NM_173742 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease, RNase K (Rnasek), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70238124:70239842:-1 gene:ENSMUSG00000093989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000125752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70238124:70239780:-1 gene:ENSMUSG00000093989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000141880 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:70238127:70239058:-1 gene:ENSMUSG00000093989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000176116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70235206:70239830:-1 gene:ENSMUSG00000040904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000176268 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70235250:70239803:-1 gene:ENSMUSG00000040904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC021602 // GenBank // Mus musculus ribonuclease, RNase K, mRNA (cDNA clone MGC:36585 IMAGE:5102170), complete cds. // chr11 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC021603 // GenBank // Mus musculus ribonuclease, RNase K, mRNA (cDNA clone MGC:36586 IMAGE:5102465), complete cds. // chr11 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC024417 // GenBank // Mus musculus ribonuclease, RNase K, mRNA (cDNA clone MGC:36382 IMAGE:5065541), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70226027:70239733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_007440 // RefSeq // Mus musculus arachidonate 12-lipoxygenase (Alox12), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000000329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70241457:70255353:-1 gene:ENSMUSG00000000320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC152329 // GenBank // Mus musculus arachidonate 12-lipoxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:161244 IMAGE:40141477), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC152403 // GenBank // Mus musculus arachidonate 12-lipoxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:173149 IMAGE:40141482), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// U04334 // GenBank // Mus musculus C57BL/6 platelet-type 12-lipoxygenase mRNA, complete cds. // chr11 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108574 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:70248963:70255341:-1 gene:ENSMUSG00000000320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// AK079232 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530045P09 product:arachidonate 12-lipoxygenase, full insert sequence. // chr11 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// GENSCAN00000009448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70248028:70255272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70242385:70247319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0
NM_145684 // RefSeq // Mus musculus arachidonate lipoxygenase, epidermal (Alox12e), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000019051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70315610:70322628:-1 gene:ENSMUSG00000018907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000123752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70319971:70321577:-1 gene:ENSMUSG00000018907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000149060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70321055:70322448:-1 gene:ENSMUSG00000018907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 89 // 29 // 8 // 9 // 0 /// BC013751 // GenBank // Mus musculus arachidonate lipoxygenase, epidermal, mRNA (cDNA clone MGC:11467 IMAGE:3596809), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC051047 // GenBank // Mus musculus arachidonate lipoxygenase, epidermal, mRNA (cDNA clone MGC:58979 IMAGE:4457881), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// U39200 // GenBank // Mus musculus epidermal 12(S)-lipoxygenase (Aloxe) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000139899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70320994:70321854:-1 gene:ENSMUSG00000018907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000009487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70272867:70322456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT010496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0
NM_009660 // RefSeq // Mus musculus arachidonate 15-lipoxygenase (Alox15), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000019068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70344152:70352031:-1 gene:ENSMUSG00000018924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC056625 // GenBank // Mus musculus arachidonate 15-lipoxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:68140 IMAGE:5005087), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC081546 // GenBank // Mus musculus arachidonate 15-lipoxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:78162 IMAGE:3671948), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// CT010263 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F0351D for gene Alox15, Arachidonate 15-lipoxygenase; complete cds, incl. stopcodon. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// L34570 // GenBank // Mouse 12-lipoxygenase mRNA, complete cds. // chr11 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// U04331 // GenBank // Mus musculus C57BL/6 and ICR leukocyte-type 12-lipoxygenase mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70344543:70353458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_029231 // RefSeq // Mus musculus proline, glutamic acid and leucine rich protein 1 (Pelp1), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000019065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70392883:70410028:-1 gene:ENSMUSG00000018921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000135148 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:70402631:70410031:-1 gene:ENSMUSG00000018921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AK016197 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930563C04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AK128966 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3013766. // chr11 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// BC016444 // GenBank // Mus musculus proline, glutamic acid and leucine rich protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:25365 IMAGE:4459875), complete cds. // chr11 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// BC090620 // GenBank // Mus musculus proline, glutamic acid and leucine rich protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:116580 IMAGE:30699968), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000009447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70392930:70402045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NM_023158 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 16 (Cxcl16), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006533920 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 16 (Cxcl16), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000019064 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70453983:70459984:-1 gene:ENSMUSG00000018920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000126391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70454238:70459408:-1 gene:ENSMUSG00000018920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000154475 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70455190:70459832:-1 gene:ENSMUSG00000018920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// AF277001 // GenBank // Mus musculus SR-PSOX mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// AF301017 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 transmembrane chemokine CXCL16 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// BC019961 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) ligand 16, mRNA (cDNA clone MGC:28190 IMAGE:3988542), complete cds. // chr11 // 79 // 66 // 15 // 19 // 0 /// GQ380016 // GenBank // Mus musculus CXCL16v1 (Cxcl16) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// GQ380017 // GenBank // Mus musculus CXCL16v2 (Cxcl16) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// NONMMUT010503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr11 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_001013607 // RefSeq // Mus musculus vitelline membrane outer layer 1 homolog (chicken) (Vmo1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021179 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70513516:70514616:-1 gene:ENSMUSG00000020830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70513568:70514602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0
ENSMUST00000100943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:70540023:70540600:-1 gene:ENSMUSG00000072768 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK043909 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830049N04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009603 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, epsilon polypeptide (Chrne), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000014753 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:70614883:70619216:-1 gene:ENSMUSG00000014609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000102556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70614883:70619194:-1 gene:ENSMUSG00000014609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000134836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70614893:70615697:-1 gene:ENSMUSG00000014609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000038543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70614973:70619175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0
NM_024211 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier oxoglutarate carrier), member 11 (Slc25a11), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006534026 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier oxoglutarate carrier), member 11 (Slc25a11), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000014750 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70644196:70647058:-1 gene:ENSMUSG00000014606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70644695:70645910:-1 gene:ENSMUSG00000014606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000139638 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:70645231:70647479:-1 gene:ENSMUSG00000014606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// BC003455 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier oxoglutarate carrier), member 11, mRNA (cDNA clone MGC:6807 IMAGE:2648336), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC019631 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier oxoglutarate carrier), member 11, mRNA (cDNA clone MGC:18695 IMAGE:4023179), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70644766:70646862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_011072 // RefSeq // Mus musculus profilin 1 (Pfn1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000018437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70651850:70654644:-1 gene:ENSMUSG00000018293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108549 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:70652622:70654598:-1 gene:ENSMUSG00000018293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000178254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70651939:70654621:-1 gene:ENSMUSG00000018293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC002080 // GenBank // Mus musculus profilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:6236 IMAGE:3490976), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000177669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70652612:70654608:-1 gene:ENSMUSG00000018293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000038537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70652124:70654480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK034932 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430063L06 product:profilin 1, full insert sequence. // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONMMUT010523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001167669 // RefSeq // Mus musculus sperm associated antigen 7 (Spag7), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_172561 // RefSeq // Mus musculus sperm associated antigen 7 (Spag7), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000018431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70663771:70669416:-1 gene:ENSMUSG00000018287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70664340:70669279:-1 gene:ENSMUSG00000018287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000129434 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:70664399:70669290:-1 gene:ENSMUSG00000018287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000137691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70664003:70669218:-1 gene:ENSMUSG00000018287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC055821 // GenBank // Mus musculus sperm associated antigen 7, mRNA (cDNA clone MGC:67704 IMAGE:4502461), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70664111:70689837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1
ENSMUST00000102277 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:70762140:70762232:-1 gene:ENSMUSG00000076232 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000121235 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70762107:70762379:-1 gene:ENSMUSG00000082983 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT010531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT010532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001045526 // RefSeq // Mus musculus SLP adaptor and CSK interacting membrane protein (Scimp), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000074572 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:70791364:70812559:-1 gene:ENSMUSG00000057135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000108534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70790932:70812586:-1 gene:ENSMUSG00000057135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147177 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A430084P05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182338 IMAGE:9056232), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC147178 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A430084P05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182321 IMAGE:9056215), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK156605 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830032G04 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr11 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// GENSCAN00000038547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70791103:70815998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_007573 // RefSeq // Mus musculus complement component 1, q subcomponent binding protein (C1qbp), mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000078528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70977836:70983026:-1 gene:ENSMUSG00000018446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000155371 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70977848:70978871:-1 gene:ENSMUSG00000018446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// AF300619 // GenBank // Mus musculus p32-RACK mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// AK010746 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410089D17 product:complement component 1, q subcomponent binding protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC038075 // GenBank // Mus musculus complement component 1, q subcomponent binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:46915 IMAGE:3154276), complete cds. // chr11 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000179291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70981010:70983007:-1 gene:ENSMUSG00000018446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000038535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70978095:70982950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AK140945 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130077O18 product:complement component 1, q subcomponent binding protein, full insert sequence. // chr11 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONMMUT010553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
ENSMUST00000083312 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:70996539:70996644:-1 gene:ENSMUSG00000065246 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134022 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 6330403K07 gene (6330403K07Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000156068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:71031941:71033513:-1 gene:ENSMUSG00000018451 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC069976 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330403K07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:78329 IMAGE:6518302), complete cds. // chr11 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
ENSMUST00000121485 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:71057166:71057969:-1 gene:ENSMUSG00000083171 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT010560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NR_027858 // RefSeq // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 1C, pseudogene (Nlrp1c-ps), non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000171546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:71242430:71285232:-1 gene:ENSMUSG00000092528 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000174668 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:71242430:71281219:-1 gene:ENSMUSG00000092528 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC141384 // GenBank // Mus musculus NLR family, pyrin domain containing 1C, mRNA (cDNA clone MGC:176346 IMAGE:9055997), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// DQ117602 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J NACHT-, LRR-, and PYD-containing protein 1 paralog c (Nalp1c) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:71242514:71281034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000059082 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72028717:72037509:-1 gene:ENSMUSG00000040554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AF296412 // GenBank // Mus musculus aryl-hydrocarbon interacting protein-like 1 (Aipl1) mRNA, complete cds. // chr11 // 89 // 70 // 25 // 28 // 0 /// BC028285 // GenBank // Mus musculus aryl hydrocarbon receptor-interacting protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:25485 IMAGE:4501401), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NM_053245 // RefSeq // Mus musculus aryl hydrocarbon receptor-interacting protein-like 1 (Aipl1), mRNA. // chr11 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// XM_006532000 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aryl hydrocarbon receptor-interacting protein-like 1 (Aipl1), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 78 // 78 // 31 // 40 // 1 /// ENSMUST00000048207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72027963:72037489:-1 gene:ENSMUSG00000040554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 78 // 78 // 31 // 40 // 1 /// GENSCAN00000026134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72029254:72036770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0
NM_001024927 // RefSeq // Mus musculus PITPNM family member 3 (Pitpnm3), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NM_001081641 // RefSeq // Mus musculus PITPNM family member 3 (Pitpnm3), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 98 // 93 // 40 // 41 // 0 /// ENSMUST00000075258 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72047528:72135778:-1 gene:ENSMUSG00000040543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000108508 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72047528:72135721:-1 gene:ENSMUSG00000040543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// BC112411 // GenBank // Mus musculus PITPNM family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:132910 IMAGE:40061037), complete cds. // chr11 // 77 // 77 // 34 // 44 // 1 /// ENSMUST00000142471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72067802:72135778:-1 gene:ENSMUSG00000040543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// AK039594 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330068P14 product:similar to NIR1 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1 /// GENSCAN00000026117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72051055:72135675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0
NM_026068 // RefSeq // Mus musculus mediator complex subunit 31 (Med31), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72211724:72215592:-1 gene:ENSMUSG00000020801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019685 // GenBank // Mus musculus mediator of RNA polymerase II transcription, subunit 31 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:30726 IMAGE:3983617), complete cds. // chr11 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// BC051929 // GenBank // Mus musculus mediator of RNA polymerase II transcription, subunit 31 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:62171 IMAGE:5709831), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK045566 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230210P04 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSMUST00000129264 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72213208:72215053:-1 gene:ENSMUSG00000020801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72211885:72266565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONMMUT010586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONMMUT010587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001004148 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent citrate transporter), member 5 (Slc13a5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533221 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent citrate transporter), member 5 (Slc13a5), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000021161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72241994:72266602:-1 gene:ENSMUSG00000020805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY368893 // GenBank // Mus musculus sodium-coupled citrate transporter (Nact) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006533220 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent citrate transporter), member 5 (Slc13a5), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// XM_006533222 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent citrate transporter), member 5 (Slc13a5), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// AK048944 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230084L22 product:Sodium-coupled citrate transporter homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000026123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72211885:72266565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001282006 // RefSeq // Mus musculus tektin 1 (Tekt1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_001282007 // RefSeq // Mus musculus tektin 1 (Tekt1), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NM_011569 // RefSeq // Mus musculus tektin 1 (Tekt1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021155 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72344729:72362442:-1 gene:ENSMUSG00000020799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000108502 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72344722:72361296:-1 gene:ENSMUSG00000020799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000108503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72344722:72361873:-1 gene:ENSMUSG00000020799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF081947 // GenBank // Mus musculus tektin mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK076858 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930512O07 product:tektin 1, full insert sequence. // chr11 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC098181 // GenBank // Mus musculus tektin 1, mRNA (cDNA clone MGC:106361 IMAGE:6312556), complete cds. // chr11 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72344764:72363006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_177776 // RefSeq // Mus musculus smoothelin-like 2 (Smtnl2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006533469 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus smoothelin-like 2 (Smtnl2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000050226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:72390114:72411713:-1 gene:ENSMUSG00000045667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000108500 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72389164:72411711:-1 gene:ENSMUSG00000045667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000125807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72399874:72403108:-1 gene:ENSMUSG00000045667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC037993 // GenBank // Mus musculus smoothelin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:47155 IMAGE:5064159), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72391287:72411633:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT010597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000129274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72451642:72454541:-1 gene:ENSMUSG00000040447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AB441166 // GenBank // Mus musculus spinster2 mRNA for spinster2, complete cds. // chr11 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// BC025823 // GenBank // Mus musculus spinster homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5100525), complete cds. // chr11 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NM_001276383 // RefSeq // Mus musculus spinster homolog 2 (Spns2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// NM_153060 // RefSeq // Mus musculus spinster homolog 2 (Spns2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000045303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:72451638:72489904:-1 gene:ENSMUSG00000040447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// BC011467 // GenBank // Mus musculus spinster homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:3154539), partial cds. // chr11 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000144940 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:72452732:72456621:-1 gene:ENSMUSG00000040447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// ENSMUST00000150491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72452608:72456350:-1 gene:ENSMUSG00000040447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000006885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72456252:72489795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
NM_029932 // RefSeq // Mus musculus spinster homolog 3 (Spns3), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// XM_006534488 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spinster homolog 3 (Spns3), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000021154 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:72498160:72550301:-1 gene:ENSMUSG00000020798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000092940 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72498155:72550506:-1 gene:ENSMUSG00000020798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC150778 // GenBank // Mus musculus spinster homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:183689 IMAGE:9087689), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000155774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72494919:72502443:-1 gene:ENSMUSG00000020798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// AK165448 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F530004B19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// GENSCAN00000006875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72498392:72549674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT010605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
ENSMUST00000082633 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:72616006:72616150:-1 gene:ENSMUSG00000064567 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT010610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001024926 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b5 domain containing 2 (Cyb5d2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000079681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72777232:72795856:-1 gene:ENSMUSG00000057778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000156294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72777249:72796142:-1 gene:ENSMUSG00000057778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC086682 // GenBank // Mus musculus cytochrome b5 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:113802 IMAGE:30666422), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC117721 // GenBank // Mus musculus cytochrome b5 domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40088442), complete cds. // chr11 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72772209:72795762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_010353 // RefSeq // Mus musculus germ cell-specific gene 2 (Gsg2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000052140 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73135485:73138294:-1 gene:ENSMUSG00000050107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC113148 // GenBank // Mus musculus germ cell-specific gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:130563 IMAGE:40054435), complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// D87326 // GenBank // Mus musculus mRNA for GSG2, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73135997:73138261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NM_001168470 // RefSeq // Mus musculus ER membrane protein complex subunit 6 (Emc6), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_025318 // RefSeq // Mus musculus ER membrane protein complex subunit 6 (Emc6), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73175519:73177037:-1 gene:ENSMUSG00000047260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73176336:73177002:-1 gene:ENSMUSG00000047260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// AK004149 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110037P24 product:weakly similar to RE35789p [Drosophila melanogaster], full insert sequence. // chr11 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// BC022104 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 93, mRNA (cDNA clone MGC:35775 IMAGE:5101119), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000092925 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCm38:11:73388081:73389030:-1 gene:ENSMUSG00000101979 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene gene:ENSMUSG00000069824 // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000140414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73388081:73389024:-1 gene:ENSMUSG00000069824 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73388081:73389024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0
NM_146921 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1 (Olfr1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73395076:73399495:-1 gene:ENSMUSG00000069823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131253 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:73395432:73399495:-1 gene:ENSMUSG00000069823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73395076:73396020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147024 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 378 (Olfr378), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000069790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:73425037:73428477:-1 gene:ENSMUSG00000055971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117349 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73425037:73428477:-1 gene:ENSMUSG00000055971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139813 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 378, mRNA (cDNA clone MGC:161819 IMAGE:40135620), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73425037:73448077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000119400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73433291:73434224:-1 gene:ENSMUSG00000084387 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_147025 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 380 (Olfr380), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:73453275:73454210:-1 gene:ENSMUSG00000072709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121209 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73453275:73457458:-1 gene:ENSMUSG00000072709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147022 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 381 (Olfr381), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:73485887:73486822:-1 gene:ENSMUSG00000072708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119863 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73485887:73491477:-1 gene:ENSMUSG00000072708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146443 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 382 (Olfr382), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000092921 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73516259:73517197:-1 gene:ENSMUSG00000095312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000118895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73540419:73541353:-1 gene:ENSMUSG00000081961 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_147023 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 385 (Olfr385), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071553 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73588798:73589736:-1 gene:ENSMUSG00000095095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73588798:73589736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000118336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73724082:73725022:-1 gene:ENSMUSG00000080781 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73724082:73777325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_147009 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 389 (Olfr389), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122224 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73776387:73780589:-1 gene:ENSMUSG00000070383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73776653:73780535:-1 gene:ENSMUSG00000070383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000037569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73724082:73777325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147006 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 392 (Olfr392), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73814142:73816880:-1 gene:ENSMUSG00000061984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73814142:73815080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147008 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 393 (Olfr393), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73847185:73848123:-1 gene:ENSMUSG00000094488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_147007 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 394 (Olfr394), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000071478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73887438:73888370:-1 gene:ENSMUSG00000056921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_147005 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 395 (Olfr395), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73906552:73907490:-1 gene:ENSMUSG00000062186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73888370:73907490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_146710 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 398 (Olfr398), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:73983662:73984606:-1 gene:ENSMUSG00000049041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73983662:73990059:-1 gene:ENSMUSG00000049041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73983662:74036418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147003 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 139 (Olfr139), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050678 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74044325:74045272:-1 gene:ENSMUSG00000047444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104101 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 139, mRNA (cDNA clone MGC:123735 IMAGE:40043110), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104102 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 139, mRNA (cDNA clone MGC:123736 IMAGE:40043111), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74044325:74045272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147004 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 399 (Olfr399), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74053822:74054757:-1 gene:ENSMUSG00000043692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120820 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 399, mRNA (cDNA clone MGC:156057 IMAGE:40129743), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120846 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 399, mRNA (cDNA clone MGC:156083 IMAGE:40129769), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74053822:74054757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146711 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 43 (Olfr43), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000078936 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74206273:74207214:-1 gene:ENSMUSG00000070377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC125464 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 43, mRNA (cDNA clone MGC:159167 IMAGE:40129979), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC125468 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 43, mRNA (cDNA clone MGC:159171 IMAGE:40129983), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000037551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74206273:74207214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000120649 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74255696:74256631:-1 gene:ENSMUSG00000081864 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_146707 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 410 (Olfr410), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74334282:74335229:-1 gene:ENSMUSG00000063116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74334282:74335229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146709 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 411 (Olfr411), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080365 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74346635:74347582:-1 gene:ENSMUSG00000054406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141134 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74346892:74352621:-1 gene:ENSMUSG00000054406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// BC138439 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 411, mRNA (cDNA clone MGC:170064 IMAGE:8861459), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC138440 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 411, mRNA (cDNA clone MGC:170065 IMAGE:8861460), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74346635:74355070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_197943 // RefSeq // Mus musculus small G protein signaling modulator 2 (Sgsm2), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// XM_006534586 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small G protein signaling modulator 2 (Sgsm2), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000057631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74849261:74897060:-1 gene:ENSMUSG00000038351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000081799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74849266:74897060:-1 gene:ENSMUSG00000038351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC058414 // GenBank // Mus musculus small G protein signaling modulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:67333 IMAGE:6822416), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// BC060163 // GenBank // Mus musculus small G protein signaling modulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:73452 IMAGE:6822416), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000123573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74856567:74860575:-1 gene:ENSMUSG00000038351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1 /// AK078057 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330407O08 product:inferred: KIAA0397 protein {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr11 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1 /// GENSCAN00000045524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74850807:74892059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 98 // 85 // 39 // 40 // 0
NM_001098203 // RefSeq // Mus musculus hypermethylated in cancer 1 (Hic1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_010430 // RefSeq // Mus musculus hypermethylated in cancer 1 (Hic1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:75164565:75169519:-1 gene:ENSMUSG00000043099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75165380:75167512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001164223 // RefSeq // Mus musculus replication protein A1 (Rpa1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_026653 // RefSeq // Mus musculus replication protein A1 (Rpa1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000000767 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:75300350:75348310:-1 gene:ENSMUSG00000000751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000092907 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:75298166:75348324:-1 gene:ENSMUSG00000000751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000135770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75301305:75342188:-1 gene:ENSMUSG00000000751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000154894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75316040:75348295:-1 gene:ENSMUSG00000000751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 93 // 38 // 14 // 15 // 0 /// BC019119 // GenBank // Mus musculus replication protein A1, mRNA (cDNA clone MGC:29293 IMAGE:4487586), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000045527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75301305:75348258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0
NM_008878 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade F, member 2 (Serpinf2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000043696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:75431736:75439501:-1 gene:ENSMUSG00000038224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000108437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75431732:75438900:-1 gene:ENSMUSG00000038224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75435914:75439591:-1 gene:ENSMUSG00000038224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000142094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75436433:75439578:-1 gene:ENSMUSG00000038224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// BC026756 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade F, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:30236 IMAGE:5124817), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GQ896353 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J serine or cysteine peptidase inhibitor clade F member 2 (Serpinf2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GQ896354 // GenBank // Mus musculus strain A/J serine or cysteine peptidase inhibitor clade F member 2 (Serpinf2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75433201:75438454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0
NM_138950 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 81 (Wdr81), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000117392 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:75440948:75454438:-1 gene:ENSMUSG00000045374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000132442 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:75440950:75451083:-1 gene:ENSMUSG00000045374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000173320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:75440944:75454717:-1 gene:ENSMUSG00000045374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75441769:75454361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_007873 // RefSeq // Mus musculus double C2, beta (Doc2b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000021209 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:75768966:75796049:-1 gene:ENSMUSG00000020848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC067030 // GenBank // Mus musculus double C2, beta, mRNA (cDNA clone MGC:91389 IMAGE:30534150), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D85037 // GenBank // Mus musculus mRNA for Doc2beta, complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75771932:75795893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_029658 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 101, member B (Fam101b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:76019194:76027782:-1 gene:ENSMUSG00000020846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:76021910:76138537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_177367 // RefSeq // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 4 (Gemin4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000102500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:76210571:76217664:-1 gene:ENSMUSG00000049396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000169701 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:76210571:76243663:-1 gene:ENSMUSG00000017286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK133821 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730435M06 product:gem (nuclear organelle) associated protein 4, full insert sequence. // chr11 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC031425 // GenBank // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:28146 IMAGE:3982927), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC062157 // GenBank // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:70055 IMAGE:6508223), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:76210757:76217487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_008750 // RefSeq // Mus musculus nucleoredoxin (Nxn), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000021204 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:76257198:76399140:-1 gene:ENSMUSG00000020844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC004688 // GenBank // Mus musculus nucleoredoxin, mRNA (cDNA clone MGC:7861 IMAGE:3501314), complete cds. // chr11 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// BC058244 // GenBank // Mus musculus nucleoredoxin, mRNA (cDNA clone MGC:65298 IMAGE:6312910), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:76258565:76279692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0
NM_016810 // RefSeq // Mus musculus golgi SNAP receptor complex member 1 (Gosr1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000010536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:76726602:76763579:-1 gene:ENSMUSG00000010392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000137767 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:76748508:76763567:-1 gene:ENSMUSG00000010392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// AF079901 // GenBank // Mus musculus 28 kDa cis-Golgi SNARE (GS28) mRNA, complete cds. // chr11 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0 /// BC008542 // GenBank // Mus musculus golgi SNAP receptor complex member 1, mRNA (cDNA clone MGC:7654 IMAGE:3495882), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC051661 // GenBank // Mus musculus golgi SNAP receptor complex member 1, mRNA (cDNA clone MGC:60520 IMAGE:30007684), complete cds. // chr11 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:76754351:76763550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0
NM_007754 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase D (Cpd), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000021201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:76778424:76847018:-1 gene:ENSMUSG00000020841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// D85391 // GenBank // Mus musculus mRNA for gp180-carboxypeptidase D-like enzyme, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK134907 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430514B16 product:carboxypeptidase D, full insert sequence. // chr11 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// GENSCAN00000023710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:76782184:76846966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0
NM_001012309 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 55 (Ccdc55), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102494 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:77044292:77078435:-1 gene:ENSMUSG00000037958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127758 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:77050635:77078037:-1 gene:ENSMUSG00000037958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC089560 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 55, mRNA (cDNA clone MGC:107323 IMAGE:30300075), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000134685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:77054494:77078435:-1 gene:ENSMUSG00000037958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK161058 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4632413D16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000023707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:77045740:77140935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONMMUT010804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NR_030756 // RefSeq // Mus musculus microRNA 423 (Mir423), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083584 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:77078064:77078172:-1 gene:ENSMUSG00000065518 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-423 // miRBase Micro RNA Database // MI0004637 Mus musculus miR-423 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_176965 // RefSeq // Mus musculus EF-hand calcium binding domain 5 (Efcab5), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// XM_006533529 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand calcium binding domain 5 (Efcab5), transcript variant X8, mRNA. // chr11 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000108400 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:77089915:77188968:-1 gene:ENSMUSG00000050944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000130901 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:77090185:77151925:-1 gene:ENSMUSG00000050944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 51 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000148985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:77102720:77137793:-1 gene:ENSMUSG00000050944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// AK035698 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530092D03 product:hypothetical EF-hand structure containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:77045740:77140935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 28 // 43 // 1 /// GENSCAN00000023718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:77151770:77216661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1
ENSMUST00000100807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:77516660:77519198:-1 gene:ENSMUSG00000072673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK040037 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430048L21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_144825 // RefSeq // Mus musculus TAO kinase 1 (Taok1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000017435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:77529162:77585506:-1 gene:ENSMUSG00000017291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:77529162:77607815:-1 gene:ENSMUSG00000017291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK173156 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1361 protein. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_144825 // RefSeq // Mus musculus TAO kinase 1 (Taok1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000017435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:77529162:77585506:-1 gene:ENSMUSG00000017291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000058496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:77529162:77607815:-1 gene:ENSMUSG00000017291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC016522 // GenBank // Mus musculus TAO kinase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3495957), complete cds. // chr11 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// BC151012 // GenBank // Mus musculus TAO kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:183925 IMAGE:9087925), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC151015 // GenBank // Mus musculus TAO kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:183928 IMAGE:9087928), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC151016 // GenBank // Mus musculus TAO kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:183929 IMAGE:9087929), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AK138443 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230109I16 product:Serine/threonine protein kinase TAO1 homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr11 // 56 // 56 // 22 // 39 // 1 /// AK173156 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1361 protein. // chr11 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// GENSCAN00000034161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:77537965:77585404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0
AK137634 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930003J22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_009965 // RefSeq // Mus musculus crystallin, beta A1 (Cryba1), mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000078623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:77718627:77725283:-1 gene:ENSMUSG00000000724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC107342 // GenBank // Mus musculus crystallin, beta A1, mRNA (cDNA clone MGC:130310 IMAGE:40055280), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// J00378 // GenBank // Mus musculus beta-A3/A1-crystallin mRNA, partial cds. // chr11 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// V00728 // GenBank // Mouse mRNA encoding beta-crystallin. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000124178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:77718615:77721834:-1 gene:ENSMUSG00000000724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// GENSCAN00000034175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:77718755:77725281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
XR_388866 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10277 (Gm10277), misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000092883 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:77785453:77787747:-1 gene:ENSMUSG00000069804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY512957 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0959G01 unknown mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008952 // RefSeq // Mus musculus pipecolic acid oxidase (Pipox), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000017597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:77880615:77894096:-1 gene:ENSMUSG00000017453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000155401 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:77882619:77884544:-1 gene:ENSMUSG00000017453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// BC013525 // GenBank // Mus musculus pipecolic acid oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:19202 IMAGE:4237443), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// U94700 // GenBank // Mus musculus sarcosine oxidase (Pso) mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000151383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:77881060:77882686:-1 gene:ENSMUSG00000017453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// AK135009 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430541F16 product:pipecolic acid oxidase, full insert sequence. // chr11 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000034184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:77871653:77914876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1
NR_033549 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11190 (Gm11190), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:77912127:77929288:-1 gene:ENSMUSG00000055045 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_394204 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 13, opposite strand (Dhrs13os), misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78030012:78032665:-1 gene:ENSMUSG00000087050 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK053376 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130012M10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK084880 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430005D11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT010864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_022313 // RefSeq // Mus musculus Era (G-protein)-like 1 (E. coli) (Eral1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000021183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78073376:78080383:-1 gene:ENSMUSG00000020832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000139731 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78073376:78080383:-1 gene:ENSMUSG00000020832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB049389 // GenBank // Mus musculus cega mRNA for conserved ERA-like GTPase, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF190730 // GenBank // Mus musculus GTPase ERA-W mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AK153947 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430010C01 product:weakly similar to GTPase ERA-W [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC037603 // GenBank // Mus musculus Era (G-protein)-like 1 (E. coli), mRNA (cDNA clone IMAGE:5363832), partial cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC068271 // GenBank // Mus musculus Era (G-protein)-like 1 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:60473 IMAGE:30008388), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF190731 // GenBank // Mus musculus GTPase ERA-S mRNA, complete cds. // chr11 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000034166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78074052:78080359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
AK082554 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230063C12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009423 // RefSeq // Mus musculus TNF receptor associated factor 4 (Traf4), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// XM_006533156 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TNF receptor associated factor 4 (Traf4), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000017530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78159400:78165589:-1 gene:ENSMUSG00000017386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000148218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78160793:78165516:-1 gene:ENSMUSG00000017386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000149437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78158499:78165589:-1 gene:ENSMUSG00000017386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// AF233449 // GenBank // Mus musculus TNF receptor associated factor 4 (traf4) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// AK046015 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230333N21 product:Tnf receptor associated factor 4, full insert sequence. // chr11 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// X92346 // GenBank // M.musculus mRNA for CART1 protein. // chr11 // 65 // 87 // 13 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78159916:78176606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1
NR_037682 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 42A (Snord42a), small nucleolar RNA. // chr11 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0 /// ENSMUST00000082606 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:78181299:78181363:-1 gene:ENSMUSG00000064540 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF357366 // GenBank // Mus musculus clone MBII-292 C/D box snoRNA, partial sequence. // chr11 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0 /// NONMMUT010884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT010885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0
NR_037683 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 42B (Snord42b), small nucleolar RNA. // chr11 // 86 // 75 // 18 // 21 // 0 /// ENSMUST00000083742 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:78183056:78183124:-1 gene:ENSMUSG00000065676 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT010887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT010888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 86 // 75 // 18 // 21 // 0
NM_009297 // RefSeq // Mus musculus suppressor of Ty 6 (Supt6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XR_388391 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus suppressor of Ty 6 (Supt6), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 96 // 68 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000002121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78206746:78245987:-1 gene:ENSMUSG00000002052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000108314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78207028:78223686:-1 gene:ENSMUSG00000002052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0 /// AK158846 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K430344H12 product:suppressor of Ty 6 homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr11 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0 /// BC072657 // GenBank // Mus musculus suppressor of Ty 6 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:91353 IMAGE:30536338), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// U40375 // GenBank // Mus musculus Supt6h mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000034168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78207583:78233653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0
NM_001277290 // RefSeq // Mus musculus forkhead box N1 (Foxn1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_008238 // RefSeq // Mus musculus forkhead box N1 (Foxn1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006532264 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus forkhead box N1 (Foxn1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000108294 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78357577:78386558:-1 gene:ENSMUSG00000002057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC108980 // GenBank // Mus musculus forkhead box N1, mRNA (cDNA clone MGC:124316 IMAGE:40047616), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC108981 // GenBank // Mus musculus forkhead box N1, mRNA (cDNA clone MGC:124317 IMAGE:40047617), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78358751:78406938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0
NM_022411 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 2 (Slc13a2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006532645 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 2 (Slc13a2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// XM_006532646 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 2 (Slc13a2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// XM_006532648 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 2 (Slc13a2), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// XM_006532649 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 2 (Slc13a2), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000001122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78397087:78422217:-1 gene:ENSMUSG00000001095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF201903 // GenBank // Mus musculus Na/dicarboxylate cotransporter mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC013493 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:19142 IMAGE:4218337), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006532647 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 2 (Slc13a2), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000034179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78358751:78406938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NM_199199 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 199 (Tmem199), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052566 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78507055:78512172:-1 gene:ENSMUSG00000051232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78507252:78508818:-1 gene:ENSMUSG00000051232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000135946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78508508:78512045:-1 gene:ENSMUSG00000051232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// BC064015 // GenBank HTC // Mus musculus transmembrane protein 199, mRNA (cDNA clone IMAGE:30244344), with apparent retained intron. // chr11 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// BC147070 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 199, mRNA (cDNA clone MGC:182163 IMAGE:9056057), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC147071 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 199, mRNA (cDNA clone MGC:182171 IMAGE:9056065), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000148393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78509514:78512083:-1 gene:ENSMUSG00000051232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000041655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78507710:78512107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_001159392 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 1 (endothelial) (Tnfaip1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_009395 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 1 (endothelial) (Tnfaip1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000017759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78522850:78536271:-1 gene:ENSMUSG00000017615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000108277 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78522850:78536332:-1 gene:ENSMUSG00000017615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC003906 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 1 (endothelial), mRNA (cDNA clone MGC:7242 IMAGE:3484017), complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533152 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 1 (endothelial) (Tnfaip1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78525305:78537110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_133706 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 97 (Tmem97), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000103242 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78541817:78550777:-1 gene:ENSMUSG00000037278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC018156 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 97, mRNA (cDNA clone MGC:25841 IMAGE:4192256), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC093511 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 97, mRNA (cDNA clone MGC:102369 IMAGE:5124076), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_008702 // RefSeq // Mus musculus nemo like kinase (Nlk), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000142739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78567168:78697373:-1 gene:ENSMUSG00000017376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF036332 // GenBank // Mus musculus nemo-like kinase (Nlk) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC057667 // GenBank // Mus musculus nemo like kinase, mRNA (cDNA clone MGC:68238 IMAGE:4235238), complete cds. // chr11 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC058652 // GenBank // Mus musculus nemo like kinase, mRNA (cDNA clone MGC:76386 IMAGE:6406851), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78568884:78596432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000145158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78708738:78709761:-1 gene:ENSMUSG00000085115 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT010930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_197989 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 58, member B (Fam58b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000059468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78750506:78751729:-1 gene:ENSMUSG00000049489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC027022 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810009O10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:36666 IMAGE:5367363), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000041633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78750910:78751662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0
NM_001159301 // RefSeq // Mus musculus lectin, galactose binding, soluble 9 (Lgals9), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_010708 // RefSeq // Mus musculus lectin, galactose binding, soluble 9 (Lgals9), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000073001 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78963395:78984831:-1 gene:ENSMUSG00000001123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78962974:78984946:-1 gene:ENSMUSG00000001123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:78962979:78984924:-1 gene:ENSMUSG00000001123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC003754 // GenBank // Mus musculus lectin, galactose binding, soluble 9, mRNA (cDNA clone MGC:5882 IMAGE:3601419), complete cds. // chr11 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// U55060 // GenBank // Mus musculus beta-galactoside binding lectin mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// U55061 // GenBank // Mus musculus beta-galactoside binding lectin intestine isoform mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78963395:79074612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000068448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:79296179:79296906:-1 gene:ENSMUSG00000055072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK039395 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330038H24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_019409 // RefSeq // Mus musculus oligodendrocyte myelin glycoprotein (Omg), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000164465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:79500982:79504084:-1 gene:ENSMUSG00000049612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC024757 // GenBank // Mus musculus oligodendrocyte myelin glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:35932 IMAGE:5369312), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:79501699:79502712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0
ENSMUST00000083349 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:79893584:79893715:-1 gene:ENSMUSG00000065283 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT010989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
AK133080 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930568M16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00001289 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_183275 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor, mitochondrial (Tefm), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006534061 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription elongation factor, mitochondrial (Tefm), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000050207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:80136678:80142175:-1 gene:ENSMUSG00000046909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000136996 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:80136678:80139909:-1 gene:ENSMUSG00000046909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC094625 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110002N22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106822 IMAGE:1515023), complete cds. // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK003325 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110002N22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// ENSMUST00000131601 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:80137946:80142143:-1 gene:ENSMUSG00000046909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000056518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:80136836:80142119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_027472 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5730455P16 gene (5730455P16Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006534198 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 5730455P16 gene (5730455P16Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000103225 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:80360493:80378034:-1 gene:ENSMUSG00000057181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000134274 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:80370418:80378034:-1 gene:ENSMUSG00000057181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000179332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:80360492:80378015:-1 gene:ENSMUSG00000057181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC044897 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730455P16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:25574 IMAGE:3990240), complete cds. // chr11 // 85 // 82 // 23 // 27 // 0 /// BC055024 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730455P16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:62693 IMAGE:5149944), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:80363812:80377981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_177390 // RefSeq // Mus musculus myosin ID (Myo1d), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000041065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:80482126:80780025:-1 gene:ENSMUSG00000035441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:80484226:80709077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_177390 // RefSeq // Mus musculus myosin ID (Myo1d), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006533586 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myosin ID (Myo1d), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000041065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:80482126:80780025:-1 gene:ENSMUSG00000035441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000070997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:80583827:80780025:-1 gene:ENSMUSG00000035441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC150765 // GenBank // Mus musculus myosin ID, mRNA (cDNA clone MGC:183676 IMAGE:9087676), complete cds. // chr11 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// ENSMUST00000125944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:80673667:80780003:-1 gene:ENSMUSG00000035441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// AK037051 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930104H07 product:MYOSIN-1D, full insert sequence. // chr11 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// GENSCAN00000053443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:80484226:80709077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0
NM_001034013 // RefSeq // Mus musculus acid-sensing (proton-gated) ion channel 2 (Asic2), transcript variant MDEG1, mRNA. // chr11 // 88 // 88 // 36 // 41 // 1 /// NM_007384 // RefSeq // Mus musculus acid-sensing (proton-gated) ion channel 2 (Asic2), transcript variant MDEG2, mRNA. // chr11 // 80 // 80 // 33 // 41 // 1 /// ENSMUST00000021045 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:80880169:81153321:-1 gene:ENSMUSG00000020704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 80 // 33 // 41 // 1 /// ENSMUST00000066197 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:80880169:81968457:-1 gene:ENSMUSG00000020704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 88 // 36 // 41 // 1 /// AF348465 // GenBank // Mus musculus brain sodium channel 1 alpha subunit (Accn1) mRNA, complete cds. // chr11 // 83 // 83 // 34 // 41 // 1 /// BC138529 // GenBank // Mus musculus amiloride-sensitive cation channel 1, neuronal (degenerin), mRNA (cDNA clone MGC:170154 IMAGE:8861549), complete cds. // chr11 // 78 // 78 // 32 // 41 // 1 /// BC138530 // GenBank // Mus musculus amiloride-sensitive cation channel 1, neuronal (degenerin), mRNA (cDNA clone MGC:170155 IMAGE:8861550), complete cds. // chr11 // 78 // 78 // 32 // 41 // 1 /// Y14634 // GenBank // Mus musculus mRNA for proton-gated cation channels modulatory subunit. // chr11 // 76 // 76 // 31 // 41 // 1 /// GENSCAN00000053444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:80881057:80907894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1
NM_001033765 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700071K01 gene (1700071K01Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000117522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:81572655:81573473:-1 gene:ENSMUSG00000080980 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC139179 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700071K01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170806 IMAGE:8862201), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC139181 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700071K01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170808 IMAGE:8862203), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:81572658:81573473:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_011329 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 1 (Ccl1), mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021043 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82176659:82179812:-1 gene:ENSMUSG00000020702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000108189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:82176657:82179812:-1 gene:ENSMUSG00000020702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC120806 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 1, mRNA (cDNA clone MGC:156043 IMAGE:40129729), complete cds. // chr11 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// M17957 // GenBank // Mus musculus T-cell activation gene 3 (TCA3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// M23501 // GenBank // Mus musculus secreted T cell protein (P500/TCA3; SIS-epsilon) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF065924 // GenBank // Mus musculus strain B10.S/J small inducible cytokine A1 precursor (Scya1) mRNA, partial cds. // chr11 // 73 // 50 // 11 // 15 // 0 /// ENSMUST00000138333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82176657:82305690:-1 gene:ENSMUSG00000020702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// BC042744 // GenBank HTC // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4187097), with apparent retained intron. // chr11 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONMMUT011063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000045075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:82155022:82179744:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSMUST00000083267 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:82596073:82596179:-1 gene:ENSMUSG00000065201 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT011066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001291242 // RefSeq // Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 6b (zeta) (Cct6b), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_009839 // RefSeq // Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 6b (zeta) (Cct6b), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006532107 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 6b (zeta) (Cct6b), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XR_388344 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 6b (zeta) (Cct6b), transcript variant X4, misc_RNA. // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000021040 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:82719250:82764306:-1 gene:ENSMUSG00000020698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000100722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82719250:82764321:-1 gene:ENSMUSG00000020698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC100457 // GenBank // Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 6b (zeta), mRNA (cDNA clone MGC:118274 IMAGE:30918851), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:82729434:82764227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
XR_393429 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-45 homolog B (C. elegans), opposite strand (Unc45bos), ncRNA. // chr11 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSMUST00000156395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:82924903:82933382:-1 gene:ENSMUSG00000086058 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK040863 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530031I11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT011085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_045932 // RefSeq // Mus musculus schlafen 5, opposite strand (Slfn5os), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127074 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82942341:82960681:-1 gene:ENSMUSG00000086327 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT011087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT011088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_172796 // RefSeq // Mus musculus schlafen 9 (Slfn9), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000038211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:82979629:82991830:-1 gene:ENSMUSG00000069793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000092840 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82980412:82991829:-1 gene:ENSMUSG00000069793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000138797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82981984:82991137:-1 gene:ENSMUSG00000069793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AY217035 // GenBank // Mus musculus putative protein mRNA, partial cds. // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AY261800 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 schlafen 9 (Slfn9) mRNA, complete cds. // chr11 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// AY261801 // GenBank // Mus musculus strain 129/SvJ schlafen 9 (Slfn9) mRNA, complete cds. // chr11 // 50 // 80 // 10 // 20 // 0 /// GENSCAN00000002625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:82973033:83017715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001167743 // RefSeq // Mus musculus schlafen 8 (Slfn8), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NM_181545 // RefSeq // Mus musculus schlafen 8 (Slfn8), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83002158:83020810:-1 gene:ENSMUSG00000035208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000092838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:83002524:83020810:-1 gene:ENSMUSG00000035208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000108152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:83002158:83020722:-1 gene:ENSMUSG00000035208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000130822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:83003887:83020108:-1 gene:ENSMUSG00000035208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AY261798 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 schlafen 8 (Slfn8) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC024709 // GenBank // Mus musculus schlafen 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:3982223), complete cds. // chr11 // 60 // 58 // 9 // 15 // 0 /// GENSCAN00000002625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:82973033:83017715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NR_073523 // RefSeq // Mus musculus schlafen 10, pseudogene (Slfn10-ps), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr11 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NR_073524 // RefSeq // Mus musculus schlafen 10, pseudogene (Slfn10-ps), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr11 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000100716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:83028130:83040042:-1 gene:ENSMUSG00000072621 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000152760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83028855:83036166:-1 gene:ENSMUSG00000072621 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr11 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// AY261802 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 truncated schlafen 10 (Slfn10) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AY261803 // GenBank // Mus musculus strain 129/SvJ schlafen 10 (Slfn10) mRNA, complete cds. // chr11 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// BC115828 // GenBank // Mus musculus schlafen 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:40060828), complete cds. // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000002609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:83027500:83035956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001013759 // RefSeq // Mus musculus growth arrest-specific 2 like 2 (Gas2l2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83421902:83429455:-1 gene:ENSMUSG00000020686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000147301 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:83421902:83429455:-1 gene:ENSMUSG00000020686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC147480 // GenBank // Mus musculus growth arrest-specific 2 like 2, mRNA (cDNA clone MGC:182822 IMAGE:9087436), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC150847 // GenBank // Mus musculus growth arrest-specific 2 like 2, mRNA (cDNA clone MGC:183758 IMAGE:9087758), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:83421902:83429428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001045543 // RefSeq // Mus musculus HEAT repeat containing 9 (Heatr9), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006533903 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 11435 (Gm11435), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000019069 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83511736:83522175:-1 gene:ENSMUSG00000018925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:83511762:83613232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_011337 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 3 (Ccl3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000001008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83647844:83649355:-1 gene:ENSMUSG00000000982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF065939 // GenBank // Mus musculus strain SJL/J small inducible cytokine A3 (ScyA3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AF065940 // GenBank // Mus musculus strain B10.S/J small inducible cytokine A3 (ScyA3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AF065941 // GenBank // Mus musculus strain BALB/cJ small inducible cytokine A3 (ScyA3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AF065942 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2J small inducible cytokine A3 (ScyA3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AF065943 // GenBank // Mus musculus strain NOD/LtJ small inducible cytokine A3 (ScyA3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC111443 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 3, mRNA (cDNA clone MGC:130461 IMAGE:40041119), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// EU366956 // GenBank // Mus musculus chemokine C-C motif ligand 3 (Ccl3) mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// J04491 // GenBank // Mouse T-cell receptor L2G25B protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// M23447 // GenBank // Mus musculus T cell secreted protein (TY5; SIS-alpha) mRNA, complete cds. // chr11 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:83648253:83658333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_172562 // RefSeq // Mus musculus transcriptional adaptor 2A (Tada2a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006532989 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcriptional adaptor 2A (Tada2a), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006532990 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcriptional adaptor 2A (Tada2a), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000018795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:84078920:84129600:-1 gene:ENSMUSG00000018651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000141852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84079636:84093854:-1 gene:ENSMUSG00000018651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AK142262 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330024K24 product:transcriptional adaptor 2 (ADA2 homolog, yeast)-like, full insert sequence. // chr11 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// BC038821 // GenBank // Mus musculus transcriptional adaptor 2 (ADA2 homolog, yeast)-like, mRNA (cDNA clone MGC:47112 IMAGE:3990023), complete cds. // chr11 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84082038:84087460:-1 gene:ENSMUSG00000018651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000001083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:84079592:84201957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONMMUT011162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001037932 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11437 (Gm11437), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000050771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:84148351:84167476:-1 gene:ENSMUSG00000051452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:84079592:84201957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_008498 // RefSeq // Mus musculus LIM homeobox protein 1 (Lhx1), mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000018842 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:84518284:84525535:-1 gene:ENSMUSG00000018698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000092827 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:84521896:84522711:-1 gene:ENSMUSG00000018698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000176503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84519706:84522067:-1 gene:ENSMUSG00000018698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000184646 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:84519442:84522331:-1 gene:ENSMUSG00000018698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// BC092374 // GenBank // Mus musculus LIM homeobox protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:90731 IMAGE:30363447), complete cds. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:84519549:84524175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0
NM_145433 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial rRNA methyltransferase 1 homolog (S. cerevisiae) (Mrm1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000018549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:84813061:84819515:-1 gene:ENSMUSG00000018405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC005625 // GenBank // Mus musculus mitochondrial rRNA methyltransferase 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:7021 IMAGE:3155732), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK041034 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530065E19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// BC039743 // GenBank HTC // Mus musculus predicted gene, ENSMUSG00000054212, mRNA (cDNA clone IMAGE:3155268), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr11 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:84793233:84819372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_177564 // RefSeq // Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 11 (Dhrs11), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006532575 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 11 (Dhrs11), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006532576 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 11 (Dhrs11), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XR_388375 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 11 (Dhrs11), transcript variant X3, misc_RNA. // chr11 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// ENSMUST00000047560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:84820856:84828964:-1 gene:ENSMUSG00000034449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC022224 // GenBank // Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 11, mRNA (cDNA clone MGC:18716 IMAGE:4219994), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151496 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84821992:84828994:-1 gene:ENSMUSG00000034449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000047640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:84821260:84828882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_027388 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class W (Pigw), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000067058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:84876315:84880195:-1 gene:ENSMUSG00000045140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC144942 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class W, mRNA (cDNA clone MGC:178498 IMAGE:9053490), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NM_001077636 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class W (Pigw), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// ENSMUST00000108080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:84876843:84880285:-1 gene:ENSMUSG00000045140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// AK086537 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930036B07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_001005223 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, HIT type 3 (Znhit3), mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533673 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, HIT type 3 (Znhit3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000103195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:84910950:84916366:-1 gene:ENSMUSG00000020526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000127838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84911505:84916305:-1 gene:ENSMUSG00000020526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 93 // 47 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000144552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84911291:84916349:-1 gene:ENSMUSG00000020526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC089554 // GenBank // Mus musculus zinc finger, HIT type 3, mRNA (cDNA clone MGC:107312 IMAGE:30300471), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000136656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84911469:84916366:-1 gene:ENSMUSG00000020526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONMMUT011202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 93 // 47 // 13 // 14 // 0
NM_001029934 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 32 (Usp32), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000000821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84985647:85029135:-1 gene:ENSMUSG00000000804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000108075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:84984442:85140038:-1 gene:ENSMUSG00000000804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK170234 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630034J08 product:hypothetical EF-Hand-like/Calcium-binding EF-hand containing protein, full insert sequence. // chr11 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// GENSCAN00000047633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:84986410:85095431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0
NM_025825 // RefSeq // Mus musculus amyloid beta precursor protein (cytoplasmic tail) binding protein 2 (Appbp2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000018625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:85187262:85235130:-1 gene:ENSMUSG00000018481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK122222 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0228 protein. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC018442 // GenBank // Mus musculus amyloid beta precursor protein (cytoplasmic tail) binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:27797 IMAGE:3157290), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC019152 // GenBank // Mus musculus amyloid beta precursor protein (cytoplasmic tail) binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:29424 IMAGE:5065139), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:85191646:85235139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
AK029910 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931436F15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK137618 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830168E02 product:hypothetical Helix-turn-helix, Fis-type containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000146433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:85846790:85850333:-1 gene:ENSMUSG00000069785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_388936 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102636185 (LOC102636185), ncRNA. // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_178309 // RefSeq // Mus musculus BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 (Brip1), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// XM_006533240 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 (Brip1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000044423 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:86058138:86201193:-1 gene:ENSMUSG00000034329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000149748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:86195033:86201164:-1 gene:ENSMUSG00000034329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// AK014036 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110009N10 product:similar to BRCA1-BINDING HELICASE-LIKE PROTEIN BACH1 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// BC094252 // GenBank // Mus musculus BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1, mRNA (cDNA clone MGC:106602 IMAGE:6401109), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000043483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:86061429:86198964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// NONMMUT011254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0
NM_027421 // RefSeq // Mus musculus integrator complex subunit 2 (Ints2), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000018212 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:86210681:86257550:-1 gene:ENSMUSG00000018068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:86212088:86256546:-1 gene:ENSMUSG00000018068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC050081 // GenBank // Mus musculus integrator complex subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:61028 IMAGE:30023969), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC059056 // GenBank // Mus musculus integrator complex subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:69851 IMAGE:6821329), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC118007 // GenBank // Mus musculus integrator complex subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:141509 IMAGE:40086155), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134883 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:86234672:86257541:-1 gene:ENSMUSG00000018068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// AK037055 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930104O17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000043463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:86212632:86285328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_001080931 // RefSeq // Mus musculus mediator complex subunit 13 (Med13), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000043624 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:86267033:86357602:-1 gene:ENSMUSG00000034297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK129168 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0593 protein. // chr11 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000043474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:86286424:86346028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000043463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:86212632:86285328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSMUST00000082592 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:86437310:86437415:-1 gene:ENSMUSG00000064526 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT011277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
BC096608 // GenBank // Mus musculus hypothetical protein C730049P21, mRNA (cDNA clone IMAGE:5362168). // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00001297 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029478 // RefSeq // Mus musculus vacuole membrane protein 1 (Vmp1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006534403 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vacuole membrane protein 1 (Vmp1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000018315 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:86583865:86683836:-1 gene:ENSMUSG00000018171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB047550 // GenBank // Mus musculus mRNA, novel lipopolysaccharide-inducible gene, complete cds. // chr11 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// AB076609 // GenBank // Mus musculus ni-2 mRNA for NF-E2 induceble protein-2, complete cds. // chr11 // 84 // 73 // 16 // 19 // 0 /// AK016312 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930579A11 product:VACUOLE MEMBRANE PROTEIN 1 homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC004013 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 49, mRNA (cDNA clone MGC:7590 IMAGE:3493738), complete cds. // chr11 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0 /// AK050796 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030020G07 product:VACUOLE MEMBRANE PROTEIN 1 homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:86594168:86671559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001003908 // RefSeq // Mus musculus clathrin, heavy polypeptide (Hc) (Cltc), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000060766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:86694655:86757501:-1 gene:ENSMUSG00000047126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000103186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:86694351:86757565:-1 gene:ENSMUSG00000047126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC031408 // GenBank // Mus musculus clathrin, heavy polypeptide (Hc), mRNA (cDNA clone IMAGE:4949242), partial cds. // chr11 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// BC079897 // GenBank // Mus musculus clathrin, heavy polypeptide (Hc), mRNA (cDNA clone MGC:92975 IMAGE:30546407), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000047025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:86695566:86757289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_026191 // RefSeq // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 40 (Dhx40), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000018569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:86768846:86807746:-1 gene:ENSMUSG00000018425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000148263 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:86775660:86801088:-1 gene:ENSMUSG00000018425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// BC058276 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 40, mRNA (cDNA clone MGC:68082 IMAGE:6515479), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000047020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:86770122:86807771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0
