NR_045803 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933440M02 gene (4933440M02Rik), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NR_045804 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933440M02 gene (4933440M02Rik), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000061823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:125329643:125349772:-1 gene:ENSMUSG00000045928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK031079 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930403A22 product:RIKEN cDNA 4933440M02 gene, full insert sequence. // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONMMUT063594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT063586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_026330 // RefSeq // Mus musculus non-SMC element 1 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006508134 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus non-SMC element 1 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// XM_006508135 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus non-SMC element 1 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// XM_006508137 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus non-SMC element 1 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce1), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000033006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:125467640:125491596:-1 gene:ENSMUSG00000030750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC031848 // GenBank // Mus musculus non-SMC element 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:25737 IMAGE:3984224), complete cds. // chr7 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC049558 // GenBank // Mus musculus non-SMC element 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:58146 IMAGE:6707952), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000138616 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:125471113:125491399:-1 gene:ENSMUSG00000030750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// GENSCAN00000049435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:125467764:125491443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 81 // 16 // 17 // 0
NM_207239 // RefSeq // Mus musculus general transcription factor III C 1 (Gtf3c1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000055506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:125640955:125707780:-1 gene:ENSMUSG00000032777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AK139264 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730084M02 product:general transcription factor III C 1, full insert sequence. // chr7 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// BC067041 // GenBank // Mus musculus general transcription factor III C 1, mRNA (cDNA clone MGC:92928 IMAGE:6853285), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000015864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:125641506:125741252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0
NM_001101488 // RefSeq // Mus musculus GSG1-like (Gsg1l), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006507898 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GSG1-like (Gsg1l), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000073935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:125878419:126082411:-1 gene:ENSMUSG00000046182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006507899 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus GSG1-like (Gsg1l), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000015857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:125876088:125973199:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000015852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:125977002:126082178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_010689 // RefSeq // Mus musculus linker for activation of T cells (Lat), mRNA. // chr7 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// XM_006507396 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus linker for activation of T cells (Lat), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000032997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:126363832:126369543:-1 gene:ENSMUSG00000030742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF036907 // GenBank // Mus musculus linker for activation of T cells (LAT) mRNA, complete cds. // chr7 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// AK134003 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830404F05 product:linker for activation of T cells, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC013337 // GenBank // Mus musculus linker for activation of T cells, mRNA (cDNA clone MGC:13859 IMAGE:4191983), complete cds. // chr7 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC052340 // GenBank // Mus musculus linker for activation of T cells, mRNA (cDNA clone MGC:60595 IMAGE:30077071), complete cds. // chr7 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000015851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126318769:126377077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_010900 // RefSeq // Mus musculus nuclear factor of activated T cells, cytoplasmic, calcineurin dependent 2 interacting protein (Nfatc2ip), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006507430 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear factor of activated T cells, cytoplasmic, calcineurin dependent 2 interacting protein (Nfatc2ip), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075671 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:126382854:126396737:-1 gene:ENSMUSG00000030722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC113761 // GenBank // Mus musculus nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 2 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:130564 IMAGE:40054445), complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// U76759 // GenBank // Mus musculus nuclear protein NIP45 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126384981:126414836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_009844 // RefSeq // Mus musculus CD19 antigen (Cd19), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006507282 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CD19 antigen (Cd19), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000032968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:126408450:126414870:-1 gene:ENSMUSG00000030724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126384981:126414836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_007504 // RefSeq // Mus musculus ATPase, Ca++ transporting, cardiac muscle, fast twitch 1 (Atp2a1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000032974 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:126445858:126463108:-1 gene:ENSMUSG00000030730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000146973 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:126445860:126447645:-1 gene:ENSMUSG00000030730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// AY081946 // GenBank // Mus musculus calcium-transporting ATPase (Atp2a1) mRNA, complete cds. // chr7 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// BC036292 // GenBank // Mus musculus ATPase, Ca++ transporting, cardiac muscle, fast twitch 1, mRNA (cDNA clone MGC:28518 IMAGE:4191741), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000015862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126446034:126475205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 89 // 40 // 41 // 0
NM_183020 // RefSeq // Mus musculus ataxin 2-like (Atxn2l), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000040202 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:126491708:126503437:-1 gene:ENSMUSG00000032637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000166682 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:126492963:126502318:-1 gene:ENSMUSG00000032637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000167759 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:126491715:126502414:-1 gene:ENSMUSG00000032637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000179818 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:126499150:126502100:-1 gene:ENSMUSG00000032637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// AK168745 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920049I02 product:ataxin 2 related protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC054483 // GenBank // Mus musculus ataxin 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:62777 IMAGE:6391591), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000015856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126492143:126506957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0
NM_146200 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit C (Eif3c), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000032992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:126546455:126566411:-1 gene:ENSMUSG00000030738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC024855 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit C, mRNA (cDNA clone MGC:36637 IMAGE:5359060), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC025032 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit C, mRNA (cDNA clone MGC:36328 IMAGE:4947435), complete cds. // chr7 // 95 // 100 // 37 // 39 // 0 /// U67328 // GenBank // Mus musculus NIPI-like protein (NIPIL(A3)) mRNA, complete cds. // chr7 // 61 // 46 // 11 // 18 // 0 /// GENSCAN00000056107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126546998:126567828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0
ENSMUST00000083407 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:126567044:126567149:-1 gene:ENSMUSG00000065341 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT063644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_145636 // RefSeq // Mus musculus interleukin 27 (Il27), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:126589010:126594941:-1 gene:ENSMUSG00000044701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY099297 // GenBank // Mus musculus IL-27 p28 subunit mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC119402 // GenBank // Mus musculus interleukin 27, mRNA (cDNA clone MGC:155718 IMAGE:8734151), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126589295:126595264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0
ENSMUST00000084587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:126649223:126649570:-1 gene:ENSMUSG00000066175 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187458 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:126648543:126649594:-1 gene:ENSMUSG00000066175 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK020571 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530025I05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133670 // RefSeq // Mus musculus sulfotransferase family 1A, phenol-preferring, member 1 (Sult1a1), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006507538 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sulfotransferase family 1A, phenol-preferring, member 1 (Sult1a1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000106371 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:126672870:126676357:-1 gene:ENSMUSG00000030711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000106372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:126672871:126676357:-1 gene:ENSMUSG00000030711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000106373 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:126672865:126676432:-1 gene:ENSMUSG00000030711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000155419 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:126674268:126676375:-1 gene:ENSMUSG00000030711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC005413 // GenBank // Mus musculus sulfotransferase family 1A, phenol-preferring, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:5691 IMAGE:3488459), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126673143:126713164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSMUST00000122029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:126687459:126690034:-1 gene:ENSMUSG00000082922 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr7 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000068836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:126774965:126776818:-1 gene:ENSMUSG00000055323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK035633 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530079E12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019674 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 4, catalytic subunit (Ppp4c), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006508049 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 4, catalytic subunit (Ppp4c), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000032936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:126785907:126792471:-1 gene:ENSMUSG00000030697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF088911 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase X (Ppx) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC001993 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 4, catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:5728 IMAGE:3491568), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126786162:126792158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
