NM_146554 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 803 (Olfr803), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000056736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129691113:129692039:-1 gene:ENSMUSG00000046041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_146555 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 805 (Olfr805), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000078876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129722583:129723542:-1 gene:ENSMUSG00000096858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:129722583:129723542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_146553 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 806 (Olfr806), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000095245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129737974:129738915:-1 gene:ENSMUSG00000071065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000049183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:129737974:129738915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_146929 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 807 (Olfr807), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000059038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129754489:129755485:-1 gene:ENSMUSG00000050478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC138074 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 807, mRNA (cDNA clone MGC:169698 IMAGE:8861093), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:129754513:129755193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
NM_146550 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 810 (Olfr810), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000091986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129790609:129791614:-1 gene:ENSMUSG00000069421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC120749 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 810, mRNA (cDNA clone MGC:155986 IMAGE:40129672), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC120751 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 810, mRNA (cDNA clone MGC:155988 IMAGE:40129674), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:129790649:129791587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_146552 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 811 (Olfr811), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129801564:129802523:-1 gene:ENSMUSG00000063173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:129801564:129802523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146795 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 812 (Olfr812), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129842020:129843062:-1 gene:ENSMUSG00000049052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132194 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 812, mRNA (cDNA clone MGC:163825 IMAGE:40130471), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132196 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 812, mRNA (cDNA clone MGC:163827 IMAGE:40130473), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:129818271:129842929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_207159 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 814 (Olfr814), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000081367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129873823:129874755:-1 gene:ENSMUSG00000059134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000049185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:129873823:129874410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_146670 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 815 (Olfr815), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000071557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129901776:129902726:-1 gene:ENSMUSG00000061961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:129901776:129902363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_146672 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 816 (Olfr816), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129911338:129912276:-1 gene:ENSMUSG00000063715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:129911338:129912276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146777 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 818 (Olfr818), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129945104:129946060:-1 gene:ENSMUSG00000058071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:129945104:129946060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001165944 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 819 (Olfr819), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_146269 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 247 (Olfr247), mRNA. // chr10 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000095239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129983480:129984442:-1 gene:ENSMUSG00000094632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENSMUST00000167974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129965736:129966698:-1 gene:ENSMUSG00000094295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000170920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129974605:129975567:-1 gene:ENSMUSG00000095608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:129965736:129988053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001165944 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 819 (Olfr819), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_146269 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 247 (Olfr247), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129983480:129984442:-1 gene:ENSMUSG00000094632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129965736:129966698:-1 gene:ENSMUSG00000094295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000170920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:129974605:129975567:-1 gene:ENSMUSG00000095608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:129965736:129988053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146673 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 823 (Olfr823), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_146674 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 824 (Olfr824), mRNA. // chr10 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000074161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:130126108:130127055:-1 gene:ENSMUSG00000095804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000081469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:130111841:130112788:-1 gene:ENSMUSG00000096747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:130126108:130180734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0
NM_146673 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 823 (Olfr823), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_146674 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 824 (Olfr824), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:130126108:130127055:-1 gene:ENSMUSG00000095804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:130111841:130112788:-1 gene:ENSMUSG00000096747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:130126108:130180734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_146677 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 825 (Olfr825), mRNA. // chr10 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000076814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:130162362:130163324:-1 gene:ENSMUSG00000058084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// BC119054 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 825, mRNA (cDNA clone MGC:155370 IMAGE:8733803), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC119056 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 825, mRNA (cDNA clone MGC:155372 IMAGE:8733805), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:130126108:130180734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 55 // 11 // 12 // 0
NM_146676 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 826 (Olfr826), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000078322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:130179937:130180878:-1 gene:ENSMUSG00000059862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000049189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:130126108:130180734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
NM_146300 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 827 (Olfr827), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:130210092:130211149:-1 gene:ENSMUSG00000045559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117109 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 827, mRNA (cDNA clone MGC:151486 IMAGE:40126428), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117111 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 827, mRNA (cDNA clone MGC:151488 IMAGE:40126430), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:130210160:130211128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007501 // RefSeq // Mus musculus neurogenic differentiation 4 (Neurod4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:10:130268153:130280240:-1 gene:ENSMUSG00000048015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC042639 // GenBank // Mus musculus neurogenic differentiation 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:4503676). // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC054391 // GenBank // Mus musculus neurogenic differentiation 4, mRNA (cDNA clone MGC:62659 IMAGE:6491248), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D85845 // GenBank // Mus musculus mRNA for mammalian atonal homolog-3, complete cds. // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:130270411:130271343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001103365 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 86 (Vmn2r86), mRNA. // chr10 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// NM_001103366 // RefSeq // Mus musculus vomeronasal 2, receptor 87 (Vmn2r87), mRNA. // chr10 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// ENSMUST00000164227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:10:130471332:130497379:-1 gene:ENSMUSG00000091511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// ENSMUST00000170257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:10:130445707:130455894:-1 gene:ENSMUSG00000092162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:10:130470187:130497223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0
NR_028317 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 8430429K09 gene (8430429K09Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142397 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:3452472:3479831:1 gene:ENSMUSG00000034587 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_045276 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 8430429K09 gene (8430429K09Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000144844 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:3452437:3456963:1 gene:ENSMUSG00000034587 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT008282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_053267 // RefSeq // Mus musculus selenoprotein M (Selm), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000094469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:3514867:3517351:1 gene:ENSMUSG00000075702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123677 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:3514684:3517348:1 gene:ENSMUSG00000075702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000131865 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:3514702:3517130:1 gene:ENSMUSG00000075702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AY043488 // GenBank // Mus musculus selenoprotein SelM mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC019742 // GenBank // Mus musculus selenoprotein M, mRNA (cDNA clone IMAGE:3992699), complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC147332 // GenBank // Mus musculus selenoprotein M, mRNA (cDNA clone MGC:182512 IMAGE:9056406), complete cds. // chr11 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC147333 // GenBank // Mus musculus selenoprotein M, mRNA (cDNA clone MGC:182502 IMAGE:9056396), complete cds. // chr11 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT008290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONMMUT008291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:3514945:3517160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001159288 // RefSeq // Mus musculus microrchidia 2A (Morc2a), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_198162 // RefSeq // Mus musculus microrchidia 2A (Morc2a), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000093389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:3649494:3690370:1 gene:ENSMUSG00000034543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000096441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:3650253:3690477:1 gene:ENSMUSG00000034543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC059243 // GenBank // Mus musculus microrchidia 2A, mRNA (cDNA clone MGC:67165 IMAGE:6417551), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:3649100:3689103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_173745 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 18 (Dusp18), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:3895240:3901296:1 gene:ENSMUSG00000047205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109996 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:3895240:3899353:1 gene:ENSMUSG00000047205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC020036 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 18, mRNA (cDNA clone MGC:28218 IMAGE:3990751), complete cds. // chr11 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONMMUT008320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_022889 // RefSeq // Mus musculus pescadillo homolog 1, containing BRCT domain (zebrafish) (Pes1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000020705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:3963975:3980004:1 gene:ENSMUSG00000020430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000109985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:3963975:3980004:1 gene:ENSMUSG00000020430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000137544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:3964049:3976884:1 gene:ENSMUSG00000020430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// AF289539 // GenBank // Mus musculus PES1 protein (Pes1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC004844 // GenBank // Mus musculus pescadillo homolog 1, containing BRCT domain (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:6292 IMAGE:2649598), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC011142 // GenBank // Mus musculus pescadillo homolog 1, containing BRCT domain (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:18823 IMAGE:4207164), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000029080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:3970575:3978910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 78 // 13 // 14 // 0
NM_001177691 // RefSeq // Mus musculus galactose-3-O-sulfotransferase 1 (Gal3st1), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NM_001177703 // RefSeq // Mus musculus galactose-3-O-sulfotransferase 1 (Gal3st1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_016922 // RefSeq // Mus musculus galactose-3-O-sulfotransferase 1 (Gal3st1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006514756 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus galactose-3-O-sulfotransferase 1 (Gal3st1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000063004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:3983713:3999315:1 gene:ENSMUSG00000049721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078757 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:3983636:3999326:1 gene:ENSMUSG00000049721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000109981 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:3989933:3999308:1 gene:ENSMUSG00000049721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AB032939 // GenBank // Mus musculus CST mRNA for cerebroside sulfotransferase, complete cds. // chr11 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC026806 // GenBank // Mus musculus galactose-3-O-sulfotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:28592 IMAGE:4215616), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:3985107:3999066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000121403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4002457:4002805:1 gene:ENSMUSG00000084170 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4002439:4002741:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 83 // 9 // 10 // 0
NM_001029937 // RefSeq // Mus musculus SEC14-like 3 (S. cerevisiae) (Sec14l3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000068322 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4064841:4077736:1 gene:ENSMUSG00000054986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123208 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4064952:4076325:1 gene:ENSMUSG00000054986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000125898 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4064952:4076325:1 gene:ENSMUSG00000054986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000129330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4064891:4069448:1 gene:ENSMUSG00000054986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC138982 // GenBank // Mus musculus SEC14-like 3 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:170609 IMAGE:8862004), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC138985 // GenBank // Mus musculus SEC14-like 3 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:170612 IMAGE:8862007), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC145485 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054048. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4031846:4076367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_026175 // RefSeq // Mus musculus splicing factor 3a, subunit 1 (Sf3a1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000002198 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4160350:4182541:1 gene:ENSMUSG00000002129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC010727 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3a, subunit 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3707947), complete cds. // chr11 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC029753 // GenBank // Mus musculus splicing factor 3a, subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:6887 IMAGE:2651773), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000132666 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4160355:4171913:1 gene:ENSMUSG00000002129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// AK051703 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130066L18 product:SPLICING FACTOR 3 SUBUNIT 1 (SPLICEOSOME ASSOCIATED PROTEIN 114) (SAP 114) (SF3A120) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4160488:4180135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_134023 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 10a (Tbc1d10a), mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006514441 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TBC1 domain family, member 10a (Tbc1d10a), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000041042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4186789:4215505:1 gene:ENSMUSG00000034412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000147485 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4186789:4214885:1 gene:ENSMUSG00000034412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000180088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:4186822:4215502:1 gene:ENSMUSG00000034412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK220243 // GenBank // Mus musculus mRNA for mFLJ00288 protein. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC018300 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 10a, mRNA (cDNA clone MGC:18701 IMAGE:4193046), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC037230 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 10a, mRNA (cDNA clone MGC:6862 IMAGE:2650923), complete cds. // chr11 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000149465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4212475:4213856:1 gene:ENSMUSG00000034412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000029090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4186789:4221920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1
NM_028022 // RefSeq // Mus musculus GATS protein-like 3 (Gatsl3), mRNA. // chr11 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000020699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4218225:4222409:1 gene:ENSMUSG00000020424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC039988 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410008K03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:47964 IMAGE:1195616), complete cds. // chr11 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC114427 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 2410008K03 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40046607), with apparent retained intron. // chr11 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000029090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4186789:4221920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1
NM_001013365 // RefSeq // Mus musculus oncostatin M (Osm), mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000075221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4236420:4241026:1 gene:ENSMUSG00000058755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000131764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4236420:4239664:1 gene:ENSMUSG00000058755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// BC099866 // GenBank // Mus musculus oncostatin M, mRNA (cDNA clone MGC:123464 IMAGE:40040107), complete cds. // chr11 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT008344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000029092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4228682:4240009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001039537 // RefSeq // Mus musculus leukemia inhibitory factor (Lif), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NM_008501 // RefSeq // Mus musculus leukemia inhibitory factor (Lif), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000040750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:4267095:4272514:1 gene:ENSMUSG00000034394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066283 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4257557:4272514:1 gene:ENSMUSG00000034394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF065917 // GenBank // Mus musculus strain B10.S/J myeloid leukemia inhibitory factor (Lif) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// AF065918 // GenBank // Mus musculus strain SJL/J myeloid leukemia inhibitory factor (Lif) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// X12810 // GenBank // Murine mRNA for myeloid leukaemia inhibitory factor (LIF). // chr11 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000029102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4266796:4269334:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0
NM_029291 // RefSeq // Mus musculus activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 (Ascc2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XR_380985 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 (Ascc2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 93 // 79 // 28 // 30 // 0 /// ENSMUST00000070257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4637747:4683385:1 gene:ENSMUSG00000020412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000109930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4637747:4685699:1 gene:ENSMUSG00000020412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AK051387 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130045F10 product:similar to ASC-1 COMPLEX SUBUNIT P100 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC013537 // GenBank // Mus musculus activating signal cointegrator 1 complex subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:19219 IMAGE:4240784), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC024840 // GenBank // Mus musculus activating signal cointegrator 1 complex subunit 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5361571), partial cds. // chr11 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4541040:4683078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0
NM_026015 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, matrin type 5 (Zmat5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006514787 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, matrin type 5 (Zmat5), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000009220 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4704678:4737669:1 gene:ENSMUSG00000009076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000154341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4704708:4737395:1 gene:ENSMUSG00000009076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// AK013415 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810477N24 product:hypothetical Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC031796 // GenBank // Mus musculus zinc finger, matrin type 5, mRNA (cDNA clone MGC:19324 IMAGE:4205598), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000141970 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4728585:4732523:1 gene:ENSMUSG00000009076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// AK051823 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230005F05 product:zinc finger protein 113, full insert sequence. // chr11 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000029082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4718601:4737461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_172438 // RefSeq // Mus musculus THO complex 5 (Thoc5), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000038237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:4895343:4928865:1 gene:ENSMUSG00000034274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000101615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4895320:4928867:1 gene:ENSMUSG00000034274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000142543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4902212:4918225:1 gene:ENSMUSG00000034274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000144371 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4902212:4914310:1 gene:ENSMUSG00000034274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// BC039758 // GenBank // Mus musculus THO complex 5, mRNA (cDNA clone MGC:49541 IMAGE:3995737), complete cds. // chr11 // 90 // 95 // 36 // 40 // 0 /// ENSMUST00000155872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4915306:4920485:1 gene:ENSMUSG00000034274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000029069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4874006:4928738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0
NM_145216 // RefSeq // Mus musculus RAS-like, family 10, member A (Rasl10a), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006514875 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS-like, family 10, member A (Rasl10a), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000037218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5058128:5060385:1 gene:ENSMUSG00000034209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF498251 // GenBank // Mus musculus strain ISS RRP22 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC107200 // GenBank // Mus musculus RAS-like, family 10, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:40051187), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC107201 // GenBank // Mus musculus RAS-like, family 10, member A, mRNA (cDNA clone MGC:130094 IMAGE:40051192), complete cds. // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000126974 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5058966:5060062:1 gene:ENSMUSG00000034209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000043611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5058306:5060065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT008379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr11 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001271730 // RefSeq // Mus musculus X-box binding protein 1 (Xbp1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_013842 // RefSeq // Mus musculus X-box binding protein 1 (Xbp1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000063084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5520659:5525893:1 gene:ENSMUSG00000020484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000149159 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:5521923:5525105:1 gene:ENSMUSG00000020484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000149623 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:5521663:5524943:1 gene:ENSMUSG00000020484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AF027963 // GenBank // Mus musculus X box binding protein-1 (Xbp1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF443192 // GenBank // Mus musculus X-box binding protein processed isoform (Xbp-1) gene, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC016079 // GenBank // Mus musculus X-box binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:27583 IMAGE:4489182), complete cds. // chr11 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// BC029197 // GenBank // Mus musculus X-box binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:36774 IMAGE:2648085), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000145588 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5521005:5524026:1 gene:ENSMUSG00000020484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// GENSCAN00000043636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5520995:5525242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_023816 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 36 (Ankrd36), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006514883 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 36 (Ankrd36), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006514887 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 36 (Ankrd36), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006514890 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat domain 36 (Ankrd36), transcript variant X8, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000109856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:5569684:5689337:1 gene:ENSMUSG00000020481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000118112 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5569817:5660839:1 gene:ENSMUSG00000020481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000137933 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:5628738:5645153:1 gene:ENSMUSG00000020481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK005775 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700008J08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5639043:5689530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000043648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5628315:5634582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001146308 // RefSeq // Mus musculus drebrin-like (Dbnl), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001146309 // RefSeq // Mus musculus drebrin-like (Dbnl), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_013810 // RefSeq // Mus musculus drebrin-like (Dbnl), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020769 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5788522:5800288:1 gene:ENSMUSG00000020476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102928 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5788530:5800962:1 gene:ENSMUSG00000020476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000109845 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5788488:5800629:1 gene:ENSMUSG00000020476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY098595 // GenBank // Mus musculus actin-binding protein 1 (Abp1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC046430 // GenBank // Mus musculus drebrin-like, mRNA (cDNA clone MGC:51371 IMAGE:4986658), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U58884 // GenBank // Mus musculus SH3-containing protein SH3P7 mRNA, complete cds. similar to Human Drebrin. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5788560:5799999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001291857 // RefSeq // Mus musculus AE binding protein 1 (Aebp1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NM_009636 // RefSeq // Mus musculus AE binding protein 1 (Aebp1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000102923 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5861947:5872088:1 gene:ENSMUSG00000020473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000109829 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5867602:5872088:1 gene:ENSMUSG00000020473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 24 // 24 // 0 /// AF053943 // GenBank // Mus musculus aortic carboxypeptidase-like protein ACLP mRNA, complete cds. // chr11 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0 /// BC082577 // GenBank // Mus musculus AE binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:100139 IMAGE:30648530), complete cds. // chr11 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// X80478 // GenBank // M.musculus AEBP1 mRNA. // chr11 // 100 // 56 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5862152:5871849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0
NM_019661 // RefSeq // Mus musculus YKT6 homolog (S. Cerevisiae) (Ykt6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000002818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5955693:5967780:1 gene:ENSMUSG00000002741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF076956 // GenBank // Mus musculus prenylated SNARE protein Ykt6 (Ykt6) mRNA, complete cds. // chr11 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// BC006760 // GenBank // Mus musculus YKT6 homolog (S. Cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:5770 IMAGE:3257673), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000143834 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5959304:5963201:1 gene:ENSMUSG00000002741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// GENSCAN00000011737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5955278:5967487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000181545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:6200029:6201643:1 gene:ENSMUSG00000096923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK080521 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730071L15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000117212 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6242378:6242721:1 gene:ENSMUSG00000081153 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000011732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:6242378:6242671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT008475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000117715 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:6453151:6453438:1 gene:ENSMUSG00000083693 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000011748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:6444338:6453438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_019511 // RefSeq // Mus musculus receptor (calcitonin) activity modifying protein 3 (Ramp3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045374 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:6658521:6677475:1 gene:ENSMUSG00000041046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139540 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6658565:6677472:1 gene:ENSMUSG00000041046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF146524 // GenBank // Mus musculus receptor activity modifying protein 3 (Ramp3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF209907 // GenBank // Mus musculus receptor activity modifying protein 3 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC024765 // GenBank // Mus musculus receptor (calcitonin) activity modifying protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:35928 IMAGE:5364778), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:6658573:6680773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_009622 // RefSeq // Mus musculus adenylate cyclase 1 (Adcy1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000020706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:7063489:7178506:1 gene:ENSMUSG00000020431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000135398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:7159882:7172879:1 gene:ENSMUSG00000020431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// BC050125 // GenBank // Mus musculus adenylate cyclase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:30015692). // chr11 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000016168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:7122131:7170805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1 /// GENSCAN00000016163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:7063600:7109539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_008341 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 1 (Igfbp1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020704 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:7197782:7202546:1 gene:ENSMUSG00000020429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC013345 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:14075 IMAGE:4161889), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X81579 // GenBank // M.musculus mRNA for insulin-like growth factor binding protein-1. // chr11 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:7189080:7202017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001037928 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11992 (Gm11992), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000043285 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:9048594:9069356:1 gene:ENSMUSG00000040978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:9049146:9115376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_178259 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 13 (Abca13), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 64 // 64 // 0 /// ENSMUST00000042740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:9191942:9684259:1 gene:ENSMUSG00000004668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 64 // 64 // 0 /// AY160971 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette transporter (Abca13) mRNA, complete cds. // chr11 // 91 // 69 // 40 // 44 // 0 /// GENSCAN00000053405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:9256733:9499557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000053411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:9547178:9647678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 14 // 14 // 9 // 64 // 1
ENSMUST00000117538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:10239337:10240251:1 gene:ENSMUSG00000082312 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000022449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:10237032:10240251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000056344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:11115851:11266638:1 gene:ENSMUSG00000050830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// ENSMUST00000129670 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:11114744:11268931:1 gene:ENSMUSG00000050830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB292670 // GenBank // Mus musculus mRNA for Brorin, complete cds. // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC120564 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor C domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:155801 IMAGE:40129487), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC137825 // GenBank // Mus musculus von Willebrand factor C domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:169449 IMAGE:8860844), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// DQ421811 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich protein G11 (G11) mRNA, complete cds. // chr11 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// NM_177033 // RefSeq // Mus musculus von Willebrand factor C domain containing 2 (Vwc2), mRNA. // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// XM_006514733 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor C domain containing 2 (Vwc2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// XR_380968 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus von Willebrand factor C domain containing 2 (Vwc2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSMUST00000109681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:11114223:11263526:1 gene:ENSMUSG00000050830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
AK012991 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810405F04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
AK040906 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530043H16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// XM_006514821 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930415F15 gene (4930415F15Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000018489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:11464289:11515100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_028669 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930415F15 gene (4930415F15Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006514821 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930415F15 gene (4930415F15Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006514823 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930415F15 gene (4930415F15Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020410 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:11487671:11515192:1 gene:ENSMUSG00000020191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109678 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:11489266:11515190:1 gene:ENSMUSG00000020191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:11464289:11515100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
ENSMUST00000121361 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:15049158:15050257:1 gene:ENSMUSG00000084183 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:15049176:15050189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000082812 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:15412300:15412406:1 gene:ENSMUSG00000064746 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT008638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000119734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:16236929:16237546:1 gene:ENSMUSG00000082410 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT008642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:16236929:16237466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 55 // 8 // 12 // 0
NM_001290539 // RefSeq // Mus musculus V-set and transmembrane domain containing 2A (Vstm2a), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NM_145967 // RefSeq // Mus musculus V-set and transmembrane domain containing 2A (Vstm2a), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006514606 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus V-set and transmembrane domain containing 2A (Vstm2a), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109645 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:16257724:16284186:1 gene:ENSMUSG00000048834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC027127 // GenBank // Mus musculus V-set and transmembrane domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:38877 IMAGE:5361611), complete cds. // chr11 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// XM_006514604 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus V-set and transmembrane domain containing 2A (Vstm2a), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// ENSMUST00000109647 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:16257803:16427310:1 gene:ENSMUSG00000048834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// AK079096 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330184N17 product:hypothetical Immunoglobulin-like/Immunoglobulin subtype/Ig-like domain profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// GENSCAN00000054516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:16238878:16268677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_007912 // RefSeq // Mus musculus epidermal growth factor receptor (Egfr), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 73 // 37 // 37 // 0 /// NM_207655 // RefSeq // Mus musculus epidermal growth factor receptor (Egfr), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000020329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:16752211:16918158:1 gene:ENSMUSG00000020122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000102884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:16752203:16887923:1 gene:ENSMUSG00000020122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 37 // 37 // 0 /// AF124513 // GenBank // Mus musculus epidermal growth factor receptor (Egfr) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr11 // 94 // 71 // 34 // 36 // 0 /// AF275367 // GenBank // Mus musculus epidermal growth factor receptor (Egfr) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 92 // 45 // 47 // 0 /// BC023729 // GenBank // Mus musculus epidermal growth factor receptor, mRNA (cDNA clone MGC:36101 IMAGE:5351807), complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 36 // 36 // 0 /// U03425 // GenBank // Mus musculus B6/C3 EGF receptor mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000053799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:16874904:16935989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 37 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000054507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:16858724:16872936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 39 // 20 // 20 // 0
NM_176982 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 48 (Fbxo48), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:16951410:16954772:1 gene:ENSMUSG00000044966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109635 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:16951375:16954447:1 gene:ENSMUSG00000044966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK041978 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630050E13 product:hypothetical F-box domain containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC125589 // GenBank // Mus musculus F-box protein 48, mRNA (cDNA clone MGC:159292 IMAGE:40130104), complete cds. // chr11 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC125591 // GenBank // Mus musculus F-box protein 48, mRNA (cDNA clone MGC:159294 IMAGE:40130106), complete cds. // chr11 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC145147 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053698, containing frame-shift errors. // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// XM_006514726 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box protein 48 (Fbxo48), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// XM_006514727 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box protein 48 (Fbxo48), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000053797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:16941617:16954335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000154425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:17192844:17195109:1 gene:ENSMUSG00000033953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// BC002267 // GenBank HTC // Mus musculus protein phosphatase 3, regulatory subunit B, alpha isoform (calcineurin B, type I), mRNA (cDNA clone IMAGE:3495820), with apparent retained intron. // chr11 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// NM_024459 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 3, regulatory subunit B, alpha isoform (calcineurin B, type I) (Ppp3r1), mRNA. // chr11 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// ENSMUST00000102880 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:17159263:17200375:1 gene:ENSMUSG00000033953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// ENSMUST00000151431 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:17182107:17232914:1 gene:ENSMUSG00000078970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// AK133403 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933413M05 product:protein phospatase 3, regulatory subunit B, alpha isoform (calcineurin B, type I), full insert sequence. // chr11 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// GENSCAN00000053811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:17019209:17205400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// AY266418 // GenBank // Mus musculus HZGJ-like protein mRNA, complete cds. // chr11 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1
NM_178909 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 92 (Wdr92), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000046955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:17211918:17233796:1 gene:ENSMUSG00000078970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC096540 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 92, mRNA (cDNA clone MGC:106509 IMAGE:6403681), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151431 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:17182107:17232914:1 gene:ENSMUSG00000078970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// AK141504 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530044A16 product:hypothetical WD40-like containing protein, full insert sequence. // chr11 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000053796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:17211964:17232914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AY266418 // GenBank // Mus musculus HZGJ-like protein mRNA, complete cds. // chr11 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_020558 // RefSeq // Mus musculus C1D nuclear receptor co-repressor (C1d), mRNA. // chr11 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000000594 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:17257594:17269176:1 gene:ENSMUSG00000000581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC005436 // GenBank // Mus musculus C1D nuclear receptor co-repressor, mRNA (cDNA clone MGC:5983 IMAGE:3591682), complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// X95591 // GenBank // M.musculus mRNA for C1D protein. // chr11 // 90 // 48 // 9 // 10 // 0 /// XM_006514762 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus C1D nuclear receptor co-repressor (C1d), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// ENSMUST00000135568 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:17257592:17264294:1 gene:ENSMUSG00000000581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// ENSMUST00000156784 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:17257688:17266624:1 gene:ENSMUSG00000000581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// GENSCAN00000053807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:17259535:17266695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000083450 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:18738695:18738796:1 gene:ENSMUSG00000065384 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT008697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000120961 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:19383685:19384708:1 gene:ENSMUSG00000082737 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_008131 // RefSeq // Mus musculus glutamate-ammonia ligase (glutamine synthetase) (Glul), mRNA. // chr11 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// ENSMUST00000086199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:1:153899944:153909723:1 gene:ENSMUSG00000026473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// ENSMUST00000120291 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:19720355:19721472:1 gene:ENSMUSG00000082100 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY044241 // GenBank // Mus musculus glutamine synthetase (Glul) mRNA, complete cds. // chr11 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// BC015086 // GenBank // Mus musculus glutamate-ammonia ligase (glutamine synthetase), mRNA (cDNA clone MGC:14045 IMAGE:4224865), complete cds. // chr11 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// U09114 // GenBank // Mus musculus glutamate-ammonia ligase mRNA, complete cds. // chr11 // 75 // 100 // 21 // 28 // 0 /// X16314 // GenBank // M.musculus mRNA for glutamine synthetase. // chr11 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// ENSMUST00000139476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:1:153900606:153907140:1 gene:ENSMUSG00000026473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 61 // 12 // 17 // 0 /// GENSCAN00000002352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:19720355:19721472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:153900535:153908182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:38359441:38360487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 89 // 15 // 25 // 0
NM_033523 // RefSeq // Mus musculus sprouty-related, EVH1 domain containing 2 (Spred2), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006514458 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sprouty-related, EVH1 domain containing 2 (Spred2), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000093298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:19924442:20022577:1 gene:ENSMUSG00000045671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000093299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:19924375:20024026:1 gene:ENSMUSG00000045671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000123036 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:19954570:20018133:1 gene:ENSMUSG00000045671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 82 // 63 // 14 // 17 // 0 /// AB063496 // GenBank // Mus musculus mRNA for Spred-2, complete cds. // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC066013 // GenBank // Mus musculus sprouty-related, EVH1 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:90041 IMAGE:5706237), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK153700 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630051L06 product:sprouty protein with EVH-1 domain 2, related sequence, full insert sequence. // chr11 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000004104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:19996249:20042218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
XM_006514458 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sprouty-related, EVH1 domain containing 2 (Spred2), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000093299 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:19924375:20024026:1 gene:ENSMUSG00000045671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC030460 // GenBank // Mus musculus sprouty-related, EVH1 domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4946146), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC040462 // GenBank // Mus musculus sprouty-related, EVH1 domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4241850). // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001290628 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 54 (yeast) (Vps54), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_139061 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 54 (yeast) (Vps54), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000006221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:21239281:21321136:1 gene:ENSMUSG00000020128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000109578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:21239281:21321122:1 gene:ENSMUSG00000020128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000132017 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:21268785:21320324:1 gene:ENSMUSG00000020128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AF424699 // GenBank // Mus musculus Hcc8 mRNA, complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC023474 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 54 (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:5007221), complete cds. // chr11 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC025012 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 54 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:32446 IMAGE:5042879), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:21263219:21319858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000120694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:21953140:21953703:1 gene:ENSMUSG00000082874 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT008837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT008838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
NM_153596 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 17 (Tmem17), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006514442 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 17 (Tmem17), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000059319 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:22512088:22519234:1 gene:ENSMUSG00000049904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC030386 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 17, mRNA (cDNA clone MGC:40971 IMAGE:5400918), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:22512484:22557816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSMUST00000083935 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:22868901:22869004:1 gene:ENSMUSG00000065869 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT008880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_011663 // RefSeq // Mus musculus zinc finger (CCCH type), RNA binding motif and serine/arginine rich 1 (Zrsr1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049506 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:22973215:22976496:1 gene:ENSMUSG00000044068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC132555 // GenBank // Mus musculus zinc finger (CCCH type), RNA binding motif and serine/arginine rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:164186 IMAGE:40130832), complete cds. // chr11 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC138594 // GenBank // Mus musculus zinc finger (CCCH type), RNA binding motif and serine/arginine rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:170219 IMAGE:8861614), complete cds. // chr11 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// D17407 // GenBank // Mus musculus SP2 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000019509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:22973228:22974514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0
NM_001190401 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 34 (Usp34), mRNA. // chr11 // 100 // 99 // 81 // 81 // 0 /// ENSMUST00000130131 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:23420055:23456686:1 gene:ENSMUSG00000056342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 30 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:23306916:23489744:1 gene:ENSMUSG00000056342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 99 // 81 // 81 // 0 /// ENSMUST00000180046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:23306895:23490560:1 gene:ENSMUSG00000056342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 99 // 81 // 81 // 0 /// BC063062 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 34, mRNA (cDNA clone IMAGE:5708348), partial cds. // chr11 // 100 // 10 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000019514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:23306523:23489188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 63 // 63 // 0
ENSMUST00000101462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:23497783:23499192:1 gene:ENSMUSG00000086459 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK132720 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4922502L06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133489 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:23498851:23499644:1 gene:ENSMUSG00000086459 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT008918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT008920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NR_045853 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933427E13 gene (4933427E13Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000044347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:25329957:25358187:1 gene:ENSMUSG00000033015 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000125234 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:25326107:25367137:1 gene:ENSMUSG00000033015 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000082827 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:25685140:25685269:1 gene:ENSMUSG00000064761 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000040593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:25672535:25685282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT008988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
XR_381117 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6899 (Gm6899), misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000089614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:26593241:26593862:1 gene:ENSMUSG00000068314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AK140159 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230320C11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_030419 // RefSeq // Mus musculus microRNA 216b (Mir216b), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102363 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:28746191:28746276:1 gene:ENSMUSG00000076318 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-216b // miRBase Micro RNA Database // MI0004126 Mus musculus miR-216b stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029797 // RefSeq // Mus musculus microRNA 216a (Mir216a), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083605 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:28757012:28757083:1 gene:ENSMUSG00000065539 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-216a // miRBase Micro RNA Database // MI0000699 Mus musculus miR-216a stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029828 // RefSeq // Mus musculus microRNA 217 (Mir217), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083481 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:28763728:28763835:1 gene:ENSMUSG00000065415 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-217 // miRBase Micro RNA Database // MI0000731 Mus musculus miR-217 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146015 // RefSeq // Mus musculus epidermal growth factor-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1 (Efemp1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006514660 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus epidermal growth factor-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1 (Efemp1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000020759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:28853204:28926743:1 gene:ENSMUSG00000020467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000139713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:28915667:28926743:1 gene:ENSMUSG00000020467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0 /// AY251056 // GenBank // Mus musculus EFEMP1 (Efemp1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC031184 // GenBank // Mus musculus epidermal growth factor-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:37612 IMAGE:4989603), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000124103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:28853244:28921526:1 gene:ENSMUSG00000020467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// GENSCAN00000041798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:28807838:28957608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0
ENSMUST00000121462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:28956724:28957608:1 gene:ENSMUSG00000081695 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000041798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:28807838:28957608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
NM_027869 // RefSeq // Mus musculus polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 (Pnpt1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_380983 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 (Pnpt1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000020756 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:29130748:29161828:1 gene:ENSMUSG00000020464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000154924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29130744:29161680:1 gene:ENSMUSG00000020464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF465249 // GenBank // Mus musculus polynucleotide phosphorylase (Old35) mRNA, complete cds. // chr11 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// BC055826 // GenBank // Mus musculus polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:67745 IMAGE:3498934), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:29130758:29161483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AK004563 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1200003F12 product:hypothetical 3 exoribonuclease family containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_134034 // RefSeq // Mus musculus SMEK homolog 2, suppressor of mek1 (Dictyostelium) (Smek2), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000020755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:29172890:29220797:1 gene:ENSMUSG00000020463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000102856 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29172890:29209641:1 gene:ENSMUSG00000020463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000127621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29197198:29209486:1 gene:ENSMUSG00000020463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000127818 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29205625:29218556:1 gene:ENSMUSG00000020463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 82 // 31 // 9 // 11 // 0 /// AK090014 // GenBank HTC // Mus musculus B cells CRL-1702 WEHI 231 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430060F19 product:similar to KAIA1223 PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 88 // 67 // 21 // 24 // 0 /// AK132660 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921508N21 product:Hypothetical Combined RanBP1/wasp domain homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BC006870 // GenBank // Mus musculus SMEK homolog 2, suppressor of mek1 (Dictyostelium), mRNA (cDNA clone MGC:11798 IMAGE:3595439), complete cds. // chr11 // 91 // 89 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:29172019:29218551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0
AK087207 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030034G19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_176841 // RefSeq // Mus musculus coiled coil domain containing 88A (Ccdc88a), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// XM_006514450 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled coil domain containing 88A (Ccdc88a), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000040182 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:29373658:29510808:1 gene:ENSMUSG00000032740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000123561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29470354:29504106:1 gene:ENSMUSG00000032740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000140194 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29485979:29503518:1 gene:ENSMUSG00000032740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC037020 // GenBank // Mus musculus coiled coil domain containing 88A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5364403), complete cds. // chr11 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000041810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:29453122:29504805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0
NM_001163521 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034F02 gene (1700034F02Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NM_028504 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034F02 gene (1700034F02Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006514818 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700034F02 gene (1700034F02Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000020753 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:29547950:29578367:1 gene:ENSMUSG00000020461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000123175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29563850:29578204:1 gene:ENSMUSG00000020461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000131366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29563833:29578346:1 gene:ENSMUSG00000020461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC137683 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034F02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169307 IMAGE:8860702), complete cds. // chr11 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// BC144828 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700034F02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178384 IMAGE:9053376), complete cds. // chr11 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:29552070:29602353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT009065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT009066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0
AK005979 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700014H11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 90 // 77 // 9 // 10 // 0
XR_393881 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102641705 (LOC102641705), transcript variant X1, ncRNA. // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XR_393882 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102641705 (LOC102641705), transcript variant X2, ncRNA. // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000146985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:30267464:30280491:1 gene:ENSMUSG00000073073 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139372 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830034E14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_381128 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102637837 (LOC102637837), transcript variant X2, ncRNA. // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT009097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000021225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:30221152:30279559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_134013 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) activator subunit 4 (Psme4), mRNA. // chr11 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000041231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:30771726:30880361:1 gene:ENSMUSG00000040850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// AF296169 // GenBank // Mus musculus TEMO mRNA, complete cds. // chr11 // 85 // 98 // 40 // 47 // 0 /// AK140717 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030012I24 product:proteasome (prosome, macropain) activator subunit 4, full insert sequence. // chr11 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// GENSCAN00000042788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:30830360:30885913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 40 // 19 // 19 // 0
NM_023906 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 3 (Asb3), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006514771 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 3 (Asb3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006514772 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 3 (Asb3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000020551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:30954395:31102704:1 gene:ENSMUSG00000020305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:30954406:31102704:1 gene:ENSMUSG00000020305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC023086 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:36977 IMAGE:4947610), complete cds. // chr11 // 90 // 74 // 18 // 20 // 0 /// ENSMUST00000117883 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:30954419:31086104:1 gene:ENSMUSG00000020305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// AK038086 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130077G12 product:ankyrin repeat and SOCS box-containing protein 3, full insert sequence. // chr11 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000042784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:30998326:31101242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_175490 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 75 (Gpr75), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000109430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:30885358:30893729:1 gene:ENSMUSG00000043999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY253852 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor GPR75 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC125614 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 75, mRNA (cDNA clone MGC:159317 IMAGE:40130129), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC125616 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 75, mRNA (cDNA clone MGC:159319 IMAGE:40130131), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:30891097:30892719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_026262 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930524B15 gene (4930524B15Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006514795 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930524B15 gene (4930524B15Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006514796 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930524B15 gene (4930524B15Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000102829 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:31965592:31979651:1 gene:ENSMUSG00000020299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK015006 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921536M15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC114574 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930524B15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:141035 IMAGE:40049349), complete cds. // chr11 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000013090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:31965660:32057634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_006514581 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuron specific gene family member 2 (Nsg2), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000093219 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:32000502:32033414:1 gene:ENSMUSG00000020297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// AK049679 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530023J09 product:neuron specific gene family member 2, full insert sequence. // chr11 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// U17259 // GenBank // Mus musculus p19 mRNA, complete cds. // chr11 // 85 // 81 // 22 // 26 // 0 /// NM_008741 // RefSeq // Mus musculus neuron specific gene family member 2 (Nsg2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// ENSMUST00000020537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:32000463:32059202:1 gene:ENSMUSG00000020297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// BC018224 // GenBank // Mus musculus neuron specific gene family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:25346 IMAGE:4527900), complete cds. // chr11 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NM_001290680 // RefSeq // Mus musculus neuron specific gene family member 2 (Nsg2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// NM_001290681 // RefSeq // Mus musculus neuron specific gene family member 2 (Nsg2), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// ENSMUST00000109409 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:32000463:32018007:1 gene:ENSMUSG00000020297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000013090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:31965660:32057634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
ENSMUST00000121140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:32185005:32185701:1 gene:ENSMUSG00000081613 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0
NM_030093 // RefSeq // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein 25 (U11/U12) (Snrnp25), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:32205415:32208984:1 gene:ENSMUSG00000040767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000121182 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:32205488:32208873:1 gene:ENSMUSG00000040767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000125837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:32206762:32208984:1 gene:ENSMUSG00000040767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000149043 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:32205446:32208408:1 gene:ENSMUSG00000040767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000155736 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:32205458:32207651:1 gene:ENSMUSG00000040767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// BC028766 // GenBank // Mus musculus small nuclear ribonucleoprotein 25 (U11/U12), mRNA (cDNA clone MGC:41251 IMAGE:1244556), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:32205622:32208742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT009177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0
NM_010405 // RefSeq // Mus musculus hemoglobin X, alpha-like embryonic chain in Hba complex (Hba-x), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000020531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:32276400:32278116:1 gene:ENSMUSG00000055609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000145569 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:32276893:32278116:1 gene:ENSMUSG00000055609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC051988 // GenBank // Mus musculus hemoglobin X, alpha-like embryonic chain in Hba complex, mRNA (cDNA clone MGC:62294 IMAGE:5711898), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// M26898 // GenBank // Mouse zeta-globin mRNA, complete cds. // chr11 // 76 // 96 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:32276664:32278008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001033981 // RefSeq // Mus musculus hemoglobin, theta 1B (Hbq1b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000101387 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:32286965:32287727:1 gene:ENSMUSG00000073063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// ENSMUST00000151724 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:32287001:32287784:1 gene:ENSMUSG00000073063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// BC141224 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA F830116E18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:176185 IMAGE:9055836), complete cds. // chr11 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_175000 // RefSeq // Mus musculus hemoglobin, theta 1A (Hbq1a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000020535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:32300069:32300873:1 gene:ENSMUSG00000020295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC139349 // GenBank // Mus musculus hemoglobin, theta 1, mRNA (cDNA clone MGC:170976 IMAGE:8862371), complete cds. // chr11 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// BC139351 // GenBank // Mus musculus hemoglobin, theta 1, mRNA (cDNA clone MGC:170978 IMAGE:8862373), complete cds. // chr11 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
NM_177364 // RefSeq // Mus musculus SH3 and PX domains 2B (Sh3pxd2b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038753 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:32347820:32428173:1 gene:ENSMUSG00000040711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB430861 // GenBank // Mus musculus fad49 mRNA for FAD49, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC141306 // GenBank // Mus musculus SH3 and PX domains 2B, mRNA (cDNA clone MGC:176267 IMAGE:9055918), complete cds. // chr11 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// AK169978 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630006G23 product:hypothetical SH3/Phox-like/Src homology 3 (SH3) domain profile/PX domain profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000013102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:32347894:32428160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0
NM_173784 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin domain containing 2 (Ubtd2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:32455370:32516687:1 gene:ENSMUSG00000044949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC057026 // GenBank // Mus musculus ubiquitin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:67186 IMAGE:6825513), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:32455477:32516487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_009288 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine kinase 10 (Stk10), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000102821 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:32533305:32624587:1 gene:ENSMUSG00000020272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC096624 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:30430068). // chr11 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// BC128363 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 10, mRNA (cDNA clone MGC:150241 IMAGE:40111177), complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// D89728 // GenBank // Mus musculus mRNA for LOK, complete cds. // chr11 // 95 // 97 // 35 // 37 // 0 /// GENSCAN00000013091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:32532574:32622561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0
NM_001271347 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 11 (Fbxw11), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// NM_001271348 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 11 (Fbxw11), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_001271349 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 11 (Fbxw11), transcript variant 4, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NM_134015 // RefSeq // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 11 (Fbxw11), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000076383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:32642875:32746816:1 gene:ENSMUSG00000020271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000093205 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:32642866:32746789:1 gene:ENSMUSG00000020271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000109366 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:32642724:32746569:1 gene:ENSMUSG00000020271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AY038079 // GenBank // Mus musculus F-box/WD40 repeat-containing protein HOS mRNA, complete cds. // chr11 // 93 // 82 // 26 // 28 // 0 /// BC034261 // GenBank // Mus musculus F-box and WD-40 domain protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:28671 IMAGE:4237375), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:32733434:32744661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0
AK083005 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530030P08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// NONMMUT009196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT009197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr11 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0
AK083005 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530030P08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT009196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT009197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
AK006938 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700072H12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XR_393906 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA D130052B06 gene (D130052B06Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr11 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// XR_393907 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA D130052B06 gene (D130052B06Rik), transcript variant X4, misc_RNA. // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000101371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:33599302:33625618:1 gene:ENSMUSG00000073052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AK051482 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130052B06 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AK136717 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230101E01 product:hypothetical Histidine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XR_381152 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA D130052B06 gene (D130052B06Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// XR_393908 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA D130052B06 gene (D130052B06Rik), transcript variant X5, misc_RNA. // chr11 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// XR_393909 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA D130052B06 gene (D130052B06Rik), transcript variant X6, misc_RNA. // chr11 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000027152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:33608000:33623961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT009213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_031169 // RefSeq // Mus musculus potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 1 (Kcnmb1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020362 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:33963013:33973641:1 gene:ENSMUSG00000020155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF020711 // GenBank // Mus musculus Maxi potassium channel beta subunit mRNA, complete cds. // chr11 // 79 // 86 // 19 // 24 // 0 /// BC013338 // GenBank // Mus musculus potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 1, mRNA (cDNA clone MGC:13890 IMAGE:3988005), complete cds. // chr11 // 77 // 79 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:33964719:33970364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
NM_010696 // RefSeq // Mus musculus lymphocyte cytosolic protein 2 (Lcp2), mRNA. // chr11 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000052413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:34046920:34092295:1 gene:ENSMUSG00000002699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000109329 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:34047168:34090224:1 gene:ENSMUSG00000002699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000169878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:34047201:34092280:1 gene:ENSMUSG00000002699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// AK037970 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130068B11 product:lymphocyte cytosolic protein 2, full insert sequence. // chr11 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// AK088552 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430020B19 product:lymphocyte cytosolic protein 2, full insert sequence. // chr11 // 95 // 90 // 35 // 37 // 0 /// AK170491 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630105K10 product:lymphocyte cytosolic protein 2, full insert sequence. // chr11 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// BC006948 // GenBank // Mus musculus lymphocyte cytosolic protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:11660 IMAGE:3603181), complete cds. // chr11 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// U20159 // GenBank // Mus musculus 76 kDa tyrosine phosphoprotein SLP-76 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000011696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:34047354:34090687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 46 // 46 // 19 // 41 // 1
NM_001025382 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 196, member B (Fam196b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:34314822:34422639:1 gene:ENSMUSG00000069911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000165963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:34314822:34422640:1 gene:ENSMUSG00000069911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:34401960:34428536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000082643 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:34899017:34899123:1 gene:ENSMUSG00000064577 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONMMUT009263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NM_011412 // RefSeq // Mus musculus slit homolog 3 (Drosophila) (Slit3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000069837 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:35121224:35708507:1 gene:ENSMUSG00000056427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000124438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:35544685:35612636:1 gene:ENSMUSG00000056427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// BC150780 // GenBank // Mus musculus slit homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:183691 IMAGE:9087691), complete cds. // chr11 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// GENSCAN00000054451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:35477311:35680638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 66 // 66 // 25 // 38 // 1
NR_029799 // RefSeq // Mus musculus microRNA 218-2 (Mir218-2), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083649 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:35616816:35616925:1 gene:ENSMUSG00000065583 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-218-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000701 Mus musculus miR-218-2 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145962 // RefSeq // Mus musculus pantothenate kinase 3 (Pank3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000018990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:35769484:35791285:1 gene:ENSMUSG00000018846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC027089 // GenBank // Mus musculus pantothenate kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:38616 IMAGE:5355443), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC032188 // GenBank // Mus musculus pantothenate kinase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5321341). // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:35755217:35790055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AK166119 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730040N22 product:pantothenate kinase 3, full insert sequence. // chr11 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NR_029754 // RefSeq // Mus musculus microRNA 103-1 (Mir103-1), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000083619 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:35782396:35782481:1 gene:ENSMUSG00000065553 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-mir-103-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000587 Mus musculus miR-103-1 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT009279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000083239 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:36722882:36722987:1 gene:ENSMUSG00000065173 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000120104 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:38219069:38220215:1 gene:ENSMUSG00000082587 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000117114 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:41591122:41592034:1 gene:ENSMUSG00000081847 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT009358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_008070 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit beta 2 (Gabrb2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT009375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_008070 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit beta 2 (Gabrb2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK080856 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230386O22 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// NONMMUT009375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0
ENSMUST00000069051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:43035746:43037278:1 gene:ENSMUSG00000055456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK086464 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930030K21 product:Hypothetical beta tubulin containing protein, full insert sequence. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000137991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:43155855:43202220:1 gene:ENSMUSG00000055415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 25 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000148911 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:43149877:43159475:1 gene:ENSMUSG00000055415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// AK033531 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030605H24 product:hypothetical Membrane all-alpha structure containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// NM_176999 // RefSeq // Mus musculus ATPase, class V, type 10B (Atp10b), mRNA. // chr11 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1 /// XM_006533534 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase, class V, type 10B (Atp10b), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 83 // 83 // 40 // 48 // 1 /// ENSMUST00000077659 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:43151599:43262285:1 gene:ENSMUSG00000055415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1 /// GENSCAN00000000488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:43155895:43259901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0
NM_148673 // RefSeq // Mus musculus SLU7 splicing factor homolog (S. cerevisiae) (Slu7), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_198936 // RefSeq // Mus musculus SLU7 splicing factor homolog (S. cerevisiae) (Slu7), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000020681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:43433759:43447981:1 gene:ENSMUSG00000020409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000136541 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:43441407:43442632:1 gene:ENSMUSG00000020409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000151880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:43433744:43445385:1 gene:ENSMUSG00000020409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000178622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:43437343:43447981:1 gene:ENSMUSG00000020409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC025870 // GenBank // Mus musculus SLU7 splicing factor homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5010821), complete cds. // chr11 // 79 // 44 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:43437361:43446191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_026979 // RefSeq // Mus musculus C1q and tumor necrosis factor related protein 2 (C1qtnf2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000057679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:43474306:43491525:1 gene:ENSMUSG00000046491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000151912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:43480829:43490864:1 gene:ENSMUSG00000046491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000173002 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:43474276:43491505:1 gene:ENSMUSG00000046491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC030324 // GenBank // Mus musculus C1q and tumor necrosis factor related protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:40933 IMAGE:5375090), complete cds. // chr11 // 76 // 88 // 22 // 29 // 0 /// DQ002395 // GenBank // Mus musculus C1qTNF2 (C1qtnf2) mRNA, complete cds. // chr11 // 93 // 42 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:43485830:43521876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_001045530 // RefSeq // Mus musculus cyclin J-like (Ccnjl), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000050574 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:43528784:43586997:1 gene:ENSMUSG00000044707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC139344 // GenBank // Mus musculus cyclin J-like, mRNA (cDNA clone MGC:170971 IMAGE:8862366), complete cds. // chr11 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// BC139345 // GenBank // Mus musculus cyclin J-like, mRNA (cDNA clone MGC:170972 IMAGE:8862367), complete cds. // chr11 // 87 // 79 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:43549555:43585715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
ENSMUST00000056256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:43587040:43589048:1 gene:ENSMUSG00000045877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK016814 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933415A04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008352 // RefSeq // Mus musculus interleukin 12b (Il12b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:44400063:44414033:1 gene:ENSMUSG00000004296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:44400063:44414010:1 gene:ENSMUSG00000004296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF128214 // GenBank // Mus musculus strain B10.S/J interleukin 12b p40 subunit (Ll12b) mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// AF128215 // GenBank // Mus musculus strain SJL/J interleukin 12b p40 subunit (Ll12b) mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// BC103608 // GenBank // Mus musculus interleukin 12b, mRNA (cDNA clone MGC:124141 IMAGE:40046200), complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC103609 // GenBank // Mus musculus interleukin 12b, mRNA (cDNA clone MGC:124142 IMAGE:40046202), complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC103610 // GenBank // Mus musculus interleukin 12b, mRNA (cDNA clone MGC:124143 IMAGE:40046204), complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC103614 // GenBank // Mus musculus interleukin 12b, mRNA (cDNA clone MGC:124144 IMAGE:40046206), complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// M86671 // GenBank // Mus musculus interleukin 12 p40 subunit, complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:44395740:44425129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_028862 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 145 (Rnf145), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// XM_006534356 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 145 (Rnf145), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// XM_006534357 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 145 (Rnf145), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// XM_006534358 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 145 (Rnf145), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000019333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:44518964:44565520:1 gene:ENSMUSG00000019189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000124959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:44520305:44548925:1 gene:ENSMUSG00000019189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// BC040799 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 145, mRNA (cDNA clone MGC:49538 IMAGE:3988157), complete cds. // chr11 // 93 // 77 // 28 // 30 // 0 /// NM_001166553 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 145 (Rnf145), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// ENSMUST00000101327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:44519442:44554977:1 gene:ENSMUSG00000019189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// GENSCAN00000015064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:44524960:44564285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 26 // 39 // 1
ENSMUST00000081265 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:44617317:45008091:1 gene:ENSMUSG00000057098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101326 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:44617317:45005529:1 gene:ENSMUSG00000057098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109268 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:44617317:45004995:1 gene:ENSMUSG00000057098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141021 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230003D17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000121695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:45829319:45829869:1 gene:ENSMUSG00000081251 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000056342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:45739979:45829869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001045520 // RefSeq // Mus musculus clathrin interactor 1 (Clint1), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000109260 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:45852051:45910625:1 gene:ENSMUSG00000006169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000109261 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:45852051:45910625:1 gene:ENSMUSG00000006169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000133715 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:45882397:45910625:1 gene:ENSMUSG00000006169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// AB093212 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0171 protein. // chr11 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:45852152:45909287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_173384 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 30 (Sox30), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000049038 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:45980310:46017994:1 gene:ENSMUSG00000040489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY005801 // GenBank // Mus musculus Sox-30 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006532797 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 30 (Sox30), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000056341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:45980500:46017356:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001291890 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 19 (meltrin beta) (Adam19), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_001291891 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 19 (meltrin beta) (Adam19), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NM_009616 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 19 (meltrin beta) (Adam19), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000011400 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46055992:46147343:1 gene:ENSMUSG00000011256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:46127905:46143857:1 gene:ENSMUSG00000011256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AB096093 // GenBank // Mus musculus ADAM19 mRNA for meltrin beta mini, complete cds, alternative splicing. // chr11 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AF019887 // GenBank // Mus musculus metalloprotease-disintegrin meltrin beta mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC093480 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30945316. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// D50410 // GenBank // Mus musculus mRNA for meltrin beta, complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:46056114:46143845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_177075 // RefSeq // Mus musculus fibronectin type III domain containing 9 (Fndc9), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46235531:46239872:1 gene:ENSMUSG00000048721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC104394 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C030019I05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:129498 IMAGE:40050426), complete cds. // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC104395 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C030019I05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:129499 IMAGE:40050429), complete cds. // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:46237656:46238336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