NM_001005341 // RefSeq // Mus musculus yippee-like 2 (Drosophila) (Ypel2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000018571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:86936425:86993707:-1 gene:ENSMUSG00000018427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB098741 // GenBank // Mus musculus Ypel2 mRNA for yippee-like 2, complete cds. // chr11 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC121190 // GenBank // Mus musculus yippee-like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:118499 IMAGE:6467362), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:86939622:86993734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_025638 // RefSeq // Mus musculus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 (Gdpd1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000020804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:87033867:87074062:-1 gene:ENSMUSG00000061666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC016541 // GenBank // Mus musculus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:28006 IMAGE:3602449), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87035173:87046659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_024262 // RefSeq // Mus musculus smg-8 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) (Smg8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000020801 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:87077732:87086774:-1 gene:ENSMUSG00000020495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC020005 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1200011M11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:25729 IMAGE:3981459), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143280 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:87077736:87085382:-1 gene:ENSMUSG00000020495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87077953:87086753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_175563 // RefSeq // Mus musculus proline rich 11 (Prr11), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000051395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:87089153:87108708:-1 gene:ENSMUSG00000020493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC023918 // GenBank // Mus musculus proline rich 11, mRNA (cDNA clone MGC:38215 IMAGE:5323297), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87091781:87106136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_177167 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1E (PP2C domain containing) (Ppm1e), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000055438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:87226906:87359023:-1 gene:ENSMUSG00000046442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC138900 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1E (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone MGC:170527 IMAGE:8861922), complete cds. // chr11 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC138903 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1E (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone MGC:170530 IMAGE:8861925), complete cds. // chr11 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000155154 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:87243065:87358637:-1 gene:ENSMUSG00000046442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000047016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87230880:87249118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000157376 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:87318694:87318799:-1 gene:ENSMUSG00000088001 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_080420 // RefSeq // Mus musculus lactoperoxidase (Lpo), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000103177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:87806428:87826113:-1 gene:ENSMUSG00000009356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000136446 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:87817734:87828289:-1 gene:ENSMUSG00000009356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC016212 // GenBank // Mus musculus lactoperoxidase, mRNA (cDNA clone MGC:27708 IMAGE:4924899), complete cds. // chr11 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87806847:87822274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_007946 // RefSeq // Mus musculus eosinophil peroxidase (Epx), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006532173 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus eosinophil peroxidase (Epx), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000049768 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:87864000:87875536:-1 gene:ENSMUSG00000052234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK132416 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4631414J10 product:eosinophil peroxidase, full insert sequence. // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// D78353 // GenBank // Mus musculus mRNA for eosinophil peroxidase, complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// L77979 // GenBank // Mus musculus (clone pBM.EPO-8/pBM.EPO-10) eosinophil peroxidase (EPO) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87864313:87875411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_146411 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 462 (Olfr462), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000049743 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:87888959:87889894:-1 gene:ENSMUSG00000093839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC108939 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 462, mRNA (cDNA clone MGC:123553 IMAGE:40041186), complete cds. // chr11 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87888959:87889894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_146413 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 463 (Olfr463), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000081417 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:87892987:87893922:-1 gene:ENSMUSG00000093920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC106969 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 463, mRNA (cDNA clone MGC:129182 IMAGE:40041195), complete cds. // chr11 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87892987:87893922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_146412 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 464 (Olfr464), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074874 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:87913963:87914904:-1 gene:ENSMUSG00000060787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120701 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 464, mRNA (cDNA clone MGC:155938 IMAGE:40129624), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87897846:87946392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK081583 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130047K18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_029023 // RefSeq // Mus musculus serine carboxypeptidase 1 (Scpep1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000000287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:88924020:88955465:-1 gene:ENSMUSG00000000278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF330052 // GenBank // Mus musculus retinoid-inducible serine carboxypeptidase precursor (Risc) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC004847 // GenBank // Mus musculus serine carboxypeptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6852 IMAGE:2650587), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// BC021399 // GenBank // Mus musculus serine carboxypeptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:29291 IMAGE:4193674), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:88909565:88955369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NR_003564 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15698 (Gm15698), non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000061938 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:88964658:88966917:-1 gene:ENSMUSG00000057534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000121228 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:88964658:88966931:-1 gene:ENSMUSG00000057534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
AK147092 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920164A13 product:weakly similar to 60S ribosomal protein L34 [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019505 // RefSeq // Mus musculus diacylglycerol kinase, epsilon (Dgke), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XR_388495 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus diacylglycerol kinase, epsilon (Dgke), transcript variant X1, misc_RNA. // chr11 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000000285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:89037582:89060748:-1 gene:ENSMUSG00000000276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000107894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:89035179:89066850:-1 gene:ENSMUSG00000000276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000152772 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:89039220:89060748:-1 gene:ENSMUSG00000000276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// AF136744 // GenBank // Mus musculus diacylglycerol kinase epsilon mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// XR_390032 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus diacylglycerol kinase, epsilon (Dgke), transcript variant X3, misc_RNA. // chr11 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// AK044596 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930026B18 product:diacylglycerol kinase, epsilon, full insert sequence. // chr11 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// GENSCAN00000053215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:89040732:89060385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
NM_008711 // RefSeq // Mus musculus noggin (Nog), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:89300638:89302332:-1 gene:ENSMUSG00000048616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132527 // GenBank // Mus musculus noggin, mRNA (cDNA clone MGC:164158 IMAGE:40130804), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC138148 // GenBank // Mus musculus noggin, mRNA (cDNA clone MGC:169772 IMAGE:8861167), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:89301322:89325743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172534 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4932411E22 gene (4932411E22Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050983 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:89390223:89418948:-1 gene:ENSMUSG00000047490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC140961 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932411E22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175922 IMAGE:9055573), complete cds. // chr11 // 73 // 88 // 16 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:89391608:89405664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001080933 // RefSeq // Mus musculus ankyrin-repeat and fibronectin type III domain containing 1 (Ankfn1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000128717 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:89420987:89639631:-1 gene:ENSMUSG00000047773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000169201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:89421086:89538556:-1 gene:ENSMUSG00000047773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:89420046:89478786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_008796 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylcholine transfer protein (Pctp), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:89982665:90002894:-1 gene:ENSMUSG00000020553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF151639 // GenBank // Mus musculus phosphatidylcholine transfer protein (Pc-tp) mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// BC071234 // GenBank // Mus musculus phosphatidylcholine transfer protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:30445835). // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
AY512956 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0957C10 unknown mRNA. // chr11 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0
NM_172563 // RefSeq // Mus musculus hepatic leukemia factor (Hlf), mRNA. // chr11 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000004051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:90336536:90390895:-1 gene:ENSMUSG00000003949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000043658 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:90338990:90389690:-1 gene:ENSMUSG00000003949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000107881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:90339142:90388207:-1 gene:ENSMUSG00000003949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// AK079068 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330137N20 product:similar to HEPATIC LEUKEMIA FACTOR [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 96 // 60 // 23 // 24 // 0 /// BC057693 // GenBank // Mus musculus hepatic leukemia factor, mRNA (cDNA clone MGC:68394 IMAGE:4196259), complete cds. // chr11 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// BC058705 // GenBank // Mus musculus hepatic leukemia factor, mRNA (cDNA clone MGC:76396 IMAGE:6839029), complete cds. // chr11 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0
NM_011505 // RefSeq // Mus musculus syntaxin binding protein 4 (Stxbp4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:90476492:90638084:-1 gene:ENSMUSG00000020546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028547 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 2B (Kif2b), mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000061019 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:91575315:91577558:-1 gene:ENSMUSG00000046755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC100484 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 2B, mRNA (cDNA clone MGC:118316 IMAGE:30919380), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC132056 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 2B, mRNA (cDNA clone MGC:163687 IMAGE:40130333), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC137981 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 2B, mRNA (cDNA clone MGC:169605 IMAGE:8861000), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:91575449:91577569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000118039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:92792699:92793279:-1 gene:ENSMUSG00000081141 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:92792871:92804223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001013375 // RefSeq // Mus musculus UTP18, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast) (Utp18), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000066888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:93859243:93885766:-1 gene:ENSMUSG00000054079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000130797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:93859243:93885766:-1 gene:ENSMUSG00000054079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC119621 // GenBank // Mus musculus UTP18, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:141453 IMAGE:40062238), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC119622 // GenBank // Mus musculus UTP18, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:141454 IMAGE:40062245), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK167248 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0045L22 product:similar to WD-repeat protein CGI-48 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:93818416:93886386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001077529 // RefSeq // Mus musculus NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 (Nme2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// NM_008705 // RefSeq // Mus musculus NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 (Nme2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000021217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:93949814:93956259:-1 gene:ENSMUSG00000020857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000072566 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:93949817:93955783:-1 gene:ENSMUSG00000020857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// BC066995 // GenBank // Mus musculus non-metastatic cells 2, protein (NM23B) expressed in, mRNA (cDNA clone MGC:93017 IMAGE:5691909), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// BC086892 // GenBank // Mus musculus non-metastatic cells 2, protein (NM23B) expressed in, mRNA (cDNA clone MGC:107562 IMAGE:6752803), complete cds. // chr11 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// BC086893 // GenBank // Mus musculus non-metastatic cells 2, protein (NM23B) expressed in, mRNA (cDNA clone MGC:107563 IMAGE:6758871), complete cds. // chr11 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
NM_008704 // RefSeq // Mus musculus NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 1 (Nme1), mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:93959472:93966043:-1 gene:ENSMUSG00000037601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000107844 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:93960668:93968272:-1 gene:ENSMUSG00000037601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000135884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:93956979:93968521:-1 gene:ENSMUSG00000037601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF033377 // GenBank // Mus musculus nucleoside diphosphate kinase A (NDPK-A) long form mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// BC005629 // GenBank // Mus musculus non-metastatic cells 1, protein (NM23A) expressed in, mRNA (cDNA clone MGC:11447 IMAGE:3964056), complete cds. // chr11 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// M65037 // GenBank // Mouse metastasis-reducing protein (nm23) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// U85511 // GenBank // Mus musculus nucleoside diphosphate kinase A long form mRNA, complete cds. // chr11 // 91 // 72 // 21 // 23 // 0 /// ENSMUST00000170303 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:93949819:93968293:-1 gene:ENSMUSG00000091228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000009688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:93959396:93965933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NM_181819 // RefSeq // Mus musculus WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 (Wfikkn2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533498 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 (Wfikkn2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533499 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 (Wfikkn2), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533502 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 (Wfikkn2), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94235956:94242707:-1 gene:ENSMUSG00000044177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181819 // RefSeq // Mus musculus WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 (Wfikkn2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533498 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 (Wfikkn2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533499 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 (Wfikkn2), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533502 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 (Wfikkn2), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000061469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94235956:94242707:-1 gene:ENSMUSG00000044177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY308804 // GenBank // Mus musculus growth and differentiation factor-associated serum protein 1 (Gasp1) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC113144 // GenBank // Mus musculus WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:130508 IMAGE:40047070), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// JQ080910 // GenBank // Mus musculus growth and differentiation factor-associated serum protein 1 (Gasp1) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AY100450 // GenBank // Mus musculus novel secreted protein precursor, mRNA, partial cds. // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000009643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94216965:94247604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0
NM_144827 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 20 (Spata20), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000041705 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94478904:94485348:-1 gene:ENSMUSG00000020867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000134332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94478904:94485101:-1 gene:ENSMUSG00000020867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000136362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94483353:94485099:-1 gene:ENSMUSG00000020867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000151707 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94483086:94484412:-1 gene:ENSMUSG00000020867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// BC050788 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 20, mRNA (cDNA clone MGC:58609 IMAGE:6706609), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC050807 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 20, mRNA (cDNA clone IMAGE:6771592). // chr11 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94473342:94484609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_027984 // RefSeq // Mus musculus epsin 3 (Epn3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006534266 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus epsin 3 (Epn3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000010224 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94491113:94499909:-1 gene:ENSMUSG00000010080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000127305 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94489599:94499974:-1 gene:ENSMUSG00000010080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC016454 // GenBank // Mus musculus epsin 3, mRNA (cDNA clone MGC:25634 IMAGE:4217221), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94491151:94496542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_170671 // RefSeq // Mus musculus MYCBP associated protein (Mycbpap), mRNA. // chr11 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// ENSMUST00000040692 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:94501347:94507355:-1 gene:ENSMUSG00000039110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 41 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000093945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94501347:94521742:-1 gene:ENSMUSG00000039110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// ENSMUST00000123496 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94501347:94521742:-1 gene:ENSMUSG00000039110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// ENSMUST00000151993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94507700:94510161:-1 gene:ENSMUSG00000039110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// AK029929 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932408B01 product:inferred: hypothetical protein {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr11 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// AK166780 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0011N18 product:Mycbp associated protein, full insert sequence. // chr11 // 96 // 64 // 24 // 25 // 0 /// BC027327 // GenBank // Mus musculus MYCBP associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:28227 IMAGE:3991131), complete cds. // chr11 // 90 // 77 // 27 // 30 // 0 /// BC050808 // GenBank // Mus musculus MYCBP associated protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:6771698), complete cds. // chr11 // 100 // 41 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000035436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94501419:94549117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0
NM_001013381 // RefSeq // Mus musculus radical S-adenosyl methionine domain containing 1 (Rsad1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533244 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus radical S-adenosyl methionine domain containing 1 (Rsad1), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000040487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94539798:94549199:-1 gene:ENSMUSG00000039096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000132274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94539798:94549255:-1 gene:ENSMUSG00000039096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC139274 // GenBank // Mus musculus radical S-adenosyl methionine domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:170901 IMAGE:8862296), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC139276 // GenBank // Mus musculus radical S-adenosyl methionine domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:170903 IMAGE:8862298), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94501419:94549117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_153807 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA synthetase family member 2 (Acsf2), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000103164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94557102:94601871:-1 gene:ENSMUSG00000076435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000131852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:65393337:65395184:1 gene:ENSMUSG00000048916 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 88 // 89 // 29 // 33 // 0 /// ENSMUST00000155122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94570291:94601769:-1 gene:ENSMUSG00000076435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// BC018371 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA synthetase family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:25878 IMAGE:4210220), complete cds. // chr11 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// BC063269 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA synthetase family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:68317 IMAGE:4159843), complete cds. // chr11 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// GENSCAN00000026562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:65393355:65395184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 86 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94558307:94563753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94569295:94601752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0
NM_177752 // RefSeq // Mus musculus essential meiotic endonuclease 1 homolog 1 (S. pombe) (Eme1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006533409 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus essential meiotic endonuclease 1 homolog 1 (S. pombe) (Eme1), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000039949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94644996:94653964:-1 gene:ENSMUSG00000039055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000127158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94647732:94650531:-1 gene:ENSMUSG00000039055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// BC089459 // GenBank // Mus musculus essential meiotic endonuclease 1 homolog 1 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:106543 IMAGE:30630337), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94645527:94652640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_145828 // RefSeq // Mus musculus xylosyltransferase II (Xylt2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XR_388413 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus xylosyltransferase II (Xylt2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr11 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000116349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94663851:94677515:-1 gene:ENSMUSG00000020868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000153485 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94664587:94677515:-1 gene:ENSMUSG00000020868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC034082 // GenBank // Mus musculus xylosyltransferase II, mRNA (cDNA clone MGC:31375 IMAGE:4239646), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000146693 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94668527:94677407:-1 gene:ENSMUSG00000020868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000035417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94663888:94677407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_001007584 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11541 (Gm11541), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000069852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94694498:94704499:-1 gene:ENSMUSG00000056008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001105561 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11545 (Gm11545), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94756976:94757763:-1 gene:ENSMUSG00000075611 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr11 // 69 // 52 // 9 // 13 // 0 /// GENSCAN00000035415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94757054:94782435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONMMUT011606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 69 // 52 // 9 // 13 // 0
NM_001034896 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 92 (Tmem92), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_001163172 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 92 (Tmem92), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000100554 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94777217:94782703:-1 gene:ENSMUSG00000075610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000143620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94777764:94782500:-1 gene:ENSMUSG00000075610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000162809 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:94777764:94782500:-1 gene:ENSMUSG00000075610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// BC172064 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 92, mRNA (cDNA clone MGC:198769 IMAGE:9054350), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94757054:94782435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
AK079763 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430060F13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XR_106394 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A430060F13 gene (A430060F13Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr11 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// XR_388968 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A430060F13 gene (A430060F13Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// GENSCAN00000035429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94861099:94864990:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_009161 // RefSeq // Mus musculus sarcoglycan, alpha (dystrophin-associated glycoprotein) (Sgca), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000100551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:94962822:94973463:-1 gene:ENSMUSG00000001508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000103162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94962791:94976327:-1 gene:ENSMUSG00000001508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000139855 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:94962797:94970676:-1 gene:ENSMUSG00000001508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000152042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94972226:94973489:-1 gene:ENSMUSG00000001508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 33 // 10 // 12 // 0 /// ENSMUST00000166320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:94963208:94976327:-1 gene:ENSMUSG00000001508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AB024920 // GenBank // Mus musculus mRNA for alpha-sarcoglycan, complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF019564 // GenBank // Mus musculus adhalin mRNA, complete cds. // chr11 // 89 // 75 // 24 // 27 // 0 /// BC060287 // GenBank // Mus musculus sarcoglycan, alpha (dystrophin-associated glycoprotein), mRNA (cDNA clone IMAGE:30286950), partial cds. // chr11 // 90 // 83 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94969055:94972627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0
NM_133667 // RefSeq // Mus musculus pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 2 (Pdk2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006532457 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 2 (Pdk2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000038431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95026258:95041354:-1 gene:ENSMUSG00000038967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95029654:95040558:-1 gene:ENSMUSG00000038967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AF267660 // GenBank // Mus musculus pyruvate dehydrogenase kinase 2 (Pdk2) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC021764 // GenBank // Mus musculus pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 2, mRNA (cDNA clone MGC:25519 IMAGE:3488813), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95027182:95041256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_013565 // RefSeq // Mus musculus integrin alpha 3 (Itga3), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000001548 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95044474:95076714:-1 gene:ENSMUSG00000001507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107739 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:95044474:95069198:-1 gene:ENSMUSG00000001507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120375 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:95044474:95076801:-1 gene:ENSMUSG00000001507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC053031 // GenBank // Mus musculus integrin alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:62260 IMAGE:6401146), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC062205 // GenBank // Mus musculus integrin alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:70286 IMAGE:4950774), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// D13867 // GenBank // Mus musculus mRNA for VLA-3 alpha subunit, complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95051386:95100020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_007867 // RefSeq // Mus musculus distal-less homeobox 4 (Dlx4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006532152 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus distal-less homeobox 4 (Dlx4), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000021241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95140447:95146263:-1 gene:ENSMUSG00000020871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC106967 // GenBank // Mus musculus distal-less homeobox 4, mRNA (cDNA clone MGC:129167 IMAGE:40040019), complete cds. // chr11 // 87 // 58 // 13 // 15 // 0 /// U73329 // GenBank // Mus musculus Dlx7 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006532151 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus distal-less homeobox 4 (Dlx4), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// ENSMUST00000146838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95143627:95145801:-1 gene:ENSMUSG00000020871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AK144866 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730045H12 product:distal-less homeobox 4, full insert sequence. // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AK145133 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830049J23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000035426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95136475:95145481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT011624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_130858 // RefSeq // Mus musculus neurexophilin 3 (Nxph3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95509845:95514570:-1 gene:ENSMUSG00000046719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC007167 // GenBank // Mus musculus neurexophilin 3, mRNA (cDNA clone MGC:7471 IMAGE:3490479), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC008114 // GenBank // Mus musculus neurexophilin 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3483798), complete cds. // chr11 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC039747 // GenBank // Mus musculus neurexophilin 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3483798), partial cds. // chr11 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// XM_006531933 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurexophilin 3 (Nxph3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000029129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95497794:95514213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_033217 // RefSeq // Mus musculus nerve growth factor receptor (TNFR superfamily, member 16) (Ngfr), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000000122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95568818:95587735:-1 gene:ENSMUSG00000000120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF105292 // GenBank // Mus musculus nerve growth factor receptor mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC038365 // GenBank // Mus musculus nerve growth factor receptor (TNFR superfamily, member 16), mRNA (cDNA clone MGC:35588 IMAGE:5367638), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95570803:95631943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
ENSMUST00000062249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:95696894:95699143:-1 gene:ENSMUSG00000045075 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK086744 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930049D19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000191115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95696898:95699143:-1 gene:ENSMUSG00000045075 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163464 // RefSeq // Mus musculus ABI gene family, member 3 (Abi3), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NM_025659 // RefSeq // Mus musculus ABI gene family, member 3 (Abi3), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006533953 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ABI gene family, member 3 (Abi3), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// XM_006533954 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ABI gene family, member 3 (Abi3), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// XM_006533957 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ABI gene family, member 3 (Abi3), transcript variant X7, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000059026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95830074:95842409:-1 gene:ENSMUSG00000018381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000131049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95831943:95842476:-1 gene:ENSMUSG00000018381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000137645 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:95832723:95835890:-1 gene:ENSMUSG00000018381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC058260 // GenBank // Mus musculus ABI gene family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:67841 IMAGE:6474610), complete cds. // chr11 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95832713:95842146:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
NM_008081 // RefSeq // Mus musculus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 2 (B4galnt2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000038343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95865943:95914891:-1 gene:ENSMUSG00000013418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC139165 // GenBank // Mus musculus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:170792 IMAGE:8862187), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC139166 // GenBank // Mus musculus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:170793 IMAGE:8862188), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// L30104 // GenBank // Mus musculus N-acetylgalactosaminyltransferase mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95866071:95958835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_009951 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1 (Igf2bp1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000013559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95957163:96005940:-1 gene:ENSMUSG00000013415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_009951 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1 (Igf2bp1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000013559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95957163:96005940:-1 gene:ENSMUSG00000013415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000152896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95973144:95982594:-1 gene:ENSMUSG00000013415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AF061569 // GenBank // Mus musculus coding region determinant binding protein mRNA, complete cds. // chr11 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC051679 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:60613 IMAGE:30008106), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000146586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95973979:95982611:-1 gene:ENSMUSG00000013415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000029119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95963500:96005633:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_172300 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2Z (putative) (Ube2z), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000100528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96047432:96065388:-1 gene:ENSMUSG00000014349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC054412 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2Z (putative), mRNA (cDNA clone MGC:62703 IMAGE:2646768), complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96050244:96065274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000082861 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:96083673:96083856:-1 gene:ENSMUSG00000064795 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT011687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001271018 // RefSeq // Mus musculus calcium binding and coiled-coil domain 2 (Calcoco2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006534459 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium binding and coiled-coil domain 2 (Calcoco2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006534460 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium binding and coiled-coil domain 2 (Calcoco2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000068686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96099326:96111964:-1 gene:ENSMUSG00000006056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF490344 // GenBank // Mus musculus NDP5211 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000097162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:96099914:96111962:-1 gene:ENSMUSG00000006056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// GENSCAN00000029122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96073104:96107595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1
ENSMUST00000130733 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96336299:96342108:-1 gene:ENSMUSG00000075589 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK138519 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330049E23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_393511 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102632302 (LOC102632302), ncRNA. // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT011711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96328236:96342204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NR_033524 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11529 (Gm11529), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96448323:96464547:-1 gene:ENSMUSG00000075586 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001163389 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 11 (Snx11), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_028965 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 11 (Snx11), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000021246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96767555:96777531:-1 gene:ENSMUSG00000020876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000107661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96767877:96777559:-1 gene:ENSMUSG00000020876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000127375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96769891:96777492:-1 gene:ENSMUSG00000020876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC014719 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 11, mRNA (cDNA clone MGC:25935 IMAGE:4236099), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK037747 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130046H18 product:sorting nexin 11, full insert sequence. // chr11 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// ENSMUST00000132354 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96772537:96774641:-1 gene:ENSMUSG00000020876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000011905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96764271:96795843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONMMUT011744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NR_033523 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11517 (Gm11517), non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000119491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96795439:96795825:-1 gene:ENSMUSG00000081249 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96764271:96795843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
NM_134021 // RefSeq // Mus musculus pyridoxine 5-phosphate oxidase (Pnpo), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000018803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96937825:96943986:-1 gene:ENSMUSG00000018659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000107629 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96939503:96943958:-1 gene:ENSMUSG00000018659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000153896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96937825:96943779:-1 gene:ENSMUSG00000018659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC010785 // GenBank // Mus musculus pyridoxine 5-phosphate oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:18833 IMAGE:4210325), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC026564 // GenBank // Mus musculus pyridoxine 5-phosphate oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:36350 IMAGE:4971745), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK051228 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130019H18 product:hypothetical Pyridoxamine 5-phosphate oxidase family protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96938915:96997703:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
NM_027026 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 46 (Lrrc46), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000021251 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97034602:97041407:-1 gene:ENSMUSG00000020878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK158517 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230005M16 product:hypothetical Leucine-rich repeat/Leucine-rich repeat, cysteine-containing type/Leucine-rich repeat, SDS22+-like containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC022723 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 46, mRNA (cDNA clone MGC:31551 IMAGE:4503387), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97034663:97036600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_019507 // RefSeq // Mus musculus T-box 21 (Tbx21), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000001484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97098071:97115331:-1 gene:ENSMUSG00000001444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF093099 // GenBank // Mus musculus transcription factor TBLYM (Tblym) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AF241242 // GenBank // Mus musculus T-cell-specific T-box transcription factor T-bet mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC137986 // GenBank // Mus musculus T-box 21, mRNA (cDNA clone MGC:169610 IMAGE:8861005), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC137988 // GenBank // Mus musculus T-box 21, mRNA (cDNA clone MGC:169612 IMAGE:8861007), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97098772:97129534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_008379 // RefSeq // Mus musculus karyopherin (importin) beta 1 (Kpnb1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000001479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97159714:97187881:-1 gene:ENSMUSG00000001440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC052438 // GenBank // Mus musculus karyopherin (importin) beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:63345 IMAGE:6405935), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC052711 // GenBank // Mus musculus karyopherin (importin) beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:64644 IMAGE:6835239), complete cds. // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC055115 // GenBank // Mus musculus karyopherin (importin) beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:59352 IMAGE:6518750), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// D45836 // GenBank // Mus musculus mRNA for nuclear pore-targeting complex component of 97kDa, complete cds. // chr11 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// D67015 // GenBank // Mus musculus mRNA for scg, complete cds. // chr11 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// XM_006532307 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus karyopherin (importin) beta 1 (Kpnb1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97162589:97188925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001081220 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 179 (Gpr179), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000093942 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97332109:97352016:-1 gene:ENSMUSG00000070337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97334446:97352016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
NM_001289118 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933428G20 gene (4933428G20Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000056955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97490783:97500340:-1 gene:ENSMUSG00000047988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000052281 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97627389:97629702:-1 gene:ENSMUSG00000043439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC055770 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E130012A19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67345 IMAGE:6403695), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97628172:97633702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_054051 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase, type II, beta (Pip4k2b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000018691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97715157:97744704:-1 gene:ENSMUSG00000018547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000144012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97720396:97726743:-1 gene:ENSMUSG00000018547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// AB054987 // GenBank // Mus musculus pipk type II beta mRNA for Phosphatidyl inositol phosphate kinase type II beta, partial cds. // chr11 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC047282 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase, type II, beta, mRNA (cDNA clone MGC:54923 IMAGE:6491155), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97718859:97744604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_026186 // RefSeq // Mus musculus CWC25 spliceosome-associated protein homolog (S. cerevisiae) (Cwc25), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000018685 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97745615:97766556:-1 gene:ENSMUSG00000018541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000124356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97745481:97751170:-1 gene:ENSMUSG00000018541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// BC021478 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 49, mRNA (cDNA clone IMAGE:5344085), partial cds. // chr11 // 88 // 69 // 21 // 24 // 0 /// BC053447 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 49, mRNA (cDNA clone IMAGE:6392959), complete cds. // chr11 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// BC079553 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 49, mRNA (cDNA clone MGC:90568 IMAGE:6856335), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000107579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97756261:97766540:-1 gene:ENSMUSG00000018541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// AK030628 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330439L06 product:RIKEN cDNA 1300013D05 gene, full insert sequence. // chr11 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000014673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97747355:97766442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT011824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0
NM_028156 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700001P01 gene (1700001P01Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97771481:97775918:-1 gene:ENSMUSG00000018543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048607 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700001P01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58669 IMAGE:6741651), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97771577:97775786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_022891 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L23 (Rpl23), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000103146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97777527:97782437:-1 gene:ENSMUSG00000071415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AF287271 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L23 (Rpl23) mRNA, complete cds. // chr11 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0
NR_028078 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 21 (Snora21), small nucleolar RNA. // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000082967 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:97781639:97781775:-1 gene:ENSMUSG00000064901 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000084006 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:68952100:68952236:-1 gene:ENSMUSG00000065940 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// NONMMUT011828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT062003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0
NM_001081435 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 47 (Fbxo47), mRNA. // chr11 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000093939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97853826:97884154:-1 gene:ENSMUSG00000070336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000125403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97853826:97855552:-1 gene:ENSMUSG00000070336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AK013672 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900052P03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// BC158049 // GenBank // Mus musculus F-box protein 47, mRNA (cDNA clone MGC:189853 IMAGE:9007353), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97840872:97919858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001163608 // RefSeq // Mus musculus plexin domain containing 1 (Plxdc1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_028199 // RefSeq // Mus musculus plexin domain containing 1 (Plxdc1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000017561 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97923238:97986444:-1 gene:ENSMUSG00000017417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000107565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97923656:97986399:-1 gene:ENSMUSG00000017417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF378760 // GenBank // Mus musculus tumor endothelial marker 7 precursor (Tem7) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC114352 // GenBank // Mus musculus plexin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:130377 IMAGE:40057410), complete cds. // chr11 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000141708 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97936843:97986433:-1 gene:ENSMUSG00000017417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// AK040620 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430110C13 product:TUMOR ENDOTHELIAL MARKER 7 PRECURSOR homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// XM_006534301 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus plexin domain containing 1 (Plxdc1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000014682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97924488:97995863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1
NM_207231 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 5C (Arl5c), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97989578:97996181:-1 gene:ENSMUSG00000038352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC065791 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 5C, mRNA (cDNA clone MGC:73657 IMAGE:3824354), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK138099 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130092E01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENSMUST00000107563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97993836:97995929:-1 gene:ENSMUSG00000038352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// AK032519 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430578K18 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97924488:97995863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_146028 // RefSeq // Mus musculus SH3 and cysteine rich domain 2 (Stac2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006533030 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH3 and cysteine rich domain 2 (Stac2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000017544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98036623:98053462:-1 gene:ENSMUSG00000017400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000131519 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:98040098:98043542:-1 gene:ENSMUSG00000017400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// BC024864 // GenBank // Mus musculus SH3 and cysteine rich domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:38869 IMAGE:5361431), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC029794 // GenBank // Mus musculus SH3 and cysteine rich domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:37020 IMAGE:4949472), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98037966:98052982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
NM_010895 // RefSeq // Mus musculus neurogenic differentiation 2 (Neurod2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000041685 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98325415:98329648:-1 gene:ENSMUSG00000038255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK158767 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230334G01 product:neurogenic differentiation 2, full insert sequence. // chr11 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC058965 // GenBank // Mus musculus neurogenic differentiation 2, mRNA (cDNA clone MGC:67032 IMAGE:6817440), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// D83507 // GenBank // Mus musculus mRNA for NeuroD-related factor (NDRF), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U58471 // GenBank // Mus musculus NeuroD2 mRNA, complete cds. // chr11 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98327185:98338855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_001033537 // RefSeq // Mus musculus post-GPI attachment to proteins 3 (Pgap3), mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006533550 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus post-GPI attachment to proteins 3 (Pgap3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98388677:98392072:-1 gene:ENSMUSG00000038208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000090827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98388677:98400490:-1 gene:ENSMUSG00000038208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC030368 // GenBank // Mus musculus per1-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5371387), partial cds. // chr11 // 96 // 70 // 22 // 23 // 0 /// BC035945 // GenBank // Mus musculus per1-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4225070). // chr11 // 92 // 76 // 23 // 25 // 0 /// XM_006533549 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus post-GPI attachment to proteins 3 (Pgap3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENSMUST00000128897 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98389624:98400435:-1 gene:ENSMUSG00000038208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// ENSMUST00000128058 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98391322:98400414:-1 gene:ENSMUSG00000038208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000010176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98390038:98400395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0
NM_025559 // RefSeq // Mus musculus migration and invasion enhancer 1 (Mien1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000002655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98437708:98438991:-1 gene:ENSMUSG00000002580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021589 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810046J19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35740 IMAGE:5100542), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98438062:98438946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_011771 // RefSeq // Mus musculus IKAROS family zinc finger 3 (Ikzf3), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533206 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IKAROS family zinc finger 3 (Ikzf3), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000103141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98464902:98545800:-1 gene:ENSMUSG00000018168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF001293 // GenBank // Mus musculus transcription factor aiolos mRNA, partial cds. // chr11 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// AK038043 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130073M10 product:zinc finger protein, subfamily 1A, 3 (Aiolos), full insert sequence. // chr11 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000140876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98484267:98489020:-1 gene:ENSMUSG00000018168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// AK004152 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110038C16 product:zinc finger protein, subfamily 1A, 3 (Aiolos), full insert sequence. // chr11 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98466986:98522566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT011885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSMUST00000122672 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:98473675:98473808:-1 gene:ENSMUSG00000084621 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT011884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_025661 // RefSeq // Mus musculus ORM1-like 3 (S. cerevisiae) (Ormdl3), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// XM_006533958 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ORM1-like 3 (S. cerevisiae) (Ormdl3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000052919 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98581256:98587368:-1 gene:ENSMUSG00000038150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC046594 // GenBank // Mus musculus ORM1-like 3 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:54482 IMAGE:6308578), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0
NM_145434 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor subfamily 1, group D, member 1 (Nr1d1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000064941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98767932:98775333:-1 gene:ENSMUSG00000020889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC008989 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor subfamily 1, group D, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:6402 IMAGE:3585478), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98768220:98774748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NR_033551 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12359 (Gm12359), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98798309:98810087:-1 gene:ENSMUSG00000075576 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000153181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98797707:98810087:-1 gene:ENSMUSG00000075576 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000141696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98804657:98810058:-1 gene:ENSMUSG00000075576 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK087290 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030042I03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK164749 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730006F12 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT011916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONMMUT011919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT011920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_178596 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, delta 3 (Gjd3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062931 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98982180:98983016:-1 gene:ENSMUSG00000047197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98982180:98983016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011623 // RefSeq // Mus musculus topoisomerase (DNA) II alpha (Top2a), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000068031 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98992943:99024189:-1 gene:ENSMUSG00000020914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AK033321 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030493B08 product:topoisomerase (DNA) II alpha, full insert sequence. // chr11 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// BC094326 // GenBank // Mus musculus topoisomerase (DNA) II alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:6415166), complete cds. // chr11 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// D12513 // GenBank // Mus musculus mRNA for DNA topoisomerase II, complete cds. // chr11 // 92 // 95 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000010168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98993804:99024066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000083328 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:99017031:99017152:-1 gene:ENSMUSG00000065262 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000139730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99016593:99022210:-1 gene:ENSMUSG00000020914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK028218 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810021D13 product:topoisomerase (DNA) II alpha, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT011941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT011942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_172564 // RefSeq // Mus musculus tensin 4 (Tns4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000017751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99065678:99089306:-1 gene:ENSMUSG00000017607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99068175:99073864:-1 gene:ENSMUSG00000017607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000153351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99070684:99075341:-1 gene:ENSMUSG00000017607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// AK039855 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430020N04 product:weakly similar to Tensin (Fragment) [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC055820 // GenBank // Mus musculus tensin 4, mRNA (cDNA clone MGC:67703 IMAGE:4209161), complete cds. // chr11 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99058529:99154998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_007719 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 7 (Ccr7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006532119 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 7 (Ccr7), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000103134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99144196:99155077:-1 gene:ENSMUSG00000037944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L31580 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor (EBI 1) mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99058529:99154998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_172946 // RefSeq // Mus musculus keratin 222 (Krt222), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99233890:99244085:-1 gene:ENSMUSG00000035849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000103132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99232761:99244067:-1 gene:ENSMUSG00000035849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000154622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99234943:99238875:-1 gene:ENSMUSG00000035849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC079890 // GenBank // Mus musculus keratin 222, mRNA (cDNA clone MGC:100296 IMAGE:30360088), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99210069:99244144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_029393 // RefSeq // Mus musculus keratin 24 (Krt24), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000017255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99279959:99285262:-1 gene:ENSMUSG00000020913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK009986 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310058N18 product:weakly similar to KERATIN, TYPE I CYTOSKELETAL 12 (CYTOKERATIN 12) [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC129847 // GenBank // Mus musculus keratin 24, mRNA (cDNA clone MGC:150029 IMAGE:40107361), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC129848 // GenBank // Mus musculus keratin 24, mRNA (cDNA clone MGC:150030 IMAGE:40107363), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GU046702 // GenBank // Mus musculus keratin 24 variant 2 (Krt24) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000045359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99265990:99322891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_133730 // RefSeq // Mus musculus keratin 25 (Krt25), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000038004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99315516:99322951:-1 gene:ENSMUSG00000035831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC018391 // GenBank // Mus musculus keratin 25, mRNA (cDNA clone MGC:25839 IMAGE:4191565), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006534209 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin 25 (Krt25), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000045359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99265990:99322891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001033397 // RefSeq // Mus musculus keratin 26 (Krt26), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533551 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin 26 (Krt26), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000100482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99328614:99337966:-1 gene:ENSMUSG00000075570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000148770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99328550:99337965:-1 gene:ENSMUSG00000075570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC116672 // GenBank // Mus musculus keratin 26, mRNA (cDNA clone MGC:144894 IMAGE:40107596), complete cds. // chr11 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99329634:99337904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_010666 // RefSeq // Mus musculus keratin 27 (Krt27), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000017732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99345565:99351104:-1 gene:ENSMUSG00000017588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB013607 // GenBank // Mus musculus mRNA for c29, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC140996 // GenBank // Mus musculus keratin 27, mRNA (cDNA clone MGC:175957 IMAGE:9055608), complete cds. // chr11 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// BC140997 // GenBank // Mus musculus keratin 27, mRNA (cDNA clone MGC:175958 IMAGE:9055609), complete cds. // chr11 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99345737:99351073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0
NM_027574 // RefSeq // Mus musculus keratin 28 (Krt28), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000006963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99364872:99374903:-1 gene:ENSMUSG00000055937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB288231 // GenBank // Mus musculus domesticus Krt28 mRNA for Keratin 28, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99365043:99389332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_010660 // RefSeq // Mus musculus keratin 10 (Krt10), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006532329 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin 10 (Krt10), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000103131 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99385254:99389364:-1 gene:ENSMUSG00000019761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// V00830 // GenBank // Mouse mRNA encoding epidermal keratin subunit. // chr11 // 60 // 91 // 18 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99365043:99389332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_010661 // RefSeq // Mus musculus keratin 12 (Krt12), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000017741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99415666:99422259:-1 gene:ENSMUSG00000020912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC131911 // GenBank // Mus musculus keratin 12, mRNA (cDNA clone MGC:163542 IMAGE:40130188), complete cds. // chr11 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// U02880 // GenBank // Mus musculus FVB/N K12 keratin mRNA, complete cds. // chr11 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// GENSCAN00000045388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99397139:99421850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_023256 // RefSeq // Mus musculus keratin 20 (Krt20), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000017743 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99428403:99438150:-1 gene:ENSMUSG00000035775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF473907 // GenBank // Mus musculus keratin 20 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC038900 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 9030623C06 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4982987), with apparent retained intron. // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC057172 // GenBank // Mus musculus keratin 20, mRNA (cDNA clone MGC:67815 IMAGE:4989154), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99428981:99438031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0
NM_033373 // RefSeq // Mus musculus keratin 23 (Krt23), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000006969 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99477974:99493137:-1 gene:ENSMUSG00000006777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF102849 // GenBank // Mus musculus type I intermediate filament cytokeratin (HAIK1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC019972 // GenBank // Mus musculus keratin 23, mRNA (cDNA clone MGC:28496 IMAGE:4187035), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000045393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99478197:99492839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0
NM_213730 // RefSeq // Mus musculus keratin 39 (Krt39), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000076948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:99514624:99521258:-1 gene:ENSMUSG00000064165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99514114:99521338:-1 gene:ENSMUSG00000064165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99508491:99520976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001039666 // RefSeq // Mus musculus keratin 40 (Krt40), mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533655 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin 40 (Krt40), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000074253 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99537485:99543158:-1 gene:ENSMUSG00000059169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107443 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:99537485:99543158:-1 gene:ENSMUSG00000059169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC119521 // GenBank // Mus musculus keratin 40, mRNA (cDNA clone MGC:141166 IMAGE:40055957), complete cds. // chr11 // 85 // 65 // 17 // 20 // 0 /// BC119522 // GenBank // Mus musculus keratin 40, mRNA (cDNA clone MGC:141167 IMAGE:40055959), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99538493:99566583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NM_025524 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 3-3 (Krtap3-3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000092700 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99550130:99550865:-1 gene:ENSMUSG00000069722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC120760 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 3-3, mRNA (cDNA clone MGC:155997 IMAGE:40129683), complete cds. // chr11 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// BC120762 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 3-3, mRNA (cDNA clone MGC:155999 IMAGE:40129685), complete cds. // chr11 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0
NM_025720 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 3-2 (Krtap3-2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000092699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99555823:99556853:-1 gene:ENSMUSG00000069721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_023511 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 3-1 (Krtap3-1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99566027:99566630:-1 gene:ENSMUSG00000047564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D86424 // GenBank // Mus musculus mRNA for high-sulfur keratin protein, partial cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99538493:99566583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONMMUT011976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_027157 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 1-5 (Krtap1-5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000054532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99579976:99581016:-1 gene:ENSMUSG00000047253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC147095 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 1-5, mRNA (cDNA clone MGC:182225 IMAGE:9056119), complete cds. // chr11 // 91 // 52 // 10 // 11 // 0 /// BC147096 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 1-5, mRNA (cDNA clone MGC:182249 IMAGE:9056143), complete cds. // chr11 // 91 // 52 // 10 // 11 // 0
NM_001039502 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 1-4 (Krtap1-4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000100479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99583062:99583654:-1 gene:ENSMUSG00000075567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// BC150831 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 1-4, mRNA (cDNA clone MGC:183742 IMAGE:9087742), complete cds. // chr11 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0 /// BC150833 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 1-4, mRNA (cDNA clone MGC:183744 IMAGE:9087744), complete cds. // chr11 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0
NM_001085526 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 1-3 (Krtap1-3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000104930 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99590461:99591339:-1 gene:ENSMUSG00000078131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_029351 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 9-3 (Krtap9-3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000062683 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99597347:99598105:-1 gene:ENSMUSG00000049809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001127354 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11938 (Gm11938), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001177537 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11562 (Gm11562), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_027800 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 2-4 (Krtap2-4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99602646:99603308:-1 gene:ENSMUSG00000057674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99619619:99620435:-1 gene:ENSMUSG00000062278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99614019:99614846:-1 gene:ENSMUSG00000060756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99609794:99610189:-1 gene:ENSMUSG00000058725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127984 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 2-4, mRNA (cDNA clone MGC:157549 IMAGE:40135467), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99602789:99606013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001127354 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11938 (Gm11938), mRNA. // chr11 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// NM_001177537 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11562 (Gm11562), mRNA. // chr11 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// NM_027800 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 2-4 (Krtap2-4), mRNA. // chr11 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSMUST00000072306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99602646:99603308:-1 gene:ENSMUSG00000057674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSMUST00000073853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99619619:99620435:-1 gene:ENSMUSG00000062278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSMUST00000074926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99614019:99614846:-1 gene:ENSMUSG00000060756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSMUST00000076478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99609794:99610189:-1 gene:ENSMUSG00000058725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC127984 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 2-4, mRNA (cDNA clone MGC:157549 IMAGE:40135467), complete cds. // chr11 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000045372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99602789:99606013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001127354 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11938 (Gm11938), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001177537 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11562 (Gm11562), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_027800 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 2-4 (Krtap2-4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000072306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99602646:99603308:-1 gene:ENSMUSG00000057674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000073853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99619619:99620435:-1 gene:ENSMUSG00000062278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000074926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99614019:99614846:-1 gene:ENSMUSG00000060756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000076478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99609794:99610189:-1 gene:ENSMUSG00000058725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC127984 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 2-4, mRNA (cDNA clone MGC:157549 IMAGE:40135467), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99602789:99606013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001048196 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 4-1 (Krtap4-1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000081007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99627224:99628238:-1 gene:ENSMUSG00000063251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC147087 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 4-1, mRNA (cDNA clone MGC:182243 IMAGE:9056137), complete cds. // chr11 // 92 // 81 // 12 // 13 // 0 /// BC147088 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 4-1, mRNA (cDNA clone MGC:182245 IMAGE:9056139), complete cds. // chr11 // 92 // 81 // 12 // 13 // 0
NM_026807 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 4-2 (Krtap4-2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99634111:99635084:-1 gene:ENSMUSG00000044649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC140967 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 4-2, mRNA (cDNA clone MGC:175928 IMAGE:9055579), complete cds. // chr11 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_029613 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 4-7 (Krtap4-7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99643106:99644089:-1 gene:ENSMUSG00000045109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC115508 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 4-7, mRNA (cDNA clone MGC:144332 IMAGE:40101065), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC115509 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 4-7, mRNA (cDNA clone MGC:144333 IMAGE:40101067), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XR_106408 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 11555 (Gm11555), misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000073126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:99649660:99650181:-1 gene:ENSMUSG00000078130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000104929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99649599:99650236:-1 gene:ENSMUSG00000078130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99649761:99655200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_026834 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 4-6 (Krtap4-6), mRNA. // chr11 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000100476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99665043:99665960:-1 gene:ENSMUSG00000075566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000119334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99662893:99663102:-1 gene:ENSMUSG00000082020 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr11 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// NONMMUT011977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001099312 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11569 (Gm11569), mRNA. // chr11 // 95 // 100 // 41 // 43 // 0 /// NM_001099313 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11554 (Gm11554), mRNA. // chr11 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// NM_027087 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 4-13 (Krtap4-13), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000050106 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99809078:99809892:-1 gene:ENSMUSG00000048294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000105056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99803557:99804446:-1 gene:ENSMUSG00000078259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 100 // 41 // 43 // 0 /// ENSMUST00000105057 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99798064:99798932:-1 gene:ENSMUSG00000078260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 100 // 41 // 43 // 0 /// GENSCAN00000045396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99804905:99812234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NM_001099313 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11554 (Gm11554), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_027087 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 4-13 (Krtap4-13), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000050106 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99809078:99809892:-1 gene:ENSMUSG00000048294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000105056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99803557:99804446:-1 gene:ENSMUSG00000078259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_001099312 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11569 (Gm11569), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 1 /// ENSMUST00000105057 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99798064:99798932:-1 gene:ENSMUSG00000078260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 1 /// GENSCAN00000045396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99804905:99812234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NM_001100614 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11564 (Gm11564), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000105055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99814976:99815666:-1 gene:ENSMUSG00000078258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000120751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99839973:99840260:-1 gene:ENSMUSG00000082531 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99839973:99849346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001013823 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 4-16 (Krtap4-16), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99850655:99851608:-1 gene:ENSMUSG00000046474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC016249 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 4-16, mRNA (cDNA clone MGC:28878 IMAGE:4910141), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99850854:99851572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
NM_001099774 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 17-1 (Krtap17-1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105049 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99993234:99993994:-1 gene:ENSMUSG00000078252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99985068:100105596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_027983 // RefSeq // Mus musculus keratin 33A (Krt33a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000018399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100011195:100016212:-1 gene:ENSMUSG00000035592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC029257 // GenBank // Mus musculus keratin 33A, mRNA (cDNA clone MGC:35623 IMAGE:4166206), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99985068:100105596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1
NM_013570 // RefSeq // Mus musculus keratin 33B (Krt33b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000073890 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100023634:100029868:-1 gene:ENSMUSG00000057723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000045394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99985068:100105596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_027563 // RefSeq // Mus musculus keratin 34 (Krt34), mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000056362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100037347:100041554:-1 gene:ENSMUSG00000043485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// BC125420 // GenBank // Mus musculus keratin 34, mRNA (cDNA clone MGC:159123 IMAGE:40129935), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// BC125446 // GenBank // Mus musculus keratin 34, mRNA (cDNA clone MGC:159149 IMAGE:40129961), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
NM_010659 // RefSeq // Mus musculus keratin 31 (Krt31), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000007318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100046646:100050551:-1 gene:ENSMUSG00000048981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// M27734 // GenBank // Mouse acidic keratin type I mRNA, complete cds. // chr11 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000045394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99985068:100105596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1
NM_001159374 // RefSeq // Mus musculus keratin 32 (Krt32), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000107419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100080857:100088226:-1 gene:ENSMUSG00000046095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000139873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100080848:100085440:-1 gene:ENSMUSG00000046095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// AK009595 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310033I11 product:keratin complex 1, acidic, gene 2, full insert sequence. // chr11 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// BC117553 // GenBank // Mus musculus keratin 32, mRNA (cDNA clone MGC:144672 IMAGE:40104816), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// BC118064 // GenBank // Mus musculus keratin 32, mRNA (cDNA clone MGC:144673 IMAGE:40104817), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99985068:100105596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1
NM_016880 // RefSeq // Mus musculus keratin 35 (Krt35), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006533743 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin 35 (Krt35), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000103127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100092193:100096225:-1 gene:ENSMUSG00000048013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000173988 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100092195:100096241:-1 gene:ENSMUSG00000048013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF020790 // GenBank // Mus musculus hair keratin acidic 5 (Ha5) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC100542 // GenBank // Mus musculus keratin 35, mRNA (cDNA clone MGC:118470 IMAGE:30295313), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC140965 // GenBank // Mus musculus keratin 35, mRNA (cDNA clone MGC:175926 IMAGE:9055577), complete cds. // chr11 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99985068:100105596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001174099 // RefSeq // Mus musculus keratin 36 (Krt36), mRNA. // chr11 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000107416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100102007:100105626:-1 gene:ENSMUSG00000020916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// X65506 // GenBank // M.musculus mRNA for type I keratin (MHR a-1). // chr11 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// XM_006532332 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin 36 (Krt36), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000045394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99985068:100105596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_010662 // RefSeq // Mus musculus keratin 13 (Krt13), mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000007275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100117327:100121566:-1 gene:ENSMUSG00000044041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000128934 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100119145:100120577:-1 gene:ENSMUSG00000044041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 75 // 39 // 9 // 12 // 0 /// BC060286 // GenBank // Mus musculus keratin 13, mRNA (cDNA clone MGC:70026 IMAGE:30292772), complete cds. // chr11 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000045402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100117596:100121495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_008469 // RefSeq // Mus musculus keratin 15 (Krt15), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000107411 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100131758:100135928:-1 gene:ENSMUSG00000054146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000148502 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100133035:100134398:-1 gene:ENSMUSG00000054146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// BC057934 // GenBank // Mus musculus keratin 15, mRNA (cDNA clone MGC:68208 IMAGE:5251453), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000045411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100132017:100135672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
NM_008471 // RefSeq // Mus musculus keratin 19 (Krt19), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000007317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100140810:100146120:-1 gene:ENSMUSG00000020911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000126460 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100140907:100143699:-1 gene:ENSMUSG00000020911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AB472075 // GenBank // Mus musculus Krt19 mRNA for keratin 19, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC034561 // GenBank // Mus musculus keratin 19, mRNA (cDNA clone MGC:25344 IMAGE:2655016), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085304 // GenBank // Mus musculus keratin 19, mRNA (cDNA clone MGC:103181 IMAGE:6437375), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M28698 // GenBank // Mus musculus cytokeratin No. 19 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000125888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100142120:100148665:-1 gene:ENSMUSG00000020911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000045366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100140913:100145859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_201255 // RefSeq // Mus musculus keratin 9 (Krt9), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000059707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100186781:100193246:-1 gene:ENSMUSG00000051617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY497550 // GenBank // Mus musculus cytokeratin 9 (K9) mRNA, complete cds. // chr11 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// GENSCAN00000045371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100181841:100196056:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_016958 // RefSeq // Mus musculus keratin 14 (Krt14), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000007272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100203162:100207548:-1 gene:ENSMUSG00000045545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000137265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100203162:100206030:-1 gene:ENSMUSG00000045545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC003325 // GenBank // Mus musculus keratin 14, mRNA (cDNA clone MGC:7044 IMAGE:3156333), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC011074 // GenBank // Mus musculus keratin 14, mRNA (cDNA clone MGC:18920 IMAGE:3497492), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100203312:100246713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0
NM_008470 // RefSeq // Mus musculus keratin 16 (Krt16), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000007280 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100246091:100248902:-1 gene:ENSMUSG00000053797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF053235 // GenBank // Mus musculus keratin 16 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC103615 // GenBank // Mus musculus keratin 16, mRNA (cDNA clone MGC:124145 IMAGE:40046209), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC103616 // GenBank // Mus musculus keratin 16, mRNA (cDNA clone MGC:124147 IMAGE:40046211), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC103617 // GenBank // Mus musculus keratin 16, mRNA (cDNA clone MGC:124146 IMAGE:40046210), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC103666 // GenBank // Mus musculus keratin 16, mRNA (cDNA clone MGC:124148 IMAGE:40046212), complete cds. // chr11 // 92 // 92 // 11 // 12 // 0 /// BC114977 // GenBank // Mus musculus keratin 16, mRNA (cDNA clone MGC:140998 IMAGE:40046220), complete cds. // chr11 // 92 // 92 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000014437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100247102:100248890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_010663 // RefSeq // Mus musculus keratin 17 (Krt17), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000080893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100256217:100261029:-1 gene:ENSMUSG00000035557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB013608 // GenBank // Mus musculus mRNA for cytokeratin 17, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC032161 // GenBank HTC // Mus musculus keratin 17, mRNA (cDNA clone IMAGE:5343793). // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC132454 // GenBank // Mus musculus keratin 17, mRNA (cDNA clone MGC:164085 IMAGE:40130731), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC132456 // GenBank // Mus musculus keratin 17, mRNA (cDNA clone MGC:164087 IMAGE:40130733), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100256402:100260965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_212483 // RefSeq // Mus musculus keratin 42 (Krt42), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006534048 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin 42 (Krt42), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006534050 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin 42 (Krt42), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000017270 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100262887:100269871:-1 gene:ENSMUSG00000053654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000107406 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100262882:100265978:-1 gene:ENSMUSG00000053654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AK019115 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410039E07 product:similar to RADIATED KERATINOCYTE MRNA 266 (KERATIN-RELATED PROTEIN) (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// AY459292 // GenBank // Mus musculus keratin 17n mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC148204 // GenBank // Mus musculus keratin 42, mRNA (cDNA clone MGC:148194 IMAGE:40056537), complete cds. // chr11 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100263070:100269871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_010404 // RefSeq // Mus musculus huntingtin-associated protein 1 (Hap1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_177981 // RefSeq // Mus musculus huntingtin-associated protein 1 (Hap1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000103124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100348859:100356087:-1 gene:ENSMUSG00000006930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000146878 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:100352256:100355383:-1 gene:ENSMUSG00000006930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000173630 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:100349298:100354040:-1 gene:ENSMUSG00000006930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AJ002271 // GenBank // Mus musculus mRNA for HAP1-A protein. // chr11 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// BC034089 // GenBank // Mus musculus huntingtin-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:31449 IMAGE:4481735), complete cds. // chr11 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// BC053043 // GenBank // Mus musculus huntingtin-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:62295 IMAGE:5694628), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006532249 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus huntingtin-associated protein 1 (Hap1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENSMUST00000138603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100347327:100356128:-1 gene:ENSMUSG00000006930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000014456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100347714:100362126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_010593 // RefSeq // Mus musculus junction plakoglobin (Jup), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006532316 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus junction plakoglobin (Jup), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000001592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100370619:100397749:-1 gene:ENSMUSG00000001552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000107403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100372296:100397749:-1 gene:ENSMUSG00000001552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC040757 // GenBank // Mus musculus junction plakoglobin, mRNA (cDNA clone MGC:49516 IMAGE:4216772), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC094461 // GenBank // Mus musculus junction plakoglobin, mRNA (cDNA clone MGC:103220 IMAGE:4459882), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK171501 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730222K01 product:junction plakoglobin, full insert sequence. // chr11 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// GENSCAN00000014433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100372310:100398008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_176830 // RefSeq // Mus musculus leprecan-like 4 (Leprel4), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000066489 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100408456:100414836:-1 gene:ENSMUSG00000006931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000141840 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:100409366:100411874:-1 gene:ENSMUSG00000006931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK029271 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4832408F05 product:SYNAPTONEMAL COMPLEX PROTEIN SC65 homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC031856 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110036O03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:25554 IMAGE:3968941), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100409122:100414656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_172565 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 11 (Klhl11), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_388414 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch-like 11 (Klhl11), transcript variant X1, misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100462614:100472741:-1 gene:ENSMUSG00000048732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC111873 // GenBank // Mus musculus kelch-like 11 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:132810 IMAGE:40059437), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100462864:100472728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_177790 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 385C (Zfp385c), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533488 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 385C (Zfp385c), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006533492 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 385C (Zfp385c), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006533494 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 385C (Zfp385c), transcript variant X7, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533495 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 385C (Zfp385c), transcript variant X8, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000103119 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100627543:100650693:-1 gene:ENSMUSG00000014198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000148560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100629957:100651684:-1 gene:ENSMUSG00000014198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC116726 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 385C, mRNA (cDNA clone MGC:144840 IMAGE:40106534), complete cds. // chr11 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// ENSMUST00000151589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100630720:100657622:-1 gene:ENSMUSG00000014198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000014436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100628832:100674164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_030150 // RefSeq // Mus musculus DEXH (Asp-Glu-X-His) box polypeptide 58 (Dhx58), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000017974 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100694884:100704271:-1 gene:ENSMUSG00000017830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100701392:100704253:-1 gene:ENSMUSG00000017830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000149869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100695253:100699235:-1 gene:ENSMUSG00000017830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AF316999 // GenBank // Mus musculus D11lgp2 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC029209 // GenBank // Mus musculus DEXH (Asp-Glu-X-His) box polypeptide 58, mRNA (cDNA clone MGC:35613 IMAGE:2651254), complete cds. // chr11 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000132930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100702760:100704271:-1 gene:ENSMUSG00000017830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AK021012 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430001I08 product:hypothetical DEAD/DEAH box helicase containing protein, full insert sequence. // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100695157:100712404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_024456 // RefSeq // Mus musculus RAB5C, member RAS oncogene family (Rab5c), mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000019317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100715011:100738215:-1 gene:ENSMUSG00000019173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000107364 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100715009:100738215:-1 gene:ENSMUSG00000019173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB232595 // GenBank // Mus musculus Rab5C mRNA for Rab5C, complete cds. // chr11 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC023027 // GenBank // Mus musculus RAB5C, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:36517 IMAGE:5369566), complete cds. // chr11 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC029678 // GenBank // Mus musculus RAB5C, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:36507 IMAGE:5368061), complete cds. // chr11 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100716047:100721230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_001081194 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 4 (Kcnh4), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_006533646 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 4 (Kcnh4), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100740376:100759740:-1 gene:ENSMUSG00000035355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000107363 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100740382:100759942:-1 gene:ENSMUSG00000035355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC150990 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:183903 IMAGE:9087903), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC150994 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:183907 IMAGE:9087907), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000014453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100740571:100759605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
