NM_172991 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 48 (Rbm48), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006503587 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 48 (Rbm48), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// XM_006503588 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 48 (Rbm48), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000042753 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:3583978:3596585:-1 gene:ENSMUSG00000040302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:3591483:3596082:-1 gene:ENSMUSG00000040302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000176000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:3584776:3596059:-1 gene:ENSMUSG00000040302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// BC029549 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C030048B08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:36303 IMAGE:5012510), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:3583799:3595382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000140871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:3632932:3641539:-1 gene:ENSMUSG00000007415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK162341 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130430G15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000119783 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:3643077:3647806:-1 gene:ENSMUSG00000007415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AB047921 // GenBank // Mus musculus mRNA for ODAG protein, complete cds. // chr5 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC019449 // GenBank // Mus musculus GATA zinc finger domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:28402 IMAGE:4024452), complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NM_026033 // RefSeq // Mus musculus GATA zinc finger domain containing 1 (Gatad1), mRNA. // chr5 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// ENSMUST00000007559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:3639961:3647934:-1 gene:ENSMUSG00000007415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// GENSCAN00000033894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:3641390:3651844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001003909 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and IBR domain containing 1 (Ankib1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NM_001289527 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and IBR domain containing 1 (Ankib1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NM_001289528 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and IBR domain containing 1 (Ankib1), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// NM_001289529 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and IBR domain containing 1 (Ankib1), transcript variant 4, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000043551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:3690000:3803109:-1 gene:ENSMUSG00000040351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AK014523 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4631416I11 product:hypothetical Ankyrin repeat structure containing protein, full insert sequence. // chr5 // 82 // 27 // 9 // 11 // 0 /// BC079620 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and IBR domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30534449), complete cds. // chr5 // 94 // 41 // 16 // 17 // 0 /// BC089031 // GenBank HTC // Mus musculus ankyrin repeat and IBR domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30670508), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// BC145511 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and IBR domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:179082 IMAGE:9054074), complete cds. // chr5 // 98 // 98 // 39 // 40 // 0 /// BC150792 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and IBR domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:183703 IMAGE:9087703), complete cds. // chr5 // 98 // 98 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000033924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:3692756:3772704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0
NM_020010 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 51 (Cyp51), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000001507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:4081145:4104746:-1 gene:ENSMUSG00000001467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF166266 // GenBank // Mus musculus lanosterol 14-alpha-demethylase (Cyp51) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC031813 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 51, mRNA (cDNA clone MGC:19072 IMAGE:4193738), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000151539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:4099124:4103381:-1 gene:ENSMUSG00000001467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:4083125:4104307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
AF039839 // GenBank // Mus musculus adriamycin-resistant related protein (Arr) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021457 // RefSeq // Mus musculus frizzled homolog 1 (Drosophila) (Fzd1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054294 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:4753873:4758035:-1 gene:ENSMUSG00000044674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF054623 // GenBank // Mus musculus frizzled-1 mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// BC053010 // GenBank // Mus musculus frizzled homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:62195 IMAGE:5697795), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:4755652:4757580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000157506 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:4985111:4985237:-1 gene:ENSMUSG00000088131 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT051143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
AK142929 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030003M06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001193659 // RefSeq // Mus musculus claudin 12 (Cldn12), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_001193660 // RefSeq // Mus musculus claudin 12 (Cldn12), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_001193661 // RefSeq // Mus musculus claudin 12 (Cldn12), transcript variant 4, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NM_022890 // RefSeq // Mus musculus claudin 12 (Cldn12), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006503598 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus claudin 12 (Cldn12), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000060947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:5505109:5514873:-1 gene:ENSMUSG00000046798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:5505223:5514730:-1 gene:ENSMUSG00000046798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000115446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:5505111:5514825:-1 gene:ENSMUSG00000046798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000179804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:5505015:5514789:-1 gene:ENSMUSG00000046798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC024057 // GenBank // Mus musculus claudin 12, mRNA (cDNA clone MGC:36392 IMAGE:5100104), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:5508408:5514789:-1 gene:ENSMUSG00000046798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_027399 // RefSeq // Mus musculus six transmembrane epithelial antigen of the prostate 1 (Steap1), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006503601 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus six transmembrane epithelial antigen of the prostate 1 (Steap1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000015796 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:5736317:5749326:-1 gene:ENSMUSG00000015652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169542 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:5736325:5740401:-1 gene:ENSMUSG00000015652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AF297098 // GenBank // Mus musculus six-transmembrane epithelial antigen of the prostate mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AY029584 // GenBank // Mus musculus dudulin mRNA, complete cds. // chr5 // 80 // 96 // 20 // 25 // 0 /// BC061023 // GenBank // Mus musculus six transmembrane epithelial antigen of the prostate 1, mRNA (cDNA clone MGC:74129 IMAGE:30304473), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:5667569:5763671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000158067 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:6014863:6015024:-1 gene:ENSMUSG00000088692 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163223 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 804B (Zfp804b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:6769030:6876523:-1 gene:ENSMUSG00000092094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:6769030:6937880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000082917 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:7177706:7177856:-1 gene:ENSMUSG00000064851 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT051174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_198620 // RefSeq // Mus musculus RUN domain containing 3B (Rundc3b), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000047485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:8490334:8622952:-1 gene:ENSMUSG00000040570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000115378 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:8492267:8622952:-1 gene:ENSMUSG00000040570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC058808 // GenBank // Mus musculus RUN domain containing 3B, mRNA (cDNA clone MGC:68340 IMAGE:6491326), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:8492444:8622612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
NM_023733 // RefSeq // Mus musculus carnitine O-octanoyltransferase (Crot), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006503610 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carnitine O-octanoyltransferase (Crot), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000003720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:8966033:8997324:-1 gene:ENSMUSG00000003623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC006593 // GenBank // Mus musculus carnitine O-octanoyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:7053 IMAGE:3156501), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC012308 // GenBank // Mus musculus carnitine O-octanoyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:19448 IMAGE:3500167), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000146115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:8973603:8982144:-1 gene:ENSMUSG00000003623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// ENSMUST00000157024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:8986181:8997042:-1 gene:ENSMUSG00000003623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// AK037973 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130068E12 product:carnitine O-octanoyltransferase, full insert sequence. // chr5 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000026392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:8966852:8970014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000026395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:8973582:8988285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0
NM_181850 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 3 (Grm3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000004076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:9485236:9725352:-1 gene:ENSMUSG00000003974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC111891 // GenBank // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 3, mRNA (cDNA clone MGC:132907 IMAGE:40061004), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC113170 // GenBank // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 3, mRNA (cDNA clone MGC:132908 IMAGE:40061005), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:9501450:9681219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0
GENSCAN00000052337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:12354918:12355358:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000038942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:13838232:13838786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
GENSCAN00000006758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:16680269:16731074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000166114 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:17223710:17227934:-1 gene:ENSMUSG00000091273 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_006535827 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6673 (Gm6673), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000023161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:17176823:17227937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_010305 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting 1 (Gnai1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000074694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:18265135:18360413:-1 gene:ENSMUSG00000057614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC138862 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting 1, mRNA (cDNA clone MGC:170489 IMAGE:8861884), complete cds. // chr5 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC138865 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting 1, mRNA (cDNA clone MGC:170492 IMAGE:8861887), complete cds. // chr5 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:18267019:18308913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0
NM_001080977 // RefSeq // Mus musculus round spermatid basic protein 1-like (Rsbn1l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:20893028:20951822:-1 gene:ENSMUSG00000039968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK033374 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430412F05 product:weakly similar to CDNA FLJ11220 FIS, CLONE PLACE1008129 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XR_389744 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus round spermatid basic protein 1-like (Rsbn1l), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000036412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:20882351:20951785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_011203 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12 (Ptpn12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006535640 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12 (Ptpn12), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000030556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:20986645:21055911:-1 gene:ENSMUSG00000028771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000126853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:20998453:21009606:-1 gene:ENSMUSG00000028771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000140057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:21009444:21055725:-1 gene:ENSMUSG00000028771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000151813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:21001288:21055753:-1 gene:ENSMUSG00000028771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// BC051980 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, mRNA (cDNA clone MGC:62274 IMAGE:6402545), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// X63440 // GenBank // M.musculus mRNA for P19-protein tyrosine phosphatase. // chr5 // 91 // 97 // 32 // 35 // 0 /// GENSCAN00000038466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:20992673:21031957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000181182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:21119149:21119522:-1 gene:ENSMUSG00000096269 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000038485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:21116064:21123871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
NM_029195 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 146 (Ccdc146), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000030552 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:21317832:21424677:-1 gene:ENSMUSG00000064280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000115245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:21292961:21424677:-1 gene:ENSMUSG00000064280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000123796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:21318109:21330906:-1 gene:ENSMUSG00000064280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// AK015926 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930528G09 product:similar to CDNA FLJ31980 FIS, CLONE NT2RP7008487, WEAKLY SIMILAR TO TRICHOHYALIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 94 // 45 // 17 // 18 // 0 /// AK220398 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1505 protein. // chr5 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000038488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:21293292:21371095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
NM_001199632 // RefSeq // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 13 (Fbxl13), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_177076 // RefSeq // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 13 (Fbxl13), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000051358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:21483847:21645605:-1 gene:ENSMUSG00000048520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000115234 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:21519179:21645557:-1 gene:ENSMUSG00000048520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000137788 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:21490200:21645587:-1 gene:ENSMUSG00000048520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AK030172 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933409A11 product:hypothetical F-box domain containing protein, full insert sequence. // chr5 // 92 // 90 // 35 // 38 // 0 /// BC145291 // GenBank // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:178853 IMAGE:9053845), complete cds. // chr5 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// BC145292 // GenBank // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:178854 IMAGE:9053846), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// XM_006535730 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 13 (Fbxl13), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// GENSCAN00000038471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:21483936:21524603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0
NM_178728 // RefSeq // Mus musculus N-acyl phosphatidylethanolamine phospholipase D (Napepld), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000060899 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:21662903:21701396:-1 gene:ENSMUSG00000044968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000115217 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:21662901:21701394:-1 gene:ENSMUSG00000044968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB112350 // GenBank // Mus musculus NAPE-PLD mRNA for N-acyl-phosphatidylethanolamine-hydrolyzing phospholipase D, complete cds. // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC062890 // GenBank // Mus musculus N-acyl phosphatidylethanolamine phospholipase D, mRNA (cDNA clone MGC:86024 IMAGE:5702354), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:21665228:21683449:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000083726 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:22430331:22430443:-1 gene:ENSMUSG00000065660 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011959 // RefSeq // Mus musculus origin recognition complex, subunit 5 (Orc5), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006535715 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus origin recognition complex, subunit 5 (Orc5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006535716 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus origin recognition complex, subunit 5 (Orc5), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000030872 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:22486489:22550375:-1 gene:ENSMUSG00000029012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000135906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:22486485:22550304:-1 gene:ENSMUSG00000029012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141263 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:22523516:22549518:-1 gene:ENSMUSG00000029012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000142987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:22523551:22550375:-1 gene:ENSMUSG00000029012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// BC006927 // GenBank // Mus musculus origin recognition complex, subunit 5-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:11653 IMAGE:3601908), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:22528321:22564130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSMUST00000178586 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:22534737:22534843:-1 gene:ENSMUSG00000096346 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK153483 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830166F06 product:pyruvate kinase, muscle, full insert sequence. // chr5 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0 /// D38379 // GenBank // Mus musculus mRNA for pyruvate kinase M, complete cds. // chr5 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0 /// GENSCAN00000017970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:22724575:22854714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0
NR_040469 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5031425E22 gene (5031425E22Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:23431810:23433919:-1 gene:ENSMUSG00000073147 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189045 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:23432287:23434269:-1 gene:ENSMUSG00000073147 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:23382308:23433324:-1 gene:ENSMUSG00000073147 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000188328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:23399780:23433336:-1 gene:ENSMUSG00000073147 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_009274 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich protein specific kinase 2 (Srpk2), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// XM_006535658 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/arginine-rich protein specific kinase 2 (Srpk2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 94 // 80 // 33 // 35 // 0 /// ENSMUST00000088392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:23503356:23616571:-1 gene:ENSMUSG00000062604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// AB006036 // GenBank // Mus musculus mRNA for SRPK2, complete cds. // chr5 // 97 // 68 // 29 // 30 // 0 /// AK161384 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930524A13 product:serine/arginine-rich protein specific kinase 2, full insert sequence. // chr5 // 100 // 34 // 15 // 15 // 0 /// BC020178 // GenBank // Mus musculus serine/arginine-rich protein specific kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:27638 IMAGE:4507346), complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// BC062941 // GenBank // Mus musculus serine/arginine-rich protein specific kinase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6842723), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// U92456 // GenBank // Mus musculus WW domain binding protein 6 mRNA, partial cds. // chr5 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// AK014004 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110005M20 product:serine/arginine-rich protein specific kinase 2, full insert sequence. // chr5 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// GENSCAN00000043954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:23507536:23576656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 24 // 24 // 0
XR_402346 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4933427G23 gene (4933427G23Rik), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000122963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:23815618:23831897:-1 gene:ENSMUSG00000086697 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000126393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:23831080:23831623:-1 gene:ENSMUSG00000086697 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AK030236 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933427G23 product:HYPOTHETICAL 21.8 KDA PROTEIN (BRMS2) (SIMILAR TO MITOCHONDRIAL RIBOSOMAL PROTEIN S4) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000043945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:23824107:23831623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
ENSMUST00000083395 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:23836167:23836321:-1 gene:ENSMUSG00000065329 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025394 // RefSeq // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 7 homolog (yeast) (Tomm7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000030851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:23838944:23844161:-1 gene:ENSMUSG00000028998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC055352 // GenBank // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 7 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:68076 IMAGE:5011269), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:23841711:23844191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_001002897 // RefSeq // Mus musculus autophagy related 9B (Atg9b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000059401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:24384181:24392143:-1 gene:ENSMUSG00000038295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY495541 // GenBank // Mus musculus autophagy 9-like 2 (Apg9l2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY515312 // GenBank // Mus musculus sONE major form (Nos3as) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AY515313 // GenBank // Mus musculus sONE minor form (Nos3as) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000138716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24384620:24390635:-1 gene:ENSMUSG00000038295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000006109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24384982:24391916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0
NM_007668 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase 5 (Cdk5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_389739 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin-dependent kinase 5 (Cdk5), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000030814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:24418250:24423530:-1 gene:ENSMUSG00000028969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC052007 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase 5, mRNA (cDNA clone MGC:62330 IMAGE:5706932), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// D29678 // GenBank // Mus musculus adult brain mRNA for cyclin-dependent kinase 5 (CDK5), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535626 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin-dependent kinase 5 (Cdk5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000006110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24419376:24423485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_022418 // RefSeq // Mus musculus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 1 (Tmub1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000030799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:24445458:24447854:-1 gene:ENSMUSG00000028958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000115033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24445466:24447625:-1 gene:ENSMUSG00000028958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000115036 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:24445466:24447317:-1 gene:ENSMUSG00000028958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000127194 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24446049:24447587:-1 gene:ENSMUSG00000028958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AB030183 // GenBank // Mus musculus mRNA, complete cds, clone:1-2. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AY603379 // GenBank // Mus musculus hepatocyte odd protein shuttling protein (Hops) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// BC019547 // GenBank // Mus musculus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:28484 IMAGE:4164765), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24441154:24448062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0
AK153723 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630061N10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015739 // RefSeq // Mus musculus gastrulation brain homeobox 1 (Gbx1), mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000088311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:24502757:24527202:-1 gene:ENSMUSG00000067724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF547996 // GenBank // Mus musculus gastrulation brain homeobox 1 (Gbx1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AY319256 // GenBank // Mus musculus gastrulation brain homeobox 1 (Gbx1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24504589:24576687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_080444 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 10 (Asb10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535615 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 10 (Asb10), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000048302 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:24532697:24540457:-1 gene:ENSMUSG00000038204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117900 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:24533633:24540978:-1 gene:ENSMUSG00000038204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000119657 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24533651:24540592:-1 gene:ENSMUSG00000038204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AF398971 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat-containing SOCS box protein 10 (Asb10) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC141311 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:176272 IMAGE:9055923), complete cds. // chr5 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC141313 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:176274 IMAGE:9055925), complete cds. // chr5 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24504589:24576687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_177676 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931409K22 gene (4931409K22Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NR_033188 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931409K22 gene (4931409K22Rik), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000088302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:24543434:24555469:-1 gene:ENSMUSG00000038199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC137999 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931409K22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169623 IMAGE:8861018), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC145792 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931409K22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175679 IMAGE:40131095), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24504589:24576687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
NM_001190443 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20), member 2 (Abcf2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_013853 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20), member 2 (Abcf2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006535727 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20), member 2 (Abcf2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:24565341:24577467:-1 gene:ENSMUSG00000028953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003300 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:7932 IMAGE:3583837), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24504589:24576687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001081441 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 86 (Wdr86), mRNA. // chr5 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// XM_006535719 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 86 (Wdr86), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 96 // 59 // 25 // 26 // 0 /// XM_006535720 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 86 (Wdr86), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000068693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:24711738:24730727:-1 gene:ENSMUSG00000055235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000142607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24712265:24730680:-1 gene:ENSMUSG00000055235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// BC048684 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810046M22 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6516807), partial cds. // chr5 // 94 // 39 // 16 // 17 // 0 /// BC059069 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810046M22 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6825904). // chr5 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// BC132276 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40130553. // chr5 // 95 // 48 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24712575:24730343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0
NM_153076 // RefSeq // Mus musculus crystallin, gamma N (Crygn), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000047119 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:24751003:24758008:-1 gene:ENSMUSG00000038135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000123386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24751003:24751324:-1 gene:ENSMUSG00000038135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AF445456 // GenBank // Mus musculus gammaN-crystallin (Crygn) mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// BC120913 // GenBank // Mus musculus crystallin, gamma N, mRNA (cDNA clone MGC:143626 IMAGE:40091405), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24751054:24821536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NONMMUT051566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
NM_053075 // RefSeq // Mus musculus Ras homolog enriched in brain (Rheb), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000030787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:24802823:24842624:-1 gene:ENSMUSG00000028945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000146310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24803667:24813959:-1 gene:ENSMUSG00000028945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// AB039919 // GenBank // Mus musculus rheb mRNA for Ras homolog, complete cds. // chr5 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// AY197373 // GenBank // Mus musculus RHEB-like protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC012273 // GenBank // Mus musculus RAS-homolog enriched in brain, mRNA (cDNA clone MGC:18654 IMAGE:3710454), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006535647 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras homolog enriched in brain (Rheb), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// ENSMUST00000154523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:24810136:24842428:-1 gene:ENSMUSG00000028945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// AK158213 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930043C05 product:RAS-homolog enriched in brain, full insert sequence. // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000006043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:24751054:24821536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENSMUST00000066954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:25222848:25223153:-1 gene:ENSMUSG00000054116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK021392 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130116L18 product:hypothetical Type I antifreeze protein containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081383 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific methyltransferase 2C (Kmt2c), mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 63 // 63 // 0 /// ENSMUST00000045291 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:25273609:25498745:-1 gene:ENSMUSG00000038056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 62 // 62 // 0 /// ENSMUST00000172556 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:25272426:25308550:-1 gene:ENSMUSG00000038056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000173073 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:25315737:25498702:-1 gene:ENSMUSG00000038056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000173174 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:25372836:25498755:-1 gene:ENSMUSG00000038056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 20 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000174734 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:25271798:25300075:-1 gene:ENSMUSG00000038056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000172626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:25382632:25498783:-1 gene:ENSMUSG00000038056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 13 // 13 // 8 // 64 // 1 /// AK044828 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130006H11 product:hypothetical HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain (A+T-hook)/PHD-finger/RING finger containing protein, full insert sequence. // chr5 // 13 // 13 // 8 // 64 // 1 /// GENSCAN00000049890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:25273666:25499635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 53 // 53 // 0
ENSMUST00000072180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:25659813:25661282:-1 gene:ENSMUSG00000059244 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:25659809:25661275:-1 gene:ENSMUSG00000059244 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140523 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930020D16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020570 // RefSeq // Mus musculus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 2 (Xrcc2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030773 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:25689812:25705825:-1 gene:ENSMUSG00000028933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC033417 // GenBank // Mus musculus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 2, mRNA (cDNA clone MGC:35883 IMAGE:5357630), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:25696680:25705764:-1 gene:ENSMUSG00000028933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000134972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:25695922:25705773:-1 gene:ENSMUSG00000028933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// AK085093 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430035K04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT051613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT051614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_029376 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated glutamate (E)-rich protein 4a (Speer4a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000079447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:26032846:26039506:-1 gene:ENSMUSG00000073119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK006439 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700027N01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000008759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:26034947:26039483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000030910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:26460074:26493278:-1 gene:ENSMUSG00000029044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK005600 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700001J09 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC049642 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930584F24 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6703227). // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK015867 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930522C06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONMMUT051630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT051631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT051632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
AK157267 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830208N12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
NM_028561 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated glutamate (E)-rich protein 4b (Speer4b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000053257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:27495639:27501438:-1 gene:ENSMUSG00000048703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000124535 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:27499958:27501391:-1 gene:ENSMUSG00000048703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// BC119075 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated glutamate (E)-rich protein 4b, mRNA (cDNA clone MGC:155391 IMAGE:8733824), complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000155721 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:27497537:27501362:-1 gene:ENSMUSG00000048703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1
NM_018878 // RefSeq // Mus musculus PAX interacting (with transcription-activation domain) protein 1 (Paxip1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006535762 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PAX interacting (with transcription-activation domain) protein 1 (Paxip1), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000002291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:27740667:27791339:-1 gene:ENSMUSG00000002221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// AF104261 // GenBank // Mus musculus Pax transcription activation domain interacting protein PTIP mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 96 // 41 // 44 // 0 /// BC066014 // GenBank // Mus musculus PAX interacting (with transcription-activation domain) protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:90057 IMAGE:5704566), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006535763 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PAX interacting (with transcription-activation domain) protein 1 (Paxip1), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 78 // 78 // 36 // 46 // 1 /// GENSCAN00000042630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:27730737:27791279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0
NM_009170 // RefSeq // Mus musculus sonic hedgehog (Shh), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006535648 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sonic hedgehog (Shh), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// XM_006535649 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sonic hedgehog (Shh), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000002708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:28456815:28467101:-1 gene:ENSMUSG00000002633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC063087 // GenBank // Mus musculus sonic hedgehog, mRNA (cDNA clone MGC:69975 IMAGE:6516263), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:28457855:28523174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_020295 // RefSeq // Mus musculus limb region 1 (Lmbr1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:29229814:29378390:-1 gene:ENSMUSG00000010721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:29229814:29378390:-1 gene:ENSMUSG00000010721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC096579 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:1547335. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020295 // RefSeq // Mus musculus limb region 1 (Lmbr1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000055195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:29229814:29378390:-1 gene:ENSMUSG00000010721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000179191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:29229814:29378390:-1 gene:ENSMUSG00000010721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 98 // 38 // 39 // 0 /// AF190665 // GenBank // Mus musculus LMBR1 long form (Lmbr1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// AK030631 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330439N09 product:LMBR1 LONG FORM homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// BC016110 // GenBank // Mus musculus limb region 1, mRNA (cDNA clone MGC:28737 IMAGE:4481088), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:29273518:29362148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
AK147752 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270024I07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_019944 // RefSeq // Mus musculus motor neuron and pancreas homeobox 1 (Mnx1), mRNA. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000001608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:29473261:29478470:-1 gene:ENSMUSG00000001566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000165512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:29473034:29478470:-1 gene:ENSMUSG00000001566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF153046 // GenBank // Mus musculus homeodomain protein HB9 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132283 // GenBank // Mus musculus motor neuron and pancreas homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:163914 IMAGE:40130560), complete cds. // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:29473869:29485905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
ENSMUST00000082612 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:29481525:29481631:-1 gene:ENSMUSG00000093875 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000016273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:29719434:29719706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NR_028426 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5129 (Gm5129), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:29735637:29735936:-1 gene:ENSMUSG00000053121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:29735637:29737444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021288 // RefSeq // Mus musculus thymidylate synthase (Tyms), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NR_033402 // RefSeq // Mus musculus thymidylate synthase (Tyms), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000026846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:30058827:30073617:-1 gene:ENSMUSG00000025747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000141630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:30058202:30073581:-1 gene:ENSMUSG00000025747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC020139 // GenBank // Mus musculus thymidylate synthase, mRNA (cDNA clone MGC:28246 IMAGE:3994204), complete cds. // chr5 // 90 // 71 // 9 // 10 // 0 /// M13019 // GenBank // Mouse thymidylate synthase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30044475:30073547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
NM_001256263 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3110082J24 gene (3110082J24Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000127749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:30103889:30105359:-1 gene:ENSMUSG00000086815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 48 // 9 // 13 // 0
NM_001014394 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 113 (Gpr113), mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006535736 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 113 (Gpr113), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000088117 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:30193431:30205722:-1 gene:ENSMUSG00000067642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:30193435:30205722:-1 gene:ENSMUSG00000067642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AY701869 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 113-like protein (Gpcr113) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30185737:30205705:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000049074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30220914:30240448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_028483 // RefSeq // Mus musculus calcium and integrin binding family member 4 (Cib4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504153 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium and integrin binding family member 4 (Cib4), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:30485583:30545836:-1 gene:ENSMUSG00000053194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099558 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700041E20 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30916660). // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC118938 // GenBank // Mus musculus calcium and integrin binding family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:143653 IMAGE:40091772), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30485658:30534348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NR_040427 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9899 (Gm9899), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:30577467:30578025:-1 gene:ENSMUSG00000053214 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// NONMMUT051713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_001134692 // RefSeq // Mus musculus oligosaccharyltransferase 4 homolog (S. cerevisiae) (Ost4), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000132034 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:30906518:30907725:-1 gene:ENSMUSG00000038803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000132253 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:30905885:30907788:-1 gene:ENSMUSG00000038803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// AK009384 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310016E02 product:P11F3 homolog [Xenopus laevis], full insert sequence. // chr5 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// BC002177 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310016E02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7346 IMAGE:3486998), complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// BC082316 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310016E02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:90609 IMAGE:6814413), complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
NM_001160149 // RefSeq // Mus musculus cell growth regulator with EF hand domain 1 (Cgref1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NM_026770 // RefSeq // Mus musculus cell growth regulator with EF hand domain 1 (Cgref1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:30933146:30945480:-1 gene:ENSMUSG00000029161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC023116 // GenBank // Mus musculus cell growth regulator with EF hand domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:28551 IMAGE:4206019), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:30933491:30945475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0
NM_011773 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 3 (Slc30a3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006503864 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 3 (Slc30a3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031037 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:31086106:31093615:-1 gene:ENSMUSG00000029151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000182444 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:31086106:31108237:-1 gene:ENSMUSG00000029151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000182776 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:31089377:31108218:-1 gene:ENSMUSG00000029151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 34 // 10 // 11 // 0 /// BC066199 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:76696 IMAGE:30476359), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U76007 // GenBank // Mus musculus zinc transporter ZnT-3 (ZnT-3) mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000182364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:31088782:31093469:-1 gene:ENSMUSG00000029151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// ENSMUST00000182672 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:31089341:31094801:-1 gene:ENSMUSG00000029151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000008902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31086770:31098134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
NM_021290 // RefSeq // Mus musculus urocortin (Ucn), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000043475 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:31138063:31138829:-1 gene:ENSMUSG00000038676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC116948 // GenBank // Mus musculus urocortin, mRNA (cDNA clone MGC:151325 IMAGE:40126267), complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC116950 // GenBank // Mus musculus urocortin, mRNA (cDNA clone MGC:151327 IMAGE:40126269), complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC144891 // GenBank // Mus musculus urocortin, mRNA (cDNA clone MGC:178447 IMAGE:9053439), complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000008918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31138152:31181570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENSMUST00000101411 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:31151142:31179911:-1 gene:ENSMUSG00000101678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000029144 // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// AK138760 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430054O16 product:TFIIIC2 subunit homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001177901 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 513 (Zfp513), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_175311 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 513 (Zfp513), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006503657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 513 (Zfp513), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000031562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:31198983:31202042:-1 gene:ENSMUSG00000043059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000114590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:31198981:31202303:-1 gene:ENSMUSG00000043059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000177310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:31201627:31202225:-1 gene:ENSMUSG00000043059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 34 // 10 // 11 // 0 /// BC058976 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 513, mRNA (cDNA clone MGC:67303 IMAGE:5685033), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000135791 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:31199881:31200762:-1 gene:ENSMUSG00000043059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// ENSMUST00000176245 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:31200669:31202215:-1 gene:ENSMUSG00000043059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000008923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31199321:31220422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT051756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_008014 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1G (formerly 2C), magnesium-dependent, gamma isoform (Ppm1g), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000031032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:31202668:31220545:-1 gene:ENSMUSG00000029147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC009004 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1G (formerly 2C), magnesium-dependent, gamma isoform, mRNA (cDNA clone MGC:6666 IMAGE:3499081), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U42383 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor inducible gene 13 (FIN13) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31199321:31220422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1
ENSMUST00000068997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:31240675:31241232:-1 gene:ENSMUSG00000055424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK076899 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930543E05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_026298 // RefSeq // Mus musculus intraflagellar transport 172 (Ift172), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000041565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:31253280:31291114:-1 gene:ENSMUSG00000038564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// AK144190 // GenBank HTC // Mus musculus RCB-0464 Meth-A cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430088I22 product:intraflagellar transport 172, full insert sequence. // chr5 // 100 // 33 // 16 // 16 // 0 /// AY339616 // GenBank // Mus musculus selective LIM-binding factor Wimple (Slb) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// BC066096 // GenBank // Mus musculus intraflagellar transport 172 homolog (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:86007 IMAGE:6856438), complete cds. // chr5 // 98 // 100 // 48 // 49 // 0 /// AK122461 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1179 protein. // chr5 // 65 // 65 // 32 // 49 // 1 /// GENSCAN00000008928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31253335:31295937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0
NM_022424 // RefSeq // Mus musculus fibronectin type III domain containing 4 (Fndc4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000041266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:31292886:31295871:-1 gene:ENSMUSG00000038552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000172435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:31292255:31295877:-1 gene:ENSMUSG00000038552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB030187 // GenBank // Mus musculus mRNA, complete cds, clone:1-73. // chr5 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC027164 // GenBank // Mus musculus fibronectin type III domain containing 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:4953822), complete cds. // chr5 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// BC139278 // GenBank // Mus musculus fibronectin type III domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:170905 IMAGE:8862300), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC139292 // GenBank // Mus musculus fibronectin type III domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:170919 IMAGE:8862314), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31253335:31295937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_028150 // RefSeq // Mus musculus suppressor of Ty 7-like (Supt7l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000065388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:31514569:31526773:-1 gene:ENSMUSG00000053134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000117642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:31514570:31526736:-1 gene:ENSMUSG00000053134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120574 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:31515322:31525268:-1 gene:ENSMUSG00000053134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC031447 // GenBank // Mus musculus suppressor of Ty 7 (S. cerevisiae)-like, mRNA (cDNA clone MGC:25489 IMAGE:4502314), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000118874 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:31516499:31526731:-1 gene:ENSMUSG00000053134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// AK047063 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930015D15 product:ANTIGEN ART1/P17 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000008901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31515632:31523066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0
NM_153196 // RefSeq // Mus musculus ribokinase (Rbks), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006504113 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribokinase (Rbks), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XR_376828 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribokinase (Rbks), transcript variant X3, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:31624439:31697627:-1 gene:ENSMUSG00000029136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK138939 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530021K02 product:ribokinase, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC023339 // GenBank // Mus musculus ribokinase, mRNA (cDNA clone MGC:31048 IMAGE:5253827), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000128047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:31660045:31686093:-1 gene:ENSMUSG00000029136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000008905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:31576359:31697601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT051800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
AK136299 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030403N14 product:hypothetical Histidine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK141859 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130030I02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_194340 // RefSeq // Mus musculus proline rich 14-like (Prr14l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:32789218:32854256:-1 gene:ENSMUSG00000054280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155392 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:32793124:32828678:-1 gene:ENSMUSG00000054280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AY372183 // GenBank // Mus musculus EMO2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC094374 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C330019G07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106464 IMAGE:30531815), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006503839 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline rich 14-like (Prr14l), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// XM_006503840 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline rich 14-like (Prr14l), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000144673 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:32737230:32827109:-1 gene:ENSMUSG00000093574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:32793532:32831531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_194340 // RefSeq // Mus musculus proline rich 14-like (Prr14l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006503839 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline rich 14-like (Prr14l), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006503840 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline rich 14-like (Prr14l), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:32789218:32854256:-1 gene:ENSMUSG00000054280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000180355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:20884608:20888200:-1 gene:ENSMUSG00000093800 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// AK134346 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030436E02 product:hypothetical Cytochrome c heme-binding site containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:32793532:32831531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT067842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:20869506:20902007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_133903 // RefSeq // Mus musculus spondin 2, extracellular matrix protein (Spon2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006503622 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spondin 2, extracellular matrix protein (Spon2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000046186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:33213518:33218238:-1 gene:ENSMUSG00000037379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK009820 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310045I24 product:MINDIN PRECURSOR homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AK042840 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730029D09 product:SIMILAR TO SPONDIN 2, EXTRACELLULAR MATRIX PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY457639 // GenBank // Mus musculus extracellular matrix protein (Spon2) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// BC017616 // GenBank // Mus musculus spondin 2, extracellular matrix protein, mRNA (cDNA clone MGC:27697 IMAGE:4923292), complete cds. // chr5 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// AK169550 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630096D03 product:spondin 2, extracellular matrix protein, full insert sequence. // chr5 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000021273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:33214468:33300192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_011320 // RefSeq // Mus musculus NK1 transcription factor related, locus 1 (Drosophila) (Nkx1-1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000173348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:33430734:33433976:-1 gene:ENSMUSG00000029112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:33430734:33433976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001289724 // RefSeq // Mus musculus stem-loop binding protein (Slbp), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 89 // 75 // 8 // 9 // 0 /// NM_001289725 // RefSeq // Mus musculus stem-loop binding protein (Slbp), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// NM_009193 // RefSeq // Mus musculus stem-loop binding protein (Slbp), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000057551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:33640055:33652574:-1 gene:ENSMUSG00000004642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000101354 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:33640055:33652306:-1 gene:ENSMUSG00000004642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC029631 // GenBank // Mus musculus stem-loop binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:5912 IMAGE:3500676), complete cds. // chr5 // 89 // 75 // 8 // 9 // 0 /// U75680 // GenBank // Mus musculus histone stem-loop binding protein (SLBP) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000075670 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:33634952:33652345:-1 gene:ENSMUSG00000004642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1 /// AK131729 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700030E24 product:stem-loop binding protein, full insert sequence. // chr5 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1
NM_026698 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 129 (Tmem129), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000019439 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:33653216:33657977:-1 gene:ENSMUSG00000019295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000140931 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:33653219:33657899:-1 gene:ENSMUSG00000019295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC029088 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 129, mRNA (cDNA clone MGC:27943 IMAGE:3587662), complete cds. // chr5 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// BC094042 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 129, mRNA (cDNA clone MGC:103341 IMAGE:5098723), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:33654366:33658332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
AK144327 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630022F23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_019694 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1 (Letm1), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006504034 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1 (Letm1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000005431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:33739673:33782817:-1 gene:ENSMUSG00000005299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF061026 // GenBank // Mus musculus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1 (Letm1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC061115 // GenBank // Mus musculus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:74237 IMAGE:6533034), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK079712 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430024F04 product:leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1, full insert sequence. // chr5 // 70 // 72 // 16 // 23 // 0 /// ENSMUST00000149886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:33742534:33753562:-1 gene:ENSMUSG00000005299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// AK161638 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730424A19 product:leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1, full insert sequence. // chr5 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000021272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:33742463:33824774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_011914 // RefSeq // Mus musculus negative elongation factor complex member A, Whsc2 (Nelfa), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000030993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:33896936:33936413:-1 gene:ENSMUSG00000029111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC038003 // GenBank // Mus musculus Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 2 (human), mRNA (cDNA clone MGC:46968 IMAGE:4912719), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000132942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:33919125:33936250:-1 gene:ENSMUSG00000029111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// AK137949 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130044L21 product:Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 2 (human), full insert sequence. // chr5 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// GENSCAN00000021281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:33898725:33936651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0
NM_010753 // RefSeq // Mus musculus Max dimerization protein 4 (Mxd4), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000042701 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:34173887:34187710:-1 gene:ENSMUSG00000037235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000119171 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:34176579:34187720:-1 gene:ENSMUSG00000037235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AK131132 // GenBank // Mus musculus mRNA for mFLJ00110 protein. // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC011303 // GenBank // Mus musculus Max dimerization protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:19425 IMAGE:3490469), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// U32395 // GenBank // Mus musculus Max-interacting transcriptional repressor (Mad4) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 73 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:34176992:34244156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1
NM_139064 // RefSeq // Mus musculus TNFAIP3 interacting protein 2 (Tnip2), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030991 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:34496087:34513963:-1 gene:ENSMUSG00000059866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000087737 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:34496087:34513991:-1 gene:ENSMUSG00000059866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114359 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:34496130:34513938:-1 gene:ENSMUSG00000059866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000143072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:34499605:34501618:-1 gene:ENSMUSG00000059866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000144791 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:34496089:34513997:-1 gene:ENSMUSG00000059866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC052083 // GenBank // Mus musculus TNFAIP3 interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:62501 IMAGE:6404610), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000137555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:34501172:34513849:-1 gene:ENSMUSG00000059866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:34481595:34513897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_029278 // RefSeq // Mus musculus NOP14 nucleolar protein (Nop14), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000041364 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:34638532:34660148:-1 gene:ENSMUSG00000036693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC024998 // GenBank // Mus musculus NOP14 nucleolar protein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:32275 IMAGE:5012070), complete cds. // chr5 // 78 // 95 // 28 // 36 // 0 /// BC043043 // GenBank // Mus musculus NOP14 nucleolar protein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:57938 IMAGE:5701430), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AK079609 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330071M14 product:RIKEN cDNA 2610033H07 gene, full insert sequence. // chr5 // 57 // 37 // 8 // 14 // 0 /// GENSCAN00000046924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:34633899:34660045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0
NM_013587 // RefSeq // Mus musculus low density lipoprotein receptor-related protein associated protein 1 (Lrpap1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000030986 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:35091490:35105766:-1 gene:ENSMUSG00000029103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000135207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:35093295:35097722:-1 gene:ENSMUSG00000029103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC094324 // GenBank // Mus musculus low density lipoprotein receptor-related protein associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:106605 IMAGE:6402163), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000147028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:35097598:35105689:-1 gene:ENSMUSG00000029103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// ENSMUST00000152028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:35102128:35105696:-1 gene:ENSMUSG00000029103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// ENSMUST00000153664 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:35093069:35102514:-1 gene:ENSMUSG00000029103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:35092159:35105691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
XR_402424 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E130018O15 gene (E130018O15Rik), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000069741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:35379152:35388476:-1 gene:ENSMUSG00000055944 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK053452 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130018O15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153107 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase Z (Cpz), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000038676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:35502215:35525698:-1 gene:ENSMUSG00000036596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF356844 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase Z mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:35502335:35518012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_030208 // RefSeq // Mus musculus tRNA methyltransferase 44 (Trmt44), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000030980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:35557206:35575070:-1 gene:ENSMUSG00000029097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC152332 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310079F23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:161257 IMAGE:40141614), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000145930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:35572496:35575051:-1 gene:ENSMUSG00000029097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000029528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:35557826:35580492:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AK053800 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130309C02 product:RIKEN cDNA 2310079F23 gene, full insert sequence. // chr5 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NR_045807 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931431C16 gene (4931431C16Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124643 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:35581227:35588763:-1 gene:ENSMUSG00000055061 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT051963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001042615 // RefSeq // Mus musculus HtrA serine peptidase 3 (Htra3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// NM_030127 // RefSeq // Mus musculus HtrA serine peptidase 3 (Htra3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// XM_006504187 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HtrA serine peptidase 3 (Htra3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000087629 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:35652041:35679782:-1 gene:ENSMUSG00000029096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000114233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:35661559:35679472:-1 gene:ENSMUSG00000029096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// AY037300 // GenBank // Mus musculus toll-associated serine protease (Tasp) mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 85 // 30 // 33 // 0 /// AY156509 // GenBank // Mus musculus pregnancy-related serine protease mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// AY280664 // GenBank // Mus musculus pregnancy-related serine protease mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr5 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// BC022646 // GenBank // Mus musculus HtrA serine peptidase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4216219), partial cds. // chr5 // 90 // 51 // 18 // 20 // 0 /// BC138587 // GenBank // Mus musculus HtrA serine peptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:170212 IMAGE:8861607), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// BC138588 // GenBank // Mus musculus HtrA serine peptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:170213 IMAGE:8861608), complete cds. // chr5 // 94 // 82 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:35652261:35679346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0
NM_194344 // RefSeq // Mus musculus SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1 (Sh3tc1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006503903 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1 (Sh3tc1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000070203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:35697180:35729276:-1 gene:ENSMUSG00000036553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000127288 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:35697181:35723946:-1 gene:ENSMUSG00000036553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000127825 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:35697180:35721603:-1 gene:ENSMUSG00000036553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000129664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:35697183:35716251:-1 gene:ENSMUSG00000036553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000151555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:35697185:35719238:-1 gene:ENSMUSG00000036553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC024909 // GenBank // Mus musculus SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3490511), partial cds. // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:35697311:35726848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_030889 // RefSeq // Mus musculus sortilin-related VPS10 domain containing receptor 2 (Sorcs2), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000037370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:36017180:36398124:-1 gene:ENSMUSG00000029093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AY004316 // GenBank // Mus musculus VPS10 domain receptor protein SorCS2 (SorCS2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC138873 // GenBank // Mus musculus sortilin-related VPS10 domain containing receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:170500 IMAGE:8861895), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC138875 // GenBank // Mus musculus sortilin-related VPS10 domain containing receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:170502 IMAGE:8861897), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000137040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:36061081:36398107:-1 gene:ENSMUSG00000029093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000030761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:36007648:36097279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_001170454 // RefSeq // Mus musculus transcriptional adaptor 2B (Tada2b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000031097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:36473670:36484285:-1 gene:ENSMUSG00000029196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000119916 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:36475742:36484112:-1 gene:ENSMUSG00000029196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:36475970:36476956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001081232 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 5, ERATO Doi 579, expressed (D5Ertd579e), mRNA. // chrUn // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// XM_006503993 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA segment, Chr 5, ERATO Doi 579, expressed (D5Ertd579e), transcript variant X2, mRNA. // chrUn // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// XM_006503994 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA segment, Chr 5, ERATO Doi 579, expressed (D5Ertd579e), transcript variant X3, mRNA. // chrUn // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000031091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:36600504:36695969:-1 gene:ENSMUSG00000029190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000132383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:36600485:36619730:-1 gene:ENSMUSG00000029190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC151085 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 5, ERATO Doi 579, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:183998 IMAGE:9087998), complete cds. // chrUn // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:36549474:36695759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_133724 // RefSeq // Mus musculus biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 4, cappuccino (Bloc1s4), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000071949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:36747374:36748679:-1 gene:ENSMUSG00000060708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC019169 // GenBank // Mus musculus cappuccino, mRNA (cDNA clone MGC:29294 IMAGE:5002867), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:36747998:36748645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_026242 // RefSeq // Mus musculus Morf4 family associated protein 1 (Mrfap1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000068795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:36794867:36796772:-1 gene:ENSMUSG00000055302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC010209 // GenBank // Mus musculus Morf4 family associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:7196 IMAGE:3482091), complete cds. // chr5 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_008550 // RefSeq // Mus musculus mannosidase 2, alpha B2 (Man2b2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000031002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:36806921:36830653:-1 gene:ENSMUSG00000029119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000124711 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:36808812:36817684:-1 gene:ENSMUSG00000029119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 18 // 18 // 0 /// AB006458 // GenBank // Mus musculus MAN2B2 mRNA for alph-D-mannosidase, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AK075649 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110034E14 product:mannosidase 2, alpha B2, full insert sequence. // chr5 // 94 // 46 // 17 // 18 // 0 /// AK079969 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530030A19 product:mannosidase 2, alpha B2, full insert sequence. // chr5 // 89 // 49 // 17 // 19 // 0 /// BC066211 // GenBank // Mus musculus mannosidase 2, alpha B2, mRNA (cDNA clone MGC:76749 IMAGE:30101816), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000030767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:36796216:36830575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// AK173067 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0935 protein. // chr5 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1
NM_011716 // RefSeq // Mus musculus Wolfram syndrome 1 homolog (human) (Wfs1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000043964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:36966104:36988982:-1 gene:ENSMUSG00000039474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000167937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:36968501:36976956:-1 gene:ENSMUSG00000039474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AF084482 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein (Wfs1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC046988 // GenBank // Mus musculus Wolfram syndrome 1 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:54625 IMAGE:6492038), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000166339 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:36966107:36988933:-1 gene:ENSMUSG00000039474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:36966873:37058205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_022416 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine kinase 32B (Stk32b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000094836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:37446828:37717153:-1 gene:ENSMUSG00000029123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AJ250840 // GenBank // Mus musculus mRNA for serine/threonine protein kinase. // chr5 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// BC052404 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 32B, mRNA (cDNA clone MGC:63434 IMAGE:5715729), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC056396 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 32B, mRNA (cDNA clone MGC:65645 IMAGE:6841272), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC058412 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 32B, mRNA (cDNA clone MGC:67312 IMAGE:5715729), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:37454931:37661196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_010835 // RefSeq // Mus musculus msh homeobox 1 (Msx1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:37820485:37824583:-1 gene:ENSMUSG00000048450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF308572 // GenBank // Mus musculus homeobox protein MSX1 variant (Msx1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC016426 // GenBank // Mus musculus homeobox, msh-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:25404 IMAGE:4923403), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:37821258:37832294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_010942 // RefSeq // Mus musculus neuron specific gene family member 1 (Nsg1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:38137193:38159467:-1 gene:ENSMUSG00000029126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF035683 // GenBank // Mus musculus p21 mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK076451 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833403F23 product:neuron specific gene family member 1, full insert sequence. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC008272 // GenBank // Mus musculus neuron specific gene family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:11446 IMAGE:3603440), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:38138672:38220752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_011715 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 1 (Wdr1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006503863 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 1 (Wdr1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000005234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:38526814:38561666:-1 gene:ENSMUSG00000005103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF020055 // GenBank // Mus musculus Wdr1 protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC119358 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:155674 IMAGE:8734107), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC125295 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:158998 IMAGE:40129810), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:38434843:38561531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_001081144 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 518B (Zfp518b), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001177902 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 518B (Zfp518b), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057258 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:38668484:38684750:-1 gene:ENSMUSG00000046572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:38668484:38684826:-1 gene:ENSMUSG00000046572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138368 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 518B, mRNA (cDNA clone MGC:169993 IMAGE:8861388), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC138369 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 518B, mRNA (cDNA clone MGC:169994 IMAGE:8861389), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:38588096:38775578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_013748 // RefSeq // Mus musculus cytokine-dependent hematopoietic cell linker (Clnk), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006503976 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytokine-dependent hematopoietic cell linker (Clnk), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000169819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:38706462:38876693:-1 gene:ENSMUSG00000039315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000171633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:38706462:38876812:-1 gene:ENSMUSG00000039315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AB021220 // GenBank // Mus musculus mRNA for MIST, complete cds. // chr5 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// AF187819 // GenBank // Mus musculus CLNK (Clnk) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC125637 // GenBank // Mus musculus cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mRNA (cDNA clone MGC:159340 IMAGE:40130152), complete cds. // chr5 // 89 // 82 // 25 // 28 // 0 /// BC125639 // GenBank // Mus musculus cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mRNA (cDNA clone MGC:159342 IMAGE:40130154), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006503977 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytokine-dependent hematopoietic cell linker (Clnk), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// GENSCAN00000027301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:38588096:38775578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1
GENSCAN00000050187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:39294058:39402245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_010474 // RefSeq // Mus musculus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 1 (Hs3st1), mRNA. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000053116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:39613939:39644634:-1 gene:ENSMUSG00000051022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000117944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:39613935:39755475:-1 gene:ENSMUSG00000051022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF019385 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate D-glucosaminyl 3-O-sulfotransferase-1 precursor (3OST1) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK132292 // GenBank HTC // Mus musculus 18 days pregnant adult female placenta and extra embryonic tissue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3830612G02 product:heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 1, full insert sequence. // chr5 // 80 // 71 // 16 // 20 // 0 /// BC009133 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:11450 IMAGE:3155049), complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:39614363:39615298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0
ENSMUST00000158768 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:40405750:40405929:-1 gene:ENSMUSG00000089393 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONMMUT052082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
GENSCAN00000021914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:41369422:41455665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_027295 // RefSeq // Mus musculus RAB28, member RAS oncogene family (Rab28), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006503650 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB28, member RAS oncogene family (Rab28), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006503651 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB28, member RAS oncogene family (Rab28), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_006503652 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB28, member RAS oncogene family (Rab28), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000031011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:41624976:41708155:-1 gene:ENSMUSG00000029128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AB232624 // GenBank // Mus musculus Rab28 mRNA for Rab28, complete cds. // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AK161391 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930529H23 product:RAB28, member RAS oncogene family, full insert sequence. // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC004580 // GenBank // Mus musculus RAB28, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:8039 IMAGE:3587008), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:41625308:41708140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_007524 // RefSeq // Mus musculus NK3 homeobox 2 (Nkx3-2), mRNA. // chr5 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:41761483:41764501:-1 gene:ENSMUSG00000049691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// BC021014 // GenBank HTC // Mus musculus NK3 homeobox 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4218150). // chr5 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// BC145872 // GenBank // Mus musculus NK3 homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:175759 IMAGE:40131175), complete cds. // chr5 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// BC145874 // GenBank // Mus musculus NK3 homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:175761 IMAGE:40131177), complete cds. // chr5 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// U87957 // GenBank // Mus musculus DNA-binding homeodomain protein Bapx1 mRNA, complete cds. // chr5 // 79 // 83 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:41757421:41844792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
NM_001081422 // RefSeq // Mus musculus biorientation of chromosomes in cell division 1-like (Bod1l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000050556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:41787542:41844168:-1 gene:ENSMUSG00000061755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK134590 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330439B04 product:hypothetical Proline-rich region profile/Lysine-rich region profile/EF-Hand-like containing protein, full insert sequence. // chr5 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000021921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:41757421:41844792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0
GENSCAN00000021918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:41853307:41854210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
GENSCAN00000047760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:42476191:42500414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0
GENSCAN00000035775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:42959048:42964755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// AF366264 // GenBank // Mus musculus SUMO-1-specific protease mRNA, complete cds. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NR_028417 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 7854 (Gm7854), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:43235002:43235352:-1 gene:ENSMUSG00000085720 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187409 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:43152047:43235354:-1 gene:ENSMUSG00000085720 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK041730 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630032M05 product:hypothetical Cysteine-rich region profile/Beta tubulin containing protein, full insert sequence. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001271616 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor binding protein 1 (Fgfbp1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF065441 // GenBank // Mus musculus FGF binding protein 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// U49641 // GenBank // Mus musculus FGF-binding protein (FGF-BP) mRNA, complete cds. // chr5 // 81 // 90 // 21 // 26 // 0 /// NM_008009 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor binding protein 1 (Fgfbp1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000061299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:43978865:43981762:-1 gene:ENSMUSG00000048373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// BC065774 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:73533 IMAGE:3975150), complete cds. // chr5 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// GENSCAN00000049281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:43979193:43979948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_173764 // RefSeq // Mus musculus transmembrane anterior posterior transformation 1 (Tapt1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006503940 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane anterior posterior transformation 1 (Tapt1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006503942 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane anterior posterior transformation 1 (Tapt1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000055128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:44175164:44226606:-1 gene:ENSMUSG00000046985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC096038 // GenBank // Mus musculus transmembrane anterior posterior transformation 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30615284), partial cds. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC110670 // GenBank HTC // Mus musculus transmembrane anterior posterior transformation 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4918554), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:44176953:44188333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NM_021518 // RefSeq // Mus musculus RAB2A, member RAS oncogene family (Rab2a), mRNA. // chr5 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// ENSMUST00000060232 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:8535644:8607778:1 gene:ENSMUSG00000047187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// AB232585 // GenBank // Mus musculus Rab2A mRNA for Rab2A, complete cds. // chr5 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// BC058382 // GenBank // Mus musculus RAB2A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:66912 IMAGE:6820798), complete cds. // chr5 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0
NM_001077398 // RefSeq // Mus musculus LIM domain binding 2 (Ldb2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001286348 // RefSeq // Mus musculus LIM domain binding 2 (Ldb2), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_010698 // RefSeq // Mus musculus LIM domain binding 2 (Ldb2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006503754 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus LIM domain binding 2 (Ldb2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:44472133:44799707:-1 gene:ENSMUSG00000039706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC079611 // GenBank // Mus musculus LIM domain binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:90639 IMAGE:30360903), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// U89487 // GenBank // Mus musculus LIM homeobox protein cofactor CLIM-1a mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// U89489 // GenBank // Mus musculus LIM homeobox protein cofactor CLIM-1b mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:44529406:44544647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
ENSMUST00000087431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:44983861:44984242:-1 gene:ENSMUSG00000067331 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// NONMMUT052150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000030975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:45155011:45169564:-1 gene:ENSMUSG00000029092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AK043596 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830011H17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// XR_402480 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102640004 (LOC102640004), ncRNA. // chr5 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// AK015324 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930435H24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONMMUT052151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT052152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_024236 // RefSeq // Mus musculus quinoid dihydropteridine reductase (Qdpr), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000015950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:45434032:45450235:-1 gene:ENSMUSG00000015806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000117425 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:45434324:45448173:-1 gene:ENSMUSG00000015806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000118097 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:45434502:45447839:-1 gene:ENSMUSG00000015806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000120867 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:45434522:45449965:-1 gene:ENSMUSG00000015806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000127562 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:45443505:45450134:-1 gene:ENSMUSG00000015806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 50 // 12 // 14 // 0 /// ENSMUST00000149290 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:45434500:45444545:-1 gene:ENSMUSG00000015806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000154962 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:45439343:45450154:-1 gene:ENSMUSG00000015806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// BC002107 // GenBank // Mus musculus quinoid dihydropteridine reductase, mRNA (cDNA clone MGC:6600 IMAGE:3487104), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:45401752:45450102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_021416 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 184, member B (Fam184b), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000016023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:45529706:45639501:-1 gene:ENSMUSG00000015879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AB257856 // GenBank // Mus musculus KIAA1276 mRNA for KIAA1276, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC056379 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 184, member B, mRNA (cDNA clone MGC:65656 IMAGE:6850901), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AK036058 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630031F12 product:inferred: KIAA1276 protein {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr5 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000039148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:45530737:45639516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// AB041544 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-2622, similar to AB033102 KIAA1276 protein (Homo sapiens). // chr5 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// NONMMUT052160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
