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 72 (Tmem72), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:116692630:116716913:-1 gene:ENSMUSG00000048108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000129255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:116695274:116716729:-1 gene:ENSMUSG00000048108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC093486 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 72, mRNA (cDNA clone MGC:118732 IMAGE:30697044), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC116440 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 72, mRNA (cDNA clone MGC:144653 IMAGE:40104615), complete cds. // chr6 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// BC116441 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 72, mRNA (cDNA clone MGC:144654 IMAGE:40104616), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:116638238:116716577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
ENSMUST00000170447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:117213656:117214048:-1 gene:ENSMUSG00000090549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:117213635:117214045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000046665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:117470771:117473425:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0
XM_006506853 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4933440N22 gene (4933440N22Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:117907110:117907760:-1 gene:ENSMUSG00000042087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK017138 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933440N22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001173372 // RefSeq // Mus musculus FXYD domain-containing ion transport regulator 4 (Fxyd4), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NM_033648 // RefSeq // Mus musculus FXYD domain-containing ion transport regulator 4 (Fxyd4), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006505288 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FXYD domain-containing ion transport regulator 4 (Fxyd4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000005114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:117933729:117937335:-1 gene:ENSMUSG00000004988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// AK054004 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230011N14 product:FXYD domain-containing ion transport regulator 4, full insert sequence. // chr6 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// BC086918 // GenBank // Mus musculus FXYD domain-containing ion transport regulator 4, mRNA (cDNA clone MGC:107631 IMAGE:6762406), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT058569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0
NM_030165 // RefSeq // Mus musculus chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (Csgalnact2), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000049344 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:118107452:118139140:-1 gene:ENSMUSG00000042042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:118107452:118129620:-1 gene:ENSMUSG00000042042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC023112 // GenBank // Mus musculus chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4010410), partial cds. // chr6 // 83 // 36 // 10 // 12 // 0 /// ENSMUST00000136265 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:118109336:118126406:-1 gene:ENSMUSG00000042042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000041498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:118109102:118186306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001080780 // RefSeq // Mus musculus ret proto-oncogene (Ret), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NM_009050 // RefSeq // Mus musculus ret proto-oncogene (Ret), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000032201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:118151748:118197744:-1 gene:ENSMUSG00000030110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000088790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:118151748:118197744:-1 gene:ENSMUSG00000030110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AF209436 // GenBank // Mus musculus c-ret proto-oncogene mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// AY326397 // GenBank // Mus musculus ret proto-oncogene isoform Ret9 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// BC059012 // GenBank // Mus musculus ret proto-oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:69638 IMAGE:6849696), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000041498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:118109102:118186306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 78 // 35 // 45 // 1
NM_194339 // RefSeq // Mus musculus BMS1 homolog, ribosome assembly protein (yeast) (Bms1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000032237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:118383383:118419417:-1 gene:ENSMUSG00000030138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AK135031 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430548C23 product:BMS1-like, ribosome assembly protein (yeast), full insert sequence. // chr6 // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// BC057054 // GenBank // Mus musculus BMS1 homolog, ribosome assembly protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:67338 IMAGE:6827225), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000041505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:118383651:118418584:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0
NM_011763 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 9 (Zfp9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:118461950:118479320:-1 gene:ENSMUSG00000072623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC059273 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:67724 IMAGE:2647280), complete cds. // chr6 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// AK045580 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230213E18 product:weakly similar to BA393J16.2 (NOVEL KRAB BOX CONTAINING ZINC FINGER GENE) (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001081112 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 26 (Ankrd26), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000112830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:118501308:118562226:-1 gene:ENSMUSG00000007827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000041504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:118428583:118562057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000068351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:119315133:119330766:-1 gene:ENSMUSG00000055003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058944 // GenBank // Mus musculus leucine-rich repeats and transmembrane domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:66594 IMAGE:6827376), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_172492 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich repeats and transmembrane domains 2 (Lrtm2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSMUST00000112756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:119315133:119330757:-1 gene:ENSMUSG00000055003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NM_001172207 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich repeats and transmembrane domains 2 (Lrtm2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000168793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:119315133:119329204:-1 gene:ENSMUSG00000055003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000051471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:119317056:119324725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_053204 // RefSeq // Mus musculus ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 (Erc1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_104484 // RefSeq // Mus musculus ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 (Erc1), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:119570804:119825226:-1 gene:ENSMUSG00000030172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000183703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:119570796:119848150:-1 gene:ENSMUSG00000030172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC002272 // GenBank // Mus musculus ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3496274). // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT058610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053204 // RefSeq // Mus musculus ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 (Erc1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_104484 // RefSeq // Mus musculus ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 (Erc1), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:119570804:119825226:-1 gene:ENSMUSG00000030172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:119570796:119848150:-1 gene:ENSMUSG00000030172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:119572630:119848099:-1 gene:ENSMUSG00000030172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001199083 // RefSeq // Mus musculus WNK lysine deficient protein kinase 1 (Wnk1), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_001199084 // RefSeq // Mus musculus WNK lysine deficient protein kinase 1 (Wnk1), transcript variant 5, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000088644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:119923971:120038655:-1 gene:ENSMUSG00000045962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000160686 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:119956096:119962930:-1 gene:ENSMUSG00000045962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000161512 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:119962308:119963733:-1 gene:ENSMUSG00000045962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:119923971:120038655:-1 gene:ENSMUSG00000045962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC146009 // GenBank // Mus musculus hereditary sensory neuropathy, type II, mRNA (cDNA clone MGC:175896 IMAGE:40131312), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC146011 // GenBank // Mus musculus hereditary sensory neuropathy, type II, mRNA (cDNA clone MGC:175898 IMAGE:40131314), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:119926370:120052718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_198884 // RefSeq // Mus musculus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 3 (B4galnt3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006506317 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 3 (B4galnt3), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000057283 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:120203094:120294559:-1 gene:ENSMUSG00000041372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000125341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:120203073:120242643:-1 gene:ENSMUSG00000041372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// AB114826 // GenBank // Mus musculus beta4GalNAcT3 mRNA for beta1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase III, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC139798 // GenBank // Mus musculus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:157481 IMAGE:40060840), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000009336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120199987:120246998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0
NM_033567 // RefSeq // Mus musculus cat eye syndrome chromosome region, candidate 6 (Cecr6), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:120488939:120493807:-1 gene:ENSMUSG00000094626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF277399 // GenBank // Mus musculus cat eye syndrome critical region 6 (Cecr6) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK140695 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930093B06 product:cat eye syndrome chromosome region, candidate 6 homolog (human), full insert sequence. // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC137862 // GenBank // Mus musculus cat eye syndrome chromosome region, candidate 6 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:169486 IMAGE:8860881), complete cds. // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000009312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120492036:120493754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_144815 // RefSeq // Mus musculus cat eye syndrome chromosome region, candidate 5 (Cecr5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505885 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cat eye syndrome chromosome region, candidate 5 (Cecr5), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000075303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:120509494:120531319:-1 gene:ENSMUSG00000058979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC014705 // GenBank // Mus musculus cat eye syndrome chromosome region, candidate 5 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:25951 IMAGE:4238201), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505883 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cat eye syndrome chromosome region, candidate 5 (Cecr5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSMUST00000125666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:120520792:120531290:-1 gene:ENSMUSG00000058979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENSMUST00000141029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:120519961:120531304:-1 gene:ENSMUSG00000058979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// AK044228 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930002G03 product:similar to CAT EYE SYNDROME CRITICAL REGION PROTEIN ISOFORM 1 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120510135:120531685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONMMUT058662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_007510 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit E1 (Atp6v1e1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000019354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:120795245:120822685:-1 gene:ENSMUSG00000019210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB074758 // GenBank // Mus musculus mRNA for V-ATPase E2 subunit, complete cds. // chr6 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// BC003421 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit E1, mRNA (cDNA clone MGC:6447 IMAGE:2598896), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC055438 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit E1, mRNA (cDNA clone MGC:65310 IMAGE:3995744), complete cds. // chr6 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// AK029146 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732497F11 product:mitochondria located 1 homolog (human), full insert sequence. // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000035033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120795702:120844019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
NM_007544 // RefSeq // Mus musculus BH3 interacting domain death agonist (Bid), mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006505411 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BH3 interacting domain death agonist (Bid), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// XM_006507120 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BH3 interacting domain death agonist (Bid), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000004560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:120892854:120916853:-1 gene:ENSMUSG00000004446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000160684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:120891930:120916836:-1 gene:ENSMUSG00000004446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AK051076 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030066A09 product:mitochondria located 1 homolog (human), full insert sequence. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC002031 // GenBank // Mus musculus BH3 interacting domain death agonist, mRNA (cDNA clone MGC:5921 IMAGE:3486537), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// U75506 // GenBank // Mus musculus apoptic death agonist (BID) mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000161594 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:120895618:120897568:-1 gene:ENSMUSG00000004446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000035043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120891781:121042259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001270475 // RefSeq // Mus musculus microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 3 (Mical3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006505780 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 3 (Mical3), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000098457 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:120931707:121003152:-1 gene:ENSMUSG00000051586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000124669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:120960012:120966118:-1 gene:ENSMUSG00000051586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000150503 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:120958343:121003153:-1 gene:ENSMUSG00000051586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000151602 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:120934781:120958635:-1 gene:ENSMUSG00000051586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// AK147803 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270047D12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// XM_006505795 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 3 (Mical3), transcript variant X18, mRNA. // chr6 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONMMUT058690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 89 // 25 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000035043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120891781:121042259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1
NM_001033354 // RefSeq // Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 3 (Iqsec3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001289685 // RefSeq // Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 3 (Iqsec3), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NR_110358 // RefSeq // Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 3 (Iqsec3), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000046373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:121372933:121473678:-1 gene:ENSMUSG00000040797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000129815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:121372933:121473623:-1 gene:ENSMUSG00000040797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000152103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:121372933:121473665:-1 gene:ENSMUSG00000040797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506112 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IQ motif and Sec7 domain 3 (Iqsec3), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// ENSMUST00000151397 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:121404801:121473678:-1 gene:ENSMUSG00000040797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// AK147268 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1004I05 product:similar to capicua (Drosophila) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000035040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:121376070:121487089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_016970 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 1 (Klrg1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:122270596:122282882:-1 gene:ENSMUSG00000030114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF097357 // GenBank // Mus musculus mast cell function-associated antigen 2F1 (Mafa) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ010751 // GenBank // Mus musculus mRNA for mast cell function-associated antigen (MAFA). // chr6 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// BC101953 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:123930 IMAGE:40044827), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC103546 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:123933 IMAGE:40044831), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC103547 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:123932 IMAGE:40044830), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC103548 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:123931 IMAGE:40044829), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122278221:122282811:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0
NM_008108 // RefSeq // Mus musculus growth differentiation factor 3 (Gdf3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505540 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus growth differentiation factor 3 (Gdf3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000032211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:122605403:122610087:-1 gene:ENSMUSG00000030117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC101963 // GenBank // Mus musculus growth differentiation factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:123990 IMAGE:40045099), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC101964 // GenBank // Mus musculus growth differentiation factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:123991 IMAGE:40045100), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC103565 // GenBank // Mus musculus growth differentiation factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:123992 IMAGE:40045101), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// L06443 // GenBank // Mus musculus putative transforming growth factor-beta (GDF-3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122591136:122609966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_009779 // RefSeq // Mus musculus complement component 3a receptor 1 (C3ar1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000042081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:122847138:122856161:-1 gene:ENSMUSG00000040552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY786554 // GenBank // Mus musculus complement component 3A receptor 1 (C3ar1) mRNA, complete cds. // chr6 // 83 // 44 // 10 // 12 // 0 /// BC003728 // GenBank // Mus musculus complement component 3a receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:5787 IMAGE:3593758), complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// U77460 // GenBank // Mus musculus anaphylatoxin C3a receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK081010 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930034M20 product:complement component 3a receptor 1, full insert sequence. // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000027684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122849823:122856137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_006544076 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 28S ribosomal protein S21, mitochondrial-like (LOC102634348), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:122900136:122900405:-1 gene:ENSMUSG00000049249 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:122899721:122902816:-1 gene:ENSMUSG00000049249 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122900136:122900405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001104634 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 20 (Vmn2r20), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:123492508:123533406:-1 gene:ENSMUSG00000093820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000170808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:123609758:123650635:-1 gene:ENSMUSG00000095486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:123385262:123418061:-1 gene:ENSMUSG00000094145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001104632 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 19 (Vmn2r19), mRNA. // chr6 // 32 // 100 // 8 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:123308333:123336537:1 gene:ENSMUSG00000091260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 100 // 8 // 25 // 0
ENSMUST00000170808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:123609758:123650635:-1 gene:ENSMUSG00000095486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000027681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:123390244:123672865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000175691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124081698:124082601:-1 gene:ENSMUSG00000095544 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0
ENSMUST00000177433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124138733:124139636:-1 gene:ENSMUSG00000094415 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001104642 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor27 (Vmn2r27), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124191596:124231784:-1 gene:ENSMUSG00000072778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001177502 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700013D24 gene (1700013D24Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:124347593:124357086:-1 gene:ENSMUSG00000079346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120816 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700013D24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:156053 IMAGE:40129739), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120818 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700013D24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:156055 IMAGE:40129741), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_153508 // RefSeq // Mus musculus calsyntenin 3 (Clstn3), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000008297 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124430759:124464794:-1 gene:ENSMUSG00000008153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000112523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124430759:124462744:-1 gene:ENSMUSG00000008153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC041781 // GenBank // Mus musculus, calsyntenin 3, clone IMAGE:4507148, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC055054 // GenBank // Mus musculus calsyntenin 3, mRNA (cDNA clone MGC:62833 IMAGE:6493096), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124431592:124466120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0
NM_001097617 // RefSeq // Mus musculus complement component 1, s subcomponent 1 (C1s1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 88 // 81 // 15 // 17 // 0 /// NM_144938 // RefSeq // Mus musculus complement component 1, s subcomponent 1 (C1s1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000160505 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124530345:124542321:-1 gene:ENSMUSG00000038521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000162443 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124530348:124542359:-1 gene:ENSMUSG00000038521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 81 // 15 // 17 // 0 /// BC018319 // GenBank // Mus musculus complement component 1, s subcomponent, mRNA (cDNA clone MGC:19094 IMAGE:4196654), complete cds. // chr6 // 76 // 81 // 13 // 17 // 0 /// BC111880 // GenBank // Mus musculus complement component 1, s subcomponent, mRNA (cDNA clone MGC:132830 IMAGE:40059749), complete cds. // chr6 // 86 // 67 // 12 // 14 // 0 /// AF459019 // GenBank // Mus musculus complement component C1SA (C1sa) mRNA, complete cds. // chr6 // 68 // 90 // 13 // 19 // 0 /// BC022123 // GenBank // Mus musculus complement component 1, s subcomponent, mRNA (cDNA clone MGC:37773 IMAGE:5097206), complete cds. // chr6 // 68 // 90 // 13 // 19 // 0 /// XM_006544090 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus complement component 1, s subcomponent (C1s), mRNA. // chr6 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// GENSCAN00000021316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124530944:124564079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1
NM_173864 // RefSeq // Mus musculus complement component 1, s subcomponent 2 (C1s2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006506226 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5077 (Gm5077), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000068797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124624625:124636085:-1 gene:ENSMUSG00000079343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AF459020 // GenBank // Mus musculus complement component C1SB (C1sb) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000021315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124625166:124641101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NM_013536 // RefSeq // Mus musculus EMG1 nucleolar protein homolog (S. cerevisiae) (Emg1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000004379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124704381:124712178:-1 gene:ENSMUSG00000004268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125795 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:124704382:124705659:-1 gene:ENSMUSG00000004268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000142187 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124704458:124712069:-1 gene:ENSMUSG00000004268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC002004 // GenBank // Mus musculus EMG1 nucleolar protein homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:5775 IMAGE:3487480), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000141251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124704951:124712141:-1 gene:ENSMUSG00000004268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// GENSCAN00000021323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124704545:124712043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NR_029554 // RefSeq // Mus musculus microRNA 141 (Mir141), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000083540 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:124717914:124717985:-1 gene:ENSMUSG00000065474 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-141 // miRBase Micro RNA Database // MI0000166 Mus musculus miR-141 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT058786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_029792 // RefSeq // Mus musculus microRNA 200c (Mir200c), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000083528 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:124718314:124718403:-1 gene:ENSMUSG00000065462 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// mmu-mir-200c // miRBase Micro RNA Database // MI0000694 Mus musculus miR-200c stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT058787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_024201 // RefSeq // Mus musculus U7 small nuclear RNA (Rnu7), small nuclear RNA. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000004389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124739183:124741374:-1 gene:ENSMUSG00000072772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000158458 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:124741225:124741286:-1 gene:ENSMUSG00000089083 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT058793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT058794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// X07183 // GenBank // Mouse U7 snRNA. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_007881 // RefSeq // Mus musculus atrophin 1 (Atn1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000088357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124742544:124756524:-1 gene:ENSMUSG00000004263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000129411 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124739189:124756021:-1 gene:ENSMUSG00000004263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC050920 // GenBank // Mus musculus atrophin 1, mRNA (cDNA clone MGC:63230 IMAGE:6406687), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC053051 // GenBank // Mus musculus atrophin 1, mRNA (cDNA clone MGC:62322 IMAGE:5706586), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// D87744 // GenBank // Mus musculus mRNA for DRPLA protein, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124739262:124779128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AK143504 // GenBank HTC // Mus musculus 8 cells embryo 8 cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E860035D06 product:dentatorubral pallidoluysian atrophy, full insert sequence. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC003254 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3500522, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_013588 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 23 (Lrrc23), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006505661 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 23 (Lrrc23), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000032218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:124769863:124779718:-1 gene:ENSMUSG00000030125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112475 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124769869:124779727:-1 gene:ENSMUSG00000030125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000128697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124778262:124779717:-1 gene:ENSMUSG00000030125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC049601 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 23, mRNA (cDNA clone MGC:58258 IMAGE:6743951), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124739262:124779128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_009415 // RefSeq // Mus musculus triosephosphate isomerase 1 (Tpi1), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// XR_403773 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus triosephosphate isomerase-like (LOC102642803), misc_RNA. // chr6 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000172132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124810586:124814296:-1 gene:ENSMUSG00000023456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC004024 // GenBank HTC // Mus musculus triosephosphate isomerase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3494521). // chr6 // 82 // 89 // 14 // 17 // 0 /// BC046761 // GenBank // Mus musculus triosephosphate isomerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:57918 IMAGE:5693696), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000149610 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:124811259:124813070:-1 gene:ENSMUSG00000023456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// GENSCAN00000017620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124811269:124829395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1
NM_013700 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 5 (isopeptidase T) (Usp5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006505915 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin specific peptidase 5 (isopeptidase T) (Usp5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000047510 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124815019:124829484:-1 gene:ENSMUSG00000038429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000122110 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:124815038:124829435:-1 gene:ENSMUSG00000038429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000131805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124815420:124818637:-1 gene:ENSMUSG00000038429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000142058 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:124822619:124829408:-1 gene:ENSMUSG00000038429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000153306 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:124824136:124828895:-1 gene:ENSMUSG00000038429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// BC066993 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 5 (isopeptidase T), mRNA (cDNA clone MGC:91316 IMAGE:5689229), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000017620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124811269:124829395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0
NM_013530 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta 3 (Gnb3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000024206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124834240:124840275:-1 gene:ENSMUSG00000023439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000129251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124834247:124839957:-1 gene:ENSMUSG00000023439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK030354 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330400P12 product:guanine nucleotide binding protein, beta 3, full insert sequence. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC018239 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:25269 IMAGE:4511683), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124834677:124879654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_013533 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 162 (Gpr162), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000046893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:124858444:124863917:-1 gene:ENSMUSG00000038390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK144543 // GenBank HTC // Mus musculus 21 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630093B11 product:hypothetical Rhodopsin-like GPCR superfamily containing protein, full insert sequence. // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// AK158847 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K430345D13 product:hypothetical Rhodopsin-like GPCR superfamily containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC031437 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 162, mRNA (cDNA clone MGC:25271 IMAGE:4527410), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC016413 // GenBank HTC // Mus musculus G protein-coupled receptor 162, mRNA (cDNA clone IMAGE:4502480), with apparent retained intron. // chr6 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000017643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124834677:124879654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_008479 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte-activation gene 3 (Lag3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000032217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124904361:124911705:-1 gene:ENSMUSG00000030124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120591 // GenBank // Mus musculus lymphocyte-activation gene 3, mRNA (cDNA clone MGC:155828 IMAGE:40129514), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124904442:124911351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_026988 // RefSeq // Mus musculus parathymosin (Ptms), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124913681:124917946:-1 gene:ENSMUSG00000030122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052699 // GenBank // Mus musculus parathymosin, mRNA (cDNA clone MGC:64697 IMAGE:5715702), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000181150 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124914049:124915224:-1 gene:ENSMUSG00000030122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENSMUST00000134916 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:124914641:124915529:-1 gene:ENSMUSG00000030122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124914402:124919543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC052052 // GenBank // Mus musculus parathymosin, mRNA (cDNA clone IMAGE:5692918), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC080800 // GenBank // Mus musculus parathymosin, mRNA (cDNA clone MGC:91196 IMAGE:4945458), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT058818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_146171 // RefSeq // Mus musculus non-SMC condensin I complex, subunit D2 (Ncapd2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006506533 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus non-SMC condensin I complex, subunit D2 (Ncapd2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000043848 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:125168007:125191701:-1 gene:ENSMUSG00000038252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC025460 // GenBank // Mus musculus non-SMC condensin I complex, subunit D2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5345340). // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC026982 // GenBank // Mus musculus non-SMC condensin I complex, subunit D2, mRNA (cDNA clone MGC:39046 IMAGE:5364933), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC029133 // GenBank // Mus musculus non-SMC condensin I complex, subunit D2, mRNA (cDNA clone MGC:37090 IMAGE:4951596), complete cds. // chr6 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:125162032:125189889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_145391 // RefSeq // Mus musculus TAP binding protein-like (Tapbpl), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505862 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TAP binding protein-like (Tapbpl), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000043422 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:125223933:125231860:-1 gene:ENSMUSG00000038213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC017613 // GenBank // Mus musculus TAP binding protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:27679 IMAGE:4912570), complete cds. // chr6 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:125221417:125231597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000158931 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:125258049:125258177:-1 gene:ENSMUSG00000089556 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT058861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_009446 // RefSeq // Mus musculus tubulin, alpha 3A (Tuba3a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000088246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:125278274:125286042:-1 gene:ENSMUSG00000067702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC050770 // GenBank // Mus musculus tubulin, alpha 3A, mRNA (cDNA clone MGC:58315 IMAGE:6774775), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC089547 // GenBank // Mus musculus tubulin, alpha 3A, mRNA (cDNA clone MGC:107295 IMAGE:6771690), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// M13442 // GenBank // Mouse alpha-tubulin isotype M-alpha-3 mRNA, complete cds. // chr6 // 78 // 95 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000017629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:125278358:125286835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
NM_010736 // RefSeq // Mus musculus lymphotoxin B receptor (Ltbr), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000032489 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:125306571:125313885:-1 gene:ENSMUSG00000030339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC138590 // GenBank // Mus musculus lymphotoxin B receptor, mRNA (cDNA clone MGC:170215 IMAGE:8861610), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC138591 // GenBank // Mus musculus lymphotoxin B receptor, mRNA (cDNA clone MGC:170216 IMAGE:8861611), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// L38423 // GenBank // Mus musculus lymphotoxin-beta receptor gene, complete cds. // chr6 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// U29173 // GenBank // Mus musculus lymphotoxin-beta receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:125307230:125313685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0
NM_198604 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 6 (Plekhg6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006505867 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 6 (Plekhg6), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000042647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:125362660:125380793:-1 gene:ENSMUSG00000038167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC026778 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 6, mRNA (cDNA clone MGC:30363 IMAGE:5133546), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000017635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:125363038:125382692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_007657 // RefSeq // Mus musculus CD9 antigen (Cd9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000032492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:125460266:125494791:-1 gene:ENSMUSG00000030342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC070474 // GenBank // Mus musculus CD9 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:99438 IMAGE:30634238), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// L08115 // GenBank // Mus musculus antigen (homologue of human CD9 antigen) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000130132 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:125460589:125478302:-1 gene:ENSMUSG00000030342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 75 // 75 // 15 // 20 // 1 /// GENSCAN00000017625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:125460661:125494639:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1
NM_001164034 // RefSeq // Mus musculus neurotrophin 3 (Ntf3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001164035 // RefSeq // Mus musculus neurotrophin 3 (Ntf3), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_008742 // RefSeq // Mus musculus neurotrophin 3 (Ntf3), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006505715 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurotrophin 3 (Ntf3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006505716 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurotrophin 3 (Ntf3), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000050484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:126101413:126166744:-1 gene:ENSMUSG00000049107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000112244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:126101413:126166744:-1 gene:ENSMUSG00000049107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC065785 // GenBank // Mus musculus neurotrophin 3, mRNA (cDNA clone MGC:73622 IMAGE:1177923), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:126049335:126127173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NR_045480 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10415 (Gm10415), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00006434 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145983 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 5 (Kcna5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:126532553:126698192:-1 gene:ENSMUSG00000045534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF108659 // GenBank // Mus musculus ventricular potassium channel Kv1.5 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021787 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:25248 IMAGE:4527103), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L22218 // GenBank // Mus musculus cardiac KV1.5 delayed rectifier K+ channel protein mRNA, complete cds. // chr6 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_010595 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 1 (Kcna1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:126636463:126645801:-1 gene:ENSMUSG00000047976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC112970 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:124402 IMAGE:40048563), complete cds. // chr6 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// Y00305 // GenBank // Mouse MBK1 mRNA for mouse brain potassium channel protein-1. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_025358 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 9 (Ndufa9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006506469 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 9 (Ndufa9), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000088194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:126821863:126849144:-1 gene:ENSMUSG00000000399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC058378 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 9, mRNA (cDNA clone MGC:66889 IMAGE:6820787), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:126822019:126849112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_207210 // RefSeq // Mus musculus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 4 (Dyrk4), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006505253 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 4 (Dyrk4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505256 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 4 (Dyrk4), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000032495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:126876199:126907511:-1 gene:ENSMUSG00000030345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000078521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:126876020:126921839:-1 gene:ENSMUSG00000030345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK077117 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933407K03 product:similar to DUAL-SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION REGULATED KINASE 4 (EC 2.7.1.-) (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC052324 // GenBank // Mus musculus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:59231 IMAGE:6315342), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:126876321:126899937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
NM_177003 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9630033F20 gene (9630033F20Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506254 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9630033F20 gene (9630033F20Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000039913 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:127085116:127109550:-1 gene:ENSMUSG00000038028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147705 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9630033F20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182850 IMAGE:9087464), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC147718 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9630033F20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182863 IMAGE:9087477), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:127087874:127109467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_009829 // RefSeq // Mus musculus cyclin D2 (Ccnd2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000000188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:127125779:127151048:-1 gene:ENSMUSG00000000184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC049086 // GenBank // Mus musculus cyclin D2, mRNA (cDNA clone MGC:61305 IMAGE:5716186), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// CT010207 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G0850D for gene Ccnd2, Cyclin D2; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// M83749 // GenBank // Mouse D-type cyclin (CYL2) mRNA, complete cds. // chr6 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// M86182 // GenBank // Mouse cyclin 2 (CYL 2) mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 59 // 14 // 16 // 0 /// AK077367 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330440O09 product:cyclin D2, full insert sequence. // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000016207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:127130335:127154347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
ENSMUST00000121087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:127282063:127282509:-1 gene:ENSMUSG00000081113 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000016197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:127267768:127282509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 89 // 7 // 8 // 0
NM_201371 // RefSeq // Mus musculus protein arginine N-methyltransferase 8 (Prmt8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506352 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein arginine N-methyltransferase 8 (Prmt8), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000032500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:127689011:127769472:-1 gene:ENSMUSG00000030350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC060250 // GenBank // Mus musculus protein arginine N-methyltransferase 8, mRNA (cDNA clone MGC:67339 IMAGE:5690424), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:127680974:127768820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
ENSMUST00000102372 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:128094917:128095026:-1 gene:ENSMUSG00000076327 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_403761 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102637737 (LOC102637737), transcript variant X1, ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000071101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:128187846:128200623:-1 gene:ENSMUSG00000056771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001080979 // RefSeq // Mus musculus TEA domain family member 4 (Tead4), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// NM_011567 // RefSeq // Mus musculus TEA domain family member 4 (Tead4), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000006311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:128227143:128300813:-1 gene:ENSMUSG00000030353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000112157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:128228183:128300813:-1 gene:ENSMUSG00000030353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000130454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128224288:128275577:-1 gene:ENSMUSG00000030353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// BC130257 // GenBank // Mus musculus TEA domain family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:161331 IMAGE:40142595), complete cds. // chr6 // 93 // 68 // 26 // 28 // 0 /// D87965 // GenBank // Mus musculus mRNA for ETF-related factor-2b (ETFR-2b), complete cds. // chr6 // 97 // 76 // 30 // 31 // 0 /// D87966 // GenBank // Mus musculus mRNA for ETF-related factor-2a (ETFR-2a), complete cds. // chr6 // 97 // 88 // 35 // 36 // 0 /// L26344 // GenBank // Mouse TEF-1-related factor (TEFR1b) mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 83 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000023362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:128228366:128274561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0
NM_011657 // RefSeq // Mus musculus tubby-like protein 3 (Tulp3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006505909 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tubby-like protein 3 (Tulp3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000001562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:128321140:128355851:-1 gene:ENSMUSG00000001521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000128708 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128323008:128325547:-1 gene:ENSMUSG00000001521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AB016963 // GenBank // Mus musculus mRNA for tubby, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF045582 // GenBank // Mus musculus tubby like protein 3 (Tulp3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC060068 // GenBank // Mus musculus tubby-like protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:64708 IMAGE:6419643), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000138313 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128331696:128355841:-1 gene:ENSMUSG00000001521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// AK142527 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630012I21 product:tubby-like protein 3, full insert sequence. // chr6 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// GENSCAN00000023343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:128323079:128355898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0
NR_027359 // RefSeq // Mus musculus RAD9-HUS1-RAD1 interacting nuclear orphan 1 (Rhno1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NR_027360 // RefSeq // Mus musculus RAD9-HUS1-RAD1 interacting nuclear orphan 1 (Rhno1), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128357324:128362868:-1 gene:ENSMUSG00000048668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128357365:128362868:-1 gene:ENSMUSG00000048668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000112152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128357000:128362812:-1 gene:ENSMUSG00000048668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK156717 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830043L12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK011109 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2510047L19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 50 // 88 // 11 // 22 // 0 /// ENSMUST00000155573 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:128357993:128359559:-1 gene:ENSMUSG00000048668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:128357651:128359270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT059024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133927 // RefSeq // Mus musculus integrin alpha FG-GAP repeat containing 2 (Itfg2), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000001559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:128409444:128424931:-1 gene:ENSMUSG00000001518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000142615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128409533:128424918:-1 gene:ENSMUSG00000001518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AK159637 // GenBank HTC // Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I420026L14 product:Uncharacterized hematopoietic stem/progenitor cells protein MDS028 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC014833 // GenBank // Mus musculus integrin alpha FG-GAP repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:25499 IMAGE:4507661), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC025492 // GenBank // Mus musculus integrin alpha FG-GAP repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:36400 IMAGE:5309950), complete cds. // chr6 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000133994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128415630:128424930:-1 gene:ENSMUSG00000001518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// AK142721 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830027E16 product:Uncharacterized hematopoietic stem/progenitor cells protein MDS028 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// GENSCAN00000023356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:128410314:128424813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
NM_010219 // RefSeq // Mus musculus FK506 binding protein 4 (Fkbp4), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000032508 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:128430103:128438677:-1 gene:ENSMUSG00000030357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000139448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128429735:128438677:-1 gene:ENSMUSG00000030357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000150387 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:128433215:128438140:-1 gene:ENSMUSG00000030357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 53 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000151796 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:128433762:128437653:-1 gene:ENSMUSG00000030357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC003447 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:6528 IMAGE:2651490), complete cds. // chr6 // 87 // 83 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:128430776:128438510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// X17068 // GenBank // Mouse mRNA for protein with homology to transition protein 2 (TP2). // chr6 // 81 // 72 // 21 // 26 // 0
NM_007376 // RefSeq // Mus musculus pregnancy zone protein (Pzp), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006505379 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pregnancy zone protein (Pzp), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000032510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128483573:128526720:-1 gene:ENSMUSG00000030359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000112132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:128483567:128526720:-1 gene:ENSMUSG00000030359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC057983 // GenBank // Mus musculus pregnancy zone protein, mRNA (cDNA clone MGC:65284 IMAGE:5134629), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// M93264 // GenBank // Mus musculus alpha-2-macroglobulin mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:128479840:128529567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000023339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:128479840:128529567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001001179 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC048546 (BC048546), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000060574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:128539822:128581606:-1 gene:ENSMUSG00000047228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC034132 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC048546, mRNA (cDNA clone IMAGE:4921437), partial cds. // chr6 // 91 // 30 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000023348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:128540297:128581512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0
NM_001159902 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1A (Klrb1a), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_010737 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1A (Klrb1a), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000032512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:128609227:128622934:-1 gene:ENSMUSG00000030361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000171306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:128609351:128622872:-1 gene:ENSMUSG00000030361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF354262 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 natural killer cell receptor protein NKR-P1A mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC120707 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1A, mRNA (cDNA clone MGC:155944 IMAGE:40129630), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC145045 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1A, mRNA (cDNA clone MGC:178601 IMAGE:9053593), complete cds. // chr6 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// DQ237927 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c NKR-P1A (Klrb1a) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// HQ713432 // GenBank // Mus musculus NKR-P1A mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// M77676 // GenBank // Mouse NKR-P1 (gene-2) mRNA, complete cds. // chr6 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// M77753 // GenBank // Mus musculus killer cell surface molecule mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF354261 // GenBank // Mus musculus strain SJL/J natural killer cell receptor protein NKR-P1A mRNA, complete cds. // chr6 // 71 // 80 // 17 // 24 // 0