AB473727 // GenBank // Mus musculus GARI-L3 mRNA for Golgi-associated Rab2B interactor-like 3, complete cds. // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC150988 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 71, member B, mRNA (cDNA clone MGC:183901 IMAGE:9087901), complete cds. // chr11 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// NM_001013783 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 71, member B (Fam71b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// ENSMUST00000063166 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46404730:46407982:1 gene:ENSMUSG00000020401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:46404803:46407868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// AK132851 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930441N17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_134250 // RefSeq // Mus musculus hepatitis A virus cellular receptor 2 (Havcr2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000020668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46454935:46481255:1 gene:ENSMUSG00000020399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000109229 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:46454969:46481246:1 gene:ENSMUSG00000020399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF450241 // GenBank // Mus musculus T cell immunoglobulin mucin-3 mRNA, complete cds. // chr11 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// AY553334 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c T-cell immunoglobulin mucin mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC106851 // GenBank // Mus musculus hepatitis A virus cellular receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:124149 IMAGE:40046221), complete cds. // chr11 // 88 // 84 // 23 // 26 // 0 /// BC106852 // GenBank // Mus musculus hepatitis A virus cellular receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:124150 IMAGE:40046222), complete cds. // chr11 // 88 // 84 // 23 // 26 // 0 /// XM_006532394 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hepatitis A virus cellular receptor 2 (Havcr2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000056349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:46451130:46479446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000050937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46571536:46589232:1 gene:ENSMUSG00000046974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052651 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC053393, mRNA (cDNA clone MGC:60735 IMAGE:30034019), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC053393 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA sequence BC053393, mRNA (cDNA clone IMAGE:30032951), with apparent retained intron. // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK145729 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0034I12 product:hypothetical Immunoglobulin subtype/Ig-like domain profile/Immunoglobulin-like/Immunoglobulin/major histocompatibility complex containing protein, full insert sequence. // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:46574581:46608998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001166631 // RefSeq // Mus musculus hepatitis A virus cellular receptor 1 (Havcr1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NM_001166632 // RefSeq // Mus musculus hepatitis A virus cellular receptor 1 (Havcr1), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NM_134248 // RefSeq // Mus musculus hepatitis A virus cellular receptor 1 (Havcr1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000047568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46751168:46779578:1 gene:ENSMUSG00000040405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000081819 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46740061:46779578:1 gene:ENSMUSG00000040405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000109223 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46750511:46779576:1 gene:ENSMUSG00000040405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// AF399829 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c TIM1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF399830 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2 TIM1 mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// BC053400 // GenBank // Mus musculus hepatitis A virus cellular receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:60733 IMAGE:30033601), complete cds. // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:46740209:46778613:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_178759 // RefSeq // Mus musculus T cell immunoglobulin and mucin domain containing 4 (Timd4), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533480 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T cell immunoglobulin and mucin domain containing 4 (Timd4), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000068877 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46810800:46844332:1 gene:ENSMUSG00000055546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY376716 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 smuckler mRNA, complete cds. // chr11 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// AY376717 // GenBank // Mus musculus strain BALB/c smuckler mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC032879 // GenBank HTC // Mus musculus T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:1195144). // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:46808621:46874526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENSMUST00000121420 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:47541432:47542306:1 gene:ENSMUSG00000082792 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT009508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000121448 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48595279:48595809:1 gene:ENSMUSG00000082250 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000031711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:48595276:48595809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT009517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_008143 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2 like 1 (Gnb2l1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:48800360:48806434:1 gene:ENSMUSG00000020372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48803152:48806073:1 gene:ENSMUSG00000020372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000139959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48800357:48806088:1 gene:ENSMUSG00000020372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC046760 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:57917 IMAGE:5693613), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// D29802 // GenBank // Mus musculus p205 mRNA for G protein beta subunit like, complete cds. // chr11 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// ENSMUST00000142269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48800332:48804974:1 gene:ENSMUSG00000020372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000136703 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48800374:48802667:1 gene:ENSMUSG00000020372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:48775537:48806045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000082566 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:48800866:48800932:1 gene:ENSMUSG00000064500 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000142269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48800332:48804974:1 gene:ENSMUSG00000020372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT009526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NR_028563 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 96A (Snord96a), small nucleolar RNA. // chr11 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// ENSMUST00000082791 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:48802032:48802112:1 gene:ENSMUSG00000064725 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48800357:48806088:1 gene:ENSMUSG00000020372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48800332:48804974:1 gene:ENSMUSG00000020372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0
NR_028564 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 95 (Snord95), small nucleolar RNA. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000082846 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:48803139:48803206:1 gene:ENSMUSG00000064780 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000125166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48803152:48806073:1 gene:ENSMUSG00000020372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000142269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48800332:48804974:1 gene:ENSMUSG00000020372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT009528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_146877 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1395 (Olfr1395), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059379 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49148259:49149212:1 gene:ENSMUSG00000050763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49148259:49160954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146276 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1394 (Olfr1394), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052668 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49160016:49160954:1 gene:ENSMUSG00000048378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127968 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1394, mRNA (cDNA clone MGC:157519 IMAGE:40135034), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49148259:49160954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146471 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1393 (Olfr1393), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006533358 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus olfactory receptor 1393 (Olfr1393), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000078932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49280150:49281085:1 gene:ENSMUSG00000059864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC104066 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1393, mRNA (cDNA clone MGC:123557 IMAGE:40041234), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC104067 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1393, mRNA (cDNA clone MGC:123558 IMAGE:40041236), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000036504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49264411:49281085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_146470 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1392 (Olfr1392), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC120614 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1392, mRNA (cDNA clone MGC:155851 IMAGE:40129537), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC120616 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1392, mRNA (cDNA clone MGC:155853 IMAGE:40129539), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000189851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49293323:49294258:1 gene:ENSMUSG00000101750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000036484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49293497:49328348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
NM_206822 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 10 (Olfr10), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC148303 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 10, mRNA (cDNA clone MGC:171112 IMAGE:40041401), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49317548:49318483:1 gene:ENSMUSG00000100923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49293497:49328348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_146468 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1391 (Olfr1391), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127961 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1391, mRNA (cDNA clone MGC:157504 IMAGE:40134837), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC148323 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1391, mRNA (cDNA clone MGC:173145 IMAGE:40134755), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150143 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1391, mRNA (cDNA clone MGC:157499 IMAGE:40134757), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187509 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49327413:49328348:1 gene:ENSMUSG00000101874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49293497:49328348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147065 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1390 (Olfr1390), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000062719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49340534:49341469:1 gene:ENSMUSG00000045421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49340708:49341469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0
NM_147066 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1389 (Olfr1389), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC120728 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1389, mRNA (cDNA clone MGC:155965 IMAGE:40129651), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC120730 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1389, mRNA (cDNA clone MGC:155967 IMAGE:40129653), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000185284 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49430478:49431413:1 gene:ENSMUSG00000102024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49378917:49431413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_146467 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1388 (Olfr1388), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000055584 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49443853:49444788:1 gene:ENSMUSG00000047702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC104275 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1388, mRNA (cDNA clone MGC:129185 IMAGE:40041223), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49443853:49444788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_146473 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1387 (Olfr1387), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073824 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49459681:49460616:1 gene:ENSMUSG00000063386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49459681:49471082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0
NM_146472 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1384 (Olfr1384), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000060434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49513640:49514596:1 gene:ENSMUSG00000044170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC119159 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1384, mRNA (cDNA clone MGC:155475 IMAGE:8733908), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120667 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1384, mRNA (cDNA clone MGC:155904 IMAGE:40129590), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49513640:49514596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_207574 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1383 (Olfr1383), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000077143 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49523725:49524660:1 gene:ENSMUSG00000099844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000057767 // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC127965 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1383, mRNA (cDNA clone MGC:157513 IMAGE:40134985), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000036499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49523725:49552684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001011790 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1382 (Olfr1382), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000074543 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49535187:49536122:1 gene:ENSMUSG00000063827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC119435 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1382, mRNA (cDNA clone MGC:140880 IMAGE:40041463), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000036499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49523725:49552684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_008029 // RefSeq // Mus musculus FMS-like tyrosine kinase 4 (Flt4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000020617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49609263:49652739:1 gene:ENSMUSG00000020357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC138346 // GenBank // Mus musculus FMS-like tyrosine kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:169971 IMAGE:8861366), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC138348 // GenBank // Mus musculus FMS-like tyrosine kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:169973 IMAGE:8861368), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// L07296 // GenBank // Mus musculus receptor tyrosine kinase (FLT4) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49627153:49663362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_054037 // RefSeq // Mus musculus secretoglobin, family 3A, member 1 (Scgb3a1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NM_170727 // RefSeq // Mus musculus secretoglobin, family 3A, member 1 (Scgb3a1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000043873 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49663610:49665118:1 gene:ENSMUSG00000064057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:49663610:49665118:1 gene:ENSMUSG00000064057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF313456 // GenBank // Mus musculus UGRP2 type A mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF313457 // GenBank // Mus musculus UGRP2 type B mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF436840 // GenBank // Mus musculus pneumo secretory protein 2 (Pnsp2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC086910 // GenBank // Mus musculus secretoglobin, family 3A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:107611 IMAGE:6759656), complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_013529 // RefSeq // Mus musculus glutamine fructose-6-phosphate transaminase 2 (Gfpt2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000020629 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49794187:49838613:1 gene:ENSMUSG00000020363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB016780 // GenBank // Mus musculus mRNA for Glutamine:fructose-6-phosphate amidotransferase 2, complete cds. // chr11 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// BC031928 // GenBank // Mus musculus glutamine fructose-6-phosphate transaminase 2, mRNA (cDNA clone MGC:18324 IMAGE:4167189), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000024271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49776555:49854251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
XM_006534379 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RasGEF domain family, member 1C (Rasgef1c), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000063444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:49902161:49980994:1 gene:ENSMUSG00000020374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000093141 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:49901835:49980222:1 gene:ENSMUSG00000020374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:49963785:49975750:1 gene:ENSMUSG00000020374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// AK039330 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330024A19 product:hypothetical Guanine-nucleotide dissociation stimulators CDC25 family containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NM_029004 // RefSeq // Mus musculus RasGEF domain family, member 1C (Rasgef1c), mRNA. // chr11 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// ENSMUST00000093142 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49901855:49980215:1 gene:ENSMUSG00000020374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// GENSCAN00000024268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49954023:50008245:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0
NR_029769 // RefSeq // Mus musculus microRNA 340 (Mir340), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083483 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:50069702:50069799:1 gene:ENSMUSG00000065417 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-340 // miRBase Micro RNA Database // MI0000623 Mus musculus miR-340 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026543 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3010026O09 gene (3010026O09Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020647 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:50174849:50200115:1 gene:ENSMUSG00000020381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000123164 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50174907:50197024:1 gene:ENSMUSG00000020381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// BC028428 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3010026O09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41012 IMAGE:1315017), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006534037 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 3010026O09 gene (3010026O09Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50131439:50200018:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_145926 // RefSeq // Mus musculus mannoside acetylglucosaminyltransferase 4, isoenzyme B (Mgat4b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000041725 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:50225335:50235103:1 gene:ENSMUSG00000036620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000122977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50234023:50234917:1 gene:ENSMUSG00000036620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AB053218 // GenBank // Mus musculus mRNA for N-acetylglucosaminyltransferase IVb, complete cds. // chr11 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC026638 // GenBank // Mus musculus mannoside acetylglucosaminyltransferase 4, isoenzyme B, mRNA (cDNA clone MGC:37502 IMAGE:4984907), complete cds. // chr11 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC031613 // GenBank // Mus musculus mannoside acetylglucosaminyltransferase 4, isoenzyme B, mRNA (cDNA clone MGC:36850 IMAGE:4216720), complete cds. // chr11 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000151803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50230740:50235103:1 gene:ENSMUSG00000036620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// GENSCAN00000024261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50225643:50234865:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0
ENSMUST00000120954 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50347628:50347889:1 gene:ENSMUSG00000082545 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50347518:50347859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006534638 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chibby homolog 3 (Drosophila) (Cby3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50357761:50359699:1 gene:ENSMUSG00000050087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:50354462:50359699:1 gene:ENSMUSG00000050087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK007228 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700121K02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50357753:50359676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001277305 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 2 (Adamts2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NM_175643 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 2 (Adamts2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006544742 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 2-like (LOC102642694), mRNA. // chr11 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000040523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:50602084:50807573:1 gene:ENSMUSG00000036545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC046456 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 2, mRNA (cDNA clone MGC:51450 IMAGE:3965027), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC115840 // GenBank // Mus musculus a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40041918), partial cds. // chr11 // 91 // 25 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000018010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50765645:50804029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0
NM_173372 // RefSeq // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 6 (Grm6), mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000000631 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50850986:50866177:1 gene:ENSMUSG00000000617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000126890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50856824:50866208:1 gene:ENSMUSG00000000617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 97 // 66 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000171427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:50850685:50866206:1 gene:ENSMUSG00000000617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// BC041684 // GenBank // Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 6, mRNA (cDNA clone MGC:49136 IMAGE:4502870), complete cds. // chr11 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// XM_006531962 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamate receptor, metabotropic 6 (Grm6), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 73 // 73 // 32 // 44 // 1 /// GENSCAN00000018016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50851142:50864658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 33 // 33 // 0
NM_146910 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1378 (Olfr1378), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052285 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:50969020:50969967:1 gene:ENSMUSG00000050343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50969020:50969967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146911 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1377 (Olfr1377), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075177 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:50984703:50985626:1 gene:ENSMUSG00000061952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137754 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1377, mRNA (cDNA clone MGC:169378 IMAGE:8860773), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50984703:50985626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146909 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 51 (Olfr51), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51006974:51007897:1 gene:ENSMUSG00000060918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51006974:51007897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010997 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 54 (Olfr54), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51027004:51027945:1 gene:ENSMUSG00000059397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51014483:51027945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010997 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 54 (Olfr54), mRNA. // chr11 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51027004:51027945:1 gene:ENSMUSG00000059397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51048109:51049050:1 gene:ENSMUSG00000057890 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51014483:51027945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51048109:51049050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009329 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 354A (Zfp354a), mRNA. // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000020628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:51060122:51070685:1 gene:ENSMUSG00000020364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000102766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51059257:51071362:1 gene:ENSMUSG00000020364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000109119 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51059815:51070734:1 gene:ENSMUSG00000020364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000109122 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51059294:51072799:1 gene:ENSMUSG00000020364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AF184111 // GenBank // Mus musculus KID1 (Kid1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC050843 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 354A, mRNA (cDNA clone MGC:59375 IMAGE:6506256), complete cds. // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC087540 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 354A, mRNA (cDNA clone MGC:91222 IMAGE:4239789), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// L77247 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein (kid-1) gene, complete cds. // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT009640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NR_045865 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9230009I02 gene (9230009I02Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000101255 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51085087:51091833:1 gene:ENSMUSG00000072982 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000120657 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51106631:51107869:1 gene:ENSMUSG00000083156 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000120114 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51142532:51143467:1 gene:ENSMUSG00000083312 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006534591 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12569 (Gm12569), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000074198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:51234125:51234908:1 gene:ENSMUSG00000061469 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000126189 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51233465:51235053:1 gene:ENSMUSG00000061469 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51226036:51234929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_153393 // RefSeq // Mus musculus collagen, type XXIII, alpha 1 (Col23a1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533210 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collagen, type XXIII, alpha 1 (Col23a1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51289920:51583918:1 gene:ENSMUSG00000063564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF410792 // GenBank // Mus musculus alpha 1 type XXIII collagen mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006533209 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collagen, type XXIII, alpha 1 (Col23a1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// GENSCAN00000018018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51539201:51578066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_026631 // RefSeq // Mus musculus NHP2 ribonucleoprotein (Nhp2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000001083 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51619771:51623429:1 gene:ENSMUSG00000001056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000127405 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51619735:51623714:1 gene:ENSMUSG00000001056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK008766 // GenBank HTC // Mus musculus adult male stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2210022A11 product:NHP2 PROTEIN (NUCLEOLAR PROTEIN FAMILY A, MEMBER 2) (H/ACA SMALL NUCLEOLAR RNPS) (LIKELY HOMOLOG OF YEAST NHP2, COMPONENT OF THE H/ACA SNORNP, HYPOTHETICAL PROTEIN FLJ20479) (SMALL NUCLEOLAR RNA BINDING-LIKE PROTEIN NHP2) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC024944 // GenBank // Mus musculus NHP2 ribonucleoprotein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:19419 IMAGE:3486985), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51619818:51623217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT009664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NR_027958 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D930048N14 gene (D930048N14Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000064493 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:51650956:51657680:1 gene:ENSMUSG00000052563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117859 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:51650954:51657681:1 gene:ENSMUSG00000052563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC095931 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D930048N14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:106227 IMAGE:5341501), complete cds. // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_025535 // RefSeq // Mus musculus SAR1 gene homolog B (S. cerevisiae) (Sar1b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000020653 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51763687:51791925:1 gene:ENSMUSG00000020386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000136363 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51763694:51782801:1 gene:ENSMUSG00000020386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 86 // 52 // 12 // 14 // 0 /// AK013559 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900019I22 product:SAR1A PROTEIN PROMOTING VESICLE BUDDING FROM THE ENDOPLASMIC RETICULUM homolog [Cricetulus griseus], full insert sequence. // chr11 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// BC082550 // GenBank // Mus musculus SAR1 gene homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:99997 IMAGE:30357800), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC085178 // GenBank // Mus musculus SAR1 gene homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:115755 IMAGE:30701201), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51777504:51791443:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT009672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 86 // 52 // 12 // 14 // 0
NM_029976 // RefSeq // Mus musculus CDKN2A interacting protein N-terminal like (Cdkn2aipnl), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51967661:51977334:1 gene:ENSMUSG00000020392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000127136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51967892:51976244:1 gene:ENSMUSG00000020392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC116362 // GenBank // Mus musculus CDKN2A interacting protein N-terminal like, mRNA (cDNA clone MGC:144231 IMAGE:40099997), complete cds. // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC116363 // GenBank // Mus musculus CDKN2A interacting protein N-terminal like, mRNA (cDNA clone MGC:144232 IMAGE:40099998), complete cds. // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000010302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51967719:51975911:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_019411 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, alpha isoform (Ppp2ca), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000020608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:52098681:52127778:1 gene:ENSMUSG00000020349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF076192 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase type 2A catalytic subunit alpha isoform mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC003856 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:6583 IMAGE:3484084), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC054458 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:62598 IMAGE:6493866), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:52111382:52121974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NM_011543 // RefSeq // Mus musculus S-phase kinase-associated protein 1A (Skp1a), mRNA. // chr11 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// XM_006532785 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus S-phase kinase-associated protein 1A (Skp1a), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000037324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:52232009:52246858:1 gene:ENSMUSG00000036309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000109072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:52232189:52246858:1 gene:ENSMUSG00000036309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000116595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:52236864:52246052:1 gene:ENSMUSG00000036309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
NM_011694 // RefSeq // Mus musculus voltage-dependent anion channel 1 (Vdac1), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000020673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:52374263:52388523:1 gene:ENSMUSG00000020402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:52360860:52389397:1 gene:ENSMUSG00000020402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000125694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:52361135:52388496:1 gene:ENSMUSG00000020402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC092257 // GenBank // Mus musculus voltage-dependent anion channel 1, mRNA (cDNA clone MGC:102491 IMAGE:5124735), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// U30840 // GenBank // Mus musculus voltage dependent anion channel 1 mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000157052 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:52374100:52376775:1 gene:ENSMUSG00000020402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000010295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:52369453:52388523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_153117 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9530068E07 gene (9530068E07Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:52396428:52408723:1 gene:ENSMUSG00000036275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:52396428:52408728:1 gene:ENSMUSG00000036275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034829 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9530068E07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28751 IMAGE:4482756), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000153855 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:52396428:52404242:1 gene:ENSMUSG00000036275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// AK012310 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2700032I04 product:immunoglobulin kappa chain variable 4 (V4), full insert sequence. // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:52396492:52407076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_177059 // RefSeq // Mus musculus follistatin-like 4 (Fstl4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_388477 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus follistatin-like 4 (Fstl4), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000036796 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:52764634:53188538:1 gene:ENSMUSG00000036264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF374459 // GenBank // Mus musculus SPIG1-A mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC132353 // GenBank // Mus musculus follistatin-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:163984 IMAGE:40130630), complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:52947847:53178328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_026479 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 10 (Zcchc10), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000018383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:53324679:53333301:1 gene:ENSMUSG00000018239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025078 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:35654 IMAGE:4504126), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087902 // GenBank // Mus musculus zinc finger, CCHC domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:107221 IMAGE:30505854), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082785 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:53390402:53390508:1 gene:ENSMUSG00000064719 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT009734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_008110 // RefSeq // Mus musculus growth differentiation factor 9 (Gdf9), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006532220 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus growth differentiation factor 9 (Gdf9), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000018382 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:53433299:53437904:1 gene:ENSMUSG00000018238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052667 // GenBank // Mus musculus growth differentiation factor 9, mRNA (cDNA clone MGC:60651 IMAGE:30054181), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// L06444 // GenBank // Mus musculus transforming growth factor-beta (GDF-9) mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:53433406:53450875:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0
ENSMUST00000067523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:53480166:53481097:1 gene:ENSMUSG00000054450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK078725 // GenBank HTC // Mus musculus adult male eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7530424I01 product:Hypothetical C-5 cytosine-specific DNA methylase containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000119147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:53501184:53501759:1 gene:ENSMUSG00000085718 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000002725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:53501184:53501762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000121977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:53645744:53646376:1 gene:ENSMUSG00000084373 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0
NM_010558 // RefSeq // Mus musculus interleukin 5 (Il5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048605 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:53720794:53725106:1 gene:ENSMUSG00000036117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC125366 // GenBank // Mus musculus interleukin 5, mRNA (cDNA clone MGC:159069 IMAGE:40129881), complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC132066 // GenBank // Mus musculus interleukin 5, mRNA (cDNA clone MGC:163697 IMAGE:40130343), complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000125096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:54158926:54160056:1 gene:ENSMUSG00000036045 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000040577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:54159697:54160056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000121368 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:54199433:54199692:1 gene:ENSMUSG00000060068 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000040571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:54199358:54199696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_029105 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930404A10 gene (4930404A10Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000094193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:54370652:54426790:1 gene:ENSMUSG00000020332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000143919 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:54370652:54426755:1 gene:ENSMUSG00000020332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK015073 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930404A10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// BC107368 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930404A10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130346 IMAGE:40056257), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// EU234030 // GenBank // Mus musculus clone 2E01 LINE L1 ASL1/BC107369 fusion protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_173753 // RefSeq // Mus musculus folliculin interacting protein 1 (Fnip1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000046835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:54438199:54518235:1 gene:ENSMUSG00000035992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC079892 // GenBank // Mus musculus folliculin interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:100017 IMAGE:30543296), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000143650 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:54464560:54502705:1 gene:ENSMUSG00000035992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// AK087849 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330029L20 product:SIMILAR TO PDZ DOMAIN-CONTAINING GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR I homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// GENSCAN00000040569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:54438297:54515476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1
NM_008248 // RefSeq // Mus musculus histidine triad nucleotide binding protein 1 (Hint1), mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000020504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:54866383:54870501:1 gene:ENSMUSG00000020267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC070415 // GenBank // Mus musculus histidine triad nucleotide binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:99939 IMAGE:5714321), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC080296 // GenBank // Mus musculus histidine triad nucleotide binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:90833 IMAGE:6814185), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// U60001 // GenBank // Mus musculus protein kinase C inhibitor (mPKCI) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000117710 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:54866481:54870307:1 gene:ENSMUSG00000020267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000022486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:54866490:54870353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_008161 // RefSeq // Mus musculus glutathione peroxidase 3 (Gpx3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:54902772:54910377:1 gene:ENSMUSG00000018339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:54902453:54909576:1 gene:ENSMUSG00000018339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000149324 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:54902926:54909534:1 gene:ENSMUSG00000018339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC003339 // GenBank // Mus musculus glutathione peroxidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:6076 IMAGE:3257333), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC037027 // GenBank // Mus musculus glutathione peroxidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:46926 IMAGE:5370640), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049235 // GenBank // Mus musculus glutathione peroxidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:54712 IMAGE:4221025), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061950 // GenBank // Mus musculus glutathione peroxidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:68217 IMAGE:6528998), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U13705 // GenBank // Mus musculus domesticus C57BL/6J plasma glutathione peroxidase (MUSPGPX) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:54902966:54909658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_010299 // RefSeq // Mus musculus GM2 ganglioside activator protein (Gm2a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:55098115:55113029:1 gene:ENSMUSG00000000594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK149642 // GenBank HTC // Mus musculus bone marrow macrophage cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G530007C07 product:GM2 ganglioside activator protein, full insert sequence. // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC004651 // GenBank // Mus musculus GM2 ganglioside activator protein, mRNA (cDNA clone MGC:5949 IMAGE:3482848), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// CT010289 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A0252D for gene Gm2a, GM2 ganglioside activator protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// L19526 // GenBank // Mouse GM2 activator protein mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// U09816 // GenBank // Mus musculus GM2 activator protein (Gm2a) mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:55098164:55109533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_153139 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 1 (Slc36a1), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000020499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:55204376:55233837:1 gene:ENSMUSG00000020261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000108867 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:55213795:55232681:1 gene:ENSMUSG00000020261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000108872 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:55204350:55236330:1 gene:ENSMUSG00000020261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000147506 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:55204374:55222074:1 gene:ENSMUSG00000020261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// AF453743 // GenBank // Mus musculus proton/amino acid transporter 1 (PAT1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AY211262 // GenBank // Mus musculus amino acid transport protein (Slc36a1) mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// BC138556 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:170181 IMAGE:8861576), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC138558 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:170183 IMAGE:8861578), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000022474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:55202204:55232638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_013716 // RefSeq // Mus musculus GTPase activating protein (SH3 domain) binding protein 1 (G3bp1), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000018727 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:55469685:55504838:1 gene:ENSMUSG00000018583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AB001927 // GenBank // Mus musculus mRNA for ras-GTPase-activating protein SH3-domain binding protein, complete cds. // chr11 // 94 // 89 // 16 // 17 // 0 /// AK141689 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030024B16 product:Ras-GTPase-activating protein SH3-domain binding protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// BC021156 // GenBank // Mus musculus Ras-GTPase-activating protein SH3-domain binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:13925 IMAGE:4020362), complete cds. // chr11 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// GENSCAN00000022485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:55481311:55509384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
NR_028480 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12238 (Gm12238), small nucleolar RNA. // chr11 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// ENSMUST00000083127 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:55482694:55482833:1 gene:ENSMUSG00000065061 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000127764 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:55482706:55482829:1 gene:ENSMUSG00000087342 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr11 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// NONMMUT009843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0
NM_022987 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein of the cerebellum 5 (Zic5), mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039118 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:14:122456795:122465677:-1 gene:ENSMUSG00000041703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118330 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:56459349:56460074:1 gene:ENSMUSG00000081749 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:14:122459193:122460021:-1 gene:ENSMUSG00000041703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AB042155 // GenBank // Mus musculus Opr mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AB114214 // GenBank // Mus musculus Zic5 mRNA for zinc finger protein of the cerebellum 5, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:14:122459333:122465230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:56432280:56460074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT022518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
ENSMUST00000157603 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:56482949:56483044:1 gene:ENSMUSG00000088228 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145426 // RefSeq // Mus musculus microfibrillar-associated protein 3 (Mfap3), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_180599 // RefSeq // Mus musculus microfibrillar-associated protein 3 (Mfap3), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020830 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:57518687:57533814:1 gene:ENSMUSG00000020522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108848 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:57522964:57529526:1 gene:ENSMUSG00000020522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000108849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:57518664:57533815:1 gene:ENSMUSG00000020522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC006828 // GenBank // Mus musculus microfibrillar-associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:11870 IMAGE:3597878), complete cds. // chr11 // 90 // 69 // 18 // 20 // 0 /// BC058567 // GenBank HTC // Mus musculus microfibrillar-associated protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6465849), with apparent retained intron. // chr11 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// ENSMUST00000128971 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:57518686:57529089:1 gene:ENSMUSG00000020522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000008062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:57528016:57530244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
NM_134189 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 (Galnt10), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006532387 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 (Galnt10), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000066987 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:57645442:57787514:1 gene:ENSMUSG00000020520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016585 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10, mRNA (cDNA clone MGC:27969 IMAGE:3595220), complete cds. // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC060617 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10, mRNA (cDNA clone MGC:79216 IMAGE:6836791), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:57645559:57784728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
ENSMUST00000083872 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:57764427:57764545:1 gene:ENSMUSG00000065806 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081168 // RefSeq // Mus musculus SAP30-like (Sap30l), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:57801637:57810217:1 gene:ENSMUSG00000020519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051686 // GenBank // Mus musculus SAP30-like, mRNA (cDNA clone MGC:60926 IMAGE:6433799), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC117029 // GenBank // Mus musculus SAP30-like, mRNA (cDNA clone MGC:151406 IMAGE:40126348), complete cds. // chr11 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC117031 // GenBank // Mus musculus SAP30-like, mRNA (cDNA clone MGC:151408 IMAGE:40126350), complete cds. // chr11 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000019247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:57802092:57828128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_028451 // RefSeq // Mus musculus La ribonucleoprotein domain family, member 1 (Larp1), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006534334 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus La ribonucleoprotein domain family, member 1 (Larp1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000071487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58009064:58062031:1 gene:ENSMUSG00000037331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000178636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58009064:58062034:1 gene:ENSMUSG00000037331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58009193:58058765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// AK148019 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270140L05 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr11 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NM_028451 // RefSeq // Mus musculus La ribonucleoprotein domain family, member 1 (Larp1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58009064:58062031:1 gene:ENSMUSG00000037331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58009064:58062034:1 gene:ENSMUSG00000037331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026949 // RefSeq // Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 8 (Cnot8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006534104 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 8 (Cnot8), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006534105 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 8 (Cnot8), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000020822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58104153:58118594:1 gene:ENSMUSG00000020515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000108843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58104229:58118594:1 gene:ENSMUSG00000020515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC004040 // GenBank // Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 8, mRNA (cDNA clone MGC:7665 IMAGE:3496188), complete cds. // chr11 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// XM_006534107 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 8 (Cnot8), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// ENSMUST00000134896 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58104366:58111369:1 gene:ENSMUSG00000020515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1 /// GENSCAN00000019240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58109650:58117588:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0
NM_175001 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L22 (Mrpl22), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000020820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58171661:58179565:1 gene:ENSMUSG00000020514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC061191 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L22, mRNA (cDNA clone MGC:74332 IMAGE:6703228), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000133038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58171676:58176206:1 gene:ENSMUSG00000020514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1 /// GENSCAN00000019249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58171686:58179489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// NONMMUT009924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
NM_001135115 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12250 (Gm12250), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119467 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58187739:58189012:1 gene:ENSMUSG00000082292 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ508486 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J interferon-gamma-inducible p47 GTPase (Irgb10) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ508487 // GenBank // Mus musculus strain C3H/HeJ interferon-gamma-inducible p47 GTPase (Irgb10) mRNA, complete cds. // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58187759:58207276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018738 // RefSeq // Mus musculus interferon gamma induced GTPase (Igtp), mRNA. // chr11 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// NM_019440 // RefSeq // Mus musculus immunity-related GTPase family M member 2 (Irgm2), mRNA. // chr11 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000035266 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58199556:58207591:1 gene:ENSMUSG00000078853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000058704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58199618:58222771:1 gene:ENSMUSG00000069874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000094169 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:58199586:58207565:1 gene:ENSMUSG00000078853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 46 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000108836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58215028:58222779:1 gene:ENSMUSG00000069874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000168280 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:58199588:58207575:1 gene:ENSMUSG00000078853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// BC132557 // GenBank // Mus musculus interferon gamma induced GTPase, mRNA (cDNA clone MGC:164188 IMAGE:40130834), complete cds. // chr11 // 80 // 27 // 8 // 10 // 0 /// BC138607 // GenBank // Mus musculus interferon gamma induced GTPase, mRNA (cDNA clone MGC:170232 IMAGE:8861627), complete cds. // chr11 // 80 // 27 // 8 // 10 // 0 /// U53219 // GenBank // Mus musculus GTPase IGTP mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000019237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58219485:58220672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0
XM_003689172 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930438A08 gene (4930438A08Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000108834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:58274799:58294289:1 gene:ENSMUSG00000069873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58288247:58294068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001040686 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 692 (Zfp692), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NM_182996 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 692 (Zfp692), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531919 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 692 (Zfp692), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000049353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58307172:58314627:1 gene:ENSMUSG00000037243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000153510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58307069:58314613:1 gene:ENSMUSG00000037243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// AK080545 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730082L10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 92 // 37 // 12 // 13 // 0 /// BC145470 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 692, mRNA (cDNA clone MGC:179040 IMAGE:9054032), complete cds. // chr11 // 88 // 69 // 21 // 24 // 0 /// BC150776 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 692, mRNA (cDNA clone MGC:183687 IMAGE:9087687), complete cds. // chr11 // 88 // 69 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58302623:58314069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0
NM_001161338 // RefSeq // Mus musculus SH3 binding domain protein 5 like (Sh3bp5l), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_024480 // RefSeq // Mus musculus SH3 binding domain protein 5 like (Sh3bp5l), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58330750:58347725:1 gene:ENSMUSG00000013646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000116376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58330724:58347728:1 gene:ENSMUSG00000013646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000154278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58331275:58347720:1 gene:ENSMUSG00000013646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK122543 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1720 protein. // chr11 // 75 // 96 // 18 // 24 // 0 /// BC003251 // GenBank // Mus musculus SH3 binding domain protein 5 like, mRNA (cDNA clone MGC:7813 IMAGE:3500047), complete cds. // chr11 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC094418 // GenBank // Mus musculus SH3 binding domain protein 5 like, mRNA (cDNA clone MGC:117080 IMAGE:30702568), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK157826 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130065K17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58331681:58346397:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001083884 // RefSeq // Mus musculus LY6/PLAUR domain containing 8 (Lypd8), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_027339 // RefSeq // Mus musculus LY6/PLAUR domain containing 8 (Lypd8), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000013787 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58379043:58390537:1 gene:ENSMUSG00000013643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000108826 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58379043:58390728:1 gene:ENSMUSG00000013643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC026828 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2210415F13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:25895 IMAGE:4218333), complete cds. // chr11 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58382333:58390381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0
NM_027239 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810065E05 gene (1810065E05Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000013797 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58421111:58426024:1 gene:ENSMUSG00000013653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026941 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:25794 IMAGE:4024443), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001045542 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12253 (Gm12253), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:58432559:58441622:1 gene:ENSMUSG00000058287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533898 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12253 (Gm12253), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58432224:58440058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_207153 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 325 (Olfr325), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000169428 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58580846:58581826:1 gene:ENSMUSG00000060765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC141015 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 325, mRNA (cDNA clone MGC:175976 IMAGE:9055627), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000033207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58580846:58598393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 75 // 10 // 12 // 0
NM_001011743 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 324 (Olfr324), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054683 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58597392:58598393:1 gene:ENSMUSG00000056564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147575 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 324, mRNA (cDNA clone MGC:182671 IMAGE:9056565), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147579 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 324, mRNA (cDNA clone MGC:182675 IMAGE:9056569), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58580846:58598393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001039047 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 58 (Trim58), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000075084 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58640465:58652404:1 gene:ENSMUSG00000037124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC147805 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 58, mRNA (cDNA clone MGC:182908 IMAGE:9087522), complete cds. // chr11 // 86 // 97 // 24 // 28 // 0 /// BC147806 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 58, mRNA (cDNA clone MGC:182909 IMAGE:9087523), complete cds. // chr11 // 86 // 97 // 24 // 28 // 0 /// BC150936 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 58, mRNA (cDNA clone MGC:183847 IMAGE:9087847), complete cds. // chr11 // 86 // 97 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58640468:58651673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_207693 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 322 (Olfr322), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58665561:58666544:1 gene:ENSMUSG00000063549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58665561:58666544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_207230 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 320 (Olfr320), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000190555 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58683875:58684795:1 gene:ENSMUSG00000100688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58683875:58684795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_146500 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 319 (Olfr319), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000076965 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58701703:58702623:1 gene:ENSMUSG00000064044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC104265 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 319, mRNA (cDNA clone MGC:129171 IMAGE:40040340), complete cds. // chr11 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000033187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58701703:58702623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001011818 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 316 (Olfr316), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC150858 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:183769 IMAGE:9087769, complete cds. // chr11 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// ENSMUST00000189911 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58757667:58758587:1 gene:ENSMUSG00000100419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58757667:58758587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_146538 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 315 (Olfr315), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081533 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58778129:58779058:1 gene:ENSMUSG00000056959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119148 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 315, mRNA (cDNA clone MGC:155464 IMAGE:8733897), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58778129:58779058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011760 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 314 (Olfr314), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000076393 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58786236:58787228:1 gene:ENSMUSG00000059504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC147421 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 314, mRNA (cDNA clone MGC:182581 IMAGE:9056475), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC147422 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 314, mRNA (cDNA clone MGC:182599 IMAGE:9056493), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58786105:58788994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_146536 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 313 (Olfr313), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000082220 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58817010:58817936:1 gene:ENSMUSG00000070438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC117002 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 313, mRNA (cDNA clone MGC:151379 IMAGE:40126321), complete cds. // chr11 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// BC120742 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 313, mRNA (cDNA clone MGC:155979 IMAGE:40129665), complete cds. // chr11 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000033174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58817010:58817936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001011819 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 312 (Olfr312), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000078217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58831156:58832082:1 gene:ENSMUSG00000096806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC104268 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 312, mRNA (cDNA clone MGC:129174 IMAGE:40040766), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// BC104273 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 312, mRNA (cDNA clone MGC:129181 IMAGE:40041031), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000033176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58831156:58832082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_146537 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 311 (Olfr311), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58841116:58842042:1 gene:ENSMUSG00000094805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58841116:58842042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006542956 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 717-like (LOC102642717), mRNA. // chr11 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// ENSMUST00000139337 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58847158:58861956:1 gene:ENSMUSG00000072915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58847112:58885537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
XM_006542956 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 717-like (LOC102642717), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58859433:58861956:1 gene:ENSMUSG00000072915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139337 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58847158:58861956:1 gene:ENSMUSG00000072915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK148532 // GenBank HTC // Mus musculus adult pancreas islet cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C820019B02 product:similar to Zinc finger protein 13 (Fragment) [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58847112:58885537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000073924 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58867216:58883288:1 gene:ENSMUSG00000020491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC058081 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2810021J22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:66608 IMAGE:6830592), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0
NM_138678 // RefSeq // Mus musculus butyrophilin-like 10 (Btnl10), mRNA. // chr11 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// XM_006532532 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus butyrophilin-like 10 (Btnl10), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020792 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58918057:58926965:1 gene:ENSMUSG00000020490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000069941 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58917908:58926608:1 gene:ENSMUSG00000020490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58918057:58926965:1 gene:ENSMUSG00000020490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000142499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58917952:58927158:1 gene:ENSMUSG00000020490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AF269232 // GenBank // Mus musculus butyrophilin-like protein BUTR-1 (Butr1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// AK143638 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430004M11 product:butyrophilin related 1, full insert sequence. // chr11 // 93 // 76 // 26 // 28 // 0 /// XM_006532535 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus butyrophilin-like 10 (Btnl10), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// GENSCAN00000033191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58914633:58923974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0
NM_030082 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 3, H2ba (Hist3h2ba), mRNA. // chr11 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// ENSMUST00000078267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58948920:58949533:1 gene:ENSMUSG00000056895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051921 // GenBank // Mus musculus histone cluster 3, H2ba, mRNA (cDNA clone MGC:62161 IMAGE:5684450), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58948940:58949320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
NM_178218 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 3, H2a (Hist3h2a), mRNA. // chr11 // 96 // 59 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000108817 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58954685:58956830:1 gene:ENSMUSG00000078851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC058119 // GenBank // Mus musculus histone cluster 3, H2a, mRNA (cDNA clone MGC:69670 IMAGE:6819179), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// BC063781 // GenBank // Mus musculus histone cluster 3, H2a, mRNA (cDNA clone MGC:70265 IMAGE:6493838), complete cds. // chr11 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000047697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58954685:58973098:1 gene:ENSMUSG00000036964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 72 // 72 // 33 // 46 // 1 /// GENSCAN00000033172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58954738:58955130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000122447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58961812:58962222:1 gene:ENSMUSG00000080152 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000033181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58961812:58962222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT009946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001290988 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 11 (Trim11), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_053168 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 11 (Trim11), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006534579 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif-containing 11 (Trim11), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000093061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58978116:58991457:1 gene:ENSMUSG00000020455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108809 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58978093:58991455:1 gene:ENSMUSG00000020455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58978115:58991458:1 gene:ENSMUSG00000020455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF220124 // GenBank // Mus musculus tripartite motif protein TRIM11 (Trim11) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC020102 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:28318 IMAGE:4014766), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58978240:58990734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000101162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:59002910:59007293:1 gene:ENSMUSG00000072902 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000162526 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59002910:59007293:1 gene:ENSMUSG00000072902 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// AK142737 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830037F02 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// NONMMUT009954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT009955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
NM_026035 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L55 (Mrpl55), mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59202492:59206134:1 gene:ENSMUSG00000036860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108784 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59202538:59205888:1 gene:ENSMUSG00000036860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108785 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59202505:59206002:1 gene:ENSMUSG00000036860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59202486:59205927:1 gene:ENSMUSG00000036860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59202489:59205888:1 gene:ENSMUSG00000036860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC028538 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L55, mRNA (cDNA clone MGC:41419 IMAGE:3368967), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59198722:59205807:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0
NM_024210 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310033P09 gene (2310033P09Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59208321:59210738:1 gene:ENSMUSG00000020441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC002181 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310033P09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7354 IMAGE:3487283), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59208429:59210344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_139298 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 9A (Wnt9a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000000128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59306928:59333552:1 gene:ENSMUSG00000000126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:59306930:59333552:1 gene:ENSMUSG00000000126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB072311 // GenBank // Mus musculus mRNA for Wnt14, complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC066165 // GenBank // Mus musculus wingless-type MMTV integration site 9A, mRNA (cDNA clone MGC:76532 IMAGE:30435371), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59287941:59331375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001011740 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 225 (Olfr225), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:59612966:59614225:1 gene:ENSMUSG00000044061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59612966:59613882:1 gene:ENSMUSG00000044061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59602499:59646122:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NR_045686 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 16062 (Gm16062), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151825 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59810080:59818491:1 gene:ENSMUSG00000087249 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138675 // RefSeq // Mus musculus mediator complex subunit 9 (Med9), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000081980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59948206:59962205:1 gene:ENSMUSG00000061650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF467888 // GenBank // Mus musculus FLJ10193 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC019367 // GenBank // Mus musculus mediator of RNA polymerase II transcription, subunit 9 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:30366 IMAGE:5134581), complete cds. // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000022623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59948267:59960775:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000120311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:60343245:60344206:1 gene:ENSMUSG00000082148 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60310872:60344166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0
NM_025757 // RefSeq // Mus musculus GID complex subunit 4, VID24 homolog (S. cerevisiae) (Gid4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000070681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60417262:60445277:1 gene:ENSMUSG00000018415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK012042 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610318F14 product:RIKEN cDNA 4933439F18 gene, full insert sequence. // chr11 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// AK142753 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830050D11 product:hypothetical Proline-rich region profile/Cysteine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC044901 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933439F18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30445 IMAGE:3660276), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC046821 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933439F18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:61252 IMAGE:6400140), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052418 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933439F18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:63350 IMAGE:6401069), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139477 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:60417145:60450927:1 gene:ENSMUSG00000018415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// AK017120 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933439F18 product:RIKEN cDNA 4933439F18 gene, full insert sequence. // chr11 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000022600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60417656:60442042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0
NM_021354 // RefSeq // Mus musculus developmentally regulated GTP binding protein 2 (Drg2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000018568 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60454591:60468754:1 gene:ENSMUSG00000020537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC082564 // GenBank // Mus musculus developmentally regulated GTP binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:96455 IMAGE:30551418), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000138713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:60454591:60461853:1 gene:ENSMUSG00000020537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// ENSMUST00000147745 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:60454624:60462651:1 gene:ENSMUSG00000020537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// GENSCAN00000022609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60454680:60468150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_172943 // RefSeq // Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 5 (E. coli) (Alkbh5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044250 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60537978:60558512:1 gene:ENSMUSG00000042650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052076 // GenBank // Mus musculus alkB, alkylation repair homolog 5 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:62491 IMAGE:6401541), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000134770 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:60536381:60554367:1 gene:ENSMUSG00000042650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60547688:60559709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001159404 // RefSeq // Mus musculus lethal giant larvae homolog 1 (Drosophila) (Llgl1), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NM_001159405 // RefSeq // Mus musculus lethal giant larvae homolog 1 (Drosophila) (Llgl1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NM_008502 // RefSeq // Mus musculus lethal giant larvae homolog 1 (Drosophila) (Llgl1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000052346 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60699723:60714186:1 gene:ENSMUSG00000020536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000108719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60699845:60714186:1 gene:ENSMUSG00000020536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// BC050913 // GenBank // Mus musculus lethal giant larvae homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:63267 IMAGE:6418169), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// BC055399 // GenBank // Mus musculus lethal giant larvae homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:62651 IMAGE:6308689), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// D16141 // GenBank // Mus musculus mgl-1 mRNA for ORF, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000006405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60699861:60713210:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 41 // 41 // 0
NM_001009927 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial elongation factor 2 (Mief2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000018743 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60728398:60732951:1 gene:ENSMUSG00000018599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000146159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:60728445:60730663:1 gene:ENSMUSG00000018599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000154890 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:60728443:60730996:1 gene:ENSMUSG00000018599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC088984 // GenBank // Mus musculus Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 7 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:113770 IMAGE:5708020), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60730289:60731970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_175491 // RefSeq // Mus musculus Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 8 homolog (human) (Smcr8), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60777524:60781067:1 gene:ENSMUSG00000049323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC085095 // GenBank // Mus musculus Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 8 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:103295 IMAGE:30732606), complete cds. // chr11 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// NM_001085440 // RefSeq // Mus musculus Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 8 homolog (human) (Smcr8), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000056907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:60777525:60788287:1 gene:ENSMUSG00000049323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000006450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60778028:60784207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
NM_001172112 // RefSeq // Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7B (Dhrs7b), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_145428 // RefSeq // Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7B (Dhrs7b), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006532869 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7B (Dhrs7b), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:60830631:60858423:1 gene:ENSMUSG00000042569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:60830679:60860195:1 gene:ENSMUSG00000042569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003479 // GenBank // Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7B, mRNA (cDNA clone MGC:6908 IMAGE:2655855), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// JX196872 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J PexRAP (dhrs7b) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60844190:60857923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_010603 // RefSeq // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 12 (Kcnj12), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041944 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:61065804:61071127:1 gene:ENSMUSG00000042529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:61065804:61071131:1 gene:ENSMUSG00000042529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC115970 // GenBank // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:144838 IMAGE:40106507), complete cds. // chr11 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC116677 // GenBank // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:144839 IMAGE:40106509), complete cds. // chr11 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// NM_001267593 // RefSeq // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 12 (Kcnj12), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// ENSMUST00000089184 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:61022564:61071131:1 gene:ENSMUSG00000042529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000006503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:61046822:61070467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0
NM_029568 // RefSeq // Mus musculus microfibrillar-associated protein 4 (Mfap4), mRNA. // chr11 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:61485461:61488075:1 gene:ENSMUSG00000042436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000064783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:61485431:61488900:1 gene:ENSMUSG00000042436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000126308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:61485516:61488900:1 gene:ENSMUSG00000042436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000127073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:61485491:61486952:1 gene:ENSMUSG00000042436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 92 // 39 // 12 // 13 // 0 /// BC022666 // GenBank // Mus musculus microfibrillar-associated protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:31325 IMAGE:4224106), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:61485742:61488001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0
NM_027817 // RefSeq // Mus musculus GRB2-related adaptor protein (Grap), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000004959 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:61653265:61672784:1 gene:ENSMUSG00000004837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120674 // GenBank // Mus musculus GRB2-related adaptor protein, mRNA (cDNA clone MGC:155911 IMAGE:40129597), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC120676 // GenBank // Mus musculus GRB2-related adaptor protein, mRNA (cDNA clone MGC:155913 IMAGE:40129599), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:61653347:61672478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_178618 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 83, member G (Fam83g), mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070453 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:61684091:61686858:1 gene:ENSMUSG00000042377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000093019 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:61684419:61709951:1 gene:ENSMUSG00000042377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AK077262 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days pregnant adult female ovary and uterus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5031431M05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC085279 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 83, member G, mRNA (cDNA clone MGC:102599 IMAGE:30438273), complete cds. // chr11 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:61683796:61707727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_001029936 // RefSeq // Mus musculus sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 (Specc1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NM_001281818 // RefSeq // Mus musculus sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 (Specc1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000092415 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:62077024:62223005:1 gene:ENSMUSG00000042331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000108709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:62029276:62223013:1 gene:ENSMUSG00000042331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AK143663 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430007D01 product:Similar to sperm antigen (Fragment) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// XM_006533657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 (Specc1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// ENSMUST00000049836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:61956779:62141726:1 gene:ENSMUSG00000042331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// GENSCAN00000012427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:62105056:62166307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0
NM_007413 // RefSeq // Mus musculus adenosine A2b receptor (Adora2b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000018644 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:62248984:62266453:1 gene:ENSMUSG00000018500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC116415 // GenBank // Mus musculus adenosine A2b receptor, mRNA (cDNA clone MGC:144574 IMAGE:40103279), complete cds. // chr11 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC116416 // GenBank // Mus musculus adenosine A2b receptor, mRNA (cDNA clone MGC:144575 IMAGE:40103280), complete cds. // chr11 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// U05673 // GenBank // Mus musculus Balb/C clone R13 adenosine receptor subtype mRNA, complete cds. // chr11 // 77 // 50 // 10 // 13 // 0 /// GENSCAN00000012441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:62239372:62265725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENSMUST00000147918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:62458608:62512238:1 gene:ENSMUSG00000014245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC096678 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class L, mRNA (cDNA clone IMAGE:874131), complete cds. // chr11 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// NM_001039536 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class L (Pigl), mRNA. // chr11 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// ENSMUST00000014389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:62458460:62514417:1 gene:ENSMUSG00000014245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// AK128932 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3003805, highly similar to N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol de-N-acetylase (EC 3.5.1.-). // chr11 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// GENSCAN00000012435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:62473268:62513142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NR_028526 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 49B (Snord49b), small nucleolar RNA. // chr11 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSMUST00000082503 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:62603079:62603150:1 gene:ENSMUSG00000064437 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF357357 // GenBank // Mus musculus clone MBII-366 C/D box snoRNA, partial sequence. // chr11 // 46 // 97 // 13 // 28 // 0 /// NONMMUT010163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0
NR_028550 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 49A (Snord49a), small nucleolar RNA. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000083800 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:62603450:62603521:1 gene:ENSMUSG00000065734 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_175002 // RefSeq // Mus musculus membrane magnesium transporter 2 (Mmgt2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:62648664:62664859:1 gene:ENSMUSG00000048497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000129162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:62649449:62666354:1 gene:ENSMUSG00000048497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000155759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:62648835:62665236:1 gene:ENSMUSG00000048497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC025076 // GenBank // Mus musculus membrane magnesium transporter 2, mRNA (cDNA clone MGC:36859 IMAGE:4459181), complete cds. // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC096408 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC025076, mRNA (cDNA clone IMAGE:3368986). // chr11 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// BC096583 // GenBank // Mus musculus membrane magnesium transporter 2, mRNA (cDNA clone MGC:106107 IMAGE:5025927), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000178750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:62753100:62753498:1 gene:ENSMUSG00000096083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK142775 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930008E18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSMUST00000082758 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:62776985:62777125:1 gene:ENSMUSG00000064692 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT010183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_026210 // RefSeq // Mus musculus trans-golgi network vesicle protein 23B (Tvp23b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000014321 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:62879455:62895185:1 gene:ENSMUSG00000014177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000128698 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:62879490:62892052:1 gene:ENSMUSG00000014177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// BC115504 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 18, member B, mRNA (cDNA clone MGC:144327 IMAGE:40101013), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC115505 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 18, member B, mRNA (cDNA clone MGC:144328 IMAGE:40101015), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000154176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:62879614:62885346:1 gene:ENSMUSG00000014177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000051153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:62879410:62935466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONMMUT010188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_025496 // RefSeq // Mus musculus CMT1A duplicated region transcript 4 (Cdrt4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:62951193:62993095:1 gene:ENSMUSG00000042200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048461 // GenBank // Mus musculus CMT1A duplicated region transcript 4, mRNA (cDNA clone MGC:58194 IMAGE:6771281), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:62980298:63126333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_027660 // RefSeq // Mus musculus tektin 3 (Tekt3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000035732 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:63061654:63094964:1 gene:ENSMUSG00000042189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY252101 // GenBank // Mus musculus testicular microtubules-related protein 3 (Tekt3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC127605 // GenBank // Mus musculus tektin 3, mRNA (cDNA clone MGC:149974 IMAGE:40057157), complete cds. // chr11 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC128270 // GenBank // Mus musculus tektin 3, mRNA (cDNA clone MGC:149975 IMAGE:40057161), complete cds. // chr11 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC139074 // GenBank // Mus musculus tektin 3, mRNA (cDNA clone MGC:170701 IMAGE:8862096), complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// BC139075 // GenBank // Mus musculus tektin 3, mRNA (cDNA clone MGC:170702 IMAGE:8862097), complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000051151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:62980298:63126333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_178870 // RefSeq // Mus musculus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3A1 (Hs3st3a1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000058652 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:64435332:64522841:1 gene:ENSMUSG00000047759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC094320 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3A1, mRNA (cDNA clone MGC:106586 IMAGE:6400013), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_023479 // RefSeq // Mus musculus elaC homolog 2 (E. coli) (Elac2), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000071891 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:64979038:65002069:1 gene:ENSMUSG00000020549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000101049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:64979074:65001600:1 gene:ENSMUSG00000020549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:64979071:65001328:1 gene:ENSMUSG00000020549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000140369 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:64979091:65002067:1 gene:ENSMUSG00000020549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF308696 // GenBank // Mus musculus ELAC2 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK172604 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830219A05 product:elaC homolog 2 (E. coli), full insert sequence. // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC023134 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4018447, containing frame-shift errors. // chr11 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC048235 // GenBank // Mus musculus elaC homolog 2 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:54495 IMAGE:6493124), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:64955197:65001228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
