NM_019457 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 6 (testis) (Lrrc6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000023006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:66379858:66500910:-1 gene:ENSMUSG00000022375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF092208 // GenBank // Mus musculus testis specific protein (Mc2) mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// BC046277 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 6 (testis), mRNA (cDNA clone MGC:54561 IMAGE:6310345), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000018441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:66397979:66500784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0
NM_172514 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 71 (Tmem71), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:66526212:66561046:-1 gene:ENSMUSG00000036944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117823 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 71, mRNA (cDNA clone MGC:143746 IMAGE:40092863), complete cds. // chr15 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC117824 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 71, mRNA (cDNA clone MGC:143747 IMAGE:40092864), complete cds. // chr15 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_009177 // RefSeq // Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 (St3gal1), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006520664 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 (St3gal1), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000092640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:67102875:67113992:-1 gene:ENSMUSG00000013846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC040763 // GenBank // Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4480779). // chr15 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC099670 // GenBank // Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:106135 IMAGE:4187038), complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC099693 // GenBank // Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:106136 IMAGE:4910140), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC023130 // GenBank HTC // Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3586292), with apparent retained intron. // chr15 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// BC084730 // GenBank // Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:90735 IMAGE:30355523), complete cds. // chr15 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000018444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:67106657:67113803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
AK143207 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130308K22 product:hypothetical Retroviral integrase, C-terminal containing protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029534 // RefSeq // Mus musculus microRNA 30b (Mir30b), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000083542 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:68337415:68337510:-1 gene:ENSMUSG00000065476 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// mmu-mir-30b // miRBase Micro RNA Database // MI0000145 Mus musculus miR-30b stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT023834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_029718 // RefSeq // Mus musculus microRNA 30d (Mir30d), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000083503 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:68341208:68341289:-1 gene:ENSMUSG00000065437 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000175699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:68340983:68363176:-1 gene:ENSMUSG00000093387 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-30d // miRBase Micro RNA Database // MI0000549 Mus musculus miR-30d stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT023836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT023837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:68320324:68364949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_020045 // RefSeq // Mus musculus NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog (S. cerevisiae) (Nfu1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// ENSMUST00000117583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:6:87009889:87028446:1 gene:ENSMUSG00000029993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// AY335195 // GenBank // Mus musculus NifU-like protein HIRIP5 (Hirip5) mRNA, partial cds. // chr15 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// BC018355 // GenBank // Mus musculus NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:5675 IMAGE:3584656), complete cds. // chr15 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:68715062:68715526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_177819 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006521395 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000022953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:71445678:71727838:-1 gene:ENSMUSG00000036800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC119174 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 135, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:8733923), complete cds. // chr15 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC137579 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 135, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:8860598), complete cds. // chr15 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:71445900:71543148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_177819 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006521395 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000022953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:71445678:71727838:-1 gene:ENSMUSG00000036800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:71445900:71543148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC125645 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 135, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:40130160), complete cds. // chr15 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC125647 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 135, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:40130162), complete cds. // chr15 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_177819 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), mRNA. // chr15 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENSMUST00000022953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:71445678:71727838:-1 gene:ENSMUSG00000036800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// XM_006521395 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000052250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:71445900:71543148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_027174 // RefSeq // Mus musculus collagen, type XXII, alpha 1 (Col22a1), mRNA. // chr15 // 100 // 98 // 59 // 59 // 0 /// XM_006521383 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collagen, type XXII, alpha 1 (Col22a1), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000159410 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:71922900:71954399:-1 gene:ENSMUSG00000079022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 17 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000159993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:15:71795795:72034227:-1 gene:ENSMUSG00000079022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 98 // 59 // 59 // 0 /// ENSMUST00000160513 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:71868881:71897616:-1 gene:ENSMUSG00000079022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 15 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000162081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:71904728:71954374:-1 gene:ENSMUSG00000079022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 28 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT023860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 100 // 28 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:71806301:71992098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 77 // 77 // 46 // 60 // 1
NM_001033876 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 9 (Kcnk9), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:72512119:72546279:-1 gene:ENSMUSG00000036760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC139167 // GenBank // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:170794 IMAGE:8862189), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC139168 // GenBank // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:170795 IMAGE:8862190), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ185133 // GenBank // Mus musculus TASK-3 two-pore-domain K+ channel (Kcnk9) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:72512119:72552613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000157739 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:72721321:72721387:-1 gene:ENSMUSG00000088364 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000157180 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:53383919:53383984:1 gene:ENSMUSG00000087805 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// AK053387 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130013E11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONMMUT037550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_153178 // RefSeq // Mus musculus argonaute RISC catalytic subunit 2 (Ago2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:73095844:73184840:-1 gene:ENSMUSG00000036698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153178 // RefSeq // Mus musculus argonaute RISC catalytic subunit 2 (Ago2), mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000044113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:73095844:73184840:-1 gene:ENSMUSG00000036698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// AB081472 // GenBank // Mus musculus mRNA for Piwi/Argonaute family protein meIF2C2, complete cds. // chr15 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// BC128379 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2C, 2, mRNA (cDNA clone MGC:150320 IMAGE:40111876), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC129922 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2C, 2, mRNA (cDNA clone MGC:150319 IMAGE:40111875), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000003847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:73103500:73152408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0
NM_001130409 // RefSeq // Mus musculus PTK2 protein tyrosine kinase 2 (Ptk2), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000170939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:73215557:73423191:-1 gene:ENSMUSG00000022607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// AB011499 // GenBank // Mus musculus mRNA for focal adhesion kinase spliced variant p110FAK, complete cds. // chr15 // 100 // 70 // 30 // 30 // 0 /// AB030035 // GenBank // Mus musculus mRNA for focal adhesion kinase, complete cds. // chr15 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// BC030180 // GenBank // Mus musculus PTK2 protein tyrosine kinase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5038658). // chr15 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// JN971016 // GenBank // Mus musculus focal ashension kinase 1 (Ptk2) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// M95408 // GenBank // Mouse focal adhesion kinase mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// NM_007982 // RefSeq // Mus musculus PTK2 protein tyrosine kinase 2 (Ptk2), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 81 // 81 // 35 // 43 // 1 /// ENSMUST00000110036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:73205105:73423191:-1 gene:ENSMUSG00000022607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 81 // 81 // 35 // 43 // 1 /// AK005468 // GenBank HTC // Mus musculus adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1600015M17 product:PTK2 protein tyrosine kinase 2, full insert sequence. // chr15 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// GENSCAN00000003861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:73206048:73325836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0
NR_029561 // RefSeq // Mus musculus microRNA 151 (Mir151), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000083678 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:73254815:73254882:-1 gene:ENSMUSG00000065612 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-151 // miRBase Micro RNA Database // MI0000173 Mus musculus miR-151 stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_023587 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b (Ptplb), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000061156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:35022421:35109175:1 gene:ENSMUSG00000035376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF169286 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like protein PTPLB (Ptplb) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC027289 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b, mRNA (cDNA clone MGC:6798 IMAGE:2647850), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC131899 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b, mRNA (cDNA clone MGC:163530 IMAGE:40130176), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC131901 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b, mRNA (cDNA clone MGC:163532 IMAGE:40130178), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006522570 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b (Ptplb), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// XM_006522571 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b (Ptplb), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000039246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:35094107:35106397:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000008431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:73330845:73408241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_173365 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 20 (Gpr20), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000064166 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:73694604:73707505:-1 gene:ENSMUSG00000045281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC117783 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 20, mRNA (cDNA clone MGC:143674 IMAGE:40092101), complete cds. // chr15 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000008451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:73695462:73744121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
GENSCAN00000008444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:73760205:73822522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000126186 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:73780961:73783580:-1 gene:ENSMUSG00000072487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000151999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:73761410:73830983:-1 gene:ENSMUSG00000072487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK132992 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930545J21 product:hypothetical ARM repeat fold containing protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000008444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:73760205:73822522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000151999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:73761410:73830983:-1 gene:ENSMUSG00000072487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132992 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930545J21 product:hypothetical ARM repeat fold containing protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:73760205:73822522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033365 // RefSeq // Mus musculus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000071419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:73786412:73839671:-1 gene:ENSMUSG00000072487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000110021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:73786936:73819410:-1 gene:ENSMUSG00000072487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC150895 // GenBank // Mus musculus gene model 628, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:183806 IMAGE:9087806), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC172046 // GenBank // Mus musculus gene model 628, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:198751 IMAGE:9054332), complete cds. // chr15 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:73761410:73830983:-1 gene:ENSMUSG00000072487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// AK132992 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930545J21 product:hypothetical ARM repeat fold containing protein, full insert sequence. // chr15 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// ENSMUST00000136698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:73796736:73839699:-1 gene:ENSMUSG00000072487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// AK158548 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230010K11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr15 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000008444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:73760205:73822522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
ENSMUST00000110021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:73786936:73819410:-1 gene:ENSMUSG00000072487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:73761410:73830983:-1 gene:ENSMUSG00000072487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132992 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930545J21 product:hypothetical ARM repeat fold containing protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150895 // GenBank // Mus musculus gene model 628, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:183806 IMAGE:9087806), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC172046 // GenBank // Mus musculus gene model 628, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:198751 IMAGE:9054332), complete cds. // chr15 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:73760205:73822522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000151999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:73761410:73830983:-1 gene:ENSMUSG00000072487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132992 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930545J21 product:hypothetical ARM repeat fold containing protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153053 // RefSeq // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 4 (Sf3b4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000076372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:96172332:96177564:1 gene:ENSMUSG00000068856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000100555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:74080234:74081511:-1 gene:ENSMUSG00000075609 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// AK201422 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0138D15, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000061281, based on BLAT search. // chr15 // 93 // 38 // 13 // 14 // 0 /// BC024418 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:36564 IMAGE:4982610), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC026567 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:36369 IMAGE:4982239), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC085273 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3b, subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:103360 IMAGE:30144329), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000153977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:96172547:96173346:1 gene:ENSMUSG00000068856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// GENSCAN00000008425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74080234:74081511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:96086871:96177166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0
AK149087 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120482A17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001177437 // RefSeq // Mus musculus maestro heat-like repeat family member 4 (Mroh4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006521353 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus maestro heat-like repeat family member 4 (Mroh4), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006521355 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus maestro heat-like repeat family member 4 (Mroh4), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000023271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74606029:74636353:-1 gene:ENSMUSG00000022603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000137963 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:74606029:74634849:-1 gene:ENSMUSG00000022603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000176767 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:74616138:74628323:-1 gene:ENSMUSG00000022603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC111897 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700016M24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:132932 IMAGE:40061435), complete cds. // chr15 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74606111:74661355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0
NM_001276684 // RefSeq // Mus musculus activity regulated cytoskeletal-associated protein (Arc), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_018790 // RefSeq // Mus musculus activity regulated cytoskeletal-associated protein (Arc), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74669083:74672568:-1 gene:ENSMUSG00000022602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:74669083:74672570:-1 gene:ENSMUSG00000022602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF162777 // GenBank // Mus musculus growth factor ARC (Arc) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC023127 // GenBank // Mus musculus activity regulated cytoskeletal-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:27890 IMAGE:3498057), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_008415 // RefSeq // Mus musculus jerky (Jrk), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050234 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74702301:74709535:-1 gene:ENSMUSG00000046380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U35730 // GenBank // Mus musculus jerky mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_020519 // RefSeq // Mus musculus secreted Ly6/Plaur domain containing 1 (Slurp1), mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023261 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:74726664:74728014:-1 gene:ENSMUSG00000022596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// BC111105 // GenBank // Mus musculus secreted Ly6/Plaur domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:130552 IMAGE:40052992), complete cds. // chr15 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC125244 // GenBank // Mus musculus secreted Ly6/Plaur domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:130553 IMAGE:40053004), complete cds. // chr15 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000190433 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74724318:74728034:-1 gene:ENSMUSG00000022596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74726808:74734287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_026671 // RefSeq // Mus musculus Ly6/Plaur domain containing 2 (Lypd2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023260 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74732247:74734329:-1 gene:ENSMUSG00000022595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB009019 // GenBank // Mus musculus VLL mRNA for H8C4 protein, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK002226 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610005K03 product:hypothetical Cell-surface glycoprotein Ly-6/CD59/CD59 antigen containing protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC099511 // GenBank // Mus musculus Ly6/Plaur domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:117783 IMAGE:30845404), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132407 // GenBank // Mus musculus Ly6/Plaur domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:164038 IMAGE:40130684), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132409 // GenBank // Mus musculus Ly6/Plaur domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:164040 IMAGE:40130686), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000188716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:74732801:74734317:-1 gene:ENSMUSG00000022595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74726808:74734287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001081961 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2300005B03 gene (2300005B03Rik), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006521359 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2300005B03 gene (2300005B03Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000057932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74742764:74746693:-1 gene:ENSMUSG00000075605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB272582 // GenBank // Mus musculus SLURP-2 mRNA for secreted Ly6/uPAR related protein-2, complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK009031 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2300005B03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr15 // 79 // 68 // 15 // 19 // 0 /// BC115610 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2300005B03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144509 IMAGE:40102714), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC115611 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2300005B03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144510 IMAGE:40102716), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74742997:74746675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT023938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 79 // 68 // 15 // 19 // 0
NM_011838 // RefSeq // Mus musculus Ly6/neurotoxin 1 (Lynx1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023259 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74747852:74753046:-1 gene:ENSMUSG00000022594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF141377 // GenBank // Mus musculus Ly-6/neurotoxin homolog (Lynx1) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK161907 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330563B21 product:Ly6/neurotoxin 1, full insert sequence. // chr15 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC037541 // GenBank // Mus musculus Ly6/neurotoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:36018 IMAGE:5325123), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:74751595:74753014:-1 gene:ENSMUSG00000022594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0
NM_010742 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus D (Ly6d), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74762056:74763620:-1 gene:ENSMUSG00000034634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025135 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus D, mRNA (cDNA clone MGC:36061 IMAGE:4914126), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74762356:74778838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NR_027836 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D730001G18 gene (D730001G18Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_027837 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D730001G18 gene (D730001G18Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC055822 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D730001G18 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4187360), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000186014 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:74770908:74778824:-1 gene:ENSMUSG00000101026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000191407 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:74770909:74778859:-1 gene:ENSMUSG00000101026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT023940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT023941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74762356:74778838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_029627 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus K (Ly6k), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000060301 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74796874:74799986:-1 gene:ENSMUSG00000044678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000168815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:74796874:74799533:-1 gene:ENSMUSG00000044678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC049723 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus K, mRNA (cDNA clone MGC:58713 IMAGE:6743692), complete cds. // chr15 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000019463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74796964:74824454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001177524 // RefSeq // Mus musculus GPI anchored molecule like protein (Gml), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006521229 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GPI anchored molecule like protein (Gml), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006521231 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GPI anchored molecule like protein (Gml), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000096400 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74813452:74817473:-1 gene:ENSMUSG00000068349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000164026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:74813454:74818815:-1 gene:ENSMUSG00000068349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC171937 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054222. // chr15 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000019463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74796964:74824454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 92 // 12 // 13 // 1
NM_001033229 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 11, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp11b1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170259 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74834125:74841643:-1 gene:ENSMUSG00000075604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC139248 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 11, subfamily b, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:170875 IMAGE:8862270), complete cds. // chr15 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// BC139250 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 11, subfamily b, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:170877 IMAGE:8862272), complete cds. // chr15 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74835753:74841606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
NM_009991 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 11, subfamily b, polypeptide 2 (Cyp11b2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000167634 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74851010:74856318:-1 gene:ENSMUSG00000022589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC116908 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 11, subfamily b, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:151285 IMAGE:40126227), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC119321 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 11, subfamily b, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:155637 IMAGE:8734070), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74851039:74856231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_025929 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2010109I03 gene (2010109I03Rik), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000077004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74878339:74881704:-1 gene:ENSMUSG00000063522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK038164 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130083I24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC116397 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010109I03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144430 IMAGE:40101946), complete cds. // chr15 // 82 // 65 // 14 // 17 // 0 /// BC116398 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010109I03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144431 IMAGE:40101947), complete cds. // chr15 // 82 // 65 // 14 // 17 // 0 /// ENSMUST00000190826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:74876987:74897021:-1 gene:ENSMUSG00000063522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74879848:74881665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT023945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_020498 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus I (Ly6i), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000023250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74979534:74983430:-1 gene:ENSMUSG00000022586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000166694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:74979812:74983430:-1 gene:ENSMUSG00000022586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// BC125350 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus I, mRNA (cDNA clone MGC:159053 IMAGE:40129865), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC132052 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus I, mRNA (cDNA clone MGC:163683 IMAGE:40130329), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF232024 // GenBank // Mus musculus Ly-6I.1 (Ly-6I) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 71 // 94 // 12 // 17 // 0 /// BC145087 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus I, mRNA (cDNA clone MGC:178643 IMAGE:9053635), complete cds. // chr15 // 57 // 78 // 8 // 14 // 0 /// XM_006521216 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus I (Ly6i), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// XM_006521214 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus I (Ly6i), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// XM_006521215 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus I (Ly6i), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// GENSCAN00000019475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74979914:75158684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
XM_001477102 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA I830127L07 gene (I830127L07Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006521615 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA I830127L07 gene (I830127L07Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AK152247 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830057H21 product:similar to Lymphocyte antigen Ly-6A.2/Ly-6E.1 precursor (T-cell-activating protein) (TAP) [Mus musculus], full insert sequence. // chr15 // 60 // 83 // 9 // 15 // 0 /// ENSMUST00000187250 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:75131377:75135128:-1 gene:ENSMUSG00000102051 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000190944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:75131675:75134824:-1 gene:ENSMUSG00000102051 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000019475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:74979914:75158684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// KnowTID_00002980 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr15 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000089689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:75235597:75238768:-1 gene:ENSMUSG00000068348 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_108041 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9030619P08 gene (9030619P08Rik), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096397 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:75427606:75431829:-1 gene:ENSMUSG00000053168 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087965 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9030619P08 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30122091), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147461 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9030619P08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182209 IMAGE:9056103), complete cds. // chr15 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// BC147464 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9030619P08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182212 IMAGE:9056106), complete cds. // chr15 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000190141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:75427966:75431436:-1 gene:ENSMUSG00000053168 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr15 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000002862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:75379410:75431436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_028404 // RefSeq // Mus musculus DNA topoisomerase 1, mitochondrial (Top1mt), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_384048 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA topoisomerase 1, mitochondrial (Top1mt), transcript variant X2, misc_RNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000000958 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:75657035:75678800:-1 gene:ENSMUSG00000000934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF362952 // GenBank // Mus musculus DNA topoisomerase I mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138582 // GenBank // Mus musculus DNA topoisomerase 1, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:170207 IMAGE:8861602), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138583 // GenBank // Mus musculus DNA topoisomerase 1, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:170208 IMAGE:8861603), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC145336 // GenBank // Mus musculus DNA topoisomerase 1, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:178900 IMAGE:9053892), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:75656310:75697133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_194350 // RefSeq // Mus musculus v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene family, protein A (avian) (Mafa), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:75746843:75747922:-1 gene:ENSMUSG00000047591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:75746843:75747922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172121 // RefSeq // Mus musculus zinc finger CCCH type containing 3 (Zc3h3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000069044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:3108535:3111950:-1 gene:ENSMUSG00000055452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSMUST00000100538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:75754432:75841915:-1 gene:ENSMUSG00000075600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC060682 // GenBank // Mus musculus zinc finger CCCH type containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:66637 IMAGE:6416246), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC111448 // GenBank // Mus musculus zinc finger CCCH type containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:40060804), complete cds. // chr15 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// ENSMUST00000181324 // ENSEMBL // proj_ensembl:novel chromosome:GRCm38:MG4151_PATCH:3108535:3111950:-1 gene:ENSMUSG00000097866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000002966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:75754786:75841895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:3102894:3111950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4151_PATCH:3102894:3111950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000182514 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:75854819:75856228:-1 gene:ENSMUSG00000098203 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000002904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:75854819:75856228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_172607 // RefSeq // Mus musculus nicotinate phosphoribosyltransferase domain containing 1 (Naprt1), mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:75890964:75894481:-1 gene:ENSMUSG00000022574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AY214331 // GenBank // Mus musculus nicotinate phosphoribosyltransferase-like protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC058800 // GenBank // Mus musculus nicotinate phosphoribosyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:67701 IMAGE:6476979), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:75884137:75894242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_025412 // RefSeq // Mus musculus pyrroline-5-carboxylate reductase-like (Pycrl), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006521252 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pyrroline-5-carboxylate reductase-like (Pycrl), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000053918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:75916463:75921560:-1 gene:ENSMUSG00000022571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC026536 // GenBank // Mus musculus pyrroline-5-carboxylate reductase-like, mRNA (cDNA clone MGC:35759 IMAGE:4987954), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK004291 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110058B13 product:pyrroline-5-carboxylate reductase-like, full insert sequence. // chr15 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:75916897:75929037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
NM_031201 // RefSeq // Mus musculus tissue specific transplantation antigen P35B (Tsta3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006520749 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tissue specific transplantation antigen P35B (Tsta3), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006520754 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tissue specific transplantation antigen P35B (Tsta3), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000023231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:75924684:75929730:-1 gene:ENSMUSG00000022570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC089003 // GenBank // Mus musculus tissue specific transplantation antigen P35B, mRNA (cDNA clone MGC:113801 IMAGE:6818427), complete cds. // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// M30127 // GenBank // Mus musculus MHC class I tum- transplantation antigen (P35B) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000002843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:75916897:75929037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_001163518 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 166 (Ccdc166), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_146059 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 166 (Ccdc166), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000182172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:75979872:75982455:-1 gene:ENSMUSG00000098176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000183130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:15:75980767:75982442:-1 gene:ENSMUSG00000098176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK019123 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410075B13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC024536 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410075B13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:37569 IMAGE:4988004), complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC047213 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410075B13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:56980 IMAGE:6395374), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:75980767:75982229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001168253 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 83, member H (Fam83h), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_134087 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 83, member H (Fam83h), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006520236 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 83, member H (Fam83h), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000060807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76001093:76014336:-1 gene:ENSMUSG00000046761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000170153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76001093:76009498:-1 gene:ENSMUSG00000046761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC117947 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 83, member H, mRNA (cDNA clone MGC:144129 IMAGE:40098049), complete cds. // chr15 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC117948 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 83, member H, mRNA (cDNA clone MGC:144130 IMAGE:40098059), complete cds. // chr15 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76001857:76013438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_134089 // RefSeq // Mus musculus scribbled homolog (Drosophila) (Scrib), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000002603 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:76047158:76069754:-1 gene:ENSMUSG00000022568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000063747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:76047158:76069754:-1 gene:ENSMUSG00000022568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000109946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:76047158:76069784:-1 gene:ENSMUSG00000022568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000136390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:76047158:76062719:-1 gene:ENSMUSG00000022568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// AF441233 // GenBank // Mus musculus PDZ-domain protein scribble mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// BC060689 // GenBank // Mus musculus scribbled homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:66791 IMAGE:6417366), complete cds. // chr15 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// BC062888 // GenBank // Mus musculus scribbled homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:86000 IMAGE:5721250), complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000002956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76047392:76091493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0
NM_001164600 // RefSeq // Mus musculus poly-U binding splicing factor 60 (Puf60), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_028364 // RefSeq // Mus musculus poly-U binding splicing factor 60 (Puf60), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_133691 // RefSeq // Mus musculus poly-U binding splicing factor 60 (Puf60), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000002599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76070184:76080946:-1 gene:ENSMUSG00000002524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000100527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76070184:76080946:-1 gene:ENSMUSG00000002524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC010601 // GenBank // Mus musculus poly-U binding splicing factor 60, mRNA (cDNA clone MGC:7165 IMAGE:3257153), complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC119437 // GenBank // Mus musculus poly-U binding splicing factor 60, mRNA (cDNA clone IMAGE:40041626), partial cds. // chr15 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000002956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76047392:76091493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NM_144847 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor binding protein 2 (Nrbp2), mRNA. // chr15 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000019516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76085595:76090013:-1 gene:ENSMUSG00000075590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// AK158425 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930115P21 product:hypothetical Protein kinase/Protein kinase domain profile/Protein kinase-like containing protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 37 // 16 // 16 // 0 /// BC011468 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:18994 IMAGE:4012880), complete cds. // chr15 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// BC012437 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:12117 IMAGE:3710089), complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// BC068117 // GenBank HTC // Mus musculus nuclear receptor binding protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6419290). // chr15 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000002956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76047392:76091493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 84 // 84 // 36 // 43 // 1
NM_144848 // RefSeq // Mus musculus epiplakin 1 (Eppk1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AY312170 // GenBank // Mus musculus epiplakin (Eppk1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000002900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76102303:76129444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001163575 // RefSeq // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 10 (Parp10), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001163576 // RefSeq // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 10 (Parp10), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000075689 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:76233003:76243441:-1 gene:ENSMUSG00000063268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000165738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:76233003:76243420:-1 gene:ENSMUSG00000063268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000166151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:76233003:76243434:-1 gene:ENSMUSG00000063268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK035309 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530013L07 product:hypothetical ADP-ribosylation structure containing protein, full insert sequence. // chr15 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC024074 // GenBank // Mus musculus plectin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5097449), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000002973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76229156:76243334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
NR_045747 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10872 (Gm10872), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_153122 // RefSeq // Mus musculus 5-oxoprolinase (ATP-hydrolysing) (Oplah), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76296603:76307245:-1 gene:ENSMUSG00000022562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:76300954:76307389:-1 gene:ENSMUSG00000022562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000171340 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:76296597:76307101:-1 gene:ENSMUSG00000022562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025120 // GenBank // Mus musculus 5-oxoprolinase (ATP-hydrolysing), mRNA (cDNA clone MGC:36824 IMAGE:4020691), complete cds. // chr15 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// BC034522 // GenBank // Mus musculus 5-oxoprolinase (ATP-hydrolysing), mRNA (cDNA clone MGC:28663 IMAGE:4236444), complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76296635:76298608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000055972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76300826:76309755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_183099 // RefSeq // Mus musculus testis-specific serine kinase 5 (Tssk5), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000071119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76371958:76374938:-1 gene:ENSMUSG00000060794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76372099:76374684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
NM_013481 // RefSeq // Mus musculus block of proliferation 1 (Bop1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000023217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76452996:76477269:-1 gene:ENSMUSG00000022557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC012693 // GenBank // Mus musculus block of proliferation 1, mRNA (cDNA clone MGC:13949 IMAGE:4193123), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// U77415 // GenBank // Mus musculus Bop1 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000055983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76453225:76456065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
NM_130893 // RefSeq // Mus musculus scratch homolog 1, zinc finger protein (Drosophila) (Scrt1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000096365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76516203:76522129:-1 gene:ENSMUSG00000048385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000164703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76516213:76521902:-1 gene:ENSMUSG00000048385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 79 // 79 // 27 // 34 // 1 /// BC057562 // GenBank // Mus musculus scratch homolog 1, zinc finger protein (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:66816 IMAGE:6401572), complete cds. // chr15 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// AY014997 // GenBank // Mus musculus transcriptional repressor scratch mRNA, complete cds. // chr15 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// GENSCAN00000055980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76518742:76523285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 35 // 11 // 12 // 0
NM_013909 // RefSeq // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 6 (Fbxl6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000023219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76535730:76538746:-1 gene:ENSMUSG00000022559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB041571 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-1275, similar to Mus musculus F-box protein containing leucine repeats 6 (Fbl6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF176522 // GenBank // Mus musculus leucine-rich repeat-containing F-box protein FBL6 mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC011485 // GenBank HTC // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:4189835), with apparent retained intron. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC054377 // GenBank // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:62608 IMAGE:6315438), complete cds. // chr15 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76535804:76538716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
AK144273 // GenBank HTC // Mus musculus adult male vesicular gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630004O07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001164173 // RefSeq // Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 1 (Cpsf1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_053193 // RefSeq // Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 1 (Cpsf1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000071898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76595809:76607591:-1 gene:ENSMUSG00000034022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF322193 // GenBank // Mus musculus cleavage and polyadenylation specificity factor 1 (Cpsf1) mRNA, complete cds. // chr15 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// BC056388 // GenBank // Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:73492 IMAGE:6854851), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC057945 // GenBank // Mus musculus cleavage and polyadenylation specific factor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5345905), partial cds. // chr15 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000055973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76595922:76616761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
NM_028064 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 4 (Slc39a4), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000073428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76612385:76616852:-1 gene:ENSMUSG00000063354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// AB052762 // GenBank // Mus musculus mAWMS2 mRNA, partial cds. // chr15 // 87 // 41 // 13 // 15 // 0 /// BC023498 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:32258 IMAGE:5011088), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000055973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76595922:76616761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0
NM_025842 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 28 (yeast) (Vps28), mRNA. // chr15 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000078803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76622088:76626027:-1 gene:ENSMUSG00000059323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000062381 // chr15 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// AF373710 // GenBank // Mus musculus CIIA (Ciia) mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// BC013535 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 28 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:19216 IMAGE:4239189), complete cds. // chr15 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76622233:76656716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0
NM_183091 // RefSeq // Mus musculus tonsoku-like, DNA repair protein (Tonsl), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:76632806:76639929:-1 gene:ENSMUSG00000059323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000168185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:76626238:76639958:-1 gene:ENSMUSG00000059323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139173 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730058O12 product:IkappaB related protein (Fragment) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr15 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// BC066068 // GenBank // Mus musculus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:86073 IMAGE:6851399), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76622233:76656716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_007989 // RefSeq // Mus musculus forkhead box H1 (Foxh1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000037824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76668284:76669948:-1 gene:ENSMUSG00000033837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF069303 // GenBank // Mus musculus forkhead-activin signal transducer 2 (Fast2) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF079514 // GenBank // Mus musculus forkhead activin signal transducer 2 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF110506 // GenBank // Mus musculus forkhead activin signal transducer 2 (Fast2) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119156 // GenBank // Mus musculus forkhead box H1, mRNA (cDNA clone MGC:155472 IMAGE:8733905), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC137781 // GenBank // Mus musculus forkhead box H1, mRNA (cDNA clone MGC:169405 IMAGE:8860800), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76668307:76669871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0
NM_058214 // RefSeq // Mus musculus RecQ protein-like 4 (Recql4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000036852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76703553:76710559:-1 gene:ENSMUSG00000033762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AB175741 // GenBank // Mus musculus Recql4 mRNA for RecQ helicase protein-like 4, complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// BC131657 // GenBank HTC // Mus musculus RecQ protein-like 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:40110616), with apparent retained intron. // chr15 // 98 // 92 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000055976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76703741:76710476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 98 // 85 // 40 // 41 // 0
NM_198119 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 24 (Lrrc24), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000049956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:76715276:76722173:-1 gene:ENSMUSG00000033707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC116884 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 24, mRNA (cDNA clone MGC:151261 IMAGE:40126203), complete cds. // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC116886 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 24, mRNA (cDNA clone MGC:151263 IMAGE:40126205), complete cds. // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000055977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76715372:76718834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_145472 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C030006K11 gene (C030006K11Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NM_176828 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C030006K11 gene (C030006K11Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76721466:76723845:-1 gene:ENSMUSG00000033707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000079002 // chr15 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC019462 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C030006K11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28718 IMAGE:4458439), complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC026997 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C030006K11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:38904 IMAGE:5362226), complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76722538:76761557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_001007568 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 251 (Zfp251), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000080406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76852148:76871435:-1 gene:ENSMUSG00000022526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK047148 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930026N24 product:hypothetical Zn-finger, C2H2 type/KRAB box containing protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC059071 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 251, mRNA (cDNA clone MGC:69913 IMAGE:6826152), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76845072:76887380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001168276 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 647 (Zfp647), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_172817 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 647 (Zfp647), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006520931 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 647 (Zfp647), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000048854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:76910851:76918010:-1 gene:ENSMUSG00000054967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AY187287 // GenBank // Mus musculus KRAB zinc-finger protein (Es492) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC055686 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 647, mRNA (cDNA clone MGC:66538 IMAGE:6414212), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:76910591:76922541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001164047 // RefSeq // Mus musculus myoglobin (Mb), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001164048 // RefSeq // Mus musculus myoglobin (Mb), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_013593 // RefSeq // Mus musculus myoglobin (Mb), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:77015489:77022727:-1 gene:ENSMUSG00000018893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000166179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:77015489:77050670:-1 gene:ENSMUSG00000018893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:77015489:77022787:-1 gene:ENSMUSG00000018893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC025172 // GenBank // Mus musculus myoglobin, mRNA (cDNA clone MGC:36715 IMAGE:3979003), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:77015926:77022583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001164640 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein L 7a (Apol7a), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NM_029419 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein L 7a (Apol7a), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006521517 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus apolipoprotein L 7a (Apol7a), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000010745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:77388957:77396458:-1 gene:ENSMUSG00000010601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000175919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:77388222:77399086:-1 gene:ENSMUSG00000010601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000176074 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:77388221:77399110:-1 gene:ENSMUSG00000010601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139137 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein L 7a, mRNA (cDNA clone MGC:170764 IMAGE:8862159), complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC139138 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein L 7a, mRNA (cDNA clone MGC:170765 IMAGE:8862160), complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000177135 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:77393333:77396934:-1 gene:ENSMUSG00000010601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:77389004:77396242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT024095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001024848 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein L 7b (Apol7b), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001134802 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein L 7e (Apol7e), mRNA. // chr15 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// ENSMUST00000089469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:77422210:77447444:-1 gene:ENSMUSG00000068252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000096358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:77698889:77719288:1 gene:ENSMUSG00000071716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// BC085284 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein L 7b, mRNA (cDNA clone MGC:102649 IMAGE:30750330), complete cds. // chr15 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSMUST00000149824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:77425298:77447492:-1 gene:ENSMUSG00000068252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// GENSCAN00000024904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:77701124:77718313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000024907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:77423184:77444120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONMMUT024097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1
NM_175391 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein L 7c (Apol7c), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000062562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:77524867:77533315:-1 gene:ENSMUSG00000044309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC139148 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein L 7c, mRNA (cDNA clone MGC:170775 IMAGE:8862170), complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC139149 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein L 7c, mRNA (cDNA clone MGC:170776 IMAGE:8862171), complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000024909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:77525635:77602121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
NM_177820 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein L 10B (Apol10b), mRNA. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006543254 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus apolipoprotein L3-like (LOC102641258), mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000089465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:77584158:77596125:-1 gene:ENSMUSG00000050014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK144113 // GenBank HTC // Mus musculus brain CRL-1443 BC3H1 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430023F20 product:Weakly similar to apolipoprotein L3, full insert sequence. // chr15 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// BC147348 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein L 10b, mRNA (cDNA clone MGC:182494 IMAGE:9056388), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC147349 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein L 10b, mRNA (cDNA clone MGC:182514 IMAGE:9056408), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006521088 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus apolipoprotein L 10B (Apol10b), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:77525635:77602121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001081970 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein L 8 (Apol8), mRNA. // chr15 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006520932 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus apolipoprotein L 8 (Apol8), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006520935 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus apolipoprotein L 8 (Apol8), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006520936 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus apolipoprotein L 8 (Apol8), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006520941 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus apolipoprotein L 8 (Apol8), transcript variant X10, mRNA. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000070911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:77748613:77755229:-1 gene:ENSMUSG00000056656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000089450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:77747799:77753072:-1 gene:ENSMUSG00000056656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC129972 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein L 8, mRNA (cDNA clone MGC:156854 IMAGE:40090463), complete cds. // chr15 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006520933 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus apolipoprotein L 8 (Apol8), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// XM_006520937 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus apolipoprotein L 8 (Apol8), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:77749355:77753274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_022410 // RefSeq // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 9, non-muscle (Myh9), mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000016771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:77760587:77842175:-1 gene:ENSMUSG00000022443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000123101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:77790741:77842047:-1 gene:ENSMUSG00000022443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// BC054360 // GenBank // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 9, non-muscle, mRNA (cDNA clone IMAGE:4984186), partial cds. // chr15 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000126796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:77788191:77842056:-1 gene:ENSMUSG00000022443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1 /// AK165379 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430206J09 product:myosin heavy chain IX, full insert sequence. // chr15 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1 /// ENSMUST00000129453 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:77790225:77842105:-1 gene:ENSMUSG00000022443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1 /// AK083071 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530042P11 product:hypothetical P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases structure containing protein, full insert sequence. // chr15 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1 /// GENSCAN00000024894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:77761899:77911512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0
ENSMUST00000122548 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:77840657:77840756:-1 gene:ENSMUSG00000084497 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK052845 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730049K18 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056623 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5002799, partial cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018749 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit D (Eif3d), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000100484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:77958998:77970824:-1 gene:ENSMUSG00000016554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB012580 // GenBank // Mus musculus mRNA for eIF3 p66, complete cds. // chr15 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC089020 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit D, mRNA (cDNA clone MGC:115774 IMAGE:30551991), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK158344 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930105G01 product:eukaryotic translation initiation factor 3, subunit 7 (zeta), full insert sequence. // chr15 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000024914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:77959109:77979736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000019290 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:77991748:78120028:-1 gene:ENSMUSG00000019146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK164203 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630048K04 product:calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 2, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC057579 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6413224, partial cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000019290 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:77991748:78120028:-1 gene:ENSMUSG00000019146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF077739 // GenBank // Mus musculus gamma-2 subunit of voltage-gated Ca2+ channel (Cacng2) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AK045362 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230106G23 product:calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 2, full insert sequence. // chr15 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// BC103563 // GenBank // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:123979 IMAGE:40045028), complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC103564 // GenBank // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:123980 IMAGE:40045029), complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC103664 // GenBank // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:123981 IMAGE:40045030), complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NM_007583 // RefSeq // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 2 (Cacng2), mRNA. // chr15 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// GENSCAN00000024895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78115623:78169028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000024899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:77984488:78032760:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_025931 // RefSeq // Mus musculus intraflagellar transport 27 (Ift27), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000016781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78159465:78174108:-1 gene:ENSMUSG00000016637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC017514 // GenBank // Mus musculus RAB, member of RAS oncogene family-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:27600 IMAGE:4502942), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK044278 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930005F09 product:hypothetical Small GTPase, Ras subfamily containing protein, full insert sequence. // chr15 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000024895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78115623:78169028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_013645 // RefSeq // Mus musculus parvalbumin (Pvalb), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000005860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:78191114:78204237:-1 gene:ENSMUSG00000005716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120592 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:78191117:78206400:-1 gene:ENSMUSG00000005716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK131986 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610303M12 product:parvalbumin, full insert sequence. // chr15 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC027424 // GenBank // Mus musculus parvalbumin, mRNA (cDNA clone MGC:35957 IMAGE:4925213), complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// X59382 // GenBank // M.musculus mRNA for parvalbumin (small transcript). // chr15 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// XM_006520643 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus parvalbumin (Pvalb), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78189629:78204145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001287389 // RefSeq // Mus musculus colony stimulating factor 2 receptor, beta 2, low-affinity (granulocyte-macrophage) (Csf2rb2), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NM_007781 // RefSeq // Mus musculus colony stimulating factor 2 receptor, beta 2, low-affinity (granulocyte-macrophage) (Csf2rb2), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000096356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78282517:78305603:-1 gene:ENSMUSG00000071714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// M29855 // GenBank // Mouse interleukin-3 receptor mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000034712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78284448:78298229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_001163612 // RefSeq // Mus musculus testis expressed 33 (Tex33), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001163613 // RefSeq // Mus musculus testis expressed 33 (Tex33), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NM_028522 // RefSeq // Mus musculus testis expressed 33 (Tex33), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000074380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78378400:78395912:-1 gene:ENSMUSG00000062154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000165170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78378400:78395912:-1 gene:ENSMUSG00000062154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000169575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78378400:78388769:-1 gene:ENSMUSG00000062154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC100472 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700061J05 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30917876). // chr15 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC107197 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700061J05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130089 IMAGE:40051085), complete cds. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC107198 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700061J05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130090 IMAGE:40051089), complete cds. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78378469:78390164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_009437 // RefSeq // Mus musculus thiosulfate sulfurtransferase, mitochondrial (Tst), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000058659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78399556:78405859:-1 gene:ENSMUSG00000044986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC005644 // GenBank // Mus musculus thiosulfate sulfurtransferase, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:5996 IMAGE:3257034), complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// CT010210 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836H0250D for gene Tst, Thiosulfate sulfurtransferase, mitochondrial; complete cds, incl. stopcodon. // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// U35741 // GenBank // Mus musculus rhodanese (Tst) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78399732:78405833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK036393 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830004K05 product:thiosulfate sulfurtransferase, mitochondrial, full insert sequence. // chr15 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_027902 // RefSeq // Mus musculus transmembrane serine protease 6 (Tmprss6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000017086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78439668:78468634:-1 gene:ENSMUSG00000016942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AY240929 // GenBank // Mus musculus matriptase-2 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC029645 // GenBank // Mus musculus transmembrane serine protease 6, mRNA (cDNA clone MGC:25857 IMAGE:4195486), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC057674 // GenBank // Mus musculus transmembrane serine protease 6, mRNA (cDNA clone MGC:68318 IMAGE:4162007), complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// EU190436 // GenBank // Mus musculus transmembrane serine protease 6 variant 1 (Tmprss6) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// EU190437 // GenBank // Mus musculus transmembrane serine protease 6 variant 2 (Tmprss6) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78440214:78467653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0
NM_008368 // RefSeq // Mus musculus interleukin 2 receptor, beta chain (Il2rb), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000089398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78480553:78495066:-1 gene:ENSMUSG00000068227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000163494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78481325:78493756:-1 gene:ENSMUSG00000068227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// BC026869 // GenBank // Mus musculus interleukin 2 receptor, beta chain, mRNA (cDNA clone MGC:18554 IMAGE:4015306), complete cds. // chr15 // 94 // 92 // 32 // 34 // 0 /// BC099616 // GenBank // Mus musculus interleukin 2 receptor, beta chain, mRNA (cDNA clone MGC:118674 IMAGE:30024496), complete cds. // chr15 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// M28052 // GenBank // Mouse interleukin 2 receptor beta-chain mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 84 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78481476:78498836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0
NM_009218 // RefSeq // Mus musculus somatostatin receptor 3 (Sstr3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006520670 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus somatostatin receptor 3 (Sstr3), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000053239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78537015:78544345:-1 gene:ENSMUSG00000044933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78539259:78540545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000180449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:78554408:78554848:-1 gene:ENSMUSG00000068226 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000034749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78554402:78554848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT024136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_009008 // RefSeq // Mus musculus RAS-related C3 botulinum substrate 2 (Rac2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000043214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78559169:78572783:-1 gene:ENSMUSG00000033220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC005455 // GenBank // Mus musculus RAS-related C3 botulinum substrate 2, mRNA (cDNA clone MGC:6255 IMAGE:3495818), complete cds. // chr15 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78561908:78593424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_183141 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III, extracellular 2 (Elfn2), mRNA. // chr15 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78670022:78718113:-1 gene:ENSMUSG00000043460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC076582 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC094219, mRNA (cDNA clone IMAGE:30616577). // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC079588 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III, extracellular 2, mRNA (cDNA clone MGC:90846 IMAGE:5706857), complete cds. // chr15 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC094219 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III, extracellular 2, mRNA (cDNA clone MGC:106480 IMAGE:6840886), complete cds. // chr15 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006521626 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/arginine repetitive matrix protein 3-like (LOC102631748), mRNA. // chr15 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_008595 // RefSeq // Mus musculus MFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase (Mfng), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006520551 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase (Mfng), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006520552 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase (Mfng), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000018313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:78755882:78773475:-1 gene:ENSMUSG00000018169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF015769 // GenBank // Mus musculus manic fringe (manic-fringe) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC010983 // GenBank // Mus musculus MFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:13899 IMAGE:3980692), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// U94349 // GenBank // Mus musculus manic fringe precursor mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000123518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:78760492:78767190:-1 gene:ENSMUSG00000018169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000034718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78756537:78802615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
NM_130859 // RefSeq // Mus musculus caspase recruitment domain family, member 10 (Card10), mRNA. // chr15 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000164826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:78775138:78803042:-1 gene:ENSMUSG00000033170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000170584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:78776493:78802669:-1 gene:ENSMUSG00000033170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// AF363456 // GenBank // Mus musculus BIMP1 (Bimp1) mRNA, complete cds. // chr15 // 91 // 96 // 41 // 45 // 0 /// BC060203 // GenBank // Mus musculus caspase recruitment domain family, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:73485 IMAGE:6855024), complete cds. // chr15 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000071115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:78787411:78790515:-1 gene:ENSMUSG00000033170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// GENSCAN00000034718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78756537:78802615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// NONMMUT024157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1
NM_025622 // RefSeq // Mus musculus lectin, galactose-binding, soluble 2 (Lgals2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:78850862:78855529:-1 gene:ENSMUSG00000043501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC027504 // GenBank // Mus musculus lectin, galactose-binding, soluble 2, mRNA (cDNA clone MGC:41038 IMAGE:1434603), complete cds. // chr15 // 64 // 96 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:78851007:78855477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
AK142477 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D530027E22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000150472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:78911966:78913660:-1 gene:ENSMUSG00000084864 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK131739 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700049K12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONMMUT024164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
NR_045746 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10865 (Gm10865), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011437 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 10 (Sox10), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000040019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:79154913:79164490:-1 gene:ENSMUSG00000033006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF017182 // GenBank // Mus musculus putative transcription factor (Sox10) mRNA, partial cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF047043 // GenBank // Mus musculus Sox-10 protein (Sox10) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AF047389 // GenBank // Mus musculus Dominant megacolon mutant Sox-10 protein (Sox10) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC018551 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 10, mRNA (cDNA clone MGC:18351 IMAGE:3675437), complete cds. // chr15 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC023356 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 10, mRNA (cDNA clone MGC:32314 IMAGE:5027211), complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC025171 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 10, mRNA (cDNA clone MGC:36299 IMAGE:4912940), complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:79155938:79164586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NM_020516 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 8 (Slc16a8), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039752 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:79251014:79254761:-1 gene:ENSMUSG00000032988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF019111 // GenBank // Mus musculus monocarboxylate transporter 3 (MCT3) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC018216 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 8, mRNA (cDNA clone MGC:25469 IMAGE:4481698), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:79251128:79255928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK037238 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A030012J09 product:solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 8, full insert sequence. // chr15 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_008427 // RefSeq // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4 (Kcnj4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006520487 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4 (Kcnj4), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_383985 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4 (Kcnj4), transcript variant X4, misc_RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:79483718:79505241:-1 gene:ENSMUSG00000044216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120593 // GenBank // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:155830 IMAGE:40129516), complete cds. // chr15 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC137594 // GenBank // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:169218 IMAGE:8860613), complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// U11075 // GenBank // Mus musculus inwardly-rectifying K+ channel protein (mb-IRK3) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:79484440:79510418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_028792 // RefSeq // Mus musculus Josephin domain containing 1 (Josd1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000023061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:79674250:79687872:-1 gene:ENSMUSG00000022426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC006928 // GenBank // Mus musculus Josephin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:6306 IMAGE:2655826), complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// BC086769 // GenBank // Mus musculus Josephin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:101975 IMAGE:5707990), complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_017470 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, light chain 4 (Dnal4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006521171 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, light chain 4 (Dnal4), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000023055 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:79761456:79774467:-1 gene:ENSMUSG00000022420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB010031 // GenBank // Mus musculus mRNA for outer arm dynein light chain 4, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC005426 // GenBank // Mus musculus dynein, axonemal, light chain 4, mRNA (cDNA clone MGC:5822 IMAGE:3593932), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000069877 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:79761453:79774383:-1 gene:ENSMUSG00000022420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// AK029618 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930414M24 product:dynein, axon, light chain 4, full insert sequence. // chr15 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000008859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:79747329:79764884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NR_030675 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D730005E14 gene (D730005E14Rik), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030675 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D730005E14 gene (D730005E14Rik), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT024230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011057 // RefSeq // Mus musculus platelet derived growth factor, B polypeptide (Pdgfb), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000000500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:79995900:80014808:-1 gene:ENSMUSG00000000489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF162784 // GenBank // Mus musculus platelet-derived growth factor beta chain (Pdgfb) mRNA, complete cds. // chr15 // 79 // 80 // 19 // 24 // 0 /// BC023427 // GenBank // Mus musculus platelet derived growth factor, B polypeptide, mRNA (cDNA clone IMAGE:5010396), partial cds. // chr15 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC053430 // GenBank // Mus musculus platelet derived growth factor, B polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:59331 IMAGE:6330609), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC064056 // GenBank // Mus musculus platelet derived growth factor, B polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:73598 IMAGE:1380782), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK087840 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330027M19 product:platelet derived growth factor, B polypeptide, full insert sequence. // chr15 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// GENSCAN00000008861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:79918319:80025601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
ENSMUST00000082950 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:80088447:80088553:-1 gene:ENSMUSG00000064884 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONMMUT024255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
NM_175109 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein S19 binding protein 1 (Rps19bp1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:80260614:80264306:-1 gene:ENSMUSG00000051518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB233218 // GenBank // Mus musculus s19bp mRNA for ribosomal protein S19 binding protein, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC038691 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein S19 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:48168 IMAGE:1495043), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC050115 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein S19 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:60996 IMAGE:30017673), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:80260984:80261394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001163189 // RefSeq // Mus musculus ENTH domain containing 1 (Enthd1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000096347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:80452240:80560470:-1 gene:ENSMUSG00000050439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158112 // GenBank // Mus musculus ENTH domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:189999 IMAGE:9088186), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:80500485:80560352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_011399 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, peroxisomal membrane protein), member 17 (Slc25a17), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:81318921:81360765:-1 gene:ENSMUSG00000022404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AJ006341 // GenBank // Mus musculus mRNA for peroxisomal integral membrane protein PMP34. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC008571 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, peroxisomal membrane protein), member 17, mRNA (cDNA clone MGC:6724 IMAGE:3587806), complete cds. // chr15 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC011292 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, peroxisomal membrane protein), member 17, mRNA (cDNA clone MGC:18353 IMAGE:3962111), complete cds. // chr15 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:81319629:81360730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
XM_006521391 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus suppression of tumorigenicity 13 (St13), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:81363669:81400043:-1 gene:ENSMUSG00000022403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133726 // RefSeq // Mus musculus suppression of tumorigenicity 13 (St13), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006521391 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus suppression of tumorigenicity 13 (St13), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000023039 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:81365450:81399594:-1 gene:ENSMUSG00000022403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000172107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:81363669:81400043:-1 gene:ENSMUSG00000022403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003843 // GenBank // Mus musculus suppression of tumorigenicity 13, mRNA (cDNA clone MGC:6361 IMAGE:3495262), complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// CT010318 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D0252D for gene St13, Suppression of tumorigenicity 13; complete cds, incl. stopcodon. // chr15 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:81365450:81399594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_021317 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 7 (Dnajb7), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:81406926:81408299:-1 gene:ENSMUSG00000047108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB028855 // GenBank // Mus musculus mRNA for mDj5, complete cds. // chr15 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:81407196:81408134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
NM_001164320 // RefSeq // Mus musculus chondroadherin-like (Chadl), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006520741 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chondroadherin-like (Chadl), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_383996 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chondroadherin-like (Chadl), transcript variant X3, misc_RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:81686165:81697287:-1 gene:ENSMUSG00000063765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY100452 // GenBank // Mus musculus lmb145-cap1-243 protein precursor, mRNA, partial cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:81692120:81726182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000092020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:81843343:81843699:-1 gene:ENSMUSG00000069439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000032221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:81843343:81847841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000039199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:81857674:81858796:-1 gene:ENSMUSG00000078960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// AK013833 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900090N22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// AK122537 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1663 protein. // chr15 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// BC011163 // GenBank // Mus musculus transducer of ERBB2, 2, mRNA (cDNA clone MGC:18667 IMAGE:4194136), complete cds. // chr15 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// NM_020507 // RefSeq // Mus musculus transducer of ERBB2, 2 (Tob2), mRNA. // chr15 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// ENSMUST00000050467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:81848270:81858326:-1 gene:ENSMUSG00000048546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// AK037631 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130030M01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// BC094031 // GenBank // Mus musculus transducer of ERBB2, 2, mRNA (cDNA clone MGC:102437 IMAGE:4945656), complete cds. // chr15 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// NONMMUT024340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
NM_026737 // RefSeq // Mus musculus PHD finger protein 5A (Phf5a), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000023117 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:81865319:81871911:-1 gene:ENSMUSG00000061360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000160415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:81865686:81871665:-1 gene:ENSMUSG00000061360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// AF479288 // GenBank // Mus musculus PHF5A (Phf5a) mRNA, complete cds. // chr15 // 83 // 82 // 15 // 18 // 0 /// BC025161 // GenBank // Mus musculus PHD finger protein 5A, mRNA (cDNA clone MGC:36856 IMAGE:4235469), complete cds. // chr15 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_030229 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide H (Polr3h), mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006521545 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide H (Polr3h), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// XR_384055 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide H (Polr3h), transcript variant X2, misc_RNA. // chr15 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000023113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:81915030:81926213:-1 gene:ENSMUSG00000022476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC010793 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide H, mRNA (cDNA clone MGC:18855 IMAGE:4221321), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK032967 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720482J09 product:RIKEN cDNA 5031409G22 gene, full insert sequence. // chr15 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// GENSCAN00000032224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:81917191:81925896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_028075 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13c (Tnfrsf13c), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82221744:82224336:-1 gene:ENSMUSG00000068105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82221745:82224339:-1 gene:ENSMUSG00000068105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF350257 // GenBank // Mus musculus TRAF3 binding protein mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF373847 // GenBank // Mus musculus BAFF receptor mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK156387 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830019J17 product:tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13c, full insert sequence. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC104126 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13c, mRNA (cDNA clone MGC:123890 IMAGE:40044558), complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC104127 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13c, mRNA (cDNA clone MGC:123891 IMAGE:40044559), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// DQ294928 // GenBank // Mus musculus strain A.SW BAFF receptor (Tnfrsf13c) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// DQ294929 // GenBank // Mus musculus strain SJL/J BAFF receptor (Tnfrsf13c) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82223098:82224312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001080158 // RefSeq // Mus musculus centromere protein M (Cenpm), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_025639 // RefSeq // Mus musculus centromere protein M (Cenpm), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_178269 // RefSeq // Mus musculus centromere protein M (Cenpm), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006521260 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centromere protein M (Cenpm), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000089155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82233779:82244747:-1 gene:ENSMUSG00000068101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000089157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82233779:82244747:-1 gene:ENSMUSG00000068101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY243536 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 proliferation associated nuclear element 1 (Pane1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AY243537 // GenBank // Mus musculus proliferation associated nuclear element 1 (Pane1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC009160 // GenBank // Mus musculus centromere protein M, mRNA (cDNA clone MGC:6905 IMAGE:2655787), complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82244133:82244679:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000032194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82234369:82241419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0