XM_006506842 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus C-type lectin domain family 2, member J (Clec2j), mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000032517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:128652438:128657032:-1 gene:ENSMUSG00000030363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:128655105:128761182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_001099918 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1 (Klrb1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000112110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:128706508:128723046:-1 gene:ENSMUSG00000079299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// DQ113419 // GenBank // Mus musculus natural killer lectin-like receptor protein 1 g (Nkrp1g) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// HQ713436 // GenBank // Mus musculus NKR-P1G mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// JF429832 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c immunoreceptor NKR-P1G (Klrb1) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0
NM_001159904 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1C (Klrb1c), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_008527 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1C (Klrb1c), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000167691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128778485:128788641:-1 gene:ENSMUSG00000030325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000172601 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:128780043:128788486:-1 gene:ENSMUSG00000030325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000174404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:128779459:128788641:-1 gene:ENSMUSG00000030325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC061168 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1C, mRNA (cDNA clone MGC:74305 IMAGE:30298562), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// M77678 // GenBank // Mouse NKR-P1 (gene-40) mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// AF354263 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 natural killer cell receptor protein NKR-P1C mRNA, complete cds. // chr6 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// ENSMUST00000174865 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:128784764:128789215:-1 gene:ENSMUSG00000030325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1 /// GENSCAN00000009725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:128780285:128823239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
NM_153506 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 2, member e (Clec2e), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000032258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:129091816:129100903:-1 gene:ENSMUSG00000030155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC051091 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 2, member e, mRNA (cDNA clone MGC:59011 IMAGE:6529908), complete cds. // chr6 // 63 // 100 // 15 // 24 // 0
NM_001033122 // RefSeq // Mus musculus CD69 antigen (Cd69), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006505463 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD69 antigen (Cd69), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000032259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:129267324:129275369:-1 gene:ENSMUSG00000030156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128272 // GenBank // Mus musculus CD69 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:149989 IMAGE:40081252), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC128273 // GenBank // Mus musculus CD69 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:149990 IMAGE:40081255), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC139135 // GenBank // Mus musculus CD69 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:170762 IMAGE:8862157), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC139136 // GenBank // Mus musculus CD69 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:170763 IMAGE:8862158), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129269572:129275285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_199034 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4922502D21 gene (4922502D21Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051283 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:129322165:129331796:-1 gene:ENSMUSG00000047720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089479 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4922502D21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107125 IMAGE:6704696), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GU553093 // GenBank // Mus musculus C-type lectin-like receptor 2m (Clec2m) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000009732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129322944:129331841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001204223 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 12, member B (Clec12b), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_027709 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 12, member B (Clec12b), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506611 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus C-type lectin domain family 12, member B (Clec12b), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006506612 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus C-type lectin domain family 12, member B (Clec12b), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000032261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:129375513:129385503:-1 gene:ENSMUSG00000030158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:129375513:129385874:-1 gene:ENSMUSG00000030158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117712 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 12, member B, mRNA (cDNA clone MGC:141599 IMAGE:40088033), complete cds. // chr6 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0
NM_175526 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 1, member a (Clec1a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000037481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:129426684:129452000:-1 gene:ENSMUSG00000033082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052840 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 1, member a, mRNA (cDNA clone MGC:60749 IMAGE:30050488), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129428857:129507089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_020008 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 7, member a (Clec7a), mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:129461591:129472777:-1 gene:ENSMUSG00000079293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184581 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:129463026:129472777:-1 gene:ENSMUSG00000079293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000184861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:129463041:129472685:-1 gene:ENSMUSG00000102040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000079293 // chr6 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AF262985 // GenBank // Mus musculus dendritic cell-associated C-type lectin-1 (Dectin-1) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// AY534909 // GenBank // Mus musculus dectin-1 mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// BC027742 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 7, member a, mRNA (cDNA clone MGC:29217 IMAGE:5036647), complete cds. // chr6 // 81 // 70 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129428857:129507089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_138648 // RefSeq // Mus musculus oxidized low density lipoprotein (lectin-like) receptor 1 (Olr1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505303 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus oxidized low density lipoprotein (lectin-like) receptor 1 (Olr1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000032265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:129485246:129507165:-1 gene:ENSMUSG00000030162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000162815 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:129499907:129507165:-1 gene:ENSMUSG00000030162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000182784 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:129487666:129507107:-1 gene:ENSMUSG00000030162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000183258 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:129487666:129507107:-1 gene:ENSMUSG00000030162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AF303744 // GenBank // Mus musculus oxidized LDL receptor (Lox-1) mRNA, complete cds. // chr6 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// HQ603085 // GenBank // Mus musculus strain CD-1 oxidized low density lipoprotein (lectin-like) receptor 1 isoform 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// HQ603086 // GenBank // Mus musculus strain CD-1 oxidized low density lipoprotein (lectin-like) receptor 1 isoform 3 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129428857:129507089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_021378 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily C, member 3 (Klrc3), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000071149 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:129639085:129643288:-1 gene:ENSMUSG00000033027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000170148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:129639064:129643337:-1 gene:ENSMUSG00000033027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// AF195779 // GenBank // Mus musculus natural killer cell group 2E cell receptor NKG2E mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
NM_001012520 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor family I member 1 (Klri1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000088046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:129697218:129717132:-1 gene:ENSMUSG00000067610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY324874 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor family I member 1 (Klri1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129642684:129740418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_177155 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor family I member 2 (Klri2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006544095 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus killer cell lectin-like receptor family I member 2 (Klri2), mRNA. // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000050385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:129729041:129740484:-1 gene:ENSMUSG00000043932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY324873 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor family I member 2 (Klri2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC132406 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor family I member 2, mRNA (cDNA clone MGC:164037 IMAGE:40130683), complete cds. // chr6 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC132408 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor family I member 2, mRNA (cDNA clone MGC:164039 IMAGE:40130685), complete cds. // chr6 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129642684:129740418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001014997 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 156 (Gm156), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:129766647:129775849:-1 gene:ENSMUSG00000071158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118532 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:129766568:129784270:-1 gene:ENSMUSG00000071158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB121775 // GenBank // Mus musculus KLRH1 mRNA for killer cell lectin-like receptor H1, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008463 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 5 (Klra5), mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000014683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:129898996:129913224:-1 gene:ENSMUSG00000030173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000118060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:129899127:129917650:-1 gene:ENSMUSG00000030173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// U10091 // GenBank // Mus musculus C57BL/6 Ly-49E-GE antigen mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// AF247643 // GenBank // Mus musculus MHC class I receptor Ly49E (Klra5) mRNA, complete cds. // chr6 // 67 // 80 // 8 // 12 // 0 /// BC120550 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:155787 IMAGE:40129473), complete cds. // chr6 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// BC137708 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:169332 IMAGE:8860727), complete cds. // chr6 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// ENSMUST00000169901 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:129899158:129913166:-1 gene:ENSMUSG00000030173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// AF419251 // GenBank // Mus musculus class I MHC receptor KLRA5 (Klra5) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr6 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// AY620247 // GenBank // Mus musculus Ly49E receptor (Klra5) mRNA, complete cds. // chr6 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// BC131790 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:156433 IMAGE:40101177), complete cds. // chr6 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_008464 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 6 (Klra6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000074056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:130013033:130026954:-1 gene:ENSMUSG00000061769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// U10092 // GenBank // Mus musculus C57BL/6 Ly-49F-GE antigen mRNA, complete cds. // chr6 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129865665:130025219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_001101620 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 8 (Klra8), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// NM_010650 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 8 (Klra8), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// ENSMUST00000014476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:130115226:130129898:-1 gene:ENSMUSG00000089727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// U12889 // GenBank // Mus musculus Ly49H mRNA, complete cds. // chr6 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
ENSMUST00000122033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:130082917:130094676:-1 gene:ENSMUSG00000072717 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001289604 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 3 (Klra3), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NM_001289605 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 3 (Klra3), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NM_010648 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 3 (Klra3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000111998 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:130323289:130337574:-1 gene:ENSMUSG00000067591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// U09739 // GenBank // Mus musculus CB.17 natural killer cell surface molecule 5E6 mRNA, complete cds. // chr6 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// U10305 // GenBank // Mus musculus C57Bl/6xCBA Ly49c protein mRNA, complete cds. // chr6 // 78 // 90 // 7 // 9 // 0 /// U49868 // GenBank // Mus musculus 5E6 (5E6/Ly-49C) mRNA, complete cds. // chr6 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// ENSMUST00000088017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:130323393:130337502:-1 gene:ENSMUSG00000067591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 90 // 9 // 10 // 1
ENSMUST00000182397 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:130482111:130504610:-1 gene:ENSMUSG00000098212 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT059119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000182210 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:130728287:130747416:-1 gene:ENSMUSG00000098015 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AK136154 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420465B09 product:similar to KRAB zinc finger protein [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000072940 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:131166365:131182379:-1 gene:ENSMUSG00000061969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:131152639:131245326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_172891 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine/tyrosine kinase 1 (Styk1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006506130 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/threonine/tyrosine kinase 1 (Styk1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006506132 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/threonine/tyrosine kinase 1 (Styk1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000049150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:131299144:131313827:-1 gene:ENSMUSG00000032899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY563053 // GenBank // Mus musculus NOK kinase mRNA, complete cds. // chr6 // 85 // 82 // 23 // 27 // 0 /// BC150724 // GenBank // Mus musculus serine/threonine/tyrosine kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:183635 IMAGE:9087635), complete cds. // chr6 // 93 // 85 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000121078 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:131300133:131316398:-1 gene:ENSMUSG00000032899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// AK035247 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530005F04 product:Similar to FGF receptor 4B, full insert sequence. // chr6 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// GENSCAN00000028988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:131300387:131343876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000083102 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:131380273:131380406:-1 gene:ENSMUSG00000065036 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199156 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 130 (Tas2r130), mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:131629823:131630912:-1 gene:ENSMUSG00000054497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC119329 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 130, mRNA (cDNA clone MGC:155645 IMAGE:8734078), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF412302 // GenBank // Mus musculus STC 7-1 mRNA, partial cds. // chr6 // 53 // 49 // 9 // 17 // 0
NM_199154 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 107 (Tas2r107), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:131659118:131660149:-1 gene:ENSMUSG00000053389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC141027 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 107, mRNA (cDNA clone MGC:175988 IMAGE:9055639), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_207016 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 106 (Tas2r106), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:131677960:131678886:-1 gene:ENSMUSG00000057754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107180 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 106, mRNA (cDNA clone MGC:130068 IMAGE:40050680), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207011 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 104 (Tas2r104), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:131684836:131685744:-1 gene:ENSMUSG00000061977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC148229 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 104, mRNA (cDNA clone MGC:161284 IMAGE:40142081), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020501 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 105 (Tas2r105), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:131686539:131687495:-1 gene:ENSMUSG00000051153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125515 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 105, mRNA (cDNA clone MGC:159218 IMAGE:40130030), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125541 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 105, mRNA (cDNA clone MGC:159244 IMAGE:40130056), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207019 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 114 (Tas2r114), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:131689134:131690063:-1 gene:ENSMUSG00000063478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024705 // RefSeq // Mus musculus proline-rich protein MP5 (Prpmp5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000048686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:132311590:132314757:-1 gene:ENSMUSG00000067543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000052262 // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK132583 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833405E09 product:similar to Proline rich protein [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// BC055856 // GenBank // Mus musculus proline-rich protein MP5, mRNA (cDNA clone MGC:67936 IMAGE:4910526), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC092075 // GenBank // Mus musculus proline-rich protein MP5, mRNA (cDNA clone MGC:103225 IMAGE:4920522), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC110664 // GenBank // Mus musculus proline-rich protein MP5, mRNA (cDNA clone MGC:117856 IMAGE:4191067), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// X63004 // GenBank // M.musculus mRNA for proline-rich protein (PRP MP5, clone p46/p28). // chr6 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0
XR_035022 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5154 (Gm5154), transcript variant X1, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC069935 // GenBank HTC // Mus musculus predicted gene, EG381818, mRNA (cDNA clone IMAGE:4924954). // chr6 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0
NM_207024 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 121 (Tas2r121), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132700090:132701007:-1 gene:ENSMUSG00000071150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104410 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 121, mRNA (cDNA clone MGC:129520 IMAGE:40050579), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104411 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 121, mRNA (cDNA clone MGC:129521 IMAGE:40050580), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207020 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 115 (Tas2r115), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132737010:132738035:-1 gene:ENSMUSG00000071149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138393 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 115, mRNA (cDNA clone MGC:170018 IMAGE:8861413), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138398 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 115, mRNA (cDNA clone MGC:170023 IMAGE:8861418), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181276 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 136 (Tas2r136), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132777179:132778162:-1 gene:ENSMUSG00000053217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207030 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 131 (Tas2r131), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132956884:132957919:-1 gene:ENSMUSG00000057699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145798 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 131, mRNA (cDNA clone MGC:175685 IMAGE:40131101), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207017 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 109 (Tas2r109), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132980015:132980965:-1 gene:ENSMUSG00000062528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207021 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 117 (Tas2r117), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132802818:132803975:1 gene:ENSMUSG00000058349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC132206 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 117, mRNA (cDNA clone MGC:163837 IMAGE:40130483), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC132208 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 117, mRNA (cDNA clone MGC:163839 IMAGE:40130485), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_053211 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 103 (Tas2r103), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000032317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:133036163:133037101:-1 gene:ENSMUSG00000030196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_021562 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 140 (Tas2r140), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:133054817:133055816:-1 gene:ENSMUSG00000071147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145965 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 140, mRNA (cDNA clone MGC:175852 IMAGE:40131268), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145967 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 140, mRNA (cDNA clone MGC:175854 IMAGE:40131270), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000021782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:133105215:133140437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000021796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:133379145:133379726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000021788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:133433010:133510089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001177652 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5886 (Gm5886), transcript variant coding allele, mRNA. // chr6 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NR_111985 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5886 (Gm5886), transcript variant non-coding allele, non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB256662 // GenBank // Mus musculus smarp mRNA for submandibular androgen-repressed protein, complete cds. // chr6 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC038040 // GenBank // Mus musculus, clone IMAGE:4193535, mRNA. // chr6 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC055924 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4925520, partial cds. // chr6 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:133765494:134128656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_010594 // RefSeq // Mus musculus kidney androgen regulated protein (Kap), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000048032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:133849855:133853667:-1 gene:ENSMUSG00000032758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC013453 // GenBank // Mus musculus kidney androgen regulated protein, mRNA (cDNA clone MGC:18550 IMAGE:4221610), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M22810 // GenBank // Mouse androgen-regulated protein mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:133765494:134128656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
GENSCAN00000019867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:133765494:134128656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0
NM_008514 // RefSeq // Mus musculus low density lipoprotein receptor-related protein 6 (Lrp6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000032322 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:134446476:134566913:-1 gene:ENSMUSG00000030201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000111950 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:134450483:134471293:-1 gene:ENSMUSG00000030201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 49 // 24 // 24 // 0 /// AF074265 // GenBank // Mus musculus LDL receptor-related protein 6 (Lrp6) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 98 // 46 // 48 // 0 /// AK140796 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130022G04 product:low density lipoprotein receptor-related protein 6, full insert sequence. // chr6 // 100 // 49 // 24 // 24 // 0 /// BC060704 // GenBank // Mus musculus low density lipoprotein receptor-related protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:67104 IMAGE:6409058), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// GENSCAN00000019866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:134450786:134522664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0
AK141161 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230078I24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026345 // RefSeq // Mus musculus MANSC domain containing 1 (Mansc1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047443 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:134609210:134632488:-1 gene:ENSMUSG00000032718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC039930 // GenBank // Mus musculus MANSC domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:49051 IMAGE:3598325), complete cds. // chr6 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:134609968:134621952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001205396 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member D (Gprc5d), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_053118 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member D (Gprc5d), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:135105991:135118246:-1 gene:ENSMUSG00000030205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000111922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:135105991:135118283:-1 gene:ENSMUSG00000030205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AB025221 // GenBank // Mus musculus mRNA for G protein-coupled receptor longer splice variant, complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AB025222 // GenBank // Mus musculus mRNA for G protein-coupled receptor shorter splice variant, complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AB099816 // GenBank // Mus musculus GPRC5D mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF218809 // GenBank // Mus musculus orphan G-protein coupled receptor (Gprc5d) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC119192 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member D, mRNA (cDNA clone MGC:155508 IMAGE:8733941), complete cds. // chr6 // 85 // 69 // 17 // 20 // 0 /// BC119194 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member D, mRNA (cDNA clone MGC:155510 IMAGE:8733943), complete cds. // chr6 // 85 // 69 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000006544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:135106194:135116907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_013546 // RefSeq // Mus musculus heme binding protein 1 (Hebp1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000045855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:135137519:135168215:-1 gene:ENSMUSG00000042770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB013095 // GenBank // Mus musculus mRNA for heme-binding protein, complete cds. // chr6 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// AF117613 // GenBank // Mus musculus heme-binding protein (Hbp) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC012654 // GenBank // Mus musculus heme binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:13794 IMAGE:4216585), complete cds. // chr6 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// CT010262 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F0251D for gene Hebp1, Heme binding protein 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:135137889:135158824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001080552 // RefSeq // Mus musculus germ cell-specific gene 1 (Gsg1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NM_001080553 // RefSeq // Mus musculus germ cell-specific gene 1 (Gsg1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NM_010352 // RefSeq // Mus musculus germ cell-specific gene 1 (Gsg1), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:135237329:135247965:-1 gene:ENSMUSG00000030206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000111909 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:135237329:135254170:-1 gene:ENSMUSG00000030206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000111910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:135237336:135254351:-1 gene:ENSMUSG00000030206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000111911 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:135237329:135254326:-1 gene:ENSMUSG00000030206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC023009 // GenBank // Mus musculus germ cell-specific gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:36019 IMAGE:5364798), complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// D87325 // GenBank // Mus musculus mRNA for GSG1, complete cds. // chr6 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:135237403:135270708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC119438 // GenBank HTC // Mus musculus germ cell-specific gene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40041658). // chr6 // 92 // 39 // 11 // 12 // 0
NM_029595 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylethanolamine binding protein 2 (Pbp2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000050471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:135309784:135310347:-1 gene:ENSMUSG00000047104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AF307146 // GenBank // Mus musculus strain CD-1 phosphatidylethanolamine binding protein-2 variant 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// AF307147 // GenBank // Mus musculus strain CD-1 phosphatidylethanolamine binding protein-2 variant 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 81 // 93 // 21 // 26 // 0 /// BC107334 // GenBank // Mus musculus phosphatidylethanolamine binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:130302 IMAGE:40054986), complete cds. // chr6 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// BC107335 // GenBank // Mus musculus phosphatidylethanolamine binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:130303 IMAGE:40054988), complete cds. // chr6 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000006540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:135309784:135310347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_008171 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor, ionotropic, NMDA2B (epsilon 2) (Grin2b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000053880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:135713232:136171722:-1 gene:ENSMUSG00000030209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000111905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:135729826:136173511:-1 gene:ENSMUSG00000030209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000152012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:135869703:136173511:-1 gene:ENSMUSG00000030209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// AK002963 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0710001J21 product:glutamate receptor, ionotropic, NMDA2B (epsilon 2), full insert sequence. // chr6 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// D10651 // GenBank // Mus musculus mRNA for glutamate receptor chanel subunit epsilon 2, complete cds. // chr6 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:135732098:135749217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000005021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:135772193:135872600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
AK034518 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330210B09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001201390 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E330021D16 gene (E330021D16Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006505223 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E330021D16 gene (E330021D16Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006505224 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E330021D16 gene (E330021D16Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000178117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:136486122:136487186:-1 gene:ENSMUSG00000091408 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:136486122:136487160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_025806 // RefSeq // Mus musculus phospholipase B domain containing 1 (Plbd1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000032336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:136612070:136661928:-1 gene:ENSMUSG00000030214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000133911 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:136613876:136634558:-1 gene:ENSMUSG00000030214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 91 // 33 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000137139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:136613303:136661873:-1 gene:ENSMUSG00000030214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AK170196 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630027C15 product:hypothetical Laminin A containing protein, full insert sequence. // chr6 // 78 // 82 // 21 // 27 // 0 /// BC019793 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1100001H23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30303 IMAGE:5133074), complete cds. // chr6 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// XM_006506485 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase B domain containing 1 (Plbd1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000005136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:136612178:136641210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_001127318 // RefSeq // Mus musculus guanylate cyclase 2c (Gucy2c), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_145067 // RefSeq // Mus musculus guanylate cyclase 2c (Gucy2c), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032338 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:136697285:136781765:-1 gene:ENSMUSG00000042638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000078095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:136697285:136781742:-1 gene:ENSMUSG00000042638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC099968 // GenBank // Mus musculus guanylate cyclase 2c, mRNA (cDNA clone MGC:107510 IMAGE:6432585), complete cds. // chr6 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:136697865:136752084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_175652 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 4, H4 (Hist4h4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:136801553:136804431:-1 gene:ENSMUSG00000096010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC111813 // GenBank // Mus musculus histone cluster 4, H4, mRNA (cDNA clone IMAGE:40040608), partial cds. // chr6 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_021714 // RefSeq // Mus musculus WW domain binding protein 11 (Wbp11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000116514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:136813654:136828233:-1 gene:ENSMUSG00000030216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF071186 // GenBank // Mus musculus WW domain binding protein 11 mRNA, complete cds. // chr6 // 83 // 56 // 15 // 18 // 0 /// BC006600 // GenBank // Mus musculus WW domain binding protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:7073 IMAGE:3156999), complete cds. // chr6 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC021823 // GenBank // Mus musculus WW domain binding protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:30815 IMAGE:3994221), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSMUST00000151333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:136819728:136828143:-1 gene:ENSMUSG00000030216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// AK145049 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830031E06 product:WW domain binding protein 11, full insert sequence. // chr6 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000005560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:136814208:136826064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_001039558 // RefSeq // Mus musculus single-pass membrane protein with coiled-coil domains 3 (Smco3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000068293 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:136829927:136835450:-1 gene:ENSMUSG00000043298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000111894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:136830421:136835452:-1 gene:ENSMUSG00000043298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AK047766 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030030A07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// XM_006544098 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3-like (LOC102641212), mRNA. // chr6 // 57 // 52 // 8 // 14 // 0
NM_026639 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosyltransferase 4 (Art4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:136848451:136857733:-1 gene:ENSMUSG00000030217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC046306 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosyltransferase 4, mRNA (cDNA clone MGC:54463 IMAGE:6306234), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:136845937:136857243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_008597 // RefSeq // Mus musculus matrix Gla protein (Mgp), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:136872436:136875805:-1 gene:ENSMUSG00000030218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK159931 // GenBank HTC // Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I420038H09 product:matrix gamma-carboxyglutamate (gla) protein, full insert sequence. // chr6 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC036991 // GenBank // Mus musculus matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:46939 IMAGE:4990627), complete cds. // chr6 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC069922 // GenBank // Mus musculus matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:78200 IMAGE:4984262), complete cds. // chr6 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC079478 // GenBank // Mus musculus matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:91073 IMAGE:4950210), complete cds. // chr6 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// D00613 // GenBank // Mus musculus mRNA for MGP precursor, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:136872644:136875730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_026983 // RefSeq // Mus musculus endoplasmic reticulum protein 27 (Erp27), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006506555 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endoplasmic reticulum protein 27 (Erp27), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000032343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:136907311:136922180:-1 gene:ENSMUSG00000030219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC037376 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810033M07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3328790), partial cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC104406 // GenBank // Mus musculus endoplasmic reticulum protein 27, mRNA (cDNA clone MGC:129514 IMAGE:40050532), complete cds. // chr6 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// BC104407 // GenBank // Mus musculus endoplasmic reticulum protein 27, mRNA (cDNA clone MGC:129515 IMAGE:40050533), complete cds. // chr6 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// ENSMUST00000162243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:136909783:136922180:-1 gene:ENSMUSG00000030219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// ENSMUST00000162755 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:136919664:136922140:-1 gene:ENSMUSG00000030219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// AK007800 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810047B09 product:hypothetical Thioredoxin-like structure containing protein, full insert sequence. // chr6 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000005543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:136888012:136922122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001164212 // RefSeq // Mus musculus RAS-like, estrogen-regulated, growth-inhibitor (Rerg), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_001164214 // RefSeq // Mus musculus RAS-like, estrogen-regulated, growth-inhibitor (Rerg), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NM_181988 // RefSeq // Mus musculus RAS-like, estrogen-regulated, growth-inhibitor (Rerg), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506039 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS-like, estrogen-regulated, growth-inhibitor (Rerg), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000032347 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:137054825:137170497:-1 gene:ENSMUSG00000030222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117919 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:137054831:137169732:-1 gene:ENSMUSG00000030222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000119610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:137056099:137169685:-1 gene:ENSMUSG00000030222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC026463 // GenBank // Mus musculus RAS-like, estrogen-regulated, growth-inhibitor, mRNA (cDNA clone MGC:31467 IMAGE:4483442), complete cds. // chr6 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:137000640:137115404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_177787 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 15, member 5 (Slc15a5), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000050132 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:137983590:138073196:-1 gene:ENSMUSG00000044378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000111873 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:137983586:138043411:-1 gene:ENSMUSG00000044378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000154461 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:138037077:138055847:-1 gene:ENSMUSG00000044378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000171804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:137983590:138079916:-1 gene:ENSMUSG00000044378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AK036413 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830102E05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC039761 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9830102E05 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4008601). // chr6 // 90 // 66 // 19 // 21 // 0 /// BC141332 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 15, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:176293 IMAGE:9055944), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC141334 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 15, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:176295 IMAGE:9055946), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT059275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:137984350:138086134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_015777 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin (CD79A) binding protein 1b (Igbp1b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:138657095:138658444:-1 gene:ENSMUSG00000046717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ010637 // GenBank // Mus musculus mRNA for alpha4-b protein. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC125601 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin (CD79A) binding protein 1b, mRNA (cDNA clone MGC:159304 IMAGE:40130116), complete cds. // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC131968 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin (CD79A) binding protein 1b, mRNA (cDNA clone MGC:163599 IMAGE:40130245), complete cds. // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000003764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:138657413:138658444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AK006203 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700021G14 product:immunoglobulin (CD79A) binding protein 1b, full insert sequence. // chr6 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0
NM_001128090 // RefSeq // Mus musculus RERG/RAS-like (Rergl), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:139493182:139501909:-1 gene:ENSMUSG00000092164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC147153 // GenBank // Mus musculus RERG/RAS-like, mRNA (cDNA clone MGC:182296 IMAGE:9056190), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC147154 // GenBank // Mus musculus RERG/RAS-like, mRNA (cDNA clone MGC:182299 IMAGE:9056193), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC147732 // GenBank // Mus musculus RERG/RAS-like, mRNA (cDNA clone MGC:182787 IMAGE:9056681), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC147735 // GenBank // Mus musculus RERG/RAS-like, mRNA (cDNA clone MGC:182790 IMAGE:9056684), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_030687 // RefSeq // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 1a4 (Slco1a4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006506960 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 1a4 (Slco1a4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000032364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:141806722:141845468:-1 gene:ENSMUSG00000030237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000163678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:141834644:141856199:-1 gene:ENSMUSG00000030237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000165990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:141805440:141856171:-1 gene:ENSMUSG00000030237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB031814 // GenBank // Mus musculus oatp2 mRNA for organic anion transporting polypeptide 2, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006506962 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 1a4 (Slco1a4), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001081318 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6614 (Gm6614), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000111832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:141972196:142008745:-1 gene:ENSMUSG00000079263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000181628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:141971845:142011414:-1 gene:ENSMUSG00000079263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000181791 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:141971845:142011414:-1 gene:ENSMUSG00000079263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:141880013:142099468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_023718 // RefSeq // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 1a6 (Slco1a6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006506964 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 1a6 (Slco1a6), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000111827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:142085761:142186153:-1 gene:ENSMUSG00000079262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000172984 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:142109207:142186149:-1 gene:ENSMUSG00000079262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// AF203701 // GenBank // Mus musculus kidney-specific organic anion transporting polypeptide 5 mRNA, complete cds, alternatively polyadenylated transcript. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF213260 // GenBank // Mus musculus kidney-specific organic anion transporting polypeptide 5 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK143970 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F530009C15 product:solute carrier organic anion transporter family, member 1a6, full insert sequence. // chr6 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC071214 // GenBank // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 1a6, mRNA (cDNA clone MGC:78129 IMAGE:5042082), complete cds. // chr6 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0
NM_145572 // RefSeq // Mus musculus glycogen synthase 2 (Gys2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000032371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:142422613:142473109:-1 gene:ENSMUSG00000030244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC021322 // GenBank // Mus musculus glycogen synthase 2, mRNA (cDNA clone MGC:29379 IMAGE:5051685), complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// BC158081 // GenBank // Mus musculus glycogen synthase 2, mRNA (cDNA clone MGC:189873 IMAGE:9007373), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000045746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:142423409:142489143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_008492 // RefSeq // Mus musculus lactate dehydrogenase B (Ldhb), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000032373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:142490249:142507957:-1 gene:ENSMUSG00000030246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000130817 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:142490251:142507921:-1 gene:ENSMUSG00000030246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// BC046755 // GenBank // Mus musculus lactate dehydrogenase B, mRNA (cDNA clone MGC:57911 IMAGE:5693226), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_008428 // RefSeq // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 8 (Kcnj8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:142564939:142571356:-1 gene:ENSMUSG00000030247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003756 // GenBank // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:5890 IMAGE:3490123), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// D88159 // GenBank // Mus musculus mRNA for ATP-sensitive inwardly rectifying K+ channel, complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:142565605:142570379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000111768 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:6:142786307:142804390:-1 gene:ENSMUSG00000048473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000156662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:142785204:142804502:-1 gene:ENSMUSG00000048473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC151094 // GenBank // Mus musculus gene model 766, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:184007 IMAGE:9088007), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC151096 // GenBank // Mus musculus gene model 766, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:184009 IMAGE:9088009), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC172155 // GenBank // Mus musculus gene model 766, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:198860 IMAGE:9054825), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:142781427:142804330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_011374 // RefSeq // Mus musculus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 (St8sia1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006506929 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 (St8sia1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000032421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:142821545:142964452:-1 gene:ENSMUSG00000030283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000147058 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:142828861:142883040:-1 gene:ENSMUSG00000030283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// AK042207 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630071C18 product:sialyltransferase 8 (alpha-2, 8-sialyltransferase) A, full insert sequence. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC024821 // GenBank // Mus musculus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:36044 IMAGE:5357151), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// L38677 // GenBank // Mus musculus alpha 2,8-sialyltransferase (GD3 synthase) mRNA, complete cds. // chr6 // 85 // 67 // 17 // 20 // 0
ENSMUST00000144026 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:144670427:144672720:-1 gene:ENSMUSG00000072677 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK016013 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930541J03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271768 // RefSeq // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member e41 (Bhlhe41), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_024469 // RefSeq // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member e41 (Bhlhe41), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:145858243:145865558:-1 gene:ENSMUSG00000030256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111703 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:145863505:145865302:-1 gene:ENSMUSG00000030256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AB044090 // GenBank // Mus musculus mRNA for bHLH protein DEC2, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK080341 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630058E17 product:basic helix-loop-helix domain containing, class B3, full insert sequence. // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000053857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:145862852:145891680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT059485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_138757 // RefSeq // Mus musculus asunder, spermatogenesis regulator (Asun), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000032427 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:146549632:146577835:-1 gene:ENSMUSG00000040250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000131662 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:146555004:146576267:-1 gene:ENSMUSG00000040250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000139979 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:146549632:146554635:-1 gene:ENSMUSG00000040250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// BC005696 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933424B01 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3597718), partial cds. // chr6 // 91 // 30 // 10 // 11 // 0 /// BC026851 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933424B01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28965 IMAGE:4459471), complete cds. // chr6 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// BC027229 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933424B01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28997 IMAGE:2615769), complete cds. // chr6 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000053847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:146527289:146576392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 65 // 23 // 24 // 0
NM_026281 // RefSeq // Mus musculus transmembrane 7 superfamily member 3 (Tm7sf3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000037709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:146602352:146634597:-1 gene:ENSMUSG00000040234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// DQ104329 // GenBank // Mus musculus NARP1 mRNA, complete cds. // chr6 // 89 // 97 // 32 // 36 // 0 /// ENSMUST00000127529 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:146610891:146634498:-1 gene:ENSMUSG00000040234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 46 // 46 // 17 // 37 // 1 /// GENSCAN00000053846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:146603759:146634461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 68 // 24 // 25 // 0
NM_001164236 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034J05 gene (1700034J05Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_028509 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034J05 gene (1700034J05Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006507111 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700034J05 gene (1700034J05Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000036592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:146950329:146954422:-1 gene:ENSMUSG00000040163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:146951302:146954414:-1 gene:ENSMUSG00000040163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC052362 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034J05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58637 IMAGE:6707822), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:146952790:146966661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001034903 // RefSeq // Mus musculus MANSC domain containing 4 (Mansc4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:147075060:147087032:-1 gene:ENSMUSG00000072662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123367 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:147081433:147087001:-1 gene:ENSMUSG00000072662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// BC150953 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:183864 IMAGE:9087864, complete cds. // chr6 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:147075103:147086964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
AK039661 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330079N23 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008970 // RefSeq // Mus musculus parathyroid hormone-like peptide (Pthlh), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000052296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:147252101:147264167:-1 gene:ENSMUSG00000048776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY183377 // GenBank // Mus musculus parathyroid hormone-related peptide (Pthlh) mRNA, complete cds. // chr6 // 75 // 48 // 9 // 12 // 0 /// AY220497 // GenBank // Mus musculus parathyroid hormone-related protein precursor (Pthlp) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC058187 // GenBank // Mus musculus parathyroid hormone-like peptide, mRNA (cDNA clone MGC:68230 IMAGE:5346064), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:147242746:147268707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSMUST00000100778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:147472194:147475815:-1 gene:ENSMUSG00000072660 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000169225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:147442802:147472330:-1 gene:ENSMUSG00000072660 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// AK144804 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730037D21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XR_378181 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6288 (Gm6288), transcript variant X1, misc_RNA. // chr6 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// XR_378182 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6288 (Gm6288), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONMMUT059536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// NONMMUT059537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT059539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NM_198967 // RefSeq // Mus musculus transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 1 (Tmtc1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000060095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:148232430:148444389:-1 gene:ENSMUSG00000030306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000100772 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:148232430:148444389:-1 gene:ENSMUSG00000030306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000140797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:148246734:148441635:-1 gene:ENSMUSG00000030306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// AK162239 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420470M21 product:ARG99 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// BC145513 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054076, containing frame-shift errors. // chr6 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000026173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:148237794:148285261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0