XM_006508347 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930451I11 gene (4930451I11Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006508348 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4930451I11 gene (4930451I11Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000061695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:126830474:126831496:-1 gene:ENSMUSG00000045989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK019625 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930451I11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC048622 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58711 IMAGE:6743640), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001163774 // RefSeq // Mus musculus TAO kinase 2 (Taok2), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NM_001163775 // RefSeq // Mus musculus TAO kinase 2 (Taok2), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000071268 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:126865678:126884703:-1 gene:ENSMUSG00000059981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000117394 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:126869503:126884703:-1 gene:ENSMUSG00000059981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC052933 // GenBank // Mus musculus TAO kinase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5056438), partial cds. // chr7 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// BC077714 // GenBank // Mus musculus TAO kinase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:30292251). // chr7 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126866397:126922960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000082800 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:126915720:126915826:-1 gene:ENSMUSG00000064734 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT063685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001039645 // RefSeq // Mus musculus aspartate beta-hydroxylase domain containing 1 (Asphd1), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006507738 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aspartate beta-hydroxylase domain containing 1 (Asphd1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000052937 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:126945989:126949582:-1 gene:ENSMUSG00000046378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000106339 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:7:126946008:126949581:-1 gene:ENSMUSG00000046378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106340 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:126945567:126949159:-1 gene:ENSMUSG00000046378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AK134834 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330589E13 product:hypothetical Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase containing protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC111101 // GenBank // Mus musculus aspartate beta-hydroxylase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:130534 IMAGE:40049679), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126946101:126948736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0
NM_080638 // RefSeq // Mus musculus major vault protein (Mvp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000165096 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:126986860:127014621:-1 gene:ENSMUSG00000030681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF210456 // GenBank // Mus musculus major vault protein (Mvp) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC006709 // GenBank // Mus musculus major vault protein, mRNA (cDNA clone MGC:7951 IMAGE:3584439), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126982194:127001933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_030240 // RefSeq // Mus musculus PAXIP1 associated glutamate rich protein 1A (Pagr1a), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000032918 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127015033:127020327:-1 gene:ENSMUSG00000030680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK013840 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2900092E17 product:HYPOTHETICAL 27.7 KDA PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr7 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// BC003932 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900092E17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:7316 IMAGE:3485982), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC054744 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900092E17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6835446). // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000162069 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127001482:127016484:-1 gene:ENSMUSG00000092534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// ENSMUST00000172958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127001480:127016484:-1 gene:ENSMUSG00000092534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000056117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127015270:127051973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001102563 // RefSeq // Mus musculus proline-rich transmembrane protein 2 (Prrt2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032918 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127015033:127020327:-1 gene:ENSMUSG00000030680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159916 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127017535:127021211:-1 gene:ENSMUSG00000045114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160767 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127017543:127020974:-1 gene:ENSMUSG00000045114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158895 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K430360B08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC054744 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2900092E17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6835446). // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC053419 // GenBank HTC // Mus musculus proline-rich transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6593004), with apparent retained intron. // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSMUST00000161931 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127018158:127019595:-1 gene:ENSMUSG00000045114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127015270:127051973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006507404 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MYC-associated zinc finger protein (purine-binding transcription factor) (Maz), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// NM_010772 // RefSeq // Mus musculus MYC-associated zinc finger protein (purine-binding transcription factor) (Maz), mRNA. // chr7 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// ENSMUST00000032916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:127022143:127026479:-1 gene:ENSMUSG00000030678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// BC004758 // GenBank // Mus musculus MYC-associated zinc finger protein (purine-binding transcription factor), mRNA (cDNA clone IMAGE:3154686), complete cds. // chr7 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// GENSCAN00000056117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127015270:127051973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1
NM_145588 // RefSeq // Mus musculus kinesin family member 22 (Kif22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000032915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:127027732:127042420:-1 gene:ENSMUSG00000030677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC003427 // GenBank // Mus musculus kinesin family member 22, mRNA (cDNA clone MGC:6456 IMAGE:2615715), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127015270:127051973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_026918 // RefSeq // Mus musculus zymogen granule protein 16 (Zg16), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:127050156:127051977:-1 gene:ENSMUSG00000049350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC031800 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810010M01 gene, mRNA (cDNA clone MGC:19113 IMAGE:4208847), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127015270:127051973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_133686 // RefSeq // Mus musculus quinolinate phosphoribosyltransferase (Qprt), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000032912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127107114:127122226:-1 gene:ENSMUSG00000030674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC011191 // GenBank // Mus musculus quinolinate phosphoribosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:19092 IMAGE:4196244), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127108023:127121985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0
NM_001037810 // RefSeq // Mus musculus sialophorin (Spn), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// NM_009259 // RefSeq // Mus musculus sialophorin (Spn), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000049931 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127133702:127137823:-1 gene:ENSMUSG00000051457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC100738 // GenBank // Mus musculus sialophorin, mRNA (cDNA clone MGC:124038 IMAGE:40045521), complete cds. // chr7 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// BC100739 // GenBank // Mus musculus sialophorin, mRNA (cDNA clone MGC:124037 IMAGE:40045520), complete cds. // chr7 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// BC100740 // GenBank // Mus musculus sialophorin, mRNA (cDNA clone MGC:124036 IMAGE:40045519), complete cds. // chr7 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// BC100741 // GenBank // Mus musculus sialophorin, mRNA (cDNA clone MGC:124035 IMAGE:40045517), complete cds. // chr7 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// NR_110337 // RefSeq // Mus musculus sialophorin (Spn), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr7 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// ENSMUST00000143713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127132232:127137814:-1 gene:ENSMUSG00000051457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// GENSCAN00000056112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127136146:127137333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0
NM_001285905 // RefSeq // Mus musculus CD2 antigen (cytoplasmic tail) binding protein 2 (Cd2bp2), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001285906 // RefSeq // Mus musculus CD2 antigen (cytoplasmic tail) binding protein 2 (Cd2bp2), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001285907 // RefSeq // Mus musculus CD2 antigen (cytoplasmic tail) binding protein 2 (Cd2bp2), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_027353 // RefSeq // Mus musculus CD2 antigen (cytoplasmic tail) binding protein 2 (Cd2bp2), transcript variant 4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000035771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:127193658:127195875:-1 gene:ENSMUSG00000042502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000166791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:127191660:127196000:-1 gene:ENSMUSG00000042502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC006920 // GenBank // Mus musculus CD2 antigen (cytoplasmic tail) binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:11991 IMAGE:3601764), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC079575 // GenBank HTC // Mus musculus CD2 antigen (cytoplasmic tail) binding protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5687011), with apparent retained intron. // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000056126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127193820:127208363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_144522 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 10b (Tbc1d10b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000120705 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127197465:127208468:-1 gene:ENSMUSG00000042492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124240 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127199362:127207747:-1 gene:ENSMUSG00000042492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000147520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127199867:127203653:-1 gene:ENSMUSG00000042492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// AF285112 // GenBank // Mus musculus unknown WZ3-85 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC072576 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 10b, mRNA (cDNA clone MGC:99856 IMAGE:6401332), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127193820:127208363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NR_030674 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4532 (Gm4532), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT063716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023203 // RefSeq // Mus musculus dCTP pyrophosphatase 1 (Dctpp1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000035276 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127256959:127260709:-1 gene:ENSMUSG00000042462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF110764 // GenBank // Mus musculus RS21-C6 (Tdrg-TL1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC004623 // GenBank // Mus musculus dCTP pyrophosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:7989 