KnowTID_00005837 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK089605 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830004G03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
AK036806 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930013C11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
NM_133911 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 125 (Gpr125), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000030971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:49959951:50058996:-1 gene:ENSMUSG00000029090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC052391 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 125, mRNA (cDNA clone IMAGE:5718990), partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000021531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:49960272:50039595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0
NM_008904 // RefSeq // Mus musculus peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 alpha (Ppargc1a), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_027710 // RefSeq // Mus musculus peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 alpha (Ppargc1a), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006503778 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peroxisome proliferative activated receptor, gamma, coactivator 1 alpha (Ppargc1a), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:51454249:51553921:-1 gene:ENSMUSG00000029167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001042620 // RefSeq // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 15 (Dhx15), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF017153 // GenBank // Mus musculus putative RNA helicase and RNA dependent ATPase (mDEAH9) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC100343 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 15, mRNA (cDNA clone MGC:117685 IMAGE:30935044), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_007839 // RefSeq // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 15 (Dhx15), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// NR_104311 // RefSeq // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 15 (Dhx15), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr5 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENSMUST00000031061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:52150209:52190519:-1 gene:ENSMUSG00000029169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000047170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:52150661:52219374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1
NM_001256059 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 149 (Ccdc149), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:52374651:52471543:-1 gene:ENSMUSG00000045790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025881 // GenBank // Mus musculus gene model 447, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:32324 IMAGE:5027889), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001256059 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 149 (Ccdc149), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000059428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:52374651:52471543:-1 gene:ENSMUSG00000045790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:52372315:52443490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
NM_144945 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich repeat LGI family, member 2 (Lgi2), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000039750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:52537864:52566303:-1 gene:ENSMUSG00000039252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AJ487515 // GenBank // Mus musculus mRNA for leucine-rich glioma inactivated protein 2 (Lgi2 gene). // chr5 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// AK122570 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1916 protein. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AY841361 // GenBank // Mus musculus LGI2B brain-derived splice form (Lgi2b) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 88 // 73 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:52537963:52566105:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NR_045738 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 8030423F21 gene (8030423F21Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000064097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:52607550:52619011:-1 gene:ENSMUSG00000052295 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT052298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_172710 // RefSeq // Mus musculus sel-1 suppressor of lin-12-like 3 (C. elegans) (Sel1l3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006503943 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sel-1 suppressor of lin-12-like 3 (C. elegans) (Sel1l3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006503944 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sel-1 suppressor of lin-12-like 3 (C. elegans) (Sel1l3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000031090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:53107084:53213452:-1 gene:ENSMUSG00000029189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK037220 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A030011D21 product:weakly similar to KIAA0746 PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC094607 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310045A20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106638 IMAGE:6837048), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC117915 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310045A20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144071 IMAGE:40097358), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC117916 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310045A20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144072 IMAGE:40097359), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:53131282:53188104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
AK144996 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830022E06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// KnowTID_00005850 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_009827 // RefSeq // Mus musculus cholecystokinin A receptor (Cckar), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000031093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:53698485:53707704:-1 gene:ENSMUSG00000029193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK164301 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130015H10 product:cholecystokinin A receptor, full insert sequence. // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC020534 // GenBank // Mus musculus cholecystokinin A receptor, mRNA (cDNA clone MGC:19349 IMAGE:4236240), complete cds. // chr5 // 86 // 81 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:53699756:53707357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000083106 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:25566660:25566822:-1 gene:ENSMUSG00000065040 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083861 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:55303420:55303581:-1 gene:ENSMUSG00000065795 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT046484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178407 // RefSeq // Mus musculus ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 (Arap2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000076623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:62602445:62766198:-1 gene:ENSMUSG00000037999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:62604270:62686484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000067917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:63649950:63650264:-1 gene:ENSMUSG00000054714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079612 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30361372. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000009078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:64757544:64816019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001276445 // RefSeq // Mus musculus toll-like receptor 1 (Tlr1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_030682 // RefSeq // Mus musculus toll-like receptor 1 (Tlr1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000059349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:64924811:64932761:-1 gene:ENSMUSG00000044827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 83 // 22 // 25 // 0 /// AF316985 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 1 (Tlr1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AY009154 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 1 (Tlr1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC141319 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:176280 IMAGE:9055931), complete cds. // chr5 // 88 // 83 // 22 // 25 // 0 /// BC141321 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:176282 IMAGE:9055933), complete cds. // chr5 // 88 // 83 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:64924845:64927298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
NM_011604 // RefSeq // Mus musculus toll-like receptor 6 (Tlr6), mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006503858 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus toll-like receptor 6 (Tlr6), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000062315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:64953106:64960048:-1 gene:ENSMUSG00000051498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AB020808 // GenBank // Mus musculus mRNA for TLR6, complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF314636 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 6 (Tlr6) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC055366 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:60565 IMAGE:30056593), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// DQ790887 // GenBank // Mus musculus mutant TLR6 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000038266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:64953142:64955529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
XM_006504243 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 156 (Tmem156), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006504244 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 156 (Tmem156), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006543957 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 156 (Tmem156), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006543958 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 156 (Tmem156), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006543959 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 156 (Tmem156), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006543961 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 156 (Tmem156), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000043352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:65062545:65091584:-1 gene:ENSMUSG00000037913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006543963 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 156 (Tmem156), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000184193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65054347:65075586:-1 gene:ENSMUSG00000037913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:65064935:65091555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_011258 // RefSeq // Mus musculus replication factor C (activator 1) 1 (Rfc1), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031092 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:65261852:65335670:-1 gene:ENSMUSG00000029191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000172660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65262955:65335613:-1 gene:ENSMUSG00000029191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000172732 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:65261858:65335616:-1 gene:ENSMUSG00000029191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000172780 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:65262628:65335564:-1 gene:ENSMUSG00000029191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC085173 // GenBank // Mus musculus replication factor C (activator 1) 1, mRNA (cDNA clone MGC:96526 IMAGE:30549691), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U01222 // GenBank // Mus musculus activator 1 large subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U07157 // GenBank // Mus musculus ISRE-binding protein (IBF-1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U36441 // GenBank // Mus musculus differentiation specific element binding protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:65263063:65319629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// M88489 // GenBank // Mus musculus nonamer binding protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0
NM_133697 // RefSeq // Mus musculus small integral membrane protein 14 (Smim14), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504087 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small integral membrane protein 14 (Smim14), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504089 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small integral membrane protein 14 (Smim14), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040532 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65450176:65492871:-1 gene:ENSMUSG00000037822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000139122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:65446844:65493051:-1 gene:ENSMUSG00000037822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000144562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65468298:65492881:-1 gene:ENSMUSG00000037822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC009097 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110003E01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7185 IMAGE:3481841), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000121661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65450358:65493313:-1 gene:ENSMUSG00000037822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// ENSMUST00000135258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65449927:65461014:-1 gene:ENSMUSG00000037822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONMMUT052497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT052495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001081321 // RefSeq // Mus musculus PDS5, regulator of cohesion maintenance, homolog A (S. cerevisiae) (Pds5a), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:65615260:65697856:-1 gene:ENSMUSG00000029202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK172992 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0648 protein. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC021408 // GenBank // Mus musculus PDS5, regulator of cohesion maintenance, homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:3964501), complete cds. // chr5 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000038285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:65600033:65696897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
AK145287 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930037E09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK046383 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230378H01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONMMUT052520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSMUST00000165250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:65988275:66000218:-1 gene:ENSMUSG00000054598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// BC127159 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 9130230L23 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40093257), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// NR_027961 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9130230L23 gene (9130230L23Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1 /// ENSMUST00000067737 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:65987928:66004285:-1 gene:ENSMUSG00000054598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1 /// ENSMUST00000125452 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:65990126:66001333:-1 gene:ENSMUSG00000054598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// ENSMUST00000147882 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:65999678:66004285:-1 gene:ENSMUSG00000054598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// BC096478 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4985908. // chr5 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONMMUT052548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// NONMMUT052549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
AK149456 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730015B19 product:hypothetical Cysteine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000030942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:66165258:66175344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000120182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:66197906:66198423:-1 gene:ENSMUSG00000084108 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:66197930:66238789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_008888 // RefSeq // Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000012664 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:67094405:67099301:-1 gene:ENSMUSG00000012520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079610 // GenBank // Mus musculus paired-like homeobox 2b, mRNA (cDNA clone MGC:90726 IMAGE:30360139), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000174251 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:67097044:67099057:-1 gene:ENSMUSG00000012520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// AK052579 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530038E02 product:paired-like homeobox 2b, full insert sequence. // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000045631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:67088980:67101999:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001164806 // RefSeq // Mus musculus BEN domain containing 4 (Bend4), mRNA. // chr5 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000169190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:67392147:67427799:-1 gene:ENSMUSG00000092060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:67398236:67438360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000087231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:69296209:69341562:-1 gene:ENSMUSG00000037653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// AK082563 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230064B13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NM_175519 // RefSeq // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 8 (Kctd8), mRNA. // chr5 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// ENSMUST00000054095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:69109285:69341709:-1 gene:ENSMUSG00000037653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// AY615967 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerization domain containing protein 8 (Kctd8) mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// BC116940 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:151317 IMAGE:40126259), complete cds. // chr5 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// BC116942 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:151319 IMAGE:40126261), complete cds. // chr5 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// GENSCAN00000051385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:69333880:69341247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000082914 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:69386066:69386172:-1 gene:ENSMUSG00000096290 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023784 // RefSeq // Mus musculus Yip1 domain family, member 7 (Yipf7), mRNA. // chr5 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031045 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:69516675:69542647:-1 gene:ENSMUSG00000029158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// AF217188 // GenBank // Mus musculus YIP1B (Yip1b) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// BC089576 // GenBank // Mus musculus Yip1 domain family, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:107572 IMAGE:6758950), complete cds. // chr5 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:69467349:69541162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 55 // 16 // 17 // 0
ENSMUST00000083135 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:70550841:70550947:-1 gene:ENSMUSG00000094803 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT052646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_010252 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit gamma 1 (Gabrg1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000031119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:70751047:70842617:-1 gene:ENSMUSG00000001260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC099939 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:107399 IMAGE:30090762), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006503737 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit gamma 1 (Gabrg1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// XM_006503738 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit gamma 1 (Gabrg1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// AK039068 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230092H19 product:gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit gamma 1, full insert sequence. // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000003594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:70734192:70782400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_008066 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit alpha 2 (Gabra2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000000572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:70961057:71095849:-1 gene:ENSMUSG00000000560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK046953 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930007L07 product:gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit alpha 2, full insert sequence. // chr5 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// AK048165 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130038H23 product:gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit alpha 2, full insert sequence. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC115727 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:140832 IMAGE:40039253), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// M86567 // GenBank // Mouse GABA-A receptor alpha-2 subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:70960796:71228084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_030052 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIb2 (Cox7b2), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000050129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:71442824:71548205:-1 gene:ENSMUSG00000049387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC059709 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIb2, mRNA (cDNA clone MGC:74055 IMAGE:6741029), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_010251 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit alpha 4 (Gabra4), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000031121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:71569734:71658308:-1 gene:ENSMUSG00000029211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AK139970 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230013A01 product:gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit alpha 4, full insert sequence. // chr5 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AK159299 // GenBank HTC // Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I420015C10 product:gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit alpha 4, full insert sequence. // chr5 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// BC094603 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:106499 IMAGE:6828002), complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:71571699:71657809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0
NM_178599 // RefSeq // Mus musculus COMM domain containing 8 (Commd8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000013693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:72157000:72168183:-1 gene:ENSMUSG00000029213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158078 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930026L19 product:COMM domain containing 8, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098183 // GenBank // Mus musculus COMM domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:106259 IMAGE:5150466), complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000031034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:72136306:72175590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
ENSMUST00000179713 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:72418713:72418819:-1 gene:ENSMUSG00000095112 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONMMUT052675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NM_133921 // RefSeq // Mus musculus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1 (Nfxl1), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000087216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:72513301:72559684:-1 gene:ENSMUSG00000072889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000135318 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:72513304:72559645:-1 gene:ENSMUSG00000072889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000149393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:72513515:72517347:-1 gene:ENSMUSG00000072889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC022652 // GenBank // Mus musculus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4219165), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC032981 // GenBank // Mus musculus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:1346965), complete cds. // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_006503653 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1 (Nfxl1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000153882 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:72521739:72524659:-1 gene:ENSMUSG00000072889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:72503056:72559266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONMMUT052679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
AK164247 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030038O13 product:weakly similar to Vegetative cell wall protein gp1 precursor (Hydroxyproline-rich glycoprotein 1) [Chlamydomonas reinhardtii], full insert sequence. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT052683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_174877 // RefSeq // Mus musculus zygote arrest 1 (Zar1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006503990 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zygote arrest 1 (Zar1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000073528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:72577114:72581084:-1 gene:ENSMUSG00000063935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AY191415 // GenBank // Mus musculus zygote arrest 1 (Zar1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC099399 // GenBank // Mus musculus zygote arrest 1, mRNA (cDNA clone MGC:117562 IMAGE:30939000), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000031024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:72578209:72587387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001024147 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5868 (Gm5868), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_173403 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 4 (Slc10a4), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:72581639:72587550:-1 gene:ENSMUSG00000060204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:73006904:73014683:1 gene:ENSMUSG00000029219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC132529 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:164160 IMAGE:40130806), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC138048 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:169672 IMAGE:8861067), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:72578209:72587387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000040688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:73007067:73012347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_007723 // RefSeq // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel alpha 1 (Cnga1), mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006503709 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclic nucleotide gated channel alpha 1 (Cnga1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:72603696:72642752:-1 gene:ENSMUSG00000067220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000126799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:72615134:72637842:-1 gene:ENSMUSG00000067220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000169997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:72604115:72637846:-1 gene:ENSMUSG00000067220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC141261 // GenBank // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:176222 IMAGE:9055873), complete cds. // chr5 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// M84742 // GenBank // Mus musculus cGMP-gated cation channel protein mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 74 // 22 // 25 // 0 /// U19717 // GenBank // Mus musculus cGMP-gated cation channel mRNA, clone mIMCD-K2 no.1, complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC085319 // GenBank // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel alpha 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30472613), complete cds. // chr5 // 71 // 50 // 12 // 17 // 0 /// GENSCAN00000031021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:72604115:72619343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000063874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:72914296:72914942:-1 gene:ENSMUSG00000052154 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK082524 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230059D16 product:weakly similar to HYPOTHETICAL 20.7 KDA PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT052690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000043711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:72965808:72974702:-1 gene:ENSMUSG00000063656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019454 // GenBank // Mus musculus SLAIN motif family, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4187099), partial cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_028194 // RefSeq // Mus musculus furry homolog-like (Drosophila) (Fryl), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// XM_006504146 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus furry homolog-like (Drosophila) (Fryl), transcript variant X10, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000094700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:73021211:73148136:-1 gene:ENSMUSG00000070733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000101127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:73020322:73256618:-1 gene:ENSMUSG00000070733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000146953 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:73021194:73047001:-1 gene:ENSMUSG00000070733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 33 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000156661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:73021198:73071578:-1 gene:ENSMUSG00000070733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 90 // 46 // 46 // 0 /// AB093265 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0826 protein. // chr5 // 94 // 94 // 45 // 48 // 0 /// BC043713 // GenBank // Mus musculus furry homolog-like (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5371108), complete cds. // chr5 // 100 // 33 // 17 // 17 // 0 /// BC051118 // GenBank // Mus musculus furry homolog-like (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5400243), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 46 // 46 // 0 /// XM_006504151 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus furry homolog-like (Drosophila) (Fryl), transcript variant X15, mRNA. // chr5 // 16 // 16 // 8 // 51 // 1 /// GENSCAN00000040697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:73022039:73148461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 46 // 46 // 0
NM_028194 // RefSeq // Mus musculus furry homolog-like (Drosophila) (Fryl), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000101127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:73020322:73256618:-1 gene:ENSMUSG00000070733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:73193828:73256618:-1 gene:ENSMUSG00000070733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK171992 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830028C06 product:weakly similar to VPS10 domain receptor protein SORCS [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000148433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:73119257:73256425:-1 gene:ENSMUSG00000070733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// AK033493 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030227G01 product:similar to DM61H21.1 (NOVEL PROTEIN) (FRAGMENT) [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONMMUT052699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_026950 // RefSeq // Mus musculus OCIA domain containing 2 (Ociad2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006504014 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus OCIA domain containing 2 (Ociad2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:73322199:73338593:-1 gene:ENSMUSG00000029153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC044883 // GenBank // Mus musculus OCIA domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:51598 IMAGE:4971755), complete cds. // chr5 // 89 // 93 // 24 // 27 // 0
XR_402560 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC100862249 (LOC100862249), transcript variant X2, ncRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000119247 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:73476444:73477353:-1 gene:ENSMUSG00000082039 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:73476600:73477286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
NM_153568 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 66 (Lrrc66), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006503953 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 66 (Lrrc66), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000087177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:73606643:73632505:-1 gene:ENSMUSG00000067206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC031901 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 66, mRNA (cDNA clone MGC:38937 IMAGE:5362830), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:73585914:73633997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_011890 // RefSeq // Mus musculus sarcoglycan, beta (dystrophin-associated glycoprotein) (Sgcb), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000081170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:73632749:73647713:-1 gene:ENSMUSG00000029156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB024921 // GenBank // Mus musculus mRNA for beta-sarcoglycan, complete cds. // chr5 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC052349 // GenBank // Mus musculus sarcoglycan, beta (dystrophin-associated glycoprotein), mRNA (cDNA clone MGC:58268 IMAGE:6744003), complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK017781 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730521F22 product:sarcoglycan, beta (43kD dystrophin-associated glycoprotein), full insert sequence. // chr5 // 60 // 71 // 12 // 20 // 0 /// GENSCAN00000040692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:73635495:73647713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_177561 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 46 (Usp46), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006504268 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin specific peptidase 46 (Usp46), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006504269 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin specific peptidase 46 (Usp46), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000068058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:73998646:74068430:-1 gene:ENSMUSG00000054814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000119154 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:73998463:74068420:-1 gene:ENSMUSG00000054814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:74001799:74035641:-1 gene:ENSMUSG00000054814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AK029604 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930412G01 product:UBIQUITIN CARBOXYL-TERMINAL HYDROLASE 12 (EC 3.1.2.15) (UBIQUITIN THIOLESTERASE 12) (UBIQUITIN-SPECIFIC PROCESSING PROTEASE 12) (DEUBIQUITINATING ENZYME 12) (UBIQUITIN HYDROLYZING ENZYME 1) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// BC030888 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4483710, containing frame-shift errors. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC039916 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 46, mRNA (cDNA clone MGC:49144 IMAGE:4950034), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:74000959:74038453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 70 // 19 // 21 // 0
NM_028850 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich hydrophobic domain 2 (Chic2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000075452 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:75001026:75044774:-1 gene:ENSMUSG00000029229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000162397 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:75011180:75011509:-1 gene:ENSMUSG00000029229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC048435 // GenBank // Mus musculus, cysteine-rich hydrophobic domain 2, clone IMAGE:6742779, mRNA, partial cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC116971 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich hydrophobic domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:151348 IMAGE:40126290), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC116973 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich hydrophobic domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:151350 IMAGE:40126292), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:75006713:75044298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 69 // 18 // 20 // 0 /// NONMMUT052784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
NM_010612 // RefSeq // Mus musculus kinase insert domain protein receptor (Kdr), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:75932827:75978458:-1 gene:ENSMUSG00000062960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK031739 // GenBank HTC // Mus musculus 14 days embryo thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6130401C07 product:kinase insert domain protein receptor, full insert sequence. // chr5 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC020530 // GenBank // Mus musculus kinase insert domain protein receptor, mRNA (cDNA clone MGC:18600 IMAGE:4238984), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// X70842 // GenBank // M.musculus Flk-1 mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000149573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:75961244:75978458:-1 gene:ENSMUSG00000062960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// AK054510 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330034B14 product:kinase insert domain protein receptor, full insert sequence. // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// EU884114 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 soluble vascular endothelial growth factor receptor 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000025577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:75934423:75979232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
AK042118 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630059M15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001289826 // RefSeq // Mus musculus circadian locomotor output cycles kaput (Clock), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// NM_007715 // RefSeq // Mus musculus circadian locomotor output cycles kaput (Clock), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000075159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:76212177:76304548:-1 gene:ENSMUSG00000029238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// AF000998 // GenBank // Mus musculus CLOCK (Clock) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// AK030352 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330400M04 product:circadian locomoter output cycles kaput, full insert sequence. // chr5 // 100 // 70 // 33 // 33 // 0 /// AK158765 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230319I16 product:circadian locomoter output cycles kaput, full insert sequence. // chr5 // 32 // 32 // 15 // 47 // 1 /// GENSCAN00000025598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76216699:76231645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000025589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76232612:76273668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 49 // 49 // 23 // 47 // 1
NM_023508 // RefSeq // Mus musculus phosducin-like 2 (Pdcl2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:76312127:76331156:-1 gene:ENSMUSG00000029235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000122213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76312115:76331133:-1 gene:ENSMUSG00000029235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC048432 // GenBank // Mus musculus phosducin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:58103 IMAGE:6773342), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76312447:76363795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_019515 // RefSeq // Mus musculus neuromedin U (Nmu), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:76333495:76363788:-1 gene:ENSMUSG00000029236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF203444 // GenBank // Mus musculus neuromedin U precursor (NmU) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC125545 // GenBank // Mus musculus neuromedin U, mRNA (cDNA clone MGC:159248 IMAGE:40130060), complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC138071 // GenBank // Mus musculus neuromedin U, mRNA (cDNA clone MGC:169695 IMAGE:8861090), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC145135 // GenBank // Mus musculus neuromedin U, mRNA (cDNA clone MGC:178691 IMAGE:9053683), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76312447:76363795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
AK036552 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830133A07 product:weakly similar to 8030498B09RIK PROTEIN [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// AK043374 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730089K16 product:hypothetical Alanine-rich region profile/Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT052845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0
NM_172146 // RefSeq // Mus musculus phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase (Ppat), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000031158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76915044:76951165:-1 gene:ENSMUSG00000029246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000140076 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:76913276:76951578:-1 gene:ENSMUSG00000029246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000155272 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:76913249:76951572:-1 gene:ENSMUSG00000029246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC006053 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3590915, containing frame-shift errors. // chr5 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC023841 // GenBank // Mus musculus phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:38417 IMAGE:5346105), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:76918034:76925877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0
NM_001289764 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 (Spink2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NM_001289767 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 (Spink2), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NM_001289768 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 (Spink2), transcript variant 4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_183284 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 (Spink2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:77205107:77211471:-1 gene:ENSMUSG00000053030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120429 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:77205107:77211438:-1 gene:ENSMUSG00000053030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121825 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:77205112:77211205:-1 gene:ENSMUSG00000053030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC087876 // GenBank // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 2, mRNA (cDNA clone MGC:107139 IMAGE:6773100), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019836 // RefSeq // Mus musculus nitric oxide associated 1 (Noa1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000047860 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:77294182:77310084:-1 gene:ENSMUSG00000036285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC017154 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610024G14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28880 IMAGE:4910547), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000150722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:77304980:77310059:-1 gene:ENSMUSG00000036285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// AK163935 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230075O14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000054560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:77294360:77310056:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001159518 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 7 (Igfbp7), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_008048 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 7 (Igfbp7), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000046746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:77349240:77408045:-1 gene:ENSMUSG00000036256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:77349240:77408045:-1 gene:ENSMUSG00000036256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB012886 // GenBank // Mus musculus mRNA for mac25, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC092538 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:107287 IMAGE:30284911), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L75822 // GenBank // Mus musculus follistatin-like protein (mac25) mRNA, complete cds. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:77350270:77362916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NR_027806 // RefSeq // Mus musculus phosphoprotein enriched in astrocytes 15B (Pea15b), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:77511178:77511564:-1 gene:ENSMUSG00000047652 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000183185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:77511194:77511748:-1 gene:ENSMUSG00000047652 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY487415 // GenBank // Mus musculus vanishin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132661 // GenBank // Mus musculus phosphoprotein enriched in astrocytes 15B, mRNA (cDNA clone MGC:164292 IMAGE:40130938), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132663 // GenBank // Mus musculus phosphoprotein enriched in astrocytes 15B, mRNA (cDNA clone MGC:164294 IMAGE:40130940), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:77511268:77511651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT052885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000122486 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:79750381:79750529:-1 gene:ENSMUSG00000084435 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT052896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153801 // RefSeq // Mus musculus trans-2,3-enoyl-CoA reductase-like (Tecrl), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053543 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:83278145:83355195:-1 gene:ENSMUSG00000049537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146669 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:83289996:83354956:-1 gene:ENSMUSG00000049537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AF548365 // GenBank // Mus musculus steroid 5-alpha-reductase 2 like 2 (Srd5a2l2) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC107366 // GenBank // Mus musculus steroid 5 alpha-reductase 2-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:130344 IMAGE:40056219), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC107367 // GenBank // Mus musculus steroid 5 alpha-reductase 2-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:130345 IMAGE:40056223), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000122782 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:83690004:83690125:-1 gene:ENSMUSG00000084731 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONMMUT052951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
NM_007683 // RefSeq // Mus musculus centromere protein C1 (Cenpc1), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:86012043:86065583:-1 gene:ENSMUSG00000029253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC150700 // GenBank // Mus musculus centromere protein C1, mRNA (cDNA clone MGC:183611 IMAGE:9087611), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// U03113 // GenBank // Mus musculus Swiss centromeric protein CENPC (CENP-C) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// AK137953 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130046D17 product:centromere autoantigen C, full insert sequence. // chr5 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000052935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86004968:86065345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NM_172712 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-like modifier activating enzyme 6 (Uba6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000039373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:86110720:86172803:-1 gene:ENSMUSG00000035898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000113373 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:86112342:86172511:-1 gene:ENSMUSG00000035898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AK029769 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930542H01 product:MOP-4 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// BC063048 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-like modifier activating enzyme 6, mRNA (cDNA clone MGC:66555 IMAGE:6825308), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000147734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:86120841:86172739:-1 gene:ENSMUSG00000035898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// AK053583 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130112E08 product:MOP-4 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// GENSCAN00000052942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86112650:86197825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1
NM_010323 // RefSeq // Mus musculus gonadotropin releasing hormone receptor (Gnrhr), mRNA. // chr5 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031172 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:86181994:86197870:-1 gene:ENSMUSG00000029255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094654 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:86184556:86197846:-1 gene:ENSMUSG00000029255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// BC061250 // GenBank // Mus musculus gonadotropin releasing hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:74406 IMAGE:30249439), complete cds. // chr5 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// L01119 // GenBank // Mouse gonadotropin-releasing hormone receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// M93108 // GenBank // Mus musculus (strain CB6F1/J) gonadotropin-releasing hormone receptor mRNA sequence. // chr5 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113372 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:86180754:86197901:-1 gene:ENSMUSG00000029255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// L28756 // GenBank // Mouse gonadotropin-releasing hormone receptor mRNA. // chr5 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// GENSCAN00000052942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86112650:86197825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001030297 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 11c (Tmprss11c), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000059424 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:86231481:86289308:-1 gene:ENSMUSG00000061184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147157 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 11c, mRNA (cDNA clone MGC:182311 IMAGE:9056205), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147158 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 11c, mRNA (cDNA clone MGC:182271 IMAGE:9056165), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86231752:86240080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_145561 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 11d (Tmprss11d), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000031175 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:86302217:86373420:-1 gene:ENSMUSG00000061259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000122377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:86302217:86327736:-1 gene:ENSMUSG00000061259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// AB053953 // GenBank // Mus musculus AST mRNA for airway spesific trypsin-like protease, complete cds. // chr5 // 94 // 86 // 29 // 31 // 0 /// AF448809 // GenBank // Mus musculus airway trypsin-like protease mRNA, complete cds. // chr5 // 76 // 92 // 25 // 33 // 0 /// AF539752 // GenBank // Mus musculus airway trypsin-like protease precursor short isoform (MAT2) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr5 // 78 // 64 // 18 // 23 // 0 /// BC020151 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 11d, mRNA (cDNA clone MGC:28382 IMAGE:4021767), complete cds. // chr5 // 76 // 94 // 26 // 34 // 0 /// GENSCAN00000052936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86303611:86339513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
NM_001033233 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 11a (Tmprss11a), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006534840 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protease, serine 11a (Tmprss11a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000101073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:86410410:86468990:-1 gene:ENSMUSG00000072845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86413342:86465988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_177162 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 11g (Tmprss11g), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000134179 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:86485876:86518600:-1 gene:ENSMUSG00000079451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000140095 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:86486367:86518571:-1 gene:ENSMUSG00000079451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC118611 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9930032O22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:148215 IMAGE:40107184), complete cds. // chr5 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// BC118660 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9930032O22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:148216 IMAGE:40107187), complete cds. // chr5 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86487399:86499630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_178730 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 11f (Tmprss11f), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000116553 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:86521898:86632424:-1 gene:ENSMUSG00000048764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC132629 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 11f, mRNA (cDNA clone MGC:164260 IMAGE:40130906), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86535725:86557221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_177024 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 11B (Tmprss11b), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000038448 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:86657631:86676362:-1 gene:ENSMUSG00000035861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC115419 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 11b, mRNA (cDNA clone MGC:143797 IMAGE:40093437), complete cds. // chr5 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// BC115420 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 11b, mRNA (cDNA clone MGC:143798 IMAGE:40093438), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86660465:86693789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0
NM_172880 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 11e (Tmprss11e), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000161306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:86705186:86745815:-1 gene:ENSMUSG00000054537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY787860 // GenBank // Mus musculus type II transmembrane serine protease (Desc1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC115432 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 11e, mRNA (cDNA clone MGC:143865 IMAGE:40094164), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC115433 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 11e, mRNA (cDNA clone MGC:143866 IMAGE:40094170), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86707273:86775008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_153598 // RefSeq // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B34 (Ugt2b34), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:86889767:86906937:-1 gene:ENSMUSG00000029260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000113333 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:86889767:86906937:-1 gene:ENSMUSG00000029260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC028826 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B34, mRNA (cDNA clone MGC:37823 IMAGE:5098890), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86863373:86904405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_152811 // RefSeq // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B1 (Ugt2b1), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:86916638:86926530:-1 gene:ENSMUSG00000035836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC027200 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B1, mRNA (cDNA clone MGC:28464 IMAGE:4161686), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:86917589:86926498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000102029 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:86928903:86929008:-1 gene:ENSMUSG00000075983 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000082752 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:22224244:22224351:1 gene:ENSMUSG00000064686 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0 /// ENSMUST00000178071 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:13:17206021:17206127:1 gene:ENSMUSG00000094754 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0 /// NONMMUT052988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT016480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0 /// NONMMUT025922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0
NM_001029867 // RefSeq // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B36 (Ugt2b36), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000094649 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:87065927:87092555:-1 gene:ENSMUSG00000070704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000145617 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:87066438:87092548:-1 gene:ENSMUSG00000070704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// BC141232 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B36, mRNA (cDNA clone MGC:176193 IMAGE:9055844), complete cds. // chr5 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// BC145555 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B36, mRNA (cDNA clone MGC:179127 IMAGE:9054119), complete cds. // chr5 // 89 // 95 // 16 // 18 // 0 /// ENSMUST00000132667 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:87081009:87092546:-1 gene:ENSMUSG00000070704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1 /// ENSMUST00000154455 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:87066441:87091157:-1 gene:ENSMUSG00000070704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// GENSCAN00000019364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87055438:87092524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NM_009467 // RefSeq // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B5 (Ugt2b5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000067790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:87124960:87140318:-1 gene:ENSMUSG00000054630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC028262 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B5, mRNA (cDNA clone MGC:40638 IMAGE:5102040), complete cds. // chr5 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_053215 // RefSeq // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B37 (Ugt2b37), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000075858 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:87240493:87254804:-1 gene:ENSMUSG00000057425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC019487 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B37, mRNA (cDNA clone MGC:28675 IMAGE:4237718), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000019361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87242269:87475107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
NM_028094 // RefSeq // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A3 (Ugt2a3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:87324972:87337195:-1 gene:ENSMUSG00000035780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC025795 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A3, mRNA (cDNA clone MGC:35622 IMAGE:5133743), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87242269:87475107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_133894 // RefSeq // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B38 (Ugt2b38), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000072818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:87409942:87424203:-1 gene:ENSMUSG00000061906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC015272 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B38, mRNA (cDNA clone MGC:18602 IMAGE:4241480), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC057169 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B38, mRNA (cDNA clone MGC:67906 IMAGE:4975249), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC069923 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B38, mRNA (cDNA clone MGC:78201 IMAGE:4974994), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000019361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87242269:87475107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NM_001024148 // RefSeq // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A2 (Ugt2a2), mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NM_053184 // RefSeq // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A1 (Ugt2a1), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000079811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:87459490:87482258:-1 gene:ENSMUSG00000029268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000144144 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:87460359:87482260:-1 gene:ENSMUSG00000029268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 57 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000147854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:87459490:87490871:-1 gene:ENSMUSG00000029268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AF184901 // GenBank // Mus musculus olfactory UDP glucuronosyltransferase mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 69 // 23 // 24 // 0 /// BC048926 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A1, mRNA (cDNA clone MGC:56935 IMAGE:6314878), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC058786 // GenBank // Mus musculus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A2, mRNA (cDNA clone MGC:65541 IMAGE:6310060), complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87242269:87475107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1
NM_019878 // RefSeq // Mus musculus sulfotransferase family 1B, member 1 (Sult1b1), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006535151 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sulfotransferase family 1B, member 1 (Sult1b1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:87513339:87538195:-1 gene:ENSMUSG00000029269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000117455 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:87513366:87536222:-1 gene:ENSMUSG00000029269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120150 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:87514689:87535146:-1 gene:ENSMUSG00000029269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AF022894 // GenBank // Mus musculus sulfotransferase (SULT1B1) mRNA, partial cds. // chr5 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC024361 // GenBank // Mus musculus sulfotransferase family 1B, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:35903 IMAGE:4990345), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// U92076 // GenBank // Mus musculus dopa/tyrosine sulfotransferase mRNA complete cds. // chr5 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87514940:87535084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// AK087595 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230020O21 product:sulfotransferase family 1B, member 1, full insert sequence. // chr5 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0
NM_016771 // RefSeq // Mus musculus sulfotransferase family 1D, member 1 (Sult1d1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:87554645:87569027:-1 gene:ENSMUSG00000029273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000166996 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:87555940:87560191:-1 gene:ENSMUSG00000029273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// AF026073 // GenBank // Mus musculus amine N-sulfotransferase (SULT-N) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC066190 // GenBank // Mus musculus sulfotransferase family 1D, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:76663 IMAGE:30472198), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// U32371 // GenBank // Mus musculus tyrosine-ester sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87555937:87602008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_023135 // RefSeq // Mus musculus sulfotransferase family 1E, member 1 (Sult1e1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:87575968:87591611:-1 gene:ENSMUSG00000029272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC034891 // GenBank // Mus musculus sulfotransferase family 1E, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:41404 IMAGE:1479883), complete cds. // chr5 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:87555937:87602008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_152839 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin joining chain (Igj), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000087033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:88520512:88527891:-1 gene:ENSMUSG00000067149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB644392 // GenBank // Mus musculus mRNA for immunoglobulin joining chain, complete cds, strain: BALB/c. // chr5 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// BC006026 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin joining chain, mRNA (cDNA clone MGC:6626 IMAGE:3491646), complete cds. // chr5 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// M90766 // GenBank // Mouse Ig active joining chain (J chain) mRNA of the b allele, complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000164073 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:88521335:88526640:-1 gene:ENSMUSG00000067149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000005593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:88521313:88527779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_001098476 // RefSeq // Mus musculus G-rich RNA sequence binding factor 1 (Grsf1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_178700 // RefSeq // Mus musculus G-rich RNA sequence binding factor 1 (Grsf1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000078945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:88659448:88676171:-1 gene:ENSMUSG00000044221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000113234 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:88659458:88675666:-1 gene:ENSMUSG00000044221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000130408 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:88662535:88671405:-1 gene:ENSMUSG00000044221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000133532 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:88671207:88675192:-1 gene:ENSMUSG00000044221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 30 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000153565 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:88665884:88675670:-1 gene:ENSMUSG00000044221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0 /// BC034695 // GenBank HTC // Mus musculus G-rich RNA sequence binding factor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3584046), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:88641987:88676111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
ENSMUST00000122035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:88838009:88839402:-1 gene:ENSMUSG00000082389 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF494488 // GenBank // Mus musculus makorin 1 pseudogene mRNA, partial sequence. // chr5 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0
NM_008096 // RefSeq // Mus musculus group specific component (Gc), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000049209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:89417511:89457898:-1 gene:ENSMUSG00000035540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC010762 // GenBank // Mus musculus group specific component, mRNA (cDNA clone MGC:18518 IMAGE:4234788), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC051395 // GenBank // Mus musculus group specific component, mRNA (cDNA clone MGC:58991 IMAGE:5125043), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:89374780:89464069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000056202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:89479055:89499979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0
NM_001081401 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_177872 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535012 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535014 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:89673841:89883334:-1 gene:ENSMUSG00000043635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:89673841:89883334:-1 gene:ENSMUSG00000043635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158091 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:189989 IMAGE:9088176), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC158105 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:189994 IMAGE:9088181), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:89637350:89687067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001081401 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_177872 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535012 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535014 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:89673841:89883334:-1 gene:ENSMUSG00000043635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:89673841:89883334:-1 gene:ENSMUSG00000043635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158091 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:189989 IMAGE:9088176), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158105 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:189994 IMAGE:9088181), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:89689803:89785131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081401 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535014 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:89673841:89883334:-1 gene:ENSMUSG00000043635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158105 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:189994 IMAGE:9088181), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081401 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_177872 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535012 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535014 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:89673841:89883334:-1 gene:ENSMUSG00000043635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:89673841:89883334:-1 gene:ENSMUSG00000043635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158091 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:189989 IMAGE:9088176), complete cds. // chr5 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC158105 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:189994 IMAGE:9088181), complete cds. // chr5 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:89689803:89785131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081401 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_177872 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535012 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535014 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:89673841:89883334:-1 gene:ENSMUSG00000043635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:89673841:89883334:-1 gene:ENSMUSG00000043635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158091 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:189989 IMAGE:9088176), complete cds. // chr5 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// BC158105 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:189994 IMAGE:9088181), complete cds. // chr5 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:89689803:89785131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081401 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_177872 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535012 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535014 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3 (Adamts3), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:89673841:89883334:-1 gene:ENSMUSG00000043635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:89673841:89883334:-1 gene:ENSMUSG00000043635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158091 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:189989 IMAGE:9088176), complete cds. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC158105 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 3, mRNA (cDNA clone MGC:189994 IMAGE:9088181), complete cds. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:89689803:89785131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK051463 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130050E23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK153997 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430020C21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
AK040636 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430110O19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00005896 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028478 // RefSeq // Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 6 (Rassf6), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000031317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:90603076:90640487:-1 gene:ENSMUSG00000029370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC039934 // GenBank // Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:3669766), partial cds. // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC075725 // GenBank HTC // Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:30439290), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// XR_389293 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 6 (Rassf6), transcript variant X11, misc_RNA. // chr5 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// GENSCAN00000002730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:90589060:90620027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1
NM_007568 // RefSeq // Mus musculus betacellulin, epidermal growth factor family member (Btc), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000121044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:91357261:91402994:-1 gene:ENSMUSG00000082361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC119152 // GenBank // Mus musculus betacellulin, epidermal growth factor family member, mRNA (cDNA clone MGC:155468 IMAGE:8733901), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC119154 // GenBank // Mus musculus betacellulin, epidermal growth factor family member, mRNA (cDNA clone MGC:155470 IMAGE:8733903), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// L08394 // GenBank // Mus musculus betacellulin (bcn) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:91360748:91377073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000178933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:91806576:91807073:-1 gene:ENSMUSG00000096726 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:91806576:91807073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000158087 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:92056064:92056192:-1 gene:ENSMUSG00000088712 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_033483 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence U90926 (U90926), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:92209896:92215408:-1 gene:ENSMUSG00000029409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U90926 // GenBank // Mus musculus putative TNF-resistance related protein mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_011148 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase, EF hand calcium-binding domain 2 (Ppef2), mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// XM_006534818 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase, EF hand calcium-binding domain 2 (Ppef2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 49 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000031359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:92226974:92253159:-1 gene:ENSMUSG00000029410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// AF023458 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase with EF-hands-2 (PPEF-2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// BC027049 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase, EF hand calcium-binding domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:38671 IMAGE:5356685), complete cds. // chr5 // 97 // 93 // 37 // 38 // 0 /// XM_006534819 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase, EF hand calcium-binding domain 2 (Ppef2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1 /// GENSCAN00000026854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:92226974:92232164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000026845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:92234125:92278132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1
NM_001163687 // RefSeq // Mus musculus N-acylethanolamine acid amidase (Naaa), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_025972 // RefSeq // Mus musculus N-acylethanolamine acid amidase (Naaa), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000113102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:92257659:92278170:-1 gene:ENSMUSG00000029413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000159345 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:92258433:92278165:-1 gene:ENSMUSG00000029413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000175656 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:92259556:92272548:-1 gene:ENSMUSG00000029413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// AB162194 // GenBank // Mus musculus NAAA mRNA for N-acylethanolamine-hydrolyzing acid amidase, complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC004572 // GenBank // Mus musculus N-acylethanolamine acid amidase, mRNA (cDNA clone MGC:8016 IMAGE:3586255), complete cds. // chr5 // 91 // 97 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000159732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:92257664:92262782:-1 gene:ENSMUSG00000029413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// AK089243 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630103D01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000026845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:92234125:92278132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_172713 // RefSeq // Mus musculus SDA1 domain containing 1 (Sdad1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000031364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:92284010:92310024:-1 gene:ENSMUSG00000029415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AK164608 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430034M02 product:hypothetical ARM repeat fold containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 35 // 16 // 16 // 0 /// BC042708 // GenBank // Mus musculus SDA1 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:51387 IMAGE:5024980), complete cds. // chr5 // 86 // 96 // 38 // 44 // 0 /// GENSCAN00000026860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:92283666:92309881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0
NM_008599 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 9 (Cxcl9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000113093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:92321331:92328079:-1 gene:ENSMUSG00000029417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003343 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 9, mRNA (cDNA clone MGC:6179 IMAGE:3257716), complete cds. // chr5 // 77 // 85 // 17 // 22 // 0 /// CT010194 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836E1050D for gene Cxcl9, Chemokine (C-X-C motif) ligand 9; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 81 // 62 // 13 // 16 // 0 /// M34815 // GenBank // Mouse monokine induced by gamma interferon (MIG) mRNA, complete cds. // chr5 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:92322425:92328023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_019494 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 11 (Cxcl11), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// NR_038116 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 11 (Cxcl11), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000077820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:92359547:92363277:-1 gene:ENSMUSG00000060183 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000122808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:92359544:92365485:-1 gene:ENSMUSG00000060183 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF136449 // GenBank // Mus musculus SCYB11 (Scyb11) mRNA, complete cds. // chr5 // 89 // 59 // 17 // 19 // 0 /// AF178672 // GenBank // Mus musculus CxC chemokine SCYB11 (Scyb11) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// AF179872 // GenBank // Mus musculus interferon-inducible T cell alpha chemoattractant proprotein mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// AK050012 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730001K22 product:small inducible cytokine subfamily B (Cys-X-Cys), member 11, full insert sequence. // chr5 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// BC025903 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 11, mRNA (cDNA clone MGC:32375 IMAGE:5035983), complete cds. // chr5 // 79 // 59 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000026864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:92355928:92363214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_183392 // RefSeq // Mus musculus nucleoporin 54 (Nup54), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000038514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:92415540:92435219:-1 gene:ENSMUSG00000034826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000122893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:92428021:92435091:-1 gene:ENSMUSG00000034826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// AK014260 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110079L04 product:similar to 5 of NUCLEOPORIN P54 [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// BC068114 // GenBank // Mus musculus nucleoporin 54, mRNA (cDNA clone MGC:92978 IMAGE:5707888), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// XM_006534957 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin 54 (Nup54), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1 /// NONMMUT053109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0
NM_007644 // RefSeq // Mus musculus scavenger receptor class B, member 2 (Scarb2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:92443873:92505608:-1 gene:ENSMUSG00000029426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB008553 // GenBank // Mus musculus mRNA for mLGP85/LIMP II, complete cds. // chr5 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// AK149102 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120483J06 product:scavenger receptor class B, member 2, full insert sequence. // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC029073 // GenBank // Mus musculus scavenger receptor class B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:11451 IMAGE:3962669), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK170555 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630107K16 product:scavenger receptor class B, member 2, full insert sequence. // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000026847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:92440853:92529882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_177230 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 158 (Ccdc158), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060930 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:92608253:92675125:-1 gene:ENSMUSG00000050050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137976 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932413O14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169600 IMAGE:8860995), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150359 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:92652054:92675271:-1 gene:ENSMUSG00000050050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000151180 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:92652054:92675265:-1 gene:ENSMUSG00000050050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:92606375:92649131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000180431 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:5:92804220:92809488:-1 gene:ENSMUSG00000097135 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK133290 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932430I15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// NONMMUT053121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_175270 // RefSeq // Mus musculus sosondowah ankyrin repeat domain family member B (Sowahb), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:93041123:93045022:-1 gene:ENSMUSG00000045314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:93042576:93044858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_017367 // RefSeq // Mus musculus cyclin I (Ccni), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000058550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:93181933:93206495:-1 gene:ENSMUSG00000063015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC003290 // GenBank // Mus musculus cyclin I, mRNA (cDNA clone MGC:5636 IMAGE:3583418), complete cds. // chr5 // 92 // 76 // 12 // 13 // 0 /// AF005886 // GenBank // Mus musculus cyclin I mRNA, complete cds. // chr5 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// GENSCAN00000003419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:93182977:93193907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
ENSMUST00000128468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:93390602:93393091:-1 gene:ENSMUSG00000053208 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:93390602:93393043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001033191 // RefSeq // Mus musculus N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit (Naa11), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:97382224:97392330:-1 gene:ENSMUSG00000046000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139104 // GenBank // Mus musculus ARD1 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:170731 IMAGE:8862126), complete cds. // chr5 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// BC145776 // GenBank // Mus musculus ARD1 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:175663 IMAGE:40131079), complete cds. // chr5 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// EU192141 // GenBank // Mus musculus arrest defective 2 (Ard2) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_010294 // RefSeq // Mus musculus glycerol kinase 2 (Gk2), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000059657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:97455161:97457008:-1 gene:ENSMUSG00000050553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF117734 // GenBank // Mus musculus glycerol kinase-like protein 2 (Gkrs2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC050764 // GenBank // Mus musculus glycerol kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:58280 IMAGE:6774427), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC061147 // GenBank // Mus musculus glycerol kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:74279 IMAGE:6770827), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000038666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:97446167:97538946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0
NM_133738 // RefSeq // Mus musculus anthrax toxin receptor 2 (Antxr2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000031281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:97882783:98030733:-1 gene:ENSMUSG00000029338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC003908 // GenBank // Mus musculus anthrax toxin receptor 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3484366), partial cds. // chr5 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// BC076595 // GenBank // Mus musculus anthrax toxin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:100142 IMAGE:30649897), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// EU234005 // GenBank // Mus musculus LINE L1 ASL1/Antrx2 fusion protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// AK155460 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630230E18 product:anthrax toxin receptor 2, full insert sequence. // chr5 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// GENSCAN00000034292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:97915934:98030549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
AK019785 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930565F05 product:hypothetical Alanine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK042889 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730035I17 product:Hypothetical alanine-rich region containing protein (Fragment), full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_389371 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102637492 (LOC102637492), ncRNA. // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000086912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:98564197:98566762:-1 gene:ENSMUSG00000067101 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// AK005827 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700010H22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK015350 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930440M09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// ENSMUST00000189748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:98553629:98566926:-1 gene:ENSMUSG00000067101 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:98566570:98572729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000187592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:98562782:98567004:-1 gene:ENSMUSG00000067101 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1
NM_145839 // RefSeq // Mus musculus RasGEF domain family, member 1B (Rasgef1b), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_181318 // RefSeq // Mus musculus RasGEF domain family, member 1B (Rasgef1b), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006534985 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RasGEF domain family, member 1B (Rasgef1b), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:99217426:99252927:-1 gene:ENSMUSG00000029333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000166484 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:99218774:99243240:-1 gene:ENSMUSG00000029333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000168092 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:99217426:99252927:-1 gene:ENSMUSG00000029333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AY129963 // GenBank // Mus musculus strain C3H GPI-gamma 4 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC050858 // GenBank // Mus musculus RasGEF domain family, member 1B, mRNA (cDNA clone MGC:59456 IMAGE:6517502), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC052726 // GenBank // Mus musculus RasGEF domain family, member 1B, mRNA (cDNA clone MGC:64687 IMAGE:6813357), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000166632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:99227794:99234066:-1 gene:ENSMUSG00000029333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000044988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:99222226:99253890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
ENSMUST00000161516 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:99375026:99729062:-1 gene:ENSMUSG00000089809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK044414 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930011G23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_030692 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A930011G23 gene (A930011G23Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSMUST00000142639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:99556527:99729065:-1 gene:ENSMUSG00000089809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// ENSMUST00000146396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:99297244:99729045:-1 gene:ENSMUSG00000089809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// AK050558 // GenBank HTC // Mus musculus adult pancreas islet cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C820017N15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// ENSMUST00000161148 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:99723455:99729056:-1 gene:ENSMUSG00000089809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT053246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
GENSCAN00000044990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:99839518:99839990:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000150506 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:100220440:100355119:-1 gene:ENSMUSG00000085915 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// NONMMUT053292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0
NM_026969 // RefSeq // Mus musculus Sec31 homolog A (S. cerevisiae) (Sec31a), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006535193 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Sec31 homolog A (S. cerevisiae) (Sec31a), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000094578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:100361649:100416234:-1 gene:ENSMUSG00000035325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000182886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:100361654:100416175:-1 gene:ENSMUSG00000035325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000182988 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:100362008:100395901:-1 gene:ENSMUSG00000035325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC025831 // GenBank // Mus musculus SEC31-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5125246), partial cds. // chr5 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:100362051:100408112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000021104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:100502631:100513620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_139198 // RefSeq // Mus musculus placenta-specific 8 (Plac8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031264 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:100553725:100572245:-1 gene:ENSMUSG00000029322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:100553726:100562858:-1 gene:ENSMUSG00000029322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:100553727:100563423:-1 gene:ENSMUSG00000029322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF263458 // GenBank // Mus musculus onzin mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AJ422151 // GenBank // Mus musculus mRNA for C15 protein. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010789 // GenBank // Mus musculus placenta-specific 8, mRNA (cDNA clone MGC:18842 IMAGE:4216402), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:100556491:100562733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_027978 // RefSeq // Mus musculus coenzyme Q2 homolog, prenyltransferase (yeast) (Coq2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_389292 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coenzyme Q2 homolog, prenyltransferase (yeast) (Coq2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000031262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:100654723:100674284:-1 gene:ENSMUSG00000029319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000126981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:100657943:100674249:-1 gene:ENSMUSG00000029319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000135146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:100655255:100674156:-1 gene:ENSMUSG00000029319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// BC050978 // GenBank HTC // Mus musculus coenzyme Q2 homolog, prenyltransferase (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:6593107). // chr5 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// BC080773 // GenBank // Mus musculus coenzyme Q2 homolog, prenyltransferase (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:91278 IMAGE:30139077), complete cds. // chr5 // 55 // 100 // 12 // 22 // 0 /// ENSMUST00000135801 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:100660172:100664419:-1 gene:ENSMUSG00000029319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// GENSCAN00000021118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:100649822:100674241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
NM_152803 // RefSeq // Mus musculus heparanase (Hpse), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000045617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:100679484:100719716:-1 gene:ENSMUSG00000035273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112908 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:100684581:100719705:-1 gene:ENSMUSG00000035273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AF359507 // GenBank // Mus musculus heparanase (Hspe) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// AK087283 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030042C09 product:heparanase, full insert sequence. // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AY077467 // GenBank // Mus musculus heparanase (Hpa) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// AY151051 // GenBank // Mus musculus heparanase mRNA, complete cds. // chr5 // 83 // 89 // 20 // 24 // 0 /// BC138782 // GenBank // Mus musculus heparanase, mRNA (cDNA clone MGC:170409 IMAGE:8861804), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC138784 // GenBank // Mus musculus heparanase, mRNA (cDNA clone MGC:170411 IMAGE:8861806), complete cds. // chr5 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:100675093:100719594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_144955 // RefSeq // Mus musculus NK6 homeobox 1 (Nkx6-1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:101659177:101664996:-1 gene:ENSMUSG00000035187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF357883 // GenBank // Mus musculus homeodomain transcription factor (Nkx6-1) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC138019 // GenBank // Mus musculus NK6 homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:169643 IMAGE:8861038), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC138020 // GenBank // Mus musculus NK6 homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:169644 IMAGE:8861039), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:101659417:101664216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0