NR_045867 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6313 (Gm6313), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:148606786:148609733:-1 gene:ENSMUSG00000070995 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:148606786:148614309:-1 gene:ENSMUSG00000070995 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:148545189:148610028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000083335 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:148642524:148642660:-1 gene:ENSMUSG00000065269 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT059587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001081113 // RefSeq // Mus musculus importin 8 (Ipo8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:148770683:148831467:-1 gene:ENSMUSG00000040029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000145960 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:148801916:148831426:-1 gene:ENSMUSG00000040029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC027360 // GenBank // Mus musculus importin 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:4952594), partial cds. // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC151036 // GenBank // Mus musculus importin 8, mRNA (cDNA clone MGC:183949 IMAGE:9087949), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC151052 // GenBank // Mus musculus importin 8, mRNA (cDNA clone MGC:183965 IMAGE:9087965), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000145743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:148790945:148824466:-1 gene:ENSMUSG00000040029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// AK141137 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230066I19 product:importin 8, full insert sequence. // chr6 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000136896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:148770683:148789991:-1 gene:ENSMUSG00000040029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:148772489:148840903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_181541 // RefSeq // Mus musculus caprin family member 2 (Caprin2), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000072324 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:148842493:148896150:-1 gene:ENSMUSG00000030309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000111569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:148842492:148896237:-1 gene:ENSMUSG00000030309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000139914 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:148877915:148895459:-1 gene:ENSMUSG00000030309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 22 // 9 // 9 // 0 /// BC025636 // GenBank // Mus musculus caprin family member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5321417), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// BC125373 // GenBank // Mus musculus caprin family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:159076 IMAGE:40129888), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// BC125375 // GenBank // Mus musculus caprin family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:159078 IMAGE:40129890), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000127941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:148842493:148851396:-1 gene:ENSMUSG00000030309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1 /// GENSCAN00000029027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:148842830:148901138:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0
NM_177192 // RefSeq // Mus musculus DENN/MADD domain containing 5B (Dennd5b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006507064 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DENN/MADD domain containing 5B (Dennd5b), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:148988071:149101680:-1 gene:ENSMUSG00000030313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK079183 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530010K13 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT059609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT059611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0
NM_177192 // RefSeq // Mus musculus DENN/MADD domain containing 5B (Dennd5b), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000111557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:148988071:149101680:-1 gene:ENSMUSG00000030313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000150436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:149013988:149101538:-1 gene:ENSMUSG00000030313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// AK050728 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030011O10 product:similar to SMALL GTP-BINDING PROTEIN ASSOCIATED PROTEIN (FRAGMENT) [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// BC132199 // GenBank // Mus musculus DENN/MADD domain containing 5B, mRNA (cDNA clone MGC:163830 IMAGE:40130476), complete cds. // chr6 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// BC132535 // GenBank // Mus musculus DENN/MADD domain containing 5B, mRNA (cDNA clone MGC:164166 IMAGE:40130812), complete cds. // chr6 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// XM_006507064 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DENN/MADD domain containing 5B (Dennd5b), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 83 // 83 // 38 // 46 // 1 /// GENSCAN00000029033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:148993706:149101309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0
ENSMUST00000083730 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:149052517:149052623:-1 gene:ENSMUSG00000065664 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK142092 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230033C15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083264 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:149074003:149074106:-1 gene:ENSMUSG00000065198 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000077868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:149147519:149147865:-1 gene:ENSMUSG00000056872 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK047167 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930030P05 product:hypothetical Arginine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK155938 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830001G10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00006470 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146176 // RefSeq // Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 3 (Cnot3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000038913 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:3645352:3661100:1 gene:ENSMUSG00000035632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000132344 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:3651309:3655827:1 gene:ENSMUSG00000035632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000143085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:3645290:3661108:1 gene:ENSMUSG00000035632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK173003 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0691 protein. // chr7 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC030332 // GenBank // Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:40675 IMAGE:5400871), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC053437 // GenBank // Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:59466 IMAGE:6394085), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC141041 // GenBank // Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:176002 IMAGE:9055653), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_006539757 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 3 (Cnot3), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// ENSMUST00000135977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:3651808:3658741:1 gene:ENSMUSG00000035632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000027050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:3630298:3660826:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
ENSMUST00000097237 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:4101890:4102060:1 gene:ENSMUSG00000075719 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT059737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
AK006430 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700027J19 product:hypothetical Glycine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081239 // RefSeq // Mus musculus leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily A (with TM domain), member 5 (Lilra5), mRNA. // chr7 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// XM_006539763 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily A (with TM domain), member 5 (Lilra5), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// ENSMUST00000117550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:4237754:4243463:1 gene:ENSMUSG00000070873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// AY998482 // GenBank // Mus musculus leukocyte immunoglobulin-like receptor (Lilrc1) mRNA, complete cds. // chr7 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_010746 // RefSeq // Mus musculus natural cytotoxicity triggering receptor 1 (Ncr1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000006792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:4337724:4345164:1 gene:ENSMUSG00000062524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126417 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:4337769:4345164:1 gene:ENSMUSG00000062524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK172251 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830110B17 product:natural cytotoxicity triggering receptor 1, full insert sequence. // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// BC042788 // GenBank // Mus musculus natural cytotoxicity triggering receptor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3601624), partial cds. // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// BC115364 // GenBank // Mus musculus natural cytotoxicity triggering receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:129310 IMAGE:40045898), complete cds. // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000043196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:4337749:4347831:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001003920 // RefSeq // Mus musculus BR serine/threonine kinase 1 (Brsk1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NM_001168572 // RefSeq // Mus musculus BR serine/threonine kinase 1 (Brsk1), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000048248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:4690928:4715997:1 gene:ENSMUSG00000035390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000120836 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:4690604:4715981:1 gene:ENSMUSG00000035390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AY533671 // GenBank // Mus musculus putative serine/threonine kinase SADB mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC086636 // GenBank // Mus musculus BR serine/threonine kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:99905 IMAGE:6402113), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// EU016556 // GenBank // Mus musculus cell-line NIH3T3 SADB-short mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// EU016557 // GenBank // Mus musculus cell-line MEF SADB-short mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// EU016558 // GenBank // Mus musculus cell-line AML-12 SADB-short mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// EU586326 // GenBank // Mus musculus SADB-short 1 mRNA, complete cds. // chr7 // 46 // 46 // 18 // 39 // 1 /// GENSCAN00000043203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:4688376:4715490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0
NM_030028 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 190 (Tmem190), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006540434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 190 (Tmem190), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540435 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 190 (Tmem190), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000013235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:4782940:4784341:1 gene:ENSMUSG00000013091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:4782983:4784937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
GENSCAN00000043202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:4909038:4938355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 88 // 15 // 17 // 1
NM_170759 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 628 (Zfp628), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000116354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:4915217:4922003:1 gene:ENSMUSG00000074406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF435832 // GenBank // Mus musculus strain ICR zinc finger protein (Zec) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC056945 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 628, mRNA (cDNA clone IMAGE:6816732), complete cds. // chr7 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// BC062973 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 628, mRNA (cDNA clone IMAGE:6816732), complete cds. // chr7 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000043202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:4909038:4938355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_201355 // RefSeq // Mus musculus N-acetyltransferase 14 (Nat14), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540016 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetyltransferase 14 (Nat14), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540017 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetyltransferase 14 (Nat14), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:4922251:4925006:1 gene:ENSMUSG00000035285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK163549 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230365P17 product:Leucine-zipper-like protein 1 homolog (Hypothetical protein), full insert sequence. // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC047219 // GenBank // Mus musculus N-acetyltransferase 14, mRNA (cDNA clone MGC:57098 IMAGE:6491365), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:4909038:4938355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_173008 // RefSeq // Mus musculus scavenger receptor cysteine rich domain containing (5 domains) (Ssc5d), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000057612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:4925844:4944821:1 gene:ENSMUSG00000035279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC141044 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A430110N23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:176005 IMAGE:9055656), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EU850434 // GenBank // Mus musculus group B scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein (S5D-SRCRB) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006540022 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus scavenger receptor cysteine rich domain containing (5 domains) (Ssc5d), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// GENSCAN00000043202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:4909038:4938355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_025324 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 524 (Zfp524), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540276 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 524 (Zfp524), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000086349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:5015501:5018486:1 gene:ENSMUSG00000051184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019995 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 524, mRNA (cDNA clone MGC:28722 IMAGE:4458724), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:5016405:5018440:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001033383 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 865 (Zfp865), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001290426 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 865 (Zfp865), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// XM_006540058 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 865 (Zfp865), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000076251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:5020376:5033138:1 gene:ENSMUSG00000074405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000085427 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:5020570:5033138:1 gene:ENSMUSG00000074405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AK031793 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6230427H18 product:weakly similar to ZNF72=KRUPPEL-TYPE ZINC FINGER (KRUPPEL-RELATED ZINC FINGER PROTEIN) (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:5028803:5032194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_026900 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 580 (Zfp580), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000069324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:5051532:5053722:1 gene:ENSMUSG00000055633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB221670 // GenBank // Mus musculus cDNA pooled tissues:(tissue_type=brain,dev_stage=8-12 days neonate,strain=BALB/c),(tissue_type=testis,dev_stage=adult, strain=C57BL/6J), clone:V01Y044E23. // chr7 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC066001 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 580, mRNA (cDNA clone MGC:90139 IMAGE:5700640), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:5047804:5060523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
BC007487 // GenBank // Mus musculus U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliary factor (U2AF) 2, mRNA (cDNA clone MGC:8307 IMAGE:3593924), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NM_001205231 // RefSeq // Mus musculus U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliary factor (U2AF) 2 (U2af2), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// NM_133671 // RefSeq // Mus musculus U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliary factor (U2AF) 2 (U2af2), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// ENSMUST00000005041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:5062143:5079945:1 gene:ENSMUSG00000030435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// ENSMUST00000165399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:5067228:5079932:1 gene:ENSMUSG00000030435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// BC043071 // GenBank // Mus musculus U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliary factor (U2AF) 2, mRNA (cDNA clone MGC:57976 IMAGE:6403830), complete cds. // chr7 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// BC106134 // GenBank // Mus musculus U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliary factor (U2AF) 2, mRNA (cDNA clone MGC:118033 IMAGE:6309073), complete cds. // chr7 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// GENSCAN00000052332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:5062288:5101586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_001252454 // RefSeq // Mus musculus epsin 1 (Epn1), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_010147 // RefSeq // Mus musculus epsin 1 (Epn1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006539529 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus epsin 1 (Epn1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000045277 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:5080293:5098176:1 gene:ENSMUSG00000035203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000098845 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:5080235:5098178:1 gene:ENSMUSG00000035203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC046962 // GenBank // Mus musculus epsin 1, mRNA (cDNA clone MGC:54970 IMAGE:6391968), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC067206 // GenBank // Mus musculus epsin 1, mRNA (cDNA clone MGC:70134 IMAGE:6514327), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC099682 // GenBank // Mus musculus epsin 1, mRNA (cDNA clone MGC:106041 IMAGE:6529672), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:5062288:5101586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NR_003622 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5065 (Gm5065), non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000056639 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:7:5350542:5360682:1 gene:ENSMUSG00000048398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:5359372:5359869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT059822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_030741 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 62 (Vmn1r62), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000173956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:5674627:5676383:1 gene:ENSMUSG00000092579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// BC113757 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D2, mRNA (cDNA clone MGC:130511 IMAGE:40047296), complete cds. // chr7 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// BC147681 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D8, mRNA (cDNA clone MGC:182760 IMAGE:9056654), complete cds. // chr7 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// BC147684 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D8, mRNA (cDNA clone MGC:182763 IMAGE:9056657), complete cds. // chr7 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// AF324867 // GenBank // Mus musculus pheromone receptor V3R2 mRNA, complete cds. // chr7 // 86 // 86 // 18 // 21 // 1
NM_031389 // RefSeq // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 4C (Nlrp4c), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000037728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:6045161:6105149:1 gene:ENSMUSG00000034690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000121583 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:6045269:6104684:1 gene:ENSMUSG00000034690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AF285581 // GenBank // Mus musculus ribonuclease/angiogenin inhibitor 2 (Rnh2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AK166869 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0019G20 product:ribonuclease/angiogenin inhibitor 2, full insert sequence. // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AY596194 // GenBank // Mus musculus NALP-alpha (Nalp-alpha) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC120833 // GenBank // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 4C, mRNA (cDNA clone MGC:156070 IMAGE:40129756), complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:6038847:6124621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_178028 // RefSeq // Mus musculus galanin-like peptide (Galp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000037553 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:6197090:6216137:1 gene:ENSMUSG00000034660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY163546 // GenBank // Mus musculus galanin-like peptide precursor (Galp) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006539789 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus galanin-like peptide (Galp), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_133204 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and SCAN domain containing 5B (Zscan5b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000072662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:6222278:6239423:1 gene:ENSMUSG00000058028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000155314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:6222295:6231404:1 gene:ENSMUSG00000058028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000165445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:6230179:6239190:1 gene:ENSMUSG00000058028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC139442 // GenBank // Mus musculus zinc finger and SCAN domain containing 5B, mRNA (cDNA clone MGC:171069 IMAGE:8862464), complete cds. // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC139456 // GenBank // Mus musculus zinc finger and SCAN domain containing 5B, mRNA (cDNA clone MGC:171083 IMAGE:8862478), complete cds. // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000016542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:6230179:6354677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001177416 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6792 (Gm6792), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001177417 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6792 (Gm6792), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540265 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6792 (Gm6792), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:7:6252710:6281859:1 gene:ENSMUSG00000053367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155248 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:6260536:6281859:1 gene:ENSMUSG00000053367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY226991 // GenBank // Mus musculus epididymal protein (Av381130) mRNA, complete sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:6258613:6282066:1 gene:ENSMUSG00000053367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONMMUT059838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001025163 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 78 (Zfp78), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001112805 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 78 (Zfp78), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NM_177888 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 78 (Zfp78), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000086323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:6371364:6379491:1 gene:ENSMUSG00000055150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000108559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:6371364:6379491:1 gene:ENSMUSG00000055150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// BC085322 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 78, mRNA (cDNA clone MGC:102644 IMAGE:30739758), complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// XM_006540100 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 78 (Zfp78), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
NM_175247 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 28 (Zfp28), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000081022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:6383318:6396633:1 gene:ENSMUSG00000062861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK173170 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1431 protein. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC062116 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 28, mRNA (cDNA clone MGC:69828 IMAGE:6817400), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// XM_006539742 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 28 (Zfp28), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// XM_006539743 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 28 (Zfp28), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// GENSCAN00000016546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:6383394:6398501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_177061 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1344 (Olfr1344), mRNA. // chr7 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054781 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:6410277:6441691:1 gene:ENSMUSG00000045929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000168341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:6439836:6440896:1 gene:ENSMUSG00000090824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// BC147050 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1344, mRNA (cDNA clone MGC:182178 IMAGE:9056072), complete cds. // chr7 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// BC147051 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1344, mRNA (cDNA clone MGC:182155 IMAGE:9056049), complete cds. // chr7 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// NM_001134752 // RefSeq // Mus musculus predicted gene, 16532 (Gm16532), mRNA. // chr7 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1 /// ENSMUST00000160218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:6415175:6432093:1 gene:ENSMUSG00000093536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1 /// ENSMUST00000161855 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:6398715:6429450:1 gene:ENSMUSG00000093536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1 /// GENSCAN00000016538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:6424717:6440867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0
NM_146915 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1336 (Olfr1336), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000056120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:6460511:6461455:1 gene:ENSMUSG00000048620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC104286 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1336, mRNA (cDNA clone MGC:129212 IMAGE:40042538), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:6460814:6461455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0
NM_146916 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1346 (Olfr1346), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000056144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:6474088:6475153:1 gene:ENSMUSG00000054938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC137876 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1346, mRNA (cDNA clone MGC:169500 IMAGE:8860895), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC137877 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1346, mRNA (cDNA clone MGC:169501 IMAGE:8860896), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:6474478:6475003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000122705 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:6512235:6512342:1 gene:ENSMUSG00000084654 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr7 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONMMUT059846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
NM_146389 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1350 (Olfr1350), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:6569993:6570919:1 gene:ENSMUSG00000056696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104063 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1350, mRNA (cDNA clone MGC:123533 IMAGE:40040754), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:6569993:6652587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001290994 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 29 (Usp29), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_021323 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 29 (Usp29), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540240 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin specific peptidase 29 (Usp29), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AF229257 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-specific processing protease mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK038752 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230060C20 product:ubiquitin specific protease 29, full insert sequence. // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// EU233992 // GenBank // Mus musculus clone 4ASIII1-1 LINE L1 ASL1/Usp29 fusion mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
AF365933 // GenBank // Mus musculus Kruppel-type zinc-finger protein ZNF264-like mRNA, complete sequence. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT059871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_146179 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 418 (Zfp418), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000051435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:7171330:7183562:1 gene:ENSMUSG00000034538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC024761 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 418, mRNA (cDNA clone MGC:38956 IMAGE:5363178), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC026490 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 418, mRNA (cDNA clone MGC:31575 IMAGE:4504776), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006539790 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 418 (Zfp418), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_134229 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 67 (Vmn1r67), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000055964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:10446789:10447784:1 gene:ENSMUSG00000046716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC138174 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, E10, mRNA (cDNA clone MGC:169798 IMAGE:8861193), complete cds. // chr7 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0 /// BC145742 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, E10, mRNA (cDNA clone MGC:175629 IMAGE:40131045), complete cds. // chr7 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0
NM_134228 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 70 (Vmn1r70), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055847 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:10633587:10634483:1 gene:ENSMUSG00000045340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF394955 // GenBank // Mus musculus vomeronasal receptor 1 D2 (V1rd2) mRNA, complete cds. // chr7 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_172481 // RefSeq // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 4B (Nlrp4b), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000047809 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:10687793:10730158:1 gene:ENSMUSG00000034087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000117413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:10687821:10730168:1 gene:ENSMUSG00000034087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AY355342 // GenBank // Mus musculus NALP4b mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AY596198 // GenBank // Mus musculus NALP-gamma (Nalp-gamma) mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0 /// BC066795 // GenBank // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 4B, mRNA (cDNA clone MGC:76462 IMAGE:30473929), complete cds. // chr7 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000132990 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:10714973:10727135:1 gene:ENSMUSG00000034087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// AK162217 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420459A08 product:Hypothetical RNI-like structure containing protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr7 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000019090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:10710231:10747429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000019090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:10710231:10747429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XR_391152 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6909 (Gm6909), misc_RNA. // chr7 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// XR_406239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6909 (Gm6909), misc_RNA. // chr7 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
GENSCAN00000051483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:11448977:11449805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:11565380:11566208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:11248333:11249161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:10845366:10846192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 47 // 68 // 9 // 19 // 0 /// GENSCAN00000051505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:11107551:11108377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 68 // 8 // 19 // 0
NM_134203 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 73 (Vmn1r73), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000055070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:11756257:11757168:1 gene:ENSMUSG00000051687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_134206 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 74 (Vmn1r74), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:11846775:11847689:1 gene:ENSMUSG00000047655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134207 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 75 (Vmn1r75), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000057229 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:11880343:11881260:1 gene:ENSMUSG00000043308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC115507 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, G6, mRNA (cDNA clone MGC:144331 IMAGE:40101051), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_134208 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 78 (Vmn1r78), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078039 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:12152464:12153405:1 gene:ENSMUSG00000061602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107195 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, G7, mRNA (cDNA clone MGC:130086 IMAGE:40051039), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC107194 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, G7, mRNA (cDNA clone MGC:130085 IMAGE:40051037), complete cds. // chr7 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0
NM_001166835 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 79 (Vmn1r79), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001167534 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 2 (Vmn1r2), mRNA. // chr7 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// NM_001167535 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 3 (Vmn1r3), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NM_001167539 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, 238 (Vmn1r238), mRNA. // chr7 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000062811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:12176193:12177113:1 gene:ENSMUSG00000096735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000105159 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:3184382:3185305:-1 gene:ENSMUSG00000095982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000105160 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:3172083:3173006:1 gene:ENSMUSG00000094798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSMUST00000165255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:3122492:3123412:-1 gene:ENSMUSG00000091539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC145887 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, G10-like, mRNA (cDNA clone MGC:175774 IMAGE:40131190), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONMMUT051077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0
NM_134204 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 80 (Vmn1r80), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:12192965:12193891:1 gene:ENSMUSG00000057161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000174235 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:12214595:12215545:1 gene:ENSMUSG00000092476 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT059944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_134234 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 82 (Vmn1r82), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:12304805:12305719:1 gene:ENSMUSG00000058132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC109325 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, G12, mRNA (cDNA clone MGC:130060 IMAGE:40050555), complete cds. // chr7 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000191002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:12304802:12305719:1 gene:ENSMUSG00000058132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000173045 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:12445358:12468852:1 gene:ENSMUSG00000092583 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr7 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:12441764:12554813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
NM_001039951 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 606 (Zfp606), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// NM_026112 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 606 (Zfp606), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// XM_006540321 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 606 (Zfp606), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000098822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:12478293:12496235:1 gene:ENSMUSG00000030386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000133515 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:12489513:12495553:1 gene:ENSMUSG00000030386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 31 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000151933 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:12478363:12495562:1 gene:ENSMUSG00000030386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// BC052747 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 606, mRNA (cDNA clone MGC:64782 IMAGE:6837952), complete cds. // chr7 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// BC110665 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 606, mRNA (cDNA clone IMAGE:4987306), complete cds. // chr7 // 92 // 60 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:12478305:12483901:1 gene:ENSMUSG00000030386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 69 // 69 // 29 // 42 // 1 /// GENSCAN00000044045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:12441764:12554813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
XM_006540386 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2900092C05 gene (2900092C05Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000032541 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:12512517:12556323:1 gene:ENSMUSG00000030385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK013837 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900092C05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC087883 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900092C05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107152 IMAGE:6772737), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC099547 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900092C05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118233 IMAGE:6741066), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006540388 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2900092C05 gene (2900092C05Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000044045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:12441764:12554813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
ENSMUST00000118665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:12603196:12604643:1 gene:ENSMUSG00000082872 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000044036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:12603102:12604648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
ENSMUST00000182237 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:12742686:12743672:1 gene:ENSMUSG00000098135 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT059953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_022981 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 110 (Zfp110), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006540275 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 110 (Zfp110), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000004614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:12834761:12850577:1 gene:ENSMUSG00000058638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000137718 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:12836291:12844905:1 gene:ENSMUSG00000058638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000168247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:12835483:12849925:1 gene:ENSMUSG00000058638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC006657 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 110, mRNA (cDNA clone MGC:5685 IMAGE:3500984), complete cds. // chr7 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000148041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:12835037:12836686:1 gene:ENSMUSG00000058638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT059965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_153802 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 128 (Zfp128), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000081891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:12881177:12891841:1 gene:ENSMUSG00000060397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:12881177:12893422:1 gene:ENSMUSG00000060397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF480861 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 8 (Znf8) mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// AK132244 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body below diaphragm region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3732409E05 product:zinc finger protein 128, full insert sequence. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC088998 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 128, mRNA (cDNA clone MGC:113768 IMAGE:6417536), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC094248 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 128, mRNA (cDNA clone MGC:106608 IMAGE:5718665), complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:12881752:12891425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_029809 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310014L17 gene (2310014L17Rik), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:12927416:12931072:1 gene:ENSMUSG00000033967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC141220 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310014L17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:176181 IMAGE:9055832), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:12922974:12942475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_178732 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 324 (Zfp324), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038701 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:12965838:12973822:1 gene:ENSMUSG00000004500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:12965845:12974236:1 gene:ENSMUSG00000004500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000128293 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:12965867:12973799:1 gene:ENSMUSG00000004500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK052251 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330013I06 product:similar to ZINC FINGER PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC053093 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 324, mRNA (cDNA clone MGC:62482 IMAGE:6400158), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134226 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 89 (Vmn1r89), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539587 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal 1 receptor 89 (Vmn1r89), transcript variant X1, partial mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:13219339:13220289:1 gene:ENSMUSG00000095629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013877 // RefSeq // Mus musculus calcium binding protein 5 (Cabp5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006540042 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium binding protein 5 (Cabp5), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000005791 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:13398132:13408887:1 gene:ENSMUSG00000005649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000152995 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:13398308:13405547:1 gene:ENSMUSG00000005649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AB079605 // GenBank // Mus musculus CABP5b mRNA for calcium-binding protein type5 spliced variant, complete cds. // chr7 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// AF169161 // GenBank // Mus musculus CaBP5 (Cabp5) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC018253 // GenBank // Mus musculus calcium binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:25494 IMAGE:4504283), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000117400 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:13398295:13406296:1 gene:ENSMUSG00000005649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// AK087416 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130013J22 product:calcium binding protein 5, full insert sequence. // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:13335227:13407808:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001033418 // RefSeq // Mus musculus binder of sperm protein homolog 1 (Bsph1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000098811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:13450841:13473449:1 gene:ENSMUSG00000074378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC147454 // GenBank // Mus musculus binder of sperm protein homolog 1, mRNA (cDNA clone MGC:182202 IMAGE:9056096), complete cds. // chr7 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// BC147459 // GenBank // Mus musculus binder of sperm protein homolog 1, mRNA (cDNA clone MGC:182207 IMAGE:9056101), complete cds. // chr7 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// BC171987 // GenBank // Mus musculus binder of sperm protein homolog 1, mRNA (cDNA clone MGC:198692 IMAGE:9054273), complete cds. // chr7 // 86 // 76 // 19 // 22 // 0 /// BC171991 // GenBank // Mus musculus binder of sperm protein homolog 1, mRNA (cDNA clone MGC:198696 IMAGE:9054277), complete cds. // chr7 // 86 // 76 // 19 // 22 // 0 /// DQ227498 // GenBank // Mus musculus bovine seminal plasma protein-like 1 (Bsph1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000186734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:13639107:13642572:1 gene:ENSMUSG00000101532 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:13624048:13642649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001111296 // RefSeq // Mus musculus sulfotransferase family 2A, dehydroepiandrosterone (DHEA)-preferring, member 1 (Sult2a1), mRNA. // chrUn // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// ENSMUST00000108522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:13796246:13837409:-1 gene:ENSMUSG00000078798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// BC125365 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C730007P19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159068 IMAGE:40129880), complete cds. // chrUn // 55 // 100 // 6 // 11 // 0 /// BC125367 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C730007P19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159070 IMAGE:40129882), complete cds. // chrUn // 55 // 100 // 6 // 11 // 0
ENSMUST00000189290 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:14015721:14016870:1 gene:ENSMUSG00000099602 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_172674 // RefSeq // Mus musculus PHD finger protein 20 (Phf20), mRNA. // chr7 // 55 // 100 // 6 // 11 // 0 /// ENSMUST00000037401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:156196642:156309952:1 gene:ENSMUSG00000038116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 55 // 100 // 6 // 11 // 0 /// BC060121 // GenBank // Mus musculus PHD finger protein 20, mRNA (cDNA clone MGC:76344 IMAGE:6413021), complete cds. // chr7 // 60 // 91 // 6 // 10 // 0 /// ENSMUST00000185066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:14304780:14307665:1 gene:ENSMUSG00000098506 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000050573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:14304780:14307666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_172674 // RefSeq // Mus musculus PHD finger protein 20 (Phf20), mRNA. // chr7 // 43 // 100 // 10 // 23 // 0 /// ENSMUST00000037401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:156196642:156309952:1 gene:ENSMUSG00000038116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 43 // 100 // 10 // 23 // 0 /// ENSMUST00000122814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:156296405:156304692:1 gene:ENSMUSG00000038116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 48 // 91 // 10 // 21 // 0 /// ENSMUST00000152617 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:156196734:156309949:1 gene:ENSMUSG00000038116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 43 // 100 // 10 // 23 // 0 /// BC060121 // GenBank // Mus musculus PHD finger protein 20, mRNA (cDNA clone MGC:76344 IMAGE:6413021), complete cds. // chr7 // 43 // 100 // 10 // 23 // 0 /// ENSMUST00000185066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:14304780:14307665:1 gene:ENSMUSG00000098506 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000050573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:14304780:14307666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
NM_001038676 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4745 (Gm4745), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000069740 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:14659733:14665996:1 gene:ENSMUSG00000055942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000183424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:14659745:14664574:1 gene:ENSMUSG00000055942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000183788 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:14659496:14665996:1 gene:ENSMUSG00000055942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000050572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:14664037:14665735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
ENSMUST00000083043 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:14778669:14778772:1 gene:ENSMUSG00000064977 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT060015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000101946 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:14912358:14912462:1 gene:ENSMUSG00000095998 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT060018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000179110 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:15593231:15593335:1 gene:ENSMUSG00000096381 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT060024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_145709 // RefSeq // Mus musculus oocyte specific homeobox 5 (Obox5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000098802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:15750377:15759800:1 gene:ENSMUSG00000074366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000173053 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:15750381:15758661:1 gene:ENSMUSG00000074366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000173455 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:15750131:15758656:1 gene:ENSMUSG00000074366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// BC052664 // GenBank // Mus musculus oocyte specific homeobox 5, mRNA (cDNA clone MGC:60755 IMAGE:30053785), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:15757537:15758997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_001033638 // RefSeq // Mus musculus cone-rod homeobox, opposite strand (Crxos), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000098801 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:15896124:15904020:1 gene:ENSMUSG00000074365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AB472692 // GenBank // Mus musculus Egam1 mRNA for EGAM1, complete cds. // chr7 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0
NM_001099277 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 541 (Zfp541), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:16071942:16096328:1 gene:ENSMUSG00000078796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC157962 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 541, mRNA (cDNA clone MGC:189787 IMAGE:9007287), complete cds. // chr7 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// DQ864732 // GenBank // Mus musculus testis-specific protein SC01 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:16061733:16095859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_148946 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 2 (Slc8a2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000168693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:16130300:16160509:1 gene:ENSMUSG00000030376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF503502 // GenBank // Mus musculus sodium-calcium exchanger (Slc8a2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC058704 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:76359 IMAGE:6838206), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC080277 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:90595 IMAGE:30354551), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006539472 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 2 (Slc8a2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000024938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:16119959:16159180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// AK129285 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1087 protein. // chr7 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_198631 // RefSeq // Mus musculus zinc finger CCCH-type containing 4 (Zc3h4), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 51 // 51 // 0 /// XM_006540104 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger CCCH-type containing 4 (Zc3h4), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 53 // 53 // 0 /// XM_006540105 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger CCCH-type containing 4 (Zc3h4), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 50 // 50 // 0 /// ENSMUST00000098789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:16401196:16437694:1 gene:ENSMUSG00000059273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 51 // 51 // 0 /// AK151148 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830026A16 product:hypothetical Bipartite nuclear localization signal containing protein, full insert sequence. // chr7 // 94 // 31 // 16 // 17 // 0 /// BC057627 // GenBank // Mus musculus zinc finger CCCH-type containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:67629 IMAGE:6412890), complete cds. // chr7 // 100 // 56 // 31 // 31 // 0 /// BC060274 // GenBank // Mus musculus zinc finger CCCH-type containing 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:6822470), complete cds. // chr7 // 100 // 35 // 19 // 19 // 0 /// AK138078 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130084P03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 18 // 18 // 10 // 55 // 1 /// GENSCAN00000024928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:16400881:16435510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 44 // 44 // 0
NM_026938 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 160 (Tmem160), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:16452779:16455489:1 gene:ENSMUSG00000019158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028534 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 160, mRNA (cDNA clone MGC:41402 IMAGE:1447954), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:16452963:16455426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000083959 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:16471813:16471931:1 gene:ENSMUSG00000065893 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT060053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_011927 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 9 (Ceacam9), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000001984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:16721929:16726110:1 gene:ENSMUSG00000007209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// L49180 // GenBank // Mus musculus putative CEA5 precursor (Cea5) mRNA, complete cds. // chr7 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0
NM_198613 // RefSeq // Mus musculus adaptor-related protein complex 2, sigma 1 subunit (Ap2s1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:16738410:16749290:1 gene:ENSMUSG00000008036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141496 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:16746764:16749294:1 gene:ENSMUSG00000008036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC023066 // GenBank HTC // Mus musculus adaptor-related protein complex 2, sigma 1 subunit, mRNA (cDNA clone IMAGE:5358852), with apparent retained intron. // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC052499 // GenBank // Mus musculus adaptor-related protein complex 2, sigma 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:62945 IMAGE:3370978), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:16723690:16749013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001252458 // RefSeq // Mus musculus protein kinase D2 (Prkd2), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NM_178900 // RefSeq // Mus musculus protein kinase D2 (Prkd2), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XR_391036 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein kinase D2 (Prkd2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr7 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000086104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:16843065:16870461:1 gene:ENSMUSG00000041187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000168093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:16842902:16870461:1 gene:ENSMUSG00000041187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC095949 // GenBank // Mus musculus protein kinase D2, mRNA (cDNA clone MGC:106162 IMAGE:4950957), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC096444 // GenBank // Mus musculus protein kinase D2, mRNA (cDNA clone MGC:106161 IMAGE:4216827), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:16816356:16870023:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1