IMAGE:3585680), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127257036:127260623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_009266 // RefSeq // Mus musculus selenophosphate synthetase 2 (Sephs2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000082428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:127272561:127273919:-1 gene:ENSMUSG00000049091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC016508 // GenBank // Mus musculus selenophosphate synthetase 2, mRNA (cDNA clone MGC:25303 IMAGE:4911695), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC028966 // GenBank // Mus musculus selenophosphate synthetase 2, mRNA (cDNA clone MGC:36791 IMAGE:5374184), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC043334 // GenBank // Mus musculus selenophosphate synthetase 2, mRNA (cDNA clone MGC:49501 IMAGE:5100207), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U43285 // GenBank // Mus musculus selenophosphate synthetase 2 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK077573 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730453E17 product:selenophosphate synthetase 2, full insert sequence. // chr7 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127272561:127273919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_146202 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 768 (Zfp768), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:127342797:127345314:-1 gene:ENSMUSG00000047371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026432 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 768, mRNA (cDNA clone MGC:31345 IMAGE:4235387), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127343257:127393436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_175560 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 747 (Zfp747), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000067425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:127372564:127376050:-1 gene:ENSMUSG00000054381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC058799 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 747, mRNA (cDNA clone MGC:68289 IMAGE:6484930), complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000056128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127343257:127393436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
NM_030226 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9130019O22 gene (9130019O22Rik), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000049052 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127382260:127387166:-1 gene:ENSMUSG00000030823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000164345 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:127383276:127387113:-1 gene:ENSMUSG00000030823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// BC031466 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130019O22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:25807 IMAGE:4038184), complete cds. // chr7 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000056128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127343257:127393436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
ENSMUST00000074249 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:127390907:127393629:-1 gene:ENSMUSG00000078580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000106303 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:127392419:127393620:-1 gene:ENSMUSG00000078580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000165495 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:7:127389673:127393619:-1 gene:ENSMUSG00000078580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC010442 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E430018J23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:8032 IMAGE:3586722), complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// NM_198011 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E430018J23 gene (E430018J23Rik), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 1 /// GENSCAN00000056128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127343257:127393436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
NM_001167832 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 764 (Zfp764), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_146203 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 764 (Zfp764), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000059199 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127403668:127406822:-1 gene:ENSMUSG00000045757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000139118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127403695:127406783:-1 gene:ENSMUSG00000045757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// BC026397 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 764, mRNA (cDNA clone MGC:31213 IMAGE:4207307), complete cds. // chr7 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_026999 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 688 (Zfp688), mRNA. // chr7 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000106300 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:127418967:127422034:-1 gene:ENSMUSG00000045251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000129038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127419591:127421967:-1 gene:ENSMUSG00000045251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000135886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127418969:127422068:-1 gene:ENSMUSG00000045251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000136123 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127418967:127422027:-1 gene:ENSMUSG00000045251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000148483 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127418967:127422039:-1 gene:ENSMUSG00000045251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC027683 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 688, mRNA (cDNA clone MGC:41678 IMAGE:1345974), complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC052512 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 688, mRNA (cDNA clone MGC:63014 IMAGE:1362502), complete cds. // chr7 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// XM_006508179 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 688 (Zfp688), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONMMUT063723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127404662:127422004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_175163 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 689 (Zfp689), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053392 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127443752:127449158:-1 gene:ENSMUSG00000048921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC052084 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 689, mRNA (cDNA clone MGC:62502 IMAGE:6404620), complete cds. // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000106299 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:127443755:127448993:-1 gene:ENSMUSG00000048921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127439680:127452855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NR_024331 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700008J07 gene (1700008J07Rik), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127510438:127512869:-1 gene:ENSMUSG00000101225 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT063735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT063736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001033040 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 166 (Gm166), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006507745 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 166 (Gm166), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000072155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:127582384:127588595:-1 gene:ENSMUSG00000057176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC066021 // GenBank // Mus musculus gene model 166, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:90108 IMAGE:5717506), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC144811 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053359. // chr7 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000024536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127583411:127588089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
NR_027915 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700120K04 gene (1700120K04Rik), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049550 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700120K04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6773284). // chr7 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// ENSMUST00000191038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127603900:127604445:-1 gene:ENSMUSG00000099579 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT063744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127604078:127675593:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_009746 // RefSeq // Mus musculus B cell CLL/lymphoma 7C (Bcl7c), mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// XM_006507269 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus B cell CLL/lymphoma 7C (Bcl7c), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000061468 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127704978:127708933:-1 gene:ENSMUSG00000030814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000106282 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:127663353:127708785:-1 gene:ENSMUSG00000030814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000144103 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127707170:127708075:-1 gene:ENSMUSG00000030814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// AK049064 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230096E12 product:B-cell CLL/lymphoma 7C, full insert sequence. // chr7 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// BC005673 // GenBank // Mus musculus B-cell CLL/lymphoma 7C, mRNA (cDNA clone MGC:11464 IMAGE:3153237), complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC058530 // GenBank // Mus musculus B-cell CLL/lymphoma 7C, mRNA (cDNA clone MGC:67056 IMAGE:6818556), complete cds. // chr7 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// NONMMUT063755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000024566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127705050:127708527:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_198858 // RefSeq // Mus musculus cardiotrophin 2 (Ctf2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006507845 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cardiotrophin 2 (Ctf2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000076091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127718106:127725616:-1 gene:ENSMUSG00000060034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB125661 // GenBank // Mus musculus CTF2 mRNA for cardiotrophin-2, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY363390 // GenBank // Mus musculus neuropoietin mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC120763 // GenBank // Mus musculus cardiotrophin 2, mRNA (cDNA clone MGC:156000 IMAGE:40129686), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC120765 // GenBank // Mus musculus cardiotrophin 2, mRNA (cDNA clone MGC:156002 IMAGE:40129688), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127719211:127725582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
XR_378504 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102635073 (LOC102635073), ncRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141716 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030040D24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00006926 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT063757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK034940 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430064I24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024414 // RefSeq // Mus musculus syntaxin 1B (Stx1b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006508044 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus syntaxin 1B (Stx1b), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000106267 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127803900:127824549:-1 gene:ENSMUSG00000030806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC132042 // GenBank // Mus musculus syntaxin 1B, mRNA (cDNA clone MGC:163673 IMAGE:40130319), complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC132068 // GenBank // Mus musculus syntaxin 1B, mRNA (cDNA clone MGC:163699 IMAGE:40130345), complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// D29743 // GenBank // Mus musculus mRNA for syntaxin 1B, complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// D45207 // GenBank // Mus musculus mRNA for syntaxin1B, complete cds. // chr7 // 42 // 100 // 15 // 36 // 0 /// XM_006508043 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus syntaxin 1B (Stx1b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// XM_006508045 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus syntaxin 1B (Stx1b), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// XM_006508046 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus syntaxin 1B (Stx1b), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// XM_006508047 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus syntaxin 1B (Stx1b), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// ENSMUST00000156135 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127807372:127810924:-1 gene:ENSMUSG00000030806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000024548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127804618:127816007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