AK046601 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430202K04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:65149234:65162660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_026107 // RefSeq // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 6 (Zkscan6), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533716 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 6 (Zkscan6), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000018491 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:65807244:65829239:1 gene:ENSMUSG00000018347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000071465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:65807175:65829238:1 gene:ENSMUSG00000018347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK007308 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700128E15 product:finger protein kox11 (fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// BC043075 // GenBank // Mus musculus zinc finger with KRAB and SCAN domains 6, mRNA (cDNA clone MGC:57981 IMAGE:6404784), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:65814465:65829274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NM_178656 // RefSeq // Mus musculus phosphoinositide-interacting regulator of transient receptor potential channels (Pirt), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006532579 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phosphoinositide-interacting regulator of transient receptor potential channels (Pirt), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000123434 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:66911981:66929876:1 gene:ENSMUSG00000048070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EU447173 // GenBank // Mus musculus phosphoinositide interacting protein (Pirt) mRNA, complete cds. // chr11 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0
NM_001291042 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 220 (Tmem220), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_001291043 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 220 (Tmem220), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NM_177392 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 220 (Tmem220), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000061786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67025154:67035312:1 gene:ENSMUSG00000050270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000079077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:67025154:67034790:1 gene:ENSMUSG00000050270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC110628 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 220, mRNA (cDNA clone MGC:130169 IMAGE:40052084), complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC110629 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 220, mRNA (cDNA clone MGC:130170 IMAGE:40052085), complete cds. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:66963490:67034244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001040026 // RefSeq // Mus musculus SCO cytochrome oxidase deficient homolog 1 (yeast) (Sco1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000092996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:67052670:67065572:1 gene:ENSMUSG00000069844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000108690 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:67052670:67065331:1 gene:ENSMUSG00000069844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000136984 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67053775:67064076:1 gene:ENSMUSG00000069844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC139008 // GenBank // Mus musculus SCO cytochrome oxidase deficient homolog 1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:170635 IMAGE:8862030), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC139009 // GenBank // Mus musculus SCO cytochrome oxidase deficient homolog 1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:170636 IMAGE:8862031), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000137779 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67058327:67067070:1 gene:ENSMUSG00000069844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000007532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67052421:67125750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001099635 // RefSeq // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 3, skeletal muscle, embryonic (Myh3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000007301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:67078300:67102291:1 gene:ENSMUSG00000020908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000108689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67078300:67102286:1 gene:ENSMUSG00000020908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000165221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:67078300:67102291:1 gene:ENSMUSG00000020908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67052421:67125750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_001039545 // RefSeq // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 2, skeletal muscle, adult (Myh2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000018641 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67171220:67197514:1 gene:ENSMUSG00000033196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000170159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:67171027:67197517:1 gene:ENSMUSG00000033196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC008538 // GenBank // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 2, skeletal muscle, adult, mRNA (cDNA clone MGC:7639 IMAGE:3495412), complete cds. // chr11 // 73 // 97 // 22 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67170751:67237249:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
NM_030679 // RefSeq // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 1, skeletal muscle, adult (Myh1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000018637 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67200111:67224495:1 gene:ENSMUSG00000056328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000075734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:67200404:67224573:1 gene:ENSMUSG00000056328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000124516 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67200052:67224575:1 gene:ENSMUSG00000056328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC108329 // GenBank // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 1, skeletal muscle, adult, mRNA (cDNA clone MGC:117705 IMAGE:30842458), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC150739 // GenBank // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 1, skeletal muscle, adult, mRNA (cDNA clone MGC:183650 IMAGE:9087650), complete cds. // chr11 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67170751:67237249:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_010855 // RefSeq // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 4, skeletal muscle (Myh4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000018632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67238029:67260446:1 gene:ENSMUSG00000057003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000170942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:67240597:67260405:1 gene:ENSMUSG00000057003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC141362 // GenBank // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 4, skeletal muscle, mRNA (cDNA clone MGC:176323 IMAGE:9055974), complete cds. // chr11 // 90 // 97 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67240624:67273979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_177369 // RefSeq // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 8, skeletal muscle, perinatal (Myh8), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000019625 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:67277124:67308634:1 gene:ENSMUSG00000055775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC150737 // GenBank // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 8, skeletal muscle, perinatal, mRNA (cDNA clone MGC:183648 IMAGE:9087648), complete cds. // chr11 // 77 // 94 // 23 // 30 // 0 /// ENSMUST00000108686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67277418:67295168:1 gene:ENSMUSG00000055775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// AK029328 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4832426G23 product:TYPE 3 MYOSIN HEAVY CHAIN (FRAGMENT) homolog [Rana pipiens], full insert sequence. // chr11 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// ENSMUST00000139052 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67279991:67292100:1 gene:ENSMUSG00000055775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// AK220548 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4211 protein. // chr11 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000007515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67278857:67308483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001081250 // RefSeq // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 13, skeletal muscle (Myh13), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000081911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:67327103:67371502:1 gene:ENSMUSG00000060180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000108684 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67321658:67371586:1 gene:ENSMUSG00000060180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000180845 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67321780:67371586:1 gene:ENSMUSG00000060180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000007537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67321382:67402982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_009038 // RefSeq // Mus musculus recoverin (Rcvrn), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021290 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:67695326:67703333:1 gene:ENSMUSG00000020907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC110564 // GenBank // Mus musculus recoverin, mRNA (cDNA clone MGC:129468 IMAGE:40050126), complete cds. // chr11 // 90 // 74 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000017210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67695417:67702993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0
XM_006534599 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12302 (Gm12302), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_618894 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12302 (Gm12302), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000181566 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:67774608:67789898:1 gene:ENSMUSG00000097886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534600 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12302 (Gm12302), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67774608:67789797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001013013 // RefSeq // Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7C (Dhrs7c), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040574 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67798288:67816005:1 gene:ENSMUSG00000033044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149722 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67798271:67801178:1 gene:ENSMUSG00000033044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000168612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:67798271:67815999:1 gene:ENSMUSG00000033044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123862 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67798187:67800810:1 gene:ENSMUSG00000033044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSMUST00000142686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67798277:67799066:1 gene:ENSMUSG00000033044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000017206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67798626:67815953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT010301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT010300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT010303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000068548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:67922376:67923792:1 gene:ENSMUSG00000055134 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK013327 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810451K12 product:ubiquitin specific protease 43, full insert sequence. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// KnowTID_00001158 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146004 // RefSeq // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 6-like (Mfsd6l), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053211 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:68556186:68558245:1 gene:ENSMUSG00000048329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024997 // GenBank // Mus musculus major facilitator superfamily domain containing 6-like, mRNA (cDNA clone MGC:32231 IMAGE:5008948), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:68556325:68558085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_177779 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 42 (Ccdc42), mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// XM_006533483 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 42 (Ccdc42), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000102612 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:68594055:68597954:1 gene:ENSMUSG00000045915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000154294 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:68587021:68597966:1 gene:ENSMUSG00000045915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// BC138437 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 42, mRNA (cDNA clone MGC:170062 IMAGE:8861457), complete cds. // chr11 // 92 // 62 // 24 // 26 // 0 /// BC138438 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 42, mRNA (cDNA clone MGC:170063 IMAGE:8861458), complete cds. // chr11 // 92 // 62 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000063006 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:68587133:68597945:1 gene:ENSMUSG00000045915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// GENSCAN00000023465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:68587215:68824766:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1
NM_175260 // RefSeq // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 10, non-muscle (Myh10), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000018887 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:68692112:68816612:1 gene:ENSMUSG00000020900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000092984 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:68692316:68816624:1 gene:ENSMUSG00000020900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000102611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:68691915:68816632:1 gene:ENSMUSG00000020900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AK147567 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1080G13 product:myosin heavy chain 10, non-muscle, full insert sequence. // chr11 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// BC089011 // GenBank // Mus musculus myosin, heavy polypeptide 10, non-muscle, mRNA (cDNA clone MGC:115764 IMAGE:30620877), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000155765 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:68692154:68769643:1 gene:ENSMUSG00000020900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// AK133946 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730551I19 product:myosin heavy chain 10, non-muscle, full insert sequence. // chr11 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// GENSCAN00000023465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:68587215:68824766:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0
NM_177060 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 222 (Rnf222), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533540 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 222 (Rnf222), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006533541 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 222 (Rnf222), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000065213 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:68888553:68895777:1 gene:ENSMUSG00000046490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK037028 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930101A07 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_009080 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein L26 (Rpl26), mRNA. // chr11 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000073471 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:68901583:68904534:1 gene:ENSMUSG00000060938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000134403 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:68902853:68904533:1 gene:ENSMUSG00000060938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000167436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:68901635:68904533:1 gene:ENSMUSG00000060938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC070397 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L26, mRNA (cDNA clone MGC:99419 IMAGE:5684553), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC099481 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L26, mRNA (cDNA clone MGC:117701 IMAGE:30847108), complete cds. // chr11 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000101014 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:68901610:68904510:1 gene:ENSMUSG00000060938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0 /// ENSMUST00000128952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:68901627:68903319:1 gene:ENSMUSG00000060938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// NONMMUT010347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_028048 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 35 (Slc25a35), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000018884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:68968148:68974365:1 gene:ENSMUSG00000018740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:68968131:68972516:1 gene:ENSMUSG00000018740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC004569 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 35, mRNA (cDNA clone IMAGE:3586188), partial cds. // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC019996 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 35, mRNA (cDNA clone MGC:28559 IMAGE:4207271), complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006534276 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 25, member 35 (Slc25a35), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// ENSMUST00000136520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:68968147:68971782:1 gene:ENSMUSG00000018740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// AK157873 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930002I03 product:hypothetical Mitochondrial substrate carrier containing protein, full insert sequence. // chr11 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000023447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:68968663:68972123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
NM_028005 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310047M10 gene (2310047M10Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69059717:69061578:1 gene:ENSMUSG00000045176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69045961:69060880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NR_028566 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 118 (Snord118), small nucleolar RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_381283 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638974 (LOC102638974), transcript variant X4, ncRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_394283 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638974 (LOC102638974), transcript variant X1, ncRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_394284 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638974 (LOC102638974), transcript variant X2, ncRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082783 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:12:13163629:13163763:-1 gene:ENSMUSG00000064717 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082965 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:69073427:69073561:1 gene:ENSMUSG00000064899 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0
NM_033041 // RefSeq // Mus musculus hairy and enhancer of split 7 (Drosophila) (Hes7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534556 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hairy and enhancer of split 7 (Drosophila) (Hes7), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000024543 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69120404:69124055:1 gene:ENSMUSG00000023781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB049065 // GenBank // Mus musculus mRNA for bHLH factor Hes7, complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC134378 // GenBank // Mus musculus hairy and enhancer of split 7 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:161795 IMAGE:40135283), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69120474:69122994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_011786 // RefSeq // Mus musculus arachidonate lipoxygenase 3 (Aloxe3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006533257 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus arachidonate lipoxygenase 3 (Aloxe3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// XR_388449 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus arachidonate lipoxygenase 3 (Aloxe3), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69125896:69149115:1 gene:ENSMUSG00000020892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000175661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69126403:69134524:1 gene:ENSMUSG00000020892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// BC116258 // GenBank // Mus musculus arachidonate lipoxygenase 3, mRNA (cDNA clone MGC:143829 IMAGE:40093733), complete cds. // chr11 // 87 // 94 // 26 // 30 // 0 /// BC116259 // GenBank // Mus musculus arachidonate lipoxygenase 3, mRNA (cDNA clone MGC:143830 IMAGE:40093735), complete cds. // chr11 // 87 // 94 // 26 // 30 // 0 /// ENSMUST00000155324 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69126215:69135507:1 gene:ENSMUSG00000020892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// AK141003 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130095N17 product:arachidonate lipoxygenase 3, full insert sequence. // chr11 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000023456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69126403:69148739:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_009659 // RefSeq // Mus musculus arachidonate 12-lipoxygenase, 12R type (Alox12b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000036424 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69156989:69169792:1 gene:ENSMUSG00000032807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF059251 // GenBank // Mus musculus lipoxygenase (alox) mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// BC113149 // GenBank // Mus musculus arachidonate 12-lipoxygenase, 12R type, mRNA (cDNA clone MGC:130560 IMAGE:40054352), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000023453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69157247:69169725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_001024206 // RefSeq // Mus musculus trafficking protein particle complex 1 (Trappc1), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060956 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69324075:69325793:1 gene:ENSMUSG00000049299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000102601 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69324063:69325793:1 gene:ENSMUSG00000049299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69323980:69325793:1 gene:ENSMUSG00000049299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69324157:69325793:1 gene:ENSMUSG00000049299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC115818 // GenBank // Mus musculus trafficking protein particle complex 1, mRNA (cDNA clone MGC:144874 IMAGE:40107010), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC115921 // GenBank // Mus musculus trafficking protein particle complex 1, mRNA (cDNA clone MGC:144875 IMAGE:40107011), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69324158:69341214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_010599 // RefSeq // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 3 (Kcnab3), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000018614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69326258:69333042:1 gene:ENSMUSG00000018470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000134561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69330324:69332143:1 gene:ENSMUSG00000018470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000142328 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69327866:69333042:1 gene:ENSMUSG00000018470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AK029750 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930528F18 product:potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 3, full insert sequence. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC017518 // GenBank // Mus musculus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 3, mRNA (cDNA clone MGC:27635 IMAGE:4507029), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// U65593 // GenBank // Mus musculus K+ channel beta4 subunit mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 47 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000023463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69324158:69341214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
NR_027827 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 3, opposite strand (Chd3os), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000129321 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69340461:69342641:1 gene:ENSMUSG00000043419 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK019090 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310043C11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AB240530 // GenBank // Mus musculus RNF21 mRNA for hypothetical protein, complete cds. // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69324158:69341214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSMUST00000166700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:69364019:69369408:1 gene:ENSMUSG00000091095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF020312 // GenBank // Mus musculus proline-rich protein 9-1 mRNA, partial cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_030083 // RefSeq // Mus musculus N(alpha)-acetyltransferase 38, NatC auxiliary subunit (Naa38), mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000082283 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69395814:69396680:1 gene:ENSMUSG00000059278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124932 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69396118:69396680:1 gene:ENSMUSG00000059278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000144531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69395647:69396680:1 gene:ENSMUSG00000059278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC048499 // GenBank // Mus musculus LSM domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:58348 IMAGE:6583055), complete cds. // chr11 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// BC062267 // GenBank // Mus musculus LSM domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:73810 IMAGE:1532489), complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr11 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000129924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69401513:69402700:1 gene:ENSMUSG00000085178 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK006879 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700064E03 product:unknown EST, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT010412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT010413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONMMUT010414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_026991 // RefSeq // Mus musculus spermidine/spermine N1-acetyl transferase 2 (Sat2), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534110 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spermidine/spermine N1-acetyl transferase 2 (Sat2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000092969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69622052:69623870:1 gene:ENSMUSG00000069835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108656 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69622024:69623870:1 gene:ENSMUSG00000069835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK011406 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610016A03 product:similar to SPERMIDINE/SPERMINE N1-ACETYL TRANSFERASE [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC061227 // GenBank // Mus musculus spermidine/spermine N1-acetyl transferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:74376 IMAGE:30312881), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000151255 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69622052:69623458:1 gene:ENSMUSG00000069835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// AK161230 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833435F13 product:spermidine/spermine N1-acetyl transferase 2, full insert sequence. // chr11 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000009482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69622267:69622978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0
NM_011814 // RefSeq // Mus musculus fragile X mental retardation, autosomal homolog 2 (Fxr2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000018909 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69632990:69653297:1 gene:ENSMUSG00000018765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC057007 // GenBank // Mus musculus fragile X mental retardation, autosomal homolog 2, mRNA (cDNA clone MGC:67043 IMAGE:6816943), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC062971 // GenBank // Mus musculus fragile X mental retardation, autosomal homolog 2, mRNA (cDNA clone MGC:73447 IMAGE:6415619), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000009488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69628236:69655903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
NM_009235 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 15 (Sox15), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000047373 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69655314:69656727:1 gene:ENSMUSG00000041287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF182945 // GenBank // Mus musculus SOX15 (Sox15) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC119067 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 15, mRNA (cDNA clone MGC:155383 IMAGE:8733816), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC119069 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 15, mRNA (cDNA clone MGC:155385 IMAGE:8733818), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69628236:69655903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NR_027913 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA G630025P09 gene (G630025P09Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019726 // RefSeq // Mus musculus G protein pathway suppressor 2 (Gps2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006537190 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein pathway suppressor 2 (Gps2), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000057884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69914192:69916591:1 gene:ENSMUSG00000023170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072581 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69913888:69916576:1 gene:ENSMUSG00000023170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000116358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:69914050:69916590:1 gene:ENSMUSG00000023170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000134581 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:69916041:69916556:1 gene:ENSMUSG00000023170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AF153696 // GenBank // Mus musculus G protein pathway suppressor 2 mRNA, complete cds. // chr11 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// BC011317 // GenBank // Mus musculus G protein pathway suppressor 2, mRNA (cDNA clone MGC:18727 IMAGE:3979292), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC138879 // GenBank // Mus musculus G protein pathway suppressor 2, mRNA (cDNA clone MGC:170506 IMAGE:8861901), complete cds. // chr11 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC138880 // GenBank // Mus musculus G protein pathway suppressor 2, mRNA (cDNA clone MGC:170507 IMAGE:8861902), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69914340:69916151:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001193619 // RefSeq // Mus musculus claudin 7 (Cldn7), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_016887 // RefSeq // Mus musculus claudin 7 (Cldn7), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000018713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69965396:69967885:1 gene:ENSMUSG00000018569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108596 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:69964835:69967882:1 gene:ENSMUSG00000018569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000108597 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69964779:69967810:1 gene:ENSMUSG00000018569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000151515 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:69966918:69967652:1 gene:ENSMUSG00000018569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// AF087825 // GenBank // Mus musculus claudin-7 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC008104 // GenBank // Mus musculus claudin 7, mRNA (cDNA clone MGC:7108 IMAGE:3157774), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC050007 // GenBank // Mus musculus claudin 7, mRNA (cDNA clone MGC:58905 IMAGE:6530942), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69964824:69966969:1 gene:ENSMUSG00000018569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000009389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69965927:69967717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_026017 // RefSeq // Mus musculus CTD nuclear envelope phosphatase 1 (Ctdnep1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108593 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69981156:69990601:1 gene:ENSMUSG00000018559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000131531 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69984254:69989548:1 gene:ENSMUSG00000018559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// ENSMUST00000141623 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:69983720:69989559:1 gene:ENSMUSG00000018559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// ENSMUST00000152226 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:69989091:69990402:1 gene:ENSMUSG00000018559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC018265 // GenBank // Mus musculus Dullard homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:25664 IMAGE:4486464), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT010469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000009408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69981487:69999452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_019749 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid receptor associated protein (Gabarap), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000018711 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69991143:69994951:1 gene:ENSMUSG00000018567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000108592 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:69991639:69994940:1 gene:ENSMUSG00000018567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000144443 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69991684:69994935:1 gene:ENSMUSG00000018567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// AF161587 // GenBank // Mus musculus GABA-A receptor-associated protein (Gabarap) mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC002126 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid receptor associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:6656 IMAGE:3497484), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC024621 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid receptor associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:25654 IMAGE:4459651), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC029329 // GenBank HTC // Mus musculus gamma-aminobutyric acid receptor associated protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:5008710). // chr11 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC030350 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid receptor associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:40719 IMAGE:5102114), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69981487:69999452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_007493 // RefSeq // Mus musculus asialoglycoprotein receptor 2 (Asgr2), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70092644:70106187:1 gene:ENSMUSG00000040963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000124721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70092748:70105411:1 gene:ENSMUSG00000040963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000143772 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:70092683:70105861:1 gene:ENSMUSG00000040963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000179757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70097692:70105856:1 gene:ENSMUSG00000040963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// BC011197 // GenBank // Mus musculus asialoglycoprotein receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:18613 IMAGE:4194949), complete cds. // chr11 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70093070:70137113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NR_030444 // RefSeq // Mus musculus microRNA 497 (Mir497), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// mmu-mir-497 // miRBase Micro RNA Database // MI0004636 Mus musculus miR-497 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT010491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_029581 // RefSeq // Mus musculus microRNA 195a (Mir195a), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000083477 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:70235042:70235135:1 gene:ENSMUSG00000065411 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// mmu-mir-195a // miRBase Micro RNA Database // MI0000237 Mus musculus miR-195 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT010492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_025397 // RefSeq // Mus musculus mediator complex subunit 11 (Med11), mRNA. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019067 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70451919:70453727:1 gene:ENSMUSG00000018923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151013 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:70451919:70453240:1 gene:ENSMUSG00000018923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000152348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70451932:70453564:1 gene:ENSMUSG00000018923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025057 // GenBank // Mus musculus mediator of RNA polymerase II transcription, subunit 11 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:35762 IMAGE:4238297), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70451979:70453239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT010502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001029929 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, MYND-type containing 15 (Zmynd15), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000039093 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70459622:70466202:1 gene:ENSMUSG00000040829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000092958 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:70460565:70466090:1 gene:ENSMUSG00000040829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000108563 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:70459433:70466202:1 gene:ENSMUSG00000040829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000136029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70460196:70466199:1 gene:ENSMUSG00000040829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK128979 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3017934. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK171931 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830020B15 product:chemokine (C-X-C motif) ligand 16, full insert sequence. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC151086 // GenBank // Mus musculus zinc finger, MYND-type containing 15, mRNA (cDNA clone MGC:183999 IMAGE:9087999), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70460570:70466086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_029360 // RefSeq // Mus musculus transmembrane 4 superfamily member 5 (Tm4sf5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000019063 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70505244:70511178:1 gene:ENSMUSG00000018919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000141924 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70510206:70510967:1 gene:ENSMUSG00000018919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000179986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70509970:70510882:1 gene:ENSMUSG00000018919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// BC010782 // GenBank // Mus musculus transmembrane 4 superfamily member 5, mRNA (cDNA clone MGC:18714 IMAGE:4219239), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70505331:70510856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_146020 // RefSeq // Mus musculus glycolipid transfer protein domain containing 2 (Gltpd2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000057685 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70519196:70520736:1 gene:ENSMUSG00000046811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000179000 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:70519639:70520519:1 gene:ENSMUSG00000046811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC025515 // GenBank // Mus musculus glycolipid transfer protein domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:38100 IMAGE:5309987), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC030735 // GenBank // Mus musculus glycolipid transfer protein domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:37941 IMAGE:5126172), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_008946 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 6 (Psmb6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006532521 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 6 (Psmb6), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000018430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70525386:70527649:1 gene:ENSMUSG00000018286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC013897 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 6, mRNA (cDNA clone MGC:14026 IMAGE:4038758), complete cds. // chr11 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// U13393 // GenBank // Mus musculus delta proteasome subunit mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000128870 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70527072:70527858:1 gene:ENSMUSG00000018286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1 /// GENSCAN00000038549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70525397:70527579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_008876 // RefSeq // Mus musculus phospholipase D2 (Pld2), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006532484 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus phospholipase D2 (Pld2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000018429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70540306:70558110:1 gene:ENSMUSG00000020828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108556 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:70540356:70546398:1 gene:ENSMUSG00000020828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000108557 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:70540343:70558110:1 gene:ENSMUSG00000020828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC047268 // GenBank // Mus musculus phospholipase D2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6310368), complete cds. // chr11 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC068317 // GenBank // Mus musculus phospholipase D2, mRNA (cDNA clone MGC:76743 IMAGE:30094606), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// U87557 // GenBank // Mus musculus phosphatidylcholine-specific phospholipase D2 (mPLD2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70539983:70613712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1
NM_010326 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein 1b, alpha polypeptide (Gp1ba), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:70639122:70642036:1 gene:ENSMUSG00000050675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70639144:70641820:1 gene:ENSMUSG00000050675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC137765 // GenBank // Mus musculus glycoprotein 1b, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:169389 IMAGE:8860784), complete cds. // chr11 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_153103 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 1C (Kif1c), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072187 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:70700576:70730424:1 gene:ENSMUSG00000020821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094499 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70700561:70730387:1 gene:ENSMUSG00000020821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102554 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70700548:70731964:1 gene:ENSMUSG00000020821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137119 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:70700650:70731964:1 gene:ENSMUSG00000020821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC016221 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 1C, mRNA (cDNA clone IMAGE:4485843). // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177565 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 3 (Zfp3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000060444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70764209:70772928:1 gene:ENSMUSG00000043602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC032259 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5371502), partial cds. // chr11 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC096463 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:106171 IMAGE:6466366), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK165781 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630070A21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000038534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70764358:70773701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT010533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_025993 // RefSeq // Mus musculus MIS12 homolog (yeast) (Mis12), mRNA. // chr11 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// XM_006533969 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MIS12 homolog (yeast) (Mis12), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000048807 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:71019611:71027371:1 gene:ENSMUSG00000040599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000136137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:71019891:71025195:1 gene:ENSMUSG00000040599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000143762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:71019862:71025158:1 gene:ENSMUSG00000040599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// BC026790 // GenBank // Mus musculus MIS12 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:30320 IMAGE:5148857), complete cds. // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000164220 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:71019611:71026066:1 gene:ENSMUSG00000040599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSMUST00000133413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:71019611:71025178:1 gene:ENSMUSG00000040599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_144526 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 64, member A (Fam64a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021164 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72042455:72047370:1 gene:ENSMUSG00000020808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72042922:72045040:1 gene:ENSMUSG00000020808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// BC029115 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6720460F02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28147 IMAGE:3983148), complete cds. // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC020115 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6720460F02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28187 IMAGE:3988382), complete cds. // chr11 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// XM_006531976 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 64, member A (Fam64a), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// ENSMUST00000133880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72042524:72046093:1 gene:ENSMUSG00000020808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONMMUT010581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_026559 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin domain containing 17 (Txndc17), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000021158 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72207547:72210015:1 gene:ENSMUSG00000020803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 81 // 16 // 17 // 0 /// BC030344 // GenBank // Mus musculus thioredoxin domain containing 17, mRNA (cDNA clone MGC:40618 IMAGE:3673521), complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0
NM_001163728 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930563E22 gene (4930563E22Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000066087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:72215138:72218450:1 gene:ENSMUSG00000053574 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72215172:72218444:1 gene:ENSMUSG00000053574 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT010588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001099688 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 39 (Fbxo39), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533899 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box protein 39 (Fbxo39), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// XM_006533901 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus F-box protein 39 (Fbxo39), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// ENSMUST00000108504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72314444:72319416:1 gene:ENSMUSG00000070388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72301678:72319211:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027819 // RefSeq // Mus musculus gamma-glutamyltransferase 6 (Ggt6), mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006534241 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-glutamyltransferase 6 (Ggt6), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// XM_006534242 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-glutamyltransferase 6 (Ggt6), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000076443 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72435526:72438400:1 gene:ENSMUSG00000040471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000100903 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:72435614:72438171:1 gene:ENSMUSG00000040471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC058747 // GenBank // Mus musculus gamma-glutamyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:67837 IMAGE:6394797), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006534243 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-glutamyltransferase 6 (Ggt6), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// BC055837 // GenBank // Mus musculus gamma-glutamyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:67836 IMAGE:4225313), complete cds. // chr11 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// ENSMUST00000108499 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:72435534:72437781:1 gene:ENSMUSG00000040471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72420905:72438169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_016776 // RefSeq // Mus musculus MYB binding protein (P160) 1a (Mybbp1a), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000045633 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72441355:72451768:1 gene:ENSMUSG00000040463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72441355:72451768:1 gene:ENSMUSG00000040463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72441357:72451229:1 gene:ENSMUSG00000040463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK154016 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430023H01 product:MYB binding protein (P160) 1a, full insert sequence. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC048858 // GenBank // Mus musculus MYB binding protein (P160) 1a, mRNA (cDNA clone MGC:54579 IMAGE:5363740), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC052889 // GenBank // Mus musculus MYB binding protein (P160) 1a, mRNA (cDNA clone MGC:60519 IMAGE:30057169), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC060167 // GenBank // Mus musculus MYB binding protein (P160) 1a, mRNA (cDNA clone IMAGE:6826362), partial cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U63648 // GenBank // Mus musculus p160 myb-binding protein (P160) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72441384:72451474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_025985 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 (Ube2g1), mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021148 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72607283:72686481:1 gene:ENSMUSG00000020794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000138247 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:72607283:72686481:1 gene:ENSMUSG00000020794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC065083 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 (UBC7 homolog, C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:6843917), partial cds. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC096474 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 (UBC7 homolog, C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:106301 IMAGE:4503077), complete cds. // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000126046 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72607319:72680140:1 gene:ENSMUSG00000020794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// AK083029 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530035C02 product:UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME E2 G1 (EC 6.3.2.19) (UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE G1) (UBIQUITIN CARRIER PROTEIN G1) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// GENSCAN00000006912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72618307:72767774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONMMUT010606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_009671 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and FYVE domain containing 1 (Ankfy1), mRNA. // chr11 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72712157:72767588:1 gene:ENSMUSG00000020790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000127610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72690006:72771221:1 gene:ENSMUSG00000020790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000155998 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72690006:72772146:1 gene:ENSMUSG00000020790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// AB011370 // GenBank // Mus musculus Ankhzn mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// AB098329 // GenBank // Mus musculus Ankhzn mRNA for ankyrin repeat hooked to a zinc finger motif long form, complete cds. // chr11 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// BC139231 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and FYVE domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:170858 IMAGE:8862253), complete cds. // chr11 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC145583 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and FYVE domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:179157 IMAGE:9054149), complete cds. // chr11 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72618307:72767774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0
NM_001045536 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, ZZ-type with EF hand domain 1 (Zzef1), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// ENSMUST00000069395 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72796254:72927118:1 gene:ENSMUSG00000055670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// ENSMUST00000150551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:72796226:72851380:1 gene:ENSMUSG00000055670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 22 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000172220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:72796226:72927120:1 gene:ENSMUSG00000055670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 58 // 58 // 0 /// AK082066 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130099L13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 17 // 10 // 10 // 0 /// AK158924 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K530009E16 product:hypothetical Calcium-binding EF-hand/Galactose-binding like/EF-Hand-like containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 22 // 13 // 13 // 0 /// BC099976 // GenBank // Mus musculus zinc finger, ZZ-type with EF hand domain 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6435283), complete cds. // chr11 // 94 // 29 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72844291:72924717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 47 // 47 // 0
ENSMUST00000083364 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:72881792:72881953:1 gene:ENSMUSG00000065298 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT010624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_008771 // RefSeq // Mus musculus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1 (P2rx1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000021141 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:72999103:73015200:1 gene:ENSMUSG00000020787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000092938 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:72999315:73014126:1 gene:ENSMUSG00000020787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000148964 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73009791:73015197:1 gene:ENSMUSG00000020787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// AK007650 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810030C05 product:purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1, full insert sequence. // chr11 // 89 // 51 // 16 // 18 // 0 /// BC015084 // GenBank // Mus musculus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1, mRNA (cDNA clone MGC:14003 IMAGE:4189541), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000006911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72953134:73040369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1
NM_018883 // RefSeq // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, alpha (Camkk1), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006536300 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, alpha (Camkk1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000092937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73019043:73042073:1 gene:ENSMUSG00000020785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000145834 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:73026585:73040293:1 gene:ENSMUSG00000020785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000155720 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73019008:73042062:1 gene:ENSMUSG00000020785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AF117384 // GenBank // Mus musculus calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase alpha (Camkk) mRNA, complete cds. // chr11 // 90 // 97 // 27 // 30 // 0 /// BC017529 // GenBank // Mus musculus calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:27706 IMAGE:4924656), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:72953134:73040369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1
NM_025818 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1200014J11 gene (1200014J11Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021135 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73047783:73080217:1 gene:ENSMUSG00000020783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC053720 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1200014J11 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30053388), partial cds. // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC098495 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1200014J11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107476 IMAGE:30021633), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC118943 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1200014J11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143706 IMAGE:40092337), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73047900:73079176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_008399 // RefSeq // Mus musculus integrin alpha E, epithelial-associated (Itgae), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NM_172944 // RefSeq // Mus musculus integrin alpha E, epithelial-associated (Itgae), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000006101 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73090583:73147446:1 gene:ENSMUSG00000005947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102537 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:73090583:73134834:1 gene:ENSMUSG00000005947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC150690 // GenBank // Mus musculus integrin alpha E, epithelial-associated, mRNA (cDNA clone MGC:183601 IMAGE:9087601), complete cds. // chr11 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// DQ386608 // GenBank // Mus musculus strain NOD integrin alpha E (Itgae) mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 81 // 23 // 26 // 0 /// U12236 // GenBank // Mus musculus AKR alpha M290 integrin mRNA, complete cds. // chr11 // 90 // 97 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73090618:73134161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_029031 // RefSeq // Mus musculus sedoheptulokinase (Shpk), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006536303 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sedoheptulokinase (Shpk), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000006105 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73199460:73224511:1 gene:ENSMUSG00000005951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000131927 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73199460:73224502:1 gene:ENSMUSG00000005951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AK171027 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630220C10 product:carbohydrate kinase-like, full insert sequence. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC054721 // GenBank // Mus musculus sedoheptulokinase, mRNA (cDNA clone MGC:64719 IMAGE:5694588), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC056433 // GenBank // Mus musculus sedoheptulokinase, mRNA (cDNA clone MGC:66695 IMAGE:5694588), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006536302 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sedoheptulokinase (Shpk), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73201227:73297200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001001445 // RefSeq // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 1 (Trpv1), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000006106 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:73238259:73260507:1 gene:ENSMUSG00000005952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73234292:73261239:1 gene:ENSMUSG00000005952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000138853 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:73240310:73254884:1 gene:ENSMUSG00000005952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// AB180097 // GenBank // Mus musculus TRPV1 mRNA for transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 1, complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AJ620495 // GenBank // Mus musculus partial mRNA for non-selective cation channel TRPV1 (trpv1 gene). // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY445519 // GenBank // Mus musculus transient receptor potential cation channel V1 (Trpv1) mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 94 // 28 // 32 // 0 /// AY452083 // GenBank // Mus musculus TRPV1alpha (Trpv1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY452084 // GenBank // Mus musculus TRPV1beta (Trpv1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000108470 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:73240046:73261242:1 gene:ENSMUSG00000005952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// GENSCAN00000006881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73201227:73297200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_145099 // RefSeq // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 3 (Trpv3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000049676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73267388:73300363:1 gene:ENSMUSG00000043029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB083654 // GenBank // Mus musculus VRL3 mRNA for TRP receptor like protein, complete cds. // chr11 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// AF510316 // GenBank // Mus musculus TRP ion channel TRPV3 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC108984 // GenBank // Mus musculus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:124324 IMAGE:40047664), complete cds. // chr11 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000006881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73201227:73297200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_001045531 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 22 (Spata22), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000092926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73329741:73346044:1 gene:ENSMUSG00000069825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117445 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:73329741:73355913:1 gene:ENSMUSG00000069825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC147586 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 22, mRNA (cDNA clone MGC:182682 IMAGE:9056576), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC147607 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 22, mRNA (cDNA clone MGC:182703 IMAGE:9056597), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_146923 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 20 (Olfr20), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117445 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:73329741:73355913:1 gene:ENSMUSG00000069825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73350839:73354699:1 gene:ENSMUSG00000062128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138172 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 20, mRNA (cDNA clone MGC:169796 IMAGE:8861191), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138173 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 20, mRNA (cDNA clone MGC:169797 IMAGE:8861192), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73353755:73354699:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001172686 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 376 (Olfr376), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NM_146922 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 376 (Olfr376), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000078952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:73371246:73375704:1 gene:ENSMUSG00000063881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000120401 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73371246:73375704:1 gene:ENSMUSG00000063881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000127789 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:73371266:73375496:1 gene:ENSMUSG00000063881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000170592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:73371246:73375704:1 gene:ENSMUSG00000063881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73374751:73375704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_207224 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 384 (Olfr384), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000072993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73602582:73603520:1 gene:ENSMUSG00000060335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73602582:73603520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000134773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73664614:73665542:1 gene:ENSMUSG00000061246 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001126489 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 735 (Zfp735), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000080407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:73688778:73713798:1 gene:ENSMUSG00000060630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000149560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73688799:73710831:1 gene:ENSMUSG00000060630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC137974 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700012C15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169598 IMAGE:8860993), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73664611:73716446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT010649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_146347 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 390 (Olfr390), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000092919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:73786940:73787875:1 gene:ENSMUSG00000069818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73782966:73787875:1 gene:ENSMUSG00000069818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73786940:73787875:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000143750 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73928007:73928945:1 gene:ENSMUSG00000086011 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_010970 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 23 (Olfr23), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000092917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:73940248:73941225:1 gene:ENSMUSG00000069816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000121280 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73940248:73941188:1 gene:ENSMUSG00000069816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000037550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73940248:73941225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000115991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:73954692:73955628:1 gene:ENSMUSG00000079875 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_146346 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 397 (Olfr397), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108465 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:73964610:73965557:1 gene:ENSMUSG00000057050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC120574 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 397, mRNA (cDNA clone MGC:155811 IMAGE:40129497), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC125526 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 397, mRNA (cDNA clone MGC:159229 IMAGE:40130041), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:73964610:73965557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001177570 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 616 (Zfp616), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000074813 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:74069955:74087292:1 gene:ENSMUSG00000069476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000108463 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:74069955:74084090:1 gene:ENSMUSG00000069476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000116546 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:74070185:74083039:1 gene:ENSMUSG00000069476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000178159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:74082907:74085870:1 gene:ENSMUSG00000069476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000118094 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74104862:74110785:1 gene:ENSMUSG00000081162 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr11 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74110257:74156103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
NM_146706 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 401 (Olfr401), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000079827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74121291:74122238:1 gene:ENSMUSG00000070380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000037561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74110257:74156103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_146708 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 402 (Olfr402), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073675 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74155156:74156103:1 gene:ENSMUSG00000070379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC116954 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 402, mRNA (cDNA clone MGC:151331 IMAGE:40126273), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74110257:74156103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_146711 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 43 (Olfr43), mRNA. // chr11 // 75 // 100 // 24 // 32 // 0 /// NM_207622 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 403 (Olfr403), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000076675 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74195505:74196446:1 gene:ENSMUSG00000070378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000078936 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74206273:74207214:-1 gene:ENSMUSG00000070377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 75 // 100 // 24 // 32 // 0 /// BC104289 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 403, mRNA (cDNA clone MGC:129217 IMAGE:40042769), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC104290 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 43, mRNA (cDNA clone MGC:129218 IMAGE:40042770), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC125464 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 43, mRNA (cDNA clone MGC:159167 IMAGE:40129979), complete cds. // chr11 // 81 // 100 // 26 // 32 // 0 /// BC125468 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 43, mRNA (cDNA clone MGC:159171 IMAGE:40129983), complete cds. // chr11 // 81 // 100 // 26 // 32 // 0 /// ENSMUST00000120649 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74255696:74256631:-1 gene:ENSMUSG00000081864 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr11 // 28 // 100 // 9 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74206273:74207214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 75 // 100 // 24 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74195505:74196446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_011002 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 59 (Olfr59), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000119717 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74283794:74289619:1 gene:ENSMUSG00000070374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000143976 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74283736:74289360:1 gene:ENSMUSG00000070374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC139159 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 59, mRNA (cDNA clone MGC:170786 IMAGE:8862181), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC139161 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 59, mRNA (cDNA clone MGC:170788 IMAGE:8862183), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000037552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74288648:74289619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000093668 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:74319792:74319910:1 gene:ENSMUSG00000070178 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT010658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000121397 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74322546:74323467:1 gene:ENSMUSG00000083299 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74322546:74323267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0
NM_001011851 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 412 (Olfr412), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74364671:74365609:1 gene:ENSMUSG00000058275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013784 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E130309D14 gene (E130309D14Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533659 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E130309D14 gene (E130309D14Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000100866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74619605:74641516:1 gene:ENSMUSG00000069814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK143211 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130309D14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// BC150886 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E130309D14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:183797 IMAGE:9087797), complete cds. // chr11 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74615682:74638571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001081158 // RefSeq // Mus musculus clustered mitochondria (cluA/CLU1) homolog (Cluh), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000092915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74649515:74670847:1 gene:ENSMUSG00000020741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117818 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:74649515:74669905:1 gene:ENSMUSG00000020741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155558 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74649540:74670847:1 gene:ENSMUSG00000020741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC072573 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1300001I01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:99410 IMAGE:5705116), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74649595:74669610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_026197 // RefSeq // Mus musculus methyltransferase like 16 (Mettl16), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000092912 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74770925:74817894:1 gene:ENSMUSG00000010554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000128504 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74770916:74773621:1 gene:ENSMUSG00000010554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000141755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74770830:74828525:1 gene:ENSMUSG00000010554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC022902 // GenBank HTC // Mus musculus methyltransferase 10 domain containing, mRNA (cDNA clone IMAGE:3967213), with apparent retained intron. // chr11 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC037452 // GenBank HTC // Mus musculus methyltransferase 10 domain containing, mRNA (cDNA clone IMAGE:4019294), with apparent retained intron. // chr11 // 94 // 82 // 29 // 31 // 0 /// BC049897 // GenBank // Mus musculus methyltransferase 10 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:54790 IMAGE:3979938), complete cds. // chr11 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// BC054724 // GenBank // Mus musculus methyltransferase 10 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:64807 IMAGE:5695738), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000010698 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:74770830:74817894:1 gene:ENSMUSG00000010554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1 /// GENSCAN00000045509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74724444:74843320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 55 // 55 // 21 // 38 // 1
NM_010813 // RefSeq // Mus musculus max binding protein (Mnt), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 95 // 95 // 0 /// XM_006532403 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus max binding protein (Mnt), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 58 // 55 // 55 // 0 /// ENSMUST00000000291 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74830920:74845725:1 gene:ENSMUSG00000000282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 95 // 95 // 0 /// ENSMUST00000133217 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74836326:74837723:1 gene:ENSMUSG00000000282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 32 // 30 // 30 // 0 /// AK014288 // GenBank HTC // Mus musculus 14, 17 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3200001K08 product:max binding protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 9 // 9 // 9 // 0 /// BC054534 // GenBank // Mus musculus max binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:62286 IMAGE:5721249), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 92 // 92 // 0 /// U77356 // GenBank // Mus musculus Myc antagonist Mnt (Mnt) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 99 // 94 // 94 // 0 /// ENSMUST00000132150 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:74837468:74843775:1 gene:ENSMUSG00000000282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 14 // 14 // 13 // 95 // 1 /// GENSCAN00000045509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74724444:74843320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 51 // 95 // 1
NM_001002764 // RefSeq // Mus musculus Smg-6 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) (Smg6), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000045281 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:74925823:75164448:1 gene:ENSMUSG00000038290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000130145 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:74930520:75164448:1 gene:ENSMUSG00000038290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000140197 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:74993853:75139369:1 gene:ENSMUSG00000038290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// BC066040 // GenBank // Mus musculus Smg-6 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:76395 IMAGE:6410245), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000045507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:74925589:75044072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75129069:75162950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NR_029794 // RefSeq // Mus musculus microRNA 212 (Mir212), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083656 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:75173388:75173478:1 gene:ENSMUSG00000065590 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// HM627212 // GenBank // Mus musculus pri-miR-212/132 microRNA isoform 2, precursor RNA, complete sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-212 // miRBase Micro RNA Database // MI0000696 Mus musculus miR-212 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029546 // RefSeq // Mus musculus microRNA 132 (Mir132), microRNA. // chr11 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// ENSMUST00000083603 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:75173665:75173765:1 gene:ENSMUSG00000065537 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75172501:75176053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// mmu-mir-132 // miRBase Micro RNA Database // MI0000158 Mus musculus miR-132 stem-loop // chr11 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// NONMMUT010700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// HM627212 // GenBank // Mus musculus pri-miR-212/132 microRNA isoform 2, precursor RNA, complete sequence. // chr11 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_177708 // RefSeq // Mus musculus reticulon 4 receptor-like 1 (Rtn4rl1), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533225 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus reticulon 4 receptor-like 1 (Rtn4rl1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000102514 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:75193783:75267769:1 gene:ENSMUSG00000045287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY250218 // GenBank // Mus musculus nogo receptor-like 2 (Ngrl2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// BC030471 // GenBank // Mus musculus reticulon 4 receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:40829 IMAGE:5368560), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75262950:75266081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_001102611 // RefSeq // Mus musculus SET and MYND domain containing 4 (Smyd4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000044530 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:75348433:75405705:1 gene:ENSMUSG00000018809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC095952 // GenBank // Mus musculus SET and MYND domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:106291 IMAGE:5037842), complete cds. // chr11 // 84 // 94 // 27 // 32 // 0 /// BC130220 // GenBank // Mus musculus SET and MYND domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:161234 IMAGE:40141368), complete cds. // chr11 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000157055 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75348495:75383018:1 gene:ENSMUSG00000018809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// AK166057 // GenBank HTC // Mus musculus lung RCB-0558 LLC cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G730031N08 product:SET and MYND domain containing 4, full insert sequence. // chr11 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000045523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75382263:75404919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT010710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NR_029739 // RefSeq // Mus musculus microRNA 22 (Mir22), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_030711 // RefSeq // Mus musculus Mir22 host gene (non-protein coding) (Mir22hg), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083595 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:75463716:75463810:1 gene:ENSMUSG00000065529 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75461715:75469663:1 gene:ENSMUSG00000038217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134345 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:75461644:75464029:1 gene:ENSMUSG00000085148 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149940 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75461539:75466676:1 gene:ENSMUSG00000085148 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-22 // miRBase Micro RNA Database // MI0000570 Mus musculus miR-22 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000134345 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:75461644:75464029:1 gene:ENSMUSG00000085148 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027249 // RefSeq // Mus musculus TLC domain containing 2 (Tlcd2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006533633 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TLC domain containing 2 (Tlcd2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000043598 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:75468079:75470657:1 gene:ENSMUSG00000038217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC021945 // GenBank // Mus musculus TLC domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:37811 IMAGE:5098319), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001291156 // RefSeq // Mus musculus TLC domain containing 2 (Tlcd2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1 /// ENSMUST00000108435 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:75468079:75470899:1 gene:ENSMUSG00000038217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1 /// ENSMUST00000124718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75461715:75469663:1 gene:ENSMUSG00000038217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// ENSMUST00000153236 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75468711:75470203:1 gene:ENSMUSG00000038217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000046810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75468205:75512843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NM_138659 // RefSeq // Mus musculus pre-mRNA processing factor 8 (Prpf8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000018449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:75486816:75509447:1 gene:ENSMUSG00000020850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000102510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75486820:75509449:1 gene:ENSMUSG00000020850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000131283 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:75486855:75495820:1 gene:ENSMUSG00000020850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 45 // 21 // 21 // 0 /// AB047391 // GenBank // Mus musculus Prp8 mRNA for pre-mRNA processing 8 protein, complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// BC093481 // GenBank // Mus musculus pre-mRNA processing factor 8, mRNA (cDNA clone MGC:118730 IMAGE:30945329), complete cds. // chr11 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000046810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75468205:75512843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0
NM_001029938 // RefSeq // Mus musculus Rab interacting lysosomal protein (Rilp), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042972 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:75510094:75513168:1 gene:ENSMUSG00000038195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75510467:75513163:1 gene:ENSMUSG00000038195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK160517 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310058B11 product:weakly similar to Hypothetical protein FLJ31193 (Rab interacting lysosomal protein) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC116750 // GenBank // Mus musculus Rab interacting lysosomal protein, mRNA (cDNA clone MGC:151127 IMAGE:40126069), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC119166 // GenBank // Mus musculus Rab interacting lysosomal protein, mRNA (cDNA clone MGC:155482 IMAGE:8733915), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75468205:75512843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001004157 // RefSeq // Mus musculus scavenger receptor class F, member 1 (Scarf1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006533635 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus scavenger receptor class F, member 1 (Scarf1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000042808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:75513540:75526582:1 gene:ENSMUSG00000038188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000123819 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75513575:75526578:1 gene:ENSMUSG00000038188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000118243 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:75513541:75526582:1 gene:ENSMUSG00000038188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// BC080288 // GenBank // Mus musculus scavenger receptor class F, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:90792 IMAGE:6411836), complete cds. // chr11 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000046812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75513578:75526196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_008850 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol transfer protein, alpha (Pitpna), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000102509 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75588159:75626433:1 gene:ENSMUSG00000017781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000143219 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:75588097:75628804:1 gene:ENSMUSG00000017781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000179445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:75588119:75626730:1 gene:ENSMUSG00000017781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000179521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:75588108:75628778:1 gene:ENSMUSG00000017781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC056171 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol transfer protein, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:67092 IMAGE:5710926), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// U96725 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol transfer protein alpha mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000140841 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:75588159:75598548:1 gene:ENSMUSG00000017781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000046809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:75588450:75703503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_198637 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700016K19 gene (1700016K19Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066408 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:75999912:76003569:1 gene:ENSMUSG00000053783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049758 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700016K19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58818 IMAGE:6773542), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:76000062:76003485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT010753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000127340 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:76179671:76214827:1 gene:ENSMUSG00000069808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK158967 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K530020O18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT010763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT010764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_021294 // RefSeq // Mus musculus diazepam binding inhibitor-like 5 (Dbil5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040806 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:76217608:76218666:1 gene:ENSMUSG00000038057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048474 // GenBank // Mus musculus diazepam binding inhibitor-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:58228 IMAGE:6773240), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:76218272:76218535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0
NM_183263 // RefSeq // Mus musculus RNA methyltransferase like 1 (Rnmtl1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040577 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:76243715:76250619:1 gene:ENSMUSG00000038046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090975 // GenBank // Mus musculus RNA methyltransferase like 1, mRNA (cDNA clone MGC:107142 IMAGE:6595681), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC115622 // GenBank // Mus musculus RNA methyltransferase like 1, mRNA (cDNA clone MGC:144521 IMAGE:40102799), complete cds. // chr11 // 71 // 68 // 12 // 17 // 0 /// BC115623 // GenBank // Mus musculus RNA methyltransferase like 1, mRNA (cDNA clone MGC:144522 IMAGE:40102801), complete cds. // chr11 // 71 // 68 // 12 // 17 // 0 /// ENSMUST00000125463 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:76243736:76244884:1 gene:ENSMUSG00000038046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AK041163 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530086N07 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// AK132643 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833444E10 product:similar to Putative RNA methyltransferase [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:76243773:76250424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001291161 // RefSeq // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 22 (Timm22), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_019818 // RefSeq // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 22 (Timm22), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_023355 // RefSeq // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 22 (Timm22), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NR_111896 // RefSeq // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 22 (Timm22), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000021203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:76407143:76416292:1 gene:ENSMUSG00000020843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120699 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:76406952:76414329:1 gene:ENSMUSG00000020843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000152183 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:76407191:76414082:1 gene:ENSMUSG00000020843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// AF223950 // GenBank // Mus musculus TIM22 preprotein translocase (Tim22) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC055279 // GenBank // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 22 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:66904 IMAGE:5688754), complete cds. // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:76407205:76416127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NONMMUT002567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_177182 // RefSeq // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member a9 (Bhlha9), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056184 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:76672470:76673676:1 gene:ENSMUSG00000044243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048728 // GenBank // Mus musculus basic helix-loop-helix family, member a9, mRNA (cDNA clone MGC:59597 IMAGE:6510150), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:76672549:76673428:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_177709 // RefSeq // Mus musculus tumor suppressor candidate 5 (Tusc5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062024 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:76679808:76698664:1 gene:ENSMUSG00000046275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119801 // GenBank // Mus musculus tumor suppressor candidate 5, mRNA (cDNA clone MGC:148251 IMAGE:40107649), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC122875 // GenBank // Mus musculus tumor suppressor candidate 5, mRNA (cDNA clone MGC:148252 IMAGE:40107655), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:76680160:76700071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_025655 // RefSeq // Mus musculus transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 (Tmigd1), mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006533948 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 (Tmigd1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000072633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:76904545:76916586:1 gene:ENSMUSG00000020839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102495 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:76902159:76916587:1 gene:ENSMUSG00000020839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000136899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:76904562:76916097:1 gene:ENSMUSG00000020839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000142166 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:76904475:76910108:1 gene:ENSMUSG00000020839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// AK008028 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010002A20 product:hypothetical Immunoglobulin and major histocompatibility complex domain/Immunoglobulin C-2 type/Immunoglobulin subtype containing protein, full insert sequence. // chr11 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// BC061082 // GenBank // Mus musculus transmembrane and immunoglobulin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:74197 IMAGE:30311543), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:76878816:76923733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001291190 // RefSeq // Mus musculus slingshot homolog 2 (Drosophila) (Ssh2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_177710 // RefSeq // Mus musculus slingshot homolog 2 (Drosophila) (Ssh2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:77216287:77460220:1 gene:ENSMUSG00000037926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004144 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor kinase-interactor 1 (Git1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000037285 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:77493562:77507786:1 gene:ENSMUSG00000011877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000100812 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:77493571:77507786:1 gene:ENSMUSG00000011877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000128796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:77505136:77506039:1 gene:ENSMUSG00000011877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 89 // 20 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000152428 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:77499091:77503115:1 gene:ENSMUSG00000011877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// BC079870 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor kinase-interactor 1, mRNA (cDNA clone MGC:79173 IMAGE:6831910), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000127302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:77500988:77505085:1 gene:ENSMUSG00000011877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 34 // 34 // 15 // 44 // 1 /// ENSMUST00000139410 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:77502479:77504832:1 gene:ENSMUSG00000011877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// GENSCAN00000034186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:77493583:77506608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// NONMMUT010827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 89 // 20 // 8 // 9 // 0