NM_008669 // RefSeq // Mus musculus N-acetyl galactosaminidase, alpha (Naga), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000023088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82329532:82338826:-1 gene:ENSMUSG00000022453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF079458 // GenBank // Mus musculus alpha-N-acetylgalactosaminidase mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// AK133576 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330407E20 product:N-acetyl galactosaminidase, alpha, full insert sequence. // chr15 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC021631 // GenBank // Mus musculus N-acetyl galactosaminidase, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:13811 IMAGE:4019197), complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000020677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82330061:82338253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_025987 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 6 (B14) (Ndufa6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006521293 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 6 (B14) (Ndufa6), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000023085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82350139:82354291:-1 gene:ENSMUSG00000022450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC048451 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 6 (B14), mRNA (cDNA clone MGC:58171 IMAGE:6773780), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82350240:82356983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0
NM_001163472 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 22 (Cyp2d22), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_019823 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 22 (Cyp2d22), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82370528:82380260:-1 gene:ENSMUSG00000061740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF221525 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 CYP2D22 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC016256 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 22, mRNA (cDNA clone MGC:28893 IMAGE:4912394), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82371547:82407122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001104531 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 11 (Cyp2d11), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000170255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82389154:82394022:-1 gene:ENSMUSG00000068085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000020671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82371547:82407122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_010005 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 10 (Cyp2d10), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000072776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82402846:82407194:-1 gene:ENSMUSG00000094806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC010989 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 10, mRNA (cDNA clone MGC:14081 IMAGE:4193743), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC057924 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 10, mRNA (cDNA clone MGC:65277 IMAGE:5100459), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// M27167 // GenBank // Mouse cytochrome P-450cb mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000020671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82371547:82407122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 67 // 5 // 6 // 0
NM_145474 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 34 (Cyp2d34), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006520813 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 34 (Cyp2d34), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000109515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82615965:82620907:-1 gene:ENSMUSG00000094559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC018285 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 34, mRNA (cDNA clone MGC:18824 IMAGE:4207630), complete cds. // chr15 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC049994 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC018285, mRNA (cDNA clone IMAGE:6397833). // chr15 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000020660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82608978:82620857:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NR_003552 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 13 (Cyp2d13), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK004933 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1300007K12 product:similar to CYTOCHROME P450 2D3 (EC 1.14.14.1) (CYPIID3) (P450-DB3) (DEBRISOQUINE 4-HYDROXYLASE) [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr15 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82636820:82641973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NR_033515 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 37, pseudogene (Cyp2d37-ps), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000100380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82689134:82690499:-1 gene:ENSMUSG00000075517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC116321 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:40096197), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT024382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82651990:82693001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_023623 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40 (Cyp2d40), mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000055721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82759835:82764183:-1 gene:ENSMUSG00000068083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC061152 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mRNA (cDNA clone MGC:74285 IMAGE:30308952), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// BC087906 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mRNA (cDNA clone MGC:107236 IMAGE:30306972), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000020656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82745386:82764110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0
ENSMUST00000180453 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:82777931:82782110:-1 gene:ENSMUSG00000058613 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000020673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82777931:82782110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_029562 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 26 (Cyp2d26), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006521524 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 26 (Cyp2d26), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000006094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82790107:82794245:-1 gene:ENSMUSG00000022445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC023241 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 26, mRNA (cDNA clone MGC:28632 IMAGE:4222538), complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82790177:82792870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001114140 // RefSeq // Mus musculus transcription factor 20 (Tcf20), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_013836 // RefSeq // Mus musculus transcription factor 20 (Tcf20), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006520732 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor 20 (Tcf20), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82808629:82912134:-1 gene:ENSMUSG00000041852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:82808629:82912134:-1 gene:ENSMUSG00000041852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY007594 // GenBank // Mus musculus stromelysin-1 PDGF-responsive element binding protein (Spbp) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC138038 // GenBank // Mus musculus transcription factor 20, mRNA (cDNA clone MGC:169662 IMAGE:8861057), complete cds. // chr15 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// U20282 // GenBank // Mus musculus stromelysin PDGF responsive element binding protein transcription factor mRNA, complete cds. // chr15 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000020665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:82812235:82864394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NR_027799 // RefSeq // Mus musculus transforming growth factor beta regulated gene 3 (Tbrg3), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC095996 // GenBank // Mus musculus transforming growth factor beta regulated gene 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:30112263). // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT024389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT024390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONMMUT024391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000018184 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:83113433:83122801:-1 gene:ENSMUSG00000018040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001004150 // RefSeq // Mus musculus alpha 1,4-galactosyltransferase (A4galt), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001170954 // RefSeq // Mus musculus alpha 1,4-galactosyltransferase (A4galt), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:83226726:83251774:-1 gene:ENSMUSG00000047878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:83226726:83251731:-1 gene:ENSMUSG00000047878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY371179 // GenBank // Mus musculus Gb3 synthase (A4galt) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138844 // GenBank // Mus musculus alpha 1,4-galactosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:170471 IMAGE:8861866), complete cds. // chr15 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC138845 // GenBank // Mus musculus alpha 1,4-galactosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:170472 IMAGE:8861867), complete cds. // chr15 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// DQ143885 // GenBank // Mus musculus alpha-1,4-galactosyltransferase mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000020663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:83227501:83228547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_025445 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor GTPase activating protein 3 (Arfgap3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000067215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:83299740:83350247:-1 gene:ENSMUSG00000054277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC004081 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor GTPase activating protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:8273 IMAGE:3592719), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC060369 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor GTPase activating protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:67835 IMAGE:6310619), complete cds. // chr15 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006521257 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ADP-ribosylation factor GTPase activating protein 3 (Arfgap3), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// GENSCAN00000038044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:83330521:83350149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000038037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:83291240:83314719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NR_027980 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700001L05 gene (1700001L05Rik), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000100370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:83357560:83367277:-1 gene:ENSMUSG00000075511 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000178628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:83357526:83367282:-1 gene:ENSMUSG00000075511 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENSMUST00000179705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:83357534:83367011:-1 gene:ENSMUSG00000075511 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AK005608 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700001L05 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr15 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000038036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:83358878:83367213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT024413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT024415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONMMUT024414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_178869 // RefSeq // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like 1 (Ttll1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000016897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:83483772:83510893:-1 gene:ENSMUSG00000022442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000109480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:83483828:83510881:-1 gene:ENSMUSG00000022442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000154401 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:83502136:83510793:-1 gene:ENSMUSG00000022442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC010510 // GenBank // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:19055 IMAGE:4191464), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000109479 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:83491874:83510874:-1 gene:ENSMUSG00000022442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// AK084005 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130075K08 product:similar to BM121M7.1 (NOVEL PROTEIN (ORTHOLOG OF HUMAN TUBULIN TYROSINE LIGASE-LIKE 1 (TTLL1)), ISOFORM 1) (SIMILAR TO TUBULIN TYROSINE LIGASE-LIKE 1) [Mus musculus], full insert sequence. // chr15 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1 /// GENSCAN00000038032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:83454370:83505362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001030014 // RefSeq // Mus musculus malonyl CoA:ACP acyltransferase (mitochondrial) (Mcat), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006520814 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus malonyl CoA:ACP acyltransferase (mitochondrial) (Mcat), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000061882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:83546797:83555711:-1 gene:ENSMUSG00000048755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099494 // GenBank // Mus musculus malonyl CoA:ACP acyltransferase (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:117743 IMAGE:30844555), complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:83547520:83555687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_183017 // RefSeq // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 12 (Ttll12), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000016901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:83575644:83595157:-1 gene:ENSMUSG00000016757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000136066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:83575119:83595157:-1 gene:ENSMUSG00000016757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC055368 // GenBank // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:60831 IMAGE:30055801), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:83576897:83595110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_013873 // RefSeq // Mus musculus sulfotransferase family 4A, member 1 (Sult4a1), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000082365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:84076097:84105754:-1 gene:ENSMUSG00000018865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF059257 // GenBank // Mus musculus sulfotransferase-related protein (Sultx3) mRNA, complete cds. // chr15 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// BC051132 // GenBank // Mus musculus sulfotransferase family 4A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:58253 IMAGE:6531493), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC054757 // GenBank // Mus musculus sulfotransferase family 4A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:64752 IMAGE:6413084), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:84077470:84105599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_029427 // RefSeq // Mus musculus patatin-like phospholipase domain containing 5 (Pnpla5), mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006521522 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus patatin-like phospholipase domain containing 5 (Pnpla5), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000019012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:84112621:84123175:-1 gene:ENSMUSG00000018868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC109360 // GenBank // Mus musculus patatin-like phospholipase domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:130406 IMAGE:40058461), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC109361 // GenBank // Mus musculus patatin-like phospholipase domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:130407 IMAGE:40058463), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:84113164:84132308:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000044225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:84346338:84346837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 59 // 15 // 17 // 0
NM_177630 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper, down-regulated in cancer 1-like (Ldoc1l), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000069476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:84553398:84557823:-1 gene:ENSMUSG00000055745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC058638 // GenBank // Mus musculus leucine zipper, down-regulated in cancer 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:73499 IMAGE:6418256), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC094559 // GenBank // Mus musculus leucine zipper, down-regulated in cancer 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:106581 IMAGE:6826763), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:84556462:84592904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_001033273 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5031439G07 gene (5031439G07Rik), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000047144 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:84943936:84988000:-1 gene:ENSMUSG00000036046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000165743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:84945720:84987971:-1 gene:ENSMUSG00000036046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000124308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:84948000:84960983:-1 gene:ENSMUSG00000036046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// AK173065 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0930 protein. // chr15 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// GENSCAN00000044217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:84949238:84987801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_080470 // RefSeq // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 1B (Smc1b), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:85064691:85131957:-1 gene:ENSMUSG00000022432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF303827 // GenBank // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 1beta mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC129800 // GenBank // Mus musculus structural maintenance of chromosomes 1B, mRNA (cDNA clone MGC:124441 IMAGE:40048794), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:85064962:85112794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000082830 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:85351063:85351254:-1 gene:ENSMUSG00000064764 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163633 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 7B (Wnt7b), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// NM_001163634 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 7B (Wnt7b), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000109424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:85535439:85578070:-1 gene:ENSMUSG00000022382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000167968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:85535439:85580729:-1 gene:ENSMUSG00000022382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// BC058398 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 7B, mRNA (cDNA clone IMAGE:6817404), partial cds. // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC066003 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 7B, mRNA (cDNA clone MGC:90019 IMAGE:5701652), complete cds. // chr15 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// NM_009528 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 7B (Wnt7b), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENSMUST00000023015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:85535439:85581821:-1 gene:ENSMUSG00000022382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// BC052018 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 7B, mRNA (cDNA clone MGC:62358 IMAGE:6401357), complete cds. // chr15 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// M89802 // GenBank // Mouse Wnt-7b mRNA, complete cds. // chr15 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// GENSCAN00000042384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:85531116:85624267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_011105 // RefSeq // Mus musculus polycystic kidney disease (polycystin) and REJ (sperm receptor for egg jelly homolog, sea urchin) (Pkdrej), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:85814676:85821733:-1 gene:ENSMUSG00000052496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:85815353:85821733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_009886 // RefSeq // Mus musculus cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 1 (flamingo homolog, Drosophila) (Celsr1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000016172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:85898758:86033777:-1 gene:ENSMUSG00000016028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF031572 // GenBank // Mus musculus seven-pass transmembrane receptor precursor (Celsr1) mRNA, complete cds. // chr15 // 89 // 97 // 31 // 35 // 0 /// GENSCAN00000042375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:85900436:85993681:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_145475 // RefSeq // Mus musculus ceramide kinase (Cerk), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000044332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:86139129:86186141:-1 gene:ENSMUSG00000035891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000150767 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:86139128:86159468:-1 gene:ENSMUSG00000035891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000156546 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:86140321:86152448:-1 gene:ENSMUSG00000035891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AB079067 // GenBank // Mus musculus cerk mRNA for ceramide kinases, complete cds. // chr15 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// AK129416 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1646 protein. // chr15 // 91 // 76 // 20 // 22 // 0 /// BC094253 // GenBank // Mus musculus ceramide kinase, mRNA (cDNA clone MGC:106531 IMAGE:6400872), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK161801 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030440D18 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr15 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000042381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:86141558:86185648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
AK012625 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810001A02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003013 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000088911 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:88698851:88734230:-1 gene:ENSMUSG00000022387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109380 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:88688296:88730771:-1 gene:ENSMUSG00000022387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000156155 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:88712900:88719155:-1 gene:ENSMUSG00000022387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// AK149714 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530012I18 product:bromodomain containing 1, full insert sequence. // chr15 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// BC130273 // GenBank // Mus musculus bromodomain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40143292), complete cds. // chr15 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// NM_001033274 // RefSeq // Mus musculus bromodomain containing 1 (Brd1), mRNA. // chr15 // 92 // 92 // 34 // 37 // 1 /// ENSMUST00000109381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:88687300:88734233:-1 gene:ENSMUSG00000022387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 92 // 34 // 37 // 1 /// XM_006520837 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus bromodomain containing 1 (Brd1), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1 /// GENSCAN00000012718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:88688297:88733865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
NM_001142357 // RefSeq // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 12 (alpha-1,6-mannosyltransferase) (Alg12), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000159328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:88814608:88819092:-1 gene:ENSMUSG00000035845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000160222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:88805244:88816171:-1 gene:ENSMUSG00000035845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000162183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:15:88805244:88819318:-1 gene:ENSMUSG00000035845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AJ429133 // GenBank // Mus musculus cDNA for putative mannosyltransferase (gene alg12). // chr15 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC021379 // GenBank // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 12 homolog (yeast, alpha-1,6-mannosyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:29374 IMAGE:5044319), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NM_145477 // RefSeq // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 12 (alpha-1,6-mannosyltransferase) (Alg12), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// ENSMUST00000043087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:15:88805245:88819285:-1 gene:ENSMUSG00000035845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// GENSCAN00000012727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:88805829:88816231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0
NM_172818 // RefSeq // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 8 (Ttll8), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006520955 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 8 (Ttll8), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006520959 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 8 (Ttll8), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109371 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:88913898:88954410:-1 gene:ENSMUSG00000022388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000177180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:88890633:88954418:-1 gene:ENSMUSG00000022388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:88913954:88954059:-1 gene:ENSMUSG00000022388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK029745 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930524K07 product:hypothetical Tubulin-tyrosine ligase containing protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC116293 // GenBank // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:143913 IMAGE:40094952), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC116294 // GenBank // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:143914 IMAGE:40094955), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:88913718:88954886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_133241 // RefSeq // Mus musculus megalencephalic leukoencephalopathy with subcortical cysts 1 homolog (human) (Mlc1), mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006520544 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus megalencephalic leukoencephalopathy with subcortical cysts 1 homolog (human) (Mlc1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000042594 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:88955884:88979007:-1 gene:ENSMUSG00000035805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000109368 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:88955884:88979007:-1 gene:ENSMUSG00000035805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF449425 // GenBank // Mus musculus KIAA0027 protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC024719 // GenBank // Mus musculus megalencephalic leukoencephalopathy with subcortical cysts 1 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:38961 IMAGE:5363238), complete cds. // chr15 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:88957022:88972845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0
NM_001163319 // RefSeq // Mus musculus tubulin, gamma complex associated protein 6 (Tubgcp6), mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000041656 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:89100410:89122886:-1 gene:ENSMUSG00000051786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000109353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:89098357:89123087:-1 gene:ENSMUSG00000051786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000169069 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:89104216:89107429:-1 gene:ENSMUSG00000051786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000012728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89100412:89168014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1
NM_013871 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 12 (Mapk12), mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000088827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:89130585:89140703:-1 gene:ENSMUSG00000022610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// AK011286 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610002F22 product:MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 12 (EC 2.7.1.-) (EXTRACELLULAR SIGNAL-REGULATED KINASE 6) (ERK-6) (STRESS-ACTIVATED PROTEIN KINASE-3) (MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE P38 GAMMA) (MAP KINASE P38 GAMMA) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr15 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// BC002134 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:3484007), complete cds. // chr15 // 100 // 52 // 23 // 23 // 0 /// BC021640 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 12, mRNA (cDNA clone MGC:13901 IMAGE:3979667), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// XM_006521061 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitogen-activated protein kinase 12 (Mapk12), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 52 // 52 // 23 // 44 // 1 /// AK165741 // GenBank HTC // Mus musculus 1 month neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630040F16 product:mitogen-activated protein kinase 12, full insert sequence. // chr15 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1 /// GENSCAN00000012728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89100412:89168014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 66 // 66 // 29 // 44 // 1
NM_011161 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 11 (Mapk11), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006520626 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitogen-activated protein kinase 11 (Mapk11), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006520627 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitogen-activated protein kinase 11 (Mapk11), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006520630 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitogen-activated protein kinase 11 (Mapk11), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000088823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:89142486:89149606:-1 gene:ENSMUSG00000053137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF135185 // GenBank // Mus musculus mitogen activated protein kinase p38beta mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AK161190 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4832421O20 product:mitogen-activated protein kinase 11, full insert sequence. // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC064737 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 11, mRNA (cDNA clone MGC:76486 IMAGE:30112690), complete cds. // chr15 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC092526 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 11, mRNA (cDNA clone MGC:107118 IMAGE:6593321), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89100412:89168014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
NM_001159521 // RefSeq // Mus musculus plexin B2 (Plxnb2), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_001284506 // RefSeq // Mus musculus plexin B2 (Plxnb2), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// NM_138749 // RefSeq // Mus musculus plexin B2 (Plxnb2), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000060808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:89155549:89170688:-1 gene:ENSMUSG00000036606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000109331 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:89155549:89171120:-1 gene:ENSMUSG00000036606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC003293 // GenBank // Mus musculus plexin B2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3500280), complete cds. // chr15 // 100 // 45 // 17 // 17 // 0 /// BC007481 // GenBank // Mus musculus plexin B2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3493309), complete cds. // chr15 // 89 // 92 // 31 // 35 // 0 /// BC031202 // GenBank // Mus musculus plexin B2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5066347), complete cds. // chr15 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// BC157960 // GenBank // Mus musculus plexin B2, mRNA (cDNA clone MGC:189945 IMAGE:9088132), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC157961 // GenBank // Mus musculus plexin B2, mRNA (cDNA clone MGC:189946 IMAGE:9088133), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC158086 // GenBank // Mus musculus plexin B2, mRNA (cDNA clone MGC:189987 IMAGE:9088174), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC172162 // GenBank // Mus musculus plexin B2, mRNA (cDNA clone MGC:198867 IMAGE:9054832), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000012728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89100412:89168014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0
NM_027081 // RefSeq // Mus musculus DENN/MADD domain containing 6B (Dennd6b), mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000078953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:89182217:89196474:-1 gene:ENSMUSG00000015377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// BC017544 // GenBank HTC // Mus musculus family with sequence similarity 116, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4527896), with apparent retained intron. // chr15 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// BC030395 // GenBank HTC // Mus musculus family with sequence similarity 116, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4504149), with apparent retained intron. // chr15 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// BC139003 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 116, member B, mRNA (cDNA clone MGC:170630 IMAGE:8862025), complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000048981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89184987:89196395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0
NM_001081030 // RefSeq // Mus musculus SET binding factor 1 (Sbf1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// NM_001170561 // RefSeq // Mus musculus SET binding factor 1 (Sbf1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000123791 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:89288236:89315311:-1 gene:ENSMUSG00000036529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000124576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:89288286:89315271:-1 gene:ENSMUSG00000036529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000144585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:89288283:89315255:-1 gene:ENSMUSG00000036529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000175778 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:89288287:89294297:-1 gene:ENSMUSG00000036529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 22 // 9 // 9 // 0 /// BC029156 // GenBank // Mus musculus SET binding factor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4953352), complete cds. // chr15 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// BC157935 // GenBank // Mus musculus SET binding factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:189928 IMAGE:9088115), complete cds. // chr15 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// BC158013 // GenBank // Mus musculus SET binding factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:189820 IMAGE:9007320), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC172094 // GenBank // Mus musculus SET binding factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:198799 IMAGE:9054380), complete cds. // chr15 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000048998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89288627:89315116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 95 // 39 // 41 // 1
NM_178919 // RefSeq // Mus musculus lipase maturation factor 2 (Lmf2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000023283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:89351004:89355659:-1 gene:ENSMUSG00000022614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK042427 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630090P16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK158371 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930111A22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// BC058973 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI451006, mRNA (cDNA clone IMAGE:5716419), partial cds. // chr15 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC079532 // GenBank // Mus musculus lipase maturation factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:90911 IMAGE:6403184), complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89351591:89355449:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0
NM_001111288 // RefSeq // Mus musculus SCO cytochrome oxidase deficient homolog 2 (yeast) (Sco2), mRNA. // chr15 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// NM_138302 // RefSeq // Mus musculus thymidine phosphorylase (Tymp), mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:89371931:89377039:-1 gene:ENSMUSG00000022615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000167643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:89371639:89373818:-1 gene:ENSMUSG00000091780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AB060274 // GenBank // Mus musculus mRNA for thymidine phosphorylase, complete cds. // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC019554 // GenBank // Mus musculus SCO cytochrome oxidase deficient homolog 2 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:28479 IMAGE:4163864), complete cds. // chr15 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000048997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89371682:89379178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1
NM_001013022 // RefSeq // Mus musculus outer dense fiber of sperm tails 3B (Odf3b), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006521387 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus outer dense fiber of sperm tails 3B (Odf3b), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006521388 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus outer dense fiber of sperm tails 3B (Odf3b), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000049968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:89377450:89379254:-1 gene:ENSMUSG00000047394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK008010 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010001J22 product:weakly similar to ORF1 5 TO PD-ECGF/TP PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr15 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC087962 // GenBank // Mus musculus outer dense fiber of sperm tails 3B, mRNA (cDNA clone MGC:107673 IMAGE:6748887), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC037508 // GenBank // Mus musculus, clone IMAGE:1445969, mRNA. // chr15 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000048997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89371682:89379178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_009948 // RefSeq // Mus musculus carnitine palmitoyltransferase 1b, muscle (Cpt1b), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NR_004843 // RefSeq // Mus musculus Chkb-Cpt1b readthrough transcript (NMD candidate) (ChkbCpt1b), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000052315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:89416405:89429696:-1 gene:ENSMUSG00000022617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000109313 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:89416405:89425863:-1 gene:ENSMUSG00000078937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000168879 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:89418765:89421401:-1 gene:ENSMUSG00000078937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 92 // 32 // 11 // 12 // 0 /// AB010826 // GenBank // Mus musculus mRNA for muscle type carnitine palmitoyltransferase I, complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AF017174 // GenBank // Mus musculus carnitine palmitoyltransferase I mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// BC018270 // GenBank // Mus musculus carnitine palmitoyltransferase 1b, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:25227 IMAGE:4920625), complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000048988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89390282:89425328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0
NM_009713 // RefSeq // Mus musculus arylsulfatase A (Arsa), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:89472528:89476113:-1 gene:ENSMUSG00000022620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000165199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:89472476:89477425:-1 gene:ENSMUSG00000022620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC011284 // GenBank // Mus musculus arylsulfatase A, mRNA (cDNA clone MGC:18487 IMAGE:3669438), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC098075 // GenBank // Mus musculus arylsulfatase A, mRNA (cDNA clone MGC:106103 IMAGE:30734943), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89473238:89475722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_018803 // RefSeq // Mus musculus synaptotagmin X (Syt10), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006521175 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptotagmin X (Syt10), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000029441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:89782393:89841860:-1 gene:ENSMUSG00000063260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB026807 // GenBank // Mus musculus mRNA for synaptotagmin X, complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC125632 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin X, mRNA (cDNA clone MGC:159335 IMAGE:40130147), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC125634 // GenBank // Mus musculus synaptotagmin X, mRNA (cDNA clone MGC:159337 IMAGE:40130149), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006521176 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptotagmin X (Syt10), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000048987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89790363:89814596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000048979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:89825528:89971665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
ENSMUST00000180218 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:90054409:90054515:-1 gene:ENSMUSG00000095422 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011994 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 2 (Abcd2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000069511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:91145884:91191807:-1 gene:ENSMUSG00000055782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019187 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:29110 IMAGE:5027149), complete cds. // chr15 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000017340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:91163054:91191608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001033633 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 13 (Slc2a13), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000109283 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:91267696:91573261:-1 gene:ENSMUSG00000036298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC119586 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 13, mRNA (cDNA clone MGC:141361 IMAGE:40058865), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:91320977:91458509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001033275 // RefSeq // Mus musculus glucoside xylosyltransferase 1 (Gxylt1), mRNA. // chr15 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000049484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:93239742:93275161:-1 gene:ENSMUSG00000036197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC141302 // GenBank // Mus musculus glycosyltransferase 8 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:176263 IMAGE:9055914), complete cds. // chr15 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// BC171972 // GenBank // Mus musculus glycosyltransferase 8 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:198677 IMAGE:9054258), complete cds. // chr15 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000057896 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:93244455:93275151:-1 gene:ENSMUSG00000036197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_024189 // RefSeq // Mus musculus YY1 associated factor 2 (Yaf2), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NR_028315 // RefSeq // Mus musculus YY1 associated factor 2 (Yaf2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000080299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:93284278:93336808:-1 gene:ENSMUSG00000022634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000133736 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:93284281:93336935:-1 gene:ENSMUSG00000022634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AB100452 // GenBank // Mus musculus YAF2 mRNA for YY1 associated factor-2-a, complete cds. // chr15 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// AB100453 // GenBank // Mus musculus YAF2 mRNA for YY1 associated factor-2-b, complete cds. // chr15 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// BC002192 // GenBank // Mus musculus YY1 associated factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:7415 IMAGE:3488691), complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT024717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:93279310:93361068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001033217 // RefSeq // Mus musculus prickle homolog 1 (Drosophila) (Prickle1), mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000048982 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:93499114:93595891:-1 gene:ENSMUSG00000036158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000109255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:93499114:93519523:-1 gene:ENSMUSG00000036158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC117892 // GenBank // Mus musculus prickle like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:144029 IMAGE:40096843), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC117893 // GenBank // Mus musculus prickle like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:144030 IMAGE:40096845), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:93500447:93523510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_172437 // RefSeq // Mus musculus pseudouridylate synthase 7 homolog (S. cerevisiae)-like (Pus7l), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:94522688:94543547:-1 gene:ENSMUSG00000033356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC066798 // GenBank // Mus musculus pseudouridylate synthase 7 homolog (S. cerevisiae)-like, mRNA (cDNA clone MGC:76467 IMAGE:30469996), complete cds. // chr15 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:94523319:94540962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_008971 // RefSeq // Mus musculus twinfilin, actin-binding protein, homolog 1 (Drosophila) (Twf1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000023087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:94577951:94589879:-1 gene:ENSMUSG00000022451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY267188 // GenBank // Mus musculus actin monomer-binding protein twinfilin-1 mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0 /// BC015081 // GenBank // Mus musculus twinfilin, actin-binding protein, homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:13938 IMAGE:3979221), complete cds. // chr15 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// BC094034 // GenBank // Mus musculus twinfilin, actin-binding protein, homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:103196 IMAGE:4934593), complete cds. // chr15 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// U82324 // GenBank // Mus musculus A6 gene product mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 71 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000034674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:94578207:94589868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_001289653 // RefSeq // Mus musculus NEL-like 2 (Nell2), mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000075275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:95219933:95528252:-1 gene:ENSMUSG00000022454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000166170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:95219451:95528706:-1 gene:ENSMUSG00000022454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// AK039790 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330108N19 product:nel-like 2 homolog (chicken), full insert sequence. // chr15 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// AK048913 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230081A19 product:nel-like 2 homolog (chicken), full insert sequence. // chr15 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// BC051968 // GenBank // Mus musculus NEL-like 2 (chicken), mRNA (cDNA clone MGC:62241 IMAGE:6401465), complete cds. // chr15 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// U59230 // GenBank // Mus musculus mel (MEL91) mRNA, complete cds. // chr15 // 90 // 87 // 36 // 40 // 0 /// XM_006521164 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NEL-like 2 (Nell2), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 83 // 83 // 38 // 46 // 1 /// GENSCAN00000008628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:95225247:95242372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000008632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:95425027:95466894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1
BC106999 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40044993. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:95097616:95149318:-1 gene:ENSMUSG00000100603 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000189291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:95097542:95162394:-1 gene:ENSMUSG00000100603 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207533 // RefSeq // Mus musculus developing brain homeobox 2 (Dbx2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:95623563:95655960:-1 gene:ENSMUSG00000045608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK034882 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430056A22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000008585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:95654091:95654762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
XR_141262 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A130051J0 gene (A130051J06Rik), misc_RNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:95787856:95791642:-1 gene:ENSMUSG00000097643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK037810 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130051J06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT024782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NovelTID_00002586 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NR_003627 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D030018L15 gene (D030018L15Rik), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000140253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:96073338:96079553:-1 gene:ENSMUSG00000078925 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000100271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:96051616:96078134:-1 gene:ENSMUSG00000078925 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// ENSMUST00000139808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:96051616:96079427:-1 gene:ENSMUSG00000078925 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr15 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// AK135992 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420444I18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONMMUT024794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT024795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT024792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NM_028148 // RefSeq // Mus musculus SR-related CTD-associated factor 11 (Scaf11), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:96411698:96460843:-1 gene:ENSMUSG00000033228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC055486 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 2, interacting protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:4484095), partial cds. // chr15 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:96414788:96479859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_001166456 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 38, member 1 (Slc38a1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001166458 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 38, member 1 (Slc38a1), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_134086 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 38, member 1 (Slc38a1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006520235 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 38, member 1 (Slc38a1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:96571418:96642913:-1 gene:ENSMUSG00000023169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:96571418:96642343:-1 gene:ENSMUSG00000023169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:96571418:96641962:-1 gene:ENSMUSG00000023169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175121 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 38, member 2 (Slc38a2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000023099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:96687394:96699698:-1 gene:ENSMUSG00000022462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC041108 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 38, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:47122 IMAGE:4038546), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC048178 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 38, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:61270 IMAGE:6825801), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK164568 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330050A21 product:solute carrier family 38, member 2, full insert sequence. // chr15 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// AK030917 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830454P10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000017137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:96684273:96698730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT024839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
ENSMUST00000177677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:96766761:96767141:-1 gene:ENSMUSG00000095638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:96766761:96790657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027052 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 38, member 4 (Slc38a4), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006521351 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 38, member 4 (Slc38a4), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000023101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:96994823:97055956:-1 gene:ENSMUSG00000022464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000166223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:96996765:97020322:-1 gene:ENSMUSG00000022464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// AB055004 // GenBank // Mus musculus mATA3 mRNA for system A amino acid transporter 3, complete cds. // chr15 // 97 // 84 // 30 // 31 // 0 /// AY027919 // GenBank // Mus musculus plasma membrane amino acid transporter mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC024072 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 38, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:37778 IMAGE:5097293), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC024123 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 38, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:37806 IMAGE:5098067), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC031717 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 38, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:25858 IMAGE:4195569), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:96996990:97019833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0
NM_001164563 // RefSeq // Mus musculus adhesion molecule with Ig like domain 2 (Amigo2), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_001164602 // RefSeq // Mus musculus adhesion molecule with Ig like domain 2 (Amigo2), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NM_178114 // RefSeq // Mus musculus adhesion molecule with Ig like domain 2 (Amigo2), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000053106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:97244074:97247287:-1 gene:ENSMUSG00000048218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AB078880 // GenBank // Mus musculus ali 1 mRNA for Alivin 1, complete cds. // chr15 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AY237006 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein AMIGO2 (Amigo2) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC095990 // GenBank // Mus musculus adhesion molecule with Ig like domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:106073 IMAGE:5358186), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:97244980:97246449:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
AK018007 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830453K13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// KnowTID_00003052 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028003 // RefSeq // Mus musculus RNA polymerase II associated protein 3 (Rpap3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:97675105:97705822:-1 gene:ENSMUSG00000022466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC004046 // GenBank // Mus musculus RNA polymerase II associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:7675 IMAGE:3496407), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:97675294:97705971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_008902 // RefSeq // Mus musculus endonuclease, polyU-specific (Endou), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000023105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:97711019:97721150:-1 gene:ENSMUSG00000022468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK169457 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630022F19 product:placental protein 11 related, full insert sequence. // chr15 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// M95545 // GenBank // Mus musculus T cell-specific protein (Tcl-30) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_001168693 // RefSeq // Mus musculus endonuclease, polyU-specific (Endou), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// XM_006520617 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endonuclease, polyU-specific (Endou), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// ENSMUST00000100249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:97711019:97731405:-1 gene:ENSMUSG00000022468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// GENSCAN00000033751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:97712049:97731269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_009504 // RefSeq // Mus musculus vitamin D receptor (Vdr), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000023119 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:97854425:97908310:-1 gene:ENSMUSG00000022479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000126568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:97876776:97896813:-1 gene:ENSMUSG00000022479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AK030339 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5131400H15 product:vitamin D receptor, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC006716 // GenBank // Mus musculus vitamin D receptor, mRNA (cDNA clone MGC:12147 IMAGE:3710866), complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// CT010294 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A0752D for gene Vdr, Vitamin D receptor; complete cds, incl. stopcodon. // chr15 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// D31969 // GenBank // Mus musculus mRNA for vitamin D receptor (VDR), complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:97857372:97909861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_001170710 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 8 (Asb8), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_001170711 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 8 (Asb8), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NM_030121 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 8 (Asb8), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:98135714:98145659:-1 gene:ENSMUSG00000048175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000123626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:98135714:98145706:-1 gene:ENSMUSG00000048175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000123922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:98135714:98165560:-1 gene:ENSMUSG00000048175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000143400 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:98134637:98165625:-1 gene:ENSMUSG00000048175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF398969 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat-containing SOCS box protein 8 (Asb8) mRNA, complete cds. // chr15 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// BC025106 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:36839 IMAGE:4194829), complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98135806:98142767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0
NM_001011733 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 288 (Olfr288), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006521174 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 288 (Olfr288), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000142443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:98186015:98195542:-1 gene:ENSMUSG00000075427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000165379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98186013:98195542:-1 gene:ENSMUSG00000075427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001011779 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 286 (Olfr286), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000073612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98226675:98227643:-1 gene:ENSMUSG00000059460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98226675:98232740:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_027304 // RefSeq // Mus musculus H1 histone family, member N, testis-specific (H1fnt), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98255982:98257307:-1 gene:ENSMUSG00000048077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB016273 // GenBank // Mus musculus Hanp1 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY496853 // GenBank // Mus musculus histone H1 variant (H1t2) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC052363 // GenBank // Mus musculus H1 histone family, member N, testis-specific, mRNA (cDNA clone MGC:58824 IMAGE:6773647), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98256584:98257266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
NM_173769 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 641 (Zfp641), mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006520973 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 641 (Zfp641), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000023722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98285588:98296130:-1 gene:ENSMUSG00000022987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000169721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98286122:98296083:-1 gene:ENSMUSG00000022987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC111896 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 641, mRNA (cDNA clone MGC:132923 IMAGE:40061302), complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// BC112418 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 641, mRNA (cDNA clone MGC:132922 IMAGE:40061301), complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98288472:98293803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_001011778 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 285 (Olfr285), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_207554 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 257 (Olfr257), mRNA. // chr15 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98312589:98313548:-1 gene:ENSMUSG00000062037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98312589:98313548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146281 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 284 (Olfr284), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98340022:98340939:-1 gene:ENSMUSG00000051793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98340022:98340939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147036 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 283 (Olfr283), mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98378096:98379197:-1 gene:ENSMUSG00000056184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC125358 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 283, mRNA (cDNA clone MGC:159061 IMAGE:40129873), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98368769:98379108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0
NM_010679 // RefSeq // Mus musculus lactalbumin, alpha (Lalba), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98480400:98482683:-1 gene:ENSMUSG00000022991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC006922 // GenBank // Mus musculus lactalbumin, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:11989 IMAGE:3601746), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069916 // GenBank // Mus musculus lactalbumin, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:78177 IMAGE:3670536), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M80909 // GenBank // Mouse alpha-lactalbumin mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC044869 // GenBank HTC // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:3599851), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000005901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98480689:98482671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC040806 // GenBank // Mus musculus, clone IMAGE:3964019, mRNA. // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NR_034051 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 34 (Snora34), small nucleolar RNA. // chr15 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000083402 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:98519716:98519853:-1 gene:ENSMUSG00000065336 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_106171 // RefSeq // Mus musculus microRNA mir-1291 (Mir1291), microRNA. // chr15 // 68 // 76 // 13 // 19 // 0 /// NONMMUT024905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// mmu-mir-1291 // miRBase Micro RNA Database // MI0026023 Mus musculus miR-1291 stem-loop // chr15 // 68 // 76 // 13 // 19 // 0
NR_034052 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 2B (Snora2b), small nucleolar RNA. // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000084005 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:98526346:98526482:-1 gene:ENSMUSG00000065939 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_007405 // RefSeq // Mus musculus adenylate cyclase 6 (Adcy6), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// XM_006520315 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenylate cyclase 6 (Adcy6), transcript variant X13, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// XM_006520317 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenylate cyclase 6 (Adcy6), transcript variant X15, mRNA. // chr15 // 100 // 68 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000096224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98589994:98607633:-1 gene:ENSMUSG00000022994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// AK122279 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0422 protein. // chr15 // 100 // 45 // 21 // 21 // 0 /// M93422 // GenBank // Mouse adenylyl cyclase type VI mRNA, complete cds. // chr15 // 95 // 94 // 42 // 44 // 0 /// GENSCAN00000005857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98592350:98606896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000159423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:98648003:98662881:-1 gene:ENSMUSG00000003360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000160506 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:98647991:98662884:-1 gene:ENSMUSG00000003360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000161030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:98652219:98662884:-1 gene:ENSMUSG00000003360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// AK014820 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921506D17 product:weakly similar to PRP28, U5 SNRNP 100 KDA PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr15 // 97 // 77 // 29 // 30 // 0 /// BC049928 // GenBank HTC // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 23, mRNA (cDNA clone IMAGE:5321607), with apparent retained intron. // chr15 // 97 // 82 // 31 // 32 // 0 /// NM_001080981 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 23 (Ddx23), mRNA. // chr15 // 85 // 85 // 33 // 39 // 1 /// ENSMUST00000003450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:98645134:98662889:-1 gene:ENSMUSG00000003360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 85 // 85 // 33 // 39 // 1 /// GENSCAN00000005838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98645794:98677349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// BC019763 // GenBank HTC // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 23, mRNA (cDNA clone IMAGE:2655962), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr15 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1
ENSMUST00000120997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:98672217:98677458:-1 gene:ENSMUSG00000054855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC048531 // GenBank // Mus musculus Rho family GTPase 1, mRNA (cDNA clone MGC:58446 IMAGE:6535763), complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NM_172612 // RefSeq // Mus musculus Rho family GTPase 1 (Rnd1), mRNA. // chr15 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000003451 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:98669205:98677461:-1 gene:ENSMUSG00000054855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000109149 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:98663421:98677460:-1 gene:ENSMUSG00000054855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// AK039992 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430040J04 product:similar to RHO-RELATED GTP-BINDING PROTEIN RHO6 (RND1) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr15 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// GENSCAN00000005838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98645794:98677349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_024169 // RefSeq // Mus musculus FK506 binding protein 11 (Fkbp11), mRNA. // chr15 // 100 // 63 // 27 // 27 // 0 /// XM_006521248 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FK506 binding protein 11 (Fkbp11), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000003445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98724373:98728198:-1 gene:ENSMUSG00000003355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 63 // 27 // 27 // 0 /// BC021345 // GenBank HTC // Mus musculus FK506 binding protein 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:4187191), with apparent retained intron. // chr15 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// BC022900 // GenBank HTC // Mus musculus FK506 binding protein 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:3590440), with apparent retained intron. // chr15 // 94 // 74 // 30 // 32 // 0 /// BC037596 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:46745 IMAGE:5250344), complete cds. // chr15 // 96 // 63 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98724385:98728085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 49 // 21 // 21 // 0
NM_007478 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor 3 (Arf3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000053183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:98737621:98763211:-1 gene:ENSMUSG00000051853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC014778 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:6687 IMAGE:3582243), complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC024935 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:28115 IMAGE:3969152), complete cds. // chr15 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// D87900 // GenBank // Mus musculus mRNA for ARF3, complete cds. // chr15 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000129354 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:98741057:98763214:-1 gene:ENSMUSG00000051853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000005840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98734883:98742740:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONMMUT024920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
BC147360 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830427D03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182534 IMAGE:9056428), complete cds. // chr15 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC147361 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830427D03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182528 IMAGE:9056422), complete cds. // chr15 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_011718 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 10B (Wnt10b), mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006520891 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus wingless related MMTV integration site 10b (Wnt10b), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000023732 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98771753:98778150:-1 gene:ENSMUSG00000022996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000166022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98772200:98777261:-1 gene:ENSMUSG00000022996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// AK029284 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4832413L14 product:weakly similar to WNT-10B PROTEIN PRECURSOR, full insert sequence. // chr15 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC114969 // GenBank // Mus musculus wingless related MMTV integration site 10b, mRNA (cDNA clone IMAGE:40039218), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// U20658 // GenBank // Mus musculus (wnt-10b) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// U30464 // GenBank // Mus musculus wnt-10B mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// U61970 // GenBank // Mus musculus Wnt10b mRNA, complete cds. // chr15 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// U61971 // GenBank // Mus musculus Wnt10b short isoform mRNA, complete cds. // chr15 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000005829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98772476:98776963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
NM_001013741 // RefSeq // Mus musculus dendrin (Ddn), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98803782:98807925:-1 gene:ENSMUSG00000059213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC157995 // GenBank // Mus musculus dendrin, mRNA (cDNA clone MGC:189958 IMAGE:9088145), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC157996 // GenBank // Mus musculus dendrin, mRNA (cDNA clone MGC:189959 IMAGE:9088146), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98800608:98807813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_016781 // RefSeq // Mus musculus protein kinase, AMP-activated, gamma 1 non-catalytic subunit (Prkag1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000168846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98812798:98831508:-1 gene:ENSMUSG00000067713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF036535 // GenBank // Mus musculus AMP activated protein kinase mRNA, complete cds. // chr15 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// BC086660 // GenBank // Mus musculus protein kinase, AMP-activated, gamma 1 non-catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:113731 IMAGE:30551467), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000005804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98813373:98866720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1
NM_001033276 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific methyltransferase 2D (Kmt2d), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:98831672:98871204:-1 gene:ENSMUSG00000048154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98831669:98871183:-1 gene:ENSMUSG00000048154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001033276 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific methyltransferase 2D (Kmt2d), mRNA. // chr15 // 100 // 99 // 75 // 75 // 0 /// ENSMUST00000023741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:98831672:98871204:-1 gene:ENSMUSG00000048154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 99 // 75 // 75 // 0 /// ENSMUST00000178486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98831669:98871183:-1 gene:ENSMUSG00000048154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 99 // 75 // 75 // 0 /// GENSCAN00000005804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98813373:98866720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 98 // 72 // 54 // 55 // 0
NM_026967 // RefSeq // Mus musculus Ras homolog enriched in brain like 1 (Rhebl1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006521344 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras homolog enriched in brain like 1 (Rhebl1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006521345 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Ras homolog enriched in brain like 1 (Rhebl1), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000024518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:98877778:98881404:-1 gene:ENSMUSG00000023755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY327413 // GenBank // Mus musculus Ras homolog enriched in brain-like 1 (Rhebl1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016521 // GenBank // Mus musculus Ras homolog enriched in brain like 1, mRNA (cDNA clone MGC:27835 IMAGE:3487009), complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000147015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:98878046:98881090:-1 gene:ENSMUSG00000023755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000005895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98878205:98881201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0
NM_007857 // RefSeq // Mus musculus desert hedgehog (Dhh), mRNA. // chr15 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// XM_006520406 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus desert hedgehog (Dhh), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000023737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:98893031:98898540:-1 gene:ENSMUSG00000023000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC062810 // GenBank HTC // Mus musculus desert hedgehog, mRNA (cDNA clone IMAGE:639130), with apparent retained intron. // chr15 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000005869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98893935:98918340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1
NM_029098 // RefSeq // Mus musculus limb region 1 like (Lmbr1l), mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000023736 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:98903921:98918231:-1 gene:ENSMUSG00000022999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000109127 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:98903921:98916212:-1 gene:ENSMUSG00000022999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000135051 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:98907880:98909460:-1 gene:ENSMUSG00000022999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AK173121 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1174 protein. // chr15 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC023397 // GenBank // Mus musculus limb region 1 like, mRNA (cDNA clone MGC:32459 IMAGE:5043877), complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000123950 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:98906179:98908937:-1 gene:ENSMUSG00000022999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// ENSMUST00000127548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:98907182:98909263:-1 gene:ENSMUSG00000022999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1 /// GENSCAN00000005869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98893935:98918340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1
NM_011653 // RefSeq // Mus musculus tubulin, alpha 1A (Tuba1a), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000097014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:98949841:98953551:-1 gene:ENSMUSG00000072235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC056169 // GenBank // Mus musculus tubulin, alpha 1A, mRNA (cDNA clone MGC:67012 IMAGE:5715646), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC083343 // GenBank // Mus musculus tubulin, alpha 1A, mRNA (cDNA clone MGC:102097 IMAGE:5687414), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC083344 // GenBank // Mus musculus tubulin, alpha 1A, mRNA (cDNA clone MGC:102098 IMAGE:5693701), complete cds. // chr15 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// BC083345 // GenBank // Mus musculus tubulin, alpha 1A, mRNA (cDNA clone MGC:102099 IMAGE:6415067), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC085256 // GenBank // Mus musculus tubulin, alpha 1A, mRNA (cDNA clone MGC:102492 IMAGE:6306481), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// M13445 // GenBank // Mouse alpha-tubulin isotype M-alpha-1 mRNA, complete cds. // chr15 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
NM_001024702 // RefSeq // Mus musculus complement component 1, q subcomponent-like 4 (C1ql4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:99084686:99087817:-1 gene:ENSMUSG00000001076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147036 // GenBank // Mus musculus complement component 1, q subcomponent-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:182152 IMAGE:9056046), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147037 // GenBank // Mus musculus complement component 1, q subcomponent-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:182173 IMAGE:9056067), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ002403 // GenBank // Mus musculus C1qTNF11 (C1qtnf11) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:99084754:99088524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000175398 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:99254882:99255014:-1 gene:ENSMUSG00000093139 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT024968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081254 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 186, member B (Fam186b), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006521173 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 186, member B (Fam186b), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000109100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:99271018:99287180:-1 gene:ENSMUSG00000078907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:99243134:99288710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011711 // RefSeq // Mus musculus formin-like 3 (Fmnl3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000081224 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:99317225:99370449:-1 gene:ENSMUSG00000023008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000088233 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:99317225:99370482:-1 gene:ENSMUSG00000023008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000120633 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:99317225:99370449:-1 gene:ENSMUSG00000023008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC131961 // GenBank // Mus musculus formin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:163592 IMAGE:40130238), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC027845 // GenBank // Mus musculus formin-like 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5342677), partial cds. // chr15 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000013405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:99318284:99370302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000179471 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:99368029:99368135:-1 gene:ENSMUSG00000095635 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT024971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001001884 // RefSeq // Mus musculus NCK-associated protein 5-like (Nckap5l), mRNA. // chr15 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023747 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:99422035:99457748:-1 gene:ENSMUSG00000023009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:99429421:99457712:-1 gene:ENSMUSG00000023009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// BC072572 // GenBank // Mus musculus Riken cDNA C230021P08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:99448 IMAGE:5719876), complete cds. // chr15 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:99422699:99457676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0
NM_029236 // RefSeq // Mus musculus BCDIN3 domain containing (Bcdin3d), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:99470084:99474730:-1 gene:ENSMUSG00000037525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC016225 // GenBank // Mus musculus BCDIN3 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:28774 IMAGE:4486953), complete cds. // chr15 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:99470459:99474773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_001038658 // RefSeq // Mus musculus Fas apoptotic inhibitory molecule 2 (Faim2), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_028224 // RefSeq // Mus musculus Fas apoptotic inhibitory molecule 2 (Faim2), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000023750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:99497005:99528017:-1 gene:ENSMUSG00000023011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF468028 // GenBank // Mus musculus lifeguard (Lfg) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// AK129246 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0950 protein. // chr15 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// AK144929 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830007C11 product:Fas apoptotic inhibitory molecule 2, full insert sequence. // chr15 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// AK136791 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330015F10 product:Fas apoptotic inhibitory molecule 2, full insert sequence. // chr15 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// BC032278 // GenBank // Mus musculus Fas apoptotic inhibitory molecule 2, mRNA (cDNA clone MGC:40667 IMAGE:5400222), complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:99500148:99556192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_028015 // RefSeq // Mus musculus ceramide synthase 5 (Cers5), mRNA. // chr15 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:99735592:99772601:-1 gene:ENSMUSG00000023021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000109035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:99734881:99772462:-1 gene:ENSMUSG00000023021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000175876 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:99739408:99772885:-1 gene:ENSMUSG00000023021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 58 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000176248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:99735311:99772465:-1 gene:ENSMUSG00000023021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr15 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000176970 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:99737335:99747070:-1 gene:ENSMUSG00000023021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 53 // 19 // 19 // 0 /// AY029533 // GenBank // Mus musculus TRH4 mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 83 // 28 // 30 // 0 /// BC010670 // GenBank // Mus musculus LAG1 homolog, ceramide synthase 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:3594967), complete cds. // chr15 // 92 // 33 // 11 // 12 // 0 /// BC043059 // GenBank // Mus musculus LAG1 homolog, ceramide synthase 5, mRNA (cDNA clone MGC:57962 IMAGE:6419704), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC046797 // GenBank // Mus musculus LAG1 homolog, ceramide synthase 5, mRNA (cDNA clone MGC:61268 IMAGE:6403129), complete cds. // chr15 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:99736221:99772379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0
NM_001113545 // RefSeq // Mus musculus LIM domain and actin binding 1 (Lima1), transcript variant a, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// NM_023063 // RefSeq // Mus musculus LIM domain and actin binding 1 (Lima1), transcript variant b, mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006521244 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus LIM domain and actin binding 1 (Lima1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// XM_006521247 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus LIM domain and actin binding 1 (Lima1), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000073691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:99778470:99875428:-1 gene:ENSMUSG00000023022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000109024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:99778470:99820143:-1 gene:ENSMUSG00000023022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AF307844 // GenBank // Mus musculus epithelial protein lost in neoplasm-a (Eplin) mRNA, complete cds. // chr15 // 88 // 89 // 29 // 33 // 0 /// AF307845 // GenBank // Mus musculus epithelial protein lost in neoplasm-b (Eplin) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 76 // 27 // 28 // 0 /// BC031490 // GenBank // Mus musculus LIM domain and actin binding 1, mRNA (cDNA clone MGC:27894 IMAGE:3498138), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// XM_006521246 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus LIM domain and actin binding 1 (Lima1), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// GENSCAN00000013404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:99780297:99888724:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000083709 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:99803020:99803126:-1 gene:ENSMUSG00000065643 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT024995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006543266 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 9763 (Gm9763), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000038391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:99898287:99898556:-1 gene:ENSMUSG00000037438 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:99898218:99898556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT025007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000005819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:98450354:98457247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 74 // 70 // 17 // 23 // 0
NM_028180 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700030F18 gene (1700030F18Rik), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006521432 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700030F18 gene (1700030F18Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006521437 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700030F18 gene (1700030F18Rik), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006521438 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700030F18 gene (1700030F18Rik), transcript variant X7, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000062631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:99918348:99931796:-1 gene:ENSMUSG00000045350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000100209 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:99918353:99967075:-1 gene:ENSMUSG00000045350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC048613 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700030F18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58686 IMAGE:6742336), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:99912138:99973398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
XM_006521432 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700030F18 gene (1700030F18Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006521437 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700030F18 gene (1700030F18Rik), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100209 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:99918353:99967075:-1 gene:ENSMUSG00000045350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK133226 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932418P17 product:hypothetical Alanine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:99912138:99973398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_028124 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310068J16 gene (2310068J16Rik), long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:99972164:99973287:-1 gene:ENSMUSG00000100084 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:99912138:99973398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT025015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153407 // RefSeq // Mus musculus cysteine-serine-rich nuclear protein 2 (Csrnp2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006520683 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cysteine-serine-rich nuclear protein 2 (Csrnp2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000061457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:100479570:100495239:-1 gene:ENSMUSG00000044636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB091689 // GenBank // Mus musculus taip-12 mRNA for TGF-beta induced apoptosis protein 12, complete cds. // chr15 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC035295 // GenBank // Mus musculus cysteine-serine-rich nuclear protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:28165 IMAGE:3985077), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:100481804:100551446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_001289603 // RefSeq // Mus musculus transcription factor CP2 (Tfcp2), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_033476 // RefSeq // Mus musculus transcription factor CP2 (Tfcp2), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006520734 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor CP2 (Tfcp2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006520740 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor CP2 (Tfcp2), transcript variant X7, mRNA. // chr15 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000009877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:100502799:100552008:-1 gene:ENSMUSG00000009733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AK141248 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330037L04 product:transcription factor CP2, full insert sequence. // chr15 // 94 // 58 // 17 // 18 // 0 /// AK147898 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270085N22 product:transcription factor CP2, full insert sequence. // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC022131 // GenBank // Mus musculus transcription factor CP2, mRNA (cDNA clone MGC:37813 IMAGE:5098336), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// M84809 // GenBank // Mus musculus alpha-globin transcription factor CP2 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:100481804:100551446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NM_001033872 // RefSeq // Mus musculus small cell adhesion glycoprotein (Smagp), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001285413 // RefSeq // Mus musculus small cell adhesion glycoprotein (Smagp), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// NM_001285414 // RefSeq // Mus musculus small cell adhesion glycoprotein (Smagp), transcript variant 4, mRNA. // chr15 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// NM_174992 // RefSeq // Mus musculus small cell adhesion glycoprotein (Smagp), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NR_104337 // RefSeq // Mus musculus small cell adhesion glycoprotein (Smagp), transcript variant 5, non-coding RNA. // chr15 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NR_104338 // RefSeq // Mus musculus small cell adhesion glycoprotein (Smagp), transcript variant 6, non-coding RNA. // chr15 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000066068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:100621342:100636855:-1 gene:ENSMUSG00000053559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000172334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:100621342:100636865:-1 gene:ENSMUSG00000053559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC004728 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC004728, mRNA (cDNA clone MGC:7903 IMAGE:3582955), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:100621848:100669493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_001270537 // RefSeq // Mus musculus bridging integrator 2 (Bin2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000182775 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:100641083:100669527:-1 gene:ENSMUSG00000098112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000182814 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:100641083:100669505:-1 gene:ENSMUSG00000098112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000183211 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:100641077:100669553:-1 gene:ENSMUSG00000098112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000182574 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:100645401:100669525:-1 gene:ENSMUSG00000098112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// XM_006521281 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus bridging integrator 2 (Bin2), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// ENSMUST00000182068 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:100645305:100669505:-1 gene:ENSMUSG00000098112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000012660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:100621848:100669493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
NM_033612 // RefSeq // Mus musculus chymotrypsin-like elastase family, member 1 (Cela1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000023775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:100674425:100687920:-1 gene:ENSMUSG00000023031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC011218 // GenBank // Mus musculus elastase 1, pancreatic, mRNA (cDNA clone MGC:19111 IMAGE:4208442), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK007931 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810062B19 product:elastase 1, pancreatic, full insert sequence. // chr15 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000012647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:100674700:100687893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0