NM_001081268 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 53 (Prss53), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006507963 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 53 (Prss53), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000121394 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127885841:127890970:-1 gene:ENSMUSG00000044139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000126662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127886227:127895454:-1 gene:ENSMUSG00000030804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC147509 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC039632, mRNA (cDNA clone MGC:182563 IMAGE:9056457), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC151010 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC039632, mRNA (cDNA clone MGC:183923 IMAGE:9087923), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC151017 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC039632, mRNA (cDNA clone MGC:183930 IMAGE:9087930), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC172059 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC039632, mRNA (cDNA clone MGC:198764 IMAGE:9054345), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK131611 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110022C08 product:hypothetical Peptidase, trypsin-like serine and cysteine proteases containing protein, full insert sequence. // chr7 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127886262:127895581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_178600 // RefSeq // Mus musculus vitamin K epoxide reductase complex, subunit 1 (Vkorc1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006507912 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus vitamin K epoxide reductase complex, subunit 1 (Vkorc1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000033074 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127893067:127895617:-1 gene:ENSMUSG00000096145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119922 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:127893238:127895309:-1 gene:ENSMUSG00000096145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// AK003237 // GenBank HTC // Mus musculus 18-day embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1110001K05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC031732 // GenBank // Mus musculus vitamin K epoxide reductase complex, subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:25747 IMAGE:3991412), complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126662 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:127886227:127895454:-1 gene:ENSMUSG00000030804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127886262:127895581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_133351 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 8 (prostasin) (Prss8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000032988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:127925725:127930113:-1 gene:ENSMUSG00000030800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB038244 // GenBank // Mus musculus mRNA for prostasin, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF188613 // GenBank // Mus musculus channel activating protease 1 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF378085 // GenBank // Mus musculus prostasin (Prss8) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY335911 // GenBank // Mus musculus prostasin (Prss8) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC003851 // GenBank // Mus musculus protease, serine, 8 (prostasin), mRNA (cDNA clone MGC:6430 IMAGE:3600399), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127926297:127946415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_023258 // RefSeq // Mus musculus PYD and CARD domain containing (Pycard), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000033056 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:127992103:127993867:-1 gene:ENSMUSG00000030793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB032249 // GenBank // Mus musculus masc mRNA for apoptosis-associated speck-like protein containing CARD, complete cds. // chr7 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// AF310104 // GenBank // Mus musculus PYCARD mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC008252 // GenBank // Mus musculus PYD and CARD domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:6811 IMAGE:2648391), complete cds. // chr7 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:127992712:127993653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0
NM_023311 // RefSeq // Mus musculus Yip1 domain family, member 5 (Yipf5), mRNA. // chr7 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSMUST00000025364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:18:40204865:40219399:-1 gene:ENSMUSG00000024487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// BC003317 // GenBank // Mus musculus Yip1 domain family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:7012 IMAGE:3155690), complete cds. // chr7 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// BC055301 // GenBank // Mus musculus Yip1 domain family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:62578 IMAGE:6466806), complete cds. // chr7 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:18:40178280:40241676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 80 // 14 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:128016957:128042279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_027870 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 3 (Armcx3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000081834 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:X:134756595:134761425:1 gene:ENSMUSG00000049047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000086880 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134756607:134760106:1 gene:ENSMUSG00000049047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000086884 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:X:134756647:134761455:1 gene:ENSMUSG00000049047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC011101 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 3, mRNA (cDNA clone MGC:19426 IMAGE:3490748), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC051113 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing, X-linked 3, mRNA (cDNA clone MGC:58973 IMAGE:5249601), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:17:54311281:54347593:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 65 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:X:134757220:134761229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:128016957:128042279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
ENSMUST00000082743 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:128061705:128061860:-1 gene:ENSMUSG00000064677 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT063791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009943 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIa polypeptide 2 (Cox6a2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:128205436:128206366:-1 gene:ENSMUSG00000030785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028514 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit VI a, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:41177 IMAGE:1447375), complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// U08439 // GenBank // Mus musculus Balb/c cytochrome c oxidase subunit VIaH mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:128205729:128206295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
NM_177001 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9130023H24 gene (9130023H24Rik), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:128234451:128238031:-1 gene:ENSMUSG00000062944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:128236406:128237419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145955 // RefSeq // Mus musculus MCM (minichromosome maintenance deficient) binding protein (Mcmbp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000057557 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:128696441:128740495:-1 gene:ENSMUSG00000048170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000119081 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:128697767:128740486:-1 gene:ENSMUSG00000048170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC025641 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110007A13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:36596 IMAGE:5322565), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC038342 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1110007A13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28519 IMAGE:4191750), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:128698444:128726728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000021501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:128997336:128998021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000021506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:129054329:129055736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NM_001162855 // RefSeq // Mus musculus non-SMC element 4 homolog A (S. cerevisiae) (Nsmce4a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000159694 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:130533770:130573118:-1 gene:ENSMUSG00000040331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000160289 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:130532523:130547381:-1 gene:ENSMUSG00000040331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000161076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:130536983:130545954:-1 gene:ENSMUSG00000040331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000161470 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:130535549:130539507:-1 gene:ENSMUSG00000040331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// ENSMUST00000162510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:130532533:130535973:-1 gene:ENSMUSG00000040331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// AK042519 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630099B03 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000026320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:130533592:130573104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT063895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONMMUT063896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
ENSMUST00000057134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:130770638:130772652:-1 gene:ENSMUSG00000050189 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB036742 // GenBank // Mus musculus DD64 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000070980 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:131137713:131146314:-1 gene:ENSMUSG00000013668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115646 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933402N03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144552 IMAGE:40103091), complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC115647 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933402N03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:144553 IMAGE:40103092), complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000026309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:131138496:131151079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
NM_008411 // RefSeq // Mus musculus CUB and zona pellucida-like domains 1 (Cuzd1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000046611 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:131308554:131322292:-1 gene:ENSMUSG00000040205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC140992 // GenBank // Mus musculus CUB and zona pellucida-like domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:175953 IMAGE:9055604), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U69699 // GenBank // Mus musculus integral membrane-associated protein 1 (Itmap1) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:131308741:131322047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_027037 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700007K09 gene (1700007K09Rik), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006508181 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700007K09 gene (1700007K09Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000033146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:131326099:131327325:-1 gene:ENSMUSG00000030858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC048596 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700007K09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58645 IMAGE:6740370), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000188899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:131325944:131329516:-1 gene:ENSMUSG00000030858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026655 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2310057M21 gene (2310057M21Rik), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006508154 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2310057M21 gene (2310057M21Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:131342718:131362698:-1 gene:ENSMUSG00000040177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK148008 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270138C04 product:hypothetical ABC transporter containing protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC044749 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310057M21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:51643 IMAGE:5102741), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_175115 // RefSeq // Mus musculus IKAROS family zinc finger 5 (Ikzf5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000046306 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:131388652:131410521:-1 gene:ENSMUSG00000040167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC048183 // GenBank // Mus musculus IKAROS family zinc finger 5, mRNA (cDNA clone MGC:61239 IMAGE:6826723), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC058537 // GenBank // Mus musculus IKAROS family zinc finger 5, mRNA (cDNA clone MGC:67336 IMAGE:6826723), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT063923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT063924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