NM_026185 // RefSeq // Mus musculus abhydrolase domain containing 15 (Abhd15), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000094004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:77515121:77520045:1 gene:ENSMUSG00000000686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// FJ154119 // GenBank // Mus musculus alpha/beta hydrolase mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000034180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:77515199:77518841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_001024205 // RefSeq // Mus musculus nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 2 (Nufip2), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006534063 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 2 (Nufip2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000100802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:77686155:77712741:1 gene:ENSMUSG00000037857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000181023 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:77686172:77741921:1 gene:ENSMUSG00000037857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// AK132603 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833415L12 product:FMRP interacting protein, 82kD homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000034174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:77685806:77709735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000117231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:77747041:77748041:1 gene:ENSMUSG00000081924 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0
NM_183286 // RefSeq // Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 13 (Dhrs13), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021187 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78032280:78037866:1 gene:ENSMUSG00000020834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000092881 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:78032359:78033477:1 gene:ENSMUSG00000020834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000122342 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:78032352:78037864:1 gene:ENSMUSG00000020834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000144028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78032349:78037791:1 gene:ENSMUSG00000020834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC115881 // GenBank // Mus musculus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 13, mRNA (cDNA clone MGC:141618 IMAGE:40088339), complete cds. // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78032372:78073204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
NR_029556 // RefSeq // Mus musculus microRNA 144 (Mir144), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083467 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:78073005:78073070:1 gene:ENSMUSG00000065401 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-144 // miRBase Micro RNA Database // MI0000168 Mus musculus miR-144 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029971 // RefSeq // Mus musculus microRNA 451a (Mir451a), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093557 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:78073170:78073241:1 gene:ENSMUSG00000070065 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-451a // miRBase Micro RNA Database // MI0001730 Mus musculus miR-451 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145430 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 222, member B (Fam222b), mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000073705 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78094660:78156700:1 gene:ENSMUSG00000037750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000100782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78094708:78156075:1 gene:ENSMUSG00000037750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000155571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78115606:78156700:1 gene:ENSMUSG00000037750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK085728 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730030D23 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 75 // 80 // 15 // 20 // 0 /// BC017647 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC017647, mRNA (cDNA clone MGC:28990 IMAGE:4527119), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC063099 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC017647, mRNA (cDNA clone MGC:70131 IMAGE:6393931), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001045516 // RefSeq // Mus musculus protein interacting with cyclin A1 (Proca1), mRNA. // chr11 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// XM_006532963 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein interacting with cyclin A1 (Proca1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XM_006532964 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein interacting with cyclin A1 (Proca1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000078099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78193392:78205504:1 gene:ENSMUSG00000044122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000108317 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:78194734:78205763:1 gene:ENSMUSG00000044122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000060539 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:78194704:78205467:1 gene:ENSMUSG00000044122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// ENSMUST00000124772 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:78204427:78205091:1 gene:ENSMUSG00000044122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// GENSCAN00000034173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78189337:78205467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
NM_009143 // RefSeq // Mus musculus stromal cell derived factor 2 (Sdf2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006532630 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus stromal cell derived factor 2 (Sdf2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000002133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78245746:78255496:1 gene:ENSMUSG00000002064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000133020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78250894:78255117:1 gene:ENSMUSG00000002064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000154080 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:78250421:78255496:1 gene:ENSMUSG00000002064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// BC058798 // GenBank // Mus musculus stromal cell derived factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:68258 IMAGE:6485217), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC062881 // GenBank // Mus musculus stromal cell derived factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:86139 IMAGE:5693309), complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC087871 // GenBank // Mus musculus stromal cell derived factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:107120 IMAGE:30279332), complete cds. // chr11 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// D50646 // GenBank // Mus musculus mRNA for SDF2, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78246020:78255227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT010895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_001002004 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2610507B11 gene (2610507B11Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// XM_006534312 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2610507B11 gene (2610507B11Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000010421 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78261752:78290623:1 gene:ENSMUSG00000010277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// BC075633 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610507B11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:92941 IMAGE:30537398), complete cds. // chr11 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000034169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78261850:78326354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0
NM_017407 // RefSeq // Mus musculus sperm associated antigen 5 (Spag5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78301529:78322457:1 gene:ENSMUSG00000002055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133579 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78301624:78315190:1 gene:ENSMUSG00000002055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000146068 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78301655:78314863:1 gene:ENSMUSG00000002055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AF420307 // GenBank // Mus musculus MAP126 mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// AK052228 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330010H01 product:sperm associated antigen 5, full insert sequence. // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC052672 // GenBank // Mus musculus sperm associated antigen 5, mRNA (cDNA clone MGC:60762 IMAGE:30058496), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// X81633 // GenBank // M.musculus mRNA for s17 protein. // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000034169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78261850:78326354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_009657 // RefSeq // Mus musculus aldolase C, fructose-bisphosphate (Aldoc), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000017534 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78322968:78327781:1 gene:ENSMUSG00000017390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000102478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78324200:78326760:1 gene:ENSMUSG00000017390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78324326:78326118:1 gene:ENSMUSG00000017390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0 /// ENSMUST00000156039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78325329:78326708:1 gene:ENSMUSG00000017390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC004802 // GenBank // Mus musculus aldolase C, fructose-bisphosphate, mRNA (cDNA clone MGC:6733 IMAGE:3589325), complete cds. // chr11 // 71 // 89 // 17 // 24 // 0 /// BC008184 // GenBank // Mus musculus aldolase C, fructose-bisphosphate, mRNA (cDNA clone MGC:6732 IMAGE:3589205), complete cds. // chr11 // 71 // 89 // 17 // 24 // 0 /// X03796 // GenBank // Mouse mRNA 5-region for aldolase C (aa 1-227). // chr11 // 63 // 59 // 10 // 16 // 0 /// ENSMUST00000148689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78323168:78324697:1 gene:ENSMUSG00000017390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000034169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78261850:78326354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONMMUT010910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_201406 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class S (Pigs), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000048073 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78328415:78342782:1 gene:ENSMUSG00000041958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK044292 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930005L23 product:phosphatidylinositol glycan, class S, full insert sequence. // chr11 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// BC058979 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class S, mRNA (cDNA clone MGC:67343 IMAGE:5716747), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK158128 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930034D12 product:phosphatidylinositol glycan, class S, full insert sequence. // chr11 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000034170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78328475:78348643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1
NM_026740 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 46, member 1 (Slc46a1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000001126 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78465697:78471945:1 gene:ENSMUSG00000020829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146431 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78465750:78471622:1 gene:ENSMUSG00000020829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC024522 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 46, member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4984454), partial cds. // chr11 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// BC057976 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 46, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:68046 IMAGE:5052851), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180786 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78470226:78472059:1 gene:ENSMUSG00000020829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78454550:78471428:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT010915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_011707 // RefSeq // Mus musculus vitronectin (Vtn), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000017488 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78499120:78502324:1 gene:ENSMUSG00000017344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128479 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78499091:78500585:1 gene:ENSMUSG00000017344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000146997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78499172:78500244:1 gene:ENSMUSG00000017344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000153628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:78500606:78502222:1 gene:ENSMUSG00000017344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// AF440693 // GenBank // Mus musculus vitronectin mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC012690 // GenBank // Mus musculus vitronectin, mRNA (cDNA clone MGC:13940 IMAGE:4193767), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// M77123 // GenBank // Mouse vitronectin mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78499350:78502247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_008759 // RefSeq // Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000001130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78503447:78505081:1 gene:ENSMUSG00000001103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125670 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:78503499:78505074:1 gene:ENSMUSG00000001103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098184 // GenBank // Mus musculus SEBOX homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:106355 IMAGE:5367903), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001076681 // RefSeq // Mus musculus LYR motif containing 9 (Lyrm9), mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000141321 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:78826604:78838256:1 gene:ENSMUSG00000072640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000147875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:78826584:78846870:1 gene:ENSMUSG00000072640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK007467 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810012P15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC130224 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810012P15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:161260 IMAGE:40141726), complete cds. // chr11 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000041641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:78777632:78959752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NR_045873 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11201 (Gm11201), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175543 // RefSeq // Mus musculus RAB11 family interacting protein 4 (class II) (Rab11fip4), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006533404 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB11 family interacting protein 4 (class II) (Rab11fip4), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000017783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:79591212:79698023:1 gene:ENSMUSG00000017639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK122559 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1821 protein. // chr11 // 93 // 44 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000056494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:79591276:79692839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1
ENSMUST00000082552 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:79595165:79595268:1 gene:ENSMUSG00000064486 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT010966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NR_029579 // RefSeq // Mus musculus microRNA 193a (Mir193a), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083461 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:79711969:79712034:1 gene:ENSMUSG00000065395 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-193a // miRBase Micro RNA Database // MI0000235 Mus musculus miR-193 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029959 // RefSeq // Mus musculus microRNA 365-2 (Mir365-2), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000083555 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:79726400:79726511:1 gene:ENSMUSG00000065489 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// mmu-mir-365-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0001645 Mus musculus miR-365-2 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT010981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
AK134871 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430500J09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00001163 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_001163018 // RefSeq // Mus musculus suppressor of zeste 12 homolog (Drosophila) (Suz12), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_199196 // RefSeq // Mus musculus suppressor of zeste 12 homolog (Drosophila) (Suz12), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000017692 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:79993106:80034123:1 gene:ENSMUSG00000017548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000148140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:79995617:80013657:1 gene:ENSMUSG00000017548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000163272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:79993106:80034122:1 gene:ENSMUSG00000017548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC064461 // GenBank // Mus musculus suppressor of zeste 12 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:69864 IMAGE:6821922), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000056500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:79993320:80032190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT010995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0
NM_001029856 // RefSeq // Mus musculus ATPase family, AAA domain containing 5 (Atad5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000017694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:80089400:80135791:1 gene:ENSMUSG00000017550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000108239 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:80089400:80135794:1 gene:ENSMUSG00000017550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000151815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:80101884:80135794:1 gene:ENSMUSG00000017550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// AK048355 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130052G03 product:weakly similar to ATP/GTP-BINDING PROTEIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 22 // 10 // 10 // 0 /// AY557610 // GenBank // Mus musculus chromosome fragility associated gene 1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC141180 // GenBank // Mus musculus ATPase family, AAA domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:176141 IMAGE:9055792), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000056499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:80089771:80134371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0
NM_172133 // RefSeq // Mus musculus ArfGAP with dual PH domains 2 (Adap2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006532973 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ArfGAP with dual PH domains 2 (Adap2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:80154105:80178958:1 gene:ENSMUSG00000020709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000134118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:80154116:80165776:1 gene:ENSMUSG00000020709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// AK050079 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730013C13 product:centaurin, alpha 2, full insert sequence. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC027165 // GenBank // Mus musculus ArfGAP with dual PH domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:36547 IMAGE:4951680), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006532972 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ArfGAP with dual PH domains 2 (Adap2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// GENSCAN00000056493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:80154216:80178671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_028019 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 135 (Rnf135), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006534272 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 135 (Rnf135), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000017839 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:80183851:80199757:1 gene:ENSMUSG00000020707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC096385 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 135, mRNA (cDNA clone MGC:106326 IMAGE:30744704), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC132307 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 135, mRNA (cDNA clone MGC:163938 IMAGE:40130584), complete cds. // chr11 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// BC138303 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 135, mRNA (cDNA clone MGC:169927 IMAGE:8861322), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:80183917:80199093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_139228 // RefSeq // Mus musculus rhomboid, veinlet-like 3 (Drosophila) (Rhbdl3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000017836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:80300912:80355955:1 gene:ENSMUSG00000017692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC054784 // GenBank // Mus musculus rhomboid, veinlet-like 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:65680 IMAGE:6817213), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC056969 // GenBank // Mus musculus rhomboid, veinlet-like 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:66788 IMAGE:6817213), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:80301161:80353683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_009871 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35) (Cdk5r1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000053413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:80477023:80481184:1 gene:ENSMUSG00000048895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AK084003 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130075I24 product:CYCLIN-DEPENDENT KINASE 5 ACTIVATOR 1 PRECURSOR (CDK5 ACTIVATOR 1) (CYCLIN-DEPENDENT KINASE 5 REGULATORY SUBUNIT 1) (TAU PROTEIN KINASE II 23 KDA SUBUNIT) (TPKII REGULATORY SUBUNIT) (P23) (P25) (P35) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC046823 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35), mRNA (cDNA clone MGC:61249 IMAGE:6400348), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC050768 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35), mRNA (cDNA clone MGC:58293 IMAGE:6533538), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC058697 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35), mRNA (cDNA clone MGC:65701 IMAGE:6825809), complete cds. // chr11 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// U89527 // GenBank // Mus musculus P35 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_029537 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 98 (Tmem98), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000040865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:80810175:80822033:1 gene:ENSMUSG00000035413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK148132 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370029G10 product:TADA1 protein (DKFZP564K1964 protein) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC011208 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 98, mRNA (cDNA clone MGC:19304 IMAGE:4163101), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:80810690:80821419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_029367 // RefSeq // Mus musculus sperm acrosome associated 3 (Spaca3), mRNA. // chr11 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000103222 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:80858372:80867814:1 gene:ENSMUSG00000053184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000103223 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:80858365:80867810:1 gene:ENSMUSG00000053184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AY572448 // GenBank // Mus musculus lysozyme-like protein 3 (Lyc3) mRNA, complete cds. // chr11 // 91 // 70 // 21 // 23 // 0 /// BC100503 // GenBank // Mus musculus sperm acrosome associated 3, mRNA (cDNA clone MGC:118348 IMAGE:30917230), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:80863039:80867793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0
NR_038010 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5530401A14 gene (5530401A14Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:81860679:81894582:1 gene:ENSMUSG00000020703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000126433 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:81860673:81866416:1 gene:ENSMUSG00000020703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AK029248 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4831440L02 product:RIKEN cDNA 5530401A14 gene, full insert sequence. // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT011051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_013654 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 7 (Ccl7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021011 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:82045712:82047525:1 gene:ENSMUSG00000035373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF128193 // GenBank // Mus musculus strain B10.S/J small inducible cytokine A7 (ScyA7) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF128194 // GenBank // Mus musculus strain SJL/J small inducible cytokine A7 (ScyA7) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC061126 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 7, mRNA (cDNA clone MGC:74254 IMAGE:30276350), complete cds. // chr11 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// L04694 // GenBank // Mouse cytokine (fic) mRNA, complete cds. // chr11 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// S50588 // GenBank // Mus musculus RANTES/sis homolog (MARC) mRNA, complete cds. // chr11 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:82045784:82047090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_011330 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 11 (Ccl11), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000000342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:82057823:82062955:1 gene:ENSMUSG00000020676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF128205 // GenBank // Mus musculus strain B10.S/J small inducible cytokine A11 (ScyA11) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AF128206 // GenBank // Mus musculus strain BALB/cByJ small inducible cytokine A11 (ScyA11) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AF128207 // GenBank // Mus musculus strain DBA/2J small inducible cytokine A11 (ScyA11) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AF128208 // GenBank // Mus musculus strain NOD/LtJ small inducible cytokine A11 (ScyA11) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AF128209 // GenBank // Mus musculus strain SJL/J small inducible cytokine A11 (ScyA11) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// BC027521 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 11, mRNA (cDNA clone MGC:41147 IMAGE:1527856), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// U26426 // GenBank // Mus musculus eotaxin precursor (Scya11) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// U40672 // GenBank // Mus musculus eotaxin mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:82057967:82062311:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_021443 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 8 (Ccl8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000009329 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:82115185:82116799:1 gene:ENSMUSG00000009185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB023418 // GenBank // Mus musculus mRNA for monocyte chemoattractant protein-2 (MCP-2) precursor, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117101 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 8, mRNA (cDNA clone MGC:151478 IMAGE:40126420), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC117103 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 8, mRNA (cDNA clone MGC:151480 IMAGE:40126422), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:82115237:82141840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_006533449 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 132E (Tmem132e), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000054245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82388900:82446332:1 gene:ENSMUSG00000020701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC137906 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 132E, mRNA (cDNA clone MGC:169530 IMAGE:8860925), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC145026 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 132E, mRNA (cDNA clone MGC:178582 IMAGE:9053574), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// NM_023438 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 132E (Tmem132e), mRNA. // chr11 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// ENSMUST00000092852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:82388900:82446327:1 gene:ENSMUSG00000020701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// AK134540 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330407G06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// GENSCAN00000002605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:82409273:82454119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0
NR_033582 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11426 (Gm11426), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000125600 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82633353:82636309:1 gene:ENSMUSG00000069796 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT011068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_025884 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 830 (Zfp830), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000056677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:82764345:82765935:1 gene:ENSMUSG00000046010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// BC024340 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 830, mRNA (cDNA clone MGC:35697 IMAGE:4981533), complete cds. // chr11 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000002638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:82764372:82765463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
NM_030224 // RefSeq // Mus musculus fibronectin type III domain containing 8 (Fndc8), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000018988 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:82892124:82900801:1 gene:ENSMUSG00000018844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120835 // GenBank // Mus musculus fibronectin type III domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:156072 IMAGE:40129758), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC137682 // GenBank // Mus musculus fibronectin type III domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:169306 IMAGE:8860701), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:82892195:82899672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_178680 // RefSeq // Mus musculus unc-45 homolog B (C. elegans) (Unc45b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006532977 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-45 homolog B (C. elegans) (Unc45b), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000018989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:82911253:82943403:1 gene:ENSMUSG00000018845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000108160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82910550:82943403:1 gene:ENSMUSG00000018845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000142336 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82933602:82937757:1 gene:ENSMUSG00000018845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000164945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:82911253:82943403:1 gene:ENSMUSG00000018845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AF539793 // GenBank // Mus musculus striated muscle UNC45 (Unc45) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AK169274 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920162K04 product:cardiomyopathy associated 4, full insert sequence. // chr11 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// BC084585 // GenBank // Mus musculus unc-45 homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:91090 IMAGE:30429260), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000002637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:82911680:82944435:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0
NM_183201 // RefSeq // Mus musculus schlafen 5 (Slfn5), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XR_388481 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus schlafen 5 (Slfn5), transcript variant X8, misc_RNA. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000067443 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:82952102:82962941:1 gene:ENSMUSG00000054404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82954661:82961906:1 gene:ENSMUSG00000054404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000108158 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82952095:82960012:1 gene:ENSMUSG00000054404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// AY261804 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 schlafen 5 (Slfn5) mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// AY261805 // GenBank // Mus musculus strain 129/SvJ schlafen 5 (Slfn5) mRNA, complete cds. // chr11 // 82 // 71 // 18 // 22 // 0 /// BC117909 // GenBank // Mus musculus schlafen 5, mRNA (cDNA clone MGC:144062 IMAGE:40097236), complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BC117910 // GenBank // Mus musculus schlafen 5, mRNA (cDNA clone MGC:144063 IMAGE:40097237), complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:82956291:82972110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000121929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:82971092:82971920:1 gene:ENSMUSG00000082726 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_011408 // RefSeq // Mus musculus schlafen 2 (Slfn2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038038 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83065112:83070678:1 gene:ENSMUSG00000072620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF099973 // GenBank // Mus musculus schlafen2 (Slfn2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138749 // GenBank // Mus musculus schlafen 2, mRNA (cDNA clone MGC:170376 IMAGE:8861771), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC138750 // GenBank // Mus musculus schlafen 2, mRNA (cDNA clone MGC:170377 IMAGE:8861772), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000002618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:83065294:83070333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_011407 // RefSeq // Mus musculus schlafen 1 (Slfn1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037994 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83116849:83122670:1 gene:ENSMUSG00000078763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF099972 // GenBank // Mus musculus schlafen1 (Slfn1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052869 // GenBank // Mus musculus schlafen 1, mRNA (cDNA clone MGC:60574 IMAGE:30073520), complete cds. // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_011410 // RefSeq // Mus musculus schlafen 4 (Slfn4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000208 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83175186:83190221:1 gene:ENSMUSG00000000204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:83175194:83190049:1 gene:ENSMUSG00000000204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC044865 // GenBank // Mus musculus schlafen 4, mRNA (cDNA clone MGC:51546 IMAGE:4459564), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150770 // GenBank // Mus musculus schlafen 4, mRNA (cDNA clone MGC:183681 IMAGE:9087681), complete cds. // chr11 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_011409 // RefSeq // Mus musculus schlafen 3 (Slfn3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006532656 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus schlafen 3 (Slfn3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000019130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83191330:83215154:1 gene:ENSMUSG00000018986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF099974 // GenBank // Mus musculus schlafen3 (Slfn3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC132627 // GenBank // Mus musculus schlafen 3, mRNA (cDNA clone MGC:164258 IMAGE:40130904), complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC138070 // GenBank // Mus musculus schlafen 3, mRNA (cDNA clone MGC:169694 IMAGE:8861089), complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC145134 // GenBank // Mus musculus schlafen 3, mRNA (cDNA clone MGC:178690 IMAGE:9053682), complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000002636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:83135512:83269223:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000082922 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:83271498:83271688:1 gene:ENSMUSG00000064856 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000101806 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72236946:72237136:1 gene:ENSMUSG00000094050 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000177868 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72244213:72244403:1 gene:ENSMUSG00000093956 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENSMUST00000178786 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72226240:72226430:1 gene:ENSMUSG00000094655 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// ENSMUST00000179876 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:1:72255008:72255198:1 gene:ENSMUSG00000093843 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT001441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// NONMMUT001443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT001445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// NONMMUT001446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT011109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NR_028362 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 7 (Snord7), small nucleolar RNA. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NR_028364 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI450353 (AI450353), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083781 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:83294304:83294400:1 gene:ENSMUSG00000065715 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013386 // RefSeq // Mus musculus RAS-like, family 10, member B (Rasl10b), mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533487 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS-like, family 10, member B (Rasl10b), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000021022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83409137:83418834:1 gene:ENSMUSG00000020684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000108140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:83409688:83421039:1 gene:ENSMUSG00000020684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000164425 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83410072:83421038:1 gene:ENSMUSG00000020684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000175848 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:83409688:83421037:1 gene:ENSMUSG00000020684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK045997 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230331P10 product:RAS-LIKE PROTEIN/VTS58635 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC116407 // GenBank // Mus musculus RAS-like, family 10, member B, mRNA (cDNA clone MGC:144489 IMAGE:40102515), complete cds. // chr11 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000001074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:83412619:83418830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0
NM_025492 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700020L24 gene (1700020L24Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533939 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700020L24 gene (1700020L24Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000037378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83437677:83441233:1 gene:ENSMUSG00000035085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC152320 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700020L24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:157630 IMAGE:40136395), complete cds. // chr11 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:83437745:83440978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000188702 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:83440131:83440828:1 gene:ENSMUSG00000035085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 42 // 8 // 11 // 0
ENSMUST00000083373 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:83521156:83521262:1 gene:ENSMUSG00000065307 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_036452 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230016K23 gene (E230016K23Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_036453 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E230016K23 gene (E230016K23Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:83582056:83623693:1 gene:ENSMUSG00000051832 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT011133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT011134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_013652 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 4 (Ccl4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000019074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83662584:83664683:1 gene:ENSMUSG00000018930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF128218 // GenBank // Mus musculus strain B10.S/J small inducible cytokine A4 (ScyA4) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF128219 // GenBank // Mus musculus strain SJL/J small inducible cytokine A4 (ScyA4) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC119257 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 4, mRNA (cDNA clone MGC:155573 IMAGE:8734006), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC119259 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 4, mRNA (cDNA clone MGC:155575 IMAGE:8734008), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// M23503 // GenBank // Mus musculus secreted T cell protein (H400, SIS-gamma) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// M35590 // GenBank // Mouse macrophage inflammatory protein 1-beta (MIP-1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:83662663:83664381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// NONMMUT011139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001081957 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 17 (Wfdc17), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000092836 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83703991:83706268:1 gene:ENSMUSG00000069792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC038870 // GenBank // Mus musculus, clone IMAGE:1348774, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// FJ007372 // GenBank // Mus musculus activated macrophage/microglia WAP domain protein precursor (Amwap) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_007969 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 18 (Wfdc18), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000001009 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83709015:83711348:1 gene:ENSMUSG00000000983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000135654 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:83709123:83711339:1 gene:ENSMUSG00000000983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC010986 // GenBank // Mus musculus extracellular proteinase inhibitor, mRNA (cDNA clone MGC:14015 IMAGE:4038377), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000139762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:83709125:83710698:1 gene:ENSMUSG00000000983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// BC002038 // GenBank // Mus musculus mRNA similar to extracellular proteinase inhibitor (cDNA clone IMAGE:3497367). // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT011147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_183249 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 21 (Wfdc21), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000070832 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83746940:83752642:1 gene:ENSMUSG00000051748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC096415 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1100001G20 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:1364952). // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK155780 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730220B11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
ENSMUST00000122379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:83800464:83801092:1 gene:ENSMUSG00000081342 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000001080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:83747027:83801856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
NM_030096 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 52 (Ddx52), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000049257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:83942062:83963088:1 gene:ENSMUSG00000020677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC029094 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 52, mRNA (cDNA clone MGC:28028 IMAGE:3662249), complete cds. // chr11 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:83942178:83961807:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000103201 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84173122:84401651:1 gene:ENSMUSG00000020532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000130012 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84179831:84231692:1 gene:ENSMUSG00000020532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// NM_133360 // RefSeq // Mus musculus acetyl-Coenzyme A carboxylase alpha (Acaca), mRNA. // chr11 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// ENSMUST00000020843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:84195438:84401645:1 gene:ENSMUSG00000020532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// ENSMUST00000183548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84173354:84233808:1 gene:ENSMUSG00000020532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// AK040962 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530052A10 product:Acetyl-CoA carboxylase 1 (Fragment) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// AY451393 // GenBank // Mus musculus acetyl-CoA carboxylase 1 (Acac) mRNA, complete cds. // chr11 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
AK089475 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730037F04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK143696 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F430010L17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_388930 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635561 (LOC102635561), ncRNA. // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// XR_393437 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635561 (LOC102635561), transcript variant X1, ncRNA. // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// KnowTID_00001168 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007607 // RefSeq // Mus musculus carbonic anhydrase 4 (Car4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006532095 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carbonic anhydrase 4 (Car4), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000103194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:84957788:84966044:1 gene:ENSMUSG00000000805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000108076 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:84964347:84966044:1 gene:ENSMUSG00000000805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000150596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84957825:84964563:1 gene:ENSMUSG00000000805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 91 // 72 // 21 // 23 // 0 /// BC012704 // GenBank // Mus musculus carbonic anhydrase 4, mRNA (cDNA clone MGC:13978 IMAGE:4217743), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000127827 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84958104:84964228:1 gene:ENSMUSG00000000805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// ENSMUST00000139416 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:84957786:84962555:1 gene:ENSMUSG00000000805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000047636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:84957887:84965805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// NONMMUT011204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENSMUST00000083077 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:85163077:85163183:1 gene:ENSMUSG00000065011 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT011214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_028589 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700125H20 gene (1700125H20Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006534341 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700125H20 gene (1700125H20Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// XM_006534342 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700125H20 gene (1700125H20Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000018623 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:85171096:85181145:1 gene:ENSMUSG00000018479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000100681 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:85170404:85181145:1 gene:ENSMUSG00000018479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// AK007281 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700125H20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC048674 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700125H20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58845 IMAGE:6774125), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006534339 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700125H20 gene (1700125H20Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// XM_006534343 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700125H20 gene (1700125H20Rik), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// XM_006534344 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700125H20 gene (1700125H20Rik), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000047638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:85149731:85180971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
AK014613 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4633401I16 product:RIKEN cDNA 1300003O07 gene, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016910 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1D magnesium-dependent, delta isoform (Ppm1d), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000020835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:85311244:85347066:1 gene:ENSMUSG00000020525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF200464 // GenBank // Mus musculus p53-induced protein phosphatase 1 (Wip1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC023492 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1D magnesium-dependent, delta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:32306 IMAGE:5026376), complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC051966 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1D magnesium-dependent, delta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:62239 IMAGE:5689560), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:85312164:85337203:1 gene:ENSMUSG00000020525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:85311212:85354975:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_009324 // RefSeq // Mus musculus T-box 2 (Tbx2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000000095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:85832551:85841948:1 gene:ENSMUSG00000000093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U15566 // GenBank // Mus musculus Tbx2 mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:85833137:85918477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_011536 // RefSeq // Mus musculus T-box 4 (Tbx4), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_172798 // RefSeq // Mus musculus T-box 4 (Tbx4), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006532781 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus T-box 4 (Tbx4), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000000096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:85890063:85916097:1 gene:ENSMUSG00000000094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000108045 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:85896765:85916095:1 gene:ENSMUSG00000000094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000108047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:85886422:85916095:1 gene:ENSMUSG00000000094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY075134 // GenBank // Mus musculus T-box 4 (Tbx4) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:85833137:85918477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000128960 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:86201370:86211192:1 gene:ENSMUSG00000085208 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC041154 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4632419I22 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4971286), partial cds. // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC053335 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3707641, partial cds. // chr11 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC067002 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4632419I22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:91302 IMAGE:5716200), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_029788 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein, transmembrane 1 (Rnft1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000020827 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:86484657:86499025:1 gene:ENSMUSG00000020521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000125675 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:86484685:86490511:1 gene:ENSMUSG00000020521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC050796 // GenBank // Mus musculus ring finger protein, transmembrane 1, mRNA (cDNA clone MGC:58708 IMAGE:6743413), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK171077 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630222I17 product:similar to PTD016 protein [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000047029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:86486112:86495955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT011278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NM_001098810 // RefSeq // Mus musculus peptidyl-tRNA hydrolase 2 (Ptrh2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NM_175004 // RefSeq // Mus musculus peptidyl-tRNA hydrolase 2 (Ptrh2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:86683985:86692457:1 gene:ENSMUSG00000072582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000108022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:86683985:86692457:1 gene:ENSMUSG00000072582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC026947 // GenBank // Mus musculus peptidyl-tRNA hydrolase 2, mRNA (cDNA clone MGC:25743 IMAGE:3990061), complete cds. // chr11 // 69 // 52 // 9 // 13 // 0
NONMMUT002567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0
NM_025377 // RefSeq // Mus musculus spindle and kinetochore associated complex subunit 2 (Ska2), mRNA. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000020794 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:87109234:87124635:1 gene:ENSMUSG00000020492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC060088 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110001A07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6416572). // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC117001 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110001A07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151378 IMAGE:40126320), complete cds. // chr11 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC119167 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110001A07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155483 IMAGE:8733916), complete cds. // chr11 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000142263 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:87109251:87124634:1 gene:ENSMUSG00000020492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONMMUT011330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NR_029652 // RefSeq // Mus musculus microRNA 301 (Mir301), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083655 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:87113004:87113089:1 gene:ENSMUSG00000065589 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-301a // miRBase Micro RNA Database // MI0000401 Mus musculus miR-301a stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_197987 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 37 (Trim37), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000041282 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:87127077:87220683:1 gene:ENSMUSG00000018548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058678 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 37, mRNA (cDNA clone MGC:76361 IMAGE:6834513), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC059070 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 37, mRNA (cDNA clone MGC:69911 IMAGE:6825999), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87109272:87229138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
NM_001199293 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 14 (Tex14), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_031386 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 14 (Tex14), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006534550 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed gene 14 (Tex14), transcript variant X10, mRNA. // chr11 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XM_006536476 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed gene 14 (Tex14), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006536481 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed gene 14 (Tex14), transcript variant X8, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000060835 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:87405065:87555823:1 gene:ENSMUSG00000010342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87433810:87549558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AF285584 // GenBank // Mus musculus testis protein TEX14 (Tex14) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
NR_002843 // RefSeq // Mus musculus U3B small nuclear RNA 4 (Rnu3b4), small nuclear RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_004415 // RefSeq // Mus musculus U3B small nuclear RNA 1 (Rnu3b1), small nuclear RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_004416 // RefSeq // Mus musculus U3B small nuclear RNA 3 (Rnu3b3), small nuclear RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_027863 // RefSeq // Mus musculus U3B small nuclear RNA 2 (Rnu3b2), small nuclear RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093738 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:87448627:87448842:1 gene:ENSMUSG00000099291 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183812 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:87443237:87443452:1 gene:ENSMUSG00000098943 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184171 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:87462286:87462500:1 gene:ENSMUSG00000098641 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185073 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:87471368:87471582:1 gene:ENSMUSG00000098925 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001045527 // RefSeq // Mus musculus heat shock transcription factor family member 5 (Hsf5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000093956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:87617164:87659542:1 gene:ENSMUSG00000070345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006536456 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus heat shock transcription factor family member 5 (Hsf5), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000029715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87617272:87657367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NR_029555 // RefSeq // Mus musculus microRNA 142 (Mir142), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// mmu-mir-142 // miRBase Micro RNA Database // MI0000167 Mus musculus miR-142 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT011373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_010824 // RefSeq // Mus musculus myeloperoxidase (Mpo), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:87793581:87804413:1 gene:ENSMUSG00000009350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000121303 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:87794209:87804413:1 gene:ENSMUSG00000009350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:87793795:87796046:1 gene:ENSMUSG00000009350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AK220229 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4033 protein. // chr11 // 77 // 93 // 20 // 26 // 0 /// BC053912 // GenBank // Mus musculus myeloperoxidase, mRNA (cDNA clone MGC:60590 IMAGE:30044601), complete cds. // chr11 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// AY500847 // GenBank // Mus musculus myeloperoxidase precursor (Mpo) mRNA, complete cds. // chr11 // 72 // 89 // 18 // 25 // 0 /// X15313 // GenBank // Mouse MPO mRNA for myeloperoxidase (EC 1.11.7). // chr11 // 68 // 100 // 19 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87799824:87803602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000029717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87794539:87798344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_001039684 // RefSeq // Mus musculus Meckel syndrome, type 1 (Mks1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006533645 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Meckel syndrome, type 1 (Mks1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038196 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:87853215:87863803:1 gene:ENSMUSG00000034121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC150995 // GenBank // Mus musculus Meckel syndrome, type 1, mRNA (cDNA clone MGC:183908 IMAGE:9087908), complete cds. // chr11 // 86 // 97 // 30 // 35 // 0 /// BC158122 // GenBank // Mus musculus Meckel syndrome, type 1, mRNA (cDNA clone MGC:190008 IMAGE:9088195), complete cds. // chr11 // 85 // 94 // 29 // 34 // 0 /// DQ177342 // GenBank // Mus musculus FABB proteome-like protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000130135 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:87853227:87859313:1 gene:ENSMUSG00000034121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// ENSMUST00000153729 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:87853665:87859313:1 gene:ENSMUSG00000034121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// AK138267 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230047P15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// AK170482 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630105G16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// GENSCAN00000029713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:87853795:87863025:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000156462 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:87944403:87944814:1 gene:ENSMUSG00000044639 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONMMUT011384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_016686 // RefSeq // Mus musculus vascular endothelial zinc finger 1 (Vezf1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000018521 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:88068279:88084729:1 gene:ENSMUSG00000018377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143052 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:88073588:88084729:1 gene:ENSMUSG00000018377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000183959 // ENSEMBL // assembly_patch_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG3829_PATCH:88068279:88084728:1 gene:ENSMUSG00000098546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF104410 // GenBank // Mus musculus vascular endothelial zinc finger 1 (Vezf1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006544935 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vascular endothelial zinc finger 1 (Vezf1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000029722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:88003731:88106477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000056859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG3829_PATCH:88003731:88106477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_028859 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700106J16 gene (1700106J16Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000037268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:88294058:88295261:1 gene:ENSMUSG00000034031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183390 // ENSEMBL // proj_ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:MG3829_PATCH:88294058:88295261:1 gene:ENSMUSG00000098681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:88204442:88294554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000056860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG3829_PATCH:88204442:88294554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000083078 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:88905121:88905227:1 gene:ENSMUSG00000065012 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONMMUT011449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NR_003492 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2210409E12 gene (2210409E12Rik), non-coding RNA. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000122062 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:88972657:88973002:1 gene:ENSMUSG00000081766 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_processed_pseudogene // chr11 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135325 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:88970252:88982645:1 gene:ENSMUSG00000033983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 75 // 94 // 24 // 32 // 0 /// BC139451 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2210409E12 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:8862473). // chr11 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// GENSCAN00000053210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:88972635:88972937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK167167 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0037B07 product:coilin, full insert sequence. // chr11 // 66 // 94 // 21 // 32 // 0
NM_016706 // RefSeq // Mus musculus coilin (Coil), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000036649 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:88973935:88991613:1 gene:ENSMUSG00000033983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:88973935:88991613:1 gene:ENSMUSG00000033983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000135325 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:88970252:88982645:1 gene:ENSMUSG00000033983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 57 // 14 // 16 // 0 /// AF208663 // GenBank // Mus musculus coilin p80 (Coil) mRNA, complete cds. // chr11 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC031167 // GenBank // Mus musculus coilin, mRNA (cDNA clone MGC:37472 IMAGE:4983919), complete cds. // chr11 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:88973817:89016721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// AK167167 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0037B07 product:coilin, full insert sequence. // chr11 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_009546 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 25 (Trim25), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000000284 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:88999376:89020293:1 gene:ENSMUSG00000000275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000100627 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:88999376:89013702:1 gene:ENSMUSG00000000275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000107896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:88999376:89020293:1 gene:ENSMUSG00000000275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK154533 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630044K20 product:tripartite motif protein 25, full insert sequence. // chr11 // 83 // 94 // 25 // 30 // 0 /// BC006908 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 25, mRNA (cDNA clone MGC:6886 IMAGE:2651664), complete cds. // chr11 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// BC034276 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 25, mRNA (cDNA clone MGC:30340 IMAGE:4022161), complete cds. // chr11 // 89 // 56 // 16 // 18 // 0 /// D63902 // GenBank // Mus musculus mRNA for estrogen-responsive finger protein, complete cds. // chr11 // 83 // 91 // 24 // 29 // 0 /// GENSCAN00000053241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:88973817:89016721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_001033266 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 525 (Gm525), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533001 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 525 (Gm525), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533002 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 525 (Gm525), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533003 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 525 (Gm525), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100619 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:89073841:89093040:1 gene:ENSMUSG00000072553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK040024 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430045L05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_390029 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 525 (Gm525), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000127186 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:89075009:89092965:1 gene:ENSMUSG00000072553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000053205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:89073951:89088672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_026433 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 100 (Tmem100), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006534030 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 100 (Tmem100), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006534031 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 100 (Tmem100), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000092788 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:90030348:90036508:1 gene:ENSMUSG00000069763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034841 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 100, mRNA (cDNA clone MGC:41016 IMAGE:3326079), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000050929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:90030665:90054133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_026178 // RefSeq // Mus musculus monocyte to macrophage differentiation-associated (Mmd), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000004050 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:90249476:90278589:1 gene:ENSMUSG00000003948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY424300 // GenBank // Mus musculus progestin and adipoQ receptor family member XI (Paqr11) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC021914 // GenBank // Mus musculus monocyte to macrophage differentiation-associated, mRNA (cDNA clone MGC:27634 IMAGE:4506710), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC034117 // GenBank HTC // Mus musculus monocyte to macrophage differentiation-associated, mRNA (cDNA clone IMAGE:4511429), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000107887 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:90249456:90268465:1 gene:ENSMUSG00000003948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// AK033889 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330110M07 product:monocyte to macrophage differentiation-associated, full insert sequence. // chr11 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000050938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:90249637:90266150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_199008 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase assembly protein 11 (Cox11), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000020851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:90638173:90644931:1 gene:ENSMUSG00000020544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000099960 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:90640178:90644661:1 gene:ENSMUSG00000020544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// BC061233 // GenBank // Mus musculus COX11 homolog, cytochrome c oxidase assembly protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:74383 IMAGE:6585499), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000002193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:90637537:90644552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
ENSMUST00000120917 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:93650759:93651969:1 gene:ENSMUSG00000082453 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT011539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:93561485:93668268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_009427 // RefSeq // Mus musculus transducer of ErbB-2.1 (Tob1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041589 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94211454:94215495:1 gene:ENSMUSG00000037573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC082588 // GenBank // Mus musculus transducer of ErbB-2.1, mRNA (cDNA clone MGC:105220 IMAGE:30629144), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94213640:94214728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_027799 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 40 (Ankrd40), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// NM_146024 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat domain 40 (Ankrd40), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94328254:94339509:1 gene:ENSMUSG00000020864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000051221 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94328013:94339923:1 gene:ENSMUSG00000020864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000107818 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94328001:94341841:1 gene:ENSMUSG00000020864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC023133 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 40, mRNA (cDNA clone MGC:29030 IMAGE:3592723), complete cds. // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000124087 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94338290:94340148:1 gene:ENSMUSG00000020864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000035412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94328254:94339699:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0
AB045721 // GenBank // Mus musculus TISP78 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_007689 // RefSeq // Mus musculus chondroadherin (Chad), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040418 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94565047:94569127:1 gene:ENSMUSG00000039084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC012672 // GenBank // Mus musculus chondroadherin, mRNA (cDNA clone MGC:13856 IMAGE:4192855), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94565098:94568350:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_133807 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 59 (Lrrc59), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021239 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94629767:94645216:1 gene:ENSMUSG00000020869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000138782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94629814:94635252:1 gene:ENSMUSG00000020869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC006877 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 59, mRNA (cDNA clone MGC:6791 IMAGE:2647513), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC066172 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 59, mRNA (cDNA clone MGC:76562 IMAGE:30429192), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94630005:94643541:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_053161 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L27 (Mrpl27), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006534567 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L27 (Mrpl27), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000025278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94653767:94660089:1 gene:ENSMUSG00000024414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AK143575 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F420006F14 product:mitochondrial ribosomal protein L27, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC030074 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L27, mRNA (cDNA clone MGC:41411 IMAGE:1514322), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000132813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94653776:94659918:1 gene:ENSMUSG00000024414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// AB049648 // GenBank // Mus musculus MRPL27 mRNA for mitochondrial ribosomal protein L27 (L27mt), complete cds. // chr11 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// GENSCAN00000035438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94653802:94659815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
ENSMUST00000021240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94741782:94743014:1 gene:ENSMUSG00000020870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AK136078 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420453J03 product:Similar to cell division cycle 34 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// ENSMUST00000188741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:94741782:94743033:1 gene:ENSMUSG00000020870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000035413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94741976:94742689:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_007742 // RefSeq // Mus musculus collagen, type I, alpha 1 (Col1a1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENSMUST00000001547 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94936224:94953042:1 gene:ENSMUSG00000001506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// BC042642 // GenBank HTC // Mus musculus collagen, type I, alpha 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4036918), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr11 // 98 // 87 // 44 // 45 // 0 /// BC050014 // GenBank // Mus musculus collagen, type I, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:28647 IMAGE:4225038), complete cds. // chr11 // 98 // 100 // 51 // 52 // 0 /// BC059281 // GenBank // Mus musculus collagen, type I, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:68307 IMAGE:3992363), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 44 // 44 // 0 /// U08020 // GenBank // Mus musculus FVB/N collagen pro-alpha-1 type I chain mRNA, complete cds. // chr11 // 98 // 98 // 50 // 51 // 0 /// GENSCAN00000035418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94936369:94951619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 47 // 47 // 0 /// AK086730 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930048E22 product:procollagen, type I, alpha 1, full insert sequence. // chr11 // 15 // 15 // 8 // 52 // 1
ENSMUST00000158779 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:94958778:94958893:1 gene:ENSMUSG00000089404 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018792 // RefSeq // Mus musculus histone H1-like protein in spermatids 1 (Hils1), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038928 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94967593:94968456:1 gene:ENSMUSG00000038994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB022320 // GenBank // Mus musculus hils1 mRNA for DNA-binding protein Hils1, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB045724 // GenBank // Mus musculus TISP64 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AY286319 // GenBank // Mus musculus spermatid-specific linker histone H1-like protein (Hils1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC061119 // GenBank // Mus musculus histone H1-like protein in spermatids 1, mRNA (cDNA clone MGC:74245 IMAGE:6773493), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94967890:94968393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
NM_172261 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 9B (Ppp1r9b), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000038696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:94991035:95006899:1 gene:ENSMUSG00000038976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000107748 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:94996064:95006899:1 gene:ENSMUSG00000038976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000151771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:94992880:95001326:1 gene:ENSMUSG00000038976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 92 // 36 // 11 // 12 // 0 /// AY508450 // GenBank // Mus musculus spinophilin mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC029672 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory subunit 9B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5362891), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94975257:95024733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_146025 // RefSeq // Mus musculus sterile alpha motif domain containing 14 (Samd14), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000055947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95009879:95026087:1 gene:ENSMUSG00000047181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000124735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95010281:95020116:1 gene:ENSMUSG00000047181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000128512 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95009882:95021640:1 gene:ENSMUSG00000047181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// BC034054 // GenBank // Mus musculus sterile alpha motif domain containing 14, mRNA (cDNA clone MGC:31049 IMAGE:4505400), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC049954 // GenBank // Mus musculus sterile alpha motif domain containing 14, mRNA (cDNA clone MGC:59073 IMAGE:4191611), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:94975257:95024733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_010055 // RefSeq // Mus musculus distal-less homeobox 3 (Dlx3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000092768 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95120119:95125296:1 gene:ENSMUSG00000001510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058852 // GenBank // Mus musculus distal-less homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:60844 IMAGE:30012395), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95120322:95130885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_053093 // RefSeq // Mus musculus tachykinin 4 (Tac4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021242 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95261529:95269265:1 gene:ENSMUSG00000020872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF235035 // GenBank // Mus musculus preprotachykinin C mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF515827 // GenBank // Mus musculus tachykinin 4 precursor (Tac4) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC119426 // GenBank // Mus musculus tachykinin 4, mRNA (cDNA clone MGC:140840 IMAGE:40039772), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95261700:95272260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_016752 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member B1 (Slc35b1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95384692:95391776:1 gene:ENSMUSG00000020873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000131193 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95384891:95391776:1 gene:ENSMUSG00000020873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000146556 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:95384757:95387890:1 gene:ENSMUSG00000020873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// BC002029 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:5917 IMAGE:3592141), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// D87990 // GenBank // Mus musculus mRNA for UDP-galactose transporter related isozyme 1, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95384902:95414859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_025287 // RefSeq // Mus musculus speckle-type POZ protein (Spop), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107722 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95414098:95493406:1 gene:ENSMUSG00000057522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000107724 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95414080:95493406:1 gene:ENSMUSG00000057522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000127713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95414243:95474335:1 gene:ENSMUSG00000057522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000150884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95414095:95474314:1 gene:ENSMUSG00000057522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000150922 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95474319:95490315:1 gene:ENSMUSG00000057522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AY538613 // GenBank // Mus musculus PDX-1 C-terminus interacting factor-1 (Pcif1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC043131 // GenBank // Mus musculus speckle-type POZ protein, mRNA (cDNA clone MGC:58071 IMAGE:6811159), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC045205 // GenBank // Mus musculus speckle-type POZ protein, mRNA (cDNA clone MGC:49448 IMAGE:4988521), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95470624:95491841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
AK158420 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930115I02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_028263 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA B130006D01 gene (B130006D01Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:95723587:95726710:1 gene:ENSMUSG00000075596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_201609 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 652 (Zfp652), mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000091565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:95749067:95764711:1 gene:ENSMUSG00000075595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000107717 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95712673:95772353:1 gene:ENSMUSG00000075595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000148945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95749000:95772353:1 gene:ENSMUSG00000075595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSMUST00000133070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95713011:95835115:1 gene:ENSMUSG00000075595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95713177:95831309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// AK143174 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130215I04 product:hypothetical Zn-finger, C2H2 type/Zinc finger C2H2 type domain profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_153104 // RefSeq // Mus musculus phosphatase, orphan 1 (Phospho1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:95824500:95832140:1 gene:ENSMUSG00000050860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133070 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:95713011:95835115:1 gene:ENSMUSG00000075595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000150134 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:95824499:95830701:1 gene:ENSMUSG00000050860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AJ457190 // GenBank // Mus musculus partial mRNA for phosphatase, orphan 1 (phospho1 gene). // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK143174 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130215I04 product:hypothetical Zn-finger, C2H2 type/Zinc finger C2H2 type domain profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:95713177:95831309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000158229 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:95921102:95921226:1 gene:ENSMUSG00000088854 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008119 // RefSeq // Mus musculus gastric inhibitory polypeptide (Gip), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000103156 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96025046:96030831:1 gene:ENSMUSG00000014351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000103157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96024545:96030831:1 gene:ENSMUSG00000014351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC104314 // GenBank // Mus musculus gastric inhibitory polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:129268 IMAGE:40044479), complete cds. // chr11 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// BC104315 // GenBank // Mus musculus gastric inhibitory polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:129269 IMAGE:40044480), complete cds. // chr11 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// U34295 // GenBank // Mus musculus glucose dependent insulinotropic polypeptide mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96025376:96030716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000183609 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:96032678:96032892:1 gene:ENSMUSG00000098425 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT011683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_033568 // RefSeq // Mus musculus SNF8, ESCRT-II complex subunit, homolog (S. cerevisiae) (Snf8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000006217 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96034885:96047430:1 gene:ENSMUSG00000006058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC003938 // GenBank // Mus musculus SNF8, ESCRT-II complex subunit, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:7335 IMAGE:3486703), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000107700 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:96034965:96047430:1 gene:ENSMUSG00000006058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// GENSCAN00000029118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96035014:96047332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NM_172799 // RefSeq // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 6 (Ttll6), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107680 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:96134219:96165451:1 gene:ENSMUSG00000038756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000167258 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96133786:96165451:1 gene:ENSMUSG00000038756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK077033 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932418K24 product:hypothetical Tubulin-tyrosine ligase containing protein, full insert sequence. // chr11 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC132203 // GenBank // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:163834 IMAGE:40130480), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC138058 // GenBank // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:169682 IMAGE:8861077), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC145130 // GenBank // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:178686 IMAGE:9053678), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC145131 // GenBank // Mus musculus tubulin tyrosine ligase-like family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:178687 IMAGE:9053679), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96133786:96155024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_008267 // RefSeq // Mus musculus homeobox B13 (Hoxb13), mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000062709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96194316:96197447:1 gene:ENSMUSG00000049604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC013639 // GenBank // Mus musculus homeo box B13, mRNA (cDNA clone MGC:18675 IMAGE:4207456), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC051087 // GenBank // Mus musculus homeo box B13, mRNA (cDNA clone MGC:58938 IMAGE:6530542), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC058813 // GenBank // Mus musculus homeo box B13, mRNA (cDNA clone MGC:65289 IMAGE:6530413), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// U57051 // GenBank // Mus musculus Hoxb-13 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000029128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96194443:96198989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
NR_029721 // RefSeq // Mus musculus microRNA 196a-1 (Mir196a-1), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083612 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:96265164:96265265:1 gene:ENSMUSG00000065546 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-196a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000552 Mus musculus miR-196a-1 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008270 // RefSeq // Mus musculus homeobox B9 (Hoxb9), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000010 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96271457:96276595:1 gene:ENSMUSG00000020875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174042 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:96271523:96276595:1 gene:ENSMUSG00000020875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK078860 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030225E15 product:homeo box B9, full insert sequence. // chr11 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000029114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96251594:96274859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_010461 // RefSeq // Mus musculus homeobox B8 (Hoxb8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006532294 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus homeobox B8 (Hoxb8), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000052650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96281905:96285315:1 gene:ENSMUSG00000056648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125410 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96282556:96284315:1 gene:ENSMUSG00000056648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// BC139209 // GenBank // Mus musculus homeo box B8, mRNA (cDNA clone MGC:170836 IMAGE:8862231), complete cds. // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC139212 // GenBank // Mus musculus homeo box B8, mRNA (cDNA clone MGC:170839 IMAGE:8862234), complete cds. // chr11 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// X13721 // GenBank // Murine Hox-2.4 mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:96282725:96284693:1 gene:ENSMUSG00000056648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// X06762 // GenBank // Mouse Hox2.3 mRNA. // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96279766:96289630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_010460 // RefSeq // Mus musculus homeobox B7 (Hoxb7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049352 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96286623:96290162:1 gene:ENSMUSG00000038721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X06762 // GenBank // Mouse Hox2.3 mRNA. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96279766:96289630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_008269 // RefSeq // Mus musculus homeobox B6 (Hoxb6), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:96299171:96301568:1 gene:ENSMUSG00000000690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000173432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96292476:96301569:1 gene:ENSMUSG00000000690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC016893 // GenBank // Mus musculus homeo box B6, mRNA (cDNA clone MGC:18719 IMAGE:4223365), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// X56459 // GenBank // Murine HOX 2.2 mRNA for a homeobox protein. // chr11 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// AK011622 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610029N04 product:HOMEOBOX PROTEIN HOX-B6 (HOX-2.2) (MH-22A) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 66 // 100 // 19 // 29 // 0 /// X56461 // GenBank // Murine Hox2.2 mRNA for a homeobox protein. // chr11 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000011946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96299177:96305137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_008268 // RefSeq // Mus musculus homeobox B5 (Hoxb5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000049272 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96303512:96306120:1 gene:ENSMUSG00000038700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC103595 // GenBank // Mus musculus homeo box B5, mRNA (cDNA clone MGC:124113 IMAGE:40046040), complete cds. // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC103596 // GenBank // Mus musculus homeo box B5, mRNA (cDNA clone MGC:124114 IMAGE:40046042), complete cds. // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC103604 // GenBank // Mus musculus homeo box B5, mRNA (cDNA clone MGC:124116 IMAGE:40046047), complete cds. // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC103607 // GenBank // Mus musculus homeo box B5, mRNA (cDNA clone MGC:124115 IMAGE:40046044), complete cds. // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// M26283 // GenBank // Mouse homeobox (Hox2.1) protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000190470 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96303336:96306121:1 gene:ENSMUSG00000038700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96299177:96305137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NR_029784 // RefSeq // Mus musculus microRNA 10a (Mir10a), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083585 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:96317165:96317274:1 gene:ENSMUSG00000065519 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-10a // miRBase Micro RNA Database // MI0000685 Mus musculus miR-10a stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010459 // RefSeq // Mus musculus homeobox B4 (Hoxb4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XR_388352 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus homeobox B4 (Hoxb4), transcript variant X1, misc_RNA. // chr11 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000049241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96318267:96321638:1 gene:ENSMUSG00000038692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC095947 // GenBank // Mus musculus homeo box B4, mRNA (cDNA clone MGC:106317 IMAGE:4947607), complete cds. // chr11 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// M36654 // GenBank // Mouse homeo box 2.6 (Hox-2.6) mRNA, complete cds. // chr11 // 89 // 61 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96318776:96320328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 32 // 9 // 10 // 0
