ENSMUST00000181174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25951472:25963610:1 gene:ENSMUSG00000097405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK052760 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630044L22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
NM_021793 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 8 (five membrane-spanning domains) (Tmem8), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006524738 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 8 (five membrane-spanning domains) (Tmem8), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025010 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26113316:26123254:1 gene:ENSMUSG00000024180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000128597 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:26119442:26123254:1 gene:ENSMUSG00000024180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AB045293 // GenBank // Mus musculus mRNA for M83 protein, complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK079893 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430106C18 product:transmembrane protein 8 (five membrane-spanning domains), full insert sequence. // chr17 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// BC005722 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 8 (five membrane-spanning domains), mRNA (cDNA clone MGC:11794 IMAGE:3595205), complete cds. // chr17 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26113450:26122234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_024227 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L28 (Mrpl28), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26123520:26126613:1 gene:ENSMUSG00000024181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127647 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:26125261:26126482:1 gene:ENSMUSG00000024181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC100322 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L28, mRNA (cDNA clone IMAGE:30844363), partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC145680 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L28, mRNA (cDNA clone MGC:175567 IMAGE:40130983), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC145682 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L28, mRNA (cDNA clone MGC:175569 IMAGE:40130985), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26123562:26126381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001159598 // RefSeq // Mus musculus axin 1 (Axin1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_009733 // RefSeq // Mus musculus axin 1 (Axin1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000074370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26138688:26195811:1 gene:ENSMUSG00000024182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000118904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26138828:26195241:1 gene:ENSMUSG00000024182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000163421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26138950:26195294:1 gene:ENSMUSG00000024182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC055491 // GenBank // Mus musculus axin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4946301), partial cds. // chr17 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC113171 // GenBank // Mus musculus axin 1, mRNA (cDNA clone MGC:132911 IMAGE:40061055), complete cds. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26142699:26195061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001081656 // RefSeq // Mus musculus neuralized homolog 1b (Drosophila) (Neurl1b), mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006524234 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuralized homolog 1b (Drosophila) (Neurl1b), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000053020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26414965:26446349:1 gene:ENSMUSG00000034413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000182897 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:26414829:26441795:1 gene:ENSMUSG00000034413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// DQ839448 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 neuralized-2 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GQ414760 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 neuralized 2 (Neurl2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000183077 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:26414829:26441795:1 gene:ENSMUSG00000034413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26422064:26441795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001081656 // RefSeq // Mus musculus neuralized homolog 1b (Drosophila) (Neurl1b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053020 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26414965:26446349:1 gene:ENSMUSG00000034413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_025272 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit E (Atp6v0e), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000015719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26676396:26699644:1 gene:ENSMUSG00000015575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC024733 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit E, mRNA (cDNA clone MGC:35788 IMAGE:5374017), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26676412:26697951:1 gene:ENSMUSG00000015575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// AK134836 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330589P19 product:ATPase, H+ transporting, V0 subunit, full insert sequence. // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// XM_006523514 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit E (Atp6v0e), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// BC021529 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit E, mRNA (cDNA clone IMAGE:5353703), partial cds. // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_009343 // RefSeq // Mus musculus PHD finger protein 1 (Phf1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006524025 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PHD finger protein 1 (Phf1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006524026 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PHD finger protein 1 (Phf1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000073724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26933127:26937890:1 gene:ENSMUSG00000024193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB011550 // GenBank // Mus musculus Tctex-3 mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// AK144793 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730035E18 product:PHD finger protein 1, full insert sequence. // chr17 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// AK155268 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630212N15 product:PHD finger protein 1, full insert sequence. // chr17 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC015077 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4007482, containing frame-shift errors. // chr17 // 83 // 94 // 25 // 30 // 0 /// U81490 // GenBank // Mus musculus polycomblike (mPcl1) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26917268:26937565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001281491 // RefSeq // Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006524238 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000081285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26941452:26970645:1 gene:ENSMUSG00000067629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000177932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26941452:26970541:1 gene:ENSMUSG00000067629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006524239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// GENSCAN00000047960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26939710:26970645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// KnowTID_00003456 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT028827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT028828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
XM_006524239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT028831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT028832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NovelTID_00002848 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NovelTID_00002849 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001281491 // RefSeq // Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006524238 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006524239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000081285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26941452:26970645:1 gene:ENSMUSG00000067629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000177932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26941452:26970541:1 gene:ENSMUSG00000067629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26939710:26970645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT028830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT028831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT028832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NovelTID_00002847 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NovelTID_00002848 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NovelTID_00002849 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001281491 // RefSeq // Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524238 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000081285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26941452:26970645:1 gene:ENSMUSG00000067629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000177932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26941452:26970541:1 gene:ENSMUSG00000067629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26939710:26970645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001281491 // RefSeq // Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006524238 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// XM_006524239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// XM_006524248 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X14, mRNA. // chr17 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26941452:26970645:1 gene:ENSMUSG00000067629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000177932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26941452:26970541:1 gene:ENSMUSG00000067629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000047960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26939710:26970645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001281491 // RefSeq // Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006524238 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006524239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006524248 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X14, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000081285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26941452:26970645:1 gene:ENSMUSG00000067629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000177932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26941452:26970541:1 gene:ENSMUSG00000067629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26939710:26970645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001281491 // RefSeq // Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524238 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524248 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat) (Syngap1), transcript variant X14, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26941452:26970645:1 gene:ENSMUSG00000067629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26941452:26970541:1 gene:ENSMUSG00000067629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26939710:26970645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005916 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 9 (Zbtb9), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120016 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26973167:26976205:1 gene:ENSMUSG00000079605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000133257 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:26973217:27036378:1 gene:ENSMUSG00000048731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC049933 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:55137 IMAGE:5387663), complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26973623:26975002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// BC054732 // GenBank // Mus musculus gametogenetin binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5709552). // chr17 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000142141 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27018040:27022517:1 gene:ENSMUSG00000048731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK002723 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610031G08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000151920 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27018013:27026693:1 gene:ENSMUSG00000048731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NM_001251881 // RefSeq // Mus musculus gametogenetin binding protein 1 (Ggnbp1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// ENSMUST00000122106 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:27018024:27036378:1 gene:ENSMUSG00000048731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONMMUT028835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT028834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001251881 // RefSeq // Mus musculus gametogenetin binding protein 1 (Ggnbp1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122106 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:27018024:27036378:1 gene:ENSMUSG00000048731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133257 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:26973217:27036378:1 gene:ENSMUSG00000048731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151920 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27018013:27026693:1 gene:ENSMUSG00000048731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC054732 // GenBank // Mus musculus gametogenetin binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5709552). // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001251881 // RefSeq // Mus musculus gametogenetin binding protein 1 (Ggnbp1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// NM_027544 // RefSeq // Mus musculus gametogenetin binding protein 1 (Ggnbp1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000053683 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:27029259:27036378:1 gene:ENSMUSG00000048731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000122106 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:27018024:27036378:1 gene:ENSMUSG00000048731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000133257 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:26973217:27036378:1 gene:ENSMUSG00000048731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AB250379 // GenBank // Mus musculus Ggnbp1 mRNA for gametogenetin binding protein 1, complete cds. // chr17 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AY141192 // GenBank // Mus musculus gametogenetin protein 1 binding protein (Ggnbp1) mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 78 // 26 // 28 // 0 /// BC049764 // GenBank // Mus musculus gametogenetin binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:58852 IMAGE:6774330), complete cds. // chr17 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000154731 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27030404:27034809:1 gene:ENSMUSG00000048731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// BC054732 // GenBank // Mus musculus gametogenetin binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5709552). // chr17 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000053743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:27029459:27121528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1
NM_080553 // RefSeq // Mus musculus inositol 1,4,5-triphosphate receptor 3 (Itpr3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// ENSMUST00000049308 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:27057304:27122223:1 gene:ENSMUSG00000042644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// AB182289 // GenBank // Mus musculus itpr3 mRNA for type-3 inositol 1,4,5-trisphosphate receptor, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// BC010323 // GenBank // Mus musculus inositol 1,4,5-triphosphate receptor 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3600031), complete cds. // chr17 // 100 // 19 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000053743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:27029459:27121528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 57 // 57 // 0
ENSMUST00000151398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27342460:27344825:1 gene:ENSMUSG00000073430 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK138223 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230038M14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001166537 // RefSeq // Mus musculus high mobility group AT-hook 1 (Hmga1), transcript variant 6, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_016660 // RefSeq // Mus musculus high mobility group AT-hook 1 (Hmga1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000117254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:27556668:27563060:1 gene:ENSMUSG00000046711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000118570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:27556668:27563663:1 gene:ENSMUSG00000046711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XR_385498 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C130040N14 gene (C130040N14Rik), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140837 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130040N14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001286743 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 (Pacsin1), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NM_011861 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 (Pacsin1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NM_178365 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 (Pacsin1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000045896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:27655588:27711106:1 gene:ENSMUSG00000040276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000097360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:27685197:27708659:1 gene:ENSMUSG00000040276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000114873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27655509:27708659:1 gene:ENSMUSG00000040276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NM_001286744 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 (Pacsin1), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// ENSMUST00000114872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27655643:27708677:1 gene:ENSMUSG00000040276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1 /// BC014698 // GenBank // Mus musculus protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1, mRNA (cDNA clone MGC:25285 IMAGE:4527708), complete cds. // chr17 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1 /// GENSCAN00000053749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:27701600:27708535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 66 // 24 // 25 // 0
NM_011432 // RefSeq // Mus musculus U1 small nuclear ribonucleoprotein C (Snrpc), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006523948 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus U1 small nuclear ribonucleoprotein C (Snrpc), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000071006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:27839974:27851964:1 gene:ENSMUSG00000024217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000137581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27840134:27851968:1 gene:ENSMUSG00000024217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC008243 // GenBank // Mus musculus U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mRNA (cDNA clone MGC:6542 IMAGE:2655238), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC067386 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6405565, partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC092266 // GenBank // Mus musculus U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mRNA (cDNA clone MGC:103157 IMAGE:4009300), complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// U70315 // GenBank // Mus musculus U1 snRNP-specific protein C mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000053741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:27840162:27845863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_001080769 // RefSeq // Mus musculus UHRF1 (ICBP90) binding protein 1 (Uhrf1bp1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000114849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:27856490:27900040:1 gene:ENSMUSG00000039512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000130810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27857243:27879761:1 gene:ENSMUSG00000039512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000137825 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27890105:27895366:1 gene:ENSMUSG00000039512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// AK144200 // GenBank HTC // Mus musculus CRL-1751 WEHI 164 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430097E10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 90 // 68 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:27856623:27897080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0
NM_001004366 // RefSeq // Mus musculus signal peptide, CUB domain, EGF-like 3 (Scube3), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000132670 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:28153602:28170145:1 gene:ENSMUSG00000038677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000137147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:28152445:28171514:1 gene:ENSMUSG00000038677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0 /// AY639609 // GenBank // Mus musculus signal peptide, CUB and EGF-like domain containing protein 3 (SCUBE3) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// BC079849 // GenBank // Mus musculus signal peptide, CUB domain, EGF-like 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5705946), partial cds. // chr17 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000043503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:28142316:28174852:1 gene:ENSMUSG00000038677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1 /// ENSMUST00000148342 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:28160761:28173027:1 gene:ENSMUSG00000038677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 67 // 67 // 32 // 48 // 1 /// GENSCAN00000016080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:28142526:28171345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0
NM_027185 // RefSeq // Mus musculus differentially expressed in FDCP 6 (Def6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000002327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:28207778:28228608:1 gene:ENSMUSG00000002257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF329497 // GenBank // Mus musculus SWAP-70-like adapter of T-cells (Slat) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AY241695 // GenBank // Mus musculus IRF4-binding protein (Ibp) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// BC120500 // GenBank // Mus musculus differentially expressed in FDCP 6, mRNA (cDNA clone MGC:155737 IMAGE:40129423), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC131953 // GenBank // Mus musculus differentially expressed in FDCP 6, mRNA (cDNA clone MGC:163584 IMAGE:40130230), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AY278770 // GenBank // Mus musculus SLAT2 (Slat) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr17 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000016074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:28207843:28299849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000095448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:28523293:28525347:1 gene:ENSMUSG00000066170 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:28523257:28525347:1 gene:ENSMUSG00000066170 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK083527 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030041F24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AK153588 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630007D12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC096647 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E230001N04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:1395609). // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026290 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 12 (Armc12), mRNA. // chr17 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025060 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:28530860:28538954:1 gene:ENSMUSG00000024223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// BC049559 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930511I11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58148 IMAGE:6707229), complete cds. // chr17 // 92 // 78 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:28530884:28552667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0
NM_001034871 // RefSeq // Mus musculus colipase-like 2 (Clpsl2), mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:28549489:28552618:1 gene:ENSMUSG00000024224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC147116 // GenBank // Mus musculus gene model 749, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182266 IMAGE:9056160), complete cds. // chr17 // 85 // 82 // 23 // 27 // 0 /// BC147117 // GenBank // Mus musculus gene model 749, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182227 IMAGE:9056121), complete cds. // chr17 // 85 // 82 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:28530884:28552667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1
NM_026571 // RefSeq // Mus musculus lipoma HMGIC fusion partner-like 5 (Lhfpl5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000080780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:28575718:28583593:1 gene:ENSMUSG00000062252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC099483 // GenBank // Mus musculus tetraspan transmembrane protein, hair cell stereocilia, mRNA (cDNA clone MGC:117706 IMAGE:30848018), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC125264 // GenBank // Mus musculus tetraspan transmembrane protein, hair cell stereocilia, mRNA (cDNA clone IMAGE:40055074), partial cds. // chr17 // 91 // 38 // 10 // 11 // 0 /// BC147842 // GenBank // Mus musculus tetraspan transmembrane protein, hair cell stereocilia, mRNA (cDNA clone MGC:182945 IMAGE:9087559), complete cds. // chr17 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// BC147847 // GenBank // Mus musculus tetraspan transmembrane protein, hair cell stereocilia, mRNA (cDNA clone MGC:182950 IMAGE:9087564), complete cds. // chr17 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000016066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:28576001:28580268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_011950 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 13 (Mapk13), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000004986 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:28769307:28778698:1 gene:ENSMUSG00000004864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000124099 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:28769336:28778219:1 gene:ENSMUSG00000004864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000129096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:28769349:28778546:1 gene:ENSMUSG00000004864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000133786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:28769372:28777562:1 gene:ENSMUSG00000004864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0 /// BC001992 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 13, mRNA (cDNA clone MGC:5725 IMAGE:3492903), complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// U81823 // GenBank // Mus musculus p38delta MAP kinase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000016067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:28769215:28780205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_001034885 // RefSeq // Mus musculus patatin-like phospholipase domain containing 1 (Pnpla1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006524583 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus patatin-like phospholipase domain containing 1 (Pnpla1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000056866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:28858411:28890308:1 gene:ENSMUSG00000043286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000114737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:28858411:28890308:1 gene:ENSMUSG00000043286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC139043 // GenBank // Mus musculus patatin-like phospholipase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:170670 IMAGE:8862065), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:28858867:28885651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_013663 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 3 (Srsf3), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NR_036613 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 3 (Srsf3), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000130216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:29032673:29043366:1 gene:ENSMUSG00000071172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC071196 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 3 (SRp20), mRNA (cDNA clone MGC:78027 IMAGE:30441615), complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_001002786 // RefSeq // Mus musculus RAB44, member RAS oncogene family (Rab44), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006524591 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB44, member RAS oncogene family (Rab44), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524592 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB44, member RAS oncogene family (Rab44), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006536774 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB44, member RAS oncogene family (Rab44), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000087942 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:29135056:29148980:1 gene:ENSMUSG00000064147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC139372 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9830134C10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170999 IMAGE:8862394), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000139931 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29136338:29148243:1 gene:ENSMUSG00000064147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000013247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:29120854:29155046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
GENSCAN00000013247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:29120854:29155046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0
NM_030561 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC004004 (BC004004), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525174 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC004004 (BC004004), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000064709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:29268788:29302881:1 gene:ENSMUSG00000052712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000120346 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:29268843:29301521:1 gene:ENSMUSG00000052712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000149405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29274104:29301525:1 gene:ENSMUSG00000052712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC004004 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC004004, mRNA (cDNA clone MGC:7550 IMAGE:3492768), complete cds. // chr17 // 83 // 89 // 20 // 24 // 0 /// BC058575 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC004004, mRNA (cDNA clone MGC:68120 IMAGE:6488611), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000156215 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29268951:29285167:1 gene:ENSMUSG00000052712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// AK157037 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830113P20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000013235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:29268494:29301450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT028996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_008842 // RefSeq // Mus musculus proviral integration site 1 (Pim1), mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000024811 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:29490812:29496111:1 gene:ENSMUSG00000024014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC042885 // GenBank // Mus musculus proviral integration site 1, mRNA (cDNA clone MGC:25501 IMAGE:4507947), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC053019 // GenBank // Mus musculus proviral integration site 1, mRNA (cDNA clone MGC:62222 IMAGE:5694941), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC055316 // GenBank // Mus musculus proviral integration site 1, mRNA (cDNA clone MGC:64796 IMAGE:5694941), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK154127 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630003I04 product:proviral integration site 1, full insert sequence. // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000013230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:29437419:29494747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_198647 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 22B (Tbc1d22b), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:29549788:29606895:1 gene:ENSMUSG00000042203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160114 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29572423:29606894:1 gene:ENSMUSG00000042203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC045600 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 22B, mRNA (cDNA clone MGC:31516 IMAGE:4489206), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC060066 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 22B, mRNA (cDNA clone IMAGE:6419023), complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000013215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:29549939:29604972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_028791 // RefSeq // Mus musculus cap methyltransferase 1 (Cmtr1), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000024816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:29660595:29705979:1 gene:ENSMUSG00000024019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128410 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29678879:29690407:1 gene:ENSMUSG00000024019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000138939 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29687056:29703359:1 gene:ENSMUSG00000024019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC024691 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1300018I05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30380 IMAGE:3668655), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130871 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29614876:29703359:1 gene:ENSMUSG00000098374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK172991 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0646 protein. // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:29614968:29702295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// AK047104 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930020M14 product:RIKEN cDNA 1300018I05 gene, full insert sequence. // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_148926 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, AN1-type domain 3 (Zfand3), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524028 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, AN1-type domain 3 (Zfand3), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000057897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:30005087:30210019:1 gene:ENSMUSG00000044477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC034396 // GenBank // Mus musculus zinc finger, AN1-type domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:36268 IMAGE:3707476), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC083124 // GenBank // Mus musculus zinc finger, AN1-type domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:103362 IMAGE:6334368), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC100559 // GenBank // Mus musculus zinc finger, AN1-type domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:118625 IMAGE:3419074), complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// X80437 // GenBank // M.musculus tex27 mRNA. // chr17 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:30130298:30208172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
AK035082 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430085I19 product:mitochondria located 1 homolog (human), full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013811 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 8 (Dnah8), mRNA. // chr17 // 100 // 99 // 90 // 90 // 0 /// ENSMUST00000170651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:30624354:30875264:1 gene:ENSMUSG00000033826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 99 // 90 // 90 // 0 /// AF356520 // GenBank // Mus musculus axonemal dynein heavy chain 8 long form (Dnahc8) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 96 // 99 // 86 // 90 // 0 /// AF356521 // GenBank // Mus musculus axonemal dynein heavy chain 8 short form (Dnahc8) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 96 // 89 // 78 // 81 // 0 /// AF356522 // GenBank // Mus musculus haplotype t axonemal dynein heavy chain 8 long form (Dnahc8) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 90 // 99 // 81 // 90 // 0 /// AF356523 // GenBank // Mus musculus haplotype t axonemal dynein heavy chain 8 short form 1 (Dnahc8) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 90 // 89 // 73 // 81 // 0 /// AF363577 // GenBank // Mus musculus haplotype t axonemal dynein heavy chain 8 short form 2 (Dnahc8) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 90 // 89 // 73 // 81 // 0 /// AK161258 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921539K09 product:dynein, axonemal, heavy chain 8, full insert sequence. // chr17 // 11 // 11 // 10 // 91 // 1 /// GENSCAN00000047720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:30763173:30891751:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 34 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:30635366:30761176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 98 // 57 // 51 // 52 // 0
NM_021332 // RefSeq // Mus musculus glucagon-like peptide 1 receptor (Glp1r), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:30901867:30936510:1 gene:ENSMUSG00000024027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ001692 // GenBank // Mus musculus mRNA for glucagon-like peptide 1 receptor. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AY293742 // GenBank // Mus musculus glucagon-like peptide-1 receptor (Glp1r) mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC139464 // GenBank // Mus musculus glucagon-like peptide 1 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:171091 IMAGE:8862486), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC139466 // GenBank // Mus musculus glucagon-like peptide 1 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:171093 IMAGE:8862488), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC145626 // GenBank // Mus musculus glucagon-like peptide 1 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:179202 IMAGE:9054194), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// DQ093397 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J glucagon-like peptide 1 receptor (Glp1r) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ093398 // GenBank // Mus musculus strain CAST/Ei glucagon-like peptide 1 receptor (Glp1r) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:30901877:30936432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_177465 // RefSeq // Mus musculus uromodulin-like 1 (Umodl1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:30954679:31010708:1 gene:ENSMUSG00000054134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000066981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:30954679:31010708:1 gene:ENSMUSG00000054134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000114555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:30954683:31010708:1 gene:ENSMUSG00000054134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY771616 // GenBank // Mus musculus olfactorin (Umodl1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AY771617 // GenBank // Mus musculus olfactorin long isoform (Umodl1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AY771618 // GenBank // Mus musculus olfactorin (Umodl1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:30954751:30994813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_009593 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 1 (Abcg1), mRNA. // chr17 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000024829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:31057698:31115777:1 gene:ENSMUSG00000024030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// AF323659 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette transporter G1 (Abcg1) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// BC119471 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:141022 IMAGE:40048166), complete cds. // chr17 // 93 // 83 // 28 // 30 // 0 /// U34920 // GenBank // Mus musculus white homolog (white) mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 89 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000139013 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:31057774:31098759:1 gene:ENSMUSG00000024030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// AK037433 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130018J23 product:ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 1, full insert sequence. // chr17 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000023267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31054751:31118510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0
NM_177823 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin associated and SH3 domain containing, A (Ubash3a), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006524434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin associated and SH3 domain containing, A (Ubash3a), transcript variant X1, mRNA. // chrUn // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000048656 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:31207873:31242202:1 gene:ENSMUSG00000042345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000151620 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:31212113:31242202:1 gene:ENSMUSG00000042345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chrUn // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AK049106 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330001M22 product:similar to UBASH3A PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chrUn // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000144772 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:31208080:31216231:1 gene:ENSMUSG00000042345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chrUn // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// BC027561 // GenBank HTC // Mus musculus ubiquitin associated and SH3 domain containing, A, mRNA (cDNA clone IMAGE:3375785), with apparent retained intron. // chrUn // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// GENSCAN00000023253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31207884:31241378:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 98 // 39 // 39 // 0
NM_001242427 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 1 (Slc37a1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// NM_153062 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 1 (Slc37a1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006524099 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 1 (Slc37a1), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000165149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:31296219:31350696:1 gene:ENSMUSG00000024036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000171233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:31295483:31350696:1 gene:ENSMUSG00000024036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AK163990 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330039O21 product:solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 1, full insert sequence. // chr17 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// BC027294 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:28167 IMAGE:3985469), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006524098 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 1 (Slc37a1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 95 // 95 // 39 // 41 // 1 /// GENSCAN00000023268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31314458:31362968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0
NM_030087 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 3 (Ndufv3), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000046288 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:31520158:31531326:1 gene:ENSMUSG00000024038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC013640 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 3, mRNA (cDNA clone MGC:18783 IMAGE:4188234), complete cds. // chr17 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// NM_001083891 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 3 (Ndufv3), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSMUST00000064798 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:31520115:31531323:1 gene:ENSMUSG00000024038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000023269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31520214:31531252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000185273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:31529093:31531326:1 gene:ENSMUSG00000024038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSMUST00000189436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:31520150:31527839:1 gene:ENSMUSG00000024038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000191598 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:31520185:31527242:1 gene:ENSMUSG00000024038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSMUST00000013706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:31557126:31559110:1 gene:ENSMUSG00000013562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000160270 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:31558192:31559113:1 gene:ENSMUSG00000013562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000162059 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:31557126:31559110:1 gene:ENSMUSG00000013562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK019514 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833413E03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_016670 // RefSeq // Mus musculus Pbx/knotted 1 homeobox (Pknox1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NR_027493 // RefSeq // Mus musculus Pbx/knotted 1 homeobox (Pknox1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000097352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:31564801:31607680:1 gene:ENSMUSG00000006705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000175806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:31564749:31605481:1 gene:ENSMUSG00000006705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000176701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:31583552:31607684:1 gene:ENSMUSG00000006705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// AF061270 // GenBank // Mus musculus homeobox protein PKNOX1 (Pknox1) mRNA, complete cds. // chr17 // 84 // 91 // 26 // 31 // 0 /// AK131788 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700119G06 product:Pbx/knotted 1 homeobox, full insert sequence. // chr17 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// BC052701 // GenBank // Mus musculus Pbx/knotted 1 homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:64705 IMAGE:5721441), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000175812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:31594821:31599601:1 gene:ENSMUSG00000006705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000023259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31583756:31604964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// NONMMUT029093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001278569 // RefSeq // Mus musculus crystallin, alpha A (Cryaa), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001278570 // RefSeq // Mus musculus crystallin, alpha A (Cryaa), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_013501 // RefSeq // Mus musculus crystallin, alpha A (Cryaa), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000019192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:31677933:31681722:1 gene:ENSMUSG00000024041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085170 // GenBank // Mus musculus crystallin, alpha A, mRNA (cDNA clone MGC:115745 IMAGE:30699322), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085172 // GenBank // Mus musculus crystallin, alpha A, mRNA (cDNA clone MGC:115743 IMAGE:30699371), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC092385 // GenBank // Mus musculus crystallin, alpha A, mRNA (cDNA clone MGC:106604 IMAGE:30602480), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// J00376 // GenBank // Mouse lens alpha-A-crystallin mRNA, 3 end. // chr17 // 70 // 77 // 14 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31658439:31681195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001163734 // RefSeq // Mus musculus ribosomal RNA processing 1 homolog B (S. cerevisiae) (Rrp1b), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_028244 // RefSeq // Mus musculus ribosomal RNA processing 1 homolog B (S. cerevisiae) (Rrp1b), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006524971 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribosomal RNA processing 1 homolog B (S. cerevisiae) (Rrp1b), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006524973 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribosomal RNA processing 1 homolog B (S. cerevisiae) (Rrp1b), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// XM_006524975 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribosomal RNA processing 1 homolog B (S. cerevisiae) (Rrp1b), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000081339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:32036100:32062865:1 gene:ENSMUSG00000058392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000147076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:32048285:32062856:1 gene:ENSMUSG00000058392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC016569 // GenBank // Mus musculus ribosomal RNA processing 1 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:27793 IMAGE:3157173), complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// XM_006524974 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribosomal RNA processing 1 homolog B (S. cerevisiae) (Rrp1b), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000029068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32036475:32060541:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0
NR_029458 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A530088E08 gene (A530088E08Rik), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177307 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39 (Cyp4f39), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000003413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:32468462:32492479:1 gene:ENSMUSG00000061126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC145755 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mRNA (cDNA clone MGC:175642 IMAGE:40131058), complete cds. // chr17 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32439194:32551233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_024442 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 16 (Cyp4f16), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000003416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:32536569:32551797:1 gene:ENSMUSG00000048440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000165515 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:32536577:32551798:1 gene:ENSMUSG00000048440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000169591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:32536558:32551798:1 gene:ENSMUSG00000048440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF233646 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 CYP4F16 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC026539 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 16, mRNA (cDNA clone MGC:35789 IMAGE:4982322), complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000170956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:32536595:32544425:1 gene:ENSMUSG00000048440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// GENSCAN00000029095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32439194:32551233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
NM_001100187 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 37 (Cyp4f37), mRNA. // chr17 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// ENSMUST00000077639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:32621319:32636184:1 gene:ENSMUSG00000062464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32621890:32648575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 86 // 17 // 19 // 0
NM_001101588 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 40 (Cyp4f40), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006524757 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 40 (Cyp4f40), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000165061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:32659410:32676687:1 gene:ENSMUSG00000090700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC158089 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 40, mRNA (cDNA clone MGC:189988 IMAGE:9088175), complete cds. // chr17 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32654276:32669899:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32671078:32702960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1
NM_134127 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 15 (Cyp4f15), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000008801 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:32685679:32703352:1 gene:ENSMUSG00000073424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000168171 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:32685627:32703352:1 gene:ENSMUSG00000073424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF233645 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 CYP4F15 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC021377 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 15, mRNA (cDNA clone MGC:29243 IMAGE:5050617), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32671078:32702960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_153063 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 472 (Zfp472), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039132 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:32965814:32979233:1 gene:ENSMUSG00000053600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027407 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 472, mRNA (cDNA clone MGC:36909 IMAGE:4945483), complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AY195875 // GenBank // Mus musculus KRAB box containing zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr17 // 65 // 80 // 13 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32972503:32993258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001045559 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 952 (Zfp952), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524254 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 952 (Zfp952), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000087666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:32993197:33005457:1 gene:ENSMUSG00000053390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000141815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:32993197:33005457:1 gene:ENSMUSG00000053390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000157017 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:32993201:33003086:1 gene:ENSMUSG00000053390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// BC057593 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C920016K16 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6810096). // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001024950 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 563 (Zfp563), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000131722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:17:33089310:33106203:1 gene:ENSMUSG00000067424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000140829 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:33092458:33105058:1 gene:ENSMUSG00000067424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000153072 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:33089564:33104724:1 gene:ENSMUSG00000067424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000041183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33075152:33123918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
XR_397419 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 14-like (LOC102642015), misc_RNA. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AK157325 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830211D24 product:weakly similar to KRAB zinc finger protein [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_029952 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 955A (Zfp955a), mRNA. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000008830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:33241519:33255040:-1 gene:ENSMUSG00000094441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 87 // 58 // 13 // 15 // 0 /// ENSMUST00000099414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:33289649:33303196:1 gene:ENSMUSG00000096910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC043067 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 422, related sequence 1, mRNA (cDNA clone MGC:57971 IMAGE:5709349), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC094586 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 422, related sequence 1, mRNA (cDNA clone MGC:106443 IMAGE:30620063), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NM_001142957 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 955B (Zfp955b), mRNA. // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33268726:33304409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AK032339 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430521J03 product:hypothetical KRAB box containing protein, full insert sequence. // chr17 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33215395:33254810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_183282 // RefSeq // Mus musculus actin-like 9 (Actl9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000174088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33432896:33434268:1 gene:ENSMUSG00000092519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089487 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700029I08 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6707709), partial cds. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33433082:33434215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_053214 // RefSeq // Mus musculus myosin IF (Myo1f), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000087605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33555719:33607762:1 gene:ENSMUSG00000024300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000173372 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33555745:33607758:1 gene:ENSMUSG00000024300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC046502 // GenBank // Mus musculus myosin IF, mRNA (cDNA clone MGC:25309 IMAGE:4167558), complete cds. // chr17 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// X97650 // GenBank // M.musculus mRNA for myosin I. // chr17 // 58 // 96 // 15 // 26 // 0 /// ENSMUST00000173426 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33582603:33607764:1 gene:ENSMUSG00000024300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// AK036840 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930017F19 product:MYOSIN IF (MYOSIN-IE) (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000041172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33516275:33645575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001002842 // RefSeq // Mus musculus PML-RAR alpha-regulated adaptor molecule 1 (Pram1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NR_028279 // RefSeq // Mus musculus PML-RAR alpha-regulated adaptor molecule 1 (Pram1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000052079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33638056:33645706:1 gene:ENSMUSG00000032739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000116619 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33638095:33645700:1 gene:ENSMUSG00000032739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000163245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33630759:33645705:1 gene:ENSMUSG00000092412 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000166215 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33644817:33645638:1 gene:ENSMUSG00000032739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// AY665714 // GenBank // Mus musculus PML-RAR alpha-regulated adaptor molecule-1 (Pram1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC141100 // GenBank // Mus musculus PML-RAR alpha-regulated adaptor molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:176061 IMAGE:9055712), complete cds. // chr17 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33516275:33645575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_019421 // RefSeq // Mus musculus CD320 antigen (Cd320), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006524631 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD320 antigen (Cd320), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000002379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33843091:33849774:1 gene:ENSMUSG00000002308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000087559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33843426:33848751:1 gene:ENSMUSG00000002308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// AK131655 // GenBank HTC // Mus musculus adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1600000E09 product:hypothetical Low density lipoprotein-receptor, class A/LDL-receptor class A (LDLRA) domain profile containing protein, full insert sequence. // chr17 // 95 // 58 // 18 // 19 // 0 /// BC026888 // GenBank // Mus musculus CD320 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:30334 IMAGE:3991556), complete cds. // chr17 // 85 // 61 // 17 // 20 // 0 /// XM_006537392 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD320 antigen (Cd320), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// ENSMUST00000173418 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33843103:33846318:1 gene:ENSMUSG00000002308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000041189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33843171:33848428:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0
NM_020625 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 22 (Zbtb22), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525442 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 22 (Zbtb22), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33916171:33919324:1 gene:ENSMUSG00000051390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026964 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 22, mRNA (cDNA clone MGC:30544 IMAGE:5043642), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052154 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 22, mRNA (cDNA clone MGC:59282 IMAGE:6329405), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33916883:33918799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001025313 // RefSeq // Mus musculus TAP binding protein (Tapbp), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_009318 // RefSeq // Mus musculus TAP binding protein (Tapbp), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025161 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33919332:33929288:1 gene:ENSMUSG00000024308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000172653 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33926118:33928276:1 gene:ENSMUSG00000024308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000172888 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33919512:33920375:1 gene:ENSMUSG00000024308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AF043943 // GenBank // Mus musculus tapasin mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// AF106278 // GenBank // Mus musculus tapasin mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC015074 // GenBank // Mus musculus TAP binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:13789 IMAGE:4223922), complete cds. // chr17 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC052870 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30075526, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr17 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33919688:33926870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT029240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT029241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_009059 // RefSeq // Mus musculus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 2 (Rgl2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006523910 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 2 (Rgl2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XR_385304 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 2 (Rgl2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr17 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000047503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33929582:33937687:1 gene:ENSMUSG00000041354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000173153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33929974:33932371:1 gene:ENSMUSG00000041354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000173284 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:33933925:33937224:1 gene:ENSMUSG00000041354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// BC068121 // GenBank // Mus musculus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:92995 IMAGE:6415928), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U54639 // GenBank // Mus musculus RalGDS-like factor (RLF) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000041169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33930286:33937276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_020603 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 46 (Wdr46), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33940660:33949695:1 gene:ENSMUSG00000024312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000172546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33941405:33943678:1 gene:ENSMUSG00000024312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC026431 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 46, mRNA (cDNA clone IMAGE:4235286), partial cds. // chr17 // 79 // 80 // 19 // 24 // 0 /// BC046977 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 46, mRNA (cDNA clone MGC:54535 IMAGE:6315172), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33940738:33949415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT029250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0
NM_172620 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 52 (yeast) (Vps52), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000025178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33955812:33966984:1 gene:ENSMUSG00000024319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000173196 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:33955915:33965973:1 gene:ENSMUSG00000024319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000173318 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33958057:33960475:1 gene:ENSMUSG00000024319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 93 // 37 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000174588 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33962389:33966269:1 gene:ENSMUSG00000024319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// BC063329 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 52 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:74357 IMAGE:30251096), complete cds. // chr17 // 76 // 87 // 25 // 33 // 0 /// ENSMUST00000173445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33959009:33960504:1 gene:ENSMUSG00000024319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1 /// GENSCAN00000041167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33956093:33966105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NR_033305 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AA388235 (AA388235), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// KnowTID_00003467 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT029259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT029261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT029262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000182803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34084672:34085823:1 gene:ENSMUSG00000098241 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34039655:34085823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_008206 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, O region alpha locus (H2-Oa), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025192 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:34092340:34095234:1 gene:ENSMUSG00000024334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174670 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34092422:34095233:1 gene:ENSMUSG00000024334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138996 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, O region alpha locus, mRNA (cDNA clone MGC:170623 IMAGE:8862018), complete cds. // chr17 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// BC138997 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, O region alpha locus, mRNA (cDNA clone MGC:170624 IMAGE:8862019), complete cds. // chr17 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// M95514 // GenBank // Mouse MHC class II protein alpha chain, complete cds. // chr17 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34092447:34095228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_010386 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, class II, locus DMa (H2-DMa), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34135182:34139101:1 gene:ENSMUSG00000037649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000173907 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34137028:34138180:1 gene:ENSMUSG00000037649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC001996 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, class II, locus DMa, mRNA (cDNA clone MGC:5743 IMAGE:3591389), complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC049992 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, class II, locus DMa, mRNA (cDNA clone MGC:58926 IMAGE:6394795), complete cds. // chr17 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// U35324 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 MHC class II H2-M alpha chain (H2-Ma) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// U35325 // GenBank // Mus musculus strain B10.M MHC class II H2-M alpha chain (H2-Ma) mRNA, complete cds. // chr17 // 82 // 65 // 14 // 17 // 0 /// U35326 // GenBank // Mus musculus strain CBA/J MHC class II H2-M alpha chain (H2-Ma) mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// U35327 // GenBank // Mus musculus strain DBA/1 MHC class II H2-M alpha chain (H2-Ma) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// U35328 // GenBank // Mus musculus strain SJL MHC class II H2-M alpha chain (H2-Ma) mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000015263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34135671:34138821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_010389 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, O region beta locus (H2-Ob), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:34238903:34245907:1 gene:ENSMUSG00000041538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525315 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, O region beta locus (H2-Ob), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENSMUST00000167280 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:34238931:34245798:1 gene:ENSMUSG00000041538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// XM_006523686 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, O region beta locus (H2-Ob), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENSMUST00000173764 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:34240036:34244460:1 gene:ENSMUSG00000041538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// AK053233 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030047G13 product:MHC CLASS II A-BETA 2 (FRAGMENT) homolog [Mus saxicola], full insert sequence. // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// BC127027 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, O region beta locus, mRNA (cDNA clone MGC:149925 IMAGE:40044586), complete cds. // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// BC127028 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, O region beta locus, mRNA (cDNA clone MGC:149926 IMAGE:40044587), complete cds. // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000015253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34238972:34250295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001033978 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, class II antigen E beta2 (H2-Eb2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006536621 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, class II antigen E beta2 (H2-Eb2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENSMUST00000050325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34325665:34340229:1 gene:ENSMUSG00000067341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK157199 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830206H12 product:weakly similar to MHC class II E-beta (p haplotype) precursor [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// BC150834 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mRNA (cDNA clone MGC:183745 IMAGE:9087745), complete cds. // chr17 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// XM_006525376 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, class II antigen E beta2 (H2-Eb2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000015232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34305954:34335908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_079835 // RefSeq // Mus musculus butyrophilin-like 2 (Btnl2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34354822:34369493:1 gene:ENSMUSG00000024340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000178562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:34354822:34369492:1 gene:ENSMUSG00000024340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC141103 // GenBank // Mus musculus butyrophilin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:176064 IMAGE:9055715), complete cds. // chr17 // 65 // 93 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34356222:34368728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001111094 // RefSeq // Mus musculus butyrophilin-like 1 (Btnl1), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006523364 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus butyrophilin-like 1 (Btnl1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000080254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:17:34377132:34385776:1 gene:ENSMUSG00000062638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC052925 // GenBank // Mus musculus butyrophilin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:56990 IMAGE:6398253), complete cds. // chr17 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34377898:34460467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_010929 // RefSeq // Mus musculus notch 4 (Notch4), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XR_385939 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus notch 4 (Notch4), transcript variant X2, misc_RNA. // chr17 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000015612 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34564268:34588503:1 gene:ENSMUSG00000015468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSMUST00000173389 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34564337:34588231:1 gene:ENSMUSG00000015468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC138044 // GenBank // Mus musculus Notch gene homolog 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169668 IMAGE:8861063), complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// M80456 // GenBank // Mus musculus Int-3 mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 94 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34564446:34591307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// U43691 // GenBank // Mus musculus Notch4 mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 97 // 29 // 32 // 0
NM_134116 // RefSeq // Mus musculus G-protein signalling modulator 3 (AGS3-like, C. elegans) (Gpsm3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038244 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34589806:34591754:1 gene:ENSMUSG00000034786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34590092:34591754:1 gene:ENSMUSG00000034786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC021942 // GenBank // Mus musculus G-protein signalling modulator 3 (AGS3-like, C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:36315 IMAGE:5068831), complete cds. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC080804 // GenBank // Mus musculus G-protein signalling modulator 3 (AGS3-like, C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:91000 IMAGE:5355970), complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC085186 // GenBank // Mus musculus G-protein signalling modulator 3 (AGS3-like, C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:109663 IMAGE:30680693), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34564446:34591307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000172945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34631404:34632397:1 gene:ENSMUSG00000015476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// NM_030890 // RefSeq // Mus musculus proline-rich transmembrane protein 1 (Prrt1), mRNA. // chr17 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000015620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34629533:34633126:1 gene:ENSMUSG00000015476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// BC115512 // GenBank // Mus musculus proline-rich transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40101091), complete cds. // chr17 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// BC115513 // GenBank // Mus musculus proline-rich transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40101092), complete cds. // chr17 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONMMUT029330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000015239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34629686:34632260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_019873 // RefSeq // Mus musculus FK506 binding protein-like (Fkbpl), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524661 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FK506 binding protein-like (Fkbpl), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524662 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FK506 binding protein-like (Fkbpl), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000036720 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34644764:34646324:1 gene:ENSMUSG00000033739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC046338 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:54550 IMAGE:6395929), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139541 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020003M05 product:FK506 binding protein-like, full insert sequence. // chr17 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34645260:34646303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_017406 // RefSeq // Mus musculus activating transcription factor 6 beta (Atf6b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006523573 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus activating transcription factor 6 beta (Atf6b), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000015605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34647146:34655074:1 gene:ENSMUSG00000015461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000173984 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:34647211:34654879:1 gene:ENSMUSG00000015461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC013534 // GenBank // Mus musculus activating transcription factor 6 beta, mRNA (cDNA clone MGC:19215 IMAGE:4239106), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC052635 // GenBank // Mus musculus activating transcription factor 6 beta, mRNA (cDNA clone MGC:58904 IMAGE:6395626), complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000015254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34647169:34719627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_031176 // RefSeq // Mus musculus tenascin XB (Tnxb), mRNA. // chr17 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// XM_006525192 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tenascin XB (Tnxb), transcript variant X8, mRNA. // chr17 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34670535:34719815:1 gene:ENSMUSG00000033327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000168533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34670535:34719627:1 gene:ENSMUSG00000033327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// AB235155 // GenBank // Mus musculus tnx mRNA for tenascin-X, complete cds. // chr17 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34647169:34719627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_198886 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 12 (Zbtb12), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525350 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 12 (Zbtb12), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000052778 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34894559:34896867:1 gene:ENSMUSG00000049823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK135305 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720464P11 product:HLA-B-associated transcript 9, full insert sequence. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC062159 // GenBank // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:70063 IMAGE:30135322), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34895241:34896620:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
NM_023557 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 44, member 4 (Slc44a4), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000007249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34914470:34930356:1 gene:ENSMUSG00000007034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000169230 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:34917719:34930436:1 gene:ENSMUSG00000007034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000173664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34914466:34930379:1 gene:ENSMUSG00000007034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// BC010808 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 44, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:18903 IMAGE:4240658), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// BC052652 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 44, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:60462 IMAGE:30034507), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000015241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34916499:34930236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0
NM_010893 // RefSeq // Mus musculus neuraminidase 1 (Neu1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000007253 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34931253:34935921:1 gene:ENSMUSG00000007038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000173269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34931314:34935953:1 gene:ENSMUSG00000007038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000174715 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34931863:34932765:1 gene:ENSMUSG00000007038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AK077444 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730409K10 product:neuraminidase 1, full insert sequence. // chr17 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC004666 // GenBank // Mus musculus neuraminidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:5824 IMAGE:3498197), complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// U93702 // GenBank // Mus musculus lysosomal sialidase (NEU) mRNA, complete cds. // chr17 // 85 // 87 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34931407:34934831:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
AK078618 // GenBank HTC // Mus musculus adult male adrenal gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7330403C04 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT029382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_013558 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 1-like (Hspa1l), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000007248 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34972703:34979285:1 gene:ENSMUSG00000007033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC129894 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:150263 IMAGE:40111516), complete cds. // chr17 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// BC129895 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:150264 IMAGE:40111517), complete cds. // chr17 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// D85732 // GenBank // Mus musculus Hsc70t mRNA for spermatid-specific heat shock protein 70, complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// EU622851 // GenBank // Mus musculus inducible heat shock protein 70 mRNA, complete cds. // chr17 // 83 // 46 // 10 // 12 // 0 /// M32218 // GenBank // Mouse heat shock-related protein (hsc70t) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34976987:34978912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 46 // 10 // 12 // 0
NM_011690 // RefSeq // Mus musculus valyl-tRNA synthetase (Vars), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000087315 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35000987:35016322:1 gene:ENSMUSG00000007029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000172637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35002714:35016322:1 gene:ENSMUSG00000007029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000173584 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:35001051:35016030:1 gene:ENSMUSG00000007029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AF087680 // GenBank // Mus musculus valyl-tRNA synthetase (G7a) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AK165326 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430012P22 product:valyl-tRNA synthetase 2, full insert sequence. // chr17 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// BC053703 // GenBank // Mus musculus valyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:60561 IMAGE:30055190), complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35000845:35027593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_138582 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor A domain containing 7 (Vwa7), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000007245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35016579:35026741:1 gene:ENSMUSG00000007030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000172499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35016638:35026520:1 gene:ENSMUSG00000007030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AF134319 // GenBank // Mus musculus G7c protein (G7c) mRNA, G7c-d allele, complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC137792 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 17, human D6S56E 3, mRNA (cDNA clone MGC:169416 IMAGE:8860811), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC144911 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 17, human D6S56E 3, mRNA (cDNA clone MGC:178467 IMAGE:9053459), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000030294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35000845:35027593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
ENSMUST00000158934 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:35049218:35049321:1 gene:ENSMUSG00000096022 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT029398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_033444 // RefSeq // Mus musculus chloride intracellular channel 1 (Clic1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000007257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35049966:35058749:1 gene:ENSMUSG00000007041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC004658 // GenBank // Mus musculus chloride intracellular channel 1, mRNA (cDNA clone MGC:6371 IMAGE:3498118), complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000172599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35052450:35055741:1 gene:ENSMUSG00000007041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35050169:35058491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001190449 // RefSeq // Mus musculus dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 (Ddah2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_016765 // RefSeq // Mus musculus dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 (Ddah2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// XM_006537387 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 (Ddah2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000007255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35059035:35062091:1 gene:ENSMUSG00000007039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000173520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35059816:35060906:1 gene:ENSMUSG00000007039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000173562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35060893:35061625:1 gene:ENSMUSG00000007039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000174493 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:35059101:35062095:1 gene:ENSMUSG00000007039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// AF004106 // GenBank // Mus musculus unknown mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 97 // 26 // 29 // 0 /// BC003328 // GenBank // Mus musculus dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2, mRNA (cDNA clone MGC:5866 IMAGE:3158175), complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// NONMMUT029399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000030335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35060165:35069534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_023463 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6C (Ly6g6c), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173207 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:35065388:35069625:1 gene:ENSMUSG00000092586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000173478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35067325:35070050:1 gene:ENSMUSG00000092586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116365 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6C, mRNA (cDNA clone MGC:144235 IMAGE:40100048), complete cds. // chr17 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// BC116366 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6C, mRNA (cDNA clone MGC:144236 IMAGE:40100049), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000174876 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:35067390:35069534:1 gene:ENSMUSG00000092586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// AJ315547 // GenBank // Mus musculus mRNA for truncated Ly6g6c protein (Ly6g6c gene), splice variant 2. // chr17 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35060165:35069534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_027366 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6E (Ly6g6e), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000013910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35076937:35078804:1 gene:ENSMUSG00000013766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172494 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:35076902:35078294:1 gene:ENSMUSG00000013766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000172678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35076931:35078550:1 gene:ENSMUSG00000013766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000172959 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:35077155:35078285:1 gene:ENSMUSG00000013766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AJ315551 // GenBank // Mus musculus mRNA for Ly6g6e protein, isoform B (Ly6G6e gene), splice variant 2. // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC132420 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6E, mRNA (cDNA clone MGC:164051 IMAGE:40130697), complete cds. // chr17 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC138777 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6E, mRNA (cDNA clone MGC:170404 IMAGE:8861799), complete cds. // chr17 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35077155:35078285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_148947 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G5C (Ly6g5c), mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000037849 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35108279:35111991:1 gene:ENSMUSG00000034482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC145966 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G5C, mRNA (cDNA clone MGC:175853 IMAGE:40131269), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC145968 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G5C, mRNA (cDNA clone MGC:175855 IMAGE:40131271), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35089325:35111953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_001128597 // RefSeq // Mus musculus G patch domain and ankyrin repeats 1 (Gpank1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NM_032460 // RefSeq // Mus musculus G patch domain and ankyrin repeats 1 (Gpank1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// XM_006525183 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G patch domain and ankyrin repeats 1 (Gpank1), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// XM_006525184 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G patch domain and ankyrin repeats 1 (Gpank1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000052167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35122952:35124806:1 gene:ENSMUSG00000092417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000165306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:35121483:35124814:1 gene:ENSMUSG00000092417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC057902 // GenBank // Mus musculus HLA-B associated transcript 4, mRNA (cDNA clone MGC:65455 IMAGE:5027029), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC120637 // GenBank // Mus musculus HLA-B associated transcript 4, mRNA (cDNA clone MGC:155874 IMAGE:40129560), complete cds. // chr17 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// BC120639 // GenBank // Mus musculus HLA-B associated transcript 4, mRNA (cDNA clone MGC:155876 IMAGE:40129562), complete cds. // chr17 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// L76155 // GenBank // Mus musculus Bat-4 gene, complete cds. // chr17 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
NM_033477 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 17, human D6S53E (D17H6S53E), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061859 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35126386:35128855:1 gene:ENSMUSG00000043311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138707 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 17, human D6S53E, mRNA (cDNA clone MGC:170334 IMAGE:8861729), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138708 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 17, human D6S53E, mRNA (cDNA clone MGC:170335 IMAGE:8861730), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35127115:35127996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000134687 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35180535:35184662:1 gene:ENSMUSG00000086076 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35183984:35196146:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_008518 // RefSeq // Mus musculus lymphotoxin B (Ltb), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35194439:35196302:1 gene:ENSMUSG00000024399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35194523:35196305:1 gene:ENSMUSG00000024399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173600 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:35194626:35196320:1 gene:ENSMUSG00000024399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC064062 // GenBank // Mus musculus lymphotoxin B, mRNA (cDNA clone IMAGE:3372747), partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U16985 // GenBank // Mus musculus lymphotoxin-beta mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35183984:35196146:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSMUST00000083339 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:35247175:35247250:1 gene:ENSMUSG00000065273 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT029431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_010390 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 1 (H2-Q1), mRNA. // chr17 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// XM_006523687 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 1 (H2-Q1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// XM_006525317 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 1 (H2-Q1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000073208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35320558:35325099:1 gene:ENSMUSG00000079507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000105041 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:35320547:35325099:1 gene:ENSMUSG00000079507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000172994 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35320405:35325099:1 gene:ENSMUSG00000079507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC080812 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 1, mRNA (cDNA clone MGC:91064 IMAGE:6398887), complete cds. // chr17 // 83 // 65 // 20 // 24 // 0 /// U96752 // GenBank // Mus musculus major histocompability complex Q1b mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 78 // 28 // 29 // 0 /// BC058170 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, blastocyst, mRNA (cDNA clone MGC:68282 IMAGE:5026047), complete cds. // chr17 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// GENSCAN00000030291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35320562:35336295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1
NM_010392 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 2 (H2-Q2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000074806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35342242:35345794:1 gene:ENSMUSG00000091705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY989880 // GenBank // Mus musculus MHC class I antigen (H2-Q2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC138688 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 2, mRNA (cDNA clone MGC:170314 IMAGE:8861709), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC138689 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 2, mRNA (cDNA clone MGC:170316 IMAGE:8861711), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35342333:35347033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000172583 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35358989:35359972:1 gene:ENSMUSG00000092253 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35358997:35398482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001143689 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 4 (H2-Q4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006537275 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 4 (H2-Q4), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// XR_385290 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 4 (H2-Q4), transcript variant X1, misc_RNA. // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000081435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35379617:35384674:1 gene:ENSMUSG00000035929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000173975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35379617:35385290:1 gene:ENSMUSG00000035929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC010602 // GenBank // Mus musculus MHC class I like protein GS10, mRNA (cDNA clone MGC:6571 IMAGE:3257482), complete cds. // chr17 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35358997:35398482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1
NR_051981 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 5 (H2-Q5), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000174854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35394126:35395632:1 gene:ENSMUSG00000055413 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000172979 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35394126:35397588:1 gene:ENSMUSG00000055413 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 1
NM_023124 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 8 (H2-Q8), mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// NM_207648 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 6 (H2-Q6), mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000113879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:35424877:35428361:1 gene:ENSMUSG00000073409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000174699 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35424850:35430055:1 gene:ENSMUSG00000073409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XR_385920 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 6 (H2-Q6), transcript variant X4, misc_RNA. // chr17 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// GENSCAN00000030310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35424877:35428597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// M29881 // GenBank // Mouse MHC class I Q8/9d cell surface antigen mRNA, complete cds. // chr17 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_010391 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 10 (H2-Q10), mRNA. // chr17 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000068291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:35470089:35474563:1 gene:ENSMUSG00000067235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000174525 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35470089:35474563:1 gene:ENSMUSG00000067235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000174589 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35470097:35474551:1 gene:ENSMUSG00000067235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC011215 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 10, mRNA (cDNA clone MGC:18815 IMAGE:4196692), complete cds. // chr17 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// BC042572 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, Q region locus 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:4158744), partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONMMUT029444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000030336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35470116:35510551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