NM_010410 // RefSeq // Mus musculus hypocretin (Hcrt), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055083 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100761691:100762931:-1 gene:ENSMUSG00000045471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF019566 // GenBank // Mus musculus preprohypocretin (Hcrt) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF041242 // GenBank // Mus musculus prepro-orexin mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116943 // GenBank // Mus musculus hypocretin, mRNA (cDNA clone MGC:151320 IMAGE:40126262), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC116969 // GenBank // Mus musculus hypocretin, mRNA (cDNA clone MGC:151346 IMAGE:40126288), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000107360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100761069:100762928:-1 gene:ENSMUSG00000045471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100761794:100770337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_031871 // RefSeq // Mus musculus GH3 domain containing (Ghdc), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000017891 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100766032:100770957:-1 gene:ENSMUSG00000017747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000139341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100769692:100770942:-1 gene:ENSMUSG00000017747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000147682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100766811:100768713:-1 gene:ENSMUSG00000017747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// AF316996 // GenBank // Mus musculus D11lgp1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC005639 // GenBank // Mus musculus GH3 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:7154 IMAGE:3256858), complete cds. // chr11 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100761794:100770337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT012026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0
NM_008986 // RefSeq // Mus musculus polymerase I and transcript release factor (Ptrf), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100956733:100970887:-1 gene:ENSMUSG00000004044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132934 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100964407:100970551:-1 gene:ENSMUSG00000004044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// AF036249 // GenBank // Mus musculus polymerase I-transcript release factor mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC110698 // GenBank // Mus musculus polymerase I and transcript release factor, mRNA (cDNA clone MGC:118550 IMAGE:30608521), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC116701 // GenBank // Mus musculus polymerase I and transcript release factor, mRNA (cDNA clone MGC:144681 IMAGE:40104877), complete cds. // chr11 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC117527 // GenBank // Mus musculus polymerase I and transcript release factor, mRNA (cDNA clone MGC:144680 IMAGE:40104876), complete cds. // chr11 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// AK169463 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630023K06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000014455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100958624:100970466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0
NM_008949 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 3, interacting protein (Psmc3ip), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000019447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101091823:101095436:-1 gene:ENSMUSG00000019303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000126386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101092132:101095400:-1 gene:ENSMUSG00000019303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000134520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101092157:101094160:-1 gene:ENSMUSG00000019303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000142545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101092487:101095376:-1 gene:ENSMUSG00000019303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB000121 // GenBank // Mus musculus mRNA for TBPIP, complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC030169 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 3, interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:29091 IMAGE:5027493), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FJ937966 // GenBank // Mus musculus GT198 (Psmc3ip) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// FJ937967 // GenBank // Mus musculus GT198a (Psmc3ip) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000014431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101092400:101095376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
NM_146030 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 3 (Plekhh3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533032 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 3 (Plekhh3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000043397 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101162679:101171351:-1 gene:ENSMUSG00000035172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123864 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101167474:101170354:-1 gene:ENSMUSG00000035172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000129895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101162679:101170955:-1 gene:ENSMUSG00000035172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101162679:101165620:-1 gene:ENSMUSG00000035172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000164474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:101162682:101171317:-1 gene:ENSMUSG00000035172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC020025 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 3, mRNA (cDNA clone MGC:27854 IMAGE:3490992), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101162879:101170886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_007721 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 10 (Ccr10), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101172997:101175443:-1 gene:ENSMUSG00000044052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF208238 // GenBank // Mus musculus 7-transmembrane G-protein coupled receptor 2 (Gpr2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AF215982 // GenBank // Mus musculus CC chemokine receptor 10A (Ccr10) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC117043 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 10, mRNA (cDNA clone MGC:151420 IMAGE:40126362), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC120542 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) receptor 10, mRNA (cDNA clone MGC:155779 IMAGE:40129465), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101173614:101175423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
AK052868 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830013H23 product:Receptor, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026618 // RefSeq // Mus musculus cytochrome C oxidase assembly factor 3 (Coa3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000017332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101277968:101279114:-1 gene:ENSMUSG00000017188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000168089 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:101278338:101278943:-1 gene:ENSMUSG00000017188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// BC026206 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 56, mRNA (cDNA clone MGC:41617 IMAGE:1265058), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000102272 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:101353342:101353437:-1 gene:ENSMUSG00000076227 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000117474 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101353309:101353545:-1 gene:ENSMUSG00000082478 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT012064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT012065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000082825 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:101397589:101397768:-1 gene:ENSMUSG00000064759 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012037 // RefSeq // Mus musculus vesicle amine transport protein 1 homolog (T californica) (Vat1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101458745:101466230:-1 gene:ENSMUSG00000034993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC025496 // GenBank // Mus musculus vesicle amine transport protein 1 homolog (T californica), mRNA (cDNA clone MGC:38107 IMAGE:5320239), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC099678 // GenBank // Mus musculus vesicle amine transport protein 1 homolog (T californica), mRNA (cDNA clone MGC:106088 IMAGE:6311681), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101460193:101466133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_009764 // RefSeq // Mus musculus breast cancer 1 (Brca1), mRNA. // chr11 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000017290 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101488764:101551879:-1 gene:ENSMUSG00000017146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000142086 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101525507:101551955:-1 gene:ENSMUSG00000017146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 31 // 15 // 15 // 0 /// BC068303 // GenBank // Mus musculus breast cancer 1, mRNA (cDNA clone MGC:76511 IMAGE:30431022), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// U31625 // GenBank // Mus musculus breast/ovarian cancer susceptibility homolog (Brca1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// U32446 // GenBank // Mus musculus putative breast/ovarian cancer susceptibility protein homolog (Brca1) mRNA, complete cds. // chr11 // 98 // 92 // 44 // 45 // 0 /// U35641 // GenBank // Mus musculus Brca1 mRNA, complete cds. // chr11 // 91 // 92 // 41 // 45 // 0 /// U36475 // GenBank // Mus musculus breast and ovarian cancer susceptibility protein (Brca1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// U68174 // GenBank // Mus musculus breast/ovarian cancer susceptibility protein (BRCA1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000156843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101496315:101508178:-1 gene:ENSMUSG00000017146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1 /// BC003248 // GenBank // Mus musculus breast cancer 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3498707), partial cds. // chr11 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1 /// GENSCAN00000018083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101479437:101549094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 37 // 18 // 18 // 0
NM_010791 // RefSeq // Mus musculus mesenchyme homeobox 1 (Meox1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006532396 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mesenchyme homeobox 1 (Meox1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000057054 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101877510:101894374:-1 gene:ENSMUSG00000001493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC011082 // GenBank // Mus musculus mesenchyme homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:18599 IMAGE:3984366), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101770366:101921523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_024449 // RefSeq // Mus musculus sclerostin (Sost), mRNA. // chr11 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// XM_006534376 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sclerostin (Sost), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000001534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101962458:101967015:-1 gene:ENSMUSG00000001494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AF326740 // GenBank // Mus musculus sclerostin mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// BC137832 // GenBank // Mus musculus sclerostin, mRNA (cDNA clone MGC:169456 IMAGE:8860851), complete cds. // chr11 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// BC137833 // GenBank // Mus musculus sclerostin, mRNA (cDNA clone MGC:169457 IMAGE:8860852), complete cds. // chr11 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101963846:101966973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0
NM_008918 // RefSeq // Mus musculus pancreatic polypeptide (Ppy), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000017460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102099930:102101319:-1 gene:ENSMUSG00000017316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000170554 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102099930:102101310:-1 gene:ENSMUSG00000017316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC099881 // GenBank // Mus musculus pancreatic polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:123523 IMAGE:40040669), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC100676 // GenBank // Mus musculus pancreatic polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:123522 IMAGE:40040664), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC101946 // GenBank // Mus musculus pancreatic polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:123521 IMAGE:40040662), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// M18208 // GenBank // Mouse pancreatic polypeptide mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_145435 // RefSeq // Mus musculus peptide YY (Pyy), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000017455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102106676:102107832:-1 gene:ENSMUSG00000017311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000127381 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:102106680:102107416:-1 gene:ENSMUSG00000017311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000177149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102106961:102107832:-1 gene:ENSMUSG00000017311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000177304 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:102106676:102107822:-1 gene:ENSMUSG00000017311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC010821 // GenBank // Mus musculus peptide YY, mRNA (cDNA clone MGC:19143 IMAGE:4218355), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102106963:102107352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT012114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_029649 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 101 (Tmem101), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102152546:102156404:-1 gene:ENSMUSG00000020921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011109 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 101, mRNA (cDNA clone MGC:19384 IMAGE:2654288), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102154174:102156347:-1 gene:ENSMUSG00000020921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000018075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102153286:102156344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000021297 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102162497:102185296:-1 gene:ENSMUSG00000020922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000107156 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102162497:102185229:-1 gene:ENSMUSG00000020922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_172947 // RefSeq // Mus musculus LSM12 homolog (S. cerevisiae) (Lsm12), mRNA. // chr11 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1 /// XM_006533414 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus LSM12 homolog (S. cerevisiae) (Lsm12), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// BC027784 // GenBank // Mus musculus LSM12 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:36610 IMAGE:5343888), complete cds. // chr11 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1 /// GENSCAN00000018085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102164075:102185206:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_011403 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 1 (Slc4a1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000006749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102348824:102365280:-1 gene:ENSMUSG00000006574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK171662 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830002O10 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr11 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AY296129 // GenBank // Mus musculus Slc4a1 anion exchanger mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC052419 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:63351 IMAGE:5702599), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC053429 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:59322 IMAGE:6506270), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// M29379 // GenBank // Mouse anion exchange protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000029598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102350287:102361395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// AK172157 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830049B09 product:solute carrier family 4 (anion exchanger), member 1, full insert sequence. // chr11 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1
NM_199200 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 171, member A2 (Fam171a2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000049057 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102436981:102447682:-1 gene:ENSMUSG00000034685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC064455 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 171, member A2, mRNA (cDNA clone MGC:69749 IMAGE:6810415), complete cds. // chr11 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102437463:102447515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0
NM_010575 // RefSeq // Mus musculus integrin alpha 2b (Itga2b), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006532309 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus integrin alpha 2b (Itga2b), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000103086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102453297:102469883:-1 gene:ENSMUSG00000034664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000149519 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102456472:102467199:-1 gene:ENSMUSG00000034664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// AF170316 // GenBank // Mus musculus glycoprotein IIb (GPalpha IIb) mRNA, GPalpha IIb-ITG2B allele, complete cds. // chr11 // 90 // 91 // 28 // 31 // 0 /// AK048700 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230009P15 product:integrin alpha 2b, full insert sequence. // chr11 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// AK140749 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130002D11 product:integrin alpha 2b, full insert sequence. // chr11 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC120493 // GenBank // Mus musculus integrin alpha 2b, mRNA (cDNA clone MGC:155730 IMAGE:40129416), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC137570 // GenBank // Mus musculus integrin alpha 2b, mRNA (cDNA clone MGC:169194 IMAGE:8860589), complete cds. // chr11 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// AK161727 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830427G09 product:integrin alpha 2b, full insert sequence. // chr11 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000029580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102453461:102526165:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0
NM_001159492 // RefSeq // Mus musculus G patch domain containing 8 (Gpatch8), mRNA. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000069673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102477207:102508447:-1 gene:ENSMUSG00000034621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000143842 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102475915:102556199:-1 gene:ENSMUSG00000034621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK122307 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0553 protein. // chr11 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000029580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102453461:102526165:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001159492 // RefSeq // Mus musculus G patch domain containing 8 (Gpatch8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102508173:102556199:-1 gene:ENSMUSG00000034621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102507494:102556199:-1 gene:ENSMUSG00000034621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143842 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102475915:102556199:-1 gene:ENSMUSG00000034621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK135410 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo female mullerian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6820415O06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK084888 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430006A07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000119744 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102659128:102659925:-1 gene:ENSMUSG00000080992 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000153157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102688319:102697734:-1 gene:ENSMUSG00000020925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC058520 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 43, mRNA (cDNA clone MGC:66877 IMAGE:6819447), complete cds. // chr11 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NM_025918 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 43 (Ccdc43), mRNA. // chr11 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// ENSMUST00000092569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102684686:102697782:-1 gene:ENSMUSG00000020925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// ENSMUST00000164506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:102684688:102697734:-1 gene:ENSMUSG00000020925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// BC061076 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 43, mRNA (cDNA clone MGC:74189 IMAGE:6594359), complete cds. // chr11 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// ENSMUST00000124869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102686340:102697536:-1 gene:ENSMUSG00000020925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// ENSMUST00000138147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102689710:102697670:-1 gene:ENSMUSG00000020925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000029567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102686309:102697708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT012178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_010277 // RefSeq // Mus musculus glial fibrillary acidic protein (Gfap), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000067444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102887336:102897131:-1 gene:ENSMUSG00000020932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AF332061 // GenBank // Mus musculus strain ISS glial fibrillary acidic protein (Gfap) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// AF332062 // GenBank // Mus musculus strain ILS glial fibrillary acidic protein (Gfap) mRNA, complete cds. // chr11 // 85 // 77 // 23 // 27 // 0 /// BC139357 // GenBank // Mus musculus glial fibrillary acidic protein, mRNA (cDNA clone MGC:170984 IMAGE:8862379), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC139358 // GenBank // Mus musculus glial fibrillary acidic protein, mRNA (cDNA clone MGC:170985 IMAGE:8862380), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NM_001131020 // RefSeq // Mus musculus glial fibrillary acidic protein (Gfap), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// XM_006532222 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glial fibrillary acidic protein (Gfap), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// XR_388347 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glial fibrillary acidic protein (Gfap), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// ENSMUST00000077902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:102890166:102897200:-1 gene:ENSMUSG00000020932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// GENSCAN00000029572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102888677:102897117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
NM_197959 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 18B (Kif18b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000021311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:102905529:102925124:-1 gene:ENSMUSG00000051378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC049272 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3000004C01 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3979295), partial cds. // chr11 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC057614 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3000004C01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67548 IMAGE:6401536), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102905683:102916507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT012194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
NM_011795 // RefSeq // Mus musculus complement component 1, q subcomponent-like 1 (C1ql1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102939264:102946688:-1 gene:ENSMUSG00000045532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF095155 // GenBank // Mus musculus C1q-related factor mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC118980 // GenBank // Mus musculus complement component 1, q subcomponent-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:144245 IMAGE:40100122), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102939733:102964110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_152813 // RefSeq // Mus musculus phospholipase C, delta 3 (Plcd3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006534309 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase C, delta 3 (Plcd3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006534310 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase C, delta 3 (Plcd3), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000103077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103070304:103101658:-1 gene:ENSMUSG00000020937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000128650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103070304:103078294:-1 gene:ENSMUSG00000020937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// AK144950 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830012I06 product:phospholipase C, delta 3, full insert sequence. // chr11 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// AK173311 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1964 protein. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC031392 // GenBank // Mus musculus phospholipase C, delta 3, mRNA (cDNA clone MGC:37122 IMAGE:4952407), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK166977 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0026G11 product:phospholipase C, delta 3, full insert sequence. // chr11 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000029579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103070841:103080711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_001254724 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700023F06 gene (1700023F06Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000021323 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103198944:103208548:-1 gene:ENSMUSG00000020940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000107026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:103198947:103208558:-1 gene:ENSMUSG00000020940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000172850 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103199416:103208522:-1 gene:ENSMUSG00000020940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 87 // 72 // 20 // 23 // 0 /// BC100507 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118352 IMAGE:30917743), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000140559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103200699:103208548:-1 gene:ENSMUSG00000020940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// ENSMUST00000174567 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:103200325:103208523:-1 gene:ENSMUSG00000020940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103198961:103221599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_177801 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 32 (Spata32), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533582 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spermatogenesis associated 32 (Spata32), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000103076 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103208127:103218432:-1 gene:ENSMUSG00000044787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC117072 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933400C05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151449 IMAGE:40126391), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC120775 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933400C05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:156012 IMAGE:40129698), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ118647 // GenBank // Mus musculus VAD1.2 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103198961:103221599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_016896 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 (Map3k14), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000021324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103219762:103267472:-1 gene:ENSMUSG00000020941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000139621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103264860:103267745:-1 gene:ENSMUSG00000078635 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// AF143094 // GenBank // Mus musculus NF-kappaB inducing kinase (Nik) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 70 // 31 // 31 // 0 /// AK006468 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700028N14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000152300 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103237030:103242271:-1 gene:ENSMUSG00000020941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1 /// BC107015 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14, mRNA (cDNA clone IMAGE:40048605), complete cds. // chr11 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1 /// GENSCAN00000010887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103225034:103242370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// AK038828 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230066D12 product:mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14, full insert sequence. // chr11 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1
NM_183288 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 27 (Arhgap27), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000092557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103359739:103363464:-1 gene:ENSMUSG00000034255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138292 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730442P18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169916 IMAGE:8861311), complete cds. // chr11 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC138293 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730442P18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169917 IMAGE:8861312), complete cds. // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NM_001205236 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 27 (Arhgap27), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSMUST00000116102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103331498:103363692:-1 gene:ENSMUSG00000034255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// BC048412 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6488438, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr11 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_183034 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 1 (Plekhm1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000041272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103364275:103412687:-1 gene:ENSMUSG00000034247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000184350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103366617:103394768:-1 gene:ENSMUSG00000034247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC053079 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 1, mRNA (cDNA clone MGC:62451 IMAGE:5702529), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK157752 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130017N20 product:pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 1, full insert sequence. // chr11 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000010911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103304580:103412713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
XM_006534616 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 37A (Lrrc37a), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103447435:103577202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001033434 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 884 (Gm884), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103534577:103621140:-1 gene:ENSMUSG00000034239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:103534577:103614739:-1 gene:ENSMUSG00000034239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027083 // RefSeq // Mus musculus lysozyme-like 6 (Lyzl6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103631073:103638890:-1 gene:ENSMUSG00000020945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140430 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103631076:103635021:-1 gene:ENSMUSG00000020945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AY566284 // GenBank // Mus musculus lysozyme-like protein 1 (Lyc1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC048617 // GenBank // Mus musculus lysozyme-like 6, mRNA (cDNA clone MGC:58694 IMAGE:6742605), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107014 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103631070:103638879:-1 gene:ENSMUSG00000020945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONMMUT012243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_019650 // RefSeq // Mus musculus golgi SNAP receptor complex member 2 (Gosr2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103676849:103697898:-1 gene:ENSMUSG00000020946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000107013 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103678726:103697694:-1 gene:ENSMUSG00000020946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000145265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103678933:103697698:-1 gene:ENSMUSG00000020946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AF007550 // GenBank // Mus musculus golgi SNARE (GS27) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC008525 // GenBank // Mus musculus golgi SNAP receptor complex member 2, mRNA (cDNA clone MGC:6437 IMAGE:3601627), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC051253 // GenBank // Mus musculus golgi SNAP receptor complex member 2, mRNA (cDNA clone MGC:58896 IMAGE:6485874), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103679236:103712528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_011719 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 9B (Wnt9b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000018630 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103727364:103749821:-1 gene:ENSMUSG00000018486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB073819 // GenBank // Mus musculus mRNA for Wnt14b, complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF469004 // GenBank // Mus musculus secreted signaling protein WNT9B (Wnt9b) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC110482 // GenBank // Mus musculus wingless-type MMTV integration site 9B, mRNA (cDNA clone MGC:124412 IMAGE:40048674), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103730750:103738234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
AK131846 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810048O14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AK153679 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630043C21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK171412 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730209F17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
ENSMUST00000118579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:105033034:105034074:-1 gene:ENSMUSG00000084120 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:105033238:105033744:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0
NR_027956 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700052K11 gene (1700052K11Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK203916 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0146K18, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000056959, based on BLAT search. // chr11 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC099431 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700052K11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117614 IMAGE:30525202), complete cds. // chr11 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000190120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:105177726:105181433:-1 gene:ENSMUSG00000099681 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001039242 // RefSeq // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 10 (March10), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// NM_172568 // RefSeq // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 10 (March10), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// XM_006533904 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 10 (March10), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000049995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:105360798:105456735:-1 gene:ENSMUSG00000078627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000100332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:105401652:105456735:-1 gene:ENSMUSG00000078627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000138977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:105360798:105455294:-1 gene:ENSMUSG00000078627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// BC100474 // GenBank // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 10, mRNA (cDNA clone MGC:118297 IMAGE:30918723), complete cds. // chr11 // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:105352481:105421884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 42 // 42 // 19 // 45 // 1
NM_026009 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 47 (Ccdc47), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000002043 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106197408:106216344:-1 gene:ENSMUSG00000078622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000106865 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:106200779:106204428:-1 gene:ENSMUSG00000078622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// AB040489 // GenBank // Mus musculus asp4 mRNA for adipocyte-specific protein 4, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC120502 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 47, mRNA (cDNA clone MGC:155739 IMAGE:40129425), complete cds. // chr11 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// BC137681 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 47, mRNA (cDNA clone MGC:169305 IMAGE:8860700), complete cds. // chr11 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// AK132273 // GenBank HTC // Mus musculus 18 days pregnant adult female placenta and extra embryonic tissue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3830420D02 product:Adipocyte-specific protein 4 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// GENSCAN00000016401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106202011:106213344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NM_025310 // RefSeq // Mus musculus FtsJ homolog 3 (E. coli) (Ftsj3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000021048 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106249142:106256079:-1 gene:ENSMUSG00000020706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC012281 // GenBank // Mus musculus FtsJ homolog 3 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:18657 IMAGE:4012961), complete cds. // chr11 // 83 // 98 // 33 // 40 // 0 /// ENSMUST00000143729 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:106254292:106255796:-1 gene:ENSMUSG00000020706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1 /// GENSCAN00000016416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106249424:106255651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0
NM_008117 // RefSeq // Mus musculus growth hormone (Gh), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006532223 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus growth hormone (Gh), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000103071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106300271:106301865:-1 gene:ENSMUSG00000020713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK077488 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730420K01 product:growth hormone, full insert sequence. // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC061157 // GenBank // Mus musculus growth hormone, mRNA (cDNA clone MGC:74294 IMAGE:30250975), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106300366:106301749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_008339 // RefSeq // Mus musculus CD79B antigen (Cd79b), mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000044228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:106311341:106314762:-1 gene:ENSMUSG00000040592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000167143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:106311344:106314529:-1 gene:ENSMUSG00000040592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC012226 // GenBank // Mus musculus CD79B antigen, mRNA (cDNA clone MGC:18588 IMAGE:4164551), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// CT010358 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A0553D for gene Cd79b, CD79B antigen; complete cds, incl. stopcodon. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// J03857 // GenBank // Mouse B-cell-specific glycoprotein (B29) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106308803:106314484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0
NM_133199 // RefSeq // Mus musculus sodium channel, voltage-gated, type IV, alpha (Scn4a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000021056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106318592:106349389:-1 gene:ENSMUSG00000001027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000016417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106319664:106382484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0
NM_010494 // RefSeq // Mus musculus intercellular adhesion molecule 2 (Icam2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006532304 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus intercellular adhesion molecule 2 (Icam2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000001055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106377656:106382781:-1 gene:ENSMUSG00000001029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:106378806:106388072:-1 gene:ENSMUSG00000001029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000141146 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:106380688:106388075:-1 gene:ENSMUSG00000001029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000173795 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:106378560:106380801:-1 gene:ENSMUSG00000001029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC039128 // GenBank // Mus musculus intercellular adhesion molecule 2, mRNA (cDNA clone MGC:11559 IMAGE:3962648), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC039970 // GenBank // Mus musculus intercellular adhesion molecule 2, mRNA (cDNA clone MGC:49482 IMAGE:4487248), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106319664:106382484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_198292 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 2 (Tex2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533145 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed gene 2 (Tex2), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000042780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106502147:106612930:-1 gene:ENSMUSG00000040548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000103070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:106544058:106579113:-1 gene:ENSMUSG00000040548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AK029537 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921519C07 product:testis expressed gene 2, full insert sequence. // chr11 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC057406 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:62520 IMAGE:5687258), complete cds. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106503596:106536020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_007840 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (Ddx5), mRNA. // chr11 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// XM_006532137 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5 (Ddx5), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// ENSMUST00000021062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106780355:106788532:-1 gene:ENSMUSG00000020719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// ENSMUST00000133426 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:106781548:106788494:-1 gene:ENSMUSG00000020719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// AK129022 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3036683, highly similar to Probable RNA-dependent helicase p68. // chr11 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// BC062916 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:85999 IMAGE:6827275), complete cds. // chr11 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// BC108369 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:118083 IMAGE:6312791), complete cds. // chr11 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// BC129873 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:150137 IMAGE:40110366), complete cds. // chr11 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// BC129874 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:150138 IMAGE:40110367), complete cds. // chr11 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NM_025481 // RefSeq // Mus musculus SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 (Smurf2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000103067 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:106820066:106920715:-1 gene:ENSMUSG00000018363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000119530 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107003909:107004740:-1 gene:ENSMUSG00000083356 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000016409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106988887:107014610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
NM_176850 // RefSeq // Mus musculus bromodomain PHD finger transcription factor (Bptf), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000057892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:107033081:107131922:-1 gene:ENSMUSG00000040481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000106762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107033083:107132127:-1 gene:ENSMUSG00000040481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000106763 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107033083:107132127:-1 gene:ENSMUSG00000040481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000149486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107060548:107067205:-1 gene:ENSMUSG00000040481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// BC060715 // GenBank // Mus musculus bromodomain PHD finger transcription factor, mRNA (cDNA clone IMAGE:6405350), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GU189417 // GenBank // Mus musculus bromodomain PHD finger transcription factor splice variant (Bptf) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// BC032289 // GenBank // Mus musculus bromodomain PHD finger transcription factor, mRNA (cDNA clone IMAGE:5368380), partial cds. // chr11 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// GENSCAN00000016398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:107039702:107131922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_176850 // RefSeq // Mus musculus bromodomain PHD finger transcription factor (Bptf), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000057892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:107033081:107131922:-1 gene:ENSMUSG00000040481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000106762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107033083:107132127:-1 gene:ENSMUSG00000040481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000106763 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107033083:107132127:-1 gene:ENSMUSG00000040481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC046973 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6487444, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GU189417 // GenBank // Mus musculus bromodomain PHD finger transcription factor splice variant (Bptf) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:107039702:107131922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001161329 // RefSeq // Mus musculus nucleolar protein 11 (Nol11), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NM_133702 // RefSeq // Mus musculus nucleolar protein 11 (Nol11), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000018577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:107166663:107189381:-1 gene:ENSMUSG00000018433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000106757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:107166663:107189381:-1 gene:ENSMUSG00000018433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC024874 // GenBank // Mus musculus nucleolar protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:28159 IMAGE:3984027), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// ENSMUST00000136917 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107178536:107184821:-1 gene:ENSMUSG00000018433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// AK054118 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230020O17 product:weakly similar to CDNA FLJ13640 FIS, CLONE PLACE1011221 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000016406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:107173146:107189257:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT012424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_007582 // RefSeq // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 1 (Cacng1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:107703218:107716522:-1 gene:ENSMUSG00000020722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ006306 // GenBank // Mus musculus mRNA for skeletal muscle calcium channel, gamma-subunit. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC099482 // GenBank // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:117703 IMAGE:30848793), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:107702331:107716391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_019431 // RefSeq // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 4 (Cacng4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021066 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:107732357:107794557:-1 gene:ENSMUSG00000020723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000134076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107735197:107742079:-1 gene:ENSMUSG00000020723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// AK144253 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630001I22 product:calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 4, full insert sequence. // chr11 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// BC138503 // GenBank // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:170128 IMAGE:8861523), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC138506 // GenBank // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:170131 IMAGE:8861526), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:107734780:107794464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001199301 // RefSeq // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 5 (Cacng5), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_080644 // RefSeq // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 5 (Cacng5), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000039071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:107874671:107915055:-1 gene:ENSMUSG00000040373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000106742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:107874605:107911362:-1 gene:ENSMUSG00000040373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF361347 // GenBank // Mus musculus voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit (Cacng5) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// AF458900 // GenBank // Mus musculus voltage dependent calcium channel gamma 5 subunit (Cacng5) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// BC120894 // GenBank // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 5, mRNA (cDNA clone MGC:141423 IMAGE:40061528), complete cds. // chr11 // 92 // 78 // 23 // 25 // 0 /// BC120895 // GenBank // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 5, mRNA (cDNA clone MGC:141424 IMAGE:40061535), complete cds. // chr11 // 93 // 84 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:107877352:107915613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
NM_011101 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C, alpha (Prkca), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000059595 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:107933387:108343928:-1 gene:ENSMUSG00000050965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000100302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107938177:107979639:-1 gene:ENSMUSG00000050965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 34 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000134910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107978341:108012805:-1 gene:ENSMUSG00000050965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// AK163950 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230094C20 product:similar to Protein kinase C beta 2 (Fragment) [Sus scrofa], full insert sequence. // chr11 // 100 // 34 // 14 // 14 // 0 /// BC096493 // GenBank // Mus musculus protein kinase C, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:106365 IMAGE:30742571), complete cds. // chr11 // 89 // 93 // 34 // 38 // 0 /// M25811 // GenBank // Mouse protein kinase C-alpha (PKC-alpha gene) mRNA, complete cds. // chr11 // 75 // 98 // 30 // 40 // 0 /// X52685 // GenBank // M.musculus mRNA for alpha protein kinase C. // chr11 // 88 // 98 // 35 // 40 // 0 /// GENSCAN00000054071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:107939516:108066307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 71 // 29 // 41 // 1
AK156365 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830018J01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0
ENSMUST00000082757 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:109066984:109067090:-1 gene:ENSMUSG00000064691 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONMMUT012512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
NR_038097 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11696 (Gm11696), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000070956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:109354778:109363654:-1 gene:ENSMUSG00000056687 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC027814 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5250818, partial cds. // chr11 // 68 // 79 // 13 // 19 // 0
NM_134038 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 6 (Slc16a6), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006531945 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 6 (Slc16a6), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006531946 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 6 (Slc16a6), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000070872 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:109452726:109473294:-1 gene:ENSMUSG00000041920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000168740 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:109459799:109472688:-1 gene:ENSMUSG00000041920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// BC017129 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:27628 IMAGE:4506255), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NM_001029842 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 6 (Slc16a6), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000070152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:109450855:109473598:-1 gene:ENSMUSG00000041920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000037523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:109453144:109467082:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0
NM_145940 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1 (Wipi1), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000047186 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:109575132:109611432:-1 gene:ENSMUSG00000041895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:109582072:109611432:-1 gene:ENSMUSG00000041895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AK045131 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130038P03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC024883 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3487182), partial cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC025560 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1, mRNA (cDNA clone MGC:36416 IMAGE:5322999), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000103060 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:109573331:109611432:-1 gene:ENSMUSG00000041895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// GENSCAN00000037521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:109577036:109611312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_153782 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 20, member A (Fam20a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XR_388388 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 20, member A (Fam20a), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000020938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:109672926:109722256:-1 gene:ENSMUSG00000020614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000144972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:109674639:109682979:-1 gene:ENSMUSG00000020614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000155559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:109669749:109722279:-1 gene:ENSMUSG00000020614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC023310 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC029169, mRNA (cDNA clone IMAGE:4024430), partial cds. // chr11 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// BC029169 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 20, member A, mRNA (cDNA clone MGC:36952 IMAGE:4947019), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000146408 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:109673474:109676422:-1 gene:ENSMUSG00000020614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000037510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:109673300:109686124:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_001162428 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012B07 gene (1700012B07Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_027038 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012B07 gene (1700012B07Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000020941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:109791557:109828022:-1 gene:ENSMUSG00000020617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000106674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:109787651:109828046:-1 gene:ENSMUSG00000020617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000143578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:109791598:109814074:-1 gene:ENSMUSG00000020617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AK005888 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700012B07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC048675 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012B07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58848 IMAGE:6774204), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:109771153:109813711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_013851 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 8b (Abca8b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000020948 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:109932190:109995845:-1 gene:ENSMUSG00000020620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000106669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:109934273:109995743:-1 gene:ENSMUSG00000020620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AF498362 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette transporter sub-family A member 8b (Abca8b) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC141401 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 8b, mRNA (cDNA clone MGC:176363 IMAGE:9056014), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000037512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:109934510:110005077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
NM_153145 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 8a (Abca8a), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// XM_006533062 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 8a (Abca8a), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// XM_006533063 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 8a (Abca8a), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000046223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:110025636:110095937:-1 gene:ENSMUSG00000041828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000100287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:110025634:110095978:-1 gene:ENSMUSG00000041828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000106664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:110025636:110095937:-1 gene:ENSMUSG00000041828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AB255881 // GenBank // Mus musculus abca8a mRNA for ABC transporter A subfamily member, A8a, complete cds. // chr11 // 94 // 92 // 32 // 34 // 0 /// AB255882 // GenBank // Mus musculus abca8a mRNA for ABC transporter A subfamily member, A8a splicing variant 1, complete cds. // chr11 // 94 // 92 // 32 // 34 // 0 /// AF498360 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette transporter sub-family A member 8a (Abca8a) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// AY732492 // GenBank // Mus musculus ABCA8a mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000037509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:110026309:110086595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0
NM_147220 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 9 (Abca9), mRNA. // chr11 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000044850 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:110100749:110168196:-1 gene:ENSMUSG00000041797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// AF491299 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette transporter sub-family A member 9 (Abca9) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000037503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:110101965:110168099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0
NM_001166556 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 6 (Abca6), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// NM_147218 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 6 (Abca6), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000044003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:110176820:110251776:-1 gene:ENSMUSG00000044749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000150988 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:110236453:110251776:-1 gene:ENSMUSG00000044749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// AF498361 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette transporter sub-family A member 6 (Abca6) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// BC132417 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:164048 IMAGE:40130694), complete cds. // chr11 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// BC132419 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:164050 IMAGE:40130696), complete cds. // chr11 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000018888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:110176969:110266289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0
NM_147219 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 5 (Abca5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000043961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:110269369:110337678:-1 gene:ENSMUSG00000018800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000124714 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:110286819:110337622:-1 gene:ENSMUSG00000018800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// AB097675 // GenBank // Mus musculus abca5 mRNA for ABC transporter subfamily A mABCA5, complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AF491842 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette transporter sub-family A member 5 (Abca5) mRNA, complete cds. // chr11 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// AK169879 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630002F13 product:ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 5, full insert sequence. // chr11 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000127318 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:110309073:110337645:-1 gene:ENSMUSG00000018800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// AK162579 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630028O18 product:ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 5, full insert sequence. // chr11 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// GENSCAN00000018886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:110273965:110327885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0
AK143961 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F530007B04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_024085 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC006965 (BC006965), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:112663927:112711356:-1 gene:ENSMUSG00000041674 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC040767 // GenBank // Mus musculus, clone IMAGE:4459030, mRNA. // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XR_393629 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 11681 (Gm11681), transcript variant X1, ncRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_393631 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 11681 (Gm11681), transcript variant X3, ncRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000127337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:112792731:112799008:-1 gene:ENSMUSG00000075437 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK138212 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230035D19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138598 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 104, member A (Fam104a), mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000120194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:113661319:113684155:-1 gene:ENSMUSG00000041629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC056429 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 11, Wayne State University 99, expressed, mRNA (cDNA clone IMAGE:5689794). // chr11 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC060965 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 11, Wayne State University 99, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:74054 IMAGE:6705115), complete cds. // chr11 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0
NM_020006 // RefSeq // Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4 (Cdc42ep4), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006533815 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4 (Cdc42ep4), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006533818 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4 (Cdc42ep4), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006533819 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4 (Cdc42ep4), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000106616 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:113726850:113751318:-1 gene:ENSMUSG00000041598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB035088 // GenBank // Mus musculus Borg4 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_001163346 // RefSeq // Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4 (Cdc42ep4), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENSMUST00000053536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:113726852:113751881:-1 gene:ENSMUSG00000041598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// BC003857 // GenBank // Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4, mRNA (cDNA clone MGC:6584 IMAGE:3484427), complete cds. // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NR_027643 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4932435O22 gene (4932435O22Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:114413643:114423887:-1 gene:ENSMUSG00000062391 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000148405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:114413401:114448860:-1 gene:ENSMUSG00000062391 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT012660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_199221 // RefSeq // Mus musculus CD300 antigen like family member B (Cd300lb), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000074300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:114922781:114934386:-1 gene:ENSMUSG00000063193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000106581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:114922781:114934386:-1 gene:ENSMUSG00000063193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB300703 // GenBank // Mus musculus LMIR5 mRMA for activating receptor, complete cds. // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AY457053 // GenBank // Mus musculus CLM7 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AY996128 // GenBank // Mus musculus immune receptor expressed on myeloid cells 3 (Irem3) mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000149663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:114922781:114934371:-1 gene:ENSMUSG00000063193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// AK171125 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630226C16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000042075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:114906457:114931519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_199225 // RefSeq // Mus musculus CD300C antigen (Cd300c), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000061637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:114956278:114960417:-1 gene:ENSMUSG00000058728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000092466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:114956268:114960417:-1 gene:ENSMUSG00000058728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY457052 // GenBank // Mus musculus CLM6 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000106580 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:114956116:114969157:-1 gene:ENSMUSG00000058728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1 /// NONMMUT012679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1
NM_145437 // RefSeq // Mus musculus CD300 molecule-like family member d (Cd300ld), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:114982274:114989922:-1 gene:ENSMUSG00000034641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB292062 // GenBank // Mus musculus LMIR4 mRNA for leukocyte mono-Ig-like receptor 4, complete cds. // chr11 // 75 // 64 // 12 // 16 // 0 /// AY457051 // GenBank // Mus musculus CLM5 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC019814 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4732429D16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30299 IMAGE:5125383), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:114958856:115016193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_134158 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence AF251705 (AF251705), mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000092464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:114996721:115001880:-1 gene:ENSMUSG00000044811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000141188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:114996722:115001880:-1 gene:ENSMUSG00000044811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB091767 // GenBank // Mus musculus mRNA for MAIR-IIa, complete cds. // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AB091768 // GenBank // Mus musculus mRNA for MAIR-IIb, complete cds. // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AF251705 // GenBank // Mus musculus polymeric immunoglobulin receptor 5 precursor (Pigr5) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AY048685 // GenBank // Mus musculus dendritic cell-derived immunoglobulin receptor 1 precusor (Digr1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AY457050 // GenBank // Mus musculus CLM4 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC006801 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AF251705, mRNA (cDNA clone MGC:11569 IMAGE:3152857), complete cds. // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AB098476 // GenBank // Mus musculus Lmir2 mRNA for leukocyte mono-Ig-like receptor2, complete cds. // chr11 // 73 // 60 // 11 // 15 // 0 /// AF251704 // GenBank // Mus musculus polymeric immunoglobulin receptor 4 precursor (Pigr4) mRNA, complete cds. // chr11 // 67 // 72 // 12 // 18 // 0
ENSMUST00000092463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:115013659:115016193:-1 gene:ENSMUSG00000089753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000106578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115010335:115016193:-1 gene:ENSMUSG00000089753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000042080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:114958856:115016193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0
NM_172050 // RefSeq // Mus musculus CD300e antigen (Cd300e), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533075 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD300e antigen (Cd300e), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000062787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115051917:115062177:-1 gene:ENSMUSG00000048498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF437879 // GenBank // Mus musculus TREM5 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AY457048 // GenBank // Mus musculus CLM2 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC034097 // GenBank // Mus musculus CD300e antigen, mRNA (cDNA clone MGC:31495 IMAGE:4487018), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC039971 // GenBank // Mus musculus CD300e antigen, mRNA (cDNA clone MGC:49720 IMAGE:4487018), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115042131:115134008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_010350 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor, ionotropic, NMDA2C (epsilon 3) (Grin2c), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006532238 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate receptor, ionotropic, NMDA2C (epsilon 3) (Grin2c), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000003351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115249169:115265429:-1 gene:ENSMUSG00000020734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:115249169:115267243:-1 gene:ENSMUSG00000020734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK147390 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1026K02 product:glutamate receptor, ionotropic, NMDA2C (epsilon 3), full insert sequence. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC137849 // GenBank // Mus musculus glutamate receptor, ionotropic, NMDA2C (epsilon 3), mRNA (cDNA clone MGC:169473 IMAGE:8860868), complete cds. // chr11 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// D10694 // GenBank // Mus musculus mRNA for glutamate receptor channel subunit epsilon 3, complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115246441:115261132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_007997 // RefSeq // Mus musculus ferredoxin reductase (Fdxr), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XR_388346 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ferredoxin reductase (Fdxr), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115268024:115277050:-1 gene:ENSMUSG00000018861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000155130 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115268024:115276914:-1 gene:ENSMUSG00000018861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// BC071268 // GenBank // Mus musculus ferredoxin reductase, mRNA (cDNA clone MGC:78350 IMAGE:6517167), complete cds. // chr11 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// D49920 // GenBank // Mus musculus mRNA for ferredoxin-NADP reductase, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000139437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115271827:115276724:-1 gene:ENSMUSG00000018861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000055210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115268324:115310683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT012692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_178035 // RefSeq // Mus musculus fatty acid desaturase domain family, member 6 (Fads6), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000056153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115279622:115297514:-1 gene:ENSMUSG00000044788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC044804 // GenBank // Mus musculus fatty acid desaturase domain family, member 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:5359987), partial cds. // chr11 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// BC132041 // GenBank // Mus musculus fatty acid desaturase domain family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:163672 IMAGE:40130318), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC132067 // GenBank // Mus musculus fatty acid desaturase domain family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:163698 IMAGE:40130344), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000055210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115268324:115310683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1
NM_176847 // RefSeq // Mus musculus Usher syndrome 1G (Ush1g), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006532313 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Usher syndrome 1G (Ush1g), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000103037 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115315192:115322041:-1 gene:ENSMUSG00000045288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB087502 // GenBank // Mus musculus mRNA for Sans, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120509 // GenBank // Mus musculus Usher syndrome 1G homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:155746 IMAGE:40129432), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC137807 // GenBank // Mus musculus Usher syndrome 1G homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:169431 IMAGE:8860826), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115317981:115321856:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_175454 // RefSeq // Mus musculus HID1 domain containing (Hid1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000044152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115347707:115367719:-1 gene:ENSMUSG00000034586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000106542 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115347707:115367756:-1 gene:ENSMUSG00000034586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000130073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115356787:115367609:-1 gene:ENSMUSG00000034586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// AK044395 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930010L14 product:weakly similar to HID-1 [Caenorhabditis elegans], full insert sequence. // chr11 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// BC024617 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C630004H02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28513 IMAGE:4190480), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSMUST00000123428 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115355359:115367667:-1 gene:ENSMUSG00000034586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// ENSMUST00000145316 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115356692:115360317:-1 gene:ENSMUSG00000034586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000055241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115348469:115374311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
NM_008258 // RefSeq // Mus musculus hematological and neurological expressed sequence 1 (Hn1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000021083 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115497353:115514387:-1 gene:ENSMUSG00000020737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC003758 // GenBank // Mus musculus hematological and neurological expressed sequence 1, mRNA (cDNA clone MGC:5893 IMAGE:3591830), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// U90123 // GenBank // Mus musculus HN1 (Hn1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000155399 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115500382:115514371:-1 gene:ENSMUSG00000020737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// NONMMUT012725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_008163 // RefSeq // Mus musculus growth factor receptor bound protein 2 (Grb2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000021090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115644045:115708597:-1 gene:ENSMUSG00000059923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000106495 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:115644650:115708576:-1 gene:ENSMUSG00000059923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000106497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115644045:115699534:-1 gene:ENSMUSG00000059923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000106499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115644045:115699307:-1 gene:ENSMUSG00000059923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// AK153557 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830175F04 product:growth factor receptor bound protein 2, full insert sequence. // chr11 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// BC052377 // GenBank // Mus musculus growth factor receptor bound protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:64680 IMAGE:5696248), complete cds. // chr11 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// BC085254 // GenBank // Mus musculus growth factor receptor bound protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:102538 IMAGE:5343274), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// D85748 // GenBank // Mus musculus mRNA for Grb3-3, isoform of Grb2, complete cds. // chr11 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// U07617 // GenBank // Mus musculus Grb2 adaptor protein (grb2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
NM_080643 // RefSeq // Mus musculus CASK-interacting protein 2 (Caskin2), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000041684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115799183:115813630:-1 gene:ENSMUSG00000034471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000132780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115804736:115808102:-1 gene:ENSMUSG00000034471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 30 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000156812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115806777:115813639:-1 gene:ENSMUSG00000034471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 25 // 10 // 11 // 0 /// AF451978 // GenBank // Mus musculus cask-interacting protein 2 (Caskin2) mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 86 // 35 // 38 // 0 /// AK129297 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1139 protein. // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC053083 // GenBank // Mus musculus CASK-interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:62457 IMAGE:5704642), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000055207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115799987:115811980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000180782 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:11:115988052:115993715:-1 gene:ENSMUSG00000097800 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140207 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230344G16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016905 // RefSeq // Mus musculus galactokinase 1 (Galk1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021114 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116008457:116012719:-1 gene:ENSMUSG00000020766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB027012 // GenBank // Mus musculus galK mRNA for galactokinase, complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC016602 // GenBank // Mus musculus galactokinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:29019 IMAGE:3490224), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC050151 // GenBank // Mus musculus galactokinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:60516 IMAGE:30024030), complete cds. // chr11 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116008643:116012678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001009573 // RefSeq // Mus musculus unc-13 homolog D (C. elegans) (Unc13d), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000075036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:116062096:116077961:-1 gene:ENSMUSG00000057948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000173345 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116062554:116077624:-1 gene:ENSMUSG00000057948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000174822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116062638:116077590:-1 gene:ENSMUSG00000057948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// AK220199 // GenBank // Mus musculus mRNA for mFLJ00067 protein. // chr11 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC141289 // GenBank // Mus musculus unc-13 homolog D (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:176250 IMAGE:9055901), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// EF127645 // GenBank // Mus musculus UNC13D (Unc13d) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006534191 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-13 homolog D (C. elegans) (Unc13d), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 97 // 97 // 32 // 33 // 1 /// ENSMUST00000106450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116062095:116077750:-1 gene:ENSMUSG00000057948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 32 // 33 // 1 /// ENSMUST00000106451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:116062096:116077961:-1 gene:ENSMUSG00000057948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 32 // 33 // 1 /// GENSCAN00000055218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116062694:116086925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_016852 // RefSeq // Mus musculus WW domain binding protein 2 (Wbp2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000074628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116078573:116086995:-1 gene:ENSMUSG00000034341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000106444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116079252:116086995:-1 gene:ENSMUSG00000034341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC031908 // GenBank // Mus musculus WW domain binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:35953 IMAGE:5365118), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC055058 // GenBank // Mus musculus WW domain binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:62599 IMAGE:6529458), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// U40826 // GenBank // Mus musculus WW-domain binding protein 2 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000145278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116079397:116081485:-1 gene:ENSMUSG00000034341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// GENSCAN00000055218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116062694:116086925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NM_178802 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 65 (Trim65), mRNA. // chr11 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000067632 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116124708:116131126:-1 gene:ENSMUSG00000054517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 70 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000106440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116121846:116131124:-1 gene:ENSMUSG00000054517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000154061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116124708:116131128:-1 gene:ENSMUSG00000054517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC057094 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 65, mRNA (cDNA clone MGC:73514 IMAGE:6418691), complete cds. // chr11 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000027213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116127438:116131005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 27 // 8 // 9 // 0
NM_024177 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L38 (Mrpl38), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 73 // 73 // 0 /// ENSMUST00000106439 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116131817:116138868:-1 gene:ENSMUSG00000020775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 73 // 73 // 0 /// ENSMUST00000133159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116132785:116138789:-1 gene:ENSMUSG00000020775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 91 // 62 // 43 // 47 // 0 /// ENSMUST00000142550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116131821:116138775:-1 gene:ENSMUSG00000020775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 76 // 76 // 0 /// BC002319 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L38, mRNA (cDNA clone MGC:8310 IMAGE:3593984), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 76 // 76 // 0 /// BC030739 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L38, mRNA (cDNA clone MGC:41062 IMAGE:1493919), complete cds. // chr11 // 97 // 96 // 71 // 73 // 0 /// ENSMUST00000124722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116134256:116134627:-1 gene:ENSMUSG00000020775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 14 // 14 // 11 // 76 // 1 /// ENSMUST00000138457 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116137782:116138865:-1 gene:ENSMUSG00000020775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 14 // 14 // 11 // 76 // 1 /// AK014632 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4733401F03 product:mitochondrial ribosomal protein L38, full insert sequence. // chr11 // 14 // 14 // 11 // 76 // 1 /// GENSCAN00000027211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116131994:116138777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 65 // 65 // 0
NM_009180 // RefSeq // Mus musculus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 2 (St6galnac2), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XR_388384 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 2 (St6galnac2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000079545 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116675303:116694868:-1 gene:ENSMUSG00000057286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC003276 // GenBank HTC // Mus musculus mRNA similar to sialyltransferase 7 ((alpha-N-acetylneuraminyl 2,3-beta-galactosyl-1,3)-N-acetyl galactosaminde alpha-2,6-sialyltransferase) B (cDNA clone IMAGE:3499717). // chr11 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000135771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116675889:116679678:-1 gene:ENSMUSG00000057286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// AK079216 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530036N03 product:sialyltransferase 7 ((alpha-N-acetylneuraminyl 2,3-beta-galactosyl-1,3)-N-acetyl galactosaminde alpha-2,6-sialyltransferase) B, full insert sequence. // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000027210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116679991:116694558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONMMUT012848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_025276 // RefSeq // Mus musculus envoplakin (Evpl), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000037007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116220559:116238077:-1 gene:ENSMUSG00000034282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000027245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116220755:116237997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0
NM_146032 // RefSeq // Mus musculus signal recognition particle 68 (Srp68), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000021133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116245166:116274217:-1 gene:ENSMUSG00000020780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000106425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116245166:116274135:-1 gene:ENSMUSG00000020780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116248796:116261338:-1 gene:ENSMUSG00000020780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC033573 // GenBank // Mus musculus signal recognition particle 68, mRNA (cDNA clone MGC:38208 IMAGE:5323201), complete cds. // chr11 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// BC070422 // GenBank // Mus musculus signal recognition particle 68, mRNA (cDNA clone MGC:95680 IMAGE:6403747), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000127205 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116245166:116274217:-1 gene:ENSMUSG00000020780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// GENSCAN00000027232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116245703:116274106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
AK145210 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930020L02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00001328 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082654 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:116326602:116326717:-1 gene:ENSMUSG00000064588 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT012817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
L13204 // GenBank // Mus musculus forkhead Box j1 (Foxj1) mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 67 // 21 // 24 // 0 /// NM_008240 // RefSeq // Mus musculus forkhead box J1 (Foxj1), mRNA. // chr11 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// ENSMUST00000036215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116330704:116335399:-1 gene:ENSMUSG00000034227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// BC082543 // GenBank // Mus musculus forkhead box J1, mRNA (cDNA clone MGC:105219 IMAGE:6808210), complete cds. // chr11 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// GENSCAN00000027236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116331710:116335592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0
NM_001033267 // RefSeq // Mus musculus glutamine rich 2 (Qrich2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000093909 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116441325:116454347:-1 gene:ENSMUSG00000070331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000134182 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:116441329:116455237:-1 gene:ENSMUSG00000070331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000140697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116444541:116446991:-1 gene:ENSMUSG00000070331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// BC150976 // GenBank // Mus musculus glutamine rich 2, mRNA (cDNA clone MGC:183889 IMAGE:9087889), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116441355:116466021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0
NM_173755 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2O (Ube2o), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000082152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116537740:116581447:-1 gene:ENSMUSG00000020802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000134102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116537740:116544017:-1 gene:ENSMUSG00000020802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 54 // 21 // 21 // 0 /// AK035970 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630022H21 product:weakly similar to CDNA FLJ12878 FIS, CLONE NT2RP2003840, WEAKLY SIMILAR TO HYPOTHETICAL 48.1 KDA PROTEIN B0403.2 IN CHROMOSOME X [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// BC059193 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2O, mRNA (cDNA clone MGC:65407 IMAGE:4160667), complete cds. // chr11 // 91 // 90 // 32 // 35 // 0 /// GENSCAN00000027222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116539044:116581413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0
NM_030206 // RefSeq // Mus musculus cytoglobin (Cygb), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021166 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116645595:116654313:-1 gene:ENSMUSG00000020810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC055040 // GenBank // Mus musculus cytoglobin, mRNA (cDNA clone MGC:62810 IMAGE:6491041), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116641890:116653898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_011371 // RefSeq // Mus musculus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1 (St6galnac1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000009732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116765025:116775507:-1 gene:ENSMUSG00000009588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC141095 // GenBank // Mus musculus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:176056 IMAGE:9055707), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC145373 // GenBank // Mus musculus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:178939 IMAGE:9053931), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC145374 // GenBank // Mus musculus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:178940 IMAGE:9053932), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// Y11274 // GenBank // M.musculus mRNA for GalNAc alpha-2,6-sialyltransferase I. // chr11 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0