NM_010458 // RefSeq // Mus musculus homeobox B3 (Hoxb3), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000055334 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96343769:96346507:1 gene:ENSMUSG00000048763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_001079869 // RefSeq // Mus musculus homeobox B3 (Hoxb3), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// XM_006532281 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus homeobox B3 (Hoxb3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// XM_006532282 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus homeobox B3 (Hoxb3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// XM_006532283 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus homeobox B3 (Hoxb3), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// XM_006532285 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus homeobox B3 (Hoxb3), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// XM_006532287 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus homeobox B3 (Hoxb3), transcript variant X7, mRNA. // chr11 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// XM_006532289 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus homeobox B3 (Hoxb3), transcript variant X9, mRNA. // chr11 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// ENSMUST00000093944 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96323326:96347930:1 gene:ENSMUSG00000048763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// ENSMUST00000123091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96328062:96344303:1 gene:ENSMUSG00000048763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000011944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96344249:96353629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_134032 // RefSeq // Mus musculus homeobox B2 (Hoxb2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000100523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96351631:96354012:1 gene:ENSMUSG00000075588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000182030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96350525:96353658:1 gene:ENSMUSG00000075588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AB221540 // GenBank // Mus musculus cDNA pooled tissues:(tissue_type=brain,dev_stage=8-12 days neonate,strain=BALB/c),(tissue_type=testis,dev_stage=adult, strain=C57BL/6J), clone:V01X002C01. // chr11 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC019414 // GenBank HTC // Mus musculus homeo box B2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5003927), with apparent retained intron. // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC138494 // GenBank // Mus musculus homeo box B2, mRNA (cDNA clone MGC:170119 IMAGE:8861514), complete cds. // chr11 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC138495 // GenBank // Mus musculus homeo box B2, mRNA (cDNA clone MGC:170120 IMAGE:8861515), complete cds. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96344249:96353629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENSMUST00000123805 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:96366258:96367221:1 gene:ENSMUSG00000018973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BC103605 // GenBank // Mus musculus homeo box B1, mRNA (cDNA clone MGC:124123 IMAGE:40046069), complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// NM_008266 // RefSeq // Mus musculus homeobox B1 (Hoxb1), mRNA. // chr11 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// ENSMUST00000019117 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96365752:96368256:1 gene:ENSMUSG00000018973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// BC103597 // GenBank // Mus musculus homeo box B1, mRNA (cDNA clone MGC:124121 IMAGE:40046066), complete cds. // chr11 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// BC103598 // GenBank // Mus musculus homeo box B1, mRNA (cDNA clone MGC:124124 IMAGE:40046076), complete cds. // chr11 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// BC103606 // GenBank // Mus musculus homeo box B1, mRNA (cDNA clone MGC:124122 IMAGE:40046068), complete cds. // chr11 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// X59474 // GenBank // M.musculus RNA for labial-like homeobox-containing gene Hox 2.9. // chr11 // 81 // 64 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96359426:96367139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
ENSMUST00000134585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96789137:96808149:1 gene:ENSMUSG00000018666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// BC055290 // GenBank // Mus musculus chromobox homolog 1 (Drosophila HP1 beta), mRNA (cDNA clone MGC:62656 IMAGE:6313666), complete cds. // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_007622 // RefSeq // Mus musculus chromobox 1 (Cbx1), mRNA. // chr11 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// ENSMUST00000093943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96789159:96808640:1 gene:ENSMUSG00000018666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// ENSMUST00000018810 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:96789127:96803969:1 gene:ENSMUSG00000018666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// AK157710 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130005N18 product:chromobox homolog 1 (Drosophila HP1 beta), full insert sequence. // chr11 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// ENSMUST00000079702 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:96789249:96808540:1 gene:ENSMUSG00000018666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// ENSMUST00000141257 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96789175:96801405:1 gene:ENSMUSG00000018666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000011896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96800808:96806760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT011746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_019877 // RefSeq // Mus musculus coatomer protein complex, subunit zeta 2 (Copz2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000018816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:96849876:96861203:1 gene:ENSMUSG00000018672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000145633 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96849881:96854153:1 gene:ENSMUSG00000018672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000147710 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96854131:96861203:1 gene:ENSMUSG00000018672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AB040137 // GenBank // Mus musculus Copz2 mRNA for nonclathrin coat protein zeta2-COP, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB047850 // GenBank // Mus musculus mRNA for zeta2-COP, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF237687 // GenBank // Mus musculus nonclathrin coat protein zeta2-COP (Copz2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC025122 // GenBank // Mus musculus coatomer protein complex, subunit zeta 2, mRNA (cDNA clone MGC:35905 IMAGE:4187541), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000154191 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:96853900:96856940:1 gene:ENSMUSG00000018672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000011922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:96844834:96901750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NR_029562 // RefSeq // Mus musculus microRNA 152 (Mir152), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083581 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:96850393:96850465:1 gene:ENSMUSG00000065515 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-152 // miRBase Micro RNA Database // MI0000174 Mus musculus miR-152 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031183 // RefSeq // Mus musculus trans-acting transcription factor 6 (Sp6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047997 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97013394:97024734:1 gene:ENSMUSG00000038560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97018733:97024731:1 gene:ENSMUSG00000038560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AM295492 // GenBank // Mus musculus mRNA for Sp6 transcription factor (Sp6 gene). // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY338955 // GenBank // Mus musculus epiprofin (Epfn) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138818 // GenBank // Mus musculus trans-acting transcription factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:170445 IMAGE:8861840), complete cds. // chr11 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC138822 // GenBank // Mus musculus trans-acting transcription factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:170449 IMAGE:8861844), complete cds. // chr11 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97013603:97022593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_146027 // RefSeq // Mus musculus secernin 2 (Scrn2), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533023 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus secernin 2 (Scrn2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000021249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97029938:97033958:1 gene:ENSMUSG00000020877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97030001:97033950:1 gene:ENSMUSG00000020877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC010784 // GenBank // Mus musculus secernin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4221814), partial cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC021346 // GenBank // Mus musculus secernin 2, mRNA (cDNA clone MGC:29406 IMAGE:4163541), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153482 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:97030134:97032276:1 gene:ENSMUSG00000020877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97028184:97033824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_026154 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L10 (Mrpl10), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000001485 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97041560:97049213:1 gene:ENSMUSG00000001445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC016219 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L10, mRNA (cDNA clone MGC:28763 IMAGE:4485332), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000054252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97041595:97048518:1 gene:ENSMUSG00000001445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97037130:97048335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001081434 // RefSeq // Mus musculus oxysterol binding protein-like 7 (Osbpl7), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000090020 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:97050628:97068904:1 gene:ENSMUSG00000038534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000154084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97050820:97052823:1 gene:ENSMUSG00000038534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000168565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:97050820:97068904:1 gene:ENSMUSG00000038534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC085242 // GenBank // Mus musculus oxysterol binding protein-like 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:6477538), complete cds. // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000142406 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97053424:97057365:1 gene:ENSMUSG00000038534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// AK038088 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130077G24 product:similar to Oxysterol-binding protein-like protein OSBPL7 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000011915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97051480:97097326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT011783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0
NM_025927 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L45 (Mrpl45), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019026 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97315716:97329920:1 gene:ENSMUSG00000018882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC020130 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L45, mRNA (cDNA clone MGC:28209 IMAGE:3990098), complete cds. // chr11 // 68 // 88 // 15 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97309872:97328568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_138657 // RefSeq // Mus musculus suppressor of cytokine signaling 7 (Socs7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006532530 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus suppressor of cytokine signaling 7 (Socs7), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// XR_388369 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus suppressor of cytokine signaling 7 (Socs7), transcript variant X4, misc_RNA. // chr11 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000045540 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97362551:97398542:1 gene:ENSMUSG00000038485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF424814 // GenBank // Mus musculus SH2 domain containing SOCS box protein SOCS7 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97362435:97501125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_021493 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 23 (Arhgap23), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006533861 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho GTPase activating protein 23 (Arhgap23), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006533864 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho GTPase activating protein 23 (Arhgap23), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000107601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:97450160:97502400:1 gene:ENSMUSG00000049807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000121799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97415533:97502402:1 gene:ENSMUSG00000049807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000142465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97452130:97502402:1 gene:ENSMUSG00000049807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006533870 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho GTPase activating protein 23 (Arhgap23), transcript variant X10, mRNA. // chr11 // 86 // 86 // 32 // 37 // 1 /// GENSCAN00000014681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97362435:97501125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0
NM_011971 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 3 (Psmb3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000103147 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97703399:97713500:1 gene:ENSMUSG00000069744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000138265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97703434:97708064:1 gene:ENSMUSG00000069744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// AF060092 // GenBank // Mus musculus proteasome subunit C10-II (Psmb3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AK080755 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930101J06 product:proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 3, full insert sequence. // chr11 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// BC014783 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 3, mRNA (cDNA clone MGC:5639 IMAGE:3500033), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC098233 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 3, mRNA (cDNA clone MGC:106850 IMAGE:1547611), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000014671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97698353:97713441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT011820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
AK013405 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810474C18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010688 // RefSeq // Mus musculus LIM and SH3 protein 1 (Lasp1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006532342 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus LIM and SH3 protein 1 (Lasp1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000043843 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:97799565:97838764:1 gene:ENSMUSG00000038366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000148280 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:97805192:97836119:1 gene:ENSMUSG00000038366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 71 // 9 // 10 // 0 /// BC010840 // GenBank // Mus musculus LIM and SH3 protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:5975 IMAGE:3490532), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// CT010288 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A0152D for gene Lasp1, LIM and SH3 protein 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr11 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000014661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:97799794:97836245:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
NM_001080935 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA B230217C12 gene (B230217C12Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000054783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:97840780:97843043:1 gene:ENSMUSG00000050538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000089676 // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000155954 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97841293:97844099:1 gene:ENSMUSG00000050538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164364 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97841315:97843809:1 gene:ENSMUSG00000050538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000170806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:97841319:97843043:1 gene:ENSMUSG00000050538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AK081899 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130085M10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT011835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT011836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001109626 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase 12 (Cdk12), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NM_026952 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase 12 (Cdk12), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000003203 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98203314:98246704:1 gene:ENSMUSG00000003119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000107538 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98203335:98251044:1 gene:ENSMUSG00000003119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AK164881 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930042O18 product:CDC2-related kinase 7, full insert sequence. // chr11 // 85 // 36 // 11 // 13 // 0 /// AY072295 // GenBank // Mus musculus protein kinase for splicing component (Pksc) mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 89 // 28 // 32 // 0 /// BC116645 // GenBank // Mus musculus CDC2-related kinase, arginine/serine-rich, mRNA (cDNA clone MGC:141525 IMAGE:40086381), complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NM_001109628 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase 12 (Cdk12), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// ENSMUST00000107539 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98203059:98251564:1 gene:ENSMUSG00000003119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// GENSCAN00000014666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98203368:98250389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000147441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98241737:98278504:1 gene:ENSMUSG00000003119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC057057 // GenBank // Mus musculus Cdc2-related kinase, arginine/serine-rich, mRNA (cDNA clone IMAGE:6826281). // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125152 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98263502:98268011:1 gene:ENSMUSG00000003119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONMMUT011862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONMMUT011864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_011540 // RefSeq // Mus musculus titin-cap (Tcap), mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000008021 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98383811:98384953:1 gene:ENSMUSG00000007877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AJ223854 // GenBank // Mus musculus telethonin complete cDNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC027631 // GenBank // Mus musculus titin-cap, mRNA (cDNA clone MGC:41137 IMAGE:1314541), complete cds. // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98383847:98384545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_008890 // RefSeq // Mus musculus phenylethanolamine-N-methyltransferase (Pnmt), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000041301 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98386450:98388181:1 gene:ENSMUSG00000038216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000124527 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:98386712:98387482:1 gene:ENSMUSG00000038216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC119079 // GenBank // Mus musculus phenylethanolamine-N-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:155395 IMAGE:8733828), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC120789 // GenBank // Mus musculus phenylethanolamine-N-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:156026 IMAGE:40129712), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000010181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98386632:98388097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT011876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
NM_001003817 // RefSeq // Mus musculus v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian) (Erbb2), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000058295 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98412470:98437716:1 gene:ENSMUSG00000062312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000136032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98412493:98437077:1 gene:ENSMUSG00000062312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC046553 // GenBank HTC // Mus musculus v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian), mRNA (cDNA clone IMAGE:5340777). // chr11 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// BC046811 // GenBank // Mus musculus v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian), mRNA (cDNA clone MGC:61178 IMAGE:5702040), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC053078 // GenBank // Mus musculus v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian), mRNA (cDNA clone MGC:62447 IMAGE:5702040), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98412663:98436668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_001007461 // RefSeq // Mus musculus gasdermin A3 (Gsdma3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006533674 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gasdermin A3 (Gsdma3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_006533675 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gasdermin A3 (Gsdma3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// ENSMUST00000073295 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98626360:98638089:1 gene:ENSMUSG00000064224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000107508 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98626360:98638226:1 gene:ENSMUSG00000064224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AY679090 // GenBank // Mus musculus gasdermin 3 (Gsdm3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98601205:98638089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
NM_029727 // RefSeq // Mus musculus gasdermin A2 (Gsdma2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000017355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98646763:98657953:1 gene:ENSMUSG00000017211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000093938 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98646759:98657964:1 gene:ENSMUSG00000017211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC109335 // GenBank // Mus musculus gasdermin A2, mRNA (cDNA clone MGC:130173 IMAGE:40052139), complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC109336 // GenBank // Mus musculus gasdermin A2, mRNA (cDNA clone MGC:130174 IMAGE:40052146), complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98649054:98676416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_021347 // RefSeq // Mus musculus gasdermin A (Gsdma), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533850 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gasdermin A (Gsdma), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000017348 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98664351:98677708:1 gene:ENSMUSG00000017204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB033595 // GenBank // Mus musculus Gd mRNA for gasdermin, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98649054:98676416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_009439 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 3 (Psmd3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000017365 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98682554:98695979:1 gene:ENSMUSG00000017221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000123676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98687787:98693840:1 gene:ENSMUSG00000017221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 42 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000152102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98682591:98695049:1 gene:ENSMUSG00000017221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// AK164333 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130052M17 product:proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 3, full insert sequence. // chr11 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// BC003197 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 3, mRNA (cDNA clone MGC:6405 IMAGE:3586427), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000149489 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98682565:98692517:1 gene:ENSMUSG00000017221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// AK031366 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030413L20 product:proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 3, full insert sequence. // chr11 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000010155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98680031:98695600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_009971 // RefSeq // Mus musculus colony stimulating factor 3 (granulocyte) (Csf3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98701263:98703629:1 gene:ENSMUSG00000038067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC120759 // GenBank // Mus musculus colony stimulating factor 3 (granulocyte), mRNA (cDNA clone MGC:155996 IMAGE:40129682), complete cds. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC120761 // GenBank // Mus musculus colony stimulating factor 3 (granulocyte), mRNA (cDNA clone MGC:155998 IMAGE:40129684), complete cds. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// M13926 // GenBank // Mouse granulocyte colony-stimulating factor (G-CSF) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98700483:98702960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_178060 // RefSeq // Mus musculus thyroid hormone receptor alpha (Thra), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000103139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98741873:98765111:1 gene:ENSMUSG00000058756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000124072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98753586:98768403:1 gene:ENSMUSG00000058756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000153043 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98742158:98756995:1 gene:ENSMUSG00000058756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 28 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000064187 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98741811:98769006:1 gene:ENSMUSG00000058756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// BC046795 // GenBank // Mus musculus thyroid hormone receptor alpha, mRNA (cDNA clone MGC:61415 IMAGE:5717946), complete cds. // chr11 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// ENSMUST00000152195 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98741811:98757695:1 gene:ENSMUSG00000058756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// AK082121 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230009M16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000010112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98725135:98764528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONMMUT011911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_138660 // RefSeq // Mus musculus cancer susceptibility candidate 3 (Casc3), mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000017384 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98804905:98833814:1 gene:ENSMUSG00000078676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000147065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98810161:98822537:1 gene:ENSMUSG00000078676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000169695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:98809808:98833806:1 gene:ENSMUSG00000078676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF526276 // GenBank // Mus musculus metastatic lymph node 51 (Mln51) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AJ292072 // GenBank // Mus musculus mRNA for MLN51 protein. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC141296 // GenBank // Mus musculus cancer susceptibility candidate 3, mRNA (cDNA clone MGC:176257 IMAGE:9055908), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98795831:98975086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1
NM_001080925 // RefSeq // Mus musculus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF)-like 1 (Rapgefl1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107479 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98836785:98853697:1 gene:ENSMUSG00000038020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC130266 // GenBank // Mus musculus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:161353 IMAGE:40143028), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98795831:98975086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1
NM_197940 // RefSeq // Mus musculus WAS/WASL interacting protein family, member 2 (Wipf2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000037480 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98863638:98905040:1 gene:ENSMUSG00000038013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000142414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98863638:98892299:1 gene:ENSMUSG00000038013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// BC057854 // GenBank // Mus musculus WAS/WASL interacting protein family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:62854 IMAGE:6494304), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000132006 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98864117:98892840:1 gene:ENSMUSG00000038013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// AK144539 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630092J22 product:weakly similar to Wasp-binding protein [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000010124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98795831:98975086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONMMUT011923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001025779 // RefSeq // Mus musculus cell division cycle 6 (Cdc6), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NM_011799 // RefSeq // Mus musculus cell division cycle 6 (Cdc6), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000092706 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98907801:98923936:1 gene:ENSMUSG00000017499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000133779 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:98907849:98923940:1 gene:ENSMUSG00000017499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// BC052434 // GenBank // Mus musculus cell division cycle 6 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:63392 IMAGE:6837113), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// XM_006533276 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cell division cycle 6 (Cdc6), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// ENSMUST00000093937 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:98908151:98921893:1 gene:ENSMUSG00000017499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// GENSCAN00000010124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:98795831:98975086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_010517 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 4 (Igfbp4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000017637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99041244:99054392:1 gene:ENSMUSG00000017493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99044766:99051815:1 gene:ENSMUSG00000017493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000130530 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99043597:99051920:1 gene:ENSMUSG00000017493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000140772 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:99047311:99051812:1 gene:ENSMUSG00000017493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC019836 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:29917 IMAGE:5123738), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000177092 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:99041760:99051701:1 gene:ENSMUSG00000017493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000010107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99041497:99051579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001177484 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11559 (Gm11559), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000092694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99864476:99865571:1 gene:ENSMUSG00000090225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001101613 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11567 (Gm11567), mRNA. // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NM_015741 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 9-1 (Krtap9-1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078442 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99879187:99880229:1 gene:ENSMUSG00000059845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093936 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99873389:99874432:1 gene:ENSMUSG00000070335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116210 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 9-1, mRNA (cDNA clone MGC:143591 IMAGE:40091112), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001177484 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11559 (Gm11559), mRNA. // chr11 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NM_001205030 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11568 (Gm11568), mRNA. // chr11 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// ENSMUST00000092694 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99864476:99865571:1 gene:ENSMUSG00000090225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107434 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99857917:99859061:1 gene:ENSMUSG00000069717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99875995:99879572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 78 // 72 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99853046:99873744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 79 // 76 // 15 // 19 // 0
NM_001101613 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11567 (Gm11567), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000078442 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99879187:99880229:1 gene:ENSMUSG00000059845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_027568 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 31-1 (Krtap31-1), mRNA. // chr11 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000093935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99907920:99908892:1 gene:ENSMUSG00000070334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001126323 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11565 (Gm11565), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000105053 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99914751:99915671:1 gene:ENSMUSG00000078256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000117567 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:99932162:99933109:1 gene:ENSMUSG00000086688 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000045381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:99914784:99933305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0
NM_001025244 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 31-2 (Krtap31-2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000058761 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:99936291:99937225:1 gene:ENSMUSG00000051481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_011508 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1 (Eif1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000049385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100319885:100322096:1 gene:ENSMUSG00000035530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AF129888 // GenBank // Mus musculus Sui1 homolog mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC003463 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:6503 IMAGE:2648657), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC081429 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:101938 IMAGE:5710951), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC096656 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:106922 IMAGE:5143414), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_010257 // RefSeq // Mus musculus gastrin (Gast), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000017309 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100334407:100336996:1 gene:ENSMUSG00000017165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC064791 // GenBank // Mus musculus gastrin, mRNA (cDNA clone MGC:76711 IMAGE:6431366), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// X94758 // GenBank // M.musculus mRNA for gastrin. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100336483:100336899:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0
NM_001163481 // RefSeq // Mus musculus FK506 binding protein 10 (Fkbp10), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_010221 // RefSeq // Mus musculus FK506 binding protein 10 (Fkbp10), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000001595 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100415697:100424824:1 gene:ENSMUSG00000001555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000134815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100415845:100422089:1 gene:ENSMUSG00000001555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// BC029546 // GenBank // Mus musculus FK506 binding protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:36024 IMAGE:5059670), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// L07063 // GenBank // Mus musculus FKBP65 binding protein mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000107400 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:100415766:100424112:1 gene:ENSMUSG00000001555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// ENSMUST00000139084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100420424:100421696:1 gene:ENSMUSG00000001555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000014460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100415784:100424073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_025727 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 10 (Klhl10), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000001599 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100441917:100457022:1 gene:ENSMUSG00000001558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107395 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:100441927:100446016:1 gene:ENSMUSG00000001558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AY495337 // GenBank // Mus musculus KLHL10 (Klhl10) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC064049 // GenBank // Mus musculus kelch-like 10 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:639105), complete cds. // chr11 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC139267 // GenBank // Mus musculus kelch-like 10 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:170894 IMAGE:8862289), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC139268 // GenBank // Mus musculus kelch-like 10 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:170895 IMAGE:8862290), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100442031:100456946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_028918 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 25 (Ttc25), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_388541 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 25 (Ttc25), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000006976 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:100545694:100572568:1 gene:ENSMUSG00000006784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000092684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:100545607:100571963:1 gene:ENSMUSG00000006784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC050805 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 25, mRNA (cDNA clone MGC:58756 IMAGE:6771545), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100545694:100569805:1 gene:ENSMUSG00000006784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// AK162855 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230052H15 product:hypothetical TPR repeat/TPR-like containing protein, full insert sequence. // chr11 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100524994:100580796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_029307 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein, alpha-crystallin-related, B9 (Hspb9), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000017976 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:100713922:100714573:1 gene:ENSMUSG00000017832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:100713850:100714575:1 gene:ENSMUSG00000017832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:100713850:100714449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_013792 // RefSeq // Mus musculus alpha-N-acetylglucosaminidase (Sanfilippo disease IIIB) (Naglu), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000001802 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101070012:101077672:1 gene:ENSMUSG00000001751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101071552:101076571:1 gene:ENSMUSG00000001751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AK158774 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K430306J22 product:alpha-N-acetylglucosaminidase (Sanfilippo disease IIIB), full insert sequence. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC055733 // GenBank // Mus musculus alpha-N-acetylglucosaminidase (Sanfilippo disease IIIB), mRNA (cDNA clone MGC:66992 IMAGE:6411530), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U85247 // GenBank // Mus musculus lysosomal alpha-N-acetylglucosaminidase Naglu mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158045 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930021C23 product:alpha-N-acetylglucosaminidase (Sanfilippo disease IIIB), full insert sequence. // chr11 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101070125:101077445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010475 // RefSeq // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 1 (Hsd17b1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006532297 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 1 (Hsd17b1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006532298 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 1 (Hsd17b1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000019445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101078411:101080527:1 gene:ENSMUSG00000019301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK143346 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330010H08 product:hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 1, full insert sequence. // chr11 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC125657 // GenBank // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 1, mRNA (cDNA clone MGC:159360 IMAGE:40130172), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC125659 // GenBank // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 1, mRNA (cDNA clone MGC:159362 IMAGE:40130174), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101078442:101091418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_027896 // RefSeq // Mus musculus Coenzyme A synthase (Coasy), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006534256 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Coenzyme A synthase (Coasy), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000107308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:101082625:101086619:1 gene:ENSMUSG00000001755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF521095 // GenBank // Mus musculus CoA synthase mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC020046 // GenBank // Mus musculus Coenzyme A synthase, mRNA (cDNA clone IMAGE:3980882), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006534257 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Coenzyme A synthase (Coasy), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// ENSMUST00000001806 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101082565:101086619:1 gene:ENSMUSG00000001755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000151056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101082618:101085620:1 gene:ENSMUSG00000001755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// ENSMUST00000151686 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101083895:101085179:1 gene:ENSMUSG00000001755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000014430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101078442:101091418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_134024 // RefSeq // Mus musculus tubulin, gamma 1 (Tubg1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000043680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101119938:101126419:1 gene:ENSMUSG00000035198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB158480 // GenBank // Mus musculus tubg1 mRNA for gamma-tubulin1, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC006581 // GenBank // Mus musculus tubulin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:8041 IMAGE:3587066), complete cds. // chr11 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101120194:101140571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_134028 // RefSeq // Mus musculus tubulin, gamma 2 (Tubg2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000043654 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101155907:101161787:1 gene:ENSMUSG00000045007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AB158481 // GenBank // Mus musculus tubg2 mRNA for gamma-tubulin2, complete cds. // chr11 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// BC019652 // GenBank // Mus musculus tubulin, gamma 2, mRNA (cDNA clone MGC:25100 IMAGE:4501003), complete cds. // chr11 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC051439 // GenBank // Mus musculus tubulin, gamma 2, mRNA (cDNA clone MGC:59064 IMAGE:6491052), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// BC078446 // GenBank // Mus musculus tubulin, gamma 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5690186). // chr11 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101156120:101161602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_016782 // RefSeq // Mus musculus contactin associated protein-like 1 (Cntnap1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533729 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus contactin associated protein-like 1 (Cntnap1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000103109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101176041:101190724:1 gene:ENSMUSG00000017167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF039833 // GenBank // Mus musculus neurexin IV mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK154468 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630036P21 product:contactin associated protein 1, full insert sequence. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101176261:101189659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_175638 // RefSeq // Mus musculus WNK lysine deficient protein kinase 4 (Wnk4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000103108 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101260598:101277409:1 gene:ENSMUSG00000035112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000147741 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101260655:101277274:1 gene:ENSMUSG00000035112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000170056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101265308:101274129:1 gene:ENSMUSG00000035112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 26 // 11 // 11 // 0 /// AY184228 // GenBank // Mus musculus protein kinase lysine deficient 4 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AY187027 // GenBank // Mus musculus WNK4 (PRKWNK4) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// AY260059 // GenBank // Mus musculus WNK4 protein kinase mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr11 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// BC026679 // GenBank // Mus musculus WNK lysine deficient protein kinase 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5059696), partial cds. // chr11 // 96 // 65 // 27 // 28 // 0 /// BC096453 // GenBank // Mus musculus WNK lysine deficient protein kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:106293 IMAGE:4234311), complete cds. // chr11 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// ENSMUST00000139487 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101260567:101277409:1 gene:ENSMUSG00000035112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 79 // 79 // 34 // 43 // 1 /// GENSCAN00000018067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101260708:101287581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 74 // 74 // 32 // 43 // 1
NM_026562 // RefSeq // Mus musculus cyclin N-terminal domain containing 1 (Cntd1), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000103107 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101279096:101288701:1 gene:ENSMUSG00000078653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK049116 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330003E20 product:hypothetical Cyclin-like structure containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC006866 // GenBank // Mus musculus cyclin N-terminal domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:11788 IMAGE:3595113), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000128735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101279012:101286545:1 gene:ENSMUSG00000078653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// AK006754 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700051C09 product:hypothetical Cyclin-like structure containing protein, full insert sequence. // chr11 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000018067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101260708:101287581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
NM_178932 // RefSeq // Mus musculus amine oxidase, copper containing 2 (retina-specific) (Aoc2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000041095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101325063:101329702:1 gene:ENSMUSG00000078651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000107264 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101325087:101329494:1 gene:ENSMUSG00000078651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// AF350445 // GenBank // Mus musculus retina-specific amine oxidase mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC150843 // GenBank // Mus musculus amine oxidase, copper containing 2 (retina-specific), mRNA (cDNA clone MGC:183754 IMAGE:9087754), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC150848 // GenBank // Mus musculus amine oxidase, copper containing 2 (retina-specific), mRNA (cDNA clone MGC:183759 IMAGE:9087759), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101325093:101329463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_009675 // RefSeq // Mus musculus amine oxidase, copper containing 3 (Aoc3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006532041 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus amine oxidase, copper containing 3 (Aoc3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000017316 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101331069:101341938:1 gene:ENSMUSG00000019326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000103105 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101330605:101339430:1 gene:ENSMUSG00000019326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF054831 // GenBank // Mus musculus vascular adhesion protein-1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF115411 // GenBank // Mus musculus semicarbazide-sensitive amine oxidase mRNA, complete cds. // chr11 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// AK040729 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530021C07 product:amine oxidase, copper containing 3, full insert sequence. // chr11 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// BC080857 // GenBank // Mus musculus amine oxidase, copper containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:90714 IMAGE:6854465), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101330940:101352508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_008061 // RefSeq // Mus musculus glucose-6-phosphatase, catalytic (G6pc), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019469 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101367561:101377903:1 gene:ENSMUSG00000078650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC013448 // GenBank // Mus musculus glucose-6-phosphatase, catalytic, mRNA (cDNA clone MGC:18472 IMAGE:4237115), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// U00445 // GenBank // Mus musculus glucose-6-phosphatase mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101367797:101376799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_172566 // RefSeq // Mus musculus RUN domain containing 1 (Rundc1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040561 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101425085:101435673:1 gene:ENSMUSG00000035007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119592 // GenBank // Mus musculus RUN domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:141375 IMAGE:40059040), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC119593 // GenBank // Mus musculus RUN domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:141376 IMAGE:40059041), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101425104:101434317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_027320 // RefSeq // Mus musculus interferon-induced protein 35 (Ifi35), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000010502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101448407:101458698:1 gene:ENSMUSG00000010358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000125958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101448444:101458125:1 gene:ENSMUSG00000010358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000131024 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101448570:101458464:1 gene:ENSMUSG00000010358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC008158 // GenBank // Mus musculus interferon-induced protein 35, mRNA (cDNA clone MGC:7005 IMAGE:3155505), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101442725:101458392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_009708 // RefSeq // Mus musculus Rho family GTPase 2 (Rnd2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000001347 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101468175:101471853:1 gene:ENSMUSG00000001313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000153185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:101464999:101471853:1 gene:ENSMUSG00000001313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// AK075970 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2510008A05 product:aplysia ras-related homolog N (RhoN), full insert sequence. // chr11 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// AK170529 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630106M15 product:ras homolog gene family, member N, full insert sequence. // chr11 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// BC139330 // GenBank // Mus musculus Rho family GTPase 2, mRNA (cDNA clone MGC:170957 IMAGE:8862352), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC139331 // GenBank // Mus musculus Rho family GTPase 2, mRNA (cDNA clone MGC:170958 IMAGE:8862353), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000018089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101468338:101471306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_025404 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 4D (Arl4d), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101665541:101667832:1 gene:ENSMUSG00000034936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC016113 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 4D, mRNA (cDNA clone MGC:28743 IMAGE:4481779), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_144831 // RefSeq // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 8 (Dhx8), mRNA. // chr11 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000039152 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101732950:101767358:1 gene:ENSMUSG00000034931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000129741 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:101733041:101766807:1 gene:ENSMUSG00000034931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 98 // 87 // 40 // 41 // 0 /// BC022656 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:4219375), complete cds. // chr11 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// BC132445 // GenBank // Mus musculus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 8, mRNA (cDNA clone MGC:164076 IMAGE:40130722), complete cds. // chr11 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// AK160848 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3526404P04 product:DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 8, full insert sequence. // chr11 // 45 // 45 // 21 // 47 // 1 /// GENSCAN00000018068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:101666650:101766859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0
NR_045806 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930417O22 gene (4930417O22Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000123249 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101952421:101960573:1 gene:ENSMUSG00000071818 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_029287 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700006E09 gene (1700006E09Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000010985 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:101987056:101992264:1 gene:ENSMUSG00000010841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000176722 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:101984279:101992256:1 gene:ENSMUSG00000010841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC100517 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30919107. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC116819 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700006E09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151196 IMAGE:40126138), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC116821 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700006E09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151198 IMAGE:40126140), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_145829 // RefSeq // Mus musculus N-acetylglutamate synthase (Nags), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000055409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102145549:102149477:1 gene:ENSMUSG00000048217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000129799 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102145513:102149477:1 gene:ENSMUSG00000048217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000147252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102146366:102149477:1 gene:ENSMUSG00000048217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// AF462069 // GenBank // Mus musculus N-acetylglutamate synthase (Nags) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr11 // 97 // 82 // 30 // 31 // 0 /// AK075765 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700120E20 product:N-acetylglutamate synthase, full insert sequence. // chr11 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC057990 // GenBank // Mus musculus N-acetylglutamate synthase, mRNA (cDNA clone MGC:67792 IMAGE:5100021), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000018074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102145587:102149071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
NM_153544 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC030867 (BC030867), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000100392 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102248882:102265187:1 gene:ENSMUSG00000034773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000133930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102248882:102265187:1 gene:ENSMUSG00000034773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000140040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102261964:102265187:1 gene:ENSMUSG00000034773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000148867 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102255652:102260616:1 gene:ENSMUSG00000034773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000152897 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102255656:102260614:1 gene:ENSMUSG00000034773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// BC108338 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC030867, mRNA (cDNA clone MGC:117894 IMAGE:5034745), complete cds. // chr11 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// NONMMUT012130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000029566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102234599:102288436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_148953 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 16 (Asb16), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000036467 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102268743:102279462:1 gene:ENSMUSG00000034768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF403044 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain-containing SOCS box protein Asb-16 mRNA, complete cds. // chr11 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC152349 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCS box-containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:164726 IMAGE:40104909), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// AK038411 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230005G17 product:hypothetical SOCS domain, C-terminus of STAT-inhibitors/Hemopexin domain containing protein, full insert sequence. // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000029566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102234599:102288436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000156326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102285196:102289237:1 gene:ENSMUSG00000034757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC029841 // GenBank // Mus musculus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:36813 IMAGE:4209499), complete cds. // chr11 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// NM_028076 // RefSeq // Mus musculus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 2 (Tmub2), mRNA. // chr11 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000036376 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102284931:102289237:1 gene:ENSMUSG00000034757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// XM_006534282 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 2 (Tmub2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// ENSMUST00000100387 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102284939:102289237:1 gene:ENSMUSG00000034757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// AK157408 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830213P03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000029566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102234599:102288436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
ENSMUST00000119782 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102545702:102546022:1 gene:ENSMUSG00000081677 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102545612:102546022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT012170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_020510 // RefSeq // Mus musculus frizzled homolog 2 (Drosophila) (Fzd2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000057893 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102604396:102608058:1 gene:ENSMUSG00000050288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF206321 // GenBank // Mus musculus frizzled 10 (fzd10) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC049774 // GenBank // Mus musculus frizzled homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:59284 IMAGE:6517721), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC055727 // GenBank // Mus musculus frizzled homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:66929 IMAGE:6411627), complete cds. // chr11 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102604732:102606444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 56 // 19 // 20 // 0
NM_001127576 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 1564 (Gm1564), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102665588:102682237:1 gene:ENSMUSG00000051455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156590 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102663716:102675308:1 gene:ENSMUSG00000051455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AK163979 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330028K06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0 /// ENSMUST00000155813 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102665623:102674124:1 gene:ENSMUSG00000051455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102665174:102680739:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001110778 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 11 (Adam11), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006532019 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 11 (Adam11), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XR_388327 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 11 (Adam11), transcript variant X8, misc_RNA. // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000068150 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102761439:102780262:1 gene:ENSMUSG00000020926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000143269 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102774117:102776401:1 gene:ENSMUSG00000020926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AB009676 // GenBank // Mus musculus mRNA for ADAM11, complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC054536 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 11, mRNA (cDNA clone MGC:62319 IMAGE:6400084), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_009613 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 11 (Adam11), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// ENSMUST00000103081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102761439:102780262:1 gene:ENSMUSG00000020926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// GENSCAN00000029561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102761621:102777082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// NONMMUT012183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000082854 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:102829878:102830014:1 gene:ENSMUSG00000064788 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT012187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_080846 // RefSeq // Mus musculus HIG1 domain family, member 1B (Higd1b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006534395 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HIG1 domain family, member 1B (Higd1b), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000021302 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102836296:102838040:1 gene:ENSMUSG00000020928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000107072 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102836446:102838040:1 gene:ENSMUSG00000020928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000107073 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:102835849:102838040:1 gene:ENSMUSG00000020928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC005568 // GenBank // Mus musculus HIG1 domain family, member 1B, mRNA (cDNA clone MGC:11725 IMAGE:3967350), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006534397 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HIG1 domain family, member 1B (Higd1b), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// XM_006534396 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus HIG1 domain family, member 1B (Higd1b), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_025766 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 187, member A (Fam187a), mRNA. // chr11 // 100 // 50 // 26 // 26 // 0 /// NM_028492 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 103 (Ccdc103), mRNA. // chr11 // 100 // 54 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102881204:102885216:1 gene:ENSMUSG00000020930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000100369 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:102885169:102886731:1 gene:ENSMUSG00000075510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159834 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:102881245:102884523:1 gene:ENSMUSG00000020930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 24 // 24 // 0 /// BC116769 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 103, mRNA (cDNA clone MGC:151146 IMAGE:40126088), complete cds. // chr11 // 100 // 44 // 23 // 23 // 0 /// BC116771 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 103, mRNA (cDNA clone MGC:151148 IMAGE:40126090), complete cds. // chr11 // 100 // 44 // 23 // 23 // 0 /// BC119102 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 103, mRNA (cDNA clone MGC:155418 IMAGE:8733851), complete cds. // chr11 // 100 // 46 // 24 // 24 // 0 /// BC119104 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 103, mRNA (cDNA clone MGC:155420 IMAGE:8733853), complete cds. // chr11 // 100 // 46 // 24 // 24 // 0 /// BC144894 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053442, containing frame-shift errors. // chr11 // 100 // 46 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:102882554:102886625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 28 // 28 // 0
AK048318 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130048P03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK013898 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3010024O21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_008707 // RefSeq // Mus musculus N-myristoyltransferase 1 (Nmt1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000021314 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103028346:103068912:1 gene:ENSMUSG00000020936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000148795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103028585:103057484:1 gene:ENSMUSG00000020936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// AF043326 // GenBank // Mus musculus N-myristoyltransferase 1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC016526 // GenBank // Mus musculus N-myristoyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:8150 IMAGE:3589678), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC021635 // GenBank // Mus musculus N-myristoyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:13841 IMAGE:3989540), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000029595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103028572:103066901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_138753 // RefSeq // Mus musculus hexamethylene bis-acetamide inducible 1 (Hexim1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000053063 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103116231:103119725:1 gene:ENSMUSG00000048878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY090614 // GenBank // Mus musculus cardiac lineage protein 1 (Clp1) mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BC022111 // GenBank // Mus musculus hexamethylene bis-acetamide inducible 1, mRNA (cDNA clone MGC:36249 IMAGE:5067620), complete cds. // chr11 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000029596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103116922:103117992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 41 // 8 // 9 // 0
NM_001077698 // RefSeq // Mus musculus formin-like 1 (Fmnl1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_019679 // RefSeq // Mus musculus formin-like 1 (Fmnl1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103192312:103198895:1 gene:ENSMUSG00000055805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000042286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103171107:103198901:1 gene:ENSMUSG00000055805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000107027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103171313:103198895:1 gene:ENSMUSG00000055805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF006466 // GenBank // Mus musculus lymphocyte specific formin related protein (Fr1) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// AK158820 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K430335F13 product:formin-like 1, full insert sequence. // chr11 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000029586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103170886:103198586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001033212 // RefSeq // Mus musculus reprimo-like (Rprml), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103649570:103650579:1 gene:ENSMUSG00000046215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC147064 // GenBank // Mus musculus reprimo-like, mRNA (cDNA clone MGC:182140 IMAGE:9056034), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC147065 // GenBank // Mus musculus reprimo-like, mRNA (cDNA clone MGC:182168 IMAGE:9056062), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103649781:103650134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0
NM_009521 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 3 (Wnt3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533168 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus wingless-related MMTV integration site 3 (Wnt3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000000127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103774150:103817957:1 gene:ENSMUSG00000000125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141154 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230075J09 product:wingless-related MMTV integration site 3, full insert sequence. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC141271 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 3, mRNA (cDNA clone MGC:176232 IMAGE:9055883), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC141274 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 3, mRNA (cDNA clone MGC:176235 IMAGE:9055886), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC152304 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 3, mRNA (cDNA clone MGC:129152 IMAGE:40039305), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC152305 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 3, mRNA (cDNA clone MGC:129153 IMAGE:40039312), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC152537 // GenBank // Mus musculus wingless-related MMTV integration site 3, mRNA (cDNA clone MGC:173137 IMAGE:40040396), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// M32502 // GenBank // Mouse proto-oncogene Wnt-3 protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103804096:103812760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_007477 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor 2 (Arf2), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000063347 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103966871:103985337:1 gene:ENSMUSG00000062421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000153092 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:103972953:103981898:1 gene:ENSMUSG00000062421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// BC010487 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:5937 IMAGE:3483748), complete cds. // chr11 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// D87899 // GenBank // Mus musculus mRNA for ARF2, complete cds. // chr11 // 90 // 65 // 18 // 20 // 0 /// ENSMUST00000057921 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:103966739:103985337:1 gene:ENSMUSG00000062421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// GENSCAN00000010898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:103969098:103983749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT012261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0
NM_001082535 // RefSeq // Mus musculus signal peptide peptidase 2C (Sppl2c), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NM_199019 // RefSeq // Mus musculus signal peptide peptidase 2C (Sppl2c), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:104186327:104191163:1 gene:ENSMUSG00000049506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000107000 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:104186327:104188551:1 gene:ENSMUSG00000049506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC100418 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933407P14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118219 IMAGE:6706317), complete cds. // chr11 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000010894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:104186376:104188448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_173756 // RefSeq // Mus musculus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006515701 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006542903 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7020 (Gm7020), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:12:84451508:84531533:1 gene:ENSMUSG00000085793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC120496 // GenBank // Mus musculus lin-52 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:155733 IMAGE:40129419), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137693 // GenBank // Mus musculus lin-52 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:169317 IMAGE:8860712), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:104549705:104573897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_016780 // RefSeq // Mus musculus integrin beta 3 (Itgb3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006532312 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus integrin beta 3 (Itgb3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:104608000:104670476:1 gene:ENSMUSG00000020689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF026509 // GenBank // Mus musculus integrin beta3 subunit mRNA, complete cds. // chr11 // 90 // 97 // 27 // 30 // 0 /// BC125518 // GenBank // Mus musculus integrin beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:159221 IMAGE:40130033), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC125520 // GenBank // Mus musculus integrin beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:159223 IMAGE:40130035), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000127140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:104637389:104669813:1 gene:ENSMUSG00000020689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// AK156518 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830028C11 product:integrin beta 3, full insert sequence. // chr11 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// GENSCAN00000053341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:104608089:104665656:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
XM_006534227 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand calcium binding domain 3 (Efcab3), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000148007 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:104685707:104753962:1 gene:ENSMUSG00000040838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000053342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:104682578:104815268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0
NM_001081046 // RefSeq // Mus musculus EF-hand calcium binding domain 3 (Efcab3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006534223 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand calcium binding domain 3 (Efcab3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534226 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand calcium binding domain 3 (Efcab3), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534227 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus EF-hand calcium binding domain 3 (Efcab3), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:105092206:105117537:1 gene:ENSMUSG00000020690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC050801 // GenBank // Mus musculus EF-hand calcium binding domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:58741 IMAGE:6770929), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000137086 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:105066838:105106439:1 gene:ENSMUSG00000020690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// AK162207 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420455C13 product:hypothetical Calcium-binding EF-hand/EF-Hand-like containing protein, full insert sequence. // chr11 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000053323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:105038357:105153439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_172567 // RefSeq // Mus musculus methyltransferase like 2 (Mettl2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000021030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:105126425:105140394:1 gene:ENSMUSG00000020691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000136214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:105126479:105140394:1 gene:ENSMUSG00000020691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK133887 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730489B15 product:methyltransferase like 2, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089591 // GenBank // Mus musculus methyltransferase like 2, mRNA (cDNA clone MGC:107608 IMAGE:6760288), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006533714 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methyltransferase like 2 (Mettl2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// XM_006533715 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methyltransferase like 2 (Mettl2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENSMUST00000132185 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:105132449:105138981:1 gene:ENSMUSG00000020691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000053323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:105038357:105153439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
ENSMUST00000100338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:105146893:105147261:1 gene:ENSMUSG00000075485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK153815 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920004J05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008626 // RefSeq // Mus musculus mannose receptor, C type 2 (Mrc2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000021038 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:105292668:105343871:1 gene:ENSMUSG00000020695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000100335 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:105292646:105351139:1 gene:ENSMUSG00000020695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AK028157 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310063K22 product:mannose receptor, C type 2, full insert sequence. // chr11 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC116642 // GenBank // Mus musculus mannose receptor, C type 2, mRNA (cDNA clone MGC:141530 IMAGE:40086489), complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// U56734 // GenBank // Mus musculus lectin lambda mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:105325413:105349925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
XM_006534482 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 (Tanc2), transcript variant X11, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124367 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:105625038:105715553:1 gene:ENSMUSG00000053580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000168598 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:105589986:105776834:1 gene:ENSMUSG00000053580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AK052263 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330015A07 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NM_181071 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 (Tanc2), mRNA. // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSMUST00000100330 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:105589991:105929304:1 gene:ENSMUSG00000053580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:105625058:105923716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
AK046653 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430302L04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:105944202:105956313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_027946 // RefSeq // Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 7 (Dcaf7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000058438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106036872:106059324:1 gene:ENSMUSG00000049354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC048165 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 68, mRNA (cDNA clone MGC:58053 IMAGE:6409531), complete cds. // chr11 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC048722 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 68, mRNA (cDNA clone MGC:59556 IMAGE:6504571), complete cds. // chr11 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000106891 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:106036900:106048644:1 gene:ENSMUSG00000049354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// AK080823 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230322A09 product:hypothetical Trp-Asp repeat (WD-repeat) structure containing protein, full insert sequence. // chr11 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000026909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106008203:106073301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
NM_027346 // RefSeq // Mus musculus translational activator of mitochondrially encoded cytochrome c oxidase I (Taco1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000002048 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106066061:106073612:1 gene:ENSMUSG00000001983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC029182 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 44, mRNA (cDNA clone MGC:36842 IMAGE:4195338), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006534154 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus translational activator of mitochondrially encoded cytochrome c oxidase I (Taco1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106008203:106073301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_011947 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 (Map3k3), mRNA. // chr11 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000002044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106084613:106155446:1 gene:ENSMUSG00000020700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// AK137127 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430093B06 product:mitogen activated protein kinase kinase kinase 3, full insert sequence. // chr11 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// AK220450 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4031 protein. // chr11 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// BC023781 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:38453 IMAGE:5346982), complete cds. // chr11 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106096972:106154194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0
XM_006534644 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus serine/arginine repetitive matrix protein 1-like (LOC102636513), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000100326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:106160850:106161158:1 gene:ENSMUSG00000075480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK131734 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700041A03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_028074 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 42 (Ddx42), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000021046 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106216926:106249139:1 gene:ENSMUSG00000020705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC043036 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 42, mRNA (cDNA clone MGC:57931 IMAGE:5698965), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106216127:106248166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0
NM_008950 // RefSeq // Mus musculus protease (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 5 (Psmc5), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000021049 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106256154:106263120:1 gene:ENSMUSG00000020708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000133131 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:106256154:106263120:1 gene:ENSMUSG00000020708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC030840 // GenBank // Mus musculus protease (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 5, mRNA (cDNA clone MGC:31044 IMAGE:3994523), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000016421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106256191:106263062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000083228 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:106260206:106260313:1 gene:ENSMUSG00000065162 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT012366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_029467 // RefSeq // Mus musculus testicular cell adhesion molecule 1 (Tcam1), mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006534399 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testicular cell adhesion molecule 1 (Tcam1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000044462 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106276748:106288745:1 gene:ENSMUSG00000020712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000142472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:106276672:106288133:1 gene:ENSMUSG00000020712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AK076581 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921523E13 product:testicular cell adhesion molecule 1, full insert sequence. // chr11 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// BC050746 // GenBank // Mus musculus testicular cell adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:58109 IMAGE:6741794), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106270247:106287029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0
NM_029345 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310007L24 gene (2310007L24Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000009354 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:106365472:106377114:1 gene:ENSMUSG00000009210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106816 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106374826:106377096:1 gene:ENSMUSG00000009210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC116233 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:40091666. // chr11 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006534388 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2310007L24 gene (2310007L24Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000190795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:106374845:106377242:1 gene:ENSMUSG00000009210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000185986 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:106374845:106377348:1 gene:ENSMUSG00000009210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSMUST00000188561 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:106374845:106377157:1 gene:ENSMUSG00000009210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000190268 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:106374845:106377558:1 gene:ENSMUSG00000009210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NR_030703 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 104 (Snord104), small nucleolar RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083192 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:106500993:106501062:1 gene:ENSMUSG00000065126 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166685 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 95 (Cep95), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_177088 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 95 (Cep95), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000018516 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:106789275:106818853:1 gene:ENSMUSG00000018372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000103068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:106789252:106818860:1 gene:ENSMUSG00000018372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC116308 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 45, mRNA (cDNA clone MGC:143937 IMAGE:40095242), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000016422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:106801856:106818725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0
NM_001163473 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810010H24 gene (1810010H24Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006534098 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1810010H24 gene (1810010H24Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006534100 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1810010H24 gene (1810010H24Rik), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006534101 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1810010H24 gene (1810010H24Rik), transcript variant X7, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:107028223:107030443:1 gene:ENSMUSG00000078607 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000140447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107028118:107030438:1 gene:ENSMUSG00000078607 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC124997 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810010H24 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40041562), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC125006 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810010H24 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40049318), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK007422 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810010H24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 36 // 96 // 9 // 25 // 0 /// NONMMUT012417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 36 // 96 // 9 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:107025894:107032302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_025894 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 12 (Psmd12), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000021063 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:107479484:107498173:1 gene:ENSMUSG00000020720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000106750 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:107479577:107497733:1 gene:ENSMUSG00000020720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC004694 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 12, mRNA (cDNA clone MGC:6375 IMAGE:3498952), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000106752 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:107479528:107504362:1 gene:ENSMUSG00000020720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// AK162779 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130042O17 product:proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 12, full insert sequence. // chr11 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// GENSCAN00000054074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:107345667:107497733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_198298 // RefSeq // Mus musculus helicase with zinc finger domain (Helz), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000075012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:107547960:107686943:1 gene:ENSMUSG00000020721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000100305 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107547956:107672287:1 gene:ENSMUSG00000020721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000133862 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107627321:107672287:1 gene:ENSMUSG00000020721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// AB093209 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0054 protein. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC076626 // GenBank // Mus musculus helicase with zinc finger domain, mRNA (cDNA clone MGC:96862 IMAGE:30640711), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000106746 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:107547968:107693826:1 gene:ENSMUSG00000020721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 35 // 36 // 1 /// GENSCAN00000054079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:107561062:107686719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_013475 // RefSeq // Mus musculus apolipoprotein H (Apoh), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000000049 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:108395293:108414396:1 gene:ENSMUSG00000000049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC019811 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein H, mRNA (cDNA clone MGC:30221 IMAGE:5125770), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC053338 // GenBank // Mus musculus apolipoprotein H, mRNA (cDNA clone MGC:58992 IMAGE:5125963), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// D10056 // GenBank // Mus musculus mRNA for beta-2-glycoprotein I, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000152958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:108381169:108407339:1 gene:ENSMUSG00000000049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000010333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:108395344:108414295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000119828 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:108423273:108423758:1 gene:ENSMUSG00000082544 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONMMUT012498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:108418912:108679962:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_015732 // RefSeq // Mus musculus axin2 (Axin2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006532058 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus axin2 (Axin2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006532059 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus axin2 (Axin2), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052915 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:108920349:108950783:1 gene:ENSMUSG00000000142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000106711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:108923181:108949511:1 gene:ENSMUSG00000000142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000139682 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:108943621:108950783:1 gene:ENSMUSG00000000142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// AF073788 // GenBank // Mus musculus conductin mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// AF205889 // GenBank // Mus musculus Axin2 (Axin2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC057338 // GenBank // Mus musculus axin2, mRNA (cDNA clone MGC:66984 IMAGE:6827741), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:108923288:108943133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_010303 // RefSeq // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha 13 (Gna13), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020930 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:109362831:109401369:1 gene:ENSMUSG00000020611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000106702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:109362831:109380475:1 gene:ENSMUSG00000020611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// AK011851 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610200H14 product:guanine nucleotide binding protein, alpha 13, full insert sequence. // chr11 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC057665 // GenBank // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha 13, mRNA (cDNA clone MGC:68178 IMAGE:4918717), complete cds. // chr11 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// M63660 // GenBank // Mouse G-alpha-13 protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006532229 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha 13 (Gna13), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// BC049898 // GenBank HTC // Mus musculus guanine nucleotide binding protein, alpha 13, mRNA (cDNA clone IMAGE:3978425), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr11 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000037518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:109354227:109396486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSMUST00000055404 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:109413917:109420405:1 gene:ENSMUSG00000045065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK036894 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930022D16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166177 // RefSeq // Mus musculus arylsulfatase G (Arsg), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// NM_028710 // RefSeq // Mus musculus arylsulfatase G (Arsg), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006534350 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus arylsulfatase G (Arsg), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000020928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:109473374:109573325:1 gene:ENSMUSG00000020604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000106696 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:109543754:109573330:1 gene:ENSMUSG00000020604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000106697 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:109485606:109573330:1 gene:ENSMUSG00000020604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC039629 // GenBank // Mus musculus arylsulfatase G, mRNA (cDNA clone IMAGE:5042793), complete cds. // chr11 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// BC084731 // GenBank // Mus musculus arylsulfatase G, mRNA (cDNA clone MGC:90567 IMAGE:6813261), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000037514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:109525334:109572493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0