NM_146248 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil alpha-helical rod protein 1 (Cchcr1), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000045956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35517176:35531015:1 gene:ENSMUSG00000040312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000164242 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35517100:35530996:1 gene:ENSMUSG00000040312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000173903 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:35517463:35531005:1 gene:ENSMUSG00000040312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC031416 // GenBank // Mus musculus coiled-coil alpha-helical rod protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:28303 IMAGE:4012768), complete cds. // chr17 // 92 // 95 // 35 // 38 // 0 /// GENSCAN00000030325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35519974:35530834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0
NM_020576 // RefSeq // Mus musculus psoriasis susceptibility 1 candidate 2 (human) (Psors1c2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025273 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35533201:35534647:1 gene:ENSMUSG00000024409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF159091 // GenBank // Mus musculus MHC psoriasis candidate protein (Pcg) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF484421 // GenBank // Mus musculus psoriasis susceptibility 1 candidate 2 (Psors1c2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC110561 // GenBank // Mus musculus psoriasis susceptibility 1 candidate 2 (human), mRNA (cDNA clone MGC:129442 IMAGE:40049760), complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35533240:35556261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001008424 // RefSeq // Mus musculus corneodesmosin (Cdsn), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525378 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus corneodesmosin (Cdsn), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000044804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35552128:35557180:1 gene:ENSMUSG00000039518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK133029 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930556G08 product:similar to Corneodesmosin (S protein) (Fragment) [Sus scrofa], full insert sequence. // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC055373 // GenBank // Mus musculus corneodesmosin, mRNA (cDNA clone MGC:60763 IMAGE:30058959), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35533240:35556261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_175148 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2300002M23 gene (2300002M23Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35567450:35568952:1 gene:ENSMUSG00000039269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174246 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35567485:35568930:1 gene:ENSMUSG00000039269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK009013 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2300002M23 product:weakly similar to TASTE BUD-SPECIFIC PROTEIN PRECURSOR [Macaca mulatta], full insert sequence. // chr17 // 84 // 70 // 16 // 19 // 0 /// BC107265 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2300002M23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130211 IMAGE:40052572), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC107266 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2300002M23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130212 IMAGE:40052573), complete cds. // chr17 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35567554:35572121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT029454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_133662 // RefSeq // Mus musculus immediate early response 3 (Ier3), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000003635 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35821684:35822923:1 gene:ENSMUSG00000003541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC006950 // GenBank // Mus musculus immediate early response 3, mRNA (cDNA clone MGC:6933 IMAGE:2811734), complete cds. // chr17 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// CT010271 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G0251D for gene Ier3, Immediate early response 3; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// X67644 // GenBank // M.musculus gly96 mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35821749:35822310:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_001010833 // RefSeq // Mus musculus mediator of DNA damage checkpoint 1 (Mdc1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_385325 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mediator of DNA damage checkpoint 1 (Mdc1), transcript variant X6, misc_RNA. // chr17 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000082337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35841515:35859670:1 gene:ENSMUSG00000061607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35844435:35857630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NM_134122 // RefSeq // Mus musculus nurim (nuclear envelope membrane protein) (Nrm), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074259 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35861318:35865402:1 gene:ENSMUSG00000059791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC021750 // GenBank // Mus musculus nurim (nuclear envelope membrane protein), mRNA (cDNA clone MGC:30515 IMAGE:4503599), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026576 // GenBank // Mus musculus nurim (nuclear envelope membrane protein), mRNA (cDNA clone MGC:36566 IMAGE:4984796), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006523392 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nurim (nuclear envelope membrane protein) (Nrm), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35861385:35874816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_026987 // RefSeq // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 16 (Dhx16), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000025292 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35879819:35892670:1 gene:ENSMUSG00000024422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000172730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35887679:35889594:1 gene:ENSMUSG00000024422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 90 // 25 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000174366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35879825:35892625:1 gene:ENSMUSG00000024422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC009147 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 16, mRNA (cDNA clone MGC:6487 IMAGE:2647184), complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// BC046781 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 16, mRNA (cDNA clone MGC:61414 IMAGE:5716182), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC138204 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 16, mRNA (cDNA clone MGC:169828 IMAGE:8861223), complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 37 // 40 // 0 /// BC138205 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 16, mRNA (cDNA clone MGC:169829 IMAGE:8861224), complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 37 // 40 // 0 /// GENSCAN00000030322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35879912:35892547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0
XR_390265 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 10 (Ppp1r10), transcript variant X3, misc_RNA. // chr17 // 97 // 82 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000087211 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35916566:35932283:1 gene:ENSMUSG00000039220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000151375 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35926494:35928329:1 gene:ENSMUSG00000039220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// NM_001163818 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 10 (Ppp1r10), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 1 /// XM_006524618 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 10 (Ppp1r10), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// ENSMUST00000087210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:35917196:35932281:1 gene:ENSMUSG00000039220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 1 /// BC052059 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 10, mRNA (cDNA clone MGC:62449 IMAGE:5702171), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 1 /// XR_390266 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 10 (Ppp1r10), transcript variant X4, misc_RNA. // chr17 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// GENSCAN00000030313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35923319:35952223:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// NONMMUT029500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0
NM_008136 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein-like 1 (Gnl1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000087200 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35979851:35989462:1 gene:ENSMUSG00000024429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC010298 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:11530 IMAGE:3155411), complete cds. // chr17 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000030337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35980175:35988762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_001034909 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6034 (Gm6034), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000097331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36042961:36058645:1 gene:ENSMUSG00000073407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000173128 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:36121678:36129692:1 gene:ENSMUSG00000092277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000090537 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36154847:36163176:1 gene:ENSMUSG00000038311 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AK082845 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330041H23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NR_033517 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2410017I17 gene (2410017I17Rik), long non-coding RNA. // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// ENSMUST00000056774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:36145018:36162374:1 gene:ENSMUSG00000038311 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// ENSMUST00000173025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36145018:36162375:1 gene:ENSMUSG00000038311 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NR_033619 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6623 (Gm6623), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000173570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36179114:36179657:1 gene:ENSMUSG00000092374 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC096040 // GenBank // Mus musculus predicted gene, EG625785, mRNA (cDNA clone IMAGE:574044). // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_023423 // RefSeq // Mus musculus akirin 1 (Akirin1), mRNA. // chr17 // 69 // 100 // 20 // 29 // 0 /// ENSMUST00000102636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:123734559:123750345:-1 gene:ENSMUSG00000023075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 100 // 20 // 29 // 0 /// ENSMUST00000174752 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36157988:36158534:1 gene:ENSMUSG00000092289 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 54 // 83 // 13 // 24 // 0 /// BC003291 // GenBank // Mus musculus akirin 1, mRNA (cDNA clone MGC:7743 IMAGE:3498569), complete cds. // chr17 // 69 // 100 // 20 // 29 // 0 /// ENSMUST00000153472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:123738940:123750231:-1 gene:ENSMUSG00000023075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000038390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36179112:36179869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT029526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT029524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 54 // 83 // 13 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:123712822:123750164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_177635 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 11 (H2-M11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000041964 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:17:36547075:36549250:1 gene:ENSMUSG00000037537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF539596 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 11 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000038395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36547075:36549999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000173591 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36558621:36561668:1 gene:ENSMUSG00000092332 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT029563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_177637 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.5 (H2-M10.5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000041531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36772910:36776234:1 gene:ENSMUSG00000037246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AY211082 // GenBank // Mus musculus major histocompatibility complex class Ib M10.7 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF539601 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.5 mRNA, complete cds. // chr17 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1 /// GENSCAN00000038368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36772910:36775070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_201611 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.6 (H2-M10.6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000041398 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36812171:36815564:1 gene:ENSMUSG00000037130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF539602 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.6 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// AY211083 // GenBank // Mus musculus major histocompatibility complex class Ib M10.8 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36812177:36814311:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
NM_011280 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 10 (Trim10), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060524 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36869574:36877833:1 gene:ENSMUSG00000073400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF134811 // GenBank // Mus musculus hematopoietic RING finger 1 (Herf1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF220121 // GenBank // Mus musculus tripartite motif protein TRIM10 (Trim10) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC051632 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:59325 IMAGE:6507331), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36869879:36878320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_146077 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 31 (Trim31), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000078438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36898118:36910214:1 gene:ENSMUSG00000058063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC026666 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 31, mRNA (cDNA clone MGC:37625 IMAGE:4990292), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36898354:36909717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001099632 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 39 (Rnf39), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000040498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36942918:36947986:1 gene:ENSMUSG00000036492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000173072 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:36943055:36945615:1 gene:ENSMUSG00000036492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC051578 // GenBank HTC // Mus musculus ring finger protein 39, mRNA (cDNA clone IMAGE:1513964). // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC132405 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 39, mRNA (cDNA clone MGC:164036 IMAGE:40130682), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC145677 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 39, mRNA (cDNA clone MGC:175564 IMAGE:40130980), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36943088:36947636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_029602 // RefSeq // Mus musculus Znrd1 antisense (Znrd1as), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006525080 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Znrd1 antisense (Znrd1as), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000040177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36958592:36965622:1 gene:ENSMUSG00000036214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000173814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36958641:36965622:1 gene:ENSMUSG00000036214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AK161503 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933417P13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC027007 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700022C21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:39068 IMAGE:5365474), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000172672 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36958619:36964941:1 gene:ENSMUSG00000036214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000038391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36963942:36965616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT029581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
ENSMUST00000174626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:37113855:37114448:1 gene:ENSMUSG00000092339 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000173709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:37175854:37176772:1 gene:ENSMUSG00000092270 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000030490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37175312:37176423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 83 // 7 // 10 // 0
NM_023137 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin D (Ubd), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000038844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37193892:37196095:1 gene:ENSMUSG00000035186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC027627 // GenBank // Mus musculus ubiquitin D, mRNA (cDNA clone MGC:41036 IMAGE:1068927), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC036383 // GenBank // Mus musculus ubiquitin D, mRNA (cDNA clone MGC:41063 IMAGE:1347593), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// CT010257 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836E0751D for gene Ubd, Ubiquitin D; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000030500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37193952:37195713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0
NM_146514 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 96 (Olfr96), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078209 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37225091:37226141:1 gene:ENSMUSG00000064121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120652 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 96, mRNA (cDNA clone MGC:155889 IMAGE:40129575), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37225127:37226068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013819 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 3 (H2-M3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038580 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37270220:37274484:1 gene:ENSMUSG00000016206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC031984 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 3, mRNA (cDNA clone MGC:18978 IMAGE:4007538), complete cds. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37270262:37274328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000178766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:37362161:37363087:1 gene:ENSMUSG00000095858 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37362254:37363087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000178647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:37382560:37383486:1 gene:ENSMUSG00000094884 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000030471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37382689:37395510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000178794 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:37394584:37395510:1 gene:ENSMUSG00000095603 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37382689:37395510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 82 // 65 // 9 // 11 // 0 /// BC145568 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054133. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_146511 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 107 (Olfr107), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000077008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37405477:37406509:1 gene:ENSMUSG00000063188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC141327 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 107, mRNA (cDNA clone MGC:176288 IMAGE:9055939), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC141329 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 107, mRNA (cDNA clone MGC:176290 IMAGE:9055941), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC148321 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 107, mRNA (cDNA clone MGC:173140 IMAGE:40054936), complete cds. // chr17 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37396801:37451594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_146465 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 108 (Olfr108), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000078207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37445480:37446517:1 gene:ENSMUSG00000059687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC132008 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 108, mRNA (cDNA clone MGC:163639 IMAGE:40130285), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC132012 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 108, mRNA (cDNA clone MGC:163643 IMAGE:40130289), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_146835 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 109 (Olfr109), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000031086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37466208:37467152:1 gene:ENSMUSG00000029184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC130246 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 109, mRNA (cDNA clone MGC:161306 IMAGE:40142352), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37466208:37467152:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146328 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 110 (Olfr110), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000168318 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37492468:37499674:1 gene:ENSMUSG00000090894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC132347 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 110, mRNA (cDNA clone MGC:163978 IMAGE:40130624), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001005485 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 111 (Olfr111), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000097325 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37529957:37530997:1 gene:ENSMUSG00000090675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC139116 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 111, mRNA (cDNA clone MGC:170743 IMAGE:8862138), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC139117 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 111, mRNA (cDNA clone MGC:170744 IMAGE:8862139), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_146288 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 122 (Olfr122), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000119082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:37771628:37772620:1 gene:ENSMUSG00000083947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000172582 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:37768607:37772789:1 gene:ENSMUSG00000083947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37726026:37796375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_213721 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 118 (Olfr118), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000122036 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37672025:37672990:1 gene:ENSMUSG00000080990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC128012 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 118, mRNA (cDNA clone MGC:157604 IMAGE:40136025), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000030494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37670135:37701637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
NM_001011830 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 119 (Olfr119), mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000080483 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37696664:37701818:1 gene:ENSMUSG00000059964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006537340 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 119 (Olfr119), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1 /// GENSCAN00000030494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37670135:37701637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
NM_146631 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 120 (Olfr120), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37725999:37726991:1 gene:ENSMUSG00000063994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146629 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 121 (Olfr121), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000074555 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37748866:37753009:1 gene:ENSMUSG00000060017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC090631 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 121, mRNA (cDNA clone MGC:115897 IMAGE:30358555), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_146630 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 123 (Olfr123), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054748 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37795435:37796375:1 gene:ENSMUSG00000045202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC148279 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 123, mRNA (cDNA clone MGC:157638 IMAGE:40136837), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC148324 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 123, mRNA (cDNA clone MGC:173146 IMAGE:40136838), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37726026:37796375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147062 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 124 (Olfr124), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37805069:37806190:1 gene:ENSMUSG00000044985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC119256 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 124, mRNA (cDNA clone MGC:155572 IMAGE:8734005), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC119258 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 124, mRNA (cDNA clone MGC:155574 IMAGE:8734007), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37805147:37806094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_146290 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 125 (Olfr125), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000050255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37834911:37836028:1 gene:ENSMUSG00000050613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC116810 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 125, mRNA (cDNA clone MGC:151187 IMAGE:40126129), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC116812 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 125, mRNA (cDNA clone MGC:151189 IMAGE:40126131), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000030470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37835001:37835963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0
NM_146377 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 127 (Olfr127), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000076331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37903522:37904616:1 gene:ENSMUSG00000058114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC132433 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 127, mRNA (cDNA clone MGC:164064 IMAGE:40130710), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC145997 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 127, mRNA (cDNA clone MGC:175884 IMAGE:40131300), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000030506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37903548:37904519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_146487 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 130 (Olfr130), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087129 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:38067173:38068126:1 gene:ENSMUSG00000094878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128267 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 130, mRNA (cDNA clone MGC:149917 IMAGE:40043327), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:38067173:38080647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_146831 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 133 (Olfr133), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:38148501:38149590:1 gene:ENSMUSG00000063240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132057 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 133, mRNA (cDNA clone MGC:163688 IMAGE:40130334), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132059 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 133, mRNA (cDNA clone MGC:163690 IMAGE:40130336), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:38148590:38176024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_146832 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 134 (Olfr134), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000074883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:38175086:38176024:1 gene:ENSMUSG00000096009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000013119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:38148590:38176024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0
NM_146332 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 135 (Olfr135), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_146831 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 133 (Olfr133), mRNA. // chr17 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:38208169:38209247:1 gene:ENSMUSG00000057801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000113636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:38148501:38149590:1 gene:ENSMUSG00000063240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// BC116774 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 135, mRNA (cDNA clone MGC:151151 IMAGE:40126093), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC116776 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 135, mRNA (cDNA clone MGC:151153 IMAGE:40126095), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC132057 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 133, mRNA (cDNA clone MGC:163688 IMAGE:40130334), complete cds. // chr17 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// BC132059 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 133, mRNA (cDNA clone MGC:163690 IMAGE:40130336), complete cds. // chr17 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// NM_146832 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 134 (Olfr134), mRNA. // chr17 // 52 // 86 // 13 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:38175086:38176024:1 gene:ENSMUSG00000096009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 86 // 13 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:38148590:38176024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0
NM_130868 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 138 (Olfr138), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:38274773:38275711:1 gene:ENSMUSG00000057443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172843 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:38261068:38275711:1 gene:ENSMUSG00000057443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104280 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 138, mRNA (cDNA clone MGC:129198 IMAGE:40041704), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104281 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 138, mRNA (cDNA clone MGC:129199 IMAGE:40041709), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127129 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 138, mRNA (cDNA clone MGC:156320 IMAGE:40041712), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127966 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 138, mRNA (cDNA clone MGC:157515 IMAGE:40134997), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:38274773:38275711:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146807 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 136 (Olfr136), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:38335159:38336097:1 gene:ENSMUSG00000096840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001038500 // RefSeq // Mus musculus exocrine gland secreted peptide 1 (Esp1), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:40727120:40731782:1 gene:ENSMUSG00000073396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AB194091 // GenBank // Mus musculus ESP1 mRNA for exocrine gland-secreting peptide 1, complete cds. // chr17 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:40728826:40731127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000182867 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:40854036:40868141:1 gene:ENSMUSG00000098082 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unitary_pseudogene // chr17 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:40811176:40871907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_008650 // RefSeq // Mus musculus methylmalonyl-Coenzyme A mutase (Mut), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006523786 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methylmalonyl-Coenzyme A mutase (Mut), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000169611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:40934685:40961989:1 gene:ENSMUSG00000023921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC019175 // GenBank // Mus musculus methylmalonyl-Coenzyme A mutase, mRNA (cDNA clone MGC:29139 IMAGE:5007694), complete cds. // chr17 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:40937084:40960696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000015219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:41013394:41102045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
NM_028474 // RefSeq // Mus musculus patched domain containing 4 (Ptchd4), mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000048691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:42315947:42507741:1 gene:ENSMUSG00000042256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC145294 // GenBank // Mus musculus similar to CG11212-PA, mRNA (cDNA clone MGC:178856 IMAGE:9053848), complete cds. // chr17 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC151166 // GenBank // Mus musculus similar to CG11212-PA, mRNA (cDNA clone MGC:184066 IMAGE:9088055), complete cds. // chr17 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// AK014270 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110082D06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
AK083240 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630030K01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028474 // RefSeq // Mus musculus patched domain containing 4 (Ptchd4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:42315947:42507741:1 gene:ENSMUSG00000042256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151166 // GenBank // Mus musculus similar to CG11212-PA, mRNA (cDNA clone MGC:184066 IMAGE:9088055), complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:42450314:42503915:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178589 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 21 (Tnfrsf21), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000024708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:43016555:43089188:1 gene:ENSMUSG00000023915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF322069 // GenBank // Mus musculus DR6 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK143175 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130215J21 product:tumor necrosis factor receptor superfamily, member 21, full insert sequence. // chr17 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AY043489 // GenBank // Mus musculus death receptor 6 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC016420 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:25901 IMAGE:4220624), complete cds. // chr17 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// AK036984 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930033B06 product:tumor necrosis factor receptor superfamily, member 21, full insert sequence. // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000039735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:43016911:43040329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000039748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:43064275:43087972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_133776 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 110 (Gpr110), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000047399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:43270329:43324737:1 gene:ENSMUSG00000041293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC019217 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 110, mRNA (cDNA clone MGC:29266 IMAGE:5065702), complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:43284669:43323918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
NM_001081178 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 116 (Gpr116), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006524124 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 116 (Gpr116), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006524125 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 116 (Gpr116), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000113599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:43389466:43459557:1 gene:ENSMUSG00000056492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000039750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:43400609:43475186:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1
ENSMUST00000082648 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:43454255:43454397:1 gene:ENSMUSG00000064582 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT029717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001285947 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 39, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp39a1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_001285948 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 39, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp39a1), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_018887 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 39, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp39a1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000170988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:43667425:43751431:1 gene:ENSMUSG00000023963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF237981 // GenBank // Mus musculus oxysterol 7alpha-hydroxylase (Cyp39A1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC021418 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 39, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:29200 IMAGE:5025117), complete cds. // chr17 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// BC037663 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 39, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:46855 IMAGE:5352740), complete cds. // chr17 // 86 // 81 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:43676858:43692678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000039740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:43702247:43751298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSMUST00000122525 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:43698363:43698552:1 gene:ENSMUSG00000084474 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172621 // RefSeq // Mus musculus chloride intracellular channel 5 (Clic5), mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524135 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chloride intracellular channel 5 (Clic5), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000024755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:44188572:44280168:1 gene:ENSMUSG00000023959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC064037 // GenBank // Mus musculus chloride intracellular channel 5, mRNA (cDNA clone MGC:73528 IMAGE:1227040), complete cds. // chr17 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// AK017800 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730531E12 product:CHLORIDE INTRACELLULAR CHANNEL 5 homolog [Rattus norvegicus]; Glutathione S-transferase C terminus containing, full insert sequence. // chr17 // 55 // 67 // 12 // 22 // 0 /// AK040195 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430075N03 product:weakly similar to CDNA FLJ10762 FIS, CLONE NT2RP4000008, MODERATELY SIMILAR TO CHLORINE CHANNEL PROTEIN P64 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// GENSCAN00000012492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:44233229:44248988:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000097320 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:44735845:44737612:1 gene:ENSMUSG00000073394 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK159059 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K530046K20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000181149 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:17:45433852:45442544:1 gene:ENSMUSG00000097119 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK083460 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030020O16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK140548 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930025G09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC023836 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B230354K17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5345146), partial cds. // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONMMUT029772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
AK138782 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430066P15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003493 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198608 // RefSeq // Mus musculus alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) (Aars2), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000024733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:45506841:45520842:1 gene:ENSMUSG00000023938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// BC059889 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6816823, with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 63 // 31 // 31 // 0 /// BC113172 // GenBank // Mus musculus alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative), mRNA (cDNA clone MGC:132902 IMAGE:40060953), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// BC113779 // GenBank // Mus musculus alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative), mRNA (cDNA clone MGC:132901 IMAGE:40060952), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000019724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:45506854:45541339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 82 // 82 // 40 // 49 // 1
NM_013688 // RefSeq // Mus musculus t-complex-associated testis expressed 1 (Tcte1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:45523434:45542679:1 gene:ENSMUSG00000023949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145741 // GenBank // Mus musculus t-complex-associated testis expressed 1, mRNA (cDNA clone MGC:175628 IMAGE:40131044), complete cds. // chr17 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// M28821 // GenBank // Mouse T-complex-associated-testes-expressed-1 (Tcte-1) peptide mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:45506854:45541339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_008690 // RefSeq // Mus musculus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B cells inhibitor, epsilon (Nfkbie), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006523789 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B cells inhibitor, epsilon (Nfkbie), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000024742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:45555716:45563169:1 gene:ENSMUSG00000023947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AF030896 // GenBank // Mus musculus IkB epsilon mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// BC030923 // GenBank // Mus musculus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, epsilon, mRNA (cDNA clone MGC:31667 IMAGE:4909950), complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:45555941:45567244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_028662 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member B2 (Slc35b2), mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:45563964:45567669:1 gene:ENSMUSG00000037089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF414190 // GenBank // Mus musculus embryonic seven-span transmembrane protein-like protein (J207) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// XM_006524996 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 35, member B2 (Slc35b2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// BC025875 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:31031 IMAGE:5137689), complete cds. // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// BC036992 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:46984 IMAGE:5003855), complete cds. // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// AK003377 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110003M08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000019713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:45555941:45567244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENSMUST00000083809 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:45620679:45620759:1 gene:ENSMUSG00000065743 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONMMUT029782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NM_026732 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L14 (Mrpl14), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524843 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L14 (Mrpl14), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006524844 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L14 (Mrpl14), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000024734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:45686322:45698495:1 gene:ENSMUSG00000023939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148537 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:45695416:45698400:1 gene:ENSMUSG00000023939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// AK144153 // GenBank HTC // Mus musculus submandibular gland CRL-1734 SCA-9 clone 15 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430045N15 product:1110006I11Rik protein (RIKEN cDNA 1110006I11 gene) (Ribosomal protein RL32) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC027021 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L14, mRNA (cDNA clone MGC:36524 IMAGE:5374870), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:45686357:45698178:1 gene:ENSMUSG00000023939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:45694046:45698414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT029785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_028198 // RefSeq // Mus musculus exportin 5 (Xpo5), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000087031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46202855:46242299:1 gene:ENSMUSG00000067150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AF343581 // GenBank // Mus musculus RanBp21 mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// AK122486 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1291 protein. // chr17 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// BC131660 // GenBank // Mus musculus exportin 5, mRNA (cDNA clone MGC:150180 IMAGE:40110670), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC131661 // GenBank // Mus musculus exportin 5, mRNA (cDNA clone MGC:150181 IMAGE:40110672), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46202921:46242271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0
NR_030466 // RefSeq // Mus musculus microRNA 693 (Mir693), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102187 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:46231531:46231619:1 gene:ENSMUSG00000076141 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-693 // miRBase Micro RNA Database // MI0004662 Mus musculus miR-693 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145353 // RefSeq // Mus musculus Yip1 domain family, member 3 (Yipf3), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524377 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Yip1 domain family, member 3 (Yipf3), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000095263 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:46248080:46252537:1 gene:ENSMUSG00000071074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123311 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:46248125:46251488:1 gene:ENSMUSG00000071074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000151488 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:46248145:46252001:1 gene:ENSMUSG00000071074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC019384 // GenBank // Mus musculus Yip1 domain family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:30294 IMAGE:5123736), complete cds. // chr17 // 80 // 89 // 20 // 25 // 0 /// BC100575 // GenBank // Mus musculus Yip1 domain family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:118671 IMAGE:6432108), complete cds. // chr17 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSMUST00000127378 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:46249029:46251904:1 gene:ENSMUSG00000071074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46248248:46256893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_001111142 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 73 (Lrrc73), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000095262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46254165:46257316:1 gene:ENSMUSG00000071073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC147714 // GenBank // Mus musculus gene model 88, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182859 IMAGE:9087473), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46248248:46256893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
BC040756 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC040756, mRNA (cDNA clone IMAGE:4221313), partial cds. // chr17 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0
NM_021346 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 318 (Zfp318), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NM_207671 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 318 (Zfp318), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XR_385351 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 318 (Zfp318), transcript variant X1, misc_RNA. // chr17 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000113481 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:46383731:46414814:1 gene:ENSMUSG00000015597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000138127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:46383751:46420920:1 gene:ENSMUSG00000015597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// AF159455 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 76 // 27 // 28 // 0 /// AF227194 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein TZF-L mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// BC150730 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 318, mRNA (cDNA clone MGC:183641 IMAGE:9087641), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000152472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:46400056:46410718:1 gene:ENSMUSG00000015597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// GENSCAN00000033268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46383839:46413786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1
ENSMUST00000083874 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:46403875:46404198:1 gene:ENSMUSG00000065808 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207161 // RefSeq // Mus musculus 2-deoxynucleoside 5-phosphate N-hydrolase 1 (Dnph1), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000046497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46496789:46499618:1 gene:ENSMUSG00000040658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC048355 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC048355, mRNA (cDNA clone MGC:54855 IMAGE:5388297), complete cds. // chr17 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// BC082791 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC048355, mRNA (cDNA clone IMAGE:30440529). // chr17 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46496810:46499055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_025302 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L2 (Mrpl2), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524369 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L2 (Mrpl2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000002844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:46646229:46650132:1 gene:ENSMUSG00000002767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113429 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:46646250:46650131:1 gene:ENSMUSG00000002767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000113430 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:46646270:46650139:1 gene:ENSMUSG00000002767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000156464 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:46646243:46647667:1 gene:ENSMUSG00000002767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC027762 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L2, mRNA (cDNA clone MGC:35778 IMAGE:5353459), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46645508:46664291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_025611 // RefSeq // Mus musculus cullin 7 (Cul7), mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000043464 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:46650337:46664364:1 gene:ENSMUSG00000038545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000132790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:46650572:46657070:1 gene:ENSMUSG00000038545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000133393 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:46652893:46664364:1 gene:ENSMUSG00000038545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000145567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:46651423:46664364:1 gene:ENSMUSG00000038545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK155454 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630229C11 product:cullin 7, full insert sequence. // chr17 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// BC138998 // GenBank // Mus musculus cullin 7, mRNA (cDNA clone MGC:170625 IMAGE:8862020), complete cds. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC139000 // GenBank // Mus musculus cullin 7, mRNA (cDNA clone MGC:170627 IMAGE:8862022), complete cds. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46645508:46664291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_145488 // RefSeq // Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 6 (Pex6), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000002840 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:46711463:46725541:1 gene:ENSMUSG00000002763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000127897 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:46711476:46717456:1 gene:ENSMUSG00000002763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000144964 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:46711463:46725541:1 gene:ENSMUSG00000002763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AK083898 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130055I09 product:similar to PEROXISOMAL BIOGENESIS FACTOR 6 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 89 // 24 // 8 // 9 // 0 /// AK220525 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4177 protein. // chr17 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC003424 // GenBank // Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:6455 IMAGE:2609884), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46711500:46725324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
NM_025966 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310039H08 gene (2310039H08Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46772635:46773407:1 gene:ENSMUSG00000062619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC038674 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310039H08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:47903 IMAGE:1513865), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178385 // RefSeq // Mus musculus tubulin-specific chaperone C (Tbcc), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46890621:46892463:1 gene:ENSMUSG00000036430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC019476 // GenBank // Mus musculus tubulin-specific chaperone C, mRNA (cDNA clone MGC:28692 IMAGE:4240883), complete cds. // chr17 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC083164 // GenBank // Mus musculus tubulin-specific chaperone C, mRNA (cDNA clone MGC:103238 IMAGE:5390600), complete cds. // chr17 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000033245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46890690:46891715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_008938 // RefSeq // Mus musculus peripherin 2 (Prph2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024773 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:46910459:46924933:1 gene:ENSMUSG00000023978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:46910478:46920347:1 gene:ENSMUSG00000023978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// AK044549 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930021L14 product:retinal degeneration, slow (retinitis pigmentosa 7), full insert sequence. // chr17 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0 /// BC028958 // GenBank // Mus musculus peripherin 2, mRNA (cDNA clone MGC:38973 IMAGE:5363367), complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC085266 // GenBank // Mus musculus peripherin 2, mRNA (cDNA clone MGC:102486 IMAGE:6490224), complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC026484 // GenBank HTC // Mus musculus peripherin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4503494), with apparent retained intron. // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000033259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46910697:46923547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
AK021406 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130209G04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001146211 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S10 (Mrps10), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// NM_001146212 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S10 (Mrps10), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// NM_183086 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S10 (Mrps10), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// XM_006524784 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S10 (Mrps10), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000060752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:47369197:47378678:1 gene:ENSMUSG00000034729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000119841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:47369197:47378679:1 gene:ENSMUSG00000034729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000119945 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:47368891:47378681:1 gene:ENSMUSG00000034729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000120737 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:47368887:47378679:1 gene:ENSMUSG00000034729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
NM_026242 // RefSeq // Mus musculus Morf4 family associated protein 1 (Mrfap1), mRNA. // chr17 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000068795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:5:36794867:36796772:-1 gene:ENSMUSG00000055302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000177586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:47410363:47410740:1 gene:ENSMUSG00000096361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK020049 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030408K18 product:similar to T-CELL ACTIVATION PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 75 // 89 // 18 // 24 // 0 /// BC010209 // GenBank // Mus musculus Morf4 family associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:7196 IMAGE:3482091), complete cds. // chr17 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:36796216:36830575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:47410195:47410740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_145489 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI661453 (AI661453), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000150819 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:47436805:47470638:1 gene:ENSMUSG00000034382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000037701 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:47436615:47470144:1 gene:ENSMUSG00000034382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// BC006605 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI661453, mRNA (cDNA clone MGC:7083 IMAGE:3157220), complete cds. // chr17 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// GENSCAN00000041572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:47443131:47469393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_198421 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 49 (Usp49), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000024779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:47630690:47686738:1 gene:ENSMUSG00000090115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000131550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:47673301:47680728:1 gene:ENSMUSG00000090115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000132397 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:47611613:47683861:1 gene:ENSMUSG00000023984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000152724 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:47672720:47681056:1 gene:ENSMUSG00000090115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// AK141369 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430041D04 product:ubiquitin specific protease 49, full insert sequence. // chr17 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// BC060712 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 49, mRNA (cDNA clone MGC:67320 IMAGE:6406180), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:47672072:47680872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_144939 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor receptor substrate 3 (Frs3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006523468 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibroblast growth factor receptor substrate 3 (Frs3), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// XM_006523469 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibroblast growth factor receptor substrate 3 (Frs3), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006523470 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibroblast growth factor receptor substrate 3 (Frs3), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000113296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:47695198:47704286:1 gene:ENSMUSG00000023266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000138316 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:47702065:47704284:1 gene:ENSMUSG00000023266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AK077209 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933432E15 product:FGFR SIGNALLING ADAPTOR SNT-2 (UNKNOWN) (PROTEIN FOR MGC:17167) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC014819 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor receptor substrate 3, mRNA (cDNA clone MGC:25496 IMAGE:4506982), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:47698596:47703862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_025973 // RefSeq // Mus musculus progastricsin (pepsinogen C) (Pgc), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000024782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:47726842:47734482:1 gene:ENSMUSG00000023987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK160474 // GenBank HTC // Mus musculus adult male stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2200003G21 product:progastricsin (pepsinogen C), full insert sequence. // chr17 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC099409 // GenBank // Mus musculus progastricsin (pepsinogen C), mRNA (cDNA clone MGC:117575 IMAGE:30790663), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000144955 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:47726844:47732393:1 gene:ENSMUSG00000023987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000041566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:47726906:47735846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082814 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:47848834:47848952:1 gene:ENSMUSG00000064748 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026625 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700067P10 gene (1700067P10Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000022028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:48089632:48090920:1 gene:ENSMUSG00000021545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048440 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58135 IMAGE:6741836), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021406 // RefSeq // Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells 1 (Trem1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006524726 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells 1 (Trem1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// XM_006524729 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells 1 (Trem1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// XM_006524730 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells 1 (Trem1), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000048782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:48232771:48246924:1 gene:ENSMUSG00000042265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000113251 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:48232768:48246362:1 gene:ENSMUSG00000042265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AF241219 // GenBank // Mus musculus TREM-1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC111875 // GenBank // Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:40059582), complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000027305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:48230340:48244648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_021407 // RefSeq // Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells 3 (Trem3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524732 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells 3 (Trem3), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:48247777:48258841:1 gene:ENSMUSG00000041754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF241220 // GenBank // Mus musculus TREM-3 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127035 // GenBank // Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells 3, mRNA (cDNA clone MGC:149943 IMAGE:40049608), complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC127036 // GenBank // Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells 3, mRNA (cDNA clone MGC:149944 IMAGE:40049609), complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001033405 // RefSeq // Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2 (Treml2), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:48300038:48312534:1 gene:ENSMUSG00000071068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK132018 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810405L24 product:hypothetical Immunoglobulin subtype/Ig-like domain profile containing protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// DQ087184 // GenBank // Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2a dominant splice variant (Treml2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// DQ341272 // GenBank // Mus musculus trem-like transcript 2 (Tlt2) mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:48300527:48327618:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_006524394 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA B430306N03 gene (B430306N03Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000049614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:48316141:48327024:1 gene:ENSMUSG00000043740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000129825 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:48316409:48324199:1 gene:ENSMUSG00000043740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// AK133242 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932420N15 product:Weakly similar to TREM-1 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// AY522648 // GenBank // Mus musculus CRKD-binding protein (Crkr) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// DQ087179 // GenBank // Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells-like 6 (Treml6) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// DQ087180 // GenBank // Mus musculus triggering receptor expressed on myeloid cells-like 6b (Treml6) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000125174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:48316165:48325525:1 gene:ENSMUSG00000043740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 95 // 95 // 21 // 22 // 1 /// GENSCAN00000027313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:48300527:48327618:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1
NM_001289490 // RefSeq // Mus musculus O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 (Oard1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001289491 // RefSeq // Mus musculus O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 (Oard1), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_207219 // RefSeq // Mus musculus O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 (Oard1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006523459 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 (Oard1), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006523460 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 (Oard1), transcript variant X7, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000046651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:48410080:48417266:1 gene:ENSMUSG00000040771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000167180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:48410014:48417254:1 gene:ENSMUSG00000040771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC022574 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI314976, mRNA (cDNA clone MGC:31023 IMAGE:3989373), complete cds. // chr17 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0 /// BC157987 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI314976, mRNA (cDNA clone MGC:189803 IMAGE:9007303), complete cds. // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_027452 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 (Lrfn2), mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000046254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:48932379:49097588:1 gene:ENSMUSG00000040490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC139418 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:171045 IMAGE:8862440), complete cds. // chr17 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// XM_006524896 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 (Lrfn2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:49048957:49097217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000082607 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:49292742:49292901:1 gene:ENSMUSG00000064541 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT029954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_177052 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 6 (Kif6), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524393 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin family member 6 (Kif6), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000024798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:49615136:49755388:1 gene:ENSMUSG00000023999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000160049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:49714110:49755388:1 gene:ENSMUSG00000023999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000162029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:49615139:49675385:1 gene:ENSMUSG00000023999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000162854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:49615172:49909847:1 gene:ENSMUSG00000023999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK083760 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130004B10 product:kinesin 6, full insert sequence. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:49610593:49727616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_177052 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 6 (Kif6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000162854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:49615172:49909847:1 gene:ENSMUSG00000023999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000159354 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:49887628:49909847:1 gene:ENSMUSG00000023999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// AK084082 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130084M03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000041018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:49832143:49899104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENSMUST00000086914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:50239404:50241524:1 gene:ENSMUSG00000067103 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180996 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:50239208:50246316:1 gene:ENSMUSG00000067103 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY702103 // GenBank // Mus musculus round spermatids protein STDP2 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT029972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_013880 // RefSeq // Mus musculus phospholipase C-like 2 (Plcl2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524150 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase C-like 2 (Plcl2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524153 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase C-like 2 (Plcl2), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000043938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:50509547:50688493:1 gene:ENSMUSG00000038910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB033615 // GenBank // Mus musculus PLC-L2 mRNA for phospholipase C-L2, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AK122439 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1092 protein. // chr17 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// BC027746 // GenBank // Mus musculus phospholipase C-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:29392 IMAGE:5065782), complete cds. // chr17 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// AK137821 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130020D07 product:phospholipase C-like 2, full insert sequence. // chr17 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:50590538:50687891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
BC026389 // GenBank // Mus musculus predicted gene, ENSMUSG00000058380, mRNA (cDNA clone IMAGE:4190185), partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003500 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001031811 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 8 (Kcnh8), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// ENSMUST00000039366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:52602709:52979194:1 gene:ENSMUSG00000035580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// GENSCAN00000032134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:52724397:52957670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 94 // 57 // 59 // 0
GENSCAN00000030074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:53140245:53258744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
NM_025887 // RefSeq // Mus musculus RAB5A, member RAS oncogene family (Rab5a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000017975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:53479234:53507671:1 gene:ENSMUSG00000017831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB232593 // GenBank // Mus musculus Rab5A mRNA for Rab5A, complete cds. // chr17 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// BC004842 // GenBank // Mus musculus RAB5A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:6509 IMAGE:2649317), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC034370 // GenBank // Mus musculus RAB5A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:18688 IMAGE:3709729), complete cds. // chr17 // 90 // 91 // 18 // 20 // 0 /// BC096481 // GenBank // Mus musculus RAB5A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:106126 IMAGE:5322132), complete cds. // chr17 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:53483913:53506429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0
NM_001190846 // RefSeq // Mus musculus K(lysine) acetyltransferase 2B (Kat2b), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_020005 // RefSeq // Mus musculus K(lysine) acetyltransferase 2B (Kat2b), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000000724 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:53566971:53672720:1 gene:ENSMUSG00000000708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF254442 // GenBank // Mus musculus PCAF acetyltransferase (Pcaf) mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 94 // 26 // 29 // 0 /// BC082581 // GenBank // Mus musculus K(lysine) acetyltransferase 2B, mRNA (cDNA clone MGC:100182 IMAGE:30653109), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC138195 // GenBank // Mus musculus K(lysine) acetyltransferase 2B, mRNA (cDNA clone MGC:169819 IMAGE:8861214), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC145896 // GenBank // Mus musculus K(lysine) acetyltransferase 2B, mRNA (cDNA clone MGC:175783 IMAGE:40131199), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:53608097:53670868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NR_073205 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4932415M13 gene (4932415M13Rik), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000077153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:53723751:53725733:1 gene:ENSMUSG00000062036 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000184645 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:53716509:53733843:1 gene:ENSMUSG00000062036 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC109354 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932415M13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130367 IMAGE:40057021), complete cds. // chr17 // 88 // 55 // 14 // 16 // 0 /// BC116728 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4932415M13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144833 IMAGE:40106470), complete cds. // chr17 // 69 // 55 // 11 // 16 // 0 /// GENSCAN00000030076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:53723947:53746708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT030071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONMMUT030072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
GENSCAN00000025390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:55247787:55248098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000056959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4222_MG3908_PATCH:55247760:55248071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0
NM_139138 // RefSeq // Mus musculus EGF-like module containing, mucin-like, hormone receptor-like sequence 4 (Emr4), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSMUST00000025004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:55749984:55853662:1 gene:ENSMUSG00000032915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// AF396935 // GenBank // Mus musculus seven-span membrane protein FIRE mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// AY032690 // GenBank // Mus musculus EGF-like module-containing mucin-like receptor EMR4 mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// BC120538 // GenBank // Mus musculus EGF-like module containing, mucin-like, hormone receptor-like sequence 4, mRNA (cDNA clone MGC:155775 IMAGE:40129461), complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// BC120540 // GenBank // Mus musculus EGF-like module containing, mucin-like, hormone receptor-like sequence 4, mRNA (cDNA clone MGC:155777 IMAGE:40129463), complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000025387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:55778248:55879027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0
NM_145490 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 959 (Zfp959), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000054780 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:55892120:55898928:1 gene:ENSMUSG00000003198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC011426 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC011426, mRNA (cDNA clone MGC:18740 IMAGE:3986622), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC138466 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC011426, mRNA (cDNA clone MGC:170091 IMAGE:8861486), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC138467 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC011426, mRNA (cDNA clone MGC:170092 IMAGE:8861487), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0
NM_015766 // RefSeq // Mus musculus Epstein-Barr virus induced gene 3 (Ebi3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000003274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:55952623:55957021:1 gene:ENSMUSG00000003206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF013114 // GenBank // Mus musculus cytokine receptor-like molecule (EBI3) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC008209 // GenBank // Mus musculus Epstein-Barr virus induced gene 3, mRNA (cDNA clone MGC:11457 IMAGE:3154957), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:55944955:55991376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_028381 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 94 (Ccdc94), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000086869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:55959187:55967949:1 gene:ENSMUSG00000003208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// AK168621 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920038O14 product:similar to Hypothetical protein (F20887_2) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC031400 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 94, mRNA (cDNA clone MGC:36340 IMAGE:4952601), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000025377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:55944955:55991376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
NM_001159523 // RefSeq // Mus musculus src homology 2 domain-containing transforming protein D (Shd), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_009168 // RefSeq // Mus musculus src homology 2 domain-containing transforming protein D (Shd), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000044216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:55970467:55976617:1 gene:ENSMUSG00000039154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB018423 // GenBank // Mus musculus shd mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC052026 // GenBank HTC // Mus musculus src homology 2 domain-containing transforming protein D, mRNA (cDNA clone IMAGE:5685991), with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC103798 // GenBank // Mus musculus src homology 2 domain-containing transforming protein D, mRNA (cDNA clone MGC:118480 IMAGE:30288676), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:55944955:55991376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_183178 // RefSeq // Mus musculus fibronectin type 3 and SPRY domain-containing protein (Fsd1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000011733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:55986511:55996881:1 gene:ENSMUSG00000011589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC055106 // GenBank // Mus musculus fibronectin type 3 and SPRY domain-containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:58341 IMAGE:6532001), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:55993843:55996752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000025377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:55944955:55991376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_026530 // RefSeq // Mus musculus MPN domain containing (Mpnd), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006524836 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MPN domain containing (Mpnd), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000124302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:56009255:56012322:1 gene:ENSMUSG00000003199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000149441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:56009201:56016790:1 gene:ENSMUSG00000003199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000153197 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:56010440:56015497:1 gene:ENSMUSG00000003199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000159340 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:56009333:56016614:1 gene:ENSMUSG00000003199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000159996 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:56009231:56016653:1 gene:ENSMUSG00000003199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000162883 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:56009208:56016646:1 gene:ENSMUSG00000003199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56009250:56016602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_013733 // RefSeq // Mus musculus chromatin assembly factor 1, subunit A (p150) (Chaf1a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000002914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56040416:56068026:1 gene:ENSMUSG00000002835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AJ132771 // GenBank // Mus musculus mRNA for chromatin assembly factor-I p150 subunit. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK135763 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420413E18 product:chromatin assembly factor 1, subunit A (p150), full insert sequence. // chr17 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC053740 // GenBank // Mus musculus chromatin assembly factor 1, subunit A (p150), mRNA (cDNA clone MGC:59315 IMAGE:6504838), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK161016 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4121404L19 product:chromatin assembly factor 1, subunit A (p150), full insert sequence. // chr17 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000009583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56046801:56067550:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_008233 // RefSeq // Mus musculus hepatoma-derived growth factor, related protein 2 (Hdgfrp2), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006523708 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hepatoma-derived growth factor, related protein 2 (Hdgfrp2), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000002911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56079657:56100596:1 gene:ENSMUSG00000002833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AK032572 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430599I16 product:weakly similar to HEPATOMA-DERIVED GROWTH FACTOR [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC003741 // GenBank // Mus musculus hepatoma-derived growth factor, related protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:5836 IMAGE:3488803), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// D63850 // GenBank // Mus musculus domesticus HDGF mRNA for hepatoma-derived growth factor, complete cds, strain:BALB/c. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56079755:56100453:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
NM_025566 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 1 (Tnfaip8l1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077788 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:56162477:56173955:1 gene:ENSMUSG00000044469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC032199 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:35739 IMAGE:5324284), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK080548 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730083F13 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003511 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029827 // RefSeq // Mus musculus microRNA 7b (Mir7b), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083557 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:56242988:56243098:1 gene:ENSMUSG00000065491 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-7b // miRBase Micro RNA Database // MI0000730 Mus musculus miR-7b stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010192 // RefSeq // Mus musculus feminization 1 homolog a (C. elegans) (Fem1a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000060253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56256793:56263608:1 gene:ENSMUSG00000043683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC009161 // GenBank // Mus musculus feminization 1 homolog a (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:6309 IMAGE:2811079), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC054382 // GenBank // Mus musculus feminization 1 homolog a (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:62617 IMAGE:6469158), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC110669 // GenBank // Mus musculus feminization 1 homolog a (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:117925 IMAGE:5042239), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0
NM_172132 // RefSeq // Mus musculus lysine (K)-specific demethylase 4B (Kdm4b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000025036 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:56326074:56402864:1 gene:ENSMUSG00000024201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000086835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:56326091:56402859:1 gene:ENSMUSG00000024201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000139679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:56326062:56356056:1 gene:ENSMUSG00000024201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000141507 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:56393920:56402870:1 gene:ENSMUSG00000024201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 26 // 26 // 0 /// BC007145 // GenBank // Mus musculus jumonji domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:6349 IMAGE:3490671), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AK145151 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930004L01 product:jumonji domain containing 2B, full insert sequence. // chr17 // 46 // 46 // 22 // 48 // 1 /// GENSCAN00000009560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56351657:56401728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0
NM_001163300 // RefSeq // Mus musculus scaffold attachment factor B (Safb), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000095224 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:56585059:56606294:1 gene:ENSMUSG00000071054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000182378 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:56597770:56606280:1 gene:ENSMUSG00000071054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000182533 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:56584974:56606219:1 gene:ENSMUSG00000071054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000182951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:56588840:56601240:1 gene:ENSMUSG00000071054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// AK087504 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130307D12 product:similar to SCAFFOLD ATTACHMENT FACTOR B [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56585162:56606105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0
NM_175350 // RefSeq // Mus musculus catsper channel auxiliary subunit delta (Catsperd), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006523430 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus catsper channel auxiliary subunit delta (Catsperd), transcript variant X9, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000112979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56628143:56664456:1 gene:ENSMUSG00000040828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC116633 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 146, mRNA (cDNA clone MGC:141232 IMAGE:40056655), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// HQ441159 // GenBank // Mus musculus CATSPER delta long variant (Tmem146) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// HQ441160 // GenBank // Mus musculus CATSPER delta short variant (Tmem146) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006523439 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus catsper channel auxiliary subunit delta (Catsperd), transcript variant X18, mRNA. // chr17 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// XM_006523441 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus catsper channel auxiliary subunit delta (Catsperd), transcript variant X20, mRNA. // chr17 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000009501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56631189:56664355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0
NM_027244 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 11 (Ndufa11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000002452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56717762:56724248:1 gene:ENSMUSG00000002379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC053075 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:5694421). // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC059729 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 11, mRNA (cDNA clone MGC:74331 IMAGE:6601702), complete cds. // chr17 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56719584:56722097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_144858 // RefSeq // Mus musculus dihydrouridine synthase 3-like (S. cerevisiae) (Dus3l), mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006524161 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dihydrouridine synthase 3-like (S. cerevisiae) (Dus3l), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000007747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56764751:56770092:1 gene:ENSMUSG00000007603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AK166183 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830007D13 product:similar to Putative zinc finger protein [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// AY040840 // GenBank // Mus musculus putative zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC023942 // GenBank // Mus musculus dihydrouridine synthase 3-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5342590), complete cds. // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC052481 // GenBank // Mus musculus dihydrouridine synthase 3-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:56820 IMAGE:5401486), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000009567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56764856:56769808:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
XM_006525141 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700061G19 gene (1700061G19Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000025048 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:56875477:56888904:1 gene:ENSMUSG00000024209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000125425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:56875503:56877818:1 gene:ENSMUSG00000024209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// AK018867 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700061G19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC116283 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143887 IMAGE:40094427), complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56876261:56888722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_017393 // RefSeq // Mus musculus caseinolytic mitochondrial matrix peptidase proteolytic subunit (Clpp), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000002735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56990264:56996371:1 gene:ENSMUSG00000002660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC001998 // GenBank // Mus musculus caseinolytic peptidase, ATP-dependent, proteolytic subunit homolog (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:5755 IMAGE:3487489), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56990328:56991390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56992826:56999092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_025538 // RefSeq // Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 7 (E. coli) (Alkbh7), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_027372 // RefSeq // Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 7 (E. coli) (Alkbh7), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000002737 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:56997343:56999322:1 gene:ENSMUSG00000002661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000074141 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:56997339:56999311:1 gene:ENSMUSG00000002661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000149632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:56998480:56999137:1 gene:ENSMUSG00000002661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC029677 // GenBank // Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 7 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:39017 IMAGE:5364485), complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56992826:56999092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT030147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000024475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57012670:57020236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_177638 // RefSeq // Mus musculus crumbs homolog 3 (Drosophila) (Crb3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006524167 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crumbs homolog 3 (Drosophila) (Crb3), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000071826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:57059105:57065912:1 gene:ENSMUSG00000044279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000097299 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:57062231:57065918:1 gene:ENSMUSG00000044279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163628 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:57062508:57065164:1 gene:ENSMUSG00000044279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 58 // 12 // 15 // 0 /// ENSMUST00000163763 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:57062299:57065427:1 gene:ENSMUSG00000044279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC024462 // GenBank // Mus musculus crumbs homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:37326 IMAGE:4975562), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006524164 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus crumbs homolog 3 (Drosophila) (Crb3), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENSMUST00000169543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:57062283:57065917:1 gene:ENSMUSG00000044279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57062694:57065296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_009404 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 9 (Tnfsf9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57105385:57107757:1 gene:ENSMUSG00000035678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138767 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:170394 IMAGE:8861789), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC138770 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:170397 IMAGE:8861792), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57105432:57107504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001242389 // RefSeq // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 10 (Trip10), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NM_001242390 // RefSeq // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 10 (Trip10), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NM_001242391 // RefSeq // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 10 (Trip10), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NM_134125 // RefSeq // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 10 (Trip10), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006523401 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 10 (Trip10), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57249451:57263697:1 gene:ENSMUSG00000019487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AF502565 // GenBank // Mus musculus Cdc42-interacting protein 4-2 (Cip4) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr17 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// AY081142 // GenBank // Mus musculus Cdc42 interaction protein 4 (Cip4) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr17 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC003249 // GenBank // Mus musculus thyroid hormone receptor interactor 10, mRNA (cDNA clone MGC:6673 IMAGE:3500118), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57249548:57263148:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0
NM_001163815 // RefSeq // Mus musculus vav 1 oncogene (Vav1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_001163816 // RefSeq // Mus musculus vav 1 oncogene (Vav1), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_011691 // RefSeq // Mus musculus vav 1 oncogene (Vav1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000005889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:57279100:57328031:1 gene:ENSMUSG00000034116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:57279127:57327955:1 gene:ENSMUSG00000034116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000169220 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:57279100:57327950:1 gene:ENSMUSG00000034116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC020487 // GenBank // Mus musculus vav 1 oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:11710 IMAGE:3965451), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// CT010321 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D0652D for gene Vav1, Vav 1 oncogene; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57279198:57327704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0
NM_010130 // RefSeq // Mus musculus EGF-like module containing, mucin-like, hormone receptor-like sequence 1 (Emr1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000004850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57358714:57483523:1 gene:ENSMUSG00000004730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000086763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57358686:57483529:1 gene:ENSMUSG00000004730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC075688 // GenBank // Mus musculus EGF-like module containing, mucin-like, hormone receptor-like sequence 1, mRNA (cDNA clone MGC:100047 IMAGE:30609706), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// U66888 // GenBank // Mus musculus Emr1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// X93328 // GenBank // M.musculus mRNA for F4/80. // chr17 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000024448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57353381:57415724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57443933:57460834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 19 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000122479 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:57747565:57747676:1 gene:ENSMUSG00000084428 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 66 // 94 // 21 // 32 // 0 /// NONMMUT030163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 66 // 94 // 21 // 32 // 0