NM_001161767 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 6 (Galnt6), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001161768 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 6 (Galnt6), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_172451 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 6 (Galnt6), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052069 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:100691815:100729376:-1 gene:ENSMUSG00000037280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159715 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:100691813:100729376:-1 gene:ENSMUSG00000037280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:100692864:100720477:-1 gene:ENSMUSG00000037280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC119324 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:155640 IMAGE:8734073), complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC119326 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:155642 IMAGE:8734075), complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:100689212:100716418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NR_045781 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA I730030J21 gene (I730030J21Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_045782 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA I730030J21 gene (I730030J21Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK146183 // GenBank HTC // Mus musculus TIB-55 BB88 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I730030J21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr15 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// KnowTID_00003058 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003059 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONMMUT025060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001214911 // RefSeq // Mus musculus fidgetin-like 2 (Fignl2), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006521283 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fidgetin-like 2 (Fignl2), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000178140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101050194:101054399:-1 gene:ENSMUSG00000095440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101052465:101061861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// KnowTID_00003060 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr15 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT025072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT025073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_028770 // RefSeq // Mus musculus keratin 80 (Krt80), mRNA. // chr15 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000077196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101349571:101370125:-1 gene:ENSMUSG00000037185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC119366 // GenBank // Mus musculus keratin 80, mRNA (cDNA clone MGC:155682 IMAGE:8734115), complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC120601 // GenBank // Mus musculus keratin 80, mRNA (cDNA clone MGC:155838 IMAGE:40129524), complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// XM_006521487 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin 80 (Krt80), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// AK004811 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1200016G03 product:weakly similar to KERATIN TYPE II (FRAGMENT) [Ovis sp], full insert sequence. // chr15 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// AK171114 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630225E14 product:weakly similar to Keratin 8 (Fragment) [Oreochromis mossambicus], full insert sequence. // chr15 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// AK036900 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930022H22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr15 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// GENSCAN00000017736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101348537:101370054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0
NM_001003668 // RefSeq // Mus musculus keratin 83 (Krt83), mRNA. // chr15 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// ENSMUST00000081945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101431490:101438804:-1 gene:ENSMUSG00000047641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// BC139321 // GenBank // Mus musculus keratin 83, mRNA (cDNA clone MGC:170948 IMAGE:8862343), complete cds. // chr15 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// BC139322 // GenBank // Mus musculus keratin 83, mRNA (cDNA clone MGC:170949 IMAGE:8862344), complete cds. // chr15 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// GENSCAN00000017761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101431794:101438770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_008474 // RefSeq // Mus musculus keratin 84 (Krt84), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006520514 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin 84 (Krt84), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 88 // 77 // 21 // 24 // 0 /// ENSMUST00000023720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101525026:101532820:-1 gene:ENSMUSG00000044294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AY028607 // GenBank // Mus musculus type II 65kD keratin (Krt2-16) mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC114971 // GenBank // Mus musculus keratin 84, mRNA (cDNA clone MGC:140837 IMAGE:40039508), complete cds. // chr15 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101517362:101550534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_053249 // RefSeq // Mus musculus keratin 82 (Krt82), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101541229:101550659:-1 gene:ENSMUSG00000049548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AY028606 // GenBank // Mus musculus type II hair keratin mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC108971 // GenBank // Mus musculus keratin 82, mRNA (cDNA clone MGC:124293 IMAGE:40047321), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101517362:101550534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// AF312019 // GenBank // Mus musculus type II hair keratin pseudogene, mRNA sequence. // chr15 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_177717 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4732456N10 gene (4732456N10Rik), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023714 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:101552356:101562950:-1 gene:ENSMUSG00000048699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC118024 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4732456N10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143719 IMAGE:40092535), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101553148:101562825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NM_133357 // RefSeq // Mus musculus keratin 75 (Krt75), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000042957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:101563345:101573904:-1 gene:ENSMUSG00000022986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC137935 // GenBank // Mus musculus keratin 75, mRNA (cDNA clone MGC:169559 IMAGE:8860954), complete cds. // chr15 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// BC137936 // GenBank // Mus musculus keratin 75, mRNA (cDNA clone MGC:169560 IMAGE:8860955), complete cds. // chr15 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101564882:101573831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_001003670 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5414 (Gm5414), mRNA. // chr15 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000062879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101624028:101628188:-1 gene:ENSMUSG00000064232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101624028:101628188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NR_003960 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 5478 (Gm5478), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000100184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101643024:101647380:-1 gene:ENSMUSG00000095241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000017755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101638669:101680223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_010669 // RefSeq // Mus musculus keratin 6B (Krt6b), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000023786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101676034:101680289:-1 gene:ENSMUSG00000023041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC119554 // GenBank // Mus musculus keratin 6B, mRNA (cDNA clone MGC:141271 IMAGE:40057432), complete cds. // chr15 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// BC119555 // GenBank // Mus musculus keratin 6B, mRNA (cDNA clone MGC:141272 IMAGE:40057433), complete cds. // chr15 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// BC139807 // GenBank // Mus musculus keratin 6B, mRNA (cDNA clone MGC:161773 IMAGE:40057436), complete cds. // chr15 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NM_008476 // RefSeq // Mus musculus keratin 6A (Krt6a), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000023788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101689932:101694307:-1 gene:ENSMUSG00000058354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC080820 // GenBank // Mus musculus keratin 6A, mRNA (cDNA clone MGC:91279 IMAGE:30141946), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC064470 // GenBank // Mus musculus keratin complex 2, basic, gene 6a, mRNA (cDNA clone IMAGE:30288108). // chr15 // 71 // 70 // 5 // 7 // 0
NM_027011 // RefSeq // Mus musculus keratin 5 (Krt5), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:101707070:101712891:-1 gene:ENSMUSG00000061527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC006780 // GenBank // Mus musculus keratin 5, mRNA (cDNA clone MGC:8116 IMAGE:3589013), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC108361 // GenBank // Mus musculus keratin 5, mRNA (cDNA clone MGC:118028 IMAGE:6312495), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101707436:101722407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_019956 // RefSeq // Mus musculus keratin 71 (Krt71), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023710 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:101733950:101743109:-1 gene:ENSMUSG00000051879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB033744 // GenBank // Mus musculus mRNA for type II cytokeratin, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB100413 // GenBank // Mus musculus Krt2-6g mRNA for type II keratin, complete cds, strain: C57BL/6J. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY033497 // GenBank // Mus musculus keratin protein K6irs mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC125346 // GenBank // Mus musculus keratin 71, mRNA (cDNA clone MGC:159049 IMAGE:40129861), complete cds. // chr15 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// BC125348 // GenBank // Mus musculus keratin 71, mRNA (cDNA clone MGC:159051 IMAGE:40129863), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101730059:101743046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NR_033444 // RefSeq // Mus musculus keratin 74 (Krt74), non-coding RNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000088018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101754259:101763504:-1 gene:ENSMUSG00000067596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101753477:101763437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_213728 // RefSeq // Mus musculus keratin 72 (Krt72), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000071104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:101776172:101786458:-1 gene:ENSMUSG00000056605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000127671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:101776333:101778693:-1 gene:ENSMUSG00000056605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000017746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101776560:101802297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_212485 // RefSeq // Mus musculus keratin 73 (Krt73), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000063292 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:101793308:101802343:-1 gene:ENSMUSG00000063661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC067067 // GenBank // Mus musculus keratin 73, mRNA (cDNA clone MGC:91305 IMAGE:30538572), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101776560:101802297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1
NM_010668 // RefSeq // Mus musculus keratin 2 (Krt2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006520516 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin 2 (Krt2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000023712 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:101810689:101818169:-1 gene:ENSMUSG00000064201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC120485 // GenBank // Mus musculus keratin 2, mRNA (cDNA clone MGC:155722 IMAGE:40129408), complete cds. // chr15 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC139485 // GenBank // Mus musculus keratin 2, mRNA (cDNA clone MGC:169192 IMAGE:8860587), complete cds. // chr15 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101811127:101818101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0
NM_008473 // RefSeq // Mus musculus keratin 1 (Krt1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000023790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101845428:101850786:-1 gene:ENSMUSG00000046834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC117842 // GenBank // Mus musculus keratin 1, mRNA (cDNA clone MGC:143810 IMAGE:40093577), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC117843 // GenBank // Mus musculus keratin 1, mRNA (cDNA clone MGC:143811 IMAGE:40093580), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// M10937 // GenBank // Mus musculus type II keratin subunit protein mRNA, complete cds. // chr15 // 91 // 97 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000017733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101845900:101850727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
NM_001003667 // RefSeq // Mus musculus keratin 77 (Krt77), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:101858732:101869705:-1 gene:ENSMUSG00000067594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107395 // GenBank // Mus musculus keratin 77, mRNA (cDNA clone MGC:130400 IMAGE:40058152), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107396 // GenBank // Mus musculus keratin 77, mRNA (cDNA clone MGC:130401 IMAGE:40058154), complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC141259 // GenBank // Mus musculus keratin 77, mRNA (cDNA clone MGC:176220 IMAGE:9055871), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101859856:101883491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033177 // RefSeq // Mus musculus keratin 76 (Krt76), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100179 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:101884351:101892920:-1 gene:ENSMUSG00000075402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101884817:101964932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_008475 // RefSeq // Mus musculus keratin 4 (Krt4), mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101918536:101924735:-1 gene:ENSMUSG00000059668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC145839 // GenBank // Mus musculus keratin 4, mRNA (cDNA clone MGC:175726 IMAGE:40131142), complete cds. // chr15 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC145841 // GenBank // Mus musculus keratin 4, mRNA (cDNA clone MGC:175728 IMAGE:40131144), complete cds. // chr15 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// X03491 // GenBank // Mouse mRNA for type II 57 kd keratin. // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101884817:101964932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_146063 // RefSeq // Mus musculus keratin 79 (Krt79), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000023799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:101929332:101940324:-1 gene:ENSMUSG00000061397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC019155 // GenBank // Mus musculus keratin 79, mRNA (cDNA clone MGC:29391 IMAGE:5065687), complete cds. // chr15 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// BC031593 // GenBank // Mus musculus keratin 79, mRNA (cDNA clone MGC:36907 IMAGE:4935395), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101884817:101964932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_212487 // RefSeq // Mus musculus keratin 78 (Krt78), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006521115 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin 78 (Krt78), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000164932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101946004:101954287:-1 gene:ENSMUSG00000050463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC119600 // GenBank // Mus musculus keratin 78, mRNA (cDNA clone IMAGE:40059477), partial cds. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:101884817:101964932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_031170 // RefSeq // Mus musculus keratin 8 (Krt8), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000023952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:101996711:102004342:-1 gene:ENSMUSG00000049382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC094009 // GenBank // Mus musculus keratin 8, mRNA (cDNA clone MGC:103331 IMAGE:4987971), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC106154 // GenBank // Mus musculus keratin 8, mRNA (cDNA clone MGC:118110 IMAGE:3994432), complete cds. // chr15 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// M21836 // GenBank // Mouse extra-embryonic endodermal cytokeratin type II (EndoA) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// M22831 // GenBank // Mouse keratin type II (EndoA) mRNA, complete cds. // chr15 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0
NM_001033277 // RefSeq // Mus musculus SPRY domain containing 3 (Spryd3), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:102118169:102128884:-1 gene:ENSMUSG00000036966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr15 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000139279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:102116528:102136192:-1 gene:ENSMUSG00000036966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000154032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:15:102116528:102136234:-1 gene:ENSMUSG00000036966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK146689 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920042B03 product:hypothetical SPla/RYanodine receptor SPRY/Gonadotropin-releasing hormone containing protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:102117579:102136213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_144942 // RefSeq // Mus musculus cysteine sulfinic acid decarboxylase (Csad), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006521001 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cysteine sulfinic acid decarboxylase (Csad), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006521003 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cysteine sulfinic acid decarboxylase (Csad), transcript variant X7, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000023805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:102176998:102189043:-1 gene:ENSMUSG00000023044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY033912 // GenBank // Mus musculus cysteine sulfinic acid decarboxylase mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:102177613:102197238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_013566 // RefSeq // Mus musculus integrin beta 7 (Itgb7), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000001327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:102215995:102231935:-1 gene:ENSMUSG00000001281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC011184 // GenBank // Mus musculus integrin beta 7, mRNA (cDNA clone MGC:18486 IMAGE:4187781), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M68903 // GenBank // Mouse integrin beta-7 subunit mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// M95632 // GenBank // Mouse integrin beta-7 subunit mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M95633 // GenBank // Mouse integrin beta-7 subunit mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:102216160:102271026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001042727 // RefSeq // Mus musculus retinoic acid receptor, gamma (Rarg), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000063339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:102234940:102246500:-1 gene:ENSMUSG00000001288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// BC013709 // GenBank // Mus musculus retinoic acid receptor, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:18523 IMAGE:3989967), complete cds. // chr15 // 81 // 71 // 22 // 27 // 0 /// M34475 // GenBank // Mouse retinoic acid receptor gamma (RAR-gamma-B) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 71 // 26 // 27 // 0 /// M34476 // GenBank // Mouse retinoic acid receptor gamma (mRAR-gamma-A) mRNA, complete cds. // chr15 // 91 // 84 // 29 // 32 // 0 /// NM_011244 // RefSeq // Mus musculus retinoic acid receptor, gamma (Rarg), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 92 // 92 // 35 // 38 // 1 /// ENSMUST00000043172 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:102234938:102257517:-1 gene:ENSMUSG00000001288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 92 // 35 // 38 // 1 /// BC012923 // GenBank // Mus musculus retinoic acid receptor, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:11555 IMAGE:3154037), complete cds. // chr15 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// ENSMUST00000135466 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:102239989:102257349:-1 gene:ENSMUSG00000001288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1 /// GENSCAN00000007812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:102216160:102271026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1
NM_153416 // RefSeq // Mus musculus achalasia, adrenocortical insufficiency, alacrimia (Aaas), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000041208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:102338247:102350759:-1 gene:ENSMUSG00000036678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC018191 // GenBank // Mus musculus achalasia, adrenocortical insufficiency, alacrimia, mRNA (cDNA clone MGC:25579 IMAGE:3994248), complete cds. // chr15 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC025501 // GenBank // Mus musculus achalasia, adrenocortical insufficiency, alacrimia, mRNA (cDNA clone MGC:38135 IMAGE:5321013), complete cds. // chr15 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC026604 // GenBank HTC // Mus musculus achalasia, adrenocortical insufficiency, alacrimia, mRNA (cDNA clone IMAGE:4976338), with apparent retained intron. // chr15 // 90 // 94 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:102338813:102352234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_130458 // RefSeq // Mus musculus Sp7 transcription factor 7 (Sp7), mRNA. // chr15 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000078508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:102356609:102366325:-1 gene:ENSMUSG00000060284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF184902 // GenBank // Mus musculus Osterix (C22) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AY803733 // GenBank // Mus musculus osterix (Sp7) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC113150 // GenBank // Mus musculus Sp7 transcription factor 7, mRNA (cDNA clone MGC:130562 IMAGE:40054399), complete cds. // chr15 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:102358137:102376944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000096143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:102528636:102529025:-1 gene:ENSMUSG00000099083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000071584 // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184616 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:15:102528636:102625450:-1 gene:ENSMUSG00000099083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK170250 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630037N13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083177 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:102627779:102627885:-1 gene:ENSMUSG00000065111 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030460 // RefSeq // Mus musculus microRNA 688 (Mir688), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102055 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:102671792:102671866:-1 gene:ENSMUSG00000076009 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:102665801:102672352:-1 gene:ENSMUSG00000062683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-688 // miRBase Micro RNA Database // MI0004653 Mus musculus miR-688 stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026192 // RefSeq // Mus musculus calcium binding and coiled coil domain 1 (Calcoco1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:15:102706779:102722178:-1 gene:ENSMUSG00000023055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000166943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:102710225:102715796:-1 gene:ENSMUSG00000023055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr15 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000168112 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:102706972:102709902:-1 gene:ENSMUSG00000023055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000171838 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:15:102707585:102722131:-1 gene:ENSMUSG00000023055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY131329 // GenBank // Mus musculus coiled-coil transcriptional coactivator (Cocoa) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC054783 // GenBank // Mus musculus calcium binding and coiled coil domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:65614 IMAGE:6815943), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:102707369:102742790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
AK135985 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420444D23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003062 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK019974 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730585A16 product:inferred: putative [Mus musculus], full insert sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003063 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027885 // RefSeq // Mus musculus single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase (Smug1), mRNA. // chr15 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000064067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:103153307:103158002:-1 gene:ENSMUSG00000036061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 39 // 15 // 15 // 0 /// BC050253 // GenBank // Mus musculus single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, mRNA (cDNA clone MGC:57026 IMAGE:6467286), complete cds. // chr15 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// BC062960 // GenBank // Mus musculus single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, mRNA (cDNA clone MGC:86151 IMAGE:30612187), complete cds. // chr15 // 96 // 68 // 25 // 26 // 0 /// XM_006521414 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase (Smug1), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// AK045411 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230114N06 product:single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, full insert sequence. // chr15 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// GENSCAN00000005942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:103155653:103168815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT025166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr15 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
NM_030720 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 84 (Gpr84), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006521554 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 84 (Gpr84), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000079824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:103308236:103310438:-1 gene:ENSMUSG00000063234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF272948 // GenBank // Mus musculus orphan G protein-coupled receptor 84 (Gpr84) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC023249 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 84, mRNA (cDNA clone MGC:30824 IMAGE:3995193), complete cds. // chr15 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:103308458:103309648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0
NM_013866 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 385A (Zfp385a), mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006521055 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 385A (Zfp385a), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// XM_006521056 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 385A (Zfp385a), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000168828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:103313895:103340086:-1 gene:ENSMUSG00000000552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AF118566 // GenBank // Mus musculus hematopoietic zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr15 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// BC017644 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 385A, mRNA (cDNA clone MGC:28982 IMAGE:4504518), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000005859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:103314995:103333151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0
NM_010577 // RefSeq // Mus musculus integrin alpha 5 (fibronectin receptor alpha) (Itga5), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:103344289:103366763:-1 gene:ENSMUSG00000000555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC050943 // GenBank // Mus musculus integrin alpha 5 (fibronectin receptor alpha), mRNA (cDNA clone MGC:63321 IMAGE:6821577), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC053431 // GenBank // Mus musculus integrin alpha 5 (fibronectin receptor alpha), mRNA (cDNA clone IMAGE:6504815), partial cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC059829 // GenBank // Mus musculus integrin alpha 5 (fibronectin receptor alpha), mRNA (cDNA clone MGC:69620 IMAGE:6821577), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// X79003 // GenBank // M.musculus mRNA for integrin alpha 5 subunit. // chr15 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:103338807:103366526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
XM_006520888 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC048502 (BC048502), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000065978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:103438965:103448459:-1 gene:ENSMUSG00000053508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC048502 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC048502, mRNA (cDNA clone MGC:58362 IMAGE:6740942), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:103439080:103444630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0
GENSCAN00000005931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:103446124:103448470:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_021391 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 1A (Ppp1r1a), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006521219 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 1A (Ppp1r1a), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000023133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:103530279:103537992:-1 gene:ENSMUSG00000022490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF281676 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase inhibitor-1 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC025123 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 1A, mRNA (cDNA clone MGC:35872 IMAGE:4019442), complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:103530944:103537878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_001289587 // RefSeq // Mus musculus glycosylation dependent cell adhesion molecule 1 (Glycam1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_008134 // RefSeq // Mus musculus glycosylation dependent cell adhesion molecule 1 (Glycam1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:103562762:103565078:-1 gene:ENSMUSG00000022491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145548 // GenBank // Mus musculus glycosylation dependent cell adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:179120 IMAGE:9054112), complete cds. // chr15 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC145832 // GenBank // Mus musculus glycosylation dependent cell adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:175719 IMAGE:40131135), complete cds. // chr15 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC145858 // GenBank // Mus musculus glycosylation dependent cell adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:175745 IMAGE:40131161), complete cds. // chr15 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// M93428 // GenBank // Mouse endothelial ligand for L-selectin (GLYCAM1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:103562884:103565031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
GENSCAN00000005934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:103587204:103589866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000078842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:103753607:103755437:-1 gene:ENSMUSG00000060311 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr15 // 91 // 52 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000005862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:103753372:103755439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0
NM_009267 // RefSeq // Mus musculus salivary protein 1 (Spt1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000037685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:103895859:103899312:-1 gene:ENSMUSG00000036925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC106151 // GenBank // Mus musculus salivary protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:118102 IMAGE:4923478), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// M33974 // GenBank // Mouse salivary protein 1 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// X00349 // GenBank // Mouse mRNA for sub-maxillary gland glycoprotein. // chr15 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:103887700:103899241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0
NM_146860 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 161 (Olfr161), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000061541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:3592398:3593339:1 gene:ENSMUSG00000051003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000003665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:3562479:3593339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000179882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:3730510:3731025:1 gene:ENSMUSG00000095834 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_008762 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 15 (Olfr15), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:3838975:3839913:1 gene:ENSMUSG00000059043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:3838975:3839913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081217 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 174 (Zfp174), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000041778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:3847268:3858880:1 gene:ENSMUSG00000054939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147582 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 174, mRNA (cDNA clone MGC:182678 IMAGE:9056572), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC151072 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 174, mRNA (cDNA clone MGC:183985 IMAGE:9087985), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC151078 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 174, mRNA (cDNA clone MGC:183991 IMAGE:9087991), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:3847873:3861224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_031184 // RefSeq // Mus musculus GLIS family zinc finger 2 (Glis2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522768 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GLIS family zinc finger 2 (Glis2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000014447 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:4594713:4615957:1 gene:ENSMUSG00000014303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:4608627:4615942:1 gene:ENSMUSG00000014303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000135577 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:4611410:4613656:1 gene:ENSMUSG00000014303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AF249340 // GenBank // Mus musculus Gli-Kruppel zinc-finger protein NKL (Nkl) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AF325913 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like zinc finger protein GLIS2 (Glis2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC016124 // GenBank HTC // Mus musculus GLIS family zinc finger 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4506253), with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC021517 // GenBank // Mus musculus GLIS family zinc finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:36775 IMAGE:5352352), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006522770 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GLIS family zinc finger 2 (Glis2), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000005055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4593476:4614176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_139307 // RefSeq // Mus musculus vasorin (Vasn), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000038770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:4639941:4650802:1 gene:ENSMUSG00000039646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC050274 // GenBank // Mus musculus vasorin, mRNA (cDNA clone MGC:31341 IMAGE:4235141), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_030192 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930562C15 gene (4930562C15Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006522751 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930562C15 gene (4930562C15Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006522752 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930562C15 gene (4930562C15Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000100211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:4835416:4867691:1 gene:ENSMUSG00000022518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000175836 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:4841107:4852129:1 gene:ENSMUSG00000022518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:non_stop_decay // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000177042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:4835416:4852123:1 gene:ENSMUSG00000022518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:non_stop_decay // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK019778 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930562C15 product:hypothetical Alanine-rich region/Type I antifreeze protein containing protein, full insert sequence. // chr16 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// AK133365 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932702E07 product:hypothetical Prefoldin containing protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000004992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4835589:4867613:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
XM_006521838 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mahogunin, ring finger 1 (Mgrn1), transcript variant X8, mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// AK034100 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330156J07 product:mahogunin, ring finger 1, full insert sequence. // chr16 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// NM_001252437 // RefSeq // Mus musculus mahogunin, ring finger 1 (Mgrn1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// NM_029657 // RefSeq // Mus musculus mahogunin, ring finger 1 (Mgrn1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// ENSMUST00000023159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:4886100:4938296:1 gene:ENSMUSG00000022517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// ENSMUST00000070658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:4886100:4938296:1 gene:ENSMUSG00000022517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// BC046830 // GenBank // Mus musculus mahogunin, ring finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:61217 IMAGE:6811606), complete cds. // chr16 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// XM_006521837 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mahogunin, ring finger 1 (Mgrn1), transcript variant X7, mRNA. // chr16 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1 /// GENSCAN00000005126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4886386:4940417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1
NM_025839 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16-like 1 (Nudt16l1), mRNA. // chr16 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// ENSMUST00000050881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:4939111:4941020:1 gene:ENSMUSG00000022516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// AF435792 // GenBank // Mus musculus syndesmos mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// BC025569 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:35707 IMAGE:5322456), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC028494 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:41032 IMAGE:1511165), complete cds. // chr16 // 89 // 56 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000005126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4886386:4940417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NR_073370 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930451G09 gene (4930451G09Rik), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000090457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:4968936:4978962:1 gene:ENSMUSG00000022543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// GENSCAN00000009041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4965538:4977738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0
NM_026666 // RefSeq // Mus musculus ubinuclein 1 (Ubn1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006521818 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubinuclein 1 (Ubn1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000052449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:5050068:5086285:1 gene:ENSMUSG00000039473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC098372 // GenBank // Mus musculus ubinuclein 1, mRNA (cDNA clone MGC:102206 IMAGE:30363389), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AK137727 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930118B04 product:ubinuclein 1, full insert sequence. // chr16 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// GENSCAN00000009057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:5047245:5084127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0
NM_001127725 // RefSeq // Mus musculus SEC14-like 5 (S. cerevisiae) (Sec14l5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006522465 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SEC14-like 5 (S. cerevisiae) (Sec14l5), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006522466 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SEC14-like 5 (S. cerevisiae) (Sec14l5), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000165810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:5147109:5183934:1 gene:ENSMUSG00000091712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC157907 // GenBank // Mus musculus SEC14-like 5 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189922 IMAGE:9088109), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC157990 // GenBank // Mus musculus SEC14-like 5 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189804 IMAGE:9007304), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:5147786:5183802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_145362 // RefSeq // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 1 (beta-1,4-mannosyltransferase) (Alg1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000049207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:5233638:5244912:1 gene:ENSMUSG00000039427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000100196 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:5233621:5244903:1 gene:ENSMUSG00000039427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000147530 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:5235170:5240518:1 gene:ENSMUSG00000039427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000142902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:5240074:5243724:1 gene:ENSMUSG00000039427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// ENSMUST00000153730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:5233638:5239738:1 gene:ENSMUSG00000039427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000009032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:5233650:5244626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT025313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT025314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_146247 // RefSeq // Mus musculus methyltransferase like 22 (Mettl22), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000046470 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:8470788:8490684:1 gene:ENSMUSG00000039345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000142899 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:8470804:8484331:1 gene:ENSMUSG00000039345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC024814 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC024814, mRNA (cDNA clone MGC:38788 IMAGE:5359405), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000150790 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:8470791:8488682:1 gene:ENSMUSG00000039345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// ENSMUST00000133208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:8486834:8490196:1 gene:ENSMUSG00000039345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// ENSMUST00000151233 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:8485566:8488843:1 gene:ENSMUSG00000039345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000041362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:8456087:8618626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_001081400 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810013L24 gene (1810013L24Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000023150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:8830100:8858916:1 gene:ENSMUSG00000022507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC116778 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810013L24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151155 IMAGE:40126097), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC116780 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810013L24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151157 IMAGE:40126099), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC038008 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810013L24 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:2649284). // chr16 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000041360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:8830460:8856038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000182616 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:10044965:10045730:1 gene:ENSMUSG00000098100 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:10009861:10083611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT025448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_026594 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L39-like (Rpl39l), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522506 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribosomal protein L39-like (Rpl39l), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:10170228:10174911:1 gene:ENSMUSG00000039209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121292 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:10170226:10174630:1 gene:ENSMUSG00000039209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC023885 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L39-like, mRNA (cDNA clone MGC:35636 IMAGE:5151514), complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC051469 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L39-like, mRNA (cDNA clone MGC:62886 IMAGE:1363159), complete cds. // chr16 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0
NM_153123 // RefSeq // Mus musculus activating transcription factor 7 interacting protein 2 (Atf7ip2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:10192712:10243051:1 gene:ENSMUSG00000039200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC018510 // GenBank // Mus musculus activating transcription factor 7 interacting protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:2645293), complete cds. // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
ENSMUST00000181721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:10835068:10892966:1 gene:ENSMUSG00000037991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK080331 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630055G03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000157918 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:10994386:10994569:1 gene:ENSMUSG00000088543 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONMMUT025482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
AK136598 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230002O09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009223 // RefSeq // Mus musculus stannin (Snn), mRNA. // chr16 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:11066298:11074983:1 gene:ENSMUSG00000037972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC006961 // GenBank // Mus musculus stannin, mRNA (cDNA clone MGC:12052 IMAGE:3707801), complete cds. // chr16 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC017685 // GenBank // Mus musculus stannin, mRNA (cDNA clone MGC:18912 IMAGE:4241981), complete cds. // chr16 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC038475 // GenBank // Mus musculus stannin, mRNA (cDNA clone MGC:46951 IMAGE:3157762), complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC063027 // GenBank // Mus musculus stannin, mRNA (cDNA clone MGC:54760 IMAGE:5343626), complete cds. // chr16 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC087932 // GenBank // Mus musculus stannin, mRNA (cDNA clone MGC:107297 IMAGE:6706156), complete cds. // chr16 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONMMUT025487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr16 // 89 // 25 // 8 // 9 // 0
NM_011608 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 17 (Tnfrsf17), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023140 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:11313812:11320074:1 gene:ENSMUSG00000022496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF061505 // GenBank // Mus musculus B-cell maturation protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC027519 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 17, mRNA (cDNA clone MGC:41134 IMAGE:1349977), complete cds. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000001192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:11315282:11355943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_028964 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 29 (Snx29), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006522668 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexin 29 (Snx29), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000115814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:11322972:11403836:1 gene:ENSMUSG00000071669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000180792 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:11322908:11755472:1 gene:ENSMUSG00000071669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000001213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:11367723:11415996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000001192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:11315282:11355943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NR_033509 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9961 (Gm9961), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068397 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:11901363:11930600:1 gene:ENSMUSG00000055015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181860 // RefSeq // Mus musculus MKL/myocardin-like 2 (Mkl2), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:13265076:13332919:1 gene:ENSMUSG00000009569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:13256506:13332922:1 gene:ENSMUSG00000009569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028459 // GenBank // Mus musculus MKL/myocardin-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:1247408), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X66901 // GenBank // M.musculus En-2/lacZ junction mRNA (Gt4-1). // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NM_001122667 // RefSeq // Mus musculus MKL/myocardin-like 2 (Mkl2), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000009713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:13256481:13415063:1 gene:ENSMUSG00000009569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001122667 // RefSeq // Mus musculus MKL/myocardin-like 2 (Mkl2), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_153588 // RefSeq // Mus musculus MKL/myocardin-like 2 (Mkl2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000009713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:13256481:13415063:1 gene:ENSMUSG00000009569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000149359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:13358421:13417529:1 gene:ENSMUSG00000009569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF532598 // GenBank // Mus musculus myocardin-related transcription factor B (Mrtf-B) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC131644 // GenBank // Mus musculus MKL/myocardin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:150100 IMAGE:40110019), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:13345094:13412695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_001122667 // RefSeq // Mus musculus MKL/myocardin-like 2 (Mkl2), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_153588 // RefSeq // Mus musculus MKL/myocardin-like 2 (Mkl2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:13358421:13417529:1 gene:ENSMUSG00000009569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029855 // RefSeq // Mus musculus microRNA 365-1 (Mir365-1), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000083515 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:13453840:13453926:1 gene:ENSMUSG00000065449 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// mmu-mir-365-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000768 Mus musculus miR-365-1 stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT025550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001039521 // RefSeq // Mus musculus RRN3 RNA polymerase I transcription factor homolog (yeast) (Rrn3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000023363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:13780699:13814840:1 gene:ENSMUSG00000022682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK080680 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830089A07 product:RRN3 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// BC138774 // GenBank // Mus musculus RRN3 RNA polymerase I transcription factor homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:170401 IMAGE:8861796), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC138776 // GenBank // Mus musculus RRN3 RNA polymerase I transcription factor homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:170403 IMAGE:8861798), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:13771933:13813272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0
NM_144518 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2900011O08 gene (2900011O08Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006522482 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2900011O08 gene (2900011O08Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000056521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:13986604:14101500:1 gene:ENSMUSG00000044117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000118412 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:13986657:14100228:1 gene:ENSMUSG00000044117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000131608 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:13986674:14095987:1 gene:ENSMUSG00000044117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC022741 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900011O08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:31632 IMAGE:4511454), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:14061879:14100666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NR_030252 // RefSeq // Mus musculus microRNA 484 (Mir484), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093566 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:14159626:14159692:1 gene:ENSMUSG00000070074 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-484 // miRBase Micro RNA Database // MI0003491 Mus musculus miR-484 stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000164528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:14502100:14509199:1 gene:ENSMUSG00000090808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:14502100:14530954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_033556 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A630010A05 gene (A630010A05Rik), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000100165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:14589209:14621286:1 gene:ENSMUSG00000075395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000129643 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:14562316:14621278:1 gene:ENSMUSG00000075395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000147024 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:14580221:14621300:1 gene:ENSMUSG00000075395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AK139693 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020011F14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT025614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_011415 // RefSeq // Mus musculus snail family zinc finger 2 (Snai2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:14705852:14709395:1 gene:ENSMUSG00000022676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062164 // GenBank // Mus musculus snail homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:70074 IMAGE:30242610), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U79550 // GenBank // Mus musculus Slug zinc finger protein (Slugh) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// U97059 // GenBank // Mus musculus Slug mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:14705974:14713381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_025769 // RefSeq // Mus musculus EF hand calcium binding domain 1 (Efcab1), mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000090277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:14906637:14925879:1 gene:ENSMUSG00000068617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK015866 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930522A05 product:RIKEN cDNA 5430404L10 gene, full insert sequence. // chr16 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC085167 // GenBank // Mus musculus EF hand calcium binding domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:96310 IMAGE:30538702), complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006522474 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF hand calcium binding domain 1 (Efcab1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// XM_006522475 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF hand calcium binding domain 1 (Efcab1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// XR_384590 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF hand calcium binding domain 1 (Efcab1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr16 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// XR_384591 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF hand calcium binding domain 1 (Efcab1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// AK015426 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930449A16 product:RIKEN cDNA 5430404L10 gene, full insert sequence. // chr16 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// AK042748 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730020N01 product:RIKEN cDNA 5430404L10 gene, full insert sequence. // chr16 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000021714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:14906755:14924142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000121314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:15426151:15427204:1 gene:ENSMUSG00000080704 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_011159 // RefSeq // Mus musculus protein kinase, DNA activated, catalytic polypeptide (Prkdc), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 87 // 87 // 0 /// ENSMUST00000023352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:15637889:15842235:1 gene:ENSMUSG00000022672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 87 // 87 // 0 /// ENSMUST00000182134 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:15637866:15684749:1 gene:ENSMUSG00000022672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 25 // 22 // 22 // 0 /// AB007544 // GenBank // Mus musculus DNA-PKcs(Prkds) mRNA for DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, complete cds. // chr16 // 100 // 99 // 86 // 86 // 0 /// AB011543 // GenBank // Mus musculus mRNA for DNA-PKcs, complete cds. // chr16 // 99 // 99 // 85 // 86 // 0 /// AK084827 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330049F08 product:protein kinase, DNA activated, catalytic polypeptide, full insert sequence. // chr16 // 100 // 25 // 22 // 22 // 0 /// D87521 // GenBank // Mus musculus DNA-PKcs mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 87 // 87 // 0 /// GENSCAN00000021710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:15651462:15841975:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 99 // 78 // 67 // 68 // 0
NM_007679 // RefSeq // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), delta (Cebpd), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:15887286:15888466:1 gene:ENSMUSG00000071637 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AK149723 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530013D06 product:CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), delta, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139293 // GenBank // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), delta, mRNA (cDNA clone MGC:170920 IMAGE:8862315), complete cds. // chr16 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// X61800 // GenBank // M.musculus mRNA for C/EBP delta. // chr16 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_026163 // RefSeq // Mus musculus plakophilin 2 (Pkp2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000039408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:16213318:16272712:1 gene:ENSMUSG00000041957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC068279 // GenBank // Mus musculus plakophilin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6436123), partial cds. // chr16 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// BC138252 // GenBank // Mus musculus plakophilin 2, mRNA (cDNA clone MGC:169876 IMAGE:8861271), complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC138253 // GenBank // Mus musculus plakophilin 2, mRNA (cDNA clone MGC:169877 IMAGE:8861272), complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000161342 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:16213318:16248489:1 gene:ENSMUSG00000041957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// AK004731 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1200012P04 product:weakly similar to PLAKOPHILIN 2 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000044431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:16213373:16272237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_176833 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1F (PP2C domain containing) (Ppm1f), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000027373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:16896469:16927364:1 gene:ENSMUSG00000026181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000145978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:16896574:16915194:1 gene:ENSMUSG00000026181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC042570 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1F (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone MGC:25978 IMAGE:4241448), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:16877947:16924022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
ENSMUST00000160015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:16542323:16542742:1 gene:ENSMUSG00000089861 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 52 // 93 // 13 // 25 // 0 /// NONMMUT025641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 52 // 93 // 13 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:16968609:17084602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001038663 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 1 (Mapk1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NM_011949 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 1 (Mapk1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000069107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:16983382:17047453:1 gene:ENSMUSG00000063358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000115731 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:16983567:17039040:1 gene:ENSMUSG00000063358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128958 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:17035338:17038705:1 gene:ENSMUSG00000063358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// D10939 // GenBank // Mus musculus mRNA for ERK2, complete cds. // chr16 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000023462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:16983382:17044749:1 gene:ENSMUSG00000063358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// BC058258 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:65270 IMAGE:6468233), complete cds. // chr16 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1 /// ENSMUST00000129477 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:17026366:17043863:1 gene:ENSMUSG00000063358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// GENSCAN00000040734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:16968609:17084602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1
NM_001033338 // RefSeq // Mus musculus RIMS binding protein 3 (Rimbp3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:17208135:17213921:1 gene:ENSMUSG00000071636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC141386 // GenBank // Mus musculus RIMS binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:176348 IMAGE:9055999), complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17201328:17213534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_178922 // RefSeq // Mus musculus hypermethylated in cancer 2 (Hic2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522431 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hypermethylated in cancer 2 (Hic2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000090190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:17233572:17263430:1 gene:ENSMUSG00000050240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17233664:17261595:1 gene:ENSMUSG00000050240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AJ868292 // GenBank // Mus musculus partial mRNA for hypothetical protein (Hic2 gene). // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC065124 // GenBank // Mus musculus hypermethylated in cancer 2, mRNA (cDNA clone MGC:85994 IMAGE:30537019), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522432 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hypermethylated in cancer 2 (Hic2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_008223 // RefSeq // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade D, member 1 (Serpind1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:17331371:17343575:1 gene:ENSMUSG00000022766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17331383:17343574:1 gene:ENSMUSG00000022766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC034543 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade D, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:18453 IMAGE:4158625), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC089610 // GenBank // Mus musculus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade D, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:107662 IMAGE:6768311), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U07425 // GenBank // Mus musculus BALB/c heparin cofactor II precursor (HCII) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17336311:17343044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_023348 // RefSeq // Mus musculus synaptosomal-associated protein 29 (Snap29), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:17406003:17430826:1 gene:ENSMUSG00000022765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY008722 // GenBank // Mus musculus GS32 (Gs32) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC030066 // GenBank // Mus musculus synaptosomal-associated protein 29, mRNA (cDNA clone MGC:41067 IMAGE:5118167), complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17392680:17428300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_007764 // RefSeq // Mus musculus v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian)-like (Crkl), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000006293 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:17451987:17486255:1 gene:ENSMUSG00000006134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC131984 // GenBank // Mus musculus v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian)-like, mRNA (cDNA clone MGC:163615 IMAGE:40130261), complete cds. // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC131986 // GenBank // Mus musculus v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian)-like, mRNA (cDNA clone MGC:163617 IMAGE:40130263), complete cds. // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NM_001277231 // RefSeq // Mus musculus v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian)-like (Crkl), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// BC023080 // GenBank // Mus musculus v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian)-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:5355496), complete cds. // chr16 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17438344:17525793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001159561 // RefSeq // Mus musculus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 6 (P2rx6), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_011028 // RefSeq // Mus musculus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 6 (P2rx6), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006521856 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 6 (P2rx6), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000023441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:17561885:17572011:1 gene:ENSMUSG00000022758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000168383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17561933:17577800:1 gene:ENSMUSG00000022758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000171002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:17561885:17571100:1 gene:ENSMUSG00000022758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AB010883 // GenBank // Mus musculus mRNA for mP2XM receptor, complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK054195 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230027A21 product:purinergic receptor P2X-like 1, orphan receptor, full insert sequence. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC117713 // GenBank // Mus musculus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 6, mRNA (cDNA clone MGC:141601 IMAGE:40088045), complete cds. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17562044:17570965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0
XM_006522039 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch-like 22 (Klhl22), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000117192 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17759671:17793380:1 gene:ENSMUSG00000022750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120488 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17762791:17793382:1 gene:ENSMUSG00000022750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC005800 // GenBank // Mus musculus kelch-like 22 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:6948 IMAGE:2812589), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_145479 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 22 (Klhl22), mRNA. // chr16 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000165790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:17759621:17793380:1 gene:ENSMUSG00000022750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000144116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17759663:17779206:1 gene:ENSMUSG00000022750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// AK086748 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930049E12 product:hypothetical BTB/POZ domain containing protein, full insert sequence. // chr16 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000040699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17734167:17792791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_153790 // RefSeq // Mus musculus scavenger receptor class F, member 2 (Scarf2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000012161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:17797282:17808287:1 gene:ENSMUSG00000012017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB024432 // GenBank // Mus musculus mRNA for NSR1, chromosome 16, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF522197 // GenBank // Mus musculus scavenger receptor type F mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK142378 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430027G05 product:scavenger receptor class F, member 2, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK170331 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630048A17 product:scavenger receptor class F, member 2, full insert sequence. // chr16 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC060084 // GenBank // Mus musculus scavenger receptor class F, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6402375), partial cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC139758 // GenBank // Mus musculus scavenger receptor class F, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:149931 IMAGE:40047931), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000040700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17797379:17807584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NR_027959 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA B830017H08 gene (B830017H08Rik), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_009435 // RefSeq // Mus musculus testis-specific serine kinase 1 (Tssk1), mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000046937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:17894203:17895651:1 gene:ENSMUSG00000041566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC050772 // GenBank // Mus musculus testis-specific serine kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:58326 IMAGE:6772455), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// U01840 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase (tsk-1) mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17894353:17895450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0
NM_009436 // RefSeq // Mus musculus testis-specific serine kinase 2 (Tssk2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:17898637:17900023:1 gene:ENSMUSG00000045521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF019926 // GenBank // Mus musculus protein kinase (tssk-2) mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC049618 // GenBank // Mus musculus testis-specific serine kinase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6773689). // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061175 // GenBank // Mus musculus testis-specific serine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:74312 IMAGE:6772604), complete cds. // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17898735:17899811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
NM_016983 // RefSeq // Mus musculus pre-B lymphocyte gene 2 (Vpreb2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000075371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:17980565:17981080:1 gene:ENSMUSG00000059280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000006630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17980565:17981080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
AK133147 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931402P21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK161355 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930458E09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003093 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003094 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022982 // RefSeq // Mus musculus reticulon 4 receptor (Rtn4r), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059589 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:18127642:18152408:1 gene:ENSMUSG00000043811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF283462 // GenBank // Mus musculus Nogo receptor mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052317 // GenBank // Mus musculus reticulon 4 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:54506 IMAGE:6397765), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058381 // GenBank // Mus musculus reticulon 4 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:66902 IMAGE:6829861), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:18148405:18154155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0
ENSMUST00000158419 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:18355616:18355763:1 gene:ENSMUSG00000089044 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184340 // ENSEMBL // proj_ncrna:novel chromosome:GRCm38:MG3833_PATCH:18355616:18355763:1 gene:ENSMUSG00000099333 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_384924 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein Bop-like (LOC102638012), misc_RNA. // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000146673 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:18498901:18501658:1 gene:ENSMUSG00000086965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// BC029862 // GenBank HTC // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 1-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:3711057), with apparent retained intron. // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:18426063:18501462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XR_384720 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930588K23 gene (4930588K23Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr16 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000156827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:18591992:18609751:1 gene:ENSMUSG00000075335 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK133126 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930588K23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_384718 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638925 (LOC102638925), ncRNA. // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONMMUT025775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT025774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_013805 // RefSeq // Mus musculus claudin 5 (Cldn5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000043577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:18776847:18778260:1 gene:ENSMUSG00000041378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF035814 // GenBank // Mus musculus BEC1 protein (Bec1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF087823 // GenBank // Mus musculus claudin-5 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC002016 // GenBank // Mus musculus claudin 5, mRNA (cDNA clone MGC:5820 IMAGE:3488769), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083341 // GenBank // Mus musculus claudin 5, mRNA (cDNA clone MGC:102088 IMAGE:6819173), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U82758 // GenBank // Mus musculus lung-specific membrane protein mRNA, complete cds. // chr16 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:18776996:18777652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001033164 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2510002D24 gene (2510002D24Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000055413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:18836578:18840160:1 gene:ENSMUSG00000071632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000190776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:18836655:18839800:1 gene:ENSMUSG00000071632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000191388 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:18836581:18840045:1 gene:ENSMUSG00000071632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000074116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19028232:19028654:1 gene:ENSMUSG00000060811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000045232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19028232:19028654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000102440 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:82408458:82408543:1 gene:ENSMUSG00000076395 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000103823 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:19319686:19319795:1 gene:ENSMUSG00000095529 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000179918 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:60174317:60174426:1 gene:ENSMUSG00000094901 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT024376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT025793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT032519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_147068 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 166 (Olfr166), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000074739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19486793:19487830:1 gene:ENSMUSG00000056822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC116856 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 166, mRNA (cDNA clone MGC:151233 IMAGE:40126175), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC119189 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 166, mRNA (cDNA clone MGC:155505 IMAGE:8733938), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19486840:19487778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000183270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:19723312:19723978:1 gene:ENSMUSG00000097945 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19723472:19770163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_029436 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 24 (Klhl24), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:20097554:20127744:1 gene:ENSMUSG00000062901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20093953:20229587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001033237 // RefSeq // Mus musculus YEATS domain containing 2 (Yeats2), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NM_001145930 // RefSeq // Mus musculus YEATS domain containing 2 (Yeats2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006521906 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus YEATS domain containing 2 (Yeats2), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000090052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:20141063:20232573:1 gene:ENSMUSG00000041215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000115560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:20141063:20232573:1 gene:ENSMUSG00000041215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC150944 // GenBank // Mus musculus YEATS domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:183855 IMAGE:9087855), complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC172099 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054385. // chr16 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// AK122463 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1197 protein. // chr16 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// NM_001145931 // RefSeq // Mus musculus YEATS domain containing 2 (Yeats2), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000039297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20093953:20229587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1
NM_172265 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 5 epsilon (Eif2b5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006522046 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 5 epsilon (Eif2b5), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000003320 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:20498817:20509955:1 gene:ENSMUSG00000003235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000148714 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:20506398:20509323:1 gene:ENSMUSG00000003235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC038620 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 5 epsilon, mRNA (cDNA clone MGC:47035 IMAGE:4211776), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC085255 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 5 epsilon, mRNA (cDNA clone MGC:103029 IMAGE:5342410), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20498914:20509020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0
NM_007889 // RefSeq // Mus musculus dishevelled 3, dsh homolog (Drosophila) (Dvl3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006521778 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dishevelled 3, dsh homolog (Drosophila) (Dvl3), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000003318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:20516982:20531650:1 gene:ENSMUSG00000003233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000171572 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:20517064:20532520:1 gene:ENSMUSG00000003233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000171774 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:20517106:20531646:1 gene:ENSMUSG00000003233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// U41285 // GenBank // Mus musculus dishevelled-3 (Dvl-3) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000169552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20517186:20525319:1 gene:ENSMUSG00000003233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// AK220155 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0208 protein. // chr16 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// BC033414 // GenBank HTC // Mus musculus dishevelled 3, dsh homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5361364), with apparent retained intron. // chr16 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000039307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20517195:20531516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT025843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_013852 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20), member 3 (Abcf3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006522206 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20), member 3 (Abcf3), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000003319 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:20548577:20561379:1 gene:ENSMUSG00000003234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000148679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20559657:20560818:1 gene:ENSMUSG00000003234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000152339 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20549668:20551669:1 gene:ENSMUSG00000003234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 83 // 29 // 10 // 12 // 0 /// ENSMUST00000154660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20550577:20558873:1 gene:ENSMUSG00000003234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 40 // 17 // 17 // 0 /// AK003527 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110007C17 product:similar to CDNA FLJ11198 FIS, CLONE PLACE1007697, WEAKLY SIMILAR TO GCN20 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// BC032923 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:41237 IMAGE:1430389), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000039320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20537661:20560515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 88 // 37 // 42 // 1
NM_182636 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5B2 (Vwa5b2), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000100074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:20589471:20598467:1 gene:ENSMUSG00000046613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000145483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20590090:20592389:1 gene:ENSMUSG00000046613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000149236 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20590146:20598462:1 gene:ENSMUSG00000046613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AK048916 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230081G24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NM_001144953 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5B2 (Vwa5b2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// ENSMUST00000096197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:20589582:20605377:1 gene:ENSMUSG00000046613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// ENSMUST00000159780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20591156:20605374:1 gene:ENSMUSG00000046613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONMMUT025856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000039303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20583109:20605085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
ENSMUST00000046188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20602775:20605377:1 gene:ENSMUSG00000046613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK045595 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230214C04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC110635 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5B2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40059173), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC125016 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5B2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40059171), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NM_001144953 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 5B2 (Vwa5b2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000096197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:20589582:20605377:1 gene:ENSMUSG00000046613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000159780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20591156:20605374:1 gene:ENSMUSG00000046613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONMMUT025857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20583109:20605085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSMUST00000056518 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:20694908:20703048:1 gene:ENSMUSG00000050821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118919 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:20693283:20703044:1 gene:ENSMUSG00000050821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006522739 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 131, member A (Fam131a), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// BC092532 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 131, member A, mRNA (cDNA clone MGC:107212 IMAGE:6594874), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// XM_006522738 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 131, member A (Fam131a), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000128273 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:20696175:20701659:1 gene:ENSMUSG00000050821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000039309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20698946:20701884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSMUST00000083438 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:20745308:20745472:1 gene:ENSMUSG00000065372 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000039306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20733148:20820706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000147052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:21079670:21080666:1 gene:ENSMUSG00000086936 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// NONMMUT025877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0
NM_010143 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor B3 (Ephb3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000006112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:21204755:21223304:1 gene:ENSMUSG00000005958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000159575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:21216817:21223305:1 gene:ENSMUSG00000005958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161063 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:21211095:21222967:1 gene:ENSMUSG00000005958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AK158043 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930020L15 product:Eph receptor B3, full insert sequence. // chr16 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC014822 // GenBank // Mus musculus Eph receptor B3, mRNA (cDNA clone MGC:18409 IMAGE:3673003), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC027805 // GenBank HTC // Mus musculus Eph receptor B3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5322161), with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC053085 // GenBank // Mus musculus Eph receptor B3, mRNA (cDNA clone MGC:62467 IMAGE:5708827), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// X76012 // GenBank // M.musculus Sek-4 mRNA. // chr16 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000051671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:21205170:21222516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_172821 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 (Map3k13), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006522583 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 (Map3k13), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:21891969:21931877:1 gene:ENSMUSG00000033618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ480427 // GenBank // Mus musculus MAP3K13 (Map3k13) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:21898479:21928778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_029457 // RefSeq // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 2 (Senp2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NR_027488 // RefSeq // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 2 (Senp2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000023561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:22009484:22049269:1 gene:ENSMUSG00000022855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AF368904 // GenBank // Mus musculus SUMO-1/Smt3-specific isopeptidase 2 (Smt3ip2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AY188288 // GenBank // Mus musculus SUMO-1 protease-1 (Supr1) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// BC031652 // GenBank // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:35618 IMAGE:3483046), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC040805 // GenBank HTC // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3968550), with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:22016253:22046695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0
NM_027244 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 11 (Ndufa11), mRNA. // chr16 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// XM_006543295 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 4943 (Gm4943), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006543296 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted pseudogene 4943 (Gm4943), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000002452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56717762:56724248:1 gene:ENSMUSG00000002379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSMUST00000132879 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:22053510:22053933:1 gene:ENSMUSG00000068487 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC053075 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:5694421). // chr16 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// BC059729 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 11, mRNA (cDNA clone MGC:74331 IMAGE:6601702), complete cds. // chr16 // 79 // 92 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:22053504:22053935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56719584:56722097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 74 // 73 // 14 // 19 // 0
ENSMUST00000082752 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:22224244:22224351:1 gene:ENSMUSG00000064686 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000178071 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:13:17206021:17206127:1 gene:ENSMUSG00000094754 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONMMUT016480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONMMUT025922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_133706 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 97 (Tmem97), mRNA. // chr16 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSMUST00000103242 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78541817:78550777:-1 gene:ENSMUSG00000037278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSMUST00000121854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:22230391:22230919:1 gene:ENSMUSG00000043870 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC018156 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 97, mRNA (cDNA clone MGC:25841 IMAGE:4192256), complete cds. // chr16 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC093511 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 97, mRNA (cDNA clone MGC:102369 IMAGE:5124076), complete cds. // chr16 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:22230391:22230810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78542537:78550653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0
ENSMUST00000183321 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:22236921:22237315:1 gene:ENSMUSG00000098043 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:22236919:22237309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT025923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_010318 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 5 (Gng5), mRNA. // chr16 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSMUST00000090031 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:3:146499834:146505572:1 gene:ENSMUSG00000068523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSMUST00000118280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:146499890:146505547:1 gene:ENSMUSG00000068523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120931 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:22295027:22295231:1 gene:ENSMUSG00000082241 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC002316 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 5, mRNA (cDNA clone MGC:8292 IMAGE:3593324), complete cds. // chr16 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// BC087872 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 5, mRNA (cDNA clone MGC:107124 IMAGE:6582824), complete cds. // chr16 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119130 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:3:146500109:146505548:1 gene:ENSMUSG00000068523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONMMUT025928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT025929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000011152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:22295027:22359126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001276449 // RefSeq // Mus musculus alpha-2-HS-glycoprotein (Ahsg), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NM_001276450 // RefSeq // Mus musculus alpha-2-HS-glycoprotein (Ahsg), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_013465 // RefSeq // Mus musculus alpha-2-HS-glycoprotein (Ahsg), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_075099 // RefSeq // Mus musculus alpha-2-HS-glycoprotein (Ahsg), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:22892042:22899438:1 gene:ENSMUSG00000022868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC012678 // GenBank // Mus musculus alpha-2-HS-glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:13882 IMAGE:4193595), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC019822 // GenBank // Mus musculus alpha-2-HS-glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:29969 IMAGE:5123689), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:22892115:22905652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001083904 // RefSeq // Mus musculus fetuin beta (Fetub), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_001083905 // RefSeq // Mus musculus fetuin beta (Fetub), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NM_021564 // RefSeq // Mus musculus fetuin beta (Fetub), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000023587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:22920222:22939766:1 gene:ENSMUSG00000022871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000116625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:22920222:22939766:1 gene:ENSMUSG00000022871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000167399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:22921745:22939757:1 gene:ENSMUSG00000022871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000170805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:22918382:22939766:1 gene:ENSMUSG00000022871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AY138459 // GenBank // Mus musculus GUGU alpha (Gugu) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY138460 // GenBank // Mus musculus GUGU beta (Gugu) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC018341 // GenBank // Mus musculus fetuin beta, mRNA (cDNA clone MGC:25848 IMAGE:4194184), complete cds. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:22929076:22939635:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_053176 // RefSeq // Mus musculus histidine-rich glycoprotein (Hrg), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000023590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:22951072:22961656:1 gene:ENSMUSG00000022877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB055897 // GenBank // Mus musculus MMHRG mRNA for histidine-rich glycoprotein, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF194028 // GenBank // Mus musculus histidine-rich glycoprotein (Hrg) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY135662 // GenBank // Mus musculus histidine-rich glycoprotein Hrg (Hrg1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC011168 // GenBank // Mus musculus histidine-rich glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:19088 IMAGE:4195766), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:22951156:22958799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000082946 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:23110383:23110507:1 gene:ENSMUSG00000064880 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000125553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:23109231:23110566:1 gene:ENSMUSG00000022884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT025961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT025963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0
ENSMUST00000082448 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:23111301:23111429:1 gene:ENSMUSG00000064382 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:23110233:23111626:1 gene:ENSMUSG00000022884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000150117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:23110672:23111940:1 gene:ENSMUSG00000022884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT025964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT025966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000083274 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:23111617:23111755:1 gene:ENSMUSG00000065208 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT025967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_009605 // RefSeq // Mus musculus adiponectin, C1Q and collagen domain containing (Adipoq), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:23146536:23158028:1 gene:ENSMUSG00000022878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000171309 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:23146646:23157292:1 gene:ENSMUSG00000022878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// AY749429 // GenBank // Mus musculus C57BL/6J 30 kDa adipocyte complement-related protein (Acdc) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AY754346 // GenBank // Mus musculus 30 KDa adipocyte complement-related protein (Acdc) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC028770 // GenBank // Mus musculus adiponectin, C1Q and collagen domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:41360 IMAGE:1329799), complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// U37222 // GenBank // Mus musculus 30kDa adipocyte complement-related protein Acrp30 mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// U49915 // GenBank // Mus musculus adipocyte specific protein adipoQ (adipoQ) mRNA, complete cds. // chr16 // 79 // 92 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:23135181:23157594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