NM_172882 // RefSeq // Mus musculus WD repeat and FYVE domain containing 3 (Wdfy3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535220 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat and FYVE domain containing 3 (Wdfy3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:101832956:102069921:-1 gene:ENSMUSG00000043940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058274 // GenBank // Mus musculus WD repeat and FYVE domain containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6515138), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081567 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 10 (Mapk10), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_009158 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 10 (Mapk10), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000170792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:102907948:103211334:-1 gene:ENSMUSG00000046709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_029415 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 6 (Slc10a6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031263 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:103605711:103629403:-1 gene:ENSMUSG00000029321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC127608 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:149979 IMAGE:40058121), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC139343 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:170970 IMAGE:8862365), complete cds. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC139346 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:170973 IMAGE:8862368), complete cds. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:103606542:103629232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_178741 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 8 (Klhl8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:103862050:103911259:-1 gene:ENSMUSG00000029312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC086802 // GenBank // Mus musculus kelch-like 8 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:102224 IMAGE:30612176), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112811 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:103861973:103886290:-1 gene:ENSMUSG00000029312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENSMUST00000112815 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:103861973:103886290:-1 gene:ENSMUSG00000029312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000131843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:103862080:103886290:-1 gene:ENSMUSG00000029312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// ENSMUST00000147184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:103870310:103874369:-1 gene:ENSMUSG00000029312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000042190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:103854314:103886149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001163486 // RefSeq // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 13 (Hsd17b13), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_198030 // RefSeq // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 13 (Hsd17b13), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000048118 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:103955440:103977364:-1 gene:ENSMUSG00000034528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000112803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:103963461:103977410:-1 gene:ENSMUSG00000034528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120320 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:103963461:103977326:-1 gene:ENSMUSG00000034528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC019427 // GenBank // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 13, mRNA (cDNA clone MGC:30360 IMAGE:5132342), complete cds. // chr5 // 82 // 88 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:103944119:103977315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_053262 // RefSeq // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 11 (Hsd17b11), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000031251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:103989762:104021919:-1 gene:ENSMUSG00000029311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF304306 // GenBank // Mus musculus alcohol dehydrogenase Pan1b mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// AY053570 // GenBank // Mus musculus retinal short-chain dehydrogenase/reductase SDR2 mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC038340 // GenBank // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 11, mRNA (cDNA clone MGC:28723 IMAGE:4458725), complete cds. // chr5 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000119025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:104001732:104021838:-1 gene:ENSMUSG00000029311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// AK049355 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330027B16 product:hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 11, full insert sequence. // chr5 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000017879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:103990510:104018580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0
NM_010097 // RefSeq // Mus musculus SPARC-like 1 (Sparcl1), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000031249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:104079111:104114088:-1 gene:ENSMUSG00000029309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC003759 // GenBank // Mus musculus SPARC-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:5894 IMAGE:3486162), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// U64827 // GenBank // Mus musculus extracellular matrix associated protein (Sc1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// U77330 // GenBank // Mus musculus extracellular matrix protein precursor SC1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:104069907:104097762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
AK047634 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030003M13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039231 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 951 (Zfp951), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006535175 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 951 (Zfp951), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 92 // 92 // 12 // 13 // 1 /// ENSMUST00000186219 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:104813169:104860070:-1 gene:ENSMUSG00000072774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_030239 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 3 (Abcg3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006534964 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 3 (Abcg3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000031239 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:104935057:104982718:-1 gene:ENSMUSG00000029299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000130644 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:104935679:104977834:-1 gene:ENSMUSG00000029299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AF324242 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette transporter ABCG3 (Abcg3) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC029095 // GenBank HTC // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3491948), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr5 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// BC138772 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:170399 IMAGE:8861794), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC138773 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:170400 IMAGE:8861795), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000003500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:104930290:104982748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_029509 // RefSeq // Mus musculus guanylate-binding protein 8 (Gbp8), mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000031235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:105014153:105139540:-1 gene:ENSMUSG00000034438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// BC031475 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830443L24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:27754 IMAGE:2654170), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000112718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:105014927:105051047:-1 gene:ENSMUSG00000034438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// DQ295175 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 8 (mGBP8) mRNA, complete cds. // chr5 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// GENSCAN00000003541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:105014949:105171730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1
NM_172777 // RefSeq // Mus musculus guanylate-binding protein 9 (Gbp9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000031238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:105078394:105110292:-1 gene:ENSMUSG00000029298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// DQ985742 // GenBank // Mus musculus guanylate-binding protein 9 (Gbp9) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006534923 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanylate-binding protein 9 (Gbp9), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// ENSMUST00000100961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:105079298:105139539:-1 gene:ENSMUSG00000029298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1
NM_001256005 // RefSeq // Mus musculus guanylate binding protein 4 (Gbp4), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NM_008620 // RefSeq // Mus musculus guanylate binding protein 4 (Gbp4), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000100962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:105115767:105139586:-1 gene:ENSMUSG00000079363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// EF494423 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 4.1 (Gbp4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// EF494424 // GenBank // Mus musculus truncated guanylate binding protein 4 (Gbp4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// XM_006534805 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanylate binding protein 4 (Gbp4), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// XM_006534807 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanylate binding protein 4 (Gbp4), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// BC141364 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:176326 IMAGE:9055977), complete cds. // chr5 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// BC147434 // GenBank // Mus musculus guanylate binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:176325 IMAGE:9055976), complete cds. // chr5 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// M81128 // GenBank // Mouse putative guanylate binding protein mRNA, complete cds. // chr5 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NM_001039647 // RefSeq // Mus musculus guanylate binding protein 11 (Gbp11), mRNA. // chr5 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// ENSMUST00000100960 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:105323042:105346472:-1 gene:ENSMUSG00000092021 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr5 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// GENSCAN00000003481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:105273102:105328608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001005477 // RefSeq // Mus musculus BarH-like 2 (Drosophila) (Barhl2), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:106452523:106458166:-1 gene:ENSMUSG00000034384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC055789 // GenBank // Mus musculus BarH-like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:6409990), partial cds. // chr5 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC078444 // GenBank // Mus musculus BarH-like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:90874 IMAGE:5688311), complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:106451972:106457841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
NM_177873 // RefSeq // Mus musculus HFM1, ATP-dependent DNA helicase homolog (S. cerevisiae) (Hfm1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006535018 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HFM1, ATP-dependent DNA helicase homolog (S. cerevisiae) (Hfm1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000112690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:106840197:106925890:-1 gene:ENSMUSG00000043410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000117588 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:106840194:106926321:-1 gene:ENSMUSG00000043410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000148495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:106840192:106895327:-1 gene:ENSMUSG00000043410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000155171 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:106841562:106889922:-1 gene:ENSMUSG00000043410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000004073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:106856847:106878722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0
NM_011578 // RefSeq // Mus musculus transforming growth factor, beta receptor III (Tgfbr3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000031224 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:107106570:107289629:-1 gene:ENSMUSG00000029287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000138469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:107109281:107192367:-1 gene:ENSMUSG00000029287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000146591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:107147980:107289595:-1 gene:ENSMUSG00000029287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// AF039601 // GenBank // Mus musculus betaglycan mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// AK133234 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932420A01 product:transforming growth factor, beta receptor III, full insert sequence. // chr5 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// AK166082 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730037A11 product:transforming growth factor, beta receptor III, full insert sequence. // chr5 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// BC070428 // GenBank // Mus musculus transforming growth factor, beta receptor III, mRNA (cDNA clone MGC:95749 IMAGE:6410554), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000136882 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:107118197:107132923:-1 gene:ENSMUSG00000029287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000004118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:107116522:107178753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
NM_001161738 // RefSeq // Mus musculus glomulin, FKBP associated protein (Glmn), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_001161739 // RefSeq // Mus musculus glomulin, FKBP associated protein (Glmn), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NM_133248 // RefSeq // Mus musculus glomulin, FKBP associated protein (Glmn), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000078021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:107548967:107597639:-1 gene:ENSMUSG00000029276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000082121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:107549023:107597888:-1 gene:ENSMUSG00000029276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000100949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:107548969:107597577:-1 gene:ENSMUSG00000029276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000124546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:107549024:107597544:-1 gene:ENSMUSG00000029276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000148505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:107572280:107597566:-1 gene:ENSMUSG00000029276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// BC003446 // GenBank // Mus musculus glomulin, FKBP associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:6885 IMAGE:2651614), complete cds. // chr5 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// GENSCAN00000004164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:107552811:107596359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0
NM_026062 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 69, member A (Fam69a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:107908053:107987085:-1 gene:ENSMUSG00000029270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000145239 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:107909703:107987033:-1 gene:ENSMUSG00000029270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC116683 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 69, member A, mRNA (cDNA clone MGC:144843 IMAGE:40106565), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:107909404:107924854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_007507 // RefSeq // Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1F0 complex, subunit E (Atp5k), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000049628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:108433244:108434448:-1 gene:ENSMUSG00000050856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000118632 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:108433244:108434448:-1 gene:ENSMUSG00000050856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000123184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:108433246:108434397:-1 gene:ENSMUSG00000050856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK011342 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610008D24 product:ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1F0 complex, subunit e, full insert sequence. // chr5 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// BC028438 // GenBank // Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1F0 complex, subunit e, mRNA (cDNA clone MGC:41222 IMAGE:1332765), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC089550 // GenBank // Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1F0 complex, subunit e, mRNA (cDNA clone MGC:107302 IMAGE:30380642), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT053643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_172883 // RefSeq // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 7A (Mfsd7a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006534933 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 7A (Mfsd7a), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:108441054:108448891:-1 gene:ENSMUSG00000029490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK087226 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030037A17 product:weakly similar to CDNA: FLJ22269 FIS, CLONE HRC03179 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK171069 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630222D07 product:similar to MYL5 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC094512 // GenBank // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 7A, mRNA (cDNA clone MGC:106306 IMAGE:2616131), complete cds. // chr5 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// XM_006534932 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 7A (Mfsd7a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// XM_006534934 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 7A (Mfsd7a), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000032581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:108441984:108452857:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_007756 // RefSeq // Mus musculus complexin 1 (Cplx1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000046892 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:108518554:108550024:-1 gene:ENSMUSG00000033615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000129040 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:108520259:108550000:-1 gene:ENSMUSG00000033615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// BC014803 // GenBank // Mus musculus complexin 1, mRNA (cDNA clone MGC:25327 IMAGE:4527117), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D38614 // GenBank // Mus musculus 921-S mRNA for presynaptic protein, complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
XM_006535331 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 212 (Rnf212), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000068946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:108731661:108749448:-1 gene:ENSMUSG00000055385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// XM_001476621 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 212 (Rnf212), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// AK089585 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830003B07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// BC109180 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40049733. // chr5 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1
NM_026109 // RefSeq // Mus musculus transmembrane emp24 protein transport domain containing (Tmed11), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000004943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:108777235:108795363:-1 gene:ENSMUSG00000004821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132664 // GenBank // Mus musculus transmembrane emp24 protein transport domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:164295 IMAGE:40130941), complete cds. // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC132666 // GenBank // Mus musculus transmembrane emp24 protein transport domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:164297 IMAGE:40130943), complete cds. // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:108758861:108808754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001104621 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 9 (Vmn2r9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000170419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:108842947:108852510:-1 gene:ENSMUSG00000091624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000032587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:108821457:108852510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000176594 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:108993412:109006471:-1 gene:ENSMUSG00000067010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF011426 // GenBank // Mus musculus putative pheromone receptor (VR16) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NM_009491 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 10 (Vmn2r10), mRNA. // chr5 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// ENSMUST00000079163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:108995539:109006436:-1 gene:ENSMUSG00000067010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// GENSCAN00000041814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:108995539:109092960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
NM_172429 // RefSeq // Mus musculus survival motor neuron domain containing 1 (Smndc1), mRNA. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006527440 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus survival motor neuron domain containing 1 (Smndc1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006527441 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus survival motor neuron domain containing 1 (Smndc1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:19:53379214:53390573:-1 gene:ENSMUSG00000025024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:109016198:109016915:-1 gene:ENSMUSG00000093545 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK077225 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933440I19 product:weakly similar to SURVIVAL MOTOR NEURON PROTEIN (FRAGMENT) [Platichthys flesus], full insert sequence. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC058779 // GenBank // Mus musculus survival motor neuron domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:68042 IMAGE:6312831), complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC098223 // GenBank // Mus musculus survival motor neuron domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:106917 IMAGE:1282458), complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:53380464:53390139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:108995539:109092960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001104623 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 12 (Vmn2r12), mRNA. // chr5 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// NM_001104624 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 13 (Vmn2r13), mRNA. // chr5 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// ENSMUST00000053253 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:109156068:109192107:-1 gene:ENSMUSG00000091635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// ENSMUST00000095922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:109085849:109097864:-1 gene:ENSMUSG00000090688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// GENSCAN00000041814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:108995539:109092960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0
NM_001104625 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 14 (Vmn2r14), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000170341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:109215502:109224622:-1 gene:ENSMUSG00000091059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000041818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:109141226:109221420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001104626 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 15 (Vmn2r15), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000167133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:109286269:109297556:-1 gene:ENSMUSG00000091375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000041826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:109286269:109295996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_016715 // RefSeq // Mus musculus cytokine receptor-like factor 2 (Crlf2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006535166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytokine receptor-like factor 2 (Crlf2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000044579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:109554711:109558993:-1 gene:ENSMUSG00000033467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AB031333 // GenBank // Mus musculus mRNA for cytokine receptor delta1, complete cds. // chr5 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// AB039945 // GenBank // Mus musculus CRLM2 mRNA for cytokine receptor like molecule 2, complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF201963 // GenBank // Mus musculus thymic stromal lymphopoietin receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// AF232936 // GenBank // Mus musculus thymic stroma derived lymphopoietin receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK170466 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630104I06 product:thymic stromal-derived lymphopoietin, receptor, full insert sequence. // chr5 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC016580 // GenBank // Mus musculus cytokine receptor-like factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:27763 IMAGE:2655857), complete cds. // chr5 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// BC023788 // GenBank // Mus musculus cytokine receptor-like factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:36784 IMAGE:5346748), complete cds. // chr5 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NM_001164735 // RefSeq // Mus musculus cytokine receptor-like factor 2 (Crlf2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// GENSCAN00000041825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:109550461:109558883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
ENSMUST00000092720 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:109674545:109691041:-1 gene:ENSMUSG00000072763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000061226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:109757522:109757931:-1 gene:ENSMUSG00000049477 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 60 // 94 // 9 // 15 // 0
ENSMUST00000167969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110046232:110046486:-1 gene:ENSMUSG00000090963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB010352 // GenBank // Mus musculus mRNA for mszf33, partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006536282 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 14-like (LOC102638775), partial mRNA. // chr5 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// NONMMUT053709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0
XM_006536282 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 14-like (LOC102638775), partial mRNA. // chr5 // 64 // 100 // 14 // 22 // 0 /// ENSMUST00000178787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:124493731:124493793:-1 gene:ENSMUSG00000096734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 100 // 9 // 22 // 0 /// NONMMUT053709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 73 // 100 // 16 // 22 // 0
AK134258 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930411N13 product:hypothetical Alanine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163538 // RefSeq // Mus musculus phosphoglycerate mutase family member 5 (Pgam5), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_028273 // RefSeq // Mus musculus phosphoglycerate mutase family member 5 (Pgam5), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000059229 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:110259155:110269887:-1 gene:ENSMUSG00000029500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000112505 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:110259130:110269913:-1 gene:ENSMUSG00000029500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC138924 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate mutase family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:170551 IMAGE:8861946), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC138925 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate mutase family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:170552 IMAGE:8861947), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC145467 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate mutase family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:179037 IMAGE:9054029), complete cds. // chr5 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000136738 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:110265237:110266035:-1 gene:ENSMUSG00000029500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// GENSCAN00000009173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110260287:110269839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_008993 // RefSeq // Mus musculus peroxisomal membrane protein 2 (Pxmp2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031472 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:110274282:110286186:-1 gene:ENSMUSG00000029499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126882 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110283524:110286119:-1 gene:ENSMUSG00000029499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000141550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110280800:110286002:-1 gene:ENSMUSG00000029499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000155266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110274295:110286021:-1 gene:ENSMUSG00000029499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AF309644 // GenBank // Mus musculus strain 129/Sv 22 kDa peroxisomal membrane protein PMP22 (Pxmp2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC057975 // GenBank // Mus musculus peroxisomal membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:68229 IMAGE:5055267), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110274560:110286005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT053757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001164833 // RefSeq // Mus musculus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 2 (P2rx2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// NM_001164834 // RefSeq // Mus musculus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 2 (P2rx2), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// NM_153400 // RefSeq // Mus musculus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 2 (P2rx2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000058016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110339812:110343035:-1 gene:ENSMUSG00000029503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000112478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110339812:110343035:-1 gene:ENSMUSG00000029503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// AB094663 // GenBank // Mus musculus mRNA for P2X2e purinergic receptor, complete cds. // chr5 // 100 // 54 // 22 // 22 // 0 /// AB094664 // GenBank // Mus musculus mRNA for P2X2b purinergic receptor, complete cds. // chr5 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0 /// AY044240 // GenBank // Mus musculus P2X2a purinergic receptor (P2x2) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 85 // 34 // 35 // 0 /// BC106963 // GenBank // Mus musculus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40039096), complete cds. // chr5 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0 /// BC106964 // GenBank // Mus musculus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 2, mRNA (cDNA clone MGC:129149 IMAGE:40039097), complete cds. // chr5 // 96 // 68 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110338104:110342955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 22 // 22 // 0
NM_001142642 // RefSeq // Mus musculus fibrosin-like 1 (Fbrsl1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 46 // 46 // 0 /// NM_028596 // RefSeq // Mus musculus fibrosin-like 1 (Fbrsl1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 68 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000056124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110361754:110387127:-1 gene:ENSMUSG00000043323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000069483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110361754:110448503:-1 gene:ENSMUSG00000043323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 46 // 46 // 0 /// BC151196 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410025L10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:184095 IMAGE:9088084), complete cds. // chr5 // 97 // 74 // 38 // 39 // 0 /// XM_006535049 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibrosin-like 1 (Fbrsl1), transcript variant X17, mRNA. // chr5 // 49 // 49 // 26 // 53 // 1 /// AK129388 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1545 protein. // chr5 // 38 // 38 // 20 // 53 // 1 /// GENSCAN00000009142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110363042:110448167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 74 // 39 // 53 // 1
NM_153570 // RefSeq // Mus musculus nucleolar complex associated 4 homolog (S. cerevisiae) (Noc4l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000042147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:110648418:110653417:-1 gene:ENSMUSG00000033294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000123380 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110648847:110650017:-1 gene:ENSMUSG00000033294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000124612 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110651364:110653366:-1 gene:ENSMUSG00000033294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 90 // 31 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000145712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110651244:110653348:-1 gene:ENSMUSG00000033294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000150100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110651070:110653259:-1 gene:ENSMUSG00000033294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC024616 // GenBank // Mus musculus nucleolar complex associated 4 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:28606 IMAGE:4218310), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110648864:110653339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_029337 // RefSeq // Mus musculus E1A binding protein p400 (Ep400), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 49 // 49 // 0 /// NM_173066 // RefSeq // Mus musculus E1A binding protein p400 (Ep400), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000041558 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:110664373:110770527:-1 gene:ENSMUSG00000029505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000112435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110664373:110770717:-1 gene:ENSMUSG00000029505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 98 // 91 // 47 // 48 // 0 /// ENSMUST00000112436 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:110664378:110770717:-1 gene:ENSMUSG00000029505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 48 // 48 // 0 /// AB092694 // GenBank // Mus musculus mRNA for mDomino, complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 48 // 48 // 0 /// AB092695 // GenBank // Mus musculus mRNA for mDomino-S, complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 47 // 47 // 0 /// AK040635 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430110O13 product:similar to P400 SWI2/SNF2-RELATED PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 19 // 10 // 10 // 0 /// AK164049 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430034P13 product:E1A binding protein p400, full insert sequence. // chr5 // 90 // 19 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000009129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110665802:110770592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 45 // 45 // 0
ENSMUST00000177596 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:110677124:110677230:-1 gene:ENSMUSG00000095178 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009469 // RefSeq // Mus musculus unc-51 like kinase 1 (Ulk1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006534852 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-51 like kinase 1 (Ulk1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000031490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:110784488:110810097:-1 gene:ENSMUSG00000029512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF053756 // GenBank // Mus musculus UNC-51-like kinase ULK1 (Ulk1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF072370 // GenBank // Mus musculus UNC51.1 serine/threonine kinase (Unc51.1) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// BC057121 // GenBank // Mus musculus Unc-51 like kinase 1 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:63344 IMAGE:6834534), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC059835 // GenBank // Mus musculus Unc-51 like kinase 1 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:69634 IMAGE:6406755), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110786172:110836429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_153571 // RefSeq // Mus musculus HscB iron-sulfur cluster co-chaperone homolog (E. coli) (Hscb), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006534692 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HscB iron-sulfur cluster co-chaperone homolog (E. coli) (Hscb), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006534694 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HscB iron-sulfur cluster co-chaperone homolog (E. coli) (Hscb), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000056937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:110829070:110839777:-1 gene:ENSMUSG00000043510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122921 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110829081:110834895:-1 gene:ENSMUSG00000043510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000144850 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:110829080:110836320:-1 gene:ENSMUSG00000043510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000145318 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:110829080:110839575:-1 gene:ENSMUSG00000043510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC027641 // GenBank // Mus musculus HscB iron-sulfur cluster co-chaperone homolog (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:41340 IMAGE:1244839), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:110786172:110836429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NR_045832 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E130006D01 gene (E130006D01Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_045833 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E130006D01 gene (E130006D01Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000129065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:111734303:111761725:-1 gene:ENSMUSG00000085271 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000137398 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:111734284:111761703:-1 gene:ENSMUSG00000085271 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087866 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E130006D01 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6594168). // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NR_045834 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E130006D01 gene (E130006D01Rik), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000129146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:111734410:111761700:-1 gene:ENSMUSG00000085271 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT053819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT053820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT053818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONMMUT053821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_021351 // RefSeq // Mus musculus crystallin, beta A4 (Cryba4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534749 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, beta A4 (Cryba4), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534750 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, beta A4 (Cryba4), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534751 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, beta A4 (Cryba4), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000086629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:112246533:112251802:-1 gene:ENSMUSG00000066975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112383 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:112246494:112251162:-1 gene:ENSMUSG00000066975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:112246493:112252518:-1 gene:ENSMUSG00000066975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC056444 // GenBank // Mus musculus crystallin, beta A4, mRNA (cDNA clone MGC:66921 IMAGE:6824277), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC058703 // GenBank // Mus musculus crystallin, beta A4, mRNA (cDNA clone MGC:63227 IMAGE:6824293), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK161601 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430424M24 product:crystallin, beta A4, full insert sequence. // chr5 // 65 // 96 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112246510:112251785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0
NM_001039228 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6583 (Gm6583), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000051117 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:112353801:112356033:-1 gene:ENSMUSG00000051503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112354427:112355836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0
NM_028386 // RefSeq // Mus musculus aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 (Asphd2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:112385448:112392213:-1 gene:ENSMUSG00000029348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK020319 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230106G13 product:RIKEN cDNA 2900006N09 gene, full insert sequence. // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC046606 // GenBank // Mus musculus aspartate beta-hydroxylase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:54823 IMAGE:6314853), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112385752:112391965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001253916 // RefSeq // Mus musculus seizure related 6 homolog like (Sez6l), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NM_001253917 // RefSeq // Mus musculus seizure related 6 homolog like (Sez6l), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_019982 // RefSeq // Mus musculus seizure related 6 homolog like (Sez6l), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000075387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:112419151:112577198:-1 gene:ENSMUSG00000058153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000079491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:112419151:112577198:-1 gene:ENSMUSG00000058153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AB206790 // GenBank // Mus musculus mRNA for BSRP-B, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC065117 // GenBank // Mus musculus seizure related 6 homolog like, mRNA (cDNA clone MGC:86064 IMAGE:6840338), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC065129 // GenBank // Mus musculus seizure related 6 homolog like, mRNA (cDNA clone MGC:86028 IMAGE:30362651), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC099839 // GenBank // Mus musculus seizure related 6 homolog like, mRNA (cDNA clone IMAGE:30618098), partial cds. // chr5 // 100 // 53 // 21 // 21 // 0 /// DQ167195 // GenBank // Mus musculus acupuncture-induced 1-L (Aig1l) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000022727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112422009:112441933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000022726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112460250:112519845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1
NM_028901 // RefSeq // Mus musculus myosin XVIIIb (Myo18b), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000086617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:112688876:112896362:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000182189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112688878:112765931:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK077135 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933411E19 product:hypothetical Serine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112699292:112875326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_028901 // RefSeq // Mus musculus myosin XVIIIb (Myo18b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:112688876:112896362:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112772886:112871586:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145218 // GenBank // Mus musculus myosin XVIIIb, mRNA (cDNA clone IMAGE:9053769), partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112699292:112875326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028901 // RefSeq // Mus musculus myosin XVIIIb (Myo18b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000086617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:112688876:112896362:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000183029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112772886:112871586:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC145218 // GenBank // Mus musculus myosin XVIIIb, mRNA (cDNA clone IMAGE:9053769), partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112699292:112875326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_028901 // RefSeq // Mus musculus myosin XVIIIb (Myo18b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000086617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:112688876:112896362:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000183029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112772886:112871586:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC145218 // GenBank // Mus musculus myosin XVIIIb, mRNA (cDNA clone IMAGE:9053769), partial cds. // chr5 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112699292:112875326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_028901 // RefSeq // Mus musculus myosin XVIIIb (Myo18b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:112688876:112896362:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112772886:112871586:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145218 // GenBank // Mus musculus myosin XVIIIb, mRNA (cDNA clone IMAGE:9053769), partial cds. // chr5 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112699292:112875326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028901 // RefSeq // Mus musculus myosin XVIIIb (Myo18b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:112688876:112896362:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112772886:112871586:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145218 // GenBank // Mus musculus myosin XVIIIb, mRNA (cDNA clone IMAGE:9053769), partial cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112699292:112875326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028901 // RefSeq // Mus musculus myosin XVIIIb (Myo18b), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000086617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:112688876:112896362:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000183029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112772886:112871586:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000183273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:112817226:112872496:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK016515 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932408L24 product:hypothetical Myosin head (motor domain) containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC145218 // GenBank // Mus musculus myosin XVIIIb, mRNA (cDNA clone IMAGE:9053769), partial cds. // chr5 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112699292:112875326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
NM_028901 // RefSeq // Mus musculus myosin XVIIIb (Myo18b), mRNA. // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000086617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:112688876:112896362:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000022722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112699292:112875326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_028901 // RefSeq // Mus musculus myosin XVIIIb (Myo18b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:112688876:112896362:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112699292:112875326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028901 // RefSeq // Mus musculus myosin XVIIIb (Myo18b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000086617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:112688876:112896362:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000022722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112699292:112875326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_028901 // RefSeq // Mus musculus myosin XVIIIb (Myo18b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:112688876:112896362:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112877985:112893792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028901 // RefSeq // Mus musculus myosin XVIIIb (Myo18b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// ENSMUST00000086617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:112688876:112896362:-1 gene:ENSMUSG00000072720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_001285806 // RefSeq // Mus musculus adrenergic receptor kinase, beta 2 (Adrbk2), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 53 // 53 // 0 /// NM_177078 // RefSeq // Mus musculus adrenergic receptor kinase, beta 2 (Adrbk2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 53 // 53 // 0 /// XR_389274 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adrenergic receptor kinase, beta 2 (Adrbk2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 100 // 84 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000065167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:112910478:113015514:-1 gene:ENSMUSG00000042249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 53 // 53 // 0 /// AK076533 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833444A01 product:BETA-ADRENERGIC RECEPTOR KINASE 2 (EC 2.7.1.126) (BETA-ARK-2) (G-PROTEIN COUPLED RECEPTOR KINASE 3) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 76 // 44 // 44 // 0 /// AK172513 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830211P10 product:adrenergic receptor kinase, beta 2, full insert sequence. // chr5 // 97 // 53 // 30 // 31 // 0 /// XR_389275 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adrenergic receptor kinase, beta 2 (Adrbk2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 78 // 78 // 45 // 58 // 1 /// GENSCAN00000020197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:112914913:112971451:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 66 // 66 // 38 // 58 // 1
NM_007773 // RefSeq // Mus musculus crystallin, beta B2 (Crybb2), mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534759 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, beta B2 (Crybb2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534760 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, beta B2 (Crybb2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534761 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, beta B2 (Crybb2), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000031295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:113058265:113068766:-1 gene:ENSMUSG00000042240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:113058258:113070117:-1 gene:ENSMUSG00000042240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC085185 // GenBank // Mus musculus crystallin, beta B2, mRNA (cDNA clone MGC:109664 IMAGE:30679384), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// M60559 // GenBank // Mus musculus Swiss Webster beta-B2 crystallin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:113062043:113069000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_172884 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2900026A02 gene (2900026A02Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006534939 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2900026A02 gene (2900026A02Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000050125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:113086323:113163351:-1 gene:ENSMUSG00000051339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK220411 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1671 protein. // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC147338 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900026A02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182496 IMAGE:9056390), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC147339 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900026A02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182522 IMAGE:9056416), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:113090060:113104043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
XR_402824 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA F830115B05 gene (F830115B05Rik), ncRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK157047 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830115B05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008153 // RefSeq // Mus musculus chemokine-like receptor 1 (Cmklr1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530164 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine-like receptor 1 (Cmklr1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006530165 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine-like receptor 1 (Cmklr1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006530166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine-like receptor 1 (Cmklr1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006530167 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine-like receptor 1 (Cmklr1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000047936 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:113612354:113650426:-1 gene:ENSMUSG00000042190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:113614036:113627615:-1 gene:ENSMUSG00000042190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AK158424 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930115P06 product:chemokine-like receptor 1, full insert sequence. // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC100612 // GenBank // Mus musculus chemokine-like receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:106100 IMAGE:2654794), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U79525 // GenBank // Mus musculus orphan G-protein coupled receptor Dez mRNA, complete cds. // chr5 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0
ENSMUST00000047891 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:113703697:113724749:-1 gene:ENSMUSG00000042184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK006923 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700069L16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_033216 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700069L16 gene (1700069L16Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000162388 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:113692422:113724772:-1 gene:ENSMUSG00000042184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000020201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:113674828:113728011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_016926 // RefSeq // Mus musculus squamous cell carcinoma antigen recognized by T cells 3 (Sart3), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006530406 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus squamous cell carcinoma antigen recognized by T cells 3 (Sart3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000019118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:113742446:113771649:-1 gene:ENSMUSG00000018974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AF172722 // GenBank // Mus musculus tumor-rejection antigen SART3 (Sart3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AK129067 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0156 protein. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC057156 // GenBank // Mus musculus squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3, mRNA (cDNA clone MGC:68131 IMAGE:5347469), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000020192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:113743129:113771635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0
NM_146162 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 119 (Tmem119), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000067853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:113793729:113800516:-1 gene:ENSMUSG00000054675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK135223 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720435I03 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC025600 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 119, mRNA (cDNA clone MGC:38046 IMAGE:5250899), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_009151 // RefSeq // Mus musculus selectin, platelet (p-selectin) ligand (Selplg), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530229 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus selectin, platelet (p-selectin) ligand (Selplg), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000100874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:113817798:113830501:-1 gene:ENSMUSG00000048163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003874 // GenBank // Mus musculus selectin, platelet (p-selectin) ligand, mRNA (cDNA clone MGC:6637 IMAGE:3495181), complete cds. // chr5 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000020219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:113818990:113827140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000083386 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:113928724:113928804:-1 gene:ENSMUSG00000065320 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT053967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
NM_198109 // RefSeq // Mus musculus slingshot homolog 1 (Drosophila) (Ssh1), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000077689 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:113942192:113989743:-1 gene:ENSMUSG00000042121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000112298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:113939765:113993779:-1 gene:ENSMUSG00000042121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000159510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:113961393:113993827:-1 gene:ENSMUSG00000042121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 89 // 29 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000159592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:113937094:113993894:-1 gene:ENSMUSG00000042121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000162322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:113966604:113993767:-1 gene:ENSMUSG00000042121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// AB099287 // GenBank // Mus musculus mSSH-1L mRNA for slingshot-1L, complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// AK173144 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1298 protein. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:113881361:113968828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_175016 // RefSeq // Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 2 (E. coli) (Alkbh2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530291 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 2 (E. coli) (Alkbh2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// XM_006530292 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 2 (E. coli) (Alkbh2), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000053657 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114123926:114128176:-1 gene:ENSMUSG00000044339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114123935:114128218:-1 gene:ENSMUSG00000044339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// AK079195 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530023G02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// BC062188 // GenBank // Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 2 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:70174 IMAGE:30146542), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149418 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114127606:114128181:-1 gene:ENSMUSG00000044339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 73 // 44 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000016937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114123948:114127739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT053974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 73 // 44 // 8 // 11 // 0
NM_148935 // RefSeq // Mus musculus forkhead box N4 (Foxn4), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000044790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114254164:114273807:-1 gene:ENSMUSG00000042002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000129530 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114255581:114263120:-1 gene:ENSMUSG00000042002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000144050 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:114260356:114273702:-1 gene:ENSMUSG00000042002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// AF323488 // GenBank // Mus musculus forkhead box containing protein N4 (Foxn4) mRNA, complete cds. // chr5 // 76 // 94 // 22 // 29 // 0 /// AY039039 // GenBank // Mus musculus forkhead box N4 (Foxn4) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC092242 // GenBank // Mus musculus forkhead box N4, mRNA (cDNA clone MGC:116586 IMAGE:30698162), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC130222 // GenBank // Mus musculus forkhead box N4, mRNA (cDNA clone MGC:161255 IMAGE:40141600), complete cds. // chr5 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114255491:114266183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_029956 // RefSeq // Mus musculus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) type B homolog (human) (Mmab), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114431034:114444059:-1 gene:ENSMUSG00000029575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000112245 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:114433200:114444021:-1 gene:ENSMUSG00000029575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000150519 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114433278:114443982:-1 gene:ENSMUSG00000029575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC057558 // GenBank // Mus musculus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) type B homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:66748 IMAGE:6415979), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006530505 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) type B homolog (human) (Mmab), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENSMUST00000123256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114434767:114443992:-1 gene:ENSMUSG00000029575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// AK034288 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330174B04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114420946:114443991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_019821 // RefSeq // Mus musculus glycolipid transfer protein (Gltp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000012028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114669403:114690984:-1 gene:ENSMUSG00000011884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112212 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:114670228:114690908:-1 gene:ENSMUSG00000011884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000112214 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:114670083:114690941:-1 gene:ENSMUSG00000011884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AF209703 // GenBank // Mus musculus glycolipid transfer protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC016584 // GenBank // Mus musculus glycolipid transfer protein, mRNA (cDNA clone MGC:29016 IMAGE:3157800), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC053729 // GenBank // Mus musculus glycolipid transfer protein, mRNA (cDNA clone MGC:60492 IMAGE:30065192), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114670407:114694535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NR_027872 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930515G01 gene (4930515G01Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000173208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114773737:114774983:-1 gene:ENSMUSG00000092183 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT053997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT053998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0
NR_027817 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1500011B03 gene (1500011B03Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000112160 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:114808196:114813976:-1 gene:ENSMUSG00000072694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NR_027818 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1500011B03 gene (1500011B03Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr5 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// ENSMUST00000061251 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:114812793:114813945:-1 gene:ENSMUSG00000072694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// BC061238 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1500011B03 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6740448). // chr5 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000016947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114809246:114813912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_181075 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2610524H06 gene (2610524H06Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000100850 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114821935:114823468:-1 gene:ENSMUSG00000092486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC096574 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610524H06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106876 IMAGE:1495259), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000117738 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114828573:114829215:-1 gene:ENSMUSG00000082052 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_006530513 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9936 (Gm9936), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140614 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930052H01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009327 // RefSeq // Mus musculus HNF1 homeobox A (Hnf1a), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:114948980:114971067:-1 gene:ENSMUSG00000029556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000176911 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114950061:114970844:-1 gene:ENSMUSG00000029556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC080698 // GenBank // Mus musculus HNF1 homeobox A, mRNA (cDNA clone MGC:91079 IMAGE:30471380), complete cds. // chr5 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// M57966 // GenBank // Mouse hepatocyte nuclear factor 1 (HNF-1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000176550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:114952579:114970844:-1 gene:ENSMUSG00000029556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000016701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:114950061:114970844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000100848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:115097689:115098295:-1 gene:ENSMUSG00000072693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC051920 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5704841. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_007383 // RefSeq // Mus musculus acyl-Coenzyme A dehydrogenase, short chain (Acads), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115110299:115119346:-1 gene:ENSMUSG00000029545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000131726 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115110299:115119287:-1 gene:ENSMUSG00000029545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000141142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115112784:115119275:-1 gene:ENSMUSG00000029545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 80 // 36 // 8 // 10 // 0 /// ENSMUST00000150291 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:115110801:115117580:-1 gene:ENSMUSG00000029545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000153374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115111996:115119310:-1 gene:ENSMUSG00000029545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0 /// BC016259 // GenBank // Mus musculus acyl-Coenzyme A dehydrogenase, short chain, mRNA (cDNA clone MGC:28900 IMAGE:4913813), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC055063 // GenBank // Mus musculus acyl-Coenzyme A dehydrogenase, short chain, mRNA (cDNA clone IMAGE:6529149), partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L11163 // GenBank // Mouse short chain acyl-CoA dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr5 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:115110854:115119270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_175352 // RefSeq // Mus musculus unc-119 homolog B (C. elegans) (Unc119b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115122550:115134975:-1 gene:ENSMUSG00000046562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC112388 // GenBank // Mus musculus unc-119 homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:117956 IMAGE:5352914), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC115529 // GenBank // Mus musculus unc-119 homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:144370 IMAGE:40101389), complete cds. // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000153403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115129623:115134925:-1 gene:ENSMUSG00000046562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK045128 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130038J23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:115125388:115134910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_175403 // RefSeq // Mus musculus malectin (Mlec), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// ENSMUST00000053271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:115142984:115158176:-1 gene:ENSMUSG00000048578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// ENSMUST00000112121 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115142981:115158179:-1 gene:ENSMUSG00000048578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// ENSMUST00000124678 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:115148106:115151046:-1 gene:ENSMUSG00000048578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 23 // 14 // 14 // 0 /// BC035300 // GenBank // Mus musculus malectin, mRNA (cDNA clone MGC:25948 IMAGE:4237864), complete cds. // chr5 // 100 // 52 // 31 // 31 // 0 /// BC058245 // GenBank // Mus musculus malectin, mRNA (cDNA clone MGC:65358 IMAGE:6313259), complete cds. // chr5 // 100 // 48 // 29 // 29 // 0 /// AK160465 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010011A09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 20 // 20 // 12 // 60 // 1 /// GENSCAN00000016695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:115147915:115158034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 43 // 26 // 26 // 0 /// X07997 // GenBank // Mouse mRNA for cytotoxic T-cell membrane glycoprotein Ly-3 3flank. // chr5 // 42 // 42 // 25 // 60 // 1
NM_175403 // RefSeq // Mus musculus malectin (Mlec), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:115142984:115158176:-1 gene:ENSMUSG00000048578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112121 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115142981:115158179:-1 gene:ENSMUSG00000048578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X07997 // GenBank // Mouse mRNA for cytotoxic T-cell membrane glycoprotein Ly-3 3flank. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_016698 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 10 (Rnf10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000040555 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:115241770:115272892:-1 gene:ENSMUSG00000041740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000112096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115241771:115272894:-1 gene:ENSMUSG00000041740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000112097 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:115241412:115272898:-1 gene:ENSMUSG00000041740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000139853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115241779:115272301:-1 gene:ENSMUSG00000041740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AB026621 // GenBank // Mus musculus mRNA for RIE2, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC010342 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:12014 IMAGE:3602969), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:115241985:115266519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC058527 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:66973 IMAGE:6816989), complete cds. // chr5 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0
NM_019682 // RefSeq // Mus musculus dynein light chain LC8-type 1 (Dynll1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000009157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115297110:115300999:-1 gene:ENSMUSG00000009013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000112090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115298505:115300912:-1 gene:ENSMUSG00000009013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// AF020185 // GenBank // Mus musculus protein inhibitor of nitric oxide synthase (PIN) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// BC008106 // GenBank // Mus musculus dynein light chain LC8-type 1, mRNA (cDNA clone MGC:7134 IMAGE:3158148), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// BC034258 // GenBank // Mus musculus dynein light chain LC8-type 1, mRNA (cDNA clone MGC:5723 IMAGE:3158148), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000016676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:115298696:115301620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
NM_029645 // RefSeq // Mus musculus glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit C homolog (bacterial) (Gatc), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115333242:115341178:-1 gene:ENSMUSG00000029536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021775 // GenBank // Mus musculus glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit C homolog (bacterial), mRNA (cDNA clone MGC:28449 IMAGE:4158979), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK047064 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930015F03 product:splicing factor, arginine/serine rich 9 (25 kDa), full insert sequence. // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:115334539:115348947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONMMUT054052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_007748 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIa polypeptide 1 (Cox6a1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000040154 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115345642:115348981:-1 gene:ENSMUSG00000041697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000137766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115345657:115348914:-1 gene:ENSMUSG00000041697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// BC003807 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit VI a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:6090 IMAGE:3487598), complete cds. // chr5 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// BC052816 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit VI a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:62637 IMAGE:6439987), complete cds. // chr5 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// L06465 // GenBank // Mus musculus cytochrome oxidase subunit VIa (liver-type isoform) mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// U08440 // GenBank // Mus musculus Balb/c cytochrome c oxidase subunit VIaL mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT054054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
XR_168603 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930430O22 gene (4930430O22Rik), ncRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK019590 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930430O22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027810 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1110006O24 gene (1110006O24Rik), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061108 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6741624. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// KnowTID_00005965 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001080808 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 64 (Ccdc64), mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000055408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:115648175:115731621:-1 gene:ENSMUSG00000041609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000148627 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:115660206:115670530:-1 gene:ENSMUSG00000041609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AK036757 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930001I18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC126948 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 64, mRNA (cDNA clone MGC:143541 IMAGE:40090576), complete cds. // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GU973876 // GenBank // Mus musculus bicaudal-D-related protein 1 (BICDR-1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000117847 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:115667254:115716559:-1 gene:ENSMUSG00000041609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// ENSMUST00000148276 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:115651819:115670264:-1 gene:ENSMUSG00000041609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// AK041990 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630051C18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:115649405:115740191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
ENSMUST00000086483 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:116169225:116288963:-1 gene:ENSMUSG00000043913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC075662 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 60, mRNA (cDNA clone IMAGE:30602836), complete cds. // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NM_177759 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 60 (Ccdc60), mRNA. // chr5 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENSMUST00000050178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:116124641:116288985:-1 gene:ENSMUSG00000043913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// BC150892 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 60, mRNA (cDNA clone MGC:183803 IMAGE:9087803), complete cds. // chr5 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// BC172040 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 60, mRNA (cDNA clone MGC:198745 IMAGE:9054326), complete cds. // chr5 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// BC060151 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 60, mRNA (cDNA clone IMAGE:6415534), partial cds. // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000019698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:116117465:116193446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_030704 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 8 (Hspb8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:116408491:116422864:-1 gene:ENSMUSG00000041548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000133335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:116408940:116415892:-1 gene:ENSMUSG00000041548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// AF250139 // GenBank // Mus musculus small stress protein-like protein HSP22 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AF273453 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 20-like protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC011219 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:18669 IMAGE:4195285), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:116409331:116422479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// NONMMUT054106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0
NM_001122666 // RefSeq // Mus musculus suppressor of defective silencing 3 homolog (S. cerevisiae) (Suds3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_178622 // RefSeq // Mus musculus suppressor of defective silencing 3 homolog (S. cerevisiae) (Suds3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000086471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:117091682:117115993:-1 gene:ENSMUSG00000066900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000166397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:117091682:117115993:-1 gene:ENSMUSG00000066900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF469109 // GenBank // Mus musculus SDS3 mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// AK147512 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1057L08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC036562 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2400003N08 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:1449687), partial cds. // chr5 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// BC055764 // GenBank // Mus musculus suppressor of defective silencing 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:67319 IMAGE:6402735), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062176 // GenBank // Mus musculus suppressor of defective silencing 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:70133 IMAGE:6514171), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:117065563:117115813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_018858 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylethanolamine binding protein 1 (Pebp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000036951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:117282651:117287625:-1 gene:ENSMUSG00000032959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AB046417 // GenBank // Mus musculus HCNPpp mRNA for hippocampal cholinergic neurostimulating peptide precursor protein, complete cds. // chr5 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// BC008169 // GenBank // Mus musculus phosphatidylethanolamine binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:5945 IMAGE:3257403), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC083063 // GenBank // Mus musculus phosphatidylethanolamine binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:103131 IMAGE:5362125), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC089332 // GenBank // Mus musculus phosphatidylethanolamine binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:102065 IMAGE:30359654), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// U43206 // GenBank // Mus musculus phosphatidylethanolamine binding protein mRNA, complete cds. // chr5 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0
ENSMUST00000100834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:117318745:117319242:-1 gene:ENSMUSG00000072688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140970 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130086L18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028128 // RefSeq // Mus musculus replication factor C (activator 1) 5 (Rfc5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000086461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:117378103:117389047:-1 gene:ENSMUSG00000029363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000150962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:117378405:117389022:-1 gene:ENSMUSG00000029363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK150036 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530123A15 product:replication factor C (activator 1) 5, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC023674 // GenBank // Mus musculus replication factor C (activator 1) 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:5354453), partial cds. // chr5 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC089001 // GenBank // Mus musculus replication factor C (activator 1) 5, mRNA (cDNA clone MGC:113787 IMAGE:6415420), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006530465 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus replication factor C (activator 1) 5 (Rfc5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1 /// GENSCAN00000052105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:117379810:117388978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_172721 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 8 (Fbxw8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000049474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:118064981:118155458:-1 gene:ENSMUSG00000032867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK053794 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130308M02 product:weakly similar to F-BOX PROTEIN FBX29 (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC009095 // GenBank // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:7142 IMAGE:3158218), complete cds. // chr5 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AK047756 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030025K24 product:weakly similar to F-BOX PROTEIN FBX29 (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:118068085:118158429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
NR_045793 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10390 (Gm10390), long non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180812 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:5:120121103:120139261:-1 gene:ENSMUSG00000097368 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_133902 // RefSeq // Mus musculus serine dehydratase-like (Sdsl), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031594 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120458202:120472810:-1 gene:ENSMUSG00000029596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000052258 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120458186:120472763:-1 gene:ENSMUSG00000029596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000132916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120460688:120467360:-1 gene:ENSMUSG00000029596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 44 // 12 // 14 // 0 /// AF328927 // GenBank // Mus musculus serine dehydratase (Sds) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC022601 // GenBank // Mus musculus serine dehydratase-like, mRNA (cDNA clone MGC:31106 IMAGE:4160199), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120458358:120472876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_023625 // RefSeq // Mus musculus phospholipase B domain containing 2 (Plbd2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120483282:120503625:-1 gene:ENSMUSG00000029598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120487299:120503612:-1 gene:ENSMUSG00000029598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC038605 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1300012G16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:46805 IMAGE:4921245), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC048826 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1300012G16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:54493 IMAGE:4196604), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000131831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120485247:120503601:-1 gene:ENSMUSG00000029598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// BC060095 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1300012G16 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6400361). // chr5 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120485671:120503591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_145853 // RefSeq // Mus musculus two pore channel 1 (Tpcn1), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000046426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:120534160:120588613:-1 gene:ENSMUSG00000032741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AF217002 // GenBank // Mus musculus calcium channel mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK077411 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730403B01 product:two pore channel 1, full insert sequence. // chr5 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC058951 // GenBank // Mus musculus two pore channel 1, mRNA (cDNA clone MGC:66697 IMAGE:6821376), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120536108:120558916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_029096 // RefSeq // Mus musculus RBPJ interacting and tubulin associated 1 (Rita1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_133908 // RefSeq // Mus musculus RBPJ interacting and tubulin associated 1 (Rita1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120609058:120612589:-1 gene:ENSMUSG00000029600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120607042:120612589:-1 gene:ENSMUSG00000029600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000140554 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120609911:120612570:-1 gene:ENSMUSG00000029600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000177800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:120609058:120612589:-1 gene:ENSMUSG00000029600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021365 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110008J03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:29211 IMAGE:5030737), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111884 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:120594305:120612339:-1 gene:ENSMUSG00000029600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT054256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
AK028021 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1190018L05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000145174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120680203:120695403:-1 gene:ENSMUSG00000029603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// U38252 // GenBank // Mus musculus FX-induced thymoma transcript (FXI-T1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NM_008052 // RefSeq // Mus musculus deltex 1 homolog (Drosophila) (Dtx1), mRNA. // chr5 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// ENSMUST00000031607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120680202:120711927:-1 gene:ENSMUSG00000029603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// AB015422 // GenBank // Mus musculus mRNA for Deltex1, complete cds. // chr5 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// BC053055 // GenBank // Mus musculus deltex 1 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:62339 IMAGE:5685525), complete cds. // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120681248:120795498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_145227 // RefSeq // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 2 (Oas2), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530324 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 2 (Oas2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006530326 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 2 (Oas2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000053909 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:120730333:120749853:-1 gene:ENSMUSG00000032690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000081491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120730334:120749853:-1 gene:ENSMUSG00000032690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000147941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120730336:120735575:-1 gene:ENSMUSG00000032690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AB067535 // GenBank // Mus musculus oasl11 mRNA for 2,5-oligoadenylate synthetase-like 11, complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AF418010 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 2 (Oas2) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AK049218 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330013N23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120681248:120795498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
ENSMUST00000166703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:120763917:120777640:-1 gene:ENSMUSG00000032661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AB067534 // GenBank // Mus musculus oasl10 mRNA for 2,5-oligoadenylate synthetase-like 10, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK158392 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930113H12 product:2-5 oligoadenylate synthetase 3, full insert sequence. // chr5 // 93 // 47 // 13 // 14 // 0 /// NM_145226 // RefSeq // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 3 (Oas3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// ENSMUST00000044833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120753098:120777661:-1 gene:ENSMUSG00000032661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// AF453830 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 3 (Oas3) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 29 // 30 // 1 /// BC141055 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 3, mRNA (cDNA clone MGC:176016 IMAGE:9055667), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120681248:120795498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1
NM_145210 // RefSeq // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1E (Oas1e), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000100785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:120786312:120795530:-1 gene:ENSMUSG00000066867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AB067531 // GenBank // Mus musculus oasl7 mRNA for 2,5-oligoadenylate synthetase-like 7, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AY055830 // GenBank // Mus musculus 2-5olygoadenylate synthetase 1E, 45kD isoform (Oas1e) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr5 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// AY055831 // GenBank // Mus musculus 2-5olygoadenylate synthetase 1E, 42kD isoform (Oas1e) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC053721 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1E, mRNA (cDNA clone MGC:60821 IMAGE:30053184), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC094918 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1E, mRNA (cDNA clone MGC:107463 IMAGE:30050168), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC108956 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1E, mRNA (cDNA clone MGC:124108 IMAGE:40046020), complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000016507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120681248:120795498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
NM_033541 // RefSeq // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1C (Oas1c), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120800194:120812514:-1 gene:ENSMUSG00000001166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB067528 // GenBank // Mus musculus oasl5 mRNA for 2,5-oligoadenylate synthetase-like 5, complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF459815 // GenBank // Mus musculus 2-5olygoadenylate synthetase 1c (Oas1c) mRNA, Oas1c-RV allele, complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF459816 // GenBank // Mus musculus 2-5olygoadenylate synthetase 1c (Oas1c) mRNA, Oas1c-He allele, complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AK078952 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130230E18 product:2-5 oligoadenylate synthetase 1C, full insert sequence. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC108955 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1C, mRNA (cDNA clone MGC:124107 IMAGE:40046017), complete cds. // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC126877 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1C, mRNA (cDNA clone MGC:124109 IMAGE:40046021), complete cds. // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000016493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120798798:120808763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_145211 // RefSeq // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1A (Oas1a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000080322 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:120896256:120907521:-1 gene:ENSMUSG00000052776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC013715 // GenBank // Mus musculus 2-5 oligoadenylate synthetase 1A, mRNA (cDNA clone MGC:6224 IMAGE:3257027), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_011286 // RefSeq // Mus musculus rabphilin 3A (Rph3a), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006530224 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus rabphilin 3A (Rph3a), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000079204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:120940502:121009518:-1 gene:ENSMUSG00000029608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// AB112924 // GenBank // Mus musculus rph mRNA for rabphilin, complete cds. // chr5 // 98 // 87 // 39 // 40 // 0 /// AK139040 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730001I15 product:rabphilin 3A, full insert sequence. // chr5 // 94 // 78 // 34 // 36 // 0 /// BC042585 // GenBank // Mus musculus rabphilin 3A, mRNA (cDNA clone MGC:39004 IMAGE:5364086), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC050883 // GenBank // Mus musculus rabphilin 3A, mRNA (cDNA clone MGC:63286 IMAGE:5698459), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// D29965 // GenBank // Mus musculus mRNA for rabphilin-3A, complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000046016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:120928070:120986495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 74 // 34 // 46 // 1
NM_001109992 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 11 (Ptpn11), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_011202 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 11 (Ptpn11), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000054547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:121130534:121191397:-1 gene:ENSMUSG00000043733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000100770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:121130533:121191397:-1 gene:ENSMUSG00000043733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000148407 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:121130535:121191367:-1 gene:ENSMUSG00000043733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000148871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:121133840:121143635:-1 gene:ENSMUSG00000043733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// BC057398 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 11, mRNA (cDNA clone MGC:62275 IMAGE:6409640), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC059278 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 11, mRNA (cDNA clone MGC:68154 IMAGE:2866038), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// D84372 // GenBank // Mus musculus mRNA for protein tyrosine phosphatase SH-PTP2, complete cds. // chr5 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:121109580:121173051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// L08663 // GenBank // Mouse mRNA sequence. // chr5 // 88 // 76 // 23 // 26 // 0
NM_026129 // RefSeq // Mus musculus endoplasmic reticulum protein 29 (Erp29), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052590 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:121444756:121452496:-1 gene:ENSMUSG00000029616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000111802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:121445241:121452348:-1 gene:ENSMUSG00000029616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000130451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:121440824:121452506:-1 gene:ENSMUSG00000029616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK165702 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630004M12 product:endoplasmic reticulum protein 29, full insert sequence. // chr5 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC017125 // GenBank // Mus musculus endoplasmic reticulum protein 29, mRNA (cDNA clone MGC:27552 IMAGE:4481563), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:121428590:121452487:-1 gene:ENSMUSG00000029616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK077472 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730419A11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:121445073:121452340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_172125 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 1b (Adam1b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:121500098:121503435:-1 gene:ENSMUSG00000062438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC140979 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 1b, mRNA (cDNA clone MGC:175940 IMAGE:9055591), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:121500560:121502980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_172126 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 1a (Adam1a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:121518576:121521695:-1 gene:ENSMUSG00000072647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052093 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 1a, mRNA (cDNA clone MGC:62530 IMAGE:5695131), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125946 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:121518613:121545482:-1 gene:ENSMUSG00000029454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:121518853:121593481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_009656 // RefSeq // Mus musculus aldehyde dehydrogenase 2, mitochondrial (Aldh2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:121566027:121593824:-1 gene:ENSMUSG00000029455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000129753 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:121570312:121593580:-1 gene:ENSMUSG00000029455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000152945 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:121576457:121593582:-1 gene:ENSMUSG00000029455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// AK043506 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830002I15 product:aldehyde dehydrogenase 2, mitochondrial, full insert sequence. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC005476 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:6764 IMAGE:3600875), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// U07235 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase (ALDH2) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:121518853:121593481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_178799 // RefSeq // Mus musculus acyl-Coenzyme A dehydrogenase family, member 12 (Acad12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000041252 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:121598284:121618938:-1 gene:ENSMUSG00000042647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000111776 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:121604572:121618938:-1 gene:ENSMUSG00000042647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// AK080793 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230114A16 product:hypothetical Acyl-CoA dehydrogenase (flavoprotein), N-terminal and middle domains structure containing protein, full insert sequence. // chr5 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// GENSCAN00000046002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:121598807:121651064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 89 // 16 // 18 // 1