ENSMUST00000047715 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:116807729:116828013:-1 gene:ENSMUSG00000020814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000150015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116807913:116828003:-1 gene:ENSMUSG00000020814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// BC075618 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810057P16 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5718362). // chr11 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// BC147321 // GenBank // Mus musculus matrix-remodelling associated 7, mRNA (cDNA clone MGC:182482 IMAGE:9056376), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NM_026280 // RefSeq // Mus musculus matrix-remodelling associated 7 (Mxra7), mRNA. // chr11 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// ENSMUST00000021170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116803062:116828046:-1 gene:ENSMUSG00000020814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// BC147320 // GenBank // Mus musculus matrix-remodelling associated 7, mRNA (cDNA clone MGC:182479 IMAGE:9056373), complete cds. // chr11 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// GENSCAN00000027231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116804540:116827998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
AK136978 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430025L22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000118083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:117420696:117421127:-1 gene:ENSMUSG00000083705 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000165677 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:117420637:117421717:-1 gene:ENSMUSG00000083705 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC099450 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30936667, containing frame-shift errors. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT012907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT012908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_027919 // RefSeq // Mus musculus threonine aldolase 1 (Tha1), mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:117867952:117873459:-1 gene:ENSMUSG00000017713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000153989 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:117867952:117873481:-1 gene:ENSMUSG00000017713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AY219871 // GenBank // Mus musculus L-threonine aldolase (Gly1) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AY219872 // GenBank // Mus musculus truncated L-threonine aldolase isoform (Gly1) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr11 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// BC066149 // GenBank // Mus musculus threonine aldolase 1, mRNA (cDNA clone MGC:76477 IMAGE:30469743), complete cds. // chr11 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000138354 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:117869724:117871911:-1 gene:ENSMUSG00000017713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000002185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:117868459:117873372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT012944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_007707 // RefSeq // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 3 (Socs3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:117966079:117969186:-1 gene:ENSMUSG00000053113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052031 // GenBank // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 3, mRNA (cDNA clone MGC:62384 IMAGE:5707539), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U88328 // GenBank // Mus musculus suppressor of cytokine signalling-3 (SOCS-3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001167746 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 17 (Dnah17), mRNA. // chr11 // 98 // 98 // 53 // 54 // 0 /// XM_006534150 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 17 (Dnah17), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 98 // 100 // 54 // 55 // 0 /// ENSMUST00000084803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:118021723:118129219:-1 gene:ENSMUSG00000033987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 98 // 98 // 53 // 54 // 0 /// ENSMUST00000106308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:118021723:118129219:-1 gene:ENSMUSG00000033987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 98 // 98 // 53 // 54 // 0 /// ENSMUST00000132685 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:118023080:118103492:-1 gene:ENSMUSG00000033987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 98 // 98 // 53 // 54 // 0 /// GENSCAN00000002192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:118023250:118110592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 98 // 96 // 52 // 53 // 0
NM_001167746 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 17 (Dnah17), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006534150 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 17 (Dnah17), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000084803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:118021723:118129219:-1 gene:ENSMUSG00000033987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000106308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:118021723:118129219:-1 gene:ENSMUSG00000033987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000124164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:118112433:118125944:-1 gene:ENSMUSG00000033987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:118112523:118129219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_011594 // RefSeq // Mus musculus tissue inhibitor of metalloproteinase 2 (Timp2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000017610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:118301069:118355506:-1 gene:ENSMUSG00000017466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000155707 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:118303701:118355740:-1 gene:ENSMUSG00000017466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// BC049126 // GenBank // Mus musculus tissue inhibitor of metalloproteinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:61198 IMAGE:6821553), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// M82858 // GenBank // Mouse tissue inhibitor (type 2) of metalloproteinases (TIMP-2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// M93954 // GenBank // M.musculus metalloproteinase inhibitor (TIMP-2) mRNA, complete cds. // chr11 // 85 // 65 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:118258119:118355090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NM_021440 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC100451 (BC100451), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533859 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC100451 (BC100451), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000103024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:118332360:118342500:-1 gene:ENSMUSG00000076433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:118332415:118334016:-1 gene:ENSMUSG00000076433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// BC100451 // GenBank // Mus musculus differential display clone 8, mRNA (cDNA clone MGC:118267 IMAGE:30918483), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:118258119:118355090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_011150 // RefSeq // Mus musculus lectin, galactoside-binding, soluble, 3 binding protein (Lgals3bp), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000043722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:118392751:118402092:-1 gene:ENSMUSG00000033880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106290 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:118396607:118401852:-1 gene:ENSMUSG00000033880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000141459 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:118396809:118401872:-1 gene:ENSMUSG00000033880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC090658 // GenBank // Mus musculus lectin, galactoside-binding, soluble, 3 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:116566 IMAGE:30666981), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L16894 // GenBank // Mus musculus Cyclophilin C (CyCAP) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:118393018:118399779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000153825 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:118476470:118479458:-1 gene:ENSMUSG00000087036 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK049482 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430016E07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_013926 // RefSeq // Mus musculus chromobox 8 (Cbx8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533519 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chromobox 8 (Cbx8), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000026663 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:119036305:119040969:-1 gene:ENSMUSG00000025578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119039053:119040831:-1 gene:ENSMUSG00000025578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000143831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119039184:119040911:-1 gene:ENSMUSG00000025578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// AF180370 // GenBank // Mus musculus polycomb protein (Pc3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC014815 // GenBank // Mus musculus chromobox homolog 8 (Drosophila Pc class), mRNA (cDNA clone MGC:25653 IMAGE:4456898), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK051905 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230017K24 product:chromobox homolog 8 (Drosophila Pc class), full insert sequence. // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000032831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119038677:119040850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT012984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
NM_007625 // RefSeq // Mus musculus chromobox 4 (Cbx4), mRNA. // chr11 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000026665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:119077573:119086221:-1 gene:ENSMUSG00000039989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000145058 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119081373:119086221:-1 gene:ENSMUSG00000039989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC018304 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4167783, containing frame-shift errors. // chr11 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC115844 // GenBank HTC // Mus musculus chromobox homolog 4 (Drosophila Pc class), mRNA (cDNA clone IMAGE:40045147), with apparent retained intron. // chr11 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC117801 // GenBank // Mus musculus chromobox homolog 4 (Drosophila Pc class), mRNA (cDNA clone MGC:143697 IMAGE:40092282), complete cds. // chr11 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// BC117802 // GenBank // Mus musculus chromobox homolog 4 (Drosophila Pc class), mRNA (cDNA clone MGC:143698 IMAGE:40092283), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// U63387 // GenBank // Mus musculus transcriptional repressor Mpc2 mRNA, complete cds. // chr11 // 86 // 90 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119080892:119090352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0
NM_172443 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 16 (Tbc1d16), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:119143045:119228499:-1 gene:ENSMUSG00000039976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC057634 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 16, mRNA (cDNA clone MGC:67717 IMAGE:2866041), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119136247:119184338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_138669 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4A3 (Eif4a3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000026667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:119288363:119300089:-1 gene:ENSMUSG00000025580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000129044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119288364:119289010:-1 gene:ENSMUSG00000025580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// ENSMUST00000138849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119288364:119289076:-1 gene:ENSMUSG00000025580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// AK169815 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430027B07 product:DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 48, full insert sequence. // chr11 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC008132 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4A, isoform 3, mRNA (cDNA clone MGC:6664 IMAGE:3498954), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC012862 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4A, isoform 3, mRNA (cDNA clone MGC:6715 IMAGE:3585696), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000016637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119288553:119300374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
NM_018822 // RefSeq // Mus musculus N-sulfoglucosamine sulfohydrolase (sulfamidase) (Sgsh), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000005173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:119343482:119355536:-1 gene:ENSMUSG00000005043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000100172 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:119343498:119355510:-1 gene:ENSMUSG00000005043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000133507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119346242:119355530:-1 gene:ENSMUSG00000005043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000136523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119343425:119355502:-1 gene:ENSMUSG00000005043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AF153827 // GenBank // Mus musculus sulphamidase mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 69 // 22 // 25 // 0 /// AF304053 // GenBank // Mus musculus heparan N-sulfatase mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// AF304054 // GenBank // Mus musculus mutant heparan N-sulfatase mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC130268 // GenBank // Mus musculus N-sulfoglucosamine sulfohydrolase (sulfamidase), mRNA (cDNA clone MGC:161356 IMAGE:40143074), complete cds. // chr11 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119349526:119355484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
NM_008730 // RefSeq // Mus musculus neuronal pentraxin 1 (Nptx1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000026670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:119538719:119547753:-1 gene:ENSMUSG00000025582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC093479 // GenBank // Mus musculus neuronal pentraxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:118731 IMAGE:30947054), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC139018 // GenBank // Mus musculus neuronal pentraxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:170645 IMAGE:8862040), complete cds. // chr11 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC139020 // GenBank // Mus musculus neuronal pentraxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:170647 IMAGE:8862042), complete cds. // chr11 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119542473:119547589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NR_029767 // RefSeq // Mus musculus microRNA 338 (Mir338), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083666 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:120014765:120014862:-1 gene:ENSMUSG00000065600 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-338 // miRBase Micro RNA Database // MI0000619 Mus musculus miR-338 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009734 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 131 (Cep131), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120064430:120086827:-1 gene:ENSMUSG00000039781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106229 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:120064430:120086827:-1 gene:ENSMUSG00000039781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:120064430:120086827:-1 gene:ENSMUSG00000039781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK134381 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030450O08 product:5-azacytidine induced gene 1, full insert sequence. // chr11 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC141108 // GenBank // Mus musculus 5-azacytidine induced gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:176069 IMAGE:9055720), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// D43921 // GenBank // Mus musculus AZ1 mRNA for pre-acrosome localization protein, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120041232:120096969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NR_030682 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2810410L24 gene (2810410L24Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000145437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120187707:120189852:-1 gene:ENSMUSG00000075389 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AK162474 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430079N08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120181342:120257715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT013068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT013069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT013070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT013071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000139014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120229802:120231585:-1 gene:ENSMUSG00000043993 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK162948 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330069N23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC094254 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6414982. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001195023 // RefSeq // Mus musculus nuclear protein localization 4 homolog (S. cerevisiae) (Nploc4), transcript variant A, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_199469 // RefSeq // Mus musculus nuclear protein localization 4 homolog (S. cerevisiae) (Nploc4), transcript variant B, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000044271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120380370:120437708:-1 gene:ENSMUSG00000039703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000103017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120380370:120437708:-1 gene:ENSMUSG00000039703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000132519 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120404265:120421457:-1 gene:ENSMUSG00000039703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// BC065156 // GenBank // Mus musculus nuclear protein localization 4 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:90115 IMAGE:5706754), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000050547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120370288:120437753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1
NM_025560 // RefSeq // Mus musculus oxidoreductase like domain containing 1 (Oxld1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120456606:120458068:-1 gene:ENSMUSG00000039670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137632 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:120456885:120457936:-1 gene:ENSMUSG00000039670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0 /// BC147291 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810049H13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182448 IMAGE:9056342), complete cds. // chr11 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC147292 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810049H13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182447 IMAGE:9056341), complete cds. // chr11 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC172027 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:198732 IMAGE:9054313, complete cds. // chr11 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000050548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120456764:120457186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001033231 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 195, member B (Fam195b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006532531 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 195, member B (Fam195b), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034913 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120542888:120549727:-1 gene:ENSMUSG00000061111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000135515 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120542888:120549701:-1 gene:ENSMUSG00000061111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120543684:120546904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_026814 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 27 (Ppp1r27), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000026121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120549979:120551132:-1 gene:ENSMUSG00000025129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC115957 // GenBank // Mus musculus dysferlin interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:141152 IMAGE:40055543), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120550206:120551053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0
NM_011032 // RefSeq // Mus musculus prolyl 4-hydroxylase, beta polypeptide (P4hb), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000026122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120560298:120573253:-1 gene:ENSMUSG00000025130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC008549 // GenBank // Mus musculus prolyl 4-hydroxylase, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:8228 IMAGE:3591404), complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// BC093512 // GenBank // Mus musculus prolyl 4-hydroxylase, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:102617 IMAGE:5124376), complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// J05185 // GenBank // Mouse protein disulfide isomerase (ERp59) mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000168360 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:120560945:120572841:-1 gene:ENSMUSG00000025130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000050515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120561183:120572807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_011568 // RefSeq // Mus musculus Aly/REF export factor (Alyref), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XR_388401 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Aly/REF export factor (Alyref), transcript variant X1, misc_RNA. // chr11 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// ENSMUST00000026125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120592121:120598365:-1 gene:ENSMUSG00000025134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000155325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120594509:120595657:-1 gene:ENSMUSG00000025134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// BC120588 // GenBank // Mus musculus THO complex 4, mRNA (cDNA clone MGC:155825 IMAGE:40129511), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC137658 // GenBank // Mus musculus THO complex 4, mRNA (cDNA clone MGC:169282 IMAGE:8860677), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// U89876 // GenBank // Mus musculus transcriptional coactivator ALY (ALY) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000156685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120595616:120598231:-1 gene:ENSMUSG00000025134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// GENSCAN00000050531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120594853:120598338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 85 // 16 // 17 // 0 /// NONMMUT013112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000058162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120625117:120633600:-1 gene:ENSMUSG00000051510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000058162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120625117:120633600:-1 gene:ENSMUSG00000051510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010756 // RefSeq // Mus musculus v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene family, protein G (avian) (Mafg), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120625117:120633600:-1 gene:ENSMUSG00000051510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106180 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:120629232:120630148:-1 gene:ENSMUSG00000051510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000106181 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:120629141:120630636:-1 gene:ENSMUSG00000051510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000106182 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:120629007:120630797:-1 gene:ENSMUSG00000051510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// BC002092 // GenBank // Mus musculus v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene family, protein G (avian), mRNA (cDNA clone MGC:6343 IMAGE:3488374), complete cds. // chr11 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// BC052633 // GenBank // Mus musculus v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene family, protein G (avian), mRNA (cDNA clone MGC:58925 IMAGE:6309003), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120629284:120644040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
ENSMUST00000026133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120639416:120643748:-1 gene:ENSMUSG00000025140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000139706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120641714:120643769:-1 gene:ENSMUSG00000025140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000151876 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:120641478:120643704:-1 gene:ENSMUSG00000025140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 37 // 10 // 11 // 0 /// BC006727 // GenBank // Mus musculus pyrroline-5-carboxylate reductase 1, mRNA (cDNA clone MGC:11688 IMAGE:3962093), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_144795 // RefSeq // Mus musculus pyrroline-5-carboxylate reductase 1 (Pycr1), mRNA. // chr11 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000170556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:120635712:120643670:-1 gene:ENSMUSG00000025140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000141254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120641224:120643643:-1 gene:ENSMUSG00000025140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000050527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120629284:120644040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_026751 // RefSeq // Mus musculus myeloid-associated differentiation marker-like 2 (Myadml2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091000 // GenBank // Mus musculus myeloid-associated differentiation marker-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:107698 IMAGE:6756293), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC109329 // GenBank // Mus musculus myeloid-associated differentiation marker-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:130107 IMAGE:40051378), complete cds. // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC125008 // GenBank // Mus musculus myeloid-associated differentiation marker-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:130108 IMAGE:40051379), complete cds. // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NM_001204820 // RefSeq // Mus musculus myeloid-associated differentiation marker-like 2 (Myadml2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSMUST00000026134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:120646031:120648158:-1 gene:ENSMUSG00000025141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSMUST00000145047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120646032:120647082:-1 gene:ENSMUSG00000025141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000050542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120647084:120647995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT013130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_175263 // RefSeq // Mus musculus notum pectinacetylesterase homolog (Drosophila) (Notum), mRNA. // chr11 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// XM_006534495 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus notum pectinacetylesterase homolog (Drosophila) (Notum), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000055439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120653845:120658044:-1 gene:ENSMUSG00000042988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000106177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120653788:120660606:-1 gene:ENSMUSG00000042988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000106178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120653788:120660829:-1 gene:ENSMUSG00000042988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// BC025832 // GenBank // Mus musculus notum pectinacetylesterase homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:37936 IMAGE:5125723), complete cds. // chr11 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// XM_006534496 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus notum pectinacetylesterase homolog (Drosophila) (Notum), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// ENSMUST00000150458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120657563:120661175:-1 gene:ENSMUSG00000042988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000050522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120654220:120664665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_026428 // RefSeq // Mus musculus dicarbonyl L-xylulose reductase (Dcxr), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006534028 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dicarbonyl L-xylulose reductase (Dcxr), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000026144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120725399:120727281:-1 gene:ENSMUSG00000039450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120725399:120727243:-1 gene:ENSMUSG00000039450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000122883 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120725455:120727229:-1 gene:ENSMUSG00000039450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000125242 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120725425:120727244:-1 gene:ENSMUSG00000039450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D89656 // GenBank // Mus musculus DCXR mRNA for Dicarbonyl/L-Xylulose Reductase, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK002803 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610038K04 product:dicarbonyl L-xylulose reductase, full insert sequence. // chr11 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// BC012247 // GenBank // Mus musculus dicarbonyl L-xylulose reductase, mRNA (cDNA clone MGC:19047 IMAGE:4189635), complete cds. // chr11 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120725504:120727229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_007621 // RefSeq // Mus musculus carbonyl reductase 2 (Cbr2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000026148 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120729489:120732114:-1 gene:ENSMUSG00000025150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000149450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120730113:120731952:-1 gene:ENSMUSG00000025150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000154565 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:120729779:120731944:-1 gene:ENSMUSG00000025150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC010758 // GenBank // Mus musculus carbonyl reductase 2, mRNA (cDNA clone MGC:18465 IMAGE:4219349), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120729722:120744355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_009053 // RefSeq // Mus musculus RFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase (Rfng), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000026156 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120780748:120784207:-1 gene:ENSMUSG00000025158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000123273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120780746:120784185:-1 gene:ENSMUSG00000025158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF015770 // GenBank // Mus musculus radical fringe (radical-fringe) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AK207192 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0107D15, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000026156, based on BLAT search. // chr11 // 75 // 41 // 9 // 12 // 0 /// BC066023 // GenBank // Mus musculus RFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:90122 IMAGE:6829176), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// U94350 // GenBank // Mus musculus radical fringe precursor mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120773223:120784162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_007988 // RefSeq // Mus musculus fatty acid synthase (Fasn), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000055655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120805940:120824178:-1 gene:ENSMUSG00000025153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// AF127033 // GenBank // Mus musculus fatty acid synthase mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// BC046513 // GenBank // Mus musculus fatty acid synthase, mRNA (cDNA clone MGC:25871 IMAGE:4196969), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000050553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120798838:120829972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0
NM_027745 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 57 (Ccdc57), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_006534232 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 57 (Ccdc57), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// XM_006534233 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 57 (Ccdc57), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// XM_006534240 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 57 (Ccdc57), transcript variant X9, mRNA. // chr11 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000056781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120826529:120932872:-1 gene:ENSMUSG00000048445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000150640 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120826542:120873671:-1 gene:ENSMUSG00000048445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// AK017054 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933434G05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AK220306 // GenBank // Mus musculus mRNA for mFLJ00130 protein. // chr11 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// BC056480 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 57, mRNA (cDNA clone MGC:67410 IMAGE:5689542), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000050544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120846971:120921926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT013147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0
NM_009854 // RefSeq // Mus musculus CD7 antigen (Cd7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026159 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121036747:121039418:-1 gene:ENSMUSG00000025163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000163465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:121037885:121039418:-1 gene:ENSMUSG00000025163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// CT010368 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836C0153D for gene Cd7, CD7 antigen; complete cds, incl. stopcodon. // chr11 // 76 // 78 // 16 // 21 // 0 /// D10329 // GenBank // Mus musculus mRNA for CD7, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC024376 // GenBank // Mus musculus CD7 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:36025 IMAGE:4985794), complete cds. // chr11 // 70 // 100 // 19 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121033434:121039365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_027622 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 19.2 (Tex19.2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000039146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121116215:121118677:-1 gene:ENSMUSG00000039337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC141309 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 19.2, mRNA (cDNA clone MGC:176270 IMAGE:9055921), complete cds. // chr11 // 87 // 68 // 13 // 15 // 0
ENSMUST00000119569 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:121165471:121165925:-1 gene:ENSMUSG00000081835 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121165459:121167393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// NONMMUT013171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0
NM_025402 // RefSeq // Mus musculus 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain containing 3 (Ogfod3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000026169 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121177591:121204711:-1 gene:ENSMUSG00000025169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024349 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110031I02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35761 IMAGE:4972349), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121177802:121201062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_025793 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 45B (Wdr45b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000026173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121327224:121354445:-1 gene:ENSMUSG00000025173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000136797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:121335384:121354393:-1 gene:ENSMUSG00000025173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// BC004595 // GenBank // Mus musculus Wdr45 like, mRNA (cDNA clone MGC:6706 IMAGE:3584839), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006533964 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 45B (Wdr45b), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// ENSMUST00000106110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:121331093:121354341:-1 gene:ENSMUSG00000025173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// GENSCAN00000052370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121328358:121388142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1
NM_139147 // RefSeq // Mus musculus Rab40B, member RAS oncogene family (Rab40b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000106107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121356125:121388251:-1 gene:ENSMUSG00000025170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000124639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:121359591:121388221:-1 gene:ENSMUSG00000025170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000135290 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:121359610:121388230:-1 gene:ENSMUSG00000025170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000149948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:121358002:121388065:-1 gene:ENSMUSG00000025170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AB232638 // GenBank // Mus musculus Rab40B mRNA for Rab40B, complete cds. // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AF425643 // GenBank // Mus musculus RAR SOCS box containing protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC096601 // GenBank // Mus musculus Rab40b, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:106328 IMAGE:4974190), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT013185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000052370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121328358:121388142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_178763 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 750 (Zfp750), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000092298 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121510978:121519333:-1 gene:ENSMUSG00000039238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC150905 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 750, mRNA (cDNA clone MGC:183816 IMAGE:9087816), complete cds. // chr11 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121511809:121514047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_008445 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 3C (Kif3c), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:3365132:3406494:1 gene:ENSMUSG00000020668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF013116 // GenBank // Mus musculus kinesin motor protein KIF3C mRNA, complete cds. // chr12 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BC052732 // GenBank HTC // Mus musculus kinesin family member 3C, mRNA (cDNA clone IMAGE:6816501), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr12 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC127063 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 3C, mRNA (cDNA clone MGC:150091 IMAGE:40109965), complete cds. // chr12 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:3365981:3502372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001278581 // RefSeq // Mus musculus pro-opiomelanocortin-alpha (Pomc), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001278582 // RefSeq // Mus musculus pro-opiomelanocortin-alpha (Pomc), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001278583 // RefSeq // Mus musculus pro-opiomelanocortin-alpha (Pomc), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NM_001278584 // RefSeq // Mus musculus pro-opiomelanocortin-alpha (Pomc), transcript variant 5, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_008895 // RefSeq // Mus musculus pro-opiomelanocortin-alpha (Pomc), transcript variant 4, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:3954951:3960618:1 gene:ENSMUSG00000020660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061215 // GenBank // Mus musculus pro-opiomelanocortin-alpha, mRNA (cDNA clone MGC:74362 IMAGE:30253829), complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:3807366:3960468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_153082 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 27 (Dnajc27), mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4082574:4110612:1 gene:ENSMUSG00000020657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4082629:4109204:1 gene:ENSMUSG00000020657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC042643 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 27, mRNA (cDNA clone MGC:38706 IMAGE:5357595), complete cds. // chr12 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC051140 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 27, mRNA (cDNA clone MGC:58353 IMAGE:6595101), complete cds. // chr12 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AY035893 // GenBank // Mus musculus Rab-related GTP-binding protein (Rabj) mRNA, complete cds. // chr12 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// XM_006515053 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 27 (Dnajc27), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000006557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:4082557:4148229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001204912 // RefSeq // Mus musculus peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1 (Ptrhd1), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000179139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4234027:4240123:1 gene:ENSMUSG00000096199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:4226349:4238583:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 94 // 65 // 16 // 17 // 0
NM_001204912 // RefSeq // Mus musculus peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1 (Ptrhd1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000179139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4234027:4240123:1 gene:ENSMUSG00000096199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_028376 // RefSeq // Mus musculus profilin family, member 4 (Pfn4), mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// XM_006515138 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus profilin family, member 4 (Pfn4), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006515141 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus profilin family, member 4 (Pfn4), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000020967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4769295:4778266:1 gene:ENSMUSG00000020639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC116888 // GenBank // Mus musculus profilin family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:151265 IMAGE:40126207), complete cds. // chr12 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// AY495949 // GenBank // Mus musculus profilin IV mRNA, complete cds. // chr12 // 81 // 81 // 30 // 37 // 1 /// ENSMUST00000178879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4769451:4778238:1 gene:ENSMUSG00000020639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1 /// BC116890 // GenBank // Mus musculus profilin family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:151267 IMAGE:40126209), complete cds. // chr12 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1 /// GENSCAN00000006430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:4761410:4830638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
NR_033599 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6682 (Gm6682), non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000006430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:4761410:4830638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_025323 // RefSeq // Mus musculus splicing factor 3B, subunit 6 (Sf3b6), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000046207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4817608:4827658:1 gene:ENSMUSG00000037361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK003683 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110014D11 product:PRE-MRNA BRANCH SITE PROTEIN P14 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chrUn // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC019535 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610009D07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28726 IMAGE:4458983), complete cds. // chrUn // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK034275 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330171D12 product:hypothetical RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif) containing protein, full insert sequence. // chrUn // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:4761410:4830638:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001170858 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC068281 (BC068281), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 88 // 60 // 21 // 24 // 0 /// NM_173416 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC068281 (BC068281), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4843303:4852913:1 gene:ENSMUSG00000051721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4850146:4856925:1 gene:ENSMUSG00000051721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// AK164024 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430016G14 product:hypothetical G-protein beta WD-40 repeat containing protein, full insert sequence. // chr12 // 90 // 25 // 9 // 10 // 0 /// AK170427 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630103C13 product:hypothetical Cytochrome cd1-nitrite reductase-like, C-terminal haem d1/G-protein beta WD-40 repeat containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// BC068281 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC068281, mRNA (cDNA clone MGC:60781 IMAGE:30008957), complete cds. // chr12 // 75 // 60 // 18 // 24 // 0 /// XM_006515077 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC068281 (BC068281), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 53 // 53 // 21 // 40 // 1 /// GENSCAN00000006550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:4850146:4858027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 48 // 19 // 19 // 0
AK085232 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530031C13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 87 // 79 // 26 // 30 // 0 /// NM_001099628 // RefSeq // Mus musculus ATPase family, AAA domain containing 2B (Atad2b), mRNA. // chr12 // 97 // 97 // 37 // 38 // 1 /// XR_381193 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase family, AAA domain containing 2B (Atad2b), transcript variant X4, misc_RNA. // chr12 // 97 // 97 // 37 // 38 // 1 /// ENSMUST00000045664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4917404:5044047:1 gene:ENSMUSG00000052812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 97 // 37 // 38 // 1 /// AK161170 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4831419P14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 55 // 55 // 21 // 38 // 1 /// NONMMUT013298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 90 // 55 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:4936113:4962430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1
NM_001099628 // RefSeq // Mus musculus ATPase family, AAA domain containing 2B (Atad2b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000045664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4917404:5044047:1 gene:ENSMUSG00000052812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:4965841:5043653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NR_015579 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2810032G03 gene (2810032G03Rik), long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000163627 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:5411641:5416631:1 gene:ENSMUSG00000037735 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK029678 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930463A03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:5375870:5416305:1 gene:ENSMUSG00000037735 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_009693 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein B (Apob), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000037520 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:7977779:8016500:1 gene:ENSMUSG00000020609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000037811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:7977648:8016835:1 gene:ENSMUSG00000020609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000171271 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:7977648:7987818:1 gene:ENSMUSG00000020609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 19 // 10 // 10 // 0 /// BC100607 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein B, mRNA (cDNA clone IMAGE:6749630), partial cds. // chr12 // 100 // 19 // 10 // 10 // 0 /// BC141357 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein B, mRNA (cDNA clone IMAGE:9055969), complete cds. // chr12 // 100 // 47 // 25 // 25 // 0 /// BC141360 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein B, mRNA (cDNA clone IMAGE:9055972), complete cds. // chr12 // 100 // 47 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171239 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:8012359:8016835:1 gene:ENSMUSG00000020609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 38 // 38 // 20 // 53 // 1 /// GENSCAN00000029745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:7977779:8016550:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 98 // 83 // 43 // 44 // 0
NM_021429 // RefSeq // Mus musculus HCLS1 binding protein 3 (Hs1bp3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000020927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:8313433:8343824:1 gene:ENSMUSG00000020605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000029753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:8313466:8342087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0
NM_011519 // RefSeq // Mus musculus syndecan 1 (Sdc1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020911 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:8771323:8793715:1 gene:ENSMUSG00000020592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:8771413:8793062:1 gene:ENSMUSG00000020592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC010560 // GenBank // Mus musculus syndecan 1, mRNA (cDNA clone MGC:5879 IMAGE:3501359), complete cds. // chr12 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:8771636:8791807:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_008640 // RefSeq // Mus musculus lysosomal-associated protein transmembrane 4A (Laptm4a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000020909 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:8921664:8938742:1 gene:ENSMUSG00000020585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC086667 // GenBank // Mus musculus lysosomal-associated protein transmembrane 4A, mRNA (cDNA clone MGC:113814 IMAGE:30633914), complete cds. // chr12 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC089021 // GenBank // Mus musculus lysosomal-associated protein transmembrane 4A, mRNA (cDNA clone MGC:115742 IMAGE:6734038), complete cds. // chr12 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// U34259 // GenBank // Mus musculus lysosome-associated protein, transmembane - 4alpha mRNA, complete cds. // chr12 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:8921959:8934988:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_010770 // RefSeq // Mus musculus matrilin 3 (Matn3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000020899 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:8947929:8972028:1 gene:ENSMUSG00000020583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC071224 // GenBank // Mus musculus matrilin 3, mRNA (cDNA clone MGC:78174 IMAGE:30446350), complete cds. // chr12 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:8948044:8952635:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000027355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:8954080:9028156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
NM_029321 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 32 (Ttc32), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000085741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:9029997:9036394:1 gene:ENSMUSG00000066637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC119273 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 32, mRNA (cDNA clone MGC:155589 IMAGE:8734022), complete cds. // chr12 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// XM_006515243 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 32 (Ttc32), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:9030057:9043568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_011859 // RefSeq // Mus musculus odd-skipped related 1 (Drosophila) (Osr1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000057021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:9574442:9581499:1 gene:ENSMUSG00000048387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF117814 // GenBank // Mus musculus odd-skipped related 1 protein (Osr1) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC023922 // GenBank // Mus musculus odd-skipped related 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:36055 IMAGE:5323948), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:9570053:9584902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0
NM_133360 // RefSeq // Mus musculus acetyl-Coenzyme A carboxylase alpha (Acaca), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000020843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:84195438:84401645:1 gene:ENSMUSG00000020532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000103201 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84173122:84401651:1 gene:ENSMUSG00000020532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000183887 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:84280455:84311401:1 gene:ENSMUSG00000020532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 21 // 11 // 11 // 0 /// AY451393 // GenBank // Mus musculus acetyl-CoA carboxylase 1 (Acac) mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 100 // 49 // 53 // 0 /// BC042725 // GenBank // Mus musculus acetyl-Coenzyme A carboxylase alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:3967191). // chr12 // 100 // 21 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000001082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:84214165:84364447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000049537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:10123501:10180339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 98 // 94 // 49 // 50 // 0
NM_027588 // RefSeq // Mus musculus 5-nucleotidase, cytosolic IB (Nt5c1b), mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006515211 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 5-nucleotidase, cytosolic IB (Nt5c1b), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000002456 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:10370044:10390170:1 gene:ENSMUSG00000020622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000118657 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:10369979:10390173:1 gene:ENSMUSG00000020622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000143739 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:10369979:10374942:1 gene:ENSMUSG00000020622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000147323 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:10369973:10390170:1 gene:ENSMUSG00000020622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AK014892 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921514H13 product:autoimmune infertility-related protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC060976 // GenBank // Mus musculus 5-nucleotidase, cytosolic IB, mRNA (cDNA clone MGC:74070 IMAGE:6773248), complete cds. // chr12 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:10362607:10390133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_023697 // RefSeq // Mus musculus retinol dehydrogenase 14 (all-trans and 9-cis) (Rdh14), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006514943 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus retinol dehydrogenase 14 (all-trans and 9-cis) (Rdh14), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:10390780:10395562:1 gene:ENSMUSG00000020621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF303831 // GenBank // Mus musculus alcohol dehydrogenase PAN2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK142290 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330035H16 product:retinol dehydrogenase 14 (all-trans and 9-cis), full insert sequence. // chr12 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC020094 // GenBank // Mus musculus retinol dehydrogenase 14 (all-trans and 9-cis), mRNA (cDNA clone MGC:28314 IMAGE:4014290), complete cds. // chr12 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC092299 // GenBank // Mus musculus retinol dehydrogenase 14 (all-trans and 9-cis), mRNA (cDNA clone MGC:102420 IMAGE:5060293), complete cds. // chr12 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:10390840:10395155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_025695 // RefSeq // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 6 (Smc6), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000020931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:11265886:11319785:1 gene:ENSMUSG00000020608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC026429 // GenBank // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:4224576), complete cds. // chr12 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC048790 // GenBank // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:6308536), complete cds. // chr12 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC090630 // GenBank // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 6, mRNA (cDNA clone MGC:96146 IMAGE:30536320), complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:11271734:11317884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_001146119 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 49, member A (Fam49a), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NM_029758 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 49, member A (Fam49a), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000069005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:12262139:12376359:1 gene:ENSMUSG00000020589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000069066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:12262139:12376359:1 gene:ENSMUSG00000020589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC049664 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 49, member B, mRNA (cDNA clone MGC:58485 IMAGE:6532813), complete cds. // chr12 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC052465 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 49, member B, mRNA (cDNA clone MGC:63391 IMAGE:6834768), complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK010821 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410157M17 product:weakly similar to BM-009 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 68 // 76 // 15 // 22 // 0 /// GENSCAN00000000108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:12322924:12372810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_027706 // RefSeq // Mus musculus neuroblastoma amplified sequence (Nbas), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:13269127:13583810:1 gene:ENSMUSG00000020576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:13247806:13290274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_027706 // RefSeq // Mus musculus neuroblastoma amplified sequence (Nbas), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:13269127:13583810:1 gene:ENSMUSG00000020576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:13307044:13453847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027706 // RefSeq // Mus musculus neuroblastoma amplified sequence (Nbas), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000042953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:13269127:13583810:1 gene:ENSMUSG00000020576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// AK016918 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933425L03 product:RIKEN cDNA 4933425L03 gene, full insert sequence. // chr12 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// BC057020 // GenBank // Mus musculus neuroblastoma amplified sequence, mRNA (cDNA clone MGC:67140 IMAGE:6822193), complete cds. // chr12 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// AK077100 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933405E13 product:similar to NEUROBLASTOMA-AMPLIFIED PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1 /// GENSCAN00000056283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:13307044:13453847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0
NR_045003 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 16497 (Gm16497), long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000101814 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:14506587:14506693:1 gene:ENSMUSG00000075760 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT013461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000082452 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:14878495:14878598:1 gene:ENSMUSG00000064386 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT013464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000043696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:14924825:14930541:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000182234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:15728097:15729095:1 gene:ENSMUSG00000098158 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000043697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:15697452:15735282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0
NM_008747 // RefSeq // Mus musculus neurotensin receptor 2 (Ntsr2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:16653470:16660236:1 gene:ENSMUSG00000020591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB041826 // GenBank // Mus musculus Ntsr2 mRNA for low affinity neurotensin receptor, complete cds, strain:ICR. // chr12 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AB041827 // GenBank // Mus musculus Ntsr2 mRNA for low affinity neurotensin receptor, complete cds, strain:C57BL/6J. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK081073 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930080I12 product:NEUROTENSIN RECEPTOR TYPE 2, full insert sequence. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC141019 // GenBank // Mus musculus neurotensin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:175980 IMAGE:9055631), complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U51908 // GenBank // Mus musculus brain neurotensin receptor mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:16653500:16670040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_033270 // RefSeq // Mus musculus E2F transcription factor 6 (E2f6), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_027677 // RefSeq // Mus musculus E2F transcription factor 6 (E2f6), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006515149 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus E2F transcription factor 6 (E2f6), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000020908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:16810965:16826743:1 gene:ENSMUSG00000057469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB221552 // GenBank // Mus musculus cDNA pooled tissues:(tissue_type=brain,dev_stage=8-12 days neonate,strain=BALB/c),(tissue_type=testis,dev_stage=adult, strain=C57BL/6J), clone:V01X004A07. // chr12 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// AF032131 // GenBank // Mus musculus E2F-like transcriptional repressor protein mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC019166 // GenBank // Mus musculus E2F transcription factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:29087 IMAGE:4236246), complete cds. // chr12 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC037656 // GenBank // Mus musculus E2F transcription factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:46747 IMAGE:5358554), complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC057929 // GenBank // Mus musculus E2F transcription factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:68115 IMAGE:5289475), complete cds. // chr12 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// AK035116 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430090E10 product:E2F transcription factor 6, full insert sequence. // chr12 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000046883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:16811208:16873502:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_009072 // RefSeq // Mus musculus Rho-associated coiled-coil containing protein kinase 2 (Rock2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006515021 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho-associated coiled-coil containing protein kinase 2 (Rock2), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515022 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho-associated coiled-coil containing protein kinase 2 (Rock2), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000020904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:16894978:16988274:1 gene:ENSMUSG00000020580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK150181 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530142C09 product:Rho-associated coiled-coil forming kinase 2, full insert sequence. // chr12 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// DQ864977 // GenBank // Mus musculus ROCK2 splice variant (Rock2) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr12 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// U58513 // GenBank // Mus musculus Rho-associated, coiled-coil forming protein kinase p160 ROCK-2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000001273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:16895190:16982735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_027959 // RefSeq // Mus musculus protein disulfide isomerase associated 6 (Pdia6), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057288 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:17266545:17284770:1 gene:ENSMUSG00000020571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC006865 // GenBank // Mus musculus protein disulfide isomerase associated 6, mRNA (cDNA clone MGC:6472 IMAGE:2645183), complete cds. // chr12 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// ENSMUST00000162936 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:17266545:17281810:1 gene:ENSMUSG00000020571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// AK005989 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700015E05 product:protein disulfide-isomerase homolog P5 precursor (fragment) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr12 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000001288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:17233612:17284006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
NM_001008421 // RefSeq // Mus musculus nucleolar protein 10 (Nol10), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000046011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:17348458:17430094:1 gene:ENSMUSG00000061458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC086676 // GenBank // Mus musculus nucleolar protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:113734 IMAGE:30659737), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000001280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:17337067:17445172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 95 // 37 // 39 // 1
NM_013614 // RefSeq // Mus musculus ornithine decarboxylase, structural 1 (Odc1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000171737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:17544873:17551502:1 gene:ENSMUSG00000011179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC033264 // GenBank // Mus musculus ornithine decarboxylase, structural 1, mRNA (cDNA clone MGC:25367 IMAGE:2645291), complete cds. // chr12 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// BC059826 // GenBank // Mus musculus ornithine decarboxylase, structural 1, mRNA (cDNA clone MGC:69610 IMAGE:6808137), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC083122 // GenBank // Mus musculus ornithine decarboxylase, structural 1, mRNA (cDNA clone MGC:103389 IMAGE:6329274), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// EU684749 // GenBank // Mus musculus ornithine decarboxylase structural 1 (Odc1) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// M20617 // GenBank // Mus musculus ornithine decarboxylase mRNA, complete cds. // chr12 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000001284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:17545189:17557810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// M10624 // GenBank // Mouse ornithine decarboxylase mRNA, complete cds. // chr12 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0
ENSMUST00000082493 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:17546146:17546281:1 gene:ENSMUSG00000064427 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT013534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_016677 // RefSeq // Mus musculus hippocalcin-like 1 (Hpcal1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006515157 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hippocalcin-like 1 (Hpcal1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000071858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:17690814:17791926:1 gene:ENSMUSG00000071379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC001997 // GenBank // Mus musculus hippocalcin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:5754 IMAGE:3496729), complete cds. // chr12 // 78 // 100 // 18 // 23 // 0 /// AF085192 // GenBank // Mus musculus neural visinin-like protein 3 (NVP-3) mRNA, complete cds. // chr12 // 74 // 100 // 17 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:17786171:17791204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000169657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:17924294:17925668:1 gene:ENSMUSG00000067356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK046603 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430203G13 product:hypothetical Phenylalanine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_381317 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9222 (Gm9222), misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC031503 // GenBank HTC // Mus musculus hypothetical protein LOC236260, mRNA (cDNA clone IMAGE:3596953), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr12 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:17911935:17945963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT013547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
XR_381315 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4983 (Gm4983), transcript variant X1, misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC030401 // GenBank // Mus musculus predicted gene, EG245297, mRNA (cDNA clone MGC:40732 IMAGE:5362444), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006515293 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 69-like (LOC102632102), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000027800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:18136186:18217254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001033157 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5730507C01 gene (5730507C01Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_001201330 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5730507C01 gene (5730507C01Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000063216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:18514738:18534191:1 gene:ENSMUSG00000073197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000177778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:18514738:18534191:1 gene:ENSMUSG00000073197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// BC150925 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183836 IMAGE:9087836), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000173213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:22367480:22467006:-1 gene:ENSMUSG00000094697 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000180089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:23526491:23634765:-1 gene:ENSMUSG00000095564 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000101544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:22274385:22274802:-1 gene:ENSMUSG00000092597 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:23350197:23427173:-1 gene:ENSMUSG00000096701 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK020054 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030426L16 product:similar to KRUPPEL-RELATED ZINC FINGER PROTEIN F80-L [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// NONMMUT013633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:23340959:23426883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000042421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:19044693:19099219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XR_381331 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5784 (Gm5784), misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000179344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:19387809:19390286:1 gene:ENSMUSG00000093908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK032716 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720413P18 product:hypothetical Alanine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK149188 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120492D10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XR_381327 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 3110053B16 gene (3110053B16Rik), misc_RNA. // chr12 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// ENSMUST00000145605 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:20874125:20877071:-1 gene:ENSMUSG00000085642 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr12 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:20224293:20278028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:20874095:20878134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:19044693:19099219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0
ENSMUST00000101568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:20415938:20433699:1 gene:ENSMUSG00000073184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK020054 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030426L16 product:similar to KRUPPEL-RELATED ZINC FINGER PROTEIN F80-L [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 31 // 100 // 8 // 26 // 0 /// XM_006515309 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 844-like (LOC102631589), mRNA. // chr12 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000030826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:21776099:21784268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000051690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:20415938:20418441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_006515310 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102631909 (LOC102631909), mRNA. // chr12 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// XR_381328 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene, 17758 (Gm17758), misc_RNA. // chr12 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// XR_381331 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5784 (Gm5784), misc_RNA. // chr12 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// ENSMUST00000179344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:19387809:19390286:1 gene:ENSMUSG00000093908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// AK032716 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720413P18 product:hypothetical Alanine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr12 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// AK046228 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230354O11 product:hypothetical Retroviral GAG p10 protein/Retroviral matrix protein containing protein, full insert sequence. // chr12 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// NM_001256489 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9030624G23 gene (9030624G23Rik), mRNA. // chr12 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// BC024416 // GenBank // Mus musculus predicted gene, EG668525, mRNA (cDNA clone IMAGE:4988668). // chr12 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
AK046228 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230354O11 product:hypothetical Retroviral GAG p10 protein/Retroviral matrix protein containing protein, full insert sequence. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_018813 // RefSeq // Mus musculus cleavage and polyadenylation specificity factor 3 (Cpsf3), mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006515158 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cleavage and polyadenylation specificity factor 3 (Cpsf3), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000067284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:21286297:21315056:1 gene:ENSMUSG00000054309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AF203969 // GenBank // Mus musculus cleavage and polyadenylation specificity factor 73 kDa subunit mRNA, complete cds. // chr12 // 88 // 68 // 23 // 26 // 0 /// BC006748 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3708747. // chr12 // 93 // 71 // 25 // 27 // 0 /// BC023297 // GenBank // Mus musculus cleavage and polyadenylation specificity factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:25445 IMAGE:4192224), complete cds. // chr12 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// BC100569 // GenBank // Mus musculus cleavage and polyadenylation specificity factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:118660 IMAGE:30041540), complete cds. // chr12 // 96 // 68 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:21285610:21314749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000093657 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:21287927:21288059:1 gene:ENSMUSG00000070166 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001480563 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4425 (Gm4425), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:22115756:22156646:-1 gene:ENSMUSG00000093846 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK031311 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030405G12 product:similar to KRUPPEL-RELATED ZINC FINGER PROTEIN F80-L [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:23221227:23315358:-1 gene:ENSMUSG00000092465 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr12 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000020470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:23314561:23315069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:22155849:22183053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XR_381335 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9292 (Gm9292), misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK132630 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833436A07 product:similar to Visinin-like protein 3 (VILIP-3) (Neural visinin-like protein 3) (NVL-3) (NVP-3) (Hippocalcin-like protein 1) [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:23090775:23178774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000141777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:22959677:23010209:-1 gene:ENSMUSG00000073164 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000149246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:22953999:23010284:-1 gene:ENSMUSG00000073164 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC063063 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410018L13 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6837407). // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006515312 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus atherin-like (LOC102632483), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000171036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:22622962:22623087:-1 gene:ENSMUSG00000095261 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000171153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:23968510:23968845:-1 gene:ENSMUSG00000095329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000025067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:23968510:24016973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000048021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:22622752:22623087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENSMUST00000173213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:22367480:22467006:-1 gene:ENSMUSG00000094697 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000103789 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:4:25861239:25861348:-1 gene:ENSMUSG00000076977 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000103846 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:10:100144254:100144363:1 gene:ENSMUSG00000095539 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000103855 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:10:100139501:100139610:1 gene:ENSMUSG00000096586 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT007112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT007114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT046497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT063051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001161406 // RefSeq // Mus musculus grainyhead-like 1 (Drosophila) (Grhl1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_145890 // RefSeq // Mus musculus grainyhead-like 1 (Drosophila) (Grhl1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:24580749:24617391:1 gene:ENSMUSG00000020656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000085553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:24572287:24617387:1 gene:ENSMUSG00000020656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF411211 // GenBank // Mus musculus p61 MGR mRNA, complete cds. // chr12 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// AF411212 // GenBank // Mus musculus p70 MGR mRNA, complete cds. // chr12 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// BC013080 // GenBank // Mus musculus grainyhead-like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:7805 IMAGE:3499860), complete cds. // chr12 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// BC037233 // GenBank // Mus musculus grainyhead-like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:36546 IMAGE:4951512), complete cds. // chr12 // 90 // 94 // 27 // 30 // 0 /// AK167035 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0028G16 product:transcription factor CP2-like 2, full insert sequence. // chr12 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000025051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:24538399:24615932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
NM_178357 // RefSeq // Mus musculus Kruppel-like factor 11 (Klf11), mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000020982 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:24651371:24662774:1 gene:ENSMUSG00000020653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AJ459773 // GenBank // Mus musculus mRNA for TGFB-inducible early growth response protein 3 (Tieg3 gene). // chr12 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// BC060642 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like factor 11, mRNA (cDNA clone MGC:79174 IMAGE:6850350), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:24650863:24660463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_009104 // RefSeq // Mus musculus ribonucleotide reductase M2 (Rrm2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000020980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:24708241:24714146:1 gene:ENSMUSG00000020649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC085136 // GenBank // Mus musculus ribonucleotide reductase M2, mRNA (cDNA clone MGC:113712 IMAGE:6402725), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// M14223 // GenBank // Mouse ribonucleotide reductase M2 subunit mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000147789 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:24708556:24709589:1 gene:ENSMUSG00000020649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// ENSMUST00000153058 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:24708752:24711769:1 gene:ENSMUSG00000020649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// ENSMUST00000154588 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:24709029:24713341:1 gene:ENSMUSG00000020649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// GENSCAN00000025058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:24708347:24713232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000158578 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:24779018:24779146:1 gene:ENSMUSG00000089203 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001083341 // RefSeq // Mus musculus membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 (Mboat2), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_026037 // RefSeq // Mus musculus membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 (Mboat2), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006515167 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 (Mboat2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000078902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:24831599:24960301:1 gene:ENSMUSG00000020646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:24831599:24960301:1 gene:ENSMUSG00000020646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB297383 // GenBank // Mus musculus LPCAT4 mRNA for LPC acyltransferase 4, complete cds. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AB305046 // GenBank // Mus musculus Oact2 mRNA for lysophospholipid acyltransferase, complete cds. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC025020 // GenBank // Mus musculus membrane bound O-acyltransferase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:39000 IMAGE:5364068), complete cds. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC025429 // GenBank HTC // Mus musculus membrane bound O-acyltransferase domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5066557). // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:24831700:24959160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001081378 // RefSeq // Mus musculus kinase D-interacting substrate 220 (Kidins220), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006515259 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinase D-interacting substrate 220 (Kidins220), transcript variant X11, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000066652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:24974932:25059697:1 gene:ENSMUSG00000036333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK083260 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630031M24 product:KIDINS220 homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr12 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// BC157898 // GenBank // Mus musculus kinase D-interacting substrate 220, mRNA (cDNA clone MGC:189903 IMAGE:9088090), complete cds. // chr12 // 76 // 88 // 22 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:24982270:25057841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
XR_381188 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytidine monophosphate (UMP-CMP) kinase 2, mitochondrial (Cmpk2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr12 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// BC027329 // GenBank // Mus musculus cytidine monophosphate (UMP-CMP) kinase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:28140 IMAGE:3982036), complete cds. // chr12 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// L32973 // GenBank // Mouse thymidylate kinase homologue mRNA, complete cds. // chr12 // 79 // 78 // 22 // 28 // 0 /// NM_020557 // RefSeq // Mus musculus cytidine monophosphate (UMP-CMP) kinase 2, mitochondrial (Cmpk2), mRNA. // chr12 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// ENSMUST00000020969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:26469204:26479835:1 gene:ENSMUSG00000020638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// BC057565 // GenBank // Mus musculus cytidine monophosphate (UMP-CMP) kinase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:66848 IMAGE:6401867), complete cds. // chr12 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// GENSCAN00000034804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:26469352:26478129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0
NM_001286865 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease H1 (Rnaseh1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_011275 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease H1 (Rnaseh1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_104608 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease H1 (Rnaseh1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000020959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:28649602:28659591:1 gene:ENSMUSG00000020630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF048993 // GenBank // Mus musculus ribonuclease H1 (Rnh1) mRNA, complete cds. // chr12 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC019411 // GenBank // Mus musculus ribonuclease H1, mRNA (cDNA clone MGC:30220 IMAGE:5133942), complete cds. // chr12 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// AK088032 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430002J10 product:similar to RIBONUCLEASE H1 (EC 3.1.26.4) (RNASE H1) [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// GENSCAN00000018796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:28649689:28681085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_134052 // RefSeq // Mus musculus acireductone dioxygenase 1 (Adi1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000020957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:28675231:28682175:1 gene:ENSMUSG00000020629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000135772 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:28675484:28681730:1 gene:ENSMUSG00000020629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC005695 // GenBank // Mus musculus acireductone dioxygenase 1, mRNA (cDNA clone MGC:11855 IMAGE:3597652), complete cds. // chr12 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:28649689:28681085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_201357 // RefSeq // Mus musculus tumor suppressing subtransferable candidate 1 (Tssc1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006515122 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tumor suppressing subtransferable candidate 1 (Tssc1), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000035657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:28751828:28867491:1 gene:ENSMUSG00000036613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC031458 // GenBank // Mus musculus tumor suppressing subtransferable candidate 1, mRNA (cDNA clone MGC:25444 IMAGE:4191954), complete cds. // chr12 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:28791820:28870260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_181395 // RefSeq // Mus musculus peroxidasin homolog (Drosophila) (Pxdn), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006515206 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peroxidasin homolog (Drosophila) (Pxdn), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 46 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000122328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:29938036:30017658:1 gene:ENSMUSG00000020674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC044828 // GenBank // Mus musculus peroxidasin homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5008265). // chr12 // 94 // 35 // 16 // 17 // 0 /// BC150789 // GenBank // Mus musculus peroxidasin homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:183700 IMAGE:9087700), complete cds. // chr12 // 87 // 96 // 40 // 46 // 0 /// ENSMUST00000118321 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:29938050:29988994:1 gene:ENSMUSG00000020674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 38 // 38 // 18 // 48 // 1 /// ENSMUST00000155318 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:29938050:29989546:1 gene:ENSMUSG00000020674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 38 // 38 // 18 // 48 // 1 /// AK163597 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430118C22 product:hypothetical Leucine-rich repeat/Cysteine-rich flanking region, C-terminal/Immunoglobulin-like/Immunoglobulin C-2 type/Immunoglobulin subtype/Leucine-rich repeat, typical subtype/Leucine-rich repeat, SDS22+-like/Ig-like domain profile containing protein, full insert sequence. // chr12 // 38 // 38 // 18 // 48 // 1 /// GENSCAN00000008878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:29965026:30016161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0
NM_172049 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 18 (Tmem18), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000057151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:30584443:30591213:1 gene:ENSMUSG00000043061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024093 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 18, mRNA (cDNA clone MGC:37926 IMAGE:5116657), complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:30573824:30591477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001159743 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 150, member B (Fam150b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:30884322:30893854:1 gene:ENSMUSG00000054204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:30865581:30892098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_027828 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 110, member C (Fam110c), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000041133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:31073968:31079937:1 gene:ENSMUSG00000036136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK139763 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020015J05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC019466 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 110, member C, mRNA (cDNA clone MGC:27529 IMAGE:4458596), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085288 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 110, member C, mRNA (cDNA clone MGC:102358 IMAGE:5354365), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:31074041:31075306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0
NR_102715 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 6030469F06 gene (6030469F06Rik), long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT013826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:31146857:31199914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_008482 // RefSeq // Mus musculus laminin B1 (Lamb1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000002979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:31265293:31329644:1 gene:ENSMUSG00000002900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000164919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:31265400:31329575:1 gene:ENSMUSG00000002900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000169088 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:31265234:31329493:1 gene:ENSMUSG00000002900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC121790 // GenBank // Mus musculus laminin B1 subunit 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40099173), complete cds. // chr12 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// BC150809 // GenBank // Mus musculus laminin B1 subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:183720 IMAGE:9087720), complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// M15525 // GenBank // Mouse laminin B1 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000020694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:31275426:31329493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000163721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:31418848:31420068:1 gene:ENSMUSG00000091040 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
AK133037 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930558G23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00001394 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163126 // RefSeq // Mus musculus component of oligomeric golgi complex 5 (Cog5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006515083 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus component of oligomeric golgi complex 5 (Cog5), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// XM_006515084 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus component of oligomeric golgi complex 5 (Cog5), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000036862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:31654869:31937630:1 gene:ENSMUSG00000035933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000042443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:31772260:31919789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 55 // 55 // 24 // 44 // 1 /// GENSCAN00000020720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:31654890:31706635:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
ENSMUST00000157617 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:31858458:31858592:1 gene:ENSMUSG00000088242 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001162903 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 71 like (Ccdc71l), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000172332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:32378704:32382943:1 gene:ENSMUSG00000090946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK008367 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010109K11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// BC028641 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010109K11 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:1349214). // chr12 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0 /// BC037374 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 2010109K11 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:1548671), with apparent retained intron. // chr12 // 100 // 45 // 19 // 19 // 0 /// BC049684 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 2010109K11 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6704018), with apparent retained intron. // chr12 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000042442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:32711660:32724282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 90 // 53 // 9 // 10 // 0
NM_021524 // RefSeq // Mus musculus nicotinamide phosphoribosyltransferase (Nampt), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000020886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:32820335:32853369:1 gene:ENSMUSG00000020572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF234625 // GenBank // Mus musculus pre-B-cell colony-enhancing factor mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY679720 // GenBank // Mus musculus nicotinamide phosphoribosyltransferase (Nampt) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC004059 // GenBank // Mus musculus nicotinamide phosphoribosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:8170 IMAGE:3590087), complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC018358 // GenBank // Mus musculus nicotinamide phosphoribosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:19365 IMAGE:2609271), complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:32820570:32850533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0
ENSMUST00000180613 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:12:32821872:32826904:1 gene:ENSMUSG00000096954 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052902 // GenBank // Mus musculus ganglioside-induced differentiation-associated-protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:60602 IMAGE:30067675), complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// Y17860 // GenBank // Mus musculus mRNA for ganglioside-induced differentiation associated protein 10. // chr12 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// NONMMUT013861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013635 // RefSeq // Mus musculus synaptophysin-like protein (Sypl), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NM_198710 // RefSeq // Mus musculus synaptophysin-like protein (Sypl), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XR_381179 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptophysin-like protein (Sypl), transcript variant X1, misc_RNA. // chr12 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000020885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:32954184:32976904:1 gene:ENSMUSG00000020570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000076698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:32953891:32979050:1 gene:ENSMUSG00000020570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000122861 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:32954247:32974152:1 gene:ENSMUSG00000020570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// BC060971 // GenBank // Mus musculus synaptophysin-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:74062 IMAGE:6770686), complete cds. // chr12 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000131562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:32965326:32970342:1 gene:ENSMUSG00000020570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000035932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:32953986:32971209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0