ENSMUST00000149488 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:23175288:23224446:1 gene:ENSMUSG00000068463 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK046764 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B630019A10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONMMUT025972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC098222 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:1344898. // chr16 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONMMUT025971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001004151 // RefSeq // Mus musculus receptor transporter protein 1 (Rtp1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522112 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus receptor transporter protein 1 (Rtp1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000038730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:23429133:23433960:1 gene:ENSMUSG00000033383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY562225 // GenBank // Mus musculus receptor transporting protein 1 (Rtp1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC138910 // GenBank // Mus musculus receptor transporter protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170537 IMAGE:8861932), complete cds. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC138912 // GenBank // Mus musculus receptor transporter protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170539 IMAGE:8861934), complete cds. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// EU070411 // GenBank // Mus musculus strain B6 receptor-transporting protein 1 short (Rtp1s) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000013910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:23428620:23431678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_023386 // RefSeq // Mus musculus receptor transporter protein 4 (Rtp4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006522491 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus receptor transporter protein 4 (Rtp4), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000038423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:23609919:23614222:1 gene:ENSMUSG00000033355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY562228 // GenBank // Mus musculus receptor transporting protein 4 (Rtp4) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC024872 // GenBank // Mus musculus receptor transporter protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:28210 IMAGE:3990099), complete cds. // chr16 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:23589209:23624133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
AK045341 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130066H02 product:hypothetical Proline-rich region containing protein, full insert sequence. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC005613 // GenBank // Mus musculus LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma, mRNA (cDNA clone IMAGE:3710749). // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029788 // RefSeq // Mus musculus microRNA 28a (Mir28a), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000083560 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:24827855:24827940:1 gene:ENSMUSG00000065494 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-28a // miRBase Micro RNA Database // MI0000690 Mus musculus miR-28 stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT026041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001145952 // RefSeq // Mus musculus LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma (Lpp), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001145954 // RefSeq // Mus musculus LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma (Lpp), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_178665 // RefSeq // Mus musculus LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma (Lpp), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:24393350:24992576:1 gene:ENSMUSG00000033306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:24448091:24992576:1 gene:ENSMUSG00000033306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:24721855:24992576:1 gene:ENSMUSG00000033306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175165 // RefSeq // Mus musculus transformation related protein 63 regulated (Tprg), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056087 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:25286817:25422344:1 gene:ENSMUSG00000048399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:25286821:25318235:1 gene:ENSMUSG00000048399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK017323 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430420C16 product:RIKEN cDNA 5430420C16 gene, full insert sequence. // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:25384909:25422315:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:25283459:25328358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT026053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
AK140112 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230302G16 product:hypothetical Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053241 // RefSeq // Mus musculus claudin 16 (Cldn16), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:26463256:26482763:1 gene:ENSMUSG00000038148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000161053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:26463135:26482765:1 gene:ENSMUSG00000038148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB009016 // GenBank // Mus musculus mRNA for H59D2a protein, complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AF323748 // GenBank // Mus musculus paracellin-1 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC115574 // GenBank // Mus musculus claudin 16, mRNA (cDNA clone MGC:144453 IMAGE:40102178), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC115575 // GenBank // Mus musculus claudin 16, mRNA (cDNA clone MGC:144454 IMAGE:40102179), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:26446218:26482651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_198112 // RefSeq // Mus musculus osteocrin (Ostn), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006522114 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus osteocrin (Ostn), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000066852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:27307489:27351212:1 gene:ENSMUSG00000052276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY395730 // GenBank // Mus musculus osteocrin precursor, mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// AY573932 // GenBank // Mus musculus musclin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC117063 // GenBank // Mus musculus osteocrin, mRNA (cDNA clone MGC:151440 IMAGE:40126382), complete cds. // chr16 // 89 // 63 // 17 // 19 // 0 /// BC117089 // GenBank // Mus musculus osteocrin, mRNA (cDNA clone MGC:151466 IMAGE:40126408), complete cds. // chr16 // 89 // 63 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000017120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:27276045:27333782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NR_033475 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10823 (Gm10823), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003118 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013751 // RefSeq // Mus musculus HRAS-like suppressor (Hrasls), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006522205 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HRAS-like suppressor (Hrasls), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000089824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:29209695:29230531:1 gene:ENSMUSG00000022525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000162747 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:29210108:29228382:1 gene:ENSMUSG00000022525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AB510982 // GenBank // Mus musculus A-C1 mRNA for phospholipase A, complete cds. // chr16 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// AF163095 // GenBank // Mus musculus HRAS suppressor (Hras) mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// BC048482 // GenBank // Mus musculus HRAS-like suppressor, mRNA (cDNA clone MGC:58260 IMAGE:6774856), complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000160794 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:29210130:29228228:1 gene:ENSMUSG00000022525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000042687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:29176869:29228234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT026111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
GENSCAN00000042678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:29671506:29671802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_008235 // RefSeq // Mus musculus hairy and enhancer of split 1 (Drosophila) (Hes1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006521797 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hairy and enhancer of split 1 (Drosophila) (Hes1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000023171 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:30065340:30067796:1 gene:ENSMUSG00000022528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC018375 // GenBank // Mus musculus hairy and enhancer of split 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:25356 IMAGE:4505427), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051428 // GenBank // Mus musculus hairy and enhancer of split 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:58939 IMAGE:6478994), complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:30065591:30067428:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
AK006338 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700025H01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000187479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:30195071:30200299:1 gene:ENSMUSG00000101888 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:30195238:30214239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// KnowTID_00003124 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT026145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONMMUT026146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_177632 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 43, member A (Fam43a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:30599723:30602797:1 gene:ENSMUSG00000046546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099947 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 43, member A, mRNA (cDNA clone MGC:107428 IMAGE:30088416), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138882 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 43, member A, mRNA (cDNA clone MGC:170509 IMAGE:8861904), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC138884 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 43, member A, mRNA (cDNA clone MGC:170511 IMAGE:8861906), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:30600600:30601874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_013900 // RefSeq // Mus musculus antigen p97 (melanoma associated) identified by monoclonal antibodies 133.2 and 96.5 (Mfi2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000023464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:31878810:31899020:1 gene:ENSMUSG00000022780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB024336 // GenBank // Mus musculus mRNA for membrane-bound transferrin-like protein p97, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC040347 // GenBank // Mus musculus antigen p97 (melanoma associated) identified by monoclonal antibodies 133.2 and 96.5, mRNA (cDNA clone MGC:18315 IMAGE:3672916), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:31880080:31917893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_172822 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Z (Pigz), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:31933851:31946046:1 gene:ENSMUSG00000045625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC117748 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Z, mRNA (cDNA clone MGC:143534 IMAGE:40090477), complete cds. // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000134928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:31933982:31942623:1 gene:ENSMUSG00000045625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSMUST00000151412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:31933943:31944348:1 gene:ENSMUSG00000045625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// AK038701 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230056A17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSMUST00000134666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:31941993:31942619:1 gene:ENSMUSG00000045625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000032434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:31924990:31945808:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT026250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONMMUT026251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONMMUT026252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_026554 // RefSeq // Mus musculus nuclear cap binding protein subunit 2 (Ncbp2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000023460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:31948513:31958472:1 gene:ENSMUSG00000022774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000115178 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:31948613:31957176:1 gene:ENSMUSG00000022774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000140965 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:31948601:31957148:1 gene:ENSMUSG00000022774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// BC118926 // GenBank // Mus musculus nuclear cap binding protein subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:143500 IMAGE:40090166), complete cds. // chr16 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// ENSMUST00000126215 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:31948606:31961781:1 gene:ENSMUSG00000022774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_025892 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 19 (Cep19), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042869 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:32099952:32108051:1 gene:ENSMUSG00000035790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000115168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:32099800:32108069:1 gene:ENSMUSG00000035790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:32103878:32108055:1 gene:ENSMUSG00000035790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC023715 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1500031L02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35695 IMAGE:5346460), complete cds. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001033539 // RefSeq // Mus musculus brain expressed gene 6 (Bex6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:32186186:32186949:1 gene:ENSMUSG00000075269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK139543 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020003O03 product:hypothetical Brain expressed X-linked like protein containing protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AY833559 // GenBank // Mus musculus chromosome 16 brain expressed X-linked 6 (Bex6) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132130 // GenBank // Mus musculus brain expressed gene 6, mRNA (cDNA clone MGC:163761 IMAGE:40130407), complete cds. // chr16 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// BC132132 // GenBank // Mus musculus brain expressed gene 6, mRNA (cDNA clone MGC:163763 IMAGE:40130409), complete cds. // chr16 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:32155831:32186720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001185162 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 53 (Wdr53), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// NM_026898 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 53 (Wdr53), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006522509 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 53 (Wdr53), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000023474 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:32247253:32257083:1 gene:ENSMUSG00000022787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000178573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:32247227:32257074:1 gene:ENSMUSG00000022787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// BC028850 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 53, mRNA (cDNA clone MGC:25430 IMAGE:3987279), complete cds. // chr16 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000032411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:32251839:32257055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
NM_183283 // RefSeq // Mus musculus single-pass membrane protein with coiled-coil domains 1 (Smco1), mRNA. // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000093183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:32271468:32274779:1 gene:ENSMUSG00000046345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC125555 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310010M20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159258 IMAGE:40130070), complete cds. // chr16 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000032436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:32270302:32274157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_027355 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 168 (Rnf168), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000014218 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:32277461:32300906:1 gene:ENSMUSG00000014074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000155649 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:32277459:32289194:1 gene:ENSMUSG00000014074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000171474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:32277461:32301434:1 gene:ENSMUSG00000014074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC046815 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 168, mRNA (cDNA clone MGC:61213 IMAGE:5702430), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:32275432:32299326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0
NM_177633 // RefSeq // Mus musculus UBX domain protein 7 (Ubxn7), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000115151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:32332252:32393747:1 gene:ENSMUSG00000053774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK147730 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270012C19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:32314102:32384935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK080392 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630090P18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001160402 // RefSeq // Mus musculus transmembrane 4 L six family member 19 (Tm4sf19), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006522217 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane 4 L six family member 19 (Tm4sf19), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000115149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:32400506:32408227:1 gene:ENSMUSG00000079625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147727 // GenBank // Mus musculus transmembrane 4 L six family member 19, mRNA (cDNA clone MGC:182782 IMAGE:9056676), complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC147729 // GenBank // Mus musculus transmembrane 4 L six family member 19, mRNA (cDNA clone MGC:182784 IMAGE:9056678), complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_006522222 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane 4 L six family member 19 (Tm4sf19), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000032424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:32400514:32409057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_025329 // RefSeq // Mus musculus Tctex1 domain containing 2 (Tctex1d2), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// XM_006522448 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Tctex1 domain containing 2 (Tctex1d2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000014220 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:32419702:32429099:1 gene:ENSMUSG00000014075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000080316 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:32419746:32429095:1 gene:ENSMUSG00000014075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000131204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:32419795:32429099:1 gene:ENSMUSG00000014075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// AK002589 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610012D17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC053332 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610012D17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6309495). // chr16 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// BC059716 // GenBank // Mus musculus Tctex1 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:74104 IMAGE:6774264), complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT026286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NM_199309 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 19 (Zdhhc19), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006522135 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 19 (Zdhhc19), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000064192 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:32496265:32507211:1 gene:ENSMUSG00000052363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049761 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:58833 IMAGE:6773873), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC141059 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:176020 IMAGE:9055671), complete cds. // chr16 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000032415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:32497087:32518494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_011638 // RefSeq // Mus musculus transferrin receptor (Tfrc), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000023486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:32608920:32632794:1 gene:ENSMUSG00000022797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000120680 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:32608983:32623741:1 gene:ENSMUSG00000022797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000128285 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:32624442:32632790:1 gene:ENSMUSG00000022797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// AK048228 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130041J04 product:transferrin receptor, full insert sequence. // chr16 // 96 // 67 // 23 // 24 // 0 /// BC054522 // GenBank // Mus musculus transferrin receptor, mRNA (cDNA clone MGC:62189 IMAGE:6406097), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC067403 // GenBank HTC // Mus musculus transferrin receptor, mRNA (cDNA clone IMAGE:30466438), with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000032421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:32612311:32630336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1
ENSMUST00000093713 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:33001903:33002021:1 gene:ENSMUSG00000070225 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000122639 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:27085126:27085207:1 gene:ENSMUSG00000084588 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// NONMMUT009003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// NONMMUT026330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_172823 // RefSeq // Mus musculus leishmanolysin-like (metallopeptidase M8 family) (Lmln), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006522123 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leishmanolysin-like (metallopeptidase M8 family) (Lmln), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023497 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:33062521:33127695:1 gene:ENSMUSG00000022802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC111899 // GenBank // Mus musculus leishmanolysin-like (metallopeptidase M8 family), mRNA (cDNA clone MGC:132967 IMAGE:40062192), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC112428 // GenBank // Mus musculus leishmanolysin-like (metallopeptidase M8 family), mRNA (cDNA clone MGC:132968 IMAGE:40062196), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000041290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:33058629:33133673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1
NM_176840 // RefSeq // Mus musculus oxysterol binding protein-like 11 (Osbpl11), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039733 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:33185071:33243311:1 gene:ENSMUSG00000022807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC035278 // GenBank // Mus musculus oxysterol binding protein-like 11, mRNA (cDNA clone MGC:32450 IMAGE:5043236), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:33165195:33271782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_080557 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 4 (Snx4), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000023502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:33251456:33299562:1 gene:ENSMUSG00000022808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC016599 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 4, mRNA (cDNA clone MGC:27730 IMAGE:2644991), complete cds. // chr16 // 94 // 90 // 17 // 18 // 0 /// BC050851 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 4, mRNA (cDNA clone MGC:59421 IMAGE:6512558), complete cds. // chr16 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// XR_384597 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexin 4 (Snx4), transcript variant X1, misc_RNA. // chr16 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
NM_011749 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 148 (Zfp148), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006522099 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 148 (Zfp148), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000089677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:33400445:33498643:1 gene:ENSMUSG00000022811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000165418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:33380775:33503903:1 gene:ENSMUSG00000022811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF316548 // GenBank // Mus musculus clone A23 G-rich box-binding protein Berf-1 (Zfp148) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC026144 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 148, mRNA (cDNA clone MGC:13942 IMAGE:3991738), complete cds. // chr16 // 86 // 92 // 19 // 22 // 0 /// U80078 // GenBank // Mus musculus transcription factor BFCOL1 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000041297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:33434642:33497344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000154863 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:33684466:33722913:1 gene:ENSMUSG00000075254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK028518 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4632417D23 product:hypothetical Serine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:33684545:33769443:1 gene:ENSMUSG00000075254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NM_175256 // RefSeq // Mus musculus HEG homolog 1 (zebrafish) (Heg1), mRNA. // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENSMUST00000152782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:33684466:33771576:1 gene:ENSMUSG00000075254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT026363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:33684612:33727596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_175256 // RefSeq // Mus musculus HEG homolog 1 (zebrafish) (Heg1), mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006522719 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HEG homolog 1 (zebrafish) (Heg1), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000126532 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:33684545:33769443:1 gene:ENSMUSG00000075254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000132797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:33731601:33740271:1 gene:ENSMUSG00000075254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000152782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:33684466:33771576:1 gene:ENSMUSG00000075254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC072651 // GenBank // Mus musculus HEG homolog 1 (zebrafish), mRNA (cDNA clone IMAGE:6856235), complete cds. // chr16 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC076596 // GenBank // Mus musculus HEG homolog 1 (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:100180 IMAGE:30645937), complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:33730477:33766810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT026365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0
NM_010739 // RefSeq // Mus musculus mucin 13, epithelial transmembrane (Muc13), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000115044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:33794037:33819927:1 gene:ENSMUSG00000022824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC024321 // GenBank // Mus musculus mucin 13, epithelial transmembrane, mRNA (cDNA clone MGC:18590 IMAGE:4219376), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// J04634 // GenBank // Mouse cell surface antigen 114/A10 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:33794367:33819934:1 gene:ENSMUSG00000022824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// GENSCAN00000051596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:33794527:33815869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_001145884 // RefSeq // Mus musculus integrin beta 5 (Itgb5), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_010580 // RefSeq // Mus musculus integrin beta 5 (Itgb5), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000069345 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:33829677:33949153:1 gene:ENSMUSG00000022817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000115028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:33829665:33949146:1 gene:ENSMUSG00000022817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000134262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:33885026:33910585:1 gene:ENSMUSG00000022817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AF022110 // GenBank // Mus musculus integrin beta-5 mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AF043256 // GenBank // Mus musculus beta5A integrin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF043257 // GenBank // Mus musculus beta5B integrin mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC046280 // GenBank // Mus musculus integrin beta 5, mRNA (cDNA clone MGC:54655 IMAGE:6394641), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC058246 // GenBank // Mus musculus integrin beta 5, mRNA (cDNA clone MGC:65272 IMAGE:6313668), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:33829891:33948752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_030744 // RefSeq // Mus musculus ropporin, rhophilin associated protein 1 (Ropn1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006522698 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ropporin, rhophilin associated protein 1 (Ropn1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000023530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:34651188:34678618:1 gene:ENSMUSG00000022832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000148562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:34649921:34677201:1 gene:ENSMUSG00000022832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AF178531 // GenBank // Mus musculus ropporin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC049544 // GenBank // Mus musculus ropporin, rhophilin associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:58111 IMAGE:6740976), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:34658859:34677315:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_172824 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 14 (Ccdc14), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000023532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:34690616:34725194:1 gene:ENSMUSG00000022833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// AK090294 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630039H03 product:weakly similar to CDNA FLJ14701 FIS, CLONE NT2RP3000109, WEAKLY SIMILAR TO P54 PROTEIN PRECURSOR [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// BC031204 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 14, mRNA (cDNA clone MGC:37725 IMAGE:5066612), complete cds. // chr16 // 80 // 88 // 28 // 35 // 0 /// XM_006522125 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 14 (Ccdc14), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 73 // 73 // 29 // 40 // 1 /// AK172014 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830029F04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_139300 // RefSeq // Mus musculus myosin, light polypeptide kinase (Mylk), mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000023538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:34784921:35002420:1 gene:ENSMUSG00000022836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AK162008 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720464I06 product:myosin, light polypeptide kinase, full insert sequence. // chr16 // 92 // 35 // 12 // 13 // 0 /// AY237726 // GenBank // Mus musculus 220 kDa myosin light chain kinase (Mlyk) mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 86 // 30 // 32 // 0 /// AY237727 // GenBank // Mus musculus 130 kDa myosin light chain kinase (mlyk) mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 51 // 18 // 19 // 0 /// BC058610 // GenBank // Mus musculus myosin, light polypeptide kinase, mRNA (cDNA clone MGC:60832 IMAGE:30056142), complete cds. // chr16 // 88 // 86 // 28 // 32 // 0 /// BC145279 // GenBank // Mus musculus myosin, light polypeptide kinase, mRNA (cDNA clone MGC:178841 IMAGE:9053833), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC150749 // GenBank // Mus musculus myosin, light polypeptide kinase, mRNA (cDNA clone MGC:183660 IMAGE:9087660), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC030478 // GenBank HTC // Mus musculus myosin, light polypeptide kinase, mRNA (cDNA clone IMAGE:5368136), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1 /// GENSCAN00000039247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:34854018:35000532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
NM_023587 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b (Ptplb), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006522570 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b (Ptplb), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// XM_006522571 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b (Ptplb), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000061156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:35022421:35109175:1 gene:ENSMUSG00000035376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF169286 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like protein PTPLB (Ptplb) mRNA, complete cds. // chr16 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// BC027289 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b, mRNA (cDNA clone MGC:6798 IMAGE:2647850), complete cds. // chr16 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1
NM_001012765 // RefSeq // Mus musculus adenylate cyclase 5 (Adcy5), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000114913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:35154877:35305737:1 gene:ENSMUSG00000022840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC090846 // GenBank // Mus musculus adenylate cyclase 5, mRNA (cDNA clone MGC:102205 IMAGE:30363147), complete cds. // chr16 // 97 // 83 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000039243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:35248188:35303741:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0
ENSMUST00000082529 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:35382045:35382247:1 gene:ENSMUSG00000064463 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175111 // RefSeq // Mus musculus Hspb associated protein 1 (Hspbap1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006522469 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Hspb associated protein 1 (Hspbap1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XR_384589 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Hspb associated protein 1 (Hspbap1), transcript variant X5, misc_RNA. // chr16 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000023555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:35770386:35828446:1 gene:ENSMUSG00000022849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK028824 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732459O03 product:similar to PROTEIN ASSOCIATING WITH SMALL STRESS PROTEIN PASS1 [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr16 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// XM_006522472 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Hspb associated protein 1 (Hspbap1), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// AK138906 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430110E09 product:Hspb associated protein 1, full insert sequence. // chr16 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// GENSCAN00000020883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:35776796:35825398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000020856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:35892578:35906014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
NM_008465 // RefSeq // Mus musculus karyopherin (importin) alpha 1 (Kpna1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000004054 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:35983315:36037131:1 gene:ENSMUSG00000022905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000172534 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36013797:36035131:1 gene:ENSMUSG00000022905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000173696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36000187:36033908:1 gene:ENSMUSG00000022905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000174500 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:35983354:36019280:1 gene:ENSMUSG00000022905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 91 // 34 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000174737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36000253:36021645:1 gene:ENSMUSG00000022905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC006771 // GenBank // Mus musculus karyopherin (importin) alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:6726 IMAGE:3588534), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// U34228 // GenBank // Mus musculus SRP1 mRNA, complete cds. // chr16 // 85 // 81 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000173641 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:36019380:36033868:1 gene:ENSMUSG00000022905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:35943405:36033908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_027113 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 5B (Wdr5b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:36041190:36042973:1 gene:ENSMUSG00000034379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC064045 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 5B, mRNA (cDNA clone MGC:73550 IMAGE:1245342), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EF011616 // GenBank // Mus musculus CDW6/WDR5B mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36041513:36042499:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001159421 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 58 (Ccdc58), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_198645 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 58 (Ccdc58), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000163352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:36071660:36092118:1 gene:ENSMUSG00000075229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000164916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:36071660:36092118:1 gene:ENSMUSG00000075229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC024862 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 58, mRNA (cDNA clone MGC:36453 IMAGE:5356370), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC053690 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 58, mRNA (cDNA clone IMAGE:4192287). // chr16 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// NM_001159422 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 58 (Ccdc58), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// ENSMUST00000099937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:36081275:36092118:1 gene:ENSMUSG00000075229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// GENSCAN00000020875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36082706:36091884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
ENSMUST00000077110 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36135939:36137731:1 gene:ENSMUSG00000060956 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr16 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0
NM_173869 // RefSeq // Mus musculus stefin A2 like 1 (Stfa2l1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000079184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:36156811:36161948:1 gene:ENSMUSG00000059657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY163161 // GenBank // Mus musculus stefin A2 protein mRNA, complete cds. // chr16 // 76 // 100 // 22 // 29 // 0 /// BC117052 // GenBank // Mus musculus stefin A2 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:151429 IMAGE:40126371), complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC119354 // GenBank // Mus musculus stefin A2 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:155670 IMAGE:8734103), complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NM_001082545 // RefSeq // Mus musculus stefin A2 (Stfa2), mRNA. // chr16 // 48 // 100 // 14 // 29 // 0 /// ENSMUST00000023619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:36403946:36408363:-1 gene:ENSMUSG00000022902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 100 // 14 // 29 // 0 /// BC138004 // GenBank // Mus musculus stefin A2, mRNA (cDNA clone MGC:169628 IMAGE:8861023), complete cds. // chr16 // 48 // 100 // 14 // 29 // 0 /// GENSCAN00000020881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36156837:36161872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36404027:36408333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 93 // 14 // 27 // 0
NM_001082542 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5416 (Gm5416), mRNA. // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000089628 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:36210403:36217788:1 gene:ENSMUSG00000094733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36210403:36217788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_029733 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2010005H15 gene (2010005H15Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC125396 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010005H15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159099 IMAGE:40129911), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC125422 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010005H15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159125 IMAGE:40129937), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC145264 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2010005H15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178825 IMAGE:9053817), complete cds. // chr16 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// ENSMUST00000187183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36221468:36257444:1 gene:ENSMUSG00000095620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000187742 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36221562:36257427:1 gene:ENSMUSG00000095620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_177128 // RefSeq // Mus musculus IQ calmodulin-binding motif containing 1 (Iqcb1), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006522248 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IQ calmodulin-binding motif containing 1 (Iqcb1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006522250 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IQ calmodulin-binding motif containing 1 (Iqcb1), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:36828408:36872713:1 gene:ENSMUSG00000022837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000114819 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36828407:36872721:1 gene:ENSMUSG00000022837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AK078554 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo female mullerian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6820449I09 product:hypothetical IQ calmodulin-binding motif containing protein, full insert sequence. // chr16 // 77 // 94 // 24 // 31 // 0 /// BC029084 // GenBank // Mus musculus IQ calmodulin-binding motif containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:27790 IMAGE:3157011), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000037492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36831515:36872421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0
NM_030035 // RefSeq // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily b, macrogolgin 1 (Golgb1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000039855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:36886134:36933085:1 gene:ENSMUSG00000034243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000114812 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:36875168:36933085:1 gene:ENSMUSG00000034243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000152864 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36924457:36928371:1 gene:ENSMUSG00000034243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// BC145221 // GenBank // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily b, macrogolgin 1, mRNA (cDNA clone MGC:178780 IMAGE:9053772), complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// BC150731 // GenBank // Mus musculus golgi autoantigen, golgin subfamily b, macrogolgin 1, mRNA (cDNA clone MGC:183642 IMAGE:9087642), complete cds. // chr16 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000037497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36886136:36937910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONMMUT026497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0
NM_008225 // RefSeq // Mus musculus hematopoietic cell specific Lyn substrate 1 (Hcls1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:36934983:36963212:1 gene:ENSMUSG00000022831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000164050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36937287:36961530:1 gene:ENSMUSG00000022831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// BC007469 // GenBank // Mus musculus hematopoietic cell specific Lyn substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:6056 IMAGE:3593456), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D42120 // GenBank // Mus musculus mRNA for HS1 (hematopoietic cell-specific protein-substrate of non-receptor type protein-tyrosine kinase), complete cds. // chr16 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36942079:36962749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_001042499 // RefSeq // Mus musculus RAB, member RAS oncogene family-like 3 (Rabl3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:37539885:37572385:1 gene:ENSMUSG00000022827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000130028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:37539900:37572382:1 gene:ENSMUSG00000022827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC050194 // GenBank // Mus musculus RAB, member of RAS oncogene family-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:60441 IMAGE:30022531), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000128036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:37539905:37564048:1 gene:ENSMUSG00000022827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// AK156982 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830111G07 product:RAB, member of RAS oncogene family-like 3, full insert sequence. // chr16 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000037483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:37539915:37612650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_008047 // RefSeq // Mus musculus follistatin-like 1 (Fstl1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000114763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:37776873:37836514:1 gene:ENSMUSG00000022816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC006185 // GenBank HTC // Mus musculus follistatin-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3498052). // chr16 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC028921 // GenBank // Mus musculus follistatin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:25371 IMAGE:2647002), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// M91380 // GenBank // Mus musculus TGF-beta-inducible protein (TSC-36) mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000056700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:37813868:37833926:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_177093 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 58 (Lrrc58), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078717 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:37868389:37888858:1 gene:ENSMUSG00000034158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC141007 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 58, mRNA (cDNA clone MGC:175968 IMAGE:9055619), complete cds. // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:37868496:37883484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_153394 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 156 (Gpr156), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006522127 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 156 (Gpr156), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000061274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:37916496:38007527:1 gene:ENSMUSG00000046961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF488740 // GenBank // Mus musculus GABAB-related G-protein coupled receptor (GABABL) mRNA, complete cds. // chr16 // 85 // 75 // 23 // 27 // 0 /// BC059227 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 156, mRNA (cDNA clone MGC:66668 IMAGE:6400663), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000056695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:37976829:38005819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000083254 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:37980087:37980226:1 gene:ENSMUSG00000065188 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK019867 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5031408D18 product:CD80 antigen, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006521738 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD80 antigen (Cd80), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// AJ278965 // GenBank // Mus musculus mRNA for CD80 antigen (Qoo609 gene), splice variant. // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONMMUT026559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_170599 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 11 (Igsf11), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006521889 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 11 (Igsf11), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000023478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:38902316:39027159:1 gene:ENSMUSG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114706 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:38901471:39025361:1 gene:ENSMUSG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AB079880 // GenBank // Mus musculus IgSF mRNA for immunoglobulin superfamily, complete cds. // chr16 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// AK160146 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700025L02 product:immunoglobulin superfamily, member 11, full insert sequence. // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC057555 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin superfamily, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:66646 IMAGE:6416190), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:38973181:39025195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENSMUST00000182967 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:39934002:39934999:1 gene:ENSMUSG00000098070 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:39881634:39934876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT026595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY512926 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:K0988E02 unknown mRNA. // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
AK086454 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930030D11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000189358 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:39984386:41209395:1 gene:ENSMUSG00000061080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
AK163487 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230304F11 product:Hypothetical phenylalanine-rich region containing protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK134586 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330437B10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001030274 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5 (Ndufs5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_002445 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC002163 (BC002163), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000030401 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123712710:123718202:-1 gene:ENSMUSG00000028648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123712710:123718186:-1 gene:ENSMUSG00000028648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123712710:123716326:-1 gene:ENSMUSG00000028648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000121906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:42955631:42955949:1 gene:ENSMUSG00000081824 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000137312 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123712869:123718181:-1 gene:ENSMUSG00000028648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC081434 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:101979 IMAGE:6412214), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123712822:123750164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000021709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:42955631:42955951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000180317 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:43126233:43126339:1 gene:ENSMUSG00000094605 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONMMUT026675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
ENSMUST00000033479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:43620877:43623955:1 gene:ENSMUSG00000022708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000036279 // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:42907652:43642602:1 gene:ENSMUSG00000022708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK038731 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230057M07 product:zinc finger protein 288, full insert sequence. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006522403 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 20 (Zbtb20), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// XM_006522408 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 20 (Zbtb20), transcript variant X8, mRNA. // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// XM_006522410 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 20 (Zbtb20), transcript variant X10, mRNA. // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// XM_006522416 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 20 (Zbtb20), transcript variant X16, mRNA. // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// XM_006522417 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 20 (Zbtb20), transcript variant X17, mRNA. // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// XM_006522423 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 20 (Zbtb20), transcript variant X23, mRNA. // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NR_030576 // RefSeq // Mus musculus microRNA 568 (Mir568), microRNA. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102417 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:43640655:43640737:1 gene:ENSMUSG00000076372 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000114694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:42907652:43642602:1 gene:ENSMUSG00000022708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-568 // miRBase Micro RNA Database // MI0005517 Mus musculus miR-568 stem-loop // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONMMUT026710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT026711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
NM_007877 // RefSeq // Mus musculus dopamine receptor D3 (Drd3), mRNA. // chr16 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:43762221:43822932:1 gene:ENSMUSG00000022705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC119286 // GenBank // Mus musculus dopamine receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:155602 IMAGE:8734035), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC137819 // GenBank // Mus musculus dopamine receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:169443 IMAGE:8860838), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:43693518:43855464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_027801 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2610015P09 gene (2610015P09Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006521958 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2610015P09 gene (2610015P09Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000122014 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:43889899:43939567:1 gene:ENSMUSG00000022701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000132859 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:43889800:43964314:1 gene:ENSMUSG00000022701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000178400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:43889902:43964314:1 gene:ENSMUSG00000022701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006521959 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2610015P09 gene (2610015P09Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// ENSMUST00000122440 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:43939124:43964314:1 gene:ENSMUSG00000022701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// AK018435 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430422M09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000013275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:43923481:43965675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000013285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:43894078:43921833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0
NM_028108 // RefSeq // Mus musculus N(alpha)-acetyltransferase 50, NatE catalytic subunit (Naa50), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000063520 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:44139886:44162472:1 gene:ENSMUSG00000022698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063542 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44139892:44161174:1 gene:ENSMUSG00000022698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000159514 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44139830:44162474:1 gene:ENSMUSG00000022698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161326 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44139853:44163366:1 gene:ENSMUSG00000022698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK167141 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0034B17 product:Mak3p homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC046283 // GenBank // Mus musculus N-acetyltransferase 13, mRNA (cDNA clone MGC:54829 IMAGE:6438976), complete cds. // chr16 // 89 // 68 // 17 // 19 // 0 /// BC057117 // GenBank // Mus musculus N-acetyltransferase 13, mRNA (cDNA clone MGC:63292 IMAGE:6409354), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC055846 // GenBank // Mus musculus N-acetyltransferase 13, mRNA (cDNA clone MGC:67873 IMAGE:3600545), complete cds. // chr16 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000013290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:44156369:44159640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
NM_001029889 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 608 (Gm608), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000088356 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:44173397:44212932:1 gene:ENSMUSG00000068284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000119746 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44173246:44227465:1 gene:ENSMUSG00000068284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44173397:44215468:1 gene:ENSMUSG00000068284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000169582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:44173397:44227463:1 gene:ENSMUSG00000068284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC141330 // GenBank // Mus musculus gene model 608, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:176291 IMAGE:9055942), complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC141331 // GenBank // Mus musculus gene model 608, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:176292 IMAGE:9055943), complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:44173459:44221824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_144550 // RefSeq // Mus musculus spindle and centriole associated protein 1 (Spice1), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000050897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:44347121:44388497:1 gene:ENSMUSG00000043065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000132663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44348046:44367748:1 gene:ENSMUSG00000043065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000133168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44370024:44385706:1 gene:ENSMUSG00000043065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000155661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44347414:44370768:1 gene:ENSMUSG00000043065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// AY099108 // GenBank // Mus musculus brain hypothetical protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC024956 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 52, mRNA (cDNA clone IMAGE:4947068). // chr16 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// BC052381 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 52, mRNA (cDNA clone MGC:63371 IMAGE:5703283), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC056960 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 52, mRNA (cDNA clone MGC:66734 IMAGE:5703283), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000013293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:44342090:44474232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1
NM_001033247 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 52 (Wdr52), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006521965 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 52 (Wdr52), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000099742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:44394799:44482428:1 gene:ENSMUSG00000071550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000120049 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:44401421:44482094:1 gene:ENSMUSG00000071550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000142648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44408602:44430062:1 gene:ENSMUSG00000071550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// AK078103 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330444M21 product:weakly similar to CDNA FLJ31910 FIS, CLONE NT2RP7004687, WEAKLY SIMILAR TO VEGETATIBLE INCOMPATIBILITY PROTEIN HET-E-1 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000013293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:44342090:44474232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000134625 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44765826:44794344:1 gene:ENSMUSG00000022667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// AK154325 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630020J21 product:antigen identified by monoclonal antibody MRC OX-2 receptor, full insert sequence. // chr16 // 83 // 32 // 10 // 12 // 0 /// AK170735 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630118A01 product:antigen identified by monoclonal antibody MRC OX-2 receptor, full insert sequence. // chr16 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NM_021325 // RefSeq // Mus musculus CD200 receptor 1 (Cd200r1), mRNA. // chr16 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1 /// ENSMUST00000057488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:44765736:44794978:1 gene:ENSMUSG00000022667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1 /// BC052682 // GenBank // Mus musculus CD200 receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:60485 IMAGE:30072503), complete cds. // chr16 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1
NM_207244 // RefSeq // Mus musculus CD200 receptor 4 (Cd200r4), mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006522128 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD200 receptor 4 (Cd200r4), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006522129 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD200 receptor 4 (Cd200r4), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006522130 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD200 receptor 4 (Cd200r4), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000114626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:44820728:44839150:1 gene:ENSMUSG00000062082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000176321 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:44811756:44839133:1 gene:ENSMUSG00000062082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000176819 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44811733:44839134:1 gene:ENSMUSG00000062082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// AY230200 // GenBank // Mus musculus CD200 cell surface glycoprotein receptor isoform 4 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// BC131946 // GenBank // Mus musculus CD200 receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:163577 IMAGE:40130223), complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC131972 // GenBank // Mus musculus CD200 receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:163603 IMAGE:40130249), complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:44826253:44838064:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0
NM_206535 // RefSeq // Mus musculus Cd200 receptor 2 (Cd200r2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000102805 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:44867097:44915840:1 gene:ENSMUSG00000090176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY230198 // GenBank // Mus musculus CD200 cell surface glycoprotein receptor isoform 2 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:44848115:44957837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_026439 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 80 (Ccdc80), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006522500 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 80 (Ccdc80), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000061050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:45094053:45127924:1 gene:ENSMUSG00000022665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000099498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:45093612:45127665:1 gene:ENSMUSG00000022665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB075019 // GenBank // Mus musculus mRNA for URB, complete cds. // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:45020337:45127510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
AK136967 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430018F04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026402 // RefSeq // Mus musculus autophagy related 3 (Atg3), mRNA. // chr16 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// XM_006522495 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus autophagy related 3 (Atg3), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:45158785:45188538:1 gene:ENSMUSG00000022663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// AB079386 // GenBank // Mus musculus mRNA for Apg3p, complete cds. // chr16 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC010809 // GenBank // Mus musculus autophagy-related 3 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:18909 IMAGE:4241199), complete cds. // chr16 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000150390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:45165883:45187894:1 gene:ENSMUSG00000022663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// BC030053 // GenBank HTC // Mus musculus autophagy-related 3 (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:1345144), with apparent retained intron. // chr16 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000030397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:45159100:45205501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001037719 // RefSeq // Mus musculus B and T lymphocyte associated (Btla), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_177584 // RefSeq // Mus musculus B and T lymphocyte associated (Btla), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000063654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:45224337:45252895:1 gene:ENSMUSG00000052013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000102802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:45224315:45252892:1 gene:ENSMUSG00000052013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY293285 // GenBank // Mus musculus B and T lymphocyte attenuator (Btla) mRNA, complete cds. // chr16 // 83 // 80 // 20 // 24 // 0 /// BC108963 // GenBank // Mus musculus B and T lymphocyte associated, mRNA (cDNA clone MGC:124217 IMAGE:40046744), complete cds. // chr16 // 82 // 93 // 23 // 28 // 0 /// BC108964 // GenBank // Mus musculus B and T lymphocyte associated, mRNA (cDNA clone MGC:124218 IMAGE:40046745), complete cds. // chr16 // 75 // 93 // 21 // 28 // 0 /// XM_006521907 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B and T lymphocyte associated (Btla), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_006521909 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B and T lymphocyte associated (Btla), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSMUST00000120054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:45411580:45412345:1 gene:ENSMUSG00000080715 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000030403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:45411515:45412198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_198106 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 9, subfamily C (Na+-transporting carboxylic acid decarboxylase), member 1 (Slc9c1), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006521912 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 9, subfamily C (Na+-transporting carboxylic acid decarboxylase), member 1 (Slc9c1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006521913 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 9, subfamily C (Na+-transporting carboxylic acid decarboxylase), member 1 (Slc9c1), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:45535309:45607001:1 gene:ENSMUSG00000033210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000162151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:45539671:45606886:1 gene:ENSMUSG00000033210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:45539671:45606886:1 gene:ENSMUSG00000033210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// AY368685 // GenBank // Mus musculus sperm-specific sodium proton exchanger mRNA, complete cds. // chr16 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// BC145031 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053579. // chr16 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// BC145032 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053580, containing frame-shift errors. // chr16 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:45540445:45620141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001159297 // RefSeq // Mus musculus germinal center associated, signaling and motility (Gcsam), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_008099 // RefSeq // Mus musculus germinal center associated, signaling and motility (Gcsam), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:45610423:45622867:1 gene:ENSMUSG00000022659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161347 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:45610380:45621239:1 gene:ENSMUSG00000022659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC099585 // GenBank // Mus musculus germinal center expressed transcript 2, mRNA (cDNA clone MGC:118422 IMAGE:30289367), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// U13263 // GenBank // Mus musculus M17 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:45540445:45620141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
ENSMUST00000117218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:47074198:47076035:1 gene:ENSMUSG00000081624 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:47019315:47095247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000053824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:47212369:47264743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0
GENSCAN00000015826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:48052076:48074187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
GENSCAN00000015831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:48104497:48104904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_001018002 // RefSeq // Mus musculus developmental pluripotency associated 4 (Dppa4), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// NM_028610 // RefSeq // Mus musculus developmental pluripotency associated 4 (Dppa4), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006522626 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus developmental pluripotency associated 4 (Dppa4), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// ENSMUST00000050705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:48283735:48294292:1 gene:ENSMUSG00000058550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// ENSMUST00000096045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:48283735:48294292:1 gene:ENSMUSG00000058550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AF490348 // GenBank // Mus musculus DPPA4 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC064754 // GenBank // Mus musculus developmental pluripotency associated 4, mRNA (cDNA clone MGC:76548 IMAGE:30024281), complete cds. // chr16 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0
NM_028615 // RefSeq // Mus musculus developmental pluripotency associated 2 (Dppa2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000097175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:48310477:48319723:1 gene:ENSMUSG00000072419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// AF490346 // GenBank // Mus musculus DPPA2 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// AK145760 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0038J17 product:developmental pluripotency associated 2, full insert sequence. // chr16 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// AY561246 // GenBank // Mus musculus pluripotent embryonic stem cell-related protein (Phsecrg2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_010816 // RefSeq // Mus musculus microrchidia 1 (Morc1), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:48431237:48630905:1 gene:ENSMUSG00000022652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF084945 // GenBank // Mus musculus microrchidia (Morc) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC030893 // GenBank // Mus musculus microrchidia 1, mRNA (cDNA clone MGC:31502 IMAGE:4487929), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:48409449:48576044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_023881 // RefSeq // Mus musculus resistin like beta (Retnlb), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000023328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:48816856:48818891:1 gene:ENSMUSG00000022650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF290871 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secreted A12-beta protein mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// AF323083 // GenBank // Mus musculus resistin-like molecule beta mRNA, complete cds. // chr16 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC022650 // GenBank // Mus musculus resistin like beta, mRNA (cDNA clone MGC:31267 IMAGE:4216606), complete cds. // chr16 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// DQ157777 // GenBank // Mus musculus resistin-like molecule beta precursor, mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000051253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:48800770:48818755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_020509 // RefSeq // Mus musculus resistin like alpha (Retnla), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000023329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:48842552:48844461:1 gene:ENSMUSG00000061100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF205951 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secreted protein FIZZ1 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AF290872 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secreted A12-gamma protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF316397 // GenBank // Mus musculus parasite-induced macrophage novel gene 1 protein (Fizz1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AF323082 // GenBank // Mus musculus resistin like-molecule alpha mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC029248 // GenBank // Mus musculus resistin like alpha, mRNA (cDNA clone MGC:35890 IMAGE:4189285), complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000051245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:48842573:48874344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_181596 // RefSeq // Mus musculus resistin like gamma (Retnlg), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000065666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:48872608:48874498:1 gene:ENSMUSG00000022651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB086819 // GenBank // Mus musculus Retnlg mRNA for resistin like molecule gamma, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AJ514933 // GenBank // Mus musculus mRNA for resistin-like molecule gamma (retn1g gene). // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC117106 // GenBank // Mus musculus resistin like gamma, mRNA (cDNA clone MGC:151483 IMAGE:40126425), complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000051245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:48842573:48874344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_172616 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C330027C09 gene (C330027C09Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000048374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:48994188:49019705:1 gene:ENSMUSG00000033031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000117994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:48994185:49019705:1 gene:ENSMUSG00000033031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000125278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:48994223:49001064:1 gene:ENSMUSG00000033031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000130080 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:49008411:49019651:1 gene:ENSMUSG00000033031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000149004 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:49015837:49019709:1 gene:ENSMUSG00000033031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// BC021874 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA C330027C09 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3675712), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// BC029698 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA C330027C09 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5355936), with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// BC137719 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C330027C09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169343 IMAGE:8860738), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000051242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:48999778:49199539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1
NM_001166210 // RefSeq // Mus musculus myosin, heavy chain 15 (Myh15), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000168680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:49057486:49199104:1 gene:ENSMUSG00000092009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000051242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:48999778:49199539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0
NM_010581 // RefSeq // Mus musculus CD47 antigen (Rh-related antigen, integrin-associated signal transducer) (Cd47), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000084838 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:49855618:49915010:1 gene:ENSMUSG00000055447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114496 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:49867968:49911081:1 gene:ENSMUSG00000055447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AB012693 // GenBank // Mus musculus mRNA for CD47, complete cds. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC009094 // GenBank // Mus musculus CD47 antigen (Rh-related antigen, integrin-associated signal transducer), mRNA (cDNA clone IMAGE:3158056), partial cds. // chr16 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// BC012667 // GenBank // Mus musculus CD47 antigen (Rh-related antigen, integrin-associated signal transducer), mRNA (cDNA clone MGC:13838 IMAGE:4187965), complete cds. // chr16 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// HQ585874 // GenBank // Mus musculus strain C57L integrin-associated protein (CD47) mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// Z25524 // GenBank // M.musculus integrin associated protein mRNA, complete CDS. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:49835733:49926262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENSMUST00000084838 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:49855618:49915010:1 gene:ENSMUSG00000055447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099691 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30738828. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT026869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK153764 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630079D20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003140 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000182962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:50111073:50112062:1 gene:ENSMUSG00000098028 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000054197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:50106094:50112053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006543337 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 60S ribosomal protein L29-like (LOC102639915), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000054198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:50143618:50144001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
XR_384896 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700116B05 gene (1700116B05Rik), transcript variant X2, ncRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000173461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:50783409:50784091:1 gene:ENSMUSG00000092276 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000174511 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:50783478:50784065:1 gene:ENSMUSG00000092276 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK018963 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700116B05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KnowTID_00003154 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT026906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT026907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001033238 // RefSeq // Mus musculus Casitas B-lineage lymphoma b (Cblb), mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006521950 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Casitas B-lineage lymphoma b (Cblb), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006521952 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Casitas B-lineage lymphoma b (Cblb), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000114471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:52031549:52208047:1 gene:ENSMUSG00000022637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AK161486 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932438G12 product:Casitas B-lineage lymphoma b, full insert sequence. // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC150934 // GenBank // Mus musculus Casitas B-lineage lymphoma b, mRNA (cDNA clone MGC:183845 IMAGE:9087845), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC150938 // GenBank // Mus musculus Casitas B-lineage lymphoma b, mRNA (cDNA clone MGC:183849 IMAGE:9087849), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:52078441:52204692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000082793 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:54354462:54354593:1 gene:ENSMUSG00000064727 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082615 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:54972431:54972537:1 gene:ENSMUSG00000064549 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000093703 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:10:58349498:58349604:-1 gene:ENSMUSG00000070214 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1 /// NONMMUT026943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT005729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
NM_173026 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 11 (Zbtb11), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000050248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:55973883:56008913:1 gene:ENSMUSG00000022601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000184618 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:56005192:56008913:1 gene:ENSMUSG00000022601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// BC055403 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:6485438). // chr16 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000031098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:55966181:56007325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSMUST00000102405 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:56070563:56070666:1 gene:ENSMUSG00000076360 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_174876 // RefSeq // Mus musculus interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 (Impg2), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000069778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:56204332:56213534:1 gene:ENSMUSG00000035270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000069936 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:56204338:56273756:1 gene:ENSMUSG00000035270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000160116 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:56204313:56271160:1 gene:ENSMUSG00000035270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// AK044279 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930005F14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// AY174061 // GenBank // Mus musculus sialoprotein associated with cones and rods proteoglycan mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// BC048863 // GenBank // Mus musculus interphotoreceptor matrix proteoglycan 2, mRNA (cDNA clone MGC:55121 IMAGE:5368568), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000031093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:56249503:56355310:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT026986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0
NM_138599 // RefSeq // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (yeast) (Tomm70a), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000166897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:57121714:57154530:1 gene:ENSMUSG00000022752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK122356 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0719 protein. // chr16 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC057096 // GenBank // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:64791 IMAGE:5709110), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC139420 // GenBank // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:171047 IMAGE:8862442), complete cds. // chr16 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC139421 // GenBank // Mus musculus translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:171048 IMAGE:8862443), complete cds. // chr16 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:57121862:57152736:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000099667 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:57353277:57515690:1 gene:ENSMUSG00000043336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK146705 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920045C21 product:similar to GPBP-interacting protein 90 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001040397 // RefSeq // Mus musculus filamin A interacting protein 1-like (Filip1l), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSMUST00000159816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:57353093:57573126:1 gene:ENSMUSG00000043336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// EU704258 // GenBank // Mus musculus downregulated in ovarian cancer 1-like protein (Filip1l) mRNA, complete cds. // chr16 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:57506609:57529958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001040397 // RefSeq // Mus musculus filamin A interacting protein 1-like (Filip1l), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NM_001177871 // RefSeq // Mus musculus filamin A interacting protein 1-like (Filip1l), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522750 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus filamin A interacting protein 1-like (Filip1l), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000159414 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:57549242:57572804:1 gene:ENSMUSG00000043336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:57353093:57573126:1 gene:ENSMUSG00000043336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC024523 // GenBank // Mus musculus filamin A interacting protein 1-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4984778), partial cds. // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC062166 // GenBank // Mus musculus filamin A interacting protein 1-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:6513146), partial cds. // chr16 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// EU623548 // GenBank // Mus musculus downregulated in ovarian cancer 1 mRNA, complete cds. // chr16 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// EU704258 // GenBank // Mus musculus downregulated in ovarian cancer 1-like protein (Filip1l) mRNA, complete cds. // chr16 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000007788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:57564953:57599820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_007757 // RefSeq // Mus musculus coproporphyrinogen oxidase (Cpox), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:58670208:58680391:1 gene:ENSMUSG00000022742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC017680 // GenBank // Mus musculus coproporphyrinogen oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:18469 IMAGE:4241687), complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// D16333 // GenBank // Mus musculus mRNA for coproporphyrinogen oxidase, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK157277 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830209C19 product:coproporphyrinogen oxidase, full insert sequence. // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000051112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:58670428:58686465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_146485 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 183 (Olfr183), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:58995404:59000616:1 gene:ENSMUSG00000062105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146998 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 195 (Olfr195), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59148829:59149823:1 gene:ENSMUSG00000062608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119110 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 195, mRNA (cDNA clone MGC:155426 IMAGE:8733859), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59148852:59149778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146486 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 203 (Olfr203), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000089305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59303152:59304075:1 gene:ENSMUSG00000068182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC128025 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 203, mRNA (cDNA clone MGC:157633 IMAGE:40136560), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000051102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59303155:59304075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001081190 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3 (Gabrr3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59407332:59461889:1 gene:ENSMUSG00000074991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC151105 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mRNA (cDNA clone MGC:184018 IMAGE:9088018), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK141642 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030001P06 product:similar to GABA-C receptor rho3 subunit (Fragment) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000051105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59415269:59458445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_178751 // RefSeq // Mus musculus ORAI calcium release-activated calcium modulator 2 (Orai2), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:5:136147464:136170656:-1 gene:ENSMUSG00000039747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AB271215 // GenBank // Mus musculus Orai2 mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC066070 // GenBank // Mus musculus ORAI calcium release-activated calcium modulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:91338 IMAGE:6853893), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC115648 // GenBank // Mus musculus ORAI calcium release-activated calcium modulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:144554 IMAGE:40103121), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC115649 // GenBank // Mus musculus ORAI calcium release-activated calcium modulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:144555 IMAGE:40103122), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK087038 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030022E18 product:inferred: unnamed protein product {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000020263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:136150425:136167796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59415269:59458445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025910 // RefSeq // Mus musculus myc induced nuclear antigen (Mina), mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XR_384594 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myc induced nuclear antigen (Mina), transcript variant X3, misc_RNA. // chr16 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000023407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:59471775:59492461:1 gene:ENSMUSG00000022724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000160571 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:59472068:59492291:1 gene:ENSMUSG00000022724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AB177385 // GenBank // Mus musculus mina mRNA for Mina53, complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// BC023462 // GenBank // Mus musculus myc induced nuclear antigen, mRNA (cDNA clone MGC:32432 IMAGE:5041558), complete cds. // chr16 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// BC025109 // GenBank // Mus musculus myc induced nuclear antigen, mRNA (cDNA clone MGC:35694 IMAGE:4236994), complete cds. // chr16 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// BC058242 // GenBank // Mus musculus myc induced nuclear antigen, mRNA (cDNA clone MGC:67965 IMAGE:6308890), complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000120674 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:59471822:59491668:1 gene:ENSMUSG00000022724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// AK014426 // GenBank HTC // Mus musculus 18 days pregnant adult female placenta and extra embryonic tissue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3830408E23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1 /// GENSCAN00000051109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59475538:59491899:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000093663 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:62571036:62571139:1 gene:ENSMUSG00000070173 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT027087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000102469 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:62808349:62808416:1 gene:ENSMUSG00000076424 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT027093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_026588 // RefSeq // Mus musculus syntaxin 19 (Stx19), mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:62814676:62824346:1 gene:ENSMUSG00000047854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC023414 // GenBank // Mus musculus syntaxin 19, mRNA (cDNA clone MGC:31033 IMAGE:5249627), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK076337 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732443C18 product:hypothetical Syntaxin / epimorphin family containing protein, full insert sequence. // chr16 // 70 // 93 // 19 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:62821823:62822701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_011173 // RefSeq // Mus musculus protein S (alpha) (Pros1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023629 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:62854307:62929346:1 gene:ENSMUSG00000022912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC128316 // GenBank // Mus musculus protein S (alpha), mRNA (cDNA clone MGC:150071 IMAGE:40109789), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// Z25469 // GenBank // M.musculus of protein S gene, complete CDS. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:62898602:62937632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_178647 // RefSeq // Mus musculus CGG triplet repeat binding protein 1 (Cggbp1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067744 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:64851996:64859507:1 gene:ENSMUSG00000054604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136532 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:64852702:64855986:1 gene:ENSMUSG00000054604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC043097 // GenBank // Mus musculus CGG triplet repeat binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:58016 IMAGE:6405954), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC057053 // GenBank // Mus musculus CGG triplet repeat binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:67337 IMAGE:6827183), complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_028572 // RefSeq // Mus musculus vestigial like 3 (Drosophila) (Vgll3), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006523098 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vestigial like 3 (Drosophila) (Vgll3), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000168064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:65815633:65863057:1 gene:ENSMUSG00000091243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK007165 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700110N18 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONMMUT027124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000002258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:65825872:65828521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSMUST00000050665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:66892511:66893974:1 gene:ENSMUSG00000045178 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK016780 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933411O13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:66892503:66901189:1 gene:ENSMUSG00000045178 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT027148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK029643 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930419J05 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT027146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000083990 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:71663788:71663918:1 gene:ENSMUSG00000065924 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT027198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_019413 // RefSeq // Mus musculus roundabout homolog 1 (Drosophila) (Robo1), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006522958 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus roundabout homolog 1 (Drosophila) (Robo1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006522959 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus roundabout homolog 1 (Drosophila) (Robo1), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006522961 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus roundabout homolog 1 (Drosophila) (Robo1), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023600 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:72663149:73046095:1 gene:ENSMUSG00000022883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000020454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:72893751:73050745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000102329 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:73974441:73974538:1 gene:ENSMUSG00000076284 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT027243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_198302 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 11 (Rbm11), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006523004 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA binding motif protein 11 (Rbm11), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000046378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:75592844:75601695:1 gene:ENSMUSG00000032940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000114249 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:75592844:75602829:1 gene:ENSMUSG00000032940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000114253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:75592891:75602825:1 gene:ENSMUSG00000032940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC050779 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:58457 IMAGE:6771154), complete cds. // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:75592948:75600900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_013918 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 25 (Usp25), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000023580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:77014069:77116779:1 gene:ENSMUSG00000022867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// AF170563 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-specific processing protease (Usp25) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// AK011798 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610101O11 product:ubiquitin specific protease 25, full insert sequence. // chr16 // 100 // 20 // 10 // 10 // 0 /// BC048171 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 25, mRNA (cDNA clone MGC:61204 IMAGE:6822095), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// BC063059 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 25, mRNA (cDNA clone MGC:66988 IMAGE:6822095), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000023527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:77044469:77115562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 39 // 39 // 0
