ENSMUST00000082908 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:3102016:3102125:1 gene:ENSMUSG00000064842 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK140060 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230115G11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00000002 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000005057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:4771131:4772199:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001159750 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII) 1 (Tcea1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_011541 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor A (SII) 1 (Tcea1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000081551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:4857814:4897905:1 gene:ENSMUSG00000033813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC061490 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor A (SII) 1, mRNA (cDNA clone MGC:70239 IMAGE:2582185), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC083127 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor A (SII) 1, mRNA (cDNA clone MGC:103154 IMAGE:6390364), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// M18210 // GenBank // Mouse transcription factor S-II, clone PSII-3. // chr1 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// BC006022 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor A (SII) 1, mRNA (cDNA clone MGC:6153 IMAGE:3590733), complete cds. // chr1 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
NM_133826 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit H (Atp6v1h), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006495437 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit H (Atp6v1h), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// XM_006495438 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit H (Atp6v1h), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000044369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:5083173:5162549:1 gene:ENSMUSG00000033793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC009154 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit H, mRNA (cDNA clone MGC:11985 IMAGE:3601621), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK034165 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330160M17 product:similar to MSTP042 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// AK081492 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130021C16 product:hypothetical V-ATPase subunit H containing protein, full insert sequence. // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000045875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:5084460:5217241:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001204371 // RefSeq // Mus musculus opioid receptor, kappa 1 (Oprk1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_011011 // RefSeq // Mus musculus opioid receptor, kappa 1 (Oprk1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027038 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:5588557:5602866:1 gene:ENSMUSG00000025905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:5588941:5604014:1 gene:ENSMUSG00000025905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000160777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:5588493:5606131:1 gene:ENSMUSG00000025905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116795 // GenBank // Mus musculus opioid receptor, kappa 1, mRNA (cDNA clone MGC:151172 IMAGE:40126114), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119026 // GenBank // Mus musculus opioid receptor, kappa 1, mRNA (cDNA clone MGC:155342 IMAGE:8733775), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L11065 // GenBank // Mouse kappa opioid receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:5596518:5603153:1 gene:ENSMUSG00000025905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// AK138198 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230031G11 product:opioid receptor, kappa 1, full insert sequence. // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:5578692:5633299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001195732 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 150, member A (Fam150a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:6359331:6394731:1 gene:ENSMUSG00000087247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006495555 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 150, member A (Fam150a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:6214132:6428628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
XR_398548 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102632303 (LOC102632303), ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK036865 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930020B22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// KnowTID_00000008 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000102181 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:8816138:8816247:1 gene:ENSMUSG00000076135 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT000092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000083691 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:9458670:9458772:1 gene:ENSMUSG00000065625 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021511 // RefSeq // Mus musculus RRS1 ribosome biogenesis regulator homolog (S. cerevisiae) (Rrs1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000072079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:9545408:9547455:1 gene:ENSMUSG00000061024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC003481 // GenBank // Mus musculus RRS1 ribosome biogenesis regulator homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:6914 IMAGE:2811004), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC055925 // GenBank // Mus musculus RRS1 ribosome biogenesis regulator homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:68331 IMAGE:4235851), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_178399 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3110035E14 gene (3110035E14Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:9601199:9627143:1 gene:ENSMUSG00000067879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC066997 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3110035E14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:91354 IMAGE:5703513), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000118263 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10039773:10067976:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000119714 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10039785:10067102:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000122156 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10039773:10068333:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000134716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10039823:10059991:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK032310 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430518I24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000190063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10039777:10058858:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000191521 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10039767:10058872:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_026493 // RefSeq // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000071087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:10038217:10136768:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000153804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10074860:10084073:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC151042 // GenBank // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:183955 IMAGE:9087955), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FJ008676 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J centrosome/spindle pole-associated protein 2 (Cspp2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FJ008677 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J centrosome/spindle pole-associated protein 3 (Cspp3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000186294 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10046493:10136145:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000188249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10074382:10085817:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000188449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10074913:10090255:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000031241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:10038080:10096030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_026493 // RefSeq // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:10038217:10136768:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10074860:10084073:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151042 // GenBank // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:183955 IMAGE:9087955), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ008676 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J centrosome/spindle pole-associated protein 2 (Cspp2) mRNA, complete cds. // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// FJ008677 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J centrosome/spindle pole-associated protein 3 (Cspp3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186294 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10046493:10136145:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10074382:10085817:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10074913:10090255:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:10038080:10096030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026493 // RefSeq // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000071087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:10038217:10136768:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000153804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10074860:10084073:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC151042 // GenBank // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:183955 IMAGE:9087955), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FJ008677 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J centrosome/spindle pole-associated protein 3 (Cspp3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FJ008676 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J centrosome/spindle pole-associated protein 2 (Cspp2) mRNA, complete cds. // chr1 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// ENSMUST00000186294 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10046493:10136145:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000188249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10074382:10085817:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000188449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10074913:10090255:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_026493 // RefSeq // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:10038217:10136768:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151042 // GenBank // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:183955 IMAGE:9087955), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ008676 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J centrosome/spindle pole-associated protein 2 (Cspp2) mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186294 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10046493:10136145:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10074382:10085817:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:10038080:10096030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_026493 // RefSeq // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:10038217:10136768:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10087747:10090317:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151042 // GenBank // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:183955 IMAGE:9087955), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ008676 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J centrosome/spindle pole-associated protein 2 (Cspp2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186294 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10046493:10136145:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10074913:10090255:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:10038080:10096030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026493 // RefSeq // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:10038217:10136768:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10087747:10090317:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151042 // GenBank // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:183955 IMAGE:9087955), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ008676 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J centrosome/spindle pole-associated protein 2 (Cspp2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186294 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10046493:10136145:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:10038080:10096030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10074913:10090255:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_026493 // RefSeq // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:10038217:10136768:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151042 // GenBank // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:183955 IMAGE:9087955), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ008676 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J centrosome/spindle pole-associated protein 2 (Cspp2) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185422 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10095864:10108554:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186294 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10046493:10136145:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:10038080:10096030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026493 // RefSeq // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:10038217:10136768:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151042 // GenBank // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:183955 IMAGE:9087955), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190625 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10104228:10108543:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_026493 // RefSeq // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:10038217:10136768:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151042 // GenBank // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:183955 IMAGE:9087955), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ008676 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J centrosome/spindle pole-associated protein 2 (Cspp2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185422 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10095864:10108554:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186294 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10046493:10136145:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190625 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10104228:10108543:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026493 // RefSeq // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:10038217:10136768:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC055915 // GenBank // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3993429), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151042 // GenBank // Mus musculus centrosome and spindle pole associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:183955 IMAGE:9087955), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ008676 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J centrosome/spindle pole-associated protein 2 (Cspp2) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENSMUST00000187226 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10112876:10134173:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000031235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:10109357:10136145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000186294 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10046493:10136145:1 gene:ENSMUSG00000056763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
ENSMUST00000188013 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10868688:10869446:1 gene:ENSMUSG00000100648 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:10846075:10927525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
ENSMUST00000187748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:12120960:12121832:1 gene:ENSMUSG00000101610 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000021145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:12115970:12121586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000059065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:13062025:13062345:1 gene:ENSMUSG00000069620 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_001011873 // RefSeq // Mus musculus X Kell blood group precursor related family member 9 homolog (Xkr9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006495547 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus X Kell blood group precursor related family member 9 homolog (Xkr9), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006495548 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus X Kell blood group precursor related family member 9 homolog (Xkr9), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000088542 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:13668771:13701723:1 gene:ENSMUSG00000067813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY534255 // GenBank // Mus musculus XK-related protein 9 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147699 // GenBank // Mus musculus X Kell blood group precursor related family member 9 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:182778 IMAGE:9056672), complete cds. // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC158121 // GenBank // Mus musculus X Kell blood group precursor related family member 9 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:190007 IMAGE:9088194), complete cds. // chr1 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0
ENSMUST00000067599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:14755454:14758373:1 gene:ENSMUSG00000054493 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK053413 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130016A22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001098528 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shab-related subfamily, member 2 (Kcnb2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006495596 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium voltage gated channel, Shab-related subfamily, member 2 (Kcnb2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000170146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:15312452:15723750:1 gene:ENSMUSG00000092083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000090498 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000175681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:15287254:15712548:1 gene:ENSMUSG00000092083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC146609 // GenBank // Mus musculus potassium voltage gated channel, Shab-related subfamily, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:157480 IMAGE:40060460), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK162605 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630053C06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:15679665:15711629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
XR_373240 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7634 (Gm7634), misc_RNA. // chr1 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000185778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:16053335:16053887:1 gene:ENSMUSG00000100652 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_133832 // RefSeq // Mus musculus retinol dehydrogenase 10 (all-trans) (Rdh10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:16105774:16133734:1 gene:ENSMUSG00000025921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000152626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:16130502:16132547:1 gene:ENSMUSG00000025921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AF456767 // GenBank // Mus musculus retinol dehydrogenase 10 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK014244 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110069K09 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC019796 // GenBank // Mus musculus retinol dehydrogenase 10 (all-trans), mRNA (cDNA clone MGC:30527 IMAGE:4923005), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:16106252:16131417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT000226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_026392 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 70 (Tmem70), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_027415 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 70 (Tmem70), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000065373 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:16665210:16678275:1 gene:ENSMUSG00000025940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176451 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:16665236:16665811:1 gene:ENSMUSG00000025940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000177501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:16665207:16678195:1 gene:ENSMUSG00000025940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000177532 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:16665210:16677215:1 gene:ENSMUSG00000025940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC011320 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 70, mRNA (cDNA clone MGC:18940 IMAGE:3979025), complete cds. // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONMMUT000251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001159711 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte antigen 96 (Ly96), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NM_016923 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte antigen 96 (Ly96), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026881 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:16688433:16709611:1 gene:ENSMUSG00000025779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB018550 // GenBank // Mus musculus MD-2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF168120 // GenBank // Mus musculus ESOP1 (Esop1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY641431 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 MD-2 isoform B mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 81 // 18 // 22 // 0 /// BC116785 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 96, mRNA (cDNA clone MGC:151162 IMAGE:40126104), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006495457 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lymphocyte antigen 96 (Ly96), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// ENSMUST00000190366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:16688508:16709537:1 gene:ENSMUSG00000025779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000191260 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:16688051:16691947:1 gene:ENSMUSG00000025779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:16677042:16703813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_053191 // RefSeq // Mus musculus peptidase inhibitor 15 (Pi15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000088476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:17601901:17630939:1 gene:ENSMUSG00000067780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF329196 // GenBank // Mus musculus SugarCrisp mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC116705 // GenBank // Mus musculus peptidase inhibitor 15, mRNA (cDNA clone MGC:144531 IMAGE:40102877), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:17602618:17624970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_031402 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich secretory protein LCCL domain containing 1 (Crispld1), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000095075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:17727088:17766344:1 gene:ENSMUSG00000025776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000159958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:17727045:17765575:1 gene:ENSMUSG00000025776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AF329198 // GenBank // Mus musculus CocoaCrisp mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// BC034334 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secretory protein LCCL domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5030052), partial cds. // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC040768 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secretory protein LCCL domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:49048 IMAGE:4458200), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:17668065:17764230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_153154 // RefSeq // Mus musculus transcription factor AP-2, delta (Tfap2d), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006495497 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor AP-2, delta (Tfap2d), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006495498 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor AP-2, delta (Tfap2d), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006495499 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor AP-2, delta (Tfap2d), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000037294 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:19103022:19166346:1 gene:ENSMUSG00000042596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000149505 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:19107181:19148367:1 gene:ENSMUSG00000042596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// AF421891 // GenBank // Mus musculus transcription factor AP-2delta mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC152324 // GenBank // Mus musculus transcription factor AP-2, delta, mRNA (cDNA clone MGC:161209 IMAGE:40141049), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC152325 // GenBank // Mus musculus transcription factor AP-2, delta, mRNA (cDNA clone MGC:161210 IMAGE:40141051), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:19037296:19147868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001025305 // RefSeq // Mus musculus transcription factor AP-2 beta (Tfap2b), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_001286340 // RefSeq // Mus musculus transcription factor AP-2 beta (Tfap2b), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NM_009334 // RefSeq // Mus musculus transcription factor AP-2 beta (Tfap2b), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006495495 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor AP-2 beta (Tfap2b), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027059 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:19208914:19238576:1 gene:ENSMUSG00000025927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000064976 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:19212054:19234624:1 gene:ENSMUSG00000025927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000186972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:19213879:19219253:1 gene:ENSMUSG00000025927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000187754 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:19208960:19238083:1 gene:ENSMUSG00000025927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:19209201:19234347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
NM_172015 // RefSeq // Mus musculus isoleucine-tRNA synthetase (Iars), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:49682130:49734267:1 gene:ENSMUSG00000037851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:49687393:49733741:1 gene:ENSMUSG00000037851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165316 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:13:49682100:49734267:1 gene:ENSMUSG00000037851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC002239 // GenBank // Mus musculus isoleucine-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3491909), partial cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC067029 // GenBank // Mus musculus isoleucine-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:91370 IMAGE:30534067), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188428 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:19330939:19333184:1 gene:ENSMUSG00000100204 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:49608809:49757123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:19332126:19333092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NR_029593 // RefSeq // Mus musculus microRNA 206 (Mir206), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083625 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:20679010:20679082:1 gene:ENSMUSG00000065559 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185494 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:20679023:20684298:1 gene:ENSMUSG00000099906 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// mmu-mir-206 // miRBase Micro RNA Database // MI0000249 Mus musculus miR-206 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000047083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:20672901:20760172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NR_029902 // RefSeq // Mus musculus microRNA 133b (Mir133b), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083546 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:20682769:20682887:1 gene:ENSMUSG00000065480 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185494 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:20679023:20684298:1 gene:ENSMUSG00000099906 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:20672901:20760172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// JN699052 // GenBank // Mus musculus long intergenic non-coding RNA muscle differentiation 1 (linc-MD1), partial sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-133b // miRBase Micro RNA Database // MI0000821 Mus musculus miR-133b stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010552 // RefSeq // Mus musculus interleukin 17A (Il17a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:20730905:20734496:1 gene:ENSMUSG00000025929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119303 // GenBank // Mus musculus interleukin 17A, mRNA (cDNA clone MGC:155619 IMAGE:8734052), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC119309 // GenBank // Mus musculus interleukin 17A, mRNA (cDNA clone MGC:155625 IMAGE:8734058), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// U43088 // GenBank // Mus Musculus IL-17 (CTLA-8) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:20672901:20760172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_028829 // RefSeq // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member VIII (Paqr8), mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000068880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:20917840:20939055:1 gene:ENSMUSG00000025931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000167119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:20917874:20935749:1 gene:ENSMUSG00000025931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// AF313617 // GenBank // Mus musculus putative membrane steroid receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 81 // 58 // 17 // 21 // 0 /// AY424297 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member VIII (Paqr8) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// BC059813 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member VIII, mRNA (cDNA clone MGC:69571 IMAGE:6843180), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000187651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:20922259:20935756:1 gene:ENSMUSG00000025931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000189400 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:20890606:20939650:1 gene:ENSMUSG00000025931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_027974 // RefSeq // Mus musculus EF-hand domain (C-terminal) containing 1 (Efhc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006495576 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand domain (C-terminal) containing 1 (Efhc1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000038447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:20951688:20990841:1 gene:ENSMUSG00000041809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// EU520262 // GenBank // Mus musculus EF-hand domain containing 1 (Efhc1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:20953891:20990052:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_001290679 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 14A (Tmem14a), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_029398 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 14A (Tmem14a), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006495579 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 14A (Tmem14a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000027064 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:21218662:21230164:1 gene:ENSMUSG00000025933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000027065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:21218575:21230167:1 gene:ENSMUSG00000025933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC034768 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 14A, mRNA (cDNA clone MGC:36280 IMAGE:4039224), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC060034 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 14A, mRNA (cDNA clone MGC:68080 IMAGE:6491675), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:21217135:21229585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
NM_183322 // RefSeq // Mus musculus KH domain containing 1A (Khdc1a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000088407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:21349641:21352200:1 gene:ENSMUSG00000067750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AY238603 // GenBank // Mus musculus Nur77 downstream protein 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT000317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0
NM_001033904 // RefSeq // Mus musculus KH domain containing 1C (Khdc1c), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_183322 // RefSeq // Mus musculus KH domain containing 1A (Khdc1a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000070223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:21368331:21370845:1 gene:ENSMUSG00000041722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000088407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:21349641:21352200:1 gene:ENSMUSG00000067750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC099381 // GenBank // Mus musculus KH domain containing 1C, mRNA (cDNA clone MGC:117514 IMAGE:30937206), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001113187 // RefSeq // Mus musculus KH domain containing 1B (Khdc1b), mRNA. // chr1 // 64 // 83 // 16 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:21383556:21386373:1 gene:ENSMUSG00000085079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 83 // 16 // 25 // 0 /// AY238603 // GenBank // Mus musculus Nur77 downstream protein 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 70 // 90 // 19 // 27 // 0 /// BC141037 // GenBank // Mus musculus KH domain containing 1C, mRNA (cDNA clone MGC:175998 IMAGE:9055649), complete cds. // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:21330652:21392317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
NM_001113187 // RefSeq // Mus musculus KH domain containing 1B (Khdc1b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000147615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:21383556:21386373:1 gene:ENSMUSG00000085079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001033904 // RefSeq // Mus musculus KH domain containing 1C (Khdc1c), mRNA. // chr1 // 52 // 93 // 13 // 25 // 0 /// NM_183322 // RefSeq // Mus musculus KH domain containing 1A (Khdc1a), mRNA. // chr1 // 50 // 96 // 13 // 26 // 0 /// ENSMUST00000070223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:21368331:21370845:1 gene:ENSMUSG00000041722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 93 // 13 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:21349641:21352200:1 gene:ENSMUSG00000067750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 96 // 13 // 26 // 0 /// BC099381 // GenBank // Mus musculus KH domain containing 1C, mRNA (cDNA clone MGC:117514 IMAGE:30937206), complete cds. // chr1 // 52 // 93 // 13 // 25 // 0 /// BC141037 // GenBank // Mus musculus KH domain containing 1C, mRNA (cDNA clone MGC:175998 IMAGE:9055649), complete cds. // chr1 // 52 // 93 // 13 // 25 // 0 /// AY238603 // GenBank // Mus musculus Nur77 downstream protein 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 35 // 96 // 9 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:21330652:21392317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 93 // 20 // 25 // 0
NR_029533 // RefSeq // Mus musculus microRNA 30a (Mir30a), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000083471 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:23272264:23272345:1 gene:ENSMUSG00000065405 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// mmu-mir-30a // miRBase Micro RNA Database // MI0000144 Mus musculus miR-30a stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT000349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NR_029717 // RefSeq // Mus musculus microRNA 30c-2 (Mir30c-2), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000083633 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:23291701:23291784:1 gene:ENSMUSG00000065567 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000182303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:23291537:23291935:1 gene:ENSMUSG00000097970 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// mmu-mir-30c-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000548 Mus musculus miR-30c-2 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT000351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT000352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
AK005585 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700001E18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001290691 // RefSeq // Mus musculus collagen, type IX, alpha 1 (Col9a1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// NM_007740 // RefSeq // Mus musculus collagen, type IX, alpha 1 (Col9a1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// XM_006495649 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collagen, type IX, alpha 1 (Col9a1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000054588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:24177610:24252684:1 gene:ENSMUSG00000026147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000088349 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:24195187:24252684:1 gene:ENSMUSG00000026147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC038017 // GenBank // Mus musculus collagen, type IX, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:47016 IMAGE:3592397), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC046970 // GenBank // Mus musculus collagen, type IX, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:54693 IMAGE:6314986), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// D17511 // GenBank // Mus musculus mRNA for alpha 1 type IX collagen chain, complete cds. // chr1 // 86 // 92 // 31 // 36 // 0 /// L12215 // GenBank // Mouse collagen alpha 1 type IX mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 87 // 30 // 34 // 0 /// ENSMUST00000124600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:24197017:24220785:1 gene:ENSMUSG00000026147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// GENSCAN00000038783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:24176617:24250040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 51 // 51 // 20 // 39 // 1
ENSMUST00000188406 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:25011941:25012756:1 gene:ENSMUSG00000100450 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XR_373278 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102633099 (LOC102633099), ncRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK048705 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230012D11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000189614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:27989910:27991782:1 gene:ENSMUSG00000101372 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:27990108:28008637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
XM_006543479 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6462 (Gm6462), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000081488 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:28938036:28938339:1 gene:ENSMUSG00000058590 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000051969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:28938008:28938340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_153601 // RefSeq // Mus musculus lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain (Lgsn), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:31176401:31204725:1 gene:ENSMUSG00000050217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161773 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:31189470:31204725:1 gene:ENSMUSG00000050217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AF545851 // GenBank // Mus musculus lengsin (Lgs) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117745 // GenBank // Mus musculus lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain, mRNA (cDNA clone MGC:143528 IMAGE:40090427), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC117746 // GenBank // Mus musculus lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain, mRNA (cDNA clone MGC:143529 IMAGE:40090429), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC128067 // GenBank // Mus musculus lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain, mRNA (cDNA clone MGC:143526 IMAGE:40090416), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:31175485:31204530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_029062 // RefSeq // Mus musculus PIH1 domain containing 3 (Pih1d3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000027230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:31222838:31224288:1 gene:ENSMUSG00000026063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC107262 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930521A18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130206 IMAGE:40052516), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:31222939:31223595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000178167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:31286945:31287640:1 gene:ENSMUSG00000094215 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:31274902:31287706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000117896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:31736057:31736891:1 gene:ENSMUSG00000082159 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000083289 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:33293676:33293775:1 gene:ENSMUSG00000065223 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// NONMMUT000476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0
ENSMUST00000083326 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:33422733:33422838:1 gene:ENSMUSG00000065260 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000187302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:34367371:34369003:1 gene:ENSMUSG00000101206 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_178601 // RefSeq // Mus musculus IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, homolog (yeast) (Imp4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000027303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:34439851:34449356:1 gene:ENSMUSG00000026127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000134327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:34439937:34444027:1 gene:ENSMUSG00000026127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000136770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:34440041:34444514:1 gene:ENSMUSG00000026127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000137794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:34439905:34443856:1 gene:ENSMUSG00000026127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000149962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:34439905:34444387:1 gene:ENSMUSG00000026127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AF334609 // GenBank // Mus musculus IMP4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC069930 // GenBank // Mus musculus IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:78217 IMAGE:3481801), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:34439794:34444470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000027303 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:34439851:34449356:1 gene:ENSMUSG00000026127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK149623 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530004B13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_011206 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18 (Ptpn18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000027302 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:34459765:34473784:1 gene:ENSMUSG00000026126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC008512 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, mRNA (cDNA clone MGC:5834 IMAGE:3591418), complete cds. // chr1 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// U35124 // GenBank // Mus musculus nonreceptor protein tyrosine phosphatase (PTPK1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U49853 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U52523 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase FLP1 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000188884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:34459792:34470324:1 gene:ENSMUSG00000026126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000190122 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:34459777:34471917:1 gene:ENSMUSG00000026126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000040844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:34459824:34473646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_009355 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 39 (Prss39), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:34498410:34503063:1 gene:ENSMUSG00000026125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB008910 // GenBank // Mus musculus mRNA for TESP1, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC049616 // GenBank // Mus musculus testicular serine protease 1, mRNA (cDNA clone MGC:58320 IMAGE:6773970), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC115665 // GenBank // Mus musculus testicular serine protease 1, mRNA (cDNA clone MGC:144580 IMAGE:40103370), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC115666 // GenBank // Mus musculus testicular serine protease 1, mRNA (cDNA clone MGC:144581 IMAGE:40103373), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000191604 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:34498421:34500132:1 gene:ENSMUSG00000026125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000040845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:34497262:34539704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_007685 // RefSeq // Mus musculus cripto, FRL-1, cryptic family 1 (Cfc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027298 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:34535648:34544311:1 gene:ENSMUSG00000026124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100705 // GenBank // Mus musculus cripto, FRL-1, cryptic family 1, mRNA (cDNA clone MGC:123898 IMAGE:40044593), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC100706 // GenBank // Mus musculus cripto, FRL-1, cryptic family 1, mRNA (cDNA clone MGC:123899 IMAGE:40044594), complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC100708 // GenBank // Mus musculus cripto, FRL-1, cryptic family 1, mRNA (cDNA clone MGC:123900 IMAGE:40044595), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC100711 // GenBank // Mus musculus cripto, FRL-1, cryptic family 1, mRNA (cDNA clone MGC:123901 IMAGE:40044596), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U57720 // GenBank // Mus musculus EGF-related protein CRYPTIC mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:34497262:34539704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_213727 // RefSeq // Mus musculus APC membrane recruitment 3 (Amer3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006495820 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus APC membrane recruitment 3 (Amer3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000052670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:34579727:34590944:1 gene:ENSMUSG00000045174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC070435 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 123, member C, mRNA (cDNA clone MGC:79165 IMAGE:6853754), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:34575248:34614720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000159747 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:34678188:34812739:1 gene:ENSMUSG00000037509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK082264 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230030N03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:34718758:34801964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000159747 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:34678188:34812739:1 gene:ENSMUSG00000037509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162599 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:34732115:34811829:1 gene:ENSMUSG00000037509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:34718758:34801964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000159021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:34750881:34807144:1 gene:ENSMUSG00000037509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159747 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:34678188:34812739:1 gene:ENSMUSG00000037509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162599 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:34732115:34811829:1 gene:ENSMUSG00000037509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:34718758:34801964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145516 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family B (evectins) member 2 (Plekhb2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006495898 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family B (evectins) member 2 (Plekhb2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000027297 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:34849992:34879580:1 gene:ENSMUSG00000026123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF189817 // GenBank // Mus musculus evectin-2 (Evt2) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// AK039771 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330105O19 product:EVECTIN-2 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// BC057994 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family B (evectins) member 2, mRNA (cDNA clone MGC:67806 IMAGE:5344583), complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NM_175421 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family B (evectins) member 2 (Plekhb2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// ENSMUST00000156687 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:34849976:34873956:1 gene:ENSMUSG00000026123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// GENSCAN00000040850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:34860007:34869491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000034126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:34924009:34962366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
ENSMUST00000082667 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:35761602:35761706:1 gene:ENSMUSG00000064601 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT000529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_015818 // RefSeq // Mus musculus heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 (Hs6st1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:36068400:36106446:1 gene:ENSMUSG00000045216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB024566 // GenBank // Mus musculus mRNA for heparan sulfate 6-sulfotransferase 1, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK166962 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0025K13 product:heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC052316 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:54588 IMAGE:6391204), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36068688:36141473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001277076 // RefSeq // Mus musculus fer-1-like 5 (C. elegans) (Fer1l5), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000140452 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:36416888:36422110:1 gene:ENSMUSG00000037432 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 96 // 49 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000179162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:36372291:36421909:1 gene:ENSMUSG00000037432 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr1 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// KC440916 // GenBank // Mus musculus clone fl-1 fer-1-like 5 protein (Fer1l5) mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 98 // 39 // 46 // 0 /// XM_006495603 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fer-1-like 5 (C. elegans) (Fer1l5), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 23 // 23 // 11 // 47 // 1 /// GENSCAN00000009235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36372291:36422276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0
NM_033570 // RefSeq // Mus musculus cyclin M4 (Cnnm4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000153128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:36471620:36508764:1 gene:ENSMUSG00000037408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF216963 // GenBank // Mus musculus ancient conserved domain protein 4 (Acdp4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GU390541 // GenBank // Mus musculus cyclin-like protein 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36471693:36506606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_001039551 // RefSeq // Mus musculus cyclin M3 (Cnnm3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_053186 // RefSeq // Mus musculus cyclin M3 (Cnnm3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000001166 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:36511867:36528237:1 gene:ENSMUSG00000001138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000097776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:36511867:36528237:1 gene:ENSMUSG00000001138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000135100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:36520761:36525600:1 gene:ENSMUSG00000001138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// AF216964 // GenBank // Mus musculus ancient conserved domain protein 3 (Acdp3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GQ225746 // GenBank // Mus musculus cyclin-like protein 3 (Clp3) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 64 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36511911:36525230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT000570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0
NM_009942 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit Vb (Cox5b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000081180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:36691487:36693385:1 gene:ENSMUSG00000061518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC096048 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit Vb, mRNA (cDNA clone MGC:107010 IMAGE:3465479), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC099474 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit Vb, mRNA (cDNA clone MGC:117683 IMAGE:30933585), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// X53157 // GenBank // Mouse mRNA for mitochondrial cytochrome c oxidase subunit Vb. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000044043 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:13:21501029:21501418:-1 gene:ENSMUSG00000079941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 81 // 19 // 26 // 0 /// XM_006544369 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial-like (LOC102638382), partial mRNA. // chr1 // 42 // 97 // 13 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36691587:36693309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:21501029:21501418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 81 // 19 // 26 // 0
NM_001289612 // RefSeq // Mus musculus zeta-chain (TCR) associated protein kinase (Zap70), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NM_001289765 // RefSeq // Mus musculus zeta-chain (TCR) associated protein kinase (Zap70), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NM_001289766 // RefSeq // Mus musculus zeta-chain (TCR) associated protein kinase (Zap70), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NM_009539 // RefSeq // Mus musculus zeta-chain (TCR) associated protein kinase (Zap70), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000027291 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:36761798:36782816:1 gene:ENSMUSG00000026117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AB083210 // GenBank // Mus musculus mRNA for truncated ZAP kinase, complete cds. // chr1 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// AB084383 // GenBank // Mus musculus mRNA for Truncated ZAP Kinase-2, complete cds. // chr1 // 93 // 41 // 13 // 14 // 0 /// BC029727 // GenBank // Mus musculus zeta-chain (TCR) associated protein kinase, mRNA (cDNA clone MGC:36162 IMAGE:4925739), complete cds. // chr1 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// U04379 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine kinase ZAP-70 mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 82 // 25 // 28 // 0 /// U77667 // GenBank // Mus musculus tyrosine kinase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000190128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:36778984:36782815:1 gene:ENSMUSG00000026117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36770760:36782584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000177688 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:37005439:37005557:1 gene:ENSMUSG00000095944 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT000598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006496378 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496380 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496381 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006543487 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_373322 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X7, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:37013384:37216944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006496378 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496380 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496381 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006543487 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_373322 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X7, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:37013384:37216944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
XM_006496378 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006496380 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006496381 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006543487 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_373322 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X7, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006496378 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// XR_373322 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X7, misc_RNA. // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000027289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:37153844:37187604:1 gene:ENSMUSG00000026115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000169057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:37153849:37187605:1 gene:ENSMUSG00000026115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// BC050813 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921511C04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58830 IMAGE:6773785), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006543487 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), mRNA. // chr1 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// GENSCAN00000029016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:37013384:37216944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1
NM_001282010 // RefSeq // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel alpha 3 (Cnga3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NM_009918 // RefSeq // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel alpha 3 (Cnga3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:37219261:37263383:1 gene:ENSMUSG00000026114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC035272 // GenBank // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:38684 IMAGE:5357087), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC049145 // GenBank // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:56803 IMAGE:5357087), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:37241879:37262096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_001037918 // RefSeq // Mus musculus lipoyltransferase 1 (Lipt1), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006496174 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipoyltransferase 1 (Lipt1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006496176 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipoyltransferase 1 (Lipt1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006496177 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipoyltransferase 1 (Lipt1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000041621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:37872206:37877387:1 gene:ENSMUSG00000037216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019519 // GenBank // Mus musculus lipoyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:28431 IMAGE:4038179), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006496175 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lipoyltransferase 1 (Lipt1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:37874865:37875986:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_027098 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L30 (Mrpl30), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006495612 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L30 (Mrpl30), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000027256 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:37890477:37898535:1 gene:ENSMUSG00000026087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC004614 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L30, mRNA (cDNA clone MGC:7981 IMAGE:3585410), complete cds. // chr1 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0
NM_198303 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 5B (Eif5b), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:37998010:38055579:1 gene:ENSMUSG00000026083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC055393 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 5B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5690155), complete cds. // chr1 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC103806 // GenBank HTC // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 5B, mRNA (cDNA clone IMAGE:30121910), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:37997047:38051713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_001011684 // RefSeq // Mus musculus neuromedin S (Nms), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:38939149:38950278:1 gene:ENSMUSG00000067604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160214 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:38939203:38948643:1 gene:ENSMUSG00000067604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// AB164466 // GenBank // Mus musculus NMS mRNA for neuromedin S precursor, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC138922 // GenBank // Mus musculus neuromedin S, mRNA (cDNA clone MGC:170549 IMAGE:8861944), complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_026850 // RefSeq // Mus musculus phosducin-like 3 (Pdcl3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000027247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:38987814:38997236:1 gene:ENSMUSG00000026078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF110512 // GenBank // Mus musculus IAP-associated factor VIAF1 (Viaf1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// AK168509 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920028N15 product:phosducin-like 3, full insert sequence. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC005601 // GenBank // Mus musculus phosducin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:7220 IMAGE:3483084), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:38987844:38996283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_008719 // RefSeq // Mus musculus neuronal PAS domain protein 2 (Npas2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000056815 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:39194212:39363234:1 gene:ENSMUSG00000026077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC109166 // GenBank // Mus musculus neuronal PAS domain protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:129355 IMAGE:40048145), complete cds. // chr1 // 98 // 95 // 40 // 41 // 0 /// U77969 // GenBank // Mus musculus neuronal PAS2 (Npas2) mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// GENSCAN00000019995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:39320337:39371333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 51 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:39276495:39315453:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
ENSMUST00000083695 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:39519533:39519747:1 gene:ENSMUSG00000065629 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT000676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_028043 // RefSeq // Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 11 (Cnot11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000003219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:39535802:39546873:1 gene:ENSMUSG00000003135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000160145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:39538245:39546483:1 gene:ENSMUSG00000003135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000161515 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:39534992:39546881:1 gene:ENSMUSG00000003135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK162118 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420424G23 product:hypothetical Glycine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC049091 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 1, Brigham & Womens Genetics 0212 expressed, mRNA (cDNA clone MGC:61254 IMAGE:6401756), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC050812 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 1, Brigham & Womens Genetics 0212 expressed, mRNA (cDNA clone MGC:58820 IMAGE:6773595), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:39536004:39556778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_010555 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 receptor, type II (Il1r2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006495726 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 1 receptor, type II (Il1r2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000027243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:40084768:40125219:1 gene:ENSMUSG00000026073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC032962 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 receptor, type II, mRNA (cDNA clone MGC:41170 IMAGE:1282531), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// CT010182 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836C0950D for gene Il1r2, Interleukin 1 receptor, type II; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:39959508:40125207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001123382 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 receptor, type I (Il1r1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NM_008362 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 receptor, type I (Il1r1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:40225080:40316177:1 gene:ENSMUSG00000026072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:40266586:40316198:1 gene:ENSMUSG00000026072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC109135 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 receptor, type I, mRNA (cDNA clone MGC:129154 IMAGE:40039321), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// M20658 // GenBank // Mouse interleukin-1 receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:40282239:40313393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_133193 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 receptor-like 2 (Il1rl2), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006495608 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 1 receptor-like 2 (Il1rl2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XM_006495609 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 1 receptor-like 2 (Il1rl2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006495610 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 1 receptor-like 2 (Il1rl2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006495611 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 1 receptor-like 2 (Il1rl2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000095020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:40324627:40365471:1 gene:ENSMUSG00000070942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AF284433 // GenBank // Mus musculus IL-1Rrp2 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// AK085780 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830007N24 product:IL-1RRP2 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC117797 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 receptor-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:143689 IMAGE:40092208), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AK054530 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330037N08 product:inferred: Mus musculus IL-1Rrp2 mRNA, complete cds / IL-1Rrp2 {Mus musculus}, full insert sequence. // chr1 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// GENSCAN00000016370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:40326495:40481101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1
NM_001025602 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 receptor-like 1 (Il1rl1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// NM_001294171 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 receptor-like 1 (Il1rl1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// NM_010743 // RefSeq // Mus musculus interleukin 1 receptor-like 1 (Il1rl1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000053043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:40440628:40465396:1 gene:ENSMUSG00000026069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000097772 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:40439627:40465415:1 gene:ENSMUSG00000026069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000173514 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:40439776:40448148:1 gene:ENSMUSG00000026069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000174335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:40429570:40446723:1 gene:ENSMUSG00000026069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// BC051445 // GenBank // Mus musculus interleukin 1 receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:60556 IMAGE:30073421), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// D13695 // GenBank // Mus musculus mRNA for ST2L protein, complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// M24843 // GenBank // Mouse T1 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:40326495:40481101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_177084 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 4 (Slc9a4), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006495625 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 4 (Slc9a4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006495626 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 4 (Slc9a4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000027233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:40580227:40630731:1 gene:ENSMUSG00000026065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC120543 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:155780 IMAGE:40129466), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:40580516:40629592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001033289 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 2 (Slc9a2), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000027231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:40681712:40768885:1 gene:ENSMUSG00000026062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AK138779 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430063P06 product:solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 2, full insert sequence. // chr1 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// BC103685 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:124410 IMAGE:40048593), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC104737 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:124408 IMAGE:40048591), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AK166114 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730039P03 product:Sodium/hydrogen exchanger 2 (Na(+)/H(+) exchanger 2) (NHE-2) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// GENSCAN00000016364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:40639908:40768799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0
NM_001081198 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 182 (Tmem182), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006496124 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 182 (Tmem182), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:40805601:40855944:1 gene:ENSMUSG00000079588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147440 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 182, mRNA (cDNA clone MGC:182188 IMAGE:9056082), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147458 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 182, mRNA (cDNA clone MGC:182206 IMAGE:9056100), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147740 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 182, mRNA (cDNA clone MGC:182795 IMAGE:9056689), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147743 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 182, mRNA (cDNA clone MGC:182798 IMAGE:9056692), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000191574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:42103289:42104333:1 gene:ENSMUSG00000100178 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:42026553:42114740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000066196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:42229726:42231108:1 gene:ENSMUSG00000053640 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK048997 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230090A06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188087 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:42229727:42231108:1 gene:ENSMUSG00000053640 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008900 // RefSeq // Mus musculus POU domain, class 3, transcription factor 3 (Pou3f3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:42695768:42703176:1 gene:ENSMUSG00000045515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079869 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6822296. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:42688244:42698969:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_053107 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 45 (Gpr45), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:43032060:43033605:1 gene:ENSMUSG00000041907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000179766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:42952963:43035456:1 gene:ENSMUSG00000041907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// AK035091 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430087F20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// BC118506 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 45, mRNA (cDNA clone MGC:144809 IMAGE:40106287), complete cds. // chr1 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// BC118510 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 45, mRNA (cDNA clone MGC:144808 IMAGE:40106284), complete cds. // chr1 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000188621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:42952872:42955155:1 gene:ENSMUSG00000041907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000000704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:43032199:43033320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT000760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000039080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:43092588:43093835:1 gene:ENSMUSG00000041878 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK018453 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430432A02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_133818 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI597479 (AI597479), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000010434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:43098710:43115947:1 gene:ENSMUSG00000010290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC006931 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI597479, mRNA (cDNA clone MGC:11912 IMAGE:3598975), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:43096962:43115302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000187749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:43270683:43271135:1 gene:ENSMUSG00000099694 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_010879 // RefSeq // Mus musculus non-catalytic region of tyrosine kinase adaptor protein 2 (Nck2), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000086421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:43445751:43570515:1 gene:ENSMUSG00000066877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AF043260 // GenBank // Mus musculus SH2/SH3 adaptor protein (mNck-beta) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// BC011071 // GenBank // Mus musculus non-catalytic region of tyrosine kinase adaptor protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:18364 IMAGE:3673483), complete cds. // chr1 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// BC034255 // GenBank // Mus musculus non-catalytic region of tyrosine kinase adaptor protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:7093 IMAGE:3157491), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000000680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:43533568:43569342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 41 // 8 // 9 // 0
NM_024283 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1500015O10 gene (1500015O10Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:43730602:43742578:1 gene:ENSMUSG00000026051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC002254 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1500015O10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7583 IMAGE:3493553), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:43730885:43742406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
XR_399117 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ADP-ribosylation factor 1-like (LOC102632770), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000191395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:43888051:43888595:1 gene:ENSMUSG00000100701 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000002088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:43888214:44002193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
ENSMUST00000189286 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:43898294:43899109:1 gene:ENSMUSG00000101395 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000002088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:43888214:44002193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 45 // 8 // 9 // 0
NM_144558 // RefSeq // Mus musculus basic, immunoglobulin-like variable motif containing (Bivm), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006495998 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus basic, immunoglobulin-like variable motif containing (Bivm), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000035991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:44119162:44144510:1 gene:ENSMUSG00000041684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000114709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:44119968:44144770:1 gene:ENSMUSG00000041684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AF411386 // GenBank // Mus musculus basic, immunoglobulin-like variable motif-containing protein (Bivm) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// BC082584 // GenBank // Mus musculus basic, immunoglobulin-like variable motif containing, mRNA (cDNA clone MGC:100346 IMAGE:30612339), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:44126392:44143142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT000788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000160854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:44551693:44788874:1 gene:ENSMUSG00000056870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000161793 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:44551727:44788495:1 gene:ENSMUSG00000056870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000162600 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:44689144:44796825:1 gene:ENSMUSG00000056870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AK017798 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730529O06 product:CED-6 PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 93 // 83 // 28 // 30 // 0 /// BC032154 // GenBank // Mus musculus GULP, engulfment adaptor PTB domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:29398 IMAGE:5068339), complete cds. // chr1 // 88 // 92 // 29 // 33 // 0 /// NM_028450 // RefSeq // Mus musculus GULP, engulfment adaptor PTB domain containing 1 (Gulp1), mRNA. // chr1 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1 /// ENSMUST00000074525 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:44551511:44796838:1 gene:ENSMUSG00000056870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSMUST00000159555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:44551693:44796826:1 gene:ENSMUSG00000056870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// GENSCAN00000002093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:44744456:44839545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0
NM_009930 // RefSeq // Mus musculus collagen, type III, alpha 1 (Col3a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENSMUST00000087883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:45311538:45349706:1 gene:ENSMUSG00000026043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// BC043089 // GenBank // Mus musculus collagen, type III, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:58006 IMAGE:6418299), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// BC052398 // GenBank // Mus musculus collagen, type III, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:63402 IMAGE:5720872), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// BC058724 // GenBank // Mus musculus collagen, type III, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:77952 IMAGE:5705762), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENSMUST00000185687 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:45335766:45340674:1 gene:ENSMUSG00000026043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 16 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000052087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:45311751:45348747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 78 // 39 // 40 // 0
ENSMUST00000185744 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:45602026:45602753:1 gene:ENSMUSG00000100894 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// GENSCAN00000052084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:45602053:45602756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
ENSMUST00000083321 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:45746895:45747025:1 gene:ENSMUSG00000065255 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT000811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000190055 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:45905623:45906798:1 gene:ENSMUSG00000099381 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:45905629:45906318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
AK143375 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330019N07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000190792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:46144697:46178717:1 gene:ENSMUSG00000041144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001160386 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 7B (Dnah7b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006495926 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 7B (Dnah7b), transcript variant X15, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006495927 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 7B (Dnah7b), transcript variant X16, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000069293 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:46066738:46373546:1 gene:ENSMUSG00000041144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000093689 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:46374197:46374315:1 gene:ENSMUSG00000096047 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONMMUT000821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
XM_006496386 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 7C (Dnah7c), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006543572 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 7C (Dnah7c), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// XM_006496387 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 7C (Dnah7c), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// ENSMUST00000189749 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:46425592:46807476:1 gene:ENSMUSG00000101337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000181115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:48881713:48882723:1 gene:ENSMUSG00000097883 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000023438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:48881713:48882629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000186145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:49236252:49237244:1 gene:ENSMUSG00000099454 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_399126 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C230029F24 gene (C230029F24Rik), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:49244616:49338246:1 gene:ENSMUSG00000051616 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK082253 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230029F24 product:weakly similar to HYPOTHETICAL 10.3 KDA PROTEIN [Arabidopsis thaliana], full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:49244616:49340443:1 gene:ENSMUSG00000051616 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000190905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:50056782:50058490:1 gene:ENSMUSG00000101760 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000030730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:49896472:50058490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0
NM_019790 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 2 (Tmeff2), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000081851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:50927519:51187270:1 gene:ENSMUSG00000026109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AB017270 // GenBank // Mus musculus TMEFF2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BC034850 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:41091 IMAGE:1397175), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// XM_006496166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 2 (Tmeff2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// ENSMUST00000114565 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:50909962:50979920:1 gene:ENSMUSG00000026109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// AK030053 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932418H01 product:transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 2, full insert sequence. // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000017785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:50908871:50943343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_138741 // RefSeq // Mus musculus serum deprivation response (Sdpr), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:51289126:51302960:1 gene:ENSMUSG00000045954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC020008 // GenBank // Mus musculus serum deprivation response, mRNA (cDNA clone MGC:25726 IMAGE:3980310), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC027005 // GenBank // Mus musculus serum deprivation response, mRNA (cDNA clone MGC:38919 IMAGE:5362530), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:51289386:51301422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_146108 // RefSeq // Mus musculus 3-hydroxyisobutyryl-Coenzyme A hydrolase (Hibch), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000044478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:52845046:52920986:1 gene:ENSMUSG00000041426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159352 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:52845013:52920981:1 gene:ENSMUSG00000041426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000161125 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:52845044:52885337:1 gene:ENSMUSG00000041426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC026437 // GenBank // Mus musculus 3-hydroxyisobutyryl-Coenzyme A hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:31364 IMAGE:4238681), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000038703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:52899769:52920378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_010834 // RefSeq // Mus musculus myostatin (Mstn), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027269 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:53061640:53068079:1 gene:ENSMUSG00000026100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC103676 // GenBank // Mus musculus myostatin, mRNA (cDNA clone MGC:124263 IMAGE:40047210), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC103677 // GenBank // Mus musculus myostatin, mRNA (cDNA clone MGC:124262 IMAGE:40047209), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC103678 // GenBank // Mus musculus myostatin, mRNA (cDNA clone MGC:124261 IMAGE:40047208), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC105674 // GenBank // Mus musculus myostatin, mRNA (cDNA clone MGC:124264 IMAGE:40047211), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// U84005 // GenBank // Mus musculus growth/differentiation factor-8 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000191197 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:53061657:53068045:1 gene:ENSMUSG00000026100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000038691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:53061808:53066631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_145517 // RefSeq // Mus musculus ORM1-like 1 (S. cerevisiae) (Ormdl1), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000027266 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:53297095:53310309:1 gene:ENSMUSG00000026097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK077562 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730448B17 product:SIMILAR TO HYPOTHETICAL PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 94 // 80 // 15 // 16 // 0 /// BC012315 // GenBank // Mus musculus ORM1-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:19257 IMAGE:3981845), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC023695 // GenBank // Mus musculus ORM1-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:36611 IMAGE:5344622), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC025572 // GenBank // Mus musculus ORM1-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:36598 IMAGE:5323819), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0
NM_030025 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 150 (Ccdc150), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006496337 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 150 (Ccdc150), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// XM_006496340 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 150 (Ccdc150), transcript variant X11, mRNA. // chr1 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000027128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:54250683:54368727:1 gene:ENSMUSG00000025983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000159682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:54354596:54368603:1 gene:ENSMUSG00000025983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000160472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:54250722:54368470:1 gene:ENSMUSG00000025983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:54329992:54368608:1 gene:ENSMUSG00000025983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// BC145597 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054163. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:54243809:54394950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001039710 // RefSeq // Mus musculus coenzyme Q10 homolog B (S. cerevisiae) (Coq10b), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_026424 // RefSeq // Mus musculus coenzyme Q10 homolog B (S. cerevisiae) (Coq10b), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000027125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:55052770:55072702:1 gene:ENSMUSG00000025981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC062129 // GenBank // Mus musculus coenzyme Q10 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:69951 IMAGE:6506502), complete cds. // chr1 // 93 // 88 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000087617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:55052770:55071953:1 gene:ENSMUSG00000025981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
XR_399327 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10561 (Gm10561), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:55226251:55235622:1 gene:ENSMUSG00000097649 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK135004 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430540D06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:55228526:55239000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONMMUT000960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_175439 // RefSeq // Mus musculus methionine-tRNA synthetase 2 (mitochondrial) (Mars2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061334 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:55237177:55248470:1 gene:ENSMUSG00000046994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099669 // GenBank // Mus musculus methionine-tRNA synthetase 2 (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:106216 IMAGE:3153138), complete cds. // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC132343 // GenBank // Mus musculus methionine-tRNA synthetase 2 (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:163974 IMAGE:40130620), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC137739 // GenBank // Mus musculus methionine-tRNA synthetase 2 (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:169363 IMAGE:8860758), complete cds. // chr1 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:55228526:55239000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000162574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:55335401:55335796:1 gene:ENSMUSG00000100215 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene gene:ENSMUSG00000089944 // chr1 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000135190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:55335367:55335883:1 gene:ENSMUSG00000089944 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0
NM_001114663 // RefSeq // Mus musculus phospholipase C-like 1 (Plcl1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006495945 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase C-like 1 (Plcl1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042986 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:55405921:55754285:1 gene:ENSMUSG00000038349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK048715 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230017K02 product:similar to CDNA FLJ13484 FIS, CLONE PLACE1003888, WEAKLY SIMILAR TO 1-PHOSPHATIDYLINOSITOL-4,5-BISPHOSPHATE PHOSPHODIESTERASE DELTA 1 (EC 3.1.4.11) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000187059 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:55702025:55735227:1 gene:ENSMUSG00000038349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000000240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:55669307:55751463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028546 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700066M21 gene (1700066M21Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000042734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:57377620:57385423:1 gene:ENSMUSG00000038323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XR_373263 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700066M21 gene (1700066M21Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1 /// XR_373264 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700066M21 gene (1700066M21Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1 /// ENSMUST00000187255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:57377640:57380078:1 gene:ENSMUSG00000038323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000017416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:57377671:57383564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000185952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:57377633:57380162:1 gene:ENSMUSG00000038323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1
NM_001081181 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9430016H08 gene (9430016H08Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027114 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:57406328:57417953:1 gene:ENSMUSG00000025971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024945 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9430016H08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28199 IMAGE:3989472), complete cds. // chr1 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// BC071241 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9430016H08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:78239 IMAGE:5125554), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK165130 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330024C19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:57406773:57445862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000185709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:57406759:57411632:1 gene:ENSMUSG00000025971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001177867 // RefSeq // Mus musculus shugoshin-like 2 (S. pombe) (Sgol2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NM_199007 // RefSeq // Mus musculus shugoshin-like 2 (S. pombe) (Sgol2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:57995971:58025899:1 gene:ENSMUSG00000026039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC052742 // GenBank // Mus musculus shugoshin-like 2 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:63378 IMAGE:6833875), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:57998098:58028320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_009676 // RefSeq // Mus musculus aldehyde oxidase 1 (Aox1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000001027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:58029931:58106413:1 gene:ENSMUSG00000063558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AB017482 // GenBank // Mus musculus mRNA for retinal oxidase/aldehyde oxidase, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF076216 // GenBank // Mus musculus aldehyde oxidase mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// BC026132 // GenBank // Mus musculus aldehyde oxidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:13774 IMAGE:4011903), complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// XM_006495630 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aldehyde oxidase 1 (Aox1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// ENSMUST00000160168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:58029964:58070879:1 gene:ENSMUSG00000063558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// AK137697 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930038L23 product:aldehyde oxidase 1, full insert sequence. // chr1 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// GENSCAN00000036047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:58049414:58138527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