NM_001081653 // RefSeq // Mus musculus contactin associated protein-like 5C (Cntnap5c), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XR_385354 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus contactin associated protein-like 5C (Cntnap5c), transcript variant X11, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000076038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57769570:58410342:1 gene:ENSMUSG00000038048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57855164:57926410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001081653 // RefSeq // Mus musculus contactin associated protein-like 5C (Cntnap5c), mRNA. // chr17 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// ENSMUST00000076038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57769570:58410342:1 gene:ENSMUSG00000038048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// XR_385354 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus contactin associated protein-like 5C (Cntnap5c), transcript variant X11, misc_RNA. // chr17 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1 /// GENSCAN00000030149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:58204315:58410342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:58003035:58170338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1
ENSMUST00000145848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:58996251:59012138:1 gene:ENSMUSG00000086594 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK015703 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930505H01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_003085139 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 12, opposite strand (Nudt12os), mRNA. // chr17 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// ENSMUST00000152750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:58996275:59024981:1 gene:ENSMUSG00000086594 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// AK132847 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930439L07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONMMUT030169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT030170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONMMUT030171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_003085139 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 12, opposite strand (Nudt12os), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000152750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:58996275:59024981:1 gene:ENSMUSG00000086594 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000167453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:59017314:59024729:1 gene:ENSMUSG00000086594 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK132847 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930439L07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT030170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT030173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT030171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSMUST00000082798 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:60486007:60486169:1 gene:ENSMUSG00000064732 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000176658 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:61360573:61361614:1 gene:ENSMUSG00000093761 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC128024 // GenBank // Mus musculus oocyte specific homeobox 6, mRNA (cDNA clone MGC:157631 IMAGE:40136487), complete cds. // chr17 // 30 // 100 // 8 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:61360572:61361615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0
NM_008549 // RefSeq // Mus musculus mannosidase 2, alpha 1 (Man2a1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000086723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:64600736:64755110:1 gene:ENSMUSG00000024085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000169668 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:64713619:64754838:1 gene:ENSMUSG00000024085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// BC138371 // GenBank // Mus musculus mannosidase 2, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:169996 IMAGE:8861391), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC138372 // GenBank // Mus musculus mannosidase 2, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:169997 IMAGE:8861392), complete cds. // chr17 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// AK144763 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730030D07 product:mannosidase 2, alpha 1, full insert sequence. // chr17 // 50 // 50 // 20 // 40 // 1 /// GENSCAN00000036604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:64733742:64752572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000036615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:64706869:64716790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000036595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:64636543:64682110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
GENSCAN00000036602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:64876201:64892443:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
AK017294 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430411C19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// KnowTID_00003520 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083372 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:66086094:66086200:1 gene:ENSMUSG00000094158 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT030285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001037757 // RefSeq // Mus musculus WAS protein family homolog (Wash), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NM_026833 // RefSeq // Mus musculus WAS protein family homolog (Wash), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006524859 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WAS protein family homolog (Wash), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000072383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:66111546:66120503:1 gene:ENSMUSG00000024101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000116556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:66111645:66120503:1 gene:ENSMUSG00000024101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC025839 // GenBank // Mus musculus open reading frame 19, mRNA (cDNA clone MGC:37972 IMAGE:5136195), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:66108635:66119136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0
NM_001003919 // RefSeq // Mus musculus DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box helicase 11 (Ddx11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006524410 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box helicase 11 (Ddx11), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_006524411 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box helicase 11 (Ddx11), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000163605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:66123520:66152167:1 gene:ENSMUSG00000035842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC049929 // GenBank // Mus musculus DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 11 (CHL1-like helicase homolog, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5309846), partial cds. // chr17 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// BC079656 // GenBank // Mus musculus DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 11 (CHL1-like helicase homolog, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:90809 IMAGE:6854039), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:66126177:66236412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
AK043876 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830044N05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008480 // RefSeq // Mus musculus laminin, alpha 1 (Lama1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// ENSMUST00000035471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:67697265:67822645:1 gene:ENSMUSG00000032796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// AK051116 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030074C12 product:laminin, alpha 1, full insert sequence. // chr17 // 100 // 25 // 16 // 16 // 0 /// J04064 // GenBank // Mus musculus laminin A chain mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 60 // 63 // 0 /// GENSCAN00000015720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:67751887:67803033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000015729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:67804410:67848964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 25 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000015750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:67697335:67748490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 17 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000150573 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:68273797:68457858:1 gene:ENSMUSG00000041565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147118 // GenBank // Mus musculus l(3)mbt-like 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:9056145), complete cds. // chr17 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// BC147119 // GenBank // Mus musculus l(3)mbt-like 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:9056132), complete cds. // chr17 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// NM_177278 // RefSeq // Mus musculus l(3)mbt-like 4 (Drosophila) (L3mbtl4), mRNA. // chr17 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// ENSMUST00000093007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:68273797:68777961:1 gene:ENSMUSG00000041565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// ENSMUST00000124543 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:68273797:68641569:1 gene:ENSMUSG00000041565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// ENSMUST00000139383 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:68273797:68630903:1 gene:ENSMUSG00000041565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// AK053068 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930040M24 product:weakly similar to HYPOTHETICAL 60.5 KDA PROTEIN [Macaca fascicularis], full insert sequence. // chr17 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
NM_177278 // RefSeq // Mus musculus l(3)mbt-like 4 (Drosophila) (L3mbtl4), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK053993 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230011E14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000093007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:68273797:68777961:1 gene:ENSMUSG00000041565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONMMUT030362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_001206661 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 200C (Tmem200c), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000178545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:68837136:68843138:1 gene:ENSMUSG00000095407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:68840424:68842337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_009547 // RefSeq // Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 14 (Zbtb14), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006524212 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger and BTB domain containing 14 (Zbtb14), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000062369 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:69383319:69390750:1 gene:ENSMUSG00000049672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000112674 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:69383050:69390750:1 gene:ENSMUSG00000049672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000112676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:69383840:69390750:1 gene:ENSMUSG00000049672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AK145517 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0009H21 product:zinc finger protein 161, full insert sequence. // chr17 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// BC052017 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 161, mRNA (cDNA clone MGC:62357 IMAGE:5697838), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// L15325 // GenBank // Mouse zinc finger 5 protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000020187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:69384029:69388658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
NR_026848 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C030034I22 gene (C030034I22Rik), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:69417461:69418931:1 gene:ENSMUSG00000073374 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK147961 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270119D12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000188481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:69417402:69421632:1 gene:ENSMUSG00000073374 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:69400955:69417920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
GENSCAN00000020181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:69570750:69571184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000050832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:70400134:70409902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSMUST00000092011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:70929058:70929546:1 gene:ENSMUSG00000066983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000050837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:70929058:70929546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000050830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:70957099:70958259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001083934 // RefSeq // Mus musculus myomesin 1 (Myom1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NM_010867 // RefSeq // Mus musculus myomesin 1 (Myom1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XR_385297 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myomesin 1 (Myom1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr17 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000024847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:71019521:71126855:1 gene:ENSMUSG00000024049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000073211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:71019568:71126856:1 gene:ENSMUSG00000024049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000179759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:71019568:71126856:1 gene:ENSMUSG00000024049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AJ012072 // GenBank // Mus musculus mRNA for myomesin/skelemin. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC060378 // GenBank // Mus musculus myomesin 1, mRNA (cDNA clone MGC:68165 IMAGE:4980452), complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// Z22866 // GenBank // M.musculus skelemin mRNA, complete CDS. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006523787 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myomesin 1 (Myom1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// AK052539 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430047A17 product:myomesin 1, full insert sequence. // chr17 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// GENSCAN00000010530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:71001992:71126369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_175639 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 43 (Wdr43), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000047086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:71616215:71659031:1 gene:ENSMUSG00000041057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC117724 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 43, mRNA (cDNA clone IMAGE:40088686). // chr17 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000010529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:71539877:71657661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1
ENSMUST00000175146 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:71640879:71640956:1 gene:ENSMUSG00000092887 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_028551 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 53 (Snord53), small nucleolar RNA. // chr17 // 74 // 76 // 14 // 19 // 0 /// NONMMUT030472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_027166 // RefSeq // Mus musculus yippee-like 5 (Drosophila) (Ypel5), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524539 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus yippee-like 5 (Drosophila) (Ypel5), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006524541 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus yippee-like 5 (Drosophila) (Ypel5), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006524542 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus yippee-like 5 (Drosophila) (Ypel5), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000045174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:72836704:72851195:1 gene:ENSMUSG00000039770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC085109 // GenBank // Mus musculus yippee-like 5 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:103278 IMAGE:30737658), complete cds. // chr17 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_029999 // RefSeq // Mus musculus limb-bud and heart (Lbh), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000024857 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:72918305:72941942:1 gene:ENSMUSG00000024063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF317517 // GenBank // Mus musculus limb bud and heart (Lbh) mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// AK020110 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720416L16 product:limb-bud and heart, full insert sequence. // chr17 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// BC052470 // GenBank // Mus musculus limb-bud and heart, mRNA (cDNA clone MGC:61177 IMAGE:6813866), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC026827 // GenBank // Mus musculus limb-bud and heart, mRNA (cDNA clone MGC:25639 IMAGE:4218560), complete cds. // chr17 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENSMUST00000179007 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:72987798:72987904:1 gene:ENSMUSG00000095729 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONMMUT030485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NM_020578 // RefSeq // Mus musculus EH-domain containing 3 (Ehd3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000024860 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:73804841:73832093:1 gene:ENSMUSG00000024065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF155883 // GenBank // Mus musculus EH-domain containing protein 2 (Ehd2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF506002 // GenBank // Mus musculus EH-domain containing protein 2 (Ehd2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC046596 // GenBank // Mus musculus EH-domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:54530 IMAGE:6312263), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:73796785:73830445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001162870 // RefSeq // Mus musculus spastin (Spast), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_016962 // RefSeq // Mus musculus spastin (Spast), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000024869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:74338987:74391113:1 gene:ENSMUSG00000024068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC046286 // GenBank // Mus musculus spastin, mRNA (cDNA clone MGC:54786 IMAGE:6441742), complete cds. // chr17 // 94 // 94 // 31 // 33 // 0 /// AK044900 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130010N24 product:spastic paraplegia 4 homolog (human), full insert sequence. // chr17 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// GENSCAN00000005090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:74335040:74423514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1
NM_026417 // RefSeq // Mus musculus Yip1 domain family, member 4 (Yipf4), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000024873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:74489493:74500277:1 gene:ENSMUSG00000024072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC003936 // GenBank // Mus musculus Yip1 domain family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:7327 IMAGE:3486503), complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:74489716:74501869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_152817 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 27 (Ttc27), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006525027 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 27 (Ttc27), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000024882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:74717750:74863570:1 gene:ENSMUSG00000024078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC021912 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 27, mRNA (cDNA clone MGC:27604 IMAGE:4503335), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000005027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:74710163:74863456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0
NM_019919 // RefSeq // Mus musculus latent transforming growth factor beta binding protein 1 (Ltbp1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_206958 // RefSeq // Mus musculus latent transforming growth factor beta binding protein 1 (Ltbp1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000001927 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:75005568:75391767:1 gene:ENSMUSG00000001870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000112514 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:75178911:75391326:1 gene:ENSMUSG00000001870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000112516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:75178810:75391336:1 gene:ENSMUSG00000001870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000135447 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:75178810:75348933:1 gene:ENSMUSG00000001870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// AF022889 // GenBank // Mus musculus latent TGF beta binding protein (LTBP-1) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// BC094612 // GenBank // Mus musculus latent transforming growth factor beta binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:106419 IMAGE:30356631), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:75224633:75390553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_001166493 // RefSeq // Mus musculus RAS, guanyl releasing protein 3 (Rasgrp3), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NM_207246 // RefSeq // Mus musculus RAS, guanyl releasing protein 3 (Rasgrp3), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006524272 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS, guanyl releasing protein 3 (Rasgrp3), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000095204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:75465538:75529043:1 gene:ENSMUSG00000071042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000164192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:75435905:75529043:1 gene:ENSMUSG00000071042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AB154824 // GenBank // Mus musculus mRNA for RasGRP3, complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC066069 // GenBank // Mus musculus RAS, guanyl releasing protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:79207 IMAGE:6851971), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC066127 // GenBank // Mus musculus RAS, guanyl releasing protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:74365 IMAGE:30280332), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000043032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:75496353:75531126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0
NM_015800 // RefSeq // Mus musculus cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 (chordin like) (Crim1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000112498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:78200248:78376592:1 gene:ENSMUSG00000024074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC100348 // GenBank // Mus musculus cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 (chordin like), mRNA (cDNA clone MGC:117704 IMAGE:30521148), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000034033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:78299959:78382034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
NM_001197028 // RefSeq // Mus musculus vitrin (Vit), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_028813 // RefSeq // Mus musculus vitrin (Vit), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006525029 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vitrin (Vit), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000024880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:78508063:78627409:1 gene:ENSMUSG00000024076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF454755 // GenBank // Mus musculus vitrin (Vit) mRNA, complete cds. // chr17 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// BC034120 // GenBank // Mus musculus vitrin, mRNA (cDNA clone MGC:31645 IMAGE:4527027), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:78583590:78646407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_181649 // RefSeq // Mus musculus G patch domain containing 11 (Gpatch11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000170759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:78835516:78848299:1 gene:ENSMUSG00000050668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC047998 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 75, mRNA (cDNA clone MGC:59610 IMAGE:6511097), complete cds. // chr17 // 76 // 89 // 19 // 25 // 0 /// BC092522 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 75, mRNA (cDNA clone MGC:106516 IMAGE:30648550), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC138310 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 75, mRNA (cDNA clone MGC:169935 IMAGE:8861330), complete cds. // chr17 // 77 // 93 // 20 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:78837856:78845983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000082836 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:78858934:78859052:1 gene:ENSMUSG00000064770 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT030697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001177402 // RefSeq // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), zeta, opposite strand (Cebpzos), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_001177403 // RefSeq // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), zeta, opposite strand (Cebpzos), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006524847 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1110001A16 gene (1110001A16Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000063817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:78916499:78921037:1 gene:ENSMUSG00000062691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000180077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:78916499:78921037:1 gene:ENSMUSG00000062691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT030701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
BC108350 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410091C18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117993 IMAGE:4220568), complete cds. // chr17 // 89 // 92 // 40 // 45 // 0 /// NM_028611 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex assembly factor 7 (Ndufaf7), mRNA. // chr17 // 88 // 88 // 43 // 49 // 1 /// ENSMUST00000024887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:78937135:78948052:1 gene:ENSMUSG00000024082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 88 // 43 // 49 // 1 /// AK010752 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410091C18 product:hypothetical S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases structure containing protein, full insert sequence. // chr17 // 80 // 80 // 39 // 49 // 1 /// XM_006524995 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex assembly factor 7 (Ndufaf7), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 71 // 71 // 35 // 49 // 1 /// BC028524 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410091C18 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3326834), complete cds. // chr17 // 53 // 53 // 26 // 49 // 1 /// BC116213 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410091C18 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40091139), complete cds. // chr17 // 35 // 35 // 17 // 49 // 1 /// BC116214 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410091C18 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40091140), complete cds. // chr17 // 35 // 35 // 17 // 49 // 1 /// BC128473 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410091C18 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40091141), complete cds. // chr17 // 35 // 35 // 17 // 49 // 1 /// BC128474 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410091C18 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40091142), complete cds. // chr17 // 35 // 35 // 17 // 49 // 1 /// GENSCAN00000034032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:78939027:78951419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 28 // 28 // 0
NM_027455 // RefSeq // Mus musculus glutaminyl-peptide cyclotransferase (glutaminyl cyclase) (Qpct), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000040789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:79051906:79090243:1 gene:ENSMUSG00000024084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC020023 // GenBank // Mus musculus glutaminyl-peptide cyclotransferase (glutaminyl cyclase), mRNA (cDNA clone MGC:27858 IMAGE:3491756), complete cds. // chr17 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// BC151027 // GenBank // Mus musculus glutaminyl-peptide cyclotransferase (glutaminyl cyclase), mRNA (cDNA clone MGC:183940 IMAGE:9087940), complete cds. // chr17 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// BC151029 // GenBank // Mus musculus glutaminyl-peptide cyclotransferase (glutaminyl cyclase), mRNA (cDNA clone MGC:183942 IMAGE:9087942), complete cds. // chr17 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:79070679:79089768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0
XM_006524505 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus regulator of microtubule dynamics 2 (Rmdn2), transcript variant X11, mRNA. // chr17 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000086570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:79626677:79628681:1 gene:ENSMUSG00000066944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK014877 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921513D11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006524495 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus regulator of microtubule dynamics 2 (Rmdn2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// XM_006524496 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus regulator of microtubule dynamics 2 (Rmdn2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// XM_006524498 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus regulator of microtubule dynamics 2 (Rmdn2), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// XM_006524499 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus regulator of microtubule dynamics 2 (Rmdn2), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// XM_006524503 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus regulator of microtubule dynamics 2 (Rmdn2), transcript variant X9, mRNA. // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// XM_006524504 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus regulator of microtubule dynamics 2 (Rmdn2), transcript variant X10, mRNA. // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000045567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:79621360:79708505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
AK076360 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732466E16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
NM_176963 // RefSeq // Mus musculus galactose mutarotase (Galm), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006524390 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus galactose mutarotase (Galm), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000039205 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:80127471:80185101:1 gene:ENSMUSG00000035473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000133955 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:80145152:80183528:1 gene:ENSMUSG00000035473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// BC028818 // GenBank // Mus musculus galactose mutarotase, mRNA (cDNA clone MGC:36399 IMAGE:5135570), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK085153 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430045C01 product:weakly similar to IBD1 PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000033542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:80127716:80168279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_026351 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 39D (Ttc39d), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:80215914:80217935:1 gene:ENSMUSG00000046196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134652 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:80207460:80217936:1 gene:ENSMUSG00000046196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC118946 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 39D, mRNA (cDNA clone MGC:143710 IMAGE:40092366), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC118947 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 39D, mRNA (cDNA clone MGC:143711 IMAGE:40092368), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:80211504:80220483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_026053 // RefSeq // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 6 (Gemin6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000069486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:80224441:80228497:1 gene:ENSMUSG00000055760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK018385 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430406F20 product:GEMIN6 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// BC025157 // GenBank // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:36701 IMAGE:3670793), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:80225640:80228113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_194269 // RefSeq // Mus musculus MORN repeat containing 2 (Morn2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:80290212:80297473:1 gene:ENSMUSG00000045257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY367765 // GenBank // Mus musculus protein containing single MORN motif in testis (Mopt) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089486 // GenBank // Mus musculus MORN repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:107136 IMAGE:6742814), complete cds. // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001145452 // RefSeq // Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 33 (Arhgef33), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524509 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 33 (Arhgef33), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524513 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 33 (Arhgef33), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524514 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 33 (Arhgef33), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524517 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 33 (Arhgef33), transcript variant X9, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524522 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 33 (Arhgef33), transcript variant X14, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000068175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:80307407:80388688:1 gene:ENSMUSG00000054901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK053944 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230005B06 product:hypothetical Dbl domain (dbl/cdc24 rhoGEF family) containing protein, full insert sequence. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:80346866:80381481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
AK082127 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230011D21 product:hypothetical TonB-dependent receptor protein containing protein, full insert sequence. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_026516 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 178 (Tmem178), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:80944632:81001816:1 gene:ENSMUSG00000024245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:80944689:80987157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSMUST00000097278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:82539258:82539545:1 gene:ENSMUSG00000073371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:82539258:82539545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_134117 // RefSeq // Mus musculus protein kinase domain containing, cytoplasmic (Pkdcc), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000168118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:83221035:83224575:1 gene:ENSMUSG00000024247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000170758 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:83220102:83224264:1 gene:ENSMUSG00000024247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000170794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:83215292:83225070:1 gene:ENSMUSG00000024247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB381893 // GenBank // Mus musculus Vlk mRNA for vertebrate lonesome kinase, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB436780 // GenBank // Mus musculus Pkdcc mRNA for putative protein kinase, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC086639 // GenBank // Mus musculus protein kinase domain containing, cytoplasmic, mRNA (cDNA clone MGC:99930 IMAGE:6828629), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:83215466:83224277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
XM_006523511 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus metastasis associated 3 (Mta3), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT030879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_177606 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 2 (Plekhh2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000047206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:84511895:84622142:1 gene:ENSMUSG00000040852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC021518 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5352356), partial cds. // chr17 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// BC125583 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 2, mRNA (cDNA clone MGC:159286 IMAGE:40130098), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC137804 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 2, mRNA (cDNA clone MGC:169428 IMAGE:8860823), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:84521703:84655363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000083385 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:84624402:84624510:1 gene:ENSMUSG00000065319 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT030918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_172256 // RefSeq // Mus musculus dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 (Dync2li1), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000025101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:84626496:84655558:1 gene:ENSMUSG00000024253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AK160259 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933404O11 product:Dynein 2 light intermediate chain homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 91 // 88 // 32 // 35 // 0 /// BC030450 // GenBank // Mus musculus dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:40646 IMAGE:5400492), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC039070 // GenBank // Mus musculus dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:7211 IMAGE:3482503), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000010006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:84521703:84655363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1
NM_009205 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 3, member 1 (Slc3a1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000024944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:85028347:85064243:1 gene:ENSMUSG00000024131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC013441 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 3, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:18365 IMAGE:4222972), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D88533 // GenBank // Mus musculus mRNA for NBAT, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:85028432:85064079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_028576 // RefSeq // Mus musculus calmodulin-lysine N-methyltransferase (Camkmt), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006524992 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calmodulin-lysine N-methyltransferase (Camkmt), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XR_385373 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calmodulin-lysine N-methyltransferase (Camkmt), transcript variant X4, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000095188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:85090726:85458139:1 gene:ENSMUSG00000071037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK147783 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270036N05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 81 // 90 // 21 // 26 // 0 /// BC138272 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700106N22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169896 IMAGE:8861291), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC138273 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700106N22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169897 IMAGE:8861292), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006524993 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calmodulin-lysine N-methyltransferase (Camkmt), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// XM_006524994 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calmodulin-lysine N-methyltransferase (Camkmt), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// AK007130 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700106N22 product:similar to CDNA: FLJ23451 FIS, CLONE HSI06456 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
D83144 // GenBank // Mus musculus mRNA for Six3a, complete cds. // chr17 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// X90871 // GenBank // M.musculus mRNA for SIX3 protein. // chr17 // 88 // 69 // 21 // 24 // 0 /// NM_011381 // RefSeq // Mus musculus sine oculis-related homeobox 3 (Six3), mRNA. // chr17 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// ENSMUST00000162695 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:85621031:85629302:1 gene:ENSMUSG00000038805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// ENSMUST00000175898 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:85613608:85625222:1 gene:ENSMUSG00000038805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// ENSMUST00000176081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:85620834:85626191:1 gene:ENSMUSG00000038805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// BC094426 // GenBank // Mus musculus sine oculis-related homeobox 3 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:117122 IMAGE:6855602), complete cds. // chr17 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// BC098096 // GenBank // Mus musculus sine oculis-related homeobox 3 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:106488 IMAGE:6402835), complete cds. // chr17 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// GENSCAN00000033375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:85554357:85623919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1
NM_011104 // RefSeq // Mus musculus protein kinase C, epsilon (Prkce), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006523832 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein kinase C, epsilon (Prkce), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000097274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:86168174:86655415:1 gene:ENSMUSG00000045038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000097275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:86167785:86657919:1 gene:ENSMUSG00000045038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000142003 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:86167819:86177505:1 gene:ENSMUSG00000045038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// AF028009 // GenBank // Mus musculus protein kinase C epsilon (Pkcea) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// AF325507 // GenBank // Mus musculus protein kinase C epsilon mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 72 // 27 // 28 // 0 /// AK042994 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730046G04 product:protein kinase C, epsilon, full insert sequence. // chr17 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000016851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:86545637:86654687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// GENSCAN00000016861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:86471637:86500066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1
AY512937 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:H4074F06 unknown mRNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_010137 // RefSeq // Mus musculus endothelial PAS domain protein 1 (Epas1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000024954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:86753907:86833410:1 gene:ENSMUSG00000024140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF045160 // GenBank // Mus musculus hypoxia-inducible factor 1 alpha related factor mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 66 // 22 // 25 // 0 /// AK158430 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930116B21 product:endothelial PAS domain protein 1, full insert sequence. // chr17 // 92 // 95 // 33 // 36 // 0 /// BC057870 // GenBank // Mus musculus endothelial PAS domain protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:68181 IMAGE:5032291), complete cds. // chr17 // 94 // 89 // 32 // 34 // 0 /// D89787 // GenBank // Mus musculus mRNA for mHLF, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// U81983 // GenBank // Mus musculus endothelial PAS domain protein 1 (EPAS1) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 84 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:86787504:86831102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0
NM_001277980 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 247 (Tmem247), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_030104 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 247 (Tmem247), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000042172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:86917348:86922366:1 gene:ENSMUSG00000037689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:86906444:86937983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_145491 // RefSeq // Mus musculus ras homolog gene family, member Q (Rhoq), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:86963082:87000069:1 gene:ENSMUSG00000024143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:86963292:86995098:1 gene:ENSMUSG00000024143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AB060650 // GenBank // Mus musculus mRNA for small GTPase Tc10, complete cds. // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC048813 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member Q, mRNA (cDNA clone MGC:54926 IMAGE:2582017), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC056363 // GenBank // Mus musculus ras homolog gene family, member Q, mRNA (cDNA clone MGC:73481 IMAGE:6821501), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:86994559:87014354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_019936 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich PDZ-binding protein (Cript), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000024959 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:87025550:87035810:1 gene:ENSMUSG00000024146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000160269 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:87025611:87035472:1 gene:ENSMUSG00000024146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// AF151637 // GenBank // Mus musculus CRIPT protein mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC002258 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich PDZ-binding protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:3494018), partial cds. // chr17 // 84 // 83 // 16 // 19 // 0 /// BC023013 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich PDZ-binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:35900 IMAGE:5369938), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000160824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:87025610:87028242:1 gene:ENSMUSG00000024146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// NONMMUT031025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_019654 // RefSeq // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 5 (Socs5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524675 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus suppressor of cytokine signaling 5 (Socs5), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000041369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:87107679:87137583:1 gene:ENSMUSG00000037104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK172997 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0671 protein. // chr17 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC053015 // GenBank // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 5, mRNA (cDNA clone MGC:62212 IMAGE:5702321), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028639 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 7 (Ttc7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000041110 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:87282886:87381769:1 gene:ENSMUSG00000036918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000127970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:87309332:87330077:1 gene:ENSMUSG00000036918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 80 // 24 // 8 // 10 // 0 /// ENSMUST00000144204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:87282951:87361921:1 gene:ENSMUSG00000036918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000154255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:87292811:87380086:1 gene:ENSMUSG00000036918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// BC042512 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 7, mRNA (cDNA clone MGC:28640 IMAGE:4223801), complete cds. // chr17 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// XM_006524202 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 7 (Ttc7), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 76 // 76 // 32 // 42 // 1 /// ENSMUST00000125875 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:87282905:87371904:1 gene:ENSMUSG00000036918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 95 // 40 // 42 // 1 /// AK153704 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630052N03 product:tetratricopeptide repeat domain 7, full insert sequence. // chr17 // 95 // 95 // 40 // 42 // 1 /// GENSCAN00000018154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:87282650:87380070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0
NM_008532 // RefSeq // Mus musculus epithelial cell adhesion molecule (Epcam), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000053577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:87635979:87651106:1 gene:ENSMUSG00000045394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC005618 // GenBank // Mus musculus epithelial cell adhesion molecule, mRNA (cDNA clone MGC:11680 IMAGE:3711069), complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC094465 // GenBank // Mus musculus epithelial cell adhesion molecule, mRNA (cDNA clone MGC:102555 IMAGE:4948935), complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// M76124 // GenBank // Mus musculus EGP314 precursor mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:87636819:87709248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_008628 // RefSeq // Mus musculus mutS homolog 2 (E. coli) (Msh2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000024967 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:87672330:87723713:1 gene:ENSMUSG00000024151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC047117 // GenBank // Mus musculus mutS homolog 2 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:51383 IMAGE:4951173), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC050897 // GenBank // Mus musculus mutS homolog 2 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:63256 IMAGE:6401835), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U21011 // GenBank // Mus musculus MutS homolog 2 (mMSH2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000173097 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:87672561:87709408:1 gene:ENSMUSG00000024151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// AK051960 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230024H20 product:mutS homolog 2 (E. coli), full insert sequence. // chr17 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// ENSMUST00000172855 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:87672609:87685566:1 gene:ENSMUSG00000024151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000018156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:87717469:87723504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000018150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:87636819:87709248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
ENSMUST00000179601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:87920977:87921393:1 gene:ENSMUSG00000093922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000018146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:87827757:87921393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000018138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:87948147:87950421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
NM_010830 // RefSeq // Mus musculus mutS homolog 6 (E. coli) (Msh6), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000005503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:87975050:87990883:1 gene:ENSMUSG00000005370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC051160 // GenBank // Mus musculus mutS homolog 6 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:56735 IMAGE:4953238), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC051634 // GenBank // Mus musculus mutS homolog 6 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:59332 IMAGE:6518577), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// U42190 // GenBank // Mus musculus G/T-mismatch binding protein (Gtmbp) mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 91 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:87988363:87990634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000018151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:87980231:87986981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0
NM_001190356 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4832 (Gm4832), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000182679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:88130715:88131113:1 gene:ENSMUSG00000058869 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000183295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:88125512:88131006:1 gene:ENSMUSG00000058869 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000004807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:88123116:88131116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_028658 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 21 (Ppp1r21), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000038551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:88530118:88588367:1 gene:ENSMUSG00000034709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AK003781 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110018J12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 24 // 11 // 11 // 0 /// BC137673 // GenBank // Mus musculus KLRAQ motif containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:169297 IMAGE:8860692), complete cds. // chr17 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// BC106118 // GenBank // Mus musculus KLRAQ motif containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5032173), complete cds. // chr17 // 24 // 24 // 11 // 45 // 1 /// ENSMUST00000185400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:88578730:88588365:1 gene:ENSMUSG00000034709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 24 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000004762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:88545333:88579027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 32 // 32 // 0
NM_029858 // RefSeq // Mus musculus stonin 1 (Ston1), mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006525111 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus stonin 1 (Ston1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006525112 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus stonin 1 (Ston1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000064035 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:88626555:88648696:1 gene:ENSMUSG00000033855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000150023 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:88626609:88662586:1 gene:ENSMUSG00000033855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153613 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:88597696:88645322:1 gene:ENSMUSG00000033855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000163588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:88626555:88645724:1 gene:ENSMUSG00000033855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK029878 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931420E09 product:similar to STONIN 1 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK029959 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932411D08 product:similar to STONIN 1 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT031093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000004817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:88626670:88714989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_023630 // RefSeq // Mus musculus general transcription factor IIA, 1-like (Gtf2a1l), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000024970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:88668660:88715152:1 gene:ENSMUSG00000024154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000161481 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:88668696:88694586:1 gene:ENSMUSG00000024154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// AF250835 // GenBank // Mus musculus TFIIA-alpha/beta-like factor mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC050756 // GenBank // Mus musculus general transcription factor IIA, 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:58209 IMAGE:6741860), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:88626670:88714989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0
AK160680 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3010002J08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC147235 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9056278. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC147236 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9056282. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT031117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000095183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:91088493:91089391:1 gene:ENSMUSG00000071033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK006863 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700062G21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_026086 // RefSeq // Mus musculus N-acetylneuraminic acid phosphatase (Nanp), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000057074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:91236787:91238116:1 gene:ENSMUSG00000043346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000066640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:151029685:151039398:-1 gene:ENSMUSG00000053916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC018527 // GenBank // Mus musculus N-acetylneuraminic acid phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:27982 IMAGE:3596532), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083086 // GenBank // Mus musculus N-acetylneuraminic acid phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:103377 IMAGE:6515732), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:91236811:91237557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000055900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:151030260:151039326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000119343 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:91667079:91668305:1 gene:ENSMUSG00000081412 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:91583529:91667283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT031140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001025309 // RefSeq // Mus musculus praja 2, RING-H2 motif containing (Pja2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_144859 // RefSeq // Mus musculus praja 2, RING-H2 motif containing (Pja2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000024888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:64281006:64313031:-1 gene:ENSMUSG00000024083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000024889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:64281006:64313031:-1 gene:ENSMUSG00000024083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172733 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:64281020:64331865:-1 gene:ENSMUSG00000024083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000172818 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:64281005:64331916:-1 gene:ENSMUSG00000024083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF493070 // GenBank // Mus musculus praja2 (Pja2) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC017130 // GenBank // Mus musculus praja 2, RING-H2 motif containing, mRNA (cDNA clone MGC:27629 IMAGE:4506259), complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AK164025 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430017L21 product:praja 2, RING-H2 motif containing, full insert sequence. // chr17 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000036619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:64269654:64334142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_009625 // RefSeq // Mus musculus adenylate cyclase activating polypeptide 1 (Adcyap1), mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006523499 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenylate cyclase activating polypeptide 1 (Adcyap1), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000064775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:93199422:93205485:1 gene:ENSMUSG00000024256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AK142765 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930004O10 product:adenylate cyclase activating polypeptide 1, full insert sequence. // chr17 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// BC057344 // GenBank // Mus musculus adenylate cyclase activating polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:67059 IMAGE:6829765), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// D14716 // GenBank // Mus musculus mRNA for pituitary adenylate cyclase activating polypeptide. // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:93200770:93204961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
ENSMUST00000181769 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:17:94834906:94836642:1 gene:ENSMUSG00000097460 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AK157290 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830209M14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// KnowTID_00003564 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// KnowTID_00003565 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// KnowTID_00003566 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT031182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT031183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT031184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_003519 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylserine decarboxylase, pseudogene 2 (Pisd-ps2), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000142526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:3076578:3084082:-1 gene:ENSMUSG00000023795 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT027940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// NONMMUT027941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
NM_146074 // RefSeq // Mus musculus transcription factor B1, mitochondrial (Tfb1m), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000041003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:3519263:3557713:-1 gene:ENSMUSG00000036983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF508971 // GenBank // Mus musculus transcription factor b1 mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC032930 // GenBank // Mus musculus transcription factor B1, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:41387 IMAGE:1382837), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_385130 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor B1, mitochondrial (Tfb1m), transcript variant X2, misc_RNA. // chr17 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// XM_006523220 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor B1, mitochondrial (Tfb1m), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// AK028212 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810005G14 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000047933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:3534859:3564414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT027979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_198958 // RefSeq // Mus musculus NADPH oxidase 3 (Nox3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000115800 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:3635240:3696261:-1 gene:ENSMUSG00000023802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY182377 // GenBank // Mus musculus NADPH oxidase 3 (Nox3) mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// AY573240 // GenBank // Mus musculus NADPH oxidase 3 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC106862 // GenBank // Mus musculus NADPH oxidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:124289 IMAGE:40047310), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000047924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:3607238:3752055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NR_045764 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930470H14 gene (4930470H14Rik), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003572 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT027986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:4044716:4114225:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_027457 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 242 (Tmem242), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000005053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:5410870:5440243:-1 gene:ENSMUSG00000004945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK003559 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110008A10 product:similar to UNCHARACTERIZED BONE MARROW PROTEIN BM033 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC019420 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5730437N04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30293 IMAGE:5053733), complete cds. // chr17 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// XM_006523253 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 242 (Tmem242), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// AK017626 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730437N04 product:RIKEN cDNA 5730437N04 gene, full insert sequence. // chr17 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// ENSMUST00000188282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:5432295:5440259:-1 gene:ENSMUSG00000004945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000185896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:5433025:5440256:-1 gene:ENSMUSG00000004945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_175349 // RefSeq // Mus musculus lactate dehydrogenase A-like 6B (Ldhal6b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY280363 // GenBank // Mus musculus L-lactate dehydrogenase A-like protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061193 // GenBank // Mus musculus lactate dehydrogenase A-like 6B, mRNA (cDNA clone MGC:74334 IMAGE:6704800), complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000189788 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:5417323:5418767:-1 gene:ENSMUSG00000101959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:5411369:5418657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NR_073378 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 8363 (Gm8363), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
AK048886 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230078O04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001111017 // RefSeq // Mus musculus serine active site containing 1 (Serac1), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NM_177311 // RefSeq // Mus musculus serine active site containing 1 (Serac1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000024570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:6044066:6079727:-1 gene:ENSMUSG00000015659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000097432 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:6042196:6079741:-1 gene:ENSMUSG00000015659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000139542 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:6064949:6079733:-1 gene:ENSMUSG00000015659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 37 // 17 // 17 // 0 /// BC119594 // GenBank // Mus musculus serine active site containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:141377 IMAGE:40059066), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// BC119595 // GenBank // Mus musculus serine active site containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:141378 IMAGE:40059071), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000048634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:6044114:6070807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0
NM_007991 // RefSeq // Mus musculus fibrillarin (Fbl), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000042405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:28169748:28179269:1 gene:ENSMUSG00000046865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000061073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:6121208:6122164:-1 gene:ENSMUSG00000051639 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC003813 // GenBank // Mus musculus fibrillarin, mRNA (cDNA clone MGC:6139 IMAGE:3487295), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC092274 // GenBank // Mus musculus fibrillarin, mRNA (cDNA clone MGC:102608 IMAGE:4196645), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:28143834:28189082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:6091194:6122164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_009510 // RefSeq // Mus musculus ezrin (Ezr), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000064234 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:6738041:6782784:-1 gene:ENSMUSG00000052397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK035271 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530007N19 product:villin 2, full insert sequence. // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC048181 // GenBank // Mus musculus ezrin, mRNA (cDNA clone MGC:61281 IMAGE:6826190), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC098502 // GenBank // Mus musculus ezrin, mRNA (cDNA clone MGC:107499 IMAGE:30047137), complete cds. // chr17 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:6739303:6759598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NR_030465 // RefSeq // Mus musculus microRNA 692-1 (Mir692-1), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000102263 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:6895229:6895337:-1 gene:ENSMUSG00000076218 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// mmu-mir-692-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0004660 Mus musculus miR-692-1 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT028090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001083945 // RefSeq // Mus musculus radial spoke 3B homolog (Chlamydomonas) (Rsph3b), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_025789 // RefSeq // Mus musculus radial spoke 3A homolog (Chlamydomonas) (Rsph3a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000024572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:6904716:6948356:-1 gene:ENSMUSG00000023806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000097423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:7945653:7979824:1 gene:ENSMUSG00000073471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC150663 // GenBank // Mus musculus radial spokehead-like 2A, mRNA (cDNA clone MGC:183574 IMAGE:9087574), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC110284 // GenBank // Mus musculus radial spokehead-like 2A, mRNA (cDNA clone MGC:117841 IMAGE:5150198), complete cds. // chr17 // 68 // 100 // 21 // 31 // 0 /// XM_006544762 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus radial spoke head protein 3 homolog A-like (LOC102641297), partial mRNA. // chr17 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000007506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:7945757:7979343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:6904894:6930389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000048647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:6939660:6948578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_145968 // RefSeq // Mus musculus T cell activation Rho GTPase activating protein (Tagap), mRNA. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NM_147155 // RefSeq // Mus musculus T cell activation GTPase activating protein 1 (Tagap1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:7926000:7934897:1 gene:ENSMUSG00000033450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000063683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:6954965:6961156:-1 gene:ENSMUSG00000052031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC030886 // GenBank // Mus musculus T-cell activation Rho GTPase-activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:31468 IMAGE:4483459), complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC039780 // GenBank // Mus musculus T-cell activation Rho GTPase-activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:49714 IMAGE:4483459), complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC150728 // GenBank // Mus musculus T-cell activation Rho GTPase-activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:183639 IMAGE:9087639), complete cds. // chr17 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000007502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:7926932:7934129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:6955778:6961129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000158775 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:13120531:13120695:-1 gene:ENSMUSG00000095980 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178099 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:7374193:7374357:-1 gene:ENSMUSG00000094369 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178753 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:13399042:13399206:-1 gene:ENSMUSG00000095446 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK018056 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830477G23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003579 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:13027859:13059369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:7405846:7416462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001013832 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 31, D17Leh66b region (Gpr31b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000091648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:13051321:13052280:-1 gene:ENSMUSG00000071311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:13027859:13059369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000007520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:7429284:7433636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:7314885:7315790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001081416 // RefSeq // Mus musculus fibronectin type III domain containing 1 (Fndc1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XR_385179 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibronectin type III domain containing 1 (Fndc1), transcript variant X5, misc_RNA. // chr17 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000097424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:7746641:7761015:-1 gene:ENSMUSG00000071984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000097425 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:7738569:7804974:-1 gene:ENSMUSG00000071984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000007493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:7739215:7804974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0
NR_073374 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930506C21 gene (4930506C21Rik), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000130639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:8293366:8311052:-1 gene:ENSMUSG00000087478 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000123341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:8297509:8311080:-1 gene:ENSMUSG00000087478 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// AK043779 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830032D15 product:brain protein 44-like, full insert sequence. // chr17 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// NONMMUT028130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT028132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
ENSMUST00000184183 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:8566399:8566869:-1 gene:ENSMUSG00000099104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000184255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:8565852:8566950:-1 gene:ENSMUSG00000099104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:translated_processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:8549551:8566908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 79 // 17 // 19 // 0
NR_027881 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 6530411M01 gene (6530411M01Rik), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181618 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:17:9147719:9167836:-1 gene:ENSMUSG00000097049 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK020377 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330161K24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK035915 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630017N24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003581 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003582 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163836 // RefSeq // Mus musculus poly(A) binding protein, cytoplasmic 6 (Pabpc6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:9666497:9669704:-1 gene:ENSMUSG00000046173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:9667689:9669620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001159516 // RefSeq // Mus musculus quaking (Qk), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// NM_001159517 // RefSeq // Mus musculus quaking (Qk), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// NM_021881 // RefSeq // Mus musculus quaking (Qk), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000042296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:10210179:10319361:-1 gene:ENSMUSG00000062078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000097414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:10206471:10319361:-1 gene:ENSMUSG00000062078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// AF090402 // GenBank // Mus musculus KH domain RNA binding protein QKI-5A mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 65 // 24 // 26 // 0 /// AF090403 // GenBank // Mus musculus KH domain RNA binding protein QKI-5B mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 80 // 30 // 32 // 0 /// AF091047 // GenBank // Mus musculus KH domain RNA binding protein QKI-7B (Qki) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 83 // 31 // 33 // 0 /// BC053426 // GenBank // Mus musculus quaking, mRNA (cDNA clone MGC:59277 IMAGE:6335004), complete cds. // chr17 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// BC056346 // GenBank // Mus musculus quaking, mRNA (cDNA clone MGC:73918 IMAGE:5705171), complete cds. // chr17 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// U44940 // GenBank // Mus musculus quaking type I (QKI) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:10195670:10294096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// AF090404 // GenBank // Mus musculus KH domain RNA binding protein QKI-6 mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 75 // 28 // 30 // 0
ENSMUST00000053066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:10319945:10320229:-1 gene:ENSMUSG00000044407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// U44941 // GenBank // Mus musculus quaking type II (QKII) mRNA, complete cds. // chr17 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
ENSMUST00000053066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:10319945:10320229:-1 gene:ENSMUSG00000044407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// U44941 // GenBank // Mus musculus quaking type II (QKII) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_027032 // RefSeq // Mus musculus PARK2 co-regulated (Pacrg), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006523353 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PARK2 co-regulated (Pacrg), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000041463 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:10403012:10840311:-1 gene:ENSMUSG00000037196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160599 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:10576478:10631067:-1 gene:ENSMUSG00000037196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC120740 // GenBank // Mus musculus PARK2 co-regulated, mRNA (cDNA clone MGC:155977 IMAGE:40129663), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
AK149677 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530009C21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011948 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 (Map3k4), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006523331 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 (Map3k4), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000089058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:12227621:12318660:-1 gene:ENSMUSG00000014426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AK133605 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330413N05 product:mitogen activated protein kinase kinase kinase 4, full insert sequence. // chr17 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC058719 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:77966 IMAGE:5705378), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// U85607 // GenBank // Mus musculus MEK kinase 4a (MEKK4a) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U85608 // GenBank // Mus musculus MEK kinase 4b (MEKK4b) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12228100:12328855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_011395 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 3 (Slc22a3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000024595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:12419972:12507704:-1 gene:ENSMUSG00000023828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF078750 // GenBank // Mus musculus organic cation transporter 3 (Slc22a3) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF082566 // GenBank // Mus musculus organic cation transporter (Oct3) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC137661 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169285 IMAGE:8860680), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC137662 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169286 IMAGE:8860681), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12419530:12464533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 53 // 19 // 19 // 0
NM_009202 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 1 (Slc22a1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000024596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:12648874:12675838:-1 gene:ENSMUSG00000023829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF010259 // GenBank // Mus musculus organic cation transporter (mOCT1/Slc22a1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC021651 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:14019 IMAGE:4211979), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U38652 // GenBank // Mus musculus transmembrane transporter (Lx1) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12633280:12675659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1
NM_010515 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor 2 receptor (Igf2r), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000024599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:12682406:12769664:-1 gene:ENSMUSG00000023830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC150817 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor 2 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:183728 IMAGE:9087728), complete cds. // chr17 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// BC171973 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor 2 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:198678 IMAGE:9054259), complete cds. // chr17 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// U04710 // GenBank // Mus musculus domesticus C57 Black 6 x CBA cation-independent mannose 6-phosphate/insulin-like growth factor II receptor precursor mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000029768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12683710:12769533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0
NM_001034866 // RefSeq // Mus musculus poly(A)-specific ribonuclease (PARN)-like domain containing 1 (Pnldc1), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XM_006523326 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus poly(A)-specific ribonuclease (PARN)-like domain containing 1 (Pnldc1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// XR_385178 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus poly(A)-specific ribonuclease (PARN)-like domain containing 1 (Pnldc1), transcript variant X11, misc_RNA. // chr17 // 97 // 82 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000163394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:12888902:12910000:-1 gene:ENSMUSG00000073460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AK139523 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020003A13 product:weakly similar to Hypothetical protein FLJ35820 (deadenylation nuclease) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 88 // 68 // 23 // 26 // 0 /// BC158033 // GenBank // Mus musculus poly(A)-specific ribonuclease (PARN)-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:189836 IMAGE:9007336), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XR_385172 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus poly(A)-specific ribonuclease (PARN)-like domain containing 1 (Pnldc1), transcript variant X5, misc_RNA. // chr17 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// XR_385173 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus poly(A)-specific ribonuclease (PARN)-like domain containing 1 (Pnldc1), transcript variant X6, misc_RNA. // chr17 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// XR_385174 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus poly(A)-specific ribonuclease (PARN)-like domain containing 1 (Pnldc1), transcript variant X7, misc_RNA. // chr17 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// GENSCAN00000029774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12890275:12916751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1
NM_026310 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L18 (Mrpl18), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006523344 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L18 (Mrpl18), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000079121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:12911349:12916345:-1 gene:ENSMUSG00000057388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000162781 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:12913951:12916103:-1 gene:ENSMUSG00000057388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// AK010150 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310074G12 product:similar to MITOCHONDRIAL 39S RIBOSOMAL PROTEIN L18 (MRP-L18) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// BC011425 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L18, mRNA (cDNA clone MGC:12024 IMAGE:3603233), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AK007465 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810012N22 product:similar to MITOCHONDRIAL 39S RIBOSOMAL PROTEIN L18 (MRP-L18) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0 /// ENSMUST00000162978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:12915502:12916069:-1 gene:ENSMUSG00000057388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// NONMMUT028262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// GENSCAN00000029774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12890275:12916751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_153151 // RefSeq // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acetyltransferase 3 (Acat3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000043923 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:12923833:12940402:-1 gene:ENSMUSG00000062480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AF356876 // GenBank // Mus musculus acetyl CoA transferase-like protein mRNA, complete cds. // chr17 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// BC049873 // GenBank // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acetyltransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:54851 IMAGE:5054536), complete cds. // chr17 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// GENSCAN00000029764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12925181:12960663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
NM_009338 // RefSeq // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acetyltransferase 2 (Acat2), mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000007005 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:12942890:12960747:-1 gene:ENSMUSG00000023832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC004823 // GenBank // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acetyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:6446 IMAGE:2598868), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC012496 // GenBank // Mus musculus acetyl-Coenzyme A acetyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:21591 IMAGE:4500929), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// M35797 // GenBank // Mouse t-complex protein (Tcp-1x) mRNA, 3 end. // chr17 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000029764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:12925181:12960663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
NM_001113533 // RefSeq // Mus musculus Wilms tumour 1-associating protein (Wtap), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000007007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:12966799:12992259:-1 gene:ENSMUSG00000060475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
NM_001013832 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 31, D17Leh66b region (Gpr31b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000091648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:13051321:13052280:-1 gene:ENSMUSG00000071311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:13027859:13059369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:7429284:7433636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:7314885:7315790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000101867 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:13249895:13250000:-1 gene:ENSMUSG00000093998 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000101829 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:13534064:13534169:-1 gene:ENSMUSG00000095184 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK157087 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830201C10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_172826 // RefSeq // Mus musculus dapper homolog 2, antagonist of beta-catenin (xenopus) (Dact2), mRNA. // chr17 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524227 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dapper homolog 2, antagonist of beta-catenin (xenopus) (Dact2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000053218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:14195231:14203831:-1 gene:ENSMUSG00000048826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AK041604 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630024E20 product:weakly similar to HYPOTHETICAL 39.6 KDA PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY297430 // GenBank // Mus musculus dapper2 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC058740 // GenBank // Mus musculus dapper homolog 2, antagonist of beta-catenin (xenopus), mRNA (cDNA clone MGC:67676 IMAGE:6312377), complete cds. // chr17 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:14195663:14203729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NR_027986 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930474M22 gene (4930474M22Rik), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089489 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930474M22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107145 IMAGE:6741101), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT028331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT028332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_011581 // RefSeq // Mus musculus thrombospondin 2 (Thbs2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000170872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:14665500:14694262:-1 gene:ENSMUSG00000023885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC053702 // GenBank // Mus musculus thrombospondin 2, mRNA (cDNA clone MGC:60568 IMAGE:30062369), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// L07803 // GenBank // Mus musculus thrombospondin 2 (THBS2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AK076503 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833431D14 product:thrombospondin 2, full insert sequence. // chr17 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1 /// GENSCAN00000022304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:14655982:14691414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0
ENSMUST00000158428 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:14791941:14792004:-1 gene:ENSMUSG00000089053 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT028334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
NM_024250 // RefSeq // Mus musculus PHD finger protein 10 (Phf10), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000024657 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:14945009:14961273:-1 gene:ENSMUSG00000023883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000171526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:14945014:14946828:-1 gene:ENSMUSG00000023883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC002206 // GenBank // Mus musculus PHD finger protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:7453 IMAGE:3489870), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000168938 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:14947738:14961273:-1 gene:ENSMUSG00000023883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// ENSMUST00000167805 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:14955711:14959527:-1 gene:ENSMUSG00000023883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000022300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:14945099:14978657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT028342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000020573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:15266393:15321882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 95 // 20 // 21 // 1
AK145347 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I0C0017H17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003597 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007865 // RefSeq // Mus musculus delta-like 1 (Drosophila) (Dll1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006523586 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus delta-like 1 (Drosophila) (Dll1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000014917 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:15367354:15375976:-1 gene:ENSMUSG00000014773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000129395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:15370609:15374072:-1 gene:ENSMUSG00000014773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000152416 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:15370256:15371831:-1 gene:ENSMUSG00000014773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC057400 // GenBank // Mus musculus delta-like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:62324 IMAGE:6402691), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC065063 // GenBank // Mus musculus delta-like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:64654 IMAGE:6416191), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT028362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000020575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:15356465:15381992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_011185 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 1 (Psmb1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000014913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:15475721:15498276:-1 gene:ENSMUSG00000014769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC018351 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 1, mRNA (cDNA clone MGC:5916 IMAGE:3584538), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// U60824 // GenBank // Mus musculus proteasome beta-subunit C5 (Psmb1) mRNA, allele B, complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_008799 // RefSeq // Mus musculus programmed cell death 2 (Pdcd2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000054450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:15521575:15527301:-1 gene:ENSMUSG00000014771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:15521593:15522143:-1 gene:ENSMUSG00000014771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000137233 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:15522791:15526986:-1 gene:ENSMUSG00000014771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000139610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:15522703:15527084:-1 gene:ENSMUSG00000014771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// U10903 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein (RP-8) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000154293 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:15519208:15527281:-1 gene:ENSMUSG00000014771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// DQ906042 // GenBank // Mus musculus programmed cell death 2 alternative transcript (Pdcd2) mRNA, complete cds. // chr17 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000020557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:15521635:15533501:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000020599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:15535065:15535691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_006525198 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 28S ribosomal protein S21, mitochondrial-like (LOC102639811), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000178455 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:15566164:15566421:-1 gene:ENSMUSG00000095920 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000020597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:15566161:15566421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_178615 // RefSeq // Mus musculus repulsive guidance molecule family member B (Rgmb), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524863 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus repulsive guidance molecule family member B (Rgmb), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:15806253:15826586:-1 gene:ENSMUSG00000048027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK004310 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110059F19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 76 // 61 // 13 // 17 // 0 /// BC096024 // GenBank // Mus musculus RGM domain family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:106503 IMAGE:6821755), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC138890 // GenBank // Mus musculus RGM domain family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:170517 IMAGE:8861912), complete cds. // chr17 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC030405 // GenBank // Mus musculus RGM domain family, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5351870), partial cds. // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONMMUT028385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:15792856:15826156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSMUST00000179031 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:15837549:15837655:-1 gene:ENSMUSG00000096849 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT028388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_172827 // RefSeq // Mus musculus leucyl/cystinyl aminopeptidase (Lnpep), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000041047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:17527723:17624489:-1 gene:ENSMUSG00000023845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// AK036967 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930031F20 product:similar to VP165 [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 51 // 22 // 22 // 0 /// AK161484 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932438G09 product:Insulin-regulated membrane aminopeptidase IRAP homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// BC066791 // GenBank // Mus musculus leucyl/cystinyl aminopeptidase, mRNA (cDNA clone MGC:76435 IMAGE:30054751), complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// BC120925 // GenBank // Mus musculus leucyl/cystinyl aminopeptidase, mRNA (cDNA clone MGC:144171 IMAGE:40098425), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// BC120926 // GenBank // Mus musculus leucyl/cystinyl aminopeptidase, mRNA (cDNA clone MGC:144172 IMAGE:40098428), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// AK162332 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130217I15 product:Insulin-regulated membrane aminopeptidase IRAP homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1 /// GENSCAN00000028785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:17529696:17579349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0
NM_008215 // RefSeq // Mus musculus hyaluronan synthase1 (Has1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000003762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:17843328:17855188:-1 gene:ENSMUSG00000003665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125424 // GenBank // Mus musculus hyaluronan synthase1, mRNA (cDNA clone MGC:159127 IMAGE:40129939), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC125426 // GenBank // Mus musculus hyaluronan synthase1, mRNA (cDNA clone MGC:159129 IMAGE:40129941), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// D82964 // GenBank // Mus musculus mRNA for hyaluronan synthase, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK053726 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130302P16 product:hyaluronan synthase1, full insert sequence. // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000028778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:17843624:17855348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_013521 // RefSeq // Mus musculus formyl peptide receptor 1 (Fpr1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:17876471:17883940:-1 gene:ENSMUSG00000045551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:17876631:17877725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