NM_008507 // RefSeq // Mus musculus SH2B adaptor protein 3 (Sh2b3), mRNA. // chr5 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040308 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:121817216:121836821:-1 gene:ENSMUSG00000042594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000086310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:121815648:121836859:-1 gene:ENSMUSG00000042594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000118580 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:121817290:121836817:-1 gene:ENSMUSG00000042594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:121817010:121836104:-1 gene:ENSMUSG00000042594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000136960 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:121815488:121836825:-1 gene:ENSMUSG00000042594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AK171128 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630226F11 product:linker of T-cell receptor pathways, full insert sequence. // chr5 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// BC006759 // GenBank // Mus musculus SH2B adaptor protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:11404 IMAGE:3709861), complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// U89992 // GenBank // Mus musculus lymphocyte-specific adaptor protein Lnk (Lnk) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:121817771:121849202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
XM_006530159 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cut-like homeobox 2 (Cux2), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:121858387:122049851:-1 gene:ENSMUSG00000042589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139469 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830094G02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 71 // 84 // 15 // 21 // 0
NM_001289809 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 63 (Ccdc63), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_001289811 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 63 (Ccdc63), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_183307 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 63 (Ccdc63), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006530388 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 63 (Ccdc63), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006530389 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 63 (Ccdc63), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000058960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:122108040:122138062:-1 gene:ENSMUSG00000043036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000152389 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:122108085:122134815:-1 gene:ENSMUSG00000043036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC118945 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 63, mRNA (cDNA clone MGC:143709 IMAGE:40092360), complete cds. // chr5 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:122108108:122132178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
AK135183 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720407N02 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000111738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:122241287:122264460:-1 gene:ENSMUSG00000038593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141281 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:122241287:122264460:-1 gene:ENSMUSG00000038593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000177148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:122252324:122264415:-1 gene:ENSMUSG00000038593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// AK085676 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730008J19 product:hypothetical Cysteine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC141084 // GenBank // Mus musculus tectonic 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:9055696), complete cds. // chr5 // 91 // 37 // 10 // 11 // 0 /// DQ278867 // GenBank // Mus musculus Tectonic mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_001039153 // RefSeq // Mus musculus tectonic family member 1 (Tctn1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NR_104441 // RefSeq // Mus musculus tectonic family member 1 (Tctn1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000042942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:122241692:122264369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT054344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0
NM_144912 // RefSeq // Mus musculus RAD9 homolog B (Rad9b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006530305 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAD9 homolog B (Rad9b), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000049009 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:122325508:122354233:-1 gene:ENSMUSG00000038569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000117263 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:122323223:122354232:-1 gene:ENSMUSG00000038569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK136504 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130009G01 product:RAD9 homolog B (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AY297460 // GenBank // Mus musculus RAD9B (Rad9B) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC021784 // GenBank // Mus musculus RAD9 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:28469 IMAGE:4162418), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000144268 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:122351272:122352785:-1 gene:ENSMUSG00000038569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// ENSMUST00000149600 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:122325506:122351294:-1 gene:ENSMUSG00000038569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000042936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:122325869:122351611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000031419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:122364580:122372364:-1 gene:ENSMUSG00000029463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC019498 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1500011H22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:27542 IMAGE:4460879), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC057658 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1500011H22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:68093 IMAGE:3153717), complete cds. // chr5 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC061033 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1500011H22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:74140 IMAGE:6590939), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK193505 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0112I09, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000031419, based on BLAT search. // chr5 // 64 // 50 // 9 // 14 // 0
NM_001110140 // RefSeq // Mus musculus ATPase, Ca++ transporting, cardiac muscle, slow twitch 2 (Atp2a2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_009722 // RefSeq // Mus musculus ATPase, Ca++ transporting, cardiac muscle, slow twitch 2 (Atp2a2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NR_027838 // RefSeq // Mus musculus ATPase, Ca++ transporting, cardiac muscle, slow twitch 2 (Atp2a2), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000031423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:122456335:122502225:-1 gene:ENSMUSG00000029467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000177974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:122453514:122502225:-1 gene:ENSMUSG00000029467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000179939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:122442702:122502225:-1 gene:ENSMUSG00000029467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC054531 // GenBank // Mus musculus ATPase, Ca++ transporting, cardiac muscle, slow twitch 2, mRNA (cDNA clone MGC:62264 IMAGE:6406916), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC054748 // GenBank // Mus musculus ATPase, Ca++ transporting, cardiac muscle, slow twitch 2, mRNA (cDNA clone MGC:64797 IMAGE:6406916), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000042932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:122455659:122501685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000071235 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:122697202:122697600:-1 gene:ENSMUSG00000059352 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:122693633:122698961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_175092 // RefSeq // Mus musculus ras homolog gene family, member f (Rhof), mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:123118178:123132692:-1 gene:ENSMUSG00000029449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123103044:123132461:-1 gene:ENSMUSG00000029449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000162208 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:123111167:123132429:-1 gene:ENSMUSG00000029449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC096597 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member f, mRNA (cDNA clone MGC:106233 IMAGE:4983233), complete cds. // chr5 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// BC132355 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member f, mRNA (cDNA clone MGC:163986 IMAGE:40130632), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC132357 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member f, mRNA (cDNA clone MGC:163988 IMAGE:40130634), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000186469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:123103044:123132396:-1 gene:ENSMUSG00000029449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123119430:123132976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0
NM_008277 // RefSeq // Mus musculus 4-hydroxyphenylpyruvic acid dioxygenase (Hpd), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031398 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:123171807:123182725:-1 gene:ENSMUSG00000029445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000154713 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:123177529:123182723:-1 gene:ENSMUSG00000029445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC013343 // GenBank // Mus musculus 4-hydroxyphenylpyruvic acid dioxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:14040 IMAGE:4193670), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D29987 // GenBank // Mus musculus mRNA for 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006530168 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 4-hydroxyphenylpyruvic acid dioxygenase (Hpd), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENSMUST00000156539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:123177529:123182722:-1 gene:ENSMUSG00000029445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123171978:123202196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_029594 // RefSeq // Mus musculus interleukin 31 (Il31), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:123480153:123482101:-1 gene:ENSMUSG00000029437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY509149 // GenBank // Mus musculus muzcytor17lig interleukin 31 (Il31) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC117082 // GenBank // Mus musculus interleukin 31, mRNA (cDNA clone MGC:151459 IMAGE:40126401), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC117084 // GenBank // Mus musculus interleukin 31, mRNA (cDNA clone MGC:151461 IMAGE:40126403), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123480419:123485690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_029929 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 33A (yeast) (Vps33a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006530504 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vacuolar protein sorting 33A (yeast) (Vps33a), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000031388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:123528764:123573015:-1 gene:ENSMUSG00000029434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF439858 // GenBank // Mus musculus vacuolar sorting protein 33a (Vps33a) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC046417 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 33A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:25670 IMAGE:4501207), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123531040:123572981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_027494 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 8 (Zcchc8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:123698302:123721044:-1 gene:ENSMUSG00000029427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC013555 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:19353 IMAGE:4238634), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123700344:123749173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_030701 // RefSeq // Mus musculus hydroxycarboxylic acid receptor 2 (Hcar2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000057145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:123863570:123865516:-1 gene:ENSMUSG00000045502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AJ300198 // GenBank // Mus musculus mRNA for putative seven transmembrane spanning receptor (Puma-g gene). // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC120715 // GenBank // Mus musculus niacin receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:155952 IMAGE:40129638), complete cds. // chr5 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC125296 // GenBank // Mus musculus niacin receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:158999 IMAGE:40129811), complete cds. // chr5 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
NM_175520 // RefSeq // Mus musculus hydrocarboxylic acid receptor 1 (Hcar1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000164267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:123876736:123880020:-1 gene:ENSMUSG00000049241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC141305 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 81, mRNA (cDNA clone MGC:176266 IMAGE:9055917), complete cds. // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// EU809459 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 81 long form (Gpr81) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// EU809460 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 81 short form (Gpr81) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000021427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:123878571:123879602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_177876 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 37B (yeast) (Vps37b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:124004641:124032260:-1 gene:ENSMUSG00000066278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026744 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 37B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:25614 IMAGE:4163734), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124004293:124032212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSMUST00000126856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124071711:124090262:-1 gene:ENSMUSG00000029408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000141510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124071711:124090262:-1 gene:ENSMUSG00000029408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// AB045382 // GenBank // Mus musculus TAPL mRNA for TAPL, complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AF216495 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette protein ABCB9 (Abcb9) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC053014 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:62210 IMAGE:5686698), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NM_019875 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 9 (Abcb9), mRNA. // chr5 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// ENSMUST00000031354 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:124061530:124095798:-1 gene:ENSMUSG00000029408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000153433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124073325:124079090:-1 gene:ENSMUSG00000029408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000021425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124062663:124090176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NM_001081203 // RefSeq // Mus musculus sno, strawberry notch homolog 1 (Drosophila) (Sbno1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000065263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:124368702:124425914:-1 gene:ENSMUSG00000038095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000168651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:124374013:124425572:-1 gene:ENSMUSG00000038095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK077133 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933409M12 product:CDNA FLJ10833 FIS, CLONE NT2RP4001206, MODERATELY SIMILAR TO DROSOPHILA MELANOGASTER STRAWBERRY NOTCH MRNA (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// BC021875 // GenBank // Mus musculus sno, strawberry notch homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:28589 IMAGE:4212192), complete cds. // chr5 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// BC138418 // GenBank // Mus musculus sno, strawberry notch homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:170043 IMAGE:8861438), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// AK164542 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330036E08 product:sno, strawberry notch homolog 1 (Drosophila), full insert sequence. // chr5 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000021431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124374529:124425314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_030259 // RefSeq // Mus musculus Rab interacting lysosomal protein-like 2 (Rilpl2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031347 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:124463265:124478366:-1 gene:ENSMUSG00000029401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK133760 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730407M15 product:similar to Hypothetical protein FLJ32372 (P40phox binding protein) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003324 // GenBank // Mus musculus Rab interacting lysosomal protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:7036 IMAGE:3156139), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124468583:124478085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_021430 // RefSeq // Mus musculus Rab interacting lysosomal protein-like 1 (Rilpl1), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006530492 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rab interacting lysosomal protein-like 1 (Rilpl1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006530493 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rab interacting lysosomal protein-like 1 (Rilpl1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000062153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:124493082:124531391:-1 gene:ENSMUSG00000029392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK013469 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900002H16 product:BRAIN CDNA, CLONE MNCB-2440, SIMILAR TO MUS MUSCULUS PARTIAL COCHLEAR MRNA (CLONE 29C9) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC029965 // GenBank HTC // Mus musculus Rab interacting lysosomal protein-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4019283). // chr5 // 91 // 72 // 21 // 23 // 0 /// BC051945 // GenBank // Mus musculus Rab interacting lysosomal protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:62198 IMAGE:5716540), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC051946 // GenBank // Mus musculus Rab interacting lysosomal protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:62199 IMAGE:6403995), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC058384 // GenBank // Mus musculus Rab interacting lysosomal protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:66916 IMAGE:5718399), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124493700:124530983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
NM_145371 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 1 (alpha) (Eif2b1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006530275 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 1 (alpha) (Eif2b1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000031334 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:124570213:124579131:-1 gene:ENSMUSG00000029388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000135361 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:124573731:124579075:-1 gene:ENSMUSG00000029388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// BC003426 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 1 (alpha), mRNA (cDNA clone MGC:6458 IMAGE:2615801), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128920 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:124576811:124578992:-1 gene:ENSMUSG00000029388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENSMUST00000152716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124571751:124574916:-1 gene:ENSMUSG00000029388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000021437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124571190:124579214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_144819 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 92 (Ccdc92), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504287 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 92 (Ccdc92), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000036206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:124834418:124862424:-1 gene:ENSMUSG00000037979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124834418:124861885:-1 gene:ENSMUSG00000037979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000143268 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:124836070:124851583:-1 gene:ENSMUSG00000037979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC021492 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 92, mRNA (cDNA clone MGC:38387 IMAGE:5345674), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:124835519:124841004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0
NM_203319 // RefSeq // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 37 (Dhx37), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000169485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:125414406:125434048:-1 gene:ENSMUSG00000029480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC066077 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 37, mRNA (cDNA clone MGC:90028 IMAGE:30354591), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC080298 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 37, mRNA (cDNA clone MGC:90822 IMAGE:30362983), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:125415081:125434037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
XM_144574 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4868 (Gm4868), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:125847949:125848740:-1 gene:ENSMUSG00000091970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:125847910:125848740:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000001421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:126025938:126026520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
NM_172885 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 132D (Tmem132d), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006504306 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 132D (Tmem132d), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:127783491:128433077:-1 gene:ENSMUSG00000034310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC140953 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 132D, mRNA (cDNA clone MGC:175914 IMAGE:9055565), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:127783762:127808540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_001081388 // RefSeq // Mus musculus RIMS binding protein 2 (Rimbp2), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006504294 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIMS binding protein 2 (Rimbp2), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006504299 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIMS binding protein 2 (Rimbp2), transcript variant X12, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000111346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:128760401:128953362:-1 gene:ENSMUSG00000029420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AK147417 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1037M13 product:RIM binding protein 2 (RIM-BP2) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 91 // 89 // 31 // 34 // 0 /// BC151100 // GenBank // Mus musculus RIMS binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:184013 IMAGE:9088013), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC151101 // GenBank // Mus musculus RIMS binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:184014 IMAGE:9088014), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AK122245 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0318 protein. // chr5 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// GENSCAN00000004539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:128796966:128846380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000004605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:128757083:128790406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1
NM_172462 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 11 (Zfp11), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000049778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:129654593:129670099:-1 gene:ENSMUSG00000051034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC094590 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:106624 IMAGE:30616053), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC139312 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:170939 IMAGE:8862334), complete cds. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC139315 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:170942 IMAGE:8862337), complete cds. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_028826 // RefSeq // Mus musculus septin 14 (Sept14), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006504325 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus septin 14 (Sept14), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000042266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:129683402:129704259:-1 gene:ENSMUSG00000034219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000182381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:129683391:129693232:-1 gene:ENSMUSG00000034219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000182386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:129683490:129708511:-1 gene:ENSMUSG00000034219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK006043 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700016K13 product:weakly similar to SEPTIN 6 [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// XM_006504326 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus septin 14 (Sept14), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000043162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:129637843:129699238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
NM_133900 // RefSeq // Mus musculus phosphoserine phosphatase (Psph), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504274 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphoserine phosphatase (Psph), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006504275 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphoserine phosphatase (Psph), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000031399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:129765558:129787204:-1 gene:ENSMUSG00000029446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:129770700:129786975:-1 gene:ENSMUSG00000029446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC002251 // GenBank // Mus musculus phosphoserine phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:7574 IMAGE:3493291), complete cds. // chr5 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// ENSMUST00000118268 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:129765558:129771615:-1 gene:ENSMUSG00000029446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSMUST00000178244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:129776866:129787252:-1 gene:ENSMUSG00000029446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// AK089221 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630041K15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000043146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:129765791:129771615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT054658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_011079 // RefSeq // Mus musculus phosphorylase kinase gamma 1 (Phkg1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006504397 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphorylase kinase gamma 1 (Phkg1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000026617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:129863421:129879083:-1 gene:ENSMUSG00000025537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000140667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:129866978:129898549:-1 gene:ENSMUSG00000025537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 47 // 12 // 14 // 0 /// BC055102 // GenBank // Mus musculus phosphorylase kinase gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:58273 IMAGE:6532722), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// J03293 // GenBank // Mouse skeletal muscle phosphorylase kinase, gamma subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000154932 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:129866211:129874105:-1 gene:ENSMUSG00000025537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000003270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:129864441:129884068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
XR_402996 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6598 (Gm6598), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK080981 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B830006I20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT054679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_023248 // RefSeq // Mus musculus Shwachman-Bodian-Diamond syndrome homolog (human) (Sbds), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000026387 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:130245731:130255530:-1 gene:ENSMUSG00000025337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000139211 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:130246405:130255405:-1 gene:ENSMUSG00000025337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC003849 // GenBank // Mus musculus Shwachman-Bodian-Diamond syndrome homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:6426 IMAGE:3599733), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000125625 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:130247884:130254085:-1 gene:ENSMUSG00000025337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// GENSCAN00000003267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:130246333:130255337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0
NM_198665 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A330070K13 gene (A330070K13Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063656 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:130378778:130384631:-1 gene:ENSMUSG00000052014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_033572 // RefSeq // Mus musculus Williams-Beuren syndrome chromosome region 16 homolog (human) (Wbscr16), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000076228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:134148054:134176774:-1 gene:ENSMUSG00000061979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000126113 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:134155774:134169373:-1 gene:ENSMUSG00000061979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000143897 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:134163624:134166749:-1 gene:ENSMUSG00000061979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// AF410456 // GenBank // Mus musculus RCC1-like G exchanging factor-like protein (Wbscr16) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC024714 // GenBank // Mus musculus Williams-Beuren syndrome chromosome region 16 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:30304 IMAGE:5134834), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC055335 // GenBank // Mus musculus Williams-Beuren syndrome chromosome region 16 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:65620 IMAGE:6412407), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:134148929:134176714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT054760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0
NM_001039162 // RefSeq // Mus musculus CAP-GLY domain containing linker protein 2 (Clip2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_009990 // RefSeq // Mus musculus CAP-GLY domain containing linker protein 2 (Clip2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006504425 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CAP-GLY domain containing linker protein 2 (Clip2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000036999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:134489386:134552434:-1 gene:ENSMUSG00000063146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000100647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:134489386:134552434:-1 gene:ENSMUSG00000063146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC039162 // GenBank // Mus musculus CAP-GLY domain containing linker protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:27892 IMAGE:3498067), complete cds. // chr5 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// BC053048 // GenBank // Mus musculus CAP-GLY domain containing linker protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:62306 IMAGE:5709279), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000014130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:134489392:134560093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1
NM_001013751 // RefSeq // Mus musculus syncytin a (Syna), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006504406 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus syncytin a (Syna), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000149604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:134557254:134560171:-1 gene:ENSMUSG00000085957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC138919 // GenBank // Mus musculus gene model 52, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:170546 IMAGE:8861941), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:134489392:134560093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1
NM_020044 // RefSeq // Mus musculus linker for activation of T cells family, member 2 (Lat2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_022964 // RefSeq // Mus musculus linker for activation of T cells family, member 2 (Lat2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006504454 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus linker for activation of T cells family, member 2 (Lat2), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006504456 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus linker for activation of T cells family, member 2 (Lat2), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000036362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:134600268:134615023:-1 gene:ENSMUSG00000040751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000077636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:134600268:134615023:-1 gene:ENSMUSG00000040751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF257136 // GenBank // Mus musculus Wbscr15 protein (Wbscr15) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AY190024 // GenBank // Mus musculus membrane-associated adaptor molecule (Lab) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC005804 // GenBank // Mus musculus linker for activation of T cells family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:6960 IMAGE:3154073), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:134602587:134608904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_033561 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4H (Eif4h), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006504419 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4H (Eif4h), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000036125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:134619880:134639348:-1 gene:ENSMUSG00000040731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK122194 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0038 protein. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK177188 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0101O20, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000036125, based on BLAT search. // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK183328 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0125I01, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000036125, based on BLAT search. // chr5 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// BC014796 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4H, mRNA (cDNA clone MGC:11689 IMAGE:3962104), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:134621509:134639560:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_007925 // RefSeq // Mus musculus elastin (Eln), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006504360 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus elastin (Eln), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000015138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:134703781:134747241:-1 gene:ENSMUSG00000029675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// BC034057 // GenBank HTC // Mus musculus elastin, mRNA (cDNA clone IMAGE:4038838), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// BC051649 // GenBank // Mus musculus elastin, mRNA (cDNA clone MGC:51697 IMAGE:5346255), complete cds. // chr5 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// U08210 // GenBank // Mus musculus tropoelastin mRNA, complete cds. // chr5 // 89 // 90 // 32 // 36 // 0 /// GENSCAN00000014128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:134657223:134747241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 29 // 40 // 1
NM_029681 // RefSeq // Mus musculus Williams-Beuren syndrome chromosome region 28 (human) (Wbscr28), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_194065 // RefSeq // Mus musculus Williams-Beuren syndrome chromosome region 28 (human) (Wbscr28), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:134901594:134906733:-1 gene:ENSMUSG00000040576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY369079 // GenBank // Mus musculus Williams-Beuren syndrome critical region protein 28 isoform A (Wbscr28) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY369080 // GenBank // Mus musculus Williams-Beuren syndrome critical region protein 28 isoform B (Wbscr28) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC114542 // GenBank // Mus musculus Williams-Beuren syndrome chromosome region 28 (human), mRNA (cDNA clone MGC:141057 IMAGE:40050280), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_020504 // RefSeq // Mus musculus claudin 13 (Cldn13), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000008987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:134914249:134915526:-1 gene:ENSMUSG00000008843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF516681 // GenBank // Mus musculus claudin 13 (Cldn13) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115481 // GenBank // Mus musculus claudin 13, mRNA (cDNA clone MGC:144291 IMAGE:40100580), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC115482 // GenBank // Mus musculus claudin 13, mRNA (cDNA clone MGC:144292 IMAGE:40100581), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:134899741:134915329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_009903 // RefSeq // Mus musculus claudin 4 (Cldn4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000051401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:134945126:134946934:-1 gene:ENSMUSG00000047501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB000713 // GenBank // Mus musculus mCPE-R mRNA for CPE-receptor, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AF087822 // GenBank // Mus musculus claudin-4 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC132376 // GenBank // Mus musculus claudin 4, mRNA (cDNA clone MGC:164007 IMAGE:40130653), complete cds. // chr5 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC132378 // GenBank // Mus musculus claudin 4, mRNA (cDNA clone MGC:164009 IMAGE:40130655), complete cds. // chr5 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:134946113:134946745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000131403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:134992530:135000507:-1 gene:ENSMUSG00000054909 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000148729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:134987433:135001350:-1 gene:ENSMUSG00000054909 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK017130 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933439O14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// AY081954 // GenBank // Mus musculus Williams-Beuren syndrome critical region protein 25 (Wbscr25) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT054798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT054799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT054801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// NONMMUT054800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// NONMMUT054802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
NM_001199677 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 37D (yeast) (Vps37d), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000067935 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:135072900:135078266:-1 gene:ENSMUSG00000043614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AY081953 // GenBank // Mus musculus Williams-Beuren syndrome critical region protein 24 (Wbscr24) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC044789 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 37D (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:51411 IMAGE:3484221), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NM_177574 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 37D (yeast) (Vps37d), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// ENSMUST00000076203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135072903:135078266:-1 gene:ENSMUSG00000043614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// AY352519 // GenBank // Mus musculus Williams-Beuren syndrome critical region protein 24 isoform beta (Wbscr24) mRNA, complete cds. // chr5 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// GENSCAN00000043586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135073591:135078199:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0
NM_010246 // RefSeq // Mus musculus frizzled homolog 9 (Drosophila) (Fzd9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135248938:135251230:-1 gene:ENSMUSG00000049551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135249251:135251029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_148932 // RefSeq // Mus musculus nuclear pore membrane protein 121 (Pom121), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006504334 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear pore membrane protein 121 (Pom121), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000065638 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:135376141:135394510:-1 gene:ENSMUSG00000053293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000111171 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135376141:135394546:-1 gene:ENSMUSG00000053293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF516680 // GenBank // Mus musculus nuclear pore membrane glycoprotein 121 kD (Pom121) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC053101 // GenBank // Mus musculus nuclear pore membrane protein 121, mRNA (cDNA clone MGC:62505 IMAGE:6405486), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135378077:135394505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_146001 // RefSeq // Mus musculus huntingtin interacting protein 1 (Hip1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000060311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:135406523:135545122:-1 gene:ENSMUSG00000039959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK166346 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830046F23 product:huntingtin interacting protein 1, full insert sequence. // chr5 // 81 // 50 // 13 // 16 // 0 /// AK220182 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4113 protein. // chr5 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// BC017516 // GenBank // Mus musculus huntingtin interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:27616 IMAGE:4504441), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK087586 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230016G06 product:huntingtin-interacting protein 1, full insert sequence. // chr5 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000043570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135400374:135545056:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001013412 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 26 (Ccl26), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000094226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:135560448:135563569:-1 gene:ENSMUSG00000070464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY587128 // GenBank // Mus musculus eotaxin 3-like protein mRNA, complete cds. // chr5 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135563293:135564853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_019577 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 24 (Ccl24), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504444 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 24 (Ccl24), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000004936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:135569937:135573043:-1 gene:ENSMUSG00000004814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF244367 // GenBank // Mus musculus CC chemokine CCL24/MPIF-2/Eotaxin-2 (Scya24) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AF281075 // GenBank // Mus musculus eotaxin-2 (Scya24) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC065389 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 24, mRNA (cDNA clone MGC:73588 IMAGE:3472002), complete cds. // chr5 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000043589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135570795:135572972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000179536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:135643955:135644336:-1 gene:ENSMUSG00000094372 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// AB073973 // GenBank // Mus musculus mRNA for MAA-76 protein, complete cds. // chr5 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// AJ290943 // GenBank // Mus musculus mRNA for a stretch regulated skeletal muscle protein (Usmg1 gene). // chr5 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// NONMMUT054835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT054836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_172541 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 120A (Tmem120a), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000043378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135735485:135744271:-1 gene:ENSMUSG00000039886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127156 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135736255:135742399:-1 gene:ENSMUSG00000039886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000141779 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135735504:135736590:-1 gene:ENSMUSG00000039886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000153399 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:135737208:135744208:-1 gene:ENSMUSG00000039886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 32 // 8 // 9 // 0 /// BC046757 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 120A, mRNA (cDNA clone MGC:57914 IMAGE:5693443), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135735692:135770358:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_018871 // RefSeq // Mus musculus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, gamma polypeptide (Ywhag), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135908409:135934599:-1 gene:ENSMUSG00000051391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB073970 // GenBank // Mus musculus mRNA for 14-3-3 protein gamma subtype, complete cds. // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC008129 // GenBank // Mus musculus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, gamma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:5794 IMAGE:3498633), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// CT010208 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G0950D for gene Ywhag, 3-monooxgenase/tryptophan 5-monooxgenase activation protein, gamma polypeptide; complete cds, incl. stopcodon. // chr5 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AF058799 // GenBank // Mus musculus 14-3-3 protein gamma mRNA, complete cds. // chr5 // 68 // 73 // 13 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135910995:135942854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001160366 // RefSeq // Mus musculus scavenger receptor cysteine rich domain containing, group B (4 domains) (Srcrb4d), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000111152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:135960223:135974497:-1 gene:ENSMUSG00000029699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000111153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135960211:135974531:-1 gene:ENSMUSG00000029699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000153823 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:135963212:135965874:-1 gene:ENSMUSG00000029699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000154181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:135966139:135974440:-1 gene:ENSMUSG00000029699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// ENSMUST00000154696 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:135963422:135967920:-1 gene:ENSMUSG00000029699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000020266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:135960892:135977114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000157563 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:136096260:136096431:-1 gene:ENSMUSG00000088188 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178751 // RefSeq // Mus musculus ORAI calcium release-activated calcium modulator 2 (Orai2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000041048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:136147464:136170656:-1 gene:ENSMUSG00000039747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AB271215 // GenBank // Mus musculus Orai2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 59 // 24 // 24 // 0 /// AK087038 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030022E18 product:inferred: unnamed protein product {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr5 // 86 // 71 // 25 // 29 // 0 /// BC042668 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A730041O15 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5363429), partial cds. // chr5 // 100 // 32 // 13 // 13 // 0 /// BC066070 // GenBank // Mus musculus ORAI calcium release-activated calcium modulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:91338 IMAGE:6853893), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC115648 // GenBank // Mus musculus ORAI calcium release-activated calcium modulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:144554 IMAGE:40103121), complete cds. // chr5 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// BC115649 // GenBank // Mus musculus ORAI calcium release-activated calcium modulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:144555 IMAGE:40103122), complete cds. // chr5 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136150425:136167796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59415269:59458445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 25 // 41 // 1
NM_025774 // RefSeq // Mus musculus Prkr interacting protein 1 (IL11 inducible) (Prkrip1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000123921 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:136181422:136197822:-1 gene:ENSMUSG00000039737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000149151 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:136181427:136198908:-1 gene:ENSMUSG00000039737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000151786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:136178127:136198963:-1 gene:ENSMUSG00000039737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK046035 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230337A22 product:HYPOTHETICAL 21.0 KDA PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC027503 // GenBank // Mus musculus Prkr interacting protein 1 (IL11 inducible), mRNA (cDNA clone MGC:41035 IMAGE:1494676), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000040980 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:136181084:136198910:-1 gene:ENSMUSG00000039737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000020259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136181396:136198900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// NONMMUT054860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
GENSCAN00000020256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136211009:136258224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_018825 // RefSeq // Mus musculus SH2B adaptor protein 2 (Sh2b2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006504420 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH2B adaptor protein 2 (Sh2b2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000005188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:136218149:136244903:-1 gene:ENSMUSG00000005057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF234838 // GenBank // Mus musculus APS protein (APS) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC049777 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6336117, containing frame-shift errors. // chr5 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// BC057334 // GenBank // Mus musculus SH2B adaptor protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:66963 IMAGE:6811850), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136211009:136258224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000053319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:136613702:136615328:-1 gene:ENSMUSG00000046548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK014627 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4731417B20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027318 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, HIT domain containing 1 (Znhit1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504496 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, HIT domain containing 1 (Znhit1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006504498 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, HIT domain containing 1 (Znhit1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034953 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:136982194:136986829:-1 gene:ENSMUSG00000059518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000085941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:136982190:136986901:-1 gene:ENSMUSG00000059518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000111090 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:136982296:136987543:-1 gene:ENSMUSG00000059518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000156963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:136982164:136988021:-1 gene:ENSMUSG00000059518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC026751 // GenBank // Mus musculus zinc finger, HIT domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:25516 IMAGE:3153902), complete cds. // chr5 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000111091 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:136982321:136987232:-1 gene:ENSMUSG00000059518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000010462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136982396:136986832:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_008871 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade E, member 1 (Serpine1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000041388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137061504:137072272:-1 gene:ENSMUSG00000037411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000077523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137061512:137072254:-1 gene:ENSMUSG00000037411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC054091 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade E, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:60665 IMAGE:30021925), complete cds. // chr5 // 90 // 91 // 27 // 30 // 0 /// M33960 // GenBank // Mouse plasminogen activator inhibitor (PAI-1) mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137037277:137071303:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
NM_201373 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 56 (Trim56), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504441 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif-containing 56 (Trim56), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006504442 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif-containing 56 (Trim56), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000054384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137105644:137116207:-1 gene:ENSMUSG00000043279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137114024:137116209:-1 gene:ENSMUSG00000043279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC045615 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 56, mRNA (cDNA clone MGC:37358 IMAGE:4976515), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137112456:137189655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_006544016 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mucin 3, intestinal (Muc3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137134950:137149320:-1 gene:ENSMUSG00000037390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160533 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:137134924:137142413:-1 gene:ENSMUSG00000037390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000160630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137134961:137139127:-1 gene:ENSMUSG00000037390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AF027131 // GenBank // Mus musculus mucin glycoprotein MUC3 mRNA, partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132919 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930516G09 product:mucin 3, intestinal, full insert sequence. // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000010380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137112456:137189655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001109909 // RefSeq // Mus musculus serrate RNA effector molecule homolog (Arabidopsis) (Srrt), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_001109910 // RefSeq // Mus musculus serrate RNA effector molecule homolog (Arabidopsis) (Srrt), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_031405 // RefSeq // Mus musculus serrate RNA effector molecule homolog (Arabidopsis) (Srrt), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006504630 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serrate RNA effector molecule homolog (Arabidopsis) (Srrt), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006504631 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serrate RNA effector molecule homolog (Arabidopsis) (Srrt), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000040873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137295704:137307674:-1 gene:ENSMUSG00000037364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC019117 // GenBank // Mus musculus arsenate resistance protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3709664), complete cds. // chr5 // 92 // 57 // 22 // 24 // 0 /// BC066831 // GenBank // Mus musculus arsenate resistance protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:76605 IMAGE:30471339), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000010358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137295831:137332636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
NM_011639 // RefSeq // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 6 (Trip6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006504563 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 6 (Trip6), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000024119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137309899:137314241:-1 gene:ENSMUSG00000023348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF097511 // GenBank // Mus musculus zyxin related protein-1 (Zrp1) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AF116823 // GenBank // Mus musculus putative intracellular signaling protein (Trip6) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AK166024 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730029L15 product:thyroid hormone receptor interactor 6, full insert sequence. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC138685 // GenBank // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 6, mRNA (cDNA clone MGC:170311 IMAGE:8861706), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC138686 // GenBank // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 6, mRNA (cDNA clone MGC:170312 IMAGE:8861707), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137295831:137332636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_031406 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 12 (potassium/chloride transporters), member 9 (Slc12a9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000039991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137314558:137333597:-1 gene:ENSMUSG00000037344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF314957 // GenBank // Mus musculus cation-chloride cotransporter-interacting protein-1 (Slc12a8) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC046982 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 12 (potassium/chloride transporters), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:54442 IMAGE:6478046), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006504634 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 12 (potassium/chloride transporters), member 9 (Slc12a9), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000010358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137295831:137332636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_011741 // RefSeq // Mus musculus zonadhesin (Zan), mRNA. // chr5 // 100 // 99 // 87 // 87 // 0 /// ENSMUST00000117564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137378637:137477064:-1 gene:ENSMUSG00000079173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 99 // 87 // 87 // 0 /// ENSMUST00000130056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137435869:137450623:-1 gene:ENSMUSG00000079173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 90 // 11 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000164178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137378637:137476595:-1 gene:ENSMUSG00000079173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 86 // 86 // 0 /// AK158504 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230003I11 product:zonadhesin, full insert sequence. // chr5 // 90 // 11 // 9 // 10 // 0 /// U97068 // GenBank // Mus musculus zonadhesin (Zan) mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 98 // 81 // 86 // 0 /// GENSCAN00000010458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137378682:137485745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 80 // 80 // 0
NM_007942 // RefSeq // Mus musculus erythropoietin (Epo), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137483020:137485816:-1 gene:ENSMUSG00000029711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137483020:137533242:-1 gene:ENSMUSG00000029711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111039 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:137483026:137485816:-1 gene:ENSMUSG00000029711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119265 // GenBank // Mus musculus erythropoietin, mRNA (cDNA clone MGC:155581 IMAGE:8734014), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119271 // GenBank // Mus musculus erythropoietin, mRNA (cDNA clone MGC:155587 IMAGE:8734020), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC144883 // GenBank // Mus musculus erythropoietin, mRNA (cDNA clone MGC:178439 IMAGE:9053431), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC144887 // GenBank // Mus musculus erythropoietin, mRNA (cDNA clone MGC:178443 IMAGE:9053435), complete cds. // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137378682:137485745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// Y11971 // GenBank // M.musculus mRNA Epo (abnormal Epo allele). // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_028753 // RefSeq // Mus musculus processing of precursor 7, ribonuclease P family, (S. cerevisiae) (Pop7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137501439:137502518:-1 gene:ENSMUSG00000029715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111035 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137501438:137502425:-1 gene:ENSMUSG00000029715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158620 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230029L17 product:processing of precursor 7, ribonuclease P family, (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC010780 // GenBank // Mus musculus processing of precursor 7, ribonuclease P family, (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:18712 IMAGE:4216163), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137501647:137511234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_027708 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 24 (Fbxo24), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006504617 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box protein 24 (Fbxo24), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137612503:137625078:-1 gene:ENSMUSG00000089984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000111002 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:137612503:137629002:-1 gene:ENSMUSG00000089984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000136028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137612506:137628956:-1 gene:ENSMUSG00000089984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000010364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137612757:137626090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_010571 // RefSeq // Mus musculus insulin receptor substrate 3 (Irs3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000057314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137643032:137645714:-1 gene:ENSMUSG00000047182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC098235 // GenBank // Mus musculus insulin receptor substrate 3, mRNA (cDNA clone MGC:106831 IMAGE:1546952), complete cds. // chr5 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000010361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137643687:137684573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
ENSMUST00000126693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137685154:137690751:-1 gene:ENSMUSG00000079163 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC028660 // GenBank // Mus musculus predicted gene, OTTMUSG00000022819, mRNA (cDNA clone MGC:41618 IMAGE:1265093), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT054944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_144913 // RefSeq // Mus musculus methylphosphate capping enzyme (Mepce), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504572 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methylphosphate capping enzyme (Mepce), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137781906:137786663:-1 gene:ENSMUSG00000029726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000132726 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:137782429:137786715:-1 gene:ENSMUSG00000029726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000140336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137782483:137783350:-1 gene:ENSMUSG00000029726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC026876 // GenBank // Mus musculus methylphosphate capping enzyme, mRNA (cDNA clone MGC:30590 IMAGE:3662118), complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137782432:137786053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_153510 // RefSeq // Mus musculus paired immunoglobin-like type 2 receptor alpha (Pilra), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000058897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137821952:137836268:-1 gene:ENSMUSG00000046245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000130460 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137823383:137831510:-1 gene:ENSMUSG00000046245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC115565 // GenBank // Mus musculus paired immunoglobin-like type 2 receptor alpha, mRNA (cDNA clone MGC:144436 IMAGE:40102015), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000110980 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:137823459:137836251:-1 gene:ENSMUSG00000046245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// AK041413 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630007P20 product:inferred: cell surface receptor FDF03 {Mus musculus}, full insert sequence. // chr5 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137823472:137836080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_133209 // RefSeq // Mus musculus paired immunoglobin-like type 2 receptor beta 1 (Pilrb1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000110978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137852147:137858049:-1 gene:ENSMUSG00000066684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AB122024 // GenBank // Mus musculus pilrb mRNA for paired immunoglobin-like type 2 receptor beta, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// BC145880 // GenBank // Mus musculus paired immunoglobin-like type 2 receptor beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:175767 IMAGE:40131183), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// BC145906 // GenBank // Mus musculus paired immunoglobin-like type 2 receptor beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:175793 IMAGE:40131209), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// BC172053 // GenBank // Mus musculus paired immunoglobin-like type 2 receptor beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:198758 IMAGE:9054339), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000055780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137851628:137921512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0
NM_001024932 // RefSeq // Mus musculus paired immunoglobin-like type 2 receptor beta 2 (Pilrb2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000164886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137865829:137871758:-1 gene:ENSMUSG00000066682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC147405 // GenBank // Mus musculus paired immunoglobin-like type 2 receptor beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:182578 IMAGE:9056472), complete cds. // chr5 // 91 // 61 // 10 // 11 // 0 /// BC147406 // GenBank // Mus musculus paired immunoglobin-like type 2 receptor beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:182573 IMAGE:9056467), complete cds. // chr5 // 91 // 61 // 10 // 11 // 0 /// XM_006504604 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus paired immunoglobin-like type 2 receptor beta 2 (Pilrb2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1
NM_007819 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 13 (Cyp3a13), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:137892932:137921619:-1 gene:ENSMUSG00000029727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC046592 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 13, mRNA (cDNA clone MGC:54689 IMAGE:6308234), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137851628:137921512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_080450 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, gamma 3 (Gjc3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006504552 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gap junction protein, gamma 3 (Gjc3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000077119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:137953809:137962959:-1 gene:ENSMUSG00000056966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY289210 // GenBank // Mus musculus gap junction protein connexin 29 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// AY293564 // GenBank // Mus musculus gap junction protein connexin 29 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// AY297108 // GenBank // Mus musculus connexin 29 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// BC125305 // GenBank // Mus musculus gap junction membrane channel protein epsilon 1, mRNA (cDNA clone MGC:159008 IMAGE:40129820), complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000055797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:137957212:137957988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_019747 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 113 (Zfp113), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000049393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138139702:138155744:-1 gene:ENSMUSG00000037007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000144786 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:138150519:138155700:-1 gene:ENSMUSG00000037007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000165640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:138144667:138152899:-1 gene:ENSMUSG00000037007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC052453 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 113, mRNA (cDNA clone MGC:63409 IMAGE:6410632), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC054525 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 113, mRNA (cDNA clone MGC:62211 IMAGE:6410632), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC056445 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 113, mRNA (cDNA clone MGC:66934 IMAGE:5703904), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132318 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:138150927:138155704:-1 gene:ENSMUSG00000037007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// AF167320 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein ZFP113 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_008568 // RefSeq // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 7 (S. cerevisiae) (Mcm7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006504556 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus minichromosome maintenance deficient 7 (S. cerevisiae) (Mcm7), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// XM_006504557 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus minichromosome maintenance deficient 7 (S. cerevisiae) (Mcm7), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000000505 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:138164583:138172422:-1 gene:ENSMUSG00000029730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC065164 // GenBank // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 7 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:90044 IMAGE:6829737), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC066024 // GenBank // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 7 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:90086 IMAGE:6829337), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// D26091 // GenBank // Mus musculus mRNA for mCDC47, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000148879 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:138164600:138171818:-1 gene:ENSMUSG00000029730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// GENSCAN00000055790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138164719:138171756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
NR_029787 // RefSeq // Mus musculus microRNA 25 (Mir25), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083460 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:138165321:138165404:-1 gene:ENSMUSG00000065394 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125316 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138164600:138165716:-1 gene:ENSMUSG00000029730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-25 // miRBase Micro RNA Database // MI0000689 Mus musculus miR-25 stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029749 // RefSeq // Mus musculus microRNA 93 (Mir93), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083593 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:138165523:138165610:-1 gene:ENSMUSG00000065527 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125316 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138164600:138165716:-1 gene:ENSMUSG00000029730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-93 // miRBase Micro RNA Database // MI0000581 Mus musculus miR-93 stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029658 // RefSeq // Mus musculus microRNA 106b (Mir106b), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083580 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:138165737:138165818:-1 gene:ENSMUSG00000065514 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-106b // miRBase Micro RNA Database // MI0000407 Mus musculus miR-106b stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT054965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033416 // RefSeq // Mus musculus galactose-3-O-sulfotransferase 4 (Gal3st4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000100530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:138264925:138272754:-1 gene:ENSMUSG00000075593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138264952:138279958:-1 gene:ENSMUSG00000029510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138264938:138272801:-1 gene:ENSMUSG00000075593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000161665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138270993:138272749:-1 gene:ENSMUSG00000075593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// XM_006504578 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus galactose-3-O-sulfotransferase 4 (Gal3st4), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// ENSMUST00000161647 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:138264921:138272840:-1 gene:ENSMUSG00000075593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENSMUST00000162557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138264938:138272801:-1 gene:ENSMUSG00000075593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000055781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138265293:138271376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_010325 // RefSeq // Mus musculus glutamate oxaloacetate transaminase 2, mitochondrial (Got2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:95864134:95888547:-1 gene:ENSMUSG00000031672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000121655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138364260:138365552:-1 gene:ENSMUSG00000080935 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000147040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:95866832:95872392:-1 gene:ENSMUSG00000031672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 89 // 58 // 16 // 18 // 0 /// BC089015 // GenBank // Mus musculus glutamate oxaloacetate transaminase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:115763 IMAGE:30606379), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC089341 // GenBank // Mus musculus glutamate oxaloacetate transaminase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:102129 IMAGE:6832287), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// J02622 // GenBank // Mouse mitochondrial aspartate aminotransferase isoenzyme mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U82470 // GenBank // Mus musculus aspartate aminotransferase precursor (Got-2) mRNA, Got-2-a allele, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000039093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95864731:95888305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138364260:138365552:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_029693 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700123K08 gene (1700123K08Rik), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:138561840:138564694:-1 gene:ENSMUSG00000029526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147525 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182623 IMAGE:9056517), complete cds. // chr5 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC147536 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182633 IMAGE:9056527), complete cds. // chr5 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138555137:138607810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001044747 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 68 (Zfp68), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_001163797 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 68 (Zfp68), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_013844 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 68 (Zfp68), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000063262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138606120:138619740:-1 gene:ENSMUSG00000058291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000085852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:138604984:138619758:-1 gene:ENSMUSG00000058291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000110905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:138604616:138619761:-1 gene:ENSMUSG00000058291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000129832 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138612067:138619653:-1 gene:ENSMUSG00000058291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// AB024005 // GenBank // Mus musculus mRNA for KRAB-containing zinc-finger protein KRAZ2, complete cds. // chr5 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC018171 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 68, mRNA (cDNA clone MGC:25247 IMAGE:3989444), complete cds. // chr5 // 70 // 74 // 16 // 23 // 0 /// AK082644 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230075L20 product:Zinc finger protein 68, full insert sequence. // chr5 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONMMUT054993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_172723 // RefSeq // Mus musculus ArfGAP with dual PH domains 1 (Adap1), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000110865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:139271876:139325622:-1 gene:ENSMUSG00000056413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000123748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139272930:139274641:-1 gene:ENSMUSG00000056413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000126762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139272858:139306291:-1 gene:ENSMUSG00000056413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000151450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139271876:139306319:-1 gene:ENSMUSG00000056413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// AK076754 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930431P11 product:similar to CENTAURIN ALPHA [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr5 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// BC144874 // GenBank // Mus musculus ArfGAP with dual PH domains 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:9053422), partial cds. // chr5 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000156815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139280522:139307809:-1 gene:ENSMUSG00000056413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1 /// GENSCAN00000027955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139272648:139325362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT055013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1
NM_197980 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase assembly protein 19 (Cox19), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049630 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139336189:139345233:-1 gene:ENSMUSG00000045438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK148526 // GenBank HTC // Mus musculus adult pancreas islet cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C820017L04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC031792 // GenBank // Mus musculus COX19 cytochrome c oxidase assembly homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:18796 IMAGE:4193998), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK007984 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810074D02 product:RIKEN cDNA 1810074D02 gene, full insert sequence. // chr5 // 67 // 96 // 16 // 24 // 0 /// ENSMUST00000133951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139338310:139345125:-1 gene:ENSMUSG00000045438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139338291:139351107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_028469 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3110082I17 gene (3110082I17Rik), mRNA. // chr5 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// ENSMUST00000066052 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139359739:139460502:-1 gene:ENSMUSG00000053553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// XM_006504738 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 3110082I17 gene (3110082I17Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// GENSCAN00000027956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139360545:139381222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
BC016220 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930432F04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28765 IMAGE:4485816), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001159908 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, AN1-type domain 2A (Zfand2a), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_133349 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, AN1-type domain 2A (Zfand2a), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139471211:139484549:-1 gene:ENSMUSG00000053581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139471216:139484517:-1 gene:ENSMUSG00000053581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143889 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139479077:139484428:-1 gene:ENSMUSG00000053581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000150992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139478482:139484464:-1 gene:ENSMUSG00000053581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// AF224494 // GenBank // Mus musculus arsenite inducible RNA associated protein (Airap) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058780 // GenBank // Mus musculus zinc finger, AN1-type domain 2A, mRNA (cDNA clone MGC:67915 IMAGE:6312202), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000027959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139449769:139500999:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_174850 // RefSeq // Mus musculus MICAL-like 2 (Micall2), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000044642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139706693:139736336:-1 gene:ENSMUSG00000036718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000170773 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:139706696:139732834:-1 gene:ENSMUSG00000036718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AB182579 // GenBank // Mus musculus mRNA for JRAB, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// AK085948 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830032H23 product:hypothetical LIM domain Calponin homology (CH) domain containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// BC043300 // GenBank // Mus musculus MICAL-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:49191 IMAGE:5025620), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000164584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139706886:139710227:-1 gene:ENSMUSG00000036718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// GENSCAN00000027951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139700917:139742698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0
NM_026748 // RefSeq // Mus musculus integrator complex subunit 1 (Ints1), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000072607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:139751282:139775678:-1 gene:ENSMUSG00000029547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 41 // 41 // 0 /// AB257854 // GenBank // Mus musculus KIAA1440 mRNA for KIAA1440, complete cds. // chr5 // 95 // 84 // 39 // 41 // 0 /// AK155838 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730229L21 product:hypothetical Actin-binding, actinin-type containing protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 31 // 15 // 15 // 0 /// BC063266 // GenBank // Mus musculus integrator complex subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:67612 IMAGE:6409930), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000027946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139751518:139787383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 39 // 39 // 0
NM_001161548 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 184a (Tmem184a), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_144914 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 184a (Tmem184a), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006504670 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 184a (Tmem184a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006504671 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 184a (Tmem184a), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000044002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:139804952:139814283:-1 gene:ENSMUSG00000036687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000110832 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139802485:139813243:-1 gene:ENSMUSG00000036687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC019731 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 184a, mRNA (cDNA clone MGC:30809 IMAGE:3993397), complete cds. // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC026659 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 184a, mRNA (cDNA clone MGC:37596 IMAGE:4988857), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139805482:139832466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_025604 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 3 (Psmg3), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:139823592:139826885:-1 gene:ENSMUSG00000029551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000182602 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139823613:139826843:-1 gene:ENSMUSG00000029551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC027410 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 3, mRNA (cDNA clone MGC:36857 IMAGE:4237608), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC058692 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 3, mRNA (cDNA clone MGC:63274 IMAGE:6818127), complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:139824475:139826875:-1 gene:ENSMUSG00000029551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK019558 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930403H09 product:1810042K04RIK PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK007751 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810042K04 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:139805482:139832466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONMMUT055041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_010752 // RefSeq // Mus musculus MAD1 mitotic arrest deficient 1-like 1 (Mad1l1), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000031534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:140008689:140321552:-1 gene:ENSMUSG00000029554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000110829 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:140008689:140321550:-1 gene:ENSMUSG00000029554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AF083812 // GenBank // Mus musculus chromosome 5 mitotic checkpoint protein isoform MAD1a (Mad1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF083813 // GenBank // Mus musculus chromosome 5 mitotic checkpoint protein isoform MAD1b (Mad1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK169976 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630006F12 product:mitotic arrest deficient 1-like 1, full insert sequence. // chr5 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// BC010702 // GenBank // Mus musculus mitotic arrest deficient 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:11400 IMAGE:3156639), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140282216:140331860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000043860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140088360:140194105:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_026510 // RefSeq // Mus musculus FtsJ homolog 2 (E. coli) (Ftsj2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:140327674:140331898:-1 gene:ENSMUSG00000029557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC064776 // GenBank // Mus musculus FtsJ homolog 2 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:76617 IMAGE:30094986), complete cds. // chr5 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140282216:140331860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_172277 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 8 (Snx8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006504672 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexin 8 (Snx8), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:140340304:140389251:-1 gene:ENSMUSG00000029560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC019142 // GenBank HTC // Mus musculus sorting nexin 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:5042144), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC037599 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 8, mRNA (cDNA clone MGC:46959 IMAGE:5150754), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006504674 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexin 8 (Snx8), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000043862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140341529:140366952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_030022 // RefSeq // Mus musculus galectin-related inter-fiber protein (Grifin), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XR_377162 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus galectin-related inter-fiber protein (Grifin), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000042993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:140563119:140565071:-1 gene:ENSMUSG00000036586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC107323 // GenBank // Mus musculus galectin-related inter-fiber protein, mRNA (cDNA clone MGC:130283 IMAGE:40053455), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC107324 // GenBank // Mus musculus galectin-related inter-fiber protein, mRNA (cDNA clone MGC:130284 IMAGE:40053456), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140551886:140567616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_175274 // RefSeq // Mus musculus tweety homolog 3 (Drosophila) (Ttyh3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006504769 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tweety homolog 3 (Drosophila) (Ttyh3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006504771 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tweety homolog 3 (Drosophila) (Ttyh3), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:140620586:140649031:-1 gene:ENSMUSG00000036565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC059083 // GenBank // Mus musculus tweety homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:69950 IMAGE:6827289), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC062917 // GenBank // Mus musculus tweety homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:65694 IMAGE:6831835), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006504768 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tweety homolog 3 (Drosophila) (Ttyh3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000043857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140623457:140648827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_010302 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha 12 (Gna12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:140758408:140830431:-1 gene:ENSMUSG00000000149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC111810 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha 12, mRNA (cDNA clone MGC:130498 IMAGE:40045663), complete cds. // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// M63659 // GenBank // Mouse G-alpha-12 protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140760549:140830296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_175362 // RefSeq // Mus musculus caspase recruitment domain family, member 11 (Card11), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000085786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:140872999:141000596:-1 gene:ENSMUSG00000036526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY135367 // GenBank // Mus musculus caspase recruitment domain family member 11 (Card11) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// BC096592 // GenBank // Mus musculus caspase recruitment domain family, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:106296 IMAGE:5318165), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:140873325:140932285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
AK155443 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630228D05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019943 // RefSeq // Mus musculus poly (A) polymerase beta (testis specific) (Papolb), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000099400 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:142525838:142530076:-1 gene:ENSMUSG00000074817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB030729 // GenBank // Mus musculus TPAP mRNA for testis-specific poly(A) polymerase, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF039957 // GenBank // Mus musculus testis-specific poly(A) polymerase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC129896 // GenBank // Mus musculus poly (A) polymerase beta (testis specific), mRNA (cDNA clone MGC:150265 IMAGE:40111521), complete cds. // chr5 // 90 // 88 // 19 // 21 // 0 /// BC129897 // GenBank // Mus musculus poly (A) polymerase beta (testis specific), mRNA (cDNA clone MGC:150266 IMAGE:40111523), complete cds. // chr5 // 90 // 88 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:142485143:142593520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0
NM_175217 // RefSeq // Mus musculus monocyte to macrophage differentiation-associated 2 (Mmd2), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000037048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:142562365:142608800:-1 gene:ENSMUSG00000039533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY134664 // GenBank // Mus musculus monocyte to macrophage differentiation factor 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY424299 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member X (Paqr10) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC025064 // GenBank // Mus musculus monocyte to macrophage differentiation-associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:36872 IMAGE:4502289), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:142485143:142593520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
AK046749 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B630006N21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001122730 // RefSeq // Mus musculus trinucleotide repeat containing 18 (Tnrc18), transcript variant A, mRNA. // chrUn // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// NM_178242 // RefSeq // Mus musculus trinucleotide repeat containing 18 (Tnrc18), transcript variant B, mRNA. // chrUn // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000036253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:142754796:142817387:-1 gene:ENSMUSG00000039477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000151477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:142754789:142817662:-1 gene:ENSMUSG00000039477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000152247 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:142750380:142788523:-1 gene:ENSMUSG00000039477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 63 // 26 // 26 // 0 /// BC049818 // GenBank // Mus musculus trinucleotide repeat containing 18, mRNA (cDNA clone MGC:59613 IMAGE:6511384), complete cds. // chrUn // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// AK173280 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1856 protein. // chrUn // 54 // 54 // 22 // 41 // 1 /// GENSCAN00000009346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:142725981:142794662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 88 // 36 // 36 // 0