NM_021880 // RefSeq // Mus musculus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type I, alpha (Prkar1a), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:109650921:109669656:1 gene:ENSMUSG00000020612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106677 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:109649405:109669656:1 gene:ENSMUSG00000020612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC003461 // GenBank // Mus musculus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type I, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:6280 IMAGE:2648357), complete cds. // chr11 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC005697 // GenBank // Mus musculus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type I, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:11864 IMAGE:3597765), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// HQ412666 // GenBank // Mus musculus cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit transcript variant 2 (Prkar1a) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr11 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000106676 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:109650575:109661753:1 gene:ENSMUSG00000020612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000037516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:109616341:109667602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_008425 // RefSeq // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 2 (Kcnj2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:111066164:111076821:1 gene:ENSMUSG00000041695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137841 // GenBank // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:169465 IMAGE:8860860), complete cds. // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC137842 // GenBank // Mus musculus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:169466 IMAGE:8860861), complete cds. // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000018893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:111056323:111073070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000121873 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:111276100:111276931:1 gene:ENSMUSG00000082272 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000055186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:111228387:111276931:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_011448 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 9 (Sox9), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000579 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:112782224:112787760:1 gene:ENSMUSG00000000567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF421878 // GenBank // Mus musculus SRY sex determining region Y-box 9 protein (Sox9) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC023796 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 9, mRNA (cDNA clone MGC:38472 IMAGE:5351850), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC023808 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 9, mRNA (cDNA clone MGC:38561 IMAGE:5354229), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC023953 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 9, mRNA (cDNA clone MGC:38112 IMAGE:5320371), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC024958 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 9, mRNA (cDNA clone MGC:37029 IMAGE:4949782), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC034264 // GenBank // Mus musculus SRY-box containing gene 9, mRNA (cDNA clone MGC:18772 IMAGE:4165469), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:112743695:112785510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSMUST00000149136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:112825154:112826210:1 gene:ENSMUSG00000020624 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000153429 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:112825179:112832469:1 gene:ENSMUSG00000020624 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK015526 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930468F18 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AK017060 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933434M16 product:inferred: RIKEN cDNA 4933434M16 gene, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000105048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:113467977:113472014:1 gene:ENSMUSG00000078251 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK082708 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230092H20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONMMUT012627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001042606 // RefSeq // Mus musculus somatostatin receptor 2 (Sstr2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NM_009217 // RefSeq // Mus musculus somatostatin receptor 2 (Sstr2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000067591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:113624257:113625636:1 gene:ENSMUSG00000047904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000106630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:113619476:113625895:1 gene:ENSMUSG00000047904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000146390 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:113619342:113626028:1 gene:ENSMUSG00000047904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000017049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:113624257:113638410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// X68951 // GenBank // M.musculus mRNA for somatostatin receptor. // chr11 // 83 // 67 // 20 // 24 // 0
NM_177777 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 11, Wayne State University 47, expressed (D11Wsu47e), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006533474 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA segment, Chr 11, Wayne State University 47, expressed (D11Wsu47e), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XR_388475 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA segment, Chr 11, Wayne State University 47, expressed (D11Wsu47e), transcript variant X7, misc_RNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000042227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:113684412:113694647:1 gene:ENSMUSG00000041623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:113684447:113694647:1 gene:ENSMUSG00000041623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK139389 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830038I07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC026908 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 11, Wayne State University 47, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:30773 IMAGE:3988907), complete cds. // chr11 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0 /// BC048942 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 11, Wayne State University 47, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:57008 IMAGE:6442008), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:113649498:113692522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XR_389132 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 11691 (Gm11691), ncRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK132953 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930532C19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:114251843:114253127:1 gene:ENSMUSG00000075431 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT012655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053273 // RefSeq // Mus musculus tweety homolog 2 (Drosophila) (Ttyh2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000045779 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:114675431:114720977:1 gene:ENSMUSG00000034714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF329682 // GenBank // Mus musculus tweety homolog 2 (Ttyh2) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// BC060740 // GenBank // Mus musculus tweety homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:67934 IMAGE:4158813), complete cds. // chr11 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:114642832:114719203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_001102615 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 19A (Kif19a), mRNA. // chr11 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_006533507 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kinesin family member 19A (Kif19a), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000084368 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:114765389:114790575:1 gene:ENSMUSG00000010021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSMUST00000126555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:114765388:114786179:1 gene:ENSMUSG00000010021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSMUST00000137326 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:114765388:114786179:1 gene:ENSMUSG00000010021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000138804 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:114765388:114788135:1 gene:ENSMUSG00000010021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC151045 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 19A, mRNA (cDNA clone MGC:183958 IMAGE:9087958), complete cds. // chr11 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC151053 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 19A, mRNA (cDNA clone MGC:183966 IMAGE:9087966), complete cds. // chr11 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// EF570784 // GenBank // Mus musculus strain C57BL KIF19A-like protein mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000042081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:114723871:114790261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_181749 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 142 (Gpr142), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533066 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor 142 (Gpr142), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000045319 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:114798924:114806745:1 gene:ENSMUSG00000034677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000106584 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:114798924:114806745:1 gene:ENSMUSG00000034677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY288428 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 142 (Gpr142) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY957501 // GenBank // Mus musculus orphan G protein-coupled receptor TRHRL1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:114799320:114868675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0
NM_001110337 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C (Gprc5c), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006534161 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C (Gprc5c), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006534163 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C (Gprc5c), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:114851842:114872617:1 gene:ENSMUSG00000051043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC005757 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C, mRNA (cDNA clone IMAGE:3601243). // chr11 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONMMUT012674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_170758 // RefSeq // Mus musculus CD300A antigen (Cd300a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006533069 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD300A antigen (Cd300a), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000045151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:114890041:114904654:1 gene:ENSMUSG00000034652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000106582 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:114890041:114904654:1 gene:ENSMUSG00000034652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB065156 // GenBank // Mus musculus mRNA for MMAC8, complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AB091765 // GenBank // Mus musculus mRNA for MAIR-Ia, complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AB091766 // GenBank // Mus musculus mRNA for MAIR-Ib, complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AY457054 // GenBank // Mus musculus CLM8 mRNA, complete cds. // chr11 // 86 // 70 // 18 // 21 // 0 /// BC139296 // GenBank // Mus musculus CD300A antigen, mRNA (cDNA clone MGC:170923 IMAGE:8862318), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC139297 // GenBank // Mus musculus CD300A antigen, mRNA (cDNA clone MGC:170924 IMAGE:8862319), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AB095675 // GenBank // Mus musculus mcpir1 mRNA for mast cell-derived paired immunoglobulin-like receptor1, complete cds. // chr11 // 71 // 80 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:114890365:114901290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 70 // 18 // 21 // 0
NM_001163753 // RefSeq // Mus musculus RAB37, member RAS oncogene family (Rab37), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NM_021411 // RefSeq // Mus musculus RAB37, member RAS oncogene family (Rab37), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006533857 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB37, member of RAS oncogene family (Rab37), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 92 // 72 // 24 // 26 // 0 /// XR_388502 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB37, member of RAS oncogene family (Rab37), transcript variant X4, misc_RNA. // chr11 // 96 // 67 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000021076 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115154157:115162236:1 gene:ENSMUSG00000020732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000067754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115091431:115162236:1 gene:ENSMUSG00000020732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AB232633 // GenBank // Mus musculus Rab37 mRNA for Rab37, complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AF233582 // GenBank // Mus musculus GTPase Rab37 (Rab37) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC050757 // GenBank // Mus musculus RAB37, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:6588697). // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC128020 // GenBank // Mus musculus RAB37, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:157622 IMAGE:40136290), complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115154199:115180509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1
NM_012030 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 3 regulator 1 (Slc9a3r1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115163341:115181181:1 gene:ENSMUSG00000020733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK188344 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y0G0144N13, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000021077, based on BLAT search. // chr11 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// BC085141 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 3 regulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:95776 IMAGE:6413140), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U74079 // GenBank // Mus musculus protein co-factor mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115154199:115180509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001033393 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 104 (Tmem104), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000061450 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115187487:115247023:1 gene:ENSMUSG00000045980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000100235 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115187487:115247023:1 gene:ENSMUSG00000045980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000135536 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115187511:115197403:1 gene:ENSMUSG00000045980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000156230 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115187551:115245764:1 gene:ENSMUSG00000045980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC140976 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 104, mRNA (cDNA clone MGC:175937 IMAGE:9055588), complete cds. // chr11 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// AK171314 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630330M20 product:hypothetical Amino acid/polyamine transporter II containing protein, full insert sequence. // chr11 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONMMUT012689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000055252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115197287:115244130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_172801 // RefSeq // Mus musculus otopetrin 2 (Otop2), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006533256 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus otopetrin 2 (Otop2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000055490 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115307163:115332303:1 gene:ENSMUSG00000050201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000106544 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115322925:115332303:1 gene:ENSMUSG00000050201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000139466 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115322530:115323511:1 gene:ENSMUSG00000050201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// AB087504 // GenBank // Mus musculus mRNA for hypothetical protein containing ten transmembrane-spanning domain, complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000055226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115323419:115331985:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT012695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0
NM_027132 // RefSeq // Mus musculus otopetrin 3 (Otop3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006534118 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus otopetrin 3 (Otop3), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000019006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:115334734:115346926:1 gene:ENSMUSG00000018862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000106543 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115334731:115346927:1 gene:ENSMUSG00000018862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC145613 // GenBank // Mus musculus otopetrin 3, mRNA (cDNA clone MGC:179187 IMAGE:9054179), complete cds. // chr11 // 88 // 71 // 22 // 25 // 0 /// BC150803 // GenBank // Mus musculus otopetrin 3, mRNA (cDNA clone MGC:183714 IMAGE:9087714), complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115334884:115346445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0
NM_001080929 // RefSeq // Mus musculus cerebellar degeneration-related protein 2-like (Cdr2l), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053288 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115381916:115396132:1 gene:ENSMUSG00000050910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC144823 // GenBank // Mus musculus cerebellar degeneration-related protein 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:178379 IMAGE:9053371), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC150668 // GenBank // Mus musculus cerebellar degeneration-related protein 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:183579 IMAGE:9087579), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115381918:115394237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033775 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933422H20 gene (4933422H20Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000093914 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115440545:115448270:1 gene:ENSMUSG00000070332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC147608 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933422H20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182704 IMAGE:9056598), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC157912 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933422H20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:189942 IMAGE:9088129), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115420168:115448220:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_177778 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 7 (Armc7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035240 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115475667:115490467:1 gene:ENSMUSG00000057219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126533 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115475742:115485286:1 gene:ENSMUSG00000057219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000140181 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115475954:115489062:1 gene:ENSMUSG00000057219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC023126 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:27721 IMAGE:2616092), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533482 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus armadillo repeat containing 7 (Armc7), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSMUST00000136985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115475698:115483777:1 gene:ENSMUSG00000057219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115475937:115489074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001002929 // RefSeq // Mus musculus nucleoporin 85 (Nup85), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// XM_006533670 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin 85 (Nup85), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000021085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115564434:115583985:1 gene:ENSMUSG00000020739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000135893 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115564525:115569891:1 gene:ENSMUSG00000020739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 28 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000138998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115581641:115583906:1 gene:ENSMUSG00000020739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 28 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000140986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115577984:115582039:1 gene:ENSMUSG00000020739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 35 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000144473 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115570115:115581843:1 gene:ENSMUSG00000020739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 33 // 13 // 14 // 0 /// AF498263 // GenBank // Mus musculus frount protein mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0 /// BC079856 // GenBank // Mus musculus nucleoporin 85, mRNA (cDNA clone MGC:105225 IMAGE:6403446), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000055209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115564530:115583822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// U05823 // GenBank // Mus musculus pericentrin mRNA, complete cds. // chr11 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NM_025305 // RefSeq // Mus musculus mitchondrial ribosomal protein S7 (Mrps7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058109 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115603925:115608036:1 gene:ENSMUSG00000046756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141556 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115604867:115607001:1 gene:ENSMUSG00000046756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AK162024 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo female mullerian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6820413L12 product:mitchondrial ribosomal protein S7, full insert sequence. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC049636 // GenBank // Mus musculus mitchondrial ribosomal protein S7, mRNA (cDNA clone MGC:58388 IMAGE:6532964), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// Y10968 // GenBank // M.musculus E800 mRNA. // chr11 // 48 // 84 // 10 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115604161:115607039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000158835 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:115727143:115727277:1 gene:ENSMUSG00000089460 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028014 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310067B10 gene (2310067B10Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006534270 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2310067B10 gene (2310067B10Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006534271 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2310067B10 gene (2310067B10Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000093912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115765433:115799366:1 gene:ENSMUSG00000020747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000103033 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115775756:115799033:1 gene:ENSMUSG00000020747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK047622 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030003A12 product:hypothetical Membrane all-alpha structure containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// BC053088 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310067B10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:62470 IMAGE:5709104), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115782693:115798347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AK122217 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0195 protein. // chr11 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0
NM_001252532 // RefSeq // Mus musculus lethal giant larvae homolog 2 (Drosophila) (Llgl2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_145438 // RefSeq // Mus musculus lethal giant larvae homolog 2 (Drosophila) (Llgl2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_388420 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lethal giant larvae homolog 2 (Drosophila) (Llgl2), transcript variant X8, misc_RNA. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000103032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115824049:115855780:1 gene:ENSMUSG00000020782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000177736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:115824058:115855778:1 gene:ENSMUSG00000020782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY033650 // GenBank // Mus musculus lethal giant larvae-like protein 2 mRNA, complete cds. // chr11 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// BC037226 // GenBank // Mus musculus lethal giant larvae homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:27928 IMAGE:3584689), complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115834828:115855473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000040703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:115880425:115887445:1 gene:ENSMUSG00000034427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000132447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115886807:115892588:1 gene:ENSMUSG00000034427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000167507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:115887601:115892603:1 gene:ENSMUSG00000034427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// AK087906 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330039G21 product:hypothetical Core domain in kinesin and myosin motor/FERM domain profile/FERM containing protein, full insert sequence. // chr11 // 94 // 47 // 17 // 18 // 0 /// AK173262 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1783 protein. // chr11 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// BC051090 // GenBank // Mus musculus myosin XVB, mRNA (cDNA clone IMAGE:6530363), partial cds. // chr11 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000093911 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115861612:115892592:1 gene:ENSMUSG00000034427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// GENSCAN00000055228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115858406:115892354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_183259 // RefSeq // Mus musculus small integral membrane protein 5 (Smim5), mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533942 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small integral membrane protein 5 (Smim5), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000142089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115900178:115905896:1 gene:ENSMUSG00000048442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000152171 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115899966:115906269:1 gene:ENSMUSG00000048442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC032884 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2210020M01 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:1179778), partial cds. // chr11 // 46 // 77 // 11 // 24 // 0 /// ENSMUST00000131566 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:115900202:115905713:1 gene:ENSMUSG00000048442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// NONMMUT012763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr11 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT012764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT012765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr11 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001162998 // RefSeq // Mus musculus small integral membrane protein 6 (Smim6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000132961 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115912017:115913920:1 gene:ENSMUSG00000075420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC038330 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110017F19 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:3328804), partial cds. // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_020483 // RefSeq // Mus musculus SAP30 binding protein (Sap30bp), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006533824 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SAP30 binding protein (Sap30bp), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021101 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115933674:115965535:1 gene:ENSMUSG00000020755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000131737 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115933637:115938408:1 gene:ENSMUSG00000020755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 75 // 39 // 9 // 12 // 0 /// ENSMUST00000140991 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:115933282:115966725:1 gene:ENSMUSG00000020755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000146209 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:115933573:115957439:1 gene:ENSMUSG00000020755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// BC021757 // GenBank // Mus musculus SAP30 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:30549 IMAGE:5065414), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000055237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:115933676:115964392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0
NM_027107 // RefSeq // Mus musculus TEN1 telomerase capping complex subunit (Ten1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000021130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:116198855:116215318:1 gene:ENSMUSG00000020778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027639 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310004N24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41326 IMAGE:1069092), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124663 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116198898:116206850:1 gene:ENSMUSG00000020778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// AK153854 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920026I08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSMUST00000146066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116198959:116215248:1 gene:ENSMUSG00000020778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116204891:116219776:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONMMUT012801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NR_004853 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase 3, pseudogene (Cdk3-ps), non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000173567 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116216540:116220287:1 gene:ENSMUSG00000092300 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116216003:116219776:1 gene:ENSMUSG00000092300 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:polymorphic_pseudogene // chr11 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000174248 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116216486:116217184:1 gene:ENSMUSG00000092300 gene_biotype:polymorphic_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000027241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116204891:116219776:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1
ENSMUST00000154277 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116281486:116283661:1 gene:ENSMUSG00000020793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AF077375 // GenBank // Mus musculus galanin receptor 2 mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// NM_010254 // RefSeq // Mus musculus galanin receptor 2 (Galr2), mRNA. // chr11 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSMUST00000055872 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116280939:116283938:1 gene:ENSMUSG00000020793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// BC116980 // GenBank // Mus musculus galanin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:151357 IMAGE:40126299), complete cds. // chr11 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// BC116982 // GenBank // Mus musculus galanin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:151359 IMAGE:40126301), complete cds. // chr11 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000027209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116281486:116286053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
ENSMUST00000121547 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116382750:116383205:1 gene:ENSMUSG00000081929 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116382968:116383228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT012824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_176902 // RefSeq // Mus musculus UBA-like domain containing 2 (Ubald2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NR_003376 // RefSeq // Mus musculus predicted pseudogene 7367 (Gm7367), non-coding RNA. // chr11 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSMUST00000057611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:60155538:60156170:1 gene:ENSMUSG00000047370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000057676 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116434094:116439077:1 gene:ENSMUSG00000050628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000144310 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116434509:116438223:1 gene:ENSMUSG00000050628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 81 // 44 // 13 // 16 // 0 /// BC116983 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 100, member B, mRNA (cDNA clone MGC:151360 IMAGE:40126302), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC119080 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 100, member B, mRNA (cDNA clone MGC:155396 IMAGE:8733829), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:60155609:60156103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116434045:116438305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_001163318 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11744 (Gm11744), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006531875 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 11744 (Gm11744), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000106381 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:116653855:116668389:1 gene:ENSMUSG00000075410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000116318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:116657108:116668387:1 gene:ENSMUSG00000075410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000178875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:116653534:116668387:1 gene:ENSMUSG00000075410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// DQ390337 // GenBank // Mus musculus progressive rod-cone degeneration (Prcd) mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148484 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116653534:116668092:1 gene:ENSMUSG00000075410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// ENSMUST00000156088 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116657156:116660116:1 gene:ENSMUSG00000075410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONMMUT012841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000027223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116654227:116674994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NR_027821 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810032O08 gene (1810032O08Rik), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000106378 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116671669:116675798:1 gene:ENSMUSG00000020812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NR_027819 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810032O08 gene (1810032O08Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr11 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// ENSMUST00000139934 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116671660:116675798:1 gene:ENSMUSG00000020812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// ENSMUST00000144049 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:116671708:116674587:1 gene:ENSMUSG00000020812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// ENSMUST00000153405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116671696:116672622:1 gene:ENSMUSG00000020812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// ENSMUST00000134818 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116671881:116673974:1 gene:ENSMUSG00000020812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// NONMMUT012843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NR_028569 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 1C (Snord1c), small nucleolar RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083701 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:56263165:56263240:-1 gene:ENSMUSG00000065635 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083706 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:116672506:116672581:1 gene:ENSMUSG00000065640 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000153405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116671696:116672622:1 gene:ENSMUSG00000020812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_028567 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 1B (Snord1b), small nucleolar RNA. // chr11 // 54 // 96 // 13 // 24 // 0 /// ENSMUST00000104416 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:116674148:116674222:1 gene:ENSMUSG00000077604 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 54 // 96 // 13 // 24 // 0 /// ENSMUST00000144049 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:116671708:116674587:1 gene:ENSMUSG00000020812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 96 // 13 // 24 // 0 /// NONMMUT009859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 54 // 96 // 13 // 24 // 0
NR_003364 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC018473 (BC018473), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132056 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116752169:116755842:1 gene:ENSMUSG00000056032 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000145570 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116752349:116755842:1 gene:ENSMUSG00000056032 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147508 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116752963:116755842:1 gene:ENSMUSG00000056032 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000156293 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116752167:116759373:1 gene:ENSMUSG00000056032 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF118273 // GenBank // Mus musculus hitchhiker-2 mRNA, complete sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF118847 // GenBank // Mus musculus Hitchhiker locus mRNA, complete sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC018473 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:2648854. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028865 // RefSeq // Mus musculus methyltransferase like 23 (Mettl23), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006534360 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methyltransferase like 23 (Mettl23), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000106370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116843278:116849740:1 gene:ENSMUSG00000090266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000175930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116843555:116850360:1 gene:ENSMUSG00000090266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK135294 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720460L15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC026936 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110005A03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30958 IMAGE:4021089), complete cds. // chr11 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000027225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116843409:116849555:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_172948 // RefSeq // Mus musculus mannoside acetylglucosaminyltransferase 5, isoenzyme B (Mgat5b), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000103027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:116918863:116986948:1 gene:ENSMUSG00000043857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000126757 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116973073:116986940:1 gene:ENSMUSG00000043857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000136584 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:116966796:116978393:1 gene:ENSMUSG00000043857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 24 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000139905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:116947335:116974307:1 gene:ENSMUSG00000043857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AB116028 // GenBank // Mus musculus mGnTVB mRNA for UDP-N-acetylglucosamine: alpha1,6-D-mannoside beta1,6-N-acetylglucosaminyltransferase b, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// AB119127 // GenBank // Mus musculus GnT-IX mRNA for beta1,6-N-acetylglucosaminyltransferase IX, complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// AK049266 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330018B01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// BC094604 // GenBank // Mus musculus mannoside acetylglucosaminyltransferase 5, isoenzyme B, mRNA (cDNA clone MGC:106427 IMAGE:6822690), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000027235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:116921954:117026917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0
NR_105853 // RefSeq // Mus musculus microRNA mir-6516 (Mir6516), microRNA. // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000145438 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:117076790:117077457:1 gene:ENSMUSG00000086859 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000157904 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:117077243:117077435:1 gene:ENSMUSG00000088529 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000182811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:117076802:117078954:1 gene:ENSMUSG00000086859 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-6516 // miRBase Micro RNA Database // MI0022266 Mus musculus miR-6516 stem-loop // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT012883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT012885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000092394 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:117484368:117489014:1 gene:ENSMUSG00000069588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK047653 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpus striatum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C030004P13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_015489 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2900041M22 gene (2900041M22Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000155384 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:117611247:117613857:1 gene:ENSMUSG00000054418 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK038849 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230068I05 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_198022 // RefSeq // Mus musculus trinucleotide repeat containing 6C (Tnrc6c), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000026658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:117654289:117763437:1 gene:ENSMUSG00000025571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000106344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:117654813:117763439:1 gene:ENSMUSG00000025571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000138299 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:117721018:117762264:1 gene:ENSMUSG00000025571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000141115 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:117654573:117763428:1 gene:ENSMUSG00000025571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK122529 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1582 protein. // chr11 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AK147471 // GenBank HTC // Mus musculus adult male brain UNDEFINED_CELL_LINE cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1049C20 product:Weakly similar to androgen receptor-related apoptosis-associated protein CBL27 (Fragment), full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000002174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:117680402:117760851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0
NM_029964 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 6030468B19 gene (6030468B19Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000106331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:117797660:117807301:1 gene:ENSMUSG00000025573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:117783110:117813475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001012273 // RefSeq // Mus musculus baculoviral IAP repeat-containing 5 (Birc5), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000093906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:117849319:117855743:1 gene:ENSMUSG00000017716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC004702 // GenBank // Mus musculus baculoviral IAP repeat-containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:5790 IMAGE:3499203), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// EU366955 // GenBank // Mus musculus baculoviral IAP repeat-containing 5 transcript variant 1 (Birc5) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// NM_009689 // RefSeq // Mus musculus baculoviral IAP repeat-containing 5 (Birc5), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENSMUST00000081387 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:117849251:117855732:1 gene:ENSMUSG00000017716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AB013819 // GenBank // Mus musculus mRNA for TIAP, complete cds. // chr11 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AF077349 // GenBank // Mus musculus inhibitor of apoptosis homolog mRNA, complete cds. // chr11 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// AK018022 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830459C16 product:baculoviral IAP repeat-containing 5, full insert sequence. // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000002149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:117849351:117855308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT012942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001085535 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 235 (Tmem235), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533756 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 235 (Tmem235), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000093905 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:117860752:117865543:1 gene:ENSMUSG00000070330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:117860752:117864359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
U72673 // GenBank // Mus musculus EF-10 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK084985 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430021L16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001204129 // RefSeq // Mus musculus C1q and tumor necrosis factor related protein 1 (C1qtnf1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_001204130 // RefSeq // Mus musculus C1q and tumor necrosis factor related protein 1 (C1qtnf1), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NM_019959 // RefSeq // Mus musculus C1q and tumor necrosis factor related protein 1 (C1qtnf1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533820 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus C1q and tumor necrosis factor related protein 1 (C1qtnf1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000017590 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:118428499:118449963:1 gene:ENSMUSG00000017446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000106286 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:118433853:118449963:1 gene:ENSMUSG00000017446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF192499 // GenBank // Mus musculus putative secreted protein ZSIG37 (Zsig37) mRNA, complete cds. // chr11 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// BC049894 // GenBank // Mus musculus C1q and tumor necrosis factor related protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:54542 IMAGE:4018549), complete cds. // chr11 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// DQ002394 // GenBank // Mus musculus C1qTNF1 (C1qtnf1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000032839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:118431737:118448351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_001030291 // RefSeq // Mus musculus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 7 (Enpp7), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000092373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:118988188:118992841:1 gene:ENSMUSG00000046697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000106273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:118988216:118992665:1 gene:ENSMUSG00000046697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC141245 // GenBank // Mus musculus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 7, mRNA (cDNA clone MGC:176206 IMAGE:9055857), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC171967 // GenBank // Mus musculus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 7, mRNA (cDNA clone MGC:198672 IMAGE:9054253), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:118988217:119008270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_007623 // RefSeq // Mus musculus chromobox 2 (Cbx2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006532103 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chromobox 2 (Cbx2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000026662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:119022962:119031270:1 gene:ENSMUSG00000025577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141647 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030003P20 product:chromobox homolog 2 (Drosophila Pc class), full insert sequence. // chr11 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC035199 // GenBank // Mus musculus chromobox homolog 2 (Drosophila Pc class), mRNA (cDNA clone MGC:30255 IMAGE:5137505), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X62537 // GenBank // M.musculus mRNA for modifier 3 (M33). // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119023109:119029170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
NM_175430 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 40 (Ccdc40), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035935 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:119228572:119265212:1 gene:ENSMUSG00000039963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053440 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:119229129:119262900:1 gene:ENSMUSG00000039963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK054172 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230024N14 product:similar to KIAA1640 PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// BC085159 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 40, mRNA (cDNA clone MGC:109697 IMAGE:30533905), complete cds. // chr11 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119229134:119285414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_178743 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 26, member 11 (Slc26a11), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000050880 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:119355557:119381079:1 gene:ENSMUSG00000039908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000151612 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119362649:119381049:1 gene:ENSMUSG00000039908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// AF345196 // GenBank // Mus musculus anion exchanger (Slc26a11) mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// AK078545 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo female mullerian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6820446C02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC095937 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 26, member 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:3982413). // chr11 // 81 // 72 // 21 // 26 // 0 /// BC132493 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 26, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:164124 IMAGE:40130770), complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC137897 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 26, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:169521 IMAGE:8860916), complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119356851:119380288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000093902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487415:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 29 // 30 // 1 /// ENSMUST00000131035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487418:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 29 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119387793:119507427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 29 // 30 // 1
ENSMUST00000093902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487415:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000131035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487418:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000016661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119387793:119507427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0
ENSMUST00000093902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487415:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000131035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487418:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119387793:119507427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000093902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487415:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487418:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119387793:119507427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSMUST00000093902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487415:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487418:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119387793:119507427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000093902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487415:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487418:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119387793:119507427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
ENSMUST00000093902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487415:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000131035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487418:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000172235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:119478057:119487417:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 55 // 25 // 27 // 0 /// AK173199 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1554 protein. // chr11 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// BC038025 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 213, mRNA (cDNA clone IMAGE:3966957), partial cds. // chr11 // 77 // 63 // 24 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:119387793:119507427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 90 // 44 // 49 // 1
ENSMUST00000093902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487415:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:119393100:119487418:1 gene:ENSMUSG00000070327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK173199 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1554 protein. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000140273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120150562:120152341:1 gene:ENSMUSG00000085636 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_393741 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102640588 (LOC102640588), ncRNA. // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// AK085311 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630010A13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
XR_389233 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9734 (Gm9734), misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK038227 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130088E03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198423 // RefSeq // Mus musculus BAH domain and coiled-coil containing 1 (Bahcc1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000044985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:120232947:120292296:1 gene:ENSMUSG00000039741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000118987 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:120236699:120292282:1 gene:ENSMUSG00000039741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000122148 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:120232947:120292282:1 gene:ENSMUSG00000039741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AB257855 // GenBank // Mus musculus KIAA1447 mRNA for KIAA1447, complete cds. // chr11 // 91 // 100 // 41 // 45 // 0 /// BC060615 // GenBank // Mus musculus BAH domain and coiled-coil containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6417635), complete cds. // chr11 // 100 // 49 // 22 // 22 // 0 /// BC072602 // GenBank // Mus musculus BAH domain and coiled-coil containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:99902 IMAGE:6830770), complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000050554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120266115:120289883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0
NR_038126 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 0610009L18 gene (0610009L18Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000143813 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120348678:120351190:1 gene:ENSMUSG00000043644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_172802 // RefSeq // Mus musculus fascin homolog 2, actin-bundling protein, retinal (Strongylocentrotus purpuratus) (Fscn2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026445 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120361534:120368168:1 gene:ENSMUSG00000025380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152556 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120366542:120367948:1 gene:ENSMUSG00000025380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC109356 // GenBank // Mus musculus fascin homolog 2, actin-bundling protein, retinal (Strongylocentrotus purpuratus), mRNA (cDNA clone MGC:130378 IMAGE:40057445), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC109357 // GenBank // Mus musculus fascin homolog 2, actin-bundling protein, retinal (Strongylocentrotus purpuratus), mRNA (cDNA clone MGC:130379 IMAGE:40057447), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130476 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120366713:120367820:1 gene:ENSMUSG00000025380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000050552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120361709:120368109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT013079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
AK086627 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930042J21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145363 // RefSeq // Mus musculus tetraspanin 10 (Tspan10), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000044105 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120442644:120446950:1 gene:ENSMUSG00000039691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000143192 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120442671:120444305:1 gene:ENSMUSG00000039691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// AK148155 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370036E16 product:oculospanin, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC019991 // GenBank // Mus musculus tetraspanin 10, mRNA (cDNA clone MGC:28508 IMAGE:4189407), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT013084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_152807 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 137 (Ccdc137), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000058370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120458115:120464358:1 gene:ENSMUSG00000049957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000140308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120458138:120458845:1 gene:ENSMUSG00000049957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000175970 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:120458142:120460111:1 gene:ENSMUSG00000049957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000176120 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:120458147:120462416:1 gene:ENSMUSG00000049957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// BC026662 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 137, mRNA (cDNA clone MGC:37602 IMAGE:4989084), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000150400 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:120458126:120459369:1 gene:ENSMUSG00000049957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// GENSCAN00000050541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120458145:120462483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0
NM_027204 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L12 (Mrpl12), mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000043627 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120484613:120489065:1 gene:ENSMUSG00000039640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC005712 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L12, mRNA (cDNA clone MGC:11632 IMAGE:3582724), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// BC019565 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L12, mRNA (cDNA clone MGC:28615 IMAGE:4219731), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000137619 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120485027:120488457:1 gene:ENSMUSG00000039640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// GENSCAN00000050550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120468975:120488434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NM_013770 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, dicarboxylate transporter), member 10 (Slc25a10), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000026899 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120491840:120499187:1 gene:ENSMUSG00000025792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000123373 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120491915:120496916:1 gene:ENSMUSG00000025792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000144706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120491888:120498593:1 gene:ENSMUSG00000025792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AF188712 // GenBank // Mus musculus mitochondrial dicarboxylate carrier mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr11 // 92 // 95 // 33 // 36 // 0 /// BC003222 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, dicarboxylate transporter), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:7207 IMAGE:3482316), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000127349 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120491909:120495913:1 gene:ENSMUSG00000025792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// ENSMUST00000138874 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120496099:120497963:1 gene:ENSMUSG00000025792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// GENSCAN00000050523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120491987:120498175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT013097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1
NM_001038230 // RefSeq // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 11 (Anapc11), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000093140 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120598532:120605776:1 gene:ENSMUSG00000025135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC023039 // GenBank // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 11, mRNA (cDNA clone MGC:35764 IMAGE:5356010), complete cds. // chr11 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NM_025389 // RefSeq // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 11 (Anapc11), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000026128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120598421:120608198:1 gene:ENSMUSG00000025135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSMUST00000148114 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120598440:120600688:1 gene:ENSMUSG00000025135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// AK158224 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930043L12 product:anaphase promoting complex subunit 11 homolog (yeast), full insert sequence. // chr11 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000050525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120599260:120605426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT013113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_153288 // RefSeq // Mus musculus neuropeptide B (Npb), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000061309 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120608505:120609033:1 gene:ENSMUSG00000044034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000106194 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120608477:120609093:1 gene:ENSMUSG00000044034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000106195 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120608477:120609093:1 gene:ENSMUSG00000044034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB085945 // GenBank // Mus musculus NPB mRNA for preproneuropeptide B, complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC134361 // GenBank // Mus musculus neuropeptide B, mRNA (cDNA clone MGC:157489 IMAGE:40134626), complete cds. // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000050517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120608509:120608943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000151998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120659157:120661815:1 gene:ENSMUSG00000053613 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK028718 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732444A12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK144387 // GenBank HTC // Mus musculus 21 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630051C23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT013132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133223 // RefSeq // Mus musculus RAS-related C3 botulinum substrate 3 (Rac3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000018156 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:120721470:120723969:1 gene:ENSMUSG00000018012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142229 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120721573:120723606:1 gene:ENSMUSG00000018012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AB040819 // GenBank // Mus musculus mRNA for Rac3, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025842 // GenBank // Mus musculus RAS-related C3 botulinum substrate 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5149761), partial cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC117028 // GenBank // Mus musculus RAS-related C3 botulinum substrate 3, mRNA (cDNA clone MGC:151405 IMAGE:40126347), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC119041 // GenBank // Mus musculus RAS-related C3 botulinum substrate 3, mRNA (cDNA clone MGC:155357 IMAGE:8733790), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000134322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:120722014:120723565:1 gene:ENSMUSG00000018012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000050533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:120673069:120723609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_028602 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 19.1 (Tex19.1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000039088 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121146143:121148319:1 gene:ENSMUSG00000039329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF285590 // GenBank // Mus musculus testis protein TEX19 (Tex19) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC053492 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 19.1, mRNA (cDNA clone MGC:60419 IMAGE:30024269), complete cds. // chr11 // 89 // 86 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121146818:121161469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_145440 // RefSeq // Mus musculus urotensin 2 receptor (Uts2r), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000039044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121160271:121161973:1 gene:ENSMUSG00000039321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF441863 // GenBank // Mus musculus urotensin II receptor mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY065981 // GenBank // Mus musculus UT receptor mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC125312 // GenBank // Mus musculus urotensin 2 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:159015 IMAGE:40129827), complete cds. // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC125318 // GenBank // Mus musculus urotensin 2 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:159021 IMAGE:40129833), complete cds. // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121146818:121161469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_026272 // RefSeq // Mus musculus nuclear prelamin A recognition factor (Narf), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000103015 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121237253:121255856:1 gene:ENSMUSG00000000056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000154047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:121244538:121245448:1 gene:ENSMUSG00000000056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// BC016090 // GenBank // Mus musculus nuclear prelamin A recognition factor, mRNA (cDNA clone MGC:27610 IMAGE:4503713), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121236260:121252922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0
NM_001080932 // RefSeq // Mus musculus forkhead box K2 (Foxk2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000106113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121259990:121309896:1 gene:ENSMUSG00000039275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// EU882160 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 interleukin enhancer binding factor 1 (Foxk2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121260131:121306964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_181420 // RefSeq // Mus musculus fructosamine 3 kinase related protein (Fn3krp), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533275 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fructosamine 3 kinase related protein (Fn3krp), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000038096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121421401:121431288:1 gene:ENSMUSG00000039253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK078838 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030012M21 product:HYPOTHETICAL FRUCTOSAMINE KINASE-LIKE PROTEIN FLJ12171/DKFZP564D202 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AY360466 // GenBank // Mus musculus fructosamine-3-kinase-related protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC032265 // GenBank // Mus musculus fructosamine 3 kinase related protein, mRNA (cDNA clone MGC:40640 IMAGE:4015688), complete cds. // chr11 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121407956:121433052:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_144797 // RefSeq // Mus musculus meteorin, glial cell differentiation regulator-like (Metrnl), mRNA. // chr11 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121702411:121716306:1 gene:ENSMUSG00000039208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000125580 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:121702763:121715829:1 gene:ENSMUSG00000039208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// AK171200 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630307M24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// BC019776 // GenBank // Mus musculus meteorin, glial cell differentiation regulator-like, mRNA (cDNA clone MGC:25696 IMAGE:3672224), complete cds. // chr11 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// BC024445 // GenBank // Mus musculus meteorin, glial cell differentiation regulator-like, mRNA (cDNA clone MGC:37284 IMAGE:4974030), complete cds. // chr11 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// BC026646 // GenBank // Mus musculus meteorin, glial cell differentiation regulator-like, mRNA (cDNA clone MGC:37553 IMAGE:4987595), complete cds. // chr11 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// BC024497 // GenBank // Mus musculus meteorin, glial cell differentiation regulator-like, mRNA (cDNA clone MGC:37440 IMAGE:4982563), complete cds. // chr11 // 76 // 76 // 28 // 37 // 1 /// ENSMUST00000106089 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:121701544:121716286:1 gene:ENSMUSG00000039208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1 /// GENSCAN00000052357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121702626:121716056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0
NM_029049 // RefSeq // Mus musculus patched domain containing 3 (Ptchd3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006534383 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus patched domain containing 3 (Ptchd3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000036690 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:121830247:121843423:1 gene:ENSMUSG00000039198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000125199 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:121830247:121836788:1 gene:ENSMUSG00000039198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AB235902 // GenBank // Mus musculus mRNA for RNDEu-3, complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK017136 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933440L20 product:hypothetical Sterol-sensing domain (SSD) profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC145091 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:178647 IMAGE:9053639, complete cds. // chr11 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// BC171943 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:198648 IMAGE:9054229, complete cds. // chr11 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// XM_006534384 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus patched domain containing 3 (Ptchd3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000052371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:121830303:121849389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000155332 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:3305426:3331178:-1 gene:ENSMUSG00000053263 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK029003 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732480K10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT008260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000117640 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:3625477:3625848:-1 gene:ENSMUSG00000084211 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:3625477:3625911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT008300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AK133410 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933416E08 product:hypothetical Proline-rich region profile/Alanine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000157625 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:3656663:3656791:-1 gene:ENSMUSG00000088250 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026150 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4921536K21 gene (4921536K21Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020712 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:3886088:3895098:-1 gene:ENSMUSG00000020434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK162162 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420443A10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 82 // 68 // 14 // 17 // 0 /// BC048445 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921536K21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58156 IMAGE:6704927), complete cds. // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000032894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:3888160:3895087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_153142 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member E4 (Slc35e4), mRNA. // chr11 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000051207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:3907022:3914664:-1 gene:ENSMUSG00000048807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000109995 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:3907021:3914664:-1 gene:ENSMUSG00000048807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// BC020181 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member E4, mRNA (cDNA clone MGC:28785 IMAGE:4488513), complete cds. // chr11 // 94 // 53 // 17 // 18 // 0 /// BC095957 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member E4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5337293), complete cds. // chr11 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000032884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:3907551:3931456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
ENSMUST00000042344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:3937541:3976778:-1 gene:ENSMUSG00000034493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK016148 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930556J24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026443 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial fission process 1 (Mtfp1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000004868 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4091480:4095445:-1 gene:ENSMUSG00000004748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058737 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700020C11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:68085 IMAGE:5400435), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4092227:4095282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_144520 // RefSeq // Mus musculus SEC14-like 2 (S. cerevisiae) (Sec14l2), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000003681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4097039:4118831:-1 gene:ENSMUSG00000003585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000123901 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4097775:4118696:-1 gene:ENSMUSG00000003585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000132421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4097775:4109261:-1 gene:ENSMUSG00000003585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// BC005759 // GenBank // Mus musculus SEC14-like 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:6302 IMAGE:2655022), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000133631 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4103440:4109011:-1 gene:ENSMUSG00000003585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// GENSCAN00000029097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4098305:4118678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0
ENSMUST00000119525 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4230754:4231265:-1 gene:ENSMUSG00000084012 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027798 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11961 (Gm11961), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4620275:4627766:-1 gene:ENSMUSG00000056288 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_027797 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 11961 (Gm11961), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENSMUST00000141157 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4625376:4630011:-1 gene:ENSMUSG00000056288 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONMMUT008360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_197979 // RefSeq // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit X (Uqcr10), mRNA. // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// XM_006514778 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit X (Uqcr10), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000058407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4701973:4704342:-1 gene:ENSMUSG00000059534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000130236 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4701982:4704053:-1 gene:ENSMUSG00000059534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000151559 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:4701975:4704334:-1 gene:ENSMUSG00000059534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC024518 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110020P15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:37480 IMAGE:4984172), complete cds. // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC087874 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110020P15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107134 IMAGE:6545811), complete cds. // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC100591 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110020P15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118702 IMAGE:30119194), complete cds. // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT008364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT008365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4685276:4704306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_138948 // RefSeq // Mus musculus calcium binding protein 7 (Cabp7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000009219 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4736892:4746778:-1 gene:ENSMUSG00000009075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF419324 // GenBank // Mus musculus calcium-binding protein CaBP7 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC104356 // GenBank // Mus musculus calcium binding protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:129428 IMAGE:40049623), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC104357 // GenBank // Mus musculus calcium binding protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:129429 IMAGE:40049625), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4738821:4746727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_010904 // RefSeq // Mus musculus neurofilament, heavy polypeptide (Nefh), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000093369 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:4938754:4948064:-1 gene:ENSMUSG00000020396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// M35131 // GenBank // Mouse neurofilament component (NF-H) mRNA, complete cds. // chr11 // 86 // 100 // 30 // 35 // 0 /// GENSCAN00000029093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:4938834:4947934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0
AK149253 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930001P06 product:hypothetical Bipartite nuclear localization signal containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001283061 // RefSeq // Mus musculus Ewing sarcoma breakpoint region 1 (Ewsr1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// NM_001283062 // RefSeq // Mus musculus Ewing sarcoma breakpoint region 1 (Ewsr1), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// NM_007968 // RefSeq // Mus musculus Ewing sarcoma breakpoint region 1 (Ewsr1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000073308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5069698:5099067:-1 gene:ENSMUSG00000009079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000079949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5069689:5099266:-1 gene:ENSMUSG00000009079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000102930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5069897:5099042:-1 gene:ENSMUSG00000009079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 81 // 12 // 13 // 0 /// BC068226 // GenBank // Mus musculus Ewing sarcoma breakpoint region 1, mRNA (cDNA clone MGC:61279 IMAGE:5707017), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000043650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5070283:5104247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_032396 // RefSeq // Mus musculus kringle containing transmembrane protein 1 (Kremen1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000020662 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5191552:5261558:-1 gene:ENSMUSG00000020393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AB059617 // GenBank // Mus musculus kremen mRNA for kringle-containing transmembrane protein, complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC082546 // GenBank // Mus musculus kringle containing transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:100041 IMAGE:6855459), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC138464 // GenBank // Mus musculus kringle containing transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170089 IMAGE:8861484), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC138465 // GenBank // Mus musculus kringle containing transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:170090 IMAGE:8861485), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006514913 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kringle containing transmembrane protein 1 (Kremen1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000043644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5187517:5261525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NM_001080924 // RefSeq // Mus musculus zinc and ring finger 3 (Znrf3), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001290501 // RefSeq // Mus musculus zinc and ring finger 3 (Znrf3), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000109867 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5276324:5444847:-1 gene:ENSMUSG00000041961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000172492 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5278602:5381740:-1 gene:ENSMUSG00000041961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC151080 // GenBank // Mus musculus zinc and ring finger 3, mRNA (cDNA clone MGC:183993 IMAGE:9087993), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC151083 // GenBank // Mus musculus zinc and ring finger 3, mRNA (cDNA clone MGC:183996 IMAGE:9087996), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000143746 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5288797:5444847:-1 gene:ENSMUSG00000041961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// AK163639 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B730033I21 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000043606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5276854:5346792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000145746 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5495192:5495446:-1 gene:ENSMUSG00000085232 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5444073:5495446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_134033 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 117 (Ccdc117), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000020776 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5528887:5542187:-1 gene:ENSMUSG00000020482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC034558 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 117, mRNA (cDNA clone MGC:30640 IMAGE:3676182), complete cds. // chr11 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// BC059888 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 117, mRNA (cDNA clone MGC:69810 IMAGE:6816177), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5529985:5542058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_018870 // RefSeq // Mus musculus phosphoglycerate mutase 2 (Pgam2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020768 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5801640:5803733:-1 gene:ENSMUSG00000020475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF029843 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate mutase muscle-specific subunit mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC010750 // GenBank // Mus musculus phosphoglycerate mutase 2, mRNA (cDNA clone MGC:18358 IMAGE:4235174), complete cds. // chr11 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5801673:5803688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_017401 // RefSeq // Mus musculus polymerase (DNA directed), mu (Polm), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006514758 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (DNA directed), mu (Polm), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000020767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:5827861:5838016:-1 gene:ENSMUSG00000020474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000109837 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5827860:5837789:-1 gene:ENSMUSG00000020474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF176098 // GenBank // Mus musculus DNA polymerase mu (Pol mu) mRNA, complete cds. // chr11 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// BC056213 // GenBank // Mus musculus polymerase (DNA directed), mu, mRNA (cDNA clone MGC:60514 IMAGE:30024844), complete cds. // chr11 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// XM_006514759 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (DNA directed), mu (Polm), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// ENSMUST00000143478 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5829215:5830200:-1 gene:ENSMUSG00000020474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// AK137747 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A030008F06 product:polymerase (DNA directed), mu, full insert sequence. // chr11 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000043638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5817081:5852503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT008454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_008894 // RefSeq // Mus musculus polymerase (DNA directed), delta 2, regulatory subunit (Pold2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006514587 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (DNA directed), delta 2, regulatory subunit (Pold2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000102922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5872180:5878292:-1 gene:ENSMUSG00000020471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000136714 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5874117:5876764:-1 gene:ENSMUSG00000020471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000141907 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5872188:5873191:-1 gene:ENSMUSG00000020471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000153995 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5874080:5877662:-1 gene:ENSMUSG00000020471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// BC003342 // GenBank // Mus musculus polymerase (DNA directed), delta 2, regulatory subunit, mRNA (cDNA clone MGC:5849 IMAGE:3257610), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5872258:5878279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_022879 // RefSeq // Mus musculus myosin, light polypeptide 7, regulatory (Myl7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102921 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5896637:5898782:-1 gene:ENSMUSG00000020469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061100 // GenBank // Mus musculus myosin, light polypeptide 7, regulatory, mRNA (cDNA clone MGC:74218 IMAGE:30300846), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5896680:5898763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
NM_001287386 // RefSeq // Mus musculus glucokinase (Gck), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_010292 // RefSeq // Mus musculus glucokinase (Gck), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000102920 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:5900823:5950081:-1 gene:ENSMUSG00000041798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000109822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5900820:5915124:-1 gene:ENSMUSG00000041798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000109823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:5900820:5915124:-1 gene:ENSMUSG00000041798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK142698 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830011E21 product:glucokinase, full insert sequence. // chr11 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// BC011139 // GenBank // Mus musculus glucokinase, mRNA (cDNA clone MGC:18414 IMAGE:4195943), complete cds. // chr11 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// L38990 // GenBank // Mus musculus glucokinase mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// XR_380955 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucokinase (Gck), transcript variant X4, misc_RNA. // chr11 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// GENSCAN00000043608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:5901670:5916504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NM_207242 // RefSeq // Mus musculus NPC1-like 1 (Npc1l1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006514693 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NPC1-like 1 (Npc1l1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000004505 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:6211013:6230143:-1 gene:ENSMUSG00000020447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AY437866 // GenBank // Mus musculus Niemann-Pick C1-like 1 (Npc1l1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC131789 // GenBank // Mus musculus NPC1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:156379 IMAGE:40086103), complete cds. // chr11 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:6185895:6230123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0
NM_026538 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56 (Ddx56), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006514745 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56 (Ddx56), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XR_380973 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56 (Ddx56), transcript variant X4, misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000004507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:6258919:6267772:-1 gene:ENSMUSG00000004393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000151446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6265637:6267772:-1 gene:ENSMUSG00000004393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AK077953 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030460H22 product:PROBABLE ATP-DEPENDENT 61 KDA NUCLEOLAR RNA HELICASE homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC018291 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56, mRNA (cDNA clone MGC:19051 IMAGE:4190167), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:6259181:6267719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK171962 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830022D23 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONMMUT008476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_134020 // RefSeq // Mus musculus transmembrane emp24 protein transport domain containing 4 (Tmed4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000004508 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:6270369:6274870:-1 gene:ENSMUSG00000004394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000130621 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6271661:6274870:-1 gene:ENSMUSG00000004394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000132147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6273741:6274865:-1 gene:ENSMUSG00000004394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AF368921 // GenBank // Mus musculus P26 protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC023041 // GenBank // Mus musculus transmembrane emp24 protein transport domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:38818 IMAGE:5360236), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:6271651:6274833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_029938 // RefSeq // Mus musculus H2A histone family, member V (H2afv), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093346 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6428138:6444352:-1 gene:ENSMUSG00000041126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000109737 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:6427229:6444443:-1 gene:ENSMUSG00000041126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028539 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member V, mRNA (cDNA clone IMAGE:3369668), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC147293 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member V, mRNA (cDNA clone MGC:182459 IMAGE:9056353), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC147294 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member V, mRNA (cDNA clone MGC:182450 IMAGE:9056344), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC147741 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member V, mRNA (cDNA clone MGC:182796 IMAGE:9056690), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC147751 // GenBank // Mus musculus H2A histone family, member V, mRNA (cDNA clone MGC:182806 IMAGE:9056700), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_011221 // RefSeq // Mus musculus purine rich element binding protein B (Purb), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:6467599:6475917:-1 gene:ENSMUSG00000094483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090992 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30503480. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT008492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011221 // RefSeq // Mus musculus purine rich element binding protein B (Purb), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179343 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:6467599:6475917:-1 gene:ENSMUSG00000094483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF017630 // GenBank // Mus musculus vascular actin single-stranded DNA-binding factor 2 p44 component (PurB beta) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:6474912:6475886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178440 // RefSeq // Mus musculus myosin IG (Myo1g), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006514700 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myosin IG (Myo1g), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000003459 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:6506548:6520958:-1 gene:ENSMUSG00000020437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000144725 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6506674:6520897:-1 gene:ENSMUSG00000020437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// BC113755 // GenBank // Mus musculus myosin IG, mRNA (cDNA clone MGC:132921 IMAGE:40061202), complete cds. // chr11 // 98 // 94 // 43 // 44 // 0 /// BC113954 // GenBank // Mus musculus myosin IG, mRNA (cDNA clone MGC:132920 IMAGE:40061200), complete cds. // chr11 // 93 // 94 // 41 // 44 // 0 /// ENSMUST00000156878 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6512964:6520958:-1 gene:ENSMUSG00000020437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 55 // 55 // 26 // 47 // 1 /// AK169450 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630019C21 product:myosin IG, full insert sequence. // chr11 // 55 // 55 // 26 // 47 // 1 /// GENSCAN00000011735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:6506676:6563706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0