GENSCAN00000028775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:17911039:17912816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_001104543 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 94 (Vmn2r94), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000172190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:18243570:18277508:-1 gene:ENSMUSG00000090417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:18243570:18290958:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
GENSCAN00000036194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:18476397:18495328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000176234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:19986868:19987798:-1 gene:ENSMUSG00000093711 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:19986868:19987796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001104566 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 104 (Vmn2r104), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000168050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20029425:20048205:-1 gene:ENSMUSG00000090315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF011417 // GenBank // Mus musculus putative pheromone receptor (VR6) mRNA, partial cds. // chr17 // 50 // 73 // 8 // 16 // 0 /// GENSCAN00000053493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:20029425:20081373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
XR_035358 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus formyl peptide receptor, related sequence 7 (Fpr-rs7), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20113210:20114226:-1 gene:ENSMUSG00000071276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:20113210:20114226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177316 // RefSeq // Mus musculus formyl peptide receptor, related sequence 6 (Fpr-rs6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20182078:20183097:-1 gene:ENSMUSG00000071275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104318 // GenBank // Mus musculus formyl peptide receptor, related sequence 6, mRNA (cDNA clone MGC:129278 IMAGE:40044730), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104319 // GenBank // Mus musculus formyl peptide receptor, related sequence 6, mRNA (cDNA clone MGC:129279 IMAGE:40044732), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:20182078:20183097:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001104567 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 105 (Vmn2r105), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20208230:20234872:-1 gene:ENSMUSG00000091670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:20208230:20330211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 79 // 73 // 15 // 19 // 0
NM_001104571 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 109 (Vmn2r109), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000167093 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20540517:20564756:-1 gene:ENSMUSG00000090572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000053491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:20506260:20564690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001104572 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 110 (Vmn2r110), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000169559 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20573829:20596259:-1 gene:ENSMUSG00000091259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000053500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:20574004:20596199:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_008040 // RefSeq // Mus musculus formyl peptide receptor, related sequence 3 (Fpr-rs3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20623846:20624877:-1 gene:ENSMUSG00000060701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:20623846:20624877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134192 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 228 (Vmn1r228), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000072410 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20776059:20777501:-1 gene:ENSMUSG00000060245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF394950 // GenBank // Mus musculus vomeronasal receptor 1 D1 (V1rd1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_134196 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 231 (Vmn1r231), mRNA. // chr17 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20889716:20890651:-1 gene:ENSMUSG00000050933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// AF394947 // GenBank // Mus musculus vomeronasal receptor 1 E5 (V1re5) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0
NM_134193 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 232 (Vmn1r232), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077001 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20913205:20914363:-1 gene:ENSMUSG00000062165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132631 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, E4, mRNA (cDNA clone MGC:164262 IMAGE:40130908), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134202 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 1 receptor 233 (Vmn1r233), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:20993727:20994686:-1 gene:ENSMUSG00000045575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115528 // GenBank // Mus musculus vomeronasal 1 receptor, F5, mRNA (cDNA clone MGC:144367 IMAGE:40101376), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:20993727:20994686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000057521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21801159:21801658:-1 gene:ENSMUSG00000049202 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK015795 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930515G13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_029281 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 820 (Zfp820), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006525066 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 820 (Zfp820), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000084141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21816876:21845759:-1 gene:ENSMUSG00000069743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC019219 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 820, mRNA (cDNA clone MGC:29393 IMAGE:5066012), complete cds. // chr17 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:21762748:21881062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
GENSCAN00000035210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:21920204:21921172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0
NM_001199048 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 942 (Zfp942), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000091879 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:21926960:21962451:-1 gene:ENSMUSG00000071267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001001491 // RefSeq // Mus musculus tropomyosin 4 (Tpm4), mRNA. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// XR_385459 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tropomyosin alpha-4 chain-like (LOC102633627), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_404661 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tropomyosin alpha-4 chain-like (LOC102641281), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000003575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:72135259:72153142:1 gene:ENSMUSG00000031799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153199 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:21967501:21968242:-1 gene:ENSMUSG00000099397 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene gene:ENSMUSG00000086869 // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:21966175:21968272:-1 gene:ENSMUSG00000086869 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC023701 // GenBank // Mus musculus tropomyosin 4, mRNA (cDNA clone MGC:38384 IMAGE:5345587), complete cds. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC023827 // GenBank // Mus musculus tropomyosin 4, mRNA (cDNA clone MGC:38326 IMAGE:5343662), complete cds. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC070421 // GenBank // Mus musculus tropomyosin 4, mRNA (cDNA clone MGC:95675 IMAGE:6403300), complete cds. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// AK206089 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y2G0103L12, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000003575, based on BLAT search. // chr17 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:21967495:21968175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000075018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:22006510:22007301:-1 gene:ENSMUSG00000040775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_177596 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 947 (Zfp947), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000080249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:22144359:22166190:-1 gene:ENSMUSG00000063383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
GENSCAN00000017656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:22184764:22186108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_176962 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 944 (Zfp944), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000115535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:22337989:22361400:-1 gene:ENSMUSG00000033972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC026813 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330416L07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4224834), complete cds. // chr17 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// BC108345 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6330416L07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117948 IMAGE:4935739), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// AK167780 // GenBank HTC // Mus musculus CRL-1722 L5178Y-R cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I730022N08 product:weakly similar to Zinc finger protein SBZF3 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
ENSMUST00000092491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:22547941:22573273:-1 gene:ENSMUSG00000095093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AB540944 // GenBank // Mus musculus domesticus V2Rp2 mRNA for vomeronasal 2 receptor p2, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000017655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:22508510:22573552:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000092491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:22547941:22573273:-1 gene:ENSMUSG00000095093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AB540944 // GenBank // Mus musculus domesticus V2Rp2 mRNA for vomeronasal 2 receptor p2, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000017655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:22508510:22573552:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NR_030709 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 16386 (Gm16386), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000181397 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:17:22784798:22817741:-1 gene:ENSMUSG00000096975 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AK144317 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630018L09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// KnowTID_00003619 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// KnowTID_00003620 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT028572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT028576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_009555 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 40 (Zfp40), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524215 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 40 (Zfp40), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000037057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23173869:23193252:-1 gene:ENSMUSG00000002617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135840 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:23177285:23193251:-1 gene:ENSMUSG00000002617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000140313 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:23174876:23178539:-1 gene:ENSMUSG00000002617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000172177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23174876:23191379:-1 gene:ENSMUSG00000002617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC061205 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 40, mRNA (cDNA clone MGC:74348 IMAGE:30248495), complete cds. // chr17 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// BC065097 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 40, mRNA (cDNA clone IMAGE:30361887), partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D10632 // GenBank // Mus musculus mRNA for zinc finger protein, complete cds, clone: NTfin12. // chr17 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000151447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23191346:23193252:-1 gene:ENSMUSG00000002617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONMMUT028590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000088673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23551073:23553488:-1 gene:ENSMUSG00000067882 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000182769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23550965:23553566:-1 gene:ENSMUSG00000067882 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006543357 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase (Casp16), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_006543358 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase (Casp16), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000045148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23552001:23561544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0
NM_001033496 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 213 (Zfp213), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23556769:23564226:-1 gene:ENSMUSG00000071256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150777 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 213, mRNA (cDNA clone MGC:183688 IMAGE:9087688), complete cds. // chr17 // 78 // 72 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23552001:23561544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_011747 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 13 (Zfp13), mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23575852:23599487:-1 gene:ENSMUSG00000062012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000115516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23575845:23586232:-1 gene:ENSMUSG00000062012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC052082 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:62500 IMAGE:6404424), complete cds. // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// FJ593171 // GenBank // Mus musculus repressor of heat-inducible transcription (Rhit) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23576057:23581240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0
NM_001033339 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 25 (Mmp25), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000024696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23629458:23645269:-1 gene:ENSMUSG00000023903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC059059 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 25, mRNA (cDNA clone IMAGE:6822049). // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC112379 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 25, mRNA (cDNA clone MGC:132821 IMAGE:40059601), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23630568:23640254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0
NM_001161746 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 12a (Tnfrsf12a), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NM_013749 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 12a (Tnfrsf12a), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000024698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23675447:23677449:-1 gene:ENSMUSG00000023905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000167059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23675447:23677449:-1 gene:ENSMUSG00000023905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF156164 // GenBank // Mus musculus type I transmembrane protein Fn14 (Fn14) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC025860 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 12a, mRNA (cDNA clone MGC:31001 IMAGE:5251646), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_020293 // RefSeq // Mus musculus claudin 9 (Cldn9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085989 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:23682584:23684018:-1 gene:ENSMUSG00000066720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058186 // GenBank // Mus musculus claudin 9, mRNA (cDNA clone MGC:68129 IMAGE:5320961), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23682996:23683619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_023824 // RefSeq // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member IV (Paqr4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006525098 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member IV (Paqr4), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000024702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23736186:23740330:-1 gene:ENSMUSG00000023909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY424293 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member IV (Paqr4) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC011185 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member IV, mRNA (cDNA clone MGC:18671 IMAGE:4196033), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC026921 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member IV, mRNA (cDNA clone MGC:25089 IMAGE:4500871), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23737566:23740025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_028416 // RefSeq // Mus musculus kringle containing transmembrane protein 2 (Kremen2), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006524983 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kringle containing transmembrane protein 2 (Kremen2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000046525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23741200:23745829:-1 gene:ENSMUSG00000040680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AJ457192 // GenBank // Mus musculus mRNA for Kremen2 protein (Kremen2 gene). // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AK013685 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900054E04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// BC120532 // GenBank // Mus musculus kringle containing transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:155769 IMAGE:40129455), complete cds. // chr17 // 93 // 80 // 26 // 28 // 0 /// BC125438 // GenBank // Mus musculus kringle containing transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:159141 IMAGE:40129953), complete cds. // chr17 // 93 // 80 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23741761:23745025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0
NM_153791 // RefSeq // Mus musculus FLYWCH-type zinc finger 1 (Flywch1), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524078 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus FLYWCH-type zinc finger 1 (Flywch1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000045517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23755432:23763786:-1 gene:ENSMUSG00000040097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000086325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23755423:23771591:-1 gene:ENSMUSG00000040097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC038031 // GenBank // Mus musculus FLYWCH-type zinc finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:47028 IMAGE:4021754), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK129391 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1552 protein. // chr17 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000045155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23747740:23765275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_029798 // RefSeq // Mus musculus FLYWCH family member 2 (Flywch2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000024704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:23776916:23786081:-1 gene:ENSMUSG00000023911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000122991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23776959:23779791:-1 gene:ENSMUSG00000023911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000127144 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23776992:23786052:-1 gene:ENSMUSG00000023911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 75 // 92 // 18 // 24 // 0 /// BC024947 // GenBank // Mus musculus FLYWCH family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:19377 IMAGE:2648415), complete cds. // chr17 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23777983:23785930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_026305 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 2 (Tceb2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000069579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23824740:23829109:-1 gene:ENSMUSG00000055839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK019181 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610311H19 product:RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION FACTOR SIII P18 SUBUNIT (0610040H15RIK PROTEIN) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC051927 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:62168 IMAGE:5684198), complete cds. // chr17 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC056983 // GenBank // Mus musculus transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:66874 IMAGE:6823854), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000045146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23816137:23844137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1
NM_001081399 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 33 (Prss33), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524450 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 33 (Prss33), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_006524451 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 33 (Prss33), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000059906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:23833360:23835743:-1 gene:ENSMUSG00000049620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000115444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23833740:23835739:-1 gene:ENSMUSG00000049620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AY262280 // GenBank // Mus musculus tryptase-6 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC101950 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 33, mRNA (cDNA clone MGC:123871 IMAGE:40044230), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC103541 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 33, mRNA (cDNA clone MGC:123870 IMAGE:40044224), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC103542 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 33, mRNA (cDNA clone MGC:123869 IMAGE:40044219), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000164140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23834668:23836056:-1 gene:ENSMUSG00000049620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000045146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23816137:23844137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_027644 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 41 (Prss41), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000024926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:23836785:23844172:-1 gene:ENSMUSG00000024114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000122936 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:23836785:23844155:-1 gene:ENSMUSG00000024114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000151797 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:23841108:23844172:-1 gene:ENSMUSG00000024114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AB049453 // GenBank // Mus musculus tessp-1 mRNA for testis serine protease-1, complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK049297 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330020F18 product:weakly similar to TESTIS SERINE PROTEASE-1 [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC150797 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931440B09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183708 IMAGE:9087708), complete cds. // chr17 // 77 // 84 // 20 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141788 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23842246:23844149:-1 gene:ENSMUSG00000024114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000045146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23816137:23844137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONMMUT028617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_001077421 // RefSeq // Mus musculus spermine binding protein-like (Sbpl), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000024939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23953085:23954919:-1 gene:ENSMUSG00000024125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC089471 // GenBank // Mus musculus spermine binding protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:107109 IMAGE:30301294), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23953245:23954863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_013921 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 30 (Prss30), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024936 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:23972126:23975230:-1 gene:ENSMUSG00000024124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23973066:23975174:-1 gene:ENSMUSG00000024124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC010970 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 8 (intestinal), mRNA (cDNA clone MGC:13754 IMAGE:4216644), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC040348 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 8 (intestinal), mRNA (cDNA clone MGC:19102 IMAGE:4206523), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006524384 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 30 (Prss30), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000135549 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:23972839:23974801:-1 gene:ENSMUSG00000024124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000151448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:23973090:23974678:-1 gene:ENSMUSG00000024124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23972613:23975180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_133731 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 22 (Prss22), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006524906 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 22 (Prss22), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000041649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:23993535:23998100:-1 gene:ENSMUSG00000045027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB010778 // GenBank // Mus musculus mBSSP-4 mRNA for brain specific serine protease-4, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC055854 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 22, mRNA (cDNA clone MGC:67911 IMAGE:4035351), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:23993838:23996778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_027008 // RefSeq // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 5 (Kctd5), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000017090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:24047734:24073485:-1 gene:ENSMUSG00000016946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC021777 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:28594 IMAGE:4215964), complete cds. // chr17 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000127755 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24056002:24068287:-1 gene:ENSMUSG00000016946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000034597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24048303:24073428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_172935 // RefSeq // Mus musculus amidohydrolase domain containing 2 (Amdhd2), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006524282 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus amidohydrolase domain containing 2 (Amdhd2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000040735 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:24155833:24163766:-1 gene:ENSMUSG00000036820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000129523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24158342:24163310:-1 gene:ENSMUSG00000036820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000130520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24155833:24163730:-1 gene:ENSMUSG00000036820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC037005 // GenBank // Mus musculus amidohydrolase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:47163 IMAGE:5101453), complete cds. // chr17 // 87 // 94 // 27 // 31 // 0 /// ENSMUST00000131766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24162220:24163693:-1 gene:ENSMUSG00000036820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// AK078259 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430547H16 product:hypothetical Metallo-dependent hydrolase, composite containing protein, full insert sequence. // chr17 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000034596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24155997:24169699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
NM_025718 // RefSeq // Mus musculus deoxyribonuclease 1-like 2 (Dnase1l2), mRNA. // chr17 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000088506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:24440087:24443105:-1 gene:ENSMUSG00000024136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119932 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24440565:24443084:-1 gene:ENSMUSG00000024136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148820 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24441719:24443104:-1 gene:ENSMUSG00000024136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 94 // 52 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000153858 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24440081:24442200:-1 gene:ENSMUSG00000024136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000154675 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:24441521:24442701:-1 gene:ENSMUSG00000024136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// AK014633 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4733401H14 product:hypothetical Deoxyribonuclease I containing protein, full insert sequence. // chr17 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// BC106188 // GenBank // Mus musculus deoxyribonuclease 1-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:118464 IMAGE:30135288), complete cds. // chr17 // 88 // 81 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24441056:24442783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_010947 // RefSeq // Mus musculus netrin 3 (Ntn3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000024931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24203848:24209387:-1 gene:ENSMUSG00000079662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF128866 // GenBank // Mus musculus netrin-3 precursor, mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// AF149094 // GenBank // Mus musculus axon guidance cue netrin-3 mRNA, complete cds. // chr17 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// AF152418 // GenBank // Mus musculus netrin-3 mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// AK031199 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930427M13 product:netrin 3, full insert sequence. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC053038 // GenBank HTC // Mus musculus netrin 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6403526), with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC094362 // GenBank // Mus musculus netrin 3, mRNA (cDNA clone MGC:106527 IMAGE:6830466), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24181241:24208986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_007634 // RefSeq // Mus musculus cyclin F (Ccnf), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000115390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24223232:24251409:-1 gene:ENSMUSG00000072082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AK162447 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430048I24 product:cyclin F, full insert sequence. // chr17 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// BC021658 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4018027, containing frame-shift errors. // chr17 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// BC037662 // GenBank // Mus musculus cyclin F, mRNA (cDNA clone MGC:46913 IMAGE:5353169), complete cds. // chr17 // 83 // 90 // 30 // 36 // 0 /// U20612 // GenBank // Mus musculus cyclin F mRNA, complete cds. // chr17 // 82 // 85 // 28 // 34 // 0 /// U20636 // GenBank // Mus musculus cyclin F mRNA, alternatively spliced form, complete cds. // chr17 // 83 // 90 // 30 // 36 // 0 /// AK031613 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030461A16 product:cyclin F, full insert sequence. // chr17 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1 /// GENSCAN00000034602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24211958:24350098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1
NM_001031621 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 17 (Abca17), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006524482 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 17 (Abca17), transcript variant X8, mRNA. // chr17 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// XM_006524483 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 17 (Abca17), transcript variant X9, mRNA. // chr17 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// XM_006524485 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 17 (Abca17), transcript variant X11, mRNA. // chr17 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000039324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24264279:24347252:-1 gene:ENSMUSG00000035435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000121226 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24264259:24351029:-1 gene:ENSMUSG00000035435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB112584 // GenBank // Mus musculus mRNA for ATP-binding cassette (ABC) transporter ABCA14, complete cds. // chr17 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24211958:24350098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0
NR_033554 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D330041H03 gene (D330041H03Rik), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181259 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24409481:24414513:-1 gene:ENSMUSG00000073437 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181760 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24409497:24414407:-1 gene:ENSMUSG00000073437 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181014 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24404649:24414429:-1 gene:ENSMUSG00000073437 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:antisense // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK038021 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130072E10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT028645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_007893 // RefSeq // Mus musculus E4F transcription factor 1 (E4f1), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XM_006523595 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus E4F transcription factor 1 (E4f1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000056032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24443792:24455311:-1 gene:ENSMUSG00000024137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AF126967 // GenBank // Mus musculus transcription factor phi AP3 mRNA, complete cds. // chr17 // 84 // 89 // 26 // 31 // 0 /// AK077014 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932409K01 product:E4F transcription factor 1, full insert sequence. // chr17 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// BC031757 // GenBank HTC // Mus musculus, E4F transcription factor 1, clone IMAGE:4504882, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC046459 // GenBank // Mus musculus E4F transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:51380 IMAGE:5322519), complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// BC071228 // GenBank // Mus musculus E4F transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:78185 IMAGE:4915902), complete cds. // chr17 // 93 // 83 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24443981:24455276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// AK157605 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830226H12 product:E4F transcription factor 1, full insert sequence. // chr17 // 90 // 86 // 27 // 30 // 0
NM_001252463 // RefSeq // Mus musculus MTOR associated protein, LST8 homolog (S. cerevisiae) (Mlst8), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_001252464 // RefSeq // Mus musculus MTOR associated protein, LST8 homolog (S. cerevisiae) (Mlst8), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_001252465 // RefSeq // Mus musculus MTOR associated protein, LST8 homolog (S. cerevisiae) (Mlst8), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NM_019988 // RefSeq // Mus musculus MTOR associated protein, LST8 homolog (S. cerevisiae) (Mlst8), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524678 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MTOR associated protein, LST8 homolog (S. cerevisiae) (Mlst8), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000070888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24473550:24479078:-1 gene:ENSMUSG00000024142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000179163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24473550:24479078:-1 gene:ENSMUSG00000024142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK048102 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130034J05 product:G BETA-LIKE PROTEIN GBL homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC015279 // GenBank // Mus musculus G protein beta subunit-like, mRNA (cDNA clone MGC:18862 IMAGE:4222934), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF237676 // GenBank // Mus musculus G beta-like protein GBL mRNA, complete cds. // chr17 // 38 // 70 // 8 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24475833:24478448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_177375 // RefSeq // Mus musculus RAB26, member RAS oncogene family (Rab26), mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000035797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:24529054:24533888:-1 gene:ENSMUSG00000079657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000061764 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:24527241:24533726:-1 gene:ENSMUSG00000079657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000176533 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:24529541:24534210:-1 gene:ENSMUSG00000079657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000177441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24529065:24533712:-1 gene:ENSMUSG00000079657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AB232621 // GenBank // Mus musculus Rab26 mRNA for Rab26, complete cds. // chr17 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// AK080607 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830020M03 product:hypothetical RAS small GTPases, Rab subfamily containing protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC094931 // GenBank // Mus musculus RAB26, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:107516 IMAGE:6436242), complete cds. // chr17 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC118018 // GenBank // Mus musculus RAB26, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:144592 IMAGE:40103722), complete cds. // chr17 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24509344:24544901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_023055 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 3 regulator 2 (Slc9a3r2), transcript variant A, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// NM_023449 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 3 regulator 2 (Slc9a3r2), transcript variant B, mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000002572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24639282:24650305:-1 gene:ENSMUSG00000002504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000019684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24639282:24644957:-1 gene:ENSMUSG00000002504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// AB026489 // GenBank // Mus musculus mRNA for mSlc9a3r2/E3karp/Sip-1/Tka-1/Octs2, complete cds. // chr17 // 90 // 91 // 38 // 42 // 0 /// BC065778 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 3 regulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:73553 IMAGE:3467172), complete cds. // chr17 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// BC070458 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 3 regulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:96425 IMAGE:30603578), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0
NM_001099664 // RefSeq // Mus musculus neuropeptide W (Npw), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000095544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:24657330:24658457:-1 gene:ENSMUSG00000071230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011522 // RefSeq // Mus musculus synaptogyrin 3 (Syngr3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000007236 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:24685092:24689955:-1 gene:ENSMUSG00000007021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF117207 // GenBank // Mus musculus synaptogyrin 3 mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BC025022 // GenBank // Mus musculus synaptogyrin 3, mRNA (cDNA clone MGC:36037 IMAGE:5369651), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24686231:24690002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0
NM_023040 // RefSeq // Mus musculus growth factor, erv1 (S. cerevisiae)-like (augmenter of liver regeneration) (Gfer), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000046839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24693191:24696156:-1 gene:ENSMUSG00000040888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB041561 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-0663, similar to Mus musculus augmenter of liver regeneration (Alr) mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF148688 // GenBank // Mus musculus augmenter of liver regeneration (Alr) mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC023941 // GenBank // Mus musculus growth factor, erv1 (S. cerevisiae)-like (augmenter of liver regeneration), mRNA (cDNA clone MGC:35826 IMAGE:5342526), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006523513 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus growth factor, erv1 (S. cerevisiae)-like (augmenter of liver regeneration) (Gfer), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000034592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24694280:24696505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_145396 // RefSeq // Mus musculus transducin (beta)-like 3 (Tbl3), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000046534 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24700458:24707631:-1 gene:ENSMUSG00000040688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000126319 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:24697949:24707660:-1 gene:ENSMUSG00000040688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000130633 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:24700886:24702507:-1 gene:ENSMUSG00000040688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 15 // 15 // 0 /// AK081572 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130044D23 product:similar to WD-REPEAT PROTEIN SAZD (TRANSDUCIN BETA-LIKE 3 PROTEIN) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC019504 // GenBank // Mus musculus transducin (beta)-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:28734 IMAGE:4460615), complete cds. // chr17 // 91 // 96 // 39 // 43 // 0 /// ENSMUST00000142362 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:24704632:24705824:-1 gene:ENSMUSG00000040688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1 /// GENSCAN00000034587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24700673:24717116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0
NM_026205 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 151 (Rnf151), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000008626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24715839:24718057:-1 gene:ENSMUSG00000008482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC049562 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 151, mRNA (cDNA clone MGC:58153 IMAGE:6774166), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_023480 // RefSeq // Mus musculus fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1 (Fahd1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24848896:24850302:-1 gene:ENSMUSG00000045316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC011330 // GenBank // Mus musculus fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3993363). // chr17 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// BC026949 // GenBank // Mus musculus fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:30285 IMAGE:4221757), complete cds. // chr17 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24849418:24850101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_011956 // RefSeq // Mus musculus nucleotide binding protein 2 (Nubp2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006524309 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleotide binding protein 2 (Nubp2), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24882611:24886350:-1 gene:ENSMUSG00000039183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF114169 // GenBank // Mus musculus nucleotide-binding protein short form (Nubp2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC012635 // GenBank // Mus musculus nucleotide binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:13715 IMAGE:4038123), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24883169:24886988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_198937 // RefSeq // Mus musculus hematological and neurological expressed 1-like (Hn1l), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000024981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24942156:24960636:-1 gene:ENSMUSG00000024165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// BC057024 // GenBank // Mus musculus hematological and neurological expressed 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:67177 IMAGE:6815840), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// BC080740 // GenBank // Mus musculus hematological and neurological expressed 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:91108 IMAGE:30460749), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// AK169647 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430004B21 product:similar to Hypothetical protein FLJ13092 (HN1 like) (Hematological and neurological expressed gene 1-like protein-like protein) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// GENSCAN00000034605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24898948:24994669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_020608 // RefSeq // Mus musculus Crm, cramped-like (Drosophila) (Cramp1l), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// XM_006524703 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Crm, cramped-like (Drosophila) (Cramp1l), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000073337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:24961228:25015230:-1 gene:ENSMUSG00000038002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// AK089393 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730021B07 product:T-complex expressed gene 4, full insert sequence. // chr17 // 92 // 83 // 36 // 39 // 0 /// AK160823 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3425401L17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1 /// BC057153 // GenBank HTC // Mus musculus Crm, cramped-like (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5340112), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr17 // 93 // 57 // 25 // 27 // 0 /// NONMMUT028700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 92 // 83 // 36 // 39 // 0 /// GENSCAN00000034605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:24898948:24994669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 66 // 66 // 31 // 47 // 1 /// NONMMUT028699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1
NM_001001183 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 204 (Tmem204), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006524578 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 204 (Tmem204), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000024984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25057702:25081181:-1 gene:ENSMUSG00000024168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000153745 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:25057904:25078224:-1 gene:ENSMUSG00000024168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// AK146008 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530023L07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// BC054438 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 204, mRNA (cDNA clone MGC:62776 IMAGE:6390142), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000004035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25058229:25080543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_172529 // RefSeq // Mus musculus N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase, gamma subunit (Gnptg), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006524009 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase, gamma subunit (Gnptg), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000038973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25234317:25240116:-1 gene:ENSMUSG00000035521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000115154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25233331:25240124:-1 gene:ENSMUSG00000035521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK044021 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830081F19 product:similar to C316G12.3 (CAB56184) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY465529 // GenBank // Mus musculus M6PR domain containing protein 1 precursor (Mdcp1) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// BC023869 // GenBank HTC // Mus musculus N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase, gamma subunit, mRNA (cDNA clone IMAGE:5354030), with apparent retained intron. // chr17 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// BC055872 // GenBank // Mus musculus N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase, gamma subunit, mRNA (cDNA clone MGC:68041 IMAGE:4925332), complete cds. // chr17 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25234600:25240111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0
NM_001163270 // RefSeq // Mus musculus BAI1-associated protein 3 (Baiap3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006524642 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BAI1-associated protein 3 (Baiap3), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006524643 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BAI1-associated protein 3 (Baiap3), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000169109 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:25243522:25256281:-1 gene:ENSMUSG00000047507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000182056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25242659:25256364:-1 gene:ENSMUSG00000047507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000182435 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:25243379:25256281:-1 gene:ENSMUSG00000047507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000182825 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:25243355:25253947:-1 gene:ENSMUSG00000047507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000182903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25246013:25248127:-1 gene:ENSMUSG00000047507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AK122358 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0734 protein. // chr17 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC158116 // GenBank // Mus musculus BAI1-associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:190002 IMAGE:9088189), complete cds. // chr17 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25243638:25274340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_011665 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2I (Ube2i), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
NM_031187 // RefSeq // Mus musculus tryptase alpha/beta 1 (Tpsab1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// NR_033521 // RefSeq // Mus musculus tryptase alpha/beta 1 (Tpsab1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000146856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25343246:25345562:-1 gene:ENSMUSG00000024173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000153118 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25343245:25345527:-1 gene:ENSMUSG00000024173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK040500 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430103N06 product:mast cell protease 7, full insert sequence. // chr17 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC011328 // GenBank // Mus musculus tryptase alpha/beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:18524 IMAGE:3994444), complete cds. // chr17 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// L00653 // GenBank // Mus musculus mast cell protease-7 mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// U42405 // GenBank // Mus musculus mast cell protease 7 (mMCP-7) mRNA, truncated trancript, complete cds. // chr17 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25343419:25345367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT028728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_001163691 // RefSeq // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, T type, alpha 1H subunit (Cacna1h), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NM_021415 // RefSeq // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, T type, alpha 1H subunit (Cacna1h), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006524735 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, T type, alpha 1H subunit (Cacna1h), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25374295:25433783:-1 gene:ENSMUSG00000024112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000159048 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:25374288:25433783:-1 gene:ENSMUSG00000024112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000159610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25374285:25433783:-1 gene:ENSMUSG00000024112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000161454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25392246:25433768:-1 gene:ENSMUSG00000024112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// BC138026 // GenBank // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, T type, alpha 1H subunit, mRNA (cDNA clone MGC:169650 IMAGE:8861045), complete cds. // chr17 // 88 // 92 // 30 // 34 // 0 /// GENSCAN00000003957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25375103:25433822:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0
NM_001191008 // RefSeq // Mus musculus somatostatin receptor 5 (Sstr5), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_011425 // RefSeq // Mus musculus somatostatin receptor 5 (Sstr5), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25489875:25497288:-1 gene:ENSMUSG00000050824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25489875:25497288:-1 gene:ENSMUSG00000050824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC145943 // GenBank // Mus musculus somatostatin receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:175830 IMAGE:40131246), complete cds. // chr17 // 73 // 44 // 8 // 11 // 0
NM_011447 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 8 (Sox8), mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25565892:25570686:-1 gene:ENSMUSG00000024176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174560 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:25567988:25570214:-1 gene:ENSMUSG00000024176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// AK033460 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030211G14 product:SRY-box containing gene 8, full insert sequence. // chr17 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC043704 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:5354286), complete cds. // chr17 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC085619 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 8, mRNA (cDNA clone MGC:78314 IMAGE:6306276), complete cds. // chr17 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173447 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:25568710:25570686:-1 gene:ENSMUSG00000024176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// GENSCAN00000004012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25567333:25570522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000180010 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:25694114:25694220:-1 gene:ENSMUSG00000096451 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT028744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_145409 // RefSeq // Mus musculus CTF18, chromosome transmission fidelity factor 18 (Chtf18), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000048054 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25718926:25727419:-1 gene:ENSMUSG00000019214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000168914 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25719030:25727366:-1 gene:ENSMUSG00000019214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000170070 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:25725576:25727410:-1 gene:ENSMUSG00000019214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000170575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25718926:25727371:-1 gene:ENSMUSG00000019214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// AK052673 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630020J05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// BC024142 // GenBank // Mus musculus CTF18, chromosome transmission fidelity factor 18 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:38008 IMAGE:5149957), complete cds. // chr17 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// BC083096 // GenBank // Mus musculus CTF18, chromosome transmission fidelity factor 18 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:30459352). // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000003966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25719148:25727337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0
ENSMUST00000102319 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:25746788:25746879:-1 gene:ENSMUSG00000076274 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018857 // RefSeq // Mus musculus mesothelin (Msln), mRNA. // chr17 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// XM_006524649 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mesothelin (Msln), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000075884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25748614:25754327:-1 gene:ENSMUSG00000063011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// BC023753 // GenBank // Mus musculus mesothelin, mRNA (cDNA clone MGC:35940 IMAGE:5354484), complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// D86370 // GenBank // Mus musculus mRNA for megakaryocyte potentiating factor, complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25748654:25761971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0
NM_145410 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 173, member A (Fam173a), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000072735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25790508:25792284:-1 gene:ENSMUSG00000057411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC096050 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 173, member A, mRNA (cDNA clone MGC:106930 IMAGE:5119802), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_001285982 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 173, member A (Fam173a), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NM_001285984 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 173, member A (Fam173a), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// XM_006524018 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 173, member A (Fam173a), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// BC008155 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 173, member A, mRNA (cDNA clone MGC:6974 IMAGE:3154632), complete cds. // chr17 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// AK132031 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900011D17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000003941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25790548:25792214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_133719 // RefSeq // Mus musculus meteorin, glial cell differentiation regulator (Metrn), mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000002344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25794949:25797136:-1 gene:ENSMUSG00000002274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 55 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000165838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25794571:25797045:-1 gene:ENSMUSG00000002274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC008695 // GenBank // Mus musculus meteorin, glial cell differentiation regulator, mRNA (cDNA clone IMAGE:3707880), partial cds. // chr17 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// BC037181 // GenBank // Mus musculus meteorin, glial cell differentiation regulator, mRNA (cDNA clone IMAGE:4222131), partial cds. // chr17 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// BC062118 // GenBank // Mus musculus meteorin, glial cell differentiation regulator, mRNA (cDNA clone IMAGE:6819134), complete cds. // chr17 // 91 // 35 // 10 // 11 // 0 /// BC132177 // GenBank // Mus musculus meteorin, glial cell differentiation regulator, mRNA (cDNA clone MGC:163808 IMAGE:40130454), complete cds. // chr17 // 94 // 55 // 16 // 17 // 0 /// DQ133462 // GenBank // Mus musculus hypoxia/reoxygenation regulatory factor in astrocytes long transcript variant (Hyrac) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// DQ133463 // GenBank // Mus musculus hypoxia/reoxygenation regulatory factor in astrocytes middle transcript variant (Hyrac) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// DQ133464 // GenBank // Mus musculus hypoxia/reoxygenation regulatory factor in astrocytes short transcript variant (Hyrac) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000004065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25794975:25796962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
NM_019719 // RefSeq // Mus musculus STIP1 homology and U-Box containing protein 1 (Stub1), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000044911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25830636:25833361:-1 gene:ENSMUSG00000039615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF129086 // GenBank // Mus musculus carboxy terminus of Hsp70-interacting protein (Chip) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// AK045776 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230310J16 product:STIP1 homology and U-Box containing protein 1, full insert sequence. // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC027427 // GenBank // Mus musculus STIP1 homology and U-Box containing protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:35920 IMAGE:4191866), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC038939 // GenBank // Mus musculus STIP1 homology and U-Box containing protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:46850 IMAGE:2598940), complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25830885:25832853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// AK008742 // GenBank HTC // Mus musculus adult male stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2210017D18 product:STIP1 homology and U-Box containing protein 1, full insert sequence. // chr17 // 91 // 65 // 20 // 22 // 0
NM_144816 // RefSeq // Mus musculus rhomboid, veinlet-like 1 (Drosophila) (Rhbdl1), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000026831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25834465:25837295:-1 gene:ENSMUSG00000025735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000176751 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25834465:25841763:-1 gene:ENSMUSG00000093593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000183929 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:25834602:25837082:-1 gene:ENSMUSG00000025735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC021549 // GenBank // Mus musculus rhomboid, veinlet-like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:28800 IMAGE:4501997), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC023948 // GenBank HTC // Mus musculus mRNA similar to hypothetical protein MGC31216 (cDNA clone IMAGE:5251419). // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000184865 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:25835773:25837251:-1 gene:ENSMUSG00000025735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// GENSCAN00000004058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25834785:25844436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 79 // 79 // 27 // 34 // 1
NM_001163766 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 90 (Wdr90), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000079461 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25844771:25861475:-1 gene:ENSMUSG00000073434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000176575 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25844773:25861468:-1 gene:ENSMUSG00000073434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000176923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25845068:25861501:-1 gene:ENSMUSG00000073434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000177031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25853335:25861475:-1 gene:ENSMUSG00000073434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000177170 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:25844771:25861383:-1 gene:ENSMUSG00000073434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AK036541 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830132D09 product:RIKEN cDNA 3230401M21 gene, full insert sequence. // chr17 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC043315 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 90, mRNA (cDNA clone IMAGE:5320618), complete cds. // chr17 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000004033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25845068:25868676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_026633 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 195, member A (Fam195a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25863698:25868738:-1 gene:ENSMUSG00000025732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024332 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9530058B02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35630 IMAGE:5011430), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25845068:25868676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001100454 // RefSeq // Mus musculus WAP, FS, Ig, KU, and NTR-containing protein 1 (Wfikkn1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000095487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25877630:25880305:-1 gene:ENSMUSG00000071192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000176696 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:25878804:25880236:-1 gene:ENSMUSG00000071192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC147298 // GenBank // Mus musculus WAP, FS, Ig, KU, and NTR-containing protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:182455 IMAGE:9056349), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147299 // GenBank // Mus musculus WAP, FS, Ig, KU, and NTR-containing protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:182461 IMAGE:9056355), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC048715 // GenBank HTC // Mus musculus WAP, FS, Ig, KU, and NTR-containing protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6333959), containing frame-shift errors. // chr17 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000004050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25877690:25880043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001039038 // RefSeq // Mus musculus NHL repeat containing 4 (Nhlrc4), mRNA. // chr17 // 100 // 63 // 26 // 26 // 0 /// XR_105886 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A930017K11 gene (A930017K11Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr17 // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000085027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:25942233:25944932:-1 gene:ENSMUSG00000090113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000162431 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:25946387:25952565:-1 gene:ENSMUSG00000025727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// AK044505 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930017K11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000159540 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:25944154:25944961:-1 gene:ENSMUSG00000090113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1 /// GENSCAN00000004053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25943361:25948561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 32 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT028772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1
NM_015830 // RefSeq // Mus musculus calpain 15 (Capn15), mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// XM_006524609 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calpain 15 (Capn15), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000041641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:25959556:25985680:-1 gene:ENSMUSG00000037326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// BC058094 // GenBank // Mus musculus small optic lobes homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:66979 IMAGE:6824892), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000004006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:25959556:25994351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0
NM_011933 // RefSeq // Mus musculus 2-4-dienoyl-Coenzyme A reductase 2, peroxisomal (Decr2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000040907 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26081211:26090300:-1 gene:ENSMUSG00000036775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000150534 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:26083655:26090300:-1 gene:ENSMUSG00000036775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// AF155575 // GenBank // Mus musculus peroxisomal D2,D4-dienoyl-CoA reductase (Pdcr) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC021865 // GenBank // Mus musculus 2-4-dienoyl-Coenzyme A reductase 2, peroxisomal, mRNA (cDNA clone MGC:29979 IMAGE:5123899), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000137672 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:26087421:26090329:-1 gene:ENSMUSG00000036775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000047984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26065516:26095512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONMMUT028781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_019731 // RefSeq // Mus musculus NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4 (Nme4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26091734:26095508:-1 gene:ENSMUSG00000024177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF153451 // GenBank // Mus musculus nucleoside diphosphate kinase (nm23-M4) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF288690 // GenBank // Mus musculus nucleoside diphosphate kinase D (Nm23-M4) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC027277 // GenBank // Mus musculus non-metastatic cells 4, protein expressed in, mRNA (cDNA clone MGC:27954 IMAGE:3591383), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000150280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:26093416:26095473:-1 gene:ENSMUSG00000024177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// AK011573 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610027N22 product:expressed in non-metastatic cells 4, protein (NM23-M4)(nucleoside diphosphate kinase), full insert sequence. // chr17 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26065516:26095512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONMMUT028782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
ENSMUST00000053575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:26098872:26099257:-1 gene:ENSMUSG00000049124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NM_026506 // RefSeq // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G (Snrpg), mRNA. // chr17 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// ENSMUST00000089558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:6:86371583:86378902:1 gene:ENSMUSG00000057278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// BC027499 // GenBank // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G, mRNA (cDNA clone MGC:41014 IMAGE:1430048), complete cds. // chr17 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// BC051470 // GenBank // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G, mRNA (cDNA clone MGC:62888 IMAGE:1244608), complete cds. // chr17 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// BC094411 // GenBank // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G, mRNA (cDNA clone MGC:106960 IMAGE:1380524), complete cds. // chr17 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// GENSCAN00000047989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26098991:26099221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
NM_001081070 // RefSeq // Mus musculus protein disulfide isomerase associated 2 (Pdia2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000039113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26195999:26199087:-1 gene:ENSMUSG00000024184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000120333 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:26196025:26199062:-1 gene:ENSMUSG00000024184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000142410 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:26197494:26199008:-1 gene:ENSMUSG00000024184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000148134 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:26196006:26196916:-1 gene:ENSMUSG00000024184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000176961 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:26196226:26201143:-1 gene:ENSMUSG00000073433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC116671 // GenBank // Mus musculus protein disulfide isomerase associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:144891 IMAGE:40107256), complete cds. // chr17 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000047988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26196176:26201143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_001206335 // RefSeq // Mus musculus integrin alpha FG-GAP repeat containing 3 (Itfg3), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_207217 // RefSeq // Mus musculus integrin alpha FG-GAP repeat containing 3 (Itfg3), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000114988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26211822:26244223:-1 gene:ENSMUSG00000024187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000118487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26212713:26244141:-1 gene:ENSMUSG00000024187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000141240 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:26213544:26216234:-1 gene:ENSMUSG00000024187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// BC046457 // GenBank // Mus musculus integrin alpha FG-GAP repeat containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:51394 IMAGE:4222961), complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSMUST00000153582 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:26215207:26216958:-1 gene:ENSMUSG00000024187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000047976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26213506:26244442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000128900 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26286363:26287061:-1 gene:ENSMUSG00000084893 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26285934:26360018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
NM_013642 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 1 (Dusp1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26505590:26508519:-1 gene:ENSMUSG00000024190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:26505591:26508474:-1 gene:ENSMUSG00000024190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC006967 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6265 IMAGE:3589849), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146077 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:26506516:26507723:-1 gene:ENSMUSG00000024190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000047991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26506280:26508323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000011196 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:26554254:26561499:-1 gene:ENSMUSG00000011052 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006745 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700049J03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008700 // RefSeq // Mus musculus NK2 homeobox 5 (Nkx2-5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000015723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:26838664:26841565:-1 gene:ENSMUSG00000015579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139299 // GenBank // Mus musculus NK2 transcription factor related, locus 5 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:170926 IMAGE:8862321), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC139303 // GenBank // Mus musculus NK2 transcription factor related, locus 5 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:170930 IMAGE:8862325), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// L20300 // GenBank // Mouse homeobox-containing gene (Csx) mRNA sequence. // chr17 // 77 // 52 // 10 // 13 // 0 /// X75415 // GenBank // M.musculus mRNA for homeobox gene. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:26793366:26844883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_007523 // RefSeq // Mus musculus BCL2-antagonist/killer 1 (Bak1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025034 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27019812:27028578:-1 gene:ENSMUSG00000057789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000078691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:27019810:27029009:-1 gene:ENSMUSG00000057789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000133448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27022576:27028587:-1 gene:ENSMUSG00000057789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AF402617 // GenBank // Mus musculus N-BAK1 (Bak1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC057589 // GenBank // Mus musculus BCL2-antagonist/killer 1, mRNA (cDNA clone MGC:67129 IMAGE:6411580), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006523517 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BCL2-antagonist/killer 1 (Bak1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000053726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:27014788:27028601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT028836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000143605 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27099658:27101440:-1 gene:ENSMUSG00000086898 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK131746 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700062I23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT028837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT028838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT028839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_026063 // RefSeq // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 2 (Uqcc2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025045 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:27122663:27133916:-1 gene:ENSMUSG00000024208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000118613 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:27122670:27133629:-1 gene:ENSMUSG00000024208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000119227 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:27122670:27133902:-1 gene:ENSMUSG00000024208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// BC030629 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900010M23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41028 IMAGE:1054665), complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// XM_006524821 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase complex assembly factor 2 (Uqcc2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// ENSMUST00000145148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27122668:27133623:-1 gene:ENSMUSG00000024208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// GENSCAN00000053748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:27122713:27133877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_173027 // RefSeq // Mus musculus inositol hexaphosphate kinase 3 (Ip6k3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:27143969:27167764:-1 gene:ENSMUSG00000024210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC141263 // GenBank // Mus musculus inositol hexaphosphate kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:176224 IMAGE:9055875), complete cds. // chr17 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:27144882:27204418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1
NM_146075 // RefSeq // Mus musculus LEM domain containing 2 (Lemd2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000055117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:27189601:27204438:-1 gene:ENSMUSG00000044857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY640307 // GenBank // Mus musculus LEM2 (Lemd2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC026588 // GenBank // Mus musculus LEM domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:37253 IMAGE:4972900), complete cds. // chr17 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:27144882:27204418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1
GENSCAN00000053742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:27210135:27215758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001002895 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI413582 (AI413582), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000080190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27563771:27565708:-1 gene:ENSMUSG00000062753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000138728 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27563773:27565749:-1 gene:ENSMUSG00000062753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000154473 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:17:27563575:27565732:-1 gene:ENSMUSG00000062753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC028464 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI413582, mRNA (cDNA clone MGC:41609 IMAGE:1264774), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT028903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000053730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:27563951:27573119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 95 // 21 // 22 // 1
NM_026836 // RefSeq // Mus musculus TAF11 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:27901128:27907724:-1 gene:ENSMUSG00000024218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000114848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:27901122:27909242:-1 gene:ENSMUSG00000024218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155667 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:27901662:27903271:-1 gene:ENSMUSG00000024218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC005603 // GenBank // Mus musculus TAF11 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:6331 IMAGE:3483315), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000053731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:27901659:27907671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
AK082145 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230013L11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_397379 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638928 (LOC102638928), ncRNA. // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_025469 // RefSeq // Mus musculus colipase, pancreatic (Clps), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:28558210:28560766:-1 gene:ENSMUSG00000024225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000114785 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:28558213:28560711:-1 gene:ENSMUSG00000024225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AF414676 // GenBank // Mus musculus C57BL/6J colipase (Clps) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF414677 // GenBank // Mus musculus CAST/Ei colipase (Clps) mRNA, complete cds. // chr17 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// BC042935 // GenBank // Mus musculus colipase, pancreatic, mRNA (cDNA clone MGC:54486 IMAGE:6399295), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:28558309:28560657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0
NM_001290320 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 26, member 8 (Slc26a8), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000114764 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:28637783:28689987:-1 gene:ENSMUSG00000036196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000145224 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:28649657:28689987:-1 gene:ENSMUSG00000036196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// BC027076 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 26, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:38861 IMAGE:5361175), complete cds. // chr17 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// XM_006543369 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 26, member 8 (Slc26a8), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 79 // 79 // 34 // 43 // 1 /// GENSCAN00000016061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:28638168:28699982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0
NM_172450 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930539E08 gene (4930539E08Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000062357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:28896397:28915324:-1 gene:ENSMUSG00000048905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC117930 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930539E08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144096 IMAGE:40097681), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000016073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:28898888:28915233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NM_153390 // RefSeq // Mus musculus peroxisomal, testis specific 1 (Pxt1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000051526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:28934291:28942262:-1 gene:ENSMUSG00000045378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF486826 // GenBank // Mus musculus small testis-specific peroxisomal protein (Stepp) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC100437 // GenBank // Mus musculus peroxisomal, testis specific 1, mRNA (cDNA clone MGC:118249 IMAGE:30915792), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:28934702:28952428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENSMUST00000122683 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:28989977:28990148:-1 gene:ENSMUSG00000084632 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK153676 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630042A18 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK134938 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430522E12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003635 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT028982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153166 // RefSeq // Mus musculus copine V (Cpne5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006524249 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus copine V (Cpne5), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000024805 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:29156550:29237797:-1 gene:ENSMUSG00000024008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000126993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29157916:29184103:-1 gene:ENSMUSG00000024008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 55 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000137727 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:29188334:29237759:-1 gene:ENSMUSG00000024008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 41 // 18 // 18 // 0 /// AK079192 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530020A03 product:hypothetical C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB) structure containing protein, full insert sequence. // chr17 // 96 // 55 // 23 // 24 // 0 /// BC036971 // GenBank // Mus musculus copine V, mRNA (cDNA clone MGC:47475 IMAGE:4527212), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000013222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:29159022:29237707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0
XM_006543372 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 217-like (LOC102640495), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:29519281:29519790:-1 gene:ENSMUSG00000091614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:29519236:29519778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001162901 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 217 (Tmem217), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001162902 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 217 (Tmem217), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XM_006524919 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 217 (Tmem217), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000114683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:29526033:29549593:-1 gene:ENSMUSG00000079580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000168339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:29526033:29549593:-1 gene:ENSMUSG00000079580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC116865 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933413N12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151242 IMAGE:40126184), complete cds. // chr17 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// BC116867 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933413N12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151244 IMAGE:40126186), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC144829 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933413N12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178385 IMAGE:9053377), complete cds. // chr17 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:29526185:29526718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_001163741 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 167 (Ccdc167), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000123502 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29697575:29716985:-1 gene:ENSMUSG00000024018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000129091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:29698321:29717009:-1 gene:ENSMUSG00000024018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000131807 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29699999:29716963:-1 gene:ENSMUSG00000024018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AK085526 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630037N19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_026782 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 167 (Ccdc167), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// ENSMUST00000128751 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:29703332:29717012:-1 gene:ENSMUSG00000024018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// ENSMUST00000137079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29689378:29717009:-1 gene:ENSMUSG00000024018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000013244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:29704366:29717271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001081160 // RefSeq // Mus musculus MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 (Mdga1), mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000073556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:29827958:29887882:-1 gene:ENSMUSG00000043557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000165528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29832056:29842421:-1 gene:ENSMUSG00000043557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000167190 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:29842119:29970087:-1 gene:ENSMUSG00000043557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000168044 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:29832283:29839910:-1 gene:ENSMUSG00000043557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000171691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:29827956:29888629:-1 gene:ENSMUSG00000043557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// DQ788983 // GenBank // Mus musculus MDGA1 (Mdga1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000013221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:29832511:29870379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000158899 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:29984034:29984141:-1 gene:ENSMUSG00000089524 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT029036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001113560 // RefSeq // Mus musculus glyoxalase 1 (Glo1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_025374 // RefSeq // Mus musculus glyoxalase 1 (Glo1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000024823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:30592866:30612659:-1 gene:ENSMUSG00000024026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000120770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:35340409:35340963:1 gene:ENSMUSG00000075391 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000167624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:30592866:30612659:-1 gene:ENSMUSG00000024026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC024663 // GenBank // Mus musculus glyoxalase 1, mRNA (cDNA clone MGC:30329 IMAGE:3591599), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC081432 // GenBank // Mus musculus glyoxalase 1, mRNA (cDNA clone MGC:101960 IMAGE:6819667), complete cds. // chr17 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// DQ487161 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J glyoxalase I (Glo1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// DQ487162 // GenBank // Mus musculus strain CAST/Ei glyoxalase I (Glo1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:35340409:35340963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:30496457:30612551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
AK077156 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933414I19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK138161 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230018F22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT029065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_011575 // RefSeq // Mus musculus trefoil factor 3, intestinal (Tff3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000024827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:31125306:31129646:-1 gene:ENSMUSG00000024029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC011042 // GenBank // Mus musculus trefoil factor 3, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:14072 IMAGE:4216708), complete cds. // chr17 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// D38410 // GenBank // Mus musculus mRNA for intestinal trefoil factor, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31125483:31144248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_009363 // RefSeq // Mus musculus trefoil factor 2 (spasmolytic protein 1) (Tff2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000024826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:31141049:31144282:-1 gene:ENSMUSG00000024028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087889 // GenBank // Mus musculus trefoil factor 2 (spasmolytic protein 1), mRNA (cDNA clone MGC:107168 IMAGE:30316277), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31125483:31144248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_009362 // RefSeq // Mus musculus trefoil factor 1 (Tff1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000024831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:31161396:31165053:-1 gene:ENSMUSG00000024032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC117054 // GenBank // Mus musculus trefoil factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:151431 IMAGE:40126373), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC117056 // GenBank // Mus musculus trefoil factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:151433 IMAGE:40126375), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31157895:31165020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001163776 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 3 (Tmprss3), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_080727 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protease, serine 3 (Tmprss3), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006523637 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protease, serine 3 (Tmprss3), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000024833 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:31179272:31197749:-1 gene:ENSMUSG00000024034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000114549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:17:31179272:31198975:-1 gene:ENSMUSG00000024034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC112375 // GenBank // Mus musculus transmembrane protease, serine 3, mRNA (cDNA clone MGC:130589 IMAGE:40057032), complete cds. // chr17 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31167835:31197694:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_025290 // RefSeq // Mus musculus radial spoke head 1 homolog (Chlamydomonas) (Rsph1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000024832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:31255019:31277356:-1 gene:ENSMUSG00000024033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB006535 // GenBank // Mus musculus mRNA for meichroacidin, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC049584 // GenBank // Mus musculus radial spoke head 1 homolog (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:58207 IMAGE:6744132), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// DQ141549 // GenBank // Mus musculus strain 129S1 TSGA2 (Tsga2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// DQ141550 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c TSGA2 (Tsga2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// DQ141551 // GenBank // Mus musculus strain Swiss Webster TSGA2 (Tsga2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// DQ141555 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 TSGA2 epididymal isoform (Tsga2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// DQ141553 // GenBank // Mus musculus haplotype tw32 TSGA2 (Tsga2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 60 // 81 // 15 // 25 // 0 /// DQ141554 // GenBank // Mus musculus haplotype tw5 TSGA2 (Tsga2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 64 // 81 // 16 // 25 // 0 /// DQ141556 // GenBank // Mus musculus haplotype tw32 TSGA2 epididymal isoform (Tsga2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 56 // 81 // 14 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31255176:31309772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