ENSMUST00000117498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:142852616:142853199:-1 gene:ENSMUSG00000082308 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:142848378:142888872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_001033312 // RefSeq // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 18 (Fbxl18), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:142871789:142895238:-1 gene:ENSMUSG00000066640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110766 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:142866946:142895421:-1 gene:ENSMUSG00000066640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:142882419:142895421:-1 gene:ENSMUSG00000066640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// AK147353 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain UNDEFINED_CELL_LINE cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1019A22 product:hypothetical Cyclin-like F-box containing protein, full insert sequence. // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000028906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:142848378:142888872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000181842 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:5:142874077:142878373:-1 gene:ENSMUSG00000097559 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK084946 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430018E03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080561 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 216 (Rnf216), transcript variant A, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_207110 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 216 (Rnf216), transcript variant B, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000053498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:142990893:143113020:-1 gene:ENSMUSG00000045078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AY572785 // GenBank // Mus musculus E3 ubiquitin ligase TRIAD3A (Triad3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AY572786 // GenBank // Mus musculus E3 ubiquitin ligase TRIAD3B (Triad3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC065066 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 216, mRNA (cDNA clone MGC:86042 IMAGE:6400486), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AK089775 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830018F18 product:ubiquitin conjugating enzyme 7 interacting protein 1, full insert sequence. // chr5 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1 /// GENSCAN00000028920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:142992649:143113061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000164536 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:143137259:143138197:-1 gene:ENSMUSG00000090981 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143137232:143138335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000028914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143146182:143166123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0
NR_040424 // RefSeq // Mus musculus Rbak downstream neighbor (non-protein coding) (Rbakdn), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NR_040425 // RefSeq // Mus musculus Rbak downstream neighbor (non-protein coding) (Rbakdn), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NR_040426 // RefSeq // Mus musculus Rbak downstream neighbor (non-protein coding) (Rbakdn), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// KnowTID_00006002 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00006003 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00006004 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// KnowTID_00006005 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT055130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT055133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT055134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001045482 // RefSeq // Mus musculus RB-associated KRAB repressor (Rbak), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_021326 // RefSeq // Mus musculus RB-associated KRAB repressor (Rbak), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000049861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:143172188:143180743:-1 gene:ENSMUSG00000061898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000164068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:143173229:143180730:-1 gene:ENSMUSG00000061898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000165318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:143172186:143180775:-1 gene:ENSMUSG00000061898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000166382 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:143172187:143176734:-1 gene:ENSMUSG00000061898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC059913 // GenBank HTC // Mus musculus RB-associated KRAB repressor, mRNA (cDNA clone IMAGE:6825552), with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000028903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143172488:143180811:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_029048 // RefSeq // Mus musculus speedy homolog B (Xenopus laevis) (Spdyb), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000085733 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:143216316:143225882:-1 gene:ENSMUSG00000039296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000160502 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:143216698:143226890:-1 gene:ENSMUSG00000039296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// BC141200 // GenBank // Mus musculus speedy homolog B (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:176161 IMAGE:9055812), complete cds. // chr5 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1 /// AY820308 // GenBank // Mus musculus speedy B isoform mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
ENSMUST00000051665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:143253209:143264656:-1 gene:ENSMUSG00000046658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// AF031955 // GenBank // Mus musculus krupple-related zinc finger protein (Emzf1) mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 40 // 13 // 14 // 0 /// AF082568 // GenBank // Mus musculus zinc finger type transcription factor MZF-3 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// BC057078 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 316, mRNA (cDNA clone MGC:67468 IMAGE:5698016), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NM_017467 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 316 (Zfp316), mRNA. // chr5 // 94 // 94 // 33 // 35 // 1 /// ENSMUST00000161448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:143249697:143270022:-1 gene:ENSMUSG00000046658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 94 // 33 // 35 // 1 /// GENSCAN00000028911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143238761:143269833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000061947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:143397248:143399563:-1 gene:ENSMUSG00000045345 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK035496 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530056K15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009007 // RefSeq // Mus musculus RAS-related C3 botulinum substrate 1 (Rac1), mRNA. // chr5 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000080537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:143505478:143528036:-1 gene:ENSMUSG00000001847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000100489 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:143505482:143527993:-1 gene:ENSMUSG00000001847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC003828 // GenBank // Mus musculus RAS-related C3 botulinum substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:6235 IMAGE:3593957), complete cds. // chr5 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// BC051053 // GenBank // Mus musculus RAS-related C3 botulinum substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:58966 IMAGE:5038182), complete cds. // chr5 // 64 // 74 // 9 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143506975:143528209:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_029749 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 42 (Usp42), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006504756 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin specific peptidase 42 (Usp42), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000053287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:143710325:143732280:-1 gene:ENSMUSG00000051306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000155408 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:143716404:143728017:-1 gene:ENSMUSG00000051306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AY336567 // GenBank // Mus musculus cell-type embryonic stem cell DUB1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// BC137852 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 42, mRNA (cDNA clone MGC:169476 IMAGE:8860871), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143711329:143767072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
XM_006504858 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 61 (Ankrd61), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006504859 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 61 (Ankrd61), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000079624 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:143890741:143895030:-1 gene:ENSMUSG00000029607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC052346 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921520G13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58183 IMAGE:6703467), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_025732 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 61 (Ankrd61), mRNA. // chr5 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// ENSMUST00000110717 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:143890741:143895067:-1 gene:ENSMUSG00000029607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// ENSMUST00000110718 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:143890743:143897685:-1 gene:ENSMUSG00000029607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// AK146023 // GenBank HTC // Mus musculus 14 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530024M23 product:hypothetical Ankyrin/Ankyrin repeat profile/Ankyrin repeat region circular profile containing protein, full insert sequence. // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000008313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143890890:143894984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
NM_177682 // RefSeq // Mus musculus CCZ1 vacuolar protein trafficking and biogenesis associated (Ccz1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006504824 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CCZ1 vacuolar protein trafficking and biogenesis associated (Ccz1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000031621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:143987916:144014853:-1 gene:ENSMUSG00000029617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC048077 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AU022870, mRNA (cDNA clone MGC:56855 IMAGE:6308253), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:143988194:144014812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_033039 // RefSeq // Mus musculus oncomodulin (Ocm), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504809 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus oncomodulin (Ocm), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504810 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus oncomodulin (Ocm), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006504811 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus oncomodulin (Ocm), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:144019804:144026599:-1 gene:ENSMUSG00000029618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:144020076:144025706:-1 gene:ENSMUSG00000029618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000110702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:144024440:144026670:-1 gene:ENSMUSG00000029618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000008301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:144019933:144025706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_025833 // RefSeq // Mus musculus BAI1-associated protein 2-like 1 (Baiap2l1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006504860 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BAI1-associated protein 2-like 1 (Baiap2l1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:144264526:144358112:-1 gene:ENSMUSG00000038859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000129287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:144281990:144288907:-1 gene:ENSMUSG00000038859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC015459 // GenBank // Mus musculus BAI1-associated protein 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:8269 IMAGE:3592632), complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// AK162158 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420442G03 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000008337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:144265957:144334987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000121256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:144723627:144723797:-1 gene:ENSMUSG00000082524 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:144723627:144768659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT055218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT055219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_177735 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 130 (Tmem130), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000061446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:144735915:144761649:-1 gene:ENSMUSG00000043388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC067004 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 130, mRNA (cDNA clone MGC:90040 IMAGE:6416222), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC127616 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 130, mRNA (cDNA clone MGC:157450 IMAGE:40093666), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC127617 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 130, mRNA (cDNA clone MGC:157451 IMAGE:40093667), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:144723627:144768659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001038627 // RefSeq // Mus musculus SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 (Smurf1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// NM_029438 // RefSeq // Mus musculus SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 (Smurf1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006504883 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 (Smurf1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000085684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:144876502:144965847:-1 gene:ENSMUSG00000038780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000100461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:5:144879111:144965847:-1 gene:ENSMUSG00000038780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000110677 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:144876495:144965839:-1 gene:ENSMUSG00000038780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000126822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:144876495:144886476:-1 gene:ENSMUSG00000038780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 44 // 18 // 18 // 0 /// AK122534 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1625 protein. // chr5 // 100 // 39 // 16 // 16 // 0 /// BC029097 // GenBank // Mus musculus SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, mRNA (cDNA clone MGC:28022 IMAGE:3660965), complete cds. // chr5 // 89 // 90 // 33 // 37 // 0 /// GENSCAN00000052944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:144879357:145035698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 78 // 32 // 41 // 1
NM_001013774 // RefSeq // Mus musculus karyopherin alpha 7 (importin alpha 8) (Kpna7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110672 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:144983727:145009633:-1 gene:ENSMUSG00000038770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110673 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:5:144983519:145010643:-1 gene:ENSMUSG00000038770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000116454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:144985690:145008028:-1 gene:ENSMUSG00000038770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AY950703 // GenBank // Mus musculus importin alpha 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FJ717332 // GenBank // Mus musculus Kpna2-like protein transcript variant 1 (AW146299) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// FJ717333 // GenBank // Mus musculus Kpna2-like protein transcript variant 2 (AW146299) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:144879357:145035698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001101463 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4871 (Gm4871), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000071421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:145029600:145032764:-1 gene:ENSMUSG00000061707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001033313 // RefSeq // Mus musculus PDGFA associated protein 1 (Pdap1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000031627 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145128769:145140238:-1 gene:ENSMUSG00000029623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC114598 // GenBank // Mus musculus PDGFA associated protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40050250), partial cds. // chr5 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC139204 // GenBank // Mus musculus PDGFA associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170831 IMAGE:8862226), complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC139205 // GenBank // Mus musculus PDGFA associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170832 IMAGE:8862227), complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000123111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:145130084:145136696:-1 gene:ENSMUSG00000029623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// AK161518 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933439M14 product:28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein (PDGF-associated protein) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr5 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// ENSMUST00000143439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:145131371:145135472:-1 gene:ENSMUSG00000029623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000052961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145130317:145139979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NM_133735 // RefSeq // Mus musculus pentatricopeptide repeat domain 1 (Ptcd1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145147514:145167108:-1 gene:ENSMUSG00000029624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC004766 // GenBank // Mus musculus pentatricopeptide repeat domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:7042 IMAGE:3156304), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083097 // GenBank // Mus musculus pentatricopeptide repeat domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:102367 IMAGE:30459747), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK172986 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0632 protein. // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000052943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145148332:145165507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC021349 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3985822, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_020582 // RefSeq // Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit F2 (Atp5j2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000037056 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:145183709:145191592:-1 gene:ENSMUSG00000038690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000161741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145183698:145192062:-1 gene:ENSMUSG00000038690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000162360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:145183706:145191592:-1 gene:ENSMUSG00000038690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AB030192 // GenBank // Mus musculus mRNA, complete cds, clone:2-31. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC029226 // GenBank // Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit f, isoform 2, mRNA (cDNA clone MGC:35884 IMAGE:2651401), complete cds. // chr5 // 92 // 72 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000052955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145183839:145201675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
NM_023322 // RefSeq // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 14 (Zkscan14), mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504861 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 14 (Zkscan14), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000031632 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145194946:145201868:-1 gene:ENSMUSG00000029627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000162220 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:145195623:145201857:-1 gene:ENSMUSG00000029627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC027512 // GenBank // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 14, mRNA (cDNA clone IMAGE:1382742), complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// BC099448 // GenBank // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 14, mRNA (cDNA clone IMAGE:30936822), complete cds. // chr5 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// BC141244 // GenBank // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 14, mRNA (cDNA clone MGC:176205 IMAGE:9055856), complete cds. // chr5 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// U62906 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 94 (Zfp94) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145183839:145201675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0
NM_007820 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 16 (Cyp3a16), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006504799 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 16 (Cyp3a16), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000031633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145436309:145469723:-1 gene:ENSMUSG00000038656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC113143 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 16, mRNA (cDNA clone MGC:130513 IMAGE:40047455), complete cds. // chr5 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// D26137 // GenBank // Mus musculus mRNA for cytochrome P450IIIA, complete cds. // chr5 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145436441:145469640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0
NM_177380 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 44 (Cyp3a44), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000067479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145773983:145805874:-1 gene:ENSMUSG00000054417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AB039380 // GenBank // Mus musculus mRNA for cytochrome P450, CYP3A, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC125522 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 44, mRNA (cDNA clone MGC:159225 IMAGE:40130037), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000052960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145742845:145805789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
NM_007818 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 11 (Cyp3a11), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000035918 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145854426:145879964:-1 gene:ENSMUSG00000056035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK149433 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730009I07 product:cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 11, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC010528 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 11, mRNA (cDNA clone MGC:18636 IMAGE:4194909), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC094062 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 11, mRNA (cDNA clone MGC:103178 IMAGE:4162188), complete cds. // chr5 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:145855067:145879776:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1
NM_019792 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 25 (Cyp3a25), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_030782 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 25 (Cyp3a25), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000068317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:145977196:146009617:-1 gene:ENSMUSG00000029630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000145062 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:145977194:146009618:-1 gene:ENSMUSG00000029630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AF204959 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 3A25 (CYP3A25) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC028855 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 25, mRNA (cDNA clone MGC:30226 IMAGE:5124151), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// Y11995 // GenBank // M.musculus mRNA for cytochrome P450IIIA25. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006504848 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 25 (Cyp3a25), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
ENSMUST00000073721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:146182441:146185304:-1 gene:ENSMUSG00000095040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC048528 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700001J03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58441 IMAGE:6774214), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000188052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:146182450:146184295:-1 gene:ENSMUSG00000095040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:146150457:146189089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NM_008151 // RefSeq // Mus musculus G-protein coupled receptor 12 (Gpr12), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC055746 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 12, mRNA (cDNA clone MGC:67082 IMAGE:6415225), complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// D21061 // GenBank // Mus musculus GPCR01 mRNA for G protein-coupled receptor, complete cds. // chr5 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NM_001010941 // RefSeq // Mus musculus G-protein coupled receptor 12 (Gpr12), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// ENSMUST00000036211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:146582151:146585239:-1 gene:ENSMUSG00000041468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// GENSCAN00000012163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:146583106:146584110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 38 // 9 // 11 // 0
NM_011669 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 12 (Usp12), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000085614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:146734809:146795006:-1 gene:ENSMUSG00000029640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000138202 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:146734839:146758448:-1 gene:ENSMUSG00000029640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC049274 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 12, mRNA (cDNA clone MGC:55011 IMAGE:4500832), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC068136 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 12, mRNA (cDNA clone MGC:92964 IMAGE:30363916), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// AF441835 // GenBank // Mus musculus deubiquitinating enzyme UBH1 mRNA, complete cds. // chr5 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// AK006739 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700049F20 product:ubiquitin hydrolyzing enzyme 1, full insert sequence. // chr5 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// ENSMUST00000124009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:146740431:146758456:-1 gene:ENSMUSG00000029640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// GENSCAN00000012164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:146737679:146770302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
AK156599 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830032C11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 73 // 100 // 22 // 30 // 0
NM_080795 // RefSeq // Mus musculus ligand of numb-protein X 2 (Lnx2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000016664 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:147016655:147076586:-1 gene:ENSMUSG00000016520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF401681 // GenBank // Mus musculus LNX2 mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC090665 // GenBank // Mus musculus ligand of numb-protein X 2, mRNA (cDNA clone MGC:115947 IMAGE:30686384), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC117937 // GenBank // Mus musculus ligand of numb-protein X 2, mRNA (cDNA clone MGC:144107 IMAGE:40097802), complete cds. // chr5 // 76 // 91 // 22 // 29 // 0 /// BC117938 // GenBank // Mus musculus ligand of numb-protein X 2, mRNA (cDNA clone MGC:144108 IMAGE:40097810), complete cds. // chr5 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:146956035:147042440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_007673 // RefSeq // Mus musculus caudal type homeobox 2 (Cdx2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:147300805:147307270:-1 gene:ENSMUSG00000029646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK049574 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430044A20 product:caudal type homeo box 2, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC103516 // GenBank // Mus musculus caudal type homeo box 2, mRNA (cDNA clone MGC:123366 IMAGE:40039012), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC103517 // GenBank // Mus musculus caudal type homeo box 2, mRNA (cDNA clone MGC:123367 IMAGE:40039015), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC103519 // GenBank // Mus musculus caudal type homeo box 2, mRNA (cDNA clone MGC:123369 IMAGE:40039019), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC103520 // GenBank // Mus musculus caudal type homeo box 2, mRNA (cDNA clone MGC:123368 IMAGE:40039017), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT055303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000032735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:147301842:147400746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001039678 // RefSeq // Mus musculus ureidoimidazoline (2-oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5) decarboxylase (Urad), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000100433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:147314984:147322440:-1 gene:ENSMUSG00000075543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147779 // GenBank // Mus musculus parahox cluster neighbor, mRNA (cDNA clone MGC:182885 IMAGE:9087499), complete cds. // chr5 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC147790 // GenBank // Mus musculus parahox cluster neighbor, mRNA (cDNA clone MGC:182894 IMAGE:9087508), complete cds. // chr5 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// DQ225767 // GenBank // Mus musculus OHCU decarboxylase (Urad) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:147301842:147400746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_010229 // RefSeq // Mus musculus FMS-like tyrosine kinase 3 (Flt3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504805 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FMS-like tyrosine kinase 3 (Flt3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000049324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:147330741:147400489:-1 gene:ENSMUSG00000042817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000176456 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:147330741:147400489:-1 gene:ENSMUSG00000042817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M64689 // GenBank // Mouse flk-2 mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// XM_006504804 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FMS-like tyrosine kinase 3 (Flt3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSMUST00000110549 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:147362557:147400489:-1 gene:ENSMUSG00000042817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// AK045865 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230315G04 product:FMS-like tyrosine kinase 3, full insert sequence. // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000032735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:147301842:147400746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000150411 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:148182899:148184377:-1 gene:ENSMUSG00000066554 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000050746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:148183169:148192297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_007513 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 1 (Slc7a1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504798 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 1 (Slc7a1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000048116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:148327410:148399904:-1 gene:ENSMUSG00000041313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000138257 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:148334520:148392815:-1 gene:ENSMUSG00000041313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC145779 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:175666 IMAGE:40131082), complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC145781 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:175668 IMAGE:40131084), complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// M26687 // GenBank // Mouse ecotropic retrovirus receptor (W1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:148332440:148352435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK162845 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230044O13 product:solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 1, full insert sequence. // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_011908 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-like 3 (Ubl3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000079324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:148504631:148552788:-1 gene:ENSMUSG00000001687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000164904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:148505142:148552789:-1 gene:ENSMUSG00000001687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AF044222 // GenBank // Mus musculus HCG-1 protein (HCG-1) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr5 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// AF044223 // GenBank // Mus musculus HCG-1 protein (HCG-1) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC024507 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:37460 IMAGE:4983604), complete cds. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC025595 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:36029 IMAGE:5342735), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC043729 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:49810 IMAGE:4983604), complete cds. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK160233 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810004I01 product:ubiquitin-like 3, full insert sequence. // chr5 // 67 // 78 // 14 // 21 // 0 /// GENSCAN00000050735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:148506135:148512102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AK156454 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830022H24 product:ubiquitin-like 3, full insert sequence. // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
ENSMUST00000122564 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:148753323:148753440:-1 gene:ENSMUSG00000084513 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT055360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_010439 // RefSeq // Mus musculus high mobility group box 1 (Hmgb1), mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// XM_006504807 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus high mobility group box 1 (Hmgb1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000085546 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:149046702:149053040:-1 gene:ENSMUSG00000066551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000110505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:149048228:149051300:-1 gene:ENSMUSG00000066551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NR_028061 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 8615 (Gm8615), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000025307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:149155446:149156081:-1 gene:ENSMUSG00000024437 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AF088903 // GenBank // Mus musculus glucosamine-6-phosphate isomerase mRNA, complete cds. // chr5 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// AF160355 // GenBank // Mus musculus glucosamine-6-phosphate deaminase (Gnpda) mRNA, complete cds. // chr5 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// AK186149 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0136G22, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000064028, based on BLAT search. // chr5 // 75 // 89 // 6 // 8 // 0 /// BC014800 // GenBank // Mus musculus glucosamine-6-phosphate deaminase 1, mRNA (cDNA clone MGC:25224 IMAGE:4220980), complete cds. // chr5 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// NM_011937 // RefSeq // Mus musculus glucosamine-6-phosphate deaminase 1 (Gnpda1), mRNA. // chr5 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// ENSMUST00000063814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:18:38327558:38339003:-1 gene:ENSMUSG00000052102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// GENSCAN00000050876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:149155446:149161310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000007136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:38328873:38338858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0
ENSMUST00000174933 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:149247952:149248244:-1 gene:ENSMUSG00000092674 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT055409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000082770 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:149281118:149281223:-1 gene:ENSMUSG00000064704 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT055410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001159693 // RefSeq // Mus musculus zygote arrest 1-like (Zar1l), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000118769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:5:150507055:150518164:-1 gene:ENSMUSG00000056586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FJ858201 // GenBank // Mus musculus zygotic arrest 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:150501851:150518159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000180345 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:150547313:150547453:-1 gene:ENSMUSG00000095531 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133898 // RefSeq // Mus musculus NEDD4 binding protein 2-like 1 (N4bp2l1), mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// XM_006504900 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NEDD4 binding protein 2-like 1 (N4bp2l1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000016279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:150571643:150594525:-1 gene:ENSMUSG00000041132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC019754 // GenBank // Mus musculus NEDD4 binding protein 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:25761 IMAGE:4007588), complete cds. // chr5 // 96 // 68 // 22 // 23 // 0 /// XR_377264 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NEDD4 binding protein 2-like 1 (N4bp2l1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr5 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
ENSMUST00000144378 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:150648210:150665577:-1 gene:ENSMUSG00000029655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// BC037393 // GenBank HTC // Mus musculus NEDD4 binding protein 2-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4167971). // chr5 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// NM_201369 // RefSeq // Mus musculus NEDD4 binding protein 2-like 2 (N4bp2l2), mRNA. // chr5 // 76 // 76 // 28 // 37 // 1 /// ENSMUST00000118316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:150635972:150665612:-1 gene:ENSMUSG00000029655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 28 // 37 // 1 /// ENSMUST00000145822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:150643013:150647793:-1 gene:ENSMUSG00000029655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr5 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// ENSMUST00000156180 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:150643000:150661487:-1 gene:ENSMUSG00000029655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// ENSMUST00000164332 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:5:150608007:150647519:-1 gene:ENSMUSG00000029655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr5 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// AK156115 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830008G10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr5 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// GENSCAN00000040518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:150622892:150680946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// NONMMUT055500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// NONMMUT055507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr5 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
XR_031666 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 8675 (Gm8675), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000067770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:151368864:151369172:-1 gene:ENSMUSG00000054622 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK080901 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430203H04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:151367720:151428210:-1 gene:ENSMUSG00000054622 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:151368724:151379750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
NM_001102582 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 18 (Vmn2r18), mRNA. // chr5 // 71 // 100 // 17 // 24 // 0 /// ENSMUST00000165928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:151561661:151586924:-1 gene:ENSMUSG00000091794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 100 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:151436024:151605707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 75 // 11 // 18 // 0
XR_391402 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2610021A01 gene (2610021A01Rik), misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000163475 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:41599261:41628533:1 gene:ENSMUSG00000091474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK011498 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610021A01 product:hypothetical KRAB box containing protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000174407 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:42473386:42505726:-1 gene:ENSMUSG00000092416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 93 // 13 // 26 // 0 /// BC063263 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC063263, mRNA (cDNA clone IMAGE:6417495). // chr7 // 46 // 93 // 12 // 26 // 0 /// NONMMUT060948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 46 // 100 // 13 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:42473435:42490053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:41606693:41633086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_023363 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 788 (Zfp788), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006541123 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 788 (Zfp788), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000045720 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:41633564:41650931:1 gene:ENSMUSG00000074165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000098508 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:41633577:41651534:1 gene:ENSMUSG00000074165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000100275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:41633531:41650878:1 gene:ENSMUSG00000074165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000131180 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:41633556:41648358:1 gene:ENSMUSG00000074165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000140964 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:41633558:41648997:1 gene:ENSMUSG00000074165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000170770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:41647584:41650596:1 gene:ENSMUSG00000074165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// BC027798 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810426N06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:38213 IMAGE:5323247), complete cds. // chr7 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000154942 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:41633203:41647548:1 gene:ENSMUSG00000074165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
GENSCAN00000014017 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCm38:JH584299.1:709369:711639:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014026 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCm38:JH584299.1:366271:392460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 90 // 66 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:95395165:95421383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 81 // 66 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014012 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCm38:JH584299.1:59754:85969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000028606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:94747462:94773667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// GENSCAN00000048048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:95077684:95103907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENSMUST00000099245 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:GRCm38:GL456354.1:25923:27230:-1 gene:ENSMUSG00000074720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:93908068:93908422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 76 // 65 // 13 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:94258373:94286087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000038518 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCm38:JH584298.1:123896:151760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 76 // 65 // 13 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046112 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCm38:GL456354.1:25911:53622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:94907165:94935029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 76 // 65 // 13 // 17 // 0 /// GENSCAN00000003421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:93566431:93638908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 32 // 96 // 8 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:94534849:94596090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042734 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCm38:JH584297.1:50165:111392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000003418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:93738066:93771756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
GENSCAN00000014017 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCm38:JH584299.1:709369:711639:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014026 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCm38:JH584299.1:366271:392460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:95395165:95421383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 90 // 67 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:94747462:94773667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000014012 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:GRCm38:JH584299.1:59754:85969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000048048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:95077684:95103907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5_JH584299_random // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
ENSMUST00000165001 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:41668609:41669308:-1 gene:ENSMUSG00000091004 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_026017 // RefSeq // Mus musculus CTD nuclear envelope phosphatase 1 (Ctdnep1), mRNA. // chr7 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69981156:69990601:1 gene:ENSMUSG00000018559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// BC018265 // GenBank // Mus musculus Dullard homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:25664 IMAGE:4486464), complete cds. // chr7 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69981487:69999452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 39 // 92 // 9 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:41666970:41683117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
ENSMUST00000159369 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:3993797:3996902:1 gene:ENSMUSG00000029663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000031673 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:3993797:3997436:1 gene:ENSMUSG00000029663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// NM_010314 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma transducing activity polypeptide 1 (Gngt1), mRNA. // chr6 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// XM_006504983 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma transducing activity polypeptide 1 (Gngt1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// XM_006504984 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma transducing activity polypeptide 1 (Gngt1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// XM_006504985 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma transducing activity polypeptide 1 (Gngt1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// XM_006504986 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma transducing activity polypeptide 1 (Gngt1), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// BC025929 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma transducing activity polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:28988 IMAGE:4511672), complete cds. // chr6 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// NONMMUT055564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000025177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:3994217:3996780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
NM_025331 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 11 (Gng11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:4003943:4008445:1 gene:ENSMUSG00000032766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC039062 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 11, mRNA (cDNA clone MGC:30993 IMAGE:5251683), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC040065 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 11, mRNA (cDNA clone MGC:46797 IMAGE:4486523), complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_007743 // RefSeq // Mus musculus collagen, type I, alpha 2 (Col1a2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENSMUST00000031668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:4505493:4541543:1 gene:ENSMUSG00000029661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENSMUST00000141483 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:4504814:4516419:1 gene:ENSMUSG00000029661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 19 // 9 // 10 // 0 /// BC007158 // GenBank // Mus musculus collagen, type I, alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:7369 IMAGE:3487477), complete cds. // chr6 // 100 // 98 // 51 // 51 // 0 /// BC042503 // GenBank // Mus musculus collagen, type I, alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:8017 IMAGE:3586272), complete cds. // chr6 // 100 // 98 // 51 // 51 // 0 /// ENSMUST00000148864 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:4520624:4529452:1 gene:ENSMUSG00000029661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 25 // 25 // 13 // 52 // 1 /// AK142111 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230039H13 product:procollagen, type I, alpha 2, full insert sequence. // chr6 // 25 // 25 // 13 // 52 // 1 /// ENSMUST00000155687 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:4530156:4535057:1 gene:ENSMUSG00000029661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 15 // 15 // 8 // 52 // 1 /// GENSCAN00000025183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:4504500:4547628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 47 // 47 // 0 /// NONMMUT055575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 15 // 15 // 8 // 52 // 1
NM_145398 // RefSeq // Mus musculus CAS1 domain containing 1 (Casd1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006505029 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CAS1 domain containing 1 (Casd1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000015333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:4600840:4643381:1 gene:ENSMUSG00000015189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000141359 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:4601203:4621132:1 gene:ENSMUSG00000015189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 23 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000181734 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:4601145:4635886:1 gene:ENSMUSG00000015189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 49 // 19 // 19 // 0 /// AB091829 // GenBank // Mus musculus Cas1 mRNA for O-acetyltransferase, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC018542 // GenBank // Mus musculus CAS1 domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:2649724), complete cds. // chr6 // 100 // 46 // 18 // 18 // 0 /// BC125377 // GenBank // Mus musculus CAS1 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:159080 IMAGE:40129892), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// BC125379 // GenBank // Mus musculus CAS1 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:159082 IMAGE:40129894), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000025178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:4600755:4625823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_001040611 // RefSeq // Mus musculus paternally expressed 10 (Peg10), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_130877 // RefSeq // Mus musculus paternally expressed 10 (Peg10), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000166678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:4747306:4760514:1 gene:ENSMUSG00000092035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000176204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:4747306:4760517:1 gene:ENSMUSG00000092035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000176551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:4755327:4760517:1 gene:ENSMUSG00000092035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AB091827 // GenBank // Mus musculus Peg10 mRNA for paternally expressed 10, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_023048 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 4 (Asb4), mRNA. // chr6 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000043294 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:5383386:5433022:1 gene:ENSMUSG00000042607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// BC046819 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:61185 IMAGE:5703017), complete cds. // chr6 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// BC054745 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:64746 IMAGE:6836490), complete cds. // chr6 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// BC056440 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:66833 IMAGE:5703017), complete cds. // chr6 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000183358 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:5390427:5402249:1 gene:ENSMUSG00000042607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// AK132068 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3010052E03 product:ankyrin repeat and SOCS box-containing protein 4, full insert sequence. // chr6 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000045863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:5390609:5443825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_010057 // RefSeq // Mus musculus distal-less homeobox 6 (Dlx6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031768 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:6863797:6867967:1 gene:ENSMUSG00000029754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000160937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:6863334:6868568:1 gene:ENSMUSG00000029754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:6863334:6867970:1 gene:ENSMUSG00000029754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EF535989 // GenBank // Mus musculus transcription factor Dlx6 (Dlx6) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// EF535990 // GenBank // Mus musculus truncated transcription factor Dlx6 (Dlx6) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000172943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:6863798:6865430:1 gene:ENSMUSG00000029754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:6863389:6868210:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONMMUT055665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001077713 // RefSeq // Mus musculus ACN9 homolog (S. cerevisiae) (Acn9), mRNA. // chr6 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000040826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:6956004:7042979:1 gene:ENSMUSG00000042505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC118927 // GenBank // Mus musculus ACN9 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:143504 IMAGE:40090186), complete cds. // chr6 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC118928 // GenBank // Mus musculus ACN9 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:143505 IMAGE:40090189), complete cds. // chr6 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000123848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:6956007:6965658:1 gene:ENSMUSG00000042505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// AK016986 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933430A16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000027715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:6956027:6956548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_009311 // RefSeq // Mus musculus tachykinin 1 (Tac1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006505027 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tachykinin 1 (Tac1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000090679 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:7555074:7562976:1 gene:ENSMUSG00000061762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000184986 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:7555096:7562700:1 gene:ENSMUSG00000061762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000185187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:7554879:7562977:1 gene:ENSMUSG00000061762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC117081 // GenBank // Mus musculus tachykinin 1, mRNA (cDNA clone MGC:151458 IMAGE:40126400), complete cds. // chr6 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC119122 // GenBank // Mus musculus tachykinin 1, mRNA (cDNA clone MGC:155438 IMAGE:8733871), complete cds. // chr6 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC144737 // GenBank // Mus musculus tachykinin 1, mRNA (cDNA clone MGC:178293 IMAGE:9053285), complete cds. // chr6 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// D17584 // GenBank // Mus musculus PPT-A mRNA for beta-preprotachykinin A, complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// M68908 // GenBank // Mus musculus tachykinin-A (beta-PPT-A) gene, partial cds. // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000030092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:7510420:7639381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_052993 // RefSeq // Mus musculus core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase, 1 (C1galt1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000040159 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:7844842:7872047:1 gene:ENSMUSG00000042460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF157962 // GenBank // Mus musculus core1 UDP-galactose:N-acetylgalactosamine-alpha-R beta 1,3-galactosyltransferase (C1galt1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC064767 // GenBank // Mus musculus core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase, 1, mRNA (cDNA clone MGC:76596 IMAGE:30077842), complete cds. // chr6 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// AK033924 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330117C03 product:core 1 UDP-galactose:N-acetylgalactosamine-alpha-R beta 1,3-galactosyltransferase, full insert sequence. // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000030099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:7856993:7879387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT055685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_145374 // RefSeq // Mus musculus missing oocyte, meiosis regulator, homolog (Drosophila) (Mios), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:8209222:8236274:1 gene:ENSMUSG00000042447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC020002 // GenBank // Mus musculus missing oocyte, meiosis regulator, homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:25527 IMAGE:3584335), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:8226635:8236268:1 gene:ENSMUSG00000042447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSMUST00000161134 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:8229505:8236268:1 gene:ENSMUSG00000042447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK030941 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830465M22 product:similar to WUGSC:H_DJ1159O04.1 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// AK034623 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430015H14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000002293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:8214806:8235481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT055694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_008751 // RefSeq // Mus musculus neurexophilin 1 (Nxph1), mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006505010 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurexophilin 1 (Nxph1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000060369 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:8949676:9249030:1 gene:ENSMUSG00000046178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160300 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:8948614:9249032:1 gene:ENSMUSG00000046178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AK047847 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130005L03 product:NEUREXOPHILIN 1 PRECURSOR homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC068137 // GenBank // Mus musculus neurexophilin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30534192). // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC145953 // GenBank // Mus musculus neurexophilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:175840 IMAGE:40131256), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC145955 // GenBank // Mus musculus neurexophilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:175842 IMAGE:40131258), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000162942 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:8948431:8952430:1 gene:ENSMUSG00000046178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139424 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830072F20 product:neurexophilin 1, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:8946911:8980764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSMUST00000083096 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:12742899:12743018:1 gene:ENSMUSG00000065030 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006544050 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 725 (Gm725), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:13263734:13264606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000022792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:14005954:14006358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000013252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:16237625:16338487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_207176 // RefSeq // Mus musculus testis derived transcript (Tes), mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000076654 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:17065224:17105828:1 gene:ENSMUSG00000029552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000115467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:17065149:17105823:1 gene:ENSMUSG00000029552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC003808 // GenBank // Mus musculus testis derived transcript, mRNA (cDNA clone MGC:6093 IMAGE:3589585), complete cds. // chr6 // 79 // 100 // 30 // 38 // 0 /// BC010465 // GenBank // Mus musculus testis derived transcript, mRNA (cDNA clone MGC:6092 IMAGE:3585670), complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// CT010319 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D0452D for gene Tes, Testis derived transcript; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 88 // 63 // 21 // 24 // 0 /// X78989 // GenBank // M.musculus mRNA for testin. // chr6 // 85 // 71 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:17096066:17101590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// X78990 // GenBank // M.musculus mRNA for testin2. // chr6 // 89 // 74 // 25 // 28 // 0
NM_001277756 // RefSeq // Mus musculus caveolin 2 (Cav2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000115459 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:17281327:17282684:1 gene:ENSMUSG00000000058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// AB049604 // GenBank // Mus musculus mRNA for caveolin-2, complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// AB049605 // GenBank // Mus musculus mRNA for caveolin-2 isoform, complete cds. // chr6 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// BC023095 // GenBank // Mus musculus caveolin 2, mRNA (cDNA clone MGC:28112 IMAGE:3968934), complete cds. // chr6 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// NM_016900 // RefSeq // Mus musculus caveolin 2 (Cav2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// ENSMUST00000000058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:17281185:17289115:1 gene:ENSMUSG00000000058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// AF141322 // GenBank // Mus musculus caveolin-2 mRNA, complete cds. // chr6 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// ENSMUST00000115462 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:17281359:17287438:1 gene:ENSMUSG00000000058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000024313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:17281361:17290322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0
NM_008591 // RefSeq // Mus musculus met proto-oncogene (Met), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000080469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:17491241:17571823:1 gene:ENSMUSG00000009376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000115442 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:17464038:17572229:1 gene:ENSMUSG00000009376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000115443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:17463800:17573980:1 gene:ENSMUSG00000009376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000145473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:17464107:17541412:1 gene:ENSMUSG00000009376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000152802 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:17535001:17547210:1 gene:ENSMUSG00000009376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AK148258 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370067N04 product:met proto-oncogene, full insert sequence. // chr6 // 95 // 48 // 19 // 20 // 0 /// Y00671 // GenBank // Mouse mRNA of met proto-oncogene. // chr6 // 93 // 95 // 37 // 40 // 0 /// GENSCAN00000024306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:17491241:17571823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000096101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:18824552:18825058:1 gene:ENSMUSG00000071568 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NM_025677 // RefSeq // Mus musculus tRNA splicing endonuclease 15 homolog (S. cerevisiae) (Tsen15), mRNA. // chr6 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// ENSMUST00000015124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:152370735:152386682:-1 gene:ENSMUSG00000014980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// BC024342 // GenBank // Mus musculus tRNA splicing endonuclease 15 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:35720 IMAGE:5002659), complete cds. // chr6 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// BC145701 // GenBank // Mus musculus tRNA splicing endonuclease 15 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:175588 IMAGE:40131004), complete cds. // chr6 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// GENSCAN00000032237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:18824552:18825058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_133939 // RefSeq // Mus musculus LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056398 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:18848579:18854053:1 gene:ENSMUSG00000044155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:18848641:18855751:1 gene:ENSMUSG00000044155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK154446 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630034G10 product:LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr6 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// AK167674 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530028C19 product:LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC019458 // GenBank // Mus musculus LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:28406 IMAGE:4024697), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT055893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:18832838:18914388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001167757 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 7 (Ankrd7), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_029202 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 7 (Ankrd7), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:18866318:18879586:1 gene:ENSMUSG00000029517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000115396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:18866318:18879586:1 gene:ENSMUSG00000029517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049731 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 7, mRNA (cDNA clone MGC:58743 IMAGE:6771078), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006505191 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 7 (Ankrd7), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// XM_006505192 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 7 (Ankrd7), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000032234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:18832838:18914388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
ENSMUST00000083768 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:19624609:19624715:1 gene:ENSMUSG00000065702 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT055899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000044556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:20495550:20495978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_019697 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Shal-related family, member 2 (Kcnd2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000081542 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:21215503:21729805:1 gene:ENSMUSG00000060882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB045326 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-7013, similar to Mus musculus potassium channel Kv4.2 mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF107780 // GenBank // Mus musculus potassium channel Kv4.2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AK032268 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430513P12 product:potassium channel Kv4.2 mRNA, full insert sequence. // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC079667 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Shal-related family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:90664 IMAGE:30356567), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000001312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:21666019:21743676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_053116 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 16 (Wnt16), mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:22288230:22298522:1 gene:ENSMUSG00000029671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148639 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:22288288:22294585:1 gene:ENSMUSG00000029671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// AK043534 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830006I11 product:wingless-related MMTV integration site 16, full insert sequence. // chr6 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BC115811 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 16, mRNA (cDNA clone MGC:144736 IMAGE:40105504), complete cds. // chr6 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// BC115925 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 16, mRNA (cDNA clone MGC:144735 IMAGE:40105502), complete cds. // chr6 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// XM_006505214 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus wingless-related MMTV integration site 16 (Wnt16), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// ENSMUST00000128245 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:22288227:22293579:1 gene:ENSMUSG00000029671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// AK053805 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130309I19 product:wingless-related MMTV integration site 16, full insert sequence. // chr6 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000032500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:22288507:22298231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0
NM_001081306 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type Z, polypeptide 1 (Ptprz1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000090568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:22875502:23052916:1 gene:ENSMUSG00000068748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AJ133130 // GenBank // Mus musculus mRNA for DSD-1-proteoglycan. // chr6 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC151071 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type Z, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:183984 IMAGE:9087984), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC157965 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type Z, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:189947 IMAGE:9088134), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AJ428208 // GenBank // Mus musculus mRNA for phosphacan short isoform (RPTP-beta gene). // chr6 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000014194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:22961596:23049677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
XM_006505206 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 15 (Asb15), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000117688 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:24556072:24573164:1 gene:ENSMUSG00000029685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AF403043 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain-containing SOCS box protein Asb-15 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC050794 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 15, mRNA (cDNA clone MGC:58689 IMAGE:6742480), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NM_080847 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 15 (Asb15), mRNA. // chr6 // 95 // 95 // 35 // 37 // 1 /// ENSMUST00000031696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:24528144:24570984:1 gene:ENSMUSG00000029685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// GENSCAN00000023016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:24556238:24570776:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0
NM_053098 // RefSeq // Mus musculus leiomodin 2 (cardiac) (Lmod2), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:24597771:24605414:1 gene:ENSMUSG00000029683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF237628 // GenBank // Mus musculus cardiac leiomodin mRNA, partial cds. // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000023015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:24590353:24607172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_028920 // RefSeq // Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 6 (Hyal6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:24733245:24745452:1 gene:ENSMUSG00000029679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151178 // GenBank // Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 6, mRNA (cDNA clone MGC:184078 IMAGE:9088067), complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC151179 // GenBank // Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 6, mRNA (cDNA clone MGC:184079 IMAGE:9088068), complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:24731080:24886458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_029848 // RefSeq // Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 4 (Hyal4), mRNA. // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:24748329:24767662:1 gene:ENSMUSG00000029680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB524072 // GenBank // Mus musculus CSHY mRNA for chondroitin sulfate hydrolase, complete cds. // chr6 // 95 // 61 // 19 // 20 // 0 /// BC125402 // GenBank // Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 4, mRNA (cDNA clone MGC:159105 IMAGE:40129917), complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC132096 // GenBank // Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 4, mRNA (cDNA clone MGC:163727 IMAGE:40130373), complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:24731080:24886458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_001079875 // RefSeq // Mus musculus sperm adhesion molecule 1 (Spam1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NM_009241 // RefSeq // Mus musculus sperm adhesion molecule 1 (Spam1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006505025 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sperm adhesion molecule 1 (Spam1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000031693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:24795824:24801048:1 gene:ENSMUSG00000029682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AK015325 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930435I06 product:sperm adhesion molecule, full insert sequence. // chr6 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// AY228460 // GenBank // Mus musculus sperm hyaluronidase PH-20 protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AY920282 // GenBank // Mus musculus sperm adhesion molecule 1 variant 1 (Spam1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// AY920283 // GenBank // Mus musculus sperm adhesion molecule 1 variant 2 (Spam1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// U33958 // GenBank // Mus musculus sperm protein PH-20 mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:24731080:24886458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_028957 // RefSeq // Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 5 (Hyal5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006505186 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 5 (Hyal5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000031689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:24875909:24891805:1 gene:ENSMUSG00000029678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC145992 // GenBank // Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 5, mRNA (cDNA clone MGC:175879 IMAGE:40131295), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC145994 // GenBank // Mus musculus hyaluronoglucosaminidase 5, mRNA (cDNA clone MGC:175881 IMAGE:40131297), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:24731080:24886458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000143551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:6:28215576:28218902:1 gene:ENSMUSG00000043340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK018330 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6530409C15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143099 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:28215555:28260862:1 gene:ENSMUSG00000043340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_007480 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor 5 (Arf5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000020717 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:28423560:28426602:1 gene:ENSMUSG00000020440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000169841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:28423590:28426346:1 gene:ENSMUSG00000020440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC132452 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor 5, mRNA (cDNA clone MGC:164083 IMAGE:40130729), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC138756 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor 5, mRNA (cDNA clone MGC:170383 IMAGE:8861778), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// D87902 // GenBank // Mus musculus mRNA for ARF5, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:28423689:28426158:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_019569 // RefSeq // Mus musculus fascin homolog 3, actin-bundling protein, testicular (Strongylocentrotus purpuratus) (Fscn3), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000031719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:28427789:28438622:1 gene:ENSMUSG00000029707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF176024 // GenBank // Mus musculus testis fascin (Fscn3) mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// BC050759 // GenBank // Mus musculus fascin homolog 3, actin-bundling protein, testicular (Strongylocentrotus purpuratus), mRNA (cDNA clone MGC:58240 IMAGE:6770861), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:28427769:28436203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 86 // 28 // 30 // 0
NR_029567 // RefSeq // Mus musculus microRNA 129-1 (Mir129-1), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000083535 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:29022619:29022691:1 gene:ENSMUSG00000065469 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-129-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000222 Mus musculus miR-129-1 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT056016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_008493 // RefSeq // Mus musculus leptin (Lep), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000069789 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:29060220:29073877:1 gene:ENSMUSG00000059201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169505 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:29065462:29070972:1 gene:ENSMUSG00000059201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// BC125245 // GenBank // Mus musculus leptin, mRNA (cDNA clone MGC:130559 IMAGE:40054245), complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// FJ374142 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 leptin (Lep) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// HQ166716 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J leptin mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U18812 // GenBank // Mus musculus obese precursor (ob) mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_001190461 // RefSeq // Mus musculus hypoxia inducible lipid droplet associated (Hilpda), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000115289 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:29272488:29275186:1 gene:ENSMUSG00000043421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC020081 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310016C08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28354 IMAGE:4018622), complete cds. // chr6 // 87 // 79 // 20 // 23 // 0 /// NM_023516 // RefSeq // Mus musculus hypoxia inducible lipid droplet associated (Hilpda), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000054445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:29272626:29275446:1 gene:ENSMUSG00000043421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// AF141311 // GenBank // Mus musculus hypoxia induced gene 2 (Hig2) mRNA, complete cds. // chr6 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// BC083056 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310016C08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:103106 IMAGE:5326823), complete cds. // chr6 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1
NM_001101486 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 71, member F2 (Fam71f2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000115286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:29281141:29290680:1 gene:ENSMUSG00000079652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000167131 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:29279593:29287780:1 gene:ENSMUSG00000079652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000167608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:29281143:29290675:1 gene:ENSMUSG00000079652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AB473724 // GenBank // Mus musculus GARI mRNA for Golgi-associated Rab2B interactor, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC151115 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 71, member F2, mRNA (cDNA clone MGC:184028 IMAGE:9088028), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC151117 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 71, member F2, mRNA (cDNA clone MGC:184030 IMAGE:9088030), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:29216041:29290518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001081185 // RefSeq // Mus musculus filamin C, gamma (Flnc), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000065090 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:29433276:29461849:1 gene:ENSMUSG00000068699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000090474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:29433153:29461888:1 gene:ENSMUSG00000068699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000101617 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:29433276:29461849:1 gene:ENSMUSG00000068699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// BC151097 // GenBank // Mus musculus filamin C, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:184010 IMAGE:9088010), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// BC158128 // GenBank // Mus musculus filamin C, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:189896 IMAGE:9007396), complete cds. // chr6 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000047122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:29396685:29461209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0
NM_025381 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit F (Atp6v1f), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000004396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:29467718:29470512:1 gene:ENSMUSG00000004285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000143101 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:29468068:29470512:1 gene:ENSMUSG00000004285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AK152929 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830091G12 product:ATPase, H+ transporting, V1 subunit F, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC016553 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit F, mRNA (cDNA clone MGC:29006 IMAGE:2812592), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505160 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit F (Atp6v1f), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSMUST00000149646 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:29468068:29470512:1 gene:ENSMUSG00000004285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000047117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:29467817:29470268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:74329533:74332529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001252382 // RefSeq // Mus musculus interferon regulatory factor 5 (Irf5), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_012057 // RefSeq // Mus musculus interferon regulatory factor 5 (Irf5), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006505094 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interferon regulatory factor 5 (Irf5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006505097 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interferon regulatory factor 5 (Irf5), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000004392 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:29526625:29537319:1 gene:ENSMUSG00000029771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163511 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:29529282:29537319:1 gene:ENSMUSG00000029771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000164922 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:29531248:29535346:1 gene:ENSMUSG00000029771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// AF028725 // GenBank // Mus musculus interferon regulatory factor 5 (mirf5) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK171356 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730038M10 product:interferon regulatory factor 5, full insert sequence. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// EU401974 // GenBank // Mus musculus interferon regulatory factor 5 bone marrow variant (Irf5) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000047113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:29526659:29536785:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_146173 // RefSeq // Mus musculus tetraspanin 33 (Tspan33), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000046750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:29694222:29718559:1 gene:ENSMUSG00000001763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000115250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:29694234:29718557:1 gene:ENSMUSG00000001763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF276890 // GenBank // Mus musculus penumbra mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC024685 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 33, mRNA (cDNA clone MGC:30714 IMAGE:3981492), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000137925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:29708028:29714822:1 gene:ENSMUSG00000001763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// AK162631 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830131H02 product:Similar to transmembrane 4 superfamily member (Tetraspan NET-7) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// GENSCAN00000047118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:29694443:29717638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_176996 // RefSeq // Mus musculus smoothened homolog (Drosophila) (Smo), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006505106 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus smoothened homolog (Drosophila) (Smo), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000001812 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:29735694:29761365:1 gene:ENSMUSG00000001761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048091 // GenBank // Mus musculus smoothened homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:57078 IMAGE:6486595), complete cds. // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC096028 // GenBank // Mus musculus smoothened homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:106446 IMAGE:6850065), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:29736011:29760285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000083144 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:29963555:29963661:1 gene:ENSMUSG00000065078 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_040263 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700023L04 gene (1700023L04Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_040264 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700023L04 gene (1700023L04Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:29985329:29993530:1 gene:ENSMUSG00000045709 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:29985331:29993776:1 gene:ENSMUSG00000045709 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT056073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT056074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
ENSMUST00000083728 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:30379101:30379214:1 gene:ENSMUSG00000065662 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029373 // RefSeq // Mus musculus serine-rich single-pass membrane protein 1 (Ssmem1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// XM_006505193 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine-rich single-pass membrane protein 1 (Ssmem1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000031798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:30512286:30520254:1 gene:ENSMUSG00000029784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NM_027073 // RefSeq // Mus musculus serine-rich single-pass membrane protein 1 (Ssmem1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 71 // 71 // 27 // 38 // 1 /// ENSMUST00000031797 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:30509849:30520253:1 gene:ENSMUSG00000029784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 27 // 38 // 1 /// BC049755 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700025E21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58810 IMAGE:6773255), complete cds. // chr6 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// ENSMUST00000131485 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:30513698:30519544:1 gene:ENSMUSG00000029784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
NM_001024698 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase A2, pancreatic (Cpa2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000096066 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:30541582:30564476:1 gene:ENSMUSG00000071553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000126426 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:30543916:30552056:1 gene:ENSMUSG00000071553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000131137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:30541670:30547110:1 gene:ENSMUSG00000071553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000144282 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:30551903:30564248:1 gene:ENSMUSG00000071553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC094929 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase A2, pancreatic, mRNA (cDNA clone MGC:107514 IMAGE:6434004), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000146936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:30544485:30549285:1 gene:ENSMUSG00000071553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// ENSMUST00000151684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:30543277:30547206:1 gene:ENSMUSG00000071553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000040125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:30541665:30564425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0
NM_027926 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase A4 (Cpa4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006505168 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxypeptidase A4 (Cpa4), transcript variant X1, partial mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000049251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:30568369:30592418:1 gene:ENSMUSG00000039070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC061206 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase A4, mRNA (cDNA clone MGC:74350 IMAGE:30249166), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:30568394:30590967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
NM_144537 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase A5 (Cpa5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000062758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:30611010:30631745:1 gene:ENSMUSG00000029788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000115138 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:30611051:30631520:1 gene:ENSMUSG00000029788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000115139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:30612188:30631743:1 gene:ENSMUSG00000029788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000165949 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:30612555:30631436:1 gene:ENSMUSG00000029788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// AF466283 // GenBank // Mus musculus metallocarboxypeptidase A5 mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC138114 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase A5, mRNA (cDNA clone MGC:169738 IMAGE:8861133), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:30610205:30631399:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NM_025350 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase A1, pancreatic (Cpa1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:30639218:30645363:1 gene:ENSMUSG00000054446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000139004 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:30640341:30641874:1 gene:ENSMUSG00000054446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC052661 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase A1, mRNA (cDNA clone MGC:60748 IMAGE:30050094), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:30639464:30645286:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NR_029900 // RefSeq // Mus musculus microRNA 335 (Mir335), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000083567 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:30741299:30741396:1 gene:ENSMUSG00000065501 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-335 // miRBase Micro RNA Database // MI0000817 Mus musculus miR-335 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT056126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000031778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:6:32050246:32058921:1 gene:ENSMUSG00000029766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:32050268:32058921:1 gene:ENSMUSG00000029766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC059718 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6774444). // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC087908 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107242 IMAGE:6774051), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_028886 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich repeats and guanylate kinase domain containing (Lrguk), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000070189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:34029448:34134034:1 gene:ENSMUSG00000056215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000101564 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:34029450:34047378:1 gene:ENSMUSG00000056215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// AK045903 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230320P20 product:hypothetical L domain-like structure containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// XM_006506713 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine-rich repeats and guanylate kinase domain containing (Lrguk), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 68 // 68 // 30 // 44 // 1 /// GENSCAN00000030663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:33955320:34133448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 80 // 35 // 44 // 1
NM_008012 // RefSeq // Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member B8 (Akr1b8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000038406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:34354119:34368463:1 gene:ENSMUSG00000029762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000133370 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:34356115:34365239:1 gene:ENSMUSG00000029762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC005789 // GenBank // Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member B8, mRNA (cDNA clone MGC:11661 IMAGE:3603424), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// U04204 // GenBank // Mus musculus BALB/c aldose reductase-related protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:34354069:34368168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