ENSMUST00000082579 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:6528033:6528165:-1 gene:ENSMUSG00000064513 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000134527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6527899:6528746:-1 gene:ENSMUSG00000085156 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AK032971 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720482N18 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// linc1257_2 // lncRNA Db // AK032971 (mouse) mm9 chr11:6,424,545-6,428,747 // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT008501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT008506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT008507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000158063 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:6546147:6546235:-1 gene:ENSMUSG00000088688 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081652 // RefSeq // Mus musculus NAC alpha domain containing (Nacad), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000045713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:6597823:6606053:-1 gene:ENSMUSG00000041073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000177050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6597892:6599392:-1 gene:ENSMUSG00000041073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000177391 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6597903:6599938:-1 gene:ENSMUSG00000041073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// GENSCAN00000011751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:6597895:6605748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082561 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:6619808:6619940:-1 gene:ENSMUSG00000064495 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT008518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000083752 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:6620319:6620454:-1 gene:ENSMUSG00000065686 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083816 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:6:70855444:70855579:1 gene:ENSMUSG00000065750 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132446 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6619586:6620445:-1 gene:ENSMUSG00000000384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT008517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT008519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT008520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT057357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011709 // RefSeq // Mus musculus whey acidic protein (Wap), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006514668 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus whey acidic protein (Wap), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000102910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:6635482:6638637:-1 gene:ENSMUSG00000000381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000127341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6635539:6637455:-1 gene:ENSMUSG00000000381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000141868 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6635482:6637466:-1 gene:ENSMUSG00000000381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AK142655 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730035E13 product:whey acidic protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC132280 // GenBank // Mus musculus whey acidic protein, mRNA (cDNA clone MGC:163911 IMAGE:40130557), complete cds. // chr11 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// BC132282 // GenBank // Mus musculus whey acidic protein, mRNA (cDNA clone MGC:163913 IMAGE:40130559), complete cds. // chr11 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// BC069895 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:2865655, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT008522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:6616613:6638622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
ENSMUST00000118511 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6781678:6783138:-1 gene:ENSMUSG00000083819 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// GENSCAN00000011741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:6781678:6783138:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
ENSMUST00000119629 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:6785838:6786580:-1 gene:ENSMUSG00000082579 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_008343 // RefSeq // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 3 (Igfbp3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000020702 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:7206086:7213897:-1 gene:ENSMUSG00000020427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058261 // GenBank // Mus musculus insulin-like growth factor binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:65287 IMAGE:6487655), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// X81581 // GenBank // M.musculus mRNA for insulin-like growth factor binding protein-3. // chr11 // 84 // 73 // 16 // 19 // 0 /// ENSMUST00000135887 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:7207686:7213923:-1 gene:ENSMUSG00000020427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000016159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:7205265:7213790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000157263 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:7886444:7886505:-1 gene:ENSMUSG00000098853 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001083587 // RefSeq // Mus musculus tensin 3 (Tns3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006514735 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tensin 3 (Tns3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006514737 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tensin 3 (Tns3), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006514740 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tensin 3 (Tns3), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006514742 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tensin 3 (Tns3), transcript variant X8, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000020695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:8431652:8664535:-1 gene:ENSMUSG00000020422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK089717 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830010I22 product:weakly similar to CDNA FLJ10923 FIS, CLONE OVARC1000437, MODERATELY SIMILAR TO TENSIN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 94 // 53 // 16 // 17 // 0 /// AK158101 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930028O08 product:Thyroid specific PTB domain protein homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000056434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:8434494:8488282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:8491980:8624494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
XM_006542939 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polycystic kidney disease 1 like 1 (Pkd1l1), mRNA. // chr11 // 97 // 71 // 38 // 39 // 0 /// ENSMUST00000154153 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:8826708:8973266:-1 gene:ENSMUSG00000046634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 49 // 49 // 0 /// ENSMUST00000178195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:8826775:8950539:-1 gene:ENSMUSG00000046634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 42 // 42 // 0 /// AB061684 // GenBank // Mus musculus Pkd1l1 mRNA for polycystin-1L1, partial cds. // chr11 // 85 // 24 // 11 // 13 // 0 /// AK140049 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230111E12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 18 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000056433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:8825745:8931691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:8933640:9040324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 31 // 31 // 17 // 55 // 1
NM_001290519 // RefSeq // Mus musculus Sad1 and UNC84 domain containing 3 (Sun3), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NM_001290520 // RefSeq // Mus musculus Sad1 and UNC84 domain containing 3 (Sun3), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NM_177576 // RefSeq // Mus musculus Sad1 and UNC84 domain containing 3 (Sun3), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006514597 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Sad1 and UNC84 domain containing 3 (Sun3), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000043377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:9016054:9039589:-1 gene:ENSMUSG00000040985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102909 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:9016054:9048991:-1 gene:ENSMUSG00000040985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AK132922 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930517I12 product:hypothetical Galactose-binding like containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC109334 // GenBank // Mus musculus Sad1 and UNC84 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:130135 IMAGE:40051782), complete cds. // chr11 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0 /// HQ141857 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J Sad1 and UNC84 domain-containing protein 3 (Sun3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// XM_006514598 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Sad1 and UNC84 domain containing 3 (Sun3), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// GENSCAN00000053402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:8933640:9040324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001185153 // RefSeq // Mus musculus zona pellucida binding protein (Zpbp), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_015785 // RefSeq // Mus musculus zona pellucida binding protein (Zpbp), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006514755 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zona pellucida binding protein (Zpbp), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000020413 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:11279626:11462408:-1 gene:ENSMUSG00000020193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK029541 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921520L14 product:zona pellucida binding protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC139450 // GenBank // Mus musculus zona pellucida binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:171077 IMAGE:8862472), complete cds. // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC139453 // GenBank // Mus musculus zona pellucida binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:171080 IMAGE:8862475), complete cds. // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC145628 // GenBank // Mus musculus zona pellucida binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:179204 IMAGE:9054196), complete cds. // chr11 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// D17569 // GenBank // Mus musculus mRNA for zona-pellucida-binding protein (sp38), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XR_380974 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zona pellucida binding protein (Zpbp), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
ENSMUST00000082832 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:11427385:11427512:-1 gene:ENSMUSG00000064766 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006542938 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102631730 (LOC102631730), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_393804 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102631730 (LOC102631730), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000081896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:11589223:11627824:-1 gene:ENSMUSG00000062511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149910 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:11623711:11627835:-1 gene:ENSMUSG00000062511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// AK015778 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930512M02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK131682 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700007I02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT008587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000132007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:11695133:11696439:-1 gene:ENSMUSG00000073145 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK136731 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230108O11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT008589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000157365 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:11913621:11913748:-1 gene:ENSMUSG00000087990 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT008605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000082868 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:12054148:12054303:-1 gene:ENSMUSG00000064802 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000052877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:16634962:16636140:-1 gene:ENSMUSG00000048149 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000118481 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:16635109:16636066:-1 gene:ENSMUSG00000101316 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene gene:ENSMUSG00000048149 // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000118306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:16643009:16643921:-1 gene:ENSMUSG00000081332 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000054509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:16643096:16670389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 89 // 16 // 17 // 0
ENSMUST00000102382 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:16645438:16645538:-1 gene:ENSMUSG00000076337 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019549 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin (Plek), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000020321 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:16971464:17052381:-1 gene:ENSMUSG00000020120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102881 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:16971206:17008702:-1 gene:ENSMUSG00000020120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AF073294 // GenBank // Mus musculus pleckstrin mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AF181829 // GenBank // Mus musculus pleckstrin (Plek) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF303745 // GenBank // Mus musculus pleckstrin 1 small isoform mRNA, complete cds. // chr11 // 86 // 72 // 18 // 21 // 0 /// AK038804 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230064M01 product:pleckstrin, full insert sequence. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC066185 // GenBank // Mus musculus pleckstrin, mRNA (cDNA clone MGC:76636 IMAGE:30433827), complete cds. // chr11 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// GENSCAN00000053806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:16964707:16998617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_025443 // RefSeq // Mus musculus partner of NOB1 homolog (S. cerevisiae) (Pno1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006514779 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus partner of NOB1 homolog (S. cerevisiae) (Pno1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000020317 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:17203198:17211568:-1 gene:ENSMUSG00000020116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF349950 // GenBank // Mus musculus putative 25.7 kDa protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC020037 // GenBank // Mus musculus partner of NOB1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:28263 IMAGE:4007940), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000123754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:17208789:17211054:-1 gene:ENSMUSG00000020116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000053805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:17208785:17211507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000117065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:17297577:17298419:-1 gene:ENSMUSG00000082797 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000053803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:17297985:17416906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_026576 // RefSeq // Mus musculus Ewing tumor-associated antigen 1 (Etaa1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000076661 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:17938756:17953875:-1 gene:ENSMUSG00000016984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC028916 // GenBank // Mus musculus Ewings tumor-associated antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:30638 IMAGE:3676092), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:17940226:17972394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000121258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:18206413:18206944:-1 gene:ENSMUSG00000080826 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:18206479:18265539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000119030 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:18325630:18327671:-1 gene:ENSMUSG00000081302 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:18317038:18332469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000158765 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:18802254:18802422:-1 gene:ENSMUSG00000089390 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT008701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_146243 // RefSeq // Mus musculus ARP2 actin-related protein 2 (Actr2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000000137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:20062304:20112913:-1 gene:ENSMUSG00000020152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC027799 // GenBank // Mus musculus ARP2 actin-related protein 2 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:36604 IMAGE:5325176), complete cds. // chr11 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000004111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:20064689:20112852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0
NM_018861 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 1 (glutamate/neutral amino acid transporter), member 4 (Slc1a4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000004634 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:20302205:20332684:-1 gene:ENSMUSG00000020142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000109594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:20302180:20332713:-1 gene:ENSMUSG00000020142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF246129 // GenBank // Mus musculus neutral amino acid transporter ASCT1 mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// BC043483 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 1 (glutamate/neutral amino acid transporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:49465 IMAGE:5003744), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC052733 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 1 (glutamate/neutral amino acid transporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:64681 IMAGE:6816689), complete cds. // chr11 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// U75215 // GenBank // Mus musculus neutral amino acid transporter mASCT1 mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:20304266:20332472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
BC106119 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4833432P19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:117943 IMAGE:5038679), complete cds. // chr11 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT008787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_173752 // RefSeq // Mus musculus lectin, galactoside binding-like (Lgalsl), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000047028 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:20823576:20831056:-1 gene:ENSMUSG00000042363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK156350 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830017J08 product:Hypothetical protein (Hypothetical Galectins), full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC019131 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110067D22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:29165 IMAGE:5036749), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000144441 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:20826350:20830755:-1 gene:ENSMUSG00000042363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// GENSCAN00000004094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:20826372:20831009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000082737 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:20847753:20847881:-1 gene:ENSMUSG00000064671 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT008799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
NM_139297 // RefSeq // Mus musculus UDP-glucose pyrophosphorylase 2 (Ugp2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000102875 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:21321138:21370477:-1 gene:ENSMUSG00000001891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF424698 // GenBank // Mus musculus uridindiphosphoglucosepyrophosphorylase 2 (Ugp2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC023810 // GenBank // Mus musculus UDP-glucose pyrophosphorylase 2, mRNA (cDNA clone MGC:38555 IMAGE:5353993), complete cds. // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC061208 // GenBank // Mus musculus UDP-glucose pyrophosphorylase 2, mRNA (cDNA clone MGC:74352 IMAGE:30250244), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_001290634 // RefSeq // Mus musculus UDP-glucose pyrophosphorylase 2 (Ugp2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENSMUST00000060895 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:21321673:21371201:-1 gene:ENSMUSG00000001891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// BC025585 // GenBank // Mus musculus UDP-glucose pyrophosphorylase 2, mRNA (cDNA clone MGC:38262 IMAGE:5324928), complete cds. // chr11 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// AK153885 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430002M09 product:UDP-glucose pyrophosphorylase 2, full insert sequence. // chr11 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000044015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:21322022:21334321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0
NR_028259 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4932414J04 gene (4932414J04Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000152483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:21494730:21511178:-1 gene:ENSMUSG00000078962 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_008618 // RefSeq // Mus musculus malate dehydrogenase 1, NAD (soluble) (Mdh1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000102874 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:21556787:21572193:-1 gene:ENSMUSG00000020321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000125302 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:21562896:21572367:-1 gene:ENSMUSG00000020321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000144978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:21559522:21564207:-1 gene:ENSMUSG00000020321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// BC050940 // GenBank // Mus musculus malate dehydrogenase 1, NAD (soluble), mRNA (cDNA clone MGC:61422 IMAGE:6820601), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// M29462 // GenBank // Mouse malate dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:21557443:21684056:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_011023 // RefSeq // Mus musculus orthodenticle homolog 1 (Otx1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000006071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:21994764:22001615:-1 gene:ENSMUSG00000005917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000147486 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:21996858:22002897:-1 gene:ENSMUSG00000005917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000172395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:21994769:22001710:-1 gene:ENSMUSG00000005917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC057105 // GenBank // Mus musculus orthodenticle homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:73430 IMAGE:6416436), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC058354 // GenBank // Mus musculus orthodenticle homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:66640 IMAGE:6816961), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK049430 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430007K15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT008839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:21995521:22025883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONMMUT008840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSMUST00000117244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:22758599:22760025:-1 gene:ENSMUSG00000084081 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:22758431:22759783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000118614 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:22786811:22787247:-1 gene:ENSMUSG00000082576 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:22786811:22827738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0
NM_001169114 // RefSeq // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 (B3gnt2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_016888 // RefSeq // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 (B3gnt2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055549 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:22834865:22860488:-1 gene:ENSMUSG00000051650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000062844 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:22834747:22860101:-1 gene:ENSMUSG00000051650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160826 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:22834744:22982090:-1 gene:ENSMUSG00000098650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AF092050 // GenBank // Mus musculus beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase mRNA, complete cds. // chr11 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// AY043479 // GenBank // Mus musculus beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase mRNA, complete cds. // chr11 // 79 // 89 // 19 // 24 // 0 /// BC009075 // GenBank // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:6892 IMAGE:2654354), complete cds. // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000019490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:22830760:22837186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000083657 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:23479561:23479667:-1 gene:ENSMUSG00000065591 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001110133 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700093K21 gene (1700093K21Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_026105 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700093K21 gene (1700093K21Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006514789 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700093K21 gene (1700093K21Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000020527 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:23516203:23519223:-1 gene:ENSMUSG00000020286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000169264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:23516203:23519942:-1 gene:ENSMUSG00000020286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC049567 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700093K21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58162 IMAGE:6773879), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:23516440:23620460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NR_004857 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12060 (Gm12060), non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000125204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:23558058:23558842:-1 gene:ENSMUSG00000085415 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT008921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000019485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:23516440:23620460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_023651 // RefSeq // Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 13 (Pex13), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006514817 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 13 (Pex13), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000020523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:23646479:23665959:-1 gene:ENSMUSG00000020283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF329877 // GenBank // Mus musculus peroxisome biogenesis PEX13 (Pex13) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC023683 // GenBank // Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 13, mRNA (cDNA clone MGC:35803 IMAGE:5343438), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000130811 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:23649456:23665852:-1 gene:ENSMUSG00000020283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000019499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:23649292:23657410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_009044 // RefSeq // Mus musculus reticuloendotheliosis oncogene (Rel), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000102864 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:23741514:23770970:-1 gene:ENSMUSG00000020275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC139447 // GenBank // Mus musculus reticuloendotheliosis oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:171074 IMAGE:8862469), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC139448 // GenBank // Mus musculus reticuloendotheliosis oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:171075 IMAGE:8862470), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC139770 // GenBank // Mus musculus reticuloendotheliosis oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:150252 IMAGE:40111461), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// X15842 // GenBank // Murine mRNA for c-rel protein. // chr11 // 79 // 97 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:23731147:23761445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0
NM_172555 // RefSeq // Mus musculus poly(A) polymerase gamma (Papolg), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006514653 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus poly(A) polymerase gamma (Papolg), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000020513 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:23862646:23895253:-1 gene:ENSMUSG00000020273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000102863 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:23870056:23895236:-1 gene:ENSMUSG00000020273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000150711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:23866411:23891904:-1 gene:ENSMUSG00000020273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// AK139065 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730011P14 product:POLY, full insert sequence. // chr11 // 100 // 67 // 32 // 32 // 0 /// BC059271 // GenBank // Mus musculus poly(A) polymerase gamma, mRNA (cDNA clone MGC:67706 IMAGE:2811338), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// DQ103505 // GenBank // Mus musculus SRP 3-adenylating protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000145013 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:23865244:23868470:-1 gene:ENSMUSG00000020273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// BC037439 // GenBank HTC // Mus musculus poly(A) polymerase gamma, mRNA (cDNA clone IMAGE:3500721), with apparent retained intron. // chr11 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// GENSCAN00000038495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:23863958:23896897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000068360 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:24048955:24075054:-1 gene:ENSMUSG00000055010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK080628 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830031A19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK159073 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K530050O17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT008944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
AK145325 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I0C0004H08 product:hypothetical Glycine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_033491 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10466 (Gm10466), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101450 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:24721006:24730722:-1 gene:ENSMUSG00000073103 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027973 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 5730522E02 gene (5730522E02Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109511 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:25619087:26210572:-1 gene:ENSMUSG00000032985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:25617668:26210569:-1 gene:ENSMUSG00000032985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:26103185:26210763:-1 gene:ENSMUSG00000032985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// AK080999 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930009L07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// AK017784 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730522E02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:26210212:26210555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 68 // 13 // 17 // 0 /// NONMMUT008985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONMMUT008992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONMMUT008986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
ENSMUST00000083955 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:26337540:26337703:-1 gene:ENSMUSG00000065889 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK135532 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo female mullerian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6820445E23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT008994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001045525 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b5 domain containing 1 (Cyb5d1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000042595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:28339104:28339867:-1 gene:ENSMUSG00000032889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000051620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69393612:69395333:-1 gene:ENSMUSG00000044795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69393263:69395333:-1 gene:ENSMUSG00000044795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC099556 // GenBank // Mus musculus cytochrome b5 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:118302 IMAGE:30915659), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000134903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69391925:69395631:-1 gene:ENSMUSG00000044795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000023454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69393638:69395293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:28339128:28438735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000129876 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29170909:29173558:-1 gene:ENSMUSG00000086725 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK042012 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630052C17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK083953 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130069E23 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC037626 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A630052C17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4506726), partial cds. // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC059020 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A630052C17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6414463), partial cds. // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT009030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_025740 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 104 (Ccdc104), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000020754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:29221532:29247409:-1 gene:ENSMUSG00000020462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000141862 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29225772:29247288:-1 gene:ENSMUSG00000020462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// BC005731 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 104, mRNA (cDNA clone MGC:11815 IMAGE:3595965), complete cds. // chr11 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000134599 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:29230625:29246922:-1 gene:ENSMUSG00000020462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000041802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:29229890:29247129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000041811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:29221884:29225944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0
NM_001163454 // RefSeq // Mus musculus prolyl-tRNA synthetase domain containing 1 (Prorsd1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_026465 // RefSeq // Mus musculus prolyl-tRNA synthetase domain containing 1 (Prorsd1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000039900 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:29512876:29515033:-1 gene:ENSMUSG00000032673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000133103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:29511757:29515031:-1 gene:ENSMUSG00000032673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK085965 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D830035G22 product:hypothetical Hypothetical protein HI1434 (YbaK homologue) structure containing protein, full insert sequence. // chr11 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// BC033930 // GenBank // Mus musculus non-protein coding RNA 117, mRNA (cDNA clone MGC:41393 IMAGE:1397170), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC115900 // GenBank // Mus musculus non-protein coding RNA 117, mRNA (cDNA clone MGC:143640 IMAGE:40091622), complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:29513251:29515000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0
NM_146016 // RefSeq // Mus musculus echinoderm microtubule associated protein like 6 (Eml6), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 57 // 57 // 0 /// ENSMUST00000058902 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:29743048:30026033:-1 gene:ENSMUSG00000044072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 57 // 57 // 0 /// ENSMUST00000123881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29744134:29764233:-1 gene:ENSMUSG00000044072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 53 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000137689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29749956:29760049:-1 gene:ENSMUSG00000044072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 14 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000142651 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29746649:29751465:-1 gene:ENSMUSG00000044072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 15 // 9 // 9 // 0 /// BC024726 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C230094A16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:38936 IMAGE:5362808), complete cds. // chr11 // 100 // 53 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:29777003:29823045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 25 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000021226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:29830979:29936563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 15 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000041799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:29744458:29764126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 28 // 28 // 0
NM_176829 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931440F15 gene (4931440F15Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000104962 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:29822395:29825668:-1 gene:ENSMUSG00000078157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC139107 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931440F15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170734 IMAGE:8862129), complete cds. // chr11 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// BC139123 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931440F15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:170750 IMAGE:8862145), complete cds. // chr11 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
NM_009260 // RefSeq // Mus musculus spectrin beta, non-erythrocytic 1 (Sptbn1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// NM_175836 // RefSeq // Mus musculus spectrin beta, non-erythrocytic 1 (Sptbn1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// XM_006514599 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spectrin beta, non-erythrocytic 1 (Sptbn1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000006629 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:30099395:30268169:-1 gene:ENSMUSG00000020315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000011877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:30099396:30219772:-1 gene:ENSMUSG00000020315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000102838 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:30106785:30198257:-1 gene:ENSMUSG00000020315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000124231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:30109948:30267214:-1 gene:ENSMUSG00000020315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// AF017112 // GenBank // Mus musculus non-erythrocyte beta spectrin mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 77 // 32 // 34 // 0 /// AK220456 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4049 protein. // chr11 // 97 // 73 // 31 // 32 // 0 /// M74773 // GenBank // Mus musculus brain beta spectrin (Spnb-2) mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 84 // 35 // 37 // 0 /// GENSCAN00000021232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:30100496:30219726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0
NM_001100394 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930505A04 gene (4930505A04Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006514872 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930505A04 gene (4930505A04Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000041763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:30426006:30471808:-1 gene:ENSMUSG00000040919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000152718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:30426006:30471827:-1 gene:ENSMUSG00000040919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK015698 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930505A04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:30426164:30481485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_029344 // RefSeq // Mus musculus acylphosphatase 2, muscle type (Acyp2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074613 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:30505991:30649587:-1 gene:ENSMUSG00000060923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027642 // GenBank // Mus musculus acylphosphatase 2, muscle type, mRNA (cDNA clone MGC:41341 IMAGE:1245384), complete cds. // chr11 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:30572934:30649352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_025745 // RefSeq // Mus musculus endoplasmic reticulum lectin 1 (Erlec1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006514784 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endoplasmic reticulum lectin 1 (Erlec1), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000073192 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:30930774:30954152:-1 gene:ENSMUSG00000020311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000129593 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:30931751:30948469:-1 gene:ENSMUSG00000020311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// BC018468 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933407N01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:27955 IMAGE:3591901), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006514782 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus endoplasmic reticulum lectin 1 (Erlec1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000042782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:30907116:30948496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0
NM_001290667 // RefSeq // Mus musculus ChaC, cation transport regulator 2 (Chac2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_026527 // RefSeq // Mus musculus ChaC, cation transport regulator 2 (Chac2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020553 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:30976952:30986334:-1 gene:ENSMUSG00000020309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000101394 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:30976707:30986350:-1 gene:ENSMUSG00000020309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025100 // GenBank // Mus musculus ChaC, cation transport regulator homolog 2 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:35645 IMAGE:3967723), complete cds. // chr11 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:30977381:30986246:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_011491 // RefSeq // Mus musculus stanniocalcin 2 (Stc2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000020546 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:31357307:31370074:-1 gene:ENSMUSG00000020303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000139991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:31357986:31369103:-1 gene:ENSMUSG00000020303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AF031035 // GenBank // Mus musculus stanniocalcin (Stc2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF056244 // GenBank // Mus musculus stanniocalcin-2 (Stc-2) mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// AK046655 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430303G03 product:stanniocalcin 2, full insert sequence. // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC012206 // GenBank // Mus musculus stanniocalcin 2, mRNA (cDNA clone MGC:18329 IMAGE:3665803), complete cds. // chr11 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NONMMUT009131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000042785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:31347520:31442795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_001024919 // RefSeq // Mus musculus biorientation of chromosomes in cell division 1 (Bod1), mRNA. // chr11 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000058060 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:31665181:31671885:-1 gene:ENSMUSG00000044502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// AK009485 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310022M17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// BC116435 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310022M17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144641 IMAGE:40104481), complete cds. // chr11 // 85 // 93 // 11 // 13 // 0 /// BC116436 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310022M17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144642 IMAGE:40104482), complete cds. // chr11 // 85 // 93 // 11 // 13 // 0 /// BC128508 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310022M17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40104484). // chr11 // 85 // 93 // 11 // 13 // 0 /// BC128509 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310022M17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:156877 IMAGE:40104485), complete cds. // chr11 // 85 // 93 // 11 // 13 // 0
NM_027031 // RefSeq // Mus musculus EF-hand calcium binding domain 9 (Efcab9), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054327 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:32522751:32527579:-1 gene:ENSMUSG00000044056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087911 // GenBank // Mus musculus EF-hand calcium binding domain 9, mRNA (cDNA clone MGC:107247 IMAGE:6771929), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:32523340:32532081:-1 gene:ENSMUSG00000044056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000013096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:32522795:32527520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
NM_027050 // RefSeq // Mus musculus small integral membrane protein 23 (Smim23), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020508 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:32820376:32824605:-1 gene:ENSMUSG00000020270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109365 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:32818529:32824562:-1 gene:ENSMUSG00000020270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000027154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:32795495:32831059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000121601 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:32880362:32880940:-1 gene:ENSMUSG00000083303 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT009200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_008005 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor 18 (Fgf18), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_102395 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor 18 (Fgf18), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006514526 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus fibroblast growth factor 18 (Fgf18), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000020507 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:33117430:33147400:-1 gene:ENSMUSG00000057967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109363 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:33117430:33146795:-1 gene:ENSMUSG00000057967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AB004639 // GenBank // Mus musculus mRNA for fibroblast growth factor (FGF-18), complete cds. // chr11 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// AF075291 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor 18 (Fgf18) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF211187 // GenBank // Mus musculus zFGF5 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:33117765:33140270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001252260 // RefSeq // Mus musculus nucleophosmin 1 (Npm1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// NM_008722 // RefSeq // Mus musculus nucleophosmin 1 (Npm1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000075641 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:33152287:33163206:-1 gene:ENSMUSG00000057113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000093201 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:33152510:33163072:-1 gene:ENSMUSG00000057113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// BC054755 // GenBank // Mus musculus nucleophosmin 1, mRNA (cDNA clone MGC:64789 IMAGE:6411700), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// BC085278 // GenBank // Mus musculus nucleophosmin 1, mRNA (cDNA clone MGC:103199 IMAGE:30438901), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// BC089546 // GenBank // Mus musculus nucleophosmin 1, mRNA (cDNA clone MGC:107291 IMAGE:30505980), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// BC092378 // GenBank // Mus musculus nucleophosmin 1, mRNA (cDNA clone MGC:106684 IMAGE:5710278), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// GU214027 // GenBank // Mus musculus nucleophosmin 1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// M33212 // GenBank // Mouse nucleolar protein N038 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// BC090842 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5710461, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr11 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
NM_019916 // RefSeq // Mus musculus T cell leukemia, homeobox 3 (Tlx3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000037746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:33200752:33203589:-1 gene:ENSMUSG00000040610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC141308 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia, homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:176269 IMAGE:9055920), complete cds. // chr11 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC145631 // GenBank // Mus musculus T-cell leukemia, homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:179207 IMAGE:9054199), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:33146812:33203459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000118265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:33394879:33395266:-1 gene:ENSMUSG00000069913 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// AY702092 // GenBank // Mus musculus acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member C (Anp32c) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000027166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:33394973:33395278:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
NM_146017 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, pi (Gabrp), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000020366 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:33550781:33578957:-1 gene:ENSMUSG00000020159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC023693 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, pi, mRNA (cDNA clone MGC:38355 IMAGE:5344479), complete cds. // chr11 // 93 // 85 // 27 // 29 // 0 /// BC025550 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, pi, mRNA (cDNA clone MGC:38123 IMAGE:5320737), complete cds. // chr11 // 92 // 76 // 24 // 26 // 0 /// BC027245 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, pi, mRNA (cDNA clone MGC:28005 IMAGE:3602400), complete cds. // chr11 // 94 // 91 // 29 // 31 // 0 /// BC031196 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, pi, mRNA (cDNA clone MGC:37685 IMAGE:5059564), complete cds. // chr11 // 93 // 85 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:33552540:33557370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000027157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:33561468:33573370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_023907 // RefSeq // Mus musculus forkhead box I1 (Foxi1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060271 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:34204338:34208089:-1 gene:ENSMUSG00000047861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC007475 // GenBank // Mus musculus forkhead box I1, mRNA (cDNA clone MGC:6438 IMAGE:3601768), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:34205510:34395914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_033374 // RefSeq // Mus musculus dedicator of cyto-kinesis 2 (Dock2), mRNA. // chrUn // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000093193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:34226815:34783892:-1 gene:ENSMUSG00000020143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AY027438 // GenBank // Mus musculus HCH mRNA, complete cds. // chrUn // 87 // 94 // 26 // 30 // 0 /// ENSMUST00000101365 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:34273045:34783892:-1 gene:ENSMUSG00000020143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// AK037611 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130029J19 product:dedicator of cyto-kinesis 2, full insert sequence. // chrUn // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000011687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:34205510:34395914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
AK157487 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830218O03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_027411 // RefSeq // Mus musculus spindle apparatus coiled-coil protein 1 (Spdl1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093191 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:34809190:34833641:-1 gene:ENSMUSG00000069910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC006674 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 99, mRNA (cDNA clone MGC:7790 IMAGE:3499487), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001004147 // RefSeq // Mus musculus fibrillarin-like 1 (Fbll1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160726 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:35797382:35798884:-1 gene:ENSMUSG00000051062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC052068 // GenBank // Mus musculus fibrillarin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:62475 IMAGE:5710336), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:35797490:35940702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_025936 // RefSeq // Mus musculus arginyl-tRNA synthetase (Rars), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000018992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:35808381:35834506:-1 gene:ENSMUSG00000018848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000143205 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:35815668:35820109:-1 gene:ENSMUSG00000018848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC020132 // GenBank // Mus musculus arginyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:28207 IMAGE:3989952), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:35797490:35940702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_170779 // RefSeq // Mus musculus WW, C2 and coiled-coil domain containing 1 (Wwc1), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000018993 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:35838400:35980527:-1 gene:ENSMUSG00000018849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// AB271907 // GenBank // Mus musculus mRNA for KIBRA, complete cds. // chr11 // 98 // 92 // 46 // 47 // 0 /// AK220259 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0869 protein. // chr11 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// BC037006 // GenBank // Mus musculus WW, C2 and coiled-coil domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:47054 IMAGE:5116674), complete cds. // chr11 // 100 // 57 // 29 // 29 // 0 /// DQ256090 // GenBank // Mus musculus KIBRA (Kibra) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000038841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:35797490:35940702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 82 // 82 // 42 // 51 // 1
AK136906 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330175G11 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_009831 // RefSeq // Mus musculus cyclin G1 (Ccng1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000020576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:40748552:40755311:-1 gene:ENSMUSG00000020326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// L49507 // GenBank // Mus musculus cyclin G1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:40694803:40756082:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
ENSMUST00000083982 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:41034968:41035123:-1 gene:ENSMUSG00000065916 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// NONMMUT009353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0
NM_010250 // RefSeq // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit alpha 1 (Gabra1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006532196 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit alpha 1 (Gabra1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000020707 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:42130939:42182930:-1 gene:ENSMUSG00000010803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000132971 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:42175984:42182930:-1 gene:ENSMUSG00000010803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC132331 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:163962 IMAGE:40130608), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC137733 // GenBank // Mus musculus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:169357 IMAGE:8860752), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// M86566 // GenBank // Mouse GABA-A receptor alpha-1 subunit mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000153147 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:42162553:42182163:-1 gene:ENSMUSG00000010803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000027395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:42133479:42202577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NR_029558 // RefSeq // Mus musculus microRNA 146 (Mir146), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000083667 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:43374397:43374461:-1 gene:ENSMUSG00000065601 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:43374344:43381051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// mmu-mir-146a // miRBase Micro RNA Database // MI0000170 Mus musculus miR-146a stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT009390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSMUST00000121374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:43463196:43463485:-1 gene:ENSMUSG00000084307 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_008375 // RefSeq // Mus musculus fatty acid binding protein 6, ileal (gastrotropin) (Fabp6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000020672 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:43596049:43601540:-1 gene:ENSMUSG00000020405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC119289 // GenBank // Mus musculus fatty acid binding protein 6, ileal (gastrotropin), mRNA (cDNA clone MGC:155605 IMAGE:8734038), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC120767 // GenBank // Mus musculus fatty acid binding protein 6, ileal (gastrotropin), mRNA (cDNA clone MGC:156004 IMAGE:40129690), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000000440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:43596112:43657803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_133795 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 1 (Ttc1), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000048578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:43730009:43747982:-1 gene:ENSMUSG00000041278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000109278 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:43729512:43748008:-1 gene:ENSMUSG00000041278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000147984 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:43745018:43747992:-1 gene:ENSMUSG00000041278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC010236 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:7871 IMAGE:3581904), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT009408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000015073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:43721078:43748049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 79 // 79 // 27 // 34 // 1
NM_001284380 // RefSeq // Mus musculus adrenergic receptor, alpha 1b (Adra1b), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NM_001284381 // RefSeq // Mus musculus adrenergic receptor, alpha 1b (Adra1b), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_007416 // RefSeq // Mus musculus adrenergic receptor, alpha 1b (Adra1b), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067258 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:43774606:43901210:-1 gene:ENSMUSG00000050541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000124306 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:43774606:43836332:-1 gene:ENSMUSG00000050541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:43776023:43901210:-1 gene:ENSMUSG00000050541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000167574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:43774606:43836332:-1 gene:ENSMUSG00000050541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC138653 // GenBank // Mus musculus adrenergic receptor, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:170278 IMAGE:8861673), complete cds. // chr11 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// BC138654 // GenBank // Mus musculus adrenergic receptor, alpha 1b, mRNA (cDNA clone MGC:170279 IMAGE:8861674), complete cds. // chr11 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// Y12738 // GenBank // M.musculus mRNA for alpha-1B adrenergic receptor. // chr11 // 86 // 61 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:43775861:43811548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
BC002236 // GenBank // Mus musculus ubiquitin-like domain containing CTD phosphatase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3491659), complete cds. // chr11 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// NM_024475 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin-like domain containing CTD phosphatase 1 (Ublcp1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 1 /// ENSMUST00000102795 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:44454571:44470498:-1 gene:ENSMUSG00000041231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 1
NM_028185 // RefSeq // Mus musculus U7 snRNP-specific Sm-like protein LSM11 (Lsm11), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000062458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:45931080:45944935:-1 gene:ENSMUSG00000044847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000129820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:45928269:45944935:-1 gene:ENSMUSG00000044847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF514309 // GenBank // Mus musculus U7 snRNA-associated Sm-like protein Lsm11 (Lsm11) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC094286 // GenBank // Mus musculus U7 snRNP-specific Sm-like protein LSM11, mRNA (cDNA clone MGC:106282 IMAGE:5294386), complete cds. // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000056362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:45923214:45944912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_172524 // RefSeq // Mus musculus NIPA-like domain containing 4 (Nipal4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46148155:46166508:-1 gene:ENSMUSG00000020411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139819 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9530066K23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:161848 IMAGE:40141293), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:46150146:46166276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001252459 // RefSeq // Mus musculus cytoplasmic FMR1 interacting protein 2 (Cyfip2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NM_001252460 // RefSeq // Mus musculus cytoplasmic FMR1 interacting protein 2 (Cyfip2), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_133769 // RefSeq // Mus musculus cytoplasmic FMR1 interacting protein 2 (Cyfip2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000093165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:46193850:46312859:-1 gene:ENSMUSG00000020340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000093166 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46193855:46312294:-1 gene:ENSMUSG00000020340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000142017 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:46196071:46270669:-1 gene:ENSMUSG00000020340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000165599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:46193850:46312358:-1 gene:ENSMUSG00000020340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF334144 // GenBank // Mus musculus CYFIP2 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC056974 // GenBank // Mus musculus cytoplasmic FMR1 interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:66804 IMAGE:6831770), complete cds. // chr11 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:46196300:46231390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000056360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:46243571:46291629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0
NM_001163358 // RefSeq // Mus musculus developmental pluripotency associated 1 (Dppa1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_178247 // RefSeq // Mus musculus developmental pluripotency associated 1 (Dppa1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533590 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus developmental pluripotency associated 1 (Dppa1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000077173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46607772:46629261:-1 gene:ENSMUSG00000064010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000109227 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46608710:46629261:-1 gene:ENSMUSG00000064010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF490345 // GenBank // Mus musculus DPPA1 mRNA, complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC115806 // GenBank // Mus musculus developmental pluripotency associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:144866 IMAGE:40106955), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC115901 // GenBank // Mus musculus developmental pluripotency associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:144867 IMAGE:40106956), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_011891 // RefSeq // Mus musculus sarcoglycan, delta (dystrophin-associated glycoprotein) (Sgcd), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000077221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:46978785:47379522:-1 gene:ENSMUSG00000020354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AB024923 // GenBank // Mus musculus mRNA for delta-sarcoglycan, complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC130019 // GenBank // Mus musculus sarcoglycan, delta (dystrophin-associated glycoprotein), mRNA (cDNA clone MGC:161177 IMAGE:40140624), complete cds. // chr11 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:46896253:47578965:-1 gene:ENSMUSG00000020354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// XM_006533308 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sarcoglycan, delta (dystrophin-associated glycoprotein) (Sgcd), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// AK047384 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930054G04 product:sarcoglycan, delta (35kD dystrophin-associated glycoprotein), full insert sequence. // chr11 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000014907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:46977081:47149948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
ENSMUST00000083870 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:47912385:47912545:-1 gene:ENSMUSG00000065804 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145377 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 41 (Trim41), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006532759 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif-containing 41 (Trim41), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// XM_006537461 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif-containing 41 (Trim41), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006537464 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif-containing 41 (Trim41), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000047145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:48806404:48817353:-1 gene:ENSMUSG00000040365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000140800 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48809097:48816953:-1 gene:ENSMUSG00000040365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// BC020156 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 41, mRNA (cDNA clone IMAGE:4021570), complete cds. // chr11 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// BC031905 // GenBank HTC // Mus musculus tripartite motif-containing 41, mRNA (cDNA clone IMAGE:5363476), with apparent retained intron. // chr11 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000036516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:48807245:48826349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0
NM_008326 // RefSeq // Mus musculus immunity-related GTPase family M member 1 (Irgm1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006537460 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus immunity-related GTPase family M member 1 (Irgm1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// ENSMUST00000049519 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:48865245:48871374:-1 gene:ENSMUSG00000046879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48866118:48871420:-1 gene:ENSMUSG00000046879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC145957 // GenBank // Mus musculus immunity-related GTPase family M member 1, mRNA (cDNA clone MGC:175844 IMAGE:40131260), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// U19119 // GenBank // Mus musculus G-protein-like LRG-47 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:48865801:48866982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000109212 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48888129:48902152:-1 gene:ENSMUSG00000058163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000036510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:48888393:48895546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_001045540 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12185 (Gm12185), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000059930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:48904658:48992226:-1 gene:ENSMUSG00000048852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// ENSMUST00000094476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:48904656:48927159:-1 gene:ENSMUSG00000048852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000036519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:48907157:48916362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000119050 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:48996687:48997713:-1 gene:ENSMUSG00000084153 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:48966549:49007045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_146337 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1396 (Olfr1396), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:49112777:49113757:-1 gene:ENSMUSG00000047511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109201 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:49112777:49114874:-1 gene:ENSMUSG00000047511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC110470 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1396, mRNA (cDNA clone MGC:123861 IMAGE:40044195), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC110471 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1396, mRNA (cDNA clone MGC:123862 IMAGE:40044201), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49112777:49129724:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172793 // RefSeq // Mus musculus butyrophilin-like 9 (Btnl9), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000046522 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49165585:49187159:-1 gene:ENSMUSG00000040283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000066531 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:49169054:49187045:-1 gene:ENSMUSG00000040283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// ENSMUST00000153999 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:49174826:49187037:-1 gene:ENSMUSG00000040283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// AY177687 // GenBank // Mus musculus butyrophilin 3 mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// BC150808 // GenBank // Mus musculus butyrophilin-like 9, mRNA (cDNA clone MGC:183719 IMAGE:9087719), complete cds. // chr11 // 84 // 89 // 26 // 31 // 0 /// BC151155 // GenBank // Mus musculus butyrophilin-like 9, mRNA (cDNA clone MGC:184054 IMAGE:9088043), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000036488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49169054:49180787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 69 // 22 // 24 // 0
NM_001290741 // RefSeq // Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 6 (Cnot6), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_212484 // RefSeq // Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 6 (Cnot6), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000020624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:49674713:49712710:-1 gene:ENSMUSG00000020362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000109183 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:49674698:49702632:-1 gene:ENSMUSG00000020362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000145353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:49671503:49712723:-1 gene:ENSMUSG00000020362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC062950 // GenBank // Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 6, mRNA (cDNA clone MGC:77956 IMAGE:6840162), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK129307 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1194 protein. // chr11 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// GENSCAN00000024249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:49675193:49702652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0
NM_008521 // RefSeq // Mus musculus leukotriene C4 synthase (Ltc4s), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000101265 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50236469:50238471:-1 gene:ENSMUSG00000020377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000102772 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:50236472:50238532:-1 gene:ENSMUSG00000020377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000125555 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50236472:50238616:-1 gene:ENSMUSG00000020377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC028760 // GenBank // Mus musculus leukotriene C4 synthase, mRNA (cDNA clone MGC:41203 IMAGE:1348372), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC038518 // GenBank HTC // Mus musculus leukotriene C4 synthase, mRNA (cDNA clone IMAGE:1397319), with apparent retained intron. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U27195 // GenBank // Mus musculus leukotriene C4 synthase mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50236571:50238435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_175334 // RefSeq // Mus musculus mastermind like 1 (Drosophila) (Maml1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000059458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:50255634:50292311:-1 gene:ENSMUSG00000050567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000135868 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:50255634:50291804:-1 gene:ENSMUSG00000050567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AY442299 // GenBank // Mus musculus mastermind-like 1 (Maml1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC094599 // GenBank // Mus musculus mastermind like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:106573 IMAGE:6407060), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50252626:50292040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_001110499 // RefSeq // Mus musculus calnexin (Canx), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001110500 // RefSeq // Mus musculus calnexin (Canx), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_007597 // RefSeq // Mus musculus calnexin (Canx), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000020637 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:50294467:50325673:-1 gene:ENSMUSG00000020368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000146979 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50296199:50299378:-1 gene:ENSMUSG00000020368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 91 // 34 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000179865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:50293961:50325673:-1 gene:ENSMUSG00000020368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC012408 // GenBank // Mus musculus calnexin, mRNA (cDNA clone MGC:7708 IMAGE:3497769), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC040244 // GenBank // Mus musculus calnexin, mRNA (cDNA clone MGC:6441 IMAGE:2582119), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// L18888 // GenBank // Mus musculus calnexin mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50295939:50311777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_172557 // RefSeq // Mus musculus RUN and FYVE domain containing 1 (Rufy1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006532841 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RUN and FYVE domain containing 1 (Rufy1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000020643 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:50389286:50431125:-1 gene:ENSMUSG00000020375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000129304 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50407908:50421991:-1 gene:ENSMUSG00000020375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 88 // 44 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000024256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50389815:50431105:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_013922 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 354C (Zfp354c), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006533517 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 354C (Zfp354c), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000000632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:50814564:50826458:-1 gene:ENSMUSG00000044807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000109135 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50811086:50827690:-1 gene:ENSMUSG00000044807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF192804 // GenBank // Mus musculus KRAB-zinc finger protein KID3 (Kid3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// BC079908 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 354C, mRNA (cDNA clone MGC:100343 IMAGE:30654724), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000136333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50826276:50827724:-1 gene:ENSMUSG00000044807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// ENSMUST00000139465 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50817193:50827686:-1 gene:ENSMUSG00000044807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// GENSCAN00000017988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50806829:50840558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// NONMMUT009627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001290779 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 879 (Zfp879), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_173387 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 879 (Zfp879), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000049625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:50832035:50841552:-1 gene:ENSMUSG00000044296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000109133 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:50832083:50841546:-1 gene:ENSMUSG00000044296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000109134 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:50832031:50841552:-1 gene:ENSMUSG00000044296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC118537 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9630041N07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143862 IMAGE:40094138), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50806829:50840558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_172794 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 454 (Zfp454), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000050595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50872720:50887443:-1 gene:ENSMUSG00000048728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000125749 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50877882:50887651:-1 gene:ENSMUSG00000048728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000126718 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50874161:50887651:-1 gene:ENSMUSG00000048728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000136599 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50878094:50887530:-1 gene:ENSMUSG00000048728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000163301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:50872720:50887501:-1 gene:ENSMUSG00000048728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// BC049793 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 454, mRNA (cDNA clone MGC:59420 IMAGE:6510760), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000109131 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50872720:50887651:-1 gene:ENSMUSG00000048728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONMMUT009629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// NONMMUT009630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000018013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50866251:50929630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_013744 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 354B (Zfp354b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000109124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50921823:50931633:-1 gene:ENSMUSG00000020335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000164280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:50922291:50930933:-1 gene:ENSMUSG00000020335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// AF184112 // GenBank // Mus musculus KID2 (Kid2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC107400 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 354B, mRNA (cDNA clone MGC:130408 IMAGE:40058571), complete cds. // chr11 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// BC107401 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 354B, mRNA (cDNA clone MGC:130409 IMAGE:40058574), complete cds. // chr11 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0
AK016566 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932442I06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000109123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:50940711:50943765:-1 gene:ENSMUSG00000072983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// ENSMUST00000156329 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50941698:50943741:-1 gene:ENSMUSG00000072983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// AK016600 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933401E19 product:RIKEN cDNA 4932442I06 gene, full insert sequence. // chr11 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONMMUT009635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_008936 // RefSeq // Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051159 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:50950806:50953765:-1 gene:ENSMUSG00000044542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162420 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:50952214:50953751:-1 gene:ENSMUSG00000044542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// U77946 // GenBank // Mus musculus pituitary specific homeodomain factor (Prop-1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:50951192:50952454:-1 gene:ENSMUSG00000044542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000018005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:50950336:50953404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT009637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_177567 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC049762 (BC049762), mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006532583 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC049762 (BC049762), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// XM_006532584 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC049762 (BC049762), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000054226 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51253651:51263046:-1 gene:ENSMUSG00000045942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51253651:51262951:-1 gene:ENSMUSG00000045942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC049762 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC049762, mRNA (cDNA clone MGC:58842 IMAGE:6774041), complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51249383:51254773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_025346 // RefSeq // Mus musculus required for meiotic nuclear division 5 homolog B (S. cerevisiae) (Rmnd5b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000001081 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51623673:51635896:-1 gene:ENSMUSG00000001054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000136020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51623671:51635647:-1 gene:ENSMUSG00000001054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000147009 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:51624039:51625834:-1 gene:ENSMUSG00000001054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC016075 // GenBank // Mus musculus required for meiotic nuclear division 5 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:27569 IMAGE:4485143), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51624083:51629614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_145974 // RefSeq // Mus musculus NEDD4 binding protein 3 (N4bp3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006532764 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NEDD4 binding protein 3 (N4bp3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000001080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51643063:51650842:-1 gene:ENSMUSG00000001053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000142721 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51645619:51650820:-1 gene:ENSMUSG00000001053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000156835 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51645554:51650837:-1 gene:ENSMUSG00000001053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC006740 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C330016O10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7136 IMAGE:3158173), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC055831 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C330016O10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:67790 IMAGE:4187601), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51643621:51650680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_025319 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 0610009B22 gene (0610009B22Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006533917 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 0610009B22 gene (0610009B22Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006533918 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 0610009B22 gene (0610009B22Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006533919 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 0610009B22 gene (0610009B22Rik), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000007921 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51685386:51688653:-1 gene:ENSMUSG00000007777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109098 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51685386:51688874:-1 gene:ENSMUSG00000007777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AK007568 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810020N06 product:SEDLIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC024353 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 0610009B22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35774 IMAGE:5009365), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51685647:51688767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC028258 // GenBank HTC // Mus musculus protein phosphatase 1H (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone IMAGE:5003992), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_199299 // RefSeq // Mus musculus jade family PHD finger 2 (Jade2), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006534466 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus jade family PHD finger 2 (Jade2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006534468 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus jade family PHD finger 2 (Jade2), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000020655 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:51813455:51857653:-1 gene:ENSMUSG00000020387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000109090 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:51813455:51857653:-1 gene:ENSMUSG00000020387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000109091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:51813460:51857396:-1 gene:ENSMUSG00000020387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AK004823 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1200017K05 product:PHD finger protein 15, full insert sequence. // chr11 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// BC117856 // GenBank // Mus musculus PHD finger protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:143877 IMAGE:40094330), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC117857 // GenBank // Mus musculus PHD finger protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:143878 IMAGE:40094331), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:51816895:51853258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0
NR_034155 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 1372, pseudogene 1 (Olfr1372-ps1), non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC055827 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 1372, pseudogene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4507463). // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_008300 // RefSeq // Mus musculus heat shock protein 4 (Hspa4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000020630 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:53259814:53300457:-1 gene:ENSMUSG00000020361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000139322 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:53262880:53267241:-1 gene:ENSMUSG00000020361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000151854 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:53264247:53300411:-1 gene:ENSMUSG00000020361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// AK053601 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130113D20 product:heat shock 70 kDa protein 4, full insert sequence. // chr11 // 94 // 77 // 32 // 34 // 0 /// BC003770 // GenBank // Mus musculus heat shock protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:5961 IMAGE:3494648), complete cds. // chr11 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// D85904 // GenBank // Mus musculus mRNA for apg-2, complete cds. // chr11 // 97 // 86 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000002718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:53261612:53355104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0
NM_153069 // RefSeq // Mus musculus liver-expressed antimicrobial peptide 2 (Leap2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036045 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:53422181:53423170:-1 gene:ENSMUSG00000036216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089593 // GenBank // Mus musculus liver-expressed antimicrobial peptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:107613 IMAGE:6749700), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:53422430:53423102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 64 // 11 // 16 // 0
NM_025352 // RefSeq // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit VII (Uqcrq), mRNA. // chr11 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// XM_006533163 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit VII (Uqcrq), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000061326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:53427922:53430827:-1 gene:ENSMUSG00000044894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000109021 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:53428953:53430827:-1 gene:ENSMUSG00000044894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000156503 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:53428953:53430831:-1 gene:ENSMUSG00000044894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 89 // 41 // 8 // 9 // 0 /// AK005374 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500040F11 product:ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC028519 // GenBank // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit VII, mRNA (cDNA clone MGC:41267 IMAGE:1365708), complete cds. // chr11 // 92 // 59 // 12 // 13 // 0 /// BC027809 // GenBank HTC // Mus musculus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit VII, mRNA (cDNA clone IMAGE:5324810), with apparent retained intron. // chr11 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// GENSCAN00000002724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:53429056:53430689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT009736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 89 // 41 // 8 // 9 // 0
ENSMUST00000084653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:53454804:53457110:-1 gene:ENSMUSG00000072963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK142660 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730036I04 product:hypothetical Phenylalanine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000057722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:53469749:53470479:-1 gene:ENSMUSG00000049427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK076795 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930467D06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:53470005:53476686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_183173 // RefSeq // Mus musculus sosondowah ankyrin repeat domain family member A (Sowaha), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000104955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:53476573:53480274:-1 gene:ENSMUSG00000044352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC117863 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat domain 43, mRNA (cDNA clone MGC:143944 IMAGE:40095300), complete cds. // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000002740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:53478261:53479907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0
NM_021283 // RefSeq // Mus musculus interleukin 4 (Il4), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000000889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:53612460:53618669:-1 gene:ENSMUSG00000000869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140684 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:53612460:53618352:-1 gene:ENSMUSG00000000869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AF352783 // GenBank // Mus musculus IMAGE:578022 interleukin 4 mRNA, complete cds. // chr11 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// BC027514 // GenBank // Mus musculus interleukin 4, mRNA (cDNA clone MGC:41086 IMAGE:3376587), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M25892 // GenBank // Mus musculus interleukin 4 (Il-4) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB174765 // GenBank // Mus musculus molossinus IL-4 mRNA for interleukin 4, complete cds. // chr11 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NR_027491 // RefSeq // Mus musculus interleukin 4 (Il4), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSMUST00000150568 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:53612460:53617338:-1 gene:ENSMUSG00000000869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000040564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:53612564:53634634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_008355 // RefSeq // Mus musculus interleukin 13 (Il13), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020650 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:53631324:53634702:-1 gene:ENSMUSG00000020383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M23504 // GenBank // Mus musculus T cell secreted protein (P600) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:53612564:53634634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_009012 // RefSeq // Mus musculus RAD50 homolog (S. cerevisiae) (Rad50), mRNA. // chr11 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000020649 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:53649519:53707319:-1 gene:ENSMUSG00000020380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124352 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:53683255:53707295:-1 gene:ENSMUSG00000020380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000128483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:53674755:53707319:-1 gene:ENSMUSG00000020380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// AK144155 // GenBank HTC // Mus musculus RCB-0035 WEHI-3 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430046N16 product:RAD50 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr11 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// U66887 // GenBank // Mus musculus DNA repair protein RAD50 (RAD50) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:53650469:53707055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0
ENSMUST00000170390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:53772281:53773187:-1 gene:ENSMUSG00000091191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK053162 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030022C11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011396 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 5 (Slc22a5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006532650 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 5 (Slc22a5), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// XR_388385 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 5 (Slc22a5), transcript variant X4, misc_RNA. // chr11 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000019044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:53864542:53891660:-1 gene:ENSMUSG00000018900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AB015800 // GenBank // Mus musculus mRNA for OCTN2, complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// AF110417 // GenBank // Mus musculus organic cation/carnitine transporter (Octn2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// AF111425 // GenBank // Mus musculus sodium-dependent carnitine transporter (Ct) mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 95 // 17 // 18 // 0 /// BC031118 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:36043 IMAGE:4981427), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000040584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:53851983:53891539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