AK036917 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930024G20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021322 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 4 (Wdr4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000166626 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:31503547:31512278:-1 gene:ENSMUSG00000024037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000169454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:31496126:31501293:-1 gene:ENSMUSG00000024037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000170176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:31494325:31512268:-1 gene:ENSMUSG00000024037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000171171 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:31494323:31512751:-1 gene:ENSMUSG00000024037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000172284 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:31494323:31512268:-1 gene:ENSMUSG00000024037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC039272 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 4, mRNA (cDNA clone MGC:35877 IMAGE:5027600), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000166992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:31499448:31503579:-1 gene:ENSMUSG00000024037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// ENSMUST00000167419 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:31503537:31519914:-1 gene:ENSMUSG00000024037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// GENSCAN00000023262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31496738:31512255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_010831 // RefSeq // Mus musculus salt inducible kinase 1 (Sik1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000024839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:31844248:31855792:-1 gene:ENSMUSG00000024042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK172427 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830207B15 product:SNF1-like kinase, full insert sequence. // chr17 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// U11494 // GenBank // Mus musculus protein kinase mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:31846283:31870729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_028902 // RefSeq // Mus musculus heat shock transcription factor 2 binding protein (Hsf2bp), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006525031 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heat shock transcription factor 2 binding protein (Hsf2bp), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006525034 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heat shock transcription factor 2 binding protein (Hsf2bp), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006525035 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heat shock transcription factor 2 binding protein (Hsf2bp), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525038 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heat shock transcription factor 2 binding protein (Hsf2bp), transcript variant X8, mRNA. // chr17 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// XM_006525039 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heat shock transcription factor 2 binding protein (Hsf2bp), transcript variant X9, mRNA. // chr17 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000002145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:31944769:32034508:-1 gene:ENSMUSG00000002076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000133308 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:31946328:32013403:-1 gene:ENSMUSG00000002076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000138172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:32011282:32023205:-1 gene:ENSMUSG00000002076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 80 // 31 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000029071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32002705:32033408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NR_027316 // RefSeq // Mus musculus pyridoxal (pyridoxine, vitamin B6) kinase, pseudogene (Pdxk-ps), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000159650 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:32076083:32091423:-1 gene:ENSMUSG00000002791 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000160550 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:32076549:32100286:-1 gene:ENSMUSG00000002791 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000183934 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:32078797:32107350:-1 gene:ENSMUSG00000002791 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONMMUT029118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32073811:32118354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_008716 // RefSeq // Mus musculus notch 3 (Notch3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000087723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:32120820:32166880:-1 gene:ENSMUSG00000038146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32121820:32166793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_001033163 // RefSeq // Mus musculus epoxide hydrolase 3 (Ephx3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000087721 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:32183770:32189463:-1 gene:ENSMUSG00000037577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000162117 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:32184661:32189549:-1 gene:ENSMUSG00000037577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC145797 // GenBank // Mus musculus abhydrolase domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:175684 IMAGE:40131100), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32184896:32189448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_017476 // RefSeq // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 8-like (Akap8l), mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006524625 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 8-like (Akap8l), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000050214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:32321425:32350581:-1 gene:ENSMUSG00000002625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC046801 // GenBank // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 8-like, mRNA (cDNA clone MGC:61282 IMAGE:6403966), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AB028921 // GenBank // Mus musculus mRNA for NAKAP95, complete cds. // chr17 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// BC010401 // GenBank HTC // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 8-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:4215967), with apparent retained intron. // chr17 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// BC062877 // GenBank // Mus musculus A kinase (PRKA) anchor protein 8-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:5686219). // chr17 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32305257:32350499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_172458 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 871 (Zfp871), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057501 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:32773252:32787547:-1 gene:ENSMUSG00000024298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000159086 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:32771236:32788287:-1 gene:ENSMUSG00000024298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC043671 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9030612M13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:49226 IMAGE:5040597), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001267583 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 811 (Zfp811), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_183177 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 811 (Zfp811), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:32797406:32800938:-1 gene:ENSMUSG00000055202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC052046 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 811, mRNA (cDNA clone MGC:62423 IMAGE:5685048), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001293229 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 799 (Zfp799), transcript variant 2, mRNA. // chrUn // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NM_177359 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 799 (Zfp799), transcript variant 1, mRNA. // chrUn // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:32815455:32822200:-1 gene:ENSMUSG00000095253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// AK137037 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430047C10 product:Cytosolic 5 nucleotidase, full insert sequence. // chrUn // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC062813 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 799, mRNA (cDNA clone IMAGE:583748), complete cds. // chrUn // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC096552 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 799, mRNA (cDNA clone MGC:106599 IMAGE:30618827), complete cds. // chrUn // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chrUn // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000029109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32852205:32852762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_207245 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 870 (Zfp870), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524252 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 870 (Zfp870), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006524253 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 870 (Zfp870), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000178401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:32879228:32886083:-1 gene:ENSMUSG00000095325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC066107 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC066107, mRNA (cDNA clone MGC:86136 IMAGE:30537752), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32871072:32891522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NR_033585 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 41 pseudogene (Cyp4f41-ps), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT029163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT029164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:32924777:32954456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT029167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_028543 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 763 (Zfp763), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087654 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33016863:33033402:-1 gene:ENSMUSG00000067430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056193 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700065O13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:60785 IMAGE:30011543), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009544 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4921501E09 gene (4921501E09Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:33064143:33068058:-1 gene:ENSMUSG00000023350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150955 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921501E09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183866 IMAGE:9087866), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33065100:33067826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177719 // RefSeq // Mus musculus microrchidia 2B (Morc2b), mRNA. // chrUn // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// XM_006524257 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus microrchidia 2B (Morc2b), transcript variant X1, mRNA. // chrUn // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// ENSMUST00000053896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33135588:33139683:-1 gene:ENSMUSG00000048602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// ENSMUST00000131954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33135643:33139499:-1 gene:ENSMUSG00000048602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// BC120896 // GenBank // Mus musculus microrchidia 2B, mRNA (cDNA clone MGC:141425 IMAGE:40061539), complete cds. // chrUn // 83 // 85 // 19 // 23 // 0 /// BC120897 // GenBank // Mus musculus microrchidia 2B, mRNA (cDNA clone MGC:141426 IMAGE:40061540), complete cds. // chrUn // 83 // 85 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33135728:33138796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 83 // 44 // 10 // 12 // 0
NM_207541 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 81 (Zfp81), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000054072 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33329342:33358878:-1 gene:ENSMUSG00000003929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC026640 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 81, mRNA (cDNA clone IMAGE:4985927), partial cds. // chr17 // 83 // 50 // 10 // 12 // 0 /// BC117831 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 81, mRNA (cDNA clone MGC:143755 IMAGE:40092935), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// BC117832 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 81, mRNA (cDNA clone MGC:143756 IMAGE:40092936), complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0
NM_008997 // RefSeq // Mus musculus RAB11B, member RAS oncogene family (Rab11b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000057373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33742484:33760530:-1 gene:ENSMUSG00000077450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001185182 // RefSeq // Mus musculus prefoldin subunit 6 (Pfdn6), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// NM_010385 // RefSeq // Mus musculus prefoldin subunit 6 (Pfdn6), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000025163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33938821:33940343:-1 gene:ENSMUSG00000024309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000173363 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:33938923:33940304:-1 gene:ENSMUSG00000024309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000174048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33938919:33940325:-1 gene:ENSMUSG00000024309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000174426 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:33938946:33940330:-1 gene:ENSMUSG00000024309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0 /// ENSMUST00000179418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:33938910:33940330:-1 gene:ENSMUSG00000024309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC022974 // GenBank // Mus musculus H2-K region expressed gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:36066 IMAGE:5373335), complete cds. // chr17 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// M65255 // GenBank // Mouse hydrophilic protein (KE2 wt) mRNA, complete cds. // chr17 // 67 // 100 // 14 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33938988:33940087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0
NM_019420 // RefSeq // Mus musculus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 4 (B3galt4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087543 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:33949909:33951477:-1 gene:ENSMUSG00000067370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF082504 // GenBank // Mus musculus GM1/GD1b/GA1 synthase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33950147:33951262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NR_004446 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, K region locus 2 (H2-K2), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000174250 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:33974831:33978790:-1 gene:ENSMUSG00000067203 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000041176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33974786:33978790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT029257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
ENSMUST00000172739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34024191:34024652:-1 gene:ENSMUSG00000024325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000174054 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34021084:34023932:-1 gene:ENSMUSG00000024325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// BC082771 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6334539), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// CT010219 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A0451D for gene Ring1, Ring finger protein 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 85 // 50 // 17 // 20 // 0 /// NM_009066 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 1 (Ring1), mRNA. // chr17 // 78 // 78 // 31 // 40 // 1 /// ENSMUST00000025183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34020792:34024680:-1 gene:ENSMUSG00000024325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 78 // 78 // 31 // 40 // 1 /// BC009070 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:6870 IMAGE:2651194), complete cds. // chr17 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1 /// NONMMUT029265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000015231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34021382:34028047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1
NR_029800 // RefSeq // Mus musculus microRNA 219a-1 (Mir219a-1), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000083621 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:34024983:34025092:-1 gene:ENSMUSG00000065555 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000174851 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34024966:34025070:-1 gene:ENSMUSG00000092338 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// mmu-mir-219a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000702 Mus musculus miR-219a-1 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT029266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_010381 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, class II antigen E alpha, pseudogene (H2-Ea-ps), mRNA. // chr17 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// XM_003688950 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, class II antigen E alpha, pseudogene (H2-Ea-ps), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000134042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34342933:34344643:-1 gene:ENSMUSG00000036322 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC106107 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, class II antigen E alpha, mRNA (cDNA clone MGC:117888 IMAGE:3491637), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U13648 // GenBank // Mus musculus domesticus MHC class II antigen H-2E alpha precursor (allele w29) mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// U13649 // GenBank // Mus musculus bactrianus MHC class II antigen H-2E alpha precursor (allele w301) mRNA, complete cds. // chr17 // 84 // 81 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34342933:34347547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
NM_030746 // RefSeq // Mus musculus butyrophilin-like 4 (Btnl4), mRNA. // chr17 // 86 // 43 // 19 // 22 // 0 /// NM_030747 // RefSeq // Mus musculus butyrophilin-like 6 (Btnl6), mRNA. // chr17 // 100 // 31 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000065841 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:34469042:34475937:-1 gene:ENSMUSG00000058435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 86 // 43 // 19 // 22 // 0 /// ENSMUST00000075483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:34507935:34517352:-1 gene:ENSMUSG00000092618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000058762 // chr17 // 100 // 31 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000173164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34507804:34517352:-1 gene:ENSMUSG00000092618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 31 // 16 // 16 // 0 /// NM_001039241 // RefSeq // Mus musculus butyrophilin-like (LOC100045026), mRNA. // chr17 // 25 // 63 // 8 // 32 // 0 /// BC046609 // GenBank // Mus musculus butyrophilin-like, mRNA (cDNA clone MGC:54828 IMAGE:6397872), complete cds. // chr17 // 16 // 16 // 8 // 51 // 1 /// GENSCAN00000015228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34469889:34561239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 53 // 53 // 27 // 51 // 1
NR_004051 // RefSeq // Mus musculus butyrophilin-like 5, pseudogene (Btnl5-ps), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000097346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34488070:34496004:-1 gene:ENSMUSG00000073420 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NR_004051 // RefSeq // Mus musculus butyrophilin-like 5, pseudogene (Btnl5-ps), non-coding RNA. // chr17 // 88 // 89 // 7 // 8 // 0 /// ENSMUST00000097346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34488070:34496004:-1 gene:ENSMUSG00000073420 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 88 // 89 // 7 // 8 // 0
NR_004051 // RefSeq // Mus musculus butyrophilin-like 5, pseudogene (Btnl5-ps), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000097346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34488070:34496004:-1 gene:ENSMUSG00000073420 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000173333 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:34495922:34497429:-1 gene:ENSMUSG00000073420 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000015228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34469889:34561239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT029307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000023469 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34532877:34547651:-1 gene:ENSMUSG00000061728 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34469889:34561239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
NM_019403 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 5 (Rnf5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000015622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34601091:34603690:-1 gene:ENSMUSG00000015478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000174475 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34601314:34603376:-1 gene:ENSMUSG00000015478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// AK010792 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410131O05 product:ring finger protein 5, full insert sequence. // chr17 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// BC016449 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:19320 IMAGE:4191746), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000174045 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34601782:34603661:-1 gene:ENSMUSG00000015478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// GENSCAN00000015244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34601569:34605795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT029324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT029325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
ENSMUST00000166095 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34614164:34615956:-1 gene:ENSMUSG00000015467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168353 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:34613777:34615788:-1 gene:ENSMUSG00000015467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000168709 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34614484:34627349:-1 gene:ENSMUSG00000092176 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34613447:34626987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000172970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34719813:34722252:-1 gene:ENSMUSG00000092471 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000015235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34719813:34722252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_009780 // RefSeq // Mus musculus complement component 4B (Chido blood group) (C4b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000069507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34728380:34743882:-1 gene:ENSMUSG00000073418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK128974 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3016051, highly similar to Complement C4 precursor. // chr17 // 89 // 82 // 16 // 18 // 0 /// AK172637 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830222K15 product:complement component 4 (within H-2S), full insert sequence. // chr17 // 81 // 95 // 17 // 21 // 0 /// BC067394 // GenBank // Mus musculus complement component 4B (Childo blood group), mRNA (cDNA clone MGC:76521 IMAGE:30107263), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC067409 // GenBank // Mus musculus complement component 4B (Childo blood group), mRNA (cDNA clone MGC:76719 IMAGE:30098613), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC150743 // GenBank // Mus musculus complement component 4B (Childo blood group), mRNA (cDNA clone MGC:183654 IMAGE:9087654), complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BC158005 // GenBank // Mus musculus complement component 4B (Childo blood group), mRNA (cDNA clone MGC:189813 IMAGE:9007313), complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// M11729 // GenBank // Mouse complement component C4 mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34723355:34770923:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_019442 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine kinase 19 (Stk19), mRNA. // chr17 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1 /// XM_006524640 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/threonine kinase 19 (Stk19), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 75 // 75 // 15 // 20 // 1 /// ENSMUST00000077477 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34823993:34836945:-1 gene:ENSMUSG00000061207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1 /// ENSMUST00000160993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34831769:34836927:-1 gene:ENSMUSG00000061207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 75 // 75 // 15 // 20 // 1 /// BC022681 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 19, mRNA (cDNA clone MGC:31382 IMAGE:4240347), complete cds. // chr17 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1 /// ENSMUST00000159333 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:34824082:34836465:-1 gene:ENSMUSG00000061207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// ENSMUST00000161885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34823994:34836867:-1 gene:ENSMUSG00000061207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// ENSMUST00000162055 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34824189:34832495:-1 gene:ENSMUSG00000061207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1 /// GENSCAN00000015227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34801780:34836876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
NM_009995 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 21, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp21a1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000025223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34801348:34804561:-1 gene:ENSMUSG00000024365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000173970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34802164:34803402:-1 gene:ENSMUSG00000024365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// BC127167 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 21, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:156449 IMAGE:40105690), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34801780:34836876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY613781 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/10J truncated steroid 21-hydroxylase (Cyp21a1) gene, complete cds. // chr17 // 65 // 100 // 13 // 20 // 0
NM_011413 // RefSeq // Mus musculus complement component 4A (Rodgers blood group) (C4a), mRNA. // chr17 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000015595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:34809094:34823454:-1 gene:ENSMUSG00000015451 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000159669 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34809094:34823464:-1 gene:ENSMUSG00000015451 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000160528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34811114:34823464:-1 gene:ENSMUSG00000015451 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000160679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34809092:34823464:-1 gene:ENSMUSG00000015451 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// M12384 // GenBank // Mouse MHC class III H2-Slp (haplotype a) sex-limited protein mRNA, complete cds. // chr17 // 79 // 93 // 11 // 14 // 0 /// M21576 // GenBank // Mouse MHC sex-limited protein (Slp) mRNA, complete cds. // chr17 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// BC141050 // GenBank // Mus musculus complement component 4A (Rodgers blood group), mRNA (cDNA clone MGC:176011 IMAGE:9055662), complete cds. // chr17 // 71 // 93 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000015227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34801780:34836876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_021337 // RefSeq // Mus musculus superkiller viralicidic activity 2-like (S. cerevisiae) (Skiv2l), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000046022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34839244:34850210:-1 gene:ENSMUSG00000040356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000174226 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34839228:34850210:-1 gene:ENSMUSG00000040356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000174363 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34839297:34850198:-1 gene:ENSMUSG00000040356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000174887 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34839249:34850192:-1 gene:ENSMUSG00000040356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK139051 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730004N10 product:Similar to superkiller viralicidic activity 2-like (S. cerevisiae) (Fragment) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC062925 // GenBank // Mus musculus superkiller viralicidic activity 2-like (S. cerevisiae ), mRNA (cDNA clone IMAGE:6850994), partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC065999 // GenBank // Mus musculus superkiller viralicidic activity 2-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:90095 IMAGE:5686586), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34839405:34848414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_013484 // RefSeq // Mus musculus complement component 2 (within H-2S) (C2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000025230 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34862605:34882100:-1 gene:ENSMUSG00000024371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000148431 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:34862606:34895547:-1 gene:ENSMUSG00000024371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000152417 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:34862604:34882026:-1 gene:ENSMUSG00000024371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC011086 // GenBank // Mus musculus complement component 2 (within H-2S), mRNA (cDNA clone MGC:18582 IMAGE:3992881), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M57891 // GenBank // Mouse complement component C2 mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSMUST00000146299 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:34856412:34882042:-1 gene:ENSMUSG00000092511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// ENSMUST00000129891 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:34856426:34872507:-1 gene:ENSMUSG00000092511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// GENSCAN00000015267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34856427:34881995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NR_028527 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 52 (Snord52), small nucleolar RNA. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000174464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34950238:34951244:-1 gene:ENSMUSG00000092203 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000175268 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:34950952:34951017:-1 gene:ENSMUSG00000093009 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000172531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34951594:34952462:-1 gene:ENSMUSG00000092203 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000174039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34950242:34952434:-1 gene:ENSMUSG00000092203 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000174946 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:34952013:34952075:-1 gene:ENSMUSG00000092687 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// KnowTID_00003653 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// KnowTID_00003657 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// KnowTID_00003661 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT029357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT029363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT029365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT029372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT029377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT029378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_010478 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 1B (Hspa1b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_010479 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 1A (Hspa1a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34969190:34972156:-1 gene:ENSMUSG00000091971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172753 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34956436:34959238:-1 gene:ENSMUSG00000090877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC054782 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:65617 IMAGE:6815894), complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC151107 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 1B, mRNA (cDNA clone MGC:184020 IMAGE:9088020), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC151109 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 1B, mRNA (cDNA clone MGC:184022 IMAGE:9088022), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC157921 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 1B, mRNA (cDNA clone MGC:189852 IMAGE:9007352), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34970000:34971925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34957079:34959007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010479 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 1A (Hspa1a), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000087328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:34969190:34972156:-1 gene:ENSMUSG00000091971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC054782 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:65617 IMAGE:6815894), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:34970000:34971925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000151136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:34976899:34981788:-1 gene:ENSMUSG00000073415 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK134269 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930424B19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT029383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
AK088284 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430010D09 product:VIRAL ENVELOPE PROTEIN G7E homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// BC027314 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 17, human D6S56E 5, mRNA (cDNA clone MGC:28170 IMAGE:3985942), complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// L78788 // GenBank // Mus musculus solitary LTR, complete sequence; and proviral envelope protein (G7e) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
NM_023893 // RefSeq // Mus musculus suppressor APC domain containing 1 (Sapcd1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_028258 // RefSeq // Mus musculus suppressor APC domain containing 1 (Sapcd1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000040151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35025977:35028016:-1 gene:ENSMUSG00000036185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173211 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35025959:35027659:-1 gene:ENSMUSG00000036185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000174037 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35025959:35027914:-1 gene:ENSMUSG00000036185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000174117 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35026265:35028016:-1 gene:ENSMUSG00000036185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC147772 // GenBank // Mus musculus Ng23 protein, mRNA (cDNA clone MGC:182881 IMAGE:9087495), complete cds. // chr17 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC147780 // GenBank // Mus musculus Ng23 protein, mRNA (cDNA clone MGC:182886 IMAGE:9087500), complete cds. // chr17 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_001033221 // RefSeq // Mus musculus immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif (ITIM) containing platelet receptor (G6b), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_001191012 // RefSeq // Mus musculus immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif (ITIM) containing platelet receptor (G6b), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000097337 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35062693:35066184:-1 gene:ENSMUSG00000073414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35064332:35066170:-1 gene:ENSMUSG00000073414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// GU269270 // GenBank // Mus musculus ITIM-receptor G6b-B (G6b) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// XM_006537224 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif (ITIM) containing platelet receptor (G6b), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001163192 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6F (Ly6g6f), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:35080480:35085610:-1 gene:ENSMUSG00000034923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC157908 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6F, mRNA (cDNA clone MGC:189923 IMAGE:9088110), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC172069 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6F, mRNA (cDNA clone MGC:198774 IMAGE:9054355), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35079815:35084649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_148939 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G5B (Ly6g5b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062657 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35113982:35115428:-1 gene:ENSMUSG00000043807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172854 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:35113948:35115428:-1 gene:ENSMUSG00000043807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK151902 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830042G22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC131964 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G5B, mRNA (cDNA clone MGC:163595 IMAGE:40130241), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC131966 // GenBank // Mus musculus lymphocyte antigen 6 complex, locus G5B, mRNA (cDNA clone MGC:163597 IMAGE:40130243), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC145150 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053701. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// HE864442 // GenBank // Mus musculus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 1108 (Csnk2b-Ly6g5b gene). // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35114415:35115400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_018816 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein M (Apom), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35128997:35132050:-1 gene:ENSMUSG00000024391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF207820 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein M mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC021597 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein M, mRNA (cDNA clone MGC:35948 IMAGE:5100655), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35129110:35131723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001199044 // RefSeq // Mus musculus proline-rich coiled-coil 2A (Prrc2a), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_020027 // RefSeq // Mus musculus proline-rich coiled-coil 2A (Prrc2a), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025253 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35149076:35164897:-1 gene:ENSMUSG00000024393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000174805 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:35149088:35162969:-1 gene:ENSMUSG00000024393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC053522 // GenBank // Mus musculus HLA-B associated transcript 2, mRNA (cDNA clone MGC:58891 IMAGE:6491366), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35149261:35162983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000082919 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:35162563:35162696:-1 gene:ENSMUSG00000064853 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT029419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_010734 // RefSeq // Mus musculus leukocyte specific transcript 1 (Lst1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35185095:35188439:-1 gene:ENSMUSG00000073412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF000428 // GenBank // Mus musculus B144 mRNA, m21r splice variant, complete cds. // chr17 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// BC086881 // GenBank // Mus musculus leukocyte specific transcript 1, mRNA (cDNA clone MGC:107548 IMAGE:6747449), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U72644 // GenBank // Mus musculus lymphocyte specific transcript (LST) mRNA, complete cds. // chr17 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// AF000427 // GenBank // Mus musculus B144 mRNA, m17r splice variant, complete cds. // chr17 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
NM_001278601 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor (Tnf), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_013693 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor (Tnf), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025263 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35199381:35202007:-1 gene:ENSMUSG00000024401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167924 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:35199507:35202004:-1 gene:ENSMUSG00000024401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC117057 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor, mRNA (cDNA clone MGC:151434 IMAGE:40126376), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC137720 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor, mRNA (cDNA clone MGC:169344 IMAGE:8860739), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// M11731 // GenBank // Mouse tumor necrosis factor (MuTNF) mRNA, complete cds. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// M13049 // GenBank // Mouse tumor necrosis factor (TNF) mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35200145:35201840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_010735 // RefSeq // Mus musculus lymphotoxin A (Lta), mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006523731 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lymphotoxin A (Lta), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000025266 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35203165:35205351:-1 gene:ENSMUSG00000024402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC099464 // GenBank // Mus musculus lymphotoxin A, mRNA (cDNA clone MGC:117668 IMAGE:30846267), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// M16819 // GenBank // Mouse tumor necrosis factor-beta mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35203737:35204653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0
NM_010909 // RefSeq // Mus musculus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B cells inhibitor like 1 (Nfkbil1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35220175:35235792:-1 gene:ENSMUSG00000042419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF095902 // GenBank // Mus musculus IkappaBL protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC013269 // GenBank // Mus musculus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:13717 IMAGE:4188066), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35220390:35222359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
NM_001163763 // RefSeq // Mus musculus transcription factor 19 (Tcf19), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001163764 // RefSeq // Mus musculus transcription factor 19 (Tcf19), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NM_025674 // RefSeq // Mus musculus transcription factor 19 (Tcf19), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159009 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35514654:35516820:-1 gene:ENSMUSG00000050410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000160885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35512737:35516785:-1 gene:ENSMUSG00000050410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35512734:35516824:-1 gene:ENSMUSG00000050410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162683 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35514818:35516547:-1 gene:ENSMUSG00000050410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC004617 // GenBank // Mus musculus transcription factor 19, mRNA (cDNA clone MGC:6711 IMAGE:3585301), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35514470:35516115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001244654 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 9573 (Gm9573), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000164502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:35617923:35626637:-1 gene:ENSMUSG00000090588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// HM596785 // GenBank // Mus musculus epiglycanin (Muc21) mRNA, complete cds. // chr17 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// ENSMUST00000173759 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:35617992:35626610:-1 gene:ENSMUSG00000090588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NONMMUT029458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NM_001033366 // RefSeq // Mus musculus diffuse panbronchiolitis critical region 1 (human) (Dpcr1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006524336 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus diffuse panbronchiolitis critical region 1 (human) (Dpcr1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000095467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35635752:35643695:-1 gene:ENSMUSG00000073408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC150798 // GenBank // Mus musculus diffuse panbronchiolitis critical region 1 (human), mRNA (cDNA clone MGC:183709 IMAGE:9087709), complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35636833:35693875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_175137 // RefSeq // Mus musculus valyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) (Vars2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000043674 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35655634:35667592:-1 gene:ENSMUSG00000038838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000164404 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35656557:35663026:-1 gene:ENSMUSG00000038838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000165787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35655655:35666263:-1 gene:ENSMUSG00000038838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000168922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35656390:35663484:-1 gene:ENSMUSG00000038838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// AK159301 // GenBank HTC // Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I420015D17 product:valyl-tRNA synthetase 2-like, full insert sequence. // chr17 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// AK173288 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1885 protein. // chr17 // 83 // 97 // 24 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35636833:35693875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1
ENSMUST00000177607 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:35699203:35699309:-1 gene:ENSMUSG00000093921 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT029466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_011655 // RefSeq // Mus musculus tubulin, beta 5 class I (Tubb5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000001566 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35833921:35838306:-1 gene:ENSMUSG00000001525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003825 // GenBank // Mus musculus tubulin, beta 5, mRNA (cDNA clone MGC:6228 IMAGE:3601177), complete cds. // chr17 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000134978 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:35835901:35838208:-1 gene:ENSMUSG00000001525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000156050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35836247:35838217:-1 gene:ENSMUSG00000001525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// ENSMUST00000173253 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35835605:35837060:-1 gene:ENSMUSG00000001525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000030331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35834982:35838053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT029479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSMUST00000145804 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35860918:35866886:-1 gene:ENSMUSG00000087443 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK017439 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5530401N12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK035015 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430073M24 product:5530401N12RIK PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT029480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_025878 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S18B (Mrps18b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000025305 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:35910379:35916389:-1 gene:ENSMUSG00000024436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000113782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35910379:35916389:-1 gene:ENSMUSG00000024436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000172642 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:35911441:35916323:-1 gene:ENSMUSG00000024436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000174349 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:35910851:35916337:-1 gene:ENSMUSG00000024436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000174807 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:35910386:35916330:-1 gene:ENSMUSG00000024436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// AB049954 // GenBank // Mus musculus MRPS18b mRNA for mitochondrial ribosomal protein S18b, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC021752 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S18B, mRNA (cDNA clone MGC:30314 IMAGE:5136720), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000174574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35913789:35916377:-1 gene:ENSMUSG00000024436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// GENSCAN00000030334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:35910667:35919615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 1
NM_019712 // RefSeq // Mus musculus ring-box 1 (Rbx1), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000023036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:15:81466316:81476369:1 gene:ENSMUSG00000022400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000173786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:35935624:35935950:-1 gene:ENSMUSG00000049832 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF140599 // GenBank // Mus musculus ring-box protein 1 (Rbx1) mRNA, complete cds. // chr17 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// AK183716 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0126N24, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000023036, based on BLAT search. // chr17 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BC027396 // GenBank // Mus musculus ring-box 1, mRNA (cDNA clone MGC:35907 IMAGE:4952242), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC051473 // GenBank // Mus musculus ring-box 1, mRNA (cDNA clone MGC:62905 IMAGE:1430400), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC056992 // GenBank // Mus musculus ring-box 1, mRNA (cDNA clone MGC:66938 IMAGE:6818827), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AK005127 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500002P15 product:ring-box 1, full insert sequence. // chr17 // 44 // 100 // 12 // 27 // 0 /// AK149259 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930003C07 product:ring-box 1, full insert sequence. // chr17 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000032217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:81466373:81475166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0
NM_008207 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, T region locus 24 (H2-T24), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006523704 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, T region locus 24 (H2-T24), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36005695:36020560:-1 gene:ENSMUSG00000053835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L22338 // GenBank // Mouse MHC class I cell surface glycoprotein (H-2T24) mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// ENSMUST00000174063 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:36006269:36020525:-1 gene:ENSMUSG00000053835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000038363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36006736:36042426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NR_046286 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, T region locus 10 (H2-T10), transcript variant 1, non-coding, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000166442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:36117090:36121149:-1 gene:ENSMUSG00000079491 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000174382 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36117090:36121465:-1 gene:ENSMUSG00000079491 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000174625 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36115876:36121435:-1 gene:ENSMUSG00000079491 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// M35246 // GenBank // Mouse MHC class I H2-TL-T10-b mRNA (b haplotype), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NM_010395 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, T region locus 10 (H2-T10), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// BC021751 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, T region locus 10, mRNA (cDNA clone MGC:25390 IMAGE:4165944), complete cds. // chr17 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// BC021760 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, T region locus 10, mRNA (cDNA clone MGC:30248 IMAGE:5055493), complete cds. // chr17 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0
XM_006536846 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7030 (Gm7030), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006536848 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7030 (Gm7030), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36094963:36129415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000174739 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36226815:36227024:-1 gene:ENSMUSG00000092428 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT029533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000038387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36226812:36271690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1
NM_177923 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.2 (H2-M10.2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000023845 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36284227:36286490:-1 gene:ENSMUSG00000023083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF539598 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.2 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AY211078 // GenBank // Mus musculus major histocompatibility complex class Ib M10.1 mRNA, partial cds. // chr17 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// BC137985 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.2, mRNA (cDNA clone MGC:169609 IMAGE:8861004), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC137987 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.2, mRNA (cDNA clone MGC:169611 IMAGE:8861006), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000038380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36284281:36286421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_013544 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.1 (H2-M10.1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000025322 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36322858:36326155:-1 gene:ENSMUSG00000024448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AY211079 // GenBank // Mus musculus major histocompatibility complex class Ib M10.2 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF539597 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.1 mRNA, complete cds. // chr17 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1 /// BC119458 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.1, mRNA (cDNA clone MGC:140969 IMAGE:40044798), complete cds. // chr17 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1 /// ENSMUST00000172576 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:36323201:36326145:-1 gene:ENSMUSG00000024448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// GENSCAN00000038389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36324016:36326150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_201608 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.3 (H2-M10.3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000073546 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36365003:36368417:-1 gene:ENSMUSG00000058124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AY211080 // GenBank // Mus musculus major histocompatibility complex class Ib M10.3 mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// AF539599 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.3 mRNA, complete cds. // chr17 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// GENSCAN00000038362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36366266:36513112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
ENSMUST00000177182 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36452409:36453253:-1 gene:ENSMUSG00000044538 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36366266:36513112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
NM_177634 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.4 (H2-M10.4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000057502 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36458917:36462334:-1 gene:ENSMUSG00000048231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000169950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:36460164:36462329:-1 gene:ENSMUSG00000048231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AF539600 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 10.4 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AY211081 // GenBank // Mus musculus major histocompatibility complex class Ib M10.5 mRNA, partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000038362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36366266:36513112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0
NM_008205 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 9 (H2-M9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000087165 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:36639285:36642666:-1 gene:ENSMUSG00000067201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000087167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36640406:36642666:-1 gene:ENSMUSG00000067201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF469488 // GenBank // Mus musculus MHC class Ib antigen (M9) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF539595 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 9 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK080256 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530093E10 product:histocompatibility 2, M region locus 9, full insert sequence. // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000038378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36622280:36642644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_177636 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 1 (H2-M1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000041662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36670008:36672219:-1 gene:ENSMUSG00000037334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF539594 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001009575 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 5 (Armcx5), mRNA. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096321 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:135742733:135747322:1 gene:ENSMUSG00000072969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173552 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36759857:36762423:-1 gene:ENSMUSG00000092460 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027106 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 5, mRNA (cDNA clone MGC:38735 IMAGE:5358405), complete cds. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:135745177:135746997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONMMUT029572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083717 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:36842226:36842352:-1 gene:ENSMUSG00000065651 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024134 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 15 (Trim15), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36860691:36867187:-1 gene:ENSMUSG00000050747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000173639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36861318:36866746:-1 gene:ENSMUSG00000050747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000174195 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36860693:36867210:-1 gene:ENSMUSG00000050747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC027186 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 15, mRNA (cDNA clone MGC:28593 IMAGE:4215801), complete cds. // chr17 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// NM_001177872 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 15 (Trim15), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// XM_006524871 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif-containing 15 (Trim15), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000038356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36862253:36867101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0
NM_029632 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 11 (Ppp1r11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000040402 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36948356:36951713:-1 gene:ENSMUSG00000036398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000174711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36949290:36951741:-1 gene:ENSMUSG00000036398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC027737 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 11, mRNA (cDNA clone MGC:29178 IMAGE:5003418), complete cds. // chr17 // 92 // 78 // 23 // 25 // 0 /// EF528576 // GenBank // Mus musculus TCTEX5 long isoform mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// EF528579 // GenBank // Mus musculus TCTEX5 isoform 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000173540 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:36949355:36951338:-1 gene:ENSMUSG00000036398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000038394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36949352:36958284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_023162 // RefSeq // Mus musculus zinc ribbon domain containing, 1 (Znrd1), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113669 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36954356:36958482:-1 gene:ENSMUSG00000036315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000172518 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36954358:36958533:-1 gene:ENSMUSG00000036315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000172823 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:36954411:36958318:-1 gene:ENSMUSG00000036315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 57 // 12 // 16 // 0 /// ENSMUST00000174466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36954443:36958559:-1 gene:ENSMUSG00000036315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AF230339 // GenBank // Mus musculus nuclear RNA polymerase I small specific subunit Rpa12 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC043016 // GenBank // Mus musculus zinc ribbon domain containing, 1, mRNA (cDNA clone MGC:57884 IMAGE:5683859), complete cds. // chr17 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36949352:36958284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSMUST00000119193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36969195:36971396:-1 gene:ENSMUSG00000083534 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006536842 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 5 (H2-M5), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT029582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000038383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36968563:36971396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_029747 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2410137M14 gene (2410137M14Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36977701:36981237:-1 gene:ENSMUSG00000064308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000173707 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:36977838:36981217:-1 gene:ENSMUSG00000064308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// BC147446 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410137M14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182194 IMAGE:9056088), complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// BC147465 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410137M14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182213 IMAGE:9056107), complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0
XM_006536842 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 5 (H2-M5), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000145260 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:36984061:36989537:-1 gene:ENSMUSG00000024459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK051129 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130003B22 product:ring finger protein 39, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001115075 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 5 (H2-M5), mRNA. // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000169189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:36986855:36989504:-1 gene:ENSMUSG00000024459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000176712 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:36987115:36989188:-1 gene:ENSMUSG00000024459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSMUST00000176784 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:36987115:36989188:-1 gene:ENSMUSG00000024459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// AB359228 // GenBank // Mus musculus H2-M5 mRNA for MHC classIb protein M5, complete cds. // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONMMUT029583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:36986904:36989504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_010814 // RefSeq // Mus musculus myelin oligodendrocyte glycoprotein (Mog), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37010743:37023398:-1 gene:ENSMUSG00000076439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167275 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:37011504:37023199:-1 gene:ENSMUSG00000076439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AY566830 // GenBank // Mus musculus MOG-alpha-2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC080860 // GenBank // Mus musculus myelin oligodendrocyte glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:90704 IMAGE:30357772), complete cds. // chr17 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// U64572 // GenBank // Mus musculus myelin/oligodendrocyte glycoprotein (Mog) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006536824 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myelin oligodendrocyte glycoprotein (Mog), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37012247:37029076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_146477 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 90 (Olfr90), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37085191:37086236:-1 gene:ENSMUSG00000056600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119191 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 90, mRNA (cDNA clone MGC:155507 IMAGE:8733940), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37085231:37086163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_182714 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 91 (Olfr91), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000087144 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37092934:37093872:-1 gene:ENSMUSG00000095377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC119413 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 91, mRNA (cDNA clone MGC:123635 IMAGE:40042089), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC119414 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 91, mRNA (cDNA clone MGC:123636 IMAGE:40042091), complete cds. // chr17 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37089303:37111980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0
NM_146456 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 92 (Olfr92), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000168659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37111042:37111980:-1 gene:ENSMUSG00000096477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37089303:37111980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001011813 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 93 (Olfr93), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000171679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37151007:37152051:-1 gene:ENSMUSG00000091601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC139238 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 93, mRNA (cDNA clone MGC:170865 IMAGE:8862260), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC139240 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 93, mRNA (cDNA clone MGC:170867 IMAGE:8862262), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37150847:37151970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000174673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:37169763:37170646:-1 gene:ENSMUSG00000090556 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC104057 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 92, mRNA (cDNA clone MGC:123503 IMAGE:40040325), complete cds. // chr17 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// NM_146456 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 92 (Olfr92), mRNA. // chr17 // 72 // 100 // 23 // 32 // 0 /// ENSMUST00000168659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37111042:37111980:-1 gene:ENSMUSG00000096477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 100 // 23 // 32 // 0 /// NM_146477 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 90 (Olfr90), mRNA. // chr17 // 41 // 91 // 12 // 29 // 0 /// ENSMUST00000070808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37085191:37086236:-1 gene:ENSMUSG00000056600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 41 // 91 // 12 // 29 // 0 /// BC119191 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 90, mRNA (cDNA clone MGC:155507 IMAGE:8733940), complete cds. // chr17 // 41 // 91 // 12 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37169708:37170301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37089303:37111980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37085231:37086163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 41 // 91 // 12 // 29 // 0
NM_001011518 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 94 (Olfr94), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37196707:37198011:-1 gene:ENSMUSG00000043827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139173 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 94, mRNA (cDNA clone MGC:170800 IMAGE:8862195), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139177 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 94, mRNA (cDNA clone MGC:170804 IMAGE:8862199), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37196806:37211851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_146513 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 95 (Olfr95), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060728 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37210894:37211867:-1 gene:ENSMUSG00000049561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37196806:37211851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_146512 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 97 (Olfr97), mRNA. // chr17 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// ENSMUST00000073667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37231414:37232472:-1 gene:ENSMUSG00000058802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37231436:37232365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_146510 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 98 (Olfr98), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000080759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37262711:37263749:-1 gene:ENSMUSG00000063660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC119060 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 98, mRNA (cDNA clone MGC:155376 IMAGE:8733809), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC120744 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 98, mRNA (cDNA clone MGC:155981 IMAGE:40129667), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC134363 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 97, mRNA (cDNA clone MGC:157492 IMAGE:40134689), complete cds. // chr17 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
ENSMUST00000122476 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:37267076:37267238:-1 gene:ENSMUSG00000084425 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146515 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 99 (Olfr99), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000077585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37279501:37280418:-1 gene:ENSMUSG00000061972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC106778 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 99, mRNA (cDNA clone MGC:123490 IMAGE:40040272), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC106777 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 99, mRNA (cDNA clone MGC:123489 IMAGE:40040271), complete cds. // chr17 // 65 // 100 // 13 // 20 // 0
NM_146834 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 101 (Olfr101), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000058046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37299446:37300484:-1 gene:ENSMUSG00000092077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC138322 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 101, mRNA (cDNA clone MGC:169947 IMAGE:8861342), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC138323 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 101, mRNA (cDNA clone MGC:169948 IMAGE:8861343), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37275324:37337230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001011721 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 102 (Olfr102), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NM_207673 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 100 (Olfr100), mRNA. // chr17 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000169373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37313411:37314437:-1 gene:ENSMUSG00000091531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC127233 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 100, mRNA (cDNA clone MGC:157438 IMAGE:40054913), complete cds. // chr17 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// BC127234 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 100, mRNA (cDNA clone MGC:157439 IMAGE:40054914), complete cds. // chr17 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// BC139114 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 102, mRNA (cDNA clone MGC:170741 IMAGE:8862136), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC139115 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 102, mRNA (cDNA clone MGC:170742 IMAGE:8862137), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000030477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37275324:37337230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_146833 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 103 (Olfr103), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000058826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:37336289:37337230:-1 gene:ENSMUSG00000049618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000173472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:37336289:37339678:-1 gene:ENSMUSG00000049618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000030477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37275324:37337230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_008204 // RefSeq // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 2 (H2-M2), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006537260 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 2 (H2-M2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000016427 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37480851:37483551:-1 gene:ENSMUSG00000016283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000171139 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:37480983:37483552:-1 gene:ENSMUSG00000016283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AY302212 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/10SnJ MHC class Ib antigen (H2-M2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AY302213 // GenBank // Mus musculus strain 129/SvJ MHC class Ib antigen (H2-M2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AY302214 // GenBank // Mus musculus strain BALB/cJ MHC class Ib antigen (H2-M2) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// AY302215 // GenBank // Mus musculus strain A.CA MHC class Ib antigen (H2-M2) mRNA, complete cds. // chr17 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// AY302216 // GenBank // Mus musculus strain P/J MHC class Ib antigen (H2-M2) mRNA, complete cds. // chr17 // 83 // 64 // 15 // 18 // 0 /// AY302217 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/10SnJ MHC class Ib antigen (H2-M2) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr17 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC150676 // GenBank // Mus musculus histocompatibility 2, M region locus 2, mRNA (cDNA clone MGC:183587 IMAGE:9087587), complete cds. // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000030480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37481464:37590327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001013575 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 112 (Olfr112), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006537342 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 112 (Olfr112), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000085548 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37563239:37567094:-1 gene:ENSMUSG00000051611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000174798 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:37563410:37566706:-1 gene:ENSMUSG00000051611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0
NM_146289 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 113 (Olfr113), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000174139 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:37574454:37575448:-1 gene:ENSMUSG00000092292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC132178 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 113, mRNA (cDNA clone MGC:163809 IMAGE:40130455), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC132180 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 113, mRNA (cDNA clone MGC:163811 IMAGE:40130457), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37481464:37590327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
NM_146287 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 114 (Olfr114), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000076914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37589382:37590381:-1 gene:ENSMUSG00000062629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC132209 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 114, mRNA (cDNA clone MGC:163840 IMAGE:40130486), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC132573 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 114, mRNA (cDNA clone MGC:164204 IMAGE:40130850), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001011753 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 115 (Olfr115), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000173118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:37609785:37627109:-1 gene:ENSMUSG00000092413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC139226 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 115, mRNA (cDNA clone MGC:170853 IMAGE:8862248), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC139227 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 115, mRNA (cDNA clone MGC:170854 IMAGE:8862249), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37609817:37624609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0
NM_146632 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 116 (Olfr116), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000072265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37623668:37624633:-1 gene:ENSMUSG00000061336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37609817:37624609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
NM_207155 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 117 (Olfr117), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073636 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:37659378:37660331:-1 gene:ENSMUSG00000095286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC148220 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 117, mRNA (cDNA clone MGC:157580 IMAGE:40135828), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC148277 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 117, mRNA (cDNA clone MGC:157581 IMAGE:40135829), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:37659378:37660331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146327 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 129 (Olfr129), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000122318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:38054599:38055591:-1 gene:ENSMUSG00000081724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174675 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:38054599:38059784:-1 gene:ENSMUSG00000081724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:38054599:38055720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146867 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 131 (Olfr131), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:38081970:38082999:-1 gene:ENSMUSG00000043312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000172933 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:38081970:38088693:-1 gene:ENSMUSG00000043312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138113 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 131, mRNA (cDNA clone MGC:169737 IMAGE:8861132), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145790 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 131, mRNA (cDNA clone MGC:175677 IMAGE:40131093), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:38082032:38131190:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001005481 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 132 (Olfr132), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:38130249:38131190:-1 gene:ENSMUSG00000067186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:38082032:38131190:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_146488 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 137 (Olfr137), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057394 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:38304521:38305460:-1 gene:ENSMUSG00000054940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC148231 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 137, mRNA (cDNA clone MGC:161300 IMAGE:40142242), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:38304521:38305165:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000172948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:38313309:38315021:-1 gene:ENSMUSG00000092615 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONMMUT029627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0
ENSMUST00000062783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:39848103:39848827:-1 gene:ENSMUSG00000045999 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 85 // 50 // 11 // 13 // 0 /// AY036118 // GenBank // Mus musculus ETS-related transcription factor ERF (Erf1) mRNA, complete cds. // chr17 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// XR_385918 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/arginine repetitive matrix protein 2-like (LOC101056014), misc_RNA. // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// BC127072 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40110205. // chr17 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// NONMMUT029673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// BC115496 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40100914. // chr17 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_031190 // RefSeq // Mus musculus phosphoglycerate kinase 2 (Pgk2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:40207018:40208609:-1 gene:ENSMUSG00000031233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052343 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:58110 IMAGE:6773764), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061054 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:74165 IMAGE:6774063), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M18654 // GenBank // Mouse testis-specific phosphoglycerate kinase (pgk-2) mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:40207282:40208535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_009639 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich secretory protein 3 (Crisp3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000026499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:40221777:40242288:-1 gene:ENSMUSG00000025433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC022573 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secretory protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:31016 IMAGE:4925349), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC132536 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secretory protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:164167 IMAGE:40130813), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC132538 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secretory protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:164169 IMAGE:40130815), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// L05560 // GenBank // Mouse cysteine-rich secretory protein-3 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// M92850 // GenBank // Mouse acidic epididymal glycoprotein-like protein (Aeg-2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_009638 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich secretory protein 1 (Crisp1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000026498 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:40293758:40319207:-1 gene:ENSMUSG00000025431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC011150 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secretory protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:18489 IMAGE:4165956), complete cds. // chr17 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// L05559 // GenBank // Mouse cysteine-rich secretory protein-1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// M92849 // GenBank // Mouse acidic epididymal glycoprotein (Aeg-1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:40228783:40313076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001204071 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich secretory protein 2 (Crisp2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_009420 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich secretory protein 2 (Crisp2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000024724 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:40764734:40794115:-1 gene:ENSMUSG00000023930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000131699 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:40784919:40794076:-1 gene:ENSMUSG00000023930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000141204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:40784995:40794067:-1 gene:ENSMUSG00000023930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000144243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:40783238:40794146:-1 gene:ENSMUSG00000023930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK018856 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700051O17 product:testis specific gene 1, full insert sequence. // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC049615 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secretory protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:58317 IMAGE:6742033), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M25533 // GenBank // Mouse testis-specific protein (Tpx-1) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:40763637:40804085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_027834 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9130008F23 gene (9130008F23Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000068258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:40875482:40880558:-1 gene:ENSMUSG00000054951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC132063 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130008F23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163694 IMAGE:40130340), complete cds. // chr17 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC132065 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130008F23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163696 IMAGE:40130342), complete cds. // chr17 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001145060 // RefSeq // Mus musculus glycine-N-acyltransferase-like 3 (Glyatl3), mRNA. // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000166343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:40904741:40914350:-1 gene:ENSMUSG00000091043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000001784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:40904741:40912755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_031863 // RefSeq // Mus musculus centromere protein Q (Cenpq), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087114 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:40923051:40935047:-1 gene:ENSMUSG00000023919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK088680 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430023H16 product:RIKEN cDNA 2610528M18Rik gene, full insert sequence. // chr17 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// BC018524 // GenBank // Mus musculus centromere protein Q, mRNA (cDNA clone MGC:27944 IMAGE:3588374), complete cds. // chr17 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// XM_006525193 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centromere protein Q (Cenpq), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// AK020761 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430104A05 product:methylmalonyl-Coenzyme A mutase, full insert sequence. // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:40923488:40933179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT029681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
AY288426 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 136 (Gpr136) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC125611 // GenBank // Mus musculus opsin 5, mRNA (cDNA clone MGC:159314 IMAGE:40130126), complete cds. // chr17 // 90 // 57 // 18 // 20 // 0 /// BC132010 // GenBank // Mus musculus opsin 5, mRNA (cDNA clone MGC:163641 IMAGE:40130287), complete cds. // chr17 // 90 // 57 // 18 // 20 // 0 /// NM_181753 // RefSeq // Mus musculus opsin 5 (Opn5), mRNA. // chr17 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// ENSMUST00000068355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:42556783:42611313:-1 gene:ENSMUSG00000043972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// AY318865 // GenBank // Mus musculus opsin mRNA, complete cds. // chr17 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// XM_006524453 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus opsin 5 (Opn5), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// XM_006524455 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus opsin 5 (Opn5), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// GENSCAN00000000612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:42550813:42672742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1
NM_001289499 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 115 (Gpr115), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NM_001289500 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 115 (Gpr115), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NM_001289501 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 115 (Gpr115), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NM_030067 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 115 (Gpr115), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000024711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:42656891:42692284:-1 gene:ENSMUSG00000023918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000167993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:42656894:42692284:-1 gene:ENSMUSG00000023918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000170723 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:42657091:42692262:-1 gene:ENSMUSG00000023918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC089564 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 115, mRNA (cDNA clone MGC:107333 IMAGE:30502915), complete cds. // chr17 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// BC140980 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 115, mRNA (cDNA clone MGC:175941 IMAGE:9055592), complete cds. // chr17 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:42550813:42672742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001033493 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 111 (Gpr111), mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524588 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 111 (Gpr111), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// XM_006524589 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 111 (Gpr111), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// XM_006524590 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 111 (Gpr111), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000113614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:42708936:42742179:-1 gene:ENSMUSG00000057899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC141353 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 111, mRNA (cDNA clone MGC:176314 IMAGE:9055965), complete cds. // chr17 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:42704729:42717141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0
NM_009847 // RefSeq // Mus musculus CD2-associated protein (Cd2ap), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000024709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:42792951:42876424:-1 gene:ENSMUSG00000061665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC138374 // GenBank // Mus musculus CD2-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:169999 IMAGE:8861394), complete cds. // chr17 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// BC157901 // GenBank // Mus musculus CD2-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:189775 IMAGE:9007275), complete cds. // chr17 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// XM_006523555 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD2-associated protein (Cd2ap), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// AF077003 // GenBank // Mus musculus SH3 domain-containing adapter protein mRNA, complete cds. // chr17 // 86 // 86 // 18 // 21 // 1 /// AF149092 // GenBank // Mus musculus SH3 domain-containing adaptor protein METS-1 (Mets1) mRNA, complete cds. // chr17 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// XM_006523557 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD2-associated protein (Cd2ap), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// AK046750 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B630006O17 product:CD2-associated protein, full insert sequence. // chr17 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// GENSCAN00000000622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:42751968:42876316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1
NM_008585 // RefSeq // Mus musculus meprin 1 alpha (Mep1a), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// XM_006523751 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus meprin 1 alpha (Mep1a), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000024707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:43474331:43502773:-1 gene:ENSMUSG00000023914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000117137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:43474324:43502812:-1 gene:ENSMUSG00000023914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC015258 // GenBank // Mus musculus meprin 1 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:18415 IMAGE:4241252), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// M74897 // GenBank // Mouse meprin A alpha-subunit (MEP-1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:43477073:43511481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_001161366 // RefSeq // Mus musculus tudor domain containing 6 (Tdrd6), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001161367 // RefSeq // Mus musculus tudor domain containing 6 (Tdrd6), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_198418 // RefSeq // Mus musculus tudor domain containing 6 (Tdrd6), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000045717 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:43615339:43630299:-1 gene:ENSMUSG00000040140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000162232 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:43615559:43620485:-1 gene:ENSMUSG00000040140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000168073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:43615335:43630299:-1 gene:ENSMUSG00000040140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB097085 // GenBank // Mus musculus Tdrd6 mRNA for tudor domain containing 6 protein, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138353 // GenBank // Mus musculus tudor domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:169978 IMAGE:8861373), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC145248 // GenBank // Mus musculus tudor domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:178808 IMAGE:9053800), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:43615845:43640141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT029732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
AK136747 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230114N20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_199016 // RefSeq // Mus musculus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 (Enpp4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:44096308:44105809:-1 gene:ENSMUSG00000023961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:44096316:44105764:-1 gene:ENSMUSG00000023961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC027749 // GenBank // Mus musculus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4, mRNA (cDNA clone MGC:29265 IMAGE:5065563), complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:44099313:44102641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000093699 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:44641025:44641143:-1 gene:ENSMUSG00000070209 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT029756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000019727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:45163227:45189141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_152810 // RefSeq // Mus musculus cell division cycle 5-like (S. pombe) (Cdc5l), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000024727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:45391892:45433707:-1 gene:ENSMUSG00000023932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// BC031480 // GenBank // Mus musculus cell division cycle 5-like (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:27895 IMAGE:3498853), complete cds. // chr17 // 86 // 88 // 12 // 14 // 0 /// BC003893 // GenBank // Mus musculus cell division cycle 5-like (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:6754 IMAGE:3593535), complete cds. // chr17 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// GENSCAN00000019723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:45392200:45462960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
NM_027649 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated, serine-rich 1 (Spats1), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000024731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:45448937:45474938:-1 gene:ENSMUSG00000023935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AK016586 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933400B06 product:hypothetical Serine-rich region containing protein, full insert sequence. // chr17 // 95 // 58 // 20 // 21 // 0 /// AY336501 // GenBank // Mus musculus Dvl2-DEP domain interacting protein (Ddip) mRNA, complete cds. // chr17 // 81 // 72 // 21 // 26 // 0 /// BC131909 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated, serine-rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:163540 IMAGE:40130186), complete cds. // chr17 // 79 // 78 // 22 // 28 // 0 /// XM_006524917 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spermatogenesis associated, serine-rich 1 (Spats1), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// AK078278 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430564H10 product:RIKEN cDNA 4933400B06 gene, full insert sequence. // chr17 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// AK165435 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F530001B17 product:spermatogenesis associated, serine-rich 1, full insert sequence. // chr17 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000019723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:45392200:45462960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001013749 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 151B (Tmem151b), mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:45541940:45549677:-1 gene:ENSMUSG00000096847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC079879 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 151B, mRNA (cDNA clone MGC:105223 IMAGE:6852149), complete cds. // chr17 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC083182 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 151B, mRNA (cDNA clone IMAGE:6853189), partial cds. // chr17 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:45544827:45552336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0
NM_001177468 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 7325 (Gm7325), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001177469 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 7325 (Gm7325), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NM_001177470 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 7325 (Gm7325), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006524789 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7325 (Gm7325), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// XM_006524790 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7325 (Gm7325), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000113529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:45600967:45602102:-1 gene:ENSMUSG00000079471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// ENSMUST00000169137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:45600967:45601915:-1 gene:ENSMUSG00000079471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000178858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:45600967:45602067:-1 gene:ENSMUSG00000079471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ190000 // GenBank // Mus musculus embryonic stem cell- and germ cell-specific protein ESGP mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:45568015:45601671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001013767 // RefSeq // Mus musculus calpain 11 (Capn11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006524338 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calpain 11 (Capn11), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120717 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:45630204:45659325:-1 gene:ENSMUSG00000058626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AY578330 // GenBank // Mus musculus calpain 11 (Capn11) mRNA, complete cds. // chr17 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// XR_385334 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calpain 11 (Capn11), transcript variant X4, misc_RNA. // chr17 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1 /// XM_006524339 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calpain 11 (Capn11), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1 /// GENSCAN00000019712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:45625940:45688110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1
NM_198167 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 63b (Tmem63b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:45660171:45686259:-1 gene:ENSMUSG00000036026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000145873 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:45667714:45685973:-1 gene:ENSMUSG00000036026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000156254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:45670014:45686905:-1 gene:ENSMUSG00000036026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC026370 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 63b, mRNA (cDNA clone IMAGE:4160190), partial cds. // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC057136 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 63b, mRNA (cDNA clone MGC:62871 IMAGE:6529222), complete cds. // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC059283 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 63b, mRNA (cDNA clone IMAGE:4036319), partial cds. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000019712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:45625940:45688110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