XR_397116 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102641316 (LOC102641316), transcript variant X3, ncRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:77236319:77596954:1 gene:ENSMUSG00000090386 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:77236317:77598423:1 gene:ENSMUSG00000090386 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:77236317:77363679:1 gene:ENSMUSG00000090386 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK048031 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130031A17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK051166 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130008K15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
AK076276 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4632408I12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
AK082961 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530024C18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:77500216:77598531:1 gene:ENSMUSG00000090386 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK033222 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030467K01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT027382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT027377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000068704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:77500216:77598531:1 gene:ENSMUSG00000090386 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000170849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:77329259:77598444:1 gene:ENSMUSG00000090386 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:77236317:77598423:1 gene:ENSMUSG00000090386 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK033222 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030467K01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK048031 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130031A17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK148800 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120447O16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029535 // RefSeq // Mus musculus microRNA 99a (Mir99a), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000083596 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:77598936:77599000:1 gene:ENSMUSG00000065530 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-99a // miRBase Micro RNA Database // MI0000146 Mus musculus miR-99a stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT027385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_029728 // RefSeq // Mus musculus microRNA let7c-1 (Mirlet7c-1), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000083623 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:77599652:77599759:1 gene:ENSMUSG00000065557 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-let-7c-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000559 Mus musculus let-7c-1 stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT027386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_029540 // RefSeq // Mus musculus microRNA 125b-2 (Mir125b-2), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000083538 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:77646273:77646343:1 gene:ENSMUSG00000065472 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// mmu-mir-125b-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000152 Mus musculus miR-125b-2 stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT027391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001025192 // RefSeq // Mus musculus coxsackie virus and adenovirus receptor (Cxadr), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NM_001276263 // RefSeq // Mus musculus coxsackie virus and adenovirus receptor (Cxadr), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// NM_009988 // RefSeq // Mus musculus coxsackie virus and adenovirus receptor (Cxadr), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006522885 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coxsackie virus and adenovirus receptor (Cxadr), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000023572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:78301496:78340752:1 gene:ENSMUSG00000022865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114229 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:78301756:78359785:1 gene:ENSMUSG00000022865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC004680 // GenBank // Mus musculus coxsackie virus and adenovirus receptor, mRNA (cDNA clone IMAGE:3500491), complete cds. // chr16 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC016457 // GenBank // Mus musculus coxsackie virus and adenovirus receptor, mRNA (cDNA clone MGC:25298 IMAGE:4216727), complete cds. // chr16 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// U90715 // GenBank // Mus musculus cell surface protein MCAR mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:78240449:78336452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
ENSMUST00000083459 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:78624747:78624853:1 gene:ENSMUSG00000093988 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT027432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_010954 // RefSeq // Mus musculus neural cell adhesion molecule 2 (Ncam2), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000037785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:81200697:81597805:1 gene:ENSMUSG00000022762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// AF001286 // GenBank // Mus musculus OCAM-GPI protein precursor mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// AF001287 // GenBank // Mus musculus OCAM-TM protein precursor mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 86 // 35 // 36 // 0 /// AF016619 // GenBank // Mus musculus Rb-8 neural cell adhesion molecule short form precursor (RNCAM) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// BC119027 // GenBank // Mus musculus neural cell adhesion molecule 2, mRNA (cDNA clone MGC:155343 IMAGE:8733776), complete cds. // chr16 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// BC119029 // GenBank // Mus musculus neural cell adhesion molecule 2, mRNA (cDNA clone MGC:155345 IMAGE:8733778), complete cds. // chr16 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// NM_001113208 // RefSeq // Mus musculus neural cell adhesion molecule 2 (Ncam2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1 /// ENSMUST00000067602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:81200697:81624285:1 gene:ENSMUSG00000022762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1 /// AK132363 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4022434B06 product:neural cell adhesion molecule 2, full insert sequence. // chr16 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1 /// GENSCAN00000031812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:81434689:81668904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1
AK148667 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120432I05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029565 // RefSeq // Mus musculus microRNA 155 (Mir155), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083463 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:84714140:84714204:1 gene:ENSMUSG00000065397 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:84713023:84715245:1 gene:ENSMUSG00000097418 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY096003 // GenBank // Mus musculus BIC noncoding mRNA, complete sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:84703167:84715245:1 gene:ENSMUSG00000097418 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-155 // miRBase Micro RNA Database // MI0000177 Mus musculus miR-155 stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000157433 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:84737350:84737476:1 gene:ENSMUSG00000088058 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT027469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_023844 // RefSeq // Mus musculus junction adhesion molecule 2 (Jam2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006523075 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus junction adhesion molecule 2 (Jam2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:84774123:84825928:1 gene:ENSMUSG00000053062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000138054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:84809407:84822886:1 gene:ENSMUSG00000053062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// AF255911 // GenBank // Mus musculus vascular endothelial junction-associated molecule mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC028778 // GenBank // Mus musculus junction adhesion molecule 2, mRNA (cDNA clone MGC:41518 IMAGE:1195543), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000098407 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:84774386:84810996:1 gene:ENSMUSG00000053062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// AK010826 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410167M24 product:junction cell adhesion molecule 2, full insert sequence. // chr16 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// AK045095 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130032E13 product:junction cell adhesion molecule 2, full insert sequence. // chr16 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// GENSCAN00000054916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:84804175:84824595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0
NM_008065 // RefSeq // Mus musculus GA repeat binding protein, alpha (Gabpa), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000009120 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:84835124:84863779:1 gene:ENSMUSG00000008976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114184 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:84834925:84861315:1 gene:ENSMUSG00000008976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AK150455 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830007O09 product:GA repeat binding protein, alpha, full insert sequence. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC013562 // GenBank // Mus musculus GA repeat binding protein, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:7596 IMAGE:3493987), complete cds. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC052448 // GenBank // Mus musculus GA repeat binding protein, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:63455 IMAGE:6408997), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M74515 // GenBank // Mouse GA binding protein (GABP-alpha subunit) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000054913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:84846126:84860603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NR_045889 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10791 (Gm10791), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024258 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 16 (Usp16), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000026710 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:87454703:87483517:1 gene:ENSMUSG00000025616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000119504 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:87454979:87483310:1 gene:ENSMUSG00000025616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000144759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:87455058:87483310:1 gene:ENSMUSG00000025616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000146386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:87473089:87479207:1 gene:ENSMUSG00000025616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// BC003278 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 16, mRNA (cDNA clone MGC:6387 IMAGE:3582180), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000131206 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:87455043:87471024:1 gene:ENSMUSG00000025616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// ENSMUST00000135399 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:87472854:87479913:1 gene:ENSMUSG00000025616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// AK158778 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K430308F02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// GENSCAN00000015427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:87464150:87483231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0
NM_144854 // RefSeq // Mus musculus Map3k7 C-terminal like (Map3k7cl), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006523006 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Map3k7 C-terminal like (Map3k7cl), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000026700 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:87553330:87595336:1 gene:ENSMUSG00000025610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY033899 // GenBank // Mus musculus C21ORF7 (C21orf7) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC115624 // GenBank // Mus musculus open reading frame 63, mRNA (cDNA clone MGC:144525 IMAGE:40102836), complete cds. // chr16 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC115625 // GenBank // Mus musculus open reading frame 63, mRNA (cDNA clone MGC:144526 IMAGE:40102837), complete cds. // chr16 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000015438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:87568581:87584917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_007520 // RefSeq // Mus musculus BTB and CNC homology 1 (Bach1), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026703 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:87698945:87733346:1 gene:ENSMUSG00000025612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000156958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:87699004:87722920:1 gene:ENSMUSG00000025612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AK030871 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830436C21 product:similar to TRANSCRIPTION REGULATOR PROTEIN BACH1 (BTB AND CNC HOMOLOG 1) [Mus musculus], full insert sequence. // chr16 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC057894 // GenBank // Mus musculus BTB and CNC homology 1, mRNA (cDNA clone MGC:68205 IMAGE:4978638), complete cds. // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// D86603 // GenBank // Mus musculus mRNA for Bach protein 1, complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:87705900:87730659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000069809 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:87784075:87793602:1 gene:ENSMUSG00000055972 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK041784 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630037M17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_385019 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635739 (LOC102635739), ncRNA. // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_183189 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 13-1 (Krtap13-1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:88728862:88729609:1 gene:ENSMUSG00000056350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027551 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 13-1, mRNA (cDNA clone MGC:41371 IMAGE:1363815), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_054100 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310034C09 gene (2310034C09Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000089111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:88758847:88759792:1 gene:ENSMUSG00000068078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC064816 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310034C09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:69987 IMAGE:30287188), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88758900:88759544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT027596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
XR_385027 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5965 (Gm5965), transcript variant X1, misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000009191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:88777896:88778528:1 gene:ENSMUSG00000009047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000049591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88777896:88778546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_013713 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 15 (Krtap15), mRNA. // chr16 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC116219 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:143617 IMAGE:40091298), complete cds. // chr16 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0 /// ENSMUST00000187823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:88828994:88829844:1 gene:ENSMUSG00000022931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88829195:88829578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 59 // 15 // 17 // 0
NM_001199334 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10229 (Gm10229), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:89015277:89015846:1 gene:ENSMUSG00000068075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D86419 // GenBank // Mus musculus mRNA for glycine tyrosine-rich hair keratin protein, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010672 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 6-1 (Krtap6-1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:89031699:89032292:1 gene:ENSMUSG00000058172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107313 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 6-1, mRNA (cDNA clone MGC:130269 IMAGE:40053340), complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC107314 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 6-1, mRNA (cDNA clone MGC:130270 IMAGE:40053341), complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// D86420 // GenBank // Mus musculus mRNA for glycine tyrosine-rich hair keratin protein, complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSMUST00000079151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:89084091:89084534:1 gene:ENSMUSG00000057855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D89901 // GenBank // Mus musculus mRNA for high-glycine tyrosine keratin type II.3, partial cds. // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185581 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:89084015:89084534:1 gene:ENSMUSG00000057855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006523123 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus keratin-associated protein 20-2-like (LOC102637192), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000073111 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:89151086:89151550:1 gene:ENSMUSG00000059113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:89151139:89169648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 100 // 10 // 18 // 0
XR_397164 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9789 (Gm9789), misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000062524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:89157952:89158348:1 gene:ENSMUSG00000044227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// AK076724 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930422A03 product:similar to HIGH-GLYCINE TYROSINE KERATIN TYPE II.3 (FRAGMENT) [Mus musculus], full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC048518 // GenBank // Mus musculus hypothetical protein LOC622866, mRNA (cDNA clone MGC:58416 IMAGE:6707555), complete cds. // chr16 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0
XR_397165 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1110057P08 gene (1110057P08Rik), misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000089097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:89174735:89175199:1 gene:ENSMUSG00000068067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK004289 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110057P08 product:similar to high-glycine tyrosine keratin type II.3 (Hypothetical protein) [Mus musculus], full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
GENSCAN00000026664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:90087105:90090490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
NR_033476 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10789 (Gm10789), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011434 // RefSeq // Mus musculus superoxide dismutase 1, soluble (Sod1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000023707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:90220742:90226322:1 gene:ENSMUSG00000022982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC002066 // GenBank // Mus musculus superoxide dismutase 1, soluble, mRNA (cDNA clone MGC:6157 IMAGE:3496016), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC048874 // GenBank // Mus musculus superoxide dismutase 1, soluble, mRNA (cDNA clone MGC:58998 IMAGE:5401293), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC086886 // GenBank // Mus musculus superoxide dismutase 1, soluble, mRNA (cDNA clone MGC:107553 IMAGE:6760550), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// M35725 // GenBank // Mouse Cu-Zn superoxide dismutase mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000026672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:90220858:90226257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
NM_015755 // RefSeq // Mus musculus hormonally upregulated Neu-associated kinase (Hunk), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XR_384941 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hormonally upregulated Neu-associated kinase (Hunk), transcript variant X1, misc_RNA. // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000065856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:90386397:90499553:1 gene:ENSMUSG00000053414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF055919 // GenBank // Mus musculus putative serine/threonine protein kinase MAK-V (Mak-v) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// AF167987 // GenBank // Mus musculus hormonally upregulated neu tumor-associated kinase (Hunk) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC137788 // GenBank // Mus musculus hormonally upregulated Neu-associated kinase, mRNA (cDNA clone MGC:169412 IMAGE:8860807), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC137790 // GenBank // Mus musculus hormonally upregulated Neu-associated kinase, mRNA (cDNA clone MGC:169414 IMAGE:8860809), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AK047337 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930050N07 product:hormonally upregulated Neu-associated kinase, full insert sequence. // chr16 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000036794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:90398390:90496748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000060246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:90554164:90554884:1 gene:ENSMUSG00000046119 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:90554164:90554886:1 gene:ENSMUSG00000046119 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK003565 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110008E08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082537 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:90602496:90602617:1 gene:ENSMUSG00000064471 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT027634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_029844 // RefSeq // Mus musculus melanocortin 2 receptor accessory protein (Mrap), mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006523108 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus melanocortin 2 receptor accessory protein (Mrap), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000038197 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:90738324:90749785:1 gene:ENSMUSG00000039956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125429 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:90738324:90749785:1 gene:ENSMUSG00000039956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138984 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:90738324:90749296:1 gene:ENSMUSG00000039956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AY079153 // GenBank // Mus musculus fat cell-specific low molecular weight protein alpha (Falpalpha) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// AY079154 // GenBank // Mus musculus fat cell-specific low molecular weight protein beta (Falpbeta) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// BC027543 // GenBank // Mus musculus melanocortin 2 receptor accessory protein, mRNA (cDNA clone MGC:41286 IMAGE:1477097), complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000036806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:90735673:90751136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_016967 // RefSeq // Mus musculus oligodendrocyte transcription factor 2 (Olig2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:91225550:91228677:1 gene:ENSMUSG00000039830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB038697 // GenBank // Mus musculus mRNA for Olig2 bHLH protein, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051967 // GenBank // Mus musculus oligodendrocyte transcription factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:62240 IMAGE:5695592), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:91226400:91227371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_016968 // RefSeq // Mus musculus oligodendrocyte transcription factor 1 (Olig1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056882 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:91269772:91271933:1 gene:ENSMUSG00000046160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB038696 // GenBank // Mus musculus mRNA for Olig1 bHLH protein, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC046316 // GenBank // Mus musculus oligodendrocyte transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:54573 IMAGE:6314266), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:91267903:91270659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_010508 // RefSeq // Mus musculus interferon (alpha and beta) receptor 1 (Ifnar1), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023689 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:91485238:91507441:1 gene:ENSMUSG00000022967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123196 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91485249:91507437:1 gene:ENSMUSG00000022967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC052217 // GenBank // Mus musculus interferon (alpha and beta) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:60599 IMAGE:30008497), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC052429 // GenBank // Mus musculus interferon (alpha and beta) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:63396 IMAGE:6836300), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// M89641 // GenBank // Mus musculus interferon alpha/beta receptor (IFNAR) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// XR_384931 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interferon (alpha and beta) receptor 1 (Ifnar1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr16 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000117748 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91485264:91507441:1 gene:ENSMUSG00000022967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// BC043935 // GenBank // Mus musculus interferon (alpha and beta) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:49745 IMAGE:4507009), complete cds. // chr16 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// GENSCAN00000020955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:91485344:91505411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_008338 // RefSeq // Mus musculus interferon gamma receptor 2 (Ifngr2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023687 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:91547072:91565169:1 gene:ENSMUSG00000022965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000127644 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91547147:91560649:1 gene:ENSMUSG00000022965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC055745 // GenBank // Mus musculus interferon gamma receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:67077 IMAGE:6403454), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000130404 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:91561323:91565169:1 gene:ENSMUSG00000022965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:91547163:91563005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT027683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
AK160609 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610314I05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_080456 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S6 (Mrps6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:92058270:92112227:1 gene:ENSMUSG00000039680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000138961 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:92106261:92112227:1 gene:ENSMUSG00000039680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AY061856 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S6 mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC027271 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S6, mRNA (cDNA clone MGC:27789 IMAGE:3156971), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT027728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000020934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:92046321:92111925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_017391 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 5 (inositol transporters), member 3 (Slc5a3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:92058322:92087473:1 gene:ENSMUSG00000089774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK133628 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330420M08 product:solute carrier family 5 (inositol transporters), member 3, full insert sequence. // chr16 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC140982 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 5 (inositol transporters), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:175943 IMAGE:9055594), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC140983 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 5 (inositol transporters), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:175944 IMAGE:9055595), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:92046321:92111925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_134110 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Isk-related subfamily, gene 2 (Kcne2), mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:92292389:92298129:1 gene:ENSMUSG00000039672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:92295616:92298129:1 gene:ENSMUSG00000039672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC022699 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Isk-related subfamily, gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:31447 IMAGE:4481325), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_138743 // RefSeq // Mus musculus small integral membrane protein 11 (Smim11), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:92301286:92313041:1 gene:ENSMUSG00000051989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ279849 // GenBank // Mus musculus partial mRNA for hypothetical protein, clone mvx2010. // chr16 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0 /// AY033901 // GenBank // Mus musculus C21ORF51 (C21orf51) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC005668 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1190017O12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:11750 IMAGE:3152735), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118064 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:92301296:92311424:1 gene:ENSMUSG00000051989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_029740 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2410124H12 gene (2410124H12Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006523107 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2410124H12 gene (2410124H12Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160494 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:92478742:92497366:1 gene:ENSMUSG00000051297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT027740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_172469 // RefSeq // Mus musculus chloride intracellular channel 6 (Clic6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000023670 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:92498134:92541243:1 gene:ENSMUSG00000022949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF448440 // GenBank // Mus musculus chloride channel (Clic6) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC075706 // GenBank // Mus musculus chloride intracellular channel 6, mRNA (cDNA clone MGC:78011 IMAGE:2648653), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000162181 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:92485736:92528805:1 gene:ENSMUSG00000022949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000006086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:92498454:92539596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_007620 // RefSeq // Mus musculus carbonyl reductase 1 (Cbr1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000039659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:93607837:93610505:1 gene:ENSMUSG00000051483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC012714 // GenBank // Mus musculus carbonyl reductase 1, mRNA (cDNA clone MGC:14021 IMAGE:4217206), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BC158026 // GenBank // Mus musculus carbonyl reductase 1, mRNA (cDNA clone MGC:189967 IMAGE:9088154), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC158029 // GenBank // Mus musculus carbonyl reductase 1, mRNA (cDNA clone MGC:189968 IMAGE:9088155), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// U31966 // GenBank // Mus musculus carbonyl reductase (Cbr1) mRNA, complete cds. // chr16 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000051359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:93607966:93610231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0
XM_006543344 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carbonyl reductase [NADPH] 1-like (LOC102641578), partial mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000120115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:93628097:93630346:1 gene:ENSMUSG00000082815 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000051367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:93626509:93630346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000122642 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:93654324:93654601:1 gene:ENSMUSG00000084591 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONMMUT027780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_173047 // RefSeq // Mus musculus carbonyl reductase 3 (Cbr3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:93683215:93690990:1 gene:ENSMUSG00000022947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028763 // GenBank // Mus musculus carbonyl reductase 3, mRNA (cDNA clone MGC:41226 IMAGE:1313642), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087735 // GenBank // Mus musculus carbonyl reductase 3, mRNA (cDNA clone MGC:99956 IMAGE:5369996), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC096658 // GenBank // Mus musculus carbonyl reductase 3, mRNA (cDNA clone MGC:106842 IMAGE:5145435), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:93679089:93810347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_026700 // RefSeq // Mus musculus dopey family member 2 (Dopey2), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 44 // 27 // 27 // 0 /// NM_027293 // RefSeq // Mus musculus dopey family member 2 (Dopey2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 55 // 55 // 0 /// ENSMUST00000045004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:93711907:93810585:1 gene:ENSMUSG00000022946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 55 // 55 // 0 /// AK122403 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0933 protein. // chr16 // 100 // 39 // 24 // 24 // 0 /// BC057081 // GenBank // Mus musculus dopey family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:67481 IMAGE:5704600), complete cds. // chr16 // 100 // 38 // 23 // 23 // 0 /// AK156170 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830010H07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 43 // 43 // 26 // 61 // 1 /// GENSCAN00000051352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:93679089:93810347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 47 // 47 // 0
NM_001045529 // RefSeq // Mus musculus microrchidia 3 (Morc3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000044068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:93832121:93876072:1 gene:ENSMUSG00000039456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK132226 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3526404D13 product:ZCWCC3 protein (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AK144885 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730047I15 product:similar to ZCWCC3 protein (Fragment) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// BC098072 // GenBank // Mus musculus microrchidia 3, mRNA (cDNA clone MGC:91153 IMAGE:30109159), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC145705 // GenBank // Mus musculus microrchidia 3, mRNA (cDNA clone MGC:175592 IMAGE:40131008), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000051351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:93837022:93906017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_028083 // RefSeq // Mus musculus chromatin assembly factor 1, subunit B (p60) (Chaf1b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006522848 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chromatin assembly factor 1, subunit B (p60) (Chaf1b), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000023666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:93883901:93906115:1 gene:ENSMUSG00000022945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000117099 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:93883924:93906077:1 gene:ENSMUSG00000022945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC013532 // GenBank // Mus musculus chromatin assembly factor 1, subunit B (p60), mRNA (cDNA clone MGC:19212 IMAGE:4238801), complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124313 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:93883931:93894288:1 gene:ENSMUSG00000022945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// AK038378 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130099P17 product:chromatin assembly factor 1, subunit B (p60), full insert sequence. // chr16 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// ENSMUST00000152980 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:93886710:93892789:1 gene:ENSMUSG00000022945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000051351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:93837022:93906017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_011377 // RefSeq // Mus musculus single-minded homolog 2 (Drosophila) (Sim2), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006522967 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus single-minded homolog 2 (Drosophila) (Sim2), transcript variant X2, mRNA. // chrUn // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006522968 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus single-minded homolog 2 (Drosophila) (Sim2), transcript variant X3, mRNA. // chrUn // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000072182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:94085260:94127032:1 gene:ENSMUSG00000062713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// D63383 // GenBank // Mus musculus mRNA for mSim, complete cds. // chrUn // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// D64135 // GenBank // Mus musculus Sim2 mRNA, complete cds. // chrUn // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// U40576 // GenBank // Mus musculus single-minded 2 (Sim2) mRNA, complete cds. // chrUn // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// U42554 // GenBank // Mus musculus sim transcription factor mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:94120321:94125892:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000051363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:94085816:94115980:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_133229 // RefSeq // Mus musculus ripply3 homolog (zebrafish) (Ripply3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000023660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:94328420:94336935:1 gene:ENSMUSG00000022941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB063284 // GenBank // Mus musculus Dscr6 mRNA, mouse homolog of Human Down syndrome critical region gene 6 DSCR6, complete cds. // chr16 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// BC060291 // GenBank // Mus musculus ripply3 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:70097 IMAGE:30135244), complete cds. // chr16 // 75 // 74 // 15 // 20 // 0 /// GENSCAN00000001413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:94303259:94335940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENSMUST00000101881 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:94429073:94429232:1 gene:ENSMUSG00000075829 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000119878 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:94570010:94695067:1 gene:ENSMUSG00000022897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140323 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430112C04 product:dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 1a, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_007890 // RefSeq // Mus musculus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 1a (Dyrk1a), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000143671 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:96082676:96089070:1 gene:ENSMUSG00000022915 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK007051 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700093J21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONMMUT027874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT027875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_207301 // RefSeq // Mus musculus tryptophan rich basic protein (Wrb), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006523091 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tryptophan rich basic protein (Wrb), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 82 // 71 // 14 // 17 // 0 /// ENSMUST00000023913 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:96145407:96157852:1 gene:ENSMUSG00000023147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC031769 // GenBank // Mus musculus tryptophan rich basic protein, mRNA (cDNA clone MGC:25932 IMAGE:4235618), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000140476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:96145407:96154775:1 gene:ENSMUSG00000023147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// AK021091 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030018G21 product:Tryptophan rich basic protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr16 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// GENSCAN00000004258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:96145477:96155952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
NM_015825 // RefSeq // Mus musculus SH3-binding domain glutamic acid-rich protein (Sh3bgr), mRNA. // chr16 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000048770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:96200470:96228933:1 gene:ENSMUSG00000040666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000132424 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:96200729:96224591:1 gene:ENSMUSG00000040666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 61 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000157060 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:96206643:96224563:1 gene:ENSMUSG00000040666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 30 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000166952 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:96200704:96220591:1 gene:ENSMUSG00000040666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 52 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000171181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:96200671:96224560:1 gene:ENSMUSG00000040666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000123728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:96200671:96228928:1 gene:ENSMUSG00000040666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// ENSMUST00000129904 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:96205719:96220591:1 gene:ENSMUSG00000040666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// AJ487014 // GenBank // Mus musculus mRNA for SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein (SH3BGR gene). // chr16 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// GENSCAN00000004230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:96200898:96220591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 45 // 14 // 15 // 0
NM_001122993 // RefSeq // Mus musculus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 5 (B3galt5), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_033149 // RefSeq // Mus musculus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 5 (B3galt5), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099497 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:96280798:96319857:1 gene:ENSMUSG00000074892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000113800 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:96235801:96319859:1 gene:ENSMUSG00000074892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC057887 // GenBank // Mus musculus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:67946 IMAGE:4983830), complete cds. // chr16 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:96282329:96316095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_008791 // RefSeq // Mus musculus Purkinje cell protein 4 (Pcp4), mRNA. // chr16 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061739 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:96467606:96525793:1 gene:ENSMUSG00000090223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC061164 // GenBank // Mus musculus Purkinje cell protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:74301 IMAGE:6593949), complete cds. // chr16 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// EF410138 // GenBank // Mus musculus Accn1/Pcp4 trans-spliced mRNA sequence. // chr16 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// ENSMUST00000113795 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:96361794:96525580:1 gene:ENSMUSG00000000159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// AK164699 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630012I06 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_019517 // RefSeq // Mus musculus beta-site APP-cleaving enzyme 2 (Bace2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000047275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:97356728:97439012:1 gene:ENSMUSG00000040605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF216310 // GenBank // Mus musculus aspartyl protease 1 mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// BC120773 // GenBank // Mus musculus beta-site APP-cleaving enzyme 2, mRNA (cDNA clone MGC:156010 IMAGE:40129696), complete cds. // chr16 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// BC131947 // GenBank // Mus musculus beta-site APP-cleaving enzyme 2, mRNA (cDNA clone MGC:163578 IMAGE:40130224), complete cds. // chr16 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:97356802:97436895:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NR_003508 // RefSeq // Mus musculus myxovirus (influenza virus) resistance 2 (Mx2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000024112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:97536083:97560899:1 gene:ENSMUSG00000023341 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK147949 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270112J10 product:myxovirus (influenza virus) resistance 2, full insert sequence. // chr16 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC007127 // GenBank // Mus musculus myxovirus (influenza virus) resistance 2, mRNA (cDNA clone MGC:5689 IMAGE:3591798), complete cds. // chr16 // 80 // 95 // 16 // 20 // 0 /// NM_013606 // RefSeq // Mus musculus myxovirus (influenza virus) resistance 2 (Mx2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 67 // 100 // 14 // 21 // 0 /// AB029920 // GenBank // Mus musculus mRNA for Mx2 protein, complete cds, feral strain NJL. // chr16 // 67 // 100 // 14 // 21 // 0 /// ENSMUST00000188251 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:97536081:97560900:1 gene:ENSMUSG00000023341 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000190447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:97535308:97560339:1 gene:ENSMUSG00000023341 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr16 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:97538646:97560569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
XM_006543348 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 709-like (LOC102641241), partial mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000113729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:98008629:98009008:1 gene:ENSMUSG00000080717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000122450 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:97997323:98010000:1 gene:ENSMUSG00000080717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK045713 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230307C23 product:similar to KRUPPEL-RELATED ZINC FINGER PROTEIN F80-L [Mus musculus], full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC056174 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5711158, partial cds. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001161790 // RefSeq // Mus musculus Mediterranean fever (Mefv), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NM_001161791 // RefSeq // Mus musculus Mediterranean fever (Mefv), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NM_019453 // RefSeq // Mus musculus Mediterranean fever (Mefv), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XM_006522361 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Mediterranean fever (Mefv), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522362 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Mediterranean fever (Mefv), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 93 // 43 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000023180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:3707215:3718124:-1 gene:ENSMUSG00000022534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000100222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:3707215:3718124:-1 gene:ENSMUSG00000022534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AF143409 // GenBank // Mus musculus pyrin (Mefv) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// BC108993 // GenBank // Mus musculus Mediterranean fever, mRNA (cDNA clone MGC:124344 IMAGE:40047838), complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC108994 // GenBank // Mus musculus Mediterranean fever, mRNA (cDNA clone MGC:124345 IMAGE:40047839), complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:3708906:3718062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0
NM_001033159 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 597 (Zfp597), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522576 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 597 (Zfp597), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000090522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:3861528:3872396:-1 gene:ENSMUSG00000039789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:3865290:3884561:-1 gene:ENSMUSG00000039789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000003661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:3865631:3889095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
AK018837 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700016D08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_026508 // RefSeq // Mus musculus TNF receptor-associated protein 1 (Trap1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000006137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:4039971:4077827:-1 gene:ENSMUSG00000005981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC022912 // GenBank // Mus musculus TNF receptor-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:28702 IMAGE:4242394), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000005212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4040123:4077780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000023165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:4081328:4213407:-1 gene:ENSMUSG00000022521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001025432 // RefSeq // Mus musculus CREB binding protein (Crebbp), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000023165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:4081328:4213407:-1 gene:ENSMUSG00000022521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4084048:4215206:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_001291910 // RefSeq // Mus musculus adenylate cyclase 9 (Adcy9), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// NM_009624 // RefSeq // Mus musculus adenylate cyclase 9 (Adcy9), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000005719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:4287545:4419587:-1 gene:ENSMUSG00000005580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000117801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:4287529:4419808:-1 gene:ENSMUSG00000005580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000120080 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:4287529:4420498:-1 gene:ENSMUSG00000005580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// U30602 // GenBank // Mus musculus adenylyl cyclase type 9 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4287898:4313766:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_175347 // RefSeq // Mus musculus sarcalumenin (Srl), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:4480228:4523075:-1 gene:ENSMUSG00000022519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000090500 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:4480216:4523075:-1 gene:ENSMUSG00000022519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB113383 // GenBank // Mus musculus SAR mRNA for sarcalumenin, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC145687 // GenBank // Mus musculus sarcalumenin, mRNA (cDNA clone MGC:175574 IMAGE:40130990), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000132284 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:4493603:4523063:-1 gene:ENSMUSG00000022519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENSMUST00000133440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:4487579:4541816:-1 gene:ENSMUSG00000022519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000005174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4445021:4523053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_031182 // RefSeq // Mus musculus transcription factor AP4 (Tfap4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006522761 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor AP4 (Tfap4), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006522763 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor AP4 (Tfap4), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006522764 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor AP4 (Tfap4), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006522765 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor AP4 (Tfap4), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006522766 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor AP4 (Tfap4), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000005862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:4544661:4559720:-1 gene:ENSMUSG00000005718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF161262 // GenBank // Mus musculus activator protein 4 (Ap4) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC047270 // GenBank // Mus musculus transcription factor AP4, mRNA (cDNA clone MGC:54445 IMAGE:6438955), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC054777 // GenBank // Mus musculus transcription factor AP4, mRNA (cDNA clone MGC:65697 IMAGE:6808430), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4545553:4570544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_145359 // RefSeq // Mus musculus UBA-like domain containing 1 (Ubald1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000037843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:4874778:4880315:-1 gene:ENSMUSG00000039568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC013706 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 100, member A, mRNA (cDNA clone MGC:19265 IMAGE:3987738), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC064081 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 100, member A, mRNA (cDNA clone MGC:73699 IMAGE:1364938), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000143873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:4874788:4879805:-1 gene:ENSMUSG00000039568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// BC056472 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1500031H01 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5719223), partial cds. // chr16 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// GENSCAN00000005082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4875519:4879736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
XM_006522611 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3 (Anks3), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// XM_006522614 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3 (Anks3), transcript variant X7, mRNA. // chr16 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// AK129471 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1977 protein. // chr16 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// BC051143 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:58444 IMAGE:6531161), complete cds. // chr16 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NM_028301 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3 (Anks3), mRNA. // chr16 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// ENSMUST00000023157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:4941415:4964237:-1 gene:ENSMUSG00000022515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// BC050929 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:61421 IMAGE:6807194), complete cds. // chr16 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// GENSCAN00000005074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4941813:4958166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
NM_027669 // RefSeq // Mus musculus septin 12 (Sept12), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_029374 // RefSeq // Mus musculus septin 12 (Sept12), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000170323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:4986858:4997852:-1 gene:ENSMUSG00000022542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC115618 // GenBank // Mus musculus septin 12, mRNA (cDNA clone MGC:144517 IMAGE:40102763), complete cds. // chr16 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC115619 // GenBank // Mus musculus septin 12, mRNA (cDNA clone MGC:144518 IMAGE:40102765), complete cds. // chr16 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:4987454:4996603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
NM_133185 // RefSeq // Mus musculus rogdi homolog (Drosophila) (Rogdi), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006522441 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus rogdi homolog (Drosophila) (Rogdi), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006522442 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus rogdi homolog (Drosophila) (Rogdi), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// XR_384585 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus rogdi homolog (Drosophila) (Rogdi), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000023191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:5008730:5013517:-1 gene:ENSMUSG00000022540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000090453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:5008755:5013517:-1 gene:ENSMUSG00000022540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// AY036117 // GenBank // Mus musculus leucine-zipper-containing transcription factor LZF (Lzf) mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// BC006914 // GenBank // Mus musculus rogdi homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:11970 IMAGE:3601096), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:5007395:5013507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001079814 // RefSeq // Mus musculus glyoxylate reductase 1 homolog (Arabidopsis) (Glyr1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_028720 // RefSeq // Mus musculus glyoxylate reductase 1 homolog (Arabidopsis) (Glyr1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006522645 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glyoxylate reductase 1 homolog (Arabidopsis) (Glyr1), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000023189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:5013906:5049910:-1 gene:ENSMUSG00000022536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000115844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:5013906:5049910:-1 gene:ENSMUSG00000022536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC006893 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3930401K13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:11922 IMAGE:3599477), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK140812 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130031D03 product:weakly similar to Cytokine-like nuclear factor n-pac [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000009072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:5015528:5037195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AK220569 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4248 protein. // chr16 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_008909 // RefSeq // Mus musculus periplakin (Ppl), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000035672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:5086291:5132481:-1 gene:ENSMUSG00000039457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// AF126834 // GenBank // Mus musculus periplakin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// BC057152 // GenBank // Mus musculus periplakin, mRNA (cDNA clone IMAGE:5337379), complete cds. // chr16 // 100 // 72 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000009037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:5087165:5132343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0
NM_013796 // RefSeq // Mus musculus N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase (Nagpa), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_027804 // RefSeq // Mus musculus N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase (Nagpa), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006522216 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase (Nagpa), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023911 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:5195289:5204012:-1 gene:ENSMUSG00000023143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000144490 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:5199813:5203477:-1 gene:ENSMUSG00000023143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000147567 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:5195289:5204002:-1 gene:ENSMUSG00000023143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC039790 // GenBank // Mus musculus N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase, mRNA (cDNA clone MGC:49786 IMAGE:4951805), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AK169539 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630086J17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000009062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:5195848:5207620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT025310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001033220 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AU021092 (AU021092), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000050160 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:5211828:5222299:-1 gene:ENSMUSG00000051669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC150828 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AU021092, mRNA (cDNA clone MGC:183739 IMAGE:9087739), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC171979 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AU021092, mRNA (cDNA clone MGC:198684 IMAGE:9054265), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:5211992:5222258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0
NM_027446 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 86 (Fam86), mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064635 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:5244152:5255983:-1 gene:ENSMUSG00000022544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132225 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:5244879:5255941:-1 gene:ENSMUSG00000022544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000139584 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:5247375:5255956:-1 gene:ENSMUSG00000022544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// AK017533 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730409G15 product:hypothetical S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases structure containing protein, full insert sequence. // chr16 // 89 // 61 // 17 // 19 // 0 /// BC051078 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730409G15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:59002 IMAGE:6311572), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000140718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:5249075:5255929:-1 gene:ENSMUSG00000022544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000009063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:5246207:5261158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
ENSMUST00000122624 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:5324036:5324157:-1 gene:ENSMUSG00000084573 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT025320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_029070 // RefSeq // Mus musculus claudin 26 (Cldn26), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:8409276:8425136:-1 gene:ENSMUSG00000022715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027071 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 114, mRNA (cDNA clone IMAGE:5357758), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147190 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 114, mRNA (cDNA clone MGC:182340 IMAGE:9056234), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC147191 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 114, mRNA (cDNA clone MGC:182320 IMAGE:9056214), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:8409529:8424652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000118361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:8623186:8623720:-1 gene:ENSMUSG00000083505 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 61 // 100 // 11 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:8623111:8623443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_025708 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 186 (Tmem186), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052505 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:8633884:8637712:-1 gene:ENSMUSG00000043140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC027261 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 186, mRNA (cDNA clone MGC:27743 IMAGE:2649343), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC058268 // GenBank HTC // Mus musculus transmembrane protein 186, mRNA (cDNA clone IMAGE:6490334), with apparent retained intron. // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_025821 // RefSeq // Mus musculus calcium regulated heat stable protein 1 (Carhsp1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006522347 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium regulated heat stable protein 1 (Carhsp1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000008537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:8658587:8672153:-1 gene:ENSMUSG00000008393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC011225 // GenBank // Mus musculus calcium regulated heat stable protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:19027 IMAGE:4166353), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC086754 // GenBank // Mus musculus calcium regulated heat stable protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:101919 IMAGE:6812962), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000122788 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:8766169:8766276:-1 gene:ENSMUSG00000084737 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT025411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_008170 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor, ionotropic, NMDA2A (epsilon 1) (Grin2a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006521795 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate receptor, ionotropic, NMDA2A (epsilon 1) (Grin2a), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000032331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:9577827:9992533:-1 gene:ENSMUSG00000059003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000115835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:9577710:9994921:-1 gene:ENSMUSG00000059003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// D10217 // GenBank // Mus musculus mRNA for N-methyl-D-aspartate receptor channel subunit epsilon 1, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:9583407:9720880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1
NM_007929 // RefSeq // Mus musculus epithelial membrane protein 2 (Emp2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000078357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:10281749:10313968:-1 gene:ENSMUSG00000022505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF083876 // GenBank // Mus musculus XMP (Xmp) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF346627 // GenBank // Mus musculus epithelial membrane protein 2 (Emp2) mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC041670 // GenBank // Mus musculus epithelial membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:49600 IMAGE:3663158), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:10284170:10292339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001099275 // RefSeq // Mus musculus tektin 5 (Tekt5), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_001291001 // RefSeq // Mus musculus tektin 5 (Tekt5), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000043415 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:10357948:10395490:-1 gene:ENSMUSG00000039179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000115831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:10361254:10395448:-1 gene:ENSMUSG00000039179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC115969 // GenBank // Mus musculus tektin 5, mRNA (cDNA clone MGC:144895 IMAGE:40107624), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GQ292766 // GenBank // Mus musculus strain CD-1 tektin 5 (Tekt5) mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006522536 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tektin 5 (Tekt5), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000038906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:10358006:10395419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_021428 // RefSeq // Mus musculus dexamethasone-induced transcript (Dexi), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038281 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:10530207:10543054:-1 gene:ENSMUSG00000038055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:10530207:10531809:-1 gene:ENSMUSG00000038055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AF152470 // GenBank // Mus musculus DEXI mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC017551 // GenBank // Mus musculus dexamethasone-induced transcript, mRNA (cDNA clone MGC:28993 IMAGE:4910742), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184863 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:10502531:10543054:-1 gene:ENSMUSG00000038055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// AK032104 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330587M05 product:dexamethasone-induced transcript, full insert sequence. // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001271603 // RefSeq // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 1 (Socs1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_009896 // RefSeq // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 1 (Socs1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:10783808:10785536:-1 gene:ENSMUSG00000038037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AB000677 // GenBank // Mus musculus mRNA for JAB, complete cds. // chr16 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// AB000710 // GenBank // Mus musculus mRNA for stat-induced stat inhibitor-1, complete cds. // chr16 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// AF120490 // GenBank // Mus musculus suppressor of cytokine signalling-1 (Socs1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF180302 // GenBank // Mus musculus suppressor of cytokine signalling-1 (Socs1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC132366 // GenBank // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 1, mRNA (cDNA clone MGC:163997 IMAGE:40130643), complete cds. // chr16 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC132368 // GenBank // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 1, mRNA (cDNA clone MGC:163999 IMAGE:40130645), complete cds. // chr16 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// U88325 // GenBank // Mus musculus suppressor of cytokine signalling-1 (SOCS-1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:10784233:10788601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_013694 // RefSeq // Mus musculus transition protein 2 (Tnp2), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000051297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:10787936:10788655:-1 gene:ENSMUSG00000043050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// BC092529 // GenBank // Mus musculus transition protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:107172 IMAGE:6773112), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// J03494 // GenBank // Mouse, transition protein 2 (TP2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// X17068 // GenBank // Mouse mRNA for protein with homology to transition protein 2 (TP2). // chr16 // 98 // 96 // 46 // 47 // 0 /// GENSCAN00000038895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:10784233:10788601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 55 // 55 // 27 // 49 // 1
NM_013638 // RefSeq // Mus musculus protamine 3 (Prm3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:10790505:10790914:-1 gene:ENSMUSG00000050058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061127 // GenBank // Mus musculus protamine 3, mRNA (cDNA clone MGC:74255 IMAGE:6771130), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090986 // GenBank // Mus musculus protamine 3, mRNA (cDNA clone MGC:107276 IMAGE:6740459), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:10790584:10791998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_008933 // RefSeq // Mus musculus protamine 2 (Prm2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:10791380:10792105:-1 gene:ENSMUSG00000038015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049612 // GenBank // Mus musculus protamine 2, mRNA (cDNA clone MGC:58301 IMAGE:6774072), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M27501 // GenBank // Mus musculus protamine 2 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000189593 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:10791537:10796134:-1 gene:ENSMUSG00000038015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:10790584:10791998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_013637 // RefSeq // Mus musculus protamine 1 (Prm1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:10796326:10796886:-1 gene:ENSMUSG00000022501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049599 // GenBank // Mus musculus protamine 1, mRNA (cDNA clone MGC:58255 IMAGE:6773822), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC059733 // GenBank // Mus musculus protamine 1, mRNA (cDNA clone MGC:74397 IMAGE:6774637), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// K02926 // GenBank // Mouse protamine 1 mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// M27500 // GenBank // Mus musculus protamine mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
NM_019980 // RefSeq // Mus musculus LPS-induced TN factor (Litaf), mRNA. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006522427 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus LPS-induced TN factor (Litaf), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000023143 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:10959275:10993121:-1 gene:ENSMUSG00000022500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000117360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:10960824:10975579:-1 gene:ENSMUSG00000022500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// AF171100 // GenBank // Mus musculus TBX1 protein mRNA, complete cds. // chr16 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// AF230522 // GenBank // Mus musculus LITAF-like protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC018559 // GenBank // Mus musculus LPS-induced TN factor, mRNA (cDNA clone MGC:6569 IMAGE:2812674), complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000001165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:10960943:11059158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
AK046786 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B830007H12 product:hypothetical Glutamic acid-rich region containing protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000162323 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:10963343:11066157:-1 gene:ENSMUSG00000022500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSMUST00000082631 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:11167105:11167267:-1 gene:ENSMUSG00000064565 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT025502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025546 // RefSeq // Mus musculus ribosomal L1 domain containing 1 (Rsl1d1), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000119953 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:11192970:11203331:-1 gene:ENSMUSG00000005846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000124454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:11196444:11203264:-1 gene:ENSMUSG00000005846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC034355 // GenBank // Mus musculus ribosomal L1 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:27753 IMAGE:2651674), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// DQ445383 // GenBank // Mus musculus domesticus NMRI liver pBK1 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:11190250:11239079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_001130008 // RefSeq // Mus musculus G1 to S phase transition 1 (Gspt1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_146066 // RefSeq // Mus musculus G1 to S phase transition 1 (Gspt1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000080030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:11220052:11254209:-1 gene:ENSMUSG00000062203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000167571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:11219292:11254270:-1 gene:ENSMUSG00000062203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC028325 // GenBank // Mus musculus G1 to S phase transition 1, mRNA (cDNA clone MGC:36230 IMAGE:4506483), complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC031640 // GenBank // Mus musculus G1 to S phase transition 1, mRNA (cDNA clone MGC:36735 IMAGE:4015544), complete cds. // chr16 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:11190250:11239079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
GENSCAN00000011747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:12936556:12951187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0
NR_037997 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310015D24 gene (2310015D24Rik), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000187920 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:13514131:13520419:-1 gene:ENSMUSG00000099411 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KnowTID_00003248 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT025561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000186717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:13519193:13521107:-1 gene:ENSMUSG00000099411 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:13516401:13672481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_028761 // RefSeq // Mus musculus poly(A)-specific ribonuclease (deadenylation nuclease) (Parn), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522649 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus poly(A)-specific ribonuclease (deadenylation nuclease) (Parn), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000058884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:13537964:13668170:-1 gene:ENSMUSG00000022685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK041044 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530068O20 product:poly(A)-specific ribonuclease (deadenylation nuclease), full insert sequence. // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC021899 // GenBank // Mus musculus poly(A)-specific ribonuclease (deadenylation nuclease), mRNA (cDNA clone MGC:28327 IMAGE:4015784), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK049829 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630002G12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:13516401:13672481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
BC006659 // GenBank HTC // Mus musculus LOC622757 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3501077), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
ENSMUST00000178021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:13982799:13984621:-1 gene:ENSMUSG00000065968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC115786 // GenBank // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:144704 IMAGE:40105118), complete cds. // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC115814 // GenBank // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:144705 IMAGE:40105119), complete cds. // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001081154 // RefSeq // Mus musculus meiosis arrest female 1 (Marf1), mRNA. // chr16 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000090300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:14109166:14159274:-1 gene:ENSMUSG00000060657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// AK220341 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0430 protein. // chr16 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000026763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:14111530:14159479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_001161775 // RefSeq // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 11, smooth muscle (Myh11), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// NM_013607 // RefSeq // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 11, smooth muscle (Myh11), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000090287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:14194527:14291408:-1 gene:ENSMUSG00000018830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC026142 // GenBank // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 11, smooth muscle, mRNA (cDNA clone MGC:13920 IMAGE:3989495), complete cds. // chr16 // 90 // 98 // 37 // 41 // 0 /// D85923 // GenBank // Mus musculus mRNA for myosin, complete cds. // chr16 // 95 // 95 // 38 // 40 // 0 /// D85924 // GenBank // Mus musculus mRNA for myosin, complete cds. // chr16 // 95 // 98 // 39 // 41 // 0 /// GENSCAN00000026764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:14195052:14259465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0
NM_025345 // RefSeq // Mus musculus Fgfr1op N-terminal like (Fopnl), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:14299244:14317375:-1 gene:ENSMUSG00000022677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120707 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:14299244:14317347:-1 gene:ENSMUSG00000022677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC011300 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610037P05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:19242 IMAGE:3671642), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522450 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Fgfr1op N-terminal like (Fopnl), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000148278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:14299442:14317332:-1 gene:ENSMUSG00000022677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// AK002785 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610037P05 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK135171 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6620402H07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:14272691:14353224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT025605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT025606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XR_396883 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA F830005K03 gene (F830005K03Rik), misc_RNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK089630 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830005K03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KnowTID_00003250 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT025623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000091759 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:15216859:15217328:-1 gene:ENSMUSG00000069315 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:15197416:15217328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 78 // 86 // 14 // 18 // 0 /// NONMMUT025624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001159351 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2 (Ube2v2), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NM_023585 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2 (Ube2v2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000115777 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:15552677:15594524:-1 gene:ENSMUSG00000022674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC083098 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2, mRNA (cDNA clone MGC:102399 IMAGE:30460946), complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
NM_008565 // RefSeq // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 4 homolog (S. cerevisiae) (Mcm4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000023353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:15623897:15637400:-1 gene:ENSMUSG00000022673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC013094 // GenBank // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 4 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:6023 IMAGE:3584640), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// D26089 // GenBank // Mus musculus mRNA for mcdc21 protein, complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AK083618 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030054K02 product:mini chromosome maintenance deficient 4 homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr16 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// GENSCAN00000021718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:15624677:15648865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_029354 // RefSeq // Mus musculus mitotic spindle organizing protein 2 (Mzt2), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023351 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:16:15848441:15863347:-1 gene:ENSMUSG00000022671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137864 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:15848443:15862722:-1 gene:ENSMUSG00000022671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC027550 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 128, member B, mRNA (cDNA clone MGC:41299 IMAGE:2936720), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006522588 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitotic spindle organizing protein 2 (Mzt2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSMUST00000117136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:15848450:15863369:-1 gene:ENSMUSG00000022671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// AK011255 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610001E06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONMMUT025627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000021721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:15848572:15864410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_146068 // RefSeq // Mus musculus scaffolding protein involved i DNA repair (Spidr), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000040248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:15889227:16146851:-1 gene:ENSMUSG00000041974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK170784 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630119L06 product:Hypothetical aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II containing protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr16 // 97 // 71 // 29 // 30 // 0 /// AK172902 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0146 protein. // chr16 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// BC026877 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310008H04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3674273), complete cds. // chr16 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// BC089026 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310008H04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:115787 IMAGE:30615298), complete cds. // chr16 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000044427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:15889630:16100055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 71 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:16112105:16146777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0
NM_146335 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 19 (Olfr19), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000057886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:16672998:16674017:-1 gene:ENSMUSG00000048101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC132306 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 19, mRNA (cDNA clone MGC:163937 IMAGE:40130583), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_045920 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933404G15 gene (4933404G15Rik), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// KnowTID_00003252 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:16422563:16863889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_015773 // RefSeq // Mus musculus sperm associated antigen 6 (Spag6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:16753016:16829313:-1 gene:ENSMUSG00000022783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF173866 // GenBank // Mus musculus axoneme central apparatus protein (Spag6) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC090660 // GenBank // Mus musculus sperm associated antigen 6, mRNA (cDNA clone MGC:116688 IMAGE:30673350), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC100455 // GenBank // Mus musculus sperm associated antigen 6, mRNA (cDNA clone MGC:118271 IMAGE:30919921), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000154624 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:16766380:16829320:-1 gene:ENSMUSG00000022783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// AK054199 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230028C21 product:sperm associated antigen 6, full insert sequence. // chr16 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000044434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:16422563:16863889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001190325 // RefSeq // Mus musculus immunoglobulin lambda-like polypeptide 1 (Igll1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000100136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:16860671:16863985:-1 gene:ENSMUSG00000075370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000124649 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:16860674:16863985:-1 gene:ENSMUSG00000075370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000124890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:16860671:16863817:-1 gene:ENSMUSG00000075370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:16422563:16863889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT025649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_016982 // RefSeq // Mus musculus pre-B lymphocyte gene 1 (Vpreb1), mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000075017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:16868403:16869255:-1 gene:ENSMUSG00000059305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000132272 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:16868405:16870843:-1 gene:ENSMUSG00000059305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// BC117051 // GenBank // Mus musculus pre-B lymphocyte gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:151428 IMAGE:40126370), complete cds. // chr16 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// BC119175 // GenBank // Mus musculus pre-B lymphocyte gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:155491 IMAGE:8733924), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// BC144850 // GenBank // Mus musculus pre-B lymphocyte gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:178406 IMAGE:9053398), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000120357 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17081999:17082691:-1 gene:ENSMUSG00000055497 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK087378 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130002D13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONMMUT025669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000093336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:17113399:17125106:-1 gene:ENSMUSG00000049916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC039993 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610318N02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:48115 IMAGE:1446463), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NR_029659 // RefSeq // Mus musculus microRNA 130b (Mir130b), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000083638 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:17124061:17124142:-1 gene:ENSMUSG00000065572 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-130b // miRBase Micro RNA Database // MI0000408 Mus musculus miR-130b stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT025675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_030415 // RefSeq // Mus musculus microRNA 301b (Mir301b), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000102333 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:17124400:17124496:-1 gene:ENSMUSG00000076288 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-mir-301b // miRBase Micro RNA Database // MI0004122 Mus musculus miR-301b stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT025676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_022324 // RefSeq // Mus musculus stromal cell-derived factor 2-like 1 (Sdf2l1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023453 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:17130138:17132383:-1 gene:ENSMUSG00000022769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB043006 // GenBank // Mus musculus SDF2L1 mRNA for SDF2 like protein 1, complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC053425 // GenBank // Mus musculus stromal cell-derived factor 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:59276 IMAGE:6508268), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17130507:17132310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_009456 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3 (Ube2l3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000090192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:17152015:17201492:-1 gene:ENSMUSG00000038965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000115699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17152013:17202649:-1 gene:ENSMUSG00000038965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC093503 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3, mRNA (cDNA clone MGC:103205 IMAGE:4216580), complete cds. // chr16 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// BC106149 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3, mRNA (cDNA clone MGC:118100 IMAGE:4502101), complete cds. // chr16 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// X97042 // GenBank // Mus musculus mRNA for UBcM4 protein. // chr16 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0
ENSMUST00000083397 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:17341906:17342012:-1 gene:ENSMUSG00000065331 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT025694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_030558 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 15 (Car15), mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:17835276:17838364:-1 gene:ENSMUSG00000090236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17835277:17891671:-1 gene:ENSMUSG00000092470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AF231122 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase XV (Car15) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC019975 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 15, mRNA (cDNA clone MGC:28637 IMAGE:4223351), complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17835327:17849794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_001081633 // RefSeq // Mus musculus DiGeorge syndrome critical region gene 14 (Dgcr14), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_022408 // RefSeq // Mus musculus DiGeorge syndrome critical region gene 14 (Dgcr14), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000003621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:17900711:17911348:-1 gene:ENSMUSG00000003527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF037256 // GenBank // Mus musculus ES2 protein (Es2) mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// BC013711 // GenBank // Mus musculus DiGeorge syndrome critical region gene 14, mRNA (cDNA clone MGC:11442 IMAGE:3708646), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17902044:17911305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_029469 // RefSeq // Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000012279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:17913107:17915059:-1 gene:ENSMUSG00000022738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK016252 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930568H22 product:GOOSECOID 2 (FRAGMENT) homolog [Gallus gallus], full insert sequence. // chr16 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC125356 // GenBank // Mus musculus goosecoid homebox 2, mRNA (cDNA clone MGC:159059 IMAGE:40129871), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC132637 // GenBank // Mus musculus goosecoid homebox 2, mRNA (cDNA clone MGC:164268 IMAGE:40130914), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17913617:17915042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_153150 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, citrate transporter), member 1 (Slc25a1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000003622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:17925211:17928219:-1 gene:ENSMUSG00000003528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000129270 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17925682:17927343:-1 gene:ENSMUSG00000003528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000131507 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:17925716:17927416:-1 gene:ENSMUSG00000003528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000142022 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17927150:17928129:-1 gene:ENSMUSG00000003528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000147384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17927417:17928209:-1 gene:ENSMUSG00000003528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC037087 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, citrate transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:47055 IMAGE:5124403), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000150925 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:17926266:17927887:-1 gene:ENSMUSG00000003528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000006615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:17925813:17928079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT025724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_011172 // RefSeq // Mus musculus proline dehydrogenase (Prodh), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006521863 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline dehydrogenase (Prodh), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006521864 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline dehydrogenase (Prodh), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// XR_384535 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline dehydrogenase (Prodh), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000003620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:18071726:18089292:-1 gene:ENSMUSG00000003526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000126087 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:18072256:18079942:-1 gene:ENSMUSG00000003526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000136776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:18071726:18090203:-1 gene:ENSMUSG00000003526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000141635 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:18072126:18079268:-1 gene:ENSMUSG00000003526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AF120279 // GenBank // Mus musculus proline dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr16 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC125327 // GenBank // Mus musculus proline dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:159030 IMAGE:40129842), complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:18072176:18144994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NR_015575 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933432I09 gene (4933432I09Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_027843 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933432I09 gene (4933432I09Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// KnowTID_00003254 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// KnowTID_00003255 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// KnowTID_00003256 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// KnowTID_00003257 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT025734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT025735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT025736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT025737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT025738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_172151 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 8 (Zdhhc8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000076957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:18220754:18235136:-1 gene:ENSMUSG00000060166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000184988 // ENSEMBL // proj_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG3833_PATCH:18220754:18235136:-1 gene:ENSMUSG00000099262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY668947 // GenBank // Mus musculus DHHC-containing protein 8 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AY894892 // GenBank // Mus musculus membrane-associated DHHC8 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:18221424:18248562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000056920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG3833_PATCH:18226459:18248562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NR_029571 // RefSeq // Mus musculus microRNA 185 (Mir185), microRNA. // chr16 // 79 // 89 // 19 // 24 // 0 /// ENSMUST00000083530 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:18327393:18327472:-1 gene:ENSMUSG00000065464 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000184719 // ENSEMBL // proj_ncrna:known chromosome:GRCm38:MG3833_PATCH:18327393:18327472:-1 gene:ENSMUSG00000098554 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-185 // miRBase Micro RNA Database // MI0000227 Mus musculus miR-185 stem-loop // chr16 // 79 // 89 // 19 // 24 // 0 /// NONMMUT025756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 79 // 89 // 19 // 24 // 0
