NM_001290633 // RefSeq // Mus musculus RALBP1 associated Eps domain containing protein 2 (Reps2), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_178256 // RefSeq // Mus musculus RALBP1 associated Eps domain containing protein 2 (Reps2), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000101102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:162411954:162643601:-1 gene:ENSMUSG00000040855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000112334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:162411954:162643649:-1 gene:ENSMUSG00000040855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000154424 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:162411954:162565514:-1 gene:ENSMUSG00000040855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000155863 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:162526385:162565612:-1 gene:ENSMUSG00000040855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// AY263368 // GenBank // Mus musculus RALBP1-associated Eps domain containing protein 2 (Reps2) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC139012 // GenBank // Mus musculus RALBP1 associated Eps domain containing protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:170639 IMAGE:8862034), complete cds. // chrX // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC145500 // GenBank // Mus musculus RALBP1 associated Eps domain containing protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:179071 IMAGE:9054063), complete cds. // chrX // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:162492562:162560409:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 45 // 17 // 17 // 0
NM_025932 // RefSeq // Mus musculus synapse associated protein 1 (Syap1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006528969 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synapse associated protein 1 (Syap1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000033723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:162857057:162888447:-1 gene:ENSMUSG00000031357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK161413 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930556G16 product:synapse associated protein 1, full insert sequence. // chrX // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC021373 // GenBank // Mus musculus synapse associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:29225 IMAGE:5039534), complete cds. // chrX // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000134629 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:162857909:162863472:-1 gene:ENSMUSG00000031357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrX // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:162781092:162888464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
NM_009789 // RefSeq // Mus musculus S100 calcium binding protein G (S100g), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000038769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:162961992:162964599:-1 gene:ENSMUSG00000040808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF028071 // GenBank // Mus musculus calcium binding protein D-9k mRNA, complete cds. // chrX // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// AF136283 // GenBank // Mus musculus calcium-binding protein D9k mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF293948 // GenBank // Mus musculus calbindin-D9K major form (Calb3) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF293949 // GenBank // Mus musculus calbindin-D9K minor form (Calb3) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC010751 // GenBank // Mus musculus S100 calcium binding protein G, mRNA (cDNA clone MGC:18373 IMAGE:4237050), complete cds. // chrX // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:162962136:162964196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 54 // 14 // 15 // 0
ENSMUST00000082494 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:163150391:163150497:-1 gene:ENSMUSG00000064428 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT074607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008177 // RefSeq // Mus musculus gastrin releasing peptide receptor (Grpr), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033730 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:163513904:163549677:-1 gene:ENSMUSG00000031364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC113145 // GenBank // Mus musculus gastrin releasing peptide receptor, mRNA (cDNA clone MGC:130509 IMAGE:40047100), complete cds. // chrX // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// M57922 // GenBank // Mouse GRP/bombesin receptor mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// M61000 // GenBank // Mouse bombesin/gastrin-releasing peptide receptor mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:163515952:163550982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_028842 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 138, retrogene 1 (Rnf138rt1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000059320 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:163760139:163761329:-1 gene:ENSMUSG00000083695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:163760237:163760983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_181315 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 5b, mitochondrial (Car5b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:163976822:164027997:-1 gene:ENSMUSG00000031373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF192978 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase VB mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chrX // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC034413 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 5b, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:35938 IMAGE:4221296), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:163979191:164000887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_009173 // RefSeq // Mus musculus seven in absentia 1B (Siah1b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528768 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus seven in absentia 1B (Siah1b), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000037928 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:164070705:164076121:-1 gene:ENSMUSG00000040749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:164070705:164076150:-1 gene:ENSMUSG00000040749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC052887 // GenBank // Mus musculus seven in absentia 1B, mRNA (cDNA clone MGC:60693 IMAGE:30053109), complete cds. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000134272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:164071885:164076493:-1 gene:ENSMUSG00000040749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_009759 // RefSeq // Mus musculus BMX non-receptor tyrosine kinase (Bmx), mRNA. // chrX // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000112263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:164193355:164250368:-1 gene:ENSMUSG00000031377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000112265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:164192842:164258193:-1 gene:ENSMUSG00000031377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// AF012104 // GenBank // Mus musculus cytoplasmic tyrosine kinase (bmx) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// BC138104 // GenBank // Mus musculus BMX non-receptor tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:169728 IMAGE:8861123), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// BC138105 // GenBank // Mus musculus BMX non-receptor tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:169729 IMAGE:8861124), complete cds. // chrX // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// U88091 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine kinase Bmx mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000049160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:164195389:164249150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 63 // 26 // 26 // 0