NM_023617 // RefSeq // Mus musculus aldehyde oxidase 3 (Aox3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000040999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:58113136:58200698:1 gene:ENSMUSG00000064294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AF172276 // GenBank // Mus musculus aldehyde oxidase homolog-1 (Aoh1) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 33 // 37 // 0 /// AY347569 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2 aldehyde oxidase 1 (Aoh1) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 95 // 31 // 35 // 0 /// AY347570 // GenBank // Mus musculus strain CD1 aldehyde oxidase 1 (Aoh1) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 95 // 31 // 35 // 0 /// BC138876 // GenBank // Mus musculus aldehyde oxidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:170503 IMAGE:8861898), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// ENSMUST00000162011 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:58113186:58139122:1 gene:ENSMUSG00000064294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// BC024046 // GenBank HTC // Mus musculus aldehyde oxidase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5134192), with apparent retained intron. // chr1 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// GENSCAN00000036060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:58145966:58267889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1
NM_023631 // RefSeq // Mus musculus aldehyde oxidase 4 (Aox4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000040442 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:58210397:58268597:1 gene:ENSMUSG00000038242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000161833 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:58210432:58260382:1 gene:ENSMUSG00000038242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AF233581 // GenBank // Mus musculus aldehyde oxidase structural homolog 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// AK160953 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4022412A04 product:Aldehyde oxidase structural homolog 2 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BC117975 // GenBank // Mus musculus aldehyde oxidase 4, mRNA (cDNA clone MGC:144189 IMAGE:40098789), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC117976 // GenBank // Mus musculus aldehyde oxidase 4, mRNA (cDNA clone MGC:144190 IMAGE:40098791), complete cds. // chr1 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000036060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:58145966:58267889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NM_001008419 // RefSeq // Mus musculus aldehyde oxidase 2 (Aox2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006495829 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aldehyde oxidase 2 (Aox2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000114366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:58278326:58380259:1 gene:ENSMUSG00000079554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AY187018 // GenBank // Mus musculus aldehyde oxidase-like protein 3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AY665589 // GenBank // Mus musculus strain CD-1 aldehyde oxidase 3 (Aoh3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC150826 // GenBank // Mus musculus aldehyde oxidase 3-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:183737 IMAGE:9087737), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000036055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:58276743:58405066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0
NM_025824 // RefSeq // Mus musculus basic leucine zipper and W2 domains 1 (Bzw1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006496197 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus basic leucine zipper and W2 domains 1 (Bzw1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000050552 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:58392898:58407353:1 gene:ENSMUSG00000051223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC005466 // GenBank // Mus musculus basic leucine zipper and W2 domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:6434 IMAGE:3601190), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC028865 // GenBank // Mus musculus basic leucine zipper and W2 domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:25505 IMAGE:4910833), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000188630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:58393132:58405487:1 gene:ENSMUSG00000051223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000188898 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:58393124:58403004:1 gene:ENSMUSG00000051223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000186949 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:58393470:58405131:1 gene:ENSMUSG00000051223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// GENSCAN00000036055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:58276743:58405066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 20 // 23 // 1
NM_025597 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex 3 (Ndufb3), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000027193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:58586384:58595964:1 gene:ENSMUSG00000026032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC036989 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex 3, mRNA (cDNA clone MGC:46791 IMAGE:4989233), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000036062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:58578840:58595805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 11 // 14 // 1
NM_001289704 // RefSeq // Mus musculus CASP8 and FADD-like apoptosis regulator (Cflar), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001293804 // RefSeq // Mus musculus CASP8 and FADD-like apoptosis regulator (Cflar), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001293805 // RefSeq // Mus musculus CASP8 and FADD-like apoptosis regulator (Cflar), transcript variant 5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_207653 // RefSeq // Mus musculus CASP8 and FADD-like apoptosis regulator (Cflar), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:58711560:58758884:1 gene:ENSMUSG00000026031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000180570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:59119833:59122139:1 gene:ENSMUSG00000097573 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK144579 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730003C15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:59119833:59122141:1 gene:ENSMUSG00000097573 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008057 // RefSeq // Mus musculus frizzled homolog 7 (Drosophila) (Fzd7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000114246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:59482424:59486955:1 gene:ENSMUSG00000041075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC063077 // GenBank // Mus musculus frizzled homolog 7 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:69633 IMAGE:6844727), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// U43320 // GenBank // Mus musculus putative transmembrane receptor (frizzled 7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000011230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:59482960:59484678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NM_007561 // RefSeq // Mus musculus bone morphogenetic protein receptor, type II (serine/threonine kinase) (Bmpr2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000087435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:59763400:59879014:1 gene:ENSMUSG00000067336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF003942 // GenBank // Mus musculus Bone morphogenetic protein type II receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 94 // 25 // 29 // 0 /// AK149385 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730003P11 product:bone morphogenic protein receptor, type II (serine/threonine kinase), full insert sequence. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// U78048 // GenBank // Mus musculus bone morphogenetic protein type II receptor BRK-3 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:59841431:59870485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
NM_001037725 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 117, member B (Fam117b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000036540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:59913006:59985346:1 gene:ENSMUSG00000041040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:59913164:59981727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
NM_173444 // RefSeq // Mus musculus neurobeachin like 1 (Nbeal1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006496031 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurobeachin like 1 (Nbeal1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006496032 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurobeachin like 1 (Nbeal1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006496035 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurobeachin like 1 (Nbeal1), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:60180599:60338328:1 gene:ENSMUSG00000073664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:60222100:60330992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000188450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:60235464:60282038:1 gene:ENSMUSG00000073664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_173444 // RefSeq // Mus musculus neurobeachin like 1 (Nbeal1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006496031 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurobeachin like 1 (Nbeal1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006496032 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurobeachin like 1 (Nbeal1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006496035 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurobeachin like 1 (Nbeal1), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000159344 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:60278770:60291929:1 gene:ENSMUSG00000073664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 26 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000160834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:60180599:60338328:1 gene:ENSMUSG00000073664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000162291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:60260314:60331466:1 gene:ENSMUSG00000073664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC060141 // GenBank // Mus musculus neurobeachin like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6835095). // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000035569 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:60260306:60319694:1 gene:ENSMUSG00000073664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 35 // 47 // 1 /// GENSCAN00000009638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:60222100:60330992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 91 // 42 // 43 // 0 /// ENSMUST00000188450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:60235464:60282038:1 gene:ENSMUSG00000073664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 36 // 36 // 17 // 47 // 1
NM_030013 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 20, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp20a1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:60343323:60388060:1 gene:ENSMUSG00000049439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114202 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:60343323:60372707:1 gene:ENSMUSG00000049439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000148443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:60343323:60388060:1 gene:ENSMUSG00000049439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK020848 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930011N14 product:cytochrome P450, family 20, subfamily A, polypeptide 1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC049147 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 20, subfamily A, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:56832 IMAGE:6306072), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:60343386:60387289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_007642 // RefSeq // Mus musculus CD28 antigen (Cd28), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:60746358:60773359:1 gene:ENSMUSG00000026012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC064058 // GenBank // Mus musculus CD28 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:73611 IMAGE:3418931), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// M34563 // GenBank // Mouse glycoprotein CD28 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000153207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:60746402:60764626:1 gene:ENSMUSG00000026012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// AK041322 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630001D17 product:CD28 antigen, full insert sequence. // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:60706471:60769785:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001281976 // RefSeq // Mus musculus cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4 (Ctla4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_009843 // RefSeq // Mus musculus cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4 (Ctla4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:60909025:60915832:1 gene:ENSMUSG00000026011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000097720 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:60909171:60914769:1 gene:ENSMUSG00000026011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC042741 // GenBank // Mus musculus cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:51581 IMAGE:4936052), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC052683 // GenBank // Mus musculus cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:60618 IMAGE:30072821), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:60909171:60938745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_017480 // RefSeq // Mus musculus inducible T cell co-stimulator (Icos), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006496140 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inducible T cell co-stimulator (Icos), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027162 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:60977927:60995797:1 gene:ENSMUSG00000026009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000102827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:60977927:61000320:1 gene:ENSMUSG00000026009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB023132 // GenBank // Mus musculus mRNA for activation-inducible lymphocyte immunomediatory molecule AILIM, complete cds. // chr1 // 85 // 69 // 17 // 20 // 0 /// AF257230 // GenBank // Mus musculus CCLP precursor (CCLP) mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 79 // 19 // 23 // 0 /// BC034852 // GenBank // Mus musculus inducible T-cell co-stimulator, mRNA (cDNA clone MGC:41104 IMAGE:1364228), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000046673 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:61639243:62637923:1 gene:ENSMUSG00000052062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NM_001081050 // RefSeq // Mus musculus par-3 family cell polarity regulator beta (Pard3b), mRNA. // chr1 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// ENSMUST00000075374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:61638824:62642284:1 gene:ENSMUSG00000052062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// ENSMUST00000094906 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:61639243:62642284:1 gene:ENSMUSG00000052062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// AK141451 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530023I11 product:Similar to ALS2CR19 protein (Fragment) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000002787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:62140709:62246084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000188325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:61638886:62169299:1 gene:ENSMUSG00000052062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001081050 // RefSeq // Mus musculus par-3 family cell polarity regulator beta (Pard3b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:61638824:62642284:1 gene:ENSMUSG00000052062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094906 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:61639243:62642284:1 gene:ENSMUSG00000052062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000118720 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:62660839:62661716:1 gene:ENSMUSG00000084333 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000082678 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:63178677:63178754:1 gene:ENSMUSG00000064612 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_028558 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 41 (Snora41), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000082668 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:63179004:63179135:1 gene:ENSMUSG00000064602 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT001233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
NM_001267872 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DBF-type containing 2 (Zdbf2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001285936 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DBF-type containing 2 (Zdbf2), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_001285937 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DBF-type containing 2 (Zdbf2), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_028673 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DBF-type containing 2 (Zdbf2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:63290738:63314575:1 gene:ENSMUSG00000027520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114132 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:63273265:63314576:1 gene:ENSMUSG00000027520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132808 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930408N08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// BC050985 // GenBank HTC // Mus musculus zinc finger, DBF-type containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6772156). // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:63280818:63309945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_172422 // RefSeq // Mus musculus FAST kinase domains 2 (Fastkd2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496312 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FAST kinase domains 2 (Fastkd2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000027103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:63730614:63754655:1 gene:ENSMUSG00000025962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:63730643:63752538:1 gene:ENSMUSG00000025962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK167714 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530029G02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC008271 // GenBank // Mus musculus FAST kinase domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:12022 IMAGE:3603187), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC057208 // GenBank // Mus musculus FAST kinase domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:68043 IMAGE:5328766), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC080813 // GenBank // Mus musculus FAST kinase domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:91230 IMAGE:6394260), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK129251 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0971 protein. // chr1 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// ENSMUST00000148758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:63730641:63737847:1 gene:ENSMUSG00000025962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:63730560:63795782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
ENSMUST00000120486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:63917848:63935932:1 gene:ENSMUSG00000082373 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT001257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NR_027824 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 13749 (Gm13749), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:63964727:63968999:1 gene:ENSMUSG00000044689 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000117621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:64150201:64150665:1 gene:ENSMUSG00000086721 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:64150201:64150665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_001097644 // RefSeq // Mus musculus cyclin Y-like 1 (Ccnyl1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006495953 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin Y-like 1 (Ccnyl1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000094898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:64691345:64725640:1 gene:ENSMUSG00000070871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114077 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:64690455:64725644:1 gene:ENSMUSG00000070871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:104501055:104502149:-1 gene:ENSMUSG00000082154 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132782 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4922505P10 product:similar to Cyclin fold protein 1 variant b [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187170 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:64690822:64723946:1 gene:ENSMUSG00000070871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:104500791:104534876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:64691172:64734153:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000187638 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:64691183:64711453:1 gene:ENSMUSG00000070871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_139270 // RefSeq // Mus musculus parathyroid hormone 2 receptor (Pth2r), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006495843 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus parathyroid hormone 2 receptor (Pth2r), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000027083 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:65311257:65389244:1 gene:ENSMUSG00000025946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000140190 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:65282056:65345341:1 gene:ENSMUSG00000025946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// AF332077 // GenBank // Mus musculus strain ISS parathyroid hormone receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF332078 // GenBank // Mus musculus strain ILS parathyroid hormone receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:65321945:65388810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_027010 // RefSeq // Mus musculus crystallin, gamma F (Crygf), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000027082 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:65926520:65928307:1 gene:ENSMUSG00000025945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000114027 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:65926538:65928306:1 gene:ENSMUSG00000025945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC056453 // GenBank // Mus musculus crystallin, gamma F, mRNA (cDNA clone MGC:67064 IMAGE:6824171), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000083760 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:66436082:66436232:1 gene:ENSMUSG00000065694 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175510 // RefSeq // Mus musculus unc-80 homolog (C. elegans) (Unc80), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000061620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:66468367:66699866:1 gene:ENSMUSG00000055567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000114008 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:66468414:66504944:1 gene:ENSMUSG00000055567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 96 // 65 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000136727 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:66468430:66486190:1 gene:ENSMUSG00000055567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 96 // 53 // 22 // 23 // 0 /// AK043914 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830050C03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 53 // 22 // 23 // 0 /// BC116430 // GenBank // Mus musculus unc-80 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:144630 IMAGE:40104344), complete cds. // chr1 // 96 // 65 // 27 // 28 // 0 /// FJ210934 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 UNC-80 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000039471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:66459215:66495524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 19 // 43 // 1 /// GENSCAN00000039477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:66503675:66717876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1
NM_175510 // RefSeq // Mus musculus unc-80 homolog (C. elegans) (Unc80), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000061620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:66468367:66699866:1 gene:ENSMUSG00000055567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FJ210934 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 UNC-80 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000039477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:66503675:66717876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000158795 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:66856641:66856703:1 gene:ENSMUSG00000089420 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001080809 // RefSeq // Mus musculus carbamoyl-phosphate synthetase 1 (Cps1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000027144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:67123026:67231259:1 gene:ENSMUSG00000025991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC126969 // GenBank // Mus musculus carbamoyl-phosphate synthetase 1, mRNA (cDNA clone MGC:144188 IMAGE:40098767), complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000001389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:67123165:67230346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000119302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:67585053:67587036:1 gene:ENSMUSG00000082473 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:67585092:67586482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT001357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000102000 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:70596815:70596921:1 gene:ENSMUSG00000075952 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026195 // RefSeq // Mus musculus 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase (Atic), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000027384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:71557150:71579631:1 gene:ENSMUSG00000026192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000155769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:71557179:71573363:1 gene:ENSMUSG00000026192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC039925 // GenBank // Mus musculus 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:49511 IMAGE:3155580), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:71537433:71578671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AK051020 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030055I22 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr1 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
ENSMUST00000097699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:71652837:71657457:1 gene:ENSMUSG00000073652 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// AK135370 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo female mullerian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6820407J23 product:hypothetical Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000125934 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:71653339:71657245:1 gene:ENSMUSG00000073652 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// AK052223 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330010C13 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NR_040308 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein L 7d (Apol7d), long non-coding RNA. // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// ENSMUST00000126516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:71653335:71662843:1 gene:ENSMUSG00000073652 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENSMUST00000178786 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72226240:72226430:1 gene:ENSMUSG00000094655 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT001441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000082922 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:83271498:83271688:1 gene:ENSMUSG00000064856 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000101806 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72236946:72237136:1 gene:ENSMUSG00000094050 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000177868 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72244213:72244403:1 gene:ENSMUSG00000093956 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENSMUST00000178786 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72226240:72226430:1 gene:ENSMUSG00000094655 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// ENSMUST00000179876 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72255008:72255198:1 gene:ENSMUSG00000093843 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT001441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// NONMMUT001443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT001445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// NONMMUT001446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT011109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000082922 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:83271498:83271688:1 gene:ENSMUSG00000064856 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000101806 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72236946:72237136:1 gene:ENSMUSG00000094050 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000177868 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72244213:72244403:1 gene:ENSMUSG00000093956 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000178786 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72226240:72226430:1 gene:ENSMUSG00000094655 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// ENSMUST00000179876 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72255008:72255198:1 gene:ENSMUSG00000093843 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT001441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// NONMMUT001443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT001445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT001446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT011109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_175564 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 169 (Tmem169), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:72284369:72303104:1 gene:ENSMUSG00000026188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000141783 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:72284395:72300773:1 gene:ENSMUSG00000026188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// BC116730 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 169, mRNA (cDNA clone MGC:151107 IMAGE:40126049), complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC117087 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 169, mRNA (cDNA clone MGC:151464 IMAGE:40126406), complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK149157 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120490A03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000052790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:72297908:72312647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_009533 // RefSeq // Mus musculus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (Xrcc5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000027379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:72307421:72394952:1 gene:ENSMUSG00000026187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AF166486 // GenBank // Mus musculus Ku autoantigen (Ku80) mRNA, complete cds. // chr1 // 87 // 93 // 33 // 38 // 0 /// BC029218 // GenBank // Mus musculus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:2647262), partial cds. // chr1 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// BC051660 // GenBank // Mus musculus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5, mRNA (cDNA clone MGC:60964 IMAGE:30008031), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// X66323 // GenBank // M.musculus mRNA for p80 Ku autoantigen. // chr1 // 88 // 98 // 35 // 40 // 0 /// GENSCAN00000052800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:72325054:72403551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 26 // 41 // 1
NM_008342 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 2 (Igfbp2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006495707 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 2 (Igfbp2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000047328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:72824503:72852474:1 gene:ENSMUSG00000039323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120564 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:72825322:72852467:1 gene:ENSMUSG00000039323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC012724 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:14074 IMAGE:2654907), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC054473 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:62643 IMAGE:6488878), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:72848699:72852148:1 gene:ENSMUSG00000039323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:72843883:72858669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001034060 // RefSeq // Mus musculus RUN and FYVE domain containing 4 (Rufy4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001170641 // RefSeq // Mus musculus RUN and FYVE domain containing 4 (Rufy4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000080167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74125541:74148223:1 gene:ENSMUSG00000061815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000127134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74125579:74147773:1 gene:ENSMUSG00000061815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC150907 // GenBank // Mus musculus RUN and FYVE domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:183818 IMAGE:9087818), complete cds. // chr1 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// BC150910 // GenBank // Mus musculus RUN and FYVE domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:183821 IMAGE:9087821), complete cds. // chr1 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74127678:74147746:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_009909 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 2 (Cxcr2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006495638 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 2 (Cxcr2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000027372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:74153989:74160610:1 gene:ENSMUSG00000026180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106899 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74153991:74161246:1 gene:ENSMUSG00000026180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051677 // GenBank // Mus musculus interleukin 8 receptor, beta, mRNA (cDNA clone MGC:60615 IMAGE:30023687), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D17630 // GenBank // Mus musculus IL-8R mRNA for interleukin-8 receptor, complete cds. // chr1 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0
ENSMUST00000101821 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:74212813:74212919:1 gene:ENSMUSG00000094768 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT001517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_029711 // RefSeq // Mus musculus actin related protein 2/3 complex, subunit 2 (Arpc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496317 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus actin related protein 2/3 complex, subunit 2 (Arpc2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000006467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74236517:74267987:1 gene:ENSMUSG00000006304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113820 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74236497:74268209:1 gene:ENSMUSG00000006304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000113819 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:74236550:74267988:1 gene:ENSMUSG00000006304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// AK083263 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630032A16 product:actin related protein 2/3 complex, subunit 2 (34 kDa), full insert sequence. // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// BC115750 // GenBank // Mus musculus actin related protein 2/3 complex, subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:141099 IMAGE:40051600), complete cds. // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74236450:74279589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_174985 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled bile acid receptor 1 (Gpbar1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077985 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74278550:74279624:1 gene:ENSMUSG00000064272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB086171 // GenBank // Mus musculus mRNA for membrane bile acid receptor, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB089308 // GenBank // Mus musculus TGR5 mRNA for G protein-coupled receptor, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC116914 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled bile acid receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:151291 IMAGE:40126233), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC119327 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled bile acid receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:155643 IMAGE:8734076), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74236450:74279589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033345 // RefSeq // Mus musculus ciliogenesis associated TTC17 interacting protein (Catip), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74362108:74369321:1 gene:ENSMUSG00000073650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128445 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:74362366:74367798:1 gene:ENSMUSG00000073650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// BC150857 // GenBank // Mus musculus gene model 216, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:183768 IMAGE:9087768), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006495987 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 216 (Gm216), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSMUST00000191010 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:74362442:74369150:1 gene:ENSMUSG00000073650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74332631:74386476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_153088 // RefSeq // Mus musculus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase 1 (Ctdsp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74391509:74397285:1 gene:ENSMUSG00000026176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74391795:74397282:1 gene:ENSMUSG00000026176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AY028804 // GenBank // Mus musculus golli-interacting protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049184 // GenBank // Mus musculus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:54918 IMAGE:6439402), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC058085 // GenBank // Mus musculus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6813331), partial cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC065158 // GenBank // Mus musculus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:90129 IMAGE:5717102), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC079638 // GenBank // Mus musculus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:90589 IMAGE:5717102), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74391898:74434991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000028357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:120044534:120047187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NR_029743 // RefSeq // Mus musculus microRNA 26b (Mir26b), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083534 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:74394310:74394394:1 gene:ENSMUSG00000065468 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-26b // miRBase Micro RNA Database // MI0000575 Mus musculus miR-26b stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009509 // RefSeq // Mus musculus villin 1 (Vil1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000027366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74409376:74435559:1 gene:ENSMUSG00000026175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000159749 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:74419053:74423018:1 gene:ENSMUSG00000026175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 11 // 11 // 0 /// BC015267 // GenBank // Mus musculus villin 1, mRNA (cDNA clone MGC:18506 IMAGE:4236751), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC117875 // GenBank // Mus musculus villin 1, mRNA (cDNA clone MGC:143974 IMAGE:40095718), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// BC145671 // GenBank // Mus musculus villin 1, mRNA (cDNA clone MGC:175558 IMAGE:40130974), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// M98454 // GenBank // Mus musculus villin protein mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000037363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74391898:74434991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0
NM_021383 // RefSeq // Mus musculus rcd1 (required for cell differentiation) homolog 1 (S. pombe) (Rqcd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000087215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74506058:74530842:1 gene:ENSMUSG00000026174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000137100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74506060:74527087:1 gene:ENSMUSG00000026174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AF221849 // GenBank // Mus musculus FL10 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC050898 // GenBank // Mus musculus rcd1 (required for cell differentiation) homolog 1 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:63331 IMAGE:6401907), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC051948 // GenBank // Mus musculus rcd1 (required for cell differentiation) homolog 1 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:62201 IMAGE:5708192), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000147810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74523527:74528177:1 gene:ENSMUSG00000026174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000037369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74506438:74565366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONMMUT001536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_025784 // RefSeq // Mus musculus BCS1-like (yeast) (Bcs1l), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496196 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BCS1-like (yeast) (Bcs1l), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000027358 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74588300:74592443:1 gene:ENSMUSG00000026172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74588374:74592189:1 gene:ENSMUSG00000026172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000113733 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74588289:74592124:1 gene:ENSMUSG00000026172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC019781 // GenBank // Mus musculus BCS1-like (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:25440 IMAGE:4036047), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74587825:74592071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_024264 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 27, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp27a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006495607 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 27, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp27a1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74713574:74737892:1 gene:ENSMUSG00000026170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC002183 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 27, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:7368 IMAGE:3487429), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC055028 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 27, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:62571 IMAGE:5098366), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000189083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74736809:74737823:1 gene:ENSMUSG00000026170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000037362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74728489:74737990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_009526 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 6 (Wnt6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006495889 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus wingless-related MMTV integration site 6 (Wnt6), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000006716 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74771892:74785322:1 gene:ENSMUSG00000033227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048700 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 6, mRNA (cDNA clone MGC:59372 IMAGE:6511061), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M89800 // GenBank // Mouse Wnt-6 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000189544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74782439:74784602:1 gene:ENSMUSG00000033227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000037356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74782124:74784600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_009518 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 10A (Wnt10a), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000006718 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74791516:74804179:1 gene:ENSMUSG00000026167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC014737 // GenBank // Mus musculus wingless related MMTV integration site 10a, mRNA (cDNA clone MGC:25311 IMAGE:4921327), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// U61969 // GenBank // Mus musculus Wnt10a mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000187238 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:74793363:74803495:1 gene:ENSMUSG00000026167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000037350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74792171:74797796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_009872 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 2 (p39) (Cdk5r2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74854934:74857732:1 gene:ENSMUSG00000090071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74855098:74856207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_010043 // RefSeq // Mus musculus desmin (Des), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:75360329:75368579:1 gene:ENSMUSG00000026208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:75362030:75363638:1 gene:ENSMUSG00000026208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC031760 // GenBank // Mus musculus desmin, mRNA (cDNA clone MGC:25641 IMAGE:4219280), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:75360418:75431451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_001085370 // RefSeq // Mus musculus SPEG complex locus (Speg), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// NM_001085371 // RefSeq // Mus musculus SPEG complex locus (Speg), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 22 // 10 // 10 // 0 /// NM_007463 // RefSeq // Mus musculus SPEG complex locus (Speg), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// XM_006496403 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SPEG complex locus (Speg), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000087122 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:75375297:75432320:1 gene:ENSMUSG00000026207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000113590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:75382114:75404563:1 gene:ENSMUSG00000026207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 22 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000137868 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:75385610:75432304:1 gene:ENSMUSG00000026207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// AF215896 // GenBank // Mus musculus striated muscle-specific serine/threonine protein kinase (Speg) mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 98 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000054699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:75360418:75431451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0
NM_183022 // RefSeq // Mus musculus acid-sensing (proton-gated) ion channel family member 4 (Asic4), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000037708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:75450699:75474343:1 gene:ENSMUSG00000033007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113577 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:75450436:75474340:1 gene:ENSMUSG00000033007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC055772 // GenBank // Mus musculus amiloride-sensitive cation channel 4, pituitary, mRNA (cDNA clone MGC:67351 IMAGE:6808924), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:75436799:75473427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1
ENSMUST00000050899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:75479580:75485705:1 gene:ENSMUSG00000051703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK158863 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K430347I15 product:hypothetical Proline-rich region profile/Leucine-rich region profile/Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC059868 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 198, mRNA (cDNA clone MGC:69730 IMAGE:6809137), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NM_177056 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 198 (Tmem198), mRNA. // chr1 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// ENSMUST00000113575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:75479532:75485693:1 gene:ENSMUSG00000051703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// ENSMUST00000148980 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:75479576:75482612:1 gene:ENSMUSG00000051703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// ENSMUST00000187411 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:75479704:75482675:1 gene:ENSMUSG00000051703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 37 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000054693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:75480232:75484984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0
NM_010564 // RefSeq // Mus musculus inhibin alpha (Inha), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037330 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:75507077:75510366:1 gene:ENSMUSG00000032968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056627 // GenBank // Mus musculus inhibin alpha, mRNA (cDNA clone MGC:68170 IMAGE:5009577), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:75507248:75536235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_027886 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine kinase 11 interacting protein (Stk11ip), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:75521529:75537335:1 gene:ENSMUSG00000026213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000113553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:75521552:75536932:1 gene:ENSMUSG00000026213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000140963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:75521791:75536935:1 gene:ENSMUSG00000026213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000156838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:75528640:75536935:1 gene:ENSMUSG00000026213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// AK156122 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830008I10 product:serine/threonine kinase 11 interacting protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC035530 // GenBank HTC // Mus musculus serine/threonine kinase 11 interacting protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:5366096), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// BC042403 // GenBank HTC // Mus musculus serine/threonine kinase 11 interacting protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:3156629). // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC061635 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 11 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:67731 IMAGE:6530178), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:75507248:75536235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1
NM_009208 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 3 (Slc4a3), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// XM_006496455 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 3 (Slc4a3), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// XM_006496457 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 3 (Slc4a3), transcript variant X9, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000027415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:75546496:75558890:1 gene:ENSMUSG00000006576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 88 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000124341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:75546266:75562172:1 gene:ENSMUSG00000006576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000132612 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:75546644:75560881:1 gene:ENSMUSG00000006576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000145258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:75550595:75555125:1 gene:ENSMUSG00000006576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 45 // 22 // 22 // 0 /// BC066086 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30534136, containing frame-shift errors. // chr1 // 98 // 90 // 43 // 44 // 0 /// BC080271 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:90734 IMAGE:6831942), complete cds. // chr1 // 98 // 96 // 46 // 47 // 0 /// M28383 // GenBank // Mouse AE3 mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 96 // 46 // 47 // 0 /// GENSCAN00000054706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:75543276:75558890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0
ENSMUST00000124341 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:75546266:75562172:1 gene:ENSMUSG00000006576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK161240 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833445E16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000121823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:75636390:75637179:1 gene:ENSMUSG00000082012 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:75615109:75637179:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000049965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:77050330:77068096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
XR_373565 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635943 (LOC102635943), transcript variant X2, ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_373564 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635943 (LOC102635943), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001004173 // RefSeq // Mus musculus sphingosine-1-phosphate phosphotase 2 (Sgpp2), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496506 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sphingosine-1-phosphate phosphotase 2 (Sgpp2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000036172 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:78310345:78420289:1 gene:ENSMUSG00000032908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC049995 // GenBank // Mus musculus sphingosine-1-phosphate phosphotase 2, mRNA (cDNA clone MGC:59240 IMAGE:6399201), complete cds. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC147843 // GenBank // Mus musculus sphingosine-1-phosphate phosphotase 2, mRNA (cDNA clone MGC:182946 IMAGE:9087560), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC147850 // GenBank // Mus musculus sphingosine-1-phosphate phosphotase 2, mRNA (cDNA clone MGC:182953 IMAGE:9087567), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XR_373543 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sphingosine-1-phosphate phosphotase 2 (Sgpp2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:78381738:78399107:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_021342 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Isk-related subfamily, gene 4 (Kcne4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:78816758:78820028:1 gene:ENSMUSG00000047330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF076533 // GenBank // Mus musculus minK-related peptide 3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC032920 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Isk-related subfamily, gene 4, mRNA (cDNA clone MGC:41085 IMAGE:3472318), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034849 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Isk-related subfamily, gene 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:3470905), complete cds. // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000187432 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:78816927:78820028:1 gene:ENSMUSG00000047330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000044767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:78799724:78818149:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
AK158220 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930043J12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0
NM_001081210 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L44 (Mrpl44), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:79776018:79781445:1 gene:ENSMUSG00000026248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK019986 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730593H20 product:weakly similar to MITOCHONDRIAL 39S RIBOSOMAL PROTEIN L45 (MRP-L45) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC019727 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L44, mRNA (cDNA clone IMAGE:3988741), partial cds. // chr1 // 76 // 68 // 13 // 17 // 0 /// ENSMUST00000189176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:79776116:79778546:1 gene:ENSMUSG00000026248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000044782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:79775328:79781138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
AK137457 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830004L10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// ENSMUST00000185548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:80186972:80192073:1 gene:ENSMUSG00000099552 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000191325 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:80184719:80192028:1 gene:ENSMUSG00000099552 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK162131 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420432F05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
AK089594 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830003P06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// KnowTID_00000094 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000023262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:82233112:82235933:1 gene:ENSMUSG00000022591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AY169784 // GenBank // Mus musculus hypothetical secreted protein SST7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001122685 // RefSeq // Mus musculus rhomboid domain containing 1 (Rhbdd1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_029777 // RefSeq // Mus musculus rhomboid domain containing 1 (Rhbdd1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006496574 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus rhomboid domain containing 1 (Rhbdd1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027322 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:82316452:82445366:1 gene:ENSMUSG00000026142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000140020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:82339049:82445366:1 gene:ENSMUSG00000026142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AY973322 // GenBank // Mus musculus MSD-50 mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC005518 // GenBank // Mus musculus rhomboid domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:7610 IMAGE:3494511), complete cds. // chr1 // 74 // 96 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:82338049:82408251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_007734 // RefSeq // Mus musculus collagen, type IV, alpha 3 (Col4a3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENSMUST00000113457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:82586976:82722059:1 gene:ENSMUSG00000079465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// AF169387 // GenBank // Mus musculus alpha 3 collagen IV (Col4a3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000033854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:82651969:82751716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 35 // 52 // 1
ENSMUST00000083121 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:82635013:82635110:1 gene:ENSMUSG00000065055 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 71 // 56 // 10 // 14 // 0 /// NONMMUT001696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 71 // 56 // 10 // 14 // 0
NM_001159738 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 20 (Ccl20), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_016960 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 20 (Ccl20), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006496447 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 20 (Ccl20), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000027351 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:83116766:83119166:1 gene:ENSMUSG00000026166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:83116774:83119167:1 gene:ENSMUSG00000026166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB015136 // GenBank // Mus musculus mRNA for chemokine LARC, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AF053313 // GenBank // Mus musculus CC chemokine ST38 precursor, mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF099052 // GenBank // Mus musculus macrophage inflammatory protein 3 alpha mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// BC028504 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 20, mRNA (cDNA clone MGC:41109 IMAGE:1380543), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000186832 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:83116793:83119167:1 gene:ENSMUSG00000026166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:83116824:83159119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NR_027636 // RefSeq // Mus musculus dynein assembly factor with WDR repeat domains 1 (Daw1), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000065403 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:83159781:83210574:1 gene:ENSMUSG00000053161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000113436 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:83159762:83210574:1 gene:ENSMUSG00000053161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000149342 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:83159769:83210570:1 gene:ENSMUSG00000053161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC049704 // GenBank HTC // Mus musculus WD repeat domain 69, mRNA (cDNA clone IMAGE:6707397), containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NM_027725 // RefSeq // Mus musculus dynein assembly factor with WDR repeat domains 1 (Daw1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 84 // 84 // 31 // 37 // 1 /// ENSMUST00000065436 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:83159762:83210568:1 gene:ENSMUSG00000053161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 84 // 31 // 37 // 1 /// BC145995 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 69, mRNA (cDNA clone MGC:175882 IMAGE:40131298), complete cds. // chr1 // 78 // 78 // 29 // 37 // 1 /// XM_006496550 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein assembly factor with WDR repeat domains 1 (Daw1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1 /// GENSCAN00000028227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:83179298:83209797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0
NM_025386 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 36 (Fbxo36), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006496520 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box protein 36 (Fbxo36), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000097672 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:84839841:84900487:1 gene:ENSMUSG00000073633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:84866436:84900487:1 gene:ENSMUSG00000073633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000143656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:84839853:84900487:1 gene:ENSMUSG00000073633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000151737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:84869151:84900487:1 gene:ENSMUSG00000073633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK002325 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610008D19 product:RIKEN cDNA 1110020F21 gene, full insert sequence. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK010335 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410002G19 product:similar to 1110020F21RIK PROTEIN [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC049581 // GenBank // Mus musculus F-box protein 36, mRNA (cDNA clone MGC:58202 IMAGE:6772363), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:84832418:84900185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
ENSMUST00000178024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:85575676:85577295:1 gene:ENSMUSG00000094127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK149712 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530012D18 product:hypothetical Phenylalanine-rich region profile/Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082480 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:85674882:85674985:1 gene:ENSMUSG00000064414 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000145440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:85650008:85696368:1 gene:ENSMUSG00000026222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT001797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
NM_133781 // RefSeq // Mus musculus calcium binding protein 39 (Cab39), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000097666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:85794511:85850365:1 gene:ENSMUSG00000036707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:85793441:85851576:1 gene:ENSMUSG00000036707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC020041 // GenBank // Mus musculus calcium binding protein 39, mRNA (cDNA clone MGC:28220 IMAGE:3990872), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:85818400:85849221:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_022417 // RefSeq // Mus musculus integral membrane protein 2C (Itm2c), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027425 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:85894281:85908675:1 gene:ENSMUSG00000026223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF272044 // GenBank // Mus musculus BRI3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF282981 // GenBank // Mus musculus putative transmembrane protein 2c mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC012952 // GenBank // Mus musculus integral membrane protein 2C, mRNA (cDNA clone MGC:6817 IMAGE:2648812), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AB030199 // GenBank // Mus musculus mRNA, complete cds, clone:2-68. // chr1 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENSMUST00000139837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:85906161:85907791:1 gene:ENSMUSG00000026223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSMUST00000185569 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:85894619:85908359:1 gene:ENSMUSG00000026223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000026110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:85894664:85923085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NR_037692 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933407L21 gene (4933407L21Rik), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000027426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:85928483:85931754:1 gene:ENSMUSG00000026224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK037440 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130019C19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000129392 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:85928727:85940624:1 gene:ENSMUSG00000026224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1 /// ENSMUST00000188949 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:85928886:85931754:1 gene:ENSMUSG00000026224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT001815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT001816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_001144992 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2810459M11 gene (2810459M11Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001144993 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2810459M11 gene (2810459M11Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:86045863:86055456:1 gene:ENSMUSG00000026227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027429 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:86045863:86053353:1 gene:ENSMUSG00000026227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// BC137675 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810459M11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169299 IMAGE:8860694), complete cds. // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// BC144821 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810459M11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178377 IMAGE:9053369), complete cds. // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:86045963:86053089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_027357 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 1 (Psmd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027432 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:86064619:86139151:1 gene:ENSMUSG00000026229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139715 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:86064619:86132749:1 gene:ENSMUSG00000026229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC138526 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 1, mRNA (cDNA clone MGC:170151 IMAGE:8861546), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138527 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 1, mRNA (cDNA clone MGC:170152 IMAGE:8861547), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:86062061:86093585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_145222 // RefSeq // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 7 (B3gnt7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000113306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:86303234:86307305:1 gene:ENSMUSG00000079445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AF502429 // GenBank // Mus musculus beta 1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 7 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 51 // 18 // 19 // 0 /// BC031187 // GenBank // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 7, mRNA (cDNA clone MGC:37623 IMAGE:4990205), complete cds. // chr1 // 96 // 76 // 27 // 28 // 0 /// BC060507 // GenBank // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 7, mRNA (cDNA clone MGC:67812 IMAGE:6394682), complete cds. // chr1 // 95 // 54 // 19 // 20 // 0 /// AK042632 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730012C22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1 /// ENSMUST00000189618 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:86302832:86304707:1 gene:ENSMUSG00000079445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1 /// NONMMUT001831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1 /// GENSCAN00000026107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:86143091:86306227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
AK144105 // GenBank HTC // Mus musculus RCB-1283 B16 melanoma cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430010N08 product:hypothetical Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_015507 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C130036L24 gene (C130036L24Rik), long non-coding RNA. // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000127284 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:86359574:86367964:1 gene:ENSMUSG00000073627 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// AK042329 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630082L19 product:inferred: nucleolin, full insert sequence. // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONMMUT001842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000190804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:86359588:86362772:1 gene:ENSMUSG00000073627 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONMMUT001839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONMMUT001841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSMUST00000137643 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:86359584:86373791:1 gene:ENSMUSG00000073627 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK030799 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830405E04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027966 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019O17 gene (1700019O17Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000046004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:86426329:86428052:1 gene:ENSMUSG00000036574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100497 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019O17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118337 IMAGE:30916756), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145753 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019O17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175640 IMAGE:40131056), complete cds. // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:86426371:86427963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000163337 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:86473659:86474006:1 gene:ENSMUSG00000101328 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene gene:ENSMUSG00000085791 // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000026111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:86473659:86487946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0
ENSMUST00000188050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:87068032:87071002:1 gene:ENSMUSG00000101940 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:87068030:87073291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT001871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 93 // 47 // 14 // 15 // 0
NM_007432 // RefSeq // Mus musculus alkaline phosphatase 3, intestine, not Mn requiring (Akp3), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000044878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:87125008:87127912:1 gene:ENSMUSG00000036500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC145627 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054195. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000187662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:87124973:87127148:1 gene:ENSMUSG00000036500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:87125008:87127912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_027084 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 56 (Prss56), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006529860 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 56 (Prss56), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044533 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:87183313:87188405:1 gene:ENSMUSG00000036480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006434 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700027L20 product:inferred: RIKEN cDNA 1700027L20 gene / putative [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// JF323950 // GenBank // Mus musculus strain C57Bl/6 serine 56 protease (Prss56) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// JF698684 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J trypsin-like serine protease (Prss56) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:87183493:87198762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_021600 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, delta polypeptide (Chrnd), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000073252 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:87190637:87200070:1 gene:ENSMUSG00000026251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK081344 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130008G12 product:cholinergic receptor, nicotinic, delta polypeptide, full insert sequence. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC052153 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, delta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:59278 IMAGE:6336578), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC141376 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, delta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:176338 IMAGE:9055989), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC141387 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, delta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:176349 IMAGE:9056000), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// K02582 // GenBank // Mouse acetylcholine receptor delta subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// L10076 // GenBank // Mus musculus nicotinic acetylcholine receptor delta1-subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186373 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:87190844:87200069:1 gene:ENSMUSG00000026251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:87183493:87198762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_009604 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, gamma polypeptide (Chrng), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000027470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:87205811:87212694:1 gene:ENSMUSG00000026253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// JN164666 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J chrng variant N2 (Chrng) mRNA, partial cds. // chr1 // 93 // 39 // 14 // 15 // 0 /// M30514 // GenBank // Mouse muscle nicotinic acetylcholine receptor gamma-subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 95 // 30 // 36 // 0 /// JN164665 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J chrng variant N1 (Chrng) mRNA, partial cds. // chr1 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// X03819 // GenBank // Mouse partially processed transcript for acetylcholine receptor gamma (aa -4 to 179). // chr1 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// ENSMUST00000186038 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:87205885:87208295:1 gene:ENSMUSG00000026253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 39 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000188796 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:87205810:87208295:1 gene:ENSMUSG00000026253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 39 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000052121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:87205825:87263556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1 /// ENSMUST00000185763 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:87204657:87208296:1 gene:ENSMUSG00000026253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// ENSMUST00000189392 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:87206074:87208595:1 gene:ENSMUSG00000026253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1
NM_028889 // RefSeq // Mus musculus EF hand domain containing 1 (Efhd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_387203 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF hand domain containing 1 (Efhd1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000027472 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:87264363:87310839:1 gene:ENSMUSG00000026255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000118687 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:87264363:87310836:1 gene:ENSMUSG00000026255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC019531 // GenBank // Mus musculus EF hand domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:28727 IMAGE:4459208), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC085088 // GenBank // Mus musculus EF hand domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:103094 IMAGE:6467625), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:87264450:87309795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_028473 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3110079O15 gene (3110079O15Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:87470271:87475482:1 gene:ENSMUSG00000026258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC115669 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3110079O15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144598 IMAGE:40104070), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC115670 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3110079O15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144599 IMAGE:40104071), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:87470339:87475438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000191095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:87472539:87475458:1 gene:ENSMUSG00000026258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
AK018050 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830472F04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_177646 // RefSeq // Mus musculus diacylglycerol kinase, delta (Dgkd), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006529471 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus diacylglycerol kinase, delta (Dgkd), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000027517 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:87853287:87944490:1 gene:ENSMUSG00000070738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC048957 // GenBank // Mus musculus diacylglycerol kinase, delta, mRNA (cDNA clone IMAGE:6490713), complete cds. // chr1 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// XM_006529473 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus diacylglycerol kinase, delta (Dgkd), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000189726 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:87935283:87940265:1 gene:ENSMUSG00000070738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000190061 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:87934397:87945180:1 gene:ENSMUSG00000070738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000041078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:87853301:87942472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001281466 // RefSeq // Mus musculus maestro heat-like repeat family member 2A (Mroh2a), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006529046 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus maestro heat-like repeat family member 2A (Mroh2a), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000061013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:88227020:88262289:1 gene:ENSMUSG00000079429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000113130 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:88227031:88262289:1 gene:ENSMUSG00000079429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000135948 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:88257758:88260169:1 gene:ENSMUSG00000079429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_029269 // RefSeq // Mus musculus secreted phosphoprotein 2 (Spp2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006529918 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus secreted phosphoprotein 2 (Spp2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000027518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:88406961:88426438:1 gene:ENSMUSG00000026295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000176708 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:88407279:88426438:1 gene:ENSMUSG00000026295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC027494 // GenBank // Mus musculus secreted phosphoprotein 2, mRNA (cDNA clone MGC:40991 IMAGE:1433655), complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000189225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:88407406:88426432:1 gene:ENSMUSG00000026295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000041059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:88407150:88457654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
ENSMUST00000188327 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:88932319:88933573:1 gene:ENSMUSG00000101333 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:88901903:88933534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
NM_133816 // RefSeq // Mus musculus SH3-domain binding protein 4 (Sh3bp4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:89070415:89155068:1 gene:ENSMUSG00000036206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012284 // GenBank // Mus musculus SH3-domain binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:18936 IMAGE:3978494), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034733 // GenBank // Mus musculus SH3-domain binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:36965 IMAGE:4947387), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:89137686:89153351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001037136 // RefSeq // Mus musculus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 (Agap1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_178119 // RefSeq // Mus musculus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 (Agap1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000027521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:89454806:89897617:1 gene:ENSMUSG00000055013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000074945 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:89580236:89895277:1 gene:ENSMUSG00000055013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AK147521 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain UNDEFINED_CELL_LINE cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1061C22 product:centaurin, gamma 2, full insert sequence. // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000190096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:89454874:89890001:1 gene:ENSMUSG00000055013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:89560449:89672946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NM_001271607 // RefSeq // Mus musculus atypical chemokine receptor 3 (Ackr3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_007722 // RefSeq // Mus musculus atypical chemokine receptor 3 (Ackr3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000065587 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:90203980:90216751:1 gene:ENSMUSG00000044337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF000236 // GenBank // Mus musculus RDC1 orphan chemokine receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC015254 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 7, mRNA (cDNA clone MGC:18378 IMAGE:4242244), complete cds. // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
ENSMUST00000070048 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:90675161:90679793:1 gene:ENSMUSG00000056128 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK039913 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430028D19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053015 // RefSeq // Mus musculus melanophilin (Mlph), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000027528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:90915085:90951142:1 gene:ENSMUSG00000026303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB057759 // GenBank // Mus musculus slac2-a mRNA for Slp homologue lacking C2 domains-a, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AF384098 // GenBank // Mus musculus melanophilin (Mlph) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC006900 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3599815, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// BC150804 // GenBank // Mus musculus melanophilin, mRNA (cDNA clone MGC:183715 IMAGE:9087715), complete cds. // chr1 // 90 // 88 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:90921869:90948609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_001101647 // RefSeq // Mus musculus prolactin releasing hormone (Prlh), mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000166281 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:90953108:90954027:1 gene:ENSMUSG00000090550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// FJ424613 // GenBank // Mus musculus prolactin-releasing peptide mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000042110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:90953108:90954012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001033408 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 44 (Rbm44), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006529704 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 44 (Rbm44), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000094698 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:91145103:91170795:1 gene:ENSMUSG00000070732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC150950 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 44, mRNA (cDNA clone MGC:183861 IMAGE:9087861), complete cds. // chr1 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:91152194:91170153:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0
XR_387264 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 330-like (LOC102639127), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000117121 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:91296045:91296936:1 gene:ENSMUSG00000083064 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000042114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:91180089:91296936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_001033292 // RefSeq // Mus musculus espin-like (Espnl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006529482 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus espin-like (Espnl), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000088904 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:91322075:91348306:1 gene:ENSMUSG00000049515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000176156 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:91322133:91345937:1 gene:ENSMUSG00000049515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:91322133:91345937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_027551 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 30 (Klhl30), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027533 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:91351016:91362416:1 gene:ENSMUSG00000026308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC115428 // GenBank // Mus musculus kelch-like 30 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:143856 IMAGE:40094085), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC115429 // GenBank // Mus musculus kelch-like 30 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:143857 IMAGE:40094088), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:91353679:91361266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_173395 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 132, member B (Fam132b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000086861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:91366430:91374217:1 gene:ENSMUSG00000047443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC056923 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 132, member B, mRNA (cDNA clone MGC:66507 IMAGE:5716432), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// HQ285249 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 myonectin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006529484 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 132, member B (Fam132b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// XM_006529486 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 132, member B (Fam132b), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// GENSCAN00000042117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:91366481:91373147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_028718 // RefSeq // Mus musculus TRAF3 interacting protein 1 (Traf3ip1), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000047242 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:91494694:91529307:1 gene:ENSMUSG00000034292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AY613437 // GenBank // Mus musculus microtubule-interacting protein associated with TRAF3 (Mipt3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC046538 // GenBank // Mus musculus TRAF3 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5326544), partial cds. // chr1 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC117868 // GenBank // Mus musculus TRAF3 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:143957 IMAGE:40095476), complete cds. // chr1 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// BC051115 // GenBank // Mus musculus TNF receptor-associated factor 3 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6307935), partial cds. // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// ENSMUST00000189341 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:91494647:91527956:1 gene:ENSMUSG00000034292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:91494766:91554878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// ENSMUST00000187588 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:91518262:91529307:1 gene:ENSMUSG00000034292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_007855 // RefSeq // Mus musculus twist basic helix-loop-helix transcription factor 2 (Twist2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000007949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:91801461:91848028:1 gene:ENSMUSG00000007805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC090636 // GenBank // Mus musculus twist homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:116582 IMAGE:30942245), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U36384 // GenBank // Mus musculus twist-related bHLH protein Dermo-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK143028 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030043J12 product:twist homolog 2 (Drosophila), full insert sequence. // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000013644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:91801627:91802109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000186075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:91801470:91803994:1 gene:ENSMUSG00000007805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_147037 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1413 (Olfr1413), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074859 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:92573125:92574206:1 gene:ENSMUSG00000058904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116898 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1413, mRNA (cDNA clone MGC:151275 IMAGE:40126217), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92573173:92574144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146277 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1412 (Olfr1412), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000062964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:92588207:92589297:1 gene:ENSMUSG00000046300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC125241 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1412, mRNA (cDNA clone MGC:130488 IMAGE:40044004), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92588332:92589297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_146490 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1411 (Olfr1411), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128013 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1411, mRNA (cDNA clone MGC:157607 IMAGE:40136041), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:92596495:92597492:1 gene:ENSMUSG00000062497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92596521:92597492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146491 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1410 (Olfr1410), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:92607839:92608807:1 gene:ENSMUSG00000063583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000062497 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:92607839:92608847:1 gene:ENSMUSG00000063583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC106991 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1410, mRNA (cDNA clone MGC:129256 IMAGE:40044064), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC106992 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1410, mRNA (cDNA clone MGC:129257 IMAGE:40044072), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92607839:92608807:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_206896 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 12 (Olfr12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081274 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:92619881:92620936:1 gene:ENSMUSG00000061616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120559 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 12, mRNA (cDNA clone MGC:155796 IMAGE:40129482), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120561 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 12, mRNA (cDNA clone MGC:155798 IMAGE:40129484), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92619908:92642014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0
NM_016696 // RefSeq // Mus musculus glypican 1 (Gpc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006529142 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glypican 1 (Gpc1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000045970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:92831645:92860779:1 gene:ENSMUSG00000034220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF185613 // GenBank // Mus musculus glypican-1 (Gpc1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK031768 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6230415P16 product:glypican 1, full insert sequence. // chr1 // 88 // 57 // 15 // 17 // 0 /// AK154584 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630049E20 product:glypican 1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// BC062902 // GenBank // Mus musculus glypican 1, mRNA (cDNA clone MGC:86094 IMAGE:6810413), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92831932:92859165:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000190215 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:92856768:92857595:1 gene:ENSMUSG00000034220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NR_029559 // RefSeq // Mus musculus microRNA 149 (Mir149), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000083536 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:92850378:92850443:1 gene:ENSMUSG00000065470 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// mmu-mir-149 // miRBase Micro RNA Database // MI0000171 Mus musculus miR-149 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT002061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_175118 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 28 (Dusp28), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060913 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:92906981:92908435:1 gene:ENSMUSG00000047067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119127 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 28, mRNA (cDNA clone MGC:155443 IMAGE:8733876), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000007068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92907055:92907687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_011796 // RefSeq // Mus musculus calpain 10 (Capn10), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:92934376:92947941:1 gene:ENSMUSG00000026270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF089089 // GenBank // Mus musculus calpain-like protease mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// AF126867 // GenBank // Mus musculus calpain-like protease (Capn8) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC005681 // GenBank // Mus musculus calpain 10, mRNA (cDNA clone MGC:11401 IMAGE:3154780), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC010969 // GenBank // Mus musculus calpain 10, mRNA (cDNA clone MGC:13731 IMAGE:4159612), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000152983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:92934833:92947929:1 gene:ENSMUSG00000026270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// ENSMUST00000117814 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:92934766:92940972:1 gene:ENSMUSG00000026270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000007051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92934874:92983491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001159658 // RefSeq // Mus musculus aquaporin 12 (Aqp12), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_177587 // RefSeq // Mus musculus aquaporin 12 (Aqp12), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:93006334:93012269:1 gene:ENSMUSG00000045091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB084104 // GenBank // Mus musculus mAQP12 mRNA for aquaporin 12, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107212 // GenBank // Mus musculus aquaporin 12, mRNA (cDNA clone MGC:130119 IMAGE:40051607), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC107213 // GenBank // Mus musculus aquaporin 12, mRNA (cDNA clone MGC:130120 IMAGE:40051613), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92989910:93012123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001276710 // RefSeq // Mus musculus alanine-glyoxylate aminotransferase (Agxt), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_016702 // RefSeq // Mus musculus alanine-glyoxylate aminotransferase (Agxt), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000027491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:93135240:93145421:1 gene:ENSMUSG00000026272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF027730 // GenBank // Mus musculus alanine:glyoxylate aminotransferase (Agxt1) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC025799 // GenBank // Mus musculus alanine-glyoxylate aminotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:35967 IMAGE:5099627), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000190603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:93139879:93145417:1 gene:ENSMUSG00000026272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000191039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:93135568:93138002:1 gene:ENSMUSG00000026272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000007053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:93133039:93145167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0