AK143033 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030047D23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028164 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1600014C23 gene (1600014C23Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000178179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:45732864:45733844:-1 gene:ENSMUSG00000094690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_029338 // RefSeq // Mus musculus radial spoke head 9 homolog (Chlamydomonas) (Rsph9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525074 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus radial spoke head 9 homolog (Chlamydomonas) (Rsph9), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006525075 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus radial spoke head 9 homolog (Chlamydomonas) (Rsph9), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000024762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:46129271:46144216:-1 gene:ENSMUSG00000023966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006440 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700027N10 product:DJ261G23.2.2 (NOVEL PROTEIN, ISOFORM 2) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019423 // GenBank // Mus musculus radial spoke head 9 homolog (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:30526 IMAGE:4922914), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000148581 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:46122035:46136830:-1 gene:ENSMUSG00000023966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000033276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46129338:46144148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_025649 // RefSeq // Mus musculus MAD2L1 binding protein (Mad2l1bp), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46147390:46153553:-1 gene:ENSMUSG00000034509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK011037 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2510031P20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// BC005768 // GenBank // Mus musculus MAD2L1 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:6825 IMAGE:2649017), complete cds. // chr17 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46147772:46153497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_030715 // RefSeq // Mus musculus polymerase (DNA directed), eta (RAD 30 related) (Polh), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006525176 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (DNA directed), eta (RAD 30 related) (Polh), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000024749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46172004:46202625:-1 gene:ENSMUSG00000023953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AB027128 // GenBank // Mus musculus XPV mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC128366 // GenBank // Mus musculus polymerase (DNA directed), eta (RAD 30 related), mRNA (cDNA clone MGC:150278 IMAGE:40111620), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46172253:46199489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_001252473 // RefSeq // Mus musculus tight junction associated protein 1 (Tjap1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NM_001252474 // RefSeq // Mus musculus tight junction associated protein 1 (Tjap1), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NM_001252475 // RefSeq // Mus musculus tight junction associated protein 1 (Tjap1), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NM_028751 // RefSeq // Mus musculus tight junction associated protein 1 (Tjap1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006525237 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102640101 (LOC102640101), mRNA. // chr17 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000012440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46257851:46283026:-1 gene:ENSMUSG00000012296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000164342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46257851:46283026:-1 gene:ENSMUSG00000012296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000180283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46257851:46283026:-1 gene:ENSMUSG00000012296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// AB712252 // GenBank // Mus musculus Pilt mRNA for protein incorporated later into tight junctions, complete cds. // chr17 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC023316 // GenBank // Mus musculus tight junction associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:28243 IMAGE:3993257), complete cds. // chr17 // 90 // 91 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46258413:46277885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
XR_397495 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9706 (Gm9706), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK019325 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900034J12 product:interferon-stimulated protein (15 kDa), full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_015783 // RefSeq // Mus musculus ISG15 ubiquitin-like modifier (Isg15), mRNA. // chr17 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// ENSMUST00000085425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:4:156199424:156200818:-1 gene:ENSMUSG00000035692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// BC031424 // GenBank // Mus musculus ISG15 ubiquitin-like modifier, mRNA (cDNA clone MGC:18616 IMAGE:3670747), complete cds. // chr17 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// BC083156 // GenBank // Mus musculus ISG15 ubiquitin-like modifier, mRNA (cDNA clone MGC:103144 IMAGE:5338191), complete cds. // chr17 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// BC109346 // GenBank // Mus musculus ISG15 ubiquitin-like modifier, mRNA (cDNA clone MGC:130321 IMAGE:40055493), complete cds. // chr17 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// X56602 // GenBank // Mus musculus mRNA Interferon-induced 15-KDa protein. // chr17 // 63 // 96 // 15 // 24 // 0 /// CT010333 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F0552D for gene G1p2, Interferon, alpha-inducible protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr17 // 47 // 68 // 8 // 17 // 0 /// GENSCAN00000008948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:156199584:156205887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 84 // 12 // 21 // 0
NM_144856 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 7 (Slc22a7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000087012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46432185:46438477:-1 gene:ENSMUSG00000067144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB069965 // GenBank // Mus musculus SLC22A7 mRNA for organic anion transporter 2, complete cds. // chr17 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// BC013474 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:18877 IMAGE:4236556), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC024119 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:37764 IMAGE:5096875), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC026597 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:37316 IMAGE:4975360), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC026598 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:37327 IMAGE:4975598), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC025813 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:37791 IMAGE:5097639), complete cds. // chr17 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000033220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46432491:46438389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0
NM_001162864 // RefSeq // Mus musculus tau tubulin kinase 1 (Ttbk1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000047034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46442448:46487675:-1 gene:ENSMUSG00000015599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC059249 // GenBank // Mus musculus tau tubulin kinase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6400755), partial cds. // chr17 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// XM_006523445 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tau tubulin kinase 1 (Ttbk1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// AK144536 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630092C12 product:similar to TAU-tubulin kinase homolog (Fragment) [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// GENSCAN00000033275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46444813:46487998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NM_020493 // RefSeq // Mus musculus serum response factor (Srf), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006523957 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serum response factor (Srf), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000015749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46546839:46556162:-1 gene:ENSMUSG00000015605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC051950 // GenBank // Mus musculus serum response factor, mRNA (cDNA clone MGC:62204 IMAGE:6404515), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46549083:46629322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_175168 // RefSeq // Mus musculus PTK7 protein tyrosine kinase 7 (Ptk7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006524922 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PTK7 protein tyrosine kinase 7 (Ptk7), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000044442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46564451:46629504:-1 gene:ENSMUSG00000023972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AF531873 // GenBank // Mus musculus receptor tyrosine kinase-like protein precursor (Ptk7) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// BC027800 // GenBank // Mus musculus PTK7 protein tyrosine kinase 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:5151185), partial cds. // chr17 // 95 // 49 // 20 // 21 // 0 /// BC076578 // GenBank // Mus musculus PTK7 protein tyrosine kinase 7, mRNA (cDNA clone MGC:96153 IMAGE:30619280), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC037175 // GenBank HTC // Mus musculus PTK7 protein tyrosine kinase 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:4503462), with apparent retained intron. // chr17 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// AK087891 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330037K16 product:PTK7 protein tyrosine kinase 7, full insert sequence. // chr17 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1 /// GENSCAN00000033251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46549083:46629322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0
NM_029091 // RefSeq // Mus musculus kinesin light chain 4 (Klc4), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006525042 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin light chain 4 (Klc4), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006525043 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin light chain 4 (Klc4), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000003642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46630631:46645144:-1 gene:ENSMUSG00000003546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC005746 // GenBank // Mus musculus kinesin light chain 4, mRNA (cDNA clone MGC:11935 IMAGE:3599898), complete cds. // chr17 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46631023:46644506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_144857 // RefSeq // Mus musculus ribosomal RNA processing 36 homolog (S. cerevisiae) (Rrp36), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006524144 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ribosomal RNA processing 36 homolog (S. cerevisiae) (Rrp36), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000024766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46667458:46674255:-1 gene:ENSMUSG00000023971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC011248 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC011248, mRNA (cDNA clone MGC:19067 IMAGE:4192711), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK148237 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370062N24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 71 // 100 // 20 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46667950:46678037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001163729 // RefSeq // Mus musculus kelch domain containing 3 (Klhdc3), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NM_027910 // RefSeq // Mus musculus kelch domain containing 3 (Klhdc3), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000071841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46674553:46680930:-1 gene:ENSMUSG00000063576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000165007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46674550:46680930:-1 gene:ENSMUSG00000063576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AB053465 // GenBank // Mus musculus mRNA for Peas, complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// BC018154 // GenBank // Mus musculus kelch domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:25567 IMAGE:3983436), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// AK079082 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330160M08 product:INTERCELLULAR MEDIATOR homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 70 // 86 // 21 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46667950:46678037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1
NM_009358 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, delta (Ppp2r5d), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000002839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46682991:46705002:-1 gene:ENSMUSG00000059409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB053464 // GenBank // Mus musculus mRNA for protein phosphatase 2A B56delta regulatory subunit, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF316616 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2 regulatory subunit B56 delta isoform (Ppp2r5d) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// AY338234 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2A B56 delta subunit mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC009163 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B (B56), delta isoform, mRNA (cDNA clone IMAGE:3603578), partial cds. // chr17 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// BC010716 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2, regulatory subunit B (B56), delta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:6551 IMAGE:2655861), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46683989:46704859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_010321 // RefSeq // Mus musculus glycine N-methyltransferase (Gnmt), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000002846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:46725664:46729168:-1 gene:ENSMUSG00000002769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000147112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:46725664:46726801:-1 gene:ENSMUSG00000002769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC014283 // GenBank // Mus musculus glycine N-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:13738 IMAGE:4210236), complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC087960 // GenBank // Mus musculus glycine N-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:107657 IMAGE:6766468), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// D89664 // GenBank // Mus musculus mRNA for glycine N-methyltransferase, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006523662 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycine N-methyltransferase (Gnmt), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46725800:46729151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_028065 // RefSeq // Mus musculus canopy 3 homolog (zebrafish) (Cnpy3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006524957 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus canopy 3 homolog (zebrafish) (Cnpy3), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006524958 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus canopy 3 homolog (zebrafish) (Cnpy3), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000059844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:46735705:46752214:-1 gene:ENSMUSG00000023973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000129200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:46735756:46752197:-1 gene:ENSMUSG00000023973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AF361644 // GenBank // Mus musculus putative retinoic acid-regulated protein mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC013549 // GenBank // Mus musculus canopy 3 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:19340 IMAGE:4222133), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000121671 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:46746987:46752195:-1 gene:ENSMUSG00000023973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// ENSMUST00000148656 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:46747219:46752177:-1 gene:ENSMUSG00000023973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46736691:46752123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_011195 // RefSeq // Mus musculus pre T cell antigen receptor alpha (Ptcra), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000041012 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:46755663:46763712:-1 gene:ENSMUSG00000036858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// U16958 // GenBank // Mus musculus pre-T cell receptor alpha-type chain precursor, mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC119062 // GenBank // Mus musculus pre T-cell antigen receptor alpha, mRNA (cDNA clone MGC:155378 IMAGE:8733811), complete cds. // chr17 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// BC120746 // GenBank // Mus musculus pre T-cell antigen receptor alpha, mRNA (cDNA clone MGC:155983 IMAGE:40129669), complete cds. // chr17 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000033243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46756376:46763593:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0
NM_025433 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L7-like 1 (Rpl7l1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000078286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46773907:46782656:-1 gene:ENSMUSG00000063888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC030165 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L7-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:29149 IMAGE:5027519), complete cds. // chr17 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0 /// AK090038 // GenBank HTC // Mus musculus kidney CCL-142 RAG cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430069H10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// GENSCAN00000033215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46778063:46782632:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0
NM_001100452 // RefSeq // Mus musculus GLTSCR1-like (Gltscr1l), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006523974 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GLTSCR1-like (Gltscr1l), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006523981 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GLTSCR1-like (Gltscr1l), transcript variant X9, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000040624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46798116:46831413:-1 gene:ENSMUSG00000036568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB093219 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0240 protein. // chr17 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC151032 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC032203, mRNA (cDNA clone MGC:183945 IMAGE:9087945), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC151054 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC032203, mRNA (cDNA clone MGC:183967 IMAGE:9087967), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:46801048:46858642:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000086675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:46889216:46890405:-1 gene:ENSMUSG00000073388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK039293 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330017A19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000165525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:47016696:47016956:-1 gene:ENSMUSG00000091775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:47000586:47016956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_008189 // RefSeq // Mus musculus guanylate cyclase activator 1a (retina) (Guca1a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:47394560:47400584:-1 gene:ENSMUSG00000023982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC026834 // GenBank // Mus musculus guanylate cyclase activator 1a (retina), mRNA (cDNA clone MGC:25342 IMAGE:4503333), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC031810 // GenBank // Mus musculus guanylate cyclase activator 1a (retina), mRNA (cDNA clone MGC:25102 IMAGE:4501021), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// L36860 // GenBank // Mus musculus guanylate cyclase activating protein (GCAP) mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000041575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:47394657:47400419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001172091 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700001C19 gene (1700001C19Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NM_029296 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700001C19 gene (1700001C19Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000061885 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:47412734:47437375:-1 gene:ENSMUSG00000047150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000160678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:47413628:47437376:-1 gene:ENSMUSG00000047150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC028263 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:40720 IMAGE:5124927), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006525067 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700001C19 gene (1700001C19Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// XM_006525068 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700001C19 gene (1700001C19Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONMMUT029877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr17 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
AF222802 // GenBank // Mus musculus taube nuss mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// BC057895 // GenBank // Mus musculus TAF8 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factorq, mRNA (cDNA clone MGC:68125 IMAGE:5031867), complete cds. // chr17 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NM_022015 // RefSeq // Mus musculus TAF8 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factorq (Taf8), mRNA. // chr17 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// ENSMUST00000067103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:47488050:47502287:-1 gene:ENSMUSG00000023980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// XM_006524764 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TAF8 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factorq (Taf8), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// XM_006524767 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TAF8 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factorq (Taf8), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// AK049949 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630015H02 product:taube nuss, full insert sequence. // chr17 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// AK162110 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420420E18 product:taube nuss, full insert sequence. // chr17 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000041568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:47483672:47523594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_016859 // RefSeq // Mus musculus bystin-like (Bysl), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000024783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:47599331:47611492:-1 gene:ENSMUSG00000023988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF007802 // GenBank // Mus musculus bystin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC017530 // GenBank // Mus musculus bystin-like, mRNA (cDNA clone MGC:27710 IMAGE:4925307), complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:47601553:47611171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001290337 // RefSeq // Mus musculus prickle homolog 4 (Drosophila) (Prickle4), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000113299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:47688517:47691476:-1 gene:ENSMUSG00000079444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000113300 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:47688517:47692466:-1 gene:ENSMUSG00000096549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142014 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:47688619:47690896:-1 gene:ENSMUSG00000096549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000143789 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:47686739:47694455:-1 gene:ENSMUSG00000079444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006543388 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prickle homolog 4 (Drosophila) (Prickle4), partial mRNA. // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// XM_006525240 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prickle homolog 4 (Drosophila) (Prickle4), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSMUST00000152214 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:47689578:47691403:-1 gene:ENSMUSG00000096549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:47686927:47692466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083093 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:47840816:47840985:-1 gene:ENSMUSG00000065027 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT029909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029689 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700122O11 gene (1700122O11Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000178823 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:48036745:48038293:-1 gene:ENSMUSG00000094928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// KnowTID_00003681 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:48029383:48057968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001177896 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9830107B12 gene (9830107B12Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_001177897 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9830107B12 gene (9830107B12Rik), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NM_177824 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9830107B12 gene (9830107B12Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000063481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:48125605:48146307:-1 gene:ENSMUSG00000073386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// EF646801 // GenBank // Mus musculus triggering receptor expressed in myeloid cells 5 (Trem5) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
NM_001113556 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A530064D06 gene (A530064D06Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// NM_178796 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A530064D06 gene (A530064D06Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006524439 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A530064D06 gene (A530064D06Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000027764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:48151897:48167270:-1 gene:ENSMUSG00000043939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000053612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:48151896:48167257:-1 gene:ENSMUSG00000043939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AB372005 // GenBank // Mus musculus pdctrem mRNA for plasmacytoid dendritic cell-specific receptor, complete cds. // chr17 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// BC139185 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A530064D06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170812 IMAGE:8862207), complete cds. // chr17 // 88 // 80 // 7 // 8 // 0 /// BC139186 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A530064D06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170813 IMAGE:8862208), complete cds. // chr17 // 88 // 80 // 7 // 8 // 0 /// EU003111 // GenBank // Mus musculus triggering receptor expressed in myeloid cells 4 (Trem4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// EU003112 // GenBank // Mus musculus triggering receptor expressed in myeloid cells 4b splice variant (Trem4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_009694 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 2 (Apobec2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000046549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:48419231:48432728:-1 gene:ENSMUSG00000040694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF161699 // GenBank // Mus musculus APOBEC-2 (Apobec2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC027530 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:41184 IMAGE:1433092), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:48422962:48435627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0
NM_027292 // RefSeq // Mus musculus translocator protein 2 (Tspo2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000024794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:48448435:48451522:-1 gene:ENSMUSG00000023995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:48447956:48451492:-1 gene:ENSMUSG00000023995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159988 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:48448568:48450070:-1 gene:ENSMUSG00000023995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000162481 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:48448519:48450073:-1 gene:ENSMUSG00000023995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC104344 // GenBank // Mus musculus benzodiazapine receptor, peripheral-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:129410 IMAGE:40049489), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC104345 // GenBank // Mus musculus benzodiazapine receptor, peripheral-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:129411 IMAGE:40049491), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT029932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:48448624:48456459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
AK044970 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130016L16 product:hypothetical Zn-finger, CCHC type/Zinc finger CCHC-type profile containing protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008231 // RefSeq // Mus musculus dishevelled associated activator of morphogenesis 2 (Daam2), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525083 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dishevelled associated activator of morphogenesis 2 (Daam2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006525085 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dishevelled associated activator of morphogenesis 2 (Daam2), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525089 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dishevelled associated activator of morphogenesis 2 (Daam2), transcript variant X8, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:49456022:49564337:-1 gene:ENSMUSG00000040260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK122266 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0381 protein. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AY426536 // GenBank // Mus musculus dishevelled associated activator of morphogenesis 2 (Daam2) mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// BC050043 // GenBank // Mus musculus dishevelled associated activator of morphogenesis 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6432883), complete cds. // chr17 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000041030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:49458526:49498873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
AK016140 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930556A20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181397 // RefSeq // Mus musculus raftlin lipid raft linker 1 (Rftn1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006525081 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus raftlin lipid raft linker 1 (Rftn1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000044503 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:49992257:50190674:-1 gene:ENSMUSG00000039316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000113195 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:49993260:50094332:-1 gene:ENSMUSG00000039316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000156094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:50036623:50190497:-1 gene:ENSMUSG00000039316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AK088466 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430018F20 product:similar to HYPOTHETICAL 35.0 KDA PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AK170913 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630209H10 product:weakly similar to Raftlin [Gallus gallus], full insert sequence. // chr17 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// BC043324 // GenBank // Mus musculus raftlin lipid raft linker 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5371547), partial cds. // chr17 // 77 // 46 // 10 // 13 // 0 /// BC052074 // GenBank // Mus musculus raftlin lipid raft linker 1, mRNA (cDNA clone MGC:62488 IMAGE:6401192), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001277863 // RefSeq // Mus musculus deleted in azoospermia-like (Dazl), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_010021 // RefSeq // Mus musculus deleted in azoospermia-like (Dazl), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006523583 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus deleted in azoospermia-like (Dazl), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000010736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:50279394:50293599:-1 gene:ENSMUSG00000010592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK160855 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3632410F05 product:deleted in azoospermia-like, full insert sequence. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC099940 // GenBank // Mus musculus deleted in azoospermia-like, mRNA (cDNA clone MGC:107400 IMAGE:30048233), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// U38690 // GenBank // Mus musculus DAZ-like putative RNA binding protein mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// U46694 // GenBank // Mus musculus Dazh mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC053386 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30053973, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr17 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// AK033316 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030492G05 product:deleted in azoospermia-like, full insert sequence. // chr17 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000030746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:50276657:50302026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
AK005461 // GenBank HTC // Mus musculus adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1600014N05 product:hypothetical RabGAP/TBC domain containing protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000122634 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:50916925:50917041:-1 gene:ENSMUSG00000084583 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0 /// NONMMUT029986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0
XR_397534 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 5094 (Gm5094), misc_RNA. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// AK037647 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130033B22 product:hypothetical Cysteine-rich region profile/Phenylalanine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003693 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001031811 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 8 (Kcnh8), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:52602709:52979194:1 gene:ENSMUSG00000035580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000184279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:52950060:52978379:1 gene:ENSMUSG00000035580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC130020 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:40140651), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC152323 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40140654. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:52973603:52978312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_172497 // RefSeq // Mus musculus EF hand domain family, member B (Efhb), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_385310 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF hand domain family, member B (Efhb), transcript variant X2, misc_RNA. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000024725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:53398889:53463321:-1 gene:ENSMUSG00000023931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK167235 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0044B08 product:hypothetical Calcium-binding EF-hand containing protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC132103 // GenBank // Mus musculus EF hand domain family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:163734 IMAGE:40130380), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137880 // GenBank // Mus musculus EF hand domain family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:169504 IMAGE:8860899), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:53384983:53467334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_173449 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 2C-like domain containing 1 (Pp2d1), mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000056198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:53507460:53539451:-1 gene:ENSMUSG00000044957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
NM_028232 // RefSeq // Mus musculus shugoshin-like 1 (S. pombe) (Sgol1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000024736 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:53674786:53689333:-1 gene:ENSMUSG00000023940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000144474 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:53687560:53689286:-1 gene:ENSMUSG00000023940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000146019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:53687707:53689278:-1 gene:ENSMUSG00000023940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AB193067 // GenBank // Mus musculus Sgo1 mRNA for shugoshin 1A protein, complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AB193068 // GenBank // Mus musculus Sgo1 mRNA for shugoshin 1B protein, complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC089014 // GenBank // Mus musculus shugoshin-like 1 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:113769 IMAGE:30604765), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:53676600:53687852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT030067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT030068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0
NM_026935 // RefSeq // Mus musculus sulfotransferase family, cytosolic, 1C, member 2 (Sult1c2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000023886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:53829637:53846339:-1 gene:ENSMUSG00000023122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY005469 // GenBank // Mus musculus sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC022665 // GenBank // Mus musculus sulfotransferase family, cytosolic, 1C, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:31323 IMAGE:4223678), complete cds. // chr17 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:53830002:53838982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_018751 // RefSeq // Mus musculus sulfotransferase family, cytosolic, 1C, member 1 (Sult1c1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000024738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:53961615:53990674:-1 gene:ENSMUSG00000023943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF033653 // GenBank // Mus musculus phenol sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 89 // 21 // 24 // 0 /// BC045149 // GenBank // Mus musculus sulfotransferase family, cytosolic, 1C, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:54566 IMAGE:6308175), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:53962072:53990646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_022025 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 5 (choline transporter), member 7 (Slc5a7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006524774 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 5 (choline transporter), member 7 (Slc5a7), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000095712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:54273594:54299034:-1 gene:ENSMUSG00000023945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF276872 // GenBank // Mus musculus sodium and chloride-dependent high-affinity choline transporter mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 73 // 22 // 24 // 0 /// AK164116 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530033E06 product:solute carrier family 5 (choline transporter), member 7, full insert sequence. // chr17 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// BC065089 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 5 (choline transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:86023 IMAGE:6851099), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:54276518:54297136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_027870 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 3 (Armcx3), mRNA. // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000081834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:134756595:134761425:1 gene:ENSMUSG00000049047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000086880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134756607:134760106:1 gene:ENSMUSG00000049047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134756647:134761455:1 gene:ENSMUSG00000049047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC011101 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 3, mRNA (cDNA clone MGC:19426 IMAGE:3490748), complete cds. // chr17 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// BC051113 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 3, mRNA (cDNA clone MGC:58973 IMAGE:5249601), complete cds. // chr17 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:54311281:54347593:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134757220:134761229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:128016957:128042279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001104582 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 118 (Vmn2r118), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000168440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:55592341:55624672:-1 gene:ENSMUSG00000091504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000184305 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:MG4222_MG3908_PATCH:55592313:55624644:-1 gene:ENSMUSG00000099175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:55514579:55697318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4222_MG3908_PATCH:55607943:55697290:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_028370 // RefSeq // Mus musculus protection of telomeres 1B (Pot1b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006544959 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protection of telomeres 1B (Pot1b), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006544961 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protection of telomeres 1B (Pot1b), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000086876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:55652025:55712628:-1 gene:ENSMUSG00000024174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000184775 // ENSEMBL // proj_ensembl:novel chromosome:GRCm38:MG4222_MG3908_PATCH:55651997:55712600:-1 gene:ENSMUSG00000098835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK050727 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030011N09 product:hypothetical Nucleic acid-binding proteins structure containing protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AK013364 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810458H16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000025381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:55514579:55697318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000056958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4222_MG3908_PATCH:55607943:55697290:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NM_144546 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 119a (Zfp119a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006523384 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 119a (Zfp119a), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000079642 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:55864892:55878930:-1 gene:ENSMUSG00000057835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF242376 // GenBank // Mus musculus KRAB zinc finger protein (Mzf13) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC118950 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 119, mRNA (cDNA clone MGC:143717 IMAGE:40092426), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AK047498 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930079E16 product:similar to DNA-BINDING PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
NM_146249 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 119b (Zfp119b), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000056147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:55938381:55945259:-1 gene:ENSMUSG00000062101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC031441 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC031441, mRNA (cDNA clone MGC:18735 IMAGE:3985007), complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC137918 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC031441, mRNA (cDNA clone MGC:169542 IMAGE:8860937), complete cds. // chr17 // 87 // 63 // 13 // 15 // 0 /// BC137919 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC031441, mRNA (cDNA clone MGC:169543 IMAGE:8860938), complete cds. // chr17 // 87 // 63 // 13 // 15 // 0 /// BC094043 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC031441, mRNA (cDNA clone MGC:103233 IMAGE:5067417), complete cds. // chr17 // 65 // 96 // 15 // 23 // 0 /// ENSMUST00000189452 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:55938381:55949500:-1 gene:ENSMUSG00000062101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_145934 // RefSeq // Mus musculus signal transducing adaptor family member 2 (Stap2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_102313 // RefSeq // Mus musculus signal transducing adaptor family member 2 (Stap2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006523446 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus signal transducing adaptor family member 2 (Stap2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000043785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:55997081:56005570:-1 gene:ENSMUSG00000038781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC026642 // GenBank // Mus musculus signal transducing adaptor family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:37525 IMAGE:4986113), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:55997496:56005531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0
NM_001252471 // RefSeq // Mus musculus SH3-domain GRB2-like 1 (Sh3gl1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_013664 // RefSeq // Mus musculus SH3-domain GRB2-like 1 (Sh3gl1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000003268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56016753:56036637:-1 gene:ENSMUSG00000003200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC138602 // GenBank // Mus musculus SH3-domain GRB2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:170227 IMAGE:8861622), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC138603 // GenBank // Mus musculus SH3-domain GRB2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:170228 IMAGE:8861623), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// U58885 // GenBank // Mus musculus endophilin II mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56017540:56045558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1
NM_020568 // RefSeq // Mus musculus perilipin 4 (Plin4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006524708 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus perilipin 4 (Plin4), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000002908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56100591:56109802:-1 gene:ENSMUSG00000002831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF064748 // GenBank // Mus musculus S3-12 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000190703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:56100591:56109803:-1 gene:ENSMUSG00000002831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56102007:56117662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001077348 // RefSeq // Mus musculus perilipin 5 (Plin5), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_025874 // RefSeq // Mus musculus perilipin 5 (Plin5), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006524805 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus perilipin 5 (Plin5), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000019808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:56111601:56117596:-1 gene:ENSMUSG00000011305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000113072 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:56111607:56117298:-1 gene:ENSMUSG00000011305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY919875 // GenBank // Mus musculus lipid droplet associated protein (PAT-1) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC024138 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310076L09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:37973 IMAGE:5136320), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// DQ473305 // GenBank // Mus musculus lipid storage droplet protein 5 (Lsdp5) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56102007:56117662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1
NM_029796 // RefSeq // Mus musculus leucine-rich alpha-2-glycoprotein 1 (Lrg1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000041357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56119680:56121946:-1 gene:ENSMUSG00000037095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB055885 // GenBank // Mus musculus lrhg mRNA for leucine-rich HEV glycoprotein, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF403429 // GenBank // Mus musculus leucine-rich alpha-2-glycoprotein (Lrg) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK009555 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310031E04 product:LEUCINE-RICH HEV GLYCOPROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// BC030733 // GenBank // Mus musculus leucine-rich alpha-2-glycoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:37928 IMAGE:5123909), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC092077 // GenBank // Mus musculus leucine-rich alpha-2-glycoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:102387 IMAGE:4975749), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56119942:56121062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0
NM_001130456 // RefSeq // Mus musculus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6B (Sema6b), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_013662 // RefSeq // Mus musculus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6B (Sema6b), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000001256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56123085:56140343:-1 gene:ENSMUSG00000001227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000167545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56123085:56133852:-1 gene:ENSMUSG00000001227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF036585 // GenBank // Mus musculus semaphorin VIb mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC139415 // GenBank // Mus musculus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6B, mRNA (cDNA clone MGC:171042 IMAGE:8862437), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000009548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56124001:56140467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NM_001130456 // RefSeq // Mus musculus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6B (Sema6b), transcript variant 2, mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_013662 // RefSeq // Mus musculus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6B (Sema6b), transcript variant 1, mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000001256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56123085:56140343:-1 gene:ENSMUSG00000001227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000167545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56123085:56133852:-1 gene:ENSMUSG00000001227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF036585 // GenBank // Mus musculus semaphorin VIb mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC139415 // GenBank // Mus musculus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6B, mRNA (cDNA clone MGC:171042 IMAGE:8862437), complete cds. // chrUn // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000009548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56124001:56140467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NM_080837 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 17, Wayne State University 104, expressed (D17Wsu104e), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019723 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:56175744:56183920:-1 gene:ENSMUSG00000019579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY038184 // GenBank // Mus musculus stromal cell-derived growth factor SF20/IL25 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132127 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 17, Wayne State University 104, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:163758 IMAGE:40130404), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132129 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 17, Wayne State University 104, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:163760 IMAGE:40130406), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140885 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:56178106:56183849:-1 gene:ENSMUSG00000019579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000009539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56176924:56183891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_172624 // RefSeq // Mus musculus dipeptidylpeptidase 9 (Dpp9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XR_385319 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dipeptidylpeptidase 9 (Dpp9), transcript variant X3, misc_RNA. // chr17 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000038794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56186682:56218889:-1 gene:ENSMUSG00000001229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK078301 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430584G11 product:DIPEPTIDYL PEPTIDASE 9 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// AK131178 // GenBank // Mus musculus mRNA for mFLJ00334 protein. // chr17 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// BC057631 // GenBank // Mus musculus dipeptidylpeptidase 9, mRNA (cDNA clone MGC:67700 IMAGE:4191886), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK039652 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330078I11 product:weakly similar to DIPEPTIDYL PEPTIDASE 9 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// GENSCAN00000009573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56187369:56211918:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0
NM_174989 // RefSeq // Mus musculus toll-like receptor adaptor molecule 1 (Ticam1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000058136 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:56269319:56276786:-1 gene:ENSMUSG00000047123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB091053 // GenBank // Mus musculus mRNA for TICAM-1, complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC033406 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor adaptor molecule 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5006587), partial cds. // chr17 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC094338 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor adaptor molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:106484 IMAGE:30606722), complete cds. // chr17 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// BC062191 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor adaptor molecule 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30290762), complete cds. // chr17 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000009521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56269895:56287859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1
NM_025836 // RefSeq // Mus musculus perilipin 3 (Plin3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000019726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56278962:56290511:-1 gene:ENSMUSG00000024197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC011116 // GenBank // Mus musculus mannose-6-phosphate receptor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:19018 IMAGE:4023354), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// DQ257436 // GenBank // Mus musculus TIP47 protein isoform 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56269895:56287859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1
NM_029799 // RefSeq // Mus musculus arrestin domain containing 5 (Arrdc5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56294113:56300286:-1 gene:ENSMUSG00000073380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100496 // GenBank // Mus musculus arrestin domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:118336 IMAGE:30916615), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56294146:56300243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_011483 // RefSeq // Mus musculus zinc and ring finger 4 (Znrf4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56511248:56512483:-1 gene:ENSMUSG00000044526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB016984 // GenBank // Mus musculus mRNA for Sperizin, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC140986 // GenBank // Mus musculus zinc and ring finger 4, mRNA (cDNA clone MGC:175947 IMAGE:9055598), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56511322:56512305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000124111 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:56560973:56564567:-1 gene:ENSMUSG00000042625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK031971 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330514O11 product:inferred: hypothetical protein KIAA0138 {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56542907:56584444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
NM_153152 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2410015M20 gene (2410015M20Rik), mRNA. // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000052832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56607452:56609771:-1 gene:ENSMUSG00000049760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY091637 // GenBank // Mus musculus QIL1 (Qil1) mRNA, complete cds. // chr17 // 84 // 70 // 16 // 19 // 0 /// BC049674 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410015M20 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6588167). // chr17 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// BC056164 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410015M20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:66669 IMAGE:5713062), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56607744:56611950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_028782 // RefSeq // Mus musculus lon peptidase 1, mitochondrial (Lonp1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000047226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56614301:56626903:-1 gene:ENSMUSG00000041168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AY190302 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ATP-dependent protease Lon mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr17 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC033426 // GenBank HTC // Mus musculus, clone IMAGE:5358451, mRNA. // chr17 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000009551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56614384:56628769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
GENSCAN00000009554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56712131:56717584:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_001166474 // RefSeq // Mus musculus vimentin-type intermediate filament associated coiled-coil protein (Vmac), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NM_178926 // RefSeq // Mus musculus vimentin-type intermediate filament associated coiled-coil protein (Vmac), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006523409 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vimentin-type intermediate filament associated coiled-coil protein (Vmac), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000067931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56713932:56716921:-1 gene:ENSMUSG00000054723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000164907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56713932:56717699:-1 gene:ENSMUSG00000054723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// BC026472 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI662250, mRNA (cDNA clone MGC:31501 IMAGE:4487505), complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC058424 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI662250, mRNA (cDNA clone IMAGE:5690401), partial cds. // chr17 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT030142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56712131:56717584:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_008738 // RefSeq // Mus musculus neurturin (Nrtn), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006523801 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neurturin (Nrtn), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000044752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56751325:56757530:-1 gene:ENSMUSG00000039481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC057993 // GenBank // Mus musculus neurturin, mRNA (cDNA clone MGC:68236 IMAGE:5345262), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U78109 // GenBank // Mus musculus prepro-neurturin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56751412:56752477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
NM_009056 // RefSeq // Mus musculus regulatory factor X, 2 (influences HLA class II expression) (Rfx2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 97 // 93 // 36 // 37 // 0 /// NM_027787 // RefSeq // Mus musculus regulatory factor X, 2 (influences HLA class II expression) (Rfx2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000002444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56775897:56831008:-1 gene:ENSMUSG00000024206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000086801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56775897:56831008:-1 gene:ENSMUSG00000024206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 93 // 36 // 37 // 0 /// BC004654 // GenBank // Mus musculus regulatory factor X, 2 (influences HLA class II expression), mRNA (cDNA clone MGC:6105 IMAGE:3497910), complete cds. // chr17 // 97 // 93 // 36 // 37 // 0 /// AK086559 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930036P17 product:regulatory factor (trans-acting) 2, full insert sequence. // chr17 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// GENSCAN00000009572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56776962:56817329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0
NM_001039114 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA synthetase bubblegum family member 2 (Acsbg2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006524443 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus acyl-CoA synthetase bubblegum family member 2 (Acsbg2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000043062 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:56843103:56874447:-1 gene:ENSMUSG00000024207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// DQ250679 // GenBank // Mus musculus ACSBG2 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56843173:56868372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_022328 // RefSeq // Mus musculus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 1 (Mllt1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56892612:56935388:-1 gene:ENSMUSG00000024212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF298887 // GenBank // Mus musculus Btk-PH-domain binding protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AF312858 // GenBank // Mus musculus leukemia associated gene protein (Mllt1) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC053005 // GenBank // Mus musculus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 1, mRNA (cDNA clone MGC:62187 IMAGE:5716396), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56894462:56953270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_175731 // RefSeq // Mus musculus alkaline ceramidase 1 (Acer1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000056113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:56953490:56982126:-1 gene:ENSMUSG00000045019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF347023 // GenBank // Mus musculus alkaline ceramidase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC130254 // GenBank // Mus musculus alkaline ceramidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:161323 IMAGE:40142524), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56955079:56982081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_008954 // RefSeq // Mus musculus persephin (Pspn), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000002740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:56999457:57000018:-1 gene:ENSMUSG00000002664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF040960 // GenBank // Mus musculus persephin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC130229 // GenBank // Mus musculus persephin, mRNA (cDNA clone MGC:161270 IMAGE:40141900), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:56999457:57000015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_133801 // RefSeq // Mus musculus general transcription factor IIF, polypeptide 1 (Gtf2f1), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000002733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57003405:57011288:-1 gene:ENSMUSG00000002658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC023081 // GenBank // Mus musculus general transcription factor IIF, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:38619 IMAGE:5355475), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC031123 // GenBank // Mus musculus general transcription factor IIF, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:36237 IMAGE:5026448), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57003427:57011120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_010613 // RefSeq // Mus musculus KH-type splicing regulatory protein (Khsrp), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000007814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57021058:57031507:-1 gene:ENSMUSG00000007670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC108414 // GenBank // Mus musculus KH-type splicing regulatory protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:6848894), partial cds. // chr17 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57021813:57059673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 78 // 78 // 29 // 37 // 1
NM_175333 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 41 (Slc25a41), mRNA. // chrUn // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000058661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:57032773:57041654:-1 gene:ENSMUSG00000011486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000169012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:57032925:57041647:-1 gene:ENSMUSG00000011486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC115588 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 41, mRNA (cDNA clone MGC:144475 IMAGE:40102382), complete cds. // chrUn // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC115589 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 41, mRNA (cDNA clone MGC:144476 IMAGE:40102384), complete cds. // chrUn // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57021813:57059673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_025877 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; phosphate carrier), member 23 (Slc25a23), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000040280 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:57043711:57059863:-1 gene:ENSMUSG00000046329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000163442 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:57045199:57052824:-1 gene:ENSMUSG00000046329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000170015 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:57045485:57053829:-1 gene:ENSMUSG00000046329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000171128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:57047195:57055385:-1 gene:ENSMUSG00000046329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000171528 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:57047051:57053582:-1 gene:ENSMUSG00000046329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC072660 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; phosphate carrier), member 23, mRNA (cDNA clone MGC:100028 IMAGE:30360302), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000024477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57021813:57059673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_153551 // RefSeq // Mus musculus DENN/MADD domain containing 1C (Dennd1c), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006524900 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DENN/MADD domain containing 1C (Dennd1c), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006524902 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DENN/MADD domain containing 1C (Dennd1c), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_006524903 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DENN/MADD domain containing 1C (Dennd1c), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// XM_006524904 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DENN/MADD domain containing 1C (Dennd1c), transcript variant X7, mRNA. // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000011623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57066056:57078510:-1 gene:ENSMUSG00000002668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK040537 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430105K15 product:hypothetical dDENN domain/DENN (AEX-3) domain containing protein, full insert sequence. // chr17 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC035208 // GenBank // Mus musculus DENN/MADD domain containing 1C, mRNA (cDNA clone MGC:30613 IMAGE:3671384), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK014482 // GenBank HTC // Mus musculus 14 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4432409M07 product:4432409M07RIK PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57066111:57076989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_009451 // RefSeq // Mus musculus tubulin, beta 4A class IVA (Tubb4a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57080066:57087782:-1 gene:ENSMUSG00000062591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049112 // GenBank // Mus musculus tubulin, beta 4, mRNA (cDNA clone MGC:61383 IMAGE:6415577), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC054831 // GenBank // Mus musculus tubulin, beta 4, mRNA (cDNA clone MGC:62570 IMAGE:6306945), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57080690:57087513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_011617 // RefSeq // Mus musculus CD70 antigen (Cd70), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57145997:57149777:-1 gene:ENSMUSG00000019489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC125407 // GenBank // Mus musculus CD70 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:159110 IMAGE:40129922), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC125409 // GenBank // Mus musculus CD70 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:159112 IMAGE:40129924), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U78091 // GenBank // Mus musculus CD70 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// Y13636 // GenBank // Mus musculus CD70 mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57146075:57154411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_019418 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 14 (Tnfsf14), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000005976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57189492:57194189:-1 gene:ENSMUSG00000005824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB029155 // GenBank // Mus musculus mRNA for LIGHT protein, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF123385 // GenBank // Mus musculus ligand for herpesvirus entry mediator mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AF227533 // GenBank // Mus musculus light mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC125477 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 14, mRNA (cDNA clone MGC:159180 IMAGE:40129992), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC125479 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 14, mRNA (cDNA clone MGC:159182 IMAGE:40129994), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57190511:57194069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_009778 // RefSeq // Mus musculus complement component 3 (C3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000024988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:57203970:57228136:-1 gene:ENSMUSG00000024164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC029976 // GenBank HTC // Mus musculus complement component 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5038612). // chr17 // 93 // 36 // 13 // 14 // 0 /// BC043338 // GenBank // Mus musculus complement component 3, mRNA (cDNA clone MGC:49527 IMAGE:5134713), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// K02782 // GenBank // Mouse complement component C3 mRNA, alpha and beta subunits, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000024452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57204013:57247636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0
NM_030084 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 108 (Gpr108), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006525129 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 108 (Gpr108), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XM_006525130 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 108 (Gpr108), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000005975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:57234914:57247641:-1 gene:ENSMUSG00000005823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AF376726 // GenBank // Mus musculus lung seven transmembrane receptor 2 (Lustr2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// AK019012 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810015L19 product:UNKNOWN (PROTEIN FOR MGC:14393) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 100 // 50 // 19 // 19 // 0 /// AK082797 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330021A20 product:LUNG SEVEN TRANSMEMBRANE RECEPTOR 2 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK170948 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630212F08 product:G protein-coupled receptor 108, full insert sequence. // chr17 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC016104 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 108, mRNA (cDNA clone MGC:27688 IMAGE:4920840), complete cds. // chr17 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57204013:57247636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1
NM_001104591 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 120 (Vmn2r120), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000165781 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:57508783:57545314:-1 gene:ENSMUSG00000090655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:57508783:57559488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000025064 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:58878808:58991375:-1 gene:ENSMUSG00000024227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000177108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:58878808:58884133:-1 gene:ENSMUSG00000024227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000177360 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:58878970:58893495:-1 gene:ENSMUSG00000024227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// BC024774 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610034M16 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5363112), complete cds. // chr17 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// BC029007 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610034M16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:38712 IMAGE:5357730), complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC033350 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610034M16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:38934 IMAGE:5362778), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC034642 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610034M16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:38982 IMAGE:5363521), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:58851542:58983973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0
NM_026497 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 12 (Nudt12), mRNA. // chr17 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// XM_006524834 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 12 (Nudt12), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000025065 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:58999618:59013372:-1 gene:ENSMUSG00000024228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000174108 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:59000111:59003707:-1 gene:ENSMUSG00000024228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000174122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:59006395:59013268:-1 gene:ENSMUSG00000024228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC050252 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:6466762). // chr17 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC057657 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 12, mRNA (cDNA clone MGC:68086 IMAGE:2646355), complete cds. // chr17 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000001279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:59002181:59020305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0
ENSMUST00000082636 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:62456987:62457120:-1 gene:ENSMUSG00000064570 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT030182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_010109 // RefSeq // Mus musculus ephrin A5 (Efna5), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_207654 // RefSeq // Mus musculus ephrin A5 (Efna5), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006523597 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ephrin A5 (Efna5), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006523599 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ephrin A5 (Efna5), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000076840 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:62604184:62881317:-1 gene:ENSMUSG00000048915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000078839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:62607319:62881144:-1 gene:ENSMUSG00000048915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC040218 // GenBank // Mus musculus ephrin A5, mRNA (cDNA clone MGC:36080 IMAGE:4954352), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U90664 // GenBank // Mus musculus ligand AL-1/RAGS mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// U90665 // GenBank // Mus musculus ligand AL-1s/RAGS mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// XM_006523596 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ephrin A5 (Efna5), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// XM_006523600 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ephrin A5 (Efna5), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// GENSCAN00000029237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:62606052:62655952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
BC016608 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:27981 IMAGE:3596365, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_015794 // RefSeq // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 17 (Fbxl17), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_385343 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 17 (Fbxl17), transcript variant X2, misc_RNA. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000024761 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:17:63057452:63500017:-1 gene:ENSMUSG00000023965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000112840 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:63057782:63492753:-1 gene:ENSMUSG00000023965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000112839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:63057782:63456166:-1 gene:ENSMUSG00000023965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// ENSMUST00000169134 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:63058938:63451711:-1 gene:ENSMUSG00000023965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// BC058120 // GenBank // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 17, mRNA (cDNA clone MGC:69753 IMAGE:6810624), complete cds. // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// BC138330 // GenBank // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 17, mRNA (cDNA clone MGC:169955 IMAGE:8861350), complete cds. // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// BC138331 // GenBank // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 17, mRNA (cDNA clone MGC:169956 IMAGE:8861351), complete cds. // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000025016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:63487673:63545541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSMUST00000050753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:63863300:63863791:-1 gene:ENSMUSG00000045506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK039032 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230088G23 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_045899 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AU016765 (AU016765), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:64514081:64555622:-1 gene:ENSMUSG00000073377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000168379 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:64514139:64555503:-1 gene:ENSMUSG00000073377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000168920 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:64514134:64555580:-1 gene:ENSMUSG00000073377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000169472 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:64514137:64555660:-1 gene:ENSMUSG00000073377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006543393 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930583I09 gene (4930583I09Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000024896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:64832523:64836071:-1 gene:ENSMUSG00000024088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK019827 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930583I09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_013933 // RefSeq // Mus musculus vesicle-associated membrane protein, associated protein A (Vapa), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000024897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:65580056:65613555:-1 gene:ENSMUSG00000024091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AF115503 // GenBank // Mus musculus VAMP-associated protein 33a mRNA, complete cds. // chr17 // 75 // 69 // 18 // 24 // 0 /// AK149040 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120478H08 product:vesicle-associated membrane protein, associated protein A, full insert sequence. // chr17 // 96 // 66 // 22 // 23 // 0 /// BC003866 // GenBank // Mus musculus vesicle-associated membrane protein, associated protein A, mRNA (cDNA clone MGC:6617 IMAGE:3490082), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:65580689:65641383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1
NM_001146002 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin domain containing 2 (spermatozoa) (Txndc2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_153519 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin domain containing 2 (spermatozoa) (Txndc2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006523986 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thioredoxin domain containing 2 (spermatozoa) (Txndc2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000050236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:65637505:65642204:-1 gene:ENSMUSG00000050612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF196282 // GenBank // Mus musculus spermatid-specific thioredoxin (Sptrx1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC060981 // GenBank // Mus musculus thioredoxin domain containing 2 (spermatozoa), mRNA (cDNA clone MGC:74076 IMAGE:6770744), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:65580689:65641383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_133685 // RefSeq // Mus musculus RAB31, member RAS oncogene family (Rab31), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000070673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:65651726:65772752:-1 gene:ENSMUSG00000056515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB232617 // GenBank // Mus musculus Rab22B mRNA for Rab22B, complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AK007048 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700093E07 product:SIMILAR TO RAB31, MEMBER RAS ONCOGENE FAMILY [Mus musculus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC013063 // GenBank // Mus musculus RAB31, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:7715 IMAGE:3497938), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT030267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:65666428:65700022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_023053 // RefSeq // Mus musculus twisted gastrulation homolog 1 (Drosophila) (Twsg1), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000024906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:65923066:65951187:-1 gene:ENSMUSG00000024098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AF292033 // GenBank // Mus musculus twisted gastrulation protein (Tsg) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// AF295097 // GenBank // Mus musculus twisted gastrulation protein mRNA, complete cds. // chr17 // 79 // 58 // 15 // 19 // 0 /// AK033504 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030407H12 product:twisted gastrulation protein, full insert sequence. // chr17 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// BC004850 // GenBank // Mus musculus twisted gastrulation homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:6913 IMAGE:2810960), complete cds. // chr17 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:65886387:65964952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001025572 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 12 (Ankrd12), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000038116 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:65967501:66077046:-1 gene:ENSMUSG00000034647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000003670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:65970152:65987493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
NM_001278415 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 2 (Ndufv2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_028388 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 2 (Ndufv2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000024909 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:66079441:66101495:-1 gene:ENSMUSG00000024099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000143987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:66078795:66101559:-1 gene:ENSMUSG00000024099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000147484 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:66087494:66101509:-1 gene:ENSMUSG00000024099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC030946 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 2, mRNA (cDNA clone MGC:32165 IMAGE:5003524), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000138847 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:66087403:66092213:-1 gene:ENSMUSG00000024099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000001787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:66012545:66101465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_024448 // RefSeq // Mus musculus RAB12, member RAS oncogene family (Rab12), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006523889 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB12, member RAS oncogene family (Rab12), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000070538 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:66494512:66519717:-1 gene:ENSMUSG00000023460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000167962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:66494512:66519670:-1 gene:ENSMUSG00000023460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB232607 // GenBank // Mus musculus Rab12 mRNA for Rab12, complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000146279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:66505788:66519710:-1 gene:ENSMUSG00000023460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// BC027647 // GenBank HTC // Mus musculus RAB12, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:1344671), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000001807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:66480067:66519714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_028998 // RefSeq // Mus musculus thymocyte selection associated family member 3 (Themis3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000024914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:66555252:66594621:-1 gene:ENSMUSG00000024105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:66555252:66601844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_008984 // RefSeq // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, M (Ptprm), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006523873 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, M (Ptprm), transcript variant X10, mRNA. // chr17 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000037974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:66666848:67354459:-1 gene:ENSMUSG00000033278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC058614 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, M, mRNA (cDNA clone MGC:60661 IMAGE:30056619), complete cds. // chr17 // 95 // 57 // 20 // 21 // 0 /// BC079621 // GenBank // Mus musculus protein tyrosine phosphatase, receptor type, M, mRNA (cDNA clone MGC:90724 IMAGE:30536348), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AK039261 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330009B13 product:protein tyrosine phosphatase, receptor-type, M, full insert sequence. // chr17 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// GENSCAN00000001798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:66667628:66702050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0
NM_001033340 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 30 (Lrrc30), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:67630965:67632723:-1 gene:ENSMUSG00000073375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147419 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 30, mRNA (cDNA clone MGC:182606 IMAGE:9056500), complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC147420 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 30, mRNA (cDNA clone MGC:182593 IMAGE:9056487), complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000015722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:67631681:67632583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_023402 // RefSeq // Mus musculus myosin, light chain 12B, regulatory (Myl12b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000038446 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:70973920:70990787:-1 gene:ENSMUSG00000034868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC028878 // GenBank // Mus musculus myosin light chain, regulatory B, mRNA (cDNA clone MGC:25448 IMAGE:4218748), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// BC099425 // GenBank // Mus musculus myosin light chain, regulatory B, mRNA (cDNA clone MGC:117602 IMAGE:30847912), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// BC131925 // GenBank // Mus musculus myosin light chain, regulatory B, mRNA (cDNA clone MGC:163556 IMAGE:40130202), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC131927 // GenBank // Mus musculus myosin light chain, regulatory B, mRNA (cDNA clone MGC:163558 IMAGE:40130204), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000050828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:70974324:70977231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
NM_026064 // RefSeq // Mus musculus myosin, light chain 12A, regulatory, non-sarcomeric (Myl12a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000148960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:70993656:71002554:-1 gene:ENSMUSG00000024048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK013776 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900073G15 product:myosin regulatory light chain A, smooth muscle homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr17 // 80 // 91 // 16 // 20 // 0 /// BC010265 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900073G15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:8089 IMAGE:3588394), complete cds. // chr17 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0 /// BC029180 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900073G15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35677 IMAGE:2599135), complete cds. // chr17 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// XM_006524822 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myosin, light chain 12A, regulatory, non-sarcomeric (Myl12a), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// ENSMUST00000024846 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:70994294:70998012:-1 gene:ENSMUSG00000024048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// ENSMUST00000126529 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:70994294:71002165:-1 gene:ENSMUSG00000024048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// BC089050 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5328490, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr17 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// ENSMUST00000123686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:70994549:71002878:-1 gene:ENSMUSG00000024048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_145158 // RefSeq // Mus musculus elastin microfibril interfacer 2 (Emilin2), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000024849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:71252176:71310965:-1 gene:ENSMUSG00000024053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AF468645 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J basilin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC053753 // GenBank // Mus musculus elastin microfibril interfacer 2, mRNA (cDNA clone MGC:59598 IMAGE:6510220), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GQ872457 // GenBank // Mus musculus strain A/J elastin microfibril interfacer 2 mRNA, complete cds. // chr17 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0 /// GQ872460 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J elastin microfibril interfacer 2 (Emilin2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:71252516:71475164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_028887 // RefSeq // Mus musculus SMC hinge domain containing 1 (Smchd1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000127430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:71344489:71475343:-1 gene:ENSMUSG00000024054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC044905 // GenBank // Mus musculus SMC hinge domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4021503), partial cds. // chr17 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// BC062946 // GenBank // Mus musculus SMC hinge domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:77958 IMAGE:30357469), complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:71252516:71475164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1
NM_028887 // RefSeq // Mus musculus SMC hinge domain containing 1 (Smchd1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000127430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:71344489:71475343:-1 gene:ENSMUSG00000024054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:71252516:71475164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_023294 // RefSeq // Mus musculus NDC80 homolog, kinetochore complex component (S. cerevisiae) (Ndc80), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000024851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:71496100:71526857:-1 gene:ENSMUSG00000024056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF326730 // GenBank // Mus musculus HEC mRNA, complete cds. // chr17 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0 /// BC020131 // GenBank // Mus musculus NDC80 homolog, kinetochore complex component (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:28069 IMAGE:3709641), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// AK132008 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810001J21 product:kinetochore associated 2, full insert sequence. // chr17 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// GENSCAN00000010534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:71496216:71525733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
NR_015549 // RefSeq // Mus musculus tRNA methyltransferase 61B (Trmt61b), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr17 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NR_027952 // RefSeq // Mus musculus tRNA methyltransferase 61B (Trmt61b), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr17 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// ENSMUST00000130952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:71557027:71598755:-1 gene:ENSMUSG00000085492 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// ENSMUST00000137830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:71557062:71598746:-1 gene:ENSMUSG00000085492 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONMMUT030468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT030463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONMMUT030464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONMMUT030465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
ENSMUST00000057405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:71743557:71752885:-1 gene:ENSMUSG00000044375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC027072 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC027072, mRNA (cDNA clone IMAGE:5357765), complete cds. // chr17 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC046516 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC027072, mRNA (cDNA clone MGC:39037 IMAGE:5364819), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC060373 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC027072, mRNA (cDNA clone MGC:65563 IMAGE:6494066), complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:71744516:71752680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0
NM_007439 // RefSeq // Mus musculus anaplastic lymphoma kinase (Alk), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006523505 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anaplastic lymphoma kinase (Alk), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XR_385265 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anaplastic lymphoma kinase (Alk), transcript variant X2, misc_RNA. // chr17 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000086639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:71869442:72603709:-1 gene:ENSMUSG00000055471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000010538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:71869442:71953100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// D83002 // GenBank // Mus musculus mRNA for tyrosine kinase, complete cds. // chr17 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0
ENSMUST00000158862 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:72499289:72499418:-1 gene:ENSMUSG00000089487 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0
ENSMUST00000183172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:72699505:72700445:-1 gene:ENSMUSG00000098193 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:72699458:72705474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_001033444 // RefSeq // Mus musculus calpain 13 (Capn13), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006524535 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calpain 13 (Capn13), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000095208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:73306464:73399296:-1 gene:ENSMUSG00000043705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC147510 // GenBank // Mus musculus calpain 13, mRNA (cDNA clone MGC:182583 IMAGE:9056477), complete cds. // chr17 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// BC147512 // GenBank // Mus musculus calpain 13, mRNA (cDNA clone MGC:182594 IMAGE:9056488), complete cds. // chr17 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000049143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:73306813:73337440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 40 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000049136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:73350356:73582764:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1
NM_011723 // RefSeq // Mus musculus xanthine dehydrogenase (Xdh), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000024866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:73883908:73950182:-1 gene:ENSMUSG00000024066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC141183 // GenBank // Mus musculus xanthine dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:176144 IMAGE:9055795), complete cds. // chr17 // 89 // 95 // 32 // 36 // 0 /// GENSCAN00000049130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:73884433:73950128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0