NM_001081655 // RefSeq // Mus musculus dapper homolog 3, antagonist of beta-catenin (xenopus) (Dact3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108493 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:16875317:16887301:1 gene:ENSMUSG00000078794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB073971 // GenBank // Mus musculus mRNA for NAA-3 protein, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// DQ832319 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 DACT3 (Dact3) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:16875425:16886414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010320 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 8 (Gng8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000078182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:16891786:16895435:1 gene:ENSMUSG00000063594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC111437 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 8, mRNA (cDNA clone MGC:130528 IMAGE:40049157), complete cds. // chr7 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// XM_006539548 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 8 (Gng8), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:16894944:16895363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_008967 // RefSeq // Mus musculus prostaglandin I receptor (IP) (Ptgir), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000144408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:16906514:16910900:1 gene:ENSMUSG00000043017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK033567 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130001I18 product:prostaglandin I receptor, full insert sequence. // chr7 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC094386 // GenBank // Mus musculus prostaglandin I receptor (IP), mRNA (cDNA clone MGC:106500 IMAGE:30608457), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// D26157 // GenBank // Mus musculus mRNA for prostacyclin receptor, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006539670 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prostaglandin I receptor (IP) (Ptgir), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000086101 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:16906490:16910905:1 gene:ENSMUSG00000043017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// GENSCAN00000024923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:16906785:16909114:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_001099636 // RefSeq // Mus musculus PNMA-like 2 (Pnmal2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:16944682:16948828:1 gene:ENSMUSG00000070802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:16942987:16984208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021913 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4504201, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001007569 // RefSeq // Mus musculus PNMA-like 1 (Pnmal1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540361 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PNMA-like 1 (Pnmal1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:16959795:16962319:1 gene:ENSMUSG00000041141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048228 // GenBank // Mus musculus PNMA-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:54820 IMAGE:6310552), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:16942987:16984208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001101535 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 8 (Ccdc8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000094805 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:16992708:16997516:1 gene:ENSMUSG00000041117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:16994837:16999450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
NM_007676 // RefSeq // Mus musculus pregnancy specific glycoprotein 16 (Psg16), mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000118367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:17074041:17098971:1 gene:ENSMUSG00000066760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000131153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:17074118:17095430:1 gene:ENSMUSG00000066760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000152671 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:17087934:17093907:1 gene:ENSMUSG00000066760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// AB500066 // GenBank // Mus musculus PSG mRNA for pregnancy-specific glycoprotein, complete cds. // chr7 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// U34272 // GenBank // Mus musculus brain carcinoembryonic antigen (bCEA) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000071399 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:17074040:17133450:1 gene:ENSMUSG00000066760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// BC030357 // GenBank // Mus musculus pregnancy specific glycoprotein 16, mRNA (cDNA clone MGC:40798 IMAGE:5367680), complete cds. // chr7 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000044724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:17088138:17447177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_054059 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3 (Ceacam3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006540151 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3 (Ceacam3), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 93 // 61 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000065540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:17150400:17163231:1 gene:ENSMUSG00000053228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000108491 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:17150282:17164253:1 gene:ENSMUSG00000053228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006540149 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3 (Ceacam3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// XM_006540150 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3 (Ceacam3), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1 /// GENSCAN00000044724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:17088138:17447177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
NM_054064 // RefSeq // Mus musculus pregnancy-specific glycoprotein 29 (Psg29), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000075934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:17203477:17215756:1 gene:ENSMUSG00000023159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK141330 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430030O18 product:Cea17 protein (Fragment) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC114207 // GenBank // Mus musculus pregnancy-specific glycoprotein 29, mRNA (cDNA clone MGC:107527 IMAGE:30083585), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000044724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:17088138:17447177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NR_002857 // RefSeq // Mus musculus pregnancy specific glycoprotein pseudogene 1 (Psg-ps1), non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M83348 // GenBank // Mouse pregnancy-specific glycoprotein processed pseudogene mRNA, complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:17672309:17681691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
NM_028480 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 (Ceacam5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000081907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:17713252:17761121:1 gene:ENSMUSG00000008789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:17714921:17793065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000081336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:17792574:17793065:1 gene:ENSMUSG00000063830 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000044723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:17714921:17793065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_025957 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 14 (Ceacam14), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006540304 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 14 (Ceacam14), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000023953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:17812633:17815663:1 gene:ENSMUSG00000023185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC099412 // GenBank // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 14, mRNA (cDNA clone MGC:117580 IMAGE:30787387), complete cds. // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:17812767:17815477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
XM_006540456 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5155 (Gm5155), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006540460 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5155 (Gm5155), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// ENSMUST00000072381 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:17871768:17919024:1 gene:ENSMUSG00000078793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000165490 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:17885980:17919024:1 gene:ENSMUSG00000078793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// AK146068 // GenBank HTC // Mus musculus 14 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530028D09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000044728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:17873450:17918798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1
NM_023289 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 11 (Ceacam11), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000094799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:17972124:17978556:1 gene:ENSMUSG00000030368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF221099 // GenBank // Mus musculus CEACAM11 mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC099452 // GenBank // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 11, mRNA (cDNA clone MGC:117645 IMAGE:30787372), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:17965013:17975670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_027210 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 13 (Ceacam13), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_028171 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 13 (Ceacam13), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:18009889:18013488:1 gene:ENSMUSG00000057195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:18009889:18019221:1 gene:ENSMUSG00000057195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC099430 // GenBank // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 13, mRNA (cDNA clone MGC:117613 IMAGE:30787167), complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:18010336:18013415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 33 // 9 // 10 // 0
NM_001162524 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12 (Ceacam12), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NM_026087 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12 (Ceacam12), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000032520 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:18065929:18071813:1 gene:ENSMUSG00000030366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000108483 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:18065991:18070427:1 gene:ENSMUSG00000030366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC099443 // GenBank // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mRNA (cDNA clone MGC:117634 IMAGE:30787251), complete cds. // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NM_001162523 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12 (Ceacam12), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSMUST00000108487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:18065929:18077986:1 gene:ENSMUSG00000030366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:18059365:18231292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001003393 // RefSeq // Mus musculus IGF-like family member 3 (Igfl3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000152973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:18176494:18181862:1 gene:ENSMUSG00000066756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY672115 // GenBank // Mus musculus insulin growth factor-like family member (Igfl) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147097 // GenBank // Mus musculus IGF-like family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:182244 IMAGE:9056138), complete cds. // chr7 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:18059365:18231292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_153749 // RefSeq // Mus musculus MHC I like leukocyte 1 (Mill1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:7:18245347:18266092:1 gene:ENSMUSG00000054005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB086265 // GenBank // Mus musculus Mill1 mRNA for MHC I - like leukocyte 1, complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC110547 // GenBank // Mus musculus MHC I like leukocyte 1, mRNA (cDNA clone MGC:129328 IMAGE:40047031), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC110548 // GenBank // Mus musculus MHC I like leukocyte 1, mRNA (cDNA clone MGC:129329 IMAGE:40047032), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006540014 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MHC I like leukocyte 1 (Mill1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:18245610:18326117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000083379 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:18549085:18549191:1 gene:ENSMUSG00000065313 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT060102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004152 // RefSeq // Mus musculus pregnancy-specific glycoprotein 22 (Psg22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000051973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:18718090:18727246:1 gene:ENSMUSG00000044903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000108481 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:18718090:18727248:1 gene:ENSMUSG00000044903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC050099 // GenBank // Mus musculus pregnancy-specific glycoprotein 22, mRNA (cDNA clone MGC:60788 IMAGE:30014305), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC080694 // GenBank // Mus musculus pregnancy-specific glycoprotein 22, mRNA (cDNA clone MGC:91102 IMAGE:30433272), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000015126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:18710377:18787928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_153760 // RefSeq // Mus musculus MHC I like leukocyte 2 (Mill2), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NM_153761 // RefSeq // Mus musculus MHC I like leukocyte 2 (Mill2), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006539934 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MHC I like leukocyte 2 (Mill2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000072386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:18839966:18858654:1 gene:ENSMUSG00000040987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000072415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:18839966:18858653:1 gene:ENSMUSG00000040987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AB086266 // GenBank // Mus musculus Mill2 mRNA for MHC I - like leukocyte 2 short form, complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AB086267 // GenBank // Mus musculus Mill2 mRNA for MHC I - like leukocyte 2 long form, complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC137748 // GenBank // Mus musculus MHC I like leukocyte 2, mRNA (cDNA clone MGC:169372 IMAGE:8860767), complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC144886 // GenBank // Mus musculus MHC I like leukocyte 2, mRNA (cDNA clone MGC:178442 IMAGE:9053434), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:18828811:18873001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_009402 // RefSeq // Mus musculus peptidoglycan recognition protein 1 (Pglyrp1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:18884690:18890438:1 gene:ENSMUSG00000030413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF076482 // GenBank // Mus musculus peptidoglycan recognition protein precursor (Pgrp) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF193843 // GenBank // Mus musculus TAG7-like protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC005582 // GenBank // Mus musculus peptidoglycan recognition protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:11430 IMAGE:3969014), complete cds. // chr7 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// CT010165 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A0650D for gene Pglyrp1, Peptidoglycan recognition protein 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:18884726:18890342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001029877 // RefSeq // Mus musculus neuro-oncological ventral antigen 2 (Nova2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// ENSMUST00000032571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:18925888:18965319:1 gene:ENSMUSG00000030411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// ENSMUST00000172835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:18925888:18962057:1 gene:ENSMUSG00000030411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000040821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:18935323:18963205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_194064 // RefSeq // Mus musculus nanos homolog 2 (Drosophila) (Nanos2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:18987524:18988962:1 gene:ENSMUSG00000051965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB095972 // GenBank // Mus musculus nos2 mRNA for Nanos2, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// JQ936992 // GenBank // Mus musculus strain kunbai NANOS2 (Nanos2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145579 // RefSeq // Mus musculus Myb-related transcription factor, partner of profilin (Mypop), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:18991245:19001764:1 gene:ENSMUSG00000048481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131087 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:18991319:19001766:1 gene:ENSMUSG00000048481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF364868 // GenBank // Mus musculus Myb protein P42POP mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC055832 // GenBank // Mus musculus Myb protein P42POP, mRNA (cDNA clone IMAGE:4481653), complete cds. // chr7 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000040863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:18992110:19001732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NM_178757 // RefSeq // Mus musculus interferon regulatory factor 2 binding protein 1 (Irf2bp1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:19004065:19006761:1 gene:ENSMUSG00000044030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK032010 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330544B13 product:similar to BRAIN MY039 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC019164 // GenBank // Mus musculus interferon regulatory factor 2 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:29437 IMAGE:3962494), complete cds. // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC036162 // GenBank // Mus musculus interferon regulatory factor 2 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:37487 IMAGE:4984359), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19004437:19006191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_026605 // RefSeq // Mus musculus symplekin (Sympk), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540332 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus symplekin (Sympk), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540333 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus symplekin (Sympk), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000023882 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:19024377:19054617:1 gene:ENSMUSG00000023118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:19024426:19051753:1 gene:ENSMUSG00000023118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AK172040 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830032D11 product:Symplekin (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC049852 // GenBank // Mus musculus symplekin, mRNA (cDNA clone MGC:54793 IMAGE:4163760), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540334 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus symplekin (Sympk), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000040859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19024577:19054517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_031255 // RefSeq // Mus musculus radial spoke head 6 homolog A (Chlamydomonas) (Rsph6a), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006540443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus radial spoke head 6 homolog A (Chlamydomonas) (Rsph6a), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000035521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:19054690:19074447:1 gene:ENSMUSG00000040866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF329192 // GenBank // Mus musculus radial spokehead-L protein (Rshl1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC137992 // GenBank // Mus musculus radial spokehead-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:169616 IMAGE:8861011), complete cds. // chr7 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// NM_001159671 // RefSeq // Mus musculus radial spoke head 6 homolog A (Chlamydomonas) (Rsph6a), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENSMUST00000076887 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:7:19054699:19074447:1 gene:ENSMUSG00000040866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// AF329191 // GenBank // Mus musculus radial spokehead-L protein (Rshl1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr7 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// GENSCAN00000040817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19054745:19074275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000108479 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:19076258:19082776:1 gene:ENSMUSG00000030410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000146429 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:19077993:19082775:1 gene:ENSMUSG00000030410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// AK086899 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030010C02 product:dystrophia myotonica linked gene, N9, full insert sequence. // chr7 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC031193 // GenBank // Mus musculus dystrophia myotonica-containing WD repeat motif, mRNA (cDNA clone MGC:37679 IMAGE:5054380), complete cds. // chr7 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// BC089027 // GenBank // Mus musculus dystrophia myotonica-containing WD repeat motif, mRNA (cDNA clone MGC:115779 IMAGE:30615314), complete cds. // chr7 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NM_010058 // RefSeq // Mus musculus dystrophia myotonica-containing WD repeat motif (Dmwd), mRNA. // chr7 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// ENSMUST00000032570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:19076249:19082776:1 gene:ENSMUSG00000030410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000040873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19076270:19081328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_011383 // RefSeq // Mus musculus sine oculis-related homeobox 5 (Six5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539694 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sine oculis-related homeobox 5 (Six5), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000049454 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:19094594:19098549:1 gene:ENSMUSG00000040841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19094637:19097745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_175530 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 46 (Fbxo46), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006539936 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box protein 46 (Fbxo46), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006539937 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box protein 46 (Fbxo46), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000053109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:19119859:19138261:1 gene:ENSMUSG00000050428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000165913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:19131693:19137812:1 gene:ENSMUSG00000050428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC049813 // GenBank // Mus musculus F-box protein 46, mRNA (cDNA clone MGC:59574 IMAGE:6507415), complete cds. // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC052088 // GenBank // Mus musculus F-box protein 46, mRNA (cDNA clone IMAGE:5689172). // chr7 // 82 // 42 // 9 // 11 // 0
NM_001162996 // RefSeq // Mus musculus echinoderm microtubule associated protein like 2 (Eml2), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_028153 // RefSeq // Mus musculus echinoderm microtubule associated protein like 2 (Eml2), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000048502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:7:19181204:19206479:1 gene:ENSMUSG00000040811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000117338 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:19176421:19206257:1 gene:ENSMUSG00000040811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000120595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:19181159:19206482:1 gene:ENSMUSG00000040811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000141718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:19181237:19186358:1 gene:ENSMUSG00000040811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000146095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:19181606:19186371:1 gene:ENSMUSG00000040811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000148246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:19181181:19206478:1 gene:ENSMUSG00000040811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC055476 // GenBank // Mus musculus echinoderm microtubule associated protein like 2, mRNA (cDNA clone MGC:65413 IMAGE:4218133), complete cds. // chr7 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000040824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19176614:19206211:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0
NR_029763 // RefSeq // Mus musculus microRNA 330 (Mir330), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083609 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:19181465:19181562:1 gene:ENSMUSG00000065543 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:19181332:19184922:1 gene:ENSMUSG00000040811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// mmu-mir-330 // miRBase Micro RNA Database // MI0000607 Mus musculus miR-330 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT060136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175668 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 4 (Gpr4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006540048 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 4 (Gpr4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000060225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:19212538:19224176:1 gene:ENSMUSG00000044317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC099398 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:117559 IMAGE:30713585), complete cds. // chr7 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_207525 // RefSeq // Mus musculus optic atrophy 3 (Opa3), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063976 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:19228334:19247868:1 gene:ENSMUSG00000052214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK170977 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630214G24 product:Optic atrophy 3 protein homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr7 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// BC094601 // GenBank // Mus musculus optic atrophy 3 (human), mRNA (cDNA clone MGC:106414 IMAGE:6404450), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC132309 // GenBank // Mus musculus optic atrophy 3 (human), mRNA (cDNA clone MGC:163940 IMAGE:40130586), complete cds. // chr7 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// BC132311 // GenBank // Mus musculus optic atrophy 3 (human), mRNA (cDNA clone MGC:163942 IMAGE:40130588), complete cds. // chr7 // 91 // 38 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000161711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:19228383:19256543:1 gene:ENSMUSG00000052214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000040822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19222155:19255840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
ENSMUST00000082646 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:19242130:19242289:1 gene:ENSMUSG00000064580 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONMMUT060138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_001025364 // RefSeq // Mus musculus reticulon 2 (Z-band associated protein) (Rtn2), transcript variant C, mRNA. // chr7 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// NM_013648 // RefSeq // Mus musculus reticulon 2 (Z-band associated protein) (Rtn2), transcript variant B, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000032559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:19282662:19296164:1 gene:ENSMUSG00000030401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000108468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:19291099:19296159:1 gene:ENSMUSG00000030401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// AF038538 // GenBank // Mus musculus brain NSP-like 1 (Nspl1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AF038539 // GenBank // Mus musculus muscle NSP-like 1 (Nspl1) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 66 // 24 // 25 // 0 /// BC031370 // GenBank // Mus musculus reticulon 2 (Z-band associated protein), mRNA (cDNA clone MGC:35990 IMAGE:5359358), complete cds. // chr7 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// AK165915 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730018P09 product:reticulon 2 (Z-band associated protein), full insert sequence. // chr7 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// GENSCAN00000040831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19282832:19295794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0
NM_001010836 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 13 like (Ppp1r13l), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:19361216:19378533:1 gene:ENSMUSG00000040734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY869711 // GenBank // Mus musculus NFkB interacting protein 1 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19368568:19378171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_007710 // RefSeq // Mus musculus creatine kinase, muscle (Ckm), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000003643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:19411094:19421583:1 gene:ENSMUSG00000030399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC132424 // GenBank // Mus musculus creatine kinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:164055 IMAGE:40130701), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC132426 // GenBank // Mus musculus creatine kinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:164057 IMAGE:40130703), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19414138:19421386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
XM_006544144 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus exocyst complex component 3-like 2 (Exoc3l2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000011407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:19489056:19496760:1 gene:ENSMUSG00000011263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137613 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:19489056:19496760:1 gene:ENSMUSG00000011263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// AK016842 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933417E01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 96 // 61 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19467591:19495248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 76 // 76 // 31 // 41 // 1
NM_027116 // RefSeq // Mus musculus NTPase, KAP family P-loop domain containing 1 (Nkpd1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:19518731:19525050:1 gene:ENSMUSG00000060621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC118925 // GenBank // Mus musculus NTPase, KAP family P-loop domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:141635 IMAGE:40088590), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19512769:19524775:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_022409 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 296 (Zfp296), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006540270 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 296 (Zfp296), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 85 // 45 // 11 // 13 // 0 /// XM_006540271 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 296 (Zfp296), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108453 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:7:19577287:19580656:1 gene:ENSMUSG00000011267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF450095 // GenBank // Mus musculus hepatocellular carcinoma-associated antigen MHCA108 mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC099454 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 296, mRNA (cDNA clone MGC:117647 IMAGE:30936046), complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19577382:19580559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0
BC038887 // GenBank // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 40 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:3326417). // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000094754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:19953783:19954583:1 gene:ENSMUSG00000070778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000010780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19953783:20099955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_027839 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20 (Ceacam20), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006540360 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20 (Ceacam20), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000094753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:19965412:19991113:1 gene:ENSMUSG00000070777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC049361 // GenBank // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, mRNA (cDNA clone MGC:57056 IMAGE:6476373), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19953783:20099955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_194058 // RefSeq // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 9B (Nlrp9b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000073151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:20008023:20062940:1 gene:ENSMUSG00000060508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000117909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:20019172:20073306:1 gene:ENSMUSG00000060508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 86 // 70 // 18 // 21 // 0 /// ENSMUST00000137183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:20008023:20023563:1 gene:ENSMUSG00000060508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AY360471 // GenBank // Mus musculus NALP9b mRNA, complete cds. // chr7 // 86 // 70 // 18 // 21 // 0 /// AY596196 // GenBank // Mus musculus NALP-delta (Nalp-delta) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC141249 // GenBank // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 9B, mRNA (cDNA clone MGC:176210 IMAGE:9055861), complete cds. // chr7 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:19953783:20099955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0
NM_001004194 // RefSeq // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 4E (Nlrp4e), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000076470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:23301275:23361922:1 gene:ENSMUSG00000045693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// AY596197 // GenBank // Mus musculus NALP-epsilon (Nalp-epsilon) mRNA, complete cds. // chr7 // 88 // 67 // 7 // 8 // 0 /// BC139319 // GenBank // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 4E, mRNA (cDNA clone MGC:170946 IMAGE:8862341), complete cds. // chr7 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC139320 // GenBank // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 4E, mRNA (cDNA clone MGC:170947 IMAGE:8862342), complete cds. // chr7 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:23301282:23358069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001166842 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 168 (Vmn1r168), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_206872 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 177 (Vmn1r177), mRNA. // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073967 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:23865520:23866449:-1 gene:ENSMUSG00000057513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:23540720:23541649:1 gene:ENSMUSG00000074291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:23486375:23487297:-1 gene:ENSMUSG00000092496 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT060204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001166722 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 170 (Vmn1r170), mRNA. // chr7 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000170166 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:23606175:23607089:1 gene:ENSMUSG00000094187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
NM_030737 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 171 (Vmn1r171), mRNA. // chr7 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000078458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:23631988:23633568:1 gene:ENSMUSG00000062483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// AF324871 // GenBank // Mus musculus pheromone receptor V3R7 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC111911 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D7, mRNA (cDNA clone MGC:130504 IMAGE:40046770), complete cds. // chr7 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0
NM_030735 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 172 (Vmn1r172), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000038694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:23658316:23660663:1 gene:ENSMUSG00000035523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000173101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:23658421:23660661:1 gene:ENSMUSG00000035523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// AF324873 // GenBank // Mus musculus pheromone receptor V3R9 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC139316 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D9, mRNA (cDNA clone MGC:170943 IMAGE:8862338), complete cds. // chr7 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BC139317 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D9, mRNA (cDNA clone MGC:170944 IMAGE:8862339), complete cds. // chr7 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BC145601 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D9, mRNA (cDNA clone MGC:179175 IMAGE:9054167), complete cds. // chr7 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
NM_207548 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 174 (Vmn1r174), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000167551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:23753911:23754852:1 gene:ENSMUSG00000090411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_206868 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 178 (Vmn1r178), mRNA. // chr7 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000078593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:23893529:23894443:1 gene:ENSMUSG00000062598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000038072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:23893529:23894443:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_206869 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 180 (Vmn1r180), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:23952387:23953356:1 gene:ENSMUSG00000092473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150717 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D16, mRNA (cDNA clone MGC:183628 IMAGE:9087628), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207546 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 181 (Vmn1r181), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000181796 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:23984065:23985048:1 gene:ENSMUSG00000097425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC120650 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D20, mRNA (cDNA clone MGC:155887 IMAGE:40129573), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_207618 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D18 (V1rd18), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_207619 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D19 (V1rd19), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:24003091:24004247:1 gene:ENSMUSG00000092456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107173 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D18, mRNA (cDNA clone MGC:130061 IMAGE:40050592), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC107174 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D18, mRNA (cDNA clone MGC:130062 IMAGE:40050594), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC147785 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D19, mRNA (cDNA clone MGC:182890 IMAGE:9087504), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147787 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D19, mRNA (cDNA clone MGC:182892 IMAGE:9087506), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_203489 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 183 (Vmn1r183), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000086012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:24054774:24055691:1 gene:ENSMUSG00000066723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC130237 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, D15, mRNA (cDNA clone MGC:161285 IMAGE:40142092), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001045486 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 180 (Zfp180), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001289634 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 180 (Zfp180), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001289640 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 180 (Zfp180), transcript variant 4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001289641 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 180 (Zfp180), transcript variant 5, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NM_172483 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 180 (Zfp180), transcript variant 6, mRNA. // chr7 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000068975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24081924:24107698:1 gene:ENSMUSG00000057101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC063741 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 180, mRNA (cDNA clone MGC:59409 IMAGE:6504558), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC066115 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 180, mRNA (cDNA clone MGC:90055 IMAGE:30619470), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC085472 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 180, mRNA (cDNA clone MGC:101916 IMAGE:6417473), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001289637 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 180 (Zfp180), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// GENSCAN00000016604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24073834:24269385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_021307 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 112 (Zfp112), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006540239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 112 (Zfp112), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000005413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:24112324:24127493:1 gene:ENSMUSG00000052675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000120006 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:24112314:24127952:1 gene:ENSMUSG00000052675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AF167319 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein ZFP112 mRNA, complete cds. // chr7 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0 /// BC120886 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 112, mRNA (cDNA clone MGC:141404 IMAGE:40060889), complete cds. // chr7 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000016604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24073834:24269385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_019941 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 235 (Zfp235), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000056549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24134174:24142266:1 gene:ENSMUSG00000047603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// AF167321 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein ZFP235 mRNA, complete cds. // chr7 // 86 // 91 // 18 // 21 // 0 /// AK147833 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270062A18 product:zinc finger protein 235, full insert sequence. // chr7 // 92 // 57 // 12 // 13 // 0 /// BC099965 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 235, mRNA (cDNA clone MGC:107482 IMAGE:30084081), complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24073834:24269385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_001029933 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 114 (Zfp114), mRNA. // chr7 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// BC138311 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 114, mRNA (cDNA clone MGC:169936 IMAGE:8861331), complete cds. // chr7 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// BC138312 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 114, mRNA (cDNA clone MGC:169937 IMAGE:8861332), complete cds. // chr7 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
NM_018791 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 108 (Zfp108), mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// AF167315 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein ZFP108 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC100339 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 108, mRNA (cDNA clone MGC:117658 IMAGE:30939834), complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
NM_009567 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 93 (Zfp93), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000032696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:24271568:24276827:1 gene:ENSMUSG00000055305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000108438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:24270420:24276817:1 gene:ENSMUSG00000055305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC003776 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 93, mRNA (cDNA clone MGC:5985 IMAGE:3496816), complete cds. // chr7 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// BC061487 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 93, mRNA (cDNA clone MGC:70223 IMAGE:5349153), complete cds. // chr7 // 88 // 62 // 7 // 8 // 0 /// U46186 // GenBank // Mus musculus KRAB-containing zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr7 // 75 // 92 // 9 // 12 // 0
NM_029806 // RefSeq // Mus musculus Ly6/Plaur domain containing 5 (Lypd5), mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24349224:24353833:1 gene:ENSMUSG00000030484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC107186 // GenBank // Mus musculus Ly6/Plaur domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:130077 IMAGE:40050796), complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC107187 // GenBank // Mus musculus Ly6/Plaur domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:130078 IMAGE:40050800), complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC119485 // GenBank // Mus musculus Ly6/Plaur domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:141070 IMAGE:40050803), complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC119486 // GenBank // Mus musculus Ly6/Plaur domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:141071 IMAGE:40050804), complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24349245:24353690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001163510 // RefSeq // Mus musculus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 4 (Kcnn4), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_008433 // RefSeq // Mus musculus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 4 (Kcnn4), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000171904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24370263:24385209:1 gene:ENSMUSG00000054342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF042487 // GenBank // Mus musculus intermediate conductance potassium channel mIK1 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF072884 // GenBank // Mus musculus intermediate conductance calcium-activated potassium channel mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC010274 // GenBank // Mus musculus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:8131 IMAGE:3589411), complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// AB128930 // GenBank // Mus musculus KCNN4 mRNA for small conductance calcium activated potassium channel type4 transcript variant 2, complete cds. // chr7 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000016622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24370437:24422378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NM_028047 // RefSeq // Mus musculus smg-9 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) (Smg9), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006540377 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus smg-9 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) (Smg9), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000002280 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:24399619:24422778:1 gene:ENSMUSG00000002210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:24399921:24407563:1 gene:ENSMUSG00000002210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000148288 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:24414733:24420930:1 gene:ENSMUSG00000002210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC034211 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1500002O20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:37579 IMAGE:4988361), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000146381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:24399619:24408273:1 gene:ENSMUSG00000002210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// AK161454 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931429A13 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr7 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000016622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24370437:24422378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
BC010309 // GenBank // Mus musculus plasminogen activator, urokinase receptor, mRNA (cDNA clone IMAGE:3158012). // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_011113 // RefSeq // Mus musculus plasminogen activator, urokinase receptor (Plaur), mRNA. // chr7 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// XM_006539639 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus plasminogen activator, urokinase receptor (Plaur), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000002284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24462500:24475873:1 gene:ENSMUSG00000046223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// AK002580 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610012B22 product:urokinase plasminogen activator receptor, full insert sequence. // chr7 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// X62700 // GenBank // M.musculus muPAR1 mRNA. // chr7 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000016629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24443750:24475471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
NM_153112 // RefSeq // Mus musculus cell adhesion molecule 4 (Cadm4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068023 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:24482023:24504539:1 gene:ENSMUSG00000054793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY059394 // GenBank // Mus musculus membrane glycoprotein (Tsll2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24482099:24503621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_153134 // RefSeq // Mus musculus immunity-related GTPase family, Q (Irgq), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24530648:24538599:1 gene:ENSMUSG00000041037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056347 // GenBank // Mus musculus immunity-related GTPase family, Q, mRNA (cDNA clone MGC:73929 IMAGE:5705226), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC080294 // GenBank // Mus musculus immunity-related GTPase family, Q, mRNA (cDNA clone MGC:90588 IMAGE:6856174), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24526826:24534487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_009532 // RefSeq // Mus musculus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 1 (Xrcc1), mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// XM_006539738 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 1 (Xrcc1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000063249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24547150:24573438:1 gene:ENSMUSG00000051768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC055900 // GenBank // Mus musculus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 1, mRNA (cDNA clone MGC:68247 IMAGE:4207343), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC085281 // GenBank // Mus musculus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 1, mRNA (cDNA clone MGC:102556 IMAGE:30472386), complete cds. // chr7 // 85 // 100 // 34 // 40 // 0 /// U02887 // GenBank // Mus musculus DNA repair protein (XRCC1) mRNA, complete cds. // chr7 // 91 // 85 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24547309:24573338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0
NM_023154 // RefSeq // Mus musculus ethylmalonic encephalopathy 1 (Ethe1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000077191 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:24587543:24608925:1 gene:ENSMUSG00000064254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB049623 // GenBank // Mus musculus HSCO mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC010592 // GenBank // Mus musculus ethylmalonic encephalopathy 1, mRNA (cDNA clone MGC:7046 IMAGE:3156338), complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC083162 // GenBank // Mus musculus ethylmalonic encephalopathy 1, mRNA (cDNA clone MGC:102424 IMAGE:6529658), complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC094044 // GenBank // Mus musculus ethylmalonic encephalopathy 1, mRNA (cDNA clone MGC:102616 IMAGE:5064931), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24593931:24640601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001102613 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology-like domain, family B, member 3 (Phldb3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000073325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24611328:24629288:1 gene:ENSMUSG00000074277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24593931:24640601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001102613 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology-like domain, family B, member 3 (Phldb3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000073325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24611328:24629288:1 gene:ENSMUSG00000074277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC052555 // GenBank HTC // Mus musculus similar to pleckstrin homology-like domain, family B, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5256323). // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24593931:24640601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_001102613 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology-like domain, family B, member 3 (Phldb3), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24611328:24629288:1 gene:ENSMUSG00000074277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24593931:24640601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_133743 // RefSeq // Mus musculus Ly6/Plaur domain containing 3 (Lypd3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24636570:24641116:1 gene:ENSMUSG00000057454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC016549 // GenBank // Mus musculus Ly6/Plaur domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:27935 IMAGE:3585545), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094282 // GenBank // Mus musculus Ly6/Plaur domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:106332 IMAGE:5029753), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24593931:24640601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_006539844 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC049730 (BC049730), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006539848 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC049730 (BC049730), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000051714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24709259:24714533:1 gene:ENSMUSG00000045587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049730 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC049730, mRNA (cDNA clone MGC:58740 IMAGE:6770790), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24688785:24713794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_007675 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 10 (Ceacam10), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006539994 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 10 (Ceacam10), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000038069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24777204:24784649:1 gene:ENSMUSG00000054169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC003346 // GenBank // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 10, mRNA (cDNA clone MGC:6052 IMAGE:3481822), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// L38422 // GenBank // Mus musculus (clone lambda Cea10a) carcinoembryonic antigen (Cea10) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24777276:24784476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
NR_045096 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5893 (Gm5893), non-coding RNA. // chr7 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000135286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:24818795:24840275:1 gene:ENSMUSG00000011350 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000164057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:24818795:24840258:1 gene:ENSMUSG00000011350 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24806496:24840254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0
NM_027732 // RefSeq // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor like family C2 (Dmrtc2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006540357 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor like family C2 (Dmrtc2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006540358 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor like family C2 (Dmrtc2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006540359 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor like family C2 (Dmrtc2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000011493 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:24870057:24877651:1 gene:ENSMUSG00000011349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF542046 // GenBank // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor 7 (Dmrt7) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC100434 // GenBank // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor like family C2, mRNA (cDNA clone MGC:118245 IMAGE:30918218), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138203 // GenBank // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor like family C2, mRNA (cDNA clone MGC:169827 IMAGE:8861222), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC145988 // GenBank // Mus musculus doublesex and mab-3 related transcription factor like family C2, mRNA (cDNA clone MGC:175875 IMAGE:40131291), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24872244:24889767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_023133 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein S19 (Rps19), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000108429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:24884714:24889806:1 gene:ENSMUSG00000040952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000153451 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:24884651:24888950:1 gene:ENSMUSG00000040952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_007655 // RefSeq // Mus musculus CD79A antigen (immunoglobulin-associated alpha) (Cd79a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000003469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:24897381:24902197:1 gene:ENSMUSG00000003379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC027633 // GenBank // Mus musculus CD79A antigen (immunoglobulin-associated alpha), mRNA (cDNA clone MGC:41188 IMAGE:1332396), complete cds. // chr7 // 89 // 69 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000016619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:24898006:24901544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_001168506 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 574 (Zfp574), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_175477 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 574 (Zfp574), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539850 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 574 (Zfp574), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006539851 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 574 (Zfp574), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539852 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 574 (Zfp574), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000053410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:25077246:25083492:1 gene:ENSMUSG00000045252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:25077205:25083492:1 gene:ENSMUSG00000045252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC059044 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 574, mRNA (cDNA clone MGC:69814 IMAGE:6816316), complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:25076906:25082257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NR_045847 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D930028M14 gene (D930028M14Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NR_045848 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D930028M14 gene (D930028M14Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000098678 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:25152457:25156627:1 gene:ENSMUSG00000074274 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000186424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25155069:25156219:1 gene:ENSMUSG00000074274 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT060264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_175436 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 526 (Zfp526), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539714 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 526 (Zfp526), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000055604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:25221451:25227507:1 gene:ENSMUSG00000046541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK051798 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130095E08 product:weakly similar to DNA-BINDING PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC096589 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 526, mRNA (cDNA clone MGC:106217 IMAGE:5341568), complete cds. // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AK173308 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1951 protein. // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000018781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:25224327:25226345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NR_046001 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9130221H12 gene (9130221H12Rik), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000169914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:25228687:25230257:1 gene:ENSMUSG00000090330 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK173308 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1951 protein. // chr7 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC022632 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130221H12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:31211 IMAGE:4207058), complete cds. // chr7 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000190693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25228723:25230263:1 gene:ENSMUSG00000090330 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT060266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