XM_006529989 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E030010N08 gene (E030010N08Rik), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006543496 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E030010N08 gene (E030010N08Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006543505 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E030010N08 gene (E030010N08Rik), transcript variant X10, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:93178695:93230948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023200 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 7 (Ppp1r7), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000027494 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:93342854:93373489:1 gene:ENSMUSG00000026275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000127141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:93343707:93352580:1 gene:ENSMUSG00000026275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// AF222867 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase-1 regulatory subunit 7 (Ppp1r7) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// AK031983 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330525M19 product:protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 7, full insert sequence. // chr1 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// BC013524 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 7, mRNA (cDNA clone MGC:19201 IMAGE:4237290), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000185498 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:93343655:93352649:1 gene:ENSMUSG00000026275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:93343660:93405694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1
ENSMUST00000082455 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:93363255:93363357:1 gene:ENSMUSG00000064389 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT002087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001271884 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 7 (Ano7), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_207031 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 7 (Ano7), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058682 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:93373930:93403402:1 gene:ENSMUSG00000034107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC116706 // GenBank // Mus musculus anoctamin 7, mRNA (cDNA clone MGC:144016 IMAGE:40096570), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000186641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:93373930:93404303:1 gene:ENSMUSG00000034107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:93343660:93405694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_145519 // RefSeq // Mus musculus FERM, RhoGEF and pleckstrin domain protein 2 (Farp2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120301 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:93512079:93621976:1 gene:ENSMUSG00000034066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC009153 // GenBank // Mus musculus FERM, RhoGEF and pleckstrin domain protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:6304 IMAGE:2655209), complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000122402 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:93512112:93581296:1 gene:ENSMUSG00000034066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// AK086699 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930046G03 product:hypothetical Serine-rich region/Band 4.1 family containing protein, full insert sequence. // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000007073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:93528711:93621371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_016778 // RefSeq // Mus musculus BCL2-related ovarian killer (Bok), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:93685660:93695764:1 gene:ENSMUSG00000026278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF027707 // GenBank // Mus musculus apoptosis activator Mtd (Mtd) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC030069 // GenBank // Mus musculus BCL2-related ovarian killer protein, mRNA (cDNA clone MGC:41110 IMAGE:2936938), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000185685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:93693817:93695455:1 gene:ENSMUSG00000026278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000188394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:93686263:93694070:1 gene:ENSMUSG00000026278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000007043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:93685898:93695162:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000188846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:93731104:93751072:1 gene:ENSMUSG00000101952 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK143968 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F530008M22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025454 // RefSeq // Mus musculus inhibitor of growth family, member 5 (Ing5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006529792 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inhibitor of growth family, member 5 (Ing5), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000027505 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:93803965:93822095:1 gene:ENSMUSG00000026283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK006421 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700027H23 product:hypothetical FYVE/PHD zinc finger structure containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC064674 // GenBank // Mus musculus inhibitor of growth family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:66742 IMAGE:6400183), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006529791 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inhibitor of growth family, member 5 (Ing5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// ENSMUST00000188402 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:93803983:93822101:1 gene:ENSMUSG00000026283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000190476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:93804345:93818382:1 gene:ENSMUSG00000026283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:93803586:93818348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
BC023277 // GenBank // Mus musculus D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:30834 IMAGE:4006813), complete cds. // chr1 // 85 // 81 // 11 // 13 // 0 /// NM_178882 // RefSeq // Mus musculus D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase (D2hgdh), mRNA. // chr1 // 63 // 100 // 10 // 16 // 0 /// ENSMUST00000097633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:93825240:93852348:1 gene:ENSMUSG00000073609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 100 // 10 // 16 // 0 /// ENSMUST00000112881 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:93825274:93852348:1 gene:ENSMUSG00000073609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 94 // 9 // 15 // 0 /// XM_006529970 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase (D2hgdh), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// XM_006529971 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase (D2hgdh), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// BC117794 // GenBank // Mus musculus D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:143685 IMAGE:40092173), complete cds. // chr1 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// GENSCAN00000010585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:93823086:93850826:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
NM_001039219 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6086 (Gm6086), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006529771 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6086 (Gm6086), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000097632 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:93990509:94017147:1 gene:ENSMUSG00000073608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_173772 // RefSeq // Mus musculus sialidase 4 (Neu4), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050890 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:94020493:94028334:1 gene:ENSMUSG00000034000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AB510404 // GenBank // Mus musculus Neu4 mRNA for sialidase 4, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AY258421 // GenBank // Mus musculus neuraminidase 4 (Neu4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC070438 // GenBank // Mus musculus sialidase 4, mRNA (cDNA clone MGC:91319 IMAGE:6842155), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190212 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:94020451:94025416:1 gene:ENSMUSG00000034000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:94003431:94025416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
AB154249 // GenBank // Mus musculus naa6 mRNA for NAA6 protein, complete cds. // chr1 // 93 // 40 // 13 // 14 // 0 /// NM_026321 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 174, member A (Fam174a), mRNA. // chr1 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// ENSMUST00000059975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:95313623:95335284:1 gene:ENSMUSG00000051185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// BC021428 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 174, member A, mRNA (cDNA clone MGC:29340 IMAGE:5034950), complete cds. // chr1 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// ENSMUST00000186780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:95313628:95327945:1 gene:ENSMUSG00000051185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000178491 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:96617099:96617205:1 gene:ENSMUSG00000095610 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT002128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_026250 // RefSeq // Mus musculus gypsy retrotransposon integrase 1 (Gin1), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006529614 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gypsy retrotransposon integrase 1 (Gin1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006529615 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gypsy retrotransposon integrase 1 (Gin1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000027571 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:97770197:97793709:1 gene:ENSMUSG00000026333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:97770172:97792969:1 gene:ENSMUSG00000026333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:97770210:97793006:1 gene:ENSMUSG00000026333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK090002 // GenBank HTC // Mus musculus bladder RCB-0544 MBT-2 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430055H06 product:hypothetical Actin-crosslinking proteins containing protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC033572 // GenBank // Mus musculus zinc finger, H2C2 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:29171 IMAGE:5067692), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000189031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:97777399:97785063:1 gene:ENSMUSG00000026333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000020041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:97775454:97820419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000178398 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:98049822:98049928:1 gene:ENSMUSG00000096085 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT002155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000180540 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:98263523:98264506:1 gene:ENSMUSG00000097608 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT002161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:98230582:98264477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_001164233 // RefSeq // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 6d1 (Slco6d1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_027584 // RefSeq // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 6d1 (Slco6d1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006529871 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 6d1 (Slco6d1), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:98421124:98509380:1 gene:ENSMUSG00000026336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000160796 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:98421154:98509247:1 gene:ENSMUSG00000026336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000162468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:98421127:98516991:1 gene:ENSMUSG00000026336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK133206 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932416I03 product:solute carrier organic anion transporter family, member 6d1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC112423 // GenBank // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 6d1, mRNA (cDNA clone MGC:132958 IMAGE:40062055), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC113131 // GenBank // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 6d1, mRNA (cDNA clone MGC:132957 IMAGE:40062053), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_172851 // RefSeq // Mus musculus contactin associated protein-like 5B (Cntnap5b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006529595 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus contactin associated protein-like 5B (Cntnap5b), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000086738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:99772765:100484849:1 gene:ENSMUSG00000067028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// AK133394 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933408P06 product:similar to Caspr5 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// XM_006529596 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus contactin associated protein-like 5B (Cntnap5b), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1 /// ENSMUST00000188735 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:100097761:100485942:1 gene:ENSMUSG00000067028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:100072110:100484701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 92 // 34 // 37 // 1
ENSMUST00000189440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:102449353:102537656:1 gene:ENSMUSG00000101890 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:102519418:102618602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
ENSMUST00000186155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:103171926:103268593:1 gene:ENSMUSG00000100955 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:103146161:103231060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000186157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:104513001:104514068:1 gene:ENSMUSG00000099464 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:104513028:104513769:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
NM_011800 // RefSeq // Mus musculus cadherin 20 (Cdh20), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062528 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:104768529:104995481:1 gene:ENSMUSG00000050840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF007116 // GenBank // Mus musculus cadherin 7 precursor (Cdh7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC119606 // GenBank // Mus musculus cadherin 20, mRNA (cDNA clone MGC:141414 IMAGE:40061260), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC119607 // GenBank // Mus musculus cadherin 20, mRNA (cDNA clone MGC:141415 IMAGE:40061261), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000005592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:104934115:104994385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_009797 // RefSeq // Mus musculus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 1 (Capza1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000086725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:105455971:105458829:1 gene:ENSMUSG00000067017 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 98 // 98 // 45 // 46 // 0 /// ENSMUST00000094028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:104822779:104864505:-1 gene:ENSMUSG00000070372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC016232 // GenBank // Mus musculus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:28790 IMAGE:4489604), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC085506 // GenBank // Mus musculus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:102194 IMAGE:6817308), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000003637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:104824984:104850901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 53 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:105455983:105456843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000187390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:9:98873064:98873916:-1 gene:ENSMUSG00000100839 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 34 // 68 // 11 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:37870270:37871113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 64 // 14 // 30 // 0
NM_009399 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 11a, NFKB activator (Tnfrsf11a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:105780718:105847981:1 gene:ENSMUSG00000026321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF019046 // GenBank // Mus musculus receptor activator of nuclear factor kappa B (RANK) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC019185 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 11a, mRNA (cDNA clone MGC:29090 IMAGE:5025470), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:105780752:105869270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// ENSMUST00000187812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:105780750:105814403:1 gene:ENSMUSG00000026321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001122675 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 2 (Zcchc2), transcript variant B, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_001122676 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 2 (Zcchc2), transcript variant A, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000118196 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:105990406:106034074:1 gene:ENSMUSG00000038866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000119166 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:105990689:106034067:1 gene:ENSMUSG00000038866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000131830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:106011744:106023258:1 gene:ENSMUSG00000038866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000188954 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:106004137:106027501:1 gene:ENSMUSG00000038866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000044696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:106011549:106035183:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000186983 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:106004122:106032448:1 gene:ENSMUSG00000038866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_133821 // RefSeq // Mus musculus PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 (Phlpp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000061047 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:106171752:106394250:1 gene:ENSMUSG00000044340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC059254 // GenBank // Mus musculus PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:67583 IMAGE:6406203), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000044681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:106205501:106393340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000189471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:106439600:106439870:1 gene:ENSMUSG00000099604 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000044684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:106439600:106439803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 94 // 15 // 17 // 0
ENSMUST00000149909 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:106541943:106575045:1 gene:ENSMUSG00000054006 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK085305 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630008O14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000144260 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:106541943:106558992:1 gene:ENSMUSG00000054006 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AK052756 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630044D05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT002233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT002234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_009257 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 5 (Serpinb5), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006529291 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 5 (Serpinb5), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000086701 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:106861173:106883348:1 gene:ENSMUSG00000067006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000112729 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:106870234:106883347:1 gene:ENSMUSG00000067006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000112730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:106861203:106883348:1 gene:ENSMUSG00000067006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC005434 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:5950 IMAGE:3600282), complete cds. // chr1 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// U54705 // GenBank // Mus musculus tumor supressor maspin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000188745 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:106861174:106880343:1 gene:ENSMUSG00000067006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000025902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:106861075:106881993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0
NM_001199213 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 12 (Serpinb12), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NM_027971 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 12 (Serpinb12), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000081277 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:106934449:106957080:1 gene:ENSMUSG00000059956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112724 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:106938953:106957080:1 gene:ENSMUSG00000059956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK040697 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530016D18 product:weakly similar to SERPIN B12 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AY367773 // GenBank // Mus musculus serpinb12 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// BC062134 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 12, mRNA (cDNA clone MGC:69970 IMAGE:30287757), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000126812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:106938955:106950458:1 gene:ENSMUSG00000059956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000025907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:106929895:107000821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_172852 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 13 (Serpinb13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000027564 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:106980984:107001195:1 gene:ENSMUSG00000048775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000136766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:106980994:107000898:1 gene:ENSMUSG00000048775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC117990 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 13, mRNA (cDNA clone MGC:144645 IMAGE:40104505), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC117991 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 13, mRNA (cDNA clone IMAGE:40104507), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:106929895:107000821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_025867 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 11 (Serpinb11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000027566 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:107361929:107380475:1 gene:ENSMUSG00000026327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY367772 // GenBank // Mus musculus serpinb11 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC010313 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 11, mRNA (cDNA clone MGC:6485 IMAGE:2646766), complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// ENSMUST00000191425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:107361198:107374182:1 gene:ENSMUSG00000026327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000025896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:107350033:107380007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_027548 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 7 (Serpinb7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000086690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:107422689:107452689:1 gene:ENSMUSG00000067001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000154538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:107399655:107435399:1 gene:ENSMUSG00000067001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// AF105328 // GenBank // Mus musculus megsin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC064004 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:69988 IMAGE:30288309), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:107428249:107452007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_001174170 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 2 (Serpinb2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_011111 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 2 (Serpinb2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000009356 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:107511423:107525598:1 gene:ENSMUSG00000062345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000064916 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:107511497:107525592:1 gene:ENSMUSG00000062345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000143832 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:107522230:107535478:1 gene:ENSMUSG00000062345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 93 // 44 // 13 // 14 // 0 /// BC138815 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:170442 IMAGE:8861837), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC138817 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:170444 IMAGE:8861839), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:107481543:107547072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_001160307 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10 (Serpinb10), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_198028 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10 (Serpinb10), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000172762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:107529027:107549271:1 gene:ENSMUSG00000092572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000182198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:107529003:107547222:1 gene:ENSMUSG00000092572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000098034 // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC029736 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:25706 IMAGE:3676050), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC069938 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:78236 IMAGE:5035202), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006529597 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10 (Serpinb10), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000025892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:107481543:107547072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001159748 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 8 (Serpinb8), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NM_011459 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 8 (Serpinb8), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006529292 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 8 (Serpinb8), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000000514 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:107590006:107608909:1 gene:ENSMUSG00000026315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:107590006:107610484:1 gene:ENSMUSG00000026315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151283 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:107590046:107606150:1 gene:ENSMUSG00000026315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC025121 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptdiase inhibitor, clade B, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:36224 IMAGE:4487039), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// U96703 // GenBank // Mus musculus NK10 (Serpinb8) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:107597590:107689674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001077425 // RefSeq // Mus musculus contactin associated protein-like 5A (Cntnap5a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000043725 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:115684756:116587323:1 gene:ENSMUSG00000070695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000035681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:116032988:116580674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0
ENSMUST00000179777 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:116802983:116823410:1 gene:ENSMUSG00000094429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:116695996:117000327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000083931 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:117536301:117536464:1 gene:ENSMUSG00000065865 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT002303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026472 // RefSeq // Mus musculus nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 (Nifk), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000027626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:118321839:118333822:1 gene:ENSMUSG00000026377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000112688 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:118321854:118332941:1 gene:ENSMUSG00000026377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000161495 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:118322152:118329380:1 gene:ENSMUSG00000026377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AB056870 // GenBank // Mus musculus nifk mRNA for nucleolar protein mNIFK, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AY030275 // GenBank // Mus musculus RNA binding protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC058559 // GenBank // Mus musculus Mki67 (FHA domain) interacting nucleolar phosphoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:68034 IMAGE:6314031), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:118311065:118335182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1
NM_023755 // RefSeq // Mus musculus transcription factor CP2-like 1 (Tfcp2l1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000027629 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:118627946:118685168:1 gene:ENSMUSG00000026380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK143960 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F530007A16 product:transcription factor CP2-like 1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC116663 // GenBank // Mus musculus transcription factor CP2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:141582 IMAGE:40087602), complete cds. // chr1 // 84 // 89 // 26 // 31 // 0 /// AF311309 // GenBank // Mus musculus transcription repressor CRTR-1 (Crtr-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 66 // 100 // 23 // 35 // 0 /// GENSCAN00000003291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:118652272:118675876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
ENSMUST00000181691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:119157586:119158565:1 gene:ENSMUSG00000096939 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000056058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:119157876:119158369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 81 // 10 // 13 // 0
NM_146103 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 185B (Tmem185b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000183952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:119526160:119528983:1 gene:ENSMUSG00000098923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC024712 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 185B, mRNA (cDNA clone MGC:25511 IMAGE:2646072), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:119499486:119527563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001012322 // RefSeq // Mus musculus secretin receptor (Sctr), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006529688 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus secretin receptor (Sctr), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006529689 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus secretin receptor (Sctr), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000072886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:120006894:120063536:1 gene:ENSMUSG00000026387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089355 // GenBank // Mus musculus secretin receptor, mRNA (cDNA clone MGC:102218 IMAGE:30551620), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000189037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:120007034:120063534:1 gene:ENSMUSG00000026387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:120007172:120063282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_207233 // RefSeq // Mus musculus complement component 1, q subcomponent-like 2 (C1ql2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:120340582:120343174:1 gene:ENSMUSG00000036907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC040774 // GenBank // Mus musculus complement component 1, q subcomponent-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:49730 IMAGE:4503096), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010133 // RefSeq // Mus musculus engrailed 1 (En1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000079721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:120602418:120607992:1 gene:ENSMUSG00000058665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK140634 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930064E24 product:engrailed 1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// L12703 // GenBank // Mouse engrailed protein (En-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:120603033:120607189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000158649 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:122510549:122510697:1 gene:ENSMUSG00000089274 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT002407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006543527 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sine oculis-binding protein homolog (LOC102638986), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:124044823:124046412:1 gene:ENSMUSG00000073586 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK140652 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930070F20 product:hypothetical Serine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT002426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:124019310:124046346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_028787 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member F5 (Slc35f5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006529910 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 35, member F5 (Slc35f5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006529911 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 35, member F5 (Slc35f5), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006529912 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 35, member F5 (Slc35f5), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000027580 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:125561016:125595820:1 gene:ENSMUSG00000026342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC026858 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member F5, mRNA (cDNA clone MGC:19280 IMAGE:4014064), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000189443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:125584513:125595148:1 gene:ENSMUSG00000026342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000028771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:125560766:125595050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0
NM_027677 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 39 (Gpr39), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006529875 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 39 (Gpr39), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000027581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:125676995:125873862:1 gene:ENSMUSG00000026343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159359 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:125840003:125873173:1 gene:ENSMUSG00000026343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AK016817 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933415E13 product:similar to PUTATIVE G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR GPR39 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC085285 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 39, mRNA (cDNA clone MGC:102647 IMAGE:30745457), complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
ENSMUST00000175405 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:127331813:127331941:1 gene:ENSMUSG00000093146 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT002455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000083753 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:127375131:127375239:1 gene:ENSMUSG00000065687 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONMMUT002457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001033041 // RefSeq // Mus musculus amino carboxymuconate semialdehyde decarboxylase (Acmsd), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000038006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:127729413:127767978:1 gene:ENSMUSG00000026348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK165228 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F420012H22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC139281 // GenBank // Mus musculus amino carboxymuconate semialdehyde decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:170908 IMAGE:8862303), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000186537 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:127756757:127767978:1 gene:ENSMUSG00000026348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000040548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:127737977:127766345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_178690 // RefSeq // Mus musculus RAB3 GTPase activating protein subunit 1 (Rab3gap1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006529407 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB3 GTPase activating protein subunit 1 (Rab3gap1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000037649 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:127868773:127943868:1 gene:ENSMUSG00000036104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000142662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:127868802:127904033:1 gene:ENSMUSG00000036104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 23 // 11 // 11 // 0 /// BC046297 // GenBank // Mus musculus RAB3 GTPase activating protein subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:54893 IMAGE:6486170), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000040547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:127870087:127944160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 72 // 33 // 34 // 0
NR_029543 // RefSeq // Mus musculus microRNA 128-1 (Mir128-1), microRNA. // chr1 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// ENSMUST00000083586 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:128202355:128202436:1 gene:ENSMUSG00000065520 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-128-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000155 Mus musculus miR-128-1 stem-loop // chr1 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// NONMMUT002501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0
NM_026390 // RefSeq // Mus musculus UBX domain protein 4 (Ubxn4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006529830 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UBX domain protein 4 (Ubxn4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:128244162:128279378:1 gene:ENSMUSG00000026353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK029431 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833435I06 product:hypothetical Thioredoxin-like structure containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC019795 // GenBank // Mus musculus UBX domain protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:30282 IMAGE:4158848), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC030190 // GenBank // Mus musculus UBX domain protein 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5352845), partial cds. // chr1 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000187031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:128259504:128273166:1 gene:ENSMUSG00000026353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000190736 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:128243964:128259535:1 gene:ENSMUSG00000026353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000040537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:128244471:128277095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000157571 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:128490040:128490173:1 gene:ENSMUSG00000088196 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT002505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172485 // RefSeq // Mus musculus thrombospondin, type I, domain containing 7B (Thsd7b), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000040311 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:129273463:130050352:1 gene:ENSMUSG00000042581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000073527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:129273344:130219278:1 gene:ENSMUSG00000042581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000140834 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:130163831:130219276:1 gene:ENSMUSG00000042581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// AK051714 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130067I03 product:weakly similar to HYPOTHETICAL PROTEIN DJ1110N13.1 IN CHROMOSOME 7 (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC063250 // GenBank // Mus musculus thrombospondin, type I, domain containing 7B, mRNA (cDNA clone MGC:66597 IMAGE:6410178), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000151700 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:129915539:130183181:1 gene:ENSMUSG00000042581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// AK166575 // GenBank HTC // Mus musculus 1 cell embryo 1 cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I0C0030I12 product:weakly similar to Hypothetical protein GS164B05.1 in chromosome 7 (Fragment) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_178691 // RefSeq // Mus musculus YOD1 OTU deubiquitinating enzyme 1 homologue (S. cerevisiae) (Yod1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000049813 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:130717327:130724358:1 gene:ENSMUSG00000046404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK044678 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930031N03 product:hypothetical OTU-like cysteine protease/Zinc finger, C2H2 type containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC099948 // GenBank // Mus musculus YOD1 OTU deubiquitinating enzyme 1 homologue (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:107429 IMAGE:30097649), complete cds. // chr1 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// BC139034 // GenBank // Mus musculus YOD1 OTU deubiquitinating enzyme 1 homologue (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:170661 IMAGE:8862056), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:130717086:130743863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_177604 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AA986860 (AA986860), mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000039323 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:130731976:130744622:1 gene:ENSMUSG00000042510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC099401 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AA986860, mRNA (cDNA clone MGC:117564 IMAGE:30713499), complete cds. // chr1 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// BC117765 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AA986860, mRNA (cDNA clone MGC:143576 IMAGE:40090933), complete cds. // chr1 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// BC117766 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AA986860, mRNA (cDNA clone MGC:143577 IMAGE:40090934), complete cds. // chr1 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000190859 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:130740272:130744621:1 gene:ENSMUSG00000042510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:130717086:130743863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// ENSMUST00000186185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:130732110:130742463:1 gene:ENSMUSG00000042510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001170632 // RefSeq // Mus musculus Fc receptor, IgA, IgM, high affinity (Fcamr), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_144960 // RefSeq // Mus musculus Fc receptor, IgA, IgM, high affinity (Fcamr), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006529784 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Fc receptor, IgA, IgM, high affinity (Fcamr), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006529785 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Fc receptor, IgA, IgM, high affinity (Fcamr), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:130800902:130814740:1 gene:ENSMUSG00000026415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000112477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:130800902:130814708:1 gene:ENSMUSG00000026415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB048834 // GenBank // Mus musculus mRNA for Fca/m receptor, complete cds. // chr1 // 79 // 88 // 22 // 28 // 0 /// BC110549 // GenBank // Mus musculus Fc receptor, IgA, IgM, high affinity, mRNA (cDNA clone MGC:129330 IMAGE:40047147), complete cds. // chr1 // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// BC110550 // GenBank // Mus musculus Fc receptor, IgA, IgM, high affinity, mRNA (cDNA clone MGC:129331 IMAGE:40047153), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// FJ011703 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 Fc IgA/IgM receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:130784377:130852139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_011082 // RefSeq // Mus musculus polymeric immunoglobulin receptor (Pigr), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000027675 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:130826684:130852249:1 gene:ENSMUSG00000026417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000133792 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:130826888:130844680:1 gene:ENSMUSG00000026417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC013556 // GenBank // Mus musculus polymeric immunoglobulin receptor, mRNA (cDNA clone MGC:5797 IMAGE:3601095), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U06431 // GenBank // Mus musculus B6/CBAFIJ polymeric immunoglobulin receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000047683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:130784377:130852139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_010548 // RefSeq // Mus musculus interleukin 10 (Il10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000016673 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131019845:131024974:1 gene:ENSMUSG00000016529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120612 // GenBank // Mus musculus interleukin 10, mRNA (cDNA clone MGC:155849 IMAGE:40129535), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC137844 // GenBank // Mus musculus interleukin 10, mRNA (cDNA clone MGC:169468 IMAGE:8860863), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M37897 // GenBank // Mouse interleukin 10 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131019912:131024268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_175382 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 72, member A (Fam72a), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068613 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131527903:131539872:1 gene:ENSMUSG00000055184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC090647 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700049P18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:116018 IMAGE:30633261), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC106123 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700049P18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117955 IMAGE:3995296), complete cds. // chr1 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC138225 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700049P18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169849 IMAGE:8861244), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC145667 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700049P18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175554 IMAGE:40130970), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_011924 // RefSeq // Mus musculus arginine vasopressin receptor 1B (Avpr1b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131599239:131612000:1 gene:ENSMUSG00000026432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000190410 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:131599723:131609754:1 gene:ENSMUSG00000026432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000047684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131599741:131609745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_007799 // RefSeq // Mus musculus cathepsin E (Ctse), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000073350 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131638306:131675505:1 gene:ENSMUSG00000004552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000112411 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:131638494:131675503:1 gene:ENSMUSG00000004552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC005432 // GenBank // Mus musculus cathepsin E, mRNA (cDNA clone MGC:5924 IMAGE:3601519), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// CT010252 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D1151D for gene Ctse, Cathepsin E; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 89 // 75 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000141061 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:131661911:131665446:1 gene:ENSMUSG00000004552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// AK165242 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430003F23 product:cathepsin E, full insert sequence. // chr1 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// GENSCAN00000005703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131661996:131674945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_145509 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5430435G22 gene (5430435G22Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000064664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:131688707:131712751:1 gene:ENSMUSG00000052688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000064679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131688695:131715439:1 gene:ENSMUSG00000052688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000130848 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:131696638:131705699:1 gene:ENSMUSG00000052688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000136247 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:131688738:131711663:1 gene:ENSMUSG00000052688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AB232641 // GenBank // Mus musculus Rab42 mRNA for Rab42, complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// JX431303 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 Rab7b mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000129905 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:131688766:131711830:1 gene:ENSMUSG00000052688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// BC019395 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 5430435G22 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3672128). // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131688853:131769248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_177243 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 26, member 9 (Slc26a9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000049027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131744022:131771504:1 gene:ENSMUSG00000042268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000147800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:131750491:131753987:1 gene:ENSMUSG00000042268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// AY034145 // GenBank // Mus musculus SLC26A9 anion transporter/exchanger mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000186122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:131744038:131764007:1 gene:ENSMUSG00000042268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131688853:131769248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 84 // 37 // 44 // 1
NM_178079 // RefSeq // Mus musculus peptidase M20 domain containing 1 (Pm20d1), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000112393 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131797381:131821461:1 gene:ENSMUSG00000042251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK128969 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3014415, weakly similar to Carboxypeptidase S precursor (EC 3.4.17.4). // chr1 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// BC120725 // GenBank // Mus musculus peptidase M20 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:155962 IMAGE:40129648), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC125395 // GenBank // Mus musculus peptidase M20 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:159098 IMAGE:40129910), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006529338 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peptidase M20 domain containing 1 (Pm20d1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000048660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:131797398:131821473:1 gene:ENSMUSG00000042251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// AK028883 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732466D17 product:hypothetical Peptidase family M20/M25/M40 containing protein, full insert sequence. // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000005712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131797418:131816110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_173865 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 41, member 1 (Slc41a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000086559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131827977:131848865:1 gene:ENSMUSG00000013275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000146360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:131842840:131846629:1 gene:ENSMUSG00000013275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 91 // 31 // 10 // 11 // 0 /// BC096596 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 41, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:106109 IMAGE:4239523), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC116280 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 41, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:143884 IMAGE:40094408), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC116281 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 41, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:143885 IMAGE:40094411), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131830622:131846735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NM_144875 // RefSeq // Mus musculus RAB29, member RAS oncogene family (Rab29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000027693 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131867240:131872887:1 gene:ENSMUSG00000026433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000112386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:131867224:131872739:1 gene:ENSMUSG00000026433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000125925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:131867511:131872502:1 gene:ENSMUSG00000026433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 91 // 71 // 20 // 22 // 0 /// AB232625 // GenBank // Mus musculus Rab29 mRNA for Rab29, complete cds. // chr1 // 90 // 65 // 18 // 20 // 0 /// BC016133 // GenBank // Mus musculus RAB7, member RAS oncogene family-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:28972 IMAGE:4485029), complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// BC029056 // GenBank // Mus musculus RAB7, member RAS oncogene family-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:36539 IMAGE:4947517), complete cds. // chr1 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// AK137928 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130040G08 product:RAB7, member RAS oncogene family-like 1, full insert sequence. // chr1 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// ENSMUST00000187084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:131867653:131870979:1 gene:ENSMUSG00000026433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131867652:131906787:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_001145804 // RefSeq // Mus musculus nuclear casein kinase and cyclin-dependent kinase substrate 1 (Nucks1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_175294 // RefSeq // Mus musculus nuclear casein kinase and cyclin-dependent kinase substrate 1 (Nucks1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000062264 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131910556:131936321:1 gene:ENSMUSG00000026434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB049825 // GenBank // Mus musculus mRNA for JC7, complete cds. // chr1 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// BC039951 // GenBank // Mus musculus nuclear casein kinase and cyclin-dependent kinase substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:49565 IMAGE:4188558), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000189946 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:131910534:131932679:1 gene:ENSMUSG00000026434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131916206:131931206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
NM_145977 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 45, member 3 (Slc45a3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131970609:131982964:1 gene:ENSMUSG00000026435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000177943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131962967:131982969:1 gene:ENSMUSG00000026435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK162123 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420429H22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// BC031381 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 45, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:32471 IMAGE:5050610), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_001177628 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 45, member 3 (Slc45a3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000190322 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:131976719:131977945:1 gene:ENSMUSG00000026435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000005733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131951796:132019992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NR_029777 // RefSeq // Mus musculus microRNA 135b (Mir135b), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083501 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:132198088:132198184:1 gene:ENSMUSG00000065435 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-135b // miRBase Micro RNA Database // MI0000646 Mus musculus miR-135b stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT002595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006543539 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 7241 (Gm7241), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000159853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:132284453:132284809:1 gene:ENSMUSG00000089808 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:132214113:132284809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_144810 // RefSeq // Mus musculus kelch domain containing 8A (Klhdc8a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000046071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:132298626:132307357:1 gene:ENSMUSG00000042115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC011135 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 8A, mRNA (cDNA clone MGC:19056 IMAGE:4191503), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:132299277:132304792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001195025 // RefSeq // Mus musculus NUAK family, SNF1-like kinase, 2 (Nuak2), transcript variant A, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_028778 // RefSeq // Mus musculus NUAK family, SNF1-like kinase, 2 (Nuak2), transcript variant B, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006529909 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NUAK family, SNF1-like kinase, 2 (Nuak2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000072177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:132316126:132333293:1 gene:ENSMUSG00000009772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000082125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:132316126:132333488:1 gene:ENSMUSG00000009772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC033302 // GenBank // Mus musculus NUAK family, SNF1-like kinase, 2, mRNA (cDNA clone MGC:30598 IMAGE:3663595), complete cds. // chr1 // 79 // 88 // 22 // 28 // 0 /// BC046833 // GenBank // Mus musculus NUAK family, SNF1-like kinase, 2, mRNA (cDNA clone MGC:61244 IMAGE:6816569), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000133246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:132327596:132330450:1 gene:ENSMUSG00000009772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000005701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:132316230:132349813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
NM_172516 // RefSeq // Mus musculus dual serine/threonine and tyrosine protein kinase (Dstyk), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006529356 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dual serine/threonine and tyrosine protein kinase (Dstyk), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000045110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:132417555:132466958:1 gene:ENSMUSG00000042046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY208852 // GenBank // Mus musculus dusty protein kinase mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AY429676 // GenBank // Mus musculus dusty protein kinase mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC130226 // GenBank // Mus musculus dual serine/threonine and tyrosine protein kinase, mRNA (cDNA clone MGC:161265 IMAGE:40141770), complete cds. // chr1 // 91 // 37 // 10 // 11 // 0 /// XR_387156 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dual serine/threonine and tyrosine protein kinase (Dstyk), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// AK043199 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730069A04 product:HDCMD38P homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// ENSMUST00000188389 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:132417604:132464092:1 gene:ENSMUSG00000042046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:132417606:132508237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000188006 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:132454575:132457639:1 gene:ENSMUSG00000042046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_172517 // RefSeq // Mus musculus retinoblastoma binding protein 5 (Rbbp5), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000027700 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:132477435:132505659:1 gene:ENSMUSG00000026439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC057632 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:67708 IMAGE:4918318), complete cds. // chr1 // 87 // 71 // 13 // 15 // 0 /// ENSMUST00000190825 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:132477365:132504490:1 gene:ENSMUSG00000026439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// ENSMUST00000190997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:132477367:132504889:1 gene:ENSMUSG00000026439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// ENSMUST00000187505 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:132477406:132504108:1 gene:ENSMUSG00000026439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// GENSCAN00000005752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:132417606:132508237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
BC095954 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 81, mRNA (cDNA clone MGC:106324 IMAGE:5068880), complete cds. // chr1 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0 /// NM_029025 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 81 (Tmem81), mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// ENSMUST00000058167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:132506230:132508639:1 gene:ENSMUSG00000048174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// BC120863 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 81, mRNA (cDNA clone MGC:156100 IMAGE:40129786), complete cds. // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// BC132045 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 81, mRNA (cDNA clone MGC:163676 IMAGE:40130322), complete cds. // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENSMUST00000188789 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:132506889:132508639:1 gene:ENSMUSG00000048174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:132417606:132508237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NR_045892 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10538 (Gm10538), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:132729355:132732826:1 gene:ENSMUSG00000101126 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT002621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010732 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat protein 2, neuronal (Lrrn2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:132880273:132940005:1 gene:ENSMUSG00000026443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159088 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:132880355:132937150:1 gene:ENSMUSG00000026443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// AY362823 // GenBank // Mus musculus neuronal leucine rich repeat 2 (Lrrn2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC056458 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat protein 2, neuronal, mRNA (cDNA clone MGC:67147 IMAGE:5685881), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT002625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0
XM_006530039 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 40S ribosomal protein S8-like (LOC102636216), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000186115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:133025801:133026439:1 gene:ENSMUSG00000100228 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000052441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:133009783:133026439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001099276 // RefSeq // Mus musculus phosphoinositide-3-kinase, class 2, beta polypeptide (Pik3c2b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006529532 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphoinositide-3-kinase, class 2, beta polypeptide (Pik3c2b), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006529533 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphoinositide-3-kinase, class 2, beta polypeptide (Pik3c2b), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000077730 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:133046012:133108687:1 gene:ENSMUSG00000026447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000124934 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:133046012:133081337:1 gene:ENSMUSG00000026447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AK049181 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330011J12 product:hypothetical Phosphoinositide 3-kinase family, ras-binding domain containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC132141 // GenBank // Mus musculus phosphoinositide-3-kinase, class 2, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:163772 IMAGE:40130418), complete cds. // chr1 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000052447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:133066300:133136887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_133819 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 15b (Ppp1r15b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000052529 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:133131143:133139783:1 gene:ENSMUSG00000046062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000122956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:133131344:133139783:1 gene:ENSMUSG00000046062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT002632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:133066300:133136887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
GENSCAN00000052443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:133158782:133329645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_026680 // RefSeq // Mus musculus golgi transport 1 homolog A (S. cerevisiae) (Golt1a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006497294 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus golgi transport 1 homolog A (S. cerevisiae) (Golt1a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000094557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:133309823:133323026:1 gene:ENSMUSG00000098306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000041717 // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY707855 // GenBank // Mus musculus KISS1 isoform a (Kiss1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC024448 // GenBank // Mus musculus golgi transport 1 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:37293 IMAGE:4974299), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000183489 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:133309827:133329901:1 gene:ENSMUSG00000098306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// ENSMUST00000184603 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:133309827:133329694:1 gene:ENSMUSG00000098306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// AY707856 // GenBank // Mus musculus KISS1 isoform b (Kiss1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000052443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:133158782:133329645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AY707859 // GenBank // Mus musculus KISS1 isoform e (Kiss1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// AY707860 // GenBank // Mus musculus KISS1 isoform f (Kiss1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_031192 // RefSeq // Mus musculus renin 1 structural (Ren1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000094556 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:133350510:133360325:1 gene:ENSMUSG00000070645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061053 // GenBank // Mus musculus renin 1 structural, mRNA (cDNA clone MGC:74164 IMAGE:30313659), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_031193 // RefSeq // Mus musculus renin 2 tandem duplication of Ren1 (Ren2), mRNA. // chr1 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// XM_006497265 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus renin 1 structural (Ren1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 71 // 89 // 17 // 24 // 0 /// BC011157 // GenBank // Mus musculus renin 2 tandem duplication of Ren1, mRNA (cDNA clone MGC:19052 IMAGE:4190969), complete cds. // chr1 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// BC011473 // GenBank // Mus musculus renin 2 tandem duplication of Ren1, mRNA (cDNA clone MGC:18521 IMAGE:4165191), complete cds. // chr1 // 52 // 100 // 14 // 27 // 0 /// J00621 // GenBank // Mus musculus renin mRNA, complete cds. // chr1 // 48 // 100 // 13 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:133353524:133360138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000131450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:133367287:133376979:1 gene:ENSMUSG00000070644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000147909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:133363576:133375050:1 gene:ENSMUSG00000070644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// BC145351 // GenBank // Mus musculus ethanolamine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:178915 IMAGE:9053907), complete cds. // chr1 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0 /// NM_175443 // RefSeq // Mus musculus ethanolamine kinase 2 (Etnk2), mRNA. // chr1 // 78 // 78 // 29 // 37 // 1 /// ENSMUST00000135222 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:133363572:133380336:1 gene:ENSMUSG00000070644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 29 // 37 // 1 /// BC152310 // GenBank // Mus musculus ethanolamine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:143480 IMAGE:40089976), complete cds. // chr1 // 78 // 78 // 29 // 37 // 1 /// XM_006529364 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ethanolamine kinase 2 (Etnk2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1 /// ENSMUST00000129213 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:133365332:133380316:1 gene:ENSMUSG00000070644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1 /// AK087818 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330024L16 product:SIMILAR TO HYPOTHETICAL PROTEIN FLJ10761 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1 /// GENSCAN00000052448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:133363110:133379389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000082880 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:133601223:133601355:1 gene:ENSMUSG00000064814 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT002645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK133141 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930598K17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00000183 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT002662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021355 // RefSeq // Mus musculus fibromodulin (Fmod), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134037254:134048277:1 gene:ENSMUSG00000041559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK054183 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230025M14 product:fibromodulin, full insert sequence. // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC064779 // GenBank // Mus musculus fibromodulin, mRNA (cDNA clone MGC:76645 IMAGE:30058603), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134040224:134046625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001284524 // RefSeq // Mus musculus chitinase 1 (chitotriosidase) (Chit1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NM_001284525 // RefSeq // Mus musculus chitinase 1 (chitotriosidase) (Chit1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_027979 // RefSeq // Mus musculus chitinase 1 (chitotriosidase) (Chit1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000086475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134138646:134151539:1 gene:ENSMUSG00000026450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134111242:134151540:1 gene:ENSMUSG00000026450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000160060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134111242:134151540:1 gene:ENSMUSG00000026450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AY458654 // GenBank // Mus musculus chitotriosidase (Chit1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AY536287 // GenBank // Mus musculus chitotriosidase precursor mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC138765 // GenBank // Mus musculus chitinase 1 (chitotriosidase), mRNA (cDNA clone MGC:170392 IMAGE:8861787), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134115250:134189612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_016749 // RefSeq // Mus musculus myosin binding protein H (Mybph), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000038445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134193448:134201231:1 gene:ENSMUSG00000042451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC116684 // GenBank // Mus musculus myosin binding protein H, mRNA (cDNA clone MGC:144855 IMAGE:40106746), complete cds. // chr1 // 85 // 92 // 28 // 33 // 0 /// BC118050 // GenBank // Mus musculus myosin binding protein H, mRNA (cDNA clone MGC:144854 IMAGE:40106744), complete cds. // chr1 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// U68267 // GenBank // Mus musculus myosin binding protein H (MyBP-H) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000191577 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134193457:134201232:1 gene:ENSMUSG00000042451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134193504:134201003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_031189 // RefSeq // Mus musculus myogenin (Myog), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027730 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134289989:134292548:1 gene:ENSMUSG00000026459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048683 // GenBank // Mus musculus myogenin, mRNA (cDNA clone MGC:59257 IMAGE:6516364), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC068019 // GenBank // Mus musculus myogenin, mRNA (cDNA clone MGC:69993 IMAGE:6508229), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D90156 // GenBank // Mus musculus mRNA for myogenin, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134289981:134291795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_173771 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933406M09 gene (4933406M09Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006529559 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4933406M09 gene (4933406M09Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134385940:134390981:1 gene:ENSMUSG00000050526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC116694 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933406M09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144741 IMAGE:40105550), complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC116697 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933406M09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144742 IMAGE:40105553), complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134387889:134390931:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_153128 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 12 (Klhl12), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000027725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134455531:134491018:1 gene:ENSMUSG00000026455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000112232 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134455531:134490873:1 gene:ENSMUSG00000026455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000116528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134455555:134490873:1 gene:ENSMUSG00000026455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC034514 // GenBank // Mus musculus kelch-like 12 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:7076 IMAGE:3157064), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// ENSMUST00000141458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134475280:134485924:1 gene:ENSMUSG00000026455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// ENSMUST00000133721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134455531:134466570:1 gene:ENSMUSG00000026455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000012355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134455515:134489458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0
NM_145510 // RefSeq // Mus musculus RAB interacting factor (Rabif), mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047978 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134494648:134508774:1 gene:ENSMUSG00000042229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC011166 // GenBank // Mus musculus RAB interacting factor, mRNA (cDNA clone MGC:19326 IMAGE:4206804), complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC024808 // GenBank // Mus musculus RAB interacting factor, mRNA (cDNA clone MGC:36632 IMAGE:5356768), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC027243 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3496488, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134494684:134523556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_152895 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 5B (Kdm5b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000047714 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134560171:134635285:1 gene:ENSMUSG00000042207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000112198 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:134560192:134631522:1 gene:ENSMUSG00000042207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK220451 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4034 protein. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY082429 // GenBank // Mus musculus PLU1 (Plu1) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AY082430 // GenBank // Mus musculus PLU1 short form (Plu1) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC048180 // GenBank // Mus musculus jumonji, AT rich interactive domain 1B (Rbp2 like), mRNA (cDNA clone MGC:61207 IMAGE:6826125), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC057318 // GenBank // Mus musculus jumonji, AT rich interactive domain 1B (Rbp2 like), mRNA (cDNA clone MGC:66676 IMAGE:6826125), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000112197 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134560207:134606791:1 gene:ENSMUSG00000042207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// AK163481 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230217H22 product:jumonji, AT rich interactive domain 1B (Rbp2 like), full insert sequence. // chr1 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000012348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134560339:134631374:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_009307 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin II (Syt2), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000121990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134709300:134753149:1 gene:ENSMUSG00000026452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AF257304 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin II (Syt2) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// AK220537 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4194 protein. // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC027019 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin II, mRNA (cDNA clone MGC:36168 IMAGE:5362352), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000188842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134646681:134749417:1 gene:ENSMUSG00000026452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134740852:134747681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0
NM_001278115 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2T (putative) (Ube2t), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_026024 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2T (putative) (Ube2t), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000027687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134962565:134974162:1 gene:ENSMUSG00000026429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC029213 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2T (putative), mRNA (cDNA clone MGC:35683 IMAGE:3591557), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134961154:134976982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENSMUST00000182275 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135108961:135113378:1 gene:ENSMUSG00000097988 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK134881 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430503F05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT002712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_026823 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 8A (Arl8a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135146824:135156269:1 gene:ENSMUSG00000026426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125774 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:135147669:135156269:1 gene:ENSMUSG00000026426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000141177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135154182:135155328:1 gene:ENSMUSG00000026426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AB185207 // GenBank // Mus musculus gie2 mRNA for novel small G protein indispensable for equal chromosome segregation 2, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC018479 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 8A, mRNA (cDNA clone MGC:28025 IMAGE:3661329), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135152082:135154295:1 gene:ENSMUSG00000026426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:135146978:135157718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT002723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT002721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_053106 // RefSeq // Mus musculus leiomodin 1 (smooth muscle) (Lmod1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000059352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135324807:135368065:1 gene:ENSMUSG00000048096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:135317394:135366108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
XR_398895 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4793 (Gm4793), misc_RNA. // chr1 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// ENSMUST00000067468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135584773:135599948:1 gene:ENSMUSG00000054412 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK044378 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930010C09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
NM_007791 // RefSeq // Mus musculus cysteine and glycine-rich protein 1 (Csrp1), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135729147:135752232:1 gene:ENSMUSG00000026421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135720061:135752232:1 gene:ENSMUSG00000026421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF092921 // GenBank // Mus musculus cysteine rich protein 1 (Crp1) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 83 // 21 // 24 // 0 /// BC006912 // GenBank // Mus musculus cysteine and glycine-rich protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:6534 IMAGE:2654089), complete cds. // chr1 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// CT010278 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G1151D for gene Csrp1, Cysteine and glycine-rich protein 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 88 // 55 // 14 // 16 // 0 /// D88793 // GenBank // Mus musculus mRNA for cystein rich protein-1, complete cds. // chr1 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000013556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:135739401:135751120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_013750 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology-like domain, family A, member 3 (Phlda3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135766119:135769136:1 gene:ENSMUSG00000041801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000136445 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:135767134:135768922:1 gene:ENSMUSG00000041801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC023408 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology-like domain, family A, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:30999 IMAGE:5252055), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT002752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_133664 // RefSeq // Mus musculus ladinin (Lad1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135818598:135833342:1 gene:ENSMUSG00000041782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016257 // GenBank // Mus musculus ladinin, mRNA (cDNA clone MGC:28896 IMAGE:4912735), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC025580 // GenBank // Mus musculus ladinin, mRNA (cDNA clone MGC:38271 IMAGE:5325039), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC031131 // GenBank // Mus musculus ladinin, mRNA (cDNA clone MGC:37195 IMAGE:4954891), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000190773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135829995:135832707:1 gene:ENSMUSG00000041782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000013555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:135818979:135870150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENSMUST00000185756 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135830534:135832462:1 gene:ENSMUSG00000041782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001160145 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 9 (Tmem9), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_001160146 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 9 (Tmem9), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_025439 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 9 (Tmem9), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000063719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:136017967:136035024:1 gene:ENSMUSG00000026411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000117950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:136018062:136034292:1 gene:ENSMUSG00000026411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000118832 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:136018015:136035024:1 gene:ENSMUSG00000026411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000140545 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:136033254:136034780:1 gene:ENSMUSG00000026411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000165125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:136008219:136035030:1 gene:ENSMUSG00000026411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC016524 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:27965 IMAGE:3594475), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136018542:136034220:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT002755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0
NM_001270609 // RefSeq // Mus musculus achaete-scute complex homolog 5 (Drosophila) (Ascl5), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000180436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:136050804:136051370:1 gene:ENSMUSG00000097918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136050804:136051370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT002756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001081023 // RefSeq // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, L type, alpha 1S subunit (Cacna1s), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NM_014193 // RefSeq // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, L type, alpha 1S subunit (Cacna1s), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// XM_006529107 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, L type, alpha 1S subunit (Cacna1s), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 64 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000112064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:136052901:136119822:1 gene:ENSMUSG00000026407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000112068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:136052784:136119535:1 gene:ENSMUSG00000026407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000160641 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:136052750:136119530:1 gene:ENSMUSG00000026407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000161865 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:136073554:136119529:1 gene:ENSMUSG00000026407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 38 // 38 // 0 /// L06234 // GenBank // Mus musculus dihydropyridine sensitive skeletal muscle calcium channel mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 98 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000013558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136052901:136179117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0
NM_001039472 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 21B (Kif21b), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSMUST00000075164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:136131389:136177998:1 gene:ENSMUSG00000041642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSMUST00000130864 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:136131430:136177998:1 gene:ENSMUSG00000041642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF202893 // GenBank // Mus musculus Kif21b (Kif21b) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 97 // 35 // 37 // 0 /// ENSMUST00000122892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:136131454:136149993:1 gene:ENSMUSG00000041642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// AK089400 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730023C13 product:KINESIN-LIKE PROTEIN (FRAGMENT) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000013558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136052901:136179117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 34 // 38 // 1
ENSMUST00000129218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:136415271:136417792:1 gene:ENSMUSG00000026404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 52 // 26 // 26 // 0 /// AK013179 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810428G23 product:hypothetical DEAD/DEAH box helicase containing protein, full insert sequence. // chr1 // 93 // 30 // 14 // 15 // 0 /// AK076462 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833411G06 product:RIKEN cDNA 4833411G06 gene, full insert sequence. // chr1 // 100 // 52 // 26 // 26 // 0 /// NM_026500 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 59 (Ddx59), mRNA. // chr1 // 78 // 78 // 39 // 50 // 1 /// ENSMUST00000027655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:136415271:136440158:1 gene:ENSMUSG00000026404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 39 // 50 // 1 /// XM_006529844 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 59 (Ddx59), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 70 // 70 // 35 // 50 // 1 /// BC023840 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 59, mRNA (cDNA clone MGC:35652 IMAGE:5344890), complete cds. // chr1 // 68 // 68 // 34 // 50 // 1 /// GENSCAN00000013548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136416593:136482650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 27 // 50 // 1
NM_001287179 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 14 (Kif14), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006529730 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin family member 14 (Kif14), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006529731 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin family member 14 (Kif14), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000047817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:136467958:136531511:1 gene:ENSMUSG00000041498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AB731728 // GenBank // Mus musculus kif14 mRNA for kinesin family member 14, complete cds, strain: B6. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK087451 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130203M01 product:weakly similar to KIAA0042 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// BC158132 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 14, mRNA (cDNA clone MGC:189899 IMAGE:9007399), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000187963 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:136466343:136495916:1 gene:ENSMUSG00000041498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000189413 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:136467935:136529580:1 gene:ENSMUSG00000041498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136486312:136573761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
ENSMUST00000047817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:136467958:136531511:1 gene:ENSMUSG00000041498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK040122 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430066C23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001160251 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 281 (Zfp281), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_177643 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 281 (Zfp281), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:136624901:136630053:1 gene:ENSMUSG00000041483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:136624901:136630053:1 gene:ENSMUSG00000041483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003243 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 281, mRNA (cDNA clone MGC:7737 IMAGE:3498439), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062153 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 281, mRNA (cDNA clone MGC:70044 IMAGE:6335572), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// CT010200 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F0850D for gene Zfp281, Zinc finger protein 281; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000013543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136607520:136627963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001110251 // RefSeq // Mus musculus hydroxymethylbilane synthase (Hmbs), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// NM_013551 // RefSeq // Mus musculus hydroxymethylbilane synthase (Hmbs), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// ENSMUST00000077353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44336350:44344228:-1 gene:ENSMUSG00000032126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// ENSMUST00000097558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:44336350:44342381:-1 gene:ENSMUSG00000032126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// AK028234 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810449A07 product:hydroxymethylbilane synthase, full insert sequence. // chr1 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// BC003861 // GenBank // Mus musculus hydroxymethylbilane synthase, mRNA (cDNA clone MGC:6604 IMAGE:3487642), complete cds. // chr1 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136793058:136793510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