NM_183427 // RefSeq // Mus musculus glycine receptor, alpha 2 subunit (Glra2), mRNA. // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006528835 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycine receptor, alpha 2 subunit (Glra2), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006528837 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycine receptor, alpha 2 subunit (Glra2), transcript variant X5, mRNA. // chrX // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000058787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:165129017:165327393:-1 gene:ENSMUSG00000018589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC056342 // GenBank // Mus musculus glycine receptor, alpha 2 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:73412 IMAGE:5708257), complete cds. // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC068987 // GenBank // Mus musculus glycine receptor, alpha 2 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:67503 IMAGE:5708257), complete cds. // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:165130284:165289601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000082563 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:165717409:165717515:-1 gene:ENSMUSG00000064497 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT074645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_177429 // RefSeq // Mus musculus oral-facial-digital syndrome 1 gene homolog (human) (Ofd1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528839 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus oral-facial-digital syndrome 1 gene homolog (human) (Ofd1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000049501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:166390033:166440704:-1 gene:ENSMUSG00000040586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119070 // GenBank // Mus musculus oral-facial-digital syndrome 1 gene homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:155386 IMAGE:8733819), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC120487 // GenBank // Mus musculus oral-facial-digital syndrome 1 gene homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:155724 IMAGE:40129410), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:166391785:166440121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_019773 // RefSeq // Mus musculus RAB9, member RAS oncogene family (Rab9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006528921 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB9, member RAS oncogene family (Rab9), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000049435 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:X:166457750:166479646:-1 gene:ENSMUSG00000079316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 65 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000112091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:166457253:166479867:-1 gene:ENSMUSG00000079316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AB027290 // GenBank // Mus musculus SID 99 mRNA for small GTP binding protein, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC008160 // GenBank // Mus musculus RAB9, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:11411 IMAGE:3964134), complete cds. // chrX // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:166457708:166549012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
ENSMUST00000146636 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:166482220:166483617:-1 gene:ENSMUSG00000085880 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:166457708:166549012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001007577 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII) N-terminal and central domain containing (Tceanc), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112187 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:166503292:166518567:-1 gene:ENSMUSG00000051224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000112188 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:166499812:166510478:-1 gene:ENSMUSG00000051224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006528863 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription elongation factor A (SII) N-terminal and central domain containing (Tceanc), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_019397 // RefSeq // Mus musculus EGF-like-domain, multiple 6 (Egfl6), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000000412 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:166523007:166585720:-1 gene:ENSMUSG00000000402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC117702 // GenBank // Mus musculus EGF-like-domain, multiple 6, mRNA (cDNA clone MGC:141463 IMAGE:40062530), complete cds. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:166457708:166549012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSMUST00000119072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:167028902:167029436:-1 gene:ENSMUSG00000082360 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:167029039:167050564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT074663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_021278 // RefSeq // Mus musculus thymosin, beta 4, X chromosome (Tmsb4x), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112172 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:167207093:167209315:-1 gene:ENSMUSG00000049775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:167207095:167209149:-1 gene:ENSMUSG00000049775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK205579 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0102C16, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000056887, based on BLAT search. // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC018286 // GenBank // Mus musculus thymosin, beta 4, X chromosome, mRNA (cDNA clone MGC:7862 IMAGE:3501378), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X16053 // GenBank // Mouse mRNA for thymosin beta-4. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:167207292:167208827:-1 gene:ENSMUSG00000049775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_133212 // RefSeq // Mus musculus toll-like receptor 8 (Tlr8), mRNA. // chrX // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:167242732:167263788:-1 gene:ENSMUSG00000040522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112170 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:167242696:167264286:-1 gene:ENSMUSG00000040522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY035890 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 8 (Tlr8) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132054 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 8, mRNA (cDNA clone MGC:163685 IMAGE:40130331), complete cds. // chrX // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:167242754:167245843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_026662 // RefSeq // Mus musculus phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 2 (Prps2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000026839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:167346322:167382749:-1 gene:ENSMUSG00000025742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC024942 // GenBank // Mus musculus phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 2, mRNA (cDNA clone MGC:28388 IMAGE:4022452), complete cds. // chrX // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// XM_006528685 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 2 (Prps2), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// ENSMUST00000145456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:167372409:167382710:-1 gene:ENSMUSG00000025742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000034971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:167305336:167405710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
XM_006529012 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6744 (Gm6744), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000119303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:167445989:167446531:-1 gene:ENSMUSG00000081216 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:167445989:167470285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_001033330 // RefSeq // Mus musculus FERM and PDZ domain containing 4 (Frmpd4), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// NM_001290427 // RefSeq // Mus musculus FERM and PDZ domain containing 4 (Frmpd4), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// NM_001290428 // RefSeq // Mus musculus FERM and PDZ domain containing 4 (Frmpd4), transcript variant 3, mRNA. // chrX // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// XM_006528888 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FERM and PDZ domain containing 4 (Frmpd4), transcript variant X6, mRNA. // chrX // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000112145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:X:167471313:167897558:-1 gene:ENSMUSG00000049176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000112146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:167471309:167855077:-1 gene:ENSMUSG00000049176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000112147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:167471309:168577231:-1 gene:ENSMUSG00000049176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000112149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:167471309:168123330:-1 gene:ENSMUSG00000049176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// BC139429 // GenBank // Mus musculus FERM and PDZ domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:171056 IMAGE:8862451), complete cds. // chrX // 97 // 83 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000034964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:167476749:167637685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 68 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000083782 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:X:169695781:169695899:-1 gene:ENSMUSG00000065716 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chrX // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT074711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NR_003635 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933400A11 gene (4933400A11Rik), non-coding RNA. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000068874 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:X:169776378:169779635:-1 gene:ENSMUSG00000055357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000068894 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:169776257:169779592:-1 gene:ENSMUSG00000055357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000112102 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:X:169776425:169779557:-1 gene:ENSMUSG00000055357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK015979 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930535E20 product:similar to F-ACTIN CAPPING PROTEIN ALPHA-1 SUBUNIT (CAPZ ALPHA-1) [Homo sapiens], full insert sequence. // chrX // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:169776477:169777343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NR_029457 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA G530011O06 gene (G530011O06Rik), long non-coding RNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000154810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:169975043:169978917:-1 gene:ENSMUSG00000072844 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:Y:90754513:90754821:-1 gene:ENSMUSG00000095366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:Y:90838869:90839177:-1 gene:ENSMUSG00000096850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT074721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011515 // RefSeq // Mus musculus vesicle-associated membrane protein 7 (Vamp7), mRNA. // chrX_GL456233_random // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051100 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:GRCm38:GL456233.1:10738:39148:-1 gene:ENSMUSG00000051412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX_GL456233_random // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003764 // GenBank // Mus musculus vesicle-associated membrane protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:5929 IMAGE:3601755), complete cds. // chrX_GL456233_random // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017140 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCm38:GL456233.1:1584:62684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX_GL456233_random // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_011667 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-activating enzyme, Chr Y (Uba1y), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006531580 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin-activating enzyme, Chr Y (Uba1y), transcript variant X2, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000115894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:Y:818713:844224:1 gene:ENSMUSG00000069053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AF150963 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-activating enzyme E1 (Ube1y1) mRNA, complete cds. // chrY // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000190013 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:818649:843684:1 gene:ENSMUSG00000069053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000023691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:818568:843522:1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000186362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:3747151:3747731:-1 gene:ENSMUSG00000099970 