NM_029152 // RefSeq // Mus musculus EF-hand calcium binding domain 10 (Efcab10), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:33394854:33401269:1 gene:ENSMUSG00000020562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099564 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30916809. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:33395090:33438080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_172253 // RefSeq // Mus musculus TWIST neighbor (Twistnb), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000020877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:33429624:33439380:1 gene:ENSMUSG00000020561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC139162 // GenBank // Mus musculus TWIST neighbor, mRNA (cDNA clone MGC:170789 IMAGE:8862184), complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// BC139163 // GenBank // Mus musculus TWIST neighbor, mRNA (cDNA clone MGC:170790 IMAGE:8862185), complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:33395090:33438080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
NM_033522 // RefSeq // Mus musculus Fer3-like (Drosophila) (Ferd3l), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:33928425:33929310:1 gene:ENSMUSG00000046518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF517121 // GenBank // Mus musculus N-TWIST basic helix-loop-helix protein (Ntwist) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC111576 // GenBank // Mus musculus Fer3-like (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:130442 IMAGE:40039965), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:33928490:33928996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_011658 // RefSeq // Mus musculus twist basic helix-loop-helix transcription factor 1 (Twist1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:33957671:33959817:1 gene:ENSMUSG00000035799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC033434 // GenBank // Mus musculus twist homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:36030 IMAGE:4935230), complete cds. // chr12 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// BC083139 // GenBank // Mus musculus twist homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:103391 IMAGE:6516673), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M63650 // GenBank // Mouse M-twist gene mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:33957978:33958598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_029294 // RefSeq // Mus musculus phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1-like 1 (Prps1l1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:34984761:34986436:1 gene:ENSMUSG00000092305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC109355 // GenBank // Mus musculus phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:130375 IMAGE:40057311), complete cds. // chr12 // 57 // 92 // 13 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:34984888:34985844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001014973 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 13 (Snx13), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:35047189:35147469:1 gene:ENSMUSG00000020590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:35047200:35134683:1 gene:ENSMUSG00000020590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC056394 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 13, mRNA (cDNA clone MGC:73414 IMAGE:6852346), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC067201 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 13, mRNA (cDNA clone MGC:69895 IMAGE:6825168), complete cds. // chr12 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:35085924:35192445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_207531 // RefSeq // Mus musculus anterior gradient 3 (Agr3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515142 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anterior gradient 3 (Agr3), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006515143 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anterior gradient 3 (Agr3), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000042101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:35925620:35949736:1 gene:ENSMUSG00000036231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC023499 // GenBank // Mus musculus anterior gradient homolog 3 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:32220 IMAGE:5008294), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:35894511:36017672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_011783 // RefSeq // Mus musculus anterior gradient 2 (Agr2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020898 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:35992907:36004087:1 gene:ENSMUSG00000020581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB016592 // GenBank // Mus musculus gob-4 mRNA, complete cds. // chr12 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// AF044262 // GenBank // Mus musculus secreted cement gland protein XAG-2 homolog (mAG-2) mRNA, complete cds. // chr12 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// AK008296 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010100J11 product:GOB-4 PROTEIN (ANTERIOR GRADIENT 2) (XENEPUS LAEVIS) (XENOPUS LAEVIS) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 79 // 86 // 19 // 24 // 0 /// BC013334 // GenBank // Mus musculus anterior gradient 2 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:13791 IMAGE:4218549), complete cds. // chr12 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// ENSMUST00000147861 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:35992907:35998003:1 gene:ENSMUSG00000020581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:35894511:36017672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NR_003649 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5434 (Gm5434), non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000071825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:36090379:36091829:1 gene:ENSMUSG00000059301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000016825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:36068232:36091039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
BC012275 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and MYND domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:18754 IMAGE:4010781), complete cds. // chr12 // 97 // 73 // 31 // 32 // 0 /// NM_146033 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and MYND domain containing 2 (Ankmy2), mRNA. // chr12 // 91 // 91 // 40 // 44 // 1 /// ENSMUST00000041640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:36157124:36197291:1 gene:ENSMUSG00000036188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 91 // 91 // 40 // 44 // 1 /// BC024959 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and MYND domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:36949 IMAGE:4946879), complete cds. // chr12 // 84 // 84 // 37 // 44 // 1 /// XM_006515066 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and MYND domain containing 2 (Ankmy2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 73 // 73 // 32 // 44 // 1 /// AK037644 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130032P05 product:WUGSC:H_GS166A23.1 PROTEIN (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 64 // 64 // 28 // 44 // 1 /// GENSCAN00000016822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:36174318:36196401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// GENSCAN00000016827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:36157357:36173348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_025312 // RefSeq // Mus musculus sclerostin domain containing 1 (Sostdc1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000041407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:36314169:36318452:1 gene:ENSMUSG00000036169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB059271 // GenBank // Mus musculus mRNA for ectodin, complete cds. // chr12 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AY134666 // GenBank // Mus musculus sclerostin-like protein mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AY255635 // GenBank // Mus musculus uterine sensitization-associated protein-1 (Usag1) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC021458 // GenBank // Mus musculus sclerostin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:29422 IMAGE:5064413), complete cds. // chr12 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000016821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:36314294:36317447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT013960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 83 // 64 // 15 // 18 // 0
NM_008584 // RefSeq // Mus musculus mesenchyme homeobox 2 (Meox2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:37108540:37179534:1 gene:ENSMUSG00000036144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC002076 // GenBank // Mus musculus mesenchyme homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:6225 IMAGE:3591924), complete cds. // chr12 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001163154 // RefSeq // Mus musculus ets variant 1 (Etv1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// NM_007960 // RefSeq // Mus musculus ets variant 1 (Etv1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006514967 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ets variant gene 1 (Etv1), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000095767 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:38780082:38868215:1 gene:ENSMUSG00000004151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000159334 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:12:38783509:38868203:1 gene:ENSMUSG00000004151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
ENSMUST00000038121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:12:40222758:40225238:1 gene:ENSMUSG00000035983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000171356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:40223429:40229169:1 gene:ENSMUSG00000035983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AK016351 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930584M23 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:40222181:40249323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_053122 // RefSeq // Mus musculus IMP2 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae) (Immp2l), mRNA. // chrUn // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000080160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:41068312:41110943:1 gene:ENSMUSG00000056899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000132121 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:41024090:41955588:1 gene:ENSMUSG00000056899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000134965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:41024329:41955242:1 gene:ENSMUSG00000056899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:41024127:41110957:1 gene:ENSMUSG00000056899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chrUn // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// AF359564 // GenBank // Mus musculus inner mitochondrial membrane peptidase 2 mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chrUn // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK161351 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930440D02 product:inner mitochondrial membrane peptidase 2-like (S. cerevisiae), full insert sequence. // chrUn // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// BC100557 // GenBank // Mus musculus IMP2 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:118611 IMAGE:5057188), complete cds. // chrUn // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT014041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrUn // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000045540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:41060470:41123341:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
GENSCAN00000040262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:42013631:42115175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000083070 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:43743037:43743165:1 gene:ENSMUSG00000065004 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT014069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_045113 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 2027 (Gm2027), non-coding RNA. // chr12 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:44221743:44223377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
NM_026164 // RefSeq // Mus musculus patatin-like phospholipase domain containing 8 (Pnpla8), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000043082 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:44269186:44312244:1 gene:ENSMUSG00000036257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122902 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:44221370:44312092:1 gene:ENSMUSG00000036257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000143771 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:44282573:44312343:1 gene:ENSMUSG00000036257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AB044139 // GenBank // Mus musculus mRNA for iPLA2-2, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AK084928 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430013N16 product:SIMILAR TO INTRACELLULAR MEMBRANE-ASSOCIATED CALCIUM-INDEPENDENT PHOSPHOLIPASE A2 GAMMA homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC019364 // GenBank // Mus musculus patatin-like phospholipase domain containing 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:4010629), complete cds. // chr12 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0 /// BC127056 // GenBank // Mus musculus patatin-like phospholipase domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:150064 IMAGE:40109753), complete cds. // chr12 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:44282784:44335463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_001146031 // RefSeq // Mus musculus neuron-glia-CAM-related cell adhesion molecule (Nrcam), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 94 // 86 // 30 // 32 // 0 /// NM_176930 // RefSeq // Mus musculus neuron-glia-CAM-related cell adhesion molecule (Nrcam), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// XM_006515944 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuron-glia-CAM-related cell adhesion molecule (Nrcam), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006515960 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuron-glia-CAM-related cell adhesion molecule (Nrcam), transcript variant X17, mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000020939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:44328885:44601846:1 gene:ENSMUSG00000020598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000110748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:44328885:44601846:1 gene:ENSMUSG00000020598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 86 // 30 // 32 // 0 /// AK087693 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330007H08 product:R NR-CAM 12 PROTEIN homolog [Rattus sp], full insert sequence. // chr12 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// AK048567 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130076O07 product:hypothetical Immunoglobulin-like/Immunoglobulin C-2 type/Immunoglobulin subtype/Ig-like domain profile containing protein, full insert sequence. // chr12 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// GENSCAN00000031758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:44532569:44598587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000173293 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:45437181:45441698:1 gene:ENSMUSG00000092404 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK082156 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230015M18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT014091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000082866 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:45984343:45984549:1 gene:ENSMUSG00000064800 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001160112 // RefSeq // Mus musculus forkhead box G1 (Foxg1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NM_008241 // RefSeq // Mus musculus forkhead box G1 (Foxg1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:49383007:49386856:1 gene:ENSMUSG00000020950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000110746 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:49385174:49394127:1 gene:ENSMUSG00000089922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000156952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:49382883:49386854:1 gene:ENSMUSG00000020950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000179669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:49382883:49386867:1 gene:ENSMUSG00000020950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC046958 // GenBank // Mus musculus forkhead box G1, mRNA (cDNA clone MGC:54714 IMAGE:6314329), complete cds. // chr12 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// U36760 // GenBank // Mus musculus brain factor-1 (Hfhbf1) mRNA, class 2, complete cds. // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AK042354 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630084I08 product:forkhead box G1, full insert sequence. // chr12 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:49325188:49407016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
ENSMUST00000056234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:49401277:49401837:1 gene:ENSMUSG00000045946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK079718 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430027J21 product:hypothetical Arginine-rich region/RNA 3-terminal phosphate cyclase containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK139962 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020047L16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:50626330:50628482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000158341 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:51085687:51085803:1 gene:ENSMUSG00000088966 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT014135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000062226 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:51297487:51297960:1 gene:ENSMUSG00000046620 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000026728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:51297487:51297963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001015099 // RefSeq // Mus musculus G2/M-phase specific E3 ubiquitin ligase (G2e3), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001167963 // RefSeq // Mus musculus G2/M-phase specific E3 ubiquitin ligase (G2e3), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001167964 // RefSeq // Mus musculus G2/M-phase specific E3 ubiquitin ligase (G2e3), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054308 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:51348061:51376986:1 gene:ENSMUSG00000035293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000119211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:51348288:51373267:1 gene:ENSMUSG00000035293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000121521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:51348372:51373370:1 gene:ENSMUSG00000035293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144767 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:51357149:51363533:1 gene:ENSMUSG00000035293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC086455 // GenBank // Mus musculus G2/M-phase specific E3 ubiquitin ligase, mRNA (cDNA clone MGC:91104 IMAGE:30458160), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:51326805:51401649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_029825 // RefSeq // Mus musculus Sec1 family domain containing 1 (Scfd1), mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000021335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:51377580:51450096:1 gene:ENSMUSG00000020952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK129238 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0917 protein. // chr12 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0 /// BC027793 // GenBank // Mus musculus Sec1 family domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:38021 IMAGE:5151118), complete cds. // chr12 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006516368 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Sec1 family domain containing 1 (Scfd1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// AK041028 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530064C17 product:RSLY1P homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr12 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:51412452:51475973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001198835 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor C homolog (Limulus polyphemus) (Coch), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_007728 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor C homolog (Limulus polyphemus) (Coch), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000085412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:51593341:51605773:1 gene:ENSMUSG00000020953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000164782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:51593341:51605773:1 gene:ENSMUSG00000020953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF006741 // GenBank // Mus musculus Coch-5B2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC045137 // GenBank // Mus musculus coagulation factor C homolog (Limulus polyphemus), mRNA (cDNA clone MGC:54694 IMAGE:6306601), complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:51593328:51605032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_021710 // RefSeq // Mus musculus adaptor-related protein complex AP-4, sigma 1 (Ap4s1), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006515437 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adaptor-related protein complex AP-4, sigma 1 (Ap4s1), transcript variant X6, mRNA. // chr12 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000021338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:51690966:51738939:1 gene:ENSMUSG00000020955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF092093 // GenBank // Mus musculus AP-4 adaptor complex sigma4 subunit mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC001985 // GenBank // Mus musculus adaptor-related protein complex AP-4, sigma 1, mRNA (cDNA clone MGC:5660 IMAGE:3495981), complete cds. // chr12 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC053339 // GenBank // Mus musculus adaptor-related protein complex AP-4, sigma 1, mRNA (cDNA clone MGC:59060 IMAGE:5370721), complete cds. // chr12 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515433 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adaptor-related protein complex AP-4, sigma 1 (Ap4s1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// GENSCAN00000041582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:51690901:51728569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
XM_974939 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5785 (Gm5785), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK033420 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030018K07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// KnowTID_00001416 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00001417 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr12 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONMMUT014158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSMUST00000159708 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:52097756:52144780:1 gene:ENSMUSG00000035142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// AK083643 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030058M09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// NM_029760 // RefSeq // Mus musculus nucleotide binding protein-like (Nubpl), mRNA. // chr12 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// ENSMUST00000040090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:52097737:52312744:1 gene:ENSMUSG00000035142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// BC062175 // GenBank // Mus musculus nucleotide binding protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:70119 IMAGE:30291107), complete cds. // chr12 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_009706 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 5 (Arhgap5), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000110725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:52516077:52567852:1 gene:ENSMUSG00000035133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC150823 // GenBank // Mus musculus Rho GTPase activating protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:183734 IMAGE:9087734), complete cds. // chr12 // 92 // 78 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:52516251:52594151:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
NM_198111 // RefSeq // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 6 (Akap6), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000095737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:52699383:53151015:1 gene:ENSMUSG00000061603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC057114 // GenBank // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:73457 IMAGE:6405025), complete cds. // chr12 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// DQ233645 // GenBank // Mus musculus A-kinase anchoring protein alpha (Akapalpha) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// DQ233646 // GenBank // Mus musculus A-kinase anchoring protein beta (Akapbeta) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_013780 // RefSeq // Mus musculus neuronal PAS domain protein 3 (Npas3), mRNA. // chr12 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// XM_006515941 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuronal PAS domain protein 3 (Npas3), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000101432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:53248677:54072175:1 gene:ENSMUSG00000021010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// AF173871 // GenBank // Mus musculus neuronal PAS3 (Npas3) mRNA, complete cds. // chr12 // 95 // 97 // 35 // 37 // 0 /// GENSCAN00000036828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:54043477:54069074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 39 // 15 // 15 // 0
NM_013780 // RefSeq // Mus musculus neuronal PAS domain protein 3 (Npas3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515941 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuronal PAS domain protein 3 (Npas3), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:53248677:54072175:1 gene:ENSMUSG00000021010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006516277 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 177, member A (Fam177a), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 94 // 37 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000177768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:55124528:55142078:1 gene:ENSMUSG00000095595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000177978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:55199533:55214076:1 gene:ENSMUSG00000094103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// BC048158 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700047I17 gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:61221 IMAGE:5698044), complete cds. // chr12 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// BC049669 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700047I17 gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:58495 IMAGE:6535412), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000011432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:55124642:55138979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000011433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:55199706:55214043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 40 // 40 // 0
ENSMUST00000177768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:55124528:55142078:1 gene:ENSMUSG00000095595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:55199533:55214076:1 gene:ENSMUSG00000094103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048158 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700047I17 gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:61221 IMAGE:5698044), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049669 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700047I17 gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:58495 IMAGE:6535412), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:55124642:55138979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:55199706:55214043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011968 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 6 (Psma6), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006515884 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 6 (Psma6), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021412 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:55398775:55418454:1 gene:ENSMUSG00000021024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000162711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:55398795:55418441:1 gene:ENSMUSG00000021024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000162972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:55407383:55412287:1 gene:ENSMUSG00000021024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 93 // 47 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000163070 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:55384222:55418310:1 gene:ENSMUSG00000021024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// AF060087 // GenBank // Mus musculus proteasome subunit iota (Psma6) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC086685 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 6, mRNA (cDNA clone MGC:113817 IMAGE:30681804), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U60288 // GenBank // Mus musculus proteasome subunit iota mRNA, complete cds. // chr12 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:55398916:55438669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_001277340 // RefSeq // Mus musculus aldolase 1 A, retrogene 2 (Aldoart2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000080123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:55565239:55566896:1 gene:ENSMUSG00000063129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// EF662062 // GenBank // Mus musculus aldolase A retroprotein 2 (Aldoart2) mRNA, complete cds. // chr12 // 90 // 42 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000011425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:55523472:55566386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_020287 // RefSeq // Mus musculus insulinoma-associated 2 (Insm2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:55598917:55602018:1 gene:ENSMUSG00000045440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:55599473:55600954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000061934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:55820611:55821580:1 gene:ENSMUSG00000046747 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK015025 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930400K19 product:hypothetical Arginine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT014276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037756 // RefSeq // Mus musculus breast cancer metastasis-suppressor 1-like (Brms1l), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_381529 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus breast cancer metastasis-suppressor 1-like (Brms1l), transcript variant X1, misc_RNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:55836366:55869735:1 gene:ENSMUSG00000012076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC034885 // GenBank // Mus musculus breast cancer metastasis-suppressor 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:41369 IMAGE:1362264), complete cds. // chr12 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000015415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:55830084:55906799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_011041 // RefSeq // Mus musculus paired box 9 (Pax9), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000001538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:56695639:56712822:1 gene:ENSMUSG00000001497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000153250 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:56691767:56712707:1 gene:ENSMUSG00000001497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC005794 // GenBank // Mus musculus paired box gene 9, mRNA (cDNA clone MGC:11500 IMAGE:3707718), complete cds. // chr12 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// ENSMUST00000152848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:56695729:56710346:1 gene:ENSMUSG00000001497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// BC006930 // GenBank HTC // Mus musculus paired box gene 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:3599040), with apparent retained intron. // chr12 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000044547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:56694842:56709907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000101398 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:57564113:57622112:1 gene:ENSMUSG00000046782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172939 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:57575817:57737928:1 gene:ENSMUSG00000046782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC100489 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921506M07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118322 IMAGE:30915676), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:57587728:57628196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_006542982 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat protein 6-like (LOC102642336), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006542983 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat protein 6-like (LOC102642336), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000172939 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:57575817:57737928:1 gene:ENSMUSG00000046782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:57656376:57737720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_009216 // RefSeq // Mus musculus somatostatin receptor 1 (Sstr1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:58211804:58214444:1 gene:ENSMUSG00000035431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110671 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:58211772:58213887:1 gene:ENSMUSG00000035431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:58083739:58213768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_025656 // RefSeq // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 2 (Gemin2), mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:59013393:59028470:1 gene:ENSMUSG00000060121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000182188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:59013454:59028399:1 gene:ENSMUSG00000060121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC053424 // GenBank // Mus musculus survival of motor neuron protein interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:59266 IMAGE:6336522), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT014353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:59013477:59072813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
ENSMUST00000083298 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:59040335:59040525:1 gene:ENSMUSG00000065232 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008891 // RefSeq // Mus musculus pinin (Pnn), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000021381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:59066919:59074017:1 gene:ENSMUSG00000020994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC132571 // GenBank // Mus musculus pinin, mRNA (cDNA clone MGC:164202 IMAGE:40130848), complete cds. // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC138014 // GenBank // Mus musculus pinin, mRNA (cDNA clone MGC:169638 IMAGE:8861033), complete cds. // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AK051640 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130061H24 product:pinin, full insert sequence. // chr12 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// AK085295 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630007J20 product:pinin, full insert sequence. // chr12 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// GENSCAN00000027260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:59013477:59072813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_177321 // RefSeq // Mus musculus melanoma inhibitory activity 2 (Mia2), mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:59095799:59109130:1 gene:ENSMUSG00000035349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AF390177 // GenBank // Mus musculus melanoma inhibitory activity protein 2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:59095800:59169084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000182374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:59291964:59292938:1 gene:ENSMUSG00000098229 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:59292064:59292938:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0
GENSCAN00000037086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:60526900:60527430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_178714 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 (Lrfn5), mRNA. // chr12 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:61523948:61845258:1 gene:ENSMUSG00000035653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:61523948:61857928:1 gene:ENSMUSG00000035653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AK220546 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4208 protein. // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC052038 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:62399 IMAGE:5708346), complete cds. // chr12 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000138980 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:61523167:61671824:1 gene:ENSMUSG00000035653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// AK162923 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330045O18 product:leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5, full insert sequence. // chr12 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000039636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:61839428:61851128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT014376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENSMUST00000083024 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:63609868:63609974:1 gene:ENSMUSG00000064958 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000058135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:64917911:64924591:1 gene:ENSMUSG00000047227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099503 // GenBank // Mus musculus gene model 527, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:117765 IMAGE:30940052), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:64918096:64924343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_177805 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 179, member B (Fam179b), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000066296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:64965742:65022573:1 gene:ENSMUSG00000035614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// AK141238 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330034B11 product:Hypothetical ARM repeat structure containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 31 // 14 // 14 // 0 /// BC062107 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 179, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:6810953), complete cds. // chr12 // 95 // 47 // 20 // 21 // 0 /// BC157958 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 179, member B, mRNA (cDNA clone MGC:189944 IMAGE:9088131), complete cds. // chr12 // 93 // 93 // 39 // 42 // 0 /// BC158008 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 179, member B, mRNA (cDNA clone MGC:189816 IMAGE:9007316), complete cds. // chr12 // 95 // 93 // 40 // 42 // 0 /// BC172117 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 179, member B, mRNA (cDNA clone MGC:198822 IMAGE:9054403), complete cds. // chr12 // 95 // 93 // 40 // 42 // 0 /// GENSCAN00000016773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:64965977:65021705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 33 // 33 // 0
NM_178912 // RefSeq // Mus musculus Fanconi anemia, complementation group M (Fancm), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000058889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:65075606:65132058:1 gene:ENSMUSG00000055884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AK086395 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930025L16 product:hypothetical DEAD/DEAH box helicase containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 29 // 14 // 14 // 0 /// BC150785 // GenBank // Mus musculus Fanconi anemia, complementation group M, mRNA (cDNA clone MGC:183696 IMAGE:9087696), complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// AK053715 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130301K02 product:hypothetical DEAD/DEAH box helicase containing protein, full insert sequence. // chr12 // 46 // 46 // 22 // 48 // 1 /// GENSCAN00000016781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:65075706:65130449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0
NM_027614 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 20, retrogene (Wdr20rt), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XR_381544 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 20, retrogene (Wdr20rt), transcript variant X1, misc_RNA. // chr12 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000046331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:65225517:65228454:1 gene:ENSMUSG00000035560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC050778 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 20b, mRNA (cDNA clone MGC:58455 IMAGE:6743775), complete cds. // chr12 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// AK015210 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930427E19 product:similar to DMR PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
ENSMUST00000122499 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:67612296:67612481:1 gene:ENSMUSG00000084448 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172054 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin domain containing 9 (Txndc9), mRNA. // chr12 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// XM_006496357 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thioredoxin domain containing 9 (Txndc9), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// XM_006496358 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thioredoxin domain containing 9 (Txndc9), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000162031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:37983867:37997208:-1 gene:ENSMUSG00000058407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// AK006170 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700020L03 product:palate, lung, and nasal epithelium expressed transcript, full insert sequence. // chr12 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// AK016756 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933409J10 product:palate, lung, and nasal epithelium expressed transcript, full insert sequence. // chr12 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC022947 // GenBank // Mus musculus thioredoxin domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:6700 IMAGE:3584012), complete cds. // chr12 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// BC083077 // GenBank // Mus musculus thioredoxin domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:103032 IMAGE:6466275), complete cds. // chr12 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:37987662:37995821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69110278:69123780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NR_052007 // RefSeq // Mus musculus 7S RNA 1 (Rn7s1), small cytoplasmic RNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NR_052008 // RefSeq // Mus musculus 7S RNA 2 (Rn7s2), small cytoplasmic RNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000175005 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:69516339:69516629:1 gene:ENSMUSG00000092746 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr12 // 67 // 75 // 4 // 6 // 0 /// ENSMUST00000174924 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:69159295:69159594:1 gene:ENSMUSG00000099021 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000175032 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:69361182:69361481:-1 gene:ENSMUSG00000099250 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT014453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT014466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT014454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 67 // 75 // 4 // 6 // 0 /// NONMMUT057333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 67 // 75 // 4 // 6 // 0
NM_001081406 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat protein 1 (Lrr1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69168814:69179010:1 gene:ENSMUSG00000034883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117053 // GenBank // Mus musculus peptidylprolyl isomerase (cyclophilin) like 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:40126372), complete cds. // chr12 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// BC117055 // GenBank // Mus musculus peptidylprolyl isomerase (cyclophilin) like 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:40126374), complete cds. // chr12 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69169033:69175117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_146035 // RefSeq // Mus musculus mannoside acetylglucosaminyltransferase 2 (Mgat2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060579 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:69184157:69186770:1 gene:ENSMUSG00000043998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010583 // GenBank // Mus musculus mannoside acetylglucosaminyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:19451 IMAGE:3500709), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027169 // GenBank // Mus musculus mannoside acetylglucosaminyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:37173 IMAGE:4954047), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69183826:69185982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NR_033222 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9330151L19 gene (9330151L19Rik), long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000181850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69197211:69199868:1 gene:ENSMUSG00000097061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK034052 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330151L19 product:hypothetical Myc-type, helix-loop-helix dimerization domain containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT014456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// NONMMUT014455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT014458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_178253 // RefSeq // Mus musculus kelch domain containing 1 (Klhdc1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515928 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch domain containing 1 (Klhdc1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000063445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:69241832:69284632:1 gene:ENSMUSG00000051890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000173419 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:69241918:69283319:1 gene:ENSMUSG00000051890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AY238938 // GenBank // Mus musculus kelch domain-containing protein 1 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC119567 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:141300 IMAGE:40057793), complete cds. // chr12 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC119568 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:141301 IMAGE:40057794), complete cds. // chr12 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69250424:69283319:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
NM_027117 // RefSeq // Mus musculus kelch domain containing 2 (Klhdc2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:69296722:69310687:1 gene:ENSMUSG00000020978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000138585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:69296755:69308666:1 gene:ENSMUSG00000020978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK051418 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130047L08 product:HOST CELL FACTOR HOMOLOG LCP (CDNA FLJ10909 FIS, CLONE OVARC1000091, WEAKLY SIMILAR TO HOST CELL FACTOR C1) (HEPATOCELLULAR CARCINOMA-ASSOCIATED ANTIGEN 33) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AY513272 // GenBank // Mus musculus endothelial differentiation inhibitory protein TNG mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC005581 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:11736 IMAGE:3968615), complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000154667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:69302401:69308694:1 gene:ENSMUSG00000020978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// AK164223 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030017F08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000052273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69296995:69310276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT014465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_007481 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor 6 (Arf6), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69372150:69375979:1 gene:ENSMUSG00000044147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003478 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:5936 IMAGE:2655889), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083112 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:102530 IMAGE:5354797), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D87903 // GenBank // Mus musculus mRNA for ARF6, complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NONMMUT002567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_026536 // RefSeq // Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit S (Atp5s), mRNA. // chr12 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// XM_006516182 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit S (Atp5s), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000021372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69724962:69744658:1 gene:ENSMUSG00000054894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AK009141 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310004I07 product:similar to MITOCHONDRIAL ATP SYNTHASE REGULATORY COMPONENT FACTOR B [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 100 // 50 // 19 // 19 // 0 /// BC027442 // GenBank // Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit s, mRNA (cDNA clone MGC:35642 IMAGE:4015414), complete cds. // chr12 // 78 // 61 // 18 // 23 // 0 /// XM_006516180 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit S (Atp5s), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1 /// XM_006516181 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit S (Atp5s), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// GENSCAN00000056389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69724411:69743833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
ENSMUST00000021378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69790288:69794511:1 gene:ENSMUSG00000020992 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015769 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930512B01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK029702 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930484B16 product:RIKEN cDNA 4930512B01 gene, full insert sequence. // chr12 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONMMUT014495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_178628 // RefSeq // Mus musculus atlastin GTPase 1 (Atl1), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69893105:69964085:1 gene:ENSMUSG00000021066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK015327 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930435M24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// BC050784 // GenBank // Mus musculus atlastin GTPase 1, mRNA (cDNA clone MGC:58537 IMAGE:6595181), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC057068 // GenBank // Mus musculus atlastin GTPase 1, mRNA (cDNA clone MGC:67412 IMAGE:5689726), complete cds. // chr12 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AK083918 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130060H04 product:spastic paraplegia 3A homolog (human), full insert sequence. // chr12 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000056382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69925779:69963338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000083393 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:69930904:69931213:1 gene:ENSMUSG00000065327 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr12 // 74 // 100 // 17 // 23 // 0 /// NONMMUT014505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr12 // 74 // 100 // 17 // 23 // 0
NR_036607 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 3086 (Gm3086), non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69963473:69969721:1 gene:ENSMUSG00000079076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC027570 // GenBank // Mus musculus atlastin GTPase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:1362466), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AK044210 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930001H09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001195033 // RefSeq // Mus musculus abhydrolase domain containing 12B (Abhd12b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000162570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:70154142:70183347:1 gene:ENSMUSG00000090121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000169156 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:70154157:70183887:1 gene:ENSMUSG00000090121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000182512 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:70154157:70183887:1 gene:ENSMUSG00000090121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000182927 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:70154157:70183887:1 gene:ENSMUSG00000090121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AK136846 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330128C21 product:similar to C14ORF29 variant 2 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000182782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:70154157:70183887:1 gene:ENSMUSG00000090121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// GENSCAN00000056365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:70169027:70183078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0
NM_028339 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin-related transmembrane protein 1 (Tmx1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000021471 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:70453095:70468040:1 gene:ENSMUSG00000021072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000162277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:70456038:70466253:1 gene:ENSMUSG00000021072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// BC017603 // GenBank // Mus musculus thioredoxin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:27603 IMAGE:4503129), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC021533 // GenBank // Mus musculus thioredoxin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:38565 IMAGE:5354337), complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000160865 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:70459841:70460576:1 gene:ENSMUSG00000021072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000056374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:70453169:70466156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 87 // 47 // 13 // 15 // 0 /// NONMMUT014528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_028127 // RefSeq // Mus musculus FERM domain containing 6 (Frmd6), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006515978 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FERM domain containing 6 (Frmd6), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000057859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:70825514:70902232:1 gene:ENSMUSG00000048285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC053929 // GenBank // Mus musculus FERM domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:56950 IMAGE:6389695), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
AK132884 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930483M16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:70906833:70914270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// KnowTID_00001436 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019785 // RefSeq // Mus musculus ARP10 actin-related protein 10 (Actr10), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000021479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:70937857:70964718:1 gene:ENSMUSG00000021076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF190797 // GenBank // Mus musculus actin-related protein 11 (Arp11) mRNA, complete cds. // chr12 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// BC002227 // GenBank // Mus musculus ARP10 actin-related protein 10 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:7494 IMAGE:3491299), complete cds. // chr12 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:70949683:70962048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_029227 // RefSeq // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast)-like (Tomm20l), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000021482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:71111428:71123222:1 gene:ENSMUSG00000021078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC048520 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930553D19 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6741198). // chr12 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_001163378 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2700049A03 gene (2700049A03Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NM_029818 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2700049A03 gene (2700049A03Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006516365 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2700049A03 gene (2700049A03Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000045907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:71136848:71243303:1 gene:ENSMUSG00000034601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000129376 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:71170589:71243299:1 gene:ENSMUSG00000034601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000149564 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:71136848:71243303:1 gene:ENSMUSG00000034601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC043104 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700049A03 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6406547), partial cds. // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC150744 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700049A03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183655 IMAGE:9087655), complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:71137885:71231840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001190466 // RefSeq // Mus musculus dapper homolog 1, antagonist of beta-catenin (xenopus) (Dact1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_021532 // RefSeq // Mus musculus dapper homolog 1, antagonist of beta-catenin (xenopus) (Dact1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000061273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:71309884:71320107:1 gene:ENSMUSG00000044548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000150639 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:71309984:71318894:1 gene:ENSMUSG00000044548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// AF251078 // GenBank // Mus musculus thymus-expressed novel gene-3 protein mRNA, complete cds. // chr12 // 82 // 50 // 14 // 17 // 0 /// AF488775 // GenBank // Mus musculus dapper 1 mRNA, complete cds. // chr12 // 88 // 76 // 23 // 26 // 0 /// BC145833 // GenBank // Mus musculus dapper homolog 1, antagonist of beta-catenin (xenopus), mRNA (cDNA clone MGC:175720 IMAGE:40131136), complete cds. // chr12 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:71309984:71318894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_001286452 // RefSeq // Mus musculus dishevelled associated activator of morphogenesis 1 (Daam1), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_026102 // RefSeq // Mus musculus dishevelled associated activator of morphogenesis 1 (Daam1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_172464 // RefSeq // Mus musculus dishevelled associated activator of morphogenesis 1 (Daam1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000085299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:71831078:71992367:1 gene:ENSMUSG00000034574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY426535 // GenBank // Mus musculus dishevelled associated activator of morphogenesis 1 (Daam1) mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC076585 // GenBank // Mus musculus dishevelled associated activator of morphogenesis 1, mRNA (cDNA clone MGC:96307 IMAGE:30622306), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK053785 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130308H01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// AK165335 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430015P19 product:dishevelled associated activator of morphogenesis 1, full insert sequence. // chr12 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000028256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:71940500:71989888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_026327 // RefSeq // Mus musculus pecanex-like 4 (Drosophila) (Pcnxl4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// XM_006516176 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pecanex-like 4 (Drosophila) (Pcnxl4), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 49 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000044352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:72536357:72580213:1 gene:ENSMUSG00000034501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// AK007829 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810048J11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 51 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:72541429:72581412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 40 // 40 // 0 /// BC050256 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 1810048J11 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6491576). // chr12 // 51 // 51 // 28 // 55 // 1
NM_008910 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1A, magnesium dependent, alpha isoform (Ppm1a), mRNA. // chr12 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:72761211:72794940:1 gene:ENSMUSG00000021096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// AF259672 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2C alpha 3 (Pp2ca3) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// AF259673 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2C alpha 1b (Pp2ca1b) mRNA, complete cds. // chr12 // 91 // 31 // 10 // 11 // 0 /// AF369981 // GenBank // Mus musculus PP alpha 2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// AK076054 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2700032K09 product:protein phosphatase 1A, magnesium dependent, alpha isoform, full insert sequence. // chr12 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// BC008595 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1A, magnesium dependent, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:6077 IMAGE:3581897), complete cds. // chr12 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// D28117 // GenBank // Mus musculus mRNA for magnesium dependent protein phosphatase alpha, complete cds. // chr12 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:72771796:72807678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_011384 // RefSeq // Mus musculus sine oculis-related homeobox 6 (Six6), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:72939892:72944899:1 gene:ENSMUSG00000021099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF050130 // GenBank // Mus musculus homeodomain protein (Optx2) mRNA, complete cds. // chr12 // 76 // 84 // 16 // 21 // 0 /// AF135267 // GenBank // Mus musculus homeobox protein SIX6 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC138838 // GenBank // Mus musculus sine oculis-related homeobox 6 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:170465 IMAGE:8861860), complete cds. // chr12 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC138839 // GenBank // Mus musculus sine oculis-related homeobox 6 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:170466 IMAGE:8861861), complete cds. // chr12 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_008612 // RefSeq // Mus musculus menage a trois 1 (Mnat1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:73123717:73273988:1 gene:ENSMUSG00000021103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089023 // GenBank // Mus musculus menage a trois 1, mRNA (cDNA clone MGC:115747 IMAGE:30702121), complete cds. // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC115630 // GenBank // Mus musculus menage a trois 1, mRNA (cDNA clone MGC:144532 IMAGE:40102880), complete cds. // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// U35249 // GenBank // Mus musculus CDK-activating kinase assembly factor p36/MAT1, complete cds. // chr12 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AK029174 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4831405B13 product:menage a trois 1, full insert sequence. // chr12 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// ENSMUST00000189644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:73123717:73272851:1 gene:ENSMUSG00000021103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000187549 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:73123717:73233548:1 gene:ENSMUSG00000021103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:73157967:73233287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_008856 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C, eta (Prkch), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000021527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:73584797:73778185:1 gene:ENSMUSG00000021108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC031121 // GenBank // Mus musculus protein kinase C, eta, mRNA (cDNA clone MGC:36148 IMAGE:5059633), complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// D90242 // GenBank // Mus musculus nPKC-eta mRNA for protein kinase C, complete cds. // chr12 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000119092 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:73584843:73761542:1 gene:ENSMUSG00000021108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// AK076352 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732457K18 product:protein kinase C, eta, full insert sequence. // chr12 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// GENSCAN00000043505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:73694694:73703962:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
AK162733 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130003H21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010431 // RefSeq // Mus musculus hypoxia inducible factor 1, alpha subunit (Hif1a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000021530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:73907904:73947530:1 gene:ENSMUSG00000021109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000110461 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:73901375:73947530:1 gene:ENSMUSG00000021109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AF003695 // GenBank // Mus musculus hypoxia-inducible factor 1 alpha (Hif1a) mRNA, complete cds. // chr12 // 93 // 86 // 28 // 30 // 0 /// BC026139 // GenBank // Mus musculus hypoxia inducible factor 1, alpha subunit, mRNA (cDNA clone MGC:13907 IMAGE:4019056), complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// X95580 // GenBank // M.musculus mRNA for hypoxia-inducible factor I alpha. // chr12 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000110464 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:73907904:73933076:1 gene:ENSMUSG00000021109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// AK017853 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730564B02 product:hypoxia inducible factor 1, alpha subunit, full insert sequence. // chr12 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// GENSCAN00000043519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:73908290:73945703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0
XM_006516427 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5068 (Gm5068), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000181735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:73961142:73961447:1 gene:ENSMUSG00000066457 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006542989 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5068 (Gm5068), mRNA. // chr12 // 55 // 92 // 6 // 11 // 0 /// GENSCAN00000043487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:73961151:73961447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
NM_178392 // RefSeq // Mus musculus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 1 (Snapc1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006516334 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 1 (Snapc1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:73964530:73984820:1 gene:ENSMUSG00000021113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC030456 // GenBank // Mus musculus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:40671 IMAGE:5401615), complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006516335 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 1 (Snapc1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000043506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:73964562:73984491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0
NM_172804 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin XVI (Syt16), mRNA. // chr12 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// XM_006515839 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptotagmin XVI (Syt16), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000110451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:73997761:74267916:1 gene:ENSMUSG00000044912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AB102950 // GenBank // Mus musculus syt14r mRNA for synaptotagmin XIV-related protein Strep14, complete cds. // chr12 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC056932 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin XVI, mRNA (cDNA clone MGC:66541 IMAGE:5708126), complete cds. // chr12 // 95 // 64 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000043494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:74202253:74266951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0
NR_030733 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700086L19 gene (1700086L19Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_030734 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700086L19 gene (1700086L19Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_030735 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700086L19 gene (1700086L19Rik), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000095617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:74288735:74295945:1 gene:ENSMUSG00000071265 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000185822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:74284289:74295945:1 gene:ENSMUSG00000071265 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000186463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:74284281:74295931:1 gene:ENSMUSG00000071265 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:74283941:74302856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONMMUT014662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT014663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT014664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_198866 // RefSeq // Mus musculus DNA binding protein with his-thr domain (Dbpht2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:74297474:74300468:1 gene:ENSMUSG00000029878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF547221 // GenBank // Mus musculus SPOT2 (Spot2) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC141071 // GenBank // Mus musculus DNA binding protein with his-thr domain, mRNA (cDNA clone MGC:176032 IMAGE:9055683), complete cds. // chr12 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
NM_001005510 // RefSeq // Mus musculus spectrin repeat containing, nuclear envelope 2 (Syne2), mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000044217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:75818318:76110900:1 gene:ENSMUSG00000063450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000143031 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:75818318:76110926:1 gene:ENSMUSG00000063450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000150317 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:75818329:75908877:1 gene:ENSMUSG00000063450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000157033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:75818350:75905903:1 gene:ENSMUSG00000063450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK052521 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430041G10 product:NUANCE (Fragment) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK084394 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230036F23 product:NUANCE (FRAGMENT) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000133623 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:75818323:75891049:1 gene:ENSMUSG00000063450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000054016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:75854069:75925755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001005510 // RefSeq // Mus musculus spectrin repeat containing, nuclear envelope 2 (Syne2), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 92 // 92 // 0 /// ENSMUST00000044217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:75818318:76110900:1 gene:ENSMUSG00000063450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 92 // 92 // 0 /// ENSMUST00000085280 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:76031614:76110920:1 gene:ENSMUSG00000063450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 45 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000132161 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:76087760:76110926:1 gene:ENSMUSG00000063450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 18 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000139204 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:76048578:76110900:1 gene:ENSMUSG00000063450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 32 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000143031 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:75818318:76110926:1 gene:ENSMUSG00000063450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 92 // 92 // 0 /// BC082586 // GenBank // Mus musculus synaptic nuclear envelope 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:30631452), complete cds. // chr12 // 100 // 37 // 35 // 35 // 0 /// FJ848978 // GenBank // Mus musculus Syne/ANC-1 family protein mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 18 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000054012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:75929702:76117422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 99 // 94 // 87 // 88 // 0
NM_001005510 // RefSeq // Mus musculus spectrin repeat containing, nuclear envelope 2 (Syne2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:75818318:76110900:1 gene:ENSMUSG00000063450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143031 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:75818318:76110926:1 gene:ENSMUSG00000063450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:75854069:75925755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138745 // RefSeq // Mus musculus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent), methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase, formyltetrahydrofolate synthase (Mthfd1), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:76255232:76319820:1 gene:ENSMUSG00000021048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF364579 // GenBank // Mus musculus C1-tetrahydrofolate synthase (Dcs) mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC008523 // GenBank // Mus musculus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent), methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase, formyltetrahydrofolate synthase, mRNA (cDNA clone MGC:6417 IMAGE:3590449), complete cds. // chr12 // 86 // 97 // 24 // 28 // 0 /// BC013563 // GenBank // Mus musculus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent), methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase, formyltetrahydrofolate synthase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3590876). // chr12 // 86 // 72 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000054021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:76254307:76325415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001101471 // RefSeq // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 5 (Akap5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000095610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:76324891:76334153:1 gene:ENSMUSG00000021057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000154078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:76324891:76334151:1 gene:ENSMUSG00000021057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000172992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:76324905:76330054:1 gene:ENSMUSG00000021057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:76327817:76330054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_178744 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 1 (Zbtb1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006515895 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 1 (Zbtb1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006515896 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 1 (Zbtb1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000042779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:76370266:76396950:1 gene:ENSMUSG00000033454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY611626 // GenBank // Mus musculus brain specific protein 2 (Bsg2) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC012239 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:19295 IMAGE:4037044), complete cds. // chr12 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:76385242:76387383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0
NM_001002012 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 2 (Hspa2), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_008301 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 2 (Hspa2), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515484 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heat shock protein 2 (Hspa2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000080449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:76404176:76406934:1 gene:ENSMUSG00000059970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC004714 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:7795 IMAGE:3499661), complete cds. // chr12 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC052350 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:58299 IMAGE:6772789), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:76404534:76406435:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0
NM_001163103 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 36 (Ppp1r36), mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000063977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:76417599:76439473:1 gene:ENSMUSG00000052221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000054011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:76422820:76444665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000101281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:76444560:76451336:1 gene:ENSMUSG00000073000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK136613 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230006H20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145927 // RefSeq // Mus musculus farnesyltransferase, CAAX box, beta (Fntb), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006515404 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus farnesyltransferase, CAAX box, beta (Fntb), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// XM_006515405 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus farnesyltransferase, CAAX box, beta (Fntb), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000041008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:76837414:76921412:1 gene:ENSMUSG00000033373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000123887 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:76840295:76887805:1 gene:ENSMUSG00000033373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000125842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:76765589:76920659:1 gene:ENSMUSG00000033373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000137826 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:76765598:76920231:1 gene:ENSMUSG00000033373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC031417 // GenBank // Mus musculus farnesyltransferase, CAAX box, beta, mRNA (cDNA clone MGC:6966 IMAGE:3154478), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000154743 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:76887058:76910246:1 gene:ENSMUSG00000033373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000026240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:76868468:76920207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000082899 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:77418417:77418576:1 gene:ENSMUSG00000064833 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 84 // 76 // 16 // 19 // 0 /// AK140755 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130005J24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 84 // 76 // 16 // 19 // 0
XM_006542994 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6657 (Gm6657), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XR_394619 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6657 (Gm6657), transcript variant X4, misc_RNA. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000188791 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:78197174:78208930:1 gene:ENSMUSG00000099418 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:78197269:78208885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000185497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:78200966:78209029:1 gene:ENSMUSG00000099418 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_145965 // RefSeq // Mus musculus gephyrin (Gphn), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_172952 // RefSeq // Mus musculus gephyrin (Gphn), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:78226655:78684767:1 gene:ENSMUSG00000047454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:78226655:78684767:1 gene:ENSMUSG00000047454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC027112 // GenBank // Mus musculus gephyrin, mRNA (cDNA clone IMAGE:5358943). // chr12 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC127058 // GenBank // Mus musculus gephyrin, mRNA (cDNA clone MGC:150066 IMAGE:40109771), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:78435029:78643891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_027597 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 71, member D (Fam71d), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NM_029069 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 71, member D (Fam71d), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000077968 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:78691535:78734513:1 gene:ENSMUSG00000056987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// AB473726 // GenBank // Mus musculus GARI-L2 mRNA for Golgi-associated Rab2B interactor-like 2, complete cds. // chr12 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// AK015802 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930516C23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 90 // 57 // 18 // 20 // 0 /// BC051149 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 71, member D, mRNA (cDNA clone MGC:58635 IMAGE:6707726), complete cds. // chr12 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:78710271:78749621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_019579 // RefSeq // Mus musculus membrane protein, palmitoylated 5 (MAGUK p55 subfamily member 5) (Mpp5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006516098 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane protein, palmitoylated 5 (MAGUK p55 subfamily member 5) (Mpp5), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006516099 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane protein, palmitoylated 5 (MAGUK p55 subfamily member 5) (Mpp5), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000082024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:78748947:78840711:1 gene:ENSMUSG00000021112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF199008 // GenBank // Mus musculus PALS1 (Pals1) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC138624 // GenBank // Mus musculus membrane protein, palmitoylated 5 (MAGUK p55 subfamily member 5), mRNA (cDNA clone MGC:170249 IMAGE:8861644), complete cds. // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:78797024:78837634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
NM_026114 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 1 alpha (Eif2s1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000071230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:78861819:78887010:1 gene:ENSMUSG00000021116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC016448 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 1 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:25452 IMAGE:4234809), complete cds. // chr12 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// BC016497 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 1 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:25484 IMAGE:4501321), complete cds. // chr12 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// AK003094 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0910001O23 product:eukaryotic translation initiation factor 2A, full insert sequence. // chr12 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// BC005463 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 1 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:6420 IMAGE:3591411), complete cds. // chr12 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// GENSCAN00000040736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:78861060:78884916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
NM_181073 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 1 (Plekhh1), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000039928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:79029163:79081648:1 gene:ENSMUSG00000060716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC028900 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3495084), partial cds. // chr12 // 93 // 47 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000040751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:78980492:79079593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_009705 // RefSeq // Mus musculus arginase type II (Arg2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000021550 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:79130777:79156301:1 gene:ENSMUSG00000021125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF032466 // GenBank // Mus musculus arginase II mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC023349 // GenBank // Mus musculus arginase type II, mRNA (cDNA clone MGC:31006 IMAGE:5254031), complete cds. // chr12 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// U90886 // GenBank // Mus musculus arginase II mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000040752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:79130870:79156031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_030017 // RefSeq // Mus musculus retinol dehydrogenase 12 (Rdh12), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006516372 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus retinol dehydrogenase 12 (Rdh12), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021548 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:79208914:79222665:1 gene:ENSMUSG00000021123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000122227 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:79208931:79222664:1 gene:ENSMUSG00000021123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000151980 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:79208947:79222664:1 gene:ENSMUSG00000021123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC016204 // GenBank // Mus musculus retinol dehydrogenase 12, mRNA (cDNA clone MGC:27665 IMAGE:4527851), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC067213 // GenBank // Mus musculus retinol dehydrogenase 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:5364453), partial cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000140823 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:79210661:79212755:1 gene:ENSMUSG00000021123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// AK164157 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630025M06 product:retinol dehydrogenase 12, full insert sequence. // chr12 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000040740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:79209041:79222065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
AF031663 // GenBank // Mus musculus striamin protein (Strn2) mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
NM_133798 // RefSeq // Mus musculus exonuclease 3-5 domain containing 2 (Exd2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000038185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:80463095:80498135:1 gene:ENSMUSG00000032705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK166390 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930007E19 product:weakly similar to Human full-length cDNA clone CS0DC026YP23 of neuroblastoma of Homo sapiens (Human) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 87 // 43 // 13 // 15 // 0 /// BC018508 // GenBank // Mus musculus exonuclease 3-5 domain-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:27781 IMAGE:3156447), complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AK138497 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330042L08 product:hypothetical Cytochrome c heme-binding site containing protein, full insert sequence. // chr12 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000021586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:80475823:80507049:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
NM_001081421 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 (Galnt16), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000021558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:80518990:80603896:1 gene:ENSMUSG00000021130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AB175683 // GenBank // Mus musculus mpp-GalNAc-T16 mRNA for UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, complete cds. // chr12 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// AK173105 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1130 protein. // chr12 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// BC110634 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:130429 IMAGE:40059147), complete cds. // chr12 // 84 // 89 // 27 // 32 // 0 /// BC125015 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:130428 IMAGE:40059141), complete cds. // chr12 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:80518334:80601832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NM_026244 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 9 (Slc39a9), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006516032 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 9 (Slc39a9), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000085245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:80644215:80683341:1 gene:ENSMUSG00000048833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK080462 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730020O03 product:solute carrier family 39 (zinc transporter), member 9, full insert sequence. // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC058649 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:6406316), partial cds. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC117754 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:143543 IMAGE:40090588), complete cds. // chr12 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// BC117755 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:143544 IMAGE:40090589), complete cds. // chr12 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// BC158056 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:189977 IMAGE:9088164), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK014734 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833420E20 product:hypothetical ZIP Zinc transporter containing protein, full insert sequence. // chr12 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000021606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:80660599:80722485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001177503 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family D (with coiled-coil domains) member 1 (Plekhd1), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515682 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family D (with coiled-coil domains) member 1 (Plekhd1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006515683 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family D (with coiled-coil domains) member 1 (Plekhd1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000140770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:80692591:80724214:1 gene:ENSMUSG00000066438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC137602 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3830431G21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169226 IMAGE:8860621), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:80660599:80722485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001242419 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933426M11 gene (4933426M11Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_178682 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933426M11 gene (4933426M11Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000068519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:80790532:80880832:1 gene:ENSMUSG00000021133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC040401 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933426M11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28532 IMAGE:4193723), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:80823566:80877595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001146217 // RefSeq // Mus musculus SPARC related modular calcium binding 1 (Smoc1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_022316 // RefSeq // Mus musculus SPARC related modular calcium binding 1 (Smoc1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006516135 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SPARC related modular calcium binding 1 (Smoc1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000021564 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:81026828:81186410:1 gene:ENSMUSG00000021136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110347 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:81026808:81186414:1 gene:ENSMUSG00000021136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000129362 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:81026828:81186410:1 gene:ENSMUSG00000021136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF070470 // GenBank // Mus musculus SPARC-related protein (SRG) mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC031804 // GenBank // Mus musculus SPARC related modular calcium binding 1, mRNA (cDNA clone MGC:30627 IMAGE:3673732), complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:81095336:81148838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000021589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:81155072:81190664:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSMUST00000051437 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:81399812:81400123:1 gene:ENSMUSG00000049246 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:81399812:81400075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001033149 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 9 (Ttc9), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:81631369:81664941:1 gene:ENSMUSG00000042734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK172918 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0227 protein. // chr12 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC139242 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 9, mRNA (cDNA clone MGC:170869 IMAGE:8862264), complete cds. // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC139244 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 9, mRNA (cDNA clone MGC:170871 IMAGE:8862266), complete cds. // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006516202 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 9 (Ttc9), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000010647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:81631405:81663595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_018814 // RefSeq // Mus musculus pecanex homolog (Drosophila) (Pcnx), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000021567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:81860030:82000924:1 gene:ENSMUSG00000021140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// AF096286 // GenBank // Mus musculus pecanex 1 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// BC057333 // GenBank // Mus musculus pecanex homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:6830383), partial cds. // chr12 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:81860372:81996162:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 72 // 30 // 31 // 0
ENSMUST00000082780 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:82150468:82150563:1 gene:ENSMUSG00000064714 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001167983 // RefSeq // Mus musculus signal-induced proliferation-associated 1 like 1 (Sipa1l1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// NM_172579 // RefSeq // Mus musculus signal-induced proliferation-associated 1 like 1 (Sipa1l1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000053969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:82311349:82451782:1 gene:ENSMUSG00000042700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000166429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:82170016:82451782:1 gene:ENSMUSG00000042700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// AK051853 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230010O12 product:HIGH-RISK HUMAN PAPILLOMA VIRUSES E6 ONCOPROTEINS TARGETED PROTEIN E6TP1 ALPHA homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 100 // 29 // 14 // 14 // 0 /// BC058681 // GenBank // Mus musculus signal-induced proliferation-associated 1 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:76338 IMAGE:6834753), complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// BC095958 // GenBank // Mus musculus signal-induced proliferation-associated 1 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:106311 IMAGE:5343588), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000010650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:82341002:82399363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 31 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000051172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:82402910:82450044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 44 // 21 // 21 // 0
AK042770 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730023A08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001165256 // RefSeq // Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 4 (Dcaf4), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_030246 // RefSeq // Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 4 (Dcaf4), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006516283 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 4 (Dcaf4), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000021645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:83520466:83541988:1 gene:ENSMUSG00000021222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC003284 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 21, mRNA (cDNA clone MGC:7874 IMAGE:3582095), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:83485877:83546593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_027349 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 25 (Rbm25), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000048155 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:83632252:83683123:1 gene:ENSMUSG00000010608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC066150 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 25, mRNA (cDNA clone IMAGE:30111354), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC067400 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 25, mRNA (cDNA clone IMAGE:30111093), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC158104 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 25, mRNA (cDNA clone MGC:189888 IMAGE:9007388), complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000182450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:83642639:83682020:1 gene:ENSMUSG00000010608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// ENSMUST00000181983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:83631236:83674417:1 gene:ENSMUSG00000010608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// ENSMUST00000183181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:83674853:83677898:1 gene:ENSMUSG00000010608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// AK162135 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420433P11 product:10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610015J01 product:similar to S164 protein homolog (Fragment), full insert sequence. // chr12 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000048260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:83640666:83681595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
NM_008943 // RefSeq // Mus musculus presenilin 1 (Psen1), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000041806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:83688203:83734113:1 gene:ENSMUSG00000019969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000101225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:83688563:83735199:1 gene:ENSMUSG00000019969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF149111 // GenBank // Mus musculus presenilin-1 mRNA, complete cds. // chr12 // 85 // 59 // 17 // 20 // 0 /// BC014744 // GenBank // Mus musculus presenilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:25288 IMAGE:4511140), complete cds. // chr12 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// BC030409 // GenBank // Mus musculus presenilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:40637 IMAGE:5133302), complete cds. // chr12 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC071233 // GenBank // Mus musculus presenilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:78198 IMAGE:3673609), complete cds. // chr12 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// L42177 // GenBank // Mus musculus S182 protein mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:83687966:83734071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 62 // 20 // 21 // 0