AK037803 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130050O07 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT002924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029795 // RefSeq // Mus musculus microRNA 181a-1 (Mir181a-1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000083631 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:137966455:137966541:1 gene:ENSMUSG00000065565 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// mmu-mir-181a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000697 Mus musculus miR-181a-1 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT002933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT002934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NR_029820 // RefSeq // Mus musculus microRNA 181b-1 (Mir181b-1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000083524 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:137966639:137966718:1 gene:ENSMUSG00000065458 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000182158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:137966531:137969918:1 gene:ENSMUSG00000098206 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-mir-181b-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000723 Mus musculus miR-181b-1 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT002934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT002935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// NONMMUT002936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_177397 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit G3 (Atp6v1g3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027643 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:138273738:138289460:1 gene:ENSMUSG00000026394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB088359 // GenBank // Mus musculus Atp6g3 mRNA for proton-translocating ATPase G subunit isoform G3, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC107267 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit G3, mRNA (cDNA clone MGC:130213 IMAGE:40052586), complete cds. // chr1 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// BC107268 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit G3, mRNA (cDNA clone MGC:130214 IMAGE:40052587), complete cds. // chr1 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:138273766:138305082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_172643 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 41 homolog (Zbtb41), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006529447 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 41 homolog (Zbtb41), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000039867 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:139422383:139453005:1 gene:ENSMUSG00000033964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC150859 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 41 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:183770 IMAGE:9087770), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:139423151:139447530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_031164 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor XIII, beta subunit (F13b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006529133 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coagulation factor XIII, beta subunit (F13b), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000027615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:139501707:139523756:1 gene:ENSMUSG00000026368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000139080 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:139501707:139513074:1 gene:ENSMUSG00000026368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 89 // 25 // 8 // 9 // 0 /// BC030166 // GenBank // Mus musculus coagulation factor XIII, beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:29126 IMAGE:5051604), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// D10071 // GenBank // Mus musculus mRNA for B subunit of factor XIII, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000039234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:139454932:139523446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT002994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 89 // 25 // 8 // 9 // 0
NM_001081027 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily T, member 2 (Kcnt2), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000060201 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:140246219:140609780:1 gene:ENSMUSG00000052726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000119786 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:140246216:140610079:1 gene:ENSMUSG00000052726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120709 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:140246226:140612063:1 gene:ENSMUSG00000052726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120796 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:140246218:140609782:1 gene:ENSMUSG00000052726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000154966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:140246219:140584412:1 gene:ENSMUSG00000052726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:140246257:140609712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NM_020025 // RefSeq // Mus musculus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 2 (B3galt2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038252 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:143640664:143654614:1 gene:ENSMUSG00000033849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC046322 // GenBank // Mus musculus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:54549 IMAGE:6392262), complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK038860 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230069F01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONMMUT003023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSMUST00000180655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:145183894:145184889:1 gene:ENSMUSG00000097130 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:145183894:145184889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1
ENSMUST00000163646 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:146420436:146421036:1 gene:ENSMUSG00000090323 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000002396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:146358425:146456468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0
NM_011198 // RefSeq // Mus musculus prostaglandin-endoperoxide synthase 2 (Ptgs2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000035065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:150100031:150108227:1 gene:ENSMUSG00000032487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052900 // GenBank // Mus musculus prostaglandin-endoperoxide synthase 2, mRNA (cDNA clone MGC:60582 IMAGE:30059181), complete cds. // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// M64291 // GenBank // Mus musculus prostaglandin synthase mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// M88242 // GenBank // Mouse glucocortoid-regulated inflammatory prostaglandin G/H synthase (griPGHS) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// M94967 // GenBank // Mouse prostaglandin synthase/cyclooxygenase (PGHS-B) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:150100224:150105782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001159730 // RefSeq // Mus musculus phosducin (Pdc), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_024458 // RefSeq // Mus musculus phosducin (Pdc), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006529270 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosducin (Pdc), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000165062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:150319417:150333905:1 gene:ENSMUSG00000006007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012507 // GenBank // Mus musculus phosducin, mRNA (cDNA clone MGC:21589 IMAGE:4500900), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021920 // GenBank // Mus musculus phosducin, mRNA (cDNA clone MGC:28835 IMAGE:4506350), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L08075 // GenBank // Mus musculus domesticus phosducin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185698 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:150319429:150333903:1 gene:ENSMUSG00000006007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186572 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:150319426:150333322:1 gene:ENSMUSG00000006007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000191228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:150319417:150333906:1 gene:ENSMUSG00000006007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:150322329:150333502:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
ENSMUST00000186208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:150549317:150549676:1 gene:ENSMUSG00000101519 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_993996 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 3110040M04 gene (3110040M04Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK014162 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110040M04 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:151210170:151211072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:151198448:151199350:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 100 // 25 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:151192418:151193323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 100 // 27 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:151182610:151183512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:151204163:151205065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000041660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:123558715:123559617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 100 // 27 // 33 // 0 /// NONMMUT003117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0
NM_026876 // RefSeq // Mus musculus tRNA methyltransferase 1 like (Trmt1l), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000065625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:151428542:151458161:1 gene:ENSMUSG00000053286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC110425 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1190005F20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118195 IMAGE:5369595), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC132299 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1190005F20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163930 IMAGE:40130576), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC061491 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 1190005F20 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3498291), with apparent retained intron. // chr1 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// AK148524 // GenBank HTC // Mus musculus adult pancreas islet cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C820017K17 product:hypothetical Zn-finger, C2H2 type containing protein, full insert sequence. // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// ENSMUST00000189655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:151428706:151458161:1 gene:ENSMUSG00000053286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:151435641:151457934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000188843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:151428642:151450941:1 gene:ENSMUSG00000053286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// ENSMUST00000188179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:151428542:151443708:1 gene:ENSMUSG00000053286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_177756 // RefSeq // Mus musculus collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 (Colgalt2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XR_387172 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 (Colgalt2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000044311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:152399830:152510695:1 gene:ENSMUSG00000032649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000127586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:152399830:152509818:1 gene:ENSMUSG00000032649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AK085716 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730024P12 product:hypothetical Glycosyltransferase family 25 containing protein, full insert sequence. // chr1 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// BC068118 // GenBank // Mus musculus glycosyltransferase 25 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:92944 IMAGE:5706069), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:152461958:152508788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_001081197 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 4 (putative) (Apobec4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:152750551:152757544:1 gene:ENSMUSG00000055547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:152756223:152778334:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_026369 // RefSeq // Mus musculus actin related protein 2/3 complex, subunit 5 (Arpc5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006529817 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus actin related protein 2/3 complex, subunit 5 (Arpc5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000077755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:152766542:152775597:1 gene:ENSMUSG00000008475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000097536 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:152766542:152775597:1 gene:ENSMUSG00000008475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// AK181983 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0120F15, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000070063, based on BLAT search. // chr1 // 80 // 59 // 8 // 10 // 0 /// BC060143 // GenBank // Mus musculus actin related protein 2/3 complex, subunit 5, mRNA (cDNA clone MGC:64804 IMAGE:6411792), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000143008 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:152768499:152774395:1 gene:ENSMUSG00000008475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
BC076609 // GenBank // Mus musculus neutrophil cytosolic factor 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:30632602). // chr1 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// NM_010877 // RefSeq // Mus musculus neutrophil cytosolic factor 2 (Ncf2), mRNA. // chr1 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1 /// XM_006529237 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neutrophil cytosolic factor 2 (Ncf2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// ENSMUST00000027754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:152807890:152836990:1 gene:ENSMUSG00000026480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1 /// AB002664 // GenBank // Mus musculus mRNA for p67phox, complete cds. // chr1 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// ENSMUST00000186568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:152800194:152836991:1 gene:ENSMUSG00000026480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_175460 // RefSeq // Mus musculus nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 (Nmnat2), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000043313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:152954998:153119261:1 gene:ENSMUSG00000042751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AK084041 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130079A07 product:hypothetical Nucleotidylyl transferase structure containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AK129155 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0479 protein. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC089007 // GenBank // Mus musculus nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:113818 IMAGE:30532596), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006529456 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 (Nmnat2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// ENSMUST00000186368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:152954993:153119164:1 gene:ENSMUSG00000042751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000186621 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:152955041:153094088:1 gene:ENSMUSG00000042751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:152955109:153115670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// ENSMUST00000185241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:152955274:153076939:1 gene:ENSMUSG00000042751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001033162 // RefSeq // Mus musculus Shc SH2-domain binding protein 1-like (Shcbp1l), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006529876 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Shc SH2-domain binding protein 1-like (Shcbp1l), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000042373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:153425162:153452574:1 gene:ENSMUSG00000042708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC113157 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012A16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130601 IMAGE:40058375), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XR_387195 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Shc SH2-domain binding protein 1-like (Shcbp1l), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// ENSMUST00000136614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153425172:153439937:1 gene:ENSMUSG00000042708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// AK171525 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730226E23 product:similar to GE36 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000016554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:153425224:153452464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0
XR_387195 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Shc SH2-domain binding protein 1-like (Shcbp1l), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000082501 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:153440079:153440218:1 gene:ENSMUSG00000064435 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT003181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_011267 // RefSeq // Mus musculus regulator of G-protein signaling 16 (Rgs16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000027748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:153740349:153745468:1 gene:ENSMUSG00000026475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC010980 // GenBank // Mus musculus regulator of G-protein signaling 16, mRNA (cDNA clone MGC:13876 IMAGE:4020813), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC049968 // GenBank // Mus musculus regulator of G-protein signaling 16, mRNA (cDNA clone MGC:59058 IMAGE:4021479), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC055459 // GenBank // Mus musculus regulator of G-protein signaling 16, mRNA (cDNA clone MGC:65376 IMAGE:4194934), complete cds. // chr1 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// U67189 // GenBank // Mus musculus G protein signaling regulator RGS16 (rgs16) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// U72881 // GenBank // Mus musculus RGS-r protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// U94828 // GenBank // Mus musculus retinally abundant regulator of G-protein signaling mRGS-r (RGS-r) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:153621451:153743855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001008426 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5531 (Gm5531), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000055314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:153874345:153876871:1 gene:ENSMUSG00000043282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_178244 // RefSeq // Mus musculus transmembrane epididymal protein 1 (Teddm1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:153891742:153893058:1 gene:ENSMUSG00000047053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC141344 // GenBank // Mus musculus transmembrane epididymal protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:176305 IMAGE:9055956), complete cds. // chr1 // 79 // 76 // 15 // 19 // 0 /// BC141345 // GenBank // Mus musculus transmembrane epididymal protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:176306 IMAGE:9055957), complete cds. // chr1 // 79 // 76 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:153891792:153892709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0
NM_008131 // RefSeq // Mus musculus glutamate-ammonia ligase (glutamine synthetase) (Glul), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000086199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:153899944:153909723:1 gene:ENSMUSG00000026473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY044241 // GenBank // Mus musculus glutamine synthetase (Glul) mRNA, complete cds. // chr1 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// X16314 // GenBank // M.musculus mRNA for glutamine synthetase. // chr1 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
AK080751 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930039A15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001204908 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 648 (Zfp648), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006529053 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 648 (Zfp648), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XR_387142 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 648 (Zfp648), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000086195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:154201187:154205689:1 gene:ENSMUSG00000066797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:154204097:154205674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_021433 // RefSeq // Mus musculus syntaxin 6 (Stx6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:155158703:155203517:1 gene:ENSMUSG00000026470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF237814 // GenBank // Mus musculus syntaxin 6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK009690 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310039E05 product:syntaxin 6, full insert sequence. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC029205 // GenBank // Mus musculus syntaxin 6, mRNA (cDNA clone MGC:36281 IMAGE:4039560), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006529766 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus syntaxin 6 (Stx6), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000001212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:155187781:155202016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000111757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:156035403:156068861:1 gene:ENSMUSG00000050565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:156035772:156059542:1 gene:ENSMUSG00000050565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AK038024 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130072J07 product:weakly similar to CDNA FLJ13142 FIS, CLONE NT2RP3003212, MODERATELY SIMILAR TO RATTUS NORVEGICUS LAMINA ASSOCIATED POLYPEPTIDE 1C (LAP1C) MRNA [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_172843 // RefSeq // Mus musculus torsin A interacting protein 2 (Tor1aip2), transcript variant 5, mRNA. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NM_001160180 // RefSeq // Mus musculus torsin A interacting protein 2 (Tor1aip2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000111754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:156035726:156053529:1 gene:ENSMUSG00000050565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK042984 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730045E23 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONMMUT003267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_172843 // RefSeq // Mus musculus torsin A interacting protein 2 (Tor1aip2), transcript variant 5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060404 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:156040890:156068861:1 gene:ENSMUSG00000050565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:156035403:156068861:1 gene:ENSMUSG00000050565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK080959 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430218K16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC066790 // GenBank // Mus musculus torsin A interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:76434 IMAGE:30099444), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK038024 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130072J07 product:weakly similar to CDNA FLJ13142 FIS, CLONE NT2RP3003212, MODERATELY SIMILAR TO RATTUS NORVEGICUS LAMINA ASSOCIATED POLYPEPTIDE 1C (LAP1C) MRNA [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:156059554:156065458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_001136104 // RefSeq // Mus musculus v-abl Abelson murine leukemia viral oncogene 2 (arg, Abelson-related gene) (Abl2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_009595 // RefSeq // Mus musculus v-abl Abelson murine leukemia viral oncogene 2 (arg, Abelson-related gene) (Abl2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:156559049:156642716:1 gene:ENSMUSG00000026596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000166172 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:156558987:156649568:1 gene:ENSMUSG00000026596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// DQ084361 // GenBank // Mus musculus ABL2 (Abl2) mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// U40827 // GenBank // Mus musculus tyrosine kinase (arg) mRNA, partial cds. // chr1 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// BC137771 // GenBank // Mus musculus v-abl Abelson murine leukemia viral oncogene homolog 2 (arg, Abelson-related gene), mRNA (cDNA clone MGC:169395 IMAGE:8860790), complete cds. // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// BC144897 // GenBank // Mus musculus v-abl Abelson murine leukemia viral oncogene homolog 2 (arg, Abelson-related gene), mRNA (cDNA clone MGC:178453 IMAGE:9053445), complete cds. // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSMUST00000190749 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:156615923:156629993:1 gene:ENSMUSG00000026596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:156590506:156642716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_028333 // RefSeq // Mus musculus angiopoietin-like 1 (Angptl1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:156838562:156861078:1 gene:ENSMUSG00000033544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111720 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:156838942:156845615:1 gene:ENSMUSG00000033544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AK012888 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810039D03 product:angiopoietin-like 1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC082563 // GenBank // Mus musculus angiopoietin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:100363 IMAGE:30607749), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:156841761:156860602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
AK132966 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930535E06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00000316 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000061537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:157412352:157420236:1 gene:ENSMUSG00000049881 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC055845 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810025M15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67868 IMAGE:3585495), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC055878 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810025M15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:68090 IMAGE:4222031), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000187761 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:157412640:157420233:1 gene:ENSMUSG00000049881 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0
NM_001033284 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC026585 (BC026585), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000046743 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:157458580:157489060:1 gene:ENSMUSG00000033488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC045198 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC026585, mRNA (cDNA clone MGC:49259 IMAGE:5065108), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000119891 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:157458580:157489060:1 gene:ENSMUSG00000033488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000033156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:157454189:157466174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
GENSCAN00000054305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:157596304:157627750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 90 // 14 // 19 // 0
NR_030441 // RefSeq // Mus musculus microRNA 488 (Mir488), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093595 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:158505625:158505733:1 gene:ENSMUSG00000070103 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-488 // miRBase Micro RNA Database // MI0004633 Mus musculus miR-488 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011931 // RefSeq // Mus musculus ring finger and WD repeat domain 2 (Rfwd2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000076894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:159232326:159347580:1 gene:ENSMUSG00000040782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000133472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:103163110:103165407:-1 gene:ENSMUSG00000048949 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 95 // 90 // 41 // 43 // 0 /// AF151110 // GenBank // Mus musculus constitutive photomorphogenic protein (Cop1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// BC082804 // GenBank // Mus musculus ring finger and WD repeat domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:90569 IMAGE:6852010), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC158002 // GenBank // Mus musculus ring finger and WD repeat domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:189811 IMAGE:9007311), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000006843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:103163110:103165407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 90 // 41 // 43 // 0 /// GENSCAN00000007015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:159232438:159418239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 30 // 48 // 1 /// BC034695 // GenBank HTC // Mus musculus G-rich RNA sequence binding factor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3584046), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 60 // 60 // 29 // 48 // 1
GENSCAN00000007015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:159232438:159418239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_022312 // RefSeq // Mus musculus tenascin R (Tnr), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000111669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:159737510:159924397:1 gene:ENSMUSG00000015829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC132392 // GenBank // Mus musculus tenascin R, mRNA (cDNA clone MGC:164023 IMAGE:40130669), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC138043 // GenBank // Mus musculus tenascin R, mRNA (cDNA clone MGC:169667 IMAGE:8861062), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000033881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:159850047:159924213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0
ENSMUST00000097514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:159614749:159684875:1 gene:ENSMUSG00000073528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158557 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230012H24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_025474 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S14 (Mrps14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006496954 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S14 (Mrps14), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000078878 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:160195215:160199820:1 gene:ENSMUSG00000058267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000135680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:160195215:160202170:1 gene:ENSMUSG00000058267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC044057 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S14, mRNA (cDNA clone MGC:54485 IMAGE:6489566), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000097193 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:160195303:160199812:1 gene:ENSMUSG00000058267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1 /// GENSCAN00000033892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:160195267:160199610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0
NM_001024952 // RefSeq // Mus musculus RING CCCH (C3H) domains 1 (Rc3h1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000035911 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:160930024:160967817:1 gene:ENSMUSG00000040423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000161609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:160906418:160974978:1 gene:ENSMUSG00000040423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AY948287 // GenBank // Mus musculus roquin (Rc3h1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC138663 // GenBank // Mus musculus RING CCCH (C3H) domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:170289 IMAGE:8861684), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000001609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:160898571:160989838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0
NM_001024952 // RefSeq // Mus musculus RING CCCH (C3H) domains 1 (Rc3h1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000161609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:160906418:160974978:1 gene:ENSMUSG00000040423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT003402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_080844 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade C (antithrombin), member 1 (Serpinc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000064725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:160978606:161003010:1 gene:ENSMUSG00000026715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC019447 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade C (antithrombin), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:30300 IMAGE:5125534), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC033377 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade C (antithrombin), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:29925 IMAGE:5123932), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:160992853:161002463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000001609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:160898571:160989838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NR_002840 // RefSeq // Mus musculus growth arrest specific 5 (Gas5), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082506 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:161035394:161035473:1 gene:ENSMUSG00000064440 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161229 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161035166:161038539:1 gene:ENSMUSG00000053332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GAS5 // lncRNA Db // mm9 chr1:162,965,297-162,968,668 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0
NR_002840 // RefSeq // Mus musculus growth arrest specific 5 (Gas5), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082882 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:161036057:161036139:1 gene:ENSMUSG00000064816 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161035188:161038539:1 gene:ENSMUSG00000053332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161036020:161036888:1 gene:ENSMUSG00000053332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161229 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161035166:161038539:1 gene:ENSMUSG00000053332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162163 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161035184:161038539:1 gene:ENSMUSG00000053332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GAS5 // lncRNA Db // mm9 chr1:162,965,297-162,968,668 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083801 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:161037601:161037681:1 gene:ENSMUSG00000065735 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162289 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161035163:161038533:1 gene:ENSMUSG00000053332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GAS5 // lncRNA Db // mm9 chr1:162,965,297-162,968,668 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_028543 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 47 (Snord47), small nucleolar RNA. // chr1 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// ENSMUST00000083034 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:161038082:161038158:1 gene:ENSMUSG00000064968 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161037718:161038537:1 gene:ENSMUSG00000053332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161037309:161038125:1 gene:ENSMUSG00000053332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// FM991905 // GenBank // Mus musculus D47 snoRNA, strain C57BL/6J. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GAS5 // lncRNA Db // mm9 chr1:162,965,297-162,968,668 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// NONMMUT003436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000083294 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:161038308:161038383:1 gene:ENSMUSG00000065228 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000159399 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161037288:161038532:1 gene:ENSMUSG00000053332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000160516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161037781:161038539:1 gene:ENSMUSG00000053332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000160551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161037353:161038535:1 gene:ENSMUSG00000053332 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FM991906 // GenBank // Mus musculus D81 snoRNA, strain C57BL/6J. // chr1 // 82 // 93 // 23 // 28 // 0 /// GAS5 // lncRNA Db // mm9 chr1:162,965,297-162,968,668 // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT003435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT003440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT003442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_028664 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 45 (Ankrd45), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006497001 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 45 (Ankrd45), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000052245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:161142767:161164191:1 gene:ENSMUSG00000044835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000111608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161142712:161169106:1 gene:ENSMUSG00000044835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125018 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161142691:161163295:1 gene:ENSMUSG00000044835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// AK016757 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933409K03 product:hypothetical Heat shock protein hsp70/Ankyrin-repeat/Yeast DNA-binding domain containing protein, full insert sequence. // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC049713 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 45, mRNA (cDNA clone MGC:58667 IMAGE:6741553), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161142712:161164215:1 gene:ENSMUSG00000044835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:161150993:161233651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000001633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:161150993:161233651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 85 // 15 // 17 // 0
GENSCAN00000001633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:161150993:161233651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_009452 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 4 (Tnfsf4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:161395409:161418410:1 gene:ENSMUSG00000026700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ176943 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily member 4 (Tnfsf4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// U12763 // GenBank // Mus musculus OX40 ligand (ox40l) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:161295739:161417338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_183391 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18 (Tnfsf18), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000086084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:161494655:161505290:1 gene:ENSMUSG00000066755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AJ577579 // GenBank // Mus musculus mRNA for GITR ligand (tnfsf 18 gene), first splice variant. // chr1 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// AJ577580 // GenBank // Mus musculus mRNA for GITR ligand (tnfsf 18 gene), second splice variant. // chr1 // 86 // 81 // 19 // 22 // 0 /// AY234223 // GenBank // Mus musculus GITR ligand (Tnfsf18) mRNA, complete cds. // chr1 // 80 // 74 // 16 // 20 // 0 /// AY267900 // GenBank // Mus musculus GITR ligand mRNA, complete cds. // chr1 // 79 // 70 // 15 // 19 // 0 /// AY320040 // GenBank // Mus musculus GITR ligand mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AY359852 // GenBank // Mus musculus glucocorticoid-induced-tumor necrosis factor receptor ligand (Gitrl) mRNA, complete cds. // chr1 // 79 // 70 // 15 // 19 // 0 /// BC137814 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:169438 IMAGE:8860833), complete cds. // chr1 // 82 // 81 // 18 // 22 // 0 /// BC137815 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:169439 IMAGE:8860834), complete cds. // chr1 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0
NM_001039045 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class C (Pigc), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_026078 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class C (Pigc), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000028021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:161969188:161972330:1 gene:ENSMUSG00000026698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000111594 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:161969186:161973435:1 gene:ENSMUSG00000026698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK016394 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930595A14 product:PHOSPHATIDYLINOSITOL-GLYCAN BIOSYNTHESIS, CLASS C PROTEIN (PIG-C) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 87 // 58 // 13 // 15 // 0 /// BC006938 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class C, mRNA (cDNA clone MGC:6508 IMAGE:2649047), complete cds. // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000028169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:161953441:161989693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NR_002870 // RefSeq // Mus musculus dynamin 3, opposite strand (Dnm3os), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000139662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:162217623:162225550:1 gene:ENSMUSG00000078190 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000178978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:162217623:162225548:1 gene:ENSMUSG00000078190 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT003483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000159707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:162477680:162479943:1 gene:ENSMUSG00000066752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK029767 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930539E22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010865 // RefSeq // Mus musculus myocilin (Myoc), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:162639150:162649693:1 gene:ENSMUSG00000026697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB013592 // GenBank // Mus musculus mRNA for myocilin, complete cds. // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// AF039869 // GenBank // Mus musculus trabecular meshwork-induced glucocorticoid response protein (TIGR) mRNA, complete cds. // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC125329 // GenBank // Mus musculus myocilin, mRNA (cDNA clone MGC:159032 IMAGE:40129844), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC137606 // GenBank // Mus musculus myocilin, mRNA (cDNA clone MGC:169230 IMAGE:8860625), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:162639264:162649201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000191040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:163623793:163624678:1 gene:ENSMUSG00000102117 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:163623793:163624681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_010629 // RefSeq // Mus musculus kinesin-associated protein 3 (Kifap3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006496681 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin-associated protein 3 (Kifap3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000027877 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:163779583:163917109:1 gene:ENSMUSG00000026585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000077642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:163779583:163917109:1 gene:ENSMUSG00000026585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC040362 // GenBank // Mus musculus kinesin-associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:25312 IMAGE:4506177), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC049100 // GenBank // Mus musculus kinesin-associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:61298 IMAGE:5698182), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// D50366 // GenBank // Mus musculus mRNA for KAP3A, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// D50367 // GenBank // Mus musculus mRNA for KAP3B, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000012946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:163848711:163940144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 34 // 34 // 15 // 44 // 1 /// GENSCAN00000012951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:163741857:163837501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1
NM_027279 // RefSeq // Mus musculus methyltransferase like 18 (Mettl18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:163994889:163997243:1 gene:ENSMUSG00000041396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:163994889:163997243:1 gene:ENSMUSG00000041396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC050143 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810422O20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:60987 IMAGE:30016117), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052693 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810422O20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:64695 IMAGE:5714638), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:163996112:163997200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_011345 // RefSeq // Mus musculus selectin, endothelial cell (Sele), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:164048234:164057677:1 gene:ENSMUSG00000026582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC119083 // GenBank // Mus musculus selectin, endothelial cell, mRNA (cDNA clone MGC:155399 IMAGE:8733832), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC120795 // GenBank // Mus musculus selectin, endothelial cell, mRNA (cDNA clone MGC:156032 IMAGE:40129718), complete cds. // chr1 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// M87862 // GenBank // Mus musculus E-selectin protein mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:164043809:164147322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1
NM_001164059 // RefSeq // Mus musculus selectin, lymphocyte (Sell), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NM_011346 // RefSeq // Mus musculus selectin, lymphocyte (Sell), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:164062076:164080782:1 gene:ENSMUSG00000026581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000097491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:164062076:164080785:1 gene:ENSMUSG00000026581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC052681 // GenBank // Mus musculus selectin, lymphocyte, mRNA (cDNA clone MGC:60578 IMAGE:30072021), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// M25324 // GenBank // Mouse peripheral lymph node-specific homing receptor (MEL-14 antigen) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// M36005 // GenBank // Mouse lymph node homing receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// M36058 // GenBank // Mouse lymph node homing receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// XM_006496718 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus selectin, lymphocyte (Sell), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// AB353767 // GenBank // Mus musculus Sell mRNA for L-selectin isoform v1, complete cds. // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// AB353768 // GenBank // Mus musculus Sell mRNA for L-selectin isoform v2, complete cds. // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000012948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:164043809:164147322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_007976 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor V (F5), mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000086040 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:164151838:164220277:1 gene:ENSMUSG00000026579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// U52925 // GenBank // Mus musculus coagulation factor V mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:164151963:164219524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_029115 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 181 (Ccdc181), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027867 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:164275585:164287847:1 gene:ENSMUSG00000026578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048086 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930455F23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:56955 IMAGE:6390120), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:164248563:164287669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_019759 // RefSeq // Mus musculus dermatopontin (Dpt), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:164796732:164824266:1 gene:ENSMUSG00000026574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF143374 // GenBank // Mus musculus early quiescence protein-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK019890 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5033416F05 product:dermatopontin, full insert sequence. // chr1 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC046420 // GenBank // Mus musculus dermatopontin, mRNA (cDNA clone MGC:51504 IMAGE:4165966), complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:164796732:164823236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001081126 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 161 (Gpr161), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006496852 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 161 (Gpr161), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:165302625:165322930:1 gene:ENSMUSG00000040836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000178700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:165301863:165322930:1 gene:ENSMUSG00000040836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137659 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 161, mRNA (cDNA clone MGC:169283 IMAGE:8860678), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF197953 // GenBank // Mus musculus orphan G protein coupled receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:165243363:165323817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_027430 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial pyruvate carrier 2 (Mpc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000027853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:165461037:165481214:1 gene:ENSMUSG00000026568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC018324 // GenBank // Mus musculus brain protein 44, mRNA (cDNA clone MGC:7857 IMAGE:3501265), complete cds. // chr1 // 76 // 89 // 13 // 17 // 0 /// ENSMUST00000138999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:165478142:165481119:1 gene:ENSMUSG00000026568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1 /// GENSCAN00000005839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:165460332:165552177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// NONMMUT003610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1
GENSCAN00000005839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:165460332:165552177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_011804 // RefSeq // Mus musculus cellular repressor of E1A-stimulated genes 1 (Creg1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496930 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cellular repressor of E1A-stimulated genes 1 (Creg1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000040298 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:165769476:165773918:1 gene:ENSMUSG00000040713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// ENSMUST00000111432 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:165763746:165775308:1 gene:ENSMUSG00000040713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:165763746:165775308:1 gene:ENSMUSG00000040713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF084524 // GenBank // Mus musculus cellular repressor of E1A-stimulated genes CREG mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC027426 // GenBank // Mus musculus cellular repressor of E1A-stimulated genes 1, mRNA (cDNA clone MGC:36084 IMAGE:3670649), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK219109 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0147G06, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000040298, based on BLAT search. // chr1 // 69 // 52 // 9 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:165769242:165781803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_021610 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein A33 (transmembrane) (Gpa33), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027847 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:166130417:166154136:1 gene:ENSMUSG00000000544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000060833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:166130238:166166510:1 gene:ENSMUSG00000000544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000166159 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:166130340:166157529:1 gene:ENSMUSG00000000544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 28 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000166860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:166130467:166166509:1 gene:ENSMUSG00000000544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 81 // 24 // 26 // 0 /// AF247659 // GenBank // Mus musculus transmembrane glycoprotein A33 antigen mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AK008784 // GenBank HTC // Mus musculus adult male stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2210401D16 product:glycoprotein A33 (transmembrane), full insert sequence. // chr1 // 79 // 44 // 11 // 14 // 0 /// BC008528 // GenBank // Mus musculus glycoprotein A33 (transmembrane), mRNA (cDNA clone MGC:6755 IMAGE:3593917), complete cds. // chr1 // 85 // 81 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:166140371:166168498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0
NM_001164528 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin-like domain containing receptor 2 (Ildr2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000111416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:166254139:166316823:1 gene:ENSMUSG00000040612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FJ024494 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c Lisch-like isoform 1 (Ll) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FJ024495 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2J Lisch-like isoform 1 (Ll) mRNA, complete cds. // chr1 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// FJ024496 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2J Lisch-like isoform 2 (Ll) mRNA, complete cds. // chr1 // 81 // 84 // 21 // 26 // 0 /// FJ024498 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2J Lisch-like isoform 4 (Ll) mRNA, complete cds. // chr1 // 79 // 94 // 23 // 29 // 0 /// FJ024499 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2J Lisch-like isoform 5 (Ll) mRNA, complete cds. // chr1 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// FJ024500 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2J Lisch-like isoform 6 (Ll) mRNA, complete cds. // chr1 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// FJ024497 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2J Lisch-like isoform 3 (Ll) mRNA, complete cds. // chr1 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// GENSCAN00000014078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:166250606:166365782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_030245 // RefSeq // Mus musculus transcriptional adaptor 1 (Tada1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:166379097:166393621:1 gene:ENSMUSG00000026563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132817 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:166379339:166382470:1 gene:ENSMUSG00000026563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000138148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:166379317:166388928:1 gene:ENSMUSG00000026563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC002307 // GenBank // Mus musculus transcriptional adaptor 1 (HFI1 homolog, yeast) like, mRNA (cDNA clone MGC:8251 IMAGE:3592046), complete cds. // chr1 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// BC027337 // GenBank // Mus musculus transcriptional adaptor 1 (HFI1 homolog, yeast) like, mRNA (cDNA clone MGC:28254 IMAGE:3995355), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138284 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:166379324:166384108:1 gene:ENSMUSG00000026563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// AK050649 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920028M06 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:166379403:166392720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001039483 // RefSeq // Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 1 (Tmco1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:167308670:167333978:1 gene:ENSMUSG00000052428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK015068 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930403O06 product:MEMBRANE PROTEIN (PUTATIVE MEMBRANE PROTEIN) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// BC011457 // GenBank // Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:7976 IMAGE:3585288), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC019761 // GenBank // Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:30289 IMAGE:5009960), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC020098 // GenBank // Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:28362 IMAGE:4019484), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:167308864:167368473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_019993 // RefSeq // Mus musculus aldehyde dehydrogenase 9, subfamily A1 (Aldh9a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006496950 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aldehyde dehydrogenase 9, subfamily A1 (Aldh9a1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000028004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:167349991:167368530:1 gene:ENSMUSG00000026687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB296386 // GenBank // Mus musculus ABALDH mRNA for gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AF170919 // GenBank // Mus musculus 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase (Tmabadh) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC003297 // GenBank // Mus musculus aldehyde dehydrogenase 9, subfamily A1, mRNA (cDNA clone MGC:6698 IMAGE:3583976), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:167308864:167368473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_001159731 // RefSeq // Mus musculus retinoid X receptor gamma (Rxrg), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NM_009107 // RefSeq // Mus musculus retinoid X receptor gamma (Rxrg), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000015987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:167598384:167639623:1 gene:ENSMUSG00000015843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000111380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:167618309:167639621:1 gene:ENSMUSG00000015843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000111384 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:167598480:167639618:1 gene:ENSMUSG00000015843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000111386 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:167598460:167639424:1 gene:ENSMUSG00000015843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// BC058401 // GenBank // Mus musculus retinoid X receptor gamma, mRNA (cDNA clone MGC:67123 IMAGE:5707723), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M84819 // GenBank // Mouse retinoid X receptor gamma (RXR-gamma) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:167551556:167639273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_033652 // RefSeq // Mus musculus LIM homeobox transcription factor 1 alpha (Lmx1a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000028003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:167689557:167848741:1 gene:ENSMUSG00000026686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000111377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:167689237:167848741:1 gene:ENSMUSG00000026686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF226662 // GenBank // Mus musculus lim homeodomain-containing transcription factor (Lmx1a) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC109167 // GenBank // Mus musculus LIM homeobox transcription factor 1 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:129356 IMAGE:40048180), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC109168 // GenBank // Mus musculus LIM homeobox transcription factor 1 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:129357 IMAGE:40048181), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000038640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:167756564:167846761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_009063 // RefSeq // Mus musculus regulator of G-protein signaling 5 (Rgs5), mRNA. // chr1 // 100 // 47 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:169655501:169695813:1 gene:ENSMUSG00000026678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// BC037683 // GenBank // Mus musculus regulator of G-protein signaling 5, mRNA (cDNA clone MGC:46953 IMAGE:3962083), complete cds. // chr1 // 96 // 47 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000152809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:169655522:169683949:1 gene:ENSMUSG00000026678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 25 // 25 // 14 // 55 // 1 /// U67188 // GenBank // Mus musculus G protein signaling regulator RGS5 (rgs5) mRNA, complete cds. // chr1 // 35 // 35 // 19 // 55 // 1 /// GENSCAN00000046067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:169605742:169703372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 16 // 55 // 1 /// NONMMUT003718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 25 // 25 // 14 // 55 // 1
ENSMUST00000027997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:169655501:169695813:1 gene:ENSMUSG00000026678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033185 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700084C01 gene (1700084C01Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006497037 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700084C01 gene (1700084C01Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000094348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:169928648:169934653:1 gene:ENSMUSG00000070532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000175731 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:169929929:169934378:1 gene:ENSMUSG00000070532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC150846 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700084C01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183757 IMAGE:9087757), complete cds. // chr1 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// BC172001 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700084C01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:198706 IMAGE:9054287), complete cds. // chr1 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:169840222:169934200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
ENSMUST00000159201 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:170214860:170215556:1 gene:ENSMUSG00000044306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AK015669 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930500M09 product:hypothetical HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain (A+T-hook) containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001033499 // RefSeq // Mus musculus SH2 domain protein 1B2 (Sh2d1b2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006543564 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH2 domain protein 1B2 (Sh2d1b2), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000097470 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:170232777:170251653:1 gene:ENSMUSG00000073494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000162752 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:170232749:170253608:1 gene:ENSMUSG00000073494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// DQ131181 // GenBank // Mus musculus EAT-2B (Sh2d1c) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// DQ140178 // GenBank // Mus musculus EAT-2-related transducer mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000056991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:170308803:170312125:1 gene:ENSMUSG00000042800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC099563 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700015E13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118338 IMAGE:30916762), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// BC132313 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700015E13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163944 IMAGE:40130590), complete cds. // chr1 // 85 // 72 // 22 // 26 // 0 /// BC132315 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700015E13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163946 IMAGE:40130592), complete cds. // chr1 // 81 // 72 // 21 // 26 // 0
AK046282 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230364I19 product:hypothetical Glycine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000036964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:170630948:170631391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0
NM_177068 // RefSeq // Mus musculus olfactomedin-like 2B (Olfml2b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000046792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:170644532:170682789:1 gene:ENSMUSG00000038463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC025654 // GenBank // Mus musculus olfactomedin-like 2B, mRNA (cDNA clone MGC:38296 IMAGE:5342879), complete cds. // chr1 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000036999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:170644922:170682325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000171747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:170868645:170881721:1 gene:ENSMUSG00000053925 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK089343 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730011C10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// KnowTID_00000341 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK051986 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230030O20 product:dual specificity phosphatase 12, full insert sequence. // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT003749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000180542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:170885065:170885881:1 gene:ENSMUSG00000096968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK010841 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2500001D14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_006535833 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MLV-related proviral Env polyprotein-like (LOC101056102), partial mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// AK161191 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4832423A03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
XR_399068 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638466 (LOC102638466), ncRNA. // chr1 // 67 // 96 // 16 // 24 // 0 /// AK154426 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630030N20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// KnowTID_00000342 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_144559 // RefSeq // Mus musculus Fc receptor, IgG, low affinity IV (Fcgr4), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:171018920:171029761:1 gene:ENSMUSG00000059089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF499613 // GenBank // Mus musculus transmembrane receptor CD16-2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC027310 // GenBank // Mus musculus Fc receptor, IgG, low affinity IV, mRNA (cDNA clone MGC:28049 IMAGE:3674499), complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// EU050648 // GenBank // Mus musculus strain NOD/LtJ Fc gamma RIIIa receptor (Fcgr4) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000037006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:171017227:171044547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_008623 // RefSeq // Mus musculus myelin protein zero (Mpz), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000070758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:171150711:171161130:1 gene:ENSMUSG00000056569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000111334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:171155515:171160507:1 gene:ENSMUSG00000056569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AK089180 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630016F01 product:myelin protein zero, full insert sequence. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC139139 // GenBank // Mus musculus myelin protein zero, mRNA (cDNA clone MGC:170766 IMAGE:8862161), complete cds. // chr1 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// BC141226 // GenBank // Mus musculus myelin protein zero, mRNA (cDNA clone MGC:176187 IMAGE:9055838), complete cds. // chr1 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:171155582:171160235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0
NM_013474 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein A-II (Apoa2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000005824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:171225082:171226378:1 gene:ENSMUSG00000005681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111319 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:171225091:171226337:1 gene:ENSMUSG00000005681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:171225084:171226373:1 gene:ENSMUSG00000005681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000111321 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:171225054:171226379:1 gene:ENSMUSG00000005681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC031786 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein A-II, mRNA (cDNA clone MGC:18589 IMAGE:4195958), complete cds. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// M79361 // GenBank // Mouse apolipoprotein A-II mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// S79794 // GenBank // Mus musculus APOAII (ApoAII) mRNA, complete cds. // chr1 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// M79362 // GenBank // Mouse apolipoprotein A-II mRNA, complete cds. // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:171225315:171226266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_172845 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 4 (Adamts4), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000006570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:171250423:171260636:1 gene:ENSMUSG00000006403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000111314 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:171252116:171260637:1 gene:ENSMUSG00000006403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000111315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:171250421:171260637:1 gene:ENSMUSG00000006403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK076295 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4632427F01 product:a disintegrin-like and metalloprotease (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 4, full insert sequence. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AK173001 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0688 protein. // chr1 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// BC027773 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 4, mRNA (cDNA clone MGC:38401 IMAGE:5345809), complete cds. // chr1 // 89 // 82 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:171250849:171276379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1
NM_011070 // RefSeq // Mus musculus prefoldin 2 (Pfdn2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000006579 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:171345730:171358402:1 gene:ENSMUSG00000006412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000135941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:171345670:171359254:1 gene:ENSMUSG00000006412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000138323 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:171356390:171357970:1 gene:ENSMUSG00000006412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC026839 // GenBank // Mus musculus prefoldin 2, mRNA (cDNA clone MGC:25898 IMAGE:4219635), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC049606 // GenBank // Mus musculus prefoldin 2, mRNA (cDNA clone MGC:58274 IMAGE:6535749), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:171345712:171358026:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0
NM_001122680 // RefSeq // Mus musculus poliovirus receptor-related 4 (Pvrl4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_027893 // RefSeq // Mus musculus poliovirus receptor-related 4 (Pvrl4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000006578 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:171370352:171388598:1 gene:ENSMUSG00000006411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000094325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:171370355:171388285:1 gene:ENSMUSG00000006411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000111286 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:171370099:171388287:1 gene:ENSMUSG00000006411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF472510 // GenBank // Mus musculus nectin 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// BC024948 // GenBank // Mus musculus poliovirus receptor-related 4, mRNA (cDNA clone MGC:28105 IMAGE:3966993), complete cds. // chr1 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:171362862:171386805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001005508 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 30 (Arhgap30), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000056449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:171388954:171410240:1 gene:ENSMUSG00000048865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000131607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:171388954:171410240:1 gene:ENSMUSG00000048865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000135312 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:171388954:171410298:1 gene:ENSMUSG00000048865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC082573 // GenBank // Mus musculus Rho GTPase activating protein 30, mRNA (cDNA clone MGC:99989 IMAGE:30548035), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000189270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:171388960:171410237:1 gene:ENSMUSG00000100327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:171389267:171418121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_009480 // RefSeq // Mus musculus upstream transcription factor 1 (Usf1), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// XM_006496748 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus upstream transcription factor 1 (Usf1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000160486 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:171411384:171418757:1 gene:ENSMUSG00000026641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000161241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:171411313:171419142:1 gene:ENSMUSG00000026641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000167546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:171411681:171418743:1 gene:ENSMUSG00000026641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// AK142437 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530007I20 product:upstream transcription factor 1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// BC049784 // GenBank // Mus musculus upstream transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:59374 IMAGE:6506829), complete cds. // chr1 // 73 // 94 // 11 // 15 // 0
NM_172647 // RefSeq // Mus musculus F11 receptor (F11r), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000043839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:171437535:171464603:1 gene:ENSMUSG00000038235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000144497 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:171437579:171460846:1 gene:ENSMUSG00000038235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// BC021876 // GenBank // Mus musculus F11 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:18960 IMAGE:3985305), complete cds. // chr1 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// CT010347 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836H0252D for gene F11r, F11 receptor; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:171438460:171463195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 62 // 20 // 21 // 0 /// NONMMUT003796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// U89915 // GenBank // Mus musculus junctional adhesion molecule (Jam) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0
NM_019484 // RefSeq // Mus musculus Aly/REF export factor 2 (Alyref2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000081527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:171503478:171504750:1 gene:ENSMUSG00000060244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC099405 // GenBank // Mus musculus RNA and export factor binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:117570 IMAGE:30846460), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
ENSMUST00000043170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:171515233:171516922:1 gene:ENSMUSG00000038218 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT003801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:171503657:171515764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_007649 // RefSeq // Mus musculus CD48 antigen (Cd48), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:171682010:171705249:1 gene:ENSMUSG00000015355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB196820 // GenBank // Mus musculus Cd48 mRNA for CD48, complete cds, strain: MRL/MpJ. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AB196821 // GenBank // Mus musculus Cd48 mRNA for CD48, complete cds, strain: NZB/BlNJ. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AB196822 // GenBank // Mus musculus Cd48 mRNA for CD48, complete cds, strain: NZW/LacJ. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AB196823 // GenBank // Mus musculus Cd48 mRNA for CD48, complete cds, strain: BXSB/MpJ. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC060977 // GenBank // Mus musculus CD48 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:74071 IMAGE:30296173), complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// XM_006496636 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD48 antigen (Cd48), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// ENSMUST00000015499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:171682009:171705258:1 gene:ENSMUSG00000015355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// AK088027 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430002H24 product:CD48 antigen, full insert sequence. // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000012710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:171673157:171699670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000097466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:171895664:171898237:1 gene:ENSMUSG00000073492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK143847 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430205G17 product:hypothetical Leucine-rich region profile/Serine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_153555 // RefSeq // Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 8 (Dcaf8), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// XM_006497066 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 8 (Dcaf8), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000074144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:172148015:172196393:1 gene:ENSMUSG00000026554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// AK047316 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930048P18 product:DNA segment, Chr 1, University of California at Los Angeles 4, full insert sequence. // chr1 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// BC023704 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 42A, mRNA (cDNA clone MGC:38390 IMAGE:5345701), complete cds. // chr1 // 93 // 74 // 26 // 28 // 0 /// BC023804 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 42A, mRNA (cDNA clone MGC:38511 IMAGE:5352941), complete cds. // chr1 // 94 // 84 // 30 // 32 // 0 /// BC078641 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 42A, mRNA (cDNA clone IMAGE:6512345). // chr1 // 86 // 95 // 31 // 36 // 0 /// AK162622 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830113F16 product:Similar to H326 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// AK164799 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730050D15 product:Similar to H326 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1 /// GENSCAN00000012701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:172172355:172194672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0
NM_001039484 // RefSeq // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10 (Kcnj10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496677 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10 (Kcnj10), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000056136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:172341210:172374085:1 gene:ENSMUSG00000044708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB039879 // GenBank // Mus musculus mRNA for ATP-dependent inward rectifier potassium channel Kir4.1, complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AF322631 // GenBank // Mus musculus inward rectifier potassium channel KIR4.1 (Kcnj10) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC141088 // GenBank // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:176049 IMAGE:9055700), complete cds. // chr1 // 64 // 56 // 9 // 14 // 0 /// NONMMUT003835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_026234 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class M (Pigm), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:172376531:172384099:1 gene:ENSMUSG00000050229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC005650 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class M, mRNA (cDNA clone MGC:7173 IMAGE:3257474), complete cds. // chr1 // 75 // 80 // 15 // 20 // 0 /// BC083115 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class M, mRNA (cDNA clone MGC:103072 IMAGE:5364341), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_029612 // RefSeq // Mus musculus SLAM family member 9 (Slamf9), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006497067 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SLAM family member 9 (Slamf9), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// XM_006497068 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SLAM family member 9 (Slamf9), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000027830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:172475358:172478575:1 gene:ENSMUSG00000026548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB196824 // GenBank // Mus musculus Cd84-h1 mRNA for CD84-H1, complete cds, strain: MRL/MpJ. // chr1 // 88 // 57 // 14 // 16 // 0 /// AB196825 // GenBank // Mus musculus Cd84-h1 mRNA for CD84-H1, complete cds, strain: NZB/BlNJ. // chr1 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// AB196826 // GenBank // Mus musculus Cd84-h1 mRNA for CD84-H1, complete cds, strain: NZW/LacJ. // chr1 // 88 // 57 // 14 // 16 // 0 /// AB196827 // GenBank // Mus musculus Cd84-h1 mRNA for CD84-H1, complete cds, strain: BXSB/MpJ. // chr1 // 88 // 57 // 14 // 16 // 0 /// BC019477 // GenBank // Mus musculus SLAM family member 9, mRNA (cDNA clone MGC:27531 IMAGE:4458767), complete cds. // chr1 // 87 // 82 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:172475497:172506708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_178598 // RefSeq // Mus musculus transgelin 2 (Tagln2), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111228 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:172501252:172506733:1 gene:ENSMUSG00000026547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000111230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:172500047:172507380:1 gene:ENSMUSG00000026547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF149291 // GenBank // Mus musculus transgelin mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// AF465519 // GenBank // Mus musculus SM22beta mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC009076 // GenBank // Mus musculus transgelin 2, mRNA (cDNA clone MGC:6300 IMAGE:2654381), complete cds. // chr1 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// BC049861 // GenBank // Mus musculus transgelin 2, mRNA (cDNA clone MGC:55042 IMAGE:4981433), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000138296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:172500047:172505934:1 gene:ENSMUSG00000026547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000012699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:172475497:172506708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONMMUT003852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_027972 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 19 (Ccdc19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000085894 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:172521044:172545870:1 gene:ENSMUSG00000026546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC150929 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:183840 IMAGE:9087840), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC151048 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:183961 IMAGE:9087961), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// BC151055 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:183968 IMAGE:9087968), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// ENSMUST00000159395 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:172526410:172532685:1 gene:ENSMUSG00000026546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// ENSMUST00000159792 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:172526049:172532685:1 gene:ENSMUSG00000026546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// ENSMUST00000160531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:172521136:172532731:1 gene:ENSMUSG00000026546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000017809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:172533988:172547415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:172527745:172533509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_177723 // RefSeq // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 8 (Vsig8), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NR_027644 // RefSeq // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 8 (Vsig8), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006496856 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 8 (Vsig8), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000061835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:172555938:172563717:1 gene:ENSMUSG00000049598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000177086 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:172559906:172563716:1 gene:ENSMUSG00000049598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC064106 // GenBank // Mus musculus V-set and immunoglobulin domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:73808 IMAGE:1528324), complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:172551178:172563304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NM_007768 // RefSeq // Mus musculus C-reactive protein, pentraxin-related (Crp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:172698056:172699966:1 gene:ENSMUSG00000037942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011124 // GenBank // Mus musculus C-reactive protein, pentraxin-related, mRNA (cDNA clone MGC:18634 IMAGE:4195658), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_008763 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 16 (Olfr16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:172956768:172957817:1 gene:ENSMUSG00000037924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119298 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 16, mRNA (cDNA clone MGC:155614 IMAGE:8734047), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC119300 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 16, mRNA (cDNA clone MGC:155616 IMAGE:8734049), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:172956797:172957726:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000085885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:173150131:173150372:1 gene:ENSMUSG00000066680 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// NONMMUT003866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001001809 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 218 (Olfr218), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:173203358:173204299:1 gene:ENSMUSG00000046643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104291 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 218, mRNA (cDNA clone MGC:129219 IMAGE:40042773), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:173200290:173204299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146881 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1404 (Olfr1404), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:173215607:173216640:1 gene:ENSMUSG00000049456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120856 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1404, mRNA (cDNA clone MGC:156093 IMAGE:40129779), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:173215653:173216594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146651 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 418, pseudogene 1 (Olfr418-ps1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:173270147:173271137:1 gene:ENSMUSG00000049605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119223 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1403, mRNA (cDNA clone MGC:155539 IMAGE:8733972), complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:173270177:173271109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175026 // RefSeq // Mus musculus pyrin and HIN domain family, member 1 (Pyhin1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000056071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:173630859:173647928:1 gene:ENSMUSG00000043263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC096384 // GenBank // Mus musculus pyrin and HIN domain family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:106299 IMAGE:30752094), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC107378 // GenBank // Mus musculus pyrin and HIN domain family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:130358 IMAGE:40056703), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// BC107379 // GenBank // Mus musculus pyrin and HIN domain family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:130359 IMAGE:40056704), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000023956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:173637306:173716076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0
NM_001162938 // RefSeq // Mus musculus pyrin domain containing 3 (Pydc3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000085876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:173673680:173698392:1 gene:ENSMUSG00000066677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000169857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:173677686:173697467:1 gene:ENSMUSG00000066677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000023956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:173637306:173716076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_146717 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 433 (Olfr433), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:174041933:174042936:1 gene:ENSMUSG00000045381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119238 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 433, mRNA (cDNA clone MGC:155554 IMAGE:8733987), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174041952:174042896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146716 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 432 (Olfr432), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:174050375:174051313:1 gene:ENSMUSG00000047048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC106793 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 432, mRNA (cDNA clone MGC:123596 IMAGE:40041669), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174050375:174051313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146718 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 430 (Olfr430), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:174069300:174070253:1 gene:ENSMUSG00000050134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174069219:174070253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_146722 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 429 (Olfr429), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:174089038:174089980:1 gene:ENSMUSG00000049528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127973 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 429, mRNA (cDNA clone MGC:157526 IMAGE:40135130), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174089042:174089980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207158 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 427 (Olfr427), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:174099460:174100407:1 gene:ENSMUSG00000059371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104103 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 427, mRNA (cDNA clone MGC:123739 IMAGE:40043136), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC104104 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 427, mRNA (cDNA clone MGC:123740 IMAGE:40043137), complete cds. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// BC106807 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 427, mRNA (cDNA clone MGC:123698 IMAGE:40042912), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC106808 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 427, mRNA (cDNA clone MGC:123699 IMAGE:40042917), complete cds. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NM_001206926 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 426 (Olfr426), mRNA. // chr1 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174099460:174100407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146721 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 424 (Olfr424), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:174136746:174137693:1 gene:ENSMUSG00000051528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104096 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 424, mRNA (cDNA clone MGC:123722 IMAGE:40043031), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC104097 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 424, mRNA (cDNA clone MGC:123723 IMAGE:40043033), complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174136719:174137693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000023959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174142443:174152324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_146720 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 421, pseudogene 1 (Olfr421-ps1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_047667 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 421, pseudogene 1 (Olfr421-ps1), transcript variant 1, non-coding, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000179386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:174151481:174152530:1 gene:ENSMUSG00000091950 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC119233 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 421, mRNA (cDNA clone MGC:155549 IMAGE:8733982), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174142443:174152324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_146305 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 420 (Olfr420), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:174158722:174159767:1 gene:ENSMUSG00000055033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145885 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 420, mRNA (cDNA clone MGC:175772 IMAGE:40131188), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011465 // RefSeq // Mus musculus spectrin alpha, erythrocytic 1 (Spta1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000027817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:174172776:174248450:1 gene:ENSMUSG00000026532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000156092 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:174215485:174247556:1 gene:ENSMUSG00000026532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 42 // 22 // 22 // 0 /// AF093576 // GenBank // Mus musculus erythroid alpha-spectrin (Spna1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 52 // 52 // 0 /// AK161449 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931418K17 product:spectrin alpha 1, full insert sequence. // chr1 // 95 // 42 // 21 // 22 // 0 /// BC150747 // GenBank // Mus musculus spectrin alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:183658 IMAGE:9087658), complete cds. // chr1 // 90 // 94 // 45 // 50 // 0 /// U87455 // GenBank // Mus musculus erythroid alpha-spectrin (Spna1) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 98 // 46 // 52 // 0 /// GENSCAN00000023964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174174303:174247457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 48 // 48 // 0
NM_025470 // RefSeq // Mus musculus mucosal pentraxin 1 (Mptx1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000027816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:174330518:174332873:1 gene:ENSMUSG00000026531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC024348 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810030J14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35753 IMAGE:4985132), complete cds. // chr1 // 56 // 100 // 9 // 16 // 0 /// GENSCAN00000023968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174330525:174332789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 81 // 12 // 13 // 0
NM_207137 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 417 (Olfr417), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000085862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:174368919:174369848:1 gene:ENSMUSG00000066672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000023970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174368919:174369848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_146714 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 248 (Olfr248), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000075329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:174391046:174392055:1 gene:ENSMUSG00000059503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// BC131960 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 415, mRNA (cDNA clone MGC:163591 IMAGE:40130237), complete cds. // chr1 // 88 // 94 // 15 // 17 // 0 /// BC131962 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 415, mRNA (cDNA clone MGC:163593 IMAGE:40130239), complete cds. // chr1 // 88 // 94 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000023965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174391200:174431383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_146761 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 414 (Olfr414), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:174430430:174431384:1 gene:ENSMUSG00000051509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC106815 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 414, mRNA (cDNA clone MGC:123767 IMAGE:40043364), complete cds. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// BC106816 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 414, mRNA (cDNA clone MGC:123768 IMAGE:40043365), complete cds. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174391200:174431383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_207694 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 220 (Olfr220), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:174448625:174449602:1 gene:ENSMUSG00000066671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174448625:174449602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019445 // RefSeq // Mus musculus formin 2 (Fmn2), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000030039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:174501825:174822717:1 gene:ENSMUSG00000028354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// AF218940 // GenBank // Mus musculus formin-2 (Fmn2) mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 94 // 38 // 45 // 0 /// BC094606 // GenBank // Mus musculus formin 2, mRNA (cDNA clone MGC:106665 IMAGE:6840339), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// AK013585 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900024F01 product:formin 2, full insert sequence. // chr1 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1 /// GENSCAN00000021150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:174581964:174729378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 28 // 28 // 0