NM_018867 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase X 2 (M14 family) (Cpxm2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006508034 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxypeptidase X 2 (M14 family) (Cpxm2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033149 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:132042816:132154739:-1 gene:ENSMUSG00000030862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000127039 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:132057065:132154622:-1 gene:ENSMUSG00000030862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AF017639 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase X2 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK038874 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230070K15 product:metallocarboxypeptidase 2, full insert sequence. // chr7 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC021444 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase X 2 (M14 family), mRNA (cDNA clone MGC:29082 IMAGE:5038528), complete cds. // chr7 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:132042561:132154613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_029935 // RefSeq // Mus musculus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-sulfate 6-O) sulfotransferase 15 (Chst15), mRNA. // chr7 // 97 // 86 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000077472 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:132235780:132316714:-1 gene:ENSMUSG00000030930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// ENSMUST00000080215 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:132235780:132317228:-1 gene:ENSMUSG00000030930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// AB187269 // GenBank // Mus musculus GalNAc4S-6ST mRNA for GalNAc 4-sulfate 6-O-sulfotransferase, complete cds. // chr7 // 95 // 59 // 21 // 22 // 0 /// AF320786 // GenBank // Mus musculus B cell RAG-associated protein mRNA, complete cds. // chr7 // 91 // 59 // 20 // 22 // 0 /// AK082318 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230037F04 product:B CELL RAG-ASSOCIATED PROTEIN, full insert sequence. // chr7 // 97 // 78 // 28 // 29 // 0 /// AK122324 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0598 protein. // chr7 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// BC031443 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4631426J05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28686 IMAGE:4240286), complete cds. // chr7 // 97 // 78 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:132238274:132369193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1
NM_016978 // RefSeq // Mus musculus ornithine aminotransferase (Oat), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000084500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:132557475:132576398:-1 gene:ENSMUSG00000030934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC008119 // GenBank // Mus musculus ornithine aminotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:6239 IMAGE:3498240), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// X64837 // GenBank // M.musculus Oat mRNA for ornithine aminotransferase. // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:132558170:132570104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_009123 // RefSeq // Mus musculus NK1 transcription factor related, locus 2 (Drosophila) (Nkx1-2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054562 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:132594878:132599637:-1 gene:ENSMUSG00000048528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF222444 // GenBank // Mus musculus homeodomain protein (Nkx-1.2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF222445 // GenBank // Mus musculus homeobox protein Nkx1.2E427 (Nkx-1.2) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AF223674 // GenBank // Mus musculus homeodomain protein Nkx-1.2T5.18 (Nkx-1.2) mRNA, partial cds. // chr7 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// BC139757 // GenBank // Mus musculus NK1 transcription factor related, locus 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:149930 IMAGE:40047346), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// X75384 // GenBank // M.musculus mRNA for Sax-1 gene encoded protein. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:132597113:132606879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
BC002195 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC002195, mRNA (cDNA clone MGC:7427 IMAGE:3489024), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000040405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:133408787:133440084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
NM_028654 // RefSeq // Mus musculus testis expressed 36 (Tex36), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:133587024:133602115:-1 gene:ENSMUSG00000030976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK015080 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930404H21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100509 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930404H21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:118359 IMAGE:30918228), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:133501773:133598899:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSMUST00000122136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:133674356:133680061:-1 gene:ENSMUSG00000030981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000131894 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:133674270:133680061:-1 gene:ENSMUSG00000030981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC106860 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 21, mRNA (cDNA clone MGC:124281 IMAGE:40047272), complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC111522 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 21, mRNA (cDNA clone MGC:124286 IMAGE:40047286), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_152944 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 21 (Mmp21), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// XM_006507560 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus matrix metallopeptidase 21 (Mmp21), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000033278 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:133674270:133680061:-1 gene:ENSMUSG00000030981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// AF507967 // GenBank // Mus musculus matrix metalloproteinase 21 (Mmp-21) mRNA, complete cds. // chr7 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// AY124569 // GenBank // Mus musculus matrix metalloproteinase-21 (Mmp21) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// BC106861 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 21, mRNA (cDNA clone MGC:124282 IMAGE:40047279), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// GENSCAN00000022939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:133674406:133680046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
NM_007400 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 12 (meltrin alpha) (Adam12), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000067680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:133883199:134225097:-1 gene:ENSMUSG00000054555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000127524 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:133981412:134232146:-1 gene:ENSMUSG00000054555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 20 // 8 // 9 // 0 /// ENSMUST00000134504 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:133975475:134232005:-1 gene:ENSMUSG00000054555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 25 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000138363 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:133886196:133961265:-1 gene:ENSMUSG00000054555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 21 // 21 // 0 /// D50411 // GenBank // Mus musculus mRNA for meltrin alpha, complete cds. // chr7 // 93 // 93 // 38 // 41 // 0 /// GENSCAN00000022929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:133887942:134019588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000152709 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:134227474:134230705:-1 gene:ENSMUSG00000050066 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK037526 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130023I24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK088084 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430003K09 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AK037273 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130002I18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONMMUT064002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT064003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr7 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
NM_001081331 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 7, ERATO Doi 443, expressed (D7Ertd443e), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_001199941 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 7, ERATO Doi 443, expressed (D7Ertd443e), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000094002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:134266262:134376828:-1 gene:ENSMUSG00000030994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000106129 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:134266275:134341986:-1 gene:ENSMUSG00000030994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000172947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:134266262:134364884:-1 gene:ENSMUSG00000030994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK016590 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933400E14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GQ499374 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J FATS mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:134262031:134298550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_001143802 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 196, member A (Fam196a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006508102 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 196, member A (Fam196a), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:134881926:134938430:-1 gene:ENSMUSG00000073805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158077 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B830028B13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:189982 IMAGE:9088169), complete cds. // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC158080 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA B830028B13 gene, mRNA (cDNA clone MGC:189985 IMAGE:9088172), complete cds. // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_178669 // RefSeq // Mus musculus clarin 3 (Clrn3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:135511466:135528654:-1 gene:ENSMUSG00000050866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC036176 // GenBank // Mus musculus clarin 3, mRNA (cDNA clone MGC:37614 IMAGE:4989703), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:135513939:135632883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001081117 // RefSeq // Mus musculus antigen identified by monoclonal antibody Ki 67 (Mki67), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000033310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:135689788:135716379:-1 gene:ENSMUSG00000031004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:135691591:135716139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