NM_023633 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2410016O06 gene (2410016O06Rik), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:83950608:83952953:1 gene:ENSMUSG00000046791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138094 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410016O06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169718 IMAGE:8861113), complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:83865285:83952503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_134188 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 2 (Acot2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000021649 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:83987861:83993873:1 gene:ENSMUSG00000021226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC064469 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 2, mRNA (cDNA clone MGC:69985 IMAGE:6508650), complete cds. // chr12 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000048263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:83987902:83993080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 89 // 69 // 8 // 9 // 0
BC022951 // GenBank HTC // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4024543), with apparent retained intron. // chr12 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// NM_012006 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 1 (Acot1), mRNA. // chr12 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// ENSMUST00000168120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84009502:84017670:1 gene:ENSMUSG00000072949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// BC028261 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:40635 IMAGE:5100478), complete cds. // chr12 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// GENSCAN00000048258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84009510:84043796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
NM_134247 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 4 (Acot4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000021652 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:84038379:84044723:1 gene:ENSMUSG00000052392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC113185 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 4, mRNA (cDNA clone MGC:132946 IMAGE:40061800), complete cds. // chr12 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000048258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84009510:84043796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
NM_134246 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 3 (Acot3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000021653 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:84052151:84059565:1 gene:ENSMUSG00000021228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY563097 // GenBank // Mus musculus peroxisomal acyl-CoA thioesterase Ia splice variant 5:1 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC138741 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 3, mRNA (cDNA clone MGC:170368 IMAGE:8861763), complete cds. // chr12 // 88 // 71 // 15 // 17 // 0 /// BC138743 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 3, mRNA (cDNA clone MGC:170370 IMAGE:8861765), complete cds. // chr12 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// XM_006515509 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acyl-CoA thioesterase 3 (Acot3), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// ENSMUST00000120927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:84052144:84059565:1 gene:ENSMUSG00000021228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// AY563098 // GenBank // Mus musculus peroxisomal acyl-CoA thioesterase Ia splice variant 5:2 mRNA, complete cds. // chr12 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// GENSCAN00000048264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84053452:84059026:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_145444 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 5 (Acot5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006515693 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acyl-CoA thioesterase 5 (Acot5), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000046422 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:84069325:84076019:1 gene:ENSMUSG00000042540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000072505 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:84069325:84076020:1 gene:ENSMUSG00000042540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// AY563099 // GenBank // Mus musculus peroxisomal acyl-CoA thioesterase Ic mRNA, complete cds. // chr12 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// BC016076 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 5, mRNA (cDNA clone MGC:27572 IMAGE:4485973), complete cds. // chr12 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84069467:84087420:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0
BC002159 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:3485583), complete cds. // chr12 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000056822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:84100654:84111349:1 gene:ENSMUSG00000043487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NM_172580 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 6 (Acot6), mRNA. // chr12 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// AY999300 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 6 (Acot6) mRNA, complete cds. // chr12 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// BC139306 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 6, mRNA (cDNA clone MGC:170933 IMAGE:8862328), complete cds. // chr12 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// BC139328 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA thioesterase 6, mRNA (cDNA clone MGC:170955 IMAGE:8862350), complete cds. // chr12 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000048248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84100972:84152220:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_028377 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 176 (Ccdc176), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006516273 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 176 (Ccdc176), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XR_381550 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 176 (Ccdc176), transcript variant X4, misc_RNA. // chr12 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000081828 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:84409071:84433780:1 gene:ENSMUSG00000057265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000151789 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:84413264:84428421:1 gene:ENSMUSG00000057265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC151099 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900006K08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:184012 IMAGE:9088012), complete cds. // chr12 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC151103 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900006K08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:184016 IMAGE:9088016), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000153540 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:84419974:84430380:1 gene:ENSMUSG00000057265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84409182:84418349:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_025525 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 113A2 (Rnf113a2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:84417196:84418578:1 gene:ENSMUSG00000098134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116426 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 113A2, mRNA (cDNA clone MGC:144613 IMAGE:40104196), complete cds. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84409182:84418349:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_173756 // RefSeq // Mus musculus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006542903 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7020 (Gm7020), mRNA. // chr12 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000137170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84451508:84531533:1 gene:ENSMUSG00000085793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC120496 // GenBank // Mus musculus lin-52 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:155733 IMAGE:40129419), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC137693 // GenBank // Mus musculus lin-52 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:169317 IMAGE:8860712), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006515701 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// GENSCAN00000053345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:104549705:104573897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_007701 // RefSeq // Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:84569762:84595457:1 gene:ENSMUSG00000021239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169934 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:12:84569840:84595457:1 gene:ENSMUSG00000021239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC031869 // GenBank // Mus musculus visual system homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:30502 IMAGE:4480964), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC051245 // GenBank // Mus musculus visual system homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:58960 IMAGE:6494544), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC058806 // GenBank // Mus musculus visual system homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:65308 IMAGE:6492679), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// L34808 // GenBank // Mus musculus (clone 6) homeobox protein (Chx10) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84512795:84593454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_001033776 // RefSeq // Mus musculus vertebrae development associated (Vrtn), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001168588 // RefSeq // Mus musculus vertebrae development associated (Vrtn), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NM_001168589 // RefSeq // Mus musculus vertebrae development associated (Vrtn), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// XM_006516062 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vertebrae development associated (Vrtn), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000095551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84642896:84651455:1 gene:ENSMUSG00000071235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000166772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84641019:84651455:1 gene:ENSMUSG00000071235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000167227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84642555:84651455:1 gene:ENSMUSG00000071235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC103771 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 7420416P09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117755 IMAGE:30935479), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84648478:84650700:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
BC022589 // GenBank // Mus musculus iron-sulfur cluster assembly 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:31079 IMAGE:4037176), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_028863 // RefSeq // Mus musculus iron-sulfur cluster assembly 2 homolog (S. cerevisiae) (Isca2), mRNA. // chr12 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// XM_006516297 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus iron-sulfur cluster assembly 2 homolog (S. cerevisiae) (Isca2), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENSMUST00000021667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84773270:84775089:1 gene:ENSMUSG00000021241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// AK019988 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730594E03 product:hypothetical Hypothetical hesB/yadR/yfhF family containing protein, full insert sequence. // chr12 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NR_028577 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D030025P21 gene (D030025P21Rik), long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000171853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84875769:84878132:1 gene:ENSMUSG00000092130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_028632 // RefSeq // Mus musculus FCF1 small subunit (SSU) processome component homolog (S. cerevisiae) (Fcf1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000021669 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:84970897:84983303:1 gene:ENSMUSG00000021243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000171040 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:84970981:84983291:1 gene:ENSMUSG00000021243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC033045 // GenBank // Mus musculus FCF1 small subunit (SSU) processome component homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:41230 IMAGE:1068150), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000047413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84969277:84983217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
NM_030225 // RefSeq // Mus musculus dihydrolipoamide S-succinyltransferase (E2 component of 2-oxo-glutarate complex) (Dlst), mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000053811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:85110833:85134091:1 gene:ENSMUSG00000004789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC006702 // GenBank // Mus musculus dihydrolipoamide S-succinyltransferase (E2 component of 2-oxo-glutarate complex), mRNA (cDNA clone MGC:7935 IMAGE:3583936), complete cds. // chr12 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC024066 // GenBank // Mus musculus dihydrolipoamide S-succinyltransferase (E2 component of 2-oxo-glutarate complex), mRNA (cDNA clone IMAGE:5068310), complete cds. // chr12 // 88 // 40 // 14 // 16 // 0 /// CT010197 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F0150D for gene Dlst, Dihydrolipoamide S-succinyltransferase (E2 component of 2-oxo-glutarate complex); complete cds, incl. stopcodon. // chr12 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// AK019713 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930529O08 product:DIHYDROLIPOAMIDE SUCCINYLTRANSFERASE COMPONENT OF 2-OXOGLUTARATE DEHYDROGENASE COMPLEX, MITOCHONDRIAL PRECURSOR (EC 2.3.1.61) (E2) (E2K) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr12 // 90 // 90 // 36 // 40 // 1 /// GENSCAN00000047403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85111000:85132753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0
NM_145445 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2 beta (Eif2b2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000004910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:85219481:85226628:1 gene:ENSMUSG00000004788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:85219582:85223488:1 gene:ENSMUSG00000004788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000136495 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:85219513:85226150:1 gene:ENSMUSG00000004788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000140900 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:85219504:85222839:1 gene:ENSMUSG00000004788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000151925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:85219546:85222826:1 gene:ENSMUSG00000004788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// BC003326 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2 beta, mRNA (cDNA clone MGC:7057 IMAGE:3156632), complete cds. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85219562:85226160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_172414 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, C2HC-type containing 1C (Zc2hc1c), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:85288591:85299358:1 gene:ENSMUSG00000045064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049940 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 164, member C, mRNA (cDNA clone MGC:54815 IMAGE:6305959), complete cds. // chr12 // 82 // 65 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000047409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85289613:85296674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_010234 // RefSeq // Mus musculus FBJ osteosarcoma oncogene (Fos), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:85473890:85477273:1 gene:ENSMUSG00000021250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000134311 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:85474911:85476063:1 gene:ENSMUSG00000021250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000140525 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:85474691:85476185:1 gene:ENSMUSG00000021250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC029814 // GenBank // Mus musculus FBJ osteosarcoma oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:36690 IMAGE:2582234), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000136122 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:85474691:85476007:1 gene:ENSMUSG00000021250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85473384:85476458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001205053 // RefSeq // Mus musculus Jun dimerization protein 2 (Jdp2), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NM_030887 // RefSeq // Mus musculus Jun dimerization protein 2 (Jdp2), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:85599416:85639877:1 gene:ENSMUSG00000034271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:85600018:85639878:1 gene:ENSMUSG00000034271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AB034697 // GenBank // Mus musculus TIF mRNA for transcriptional inhibitory factor, complete cds. // chr12 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// AB077438 // GenBank // Mus musculus jdp2 mRNA for jun dimerization protein 2, complete cds. // chr12 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC019780 // GenBank // Mus musculus Jun dimerization protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:25593 IMAGE:4012135), complete cds. // chr12 // 86 // 73 // 19 // 22 // 0 /// BC115852 // GenBank // Mus musculus Jun dimerization protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40055566), complete cds. // chr12 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// NM_001205052 // RefSeq // Mus musculus Jun dimerization protein 2 (Jdp2), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// ENSMUST00000177587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:85599105:85639878:1 gene:ENSMUSG00000034271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000042253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85599129:85638958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_016767 // RefSeq // Mus musculus basic leucine zipper transcription factor, ATF-like (Batf), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:85686669:85709087:1 gene:ENSMUSG00000034266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF017021 // GenBank // Mus musculus B-ATF mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC132410 // GenBank // Mus musculus basic leucine zipper transcription factor, ATF-like, mRNA (cDNA clone MGC:164041 IMAGE:40130687), complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC132412 // GenBank // Mus musculus basic leucine zipper transcription factor, ATF-like, mRNA (cDNA clone MGC:164043 IMAGE:40130689), complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85642639:85708752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_145447 // RefSeq // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 7C (Mfsd7c), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000040461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:85746539:85813585:1 gene:ENSMUSG00000034258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY260574 // GenBank // Mus musculus transporter mRNA, complete cds. // chr12 // 90 // 83 // 27 // 30 // 0 /// AY260575 // GenBank // Mus musculus transporter mRNA, complete cds. // chr12 // 91 // 92 // 30 // 33 // 0 /// AY260576 // GenBank // Mus musculus transporter mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// BC011209 // GenBank // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 7C, mRNA (cDNA clone MGC:19050 IMAGE:4190027), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000042236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85746852:85802801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000042252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85803175:85812119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0
NM_001199843 // RefSeq // Mus musculus intraflagellar transport 43 (Ift43), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// NM_029601 // RefSeq // Mus musculus intraflagellar transport 43 (Ift43), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000054565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:86082561:86162458:1 gene:ENSMUSG00000007867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// BC038915 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019E19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:49305 IMAGE:5148723), complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006516359 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus intraflagellar transport 43 homolog (Chlamydomonas) (Ift43), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// GENSCAN00000042251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:86143485:86162297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
NM_027405 // RefSeq // Mus musculus G patch domain containing 2 like (Gpatch2l), mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000071106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:86241890:86291414:1 gene:ENSMUSG00000021254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AK190554 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0103B19, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000071106, based on BLAT search. // chr12 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC048169 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700020O03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:61187 IMAGE:6821902), complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC050782 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700020O03 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6707201), partial cds. // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC058256 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700020O03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:65388 IMAGE:6466603), complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:86244045:86319688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENSMUST00000101884 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:86655125:86655231:1 gene:ENSMUSG00000075832 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT015100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_177354 // RefSeq // Mus musculus vasohibin 1 (Vash1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000021681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:86678700:86692091:1 gene:ENSMUSG00000021256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB284948 // GenBank // Mus musculus Vash1 mRNA for Vasohibin 1, complete cds. // chr12 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// BC086688 // GenBank // Mus musculus vasohibin 1, mRNA (cDNA clone MGC:113767 IMAGE:30686635), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:86678691:86693859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 45 // 14 // 15 // 0
NM_001195767 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 74 (Lrrc74), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006516126 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6772 (Gm6772), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006516127 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6772 (Gm6772), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000095527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:86734383:86763795:1 gene:ENSMUSG00000059114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:86734655:86827330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001252555 // RefSeq // Mus musculus glutathione transferase zeta 1 (maleylacetoacetate isomerase) (Gstz1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_001252556 // RefSeq // Mus musculus glutathione transferase zeta 1 (maleylacetoacetate isomerase) (Gstz1), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_010363 // RefSeq // Mus musculus glutathione transferase zeta 1 (maleylacetoacetate isomerase) (Gstz1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006515473 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutathione transferase zeta 1 (maleylacetoacetate isomerase) (Gstz1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000063117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:87147707:87164721:1 gene:ENSMUSG00000021033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF093418 // GenBank // Mus musculus maleylacetoacetate isomerase mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC031777 // GenBank // Mus musculus glutathione transferase zeta 1 (maleylacetoacetate isomerase), mRNA (cDNA clone MGC:18309 IMAGE:4168439), complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87157649:87163830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_146036 // RefSeq // Mus musculus AHA1, activator of heat shock protein ATPase 1 (Ahsa1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515729 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus AHA1, activator of heat shock protein ATPase 1 (Ahsa1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000021425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:87266746:87273997:1 gene:ENSMUSG00000021037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC023857 // GenBank // Mus musculus AHA1, activator of heat shock protein ATPase homolog 1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:36618 IMAGE:5346745), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025552 // GenBank // Mus musculus AHA1, activator of heat shock protein ATPase homolog 1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:36589 IMAGE:5320590), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC036967 // GenBank HTC // Mus musculus AHA1, activator of heat shock protein ATPase homolog 1 (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:4511748), with apparent retained intron. // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000016237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87266424:87273763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_026958 // RefSeq // Mus musculus SRA stem-loop interacting RNA binding protein (Slirp), mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000077462 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:87443936:87449904:1 gene:ENSMUSG00000021040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 81 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160488 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:87443912:87449920:1 gene:ENSMUSG00000021040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000160880 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:87443946:87449924:1 gene:ENSMUSG00000021040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC065396 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810035L17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3974474). // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC116739 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810035L17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151116 IMAGE:40126058), complete cds. // chr12 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC116741 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810035L17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151118 IMAGE:40126060), complete cds. // chr12 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000161023 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:87443896:87452206:1 gene:ENSMUSG00000021040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// BC048513 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 1810035L17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6582631), containing frame-shift errors. // chr12 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// GENSCAN00000031357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87447165:87449878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000031343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87478322:87482815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87779363:87783894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0
NM_001177564 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4027 (Gm4027), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_001177573 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence BB287469 (BB287469), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000110148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:87973528:87980224:1 gene:ENSMUSG00000079030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000110149 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:87816577:87820676:1 gene:ENSMUSG00000079031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000164838 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:87618869:87622955:1 gene:ENSMUSG00000092019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC147392 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:182571 IMAGE:9056465, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC147393 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:182568 IMAGE:9056462, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000031317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87819321:87819755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000031334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87621600:87622034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000031323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87927775:87980224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1
ENSMUST00000177720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:88083697:88084128:1 gene:ENSMUSG00000095265 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000031347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:88083697:88084131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_990056 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 8587 (Gm8587), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000076538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:88089116:88089976:1 gene:ENSMUSG00000071207 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000031355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:88089134:88128064:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_006543028 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal-like (LOC100503047), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000091715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:88329254:88329682:1 gene:ENSMUSG00000069276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000031335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:88323832:88329682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000082614 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:90801619:90801735:1 gene:ENSMUSG00000064548 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001113404 // RefSeq // Mus musculus thyroid stimulating hormone receptor (Tshr), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// NM_011648 // RefSeq // Mus musculus thyroid stimulating hormone receptor (Tshr), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000021343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:91401000:91522541:1 gene:ENSMUSG00000020963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021346 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:91400994:91540509:1 gene:ENSMUSG00000020963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// BC028754 // GenBank // Mus musculus thyroid stimulating hormone receptor, mRNA (cDNA clone IMAGE:1179318), complete cds. // chr12 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// BC086691 // GenBank // Mus musculus thyroid stimulating hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:113790 IMAGE:30682686), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// BC092523 // GenBank // Mus musculus thyroid stimulating hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:106521 IMAGE:30650002), complete cds. // chr12 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// U02601 // GenBank // Mus musculus hyt/hyt BALB/cBY mutant thyroid stimulating hormone receptor (TSHr) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// U02602 // GenBank // Mus musculus BALB/cBY thyroid stimulating hormone receptor (TSHr) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:91493103:91538584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 46 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000083369 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:93746502:93746662:1 gene:ENSMUSG00000065303 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT015248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
GENSCAN00000006672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:95611260:95695975:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_201518 // RefSeq // Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 (Flrt2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000057324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:95692226:95785215:1 gene:ENSMUSG00000047414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000110117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:95695357:95781107:1 gene:ENSMUSG00000047414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// AK172945 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0405 protein. // chr12 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// AY495669 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6xCBA fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 (Flrt2) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC096471 // GenBank // Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:106049 IMAGE:3582155), complete cds. // chr12 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC138297 // GenBank // Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:169921 IMAGE:8861316), complete cds. // chr12 // 93 // 47 // 14 // 15 // 0 /// BC138298 // GenBank // Mus musculus fibronectin leucine rich transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:169922 IMAGE:8861317), complete cds. // chr12 // 93 // 47 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:95778890:95780872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000002704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:97640328:97663862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_008152 // RefSeq // Mus musculus G-protein coupled receptor 65 (Gpr65), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:98268635:98276624:1 gene:ENSMUSG00000021886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011332 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor 65, mRNA (cDNA clone MGC:18408 IMAGE:3661818), complete cds. // chr12 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// U39827 // GenBank // Mus musculus putative G protein-coupled receptor TDAG8 (TDAG8) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000158726 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:98599033:98599095:1 gene:ENSMUSG00000089351 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000178017 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:30601514:30601576:1 gene:ENSMUSG00000094704 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// NONMMUT015321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT022988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0
NM_029553 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 8 (Ttc8), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_198311 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 8 (Ttc8), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000079146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:98920612:98983238:1 gene:ENSMUSG00000021013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000085109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:98920574:98983232:1 gene:ENSMUSG00000021013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124514 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:98943319:98970724:1 gene:ENSMUSG00000021013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000132878 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:98920820:98961492:1 gene:ENSMUSG00000021013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000168255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:98974469:98982562:1 gene:ENSMUSG00000021013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC017523 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 8, mRNA (cDNA clone MGC:27659 IMAGE:4527657), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:98920670:98982574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1
ENSMUST00000046994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:99346398:99361827:1 gene:ENSMUSG00000033731 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000126476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:99341154:99361827:1 gene:ENSMUSG00000033731 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr12 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AK014365 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3300002A11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XR_394728 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 3300002A11 gene (3300002A11Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr12 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONMMUT015352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT015353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006516456 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102637172 (LOC102637172), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006543003 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642532 (LOC102642532), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000014107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:99416775:99576202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
AK137004 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430032B05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001164426 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 13 (Kcnk13), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NM_001164427 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 13 (Kcnk13), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NM_146037 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 13 (Kcnk13), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000049788 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:99964525:100062674:1 gene:ENSMUSG00000045404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000160413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:99964499:100062682:1 gene:ENSMUSG00000045404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000162221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:99964505:99966280:1 gene:ENSMUSG00000045404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000177549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:99964499:100062682:1 gene:ENSMUSG00000045404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AK089394 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730021E22 product:potassium channel, subfamily K, member 13, full insert sequence. // chr12 // 94 // 46 // 16 // 17 // 0 /// BC023443 // GenBank // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 13, mRNA (cDNA clone MGC:31053 IMAGE:5251817), complete cds. // chr12 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:99884493:99989025:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1
NM_008947 // RefSeq // Mus musculus protease (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 1 (Psmc1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000021595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:100110186:100123364:1 gene:ENSMUSG00000021178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC003860 // GenBank // Mus musculus protease (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6597 IMAGE:3486436), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// U39302 // GenBank // Mus musculus 26S proteasome subunit 4 ATPase mRNA, complete cds. // chr12 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000014120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:100110209:100123192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0
NR_045282 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10433 (Gm10433), long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:100188773:100192745:1 gene:ENSMUSG00000072884 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:100187968:100193540:1 gene:ENSMUSG00000072884 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009790 // RefSeq // Mus musculus calmodulin 1 (Calm1), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000001204 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:100200144:100209806:1 gene:ENSMUSG00000001175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000110082 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:100199435:100209806:1 gene:ENSMUSG00000001175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK145841 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530005B05 product:calmodulin 1, full insert sequence. // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC054805 // GenBank // Mus musculus calmodulin 1, mRNA (cDNA clone MGC:64720 IMAGE:6838207), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// M19381 // GenBank // Mouse calmodulin (Cam I) mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0 /// ENSMUST00000127300 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:100205403:100206495:1 gene:ENSMUSG00000001175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// ENSMUST00000153524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:100199529:100203937:1 gene:ENSMUSG00000001175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000014110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:100199382:100266494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONMMUT015388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NR_045741 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10432 (Gm10432), long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000180617 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:12:100941742:100949875:1 gene:ENSMUSG00000097160 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// AK153749 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630072L19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// XR_394741 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A630072L19 gene (A630072L19Rik), transcript variant X4, ncRNA. // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AK089356 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730014G11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT015410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONMMUT015411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NR_038047 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D130020L05 gene (D130020L05Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_038048 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D130020L05 gene (D130020L05Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_038049 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D130020L05 gene (D130020L05Rik), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_038050 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D130020L05 gene (D130020L05Rik), transcript variant 4, long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180800 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:12:101082481:101088927:1 gene:ENSMUSG00000097121 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK047073 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930016L22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT015427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NR_033653 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 4, pseudogene (Kif4-ps), non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:101145614:101149278:1 gene:ENSMUSG00000092054 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:101145614:101149282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000182069 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:101205723:101206514:1 gene:ENSMUSG00000098167 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000005538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:101160772:101206466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NM_173023 // RefSeq // Mus musculus catsper channel auxiliary subunit beta (Catsperb), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:101404673:101626009:1 gene:ENSMUSG00000047014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132479 // GenBank // Mus musculus cation channel, sperm-associated, beta, mRNA (cDNA clone MGC:164110 IMAGE:40130756), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EF199807 // GenBank // Mus musculus CatSper channel subunit beta mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:101459878:101625742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_016856 // RefSeq // Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 2 (Cpsf2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000047357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:101975974:102005993:1 gene:ENSMUSG00000041781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF012822 // GenBank // Mus musculus cleavage and polyadenylation specificity factor (MCPSF) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC013628 // GenBank // Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:5855 IMAGE:3497854), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:101981947:102029474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
NM_172152 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 4 (Slc24a4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000079020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:102129174:102266749:1 gene:ENSMUSG00000041771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000159329 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:102128733:102267091:1 gene:ENSMUSG00000041771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000161325 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:102129391:102266641:1 gene:ENSMUSG00000041771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AY156046 // GenBank // Mus musculus K-dependent Na/Ca exchanger NCKX4 (Slc24a4) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC137945 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:169569 IMAGE:8860964), complete cds. // chr12 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// BC171939 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:198644 IMAGE:9054225), complete cds. // chr12 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:102210559:102239521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
NM_001161365 // RefSeq // Mus musculus Ras and Rab interactor 3 (Rin3), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NM_177620 // RefSeq // Mus musculus Ras and Rab interactor 3 (Rin3), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000056950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:102283048:102390855:1 gene:ENSMUSG00000044456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000133820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:102283641:102390855:1 gene:ENSMUSG00000044456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// AY265356 // GenBank // Mus musculus Ras and Rab interactor 3 (Rin3) mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 94 // 31 // 33 // 0 /// BC058432 // GenBank // Mus musculus Ras and Rab interactor 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5694731), complete cds. // chr12 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// BC137907 // GenBank // Mus musculus Ras and Rab interactor 3, mRNA (cDNA clone MGC:169531 IMAGE:8860926), complete cds. // chr12 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000101114 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:102283167:102363068:1 gene:ENSMUSG00000044456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// AK133988 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730598M04 product:Ras and Rab interactor 3, full insert sequence. // chr12 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// GENSCAN00000010022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:102274095:102390144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
NM_001199004 // RefSeq // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 5 (Golga5), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_013747 // RefSeq // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 5 (Golga5), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006515935 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 5 (Golga5), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:102469910:102497902:1 gene:ENSMUSG00000021192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000179218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:102469134:102497902:1 gene:ENSMUSG00000021192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB016784 // GenBank // Mus musculus ret-11 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF026274 // GenBank // Mus musculus Sumiko (sumiko) mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// BC016883 // GenBank // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 5, mRNA (cDNA clone MGC:18341 IMAGE:4235952), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC086782 // GenBank // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 5, mRNA (cDNA clone MGC:102087 IMAGE:6813878), complete cds. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:102472028:102497527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NM_007693 // RefSeq // Mus musculus chromogranin A (Chga), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000021610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:102554969:102565027:1 gene:ENSMUSG00000021194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC026554 // GenBank // Mus musculus chromogranin A, mRNA (cDNA clone MGC:36117 IMAGE:4990941), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M64278 // GenBank // Mouse chromogranin A cDNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:102555125:102564693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_177140 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 251 (Tmem251), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:102743760:102747561:1 gene:ENSMUSG00000046675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK172131 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830043N19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AK219426 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0148G21, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000057416, based on BLAT search. // chr12 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0 /// BC096606 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D230037D09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106188 IMAGE:5366962), complete cds. // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_025666 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 7 (putative) (Ubr7), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000046404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:102757975:102777701:1 gene:ENSMUSG00000041712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC094423 // GenBank // Mus musculus ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 7 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:122967 IMAGE:6812389), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:102758029:102775786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_001039049 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIIc (Cox8c), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:102899306:102900534:1 gene:ENSMUSG00000043319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145768 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit VIIIc, mRNA (cDNA clone MGC:175655 IMAGE:40131071), complete cds. // chr12 // 82 // 68 // 14 // 17 // 0 /// BC145770 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit VIIIc, mRNA (cDNA clone MGC:175657 IMAGE:40131073), complete cds. // chr12 // 82 // 68 // 14 // 17 // 0
NM_001081017 // RefSeq // Mus musculus unc-79 homolog (C. elegans) (Unc79), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// XM_006515742 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-79 homolog (C. elegans) (Unc79), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000085079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:103001889:103183998:1 gene:ENSMUSG00000021198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000101099 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:102948859:103184001:1 gene:ENSMUSG00000021198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000178076 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:103001946:103184065:1 gene:ENSMUSG00000021198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000179002 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:102949554:103183613:1 gene:ENSMUSG00000021198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// AB257853 // GenBank // Mus musculus KIAA1409 mRNA for KIAA1409, complete cds. // chr12 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// GQ334471 // GenBank // Mus musculus UNC79 (Unc79) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000010035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:103041665:103193106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 38 // 38 // 0
NM_001195726 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 181, member A (Fam181a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006515320 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 181, member A (Fam181a), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006515321 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 181, member A (Fam181a), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000179363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:103314959:103317065:1 gene:ENSMUSG00000096753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000189885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:103314953:103316318:1 gene:ENSMUSG00000096753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000191218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:103310975:103317065:1 gene:ENSMUSG00000096753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:103280501:103316716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000166601 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:104080649:104086724:1 gene:ENSMUSG00000092075 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr12 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// BC024071 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 4, pseudogene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5097263). // chr12 // 67 // 67 // 12 // 18 // 0 /// BC031891 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 4, pseudogene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5123840). // chr12 // 65 // 85 // 15 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:104080557:104086724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_172953 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 5 (Serpina5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515916 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 5 (Serpina5), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000021495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:104101113:104106137:1 gene:ENSMUSG00000041550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090981 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:107222 IMAGE:30285598), complete cds. // chr12 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:104101682:104141878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001167705 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3A (Serpina3a), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_028740 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3A (Serpina3a), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006516287 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3A (Serpina3a), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000021496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:104115970:104121518:1 gene:ENSMUSG00000041536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000109965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:104112724:104121896:1 gene:ENSMUSG00000041536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC063325 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3A, mRNA (cDNA clone MGC:74171 IMAGE:30280343), complete cds. // chr12 // 76 // 96 // 19 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:104112780:104121808:1 gene:ENSMUSG00000041536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:104101682:104141878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_173024 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3B (Serpina3b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000085052 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:104127996:104139545:1 gene:ENSMUSG00000066364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC125418 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3B, mRNA (cDNA clone MGC:159121 IMAGE:40129933), complete cds. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC145808 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3B, mRNA (cDNA clone MGC:175695 IMAGE:40131111), complete cds. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006515931 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3B (Serpina3b), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:104101682:104141878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NR_033450 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3H (Serpina3h), non-coding RNA. // chr12 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0 /// ENSMUST00000049922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:104247905:104252963:1 gene:ENSMUSG00000041449 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 82 // 46 // 9 // 11 // 0 /// ENSMUST00000116393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:104250152:104253669:1 gene:ENSMUSG00000041449 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr12 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:104250152:104253669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_011458 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3K (Serpina3k), mRNA. // chr12 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000043058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:104338486:104346144:1 gene:ENSMUSG00000058207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:104340511:104363534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_009253 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3M (Serpina3m), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000101078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:104338486:104394256:1 gene:ENSMUSG00000079012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000168797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:104387164:104394257:1 gene:ENSMUSG00000079012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC011158 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3M, mRNA (cDNA clone MGC:18640 IMAGE:4194074), complete cds. // chr12 // 94 // 94 // 15 // 16 // 0 /// BC053337 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3M, mRNA (cDNA clone MGC:59026 IMAGE:4208766), complete cds. // chr12 // 92 // 71 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:104389076:104393927:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0
NM_009252 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3N (Serpina3n), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000021506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:104406729:104414329:1 gene:ENSMUSG00000021091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC013651 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3N, mRNA (cDNA clone MGC:18516 IMAGE:4160649), complete cds. // chr12 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// M64086 // GenBank // Mouse spi2 proteinase inhibitor (spi2/eb4) mRNA, complete cds. // chr12 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:104408671:104413606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000070814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:104474488:104477489:1 gene:ENSMUSG00000056606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK045313 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130064M22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000021520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:104865330:104871524:1 gene:ENSMUSG00000021101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015114 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930408O17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_394763 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102633916 (LOC102633916), ncRNA. // chr12 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_028419 // RefSeq // Mus musculus glutaredoxin 5 homolog (S. cerevisiae) (Glrx5), mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:105032689:105040910:1 gene:ENSMUSG00000021102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC058371 // GenBank // Mus musculus glutaredoxin 5 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:66779 IMAGE:6819353), complete cds. // chr12 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// DQ083330 // GenBank // Mus musculus glutaredoxin 5 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// AK148847 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120454G15 product:2900070E19Rik protein (Weakly similar to glutaredoxin-related protein) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// GENSCAN00000007357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:105032700:105040450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0
NM_013775 // RefSeq // Mus musculus T cell leukemia/lymphoma 1B, 2 (Tcl1b2), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000081379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:105147033:105155225:1 gene:ENSMUSG00000060863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000142230 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:105146014:105155009:1 gene:ENSMUSG00000060863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000146174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:105147019:105155223:1 gene:ENSMUSG00000060863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// AF195489 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia protein Tcl1b2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// BC099461 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia/lymphoma 1B, 2, mRNA (cDNA clone MGC:117664 IMAGE:30935073), complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:105136416:105212313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_013773 // RefSeq // Mus musculus T cell leukemia/lymphoma 1B, 1 (Tcl1b1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000085043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:105159690:105166622:1 gene:ENSMUSG00000066359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF195488 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia protein Tcl1b1 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC052337 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia/lymphoma 1B, 1, mRNA (cDNA clone MGC:60528 IMAGE:30053367), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:105136416:105212313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_013776 // RefSeq // Mus musculus T cell leukemia/lymphoma 1B, 5 (Tcl1b5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000000717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:105176358:105181143:1 gene:ENSMUSG00000000701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF195493 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia protein Tcl1b5 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC125294 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia/lymphoma 1B, 5, mRNA (cDNA clone MGC:158997 IMAGE:40129809), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000007340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:105136416:105212313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_013772 // RefSeq // Mus musculus T cell leukemia/lymphoma 1B, 3 (Tcl1b3), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000090990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:105191043:105195610:1 gene:ENSMUSG00000068940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// AF195490 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia protein Tcl1b3 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// AF195491 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia protein Tcl1b3a mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr12 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// BC119260 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia/lymphoma 1B, 3, mRNA (cDNA clone MGC:155576 IMAGE:8734009), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC120575 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia/lymphoma 1B, 3, mRNA (cDNA clone MGC:155812 IMAGE:40129498), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:105136416:105212313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_013774 // RefSeq // Mus musculus T cell leukemia/lymphoma 1B, 4 (Tcl1b4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000000718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:105202422:105206993:1 gene:ENSMUSG00000079007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF195492 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia protein Tcl1b4 mRNA, complete cds. // chr12 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC145148 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia/lymphoma 1B, 4, mRNA (cDNA clone MGC:178707 IMAGE:9053699), complete cds. // chr12 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC145788 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia/lymphoma 1B, 4, mRNA (cDNA clone MGC:175675 IMAGE:40131091), complete cds. // chr12 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:105136416:105212313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_009747 // RefSeq // Mus musculus bradykinin receptor, beta 2 (Bdkrb2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000001652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:105563172:105593071:1 gene:ENSMUSG00000021070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137755 // GenBank // Mus musculus bradykinin receptor, beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:169379 IMAGE:8860774), complete cds. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC137756 // GenBank // Mus musculus bradykinin receptor, beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:169380 IMAGE:8860775), complete cds. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:105578070:105592680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_007539 // RefSeq // Mus musculus bradykinin receptor, beta 1 (Bdkrb1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:105604091:105605428:1 gene:ENSMUSG00000041347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:105603085:105605339:1 gene:ENSMUSG00000041347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183086 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:105603119:105604982:1 gene:ENSMUSG00000041347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// BC120684 // GenBank // Mus musculus bradykinin receptor, beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:155921 IMAGE:40129607), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:105596440:105605181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_178613 // RefSeq // Mus musculus GSK3B interacting protein (Gskip), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000051934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:105685352:105703047:1 gene:ENSMUSG00000044715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC031494 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933433P14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:27787 IMAGE:3156862), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_030187 // RefSeq // Mus musculus adenylate kinase 7 (Ak7), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_381556 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenylate kinase 7 (Ak7), transcript variant X3, misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000040876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:105705982:105782447:1 gene:ENSMUSG00000041323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006516391 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenylate kinase 7 (Ak7), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// AK078221 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430521C12 product:hypothetical NAD(P)-binding Rossmann-fold domains structure containing protein, full insert sequence. // chr12 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000013720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:105698719:105911222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000082269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:107488632:107489636:1 gene:ENSMUSG00000060375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK014062 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110018I06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_009832 // RefSeq // Mus musculus cyclin K (Ccnk), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000101055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:108179738:108203359:1 gene:ENSMUSG00000021258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC027297 // GenBank // Mus musculus cyclin K, mRNA (cDNA clone MGC:28173 IMAGE:3986609), complete cds. // chr12 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:108178385:108202701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_001044380 // RefSeq // Mus musculus hedgehog interacting protein-like 1 (Hhipl1), mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006515665 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hedgehog interacting protein-like 1 (Hhipl1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:108306270:108328300:1 gene:ENSMUSG00000021260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK129450 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1822 protein. // chr12 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// AK138646 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330092C16 product:MKIAA1822 protein (Fragment) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC057108 // GenBank HTC // Mus musculus hedgehog interacting protein-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5702152), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr12 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC113163 // GenBank // Mus musculus hedgehog interacting protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:132851 IMAGE:40060054), complete cds. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC113773 // GenBank // Mus musculus hedgehog interacting protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:132850 IMAGE:40060051), complete cds. // chr12 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:108306411:108328212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_010010 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 46, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp46a1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000021684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:108334377:108362231:1 gene:ENSMUSG00000021259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF094479 // GenBank // Mus musculus cholesterol 24-hydroxylase mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC018307 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 46, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:18311 IMAGE:4195579), complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:108334446:108361684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0
NR_029771 // RefSeq // Mus musculus microRNA 342 (Mir342), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083502 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:108658620:108658718:1 gene:ENSMUSG00000065436 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-342 // miRBase Micro RNA Database // MI0000627 Mus musculus miR-342 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009537 // RefSeq // Mus musculus YY1 transcription factor (Yy1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006515820 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus YY1 transcription factor (Yy1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000021692 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:108792973:108816632:1 gene:ENSMUSG00000021264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC055899 // GenBank // Mus musculus YY1 transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:68246 IMAGE:3156776), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M73963 // GenBank // Mus musculus UCR-motif DNA-binding protein (UCRBP) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M74590 // GenBank // Mouse delta transcription factor mRNA, complete cds. // chr12 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// ENSMUST00000126912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:108806239:108815564:1 gene:ENSMUSG00000021264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000010548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:108757628:108815655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
NR_029773 // RefSeq // Mus musculus microRNA 345 (Mir345), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083495 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:108836973:108837068:1 gene:ENSMUSG00000065429 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-345 // miRBase Micro RNA Database // MI0000632 Mus musculus miR-345 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012310 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 47 (Slc25a47), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:108851129:108856814:1 gene:ENSMUSG00000048856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC042739 // GenBank HTC // Mus musculus expressed sequence AI132487, mRNA (cDNA clone IMAGE:4236520), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr12 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC069939 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI132487, mRNA (cDNA clone MGC:78238 IMAGE:5053384), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089616 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI132487, mRNA (cDNA clone MGC:107675 IMAGE:6760348), complete cds. // chr12 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:108849909:108856219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_177602 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 25 (Wdr25), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 25 (Wdr25), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515660 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 25 (Wdr25), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515661 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 25 (Wdr25), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515664 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 25 (Wdr25), transcript variant X8, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:108894317:109028325:1 gene:ENSMUSG00000040877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:108894272:109028452:1 gene:ENSMUSG00000040877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK147993 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270131G12 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177602 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 25 (Wdr25), mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006515657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 25 (Wdr25), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006515660 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 25 (Wdr25), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000047115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:108894317:109028325:1 gene:ENSMUSG00000040877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000167816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:108894272:109028452:1 gene:ENSMUSG00000040877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK081117 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930090D16 product:hypothetical Trp-Asp repeat (WD-repeat) structure containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK147993 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270131G12 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006515661 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 25 (Wdr25), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000010557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:108950525:109027467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
GENSCAN00000010545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:109092699:109098703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
GENSCAN00000056931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109408282:109426428:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NR_030438 // RefSeq // Mus musculus microRNA 673 (Mir673), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102361 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109571990:109572080:1 gene:ENSMUSG00000076316 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184307 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109572498:109572588:1 gene:ENSMUSG00000098324 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-673 // miRBase Micro RNA Database // MI0004601 Mus musculus miR-673 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029765 // RefSeq // Mus musculus microRNA 337 (Mir337), microRNA. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083592 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109585790:109585886:1 gene:ENSMUSG00000065526 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184047 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109586298:109586394:1 gene:ENSMUSG00000099194 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:109580102:109586028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109580610:109586536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-337 // miRBase Micro RNA Database // MI0000615 Mus musculus miR-337 stem-loop // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT015728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_030260 // RefSeq // Mus musculus microRNA 540 (Mir540), microRNA. // chr12 // 81 // 81 // 17 // 21 // 0 /// ENSMUST00000102167 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109586071:109586154:1 gene:ENSMUSG00000072900 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000185161 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109586579:109586662:1 gene:ENSMUSG00000098806 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// mmu-mir-540 // miRBase Micro RNA Database // MI0003518 Mus musculus miR-540 stem-loop // chr12 // 81 // 81 // 17 // 21 // 0 /// NONMMUT015729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT015730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 81 // 81 // 17 // 21 // 0
NR_030425 // RefSeq // Mus musculus microRNA 665 (Mir665), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102358 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109586314:109586407:1 gene:ENSMUSG00000076313 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184551 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109586822:109586915:1 gene:ENSMUSG00000099048 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-665 // miRBase Micro RNA Database // MI0004171 Mus musculus miR-665 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029951 // RefSeq // Mus musculus microRNA 431 (Mir431), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093572 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109590447:109590537:1 gene:ENSMUSG00000070080 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184116 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109590955:109591045:1 gene:ENSMUSG00000098321 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-431 // miRBase Micro RNA Database // MI0001524 Mus musculus miR-431 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002848 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 6430411K18 gen (6430411K18Rik), long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_029952 // RefSeq // Mus musculus microRNA 433 (Mir433), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093564 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109591715:109591838:1 gene:ENSMUSG00000070072 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183961 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109592223:109592346:1 gene:ENSMUSG00000098576 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU434921 // GenBank // Mus musculus Peg11 antisense RNA, partial sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// antiPeg11 // lncRNA Db // GenBank: EU434921.1_Mus musculus Peg11 antisense RNA, partial sequence.mm9 chr12:110,828,763-110,831,063 // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-433 // miRBase Micro RNA Database // MI0001525 Mus musculus miR-433 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029542 // RefSeq // Mus musculus microRNA 127 (Mir127), microRNA. // chr12 // 75 // 80 // 15 // 20 // 0 /// ENSMUST00000093568 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109592832:109592928:1 gene:ENSMUSG00000070076 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184610 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109593340:109593436:1 gene:ENSMUSG00000099044 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-127 // miRBase Micro RNA Database // MI0000154 Mus musculus miR-127 stem-loop // chr12 // 75 // 80 // 15 // 20 // 0 /// NONMMUT015738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 75 // 80 // 15 // 20 // 0
NR_029953 // RefSeq // Mus musculus microRNA 434 (Mir434), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093625 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109594506:109594599:1 gene:ENSMUSG00000070133 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183896 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109595014:109595107:1 gene:ENSMUSG00000099171 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-434 // miRBase Micro RNA Database // MI0001526 Mus musculus miR-434 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029550 // RefSeq // Mus musculus microRNA 136 (Mir136), microRNA. // chr12 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// ENSMUST00000093621 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109595317:109595398:1 gene:ENSMUSG00000070129 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184309 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109595825:109595906:1 gene:ENSMUSG00000098913 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-136 // miRBase Micro RNA Database // MI0000162 Mus musculus miR-136 stem-loop // chr12 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// NONMMUT015742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0
NR_029770 // RefSeq // Mus musculus microRNA 341 (Mir341), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093593 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109611500:109611595:1 gene:ENSMUSG00000070101 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000184344 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109612008:109612103:1 gene:ENSMUSG00000099090 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// mmu-mir-341 // miRBase Micro RNA Database // MI0000625 Mus musculus miR-341 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT015755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_029918 // RefSeq // Mus musculus microRNA 370 (Mir370), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000083499 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109618258:109618336:1 gene:ENSMUSG00000065433 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000183521 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109618766:109618844:1 gene:ENSMUSG00000098610 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-370 // miRBase Micro RNA Database // MI0001165 Mus musculus miR-370 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT015758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000082518 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109631074:109631148:1 gene:ENSMUSG00000064452 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183909 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109631582:109631656:1 gene:ENSMUSG00000098352 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000158892 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109641022:109641094:1 gene:ENSMUSG00000089517 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000183191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:109640341:109642351:1 gene:ENSMUSG00000098061 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000183766 // ENSEMBL // proj_havana:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109640849:109642859:1 gene:ENSMUSG00000099040 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000184341 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109641530:109641602:1 gene:ENSMUSG00000098902 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK049674 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530021M01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT015768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT015769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_046305 // RefSeq // Mus musculus snoRNA DQ267101 (DQ267101), small nucleolar RNA. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000082562 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109651424:109651496:1 gene:ENSMUSG00000064496 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000184018 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109651932:109652004:1 gene:ENSMUSG00000099046 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT015781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT015787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000083079 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109653033:109653104:1 gene:ENSMUSG00000065013 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000180876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:109646162:109655009:1 gene:ENSMUSG00000097451 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK163850 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130082M19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB076245 // GenBank // Mus musculus mRNA, MBII-343 snoRNA. // chr12 // 52 // 100 // 15 // 29 // 0 /// ENSMUST00000183744 // ENSEMBL // proj_havana:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109646670:109655517:1 gene:ENSMUSG00000099249 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000184376 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109653541:109653612:1 gene:ENSMUSG00000098581 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT015776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT015788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_028433 // RefSeq // Mus musculus snoRNA AF357355 (AF357355), small nucleolar RNA. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082687 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109654627:109654698:1 gene:ENSMUSG00000064621 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:109646162:109655009:1 gene:ENSMUSG00000097451 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB076245 // GenBank // Mus musculus mRNA, MBII-343 snoRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF357355 // GenBank // Mus musculus clone MBII-343 C/D box snoRNA, partial sequence. // chr12 // 50 // 72 // 9 // 18 // 0 /// ENSMUST00000183667 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109655135:109655206:1 gene:ENSMUSG00000098971 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183744 // ENSEMBL // proj_havana:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109646670:109655517:1 gene:ENSMUSG00000099249 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 78 // 72 // 14 // 18 // 0 /// NONMMUT015792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 78 // 72 // 14 // 18 // 0 /// NONMMUT015793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 78 // 72 // 14 // 18 // 0 /// NONMMUT015791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 50 // 72 // 9 // 18 // 0
NR_046306 // RefSeq // Mus musculus snoRNA DQ267102 (DQ267102), small nucleolar RNA. // chr12 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000082483 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109656345:109656416:1 gene:ENSMUSG00000064417 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000184345 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109656853:109656924:1 gene:ENSMUSG00000098372 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT015794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000082745 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109657125:109657196:1 gene:ENSMUSG00000064679 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000183854 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109657633:109657704:1 gene:ENSMUSG00000098673 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT015795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000083823 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109673913:109673994:1 gene:ENSMUSG00000065757 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184447 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109674421:109674502:1 gene:ENSMUSG00000098637 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141557 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630025E23 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083815 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109679945:109680013:1 gene:ENSMUSG00000065749 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000183391 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109680453:109680521:1 gene:ENSMUSG00000098523 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT015801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000082553 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109680800:109680874:1 gene:ENSMUSG00000064487 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082611 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109682384:109682458:1 gene:ENSMUSG00000064545 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183585 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109681308:109681382:1 gene:ENSMUSG00000098337 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184468 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109682892:109682966:1 gene:ENSMUSG00000099271 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083088 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109681519:109681593:1 gene:ENSMUSG00000065022 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF357341 // GenBank // Mus musculus clone MBII-19 C/D box snoRNA, partial sequence. // chr12 // 81 // 87 // 22 // 27 // 0 /// ENSMUST00000184368 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109682027:109682101:1 gene:ENSMUSG00000098556 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT015803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT015804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 81 // 87 // 22 // 27 // 0
XR_394816 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642047 (LOC102642047), transcript variant X2, ncRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XR_394818 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642047 (LOC102642047), transcript variant X4, ncRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XR_394821 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642047 (LOC102642047), transcript variant X7, ncRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XR_394827 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642047 (LOC102642047), transcript variant X13, ncRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000082786 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109682994:109683068:1 gene:ENSMUSG00000064720 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000184057 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109683502:109683576:1 gene:ENSMUSG00000099038 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT015807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XR_394816 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642047 (LOC102642047), transcript variant X2, ncRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082792 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109686798:109686869:1 gene:ENSMUSG00000064726 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183810 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG4180_PATCH:109687306:109687377:1 gene:ENSMUSG00000099029 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029880 // RefSeq // Mus musculus microRNA 379 (Mir379), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083564 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109709056:109709135:1 gene:ENSMUSG00000065498 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-379 // miRBase Micro RNA Database // MI0000796 Mus musculus miR-379 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029916 // RefSeq // Mus musculus microRNA 411 (Mir411), microRNA. // chr12 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083543 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109710175:109710270:1 gene:ENSMUSG00000065477 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-411 // miRBase Micro RNA Database // MI0001163 Mus musculus miR-411 stem-loop // chr12 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONMMUT015817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NR_029650 // RefSeq // Mus musculus microRNA 299a (Mir299a), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-299a // miRBase Micro RNA Database // MI0000399 Mus musculus miR-299 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029881 // RefSeq // Mus musculus microRNA 380 (Mir380), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-380 // miRBase Micro RNA Database // MI0000797 Mus musculus miR-380 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029757 // RefSeq // Mus musculus microRNA 323 (Mir323), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083683 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109712508:109712593:1 gene:ENSMUSG00000065617 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-323 // miRBase Micro RNA Database // MI0000592 Mus musculus miR-323 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029762 // RefSeq // Mus musculus microRNA 329 (Mir329), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083643 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109713481:109713577:1 gene:ENSMUSG00000065577 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-329 // miRBase Micro RNA Database // MI0000605 Mus musculus miR-329 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030269 // RefSeq // Mus musculus microRNA 494 (Mir494), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000093632 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109715318:109715402:1 gene:ENSMUSG00000070141 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-mir-494 // miRBase Micro RNA Database // MI0003532 Mus musculus miR-494 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT015826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_030445 // RefSeq // Mus musculus microRNA 679 (Mir679), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102191 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109715577:109715650:1 gene:ENSMUSG00000076145 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-679 // miRBase Micro RNA Database // MI0004638 Mus musculus miR-679 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT015827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_030435 // RefSeq // Mus musculus microRNA 666 (Mir666), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102317 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109717085:109717183:1 gene:ENSMUSG00000076272 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-666 // miRBase Micro RNA Database // MI0004553 Mus musculus miR-666 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030261 // RefSeq // Mus musculus microRNA 543 (Mir543), microRNA. // chr12 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// ENSMUST00000102286 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109717256:109717335:1 gene:ENSMUSG00000076241 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-543 // miRBase Micro RNA Database // MI0003519 Mus musculus miR-543 stem-loop // chr12 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NONMMUT015830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0
NR_030446 // RefSeq // Mus musculus microRNA 495 (Mir495), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000093597 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109718747:109718826:1 gene:ENSMUSG00000070105 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// mmu-mir-495 // miRBase Micro RNA Database // MI0004639 Mus musculus miR-495 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT015831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT015832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NR_030426 // RefSeq // Mus musculus microRNA 667 (Mir667), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102441 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109720006:109720097:1 gene:ENSMUSG00000076396 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-667 // miRBase Micro RNA Database // MI0004196 Mus musculus miR-667 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030270 // RefSeq // Mus musculus microRNA 376c (Mir376c), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-mir-376c // miRBase Micro RNA Database // MI0003533 Mus musculus miR-376c stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT015836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_029915 // RefSeq // Mus musculus microRNA 376b (Mir376b), microRNA. // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102052 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109723456:109723541:1 gene:ENSMUSG00000076006 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-376b // miRBase Micro RNA Database // MI0001162 Mus musculus miR-376b stem-loop // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONMMUT015838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
NR_029877 // RefSeq // Mus musculus microRNA 376a (Mir376a), microRNA. // chr12 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// mmu-mir-376a // miRBase Micro RNA Database // MI0000793 Mus musculus miR-376a stem-loop // chr12 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// NONMMUT015840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0
NR_029651 // RefSeq // Mus musculus microRNA 300 (Mir300), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000083485 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109724305:109724394:1 gene:ENSMUSG00000098807 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:109689114:109734890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-300 // miRBase Micro RNA Database // MI0000400 Mus musculus miR-300 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT015841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_029882 // RefSeq // Mus musculus microRNA 381 (Mir381), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000083632 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109726812:109726901:1 gene:ENSMUSG00000098838 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-381 // miRBase Micro RNA Database // MI0000798 Mus musculus miR-381 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT015842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_030271 // RefSeq // Mus musculus microRNA 487b (Mir487b), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000102265 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109727333:109727414:1 gene:ENSMUSG00000076219 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// mmu-mir-487b // miRBase Micro RNA Database // MI0003534 Mus musculus miR-487b stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT015843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NR_030262 // RefSeq // Mus musculus microRNA 539 (Mir539), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102109 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109728129:109728202:1 gene:ENSMUSG00000076063 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-539 // miRBase Micro RNA Database // MI0003520 Mus musculus miR-539 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029883 // RefSeq // Mus musculus microRNA 382 (Mir382), microRNA. // chr12 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// ENSMUST00000083494 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109733772:109733851:1 gene:ENSMUSG00000065428 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// mmu-mir-382 // miRBase Micro RNA Database // MI0000799 Mus musculus miR-382 stem-loop // chr12 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NONMMUT015854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0
NR_030424 // RefSeq // Mus musculus microRNA 668 (Mir668), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183620 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109734708:109734813:1 gene:ENSMUSG00000099236 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-668 // miRBase Micro RNA Database // MI0004134 Mus musculus miR-668 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029564 // RefSeq // Mus musculus microRNA 154 (Mir154), microRNA. // chr12 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// ENSMUST00000083514 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109738424:109738507:1 gene:ENSMUSG00000065448 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-154 // miRBase Micro RNA Database // MI0000176 Mus musculus miR-154 stem-loop // chr12 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// NONMMUT015863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0
NR_030437 // RefSeq // Mus musculus microRNA 496a (Mir496a), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000093627 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109739119:109739197:1 gene:ENSMUSG00000070136 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-496a // miRBase Micro RNA Database // MI0004589 Mus musculus miR-496 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT015865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_029878 // RefSeq // Mus musculus microRNA 377 (Mir377), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000083504 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109740510:109740577:1 gene:ENSMUSG00000065438 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000181496 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:109737780:109741503:1 gene:ENSMUSG00000097391 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-377 // miRBase Micro RNA Database // MI0000794 Mus musculus miR-377 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT015862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT015866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_030263 // RefSeq // Mus musculus microRNA 541 (Mir541), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102097 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109742409:109742498:1 gene:ENSMUSG00000076052 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-541 // miRBase Micro RNA Database // MI0003521 Mus musculus miR-541 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029913 // RefSeq // Mus musculus microRNA 409 (Mir409), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-409 // miRBase Micro RNA Database // MI0001160 Mus musculus miR-409 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029917 // RefSeq // Mus musculus microRNA 412 (Mir412), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083636 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109743289:109743368:1 gene:ENSMUSG00000065570 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-412 // miRBase Micro RNA Database // MI0001164 Mus musculus miR-412 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030272 // RefSeq // Mus musculus microRNA 369 (Mir369), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000083627 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:109743418:109743496:1 gene:ENSMUSG00000065561 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// mmu-mir-369 // miRBase Micro RNA Database // MI0003535 Mus musculus miR-369 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT015871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000025642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:109790305:109841961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_172119 // RefSeq // Mus musculus deiodinase, iodothyronine type III (Dio3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000097228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:110279260:110280708:1 gene:ENSMUSG00000075707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000173014 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:110279068:110281097:1 gene:ENSMUSG00000075707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC106847 // GenBank // Mus musculus deiodinase, iodothyronine type III, mRNA (cDNA clone MGC:124117 IMAGE:40046057), complete cds. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC106848 // GenBank // Mus musculus deiodinase, iodothyronine type III, mRNA (cDNA clone MGC:124118 IMAGE:40046058), complete cds. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:110278437:110302140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001135001 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma (Ppp2r5c), transcript variant 4, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK129042 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0044 protein. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