AK142791 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930014K24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029453 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 64 (Wdr64), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000094288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:175698593:175815734:1 gene:ENSMUSG00000026523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000171939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:175698593:175815734:1 gene:ENSMUSG00000026523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK133092 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930571N01 product:hypothetical WD40-like/H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000008028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:175724667:175774534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:175784395:175816053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_012012 // RefSeq // Mus musculus exonuclease 1 (Exo1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006496862 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus exonuclease 1 (Exo1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000039725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:175880778:175911396:1 gene:ENSMUSG00000039748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC006671 // GenBank // Mus musculus exonuclease 1, mRNA (cDNA clone MGC:5686 IMAGE:3499406), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:175882908:175908565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000157250 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:176700617:176700724:1 gene:ENSMUSG00000087875 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT003908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001012330 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 18 (Zbtb18), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NM_013915 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 18 (Zbtb18), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// XM_006496889 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 18 (Zbtb18), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// XM_006496896 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 18 (Zbtb18), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000077225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:177445821:177450760:1 gene:ENSMUSG00000063659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000094276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:177444661:177450760:1 gene:ENSMUSG00000063659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// AF140224 // GenBank // Mus musculus transcriptional repressor RP58 (rp58) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 83 // 18 // 19 // 0 /// BC050909 // GenBank // Mus musculus, zinc finger protein 238, clone IMAGE:6417039, mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// BC054529 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 238, mRNA (cDNA clone MGC:62253 IMAGE:5721393), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC054742 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 238, mRNA (cDNA clone MGC:64779 IMAGE:5721393), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:177447103:177448671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0
NM_027077 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700016C15 gene (1700016C15Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006496975 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700016C15 gene (1700016C15Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006496976 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700016C15 gene (1700016C15Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000016106 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:177729814:177753324:1 gene:ENSMUSG00000015962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006496978 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700016C15 gene (1700016C15Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000004508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:177733497:177753557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0
XM_006497088 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102632386 (LOC102632386), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006497089 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102632386 (LOC102632386), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006497091 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102632386 (LOC102632386), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006497092 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102632386 (LOC102632386), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// AK029617 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930414L09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK139440 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830084G10 product:hypothetical Immunoglobulin-like containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000004509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:177843350:178275277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_001034899 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 16432 (Gm16432), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_399150 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7068 (Gm7068), transcript variant X4, misc_RNA. // chr1 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// ENSMUST00000094273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:177991435:178048291:1 gene:ENSMUSG00000091476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK029617 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930414L09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// XM_006497083 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7068 (Gm7068), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// XM_006497084 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7068 (Gm7068), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// AK139440 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830084G10 product:hypothetical Immunoglobulin-like containing protein, full insert sequence. // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000004509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:177843350:178275277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_024282 // RefSeq // Mus musculus desumoylating isopeptidase 2 (Desi2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006497038 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus desumoylating isopeptidase 2 (Desi2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000027783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:178187532:178252598:1 gene:ENSMUSG00000026502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000161075 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:178187417:178250901:1 gene:ENSMUSG00000026502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// AK029574 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930402D02 product:similar to APOPTOSIS-RELATED PROTEIN PNAS-4 (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// AK160733 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3021403L19 product:5830417C01Rik protein (Similar to CGI-146 protein) (Similar to apoptosis-related protein PNAS-4) (RIKEN cDNA 5830417C01 gene), full insert sequence. // chr1 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// BC002200 // GenBank // Mus musculus PPPDE peptidase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:7435 IMAGE:3489351), complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// BC046816 // GenBank // Mus musculus PPPDE peptidase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:61384 IMAGE:5702476), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000069568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:178256103:178257295:1 gene:ENSMUSG00000055831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK078283 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430567L13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025511 // RefSeq // Mus musculus COX20 Cox2 chaperone (Cox20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000027781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:178319130:178322693:1 gene:ENSMUSG00000026500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK153188 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830126P15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// BC055277 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310005N03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:66744 IMAGE:5714061), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC059717 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310005N03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:74109 IMAGE:6543216), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000083020 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:178390819:178390924:1 gene:ENSMUSG00000064954 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT003970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_026626 // RefSeq // Mus musculus EF-hand calcium binding domain 2 (Efcab2), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:178405881:178483247:1 gene:ENSMUSG00000026495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK029880 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931421D06 product:hypothetical EF-hand containing protein, full insert sequence. // chr1 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// BC025062 // GenBank // Mus musculus EF-hand calcium binding domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:35632 IMAGE:4240831), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:178406103:178483323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_001161665 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 26B (Kif26b), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000161017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:178529125:178932730:1 gene:ENSMUSG00000026494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AB355846 // GenBank // Mus musculus Kif26b mRNA for kinesin family protein 26b, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC120791 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D230039L06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:156028 IMAGE:40129714), complete cds. // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC137689 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D230039L06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169313 IMAGE:8860708), complete cds. // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:178529563:178534645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000083033 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:178636905:178637071:1 gene:ENSMUSG00000064967 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001161665 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 26B (Kif26b), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000160789 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:178798438:178932855:1 gene:ENSMUSG00000026494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000161017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:178529125:178932730:1 gene:ENSMUSG00000026494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AB355846 // GenBank // Mus musculus Kif26b mRNA for kinesin family protein 26b, complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// BC056349 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 26B, mRNA (cDNA clone MGC:73517 IMAGE:6405419), complete cds. // chr1 // 93 // 85 // 27 // 29 // 0 /// BC068141 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC056349, mRNA (cDNA clone IMAGE:30356461). // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000026356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:178840975:178932228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_146105 // RefSeq // Mus musculus consortin, connexin sorting protein (Cnst), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006496799 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus consortin, connexin sorting protein (Cnst), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000040706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:179546370:179627478:1 gene:ENSMUSG00000038949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC034107 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9630058J23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:31547 IMAGE:4503249), complete cds. // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC054802 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9630058J23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:65712 IMAGE:6837803), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000153962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:179546509:179602330:1 gene:ENSMUSG00000038949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// AK087361 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030050E10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000054222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:179592702:179686677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_178653 // RefSeq // Mus musculus saccharopine dehydrogenase (putative) (Sccpdh), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:179668210:179687189:1 gene:ENSMUSG00000038936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:179668210:179687189:1 gene:ENSMUSG00000038936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000144480 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:179680518:179686825:1 gene:ENSMUSG00000038936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC025803 // GenBank // Mus musculus saccharopine dehydrogenase (putative), mRNA (cDNA clone MGC:36578 IMAGE:5100552), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:179592702:179686677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XR_373767 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10518 (Gm10518), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:179803376:179804676:1 gene:ENSMUSG00000073486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132815 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930417B17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001081175 // RefSeq // Mus musculus inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase B (Itpkb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000070181 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:180330485:180424802:1 gene:ENSMUSG00000038855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC151160 // GenBank // Mus musculus inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase B, mRNA (cDNA clone MGC:184060 IMAGE:9088049), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC157986 // GenBank // Mus musculus inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase B, mRNA (cDNA clone MGC:189955 IMAGE:9088142), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC158000 // GenBank // Mus musculus inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase B, mRNA (cDNA clone MGC:189961 IMAGE:9088148), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006496903 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase B (Itpkb), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:180412701:180421890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_007415 // RefSeq // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 1 (Parp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000027777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:180568955:180601253:1 gene:ENSMUSG00000026496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AF126717 // GenBank // Mus musculus msPARP mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 58 // 27 // 28 // 0 /// AK135977 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420443K22 product:ADP-ribosyltransferase (NAD+; poly (ADP-ribose) polymerase) 1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// BC012041 // GenBank // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:6498 IMAGE:2648390), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// X14206 // GenBank // Mouse mRNA for poly (ADP-ribose) polymerase (EC 2.4.2.30). // chr1 // 71 // 94 // 32 // 45 // 0 /// GENSCAN00000030849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:180517541:180620888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 94 // 44 // 45 // 0
NM_001103182 // RefSeq // Mus musculus lin-9 homolog (C. elegans) (Lin9), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NR_120498 // RefSeq // Mus musculus lin-9 homolog (C. elegans) (Lin9), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006496987 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lin-9 homolog (C. elegans) (Lin9), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000085803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:180641150:180690518:1 gene:ENSMUSG00000058729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000085804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:180641334:180681626:1 gene:ENSMUSG00000058729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AK052618 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630006C22 product:TGS1 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC099695 // GenBank HTC // Mus musculus lin-9 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:4507547), with apparent retained intron. // chr1 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// GENSCAN00000030867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:180659078:180689373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_133225 // RefSeq // Mus musculus acyl-Coenzyme A binding domain containing 3 (Acbd3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:180726043:180754203:1 gene:ENSMUSG00000026499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF022770 // GenBank // Mus musculus peripherial benzodiazepine receptor associated protein (Pap7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC060602 // GenBank // Mus musculus acyl-Coenzyme A binding domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:79166 IMAGE:5706182), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:180721741:180770709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
ENSMUST00000097448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:180813784:180816688:1 gene:ENSMUSG00000073485 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK148381 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370120E05 product:hypothetical Glycine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145943 // RefSeq // Mus musculus SDE2 telomere maintenance homolog (S. pombe) (Sde2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000038091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:180851151:180868097:1 gene:ENSMUSG00000038806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC031781 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC031781, mRNA (cDNA clone MGC:30618 IMAGE:3672316), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:180851173:180866293:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_177099 // RefSeq // Mus musculus left-right determination factor 2 (Lefty2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000085797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:180893108:180899103:1 gene:ENSMUSG00000066652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC066224 // GenBank // Mus musculus left-right determination factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:76786 IMAGE:30008028), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_133705 // RefSeq // Mus musculus pyrroline-5-carboxylate reductase family, member 2 (Pycr2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:180904274:180908087:1 gene:ENSMUSG00000026520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC006882 // GenBank // Mus musculus pyrroline-5-carboxylate reductase family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:6271 IMAGE:2647612), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:180893184:180907642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_010094 // RefSeq // Mus musculus left right determination factor 1 (Lefty1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000037361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:180935022:180938400:1 gene:ENSMUSG00000038793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC050221 // GenBank // Mus musculus left right determination factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:60608 IMAGE:30005856), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// D83921 // GenBank // Mus musculus mRNA for Lefty prepro-protein, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:180935110:180974336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_144794 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 63a (Tmem63a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006496720 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 63a (Tmem63a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000027800 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:180942459:180975112:1 gene:ENSMUSG00000026519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000159436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:180942574:180956005:1 gene:ENSMUSG00000026519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 23 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000161523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:180944035:180975103:1 gene:ENSMUSG00000026519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// BC014795 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 63a, mRNA (cDNA clone MGC:11687 IMAGE:3961992), complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// BC019442 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 63a, mRNA (cDNA clone MGC:25803 IMAGE:4036849), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000030856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:180935110:180974336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0
NM_001033819 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9130409I23 gene (9130409I23Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:181051237:181060667:1 gene:ENSMUSG00000038768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147378 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130409I23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182559 IMAGE:9056453), complete cds. // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC147379 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130409I23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182555 IMAGE:9056449), complete cds. // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:181051235:181059814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_030131 // RefSeq // Mus musculus cornichon homolog 4 (Drosophila) (Cnih4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000075968 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:181154738:181166381:1 gene:ENSMUSG00000062169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000111057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:181155720:181166349:1 gene:ENSMUSG00000062169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000111059 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:181150931:181168994:1 gene:ENSMUSG00000062169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000134115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:181150931:181168994:1 gene:ENSMUSG00000062169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC065395 // GenBank // Mus musculus cornichon homolog 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:73670 IMAGE:876056), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT004067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:181150886:181168081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
XR_399164 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A430110L20 gene (A430110L20Rik), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:181226076:181228490:1 gene:ENSMUSG00000054135 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:181225986:181228498:1 gene:ENSMUSG00000054135 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK040631 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430110L20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001160211 // RefSeq // Mus musculus cornichon homolog 3 (Drosophila) (Cnih3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_001160212 // RefSeq // Mus musculus cornichon homolog 3 (Drosophila) (Cnih3), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_028408 // RefSeq // Mus musculus cornichon homolog 3 (Drosophila) (Cnih3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000027795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:181352630:181460641:1 gene:ENSMUSG00000026514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161880 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:181352628:181459909:1 gene:ENSMUSG00000026514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000162685 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:181353198:181459287:1 gene:ENSMUSG00000026514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0 /// BC115640 // GenBank // Mus musculus cornichon homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:144544 IMAGE:40103001), complete cds. // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC115641 // GenBank // Mus musculus cornichon homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:144545 IMAGE:40103002), complete cds. // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:181402945:181420115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
XM_006497105 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 14 (Dnah14), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006497106 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 14 (Dnah14), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:181598385:181814719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
XM_006497105 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 14 (Dnah14), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006497106 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 14 (Dnah14), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:181738988:181755444:1 gene:ENSMUSG00000047369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000160345 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:181741036:181769674:1 gene:ENSMUSG00000047369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK038967 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230079K17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK043618 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830012N02 product:weakly similar to DYNEIN HEAVY CHAIN ISOTYPE 7C (EC 3.6.1.3) (FRAGMENT) [Tripneustes gratilla], full insert sequence. // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:181598385:181814719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_012058 // RefSeq // Mus musculus signal recognition particle 9 (Srp9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000027792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:182124750:182132407:1 gene:ENSMUSG00000026511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC039648 // GenBank // Mus musculus signal recognition particle 9, mRNA (cDNA clone MGC:49477 IMAGE:5353755), complete cds. // chr1 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1
NM_173378 // RefSeq // Mus musculus transformation related protein 53 binding protein 2 (Trp53bp2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000117245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:182409172:182462432:1 gene:ENSMUSG00000026510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000013963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:182403387:182462104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_144796 // RefSeq // Mus musculus sushi domain containing 4 (Susd4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006497061 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sushi domain containing 4 (Susd4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000085724 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:182764895:182896598:1 gene:ENSMUSG00000038576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000153348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:182764012:182895232:1 gene:ENSMUSG00000038576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK088629 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430021N18 product:hypothetical Sushi domain / SCR repeat / CCP module containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC021842 // GenBank // Mus musculus sushi domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:30368 IMAGE:5135798), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000155229 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:182763860:182854040:1 gene:ENSMUSG00000038576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000012874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:182838284:182920392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_022019 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 10 (Dusp10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:184034381:184075636:1 gene:ENSMUSG00000039384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB037908 // GenBank // Mus musculus MKP-5 mRNA for MAP kinase phosphatase-5, complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC025066 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 10, mRNA (cDNA clone MGC:35845 IMAGE:3495358), complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:184036839:184074523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001163754 // RefSeq // Mus musculus RAB3 GTPase activating protein subunit 2 (Rab3gap2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000069652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:185204168:185286743:1 gene:ENSMUSG00000039318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC052505 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:1245109, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// BC057872 // GenBank // Mus musculus RAB3 GTPase activating protein subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:67698 IMAGE:5294131), complete cds. // chr1 // 96 // 70 // 25 // 26 // 0 /// AK122385 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0839 protein. // chr1 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// AK048759 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230048M19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// GENSCAN00000004224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:185204242:185283996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0
NR_034044 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 36B (Snora36b), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_035529 // RefSeq // Mus musculus microRNA 664 (Mir664), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000104383 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:185242907:185243038:1 gene:ENSMUSG00000077571 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-664 // miRBase Micro RNA Database // MI0012531 Mus musculus miR-664 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029580 // RefSeq // Mus musculus microRNA 194-1 (Mir194-1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000083647 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:185313319:185313385:1 gene:ENSMUSG00000065581 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// mmu-mir-194-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000236 Mus musculus miR-194-1 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT004204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NR_029908 // RefSeq // Mus musculus microRNA 215 (Mir215), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083628 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:185313581:185313692:1 gene:ENSMUSG00000065562 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-215 // miRBase Micro RNA Database // MI0000974 Mus musculus miR-215 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_011794 // RefSeq // Mus musculus bisphosphate 3-nucleotidase 1 (Bpnt1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006497160 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus bisphosphate 3-nucleotidase 1 (Bpnt1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027916 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:185332149:185357777:1 gene:ENSMUSG00000026617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000110965 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:185332180:185356781:1 gene:ENSMUSG00000026617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000137757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:185332207:185346704:1 gene:ENSMUSG00000026617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 79 // 48 // 11 // 14 // 0 /// ENSMUST00000151769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:185332173:185345339:1 gene:ENSMUSG00000026617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// AF125043 // GenBank // Mus musculus bisphosphate 3-nucleotidase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC011036 // GenBank // Mus musculus bisphosphate 3-nucleotidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:13732 IMAGE:4160742), complete cds. // chr1 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:185335909:185356626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_029735 // RefSeq // Mus musculus glutamyl-prolyl-tRNA synthetase (Eprs), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000046514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:185363095:185428355:1 gene:ENSMUSG00000026615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC040802 // GenBank // Mus musculus glutamyl-prolyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3980665), partial cds. // chr1 // 90 // 61 // 18 // 20 // 0 /// BC141049 // GenBank // Mus musculus glutamyl-prolyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:176010 IMAGE:9055661), complete cds. // chr1 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:185363198:185428147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
NM_001033286 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 30, member 10 (Slc30a10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:185454848:185468762:1 gene:ENSMUSG00000026614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC054548 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 30, member 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:6402620). // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC108419 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 30, member 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:30536879), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XR_373768 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 30, member 10 (Slc30a10), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000004208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:185455064:185464555:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000158420 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:186676742:186676876:1 gene:ENSMUSG00000089045 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000180973 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:186960508:186961513:1 gene:ENSMUSG00000097935 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000011610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:186892339:186961513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_033077 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 1, Pasteur Institute 1 (D1Pas1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000045108 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:186967416:186970627:1 gene:ENSMUSG00000039224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC139286 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 1, Pasteur Institute 1, mRNA (cDNA clone MGC:170913 IMAGE:8862308), complete cds. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC139287 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 1, Pasteur Institute 1, mRNA (cDNA clone MGC:170914 IMAGE:8862309), complete cds. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// J04847 // GenBank // Mouse PL10 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000011587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:186967876:186969858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_021408 // RefSeq // Mus musculus Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild) (Ush2a), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 71 // 71 // 0 /// ENSMUST00000060479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:188263034:188965041:1 gene:ENSMUSG00000026609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 70 // 70 // 0 /// ENSMUST00000124358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:188262035:188452401:1 gene:ENSMUSG00000026609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 30 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000142159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:188537807:188678687:1 gene:ENSMUSG00000026609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 16 // 12 // 12 // 0 /// AF151717 // GenBank // Mus musculus putative extracellular matrix protein MUSH2A mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 30 // 21 // 22 // 0 /// AK044734 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930037M10 product:hypothetical Fibronectin type III domain containing protein, full insert sequence. // chr1 // 92 // 16 // 11 // 12 // 0 /// DQ073638 // GenBank // Mus musculus usherin (Ush2A) mRNA, complete cds. // chr1 // 99 // 95 // 69 // 70 // 0 /// GENSCAN00000035337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:188395083:188459574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 12 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000050492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:188703585:188852860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:188904980:188964928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 14 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000050479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:188511472:188596075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 15 // 15 // 11 // 74 // 1
NR_027298 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A230020J21 gene (A230020J21Rik), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:191025350:191026186:1 gene:ENSMUSG00000097845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029336 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 45 (Spata45), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006497211 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700022P22 gene (1700022P22Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000077889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:191036822:191042941:1 gene:ENSMUSG00000057072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:191039526:191042898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 56 // 11 // 14 // 0
NM_198654 // RefSeq // Mus musculus NSL1, MIND kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae) (Nsl1), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076952 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:191063012:191075206:1 gene:ENSMUSG00000062510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000078259 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:191063031:191084558:1 gene:ENSMUSG00000062510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139340 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:191063024:191076939:1 gene:ENSMUSG00000062510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AK029421 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833432M17 product:weakly similar to DC31 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// BC029086 // GenBank // Mus musculus NSL1, MIND kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:27788 IMAGE:3156934), complete cds. // chr1 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// XM_006497181 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NSL1, MIND kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae) (Nsl1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000021747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:191063039:191108633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_030060 // RefSeq // Mus musculus basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 3 (Batf3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:191098414:191108943:1 gene:ENSMUSG00000026630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK171970 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830023B19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC117083 // GenBank // Mus musculus basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:151460 IMAGE:40126402), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC117085 // GenBank // Mus musculus basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:151462 IMAGE:40126404), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006497182 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 3 (Batf3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONMMUT004352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000021747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:191063039:191108633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSMUST00000139056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:191224474:191225686:1 gene:ENSMUSG00000073478 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK021325 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730003I15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK157967 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930012J16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XR_373874 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102634085 (LOC102634085), transcript variant X5, ncRNA. // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XR_399270 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102634085 (LOC102634085), transcript variant X3, ncRNA. // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONMMUT004356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025864 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 206 (Tmem206), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027940 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:191325912:191350914:1 gene:ENSMUSG00000026627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC027151 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 206, mRNA (cDNA clone MGC:35701 IMAGE:4948749), complete cds. // chr1 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:191326041:191349850:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_178632 // RefSeq // Mus musculus integrator complex subunit 7 (Ints7), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000045450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:191575763:191622672:1 gene:ENSMUSG00000037461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC054120 // GenBank // Mus musculus integrator complex subunit 7, mRNA (cDNA clone MGC:59468 IMAGE:6506658), complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// XM_006497215 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus integrator complex subunit 7 (Ints7), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// AK085362 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630016B11 product:hypothetical ARM repeat structure containing protein, full insert sequence. // chr1 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// GENSCAN00000023207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:191575206:191621464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0
NM_001134829 // RefSeq // Mus musculus lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1 (Lpgat1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NM_172266 // RefSeq // Mus musculus lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1 (Lpgat1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006497154 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1 (Lpgat1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// XM_006497157 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1 (Lpgat1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000110855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:191717834:191784255:1 gene:ENSMUSG00000026623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000110856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:191718389:191779977:1 gene:ENSMUSG00000026623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000130876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:191718521:191760184:1 gene:ENSMUSG00000026623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 49 // 16 // 17 // 0 /// BC013667 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:18768 IMAGE:4020003), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:191718508:191778534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
NM_009579 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 1 (Slc30a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006497158 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 1 (Slc30a1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000044954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:191906767:191913247:1 gene:ENSMUSG00000037434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052166 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:59378 IMAGE:6333155), complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:191907007:191909755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000023209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:191992860:191993195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NR_033536 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10516 (Gm10516), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180598 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:1:192136898:192151013:1 gene:ENSMUSG00000097316 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONMMUT004416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT004417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001038607 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1 (Kcnh1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NM_010600 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1 (Kcnh1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_373887 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1 (Kcnh1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000078470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:192190784:192510159:1 gene:ENSMUSG00000058248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000110844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:192190784:192510158:1 gene:ENSMUSG00000058248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC109012 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:124419 IMAGE:40048708), complete cds. // chr1 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC109013 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:124420 IMAGE:40048709), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// U04294 // GenBank // Mus musculus potassium channel subunit (m-eag) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006497230 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1 (Kcnh1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000023210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:192191014:192283818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000082947 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:192745571:192745686:1 gene:ENSMUSG00000094131 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000160822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:193168049:193175180:1 gene:ENSMUSG00000079144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK005889 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700012B08 product:ADULT MALE TESTIS CDNA, RIKEN FULL-LENGTH ENRICHED LIBRARY, CLONE:1700012B08, FULL INSERT SEQUENCE, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001277928 // RefSeq // Mus musculus laminin, beta 3 (Lamb3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NM_008484 // RefSeq // Mus musculus laminin, beta 3 (Lamb3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000016315 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:193301957:193343878:1 gene:ENSMUSG00000026639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000159955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:193302243:193343875:1 gene:ENSMUSG00000026639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// BC008516 // GenBank // Mus musculus laminin, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:5994 IMAGE:3592888), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// U43298 // GenBank // Mus musculus laminin beta3 (Lamb3) chain mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 94 // 42 // 45 // 0 /// GENSCAN00000035950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:193289249:193343510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0
GENSCAN00000030596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:193867385:193867828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0
NM_008882 // RefSeq // Mus musculus plexin A2 (Plxna2), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000027952 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:194619829:194816869:1 gene:ENSMUSG00000026640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000124785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:194804710:194814227:1 gene:ENSMUSG00000026640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC051045 // GenBank // Mus musculus plexin A2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4505411), complete cds. // chr1 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC056475 // GenBank // Mus musculus plexin A2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5684836), partial cds. // chr1 // 100 // 30 // 11 // 11 // 0 /// BC068155 // GenBank // Mus musculus plexin A2, mRNA (cDNA clone MGC:92932 IMAGE:30362726), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// D86949 // GenBank // Mus musculus mRNA for plexin 2, complete cds. // chr1 // 97 // 86 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:194724618:194812161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0
NM_001111059 // RefSeq // Mus musculus CD34 antigen (Cd34), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_133654 // RefSeq // Mus musculus CD34 antigen (Cd34), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000016638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:194938821:194961292:1 gene:ENSMUSG00000016494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000110815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:194938821:194961292:1 gene:ENSMUSG00000016494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC006607 // GenBank // Mus musculus CD34 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:11720 IMAGE:3966337), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK051507 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130053J17 product:CD34 antigen, full insert sequence. // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000055665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:194938966:194960121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT004489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NR_015566 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A330023F24 gene (A330023F24Rik), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_029809 // RefSeq // Mus musculus microRNA 29b-2 (Mir29b-2), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000083478 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:195037040:195037123:1 gene:ENSMUSG00000065412 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000181273 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:1:195017399:195037908:1 gene:ENSMUSG00000096929 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC058715 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C030002C11 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6842978), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-29b-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000712 Mus musculus miR-29b-2 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT004500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT004505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_015566 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A330023F24 gene (A330023F24Rik), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NR_029745 // RefSeq // Mus musculus microRNA 29c (Mir29c), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000083614 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:195037547:195037634:1 gene:ENSMUSG00000065548 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000181273 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:1:195017399:195037908:1 gene:ENSMUSG00000096929 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC058715 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C030002C11 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6842978), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-29c // miRBase Micro RNA Database // MI0000577 Mus musculus miR-29c stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT004500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT004506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001011874 // RefSeq // Mus musculus X Kell blood group precursor related family member 4 (Xkr4), mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070533 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:3214482:3671498:-1 gene:ENSMUSG00000051951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AY534250 // GenBank // Mus musculus XK-related protein 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:3637518:3671348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0
NM_011283 // RefSeq // Mus musculus retinitis pigmentosa 1 (human) (Rp1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:4343507:4360314:-1 gene:ENSMUSG00000025900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF155141 // GenBank // Mus musculus oxygen-regulated photoreceptor protein 1 (Rp1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC120927 // GenBank // Mus musculus retinitis pigmentosa 1 (human), mRNA (cDNA clone MGC:144210 IMAGE:40099705), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC120928 // GenBank // Mus musculus retinitis pigmentosa 1 (human), mRNA (cDNA clone MGC:144211 IMAGE:40099706), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001195662 // RefSeq // Mus musculus retinitis pigmentosa 1 (human) (Rp1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// XM_006495473 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus retinitis pigmentosa 1 (human) (Rp1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000004990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:4257527:4406812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000182774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:4687934:4689403:-1 gene:ENSMUSG00000098104 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:4687976:4689404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_010342 // RefSeq // Mus musculus neuropeptides B/W receptor 1 (Npbwr1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:5913707:5917398:-1 gene:ENSMUSG00000033774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:5916304:5917955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000097832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:6214612:6215292:-1 gene:ENSMUSG00000073741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK137762 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A030014E13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000007884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:6429867:6601340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000103887 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:8588615:8588724:-1 gene:ENSMUSG00000093970 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT000088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001290397 // RefSeq // Mus musculus myeloblastosis oncogene-like 1 (Mybl1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NM_008651 // RefSeq // Mus musculus myeloblastosis oncogene-like 1 (Mybl1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000088658 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:9667415:9700209:-1 gene:ENSMUSG00000025912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000115468 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:9669537:9700024:-1 gene:ENSMUSG00000025912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC103533 // GenBank // Mus musculus myeloblastosis oncogene-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:123416 IMAGE:40039678), complete cds. // chr1 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// L35261 // GenBank // Mus musculus transcriptional regulatory protein (A-myb) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000188212 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:9681863:9699654:-1 gene:ENSMUSG00000025912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:9659117:9699954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1
NM_173443 // RefSeq // Mus musculus valosin containing protein (p97)/p47 complex interacting protein 1 (Vcpip1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:9718622:9748382:-1 gene:ENSMUSG00000045210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC059209 // GenBank // Mus musculus valosin containing protein (p97)/p47 complex interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:66512 IMAGE:6406239), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:9724482:9748156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
XM_885368 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 6195 (Gm6195), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000063059 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:9802197:9802553:-1 gene:ENSMUSG00000046334 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_026632 // RefSeq // Mus musculus replication protein A3 (Rpa3), mRNA. // chr1 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0 /// BC028489 // GenBank // Mus musculus replication protein A3, mRNA (cDNA clone MGC:41008 IMAGE:1448430), complete cds. // chr1 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:9802194:9802541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_004410 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 87 (Snord87), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000175437 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:9942463:9942549:-1 gene:ENSMUSG00000093178 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001285425 // RefSeq // Mus musculus transcription factor 24 (Tcf24), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:9960171:9962809:-1 gene:ENSMUSG00000099032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000073738 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185184 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:9960163:9967932:-1 gene:ENSMUSG00000099032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000179194 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:10009814:10009917:-1 gene:ENSMUSG00000095780 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT000134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
GENSCAN00000031243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:10100477:10101948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001102430 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor guanine nucleotide-exchange factor 1(brefeldin A-inhibited) (Arfgef1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000088615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:10137571:10232670:-1 gene:ENSMUSG00000067851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000131556 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:10173075:10232670:-1 gene:ENSMUSG00000067851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// AK085726 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730028O18 product:BREFELDIN A-INHIBITED GUANINE NUCLEOTIDE-EXCHANGE PROTEIN 1 (BREFELDIN A-INHIBITED GEP 1) (P200 ARF-GEP1) (P200 ARF GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0 /// BC037453 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor guanine nucleotide-exchange factor 1(brefeldin A-inhibited), mRNA (cDNA clone IMAGE:4020499). // chr1 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// GENSCAN00000031225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:10138832:10230455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0
NM_001289497 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase A6 (Cpa6), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NM_177834 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase A6 (Cpa6), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006495545 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxypeptidase A6 (Cpa6), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000035577 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:10324727:10719945:-1 gene:ENSMUSG00000042501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000153695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:10324720:10719945:-1 gene:ENSMUSG00000042501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AY773477 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase A6 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC119559 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase A6, mRNA (cDNA clone MGC:141281 IMAGE:40057538), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// BC119560 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase A6, mRNA (cDNA clone MGC:141282 IMAGE:40057539), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:10325124:10350279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
ENSMUST00000179958 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:10555554:10555660:-1 gene:ENSMUSG00000094979 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081209 // RefSeq // Mus musculus PR domain containing 14 (Prdm14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000047577 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:13113457:13127163:-1 gene:ENSMUSG00000042414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK134292 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030400A03 product:weakly similar to PR-domain zinc finger protein 14 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 79 // 94 // 23 // 29 // 0 /// KJ463838 // GenBank // Mus musculus PR domain-containing 14 (PRDM14) mRNA, complete cds. // chr1 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:13114260:13125835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000187246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:13407012:13407655:-1 gene:ENSMUSG00000101171 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000042550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:13363327:13409187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_028173 // RefSeq // Mus musculus translocating chain-associating membrane protein 1 (Tram1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:13564698:13589910:-1 gene:ENSMUSG00000025935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY029764 // GenBank // Mus musculus TRAM1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC012401 // GenBank // Mus musculus translocating chain-associating membrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:11724 IMAGE:3967323), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// CT010238 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836C0551D for gene Tram1, Translocating chain-associating membrane protein 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000185447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:13576144:13579798:-1 gene:ENSMUSG00000025935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_145381 // RefSeq // Mus musculus lactamase, beta 2 (Lactb2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006495490 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lactamase, beta 2 (Lactb2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:13623330:13660546:-1 gene:ENSMUSG00000025937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000156222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:13629995:13638411:-1 gene:ENSMUSG00000025937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC004045 // GenBank // Mus musculus lactamase, beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:7674 IMAGE:3496398), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:13614163:13660450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_010827 // RefSeq // Mus musculus musculin (Msc), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:14753346:14755990:-1 gene:ENSMUSG00000025930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF087035 // GenBank // Mus musculus musculin mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AF108216 // GenBank // Mus musculus muscle-specific basic helix-loop-helix transcription factor MyoR mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC103592 // GenBank // Mus musculus musculin, mRNA (cDNA clone MGC:124110 IMAGE:40046034), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC103593 // GenBank // Mus musculus musculin, mRNA (cDNA clone MGC:124111 IMAGE:40046035), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC103594 // GenBank // Mus musculus musculin, mRNA (cDNA clone MGC:124112 IMAGE:40046036), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC103623 // GenBank // Mus musculus musculin, mRNA (cDNA clone MGC:124180 IMAGE:40046489), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000190719 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:14753746:14755353:-1 gene:ENSMUSG00000025930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000188982 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:14753935:14754665:-1 gene:ENSMUSG00000025930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_177781 // RefSeq // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily A, member 1 (Trpa1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006495526 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily A, member 1 (Trpa1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000041447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:14872648:14918862:-1 gene:ENSMUSG00000032769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY231177 // GenBank // Mus musculus ANKTM1 (Anktm1) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC120563 // GenBank // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:155800 IMAGE:40129486), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC131963 // GenBank // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:163594 IMAGE:40130240), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// KF460461 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 TRPA1b mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:14882377:14903270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NM_001033288 // RefSeq // Mus musculus somatomedin B and thrombospondin, type 1 domain containing (Sbspon), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:15853862:15892722:-1 gene:ENSMUSG00000032719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147194 // GenBank // Mus musculus gene model 106, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182346 IMAGE:9056240), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC147195 // GenBank // Mus musculus gene model 106, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182330 IMAGE:9056224), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000115367 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:16065979:16081212:-1 gene:ENSMUSG00000067795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000145070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:16065979:16093325:-1 gene:ENSMUSG00000067795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001243238 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930444P10 gene (4930444P10Rik), mRNA. // chr1 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// XM_006495582 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930444P10 gene (4930444P10Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENSMUST00000151004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:16065979:16093325:-1 gene:ENSMUSG00000067795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1
ENSMUST00000186738 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:16662980:16663662:-1 gene:ENSMUSG00000100959 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:16643288:16665549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
ENSMUST00000071842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:16768279:16770138:-1 gene:ENSMUSG00000091020 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:16768246:16770138:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020604 // RefSeq // Mus musculus junctophilin 1 (Jph1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:16994938:17097889:-1 gene:ENSMUSG00000042686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020604 // RefSeq // Mus musculus junctophilin 1 (Jph1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000038382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:16994938:17097889:-1 gene:ENSMUSG00000042686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB024445 // GenBank // Mus musculus JP-1 mRNA for junctophilin type 1, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC120839 // GenBank // Mus musculus junctophilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:156076 IMAGE:40129762), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC137669 // GenBank // Mus musculus junctophilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:169293 IMAGE:8860688), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:17003876:17092028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000186024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:16964560:17004219:-1 gene:ENSMUSG00000042686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
ENSMUST00000186816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:17429043:17429528:-1 gene:ENSMUSG00000102048 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_030033 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich secretory protein 4 (Crisp4), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006495589 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cysteine-rich secretory protein 4 (Crisp4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000026876 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:18115191:18145902:-1 gene:ENSMUSG00000025774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000115340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:18115204:18137051:-1 gene:ENSMUSG00000025774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000115344 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:18115600:18145902:-1 gene:ENSMUSG00000025774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000130669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:18115191:18145896:-1 gene:ENSMUSG00000025774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY705449 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secretory protein (Crisp4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// DQ200908 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secretory protein 4 (Crisp4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:18125332:18136309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NR_002879 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 44, pseudogene (Defb44-ps), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000126871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:18210053:18223564:-1 gene:ENSMUSG00000070977 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY621334 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 49 (Defb49) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT000276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT000277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001039123 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 18 (Defb18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:18236473:18237443:-1 gene:ENSMUSG00000073735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ012029 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 18 (Defb18) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001040027 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15386 (Gm15386), mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 31 // 31 // 0 /// NM_183124 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 41 (Defb41), mRNA. // chr1 // 97 // 77 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000088463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:18250980:18265138:-1 gene:ENSMUSG00000067773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 77 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000097817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:18260524:18265080:-1 gene:ENSMUSG00000067773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000089923 // chr1 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0 /// DQ012027 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 16 (Defb16) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 77 // 33 // 34 // 0 /// DQ012028 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 17 (Defb17) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000190883 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:19320226:19320697:-1 gene:ENSMUSG00000101117 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 93 // 88 // 14 // 15 // 0
NM_153179 // RefSeq // Mus musculus polycystic kidney and hepatic disease 1 (Pkhd1), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 65 // 65 // 0 /// XM_006495521 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polycystic kidney and hepatic disease 1 (Pkhd1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 51 // 51 // 0 /// ENSMUST00000088448 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:20057779:20618064:-1 gene:ENSMUSG00000043760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 65 // 65 // 0 /// AY130764 // GenBank // Mus musculus polyductin (Pkhd1) mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 98 // 59 // 65 // 0 /// AY438374 // GenBank // Mus musculus PKHD1 (Pkhd1) mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 97 // 58 // 64 // 0 /// GENSCAN00000047096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:20116926:20420805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:20444258:20615323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000093665 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:20444811:20444912:-1 gene:ENSMUSG00000070175 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145856 // RefSeq // Mus musculus interleukin 17F (Il17f), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000039046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:20777146:20784270:-1 gene:ENSMUSG00000041872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB116259 // GenBank // Mus musculus mIL-17Ftv mRNA for interleukin 17F, transcript variant, complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AF458064 // GenBank // Mus musculus IL-17F mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AY380822 // GenBank // Mus musculus interleukin 17F mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// BC145977 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40131280, with apparent retained intron. // chr1 // 85 // 71 // 23 // 27 // 0 /// ENSMUST00000191111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:20777679:20779554:-1 gene:ENSMUSG00000041872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 96 // 71 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000189301 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:20777783:20790617:-1 gene:ENSMUSG00000041872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// GENSCAN00000047095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:20777767:20820208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1
NM_008563 // RefSeq // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 3 (S. cerevisiae) (Mcm3), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000053266 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:20802968:20820312:-1 gene:ENSMUSG00000041859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC031700 // GenBank // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 3 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:30531 IMAGE:5007886), complete cds. // chr1 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// ENSMUST00000185296 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:20802973:20820260:-1 gene:ENSMUSG00000041859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000047095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:20777767:20820208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_177409 // RefSeq // Mus musculus translocating chain-associating membrane protein 2 (Tram2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000037998 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:20996299:21079229:-1 gene:ENSMUSG00000041779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY029530 // GenBank // Mus musculus TRAM2 mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// BC018212 // GenBank // Mus musculus translocating chain-associating membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:25725 IMAGE:3980004), complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// ENSMUST00000187210 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:21004313:21043656:-1 gene:ENSMUSG00000041779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000026616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:20994069:21043869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NR_002858 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4956 (Gm4956), non-coding RNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000082032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:21285246:21298312:-1 gene:ENSMUSG00000025936 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000178869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:21285608:21298127:-1 gene:ENSMUSG00000025936 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000179730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:21289985:21298247:-1 gene:ENSMUSG00000025936 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:21283554:21301874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT000315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_001160139 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily Q, member 5 (Kcnq5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_023872 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily Q, member 5 (Kcnq5), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000029667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:21398403:21961581:-1 gene:ENSMUSG00000028033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000115299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:21466245:21961665:-1 gene:ENSMUSG00000028033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000115300 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:21398408:21961942:-1 gene:ENSMUSG00000028033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000173404 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:21402163:21961581:-1 gene:ENSMUSG00000028033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000174183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:21402163:21961581:-1 gene:ENSMUSG00000028033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AY679158 // GenBank // Mus musculus KCNQ5 potassium channel mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000173058 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:21402163:21961581:-1 gene:ENSMUSG00000028033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000026610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:21402163:21507005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_145380 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit M (Eif3m), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000028592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:104999656:105017080:-1 gene:ENSMUSG00000027170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000119064 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:21511933:21513056:-1 gene:ENSMUSG00000082935 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000148476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104999659:105006823:-1 gene:ENSMUSG00000027170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// BC005598 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit M, mRNA (cDNA clone MGC:11741 IMAGE:3969335), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC103795 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit M, mRNA (cDNA clone MGC:118449 IMAGE:30135815), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC116787 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit M, mRNA (cDNA clone MGC:151164 IMAGE:40126106), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC116789 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit M, mRNA (cDNA clone MGC:151166 IMAGE:40126108), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000111110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:104999689:105017043:-1 gene:ENSMUSG00000027170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 1 /// GENSCAN00000026619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:21511933:21522204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000189850 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:22030064:22030615:-1 gene:ENSMUSG00000099692 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:22030409:22030615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
NM_025746 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933415F23 gene (4933415F23Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000073179 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:23100473:23102253:-1 gene:ENSMUSG00000073730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC115556 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933415F23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144410 IMAGE:40101816), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:23101770:23102375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT000344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
AK131727 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700028D19 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:23212471:23257401:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001081079 // RefSeq // Mus musculus opioid growth factor receptor-like 1 (Ogfrl1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000027343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:23366424:23383175:-1 gene:ENSMUSG00000026158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC019747 // GenBank // Mus musculus opioid growth factor receptor-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4485439), complete cds. // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC041673 // GenBank HTC // Mus musculus opioid growth factor receptor-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4486593), with apparent retained intron. // chr1 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// ENSMUST00000186064 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:23369724:23380801:-1 gene:ENSMUSG00000026158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000188677 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:23370268:23397541:-1 gene:ENSMUSG00000026158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000055432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:23369749:23383249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_026503 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1110058L19 gene (1110058L19Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027338 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:23995939:24005656:-1 gene:ENSMUSG00000026154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028981 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110058L19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35651 IMAGE:5367409), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155767 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:24002966:24005630:-1 gene:ENSMUSG00000026154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:23996251:24010347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONMMUT000363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_007733 // RefSeq // Mus musculus collagen, type XIX, alpha 1 (Col19a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000051344 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:24279770:24587411:-1 gene:ENSMUSG00000026141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000115244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:24263994:24587472:-1 gene:ENSMUSG00000026141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000144297 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:24261890:24452745:-1 gene:ENSMUSG00000026141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 73 // 36 // 36 // 0 /// AB000636 // GenBank // Mus musculus mRNA for collagen a1 XIX chain, complete cds. // chr1 // 81 // 98 // 39 // 48 // 0 /// AK019854 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931426B13 product:procollagen, type XIX, alpha 1, full insert sequence. // chr1 // 94 // 73 // 34 // 36 // 0 /// AK149136 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120487B09 product:procollagen, type XIX, alpha 1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// BC118970 // GenBank // Mus musculus collagen, type XIX, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:144116 IMAGE:40097873), complete cds. // chr1 // 87 // 96 // 41 // 47 // 0 /// NONMMUT000369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 73 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000038780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:24256752:24350012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 19 // 49 // 1
ENSMUST00000084013 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:9877:10173:1 gene:ENSMUSG00000065947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:24612407:24612700:-1 gene:ENSMUSG00000067736 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC050862 // GenBank HTC // Mus musculus lactation elevated 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6508207), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NC_005089 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 4L, Mitochondrion [Mus musculus] // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082407 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:7766:7969:1 gene:ENSMUSG00000064356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000082408 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:7927:8607:1 gene:ENSMUSG00000064357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AF093677 // GenBank // Mus musculus ATPase subunit 6 (Atpase6) mRNA, mitochondrial gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC069931 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:78219 IMAGE:3489785, complete cds. // chr1 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000189941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:24613974:24614651:-1 gene:ENSMUSG00000100862 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AK132015 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810030A17 product:ATP synthase 6, mitochondrial, full insert sequence. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NC_005089 // GenBank // ATP synthase F0 subunit 8, Mitochondrion [Mus musculus] // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NC_005089 // GenBank // ATP synthase F0 subunit 6, Mitochondrion [Mus musculus] // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC020072 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:28280 IMAGE:4010194, complete cds. // chr1 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0
ENSMUST00000082405 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCm38:MT:7013:7696:1 gene:ENSMUSG00000064354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF378830 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit II (Cox2) mRNA, complete cds; mitochondrial gene for mitochondrial product. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:22587291:22587962:-1 gene:ENSMUSG00000083863 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:24614885:24615565:-1 gene:ENSMUSG00000102070 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00000407 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NC_005089 // GenBank // cytochrome c oxidase subunit II, Mitochondrion [Mus musculus] // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT036057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0
ENSMUST00000178643 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:25279445:25279551:-1 gene:ENSMUSG00000096866 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT000391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001033764 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931408C20 gene (4931408C20Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097801 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:26681814:26687460:-1 gene:ENSMUSG00000073722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:26641440:26742334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000179494 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:26959103:26959221:-1 gene:ENSMUSG00000095256 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013750 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 597 (Gm597), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006495819 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 597 (Gm597), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000059937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:28776117:28780252:-1 gene:ENSMUSG00000048411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC150996 // GenBank // Mus musculus gene model 597, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:183909 IMAGE:9087909), complete cds. // chr1 // 80 // 96 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:28759111:28780141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000122295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:28800240:28802721:-1 gene:ENSMUSG00000081557 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000082499 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:29280964:29281075:-1 gene:ENSMUSG00000064433 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT000425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000065469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:30718560:30719962:-1 gene:ENSMUSG00000053185 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK087209 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030034H13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
ENSMUST00000152491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:30998184:30998906:-1 gene:ENSMUSG00000087346 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 81 // 92 // 39 // 48 // 0 /// ENSMUST00000178167 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:31286945:31287640:1 gene:ENSMUSG00000094215 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 75 // 85 // 33 // 44 // 0 /// ENSMUST00000178317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:30977244:30977967:-1 gene:ENSMUSG00000086151 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 82 // 98 // 42 // 51 // 0 /// ENSMUST00000135273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:30986226:30986952:-1 gene:ENSMUSG00000086726 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 52 // 88 // 24 // 46 // 0 /// GENSCAN00000010504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:31274902:31287706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 100 // 41 // 52 // 0 /// GENSCAN00000010507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:30998183:30998908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 94 // 40 // 49 // 0 /// GENSCAN00000010521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:30977243:30977968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 100 // 43 // 52 // 0 /// GENSCAN00000010524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:30986486:30986953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 52 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000190905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:50056782:50058490:1 gene:ENSMUSG00000101760 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 27 // 27 // 14 // 52 // 1
ENSMUST00000135245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:31202931:31222684:-1 gene:ENSMUSG00000086727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// AK016212 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930563O14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// AK162175 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420445O19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 66 // 26 // 27 // 0 /// BC147514 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182612 IMAGE:9056506), complete cds. // chr1 // 90 // 49 // 18 // 20 // 0 /// BC147546 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182643 IMAGE:9056537), complete cds. // chr1 // 90 // 49 // 18 // 20 // 0 /// BC172083 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:198788 IMAGE:9054369), complete cds. // chr1 // 100 // 44 // 18 // 18 // 0 /// NR_033445 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931428L18 gene (4931428L18Rik), long non-coding RNA. // chr1 // 78 // 78 // 32 // 41 // 1 /// ENSMUST00000127775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:31141164:31222657:-1 gene:ENSMUSG00000086727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 31 // 41 // 1 /// ENSMUST00000187659 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:31141717:31222628:-1 gene:ENSMUSG00000086727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000187892 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:31135226:31222597:-1 gene:ENSMUSG00000086727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 41 // 16 // 17 // 0
ENSMUST00000082754 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:32213133:32213239:-1 gene:ENSMUSG00000064688 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008922 // RefSeq // Mus musculus DNA primase, p58 subunit (Prim2), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006495792 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA primase, p58 subunit (Prim2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// XM_006495793 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA primase, p58 subunit (Prim2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// XM_006495794 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA primase, p58 subunit (Prim2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000027312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:33453810:33669795:-1 gene:ENSMUSG00000026134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC019500 // GenBank // Mus musculus DNA primase, p58 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:18491 IMAGE:3602929), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// D13545 // GenBank // Mus musculus mRNA for primase large subunit, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// D17385 // GenBank // Mus musculus mRNA for DNA primase large subunit p58, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XR_373246 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA primase, p58 subunit (Prim2), transcript variant X7, misc_RNA. // chr1 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// AK166687 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0002J24 product:DNA primase, p58 subunit, full insert sequence. // chr1 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// ENSMUST00000189552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:33478942:33622142:-1 gene:ENSMUSG00000026134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000042846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:33619374:33715272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_145392 // RefSeq // Mus musculus BCL2-associated athanogene 2 (Bag2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:33745484:33757795:-1 gene:ENSMUSG00000042215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC016230 // GenBank // Mus musculus BCL2-associated athanogene 2, mRNA (cDNA clone MGC:28786 IMAGE:4488760), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028944 // GenBank // Mus musculus BCL2-associated athanogene 2, mRNA (cDNA clone MGC:36682 IMAGE:5371263), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:33746739:33748719:-1 gene:ENSMUSG00000042215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000042839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:33746607:33797520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001161816 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15455 (Gm15455), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000117459 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:33836122:33838680:-1 gene:ENSMUSG00000081402 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000042860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:33836122:33838680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_177235 // RefSeq // Mus musculus BEN domain containing 6 (Bend6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000062289 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:33852052:33907816:-1 gene:ENSMUSG00000042182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000115161 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:33852052:33907790:-1 gene:ENSMUSG00000042182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC057378 // GenBank // Mus musculus BEN domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:67495 IMAGE:5707039), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126724 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:33863156:33883842:-1 gene:ENSMUSG00000042182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// AK045534 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230209C24 product:similar to CDNA FLJ30162 FIS, CLONE BRACE2000565 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENSMUST00000129464 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:33852052:33907790:-1 gene:ENSMUSG00000042182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:33849723:33883560:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_027159 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 115 (Ccdc115), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000042493 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:34436670:34439672:-1 gene:ENSMUSG00000042111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AK154179 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630006L06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// BC019430 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 115, mRNA (cDNA clone MGC:25689 IMAGE:3491825), complete cds. // chr1 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
NM_009356 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 40 (Prss40), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006495857 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 40 (Prss40), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006495859 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 40 (Prss40), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000047840 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:34552334:34560920:-1 gene:ENSMUSG00000037529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC145989 // GenBank // Mus musculus testicular serine protease 2, mRNA (cDNA clone MGC:175876 IMAGE:40131292), complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AB008911 // GenBank // Mus musculus mRNA for TESP2, complete cds. // chr1 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// XM_006495862 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 40 (Prss40), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// ENSMUST00000115071 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:34543975:34560943:-1 gene:ENSMUSG00000037529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// AK132909 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930511E24 product:testicular serine protease 2, full insert sequence. // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// ENSMUST00000190790 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:34552345:34558111:-1 gene:ENSMUSG00000037529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000040847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:34544505:34560904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000062557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:34579224:34579613:-1 gene:ENSMUSG00000045815 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK007108 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700101I19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186712 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:34579202:34579711:-1 gene:ENSMUSG00000045815 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153408 // RefSeq // Mus musculus neuralized homolog 3 homolog (Drosophila) (Neurl3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006495847 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuralized homolog 3 homolog (Drosophila) (Neurl3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000056946 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:36264597:36273435:-1 gene:ENSMUSG00000047180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF321278 // GenBank // Mus musculus lung inducible neuralized-related C3HC4 RING finger protein (Lincr) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC056622 // GenBank // Mus musculus neuralized homolog 3 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:67771 IMAGE:4989283), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK040949 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530050E01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000009217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36266360:36275211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000188666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:36269242:36274679:-1 gene:ENSMUSG00000047180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_153502 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 23 (Ankrd23), mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000054665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:36530534:36535729:-1 gene:ENSMUSG00000067653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// AF492400 // GenBank // Mus musculus diabetes related ankyrin repeat protein (Darp) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// BC022973 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 23, mRNA (cDNA clone IMAGE:5362214), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// BC132370 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 23, mRNA (cDNA clone MGC:164001 IMAGE:40130647), complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// BC138797 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 23, mRNA (cDNA clone MGC:170424 IMAGE:8861819), complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// BC145421 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 23, mRNA (cDNA clone MGC:178987 IMAGE:9053979), complete cds. // chr1 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36531546:36535708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0