NM_001110131 // RefSeq // Mus musculus capicua homolog (Drosophila) (Cic), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NM_001110132 // RefSeq // Mus musculus capicua homolog (Drosophila) (Cic), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NM_027882 // RefSeq // Mus musculus capicua homolog (Drosophila) (Cic), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006540367 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus capicua homolog (Drosophila) (Cic), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000005578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:25282179:25294148:1 gene:ENSMUSG00000005442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000163320 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:25282179:25294145:1 gene:ENSMUSG00000005442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000165239 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25282810:25291342:1 gene:ENSMUSG00000005442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000167379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25285823:25294142:1 gene:ENSMUSG00000005442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000169266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25267704:25294159:1 gene:ENSMUSG00000005442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AF363690 // GenBank // Mus musculus capicua protein (Cic) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000018782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:25260224:25294141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0
NM_001081294 // RefSeq // Mus musculus proline rich 19 (Prr19), mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006540262 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline rich 19 (Prr19), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000080288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:25301359:25304133:1 gene:ENSMUSG00000058741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC147639 // GenBank // Mus musculus proline rich 19, mRNA (cDNA clone MGC:182735 IMAGE:9056629), complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC147641 // GenBank // Mus musculus proline rich 19, mRNA (cDNA clone MGC:182737 IMAGE:9056631), complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC147701 // GenBank // Mus musculus proline rich 19, mRNA (cDNA clone MGC:182846 IMAGE:9087460), complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC147708 // GenBank // Mus musculus proline rich 19, mRNA (cDNA clone MGC:182853 IMAGE:9087467), complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:25301083:25303837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_183311 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 145 (Tmem145), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000108409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:25306108:25316195:1 gene:ENSMUSG00000043843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000119703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25306108:25316182:1 gene:ENSMUSG00000043843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000140016 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25306106:25308826:1 gene:ENSMUSG00000043843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 89 // 62 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000018760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:25306164:25315645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_001160400 // RefSeq // Mus musculus multiple EGF-like-domains 8 (Megf8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000128119 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:7:25317164:25365917:1 gene:ENSMUSG00000045039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000153077 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25345981:25365914:1 gene:ENSMUSG00000045039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// BC051121 // GenBank // Mus musculus multiple EGF-like-domains 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:5397329), partial cds. // chr7 // 85 // 38 // 11 // 13 // 0 /// EU723517 // GenBank // Mus musculus strain C3H/HeJ multiple EGF-domain-containing 8 (Megf8) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XR_391069 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus multiple EGF-like-domains 8 (Megf8), transcript variant X1, misc_RNA. // chr7 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// GENSCAN00000018786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:25317507:25364590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NR_073028 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4732471J01 gene (4732471J01Rik), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000066316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:25384805:25385573:1 gene:ENSMUSG00000053714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT060276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001290487 // RefSeq // Mus musculus ATP5S-like (Atp5sl), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_025504 // RefSeq // Mus musculus ATP5S-like (Atp5sl), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000077338 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:25619414:25625551:1 gene:ENSMUSG00000057229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000085953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:25619493:25625548:1 gene:ENSMUSG00000057229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25620895:25624082:1 gene:ENSMUSG00000057229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// BC024867 // GenBank // Mus musculus ATP5S-like, mRNA (cDNA clone MGC:35750 IMAGE:4951552), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000130897 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25620537:25622406:1 gene:ENSMUSG00000057229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000018764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:25619443:25629316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONMMUT060289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_146184 // RefSeq // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 8 (B3gnt8), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001036740 // RefSeq // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 8 (B3gnt8), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000076034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:25627624:25629490:1 gene:ENSMUSG00000059479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// BC025206 // GenBank // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 8, mRNA (cDNA clone MGC:32391 IMAGE:5037295), complete cds. // chr7 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// GENSCAN00000018764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:25619443:25629316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_138586 // RefSeq // Mus musculus exosome component 5 (Exosc5), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NR_104358 // RefSeq // Mus musculus exosome component 5 (Exosc5), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000079634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:25659153:25668031:1 gene:ENSMUSG00000061286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK137780 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130007C08 product:exosome component 5, full insert sequence. // chr7 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BC034358 // GenBank // Mus musculus exosome component 5, mRNA (cDNA clone MGC:27748 IMAGE:2651418), complete cds. // chr7 // 83 // 89 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:25642936:25670611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_172148 // RefSeq // Mus musculus B9 protein domain 2 (B9d2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539854 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B9 protein domain 2 (B9d2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000108403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:25681158:25686558:1 gene:ENSMUSG00000063439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141500 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530042N01 product:hypothetical B9/C2 calcium/lipid-binding domain, CaLB containing protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC028440 // GenBank // Mus musculus B9 protein domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:41256 IMAGE:1265537), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:25681387:25686294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_011577 // RefSeq // Mus musculus transforming growth factor, beta 1 (Tgfb1), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000002678 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:25687002:25705077:1 gene:ENSMUSG00000002603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000171757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25692418:25697174:1 gene:ENSMUSG00000002603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// BC013738 // GenBank // Mus musculus transforming growth factor, beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:5747 IMAGE:3586216), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// M13177 // GenBank // Mouse transforming growth factor beta mRNA (TGF-beta), complete cds. // chr7 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000169009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25688927:25697213:1 gene:ENSMUSG00000002603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// GENSCAN00000018770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:25687869:25704942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000175258 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:25868945:25869051:1 gene:ENSMUSG00000092999 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT060309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_009999 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 10 (Cyp2b10), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000005477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:25897676:25926559:1 gene:ENSMUSG00000030483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000072438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:25897620:25926624:1 gene:ENSMUSG00000030483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF128849 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 2B10 related protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC060973 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 10, mRNA (cDNA clone MGC:74066 IMAGE:30301385), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// X99715 // GenBank // M.musculus mRNA for hybrid form of cytochrome P450 2B10 and NADPH cytochrome P450 oxidoreductase. // chr7 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// M21856 // GenBank // Mouse testosterone 16-alpha-hydroxylase mRNA, complete cds, clone pf3/46. // chr7 // 71 // 100 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:25903511:26021260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_007813 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 13 (Cyp2b13), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000005669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:26061495:26096196:1 gene:ENSMUSG00000040583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC145895 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 13, mRNA (cDNA clone MGC:175782 IMAGE:40131198), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000048673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:26077283:26095821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_010000 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 9 (Cyp2b9), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000082214 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:26173411:26210661:1 gene:ENSMUSG00000040660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC120525 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 9, mRNA (cDNA clone MGC:155762 IMAGE:40129448), complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC120527 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 9, mRNA (cDNA clone MGC:155764 IMAGE:40129450), complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// M21855 // GenBank // Mouse testosterone 16-alpha-hydroxylase mRNA, complete cds, clone pf26. // chr7 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:26173434:26247897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
ENSMUST00000180343 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:26531184:26531293:1 gene:ENSMUSG00000094866 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT060317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001048219 // RefSeq // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 9A (Nlrp9a), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_001048220 // RefSeq // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 9A (Nlrp9a), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000071780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:26535065:26574144:1 gene:ENSMUSG00000054102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000108387 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:26535023:26574140:1 gene:ENSMUSG00000054102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000117252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:26550812:26575615:1 gene:ENSMUSG00000054102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// ENSMUST00000122040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:26550812:26573953:1 gene:ENSMUSG00000054102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000153452 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:26535066:26568003:1 gene:ENSMUSG00000054102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AY364009 // GenBank // Mus musculus NALP9A mRNA, complete cds. // chr7 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// AY596202 // GenBank // Mus musculus NALP-theta (Nalp-theta) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000048666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:26430445:26611814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0
NM_007814 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 19 (Cyp2b19), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006539512 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 19 (Cyp2b19), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_006539514 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 19 (Cyp2b19), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000077855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:26757163:26772630:1 gene:ENSMUSG00000066704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF047529 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 CYP2B19 (Cyp2b19) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC137965 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 19, mRNA (cDNA clone MGC:169589 IMAGE:8860984), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC137966 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 19, mRNA (cDNA clone MGC:169590 IMAGE:8860985), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000132315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:26757163:26765634:1 gene:ENSMUSG00000066704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// AK029227 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4831430P04 product:cytochrome P450, 2b19, full insert sequence. // chr7 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000048671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:26738448:26771414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_013809 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily g, polypeptide 1 (Cyp2g1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000040944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:26808927:26821197:1 gene:ENSMUSG00000049685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC058222 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily g, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:65254 IMAGE:6306453), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// L81171 // GenBank // Mus musculus olfactory-specific steroid hydroxylase (Cyp2g1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:26808927:26820829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0
NM_133657 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily a, polypeptide 12 (Cyp2a12), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000075552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:27029090:27036807:1 gene:ENSMUSG00000060407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC018356 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily a, polypeptide 12, mRNA (cDNA clone MGC:25859 IMAGE:4195640), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC094017 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily a, polypeptide 12, mRNA (cDNA clone MGC:102371 IMAGE:5101743), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// L06463 // GenBank // Mus musculus steroid cytochrome p450 7-alpha hydroxylase mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000024748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:27029106:27036646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
NM_007817 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily f, polypeptide 2 (Cyp2f2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000003100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:27119909:27133660:1 gene:ENSMUSG00000052974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000133841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:27119961:27125357:1 gene:ENSMUSG00000052974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC011089 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily f, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:11546 IMAGE:3968809), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024742 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily f, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:29973 IMAGE:5123751), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M77497 // GenBank // Mus musculus cytochrome P-450 naphthalene hydroxylase mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:27110856:27133397:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001100184 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily t, polypeptide 4 (Cyp2t4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000108385 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:27155114:27158668:1 gene:ENSMUSG00000078787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000164093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:27153714:27158564:1 gene:ENSMUSG00000078787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:27155121:27158564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001243888 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC024978 (BC024978), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NM_001290511 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC024978 (BC024978), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// NM_001290513 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC024978 (BC024978), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006540160 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC024978 (BC024978), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108379 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:27195781:27205386:1 gene:ENSMUSG00000078786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000155931 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:27197123:27204161:1 gene:ENSMUSG00000078786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000179391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:27195781:27204320:1 gene:ENSMUSG00000078786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000123108 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:27202632:27204320:1 gene:ENSMUSG00000078786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000024745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:27200445:27204093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_001290525 // RefSeq // Mus musculus biliverdin reductase B (flavin reductase (NADPH)) (Blvrb), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NM_144923 // RefSeq // Mus musculus biliverdin reductase B (flavin reductase (NADPH)) (Blvrb), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000037399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:27447978:27466144:1 gene:ENSMUSG00000040466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108357 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:27452418:27465984:1 gene:ENSMUSG00000040466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000108358 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:27448032:27465998:1 gene:ENSMUSG00000040466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000133750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:27448054:27459763:1 gene:ENSMUSG00000040466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000153644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:27452444:27462695:1 gene:ENSMUSG00000040466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// BC006617 // GenBank // Mus musculus biliverdin reductase B (flavin reductase (NADPH)), mRNA (cDNA clone MGC:11726 IMAGE:3967600), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC027279 // GenBank // Mus musculus biliverdin reductase B (flavin reductase (NADPH)), mRNA (cDNA clone MGC:27866 IMAGE:3492861), complete cds. // chr7 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:27458937:27465877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_133210 // RefSeq // Mus musculus SERTA domain containing 3 (Sertad3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:27473768:27477359:1 gene:ENSMUSG00000055200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF317202 // GenBank // Mus musculus replication protein-binding trans-activator (RBT1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK134829 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330584I12 product:SERTA domain containing 3, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034886 // GenBank // Mus musculus SERTA domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:41372 IMAGE:1364881), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:27476143:27476736:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_018820 // RefSeq // Mus musculus SERTA domain containing 1 (Sertad1), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540217 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SERTA domain containing 1 (Sertad1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000008528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:27486910:27490316:1 gene:ENSMUSG00000008384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF218291 // GenBank // Mus musculus p34SEI-1 (Sei1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AF366401 // GenBank // Mus musculus TRIP-Br1 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016077 // GenBank // Mus musculus SERTA domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:27573 IMAGE:4486318), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:27478630:27519834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_019412 // RefSeq // Mus musculus periaxin (Prx), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_198048 // RefSeq // Mus musculus periaxin (Prx), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// XM_006539665 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus periaxin (Prx), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000065487 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:27507806:27520041:1 gene:ENSMUSG00000053198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000098644 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:27499324:27520214:1 gene:ENSMUSG00000053198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000108355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:27499324:27520214:1 gene:ENSMUSG00000053198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:27507801:27520034:1 gene:ENSMUSG00000053198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AJ222969 // GenBank // Mus musculus mRNA for S-periaxin. // chr7 // 90 // 91 // 27 // 30 // 0 /// BC068135 // GenBank // Mus musculus periaxin, mRNA (cDNA clone MGC:92965 IMAGE:30354483), complete cds. // chr7 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000024738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:27478630:27519834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000037134 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:27527059:27531170:1 gene:ENSMUSG00000040424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC147572 // GenBank // Mus musculus homeodomain interacting protein kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:182668 IMAGE:9056562), complete cds. // chr7 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// BC147577 // GenBank // Mus musculus homeodomain interacting protein kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:182673 IMAGE:9056567), complete cds. // chr7 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NM_001033315 // RefSeq // Mus musculus homeodomain interacting protein kinase 4 (Hipk4), mRNA. // chr7 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// ENSMUST00000108353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:27523267:27531175:1 gene:ENSMUSG00000040424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// AB354583 // GenBank // Mus musculus HIPK4 mRNA for homeodomain-interacting protein kinase 4, complete cds. // chr7 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// GENSCAN00000024740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:27523517:27530867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_028417 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 9B (Ttc9b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000008088 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:27653915:27656208:1 gene:ENSMUSG00000007944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089566 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 9B, mRNA (cDNA clone MGC:107339 IMAGE:6531894), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:27653927:27656026:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK038864 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230069I23 product:similar to CDNA FLJ30373 FIS, CLONE BRACE2007882, WEAKLY SIMILAR TO ACTIN-DEPOLYMERIZING PROTEIN N-WASP [Homo sapiens], full insert sequence. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001112731 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C030039L03 gene (C030039L03Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// NM_198417 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C030039L03 gene (C030039L03Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000120004 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:27689340:27706484:1 gene:ENSMUSG00000057093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// BC060708 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C030039L03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67156 IMAGE:6406744), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_009560 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 60 (Zfp60), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_029531 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 60 (Zfp60), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000042641 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:27731511:27750461:1 gene:ENSMUSG00000037640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000108336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:27731389:27753702:1 gene:ENSMUSG00000037640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000167955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:27736956:27750023:1 gene:ENSMUSG00000037640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// BC031754 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 60, mRNA (cDNA clone MGC:18742 IMAGE:3992720), complete cds. // chr7 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000126884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:27731411:27742325:1 gene:ENSMUSG00000037640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// AK044869 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130009B07 product:zinc finger protein 60, full insert sequence. // chr7 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// ENSMUST00000136373 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:27731443:27748546:1 gene:ENSMUSG00000037640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// NONMMUT060381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
ENSMUST00000108336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:27731389:27753702:1 gene:ENSMUSG00000037640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK018216 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330516O17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094367 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 60, mRNA (cDNA clone IMAGE:6840573). // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_387723 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 626 (Zfp626), transcript variant X2, misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000080175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:27810813:27818669:1 gene:ENSMUSG00000030604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// AK016934 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933426I21 product:similar to MSZF70 (FRAGMENT) [Mus musculus], full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC024577 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933426I21 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5059613), complete cds. // chr7 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
NM_001024726 // RefSeq // Mus musculus zinc finger proten 607 (Zfp607), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC141161 // GenBank // Mus musculus zinc finger proten 607, mRNA (cDNA clone MGC:176122 IMAGE:9055773), complete cds. // chr7 // 92 // 93 // 12 // 13 // 0 /// XM_006540210 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger proten 607 (Zfp607), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// XR_391086 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger proten 607 (Zfp607), transcript variant X6, misc_RNA. // chr7 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
ENSMUST00000082859 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:28123254:28123359:1 gene:ENSMUSG00000064793 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT060434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_007991 // RefSeq // Mus musculus fibrillarin (Fbl), mRNA. // chr7 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000042405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:28169748:28179269:1 gene:ENSMUSG00000046865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// BC092274 // GenBank // Mus musculus fibrillarin, mRNA (cDNA clone MGC:102608 IMAGE:4196645), complete cds. // chr7 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
NM_198425 // RefSeq // Mus musculus EP300 interacting inhibitor of differentiation 2 (Eid2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:28267881:28269272:1 gene:ENSMUSG00000046058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY251273 // GenBank // Mus musculus EID2 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC094513 // GenBank // Mus musculus EP300 interacting inhibitor of differentiation 2, mRNA (cDNA clone MGC:106065 IMAGE:2648407), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:28268096:28268665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_001177427 // RefSeq // Mus musculus EP300 interacting inhibitor of differentiation 2B (Eid2b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:28277706:28280129:1 gene:ENSMUSG00000070705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039192 // RefSeq // Mus musculus glia maturation factor, gamma (Gmfg), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// NM_001290550 // RefSeq // Mus musculus glia maturation factor, gamma (Gmfg), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// NM_022024 // RefSeq // Mus musculus glia maturation factor, gamma (Gmfg), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000138741 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:28443107:28448233:1 gene:ENSMUSG00000060791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// AK152486 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830075M09 product:glia maturation factor, gamma, full insert sequence. // chr7 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_177396 // RefSeq // Mus musculus interferon lambda 3 (Ifnl3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000078364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:28522836:28524322:1 gene:ENSMUSG00000060747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY184375 // GenBank // Mus musculus interferon-lambda mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY869695 // GenBank // Mus musculus interferon-lambda2 (Ifnl2) mRNA, complete cds. // chr7 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// AY869696 // GenBank // Mus musculus interferon-lambda3 (Ifnl3) mRNA, complete cds. // chr7 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// GENSCAN00000009276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:28522717:28524322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_026716 // RefSeq // Mus musculus syncollin (Sycn), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:28540885:28542210:1 gene:ENSMUSG00000084174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC019567 // GenBank // Mus musculus syncollin, mRNA (cDNA clone MGC:28565 IMAGE:4208065), complete cds. // chr7 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:28540910:28541308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_023637 // RefSeq // Mus musculus seryl-aminoacyl-tRNA synthetase 2 (Sars2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006540374 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus seryl-aminoacyl-tRNA synthetase 2 (Sars2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006540375 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus seryl-aminoacyl-tRNA synthetase 2 (Sars2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// XM_006540376 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus seryl-aminoacyl-tRNA synthetase 2 (Sars2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000094632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:28741968:28753879:1 gene:ENSMUSG00000070699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB029949 // GenBank // Mus musculus SerRSmt mRNA for mitochondrial seryl-tRNA synthetase, complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC079664 // GenBank // Mus musculus seryl-aminoacyl-tRNA synthetase 2, mRNA (cDNA clone MGC:90649 IMAGE:30357834), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:28742016:28753574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_177158 // RefSeq // Mus musculus Ras and Rab interactor-like (Rinl), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000059857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:28788969:28798963:1 gene:ENSMUSG00000051735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC044878 // GenBank // Mus musculus Ras and Rab interactor-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:3589197), complete cds. // chr7 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC046530 // GenBank // Mus musculus Ras and Rab interactor-like, mRNA (cDNA clone MGC:51683 IMAGE:5329601), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:28790359:28797854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
NM_008496 // RefSeq // Mus musculus lectin, galactose binding, soluble 7 (Lgals7), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539567 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lectin, galactose binding, soluble 7 (Lgals7), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:28864229:28866284:1 gene:ENSMUSG00000053522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:28863853:28865696:1 gene:ENSMUSG00000053522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AF038562 // GenBank // Mus musculus galectin-7 mRNA, complete cds. // chr7 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// AF331640 // GenBank // Mus musculus beta-galactoside-binding protein galectin-7 (Lgals7) mRNA, complete cds. // chr7 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC116838 // GenBank // Mus musculus lectin, galactose binding, soluble 7, mRNA (cDNA clone MGC:151215 IMAGE:40126157), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC116840 // GenBank // Mus musculus lectin, galactose binding, soluble 7, mRNA (cDNA clone MGC:151217 IMAGE:40126159), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:28862090:28888820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001110807 // RefSeq // Mus musculus calpain 12 (Capn12), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// XM_006540251 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calpain 12 (Capn12), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 98 // 98 // 51 // 52 // 0 /// ENSMUST00000066880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:28881656:28893585:1 gene:ENSMUSG00000054083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// BC028751 // GenBank // Mus musculus calpain 12, mRNA (cDNA clone MGC:41077 IMAGE:1314413), complete cds. // chr7 // 62 // 62 // 33 // 53 // 1 /// AK029042 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732483O06 product:calpain 12, full insert sequence. // chr7 // 15 // 15 // 8 // 53 // 1 /// GENSCAN00000015553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:28889197:28892988:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 25 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000009319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:28862090:28888820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 33 // 53 // 1 /// NONMMUT060479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr7 // 15 // 15 // 8 // 53 // 1
NM_008279 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 1 (Map4k1), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006539999 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 1 (Map4k1), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000085835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:28982854:29003279:1 gene:ENSMUSG00000037337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK143215 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130311C23 product:mitogen activated protein kinase kinase kinase kinase 1, full insert sequence. // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC005433 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:5927 IMAGE:3494470), complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:28982956:29003166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000053062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:29155680:29156918:1 gene:ENSMUSG00000050633 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK004111 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110035H17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:29155680:29156920:1 gene:ENSMUSG00000099098 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT060487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_182694 // RefSeq // Mus musculus gametogenetin (Ggn), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006539944 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gametogenetin (Ggn), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000098609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:29170220:29173933:1 gene:ENSMUSG00000031493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AF538032 // GenBank // Mus musculus gametogenetin protein 1 (Ggn) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr7 // 92 // 84 // 35 // 38 // 0 /// BC089358 // GenBank // Mus musculus gametogenetin, mRNA (cDNA clone MGC:102222 IMAGE:30610755), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NM_182696 // RefSeq // Mus musculus gametogenetin (Ggn), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 58 // 58 // 26 // 45 // 1 /// ENSMUST00000033886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:29170390:29173912:1 gene:ENSMUSG00000031493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 58 // 58 // 26 // 45 // 1 /// AF538033 // GenBank // Mus musculus gametogenetin protein 2 (Ggn) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr7 // 69 // 69 // 31 // 45 // 1 /// AF538034 // GenBank // Mus musculus gametogenetin protein 3 (Ggn) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr7 // 51 // 51 // 23 // 45 // 1 /// GENSCAN00000015567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:29171197:29173873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 78 // 34 // 35 // 0
NM_026731 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14A (Ppp1r14a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:29289320:29293390:1 gene:ENSMUSG00000037166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF352573 // GenBank // Mus musculus CPI17 (Cpi17) mRNA, complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AY050672 // GenBank // Mus musculus PKC-potentiated PP1 inhibitory protein (Ppp1r14a) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010832 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14A, mRNA (cDNA clone MGC:19334 IMAGE:4216018), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:29289335:29293318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
XR_403979 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4932431P20 gene (4932431P20Rik), misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141713 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:29519205:29538057:1 gene:ENSMUSG00000074224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:29524543:29582198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_403979 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4932431P20 gene (4932431P20Rik), misc_RNA. // chr7 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000098602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:29536716:29538055:1 gene:ENSMUSG00000074224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141713 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:29519205:29538057:1 gene:ENSMUSG00000074224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK133138 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930597C07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:29524543:29582198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
XR_403980 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930432E11 gene (4930432E11Rik), misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053635 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:29560515:29575478:1 gene:ENSMUSG00000046958 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000063585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:29558579:29582169:1 gene:ENSMUSG00000046958 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene gene:ENSMUSG00000051976 // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK029660 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930432E11 product:hypothetical Trp-Asp repeat (WD-repeat) structure containing protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:29524543:29582198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006540522 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat-containing protein 87-like (LOC102632285), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:29558579:29582169:1 gene:ENSMUSG00000046958 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene gene:ENSMUSG00000051976 // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK031916 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330444E15 product:Hypothetical EF-hand/glutamic acid-rich region containing protein, full insert sequence. // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:29524543:29582198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023750 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 84 (Zfp84), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000032802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:29768552:29779821:1 gene:ENSMUSG00000046185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK158422 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930115L08 product:zinc finger protein 84, full insert sequence. // chr7 // 78 // 60 // 14 // 18 // 0 /// BC008540 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 84, mRNA (cDNA clone MGC:7645 IMAGE:3495627), complete cds. // chr7 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_013705 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 30 (Zfp30), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:29783998:29794702:1 gene:ENSMUSG00000047473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000122387 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:29784084:29794702:1 gene:ENSMUSG00000047473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK173073 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0961 protein. // chr7 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AY605122 // GenBank // Mus musculus brain specifically expressed BSG3 (Bsg3) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC049120 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 30, mRNA (cDNA clone MGC:61210 IMAGE:6813126), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC051972 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 30, mRNA (cDNA clone MGC:62252 IMAGE:5707652), complete cds. // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000126504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:29784023:29791912:1 gene:ENSMUSG00000047473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// AK030562 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330432C24 product:zinc finger protein 30, full insert sequence. // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONMMUT060515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000015557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:29771371:29795591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001145880 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 790 (Zfp790), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_146185 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 790 (Zfp790), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:29816072:29832042:1 gene:ENSMUSG00000011427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000178162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:29816072:29832042:1 gene:ENSMUSG00000011427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC007476 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 790, mRNA (cDNA clone MGC:6654 IMAGE:3497180), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC046774 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 790, mRNA (cDNA clone MGC:61255 IMAGE:5708351), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:29823012:29830938:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_172740 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 420 (Zfp420), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000057652 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:29860041:29876827:1 gene:ENSMUSG00000058402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000074876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:7:29859979:29876505:1 gene:ENSMUSG00000058402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000145952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:29860011:29877292:1 gene:ENSMUSG00000058402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC055817 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 420, mRNA (cDNA clone MGC:67687 IMAGE:3595825), complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000130272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:29872524:29874536:1 gene:ENSMUSG00000058402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT060525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSMUST00000077142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:29953621:29955992:1 gene:ENSMUSG00000063623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK082547 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230062I16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033355 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 568 (Zfp568), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001167872 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 568 (Zfp568), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001167873 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 568 (Zfp568), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000074322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:29987773:30023647:1 gene:ENSMUSG00000074221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000146074 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:29985299:30028282:1 gene:ENSMUSG00000074221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000148442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:29983955:30025111:1 gene:ENSMUSG00000074221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000177931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:29987773:30023647:1 gene:ENSMUSG00000074221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC082606 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 568, mRNA (cDNA clone MGC:105217 IMAGE:30672810), complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:29968815:30030606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0
NM_011981 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 260 (Zfp260), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050735 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:30094794:30107622:1 gene:ENSMUSG00000049421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:30095185:30107614:1 gene:ENSMUSG00000049421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000130526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:30095169:30104759:1 gene:ENSMUSG00000049421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC082570 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 260, mRNA (cDNA clone MGC:105207 IMAGE:30607787), complete cds. // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC085180 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 260, mRNA (cDNA clone MGC:96843 IMAGE:30639007), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D45210 // GenBank // Mus musculus mRNA for zinc finger protein, complete cds. // chr7 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// ENSMUST00000134365 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:30095178:30107619:1 gene:ENSMUSG00000049421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT060545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001081007 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 382 (Zfp382), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:30121942:30134665:1 gene:ENSMUSG00000074220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153792 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:30121970:30130816:1 gene:ENSMUSG00000074220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000156543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:30125615:30133545:1 gene:ENSMUSG00000074220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// BC151163 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 382, mRNA (cDNA clone MGC:184063 IMAGE:9088052), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:30104677:30151863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001033540 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5113 (Gm5113), mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:30169875:30180209:1 gene:ENSMUSG00000066647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AK142560 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630035C17 product:weakly similar to Zinc finger protein 331 (Zinc finger protein 463) (C2H2-like zinc finger protein rearranged in thyroid adenomas) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr7 // 90 // 70 // 19 // 21 // 0
NM_009944 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIa 1 (Cox7a1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:30184171:30186028:1 gene:ENSMUSG00000074218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF037370 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIa-H precursor (Cox7ah) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC060974 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit VIIa 1, mRNA (cDNA clone MGC:74067 IMAGE:6543330), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:30162010:30185967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
ENSMUST00000014072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:30280094:30290237:1 gene:ENSMUSG00000013928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108187 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:30280094:30290237:1 gene:ENSMUSG00000013928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006173 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700020L13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001081114 // RefSeq // Mus musculus CAP-GLY domain containing linker protein 3 (Clip3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000014065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:30291672:30308367:1 gene:ENSMUSG00000013921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000125935 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:30297117:30299156:1 gene:ENSMUSG00000013921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// BC138413 // GenBank // Mus musculus CAP-GLY domain containing linker protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:170038 IMAGE:8861433), complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSMUST00000132844 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:30303902:30307304:1 gene:ENSMUSG00000013921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000010215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:30284210:30319001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT060564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
ENSMUST00000098585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:30321740:30323472:1 gene:ENSMUSG00000074210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK143172 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130208F15 product:hypothetical Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011662 // RefSeq // Mus musculus TYRO protein tyrosine kinase binding protein (Tyrobp), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:30413788:30417577:1 gene:ENSMUSG00000030579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF024637 // GenBank // Mus musculus DAP12 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AF077829 // GenBank // Mus musculus KAR-associated protein mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC056450 // GenBank // Mus musculus TYRO protein tyrosine kinase binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:67011 IMAGE:6814478), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:30377044:30428187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
XM_006540215 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nephrosis 1, nephrin (Nphs1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126297 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:30458315:30461009:1 gene:ENSMUSG00000006649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB513652 // GenBank // Mus musculus Nphs1 mRNA for NephrinB, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141081 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230040G20 product:nephrosis 1 homolog, nephrin (human), full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019459 // RefSeq // Mus musculus nephrosis 1, nephrin (Nphs1), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006540215 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nephrosis 1, nephrin (Nphs1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000006825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:30459725:30487223:1 gene:ENSMUSG00000006649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB513652 // GenBank // Mus musculus Nphs1 mRNA for NephrinB, complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF168466 // GenBank // Mus musculus nephrin (Nphs1) mRNA, complete cds. // chr7 // 89 // 87 // 24 // 27 // 0 /// AF172256 // GenBank // Mus musculus nephrin mRNA, complete cds. // chr7 // 90 // 97 // 27 // 30 // 0 /// AF191090 // GenBank // Mus musculus nephrin (Nphs1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK141081 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230040G20 product:nephrosis 1 homolog, nephrin (human), full insert sequence. // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000010140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:30460144:30521904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NR_036630 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 33, opposite strand (Arhgap33os), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000124276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:30515122:30522193:1 gene:ENSMUSG00000062132 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC065044 // GenBank // Mus musculus gene model 1082, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:86006 IMAGE:5685982), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000010140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:30460144:30521904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_001012401 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein, alpha-crystallin-related, B6 (Hspb6), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006539957 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heat shock protein, alpha-crystallin-related, B6 (Hspb6), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000044048 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:30553268:30555443:1 gene:ENSMUSG00000036854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:30552524:30555439:1 gene:ENSMUSG00000036854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000126989 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:30552178:30555440:1 gene:ENSMUSG00000036854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000146732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:30553885:30554644:1 gene:ENSMUSG00000036854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC051228 // GenBank // Mus musculus heat shock protein, alpha-crystallin-related, B6, mRNA (cDNA clone IMAGE:3471643), partial cds. // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC089621 // GenBank // Mus musculus heat shock protein, alpha-crystallin-related, B6, mRNA (cDNA clone MGC:107687 IMAGE:6753521), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:30553335:30554636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT060595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_026961 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2200002J24 gene (2200002J24Rik), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000013227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:30699783:30700380:1 gene:ENSMUSG00000013083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC048568 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2200002J24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58584 IMAGE:6705641), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006540347 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2200002J24 gene (2200002J24Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