NM_001285472 // RefSeq // Mus musculus T-box 1 (Tbx1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// NM_001285476 // RefSeq // Mus musculus T-box 1 (Tbx1), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NM_011532 // RefSeq // Mus musculus T-box 1 (Tbx1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000009241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:18581713:18586969:-1 gene:ENSMUSG00000009097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// AF326960 // GenBank // Mus musculus T-box 1 (Tbx1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// AF349658 // GenBank // Mus musculus T-box 1 transcription factor (Tbx1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC139474 // GenBank // Mus musculus T-box 1, mRNA (cDNA clone MGC:171101 IMAGE:8862496), complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// AK029096 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732491B01 product:predicted gene Vo59c07 (T-BOX TRANSCRIPTION FACTOR TBX1 (T-BOX PROTEIN 1) (TESTIS-SPECIFIC T-BOX PROTEIN), full insert sequence. // chr16 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1 /// GENSCAN00000006606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:18581993:18613669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0
NM_001001999 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein Ib, beta polypeptide (Gp1bb), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 45 // 29 // 29 // 0 /// NM_213614 // RefSeq // Mus musculus septin 5 (Sept5), mRNA. // chr16 // 100 // 63 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000096987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:18621811:18629938:-1 gene:ENSMUSG00000072214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 40 // 40 // 0 /// BC138156 // GenBank // Mus musculus glycoprotein Ib, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:169780 IMAGE:8861175), complete cds. // chr16 // 97 // 45 // 28 // 29 // 0 /// BC141073 // GenBank // Mus musculus septin 5, mRNA (cDNA clone MGC:176034 IMAGE:9055685), complete cds. // chr16 // 100 // 52 // 33 // 33 // 0 /// BC145160 // GenBank // Mus musculus glycoprotein Ib, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:178719 IMAGE:9053711), complete cds. // chr16 // 97 // 45 // 28 // 29 // 0 /// BC145331 // GenBank // Mus musculus septin 5, mRNA (cDNA clone MGC:178895 IMAGE:9053887), complete cds. // chr16 // 100 // 52 // 33 // 33 // 0 /// BC145332 // GenBank // Mus musculus septin 5, mRNA (cDNA clone MGC:178896 IMAGE:9053888), complete cds. // chr16 // 100 // 52 // 33 // 33 // 0 /// NM_010327 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein Ib, beta polypeptide (Gp1bb), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 39 // 39 // 25 // 64 // 1 /// ENSMUST00000167388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:18620319:18622403:-1 gene:ENSMUSG00000050761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 39 // 39 // 25 // 64 // 1 /// GENSCAN00000006611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:18620722:18629850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 66 // 42 // 42 // 0
NM_010922 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L40 (Mrpl40), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023391 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:18872018:18876767:-1 gene:ENSMUSG00000022706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119273 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:18872226:18876539:-1 gene:ENSMUSG00000022706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF034092 // GenBank // Mus musculus nuclear localization signal containing protein (Nlvcf) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC028436 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L40, mRNA (cDNA clone MGC:41161 IMAGE:1246513), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:18854566:18876523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
AF138740 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin J-C lambda 1 cluster mRNA sequence. // chr16 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC106994 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40044641. // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// HQ724329 // GenBank // Mus musculus anti-human Langerin 2G3 lambda chain mRNA, complete cds. // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// M94350 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin lambda chain (IgL) mRNA, complete cds. // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000045223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19061752:19087488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000103752 // ENSEMBL // ensembl_ig_gene:known chromosome:GRCm38:16:19260401:19260844:-1 gene:ENSMUSG00000076940 gene_biotype:IG_LV_gene transcript_biotype:IG_LV_gene // chr16 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// M34598 // GenBank // Mouse Ig active lambda-chain mRNA Vx-J2-C2-region, complete cds. // chr16 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000103749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19198401:19200351:-1 gene:ENSMUSG00000076937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// AF138741 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin J-C lambda 2 cluster mRNA sequence. // chr16 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// AK008551 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010309G21 product:Mus musculus germline J and C regions of immuoglobulin lambda-2 and germline J and C regions of the immuoglobulin lambda-4 pseudo-gene, full insert sequence. // chr16 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// M94350 // GenBank // Mus musculus immunoglobulin lambda chain (IgL) mRNA, complete cds. // chr16 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// GENSCAN00000045237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19194999:19260844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_146451 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 164 (Olfr164), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000056727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19285743:19286837:-1 gene:ENSMUSG00000050742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC145676 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 164, mRNA (cDNA clone MGC:175563 IMAGE:40130979), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19285794:19407882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_146466 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 165 (Olfr165), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19407039:19408078:-1 gene:ENSMUSG00000050158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120624 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 165, mRNA (cDNA clone MGC:155861 IMAGE:40129547), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120626 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 165, mRNA (cDNA clone MGC:155863 IMAGE:40129549), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19285794:19407882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_146935 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 167 (Olfr167), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19514696:19515634:-1 gene:ENSMUSG00000045341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19514696:19530603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_146357 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 168 (Olfr168), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000078554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19529980:19530918:-1 gene:ENSMUSG00000061361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC127969 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 168, mRNA (cDNA clone MGC:157521 IMAGE:40135070), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19514696:19530603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
NM_001011855 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 169 (Olfr169), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000090062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19565940:19566881:-1 gene:ENSMUSG00000068535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_146957 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 170 (Olfr170), mRNA. // chr16 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// NM_146958 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 171 (Olfr171), mRNA. // chr16 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19624157:19625101:-1 gene:ENSMUSG00000060480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19605696:19606703:-1 gene:ENSMUSG00000062245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// BC132585 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 170, mRNA (cDNA clone MGC:164216 IMAGE:40130862), complete cds. // chr16 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// BC132587 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 170, mRNA (cDNA clone MGC:164218 IMAGE:40130864), complete cds. // chr16 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19565940:19624966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146957 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 170 (Olfr170), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19605696:19606703:-1 gene:ENSMUSG00000062245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132585 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 170, mRNA (cDNA clone MGC:164216 IMAGE:40130862), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132587 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 170, mRNA (cDNA clone MGC:164218 IMAGE:40130864), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19565940:19624966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146958 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 171 (Olfr171), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000079891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19624157:19625101:-1 gene:ENSMUSG00000060480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000045231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19565940:19624966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
NM_177356 // RefSeq // Mus musculus lysosomal-associated membrane protein 3 (Lamp3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000081880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19653381:19706365:-1 gene:ENSMUSG00000041247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19655387:19722134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NR_015488 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A930003A15 gene (A930003A15Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_027896 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A930003A15 gene (A930003A15Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000100083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:19876570:19883897:-1 gene:ENSMUSG00000075330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT025800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_183390 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 6 (Klhl6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000058839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:19946499:19983037:-1 gene:ENSMUSG00000043008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000166801 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:19956970:19983007:-1 gene:ENSMUSG00000043008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000171910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:19956950:19966319:-1 gene:ENSMUSG00000043008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AY350736 // GenBank // Mus musculus kelch-like protein KLHL6 mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC100568 // GenBank // Mus musculus kelch-like 6 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:118659 IMAGE:30073940), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:19946991:19982976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_198599 // RefSeq // Mus musculus MAP6 domain containing 1 (Map6d1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:20233310:20241358:-1 gene:ENSMUSG00000041205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116220 // GenBank // Mus musculus MAP6 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:143618 IMAGE:40091320), complete cds. // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC116221 // GenBank // Mus musculus MAP6 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:143619 IMAGE:40091321), complete cds. // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_183158 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily ab, polypeptide 1 (Cyp2ab1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006522043 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily ab, polypeptide 1 (Cyp2ab1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006522044 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily ab, polypeptide 1 (Cyp2ab1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000023513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:20308387:20323065:-1 gene:ENSMUSG00000022818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000182508 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20308387:20323008:-1 gene:ENSMUSG00000022818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000182736 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20309670:20314210:-1 gene:ENSMUSG00000022818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000182741 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:20309776:20316750:-1 gene:ENSMUSG00000022818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC138088 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 2, subfamily ab, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:169712 IMAGE:8861107), complete cds. // chr16 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000039310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20309776:20316059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NR_030670 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15760 (Gm15760), non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20545918:20546200:-1 gene:ENSMUSG00000080797 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT025847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT025848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_145939 // RefSeq // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 3 (alpha-1,3-mannosyltransferase) (Alg3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000045918 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:20605451:20610768:-1 gene:ENSMUSG00000033809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000123774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20605473:20610747:-1 gene:ENSMUSG00000033809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000127454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:20605472:20610731:-1 gene:ENSMUSG00000033809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC031893 // GenBank // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 3 homolog (yeast, alpha-1,3-mannosyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:36684 IMAGE:5371807), complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20605555:20610738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_028420 // RefSeq // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 2 (Camk2n2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052939 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:20619215:20621287:-1 gene:ENSMUSG00000051146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147550 // GenBank // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 2, mRNA (cDNA clone MGC:182647 IMAGE:9056541), complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC147736 // GenBank // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 2, mRNA (cDNA clone MGC:182791 IMAGE:9056685), complete cds. // chr16 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// BC147745 // GenBank // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 2, mRNA (cDNA clone MGC:182800 IMAGE:9056694), complete cds. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC157896 // GenBank // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 2, mRNA (cDNA clone MGC:182653 IMAGE:9056547), complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20620173:20622645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001173505 // RefSeq // Mus musculus thrombopoietin (Thpo), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_001289894 // RefSeq // Mus musculus thrombopoietin (Thpo), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_001289896 // RefSeq // Mus musculus thrombopoietin (Thpo), transcript variant 4, mRNA. // chr16 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NM_009379 // RefSeq // Mus musculus thrombopoietin (Thpo), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076422 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:20725158:20730627:-1 gene:ENSMUSG00000022847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000115437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:20725158:20734511:-1 gene:ENSMUSG00000022847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC003803 // GenBank // Mus musculus thrombopoietin, mRNA (cDNA clone MGC:6080 IMAGE:3593885), complete cds. // chr16 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// L34169 // GenBank // Mus musculus thrombopoietin mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// XM_006521986 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thrombopoietin (Thpo), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// XM_006521988 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thrombopoietin (Thpo), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// GENSCAN00000039305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:20725408:20730736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_025634 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310042E22 gene (2310042E22Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000170665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:21152655:21154000:-1 gene:ENSMUSG00000090356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC115655 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310042E22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144564 IMAGE:40103183), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC115656 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310042E22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144565 IMAGE:40103184), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XR_396899 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus melanoma antigen family F, 1 (Magef1), misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK018285 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430590I03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:21322652:21338559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// KnowTID_00003264 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001881 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2510009E07 gene (2510009E07Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522599 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2510009E07 gene (2510009E07Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000053336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:21649045:21694665:-1 gene:ENSMUSG00000043391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC072629 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2510009E07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:99929 IMAGE:6833156), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK051892 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230016A15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// AK053253 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130001M03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_023737 // RefSeq // Mus musculus enoyl-Coenzyme A, hydratase/3-hydroxyacyl Coenzyme A dehydrogenase (Ehhadh), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:21761287:21787844:-1 gene:ENSMUSG00000022853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC016899 // GenBank // Mus musculus enoyl-Coenzyme A, hydratase/3-hydroxyacyl Coenzyme A dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:19225 IMAGE:4241677), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:21758970:21819314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_025693 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 41a (Tmem41a), transcript variant 1, mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_037773 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 41a (Tmem41a), transcript variant 2, non-coding RNA. // chrUn // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000023562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:21934327:21947552:-1 gene:ENSMUSG00000022856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK160292 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730578N08 product:NYGGF3 (Fragment) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chrUn // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC019770 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 41a, mRNA (cDNA clone MGC:30556 IMAGE:5124769), complete cds. // chrUn // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:21934825:21947486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001083894 // RefSeq // Mus musculus lipase, member H (Liph), transcript variant 1, mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001289581 // RefSeq // Mus musculus lipase, member H (Liph), transcript variant 3, mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001289582 // RefSeq // Mus musculus lipase, member H (Liph), transcript variant 4, mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_153404 // RefSeq // Mus musculus lipase, member H (Liph), transcript variant 2, mRNA. // chrUn // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000060673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:21953826:21995542:-1 gene:ENSMUSG00000044626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000074230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:21953826:21995542:-1 gene:ENSMUSG00000044626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY093499 // GenBank // Mus musculus lipase H (Liph) mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC037489 // GenBank // Mus musculus lipase, member H, mRNA (cDNA clone MGC:47395 IMAGE:4487939), complete cds. // chrUn // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:21956090:22010664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
ENSMUST00000129913 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:22059055:22163019:-1 gene:ENSMUSG00000033581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK077404 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430439D08 product:HEPATOCELLULAR CARCINOMA AUTOANTIGEN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// AY531659 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 2 (Imp2) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// NM_183029 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 2 (Igf2bp2), mRNA. // chr16 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// ENSMUST00000100052 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:22059009:22163299:-1 gene:ENSMUSG00000033581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// ENSMUST00000115379 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:22059460:22161450:-1 gene:ENSMUSG00000033581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1 /// ENSMUST00000134188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:22059074:22089118:-1 gene:ENSMUSG00000033581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// BC023758 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C330012H03 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5354659), partial cds. // chr16 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// GENSCAN00000011148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:22060793:22141282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
NM_009186 // RefSeq // Mus musculus transformer 2 beta homolog (Drosophila) (Tra2b), mRNA. // chr16 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000161286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:22244549:22266005:-1 gene:ENSMUSG00000022858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// XM_006521878 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transformer 2 beta homolog (Drosophila) (Tra2b), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1 /// ENSMUST00000162413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:22246462:22265829:-1 gene:ENSMUSG00000022858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
NM_023794 // RefSeq // Mus musculus ets variant 5 (Etv5), mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000079601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:22381309:22439719:-1 gene:ENSMUSG00000013089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000165506 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:22401864:22439616:-1 gene:ENSMUSG00000013089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000168774 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:22381316:22436514:-1 gene:ENSMUSG00000013089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000170393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:22412924:22439570:-1 gene:ENSMUSG00000013089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0 /// BC034680 // GenBank // Mus musculus ets variant gene 5, mRNA (cDNA clone MGC:28414 IMAGE:4036564), complete cds. // chr16 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AY004174 // GenBank // Mus musculus ets-related transcription factor (Etv5) mRNA, complete cds. // chr16 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// GENSCAN00000011156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:22383470:22506486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_009967 // RefSeq // Mus musculus crystallin, gamma S (Crygs), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006521755 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crystallin, gamma S (Crygs), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000040592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:22805203:22811410:-1 gene:ENSMUSG00000033501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF032995 // GenBank // Mus musculus gammaS-crystallin (crygs) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056452 // GenBank // Mus musculus crystallin, gamma S, mRNA (cDNA clone MGC:67050 IMAGE:6824006), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:22805319:22813956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001081368 // RefSeq // Mus musculus TBCC domain containing 1 (Tbccd1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006522569 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TBCC domain containing 1 (Tbccd1), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// XR_384598 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TBCC domain containing 1 (Tbccd1), transcript variant X7, misc_RNA. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000004576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:22813215:22857569:-1 gene:ENSMUSG00000004462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK040787 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530024P22 product:RIKEN cDNA 5730478M09 gene, full insert sequence. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK043059 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730051J12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC029679 // GenBank // Mus musculus TBCC domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5363940). // chr16 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// BC082558 // GenBank // Mus musculus TBCC domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:105230 IMAGE:30605020), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK035909 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630017E06 product:RIKEN cDNA 5730478M09 gene, full insert sequence. // chr16 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000013911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:22818414:22842064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
NM_145480 // RefSeq // Mus musculus replication factor C (activator 1) 4 (Rfc4), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:23113943:23127737:-1 gene:ENSMUSG00000022881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000115337 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:23120909:23127728:-1 gene:ENSMUSG00000022881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000115338 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:23113951:23127717:-1 gene:ENSMUSG00000022881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000133847 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:23114707:23127691:-1 gene:ENSMUSG00000022881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000147321 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:23113995:23114744:-1 gene:ENSMUSG00000022881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// BC003335 // GenBank // Mus musculus replication factor C (activator 1) 4, mRNA (cDNA clone MGC:6326 IMAGE:3257208), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:23114012:23127742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
XR_396932 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC106179 (BC106179), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000055369 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:23220656:23225368:-1 gene:ENSMUSG00000045231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC106179 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC106179, mRNA (cDNA clone MGC:118427 IMAGE:6509459), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XR_384758 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC106179 (BC106179), transcript variant X3, misc_RNA. // chr16 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
ENSMUST00000120629 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:23717169:23718755:-1 gene:ENSMUSG00000083681 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:23664159:23804251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_009215 // RefSeq // Mus musculus somatostatin (Sst), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000004480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:23889581:23890844:-1 gene:ENSMUSG00000004366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC010770 // GenBank // Mus musculus somatostatin, mRNA (cDNA clone MGC:18606 IMAGE:4218815), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:23889729:23890744:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001008230 // RefSeq // Mus musculus receptor transporter protein 2 (Rtp2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522047 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus receptor transporter protein 2 (Rtp2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000061030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:23925548:23930787:-1 gene:ENSMUSG00000047531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AY562226 // GenBank // Mus musculus receptor transporting protein 2 (Rtp2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC049158 // GenBank // Mus musculus receptor transporter protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:56957 IMAGE:6390582), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:23926207:23930698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_009744 // RefSeq // Mus musculus B cell leukemia/lymphoma 6 (Bcl6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:23965052:23988852:-1 gene:ENSMUSG00000022508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC052315 // GenBank // Mus musculus B-cell leukemia/lymphoma 6, mRNA (cDNA clone MGC:54682 IMAGE:6309948), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U41465 // GenBank // Mus musculus BCL-6 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135352 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:23967694:23972380:-1 gene:ENSMUSG00000022508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000037017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:23966125:23977675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AK046709 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430319J10 product:B-cell leukemia/lymphoma 6, full insert sequence. // chr16 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONMMUT026002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSMUST00000157236 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:24406355:24406417:-1 gene:ENSMUSG00000087861 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174963 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:5:22645119:22645183:-1 gene:ENSMUSG00000092704 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179457 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:15:55262542:55262603:-1 gene:ENSMUSG00000095792 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// NONMMUT026032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT051453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONMMUT002112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// NONMMUT023514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
ENSMUST00000083399 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:25702642:25702748:-1 gene:ENSMUSG00000065333 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT026055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_173379 // RefSeq // Mus musculus leprecan-like 1 (Leprel1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000039990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:25959288:26105784:-1 gene:ENSMUSG00000038168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000160067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:25972282:25985174:-1 gene:ENSMUSG00000038168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AJ430350 // GenBank // Mus musculus mRNA for leprecan-like 1 protein (LEPREL1 gene). // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK076434 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4832416N06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// GENSCAN00000055821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:25960358:26083047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_016674 // RefSeq // Mus musculus claudin 1 (Cldn1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000023154 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:26356642:26371841:-1 gene:ENSMUSG00000022512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF072127 // GenBank // Mus musculus claudin-1 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK161125 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732452L23 product:claudin 1, full insert sequence. // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC002003 // GenBank // Mus musculus claudin 1, mRNA (cDNA clone MGC:5767 IMAGE:3491319), complete cds. // chr16 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// CT010299 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B0152D for gene Cldn1, Claudin 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr16 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// EU076705 // GenBank // Mus musculus claudin 1 mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000055812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:26359038:26410993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001101640 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 207 (Tmem207), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006521650 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 207 (Tmem207), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000165687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:26503793:26526771:-1 gene:ENSMUSG00000091972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006521651 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 207 (Tmem207), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONMMUT026070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001013761 // RefSeq // Mus musculus geminin coiled-coil domain containing (Gmnc), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001285916 // RefSeq // Mus musculus geminin coiled-coil domain containing (Gmnc), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001285918 // RefSeq // Mus musculus geminin coiled-coil domain containing (Gmnc), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000089832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:26957236:26989974:-1 gene:ENSMUSG00000068428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086669 // GenBank // Mus musculus gene model 606, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:113813 IMAGE:30639759), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:26960254:26968306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_198166 // RefSeq // Mus musculus urotensin 2B (Uts2b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000070531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:27353322:27370239:-1 gene:ENSMUSG00000056423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB116020 // GenBank // Mus musculus URP mRNA for urotensin II-related peptide, complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AY321315 // GenBank // Mus musculus urotensin IIB precursor, mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC117024 // GenBank // Mus musculus urotensin 2 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:151401 IMAGE:40126343), complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC117026 // GenBank // Mus musculus urotensin 2 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:151403 IMAGE:40126345), complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:27343111:27370136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NR_030463 // RefSeq // Mus musculus microRNA 690 (Mir690), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102110 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:28599935:28600043:-1 gene:ENSMUSG00000076064 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-690 // miRBase Micro RNA Database // MI0004658 Mus musculus miR-690 stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT026099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_177718 // RefSeq // Mus musculus Mab-21 domain containing 2 (Mb21d2), mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// XM_006522115 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Mab-21 domain containing 2 (Mb21d2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// XM_006522117 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Mab-21 domain containing 2 (Mb21d2), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000100023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:28826176:28929698:-1 gene:ENSMUSG00000051065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// AK079722 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430031N04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 45 // 17 // 17 // 0 /// BC085092 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1600021P15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:103296 IMAGE:30735763), complete cds. // chr16 // 92 // 66 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:28926288:28929657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001284375 // RefSeq // Mus musculus ATPase type 13A5 (Atp13a5), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NM_175650 // RefSeq // Mus musculus ATPase type 13A5 (Atp13a5), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006522198 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase type 13A5 (Atp13a5), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000075806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:29231851:29378732:-1 gene:ENSMUSG00000048939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000142681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:29231914:29378706:-1 gene:ENSMUSG00000048939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000143373 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:29232460:29378667:-1 gene:ENSMUSG00000048939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC115739 // GenBank // Mus musculus ATPase type 13A5, mRNA (cDNA clone MGC:141506 IMAGE:40086065), complete cds. // chr16 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:29232603:29308290:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0
AK035350 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530020O07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003280 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_037689 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1968 (Gm1968), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000100016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:29958493:29962307:-1 gene:ENSMUSG00000075286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT026130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_027904 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase N, polypeptide 2 (Cpn2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000064856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:30256378:30267532:-1 gene:ENSMUSG00000023176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC138287 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase N, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:169911 IMAGE:8861306), complete cds. // chr16 // 100 // 59 // 24 // 24 // 0 /// BC138288 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase N, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:169912 IMAGE:8861307), complete cds. // chr16 // 100 // 59 // 24 // 24 // 0
NM_028973 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 15 (Lrrc15), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000064606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:30269302:30283256:-1 gene:ENSMUSG00000052316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC050245 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 15, mRNA (cDNA clone MGC:56912 IMAGE:6312567), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008148 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein 5 (platelet) (Gp5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:30307686:30310779:-1 gene:ENSMUSG00000047953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:30308151:30309854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001128094 // RefSeq // Mus musculus ATPase type 13A3 (Atp13a3), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001128096 // RefSeq // Mus musculus ATPase type 13A3 (Atp13a3), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061350 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:16:30312423:30388530:-1 gene:ENSMUSG00000022533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:30312423:30388530:-1 gene:ENSMUSG00000022533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001128094 // RefSeq // Mus musculus ATPase type 13A3 (Atp13a3), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001128096 // RefSeq // Mus musculus ATPase type 13A3 (Atp13a3), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000061350 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:16:30312423:30388530:-1 gene:ENSMUSG00000022533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000100013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:30312423:30388530:-1 gene:ENSMUSG00000022533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:30315704:30389644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_198626 // RefSeq // Mus musculus xyloside xylosyltransferase 1 (Xxylt1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522199 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus xyloside xylosyltransferase 1 (Xxylt1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006522200 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus xyloside xylosyltransferase 1 (Xxylt1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000055389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:30955627:31081432:-1 gene:ENSMUSG00000047434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140566 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:30957461:31061427:-1 gene:ENSMUSG00000047434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC031419 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI480653, mRNA (cDNA clone MGC:19367 IMAGE:2615706), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:31025120:31081335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000034288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:30957338:31009506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_030138 // RefSeq // Mus musculus ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 (Acap2), mRNA. // chr16 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// ENSMUST00000058033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:31092413:31201238:-1 gene:ENSMUSG00000049076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// AB490692 // GenBank // Mus musculus centb2 mRNA for centaurin beta 2, complete cds. // chr16 // 98 // 93 // 42 // 43 // 0 /// GENSCAN00000034285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:31096346:31161502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0
NM_025800 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 2 (Ppp1r2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000060188 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:31251537:31275277:-1 gene:ENSMUSG00000047714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC069885 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:78100 IMAGE:3671082), complete cds. // chr16 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// BC069886 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:78101 IMAGE:6310133), complete cds. // chr16 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NR_027897 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 0610012G03 gene (0610012G03Rik), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000179515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:31948024:31948448:-1 gene:ENSMUSG00000096232 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC021536 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5352549. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK007789 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810045L01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONMMUT020634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_177326 // RefSeq // Mus musculus p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 2 (Pak2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006522072 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 2 (Pak2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:32016290:32079342:-1 gene:ENSMUSG00000022781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY167030 // GenBank // Mus musculus p21-activated kinase 2 (Pak2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC043712 // GenBank // Mus musculus p21 (CDKN1A)-activated kinase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5370331), partial cds. // chr16 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC063068 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6825673, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC086650 // GenBank // Mus musculus p21 (CDKN1A)-activated kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:65654 IMAGE:6849008), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:32006626:32052362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_173439 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 45 (Fbxo45), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:32230112:32247158:-1 gene:ENSMUSG00000035764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026799 // GenBank // Mus musculus F-box protein 45, mRNA (cDNA clone MGC:19444 IMAGE:3499785), complete cds. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC088738 // GenBank // Mus musculus F-box protein 45, mRNA (cDNA clone MGC:90920 IMAGE:6337188), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098203 // GenBank // Mus musculus F-box protein 45, mRNA (cDNA clone MGC:106628 IMAGE:5705872), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:32233083:32246811:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_145932 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 51, alpha subunit (Slc51a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000042042 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:32475522:32487879:-1 gene:ENSMUSG00000035699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC024441 // GenBank // Mus musculus organic solute transporter alpha, mRNA (cDNA clone MGC:37279 IMAGE:4973857), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC025912 // GenBank // Mus musculus organic solute transporter alpha, mRNA (cDNA clone MGC:32504 IMAGE:5064489), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC031178 // GenBank // Mus musculus organic solute transporter alpha, mRNA (cDNA clone MGC:37573 IMAGE:4988213), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:32475785:32487680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NR_033493 // RefSeq // Mus musculus tyrosine kinase, non-receptor 2, opposite strand (Tnk2os), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141256 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:32665223:32668197:-1 gene:ENSMUSG00000075265 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT026299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001145874 // RefSeq // Mus musculus mucin 20 (Muc20), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NM_146071 // RefSeq // Mus musculus mucin 20 (Muc20), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:32786040:32797435:-1 gene:ENSMUSG00000035638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:16:32777419:32797435:-1 gene:ENSMUSG00000035638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AB098732 // GenBank // Mus musculus mRNA for transmembrane mucin MUC20, complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC026367 // GenBank // Mus musculus mucin 20, mRNA (cDNA clone MGC:31081 IMAGE:4037422), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:32786325:32797392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_178378 // RefSeq // Mus musculus IQ motif containing G (Iqcg), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006522519 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IQ motif containing G (Iqcg), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006522520 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IQ motif containing G (Iqcg), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000040309 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:33040769:33056218:-1 gene:ENSMUSG00000035578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000115100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:33015385:33056190:-1 gene:ENSMUSG00000035578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000133219 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:33016950:33023937:-1 gene:ENSMUSG00000035578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// AK010269 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2400003L07 product:hypothetical IQ calmodulin-binding motif containing protein, full insert sequence. // chr16 // 91 // 67 // 20 // 22 // 0 /// BC049990 // GenBank // Mus musculus IQ motif containing G, mRNA (cDNA clone MGC:59000 IMAGE:6310844), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000041295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:33016938:33057210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_009471 // RefSeq // Mus musculus uridine monophosphate synthetase (Umps), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006522008 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uridine monophosphate synthetase (Umps), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000023510 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:33954782:33967038:-1 gene:ENSMUSG00000022814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000131990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:33954794:33967003:-1 gene:ENSMUSG00000022814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC003887 // GenBank // Mus musculus uridine monophosphate synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:6738 IMAGE:3590810), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC095981 // GenBank // Mus musculus uridine monophosphate synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:106092 IMAGE:3499037), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// M29395 // GenBank // Mouse orotidine-5-monophosphate decarboxylase mRNA, 3 end. // chr16 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000051611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:33956763:33966981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000122632 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:35234796:35234923:-1 gene:ENSMUSG00000084581 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133704 // RefSeq // Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homolog A (S. cerevisiae) (Sec22a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006522233 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homolog A (S. cerevisiae) (Sec22a), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522235 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homolog A (S. cerevisiae) (Sec22a), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000043521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:35311131:35363918:-1 gene:ENSMUSG00000034473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC138969 // GenBank // Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homologe A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:170596 IMAGE:8861991), complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC138971 // GenBank // Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homologe A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:170598 IMAGE:8861993), complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC145478 // GenBank // Mus musculus SEC22 vesicle trafficking protein homologe A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:179048 IMAGE:9054040), complete cds. // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000154216 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:35348910:35363815:-1 gene:ENSMUSG00000034473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONMMUT026415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSMUST00000082835 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:35387933:35388085:-1 gene:ENSMUSG00000064769 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 88 // 71 // 15 // 17 // 0 /// NONMMUT026422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 88 // 71 // 15 // 17 // 0
NM_028295 // RefSeq // Mus musculus protein disulfide isomerase associated 5 (Pdia5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000023550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:35397313:35490873:-1 gene:ENSMUSG00000022844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC009151 // GenBank // Mus musculus protein disulfide isomerase associated 5, mRNA (cDNA clone MGC:11961 IMAGE:3600849), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000039249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:35397458:35474418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0
XM_006522823 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 40S ribosomal protein S21-like (LOC102638850), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000143451 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:35573321:35573556:-1 gene:ENSMUSG00000052192 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006500702 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribosomal protein S21 (Rps21), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 50 // 100 // 8 // 16 // 0 /// ENSMUST00000059080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:180257377:180258445:1 gene:ENSMUSG00000039001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 100 // 8 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:35573317:35573556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000052718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:180257634:180258105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 100 // 8 // 16 // 0
NM_153550 // RefSeq // Mus musculus disrupted in renal carcinoma 2 (human) (Dirc2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000023554 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:35694062:35769356:-1 gene:ENSMUSG00000022848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000149892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:35697548:35769330:-1 gene:ENSMUSG00000022848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC037460 // GenBank // Mus musculus disrupted in renal carcinoma 2 (human), mRNA (cDNA clone MGC:47126 IMAGE:4190539), complete cds. // chr16 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0
NM_001039530 // RefSeq // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 14 (Parp14), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000042665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:35832874:35871544:-1 gene:ENSMUSG00000034422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AK089685 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830008K13 product:hypothetical Appr-1-p processing enzyme family containing protein, full insert sequence. // chr16 // 92 // 69 // 22 // 24 // 0 /// AK220263 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1268 protein. // chr16 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// BC021340 // GenBank // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 14, mRNA (cDNA clone IMAGE:5065398), complete cds. // chr16 // 80 // 29 // 8 // 10 // 0 /// BC138874 // GenBank // Mus musculus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 14, mRNA (cDNA clone MGC:170501 IMAGE:8861896), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// DQ372930 // GenBank // Mus musculus collaborator of STAT6 mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// ENSMUST00000142946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:35857265:35871382:-1 gene:ENSMUSG00000034422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// AK156593 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830031O10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// GENSCAN00000020877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:35834058:35880175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
NM_001013371 // RefSeq // Mus musculus deltex 3-like (Drosophila) (Dtx3l), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000081933 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:35926511:35939151:-1 gene:ENSMUSG00000049502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114885 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:35931861:35939151:-1 gene:ENSMUSG00000049502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// AK090152 // GenBank HTC // Mus musculus adult male accessory axillary lymph node cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630007B09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// BC085093 // GenBank // Mus musculus deltex 3-like (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:103262 IMAGE:30735413), complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC137694 // GenBank // Mus musculus deltex 3-like (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169318 IMAGE:8860713), complete cds. // chr16 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:35929299:35941164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_027342 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 162, member A (Fam162a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000004057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:36043844:36071515:-1 gene:ENSMUSG00000003955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK212003 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0123I21, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000004057, based on BLAT search. // chr16 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC010826 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 162, member A, mRNA (cDNA clone MGC:19151 IMAGE:4219531), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M97159 // GenBank // Mouse (clone pIL2) B1 dispersed repeat unit. // chr16 // 76 // 78 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36043999:36072284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_001033239 // RefSeq // Mus musculus cystatin A1 (Csta1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000096090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:36119946:36131241:-1 gene:ENSMUSG00000034362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000161638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36122169:36131205:-1 gene:ENSMUSG00000034362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC139156 // GenBank // Mus musculus cystatin A, mRNA (cDNA clone MGC:170783 IMAGE:8862178), complete cds. // chr16 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// BC139157 // GenBank // Mus musculus cystatin A, mRNA (cDNA clone MGC:170784 IMAGE:8862179), complete cds. // chr16 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000099936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:36235604:36235697:-1 gene:ENSMUSG00000075228 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 80 // 97 // 24 // 30 // 0 /// NONMMUT026456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001001332 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC1179090 (BC117090), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000114850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:36321665:36334332:-1 gene:ENSMUSG00000079594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000020873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36321722:36355613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001082545 // RefSeq // Mus musculus stefin A2 (Stfa2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000023619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:36403946:36408363:-1 gene:ENSMUSG00000022902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC138004 // GenBank // Mus musculus stefin A2, mRNA (cDNA clone MGC:169628 IMAGE:8861023), complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000020869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36404027:36408333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0
NM_025288 // RefSeq // Mus musculus stefin A3 (Stfa3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000068182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:36450537:36455392:-1 gene:ENSMUSG00000054905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY169236 // GenBank // Mus musculus strain A/J stefin A3 (Stfa3) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107224 // GenBank // Mus musculus stefin A3, mRNA (cDNA clone MGC:130145 IMAGE:40051891), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107225 // GenBank // Mus musculus stefin A3, mRNA (cDNA clone MGC:130146 IMAGE:40051892), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36409398:36455364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 81 // 81 // 17 // 21 // 0
NM_013803 // RefSeq // Mus musculus calcium-sensing receptor (Casr), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006521729 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium-sensing receptor (Casr), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000063597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:36493696:36562134:-1 gene:ENSMUSG00000051980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000172826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36494467:36561606:-1 gene:ENSMUSG00000051980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AF110178 // GenBank // Mus musculus calcium-sensing receptor (Casr) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF128842 // GenBank // Mus musculus extracellular calcium-sensing receptor (Casr) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000114847 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36493696:36562134:-1 gene:ENSMUSG00000051980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// AF110179 // GenBank // Mus musculus calcium-sensing receptor (Casr) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr16 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36491011:36517786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
NM_019388 // RefSeq // Mus musculus CD86 antigen (Cd86), mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006521741 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD86 antigen (Cd86), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000089620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:36603869:36666077:-1 gene:ENSMUSG00000022901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF065897 // GenBank // Mus musculus strain A/J CD86 antigen (Cd86) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AF065898 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J CD86 antigen (Cd86) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AF065899 // GenBank // Mus musculus strain B10.S/J CD86 antigen (Cd86) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AF065900 // GenBank // Mus musculus strain SJL/J CD86 antigen (Cd86) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC013807 // GenBank // Mus musculus CD86 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:18471 IMAGE:4008635), complete cds. // chr16 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// L25606 // GenBank // Murine B7-2 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// XR_384518 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD86 antigen (Cd86), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// ENSMUST00000135280 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:36620713:36642805:-1 gene:ENSMUSG00000022901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000020862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:36571979:36629015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_001037321 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 40 (Fbxo40), mRNA. // chr16 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000075869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:36963460:36990467:-1 gene:ENSMUSG00000047746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000114806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:36966073:36979136:-1 gene:ENSMUSG00000047746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000127808 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:36966040:36970765:-1 gene:ENSMUSG00000047746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// AK220373 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1195 protein. // chr16 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC107406 // GenBank // Mus musculus F-box protein 40, mRNA (cDNA clone MGC:130416 IMAGE:40058923), complete cds. // chr16 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000132511 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:36965931:36978776:-1 gene:ENSMUSG00000047746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// BC107407 // GenBank // Mus musculus F-box protein 40, mRNA (cDNA clone IMAGE:40058924), complete cds. // chr16 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// NONMMUT026501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_028812 // RefSeq // Mus musculus general transcription factor II E, polypeptide 1 (alpha subunit) (Gtf2e1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522659 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus general transcription factor II E, polypeptide 1 (alpha subunit) (Gtf2e1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000023525 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:37509790:37539789:-1 gene:ENSMUSG00000022828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK154283 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630014J17 product:general transcription factor II E, polypeptide 1 (alpha subunit), full insert sequence. // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC056966 // GenBank // Mus musculus general transcription factor II E, polypeptide 1 (alpha subunit), mRNA (cDNA clone MGC:66764 IMAGE:6817212), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:37532520:37539776:-1 gene:ENSMUSG00000022828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// AK084978 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430021C16 product:general transcription factor IIE, polypeptide 1 (alpha subunit, 56kDa), full insert sequence. // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:37511389:37536168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
XM_006522825 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus butyrophilin-like protein 2-like (LOC102639802), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:37841784:37859244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NR_033221 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC031361 (BC031361), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK169533 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630082L02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0
NM_001098404 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2 (Nr1i2), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NM_010936 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2 (Nr1i2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XR_384532 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2 (Nr1i2), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 93 // 75 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000023504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:38248323:38294824:-1 gene:ENSMUSG00000022809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF031814 // GenBank // Mus musculus pregnane X receptor mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC120796 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:156033 IMAGE:40129719), complete cds. // chr16 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC137780 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:169404 IMAGE:8860799), complete cds. // chr16 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:38249245:38266101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0
NM_001081025 // RefSeq // Mus musculus MYCBP-associated, testis expressed 1 (Maats1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000023501 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:38297754:38341845:-1 gene:ENSMUSG00000022805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000114740 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:38322181:38341812:-1 gene:ENSMUSG00000022805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// ENSMUST00000141896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:38332161:38342143:-1 gene:ENSMUSG00000022805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// AF503943 // GenBank // Mus musculus unknown mRNA. // chr16 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// AK045121 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130036H24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// GENSCAN00000056670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:38286804:38341777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_134102 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A1 member A (Pla1a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006522771 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase A1 member A (Pla1a), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006522773 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase A1 member A (Pla1a), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000002926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:38396119:38433145:-1 gene:ENSMUSG00000002847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF063498 // GenBank // Mus musculus phosphatidylserine-specific phospholipase A1 (Ps-pla1) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// BC003470 // GenBank // Mus musculus phospholipase A1 member A, mRNA (cDNA clone MGC:6511 IMAGE:2649848), complete cds. // chr16 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// BC030670 // GenBank // Mus musculus phospholipase A1 member A, mRNA (cDNA clone MGC:41255 IMAGE:1247206), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000056690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:38392220:38450624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1
NM_007414 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylarginine hydrolase (Adprh), mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000002923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:38445399:38452689:-1 gene:ENSMUSG00000002844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF244347 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylarginine hydrolase mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC003437 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylarginine hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:6488 IMAGE:2647247), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// L13290 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylarginine hydrolase mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000056690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:38392220:38450624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_024273 // RefSeq // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 (Timmdc1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006522713 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 (Timmdc1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// XM_006522714 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 (Timmdc1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000002925 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:38498347:38522663:-1 gene:ENSMUSG00000002846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC002243 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930455C21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7537 IMAGE:3492342), complete cds. // chr16 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// ENSMUST00000147543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:38516660:38522641:-1 gene:ENSMUSG00000002846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// AK015460 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930455C21 product:RIKEN cDNA 4930455C21 gene, full insert sequence. // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONMMUT026561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_172380 // RefSeq // Mus musculus protein O-glucosyltransferase 1 (Poglut1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000036210 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:38525137:38550258:-1 gene:ENSMUSG00000034064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000153187 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:38525140:38550222:-1 gene:ENSMUSG00000034064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC026809 // GenBank // Mus musculus KTEL (Lys-Tyr-Glu-Leu) containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:28548 IMAGE:4205469), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000137762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:38548020:38550222:-1 gene:ENSMUSG00000034064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// AK082556 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230063G23 product:inferred: x 010 protein {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr16 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000056680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:38526625:38550167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT026569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_020260 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 31 (Arhgap31), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:38598340:38713274:-1 gene:ENSMUSG00000022799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF151363 // GenBank // Mus musculus Cdc42 GTPase-activating protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK138417 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230098H13 product:Cdc42 GTPase-activating protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC138870 // GenBank // Mus musculus CDC42 GTPase-activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:170497 IMAGE:8861892), complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124866 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:38623163:38712899:-1 gene:ENSMUSG00000022799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// AK018057 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830477L08 product:Cdc42 GTPase-activating protein, full insert sequence. // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000056677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:38600657:38682478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000119414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:38748729:38750309:-1 gene:ENSMUSG00000083183 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:38704488:38749343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_178924 // RefSeq // Mus musculus uroplakin 1B (Upk1b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006522010 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uroplakin 1B (Upk1b), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000057767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:38773184:38800203:-1 gene:ENSMUSG00000049436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF274865 // GenBank // Mus musculus uroplakin Ib mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC046604 // GenBank // Mus musculus uroplakin 1B, mRNA (cDNA clone MGC:54825 IMAGE:6389837), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:38778348:38828745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_029042 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930435E12 gene (4930435E12Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000122078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:38812205:38828749:-1 gene:ENSMUSG00000022798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000130241 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:38824331:38828731:-1 gene:ENSMUSG00000022798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AK015321 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930435E12 product:RIKEN cDNA 4930435E12 gene, full insert sequence. // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC115688 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144621 IMAGE:40104289), complete cds. // chr16 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:38778348:38828745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_008083 // RefSeq // Mus musculus growth associated protein 43 (Gap43), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:42248442:42340651:-1 gene:ENSMUSG00000047261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125187 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:42248458:42276072:-1 gene:ENSMUSG00000047261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC028288 // GenBank // Mus musculus growth associated protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:25402 IMAGE:4503501), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC080758 // GenBank // Mus musculus growth associated protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:91069 IMAGE:5363932), complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// J02809 // GenBank // Mouse neural specific calmodulin-binding protein P-57 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT026651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NR_040522 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4932412D23 gene (4932412D23Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:42796388:42875762:-1 gene:ENSMUSG00000075070 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000147181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:42796749:42875740:-1 gene:ENSMUSG00000075070 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000130331 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:42796901:42875746:-1 gene:ENSMUSG00000075070 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONMMUT026656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT026657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT026659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT026660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:42796739:42915360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONMMUT026658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONMMUT026661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSMUST00000147504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:43345887:43363666:-1 gene:ENSMUSG00000055370 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK031098 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930404K09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT026682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001146325 // RefSeq // Mus musculus T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (Tigit), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000096065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:43648861:43664184:-1 gene:ENSMUSG00000071552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EU675311 // GenBank // Mus musculus T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (Tigit) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:43649001:43664087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001007460 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 23 (Zdhhc23), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000036321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:43969078:43979093:-1 gene:ENSMUSG00000036304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000165648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:43969146:43979050:-1 gene:ENSMUSG00000036304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY668949 // GenBank // Mus musculus DHHC-containing protein 11 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC139052 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 23, mRNA (cDNA clone MGC:170679 IMAGE:8862074), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC145525 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 23, mRNA (cDNA clone MGC:179096 IMAGE:9054088), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC145526 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 23, mRNA (cDNA clone MGC:179097 IMAGE:9054089), complete cds. // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC145527 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054090. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC145684 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 23, mRNA (cDNA clone MGC:175571 IMAGE:40130987), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:43973434:44030359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001172107 // RefSeq // Mus musculus GRAM domain containing 1C (Gramd1c), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NM_153528 // RefSeq // Mus musculus GRAM domain containing 1C (Gramd1c), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036174 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:43980355:44016436:-1 gene:ENSMUSG00000036292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114677 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:43980355:44027945:-1 gene:ENSMUSG00000036292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000179565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:43980350:44013039:-1 gene:ENSMUSG00000036292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// AK129016 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3032873. // chr16 // 92 // 72 // 24 // 26 // 0 /// BC037472 // GenBank // Mus musculus GRAM domain containing 1C, mRNA (cDNA clone MGC:47315 IMAGE:4236901), complete cds. // chr16 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// XM_006521894 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GRAM domain containing 1C (Gramd1c), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// XM_006521895 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GRAM domain containing 1C (Gramd1c), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// XM_006521896 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GRAM domain containing 1C (Gramd1c), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// GENSCAN00000013289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:43973434:44030359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_001159419 // RefSeq // Mus musculus SID1 transmembrane family, member 1 (Sidt1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_198034 // RefSeq // Mus musculus SID1 transmembrane family, member 1 (Sidt1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:44240525:44333196:-1 gene:ENSMUSG00000022696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44240180:44269532:-1 gene:ENSMUSG00000022696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000136381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:44240180:44332991:-1 gene:ENSMUSG00000022696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK046836 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B830021E24 product:weakly similar to CGI-40 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 81 // 93 // 21 // 26 // 0 /// AY562213 // GenBank // Mus musculus Msid1 mRNA, partial cds. // chr16 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// BC025888 // GenBank // Mus musculus SID1 transmembrane family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:32412 IMAGE:5039343), complete cds. // chr16 // 80 // 54 // 12 // 15 // 0 /// BC079584 // GenBank // Mus musculus SID1 transmembrane family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:90752 IMAGE:5704672), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:44264902:44302580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
NM_172506 // RefSeq // Mus musculus biregional cell adhesion molecule-related/down-regulated by oncogenes (Cdon) binding protein (Boc), mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000023370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:44485045:44558870:-1 gene:ENSMUSG00000022687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000114634 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:44485049:44558897:-1 gene:ENSMUSG00000022687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AF388037 // GenBank // Mus musculus brother of CDO (Boc) mRNA, partial cds. // chr16 // 88 // 79 // 29 // 33 // 0 /// BC056138 // GenBank // Mus musculus biregional cell adhesion molecule-related/down-regulated by oncogenes (Cdon) binding protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:6486774), complete cds. // chr16 // 91 // 52 // 20 // 22 // 0 /// BC062892 // GenBank // Mus musculus biregional cell adhesion molecule-related/down-regulated by oncogenes (Cdon) binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:86058 IMAGE:6418202), complete cds. // chr16 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// BC078631 // GenBank // Mus musculus biregional cell adhesion molecule-related/down-regulated by oncogenes (Cdon) binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:77995 IMAGE:6515418), complete cds. // chr16 // 94 // 81 // 32 // 34 // 0 /// AK131182 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mFLJ00376 protein. // chr16 // 64 // 64 // 27 // 42 // 1 /// AK043379 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730090B12 product:biregional cell adhesion molecule-related/down-regulated by oncogenes (Cdon)binding protein, full insert sequence. // chr16 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// GENSCAN00000013284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:44485612:44521240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0
NM_001005854 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 609 (Gm609), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000114585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:45416755:45492969:-1 gene:ENSMUSG00000053182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC054854 // GenBank // Mus musculus gene model 609, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:62869 IMAGE:6529072), complete cds. // chr16 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// ENSMUST00000144346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:45411768:45454978:-1 gene:ENSMUSG00000053182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// AK136536 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130202L22 product:hypothetical Immunoglobulin subtype/Immunoglobulin V-type/Immunoglobulin-like containing protein, full insert sequence. // chr16 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_145389 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence, BC016579 (BC016579), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006521974 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence, BC016579 (BC016579), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000036732 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:45626848:45654118:-1 gene:ENSMUSG00000033187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC016579 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence, BC016579, mRNA (cDNA clone MGC:27720 IMAGE:2615865), complete cds. // chr16 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:45632530:45664370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_172455 // RefSeq // Mus musculus transmembrane serine protease 7 (Tmprss7), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000114562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:45656315:45693658:-1 gene:ENSMUSG00000033177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000169421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:45656341:45689615:-1 gene:ENSMUSG00000033177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000170951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:45656317:45685376:-1 gene:ENSMUSG00000033177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// AK045663 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230219I23 product:weakly similar to BLOOD COAGULATION FACTOR XI (FRAGMENT) [Bos taurus], full insert sequence. // chr16 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// DQ061860 // GenBank // Mus musculus matriptase-3 mRNA, complete cds. // chr16 // 75 // 95 // 27 // 36 // 0 /// XR_384541 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane serine protease 7 (Tmprss7), transcript variant X7, misc_RNA. // chr16 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// GENSCAN00000007065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:45632530:45664370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// GENSCAN00000007074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:45680444:45742891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NM_019754 // RefSeq // Mus musculus transgelin 3 (Tagln3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000096057 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:45711230:45724608:-1 gene:ENSMUSG00000022658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB031291 // GenBank // Mus musculus NP25 mRNA for neuronal protein, complete cds. // chr16 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// AK012333 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2700038H05 product:transgelin 3, full insert sequence. // chr16 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC043027 // GenBank // Mus musculus transgelin 3, mRNA (cDNA clone MGC:57899 IMAGE:5692098), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC055338 // GenBank // Mus musculus transgelin 3, mRNA (cDNA clone MGC:65583 IMAGE:6414888), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:45680444:45742891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_001134480 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 2 (Plcxd2), mRNA. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000130481 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:45959263:46010218:-1 gene:ENSMUSG00000087141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC151059 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:183972 IMAGE:9087972), complete cds. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC151063 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:183976 IMAGE:9087976), complete cds. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:45965018:45993113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
ENSMUST00000177997 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:46018067:46018173:-1 gene:ENSMUSG00000095243 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032465 // RefSeq // Mus musculus CD96 antigen (Cd96), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000023336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:46035657:46120251:-1 gene:ENSMUSG00000022657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK154076 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430035B17 product:T cell activation, increased late expression homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr16 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// AY029156 // GenBank // Mus musculus cell surface antigen CD96 (Cd96) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC052865 // GenBank // Mus musculus CD96 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:60412 IMAGE:30072864), complete cds. // chr16 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// AK040329 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430087I06 product:T cell activation, increased late expression, full insert sequence. // chr16 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000007077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:46021981:46139100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
XR_397039 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 6430553K19 gene (6430553K19Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr16 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// AK135041 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430553K19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// KnowTID_00003312 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT026836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT026837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT026838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
ENSMUST00000082998 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:48410306:48410424:-1 gene:ENSMUSG00000064932 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198297 // RefSeq // Mus musculus T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 (Trat1), mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XM_006522730 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 (Trat1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522731 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 (Trat1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000170861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:48734690:48771956:-1 gene:ENSMUSG00000030775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AJ297969 // GenBank // Mus musculus mRNA for T cell receptor interacting molecule (Trim gene). // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AK030807 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830409K14 product:weakly similar to HSPC062 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC104350 // GenBank // Mus musculus T cell receptor associated transmembrane adaptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:129418 IMAGE:40049557), complete cds. // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC104351 // GenBank // Mus musculus T cell receptor associated transmembrane adaptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:129419 IMAGE:40049558), complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_001110017 // RefSeq // Mus musculus DAZ interacting protein 3, zinc finger (Dzip3), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_027341 // RefSeq // Mus musculus DAZ interacting protein 3, zinc finger (Dzip3), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000114516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:48925879:48993941:-1 gene:ENSMUSG00000064061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000121869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:48924232:48994165:-1 gene:ENSMUSG00000064061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC117953 // GenBank // Mus musculus DAZ interacting protein 3, zinc finger, mRNA (cDNA clone MGC:144137 IMAGE:40098141), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC117954 // GenBank // Mus musculus DAZ interacting protein 3, zinc finger, mRNA (cDNA clone MGC:144138 IMAGE:40098143), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// EU233997 // GenBank // Mus musculus clone 11AS1-1 LINE L1 ASL1/Dzip3 fusion mRNA sequence. // chr16 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000139350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:48924234:48938582:-1 gene:ENSMUSG00000064061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// ENSMUST00000147358 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:48924232:48938674:-1 gene:ENSMUSG00000064061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// AK122344 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0675 protein. // chr16 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000051250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:48925992:48984566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000083733 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:48942999:48943102:-1 gene:ENSMUSG00000065667 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000080694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:49296648:49297394:-1 gene:ENSMUSG00000058176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000051248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:49296648:49348857:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000051252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:49546932:49596758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
XR_397050 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5486 (Gm5486), transcript variant X2, misc_RNA. // chr16 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XR_397051 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5486 (Gm5486), transcript variant X3, misc_RNA. // chr16 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AK139943 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020041A18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK135986 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420444D24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONMMUT026872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONMMUT026871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NR_045935 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4827 (Gm4827), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003313 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027046 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 54 (Ccdc54), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000062439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:50589859:50591154:-1 gene:ENSMUSG00000050685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC049741 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 54, mRNA (cDNA clone MGC:58762 IMAGE:6771599), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:50589912:50591820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_008947 // RefSeq // Mus musculus protease (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 1 (Psmc1), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:100110186:100123364:1 gene:ENSMUSG00000021178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:50665008:50666346:-1 gene:ENSMUSG00000083692 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003860 // GenBank // Mus musculus protease (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6597 IMAGE:3486436), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// U39302 // GenBank // Mus musculus 26S proteasome subunit 4 ATPase mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:100110209:100123192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:19:37784266:37786442:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 92 // 18 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:50665044:50666321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000178157 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:50920542:50920648:-1 gene:ENSMUSG00000094301 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000035029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:50998189:51016907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0
ENSMUST00000118650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:51362452:51363832:-1 gene:ENSMUSG00000081453 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000035023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:51362471:51363831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000082577 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:53404086:53404193:-1 gene:ENSMUSG00000064511 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_178720 // RefSeq // Mus musculus zona pellucida like domain containing 1 (Zpld1), mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000036412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:55225175:55283237:-1 gene:ENSMUSG00000064310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000143914 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:55225175:55297986:-1 gene:ENSMUSG00000064310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK052599 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630002M15 product:Hypothetical Endoglin / CD105 antigen containing protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC116254 // GenBank // Mus musculus zona pellucida like domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:143818 IMAGE:40093631), complete cds. // chr16 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// BC116255 // GenBank // Mus musculus zona pellucida like domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:143819 IMAGE:40093632), complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000036325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:55226361:55285638:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000179948 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:55594782:55594888:-1 gene:ENSMUSG00000094020 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONMMUT026953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NovelTID_00002769 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr16 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001134457 // RefSeq // Mus musculus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 3 (Nxpe3), mRNA. // chr16 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// XM_006522327 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 3 (Nxpe3), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000099705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:55839953:55895279:-1 gene:ENSMUSG00000075033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// BC150961 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 55, member C, mRNA (cDNA clone MGC:183872 IMAGE:9087872), complete cds. // chr16 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// BC150969 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 55, member C, mRNA (cDNA clone MGC:183882 IMAGE:9087882), complete cds. // chr16 // 65 // 83 // 13 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:55823533:55866540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NR_027965 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310061J03 gene (2310061J03Rik), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC017620 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310061J03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:27704 IMAGE:4924337), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000186480 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:55973268:55974617:-1 gene:ENSMUSG00000102101 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT026967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT026968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0