NM_026241 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 39 (Ankrd39), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000001172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:36538173:36547201:-1 gene:ENSMUSG00000079610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC117004 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 39, mRNA (cDNA clone MGC:151381 IMAGE:40126323), complete cds. // chr1 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// BC119100 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 39, mRNA (cDNA clone MGC:155416 IMAGE:8733849), complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC144893 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053441. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006495624 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 39 (Ankrd39), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000009247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36539391:36547185:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_001126047 // RefSeq // Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4C (Sema4c), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006495808 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4C (Sema4c), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006495809 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4C (Sema4c), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:36548642:36558381:-1 gene:ENSMUSG00000026121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK173247 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1739 protein. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36549539:36682044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1
NM_001126046 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), transcript variant A, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_027957 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), transcript variant B, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006496121 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:36562694:36683183:-1 gene:ENSMUSG00000046337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC114576 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 178, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:40049287), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36549539:36682044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONMMUT000577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001126046 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), transcript variant A, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NM_201365 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), transcript variant C, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006496119 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006496120 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000114981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:36599976:36683183:-1 gene:ENSMUSG00000046337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000170295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:36562694:36683183:-1 gene:ENSMUSG00000046337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC050210 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 178, member B, mRNA (cDNA clone MGC:60970 IMAGE:30009484), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006496121 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// GENSCAN00000009227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36549539:36682044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_018872 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 131 (Tmem131), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006496152 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 131 (Tmem131), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000027290 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:36792194:36939527:-1 gene:ENSMUSG00000026116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AF060565 // GenBank // Mus musculus RW1 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 37 // 41 // 0 /// AK079825 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430077D20 product:RW1 protein, full insert sequence. // chr1 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1 /// GENSCAN00000009239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:36792921:36889325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000191381 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:36800953:36816586:-1 gene:ENSMUSG00000026116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1
AK089564 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830002C21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198006 // RefSeq // Mus musculus cytochrome C oxidase assembly factor 5 (Coa5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:37417084:37430103:-1 gene:ENSMUSG00000026112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC002137 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330578E17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7247 IMAGE:3484305), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_001290801 // RefSeq // Mus musculus mannoside acetylglucosaminyltransferase 4, isoenzyme A (Mgat4a), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_173870 // RefSeq // Mus musculus mannoside acetylglucosaminyltransferase 4, isoenzyme A (Mgat4a), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000042161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:37439340:37536235:-1 gene:ENSMUSG00000026110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000143636 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:37444320:37496130:-1 gene:ENSMUSG00000026110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000151952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:37439340:37541016:-1 gene:ENSMUSG00000026110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000154819 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:37443716:37536404:-1 gene:ENSMUSG00000026110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB053217 // GenBank // Mus musculus mRNA for N-acetylglucosaminyltransferase IVa, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// AK052278 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330018H11 product:UDP-GLCNAC:A-1,3-D-MANNOSIDE B-1,4-N-ACETYLGLUCOSAMINYLTRANSFERASE IV (EC 2.4.1.145) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:37439945:37470135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_028096 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2010300C02 gene (2010300C02Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006496291 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2010300C02 gene (2010300C02Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006496293 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2010300C02 gene (2010300C02Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000160023 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:37611677:37625242:-1 gene:ENSMUSG00000026090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000162875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:37611677:37720085:-1 gene:ENSMUSG00000026090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC029089 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3599818), complete cds. // chr1 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC072639 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:99973 IMAGE:30355303), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:37547837:37665495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_026913 // RefSeq // Mus musculus MIT, microtubule interacting and transport, domain containing 1 (Mitd1), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:37878729:37890411:-1 gene:ENSMUSG00000026088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000127170 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:37878988:37881868:-1 gene:ENSMUSG00000026088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000139725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:37874801:37890407:-1 gene:ENSMUSG00000026088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC020137 // GenBank // Mus musculus MIT, microtubule interacting and transport, domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:28063 IMAGE:3709157), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000138806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:37881929:37890276:-1 gene:ENSMUSG00000026088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000028996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:37879268:37890310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0
NM_001033427 // RefSeq // Mus musculus lysozyme G-like 2 (Lyg2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496095 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lysozyme G-like 2 (Lyg2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000078307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:37905921:37916493:-1 gene:ENSMUSG00000061584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147562 // GenBank // Mus musculus lysozyme G-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:182658 IMAGE:9056552), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC147567 // GenBank // Mus musculus lysozyme G-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:182663 IMAGE:9056557), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:37907557:37915762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_027111 // RefSeq // Mus musculus lysozyme G-like 1 (Lyg1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000027254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:37946736:37957759:-1 gene:ENSMUSG00000026085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000114894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:37946738:37957759:-1 gene:ENSMUSG00000026085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000144184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:37946736:37948999:-1 gene:ENSMUSG00000026085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC119394 // GenBank // Mus musculus lysozyme G-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:155710 IMAGE:8734143), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC119396 // GenBank // Mus musculus lysozyme G-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:155712 IMAGE:8734145), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:37946885:37952782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT000640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_172054 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin domain containing 9 (Txndc9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000162031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:37983867:37997208:-1 gene:ENSMUSG00000058407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC083077 // GenBank // Mus musculus thioredoxin domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:103032 IMAGE:6466275), complete cds. // chr1 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_019570 // RefSeq // Mus musculus REV1 homolog (S. cerevisiae) (Rev1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496153 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus REV1 homolog (S. cerevisiae) (Rev1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006496159 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus REV1 homolog (S. cerevisiae) (Rev1), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006496161 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus REV1 homolog (S. cerevisiae) (Rev1), transcript variant X9, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006496162 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus REV1 homolog (S. cerevisiae) (Rev1), transcript variant X10, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000027251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:38052787:38129662:-1 gene:ENSMUSG00000026082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB057418 // GenBank // Mus musculus Rev1 mRNA for deoxycytidyl transferase, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF179302 // GenBank // Mus musculus REV1 protein (Rev1) mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// BC006721 // GenBank HTC // Mus musculus REV1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:3710943), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC058093 // GenBank // Mus musculus REV1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:66950 IMAGE:6827108), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:38053087:38129915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001290814 // RefSeq // Mus musculus AF4/FMR2 family, member 3 (Aff3), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 45 // 45 // 0 /// XM_006495737 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus AF4/FMR2 family, member 3 (Aff3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000027250 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:38335431:38664955:-1 gene:ENSMUSG00000037138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000039827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:38177327:38664955:-1 gene:ENSMUSG00000037138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000095027 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:38177326:38627185:-1 gene:ENSMUSG00000037138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000136641 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:38181262:38197443:-1 gene:ENSMUSG00000037138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 20 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000142875 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:38179243:38627201:-1 gene:ENSMUSG00000037138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 82 // 42 // 42 // 0 /// AK046648 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430219L17 product:similar to LAF-4 PROTEIN (LYMPHOID NUCLEAR PROTEIN RELATED TO AF4) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 31 // 16 // 16 // 0 /// BC052061 // GenBank // Mus musculus AF4/FMR2 family, member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5702935). // chr1 // 100 // 86 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000032650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:38179449:38218535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 23 // 23 // 0
NM_001029878 // RefSeq // Mus musculus LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2 (Lonrf2), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000039612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:38794509:38821215:-1 gene:ENSMUSG00000048814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000147695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:38793669:38836090:-1 gene:ENSMUSG00000048814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC139127 // GenBank // Mus musculus LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:170754 IMAGE:8862149), complete cds. // chr1 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// BC139130 // GenBank // Mus musculus LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:170757 IMAGE:8862152), complete cds. // chr1 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000032652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:38794375:38836428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0
NM_145142 // RefSeq // Mus musculus carbohydrate sulfotransferase 10 (Chst10), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006496365 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carbohydrate sulfotransferase 10 (Chst10), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000027249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:38863877:38898160:-1 gene:ENSMUSG00000026080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AF360543 // GenBank // Mus musculus HNK-1 sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AK047378 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930054A18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// BC132223 // GenBank // Mus musculus carbohydrate sulfotransferase 10, mRNA (cDNA clone MGC:163854 IMAGE:40130500), complete cds. // chr1 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// BC132225 // GenBank // Mus musculus carbohydrate sulfotransferase 10, mRNA (cDNA clone MGC:163856 IMAGE:40130502), complete cds. // chr1 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// AK171758 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830008N17 product:carbohydrate sulfotransferase 10, full insert sequence. // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000032641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:38865498:38886592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_018775 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 8 (Tbc1d8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006496146 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TBC1 domain family, member 8 (Tbc1d8), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000054462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:39371499:39478747:-1 gene:ENSMUSG00000003134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AK141816 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130009N18 product:TBC1 domain family, member 8, full insert sequence. // chr1 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// BC065081 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:86046 IMAGE:6832495), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// U88873 // GenBank // Mus musculus BUB2-like protein 1 (HBLP1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000020000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:39372349:39478566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0
NM_001033135 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 149 (Rnf149), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006496226 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 149 (Rnf149), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000062525 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:39551296:39577405:-1 gene:ENSMUSG00000048234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC115968 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 149, mRNA (cDNA clone MGC:144892 IMAGE:40107454), complete cds. // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000019991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:39560650:39577274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000083002 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:39573746:39573875:-1 gene:ENSMUSG00000064936 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000019988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:39590994:39600690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_170597 // RefSeq // Mus musculus cellular repressor of E1A-stimulated genes 2 (Creg2), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006496005 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cellular repressor of E1A-stimulated genes 2 (Creg2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000053355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:39618406:39651182:-1 gene:ENSMUSG00000050967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB046110 // GenBank // Mus musculus mCREG2 mRNA for CREG2, complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC116790 // GenBank // Mus musculus cellular repressor of E1A-stimulated genes 2, mRNA (cDNA clone MGC:151167 IMAGE:40126109), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC116792 // GenBank // Mus musculus cellular repressor of E1A-stimulated genes 2, mRNA (cDNA clone MGC:151169 IMAGE:40126111), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000020004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:39626053:39720942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001145660 // RefSeq // Mus musculus regulatory factor X 8 (Rfx8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151913 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:39665306:39720997:-1 gene:ENSMUSG00000057173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:39626053:39720942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_172499 // RefSeq // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 9 (Mfsd9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000039672 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:40772038:40790663:-1 gene:ENSMUSG00000041945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000131390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:40772041:40790687:-1 gene:ENSMUSG00000041945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC057633 // GenBank // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:67711 IMAGE:4035998), complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// ENSMUST00000144385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:40781230:40790657:-1 gene:ENSMUSG00000041945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// AK170820 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630201P15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:40773753:40790619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
ENSMUST00000178542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:40863734:40864219:-1 gene:ENSMUSG00000094136 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:40863734:40877486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013025 // RefSeq // Mus musculus transforming growth factor, beta receptor associated protein 1 (Tgfbrap1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006496301 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transforming growth factor, beta receptor associated protein 1 (Tgfbrap1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000095014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:43047200:43098622:-1 gene:ENSMUSG00000070939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK141742 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030049N14 product:tansforming growth factor, beta receptor associated protein 1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC138866 // GenBank // Mus musculus transforming growth factor, beta receptor associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170493 IMAGE:8861888), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC138867 // GenBank // Mus musculus transforming growth factor, beta receptor associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170494 IMAGE:8861889), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:43047220:43092729:-1 gene:ENSMUSG00000070939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000188728 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:43059891:43092447:-1 gene:ENSMUSG00000070939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:43049659:43086418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0
NM_001289533 // RefSeq // Mus musculus four and a half LIM domains 2 (Fhl2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_010212 // RefSeq // Mus musculus four and a half LIM domains 2 (Fhl2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000008280 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:43123074:43163961:-1 gene:ENSMUSG00000008136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AF114381 // GenBank // Mus musculus four and half LIM domain protein 2 (Fhl2) mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 69 // 18 // 20 // 0 /// AF153340 // GenBank // Mus musculus four and a half LIM-domain protein DRAL mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// BC021468 // GenBank // Mus musculus four and a half LIM domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:29060 IMAGE:5066565), complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// U77040 // GenBank // Mus musculus LIM protein FHL2 (FHL2) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// AF055889 // GenBank // Mus musculus LIM protein FHL2 (Fhl2) mRNA, complete cds. // chr1 // 70 // 79 // 16 // 23 // 0 /// ENSMUST00000185893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:43123290:43196984:-1 gene:ENSMUSG00000008136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:43123514:43153231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
XM_006496227 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UDP-glucuronate decarboxylase 1 (Uxs1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000076997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:43749512:43827741:-1 gene:ENSMUSG00000057363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000126008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:43746966:43827800:-1 gene:ENSMUSG00000057363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC037049 // GenBank // Mus musculus UDP-glucuronate decarboxylase 1, mRNA (cDNA clone MGC:47494 IMAGE:4935237), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_026430 // RefSeq // Mus musculus UDP-glucuronate decarboxylase 1 (Uxs1), mRNA. // chr1 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// AF399958 // GenBank // Mus musculus UDP-glucuronic acid decarboxylase (Uxs1) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// GENSCAN00000000695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:43750231:43780122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_001013799 // RefSeq // Mus musculus methyltransferase like 21C (Mettl21c), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496127 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methyltransferase like 21C (Mettl21c), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000061421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:44009408:44020006:-1 gene:ENSMUSG00000047343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147328 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A530098C11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182500 IMAGE:9056394), complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC147329 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A530098C11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182520 IMAGE:9056414), complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000159881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:44010510:44020034:-1 gene:ENSMUSG00000047343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000162750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:44009935:44017468:-1 gene:ENSMUSG00000047343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// AK163176 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730069E18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000002082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:44005224:44018715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONMMUT000783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XM_006496395 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102636082 (LOC102636082), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:44055952:44061936:-1 gene:ENSMUSG00000091844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:44025071:44084549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207281 // RefSeq // Mus musculus methyltransferase like 21E (Mettl21e), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054801 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:44204070:44218961:-1 gene:ENSMUSG00000046828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC100531 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4832428D23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118402 IMAGE:30292619), complete cds. // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000150062 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:44206425:44218913:-1 gene:ENSMUSG00000046828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000002100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:44206350:44216347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSMUST00000186385 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:44463923:44464231:-1 gene:ENSMUSG00000101567 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000002097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:44460544:44464231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_007737 // RefSeq // Mus musculus collagen, type V, alpha 2 (Col5a2), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 57 // 57 // 0 /// ENSMUST00000086430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:45374321:45503282:-1 gene:ENSMUSG00000026042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 57 // 57 // 0 /// ENSMUST00000134681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:45414199:45503282:-1 gene:ENSMUSG00000026042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 29 // 17 // 17 // 0 /// BC055077 // GenBank // Mus musculus collagen, type V, alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:60628 IMAGE:30059991), complete cds. // chr1 // 95 // 95 // 52 // 55 // 0 /// L02918 // GenBank // Mouse procollagen type V alpha 2 (Col5a-2) mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 91 // 45 // 53 // 0 /// AK080811 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230306G11 product:procollagen, type V, alpha 2, full insert sequence. // chr1 // 26 // 26 // 15 // 58 // 1 /// ENSMUST00000150143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:45389031:45393634:-1 gene:ENSMUSG00000026042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 14 // 14 // 8 // 58 // 1 /// AK149043 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120478J22 product:procollagen, type V, alpha 2, full insert sequence. // chr1 // 14 // 14 // 8 // 58 // 1 /// GENSCAN00000052088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:45376084:45427050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 67 // 37 // 39 // 0 /// NONMMUT000807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 29 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT000806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 14 // 14 // 8 // 58 // 1
ENSMUST00000179545 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:45685456:45685562:-1 gene:ENSMUSG00000095121 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT000810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_016917 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 40 (iron-regulated transporter), member 1 (Slc40a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:45908068:45925582:-1 gene:ENSMUSG00000025993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF215637 // GenBank // Mus musculus SLC11A3 iron transporter mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AF226613 // GenBank // Mus musculus ferroportin1 (Fpn1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AF231120 // GenBank // Mus musculus iron-regulated transporter IREG1 (Ireg1) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC003438 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 40 (iron-regulated transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:6489 IMAGE:2647365), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AK033987 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330134D20 product:solute carrier family 39 (iron-regulated transporter), member 1, full insert sequence. // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:45909406:45921431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000191247 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:45915241:45925609:-1 gene:ENSMUSG00000025993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000186822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:45918936:45925262:-1 gene:ENSMUSG00000025993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NR_037691 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4776 (Gm4776), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000051224 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:46020072:46030469:-1 gene:ENSMUSG00000044457 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000171707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:46020415:46030437:-1 gene:ENSMUSG00000044457 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// NR_037690 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4776 (Gm4776), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// ENSMUST00000167676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:46020415:46030437:-1 gene:ENSMUSG00000044457 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
ENSMUST00000083009 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:48462173:48462293:-1 gene:ENSMUSG00000064943 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 60 // 60 // 9 // 15 // 0 /// NONMMUT000830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 9 // 15 // 0
ENSMUST00000189223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:48731579:48733090:-1 gene:ENSMUSG00000101721 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:48731997:48796216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
ENSMUST00000186262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:49579150:49579586:-1 gene:ENSMUSG00000099882 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000185162 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:51938974:51939095:-1 gene:ENSMUSG00000099135 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000083258 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:52444436:52444544:-1 gene:ENSMUSG00000065192 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008667 // RefSeq // Mus musculus Ngfi-A binding protein 1 (Nab1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006495771 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ngfi-A binding protein 1 (Nab1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000069792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:52457294:52500679:-1 gene:ENSMUSG00000002881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167732 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:52459241:52467057:-1 gene:ENSMUSG00000002881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000170269 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:52459218:52490736:-1 gene:ENSMUSG00000002881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC005627 // GenBank // Mus musculus Ngfi-A binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:7025 IMAGE:3155795), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC016886 // GenBank // Mus musculus Ngfi-A binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:18399 IMAGE:4236565), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U47008 // GenBank // Mus musculus transcriptional repressor (NAB1) NAB1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000186764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:52457294:52500300:-1 gene:ENSMUSG00000002881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000019646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:52453635:52500296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
ENSMUST00000180794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:52503234:52504229:-1 gene:ENSMUSG00000097833 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000019642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:52503342:52554372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_008384 // RefSeq // Mus musculus inositol polyphosphate-1-phosphatase (Inpp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006495736 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inositol polyphosphate-1-phosphatase (Inpp1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000027271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:52785427:52817688:-1 gene:ENSMUSG00000026102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000162351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:52796979:52817451:-1 gene:ENSMUSG00000026102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000162576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:52794665:52817568:-1 gene:ENSMUSG00000026102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000177279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:52789668:52799488:-1 gene:ENSMUSG00000026102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC025072 // GenBank // Mus musculus inositol polyphosphate-1-phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:36129 IMAGE:4456812), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// U27295 // GenBank // Mus musculus inositol polyphosphate 1-phosphatase mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159607 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:52790056:52795048:-1 gene:ENSMUSG00000026102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONMMUT000898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000019650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:52770950:52799488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_027070 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019A02 gene (1700019A02Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_373260 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700019A02 gene (1700019A02Rik), transcript variant X4, misc_RNA. // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000072235 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:53158577:53187636:-1 gene:ENSMUSG00000060715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000190748 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:53158600:53187608:-1 gene:ENSMUSG00000060715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153556 // RefSeq // Mus musculus postmeiotic segregation increased 1 (S. cerevisiae) (Pms1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006495940 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus postmeiotic segregation increased 1 (S. cerevisiae) (Pms1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000027267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:53189187:53297018:-1 gene:ENSMUSG00000026098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000135246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:53197112:53297017:-1 gene:ENSMUSG00000026098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC028939 // GenBank // Mus musculus postmeiotic segregation increased 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:36491 IMAGE:5364251), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:53182701:53255845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
NM_001252070 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 7A (Dnah7a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000094964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:53397006:53706761:-1 gene:ENSMUSG00000096141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000038696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:53405661:53700663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_133810 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine kinase 17b (apoptosis-inducing) (Stk17b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027263 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:53755506:53785224:-1 gene:ENSMUSG00000026094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY092028 // GenBank // Mus musculus DAP kinase-related apoptotic kinase 2 (Drak2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC006579 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 17b (apoptosis-inducing), mRNA (cDNA clone MGC:6721 IMAGE:3586767), complete cds. // chr1 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// ENSMUST00000185920 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:53761149:53785157:-1 gene:ENSMUSG00000026094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000038698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:53757488:53800226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001033194 // RefSeq // Mus musculus general transcription factor IIIC, polypeptide 3 (Gtf3c3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000041638 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:54396004:54438971:-1 gene:ENSMUSG00000041303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC141157 // GenBank // Mus musculus general transcription factor IIIC, polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:176118 IMAGE:9055769), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:54397880:54584569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001163314 // RefSeq // Mus musculus post-GPI attachment to proteins 1 (Pgap1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:54472994:54557682:-1 gene:ENSMUSG00000073678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT000936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163314 // RefSeq // Mus musculus post-GPI attachment to proteins 1 (Pgap1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000097739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:54472994:54557682:-1 gene:ENSMUSG00000073678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000185817 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:54524284:54557684:-1 gene:ENSMUSG00000073678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:54397880:54584569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0
NM_031179 // RefSeq // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 1 (Sf3b1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496344 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus splicing factor 3b, subunit 1 (Sf3b1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000027127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:54985169:55027481:-1 gene:ENSMUSG00000025982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB037890 // GenBank // Mus musculus Sf3b1 mRNA for pre-mRNA splicing factor SF3b 155 kDa subunit, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058563 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6440875). // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC037098 // GenBank HTC // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5347143), with apparent retained intron. // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:54990239:55027525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000187500 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:55003151:55027464:-1 gene:ENSMUSG00000025982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
AK143349 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330011M16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_010477 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 1 (chaperonin) (Hspd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006495706 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heat shock protein 1 (chaperonin) (Hspd1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000027123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:55077835:55088024:-1 gene:ENSMUSG00000025980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC016400 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 1 (chaperonin), mRNA (cDNA clone MGC:6709 IMAGE:3585270), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC018545 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 1 (chaperonin), mRNA (cDNA clone IMAGE:3602208), complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// BC106112 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 1 (chaperonin), mRNA (cDNA clone IMAGE:5032757), partial cds. // chr1 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// GENSCAN00000000233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:55072420:55086939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
ENSMUST00000185999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:55120080:55120873:-1 gene:ENSMUSG00000100736 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:55120074:55131925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
NM_028713 // RefSeq // Mus musculus raftlin family member 2 (Rftn2), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000027121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:55170159:55226782:-1 gene:ENSMUSG00000025978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000114428 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:55201651:55226782:-1 gene:ENSMUSG00000025978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000132055 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:55171748:55226782:-1 gene:ENSMUSG00000025978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC026871 // GenBank // Mus musculus raftlin family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:30669 IMAGE:3966594), complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC038341 // GenBank // Mus musculus raftlin family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:28608 IMAGE:4218473), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:55171810:55215704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
XM_006496399 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor BTF3-like (LOC101055993), mRNA. // chr1 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000191444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:55370016:55370363:-1 gene:ENSMUSG00000101945 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000000242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:55370013:55406623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
NM_027661 // RefSeq // Mus musculus heat shock transcription factor, Y linked 2 (Hsfy2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000062085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:56636044:56637435:-1 gene:ENSMUSG00000045336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC049724 // GenBank // Mus musculus heat shock transcription factor, Y linked 2, mRNA (cDNA clone MGC:58721 IMAGE:6743885), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:56636198:56637376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_139146 // RefSeq // Mus musculus special AT-rich sequence binding protein 2 (Satb2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006495828 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus special AT-rich sequence binding protein 2 (Satb2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000042857 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:56793981:56972502:-1 gene:ENSMUSG00000038331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114415 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:56793986:56971858:-1 gene:ENSMUSG00000038331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000177424 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:56793988:56969872:-1 gene:ENSMUSG00000038331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// AF319623 // GenBank // Mus musculus KIAA1034-like DNA binding protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK129270 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1034 protein. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC138625 // GenBank // Mus musculus special AT-rich sequence binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:170250 IMAGE:8861645), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC138626 // GenBank // Mus musculus special AT-rich sequence binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:170251 IMAGE:8861646), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000188353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:57291425:57292401:-1 gene:ENSMUSG00000101129 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:57291904:57292308:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000188636 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:57518523:57519412:-1 gene:ENSMUSG00000101826 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:57518523:57519087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0
NM_001025378 // RefSeq // Mus musculus origin recognition complex, subunit 2 (Orc2), transcript variant b, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NM_001271526 // RefSeq // Mus musculus origin recognition complex, subunit 2 (Orc2), transcript variant c, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NM_008765 // RefSeq // Mus musculus origin recognition complex, subunit 2 (Orc2), transcript variant a, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006495775 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus origin recognition complex, subunit 2 (Orc2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000027198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:58462771:58505109:-1 gene:ENSMUSG00000026037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000114325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:58464204:58501416:-1 gene:ENSMUSG00000026037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// AB190256 // GenBank // Mus musculus Orc2l mRNA for origin recognition complex subunit 2 isoform B, complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// BC015257 // GenBank // Mus musculus origin recognition complex, subunit 2-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:18406 IMAGE:4234871), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// U27457 // GenBank // Mus musculus origin recognition complex protein 2 homolog mORC2L mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000036057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:58464204:58501416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000190695 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:58483698:58504925:-1 gene:ENSMUSG00000026037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_172513 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 126, member B (Fam126b), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006495835 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 126, member B (Fam126b), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000038372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:58529083:58586191:-1 gene:ENSMUSG00000038174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000097724 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:58527021:58586266:-1 gene:ENSMUSG00000038174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000161000 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:58552187:58586275:-1 gene:ENSMUSG00000038174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000161600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:58522806:58586323:-1 gene:ENSMUSG00000038174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC068302 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 126, member B, mRNA (cDNA clone MGC:76460 IMAGE:30431671), complete cds. // chr1 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// ENSMUST00000187717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:58527743:58565954:-1 gene:ENSMUSG00000038174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:58510736:58558027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000191562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:58625214:58625565:-1 gene:ENSMUSG00000100202 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:58616145:58625432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_172406 // RefSeq // Mus musculus trafficking protein, kinesin binding 2 (Trak2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000027186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:58900449:58973430:-1 gene:ENSMUSG00000026028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000174120 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:58903504:58946337:-1 gene:ENSMUSG00000026028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC060681 // GenBank // Mus musculus trafficking protein, kinesin binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:66607 IMAGE:6410345), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:58903504:58946337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
XM_006543608 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102636554 (LOC102636554), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054653 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:58997315:59006218:-1 gene:ENSMUSG00000047383 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015211 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930427H07 product:weakly similar to ALS2CR11 PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:58997263:59094860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_175200 // RefSeq // Mus musculus amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) chromosome region, candidate 11 (human) (Als2cr11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000097080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:59050506:59094900:-1 gene:ENSMUSG00000072295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC118929 // GenBank // Mus musculus amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) chromosome region, candidate 11 (human), mRNA (cDNA clone MGC:143518 IMAGE:40090362), complete cds. // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:58997263:59094860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001159948 // RefSeq // Mus musculus amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) (Als2), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NM_028717 // RefSeq // Mus musculus amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) (Als2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_146109 // RefSeq // Mus musculus amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) (Als2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000027178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:59162926:59237231:-1 gene:ENSMUSG00000026024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000159166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:59191609:59237231:-1 gene:ENSMUSG00000026024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000163058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:59164058:59237093:-1 gene:ENSMUSG00000026024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// AB053307 // GenBank // Mus musculus Als2 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// BC031479 // GenBank // Mus musculus amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:27807 IMAGE:3257574), complete cds. // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// BC046828 // GenBank // Mus musculus amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:61402 IMAGE:6409924), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:59144650:59221561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
NM_027407 // RefSeq // Mus musculus islet cell autoantigen 1-like (Ica1l), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006496272 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus islet cell autoantigen 1-like (Ica1l), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000027172 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:59989068:60043087:-1 gene:ENSMUSG00000026018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC079669 // GenBank // Mus musculus islet cell autoantigen 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:90771 IMAGE:30355976), complete cds. // chr1 // 94 // 91 // 29 // 31 // 0 /// ENSMUST00000189776 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:59991124:60028229:-1 gene:ENSMUSG00000026018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000191251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:59989075:60043122:-1 gene:ENSMUSG00000026018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:59989816:60028229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0
NM_001199060 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 12 (Wdr12), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NM_001199061 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 12 (Wdr12), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NM_021312 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 12 (Wdr12), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000027173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:60069785:60097908:-1 gene:ENSMUSG00000026019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000117438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:60076868:60098645:-1 gene:ENSMUSG00000026019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000122038 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:60076868:60098146:-1 gene:ENSMUSG00000026019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC052386 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 12, mRNA (cDNA clone MGC:63308 IMAGE:6418498), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC004748 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 12, mRNA (cDNA clone MGC:7936 IMAGE:3583955), complete cds. // chr1 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// BC096651 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 12, mRNA (cDNA clone MGC:106820 IMAGE:1514703), complete cds. // chr1 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// AF239765 // GenBank // Mus musculus nuclear protein Ytm1p mRNA, complete cds. // chr1 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// AY059431 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 12 (Wdr12) mRNA, complete cds. // chr1 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// GENSCAN00000009672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:60042519:60097547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001045513 // RefSeq // Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 (Raph1), mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// XM_006496322 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 (Raph1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006496327 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 (Raph1), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000027168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:60483236:60566765:-1 gene:ENSMUSG00000026014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000090293 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:60490676:60566769:-1 gene:ENSMUSG00000026014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000140485 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:60482292:60566779:-1 gene:ENSMUSG00000026014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000182085 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:60483185:60499550:-1 gene:ENSMUSG00000026014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// XM_006496326 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 (Raph1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// GENSCAN00000009669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:60478105:60567341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
AF362573 // GenBank HTC // Mus musculus L115 (L115) mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
NM_146250 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 1 (Gpr1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006495980 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 1 (Gpr1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006495981 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 1 (Gpr1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000050536 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:63182691:63214543:-1 gene:ENSMUSG00000046856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC032934 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:41704 IMAGE:1363204), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000187533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:63208742:63214223:-1 gene:ENSMUSG00000046856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000000915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:63183013:63244533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENSMUST00000083151 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:63300280:63300383:-1 gene:ENSMUSG00000094214 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT001244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_025596 // RefSeq // Mus musculus PRELI domain containing 1 (Prelid1), mRNA. // chr1 // 77 // 100 // 23 // 30 // 0 /// ENSMUST00000021942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:13:55322055:55325271:1 gene:ENSMUSG00000021486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 100 // 23 // 30 // 0 /// ENSMUST00000120413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:63364720:63365365:-1 gene:ENSMUSG00000081643 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK012144 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610524G07 product:PX19 (SBBI12) (PX19-LIKE PROTEIN) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC025859 // GenBank // Mus musculus PRELI domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:30986 IMAGE:5251367), complete cds. // chr1 // 77 // 100 // 23 // 30 // 0 /// BC098241 // GenBank // Mus musculus PRELI domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:106798 IMAGE:5254697), complete cds. // chr1 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// ENSMUST00000175771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:14:122494613:122495251:-1 gene:ENSMUSG00000093669 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 33 // 100 // 10 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:13:55322190:55324972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 100 // 23 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:63324966:63373107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSMUST00000126954 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:63664220:63686910:-1 gene:ENSMUSG00000069085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK158076 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930026G16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// NM_001081658 // RefSeq // Mus musculus dystrotelin (Dytn), mRNA. // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENSMUST00000090313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:63622851:63686927:-1 gene:ENSMUSG00000069085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// DQ443727 // GenBank // Mus musculus dystrotelin mRNA, complete cds. // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000000882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:63623015:63726603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_029696 // RefSeq // Mus musculus malate dehydrogenase 1B, NAD (soluble) (Mdh1b), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000114094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:63698819:63730318:-1 gene:ENSMUSG00000025963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC050786 // GenBank // Mus musculus malate dehydrogenase 1B, NAD (soluble), mRNA (cDNA clone MGC:58554 IMAGE:6703279), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000000882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:63623015:63726603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0
NM_001256158 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933402D24 gene (4933402D24Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:63754907:63769267:-1 gene:ENSMUSG00000025961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000120280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:63844827:63845578:-1 gene:ENSMUSG00000080817 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_025964 // RefSeq // Mus musculus methyltransferase like 21A (Mettl21a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496203 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methyltransferase like 21A (Mettl21a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000053469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:64606480:64617168:-1 gene:ENSMUSG00000025956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:64606473:64617242:-1 gene:ENSMUSG00000025956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000161264 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:64614204:64617184:-1 gene:ENSMUSG00000025956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AK011433 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610017G06 product:HEPATOCELLULAR CARCINOMA-ASSOCIATED ANTIGEN HCA557B homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// BC026952 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 119, member A, mRNA (cDNA clone MGC:30396 IMAGE:4483032), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006496205 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methyltransferase like 21A (Mettl21a), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:64607740:64616419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001042659 // RefSeq // Mus musculus frizzled homolog 5 (Drosophila) (Fzd5), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_022721 // RefSeq // Mus musculus frizzled homolog 5 (Drosophila) (Fzd5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000063982 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:64730558:64737751:-1 gene:ENSMUSG00000045005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000116133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:64734469:64737749:-1 gene:ENSMUSG00000045005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// BC117723 // GenBank // Mus musculus frizzled homolog 5 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:141642 IMAGE:40088671), complete cds. // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000007567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:64734843:64779975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_001039493 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family M, member 3 (Plekhm3), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000097713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:64789121:64956824:-1 gene:ENSMUSG00000051344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000139649 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:64785983:64956824:-1 gene:ENSMUSG00000051344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC063098 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family M, member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:30286690). // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140857 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:64860298:64928097:-1 gene:ENSMUSG00000051344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// AK172220 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830107B19 product:Hypothetical pleckstrin homology homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_027582 // RefSeq // Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member C-like (Akr1cl), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006496283 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member C-like (Akr1cl), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000069142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:65012689:65032759:-1 gene:ENSMUSG00000025955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000159566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:65016068:65032686:-1 gene:ENSMUSG00000025955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000162800 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:65012689:65032747:-1 gene:ENSMUSG00000025955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK014937 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921521F21 product:PROSTAGLANDIN F SYNTHASE (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC051128 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921521F21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58127 IMAGE:6707386), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:65013113:65030648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_007776 // RefSeq // Mus musculus crystallin, gamma D (Crygd), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000045028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:65061872:65063452:-1 gene:ENSMUSG00000067299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// BC057013 // GenBank // Mus musculus crystallin, gamma D, mRNA (cDNA clone MGC:67067 IMAGE:6824399), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC132116 // GenBank // Mus musculus crystallin, gamma D, mRNA (cDNA clone MGC:163747 IMAGE:40130393), complete cds. // chr1 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// BC132118 // GenBank // Mus musculus crystallin, gamma D, mRNA (cDNA clone MGC:163749 IMAGE:40130395), complete cds. // chr1 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// K02583 // GenBank // Mouse gamma-D-crystallin (gamma-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:65048624:65073505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
NM_001082573 // RefSeq // Mus musculus crystallin, gamma C (Crygc), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_007775 // RefSeq // Mus musculus crystallin, gamma C (Crygc), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000027089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:65071525:65073689:-1 gene:ENSMUSG00000025952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000114064 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:65071531:65073521:-1 gene:ENSMUSG00000025952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC056454 // GenBank // Mus musculus crystallin, gamma C, mRNA (cDNA clone MGC:67068 IMAGE:6824225), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// EF426301 // GenBank // Mus musculus gammaC-crystallin (Crygc) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// EF426302 // GenBank // Mus musculus gammaCins-crystallin splice variant (Crygc) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:65048624:65073505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
NM_144761 // RefSeq // Mus musculus crystallin, gamma B (Crygb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000027090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:65080219:65082288:-1 gene:ENSMUSG00000073658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC056455 // GenBank // Mus musculus crystallin, gamma B, mRNA (cDNA clone MGC:67069 IMAGE:6824341), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// EF426303 // GenBank // Mus musculus gammaB-crystallin (Crygb) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000014000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:65080292:65130865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_007774 // RefSeq // Mus musculus crystallin, gamma A (Cryga), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000061497 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:65100389:65103373:-1 gene:ENSMUSG00000044429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000154012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:65100389:65103360:-1 gene:ENSMUSG00000044429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC056430 // GenBank // Mus musculus crystallin, gamma A, mRNA (cDNA clone MGC:66631 IMAGE:6824353), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000144760 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:65100619:65119558:-1 gene:ENSMUSG00000100846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000044816 // chr1 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// GENSCAN00000014000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:65080292:65130865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// AK021393 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130116M23 product:crystallin, gamma A, full insert sequence. // chr1 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001285881 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D630023F18 gene (D630023F18Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NM_175293 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D630023F18 gene (D630023F18Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000050047 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:65107313:65123193:-1 gene:ENSMUSG00000044816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000153330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:65108719:65123114:-1 gene:ENSMUSG00000044816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC137870 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D630023F18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169494 IMAGE:8860889), complete cds. // chr1 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// NM_001285882 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D630023F18 gene (D630023F18Rik), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000148020 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:65105285:65123214:-1 gene:ENSMUSG00000044816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000144760 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:65100619:65119558:-1 gene:ENSMUSG00000100846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000044816 // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000014000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:65080292:65130865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_001111320 // RefSeq // Mus musculus isocitrate dehydrogenase 1 (NADP+), soluble (Idh1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_010497 // RefSeq // Mus musculus isocitrate dehydrogenase 1 (NADP+), soluble (Idh1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000097709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:65158616:65179181:-1 gene:ENSMUSG00000025950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000169032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:65158618:65186479:-1 gene:ENSMUSG00000025950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF020039 // GenBank // Mus musculus NADP-dependent isocitrate dehydrogenase (Idh) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC088986 // GenBank // Mus musculus isocitrate dehydrogenase 1 (NADP+), soluble, mRNA (cDNA clone MGC:115782 IMAGE:6808731), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000188109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:65166199:65186438:-1 gene:ENSMUSG00000025950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 37 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000014006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:65154972:65175352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000188876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:65166244:65186500:-1 gene:ENSMUSG00000025950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENSMUST00000147494 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:66322276:66328796:-1 gene:ENSMUSG00000073656 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK145171 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930009L13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007381 // RefSeq // Mus musculus acyl-Coenzyme A dehydrogenase, long-chain (Acadl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000027153 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:66830839:66863277:-1 gene:ENSMUSG00000026003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000139208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:66845299:66858331:-1 gene:ENSMUSG00000026003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 92 // 36 // 12 // 13 // 0 /// BC027412 // GenBank // Mus musculus acyl-Coenzyme A dehydrogenase, long-chain, mRNA (cDNA clone MGC:36219 IMAGE:4236225), complete cds. // chr1 // 82 // 92 // 27 // 33 // 0 /// U21489 // GenBank // Mus musculus long-chain acyl-CoA dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 92 // 28 // 33 // 0 /// GENSCAN00000001365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:66849105:66863249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000001371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:66834068:66845443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_021285 // RefSeq // Mus musculus myosin, light polypeptide 1 (Myl1), transcript variant 1f, mRNA. // chr1 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// ENSMUST00000027151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:66924295:66945143:-1 gene:ENSMUSG00000061816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// ENSMUST00000160100 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:66926622:66945384:-1 gene:ENSMUSG00000061816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
ENSMUST00000143596 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:66948563:66948940:-1 gene:ENSMUSG00000094191 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000001388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:66948563:66948940:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001190984 // RefSeq // Mus musculus LanC (bacterial lantibiotic synthetase component C)-like 1 (Lancl1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001190985 // RefSeq // Mus musculus LanC (bacterial lantibiotic synthetase component C)-like 1 (Lancl1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_021295 // RefSeq // Mus musculus LanC (bacterial lantibiotic synthetase component C)-like 1 (Lancl1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000027149 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:67000517:67038865:-1 gene:ENSMUSG00000026000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000113979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:67000517:67038872:-1 gene:ENSMUSG00000026000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000119559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:67003375:67038834:-1 gene:ENSMUSG00000026000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000149996 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:67009933:67038834:-1 gene:ENSMUSG00000026000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 45 // 14 // 15 // 0 /// BC058560 // GenBank // Mus musculus LanC (bacterial lantibiotic synthetase component C)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:68071 IMAGE:6315377), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:66957479:67024480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_010154 // RefSeq // Mus musculus v-erb-a erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 4 (avian) (Erbb4), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000119142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:68032186:69107756:-1 gene:ENSMUSG00000062209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000121473 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:68032186:69108059:-1 gene:ENSMUSG00000062209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000153432 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:68250655:69107756:-1 gene:ENSMUSG00000062209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// XM_006495695 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus v-erb-a erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 4 (avian) (Erbb4), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// GENSCAN00000044902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:68192267:68413710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000044907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:68040041:68161327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000122454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:69130914:69131299:-1 gene:ENSMUSG00000084332 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000025143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:69130988:69131299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT001393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_007525 // RefSeq // Mus musculus BRCA1 associated RING domain 1 (Bard1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027393 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:71027498:71103146:-1 gene:ENSMUSG00000026196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK165525 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G130202G20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048353 // GenBank // Mus musculus, clone IMAGE:5035117, mRNA. // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONMMUT001415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007525 // RefSeq // Mus musculus BRCA1 associated RING domain 1 (Bard1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027393 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:71027498:71103146:-1 gene:ENSMUSG00000026196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK165525 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G130202G20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048353 // GenBank // Mus musculus, clone IMAGE:5035117, mRNA. // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT001415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007525 // RefSeq // Mus musculus BRCA1 associated RING domain 1 (Bard1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006495631 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BRCA1 associated RING domain 1 (Bard1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006495632 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BRCA1 associated RING domain 1 (Bard1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 95 // 64 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000027393 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:71027498:71103146:-1 gene:ENSMUSG00000026196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF057157 // GenBank // Mus musculus BRCA1-associated RING domain protein (Bard1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC128370 // GenBank // Mus musculus BRCA1 associated RING domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:150286 IMAGE:40111665), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC128371 // GenBank // Mus musculus BRCA1 associated RING domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:150287 IMAGE:40111666), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:71030520:71102750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000188170 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:71155246:71156020:-1 gene:ENSMUSG00000101551 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000016801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:71107835:71162387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
ENSMUST00000191383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:71709705:71710055:-1 gene:ENSMUSG00000101834 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000016786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:71709702:71710055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000191412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:71714048:71714924:-1 gene:ENSMUSG00000100319 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000016803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:71714239:71729163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_001005423 // RefSeq // Mus musculus melanoregulin (Mreg), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006496111 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus melanoregulin (Mreg), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000048860 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:72159442:72212307:-1 gene:ENSMUSG00000039395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY628210 // GenBank // Mus musculus dilute suppressor protein (Dsu) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC068125 // GenBank // Mus musculus melanoregulin, mRNA (cDNA clone MGC:92980 IMAGE:6828150), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:72160885:72195229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001045533 // RefSeq // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 4 (March4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496112 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 4 (March4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// XM_006496113 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 4 (March4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000047786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:72427112:72536930:-1 gene:ENSMUSG00000039372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK122502 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1399 protein. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC098191 // GenBank // Mus musculus membrane-associated ring finger (C3HC4) 4, mRNA (cDNA clone MGC:107707 IMAGE:6832500), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_176980 // RefSeq // Mus musculus ankyrin and armadillo repeat containing (Ankar), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006496061 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin and armadillo repeat containing (Ankar), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000053499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:72642980:72700564:-1 gene:ENSMUSG00000039342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC132415 // GenBank // Mus musculus ankyrin and armadillo repeat containing, mRNA (cDNA clone MGC:164046 IMAGE:40130692), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC145253 // GenBank // Mus musculus ankyrin and armadillo repeat containing, mRNA (cDNA clone MGC:178813 IMAGE:9053805), complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000052804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:72643007:72699021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
NM_010518 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 5 (Igfbp5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027377 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:72857932:72874884:-1 gene:ENSMUSG00000026185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000137339 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:72858065:72874275:-1 gene:ENSMUSG00000026185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC026805 // GenBank HTC // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:3979276), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// BC054812 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:65658 IMAGE:6841070), complete cds. // chr1 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC057447 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:65274 IMAGE:2648602), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// L12447 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 5 (IGFBP5) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:72862377:72874139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_009407 // RefSeq // Mus musculus transition protein 1 (Tnp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:73015074:73015909:-1 gene:ENSMUSG00000026182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048494 // GenBank // Mus musculus transition protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:58319 IMAGE:6775189), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061170 // GenBank // Mus musculus transition protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:74307 IMAGE:6773623), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:72963648:73050467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_027884 // RefSeq // Mus musculus tensin 1 (Tns1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006495874 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tensin 1 (Tns1), transcript variant X12, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006495881 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tensin 1 (Tns1), transcript variant X19, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000169786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:73910231:74124447:-1 gene:ENSMUSG00000055322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000185702 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:73914093:73995372:-1 gene:ENSMUSG00000055322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000037366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:73914530:74098317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001289895 // RefSeq // Mus musculus tensin 1 (Tns1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_027884 // RefSeq // Mus musculus tensin 1 (Tns1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006495874 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tensin 1 (Tns1), transcript variant X12, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006495881 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tensin 1 (Tns1), transcript variant X19, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:73910231:74124447:-1 gene:ENSMUSG00000055322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185331 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:73914117:73995372:-1 gene:ENSMUSG00000055322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185702 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:73914093:73995372:-1 gene:ENSMUSG00000055322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187584 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:73910232:74091351:-1 gene:ENSMUSG00000055322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000191104 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:73910232:74124449:-1 gene:ENSMUSG00000055322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:73914530:74098317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006495955 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 1 (Cxcr1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY227797 // GenBank // Mus musculus CXC chemokine receptor1-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AY749637 // GenBank // Mus musculus CXC chemokine receptor 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_178241 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 1 (Cxcr1), mRNA. // chr1 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000053389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74191785:74194631:-1 gene:ENSMUSG00000048480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// AY390263 // GenBank // Mus musculus CXC chemokine receptor 1-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000190313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74191785:74193235:-1 gene:ENSMUSG00000048480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74191806:74192861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_001190444 // RefSeq // Mus musculus angio-associated migratory protein (Aamp), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_146110 // RefSeq // Mus musculus angio-associated migratory protein (Aamp), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006495957 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus angio-associated migratory protein (Aamp), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000006462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74279840:74284738:-1 gene:ENSMUSG00000006299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000178235 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74279846:74284680:-1 gene:ENSMUSG00000006299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC031795 // GenBank // Mus musculus angio-associated migratory protein, mRNA (cDNA clone MGC:30660 IMAGE:3965387), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000186833 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74279846:74284016:-1 gene:ENSMUSG00000006299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000191258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74281060:74283142:-1 gene:ENSMUSG00000006299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000037367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74280234:74284623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000187046 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:74280933:74283979:-1 gene:ENSMUSG00000006299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_027154 // RefSeq // Mus musculus transmembrane BAX inhibitor motif containing 1 (Tmbim1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000016309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74288247:74304405:-1 gene:ENSMUSG00000006301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74288253:74304361:-1 gene:ENSMUSG00000006301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74288251:74304351:-1 gene:ENSMUSG00000006301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74288251:74295695:-1 gene:ENSMUSG00000006301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AB097685 // GenBank // Mus musculus mRNA for RECS1, complete cds. // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// AK166926 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0023F12 product:similar to RECS1 protein (Responsive to centrifugal force and shear stress gene 1 protein) [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK220296 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4161 protein. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC004752 // GenBank // Mus musculus transmembrane BAX inhibitor motif containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:7955 IMAGE:3584518), complete cds. // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74289372:74295399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_153111 // RefSeq // Mus musculus FEV (ETS oncogene family) (Fev), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000068631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74881509:74885419:-1 gene:ENSMUSG00000055197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159232 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:74882006:74885322:-1 gene:ENSMUSG00000055197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AY049085 // GenBank // Mus musculus ETS-domain transcription factor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138435 // GenBank // Mus musculus FEV (ETS oncogene family), mRNA (cDNA clone MGC:170060 IMAGE:8861455), complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC138436 // GenBank // Mus musculus FEV (ETS oncogene family), mRNA (cDNA clone MGC:170061 IMAGE:8861456), complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC145276 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053830. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000054721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74882076:74885788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_021541 // RefSeq // Mus musculus crystallin, beta A2 (Cryba2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006495657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, beta A2 (Cryba2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006495658 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, beta A2 (Cryba2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000006721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74889934:74893143:-1 gene:ENSMUSG00000006546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY160973 // GenBank // Mus musculus betaA2-crystallin (cryba2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC052746 // GenBank // Mus musculus crystallin, beta A2, mRNA (cDNA clone MGC:63254 IMAGE:6824801), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC056989 // GenBank // Mus musculus crystallin, beta A2, mRNA (cDNA clone MGC:66910 IMAGE:6824245), complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000133833 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74890531:74892892:-1 gene:ENSMUSG00000006546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74887914:74951214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// NONMMUT001562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NR_029876 // RefSeq // Mus musculus microRNA 375 (Mir375), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083682 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:74900652:74900726:-1 gene:ENSMUSG00000065616 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74887914:74951214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// mmu-mir-375 // miRBase Micro RNA Database // MI0000792 Mus musculus miR-375 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039495 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 108 (Ccdc108), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006495992 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 108 (Ccdc108), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006495994 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 108 (Ccdc108), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000094844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74902071:74935599:-1 gene:ENSMUSG00000047021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000139950 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74922303:74935594:-1 gene:ENSMUSG00000047021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// AK038623 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230051F10 product:hypothetical PapD-like structure containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// AK046272 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230363K08 product:hypothetical PapD-like structure containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// BC150939 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 108, mRNA (cDNA clone MGC:183850 IMAGE:9087850), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000130489 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74923392:74935592:-1 gene:ENSMUSG00000047021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// GENSCAN00000054713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74887914:74951214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
NM_010544 // RefSeq // Mus musculus Indian hedgehog (Ihh), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74945315:74951672:-1 gene:ENSMUSG00000006538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC046984 // GenBank // Mus musculus Indian hedgehog, mRNA (cDNA clone MGC:54436 IMAGE:6477118), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U85610 // GenBank // Mus musculus Indian hedgehog protein (Ihh) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK090147 // GenBank HTC // Mus musculus adult male intestinal mucosa cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630005N21 product:Indian hedgehog homolog, (Drosophila), full insert sequence. // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000189364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:74947724:74951442:-1 gene:ENSMUSG00000006538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000054713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:74887914:74951214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_029342 // RefSeq // Mus musculus nonhomologous end-joining factor 1 (Nhej1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000152855 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:74967139:75046639:-1 gene:ENSMUSG00000026162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC006063 // GenBank // Mus musculus nonhomologous end-joining factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:8243 IMAGE:3591824), complete cds. // chr1 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// BC107252 // GenBank // Mus musculus nonhomologous end-joining factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:130191 IMAGE:40052353), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC107253 // GenBank // Mus musculus nonhomologous end-joining factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:130192 IMAGE:40052354), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC132359 // GenBank // Mus musculus nonhomologous end-joining factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:163990 IMAGE:40130636), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC132361 // GenBank // Mus musculus nonhomologous end-joining factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:163992 IMAGE:40130638), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK006481 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700029B21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_009049 // RefSeq // Mus musculus regulated endocrine-specific protein 18 (Resp18), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000039534 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:75272199:75278415:-1 gene:ENSMUSG00000033061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC027535 // GenBank // Mus musculus regulated endocrine-specific protein 18, mRNA (cDNA clone MGC:41217 IMAGE:3376899), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// FJ621497 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 regulated endocrine-specific protein 18 isoform c (Resp18) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// L34214 // GenBank // Mus musculus glucocorticoid regulated endocrine protein (RESP18) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000186229 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:75272311:75278316:-1 gene:ENSMUSG00000033061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000191283 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:75272201:75274263:-1 gene:ENSMUSG00000033061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000189203 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:75274070:75278284:-1 gene:ENSMUSG00000033061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000054697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:75266466:75318098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
ENSMUST00000083281 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:77898283:77898446:-1 gene:ENSMUSG00000065215 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001159520 // RefSeq // Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// NM_008781 // RefSeq // Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006496442 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000087086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:78101270:78197134:-1 gene:ENSMUSG00000004872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC048699 // GenBank // Mus musculus paired box gene 3, mRNA (cDNA clone MGC:59364 IMAGE:6518115), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000004994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:78101267:78196838:-1 gene:ENSMUSG00000004872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 31 // 38 // 1 /// XM_006496443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// ENSMUST00000172555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:78183456:78197113:-1 gene:ENSMUSG00000004872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// AK048723 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230022H20 product:paired box gene 3, full insert sequence. // chr1 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// GENSCAN00000011468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:78088368:78196749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1