AK156355 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830017M21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// KnowTID_00006937 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029886 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9430038I01 gene (9430038I01Rik), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000068996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:7:137375574:137410762:-1 gene:ENSMUSG00000040139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117404 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:137376137:137410735:-1 gene:ENSMUSG00000040139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000145881 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:137375574:137410756:-1 gene:ENSMUSG00000040139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000120340 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:137383046:137410732:-1 gene:ENSMUSG00000040139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENSMUST00000135335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:137383014:137410756:-1 gene:ENSMUSG00000040139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AK171836 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830013L16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONMMUT064081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT064082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSMUST00000082641 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:138101433:138101539:-1 gene:ENSMUSG00000064575 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT064089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_183289 // RefSeq // Mus musculus transcription elongation regulator 1-like (Tcerg1l), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000160436 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:138208974:138397728:-1 gene:ENSMUSG00000091002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000161213 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:138209717:138271329:-1 gene:ENSMUSG00000091002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 36 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000162222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:138258587:138397730:-1 gene:ENSMUSG00000091002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// BC048631 // GenBank // Mus musculus transcription elongation regulator 1-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:6744153), partial cds. // chr7 // 100 // 36 // 15 // 15 // 0 /// BC107234 // GenBank // Mus musculus transcription elongation regulator 1-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:40052098), complete cds. // chr7 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0 /// BC107235 // GenBank // Mus musculus transcription elongation regulator 1-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:40052099), complete cds. // chr7 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:138258315:138285889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
ENSMUST00000119664 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:138835823:138846273:-1 gene:ENSMUSG00000041775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC055699 // GenBank // Mus musculus mitogen activated protein kinase 1 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6414919). // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC069850 // GenBank // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:78028 IMAGE:5366053), complete cds. // chr7 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// NM_001045483 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 (Mapk1ip1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// ENSMUST00000075667 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:138835833:138846260:-1 gene:ENSMUSG00000041775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// NM_027115 // RefSeq // Mus musculus mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 (Mapk1ip1), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// ENSMUST00000118810 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:138835878:138846257:-1 gene:ENSMUSG00000041775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1
NM_009760 // RefSeq // Mus musculus BCL2/adenovirus E1B interacting protein 3 (Bnip3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000106112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:138890836:138909506:-1 gene:ENSMUSG00000078566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AF041054 // GenBank // Mus musculus E1B 19K/Bcl-2-binding protein homolog (Nip3) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// BC046603 // GenBank // Mus musculus BCL2/adenovirus E1B interacting protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:54681 IMAGE:6390074), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000130500 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:138894281:138909495:-1 gene:ENSMUSG00000078566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1
NM_001162540 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine kinase 32C (Stk32c), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_021302 // RefSeq // Mus musculus serine/threonine kinase 32C (Stk32c), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000016125 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:139103638:139188517:-1 gene:ENSMUSG00000015981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000165870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:139103638:139213307:-1 gene:ENSMUSG00000015981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AB041542 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-1563, similar to AJ250840 serine/threonine protein kinase (Mus musculus). // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC026457 // GenBank // Mus musculus serine/threonine kinase 32C, mRNA (cDNA clone MGC:31445 IMAGE:4481218), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000020894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:139118691:139131417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0
NM_183248 // RefSeq // Mus musculus NK6 homeobox 2 (Nkx6-2), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NR_027857 // RefSeq // Mus musculus NK6 homeobox 2 (Nkx6-2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000097974 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:139579376:139582797:-1 gene:ENSMUSG00000041309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000106095 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:139581220:139582790:-1 gene:ENSMUSG00000041309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000040334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:139579474:139582539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_001243018 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA E030019B06 gene (E030019B06Rik), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006536165 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA E030019B06 gene (E030019B06Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000093991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:139600951:139616329:-1 gene:ENSMUSG00000070357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000166503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:139601080:139616309:-1 gene:ENSMUSG00000070357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AK086998 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030019B06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// BC116882 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E030019B06 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40126201), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC120533 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E030019B06 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40129456), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC144767 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E030019B06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178323 IMAGE:9053315), complete cds. // chr7 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:139587148:139683770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000040316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:139887477:139890581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NR_029589 // RefSeq // Mus musculus microRNA 202 (Mir202), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083568 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:139957689:139957760:-1 gene:ENSMUSG00000065502 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130771 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:139957005:139958039:-1 gene:ENSMUSG00000085354 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-202 // miRBase Micro RNA Database // MI0000245 Mus musculus miR-202 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:139950056:140033762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001033465 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 6430531B16 gene (6430531B16Rik), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006536199 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 6430531B16 gene (6430531B16Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000097970 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:139972303:139978755:-1 gene:ENSMUSG00000073795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000146974 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:139972303:139978723:-1 gene:ENSMUSG00000073795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC025923 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5036118). // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC145730 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175617 IMAGE:40131033), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC171930 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054023. // chr7 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000121412 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:139975497:139978723:-1 gene:ENSMUSG00000073795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// AK164921 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030024P13 product:hypothetical Calponin-like actin-binding containing protein, full insert sequence. // chr7 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONMMUT064129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:139950056:140033762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001286007 // RefSeq // Mus musculus tubulin, gamma complex associated protein 2 (Tubgcp2), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_001286009 // RefSeq // Mus musculus tubulin, gamma complex associated protein 2 (Tubgcp2), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NM_001286011 // RefSeq // Mus musculus tubulin, gamma complex associated protein 2 (Tubgcp2), transcript variant 4, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_133755 // RefSeq // Mus musculus tubulin, gamma complex associated protein 2 (Tubgcp2), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000026547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:139995955:140036350:-1 gene:ENSMUSG00000025474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC012519 // GenBank // Mus musculus tubulin, gamma complex associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:11984 IMAGE:3601589), complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC025582 // GenBank // Mus musculus tubulin, gamma complex associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:38266 IMAGE:5324981), complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000040317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:139950056:140033762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_010836 // RefSeq // Mus musculus msh homeobox 3 (Msx3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000055353 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:140046157:140049089:-1 gene:ENSMUSG00000025469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000172775 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:140046374:140049088:-1 gene:ENSMUSG00000025469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC051983 // GenBank // Mus musculus homeobox, msh-like 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6403259), partial cds. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC137577 // GenBank // Mus musculus homeobox, msh-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:169201 IMAGE:8860596), complete cds. // chr7 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC137578 // GenBank // Mus musculus homeobox, msh-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:169202 IMAGE:8860597), complete cds. // chr7 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// U62523 // GenBank // Mus musculus Msx3 mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140047740:140048999:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_001190385 // RefSeq // Mus musculus calcyon neuron-specific vesicular protein (Caly), transcript variant B, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NM_001190386 // RefSeq // Mus musculus calcyon neuron-specific vesicular protein (Caly), transcript variant C, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NM_026769 // RefSeq // Mus musculus calcyon neuron-specific vesicular protein (Caly), transcript variant A, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// XM_006536235 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcyon neuron-specific vesicular protein (Caly), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000026541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140069880:140082548:-1 gene:ENSMUSG00000025468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000166758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140069880:140082301:-1 gene:ENSMUSG00000025468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC049663 // GenBank // Mus musculus calcyon neuron-specific vesicular protein, mRNA (cDNA clone MGC:58484 IMAGE:6532801), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AK163466 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230204M08 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000040318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140070347:140089433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT064134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_183147 // RefSeq // Mus musculus shadow of prion protein (Sprn), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059241 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:140150628:140154877:-1 gene:ENSMUSG00000045733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC056484 // GenBank // Mus musculus shadow of prion protein, mRNA (cDNA clone MGC:67455 IMAGE:5696462), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140153214:140155119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_146952 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 522 (Olfr522), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140161939:140163014:-1 gene:ENSMUSG00000051180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC120696 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 522, mRNA (cDNA clone MGC:155933 IMAGE:40129619), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140162010:140162948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001011814 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 524 (Olfr524), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140201743:140202800:-1 gene:ENSMUSG00000050366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147558 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 524, mRNA (cDNA clone MGC:182655 IMAGE:9056549), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147561 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 524, mRNA (cDNA clone MGC:182657 IMAGE:9056551), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140201812:140208597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146955 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 60 (Olfr60), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000075470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140345052:140345987:-1 gene:ENSMUSG00000060112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC106784 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 60, mRNA (cDNA clone MGC:123562 IMAGE:40041376), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC106785 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 60, mRNA (cDNA clone MGC:123563 IMAGE:40041377), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000040303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140345052:140345987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_146519 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 530 (Olfr530), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000074177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140372587:140373666:-1 gene:ENSMUSG00000060974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138081 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 530, mRNA (cDNA clone MGC:169705 IMAGE:8861100), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138082 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 530, mRNA (cDNA clone MGC:169706 IMAGE:8861101), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140372685:140373608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146953 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 531 (Olfr531), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000080153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140400130:140401044:-1 gene:ENSMUSG00000062712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC104052 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 531, mRNA (cDNA clone MGC:123485 IMAGE:40040241), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC104053 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 531, mRNA (cDNA clone MGC:123486 IMAGE:40040242), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140400130:140456538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_147026 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 532 (Olfr532), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000073226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140418842:140419771:-1 gene:ENSMUSG00000063823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140400130:140456538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146520 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 536 (Olfr536), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000064392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140500856:140507318:-1 gene:ENSMUSG00000052508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC051116 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 536, mRNA (cDNA clone MGC:59206 IMAGE:6307473), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001143765 // RefSeq // Mus musculus synaptonemal complex central element protein 1 (Syce1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000026553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140777229:140787854:-1 gene:ENSMUSG00000025480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006536261 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus synaptonemal complex central element protein 1 (Syce1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// GENSCAN00000007563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140777661:140830177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_001001180 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 941 (Zfp941), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080651 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:140807449:140822178:-1 gene:ENSMUSG00000060314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000106052 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:140809689:140822132:-1 gene:ENSMUSG00000060314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141045 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230015I10 product:similar to Zinc finger protein 18 (Fragment) [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC066028 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC066028, mRNA (cDNA clone MGC:90032 IMAGE:5702088), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC068250 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC066028, mRNA (cDNA clone MGC:61003 IMAGE:30018777), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000150053 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:140818464:140822146:-1 gene:ENSMUSG00000060314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140777661:140830177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT064152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_018742 // RefSeq // Mus musculus blocked early in transport 1 homolog (S. cerevisiae)-like (Bet1l), mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000026557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140853384:140856383:-1 gene:ENSMUSG00000025484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AF003999 // GenBank // Mus musculus Golgi SNARE GS15 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// BC019730 // GenBank // Mus musculus blocked early in transport 1 homolog (S. cerevisiae)-like, mRNA (cDNA clone MGC:30331 IMAGE:3667829), complete cds. // chr7 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140853973:140856239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// AK159884 // GenBank HTC // Mus musculus osteoclast-like cell cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I420036H22 product:blocked early in transport 1 homolog (S. cerevisiae)-like, full insert sequence. // chr7 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1
NM_007751 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIIIb (Cox8b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000026561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140898943:140900446:-1 gene:ENSMUSG00000025488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC027531 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit VIIIb, mRNA (cDNA clone MGC:41187 IMAGE:1515187), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC086930 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase, subunit VIIIb, mRNA (cDNA clone MGC:107661 IMAGE:6752860), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U15541 // GenBank // Mus musculus cytochrome c oxidase subunit VIII-H precursor (COX8H) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140898988:140900342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
NM_053088 // RefSeq // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 5 (Ifitm5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000026562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140948963:140950239:-1 gene:ENSMUSG00000025489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ009781 // GenBank // Mus musculus mRNA for putative haemopoietic membrane protein. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC103790 // GenBank // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:118415 IMAGE:30287396), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EU380257 // GenBank // Mus musculus bone-restricted interferon induced transmembrane protein-like (Bril) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// FJ200451 // GenBank // Mus musculus bone-restricted interferon induced transmembrane protein-like protein (Bril) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140949236:140950209:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_030694 // RefSeq // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 2 (Ifitm2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000081649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:140954839:140955961:-1 gene:ENSMUSG00000060591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AY082486 // GenBank // Mus musculus fragilis R mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC002102 // GenBank // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:6589 IMAGE:3485116), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC002160 // GenBank // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:7307 IMAGE:3485614), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC084679 // GenBank // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:102396 IMAGE:5374182), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000007543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:140954985:140955915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
NM_025378 // RefSeq // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 3 (Ifitm3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000026565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:141009586:141010770:-1 gene:ENSMUSG00000025492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY082484 // GenBank // Mus musculus fragilis mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// AY594690 // GenBank // Mus musculus interferon-inducible protein 15 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC010291 // GenBank // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:11751 IMAGE:3152819), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:141009725:141016858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
NM_001033632 // RefSeq // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 6 (Ifitm6), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000081924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141015812:141016892:-1 gene:ENSMUSG00000059108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC104338 // GenBank // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:129398 IMAGE:40049250), complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC104339 // GenBank // Mus musculus interferon induced transmembrane protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:129399 IMAGE:40049257), complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:141009725:141016858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_023059 // RefSeq // Mus musculus single immunoglobulin and toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain (Sigirr), mRNA. // chr7 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// XM_006536175 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus single immunoglobulin and toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain (Sigirr), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// XM_006536180 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus single immunoglobulin and toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain (Sigirr), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000097958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141091175:141100546:-1 gene:ENSMUSG00000025494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// AF113795 // GenBank // Mus musculus toll/interleukin-1 receptor 8 (TIR8) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 65 // 23 // 24 // 0 /// AF239957 // GenBank // Mus musculus single Ig IL-1R-related protein mRNA, complete cds. // chr7 // 83 // 81 // 25 // 30 // 0 /// BC010806 // GenBank // Mus musculus single immunoglobulin and toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain, mRNA (cDNA clone MGC:18899 IMAGE:4240425), complete cds. // chr7 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// BC094069 // GenBank // Mus musculus single immunoglobulin and toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain, mRNA (cDNA clone MGC:102426 IMAGE:4974962), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000007576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:141091338:141116045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1