NM_053188 // RefSeq // Mus musculus steroid 5 alpha-reductase 2 (Srd5a2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000043458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:74017706:74047916:-1 gene:ENSMUSG00000038541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB049456 // GenBank // Mus musculus 5ART2 mRNA for steroid 5 alpha reductase type 2, complete cds. // chr17 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// BC125510 // GenBank // Mus musculus steroid 5 alpha-reductase 2, mRNA (cDNA clone MGC:159213 IMAGE:40130025), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:74020714:74042093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_133771 // RefSeq // Mus musculus mediator of cell motility 1 (Memo1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006525108 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mediator of cell motility 1 (Memo1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006525109 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mediator of cell motility 1 (Memo1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_385385 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mediator of cell motility 1 (Memo1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_385387 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mediator of cell motility 1 (Memo1), transcript variant X6, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_385388 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mediator of cell motility 1 (Memo1), transcript variant X7, misc_RNA. // chr17 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000078459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:74200706:74294883:-1 gene:ENSMUSG00000058704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF363447 // GenBank // Mus musculus C21orf19-like protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC013819 // GenBank // Mus musculus mediator of cell motility 1, mRNA (cDNA clone MGC:19424 IMAGE:3489363), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006525110 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mediator of cell motility 1 (Memo1), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1 /// GENSCAN00000005003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:74221056:74316279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1
NM_001146222 // RefSeq // Mus musculus dpy-30 homolog (C. elegans) (Dpy30), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_001146223 // RefSeq // Mus musculus dpy-30 homolog (C. elegans) (Dpy30), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_001146224 // RefSeq // Mus musculus dpy-30 homolog (C. elegans) (Dpy30), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_024428 // RefSeq // Mus musculus dpy-30 homolog (C. elegans) (Dpy30), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:74299474:74316394:-1 gene:ENSMUSG00000024067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000164832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:74299474:74323944:-1 gene:ENSMUSG00000024067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AY297538 // GenBank // Mus musculus dosage compensation-related protein DPY30 mRNA, complete cds. // chr17 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// BC002240 // GenBank // Mus musculus dpy-30 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:7522 IMAGE:3491912), complete cds. // chr17 // 78 // 96 // 21 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:74221056:74316279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_025381 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit F (Atp6v1f), mRNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000004396 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:6:29467718:29470512:1 gene:ENSMUSG00000004285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK152929 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830091G12 product:ATPase, H+ transporting, V1 subunit F, full insert sequence. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC016553 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit F, mRNA (cDNA clone MGC:29006 IMAGE:2812592), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006505160 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit F (Atp6v1f), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000143101 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:6:29468068:29470512:1 gene:ENSMUSG00000004285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000149646 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:6:29468068:29470512:1 gene:ENSMUSG00000004285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000047117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:6:29467817:29470268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:74329533:74332529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
GENSCAN00000005182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:74329533:74332529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
NM_001033367 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 4 (Nlrc4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000052124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:74426295:74459108:-1 gene:ENSMUSG00000039193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:74426842:74458236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_133747 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 98, member A (Fam98a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000112507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:75537086:75551946:-1 gene:ENSMUSG00000002017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK046481 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230397M13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC004626 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 98, member A, mRNA (cDNA clone MGC:7991 IMAGE:3585698), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000140729 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:75539031:75540572:-1 gene:ENSMUSG00000002017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// ENSMUST00000141969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:75544467:75551796:-1 gene:ENSMUSG00000002017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000043037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:75538165:75551793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
ENSMUST00000083359 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:76111197:76111304:-1 gene:ENSMUSG00000065293 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT030671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000086601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:76284415:76284861:-1 gene:ENSMUSG00000066958 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:76114778:76284861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 85 // 72 // 11 // 13 // 0 /// NONMMUT030672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000039375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:78177590:78177947:-1 gene:ENSMUSG00000037064 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT030675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000034048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:78176276:78177947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1
NM_001285940 // RefSeq // Mus musculus fasciculation and elongation protein zeta 2 (zygin II) (Fez2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_199448 // RefSeq // Mus musculus fasciculation and elongation protein zeta 2 (zygin II) (Fez2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000070039 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:78377885:78418131:-1 gene:ENSMUSG00000056121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000112487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:78377885:78418131:-1 gene:ENSMUSG00000056121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AY382580 // GenBank // Mus musculus fasciculation and elongation protein zeta 2 (Fez2) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// BC096619 // GenBank // Mus musculus fasciculation and elongation protein zeta 2 (zygin II), mRNA (cDNA clone MGC:106053 IMAGE:6391451), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NM_001285946 // RefSeq // Mus musculus fasciculation and elongation protein zeta 2 (zygin II) (Fez2), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// NM_001285949 // RefSeq // Mus musculus fasciculation and elongation protein zeta 2 (zygin II) (Fez2), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 82 // 82 // 31 // 38 // 1 /// GENSCAN00000034036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:78400444:78418083:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1
NM_011500 // RefSeq // Mus musculus striatin, calmodulin binding protein (Strn), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000024881 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:78654596:78688817:-1 gene:ENSMUSG00000024077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000145480 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:78667196:78684352:-1 gene:ENSMUSG00000024077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000145910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:78649913:78737196:-1 gene:ENSMUSG00000024077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK136032 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420449F11 product:striatin, calmodulin binding protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC090968 // GenBank // Mus musculus striatin, calmodulin binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:106672 IMAGE:30646517), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC150727 // GenBank // Mus musculus striatin, calmodulin binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:183638 IMAGE:9087638), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:78655490:78704672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
BC019508 // GenBank // Mus musculus HEAT repeat containing 5B, mRNA (cDNA clone IMAGE:4237004), complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001081179 // RefSeq // Mus musculus HEAT repeat containing 5B (Heatr5b), mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000097281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:78752906:78835381:-1 gene:ENSMUSG00000039414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// AK052391 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330050P16 product:hypothetical ATP/GTP-binding site motif A (P-loop) containing protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// AK146166 // GenBank HTC // Mus musculus CRL-1722 L5178Y-R cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I730027B06 product:Hypothetical ARM repeat structure containing protein (Fragment), full insert sequence. // chr17 // 81 // 68 // 22 // 27 // 0 /// BC086652 // GenBank // Mus musculus HEAT repeat containing 5B, mRNA (cDNA clone MGC:77977 IMAGE:6856641), complete cds. // chr17 // 95 // 55 // 21 // 22 // 0 /// AK053037 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930028M17 product:hypothetical ARM repeat structure containing protein, full insert sequence. // chr17 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1 /// AK141783 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030067L04 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr17 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// GENSCAN00000034022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:78753032:78835542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0
NR_003363 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6548 (Gm6548), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000167498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:78850792:78851956:-1 gene:ENSMUSG00000091549 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:78850789:78852164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0
NM_011163 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 2 (Eif2ak2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006523863 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 2 (Eif2ak2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000024884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:78852564:78882573:-1 gene:ENSMUSG00000024079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000171852 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:78873778:78882548:-1 gene:ENSMUSG00000024079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC016422 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:11397 IMAGE:3964935), complete cds. // chr17 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// M65029 // GenBank // Mouse serine/threonine kinase mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// M93567 // GenBank // Mus musculus interferon-induced double-stranded RNA-activated p68 kinase mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:78855139:78906992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_001163625 // RefSeq // Mus musculus sulfotransferase family, cytosolic, 6B, member 1 (Sult6b1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042683 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:78885066:78906899:-1 gene:ENSMUSG00000038045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000146474 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:78884897:78895100:-1 gene:ENSMUSG00000038045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000159710 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:78885066:78906899:-1 gene:ENSMUSG00000038045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000169544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:78883938:78906992:-1 gene:ENSMUSG00000038045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK010729 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410078J06 product:weakly similar to SULFOTRANSFERASE [Gallus gallus], full insert sequence. // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000034014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:78855139:78906992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001024806 // RefSeq // Mus musculus CCAAT/enhancer binding protein zeta (Cebpz), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000024885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:78919006:78937070:-1 gene:ENSMUSG00000024081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U19891 // GenBank // Mus musculus putative CCAAT binding factor 1 (mCBF) mRNA, alternatively spliced transcript mCBF1, complete cds. // chr17 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// U19892 // GenBank // Mus musculus putative CCAAT binding factor 2 (mCBF) mRNA, alternatively spliced transcript mCBF2, complete cds. // chr17 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:78919881:78937030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
GENSCAN00000045579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:79103234:79165002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_026514 // RefSeq // Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3 (Cdc42ep3), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006524295 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3 (Cdc42ep3), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000068958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:79334025:79355091:-1 gene:ENSMUSG00000036533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC021409 // GenBank // Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3, mRNA (cDNA clone MGC:29409 IMAGE:5007192), complete cds. // chr17 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC034714 // GenBank // Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3, mRNA (cDNA clone MGC:11796 IMAGE:3595315), complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC092297 // GenBank // Mus musculus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3, mRNA (cDNA clone MGC:103096 IMAGE:5063754), complete cds. // chr17 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NR_033462 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10494 (Gm10494), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:79493353:79510518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 96 // 18 // 24 // 0 /// KnowTID_00003732 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009994 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 1, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp1b1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006523577 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 1, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp1b1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// XR_385277 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 1, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp1b1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000024894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:79706953:79715041:-1 gene:ENSMUSG00000024087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC050063 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 1, subfamily b, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:60612 IMAGE:30007248), complete cds. // chr17 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// U03283 // GenBank // Mus musculus C3H cytochrome P450 (Cyp1b1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:79710093:79714311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_001286647 // RefSeq // Mus musculus atlastin GTPase 2 (Atl2), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 64 // 64 // 0 /// NM_019717 // RefSeq // Mus musculus atlastin GTPase 2 (Atl2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 64 // 64 // 0 /// NM_178050 // RefSeq // Mus musculus atlastin GTPase 2 (Atl2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 62 // 62 // 0 /// XM_006524656 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus atlastin GTPase 2 (Atl2), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 62 // 62 // 0 /// ENSMUST00000068282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:79848392:79896028:-1 gene:ENSMUSG00000059811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 64 // 64 // 0 /// ENSMUST00000112437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:79848392:79896123:-1 gene:ENSMUSG00000059811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 62 // 62 // 0 /// AF133670 // GenBank // Mus musculus ARL-6 interacting protein-2 (Aip-2) mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 36 // 23 // 25 // 0 /// AK032050 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330563G07 product:ADP-ribosylation-like factor 6 interacting protein 2, full insert sequence. // chr17 // 100 // 70 // 49 // 49 // 0 /// BC060501 // GenBank // Mus musculus atlastin GTPase 2, mRNA (cDNA clone MGC:65383 IMAGE:5362692), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 60 // 60 // 0 /// BC051095 // GenBank HTC // Mus musculus atlastin GTPase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4504369), with apparent retained intron. // chr17 // 56 // 56 // 39 // 70 // 1 /// GENSCAN00000045560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:79850686:79921324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 42 // 70 // 1
NM_001195485 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 7 (Srsf7), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_001195486 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 7 (Srsf7), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_001195487 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 7 (Srsf7), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NM_146083 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 7 (Srsf7), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NR_036615 // RefSeq // Mus musculus serine/arginine-rich splicing factor 7 (Srsf7), transcript variant 5, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000063417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:80200089:80207305:-1 gene:ENSMUSG00000024097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AK045884 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230317H03 product:SPLICING FACTOR, ARGININE/SERINE-RICH 7 (SPLICING FACTOR 9G8) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr17 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC014857 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 7, mRNA (cDNA clone MGC:6268 IMAGE:2646366), complete cds. // chr17 // 86 // 64 // 18 // 21 // 0 /// BC025529 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 7, mRNA (cDNA clone MGC:38287 IMAGE:5342587), complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC027391 // GenBank // Mus musculus splicing factor, arginine/serine-rich 7, mRNA (cDNA clone MGC:36924 IMAGE:4945988), complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:80183363:80207202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NR_028385 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10190 (Gm10190), long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000086549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:80373218:80373541:-1 gene:ENSMUSG00000066938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009231 // RefSeq // Mus musculus son of sevenless homolog 1 (Drosophila) (Sos1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000068714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:80393752:80480453:-1 gene:ENSMUSG00000024241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AK140310 // GenBank HTC // Mus musculus adult male adrenal gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B330033M09 product:Son of sevenless homolog 1 (Drosophila), full insert sequence. // chr17 // 87 // 87 // 41 // 47 // 1 /// GENSCAN00000033529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:80398181:80463762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 38 // 38 // 0
NM_001033443 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase-like 4 (Cdkl4), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006524526 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin-dependent kinase-like 4 (Cdkl4), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524527 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin-dependent kinase-like 4 (Cdkl4), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006524530 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin-dependent kinase-like 4 (Cdkl4), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// XM_006524532 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclin-dependent kinase-like 4 (Cdkl4), transcript variant X7, mRNA. // chr17 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000086545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:80523550:80563834:-1 gene:ENSMUSG00000033966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC138986 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:170613 IMAGE:8862008), complete cds. // chr17 // 84 // 76 // 21 // 25 // 0 /// BC138988 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:170615 IMAGE:8862010), complete cds. // chr17 // 84 // 76 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:80523363:80560517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_001290345 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 (Map4k3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000025089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:80580512:80728093:-1 gene:ENSMUSG00000024242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000112389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:80580512:80728093:-1 gene:ENSMUSG00000024242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC006037 // GenBank HTC // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3493073). // chr17 // 95 // 57 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:80583240:80628317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
XM_006524962 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus THUMP domain containing 2 (Thumpd2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006524963 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus THUMP domain containing 2 (Thumpd2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// XM_006524964 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus THUMP domain containing 2 (Thumpd2), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NM_028138 // RefSeq // Mus musculus THUMP domain containing 2 (Thumpd2), mRNA. // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENSMUST00000025093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:81026327:81065085:-1 gene:ENSMUSG00000024246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000044749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:81026571:81065060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001112798 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1 (Slc8a1), transcript variant B, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001286684 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1 (Slc8a1), transcript variant C, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_011406 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1 (Slc8a1), transcript variant A, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_104580 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1 (Slc8a1), transcript variant D, non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094585 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30621011). // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC038249 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5365436, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT030788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT030787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
ENSMUST00000181557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:81791555:81791933:-1 gene:ENSMUSG00000097897 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000044745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:81783798:81803622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000044739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:81893971:81980133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
NM_001159529 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2-like (Cox7a2l), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_009187 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2-like (Cox7a2l), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000025095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:83501919:83514333:-1 gene:ENSMUSG00000024248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000167741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:83501919:83514333:-1 gene:ENSMUSG00000024248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC004715 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:6048 IMAGE:3582142), complete cds. // chr17 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0 /// BC085296 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:103208 IMAGE:5337317), complete cds. // chr17 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0
NM_153512 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 3 (Kcng3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:83585957:83631895:-1 gene:ENSMUSG00000045053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF454551 // GenBank // Mus musculus voltage-gated potassium channel subunit Kv10.1a mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// AF454552 // GenBank // Mus musculus voltage-gated potassium channel subunit Kv10.1b mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:83502603:83631618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001001806 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 36, C3H type-like 2 (Zfp36l2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000060366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:84183931:84187947:-1 gene:ENSMUSG00000045817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC006189 // GenBank HTC // Mus musculus zinc finger protein 36, C3H type-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3603695). // chr17 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC139416 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 36, C3H type-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:171043 IMAGE:8862438), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// M58564 // GenBank // Mouse TIS11 primary response gene, complete cds. // chr17 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AK142565 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630039C13 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr17 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000010010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:84185753:84358054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
XM_006524280 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thyroid adenoma associated (Thada), transcript variant X7, mRNA. // chr17 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// XR_385327 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thyroid adenoma associated (Thada), transcript variant X9, misc_RNA. // chr17 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// AK154078 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430036C19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// AK170056 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630013F12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// NM_183021 // RefSeq // Mus musculus thyroid adenoma associated (Thada), mRNA. // chr17 // 97 // 97 // 38 // 39 // 1 /// ENSMUST00000047524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:84190056:84466196:-1 gene:ENSMUSG00000024251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 97 // 38 // 39 // 1 /// EF222207 // GenBank // Mus musculus thyroid adenoma-associated protein (THADA) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 38 // 39 // 1 /// XM_006524279 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thyroid adenoma associated (Thada), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// AK173258 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1767 protein. // chr17 // 38 // 38 // 15 // 39 // 1 /// BC052885 // GenBank // Mus musculus thyroid adenoma associated, mRNA (cDNA clone IMAGE:30053240), complete cds. // chr17 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1 /// GENSCAN00000009994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:84372770:84482813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 46 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:84185753:84358054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1
ENSMUST00000083798 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:84287641:84287747:-1 gene:ENSMUSG00000065732 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONMMUT030911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NM_031884 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 5 (Abcg5), mRNA. // chr17 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000066175 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:84658234:84683011:-1 gene:ENSMUSG00000040505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000171544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:84669917:84674370:-1 gene:ENSMUSG00000040505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000172439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:84670395:84676426:-1 gene:ENSMUSG00000040505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// AF312713 // GenBank // Mus musculus sterolin (Abcg5) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY195872 // GenBank // Mus musculus strain I/LnJ ATP-binding cassette sub-family G member 5 (Abcg5) mRNA, complete cds. // chr17 // 76 // 100 // 22 // 29 // 0 /// AY195873 // GenBank // Mus musculus strain PERA/Ei ATP-binding cassette sub-family G member 5 (Abcg5) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC106766 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:123400 IMAGE:40039484), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163375 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:84658488:84682202:-1 gene:ENSMUSG00000040505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000009999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:84658488:84682873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001163622 // RefSeq // Mus musculus prolyl endopeptidase-like (Prepl), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001163623 // RefSeq // Mus musculus prolyl endopeptidase-like (Prepl), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_001163624 // RefSeq // Mus musculus prolyl endopeptidase-like (Prepl), transcript variant 4, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NM_145984 // RefSeq // Mus musculus prolyl endopeptidase-like (Prepl), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000072406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:85063477:85090267:-1 gene:ENSMUSG00000024127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000171795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:85063477:85090267:-1 gene:ENSMUSG00000024127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK129142 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0436 protein. // chr17 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// BC004612 // GenBank // Mus musculus prolyl endopeptidase-like, mRNA (cDNA clone MGC:7980 IMAGE:3585402), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK163108 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530086K04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000033386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:85064644:85088552:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_011380 // RefSeq // Mus musculus sine oculis-related homeobox 2 (Six2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000024947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:85684282:85688254:-1 gene:ENSMUSG00000024134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000163568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:85684277:85688274:-1 gene:ENSMUSG00000024134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC068021 // GenBank // Mus musculus sine oculis-related homeobox 2 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:70123 IMAGE:6394139), complete cds. // chr17 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// X80338 // GenBank // M.musculus Six2 mRNA. // chr17 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// AK142139 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230050D09 product:sine oculis-related homeobox 2 homolog (Drosophila), full insert sequence. // chr17 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:85685183:85687952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NM_030133 // RefSeq // Mus musculus S1 RNA binding domain 1 (Srbd1), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 55 // 55 // 0 /// XM_006525140 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus S1 RNA binding domain 1 (Srbd1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 61 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000095187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:85984665:86145175:-1 gene:ENSMUSG00000024135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 55 // 55 // 0 /// BC038140 // GenBank // Mus musculus S1 RNA binding domain 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:1384147), complete cds. // chr17 // 100 // 47 // 30 // 30 // 0 /// BC100359 // GenBank // Mus musculus S1 RNA binding domain 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30936325), complete cds. // chr17 // 100 // 64 // 41 // 41 // 0 /// BC147429 // GenBank // Mus musculus S1 RNA binding domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:182588 IMAGE:9056482), complete cds. // chr17 // 100 // 38 // 24 // 24 // 0 /// BC147430 // GenBank // Mus musculus S1 RNA binding domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:182585 IMAGE:9056479), complete cds. // chr17 // 100 // 38 // 24 // 24 // 0 /// BC172066 // GenBank // Mus musculus S1 RNA binding domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:198771 IMAGE:9054352), complete cds. // chr17 // 100 // 41 // 26 // 26 // 0 /// XM_006525139 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus S1 RNA binding domain 1 (Srbd1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 50 // 50 // 32 // 64 // 1 /// BC172071 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:198776 IMAGE:9054357, complete cds. // chr17 // 28 // 28 // 18 // 64 // 1 /// GENSCAN00000016855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:85994737:86161423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000033376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:85958902:85988484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 16 // 16 // 10 // 64 // 1
ENSMUST00000095186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:86497732:86505232:-1 gene:ENSMUSG00000071036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK076576 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921519B16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_029121 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit E2 (Atp6v1e2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:86944109:86947887:-1 gene:ENSMUSG00000053375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB074757 // GenBank // Mus musculus mRNA for V-ATPase E1 subunit, complete cds. // chr17 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// BC049547 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit E2, mRNA (cDNA clone MGC:58119 IMAGE:6770428), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061059 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit E2, mRNA (cDNA clone MGC:74170 IMAGE:6744043), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:86944288:86944968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_008838 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class F (Pigf), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006523831 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class F (Pigf), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000024957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:86997256:87025406:-1 gene:ENSMUSG00000024145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC028862 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class F, mRNA (cDNA clone MGC:18392 IMAGE:3673399), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D50264 // GenBank // Mus musculus Pig-f mRNA for phosphatidylinositol glycan class F, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_029298 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700011E24 gene (1700011E24Rik), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006525072 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700011E24 gene (1700011E24Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XR_385380 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700011E24 gene (1700011E24Rik), transcript variant X5, misc_RNA. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000040609 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:87389571:87427741:-1 gene:ENSMUSG00000036557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006525070 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700011E24 gene (1700011E24Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// XM_006525073 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700011E24 gene (1700011E24Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSMUST00000186211 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:17:87411205:87427708:-1 gene:ENSMUSG00000036557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000187078 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:87389576:87427687:-1 gene:ENSMUSG00000036557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000189487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:87417500:87427635:-1 gene:ENSMUSG00000036557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000018148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:87405735:87603450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_007589 // RefSeq // Mus musculus calmodulin 2 (Calm2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000040440 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:17:87433412:87446935:-1 gene:ENSMUSG00000036438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AK002974 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0710001N16 product:calmodulin 2, full insert sequence. // chr17 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// BC021347 // GenBank // Mus musculus calmodulin 2, mRNA (cDNA clone MGC:29145 IMAGE:4006686), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC051444 // GenBank // Mus musculus calmodulin 2, mRNA (cDNA clone MGC:60634 IMAGE:30072702), complete cds. // chr17 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// BC100301 // GenBank // Mus musculus calmodulin 2, mRNA (cDNA clone MGC:117494 IMAGE:30526959), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_199251 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 12 (Kcnk12), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:87745837:87797994:-1 gene:ENSMUSG00000050138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AB052939 // GenBank // Mus musculus mntk1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138133 // GenBank // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:169757 IMAGE:8861152), complete cds. // chr17 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// BC138134 // GenBank // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:169758 IMAGE:8861153), complete cds. // chr17 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// XM_006523971 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 12 (Kcnk12), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001081034 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 11 (Fbxo11), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006524204 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box protein 11 (Fbxo11), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000005504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:17:87990859:88065291:-1 gene:ENSMUSG00000005371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000127334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:87993213:88000982:-1 gene:ENSMUSG00000005371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr17 // 93 // 33 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000130379 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:17:87990859:88065028:-1 gene:ENSMUSG00000005371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000135639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:87991418:88008696:-1 gene:ENSMUSG00000005371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr17 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// BC117884 // GenBank // Mus musculus F-box protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:143993 IMAGE:40096054), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC117885 // GenBank // Mus musculus F-box protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:143994 IMAGE:40096055), complete cds. // chr17 // 93 // 96 // 41 // 44 // 0 /// BC128479 // GenBank // Mus musculus F-box protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:156416 IMAGE:40096053), complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000004740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:87992046:88071128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// BC088730 // GenBank HTC // Mus musculus F-box protein 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:4237432), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
ENSMUST00000093636 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:88392826:88392932:-1 gene:ENSMUSG00000095624 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT031087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_013582 // RefSeq // Mus musculus luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor (Lhcgr), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006523726 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor (Lhcgr), transcript variant X8, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000024916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:88741549:88791976:-1 gene:ENSMUSG00000024107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M81310 // GenBank // Mouse luteinizing hormone receptor mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK030325 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5031438A04 product:LUTROPIN-CHORIOGONADOTROPIC HORMONE RECEPTOR PRECURSOR, full insert sequence. // chr17 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// AK138461 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330016A07 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr17 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000004737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:88741994:88791971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_013523 // RefSeq // Mus musculus follicle stimulating hormone receptor (Fshr), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000035701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:88985170:89200612:-1 gene:ENSMUSG00000032937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AF095642 // GenBank // Mus musculus follicle stimulating hormone receptor (Fshr) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC137990 // GenBank // Mus musculus follicle stimulating hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:169614 IMAGE:8861009), complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// BC137991 // GenBank // Mus musculus follicle stimulating hormone receptor, mRNA (cDNA clone MGC:169615 IMAGE:8861010), complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0
GENSCAN00000003731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:92371972:92460576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_176917 // RefSeq // Mus musculus methyltransferase like 4 (Mettl4), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:94727080:94749892:-1 gene:ENSMUSG00000055660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC099943 // GenBank // Mus musculus methyltransferase like 4, mRNA (cDNA clone MGC:107417 IMAGE:30020588), complete cds. // chr17 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:94683179:94747877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NR_045963 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1976 (Gm1976), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NR_045964 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1976 (Gm1976), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000084298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:94761250:94764541:-1 gene:ENSMUSG00000066057 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000182639 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:17:94759944:94834799:-1 gene:ENSMUSG00000066057 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT031160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT031161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT031162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000083724 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:17:94869873:94869988:-1 gene:ENSMUSG00000065658 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT031186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_146937 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 63 (Olfr63), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000067840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:17:33268722:33269676:1 gene:ENSMUSG00000054666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC127997 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 63, mRNA (cDNA clone MGC:157574 IMAGE:40135782), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:33268726:33304409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_026505 // RefSeq // Mus musculus BMP and activin membrane-bound inhibitor (Bambi), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:3507957:3516404:1 gene:ENSMUSG00000024232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF153440 // GenBank // Mus musculus Nma (Nma) mRNA, complete cds. // chr18 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0 /// BC019378 // GenBank // Mus musculus BMP and activin membrane-bound inhibitor, homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:30413 IMAGE:5009872), complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:3507317:3512400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_026092 // RefSeq // Mus musculus lysozyme-like 1 (Lyzl1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025076 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:4165832:4182232:1 gene:ENSMUSG00000024233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120837 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:4165862:4182232:1 gene:ENSMUSG00000024233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// AY572447 // GenBank // Mus musculus lysozyme-like protein 2 (Lyc2) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC048450 // GenBank // Mus musculus lysozyme-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:58168 IMAGE:6774504), complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:4148257:4186295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_026157 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial poly(A) polymerase (Mtpap), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:4375592:4397330:1 gene:ENSMUSG00000024234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK045203 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130046L03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// BC057643 // GenBank // Mus musculus mitochondrial poly(A) polymerase, mRNA (cDNA clone MGC:67857 IMAGE:2616306), complete cds. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:4351084:4642562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
AK043736 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830026L17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081963 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9430020K01 gene (9430020K01Rik), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:4634929:4682868:1 gene:ENSMUSG00000033960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC144919 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9430020K01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178475 IMAGE:9053467), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:4672651:4743876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0
NR_045881 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10556 (Gm10556), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180904 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:18:4812486:4850959:1 gene:ENSMUSG00000097043 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003771 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT031313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC025933 // GenBank // Mus musculus predicted gene, ENSMUSG00000073645, mRNA (cDNA clone IMAGE:5068496), partial cds. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
GENSCAN00000003347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:6493471:6557799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_027598 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4921524L21 gene (4921524L21Rik), mRNA. // chr18 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// XM_006526244 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4921524L21 gene (4921524L21Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:6603633:6638966:1 gene:ENSMUSG00000039540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC049627 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921524L21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58359 IMAGE:6706381), complete cds. // chr18 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:6565427:6675289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_001278447 // RefSeq // Mus musculus RAB18, member RAS oncogene family (Rab18), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_181070 // RefSeq // Mus musculus RAB18, member RAS oncogene family (Rab18), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000097680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:6765205:6790231:1 gene:ENSMUSG00000073639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB232612 // GenBank // Mus musculus Rab18 mRNA for Rab18, complete cds. // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC056351 // GenBank // Mus musculus RAB18, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:73458 IMAGE:6807284), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// L04966 // GenBank // Mus musculus ras-related protein (rab18) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// M79308 // GenBank // Mus musculus GTP-binding protein RAB18 mRNA, partial cds. // chr18 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000003350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:6772669:6881900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
GENSCAN00000034225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:7504097:7549526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000072582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:7581516:7581923:1 gene:ENSMUSG00000094334 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:7581516:7581923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000033582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:8051203:8051995:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
AK145555 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0015F22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// KnowTID_00003776 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr18 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_008058 // RefSeq // Mus musculus frizzled homolog 8 (Drosophila) (Fzd8), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:9212856:9216201:1 gene:ENSMUSG00000036904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132543 // GenBank // Mus musculus frizzled homolog 8 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:164174 IMAGE:40130820), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138062 // GenBank // Mus musculus frizzled homolog 8 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:169686 IMAGE:8861081), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:9212920:9214977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000023584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:9495621:9496484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 80 // 15 // 16 // 0
GENSCAN00000023570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:9629731:9630960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
NM_130449 // RefSeq // Mus musculus collectin sub-family member 12 (Colec12), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006525640 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collectin sub-family member 12 (Colec12), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000040069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:9707648:9877995:1 gene:ENSMUSG00000036103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AB038519 // GenBank // Mus musculus srcl mRNA for scavenger receptor with C-type lectin, complete cds. // chr18 // 90 // 97 // 28 // 31 // 0 /// AB078434 // GenBank // Mus musculus CL-P1 mRNA for collectin placenta 1, complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC057936 // GenBank // Mus musculus collectin sub-family member 12, mRNA (cDNA clone MGC:68108 IMAGE:5326386), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000023577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:9813288:9910505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
AK132205 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3426401L04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000023577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:9813288:9910505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000165917 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:9916927:9917758:1 gene:ENSMUSG00000092039 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000023573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:9916925:9917761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_153552 // RefSeq // Mus musculus THO complex 1 (Thoc1), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000025137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:9958180:9995484:1 gene:ENSMUSG00000024287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// AK168619 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920038L16 product:THO complex 1, full insert sequence. // chr18 // 95 // 91 // 41 // 43 // 0 /// BC024951 // GenBank // Mus musculus THO complex 1, mRNA (cDNA clone MGC:28284 IMAGE:4010605), complete cds. // chr18 // 98 // 91 // 42 // 43 // 0 /// BC027149 // GenBank // Mus musculus THO complex 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4947434), partial cds. // chr18 // 100 // 66 // 31 // 31 // 0 /// AK047991 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130028D08 product:NUCLEAR MATRIX PROTEIN P84 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 40 // 40 // 19 // 47 // 1 /// GENSCAN00000015616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:9968751:9993616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 43 // 20 // 20 // 0
NM_175112 // RefSeq // Mus musculus RAE1 RNA export 1 homolog (S. pombe) (Rae1), mRNA. // chr18 // 43 // 100 // 10 // 23 // 0 /// XM_006500024 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAE1 RNA export 1 homolog (S. pombe) (Rae1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 43 // 100 // 10 // 23 // 0 /// ENSMUST00000029013 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:173000117:173015739:1 gene:ENSMUSG00000027509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 43 // 100 // 10 // 23 // 0 /// BC059051 // GenBank // Mus musculus RAE1 RNA export 1 homolog (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:69835 IMAGE:6818771), complete cds. // chr18 // 43 // 100 // 10 // 23 // 0 /// BC060072 // GenBank // Mus musculus RAE1 RNA export 1 homolog (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:73449 IMAGE:5718934), complete cds. // chr18 // 43 // 100 // 10 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:10262207:10263012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 83 // 52 // 10 // 12 // 0
NM_001083628 // RefSeq // Mus musculus growth regulation by estrogen in breast cancer-like (Greb1l), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526069 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus growth regulation by estrogen in breast cancer-like (Greb1l), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048977 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:10325179:10562934:1 gene:ENSMUSG00000042942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147570 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AK220484, mRNA (cDNA clone MGC:182666 IMAGE:9056560), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000172532 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:10458225:10538289:1 gene:ENSMUSG00000042942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// ENSMUST00000173356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:10325177:10502412:1 gene:ENSMUSG00000042942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// AK142556 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630033P06 product:weakly similar to GREB1c [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000015622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:10458225:10478377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000015624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:10496601:10560483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001083628 // RefSeq // Mus musculus growth regulation by estrogen in breast cancer-like (Greb1l), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048977 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:10325179:10562934:1 gene:ENSMUSG00000042942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147570 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence AK220484, mRNA (cDNA clone MGC:182666 IMAGE:9056560), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// XM_006526069 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus growth regulation by estrogen in breast cancer-like (Greb1l), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000172680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:10510705:10553704:1 gene:ENSMUSG00000042942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000015624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:10496601:10560483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
NM_009226 // RefSeq // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein D1 (Snrpd1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000002551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:10617796:10628230:1 gene:ENSMUSG00000002477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC024875 // GenBank // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein D1, mRNA (cDNA clone MGC:18517 IMAGE:4009014), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// M58558 // GenBank // Mus musculus Sm-D autoantigen mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:10609750:10627870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1
ENSMUST00000157191 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:10757536:10757657:1 gene:ENSMUSG00000087816 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT031460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_010258 // RefSeq // Mus musculus GATA binding protein 6 (Gata6), mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006525657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GATA binding protein 6 (Gata6), transcript variant X6, mRNA. // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000047762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:11052510:11085635:1 gene:ENSMUSG00000005836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF179425 // GenBank // Mus musculus transcription factor GATA-6 (Gata6) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AK053151 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030017M08 product:TRANSCRIPTION FACTOR GATA-6 (FRAGMENT) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr18 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000002403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:11054073:11084482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001146287 // RefSeq // Mus musculus CDK5 and Abl enzyme substrate 1 (Cables1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_022021 // RefSeq // Mus musculus CDK5 and Abl enzyme substrate 1 (Cables1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000046948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:11839274:11945627:1 gene:ENSMUSG00000040957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000171109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:11839220:11945621:1 gene:ENSMUSG00000040957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF133208 // GenBank // Mus musculus cdk-binding protein (Cables) mRNA, complete cds. // chr18 // 84 // 91 // 27 // 32 // 0 /// AF328140 // GenBank // Mus musculus cdk3-binding protein ik3-1 mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 77 // 25 // 27 // 0 /// BC043661 // GenBank // Mus musculus Cdk5 and Abl enzyme substrate 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5008325). // chr18 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// BC145142 // GenBank // Mus musculus CDK5 and Abl enzyme substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:178701 IMAGE:9053693), complete cds. // chr18 // 86 // 83 // 25 // 29 // 0 /// BC150714 // GenBank // Mus musculus CDK5 and Abl enzyme substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:183625 IMAGE:9087625), complete cds. // chr18 // 86 // 83 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:11839806:11893133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// GENSCAN00000002398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:11896798:11954591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_024182 // RefSeq // Mus musculus RIO kinase 3 (Riok3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_386007 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIO kinase 3 (Riok3), transcript variant X2, misc_RNA. // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:12128850:12157367:1 gene:ENSMUSG00000024404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK167309 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days pregnant adult female placenta cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530003E14 product:RIO kinase 3 (yeast), full insert sequence. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC033271 // GenBank // Mus musculus RIO kinase 3 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:25438 IMAGE:4016197), complete cds. // chr18 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:12128911:12155327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000122799 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:12163438:12163556:1 gene:ENSMUSG00000084748 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT031509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_010680 // RefSeq // Mus musculus laminin, alpha 3 (Lama3), mRNA. // chr18 // 100 // 99 // 74 // 74 // 0 /// XM_006525687 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus laminin, alpha 3 (Lama3), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 60 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000092070 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:12333819:12583013:1 gene:ENSMUSG00000024421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 99 // 74 // 74 // 0 /// X84013 // GenBank // M.musculus mRNA for laminin-5, alpha3A chain. // chr18 // 97 // 51 // 37 // 38 // 0 /// ENSMUST00000188815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:12504199:12583013:1 gene:ENSMUSG00000024421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 51 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000033482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:12502928:12591328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 97 // 44 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:12438357:12498055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 20 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000033475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:12334024:12424920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 13 // 13 // 10 // 75 // 1
NM_028341 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 39C (Ttc39c), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526284 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 39C (Ttc39c), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025294 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:12643344:12737049:1 gene:ENSMUSG00000024424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000169401 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:12599926:12737050:1 gene:ENSMUSG00000024424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC020021 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 39C, mRNA (cDNA clone MGC:27740 IMAGE:2648772), complete cds. // chr18 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// AK077971 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030487O11 product:hypothetical Tetratricopeptide repeat (TPR) structure containing protein, full insert sequence. // chr18 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:12614798:12736763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
NM_008378 // RefSeq // Mus musculus impact, RWD domain protein (Impact), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006525684 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus impact, RWD domain protein (Impact), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:12972252:12992948:1 gene:ENSMUSG00000024423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC020524 // GenBank // Mus musculus imprinted and ancient, mRNA (cDNA clone MGC:18331 IMAGE:4223620), complete cds. // chr18 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// D87973 // GenBank // Mus musculus Impact mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000037307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:12959494:13019301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NM_153087 // RefSeq // Mus musculus histamine receptor H4 (Hrh4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525817 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histamine receptor H4 (Hrh4), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000041676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:13006990:13022882:1 gene:ENSMUSG00000037346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF358859 // GenBank // Mus musculus histamine H4 receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC111862 // GenBank // Mus musculus histamine receptor H4, mRNA (cDNA clone MGC:130500 IMAGE:40046148), complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// EU660534 // GenBank // Mus musculus histamine receptor H4 transcript variant 2 (Hrh4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr18 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000037307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:12959494:13019301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000069552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:14424868:14425311:1 gene:ENSMUSG00000055795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000036177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:14424868:14425311:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000036168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:14476189:14492246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001163609 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type, 8 (Psma8), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526294 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type, 8 (Psma8), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000040860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:14706151:14762299:1 gene:ENSMUSG00000036743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC019368 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type, 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:4010865), partial cds. // chr18 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// BC116990 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type, 8, mRNA (cDNA clone MGC:151367 IMAGE:40126309), complete cds. // chr18 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC116992 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type, 8, mRNA (cDNA clone MGC:151369 IMAGE:40126311), complete cds. // chr18 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC144771 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type, 8, mRNA (cDNA clone MGC:178327 IMAGE:9053319), complete cds. // chr18 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC144772 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type, 8, mRNA (cDNA clone MGC:178328 IMAGE:9053320), complete cds. // chr18 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000036173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:14706231:14761439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001100449 // RefSeq // Mus musculus TAF4B RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf4b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000169862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:14783245:14900359:1 gene:ENSMUSG00000054321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:14783595:14915107:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000012234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:15408543:15415403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0
AK145513 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0009C06 product:hypothetical DeoxyUTP pyrophosphatase/Aspartyl protease, retroviral-type family profile/Retrovirus capsid, C-terminal/Peptidase aspartic/Peptidase aspartic, active site containing protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:3054233:3054733:1 gene:ENSMUSG00000090025 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr18 // 50 // 100 // 13 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:179612622:179613567:-1 gene:ENSMUSG00000083410 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 38 // 100 // 10 // 26 // 0 /// KnowTID_00003789 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT031618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK145782 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0042P10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 50 // 100 // 13 // 26 // 0 /// KnowTID_00005135 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr18 // 50 // 100 // 13 // 26 // 0 /// NONMMUT044096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 50 // 100 // 13 // 26 // 0 /// AK139746 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020014N01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 31 // 100 // 8 // 26 // 0
NM_181680 // RefSeq // Mus musculus desmoglein 1 gamma (Dsg1c), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000054128 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:20247340:20285031:1 gene:ENSMUSG00000034774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AY192159 // GenBank // Mus musculus desmoglein 6 (Dsg6) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AY314983 // GenBank // Mus musculus desmoglein 1gamma (Dsg1gamma) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:20247440:20318380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
NM_181682 // RefSeq // Mus musculus desmoglein 1 beta (Dsg1b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006525821 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus desmoglein 1 beta (Dsg1b), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000076737 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:20376729:20410196:1 gene:ENSMUSG00000061928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY192158 // GenBank // Mus musculus desmoglein 5 (Dsg5) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY315940 // GenBank // Mus musculus desmoglein 1beta (Dsg1b) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC137927 // GenBank // Mus musculus desmoglein 1 beta, mRNA (cDNA clone MGC:169551 IMAGE:8860946), complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000035638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:20376935:20499887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
NM_181564 // RefSeq // Mus musculus desmoglein 4 (Dsg4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000019426 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:20436175:20471821:1 gene:ENSMUSG00000001804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB240192 // GenBank // Mus musculus dsg4 mRNA for desmoglein4, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY170623 // GenBank // Mus musculus desmoglein 4 (Dsg4) mRNA, partial cds. // chr18 // 90 // 28 // 9 // 10 // 0 /// AY191584 // GenBank // Mus musculus desmoglein 4 (Dsg4) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY227349 // GenBank // Mus musculus desmoglein 4 (Dsg4) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:20376935:20499887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_030596 // RefSeq // Mus musculus desmoglein 3 (Dsg3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000070892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:20510304:20541310:1 gene:ENSMUSG00000056632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK029018 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732482D04 product:desmoglein 3, full insert sequence. // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC132058 // GenBank // Mus musculus desmoglein 3, mRNA (cDNA clone MGC:163689 IMAGE:40130335), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC132639 // GenBank // Mus musculus desmoglein 3, mRNA (cDNA clone MGC:164270 IMAGE:40130916), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:20510375:20540255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_007883 // RefSeq // Mus musculus desmoglein 2 (Dsg2), mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000059787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:20558074:20604521:1 gene:ENSMUSG00000044393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000120102 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:20558155:20585553:1 gene:ENSMUSG00000044393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000121837 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:20558246:20582916:1 gene:ENSMUSG00000044393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// AB072269 // GenBank // Mus musculus mDSG2 mRNA for desmoglein 2, complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC020144 // GenBank // Mus musculus desmoglein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:3993281), complete cds. // chr18 // 93 // 43 // 14 // 15 // 0 /// BC044848 // GenBank // Mus musculus desmoglein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5355674), complete cds. // chr18 // 94 // 51 // 17 // 18 // 0 /// BC131653 // GenBank // Mus musculus desmoglein 2, mRNA (cDNA clone MGC:150160 IMAGE:40110529), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC131654 // GenBank // Mus musculus desmoglein 2, mRNA (cDNA clone MGC:150161 IMAGE:40110531), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:20558285:20602335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0
NM_013697 // RefSeq // Mus musculus transthyretin (Ttr), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000075312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:20665250:20674324:1 gene:ENSMUSG00000061808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024702 // GenBank // Mus musculus transthyretin, mRNA (cDNA clone MGC:18651 IMAGE:4192268), complete cds. // chr18 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// BC086926 // GenBank // Mus musculus transthyretin, mRNA (cDNA clone MGC:107649 IMAGE:6749152), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// D89076 // GenBank // Mus musculus mRNA for prealbumin, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:20665439:20673738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_026301 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 125 (Rnf125), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000050004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:20944625:20983848:1 gene:ENSMUSG00000033107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC116883 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 125, mRNA (cDNA clone MGC:151260 IMAGE:40126202), complete cds. // chr18 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// BC116887 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 125, mRNA (cDNA clone MGC:151264 IMAGE:40126206), complete cds. // chr18 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
NM_019706 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 138 (Rnf138), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_207623 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 138 (Rnf138), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006526117 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 138 (Rnf138), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:21001341:21028223:1 gene:ENSMUSG00000024317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000072847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:21001341:21028223:1 gene:ENSMUSG00000024317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AB025010 // GenBank // Mus musculus mRNA for Trif, complete cds. // chr18 // 92 // 76 // 23 // 25 // 0 /// AB025011 // GenBank // Mus musculus mRNA for Trif-d, complete cds. // chr18 // 92 // 79 // 24 // 26 // 0 /// BC003712 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 138, mRNA (cDNA clone MGC:5701 IMAGE:3593899), complete cds. // chr18 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT031642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:21002060:21070709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_008586 // RefSeq // Mus musculus meprin 1 beta (Mep1b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000082235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:21072344:21100199:1 gene:ENSMUSG00000024313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC125627 // GenBank // Mus musculus meprin 1 beta, mRNA (cDNA clone MGC:159330 IMAGE:40130142), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC145979 // GenBank // Mus musculus meprin 1 beta, mRNA (cDNA clone MGC:175866 IMAGE:40131282), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// L15193 // GenBank // Mus musculus meprin beta-subunit (Mep-1b) mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:21084081:21124059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000013874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:22189278:22319931:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_001167777 // RefSeq // Mus musculus additional sex combs like 3 (Drosophila) (Asxl3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006525739 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus additional sex combs like 3 (Drosophila) (Asxl3), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006525741 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus additional sex combs like 3 (Drosophila) (Asxl3), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006525742 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus additional sex combs like 3 (Drosophila) (Asxl3), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006525743 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus additional sex combs like 3 (Drosophila) (Asxl3), transcript variant X5, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000097655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:22345089:22530227:1 gene:ENSMUSG00000045215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000120223 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:22345089:22530015:1 gene:ENSMUSG00000045215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:22509131:22525549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000013869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:22371275:22465636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
GENSCAN00000001137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:23188534:23217561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
NM_027007 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 397 (Zfp397), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006526223 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 397 (Zfp397), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:23954688:23964671:1 gene:ENSMUSG00000024276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK013086 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810411K16 product:hypothetical SCAN domain containing protein, full insert sequence. // chr18 // 82 // 39 // 9 // 11 // 0 /// AY338468 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 397 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// AK078454 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720480F11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONMMUT031699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// NONMMUT031697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_011755 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 35 (Zfp35), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:23989632:24005376:1 gene:ENSMUSG00000063281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138830 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 35, mRNA (cDNA clone MGC:170457 IMAGE:8861852), complete cds. // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC138832 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 35, mRNA (cDNA clone MGC:170459 IMAGE:8861854), complete cds. // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
XM_006526202 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2700062C07 gene (2700062C07Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000097646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:24470861:24477765:1 gene:ENSMUSG00000024273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// AK012467 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2700062C07 product:weakly similar to PNAS-131 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// AK164298 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130008C05 product:weakly similar to PNAS-131 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// BC037075 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700062C07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:46767 IMAGE:5038294), complete cds. // chr18 // 92 // 80 // 11 // 12 // 0 /// BC084681 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700062C07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:103375 IMAGE:30144888), complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT031718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_021448 // RefSeq // Mus musculus elongator acetyltransferase complex subunit 2 (Elp2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006526130 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus elongator acetyltransferase complex subunit 2 (Elp2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000025120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:24603961:24638830:1 gene:ENSMUSG00000024271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF291064 // GenBank // Mus musculus Stat3-interacting protein mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// BC015284 // GenBank // Mus musculus elongation protein 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:18889 IMAGE:4239056), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC051943 // GenBank // Mus musculus elongation protein 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:62196 IMAGE:5686798), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AK044699 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930034F08 product:signal transducer and activator of transcription interacting protein 1, full insert sequence. // chr18 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// GENSCAN00000055043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:24603995:24775167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1
NM_026779 // RefSeq // Mus musculus molybdenum cofactor sulfurase (Mocos), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006526211 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus molybdenum cofactor sulfurase (Mocos), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000068006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:24653691:24701556:1 gene:ENSMUSG00000039616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK003797 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110018O12 product:similar to MOLYBDENUM COFACTOR SULFURASE [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 91 // 37 // 10 // 11 // 0 /// AK076385 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732481D19 product:similar to molybdenum cofactor sulfurase protein [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC113180 // GenBank // Mus musculus molybdenum cofactor sulfurase, mRNA (cDNA clone MGC:132885 IMAGE:40060723), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC113786 // GenBank // Mus musculus molybdenum cofactor sulfurase, mRNA (cDNA clone MGC:132884 IMAGE:40060721), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:24603995:24775167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001289654 // RefSeq // Mus musculus formin homology 2 domain containing 3 (Fhod3), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001289655 // RefSeq // Mus musculus formin homology 2 domain containing 3 (Fhod3), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_175276 // RefSeq // Mus musculus formin homology 2 domain containing 3 (Fhod3), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000037097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:24709445:25133500:1 gene:ENSMUSG00000034295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB078608 // GenBank // Mus musculus FHOS2 mRNA for FHOS2L splicing variant, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB078609 // GenBank // Mus musculus FHOS2 mRNA for FHOS2S splicing variant, complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB100088 // GenBank // Mus musculus FHOS2 mRNA for FHOS2M splicing variant, complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC060607 // GenBank // Mus musculus formin homology 2 domain containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5715874), complete cds. // chr18 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC138046 // GenBank // Mus musculus formin homology 2 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:169670 IMAGE:8861065), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:24935715:25115902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_181414 // RefSeq // Mus musculus phosphoinositide-3-kinase, class 3 (Pik3c3), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000091978 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:30272872:30343116:1 gene:ENSMUSG00000033628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000115811 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:30272870:30330968:1 gene:ENSMUSG00000033628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000115812 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:30272747:30348126:1 gene:ENSMUSG00000033628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:30272927:30348120:1 gene:ENSMUSG00000033628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK030578 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330434F23 product:similar to PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC024675 // GenBank // Mus musculus phosphoinositide-3-kinase, class 3, mRNA (cDNA clone MGC:30377 IMAGE:3661094), complete cds. // chr18 // 79 // 92 // 19 // 24 // 0 /// BC057678 // GenBank // Mus musculus phosphoinositide-3-kinase, class 3, mRNA (cDNA clone MGC:68341 IMAGE:3496633), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:30272951:30305647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000054589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:30308805:30353974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000181067 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:18:31440318:31449099:1 gene:ENSMUSG00000096934 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK043527 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830005M13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT031798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000164667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:31609512:31610751:1 gene:ENSMUSG00000092124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK138158 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230017L24 product:hypothetical Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172965 // RefSeq // Mus musculus Sin3A associated protein (Sap130), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000025109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:31634383:31723061:1 gene:ENSMUSG00000024260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000178164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:31634371:31723061:1 gene:ENSMUSG00000024260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC036975 // GenBank // Mus musculus Sin3A associated protein, 130kDa, mRNA (cDNA clone IMAGE:4935359). // chr18 // 94 // 38 // 15 // 16 // 0 /// BC063075 // GenBank // Mus musculus Sin3A associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:67538 IMAGE:5721433), complete cds. // chr18 // 97 // 86 // 35 // 36 // 0 /// BC066030 // GenBank // Mus musculus Sin3A associated protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:6417179), partial cds. // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK084078 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130084E01 product:similar to CDNA FLJ31417 FIS, CLONE NT2NE2000327, WEAKLY SIMILAR TO GLUCOAMYLASE S1/S2 PRECURSOR (EC 3.2.1.3) (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// GENSCAN00000018557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:31631407:31796128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
NM_001242430 // RefSeq // Mus musculus AMME chromosomal region gene 1-like (Ammecr1l), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_153515 // RefSeq // Mus musculus AMME chromosomal region gene 1-like (Ammecr1l), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:31759824:31784071:1 gene:ENSMUSG00000041915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC034661 // GenBank // Mus musculus AMME chromosomal region gene 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:32132 IMAGE:5137474), complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC056948 // GenBank // Mus musculus AMME chromosomal region gene 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:66664 IMAGE:6827318), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK030009 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932415E21 product:weakly similar to AMMECR1 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// AK054131 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230022H04 product:weakly similar to AMMECR1 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000018557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:31631407:31796128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_027002 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide D (Polr2d), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_027101 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide D (Polr2d), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526222 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide D (Polr2d), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000025106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:31789159:31796642:1 gene:ENSMUSG00000024258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK009093 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310002G05 product:DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II 16 KDA POLYPEPTIDE (EC 2.7.7.6) (RPB4) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC004810 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide D, mRNA (cDNA clone MGC:8083 IMAGE:3588284), complete cds. // chr18 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:31631407:31796128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
AK160455 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810036N14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AK005221 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500011M10 product:hypothetical Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_144862 // RefSeq // Mus musculus LIM and senescent cell antigen like domains 2 (Lims2), mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006525846 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus LIM and senescent cell antigen like domains 2 (Lims2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:31931507:31958619:1 gene:ENSMUSG00000024395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC010816 // GenBank // Mus musculus LIM and senescent cell antigen like domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:19129 IMAGE:4212305), complete cds. // chr18 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:31953944:31957990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_173441 // RefSeq // Mus musculus IWS1 homolog (S. cerevisiae) (Iws1), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XR_386017 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IWS1 homolog (S. cerevisiae) (Iws1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr18 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:32067734:32104331:1 gene:ENSMUSG00000024384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC068184 // GenBank // Mus musculus IWS1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93016 IMAGE:30639737), complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006526291 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus IWS1 homolog (S. cerevisiae) (Iws1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// GENSCAN00000020246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:32068006:32093667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0
NM_011946 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 (Map3k2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000096575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:32163089:32236751:1 gene:ENSMUSG00000024383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK143367 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330016G04 product:mitogen activated protein kinase kinase kinase 2, full insert sequence. // chr18 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:32163006:32269889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
NM_133658 // RefSeq // Mus musculus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3 (Ercc3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:32240300:32270151:1 gene:ENSMUSG00000024382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000142213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:32240354:32270151:1 gene:ENSMUSG00000024382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC016595 // GenBank // Mus musculus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3, mRNA (cDNA clone MGC:29007 IMAGE:3153847), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC026575 // GenBank // Mus musculus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3, mRNA (cDNA clone MGC:36555 IMAGE:4955015), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:32163006:32269889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_001083334 // RefSeq // Mus musculus bridging integrator 1 (Bin1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NM_009668 // RefSeq // Mus musculus bridging integrator 1 (Bin1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006525979 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus bridging integrator 1 (Bin1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000025239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:32377217:32435736:1 gene:ENSMUSG00000024381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000091967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:32377217:32435736:1 gene:ENSMUSG00000024381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// BC065160 // GenBank // Mus musculus bridging integrator 1, mRNA (cDNA clone MGC:90098 IMAGE:5718309), complete cds. // chr18 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// U60884 // GenBank // Mus musculus SH3P9 mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 74 // 27 // 28 // 0 /// BC030446 // GenBank HTC // Mus musculus bridging integrator 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5400713), with apparent retained intron. // chr18 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// GENSCAN00000020240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:32377416:32442229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// U86405 // GenBank // Mus musculus brain amphiphysin 2 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_021367 // RefSeq // Mus musculus thymic stromal lymphopoietin (Tslp), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_033206 // RefSeq // Mus musculus thymic stromal lymphopoietin (Tslp), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000025237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:32815383:32819799:1 gene:ENSMUSG00000024379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF232937 // GenBank // Mus musculus thymic stroma derived lymphopoietin mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC130230 // GenBank // Mus musculus thymic stromal lymphopoietin, mRNA (cDNA clone MGC:161272 IMAGE:40141922), complete cds. // chr18 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONMMUT031851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000020229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:32811274:32871237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_144863 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 36 (Wdr36), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// NM_001110015 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 36 (Wdr36), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1 /// NM_001110016 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 36 (Wdr36), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1 /// ENSMUST00000053663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:32837225:32866420:1 gene:ENSMUSG00000038299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1 /// ENSMUST00000166214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:32837225:32866350:1 gene:ENSMUSG00000038299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1 /// BC094453 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 36, mRNA (cDNA clone MGC:103340 IMAGE:5068941), complete cds. // chr18 // 80 // 80 // 32 // 40 // 1 /// GENSCAN00000020229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:32811274:32871237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0
NM_009793 // RefSeq // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase IV (Camk4), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006525544 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase IV (Camk4), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XM_006525545 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase IV (Camk4), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000042868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:32939041:33195767:1 gene:ENSMUSG00000038128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC070420 // GenBank // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase IV, mRNA (cDNA clone MGC:95670 IMAGE:5718423), complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000056712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:33165407:33185201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:33056509:33110585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// GENSCAN00000056720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:33119544:33161741:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NR_045415 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10549 (Gm10549), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:33464163:33472448:1 gene:ENSMUSG00000073610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000175078 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:33795164:33795295:1 gene:ENSMUSG00000092819 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// KnowTID_00003815 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr18 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT031880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000029185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34046789:34081730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_009290 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 8A (Wnt8a), mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000012426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:34542313:34548273:1 gene:ENSMUSG00000012282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119212 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 8A, mRNA (cDNA clone MGC:155528 IMAGE:8733961), complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC120517 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 8A, mRNA (cDNA clone MGC:155754 IMAGE:40129440), complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// Z68889 // GenBank // M.musculus mRNA for wnt-8D protein. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34542369:34555805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001166406 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 20A (Kif20a), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_001166407 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 20A (Kif20a), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NM_009004 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 20A (Kif20a), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000166044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:34625033:34633265:1 gene:ENSMUSG00000003779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000167161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:34624624:34633265:1 gene:ENSMUSG00000003779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AK142764 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930003F13 product:kinesin family member 20A, full insert sequence. // chr18 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// BC060608 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 20A, mRNA (cDNA clone MGC:79184 IMAGE:5720408), complete cds. // chr18 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000029173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34624164:34632615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0