NM_001024622 // RefSeq // Mus musculus PEST proteolytic signal containing nuclear protein (Pcnp), mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000114444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:56015506:56029739:-1 gene:ENSMUSG00000071533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000125040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:56015506:56029696:-1 gene:ENSMUSG00000071533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// AK172325 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830201F18 product:Ab2-416 homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr16 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// BC106192 // GenBank // Mus musculus PEST proteolytic signal containing nuclear protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:6333132), partial cds. // chr16 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// NONMMUT026970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0
NM_029092 // RefSeq // Mus musculus tRNA methyltransferase 10C (Trmt10c), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059052 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:56032609:56037819:-1 gene:ENSMUSG00000044763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC023147 // GenBank // Mus musculus RNA (guanine-9-) methyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:28071 IMAGE:3710019), complete cds. // chr16 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC106131 // GenBank // Mus musculus RNA (guanine-9-) methyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:118020 IMAGE:4983843), complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AK148219 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370057E06 product:RNA (guanine-9-) methyltransferase domain containing 1, full insert sequence. // chr16 // 48 // 96 // 12 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:56034026:56037982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0
ENSMUST00000083060 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:56035753:56035887:-1 gene:ENSMUSG00000064994 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:56034026:56037982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT026974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_172825 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 128 (Gpr128), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000023437 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:56724609:56795855:-1 gene:ENSMUSG00000022755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC132302 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 128, mRNA (cDNA clone MGC:163933 IMAGE:40130579), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC137963 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 128, mRNA (cDNA clone MGC:169587 IMAGE:8860982), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:56724755:56778650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NM_019631 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 45a (Tmem45a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006522395 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 45a (Tmem45a), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006522396 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 45a (Tmem45a), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006522397 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 45a (Tmem45a), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000023435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:56805161:56886166:-1 gene:ENSMUSG00000022754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC064715 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 45a, mRNA (cDNA clone MGC:74403 IMAGE:30246737), complete cds. // chr16 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// M32486 // GenBank // Mouse 19.5 mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:56819514:56839210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_183281 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310005G13 gene (2310005G13Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006522517 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2310005G13 gene (2310005G13Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000067173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:57036967:57071346:-1 gene:ENSMUSG00000046748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC150914 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310005G13 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:9087825), complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC150924 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310005G13 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:9087835), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC172084 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310005G13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:198789 IMAGE:9054370), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:57014274:57071031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_023175 // RefSeq // Mus musculus nitrilase family, member 2 (Nit2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000023432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:57156671:57167332:-1 gene:ENSMUSG00000022751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF284573 // GenBank // Mus musculus Nit protein 2 (Nit2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC020153 // GenBank // Mus musculus nitrilase family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:28240 IMAGE:3992930), complete cds. // chr16 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// AK052922 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830044I01 product:similar to NIT PROTEIN 2 (CUA002) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// BC080749 // GenBank // Mus musculus nitrilase family, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4037707). // chr16 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000026815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:57157075:57290907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1
NM_026254 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 23 (Tbc1d23), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006522486 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TBC1 domain family, member 23 (Tbc1d23), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:57168866:57231466:-1 gene:ENSMUSG00000022749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AK171591 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730314N23 product:hypothetical TBC/rab GAP domain profile/RabGAP/TBC domain containing protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// BC031706 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 23, mRNA (cDNA clone MGC:25849 IMAGE:4194266), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000026815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:57157075:57290907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1
NM_027651 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 30C (Tmem30c), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006522574 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 30C (Tmem30c), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000023434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:57266410:57292851:-1 gene:ENSMUSG00000022753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119407 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:57266139:57292865:-1 gene:ENSMUSG00000022753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120112 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:57269309:57292851:-1 gene:ENSMUSG00000022753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK161475 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932427N16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006522575 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 30C (Tmem30c), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000026815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:57157075:57290907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
XM_006522459 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cms small ribosomal subunit 1 (Cmss1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// XM_006522460 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cms small ribosomal subunit 1 (Cmss1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// XM_006522461 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cms small ribosomal subunit 1 (Cmss1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NM_025599 // RefSeq // Mus musculus cms small ribosomal subunit 1 (Cmss1), mRNA. // chr16 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// ENSMUST00000114371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:57302199:57606825:-1 gene:ENSMUSG00000022748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// AK019979 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730589J07 product:hypothetical P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases structure containing protein, full insert sequence. // chr16 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// BC038891 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610528E23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:48272 IMAGE:3371329), complete cds. // chr16 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// GENSCAN00000026812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:57303250:57332580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1
NM_007739 // RefSeq // Mus musculus collagen, type VIII, alpha 1 (Col8a1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000089332 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:57624258:57754737:-1 gene:ENSMUSG00000068196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC011061 // GenBank // Mus musculus collagen, type VIII, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:18687 IMAGE:3674027), complete cds. // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000007804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:57606467:57683413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
GENSCAN00000051101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:58528518:58534059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1
NM_001033404 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 813 (Gm813), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000099663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:58613686:58616978:-1 gene:ENSMUSG00000075002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC145922 // GenBank // Mus musculus gene model 813, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:175809 IMAGE:40131225), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC145924 // GenBank // Mus musculus gene model 813, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:175811 IMAGE:40131227), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:58613822:58616943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0
ENSMUST00000053249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:58635167:58638739:-1 gene:ENSMUSG00000055789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC099383 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E330017A01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117520 IMAGE:30936622), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:58635330:58636877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_001162955 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 15 (Gpr15), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000089318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:58717435:58718724:-1 gene:ENSMUSG00000047293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107229 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 15, mRNA (cDNA clone MGC:130164 IMAGE:40052032), complete cds. // chr16 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC119501 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 15, mRNA (cDNA clone MGC:141113 IMAGE:40052770), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC119502 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 15, mRNA (cDNA clone MGC:141114 IMAGE:40052772), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC119518 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 15, mRNA (cDNA clone MGC:141158 IMAGE:40055788), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AK017124 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933439K08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000051117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:58717642:58718724:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_147001 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 172 (Olfr172), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000095991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:58760152:58761240:-1 gene:ENSMUSG00000071510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC131922 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 172, mRNA (cDNA clone MGC:163553 IMAGE:40130199), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC131948 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 172, mRNA (cDNA clone MGC:163579 IMAGE:40130225), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_147000 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 173 (Olfr173), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000049940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:58796779:58797942:-1 gene:ENSMUSG00000049362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC120572 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 173, mRNA (cDNA clone MGC:155809 IMAGE:40129495), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC137837 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 173, mRNA (cDNA clone MGC:169461 IMAGE:8860856), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_147002 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 175, pseudogene 1 (Olfr175-ps1), mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:58823781:58826761:-1 gene:ENSMUSG00000060663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:58743185:58890098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_146996 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 177 (Olfr177), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:58872219:58873148:-1 gene:ENSMUSG00000063137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_146993 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 176 (Olfr176), mRNA. // chr16 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:58743185:58890098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_146997 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 178 (Olfr178), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000058564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:58889259:58890218:-1 gene:ENSMUSG00000044029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001011662 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 180 (Olfr180), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000171656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:58915686:58918486:-1 gene:ENSMUSG00000090629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_146999 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 181 (Olfr181), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:58925557:58928644:-1 gene:ENSMUSG00000090951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125397 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 181, mRNA (cDNA clone MGC:159100 IMAGE:40129912), complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC131916 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 181, mRNA (cDNA clone MGC:163547 IMAGE:40130193), complete cds. // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_146321 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 186 (Olfr186), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59026923:59027927:-1 gene:ENSMUSG00000047960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150713 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 186, mRNA (cDNA clone MGC:183624 IMAGE:9087624), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146322 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 187 (Olfr187), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000054385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59035780:59039749:-1 gene:ENSMUSG00000043357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC119304 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 187, mRNA (cDNA clone MGC:155620 IMAGE:8734053), complete cds. // chr16 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// BC119306 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 187, mRNA (cDNA clone MGC:155622 IMAGE:8734055), complete cds. // chr16 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59022807:59086481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_146397 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 190 (Olfr190), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000071243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59074155:59075078:-1 gene:ENSMUSG00000064006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC104050 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 190, mRNA (cDNA clone MGC:123481 IMAGE:40040225), complete cds. // chr16 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// BC104051 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 190, mRNA (cDNA clone MGC:123482 IMAGE:40040226), complete cds. // chr16 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
NM_001011807 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 191 (Olfr191), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000078517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59085552:59086481:-1 gene:ENSMUSG00000094539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_207549 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 192 (Olfr192), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000080251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59098066:59098990:-1 gene:ENSMUSG00000059041 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000051110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59098066:59119957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1
NM_001011791 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 193 (Olfr193), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000076262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59109625:59110631:-1 gene:ENSMUSG00000060057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC147133 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 193, mRNA (cDNA clone MGC:182289 IMAGE:9056183), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC147134 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 193, mRNA (cDNA clone MGC:182288 IMAGE:9056182), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001005524 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 194 (Olfr194), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_146486 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 203 (Olfr203), mRNA. // chr16 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSMUST00000072608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59119148:59120068:-1 gene:ENSMUSG00000063020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000089305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59303152:59304075:1 gene:ENSMUSG00000068182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// BC128025 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 203, mRNA (cDNA clone MGC:157633 IMAGE:40136560), complete cds. // chr16 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59303155:59304075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0
NM_146779 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 196 (Olfr196), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59167212:59168141:-1 gene:ENSMUSG00000096695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146484 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 197 (Olfr197), mRNA. // chr16 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENSMUST00000080031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59185556:59186481:-1 gene:ENSMUSG00000061501 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59186191:59202424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001011808 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 198 (Olfr198), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006522142 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 198 (Olfr198), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000064452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59201466:59202519:-1 gene:ENSMUSG00000052537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC147215 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 198, mRNA (cDNA clone MGC:182357 IMAGE:9056251), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000051116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59186191:59202424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_207550 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 199 (Olfr199), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000099657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59215685:59216615:-1 gene:ENSMUSG00000074996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128028 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 199, mRNA (cDNA clone MGC:157637 IMAGE:40136725), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59215685:59269665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146994 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 201 (Olfr201), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000099656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59268739:59269665:-1 gene:ENSMUSG00000074995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000051103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59215685:59269665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 100 // 8 // 16 // 0
NM_146995 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 202 (Olfr202), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59283572:59284495:-1 gene:ENSMUSG00000048810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59283572:59284495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146992 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 204 (Olfr204), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59314488:59315405:-1 gene:ENSMUSG00000095928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011736 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 205 (Olfr205), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_146992 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 204 (Olfr204), mRNA. // chr16 // 76 // 100 // 26 // 34 // 0 /// ENSMUST00000072517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59314488:59315405:-1 gene:ENSMUSG00000095928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 76 // 100 // 26 // 34 // 0 /// ENSMUST00000074125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59328590:59329507:-1 gene:ENSMUSG00000094422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000137795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:106906738:106906980:1 gene:ENSMUSG00000067047 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 88 // 50 // 15 // 17 // 0 /// BC150839 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 205, mRNA (cDNA clone MGC:183750 IMAGE:9087750), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_146991 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 206 (Olfr206), mRNA. // chr16 // 30 // 97 // 10 // 33 // 0 /// ENSMUST00000084791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59344722:59345726:-1 gene:ENSMUSG00000066257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 30 // 97 // 10 // 33 // 0 /// BC138396 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 206, mRNA (cDNA clone MGC:170021 IMAGE:8861416), complete cds. // chr16 // 30 // 97 // 10 // 33 // 0 /// BC138397 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 206, mRNA (cDNA clone MGC:170022 IMAGE:8861417), complete cds. // chr16 // 30 // 97 // 10 // 33 // 0 /// NONMMUT053556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 88 // 50 // 15 // 17 // 0
NM_146991 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 206 (Olfr206), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000084791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59344722:59345726:-1 gene:ENSMUSG00000066257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138396 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 206, mRNA (cDNA clone MGC:170021 IMAGE:8861416), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138397 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 206, mRNA (cDNA clone MGC:170022 IMAGE:8861417), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146384 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 208 (Olfr208), mRNA. // chr16 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// NM_207551 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 209 (Olfr209), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000055868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:59361299:59362216:-1 gene:ENSMUSG00000095706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_001011792 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 207 (Olfr207), mRNA. // chr16 // 45 // 100 // 9 // 20 // 0
NM_174848 // RefSeq // Mus musculus beta-gamma crystallin domain containing 3 (Crybg3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000044604 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:59492088:59555752:-1 gene:ENSMUSG00000022723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000129350 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:59526505:59539880:-1 gene:ENSMUSG00000022723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// BC043118 // GenBank // Mus musculus beta-gamma crystallin domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:58045 IMAGE:6408859), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000129762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:59490775:59525614:-1 gene:ENSMUSG00000022723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// AK162506 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530036A08 product:Hypothetical lectin domain of ricin B chain profile/ricin B lectin domain containing protein (Fragment) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr16 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// ENSMUST00000139989 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:59544071:59553970:-1 gene:ENSMUSG00000022723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000038146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59520043:59593046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// GENSCAN00000051111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59493597:59509390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_019665 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 6 (Arl6), mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023405 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:59612949:59639167:-1 gene:ENSMUSG00000022722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000099646 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:59613328:59639391:-1 gene:ENSMUSG00000022722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF031903 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation-like factor homolog ARL6 (Arl6) mRNA, complete cds. // chr16 // 86 // 76 // 19 // 22 // 0 /// AK003778 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110018H24 product:ADP-RIBOSYLATION-LIKE 6, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC018497 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 6, mRNA (cDNA clone MGC:27826 IMAGE:3484868), complete cds. // chr16 // 80 // 86 // 20 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:59613605:59632520:-1 gene:ENSMUSG00000022722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// ENSMUST00000149797 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:59621219:59639129:-1 gene:ENSMUSG00000022722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// AB232697 // GenBank // Mus musculus ARL6 mRNA for ADP-ribosylation factor-like protein 6, complete cds. // chr16 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000038151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59621215:59645534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_007938 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor A6 (Epha6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000068860 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:59653483:60605248:-1 gene:ENSMUSG00000055540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC141090 // GenBank // Mus musculus Eph receptor A6, mRNA (cDNA clone MGC:176051 IMAGE:9055702), complete cds. // chr16 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// BC145362 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053920. // chr16 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// U58332 // GenBank // Mus musculus receptor tyrosine kinase mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// ENSMUST00000161358 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:59760161:60005721:-1 gene:ENSMUSG00000055540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// AK077099 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933405C12 product:Eph receptor A6, full insert sequence. // chr16 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// ENSMUST00000159383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:60424262:60605531:-1 gene:ENSMUSG00000055540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// AK090366 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630065L16 product:Eph receptor A6, full insert sequence. // chr16 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000038152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:59854611:60075906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
ENSMUST00000082533 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:61373027:61373144:-1 gene:ENSMUSG00000064467 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178925 // RefSeq // Mus musculus NOL1/NOP2/Sun domain family member 3 (Nsun3), mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000063089 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:62732444:62786777:-1 gene:ENSMUSG00000050312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000151583 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:62776166:62786818:-1 gene:ENSMUSG00000050312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000152553 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:62770692:62786766:-1 gene:ENSMUSG00000050312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC125628 // GenBank // Mus musculus NOL1/NOP2/Sun domain family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:159331 IMAGE:40130143), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC125630 // GenBank // Mus musculus NOL1/NOP2/Sun domain family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:159333 IMAGE:40130145), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006521671 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NOL1/NOP2/Sun domain family member 3 (Nsun3), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENSMUST00000143314 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:62732444:62786777:-1 gene:ENSMUSG00000050312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// XM_006521673 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NOL1/NOP2/Sun domain family member 3 (Nsun3), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:62735115:62792186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_026577 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 13B (Arl13b), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000089289 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:62793685:62847040:-1 gene:ENSMUSG00000022911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK020859 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930014M17 product:hypothetical ADP-ribosylation factors family/ATP/GTP-binding site motif A (P-loop)/SAR1 GTP-binding protein family containing protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC082574 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 13B, mRNA (cDNA clone MGC:105188 IMAGE:30550373), complete cds. // chr16 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// ENSMUST00000132902 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:62825605:62847040:-1 gene:ENSMUSG00000022911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// AK051159 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130007O13 product:hypothetical P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases structure containing protein, full insert sequence. // chr16 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:62795632:62813554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT027094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_010140 // RefSeq // Mus musculus Eph receptor A3 (Epha3), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000064405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:63543538:63864158:-1 gene:ENSMUSG00000052504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC138641 // GenBank // Mus musculus Eph receptor A3, mRNA (cDNA clone MGC:170266 IMAGE:8861661), complete cds. // chr16 // 97 // 83 // 32 // 33 // 0 /// BC138643 // GenBank // Mus musculus Eph receptor A3, mRNA (cDNA clone MGC:170268 IMAGE:8861663), complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// BC145349 // GenBank // Mus musculus Eph receptor A3, mRNA (cDNA clone MGC:178913 IMAGE:9053905), complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// M68513 // GenBank // Mouse eph-related receptor tyrosine kinase (Mek4) mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 85 // 32 // 34 // 0 /// M68515 // GenBank // Mouse eph-related receptor tyrosine kinase (Mek4) secreted mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:63546131:63704956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 70 // 27 // 28 // 0
NM_173861 // RefSeq // Mus musculus casein kinase 2, alpha prime interacting protein (Csnka2ip), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:64477813:64479148:-1 gene:ENSMUSG00000068167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF463503 // GenBank // Mus musculus CKT2 (Ckt2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137818 // GenBank // Mus musculus CKT2 protein, mRNA (cDNA clone MGC:169442 IMAGE:8860837), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:64472390:64479780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_026273 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930453N24 gene (4930453N24Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000076991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:64762136:64771161:-1 gene:ENSMUSG00000059920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC020029 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930453N24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28305 IMAGE:4012943), complete cds. // chr16 // 67 // 60 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000018942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:64766313:64770863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
NM_028059 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 654 (Zfp654), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:64780351:64786321:-1 gene:ENSMUSG00000047141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC068018 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 654, mRNA (cDNA clone MGC:69963 IMAGE:6336013), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:64783032:64852952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
GENSCAN00000018931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:64783032:64852952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000018934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:64917979:64918977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0
NM_008310 // RefSeq // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1F (Htr1f), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000063076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:64924729:65105784:-1 gene:ENSMUSG00000050783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC120507 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1F, mRNA (cDNA clone MGC:155744 IMAGE:40129430), complete cds. // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC137604 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1F, mRNA (cDNA clone MGC:169228 IMAGE:8860623), complete cds. // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000018926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:64925827:64926927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_026879 // RefSeq // Mus musculus charged multivesicular body protein 2B (Chmp2b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000004965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:65539133:65562697:-1 gene:ENSMUSG00000004843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC055809 // GenBank // Mus musculus chromatin modifying protein 2B, mRNA (cDNA clone MGC:67644 IMAGE:6414077), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:65540140:65613471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
AK038707 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230056F15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT027163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_173069 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated glutamate (E)-rich protein 2 (Speer2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000076500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:69856874:69863744:-1 gene:ENSMUSG00000063163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AY151401 // GenBank // Mus musculus SPEER 2 (Speer2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006523002 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spermatogenesis associated glutamate (E)-rich protein 2 (Speer2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// ENSMUST00000164146 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:69858705:69861724:-1 gene:ENSMUSG00000063163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// GENSCAN00000011617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:69857065:69967429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
AK015192 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930423O20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000082896 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:73422793:73422959:-1 gene:ENSMUSG00000064830 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175549 // RefSeq // Mus musculus roundabout homolog 2 (Drosophila) (Robo2), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006523036 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus roundabout homolog 2 (Drosophila) (Robo2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000116586 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:73920206:74411785:-1 gene:ENSMUSG00000052516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:73892306:74410989:-1 gene:ENSMUSG00000052516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC055333 // GenBank // Mus musculus roundabout homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:65719 IMAGE:6409283), complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// DQ533875 // GenBank // Mus musculus ROBO2 isoform a mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// DQ533876 // GenBank // Mus musculus ROBO2 isoform b mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000117200 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:73894355:74411292:-1 gene:ENSMUSG00000052516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// GENSCAN00000050604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:73886896:74059194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_001252513 // RefSeq // Mus musculus lipase, member I (Lipi), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000062721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:75540514:75586061:-1 gene:ENSMUSG00000032948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AK079027 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230112J23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// BC147403 // GenBank // Mus musculus lipase, member I, mRNA (cDNA clone MGC:182552 IMAGE:9056446), complete cds. // chr16 // 95 // 54 // 19 // 20 // 0 /// BC147404 // GenBank // Mus musculus lipase, member I, mRNA (cDNA clone MGC:182551 IMAGE:9056445), complete cds. // chr16 // 95 // 54 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000186809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:75540544:75567682:-1 gene:ENSMUSG00000032948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:75541251:75574192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0
NM_030201 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 70 family, member 13 (Hspa13), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_027492 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 70 family, member 13 (Hspa13), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000046283 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:75755190:75766821:-1 gene:ENSMUSG00000032932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114244 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:75756640:75766791:-1 gene:ENSMUSG00000032932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC085181 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 70 family, member 13, mRNA (cDNA clone MGC:113760 IMAGE:30646642), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006522849 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heat shock protein 70 family, member 13 (Hspa13), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000137806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:75759188:75766782:-1 gene:ENSMUSG00000032932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK049011 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230091J24 product:stress 70 protein chaperone, microsome-associated, human homolog, full insert sequence. // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:75757781:75766707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
XR_384978 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102633149 (LOC102633149), transcript variant X1, ncRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140789 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130019G03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082928 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:78423730:78423859:-1 gene:ENSMUSG00000064862 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001252438 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 16, ERATO Doi 472, expressed (D16Ertd472e), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001252439 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 16, ERATO Doi 472, expressed (D16Ertd472e), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001252440 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 16, ERATO Doi 472, expressed (D16Ertd472e), transcript variant 4, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_025967 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 16, ERATO Doi 472, expressed (D16Ertd472e), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114218 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:78544961:78576657:-1 gene:ENSMUSG00000022864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000114219 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:78544689:78576657:-1 gene:ENSMUSG00000022864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000114220 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:78544012:78576657:-1 gene:ENSMUSG00000022864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC019957 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 16, ERATO Doi 472, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:28102 IMAGE:3966397), complete cds. // chr16 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// AK005829 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700010I10 product:similar to EURL PROTEIN HOMOLOG [Mus musculus], full insert sequence. // chr16 // 50 // 69 // 9 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:78545118:78560422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_008941 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 15 (Tmprss15), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_178855 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 15 (Tmprss15), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023566 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:78953008:79091092:-1 gene:ENSMUSG00000022857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000060402 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:78953464:79091097:-1 gene:ENSMUSG00000022857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC117917 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 7 (enterokinase), mRNA (cDNA clone MGC:144073 IMAGE:40097367), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC117918 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 7 (enterokinase), mRNA (cDNA clone MGC:144074 IMAGE:40097370), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// U73378 // GenBank // Mus musculus enteropeptidase mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000045108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:78953800:79090860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000181937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:79914460:79914889:-1 gene:ENSMUSG00000097552 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:79876845:79914714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT027437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000122722 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:81261703:81262015:-1 gene:ENSMUSG00000084671 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr16 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NONMMUT027447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr16 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0
GENSCAN00000054930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:84513424:84533177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0
NM_017404 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L39 (Mrpl39), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000116584 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:84717576:84735742:-1 gene:ENSMUSG00000022889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC012274 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L39, mRNA (cDNA clone MGC:18950 IMAGE:3981658), complete cds. // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC016561 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L39, mRNA (cDNA clone MGC:27731 IMAGE:2645316), complete cds. // chr16 // 70 // 91 // 21 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:84703288:84736452:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_009621 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 1 (Adamts1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000023610 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:85793827:85803113:-1 gene:ENSMUSG00000022893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000125897 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:85795476:85801481:-1 gene:ENSMUSG00000022893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AK161409 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930551O15 product:a disintegrin-like and metalloprotease (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 1, full insert sequence. // chr16 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC040382 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 1, mRNA (cDNA clone MGC:25279 IMAGE:3156736), complete cds. // chr16 // 89 // 82 // 24 // 27 // 0 /// BC050834 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 1, mRNA (cDNA clone MGC:59345 IMAGE:6505494), complete cds. // chr16 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// D67076 // GenBank // Mus musculus mRNA for secretory protein containing thrombospondin motifs, complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:85721960:85802608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_011782 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 5 (aggrecanase-2) (Adamts5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000023611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:85858170:85901125:-1 gene:ENSMUSG00000022894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF140673 // GenBank // Mus musculus putative secreted metalloprotease ADAMTS5 (Adamts5) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC138619 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 5 (aggrecanase-2), mRNA (cDNA clone MGC:170244 IMAGE:8861639), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC138620 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 5 (aggrecanase-2), mRNA (cDNA clone MGC:170245 IMAGE:8861640), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:85862610:85900267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
BC039795 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 160, mRNA (cDNA clone IMAGE:1329198), complete cds. // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NM_001081068 // RefSeq // Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), mRNA. // chr16 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// XM_006523112 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// ENSMUST00000039449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:87376651:87432606:-1 gene:ENSMUSG00000052299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// GENSCAN00000015450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:87366027:87432467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001081068 // RefSeq // Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006523112 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:87376651:87432606:-1 gene:ENSMUSG00000052299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:87366027:87432467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081068 // RefSeq // Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006523112 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000039449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:87376651:87432606:-1 gene:ENSMUSG00000052299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:87366027:87432467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001081068 // RefSeq // Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006523112 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:87376651:87432606:-1 gene:ENSMUSG00000052299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_384951 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001081068 // RefSeq // Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006523112 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_384951 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:87376651:87432606:-1 gene:ENSMUSG00000052299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081068 // RefSeq // Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006523112 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_384951 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:87376651:87432606:-1 gene:ENSMUSG00000052299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:87366027:87432467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081068 // RefSeq // Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006523112 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_384951 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:87376651:87432606:-1 gene:ENSMUSG00000052299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:87366027:87432467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001081068 // RefSeq // Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XR_384951 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000039449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:87376651:87432606:-1 gene:ENSMUSG00000052299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC116272 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 160, mRNA (cDNA clone IMAGE:40094146), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC116273 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 160, mRNA (cDNA clone IMAGE:40094147), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000015450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:87366027:87432467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000083713 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:87418909:87419044:-1 gene:ENSMUSG00000065647 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016924 // RefSeq // Mus musculus RWD domain containing 2B (Rwdd2b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000039101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:87433407:87440573:-1 gene:ENSMUSG00000041079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF177771 // GenBank // Mus musculus orf5 protein mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC002143 // GenBank // Mus musculus RWD domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:7257 IMAGE:3484719), complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:87434392:87437500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_009840 // RefSeq // Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 8 (theta) (Cct8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000026704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:87483326:87495873:-1 gene:ENSMUSG00000025613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000175750 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:87484911:87488843:-1 gene:ENSMUSG00000025613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000175977 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:87483988:87495788:-1 gene:ENSMUSG00000025613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000176041 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:87488931:87495859:-1 gene:ENSMUSG00000025613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 91 // 34 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000176750 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:87490488:87495704:-1 gene:ENSMUSG00000025613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000177376 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:87483988:87495788:-1 gene:ENSMUSG00000025613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC009007 // GenBank // Mus musculus chaperonin containing Tcp1, subunit 8 (theta), mRNA (cDNA clone MGC:6053 IMAGE:3582639), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:87483988:87493775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000079114 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:87549062:87549451:-1 gene:ENSMUSG00000090753 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000082736 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:87621014:87621120:-1 gene:ENSMUSG00000064670 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181490 // RefSeq // Mus musculus claudin 17 (Cldn17), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000069549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:88505807:88506978:-1 gene:ENSMUSG00000055811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88506165:88507053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_018778 // RefSeq // Mus musculus claudin 8 (Cldn8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000049697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:88560828:88563183:-1 gene:ENSMUSG00000050520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF087826 // GenBank // Mus musculus claudin-8 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC003868 // GenBank // Mus musculus claudin 8, mRNA (cDNA clone MGC:6620 IMAGE:3490218), complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88562358:88563035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_001163141 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 24-1 (Krtap24-1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:88610709:88612279:-1 gene:ENSMUSG00000050239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88611490:88612428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027173 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310079G19 gene (2310079G19Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:88626786:88627666:-1 gene:ENSMUSG00000045331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88627044:88647731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_027105 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 26-1 (Krtap26-1), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:88646824:88647796:-1 gene:ENSMUSG00000071471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128283 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 26-1, mRNA (cDNA clone MGC:150009 IMAGE:40101041), complete cds. // chr16 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC139410 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 26-1, mRNA (cDNA clone MGC:171037 IMAGE:8862432), complete cds. // chr16 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// BC139411 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 26-1, mRNA (cDNA clone MGC:171038 IMAGE:8862433), complete cds. // chr16 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88627044:88647731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_027155 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310061N02 gene (2310061N02Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050882 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:88707169:88707962:-1 gene:ENSMUSG00000050704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC133700 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310061N02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:156878 IMAGE:40106000), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010671 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 13 (Krtap13), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:88750747:88751628:-1 gene:ENSMUSG00000050224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF031485 // GenBank // Mus musculus putative keratin-associated protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC063754 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:70025 IMAGE:30293948), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88751005:88751598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_027170 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310057N15 gene (2310057N15Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000054223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:88773179:88774206:-1 gene:ENSMUSG00000048830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_013707 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 14 (Krtap14), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF003691 // GenBank // Mus musculus pmg-1 protein (pmg-1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC104262 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 14, mRNA (cDNA clone MGC:129168 IMAGE:40040069), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC104263 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 14, mRNA (cDNA clone MGC:129169 IMAGE:40040071), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D85925 // GenBank // Mus musculus mRNA for anagen-specific protein mKAP13, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000189774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:88825290:88826145:-1 gene:ENSMUSG00000074928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_130876 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 19-1 (Krtap19-1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000081334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:88868918:88869410:-1 gene:ENSMUSG00000060691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF345299 // GenBank // Mus musculus keratin-associated protein 16.9 (Krtap16.9) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88869134:88869505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
NM_130870 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 16-1 (Krtap16-1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000076186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:88873665:88874269:-1 gene:ENSMUSG00000057650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF345291 // GenBank // Mus musculus keratin-associated protein 16.1 (Krtap16.1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK137740 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A030001P08 product:keratin associated protein 16-1, full insert sequence. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC115787 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 16-1, mRNA (cDNA clone MGC:144702 IMAGE:40105094), complete cds. // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC115815 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 16-1, mRNA (cDNA clone MGC:144703 IMAGE:40105095), complete cds. // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88873830:88874255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_130857 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 19-3 (Krtap19-3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000075284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:88877513:88878038:-1 gene:ENSMUSG00000060469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF345295 // GenBank // Mus musculus keratin-associated protein 16.5 (Krtap16.5) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC115545 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 16-5, mRNA (cDNA clone MGC:144393 IMAGE:40101652), complete cds. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC115546 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 16-5, mRNA (cDNA clone MGC:144394 IMAGE:40101653), complete cds. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88877703:88877960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0
NM_130873 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 19-4 (Krtap19-4), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000051103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:88884786:88885089:-1 gene:ENSMUSG00000043982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// AF345294 // GenBank // Mus musculus keratin-associated protein 16.4 (Krtap16.4) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC116200 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 16-4, mRNA (cDNA clone MGC:143492 IMAGE:40090087), complete cds. // chr16 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// BC116201 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 16-4, mRNA (cDNA clone MGC:143493 IMAGE:40090088), complete cds. // chr16 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88884812:88885066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
NM_010676 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 19-5 (Krtap19-5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:88895968:88896450:-1 gene:ENSMUSG00000051802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D86422 // GenBank // Mus musculus mRNA for glycine tyrosine-rich hair protein, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88896234:88896422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000062005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:88924050:88924217:-1 gene:ENSMUSG00000048643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF477980 // GenBank // Mus musculus Krtap16.10 mRNA, partial cds. // chr16 // 39 // 100 // 11 // 28 // 0
NM_133359 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 19-9B (Krtap19-9b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:88931804:88932264:-1 gene:ENSMUSG00000057174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY026312 // GenBank // Mus musculus high-glycine/tyrosine protein type I E5 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119613 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AY026312, mRNA (cDNA clone MGC:141439 IMAGE:40061693), complete cds. // chr16 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// BC119614 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AY026312, mRNA (cDNA clone MGC:141440 IMAGE:40061695), complete cds. // chr16 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88932035:88938521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_183296 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 16-3 (Krtap16-3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000179707 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:88962273:88962873:-1 gene:ENSMUSG00000096534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF345293 // GenBank // Mus musculus keratin-associated protein 16.3 (Krtap16.3) mRNA, complete cds. // chr16 // 81 // 87 // 21 // 26 // 0 /// BC132658 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 16-10, mRNA (cDNA clone MGC:164289 IMAGE:40130935), complete cds. // chr16 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// BC132660 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 16-10, mRNA (cDNA clone MGC:164291 IMAGE:40130937), complete cds. // chr16 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// NONMMUT027598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// AF345296 // GenBank // Mus musculus keratin-associated protein 16.6 (Krtap16.6) mRNA, partial cds. // chr16 // 65 // 77 // 15 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88962563:88981785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
GENSCAN00000049584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:88962563:88981785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 63 // 100 // 19 // 30 // 0
NM_001270487 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10228 (Gm10228), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000089105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:89040921:89041452:-1 gene:ENSMUSG00000068074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// D86421 // GenBank // Mus musculus mRNA for glycine tyrosine-rich hair keratin protein, complete cds. // chr16 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0
NM_130856 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 6-5 (Krtap6-5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000074637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:89047300:89047899:-1 gene:ENSMUSG00000062400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF345298 // GenBank // Mus musculus keratin-associated protein 16.8 (Krtap16.8) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC059086 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30293202. // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_028621 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 21-1 (Krtap21-1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000078422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:89403027:89403774:-1 gene:ENSMUSG00000058368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF345297 // GenBank // Mus musculus keratin-associated protein 16.7 (Krtap16.7) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC147776 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 16-7, mRNA (cDNA clone MGC:182883 IMAGE:9087497), complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC147786 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 16-7, mRNA (cDNA clone MGC:182891 IMAGE:9087505), complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000026687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:89400379:89403752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0
NM_010673 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 6-2 (Krtap6-2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:89419326:89420111:-1 gene:ENSMUSG00000062433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D89902 // GenBank // Mus musculus mRNA for high-glycine tyrosine keratin type II.4, complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:89419573:89420031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// NONMMUT027602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_010675 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 8-1 (Krtap8-1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:89487374:89487952:-1 gene:ENSMUSG00000059632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:89487722:89487907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027771 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 7-1 (Krtap7-1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:89507704:89508323:-1 gene:ENSMUSG00000056706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:89507999:89508262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001113406 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 11-1 (Krtap11-1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171542 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:89570176:89571183:-1 gene:ENSMUSG00000091212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000026673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:89732811:89733143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178923 // RefSeq // Mus musculus SR-related CTD-associated factor 4 (Scaf4), mRNA. // chr16 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// ENSMUST00000039280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:90229156:90284425:-1 gene:ENSMUSG00000022983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000163419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:90228957:90284308:-1 gene:ENSMUSG00000022983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// AK173120 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1172 protein. // chr16 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// BC041782 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:4527716). // chr16 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// BC053096 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 15, mRNA (cDNA clone MGC:62487 IMAGE:6401143), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// BC057592 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 15, mRNA (cDNA clone MGC:67163 IMAGE:6417362), complete cds. // chr16 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// AK048239 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130042F01 product:C-terminal domain-binding protein rA4, splice form 1 (fragment) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr16 // 30 // 30 // 13 // 44 // 1 /// GENSCAN00000026666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:90229298:90263131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 31 // 31 // 0
NM_025642 // RefSeq // Mus musculus MIS18 kinetochore protein homolog A (S. pombe) (Mis18a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000099554 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:90719312:90727404:-1 gene:ENSMUSG00000022978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000129171 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:90719312:90727404:-1 gene:ENSMUSG00000022978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079900 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610039C10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:100039 IMAGE:30602551), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000147546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:90721447:90727139:-1 gene:ENSMUSG00000022978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000036811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:90668256:90727272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_029497 // RefSeq // Mus musculus URB1 ribosome biogenesis 1 homolog (S. cerevisiae) (Urb1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000140920 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:90751527:90810392:-1 gene:ENSMUSG00000039929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000142955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:90783143:90810392:-1 gene:ENSMUSG00000039929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// AK050735 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030012J21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:90751985:90814335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_026502 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1110004E09 gene (1110004E09Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000023694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:90925809:90934827:-1 gene:ENSMUSG00000022972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125519 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:90925970:90934927:-1 gene:ENSMUSG00000022972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// ENSMUST00000129345 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:90925953:90929983:-1 gene:ENSMUSG00000022972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000142340 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:90927182:90934506:-1 gene:ENSMUSG00000022972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000149833 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:90927119:90934723:-1 gene:ENSMUSG00000022972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// BC019533 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110004E09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28517 IMAGE:4191729), complete cds. // chr16 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:90924551:91044510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_026110 // RefSeq // Mus musculus PAX3 and PAX7 binding protein 1 (Paxbp1), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000023698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91014916:91044164:-1 gene:ENSMUSG00000022974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000118522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:91014037:91044543:-1 gene:ENSMUSG00000022974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000127002 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91031564:91044354:-1 gene:ENSMUSG00000022974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// BC014838 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810007M14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:8087 IMAGE:3588322), complete cds. // chr16 // 95 // 51 // 19 // 20 // 0 /// BC027145 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810007M14 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4947371), complete cds. // chr16 // 95 // 51 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000146281 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91024811:91030816:-1 gene:ENSMUSG00000022974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// AK079394 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830002H18 product:GC-RICH SEQUENCE DNA-BINDING FACTOR HOMOLOG (FRAGMENT) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr16 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// GENSCAN00000036796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:90924551:91044510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0
NM_001163695 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4932438H23 gene (4932438H23Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XM_006523105 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4932438H23 gene (4932438H23Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000114076 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:91053935:91069145:-1 gene:ENSMUSG00000039851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC032975 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932438H23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41604 IMAGE:1264334), complete cds. // chr16 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// NM_028905 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4932438H23 gene (4932438H23Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000035689 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:91053935:91069145:-1 gene:ENSMUSG00000039851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_006523104 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4932438H23 gene (4932438H23Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// XM_006523106 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4932438H23 gene (4932438H23Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENSMUST00000119544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:91114189:91114599:-1 gene:ENSMUSG00000081176 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000036801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:91114189:91114599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// X91866 // GenBank // M.musculus mRNA for H3.3A variant histone. // chr16 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
XR_141302 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9881 (Gm9881), misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:91168197:91171401:-1 gene:ENSMUSG00000052471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK045597 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230214C11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_030018 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 50B (Tmem50b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006523110 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 50B (Tmem50b), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000023686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:91574503:91597800:-1 gene:ENSMUSG00000022964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000133180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91575758:91597664:-1 gene:ENSMUSG00000022964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000141885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91580202:91597800:-1 gene:ENSMUSG00000022964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK150773 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830015E16 product:Membrane protein C21orf4 homolog, full insert sequence. // chr16 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// BC004841 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 50B, mRNA (cDNA clone MGC:6289 IMAGE:2649264), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:91576582:91587040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001099738 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 28 (Dnajc28), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_138664 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 28 (Dnajc28), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:16:91615726:91618994:-1 gene:ENSMUSG00000039763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143058 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:91616837:91618991:-1 gene:ENSMUSG00000039763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000169982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:91614257:91618999:-1 gene:ENSMUSG00000039763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC020175 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 28, mRNA (cDNA clone MGC:27620 IMAGE:4505154), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:91616197:91617246:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000120450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91633405:91646935:-1 gene:ENSMUSG00000022962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// U01023 // GenBank // Mus musculus clone pJKMF glycinamide ribonucleotide synthetase mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 52 // 21 // 24 // 0 /// NM_010256 // RefSeq // Mus musculus phosphoribosylglycinamide formyltransferase (Gart), mRNA. // chr16 // 96 // 96 // 44 // 46 // 1 /// XM_006522912 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphoribosylglycinamide formyltransferase (Gart), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 96 // 96 // 44 // 46 // 1 /// ENSMUST00000023684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:91621186:91646952:-1 gene:ENSMUSG00000022962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 96 // 44 // 46 // 1 /// ENSMUST00000156713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91621393:91643146:-1 gene:ENSMUSG00000022962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 91 // 91 // 42 // 46 // 1 /// BC070465 // GenBank // Mus musculus phosphoribosylglycinamide formyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:96643 IMAGE:30611835), complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 44 // 46 // 1 /// U01024 // GenBank // Mus musculus clone pWTF glycinamide ribonucleotide synthetase mRNA, complete cds. // chr16 // 83 // 83 // 38 // 46 // 1 /// GENSCAN00000020942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:91621557:91643101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 37 // 37 // 0
NM_138597 // RefSeq // Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, O subunit (Atp5o), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:91925214:91931687:-1 gene:ENSMUSG00000022956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91925313:91931274:-1 gene:ENSMUSG00000022956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000155452 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91925221:91931546:-1 gene:ENSMUSG00000022956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC012241 // GenBank // Mus musculus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, O subunit, mRNA (cDNA clone MGC:19017 IMAGE:4023318), complete cds. // chr16 // 71 // 84 // 15 // 21 // 0 /// ENSMUST00000150642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91925219:91926684:-1 gene:ENSMUSG00000022956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000154661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:91926859:91931418:-1 gene:ENSMUSG00000022956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSMUST00000159295 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:91684398:91926982:-1 gene:ENSMUSG00000022956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000020943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:91925278:92036891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_029252 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930563D23 gene (4930563D23Rik), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000062638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:92318763:92321441:-1 gene:ENSMUSG00000051728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147584 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930563D23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182680 IMAGE:9056574), complete cds. // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC147622 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930563D23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182718 IMAGE:9056612), complete cds. // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:92318273:92321398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_008424 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Isk-related subfamily, member 1 (Kcne1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:92346001:92359468:-1 gene:ENSMUSG00000039639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000166707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:92348432:92358874:-1 gene:ENSMUSG00000039639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC094276 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, Isk-related subfamily, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:106148 IMAGE:4189679), complete cds. // chr16 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// X60457 // GenBank // M.musculus mRNA for K+ Channel. // chr16 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000006079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:92348565:92390717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001165925 // RefSeq // Mus musculus claudin 14 (Cldn14), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NM_019500 // RefSeq // Mus musculus claudin 14 (Cldn14), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:93919032:94008837:-1 gene:ENSMUSG00000047109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:93919031:93929567:-1 gene:ENSMUSG00000047109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AF314089 // GenBank // Mus musculus claudin 14 (Cldn14) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC132183 // GenBank // Mus musculus claudin 14, mRNA (cDNA clone MGC:163814 IMAGE:40130460), complete cds. // chr16 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC138497 // GenBank // Mus musculus claudin 14, mRNA (cDNA clone MGC:170122 IMAGE:8861517), complete cds. // chr16 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// NM_001165926 // RefSeq // Mus musculus claudin 14 (Cldn14), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000169391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:93919031:93929817:-1 gene:ENSMUSG00000047109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000051371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:93919237:93919956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000102349 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:16:94169302:94169411:-1 gene:ENSMUSG00000076304 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONMMUT027804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0
NM_007834 // RefSeq // Mus musculus Down syndrome critical region gene 3 (Dscr3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000023615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:94497783:94526830:-1 gene:ENSMUSG00000022898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000125229 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:94502107:94510893:-1 gene:ENSMUSG00000022898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr16 // 88 // 50 // 14 // 16 // 0 /// ENSMUST00000127449 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:94504187:94526432:-1 gene:ENSMUSG00000022898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AB001990 // GenBank // Mus musculus mRNA for Dcra, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC003740 // GenBank // Mus musculus Down syndrome critical region gene 3, mRNA (cDNA clone MGC:5833 IMAGE:3592608), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000133944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:94510166:94526441:-1 gene:ENSMUSG00000022898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// ENSMUST00000142988 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:94511860:94526417:-1 gene:ENSMUSG00000022898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONMMUT027829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 88 // 50 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000001409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:94499000:94526394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONMMUT027830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
AK078339 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6530402D11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_019537 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 1 (Psmg1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023630 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:95979933:95990960:-1 gene:ENSMUSG00000022913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000117044 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:95980037:95990890:-1 gene:ENSMUSG00000022913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000149066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:95980037:95990890:-1 gene:ENSMUSG00000022913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC032965 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 1, mRNA (cDNA clone MGC:41332 IMAGE:1196077), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC060285 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 1, mRNA (cDNA clone MGC:70015 IMAGE:6508084), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:95980037:95990890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_008251 // RefSeq // Mus musculus high mobility group nucleosomal binding domain 1 (Hmgn1), mRNA. // chr16 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000050884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:96120618:96127729:-1 gene:ENSMUSG00000040681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC088834 // GenBank // Mus musculus high mobility group nucleosomal binding domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:103185 IMAGE:6490162), complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// BC083138 // GenBank // Mus musculus high mobility group nucleosomal binding domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:103397 IMAGE:6515849), complete cds. // chr16 // 73 // 79 // 11 // 15 // 0 /// XM_006522922 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus high mobility group nucleosomal binding domain 1 (Hmgn1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// ENSMUST00000142179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:96126605:96127466:-1 gene:ENSMUSG00000040681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// GENSCAN00000004242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:96002189:96127803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// NONMMUT027884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr16 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NM_001001492 // RefSeq // Mus musculus Leber congenital amaurosis 5-like (Lca5l), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006536892 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Leber congenital amaurosis 5-like (Lca5l), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006536894 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Leber congenital amaurosis 5-like (Lca5l), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000054855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:96159068:96192257:-1 gene:ENSMUSG00000045275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000113804 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:96158407:96192250:-1 gene:ENSMUSG00000045275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC141285 // GenBank // Mus musculus Leber congenital amaurosis 5-like, mRNA (cDNA clone MGC:176246 IMAGE:9055897), complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC145611 // GenBank // Mus musculus Leber congenital amaurosis 5-like, mRNA (cDNA clone MGC:179185 IMAGE:9054177), complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000142620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:96160499:96192250:-1 gene:ENSMUSG00000045275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr16 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// AK133316 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932432K06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000004253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:96159068:96183411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_008405 // RefSeq // Mus musculus integrin beta 2-like (Itgb2l), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006522926 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus integrin beta 2-like (Itgb2l), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006522927 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus integrin beta 2-like (Itgb2l), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000000161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:96422288:96443619:-1 gene:ENSMUSG00000000157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000113773 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:96422376:96443612:-1 gene:ENSMUSG00000000157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000131567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:96422292:96443614:-1 gene:ENSMUSG00000000157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AF051367 // GenBank // Mus musculus pactolus mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC113142 // GenBank // Mus musculus integrin beta 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:130514 IMAGE:40047633), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:96418446:96438797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_031174 // RefSeq // Mus musculus Down syndrome cell adhesion molecule (Dscam), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000056102 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:96592079:97170752:-1 gene:ENSMUSG00000050272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF315558 // GenBank // Mus musculus Down syndrome cell adhesion molecule (Dscam) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AY005483 // GenBank // Mus musculus Down syndrome cell adhesion molecule (Dscam) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000036789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:96634296:96884327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0
AK148233 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370062D05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_020622 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 3, member B (Fam3b), mRNA. // chrUn // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000049721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:97471084:97504936:-1 gene:ENSMUSG00000022938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AF360358 // GenBank // Mus musculus putative C21orf11 protein (C21orf11) mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AF494380 // GenBank // Mus musculus cytokine-like protein 2-21 mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC048949 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 3, member B, mRNA (cDNA clone MGC:57051 IMAGE:6474753), complete cds. // chrUn // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000125475 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:97471050:97476307:-1 gene:ENSMUSG00000022938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrUn // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000027654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:97448142:97488428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_015775 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 2 (Tmprss2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000000395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:97564684:97611195:-1 gene:ENSMUSG00000000385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF113596 // GenBank // Mus musculus mosaic serine protease epitheliasin mRNA, complete cds. // chr16 // 80 // 83 // 20 // 25 // 0 /// AF199362 // GenBank // Mus musculus serine protease TMPRSS2 (Tmprss2) mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// AF243500 // GenBank // Mus musculus plasmic transmembrane protein X mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 83 // 22 // 25 // 0 /// BC038393 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 2, mRNA (cDNA clone MGC:6821 IMAGE:2648878), complete cds. // chr16 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// BC054348 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 2, mRNA (cDNA clone MGC:62602 IMAGE:2648889), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:97564957:97599269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_023663 // RefSeq // Mus musculus receptor-interacting serine-threonine kinase 4 (Ripk4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:16:97741933:97763737:-1 gene:ENSMUSG00000005251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000113743 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:16:97741933:97763491:-1 gene:ENSMUSG00000005251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF302127 // GenBank // Mus musculus PKC-regulated kinase PKK mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK077233 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5031407D20 product:ankyrin repeat domain 3, full insert sequence. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC057871 // GenBank // Mus musculus receptor-interacting serine-threonine kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:67753 IMAGE:5294197), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:97743085:97763709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_144789 // RefSeq // Mus musculus PR domain containing 15 (Prdm15), mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XR_384928 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PR domain containing 15 (Prdm15), transcript variant X11, misc_RNA. // chr16 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000095849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:97791467:97851227:-1 gene:ENSMUSG00000014039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000121584 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:16:97791520:97851850:-1 gene:ENSMUSG00000014039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000142295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:16:97791877:97851783:-1 gene:ENSMUSG00000014039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC072597 // GenBank // Mus musculus PR domain containing 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:6409577), partial cds. // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:97794180:97922315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_174847 // RefSeq // Mus musculus C2 calcium-dependent domain containing 2 (C2cd2), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000170757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:97855210:97922633:-1 gene:ENSMUSG00000045975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK017896 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830404H04 product:similar to C21ORF258 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr16 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC038064 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830404H04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4486244), complete cds. // chr16 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// BC043688 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5830404H04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:49297 IMAGE:5136661), complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:97794180:97922315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_001081684 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 21 (Zbtb21), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_001081685 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 21 (Zbtb21), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_175428 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 21 (Zbtb21), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000052089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:97947435:97962621:-1 gene:ENSMUSG00000046962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000063605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:97947435:97962621:-1 gene:ENSMUSG00000046962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:16:97947435:97962621:-1 gene:ENSMUSG00000046962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC051176 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 295, mRNA (cDNA clone IMAGE:6311667), complete cds. // chr16 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// BC027135 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 295, mRNA (cDNA clone MGC:38832 IMAGE:5360683), complete cds. // chr16 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000027647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:16:97949881:97953081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NR_015491 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A630089N07 gene (A630089N07Rik), long non-coding RNA. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AK043155 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730061D09 product:similar to KRUPPEL-RELATED ZINC FINGER PROTEIN F80-L [Mus musculus], full insert sequence. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC027541 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA A630089N07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:1382435), with apparent retained intron. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT027929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT027930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT027931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT027933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT027934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_134123 // RefSeq // Mus musculus SR-related CTD-associated factor 8 (Scaf8), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:3114972:3198855:1 gene:ENSMUSG00000046201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC038363 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 16, mRNA (cDNA clone MGC:36686 IMAGE:5371946), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC075621 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 16, mRNA (cDNA clone MGC:99843 IMAGE:6406441), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:3142739:3187837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NONMMUT027964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001101560 // RefSeq // Mus musculus claudin 20 (Cldn20), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:3532554:3533213:1 gene:ENSMUSG00000091530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:3532554:3533213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000180078 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:4678020:4678126:1 gene:ENSMUSG00000096200 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT027996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
KnowTID_00003409 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT028006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK156149 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830009H16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 70 // 100 // 16 // 23 // 0
NM_001085355 // RefSeq // Mus musculus AT rich interactive domain 1B (SWI-like) (Arid1b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006523222 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus AT rich interactive domain 1B (SWI-like) (Arid1b), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006523223 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus AT rich interactive domain 1B (SWI-like) (Arid1b), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000092723 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:4994939:5343505:1 gene:ENSMUSG00000069729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000115797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:4995074:5347656:1 gene:ENSMUSG00000069729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000115799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:4996421:5347656:1 gene:ENSMUSG00000069729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000041036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:5242958:5343087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0
NM_146073 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 14 (Zdhhc14), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000089185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:5492600:5753891:1 gene:ENSMUSG00000034265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF542387 // GenBank // Mus musculus NEW1 domain containing protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC059814 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 14, mRNA (cDNA clone MGC:69577 IMAGE:6813525), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006523217 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 14 (Zdhhc14), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// XM_006523219 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 14 (Zdhhc14), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:5681983:5753093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT028025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_025664 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 9 (Snx9), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006523241 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexin 9 (Snx9), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000002436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:5841328:5931033:1 gene:ENSMUSG00000002365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AK004449 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1190002G15 product:sorting nexin 9, full insert sequence. // chr17 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// BC014814 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 9, mRNA (cDNA clone MGC:6327 IMAGE:3257422), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000041043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:5873721:5996961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1