NM_172398 // RefSeq // Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member B10 (aldose reductase) (Akr1b10), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000038383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:34384218:34396950:1 gene:ENSMUSG00000061758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000115051 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:34384281:34396748:1 gene:ENSMUSG00000061758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000144384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:34384249:34389579:1 gene:ENSMUSG00000061758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// BC026843 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310005E10 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4487182), complete cds. // chr6 // 82 // 41 // 9 // 11 // 0 /// ENSMUST00000139156 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:34384281:34396947:1 gene:ENSMUSG00000061758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// BC037690 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310005E10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:46975 IMAGE:3661180), complete cds. // chr6 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:34384342:34400845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_009731 // RefSeq // Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member B7 (Akr1b7), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000007449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:34412334:34423142:1 gene:ENSMUSG00000052131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086929 // GenBank // Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member B7, mRNA (cDNA clone MGC:107658 IMAGE:6775941), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// J05663 // GenBank // Mouse vas deferens androgen related protein (MVDP) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:34412410:34422888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_007563 // RefSeq // Mus musculus 2,3-bisphosphoglycerate mutase (Bpgm), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:34476207:34505613:1 gene:ENSMUSG00000038871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006315 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700024P22 product:2,3-bisphosphoglycerate mutase, full insert sequence. // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC004589 // GenBank // Mus musculus 2,3-bisphosphoglycerate mutase, mRNA (cDNA clone MGC:6263 IMAGE:3587820), complete cds. // chr6 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// XM_006505412 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 2,3-bisphosphoglycerate mutase (Bpgm), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000135743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:34476356:34489083:1 gene:ENSMUSG00000038871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// AK037239 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A030012J18 product:2,3-bisphosphoglycerate mutase, full insert sequence. // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:34487350:34504449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_197986 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 140 (Tmem140), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506540 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 140 (Tmem140), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006506541 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 140 (Tmem140), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000074949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:34863146:34874946:1 gene:ENSMUSG00000057137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC023802 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 140, mRNA (cDNA clone MGC:38515 IMAGE:5352975), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC020080 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 140, mRNA (cDNA clone MGC:28217 IMAGE:3990521), complete cds. // chr6 // 71 // 84 // 15 // 21 // 0 /// NONMMUT056329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_009292 // RefSeq // Mus musculus stimulated by retinoic acid gene 8 (Stra8), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:34920163:34939344:1 gene:ENSMUSG00000029848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114997 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:34921010:34939342:1 gene:ENSMUSG00000029848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000114999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:34920960:34939342:1 gene:ENSMUSG00000029848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185102 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:34921004:34933145:1 gene:ENSMUSG00000029848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC103590 // GenBank // Mus musculus stimulated by retinoic acid gene 8, mRNA (cDNA clone MGC:124088 IMAGE:40045824), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC103591 // GenBank // Mus musculus stimulated by retinoic acid gene 8, mRNA (cDNA clone MGC:124087 IMAGE:40045823), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:34927725:34938144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
NM_027513 // RefSeq // Mus musculus nucleoporin 205 (Nup205), mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000043815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:35177430:35247449:1 gene:ENSMUSG00000038759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AK014419 // GenBank HTC // Mus musculus 18 days pregnant adult female placenta and extra embryonic tissue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3830404O05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 93 // 33 // 13 // 14 // 0 /// AK087717 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330010J03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// AK129093 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0225 protein. // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC060223 // GenBank // Mus musculus nucleoporin 205, mRNA (cDNA clone IMAGE:30356866). // chr6 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// BC141333 // GenBank // Mus musculus nucleoporin 205, mRNA (cDNA clone MGC:176294 IMAGE:9055945), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000051528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:35177632:35247413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0
NR_015608 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810058I24 gene (1810058I24Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NR_027875 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810058I24 gene (1810058I24Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000130875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:35252716:35261637:1 gene:ENSMUSG00000073155 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000136110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:35252732:35262022:1 gene:ENSMUSG00000073155 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000152147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:35252654:35263496:1 gene:ENSMUSG00000073155 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT056355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NR_030524 // RefSeq // Mus musculus microRNA 490 (Mir490), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093567 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:36421742:36421825:1 gene:ENSMUSG00000070075 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-490 // miRBase Micro RNA Database // MI0005002 Mus musculus miR-490 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_203491 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, muscarinic 2, cardiac (Chrm2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506137 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cholinergic receptor, muscarinic 2, cardiac (Chrm2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:36388084:36528414:1 gene:ENSMUSG00000045613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:36473369:36528749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000031863 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:36937048:36985784:1 gene:ENSMUSG00000029837 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK007169 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700111E14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_145364 // RefSeq // Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member D1 (Akr1d1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006505826 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member D1 (Akr1d1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006505827 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member D1 (Akr1d1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000040987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:37530173:37568815:1 gene:ENSMUSG00000038641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151256 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:37530222:37554506:1 gene:ENSMUSG00000038641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 37 // 8 // 10 // 0 /// BC018333 // GenBank // Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member D1, mRNA (cDNA clone MGC:25814 IMAGE:4162788), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006505828 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member D1 (Akr1d1), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:37552368:37566921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:37410486:37542391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_029921 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 213 (Tmem213), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000031851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:38109353:38115806:1 gene:ENSMUSG00000029829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC104374 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 213, mRNA (cDNA clone MGC:129460 IMAGE:40049947), complete cds. // chr6 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC104375 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 213, mRNA (cDNA clone MGC:129461 IMAGE:40049948), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC119477 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 213, mRNA (cDNA clone MGC:141049 IMAGE:40049949), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:38109444:38115718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
GENSCAN00000029989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:38212443:38284837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
NM_025363 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1110001J03 gene (1110001J03Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000019833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:38534823:38539449:1 gene:ENSMUSG00000019689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC059710 // GenBank // Mus musculus formation of mitochondrial complexes 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:74060 IMAGE:6539235), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000147651 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:38533502:38539448:1 gene:ENSMUSG00000019689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000029992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:38534873:38599890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONMMUT056465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001101507 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 2, member L (Clec2l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:38663069:38680864:1 gene:ENSMUSG00000079598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:38663236:38677613:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NR_045813 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930599N23 gene (4930599N23Rik), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:39118408:39119955:1 gene:ENSMUSG00000073144 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:39118473:39148312:1 gene:ENSMUSG00000073144 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK042039 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630054A15 product:Hypothetical arginine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_011226 // RefSeq // Mus musculus RAB19, member RAS oncogene family (Rab19), mRNA. // chr6 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// XM_006505760 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB19, member RAS oncogene family (Rab19), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 88 // 65 // 21 // 24 // 0 /// ENSMUST00000031986 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:39381175:39390380:1 gene:ENSMUSG00000029923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// AB232613 // GenBank // Mus musculus Rab19 mRNA for Rab19, complete cds. // chr6 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0 /// BC032936 // GenBank // Mus musculus RAB19, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:41730 IMAGE:1379043), complete cds. // chr6 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:39383819:39389806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0
XR_403300 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10244 (Gm10244), misc_RNA. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000090237 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:39420378:39421294:1 gene:ENSMUSG00000068601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB106871 // GenBank // Mus musculus AnMKRN1 mRNA for hypothetical protein, complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:39419887:39420902:1 gene:ENSMUSG00000068601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT056525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_178873 // RefSeq // Mus musculus aarF domain containing kinase 2 (Adck2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000051249 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:39573964:39587752:1 gene:ENSMUSG00000046947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000140364 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:39573873:39588769:1 gene:ENSMUSG00000046947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000149304 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:39576392:39582089:1 gene:ENSMUSG00000046947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC069944 // GenBank // Mus musculus aarF domain containing kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:78248 IMAGE:30446117), complete cds. // chr6 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000145788 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:39573959:39584062:1 gene:ENSMUSG00000046947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000042004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:39572112:39587509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_001004182 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 178B (Tmem178b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40110251:40248437:1 gene:ENSMUSG00000057716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023538 // RefSeq // Mus musculus acylglycerol kinase (Agk), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000031977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:40325478:40396762:1 gene:ENSMUSG00000029916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000178288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:89577155:89578413:-1 gene:ENSMUSG00000094463 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 91 // 95 // 32 // 35 // 0 /// AY772469 // GenBank // Mus musculus multi-substrate lipid kinase mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC019145 // GenBank // Mus musculus acylglycerol kinase, mRNA (cDNA clone MGC:29378 IMAGE:5051535), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC093525 // GenBank // Mus musculus acylglycerol kinase, mRNA (cDNA clone MGC:102619 IMAGE:5151866), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AK011715 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610037M15 product:RIKEN cDNA 2610037M15 gene, full insert sequence. // chr6 // 46 // 46 // 17 // 37 // 1 /// AK155346 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630221J19 product:Putative lipid kinase homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// GENSCAN00000000898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:89577155:89578146:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40234437:40396313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1
NM_201370 // RefSeq // Mus musculus WEE1 homolog 2 (S. pombe) (Wee2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506326 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WEE1 homolog 2 (S. pombe) (Wee2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000038907 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40442863:40466813:1 gene:ENSMUSG00000037159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052883 // GenBank // Mus musculus WEE1 homolog 2 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:60753 IMAGE:30053490), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC080784 // GenBank // Mus musculus WEE1 homolog 2 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:91129 IMAGE:30481521), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// DQ011691 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J Wee1B protein kinase mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40443978:40494485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_028358 // RefSeq // Mus musculus single-stranded DNA binding protein 1 (Ssbp1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000031971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40471415:40478587:1 gene:ENSMUSG00000029911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// NM_001286663 // RefSeq // Mus musculus single-stranded DNA binding protein 1 (Ssbp1), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// NM_001286664 // RefSeq // Mus musculus single-stranded DNA binding protein 1 (Ssbp1), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// NM_212468 // RefSeq // Mus musculus single-stranded DNA binding protein 1 (Ssbp1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// XM_006506328 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus single-stranded DNA binding protein 1 (Ssbp1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// ENSMUST00000114779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40471352:40481823:1 gene:ENSMUSG00000029911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// BC028648 // GenBank // Mus musculus single-stranded DNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:41439 IMAGE:1314987), complete cds. // chr6 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_001025385 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 137 (Tas2r137), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:40491238:40492239:1 gene:ENSMUSG00000052850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020502 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 108 (Tas2r108), mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:40493592:40494485:1 gene:ENSMUSG00000037140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AY916507 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 T2R108 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC116952 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 108, mRNA (cDNA clone MGC:151329 IMAGE:40126271), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40443978:40494485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
AK044970 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130016L16 product:hypothetical Zn-finger, CCHC type/Zinc finger CCHC-type profile containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146383 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 460 (Olfr460), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:40571357:40572417:1 gene:ENSMUSG00000045514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC119048 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 460, mRNA (cDNA clone MGC:155364 IMAGE:8733797), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC120738 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 460, mRNA (cDNA clone MGC:155975 IMAGE:40129661), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000026631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40562884:40572332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_001171003 // RefSeq // Mus musculus maltase-glucoamylase (Mgam), mRNA. // chr6 // 79 // 97 // 27 // 34 // 0 /// ENSMUST00000071535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:40628831:40769123:1 gene:ENSMUSG00000068587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 97 // 27 // 34 // 0 /// EU937529 // GenBank // Mus musculus maltase-glucoamylase (Mgam) mRNA, complete cds. // chr6 // 79 // 97 // 27 // 34 // 0 /// GENSCAN00000026626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40626656:40868164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
GENSCAN00000026626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40626656:40868164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000103262 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:40891296:40891885:1 gene:ENSMUSG00000076461 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK138971 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530039M09 product:T-cell receptor beta, variable 13, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// X02780 // GenBank // Mouse mRNA fragment for T-cell receptor beta-chain (AR1) V, D and J segments from T(C)-cells. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// X03762 // GenBank // Mouse mRNA for T-cell receptor beta chain V-D-J (BDFL beta I). // chr6 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000026640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40891296:40891976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001102660 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 2663 (Gm2663), mRNA. // chr6 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// NM_023707 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810009J06 gene (1810009J06Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000076638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:40964772:40968427:1 gene:ENSMUSG00000094808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000166306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:40995822:40999479:-1 gene:ENSMUSG00000096525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// BC132243 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810009J06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163874 IMAGE:40130520), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC132245 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810009J06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163876 IMAGE:40130522), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40964789:40968332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:40995928:40999459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 94 // 25 // 30 // 0
ENSMUST00000103281 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:41271403:41271881:1 gene:ENSMUSG00000076480 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X00696 // GenBank // Murine mRNA for beta-subunit of T-cell receptor. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41259377:41271921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_009430 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 2 (Prss2), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:41521787:41525079:1 gene:ENSMUSG00000057163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC064796 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6433230). // chr6 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000011317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41521804:41548750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_011646 // RefSeq // Mus musculus trypsin 4 (Try4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000031913 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:41302269:41305532:1 gene:ENSMUSG00000054106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC061135 // GenBank // Mus musculus trypsin 4, mRNA (cDNA clone MGC:74265 IMAGE:30306436), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000011288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41302285:41305488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001038996 // RefSeq // Mus musculus trypsin 10 (Try10), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000072103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:41354105:41357944:1 gene:ENSMUSG00000071521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC138698 // GenBank // Mus musculus trypsin 10, mRNA (cDNA clone MGC:170325 IMAGE:8861720), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC146017 // GenBank // Mus musculus trypsin 10, mRNA (cDNA clone MGC:175904 IMAGE:40131320), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000011314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41354192:41357882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001038997 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5771 (Gm5771), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000049079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:41392356:41397256:1 gene:ENSMUSG00000058119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000011297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41392389:41419592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001003664 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 5409 (Gm5409), mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000160346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:41416912:41419589:1 gene:ENSMUSG00000059014 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000011297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41392389:41419592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
NM_001146351 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor B6 (Ephb6), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_007680 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor B6 (Ephb6), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006505506 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Eph receptor B6 (Ephb6), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// XR_377419 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Eph receptor B6 (Ephb6), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000114732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:41605482:41620509:1 gene:ENSMUSG00000029869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC031924 // GenBank // Mus musculus Eph receptor B6, mRNA (cDNA clone MGC:25301 IMAGE:4911959), complete cds. // chr6 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// L77867 // GenBank // Mus musculus MEP mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000011282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41613559:41620082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0
XM_006506737 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700034O15 gene (1700034O15Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000031900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:41684431:41685717:1 gene:ENSMUSG00000029867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048592 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034O15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58639 IMAGE:6707911), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41684518:41685390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_008843 // RefSeq // Mus musculus prolactin induced protein (Pip), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:41847549:41852062:1 gene:ENSMUSG00000058499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB017907 // GenBank // Mus musculus mRNA for gross cystic disease fluid protein 15, complete cds. // chr6 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC028889 // GenBank // Mus musculus prolactin induced protein, mRNA (cDNA clone MGC:18623 IMAGE:4165968), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// X02510 // GenBank // Mouse mRNA for sub-maxillary gland glycoprotein (pSMG143 family). // chr6 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// BC018264 // GenBank // Mus musculus prolactin induced protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:4187458), partial cds. // chr6 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XM_006505736 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prolactin induced protein (Pip), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41832374:41851963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_032542 // RefSeq // Mus musculus seminal vesicle antigen-like 2 (Sval2), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000014248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:41860239:41864372:1 gene:ENSMUSG00000014104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000119995 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:41861792:41864372:1 gene:ENSMUSG00000014104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120605 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:41852989:41864413:1 gene:ENSMUSG00000014104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AB050614 // GenBank // Mus musculus mRNA for SLP-M, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC119343 // GenBank // Mus musculus seminal vesicle antigen-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:155659 IMAGE:8734092), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC119345 // GenBank // Mus musculus seminal vesicle antigen-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:155661 IMAGE:8734094), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000143093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:41863340:41864289:1 gene:ENSMUSG00000014104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// GENSCAN00000011300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41861402:41864322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT056619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_027832 // RefSeq // Mus musculus seminal vesicle antigen-like 1 (Sval1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031898 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:41951630:41956098:1 gene:ENSMUSG00000029865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC114422 // GenBank // Mus musculus seminal vesicle antigen-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:140938 IMAGE:40043764), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41953214:41955965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001003952 // RefSeq // Mus musculus seminal vesicle antigen-like 3 (Sval3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:41968140:41973090:1 gene:ENSMUSG00000062833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB098509 // GenBank // Mus musculus SVAL3 mRNA for seminal vesicle autoantigen like protein 3, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41968140:42110476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_009299 // RefSeq // Mus musculus seminal vesicle antigen (Sva), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42038394:42042851:1 gene:ENSMUSG00000023289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117406 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:42038394:42042845:1 gene:ENSMUSG00000023289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104304 // GenBank // Mus musculus seminal vesicle antigen, mRNA (cDNA clone MGC:129252 IMAGE:40043712), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC104305 // GenBank // Mus musculus seminal vesicle antigen, mRNA (cDNA clone MGC:129253 IMAGE:40043713), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M94179 // GenBank // Mouse 19 kD glycoprotein autoantigen mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:41968140:42110476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_181275 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 139 (Tas2r139), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42140936:42141895:1 gene:ENSMUSG00000047102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001001453 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 144 (Tas2r144), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42215328:42216287:1 gene:ENSMUSG00000051917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029555 // RefSeq // Mus musculus glutathione S-transferase kappa 1 (Gstk1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42245935:42250441:1 gene:ENSMUSG00000029864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY279096 // GenBank // Mus musculus class kappa glutathione S-transferase mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC051507 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase kappa 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:1379255). // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC058163 // GenBank // Mus musculus glutathione S-transferase kappa 1, mRNA (cDNA clone MGC:67852 IMAGE:5100572), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42246619:42264127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_175408 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 139 (Tmem139), mRNA. // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000095987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42261970:42264555:1 gene:ENSMUSG00000071506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC096053 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 139, mRNA (cDNA clone MGC:106893 IMAGE:3467410), complete cds. // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// XM_006505329 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 139 (Tmem139), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001289618 // RefSeq // Mus musculus zyxin (Zyx), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NM_001289619 // RefSeq // Mus musculus zyxin (Zyx), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NM_011777 // RefSeq // Mus musculus zyxin (Zyx), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006505936 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zyxin (Zyx), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000070635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42349828:42358392:1 gene:ENSMUSG00000029860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AK076491 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833427M15 product:zyxin, full insert sequence. // chr6 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// BC054775 // GenBank // Mus musculus zyxin, mRNA (cDNA clone MGC:65721 IMAGE:6808149), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NM_001289617 // RefSeq // Mus musculus zyxin (Zyx), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1 /// ENSMUST00000164375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42350058:42360146:1 gene:ENSMUSG00000029860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1 /// AK165290 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430010D21 product:zyxin, full insert sequence. // chr6 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// GENSCAN00000010961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42350269:42357956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0
NM_001001452 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 143 (Tas2r143), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42400238:42401119:1 gene:ENSMUSG00000046652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC148239 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 143, mRNA (cDNA clone MGC:165170 IMAGE:40050382), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42400238:42401119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199159 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 135 (Tas2r135), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42405434:42406526:1 gene:ENSMUSG00000056203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115532 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 135, mRNA (cDNA clone MGC:144373 IMAGE:40101425), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115533 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 135, mRNA (cDNA clone MGC:144374 IMAGE:40101426), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139470 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 135, mRNA (cDNA clone MGC:171097 IMAGE:8862492), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139473 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 135, mRNA (cDNA clone MGC:171100 IMAGE:8862495), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207028 // RefSeq // Mus musculus taste receptor, type 2, member 126 (Tas2r126), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42434535:42435464:1 gene:ENSMUSG00000048284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC126974 // GenBank // Mus musculus taste receptor, type 2, member 126, mRNA (cDNA clone MGC:144349 IMAGE:40101187), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011799 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 453 (Olfr453), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000053647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42744039:42744992:1 gene:ENSMUSG00000095831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42733898:42763007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 63 // 79 // 12 // 19 // 0
NM_146986 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 38 (Olfr38), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42762054:42763007:1 gene:ENSMUSG00000095236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC106817 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 38, mRNA (cDNA clone IMAGE:40043395), partial cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128054 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 38, mRNA (cDNA clone MGC:123798 IMAGE:40043588), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42733898:42763007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001011869 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 452 (Olfr452), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000075468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:42790015:42791063:1 gene:ENSMUSG00000094192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000010937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42790041:42790994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
GENSCAN00000010960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42800842:42801441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_146445 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 450 (Olfr450), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42817473:42818405:1 gene:ENSMUSG00000054431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42817473:42838818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147064 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 449 (Olfr449), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42837852:42838888:1 gene:ENSMUSG00000049168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138166 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 449, mRNA (cDNA clone MGC:169790 IMAGE:8861185), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42817473:42838818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146273 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 448 (Olfr448), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42896453:42897385:1 gene:ENSMUSG00000043119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107337 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 448, mRNA (cDNA clone MGC:130305 IMAGE:40055003), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42896345:42897385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146988 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 447 (Olfr447), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42911525:42912457:1 gene:ENSMUSG00000045708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104271 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 447, mRNA (cDNA clone MGC:129177 IMAGE:40040950), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42911588:42912457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146295 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 446 (Olfr446), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42927233:42928159:1 gene:ENSMUSG00000073111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:42927828:42956432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_146656 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 444 (Olfr444), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000095955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:42955459:42956508:1 gene:ENSMUSG00000073110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC145664 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 444, mRNA (cDNA clone MGC:175551 IMAGE:40130967), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000163240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:43094435:43095349:1 gene:ENSMUSG00000091386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// BC087904 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 446, mRNA (cDNA clone IMAGE:30251255), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC104060 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 446, mRNA (cDNA clone IMAGE:40040740), complete cds. // chr6 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// BC104061 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 446, mRNA (cDNA clone IMAGE:40040741), complete cds. // chr6 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT056649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_146654 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 237, pseudogene 1 (Olfr237-ps1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000095953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:43153262:43154261:1 gene:ENSMUSG00000094200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC120515 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 438, mRNA (cDNA clone MGC:155752 IMAGE:40129438), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC120519 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 438, mRNA (cDNA clone MGC:155756 IMAGE:40129442), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000002893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:43153307:43154239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_146296 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 437 (Olfr437), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:43167010:43168027:1 gene:ENSMUSG00000071481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137777 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 437, mRNA (cDNA clone MGC:169401 IMAGE:8860796), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:43167060:43167992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146652 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 13 (Olfr13), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:43173952:43175005:1 gene:ENSMUSG00000043605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC120850 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 13, mRNA (cDNA clone MGC:156087 IMAGE:40129773), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:43174051:43174920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_146653 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 435 (Olfr435), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:43201646:43202587:1 gene:ENSMUSG00000048693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:43201646:43202587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146369 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 434 (Olfr434), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:43216883:43217938:1 gene:ENSMUSG00000059411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120611 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 434, mRNA (cDNA clone MGC:155848 IMAGE:40129534), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120613 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 434, mRNA (cDNA clone MGC:155850 IMAGE:40129536), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:43216933:43229836:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0
NM_146370 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 47 (Olfr47), mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000078057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:43235578:43236636:1 gene:ENSMUSG00000061210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC120658 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 47, mRNA (cDNA clone MGC:155895 IMAGE:40129581), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC120660 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 47, mRNA (cDNA clone MGC:155897 IMAGE:40129583), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_133674 // RefSeq // Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 5 (Arhgef5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:43265582:43289320:1 gene:ENSMUSG00000033542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:43235748:43292914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004357 // RefSeq // Mus musculus contactin associated protein-like 2 (Cntnap2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// NM_025771 // RefSeq // Mus musculus contactin associated protein-like 2 (Cntnap2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 56 // 28 // 28 // 0 /// XM_006506483 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus contactin associated protein-like 2 (Cntnap2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 62 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000060839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:47244402:47299570:1 gene:ENSMUSG00000039419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:45060061:47301369:1 gene:ENSMUSG00000039419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// BC029826 // GenBank // Mus musculus contactin associated protein-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4456740), complete cds. // chr6 // 100 // 52 // 26 // 26 // 0 /// BC064467 // GenBank // Mus musculus contactin associated protein-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6825764), partial cds. // chr6 // 98 // 82 // 40 // 41 // 0 /// BC103799 // GenBank // Mus musculus contactin associated protein-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6332967), complete cds. // chr6 // 100 // 54 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:47162700:47298614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 22 // 22 // 11 // 50 // 1
NM_012042 // RefSeq // Mus musculus cullin 1 (Cul1), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506188 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cullin 1 (Cul1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000031697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:47454320:47526139:1 gene:ENSMUSG00000029686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:47453904:47523766:1 gene:ENSMUSG00000029686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AF136441 // GenBank // Mus musculus cullin 1 (Cul1) mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// AF176910 // GenBank // Mus musculus cullin 1 (Cul1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK164274 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030060P08 product:cullin 1, full insert sequence. // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC029260 // GenBank // Mus musculus cullin 1, mRNA (cDNA clone MGC:35976 IMAGE:2812400), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF083216 // GenBank // Mus musculus SCF complex protein cul-1 mRNA, complete cds. // chr6 // 62 // 81 // 13 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:47492862:47525634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NR_024202 // RefSeq // Mus musculus RNA, Y3 small cytoplasmic (associated with Ro protein) (Rny3), Y RNA. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000083011 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:47781624:47781725:1 gene:ENSMUSG00000064945 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT056768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_027477 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 398 (Zfp398), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006506208 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 398 (Zfp398), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079881 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:47835664:47867688:1 gene:ENSMUSG00000062519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC112382 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 398, mRNA (cDNA clone MGC:132822 IMAGE:40059618), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NM_173034 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 398 (Zfp398), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// ENSMUST00000114598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:47835695:47868257:1 gene:ENSMUSG00000062519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// ENSMUST00000146202 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:47835661:47843647:1 gene:ENSMUSG00000062519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// AK046208 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230352J12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// GENSCAN00000046198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:47839187:47866947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0
NM_146175 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 282 (Zfp282), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000061890 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:47877204:47908485:1 gene:ENSMUSG00000025821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC025581 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 282, mRNA (cDNA clone MGC:36603 IMAGE:5325029), complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000125957 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:47877656:47892813:1 gene:ENSMUSG00000025821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// AK081854 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130082I06 product:hypothetical KRAB box containing protein, full insert sequence. // chr6 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000046190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:47877672:47905381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
NM_001145881 // RefSeq // Mus musculus Zinc finger protein 212 (Zfp212), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_145576 // RefSeq // Mus musculus Zinc finger protein 212 (Zfp212), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000009411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:47920476:47932639:1 gene:ENSMUSG00000052763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000156500 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:47926306:47927146:1 gene:ENSMUSG00000052763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// BC006693 // GenBank // Mus musculus Zinc finger protein 212, mRNA (cDNA clone MGC:7897 IMAGE:3582679), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC088737 // GenBank // Mus musculus Zinc finger protein 212, mRNA (cDNA clone MGC:90976 IMAGE:5372342), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:47920519:47931567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000175147 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:48289228:48289427:1 gene:ENSMUSG00000092888 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT056803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_133922 // RefSeq // Mus musculus KRAB-A domain containing 1 (Krba1), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000031815 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:48395614:48416904:1 gene:ENSMUSG00000042810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000077093 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:48395658:48419545:1 gene:ENSMUSG00000042810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000114571 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:48395586:48419545:1 gene:ENSMUSG00000042810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000114572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48395586:48419855:1 gene:ENSMUSG00000042810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AK173281 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1862 protein. // chr6 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// BC066816 // GenBank // Mus musculus KRAB-A domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:76561 IMAGE:30084911), complete cds. // chr6 // 94 // 90 // 34 // 36 // 0 /// ENSMUST00000154536 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:48409199:48419545:1 gene:ENSMUSG00000042810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// AK029235 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4831434C03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// GENSCAN00000020095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48215095:48418385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 23 // 40 // 1 /// NONMMUT056809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1
NM_173428 // RefSeq // Mus musculus SCO-spondin (Sspo), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 101 // 101 // 0 /// ENSMUST00000043676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48448229:48501250:1 gene:ENSMUSG00000029797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 99 // 100 // 100 // 0 /// ENSMUST00000169350 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:48448229:48501235:1 gene:ENSMUSG00000029797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 101 // 101 // 0 /// AK165841 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730006I10 product:subcommissural organ spondin, full insert sequence. // chr6 // 100 // 14 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000185370 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:48488042:48501250:1 gene:ENSMUSG00000029797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 23 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000189910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:48480605:48487490:1 gene:ENSMUSG00000029797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 14 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000020085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48448456:48523850:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 64 // 64 // 0
NM_133764 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit E2 (Atp6v0e2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48537569:48541798:1 gene:ENSMUSG00000039347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010790 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit E2, mRNA (cDNA clone MGC:18845 IMAGE:4218132), complete cds. // chr6 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48528566:48556665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001110160 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 61 (Lrrc61), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_177736 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 61 (Lrrc61), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506073 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 61 (Lrrc61), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000101436 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:48554805:48570721:1 gene:ENSMUSG00000073096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000114545 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:48554796:48570722:1 gene:ENSMUSG00000073096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK171463 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730217A08 product:hypothetical Leucine-rich repeat/Leucine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC027309 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 61, mRNA (cDNA clone MGC:28139 IMAGE:3981816), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_183309 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5111 (Gm5111), mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000064744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:6:48589445:48590584:1 gene:ENSMUSG00000052730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000181661 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:48589588:48590518:1 gene:ENSMUSG00000052730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC127138 // GenBank // Mus musculus predicted gene, EG330305, mRNA (cDNA clone IMAGE:40049828), complete cds. // chr6 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_173429 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 775 (Zfp775), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506077 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 775 (Zfp775), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000061720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48613180:48623227:1 gene:ENSMUSG00000007216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK167452 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530014I07 product:Similar to zinc finger protein 13, full insert sequence. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC141223 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 775, mRNA (cDNA clone MGC:176184 IMAGE:9055835), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48601632:48620810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NR_027236 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI854703 (AI854703), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000154570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:48627935:48633689:1 gene:ENSMUSG00000053297 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48626764:48633685:1 gene:ENSMUSG00000053297 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// AK039299 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330018G02 product:weakly similar to Kruppel-type zinc finger protein ZNF72 (fragment) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONMMUT056828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NM_001077410 // RefSeq // Mus musculus GTPase, IMAP family member 8 (Gimap8), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_212486 // RefSeq // Mus musculus GTPase, IMAP family member 8 (Gimap8), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000078223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48647234:48660875:1 gene:ENSMUSG00000064262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AB178029 // GenBank // Mus musculus IAN9 mRNA for immune-associated nucleotide-binding protein 9, complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC137943 // GenBank // Mus musculus GTPase, IMAP family member 8, mRNA (cDNA clone MGC:169567 IMAGE:8860962), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC137944 // GenBank // Mus musculus GTPase, IMAP family member 8, mRNA (cDNA clone MGC:169568 IMAGE:8860963), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NM_001286629 // RefSeq // Mus musculus GTPase, IMAP family member 8 (Gimap8), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000020079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48639707:48691299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_174960 // RefSeq // Mus musculus GTPase, IMAP family member 9 (Gimap9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:48676129:48678699:1 gene:ENSMUSG00000051124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC096680 // GenBank // Mus musculus GTPase, IMAP family member 9, mRNA (cDNA clone MGC:106910 IMAGE:1345477), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48639707:48691299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_146167 // RefSeq // Mus musculus GTPase, IMAP family member 7 (Gimap7), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:48718621:48724636:1 gene:ENSMUSG00000043931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026200 // GenBank // Mus musculus GTPase, IMAP family member 7, mRNA (cDNA clone MGC:41480 IMAGE:963503), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008376 // RefSeq // Mus musculus GTPase, IMAP family member 1 (Gimap1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_175860 // RefSeq // Mus musculus GTPase, IMAP family member 1 (Gimap1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:48739054:48743790:1 gene:ENSMUSG00000090019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000140054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:48739076:48742676:1 gene:ENSMUSG00000090019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC132601 // GenBank // Mus musculus GTPase, IMAP family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:164232 IMAGE:40130878), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC132603 // GenBank // Mus musculus GTPase, IMAP family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:164234 IMAGE:40130880), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// Y08026 // GenBank // Mus musculus mRNA for immunity associated protein 38 (iap38). // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000020073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48741390:48743358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_175035 // RefSeq // Mus musculus GTPase, IMAP family member 5 (Gimap5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506228 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GTPase, IMAP family member 5 (Gimap5), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000055558 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:48746197:48754210:1 gene:ENSMUSG00000043505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB126961 // GenBank // Mus musculus mRNA for mitochondrial GTP-binding protein IAN5, complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC095995 // GenBank // Mus musculus GTPase, IMAP family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:106292 IMAGE:30470329), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48750460:48753424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000127537 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:48718607:48752600:1 gene:ENSMUSG00000098715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000155017 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:48718607:48752600:1 gene:ENSMUSG00000098715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001098271 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 176A (Tmem176a), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NM_025326 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 176A (Tmem176a), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000101426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48841483:48845364:1 gene:ENSMUSG00000023367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000168406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48841656:48845364:1 gene:ENSMUSG00000023367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AB063313 // GenBank // Mus musculus KEG 2 mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// AK079378 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630050K02 product:weakly similar to HEPATOCELLULAR CARCINOMA-ASSOCIATED ANTIGEN 112 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// AK165660 // GenBank HTC // Mus musculus brain CRL-1443 BC3H1 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430112P12 product:Kidney expressed gene 2 product, full insert sequence. // chr6 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC010831 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 176A, mRNA (cDNA clone MGC:19158 IMAGE:4221626), complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// CT010190 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836E0150D for gene 0610011I04Rik, RIKEN cDNA 0610011I04 gene; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48839959:48908833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1
XR_403343 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7932 (Gm7932), misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48860356:48864297:1 gene:ENSMUSG00000073090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139445 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830086M05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081273 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1600015I10 gene (1600015I10Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031837 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:48929895:48933687:1 gene:ENSMUSG00000029813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC085280 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1600015I10 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30436639). // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48930086:48933511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001029987 // RefSeq // Mus musculus diamine oxidase-like protein 2 (Doxl2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006506081 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus diamine oxidase-like protein 2 (Doxl2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000090063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:48975074:48978746:1 gene:ENSMUSG00000068536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000184852 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:48977234:48978743:1 gene:ENSMUSG00000068536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000184917 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:48974963:48978745:1 gene:ENSMUSG00000068536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK144307 // GenBank HTC // Mus musculus adult male vesicular gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630014J02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// BC150935 // GenBank // Mus musculus diamine oxidase-like protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:183846 IMAGE:9087846), complete cds. // chr6 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48973694:48978629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0
NM_172888 // RefSeq // Mus musculus seminal vesicle secretory protein 1 (Svs1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000037696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:48986861:48991725:1 gene:ENSMUSG00000039215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY115568 // GenBank // Mus musculus pSv-2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AY283179 // GenBank // Mus musculus semen coagulation protein precursor, mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC125635 // GenBank // Mus musculus seminal vesicle secretory protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:159338 IMAGE:40130150), complete cds. // chr6 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:48981101:49018545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_053110 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein (transmembrane) nmb (Gpnmb), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000031840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:49036518:49058182:1 gene:ENSMUSG00000029816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AF322054 // GenBank // Mus musculus dendritic cell-associated transmembrane protein precursor (Dchil) mRNA, complete cds. // chr6 // 85 // 87 // 28 // 33 // 0 /// AJ251685 // GenBank // Mus musculus mRNA for putative transmembrane glycoprotein (NMB gene). // chr6 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC026375 // GenBank // Mus musculus glycoprotein (transmembrane) nmb, mRNA (cDNA clone MGC:31121 IMAGE:4164706), complete cds. // chr6 // 85 // 87 // 28 // 33 // 0 /// AK079220 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530038P20 product:glycoprotein (transmembrane) nmb, full insert sequence. // chr6 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// GENSCAN00000042987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:49041880:49084690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1
NM_175098 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 126 (Ccdc126), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000055559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:49319274:49341582:1 gene:ENSMUSG00000050786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000114491 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:49319307:49341578:1 gene:ENSMUSG00000050786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC095987 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 126, mRNA (cDNA clone MGC:106234 IMAGE:5365989), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC117837 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 126, mRNA (cDNA clone MGC:143769 IMAGE:40093139), complete cds. // chr6 // 93 // 79 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:49334087:49340010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0
NM_001172216 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 221, member A (Fam221a), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_172727 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 221, member A (Fam221a), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000060561 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:49367739:49389905:1 gene:ENSMUSG00000047115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000121903 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:49367823:49389280:1 gene:ENSMUSG00000047115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000141910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:49385252:49389273:1 gene:ENSMUSG00000047115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC055818 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D330028D13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67688 IMAGE:4487036), complete cds. // chr6 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000142950 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:49378974:49385455:1 gene:ENSMUSG00000047115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000042990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:49357809:49388885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT056863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_029916 // RefSeq // Mus musculus serine threonine kinase 31 (Stk31), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006506747 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine threonine kinase 31 (Stk31), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000024171 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:49395604:49469501:1 gene:ENSMUSG00000023403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000163954 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:49395635:49469352:1 gene:ENSMUSG00000023403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000167846 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:49438564:49469500:1 gene:ENSMUSG00000023403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000172459 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:49395635:49469352:1 gene:ENSMUSG00000023403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AF285580 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 31 (Stk31) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC137989 // GenBank // Mus musculus serine threonine kinase 31, mRNA (cDNA clone MGC:169613 IMAGE:8861008), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000043008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:49417234:49469352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 31 // 31 // 0
NM_023456 // RefSeq // Mus musculus neuropeptide Y (Npy), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000031843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:49822710:49829507:1 gene:ENSMUSG00000029819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF273768 // GenBank // Mus musculus preproneuropeptide Y (Npy) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC043012 // GenBank // Mus musculus neuropeptide Y, mRNA (cDNA clone MGC:57879 IMAGE:5683102), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:49804137:49827633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
AK047380 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930054E20 product:fibroblast growth factor inducible 15, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT056876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000096092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:23165338:23167413:-1 gene:ENSMUSG00000096702 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000096093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:23157986:23160061:-1 gene:ENSMUSG00000094300 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000164674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:50608637:50610709:1 gene:ENSMUSG00000092012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000168705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:50619822:50621885:-1 gene:ENSMUSG00000091981 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23165338:23167413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:23157986:23160061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:50619813:50621885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:50608637:50610715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
BC022713 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4487487. // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// KnowTID_00006088 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT056905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010903 // RefSeq // Mus musculus nuclear factor, erythroid derived 2, like 3 (Nfe2l3), mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000005103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:51432670:51458768:1 gene:ENSMUSG00000029832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:51432749:51436928:1 gene:ENSMUSG00000029832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000160133 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:51432749:51456876:1 gene:ENSMUSG00000029832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AB013852 // GenBank // Mus musculus mRNA for Nrf3, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AK017278 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430406J03 product:nuclear factor, erythroid derived 2, like 3, full insert sequence. // chr6 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AK020550 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530007C14 product:nuclear factor, erythroid derived 2, like 3, full insert sequence. // chr6 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC005416 // GenBank // Mus musculus nuclear factor, erythroid derived 2, like 3, mRNA (cDNA clone MGC:5702 IMAGE:3485182), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006505703 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear factor, erythroid derived 2, like 3 (Nfe2l3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000050229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:51432907:51460127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000114435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:52168510:52169564:1 gene:ENSMUSG00000056445 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000155922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52165674:52169451:1 gene:ENSMUSG00000056445 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC094279 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730446D14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106080 IMAGE:5340510), complete cds. // chr6 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000189230 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52166518:52169564:1 gene:ENSMUSG00000056445 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AK012902 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810043O09 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT056941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT056943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT056944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
XR_403371 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 5730596B20 gene (5730596B20Rik), misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:52177498:52180851:1 gene:ENSMUSG00000056468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK051764 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130074O04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_110441 // RefSeq // Mus musculus Hoxa distal transcript antisense RNA (Hottip), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141300 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52262784:52267079:1 gene:ENSMUSG00000055408 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_110442 // RefSeq // Mus musculus Hoxa distal transcript antisense RNA (Hottip), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSMUST00000152875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52262775:52267603:1 gene:ENSMUSG00000055408 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSMUST00000184418 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:52263058:52263418:1 gene:ENSMUSG00000099229 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT056974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// HOTTIP // lncRNA Db // BC046496.1 (Mouse)mm9 chr6:52,212,769-52,217,597 // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONMMUT056973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_007966 // RefSeq // Mus musculus even skipped homeotic gene 1 homolog (Evx1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000031787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52313498:52318378:1 gene:ENSMUSG00000005503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000129243 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:52313552:52316644:1 gene:ENSMUSG00000005503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC126907 // GenBank // Mus musculus even skipped homeotic gene 1 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:130611 IMAGE:40059181), complete cds. // chr6 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// X54239 // GenBank // M.musculus mRNA for Evx1 protein. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52313845:52332972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_025816 // RefSeq // Mus musculus Tax1 (human T cell leukemia virus type I) binding protein 1 (Tax1bp1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006506370 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Tax1 (human T cell leukemia virus type I) binding protein 1 (Tax1bp1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006506371 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Tax1 (human T cell leukemia virus type I) binding protein 1 (Tax1bp1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000080723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:52713729:52766780:1 gene:ENSMUSG00000004535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000149588 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:52713750:52733221:1 gene:ENSMUSG00000004535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// BC014798 // GenBank // Mus musculus Tax1 (human T-cell leukemia virus type I) binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:11692 IMAGE:3962810), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:52676241:52758364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000083282 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:53433974:53434137:1 gene:ENSMUSG00000096147 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT057010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_030024 // RefSeq // Mus musculus proline rich 15 (Prr15), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:54327012:54330200:1 gene:ENSMUSG00000045725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC055838 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E130201N16 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3994796), partial cds. // chr6 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// BC132416 // GenBank // Mus musculus proline rich 15, mRNA (cDNA clone MGC:164047 IMAGE:40130693), complete cds. // chr6 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0 /// BC138757 // GenBank // Mus musculus proline rich 15, mRNA (cDNA clone MGC:170384 IMAGE:8861779), complete cds. // chr6 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0
NM_001001335 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 8 (Plekha8), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_001164361 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 8 (Plekha8), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006505945 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 8 (Plekha8), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000101385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:54603147:54641033:1 gene:ENSMUSG00000005225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000119706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:54595111:54645839:1 gene:ENSMUSG00000005225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC052360 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 8, mRNA (cDNA clone MGC:58573 IMAGE:6704789), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000056148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:54600363:54663138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001289740 // RefSeq // Mus musculus maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog (Xenopus) (Mturn), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001289741 // RefSeq // Mus musculus maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog (Xenopus) (Mturn), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000046276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:54681772:54700406:1 gene:ENSMUSG00000038065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC042507 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410066E13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30499 IMAGE:4235651), complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// BC052467 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410066E13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:63406 IMAGE:6834900), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000187701 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:54681754:54701141:1 gene:ENSMUSG00000038065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000190641 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:54681624:54703851:1 gene:ENSMUSG00000038065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:54681770:54870614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// ENSMUST00000185518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:54681802:54689520:1 gene:ENSMUSG00000038065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_199143 // RefSeq // Mus musculus zinc and ring finger 2 (Znrf2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000079869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:54816916:54893500:1 gene:ENSMUSG00000058446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000148425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:54817270:54878421:1 gene:ENSMUSG00000058446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 85 // 48 // 11 // 13 // 0 /// AF513708 // GenBank // Mus musculus ZNRF2 protein (Znfr2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC104316 // GenBank // Mus musculus zinc and ring finger 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40044720), complete cds. // chr6 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC104317 // GenBank // Mus musculus zinc and ring finger 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40044722), complete cds. // chr6 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC125242 // GenBank // Mus musculus zinc and ring finger 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40044735), complete cds. // chr6 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// XM_006506357 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc and ring finger 2 (Znrf2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// ENSMUST00000127331 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:54817448:54885111:1 gene:ENSMUSG00000058446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONMMUT057074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 85 // 48 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000056145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:54681770:54870614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_180678 // RefSeq // Mus musculus glycyl-tRNA synthetase (Gars), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000003572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:55038001:55079504:1 gene:ENSMUSG00000029777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC021747 // GenBank // Mus musculus glycyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:30342 IMAGE:4192628), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:55038042:55086915:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_001142781 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 188, member B (Fam188b), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NM_177883 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 188, member B (Fam188b), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// XR_377470 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 188, member B (Fam188b), transcript variant X4, misc_RNA. // chr6 // 96 // 70 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000053094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:55203383:55320222:1 gene:ENSMUSG00000038022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC118940 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C330043M08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143672 IMAGE:40092089), complete cds. // chr6 // 95 // 55 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:55203507:55326286:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0
NM_007472 // RefSeq // Mus musculus aquaporin 1 (Aqp1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000004774 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:55336432:55348555:1 gene:ENSMUSG00000004655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// L02914 // GenBank // Mus musculus aquaporin-1 (AQ1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC007125 // GenBank // Mus musculus aquaporin 1, mRNA (cDNA clone MGC:5663 IMAGE:3491276), complete cds. // chr6 // 65 // 85 // 15 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:55336491:55346797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_001003685 // RefSeq // Mus musculus growth hormone releasing hormone receptor (Ghrhr), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000063578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:55376295:55388530:1 gene:ENSMUSG00000004654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC120748 // GenBank // Mus musculus growth hormone releasing hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:155985 IMAGE:40129671), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC120774 // GenBank // Mus musculus growth hormone releasing hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:156011 IMAGE:40129697), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK133683 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330436N08 product:growth hormone releasing hormone receptor, full insert sequence. // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000029513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:55376385:55388294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0
NM_001081665 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 129 (Ccdc129), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505947 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 129 (Ccdc129), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// XM_006505950 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 129 (Ccdc129), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 91 // 38 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000044729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:55836895:55978622:1 gene:ENSMUSG00000037973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000169699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:55886825:55978735:1 gene:ENSMUSG00000037973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// AK085190 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530004J12 product:hypothetical Cysteine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC116335 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 129, mRNA (cDNA clone MGC:144044 IMAGE:40097026), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:55941435:55978513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000029517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:55872491:55897871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_011153 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 17 (Ppp1r17), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:56017515:56032688:1 gene:ENSMUSG00000002930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF071562 // GenBank // Mus musculus G-substrate mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AF500906 // GenBank // Mus musculus G substrate mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026822 // GenBank // Mus musculus G substrate, mRNA (cDNA clone MGC:25251 IMAGE:4511839), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:56008867:56028354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_030235 // RefSeq // Mus musculus AVL9 homolog (S. cerevisiase) (Avl9), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000031805 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:56714927:56761911:1 gene:ENSMUSG00000029787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000177249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:56714938:56737157:1 gene:ENSMUSG00000029787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// BC051177 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830411G16 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6314197). // chr6 // 95 // 56 // 18 // 19 // 0 /// BC117878 // GenBank // Mus musculus AVL9 homolog (S. cerevisiase), mRNA (cDNA clone MGC:143982 IMAGE:40095961), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000176560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:56740913:56754052:1 gene:ENSMUSG00000029787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000000446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:56736440:56757387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0
XM_006506850 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus arginine/serine-rich protein 45-like (LOC102633652), mRNA. // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK030541 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330429D05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_012056 // RefSeq // Mus musculus FK506 binding protein 9 (Fkbp9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000031795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:56832059:56879358:1 gene:ENSMUSG00000029781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF090334 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein (Fkbp63) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF279263 // GenBank // Mus musculus FKBP65RS mRNA, complete cds. // chr6 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC026133 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:13784 IMAGE:4018235), complete cds. // chr6 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC043129 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:58069 IMAGE:6810029), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:56832207:56878210:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_134176 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 4 (Vmn1r4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006505671 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal 1 receptor 4 (Vmn1r4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006505672 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal 1 receptor 4 (Vmn1r4), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006505673 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal 1 receptor 4 (Vmn1r4), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000096612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:56956466:56957499:1 gene:ENSMUSG00000071893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000176838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:56924022:56958100:1 gene:ENSMUSG00000071893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC132386 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C21, mRNA (cDNA clone MGC:164017 IMAGE:40130663), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC138489 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C21, mRNA (cDNA clone MGC:170114 IMAGE:8861509), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_134174 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 5 (Vmn1r5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000164307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:56985295:56986350:1 gene:ENSMUSG00000090346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC138068 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C19, mRNA (cDNA clone MGC:169692 IMAGE:8861087), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC138069 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C19, mRNA (cDNA clone MGC:169693 IMAGE:8861088), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:56947571:57003266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 89 // 12 // 17 // 0
NM_134175 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 6 (Vmn1r6), mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000079669 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57002300:57003363:1 gene:ENSMUSG00000058923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC125532 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C20, mRNA (cDNA clone MGC:159235 IMAGE:40130047), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC125534 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C20, mRNA (cDNA clone MGC:159237 IMAGE:40130049), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_134187 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 8 (Vmn1r8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000078186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57035913:57037125:1 gene:ENSMUSG00000061208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF394951 // GenBank // Mus musculus vomeronasal receptor 1 B2 (V1rb2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000032523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57036221:57036877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0
NM_053231 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 10 (Vmn1r10), mRNA. // chr6 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// NM_134185 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 9 (Vmn1r9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000171186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57070895:57071945:1 gene:ENSMUSG00000091541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000176073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57113396:57114367:1 gene:ENSMUSG00000093785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// BC132241 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C30, mRNA (cDNA clone MGC:163872 IMAGE:40130518), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC132577 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C30, mRNA (cDNA clone MGC:164208 IMAGE:40130854), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57071512:57071841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0
NM_053231 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 10 (Vmn1r10), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_134185 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 9 (Vmn1r9), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57070895:57071945:1 gene:ENSMUSG00000091541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57113396:57114367:1 gene:ENSMUSG00000093785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132241 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C30, mRNA (cDNA clone MGC:163872 IMAGE:40130518), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC132577 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C30, mRNA (cDNA clone MGC:164208 IMAGE:40130854), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57071512:57071841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0
NM_053233 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 11 (Vmn1r11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57137299:57138325:1 gene:ENSMUSG00000093635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104398 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C3, mRNA (cDNA clone MGC:129504 IMAGE:40050459), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104399 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C3, mRNA (cDNA clone MGC:129505 IMAGE:40050460), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57137608:57138252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000177200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:57188507:57189344:1 gene:ENSMUSG00000093728 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_053235 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 13 (Vmn1r13), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000078885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57209858:57210760:1 gene:ENSMUSG00000064259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57154498:57210760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NM_053237 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 14 (Vmn1r14), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000176376 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57232843:57234371:1 gene:ENSMUSG00000093692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57233910:57259048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_053236 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 15 (Vmn1r15), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000071304 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57258149:57259048:1 gene:ENSMUSG00000058731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC115501 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C6, mRNA (cDNA clone MGC:144320 IMAGE:40100944), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC115502 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C6, mRNA (cDNA clone MGC:144321 IMAGE:40100945), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57233910:57259048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
ENSMUST00000176165 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:57312939:57313827:1 gene:ENSMUSG00000093621 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT057126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_134182 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 19 (Vmn1r19), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006505676 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal 1 receptor 19 (Vmn1r19), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000089830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57404366:57405483:1 gene:ENSMUSG00000068426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125351 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C27, mRNA (cDNA clone MGC:159054 IMAGE:40129866), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132235 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C27, mRNA (cDNA clone MGC:163866 IMAGE:40130512), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001101533 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 20 (Vmn1r20), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_134436 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 27 (Vmn1r27), mRNA. // chr6 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// ENSMUST00000095862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:58215106:58216017:-1 gene:ENSMUSG00000071428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// ENSMUST00000176085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57431644:57432695:1 gene:ENSMUSG00000093679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:58145166:58441348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_025992 // RefSeq // Mus musculus hect domain and RLD 6 (Herc6), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000031817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:57580992:57665136:1 gene:ENSMUSG00000029798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK007221 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700121D12 product:EST AI451296, full insert sequence. // chr6 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AK015214 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930427L17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AK161293 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4922505H21 product:hypothetical HECT domain (Ubiquitin-protein ligase)/HECT domain profile containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000032520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57572759:57662914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0
NM_133737 // RefSeq // Mus musculus LanC (bacterial lantibiotic synthetase component C)-like 2 (Lancl2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000050077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57702636:57738482:1 gene:ENSMUSG00000062190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000072954 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:57702601:57739438:1 gene:ENSMUSG00000062190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151042 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:57703051:57737972:1 gene:ENSMUSG00000062190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:57703087:57739438:1 gene:ENSMUSG00000062190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AB035967 // GenBank // Mus musculus tasp mRNA for testis-specific adriamycin sensitivity protein, complete cds. // chr6 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC016072 // GenBank // Mus musculus LanC (bacterial lantibiotic synthetase component C)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:27554 IMAGE:4482042), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:57703060:57732528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0
NM_134180 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 28 (Vmn1r28), mRNA. // chr6 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000176874 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:58265078:58266162:1 gene:ENSMUSG00000094291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// AF394949 // GenBank // Mus musculus vomeronasal receptor 1 B1 (V1rb1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_053232 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 29 (Vmn1r29), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006505384 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal 1 receptor 29 (Vmn1r29), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:58307268:58308290:1 gene:ENSMUSG00000091734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150722 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, C2, mRNA (cDNA clone MGC:183633 IMAGE:9087633), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000177167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:58461107:58461536:1 gene:ENSMUSG00000093747 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000031163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:58461070:58461610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT057161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
NM_028705 // RefSeq // Mus musculus hect domain and RLD 3 (Herc3), mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// XR_377496 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hect domain and RLD 3 (Herc3), transcript variant X9, misc_RNA. // chr6 // 100 // 51 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031823 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:58831861:58904081:1 gene:ENSMUSG00000029804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000041401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:58833700:58920398:1 gene:ENSMUSG00000029804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// AK017531 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730409F18 product:hect domain and RLD 3, full insert sequence. // chr6 // 98 // 84 // 40 // 41 // 0 /// AK122192 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0032 protein. // chr6 // 100 // 88 // 43 // 43 // 0 /// BC042574 // GenBank // Mus musculus hect domain and RLD 3, mRNA (cDNA clone MGC:30404 IMAGE:4503584), complete cds. // chr6 // 98 // 98 // 47 // 48 // 0 /// BC145978 // GenBank // Mus musculus hect domain and RLD 3, mRNA (cDNA clone MGC:175865 IMAGE:40131281), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// BC145980 // GenBank // Mus musculus hect domain and RLD 3, mRNA (cDNA clone MGC:175867 IMAGE:40131283), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// XM_006506701 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hect domain and RLD 3 (Herc3), transcript variant X7, mRNA. // chr6 // 57 // 57 // 28 // 49 // 1 /// GENSCAN00000031168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:58655657:58894171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 32 // 49 // 1
NM_001081145 // RefSeq // Mus musculus tigger transposable element derived 2 (Tigd2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000062626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:59208870:59212033:1 gene:ENSMUSG00000049232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120592 // GenBank // Mus musculus tigger transposable element derived 2, mRNA (cDNA clone MGC:155829 IMAGE:40129515), complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC125491 // GenBank // Mus musculus tigger transposable element derived 2, mRNA (cDNA clone MGC:159194 IMAGE:40130006), complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000013853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:59657809:59877036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