ENSMUST00000082923 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:34647400:34647518:1 gene:ENSMUSG00000064857 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT031912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000049281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:34758906:34773760:1 gene:ENSMUSG00000034300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:34759556:34773738:1 gene:ENSMUSG00000034300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC044896 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 53, member C, mRNA (cDNA clone IMAGE:4194032), complete cds. // chr18 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC057111 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 53, member C, mRNA (cDNA clone MGC:61397 IMAGE:6417613), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34752210:34770858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001081256 // RefSeq // Mus musculus KDM3B lysine (K)-specific demethylase 3B (Kdm3b), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006525975 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus KDM3B lysine (K)-specific demethylase 3B (Kdm3b), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006525977 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus KDM3B lysine (K)-specific demethylase 3B (Kdm3b), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000043775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:34777008:34839370:1 gene:ENSMUSG00000038773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK147120 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days pregnant adult female amnion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920178N10 product:jumonji domain containing 1B, full insert sequence. // chr18 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC038376 // GenBank // Mus musculus jumonji domain containing 1B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5360429), partial cds. // chr18 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// BC151084 // GenBank // Mus musculus jumonji domain containing 1B, mRNA (cDNA clone MGC:183997 IMAGE:9087997), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34777131:34863768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_001204914 // RefSeq // Mus musculus receptor accessory protein 2 (Reep2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_144865 // RefSeq // Mus musculus receptor accessory protein 2 (Reep2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000043484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:34840589:34847463:1 gene:ENSMUSG00000038555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY562230 // GenBank // Mus musculus receptor expression enhancing protein 2 (Reep2) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC020184 // GenBank // Mus musculus receptor accessory protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:28827 IMAGE:4505679), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// EU555417 // GenBank // Mus musculus receptor expression enhancing protein 2 splice variant (REEP2) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34777131:34863768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_007913 // RefSeq // Mus musculus early growth response 1 (Egr1), mRNA. // chr18 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000064795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:34859823:34864984:1 gene:ENSMUSG00000038418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000165033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:34861207:34864956:1 gene:ENSMUSG00000038418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC138613 // GenBank // Mus musculus early growth response 1, mRNA (cDNA clone MGC:170238 IMAGE:8861633), complete cds. // chr18 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// BC138615 // GenBank // Mus musculus early growth response 1, mRNA (cDNA clone MGC:170240 IMAGE:8861635), complete cds. // chr18 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// M20157 // GenBank // Mouse Egr-1 mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// M22326 // GenBank // Mouse growth factor-induced protein (zif/268) mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000029184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:34777131:34863768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
NM_009818 // RefSeq // Mus musculus catenin (cadherin associated protein), alpha 1 (Ctnna1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006525549 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus catenin (cadherin associated protein), alpha 1 (Ctnna1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000042345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:35118888:35254773:1 gene:ENSMUSG00000037815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK046513 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230399P04 product:catenin alpha 1, full insert sequence. // chr18 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// BC048163 // GenBank // Mus musculus catenin (cadherin associated protein), alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:61278 IMAGE:6418358), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC068316 // GenBank // Mus musculus catenin (cadherin associated protein), alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:76718 IMAGE:30106659), complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC105576 // GenBank // Mus musculus catenin (cadherin associated protein), alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:106371 IMAGE:3967124), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// D90362 // GenBank // Mus musculus mRNA for cadherin associated protein, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35243906:35253892:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0
NR_002905 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 74A (Snora74a), small nucleolar RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083715 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:35557032:35557227:1 gene:ENSMUSG00000065649 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X94291 // GenBank // M.musculus small nuclear RNA. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185814 // ENSEMBL // ensembl_havana_lincrna:known chromosome:GRCm38:18:35553412:35557230:1 gene:ENSMUSG00000097769 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT031953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT031956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// SNHG4 // lncRNA Db // mm9 chr18:35,713,064-35,717,970 // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY223547 // GenBank // Mus musculus prenatal alcohol-1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000189019 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:35579027:35580726:1 gene:ENSMUSG00000037236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_026420 // RefSeq // Mus musculus polyadenylate-binding protein-interacting protein 2 (Paip2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:35598617:35617186:1 gene:ENSMUSG00000037058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:35598649:35617183:1 gene:ENSMUSG00000037058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115736 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:35598641:35616519:1 gene:ENSMUSG00000037058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000115737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:35598624:35616350:1 gene:ENSMUSG00000037058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC010190 // GenBank // Mus musculus polyadenylate-binding protein-interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:11595 IMAGE:3964799), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:35599237:35616395:1 gene:ENSMUSG00000037058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35610897:35616255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001033168 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700066B19 gene (1700066B19Rik), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526290 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700066B19 gene (1700066B19Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000097617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:35726989:35730869:1 gene:ENSMUSG00000073598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143778 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:35703225:35729770:1 gene:ENSMUSG00000073598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AK006900 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700066B19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT031970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
XM_006526418 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 40S ribosomal protein S25-like (LOC102638785), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000165299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:35770318:35770668:1 gene:ENSMUSG00000091842 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35770318:35866896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_133687 // RefSeq // Mus musculus CXXC finger 5 (Cxxc5), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526177 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CXXC finger 5 (Cxxc5), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006526178 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CXXC finger 5 (Cxxc5), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006526180 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CXXC finger 5 (Cxxc5), transcript variant X5, mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006526181 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CXXC finger 5 (Cxxc5), transcript variant X6, mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000060722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:35829818:35861687:1 gene:ENSMUSG00000046668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK132950 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930528M07 product:CXXC finger 5, full insert sequence. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC016207 // GenBank // Mus musculus CXXC finger 5, mRNA (cDNA clone MGC:27678 IMAGE:4912395), complete cds. // chr18 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC089314 // GenBank // Mus musculus CXXC finger 5, mRNA (cDNA clone MGC:101987 IMAGE:30541251), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:35770318:35866896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NR_015571 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930471G03 gene (4930471G03Rik), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100467 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930471G03 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30916084). // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK018831 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700007N01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONMMUT031983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT031984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008989 // RefSeq // Mus musculus purine rich element binding protein A (Pura), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051301 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:36281097:36301521:1 gene:ENSMUSG00000043991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF017631 // GenBank // Mus musculus purine-rich single-stranded DNA-binding protein alpha (PurA) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// U02098 // GenBank // Mus musculus Pur-alpha mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36287162:36288127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000050584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36348697:36402980:1 gene:ENSMUSG00000046727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36365781:36402540:1 gene:ENSMUSG00000046727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// BC028765 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610010O12 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41247 IMAGE:1195860), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001081365 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich transmembrane module containing 1 (Cystm1), mRNA. // chr18 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000145439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36348763:36368255:1 gene:ENSMUSG00000046727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSMUST00000152804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:36348774:36393370:1 gene:ENSMUSG00000046727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// AK089711 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830010E04 product:weakly similar to PUTATIVE NUCLEAR PROTEIN (PUTATIVE NUCLEAR PROTEIN ORF1-FL49) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSMUST00000139727 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36345619:36366720:1 gene:ENSMUSG00000046727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT031994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000042530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36360533:36393308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_175375 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and KH domain containing 1 (Ankhd1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000006205 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36560611:36658908:1 gene:ENSMUSG00000024483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000037072 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:36644298:36658913:1 gene:ENSMUSG00000024483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000142977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36560678:36665917:1 gene:ENSMUSG00000024483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000155329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:18:36560611:36658908:1 gene:ENSMUSG00000024483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000142780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36606193:36634369:1 gene:ENSMUSG00000024483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000042517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36560738:36665619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0
NM_201256 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 3 (Eif4ebp3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:36664060:36665917:1 gene:ENSMUSG00000090264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY226182 // GenBank // Mus musculus eIF4E-binding protein 3 (Eif4ebp3) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC061242 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:74395 IMAGE:6743910), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC111107 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:130577 IMAGE:40055518), complete cds. // chr18 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000140061 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:36647860:36665917:1 gene:ENSMUSG00000024483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000142977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36560678:36665917:1 gene:ENSMUSG00000024483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK129284 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1085 protein. // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000042517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36560738:36665619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001083317 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member A4 (Slc35a4), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_026404 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member A4 (Slc35a4), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000036158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:36679592:36683858:1 gene:ENSMUSG00000033272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000050476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:36679579:36683853:1 gene:ENSMUSG00000033272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC006050 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member A4, mRNA (cDNA clone MGC:8198 IMAGE:3590779), complete cds. // chr18 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// BC117795 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member A4, mRNA (cDNA clone MGC:143687 IMAGE:40092185), complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// BC117796 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member A4, mRNA (cDNA clone MGC:143688 IMAGE:40092186), complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000186538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:36679215:36683861:1 gene:ENSMUSG00000033272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_028036 // RefSeq // Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 6 (Tmco6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000007046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:36735068:36742391:1 gene:ENSMUSG00000006850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC005637 // GenBank // Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 6, mRNA (cDNA clone MGC:7060 IMAGE:3156734), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK046207 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230352J11 product:RIKEN cDNA 2410015B03 gene, full insert sequence. // chr18 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// GENSCAN00000042534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36735172:36742163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0
NM_011879 // RefSeq // Mus musculus IK cytokine (Ik), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000007042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:36744656:36757639:1 gene:ENSMUSG00000024474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC006706 // GenBank HTC // Mus musculus IK cytokine, mRNA (cDNA clone IMAGE:3584053), with apparent retained intron. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC014739 // GenBank // Mus musculus IK cytokine, mRNA (cDNA clone MGC:25508 IMAGE:4920184), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC026569 // GenBank // Mus musculus IK cytokine, mRNA (cDNA clone MGC:36371 IMAGE:4982612), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC029671 // GenBank // Mus musculus IK cytokine, mRNA (cDNA clone MGC:36494 IMAGE:5364953), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC029694 // GenBank // Mus musculus IK cytokine, mRNA (cDNA clone MGC:36516 IMAGE:5369477), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC033356 // GenBank // Mus musculus IK cytokine, mRNA (cDNA clone MGC:36500 IMAGE:5366230), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36748165:36763425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_026464 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 55 (Wdr55), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000049323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:36760239:36763708:1 gene:ENSMUSG00000042660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC011484 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 55, mRNA (cDNA clone IMAGE:4205462), complete cds. // chr18 // 90 // 72 // 19 // 21 // 0 /// BC131932 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 55, mRNA (cDNA clone MGC:163563 IMAGE:40130209), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC131934 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 55, mRNA (cDNA clone MGC:163565 IMAGE:40130211), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XR_386010 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus WD repeat domain 55 (Wdr55), transcript variant X1, misc_RNA. // chr18 // 97 // 97 // 28 // 29 // 1 /// GENSCAN00000042512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36748165:36763425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_080636 // RefSeq // Mus musculus histidyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) (Hars2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526239 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histidyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) (Hars2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// XR_386015 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus histidyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) (Hars2), transcript variant X4, misc_RNA. // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000152954 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:36783008:36792562:1 gene:ENSMUSG00000019143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC004596 // GenBank // Mus musculus histidyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative), mRNA (cDNA clone MGC:6398 IMAGE:3584555), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000019287 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:36783231:36791694:1 gene:ENSMUSG00000019143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// ENSMUST00000134122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36783008:36790618:1 gene:ENSMUSG00000019143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// ENSMUST00000145876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36783269:36786458:1 gene:ENSMUSG00000019143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36785547:36798022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONMMUT032022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr18 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_025594 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, matrin type 2 (Zmat2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000001419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:36793923:36799660:1 gene:ENSMUSG00000001383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024881 // GenBank // Mus musculus zinc finger, matrin type 2, mRNA (cDNA clone MGC:28387 IMAGE:4022326), complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC089501 // GenBank // Mus musculus zinc finger, matrin type 2, mRNA (cDNA clone MGC:107181 IMAGE:6594761), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36785547:36798022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NR_027885 // RefSeq // Mus musculus vault RNA component 5 (Vaultrc5), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000083211 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:36801866:36802008:1 gene:ENSMUSG00000065145 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONMMUT032025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONMMUT032026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NR_076393 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6756 (Gm6756), non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000180647 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:36920396:36922015:1 gene:ENSMUSG00000063514 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AK076985 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930590G01 product:D-3-PHOSPHOGLYCERATE DEHYDROGENASE (EC 1.1.1.95) (PGDH) (A10) (FRAGMENT) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr18 // 71 // 100 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:36920438:36922084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_053126 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 1 (Pcdhb1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37264998:37267454:1 gene:ENSMUSG00000051663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY013770 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132112 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:163743 IMAGE:40130389), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132296 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:163927 IMAGE:40130573), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37264998:37267454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053127 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 2 (Pcdhb2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37294840:37297613:1 gene:ENSMUSG00000051599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY013781 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 2 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC141154 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:176115 IMAGE:9055766), complete cds. // chr18 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37294976:37297375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_053128 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 3 (Pcdhb3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37300799:37304585:1 gene:ENSMUSG00000045498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF326296 // GenBank // Mus musculus protocadherin-betaC (Pcdhb3) mRNA, complete cds. // chr18 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// AY013785 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 3 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC079557 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:90622 IMAGE:30360109), complete cds. // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000014297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37301067:37303337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_053129 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 4 (Pcdhb4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37307455:37311173:1 gene:ENSMUSG00000045689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY013786 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 4 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC053098 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 4, mRNA (cDNA clone MGC:62492 IMAGE:6401988), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37307639:37309993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_053130 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 5 (Pcdhb5), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37320381:37323913:1 gene:ENSMUSG00000063687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY013787 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 5 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC141147 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 5, mRNA (cDNA clone MGC:176108 IMAGE:9055759), complete cds. // chr18 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// BC066179 // GenBank // Mus musculus similar to protocadherin beta 5, mRNA (cDNA clone MGC:76592 IMAGE:30102205), complete cds. // chr18 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37320569:37322947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_053131 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 6 (Pcdhb6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37333946:37336398:1 gene:ENSMUSG00000051678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK032193 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430411B17 product:protocadherin beta 6, full insert sequence. // chr18 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AY013788 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 6 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150716 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 6, mRNA (cDNA clone MGC:183627 IMAGE:9087627), complete cds. // chr18 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37334028:37400128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_053132 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 7 (Pcdhb7), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000053037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37341702:37345207:1 gene:ENSMUSG00000045062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF326300 // GenBank // Mus musculus protocadherin-betaG (Pcdhb4b) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AY013789 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 7 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000014284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37334028:37400128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_053133 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 8 (Pcdhb8), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37355271:37357610:1 gene:ENSMUSG00000045876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY013790 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 8 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116268 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:40094056), partial cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127160 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 8, mRNA (cDNA clone MGC:156410 IMAGE:40094058), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37334028:37400128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_053134 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 9 (Pcdhb9), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37400855:37403909:1 gene:ENSMUSG00000051242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY013791 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 9 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC055319 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 9, mRNA (cDNA clone MGC:65696 IMAGE:5703531), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062640 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 9, mRNA (cDNA clone MGC:66841 IMAGE:5703531), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37400955:37403441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_053135 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 10 (Pcdhb10), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000051126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37411674:37414514:1 gene:ENSMUSG00000045657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY013771 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 10 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000014282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37411873:37414266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
NM_053136 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 11 (Pcdhb11), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37421418:37425032:1 gene:ENSMUSG00000051486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY013772 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 11 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37421619:37444961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_053137 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 12 (Pcdhb12), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000055495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37435621:37438654:1 gene:ENSMUSG00000043458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY013773 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 12 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC127609 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 12, mRNA (cDNA clone MGC:149981 IMAGE:40059392), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC129838 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 12, mRNA (cDNA clone MGC:149982 IMAGE:40059393), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_053138 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 13 (Pcdhb13), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000056915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37442517:37446209:1 gene:ENSMUSG00000047307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY013774 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 13 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC138123 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 13, mRNA (cDNA clone MGC:169747 IMAGE:8861142), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC138124 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 13, mRNA (cDNA clone MGC:169748 IMAGE:8861143), complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37421619:37444961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_053139 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 14 (Pcdhb14), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000052387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37447657:37451094:1 gene:ENSMUSG00000044043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY013775 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 14 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// BC059821 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 14, mRNA (cDNA clone MGC:69590 IMAGE:6838626), complete cds. // chr18 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37447843:37460759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 92 // 39 // 11 // 12 // 0
NM_053140 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 15 (Pcdhb15), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37473546:37476340:1 gene:ENSMUSG00000047033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY013776 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 15 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC066178 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 15, mRNA (cDNA clone MGC:76583 IMAGE:30100073), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37473717:37491997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_053141 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 16 (Pcdhb16), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000051442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37477768:37483035:1 gene:ENSMUSG00000047910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY013777 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 16 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC115720 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 16, mRNA (cDNA clone MGC:141532 IMAGE:40086527), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116625 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 16, mRNA (cDNA clone MGC:141531 IMAGE:40086525), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053142 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 17 (Pcdhb17), mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37485021:37488289:1 gene:ENSMUSG00000046387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF326310 // GenBank // Mus musculus protocadherin-betaQ (Pcdhb16) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK122533 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1621 protein. // chr18 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AY013778 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 17 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC017149 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 17, mRNA (cDNA clone MGC:28840 IMAGE:4506788), complete cds. // chr18 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_053143 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 18 (Pcdhb18), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000055949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37489465:37494503:1 gene:ENSMUSG00000048347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY013779 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 18 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC099958 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 18, mRNA (cDNA clone MGC:107468 IMAGE:30086462), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37473717:37491997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_053144 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 19 (Pcdhb19), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37496997:37504127:1 gene:ENSMUSG00000043313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF326312 // GenBank // Mus musculus protocadherin-betaS (Pcdhb11) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AY013780 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 19 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC141290 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 19, mRNA (cDNA clone MGC:176251 IMAGE:9055902), complete cds. // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC141291 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 19, mRNA (cDNA clone MGC:176252 IMAGE:9055903), complete cds. // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000014296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37497154:37499559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_053145 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 20 (Pcdhb20), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37504264:37507658:1 gene:ENSMUSG00000046191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF326313 // GenBank // Mus musculus protocadherin-betaT (Pcdhb14) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AY013782 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 20 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC031895 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 20, mRNA (cDNA clone MGC:39006 IMAGE:5364116), complete cds. // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37504423:37506822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_053146 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 21 (Pcdhb21), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37513652:37518313:1 gene:ENSMUSG00000044022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF326314 // GenBank // Mus musculus protocadherin-betaU (Pcdhb18) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AY013783 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 21 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC138121 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 21, mRNA (cDNA clone MGC:169745 IMAGE:8861140), complete cds. // chr18 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// BC138122 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 21, mRNA (cDNA clone MGC:169746 IMAGE:8861141), complete cds. // chr18 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000014291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37513820:37516144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_053147 // RefSeq // Mus musculus protocadherin beta 22 (Pcdhb22), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37518353:37521419:1 gene:ENSMUSG00000073591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF326315 // GenBank // Mus musculus protocadherin-betaV (Pcdhb15) mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// AY013784 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 22 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC094239 // GenBank // Mus musculus protocadherin beta 22, mRNA (cDNA clone MGC:106505 IMAGE:30606144), complete cds. // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:37518580:37520865:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000097608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:37655907:37658737:1 gene:ENSMUSG00000073590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AK086343 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930022P05 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr18 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// AK149307 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930017P16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
AK141675 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030019G05 product:hypothetical Sel1-like repeat/TPR repeat/Tetraspanin containing protein, full insert sequence. // chr18 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC002117 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610009O20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:6622 IMAGE:3490474), complete cds. // chr18 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NM_024179 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 0610009O20 gene (0610009O20Rik), mRNA. // chr18 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// ENSMUST00000025314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:38250249:38262629:1 gene:ENSMUSG00000024442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// AK035876 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630013B04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000007150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:38244828:38263251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_022996 // RefSeq // Mus musculus Nedd4 family interacting protein 1 (Ndfip1), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:38418975:38464399:1 gene:ENSMUSG00000024425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AF220209 // GenBank // Mus musculus Nedd4 WW domain-binding protein 5 mRNA, partial cds. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC026372 // GenBank // Mus musculus Nedd4 family interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:31113 IMAGE:4162070), complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:38376802:38486702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1
XR_397931 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 9630014M24 gene (9630014M24Rik), misc_RNA. // chr18 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// ENSMUST00000145090 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:38601534:38645922:1 gene:ENSMUSG00000036452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000149112 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:38627287:38642930:1 gene:ENSMUSG00000036452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AK035890 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630014M24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:38601603:38789045:1 gene:ENSMUSG00000036452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT032107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT032106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001033789 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5820 (Gm5820), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000115580 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:38892458:38971272:1 gene:ENSMUSG00000036452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148850 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:38676718:39110534:1 gene:ENSMUSG00000036452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000187912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:38892717:38933964:1 gene:ENSMUSG00000036452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_175164 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 26 (Arhgap26), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526263 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho GTPase activating protein 26 (Arhgap26), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526265 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho GTPase activating protein 26 (Arhgap26), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000097593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:38993145:39376284:1 gene:ENSMUSG00000036452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000154551 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:39227368:39372511:1 gene:ENSMUSG00000036452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000155576 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:38993476:39371162:1 gene:ENSMUSG00000036452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC141394 // GenBank // Mus musculus Rho GTPase activating protein 26, mRNA (cDNA clone MGC:176356 IMAGE:9056007), complete cds. // chr18 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// AK052502 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430038K17 product:GRAF PROTEIN (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000008993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:39082533:39151878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_011033 // RefSeq // Mus musculus poly(A) binding protein, cytoplasmic 2 (Pabpc2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063219 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:39773497:39776082:1 gene:ENSMUSG00000051732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051134 // GenBank // Mus musculus poly(A) binding protein, cytoplasmic 2, mRNA (cDNA clone MGC:58275 IMAGE:6704229), complete cds. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:39773684:39775570:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NR_045177 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2900055J20 gene (2900055J20Rik), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:40256962:40257684:1 gene:ENSMUSG00000071860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026135 // RefSeq // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 16 (Kctd16), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000091927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:40258361:40531168:1 gene:ENSMUSG00000051401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015313 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930434H12 product:RIKEN cDNA 4930434H12 gene, full insert sequence. // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// BC049734 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 16, mRNA (cDNA clone IMAGE:6771233). // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000026778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:40527849:40531103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:40257113:40264835:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
ENSMUST00000180504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:40726269:40726709:1 gene:ENSMUSG00000095150 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:40718098:40726709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT032145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001146299 // RefSeq // Mus musculus SH3 domain containing ring finger 2 (Sh3rf2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_172966 // RefSeq // Mus musculus SH3 domain containing ring finger 2 (Sh3rf2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072008 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:42053667:42158960:1 gene:ENSMUSG00000057719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000074679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:42053710:42158451:1 gene:ENSMUSG00000057719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC137955 // GenBank // Mus musculus SH3 domain containing ring finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:169579 IMAGE:8860974), complete cds. // chr18 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC145060 // GenBank // Mus musculus SH3 domain containing ring finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:178616 IMAGE:9053608), complete cds. // chr18 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:42122891:42153390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000028042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:42053818:42116657:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSMUST00000041389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:42173370:42173663:1 gene:ENSMUSG00000034339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:42173370:42173663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_172626 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 27 (Rbm27), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000046972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:42275353:42341542:1 gene:ENSMUSG00000024491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000091920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:42275353:42341542:1 gene:ENSMUSG00000024491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AY461716 // GenBank // Mus musculus peri implantation stem cell 1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// BC054080 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 27, mRNA (cDNA clone MGC:56960 IMAGE:6390990), complete cds. // chr18 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000028021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:42261965:42338475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0
NM_138945 // RefSeq // Mus musculus POU domain, class 4, transcription factor 3 (Pou4f3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:42394539:42397249:1 gene:ENSMUSG00000024497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK039639 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330076M02 product:POU domain, class 4, transcription factor 3, full insert sequence. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC145941 // GenBank // Mus musculus POU domain, class 4, transcription factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:175828 IMAGE:40131244), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:42374865:42401747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000028026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:42487272:42487769:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001039474 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation regulator 1 (CA150) (Tcerg1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// NM_001289526 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation regulator 1 (CA150) (Tcerg1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// NR_110344 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation regulator 1 (CA150) (Tcerg1), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// XM_006526116 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription elongation regulator 1 (CA150) (Tcerg1), transcript variant X7, mRNA. // chr18 // 100 // 53 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000025375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:42511510:42575551:1 gene:ENSMUSG00000024498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000173642 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:42511523:42574844:1 gene:ENSMUSG00000024498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// AB023485 // GenBank // Mus musculus mRNA for transcription factor CA150b, complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// BC039185 // GenBank // Mus musculus transcription elongation regulator 1 (CA150), mRNA (cDNA clone MGC:28934 IMAGE:3982736), complete cds. // chr18 // 93 // 90 // 41 // 44 // 0 /// BC040284 // GenBank // Mus musculus transcription elongation regulator 1 (CA150), mRNA (cDNA clone MGC:36862 IMAGE:4460736), complete cds. // chr18 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000028027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:42519369:42574719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 39 // 39 // 0
NM_178749 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine kinase 32A (Stk32a), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:43207697:43317481:1 gene:ENSMUSG00000039954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK042599 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730009C22 product:weakly similar to SERINE/THREONINE PROTEIN KINASE [Mus musculus], full insert sequence. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK044474 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930015B13 product:SIMILAR TO SERINE THREONINE KINASE 32 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC055002 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 32A, mRNA (cDNA clone MGC:56750 IMAGE:6313304), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:43240753:43313112:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
ENSMUST00000043803 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:43764327:43767399:1 gene:ENSMUSG00000038791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF274961 // GenBank // Mus musculus UGRP1C mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// AF439546 // GenBank // Mus musculus pneumo secretory protein 1 (Pnsp1) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NM_001289643 // RefSeq // Mus musculus secretoglobin, family 3A, member 2 (Scgb3a2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// AF274960 // GenBank // Mus musculus UGRP1B mRNA, complete cds. // chr18 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NM_001289644 // RefSeq // Mus musculus secretoglobin, family 3A, member 2 (Scgb3a2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// AF274959 // GenBank // Mus musculus UGRP1A mRNA, complete cds. // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// BC061046 // GenBank // Mus musculus secretoglobin, family 3A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:74157 IMAGE:30301032), complete cds. // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// ENSMUST00000189750 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:43764327:43767399:1 gene:ENSMUSG00000038791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000187157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:43764289:43767399:1 gene:ENSMUSG00000038791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000013695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:43764418:43778742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001081180 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 (Spink5), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000069245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:18:43963235:44022501:1 gene:ENSMUSG00000055561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC118011 // GenBank // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 5, mRNA (cDNA clone MGC:144075 IMAGE:40097427), complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:43963306:44078964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
NM_001039218 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 14 (Spink14), mRNA. // chr18 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:44027869:44032208:1 gene:ENSMUSG00000051050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:44028694:44032208:1 gene:ENSMUSG00000051050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// AK036889 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930022A15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
NM_001013797 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 6 (Spink6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000068473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:44071393:44083610:1 gene:ENSMUSG00000055095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147471 // GenBank // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 6, mRNA (cDNA clone MGC:182219 IMAGE:9056113), complete cds. // chr18 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0 /// BC171990 // GenBank // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 6, mRNA (cDNA clone MGC:198695 IMAGE:9054276), complete cds. // chr18 // 76 // 61 // 13 // 17 // 0
NM_030061 // RefSeq // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 12 (Spink12), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000081271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:44104407:44108543:1 gene:ENSMUSG00000061144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC145914 // GenBank // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 11, mRNA (cDNA clone MGC:175801 IMAGE:40131217), complete cds. // chr18 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// BC145916 // GenBank // Mus musculus serine peptidase inhibitor, Kazal type 11, mRNA (cDNA clone MGC:175803 IMAGE:40131219), complete cds. // chr18 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// DQ437332 // GenBank // Mus musculus serine protease inhibitor Kazal type 12 (Spink12) mRNA, complete cds. // chr18 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:44103015:44226819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENSMUST00000097586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:44201264:44206018:1 gene:ENSMUSG00000073572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:44103015:44226819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_010935 // RefSeq // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y6 (Npy6r), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:44270127:44277700:1 gene:ENSMUSG00000038071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC103620 // GenBank // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y6, mRNA (cDNA clone MGC:124159 IMAGE:40046295), complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC103621 // GenBank // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y6, mRNA (cDNA clone MGC:124157 IMAGE:40046291), complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC103622 // GenBank // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y6, mRNA (cDNA clone MGC:124160 IMAGE:40046297), complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC103667 // GenBank // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y6, mRNA (cDNA clone MGC:124158 IMAGE:40046294), complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:44275655:44355280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001033621 // RefSeq // Mus musculus myotilin (Myot), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000025349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:44334074:44355724:1 gene:ENSMUSG00000024471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000115498 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:44334074:44355724:1 gene:ENSMUSG00000024471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF230979 // GenBank // Mus musculus myotilin mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC016214 // GenBank // Mus musculus myotilin, mRNA (cDNA clone MGC:28747 IMAGE:4482382), complete cds. // chr18 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC064052 // GenBank // Mus musculus myotilin, mRNA (cDNA clone MGC:73578 IMAGE:1366418), complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:44275655:44355280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
NM_027490 // RefSeq // Mus musculus DCP2 decapping enzyme homolog (S. cerevisiae) (Dcp2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:44380500:44424969:1 gene:ENSMUSG00000024472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:44388621:44426560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001163013 // RefSeq // Mus musculus YTH domain containing 2 (Ythdc2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000037763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:44828665:44889720:1 gene:ENSMUSG00000034653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC138263 // GenBank // Mus musculus YTH domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:169887 IMAGE:8861282), complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC171951 // GenBank // Mus musculus YTH domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:198656 IMAGE:9054237), complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:44828687:44851918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000016903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:44854603:44925468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
AK006077 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700018A14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NM_010120 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1A (Eif1a), mRNA. // chr18 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000078079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:46597704:46610225:1 gene:ENSMUSG00000057561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000168382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:46597708:46609171:1 gene:ENSMUSG00000057561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// AF026481 // GenBank // Mus musculus eIF-1A (eIF-1A) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC027437 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:36200 IMAGE:4017054), complete cds. // chr18 // 76 // 55 // 13 // 17 // 0 /// AK166368 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930002H11 product:eukaryotic translation initiation factor 1A, full insert sequence. // chr18 // 68 // 61 // 13 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46606867:46608134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0
BC113158 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4833403I15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130603 IMAGE:40058444), complete cds. // chr18 // 83 // 43 // 15 // 18 // 0 /// NM_029008 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4833403I15 gene (4833403I15Rik), mRNA. // chr18 // 93 // 93 // 39 // 42 // 1 /// XM_006526304 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4833403I15 gene (4833403I15Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 88 // 88 // 37 // 42 // 1 /// XM_006526305 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4833403I15 gene (4833403I15Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 88 // 88 // 37 // 42 // 1 /// ENSMUST00000025358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:46850039:46905446:1 gene:ENSMUSG00000024481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 93 // 93 // 39 // 42 // 1 /// GENSCAN00000009831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46870822:46932628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1
NM_001033446 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 14 effector protein-like (Arl14epl), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000097580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:46925982:46934222:1 gene:ENSMUSG00000073568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC147441 // GenBank // Mus musculus gene model 949, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182189 IMAGE:9056083), complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// BC147472 // GenBank // Mus musculus gene model 949, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182220 IMAGE:9056114), complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0
NM_178377 // RefSeq // Mus musculus COMM domain containing 10 (Commd10), mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000049388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:46958862:47087992:1 gene:ENSMUSG00000042705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AB052770 // GenBank // Mus musculus mDRWMS2 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// AK009101 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310003A05 product:inferred: RIKEN cDNA 2310003A05 gene / HSPC305 {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr18 // 92 // 34 // 11 // 12 // 0 /// BC034879 // GenBank // Mus musculus COMM domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:41312 IMAGE:3468632), complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006526226 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus COMM domain containing 10 (Commd10), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// AK139321 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830008H01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// NONMMUT032291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 92 // 34 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000009873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:46963048:46978827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
GENSCAN00000009851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:47729844:47730140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000182835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:48626704:48627710:1 gene:ENSMUSG00000097965 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:48594198:48665125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 71 // 74 // 12 // 17 // 0
NM_001081371 // RefSeq // Mus musculus Dmx-like 1 (Dmxl1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006525916 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Dmx-like 1 (Dmxl1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000041772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:49832997:49965473:1 gene:ENSMUSG00000037416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000180611 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:49832670:49964254:1 gene:ENSMUSG00000037416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AY590892 // GenBank // Mus musculus Dmx-like 1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000181907 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:49894096:49933274:1 gene:ENSMUSG00000037416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// AK049893 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630007L23 product:X-LIKE 1 PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// GENSCAN00000050757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:49840387:49962397:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0
ENSMUST00000087655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:49979491:50051320:1 gene:ENSMUSG00000062210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:50046740:50047152:1 gene:ENSMUSG00000062210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000094040 // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK170322 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630047E17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT032322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_008292 // RefSeq // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4 (Hsd17b4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000025385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:50128201:50196269:1 gene:ENSMUSG00000024507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC022175 // GenBank // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4, mRNA (cDNA clone MGC:13992 IMAGE:4209394), complete cds. // chr18 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000050762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:50134813:50195944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 66 // 66 // 31 // 47 // 1
NM_001004061 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 170, member A (Fam170a), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:50278369:50283019:1 gene:ENSMUSG00000035420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AY692448 // GenBank // Mus musculus Znf domain containing protein isoform a (Znfd) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AY692449 // GenBank // Mus musculus Znf domain containing protein isoform b (Znfd) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC147592 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 170, member A, mRNA (cDNA clone MGC:182688 IMAGE:9056582), complete cds. // chr18 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// BC147595 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 170, member A, mRNA (cDNA clone MGC:182691 IMAGE:9056585), complete cds. // chr18 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC172108 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054394. // chr18 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:50278624:50392358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
AK042678 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730014O07 product:MESENCHYMAL STEM CELL PROTEIN DSC54 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NM_001081224 // RefSeq // Mus musculus proline rich 16 (Prr16), mRNA. // chr18 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSMUST00000116639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:51117898:51304641:1 gene:ENSMUSG00000073565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// BC132481 // GenBank // Mus musculus proline rich 16, mRNA (cDNA clone MGC:164112 IMAGE:40130758), complete cds. // chr18 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// AK045646 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230218B10 product:MESENCHYMAL STEM CELL PROTEIN DSC54 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000037657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:51299842:51303365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_026286 // RefSeq // Mus musculus ferritin mitochondrial (Ftmt), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:52331536:52332986:1 gene:ENSMUSG00000024510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115514 // GenBank // Mus musculus ferritin mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:144339 IMAGE:40101116), complete cds. // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC115515 // GenBank // Mus musculus ferritin mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:144340 IMAGE:40101117), complete cds. // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000033356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:52317407:52332327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_026040 // RefSeq // Mus musculus serum response factor binding protein 1 (Srfbp1), mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000025406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:52465693:52490738:1 gene:ENSMUSG00000024528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AY611629 // GenBank // Mus musculus SRF-dependent transcription regulation associated protein mRNA, complete cds. // chr18 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// BC024338 // GenBank // Mus musculus serum response factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:35681 IMAGE:5009612), complete cds. // chr18 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:52475109:52497956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
XM_006526164 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 474 (Zfp474), transcript variant X7, mRNA. // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AY350709 // GenBank // Mus musculus testis-specific zinc finger protein (Zfp474) mRNA, complete cds. // chr18 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// NM_025749 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 474 (Zfp474), mRNA. // chr18 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// ENSMUST00000072666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:52615915:52639830:1 gene:ENSMUSG00000046886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// BC055099 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 474, mRNA (cDNA clone MGC:58179 IMAGE:6704066), complete cds. // chr18 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENSMUST00000091904 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:52646216:52663733:1 gene:ENSMUSG00000024532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000118724 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:52646209:52663733:1 gene:ENSMUSG00000024532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC048563 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58564 IMAGE:6704020), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:52660397:52677325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_010293 // RefSeq // Mus musculus glycerol kinase-like 1 (Gykl1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:52693679:52695668:1 gene:ENSMUSG00000053624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF117733 // GenBank // Mus musculus glycerol kinase-like protein 1 (Gkrs1) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119574 // GenBank // Mus musculus glycerol kinase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:141317 IMAGE:40058020), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:52693722:52731597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_026386 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 2 (Snx2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000037850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:53176365:53220860:1 gene:ENSMUSG00000034484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC006960 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 2, mRNA (cDNA clone MGC:6322 IMAGE:2812557), complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// CT010229 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B0551D for gene Snx2, Sorting nexin 2; complete cds, incl. stopcodon. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:53176380:53213263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_029394 // RefSeq // Mus musculus sorting nexing 24 (Snx24), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000165032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:53245662:53390823:1 gene:ENSMUSG00000024535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK017610 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730433I16 product:HYPOTHETICAL 19.8 KDA PROTEIN (SORTING NEXIN SNX24) (SIMILAR TO SBBI31 PROTEIN) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC051168 // GenBank // Mus musculus sorting nexing 24, mRNA (cDNA clone MGC:56843 IMAGE:6306904), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006526220 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexing 24 (Snx24), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000025417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:53245769:53390823:1 gene:ENSMUSG00000024535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// AK012711 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810011K15 product:hypothetical PX (Bem1/NCF1/PI3K) domain containing protein, full insert sequence. // chr18 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_006526221 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexing 24 (Snx24), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000028741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:53364553:53389693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001033281 // RefSeq // Mus musculus PR domain containing 6 (Prdm6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000091900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:53464546:53575857:1 gene:ENSMUSG00000069378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000115398 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:53551594:53575857:1 gene:ENSMUSG00000069378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000115399 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:53472981:53575907:1 gene:ENSMUSG00000069378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000154557 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:53465051:53575857:1 gene:ENSMUSG00000069378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK135836 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420424A22 product:PR-domain zinc finger protein 6 (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC139295 // GenBank // Mus musculus PR domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:170922 IMAGE:8862317), complete cds. // chr18 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// DQ340564 // GenBank // Mus musculus PRISM/PRDM6 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:53536181:53575069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:53449492:53475849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_152809 // RefSeq // Mus musculus casein kinase 1, gamma 3 (Csnk1g3), mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000069597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:53862113:53955684:1 gene:ENSMUSG00000073563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AK080491 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730054O21 product:CASEIN KINASE I, GAMMA 3 ISOFORM (EC 2.7.1.-) (CKI-GAMMA 3) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr18 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT032379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr18 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000175125 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:18:56221834:56222018:1 gene:ENSMUSG00000092866 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026240 // RefSeq // Mus musculus GRAM domain containing 3 (Gramd3), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006525493 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GRAM domain containing 3 (Gramd3), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000070166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:56432132:56503792:1 gene:ENSMUSG00000001700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK161329 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930406J16 product:Hypothetical protein FLJ21313 (HCV NS3-transactivated protein 2) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC057978 // GenBank // Mus musculus GRAM domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:67833 IMAGE:5044170), complete cds. // chr18 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// AK038289 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130093E18 product:RIKEN cDNA 9030613F08 gene, full insert sequence. // chr18 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000028568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:56473843:56514251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NM_001162989 // RefSeq // Mus musculus phosphorylated adaptor for RNA export (Phax), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_019996 // RefSeq // Mus musculus phosphorylated adaptor for RNA export (Phax), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000008445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:56572822:56587712:1 gene:ENSMUSG00000008301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000130163 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:18:56562443:56587189:1 gene:ENSMUSG00000008301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000132628 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:56562593:56580300:1 gene:ENSMUSG00000008301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// BC049590 // GenBank // Mus musculus phosphorylated adaptor for RNA export, mRNA (cDNA clone MGC:58231 IMAGE:6587693), complete cds. // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC061110 // GenBank // Mus musculus phosphorylated adaptor for RNA export, mRNA (cDNA clone MGC:74231 IMAGE:30303763), complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:56573040:56576052:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000028571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:56580041:56594657:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_026099 // RefSeq // Mus musculus testis expressed 43 (Tex43), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006526175 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700065I17 gene (1700065I17Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000035640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:56588350:56594782:1 gene:ENSMUSG00000032900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000147775 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:56588426:56594782:1 gene:ENSMUSG00000032900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000153248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:56588389:56594712:1 gene:ENSMUSG00000032900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr18 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// BC048448 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700065I17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6704292). // chr18 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC099538 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700065I17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118202 IMAGE:30916077), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FJ211594 // GenBank // Mus musculus testis specific expressed protein 7 (Tseg7) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000127591 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:56588379:56592714:1 gene:ENSMUSG00000032900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// BC048449 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700065I17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6706004). // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000028571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:56580041:56594657:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_010721 // RefSeq // Mus musculus lamin B1 (Lmnb1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025486 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:56707813:56753424:1 gene:ENSMUSG00000024590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000128651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:56728441:56733456:1 gene:ENSMUSG00000024590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// BC052729 // GenBank // Mus musculus lamin B1, mRNA (cDNA clone MGC:64675 IMAGE:6816118), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC058392 // GenBank // Mus musculus lamin B1, mRNA (cDNA clone MGC:67037 IMAGE:6816118), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M35153 // GenBank // Mus musculus lamin B mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:56739782:56754375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000028561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:56625160:56734364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NR_033455 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10536 (Gm10536), long non-coding RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00003851 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT032447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001979 // RefSeq // Mus musculus multiple EGF-like-domains 10 (Megf10), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075770 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:57133090:57297467:1 gene:ENSMUSG00000024593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139892 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:57142786:57292728:1 gene:ENSMUSG00000024593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK148084 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370013A07 product:MEGF10 protein (Hypothetical protein KIAA1780) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr18 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// BC075647 // GenBank // Mus musculus multiple EGF-like-domains 10, mRNA (cDNA clone MGC:100091 IMAGE:30620548), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:57238602:57294055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_028447 // RefSeq // Mus musculus proline-rich coiled-coil 1 (Prrc1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006526289 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline-rich coiled-coil 1 (Prrc1), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000025490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:57354733:57392719:1 gene:ENSMUSG00000024594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK004443 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1190002C06 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr18 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// AK147610 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1088M20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC014817 // GenBank // Mus musculus proline-rich coiled-coil 1, mRNA (cDNA clone MGC:12103 IMAGE:3709357), complete cds. // chr18 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:57371454:57389429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0
NM_001134697 // RefSeq // Mus musculus cortexin 3 (Ctxn3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526139 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cortexin 3 (Ctxn3), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// XM_006526140 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cortexin 3 (Ctxn3), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000091892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:57468486:57478134:1 gene:ENSMUSG00000069372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029290 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700011I03 gene (1700011I03Rik), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000079738 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:18:57533780:57731065:1 gene:ENSMUSG00000058925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123872 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:57563176:57731006:1 gene:ENSMUSG00000058925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000135806 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:57533829:57731065:1 gene:ENSMUSG00000058925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC048576 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700011I03 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6706160). // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_009194 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 12, member 2 (Slc12a2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_385981 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 12, member 2 (Slc12a2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000115366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:57878678:57946821:1 gene:ENSMUSG00000024597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U13174 // GenBank // Mus musculus putative basolateral Na-K-2Cl cotransporter mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:57819064:57941177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_001081072 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 6 (Slc27a6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025500 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:58556257:58612773:1 gene:ENSMUSG00000024600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC115435 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:143900 IMAGE:40094587), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:58556464:58612355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_025478 // RefSeq // Mus musculus isochorismatase domain containing 1 (Isoc1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000025503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:58659482:58679570:1 gene:ENSMUSG00000024601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK011674 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610034N03 product:hypothetical Isochorismatase hydrolase family containing protein, full insert sequence. // chr18 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// AY035213 // GenBank // Mus musculus NN5H6H tumor-related protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC016576 // GenBank // Mus musculus isochorismatase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:27719 IMAGE:2609919), complete cds. // chr18 // 87 // 82 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:58659492:58677911:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_175506 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 19 (Adamts19), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000052907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:58836764:59053678:1 gene:ENSMUSG00000053441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AY135183 // GenBank // Mus musculus secreted metalloprotease ADAMTS19 mRNA, complete cds. // chr18 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// BC150736 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 19, mRNA (cDNA clone MGC:183647 IMAGE:9087647), complete cds. // chr18 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// AK029178 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4831407I23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 52 // 52 // 23 // 44 // 1 /// XM_006525923 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 19 (Adamts19), transcript variant X5, mRNA. // chr18 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// AK053213 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030042C16 product:hypothetical Pep_M12B_propep protein containing protein, full insert sequence. // chr18 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1 /// AK165144 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330036K09 product:a disintegrin-like and metalloprotease (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 19, full insert sequence. // chr18 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// GENSCAN00000015656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:58952345:58989065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0
NM_001081328 // RefSeq // Mus musculus chondroitin sulfate synthase 3 (Chsy3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:59175401:59410446:1 gene:ENSMUSG00000058152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK220519 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4168 protein. // chr18 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC151164 // GenBank // Mus musculus chondroitin sulfate synthase 3, mRNA (cDNA clone MGC:184064 IMAGE:9088053), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC151165 // GenBank // Mus musculus chondroitin sulfate synthase 3, mRNA (cDNA clone MGC:184065 IMAGE:9088054), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC157985 // GenBank // Mus musculus chondroitin sulfate synthase 3, mRNA (cDNA clone MGC:189954 IMAGE:9088141), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK038429 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230009F23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// AK043732 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830026G02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:59404521:59410446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000015644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:59175677:59176660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001033767 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4951 (Gm4951), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006525925 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4951 (Gm4951), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// XM_006537475 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4951 (Gm4951), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000031549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:60212080:60247820:1 gene:ENSMUSG00000073555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK149556 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730037J11 product:similar to interferon-inducible GTPase [Mus musculus], full insert sequence. // chr18 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000036117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60220845:60246615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
ENSMUST00000131638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:60220843:60222058:1 gene:ENSMUSG00000085977 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60220845:60246615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 91 // 14 // 21 // 0
GENSCAN00000036122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60299847:60325023:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001146275 // RefSeq // Mus musculus interferon inducible GTPase 1 (Iigp1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_021792 // RefSeq // Mus musculus interferon inducible GTPase 1 (Iigp1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:60376029:60392627:1 gene:ENSMUSG00000054072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000066912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:60376029:60392627:1 gene:ENSMUSG00000054072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF194871 // GenBank // Mus musculus interferon-inducible GTPase mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC004649 // GenBank // Mus musculus interferon inducible GTPase 1, mRNA (cDNA clone MGC:5713 IMAGE:3483102), complete cds. // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// CT010300 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836B0252D for gene Iigp1, Interferon inducible GTPase 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr18 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AK089702 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830009I11 product:interferon-inducible GTPase, full insert sequence. // chr18 // 68 // 81 // 15 // 22 // 0
XR_397994 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC023105 (BC023105), misc_RNA. // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000073997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:60441753:60442983:1 gene:ENSMUSG00000063388 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// BC023105 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC023105, mRNA (cDNA clone MGC:28198 IMAGE:3989161), complete cds. // chr18 // 56 // 100 // 9 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60435545:60442995:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 89 // 56 // 8 // 9 // 0
NM_026302 // RefSeq // Mus musculus dynactin 4 (Dctn4), mRNA. // chr18 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000025505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:60526221:60558762:1 gene:ENSMUSG00000024603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// AK163240 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020005D04 product:dynactin 4, full insert sequence. // chr18 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC034725 // GenBank // Mus musculus dynactin 4, mRNA (cDNA clone MGC:29051 IMAGE:3667031), complete cds. // chr18 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// AK050896 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030031K12 product:dynactin 4, full insert sequence. // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000036120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60526231:60571953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_025776 // RefSeq // Mus musculus RNA binding motif protein 22 (Rbm22), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000025506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:18:60560736:60572810:1 gene:ENSMUSG00000024604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC042691 // GenBank HTC // Mus musculus RNA binding motif protein 22, mRNA (cDNA clone IMAGE:3709389). // chr18 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC080205 // GenBank // Mus musculus RNA binding motif protein 22, mRNA (cDNA clone MGC:91134 IMAGE:3709760), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000161544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:60560768:60570308:1 gene:ENSMUSG00000024604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr18 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// AK165277 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430008C17 product:hypothetical Zn-finger, C-x8-C-x5-C-x3-H type containing protein, full insert sequence. // chr18 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000036120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60526231:60571953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_020600 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein S14 (Rps14), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000025511 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:60774510:60778546:1 gene:ENSMUSG00000024608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000118551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:60774681:60778541:1 gene:ENSMUSG00000024608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000122279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:60776239:60778545:1 gene:ENSMUSG00000024608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK152461 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I830073F15 product:ribosomal protein S14, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC042940 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein S14, mRNA (cDNA clone MGC:54536 IMAGE:6487681), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC062874 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein S14, mRNA (cDNA clone MGC:86125 IMAGE:5683900), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC081449 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein S14, mRNA (cDNA clone MGC:102053 IMAGE:5684375), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000137400 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:60775716:60778457:1 gene:ENSMUSG00000024608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 100 // 9 // 14 // 0 /// GENSCAN00000036110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60771290:60778498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001042605 // RefSeq // Mus musculus CD74 antigen (invariant polypeptide of major histocompatibility complex, class II antigen-associated) (Cd74), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_010545 // RefSeq // Mus musculus CD74 antigen (invariant polypeptide of major histocompatibility complex, class II antigen-associated) (Cd74), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000050487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:60803848:60812646:1 gene:ENSMUSG00000024610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000097563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:60803848:60812646:1 gene:ENSMUSG00000024610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000167610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:60803856:60812646:1 gene:ENSMUSG00000024610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC003476 // GenBank // Mus musculus CD74 antigen (invariant polypeptide of major histocompatibility complex, class II antigen-associated), mRNA (cDNA clone MGC:6517 IMAGE:2650401), complete cds. // chr18 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// BC096435 // GenBank // Mus musculus CD74 antigen (invariant polypeptide of major histocompatibility complex, class II antigen-associated), mRNA (cDNA clone MGC:106056 IMAGE:6530802), complete cds. // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// X00496 // GenBank // Mouse Ia-associated invariant chain (Ii) mRNA fragment. // chr18 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60803843:60812317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_001038499 // RefSeq // Mus musculus arylsulfatase i (Arsi), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:60911780:60918561:1 gene:ENSMUSG00000036412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138970 // GenBank // Mus musculus arylsulfatase i, mRNA (cDNA clone MGC:170597 IMAGE:8861992), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC141169 // GenBank // Mus musculus arylsulfatase i, mRNA (cDNA clone MGC:176130 IMAGE:9055781), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC020108 // GenBank // Mus musculus arylsulfatase i, mRNA (cDNA clone IMAGE:3991175), partial cds. // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000035843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60912240:60917768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001286809 // RefSeq // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II alpha (Camk2a), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 100 // 47 // 26 // 26 // 0 /// NM_009792 // RefSeq // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II alpha (Camk2a), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 53 // 29 // 29 // 0 /// NM_177407 // RefSeq // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II alpha (Camk2a), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000025519 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:60925632:60986407:1 gene:ENSMUSG00000024617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000039904 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:18:60963600:60985697:1 gene:ENSMUSG00000024617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 42 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000102888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:60925618:60988152:1 gene:ENSMUSG00000024617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000115295 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:60963554:60984863:1 gene:ENSMUSG00000024617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 45 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137805 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:60926949:60955639:1 gene:ENSMUSG00000024617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 22 // 12 // 12 // 0 /// BC031745 // GenBank // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II alpha, mRNA (cDNA clone MGC:25415 IMAGE:4506005), complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000035835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:60925779:60990000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 39 // 39 // 0
NM_001146268 // RefSeq // Mus musculus platelet derived growth factor receptor, beta polypeptide (Pdgfrb), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NM_008809 // RefSeq // Mus musculus platelet derived growth factor receptor, beta polypeptide (Pdgfrb), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000025522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:61045150:61085061:1 gene:ENSMUSG00000024620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000115274 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:18:61045200:61085056:1 gene:ENSMUSG00000024620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// BC055311 // GenBank // Mus musculus platelet derived growth factor receptor, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:60668 IMAGE:30060666), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// DQ979390 // GenBank // Mus musculus platelet-derived growth factor receptor beta variant 1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// X04367 // GenBank // Mouse pre-PDGF receptor mRNA (PDGF = platelet-derived growth factor). // chr18 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006525720 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus platelet derived growth factor receptor, beta polypeptide (Pdgfrb), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 42 // 42 // 20 // 48 // 1 /// GENSCAN00000035837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61051506:61130480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 83 // 83 // 40 // 48 // 1
NM_146086 // RefSeq // Mus musculus phosphodiesterase 6A, cGMP-specific, rod, alpha (Pde6a), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000025468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:18:61220482:61289924:1 gene:ENSMUSG00000024575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000135688 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:18:61275023:61289924:1 gene:ENSMUSG00000024575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// AK042142 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630063G20 product:phosphodiesterase 6A, cGMP-specific, rod, alpha, full insert sequence. // chr18 // 100 // 22 // 10 // 10 // 0 /// BC031925 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 6A, cGMP-specific, rod, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:25111 IMAGE:4501123), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC044892 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 6A, cGMP-specific, rod, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:25410 IMAGE:4527430), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC158126 // GenBank // Mus musculus phosphodiesterase 6A, cGMP-specific, rod, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:189894 IMAGE:9007394), complete cds. // chr18 // 93 // 93 // 40 // 43 // 0 /// XM_006525879 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphodiesterase 6A, cGMP-specific, rod, alpha (Pde6a), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 91 // 91 // 42 // 46 // 1 /// GENSCAN00000035838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61220605:61258391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 52 // 24 // 24 // 0
NM_019508 // RefSeq // Mus musculus interleukin 17B (Il17b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006526108 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 17B (Il17b), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006526109 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 17B (Il17b), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:61687935:61692537:1 gene:ENSMUSG00000024578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF184970 // GenBank // Mus musculus cytokine-like protein ZCYTO7 (Zcyto7) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF218726 // GenBank // Mus musculus neuronal interleukin-17 related factor mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF250308 // GenBank // Mus musculus cytokine CX1 precusor mRNA, complete cds. // chr18 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC002271 // GenBank // Mus musculus interleukin 17B, mRNA (cDNA clone MGC:7662 IMAGE:3496106), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61688673:61692437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0
NM_172628 // RefSeq // Mus musculus SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2 (Sh3tc2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006525881 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2 (Sh3tc2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006525883 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2 (Sh3tc2), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006525884 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2 (Sh3tc2), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000051720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:61953075:62015715:1 gene:ENSMUSG00000045629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK048066 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130032N06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AK143600 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F420014A15 product:hypothetical TPR repeat containing protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:61929832:62015090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
XR_105915 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9949 (Gm9949), transcript variant X1, misc_RNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000067743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:62180126:62184405:1 gene:ENSMUSG00000054589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK042188 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630068A11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_008313 // RefSeq // Mus musculus 5 hydroxytryptamine (serotonin) receptor 4 (Htr4), mRNA. // chr18 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006525678 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 5 hydroxytryptamine (serotonin) receptor 4 (Htr4), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 95 // 62 // 20 // 21 // 0 /// XM_006525679 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 5 hydroxytryptamine (serotonin) receptor 4 (Htr4), transcript variant X5, mRNA. // chr18 // 95 // 62 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000027560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:62324204:62467802:1 gene:ENSMUSG00000026322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AJ011369 // GenBank // Mus musculus mRNA for serotonin 4 receptor, splice variant m5-HT4(f). // chr18 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// BC145161 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053712, containing frame-shift errors. // chr18 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// JN418927 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine receptor variant T1 (5HTR4) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr18 // 92 // 35 // 11 // 12 // 0 /// JN418928 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine receptor variant T2l (5HTR4) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr18 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// JN418930 // GenBank // Mus musculus 5-hydroxytryptamine receptor variant T3 (5HTR4) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr18 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// XM_006525681 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus 5 hydroxytryptamine (serotonin) receptor 4 (Htr4), transcript variant X7, mRNA. // chr18 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// GENSCAN00000055557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:62361015:62439983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0
NM_133237 // RefSeq // Mus musculus adenomatosis polyposis coli down-regulated 1 (Apcdd1), mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000096554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:62922327:62953195:1 gene:ENSMUSG00000071847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000163716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:62922329:62952464:1 gene:ENSMUSG00000071847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 91 // 71 // 20 // 22 // 0 /// BC141270 // GenBank // Mus musculus adenomatosis polyposis coli down-regulated 1, mRNA (cDNA clone MGC:176231 IMAGE:9055882), complete cds. // chr18 // 91 // 71 // 20 // 22 // 0 /// BC141269 // GenBank // Mus musculus adenomatosis polyposis coli down-regulated 1, mRNA (cDNA clone MGC:176230 IMAGE:9055881), complete cds. // chr18 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// GENSCAN00000049812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:62936829:62952278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0