BC147179 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9056210. // chr12 // 82 // 44 // 9 // 11 // 0 /// NM_001135001 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma (Ppp2r5c), transcript variant 4, mRNA. // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// AK129042 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0044 protein. // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001135001 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma (Ppp2r5c), transcript variant 4, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK129042 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0044 protein. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030238 // RefSeq // Mus musculus dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1 (Dync1h1), mRNA. // chr12 // 100 // 99 // 77 // 77 // 0 /// ENSMUST00000018851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:110601452:110666945:1 gene:ENSMUSG00000018707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 99 // 77 // 77 // 0 /// AY004877 // GenBank // Mus musculus cytoplasmic dynein heavy chain mRNA, complete cds. // chr12 // 95 // 99 // 73 // 77 // 0 /// GENSCAN00000030455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:110601605:110666691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 99 // 77 // 77 // 0 /// BC026518 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4913179, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr12 // 100 // 15 // 12 // 12 // 0
NM_027149 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 20 (Wdr20), mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// XM_006516203 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 20 (Wdr20), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// XM_006516205 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 20 (Wdr20), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000095410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:110737949:110795028:1 gene:ENSMUSG00000037957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC026761 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 20A, mRNA (cDNA clone MGC:30262 IMAGE:4221717), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// AK009711 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310040A13 product:DMR-N9 PROTEIN (FRAGMENT) homolog [Xenopus laevis], full insert sequence. // chr12 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1 /// BC027497 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:1382359, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr12 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// GENSCAN00000030452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:110738029:110797005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0
NM_001199785 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 839 (Zfp839), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_028365 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 839 (Zfp839), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000170060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:110850279:110869998:1 gene:ENSMUSG00000021271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC150732 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 839, mRNA (cDNA clone MGC:183643 IMAGE:9087643), complete cds. // chr12 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// XR_381547 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 839 (Zfp839), transcript variant X2, misc_RNA. // chr12 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000030447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:110850318:110869078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1
NM_001081057 // RefSeq // Mus musculus tectonin beta-propeller repeat containing 2 (Tecpr2), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NM_001289510 // RefSeq // Mus musculus tectonin beta-propeller repeat containing 2 (Tecpr2), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_175336 // RefSeq // Mus musculus tectonin beta-propeller repeat containing 2 (Tecpr2), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000165978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:110889264:110972392:1 gene:ENSMUSG00000021275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000169597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:110889264:110972394:1 gene:ENSMUSG00000021275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC138354 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930573I19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169979 IMAGE:8861374), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK031736 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030499N03 product:hypothetical Trp-Asp repeat (WD-repeat) structure containing protein, full insert sequence. // chr12 // 48 // 48 // 19 // 40 // 1 /// GENSCAN00000030453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:110914656:110969020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
NM_198023 // RefSeq // Mus musculus REST corepressor 1 (Rcor1), mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000084968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:111039351:111115901:1 gene:ENSMUSG00000037896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000116388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:111039798:111113384:1 gene:ENSMUSG00000037896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AB093210 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0071 protein. // chr12 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// BC042731 // GenBank // Mus musculus REST corepressor 1, mRNA (cDNA clone MGC:51582 IMAGE:4936863), complete cds. // chr12 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000030454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:111093002:111150494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1
AY512946 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0921A07 unknown mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_033603 // RefSeq // Mus musculus amnionless (Amn), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:111271111:111276426:1 gene:ENSMUSG00000021278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF320619 // GenBank // Mus musculus amnionless precursor protein (Amn) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK088429 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430016G22 product:amnionless, full insert sequence. // chr12 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC087954 // GenBank // Mus musculus amnionless, mRNA (cDNA clone MGC:107601 IMAGE:30119116), complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:111194088:111276129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001289487 // RefSeq // Mus musculus exocyst complex component 3-like 4 (Exoc3l4), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001289488 // RefSeq // Mus musculus exocyst complex component 3-like 4 (Exoc3l4), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NM_028807 // RefSeq // Mus musculus exocyst complex component 3-like 4 (Exoc3l4), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000072646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:111417430:111431182:1 gene:ENSMUSG00000021280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK005443 // GenBank HTC // Mus musculus adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1600013K19 product:hypothetical Gram-positive cocci surface protein anchoring hexapeptide containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC075664 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1200009I06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:96436 IMAGE:30604610), complete cds. // chr12 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// NM_001289489 // RefSeq // Mus musculus exocyst complex component 3-like 4 (Exoc3l4), transcript variant 4, mRNA. // chr12 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// AK154875 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630110G08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000032980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:111418990:111430852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NR_033168 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 28 (Snora28), small nucleolar RNA. // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000082559 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:111540941:111541067:1 gene:ENSMUSG00000064493 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK160879 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body below diaphragm region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3732405H24 product:eukaryotic translation initiation factor 5, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT015968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_021516 // RefSeq // Mus musculus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3 (Mark3), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// NM_022801 // RefSeq // Mus musculus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3 (Mark3), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// XM_006515520 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3 (Mark3), transcript variant X10, mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000075281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:111574510:111656227:1 gene:ENSMUSG00000007411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000084953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:111574510:111656227:1 gene:ENSMUSG00000007411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// AF240782 // GenBank // Mus musculus ELKL motif kinase 2 long form (EMK2) mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// AF240783 // GenBank // Mus musculus ELKL motif kinase 2 short form (EMK2) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// BC026445 // GenBank // Mus musculus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:31426 IMAGE:4459439), complete cds. // chr12 // 94 // 45 // 17 // 18 // 0 /// BC066071 // GenBank // Mus musculus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6854192), partial cds. // chr12 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// AK220557 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4230 protein. // chr12 // 48 // 48 // 19 // 40 // 1 /// GENSCAN00000032981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:111563216:111655615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0
NM_001099793 // RefSeq // Mus musculus tRNA methyltransferase 61A (Trmt61a), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NM_177374 // RefSeq // Mus musculus tRNA methyltransferase 61A (Trmt61a), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000084947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:111678105:111683902:1 gene:ENSMUSG00000060950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051186 // GenBank // Mus musculus tRNA methyltransferase 61 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:57040 IMAGE:6468754), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001099792 // RefSeq // Mus musculus tRNA methyltransferase 61A (Trmt61a), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSMUST00000168338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:111678105:111683902:1 gene:ENSMUSG00000060950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// AK133579 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330408I23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000032975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:111678632:111682869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_026752 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 21 (Zfyve21), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006516196 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 21 (Zfyve21), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000021714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:111814170:111828388:1 gene:ENSMUSG00000021286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC019521 // GenBank // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 21, mRNA (cDNA clone MGC:28620 IMAGE:4220205), complete cds. // chr12 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// BC132248 // GenBank // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 21, mRNA (cDNA clone MGC:163879 IMAGE:40130525), complete cds. // chr12 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC132250 // GenBank // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 21, mRNA (cDNA clone MGC:163881 IMAGE:40130527), complete cds. // chr12 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:111814240:111828208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1
NM_029056 // RefSeq // Mus musculus tudor domain containing 9 (Tdrd9), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006516317 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tudor domain containing 9 (Tdrd9), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XR_381553 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tudor domain containing 9 (Tdrd9), transcript variant X8, misc_RNA. // chr12 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000079009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:111971559:112068854:1 gene:ENSMUSG00000054003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AB362563 // GenBank // Mus musculus tdrd9 mRNA for tudor domain containing 9, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC115831 // GenBank // Mus musculus tudor domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:141512 IMAGE:40086202), complete cds. // chr12 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// BC116656 // GenBank // Mus musculus tudor domain containing 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:40086194), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:111971642:112068280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
NM_001081169 // RefSeq // Mus musculus asparaginase homolog (S. cerevisiae) (Aspg), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006515345 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus asparaginase homolog (S. cerevisiae) (Aspg), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006515347 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus asparaginase homolog (S. cerevisiae) (Aspg), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000079400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112106683:112127573:1 gene:ENSMUSG00000037686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC023353 // GenBank HTC // Mus musculus asparaginase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5040222), with apparent retained intron. // chr12 // 79 // 44 // 11 // 14 // 0 /// BC126962 // GenBank // Mus musculus asparaginase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:143744 IMAGE:40092851), complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:112106892:112126745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NR_029590 // RefSeq // Mus musculus microRNA 203 (Mir203), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083640 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:112130880:112130955:1 gene:ENSMUSG00000065574 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-203 // miRBase Micro RNA Database // MI0000246 Mus musculus miR-203 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT016011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001097621 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 26A (Kif26a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000128402 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:112146208:112181747:1 gene:ENSMUSG00000021294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000183816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:112179154:112180533:1 gene:ENSMUSG00000021294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// AK129315 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1236 protein. // chr12 // 88 // 84 // 23 // 26 // 0 /// GQ489027 // GenBank // Mus musculus strain A/J kinesin superfamily protein 26A (Kif26a) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:112144193:112180632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_177039 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A530016L24 gene (A530016L24Rik), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515981 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A530016L24 gene (A530016L24Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000057465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112489448:112499927:1 gene:ENSMUSG00000043122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026527 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A530016L24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:32149 IMAGE:4924828), complete cds. // chr12 // 65 // 80 // 13 // 20 // 0 /// BC096642 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A530016L24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106887 IMAGE:1067695), complete cds. // chr12 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// AK040838 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530029K01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONMMUT016022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000025288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:112468378:112498775:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_198411 // RefSeq // Mus musculus inverted formin, FH2 and WH2 domain containing (Inf2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000101029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112588784:112615556:1 gene:ENSMUSG00000037679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC060610 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610204M08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:79233 IMAGE:6416724), complete cds. // chr12 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC099931 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610204M08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107363 IMAGE:30063439), complete cds. // chr12 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// DQ834374 // GenBank // Mus musculus INF2 mRNA, complete cds. // chr12 // 81 // 96 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:112583503:112614923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_007421 // RefSeq // Mus musculus adenylosuccinate synthetase like 1 (Adssl1), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112620047:112641354:1 gene:ENSMUSG00000011148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112620045:112641339:1 gene:ENSMUSG00000011148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK146907 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920073H18 product:adenylosuccinate synthetase, muscle, full insert sequence. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC039943 // GenBank // Mus musculus adenylosuccinate synthetase like 1, mRNA (cDNA clone MGC:49504 IMAGE:4014672), complete cds. // chr12 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// M74495 // GenBank // Mouse adenylosuccinate synthetase mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:112620119:112641010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001161737 // RefSeq // Mus musculus SIVA1, apoptosis-inducing factor (Siva1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// NM_013929 // RefSeq // Mus musculus SIVA1, apoptosis-inducing factor (Siva1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000021728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112644828:112649152:1 gene:ENSMUSG00000064326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000109755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112644828:112649152:1 gene:ENSMUSG00000064326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// AF033112 // GenBank // Mus musculus Siva-2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// AF033113 // GenBank // Mus musculus Siva-1 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// AF033114 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J Siva-1 mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// AK010562 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410021B16 product:Cd27 binding protein (Hindu God of destruction), full insert sequence. // chr12 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// BC012279 // GenBank // Mus musculus SIVA1, apoptosis-inducing factor, mRNA (cDNA clone MGC:18759 IMAGE:4013026), complete cds. // chr12 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000025279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:112644967:112649379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0
NM_001100460 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 42 (Zbtb42), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000169593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:112678840:112682747:1 gene:ENSMUSG00000037638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000174780 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:112678828:112682747:1 gene:ENSMUSG00000037638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC051084 // GenBank // Mus musculus similar to RP58 protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:6474882). // chr12 // 75 // 77 // 15 // 20 // 0 /// ENSMUST00000173942 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:112678878:112679970:1 gene:ENSMUSG00000037638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000025311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:112679393:112680655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001024602 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 170B (Cep170b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006515765 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centrosomal protein 170B (Cep170b), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006515767 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centrosomal protein 170B (Cep170b), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000092279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112722194:112746587:1 gene:ENSMUSG00000072825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000101018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112722174:112746591:1 gene:ENSMUSG00000072825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000179041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112722194:112746587:1 gene:ENSMUSG00000072825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AK122236 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0284 protein. // chr12 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC050077 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AW555464, mRNA (cDNA clone IMAGE:30022623), complete cds. // chr12 // 97 // 71 // 29 // 30 // 0 /// BC141174 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AW555464, mRNA (cDNA clone MGC:176135 IMAGE:9055786), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000025292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:112724651:112744912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0
NM_178911 // RefSeq // Mus musculus phospholipase D family, member 4 (Pld4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000063888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112760655:112768986:1 gene:ENSMUSG00000052160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK079878 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430098J23 product:hypothetical Phospholipase D/Transphosphatidylase containing protein, full insert sequence. // chr12 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// AK151551 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830031K04 product:hypothetical Phospholipase D/Transphosphatidylase/Phospholipase D phosphodiesterase active site profile containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC058565 // GenBank // Mus musculus phospholipase D family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:68329 IMAGE:6442038), complete cds. // chr12 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000025287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:112763391:112769654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_145450 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC022687 (BC022687), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000037014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112808975:112816245:1 gene:ENSMUSG00000037594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000177808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112808975:112815710:1 gene:ENSMUSG00000037594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC022687 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC022687, mRNA (cDNA clone MGC:31401 IMAGE:4242460), complete cds. // chr12 // 83 // 75 // 20 // 24 // 0 /// BC090976 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC022687, mRNA (cDNA clone MGC:107155 IMAGE:6741627), complete cds. // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_001145900 // RefSeq // Mus musculus BTB (POZ) domain containing 6 (Btbd6), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NM_201646 // RefSeq // Mus musculus BTB (POZ) domain containing 6 (Btbd6), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006516057 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BTB (POZ) domain containing 6 (Btbd6), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000002880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112976563:112978930:1 gene:ENSMUSG00000002803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000165079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112976482:112978930:1 gene:ENSMUSG00000002803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC031195 // GenBank // Mus musculus BTB (POZ) domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:37682 IMAGE:5059510), complete cds. // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:112976606:112978536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000180971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:112999964:113001926:1 gene:ENSMUSG00000097100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK033757 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230104M06 product:weakly similar to HYDROXYPROLINE-RICH GLYCOPROTEIN DZ-HRGP PRECURSOR [Volvox carteri f. nagariensis], full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT016051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT016052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001081170 // RefSeq // Mus musculus phosphofurin acidic cluster sorting protein 2 (Pacs2), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_001291444 // RefSeq // Mus musculus phosphofurin acidic cluster sorting protein 2 (Pacs2), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_001291445 // RefSeq // Mus musculus phosphofurin acidic cluster sorting protein 2 (Pacs2), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000084891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:113014508:113074401:1 gene:ENSMUSG00000021143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC059076 // GenBank // Mus musculus phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6826854), complete cds. // chr12 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000025298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:113014564:113071656:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
NM_029381 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 22 (Tex22), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006516338 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed gene 22 (Tex22), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000012355 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:113074502:113088914:1 gene:ENSMUSG00000012211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146107 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:113074502:113088916:1 gene:ENSMUSG00000012211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF522069 // GenBank // Mus musculus 22 kDa testis expressed protein (Tep22) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109729 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:113074756:113088917:1 gene:ENSMUSG00000012211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// BC048634 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 22, mRNA (cDNA clone MGC:58738 IMAGE:6770610), complete cds. // chr12 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000025284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:113074416:113088893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_024223 // RefSeq // Mus musculus cysteine rich protein 2 (Crip2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006536328 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cysteine rich protein 2 (Crip2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000084882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:113140236:113145504:1 gene:ENSMUSG00000006356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF469648 // GenBank // Mus musculus LIM protein (Hlp) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC002093 // GenBank // Mus musculus cysteine rich protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:6346 IMAGE:3489018), complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC002096 // GenBank // Mus musculus cysteine rich protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:6358 IMAGE:3493903), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// CT010309 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836C0352D for gene Crip2, Cysteine rich protein 2; complete cds, incl. stopcodon. // chr12 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:113140572:113145030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_007763 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich protein 1 (intestinal) (Crip1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000006523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:113152012:113153877:1 gene:ENSMUSG00000006360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC030406 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5344621, with apparent retained intron. // chr12 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC031922 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich protein 1 (intestinal), mRNA (cDNA clone MGC:18577 IMAGE:4206322), complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC064074 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich protein 1 (intestinal), mRNA (cDNA clone MGC:73671 IMAGE:948562), complete cds. // chr12 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// M13018 // GenBank // Mouse cysteine-rich intestinal protein (CRIP) mRNA, complete cds. // chr12 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0
NM_134041 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930427A07 gene (4930427A07Rik), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000049271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:113156421:113165456:1 gene:ENSMUSG00000037466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC116830 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930427A07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40126149), complete cds. // chr12 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC116834 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930427A07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40126153), complete cds. // chr12 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AK146189 // GenBank HTC // Mus musculus CRL-1722 L5178Y-R cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I730031O18 product:weakly similar to Human full-length cDNA clone CS0DI081YB03 of placenta of Homo sapiens (Human) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0 /// AK220305 // GenBank // Mus musculus mRNA for mFLJ00116 protein. // chr12 // 70 // 100 // 19 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:113156437:113165193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_153776 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 121 (Tmem121), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:113185903:113189520:1 gene:ENSMUSG00000049036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF488729 // GenBank // Mus musculus hole mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC043474 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 121, mRNA (cDNA clone MGC:49374 IMAGE:5364389), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:113185165:113246580:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001009545 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 6B (Adam6b), mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:113489545:113492018:1 gene:ENSMUSG00000051804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC111877 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930523C11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:132823 IMAGE:40059665), complete cds. // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:113489586:113491835:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_174885 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 6A (Adam6a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:113543908:113546414:1 gene:ENSMUSG00000043945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY158689 // GenBank // Mus musculus strain ICR ADAM6 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048757 // GenBank HTC // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:6703714). // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC108387 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:30916977), partial cds. // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC139059 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 6, mRNA (cDNA clone MGC:170686 IMAGE:8862081), complete cds. // chr12 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:113544030:113546273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000028096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:115170798:115176272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
AK079758 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430059D01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0
GENSCAN00000028108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:115615953:115617713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001004066 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 386 (Kruppel-like) (Zfp386), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001286214 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 386 (Kruppel-like) (Zfp386), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NM_019565 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 386 (Kruppel-like) (Zfp386), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000073551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:116047724:116060592:1 gene:ENSMUSG00000042063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000183125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:116047776:116063360:1 gene:ENSMUSG00000042063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AF175222 // GenBank // Mus musculus kruppel-like protein mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 53 // 17 // 18 // 0 /// AK043310 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730083G01 product:Kruppel associated box (KRAB) zinc finger 1, full insert sequence. // chr12 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// AK220544 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4205 protein. // chr12 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// BC004747 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 386 (Kruppel-like), mRNA (cDNA clone MGC:6701 IMAGE:3584034), complete cds. // chr12 // 93 // 85 // 27 // 29 // 0 /// ENSMUST00000182566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:116047764:116055116:1 gene:ENSMUSG00000042063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_133762 // RefSeq // Mus musculus non-SMC condensin II complex, subunit G2 (Ncapg2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000084828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:116405402:116463531:1 gene:ENSMUSG00000042029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY455829 // GenBank // Mus musculus more than blood (Mtb) mRNA, complete cds. // chr12 // 84 // 76 // 21 // 25 // 0 /// BC008539 // GenBank // Mus musculus non-SMC condensin II complex, subunit G2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3495609), complete cds. // chr12 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// BC076631 // GenBank // Mus musculus non-SMC condensin II complex, subunit G2, mRNA (cDNA clone MGC:96880 IMAGE:30637859), complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:116407233:116461531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0
NR_029563 // RefSeq // Mus musculus microRNA 153 (Mir153), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083604 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:117250817:117250885:1 gene:ENSMUSG00000065538 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-153 // miRBase Micro RNA Database // MI0000175 Mus musculus miR-153 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT016142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175930 // RefSeq // Mus musculus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 5 (Rapgef5), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515781 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 5 (Rapgef5), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:117516479:117756978:1 gene:ENSMUSG00000041992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK083591 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030051B22 product:hypothetical Guanine-nucleotide dissociation stimulators CDC25 family/Guanine nucleotide exchange factor for Ras-like GTPases; N-terminal motif containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC046627 // GenBank // Mus musculus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 5, mRNA (cDNA clone MGC:54925 IMAGE:6494175), complete cds. // chr12 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// AK122234 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0277 protein. // chr12 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000013136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:117714097:117756081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NM_146040 // RefSeq // Mus musculus cell division cycle associated 7 like (Cdca7l), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006515782 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cell division cycle associated 7 like (Cdca7l), transcript variant X1, mRNA. // chrUn // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:117843515:117878706:1 gene:ENSMUSG00000021175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000176735 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:117843884:117873757:1 gene:ENSMUSG00000021175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000177339 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:117843888:117875627:1 gene:ENSMUSG00000021175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// BC006933 // GenBank // Mus musculus cell division cycle associated 7 like, mRNA (cDNA clone MGC:11998 IMAGE:3602150), complete cds. // chrUn // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006515785 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cell division cycle associated 7 like (Cdca7l), transcript variant X4, mRNA. // chrUn // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:117864770:117877046:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_177082 // RefSeq // Mus musculus trans-acting transcription factor 8 (Sp8), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515986 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus trans-acting transcription factor 8 (Sp8), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006515988 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus trans-acting transcription factor 8 (Sp8), transcript variant X7, mRNA. // chr12 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000063918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:118846329:118852578:1 gene:ENSMUSG00000048562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK053093 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930049B17 product:weakly similar to C2H2 ZINC FINGER TRANSCRIPTION FACTOR [Drosophila melanogaster], full insert sequence. // chr12 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC082582 // GenBank // Mus musculus trans-acting transcription factor 8, mRNA (cDNA clone MGC:105193 IMAGE:30653287), complete cds. // chr12 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:118842542:118849872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
NM_001163136 // RefSeq // Mus musculus metastasis associated in colon cancer 1 (Macc1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006515861 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus metastasis associated in colon cancer 1 (Macc1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000048880 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:119443410:119466934:1 gene:ENSMUSG00000041886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000047513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:119426382:119465672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001160385 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 196 (Tmem196), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001294146 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 196 (Tmem196), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001294154 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 196 (Tmem196), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006515787 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 196 (Tmem196), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000058644 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:119945957:120019211:1 gene:ENSMUSG00000048004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000183694 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:119946410:120018813:1 gene:ENSMUSG00000048004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000184069 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:119946570:120019054:1 gene:ENSMUSG00000048004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000184820 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:119946558:120018706:1 gene:ENSMUSG00000048004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000184209 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:119946424:120014885:1 gene:ENSMUSG00000048004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_016676 // RefSeq // Mus musculus RAB10, member RAS oncogene family (Rab10), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:3247430:3309969:-1 gene:ENSMUSG00000020671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB232604 // GenBank // Mus musculus Rab10 mRNA for Rab10, complete cds. // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AF035646 // GenBank // Mus musculus small GTPase Rab10 (Rab10) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC052735 // GenBank // Mus musculus RAB10, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:6822417), partial cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056374 // GenBank // Mus musculus RAB10, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:65631 IMAGE:6848840), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// CT010394 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F0753D for gene Rab10, RAB10, member RAS oncogene family; complete cds, incl. stopcodon. // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK045299 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130063I11 product:GTP-binding protein rab10 [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:3249787:3279047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT013218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NR_030694 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1110002L01 gene (1110002L01Rik), long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000095903 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:3405310:3426740:-1 gene:ENSMUSG00000071456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000168012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:3403878:3427011:-1 gene:ENSMUSG00000071456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000179637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:3406706:3426714:-1 gene:ENSMUSG00000071456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// AK031200 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930428C01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000048581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:3521919:3523555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
NR_045884 // RefSeq // Mus musculus DNA methyltransferase 3A, opposite strand (Dnmt3aos), long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:3859293:3862244:-1 gene:ENSMUSG00000073242 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001082483 // RefSeq // Mus musculus EFR3 homolog B (S. cerevisiae) (Efr3b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000111178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:3962554:4038915:-1 gene:ENSMUSG00000020658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC147643 // GenBank // Mus musculus EFR3 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:182739 IMAGE:9056633), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC157968 // GenBank // Mus musculus EFR3 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189949 IMAGE:9088136), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000006458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:3971766:4009509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:3966442:3971067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0
NM_010881 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor coactivator 1 (Ncoa1), mRNA. // chrUn // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000085814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4247363:4477182:-1 gene:ENSMUSG00000020647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// BC068177 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor coactivator 1, mRNA (cDNA clone MGC:92937 IMAGE:30628581), complete cds. // chrUn // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// BC080866 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor coactivator 1, mRNA (cDNA clone MGC:90703 IMAGE:30532122), complete cds. // chrUn // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// U56920 // GenBank // Mus musculus steroid receptor coactivator 1a (Src1a) mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// U64606 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor co-activator (mNRC-1) mRNA, complete cds. // chrUn // 95 // 83 // 38 // 40 // 0 /// U64828 // GenBank // Mus musculus steroid receptor coactivator-1 (mSRC-1) mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AK035922 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630018F04 product:nuclear receptor coactivator 1, full insert sequence. // chrUn // 29 // 29 // 14 // 48 // 1 /// GENSCAN00000006522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:4278098:4372553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 44 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:4247878:4277137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 35 // 35 // 17 // 48 // 1
NM_029107 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 228, member A (Fam228a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006515237 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 228, member A (Fam228a), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// XR_381205 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 228, member A (Fam228a), transcript variant X6, misc_RNA. // chr12 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XR_381206 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 228, member A (Fam228a), transcript variant X7, misc_RNA. // chr12 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000111154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4713817:4738383:-1 gene:ENSMUSG00000079177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC138846 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930417G10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170473 IMAGE:8861868), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC138853 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930417G10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170480 IMAGE:8861875), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006515233 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 228, member A (Fam228a), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// XM_006515234 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 228, member A (Fam228a), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// AK015158 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930417G10 product:RIKEN cDNA 4930417G10 gene, full insert sequence. // chr12 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000006534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:4714985:4748345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_175431 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 228, member B (Fam228b), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006515032 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 228, member B (Fam228b), transcript variant X4, mRNA. // chrUn // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006515036 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 228, member B (Fam228b), transcript variant X8, mRNA. // chrUn // 94 // 55 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000053458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4746216:4769267:-1 gene:ENSMUSG00000050545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK044133 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830093I24 product:weakly similar to CDNA FLJ30851 FIS, CLONE FEBRA2002908 [Homo sapiens], full insert sequence. // chrUn // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC100429 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A830093I24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118237 IMAGE:30917787), complete cds. // chrUn // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC144941 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053489. // chrUn // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC145648 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A830093I24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175535 IMAGE:40130951), complete cds. // chrUn // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515029 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 228, member B (Fam228b), transcript variant X1, mRNA. // chrUn // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// XM_006515031 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 228, member B (Fam228b), transcript variant X3, mRNA. // chrUn // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NM_016863 // RefSeq // Mus musculus FK506 binding protein 1b (Fkbp1b), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:4833175:4841595:-1 gene:ENSMUSG00000020635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AB107918 // GenBank // Mus musculus FKBP1b-B mRNA for FK506-binding protein, complete cds. // chr12 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AB285017 // GenBank // Mus musculus FKBP12.6 mRNA for FK506-binding protein 12.6, complete cds. // chr12 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// AF060872 // GenBank // Mus musculus FK506-binding protein 12.6 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC049596 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein 1b, mRNA (cDNA clone MGC:58248 IMAGE:6593663), complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC061121 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein 1b, mRNA (cDNA clone MGC:74247 IMAGE:6535176), complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006514973 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FK506 binding protein 1b (Fkbp1b), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_145441 // RefSeq // Mus musculus UBX domain protein 2A (Ubxn2a), mRNA. // chr12 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000020962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:4879032:4907705:-1 gene:ENSMUSG00000020634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000141360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:4880390:4907439:-1 gene:ENSMUSG00000020634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000142867 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:4879349:4907264:-1 gene:ENSMUSG00000020634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC004632 // GenBank // Mus musculus UBX domain protein 2A, mRNA (cDNA clone MGC:7992 IMAGE:3585699), complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// AK134666 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330520D07 product:UBX domain containing 4, full insert sequence. // chr12 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// GENSCAN00000006438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:4880582:4917438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
NM_001164493 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 29 (Klhl29), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:5077472:5375682:-1 gene:ENSMUSG00000020627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC138283 // GenBank // Mus musculus kelch-like 29 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169907 IMAGE:8861302), complete cds. // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC145748 // GenBank // Mus musculus kelch-like 29 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:175635 IMAGE:40131051), complete cds. // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000042425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:5066942:5115468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000000837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:6966718:6987855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000000839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:7868070:7883870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_013527 // RefSeq // Mus musculus growth differentiation factor 7 (Gdf7), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:8297934:8301954:-1 gene:ENSMUSG00000037660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF525752 // GenBank // Mus musculus growth differentiation factor 7 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:8297934:8301933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007483 // RefSeq // Mus musculus ras homolog gene family, member B (Rhob), mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:8497763:8499985:-1 gene:ENSMUSG00000054364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF481943 // GenBank // Mus musculus RhoB mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// AK086873 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030007B22 product:aplysia ras-related homolog B (RhoB), full insert sequence. // chr12 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// BC018275 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:19314 IMAGE:4168565), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC110992 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:117867 IMAGE:5376565), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
XR_105447 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9930038B18 gene (9930038B18Rik), misc_RNA. // chr12 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000151816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:8873187:8877459:-1 gene:ENSMUSG00000042976 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK037014 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930038B18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT013382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_008828 // RefSeq // Mus musculus phosphoglycerate kinase 1 (Pgk1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000081593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:106187100:106203699:1 gene:ENSMUSG00000062070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000085735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:10898566:10900296:-1 gene:ENSMUSG00000066632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000091117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:3:58102609:58104269:-1 gene:ENSMUSG00000069008 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000135949 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:106187163:106203661:1 gene:ENSMUSG00000062070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// BC083355 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:102158 IMAGE:6828087), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC108372 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:118097 IMAGE:5060103), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// M15668 // GenBank // Mus musculus X chromosome-linked phosphoglycerate kinase (pgk-1) mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:106189201:106203672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:58074253:58104247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:10866835:10900241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0
NM_001168564 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, delayed-rectifier, subfamily S, member 3 (Kcns3), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NM_173417 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, delayed-rectifier, subfamily S, member 3 (Kcns3), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:11090202:11150373:-1 gene:ENSMUSG00000043673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000164495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:11090202:11150842:-1 gene:ENSMUSG00000043673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC132164 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, delayed-rectifier, subfamily S, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:163795 IMAGE:40130441), complete cds. // chr12 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC132464 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, delayed-rectifier, subfamily S, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:164095 IMAGE:40130741), complete cds. // chr12 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_019544 // RefSeq // Mus musculus mesogenin 1 (Msgn1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:11208382:11208948:-1 gene:ENSMUSG00000047002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF261105 // GenBank // Mus musculus pMesogenin1 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116996 // GenBank // Mus musculus mesogenin 1, mRNA (cDNA clone MGC:151373 IMAGE:40126315), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:11196257:11230958:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
AK006597 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700034J04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177331 // RefSeq // Mus musculus Gen homolog 1, endonuclease (Drosophila) (Gen1), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000166117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:11240926:11265787:-1 gene:ENSMUSG00000051235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC090653 // GenBank // Mus musculus Gen homolog 1, endonuclease (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:115970 IMAGE:30659763), complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC099936 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30092757. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC138157 // GenBank // Mus musculus Gen homolog 1, endonuclease (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169781 IMAGE:8861176), complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC138158 // GenBank // Mus musculus Gen homolog 1, endonuclease (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169782 IMAGE:8861177), complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:11241255:11262567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_012038 // RefSeq // Mus musculus visinin-like 1 (Vsnl1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:11325247:11436649:-1 gene:ENSMUSG00000054459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY101375 // GenBank // Mus musculus visinin-like protein 1 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC046226 // GenBank // Mus musculus visinin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:57901 IMAGE:5692284), complete cds. // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// D21165 // GenBank // Mus musculus mRNA for neural visinin-like Ca2+-binding protein type 1 (NVP-1), complete cds. // chr12 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// EU373446 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c visinin-like protein 1 (Vsnl1) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000029898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:11326307:11335103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000029891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:11652066:11691736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_023716 // RefSeq // Mus musculus tubulin, beta 2B class IIB (Tubb2b), mRNA. // chr12 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// ENSMUST00000075774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:34127008:34130354:-1 gene:ENSMUSG00000045136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// BC138935 // GenBank // Mus musculus tubulin, beta 2B, mRNA (cDNA clone MGC:170562 IMAGE:8861957), complete cds. // chr12 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// BC138936 // GenBank // Mus musculus tubulin, beta 2B, mRNA (cDNA clone MGC:170563 IMAGE:8861958), complete cds. // chr12 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// NM_009450 // RefSeq // Mus musculus tubulin, beta 2A class IIA (Tubb2a), mRNA. // chr12 // 26 // 100 // 8 // 31 // 0 /// ENSMUST00000056427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:34074301:34078008:-1 gene:ENSMUSG00000058672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 26 // 100 // 8 // 31 // 0 /// BC055441 // GenBank // Mus musculus tubulin, beta 2A, mRNA (cDNA clone MGC:65316 IMAGE:4016867), complete cds. // chr12 // 26 // 100 // 8 // 31 // 0 /// NR_003964 // RefSeq // Mus musculus tubulin, beta 2a, pseudogene 2 (Tubb2a-ps2), non-coding RNA. // chr12 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000027930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:34127471:34130233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:11881327:11882664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:34074468:34077929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 26 // 100 // 8 // 31 // 0 /// KnowTID_00001532 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr12 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_008709 // RefSeq // Mus musculus v-myc myelocytomatosis viral related oncogene, neuroblastoma derived (avian) (Mycn), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000043396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:12936096:12941914:-1 gene:ENSMUSG00000037169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000130990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:12936096:12940616:-1 gene:ENSMUSG00000037169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC005453 // GenBank // Mus musculus v-myc myelocytomatosis viral related oncogene, neuroblastoma derived (avian), mRNA (cDNA clone MGC:6240 IMAGE:3495446), complete cds. // chr12 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// BC049783 // GenBank // Mus musculus v-myc myelocytomatosis viral related oncogene, neuroblastoma derived (avian), mRNA (cDNA clone MGC:59366 IMAGE:6517457), complete cds. // chr12 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// M36277 // GenBank // Mus musculus N-myc protein mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000056286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:12937006:12940369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
GENSCAN00000056274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:13149682:13209962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
NR_028566 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 118 (Snord118), small nucleolar RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_381283 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638974 (LOC102638974), transcript variant X4, ncRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_394283 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638974 (LOC102638974), transcript variant X1, ncRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_394284 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638974 (LOC102638974), transcript variant X2, ncRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082783 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:13163629:13163763:-1 gene:ENSMUSG00000064717 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082965 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:69073427:69073561:1 gene:ENSMUSG00000064899 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0
NM_134040 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 1 (Ddx1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000071103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:13219308:13249213:-1 gene:ENSMUSG00000037149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC008570 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:6410 IMAGE:3587491), complete cds. // chr12 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// BC010624 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:11570 IMAGE:3153029), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:13219498:13246075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000101960 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:13490509:13490615:-1 gene:ENSMUSG00000096163 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT013452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000182021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:13752674:13753665:-1 gene:ENSMUSG00000097973 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000056292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:13752946:13794031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
GENSCAN00000056292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:13752946:13794031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0
NM_029007 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 84, member A (Fam84a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:14147599:14152038:-1 gene:ENSMUSG00000020607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC005488 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 84, member A, mRNA (cDNA clone MGC:7324 IMAGE:3486254), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:14149846:14152125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT013458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// D83204 // GenBank // Mus musculus mRNA, one isoform of PTP-RL9. // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_144551 // RefSeq // Mus musculus tribbles homolog 2 (Drosophila) (Trib2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515055 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tribbles homolog 2 (Drosophila) (Trib2), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000020922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:15791727:15816785:-1 gene:ENSMUSG00000020601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF358867 // GenBank // Mus musculus TRB-2 mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// BC034338 // GenBank // Mus musculus tribbles homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:32449 IMAGE:5043179), complete cds. // chr12 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC037387 // GenBank // Mus musculus tribbles homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:38955 IMAGE:5363174), complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001252071 // RefSeq // Mus musculus gene regulated by estrogen in breast cancer protein (Greb1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_015764 // RefSeq // Mus musculus gene regulated by estrogen in breast cancer protein (Greb1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000048064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:16670615:16757241:-1 gene:ENSMUSG00000036523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000159120 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:16672079:16757195:-1 gene:ENSMUSG00000036523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000161036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:16690531:16740254:-1 gene:ENSMUSG00000036523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000162112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:16670615:16800684:-1 gene:ENSMUSG00000036523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF180470 // GenBank // Mus musculus Kiaa0575 mRNA, complete cds. // chr12 // 79 // 100 // 27 // 34 // 0 /// AK157808 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130051K09 product:gene regulated by estrogen in breast cancer protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:16672380:16740045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_001201332 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2410004P03 gene (2410004P03Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001201333 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2410004P03 gene (2410004P03Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006515230 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2410004P03 gene (2410004P03Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// XM_006515231 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2410004P03 gene (2410004P03Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000095823 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:17003319:17011727:-1 gene:ENSMUSG00000071398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000189479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:17007140:17011503:-1 gene:ENSMUSG00000071398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000190691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:17005590:17011554:-1 gene:ENSMUSG00000071398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:17007045:17024749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT013524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_201531 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily F, member 1 (Kcnf1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000170580 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:17172100:17176888:-1 gene:ENSMUSG00000051726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC053089 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily F, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:62472 IMAGE:5709192), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000110971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:20814257:20815727:-1 gene:ENSMUSG00000091071 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK041326 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630001I11 product:KIAA0400 PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XR_381327 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 3110053B16 gene (3110053B16Rik), misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000145605 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:20874125:20877071:-1 gene:ENSMUSG00000085642 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000030823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:20874095:20878134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
AK144596 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730007D18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000084451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:20896239:20896638:-1 gene:ENSMUSG00000073179 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// AJ005350 // GenBank // Mus musculus of ZT2 gene encoding zinc finger protein 125. // chr12 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// AK135060 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430562O12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// NONMMUT013575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT013576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000079237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:20899822:20900867:-1 gene:ENSMUSG00000069755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AJ005350 // GenBank // Mus musculus of ZT2 gene encoding zinc finger protein 125. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
AK086127 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930007E19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT013578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
NM_008403 // RefSeq // Mus musculus integrin beta 1 binding protein 1 (Itgb1bp1), mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000076260 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:21269806:21286237:-1 gene:ENSMUSG00000062352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000172834 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:21271288:21286185:-1 gene:ENSMUSG00000062352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000173688 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:21270704:21272123:-1 gene:ENSMUSG00000062352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000173729 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:21270093:21286097:-1 gene:ENSMUSG00000062352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AJ001373 // GenBank // Mus musculus bodenin gene. // chr12 // 75 // 80 // 18 // 24 // 0 /// AK147929 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270105E24 product:integrin beta 1 binding protein 1, full insert sequence. // chr12 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC021151 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4007100, containing frame-shift errors. // chr12 // 86 // 73 // 19 // 22 // 0 /// BC028772 // GenBank // Mus musculus integrin beta 1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:41376 IMAGE:1230640), complete cds. // chr12 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// XM_006514990 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus integrin beta 1 binding protein 1 (Itgb1bp1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000030833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:21270775:21279471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_011739 // RefSeq // Mus musculus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, theta polypeptide (Ywhaq), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000103002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:21390329:21417436:-1 gene:ENSMUSG00000076432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000135088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:21390071:21417637:-1 gene:ENSMUSG00000076432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000155480 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:21390332:21417588:-1 gene:ENSMUSG00000076432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// AK012540 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2700080C06 product:14-3-3 PROTEIN TAU (14-3-3 PROTEIN THETA), full insert sequence. // chr12 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// BC085299 // GenBank // Mus musculus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, theta polypeptide, mRNA (cDNA clone IMAGE:6306967), partial cds. // chr12 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// BC090838 // GenBank // Mus musculus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, theta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:102094 IMAGE:6403848), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
AK170335 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630048H11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// AK086409 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930026E18 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_381329 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene, 19924 (Gm19924), misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099486 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6030426L16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117729 IMAGE:30937101), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:21691592:21730374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:20458578:20501194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
XM_006515309 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 844-like (LOC102631589), mRNA. // chr12 // 92 // 100 // 34 // 37 // 0 /// ENSMUST00000101568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:20415938:20433699:1 gene:ENSMUSG00000073184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// GENSCAN00000030826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:21776099:21784268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1 /// GENSCAN00000051690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:20415938:20418441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1
XM_001480563 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4425 (Gm4425), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000172838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:22115756:22156646:-1 gene:ENSMUSG00000093846 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AK031311 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030405G12 product:similar to KRUPPEL-RELATED ZINC FINGER PROTEIN F80-L [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000174403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:23221227:23315358:-1 gene:ENSMUSG00000092465 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr12 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1 /// GENSCAN00000020470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:23314561:23315069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1 /// GENSCAN00000048025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:22155849:22183053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
ENSMUST00000072014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:23778912:23780265:-1 gene:ENSMUSG00000071362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK050906 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030032N01 product:inferred: Similar to zinc finger protein 14 (KOX 6) {Mus musculus}, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001256489 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9030624G23 gene (9030624G23Rik), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000101538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:24044701:24096968:-1 gene:ENSMUSG00000073158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006515293 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 69-like (LOC102632102), mRNA. // chr12 // 27 // 100 // 8 // 30 // 0 /// XM_006515300 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9257 (Gm9257), mRNA. // chr12 // 40 // 100 // 12 // 30 // 0 /// AK020054 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030426L16 product:similar to KRUPPEL-RELATED ZINC FINGER PROTEIN F80-L [Mus musculus], full insert sequence. // chr12 // 28 // 97 // 8 // 29 // 0 /// NONMMUT013636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 62 // 70 // 13 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:24096418:24096968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSMUST00000073088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:24493207:24493656:-1 gene:ENSMUSG00000057160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000025052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:24493105:24493656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001159529 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2-like (Cox7a2l), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// NM_009187 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2-like (Cox7a2l), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSMUST00000025095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:83501919:83514333:-1 gene:ENSMUSG00000024248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSMUST00000140065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:24638669:24639010:-1 gene:ENSMUSG00000066553 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000167741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:83501919:83514333:-1 gene:ENSMUSG00000024248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// BC004715 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:6048 IMAGE:3582142), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC085296 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:103208 IMAGE:5337317), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000025068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:24638669:24643201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000013203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:83502603:83631618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
GENSCAN00000025055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:24776361:24812854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_010496 // RefSeq // Mus musculus inhibitor of DNA binding 2 (Id2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000020974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:25093801:25096092:-1 gene:ENSMUSG00000020644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC006921 // GenBank // Mus musculus inhibitor of DNA binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:6541 IMAGE:2655173), complete cds. // chr12 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC053699 // GenBank // Mus musculus inhibitor of DNA binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:62629 IMAGE:6515664), complete cds. // chr12 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0 /// AK013239 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810434H03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// GENSCAN00000000149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:25083407:25096010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001081977 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 144A (Rnf144a), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_080563 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 144A (Rnf144a), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000020971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:26306797:26415256:-1 gene:ENSMUSG00000020642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000062149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:26306797:26415256:-1 gene:ENSMUSG00000020642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AF360998 // GenBank // Mus musculus UbcM4-interacting protein 4 mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// BC030187 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 144A, mRNA (cDNA clone MGC:38379 IMAGE:5345434), complete cds. // chr12 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:26310658:26322413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_021384 // RefSeq // Mus musculus radical S-adenosyl methionine domain containing 2 (Rsad2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000020970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:26442753:26456452:-1 gene:ENSMUSG00000020641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000137792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:26442753:26456431:-1 gene:ENSMUSG00000020641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF236064 // GenBank // Mus musculus viperin mRNA, complete cds. // chr12 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// AF442152 // GenBank // Mus musculus viperin (Vig1) mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC057868 // GenBank // Mus musculus radical S-adenosyl methionine domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:67986 IMAGE:5327504), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// CT010378 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D0353D for gene Rsad2, Radical S-adenosyl methionine domain containing 2; complete cds, incl. stopcodon. // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006515160 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus radical S-adenosyl methionine domain containing 2 (Rsad2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000034809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:26436671:26456419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NR_045868 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9866 (Gm9866), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NR_045869 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9866 (Gm9866), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NR_045870 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9866 (Gm9866), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000177636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:27141898:27160446:-1 gene:ENSMUSG00000094002 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000182473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:27140796:27160311:-1 gene:ENSMUSG00000094002 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000182592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:27140802:27160633:-1 gene:ENSMUSG00000094002 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK044503 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930017G19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 50 // 100 // 13 // 26 // 0 /// NONMMUT013750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT013751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT013752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT013753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_009234 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 11 (Sox11), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000079063 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:27334264:27342574:-1 gene:ENSMUSG00000063632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC062095 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 11, mRNA (cDNA clone MGC:69636 IMAGE:5716171), complete cds. // chr12 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC078643 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 11, mRNA (cDNA clone MGC:78354 IMAGE:30144974), complete cds. // chr12 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// AF009414 // GenBank // Mus musculus SOX11 (Sox11) mRNA, complete cds. // chr12 // 60 // 74 // 12 // 20 // 0 /// GENSCAN00000039360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:27339016:27346102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_001177964 // RefSeq // Mus musculus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515179 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515180 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515183 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515185 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), transcript variant X7, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515186 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), transcript variant X8, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006515189 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), transcript variant X11, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_381203 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), transcript variant X12, misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:28516284:28552303:-1 gene:ENSMUSG00000020633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000189735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:28437795:28548337:-1 gene:ENSMUSG00000020633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:28470210:28607404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_053156 // RefSeq // Mus musculus allantoicase (Allc), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006515287 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus allantoicase (Allc), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000020965 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:28553755:28582523:-1 gene:ENSMUSG00000020636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000110917 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:28553755:28582515:-1 gene:ENSMUSG00000020636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AF278712 // GenBank // Mus musculus allantoicase mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// AK005893 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700012B22 product:allantoicase, full insert sequence. // chr12 // 84 // 94 // 26 // 31 // 0 /// BC108957 // GenBank // Mus musculus allantoicase, mRNA (cDNA clone MGC:124129 IMAGE:40046116), complete cds. // chr12 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC108958 // GenBank // Mus musculus allantoicase, mRNA (cDNA clone MGC:124130 IMAGE:40046117), complete cds. // chr12 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:28470210:28607404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0
NM_027866 // RefSeq // Mus musculus collectin sub-family member 11 (Colec11), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006515222 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collectin sub-family member 11 (Colec11), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000036136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:28594173:28623290:-1 gene:ENSMUSG00000036655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC104380 // GenBank // Mus musculus collectin sub-family member 11, mRNA (cDNA clone MGC:129470 IMAGE:40050136), complete cds. // chr12 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC104381 // GenBank // Mus musculus collectin sub-family member 11, mRNA (cDNA clone MGC:129471 IMAGE:40050143), complete cds. // chr12 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:28470210:28607404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000018793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:28612671:28625703:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_009417 // RefSeq // Mus musculus thyroid peroxidase (Tpo), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006515073 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thyroid peroxidase (Tpo), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// XM_006515075 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thyroid peroxidase (Tpo), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:30054659:30132624:-1 gene:ENSMUSG00000020673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000155263 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:30116618:30131899:-1 gene:ENSMUSG00000020673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// BC099421 // GenBank // Mus musculus thyroid peroxidase, mRNA (cDNA clone IMAGE:30844986), complete cds. // chr12 // 90 // 28 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:30055057:30130275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 61 // 21 // 22 // 0
NM_172951 // RefSeq // Mus musculus syntrophin, gamma 2 (Sntg2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006515108 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus syntrophin, gamma 2 (Sntg2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000021004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:30174483:30373375:-1 gene:ENSMUSG00000020672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000133324 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:30174994:30373328:-1 gene:ENSMUSG00000020672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000142046 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:30174482:30373328:-1 gene:ENSMUSG00000020672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000149710 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:30174989:30373265:-1 gene:ENSMUSG00000020672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000156953 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:30267031:30357683:-1 gene:ENSMUSG00000020672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// AF367760 // GenBank // Mus musculus gamma-2 syntrophin (Sntg2) mRNA, complete cds. // chr12 // 88 // 97 // 30 // 34 // 0 /// BC138956 // GenBank // Mus musculus syntrophin, gamma 2, mRNA (cDNA clone MGC:170583 IMAGE:8861978), complete cds. // chr12 // 88 // 97 // 30 // 34 // 0 /// GENSCAN00000008869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:30175128:30349430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
NM_001110239 // RefSeq // Mus musculus acid phosphatase 1, soluble (Acp1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_021330 // RefSeq // Mus musculus acid phosphatase 1, soluble (Acp1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000062740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:30893326:30911612:-1 gene:ENSMUSG00000044573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000074038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:30893326:30911612:-1 gene:ENSMUSG00000044573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000083266 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:31258933:31259062:-1 gene:ENSMUSG00000065200 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT013827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_007861 // RefSeq // Mus musculus dihydrolipoamide dehydrogenase (Dld), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000110857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:31331564:31351437:-1 gene:ENSMUSG00000020664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC003368 // GenBank // Mus musculus dihydrolipoamide dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:5874 IMAGE:3589344), complete cds. // chr12 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// U73445 // GenBank // Mus musculus dihydrolipoamide dehydrogenase (Dld) mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:31332177:31357084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
NONMMUT013832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_011867 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 26, member 4 (Slc26a4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000001253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:31519827:31559969:-1 gene:ENSMUSG00000020651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF167411 // GenBank // Mus musculus pendrin (Pds) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC140995 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 26, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:175956 IMAGE:9055607), complete cds. // chr12 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000020713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:31487279:31600718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0
NM_001164090 // RefSeq // Mus musculus B cell receptor associated protein 29 (Bcap29), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_007530 // RefSeq // Mus musculus B cell receptor associated protein 29 (Bcap29), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:31595354:31634597:-1 gene:ENSMUSG00000020650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000177962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:31595354:31634658:-1 gene:ENSMUSG00000020650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC003303 // GenBank // Mus musculus B-cell receptor-associated protein 29, mRNA (cDNA clone MGC:6075 IMAGE:3584161), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC021661 // GenBank // Mus musculus B-cell receptor-associated protein 29, mRNA (cDNA clone MGC:14077 IMAGE:2646883), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC040751 // GenBank // Mus musculus B-cell receptor-associated protein 29, mRNA (cDNA clone IMAGE:4016907), partial cds. // chr12 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:31605827:31627782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_028002 // RefSeq // Mus musculus dihydrouridine synthase 4-like (S. cerevisiae) (Dus4l), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006515226 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dihydrouridine synthase 4-like (S. cerevisiae) (Dus4l), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000020977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:31640055:31654826:-1 gene:ENSMUSG00000020648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC109351 // GenBank // Mus musculus dihydrouridine synthase 4-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:130363 IMAGE:40056894), complete cds. // chr12 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:31640676:31652406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_175191 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 22 (Gpr22), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000057783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:31706867:31713926:-1 gene:ENSMUSG00000044067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089509 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 22, mRNA (cDNA clone MGC:107197 IMAGE:30252116), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000176710 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:31708712:31713947:-1 gene:ENSMUSG00000044067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_011158 // RefSeq // Mus musculus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type II beta (Prkar2b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006515014 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type II beta (Prkar2b), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515015 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type II beta (Prkar2b), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000003079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:31958476:32061235:-1 gene:ENSMUSG00000002997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000036497 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:31958476:32061296:-1 gene:ENSMUSG00000002997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000146865 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:31958480:32060589:-1 gene:ENSMUSG00000002997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK081805 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130078K06 product:protein kinase, cAMP dependent regulatory, type II beta, full insert sequence. // chr12 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC048710 // GenBank // Mus musculus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type II beta, mRNA (cDNA clone MGC:59470 IMAGE:6506827), complete cds. // chr12 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0
ENSMUST00000083711 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:32354885:32355202:-1 gene:ENSMUSG00000065645 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr12 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONMMUT013855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_001024478 // RefSeq // Mus musculus cadherin-related family member 3 (Cdhr3), mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_006515192 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cadherin-related family member 3 (Cdhr3), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000095774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:33033796:33092875:-1 gene:ENSMUSG00000035860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// BC138911 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110049B09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170538 IMAGE:8861933), complete cds. // chr12 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// AK043828 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830037N18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000035933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:32993393:33061750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 36 // 36 // 15 // 42 // 1 /// GENSCAN00000035917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:33067204:33105599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
ENSMUST00000061679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:34873730:34874828:-1 gene:ENSMUSG00000052376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK014845 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921508M14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030449 // RefSeq // Mus musculus microRNA 680-3 (Mir680-3), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000102298 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:35194811:35194897:-1 gene:ENSMUSG00000076253 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// mmu-mir-680-3 // miRBase Micro RNA Database // MI0004642 Mus musculus miR-680-3 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT013929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_025359 // RefSeq // Mus musculus tetraspanin 13 (Tspan13), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:36014557:36042489:-1 gene:ENSMUSG00000020577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000128644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:36021801:36042500:-1 gene:ENSMUSG00000020577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC018317 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 13, mRNA (cDNA clone MGC:18777 IMAGE:4166625), complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000138393 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:36021812:36039935:-1 gene:ENSMUSG00000020577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:36020645:36042313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
AB244988 // GenBank // Mus musculus molossinus Bdm2 mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// BC058796 // GenBank // Mus musculus basic leucine zipper and W2 domains 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6486091), complete cds. // chr12 // 100 // 34 // 13 // 13 // 0 /// NM_025840 // RefSeq // Mus musculus basic leucine zipper and W2 domains 2 (Bzw2), mRNA. // chr12 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// XM_006515164 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus basic leucine zipper and W2 domains 2 (Bzw2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1 /// XM_006515166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus basic leucine zipper and W2 domains 2 (Bzw2), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// ENSMUST00000020856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:36091846:36156825:-1 gene:ENSMUSG00000020547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// AK162647 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830141H16 product:basic leucine zipper and W2 domains 2, full insert sequence. // chr12 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1 /// BC013060 // GenBank // Mus musculus basic leucine zipper and W2 domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:7203 IMAGE:3482251), complete cds. // chr12 // 92 // 92 // 35 // 38 // 1 /// GENSCAN00000016815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:36092281:36135608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0
NM_027699 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 72 (Lrrc72), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006515214 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 72 (Lrrc72), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000020853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:36208345:36218202:-1 gene:ENSMUSG00000020545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107290 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700108M19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130241 IMAGE:40053043), complete cds. // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC107291 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700108M19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130242 IMAGE:40053045), complete cds. // chr12 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// NM_001177877 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 72 (Lrrc72), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000122115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:12:36209563:36253398:-1 gene:ENSMUSG00000020545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000152817 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:36212283:36218218:-1 gene:ENSMUSG00000020545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AK077182 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933421P06 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr12 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONMMUT013957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000016828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:36210045:36224486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSMUST00000171007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:36381242:36382181:-1 gene:ENSMUSG00000091007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK142563 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630036H23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC118030 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40093981. // chr12 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