ENSMUST00000170511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:78497026:78512158:-1 gene:ENSMUSG00000090486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// BC034187 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC035947, mRNA (cDNA clone MGC:37308 IMAGE:4975064), complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// BC138135 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC035947, mRNA (cDNA clone MGC:169759 IMAGE:8861154), complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// BC138136 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC035947, mRNA (cDNA clone MGC:169760 IMAGE:8861155), complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000190853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:78497029:78501165:-1 gene:ENSMUSG00000090486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_009129 // RefSeq // Mus musculus secretogranin II (Scg2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049972 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:79434669:79440120:-1 gene:ENSMUSG00000050711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048249 // GenBank // Mus musculus secretogranin II, mRNA (cDNA clone MGC:54765 IMAGE:6493827), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000185234 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:79434669:79440042:-1 gene:ENSMUSG00000050711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:79435151:79437004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_173425 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 124, member B (Fam124b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:80198706:80213944:-1 gene:ENSMUSG00000043230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC150872 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 124, member B, mRNA (cDNA clone MGC:183783 IMAGE:9087783), complete cds. // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// XM_006496484 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 124, member B (Fam124b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000008629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:80199910:80204429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_016716 // RefSeq // Mus musculus cullin 3 (Cul3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000163119 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:80264923:80340480:-1 gene:ENSMUSG00000004364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000164108 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:80266823:80340311:-1 gene:ENSMUSG00000004364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF129738 // GenBank // Mus musculus cullin 3 (Cul3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK129174 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0617 protein. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC027304 // GenBank // Mus musculus cullin 3, mRNA (cDNA clone MGC:28933 IMAGE:3981170), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:80267156:80341683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000164487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:80383104:80385185:-1 gene:ENSMUSG00000090637 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:80383104:80385206:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_010570 // RefSeq // Mus musculus insulin receptor substrate 1 (Irs1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496441 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus insulin receptor substrate 1 (Irs1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000069799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:82233101:82291416:-1 gene:ENSMUSG00000055980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK142242 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330018O06 product:insulin receptor substrate 1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// L24563 // GenBank // Mouse insulin receptor substrate-1 (IRS-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:82286798:82303968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_007735 // RefSeq // Mus musculus collagen, type IV, alpha 4 (Col4a4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000087050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:82448423:82586849:-1 gene:ENSMUSG00000067158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AF169388 // GenBank // Mus musculus alpha 4 collagen IV (Col4a4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC117709 // GenBank // Mus musculus collagen, type IV, alpha 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:40087152), complete cds. // chr1 // 100 // 40 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000033860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:82441565:82553460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 73 // 34 // 35 // 0
NM_025453 // RefSeq // Mus musculus transmembrane 4 L six family member 20 (Tm4sf20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:82756649:82768461:-1 gene:ENSMUSG00000026149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138787 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:82757402:82768461:-1 gene:ENSMUSG00000026149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC117736 // GenBank // Mus musculus transmembrane 4 L six family member 20, mRNA (cDNA clone MGC:143474 IMAGE:40089849), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:82757432:82768417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
XR_399457 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene, 17764 (Gm17764), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000185925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:82822471:82822861:-1 gene:ENSMUSG00000100744 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000028228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:82778210:82822850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_172430 // RefSeq // Mus musculus SPHK1 interactor, AKAP domain containing (Sphkap), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006496576 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SPHK1 interactor, AKAP domain containing (Sphkap), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000053075 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:83265127:83408165:-1 gene:ENSMUSG00000026163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000159078 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:83255442:83279165:-1 gene:ENSMUSG00000026163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000160953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:83254139:83408200:-1 gene:ENSMUSG00000026163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK038638 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230052B03 product:hypothetical Signal peptidase containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC069832 // GenBank // Mus musculus SPHK1 interactor, AKAP domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:76468 IMAGE:30431760), complete cds. // chr1 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:83212353:83296305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NONMMUT063051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 1
NM_152915 // RefSeq // Mus musculus delta/notch-like EGF-related receptor (Dner), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000049126 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:84369839:84696221:-1 gene:ENSMUSG00000036766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AB067650 // GenBank // Mus musculus mRNA for transmembrane protein Bet, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AF370126 // GenBank // Mus musculus brain EGF repeat-containing transmembrane protein (Bret) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AY032924 // GenBank // Mus musculus Delta/Notch-like EGF-related receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC034634 // GenBank // Mus musculus delta/notch-like EGF-related receptor, mRNA (cDNA clone MGC:39059 IMAGE:5365190), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK030642 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330440O04 product:delta/notch-like EGF-related receptor, full insert sequence. // chr1 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000050208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:84370764:84427793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000191306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:84533944:84696019:-1 gene:ENSMUSG00000036766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_133975 // RefSeq // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 12 (Trip12), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000027421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:84721189:84839304:-1 gene:ENSMUSG00000026219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// BC044869 // GenBank HTC // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:3599851), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 100 // 38 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000186465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:84721189:84840516:-1 gene:ENSMUSG00000026219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000186648 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:84724264:84839288:-1 gene:ENSMUSG00000026219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000186894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:84754403:84839304:-1 gene:ENSMUSG00000026219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000189670 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:84724264:84749277:-1 gene:ENSMUSG00000026219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000050204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:84724618:84768731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 32 // 32 // 0
NM_027921 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 14 (Slc16a14), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027422 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:84905898:84935134:-1 gene:ENSMUSG00000026220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC023456 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 14, mRNA (cDNA clone MGC:32427 IMAGE:5041164), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:84908988:84956897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_213615 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A530032D15Rik gene (A530032D15Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006496502 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A530032D15Rik gene (A530032D15Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000160792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:85088407:85109853:-1 gene:ENSMUSG00000089844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001033290 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 55 (Gpr55), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006529457 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 55 (Gpr55), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// XM_006529460 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 55 (Gpr55), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// XM_006529463 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 55 (Gpr55), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000086975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:85938318:85961007:-1 gene:ENSMUSG00000049608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK146484 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days pregnant adult female amnion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920012I16 product:similar to G protein-coupled receptor (Fragment) [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC115578 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 55, mRNA (cDNA clone MGC:144459 IMAGE:40102229), complete cds. // chr1 // 91 // 38 // 10 // 11 // 0 /// BC115579 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 55, mRNA (cDNA clone MGC:144460 IMAGE:40102231), complete cds. // chr1 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0
NM_008311 // RefSeq // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 2B (Htr2b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000027431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:86099026:86111970:-1 gene:ENSMUSG00000026228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000155077 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:86100101:86110672:-1 gene:ENSMUSG00000026228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// AF498254 // GenBank // Mus musculus strain ILS serotonin receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AF498255 // GenBank // Mus musculus strain ISS serotonin receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC023690 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 2B, mRNA (cDNA clone MGC:36132 IMAGE:5344328), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// Z15119 // GenBank // M.musculus mRNA for serotonin receptor. // chr1 // 88 // 76 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:86099343:86110759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_010880 // RefSeq // Mus musculus nucleolin (Ncl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006529238 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleolin (Ncl), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:86344719:86359400:-1 gene:ENSMUSG00000026234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF318184 // GenBank // Mus musculus nucleolin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC005460 // GenBank // Mus musculus nucleolin, mRNA (cDNA clone MGC:6363 IMAGE:3495665), complete cds. // chr1 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// AK165167 // GenBank HTC // Mus musculus 8 cells embryo 8 cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E860016D17 product:nucleolin, full insert sequence. // chr1 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000026096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:86350620:86359223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000185676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:86350495:86359364:-1 gene:ENSMUSG00000026234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
ENSMUST00000082903 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:86351169:86351301:-1 gene:ENSMUSG00000064837 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_028478 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 75 (Snora75), small nucleolar RNA. // chr1 // 73 // 44 // 8 // 11 // 0 /// ENSMUST00000189504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:86351101:86352306:-1 gene:ENSMUSG00000026234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
NR_106184 // RefSeq // Mus musculus microRNA mir-3535 (Mir3535), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082762 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:86352008:86352087:-1 gene:ENSMUSG00000064696 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:86350564:86352063:-1 gene:ENSMUSG00000026234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// mmu-mir-3535 // miRBase Micro RNA Database // MI0026036 Mus musculus miR-3535 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_002851 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 82 (Snord82), small nucleolar RNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000082889 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:86356261:86356330:-1 gene:ENSMUSG00000064823 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT001838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_010341 // RefSeq // Mus musculus neuromedin U receptor 1 (Nmur1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:86386242:86388162:-1 gene:ENSMUSG00000026237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF044602 // GenBank // Mus musculus orphan G protein-coupled receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC120822 // GenBank // Mus musculus neuromedin U receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:156059 IMAGE:40129745), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC137775 // GenBank // Mus musculus neuromedin U receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:169399 IMAGE:8860794), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:86386325:86390052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_010933 // RefSeq // Mus musculus natriuretic peptide type C (Nppc), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:86666291:86670571:-1 gene:ENSMUSG00000026241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC111834 // GenBank // Mus musculus natriuretic peptide precursor type C, mRNA (cDNA clone MGC:130574 IMAGE:40055241), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:86616022:86670438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_007433 // RefSeq // Mus musculus alkaline phosphatase, placental-like 2 (Alppl2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:87086694:87089911:-1 gene:ENSMUSG00000026246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY054302 // GenBank // Mus musculus secreted embryonic phosphatase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC052874 // GenBank // Mus musculus alkaline phosphatase 5, mRNA (cDNA clone MGC:60698 IMAGE:30033693), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000188310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:87086695:87089928:-1 gene:ENSMUSG00000026246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:87087048:87089763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001081082 // RefSeq // Mus musculus alkaline phosphatase, intestinal (Alpi), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113270 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:87098002:87101606:-1 gene:ENSMUSG00000079440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:87098603:87101535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001277925 // RefSeq // Mus musculus endothelin converting enzyme-like 1 (Ecel1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// NM_021306 // RefSeq // Mus musculus endothelin converting enzyme-like 1 (Ecel1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006529122 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endothelin converting enzyme-like 1 (Ecel1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// XM_006529123 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endothelin converting enzyme-like 1 (Ecel1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000027463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:87147658:87155027:-1 gene:ENSMUSG00000026247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000160810 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:87147662:87156165:-1 gene:ENSMUSG00000026247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000161002 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:87147655:87156521:-1 gene:ENSMUSG00000026247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// AB026294 // GenBank // Mus musculus DINE mRNA for metallopeptidase, complete cds. // chr1 // 91 // 83 // 31 // 34 // 0 /// BC057569 // GenBank // Mus musculus endothelin converting enzyme-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:66922 IMAGE:6413731), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:87143131:87154989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0
ENSMUST00000178461 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:87341455:87341561:-1 gene:ENSMUSG00000095281 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT001885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001110227 // RefSeq // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 13 (Kcnj13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000113212 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:87386363:87394729:-1 gene:ENSMUSG00000079436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000174179 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:87387002:87389389:-1 gene:ENSMUSG00000079436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000052117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:87386416:87389389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_008299 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 3 (Dnajb3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119972 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:88204732:88205782:-1 gene:ENSMUSG00000081984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048490 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:58300 IMAGE:6775233), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// U95607 // GenBank // Mus musculus testis specific DNAj-homolog mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:88204950:88205678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000054674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:88262471:88277633:-1 gene:ENSMUSG00000044783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// AB162219 // GenBank // Mus musculus mfleg1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// BC057309 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6430706D22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:66590 IMAGE:6826508), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC062125 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6430706D22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:69925 IMAGE:6826662), complete cds. // chr1 // 92 // 63 // 11 // 12 // 0 /// NM_198652 // RefSeq // Mus musculus Holliday junction recognition protein (Hjurp), mRNA. // chr1 // 89 // 89 // 17 // 19 // 1
NM_008132 // RefSeq // Mus musculus glutamine repeat protein 1 (Glrp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:88499871:88510066:-1 gene:ENSMUSG00000062310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U46463 // GenBank // Mus musculus glutamine repeat protein-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// BC139128 // GenBank // Mus musculus glutamine repeat protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170755 IMAGE:8862150), complete cds. // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// BC139129 // GenBank // Mus musculus glutamine repeat protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170756 IMAGE:8862151), complete cds. // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_177305 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 4C (Arl4c), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000051236 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:88673125:88701876:-1 gene:ENSMUSG00000049866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000159814 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:88698225:88702221:-1 gene:ENSMUSG00000049866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC049804 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 4C, mRNA (cDNA clone IMAGE:6394603), partial cds. // chr1 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// BC055769 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 4C, mRNA (cDNA clone MGC:67327 IMAGE:6414771), complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000187810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:88673127:88701876:-1 gene:ENSMUSG00000049866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000041058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:88701086:88722699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000191231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:89256182:89256981:-1 gene:ENSMUSG00000102083 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:89256182:89256981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0
NM_010262 // RefSeq // Mus musculus gastrulation brain homeobox 2 (Gbx2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:89927956:89931179:-1 gene:ENSMUSG00000034486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK138361 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230078E08 product:gastrulation brain homeobox 2, full insert sequence. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC050989 // GenBank // Mus musculus gastrulation brain homeobox 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6333113). // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC116965 // GenBank // Mus musculus gastrulation brain homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:151342 IMAGE:40126284), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC120492 // GenBank // Mus musculus gastrulation brain homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:155729 IMAGE:40129415), complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// L39770 // GenBank // Mus musculus homeobox protein (Gbx-2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:89927966:89929185:-1 gene:ENSMUSG00000034486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000010720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:89928620:89934484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_029122 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing with AAA domain (Iqca), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006529917 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IQ motif containing with AAA domain (Iqca), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000113094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:90042132:90153401:-1 gene:ENSMUSG00000026301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK139726 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020013L18 product:weakly similar to Hypothetical AAA-protein [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000189690 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:90042135:90090144:-1 gene:ENSMUSG00000026301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:90042626:90073846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_029122 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing with AAA domain (Iqca), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:90042132:90153401:-1 gene:ENSMUSG00000026301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:90097595:90115175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_029122 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing with AAA domain (Iqca), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:90042132:90153401:-1 gene:ENSMUSG00000026301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:90097595:90115175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029122 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing with AAA domain (Iqca), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113094 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:90042132:90153401:-1 gene:ENSMUSG00000026301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK016353 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930585L22 product:hypothetical IQ calmodulin-binding motif containing protein, full insert sequence. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:90127144:90153401:-1 gene:ENSMUSG00000026301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:90130049:90145144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001243008 // RefSeq // Mus musculus collagen, type VI, alpha 3 (Col6a3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NM_001243009 // RefSeq // Mus musculus collagen, type VI, alpha 3 (Col6a3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000056925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:90765923:90843971:-1 gene:ENSMUSG00000048126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000097653 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:90766860:90843952:-1 gene:ENSMUSG00000048126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000130846 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:90802473:90843928:-1 gene:ENSMUSG00000048126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 23 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000136916 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:90791467:90807982:-1 gene:ENSMUSG00000048126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 34 // 16 // 16 // 0 /// AF064749 // GenBank // Mus musculus type VI collagen alpha 3 subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// AK076391 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732489C18 product:procollagen, type VI, alpha 3, full insert sequence. // chr1 // 100 // 34 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000188587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:90765923:90843971:-1 gene:ENSMUSG00000048126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000042099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:90763220:90830230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0
NM_011066 // RefSeq // Mus musculus period circadian clock 2 (Per2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000069620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:91415982:91459324:-1 gene:ENSMUSG00000055866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AF035830 // GenBank // Mus musculus PERIOD 2 (Per2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AF036893 // GenBank // Mus musculus circadian clock protein (Per2) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// AK044658 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930030B13 product:period homolog 2 (Drosophila), full insert sequence. // chr1 // 100 // 54 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:91375121:91470077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 42 // 48 // 1
XM_006529302 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histone deacetylase 4 (Hdac4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006529311 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histone deacetylase 4 (Hdac4), transcript variant X10, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006529314 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histone deacetylase 4 (Hdac4), transcript variant X13, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:91928779:92180341:-1 gene:ENSMUSG00000026313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000073617 // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK170461 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630104H03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_024197 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 10 (Ndufa10), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000027478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:92439010:92473860:-1 gene:ENSMUSG00000026260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AK046292 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230365D16 product:similar to NADH-UBIQUINONE OXIDOREDUCTASE 42 KDA SUBUNIT, MITOCHONDRIAL PRECURSOR (EC 1.6.5.3) (EC 1.6.99.3) (COMPLEX I-42KD) (CI-42KD) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// BC003439 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 10, mRNA (cDNA clone MGC:6491 IMAGE:2647815), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000185466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:92463103:92471051:-1 gene:ENSMUSG00000026260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 93 // 43 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000187141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:92462222:92470862:-1 gene:ENSMUSG00000026260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000189503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:92439279:92473757:-1 gene:ENSMUSG00000026260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92355950:92473737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1
NM_147038 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1416 (Olfr1416), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000086837 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:92479681:92480619:-1 gene:ENSMUSG00000067064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC104079 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1416, mRNA (cDNA clone IMAGE:40042053), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000013630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92479681:92480619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_147039 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1414 (Olfr1414), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000062353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:92511048:92518515:-1 gene:ENSMUSG00000042849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC120830 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1414, mRNA (cDNA clone MGC:156067 IMAGE:40129753), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000188197 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:92511325:92518515:-1 gene:ENSMUSG00000042849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000189174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:92511048:92518419:-1 gene:ENSMUSG00000042849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92511088:92512026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000159803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:92644219:92648254:-1 gene:ENSMUSG00000044055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY078071 // GenBank // Mus musculus organ of Corti 10 kDa protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC132494 // GenBank // Mus musculus otospiralin, mRNA (cDNA clone MGC:164125 IMAGE:40130771), complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC132498 // GenBank // Mus musculus otospiralin, mRNA (cDNA clone MGC:164129 IMAGE:40130775), complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NM_153114 // RefSeq // Mus musculus otospiralin (Otos), mRNA. // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_006529618 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus otospiralin (Otos), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENSMUST00000053144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:92644218:92648841:-1 gene:ENSMUSG00000044055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// BC100323 // GenBank // Mus musculus otospiralin, mRNA (cDNA clone MGC:117594 IMAGE:30788363), complete cds. // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_006529619 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus otospiralin (Otos), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92644333:92645391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT002047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_172850 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and MYND domain containing 1 (Ankmy1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006529590 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and MYND domain containing 1 (Ankmy1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000112998 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:92870129:92902906:-1 gene:ENSMUSG00000034212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000160548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:92870129:92902906:-1 gene:ENSMUSG00000034212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC120887 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and MYND domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:141406 IMAGE:40060916), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC120888 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and MYND domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:141407 IMAGE:40060917), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000007052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:92861194:92902583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
AK137082 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430066H12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090260 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6395059. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000191563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:92933526:92950590:-1 gene:ENSMUSG00000100632 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT002066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001159940 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310007B03 gene (2310007B03Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_172411 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310007B03 gene (2310007B03Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006529877 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2310007B03 gene (2310007B03Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000043718 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:93151349:93160948:-1 gene:ENSMUSG00000034159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000143419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:93151583:93160870:-1 gene:ENSMUSG00000034159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK009193 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310007B03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// BC089525 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310007B03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107226 IMAGE:30315016), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:93152008:93166809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0
NM_001105667 // RefSeq // Mus musculus deoxythymidylate kinase (Dtymk), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// NM_023136 // RefSeq // Mus musculus deoxythymidylate kinase (Dtymk), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000027503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:93792576:93801934:-1 gene:ENSMUSG00000026281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// BC030178 // GenBank // Mus musculus deoxythymidylate kinase, mRNA (cDNA clone MGC:29227 IMAGE:5039765), complete cds. // chr1 // 97 // 90 // 34 // 35 // 0 /// BC069902 // GenBank // Mus musculus deoxythymidylate kinase, mRNA (cDNA clone MGC:78134 IMAGE:5026527), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112890 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:93800065:93801906:-1 gene:ENSMUSG00000026281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 25 // 39 // 1 /// AK011955 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610301G23 product:thymidylate kinase, full insert sequence. // chr1 // 64 // 64 // 25 // 39 // 1 /// ENSMUST00000112893 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:93792724:93799001:-1 gene:ENSMUSG00000026281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1 /// GENSCAN00000010575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:93792833:93801827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0
NM_008798 // RefSeq // Mus musculus programmed cell death 1 (Pdcd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:94038305:94052553:-1 gene:ENSMUSG00000026285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119179 // GenBank // Mus musculus programmed cell death 1, mRNA (cDNA clone MGC:155495 IMAGE:8733928), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC120602 // GenBank // Mus musculus programmed cell death 1, mRNA (cDNA clone MGC:155839 IMAGE:40129525), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// X67914 // GenBank // M.musculus PD-1 mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:94035043:94041615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000190584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:95255963:95256810:-1 gene:ENSMUSG00000099592 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:95255963:95256810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000157236 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:24406355:24406417:-1 gene:ENSMUSG00000087861 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// ENSMUST00000158605 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:38176614:38176671:-1 gene:ENSMUSG00000089230 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174963 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:22645119:22645183:-1 gene:ENSMUSG00000092704 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// NONMMUT002112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// NONMMUT051453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// NONMMUT060843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
AK039506 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330052C08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK162837 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230034C19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// KnowTID_00000504 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// KnowTID_00000505 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT002113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT002114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_172658 // RefSeq // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 4C1 (Slco4c1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_006529488 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 4C1 (Slco4c1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 94 // 51 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000071985 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:96816270:96872171:-1 gene:ENSMUSG00000040693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AY654588 // GenBank // Mus musculus organic anion transporer OATP-r mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC119022 // GenBank // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 4C1, mRNA (cDNA clone MGC:155338 IMAGE:8733771), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000002256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:96803572:96872109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0
NR_120500 // RefSeq // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 6b1 (Slco6b1), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000060976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:96911866:96997572:-1 gene:ENSMUSG00000045463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000167383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:96906176:96997577:-1 gene:ENSMUSG00000045463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript gene:ENSMUSG00000090974 // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000178359 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:96921918:96997237:-1 gene:ENSMUSG00000045463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AY461596 // GenBank // Mus musculus OATP-I mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:96940162:96997482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENSMUST00000180888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:97001820:97002783:-1 gene:ENSMUSG00000097480 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:97002556:97012268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT002133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028942 // RefSeq // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 6c1 (Slco6c1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006529913 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 6c1 (Slco6c1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006529914 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 6c1 (Slco6c1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000027569 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:97059038:97128206:-1 gene:ENSMUSG00000026331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC139066 // GenBank // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 6c1, mRNA (cDNA clone MGC:170693 IMAGE:8862088), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC139067 // GenBank // Mus musculus solute carrier organic anion transporter family, member 6c1, mRNA (cDNA clone MGC:170694 IMAGE:8862089), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000189547 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:97059514:97128301:-1 gene:ENSMUSG00000026331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:97039901:97128174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_133825 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 1, ERATO Doi 622, expressed (D1Ertd622e), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006529748 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA segment, Chr 1, ERATO Doi 622, expressed (D1Ertd622e), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000053033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:97606318:97662074:-1 gene:ENSMUSG00000044768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000149927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:97643903:97662074:-1 gene:ENSMUSG00000044768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000153115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:97643903:97661676:-1 gene:ENSMUSG00000044768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// AK137265 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530083L13 product:Similar to hypothetical gene supported by AF038182, BC009203 (DNA segment, Chr 1, ERATO Doi 622, expressed), full insert sequence. // chr1 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC019375 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 1, ERATO Doi 622, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:30533 IMAGE:5008599), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC023951 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 1, ERATO Doi 622, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:36588 IMAGE:5320263), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_173760 // RefSeq // Mus musculus diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 2 (Ppip5k2), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006529493 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 2 (Ppip5k2), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000042509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:97706048:97770411:-1 gene:ENSMUSG00000040648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000112845 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:97706048:97770411:-1 gene:ENSMUSG00000040648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000171129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:97707665:97761538:-1 gene:ENSMUSG00000040648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC053396 // GenBank // Mus musculus histidine acid phosphatase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:60711 IMAGE:30044788), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:97740462:97761538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000002268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:97645715:97734109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_013626 // RefSeq // Mus musculus peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase (Pam), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000058762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:97821094:98095621:-1 gene:ENSMUSG00000026335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:97821095:98095632:-1 gene:ENSMUSG00000026335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161567 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:97821100:97977255:-1 gene:ENSMUSG00000026335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC129869 // GenBank // Mus musculus peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase, mRNA (cDNA clone IMAGE:40110131), complete cds. // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// U79523 // GenBank // Mus musculus peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase (PAM) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:97821810:97904204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
AK149050 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120479H13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
AK048760 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230049M14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001160368 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 152 (Rnf152), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_178779 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 152 (Rnf152), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006529699 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 152 (Rnf152), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000058688 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:105276914:105356670:-1 gene:ENSMUSG00000047496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000172299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:105276917:105356710:-1 gene:ENSMUSG00000047496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC118961 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 152, mRNA (cDNA clone MGC:143891 IMAGE:40094497), complete cds. // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_009741 // RefSeq // Mus musculus B cell leukemia/lymphoma 2 (Bcl2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// NM_177410 // RefSeq // Mus musculus B cell leukemia/lymphoma 2 (Bcl2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000112751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:106538178:106714274:-1 gene:ENSMUSG00000057329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// BC068988 // GenBank // Mus musculus B-cell leukemia/lymphoma 2, mRNA (cDNA clone MGC:73774 IMAGE:1265430), complete cds. // chr1 // 100 // 43 // 19 // 19 // 0 /// BC095964 // GenBank // Mus musculus B-cell leukemia/lymphoma 2, mRNA (cDNA clone MGC:106289 IMAGE:6306635), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// AK077913 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030439K11 product:B-cell leukemia/lymphoma 2, full insert sequence. // chr1 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1 /// GENSCAN00000025893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:106712281:106712880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT002238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000189999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:106710339:106713179:-1 gene:ENSMUSG00000057329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 19 // 44 // 1
NM_027534 // RefSeq // Mus musculus 3-ketodihydrosphingosine reductase (Kdsr), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006529865 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 3-ketodihydrosphingosine reductase (Kdsr), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000010049 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:106720459:106759727:-1 gene:ENSMUSG00000009905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY634684 // GenBank // Mus musculus follicular lymphoma variant translocation 1 (Fvt1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC023820 // GenBank // Mus musculus 3-ketodihydrosphingosine reductase, mRNA (cDNA clone MGC:36450 IMAGE:5354804), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSMUST00000187319 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:106747500:106759699:-1 gene:ENSMUSG00000009905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 94 // 47 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000025903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:106724902:106759651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_009190 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 4b (yeast) (Vps4b), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000094646 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:106769430:106796728:-1 gene:ENSMUSG00000009907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC003799 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 4b (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:6072 IMAGE:3488471), complete cds. // chr1 // 89 // 89 // 17 // 19 // 1 /// U10119 // GenBank // Mus musculus SKD1 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 89 // 17 // 19 // 1 /// ENSMUST00000112736 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:106764071:106796667:-1 gene:ENSMUSG00000009907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// AK165594 // GenBank HTC // Mus musculus bladder RCB-0544 MBT-2 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430034G24 product:vacuolar protein sorting 4b (yeast), full insert sequence. // chr1 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// GENSCAN00000025908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:106772447:106842546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1
NM_009126 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 3A (Serpinb3a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000027567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:107045587:107051797:-1 gene:ENSMUSG00000044594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000112717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:107045605:107052303:-1 gene:ENSMUSG00000044594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC063756 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 3A, mRNA (cDNA clone MGC:70040 IMAGE:30288465), complete cds. // chr1 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// AY144683 // GenBank // Mus musculus strain Car-S squamous cell carcinoma antigen 2 (Scca2) mRNA, complete cds. // chr1 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// AY144684 // GenBank // Mus musculus strain Car-R squamous cell carcinoma antigen 2 (Scca2) mRNA, complete cds. // chr1 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// GENSCAN00000025898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:107046016:107083480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
NM_201376 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 3D (Serpinb3d), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000023861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:107078167:107083506:-1 gene:ENSMUSG00000058017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY367776 // GenBank // Mus musculus serpinb3d mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC138290 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 3D, mRNA (cDNA clone MGC:169914 IMAGE:8861309), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC138291 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 3D, mRNA (cDNA clone MGC:169915 IMAGE:8861310), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:107046016:107083480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0
NM_198680 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 3B (Serpinb3b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000086694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:107153940:107161114:-1 gene:ENSMUSG00000073602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000166100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:107153961:107278361:-1 gene:ENSMUSG00000073602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC099584 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 3B, mRNA (cDNA clone MGC:118408 IMAGE:30291007), complete cds. // chr1 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0 /// AY367774 // GenBank // Mus musculus serpinb3b mRNA, complete cds. // chr1 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// GENSCAN00000025899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:107137844:107159777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NM_201363 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 3C (Serpinb3c), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000027565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:107271201:107278371:-1 gene:ENSMUSG00000073601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC132091 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 3C, mRNA (cDNA clone MGC:163722 IMAGE:40130368), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// AY367775 // GenBank // Mus musculus serpinb3c mRNA, complete cds. // chr1 // 70 // 95 // 14 // 20 // 0 /// GENSCAN00000025905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:107195783:107302354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 90 // 19 // 21 // 1
ENSMUST00000185629 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:108376970:108379438:-1 gene:ENSMUSG00000100041 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:108377038:108379439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001081386 // RefSeq // Mus musculus cadherin 19, type 2 (Cdh19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006529519 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cadherin 19, type 2 (Cdh19), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000094626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:110888326:110977363:-1 gene:ENSMUSG00000047216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC157927 // GenBank // Mus musculus cadherin 19, type 2, mRNA (cDNA clone MGC:189913 IMAGE:9088100), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000044758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:110889698:111018181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_001081316 // RefSeq // Mus musculus dermatan sulfate epimerase-like (Dsel), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:111858706:111864918:-1 gene:ENSMUSG00000038702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120567 // GenBank // Mus musculus dermatan sulfate epimerase-like, mRNA (cDNA clone MGC:155804 IMAGE:40129490), complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC137796 // GenBank // Mus musculus dermatan sulfate epimerase-like, mRNA (cDNA clone MGC:169420 IMAGE:8860815), complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000186365 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:111858702:111864768:-1 gene:ENSMUSG00000038702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:111841606:111862803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000185902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:115219190:115219763:-1 gene:ENSMUSG00000101687 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:115219157:115472021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_027901 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2900060B14 gene (2900060B14Rik), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT002311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_008381 // RefSeq // Mus musculus inhibin beta-B (Inhbb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:119415465:119422248:-1 gene:ENSMUSG00000037035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048845 // GenBank // Mus musculus inhibin beta-B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5039824), partial cds. // chr1 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:119417322:119421086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_022327 // RefSeq // Mus musculus v-ral simian leukemia viral oncogene homolog B (ras related) (Ralb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000004565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:119470305:119504794:-1 gene:ENSMUSG00000004451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF174296 // GenBank // Mus musculus GTPase RalB (RalB) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC006907 // GenBank // Mus musculus v-ral simian leukemia viral oncogene homolog B (ras related), mRNA (cDNA clone MGC:11937 IMAGE:3599947), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142945 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:119472145:119478079:-1 gene:ENSMUSG00000004451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENSMUST00000156213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:119481133:119504794:-1 gene:ENSMUSG00000004451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// AK172364 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830204J03 product:v-ral simian leukemia viral oncogene homolog B (ras related), full insert sequence. // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000056061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:119431872:119483607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONMMUT002341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_019933 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4 (Ptpn4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000064091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:119652467:119837613:-1 gene:ENSMUSG00000026384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000163435 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:119689801:119837347:-1 gene:ENSMUSG00000026384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000166624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:119658044:119687637:-1 gene:ENSMUSG00000026384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AF106702 // GenBank // Mus musculus testis-enriched protein tyrosine phosphatase mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AK046683 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430311G24 product:protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, full insert sequence. // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:119682705:119772660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_175106 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 177 (Tmem177), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:119907890:119913208:-1 gene:ENSMUSG00000036975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094344 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 177, mRNA (cDNA clone MGC:106585 IMAGE:6402386), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC131993 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 177, mRNA (cDNA clone MGC:163624 IMAGE:40130270), complete cds. // chr1 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// BC132021 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 177, mRNA (cDNA clone MGC:163652 IMAGE:40130298), complete cds. // chr1 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
NM_001115074 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 101 (Gm101), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006529404 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 101 (Gm101), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000037840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:119923519:119995210:-1 gene:ENSMUSG00000036962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000174370 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:119923341:119997190:-1 gene:ENSMUSG00000036962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// EF632061 // GenBank // Mus musculus primary ciliary dyskinesia protein 1 (Pcdp1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000045499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:119913146:120002306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_019432 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 37 (Tmem37), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:120067377:120074074:-1 gene:ENSMUSG00000050777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024613 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 37, mRNA (cDNA clone MGC:25884 IMAGE:4215775), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:120067710:120082617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
NM_010766 // RefSeq // Mus musculus macrophage receptor with collagenous structure (Marco), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000027639 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:120474538:120505024:-1 gene:ENSMUSG00000026390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC132338 // GenBank // Mus musculus macrophage receptor with collagenous structure, mRNA (cDNA clone MGC:163969 IMAGE:40130615), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC137939 // GenBank // Mus musculus macrophage receptor with collagenous structure, mRNA (cDNA clone MGC:169563 IMAGE:8860958), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// U18424 // GenBank // Mus musculus bacteria binding macrophage receptor MARCO mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000186432 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:120490913:120504756:-1 gene:ENSMUSG00000026390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000045503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:120401064:120533928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0
NM_010483 // RefSeq // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 5B (Htr5b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:121509842:121528465:-1 gene:ENSMUSG00000050534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC114988 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 5B, mRNA (cDNA clone MGC:141198 IMAGE:40056207), complete cds. // chr1 // 73 // 60 // 11 // 15 // 0 /// BC115825 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 5B, mRNA (cDNA clone MGC:141197 IMAGE:40056204), complete cds. // chr1 // 73 // 60 // 11 // 15 // 0 /// X69867 // GenBank // M.musculus mRNA encoding 5-HT5B serotonin receptor. // chr1 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_025860 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18 (Ddx18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006529794 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18 (Ddx18), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000001724 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:121553835:121567989:-1 gene:ENSMUSG00000001674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC028246 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18, mRNA (cDNA clone MGC:40620 IMAGE:2582151), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC103776 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18, mRNA (cDNA clone MGC:117904 IMAGE:6492142), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC141230 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18, mRNA (cDNA clone MGC:176191 IMAGE:9055842), complete cds. // chr1 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// BC141231 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18, mRNA (cDNA clone MGC:176192 IMAGE:9055843), complete cds. // chr1 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0
NM_199021 // RefSeq // Mus musculus dipeptidylpeptidase 10 (Dpp10), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112603 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:123332142:124045163:-1 gene:ENSMUSG00000036815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000112606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:123321471:124045559:-1 gene:ENSMUSG00000036815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC063074 // GenBank // Mus musculus dipeptidylpeptidase 10, mRNA (cDNA clone MGC:67462 IMAGE:5697531), complete cds. // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC067026 // GenBank // Mus musculus dipeptidylpeptidase 10, mRNA (cDNA clone MGC:91366 IMAGE:6853947), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000189908 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:124615191:124615596:-1 gene:ENSMUSG00000101006 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:124615205:124658796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0
NM_001205385 // RefSeq // Mus musculus ARP3 actin-related protein 3 (Actr3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NM_001205386 // RefSeq // Mus musculus ARP3 actin-related protein 3 (Actr3), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NM_023735 // RefSeq // Mus musculus ARP3 actin-related protein 3 (Actr3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000027579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:125392905:125435727:-1 gene:ENSMUSG00000026341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000178474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:125392906:125435547:-1 gene:ENSMUSG00000026341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC005557 // GenBank // Mus musculus ARP3 actin-related protein 3 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:7062 IMAGE:3156748), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// BC080806 // GenBank // Mus musculus ARP3 actin-related protein 3 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:90958 IMAGE:5350752), complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC108386 // GenBank // Mus musculus ARP3 actin-related protein 3 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:118188 IMAGE:5051125), complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_028135 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 163 (Tmem163), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:127486546:127678096:-1 gene:ENSMUSG00000026347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000160616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:127486558:127678021:-1 gene:ENSMUSG00000026347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000162406 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:127491545:127537430:-1 gene:ENSMUSG00000026347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// BC046234 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 163, mRNA (cDNA clone MGC:58089 IMAGE:6816957), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC059048 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 163, mRNA (cDNA clone MGC:69823 IMAGE:6816957), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000185560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:127490898:127679548:-1 gene:ENSMUSG00000026347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:127491600:127589761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_011737 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 19 (Map3k19), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000061512 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:127815271:127840321:-1 gene:ENSMUSG00000051590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000187653 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:127815253:127840321:-1 gene:ENSMUSG00000051590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000189398 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:127815262:127840321:-1 gene:ENSMUSG00000051590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000191333 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:127815262:127840321:-1 gene:ENSMUSG00000051590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:127817231:127869110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0
NM_001081078 // RefSeq // Mus musculus lactase (Lct), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000073490 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:128284756:128328318:-1 gene:ENSMUSG00000026354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY751548 // GenBank // Mus musculus lactase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000040534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:128277750:128328303:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_008567 // RefSeq // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 6 (MIS5 homolog, S. pombe) (S. cerevisiae) (Mcm6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000027601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:128331590:128359664:-1 gene:ENSMUSG00000026355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC050886 // GenBank // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 6 (MIS5 homolog, S. pombe) (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:63289 IMAGE:5703922), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC057584 // GenBank // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 6 (MIS5 homolog, S. pombe) (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:67102 IMAGE:6401827), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// D86726 // GenBank // Mus musculus mRNA for mMIS5, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000190495 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:128331593:128359647:-1 gene:ENSMUSG00000026355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000191454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:128339468:128346042:-1 gene:ENSMUSG00000026355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000040536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:128331935:128417436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_145507 // RefSeq // Mus musculus aspartyl-tRNA synthetase (Dars), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NM_177445 // RefSeq // Mus musculus aspartyl-tRNA synthetase (Dars), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000027602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:128363707:128417359:-1 gene:ENSMUSG00000026356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000064309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:128412118:128417368:-1 gene:ENSMUSG00000026356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC008638 // GenBank // Mus musculus aspartyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:6719 IMAGE:3586278), complete cds. // chr1 // 90 // 94 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:128331935:128417436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_009911 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 4 (Cxcr4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052172 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:128588199:128592290:-1 gene:ENSMUSG00000045382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142893 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:128589099:128592293:-1 gene:ENSMUSG00000045382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AB000803 // GenBank // Mus musculus mRNA for murine CXCR-4, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC031665 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:36266 IMAGE:3592479), complete cds. // chr1 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// BC098322 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-X-C motif) receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:102523 IMAGE:2864967), complete cds. // chr1 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// U59760 // GenBank // Mus musculus fusin homolog mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// X99582 // GenBank // M.musculus mRNA for leukocyte-dervied seven transmembrane domain receptor. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// D87747 // GenBank // Mus musculus mRNA for murine CXCR-4, complete cds. // chr1 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:128539691:128590974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000082803 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:128885909:128886019:-1 gene:ENSMUSG00000064737 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT002511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_007827 // RefSeq // Mus musculus decay accelerating factor 2 (Daf2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000112488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:130388537:130423009:-1 gene:ENSMUSG00000026401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// L41365 // GenBank // Mus musculus decay-accelerating factor transmembrane (Daf-TM) mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// ENSMUST00000119432 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:130388537:130423009:-1 gene:ENSMUSG00000026401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// BC127150 // GenBank // Mus musculus decay accelerating factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:156369 IMAGE:40055987), complete cds. // chr1 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// GENSCAN00000005365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:130410878:130422980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
NM_009581 // RefSeq // Mus musculus zona pellucida 3 receptor (Zp3r), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039862 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:130576713:130629621:-1 gene:ENSMUSG00000042554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128128 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:130576713:130629621:-1 gene:ENSMUSG00000042554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000142416 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:130576716:130629612:-1 gene:ENSMUSG00000042554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC119121 // GenBank // Mus musculus zona pellucida 3 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:155437 IMAGE:8733870), complete cds. // chr1 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// BC119123 // GenBank // Mus musculus zona pellucida 3 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:155439 IMAGE:8733872), complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// U17108 // GenBank // Mus musculus sperm fertilization protein sp56 precursor (SP56) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:130476013:130619500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000082461 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:130595570:130595676:-1 gene:ENSMUSG00000064395 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// NONMMUT002535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0
NM_007576 // RefSeq // Mus musculus complement component 4 binding protein (C4bp), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000027657 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:130634773:130661632:-1 gene:ENSMUSG00000026405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000137276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:130643070:130661610:-1 gene:ENSMUSG00000026405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000171642 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:130636814:130648419:-1 gene:ENSMUSG00000026405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// AB094485 // GenBank // Mus musculus C4bpa mRNA for C4b-binding protein alpha-chain, complete cds, tissue_type:liver. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB094486 // GenBank // Mus musculus C4bpa mRNA for C4b-bindng protein alpha-chain, complete cds, tissue_type:epididymis. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC012257 // GenBank // Mus musculus complement component 4 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:18586 IMAGE:4163203), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// M17122 // GenBank // Mouse C4b-binding protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:130636206:130643113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000047669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:130648029:130709829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NR_028304 // RefSeq // Mus musculus complement component 4 binding protein, pseudogene 1 (C4bp-ps1), non-coding RNA. // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// ENSMUST00000189393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:130670261:130684071:-1 gene:ENSMUSG00000100257 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000188520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:130670209:130715799:-1 gene:ENSMUSG00000101904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AK016729 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933407L07 product:6-phosphofructo-2-kinase/ fructose-2,6-biphosphatase 2, full insert sequence. // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_053095 // RefSeq // Mus musculus interleukin 24 (Il24), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000121040 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:130882074:130887454:-1 gene:ENSMUSG00000026420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF235006 // GenBank // Mus musculus melanoma differentiation associated gene-7 mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// AF333251 // GenBank // Mus musculus Th2-specific cytokine FISP mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// DQ401033 // GenBank // Mus musculus FISP cytokine variant FISP-sp mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 91 // 69 // 20 // 22 // 0 /// ENSMUST00000187650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:130882074:130885996:-1 gene:ENSMUSG00000026420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000191279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:130882455:130887339:-1 gene:ENSMUSG00000026420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:130882455:130884940:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000188148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:130884787:130887413:-1 gene:ENSMUSG00000026420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_021380 // RefSeq // Mus musculus interleukin 20 (Il20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000027673 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:130906985:130911451:-1 gene:ENSMUSG00000026416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF224267 // GenBank // Mus musculus four helix bundle cytokine (Zcyto10) mRNA, Zcyto10-1 allele, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY876923 // GenBank // Mus musculus interleukin 20 short form (Il20) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC111821 // GenBank // Mus musculus interleukin 20, mRNA (cDNA clone MGC:130536 IMAGE:40049751), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000188581 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:130907415:130911226:-1 gene:ENSMUSG00000026416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001009940 // RefSeq // Mus musculus interleukin 19 (Il19), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000016668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:130932658:130939241:-1 gene:ENSMUSG00000016524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000112465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:130932858:130940073:-1 gene:ENSMUSG00000016524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC115793 // GenBank // Mus musculus interleukin 19, mRNA (cDNA clone MGC:144324 IMAGE:40100999), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000187410 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:130932656:130940101:-1 gene:ENSMUSG00000016524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000187916 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:130932816:130940115:-1 gene:ENSMUSG00000016524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000047675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:130934936:131018657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NM_008551 // RefSeq // Mus musculus MAP kinase-activated protein kinase 2 (Mapkapk2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000016672 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131053700:131097826:-1 gene:ENSMUSG00000016528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC063064 // GenBank // Mus musculus MAP kinase-activated protein kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:67217 IMAGE:5687007), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// X76850 // GenBank // M. musculus mRNA for MAP kinase-activated protein kinase 2. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000188459 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:131056889:131072526:-1 gene:ENSMUSG00000016528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000047676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131055092:131138156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1
NM_145508 // RefSeq // Mus musculus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 3 (Dyrk3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000016670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131127455:131138340:-1 gene:ENSMUSG00000016526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK035114 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430089O14 product:REGULATORY ERYTHROID KINASE SHORT FORM (DUAL-SPECIFICITY TYROSINE-(Y)- PHOSPHORYLATION REGULATED KINASE 5) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK161495 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933409C19 product:dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 3, full insert sequence. // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC006704 // GenBank // Mus musculus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:6699 IMAGE:3584001), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189756 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:131129875:131138245:-1 gene:ENSMUSG00000016526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000047676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131055092:131138156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_018750 // RefSeq // Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 5 (Rassf5), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000027688 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:131176410:131245258:-1 gene:ENSMUSG00000026430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000068564 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:131176410:131200135:-1 gene:ENSMUSG00000026430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112442 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:131176410:131245258:-1 gene:ENSMUSG00000026430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000124796 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:131207654:131245258:-1 gene:ENSMUSG00000026430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// AF053959 // GenBank // Mus musculus putative ras effector Nore1 mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 80 // 23 // 28 // 0 /// AK131147 // GenBank // Mus musculus mRNA for mFLJ00186 protein. // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// AY261333 // GenBank // Mus musculus Rap1-binding protein (Rapl) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// BC089605 // GenBank // Mus musculus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:107647 IMAGE:30121804), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:131177281:131199972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000102332 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:131498639:131498802:-1 gene:ENSMUSG00000076287 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT002565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000179174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:131632509:131632969:-1 gene:ENSMUSG00000095841 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_008795 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase 18 (Cdk18), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XR_387152 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin-dependent kinase 18 (Cdk18), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000027697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:132112237:132139684:-1 gene:ENSMUSG00000026437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000112362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:132114764:132139605:-1 gene:ENSMUSG00000026437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC119617 // GenBank // Mus musculus PCTAIRE-motif protein kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:141443 IMAGE:40061728), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000188387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:132114586:132116913:-1 gene:ENSMUSG00000026437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000005682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:132075585:132123506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000086544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:132229048:132229767:-1 gene:ENSMUSG00000066936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK015739 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930509N14 product:hypothetical Glutamine amidotransferase, class-II containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177129 // RefSeq // Mus musculus contactin 2 (Cntn2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006529363 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus contactin 2 (Cntn2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000086521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:132511782:132542939:-1 gene:ENSMUSG00000053024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC066106 // GenBank // Mus musculus contactin 2, mRNA (cDNA clone MGC:90117 IMAGE:30362931), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000186487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:132511778:132542890:-1 gene:ENSMUSG00000053024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000188065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:132509427:132523393:-1 gene:ENSMUSG00000053024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000190601 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:132511792:132542865:-1 gene:ENSMUSG00000053024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:132512234:132533732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
AK084736 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330037D08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011439 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 13 (Sox13), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006497269 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 13 (Sox13), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 83 // 88 // 24 // 29 // 0 /// XM_006497274 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 13 (Sox13), transcript variant X9, mRNA. // chr1 // 84 // 94 // 26 // 31 // 0 /// ENSMUST00000094551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:133383651:133393270:-1 gene:ENSMUSG00000070643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144386 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:133382303:133393218:-1 gene:ENSMUSG00000070643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000153799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:133382303:133424377:-1 gene:ENSMUSG00000070643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AB006329 // GenBank // Mus musculus mSox13 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC007130 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 13, mRNA (cDNA clone MGC:5792 IMAGE:3493465), complete cds. // chr1 // 79 // 88 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:133383651:133449785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1
NM_054077 // RefSeq // Mus musculus proline arginine-rich end leucine-rich repeat (Prelp), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006529083 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline arginine-rich end leucine-rich repeat (Prelp), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000048432 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:133910304:133921414:-1 gene:ENSMUSG00000041577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC019775 // GenBank // Mus musculus proline arginine-rich end leucine-rich repeat, mRNA (cDNA clone MGC:25825 IMAGE:4165772), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000127583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:133912720:133921411:-1 gene:ENSMUSG00000041577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:133912606:133915498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_007570 // RefSeq // Mus musculus B cell translocation gene 2, anti-proliferative (Btg2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020692 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134075170:134079120:-1 gene:ENSMUSG00000020423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132259 // GenBank // Mus musculus B-cell translocation gene 2, anti-proliferative, mRNA (cDNA clone MGC:163890 IMAGE:40130536), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC138639 // GenBank // Mus musculus B-cell translocation gene 2, anti-proliferative, mRNA (cDNA clone MGC:170264 IMAGE:8861659), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134077369:134095777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001008533 // RefSeq // Mus musculus adenosine A1 receptor (Adora1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_001039510 // RefSeq // Mus musculus adenosine A1 receptor (Adora1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NM_001282945 // RefSeq // Mus musculus adenosine A1 receptor (Adora1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NM_001291928 // RefSeq // Mus musculus adenosine A1 receptor (Adora1), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// NM_001291930 // RefSeq // Mus musculus adenosine A1 receptor (Adora1), transcript variant 5, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000038191 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134201349:134235397:-1 gene:ENSMUSG00000042429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000086465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134199225:134235431:-1 gene:ENSMUSG00000042429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000169927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134199223:134234578:-1 gene:ENSMUSG00000042429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// BC079624 // GenBank // Mus musculus adenosine A1 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:90841 IMAGE:30536680), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000187631 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134203397:134235364:-1 gene:ENSMUSG00000042429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
ENSMUST00000122560 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:134280885:134280991:-1 gene:ENSMUSG00000096676 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT002678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001144855 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, f polypeptide (PTPRF), interacting protein (liprin), alpha 4 (Ppfia4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006529850 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, f polypeptide (PTPRF), interacting protein (liprin), alpha 4 (Ppfia4), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000168515 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134296783:134332928:-1 gene:ENSMUSG00000026458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// EU568872 // GenBank // Mus musculus liprin-alpha 4 (ppfia4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000186730 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:134296784:134327266:-1 gene:ENSMUSG00000026458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000189361 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:134297501:134332928:-1 gene:ENSMUSG00000026458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134298779:134332523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001145300 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931440L10 gene (4931440L10Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001291015 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931440L10 gene (4931440L10Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134540945:134547022:-1 gene:ENSMUSG00000046367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000172898 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134540941:134549682:-1 gene:ENSMUSG00000046367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145149 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931440L10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178708 IMAGE:9053700), complete cds. // chr1 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0 /// BC145786 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931440L10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175673 IMAGE:40131089), complete cds. // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000185836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134540955:134546950:-1 gene:ENSMUSG00000046367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134540985:134554277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001081307 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B (Ppp1r12b), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006529711 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B (Ppp1r12b), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045665 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:134754658:134955940:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134765943:134955940:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134834066:134955928:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134759969:134955851:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141375 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430042A21 product:protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B, full insert sequence. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC145746 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B, mRNA (cDNA clone MGC:175633 IMAGE:40131049), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134834154:134955782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081307 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B (Ppp1r12b), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006529711 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B (Ppp1r12b), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045665 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:134754658:134955940:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134765943:134955940:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134834066:134955928:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134759969:134955851:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141375 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430042A21 product:protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145746 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B, mRNA (cDNA clone MGC:175633 IMAGE:40131049), complete cds. // chr1 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_001081307 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B (Ppp1r12b), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006529711 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B (Ppp1r12b), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000045665 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:134754658:134955940:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000086444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134765943:134955940:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000132025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134834066:134955928:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000168381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134759969:134955851:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK141375 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430042A21 product:protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC145746 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B, mRNA (cDNA clone MGC:175633 IMAGE:40131049), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134834154:134955782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001081307 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B (Ppp1r12b), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006529711 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B (Ppp1r12b), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000045665 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:134754658:134955940:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000086444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134765943:134955940:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000132025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:134834066:134955928:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000168381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:134759969:134955851:-1 gene:ENSMUSG00000073557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK141375 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430042A21 product:protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC145746 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12B, mRNA (cDNA clone MGC:175633 IMAGE:40131049), complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134834154:134955782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_001033409 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich repeat-containing G protein-coupled receptor 6 (Lgr6), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000044828 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:134983301:135105276:-1 gene:ENSMUSG00000042793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000137968 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:134986355:135017779:-1 gene:ENSMUSG00000042793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// BC141210 // GenBank // Mus musculus leucine-rich repeat-containing G protein-coupled receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:176171 IMAGE:9055822), complete cds. // chr1 // 82 // 92 // 28 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134986936:135129188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0
NM_007955 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, V (Ptprv), mRNA. // chr1 // 91 // 97 // 32 // 35 // 0 /// ENSMUST00000183317 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135108498:135132594:-1 gene:ENSMUSG00000097993 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF300701 // GenBank // Mus musculus osteotesticular protein tyrosine phosphatase mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// U36488 // GenBank // Mus musculus embryonic stem cell phosphatase (Esp) mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 92 // 28 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:134986936:135129188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_134438 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 37-like 1 (Gpr37l1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000027682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135160234:135167681:-1 gene:ENSMUSG00000026424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB016602 // GenBank // Mus musculus mRNA for G-protein coupled receptor, complete cds. // chr1 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC098482 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 37-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:107437 IMAGE:30103328), complete cds. // chr1 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// BC127619 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 37-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:157466 IMAGE:40106370), complete cds. // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC127620 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 37-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:157467 IMAGE:40106375), complete cds. // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:135160880:135172510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT002724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