XM_006540347 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2200002J24 gene (2200002J24Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000085702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:30709736:30710263:1 gene:ENSMUSG00000066620 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:30709736:30710263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000180820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:30729579:30745929:1 gene:ENSMUSG00000097320 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183194 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:30732706:30737499:1 gene:ENSMUSG00000097320 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AK049951 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630016N16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_391240 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C630016N16 gene (C630016N16Rik), misc_RNA. // chr7 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONMMUT060612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT060614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT060616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT060617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT060618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT060613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr7 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// NONMMUT060615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr7 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001242647 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 187, member B (Fam187b), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:30982318:30989462:1 gene:ENSMUSG00000046826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// NM_175240 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 187, member B (Fam187b), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// ENSMUST00000058093 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:30977043:30989465:1 gene:ENSMUSG00000046826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// BC120864 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 162, mRNA (cDNA clone MGC:156101 IMAGE:40129787), complete cds. // chr7 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// BC125560 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 162, mRNA (cDNA clone MGC:159263 IMAGE:40130075), complete cds. // chr7 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// NR_038860 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 187, member B (Fam187b), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr7 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// ENSMUST00000129773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:30973804:30989720:1 gene:ENSMUSG00000046826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// AK006143 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700020B09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// GENSCAN00000007908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:30977068:31002662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT060629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_144556 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich repeat LGI family, member 4 (Lgi4), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006539958 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine-rich repeat LGI family, member 4 (Lgi4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XM_006539959 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine-rich repeat LGI family, member 4 (Lgi4), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:31059342:31070935:1 gene:ENSMUSG00000036560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000164725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:31061078:31064074:1 gene:ENSMUSG00000036560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000169785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:31060567:31063669:1 gene:ENSMUSG00000036560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// AK033967 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330129M12 product:hypothetical Cysteine-rich flanking region, C-terminal/Leucine-rich repeat/Leucine-rich repeat, typical subtype containing protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC098469 // GenBank // Mus musculus leucine-rich repeat LGI family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:107385 IMAGE:30099294), complete cds. // chr7 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:31060021:31069191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT060634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0
NR_046062 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10640 (Gm10640), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:31162358:31170641:1 gene:ENSMUSG00000100985 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00006523 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT060643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207262 // RefSeq // Mus musculus secretoglobin, family 2B, member 2 (Scgb2b2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000038835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:31302761:31304977:1 gene:ENSMUSG00000036521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY370634 // GenBank // Mus musculus lacrimal androgen-binding protein epsilon (Abpe) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:31302782:31304823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000106038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:33018397:33019378:1 gene:ENSMUSG00000101486 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene gene:ENSMUSG00000081524 // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:32791496:32792487:1 gene:ENSMUSG00000097952 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:32059024:32060008:1 gene:ENSMUSG00000101777 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:32937754:33018507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:32710859:32791608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000191583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:32388481:32388943:1 gene:ENSMUSG00000100513 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000045166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:32388569:32388946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006544166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 60S ribosomal protein L23a-like (LOC102635284), mRNA. // chr7 // 92 // 100 // 34 // 37 // 0 /// ENSMUST00000187732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:32495638:32496100:1 gene:ENSMUSG00000100751 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000187984 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:31766952:31767414:1 gene:ENSMUSG00000100517 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 92 // 100 // 34 // 37 // 0 /// GENSCAN00000007907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:31766952:31818153:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 100 // 34 // 37 // 0 /// GENSCAN00000045168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:32495638:32546802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
ENSMUST00000106038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:33018397:33019378:1 gene:ENSMUSG00000101486 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene gene:ENSMUSG00000081524 // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000182698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:32791496:32792487:1 gene:ENSMUSG00000097952 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000182081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:33137119:33138109:1 gene:ENSMUSG00000098044 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 30 // 100 // 8 // 27 // 0 /// ENSMUST00000182963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:32171714:32172703:1 gene:ENSMUSG00000098013 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 30 // 100 // 8 // 27 // 0 /// ENSMUST00000188041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:32059024:32060008:1 gene:ENSMUSG00000101777 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:33112684:33138057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 81 // 8 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:32151205:32172652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 81 // 8 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:32937754:33018507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000045162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:32710859:32791608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENSMUST00000190969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:33423670:33424150:1 gene:ENSMUSG00000099578 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000012689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:33423670:33424047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000119465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:33879295:33880094:1 gene:ENSMUSG00000081317 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000121845 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:33958805:33959986:1 gene:ENSMUSG00000083942 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GU269229 // GenBank // Mus musculus androgen-binding protein (Abpa26) mRNA, partial cds. // chr7 // 87 // 71 // 13 // 15 // 0 /// NONMMUT060671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 87 // 71 // 13 // 15 // 0
ENSMUST00000122297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:33998012:34006461:1 gene:ENSMUSG00000081768 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr7 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// NONMMUT060673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_009596 // RefSeq // Mus musculus secretoglobin, family 1B, member 27 (Scgb1b27), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000085618 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:34021483:34022881:1 gene:ENSMUSG00000066583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC016132 // GenBank // Mus musculus androgen binding protein alpha, mRNA (cDNA clone MGC:28914 IMAGE:4922791), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC132436 // GenBank // Mus musculus androgen binding protein alpha, mRNA (cDNA clone MGC:164067 IMAGE:40130713), complete cds. // chr7 // 90 // 87 // 18 // 20 // 0 /// ENSMUST00000173387 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:34021567:34022449:1 gene:ENSMUSG00000066583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// GENSCAN00000005654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:34021568:34021961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0
NM_008820 // RefSeq // Mus musculus peptidase D (Pepd), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000075068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:34912379:35044710:1 gene:ENSMUSG00000063931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000161900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:34945589:35021746:1 gene:ENSMUSG00000063931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 83 // 43 // 10 // 12 // 0 /// BC086644 // GenBank // Mus musculus peptidase D, mRNA (cDNA clone MGC:113745 IMAGE:6807359), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC131945 // GenBank // Mus musculus peptidase D, mRNA (cDNA clone MGC:163576 IMAGE:40130222), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC131973 // GenBank // Mus musculus peptidase D, mRNA (cDNA clone MGC:163604 IMAGE:40130250), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D82983 // GenBank // Mus musculus mRNA for prolidase, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U51014 // GenBank // Mus musculus prolidase (pep4) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000161128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:34969283:35040734:1 gene:ENSMUSG00000063931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000028878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:34920225:34973455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:35013377:35044368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0
NM_001287514 // RefSeq // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha (Cebpa), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001287515 // RefSeq // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha (Cebpa), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001287521 // RefSeq // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha (Cebpa), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001287523 // RefSeq // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha (Cebpa), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_007678 // RefSeq // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha (Cebpa), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:35119293:35121926:1 gene:ENSMUSG00000034957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011118 // GenBank // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha, mRNA (cDNA clone MGC:18705 IMAGE:4194023), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028890 // GenBank // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha, mRNA (cDNA clone MGC:19302 IMAGE:4160963), complete cds. // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC051102 // GenBank // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha, mRNA (cDNA clone MGC:58988 IMAGE:5051761), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058161 // GenBank // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha, mRNA (cDNA clone MGC:65349 IMAGE:5053056), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:35119137:35120498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_017394 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 10 (Slc7a10), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000001854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:35186385:35201110:1 gene:ENSMUSG00000030495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000131048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:35186421:35200914:1 gene:ENSMUSG00000030495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000167441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:35186482:35197951:1 gene:ENSMUSG00000030495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// AB026688 // GenBank // Mus musculus mRNA for asc1, complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC054765 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:64793 IMAGE:6414759), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000028889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:35186500:35200851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
NM_027897 // RefSeq // Mus musculus rhophilin, Rho GTPase binding protein 2 (Rhpn2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000032705 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:35334170:35392289:1 gene:ENSMUSG00000030494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000085556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:35334330:35392285:1 gene:ENSMUSG00000030494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC100314 // GenBank // Mus musculus rhophilin, Rho GTPase binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:117535 IMAGE:30848276), complete cds. // chr7 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:35334343:35391015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000181932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:35555367:35556935:1 gene:ENSMUSG00000097509 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK045908 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230322F03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_033567 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E130304I02 gene (E130304I02Rik), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:35802593:35803027:1 gene:ENSMUSG00000044997 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:35802592:35838074:1 gene:ENSMUSG00000044997 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT060780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172298 // RefSeq // Mus musculus teashirt zinc finger family member 3 (Tshz3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006539961 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus teashirt zinc finger family member 3 (Tshz3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000021641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:36698118:36773553:1 gene:ENSMUSG00000021217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK220396 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1474 protein. // chr7 // 82 // 81 // 18 // 22 // 0 /// AY063491 // GenBank // Mus musculus teashirt 3 (Tsh3) mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC150674 // GenBank // Mus musculus teashirt zinc finger family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:183585 IMAGE:9087585), complete cds. // chr7 // 79 // 89 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:36768621:36771833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000052002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:37876486:37936627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000179674 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:38380349:38380455:1 gene:ENSMUSG00000094848 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT060852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000178612 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:38928775:38928879:1 gene:ENSMUSG00000095053 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000179167 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:39283976:39284080:1 gene:ENSMUSG00000096181 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000179790 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:38613149:38613253:1 gene:ENSMUSG00000095537 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT060857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT060858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT060859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000178103 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:38792638:38792744:1 gene:ENSMUSG00000094419 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001243021 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 939 (Zfp939), mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// XM_006540813 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 939 (Zfp939), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006540814 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 939 (Zfp939), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000061201 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:39449518:39477413:1 gene:ENSMUSG00000030424 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000186855 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:39449518:39477413:1 gene:ENSMUSG00000030424 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT060862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000033077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:39456389:39499518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001004139 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 619 (Zfp619), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108015 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:39517766:39540415:1 gene:ENSMUSG00000068959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC080693 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 619, mRNA (cDNA clone MGC:91101 IMAGE:30432277), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
ENSMUST00000093724 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:39630392:39630502:1 gene:ENSMUSG00000070236 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT060879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000122524 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:40879658:40879738:1 gene:ENSMUSG00000084473 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT060913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_021387 // RefSeq // Mus musculus V-set and transmembrane domain containing 2B (Vstm2b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044705 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:40899215:40930594:1 gene:ENSMUSG00000039257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB030198 // GenBank // Mus musculus mRNA, complete cds, clone:2-65. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK020370 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330151I22 product:RIKEN cDNA 2900093B09 gene, full insert sequence. // chr7 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000009031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:40844906:41044693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENSMUST00000171664 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:40987555:40995181:1 gene:ENSMUSG00000091692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// GENSCAN00000009031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:40844906:41044693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
NM_183166 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4884 (Gm4884), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006540815 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4884 (Gm4884), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000164422 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:41032719:41045302:1 gene:ENSMUSG00000048312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000009031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:40844906:41044693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001033782 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5592 (Gm5592), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000097044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:41284327:41290183:1 gene:ENSMUSG00000072259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000009025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:41233378:41289869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000117587 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:41335384:41338873:1 gene:ENSMUSG00000082080 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:41335384:41338873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT060926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000119135 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:41490351:41491721:1 gene:ENSMUSG00000083500 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:41448480:41491256:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
XR_391402 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2610021A01 gene (2610021A01Rik), misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163475 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:41599261:41628533:1 gene:ENSMUSG00000091474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK011498 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610021A01 product:hypothetical KRAB box containing protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000174407 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:42473386:42505726:-1 gene:ENSMUSG00000092416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 92 // 11 // 24 // 0 /// BC063263 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC063263, mRNA (cDNA clone IMAGE:6417495). // chr7 // 46 // 92 // 11 // 24 // 0 /// NONMMUT060948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 42 // 100 // 11 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:42473435:42490053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000009036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:41606693:41633086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001105057 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 60 (Vmn2r60), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000166447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:42116471:42195776:1 gene:ENSMUSG00000090619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000173599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:42488801:42489055:1 gene:ENSMUSG00000092505 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT060953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000172692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:42878596:42880005:1 gene:ENSMUSG00000092191 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// NONMMUT060968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0
ENSMUST00000117401 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:42951724:42952207:1 gene:ENSMUSG00000080892 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000102235 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:42958351:42958460:1 gene:ENSMUSG00000076190 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000104784 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:40051904:40052013:1 gene:ENSMUSG00000095188 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 33 // 100 // 8 // 24 // 0 /// ENSMUST00000180080 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:22789818:22789927:1 gene:ENSMUSG00000096721 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 38 // 100 // 9 // 24 // 0 /// NONMMUT060969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT029674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 100 // 8 // 24 // 0 /// NONMMUT055952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 100 // 9 // 24 // 0 /// ENSMUST00000183692 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:129189015:129189124:-1 gene:ENSMUSG00000098268 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// NONMMUT073123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
XM_006541330 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102639120 (LOC102639120), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000002743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:42756073:42818426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000046305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:42983855:43280420:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONMMUT060966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONMMUT060967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONMMUT060971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000046075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:170230662:170255580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 63 // 100 // 24 // 38 // 0
ENSMUST00000087694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43099719:43099843:1 gene:ENSMUSG00000071952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB010332 // GenBank // Mus musculus mRNA for mszf19, partial cds. // chr7 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT060972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT060973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT060974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT060975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT060976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT060977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001034893 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 936 (Zfp936), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000072829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43187170:43190481:1 gene:ENSMUSG00000064194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC066874 // GenBank // Mus musculus similar to crooked legs CG14938-PB, mRNA (cDNA clone MGC:76792 IMAGE:30106557), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001177525 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence EU599041 (EU599041), mRNA. // chr7 // 42 // 73 // 8 // 19 // 0 /// EU599041 // GenBank // Mus musculus TU7 isoform A (Tu7) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr7 // 42 // 73 // 8 // 19 // 0 /// EU599042 // GenBank // Mus musculus TU7 isoform B (Tu7) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr7 // 42 // 73 // 8 // 19 // 0 /// NM_001008427 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5595 (Gm5595), mRNA. // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// ENSMUST00000107992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:42660105:42692718:-1 gene:ENSMUSG00000069727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT060973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT060975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001034893 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 936 (Zfp936), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000072829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43187170:43190481:1 gene:ENSMUSG00000064194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC066874 // GenBank // Mus musculus similar to crooked legs CG14938-PB, mRNA (cDNA clone MGC:76792 IMAGE:30106557), complete cds. // chr7 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// NM_001177525 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence EU599041 (EU599041), mRNA. // chr7 // 42 // 59 // 8 // 19 // 0 /// EU599041 // GenBank // Mus musculus TU7 isoform A (Tu7) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr7 // 42 // 59 // 8 // 19 // 0 /// EU599042 // GenBank // Mus musculus TU7 isoform B (Tu7) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr7 // 42 // 59 // 8 // 19 // 0 /// NM_001008427 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5595 (Gm5595), mRNA. // chr7 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NM_001242388 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9830147E19 gene (9830147E19Rik), mRNA. // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// ENSMUST00000098503 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:42612504:42642547:-1 gene:ENSMUSG00000074158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// ENSMUST00000107992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:42660105:42692718:-1 gene:ENSMUSG00000069727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONMMUT060973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONMMUT060975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001271019 // RefSeq // Mus musculus sialic acid binding Ig-like lectin 5 (Siglec5), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_145581 // RefSeq // Mus musculus sialic acid binding Ig-like lectin 5 (Siglec5), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000012798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:43351395:43359470:1 gene:ENSMUSG00000039013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000121494 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:43351548:43356618:1 gene:ENSMUSG00000039013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000122423 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:43351408:43359531:1 gene:ENSMUSG00000039013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000145867 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:43351341:43359468:1 gene:ENSMUSG00000039013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF293371 // GenBank // Mus musculus sialic acid-binding lectin Siglec-F mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY210401 // GenBank // Mus musculus Siglec-F variant mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC145038 // GenBank // Mus musculus sialic acid binding Ig-like lectin 5, mRNA (cDNA clone MGC:178594 IMAGE:9053586), complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC145987 // GenBank // Mus musculus sialic acid binding Ig-like lectin 5, mRNA (cDNA clone MGC:175874 IMAGE:40131290), complete cds. // chr7 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43339584:43358774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_177693 // RefSeq // Mus musculus lens intrinsic membrane protein 2 (Lim2), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000004732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:43430088:43435991:1 gene:ENSMUSG00000004613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000177375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:43427670:43435991:1 gene:ENSMUSG00000093639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC092386 // GenBank // Mus musculus lens intrinsic membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:106539 IMAGE:30551056), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC119253 // GenBank // Mus musculus lens intrinsic membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:155569 IMAGE:8734002), complete cds. // chr7 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC119255 // GenBank // Mus musculus lens intrinsic membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:155571 IMAGE:8734004), complete cds. // chr7 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43408560:43457740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_024253 // RefSeq // Mus musculus natural killer cell group 7 sequence (Nkg7), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000070518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43437073:43438246:1 gene:ENSMUSG00000004612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC055882 // GenBank // Mus musculus natural killer cell group 7 sequence, mRNA (cDNA clone MGC:68124 IMAGE:3497559), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43408560:43457740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_028849 // RefSeq // Mus musculus claudin domain containing 2 (Cldnd2), mRNA. // chr7 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// XM_006541230 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus claudin domain containing 2 (Cldnd2), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// ENSMUST00000040227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43440782:43443328:1 gene:ENSMUSG00000038973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC128277 // GenBank // Mus musculus claudin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:149997 IMAGE:40091490), complete cds. // chr7 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43408560:43457740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_026695 // RefSeq // Mus musculus electron transferring flavoprotein, beta polypeptide (Etfb), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NR_075104 // RefSeq // Mus musculus electron transferring flavoprotein, beta polypeptide (Etfb), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000004729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:43444108:43457800:1 gene:ENSMUSG00000004610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000143096 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:43456501:43457780:1 gene:ENSMUSG00000004610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC049237 // GenBank // Mus musculus electron transferring flavoprotein, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:54845 IMAGE:4241552), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC069877 // GenBank // Mus musculus electron transferring flavoprotein, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:78079 IMAGE:5370580), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006544766 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus electron transfer flavoprotein subunit beta-like (LOC102642019), partial mRNA. // chr7 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000046288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43408560:43457740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT060988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
NM_001290316 // RefSeq // Mus musculus ZV-set and immunoglobulin domain containing 10 like (Vsig10l), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107977 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:43463151:43471913:1 gene:ENSMUSG00000070604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43463233:43471045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001008549 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 658 (Zfp658), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000005597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43564784:43574966:1 gene:ENSMUSG00000056592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000107972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:43562256:43575461:1 gene:ENSMUSG00000056592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC087557 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC043301, mRNA (cDNA clone MGC:102645 IMAGE:30742836), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
NM_172482 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 719 (Zfp719), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:7:43579610:43593235:1 gene:ENSMUSG00000030469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081548 // GenBank HTC // Mus musculus zinc finger protein 719, mRNA (cDNA clone IMAGE:30439371), containing frame-shift errors. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147075 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:43579639:43584508:1 gene:ENSMUSG00000030469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43560575:43596181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT060995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_028913 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 819 (Zfp819), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000032661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:43607225:43618285:1 gene:ENSMUSG00000055102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000116324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43609907:43617918:1 gene:ENSMUSG00000055102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000120935 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:43607169:43618216:1 gene:ENSMUSG00000055102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000127765 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:43607209:43612644:1 gene:ENSMUSG00000055102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC050101 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 819, mRNA (cDNA clone MGC:60960 IMAGE:30007787), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_028236 // RefSeq // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 18 (Ceacam18), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43634739:43649287:1 gene:ENSMUSG00000030472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC042780 // GenBank // Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 18, mRNA (cDNA clone MGC:51532 IMAGE:4224563), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006541215 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 18 (Ceacam18), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43623689:43644438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_145582 // RefSeq // Mus musculus cytosolic thiouridylase subunit 1 homolog (S. pombe) (Ctu1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:43672016:43678298:1 gene:ENSMUSG00000038888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC005752 // GenBank // Mus musculus ATP binding domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:6894 IMAGE:2654430), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43675139:43677181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_174866 // RefSeq // Mus musculus kallikrein related-peptidase 14 (Klk14), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006540956 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kallikrein related-peptidase 14 (Klk14), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:43690418:43695536:1 gene:ENSMUSG00000044737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC044756 // GenBank HTC // Mus musculus kallikrein related-peptidase 14, mRNA (cDNA clone IMAGE:5324506), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC128019 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 14, mRNA (cDNA clone MGC:157618 IMAGE:40136266), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43691262:43695019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001039042 // RefSeq // Mus musculus kallikrein related-peptidase 13 (Klk13), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006541055 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kallikrein related-peptidase 13 (Klk13), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006541057 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kallikrein related-peptidase 13 (Klk13), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000066834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43712567:43726758:1 gene:ENSMUSG00000054046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43713831:43726733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0
NM_027097 // RefSeq // Mus musculus kallikrein related-peptidase 12 (Klk12), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006541174 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kallikrein related-peptidase 12 (Klk12), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000014063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43769100:43773481:1 gene:ENSMUSG00000044430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000107970 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:43768897:43773576:1 gene:ENSMUSG00000044430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK009217 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310008B01 product:similar to KALLIKREIN 12 PRECURSOR (EC 3.4.21.-) (KALLIKREIN-LIKE PROTEIN 5) (KLK-L5) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147442 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 12, mRNA (cDNA clone MGC:182190 IMAGE:9056084), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC147463 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 12, mRNA (cDNA clone MGC:182211 IMAGE:9056105), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006541173 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kallikrein related-peptidase 12 (Klk12), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43769199:43773394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001177373 // RefSeq // Mus musculus kallikrein related-peptidase 11 (Klk11), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_019974 // RefSeq // Mus musculus kallikrein related-peptidase 11 (Klk11), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006541005 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kallikrein related-peptidase 11 (Klk11), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000080211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43774617:43779258:1 gene:ENSMUSG00000067616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000171458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43776329:43779258:1 gene:ENSMUSG00000067616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AB016226 // GenBank // Mus musculus mRNA for hippostasin, complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AB016227 // GenBank // Mus musculus mRNA for hippostasin prostate type, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43776518:43785022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_133712 // RefSeq // Mus musculus kallikrein related-peptidase 10 (Klk10), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000014058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43781054:43785410:1 gene:ENSMUSG00000030693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC002100 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 10, mRNA (cDNA clone MGC:6585 IMAGE:3484608), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43776518:43785022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_028660 // RefSeq // Mus musculus kallikrein related-peptidase 9 (Klk9), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000005891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43791891:43796756:1 gene:ENSMUSG00000047884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC109326 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 9, mRNA (cDNA clone MGC:130095 IMAGE:40051199), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC109327 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 9, mRNA (cDNA clone MGC:130096 IMAGE:40051200), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK004807 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1200016C12 product:similar to KALLIKREIN 9 PRECURSOR (EC 3.4.21.-) (KALLIKREIN-LIKE PROTEIN 3) (KLK- L3) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr7 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43791997:43796143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_008940 // RefSeq // Mus musculus kallikrein related-peptidase 8 (Klk8), mRNA. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000085461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43797577:43803822:1 gene:ENSMUSG00000064023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AB074296 // GenBank // Mus musculus NP mRNA for neuropsin, partial cds. // chr7 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC055895 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 8, mRNA (cDNA clone MGC:68231 IMAGE:4019947), complete cds. // chr7 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// D30785 // GenBank // Mus musculus mRNA for neuropsin, complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43798063:43803769:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_011872 // RefSeq // Mus musculus kallikrein related-peptidase 7 (chymotryptic, stratum corneum) (Klk7), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000032955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43811444:43816359:1 gene:ENSMUSG00000030713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AB008371 // GenBank // Mus musculus mRNA for thymopsin, complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC027823 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 7 (chymotryptic, stratum corneum), mRNA (cDNA clone MGC:38194 IMAGE:5322691), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43811961:43830330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_026806 // RefSeq // Mus musculus kallikrein related-peptidase 5 (Klk5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:43842269:43851181:1 gene:ENSMUSG00000074155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139475 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 5, mRNA (cDNA clone MGC:171102 IMAGE:8862497), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139478 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 5, mRNA (cDNA clone MGC:171105 IMAGE:8862500), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43842316:43864060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_019928 // RefSeq // Mus musculus kallikrein related-peptidase 4 (prostase, enamel matrix, prostate) (Klk4), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000007161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43881172:43885804:1 gene:ENSMUSG00000006948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF019979 // GenBank // Mus musculus enamel matrix serine proteinase 1 precursor, mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC100716 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 4 (prostase, enamel matrix, prostate), mRNA (cDNA clone MGC:123985 IMAGE:40045068), complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC100717 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 4 (prostase, enamel matrix, prostate), mRNA (cDNA clone MGC:123984 IMAGE:40045067), complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC100718 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 4 (prostase, enamel matrix, prostate), mRNA (cDNA clone MGC:123983 IMAGE:40045065), complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC100719 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 4 (prostase, enamel matrix, prostate), mRNA (cDNA clone MGC:123982 IMAGE:40045063), complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43881649:43885386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NM_174865 // RefSeq // Mus musculus kallikrein related-peptidase 15 (Klk15), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006540952 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kallikrein related-peptidase 15 (Klk15), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000068625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:43933771:43939590:1 gene:ENSMUSG00000055193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC106965 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 15, mRNA (cDNA clone MGC:129160 IMAGE:40039744), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC107012 // GenBank // Mus musculus kallikrein related-peptidase 15, mRNA (cDNA clone MGC:129345 IMAGE:40047687), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43918473:43962947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NR_033120 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b7, pseudogene (Klk1b7-ps), non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000078897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:43945012:43945927:1 gene:ENSMUSG00000060161 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000183762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:43942662:43945856:1 gene:ENSMUSG00000060161 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_008457 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b8 (Klk1b8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006540677 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b8 (Klk1b8), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000072204 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:43950664:43954941:1 gene:ENSMUSG00000063089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC031798 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b8, mRNA (cDNA clone MGC:18615 IMAGE:4167600), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000022715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43918473:43962947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 78 // 95 // 14 // 18 // 0
NM_010645 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b1 (Klk1b1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000078835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:43966751:43971318:1 gene:ENSMUSG00000063133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC026378 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b1, mRNA (cDNA clone MGC:31128 IMAGE:4165617), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000022719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43966787:43971273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0
NM_010116 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b9 (Klk1b9), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000081399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:43976061:43980376:1 gene:ENSMUSG00000059042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC024624 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b9, mRNA (cDNA clone MGC:25400 IMAGE:4914236), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC048869 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b9, mRNA (cDNA clone MGC:59025 IMAGE:4164261), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// M17962 // GenBank // Mouse major epidermal growth factor binding protein (EGF-BP) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000022706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43974129:43980328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_010640 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b11 (Klk1b11), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000007156 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:43995877:43999875:1 gene:ENSMUSG00000044485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC013660 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b11, mRNA (cDNA clone MGC:19030 IMAGE:4167568), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_010644 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related petidase b26 (Klk1b26), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000048945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:44012678:44016965:1 gene:ENSMUSG00000053719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC024688 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related petidase b26, mRNA (cDNA clone MGC:18572 IMAGE:4167696), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC138704 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related petidase b26, mRNA (cDNA clone MGC:170331 IMAGE:8861726), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// K01831 // GenBank // Mouse epidermal growth factor-binding protein type b mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AB016032 // GenBank // Mus musculus mRNA for prorenin-converting enzyme (mK13b), complete cds. // chr7 // 60 // 87 // 12 // 20 // 0 /// NM_010115 // RefSeq // Mus musculus epidermal growth factor binding protein type B (Egfbp2), mRNA. // chr7 // 48 // 100 // 11 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:43991156:44016920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
NM_020268 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b27 (Klk1b27), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000079859 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44052290:44056705:1 gene:ENSMUSG00000063177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AB039275 // GenBank // Mus musculus GK27 mRNA for glandular kallikrein 27, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC132090 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b27, mRNA (cDNA clone MGC:163721 IMAGE:40130367), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC132665 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b27, mRNA (cDNA clone MGC:164296 IMAGE:40130942), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000022710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44052341:44075247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0
NM_010114 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b22 (Klk1b22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000077528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44112673:44116922:1 gene:ENSMUSG00000060177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC106155 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b22, mRNA (cDNA clone MGC:118112 IMAGE:4189167), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000022701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44102364:44116876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_008454 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b16 (Klk1b16), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000005933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44136767:44141607:1 gene:ENSMUSG00000038968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC012237 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b16, mRNA (cDNA clone MGC:18522 IMAGE:4165443), complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// J03877 // GenBank // Mouse gamma-renin mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000022711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44122293:44141561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_010643 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b24 (Klk1b24), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000073713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44188236:44192452:1 gene:ENSMUSG00000063713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AB039277 // GenBank // Mus musculus GK24 mRNA for glandular kallikrein 24, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC146015 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b24, mRNA (cDNA clone MGC:175902 IMAGE:40131318), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC146019 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b24, mRNA (cDNA clone MGC:175906 IMAGE:40131322), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000022704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44188273:44192406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_008693 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b3 (Klk1b3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000085450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44198191:44202351:1 gene:ENSMUSG00000066515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC132657 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b3, mRNA (cDNA clone MGC:164288 IMAGE:40130934), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC132659 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b3, mRNA (cDNA clone MGC:164290 IMAGE:40130936), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000022695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44198247:44215213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0
NM_010915 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related pepidase b4 (Klk1b4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000077354 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44207435:44211754:1 gene:ENSMUSG00000066513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC034518 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related pepidase b4, mRNA (cDNA clone MGC:25388 IMAGE:4911885), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// M11434 // GenBank // Mouse nerve growth factor 7S alpha-subunit mRNA, complete cds. // chr7 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000022695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44198247:44215213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0
NM_008456 // RefSeq // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b5 (Klk1b5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000074359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44216474:44220703:1 gene:ENSMUSG00000066512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC013659 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b5, mRNA (cDNA clone MGC:18627 IMAGE:4190286), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC094281 // GenBank // Mus musculus kallikrein 1-related peptidase b5, mRNA (cDNA clone MGC:106360 IMAGE:4923171), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000022712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44216501:44220654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0
NM_001114116 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin III (Syt3), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_016663 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin III (Syt3), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000118831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44384154:44400187:1 gene:ENSMUSG00000030731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000118962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44384102:44400029:1 gene:ENSMUSG00000030731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000120262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:44384868:44399763:1 gene:ENSMUSG00000030731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AB000893 // GenBank // Mus musculus mRNA for synaptotagmin 3, complete cds. // chr7 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC051969 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin III, mRNA (cDNA clone MGC:62242 IMAGE:5694653), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// D45858 // GenBank // Mus musculus mRNA for synaptotagumin III, complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSMUST00000130844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:44384604:44386121:1 gene:ENSMUSG00000030731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000022692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44374423:44445368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 85 // 26 // 28 // 0
NM_198250 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 4B (Lrrc4b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44442485:44463351:1 gene:ENSMUSG00000047085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:44429018:44461361:1 gene:ENSMUSG00000047085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000156093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:44442737:44461407:1 gene:ENSMUSG00000047085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC060263 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 4B, mRNA (cDNA clone MGC:69683 IMAGE:5686281), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44449426:44471514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000022692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44374423:44445368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_026690 // RefSeq // Mus musculus aspartate dehydrogenase domain containing (Aspdh), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000035929 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44465391:44467757:1 gene:ENSMUSG00000038704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000133801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:44465426:44467212:1 gene:ENSMUSG00000038704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000135624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:44465444:44467316:1 gene:ENSMUSG00000038704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000146128 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:44465409:44467334:1 gene:ENSMUSG00000038704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:44465417:44467221:1 gene:ENSMUSG00000038704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000156957 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:44466469:44467695:1 gene:ENSMUSG00000038704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC019451 // GenBank // Mus musculus aspartate dehydrogenase domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:28543 IMAGE:4194890), complete cds. // chr7 // 86 // 97 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44449426:44471514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_028169 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 71, member E1 (Fam71e1), mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_006541244 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 71, member E1 (Fam71e1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006541245 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 71, member E1 (Fam71e1), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_006541249 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 71, member E1 (Fam71e1), transcript variant X8, mRNA. // chr7 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000107927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:44496588:44501134:1 gene:ENSMUSG00000051113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AB473729 // GenBank // Mus musculus GARI-L5 mRNA for Golgi-associated Rab2B interactor-like 5, complete cds. // chr7 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// AK006222 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700021N13 product:RIKEN cDNA 1700021N13 gene, full insert sequence. // chr7 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC049752 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 71, member E1, mRNA (cDNA clone MGC:58802 IMAGE:6773108), complete cds. // chr7 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC130017 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 71, member E1, mRNA (cDNA clone MGC:161173 IMAGE:40140477), complete cds. // chr7 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000022699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44496827:44501104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_008437 // RefSeq // Mus musculus napsin A aspartic peptidase (Napsa), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000002274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44572432:44586862:1 gene:ENSMUSG00000002204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB038144 // GenBank // Mus musculus mRNA for aspartic proteinase family member similar to renin, complete cds. // chr7 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC014813 // GenBank // Mus musculus napsin A aspartic peptidase, mRNA (cDNA clone MGC:25302 IMAGE:4221844), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// D88899 // GenBank // Mus musculus Aspl mRNA for kidney-derived aspartic protease-like protein, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000153124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:44572432:44583191:1 gene:ENSMUSG00000002204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// AK007861 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810054L16 product:kidney-derived aspartic protease-like protein, full insert sequence. // chr7 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000022700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44572616:44602005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001290682 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 3 (Kcnc3), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// NM_008422 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 3 (Kcnc3), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// XM_006540657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 3 (Kcnc3), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000071062 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:44590664:44602141:1 gene:ENSMUSG00000062785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107905 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:44590664:44602141:1 gene:ENSMUSG00000062785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000107906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:7:44590886:44604754:1 gene:ENSMUSG00000062785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107907 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44590664:44604754:1 gene:ENSMUSG00000062785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// XM_006540662 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 3 (Kcnc3), transcript variant X14, mRNA. // chr7 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// GENSCAN00000022700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44572616:44602005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0