XR_403419 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5570 (Gm5570), misc_RNA. // chr6 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// ENSMUST00000082153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:60082484:60086391:1 gene:ENSMUSG00000073045 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000101355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:60031967:60150045:1 gene:ENSMUSG00000073045 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK134759 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330552M03 product:hypothetical Calycin containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT057188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT057190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000082581 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:60250792:60250910:1 gene:ENSMUSG00000064515 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163507 // RefSeq // Mus musculus multimerin 1 (Mmrn1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_027613 // RefSeq // Mus musculus multimerin 1 (Mmrn1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000129603 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:60944476:60989378:1 gene:ENSMUSG00000054641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC046425 // GenBank // Mus musculus multimerin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5347775), partial cds. // chr6 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// BC137623 // GenBank // Mus musculus multimerin 1, mRNA (cDNA clone MGC:169247 IMAGE:8860642), complete cds. // chr6 // 90 // 97 // 28 // 31 // 0 /// BC144789 // GenBank // Mus musculus multimerin 1, mRNA (cDNA clone MGC:178345 IMAGE:9053337), complete cds. // chr6 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:60944561:60965164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000002435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:60972977:60988619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000082841 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:64413648:64413750:1 gene:ENSMUSG00000064775 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT057241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_007500 // RefSeq // Mus musculus atonal homolog 1 (Drosophila) (Atoh1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:64729146:64731233:1 gene:ENSMUSG00000073043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010820 // GenBank // Mus musculus atonal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:19141 IMAGE:4218223), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051256 // GenBank // Mus musculus atonal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:58933 IMAGE:6530849), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:64677565:64730378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000137642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:64990955:64991508:1 gene:ENSMUSG00000086176 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:64978739:64991538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
AF037046 // GenBank // Mus musculus strain M.SPRET/EI thiopurine S-methyltransferase (Tpmt) pseudogene, mRNA sequence. // chr6 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// AF037047 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2J thiopurine S-methyltransferase (Tpmt) pseudogene, mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000037740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:65328431:65328942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 79 // 14 // 15 // 0 /// KnowTID_00006107 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// KnowTID_00006108 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT057253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT057254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0
NM_175524 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C130060K24 gene (C130060K24Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000170608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:65381294:65458150:1 gene:ENSMUSG00000029917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC119578 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C130060K24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:141328 IMAGE:40058179), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC119579 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C130060K24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:141329 IMAGE:40058180), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:65420377:65456448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001001495 // RefSeq // Mus musculus TNFAIP3 interacting protein 3 (Tnip3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006506359 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TNFAIP3 interacting protein 3 (Tnip3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000114236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:65590398:65634040:1 gene:ENSMUSG00000044162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC104393 // GenBank // Mus musculus TNFAIP3 interacting protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:129495 IMAGE:40050409), complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// EF585494 // GenBank // Mus musculus TNFAIP3-interacting protein 3 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// EF585495 // GenBank // Mus musculus TNFAIP3-interacting protein 3 beta mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000037734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:65595315:65635871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_172399 // RefSeq // Mus musculus neuron-derived neurotrophic factor (Ndnf), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506528 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuron-derived neurotrophic factor (Ndnf), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000054351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:65671590:65706930:1 gene:ENSMUSG00000049001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC047154 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A930038C07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:54980 IMAGE:6489681), complete cds. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:65696040:65758169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000119894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:65757936:65758321:1 gene:ENSMUSG00000082115 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT057262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:65696040:65758169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_001161773 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930544G11 gene (4930544G11Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000043382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:65952571:65954012:1 gene:ENSMUSG00000036463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000121764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:67012485:67012871:1 gene:ENSMUSG00000084154 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:66996456:67017589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
ENSMUST00000083053 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:67027043:67027176:1 gene:ENSMUSG00000064987 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT057277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
AK083337 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920008P08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000120174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:67205619:67206083:1 gene:ENSMUSG00000047905 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000001197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:67159676:67206083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0
NM_001113565 // RefSeq // Mus musculus serpine1 mRNA binding protein 1 (Serbp1), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_001113566 // RefSeq // Mus musculus serpine1 mRNA binding protein 1 (Serbp1), transcript variant 4, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_025814 // RefSeq // Mus musculus serpine1 mRNA binding protein 1 (Serbp1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000042990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:67266979:67289302:1 gene:ENSMUSG00000036371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC013665 // GenBank // Mus musculus serpine1 mRNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:18794 IMAGE:4193513), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC030502 // GenBank // Mus musculus serpine1 mRNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:40621 IMAGE:5401573), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_001113564 // RefSeq // Mus musculus serpine1 mRNA binding protein 1 (Serbp1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// AK045190 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130045C05 product:PAI-1 MRNA-BINDING PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// GENSCAN00000001168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:67265383:67283959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000103302 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:67555636:67556216:1 gene:ENSMUSG00000076501 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// AJ555479 // GenBank // Mus musculus mRNA for anti-human CD19 monoclonal antibody 4G7 immunoglobulin kappa light chain (IGK gene). // chr6 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000001202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:67555636:67610608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 95 // 18 // 20 // 0
ENSMUST00000103307 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:67791046:67791511:1 gene:ENSMUSG00000096461 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:67791046:67791536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// X96756 // GenBank // M.musculus mRNA for variable light chain. // chr6 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
ENSMUST00000103308 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:67839793:67840266:1 gene:ENSMUSG00000093906 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:67839793:67840291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000103311 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:67913573:67914052:1 gene:ENSMUSG00000095737 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:67896177:67914077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT057309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 94 // 89 // 16 // 17 // 0
ENSMUST00000103317 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:68121091:68121827:1 gene:ENSMUSG00000094335 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// AF015196 // GenBank // Mus musculus mAb124 IgG2b/K VLJ region mRNA, partial cds. // chr6 // 91 // 85 // 10 // 11 // 0 /// AJ222601 // GenBank // mouse DNA, light chain of a recombinant single chain Fv against the human C3a receptor. // chr6 // 91 // 85 // 10 // 11 // 0 /// BC002035 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:5947 IMAGE:3491358, complete cds. // chr6 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// U29598 // GenBank // Mus musculus mAb light chain variable region mRNA, partial cds. // chr6 // 91 // 85 // 10 // 11 // 0 /// U65535 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin kappa chain mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// X76021 // GenBank // Mus musculus (BALB/c) Ig mRNA clones 251-6. // chr6 // 91 // 85 // 10 // 11 // 0 /// Z95480 // GenBank // Mus musculus mRNA for IgG1/kappa antibody, scFv(glyc)-CK. // chr6 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// AF015218 // GenBank // Mus musculus mAb638 IgG1/k VLJ region mRNA, partial cds. // chr6 // 73 // 85 // 8 // 11 // 0 /// AJ222599 // GenBank // mouse DNA, light chain of a recombinant single chain Fv against the human C3a receptor. // chr6 // 73 // 85 // 8 // 11 // 0 /// Z95477 // GenBank // Mus musculus mRNA for IgG1/kappa antibody, scFv59-CK. // chr6 // 73 // 85 // 8 // 11 // 0 /// Z95478 // GenBank // Mus musculus mRNA for IgG3/kappa antibody, scFv49-CK. // chr6 // 73 // 85 // 8 // 11 // 0 /// NONMMUT057311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000020841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:68121091:68179890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0
ENSMUST00000103316 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:68049983:68050456:1 gene:ENSMUSG00000094872 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// L41880 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin kappa chain mRNA, 5 end of cds. // chr6 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:68049983:68050481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000103318 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:68151885:68152619:1 gene:ENSMUSG00000094769 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000020841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:68121091:68179890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0
ENSMUST00000103319 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:68219981:68220706:1 gene:ENSMUSG00000076518 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC005685 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC005685, mRNA (cDNA clone IMAGE:3154990), partial cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
X56394 // GenBank // Mouse mAB-15C5 mRNA for immunoglobulin kappa chain. // chr6 // 89 // 28 // 8 // 9 // 0 /// S65921 // GenBank // Mus musculus anti-colorectal carcinoma light chain mRNA, complete cds. // chr6 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
ENSMUST00000103322 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:68302439:68303160:1 gene:ENSMUSG00000094749 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF466768 // GenBank // Mus musculus monoclonal antibody BBK-1 light chain mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000103318 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:68151885:68152619:1 gene:ENSMUSG00000094769 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 61 // 100 // 17 // 28 // 0 /// X76017 // GenBank // Mus musculus (BALB/c) Ig mRNA clones 241-4. // chr6 // 57 // 75 // 12 // 21 // 0 /// ENSMUST00000103302 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:67555636:67556216:1 gene:ENSMUSG00000076501 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 46 // 100 // 13 // 28 // 0 /// AJ555479 // GenBank // Mus musculus mRNA for anti-human CD19 monoclonal antibody 4G7 immunoglobulin kappa light chain (IGK gene). // chr6 // 46 // 100 // 13 // 28 // 0 /// Z49934 // GenBank // M.musculus mRNA for SV5 light chain leader, variable and partial constant kappa region. // chr6 // 43 // 100 // 12 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:67555636:67610608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:68121091:68179890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSMUST00000103382 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70193228:70193797:1 gene:ENSMUSG00000076581 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000103390 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70355877:70356445:1 gene:ENSMUSG00000076589 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70193228:70193840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70353507:70356480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 59 // 13 // 16 // 0
ENSMUST00000097219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:70424270:70424430:1 gene:ENSMUSG00000072477 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0 /// NONMMUT057341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000103398 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:6:70588189:70588777:1 gene:ENSMUSG00000095338 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr6 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0 /// GENSCAN00000031257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70588189:70608055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0
NM_010121 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 (Eif2ak3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000034093 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:70844515:70905245:1 gene:ENSMUSG00000031668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000159401 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:70878561:70893436:1 gene:ENSMUSG00000031668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// AF076681 // GenBank // Mus musculus type-I transmembrane ER-resident serine/threonine kinase PERK mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// AK139679 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020010I18 product:eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3, full insert sequence. // chr6 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// BC054809 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:65679 IMAGE:6839221), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000044377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70876678:70889601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000083752 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:6620319:6620454:-1 gene:ENSMUSG00000065686 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083816 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:70855444:70855579:1 gene:ENSMUSG00000065750 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6619586:6620445:-1 gene:ENSMUSG00000000384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT008517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT008519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT008520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001101464 // RefSeq // Mus musculus forkhead box I3 (Foxi3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000069634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:70956606:70961066:1 gene:ENSMUSG00000055874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:70956531:70961063:1 gene:ENSMUSG00000055874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:70956531:70961063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_017399 // RefSeq // Mus musculus fatty acid binding protein 1, liver (Fabp1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000067492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:71199827:71205023:1 gene:ENSMUSG00000054422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK131868 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010105C24 product:fatty acid binding protein 1, liver, full insert sequence. // chr6 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC009812 // GenBank // Mus musculus fatty acid binding protein 1, liver, mRNA (cDNA clone MGC:13855 IMAGE:4159971), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71199927:71205420:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_145568 // RefSeq // Mus musculus lysine-rich coiled-coil 1 (Krcc1), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:71282280:71285318:1 gene:ENSMUSG00000053012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000168700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:71272019:71285318:1 gene:ENSMUSG00000053012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC005704 // GenBank // Mus musculus lysine-rich coiled-coil 1, mRNA (cDNA clone MGC:11901 IMAGE:3598565), complete cds. // chr6 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC046798 // GenBank // Mus musculus lysine-rich coiled-coil 1, mRNA (cDNA clone MGC:61275 IMAGE:6403577), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC069863 // GenBank // Mus musculus lysine-rich coiled-coil 1, mRNA (cDNA clone MGC:78050 IMAGE:6306896), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71283986:71284756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 38 // 10 // 11 // 0
ENSMUST00000114185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:6:71293765:71302718:1 gene:ENSMUSG00000073018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC147402 // GenBank // Mus musculus gene model 1070, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182560 IMAGE:9056454), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71294084:71300709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_009858 // RefSeq // Mus musculus CD8 antigen, beta chain 1 (Cd8b1), mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:71322836:71337477:1 gene:ENSMUSG00000053044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// M16799 // GenBank // Mouse lymphocyte differentiation antigen (Lyt-3) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// M17534 // GenBank // Mouse T-cell membrane glycoprotein (Ly-3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// M19504 // GenBank // Mouse T-cell differentiation antigen (Ly-3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// X07698 // GenBank // Mouse mRNA for CD8 molecule Ly-3 chain. // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// U34882 // GenBank // Mus musculus CD8 mRNA, Lyt3a allele, complete cds. // chr6 // 69 // 43 // 9 // 13 // 0 /// GENSCAN00000044376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71322857:71335403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0
NM_001081110 // RefSeq // Mus musculus CD8 antigen, alpha chain (Cd8a), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_009857 // RefSeq // Mus musculus CD8 antigen, alpha chain (Cd8a), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000066747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:71373427:71379171:1 gene:ENSMUSG00000053977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000172321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:71373427:71379171:1 gene:ENSMUSG00000053977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// AK088447 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430016N08 product:CD8 antigen, alpha chain, full insert sequence. // chr6 // 88 // 89 // 21 // 24 // 0 /// BC030679 // GenBank // Mus musculus CD8 antigen, alpha chain, mRNA (cDNA clone MGC:41580 IMAGE:1247019), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// M12052 // GenBank // Mouse T-cell differentiation antigen (Lyt-2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// M12825 // GenBank // Mouse T-cell differentiation antigen Lyt-2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// M16981 // GenBank // Mouse differentiation antigen Lyt-2-alpha-prime mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// U34881 // GenBank // Mus musculus CD8 mRNA, Lyt2a allele, complete cds. // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000044401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71373553:71396200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_025783 // RefSeq // Mus musculus charged multivesicular body protein 3 (Chmp3), mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000059462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:71543797:71581579:1 gene:ENSMUSG00000053119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC049964 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 24 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:59065 IMAGE:3154282), complete cds. // chr6 // 93 // 68 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000065364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:71543917:71582609:1 gene:ENSMUSG00000053119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// AK014818 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921505F14 product:NEUROENDOCRINE DIFFERENTIATION FACTOR homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// XM_006506480 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus charged multivesicular body protein 3 (Chmp3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// XM_006506482 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus charged multivesicular body protein 3 (Chmp3), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// ENSMUST00000128382 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:71577589:71579819:1 gene:ENSMUSG00000053119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// GENSCAN00000044386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71534433:71579792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NM_178608 // RefSeq // Mus musculus receptor accessory protein 1 (Reep1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000121469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:71707561:71810710:1 gene:ENSMUSG00000052852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY562229 // GenBank // Mus musculus receptor expression enhancing protein 1 (Reep1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC046826 // GenBank // Mus musculus receptor accessory protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:61280 IMAGE:6417744), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000044393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71753239:71783048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_009088 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) I polypeptide A (Polr1a), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006505804 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (RNA) I polypeptide A (Polr1a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000055296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:71909053:71979356:1 gene:ENSMUSG00000049553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AF000938 // GenBank // Mus musculus RNA polymerase I largest subunit (RPA1) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// AK031689 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030490M24 product:RNA polymerase 1-4 (194 kDa subunit), full insert sequence. // chr6 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// AK087773 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330019F09 product:RNA polymerase 1-4 (194 kDa subunit), full insert sequence. // chr6 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// BC053744 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) I polypeptide A, mRNA (cDNA clone MGC:59379 IMAGE:6505567), complete cds. // chr6 // 94 // 92 // 32 // 34 // 0 /// AK077818 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5832447M01 product:RNA polymerase 1-4 (194 kDa subunit), full insert sequence. // chr6 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1 /// GENSCAN00000040963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:71909163:71978515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0
NM_001282071 // RefSeq // Mus musculus surfactant associated protein B (Sftpb), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NM_147779 // RefSeq // Mus musculus surfactant associated protein B (Sftpb), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000070437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:72304625:72312932:1 gene:ENSMUSG00000056370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000182014 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:72304620:72314367:1 gene:ENSMUSG00000056370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000183018 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:72304610:72314371:1 gene:ENSMUSG00000056370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000183278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:72304625:72312932:1 gene:ENSMUSG00000056370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000182765 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:72306406:72314045:1 gene:ENSMUSG00000056370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// GENSCAN00000040958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72304625:72314333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// BC111910 // GenBank // Mus musculus surfactant associated protein B, mRNA (cDNA clone IMAGE:40046445). // chr6 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1
NM_026696 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 0610030E20 gene (0610030E20Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006506534 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 0610030E20 gene (0610030E20Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000077783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:72347317:72353158:1 gene:ENSMUSG00000058706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC064080 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610030E20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:73698 IMAGE:1246433), complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC066053 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610030E20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:91374 IMAGE:6827710), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC117811 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610030E20 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40092655). // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC117812 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610030E20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143727 IMAGE:40092656), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT057423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT057422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000040960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72347469:72358773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_144916 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 150A (Tmem150a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000069695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:72355447:72359762:1 gene:ENSMUSG00000055912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000132243 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:72355447:72359762:1 gene:ENSMUSG00000055912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC014685 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 150, mRNA (cDNA clone MGC:25977 IMAGE:4241375), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC028825 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 150, mRNA (cDNA clone MGC:37802 IMAGE:5097962), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72347469:72358773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_019802 // RefSeq // Mus musculus gamma-glutamyl carboxylase (Ggcx), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006506414 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-glutamyl carboxylase (Ggcx), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506415 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-glutamyl carboxylase (Ggcx), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// XM_006506416 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-glutamyl carboxylase (Ggcx), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000065906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:72414308:72430712:1 gene:ENSMUSG00000053460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF087938 // GenBank // Mus musculus gamma-carboxylase mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC138763 // GenBank // Mus musculus gamma-glutamyl carboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:170390 IMAGE:8861785), complete cds. // chr6 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC138764 // GenBank // Mus musculus gamma-glutamyl carboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:170391 IMAGE:8861786), complete cds. // chr6 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72414407:72430156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_026159 // RefSeq // Mus musculus retinol saturase (all trans retinol 13,14 reductase) (Retsat), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000070597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:72598475:72608425:1 gene:ENSMUSG00000056666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000176364 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:72598628:72607381:1 gene:ENSMUSG00000056666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AY704159 // GenBank // Mus musculus all-trans-13,14-dihydroretinol saturase mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC117751 // GenBank // Mus musculus retinol saturase (all trans retinol 13,14 reductase), mRNA (cDNA clone MGC:143538 IMAGE:40090531), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// EF620363 // GenBank // Mus musculus PPSIG-3 isoform (Ppsig) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// EF620364 // GenBank // Mus musculus PPSIG-2 isoform (Ppsig) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// EF620365 // GenBank // Mus musculus PPSIG-1 isoform (Ppsig) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000176168 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:72598628:72607381:1 gene:ENSMUSG00000056666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// GENSCAN00000040944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:72598628:72607381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0
NR_040421 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15401 (Gm15401), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_040422 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15401 (Gm15401), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081929 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:72629837:72637366:1 gene:ENSMUSG00000072999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101278 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:72636253:72637717:1 gene:ENSMUSG00000072999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK131839 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810035C01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156497 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:72629288:72636483:1 gene:ENSMUSG00000072999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT057444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019879 // RefSeq // Mus musculus succinate-CoA ligase, GDP-forming, alpha subunit (Suclg1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000064740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:73248382:73276911:1 gene:ENSMUSG00000052738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000123159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:73248652:73264273:1 gene:ENSMUSG00000052738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000173409 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:73260360:73264269:1 gene:ENSMUSG00000052738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AF144101 // GenBank // Mus musculus succinyl-CoA synthetase (Sucla1) mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC011087 // GenBank // Mus musculus succinate-CoA ligase, GDP-forming, alpha subunit, mRNA (cDNA clone MGC:18990 IMAGE:4012310), complete cds. // chr6 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000127660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:73248668:73263051:1 gene:ENSMUSG00000052738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// AK139288 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730094K07 product:succinate-CoA ligase, GDP-forming, alpha subunit, full insert sequence. // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000036303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:73248696:73421143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_028880 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 (Lrrtm1), mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000020400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:77242689:77257791:1 gene:ENSMUSG00000060780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000159616 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:77242697:77245517:1 gene:ENSMUSG00000060780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000161677 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:77242718:77245511:1 gene:ENSMUSG00000060780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC027803 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, mRNA (cDNA clone MGC:38174 IMAGE:5321979), complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
NM_011036 // RefSeq // Mus musculus regenerating islet-derived 3 beta (Reg3b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000096904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:78370885:78373466:1 gene:ENSMUSG00000071356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC027525 // GenBank // Mus musculus regenerating islet-derived 3 beta, mRNA (cDNA clone MGC:41159 IMAGE:3471932), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D13509 // GenBank // Mus musculus mRNA for PAP homologous protein, complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// D63359 // GenBank // Mus musculus mRNA for regIIIbeta/PAP protein, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:78371205:78383608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_011259 // RefSeq // Mus musculus regenerating islet-derived 3 alpha (Reg3a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000101272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:78380709:78383839:1 gene:ENSMUSG00000079516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC119153 // GenBank // Mus musculus regenerating islet-derived 3 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:155469 IMAGE:8733902), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// D63356 // GenBank // Mus musculus mRNA for regIIIalpha protein, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D63357 // GenBank // Mus musculus mRNA for regIIIalpha protein, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:78371205:78383608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_009043 // RefSeq // Mus musculus regenerating islet-derived 2 (Reg2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:78405155:78408097:1 gene:ENSMUSG00000023140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098503 // GenBank // Mus musculus regenerating islet-derived 2, mRNA (cDNA clone MGC:107500 IMAGE:6431377), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:78405513:78419034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_009042 // RefSeq // Mus musculus regenerating islet-derived 1 (Reg1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000079926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:78425983:78428666:1 gene:ENSMUSG00000059654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC028761 // GenBank // Mus musculus regenerating islet-derived 1, mRNA (cDNA clone MGC:41218 IMAGE:1263580), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:78426331:78428466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000083352 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:78911167:78911330:1 gene:ENSMUSG00000094980 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083278 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:81638311:81638469:1 gene:ENSMUSG00000065212 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT057520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_145570 // RefSeq // Mus musculus eva-1 homolog A (C. elegans) (Eva1a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006505960 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus eva-1 homolog A (C. elegans) (Eva1a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006505962 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus eva-1 homolog A (C. elegans) (Eva1a), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000042974 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:82041623:82093099:1 gene:ENSMUSG00000035104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149023 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:82052307:82092160:1 gene:ENSMUSG00000035104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// BC014699 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 176, member A, mRNA (cDNA clone MGC:25911 IMAGE:4221746), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC027150 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 176, member A, mRNA (cDNA clone MGC:37042 IMAGE:4950341), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150976 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:82041043:82091895:1 gene:ENSMUSG00000035104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:82071143:82092164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000052461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:82242174:82242512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_009313 // RefSeq // Mus musculus tachykinin receptor 1 (Tacr1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000032122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:82402475:82560103:1 gene:ENSMUSG00000030043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC075631 // GenBank // Mus musculus tachykinin receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:100033 IMAGE:30536972), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC098332 // GenBank // Mus musculus tachykinin receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:106524 IMAGE:30618488), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:82487373:82557218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_033079 // RefSeq // Mus musculus meiosis 1 associated protein (M1ap), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006507116 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus meiosis 1 associated protein (M1ap), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000113980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:82946902:83030183:1 gene:ENSMUSG00000030041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF084364 // GenBank // Mus musculus D6MM5E protein (D6Mm5e) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC119803 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 6, Miriam Meisler 5, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:148256 IMAGE:40107692), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC122521 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 6, Miriam Meisler 5, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:148255 IMAGE:40107688), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:82956467:83029937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_013586 // RefSeq // Mus musculus lysyl oxidase-like 3 (Loxl3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000000707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83034173:83052562:1 gene:ENSMUSG00000000693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF053368 // GenBank // Mus musculus lysyl oxidase-related protein 2 (Lor2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC011298 // GenBank // Mus musculus lysyl oxidase-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:19423 IMAGE:3488978), complete cds. // chr6 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000101257 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:83034173:83052562:1 gene:ENSMUSG00000000693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000039703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83035482:83050873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_007517 // RefSeq // Mus musculus ancient ubiquitous protein 1 (Aup1), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000092618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83054653:83057680:1 gene:ENSMUSG00000068328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// BC012699 // GenBank // Mus musculus ancient ubiquitous protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:13961 IMAGE:3986517), complete cds. // chr6 // 97 // 80 // 32 // 33 // 0 /// BC016485 // GenBank // Mus musculus ancient ubiquitous protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:11483 IMAGE:3962982), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// U41736 // GenBank // Mus musculus ancient ubiquitous 46 kDa protein AUP1 precursor (Aup1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// AK156867 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830104B06 product:ancient ubiquitous protein, full insert sequence. // chr6 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1 /// AK144497 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630080L16 product:ancient ubiquitous protein, full insert sequence. // chr6 // 49 // 49 // 20 // 41 // 1 /// GENSCAN00000039675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83054696:83057398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 68 // 27 // 28 // 0
NM_033606 // RefSeq // Mus musculus DEAQ RNA-dependent ATPase (Dqx1), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506808 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAQ RNA-dependent ATPase (Dqx1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006506813 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAQ RNA-dependent ATPase (Dqx1), transcript variant X7, mRNA. // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000077502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83057844:83067210:1 gene:ENSMUSG00000009145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF318278 // GenBank // Mus musculus DEAQ RNA-dependent ATPase DQX1 (Dqx1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC048936 // GenBank // Mus musculus DEAQ RNA-dependent ATPase, mRNA (cDNA clone IMAGE:6395460), complete cds. // chr6 // 88 // 59 // 14 // 16 // 0 /// BC075680 // GenBank // Mus musculus DEAQ RNA-dependent ATPase, mRNA (cDNA clone MGC:100014 IMAGE:30612145), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506809 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAQ RNA-dependent ATPase (Dqx1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000039700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83058508:83066592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_197992 // RefSeq // Mus musculus polycomb group ring finger 1 (Pcgf1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000092614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83078390:83080847:1 gene:ENSMUSG00000069678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000165164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83078346:83080855:1 gene:ENSMUSG00000069678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000177177 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:83078630:83080854:1 gene:ENSMUSG00000069678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// AK008048 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010002K04 product:nervous system polycomb 1, full insert sequence. // chr6 // 88 // 73 // 7 // 8 // 0 /// BC028560 // GenBank // Mus musculus polycomb group ring finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:41745 IMAGE:1380201), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000176027 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83078630:83080757:1 gene:ENSMUSG00000069678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
NM_010692 // RefSeq // Mus musculus ladybird homeobox homolog 2 (Drosophila) (Lbx2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83086367:83088243:1 gene:ENSMUSG00000034968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151508 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83087338:83088096:1 gene:ENSMUSG00000034968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// AF146150 // GenBank // Mus musculus ladybird-like homeodomain protein LBX2 (Lbx2) mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC109347 // GenBank // Mus musculus ladybird homeobox homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:130325 IMAGE:40055655), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83078422:83109673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001081266 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 142 (Ccdc142), mRNA. // chr6 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// NM_026744 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L53 (Mrpl53), mRNA. // chr6 // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000101253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83101617:83109939:1 gene:ENSMUSG00000079511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000101254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:83101617:83108377:1 gene:ENSMUSG00000079511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 49 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000113938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83109095:83109939:1 gene:ENSMUSG00000030037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000129656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83109120:83109939:1 gene:ENSMUSG00000030037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// BC022162 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L53, mRNA (cDNA clone MGC:37995 IMAGE:5148541), complete cds. // chr6 // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// BC065995 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L53, mRNA (cDNA clone MGC:90068 IMAGE:5688315), complete cds. // chr6 // 61 // 61 // 25 // 41 // 1 /// AK038734 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230058J24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1 /// GENSCAN00000039689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83078422:83109673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 73 // 30 // 41 // 1
NM_020619 // RefSeq // Mus musculus mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Mogs), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000032114 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83115496:83118898:1 gene:ENSMUSG00000030036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC051949 // GenBank // Mus musculus glucosidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:62203 IMAGE:5716189), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83115581:83118708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_027948 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700003E16 gene (1700003E16Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000032106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83156404:83162975:1 gene:ENSMUSG00000030030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK005628 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700003E16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC126949 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700003E16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143552 IMAGE:40090681), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83160656:83303497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSMUST00000038658 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:83326080:83343775:1 gene:ENSMUSG00000043131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055261 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83326016:83343776:1 gene:ENSMUSG00000043131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_028382 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA B230319C09 gene (B230319C09Rik), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000063376 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:83441755:83448322:1 gene:ENSMUSG00000051844 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000167886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83441812:83442640:1 gene:ENSMUSG00000051844 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000170986 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:83441810:83445360:1 gene:ENSMUSG00000051844 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK075695 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1190020E20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT057610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT057611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_011912 // RefSeq // Mus musculus ventral anterior homeobox 2 (Vax2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037807 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:83711264:83738313:1 gene:ENSMUSG00000034777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF028715 // GenBank // Mus musculus ventral retina homeodomain protein (vex) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090635 // GenBank // Mus musculus ventral anterior homeobox containing gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:116595 IMAGE:30942578), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116389 // GenBank // Mus musculus ventral anterior homeobox containing gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:144411 IMAGE:40101824), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC116390 // GenBank // Mus musculus ventral anterior homeobox containing gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:144412 IMAGE:40101825), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83711297:83737983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_134157 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit B1 (Atp6v1b1), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000006431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83743017:83758809:1 gene:ENSMUSG00000006269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF435091 // GenBank // Mus musculus vacuolar proton translocating ATPase B1 isoform mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK078810 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430420B20 product:SIMILAR TO ATPASE, H+ TRANSPORTING, LYSOSOMAL (VACUOLAR PROTON PUMP), BETA POLYPEPTIDE, 56/58KD, ISOFORM 1 (RENAL TUBULAR ACIDOSIS WITH DEAFNESS) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC017127 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit B1, mRNA (cDNA clone MGC:27582 IMAGE:4489144), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC062202 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit B1, mRNA (cDNA clone MGC:70240 IMAGE:2650839), complete cds. // chr6 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83743085:83758493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_029245 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 53 (Ankrd53), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000014891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83762644:83768326:1 gene:ENSMUSG00000014747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83762866:83768303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001166371 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, matrin-like (Zfml), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NM_008717 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, matrin-like (Zfml), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006505711 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, matrin-like (Zfml), transcript variant X8, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006505713 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, matrin-like (Zfml), transcript variant X10, mRNA. // chr6 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000032088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83914353:83986869:1 gene:ENSMUSG00000030016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83914353:83986869:1 gene:ENSMUSG00000030016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:83914390:83986869:1 gene:ENSMUSG00000030016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC076615 // GenBank // Mus musculus zinc finger, matrin-like, mRNA (cDNA clone MGC:96818 IMAGE:30640388), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// D83033 // GenBank // Mus musculus mRNA for nuclear protein, NP220, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:83928855:84021950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0
NM_008723 // RefSeq // Mus musculus nucleoplasmin 3 (Npm3), mRNA. // chr6 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0 /// NR_002702 // RefSeq // Mus musculus nucleoplasmin 3, pseudogene 1 (Npm3-ps1), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000070215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:19:45747734:45749591:-1 gene:ENSMUSG00000056209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0 /// ENSMUST00000119728 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85076192:85076719:1 gene:ENSMUSG00000081669 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC048491 // GenBank // Mus musculus nucleoplasmin 3, mRNA (cDNA clone MGC:58307 IMAGE:6704326), complete cds. // chr6 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0 /// U64450 // GenBank // Mus musculus nucleophosmin/nucleoplasmin-3 (Npm3) mRNA, complete cds. // chr6 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0 /// GENSCAN00000020072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:45748171:45749556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0 /// GENSCAN00000048490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85076291:85076719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
NM_001034902 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5878 (Gm5878), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_403489 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635901 (LOC102635901), transcript variant X1, ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:85111416:85126125:-1 gene:ENSMUSG00000072952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85140505:85143649:1 gene:ENSMUSG00000072950 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000089584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85155005:85155968:1 gene:ENSMUSG00000068303 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85140225:85179202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000187705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85152621:85155512:1 gene:ENSMUSG00000068303 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 94 // 94 // 15 // 16 // 1
NM_010131 // RefSeq // Mus musculus empty spiracles homeobox 1 (Emx1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045942 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85187438:85204358:1 gene:ENSMUSG00000033726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85193519:85204462:1 gene:ENSMUSG00000033726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85187943:85204076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001007472 // RefSeq // Mus musculus notochord homolog (Xenopus laevis) (Noto), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000089578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85423886:85428877:1 gene:ENSMUSG00000068302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000174469 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:85424068:85428277:1 gene:ENSMUSG00000068302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC139154 // GenBank // Mus musculus notochord homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:170781 IMAGE:8862176), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC139155 // GenBank // Mus musculus notochord homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:170782 IMAGE:8862177), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85400276:85428103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_144918 // RefSeq // Mus musculus SET and MYND domain containing 5 (Smyd5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000045693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85431989:85446435:1 gene:ENSMUSG00000033706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000134405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85441630:85445443:1 gene:ENSMUSG00000033706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000152218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85432002:85440342:1 gene:ENSMUSG00000033706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000156322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85441725:85444960:1 gene:ENSMUSG00000033706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC016525 // GenBank // Mus musculus SET and MYND domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:29044 IMAGE:3601356), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000130928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85441740:85445197:1 gene:ENSMUSG00000033706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000048507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85432005:85445216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT057700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_007638 // RefSeq // Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 7 (eta) (Cct7), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000032078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:85451505:85468477:1 gene:ENSMUSG00000030007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC008255 // GenBank // Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 7 (eta), mRNA (cDNA clone MGC:6499 IMAGE:2648519), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85458619:85468277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_145223 // RefSeq // Mus musculus Alstrom syndrome 1 (Alms1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000072018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85587531:85702753:1 gene:ENSMUSG00000063810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF425257 // GenBank // Mus musculus Almstrom syndrome 1 protein (Alms1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85587646:85702421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_145223 // RefSeq // Mus musculus Alstrom syndrome 1 (Alms1), mRNA. // chr6 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// NR_040440 // RefSeq // Mus musculus Alstrom syndrome 1, pseudogene 2 (Alms1-ps2), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000072018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85587531:85702753:1 gene:ENSMUSG00000063810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENSMUST00000159498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85721925:85756526:1 gene:ENSMUSG00000090256 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000160606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85792117:85804057:1 gene:ENSMUSG00000090098 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000161983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85774393:85804057:1 gene:ENSMUSG00000090098 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF425257 // GenBank // Mus musculus Almstrom syndrome 1 protein (Alms1) mRNA, complete cds. // chr6 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// AK172934 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0328 protein. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85779230:85803728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85726754:85756312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85587646:85702421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_145223 // RefSeq // Mus musculus Alstrom syndrome 1 (Alms1), mRNA. // chr6 // 80 // 94 // 24 // 30 // 0 /// NR_040440 // RefSeq // Mus musculus Alstrom syndrome 1, pseudogene 2 (Alms1-ps2), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000072018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:85587531:85702753:1 gene:ENSMUSG00000063810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 94 // 24 // 30 // 0 /// ENSMUST00000159498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85721925:85756526:1 gene:ENSMUSG00000090256 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000160606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85792117:85804057:1 gene:ENSMUSG00000090098 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000161983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:85774393:85804057:1 gene:ENSMUSG00000090098 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF425257 // GenBank // Mus musculus Almstrom syndrome 1 protein (Alms1) mRNA, complete cds. // chr6 // 76 // 91 // 22 // 29 // 0 /// AK172934 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0328 protein. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85779230:85803728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85726754:85756312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85587646:85702421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_012013 // RefSeq // Mus musculus folliculogenesis specific basic helix-loop-helix (Figla), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006506186 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus folliculogenesis specific basic helix-loop-helix (Figla), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000032070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:86017191:86020996:1 gene:ENSMUSG00000030001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// JN700518 // GenBank // Mus musculus strain Kunming factor in the germline alpha (Figla) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// U91840 // GenBank // Mus musculus transcription factor FIGa mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:85987004:86189498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_031199 // RefSeq // Mus musculus transforming growth factor alpha (Tgfa), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:86195251:86275449:1 gene:ENSMUSG00000029999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK162680 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930016D10 product:transforming growth factor alpha, full insert sequence. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC132185 // GenBank // Mus musculus transforming growth factor alpha, mRNA (cDNA clone MGC:163816 IMAGE:40130462), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC132211 // GenBank // Mus musculus transforming growth factor alpha, mRNA (cDNA clone MGC:163842 IMAGE:40130488), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// M92420 // GenBank // Mouse transforming growth factor alpha mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// U65016 // GenBank // Mus musculus transforming growth factor alpha (TGFa) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:86211052:86322399:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_006506475 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 136, member A (Fam136a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000071492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:86365683:86370057:1 gene:ENSMUSG00000057497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC024049 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010309E21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35736 IMAGE:5100000), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// BC103775 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010309E21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117903 IMAGE:6485116), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
NM_026506 // RefSeq // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G (Snrpg), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000053575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26098872:26099257:-1 gene:ENSMUSG00000049124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// ENSMUST00000089558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:86371583:86378902:1 gene:ENSMUSG00000057278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// AK017852 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730563P06 product:small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G, full insert sequence. // chr6 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC027499 // GenBank // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G, mRNA (cDNA clone MGC:41014 IMAGE:1430048), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC051470 // GenBank // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G, mRNA (cDNA clone MGC:62888 IMAGE:1244608), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC094411 // GenBank // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G, mRNA (cDNA clone MGC:106960 IMAGE:1380524), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:86365733:86378783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26098991:26099221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 41 // 13 // 14 // 0
NM_026414 // RefSeq // Mus musculus aspartic peptidase, retroviral-like 1 (Asprv1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000043400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:86628174:86629702:1 gene:ENSMUSG00000033508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC057938 // GenBank // Mus musculus aspartic peptidase, retroviral-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5325201), partial cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ841260 // GenBank // Mus musculus skin-specific retroviral-like aspartic protease mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC108357 // GenBank // Mus musculus aspartic peptidase, retroviral-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3591797), partial cds. // chr6 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:86608307:86629193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001040106 // RefSeq // Mus musculus AP2 associated kinase 1 (Aak1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// NM_177762 // RefSeq // Mus musculus AP2 associated kinase 1 (Aak1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// XM_006506191 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus AP2 associated kinase 1 (Aak1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000003710 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:86850053:86991864:1 gene:ENSMUSG00000057230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000089519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:86849517:86991864:1 gene:ENSMUSG00000057230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000113668 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:86849628:86951019:1 gene:ENSMUSG00000057230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 22 // 22 // 0 /// AK158879 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K430355L13 product:similar to BMP-2 inducible protein kinase (EC 2.7.1.37) (BIKe) [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 100 // 47 // 22 // 22 // 0 /// BC141176 // GenBank // Mus musculus AP2 associated kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:176137 IMAGE:9055788), complete cds. // chr6 // 93 // 91 // 40 // 43 // 0 /// GENSCAN00000053788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:86904898:86996963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 26 // 47 // 1
NM_001040106 // RefSeq // Mus musculus AP2 associated kinase 1 (Aak1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_177762 // RefSeq // Mus musculus AP2 associated kinase 1 (Aak1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001170591 // RefSeq // Mus musculus NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog (S. cerevisiae) (Nfu1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NM_020045 // RefSeq // Mus musculus NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog (S. cerevisiae) (Nfu1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006506421 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog (S. cerevisiae) (Nfu1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000032060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:87009836:87028454:1 gene:ENSMUSG00000029993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000117583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:87009889:87028446:1 gene:ENSMUSG00000029993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000120240 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:87009236:87028461:1 gene:ENSMUSG00000029993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AY335195 // GenBank // Mus musculus NifU-like protein HIRIP5 (Hirip5) mRNA, partial cds. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC018355 // GenBank // Mus musculus NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:5675 IMAGE:3584656), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000053793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87009901:87112251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_025467 // RefSeq // Mus musculus gastrokine 2 (Gkn2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:87373365:87379494:1 gene:ENSMUSG00000030049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY943909 // GenBank // Mus musculus blottin precursor, mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC099445 // GenBank // Mus musculus gastrokine 2, mRNA (cDNA clone MGC:117638 IMAGE:30788014), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87373396:87379303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_009756 // RefSeq // Mus musculus bone morphogenetic protein 10 (Bmp10), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:87429002:87434512:1 gene:ENSMUSG00000030046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF101033 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 10 precursor (Bmp10) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145044 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:178600 IMAGE:9053592), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145983 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:175870 IMAGE:40131286), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87429033:87434492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000095740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:87672430:87680237:1 gene:ENSMUSG00000071332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000159884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:87672430:87681024:1 gene:ENSMUSG00000071332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160577 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:87672382:87679286:1 gene:ENSMUSG00000071332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AK042791 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730024K24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AK054052 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230015B07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT057832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT057833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000160743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:87730869:87734017:1 gene:ENSMUSG00000068263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB041550 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-4779. // chr6 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NM_001159697 // RefSeq // Mus musculus EF hand and coiled-coil domain containing 1 (Efcc1), mRNA. // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// XM_006506439 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF hand and coiled-coil domain containing 1 (Efcc1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// ENSMUST00000032132 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:87730893:87755908:1 gene:ENSMUSG00000068263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// ENSMUST00000159570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:87730869:87755451:1 gene:ENSMUSG00000068263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000053777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87730893:87754859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001159697 // RefSeq // Mus musculus EF hand and coiled-coil domain containing 1 (Efcc1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032132 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:87730893:87755908:1 gene:ENSMUSG00000068263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:87730869:87755451:1 gene:ENSMUSG00000068263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506439 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF hand and coiled-coil domain containing 1 (Efcc1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// ENSMUST00000159681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:87753522:87754762:1 gene:ENSMUSG00000068263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000053777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87730893:87754859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT057837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_018762 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein 9 (platelet) (Gp9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506393 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycoprotein 9 (platelet) (Gp9), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006506394 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycoprotein 9 (platelet) (Gp9), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:87778136:87779762:1 gene:ENSMUSG00000030054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB007464 // GenBank // Mus musculus mRNA for platelet glycoprotein IX, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC111106 // GenBank // Mus musculus glycoprotein 9 (platelet), mRNA (cDNA clone MGC:130579 IMAGE:40055578), complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000053794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87779098:87779538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0
NM_173737 // RefSeq // Mus musculus 5-hydroxymethylcytosine (hmC) binding, ES cell specific (Hmces), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_377441 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 5-hydroxymethylcytosine (hmC) binding, ES cell specific (Hmces), transcript variant X1, misc_RNA. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000032141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:87913935:87936629:1 gene:ENSMUSG00000030060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:87914306:87936629:1 gene:ENSMUSG00000030060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000124551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:87917924:87933425:1 gene:ENSMUSG00000030060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000148914 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:87932993:87936529:1 gene:ENSMUSG00000030060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// AK018400 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430410A17 product:similar to DC12 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC024401 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 8430410A17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:36239 IMAGE:5026919), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC064070 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 8430410A17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:73655 IMAGE:3371288), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:87850547:87936326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
ENSMUST00000153372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:6:87981683:88005471:1 gene:ENSMUSG00000084950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK020089 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6230424B18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NR_026990 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5577 (Gm5577), long non-coding RNA. // chr6 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// ENSMUST00000143871 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:87981683:87984172:1 gene:ENSMUSG00000084950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
NM_133933 // RefSeq // Mus musculus ribophorin I (Rpn1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000032143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:88084473:88105304:1 gene:ENSMUSG00000030062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC016080 // GenBank // Mus musculus ribophorin I, mRNA (cDNA clone MGC:27584 IMAGE:4489287), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC051038 // GenBank HTC // Mus musculus ribophorin I, mRNA (cDNA clone IMAGE:4924480), with apparent retained intron. // chr6 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000044097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:88084531:88103547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0
NM_008090 // RefSeq // Mus musculus GATA binding protein 2 (Gata2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000015197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:88198664:88207030:1 gene:ENSMUSG00000015053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000170089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:88193891:88207030:1 gene:ENSMUSG00000015053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB000096 // GenBank // Mus musculus mRNA for GATA-2 protein, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK004675 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1200009I20 product:GATA binding protein 2, full insert sequence. // chr6 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// BC107009 // GenBank // Mus musculus GATA binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:129339 IMAGE:40047573), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC107010 // GenBank // Mus musculus GATA binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:129340 IMAGE:40047574), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:88199561:88205494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_019964 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 8 (Dnajb8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:88222268:88223257:1 gene:ENSMUSG00000048206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB028856 // GenBank // Mus musculus mRNA for mDj6, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049591 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:58232 IMAGE:6773959), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061112 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:74233 IMAGE:6772873), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:88222484:88223167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_019685 // RefSeq // Mus musculus RuvB-like protein 1 (Ruvbl1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000032165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:88465409:88497572:1 gene:ENSMUSG00000030079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF100694 // GenBank // Mus musculus Pontin52 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC004718 // GenBank // Mus musculus RuvB-like protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:5718 IMAGE:3582426), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000129035 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:88465727:88482187:1 gene:ENSMUSG00000030079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000032718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:139928314:139929609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:88465528:88497387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
NR_045880 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15612 (Gm15612), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147542 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:88842854:88847274:1 gene:ENSMUSG00000085828 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175017 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933427D06 gene (4933427D06Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505981 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4933427D06 gene (4933427D06Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_006505982 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4933427D06 gene (4933427D06Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000068968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:89096115:89110030:1 gene:ENSMUSG00000055403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000168837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:88950683:89110030:1 gene:ENSMUSG00000055403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC098480 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933427D06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107427 IMAGE:30048571), complete cds. // chr6 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// ENSMUST00000153517 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:89096110:89107834:1 gene:ENSMUSG00000055403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENSMUST00000153981 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:89101018:89107853:1 gene:ENSMUSG00000055403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NR_121593 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1965 (Gm1965), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_121594 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1965 (Gm1965), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_121595 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1965 (Gm1965), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NR_121596 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1965 (Gm1965), transcript variant 4, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000160361 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:89141005:89147385:1 gene:ENSMUSG00000090254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000161362 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:89141005:89147353:1 gene:ENSMUSG00000090254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162900 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:89141005:89146674:1 gene:ENSMUSG00000090254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147526 // GenBank // Mus musculus gene model 1965, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182624 IMAGE:9056518), complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC147534 // GenBank // Mus musculus gene model 1965, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182631 IMAGE:9056525), complete cds. // chr6 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// BC172072 // GenBank // Mus musculus gene model 1965, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:198777 IMAGE:9054358), complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK145455 // GenBank HTC // Mus musculus 1 cell embryo 1 cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I0C0047N05 product:epsin 2, full insert sequence. // chr6 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NR_121593 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1965 (Gm1965), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NR_121594 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1965 (Gm1965), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NR_121595 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1965 (Gm1965), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NR_121596 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1965 (Gm1965), transcript variant 4, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000160361 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:89141005:89147385:1 gene:ENSMUSG00000090254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000161362 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:89141005:89147353:1 gene:ENSMUSG00000090254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000162900 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:89141005:89146674:1 gene:ENSMUSG00000090254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001178058 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin reductase 3 (Txnrd3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_153162 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin reductase 3 (Txnrd3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000000828 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:89643988:89675529:1 gene:ENSMUSG00000000811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF349659 // GenBank // Mus musculus thioredoxin and glutathione reductase (Tgr) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC076605 // GenBank // Mus musculus thioredoxin reductase 3, mRNA (cDNA clone MGC:100108 IMAGE:30628949), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_001178059 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin reductase 3 (Txnrd3), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// NM_001178060 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin reductase 3 (Txnrd3), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// ENSMUST00000101171 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:89643988:89675529:1 gene:ENSMUSG00000000811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// GENSCAN00000055931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:89612941:89835570:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0
NM_053228 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 40 (Vmn1r40), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000075158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:89714203:89715135:1 gene:ENSMUSG00000096051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053230 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 41 (Vmn1r41), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000089417 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:89746479:89747414:1 gene:ENSMUSG00000094586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000127465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:147452748:147453707:-1 gene:ENSMUSG00000067262 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 92 // 93 // 34 // 37 // 0 /// NM_053226 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 53 (Vmn1r53), mRNA. // chr6 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// ENSMUST00000076086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90223317:90224438:-1 gene:ENSMUSG00000057697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// BC125605 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, B3, mRNA (cDNA clone MGC:159308 IMAGE:40130120), complete cds. // chr6 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// BC132002 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, B3, mRNA (cDNA clone MGC:163633 IMAGE:40130279), complete cds. // chr6 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// GENSCAN00000023740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:147403811:147453089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// GENSCAN00000055931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:89612941:89835570:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
NM_053227 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 44 (Vmn1r44), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006505380 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal 1 receptor 44 (Vmn1r44), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089420 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:89893177:89894284:1 gene:ENSMUSG00000068234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151088 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, B4, mRNA (cDNA clone MGC:184001 IMAGE:9088001), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000174767 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:89907677:89908618:1 gene:ENSMUSG00000092228 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT057928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_053229 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 46 (Vmn1r46), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000075797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:89976171:89977100:1 gene:ENSMUSG00000061653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_053219 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 47 (Vmn1r47), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074881 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90021888:90022820:1 gene:ENSMUSG00000060724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053225 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 50 (Vmn1r50), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90107275:90108207:1 gene:ENSMUSG00000094553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107183 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, B1, mRNA (cDNA clone MGC:130072 IMAGE:40050746), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011683 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 51 (Vmn1r51), mRNA. // chr6 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000072859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:90128424:90130990:1 gene:ENSMUSG00000062818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000174204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:90122643:90130990:1 gene:ENSMUSG00000062818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC046308 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, A1, mRNA (cDNA clone MGC:54628 IMAGE:6306893), complete cds. // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// Y12725 // GenBank // Mus musculus mRNA for pheromone receptor 1. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000174389 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:90153047:90154002:1 gene:ENSMUSG00000061843 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_011684 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 45 (Vmn1r45), mRNA. // chr6 // 66 // 100 // 19 // 29 // 0 /// NM_053218 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 48 (Vmn1r48), mRNA. // chr6 // 57 // 97 // 16 // 28 // 0 /// ENSMUST00000054202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:89931649:89940507:-1 gene:ENSMUSG00000044248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 66 // 100 // 19 // 29 // 0 /// ENSMUST00000073415 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90035933:90036841:-1 gene:ENSMUSG00000057592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 97 // 16 // 28 // 0 /// NM_053219 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 47 (Vmn1r47), mRNA. // chr6 // 39 // 97 // 11 // 28 // 0 /// ENSMUST00000074881 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90021888:90022820:1 gene:ENSMUSG00000060724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 39 // 97 // 11 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:89933030:89933626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 69 // 90 // 18 // 26 // 0 /// Y12724 // GenBank // Mus musculus mRNA for pheromone receptor 2. // chr6 // 66 // 100 // 19 // 29 // 0
NM_053222 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 52 (Vmn1r52), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000079832 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90178716:90179645:1 gene:ENSMUSG00000060816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_053223 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, A8 (V1ra8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000078371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90202793:90203682:1 gene:ENSMUSG00000062546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC138392 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, A8, mRNA (cDNA clone MGC:170017 IMAGE:8861412), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC138394 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, A8, mRNA (cDNA clone MGC:170019 IMAGE:8861414), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000089408 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCm38:6:90242322:90243243:1 gene:ENSMUSG00000101620 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene gene:ENSMUSG00000068228 // chr6 // 80 // 91 // 8 // 10 // 0 /// ENSMUST00000174046 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:90242272:90243214:1 gene:ENSMUSG00000099754 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene gene:ENSMUSG00000068228 // chr6 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// NONMMUT057936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// NONMMUT057937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_053224 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 54 (Vmn1r54), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000058039 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90269106:90270053:1 gene:ENSMUSG00000047203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006506090 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC048671 (BC048671), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000167550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90302131:90305449:1 gene:ENSMUSG00000049694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC048671 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC048671, mRNA (cDNA clone MGC:58841 IMAGE:6774036), complete cds. // chr6 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NM_177738 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC048671 (BC048671), mRNA. // chr6 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// ENSMUST00000054799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90301219:90305448:1 gene:ENSMUSG00000049694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// GENSCAN00000043788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:90269814:90305276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_144940 // RefSeq // Mus musculus urocanase domain containing 1 (Uroc1), mRNA. // chr6 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// ENSMUST00000046128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90333289:90364551:1 gene:ENSMUSG00000034456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// ENSMUST00000164761 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:90333289:90364546:1 gene:ENSMUSG00000034456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC022133 // GenBank // Mus musculus urocanase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:37818 IMAGE:5098655), complete cds. // chr6 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000043792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:90327879:90363247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
NM_030260 // RefSeq // Mus musculus ZXD family zinc finger C (Zxdc), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 74 // 35 // 35 // 0 /// NM_173002 // RefSeq // Mus musculus ZXD family zinc finger C (Zxdc), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000045740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:90369494:90385394:1 gene:ENSMUSG00000034430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000075117 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90369494:90403490:1 gene:ENSMUSG00000034430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000113539 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:90369492:90385084:1 gene:ENSMUSG00000034430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 35 // 35 // 0 /// AK169517 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630071O07 product:DNA-binding protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr6 // 95 // 43 // 19 // 20 // 0 /// BC003332 // GenBank // Mus musculus ZXD family zinc finger C, mRNA (cDNA clone MGC:7160 IMAGE:3256958), complete cds. // chr6 // 100 // 60 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000137483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:90369618:90374551:1 gene:ENSMUSG00000034430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 34 // 34 // 16 // 47 // 1 /// AK141613 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630044H09 product:weakly similar to Zinc finger X-linked protein ZXDB [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 34 // 34 // 16 // 47 // 1 /// GENSCAN00000043790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:90369659:90402106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 33 // 33 // 0
NM_023184 // RefSeq // Mus musculus Kruppel-like factor 15 (Klf15), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90462576:90475238:1 gene:ENSMUSG00000030087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113530 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:90465304:90475235:1 gene:ENSMUSG00000030087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF317225 // GenBank // Mus musculus cardiovascular Kruppel-like factor mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC013486 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like factor 15, mRNA (cDNA clone MGC:19125 IMAGE:4211067), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006506472 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Kruppel-like factor 15 (Klf15), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// XR_377485 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Kruppel-like factor 15 (Klf15), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000043786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:90462740:90536839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001037493 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 41, member 3 (Slc41a3), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006506625 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 41, member 3 (Slc41a3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006506626 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 41, member 3 (Slc41a3), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000032177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:90619246:90646412:1 gene:ENSMUSG00000030089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC011108 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 41, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:18986 IMAGE:4011836), complete cds. // chr6 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// NM_027868 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 41, member 3 (Slc41a3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1 /// ENSMUST00000044019 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:90604725:90646412:1 gene:ENSMUSG00000030089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1 /// GENSCAN00000043791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:90539503:90645973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1
NM_144919 // RefSeq // Mus musculus histone deacetylase 11 (Hdac11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000041736 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:91156665:91174692:1 gene:ENSMUSG00000034245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000143621 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:91156826:91166522:1 gene:ENSMUSG00000034245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000155007 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:91157397:91173516:1 gene:ENSMUSG00000034245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC016208 // GenBank // Mus musculus histone deacetylase 11, mRNA (cDNA clone MGC:27683 IMAGE:4913322), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006505996 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histone deacetylase 11 (Hdac11), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENSMUST00000127768 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:91157164:91167848:1 gene:ENSMUSG00000034245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000022766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91142807:91173264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_007992 // RefSeq // Mus musculus fibulin 2 (Fbln2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000041544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:91212455:91272540:1 gene:ENSMUSG00000064080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000113498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:91212455:91272539:1 gene:ENSMUSG00000064080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000137029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:91265879:91272431:1 gene:ENSMUSG00000064080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AK087922 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430001A04 product:fibulin 2, full insert sequence. // chr6 // 83 // 32 // 10 // 12 // 0 /// AK159361 // GenBank HTC // Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I420018E07 product:fibulin 2, full insert sequence. // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC005443 // GenBank // Mus musculus fibulin 2, mRNA (cDNA clone MGC:6112 IMAGE:3490759), complete cds. // chr6 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// NM_001081437 // RefSeq // Mus musculus fibulin 2 (Fbln2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// GENSCAN00000022763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91233076:91271879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0
NM_028766 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 43 (Tmem43), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000032183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:91473703:91488459:1 gene:ENSMUSG00000030095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC005521 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3494778, containing frame-shift errors. // chr6 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// BC024933 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:28213 IMAGE:3990353), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// ENSMUST00000140246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:91473759:91479140:1 gene:ENSMUSG00000030095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// GENSCAN00000022762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91475467:91486947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