NM_001163131 // RefSeq // Mus musculus E74-like factor 3 (Elf3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_007921 // RefSeq // Mus musculus E74-like factor 3 (Elf3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000003135 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135253575:135258568:-1 gene:ENSMUSG00000003051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF016294 // GenBank // Mus musculus Ets transcription factor (ELF3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC138692 // GenBank // Mus musculus E74-like factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:170319 IMAGE:8861714), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC145380 // GenBank // Mus musculus E74-like factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:178946 IMAGE:9053938), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000185752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135253579:135258438:-1 gene:ENSMUSG00000003051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135256657:135257649:-1 gene:ENSMUSG00000003051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000029301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:135254266:135284008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_001159624 // RefSeq // Mus musculus arginyl aminopeptidase (aminopeptidase B) (Rnpep), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_145417 // RefSeq // Mus musculus arginyl aminopeptidase (aminopeptidase B) (Rnpep), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XR_387158 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus arginyl aminopeptidase (aminopeptidase B) (Rnpep), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000074357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:135262712:135284084:-1 gene:ENSMUSG00000041926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000077340 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135262712:135284084:-1 gene:ENSMUSG00000041926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC019200 // GenBank // Mus musculus arginyl aminopeptidase (aminopeptidase B), mRNA (cDNA clone MGC:29229 IMAGE:5041005), complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSMUST00000141234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135265194:135267402:-1 gene:ENSMUSG00000041926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000029301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:135254266:135284008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT002726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_011590 // RefSeq // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 17a (Timm17a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000081104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135295213:135313778:-1 gene:ENSMUSG00000062580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000134088 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:135304503:135313691:-1 gene:ENSMUSG00000062580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 71 // 14 // 17 // 0 /// ENSMUST00000152706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135301816:135309839:-1 gene:ENSMUSG00000062580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// AF106620 // GenBank // Mus musculus mitochondrial inner membrane translocase component Tim17a mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC010830 // GenBank // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 17a, mRNA (cDNA clone MGC:19157 IMAGE:4220707), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// BC098216 // GenBank // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 17a, mRNA (cDNA clone MGC:106830 IMAGE:1527710), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000125454 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:135309135:135311345:-1 gene:ENSMUSG00000062580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// GENSCAN00000029309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:135301918:135313719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
NM_175259 // RefSeq // Mus musculus shisa homolog 4 (Xenopus laevis) (Shisa4), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006529951 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus shisa homolog 4 (Xenopus laevis) (Shisa4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000041240 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135371057:135375237:-1 gene:ENSMUSG00000041889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135373888:135375077:-1 gene:ENSMUSG00000041889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// AK020369 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330132O05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC044813 // GenBank // Mus musculus shisa homolog 4 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:51586 IMAGE:4950177), complete cds. // chr1 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135371060:135373450:-1 gene:ENSMUSG00000041889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// AK134719 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330535K23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000029297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:135371950:135374961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT002732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_153774 // RefSeq // Mus musculus importin 9 (Ipo9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000041023 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135382312:135430499:-1 gene:ENSMUSG00000041879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135384473:135430458:-1 gene:ENSMUSG00000041879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135384473:135430491:-1 gene:ENSMUSG00000041879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF273672 // GenBank // Mus musculus Importin9 isoform 1 (Importin9) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// AF273673 // GenBank // Mus musculus Importin9 isoform 2 (Importin9) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC079546 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6851434, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC098508 // GenBank // Mus musculus importin 9, mRNA (cDNA clone MGC:107534 IMAGE:30015513), complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AK173127 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1192 protein. // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000029299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:135385367:135430430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_019645 // RefSeq // Mus musculus plakophilin 1 (Pkp1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135871395:135919207:-1 gene:ENSMUSG00000026413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000163260 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135872950:135919120:-1 gene:ENSMUSG00000026413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC139041 // GenBank // Mus musculus plakophilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:170668 IMAGE:8862063), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC139042 // GenBank // Mus musculus plakophilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:170669 IMAGE:8862064), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// Y07941 // GenBank // M.musculus mRNA for plakophilin 1. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000189805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135873366:135919142:-1 gene:ENSMUSG00000026413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:135873099:135919012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_177642 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin-like and fibronectin type III domain containing 1 (Igfn1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124134 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:135954598:135982482:-1 gene:ENSMUSG00000051985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000140703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:135953578:135963140:-1 gene:ENSMUSG00000051985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000166193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:135953585:136006342:-1 gene:ENSMUSG00000051985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC107027 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin-like and fibronectin type III domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:129490 IMAGE:40050318), complete cds. // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC107028 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin-like and fibronectin type III domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:129491 IMAGE:40050319), complete cds. // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// EU429481 // GenBank // Mus musculus IGFN1_v2 (Igfn1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// EU429482 // GenBank // Mus musculus IGFN1_v3 (Igfn1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// GU290042 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 immunoglobulin-like and fibronectin type 3 domain containing 1 protein (Igfn1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:135943743:136006342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
XR_387432 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus maestro heat-like repeat family member 3 (Mroh3), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// XR_398898 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus maestro heat-like repeat family member 3 (Mroh3), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// XR_398899 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus maestro heat-like repeat family member 3 (Mroh3), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// XR_398901 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus maestro heat-like repeat family member 3 (Mroh3), transcript variant X5, misc_RNA. // chr1 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000146112 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:136181652:136190712:-1 gene:ENSMUSG00000087230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000168561 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:136181474:136207097:-1 gene:ENSMUSG00000087230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// AK009188 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310006M14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000013554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136181727:136260900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
NM_001101516 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 25 (Gpr25), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:136258914:136260873:-1 gene:ENSMUSG00000052759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136181727:136260900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081360 // RefSeq // Mus musculus calmodulin regulated spectrin-associated protein family, member 2 (Camsap2), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000048309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:136268123:136346104:-1 gene:ENSMUSG00000041570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC138367 // GenBank // Mus musculus calmodulin regulated spectrin-associated protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:169992 IMAGE:8861387), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC145258 // GenBank // Mus musculus calmodulin regulated spectrin-associated protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:178819 IMAGE:9053811), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136270842:136339229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
NM_001159769 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor subfamily 5, group A, member 2 (Nr5a2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_030676 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor subfamily 5, group A, member 2 (Nr5a2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006529620 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear receptor subfamily 5, group A, member 2 (Nr5a2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006529622 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear receptor subfamily 5, group A, member 2 (Nr5a2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:136843584:136960427:-1 gene:ENSMUSG00000026398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000168126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:136843584:136953630:-1 gene:ENSMUSG00000026398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC137845 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor subfamily 5, group A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:169469 IMAGE:8860864), complete cds. // chr1 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// DQ133942 // GenBank // Mus musculus liver receptor-like protein 1 variant 2 (Nr5a2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// M81385 // GenBank // Mouse liver receptor homologous protein (LRH-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136845463:136897956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000010677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:136940337:136971144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
ENSMUST00000158345 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:136990211:136990270:-1 gene:ENSMUSG00000088970 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 85 // 93 // 11 // 13 // 0 /// NONMMUT002898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 93 // 11 // 13 // 0
ENSMUST00000083341 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:138878262:138878377:-1 gene:ENSMUSG00000065275 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT002965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001029977 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4788 (Gm4788), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NM_001160303 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4788 (Gm4788), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NM_001160304 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4788 (Gm4788), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000027612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:139697635:139781236:-1 gene:ENSMUSG00000070594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000111986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:139697919:139781239:-1 gene:ENSMUSG00000070594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000111989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:139697919:139781239:-1 gene:ENSMUSG00000070594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// M29009 // GenBank // Mouse complement factor H-related protein mRNA, complete cds, clone 9C4. // chr1 // 64 // 85 // 14 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:139628136:139925553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_015780 // RefSeq // Mus musculus complement factor H-related 1 (Cfhr1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000023965 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:139547062:139560258:-1 gene:ENSMUSG00000057037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000160423 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:139553518:139560158:-1 gene:ENSMUSG00000057037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// BC111870 // GenBank // Mus musculus complement factor H-related 1, mRNA (cDNA clone MGC:130590 IMAGE:40057075), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// M29008 // GenBank // Mouse complement factor H-related protein mRNA, complete cds, clone 13G1. // chr1 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:139547700:139622231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
ENSMUST00000170441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:139593755:139608282:-1 gene:ENSMUSG00000090623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// AK015277 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930431N10 product:weakly similar to COMPLEMENT FACTOR H-RELATED PROTEIN 1 PRECURSOR (FHR-1) (H FACTOR-LIKE PROTEIN 1) (H-FACTOR LIKE 1) (H36) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// XM_006530025 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus complement factor H-related 3 (Cfhr3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// XM_006530026 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus complement factor H-related 3 (Cfhr3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// BC013664 // GenBank HTC // Mus musculus complement factor H-related 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4163011), with apparent retained intron. // chr1 // 67 // 91 // 14 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:139547700:139622231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_009888 // RefSeq // Mus musculus complement component factor h (Cfh), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000066859 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:140085855:140183411:-1 gene:ENSMUSG00000026365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000111976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:140085855:140183411:-1 gene:ENSMUSG00000026365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000111977 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:140085855:140183317:-1 gene:ENSMUSG00000026365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000123238 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:140085879:140183322:-1 gene:ENSMUSG00000026365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC066092 // GenBank // Mus musculus complement component factor h, mRNA (cDNA clone MGC:90130 IMAGE:6842070), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// M12660 // GenBank // Mouse CFh locus, complement protein H gene, complete cds, clones MH(4,8). // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000148225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:140145219:140183411:-1 gene:ENSMUSG00000026365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// AK052688 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630023O13 product:complement component factor h, full insert sequence. // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000032724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:139930695:140226740:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
ENSMUST00000179202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:141256568:141257158:-1 gene:ENSMUSG00000095238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:141256568:141257158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_145991 // RefSeq // Mus musculus cell division cycle 73, Paf1/RNA polymerase II complex component (Cdc73), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000018337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:143598800:143702893:-1 gene:ENSMUSG00000026361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000162638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:143606161:143640581:-1 gene:ENSMUSG00000026361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0 /// AK048027 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130030P16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0 /// BC027756 // GenBank // Mus musculus cell division cycle 73, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:29274 IMAGE:5067496), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC031127 // GenBank // Mus musculus cell division cycle 73, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:36559 IMAGE:4972826), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006529365 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cell division cycle 73, Paf1/RNA polymerase II complex component (Cdc73), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// GENSCAN00000006474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:143615303:143635119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0
NM_013835 // RefSeq // Mus musculus TROVE domain family, member 2 (Trove2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000018343 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:143755848:143776922:-1 gene:ENSMUSG00000018199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000159879 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:143750790:143777068:-1 gene:ENSMUSG00000018199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC040368 // GenBank HTC // Mus musculus TROVE domain family, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4503545), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC051974 // GenBank // Mus musculus TROVE domain family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:62256 IMAGE:5697399), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC052380 // GenBank // Mus musculus TROVE domain family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:64638 IMAGE:5697399), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// L81154 // GenBank // Mus musculus ribonucleoprotein (Ro) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// U66843 // GenBank // Mus musculus 60kDa ribonucleoprotein SS-A/Ro mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:143757742:143771005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_009061 // RefSeq // Mus musculus regulator of G-protein signaling 2 (Rgs2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000027606 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:144001680:144004135:-1 gene:ENSMUSG00000026360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000127206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:143999338:144004161:-1 gene:ENSMUSG00000026360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF215668 // GenBank // Mus musculus regulator of G-protein signaling 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// AF432916 // GenBank // Mus musculus implantation-related RGS2-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// BC023001 // GenBank // Mus musculus regulator of G-protein signaling 2, mRNA (cDNA clone MGC:36187 IMAGE:5365271), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// U67187 // GenBank // Mus musculus G protein signaling regulator RGS2 (rgs2) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000134817 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:144002517:144004121:-1 gene:ENSMUSG00000026360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// ENSMUST00000153527 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:144001883:144004032:-1 gene:ENSMUSG00000026360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000006482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:144001680:144011815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONMMUT003037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_153171 // RefSeq // Mus musculus regulator of G-protein signaling 13 (Rgs13), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:144138654:144177372:-1 gene:ENSMUSG00000051079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:144138667:144177275:-1 gene:ENSMUSG00000051079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AF498319 // GenBank // Mus musculus RGS13 (Rgs13) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC049624 // GenBank // Mus musculus regulator of G-protein signaling 13, mRNA (cDNA clone MGC:58349 IMAGE:6585574), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_001290269 // RefSeq // Mus musculus regulator of G-protein signalling 21 (Rgs21), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_110891 // RefSeq // Mus musculus regulator of G-protein signalling 21 (Rgs21), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000184008 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:144516648:144567667:-1 gene:ENSMUSG00000098509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000184189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:144518609:144551564:-1 gene:ENSMUSG00000098509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:144519690:144575439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000157471 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:144609004:144609110:-1 gene:ENSMUSG00000088096 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 71 // 100 // 20 // 28 // 0 /// NONMMUT003044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 71 // 100 // 20 // 28 // 0
NM_022881 // RefSeq // Mus musculus regulator of G-protein signaling 18 (Rgs18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027603 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:144752683:144775435:-1 gene:ENSMUSG00000026357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB042807 // GenBank // Mus musculus RGS mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// AF302685 // GenBank // Mus musculus regulator of G-protein signaling RGS18 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC099387 // GenBank // Mus musculus regulator of G-protein signaling 18, mRNA (cDNA clone MGC:117531 IMAGE:30846527), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC132544 // GenBank // Mus musculus regulator of G-protein signaling 18, mRNA (cDNA clone MGC:164175 IMAGE:40130821), complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC132546 // GenBank // Mus musculus regulator of G-protein signaling 18, mRNA (cDNA clone MGC:164177 IMAGE:40130823), complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0
ENSMUST00000083853 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:144960734:144960839:-1 gene:ENSMUSG00000065787 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK089774 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830018F06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008869 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A2, group IVA (cytosolic, calcium-dependent) (Pla2g4a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006529252 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase A2, group IVA (cytosolic, calcium-dependent) (Pla2g4a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000070200 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:149829618:149961290:-1 gene:ENSMUSG00000056220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000111926 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:149829636:149922439:-1 gene:ENSMUSG00000056220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// AK004701 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1200011D06 product:phospholipase A2, group IVA (cytosolic, calcium-dependent), full insert sequence. // chr1 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC003816 // GenBank // Mus musculus phospholipase A2, group IVA (cytosolic, calcium-dependent), mRNA (cDNA clone MGC:6168 IMAGE:3485483), complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// M72394 // GenBank // Mouse calcium-dependent phospholipid binding protein (PLA2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000190507 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:149886144:149961258:-1 gene:ENSMUSG00000056220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 30 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000033706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:149814159:149908379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0
NM_212457 // RefSeq // Mus musculus brain expressed gene 4 (Bex4), mRNA. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000116527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:136138996:136140443:1 gene:ENSMUSG00000047844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:57948729:57949085:-1 gene:ENSMUSG00000083657 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AY833558 // GenBank // Mus musculus chromosome X brain expressed X-linked 4 (Bex4) mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC090663 // GenBank // Mus musculus brain expressed gene 4, mRNA (cDNA clone MGC:116687 IMAGE:30677421), complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC116226 // GenBank // Mus musculus brain expressed gene 4, mRNA (cDNA clone MGC:143633 IMAGE:40091511), complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000191094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:150268926:150269261:-1 gene:ENSMUSG00000100690 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:136105150:136140216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:150265535:150269261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT009903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001024720 // RefSeq // Mus musculus hemicentin 1 (Hmcn1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000074783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:150562524:150993051:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000137197 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:150563527:150993051:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000177036 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:150563684:150583212:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000026932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:150593825:150680716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 19 // 44 // 1 /// GENSCAN00000033694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:150547379:150593058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 17 // 44 // 1
NM_001024720 // RefSeq // Mus musculus hemicentin 1 (Hmcn1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:150562524:150993051:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137197 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:150563527:150993051:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:150593825:150680716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024720 // RefSeq // Mus musculus hemicentin 1 (Hmcn1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:150562524:150993051:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137197 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:150563527:150993051:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024720 // RefSeq // Mus musculus hemicentin 1 (Hmcn1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:150562524:150993051:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137197 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:150563527:150993051:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:150593825:150680716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001024720 // RefSeq // Mus musculus hemicentin 1 (Hmcn1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:150562524:150993051:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137197 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:150563527:150993051:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:150682930:150877167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024720 // RefSeq // Mus musculus hemicentin 1 (Hmcn1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000074783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:150562524:150993051:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000137197 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:150563527:150993051:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:150682930:150877167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000155715 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:150873748:150993435:-1 gene:ENSMUSG00000066842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147549 // GenBank // Mus musculus hemicentin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:9056540), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC147568 // GenBank // Mus musculus hemicentin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:9056558), complete cds. // chr1 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// NM_001024720 // RefSeq // Mus musculus hemicentin 1 (Hmcn1), mRNA. // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000026944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:150990160:151002133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSMUST00000076388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:151344369:151344736:-1 gene:ENSMUSG00000063886 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK030663 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430408M19 product:activin receptor interacting protein 1, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186597 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:151342734:151345231:-1 gene:ENSMUSG00000100954 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB029485 // GenBank // Mus musculus ARIP1 mRNA for activin receptor interacting protein 1, complete cds. // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_025819 // RefSeq // Mus musculus SWT1 RNA endoribonuclease homolog (S. cerevisiae) (Swt1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000064771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:151367699:151428455:-1 gene:ENSMUSG00000052748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000111883 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:151368364:151428436:-1 gene:ENSMUSG00000052748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// BC055064 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1200016B10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:62864 IMAGE:6528686), complete cds. // chr1 // 91 // 90 // 32 // 35 // 0 /// BC060204 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1200016B10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:73488 IMAGE:6855442), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000129939 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:151401123:151423555:-1 gene:ENSMUSG00000052748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1 /// GENSCAN00000026941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:151368459:151430138:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0
NM_025379 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIb (Cox7b), mRNA. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:106015700:106022450:1 gene:ENSMUSG00000031231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:106019391:106021958:1 gene:ENSMUSG00000031231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// BC024350 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIb, mRNA (cDNA clone MGC:35766 IMAGE:4987472), complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC089538 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIb, mRNA (cDNA clone MGC:107263 IMAGE:6533206), complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:106015716:106016129:1 gene:ENSMUSG00000031231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSMUST00000187109 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:151520447:151520687:-1 gene:ENSMUSG00000100551 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT073620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// NONMMUT073619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSMUST00000122608 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:151854823:151854955:-1 gene:ENSMUSG00000084557 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONMMUT003147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_197990 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700025G04 gene (1700025G04Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:151884524:152090125:-1 gene:ENSMUSG00000032666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC022177 // GenBank // Mus musculus predicted gene, ENSMUSG00000073540, mRNA (cDNA clone MGC:14005 IMAGE:3660311), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016846 // RefSeq // Mus musculus ral guanine nucleotide dissociation stimulator,-like 1 (Rgl1), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006529268 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ral guanine nucleotide dissociation stimulator,-like 1 (Rgl1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000027760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:152516951:152625217:-1 gene:ENSMUSG00000026482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000111859 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:152516760:152766305:-1 gene:ENSMUSG00000026482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AK173071 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0959 protein. // chr1 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// BC017678 // GenBank // Mus musculus ral guanine nucleotide dissociation stimulator,-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:18430 IMAGE:4241244), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// U14103 // GenBank // Mus musculus RGL protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000111857 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:152518750:152766351:-1 gene:ENSMUSG00000026482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// GENSCAN00000012854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:152518338:152587430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1
ENSMUST00000119836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:152729159:152730559:-1 gene:ENSMUSG00000080950 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000016567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:152729159:152745419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
NM_001005507 // RefSeq // Mus musculus Smg-7 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) (Smg7), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_001160256 // RefSeq // Mus musculus Smg-7 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) (Smg7), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_001160257 // RefSeq // Mus musculus Smg-7 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) (Smg7), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000043560 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:152836996:152878168:-1 gene:ENSMUSG00000042772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:152836995:152902622:-1 gene:ENSMUSG00000042772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:152838870:152902646:-1 gene:ENSMUSG00000042772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC082789 // GenBank // Mus musculus Smg-7 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:91209 IMAGE:30105222), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC086651 // GenBank // Mus musculus Smg-7 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:113724 IMAGE:6851591), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:152839272:152890010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000187136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:152949395:152950097:-1 gene:ENSMUSG00000100702 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_008485 // RefSeq // Mus musculus laminin, gamma 2 (Lamc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:153122756:153186447:-1 gene:ENSMUSG00000026479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U43327 // GenBank // Mus musculus laminin gamma 2 chain precursor (B2t) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// ENSMUST00000185356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153122756:153186047:-1 gene:ENSMUSG00000026479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:153124030:153185987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_010683 // RefSeq // Mus musculus laminin, gamma 1 (Lamc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027752 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:153218922:153332786:-1 gene:ENSMUSG00000026478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// J02930 // GenBank // Mouse laminin B2 chain mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// J03484 // GenBank // Mouse laminin B2 chain mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:153221473:153275782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NR_033736 // RefSeq // Mus musculus Riken cDNA E330020D12 gene (E330020D12Rik), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000097535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:153404827:153408429:-1 gene:ENSMUSG00000073538 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK087784 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330020D12 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000186785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153404827:153407790:-1 gene:ENSMUSG00000073538 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000188717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153406247:153414233:-1 gene:ENSMUSG00000073538 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT003178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT003179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT003180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_007842 // RefSeq // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 9 (Dhx9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006529118 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 9 (Dhx9), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000042141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:153455758:153487660:-1 gene:ENSMUSG00000042699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY512925 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0544F08 unknown mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC089159 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:30110495), complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// U91922 // GenBank // Mus musculus RNA helicase A (Ddx9) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000186380 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153455758:153487608:-1 gene:ENSMUSG00000042699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000186966 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153462633:153487645:-1 gene:ENSMUSG00000042699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000188345 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:153464342:153487651:-1 gene:ENSMUSG00000042699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000190544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153462639:153478139:-1 gene:ENSMUSG00000042699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000016568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:153456293:153482852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_028749 // RefSeq // Mus musculus N-acetylneuraminate pyruvate lyase (Npl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000041874 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:153503015:153550045:-1 gene:ENSMUSG00000042684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC022734 // GenBank // Mus musculus N-acetylneuraminate pyruvate lyase, mRNA (cDNA clone MGC:31604 IMAGE:4506776), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:153507738:153583222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
AK154216 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630010C12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 42 // 96 // 10 // 24 // 0 /// ENSMUST00000187747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153548422:153549711:-1 gene:ENSMUSG00000042684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146126 // RefSeq // Mus musculus sorbitol dehydrogenase (Sord), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000110551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:122234749:122265340:1 gene:ENSMUSG00000027227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024124 // GenBank // Mus musculus sorbitol dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:37836 IMAGE:5099395), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC030875 // GenBank // Mus musculus sorbitol dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:31355 IMAGE:4237164), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC092291 // GenBank // Mus musculus sorbitol dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:103040 IMAGE:5097505), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U27014 // GenBank // Mus musculus sorbitol dehydrogenase precursor mRNA, partial cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000186414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153619604:153620673:-1 gene:ENSMUSG00000099858 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:153619599:153620673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:122241212:122264206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001243223 // RefSeq // Mus musculus regulator of G-protein signaling like 1 (Rgsl1), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000124558 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:153779386:153844142:-1 gene:ENSMUSG00000042641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000141249 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:153779381:153808164:-1 gene:ENSMUSG00000042641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000184095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153802304:153825296:-1 gene:ENSMUSG00000042641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 92 // 39 // 11 // 12 // 0 /// AK029630 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930415K13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000134030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153792954:153821512:-1 gene:ENSMUSG00000042641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// ENSMUST00000185164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153785143:153844134:-1 gene:ENSMUSG00000042641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// AK161463 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932418D05 product:weakly similar to Regulator of G protein signaling protein [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// GENSCAN00000029455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:153781689:153812536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
NM_001243223 // RefSeq // Mus musculus regulator of G-protein signaling like 1 (Rgsl1), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006529583 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus regulator of G-protein signaling like 1 (Rgsl1), transcript variant X10, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124558 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:153779386:153844142:-1 gene:ENSMUSG00000042641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000185164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153785143:153844134:-1 gene:ENSMUSG00000042641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:153821078:153844114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_178243 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5830403L16 gene (5830403L16Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000059607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:153849542:153851195:-1 gene:ENSMUSG00000045968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000123490 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:153849542:153900208:-1 gene:ENSMUSG00000045968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC120491 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830403L16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155728 IMAGE:40129414), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC131905 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830403L16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163536 IMAGE:40130182), complete cds. // chr1 // 84 // 68 // 16 // 19 // 0 /// DQ402363 // GenBank // Mus musculus epididymal protein Me9 (Me9) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:153850344:153850967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000082926 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:154311408:154311527:-1 gene:ENSMUSG00000064860 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT003212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_010500 // RefSeq // Mus musculus immediate early response 5 (Ier5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055322 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:155096361:155099636:-1 gene:ENSMUSG00000056708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF079527 // GenBank // Mus musculus IER5 (Ier5) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC051986 // GenBank // Mus musculus immediate early response 5, mRNA (cDNA clone MGC:62292 IMAGE:5707524), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:155098504:155099430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_008209 // RefSeq // Mus musculus major histocompatibility complex, class I-related (Mr1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000027744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:155127878:155146783:-1 gene:ENSMUSG00000026471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF010448 // GenBank // Mus musculus MHC class I related protein 1 isoform A (MR1A) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF010449 // GenBank // Mus musculus MHC class I related protein 1 isoform B (MR1B) pseudogene mRNA, complete sequence. // chr1 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// AF010451 // GenBank // Mus musculus MHC class I related protein 1 isoform D (MR1D) pseudogene mRNA, complete sequence. // chr1 // 88 // 53 // 14 // 16 // 0 /// AF010453 // GenBank // Mus musculus MHC class I related protein 1 isoform F (MR1F) pseudogene mRNA, complete sequence. // chr1 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// BC026137 // GenBank // Mus musculus major histocompatibility complex, class I-related, mRNA (cDNA clone MGC:13881 IMAGE:4017492), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U94989 // GenBank // Mus musculus MHC class I-like protein (MR1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK041171 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530087F01 product:major histocompatibility complex, class I-related, full insert sequence. // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000001208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:155106339:155146683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0
XM_006530033 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC034090 (BC034090), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530035 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC034090 (BC034090), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530036 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC034090 (BC034090), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_148974 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC034090 (BC034090), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000035914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:155212473:155232740:-1 gene:ENSMUSG00000033722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK129406 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1614 protein. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC034090 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC034090, mRNA (cDNA clone IMAGE:4482000), partial cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XR_387502 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC034090 (BC034090), transcript variant X9, misc_RNA. // chr1 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// ENSMUST00000186156 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:155212471:155244444:-1 gene:ENSMUSG00000033722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000186551 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:155218271:155225174:-1 gene:ENSMUSG00000033722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT003227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:155213520:155242277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_010712 // RefSeq // Mus musculus LIM homeobox protein 4 (Lhx4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006529168 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus LIM homeobox protein 4 (Lhx4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000027740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:155698031:155751710:-1 gene:ENSMUSG00000026468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF135415 // GenBank // Mus musculus LIM-homeobox protein (Lhx4) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// BC049834 // GenBank // Mus musculus LIM homeobox protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:54612 IMAGE:6493203), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:155702222:155725562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001024945 // RefSeq // Mus musculus quiescin Q6 sulfhydryl oxidase 1 (Qsox1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_023268 // RefSeq // Mus musculus quiescin Q6 sulfhydryl oxidase 1 (Qsox1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000035325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:155778155:155812883:-1 gene:ENSMUSG00000033684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000111764 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:155778159:155812851:-1 gene:ENSMUSG00000033684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB044284 // GenBank // Mus musculus SOx mRNA for sulfhydryl oxidase, complete cds. // chr1 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC076590 // GenBank // Mus musculus quiescin Q6 sulfhydryl oxidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:100040 IMAGE:30548238), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC034131 // GenBank // Mus musculus quiescin Q6 sulfhydryl oxidase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4920854), partial cds. // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000014526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:155779169:155798316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001039184 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 350 (Cep350), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000138762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:155844966:155972887:-1 gene:ENSMUSG00000033671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:155830942:155962547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1
NM_001039184 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 350 (Cep350), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:155844966:155972887:-1 gene:ENSMUSG00000033671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:155830942:155962547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039184 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 350 (Cep350), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000124495 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:155953442:155972890:-1 gene:ENSMUSG00000033671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000138762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:155844966:155972887:-1 gene:ENSMUSG00000033671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC089561 // GenBank // Mus musculus centrosomal protein 350, mRNA (cDNA clone IMAGE:30301662), complete cds. // chr1 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:155830942:155962547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_177838 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 163, member A (Fam163a), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000015628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:156075966:156205026:-1 gene:ENSMUSG00000015484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB299026 // GenBank // Mus musculus mRNA for cebelin, complete cds. // chrUn // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC116972 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 163, member A, mRNA (cDNA clone MGC:151349 IMAGE:40126291), complete cds. // chrUn // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC116974 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 163, member A, mRNA (cDNA clone MGC:151351 IMAGE:40126293), complete cds. // chrUn // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001134741 // RefSeq // Mus musculus tudor domain containing 5 (Tdrd5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001277730 // RefSeq // Mus musculus tudor domain containing 5 (Tdrd5), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006496732 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tudor domain containing 5 (Tdrd5), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000121146 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:156255296:156303664:-1 gene:ENSMUSG00000060985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000167528 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:156255298:156303348:-1 gene:ENSMUSG00000060985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC099972 // GenBank // Mus musculus tudor domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:107536 IMAGE:30080156), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000014528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:156248731:156302598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
XM_006543563 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus axonemal dynein light chain domain containing 1 (Axdnd1), mRNA. // chr1 // 98 // 95 // 55 // 56 // 0 /// ENSMUST00000027895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:156364926:156399990:-1 gene:ENSMUSG00000026601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 56 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000177824 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:156323509:156419310:-1 gene:ENSMUSG00000026601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 52 // 52 // 0 /// ENSMUST00000180173 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:156365519:156398542:-1 gene:ENSMUSG00000026601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 51 // 30 // 30 // 0 /// BC150932 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9430070O13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183843 IMAGE:9087843), complete cds. // chr1 // 97 // 51 // 29 // 30 // 0 /// BC172088 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9430070O13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:198793 IMAGE:9054374), complete cds. // chr1 // 97 // 51 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000178036 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:156323509:156421159:-1 gene:ENSMUSG00000026601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 95 // 56 // 59 // 1 /// GENSCAN00000014519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:156376437:156404217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 49 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:156330643:156349055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 20 // 20 // 12 // 59 // 1
NM_009230 // RefSeq // Mus musculus sterol O-acyltransferase 1 (Soat1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000051396 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:156429793:156466804:-1 gene:ENSMUSG00000026600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// BC083092 // GenBank // Mus musculus sterol O-acyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:102564 IMAGE:30446741), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// DQ903181 // GenBank // Mus musculus sterol O-acyltransferase 1 (soat1) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 89 // 32 // 34 // 0 /// AK054149 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230023O14 product:sterol O-acyltransferase 1, full insert sequence. // chr1 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// ENSMUST00000187507 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:156440576:156474296:-1 gene:ENSMUSG00000026600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000189661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:156424525:156474331:-1 gene:ENSMUSG00000026600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// L42293 // GenBank // Mus musculus acyl-coenzyme A:cholesterol acyltransferase (ACACT) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000191379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:156440150:156474240:-1 gene:ENSMUSG00000026600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// GENSCAN00000014508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:156416768:156448757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1
NM_177644 // RefSeq // Mus musculus RAS protein activator like 2 (Rasal2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006496753 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS protein activator like 2 (Rasal2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000078308 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:157135182:157412595:-1 gene:ENSMUSG00000070565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000132699 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:157140534:157411934:-1 gene:ENSMUSG00000070565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000134543 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:157176172:157256682:-1 gene:ENSMUSG00000070565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC120902 // GenBank // Mus musculus RAS protein activator like 2, mRNA (cDNA clone MGC:141546 IMAGE:40086771), complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// ENSMUST00000129880 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:157175979:157244490:-1 gene:ENSMUSG00000070565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// GENSCAN00000033147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:157139795:157231574:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0
NM_207583 // RefSeq // Mus musculus bone morphogenic protein/retinoic acid inducible neural-specific 2 (Brinp2), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000004133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:158245271:158356260:-1 gene:ENSMUSG00000004031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK122549 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1747 protein. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC067038 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6430517E21 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6840309), partial cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC076572 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 5, member B, mRNA (cDNA clone MGC:100244 IMAGE:30363878), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006496836 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus bone morphogenic protein/retinoic acid inducible neural-specific 2 (Brinp2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:158246198:158295694:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001085376 // RefSeq // Mus musculus pappalysin 2 (Pappa2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:158711727:158958367:-1 gene:ENSMUSG00000073530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094560 // GenBank // Mus musculus pappalysin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6826131), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:158714946:158878317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_001085376 // RefSeq // Mus musculus pappalysin 2 (Pappa2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:158814274:158845032:-1 gene:ENSMUSG00000073530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:158711727:158958367:-1 gene:ENSMUSG00000073530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:158828656:158838559:-1 gene:ENSMUSG00000073530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK005504 // GenBank HTC // Mus musculus adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1600020F20 product:cellular repressor of E1A-stimulated genes, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:158714946:158878317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001085376 // RefSeq // Mus musculus pappalysin 2 (Pappa2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000159861 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:158711727:158958367:-1 gene:ENSMUSG00000073530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:158714946:158878317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
ENSMUST00000062159 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:158967701:158980463:-1 gene:ENSMUSG00000047661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC100356 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30786773. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000159892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:158958127:158980490:-1 gene:ENSMUSG00000073530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// NONMMUT003335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NR_038030 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930562F07 gene (4930562F07Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_038031 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930562F07 gene (4930562F07Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000028061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:1:160074735:160077918:-1 gene:ENSMUSG00000026729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000164249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:160074735:160077985:-1 gene:ENSMUSG00000026729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000169600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:160074970:160077942:-1 gene:ENSMUSG00000026729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT003370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT003371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_177839 // RefSeq // Mus musculus tenascin N (Tnn), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:160085036:160153580:-1 gene:ENSMUSG00000026725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000131919 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:160085968:160147888:-1 gene:ENSMUSG00000026725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AF455756 // GenBank // Mus musculus tenascin-N (Tnn) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138335 // GenBank // Mus musculus tenascin N, mRNA (cDNA clone MGC:169960 IMAGE:8861355), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC138336 // GenBank // Mus musculus tenascin N, mRNA (cDNA clone MGC:169961 IMAGE:8861356), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:160086031:160147840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_009786 // RefSeq // Mus musculus calcyclin binding protein (Cacybp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000014370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:160202367:160212892:-1 gene:ENSMUSG00000014226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC025948 // GenBank // Mus musculus calcyclin binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:38013 IMAGE:5150537), complete cds. // chr1 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1 /// GENSCAN00000033878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:160203567:160217135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_001146330 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 52 (Gpr52), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039482 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 20 (Klhl20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_373601 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch-like 20 (Klhl20), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:161088375:161131511:-1 gene:ENSMUSG00000026705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161088380:161131428:-1 gene:ENSMUSG00000026705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161088375:161131511:-1 gene:ENSMUSG00000026705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC019571 // GenBank // Mus musculus kelch-like 20 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:28950 IMAGE:4235202), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000148952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161096445:161131511:-1 gene:ENSMUSG00000026705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// AK054169 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230024I19 product:KELCH-LIKE PROTEIN X homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000001621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:161089034:161131568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
NM_001195189 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930469G21 gene (4930469G21Rik), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000135643 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:161154558:161159314:-1 gene:ENSMUSG00000049160 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000178511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:161156843:161159314:-1 gene:ENSMUSG00000049160 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001205243 // RefSeq // Mus musculus Fas ligand (TNF superfamily, member 6) (Fasl), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_010177 // RefSeq // Mus musculus Fas ligand (TNF superfamily, member 6) (Fasl), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000000834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:161780691:161788495:-1 gene:ENSMUSG00000000817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF288572 // GenBank // Mus musculus FasL isoform mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC052866 // GenBank // Mus musculus Fas ligand (TNF superfamily, member 6), mRNA (cDNA clone MGC:60606 IMAGE:30073084), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// U06948 // GenBank // Mus musculus Fas ligand mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// U10984 // GenBank // Mus musculus C57BL/6 Fas ligand mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// U58995 // GenBank // Mus musculus strain Balb/c Fas ligand mRNA, complete cds. // chr1 // 87 // 52 // 13 // 15 // 0 /// DQ846747 // GenBank // Mus musculus strain SEG/Pas Fas ligand mRNA, complete cds. // chr1 // 53 // 52 // 8 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:161781576:161788285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NM_172645 // RefSeq // Mus musculus SUN domain containing ossification factor (Suco), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:161816112:161876661:-1 gene:ENSMUSG00000040297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC138379 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI848100, mRNA (cDNA clone MGC:170004 IMAGE:8861399), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000028173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:161827097:161869292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001204904 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930558K02 gene (4930558K02Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001204905 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930558K02 gene (4930558K02Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006497015 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930558K02 gene (4930558K02Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141397 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:161942091:161969148:-1 gene:ENSMUSG00000086277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000162676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:161942086:161979636:-1 gene:ENSMUSG00000086277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
AK137523 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830128E01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// Z31360 // GenBank // M.musculus (Balb/C) P/L01 mRNA. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
ENSMUST00000169439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:162647203:162658173:-1 gene:ENSMUSG00000091060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK136134 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420461P10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC099523 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30935132. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006496591 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 7420461P10 gene (7420461P10Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// XM_006496592 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 7420461P10 gene (7420461P10Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:162650892:162660619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001081290 // RefSeq // Mus musculus proline-rich coiled-coil 2C (Prrc2c), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000028016 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:162673402:162740550:-1 gene:ENSMUSG00000040225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000182149 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:162670725:162740495:-1 gene:ENSMUSG00000040225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000182393 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:162671788:162705192:-1 gene:ENSMUSG00000040225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000182593 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:162672889:162740481:-1 gene:ENSMUSG00000040225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000182660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:162670727:162740556:-1 gene:ENSMUSG00000040225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000183011 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:162710534:162740404:-1 gene:ENSMUSG00000040225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000183223 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:162671785:162704766:-1 gene:ENSMUSG00000040225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000011530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:162673402:162724815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
NM_144878 // RefSeq // Mus musculus flavin containing monooxygenase 4 (Fmo4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496774 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus flavin containing monooxygenase 4 (Fmo4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496775 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus flavin containing monooxygenase 4 (Fmo4), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000028014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:162793883:162812549:-1 gene:ENSMUSG00000026692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111525 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:162793883:162813672:-1 gene:ENSMUSG00000026692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF461145 // GenBank // Mus musculus flavin-containing monooxygenase 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC106858 // GenBank // Mus musculus flavin containing monooxygenase 4, mRNA (cDNA clone MGC:124273 IMAGE:40047236), complete cds. // chr1 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// BC106859 // GenBank // Mus musculus flavin containing monooxygenase 4, mRNA (cDNA clone MGC:124274 IMAGE:40047237), complete cds. // chr1 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// ENSMUST00000140031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:162802853:162813672:-1 gene:ENSMUSG00000026692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// AK146562 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days pregnant adult female amnion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920026L13 product:flavin containing monooxygenase 4, full insert sequence. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:162792469:162862821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_018881 // RefSeq // Mus musculus flavin containing monooxygenase 2 (Fmo2), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045902 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:162874317:162898712:-1 gene:ENSMUSG00000040170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:162876436:162898665:-1 gene:ENSMUSG00000040170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000143123 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:162887568:162898484:-1 gene:ENSMUSG00000040170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// AF184981 // GenBank // Mus musculus flavin-containing monooxygenase 2 (Fmo2) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// AK129026 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3037267, highly similar to Mus musculus flavin containing monooxygenase 2 (Fmo2). // chr1 // 81 // 57 // 13 // 16 // 0 /// BC031415 // GenBank // Mus musculus flavin containing monooxygenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:28212 IMAGE:3990305), complete cds. // chr1 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:162876728:162898305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_008030 // RefSeq // Mus musculus flavin containing monooxygenase 3 (Fmo3), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000028010 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:162953802:162984527:-1 gene:ENSMUSG00000026691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000142759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:162963514:162984528:-1 gene:ENSMUSG00000026691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// AK050123 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730018G15 product:flavin containing monooxygenase 3, full insert sequence. // chr1 // 96 // 68 // 22 // 23 // 0 /// U87147 // GenBank // Mus musculus flavin-containing monooxygenase 3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:162916723:163087341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1
NM_030071 // RefSeq // Mus musculus maestro heat-like repeat family member 9 (Mroh9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000096608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:163024302:163085670:-1 gene:ENSMUSG00000071890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000011519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:162916723:163087341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
NM_178883 // RefSeq // Mus musculus golgin, RAB6-interacting (Gorab), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045138 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:163384908:163403669:-1 gene:ENSMUSG00000040124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK170455 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630104E20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119132 // GenBank // Mus musculus golgin, RAB6-interacting, mRNA (cDNA clone MGC:155448 IMAGE:8733881), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC119134 // GenBank // Mus musculus golgin, RAB6-interacting, mRNA (cDNA clone MGC:155450 IMAGE:8733883), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000185299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:163394416:163403611:-1 gene:ENSMUSG00000040124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000186402 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:163384912:163403656:-1 gene:ENSMUSG00000040124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:163386253:163456172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001143956 // RefSeq // Mus musculus methyltransferase like 11B (Mettl11b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006496843 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methyltransferase like 11B (Mettl11b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006496844 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methyltransferase like 11B (Mettl11b), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000159679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:163702256:163725232:-1 gene:ENSMUSG00000040113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000160495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:163702999:163725232:-1 gene:ENSMUSG00000040113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC157906 // GenBank // Mus musculus methyltransferase like 11B, mRNA (cDNA clone MGC:189921 IMAGE:9088108), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158115 // GenBank // Mus musculus methyltransferase like 11B, mRNA (cDNA clone MGC:190001 IMAGE:9088188), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC172048 // GenBank // Mus musculus methyltransferase like 11B, mRNA (cDNA clone MGC:198753 IMAGE:9054334), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC172056 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054342. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:163688397:163725055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006496909 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC055324 (BC055324), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496911 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC055324 (BC055324), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:163953746:163994796:-1 gene:ENSMUSG00000041406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097493 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:163945993:163994796:-1 gene:ENSMUSG00000041406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK141661 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030013A14 product:hypothetical Short-chain dehydrogenase/reductase SDR containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK163374 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020028F21 product:hypothetical Short-chain dehydrogenase/reductase SDR containing protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC052855 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC055324, mRNA (cDNA clone MGC:60834 IMAGE:30058659), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC055324 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC055324, mRNA (cDNA clone MGC:65590 IMAGE:5715852), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:163961925:163987689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NM_009721 // RefSeq // Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 1 polypeptide (Atp1b1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000027863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:164437267:164458355:-1 gene:ENSMUSG00000026576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC027319 // GenBank // Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 1 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:6286 IMAGE:2648940), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC094070 // GenBank // Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 1 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:102524 IMAGE:4974089), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:164438276:164456052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_008510 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C motif) ligand 1 (Xcl1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027860 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:164931644:164935527:-1 gene:ENSMUSG00000026573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC062249 // GenBank // Mus musculus chemokine (C motif) ligand 1, mRNA (cDNA clone MGC:73627 IMAGE:3974601), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D43769 // GenBank // Mus musculus mRNA for SCM-1 (single cysteine motif-1), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U15607 // GenBank // Mus musculus lymphotactin mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:164931785:164935490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_032005 // RefSeq // Mus musculus T-box 19 (Tbx19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006497043 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T-box 19 (Tbx19), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000027859 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:165137855:165160773:-1 gene:ENSMUSG00000026572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000161144 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:165138947:165153726:-1 gene:ENSMUSG00000026572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000161777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:165138889:165149694:-1 gene:ENSMUSG00000026572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AF345520 // GenBank // Mus musculus T-box 19 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF348321 // GenBank // Mus musculus Tpit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC120635 // GenBank // Mus musculus T-box 19, mRNA (cDNA clone MGC:155872 IMAGE:40129558), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC137731 // GenBank // Mus musculus T-box 19, mRNA (cDNA clone MGC:169355 IMAGE:8860750), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:165138963:165160562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_145512 // RefSeq // Mus musculus SFT2 domain containing 2 (Sft2d2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000043338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:165174341:165194433:-1 gene:ENSMUSG00000040848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC017549 // GenBank // Mus musculus SFT2 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:28921 IMAGE:4924681), complete cds. // chr1 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:165177271:165236830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_145513 // RefSeq // Mus musculus TIP41, TOR signalling pathway regulator-like (S. cerevisiae) (Tiprl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006496779 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TIP41, TOR signalling pathway regulator-like (S. cerevisiae) (Tiprl), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496780 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TIP41, TOR signalling pathway regulator-like (S. cerevisiae) (Tiprl), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000043235 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:165214922:165236943:-1 gene:ENSMUSG00000040843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:165222445:165236922:-1 gene:ENSMUSG00000040843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC002098 // GenBank // Mus musculus TIP41, TOR signalling pathway regulator-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:6416 IMAGE:3590157), complete cds. // chr1 // 86 // 75 // 18 // 21 // 0 /// BC058250 // GenBank // Mus musculus TIP41, TOR signalling pathway regulator-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:68063 IMAGE:6315314), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:165177271:165236830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_028759 // RefSeq // Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 6 (Dcaf6), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006497007 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 6 (Dcaf6), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// XM_006497008 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 6 (Dcaf6), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000027856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:165329511:165460465:-1 gene:ENSMUSG00000026571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AK161893 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330543E12 product:hypothetical IQ calmodulin-binding region/IQ motif profile containing protein, full insert sequence. // chr1 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// GENSCAN00000005825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:165327635:165429261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0
NM_001001880 // RefSeq // Mus musculus myelin protein zero-like 1 (Mpzl1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NM_001083897 // RefSeq // Mus musculus myelin protein zero-like 1 (Mpzl1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000068705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:165592181:165634541:-1 gene:ENSMUSG00000026566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:165592181:165634541:-1 gene:ENSMUSG00000026566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK076882 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930534A01 product:similar to myelin protein zero-like 1 Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// AK210564 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0118N15, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000068705, based on BLAT search. // chr1 // 89 // 29 // 8 // 9 // 0 /// AY764247 // GenBank // Mus musculus protein zero-related (Mpzl1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC072563 // GenBank // Mus musculus myelin protein zero-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:99880 IMAGE:6808882), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:165593576:165634393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_001038846 // RefSeq // Mus musculus RCSD domain containing 1 (Rcsd1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_178593 // RefSeq // Mus musculus RCSD domain containing 1 (Rcsd1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006496781 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RCSD domain containing 1 (Rcsd1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006496783 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RCSD domain containing 1 (Rcsd1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000040357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:165648945:165708094:-1 gene:ENSMUSG00000040723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000097474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:165648945:165708094:-1 gene:ENSMUSG00000040723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC025872 // GenBank // Mus musculus RCSD domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:32399 IMAGE:5037953), complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:165650178:165671944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_001033344 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 27 (putative) (Dusp27), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001160049 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 27 (putative) (Dusp27), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:166098153:166127898:-1 gene:ENSMUSG00000026564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117936 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 27 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:144106 IMAGE:40097789), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:166098625:166127179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_175296 // RefSeq // Mus musculus maelstrom homolog (Drosophila) (Mael), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000038782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:166201385:166238744:-1 gene:ENSMUSG00000040629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC050800 // GenBank // Mus musculus maelstrom homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:58726 IMAGE:6744032), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000014082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:166185640:166247950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
ENSMUST00000168347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:166306741:166309585:-1 gene:ENSMUSG00000091393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK030611 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330438I03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025650 // RefSeq // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit XI (Uqcr11), mRNA. // chr1 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// ENSMUST00000020372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:10:80402997:80406830:-1 gene:ENSMUSG00000020163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// ENSMUST00000118577 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:166431705:166431875:-1 gene:ENSMUSG00000084093 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000138428 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:10:80402997:80406766:-1 gene:ENSMUSG00000020163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// ENSMUST00000141683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:10:80402998:80406795:-1 gene:ENSMUSG00000020163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// BC034408 // GenBank // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase (6.4kD) subunit, mRNA (cDNA clone MGC:35722 IMAGE:4235605), complete cds. // chr1 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// NONMMUT003665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT006413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// NONMMUT006414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0
NM_001164312 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4847 (Gm4847), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000046662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:1:166628971:166647693:-1 gene:ENSMUSG00000051081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000045261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:166630492:166643479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0
NM_172844 // RefSeq // Mus musculus flavin containing monooxygenase 9 (Fmo9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000027843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:166662055:166681845:-1 gene:ENSMUSG00000026560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000148677 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:166662387:166681835:-1 gene:ENSMUSG00000026560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC111885 // GenBank // Mus musculus flavin containing monooxygenase 9, mRNA (cDNA clone MGC:132867 IMAGE:40060432), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC112405 // GenBank // Mus musculus flavin containing monooxygenase 9, mRNA (cDNA clone MGC:132866 IMAGE:40060428), complete cds. // chr1 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000045266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:166653050:166680284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
XM_006497039 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uridine-cytidine kinase 2 (Uck2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:167223827:167223919:-1 gene:ENSMUSG00000053664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC004016 // GenBank // Mus musculus uridine-cytidine kinase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3493906), partial cds. // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NM_030724 // RefSeq // Mus musculus uridine-cytidine kinase 2 (Uck2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006497039 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uridine-cytidine kinase 2 (Uck2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000027839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:167226090:167285127:-1 gene:ENSMUSG00000026558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF236636 // GenBank // Mus musculus uridine-cytidine kinase 2 (Uck2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC023789 // GenBank // Mus musculus uridine-cytidine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:35611 IMAGE:5352192), complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:167226382:167284874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NONMMUT003686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_025569 // RefSeq // Mus musculus microsomal glutathione S-transferase 3 (Mgst3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000028005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:167371966:167393841:-1 gene:ENSMUSG00000026688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC029669 // GenBank // Mus musculus microsomal glutathione S-transferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:35738 IMAGE:5372427), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:167372503:167378408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
NM_001013382 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 52 (Lrrc52), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:167445675:167466780:-1 gene:ENSMUSG00000040485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087947 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 52, mRNA (cDNA clone MGC:107341 IMAGE:30303788), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:167445801:167466663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
ENSMUST00000076828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:169453528:169453869:-1 gene:ENSMUSG00000058622 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000042967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:169453528:169514967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_023284 // RefSeq // Mus musculus NUF2, NDC80 kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae) (Nuf2), mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000028000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:169498312:169531428:-1 gene:ENSMUSG00000026683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000111368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:169497934:169531464:-1 gene:ENSMUSG00000026683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// AF326732 // GenBank // Mus musculus NUF2R mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// AK089939 // GenBank HTC // Mus musculus colon RCB-0549 Cle-H3 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430008M12 product:NUF2R homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr1 // 77 // 67 // 17 // 22 // 0 /// BC020026 // GenBank // Mus musculus NUF2, NDC80 kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:27942 IMAGE:3587655), complete cds. // chr1 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:169453528:169514967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_010476 // RefSeq // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 7 (Hsd17b7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000027989 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:169949535:169969241:-1 gene:ENSMUSG00000026675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000123230 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:169959453:169966149:-1 gene:ENSMUSG00000026675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 80 // 48 // 12 // 15 // 0 /// ENSMUST00000133563 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:169952876:169965723:-1 gene:ENSMUSG00000026675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000111353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:169955501:169969241:-1 gene:ENSMUSG00000026675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// AK077914 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030439M15 product:hydroxysteroid 17-beta dehydrogenase 7, full insert sequence. // chr1 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// GENSCAN00000046066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:169940474:170035994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_022563 // RefSeq // Mus musculus discoidin domain receptor family, member 2 (Ddr2), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000027985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:169977804:170110501:-1 gene:ENSMUSG00000026674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// ENSMUST00000170800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:169972308:170088944:-1 gene:ENSMUSG00000026674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC138826 // GenBank // Mus musculus discoidin domain receptor family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:170453 IMAGE:8861848), complete cds. // chr1 // 79 // 94 // 27 // 34 // 0 /// BC138827 // GenBank // Mus musculus discoidin domain receptor family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:170454 IMAGE:8861849), complete cds. // chr1 // 76 // 92 // 25 // 33 // 0 /// X76505 // GenBank // M.musculus (C57B1/6) Tyro 10 mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:169940474:170035994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC050083 // GenBank HTC // Mus musculus discoidin domain receptor family, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:30027315), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_133806 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1 (Uap1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000027981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:170142003:170174946:-1 gene:ENSMUSG00000026670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000111350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:170141938:170174957:-1 gene:ENSMUSG00000026670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000111351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:170142002:170174946:-1 gene:ENSMUSG00000026670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC016406 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1, mRNA (cDNA clone MGC:25668 IMAGE:4489112), complete cds. // chr1 // 82 // 97 // 27 // 33 // 0 /// BC017547 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1, mRNA (cDNA clone MGC:28907 IMAGE:4920702), complete cds. // chr1 // 80 // 88 // 24 // 30 // 0 /// ENSMUST00000162253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:170149671:170174792:-1 gene:ENSMUSG00000026670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// AK163314 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020013G17 product:UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase 1, full insert sequence. // chr1 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// GENSCAN00000046082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:170058101:170166905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_010633 // RefSeq // Mus musculus U2AF homology motif (UHM) kinase 1 (Uhmk1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000027979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:170193420:170215397:-1 gene:ENSMUSG00000026667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000123399 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:170193420:170215397:-1 gene:ENSMUSG00000026667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000150821 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:170193420:170214734:-1 gene:ENSMUSG00000026667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC058732 // GenBank // Mus musculus U2AF homology motif (UHM) kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:64770 IMAGE:6414877), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// X82320 // GenBank // M.musculus KIS mRNA. // chr1 // 89 // 60 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000046074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:170199867:170215240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001081304 // RefSeq // Mus musculus activating transcription factor 6 (Atf6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000027974 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:170704674:170867771:-1 gene:ENSMUSG00000026663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK087000 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030019E01 product:similar to CYCLIC-AMP-DEPENDENT TRANSCRIPTION FACTOR ATF-6 ALPHA (ACTIVATING TRANSCRIPTION FACTOR 6 ALPHA) (ATF6-ALPHA) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC141028 // GenBank // Mus musculus activating transcription factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:175989 IMAGE:9055640), complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000036996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:170774651:170821344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 47 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:170826434:170885407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENSMUST00000180190 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:170751717:170751823:-1 gene:ENSMUSG00000096310 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONMMUT003743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
ENSMUST00000179933 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:170832765:170832871:-1 gene:ENSMUSG00000096547 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT003746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001029984 // RefSeq // Mus musculus Fc receptor-like B (Fcrlb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000094337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:170907273:170912941:-1 gene:ENSMUSG00000070524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY513660 // GenBank // Mus musculus FREB-2 mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// DQ119292 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 FcRY mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:170907273:170924598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_025321 // RefSeq // Mus musculus succinate dehydrogenase complex, subunit C, integral membrane protein (Sdhc), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006496955 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus succinate dehydrogenase complex, subunit C, integral membrane protein (Sdhc), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000081560 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:1:171129407:171150591:-1 gene:ENSMUSG00000058076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000111336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:171127165:171150603:-1 gene:ENSMUSG00000058076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC005779 // GenBank // Mus musculus succinate dehydrogenase complex, subunit C, integral membrane protein, mRNA (cDNA clone MGC:6555 IMAGE:2810852), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC083091 // GenBank // Mus musculus succinate dehydrogenase complex, subunit C, integral membrane protein, mRNA (cDNA clone MGC:103103 IMAGE:30445339), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155798 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:1:171138726:171150588:-1 gene:ENSMUSG00000058076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:171129801:171145777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0