XR_140822 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2310016G11 gene (2310016G11Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000094460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:44676965:44678235:1 gene:ENSMUSG00000070574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK009387 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310016G11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_029317 // RefSeq // Mus musculus IZUMO family member 2 (Izumo2), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000085422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:44708743:44719842:1 gene:ENSMUSG00000066500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC048526 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700023D19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58435 IMAGE:6772588), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44708743:44715455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_133945 // RefSeq // Mus musculus vaccinia related kinase 3 (Vrk3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000002275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44748413:44777515:1 gene:ENSMUSG00000002205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000144515 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:44748647:44764803:1 gene:ENSMUSG00000002205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000147952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:44748636:44777515:1 gene:ENSMUSG00000002205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000165957 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:44748646:44763055:1 gene:ENSMUSG00000002205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC010473 // GenBank // Mus musculus vaccinia related kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:8021 IMAGE:3586304), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024782 // GenBank // Mus musculus vaccinia related kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:29926 IMAGE:5123949), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024839 // GenBank // Mus musculus vaccinia related kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:38623 IMAGE:5355521), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC034196 // GenBank // Mus musculus vaccinia related kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:37512 IMAGE:4985176), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44747942:44786872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_053074 // RefSeq // Mus musculus nucleoporin 62 (Nup62), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44816088:44830809:1 gene:ENSMUSG00000043858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:44816088:44830809:1 gene:ENSMUSG00000043858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC005784 // GenBank // Mus musculus nucleoporin 62, mRNA (cDNA clone MGC:12027 IMAGE:3603287), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC089317 // GenBank // Mus musculus nucleoporin 62, mRNA (cDNA clone MGC:101995 IMAGE:6829463), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44828563:44830143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_001290694 // RefSeq // Mus musculus AKT1 substrate 1 (proline-rich) (Akt1s1), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_030488 // RefSeq // Mus musculus microRNA 707 (Mir707), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102096 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:44849699:44849771:1 gene:ENSMUSG00000076051 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107882 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:44849629:44854736:1 gene:ENSMUSG00000011096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:44849344:44855417:1 gene:ENSMUSG00000011096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-707 // miRBase Micro RNA Database // MI0004691 Mus musculus miR-707 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT061073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001077591 // RefSeq // Mus musculus testis-specific serine kinase substrate (Tsks), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NM_011651 // RefSeq // Mus musculus testis-specific serine kinase substrate (Tsks), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// XM_006540793 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis-specific serine kinase substrate (Tsks), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000080233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:7:44943261:44958032:1 gene:ENSMUSG00000059891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000120929 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:44943222:44958035:1 gene:ENSMUSG00000059891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// AF025310 // GenBank // Mus musculus testis specific serine kinase substrate mRNA, complete cds. // chr7 // 94 // 97 // 32 // 34 // 0 /// BC118618 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 22 substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:148222 IMAGE:40107271), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC121827 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 22 substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:148221 IMAGE:40107270), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:44943284:44957725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 74 // 24 // 26 // 0
NM_009101 // RefSeq // Mus musculus Harvey rat sarcoma oncogene, subgroup R (Rras), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:45017978:45021646:1 gene:ENSMUSG00000038387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC009105 // GenBank // Mus musculus Harvey rat sarcoma oncogene, subgroup R, mRNA (cDNA clone MGC:6162 IMAGE:3483313), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC110562 // GenBank // Mus musculus Harvey rat sarcoma oncogene, subgroup R, mRNA (cDNA clone MGC:129444 IMAGE:40049793), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC110563 // GenBank // Mus musculus Harvey rat sarcoma oncogene, subgroup R, mRNA (cDNA clone MGC:129445 IMAGE:40049794), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC145932 // GenBank // Mus musculus Harvey rat sarcoma oncogene, subgroup R, mRNA (cDNA clone MGC:175819 IMAGE:40131235), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC145934 // GenBank // Mus musculus Harvey rat sarcoma oncogene, subgroup R, mRNA (cDNA clone MGC:175821 IMAGE:40131237), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// M21019 // GenBank // Mouse R-ras mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000142115 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:45019470:45020405:1 gene:ENSMUSG00000038387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000008091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45018016:45021364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONMMUT061108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NR_029560 // RefSeq // Mus musculus microRNA 150 (Mir150), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083561 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:45121757:45121821:1 gene:ENSMUSG00000065495 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-150 // miRBase Micro RNA Database // MI0000172 Mus musculus miR-150 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT061119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC028989 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 17 (sodium-dependent inorganic phosphate cotransporter), member 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:5363081), partial cds. // chr7 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// BC054462 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 17 (sodium-dependent inorganic phosphate cotransporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:62859 IMAGE:6494471), complete cds. // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_182993 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 17 (sodium-dependent inorganic phosphate cotransporter), member 7 (Slc17a7), mRNA. // chr7 // 92 // 92 // 35 // 38 // 1 /// ENSMUST00000085374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:45163921:45176138:1 gene:ENSMUSG00000070570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 92 // 35 // 38 // 1 /// AK044409 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930011F10 product:inferred: brain-specific Na-dependent inorganic phosphate cotransporter {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr7 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1 /// GENSCAN00000008123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45164083:45175044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT061134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1
NM_053256 // RefSeq // Mus musculus parathyroid hormone 2 (Pth2), mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006540562 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus parathyroid hormone 2 (Pth2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// XM_006540563 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus parathyroid hormone 2 (Pth2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// XM_006540564 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus parathyroid hormone 2 (Pth2), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000042754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:45180995:45181838:1 gene:ENSMUSG00000038300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AF399674 // GenBank // Mus musculus tuberoinfundibular 39 residue protein precursor, mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540565 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus parathyroid hormone 2 (Pth2), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// AY048587 // GenBank // Mus musculus tuberoinfundibular 39 residue protein precursor (TIP39) mRNA, partial cds. // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000008094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45181309:45181772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
XM_355900 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 6, member 16 (Slc6a16), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000179310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:45259031:45272689:1 gene:ENSMUSG00000094152 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45259154:45273299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000176276 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:45277513:45288994:1 gene:ENSMUSG00000070568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45279884:45288533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NR_110499 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L14, pseudogene 1 (Rpl14-ps1), non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000026901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:45324941:45325651:1 gene:ENSMUSG00000046721 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000008205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45324965:45325615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_010473 // RefSeq // Mus musculus histidine rich calcium binding protein (Hrc), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000085351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:7:45335290:45338973:1 gene:ENSMUSG00000038239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF132218 // GenBank // Mus musculus histidine-rich calcium-binding protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF158597 // GenBank // Mus musculus histidine-rich Ca2+ binding protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC141121 // GenBank // Mus musculus histidine rich calcium binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:176082 IMAGE:9055733), complete cds. // chr7 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45335427:45339465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NR_015480 // RefSeq // Mus musculus metastasis associated gene 2 (Mtag2), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NR_027802 // RefSeq // Mus musculus metastasis associated gene 2 (Mtag2), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:45367233:45367948:1 gene:ENSMUSG00000091510 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:45366163:45367948:1 gene:ENSMUSG00000049661 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// U88401 // GenBank // Mus musculus tumor metastasis associated gene product (MAG) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT061153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT061154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010596 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 7 (Kcna7), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:45405960:45411382:1 gene:ENSMUSG00000038201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF032099 // GenBank // Mus musculus voltage-gated potassium channel Kv1.7 (Kcnc7) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AY779767 // GenBank // Mus musculus voltage-dependent potassium channel Kv1.7 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000008105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45406458:45416075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_198190 // RefSeq // Mus musculus neurotrophin 5 (Ntf5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006541312 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurotrophin 5 (Ntf5), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006541313 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurotrophin 5 (Ntf5), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000058879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:45413695:45417178:1 gene:ENSMUSG00000074121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC052191 // GenBank // Mus musculus neurotrophin 5, mRNA (cDNA clone MGC:59562 IMAGE:6505258), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45406458:45416075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_008497 // RefSeq // Mus musculus luteinizing hormone beta (Lhb), mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000072453 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:45420820:45421861:1 gene:ENSMUSG00000100916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000038194 // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000127256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:45418353:45421845:1 gene:ENSMUSG00000038194 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000155591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:45418353:45421854:1 gene:ENSMUSG00000038194 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000137350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:45418372:45421636:1 gene:ENSMUSG00000038194 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000008128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45418370:45421778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONMMUT061161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_030678 // RefSeq // Mus musculus glycogen synthase 1, muscle (Gys1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000003964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:45434844:45456619:1 gene:ENSMUSG00000003865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000107766 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:45434877:45455847:1 gene:ENSMUSG00000003865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000150689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:45448254:45455339:1 gene:ENSMUSG00000003865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// BC019389 // GenBank // Mus musculus glycogen synthase 1, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:25254 IMAGE:3663506), complete cds. // chr7 // 94 // 97 // 32 // 34 // 0 /// BC131687 // GenBank // Mus musculus glycogen synthase 1, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:150296 IMAGE:40111722), complete cds. // chr7 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// BC131688 // GenBank // Mus musculus glycogen synthase 1, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:150297 IMAGE:40111723), complete cds. // chr7 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// BC152550 // GenBank // Mus musculus glycogen synthase 1, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:165203 IMAGE:40111724), complete cds. // chr7 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// U53218 // GenBank // Mus musculus muscle glycogen synthase (Gys) mRNA, complete cds. // chr7 // 91 // 94 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45435053:45455367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AK148019 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270140L05 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
AK158602 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230024L20 product:unknown EST, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008051 // RefSeq // Mus musculus fucosyltransferase 1 (Fut1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540616 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fucosyltransferase 1 (Fut1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000008605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:45617606:45621059:1 gene:ENSMUSG00000008461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF113533 // GenBank // Mus musculus GDP-L-fucose:beta-D-galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase FUT-I mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC109145 // GenBank // Mus musculus fucosyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:129302 IMAGE:40045410), complete cds. // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC109146 // GenBank // Mus musculus fucosyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:129303 IMAGE:40045419), complete cds. // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NM_001271981 // RefSeq // Mus musculus fucosyltransferase 1 (Fut1), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// XR_391317 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fucosyltransferase 1 (Fut1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000008104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45618624:45638884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001018013 // RefSeq // Mus musculus izumo sperm-egg fusion 1 (Izumo1), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006541222 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus izumo sperm-egg fusion 1 (Izumo1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000033100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:45621811:45627242:1 gene:ENSMUSG00000064158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB195681 // GenBank // Mus musculus mRNA for Izumo, complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC139270 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:8862292. // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:45624393:45628823:1 gene:ENSMUSG00000064158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000008104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45618624:45638884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// BC023959 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5321306, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr7 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_028544 // RefSeq // Mus musculus Ras interacting protein 1 (Rasip1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:45627488:45639093:1 gene:ENSMUSG00000044562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC028444 // GenBank // Mus musculus Ras interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:1245387), complete cds. // chr7 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC127059 // GenBank // Mus musculus Ras interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:150078 IMAGE:40109852), complete cds. // chr7 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// BC150766 // GenBank // Mus musculus Ras interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:183677 IMAGE:9087677), complete cds. // chr7 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45618624:45638884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001033356 // RefSeq // Mus musculus netrin 5 (Ntn5), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_001289692 // RefSeq // Mus musculus netrin 5 (Ntn5), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_001289693 // RefSeq // Mus musculus netrin 5 (Ntn5), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006540885 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus netrin 5 (Ntn5), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006540886 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus netrin 5 (Ntn5), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006540892 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus netrin 5 (Ntn5), transcript variant X8, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000107742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:45684416:45694556:1 gene:ENSMUSG00000070564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000182750 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:45684022:45694553:1 gene:ENSMUSG00000070564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000183120 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:45684429:45694427:1 gene:ENSMUSG00000070564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC150901 // GenBank // Mus musculus netrin 5, mRNA (cDNA clone MGC:183812 IMAGE:9087812), complete cds. // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XR_391341 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus netrin 5 (Ntn5), transcript variant X11, misc_RNA. // chr7 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000008093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45684866:45694390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0
NM_009800 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 11 (Car11), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000003360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:45699843:45704682:1 gene:ENSMUSG00000003273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000126106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:45701035:45703477:1 gene:ENSMUSG00000003273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 92 // 39 // 12 // 13 // 0 /// AB079601 // GenBank // Mus musculus m CA-RP XI mRNA for carbonic anhydrase-related protein XI, complete cds. // chr7 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// AF050105 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase-related protein XI mRNA, partial cds. // chr7 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// AY075026 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase-related 11 protein mRNA, complete cds. // chr7 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC019393 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 11, mRNA (cDNA clone MGC:25553 IMAGE:3968862), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000137294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:45701016:45703477:1 gene:ENSMUSG00000003273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000008113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45700273:45709880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1
NM_016974 // RefSeq // Mus musculus D site albumin promoter binding protein (Dbp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:45705088:45710155:1 gene:ENSMUSG00000059824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC018323 // GenBank // Mus musculus D site albumin promoter binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:18803 IMAGE:4195116), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006540596 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus D site albumin promoter binding protein (Dbp), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// BC084676 // GenBank // Mus musculus D site albumin promoter binding protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:6442243), complete cds. // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// XM_006540597 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus D site albumin promoter binding protein (Dbp), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSMUST00000107740 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:45705624:45710114:1 gene:ENSMUSG00000059824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENSMUST00000107741 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:45705624:45710114:1 gene:ENSMUSG00000059824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSMUST00000123587 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:45707104:45710028:1 gene:ENSMUSG00000059824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// BC064094 // GenBank // Mus musculus D site albumin promoter binding protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:963965). // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000008113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45700273:45709880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001033170 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 83, member E (Fam83e), mRNA. // chr7 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XR_391366 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 83, member E (Fam83e), transcript variant X2, misc_RNA. // chr7 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000129507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:45721212:45729492:1 gene:ENSMUSG00000054161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000146391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:45725859:45729489:1 gene:ENSMUSG00000054161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000156689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:45721220:45724859:1 gene:ENSMUSG00000054161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AK015058 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930403C10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC139284 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 83, member E, mRNA (cDNA clone MGC:170911 IMAGE:8862306), complete cds. // chr7 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000008132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45722181:45728848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0
NM_133950 // RefSeq // Mus musculus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) endoplasmic reticulum protein retention receptor 1 (Kdelr1), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000002855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:45872772:45883731:1 gene:ENSMUSG00000002778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107718 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:45873127:45883247:1 gene:ENSMUSG00000002778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000107719 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:45872825:45883729:1 gene:ENSMUSG00000002778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000133022 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:45881437:45883353:1 gene:ENSMUSG00000002778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000146932 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:45872887:45874365:1 gene:ENSMUSG00000002778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AY027435 // GenBank // Mus musculus KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 1 mRNA, complete cds. // chr7 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// BC011370 // GenBank // Mus musculus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) endoplasmic reticulum protein retention receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:11608 IMAGE:3152867), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45873011:45883484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT061213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
NM_001033243 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 114 (Ccdc114), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XM_006540764 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 114 (Ccdc114), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000038720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:45928398:45948956:1 gene:ENSMUSG00000040189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000133500 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:45924243:45936669:1 gene:ENSMUSG00000040189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// BC013491 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 114, mRNA (cDNA clone IMAGE:4216925), partial cds. // chr7 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// BC172013 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054299, containing frame-shift errors. // chr7 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000007750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45940347:45948644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 43 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000007823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:45924511:45936904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0
NM_153057 // RefSeq // Mus musculus nodal modulator 1 (Nomo1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000033121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:46033698:46084212:1 gene:ENSMUSG00000030835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC024503 // GenBank // Mus musculus nodal modulator 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4983418), complete cds. // chr7 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC033923 // GenBank // Mus musculus nodal modulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:37848 IMAGE:5099899), complete cds. // chr7 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// BC072630 // GenBank // Mus musculus nodal modulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:99906 IMAGE:6833516), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000007808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:46033832:46088667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
AK036542 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830132E05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_013624 // RefSeq // Mus musculus otogelin (Otog), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// ENSMUST00000164538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:46240987:46311434:1 gene:ENSMUSG00000009487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// AK165831 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730002A12 product:otogelin, full insert sequence. // chr7 // 100 // 30 // 17 // 17 // 0 /// U96411 // GenBank // Mus musculus otogelin mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 100 // 53 // 56 // 0 /// GENSCAN00000007827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:46245331:46310169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 47 // 47 // 0
NM_010866 // RefSeq // Mus musculus myogenic differentiation 1 (Myod1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000072514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:46376474:46379092:1 gene:ENSMUSG00000009471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC103613 // GenBank // Mus musculus myogenic differentiation 1, mRNA (cDNA clone MGC:124165 IMAGE:40046317), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC103618 // GenBank // Mus musculus myogenic differentiation 1, mRNA (cDNA clone MGC:124167 IMAGE:40046319), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC103619 // GenBank // Mus musculus myogenic differentiation 1, mRNA (cDNA clone MGC:124166 IMAGE:40046318), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// M18779 // GenBank // Mouse myoblast D1 (MyoD1) mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// M84918 // GenBank // M.musculus MyoD mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:46376673:46383270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_008421 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 1 (Kcnc1), transcript variant B, mRNA. // chr7 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000025202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:46396497:46433353:1 gene:ENSMUSG00000058975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// AK139272 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730088I03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC125470 // GenBank // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:159173 IMAGE:40129985), complete cds. // chr7 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// BC132439 // GenBank // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:164070 IMAGE:40130716), complete cds. // chr7 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// NM_001112739 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 1 (Kcnc1), transcript variant A, mRNA. // chr7 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// ENSMUST00000160433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:7:46397648:46438375:1 gene:ENSMUSG00000058975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000007774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:46397678:46454573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_011314 // RefSeq // Mus musculus serum amyloid A 2 (Saa2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000075982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:46751833:46754314:1 gene:ENSMUSG00000057465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// M11130 // GenBank // Mouse serum amyloid A protein SAA2 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// L22190 // GenBank // Mus musculus serum amyloid A protein mRNA, complete cds. // chr7 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// U60438 // GenBank // Mus musculus serum amyloid A protein isoform 2 mRNA, complete cds. // chr7 // 55 // 100 // 6 // 11 // 0 /// GENSCAN00000007792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:46752291:46754109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0
NM_001291075 // RefSeq // Mus musculus general transcription factor II H, polypeptide 1 (Gtf2h1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_008186 // RefSeq // Mus musculus general transcription factor II H, polypeptide 1 (Gtf2h1), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000006774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:46796103:46823800:1 gene:ENSMUSG00000006599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000107644 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:46796671:46823275:1 gene:ENSMUSG00000006599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000128420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:46801687:46822909:1 gene:ENSMUSG00000006599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000144708 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:46808452:46815418:1 gene:ENSMUSG00000006599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000165031 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:46796114:46805027:1 gene:ENSMUSG00000006599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 25 // 8 // 9 // 0 /// BC052837 // GenBank // Mus musculus general transcription factor II H, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:60648 IMAGE:30049274), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000007777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:46796048:46819214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// AJ002366 // GenBank // Mus musculus mRNA for transcription factor TFIIH, 62 kD subunit. // chr7 // 93 // 78 // 26 // 28 // 0
NM_013580 // RefSeq // Mus musculus lactate dehydrogenase C (Ldhc), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006540679 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lactate dehydrogenase C (Ldhc), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006540681 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lactate dehydrogenase C (Ldhc), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000014545 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:46861203:46878142:1 gene:ENSMUSG00000030851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000126004 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:46861407:46876474:1 gene:ENSMUSG00000030851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000148565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:46861322:46875788:1 gene:ENSMUSG00000030851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC049602 // GenBank // Mus musculus lactate dehydrogenase C, mRNA (cDNA clone MGC:58259 IMAGE:6774010), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// L10389 // GenBank // Mouse lactate dehydrogenase-X mRNA, complete cds. // chr7 // 86 // 78 // 18 // 21 // 0 /// M17587 // GenBank // Mouse sperm-specific lactate dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:46847326:46881383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NR_033461 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9999 (Gm9999), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000070660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:46983580:46987795:1 gene:ENSMUSG00000056509 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC100529 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30920585. // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000188312 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:46983661:46987803:1 gene:ENSMUSG00000056509 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT061257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000185832 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:46986820:46987796:1 gene:ENSMUSG00000056509 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT061258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_026436 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 86A (Tmem86a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000010451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:47050640:47054776:1 gene:ENSMUSG00000010307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC056619 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 86A, mRNA (cDNA clone MGC:68084 IMAGE:4987281), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:47007491:47053852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
XM_884524 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MAS-related GPR, member B13 (Mrgprb13), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000188191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:48311304:48312288:1 gene:ENSMUSG00000099620 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr7 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000053766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:48311304:48312323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0
NM_207539 // RefSeq // Mus musculus MAS-related GPR, member B8 (Mrgprb8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:48388526:48389648:1 gene:ENSMUSG00000050870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138164 // GenBank // Mus musculus MAS-related GPR, member B8, mRNA (cDNA clone MGC:169788 IMAGE:8861183), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138165 // GenBank // Mus musculus MAS-related GPR, member B8, mRNA (cDNA clone MGC:169789 IMAGE:8861184), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:48388583:48389575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028031 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 13 (Zdhhc13), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000118927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:48789003:48827440:1 gene:ENSMUSG00000030471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000125280 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:48789026:48824717:1 gene:ENSMUSG00000030471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC046599 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 13, mRNA (cDNA clone MGC:54871 IMAGE:6311721), complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000053761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:48789111:48805757:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0
AK157552 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830223B06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172901 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933405O20 gene (4933405O20Rik), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119710 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:50599190:50600530:1 gene:ENSMUSG00000084234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC060958 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933405O20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:74047 IMAGE:6744040), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:50557892:50600410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000022777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:51153038:51155424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:51170517:51176512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:83411977:83414337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 100 // 10 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:50984542:50986908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 100 // 10 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:50912346:50943154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 100 // 10 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:50975790:50978156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 100 // 10 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:50949537:50951903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 100 // 10 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:50958284:50960650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 100 // 10 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:50967039:50969404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 100 // 10 // 30 // 0
NM_001271879 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 5 (Ano5), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// NM_177694 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 5 (Ano5), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NR_073508 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 5 (Ano5), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr7 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// XM_006540822 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anoctamin 5 (Ano5), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000043944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:51511029:51598709:1 gene:ENSMUSG00000055489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AB125740 // GenBank // Mus musculus GDD1 mRNA for integral membrane protein GDD1, complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// AB206762 // GenBank // Mus musculus mRNA for integral membrane protein GDD1, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC109163 // GenBank // Mus musculus anoctamin 5, mRNA (cDNA clone MGC:129351 IMAGE:40047987), complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000022772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:51510284:51669360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 80 // 36 // 45 // 1
NM_080853 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 17 (sodium-dependent inorganic phosphate cotransporter), member 6 (Slc17a6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000032710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:51621830:51671125:1 gene:ENSMUSG00000030500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF324864 // GenBank // Mus musculus vesicular glutamate transporter 2 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC038375 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 17 (sodium-dependent inorganic phosphate cotransporter), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:36456 IMAGE:5357143), complete cds. // chr7 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AK043753 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830028E05 product:solute carrier family 17 (sodium-dependent inorganic phosphate cotransporter), member 6, full insert sequence. // chr7 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000022772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:51510284:51669360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
ENSMUST00000117187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:52755465:52755728:1 gene:ENSMUSG00000074092 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_178705 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper protein 2 (Luzp2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000082373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:54835959:55265366:1 gene:ENSMUSG00000063297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AY164459 // GenBank // Mus musculus leucine-zipper motif 2 (Luzp2) mRNA, complete cds. // chr7 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// BC075646 // GenBank // Mus musculus leucine zipper protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:100090 IMAGE:30620475), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AK082126 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230011D12 product:leucine zipper protein 2, full insert sequence. // chr7 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// GENSCAN00000014729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:55034494:55350951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
ENSMUST00000158015 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:55702154:55702215:1 gene:ENSMUSG00000088640 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT061357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_015495 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A230056P14 gene (A230056P14Rik), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000130189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:55962531:55980868:1 gene:ENSMUSG00000087178 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK075669 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110060P04 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 94 // 50 // 16 // 17 // 0 /// NONMMUT061365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT061370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 92 // 38 // 12 // 13 // 0 /// NONMMUT061371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT061372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT061367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONMMUT061369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_010418 // RefSeq // Mus musculus hect (homologous to the E6-AP (UBE3A) carboxyl terminus) domain and RCC1 (CHC1)-like domain (RLD) 2 (Herc2), mRNA. // chr7 // 100 // 99 // 93 // 93 // 0 /// ENSMUST00000076226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:56050155:56231794:1 gene:ENSMUSG00000030451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 99 // 93 // 93 // 0 /// ENSMUST00000164095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:56050389:56231763:1 gene:ENSMUSG00000030451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 99 // 93 // 93 // 0 /// AF061529 // GenBank // Mus musculus rjs (rjs) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 99 // 89 // 93 // 0 /// AF071173 // GenBank // Mus musculus Herc2 (Herc2) mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 99 // 90 // 93 // 0 /// AK165121 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330019L19 product:hect (homologous to the E6-AP (UBE3A) carboxyl terminus) domain and RCC1 (CHC1)-like domain (RLD) 2, full insert sequence. // chr7 // 100 // 19 // 18 // 18 // 0 /// EU234008 // GenBank // Mus musculus LINE L1 ASL1/Herc2 fusion protein mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 95 // 86 // 89 // 0 /// GENSCAN00000047848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:56068026:56231132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 88 // 88 // 0
NM_021879 // RefSeq // Mus musculus oculocutaneous albinism II (Oca2), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// XM_006540699 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus oculocutaneous albinism II (Oca2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// XM_006540701 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus oculocutaneous albinism II (Oca2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 61 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000032633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:56239760:56536517:1 gene:ENSMUSG00000030450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000144739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:56239808:56536513:1 gene:ENSMUSG00000030450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000152693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:56239777:56536265:1 gene:ENSMUSG00000030450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// BC119220 // GenBank // Mus musculus oculocutaneous albinism II, mRNA (cDNA clone MGC:155536 IMAGE:8733969), complete cds. // chr7 // 96 // 94 // 44 // 46 // 0 /// BC120549 // GenBank // Mus musculus oculocutaneous albinism II, mRNA (cDNA clone MGC:155786 IMAGE:40129472), complete cds. // chr7 // 96 // 94 // 44 // 46 // 0 /// GENSCAN00000047840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:56254788:56293938:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 22 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000047846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:56314678:56477336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 33 // 16 // 49 // 1
NR_033504 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9962 (Gm9962), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:57387304:57408879:1 gene:ENSMUSG00000055048 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:57387272:57409941:1 gene:ENSMUSG00000055048 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009728 // RefSeq // Mus musculus ATPase, class V, type 10A (Atp10a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006540582 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase, class V, type 10A (Atp10a), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000168747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:58658202:58829426:1 gene:ENSMUSG00000025324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AF156549 // GenBank // Mus musculus putative E1-E2 ATPase mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 95 // 40 // 42 // 0 /// BC138356 // GenBank // Mus musculus ATPase, class V, type 10A, mRNA (cDNA clone MGC:169981 IMAGE:8861376), complete cds. // chr7 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC138357 // GenBank // Mus musculus ATPase, class V, type 10A, mRNA (cDNA clone MGC:169982 IMAGE:8861377), complete cds. // chr7 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000028924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:58781135:58807778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:58813490:58830577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 34 // 15 // 15 // 0
GENSCAN00000028932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:59109956:59110485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 95 // 18 // 20 // 0
NM_176902 // RefSeq // Mus musculus UBA-like domain containing 2 (Ubald2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_003376 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 7367 (Gm7367), non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:60155538:60156170:1 gene:ENSMUSG00000047370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116434094:116439077:1 gene:ENSMUSG00000050628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116434509:116438223:1 gene:ENSMUSG00000050628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0 /// BC116983 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 100, member B, mRNA (cDNA clone MGC:151360 IMAGE:40126302), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119080 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 100, member B, mRNA (cDNA clone MGC:155396 IMAGE:8733829), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:60155609:60156103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116434045:116438305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010882 // RefSeq // Mus musculus necdin (Ndn), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:62348277:62349928:1 gene:ENSMUSG00000033585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147249 // GenBank // Mus musculus necdin, mRNA (cDNA clone MGC:182402 IMAGE:9056296), complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC147250 // GenBank // Mus musculus necdin, mRNA (cDNA clone MGC:182404 IMAGE:9056298), complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// M80840 // GenBank // M.musculus necdin mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC015268 // GenBank HTC // Mus musculus necdin, mRNA (cDNA clone IMAGE:4217666). // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013779 // RefSeq // Mus musculus melanoma antigen, family L, 2 (Magel2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:62376979:62381640:1 gene:ENSMUSG00000056972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC054763 // GenBank // Mus musculus melanoma antigen, family L, 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6414320), complete cds. // chr7 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000017214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:62365266:62381204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_130880 // RefSeq // Mus musculus OTU domain containing 7A (Otud7a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006540682 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus OTU domain containing 7A (Otud7a), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006540683 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus OTU domain containing 7A (Otud7a), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000058476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:63444751:63759028:1 gene:ENSMUSG00000033510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000177534 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:63650815:63757989:1 gene:ENSMUSG00000033510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000044081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:63698579:63755057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NONMMUT002567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0
NR_029805 // RefSeq // Mus musculus microRNA 211 (Mir211), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083651 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:64205806:64205911:1 gene:ENSMUSG00000065585 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-211 // miRBase Micro RNA Database // MI0000708 Mus musculus miR-211 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT061864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172742 // RefSeq // Mus musculus myotubularin related protein 10 (Mtmr10), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000032736 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:64287670:64340407:1 gene:ENSMUSG00000030522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000173448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:64300633:64321221:1 gene:ENSMUSG00000030522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 92 // 30 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000174210 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:64287782:64338029:1 gene:ENSMUSG00000030522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// BC055074 // GenBank // Mus musculus myotubularin related protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:60820 IMAGE:30052208), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000035060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:64287782:64337955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT061869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT061870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0
NM_028626 // RefSeq // Mus musculus methylmalonyl CoA epimerase (Mcee), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006541223 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methylmalonyl CoA epimerase (Mcee), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000037205 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:64392645:64412121:1 gene:ENSMUSG00000033429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC038157 // GenBank // Mus musculus methylmalonyl CoA epimerase, mRNA (cDNA clone MGC:48155 IMAGE:1479934), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_172310 // RefSeq // Mus musculus threonyl-tRNA synthetase-like 2 (Tarsl2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000032728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:65644898:65692091:1 gene:ENSMUSG00000030515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000127354 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:65678064:65690082:1 gene:ENSMUSG00000030515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 26 // 11 // 11 // 0 /// BC039225 // GenBank // Mus musculus threonyl-tRNA synthetase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:31414 IMAGE:4458085), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000126941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:65644898:65683814:1 gene:ENSMUSG00000030515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1 /// AK044290 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930005L19 product:similar to THREONYL-TRNA SYNTHETASE [Homo sapiens], full insert sequence. // chr7 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1 /// GENSCAN00000018122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:65644945:65712755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1
NM_026795 // RefSeq // Mus musculus TM2 domain containing 3 (Tm2d3), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NM_178056 // RefSeq // Mus musculus TM2 domain containing 3 (Tm2d3), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000032726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:65693417:65701902:1 gene:ENSMUSG00000078681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000065574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:65691169:65701911:1 gene:ENSMUSG00000078681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000107495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:65693417:65701913:1 gene:ENSMUSG00000078681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000129166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:65693467:65697879:1 gene:ENSMUSG00000078681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 50 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000143508 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:65693447:65697732:1 gene:ENSMUSG00000078681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// BC024620 // GenBank // Mus musculus TM2 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:28525 IMAGE:4192712), complete cds. // chr7 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:65644945:65712755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1
NONMMUT061890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001291184 // RefSeq // Mus musculus proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 (Pcsk6), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// NM_011048 // RefSeq // Mus musculus proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 (Pcsk6), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENSMUST00000055576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:65862029:66050335:1 gene:ENSMUSG00000030513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENSMUST00000098391 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:65862136:66050334:1 gene:ENSMUSG00000030513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// ENSMUST00000176209 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:65862432:66050340:1 gene:ENSMUSG00000030513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:65862171:66049003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_021336 // RefSeq // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A (Snrpa1), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000032723 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:66060544:66074580:1 gene:ENSMUSG00000030512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139082 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:66060564:66071612:1 gene:ENSMUSG00000030512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:66060338:66074582:1 gene:ENSMUSG00000030512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AF230356 // GenBank // Mus musculus U2 small nuclear ribonucleoprotein A mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC013777 // GenBank // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A, mRNA (cDNA clone MGC:6298 IMAGE:2651704), complete cds. // chr7 // 90 // 97 // 26 // 29 // 0 /// BC029642 // GenBank // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A, mRNA (cDNA clone MGC:25531 IMAGE:3588138), complete cds. // chr7 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// ENSMUST00000123157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:66060299:66069526:1 gene:ENSMUSG00000030512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// AK032921 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720473C09 product:small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A, full insert sequence. // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:66060611:66088846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_024439 // RefSeq // Mus musculus VCP-interacting membrane protein (Vimp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000101801 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:66079649:66089412:1 gene:ENSMUSG00000075701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF335543 // GenBank // Mus musculus minor histocompatibility antigen precursor (H47) mRNA, H47a allele, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC011091 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 47, mRNA (cDNA clone MGC:18954 IMAGE:3983625), complete cds. // chr7 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:66060611:66088846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001081163 // RefSeq // Mus musculus chondroitin sulfate synthase 1 (Chsy1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006540910 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chondroitin sulfate synthase 1 (Chsy1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000036372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:66109515:66173789:1 gene:ENSMUSG00000032640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:66109911:66172421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