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrY // 79 // 100 // 30 // 38 // 0 /// ENSMUST00000186637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:3804121:3804701:-1 gene:ENSMUSG00000101016 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrY // 79 // 100 // 30 // 38 // 0 /// ENSMUST00000187552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:2806115:2806692:-1 gene:ENSMUSG00000100700 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrY // 79 // 100 // 30 // 38 // 0 /// ENSMUST00000191243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:2095392:2095972:1 gene:ENSMUSG00000101443 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000029198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:2004507:2095972:1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000187648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:873640:874215:1 gene:ENSMUSG00000101666 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrY // 45 // 100 // 17 // 38 // 0 /// GENSCAN00000029194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:2736967:2815977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 34 // 34 // 13 // 38 // 1
ENSMUST00000190871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:2264257:2278687:1 gene:ENSMUSG00000099614 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000029211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:2426317:2441954:1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_001113395 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 16501 (Gm16501), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001177569 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6026 (Gm6026), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:Y:2599099:2599434:1 gene:ENSMUSG00000094881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000168551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:Y:2720339:2720674:-1 gene:ENSMUSG00000095573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EU315689 // GenBank // Mus musculus H2al2y protein mRNA, complete cds. // chrY // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000185885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:2599103:2599380:1 gene:ENSMUSG00000094881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:2720339:2720674:-1 gene:ENSMUSG00000095573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:2599099:2599434:1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:2720339:2720674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000190394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:3859067:3859672:1 gene:ENSMUSG00000099838 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:3857158:3859681:1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
AK145513 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0009C06 product:hypothetical DeoxyUTP pyrophosphatase/Aspartyl protease, retroviral-type family profile/Retrovirus capsid, C-terminal/Peptidase aspartic/Peptidase aspartic, active site containing protein, full insert sequence. // chrY // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// KnowTID_00003789 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chrY // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// NONMMUT031618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrY // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// AK145590 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0019N16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chrY // 31 // 100 // 8 // 26 // 0 /// AK145700 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0031F10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrY // 31 // 100 // 8 // 26 // 0 /// KnowTID_00001379 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chrY // 31 // 100 // 8 // 26 // 0 /// KnowTID_00001380 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chrY // 31 // 100 // 8 // 26 // 0 /// KnowTID_00002704 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chrY // 31 // 100 // 8 // 26 // 0 /// NONMMUT013638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrY // 31 // 100 // 8 // 26 // 0 /// NONMMUT013641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrY // 31 // 100 // 8 // 26 // 0 /// NONMMUT023055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrY // 31 // 100 // 8 // 26 // 0
ENSMUST00000190764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:4005164:4016574:1 gene:ENSMUSG00000101499 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_011667 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-activating enzyme, Chr Y (Uba1y), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006531580 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin-activating enzyme, Chr Y (Uba1y), transcript variant X2, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000115894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:Y:818713:844224:1 gene:ENSMUSG00000069053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF150963 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-activating enzyme E1 (Ube1y1) mRNA, complete cds. // chrY // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000189146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:670179:695777:-1 gene:ENSMUSG00000100968 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000190013 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:818649:843684:1 gene:ENSMUSG00000069053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:818568:843522:1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:670341:703786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_009570 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 1, Y linked (Zfy1), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000065545 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:Y:725209:797409:-1 gene:ENSMUSG00000053211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000189888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:725128:797405:-1 gene:ENSMUSG00000053211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000023694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:725415:759910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000101925 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:Y:991630:991748:-1 gene:ENSMUSG00000075874 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chrY // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT074746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrY // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_012008 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 3, Y-linked (Ddx3y), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000091190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:Y:1260771:1286629:-1 gene:ENSMUSG00000069045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC021453 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 3, Y-linked, mRNA (cDNA clone MGC:29067 IMAGE:5043470), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000188182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:1260772:1265031:-1 gene:ENSMUSG00000069045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrY // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000188484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:1262313:1286582:-1 gene:ENSMUSG00000069045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrY // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000023080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:1118609:1485500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 82 // 82 // 28 // 34 // 1