NM_019687 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 4 (Slc22a4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533512 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 4 (Slc22a4), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000020586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:53983123:54028090:-1 gene:ENSMUSG00000020334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB016257 // GenBank // Mus musculus mRNA for OCTN1, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC010590 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:18328 IMAGE:3670138), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533514 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 4 (Slc22a4), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// ENSMUST00000146351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:53992059:54007964:-1 gene:ENSMUSG00000020334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:53909286:54027976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_019417 // RefSeq // Mus musculus PDZ and LIM domain 4 (Pdlim4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000018755 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:54054928:54069014:-1 gene:ENSMUSG00000020388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000093109 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:54054948:54068932:-1 gene:ENSMUSG00000020388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000144477 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:54055920:54064796:-1 gene:ENSMUSG00000020388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 41 // 12 // 13 // 0 /// BC030068 // GenBank // Mus musculus PDZ and LIM domain 4, mRNA (cDNA clone MGC:41095 IMAGE:5144166), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000127271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:54058951:54068991:-1 gene:ENSMUSG00000020388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// AK035513 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530058N05 product:PDZ and LIM domain 4, full insert sequence. // chr11 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000040575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:54045620:54070849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_009969 // RefSeq // Mus musculus colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage) (Csf2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019060 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:54247271:54249667:-1 gene:ENSMUSG00000018916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC116878 // GenBank // Mus musculus colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:151255 IMAGE:40126197), complete cds. // chr11 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC116880 // GenBank // Mus musculus colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:151257 IMAGE:40126199), complete cds. // chr11 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// EU366957 // GenBank // Mus musculus granulocyte-macrophage colony stimulating factor 2 (Csf2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// X02333 // GenBank // Murine mRNA for granulocyte-macrophage colony stimulating factor (GM-GSF). // chr11 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// XM_006532127 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage) (Csf2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000040565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:54247588:54249610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_010556 // RefSeq // Mus musculus interleukin 3 (Il3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019058 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:54265303:54267277:-1 gene:ENSMUSG00000018914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC125552 // GenBank // Mus musculus interleukin 3, mRNA (cDNA clone MGC:159255 IMAGE:40130067), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC125554 // GenBank // Mus musculus interleukin 3, mRNA (cDNA clone MGC:159257 IMAGE:40130069), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// DQ788721 // GenBank // Mus musculus interleukin-3 mRNA, complete cds. // chr11 // 77 // 88 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:54265404:54267705:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_178626 // RefSeq // Mus musculus CDC42 small effector 2 (Cdc42se2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000064104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:54717456:54787675:-1 gene:ENSMUSG00000052298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000135903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:54740310:54787625:-1 gene:ENSMUSG00000052298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000153209 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:54723574:54787646:-1 gene:ENSMUSG00000052298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC048935 // GenBank // Mus musculus CDC42 small effector 2, mRNA (cDNA clone MGC:56977 IMAGE:6394856), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000136059 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:54739986:54787641:-1 gene:ENSMUSG00000052298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AK012983 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810404F18 product:NON-KINASE CDC42 EFFECTOR PROTEIN SPEC2 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AK161819 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030474G01 product:similar to Non-kinase Cdc42 effector protein SPEC2 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONMMUT009805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT009804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001110211 // RefSeq // Mus musculus annexin A6 (Anxa6), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_013472 // RefSeq // Mus musculus annexin A6 (Anxa6), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000102727 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:54979108:55033445:-1 gene:ENSMUSG00000018340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108883 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:54979108:55033445:-1 gene:ENSMUSG00000018340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000148298 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:54990950:55033415:-1 gene:ENSMUSG00000018340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK013026 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810407D22 product:annexin A6, full insert sequence. // chr11 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC005595 // GenBank // Mus musculus annexin A6, mRNA (cDNA clone MGC:6574 IMAGE:3482035), complete cds. // chr11 // 76 // 96 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:54972708:55067169:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
AK154101 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630001P11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSMUST00000108880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:55050730:55078131:-1 gene:ENSMUSG00000049588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK079810 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430075A01 product:RIKEN cDNA 2210021E03 gene, full insert sequence. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC096763 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 69, mRNA (cDNA clone MGC:107403 IMAGE:30053993), complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// NM_177471 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 69 (Ccdc69), mRNA. // chr11 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSMUST00000055040 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:55049731:55078107:-1 gene:ENSMUSG00000049588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000022482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:54972708:55067169:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
XM_006532830 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 3 (Slc36a3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000069816 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:55149491:55151708:-1 gene:ENSMUSG00000049491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000128244 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:55124825:55151686:-1 gene:ENSMUSG00000049491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC049682 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6703259), complete cds. // chr11 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NM_172258 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 3 (Slc36a3), mRNA. // chr11 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// ENSMUST00000020502 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:55124815:55151708:-1 gene:ENSMUSG00000049491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// AF453745 // GenBank // Mus musculus proton/amino acid transporter 3 (PAT3) mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// AY211261 // GenBank // Mus musculus putative amino acid transport protein (Slc36a3) mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// GENSCAN00000022484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:55118101:55151321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000125560 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:55168004:55185077:-1 gene:ENSMUSG00000020264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// AF453744 // GenBank // Mus musculus proton/amino acid transporter 2 (PAT2) mRNA, complete cds. // chr11 // 93 // 83 // 27 // 29 // 0 /// AY228366 // GenBank // Mus musculus truncated SLC36A2 protein (Slc36a2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// BC044800 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:51510 IMAGE:4189221), complete cds. // chr11 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// NM_153170 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 2 (Slc36a2), mRNA. // chr11 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1 /// ENSMUST00000039305 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:55158470:55185077:-1 gene:ENSMUSG00000020264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1 /// AF512429 // GenBank // Mus musculus tramdorin 1 (Tramd1) mRNA, complete cds. // chr11 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// GENSCAN00000022478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:55159344:55170003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000022477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:55180328:55184959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001029988 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 2 (Drosophila) (Fat2), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000068853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:55250609:55336564:-1 gene:ENSMUSG00000055333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000108864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:55250610:55312257:-1 gene:ENSMUSG00000055333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AK173031 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0811 protein. // chr11 // 100 // 63 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:55251966:55350096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0
NM_009720 // RefSeq // Mus musculus ATX1 (antioxidant protein 1) homolog 1 (yeast) (Atox1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000108857 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:55446641:55461239:-1 gene:ENSMUSG00000018585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000138412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:55446644:55461197:-1 gene:ENSMUSG00000018585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// AF004591 // GenBank // Mus musculus copper transport protein Atox1 (ATOX1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC027632 // GenBank // Mus musculus ATX1 (antioxidant protein 1) homolog 1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:41183 IMAGE:1328907), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:55450501:55461093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT009838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0
NM_001290821 // RefSeq // Mus musculus glycine receptor, alpha 1 subunit (Glra1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_020492 // RefSeq // Mus musculus glycine receptor, alpha 1 subunit (Glra1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000075603 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:55514238:55607821:-1 gene:ENSMUSG00000000263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102716 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:55514238:55608198:-1 gene:ENSMUSG00000000263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000108853 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:55514238:55607733:-1 gene:ENSMUSG00000000263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AY129229 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 glycine receptor alpha 1 subunit (Glra1) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC131949 // GenBank // Mus musculus glycine receptor, alpha 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:163580 IMAGE:40130226), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC137725 // GenBank // Mus musculus glycine receptor, alpha 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:169349 IMAGE:8860744), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:55514813:55574409:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_153079 // RefSeq // Mus musculus neuromedin U receptor 2 (Nmur2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000037682 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:56024987:56041010:-1 gene:ENSMUSG00000037393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY057384 // GenBank // Mus musculus neuromedin U receptor type 2 mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC137611 // GenBank // Mus musculus neuromedin U receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:169235 IMAGE:8860630), complete cds. // chr11 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000054178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:55999775:56122293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001168667 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 114, member A2 (Fam114a2), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_001168668 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 114, member A2 (Fam114a2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_026342 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 114, member A2 (Fam114a2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000020831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:57482993:57518617:-1 gene:ENSMUSG00000020523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000108850 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:57483792:57518603:-1 gene:ENSMUSG00000020523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000130596 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:57507375:57518602:-1 gene:ENSMUSG00000020523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC019518 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 114, member A2, mRNA (cDNA clone MGC:28706 IMAGE:4456429), complete cds. // chr11 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:57484018:57523698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_008213 // RefSeq // Mus musculus heart and neural crest derivatives expressed transcript 1 (Hand1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000036917 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:57828707:57832147:-1 gene:ENSMUSG00000037335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000160392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:57828705:57832818:-1 gene:ENSMUSG00000037335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AK146084 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I530029C10 product:heart and neural crest derivatives expressed transcript 1, full insert sequence. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC050182 // GenBank // Mus musculus heart and neural crest derivatives expressed transcript 1, mRNA (cDNA clone MGC:60647 IMAGE:30022934), complete cds. // chr11 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// U21226 // GenBank // Mus musculus Thing1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U43714 // GenBank // Mus musculus helix-loop-helix transcription factor (Hxt) mRNA, complete cds. // chr11 // 64 // 54 // 9 // 14 // 0 /// GENSCAN00000019252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:57829599:57832871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 58 // 12 // 15 // 0
XR_394041 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12248 (Gm12248), transcript variant X1, misc_RNA. // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XR_394044 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12248 (Gm12248), transcript variant X4, misc_RNA. // chr11 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// ENSMUST00000137124 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58063828:58072937:-1 gene:ENSMUSG00000086962 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58063811:58072913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
XR_394051 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12247 (Gm12247), misc_RNA. // chr11 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// ENSMUST00000117585 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58097104:58097773:-1 gene:ENSMUSG00000081223 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001166669 // RefSeq // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 5 (Gemin5), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001166670 // RefSeq // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 5 (Gemin5), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001166671 // RefSeq // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 5 (Gemin5), transcript variant 4, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NM_172558 // RefSeq // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 5 (Gemin5), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000035604 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58121290:58168539:-1 gene:ENSMUSG00000037275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000102711 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58121290:58168539:-1 gene:ENSMUSG00000037275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000172035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58120002:58168539:-1 gene:ENSMUSG00000037275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC137802 // GenBank // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:169426 IMAGE:8860821), complete cds. // chr11 // 90 // 94 // 26 // 29 // 0 /// BC144922 // GenBank // Mus musculus gem (nuclear organelle) associated protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:178478 IMAGE:9053470), complete cds. // chr11 // 90 // 94 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58121514:58168453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000019250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58230480:58268994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSMUST00000065533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58327721:58330339:-1 gene:ENSMUSG00000049755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000053218 // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000185661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58327215:58330339:-1 gene:ENSMUSG00000049755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AK045609 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230215E14 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_207527 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930504O13 gene (4930504O13Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000064614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58446149:58452923:-1 gene:ENSMUSG00000052642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048595 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58644 IMAGE:6740346), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58446208:58458459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_146878 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 30 (Olfr30), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055204 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58455000:58455947:-1 gene:ENSMUSG00000043314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119375 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 30, mRNA (cDNA clone MGC:155691 IMAGE:8734124), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58446208:58458459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000122311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58477352:58478157:-1 gene:ENSMUSG00000081287 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58477685:58490753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001011770 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 332 (Olfr332), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180165 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58489719:58492499:-1 gene:ENSMUSG00000050813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58477685:58490753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_146879 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 330 (Olfr330), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000062869 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58529037:58529984:-1 gene:ENSMUSG00000050818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC120838 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 330, mRNA (cDNA clone MGC:156075 IMAGE:40129761), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000019236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58508791:58529984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0
NM_146502 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 328 (Olfr328), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000073933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58551305:58552237:-1 gene:ENSMUSG00000057654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000108824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58551305:58554642:-1 gene:ENSMUSG00000057654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC110465 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 328, mRNA (cDNA clone MGC:123536 IMAGE:40040838), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC110466 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 328, mRNA (cDNA clone MGC:123537 IMAGE:40040839), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58551305:58552237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_207695 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 224 (Olfr224), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000081102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58566399:58567343:-1 gene:ENSMUSG00000059279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000108822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58566397:58570559:-1 gene:ENSMUSG00000059279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000108823 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58566399:58568797:-1 gene:ENSMUSG00000059279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000033175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58566399:58567343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_144544 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2210407C18 gene (2210407C18Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000048801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58608209:58613492:-1 gene:ENSMUSG00000037145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000108821 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58608204:58616075:-1 gene:ENSMUSG00000037145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY148487 // GenBank // Mus musculus EP1 (Ep1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC019553 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2210407C18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28707 IMAGE:4456658), complete cds. // chr11 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// ENSMUST00000126695 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:58612315:58613485:-1 gene:ENSMUSG00000037145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58604680:58612878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT009937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_146376 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 323 (Olfr323), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070804 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58625073:58626044:-1 gene:ENSMUSG00000043880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58625073:58626044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011769 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 317 (Olfr317), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58732180:58733163:-1 gene:ENSMUSG00000060030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147131 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 317, mRNA (cDNA clone MGC:182300 IMAGE:9056194), complete cds. // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC147132 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 317, mRNA (cDNA clone MGC:182280 IMAGE:9056174), complete cds. // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58720126:58733163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001162878 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 183, member B (Fam183b), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NM_029283 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 183, member B (Fam183b), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060581 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58792811:58801960:-1 gene:ENSMUSG00000049154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000094156 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58792797:58801960:-1 gene:ENSMUSG00000049154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC126964 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 3100002J23 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40093265). // chr11 // 83 // 85 // 19 // 23 // 0 /// FJ468008 // GenBank // Mus musculus testis highly expressed protein 6 (Theg6) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000033204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58792889:58801899:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_011758 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 39 (Zfp39), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102703 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58888153:58904225:-1 gene:ENSMUSG00000037001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC108271 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 39, mRNA (cDNA clone MGC:107359 IMAGE:30102085), complete cds. // chr11 // 77 // 81 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58889268:58904117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_022423 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 187 (Rnf187), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000094151 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58932288:58938916:-1 gene:ENSMUSG00000020496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB030190 // GenBank // Mus musculus mRNA, complete cds, clone:2-24. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC072613 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 187, mRNA (cDNA clone IMAGE:6807364), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58933242:58944501:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_206882 // RefSeq // Mus musculus histone cluster 3, H2bb, pseudogene (Hist3h2bb-ps), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000117558 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:58954048:58954512:-1 gene:ENSMUSG00000080712 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107301 // GenBank // Mus musculus histone cluster 3, H2bb, mRNA (cDNA clone MGC:130255 IMAGE:40053183), complete cds. // chr11 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// BC107302 // GenBank // Mus musculus histone cluster 3, H2bb, mRNA (cDNA clone MGC:130256 IMAGE:40053184), complete cds. // chr11 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58954048:58954512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001171512 // RefSeq // Mus musculus obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF (Obscn), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000047441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:58994256:59136375:-1 gene:ENSMUSG00000061462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000138587 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:58994259:59035064:-1 gene:ENSMUSG00000061462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AY603754 // GenBank // Mus musculus obscurin-MLCK mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC046431 // GenBank // Mus musculus obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF, mRNA (cDNA clone IMAGE:4006702), partial cds. // chr11 // 83 // 26 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000033177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:58991456:59136375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0
NM_173785 // RefSeq // Mus musculus IBA57, iron-sulfur cluster assembly homolog (S. cerevisiae) (Iba57), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000054523 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59155369:59163739:-1 gene:ENSMUSG00000049287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC094909 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA A230051G13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107430 IMAGE:6432747), complete cds. // chr11 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// NM_001270791 // RefSeq // Mus musculus IBA57, iron-sulfur cluster assembly homolog (S. cerevisiae) (Iba57), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59158265:59163691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000069631 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:59161123:59163317:-1 gene:ENSMUSG00000049287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK016031 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930543L23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001270791 // RefSeq // Mus musculus IBA57, iron-sulfur cluster assembly homolog (S. cerevisiae) (Iba57), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_080454 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, gamma 2 (Gjc2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_175452 // RefSeq // Mus musculus gap junction protein, gamma 2 (Gjc2), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000108790 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59175568:59183213:-1 gene:ENSMUSG00000043448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000108793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59175568:59182826:-1 gene:ENSMUSG00000043448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC113759 // GenBank // Mus musculus gap junction protein, gamma 2, mRNA (cDNA clone MGC:130506 IMAGE:40046961), complete cds. // chr11 // 73 // 37 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000033169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59176332:59191811:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001159410 // RefSeq // Mus musculus guanylate kinase 1 (Guk1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NM_008193 // RefSeq // Mus musculus guanylate kinase 1 (Guk1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006532246 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanylate kinase 1 (Guk1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006532247 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanylate kinase 1 (Guk1), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000151211 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59184110:59185455:-1 gene:ENSMUSG00000020444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000170202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59183875:59191952:-1 gene:ENSMUSG00000020444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000170895 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:11:59184047:59187741:-1 gene:ENSMUSG00000020444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC024625 // GenBank // Mus musculus guanylate kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:25313 IMAGE:4485215), complete cds. // chr11 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// U53514 // GenBank // Mus musculus guanylate kinase (gmk) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59186182:59191812:-1 gene:ENSMUSG00000020444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000033169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59176332:59191811:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
ENSMUST00000101158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:59208246:59208720:-1 gene:ENSMUSG00000072898 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK137066 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430059O11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001130408 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor 1 (Arf1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// NM_007476 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor 1 (Arf1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000061242 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59211414:59228270:-1 gene:ENSMUSG00000048076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000163300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:59211412:59228162:-1 gene:ENSMUSG00000048076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC021403 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4009585). // chr11 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC031986 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:18993 IMAGE:4012689), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// D87898 // GenBank // Mus musculus mRNA for ARF1, complete cds. // chr11 // 80 // 77 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59212534:59240758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1
NM_009522 // RefSeq // Mus musculus wingless-type MMTV integration site family, member 3A (Wnt3a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000010044 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59248033:59290752:-1 gene:ENSMUSG00000009900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X56842 // GenBank // Mouse mRNA Wnt-3A for cysteine-rich protein. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59249630:59284164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001045521 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 38 (Prss38), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000061481 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59372669:59375657:-1 gene:ENSMUSG00000049291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC147400 // GenBank // Mus musculus gene model 249, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182561 IMAGE:9056455), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC147401 // GenBank // Mus musculus gene model 249, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:182553 IMAGE:9056447), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006532856 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 38 (Prss38), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59346456:59375630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_144521 // RefSeq // Mus musculus synaptosomal-associated protein, 47 (Snap47), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006534023 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptosomal-associated protein, 47 (Snap47), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000010038 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59407134:59449999:-1 gene:ENSMUSG00000009894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120940 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:59407144:59450007:-1 gene:ENSMUSG00000009894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000132969 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59438034:59449999:-1 gene:ENSMUSG00000009894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000136436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59428767:59449913:-1 gene:ENSMUSG00000009894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000156146 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59428761:59449999:-1 gene:ENSMUSG00000009894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC023182 // GenBank // Mus musculus synaptosomal-associated protein, 47, mRNA (cDNA clone MGC:37030 IMAGE:4949809), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC029025 // GenBank // Mus musculus synaptosomal-associated protein, 47, mRNA (cDNA clone MGC:32377 IMAGE:5036036), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59407664:59443068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_178417 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 867 (Zfp867), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057799 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59461197:59472474:-1 gene:ENSMUSG00000054519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC050078 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC050078, mRNA (cDNA clone MGC:60963 IMAGE:30008012), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000139707 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59525452:59526751:-1 gene:ENSMUSG00000020472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK155809 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730224P06 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT009982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001011789 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 222 (Olfr222), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000071943 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59570782:59571738:-1 gene:ENSMUSG00000059610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147220 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 222, mRNA (cDNA clone MGC:182359 IMAGE:9056253), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147221 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 222, mRNA (cDNA clone MGC:182353 IMAGE:9056247), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59570782:59571738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000117499 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59577992:59578636:-1 gene:ENSMUSG00000081262 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_146429 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 223 (Olfr223), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061293 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59589128:59590087:-1 gene:ENSMUSG00000048919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC119106 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 223, mRNA (cDNA clone MGC:155422 IMAGE:8733855), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC119108 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 223, mRNA (cDNA clone MGC:155424 IMAGE:8733857), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59589128:59590087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001290283 // RefSeq // Mus musculus phospholipase D family, member 6 (Pld6), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_183139 // RefSeq // Mus musculus phospholipase D family, member 6 (Pld6), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_110894 // RefSeq // Mus musculus phospholipase D family, member 6 (Pld6), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000051493 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59783897:59787645:-1 gene:ENSMUSG00000043648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000125307 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59784703:59787642:-1 gene:ENSMUSG00000043648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC119245 // GenBank // Mus musculus phospholipase D family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:155561 IMAGE:8733994), complete cds. // chr11 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000022613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59784978:59787635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001271356 // RefSeq // Mus musculus folliculin (Flcn), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001271357 // RefSeq // Mus musculus folliculin (Flcn), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_146018 // RefSeq // Mus musculus folliculin (Flcn), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NR_073164 // RefSeq // Mus musculus folliculin (Flcn), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000091246 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59791790:59809588:-1 gene:ENSMUSG00000032633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000102697 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59791408:59810016:-1 gene:ENSMUSG00000032633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000148151 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:59791457:59809924:-1 gene:ENSMUSG00000032633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AK136071 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420453B18 product:Folliculin homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC025820 // GenBank // Mus musculus folliculin, mRNA (cDNA clone MGC:37841 IMAGE:5099493), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59792610:59839724:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_009026 // RefSeq // Mus musculus RAS, dexamethasone-induced 1 (Rasd1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062405 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:59963181:59964944:-1 gene:ENSMUSG00000049892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF009246 // GenBank // Mus musculus ras-related protein (DEXRAS1) mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC034166 // GenBank // Mus musculus RAS, dexamethasone-induced 1, mRNA (cDNA clone MGC:36188 IMAGE:4989312), complete cds. // chr11 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// CT010376 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D0153D for gene Rasd1, RAS, dexamethasone-induced 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000022606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:59963810:59999585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSMUST00000130746 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60112219:60115230:-1 gene:ENSMUSG00000051008 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK029606 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930412M03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK089395 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730021I03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT010016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONMMUT010018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT010019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_022009 // RefSeq // Mus musculus flightless I homolog (Drosophila) (Flii), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006544727 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein flightless-1 homolog (LOC102642960), partial mRNA. // chr11 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000002889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60714143:60727263:-1 gene:ENSMUSG00000002812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF287264 // GenBank // Mus musculus cytoskeletal actin-modulating protein (Fliih) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC027744 // GenBank // Mus musculus flightless I homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:29363 IMAGE:5040746), complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60714313:60727189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_009410 // RefSeq // Mus musculus topoisomerase (DNA) III alpha (Top3a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000002891 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60740058:60777365:-1 gene:ENSMUSG00000002814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000102668 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:60741891:60777265:-1 gene:ENSMUSG00000002814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000117743 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:60740059:60777287:-1 gene:ENSMUSG00000002814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000120417 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:60742234:60777264:-1 gene:ENSMUSG00000002814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000130068 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:60761732:60777299:-1 gene:ENSMUSG00000002814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AB006074 // GenBank // Mus musculus mTOP3 mRNA for topoisomerase III, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK037640 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130032H22 product:topoisomerase (DNA) III alpha, full insert sequence. // chr11 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// BC099689 // GenBank // Mus musculus topoisomerase (DNA) III alpha, mRNA (cDNA clone MGC:106383 IMAGE:30731611), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000006442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60742404:60777101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0
XR_106240 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12618 (Gm12618), misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000121754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:60818796:60819278:-1 gene:ENSMUSG00000083016 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000006382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60818811:60819278:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001168507 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 11 (Tmem11), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_173453 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 11 (Tmem11), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062677 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60864452:60879272:-1 gene:ENSMUSG00000043284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000168218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:60864452:60879038:-1 gene:ENSMUSG00000043284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048514 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:58401 IMAGE:6594842), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000155031 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:60864987:60878787:-1 gene:ENSMUSG00000043284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60864832:60878768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_025294 // RefSeq // Mus musculus N-acetyltransferase domain containing 1 (Natd1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60902246:60913812:-1 gene:ENSMUSG00000018931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034332 // GenBank // Mus musculus gene trap locus F3b, mRNA (cDNA clone MGC:32304 IMAGE:5025968), complete cds. // chr11 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC038816 // GenBank // Mus musculus gene trap locus F3b, mRNA (cDNA clone MGC:46800 IMAGE:3490657), complete cds. // chr11 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:60906005:60918344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NR_027800 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase 3, opposite strand (Map2k3os), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123544 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:60920917:60931867:-1 gene:ENSMUSG00000042549 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC031537 // GenBank // Mus musculus gene trap locus F3a, mRNA (cDNA clone IMAGE:3979868). // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT010072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001004143 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 22 (Usp22), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000041683 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:61151785:61175055:-1 gene:ENSMUSG00000042506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000174035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:61155710:61159384:-1 gene:ENSMUSG00000042506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000174220 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:61162772:61175029:-1 gene:ENSMUSG00000042506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// AK040187 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430075H11 product:ubiquitin specific protease 22, full insert sequence. // chr11 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC080737 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 22, mRNA (cDNA clone MGC:91200 IMAGE:30431735), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:61130927:61184333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001033542 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 47, member 2 (Slc47a2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006533618 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 47, member 2 (Slc47a2), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000093029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:61301631:61342860:-1 gene:ENSMUSG00000069855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000134423 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:61303921:61342850:-1 gene:ENSMUSG00000069855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC147619 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 47, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:182715 IMAGE:9056609), complete cds. // chr11 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// BC157913 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 47, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:189943 IMAGE:9088130), complete cds. // chr11 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:61243938:61378047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
XM_006533996 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 47, member 1 (Slc47a1), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000131723 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:61343402:61378064:-1 gene:ENSMUSG00000010122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_026183 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 47, member 1 (Slc47a1), mRNA. // chr11 // 89 // 89 // 34 // 38 // 1 /// XM_006533993 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 47, member 1 (Slc47a1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// ENSMUST00000010267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:61343401:61378081:-1 gene:ENSMUSG00000010122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 89 // 34 // 38 // 1 /// XM_006533995 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 47, member 1 (Slc47a1), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// ENSMUST00000148671 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:61362886:61378345:-1 gene:ENSMUSG00000010122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// GENSCAN00000006418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:61243938:61378047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1
XM_890719 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 12271 (Gm12271), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000121719 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:61416402:61416815:-1 gene:ENSMUSG00000082032 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000006439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:61416402:61416815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XR_141098 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B9 protein domain 1, opposite strand (B9d1os), misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000137010 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:61504386:61505059:-1 gene:ENSMUSG00000060808 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK014168 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110043A19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033227 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 10 (Slc5a10), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006531977 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 10 (Slc5a10), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// XM_006531981 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 10 (Slc5a10), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000051552 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:61672782:61720799:-1 gene:ENSMUSG00000042371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000128196 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:61672781:61720826:-1 gene:ENSMUSG00000042371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENSMUST00000148584 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:61672792:61719997:-1 gene:ENSMUSG00000042371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC141325 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:176286 IMAGE:9055937), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000151780 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:61672782:61719946:-1 gene:ENSMUSG00000042371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// GENSCAN00000012447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:61673005:61678693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000012424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:61709141:61725096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_013881 // RefSeq // Mus musculus unc-51 like kinase 2 (Ulk2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006533508 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus unc-51 like kinase 2 (Ulk2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000004920 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:61775649:61855073:-1 gene:ENSMUSG00000004798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000129025 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:61777502:61854502:-1 gene:ENSMUSG00000004798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AB019577 // GenBank // Mus musculus mRNA for UNC-51-like kinase (ULK) 2, complete cds. // chr11 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// AF145922 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase UNC51.2 (Unc51.2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC046778 // GenBank // Mus musculus Unc-51 like kinase 2 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:61227 IMAGE:5709559), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC053029 // GenBank // Mus musculus Unc-51 like kinase 2 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:62255 IMAGE:5709559), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:61779576:61854576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000101077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:61864568:61867269:-1 gene:ENSMUSG00000072847 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000148413 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:61865203:61868058:-1 gene:ENSMUSG00000072847 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK040705 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530017D24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK138613 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330075L03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// NONMMUT010111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONMMUT010112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_027198 // RefSeq // Mus musculus zinc finger SWIM-type containing 7 (Zswim7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000072916 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:62267224:62281375:-1 gene:ENSMUSG00000014243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC109343 // GenBank // Mus musculus zinc finger, SWIM-type containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:130274 IMAGE:40053371), complete cds. // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:62267454:62275832:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NM_198861 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 75A (Lrrc75a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006532577 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 211, member A (Fam211a), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000057194 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:62604884:62648523:-1 gene:ENSMUSG00000046417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128705 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:62605823:62648040:-1 gene:ENSMUSG00000046417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000143262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:62606027:62648049:-1 gene:ENSMUSG00000046417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AK146714 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days pregnant adult female amnion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920046F18 product:weakly similar to Hypothetical gene supported by BC017595 (Fragment) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC053455 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC046404, mRNA (cDNA clone MGC:59632 IMAGE:6513708), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006532578 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 211, member A (Fam211a), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000051167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:62602862:62648390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000117937 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:62750064:62751280:-1 gene:ENSMUSG00000084020 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000051163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:62750064:62757150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
NM_018805 // RefSeq // Mus musculus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3B1 (Hs3st3b1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000094103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:63885792:63922290:-1 gene:ENSMUSG00000070407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// AF168992 // GenBank // Mus musculus D-glycosaminyl 3-O-sulfotransferase-3B mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// BC116733 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3B1, mRNA (cDNA clone MGC:151110 IMAGE:40126052), complete cds. // chr11 // 85 // 59 // 11 // 13 // 0 /// BC116743 // GenBank // Mus musculus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3B1, mRNA (cDNA clone MGC:151120 IMAGE:40126062), complete cds. // chr11 // 85 // 59 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000035294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:63889127:63950431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_178379 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase assembly protein 10 (Cox10), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000049091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:63962627:64079466:-1 gene:ENSMUSG00000042148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000125702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:64071398:64079468:-1 gene:ENSMUSG00000042148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC038046 // GenBank // Mus musculus COX10 homolog, cytochrome c oxidase assembly protein, heme A: farnesyltransferase (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:47032 IMAGE:4206826), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006534168 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome c oxidase assembly protein 10 (Cox10), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// AK172718 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830304K23 product:COX10 homolog, cytochrome c oxidase assembly protein, heme A: farnesyltransferase (yeast), full insert sequence. // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000035291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:64042474:64110140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NR_028445 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA F930015N05 gene (F930015N05Rik), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000177999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:64435156:64436653:-1 gene:ENSMUSG00000095224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000102439 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:65067709:65067807:-1 gene:ENSMUSG00000076394 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT010232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XR_388748 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700086D15 gene (1700086D15Rik), transcript variant X2, ncRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000020855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:65151910:65159890:-1 gene:ENSMUSG00000020548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000108696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:65151910:65159891:-1 gene:ENSMUSG00000020548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK007013 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700086D15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_394085 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700086D15 gene (1700086D15Rik), transcript variant X1, ncRNA. // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_145136 // RefSeq // Mus musculus myocardin (Myocd), transcript variant A, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_146386 // RefSeq // Mus musculus myocardin (Myocd), transcript variant B, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000101042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:65178428:65218559:-1 gene:ENSMUSG00000020542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000102635 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:65176561:65269941:-1 gene:ENSMUSG00000020542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000108695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:65176574:65269989:-1 gene:ENSMUSG00000020542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF384055 // GenBank // Mus musculus transcription factor myocardin mRNA, complete cds. // chr11 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// AF437877 // GenBank // Mus musculus myocardin A (BSAC2A) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// AY303755 // GenBank // Mus musculus myocardin A mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC141281 // GenBank // Mus musculus myocardin, mRNA (cDNA clone MGC:176242 IMAGE:9055893), complete cds. // chr11 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:65178445:65345721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1
NM_009157 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase 4 (Map2k4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006533370 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase 4 (Map2k4), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000046963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:65688243:65788297:-1 gene:ENSMUSG00000033352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000125598 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:11:65690333:65719603:-1 gene:ENSMUSG00000033352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000140301 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:65696288:65788285:-1 gene:ENSMUSG00000033352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000152096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:65712219:65788286:-1 gene:ENSMUSG00000033352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// BC029833 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:36532 IMAGE:3962163), complete cds. // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// U18310 // GenBank // Mus musculus protein kinase (SEK1) mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000000431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:65690691:65788244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_001099633 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 9 (Dnah9), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 70 // 70 // 0 /// ENSMUST00000080665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:65831282:66168533:-1 gene:ENSMUSG00000056752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 70 // 70 // 0 /// ENSMUST00000108691 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:66121091:66168444:-1 gene:ENSMUSG00000056752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 16 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000152386 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:65831403:66005195:-1 gene:ENSMUSG00000056752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 32 // 32 // 0 /// AK082443 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230051G16 product:similar to CILIARY DYNEIN HEAVY CHAIN (AXONEMAL DYNEIN HEAVY CHAIN) (DYNEIN HEAVY CHAIN 9) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 100 // 16 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000000400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:65831559:65982245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 40 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:66067740:66111423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 16 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000000427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:65987189:66061903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 21 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000000429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:66112058:66168467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 19 // 19 // 13 // 70 // 1 /// AK122256 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0357 protein. // chr11 // 21 // 21 // 15 // 70 // 1
NM_001034874 // RefSeq // Mus musculus shisa homolog 6 (Xenopus laevis) (Shisa6), mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006533619 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus shisa homolog 6 (Xenopus laevis) (Shisa6), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000066679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:66217472:66525964:-1 gene:ENSMUSG00000053930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000123454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:66211725:66525795:-1 gene:ENSMUSG00000053930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000134562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:66375133:66502814:-1 gene:ENSMUSG00000053930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000000423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:66217472:66234196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000007512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:66502652:66525964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT010266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0
NR_033539 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 12298 (Gm12298), long non-coding RNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000126999 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:66905721:66947086:-1 gene:ENSMUSG00000072834 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT010270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_025510 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribose/CDP-alcohol diphosphatase, manganese dependent (Adprm), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000116363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:67038041:67052570:-1 gene:ENSMUSG00000020910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000146338 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67037905:67052594:-1 gene:ENSMUSG00000020910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC004029 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310004I24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7625 IMAGE:3495093), complete cds. // chr11 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// ENSMUST00000136013 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67038269:67040527:-1 gene:ENSMUSG00000020910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67038141:67042081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT010278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_175681 // RefSeq // Mus musculus glucagon-like peptide 2 receptor (Glp2r), mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000051765 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:67706430:67771153:-1 gene:ENSMUSG00000049928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AY605231 // GenBank // Mus musculus glucagon-like peptide-2 receptor mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0 /// BC044746 // GenBank // Mus musculus glucagon-like peptide 2 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:51728 IMAGE:5363416), complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006534562 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucagon-like peptide 2 receptor (Glp2r), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// ENSMUST00000021289 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67661502:67757703:-1 gene:ENSMUSG00000049928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// AK035702 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530092J08 product:similar to GLUCAGON-LIKE PEPTIDE 2 RECEPTOR PRECURSOR (GLP-2 RECEPTOR) (GLP-2-R) (GLP-2R) [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr11 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// GENSCAN00000017204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67736262:67764866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000017212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67709483:67733386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0
NM_001291049 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 43 (Usp43), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_173754 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 43 (Usp43), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000021288 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:67854523:67922153:-1 gene:ENSMUSG00000020905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000108677 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:67854523:67922153:-1 gene:ENSMUSG00000020905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC021474 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 43, mRNA (cDNA clone MGC:38313 IMAGE:5343429), complete cds. // chr11 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// ENSMUST00000152120 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67897239:67921209:-1 gene:ENSMUSG00000020905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000017202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67855481:67922048:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT010306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_027963 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 16 (Wdr16), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021287 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:67924808:67965642:-1 gene:ENSMUSG00000020904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000126766 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:67938807:67965651:-1 gene:ENSMUSG00000020904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AK016839 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933417B11 product:hypothetical G-protein beta WD-40 repeats containing protein, full insert sequence. // chr11 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// BC118541 // GenBank // Mus musculus WD repeat domain 16, mRNA (cDNA clone MGC:141350 IMAGE:40058756), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:67925093:67965591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_008744 // RefSeq // Mus musculus netrin 1 (Ntn1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000021284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:68209364:68386826:-1 gene:ENSMUSG00000020902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000108674 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:68209364:68400823:-1 gene:ENSMUSG00000020902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF128865 // GenBank // Mus musculus netrin-1 precursor, mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC141294 // GenBank // Mus musculus netrin 1, mRNA (cDNA clone MGC:176255 IMAGE:9055906), complete cds. // chr11 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// U65418 // GenBank // Mus musculus Netrin-1 (netrin-1) mRNA, complete cds. // chr11 // 61 // 67 // 11 // 18 // 0 /// GENSCAN00000017198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:68213006:68316979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_145746 // RefSeq // Mus musculus outer dense fiber of sperm tails 4 (Odf4), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000038932 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:68921835:68927049:-1 gene:ENSMUSG00000032921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000125134 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:68922819:68927074:-1 gene:ENSMUSG00000032921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000130271 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:68921836:68927081:-1 gene:ENSMUSG00000032921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000156828 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:68921963:68926816:-1 gene:ENSMUSG00000032921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// AB074438 // GenBank // Mus musculus mRNA for OPPO 1, complete cds. // chr11 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// BC060992 // GenBank // Mus musculus outer dense fiber of sperm tails 4, mRNA (cDNA clone MGC:74088 IMAGE:6773583), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:68921958:68955024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NM_001159519 // RefSeq // Mus musculus phosphoribosylformylglycinamidine synthase (FGAR amidotransferase) (Pfas), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000021282 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:68985697:69008460:-1 gene:ENSMUSG00000020899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000172915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:68985700:68994276:-1 gene:ENSMUSG00000020899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC114997 // GenBank // Mus musculus phosphoribosylformylglycinamidine synthase (FGAR amidotransferase), mRNA (cDNA clone MGC:118146 IMAGE:30110327), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSMUST00000172987 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:68996955:69008451:-1 gene:ENSMUSG00000020899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// AK139115 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730032G07 product:Phosphoribosylformylglycinamidine synthase (EC 6.3.5.3) (FGAM synthase) (FGAMS) (Formylglycinamide ribotide amidotransferase) (FGARAT) (Formylglycinamide ribotide synthetase) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr11 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000023469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:68972939:69003837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000101007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69057718:69060483:-1 gene:ENSMUSG00000072809 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK137386 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630042H03 product:hypothetical Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT010376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000180487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:69120054:69122589:-1 gene:ENSMUSG00000097386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK033665 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cecum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9130213A22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009661 // RefSeq // Mus musculus arachidonate 8-lipoxygenase (Alox8), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000021262 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69183932:69197843:-1 gene:ENSMUSG00000020891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000094078 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:69185090:69197809:-1 gene:ENSMUSG00000020891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000144787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69189872:69197811:-1 gene:ENSMUSG00000020891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// AK158553 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230011N15 product:arachidonate 15-lipoxygenase, second type, full insert sequence. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC015253 // GenBank // Mus musculus arachidonate 8-lipoxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:18359 IMAGE:4221815), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// U93277 // GenBank // Mus musculus 8S-lipoxygenase mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69185090:69197809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_008192 // RefSeq // Mus musculus guanylate cyclase 2e (Gucy2e), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006532243 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus guanylate cyclase 2e (Gucy2e), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000021259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:69218117:69237022:-1 gene:ENSMUSG00000020890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000108664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69221158:69237036:-1 gene:ENSMUSG00000020890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000108665 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69218120:69237022:-1 gene:ENSMUSG00000020890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000155457 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69226635:69237022:-1 gene:ENSMUSG00000020890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// AK044282 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930005H11 product:guanylate cyclase 2e, full insert sequence. // chr11 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69221152:69236645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0
NM_172560 // RefSeq // Mus musculus centrobin, centrosomal BRCA2 interacting protein (Cntrob), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006532878 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centrobin, centrosomal BRCA2 interacting protein (Cntrob), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000092973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69299487:69323775:-1 gene:ENSMUSG00000032782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000123176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69299487:69323775:-1 gene:ENSMUSG00000032782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000125777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69314776:69320072:-1 gene:ENSMUSG00000032782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// BC058512 // GenBank // Mus musculus centrobin, centrosomal BRCA2 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:66579 IMAGE:6817014), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000023461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69302103:69322962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0
NM_146019 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 3 (Chd3), mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// XM_006532887 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 3 (Chd3), transcript variant X9, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000092971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:69344351:69369391:-1 gene:ENSMUSG00000018474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000108661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69343273:69369406:-1 gene:ENSMUSG00000018474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000128981 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:69345136:69364779:-1 gene:ENSMUSG00000018474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// BC060721 // GenBank // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6406263), partial cds. // chr11 // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000122992 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69343273:69348610:-1 gene:ENSMUSG00000018474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 20 // 20 // 9 // 46 // 1 /// BC030435 // GenBank // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5369285), complete cds. // chr11 // 20 // 20 // 9 // 46 // 1 /// GENSCAN00000023458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69344351:69369391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0
NM_001045525 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b5 domain containing 1 (Cyb5d1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000042595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:28339104:28339867:-1 gene:ENSMUSG00000032889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// ENSMUST00000051620 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69393612:69395333:-1 gene:ENSMUSG00000044795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000108660 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69393263:69395333:-1 gene:ENSMUSG00000044795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC099556 // GenBank // Mus musculus cytochrome b5 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:118302 IMAGE:30915659), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000134903 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69391925:69395631:-1 gene:ENSMUSG00000044795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000023454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69393638:69395293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:28339128:28438735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 80 // 20 // 24 // 0
NM_025915 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 88 (Tmem88), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000050140 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69396519:69398234:-1 gene:ENSMUSG00000045377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC120912 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 88, mRNA (cDNA clone MGC:143608 IMAGE:40091214), complete cds. // chr11 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000023448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69397612:69398225:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_001017426 // RefSeq // Mus musculus KDM1 lysine (K)-specific demethylase 6B (Kdm6b), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006532893 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus KDM1 lysine (K)-specific demethylase 6B (Kdm6b), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 98 // 94 // 44 // 45 // 0 /// XM_006532894 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus KDM1 lysine (K)-specific demethylase 6B (Kdm6b), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 98 // 90 // 42 // 43 // 0 /// XM_006532895 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus KDM1 lysine (K)-specific demethylase 6B (Kdm6b), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 98 // 90 // 42 // 43 // 0 /// XM_006532896 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus KDM1 lysine (K)-specific demethylase 6B (Kdm6b), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 98 // 90 // 42 // 43 // 0 /// ENSMUST00000094077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69398508:69413675:-1 gene:ENSMUSG00000018476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// BC075632 // GenBank // Mus musculus jumonji domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:91376 IMAGE:30362899), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000023455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69399826:69477755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0
NM_001081330 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 2 (Dnah2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 85 // 85 // 0 /// XM_006533559 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 2 (Dnah2), transcript variant X8, mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 74 // 74 // 0 /// XM_006533560 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, axonemal, heavy chain 2 (Dnah2), transcript variant X9, mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 74 // 74 // 0 /// ENSMUST00000035539 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69420809:69544556:-1 gene:ENSMUSG00000005237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 85 // 85 // 0 /// ENSMUST00000108659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:69420809:69549108:-1 gene:ENSMUSG00000005237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 85 // 85 // 0 /// ENSMUST00000149991 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69510666:69549110:-1 gene:ENSMUSG00000005237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 13 // 11 // 11 // 0 /// AK051796 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130094J20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr11 // 91 // 13 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000023455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69399826:69477755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 64 // 64 // 54 // 85 // 1 /// GENSCAN00000009392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69478025:69579312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 34 // 34 // 29 // 85 // 1
NM_007911 // RefSeq // Mus musculus ephrin B3 (Efnb3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006532160 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ephrin B3 (Efnb3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000004036 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69554092:69560205:-1 gene:ENSMUSG00000003934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF025288 // GenBank // Mus musculus m-ephrin-B3 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC052001 // GenBank // Mus musculus ephrin B3, mRNA (cDNA clone MGC:62320 IMAGE:5695429), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC058617 // GenBank // Mus musculus ephrin B3, mRNA (cDNA clone MGC:64741 IMAGE:5695418), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69478025:69579312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_144824 // RefSeq // Mus musculus WD repeat containing, antisense to Trp53 (Wrap53), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000048139 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69561759:69579324:-1 gene:ENSMUSG00000041346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000155894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69561758:69563922:-1 gene:ENSMUSG00000041346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// AK169271 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920161K01 product:similar to Guanine nucleotide-binding protein beta 5 [Mesocricetus auratus], full insert sequence. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC021790 // GenBank // Mus musculus WD repeat containing, antisense to TP53, mRNA (cDNA clone MGC:28622 IMAGE:4220923), complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// BC069868 // GenBank // Mus musculus WD repeat containing, antisense to TP53, mRNA (cDNA clone MGC:78058 IMAGE:5101220), complete cds. // chr11 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69478025:69579312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1
NM_013415 // RefSeq // Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide (Atp1b2), mRNA. // chr11 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// ENSMUST00000047889 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69599736:69605829:-1 gene:ENSMUSG00000041329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// ENSMUST00000130394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69599741:69605942:-1 gene:ENSMUSG00000041329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000138694 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69600666:69602741:-1 gene:ENSMUSG00000041329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000144425 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69601358:69603613:-1 gene:ENSMUSG00000041329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 91 // 71 // 20 // 22 // 0 /// BC042467 // GenBank // Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:21650 IMAGE:4500972), complete cds. // chr11 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// BC058763 // GenBank // Mus musculus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:65256 IMAGE:6490870), complete cds. // chr11 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// ENSMUST00000153198 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69602144:69603162:-1 gene:ENSMUSG00000041329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// GENSCAN00000009463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69601248:69617862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NM_011367 // RefSeq // Mus musculus sex hormone binding globulin (Shbg), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000005334 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69614804:69617905:-1 gene:ENSMUSG00000005202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000137159 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69615648:69616940:-1 gene:ENSMUSG00000005202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC120785 // GenBank // Mus musculus sex hormone binding globulin, mRNA (cDNA clone MGC:156022 IMAGE:40129708), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC120787 // GenBank // Mus musculus sex hormone binding globulin, mRNA (cDNA clone MGC:156024 IMAGE:40129710), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U85644 // GenBank // Mus musculus testis-specific androgen-binding protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT010420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69601248:69617862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_001291058 // RefSeq // Mus musculus CD68 antigen (Cd68), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000018918 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69664213:69666153:-1 gene:ENSMUSG00000018774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000108654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:69664371:69666062:-1 gene:ENSMUSG00000018774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC021637 // GenBank // Mus musculus CD68 antigen, mRNA (cDNA clone MGC:13848 IMAGE:3981024), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NR_110993 // RefSeq // Mus musculus CD68 antigen (Cd68), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr11 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// ENSMUST00000154124 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69664306:69666062:-1 gene:ENSMUSG00000018774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000009388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69664371:69665874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000083928 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:11:69667834:69667976:-1 gene:ENSMUSG00000065862 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000133067 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69667453:69668289:-1 gene:ENSMUSG00000059796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000142348 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69667222:69668237:-1 gene:ENSMUSG00000059796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONMMUT010431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONMMUT010432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001163571 // RefSeq // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 3 (Senp3), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// NM_030702 // RefSeq // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 3 (Senp3), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000005336 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69673115:69681846:-1 gene:ENSMUSG00000005204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000066760 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69673121:69682084:-1 gene:ENSMUSG00000005204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// AY008764 // GenBank // Mus musculus sentrin/SUMO-specific protease (SENP3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// BC037014 // GenBank // Mus musculus SUMO/sentrin specific peptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:46759 IMAGE:5344274), complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000123084 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69673116:69674976:-1 gene:ENSMUSG00000005204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// AF194031 // GenBank // Mus musculus SMT3 isopeptidase 1 (Smt3ip) mRNA, complete cds. // chr11 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
NM_001291068 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A (Polr2a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000058470 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69733997:69758637:-1 gene:ENSMUSG00000005198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000071213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:69734410:69758223:-1 gene:ENSMUSG00000005198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// U37500 // GenBank // Mus musculus RNA polymerase II largest subunit (RPB1) mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69734410:69758223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_019871 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member G3 (Slc35g3), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69759890:69761968:-1 gene:ENSMUSG00000018776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF016712 // GenBank // Mus musculus testicular condensing enzyme (AMAC1) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC137893 // GenBank // Mus musculus acyl-malonyl condensing enzyme 1, mRNA (cDNA clone MGC:169517 IMAGE:8860912), complete cds. // chr11 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// BC137894 // GenBank // Mus musculus acyl-malonyl condensing enzyme 1, mRNA (cDNA clone MGC:169518 IMAGE:8860913), complete cds. // chr11 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69760135:69761684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NM_009601 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 1 (muscle) (Chrnb1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006532005 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 1 (muscle) (Chrnb1), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045971 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69784036:69795943:-1 gene:ENSMUSG00000041189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000147791 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69793520:69795905:-1 gene:ENSMUSG00000041189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr11 // 92 // 35 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000154816 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69792704:69794270:-1 gene:ENSMUSG00000041189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr11 // 92 // 35 // 11 // 12 // 0 /// BC023318 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 1 (muscle), mRNA (cDNA clone MGC:28277 IMAGE:4009493), complete cds. // chr11 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// M14537 // GenBank // Mouse nicotinic acetylcholine receptor beta subunit mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69784621:69801625:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
NM_001291104 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor 11 (Fgf11), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NM_010198 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor 11 (Fgf11), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000011285 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:11:69796068:69801716:-1 gene:ENSMUSG00000042826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000102585 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69796073:69801857:-1 gene:ENSMUSG00000042826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC066859 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor 11, mRNA (cDNA clone MGC:76712 IMAGE:30101881), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// U66203 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor homologous factor 3 (FHF-3) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69784621:69801625:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1
NM_001033433 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 102 (Tmem102), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000051025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69803603:69805624:-1 gene:ENSMUSG00000089876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC144871 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053419. // chr11 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69803615:69805233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_175368 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933402P03 gene (4933402P03Rik), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69816566:69818465:-1 gene:ENSMUSG00000044084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137961 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933402P03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169585 IMAGE:8860980), complete cds. // chr11 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69811117:69818397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_028855 // RefSeq // Mus musculus sperm maturation 1 (Spem1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000045771 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69820876:69822180:-1 gene:ENSMUSG00000041165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC100505 // GenBank // Mus musculus sperm maturation 1, mRNA (cDNA clone MGC:118350 IMAGE:30917608), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC144838 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053386. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EF120626 // GenBank // Mus musculus spermatid maturation 1 (Spem1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69820904:69834438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_198862 // RefSeq // Mus musculus neuroligin 2 (Nlgn2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000056484 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69823122:69834849:-1 gene:ENSMUSG00000051790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000108634 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69823122:69837784:-1 gene:ENSMUSG00000051790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000139893 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:11:69827739:69834259:-1 gene:ENSMUSG00000051790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// BC056478 // GenBank // Mus musculus neuroligin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5686403), complete cds. // chr11 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000009477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69820904:69834438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_031880 // RefSeq // Mus musculus tyrosine kinase, non-receptor, 1 (Tnk1), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000001626 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69851005:69858730:-1 gene:ENSMUSG00000001583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000108626 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69854480:69858730:-1 gene:ENSMUSG00000001583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000125571 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69855581:69858708:-1 gene:ENSMUSG00000001583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 37 // 13 // 14 // 0 /// AF307746 // GenBank // Mus musculus non-receptor tyrosine kinase (Kos1) mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 53 // 19 // 20 // 0 /// AF332512 // GenBank // Mus musculus non-receptor tyrosine kinase (Tnk1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// BC029623 // GenBank // Mus musculus tyrosine kinase, non-receptor, 1, mRNA (cDNA clone MGC:25809 IMAGE:4039780), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC055303 // GenBank // Mus musculus tyrosine kinase, non-receptor, 1, mRNA (cDNA clone MGC:62548 IMAGE:6439288), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000108628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69851219:69857125:-1 gene:ENSMUSG00000001583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// ENSMUST00000156507 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:11:69852075:69855602:-1 gene:ENSMUSG00000001583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000009391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:69851602:69857074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0
NM_001195710 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 95 (Tmem95), mRNA. // chr11 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// NM_153143 // RefSeq // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 11 (Kctd11), mRNA. // chr11 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000050555 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:69878261:69881406:-1 gene:ENSMUSG00000046731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000178597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:11:69876684:69878018:-1 gene:ENSMUSG00000094845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// AF465352 // GenBank // Mus musculus REN (Ren) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// BC052502 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:62965 IMAGE:5119264), complete cds. // chr11 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// BC052734 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:64618 IMAGE:6816736), complete cds. // chr11 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT010455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr11 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
NM_172371 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 13 (Slc16a13), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006534113 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 13 (Slc16a13), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000060010 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70216789:70220994:-1 gene:ENSMUSG00000044367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC039949 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 13, mRNA (cDNA clone MGC:49559 IMAGE:4167719), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70217716:70220677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_007528 // RefSeq // Mus musculus B cell CLL/lymphoma 6, member B (Bcl6b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000000326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:11:70224128:70229739:-1 gene:ENSMUSG00000000317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB011665 // GenBank // Mus musculus mRNA for BAZF, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC090998 // GenBank // Mus musculus B-cell CLL/lymphoma 6, member B, mRNA (cDNA clone MGC:107669 IMAGE:6750884), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:11:70226027:70239733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1