NM_181392 // RefSeq // Mus musculus general transcription factor IIH, polypeptide 5 (Gtf2h5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:6079786:6086517:1 gene:ENSMUSG00000034345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000100955 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:6079930:6085132:1 gene:ENSMUSG00000034345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK012257 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2700017P07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC029238 // GenBank // Mus musculus general transcription factor IIH, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:36227 IMAGE:4489531), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006523240 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus general transcription factor IIH, polypeptide 5 (Gtf2h5), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// ENSMUST00000146035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:6079837:6082339:1 gene:ENSMUSG00000034345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// AK084443 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230048I16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000048649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:6079817:6084652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT028047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSMUST00000145340 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:6118294:6123263:1 gene:ENSMUSG00000034377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000146758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:6106858:6124835:1 gene:ENSMUSG00000034377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK077171 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933417E08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// NM_001103181 // RefSeq // Mus musculus tubby like protein 4 (Tulp4), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// XM_006523274 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 5E5 antigen-like (LOC102640552), mRNA. // chr17 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// ENSMUST00000149756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:6106891:6240628:1 gene:ENSMUSG00000034377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// ENSMUST00000152672 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:6106858:6138789:1 gene:ENSMUSG00000034377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// NONMMUT028049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT028053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT028056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT028052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001103181 // RefSeq // Mus musculus tubby like protein 4 (Tulp4), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// NM_054040 // RefSeq // Mus musculus tubby like protein 4 (Tulp4), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000039655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:6138148:6240628:1 gene:ENSMUSG00000034377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000142030 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:6106479:6206914:1 gene:ENSMUSG00000034377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 43 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000149756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:6106891:6240628:1 gene:ENSMUSG00000034377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// AF219945 // GenBank // Mus musculus tubby super-family protein (Tusp) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC138024 // GenBank // Mus musculus tubby like protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:169648 IMAGE:8861043), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// BC138025 // GenBank // Mus musculus tubby like protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:169649 IMAGE:8861044), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000141059 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:6138148:6226841:1 gene:ENSMUSG00000034377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// AK173165 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1397 protein. // chr17 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// GENSCAN00000048648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:6169192:6305447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1
XR_385187 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1604A (Gm1604A), transcript variant X5, misc_RNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XR_385188 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1604A (Gm1604A), transcript variant X6, misc_RNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XR_385190 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1604A (Gm1604A), transcript variant X8, misc_RNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XR_385194 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1604A (Gm1604A), transcript variant X12, misc_RNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XR_385195 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1604A (Gm1604A), transcript variant X13, misc_RNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AK052649 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630013A12 product:hypothetical Ribonuclease T2 family containing protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145968 // RefSeq // Mus musculus T cell activation Rho GTPase activating protein (Tagap), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000036370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:7926000:7934897:1 gene:ENSMUSG00000033450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC030886 // GenBank // Mus musculus T-cell activation Rho GTPase-activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:31468 IMAGE:4483459), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC039780 // GenBank // Mus musculus T-cell activation Rho GTPase-activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:49714 IMAGE:4483459), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC150728 // GenBank // Mus musculus T-cell activation Rho GTPase-activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:183639 IMAGE:9087639), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:7926932:7934129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NM_001083945 // RefSeq // Mus musculus radial spoke 3B homolog (Chlamydomonas) (Rsph3b), mRNA. // chr17 // 91 // 89 // 29 // 32 // 0 /// NM_025789 // RefSeq // Mus musculus radial spoke 3A homolog (Chlamydomonas) (Rsph3a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000024572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:6904716:6948356:-1 gene:ENSMUSG00000023806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 89 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000097423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:7945653:7979824:1 gene:ENSMUSG00000073471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC150663 // GenBank // Mus musculus radial spokehead-like 2A, mRNA (cDNA clone MGC:183574 IMAGE:9087574), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC110284 // GenBank // Mus musculus radial spokehead-like 2A, mRNA (cDNA clone MGC:117841 IMAGE:5150198), complete cds. // chr17 // 61 // 100 // 22 // 36 // 0 /// BC110424 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5371116. // chr17 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// XM_006544762 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus radial spoke head protein 3 homolog A-like (LOC102641297), partial mRNA. // chr17 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000007506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:7945757:7979343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:6904894:6930389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 53 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:6939660:6948578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 73 // 31 // 8 // 11 // 0
NM_001197046 // RefSeq // Mus musculus Fgfr1 oncogene partner (Fgfr1op), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_201230 // RefSeq // Mus musculus Fgfr1 oncogene partner (Fgfr1op), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000024636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:8165540:8196475:1 gene:ENSMUSG00000069135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000097419 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:8165501:8196804:1 gene:ENSMUSG00000069135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000161898 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:8182247:8194945:1 gene:ENSMUSG00000069135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 35 // 11 // 12 // 0 /// BC080717 // GenBank // Mus musculus Fgfr1 oncogene partner, mRNA (cDNA clone MGC:90966 IMAGE:4935625), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC108331 // GenBank // Mus musculus Fgfr1 oncogene partner, mRNA (cDNA clone MGC:117820 IMAGE:30434232), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000162586 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:8165520:8176081:1 gene:ENSMUSG00000069135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// AK029470 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833442I21 product:FGFR1 ONCOGENE PARTNER (FOP) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// GENSCAN00000032267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:8165597:8296960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_178774 // RefSeq // Mus musculus proline rich 18 (Prr18), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NR_028280 // RefSeq // Mus musculus proline rich 18 (Prr18), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000069742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:8340406:8344112:1 gene:ENSMUSG00000055945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:8340739:8344112:1 gene:ENSMUSG00000055945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC060190 // GenBank // Mus musculus proline rich region 18, mRNA (cDNA clone MGC:65665 IMAGE:6833275), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:8311223:8341937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001161832 // RefSeq // Mus musculus brachyury 2 (T2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006523302 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus brachyury 2 (T2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006523303 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus brachyury 2 (T2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006523306 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus brachyury 2 (T2), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006523307 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus brachyury 2 (T2), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000163578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:8372396:8422728:1 gene:ENSMUSG00000058159 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000169635 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:8396629:8422728:1 gene:ENSMUSG00000058159 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF072546 // GenBank // Mus musculus Brachyury the second (T2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC119261 // GenBank // Mus musculus brachyury 2, mRNA (cDNA clone MGC:155577 IMAGE:8734010), complete cds. // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC119287 // GenBank // Mus musculus brachyury 2, mRNA (cDNA clone MGC:155603 IMAGE:8734036), complete cds. // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT028143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000032263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:8388558:8422155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_009309 // RefSeq // Mus musculus brachyury (T), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_385171 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus brachyury (T), transcript variant X2, misc_RNA. // chr17 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000074667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:8434423:8442496:1 gene:ENSMUSG00000062327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000177118 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:8435411:8441742:1 gene:ENSMUSG00000062327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC120807 // GenBank // Mus musculus brachyury, mRNA (cDNA clone MGC:156044 IMAGE:40129730), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:8434531:8441869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_025851 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700010I14 gene (1700010I14Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000024650 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:8988333:9008319:1 gene:ENSMUSG00000023873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000136954 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:8988383:9005263:1 gene:ENSMUSG00000023873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000151609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:8988357:9008318:1 gene:ENSMUSG00000023873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK015220 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930428F03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 91 // 71 // 20 // 22 // 0 /// BC061078 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700010I14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:74191 IMAGE:6770439), complete cds. // chr17 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:8988397:8997107:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000015379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:9001781:9011846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
GENSCAN00000029763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12356482:12357303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_008877 // RefSeq // Mus musculus plasminogen (Plg), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000014578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:12378609:12419384:1 gene:ENSMUSG00000059481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AY424276 // GenBank // Mus musculus angiostatin mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 56 // 21 // 22 // 0 /// BC014773 // GenBank // Mus musculus plasminogen, mRNA (cDNA clone MGC:18525 IMAGE:4193957), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC057186 // GenBank // Mus musculus plasminogen, mRNA (cDNA clone MGC:68234 IMAGE:5097123), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// J04766 // GenBank // Mouse plasminogen mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 37 // 39 // 0 /// AK040840 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530029M06 product:plasminogen, full insert sequence. // chr17 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// GENSCAN00000029775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12396494:12419127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12378668:12391873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0
NM_013667 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 2 (Slc22a2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000046959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:12584189:12628465:1 gene:ENSMUSG00000040966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// AJ006036 // GenBank // Mus musculus musculus mRNA for organic cation transporter 2. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK052658 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630015G10 product:solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 2, full insert sequence. // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC015250 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:18339 IMAGE:4242038), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC069911 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:78155 IMAGE:4974824), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12584281:12627320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
NR_002853 // RefSeq // Mus musculus antisense Igf2r RNA (Airn), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NR_027784 // RefSeq // Mus musculus antisense Igf2r RNA (Airn), transcript variant 4, long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000079529 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:12741374:12815557:1 gene:ENSMUSG00000078247 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT028236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT028238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000159731 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:12741398:12830151:1 gene:ENSMUSG00000078247 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 82 // 44 // 9 // 11 // 0 /// ENSMUST00000161890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:12815931:12830335:1 gene:ENSMUSG00000078247 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:12741330:12830250:1 gene:ENSMUSG00000078247 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AK048221 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130041A08 product:weakly similar to 60S RIBOSOMAL PROTEIN L3 (J1 PROTEIN) [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT028240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 82 // 44 // 9 // 11 // 0 /// NONMMUT028253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030726 // RefSeq // Mus musculus MAS-related GPR, member H (Mrgprh), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:12876034:12877842:1 gene:ENSMUSG00000059408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF295365 // GenBank // Mus musculus G-protein coupled receptor GPR90 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116696 // GenBank // Mus musculus MAS-related GPR, member H, mRNA (cDNA clone MGC:144746 IMAGE:40105568), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC117525 // GenBank // Mus musculus MAS-related GPR, member H, mRNA (cDNA clone MGC:144745 IMAGE:40105567), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12851642:12877840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
ENSMUST00000083171 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:12919585:12919722:1 gene:ENSMUSG00000065105 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000129632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:12916449:12924562:1 gene:ENSMUSG00000068039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000134665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:12919673:12920640:1 gene:ENSMUSG00000068039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONMMUT028265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NR_028479 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 20 (Snora20), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000082703 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:12922790:12922917:1 gene:ENSMUSG00000064637 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_013671 // RefSeq // Mus musculus superoxide dismutase 2, mitochondrial (Sod2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000007012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:13007839:13018119:1 gene:ENSMUSG00000006818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC010548 // GenBank // Mus musculus superoxide dismutase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:6144 IMAGE:3581909), complete cds. // chr17 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// CT010273 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G0551D for gene Sod2, Superoxide dismutase 2, mitochondrial; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000003522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:13008184:13015171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC066063 // GenBank // Mus musculus superoxide dismutase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone IMAGE:6849521). // chr17 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NR_033458 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10512 (Gm10512), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:13502199:13511193:1 gene:ENSMUSG00000090211 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT028284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT028302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_013741 // RefSeq // Mus musculus sperm motility kinase 2A (Smok2a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000080647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:13221188:13227658:1 gene:ENSMUSG00000073458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001167913 // RefSeq // Mus musculus sperm motility kinase 2B (Smok2b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000059824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:13234871:13236454:1 gene:ENSMUSG00000073457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000162940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:13230257:13237184:1 gene:ENSMUSG00000073457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:13225598:13239338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
NM_001122977 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 7168 (Gm7168), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006524762 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7168 (Gm7168), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000088809 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:13948373:13950678:1 gene:ENSMUSG00000067941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000003536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:13901703:13955374:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_022315 // RefSeq // Mus musculus SPARC related modular calcium binding 2 (Smoc2), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000024660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:14279506:14404790:1 gene:ENSMUSG00000023886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC019527 // GenBank // Mus musculus SPARC related modular calcium binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:28521 IMAGE:4191849), complete cds. // chr17 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// AK172312 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830119N06 product:SPARC related modular calcium binding 2, full insert sequence. // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000022319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:14335228:14406523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001083880 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1600012H06 gene (1600012H06Rik), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_001083881 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1600012H06 gene (1600012H06Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001083882 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1600012H06 gene (1600012H06Rik), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_026451 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1600012H06 gene (1600012H06Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524833 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1600012H06 gene (1600012H06Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:14943184:14945936:1 gene:ENSMUSG00000050088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164837 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:14943230:14945934:1 gene:ENSMUSG00000050088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000174004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:14943269:14944986:1 gene:ENSMUSG00000050088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// AK028052 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500005J06 product:RIKEN cDNA 1600012H06 gene, full insert sequence. // chr17 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC027313 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1600012H06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28079 IMAGE:3710655), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
XR_385341 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ER membrane associated RNA degradation (Ermard), transcript variant X18, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK019108 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410011O22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT028352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
NM_024203 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 120, member B (Fam120b), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NR_033586 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 120, member B (Fam120b), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000055352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:15396246:15433580:1 gene:ENSMUSG00000014763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC003200 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 120, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:3586654), complete cds. // chr17 // 75 // 63 // 15 // 20 // 0 /// BC085163 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 120, member B, mRNA (cDNA clone MGC:109687 IMAGE:30618952), complete cds. // chr17 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// DQ873694 // GenBank // Mus musculus PPARgamma constitutive coactivator-1 (Pgcc1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AK220425 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1838 protein. // chr17 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:15414654:15427526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_007690 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 1 (Chd1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000024627 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:15704967:15772610:1 gene:ENSMUSG00000023852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000173159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:15705018:15731908:1 gene:ENSMUSG00000023852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000173311 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:15704974:15752992:1 gene:ENSMUSG00000023852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000174461 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:15738535:15755348:1 gene:ENSMUSG00000023852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// AK015218 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930428D05 product:chromodomain helicase DNA binding protein 1, full insert sequence. // chr17 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// AK049686 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530025C07 product:chromodomain helicase DNA binding protein 1, full insert sequence. // chr17 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// BC115822 // GenBank // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:141554 IMAGE:40086932), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// L10410 // GenBank // Mouse DNA-binding protein (CHD-1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000020582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:15722953:15770323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0
GENSCAN00000027993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:16847350:16847991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
GENSCAN00000027998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:16889355:16933722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
XR_397340 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC002059 (BC002059), misc_RNA. // chr17 // 92 // 68 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000071374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:16972910:16973770:1 gene:ENSMUSG00000060149 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// BC002059 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC002059, mRNA (cDNA clone MGC:6110 IMAGE:3484516), complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000190415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:16951539:16974157:1 gene:ENSMUSG00000060149 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000105311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:17316078:17319511:1 gene:ENSMUSG00000072761 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// AK164331 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130050H01 product:similar to kruppel-related zinc finger protein F80-L [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000186431 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:17294443:17318104:1 gene:ENSMUSG00000072761 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
NM_025934 // RefSeq // Mus musculus RIO kinase 2 (yeast) (Riok2), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006524814 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIO kinase 2 (yeast) (Riok2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524815 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIO kinase 2 (yeast) (Riok2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000024620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:17374332:17394898:1 gene:ENSMUSG00000023852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000023846 // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK090011 // GenBank HTC // Mus musculus RCB-0464 Meth-A cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430059M05 product:RIKEN cDNA 2010110K24 gene, full insert sequence. // chr17 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// BC010781 // GenBank // Mus musculus RIO kinase 2 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:18713 IMAGE:4216633), complete cds. // chr17 // 90 // 91 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:17370075:17393582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// AK140922 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130072C02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_025681 // RefSeq // Mus musculus limb expression 1 homolog (chicken) (Lix1), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000115576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:17402672:17459387:1 gene:ENSMUSG00000047786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// AF351204 // GenBank // Mus musculus LIX1 (Lix1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// BC049574 // GenBank // Mus musculus limb expression 1 homolog (chicken), mRNA (cDNA clone MGC:58187 IMAGE:6593108), complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// BC052700 // GenBank // Mus musculus limb expression 1 homolog (chicken), mRNA (cDNA clone MGC:64696 IMAGE:6416835), complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// BC063057 // GenBank // Mus musculus limb expression 1 homolog (chicken), mRNA (cDNA clone MGC:66883 IMAGE:5715784), complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000028794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:17402945:17457393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0
NM_001104539 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 90 (Vmn2r90), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000169805 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:17703941:17734167:1 gene:ENSMUSG00000092120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:17703941:17791735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NR_029536 // RefSeq // Mus musculus microRNA 99b (Mir99b), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083462 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:17830188:17830257:1 gene:ENSMUSG00000065396 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-99b // miRBase Micro RNA Database // MI0000147 Mus musculus miR-99b stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029730 // RefSeq // Mus musculus microRNA let7e (Mirlet7e), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-let-7e // miRBase Micro RNA Database // MI0000561 Mus musculus let-7e stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT028429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_029539 // RefSeq // Mus musculus microRNA 125a (Mir125a), microRNA. // chr17 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// ENSMUST00000083545 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:17830803:17830887:1 gene:ENSMUSG00000065479 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133912 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:17830719:17832433:1 gene:ENSMUSG00000080316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// mmu-mir-125a // miRBase Micro RNA Database // MI0000151 Mus musculus miR-125a stem-loop // chr17 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// NONMMUT028430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0
NM_008039 // RefSeq // Mus musculus formyl peptide receptor 2 (Fpr2), mRNA. // chr17 // 100 // 49 // 21 // 21 // 0 /// NM_008042 // RefSeq // Mus musculus formyl peptide receptor 3 (Fpr3), mRNA. // chr17 // 100 // 51 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000064068 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:17887888:17893853:1 gene:ENSMUSG00000052270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 30 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000115565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:17970458:17971677:1 gene:ENSMUSG00000079700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 51 // 22 // 22 // 0 /// BC117066 // GenBank // Mus musculus formyl peptide receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:151443 IMAGE:40126385), complete cds. // chr17 // 100 // 30 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000054871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:17887852:17971677:1 gene:ENSMUSG00000079700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 25 // 43 // 1 /// U78299 // GenBank // Mus musculus lipoxin A4 receptor mRNA, complete cds. // chr17 // 60 // 60 // 26 // 43 // 1 /// ENSMUST00000149944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:17887824:17893952:1 gene:ENSMUSG00000052270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 49 // 49 // 21 // 43 // 1 /// GENSCAN00000028788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:17970469:17971524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000028796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:17892744:17893799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 28 // 11 // 12 // 0 /// NONMMUT028443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 49 // 49 // 21 // 43 // 1
NM_008041 // RefSeq // Mus musculus formyl peptide receptor, related sequence 4 (Fpr-rs4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095651 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:18021733:18022704:1 gene:ENSMUSG00000048062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:18001540:18074220:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_001104541 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 92 (Vmn2r92), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000169686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:18151930:18185178:1 gene:ENSMUSG00000091350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000172359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:18085057:18136643:1 gene:ENSMUSG00000091206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NM_001104542 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 93 (Vmn2r93), mRNA. // chr17 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENSMUST00000079206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:18298281:18326441:1 gene:ENSMUSG00000079698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000036189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:18105920:18185178:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001104542 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 93 (Vmn2r93), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000079206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:18298281:18326441:1 gene:ENSMUSG00000079698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000036193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:18305255:18452324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0
NM_001104547 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 96 (Vmn2r96), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000165692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:18581727:18598157:1 gene:ENSMUSG00000091679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000177244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:18582406:18598157:1 gene:ENSMUSG00000091679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000036191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:18582538:18838460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000176341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:19279322:19304478:1 gene:ENSMUSG00000093776 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:19277337:19612317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001104551 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 99 (Vmn2r99), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000176107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:19362135:19394590:1 gene:ENSMUSG00000090304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001104569 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 107 (Vmn2r107), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000042090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20345425:20375772:1 gene:ENSMUSG00000056910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF011417 // GenBank // Mus musculus putative pheromone receptor (VR6) mRNA, partial cds. // chr17 // 39 // 100 // 9 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:20356453:20379299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
NM_001166735 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 224 (Vmn1r224), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170076 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20419163:20420059:1 gene:ENSMUSG00000091151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_134194 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 225 (Vmn1r225), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061660 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20502299:20503195:1 gene:ENSMUSG00000043537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000095633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:20570362:20571198:1 gene:ENSMUSG00000071273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000053502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:20570380:20571198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_134191 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 226 (Vmn1r226), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20687508:20688404:1 gene:ENSMUSG00000042848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119430 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, E2, mRNA (cDNA clone MGC:140855 IMAGE:40040474), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134195 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 227 (Vmn1r227), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088829 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:20735100:20736126:1 gene:ENSMUSG00000067951 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:20735100:20736126:1 gene:ENSMUSG00000095451 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134190 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 229 (Vmn1r229), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20814495:20815415:1 gene:ENSMUSG00000061150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134197 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 230 (Vmn1r230), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053974 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20846551:20847501:1 gene:ENSMUSG00000045417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000088826 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:GRCm38:17:20933594:20934335:1 gene:ENSMUSG00000100414 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene gene:ENSMUSG00000067949 // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:20933610:20934548:1 gene:ENSMUSG00000067949 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016891 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit A, alpha (Ppp2r1a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000007708 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20945311:20965916:1 gene:ENSMUSG00000007564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000173658 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:20945487:20958784:1 gene:ENSMUSG00000007564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// AB021743 // GenBank // Mus musculus mRNA for PR65 (type 2A serine/threonine protein phosphatase A subunit), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC006606 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2 (formerly 2A), regulatory subunit A (PR 65), alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:7086 IMAGE:3157293), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC052678 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2 (formerly 2A), regulatory subunit A (PR 65), alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:60513 IMAGE:30062580), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000053497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:20954463:20969370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_145483 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 160 (Zfp160), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21008941:21028852:1 gene:ENSMUSG00000067942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK173216 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1611 protein. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC015291 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 160, mRNA (cDNA clone MGC:18913 IMAGE:4242025), complete cds. // chr17 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// AK161712 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730599L16 product:hypothetical DNA-directed DNA polymerase containing protein, full insert sequence. // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK162583 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630036N19 product:hypothetical DNA-directed DNA polymerase containing protein, full insert sequence. // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000096981 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:21152562:21154088:1 gene:ENSMUSG00000094582 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000167648 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:21198952:21200478:1 gene:ENSMUSG00000095963 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 80 // 65 // 12 // 15 // 0 /// ENSMUST00000167568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:22039028:22040539:-1 gene:ENSMUSG00000092147 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 73 // 65 // 11 // 15 // 0 /// ENSMUST00000170486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:21129351:21130877:1 gene:ENSMUSG00000096857 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 60 // 65 // 9 // 15 // 0 /// ENSMUST00000186171 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:21175779:21177305:1 gene:ENSMUSG00000100191 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:21093172:21202597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000017647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:22039028:22172664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 73 // 65 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000001753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:149015023:149016402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_134198 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 234 (Vmn1r234), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:21228826:21229815:1 gene:ENSMUSG00000057203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127026 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, F1, mRNA (cDNA clone MGC:149924 IMAGE:40044289), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134199 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 235 (Vmn1r235), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060603 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:21260427:21262863:1 gene:ENSMUSG00000050102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF394953 // GenBank // Mus musculus vomeronasal receptor 1 E4 (V1re4) mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_134201 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 236 (Vmn1r236), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000066998 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:21286533:21287653:1 gene:ENSMUSG00000054142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC125459 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, F4, mRNA (cDNA clone MGC:159162 IMAGE:40129974), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC125461 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, F4, mRNA (cDNA clone MGC:159164 IMAGE:40129976), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_134200 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 237 (Vmn1r237), mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077301 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:21313963:21314912:1 gene:ENSMUSG00000058030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC125543 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, F3, mRNA (cDNA clone MGC:159246 IMAGE:40130058), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC138066 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, F3, mRNA (cDNA clone MGC:169690 IMAGE:8861085), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:21314017:21399670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NM_172486 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 677 (Zfp677), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:21383748:21399262:1 gene:ENSMUSG00000062743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162659 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:21383748:21399265:1 gene:ENSMUSG00000062743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC057947 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 677, mRNA (cDNA clone MGC:67713 IMAGE:5344769), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011760 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 54 (Zfp54), mRNA. // chr17 // 92 // 78 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000007884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:21423233:21435154:1 gene:ENSMUSG00000023882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000165230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:21423227:21435640:1 gene:ENSMUSG00000023882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF080070 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 54 (Zfp54) mRNA, complete cds. // chr17 // 78 // 72 // 18 // 23 // 0 /// BC080782 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 54, mRNA (cDNA clone MGC:91117 IMAGE:30468186), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000167749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:21423258:21433945:1 gene:ENSMUSG00000023882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_009558 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 51 (Zfp51), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006524219 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 51 (Zfp51), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000039577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21450352:21465591:1 gene:ENSMUSG00000023892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC011183 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 51, mRNA (cDNA clone MGC:18444 IMAGE:4036027), complete cds. // chr17 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0 /// X74855 // GenBank // M.musculus Zfp-51 mRNA for a zinc finger protein. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_013843 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 53 (Zfp53), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21491256:21509764:1 gene:ENSMUSG00000057409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// AB024004 // GenBank // Mus musculus mRNA for KRAB-containing zinc-finger protein KRAZ1, complete cds. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK147827 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270055N23 product:zinc finger protein 53, full insert sequence. // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC046328 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 53, mRNA (cDNA clone MGC:54591 IMAGE:6475651), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC023798 // GenBank HTC // Mus musculus zinc finger protein 53, mRNA (cDNA clone IMAGE:5353186), with apparent retained intron. // chr17 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000035216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:21472334:21517904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_144515 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 52 (Zfp52), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000079242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21555046:21562066:1 gene:ENSMUSG00000051341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// BC021527 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 52, mRNA (cDNA clone MGC:35978 IMAGE:5353641), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001002008 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 948 (Zfp948), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000088787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21567046:21588697:1 gene:ENSMUSG00000067931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC049807 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC049807, mRNA (cDNA clone MGC:59506 IMAGE:6333379), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC076634 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC049807, mRNA (cDNA clone MGC:100178 IMAGE:30659397), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001166497 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3110052M02 gene (3110052M02Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000039726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21657582:21662540:1 gene:ENSMUSG00000035868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// BC064464 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 3110052M02 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6822779), with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006524985 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 3110052M02 gene (3110052M02Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1 /// AK161479 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932432P12 product:similar to Zinc finger protein 118 [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1
NR_045766 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10509 (Gm10509), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21690766:21691024:1 gene:ENSMUSG00000073448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB010359 // GenBank // Mus musculus mRNA for mszf71, partial cds. // chr17 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0 /// AB010360 // GenBank // Mus musculus mRNA for mszf57, partial cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_001166497 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3110052M02 gene (3110052M02Rik), mRNA. // chr17 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// XM_006524985 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 3110052M02 gene (3110052M02Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21657582:21662540:1 gene:ENSMUSG00000035868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// AK161479 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932432P12 product:similar to Zinc finger protein 118 [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// BC064464 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 3110052M02 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6822779), with apparent retained intron. // chr17 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONMMUT028505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008501 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 760 (Zfp760), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21707741:21725636:1 gene:ENSMUSG00000067928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC029103 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 760, mRNA (cDNA clone IMAGE:3990356), complete cds. // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC085182 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 760, mRNA (cDNA clone MGC:105247 IMAGE:30653533), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001164676 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 229 (Zfp229), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21733724:21748968:1 gene:ENSMUSG00000061544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:21735912:21748969:1 gene:ENSMUSG00000061544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:21730795:21745061:1 gene:ENSMUSG00000061544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSMUST00000183192 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:21733724:21769342:1 gene:ENSMUSG00000061544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// AK147958 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270118J08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000035212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:21530352:21754121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSMUST00000050900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21808186:21808444:1 gene:ENSMUSG00000047189 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT028511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XR_404662 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102641357 (LOC102641357), transcript variant X1, ncRNA. // chr17 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// XR_404663 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102641357 (LOC102641357), transcript variant X2, ncRNA. // chr17 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// AK132964 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930534P05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// NONMMUT028513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001025373 // RefSeq // Mus musculus zinc finger prtoein 943 (Zfp943), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:17:21962552:21994366:1 gene:ENSMUSG00000053347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC066031 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930432O21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:90082 IMAGE:6418362), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153985 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:21962559:21992044:1 gene:ENSMUSG00000053347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000174015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:21962586:22071168:1 gene:ENSMUSG00000053347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK015297 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930432O21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK036434 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830107M17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// BC038865 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930432O21 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3376934), partial cds. // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_145484 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 758 (Zfp758), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000072477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:22361455:22376256:1 gene:ENSMUSG00000044501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000088765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:22361453:22377280:1 gene:ENSMUSG00000044501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000121315 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:22361522:22377281:1 gene:ENSMUSG00000044501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000149699 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:22361453:22377281:1 gene:ENSMUSG00000044501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// BC021442 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 758, mRNA (cDNA clone MGC:29357 IMAGE:5038660), complete cds. // chr17 // 82 // 85 // 14 // 17 // 0 /// BC056632 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 758, mRNA (cDNA clone MGC:67807 IMAGE:5036441), complete cds. // chr17 // 79 // 70 // 11 // 14 // 0
NM_198003 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 946 (Zfp946), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525018 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 946 (Zfp946), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000088763 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:22424268:22456689:1 gene:ENSMUSG00000071266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:22424259:22456689:1 gene:ENSMUSG00000071266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC025651 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1300003B13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:38303 IMAGE:5343080), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC098460 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1300003B13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107365 IMAGE:30061104), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000141831 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:22424222:22447416:1 gene:ENSMUSG00000071266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// AK079610 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330073H21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONMMUT028549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENSMUST00000097381 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:22601148:22619133:1 gene:ENSMUSG00000094921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AB540943 // GenBank // Mus musculus domesticus V2Rp1 mRNA for vomeronasal 2 receptor p1, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000017646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:22600869:22615029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000055305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:22689771:22689941:1 gene:ENSMUSG00000046088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AB010339 // GenBank // Mus musculus mRNA for mszf58, partial cds. // chr17 // 53 // 100 // 10 // 19 // 0
ENSMUST00000183060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:22734963:22735380:1 gene:ENSMUSG00000098210 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000017652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:22731067:22748225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT028567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000170322 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:22943184:22958814:1 gene:ENSMUSG00000092111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000176367 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:22916878:22932941:-1 gene:ENSMUSG00000090355 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB540949 // GenBank // Mus musculus domesticus V2Rp7 mRNA for vomeronasal 2 receptor p7, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006544790 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vomeronasal type-2 receptor 26-like (LOC102642069), mRNA. // chr17 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0 /// ENSMUST00000175853 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:23061367:23077425:1 gene:ENSMUSG00000095658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// ENSMUST00000177509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:22992706:23008970:1 gene:ENSMUSG00000094752 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:22995714:22996286:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 52 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000017650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:22946150:22990495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:22916956:22929963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENSMUST00000168175 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:23343977:23360128:1 gene:ENSMUSG00000091076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 88 // 9 // 14 // 0 /// AB540946 // GenBank // Mus musculus domesticus V2Rp4 mRNA for vomeronasal 2 receptor p4, complete cds. // chr17 // 64 // 88 // 9 // 14 // 0
GENSCAN00000045154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23397584:23515776:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_153784 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 64B (Ccdc64b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006523985 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 64B (Ccdc64b), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000062967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23660523:23668610:1 gene:ENSMUSG00000043782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC038613 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 64B, mRNA (cDNA clone MGC:47347 IMAGE:4458084), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23642237:23668264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_181821 // RefSeq // Mus musculus host cell factor C1 regulator 1 (XPO1-dependent) (Hcfc1r1), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:23673608:23675227:1 gene:ENSMUSG00000023904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000179928 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:23673627:23675174:1 gene:ENSMUSG00000023904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC079865 // GenBank // Mus musculus host cell factor C1 regulator 1 (XPO1-dependent), mRNA (cDNA clone MGC:99867 IMAGE:6818222), complete cds. // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000180140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23673596:23675227:1 gene:ENSMUSG00000023904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23673983:23675019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0
NM_018777 // RefSeq // Mus musculus claudin 6 (Cldn6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000024699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:23679365:23682446:1 gene:ENSMUSG00000023906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF087824 // GenBank // Mus musculus claudin-6 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AF125305 // GenBank // Mus musculus Skullin mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// BC005718 // GenBank // Mus musculus claudin 6, mRNA (cDNA clone MGC:11572 IMAGE:3594823), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC050138 // GenBank // Mus musculus claudin 6, mRNA (cDNA clone MGC:60508 IMAGE:30028814), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ864649 // GenBank // Mus musculus tight junction molecule claudin 6 (Cldn6) mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000045145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23676612:23681723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_023058 // RefSeq // Mus musculus protein kinase, membrane associated tyrosine/threonine 1 (Pkmyt1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524310 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein kinase, membrane associated tyrosine/threonine 1 (Pkmyt1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000024701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23726336:23736729:1 gene:ENSMUSG00000023908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF175892 // GenBank // Mus musculus MYT1 kinase (Myt1) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC025061 // GenBank // Mus musculus protein kinase, membrane associated tyrosine/threonine 1, mRNA (cDNA clone MGC:35824 IMAGE:2609421), complete cds. // chr17 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23726355:23736606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AK048943 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230084K19 product:membrane-associated tyrosine-and threonine-specific cdc2-inhibitory kinase, full insert sequence. // chr17 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_175229 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine repetitive matrix 2 (Srrm2), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525079 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/arginine repetitive matrix 2 (Srrm2), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XR_385381 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/arginine repetitive matrix 2 (Srrm2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:23803221:23824741:1 gene:ENSMUSG00000039218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000190686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23803187:23824736:1 gene:ENSMUSG00000039218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000045126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23806961:23811735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0
NM_027220 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 32 (Prss32), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000061725 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:23853543:23859776:1 gene:ENSMUSG00000048992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000154347 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23853786:23859336:1 gene:ENSMUSG00000048992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AY266139 // GenBank // Mus musculus tryptase 5 mRNA, complete cds. // chr17 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// BC024903 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 32, mRNA (cDNA clone MGC:25874 IMAGE:4208033), complete cds. // chr17 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23853797:23863350:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_020487 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 21 (Prss21), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000024928 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:23868056:23873114:1 gene:ENSMUSG00000024116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB033822 // GenBank // Mus musculus mesp-1 mRNA for ESP-1, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AB059415 // GenBank // Mus musculus mRNA for TESP5, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AF176209 // GenBank // Mus musculus tryptase 4 mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AY005145 // GenBank // Mus musculus testisin mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC049588 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 21, mRNA (cDNA clone IMAGE:6707057), partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116755 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 21, mRNA (cDNA clone MGC:151132 IMAGE:40126074), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC116757 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 21, mRNA (cDNA clone MGC:151134 IMAGE:40126076), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23868095:23886551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_019910 // RefSeq // Mus musculus demilune cell and parotid protein 1 (Dcpp1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000068580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23880876:23882853:1 gene:ENSMUSG00000096445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC005655 // GenBank // Mus musculus demilune cell and parotid protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:11676 IMAGE:3709995), complete cds. // chr17 // 56 // 90 // 5 // 9 // 0
NM_001039238 // RefSeq // Mus musculus demilune cell and parotid protein 2 (Dcpp2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006524756 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus demilune cell and parotid protein 2 (Dcpp2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000088598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23898722:23900787:1 gene:ENSMUSG00000096278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000168272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23880880:23900764:1 gene:ENSMUSG00000096278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC059096 // GenBank // Mus musculus demilune cell and parotid protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:70235 IMAGE:4914089), complete cds. // chr17 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// BC171996 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:198701 IMAGE:9054282, complete cds. // chr17 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// DQ237937 // GenBank // Mus musculus sublingual parotid tongue-2 salivary protein mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0
NM_001077633 // RefSeq // Mus musculus demilune cell and parotid protein 3 (Dcpp3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000115428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23917458:23919441:1 gene:ENSMUSG00000057417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000045136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23917585:23923126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1
NM_011321 // RefSeq // Mus musculus spermine binding protein (Sbp), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000024940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23942375:23945607:1 gene:ENSMUSG00000024128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000181985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23941672:23945603:1 gene:ENSMUSG00000024128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000183017 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:23941913:23945603:1 gene:ENSMUSG00000024128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000183155 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23942077:23945599:1 gene:ENSMUSG00000024128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000183252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23941833:23945607:1 gene:ENSMUSG00000024128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC049605 // GenBank // Mus musculus spermine binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:58270 IMAGE:6743567), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000182868 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:23941985:23945348:1 gene:ENSMUSG00000024128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// ENSMUST00000182519 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:23942383:23945603:1 gene:ENSMUSG00000024128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// GENSCAN00000045137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23942446:23945445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_175440 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 27 (Prss27), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000059482 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:24038144:24045954:1 gene:ENSMUSG00000050762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF542056 // GenBank // Mus musculus pancreasin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC117009 // GenBank // Mus musculus protease, serine 27, mRNA (cDNA clone MGC:151386 IMAGE:40126328), complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC117011 // GenBank // Mus musculus protease, serine 27, mRNA (cDNA clone MGC:151388 IMAGE:40126330), complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24038307:24045851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000148704 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24208861:24221545:1 gene:ENSMUSG00000085185 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000171563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24208861:24221547:1 gene:ENSMUSG00000085185 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// AK017296 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430411J08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// ENSMUST00000137883 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:24212515:24221730:1 gene:ENSMUSG00000085185 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// BC028777 // GenBank // Mus musculus, clone IMAGE:1067795, mRNA. // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONMMUT028635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// NONMMUT028636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT028637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001080127 // RefSeq // Mus musculus ribonucleic acid binding protein S1 (Rnps1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NM_001080128 // RefSeq // Mus musculus ribonucleic acid binding protein S1 (Rnps1), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NM_009070 // RefSeq // Mus musculus ribonucleic acid binding protein S1 (Rnps1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000088512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24414675:24425895:1 gene:ENSMUSG00000034681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000115371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24414675:24425895:1 gene:ENSMUSG00000034681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000163717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24414675:24425895:1 gene:ENSMUSG00000034681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000178598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:7981829:7983430:-1 gene:ENSMUSG00000096403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// BC002061 // GenBank // Mus musculus ribonucleic acid binding protein S1, mRNA (cDNA clone MGC:6115 IMAGE:3485311), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC008089 // GenBank // Mus musculus ribonucleic acid binding protein S1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3586615), partial cds. // chr17 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24364533:24439935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_010023 // RefSeq // Mus musculus enoyl-Coenzyme A delta isomerase 1 (Eci1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000024946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24426683:24439316:1 gene:ENSMUSG00000024132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC022712 // GenBank // Mus musculus dodecenoyl-Coenzyme A delta isomerase (3,2 trans-enoyl-Coenyme A isomerase), mRNA (cDNA clone MGC:31498 IMAGE:4487371), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC054444 // GenBank // Mus musculus dodecenoyl-Coenzyme A delta isomerase (3,2 trans-enoyl-Coenyme A isomerase), mRNA (cDNA clone MGC:62632 IMAGE:6476161), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24364533:24439935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0
NM_025954 // RefSeq // Mus musculus phosphoglycolate phosphatase (Pgp), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24470473:24471591:1 gene:ENSMUSG00000043445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC040100 // GenBank // Mus musculus phosphoglycolate phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:49690 IMAGE:4456284), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC083113 // GenBank // Mus musculus phosphoglycolate phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:103027 IMAGE:5356187), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK013578 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900022O04 product:hypothetical HAD-like structure containing protein, full insert sequence. // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// AK012010 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610311O05 product:hypothetical HAD-like structure containing protein, full insert sequence. // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000034600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24470210:24475334:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0
NM_175682 // RefSeq // Mus musculus BRICHOS domain containing 5 (Bricd5), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006524387 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BRICHOS domain containing 5 (Bricd5), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000054946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24473884:24475469:1 gene:ENSMUSG00000045744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000164508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24473967:24475387:1 gene:ENSMUSG00000045744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// BC096398 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9930021D14 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5057834), partial cds. // chr17 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// BC119389 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9930021D14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155705 IMAGE:8734138), complete cds. // chr17 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// BC120670 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9930021D14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155907 IMAGE:40129593), complete cds. // chr17 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// BC145010 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9930021D14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178566 IMAGE:9053558), complete cds. // chr17 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24470210:24475334:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
NM_027937 // RefSeq // Mus musculus CASK interacting protein 1 (Caskin1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006524316 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CASK interacting protein 1 (Caskin1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 36 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000024958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24488783:24508905:1 gene:ENSMUSG00000033597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AK129327 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1306 protein. // chr17 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// BC138443 // GenBank // Mus musculus CASK interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170068 IMAGE:8861463), complete cds. // chr17 // 98 // 87 // 40 // 41 // 0 /// BC145281 // GenBank // Mus musculus CASK interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:178843 IMAGE:9053835), complete cds. // chr17 // 98 // 87 // 40 // 41 // 0 /// AK014376 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3300002N10 product:CASK-INTERACTING PROTEIN 1 homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr17 // 45 // 45 // 21 // 47 // 1 /// GENSCAN00000034585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24487533:24507216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 79 // 36 // 37 // 0
ENSMUST00000082834 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:24528476:24528553:1 gene:ENSMUSG00000064768 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176215 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24528267:24528743:1 gene:ENSMUSG00000093565 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013630 // RefSeq // Mus musculus polycystic kidney disease 1 homolog (Pkd1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000035565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24549950:24596514:1 gene:ENSMUSG00000032855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// U70209 // GenBank // Mus musculus polycystic kidney disease 1 protein (Pkd1) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 44 // 46 // 0 /// GENSCAN00000034581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24550263:24595539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0
NM_008743 // RefSeq // Mus musculus nth (endonuclease III)-like 1 (E.coli) (Nthl1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000047611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24632682:24638838:1 gene:ENSMUSG00000041429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB006812 // GenBank // Mus musculus mRNA for endonuclease III homologue, complete cds. // chr17 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// BC138852 // GenBank // Mus musculus nth (endonuclease III)-like 1 (E.coli), mRNA (cDNA clone MGC:170479 IMAGE:8861874), complete cds. // chr17 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// BC138855 // GenBank // Mus musculus nth (endonuclease III)-like 1 (E.coli), mRNA (cDNA clone MGC:170482 IMAGE:8861877), complete cds. // chr17 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// BC145443 // GenBank // Mus musculus nth (endonuclease III)-like 1 (E.coli), mRNA (cDNA clone IMAGE:9054001), partial cds. // chr17 // 78 // 85 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24634091:24644557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_183149 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 598 (Zfp598), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000047179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24669752:24682015:1 gene:ENSMUSG00000041130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK138860 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430092M15 product:zinc finger protein 598, full insert sequence. // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC050859 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 598, mRNA (cDNA clone MGC:59461 IMAGE:6328878), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24669758:24681462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_025425 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L3-like (Rpl3l), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000045186 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:24732685:24736143:1 gene:ENSMUSG00000002500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000183214 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:24728174:24733364:1 gene:ENSMUSG00000002500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// BC037498 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L3-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:1397431), partial cds. // chr17 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// BC085243 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L3-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:30292612), partial cds. // chr17 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// BC145876 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L3-like, mRNA (cDNA clone MGC:175763 IMAGE:40131179), complete cds. // chr17 // 96 // 59 // 22 // 23 // 0 /// BC145878 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L3-like, mRNA (cDNA clone MGC:175765 IMAGE:40131181), complete cds. // chr17 // 96 // 59 // 22 // 23 // 0 /// NM_001163945 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L3-like (Rpl3l), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// ENSMUST00000170239 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:24727820:24736143:1 gene:ENSMUSG00000002500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// GENSCAN00000034583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24727648:24740160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0
NM_013759 // RefSeq // Mus musculus methionine sulfoxide reductase B1 (Msrb1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101800 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:24736682:24742771:1 gene:ENSMUSG00000075705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000115262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:24736642:24742778:1 gene:ENSMUSG00000075705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF195142 // GenBank // Mus musculus selenoprotein R mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090646 // GenBank // Mus musculus selenoprotein X 1, mRNA (cDNA clone MGC:116594 IMAGE:30946285), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC141146 // GenBank // Mus musculus selenoprotein X 1, mRNA (cDNA clone MGC:176107 IMAGE:9055758), complete cds. // chr17 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24727648:24740160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001012402 // RefSeq // Mus musculus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 6 (Hs3st6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006524427 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 6 (Hs3st6), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000044922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24753003:24758683:1 gene:ENSMUSG00000039628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY574375 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate 3-O-sulfotransferase 6 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132520 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:164151 IMAGE:40130797), complete cds. // chr17 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC138814 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:170441 IMAGE:8861836), complete cds. // chr17 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC145424 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:178990 IMAGE:9053982), complete cds. // chr17 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// BC145425 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053983. // chr17 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24753086:24758576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_029197 // RefSeq // Mus musculus meiosis specific with OB domains (Meiob), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24804382:24839787:1 gene:ENSMUSG00000024155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119085 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930528F23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155401 IMAGE:8733834), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC119087 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930528F23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155403 IMAGE:8733836), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24775987:24847841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_008340 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein, acid labile subunit (Igfals), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006523711 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus insulin-like growth factor binding protein, acid labile subunit (Igfals), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24878770:24882008:1 gene:ENSMUSG00000046070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK220290 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4111 protein. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC129875 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein, acid labile subunit, mRNA (cDNA clone MGC:150140 IMAGE:40110389), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC129876 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein, acid labile subunit, mRNA (cDNA clone MGC:150141 IMAGE:40110391), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24876976:24881748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_023260 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S34 (Mrps34), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000043907 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:24895116:24896289:1 gene:ENSMUSG00000038880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000138648 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24895135:24896116:1 gene:ENSMUSG00000038880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000154236 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24895123:24897502:1 gene:ENSMUSG00000038880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK019922 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330430D13 product:T-complex expressed gene 2, full insert sequence. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC024336 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S34, mRNA (cDNA clone MGC:35669 IMAGE:4985502), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24895168:24896080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
XR_397352 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102643054 (LOC102643054), ncRNA. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK005803 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700009P10 product:hypothetical Serine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_001163416 // RefSeq // Mus musculus pentraxin 4 (Ptx4), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NM_026747 // RefSeq // Mus musculus pentraxin 4 (Ptx4), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000054930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25120760:25125268:1 gene:ENSMUSG00000044172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC107380 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110018H23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130368 IMAGE:40057084), complete cds. // chr17 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC107381 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110018H23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130369 IMAGE:40057088), complete cds. // chr17 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC115902 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110018H23 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40106399), complete cds. // chr17 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// BC118508 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110018H23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144823 IMAGE:40106397), complete cds. // chr17 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// XM_006524845 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pentraxin 4 (Ptx4), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000004025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25120851:25171851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_011930 // RefSeq // Mus musculus chloride channel 7 (Clcn7), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040729 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25133391:25162104:1 gene:ENSMUSG00000036636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160961 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:25136622:25162098:1 gene:ENSMUSG00000036636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000161153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25146316:25152397:1 gene:ENSMUSG00000036636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000162862 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:25151174:25157902:1 gene:ENSMUSG00000036636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AK150395 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830006K16 product:chloride channel 7, full insert sequence. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC050907 // GenBank // Mus musculus chloride channel 7, mRNA (cDNA clone MGC:63219 IMAGE:5698121), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC053049 // GenBank // Mus musculus chloride channel 7, mRNA (cDNA clone MGC:62309 IMAGE:5698121), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC054799 // GenBank // Mus musculus chloride channel 7, mRNA (cDNA clone MGC:65716 IMAGE:6849205), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25120851:25171851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_001079929 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 154 (Ccdc154), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000073277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25162461:25171913:1 gene:ENSMUSG00000059562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000182292 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:25162842:25171882:1 gene:ENSMUSG00000059562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000182621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25162464:25171911:1 gene:ENSMUSG00000059562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000183178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25162461:25171913:1 gene:ENSMUSG00000059562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK133084 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930569H12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// JN935900 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 154 (Ccdc154) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// XM_006523955 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 154 (Ccdc154), transcript variant X7, mRNA. // chr17 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000004025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25120851:25171851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_183150 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC003965 (BC003965), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000088307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25184561:25187661:1 gene:ENSMUSG00000067722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003965 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA sequence BC003965, mRNA (cDNA clone IMAGE:3488364), with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094389 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5708321. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25184256:25185098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001197024 // RefSeq // Mus musculus unkempt-like (Drosophila) (Unkl), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001290736 // RefSeq // Mus musculus unkempt-like (Drosophila) (Unkl), transcript variant isoform 3, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006525021 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unkempt-like (Drosophila) (Unkl), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006525022 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unkempt-like (Drosophila) (Unkl), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000039734 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:25188397:25234443:1 gene:ENSMUSG00000015127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160785 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25189464:25205734:1 gene:ENSMUSG00000015127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000160896 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:25188914:25234443:1 gene:ENSMUSG00000015127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC059910 // GenBank // Mus musculus unkempt-like (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:6825134). // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25188416:25231867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163718 // RefSeq // Mus musculus TSR3 20S rRNA accumulation (Tsr3), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_026676 // RefSeq // Mus musculus TSR3 20S rRNA accumulation (Tsr3), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000063574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25240170:25242798:1 gene:ENSMUSG00000015126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC027751 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610007P22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:29196 IMAGE:5011894), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC038884 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610007P22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:48205 IMAGE:1516275), complete cds. // chr17 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC089019 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610007P22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:113771 IMAGE:30551363), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25240253:25242661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_178372 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 34 (Prss34), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25298394:25300161:1 gene:ENSMUSG00000056399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY261775 // GenBank // Mus musculus mast cell protease-11 (Mcp11) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25298506:25322507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000158305 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:25306112:25306248:1 gene:ENSMUSG00000088930 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053259 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 28 (Prss28), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000015267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25308646:25311876:1 gene:ENSMUSG00000024171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF184895 // GenBank // Mus musculus implantation serine proteinase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC119386 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 28, mRNA (cDNA clone MGC:155702 IMAGE:8734135), complete cds. // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC119388 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 28, mRNA (cDNA clone MGC:155704 IMAGE:8734137), complete cds. // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000004016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25298506:25322507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_053260 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 29 (Prss29), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25318654:25322681:1 gene:ENSMUSG00000034039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF305425 // GenBank // Mus musculus implantation serine proteinase 2 mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AF442819 // GenBank // Mus musculus implantation serine proteinase 2 mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC104122 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 29, mRNA (cDNA clone MGC:123865 IMAGE:40044207), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25298506:25322507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_010781 // RefSeq // Mus musculus tryptase beta 2 (Tpsb2), mRNA. // chr17 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000069616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25366550:25368094:1 gene:ENSMUSG00000033825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// BC024374 // GenBank // Mus musculus tryptase beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:36021 IMAGE:4983727), complete cds. // chr17 // 75 // 61 // 21 // 28 // 0 /// L31853 // GenBank // Mus musculus serine protease (MMCP-6) mRNA, complete cds. // chr17 // 75 // 61 // 21 // 28 // 0 /// M57625 // GenBank // Mouse protease-6 gene, complete cds. // chr17 // 80 // 100 // 37 // 46 // 0 /// M57626 // GenBank // Mouse protease-6 gene, complete cds. // chr17 // 75 // 61 // 21 // 28 // 0 /// X78542 // GenBank // M.musculus MCP-6 mRNA for non functional serine protease variant. // chr17 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1 /// GENSCAN00000003963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25366552:25367846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0
NM_027951 // RefSeq // Mus musculus tektin 4 (Tekt4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006524947 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tektin 4 (Tekt4), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006524948 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tektin 4 (Tekt4), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000025002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25471590:25476594:1 gene:ENSMUSG00000024175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY485267 // GenBank // Mus musculus testicular microtubules-related protein 4 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC117510 // GenBank // Mus musculus tektin 4, mRNA (cDNA clone MGC:144760 IMAGE:40105676), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC117526 // GenBank // Mus musculus tektin 4, mRNA (cDNA clone MGC:144759 IMAGE:40105675), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25455047:25476538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_022422 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 13 (Gng13), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006524779 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 13 (Gng13), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115108 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25717528:25719087:1 gene:ENSMUSG00000025739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25717171:25719406:1 gene:ENSMUSG00000025739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AB030194 // GenBank // Mus musculus mRNA for G gamma protein, complete cds, clone:2-35. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AY029485 // GenBank // Mus musculus G protein gamma subunit 13 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC048431 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 13, mRNA (cDNA clone MGC:58102 IMAGE:6601662), complete cds. // chr17 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// BC059712 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 13, mRNA (cDNA clone MGC:74069 IMAGE:6544762), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25712041:25719032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 63 // 17 // 19 // 0
NM_028009 // RefSeq // Mus musculus RNA pseudouridylate synthase domain containing 1 (Rpusd1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006523415 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RNA pseudouridylate synthase domain containing 1 (Rpusd1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25727751:25731456:1 gene:ENSMUSG00000041199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC018186 // GenBank // Mus musculus RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:25610 IMAGE:4160116), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25728210:25748080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_177822 // RefSeq // Mus musculus mesothelin-like (Mslnl), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006524429 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mesothelin-like (Mslnl), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006524430 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mesothelin-like (Mslnl), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000047098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25736040:25748330:1 gene:ENSMUSG00000041062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC052484 // GenBank // Mus musculus mesothelin-like, mRNA (cDNA clone MGC:56915 IMAGE:6312790), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25728210:25748080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_026238 // RefSeq // Mus musculus nuclear prelamin A recognition factor-like (Narfl), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000002350 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25773776:25783332:1 gene:ENSMUSG00000002280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000130861 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25776819:25779593:1 gene:ENSMUSG00000002280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 92 // 33 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000131458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25773817:25779513:1 gene:ENSMUSG00000002280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000134108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25773776:25782791:1 gene:ENSMUSG00000002280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000149645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25773819:25782796:1 gene:ENSMUSG00000002280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC052830 // GenBank // Mus musculus nuclear prelamin A recognition factor-like, mRNA (cDNA clone MGC:60442 IMAGE:30040958), complete cds. // chr17 // 91 // 92 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000003961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25773822:25782254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_001165929 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 78 (Ccdc78), mRNA. // chr17 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000095500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25786580:25790513:1 gene:ENSMUSG00000071202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25786646:25790029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NM_001164225 // RefSeq // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 16 (Fbxl16), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524019 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 16 (Fbxl16), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25809085:25821244:1 gene:ENSMUSG00000025738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132383 // GenBank // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 16, mRNA (cDNA clone MGC:164014 IMAGE:40130660), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC137657 // GenBank // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 16, mRNA (cDNA clone MGC:169281 IMAGE:8860676), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25804225:25819522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_173741 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 24 (Wdr24), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000026833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25823627:25828730:1 gene:ENSMUSG00000025737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000160349 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25823649:25828721:1 gene:ENSMUSG00000025737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC037651 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 24, mRNA (cDNA clone MGC:47001 IMAGE:5148210), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25824206:25830322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_026686 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 0610011F06 gene (0610011F06Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25875500:25877169:1 gene:ENSMUSG00000025731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25875464:25877160:1 gene:ENSMUSG00000025731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000163356 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:25875530:25886007:1 gene:ENSMUSG00000025731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000169308 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:25875501:25877169:1 gene:ENSMUSG00000025731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC069266 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610011F06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:73675 IMAGE:1248589), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169085 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:25875530:25876997:1 gene:ENSMUSG00000025731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000003980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25875530:25876584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0