NM_026309 // RefSeq // Mus musculus LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000040607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:91515928:91522625:1 gene:ENSMUSG00000034192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC054368 // GenBank // Mus musculus LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:62561 IMAGE:5353718), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC062875 // GenBank // Mus musculus LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:86095 IMAGE:5684590), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000126253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:91515957:91519835:1 gene:ENSMUSG00000034192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// GENSCAN00000022749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91516058:91634485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_009320 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, taurine), member 6 (Slc6a6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000032185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:91684067:91759063:1 gene:ENSMUSG00000030096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC015245 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, taurine), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:18313 IMAGE:4242193), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// L03292 // GenBank // Mus musculus sodium-dependent taurine transporter (Slc6a6) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK162776 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130042D17 product:solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, taurine), member 6, full insert sequence. // chr6 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// GENSCAN00000022754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91739814:91755057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// AF020194 // GenBank // Mus musculus retinal taurine transporter (mTAUT) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91684093:91726250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_172730 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 174 (Ccdc174), mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000037783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:91878053:91899843:1 gene:ENSMUSG00000034083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000136090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:91878053:91899843:1 gene:ENSMUSG00000034083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC051147 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C130022K22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58539 IMAGE:6595828), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// XM_006505998 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 174 (Ccdc174), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 83 // 83 // 15 // 18 // 1 /// ENSMUST00000138868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:91878075:91884987:1 gene:ENSMUSG00000034083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// ENSMUST00000139240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:91878075:91888317:1 gene:ENSMUSG00000034083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// BC038871 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C130022K22 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:1395122), partial cds. // chr6 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// GENSCAN00000041713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91843261:91900462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// NONMMUT057995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
NM_198668 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930590J08 gene (4930590J08Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006506331 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930590J08 gene (4930590J08Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// XM_006506332 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930590J08 gene (4930590J08Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000059318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:91914759:91950640:1 gene:ENSMUSG00000034063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91914759:92167633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1
NM_172731 // RefSeq // Mus musculus FYVE, RhoGEF and PH domain containing 5 (Fgd5), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000089334 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:91978878:92076004:1 gene:ENSMUSG00000034037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000113466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:91987110:92076004:1 gene:ENSMUSG00000034037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000146743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:92067429:92076004:1 gene:ENSMUSG00000034037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// AK049341 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330025N11 product:hypothetical FYVE Zn-finger, rabphilin/VPS27/FAB1 type/Pleckstrin homology (PH) domain containing protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// AK220153 // GenBank // Mus musculus mRNA for mFLJ00274 protein. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC145502 // GenBank // Mus musculus FYVE, RhoGEF and PH domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:179073 IMAGE:9054065), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// BC150786 // GenBank // Mus musculus FYVE, RhoGEF and PH domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:183697 IMAGE:9087697), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000041712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:91914759:92167633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0
XR_377879 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730049H05 gene (A730049H05Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XR_377880 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730049H05 gene (A730049H05Rik), transcript variant X4, misc_RNA. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XR_377882 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730049H05 gene (A730049H05Rik), transcript variant X6, misc_RNA. // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XR_403587 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730049H05 gene (A730049H05Rik), transcript variant X5, misc_RNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000057977 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:92816478:92843465:1 gene:ENSMUSG00000048636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK043032 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730049H05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_377878 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730049H05 gene (A730049H05Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// XR_377883 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A730049H05 gene (A730049H05Rik), transcript variant X7, misc_RNA. // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSMUST00000133858 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:92827632:92847174:1 gene:ENSMUSG00000048636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// AK054516 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330035H20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONMMUT058028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENSMUST00000158444 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:93890615:93890750:1 gene:ENSMUSG00000089069 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008785 // RefSeq // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 8 (Kbtbd8), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001102670 // RefSeq // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 8 (Kbtbd8), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000032107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:95117740:95129656:1 gene:ENSMUSG00000030031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000119582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:95117880:95129718:1 gene:ENSMUSG00000030031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000122938 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:95117240:95121890:1 gene:ENSMUSG00000030031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000145387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:95117984:95121797:1 gene:ENSMUSG00000030031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC088734 // GenBank // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:91215 IMAGE:30459462), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:95114722:95126940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000089304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:95322112:95322210:1 gene:ENSMUSG00000068181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_182808 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 19, member A1 (Fam19a1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006506268 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 19, member A1 (Fam19a1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000075080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:96115311:96656467:1 gene:ENSMUSG00000059187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000122120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:96113154:96657198:1 gene:ENSMUSG00000059187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK049880 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630007B19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AY325120 // GenBank // Mus musculus TAFA1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC132179 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 19, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:163810 IMAGE:40130456), complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC132181 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 19, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:163812 IMAGE:40130458), complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000125951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:96113242:96131950:1 gene:ENSMUSG00000059187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONMMUT058114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_022992 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 6 interacting protein 5 (Arl6ip5), mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:97210689:97233315:1 gene:ENSMUSG00000035199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF265214 // GenBank // Mus musculus JWA protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AF421860 // GenBank // Mus musculus EAAT3 glutamate transporter regulator GTRAP3-18 (Arl6ip5) mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 83 // 22 // 25 // 0 /// BC003897 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 6 interacting protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:6760 IMAGE:3600236), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// D87211 // GenBank // Mus musculus mRNA for addicsin, complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:97228420:97240243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001113198 // RefSeq // Mus musculus microphthalmia-associated transcription factor (Mitf), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_001178049 // RefSeq // Mus musculus microphthalmia-associated transcription factor (Mitf), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_008601 // RefSeq // Mus musculus microphthalmia-associated transcription factor (Mitf), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006505690 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus microphthalmia-associated transcription factor (Mitf), transcript variant X7, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006505691 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus microphthalmia-associated transcription factor (Mitf), transcript variant X8, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000043637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:97807058:98021349:1 gene:ENSMUSG00000035158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT058150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
XR_377901 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635190 (LOC102635190), ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK160945 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4022404I08 product:hypothetical Histidine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_008158 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 27 (Gpr27), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:99692679:99693818:1 gene:ENSMUSG00000072875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:99692679:99693818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000019136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:99734151:99771127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0
NM_198612 // RefSeq // Mus musculus glucoside xylosyltransferase 2 (Gxylt2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006506007 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucoside xylosyltransferase 2 (Gxylt2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000032157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:100704734:100805081:1 gene:ENSMUSG00000030074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC049816 // GenBank // Mus musculus glycosyltransferase 8 domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:59592 IMAGE:6509198), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:100782971:100804700:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_182939 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 4, regulatory subunit 2 (Ppp4r2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000063854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:100833638:100868717:1 gene:ENSMUSG00000052144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC056340 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 4, regulatory subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:73463 IMAGE:5703151), complete cds. // chr6 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// BC098464 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 4, regulatory subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:107373 IMAGE:30093511), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC110429 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 4, regulatory subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:117881 IMAGE:5350332), complete cds. // chr6 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// BC112399 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 4, regulatory subunit 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40059703), partial cds. // chr6 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
AK050931 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030040J03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027989 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9871 (Gm9871), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC144923 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053471. // chr6 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONMMUT058262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000034761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:102062210:102071941:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
NM_017383 // RefSeq // Mus musculus contactin 6 (Cntn6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506381 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus contactin 6 (Cntn6), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506385 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus contactin 6 (Cntn6), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000089215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:104492922:104863406:1 gene:ENSMUSG00000030092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161070 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:104492811:104863248:1 gene:ENSMUSG00000030092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000162872 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:104493248:104863401:1 gene:ENSMUSG00000030092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AB032602 // GenBank // Mus musculus mNB-3 mRNA for neural recognition molecule NB-3, complete cds. // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC076594 // GenBank // Mus musculus contactin 6, mRNA (cDNA clone MGC:100179 IMAGE:30649661), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:104650424:104804446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:104832498:104879396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_008516 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat protein 1, neuronal (Lrrn1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:107529726:107570228:1 gene:ENSMUSG00000034648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC031122 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat protein 1, neuronal, mRNA (cDNA clone MGC:36161 IMAGE:4972803), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC058701 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat protein 1, neuronal, mRNA (cDNA clone MGC:73917 IMAGE:6853964), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D45913 // GenBank // Mus musculus NLRR-1 mRNA for leucine-rich-repeat protein, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:107567243:107569393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001276356 // RefSeq // Mus musculus SET domain without mariner transposase fusion (Setmar), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_178391 // RefSeq // Mus musculus SET domain without mariner transposase fusion (Setmar), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:108065045:108077122:1 gene:ENSMUSG00000034639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138140 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:108065062:108076061:1 gene:ENSMUSG00000034639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC045208 // GenBank // Mus musculus SET domain and mariner transposase fusion gene, mRNA (cDNA clone MGC:49525 IMAGE:5067523), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010585 // RefSeq // Mus musculus inositol 1,4,5-trisphosphate receptor 1 (Itpr1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// ENSMUST00000032192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:108213118:108551109:1 gene:ENSMUSG00000030102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// AK049015 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230091M20 product:inositol 1,4,5-triphosphate receptor 1, full insert sequence. // chr6 // 100 // 35 // 22 // 22 // 0 /// BC003271 // GenBank // Mus musculus inositol 1,4,5-triphosphate receptor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3499330), complete cds. // chr6 // 93 // 22 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000005255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:108348468:108420607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 52 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:108464750:108556287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 27 // 27 // 17 // 63 // 1
NM_011498 // RefSeq // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member e40 (Bhlhe40), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:108660629:108666925:1 gene:ENSMUSG00000030103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163617 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:108660874:108662699:1 gene:ENSMUSG00000030103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AF010305 // GenBank // Mus musculus Stra13 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AF364051 // GenBank // Mus musculus CLAST5 (Clast5) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC010720 // GenBank // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member e40, mRNA (cDNA clone MGC:11663 IMAGE:3707474), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:108659347:108665332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_026011 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 8B (Arl8b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000032196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:108783059:108823723:1 gene:ENSMUSG00000030105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB185206 // GenBank // Mus musculus gie1 mRNA for novel small G protein indispensable for equal chromosome segregation 1, complete cds. // chr6 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// BC013719 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 8B, mRNA (cDNA clone MGC:19261 IMAGE:3983809), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// CT010337 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G0252D for gene Arl10c, ADP-ribosylation factor-like 10C; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:108810235:108821614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0
NM_138677 // RefSeq // Mus musculus ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 1 (Edem1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000089162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:108828641:108859356:1 gene:ENSMUSG00000030104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB042828 // GenBank // Mus musculus EDEM mRNA, complete cds, similar to alpha-mannosidase. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC023237 // GenBank // Mus musculus ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:25513 IMAGE:2654113), complete cds. // chr6 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:108828740:108912960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_177328 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 7 (Grm7), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006505299 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 7 (Grm7), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// XR_377401 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 7 (Grm7), transcript variant X8, misc_RNA. // chr6 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000071076 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:110645581:111566067:1 gene:ENSMUSG00000056755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000172951 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:110645582:111567230:1 gene:ENSMUSG00000056755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000174018 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:110645581:111497090:1 gene:ENSMUSG00000056755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// AK053447 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130018M02 product:METABOTROPIC GLUTAMATE RECEPTOR 7 PRECURSOR homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr6 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// BC080315 // GenBank // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 7, mRNA (cDNA clone MGC:90857 IMAGE:6853901), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006505301 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 7 (Grm7), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 81 // 81 // 30 // 37 // 1
NM_144799 // RefSeq // Mus musculus LIM and cysteine-rich domains 1 (Lmcd1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000032376 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:112273758:112330425:1 gene:ENSMUSG00000057604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC019124 // GenBank // Mus musculus LIM and cysteine-rich domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:29184 IMAGE:5007525), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:112271027:112318269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_007617 // RefSeq // Mus musculus caveolin 3 (Cav3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:112459501:112472871:1 gene:ENSMUSG00000062694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024383 // GenBank // Mus musculus caveolin 3, mRNA (cDNA clone MGC:36120 IMAGE:4988598), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U36579 // GenBank // Mus musculus M-caveolin (Cav) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:112459812:112472478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000120088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:112563642:112565207:1 gene:ENSMUSG00000083443 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000028060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:112544484:112564736:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
ENSMUST00000117265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:112976213:112976383:1 gene:ENSMUSG00000094189 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000045694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:112976213:112976383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT058387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_008188 // RefSeq // Mus musculus THUMP domain containing 3 (Thumpd3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006505579 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus THUMP domain containing 3 (Thumpd3), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000032398 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:113046225:113068273:1 gene:ENSMUSG00000030264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000153310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:113065426:113067896:1 gene:ENSMUSG00000030264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// BC002024 // GenBank // Mus musculus THUMP domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:5905 IMAGE:3591186), complete cds. // chr6 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// BC012688 // GenBank // Mus musculus THUMP domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:13936 IMAGE:3987438), complete cds. // chr6 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// BC046800 // GenBank // Mus musculus THUMP domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:61349 IMAGE:6403880), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U83176 // GenBank // Mus musculus ROSA 26 transcription AS ROSA26AS mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000137396 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:113046315:113060797:1 gene:ENSMUSG00000030264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// AK017246 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430400L19 product:gene trap ROSA 26 antisense, Philippe Soriano, full insert sequence. // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000045690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113047447:113077226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001205025 // RefSeq // Mus musculus jagunal homolog 1 (Drosophila) (Jagn1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NM_001243739 // RefSeq // Mus musculus jagunal homolog 1 (Drosophila) (Jagn1), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_026365 // RefSeq // Mus musculus jagunal homolog 1 (Drosophila) (Jagn1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:113442569:113448229:1 gene:ENSMUSG00000051256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011296 // GenBank // Mus musculus jagunal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:19251 IMAGE:3962988), complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC025910 // GenBank // Mus musculus jagunal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:30981 IMAGE:5252891), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC037019 // GenBank // Mus musculus jagunal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:46770 IMAGE:5364053), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113442709:113447720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
NM_134159 // RefSeq // Mus musculus interleukin 17 receptor C (Il17rc), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 97 // 85 // 32 // 33 // 0 /// NM_178942 // RefSeq // Mus musculus interleukin 17 receptor C (Il17rc), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// XM_006505667 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 17 receptor C (Il17rc), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000058300 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:113471427:113483140:1 gene:ENSMUSG00000030281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 85 // 32 // 33 // 0 /// ENSMUST00000113062 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:113471507:113483140:1 gene:ENSMUSG00000030281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000149899 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:113472794:113483140:1 gene:ENSMUSG00000030281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// AF458066 // GenBank // Mus musculus IL-17RC mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 85 // 31 // 33 // 0 /// BC004759 // GenBank // Mus musculus interleukin 17 receptor C, mRNA (cDNA clone MGC:6973 IMAGE:3154616), complete cds. // chr6 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000045677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113470955:113483119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0
NM_001033244 // RefSeq // Mus musculus Fanconi anemia, complementation group D2 (Fancd2), mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000036340 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:113531682:113597017:1 gene:ENSMUSG00000034023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC139004 // GenBank // Mus musculus Fanconi anemia, complementation group D2, mRNA (cDNA clone MGC:170631 IMAGE:8862026), complete cds. // chr6 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000045691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113535774:113595959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0
NM_133937 // RefSeq // Mus musculus BRICK1, SCAR/WAVE actin-nucleating complex subunit (Brk1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:113604772:113616948:1 gene:ENSMUSG00000033940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010582 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6720456B07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:6981 IMAGE:3154777), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000045692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113604779:113629569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_009507 // RefSeq // Mus musculus von Hippel-Lindau tumor suppressor (Vhl), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035673 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:113623959:113631633:1 gene:ENSMUSG00000033933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128770 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:113624721:113629761:1 gene:ENSMUSG00000033933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC052417 // GenBank // Mus musculus von Hippel-Lindau syndrome, mRNA (cDNA clone MGC:64631 IMAGE:6402536), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U12570 // GenBank // Mus musculus ICR outbred strain von Hippel-Lindau tumor suppressor protein (VHL) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113604779:113629569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001033463 // RefSeq // Mus musculus TatD DNase domain containing 2 (Tatdn2), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XR_377476 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TatD DNase domain containing 2 (Tatdn2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000089018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:113697050:113711069:1 gene:ENSMUSG00000056952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000113022 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:113697673:113710205:1 gene:ENSMUSG00000056952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000153661 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:113704817:113711066:1 gene:ENSMUSG00000056952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC141065 // GenBank // Mus musculus TatD DNase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:176026 IMAGE:9055677), complete cds. // chr6 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC145318 // GenBank // Mus musculus TatD DNase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:178881 IMAGE:9053873), complete cds. // chr6 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000138420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:113707276:113710449:1 gene:ENSMUSG00000056952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000045693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:113638548:113710030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0
NM_172890 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 11 (Slc6a11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000032451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:114131241:114249886:1 gene:ENSMUSG00000030307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:114131277:114167318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000012008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:114173736:114247740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_178703 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 1 (Slc6a1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000032454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:114282635:114317522:1 gene:ENSMUSG00000030310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK047663 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030005M05 product:solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 1, full insert sequence. // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AK053798 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130309B01 product:gamma-aminobutyric acid (GABA-A) transporter 1, full insert sequence. // chr6 // 93 // 44 // 13 // 14 // 0 /// BC059080 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:69943 IMAGE:6827121), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK053831 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130314A22 product:gamma-aminobutyric acid (GABA-A) transporter 1, full insert sequence. // chr6 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000012009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:114260744:114315409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
AF096867 // GenBank // Mus musculus synapsin IIb mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_001111015 // RefSeq // Mus musculus synapsin II (Syn2), transcript variant IIa, mRNA. // chr6 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// NM_013681 // RefSeq // Mus musculus synapsin II (Syn2), transcript variant IIb, mRNA. // chr6 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000009538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:115134902:115282626:1 gene:ENSMUSG00000009394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// ENSMUST00000169345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:115134902:115276559:1 gene:ENSMUSG00000009394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// BC085129 // GenBank // Mus musculus synapsin II, mRNA (cDNA clone MGC:113746 IMAGE:5701861), complete cds. // chr6 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// AK043584 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830010H21 product:synapsin II, full insert sequence. // chr6 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000040977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:115253323:115281223:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000040989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:115221251:115244848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_199033 // RefSeq // Mus musculus tRNA splicing endonuclease 2 homolog (S. cerevisiae) (Tsen2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000040234 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:115544664:115578350:1 gene:ENSMUSG00000042389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000143520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:115574448:115577991:1 gene:ENSMUSG00000042389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// BC061473 // GenBank // Mus musculus tRNA splicing endonuclease 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:69703 IMAGE:6414790), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000130425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:115544664:115554272:1 gene:ENSMUSG00000042389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000040979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:115544827:115577990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
NM_023290 // RefSeq // Mus musculus makorin, ring finger protein, 2 (Mkrn2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000000449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:115601938:115618670:1 gene:ENSMUSG00000000439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF277171 // GenBank // Mus musculus Makorin RING zinc-finger protein 2 (Mkrn2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC025547 // GenBank // Mus musculus makorin, ring finger protein, 2, mRNA (cDNA clone MGC:35811 IMAGE:5320887), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:115601988:115617731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 57 // 11 // 12 // 0
AK142706 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830015D18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_025958 // RefSeq // Mus musculus cullin-associated and neddylation-dissociated 2 (putative) (Cand2), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000075995 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:115774538:115804893:1 gene:ENSMUSG00000030319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK170420 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630103A12 product:TIP120-family protein TIP120B homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr6 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// BC056365 // GenBank // Mus musculus cullin-associated and neddylation-dissociated 2 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:73507 IMAGE:6824847), complete cds. // chr6 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:115774611:115795871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
NM_145383 // RefSeq // Mus musculus rhodopsin (Rho), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006505860 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus rhodopsin (Rho), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006505861 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus rhodopsin (Rho), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000032471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:115931927:115938829:1 gene:ENSMUSG00000030324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC013125 // GenBank // Mus musculus rhodopsin, mRNA (cDNA clone MGC:21585 IMAGE:4500760), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC031766 // GenBank // Mus musculus rhodopsin, mRNA (cDNA clone MGC:25387 IMAGE:4527040), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:115857998:115950078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
XM_006505860 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus rhodopsin (Rho), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK164314 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130033I21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:115857998:115950078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_138311 // RefSeq // Mus musculus H1 histone family, member O, oocyte-specific (H1foo), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000037831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:115944938:115950231:1 gene:ENSMUSG00000042279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000161617 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:115944938:115950231:1 gene:ENSMUSG00000042279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161969 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:115944938:115950236:1 gene:ENSMUSG00000042279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000162084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:115944938:115950231:1 gene:ENSMUSG00000042279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK165127 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330021E10 product:H1 histone family, member O, oocyte-specific, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY007195 // GenBank // Mus musculus oocyte-specific linker histone H1oo mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC137916 // GenBank // Mus musculus H1 histone family, member O, oocyte-specific, mRNA (cDNA clone MGC:169540 IMAGE:8860935), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:115857998:115950078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_026585 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 21 (Fam21), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XR_377465 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 21 (Fam21), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:116208033:116262668:1 gene:ENSMUSG00000024104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK122320 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0592 protein. // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC032177 // GenBank HTC // Mus musculus DNA segment, Chr 6, Wayne State University 116, expressed, mRNA (cDNA clone IMAGE:5342165), containing frame-shift errors. // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC056942 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 6, Wayne State University 116, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:66612 IMAGE:6827177), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:116207271:116262474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_001290338 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, AN1-type domain 4 (Zfand4), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NM_001290339 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, AN1-type domain 4 (Zfand4), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006506506 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, AN1-type domain 4 (Zfand4), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006506510 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, AN1-type domain 4 (Zfand4), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000036503 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:116264222:116330298:1 gene:ENSMUSG00000042213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000069169 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:116266532:116330298:1 gene:ENSMUSG00000042213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000112900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:116264222:116330298:1 gene:ENSMUSG00000042213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000153244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:116264245:116305870:1 gene:ENSMUSG00000042213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC048508 // GenBank // Mus musculus AN1, ubiquitin-like, homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone IMAGE:6774262), complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000022379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:116273689:116326963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_146912 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 211 (Olfr211), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:116493611:116494540:1 gene:ENSMUSG00000053391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:116493611:116541438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_001011800 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 212 (Olfr212), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006506140 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 212 (Olfr212), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000075756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:116506516:116517965:1 gene:ENSMUSG00000053251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC141000 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 212, mRNA (cDNA clone MGC:175961 IMAGE:9055612), complete cds. // chr6 // 67 // 100 // 12 // 18 // 0 /// XM_006506141 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 212 (Olfr212), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// GENSCAN00000022371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:116493611:116541438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
NM_001011801 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 213 (Olfr213), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000121958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:116540455:116541438:1 gene:ENSMUSG00000081649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000022371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:116493611:116541438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_146759 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 214 (Olfr214), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:116556405:116557412:1 gene:ENSMUSG00000051046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138076 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 214, mRNA (cDNA clone MGC:169700 IMAGE:8861095), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138077 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 214, mRNA (cDNA clone MGC:169701 IMAGE:8861096), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:116556427:116557389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166580 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 8430408G22 gene (8430408G22Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_145980 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 8430408G22 gene (8430408G22Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:116650684:116652847:1 gene:ENSMUSG00000048489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:116650684:116652847:1 gene:ENSMUSG00000048489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB024924 // GenBank // Mus musculus FSEG (fat-specific expressed gene) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC031533 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 8430408G22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:6835 IMAGE:2649431), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC058515 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 8430408G22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:66693 IMAGE:6820680), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000008011 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:117559697:117568193:1 gene:ENSMUSG00000054488 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK049916 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630010N09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162741 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:117559697:117572329:1 gene:ENSMUSG00000054488 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// AK162833 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230027N10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT058544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NR_024329 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2900097C17 gene (2900097C17Rik), long non-coding RNA. // chr6 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// NONMMUT040754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// NONMMUT040757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// NONMMUT040758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 93 // 98 // 37 // 40 // 0 /// NONMMUT040759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// NONMMUT058552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// AB041588 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-2630, similar to Mus musculus Gng3lg mRNA. // chr6 // 98 // 98 // 40 // 41 // 1 /// NONMMUT024635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 44 // 44 // 18 // 41 // 1
NM_026053 // RefSeq // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 6 (Gemin6), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_886102 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 6253 (Gm6253), mRNA. // chr6 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000069486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:80224441:80228497:1 gene:ENSMUSG00000055760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:117808720:117809220:1 gene:ENSMUSG00000071237 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// AK018385 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430406F20 product:GEMIN6 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// BC025157 // GenBank // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:36701 IMAGE:3670793), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000156869 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:80224441:80226818:1 gene:ENSMUSG00000055760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:80225640:80228113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000041503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:117808720:117809220:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000050794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:6498163:6498606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 50 // 10 // 14 // 0 /// NONMMUT030742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
ENSMUST00000118257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:117997207:117997992:1 gene:ENSMUSG00000082791 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000041506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:117979117:117997992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_027526 // RefSeq // Mus musculus RasGEF domain family, member 1A (Rasgef1a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006506597 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RasGEF domain family, member 1A (Rasgef1a), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006506599 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RasGEF domain family, member 1A (Rasgef1a), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000164960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:118066385:118091546:1 gene:ENSMUSG00000030134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK018120 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330404M18 product:weakly similar to CDNA FLJ31695 FIS, CLONE NT2RI2005811, WEAKLY SIMILAR TO CELL DIVISION CONTROL PROTEIN 25 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr6 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// AK158756 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230312J18 product:RasGEF domain family, member 1A, full insert sequence. // chr6 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// BC138284 // GenBank // Mus musculus RasGEF domain family, member 1A, mRNA (cDNA clone MGC:169908 IMAGE:8861303), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC145232 // GenBank // Mus musculus RasGEF domain family, member 1A, mRNA (cDNA clone MGC:178792 IMAGE:9053784), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC145752 // GenBank // Mus musculus RasGEF domain family, member 1A, mRNA (cDNA clone MGC:175639 IMAGE:40131055), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000041508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:118054819:118089830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_133940 // RefSeq // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 14 (Fbxl14), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000032094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:119479668:119482630:1 gene:ENSMUSG00000030019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC021329 // GenBank // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 14, mRNA (cDNA clone MGC:29433 IMAGE:3710945), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NR_030776 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3110021A11 gene (3110021A11Rik), long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:119848193:119849013:1 gene:ENSMUSG00000050604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000121192 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:119892920:119893803:1 gene:ENSMUSG00000080719 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:119892956:119893396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0
NM_016718 // RefSeq // Mus musculus ninjurin 2 (Ninj2), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006506221 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ninjurin 2 (Ninj2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// XM_006506222 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ninjurin 2 (Ninj2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// XM_006506223 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ninjurin 2 (Ninj2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// XM_006506224 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ninjurin 2 (Ninj2), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000035244 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:120193823:120200334:1 gene:ENSMUSG00000041377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000112711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:120093350:120200339:1 gene:ENSMUSG00000041377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AF205634 // GenBank // Mus musculus ninjurin2 (Ninj2) mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// BC116206 // GenBank // Mus musculus ninjurin 2, mRNA (cDNA clone MGC:143502 IMAGE:40090174), complete cds. // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120197915:120198809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000181956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:120294364:120295432:1 gene:ENSMUSG00000097481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK052280 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330020A13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145997 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 5A (Kdm5a), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000005108 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:120364124:120444574:1 gene:ENSMUSG00000030180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000100996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:120364099:120444574:1 gene:ENSMUSG00000030180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000132009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:120364458:120419446:1 gene:ENSMUSG00000030180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000135802 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:120364124:120419473:1 gene:ENSMUSG00000030180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC010717 // GenBank // Mus musculus jumonji, AT rich interactive domain 1A (Rbp2 like), mRNA (cDNA clone IMAGE:3603073), complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120364614:120482484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_008359 // RefSeq // Mus musculus interleukin 17 receptor A (Il17ra), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000002976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:120463197:120483727:1 gene:ENSMUSG00000002897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// U31993 // GenBank // Mus musculus interleukin 17 receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120364614:120482484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1
NM_001128151 // RefSeq // Mus musculus cat eye syndrome chromosome region, candidate 2 (Cecr2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000100993 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:120666582:120766904:1 gene:ENSMUSG00000071226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:120666421:120771190:1 gene:ENSMUSG00000071226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120718551:120767221:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
NM_001081048 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier), member 18 (Slc25a18), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006507132 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier), member 18 (Slc25a18), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSMUST00000112682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:120773768:120793982:1 gene:ENSMUSG00000004902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC116828 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier), member 18, mRNA (cDNA clone MGC:151205 IMAGE:40126147), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC137603 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier), member 18, mRNA (cDNA clone MGC:169227 IMAGE:8860622), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120788194:120793643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120784370:120786778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_153516 // RefSeq // Mus musculus BCL2-like 13 (apoptosis facilitator) (Bcl2l13), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000009256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:120836230:120892842:1 gene:ENSMUSG00000009112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC027307 // GenBank // Mus musculus BCL2-like 13 (apoptosis facilitator), mRNA (cDNA clone MGC:28321 IMAGE:4014844), complete cds. // chr6 // 87 // 77 // 20 // 23 // 0 /// BC029016 // GenBank // Mus musculus BCL2-like 13 (apoptosis facilitator), mRNA (cDNA clone MGC:38758 IMAGE:5358785), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK171256 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630317N13 product:BCL2-like 13 (apoptosis facilitator), full insert sequence. // chr6 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000035039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:120859667:120887391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
XR_378008 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9878 (Gm9878), misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK042438 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630091L03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017379 // RefSeq // Mus musculus tubulin, alpha 8 (Tuba8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:121210734:121226854:1 gene:ENSMUSG00000030137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC017631 // GenBank // Mus musculus tubulin, alpha 8, mRNA (cDNA clone MGC:28850 IMAGE:4507364), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GU591980 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 alpha tubulin 8 (Tuba8) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:121184265:121270517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0
NM_011909 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 18 (Usp18), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000032198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:121245906:121270916:1 gene:ENSMUSG00000030107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF069502 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific protease UBP43 mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC138562 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 18, mRNA (cDNA clone MGC:170187 IMAGE:8861582), complete cds. // chr6 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// BC138577 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 18, mRNA (cDNA clone MGC:170202 IMAGE:8861597), complete cds. // chr6 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// CT010228 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B0451D for gene Usp18, Ubiquitin specific protease 18; complete cds, incl. stopcodon. // chr6 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000035032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:121184265:121270517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_144512 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 13 (Slc6a13), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000064580 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:121300227:121337733:1 gene:ENSMUSG00000030108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000142021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:121300289:121333591:1 gene:ENSMUSG00000030108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000142419 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:121300782:121324330:1 gene:ENSMUSG00000030108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK078399 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720408E06 product:solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 13, full insert sequence. // chr6 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// BC023117 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 13, mRNA (cDNA clone MGC:28956 IMAGE:4240641), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC029637 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 13, mRNA (cDNA clone MGC:19082 IMAGE:4195373), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:121302762:121365372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_175628 // RefSeq // Mus musculus alpha-2-macroglobulin (A2m), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000032203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:121636173:121679237:1 gene:ENSMUSG00000030111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY185125 // GenBank // Mus musculus alpha-2-macroglobulin-P (A2mp) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC072642 // GenBank // Mus musculus alpha-2-macroglobulin, mRNA (cDNA clone MGC:95993 IMAGE:6839761), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000035041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:121636289:121709205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000035037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:121733030:121784755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0
NM_008645 // RefSeq // Mus musculus murinoglobulin 1 (Mug1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006505698 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus murinoglobulin 1 (Mug1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000032228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:121838541:121889057:1 gene:ENSMUSG00000059908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000148563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:121838578:121881852:1 gene:ENSMUSG00000059908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// AK149376 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730002N16 product:murinoglobulin 1, full insert sequence. // chr6 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC051037 // GenBank // Mus musculus murinoglobulin 1, mRNA (cDNA clone MGC:58950 IMAGE:4195193), complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// M65736 // GenBank // Mouse murinoglobulin mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:121838639:121995707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
NM_008646 // RefSeq // Mus musculus murinoglobulin 2 (Mug2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000081777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:122006798:122085967:1 gene:ENSMUSG00000030131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// M65238 // GenBank // Mouse murinoglobulin (MUG2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122006859:122164957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
NR_003624 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 10319 (Gm10319), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000078431 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:122136628:122150963:1 gene:ENSMUSG00000071204 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_008646 // RefSeq // Mus musculus murinoglobulin 2 (Mug2), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000081777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:122006798:122085967:1 gene:ENSMUSG00000030131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000159439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:122136732:122152016:1 gene:ENSMUSG00000071204 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// M65238 // GenBank // Mouse murinoglobulin (MUG2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122006859:122164957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
XR_403710 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700063H04 gene (1700063H04Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XR_403711 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700063H04 gene (1700063H04Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000043553 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:122391379:122392687:1 gene:ENSMUSG00000040657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK006869 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700063H04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_009645 // RefSeq // Mus musculus activation-induced cytidine deaminase (Aicda), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000043301 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:122553801:122564180:1 gene:ENSMUSG00000040627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160685 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:122560485:122563076:1 gene:ENSMUSG00000040627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AF132979 // GenBank // Mus musculus activation-induced cytidine deaminase (AID) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK080144 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530070C03 product:activation-induced cytidine deaminase, full insert sequence. // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122514343:122563619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENSMUST00000083787 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:122623547:122623658:1 gene:ENSMUSG00000065721 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT058734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_139218 // RefSeq // Mus musculus developmental pluripotency-associated 3 (Dppa3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000049644 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:122626410:122630272:1 gene:ENSMUSG00000046323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000123429 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:122626753:122630272:1 gene:ENSMUSG00000046323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// AB072734 // GenBank // Mus musculus mRNA for PGC7, complete cds. // chr6 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// AF490347 // GenBank // Mus musculus DPPA3 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AY082485 // GenBank // Mus musculus stella mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AY134859 // GenBank // Mus musculus compaction-associated protein 1 (Crg1) mRNA, complete cds. // chr6 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// BC099433 // GenBank // Mus musculus developmental pluripotency-associated 3, mRNA (cDNA clone MGC:117617 IMAGE:30933569), complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// BC100331 // GenBank // Mus musculus developmental pluripotency-associated 3, mRNA (cDNA clone MGC:117618 IMAGE:30934920), complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// BC107340 // GenBank // Mus musculus developmental pluripotency-associated 3, mRNA (cDNA clone MGC:130308 IMAGE:40055218), complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// BC107341 // GenBank // Mus musculus developmental pluripotency-associated 3, mRNA (cDNA clone MGC:130309 IMAGE:40055220), complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000009122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122626523:122630005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_021899 // RefSeq // Mus musculus forkhead box J2 (Foxj2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000003238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:122819914:122845366:1 gene:ENSMUSG00000003154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000177927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:122820511:122845341:1 gene:ENSMUSG00000003154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF253052 // GenBank // Mus musculus fork head transcription factor Fhx (Fhx) mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 92 // 30 // 33 // 0 /// AK154574 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630048I05 product:forkhead box J2, full insert sequence. // chr6 // 75 // 33 // 9 // 12 // 0 /// BC040395 // GenBank // Mus musculus forkhead box J2, mRNA (cDNA clone MGC:28510 IMAGE:4190087), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122801513:122842852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NM_026267 // RefSeq // Mus musculus NECAP endocytosis associated 1 (Necap1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000032477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:122874557:122888934:1 gene:ENSMUSG00000030327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC011466 // GenBank // Mus musculus NECAP endocytosis associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:18995 IMAGE:4013043), complete cds. // chr6 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// BC119133 // GenBank // Mus musculus NECAP endocytosis associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:155449 IMAGE:8733882), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC120841 // GenBank // Mus musculus NECAP endocytosis associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:156078 IMAGE:40129764), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122874569:122897388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_199311 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member a1 (Clec4a1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000060484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:122921848:122934619:1 gene:ENSMUSG00000049037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY397675 // GenBank // Mus musculus dendritic cell inhibitory receptor 4 (Dcir4) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC049354 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member a1, mRNA (cDNA clone MGC:56880 IMAGE:6310008), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_153197 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member a3 (Clec4a3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:122952644:122969874:1 gene:ENSMUSG00000043832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AY397674 // GenBank // Mus musculus dendritic cell inhibitory receptor 3 (Dcir3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NM_001204241 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member a3 (Clec4a3), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// ENSMUST00000117173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:122952515:122969875:1 gene:ENSMUSG00000043832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// BC034893 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member a3, mRNA (cDNA clone MGC:41407 IMAGE:1496162), complete cds. // chr6 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_001005860 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member a4 (Clec4a4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000079379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:122990367:123024105:1 gene:ENSMUSG00000059639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY397673 // GenBank // Mus musculus dendritic cell inhibitory receptor 2 (Dcir2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC104370 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member a4, mRNA (cDNA clone MGC:129456 IMAGE:40049888), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000027683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122921974:123246585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_001190310 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member b1 (Clec4b1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_027218 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member b1 (Clec4b1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006506570 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus C-type lectin domain family 4, member b1 (Clec4b1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000077228 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:123049962:123071544:1 gene:ENSMUSG00000030147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000078559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:123049998:123071555:1 gene:ENSMUSG00000030147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AY230259 // GenBank // Mus musculus dendritic cell immuno-activating receptor alpha isoform (Dcar) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AY230260 // GenBank // Mus musculus dendritic cell immuno-activating receptor beta isoform (Dcar) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AY365134 // GenBank // Mus musculus antigen presenting cell lectin-like receptor A2 (Aplra2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000027683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122921974:123246585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_001004159 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member b2 (Clec4b2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506338 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus C-type lectin domain family 4, member b2 (Clec4b2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000088455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:123172893:123204671:1 gene:ENSMUSG00000067767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY365133 // GenBank // Mus musculus antigen presenting cell lectin-like receptor A1 (Aplra1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006506339 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus C-type lectin domain family 4, member b2 (Clec4b2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// XR_377477 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus C-type lectin domain family 4, member b2 (Clec4b2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000027683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:122921974:123246585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_001163161 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member d (Clec4d), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_010819 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member d (Clec4d), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:123262107:123275268:1 gene:ENSMUSG00000030144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF061272 // GenBank // Mus musculus C-type lectin (Mcl) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC099471 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member d, mRNA (cDNA clone MGC:117678 IMAGE:30845162), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:123267048:123337344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001104632 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 19 (Vmn2r19), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000073948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:123308333:123336537:1 gene:ENSMUSG00000091260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000175794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:123559122:123559878:1 gene:ENSMUSG00000093724 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176474 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:123443775:123444534:1 gene:ENSMUSG00000093652 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT058754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001104638 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 23 (Vmn2r23), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000172391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:123702821:123742291:1 gene:ENSMUSG00000091620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000027682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:123694769:123780690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001104638 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 23 (Vmn2r23), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000172391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:123702821:123742291:1 gene:ENSMUSG00000091620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:123694769:123780690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_001104639 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 24 (Vmn2r24), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000075095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:123778971:123816280:1 gene:ENSMUSG00000072780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_019917 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 26 (Vmn2r26), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000032238 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124024758:124062035:1 gene:ENSMUSG00000096630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF053985 // GenBank // Mus musculus tissue-type vomeronasal neurons putative pheromone receptor V2R1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AY426342 // GenBank // Mus musculus putative pheromone receptor V2R1b mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000021326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124024271:124039934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000021328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124251586:124252554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_001170395 // RefSeq // Mus musculus CD163 antigen (Cd163), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NM_053094 // RefSeq // Mus musculus CD163 antigen (Cd163), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000032234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:124304651:124330527:1 gene:ENSMUSG00000008845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000112541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:124304651:124330527:1 gene:ENSMUSG00000008845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AF274883 // GenBank // Mus musculus macrophage hemoglobin scavenger receptor CD163 precursor, mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 95 // 36 // 37 // 0 /// BC144848 // GenBank // Mus musculus CD163 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:178404 IMAGE:9053396), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// BC145793 // GenBank // Mus musculus CD163 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:175680 IMAGE:40131096), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// DQ058616 // GenBank // Mus musculus CD163v2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// DQ058617 // GenBank // Mus musculus CD163v3 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// AK032012 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330544J03 product:CD163 antigen, full insert sequence. // chr6 // 44 // 44 // 17 // 39 // 1 /// GENSCAN00000021321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124258031:124364442:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0
NM_181344 // RefSeq // Mus musculus complement component 1, r subcomponent-like (C1rl), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000049124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:124493113:124510643:1 gene:ENSMUSG00000038527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF456428 // GenBank // Mus musculus C1r-like protein (C1rlp) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AK162497 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530025L20 product:complement component 1, r subcomponent-like, full insert sequence. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC070472 // GenBank // Mus musculus complement component 1, r subcomponent-like, mRNA (cDNA clone MGC:92956 IMAGE:30627947), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124474101:124522980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_023143 // RefSeq // Mus musculus complement component 1, r subcomponent A (C1ra), mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000068593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:124512632:124523440:1 gene:ENSMUSG00000055172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// AF148216 // GenBank // Mus musculus serine protease mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC004637 // GenBank // Mus musculus complement component 1, r subcomponent, mRNA (cDNA clone MGC:6404 IMAGE:3586055), complete cds. // chr6 // 89 // 75 // 8 // 9 // 0 /// BC093528 // GenBank // Mus musculus complement component 1, r subcomponent, mRNA (cDNA clone MGC:103110 IMAGE:5135606), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// BC172078 // GenBank // Mus musculus complement component 1, r subcomponent, mRNA (cDNA clone MGC:198783 IMAGE:9054364), complete cds. // chr6 // 89 // 75 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000021330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124474101:124522980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_007531 // RefSeq // Mus musculus prohibitin 2 (Phb2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000004375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:124712336:124716950:1 gene:ENSMUSG00000004264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130279 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:124713122:124716640:1 gene:ENSMUSG00000004264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000145447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124712336:124716950:1 gene:ENSMUSG00000004264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY211613 // GenBank // Mus musculus repressor of estrogen receptor activity (Bcap37) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY319418 // GenBank // Mus musculus repressor of estrogen receptor activity (REA) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC145875 // GenBank // Mus musculus prohibitin 2, mRNA (cDNA clone MGC:175762 IMAGE:40131178), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000124779 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:124712336:124713870:1 gene:ENSMUSG00000004264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// AK158423 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930115L10 product:B-cell receptor-associated protein 37, full insert sequence. // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000021325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124712491:124717552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
XR_105027 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A230083G16 gene (A230083G16Rik), misc_RNA. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000069553 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:6:124916863:124925844:1 gene:ENSMUSG00000055818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK038996 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230083G16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001170341 // RefSeq // Mus musculus myeloid leukemia factor 2 (Mlf2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_145385 // RefSeq // Mus musculus myeloid leukemia factor 2 (Mlf2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:124931388:124936138:1 gene:ENSMUSG00000030120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:124931388:124936138:1 gene:ENSMUSG00000030120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003975 // GenBank // Mus musculus myeloid leukemia factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:7424 IMAGE:3488851), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:124931624:124948782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
ENSMUST00000083831 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:124964285:124964387:1 gene:ENSMUSG00000065765 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT058821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001163268 // RefSeq // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 5 (Lpar5), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_001163269 // RefSeq // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 5 (Lpar5), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000088292 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:125067920:125082472:1 gene:ENSMUSG00000067714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:125071277:125081808:1 gene:ENSMUSG00000067714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000171989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:125071277:125082472:1 gene:ENSMUSG00000067714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC116702 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:144679 IMAGE:40104865), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC117528 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:144678 IMAGE:40104864), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:125081318:125082472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_145979 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 4 (Chd4), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000056889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:125095981:125130591:1 gene:ENSMUSG00000063870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000112390 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:125096162:125130591:1 gene:ENSMUSG00000063870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000112392 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:125095981:125130585:1 gene:ENSMUSG00000063870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000124317 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:125113569:125121942:1 gene:ENSMUSG00000063870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 22 // 9 // 9 // 0 /// BC058578 // GenBank // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:68269 IMAGE:6489649), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000017634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:125095492:125161234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0
NM_138747 // RefSeq // Mus musculus NOP2 nucleolar protein (Nop2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000044200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:125131883:125144753:1 gene:ENSMUSG00000038279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC004733 // GenBank // Mus musculus NOP2 nucleolar protein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:7905 IMAGE:3583039), complete cds. // chr6 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC007151 // GenBank // Mus musculus NOP2 nucleolar protein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:6746 IMAGE:3592148), complete cds. // chr6 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:125095492:125161234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_025595 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L51 (Mrpl51), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000032485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:125192165:125195583:1 gene:ENSMUSG00000030335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_011609 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1a (Tnfrsf1a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:125349723:125362484:1 gene:ENSMUSG00000030341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000125880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:125357371:125361105:1 gene:ENSMUSG00000030341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr6 // 82 // 42 // 9 // 11 // 0 /// ENSMUST00000134803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:125360427:125361874:1 gene:ENSMUSG00000030341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000144524 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:125357765:125361778:1 gene:ENSMUSG00000030341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC004599 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1a, mRNA (cDNA clone MGC:6117 IMAGE:3585060), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052675 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1a, mRNA (cDNA clone MGC:60564 IMAGE:30061894), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L26349 // GenBank // Mus musculus Tumor Necrosis Factor Receptor 55 KD (TNF 55) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M59377 // GenBank // Murine tumor necrosis factor II receptor (TNFR-2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// M60468 // GenBank // Mouse tumor necrosis factor receptor 1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:125321884:125361994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_009650 // RefSeq // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 3 (Akap3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000095440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:126853098:126874307:1 gene:ENSMUSG00000030344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF093406 // GenBank // Mus musculus protein kinase A binding protein AKAP110 mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC100458 // GenBank // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:118275 IMAGE:30917596), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:126852597:126874115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_138594 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 6, Wayne State University 163, expressed (D6Wsu163e), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000032497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:126939966:126975704:1 gene:ENSMUSG00000030347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC016429 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 6, Wayne State University 163, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:25665 IMAGE:4486831), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK037095 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930113F12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:126941528:127080478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_010204 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor 6 (Fgf6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000000187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:127015542:127024718:1 gene:ENSMUSG00000000183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M92416 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor (Fgf6) mRNA, 3 end. // chr6 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000016218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:126941528:127080478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_022657 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor 23 (Fgf23), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:127072902:127081408:1 gene:ENSMUSG00000000182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB037889 // GenBank // Mus musculus FGF23 mRNA for FGF-23, complete cds. // chr6 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// AF263536 // GenBank // Mus musculus FGF23 (Fgf23) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC120605 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor 23, mRNA (cDNA clone MGC:155842 IMAGE:40129528), complete cds. // chr6 // 57 // 92 // 13 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:126941528:127080478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000071458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:127233762:127234619:1 gene:ENSMUSG00000062365 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:127232282:127234619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
AK136714 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230028M13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006506341 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506342 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506343 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_377478 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X12, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_377479 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X13, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506346 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:127561308:127672403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026743 // RefSeq // Mus musculus tetraspanin 11 (Tspan11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000032501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:127887589:127953031:1 gene:ENSMUSG00000030351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000149801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:127887772:127923881:1 gene:ENSMUSG00000030351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC057639 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 11, mRNA (cDNA clone MGC:67784 IMAGE:4218418), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:127929083:127945886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_008021 // RefSeq // Mus musculus forkhead box M1 (Foxm1), mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073316 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:128362967:128375893:1 gene:ENSMUSG00000001517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128365705:128373966:1 gene:ENSMUSG00000001517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000125456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128367365:128372170:1 gene:ENSMUSG00000001517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr6 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000153423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:128370959:128373182:1 gene:ENSMUSG00000001517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// BC065067 // GenBank // Mus musculus forkhead box M1, mRNA (cDNA clone MGC:86019 IMAGE:6417437), complete cds. // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC075723 // GenBank // Mus musculus forkhead box M1, mRNA (cDNA clone MGC:78195 IMAGE:6515008), complete cds. // chr6 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:128365705:128373966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT059028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0
NR_028592 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10069 (Gm10069), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000144745 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:128438757:128475617:1 gene:ENSMUSG00000059659 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_053165 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 2, member h (Clec2h), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:128662385:128677374:1 gene:ENSMUSG00000030364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF350410 // GenBank // Mus musculus C-lectin related CLRF mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC021766 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 2, member h, mRNA (cDNA clone MGC:30345 IMAGE:4238060), complete cds. // chr6 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// HQ713437 // GenBank // Mus musculus Clr-F mRNA, complete cds. // chr6 // 80 // 58 // 12 // 15 // 0 /// AK136426 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030023E08 product:C-type lectin related f, full insert sequence. // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NR_073569 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, pseudogene 1 (Klrb1-ps1), non-coding RNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000184388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:129116518:129129446:1 gene:ENSMUSG00000079295 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// DQ237930 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c NKR-P1E (Klrb1e) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 70 // 100 // 19 // 27 // 0 /// NONMMUT059074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_053109 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 2, member d (Clec2d), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506805 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus C-type lectin domain family 2, member d (Clec2d), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000032260 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:129180615:129186534:1 gene:ENSMUSG00000030157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF321553 // GenBank // Mus musculus osteoclast inhibitory lectin (Ocil) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF350409 // GenBank // Mus musculus C-lectin related CLRB mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AY320031 // GenBank // Mus musculus osteoclast inhibitory lectin (Ocil) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC106776 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 2, member d, mRNA (cDNA clone MGC:123478 IMAGE:40040181), complete cds. // chr6 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// HQ713439 // GenBank // Mus musculus Clr-B mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000009722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129112941:129209387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_177686 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 12, member a (Clec12a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000065289 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:129350244:129365303:1 gene:ENSMUSG00000053063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000151671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:129342691:129359415:1 gene:ENSMUSG00000053063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC094904 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 12, member a, mRNA (cDNA clone MGC:107404 IMAGE:30044572), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000133756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:129356802:129364416:1 gene:ENSMUSG00000053063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENSMUST00000147106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:129349742:129353515:1 gene:ENSMUSG00000053063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// BC026844 // GenBank HTC // Mus musculus C-type lectin domain family 12, member a, mRNA (cDNA clone IMAGE:4222028), with apparent retained intron. // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129350421:129422358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONMMUT059093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001081186 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 52B (Tmem52b), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:129512557:129519227:1 gene:ENSMUSG00000030160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC120661 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D630042F21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155898 IMAGE:40129584), complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC120663 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D630042F21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155900 IMAGE:40129586), complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129510583:129541167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_020590 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor-associated protein-like 1 (Gabarapl1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:129533200:129542331:1 gene:ENSMUSG00000030161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB041648 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-0091. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AF180518 // GenBank // Mus musculus GABA-A receptor-associated protein-like protein 1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC004602 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA(A)) receptor-associated protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:6401 IMAGE:3585132), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC024706 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA(A)) receptor-associated protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:30260 IMAGE:3711973), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129510583:129541167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_153590 // RefSeq // Mus musculus killer cell lectin-like receptor family E member 1 (Klre1), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006506129 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus killer cell lectin-like receptor family E member 1 (Klre1), transcript variant X9, mRNA. // chr6 // 89 // 67 // 16 // 18 // 0 /// ENSMUST00000053708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:129577893:129585824:1 gene:ENSMUSG00000050241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF306663 // GenBank // Mus musculus putative NK receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AY100458 // GenBank // Mus musculus killer cell lectin-like receptor family E member 1 (Klre1) mRNA, complete cds. // chr6 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// BC145177 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053728. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XM_006506122 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus killer cell lectin-like receptor family E member 1 (Klre1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// AK041224 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530092N20 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000009728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:129559589:129607416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONMMUT059100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NR_030447 // RefSeq // Mus musculus microRNA 680-1 (Mir680-1), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000102257 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:129691535:129691643:1 gene:ENSMUSG00000076212 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000179335 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:70027982:70028091:-1 gene:ENSMUSG00000094641 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 44 // 100 // 8 // 18 // 0 /// mmu-mir-680-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0004640 Mus musculus miR-680-1 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT059105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT057338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 100 // 8 // 18 // 0
NM_001244628 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5430401F13 gene (5430401F13Rik), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:131486400:131553757:1 gene:ENSMUSG00000094113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159229 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:131486400:131491487:1 gene:ENSMUSG00000095577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161385 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:131543762:131553757:1 gene:ENSMUSG00000094113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:131543762:131553757:1 gene:ENSMUSG00000094113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006544094 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus repetin-like (LOC102638913), mRNA. // chr6 // 70 // 80 // 14 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:131543784:131553838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 77 // 52 // 10 // 13 // 0 /// GENSCAN00000028990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:131486422:131491568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 77 // 52 // 10 // 13 // 0
ENSMUST00000082898 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:132564972:132565092:1 gene:ENSMUSG00000094823 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT059137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011174 // RefSeq // Mus musculus proline rich protein HaeIII subfamily 1 (Prh1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_031499 // RefSeq // Mus musculus proline rich protein 2 (Prp2), mRNA. // chr6 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// ENSMUST00000074042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132569809:132572401:1 gene:ENSMUSG00000059934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000076061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:132595913:132601236:1 gene:ENSMUSG00000058295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// ENSMUST00000111972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132569842:132572401:1 gene:ENSMUSG00000059934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000177523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:132569809:132572941:1 gene:ENSMUSG00000059934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000178961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132595946:132600702:1 gene:ENSMUSG00000058295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// M11902 // GenBank // Mouse proline-rich salivary protein mRNA, partial cds of clone pUMP40. // chr6 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0 /// M19419 // GenBank // Mouse proline-rich salivary protein mRNA, partial cds. // chr6 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// GENSCAN00000007460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:132569842:132572401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000007468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:132595946:132600702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0
ENSMUST00000083227 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:132591058:132591178:1 gene:ENSMUSG00000095102 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONMMUT059138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
NM_031499 // RefSeq // Mus musculus proline rich protein 2 (Prp2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000076061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:132595913:132601236:1 gene:ENSMUSG00000058295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000178961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:132595946:132600702:1 gene:ENSMUSG00000058295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000007468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:132595946:132600702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0