NM_148943 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 9, Y chromosome (Usp9y), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000091188 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:Y:1298961:1459782:-1 gene:ENSMUSG00000069044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ307017 // GenBank // Mus musculus mRNA for putative ubiquitin-specific protease (Usp9y gene). // chrY // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:1118609:1485500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000186412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:2061234:2061919:-1 gene:ENSMUSG00000100576 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_009571 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 2, Y linked (Zfy2), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006531600 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 2, Y linked (Zfy2), transcript variant X1, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006531602 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 2, Y linked (Zfy2), transcript variant X3, mRNA. // chrY // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000115891 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:Y:2106175:2170409:-1 gene:ENSMUSG00000000103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AK030048 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932417N18 product:zinc finger protein 2, Y linked, full insert sequence. // chrY // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// M24401 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein (Zfy-2) mRNA, complete cds. // chrY // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// ENSMUST00000187148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:2106015:2150346:-1 gene:ENSMUSG00000000103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_011564 // RefSeq // Mus musculus sex determining region of Chr Y (Sry), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000091178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:Y:2662471:2663658:-1 gene:ENSMUSG00000069036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC111528 // GenBank // Mus musculus sex determining region of Chr Y, mRNA (cDNA clone MGC:129295 IMAGE:40045188), complete cds. // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:2662471:2663658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000186362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:3747151:3747731:-1 gene:ENSMUSG00000099970 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000186637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:3804121:3804701:-1 gene:ENSMUSG00000101016 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000187552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:2806115:2806692:-1 gene:ENSMUSG00000100700 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000191243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:2095392:2095972:1 gene:ENSMUSG00000101443 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrY // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:2004507:2095972:1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// ENSMUST00000187648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:873640:874215:1 gene:ENSMUSG00000101666 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrY // 44 // 100 // 14 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:2736967:2815977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENSMUST00000189153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:3846545:3853545:-1 gene:ENSMUSG00000100360 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000037674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:3845652:3853133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 91 // 85 // 10 // 11 // 0
ENSMUST00000180910 // ENSEMBL // assembly_patch_ensembl:novel chromosome:GRCm38:MG4211_PATCH:66145305:66146387:-1 gene:ENSMUSG00000097389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000021829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:53516571:53518183:1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000056848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4211_PATCH:66144223:66145835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000185212 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:11763935:11764634:-1 gene:ENSMUSG00000101690 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000034374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:16430687:16449977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000040451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:11745322:11764622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000189076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:40905273:40935589:-1 gene:ENSMUSG00000099645 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000187664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:41243623:41274433:1 gene:ENSMUSG00000100091 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
NM_001293057 // RefSeq // Mus musculus predicted gene, 21379 (Gm21379), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_028970 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif 31, Y-linked (Rbm31y), mRNA. // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000179408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:Y:17400761:17402718:1 gene:ENSMUSG00000095365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000179772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:Y:12688110:12690064:1 gene:ENSMUSG00000094135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000188471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:17400761:17402715:1 gene:ENSMUSG00000095365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:17400788:17402485:1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:12688137:12689834:1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000178403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:Y:32380225:32404629:1 gene:ENSMUSG00000094529 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chrY // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000004549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:Y:32380234:32439684:1 transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006542686 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus X-linked lymphocyte-regulated protein PM1-like (LOC102639094), transcript variant X3, mRNA. // chrY // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// ENSMUST00000187146 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:Y:88053315:88079494:1 gene:ENSMUSG00000101915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
ENSMUST00000185348 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:Y:7632774:7638489:-1 gene:ENSMUSG00000094081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000189201 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:Y:7165068:7169293:-1 gene:ENSMUSG00000094484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrY // 100 // 100 // 11 // 11 // 0