AK157511 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830220E19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00006552 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT061926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001164201 // RefSeq // Mus musculus ceramide synthase 3 (Cers3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006541001 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ceramide synthase 3 (Cers3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000066475 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:66743504:66823692:1 gene:ENSMUSG00000030510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// DQ358087 // GenBank // Mus musculus longevity assurance 3-like protein (Lass3) mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// DQ646881 // GenBank // Mus musculus longevity assurance 3-like protein variant 2 (Lass3) mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:66753618:66821842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001033877 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 17 (Adamts17), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540843 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 17 (Adamts17), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540844 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 17 (Adamts17), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540845 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 17 (Adamts17), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:66839735:67152621:1 gene:ENSMUSG00000058145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107478 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:66839813:67152625:1 gene:ENSMUSG00000058145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:66842255:67062157:1 gene:ENSMUSG00000058145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:67001323:67088213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK086977 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030017D19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033877 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 17 (Adamts17), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006540845 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 17 (Adamts17), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000098382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:66839735:67152621:1 gene:ENSMUSG00000058145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107478 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:66839813:67152625:1 gene:ENSMUSG00000058145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000154103 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:67047471:67078304:1 gene:ENSMUSG00000058145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// XM_006540843 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 17 (Adamts17), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// XM_006540844 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 17 (Adamts17), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000038217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:67108991:67150066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000038202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:67001323:67088213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001033877 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 17 (Adamts17), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:66839735:67152621:1 gene:ENSMUSG00000058145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107478 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:66839813:67152625:1 gene:ENSMUSG00000058145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191051 // RefSeq // Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 4 (Lysmd4), transcript variant A, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_175215 // RefSeq // Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 4 (Lysmd4), transcript variant B, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006541236 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 4 (Lysmd4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000058771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:67222544:67228468:1 gene:ENSMUSG00000043831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000179106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:67222616:67228468:1 gene:ENSMUSG00000043831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC030310 // GenBank // Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5369153). // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC057459 // GenBank // Mus musculus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:65434 IMAGE:4504057), complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK039294 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330017C21 product:RIKEN cDNA 4930506D23 gene, full insert sequence. // chr7 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000038209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:67223619:67226472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT061936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr7 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_010513 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor I receptor (Igf1r), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000005671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:67952859:68226780:1 gene:ENSMUSG00000005533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// AF056187 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor I receptor mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// AK155884 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730313B05 product:insulin-like growth factor I receptor, full insert sequence. // chr7 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// BC138868 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor I receptor, mRNA (cDNA clone MGC:170495 IMAGE:8861890), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// BC138869 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor I receptor, mRNA (cDNA clone MGC:170496 IMAGE:8861891), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// AK155079 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630119N11 product:insulin-like growth factor I receptor, full insert sequence. // chr7 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// GENSCAN00000035323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:68164765:68226401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 37 // 37 // 0
NR_003648 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 5334 (Gm5334), non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:68618456:68620009:1 gene:ENSMUSG00000094854 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:68618838:68619557:1 gene:ENSMUSG00000094854 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr7 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0
BC070425 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B130024G19 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6405558). // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_045850 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA B130024G19 gene (B130024G19Rik), long non-coding RNA. // chr7 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000189966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:70365159:70411142:1 gene:ENSMUSG00000100005 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:70386493:70411146:1 gene:ENSMUSG00000100005 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000191084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:70386493:70402483:1 gene:ENSMUSG00000100005 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr7 // 87 // 50 // 13 // 15 // 0 /// NONMMUT062058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT062057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// NONMMUT062061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
AK032923 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720473E08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116191 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein of the cerebellum 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:40088151), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC126931 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40087431. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00006557 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT062059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177740 // RefSeq // Mus musculus repulsive guidance molecule family member A (Rgma), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000094312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:73375520:73419899:1 gene:ENSMUSG00000070509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:73391227:73419899:1 gene:ENSMUSG00000070509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC023870 // GenBank // Mus musculus RGM domain family, member A, mRNA (cDNA clone MGC:38550 IMAGE:5353958), complete cds. // chr7 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BC059072 // GenBank // Mus musculus RGM domain family, member A, mRNA (cDNA clone MGC:69915 IMAGE:6826181), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119206 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:73375520:73419899:1 gene:ENSMUSG00000070509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// GENSCAN00000015160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:73388333:73428036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001162532 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 174, member B (Fam174b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:73740307:73776919:1 gene:ENSMUSG00000078670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC110691 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 174, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:6314230). // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:73740503:73832688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
AK135124 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430706K06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000091506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:75366055:75366264:1 gene:ENSMUSG00000069196 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000044925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:75366055:75384473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 71 // 9 // 10 // 0 /// NONMMUT062244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001122780 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 25 (Klhl25), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NM_029652 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 25 (Klhl25), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NM_182782 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 25 (Klhl25), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000092073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:75848338:75874130:1 gene:ENSMUSG00000055652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000171155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:75848338:75874130:1 gene:ENSMUSG00000055652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AK157879 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930003D19 product:hypothetical Kelch repeat/Galactose oxidase, central containing protein, full insert sequence. // chr7 // 94 // 58 // 17 // 18 // 0 /// BC027373 // GenBank // Mus musculus kelch-like 25 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:36331 IMAGE:4948451), complete cds. // chr7 // 88 // 81 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:75848161:75867117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
ENSMUST00000026854 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:76411062:76700123:1 gene:ENSMUSG00000025754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107442 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:7:76411062:76766608:1 gene:ENSMUSG00000025754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AK052433 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430020F16 product:hypothetical Zn-dependent exopeptidases structure containing protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// DQ867033 // GenBank // Mus musculus cytosolic carboxypeptidase 4 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NM_001199224 // RefSeq // Mus musculus ATP/GTP binding protein-like 1 (Agbl1), mRNA. // chr7 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// XM_006540903 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP/GTP binding protein-like 1 (Agbl1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:76384081:76461978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
ENSMUST00000064591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:78578830:78581034:1 gene:ENSMUSG00000052629 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC006942 // GenBank // Mus musculus predicted gene, ENSMUSG00000052629, mRNA (cDNA clone MGC:6909 IMAGE:2655941), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:78578830:78581038:1 gene:ENSMUSG00000052629 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029826 // RefSeq // Mus musculus microRNA 7-2 (Mir7-2), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000083675 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:78888277:78888373:1 gene:ENSMUSG00000065609 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-7a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000729 Mus musculus miR-7a-2 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT062309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_026531 // RefSeq // Mus musculus apoptosis enhancing nuclease (Aen), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:78896009:78908378:1 gene:ENSMUSG00000030609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000107425 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:78895927:78909140:1 gene:ENSMUSG00000030609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK076421 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4831429I18 product:RIKEN cDNA 2700083B06 gene, full insert sequence. // chr7 // 83 // 62 // 15 // 18 // 0 /// BC022614 // GenBank // Mus musculus apoptosis enhancing nuclease, mRNA (cDNA clone MGC:31146 IMAGE:4167800), complete cds. // chr7 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NM_001162939 // RefSeq // Mus musculus apoptosis enhancing nuclease (Aen), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENSMUST00000107421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:78895934:78908374:1 gene:ENSMUSG00000030609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// ENSMUST00000123824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:78895854:78911209:1 gene:ENSMUSG00000030609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000052197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:78856420:78907416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_007424 // RefSeq // Mus musculus aggrecan (Acan), mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000032835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:79053483:79115099:1 gene:ENSMUSG00000030607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// L07049 // GenBank // Mus musculus aggrecan mRNA, complete cds. // chr7 // 86 // 95 // 30 // 35 // 0 /// GENSCAN00000052212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:79081141:79114276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0
NM_018811 // RefSeq // Mus musculus abhydrolase domain containing 2 (Abhd2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000037315 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:79273201:79365508:1 gene:ENSMUSG00000039202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF201730 // GenBank // Mus musculus alpha/beta hydrolase-2 fold protein (LABH-2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF546701 // GenBank // Mus musculus a/b hydrolase II (Abhd2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC027098 // GenBank // Mus musculus abhydrolase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:35944 IMAGE:5356667), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC089477 // GenBank // Mus musculus abhydrolase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:107122 IMAGE:6741521), complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000135333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:79273255:79345371:1 gene:ENSMUSG00000039202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// AK053460 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130019K17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000052205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:79264212:79360156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_145946 // RefSeq // Mus musculus Fanconi anemia, complementation group I (Fanci), mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000036865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:79392338:79450264:1 gene:ENSMUSG00000039187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000117227 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:79392317:79450265:1 gene:ENSMUSG00000039187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// ENSMUST00000118959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:79392324:79409582:1 gene:ENSMUSG00000039187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000132091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:79392353:79450264:1 gene:ENSMUSG00000039187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// AK085572 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630042J03 product:hypothetical Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen containing protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// BC025462 // GenBank HTC // Mus musculus Fanconi anemia, complementation group I, mRNA (cDNA clone IMAGE:5345929), with apparent retained intron. // chr7 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// BC027836 // GenBank // Mus musculus Fanconi anemia, complementation group I, mRNA (cDNA clone IMAGE:5322726). // chr7 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000137667 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:79399136:79435691:1 gene:ENSMUSG00000039187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 59 // 23 // 39 // 1 /// GENSCAN00000052203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:79395912:79449231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0
AK139984 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230032P10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141697 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030029J11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// KnowTID_00006584 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT062330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029818 // RefSeq // Mus musculus microRNA 9-3 (Mir9-3), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000175497 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:79505264:79505353:1 gene:ENSMUSG00000093238 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-9-3 // miRBase Micro RNA Database // MI0000721 Mus musculus miR-9-3 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT062337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_029835 // RefSeq // Mus musculus TOPBP1-interacting checkpoint and replication regulator (Ticrr), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000035977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:79660196:79698134:1 gene:ENSMUSG00000046591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC158103 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730590G19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:189993 IMAGE:9088180), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AK157802 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130049O14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1 /// GENSCAN00000052209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:79660340:79691003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000035939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:7:79710283:79712357:1 gene:ENSMUSG00000039133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK034273 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330171B17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037927 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 93 (Wdr93), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006541048 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 93 (Wdr93), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000035622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:79743163:79785950:1 gene:ENSMUSG00000039099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC150920 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 93, mRNA (cDNA clone MGC:183831 IMAGE:9087831), complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006541053 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 93 (Wdr93), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000005435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:79749120:79785934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_008589 // RefSeq // Mus musculus mesoderm posterior 2 (Mesp2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:79810727:79813431:1 gene:ENSMUSG00000030543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC145652 // GenBank // Mus musculus mesoderm posterior 2, mRNA (cDNA clone MGC:175539 IMAGE:40130955), complete cds. // chr7 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC145654 // GenBank // Mus musculus mesoderm posterior 2, mRNA (cDNA clone MGC:175541 IMAGE:40130957), complete cds. // chr7 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// U71125 // GenBank // Mus musculus bHLH protein MesP2 (Mesp2) mRNA, complete cds. // chr7 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0
NM_001145999 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 710 (Zfp710), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001146000 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 710 (Zfp710), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_175433 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 710 (Zfp710), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540742 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 710 (Zfp710), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:80026228:80092751:1 gene:ENSMUSG00000048897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:80024814:80092751:1 gene:ENSMUSG00000048897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000166250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:80024814:80092751:1 gene:ENSMUSG00000048897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK083979 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130071H01 product:weakly similar to ZINC FINGER PROTEIN [Fugu rubripes], full insert sequence. // chr7 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC058640 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 710, mRNA (cDNA clone MGC:73501 IMAGE:6835601), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC060641 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 710, mRNA (cDNA clone MGC:79151 IMAGE:6849964), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:80081077:80090504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_013659 // RefSeq // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4B (Sema4b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000032754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:80186841:80226394:1 gene:ENSMUSG00000030539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK173249 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1745 protein. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// DQ073331 // GenBank // Mus musculus semaphorin 4B (Sema4b) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107383 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:80186841:80221832:1 gene:ENSMUSG00000030539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// AK028896 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732467N09 product:sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4B, full insert sequence. // chr7 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// GENSCAN00000005403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:80198653:80225335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_178752 // RefSeq // Mus musculus GDP-D-glucose phosphorylase 1 (Gdpgp1), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000062915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:80232867:80241006:1 gene:ENSMUSG00000050973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK085577 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630042P08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC037479 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D330012F22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:47349 IMAGE:4458984), complete cds. // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_177765 // RefSeq // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 13 (Ttll13), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006540914 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 13 (Ttll13), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006540925 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 13 (Ttll13), transcript variant X13, mRNA. // chr7 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000058266 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:7:80246376:80260821:1 gene:ENSMUSG00000045467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000107381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:80246555:80259195:1 gene:ENSMUSG00000045467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AK161519 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933440B12 product:Hypothetical tubulin-tyrosine ligase containing protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000133958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:80246994:80252882:1 gene:ENSMUSG00000045467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// BC024578 // GenBank HTC // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 13, mRNA (cDNA clone IMAGE:5059754), with apparent retained intron. // chr7 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000005444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:80238223:80315185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NR_028053 // RefSeq // Mus musculus neugrin, neurite outgrowth associated (Ngrn), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138005 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:80261220:80265374:1 gene:ENSMUSG00000047084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB047544 // GenBank // Mus musculus mRNA for FI58GM, complete cds. // chr7 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC004034 // GenBank // Mus musculus neugrin, neurite outgrowth associated, mRNA (cDNA clone MGC:7646 IMAGE:3495639), complete cds. // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NM_031375 // RefSeq // Mus musculus neugrin, neurite outgrowth associated (Ngrn), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSMUST00000117989 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:80261215:80265374:1 gene:ENSMUSG00000047084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000005444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:80238223:80315185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_178070 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 33B (yeast) (Vps33b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006540846 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vacuolar protein sorting 33B (yeast) (Vps33b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006540854 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vacuolar protein sorting 33B (yeast) (Vps33b), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000032749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:80269649:80291579:1 gene:ENSMUSG00000030534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:80269734:80285750:1 gene:ENSMUSG00000030534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000135053 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:80269740:80291571:1 gene:ENSMUSG00000030534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000150585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:80269679:80291573:1 gene:ENSMUSG00000030534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK134927 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430519I23 product:vacuolar protein sorting 33B (yeast), full insert sequence. // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC034170 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 33B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:36556 IMAGE:4971695), complete cds. // chr7 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:80238223:80315185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_026812 // RefSeq // Mus musculus HD domain containing 3 (Hddc3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006541153 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HD domain containing 3 (Hddc3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_006541154 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HD domain containing 3 (Hddc3), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_006541155 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HD domain containing 3 (Hddc3), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000032747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:80343137:80346097:1 gene:ENSMUSG00000030532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK080642 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830036O08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC038310 // GenBank // Mus musculus HD domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:47986 IMAGE:5119020), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC055847 // GenBank // Mus musculus HD domain containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3662340). // chr7 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:80343138:80345778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK145197 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930017M01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 75 // 57 // 12 // 16 // 0
ENSMUST00000118776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:80429210:80430740:1 gene:ENSMUSG00000081664 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT062405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:80417243:80448272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_009553 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and SCAN domain containing 2 (Zscan2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006540811 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and SCAN domain containing 2 (Zscan2), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000044115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:80862108:80876516:1 gene:ENSMUSG00000038797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000132163 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:80860920:80874969:1 gene:ENSMUSG00000038797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000147125 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:80860953:80875888:1 gene:ENSMUSG00000038797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000155128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:80862900:80875098:1 gene:ENSMUSG00000038797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC046961 // GenBank // Mus musculus zinc finger and SCAN domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:54769 IMAGE:6392290), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// X55126 // GenBank // M.musculus Zfp-29 gene for zinc finger protein. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:80857339:80876377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_178707 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 592 (Zfp592), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000107353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:80993681:81045164:1 gene:ENSMUSG00000005621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000125137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:81038015:81041453:1 gene:ENSMUSG00000005621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// BC094321 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 592, mRNA (cDNA clone MGC:106584 IMAGE:6401005), complete cds. // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC118972 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 592, mRNA (cDNA clone MGC:144155 IMAGE:40098313), complete cds. // chr7 // 92 // 73 // 22 // 24 // 0 /// BC118973 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 592, mRNA (cDNA clone MGC:144156 IMAGE:40098315), complete cds. // chr7 // 92 // 73 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:81023290:81041863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0
NM_054085 // RefSeq // Mus musculus alpha-kinase 3 (Alpk3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:81057600:81105612:1 gene:ENSMUSG00000038763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF338872 // GenBank // Mus musculus myocytic induction/differentiation originator mRNA, complete cds. // chr7 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:81064805:81215614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0
NM_001004184 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 28 (sodium-coupled nucleoside transporter), member 1 (Slc28a1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XR_391350 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 28 (sodium-coupled nucleoside transporter), member 1 (Slc28a1), transcript variant X5, misc_RNA. // chr7 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000026820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:81114799:81170416:1 gene:ENSMUSG00000025726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000119083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:81114850:81170416:1 gene:ENSMUSG00000025726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC061230 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 28 (sodium-coupled nucleoside transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:74379 IMAGE:30379959), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000006177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:81064805:81215614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1
NM_008803 // RefSeq // Mus musculus phosphodiesterase 8A (Pde8a), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000026672 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:81213596:81334533:1 gene:ENSMUSG00000025584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000128154 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:81295707:81315187:1 gene:ENSMUSG00000025584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000130494 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:81306693:81319440:1 gene:ENSMUSG00000025584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 92 // 30 // 12 // 13 // 0 /// AF067806 // GenBank // Mus musculus cAMP-specific cyclic nucleotide phosphodiesterase PDE8 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC125578 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 8A, mRNA (cDNA clone MGC:159281 IMAGE:40130093), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// BC132145 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 8A, mRNA (cDNA clone MGC:163776 IMAGE:40130422), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000006184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:81233656:81333690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000117118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:81445920:81446696:1 gene:ENSMUSG00000081747 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000006190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:81405886:81453516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT062447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NR_035501 // RefSeq // Mus musculus microRNA 1839 (Mir1839), microRNA. // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000175366 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:81529855:81529981:1 gene:ENSMUSG00000093107 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:81523563:81530146:1 gene:ENSMUSG00000097277 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-1839 // miRBase Micro RNA Database // MI0009991 Mus musculus miR-1839 stem-loop // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT062452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT062464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK080712 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930012L21 product:hypothetical Arginine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr7 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONMMUT062487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001190374 // RefSeq // Mus musculus ADAMTS-like 3 (Adamtsl3), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000173287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:82335732:82614450:1 gene:ENSMUSG00000070469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000173828 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:82337218:82612430:1 gene:ENSMUSG00000070469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000007389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:82519670:82574774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0
XR_404313 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700010L04 gene (1700010L04Rik), transcript variant X7, misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XR_404316 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700010L04 gene (1700010L04Rik), transcript variant X10, misc_RNA. // chr7 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000032872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:82856263:82859404:1 gene:ENSMUSG00000030636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000178848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:82856253:82859848:1 gene:ENSMUSG00000030636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK005840 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700010L04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XR_404307 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700010L04 gene (1700010L04Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr7 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// XR_404308 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700010L04 gene (1700010L04Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr7 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// XR_404310 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700010L04 gene (1700010L04Rik), transcript variant X4, misc_RNA. // chr7 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// XR_404311 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700010L04 gene (1700010L04Rik), transcript variant X5, misc_RNA. // chr7 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// ENSMUST00000179662 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:82851599:82859849:1 gene:ENSMUSG00000030636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONMMUT062511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_175366 // RefSeq // Mus musculus mex3 homolog B (C. elegans) (Mex3b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:82867333:82871563:1 gene:ENSMUSG00000057706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK173330 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA2009 protein. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:82866296:82870209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000066005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:83148644:83155922:1 gene:ENSMUSG00000053528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC145053 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053601. // chr7 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0
GENSCAN00000020329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:83411977:83414337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_177695 // RefSeq // Mus musculus transmembrane channel-like gene family 3 (Tmc3), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// XM_006507591 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane channel-like gene family 3 (Tmc3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0 /// XM_006507592 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane channel-like gene family 3 (Tmc3), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// XR_378233 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane channel-like gene family 3 (Tmc3), transcript variant X3, misc_RNA. // chr7 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000039317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:83584931:83625614:1 gene:ENSMUSG00000038540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000163297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:83584927:83618107:1 gene:ENSMUSG00000038540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000164944 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:83585092:83622947:1 gene:ENSMUSG00000038540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// AY236491 // GenBank // Mus musculus transmembrane channel-like protein 3 (Tmc3) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0 /// AY263157 // GenBank // Mus musculus Tmc3 protein (Tmc3) mRNA, complete cds. // chr7 // 98 // 96 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000020318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:83601783:83640376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 21 // 48 // 1 /// GENSCAN00000020332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:83572590:83600277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1
NM_023403 // RefSeq // Mus musculus mesoderm development candidate 2 (Mesdc2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:83892000:83901532:1 gene:ENSMUSG00000038503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130103 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:83892002:83897767:1 gene:ENSMUSG00000038503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC014742 // GenBank // Mus musculus mesoderm development candidate 2, mRNA (cDNA clone MGC:25959 IMAGE:4239248), complete cds. // chr7 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// XR_378266 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mesoderm development candidate 2 (Mesdc2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr7 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// BC058612 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30033905, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr7 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENSMUST00000153377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:83892330:83898080:1 gene:ENSMUSG00000038503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// AK172009 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830028N06 product:mesoderm development candiate 2, full insert sequence. // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000039325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:83892290:83898005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000175002 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:84170565:84170722:1 gene:ENSMUSG00000092743 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT062549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_038175 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2610206C17 gene (2610206C17Rik), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000129059 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:84689640:84776549:1 gene:ENSMUSG00000085236 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:84775703:84776020:1 gene:ENSMUSG00000085236 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT062568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT062569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT062571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146415 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 291 (Olfr291), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078172 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:84853573:84857318:1 gene:ENSMUSG00000070460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC114974 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 291, mRNA (cDNA clone MGC:140931 IMAGE:40043317), complete cds. // chr7 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:84856365:84857318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146416 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 290 (Olfr290), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:84915781:84916728:1 gene:ENSMUSG00000070459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127990 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 290, mRNA (cDNA clone MGC:157560 IMAGE:40135660), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:84915781:84916728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105184 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 71 (Vmn2r71), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000172338 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:85615462:85624547:1 gene:ENSMUSG00000091205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_212436 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 301 (Olfr301), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:86403849:86413299:1 gene:ENSMUSG00000061549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:86395204:86413299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000174262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:86443021:86443926:1 gene:ENSMUSG00000092401 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr7 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT062604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0
NM_001011767 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 299 (Olfr299), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000057734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:86465413:86466405:1 gene:ENSMUSG00000020168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_146618 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 297 (Olfr297), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:86526759:86527691:1 gene:ENSMUSG00000057067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:86526774:86527691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146851 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 295 (Olfr295), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000078447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:86585277:86586206:1 gene:ENSMUSG00000059319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000172965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:86583903:86586206:1 gene:ENSMUSG00000059319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:86561813:86664674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_001011752 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 293 (Olfr293), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000081474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:86663664:86664674:1 gene:ENSMUSG00000063394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000011185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:86561813:86664674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_146620 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 292 (Olfr292), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:86688340:86695384:1 gene:ENSMUSG00000060688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105188 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 77 (Vmn2r77), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000164996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:86795141:86812032:1 gene:ENSMUSG00000090949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:86801490:86878392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
ENSMUST00000174393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:86884865:86885740:1 gene:ENSMUSG00000092195 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001105189 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 78 (Vmn2r78), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000170835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:86915300:86955177:1 gene:ENSMUSG00000091962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001105190 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 79 (Vmn2r79), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000164462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:86996465:87037968:1 gene:ENSMUSG00000090362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000045062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:86920849:87122654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001081414 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 5 (Grm5), transcript variant a, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_001143834 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 5 (Grm5), transcript variant b, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:87602544:88130869:1 gene:ENSMUSG00000049583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:87803815:88134907:1 gene:ENSMUSG00000049583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000155358 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:87803815:88131654:1 gene:ENSMUSG00000049583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:87602544:88130869:1 gene:ENSMUSG00000049583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC096533 // GenBank // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:30620703), partial cds. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC144727 // GenBank // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 5, mRNA (cDNA clone MGC:178283 IMAGE:9053275), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// EF508472 // GenBank // Mus musculus metabotropic glutamate receptor subtype 5b (Grm5) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:87945973:88130869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_009982 // RefSeq // Mus musculus cathepsin C (Ctsc), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:88278085:88310888:1 gene:ENSMUSG00000030560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128791 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:88278134:88308023:1 gene:ENSMUSG00000030560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// BC067063 // GenBank // Mus musculus cathepsin C, mRNA (cDNA clone MGC:91337 IMAGE:30541061), complete cds. // chr7 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// U74683 // GenBank // Mus musculus dipeptidyl peptidase I precursor mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// U89269 // GenBank // Mus musculus preprodipeptidyl peptidase I mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006507319 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cathepsin C (Ctsc), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// ENSMUST00000131108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:88278138:88291390:1 gene:ENSMUSG00000030560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// ENSMUST00000152834 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:88296852:88302300:1 gene:ENSMUSG00000030560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// AK152524 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830078D18 product:cathepsin C, full insert sequence. // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000002213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:88274270:88309902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_028238 // RefSeq // Mus musculus RAB38, member RAS oncogene family (Rab38), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:88430273:88491466:1 gene:ENSMUSG00000030559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AB232634 // GenBank // Mus musculus Rab38 mRNA for Rab38, complete cds. // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AY062237 // GenBank // Mus musculus RAB38 mRNA, complete cds. // chr7 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC089578 // GenBank // Mus musculus RAB38, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:107581 IMAGE:6762755), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:88344118:88490760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_008055 // RefSeq // Mus musculus frizzled homolog 4 (Drosophila) (Fzd4), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006507376 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus frizzled homolog 4 (Drosophila) (Fzd4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000058755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:89404366:89410110:1 gene:ENSMUSG00000049791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC015256 // GenBank // Mus musculus frizzled homolog 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:18403 IMAGE:4238940), complete cds. // chr7 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// U43317 // GenBank // Mus musculus putative transmembrane receptor (frizzled 4) mRNA, complete cds. // chr7 // 75 // 59 // 12 // 16 // 0 /// GENSCAN00000024574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:89404687:89408360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000032858 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:89510023:89510491:1 gene:ENSMUSG00000030623 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000179361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:89510007:89511368:1 gene:ENSMUSG00000030623 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK131801 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700123D09 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT062631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT062632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT062633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSMUST00000181784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:89980749:89981848:1 gene:ENSMUSG00000097585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK053947 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230006A20 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONMMUT062642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0
NM_027298 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 89 (Ccdc89), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:90426312:90428660:1 gene:ENSMUSG00000044362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006105 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700019B01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:90426584:90427696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001162918 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 90B (Ccdc90b), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_025515 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 90B (Ccdc90b), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006508116 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 90B (Ccdc90b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000032842 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:92561149:92582294:1 gene:ENSMUSG00000030613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000085017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:7:92561149:92582294:1 gene:ENSMUSG00000030613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK011631 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610030G13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 79 // 85 // 22 // 28 // 0 /// BC034878 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 90B, mRNA (cDNA clone MGC:41311 IMAGE:3468518), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC115973 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 90B, mRNA (cDNA clone MGC:144297 IMAGE:40100643), complete cds. // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:92539087:92581953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_029494 // RefSeq // Mus musculus RAB30, member RAS oncogene family (Rab30), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006508293 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB30, member RAS oncogene family (Rab30), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000032879 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:92741603:92837117:1 gene:ENSMUSG00000030643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:92819905:92836647:1 gene:ENSMUSG00000030643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AB232626 // GenBank // Mus musculus Rab30 mRNA for Rab30, complete cds. // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AF399756 // GenBank // Mus musculus RAB30 (Rab30) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AK017185 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5033421K01 product:RAB30 (Rab30) mRNA, full insert sequence. // chr7 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// BC017550 // GenBank // Mus musculus RAB30, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:28980 IMAGE:4503909), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107179 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:92819920:92836644:1 gene:ENSMUSG00000030643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000038887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:92819991:92853723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_028243 // RefSeq // Mus musculus prolylcarboxypeptidase (angiotensinase C) (Prcp), mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000076052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:92875253:92934573:1 gene:ENSMUSG00000061119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC055022 // GenBank // Mus musculus prolylcarboxypeptidase (angiotensinase C), mRNA (cDNA clone MGC:62717 IMAGE:4017462), complete cds. // chr7 // 81 // 76 // 21 // 26 // 0 /// BC089575 // GenBank HTC // Mus musculus prolylcarboxypeptidase (angiotensinase C), mRNA (cDNA clone IMAGE:6761194), containing frame-shift errors. // chr7 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:92896387:92933179:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0
AK138625 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330078G03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00006610 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT062747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021427 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 181, member B (Fam181b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:93079879:93081715:1 gene:ENSMUSG00000051515 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC043329 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 181, member B, mRNA (cDNA clone MGC:49453 IMAGE:5369836), complete cds. // chr7 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// EF537863 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J mRNA sequence. // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000038885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:93080021:93097689:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
ENSMUST00000071770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:94197210:94197461:1 gene:ENSMUSG00000096033 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:94197210:94197461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT062765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000038925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:95446916:95463112:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000068485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:95958215:95961613:1 gene:ENSMUSG00000055099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK030497 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330421K23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011858 // RefSeq // Mus musculus teneurin transmembrane protein 4 (Tenm4), mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006507792 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus teneurin transmembrane protein 4 (Tenm4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006507801 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus teneurin transmembrane protein 4 (Tenm4), transcript variant X10, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000107162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:96171244:96911093:1 gene:ENSMUSG00000048078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000107165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:7:96211671:96911093:1 gene:ENSMUSG00000048078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000107166 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:7:96210637:96911093:1 gene:ENSMUSG00000048078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AB025413 // GenBank // Mus musculus mRNA for Ten-m4, complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// AF059485 // GenBank // Mus musculus DOC4 (Doc4) mRNA, complete cds. // chr7 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000035491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:96640715:96911935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0
XM_006507792 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus teneurin transmembrane protein 4 (Tenm4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000129445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:96210146:96438966:1 gene:ENSMUSG00000048078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000138760 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:96210146:96550300:1 gene:ENSMUSG00000048078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK031375 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030416D17 product:odd Oz/ten-m homolog 4 (Drosophila), full insert sequence. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:96209110:96211076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT062773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_030489 // RefSeq // Mus musculus microRNA 708 (Mir708), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000102189 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:96249424:96249532:1 gene:ENSMUSG00000076143 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// mmu-mir-708 // miRBase Micro RNA Database // MI0004692 Mus musculus miR-708 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT062774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0