GENSCAN00000052064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:38741592:38742083:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001146196 // RefSeq // Mus musculus scinderin (Scin), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000002640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:40059773:40134228:-1 gene:ENSMUSG00000002565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC063328 // GenBank // Mus musculus scinderin, mRNA (cDNA clone MGC:74315 IMAGE:30314464), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U04354 // GenBank // Mus musculus ADSEVERIN mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NM_009132 // RefSeq // Mus musculus scinderin (Scin), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000078481 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:40059769:40134183:-1 gene:ENSMUSG00000002565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000053912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:40036144:40134108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_001033437 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich single-pass membrane protein 1 (Lsmem1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000095760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:40176386:40199315:-1 gene:ENSMUSG00000071342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK134025 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830411J12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC147386 // GenBank // Mus musculus gene model 889, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182554 IMAGE:9056448), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC147387 // GenBank // Mus musculus gene model 889, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182550 IMAGE:9056444), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_172575 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 277 (Zfp277), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NM_178845 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 277 (Zfp277), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000069637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:40315046:40445790:-1 gene:ENSMUSG00000055917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000069692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:40315558:40445769:-1 gene:ENSMUSG00000055917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC043453 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 277, mRNA (cDNA clone MGC:49169 IMAGE:5004865), complete cds. // chr12 // 94 // 86 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000053901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:40260441:40381688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
GENSCAN00000045541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:40883755:40884614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
NM_001271708 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat protein 3, neuronal (Lrrn3), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001271709 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat protein 3, neuronal (Lrrn3), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NM_010733 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat protein 3, neuronal (Lrrn3), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000043884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:41451673:41485751:-1 gene:ENSMUSG00000036295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// BC069041 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat protein 3, neuronal, mRNA (cDNA clone MGC:67223 IMAGE:5698788), complete cds. // chr12 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:41452193:41454316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0
AY512922 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0976C05 unknown mRNA. // chr12 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// KnowTID_00001581 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013760 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 9 (Dnajb9), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000015049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:44205897:44210068:-1 gene:ENSMUSG00000014905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AB028857 // GenBank // Mus musculus mRNA for mDj7, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC042713 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:51352 IMAGE:4039558), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC096676 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:106863 IMAGE:963849), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// CT010304 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B0652D for gene Dnajb9, DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 9; complete cds, incl. stopcodon. // chr12 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000031763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:44206954:44208303:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
NM_144552 // RefSeq // Mus musculus syntaxin binding protein 6 (amisyn) (Stxbp6), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515667 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus syntaxin binding protein 6 (amisyn) (Stxbp6), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000053768 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:44855221:45074493:-1 gene:ENSMUSG00000046314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000120531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:44852488:45074112:-1 gene:ENSMUSG00000046314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK158779 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K430308H17 product:syntaxin binding protein 6 (amisyn), full insert sequence. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC024598 // GenBank // Mus musculus syntaxin binding protein 6 (amisyn), mRNA (cDNA clone MGC:30948 IMAGE:4020199), complete cds. // chr12 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// XM_006515668 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus syntaxin binding protein 6 (amisyn) (Stxbp6), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:44820861:44933539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_021361 // RefSeq // Mus musculus neuro-oncological ventral antigen 1 (Nova1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:46694517:46818775:-1 gene:ENSMUSG00000021047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021361 // RefSeq // Mus musculus neuro-oncological ventral antigen 1 (Nova1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006516150 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuro-oncological ventral antigen 1 (Nova1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006516151 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuro-oncological ventral antigen 1 (Nova1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006516152 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuro-oncological ventral antigen 1 (Nova1), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000021438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:46694517:46818775:-1 gene:ENSMUSG00000021047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006516154 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuro-oncological ventral antigen 1 (Nova1), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:46699969:46818751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NONMMUT014107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 75 // 64 // 12 // 16 // 0
NM_008858 // RefSeq // Mus musculus protein kinase D1 (Prkd1), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006515588 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein kinase D1 (Prkd1), transcript variant X3, mRNA. // chrUn // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XM_006515590 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein kinase D1 (Prkd1), transcript variant X5, mRNA. // chrUn // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000002765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:50341231:50649223:-1 gene:ENSMUSG00000002688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000025721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:50388200:50523767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_001172098 // RefSeq // Mus musculus striatin, calmodulin binding protein 3 (Strn3), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NM_052973 // RefSeq // Mus musculus striatin, calmodulin binding protein 3 (Strn3), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000013130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:51608541:51691914:-1 gene:ENSMUSG00000020954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000169503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:51608541:51691914:-1 gene:ENSMUSG00000020954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AF307777 // GenBank // Mus musculus SG2NA beta isoform mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC138055 // GenBank // Mus musculus striatin, calmodulin binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:169679 IMAGE:8861074), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC145127 // GenBank // Mus musculus striatin, calmodulin binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:178683 IMAGE:9053675), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// EF685152 // GenBank // Mus musculus striatin-3 35 kDa variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr12 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006516413 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus striatin, calmodulin binding protein 3 (Strn3), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// GENSCAN00000026721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:51610103:51623343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000041584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:51627686:51681276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0
NM_144788 // RefSeq // Mus musculus HECT domain containing 1 (Hectd1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000042052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:51743722:51829536:-1 gene:ENSMUSG00000035247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000179265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:51743722:51829536:-1 gene:ENSMUSG00000035247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000041603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:51744521:51812125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0
NM_177171 // RefSeq // Mus musculus HEAT repeat containing 5A (Heatr5a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000040583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:51875873:51971321:-1 gene:ENSMUSG00000035181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK053055 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930036F22 product:hypothetical ARM repeat structure containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// AK161444 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931408K23 product:weakly similar to SI:dZ142B24.3 (Novel protein similar to human KIAA1316 protein and fly CG2747 protein) [Brachydanio rerio], full insert sequence. // chr12 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// BC086656 // GenBank // Mus musculus HEAT repeat containing 5A, mRNA (cDNA clone MGC:99412 IMAGE:30544145), complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// AK047221 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930037B01 product:hypothetical FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)/Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component containing protein, full insert sequence. // chr12 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// GENSCAN00000041602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:51877312:51968272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0
NM_008159 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 33 (Gpr33), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:52023003:52028063:-1 gene:ENSMUSG00000035148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF045766 // GenBank // Mus musculus orphan G protein-coupled receptor (GPR33) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC064084 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 33, mRNA (cDNA clone MGC:73717 IMAGE:575313), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GQ981323 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 33 variant 1 (Gpr33) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GQ981327 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 33 variant 2 (Gpr33) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:52023235:52024254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000093682 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:53046708:53046826:-1 gene:ENSMUSG00000070192 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT014199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_028133 // RefSeq // Mus musculus egl-9 family hypoxia-inducible factor 3 (Egln3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000039516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:54178981:54203860:-1 gene:ENSMUSG00000035105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF421882 // GenBank // Mus musculus SM-20 mRNA, complete cds. // chr12 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// BC044926 // GenBank // Mus musculus EGL nine homolog 3 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:49409 IMAGE:5373240), complete cds. // chr12 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC058278 // GenBank // Mus musculus EGL nine homolog 3 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:65566 IMAGE:6528802), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC069893 // GenBank // Mus musculus EGL nine homolog 3 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:78112 IMAGE:4978765), complete cds. // chr12 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:54180467:54203561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// BC022961 // GenBank // Mus musculus EGL nine homolog 3 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:36685 IMAGE:5371854), complete cds. // chr12 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
GENSCAN00000036839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:54344799:54452355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
AK142489 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530037I10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00001591 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134054 // RefSeq // Mus musculus serine palmitoyltransferase, small subunit A (Sptssa), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:54645374:54656572:-1 gene:ENSMUSG00000044408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC022674 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110002B05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:31353 IMAGE:4236922), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr12 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000175581 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:54666677:54666786:-1 gene:ENSMUSG00000093322 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr12 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// NONMMUT014233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0
NM_026998 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 6 (Snx6), mRNA. // chrUn // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000005798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:54746349:54795703:-1 gene:ENSMUSG00000005656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC025911 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:5027318), complete cds. // chrUn // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// BC061028 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 6, mRNA (cDNA clone MGC:74135 IMAGE:6594585), complete cds. // chrUn // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:54714870:54795653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 87 // 87 // 33 // 38 // 1
NM_007688 // RefSeq // Mus musculus cofilin 2, muscle (Cfl2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515452 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cofilin 2, muscle (Cfl2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000078124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:54858817:54862877:-1 gene:ENSMUSG00000062929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC007138 // GenBank // Mus musculus cofilin 2, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:6084 IMAGE:3590849), complete cds. // chr12 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// L29468 // GenBank // Mouse cofilin isoform mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:54827137:54979113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_013815 // RefSeq // Mus musculus bromodomain adjacent to zinc finger domain 1A (Baz1a), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000038926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:54892989:54986336:-1 gene:ENSMUSG00000035021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000173433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:54893551:54986507:-1 gene:ENSMUSG00000035021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC065123 // GenBank // Mus musculus bromodomain adjacent to zinc finger domain 1A, mRNA (cDNA clone IMAGE:30536990), partial cds. // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:54827137:54979113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_028314 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2700097O09 gene (2700097O09Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NR_030764 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2700097O09 gene (2700097O09Rik), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_381546 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2700097O09 gene (2700097O09Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:55045661:55080110:-1 gene:ENSMUSG00000062198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC056967 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700097O09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:66777 IMAGE:5694212), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000156852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:55053754:55080108:-1 gene:ENSMUSG00000062198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// AK079348 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630036G15 product:hypothetical S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases structure containing protein, full insert sequence. // chr12 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENSMUST00000136281 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:55045676:55054101:-1 gene:ENSMUSG00000062198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// BC016540 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 2700097O09 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3595243), with apparent retained intron. // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:54993979:55080077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
XM_006516420 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3-like (LOC102640226), mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC002306 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide H, mRNA (cDNA clone MGC:8248 IMAGE:3591968), complete cds. // chr12 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:54993979:55080077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
AK021321 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730001C10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021529 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma (Ppp2r3c), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000021410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:55280814:55303000:-1 gene:ENSMUSG00000021022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC024754 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:35859 IMAGE:5375405), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC138295 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:169919 IMAGE:8861314), complete cds. // chr12 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// BC138296 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:169920 IMAGE:8861315), complete cds. // chr12 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// AJ238247 // GenBank // Mus musculus mRNA for putative phosphatase subunit (G5pr gene). // chr12 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// GENSCAN00000011440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:55281617:55302651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_010907 // RefSeq // Mus musculus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B cells inhibitor, alpha (Nfkbia), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000021413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:55489411:55492647:-1 gene:ENSMUSG00000021025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC046754 // GenBank // Mus musculus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:57910 IMAGE:5693175), complete cds. // chr12 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// U36277 // GenBank // Mus musculus I-kappa B alpha chain mRNA, complete cds. // chr12 // 89 // 87 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:55488652:55514369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000083310 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:55910821:55910923:-1 gene:ENSMUSG00000065244 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT014278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_145442 // RefSeq // Mus musculus MAP3K12 binding inhibitory protein 1 (Mbip), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006515674 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MAP3K12 binding inhibitory protein 1 (Mbip), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006515675 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MAP3K12 binding inhibitory protein 1 (Mbip), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000021416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:56328306:56345894:-1 gene:ENSMUSG00000021028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC002277 // GenBank // Mus musculus MAP3K12 binding inhibitory protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:7681 IMAGE:3496688), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:56298177:56345800:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001146198 // RefSeq // Mus musculus NK2 homeobox 1 (Nkx2-1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NM_009385 // RefSeq // Mus musculus NK2 homeobox 1 (Nkx2-1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006515790 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NK2 homeobox 1 (Nkx2-1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XM_006515791 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NK2 homeobox 1 (Nkx2-1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000001536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:56531958:56536908:-1 gene:ENSMUSG00000001496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000178477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:56531958:56535106:-1 gene:ENSMUSG00000001496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC057607 // GenBank // Mus musculus NK2 homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:67328 IMAGE:6416507), complete cds. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC080868 // GenBank // Mus musculus NK2 homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:90732 IMAGE:30363051), complete cds. // chr12 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:56533035:56548941:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_008701 // RefSeq // Mus musculus NK2 homeobox 9 (Nkx2-9), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006515533 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NK2 homeobox 9 (Nkx2-9), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000072631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:56611389:56613284:-1 gene:ENSMUSG00000058669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC150762 // GenBank // Mus musculus NK2 transcription factor related, locus 9 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:183673 IMAGE:9087673), complete cds. // chr12 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// Y15741 // GenBank // Mus musculus mRNA for NK2 homeodomain transcription factor. // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001167976 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial oxodicarboxylate carrier), member 21 (Slc25a21), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NM_172577 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial oxodicarboxylate carrier), member 21 (Slc25a21), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044634 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:56712634:57197472:-1 gene:ENSMUSG00000035472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:56713813:57159244:-1 gene:ENSMUSG00000035472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC057980 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial oxodicarboxylate carrier), member 21, mRNA (cDNA clone MGC:67702 IMAGE:5042653), complete cds. // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// EU180236 // GenBank // Mus musculus mitochondrial solute carrier family 25 member 21 (Slc25a21) mRNA, complete cds, alternatively spliced; nuclear gene for mitochondrial product. // chr12 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000044549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:56713813:56778142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
XR_394617 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642272 (LOC102642272), misc_RNA. // chr12 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000146126 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:57519043:57520624:-1 gene:ENSMUSG00000084793 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_008259 // RefSeq // Mus musculus forkhead box A1 (Foxa1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:57540631:57546121:-1 gene:ENSMUSG00000035451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC096524 // GenBank // Mus musculus forkhead box A1, mRNA (cDNA clone MGC:106671 IMAGE:5720113), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U44752 // GenBank // Mus musculus hepatocyte nuclear factor 3 alpha (HNF-3A) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000044524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:57542026:57546218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000085379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:57632578:57633015:-1 gene:ENSMUSG00000066489 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:57632578:57633015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_025809 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 14, member a (Clec14a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000062254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:58264720:58269258:-1 gene:ENSMUSG00000045930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC019452 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 14, member a, mRNA (cDNA clone MGC:28590 IMAGE:4215467), complete cds. // chr12 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:58267455:58268834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
NM_009147 // RefSeq // Mus musculus SEC23A (S. cerevisiae) (Sec23a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000021375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:58958383:59012017:-1 gene:ENSMUSG00000020986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000165134 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:58959704:59007235:-1 gene:ENSMUSG00000020986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// AY082671 // GenBank // Mus musculus Sec23-like A protein (Sec23a) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// BC034610 // GenBank // Mus musculus SEC23A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:36492 IMAGE:5364796), complete cds. // chr12 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000027263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:58959997:59007210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 72 // 30 // 31 // 0
NM_030057 // RefSeq // Mus musculus trafficking protein particle complex 6B (Trappc6b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000021380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:59043093:59061461:-1 gene:ENSMUSG00000020993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC031464 // GenBank // Mus musculus trafficking protein particle complex 6B, mRNA (cDNA clone MGC:25781 IMAGE:4017482), complete cds. // chr12 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0
NM_001033156 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 33 (Fbxo33), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000043204 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:59200655:59219725:-1 gene:ENSMUSG00000035329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000160204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:59200658:59205689:-1 gene:ENSMUSG00000035329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC138618 // GenBank // Mus musculus F-box protein 33, mRNA (cDNA clone MGC:170243 IMAGE:8861638), complete cds. // chr12 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0 /// BC138621 // GenBank // Mus musculus F-box protein 33, mRNA (cDNA clone MGC:170246 IMAGE:8861641), complete cds. // chr12 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:59202408:59278303:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
NR_033604 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4971 (Gm4971), non-coding RNA. // chr12 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:73685523:73686572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 83 // 97 // 24 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:59317123:59318178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000027265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:59355088:59355609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000037091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:59965319:59977092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000182220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:62882277:62883282:-1 gene:ENSMUSG00000098200 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:62882277:62945662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000080271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:63072845:63073141:-1 gene:ENSMUSG00000058933 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:63072528:63073114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT014386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163271 // RefSeq // Mus musculus fibrous sheath CABYR binding protein (Fscb), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000059833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:64471333:64474898:-1 gene:ENSMUSG00000043060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// EF133693 // GenBank // Mus musculus PKA phosphorylated calcium and CABYR-binding protein mRNA, complete cds. // chr12 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:64449724:64474690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
GENSCAN00000016794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:64876828:64877628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
NM_025707 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 28 (Klhl28), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006516156 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch-like 28 (Klhl28), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006516157 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch-like 28 (Klhl28), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000021331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:64942440:64965536:-1 gene:ENSMUSG00000020948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC037017 // GenBank // Mus musculus kelch-like 28 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:47075 IMAGE:5347183), complete cds. // chr12 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// AK013278 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810440N09 product:BTB/POZ domain containing protein, full insert sequence. // chr12 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000016783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:64935709:64957713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_013902 // RefSeq // Mus musculus FK506 binding protein 3 (Fkbp3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:65062436:65073944:-1 gene:ENSMUSG00000020949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF110812 // GenBank // Mus musculus 25 kDa FK506-binding protein (Fkbp25) mRNA, complete cds. // chr12 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// AF135595 // GenBank // Mus musculus 25 kDa FK506 binding protein FKBP25 (Fkbp25) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC002122 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:6631 IMAGE:3492535), complete cds. // chr12 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// AK139213 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730071C16 product:FK506 binding protein 3, full insert sequence. // chr12 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000016780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:65063659:65073922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_172578 // RefSeq // Mus musculus MIS18 binding protein 1 (Mis18bp1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000052201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:65132734:65172580:-1 gene:ENSMUSG00000047534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000140391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:65132734:65172604:-1 gene:ENSMUSG00000047534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC021832 // GenBank // Mus musculus expressed sequence C79407, mRNA (cDNA clone IMAGE:4010593), complete cds. // chr12 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// BC042728 // GenBank // Mus musculus expressed sequence C79407, mRNA (cDNA clone IMAGE:4951964), complete cds. // chr12 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC052175 // GenBank // Mus musculus expressed sequence C79407, mRNA (cDNA clone MGC:59441 IMAGE:6394068), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK162657 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830146P13 product:Hypothetical Myb DNA binding domain containing protein, full insert sequence. // chr12 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000016787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:65133531:65196850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_001162933 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L10-like (Rpl10l), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000081908 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:66283379:66284401:-1 gene:ENSMUSG00000060499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000044300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:66283713:66284357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001193266 // RefSeq // Mus musculus MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 (Mdga2), transcript variant A, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_207010 // RefSeq // Mus musculus MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 (Mdga2), transcript variant B, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:66469568:67222549:-1 gene:ENSMUSG00000034912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:66470636:66471058:-1 gene:ENSMUSG00000034912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000079510 // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000083299 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:67489113:67489231:-1 gene:ENSMUSG00000065233 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT014437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000119887 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:69141430:69142066:-1 gene:ENSMUSG00000083191 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69130230:69159058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT014450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000158446 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:69152274:69152377:-1 gene:ENSMUSG00000089071 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027269 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal assembly factor 2 (Dnaaf2), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000021356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:12:69189087:69198429:-1 gene:ENSMUSG00000020973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB455811 // GenBank // Mus musculus mknt mRNA for kintoun homolog, complete cds. // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK075648 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110034A24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC055807 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110034A24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67642 IMAGE:6414041), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC058344 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110034A24 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5717791), complete cds. // chr12 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC062898 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110034A24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:65726 IMAGE:6414041), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// EU599049 // GenBank // Mus musculus TU54 (Tu54) mRNA, complete cds. // chr12 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69189888:69198285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_011133 // RefSeq // Mus musculus polymerase (DNA directed), epsilon 2 (p59 subunit) (Pole2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006515598 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (DNA directed), epsilon 2 (p59 subunit) (Pole2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000021359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69201779:69228190:-1 gene:ENSMUSG00000020974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK011194 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2600013D08 product:polymerase (DNA directed), epsilon 2 (p59 subunit), full insert sequence. // chr12 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// BC063772 // GenBank // Mus musculus polymerase (DNA directed), epsilon 2 (p59 subunit), mRNA (cDNA clone MGC:70176 IMAGE:30147626), complete cds. // chr12 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69203574:69228164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
NM_025441 // RefSeq // Mus musculus nuclear export mediator factor (Nemf), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000021368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69311544:69357176:-1 gene:ENSMUSG00000020982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AK039497 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330050K21 product:hypothetical Lysine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC037106 // GenBank // Mus musculus serologically defined colon cancer antigen 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5366193), complete cds. // chr12 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// BC053488 // GenBank // Mus musculus serologically defined colon cancer antigen 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30014193), complete cds. // chr12 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// AK032388 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430532E20 product:similar to SEROLOGICALLY DEFINED COLON CANCER ANTIGEN 1 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// AK149005 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120474I06 product:serologically defined colon cancer antigen 1, full insert sequence. // chr12 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// AK162377 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230116I23 product:serologically defined colon cancer antigen 1, full insert sequence. // chr12 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// GENSCAN00000052275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69312003:69366000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000053451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69371835:69372458:-1 gene:ENSMUSG00000052673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK017126 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933439M10 product:hypothetical C-5 cytosine-specific DNA methylase containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT014470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000177928 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:69561229:69561337:-1 gene:ENSMUSG00000095776 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT014483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033236 // RefSeq // Mus musculus valosin containing protein lysine (K) methyltransferase (Vcpkmt), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006515641 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus valosin containing protein lysine (K) methyltransferase (Vcpkmt), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000058639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69577628:69583028:-1 gene:ENSMUSG00000049882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC138942 // GenBank // Mus musculus gene model 71, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:170569 IMAGE:8861964), complete cds. // chr12 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// BC138943 // GenBank // Mus musculus gene model 71, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:170570 IMAGE:8861965), complete cds. // chr12 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// AK083148 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630017J20 product:hypothetical S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases structure containing protein, full insert sequence. // chr12 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000056392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69578448:69582986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NM_001135559 // RefSeq // Mus musculus son of sevenless homolog 2 (Drosophila) (Sos2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000035773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:69583766:69681852:-1 gene:ENSMUSG00000034801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000182396 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:69585089:69681627:-1 gene:ENSMUSG00000034801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000183277 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:69584853:69681841:-1 gene:ENSMUSG00000034801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000056384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69585123:69618099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69624061:69722417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1
ENSMUST00000083985 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:69586153:69586258:-1 gene:ENSMUSG00000065919 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145443 // RefSeq // Mus musculus L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase (L2hgdh), mRNA. // chr12 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000021370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69690436:69724874:-1 gene:ENSMUSG00000020988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0
NM_183294 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase-like 1 (CDC2-related kinase) (Cdkl1), mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006516229 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin-dependent kinase-like 1 (CDC2-related kinase) (Cdkl1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// XM_006516230 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin-dependent kinase-like 1 (CDC2-related kinase) (Cdkl1), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000021377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69746848:69790707:-1 gene:ENSMUSG00000020990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC115909 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase-like 1 (CDC2-related kinase), mRNA (cDNA clone MGC:144707 IMAGE:40105122), complete cds. // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69751816:69790154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NR_030450 // RefSeq // Mus musculus microRNA 681 (Mir681), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102111 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:69763835:69763944:-1 gene:ENSMUSG00000076065 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-681 // miRBase Micro RNA Database // MI0004643 Mus musculus miR-681 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022028 // RefSeq // Mus musculus salvador homolog 1 (Drosophila) (Sav1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:69965012:69987002:-1 gene:ENSMUSG00000021067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AJ292968 // GenBank // Mus musculus mRNA for WW45 protein. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC019377 // GenBank // Mus musculus salvador homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:30471 IMAGE:4021056), complete cds. // chr12 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AK034983 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430070C07 product:WW domain-containing protein 3, full insert sequence. // chr12 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000056372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69984195:69986767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000056376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:69966140:69972560:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000158528 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:69994790:69994892:-1 gene:ENSMUSG00000089153 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT014507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_133198 // RefSeq // Mus musculus liver glycogen phosphorylase (Pygl), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000071250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:70190811:70227683:-1 gene:ENSMUSG00000021069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000161083 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:70190819:70231488:-1 gene:ENSMUSG00000021069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000161840 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:70210791:70227612:-1 gene:ENSMUSG00000021069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// AF288783 // GenBank // Mus musculus glycogen phosphorylase mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// AK149491 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730025I07 product:liver glycogen phosphorylase, full insert sequence. // chr12 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// BC013636 // GenBank // Mus musculus liver glycogen phosphorylase, mRNA (cDNA clone MGC:19091 IMAGE:4196237), complete cds. // chr12 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// GENSCAN00000056381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:70190983:70227583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0
ENSMUST00000183329 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:71846311:71847291:-1 gene:ENSMUSG00000098224 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000028264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:71831134:71857160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_181752 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 135 (Gpr135), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:72069618:72070991:-1 gene:ENSMUSG00000043398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY288425 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 135 (Gpr135) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062104 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 135, mRNA (cDNA clone MGC:69736 IMAGE:6809932), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139332 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 135, mRNA (cDNA clone MGC:170959 IMAGE:8862354), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139335 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 135, mRNA (cDNA clone MGC:170962 IMAGE:8862357), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC148305 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 135, mRNA (cDNA clone IMAGE:40056233), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:72069618:72070991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026038 // RefSeq // Mus musculus L-3-hydroxyproline dehydratase (trans-) (L3hypdh), mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000019862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:72073428:72085439:-1 gene:ENSMUSG00000019718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000138029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:72077264:72085018:-1 gene:ENSMUSG00000019718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC004753 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810055F11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7947 IMAGE:3584353), complete cds. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:72076496:72085439:-1 gene:ENSMUSG00000019718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// AK137154 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530014J15 product:hypothetical Proline racemase containing protein, full insert sequence. // chr12 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000028265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:72073911:72090171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_028687 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 175 (Ccdc175), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000021494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:72101292:72185029:-1 gene:ENSMUSG00000021086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000028262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:72101592:72223738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0
NM_025522 // RefSeq // Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7 (Dhrs7), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000021512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:72650356:72664828:-1 gene:ENSMUSG00000021094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC016189 // GenBank // Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7, mRNA (cDNA clone MGC:27561 IMAGE:4482814), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:72650573:72664761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
NM_009189 // RefSeq // Mus musculus sine oculis-related homeobox 1 (Six1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:73041827:73047179:-1 gene:ENSMUSG00000051367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC023304 // GenBank // Mus musculus sine oculis-related homeobox 1 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:30484 IMAGE:4188451), complete cds. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:73043535:73046426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_011382 // RefSeq // Mus musculus sine oculis-related homeobox 4 (Six4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000043208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:73099609:73113425:-1 gene:ENSMUSG00000034460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC137931 // GenBank // Mus musculus sine oculis-related homeobox 4 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169555 IMAGE:8860950), complete cds. // chr12 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC137934 // GenBank // Mus musculus sine oculis-related homeobox 4 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169558 IMAGE:8860953), complete cds. // chr12 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// D50416 // GenBank // Mus musculus mRNA for AREC3, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// D50417 // GenBank // Mus musculus mRNA for AREC3, partial cds. // chr12 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// D50418 // GenBank // Mus musculus mRNA for AREC3, partial cds. // chr12 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000175693 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:73103441:73113456:-1 gene:ENSMUSG00000034460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000012137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:73103442:73113121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_029580 // RefSeq // Mus musculus TRM5 tRNA methyltransferase 5 (Trmt5), mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000116420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:73280410:73286711:-1 gene:ENSMUSG00000034442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK220389 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1393 protein. // chr12 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// BC012521 // GenBank // Mus musculus TRM5 tRNA methyltransferase 5 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:6806 IMAGE:2648293), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:73268531:73288563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NR_046013 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D830013O20 gene (D830013O20Rik), long non-coding RNA. // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000070425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:73364075:73371445:-1 gene:ENSMUSG00000056359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT014639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT014640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_178715 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 30B (Tmem30b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000042975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:73543114:73546395:-1 gene:ENSMUSG00000034435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119224 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 30B, mRNA (cDNA clone MGC:155540 IMAGE:8733973), complete cds. // chr12 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC119226 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 30B, mRNA (cDNA clone MGC:155542 IMAGE:8733975), complete cds. // chr12 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_172805 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 5 (Kcnh5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000042299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:74897217:75177332:-1 gene:ENSMUSG00000034402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC066138 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:76437 IMAGE:30094199), complete cds. // chr12 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000023215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:75076515:75159325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
NM_175644 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein hormone beta 5 (Gphb5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:75411720:75416781:-1 gene:ENSMUSG00000048982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF467771 // GenBank // Mus musculus glycoprotein hormone beta subunit (Zlut1) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC139462 // GenBank // Mus musculus glycoprotein hormone beta 5, mRNA (cDNA clone MGC:171089 IMAGE:8862484), complete cds. // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC139463 // GenBank // Mus musculus glycoprotein hormone beta 5, mRNA (cDNA clone MGC:171090 IMAGE:8862485), complete cds. // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:75412827:75449107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_012024 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, epsilon (Ppp2r5e), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006515927 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, epsilon (Ppp2r5e), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:75450883:75596200:-1 gene:ENSMUSG00000021051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC019199 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B (B56), epsilon isoform, mRNA (cDNA clone IMAGE:5040975), partial cds. // chr12 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC085149 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B (B56), epsilon isoform, mRNA (cDNA clone MGC:92976 IMAGE:6848033), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:75459724:75494164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0
NM_028203 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 89 (Wdr89), mRNA. // chr12 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000062370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:75630596:75669537:-1 gene:ENSMUSG00000045690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// AK011125 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2600001A11 product:hypothetical Trp-Asp (WD) repeats profile/Trp-Asp (WD) repeats circular profile/G-protein beta WD-40 repeats containing protein, full insert sequence. // chr12 // 92 // 72 // 12 // 13 // 0 /// BC111903 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 89, mRNA (cDNA clone MGC:132979 IMAGE:40062287), complete cds. // chr12 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// BC112430 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 89, mRNA (cDNA clone MGC:132978 IMAGE:40062286), complete cds. // chr12 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000187307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:75631397:75669527:-1 gene:ENSMUSG00000045690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0
NM_030750 // RefSeq // Mus musculus sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 (Sgpp1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:75714248:75735729:-1 gene:ENSMUSG00000021054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF247177 // GenBank // Mus musculus sphingosine-1-phosphate phosphohydrolase (Spp1) mRNA, complete cds. // chr12 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// AF415215 // GenBank // Mus musculus sphingosine-1-phosphate phosphatase mRNA, complete cds. // chr12 // 85 // 48 // 11 // 13 // 0 /// BC037592 // GenBank // Mus musculus sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:46758 IMAGE:5004335), complete cds. // chr12 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// AK043586 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830010K07 product:sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, full insert sequence. // chr12 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000054027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:75716113:75735563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000121461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:76152336:76152627:-1 gene:ENSMUSG00000046580 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT014701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT014702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001159532 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 21 (Tex21), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_019784 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 21 (Tex21), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006516393 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed gene 21 (Tex21), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000021453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:76198692:76246746:-1 gene:ENSMUSG00000021056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB000682 // GenBank // Mus musculus tsec-2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK016434 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931406F04 product:testis expressed gene 21, full insert sequence. // chr12 // 77 // 87 // 20 // 26 // 0 /// BC100432 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 21, mRNA (cDNA clone MGC:118241 IMAGE:30917866), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:76198793:76248846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0
NM_013675 // RefSeq // Mus musculus spectrin beta, erythrocytic (Sptb), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000021458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:76580488:76710547:-1 gene:ENSMUSG00000021061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000166101 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:76596130:76710023:-1 gene:ENSMUSG00000021061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC117711 // GenBank // Mus musculus spectrin beta 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40087674), complete cds. // chr12 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// BC129806 // GenBank // Mus musculus spectrin beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:141584 IMAGE:40087684), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC150783 // GenBank // Mus musculus spectrin beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:183694 IMAGE:9087694), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000026244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:76583225:76649924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0
NM_030677 // RefSeq // Mus musculus glutathione peroxidase 2 (Gpx2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000082431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:76792335:76795554:-1 gene:ENSMUSG00000042808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC010823 // GenBank // Mus musculus glutathione peroxidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:19146 IMAGE:4218623), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// BC034335 // GenBank // Mus musculus glutathione peroxidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:32403 IMAGE:5038341), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// BC039658 // GenBank // Mus musculus glutathione peroxidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:49159 IMAGE:4987478), complete cds. // chr12 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// BC054848 // GenBank // Mus musculus glutathione peroxidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:62872 IMAGE:6529267), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
NM_001146176 // RefSeq // Mus musculus Max protein (Max), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NM_008558 // RefSeq // Mus musculus Max protein (Max), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XR_381483 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Max protein (Max), transcript variant X3, misc_RNA. // chr12 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000082136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:76937269:76962248:-1 gene:ENSMUSG00000059436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000110395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:76937269:76962248:-1 gene:ENSMUSG00000059436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC138671 // GenBank // Mus musculus Max protein, mRNA (cDNA clone MGC:170297 IMAGE:8861692), complete cds. // chr12 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC138672 // GenBank // Mus musculus Max protein, mRNA (cDNA clone MGC:170298 IMAGE:8861693), complete cds. // chr12 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC145369 // GenBank // Mus musculus Max protein, mRNA (cDNA clone MGC:178935 IMAGE:9053927), complete cds. // chr12 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// M63903 // GenBank // Mus musculus B/HLH/Z protein (Myn) mRNA, complete cds. // chr12 // 83 // 83 // 20 // 24 // 0 /// XM_006515524 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Max protein (Max), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000026248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:76922519:77035051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
GENSCAN00000035535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:77623551:77624901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_023721 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit D (Atp6v1d), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:78842989:78861638:-1 gene:ENSMUSG00000021114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF298810 // GenBank // Mus musculus vacuolar ATPase subunit D (Atp6m) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC033457 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit D, mRNA (cDNA clone MGC:28226 IMAGE:3991107), complete cds. // chr12 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:78843469:78857331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0
NM_013738 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin 2 (Plek2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006515934 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin 2 (Plek2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:78888691:78906964:-1 gene:ENSMUSG00000021118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF157600 // GenBank // Mus musculus pleckstrin 2 mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AF170564 // GenBank // Mus musculus pleckstrin 2 mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC028902 // GenBank // Mus musculus pleckstrin 2, mRNA (cDNA clone MGC:18708 IMAGE:4208341), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:78889180:78938651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001170401 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 229B (Tmem229b), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// NM_178745 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 229B (Tmem229b), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// XM_006515911 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 229B (Tmem229b), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// XM_006515912 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 229B (Tmem229b), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000056660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:78961800:79007277:-1 gene:ENSMUSG00000046157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000070174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:78961795:78983478:-1 gene:ENSMUSG00000046157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000174072 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:78961797:78980763:-1 gene:ENSMUSG00000046157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// AK149922 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530105P19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 90 // 63 // 9 // 10 // 0 /// BC066067 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330442E10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:91312 IMAGE:6851142), complete cds. // chr12 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// BC079613 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330442E10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:90839 IMAGE:30361094), complete cds. // chr12 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
NM_029988 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class H (Pigh), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:79080673:79089670:-1 gene:ENSMUSG00000021120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK030744 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730505F11 product:PHOSPHATIDYLINOSITOL GLYCAN, CLASS H homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC086806 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class H, mRNA (cDNA clone MGC:102258 IMAGE:30603877), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XR_381471 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class H (Pigh), transcript variant X3, misc_RNA. // chr12 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000040747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:79082404:79089619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001008550 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 26 (Zfyve26), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000021547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:79232347:79296282:-1 gene:ENSMUSG00000066440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// AK132344 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4022426B02 product:Hypothetical arginine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 45 // 19 // 19 // 0 /// BC048379 // GenBank // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 26, mRNA (cDNA clone IMAGE:5036022), complete cds. // chr12 // 90 // 24 // 9 // 10 // 0 /// BC141359 // GenBank // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 26, mRNA (cDNA clone MGC:176320 IMAGE:9055971), complete cds. // chr12 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// AK042386 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630086P05 product:KIAA0321 PROTEIN (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr12 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1 /// GENSCAN00000040743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:79233966:79298222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0
GENSCAN00000040375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:79962660:79995987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_007564 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 36, C3H type-like 1 (Zfp36l1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000021552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:80107760:80113013:-1 gene:ENSMUSG00000021127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000165114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:80108698:80112998:-1 gene:ENSMUSG00000021127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// AK077855 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930421O16 product:zinc finger protein 36, C3H type-like 1, full insert sequence. // chr12 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// BC016621 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 36, C3H type-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:11624 IMAGE:3157001), complete cds. // chr12 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// BC037998 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 36, C3H type-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5257866), partial cds. // chr12 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// M58566 // GenBank // Mouse TIS11 primary response gene, complete cds. // chr12 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:80109589:80112875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0
NM_134156 // RefSeq // Mus musculus actinin, alpha 1 (Actn1), mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// XM_006515384 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus actinin, alpha 1 (Actn1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000021554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:80167542:80260371:-1 gene:ENSMUSG00000015143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000167327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:80168322:80260091:-1 gene:ENSMUSG00000015143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// BC038919 // GenBank HTC // Mus musculus actinin, alpha 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5352202), with apparent retained intron. // chr12 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// BC054830 // GenBank // Mus musculus actinin, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:62771 IMAGE:6308412), complete cds. // chr12 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// DQ288940 // GenBank // Mus musculus alpha actinin 1a (Actn1a) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000040365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:80168322:80211704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0
NM_177267 // RefSeq // Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 5 (Dcaf5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000054145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:80335847:80436601:-1 gene:ENSMUSG00000049106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC046813 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 22, mRNA (cDNA clone MGC:61362 IMAGE:5702325), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:80338510:80404698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NR_037995 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family D (with coiled-coil domains) member 1, opposite strand (Plekhd1os), long non-coding RNA. // chr12 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000153297 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:80686370:80692466:-1 gene:ENSMUSG00000044062 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT014847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008423 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 177 (Ccdc177), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:80754046:80760541:-1 gene:ENSMUSG00000062961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK147473 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain UNDEFINED_CELL_LINE cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1049E04 product:hypothetical Glutamic acid-rich region profile/Arginine-rich region profile/Serine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC067044 // GenBank // Mus musculus gene model 1568, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:91363 IMAGE:30531780), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:80757378:80777982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001177561 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 1 (Slc10a1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_011387 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 1 (Slc10a1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000095572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:80953185:80968079:-1 gene:ENSMUSG00000021135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AB003303 // GenBank // Mus musculus mRNA for sodium-dependent bile acid transporter, complete cds. // chr12 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC021154 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:13910 IMAGE:4162098), complete cds. // chr12 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC094023 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:102495 IMAGE:4160598), complete cds. // chr12 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// U95131 // GenBank // Mus musculus Na/taurocholate cotransporting polypeptide 1 (Ntcp) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr12 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// U95132 // GenBank // Mus musculus Na/taurocholate cotransporting polypeptide 2 (Ntcp) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr12 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:80953635:80989538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_001038995 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4787 (Gm4787), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000062182 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:81376991:81379464:-1 gene:ENSMUSG00000072974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_009620 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 4 (Adam4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000085319 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:81419443:81421946:-1 gene:ENSMUSG00000072972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY158688 // GenBank // Mus musculus strain ICR ADAM4 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC150159 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 4, mRNA (cDNA clone MGC:161247 IMAGE:40141514), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC150481 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 4, mRNA (cDNA clone MGC:161248 IMAGE:40141515), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_020330 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 21 (Adam21), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000008582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:81558584:81568474:-1 gene:ENSMUSG00000008438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF251559 // GenBank // Mus musculus metalloprotease-disintegrin protein (Adam31) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC132152 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 21, mRNA (cDNA clone MGC:163783 IMAGE:40130429), complete cds. // chr12 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC132344 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 21, mRNA (cDNA clone MGC:163975 IMAGE:40130621), complete cds. // chr12 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001174107 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 (Map3k9), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// NM_177395 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 (Map3k9), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000035987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:81714950:81781170:-1 gene:ENSMUSG00000042724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:81722039:81780874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0
NM_183154 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 1 (Zfyve1), mRNA. // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515689 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 1 (Zfyve1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006515692 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 1 (Zfyve1), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000048319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:83546941:83597147:-1 gene:ENSMUSG00000042628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AK129400 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1589 protein. // chr12 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC050015 // GenBank // Mus musculus zinc finger, FYVE domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:60726 IMAGE:30016571), complete cds. // chr12 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:83547883:83594880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
XM_006516452 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HEAT repeat-containing protein 4-like (LOC101055670), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000164935 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:83954499:83984852:-1 gene:ENSMUSG00000090843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:83954499:83980226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
XM_006516452 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HEAT repeat-containing protein 4-like (LOC101055670), mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000181399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:83950690:83951355:-1 gene:ENSMUSG00000096953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK078791 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030489M13 product:hypothetical Alanine-rich region/Treacher Collins syndrome protein Treacle containing protein, full insert sequence. // chr12 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
ENSMUST00000180751 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:12:84039469:84053807:-1 gene:ENSMUSG00000097762 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132490 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732463B04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000058999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84087015:84087625:-1 gene:ENSMUSG00000044515 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0
NM_027438 // RefSeq // Mus musculus paraneoplastic antigen MA1 (Pnma1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061425 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:84146131:84148489:-1 gene:ENSMUSG00000054383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116687 // GenBank // Mus musculus paraneoplastic antigen MA1, mRNA (cDNA clone MGC:144790 IMAGE:40106117), complete cds. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC116688 // GenBank // Mus musculus paraneoplastic antigen MA1, mRNA (cDNA clone MGC:144789 IMAGE:40106116), complete cds. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000058103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84258332:84258973:-1 gene:ENSMUSG00000042962 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000048259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84258332:84270681:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_172581 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 161, member B (Fam161b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006515698 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 161, member B (Fam161b), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000021659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:84345317:84361821:-1 gene:ENSMUSG00000021234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000065536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:84345309:84361833:-1 gene:ENSMUSG00000021234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000133230 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:84346492:84361792:-1 gene:ENSMUSG00000021234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// AK046195 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230349N02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// BC062132 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 161, member B, mRNA (cDNA clone MGC:69959 IMAGE:6509090), complete cds. // chr12 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000126752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:84348359:84354855:-1 gene:ENSMUSG00000021234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000048250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84346828:84358155:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
NM_134042 // RefSeq // Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 6, subfamily A1 (Aldh6a1), mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000085192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84430723:84450950:-1 gene:ENSMUSG00000021238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// AF297860 // GenBank // Mus musculus methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// AK147146 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920188E21 product:aldehyde dehydrogenase family 6, subfamily A1, full insert sequence. // chr12 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC031148 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 6, subfamily A1, mRNA (cDNA clone MGC:37325 IMAGE:4975560), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// BC033440 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 6, subfamily A1, mRNA (cDNA clone MGC:28587 IMAGE:4212084), complete cds. // chr12 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// BC115855 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase family 6, subfamily A1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40054698), partial cds. // chr12 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// AK164366 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130073L14 product:aldehyde dehydrogenase family 6, subfamily A1, full insert sequence. // chr12 // 54 // 54 // 21 // 39 // 1 /// GENSCAN00000047421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84432444:84450939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0
NM_001033334 // RefSeq // Mus musculus synapse differentiation inducing 1 like (Syndig1l), mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84677278:84698807:-1 gene:ENSMUSG00000071234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK140195 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230339N19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY993933 // GenBank // Mus musculus capucin mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr12 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AY993934 // GenBank // Mus musculus capucin mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr12 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC132221 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 90a, mRNA (cDNA clone MGC:163852 IMAGE:40130498), complete cds. // chr12 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// BC138501 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 90a, mRNA (cDNA clone MGC:170126 IMAGE:8861521), complete cds. // chr12 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000047420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84678717:84772867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_023409 // RefSeq // Mus musculus Niemann-Pick type C2 (Npc2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84754560:84773112:-1 gene:ENSMUSG00000021242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB021289 // GenBank // Mus musculus mRNA for epididymal secretory protein, complete cds. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC003471 // GenBank // Mus musculus Niemann Pick type C2, mRNA (cDNA clone MGC:6291 IMAGE:2649564), complete cds. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC007190 // GenBank // Mus musculus Niemann Pick type C2, mRNA (cDNA clone MGC:8265 IMAGE:3592515), complete cds. // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK151080 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830022K18 product:Niemann Pick type C2, full insert sequence. // chr12 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000047420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84678717:84772867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_013589 // RefSeq // Mus musculus latent transforming growth factor beta binding protein 2 (Ltbp2), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000002073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:84783212:84876532:-1 gene:ENSMUSG00000002020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000110254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84783213:84876495:-1 gene:ENSMUSG00000002020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000163189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:84783329:84876479:-1 gene:ENSMUSG00000002020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AF004874 // GenBank // Mus musculus latent TGF-beta binding protein-2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC119785 // GenBank // Mus musculus latent transforming growth factor beta binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:144212 IMAGE:40099725), complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000168699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:84807713:84876491:-1 gene:ENSMUSG00000002020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// AK052980 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930007I24 product:latent transforming growth factor beta binding protein 2, full insert sequence. // chr12 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000047417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84784250:84883301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_178065 // RefSeq // Mus musculus apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 (Arel1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000043169 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:84918150:84970900:-1 gene:ENSMUSG00000042350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000163231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:84918148:84970824:-1 gene:ENSMUSG00000042350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr12 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000167448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:84941782:84970856:-1 gene:ENSMUSG00000042350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 89 // 22 // 8 // 9 // 0 /// AK077015 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932409N14 product:hypothetical HECT domain (Ubiquitin-protein ligase) containing protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// BC060658 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110018G07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:79161 IMAGE:30355406), complete cds. // chr12 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000047418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:84915122:84951070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0
NM_175198 // RefSeq // Mus musculus prospero homeobox 2 (Prox2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006516279 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prospero homeobox 2 (Prox2), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000110249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:85086814:85106431:-1 gene:ENSMUSG00000042320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000177289 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:85086385:85097081:-1 gene:ENSMUSG00000042320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK029978 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932411P22 product:similar to PROX1 (FRAGMENT) [Xenopus laevis], full insert sequence. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC119330 // GenBank // Mus musculus prospero homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:155646 IMAGE:8734079), complete cds. // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC119332 // GenBank // Mus musculus prospero homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:155648 IMAGE:8734081), complete cds. // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000191324 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:85094023:85095615:-1 gene:ENSMUSG00000042320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000047419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85071768:85095427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_146244 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein S6 kinase-like 1 (Rps6kl1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006515850 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribosomal protein S6 kinase-like 1 (Rps6kl1), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000019379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:85135596:85151264:-1 gene:ENSMUSG00000019235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK036734 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830168N19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// BC024798 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein S6 kinase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:38756 IMAGE:5358742), complete cds. // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC027298 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein S6 kinase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:28043 IMAGE:3672127), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85136122:85176963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_001271705 // RefSeq // Mus musculus placental growth factor (Pgf), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_008827 // RefSeq // Mus musculus placental growth factor (Pgf), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000004913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:85166639:85177296:-1 gene:ENSMUSG00000004791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC016567 // GenBank // Mus musculus placental growth factor, mRNA (cDNA clone MGC:11485 IMAGE:2649577), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000047400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85136122:85176963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_175337 // RefSeq // Mus musculus mutL homolog 3 (E coli) (Mlh3), mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000019378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:85234529:85270564:-1 gene:ENSMUSG00000021245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000166821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:85234529:85270591:-1 gene:ENSMUSG00000021245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC003865 // GenBank // Mus musculus mutL homolog 3 (E coli), mRNA (cDNA clone IMAGE:3489678), complete cds. // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC079861 // GenBank // Mus musculus mutL homolog 3 (E coli), mRNA (cDNA clone MGC:100285 IMAGE:6834767), complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85235622:85250407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000047412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85260764:85269410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_145138 // RefSeq // Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 9 (Nek9), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006515708 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 9 (Nek9), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000040992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:85299514:85339362:-1 gene:ENSMUSG00000034290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC024926 // GenBank // Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:3990812), complete cds. // chr12 // 90 // 22 // 9 // 10 // 0 /// BC117971 // GenBank // Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 9, mRNA (cDNA clone MGC:144165 IMAGE:40098375), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC117972 // GenBank // Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 9, mRNA (cDNA clone MGC:144166 IMAGE:40098378), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000047404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:85300932:85339221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0
NM_026775 // RefSeq // Mus musculus transmembrane emp24-like trafficking protein 10 (yeast) (Tmed10), mRNA. // chr12 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000040766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:85340614:85374717:-1 gene:ENSMUSG00000021248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC006774 // GenBank // Mus musculus transmembrane emp24-like trafficking protein 10 (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:3588721), complete cds. // chr12 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0
ENSMUST00000102019 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:85718477:85718595:-1 gene:ENSMUSG00000075973 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT015067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_009368 // RefSeq // Mus musculus transforming growth factor, beta 3 (Tgfb3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000003687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:86056744:86079041:-1 gene:ENSMUSG00000021253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC005513 // GenBank // Mus musculus transforming growth factor, beta 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3492763), partial cds. // chr12 // 85 // 79 // 22 // 26 // 0 /// BC014690 // GenBank // Mus musculus transforming growth factor, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:18512 IMAGE:3663150), complete cds. // chr12 // 82 // 85 // 23 // 28 // 0 /// BC108426 // GenBank // Mus musculus transforming growth factor, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:118722 IMAGE:6757707), complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// M32745 // GenBank // mouse transforming growth factor beta-3 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:86037240:86077926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_144524 // RefSeq // Mus musculus angel homolog 1 (Drosophila) (Angel1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006516198 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus angel homolog 1 (Drosophila) (Angel1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:86700502:86726460:-1 gene:ENSMUSG00000021257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC019148 // GenBank // Mus musculus angel homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:29167 IMAGE:5052974), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000163388 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:86702439:86718186:-1 gene:ENSMUSG00000021257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:86715812:86726393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_145836 // RefSeq // Mus musculus interferon regulatory factor 2 binding protein-like (Irf2bpl), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000038422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:86880703:86884814:-1 gene:ENSMUSG00000034168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF525300 // GenBank // Mus musculus polyglutamine-containing protein mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC057128 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6430527G18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:63318 IMAGE:6810092), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BC063253 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6430527G18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:66698 IMAGE:6810092), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000016243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:86857089:86883897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
XM_006515851 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC-type containing 22 (Zdhhc22), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK080584 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830006A04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001080943 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC-type containing 22 (Zdhhc22), mRNA. // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// XM_006515853 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC-type containing 22 (Zdhhc22), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENSMUST00000095521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:86983381:86988676:-1 gene:ENSMUSG00000048483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// BC128021 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC-type containing 22, mRNA (cDNA clone MGC:157624 IMAGE:40136338), complete cds. // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:86983381:87044323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001080943 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC-type containing 22 (Zdhhc22), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515851 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC-type containing 22 (Zdhhc22), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006515853 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC-type containing 22 (Zdhhc22), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000095521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:86983381:86988676:-1 gene:ENSMUSG00000048483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC128021 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC-type containing 22, mRNA (cDNA clone MGC:157624 IMAGE:40136338), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:86983381:87044323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001294308 // RefSeq // Mus musculus neuroglobin (Ngb), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_022414 // RefSeq // Mus musculus neuroglobin (Ngb), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021420 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:87097531:87102539:-1 gene:ENSMUSG00000021032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110176 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:12:87098025:87102350:-1 gene:ENSMUSG00000021032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000110177 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:87097531:87102522:-1 gene:ENSMUSG00000021032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC024263 // GenBank // Mus musculus neuroglobin, mRNA (cDNA clone MGC:35839 IMAGE:5133442), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87098412:87102260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_153415 // RefSeq // Mus musculus protein-O-mannosyltransferase 2 (Pomt2), mRNA. // chr12 // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// ENSMUST00000037788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:87106866:87147902:-1 gene:ENSMUSG00000034126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// AF246235 // GenBank // Mus musculus putative protein O-mannosyltransferase POMT2 mRNA, complete cds. // chr12 // 98 // 89 // 40 // 41 // 0 /// AY090481 // GenBank // Mus musculus protein O-mannosyltransferase 2 (Pomt2) mRNA, putative testis isoform, complete cds. // chr12 // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// AY090482 // GenBank // Mus musculus protein O-mannosyltransferase 2 (Pomt2) mRNA, somatic isoform, complete cds. // chr12 // 98 // 93 // 42 // 43 // 0 /// BC052045 // GenBank // Mus musculus protein-O-mannosyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:62419 IMAGE:6402328), complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// XM_006515728 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein-O-mannosyltransferase 2 (Pomt2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1 /// AK085703 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730019E11 product:protein-O-mannosyltransferase 2, full insert sequence. // chr12 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1 /// GENSCAN00000016228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87109188:87147628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 98 // 87 // 39 // 40 // 0
NM_001033475 // RefSeq // Mus musculus transmembrane emp24 domain containing 8 (Tmed8), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006516050 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane emp24 domain containing 8 (Tmed8), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:87166242:87200229:-1 gene:ENSMUSG00000034111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150860 // GenBank // Mus musculus transmembrane emp24 domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:183771 IMAGE:9087771), complete cds. // chr12 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000016247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87172414:87184878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_027744 // RefSeq // Mus musculus NADP+ dependent oxidoreductase domain containing 1 (Noxred1), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006516231 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NADP+ dependent oxidoreductase domain containing 1 (Noxred1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:87221255:87233556:-1 gene:ENSMUSG00000072919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// AK017096 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933437F05 product:hypothetical NAD(P)-binding Rossmann-fold domains structure containing protein, full insert sequence. // chr12 // 93 // 85 // 27 // 29 // 0 /// BC125331 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933437F05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159034 IMAGE:40129846), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC125333 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933437F05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159036 IMAGE:40129848), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87217090:87263997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
NM_001290302 // RefSeq // Mus musculus isthmin 2 homolog (zebrafish) (Ism2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006542999 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus isthmin 2 homolog (zebrafish) (Ism2), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:87279682:87287137:-1 gene:ENSMUSG00000050671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125733 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:12:87278638:87299705:-1 gene:ENSMUSG00000050671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000145714 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:87282420:87287073:-1 gene:ENSMUSG00000050671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// XM_006516434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus isthmin 2 homolog (zebrafish) (Ism2), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87279682:87299705:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_011479 // RefSeq // Mus musculus serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 2 (Sptlc2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021424 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:87305058:87388355:-1 gene:ENSMUSG00000021036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000167911 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:87346734:87388241:-1 gene:ENSMUSG00000021036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr12 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000169845 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:12:87308070:87343848:-1 gene:ENSMUSG00000021036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr12 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AK172965 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0526 protein. // chr12 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC003227 // GenBank // Mus musculus serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:5898 IMAGE:3483158), complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// U27455 // GenBank // Mus musculus serine palmitoyltransferase LCB2 subunit mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:87309901:87356702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0