NM_178381 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 9 (Ano9), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// XM_006536248 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anoctamin 9 (Ano9), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// XM_006536249 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anoctamin 9 (Ano9), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141101219:141117806:-1 gene:ENSMUSG00000054662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC049815 // GenBank HTC // Mus musculus anoctamin 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:6508837). // chr7 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:141091338:141116045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1
NM_001172100 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease/angiogenin inhibitor 1 (Rnh1), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_001172101 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease/angiogenin inhibitor 1 (Rnh1), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_145135 // RefSeq // Mus musculus ribonuclease/angiogenin inhibitor 1 (Rnh1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000106033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141160328:141168936:-1 gene:ENSMUSG00000038650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000167493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141160328:141172851:-1 gene:ENSMUSG00000038650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AF071546 // GenBank // Mus musculus ribonuclease/angiogenesis inhibitor mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC010331 // GenBank // Mus musculus ribonuclease/angiogenin inhibitor 1, mRNA (cDNA clone MGC:6299 IMAGE:2654341), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000007540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:141160478:141166768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_029767 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein S9 (Rps9), mRNA. // chr7 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// ENSMUST00000006496 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:3703993:3706901:1 gene:ENSMUSG00000006333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// ENSMUST00000108625 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:3704052:3706857:1 gene:ENSMUSG00000006333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:141177885:141178265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000027046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:3694347:3706828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
NM_028050 // RefSeq // Mus musculus lamin tail domain containing 2 (Lmntd2), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006536255 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1600016N20 gene (1600016N20Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141210043:141214080:-1 gene:ENSMUSG00000025500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000170841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141210043:141214082:-1 gene:ENSMUSG00000025500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC119093 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1600016N20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155409 IMAGE:8733842), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC119119 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1600016N20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155435 IMAGE:8733868), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC144834 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1600016N20 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178390 IMAGE:9053382), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006536258 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1600016N20 gene (1600016N20Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000007612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:141210073:141214058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NR_029793 // RefSeq // Mus musculus microRNA 210 (Mir210), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083617 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:141221384:141221493:-1 gene:ENSMUSG00000065551 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-210 // miRBase Micro RNA Database // MI0000695 Mus musculus miR-210 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001114322 // RefSeq // Mus musculus cadherin-related family member 5 (Cdhr5), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000167263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141269085:141276786:-1 gene:ENSMUSG00000025497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF462391 // GenBank // Mus musculus mu-protocadherin mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC043336 // GenBank // Mus musculus mucin-like protocadherin, mRNA (cDNA clone MGC:49520 IMAGE:5042289), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_028069 // RefSeq // Mus musculus cadherin-related family member 5 (Cdhr5), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENSMUST00000080654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141269085:141276786:-1 gene:ENSMUSG00000025497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// BC054469 // GenBank // Mus musculus mucin-like protocadherin, mRNA (cDNA clone MGC:62689 IMAGE:4225164), complete cds. // chr7 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000007608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:141269150:141276718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
NM_001287171 // RefSeq // Mus musculus secretin (Sct), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_011328 // RefSeq // Mus musculus secretin (Sct), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_105048 // RefSeq // Mus musculus secretin (Sct), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000046156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141278331:141279133:-1 gene:ENSMUSG00000038580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141278354:141279131:-1 gene:ENSMUSG00000038580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC048484 // GenBank // Mus musculus secretin, mRNA (cDNA clone MGC:58269 IMAGE:6707701), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:141278410:141279098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NR_033532 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA B230206H07 gene (B230206H07Rik), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000129373 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:141359178:141365110:-1 gene:ENSMUSG00000086844 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK080797 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230206H07 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000134845 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:141359141:141365082:-1 gene:ENSMUSG00000086844 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONMMUT064205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// NONMMUT064207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT064208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT064206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_021316 // RefSeq // Mus musculus cell cycle exit and neuronal differentiation 1 (Cend1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000084436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:141426446:141429425:-1 gene:ENSMUSG00000060240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124444 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:141426446:141429491:-1 gene:ENSMUSG00000060240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000137488 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:141426451:141429418:-1 gene:ENSMUSG00000060240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000164387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141426451:141429351:-1 gene:ENSMUSG00000060240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// AF243130 // GenBank // Mus musculus BM88 antigen mRNA, complete cds. // chr7 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// BC023032 // GenBank // Mus musculus cell cycle exit and neuronal differentiation 1, mRNA (cDNA clone MGC:35878 IMAGE:5366891), complete cds. // chr7 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000097947 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:141461483:141467771:-1 gene:ENSMUSG00000073787 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK149132 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120486K11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_040337 // RefSeq // Mus musculus predicted gene, 16982 (Gm16982), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000181275 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:7:141610066:141613747:-1 gene:ENSMUSG00000097170 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT064234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT064235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_181729 // RefSeq // Mus musculus mucin 6, gastric (Muc6), mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000062451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:141633972:141655319:-1 gene:ENSMUSG00000048191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC120907 // GenBank // Mus musculus mucin 6, gastric, mRNA (cDNA clone MGC:141593 IMAGE:40087870), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000189314 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:141633456:141655319:-1 gene:ENSMUSG00000048191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000190907 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:141634049:141655308:-1 gene:ENSMUSG00000048191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000031739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:141634049:141655308:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0
NM_023764 // RefSeq // Mus musculus toll interacting protein (Tollip), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000001950 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:141881583:141902487:-1 gene:ENSMUSG00000025139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055819 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:141874813:141902415:-1 gene:ENSMUSG00000025139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000130439 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:141891993:141902423:-1 gene:ENSMUSG00000025139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000151890 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:141884273:141918507:-1 gene:ENSMUSG00000025139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// AJ242971 // GenBank // Mus musculus mRNA for TOLLIP protein. // chr7 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AK015062 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930403G24 product:toll interacting protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AK078391 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6530441F20 product:toll interacting protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC062139 // GenBank // Mus musculus toll interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:69995 IMAGE:6334946), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:141884367:141902308:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_028308 // RefSeq // Mus musculus MOB kinase activator 2 (Mob2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006508448 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MOB kinase activator 2 (Mob2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000084418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:142008553:142061034:-1 gene:ENSMUSG00000025147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF228503 // GenBank // Mus musculus ovary-specific MOB-like protein (Mmh) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019522 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4459673. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC037588 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700078K21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:47044 IMAGE:5010535), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK037090 // GenBank HTC // Mus musculus adult female vagina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9930111M04 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:142009268:142061001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_008748 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 8 (Dusp8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:142079490:142095272:-1 gene:ENSMUSG00000037887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008748 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 8 (Dusp8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006508509 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dual specificity phosphatase 8 (Dusp8), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000039926 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:142079490:142095272:-1 gene:ENSMUSG00000037887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000143661 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142083594:142095843:-1 gene:ENSMUSG00000037887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// BC052705 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 8, mRNA (cDNA clone MGC:64619 IMAGE:5697787), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:142081860:142090174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_027844 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 5-2 (Krtap5-2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000067978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:142174535:142176005:-1 gene:ENSMUSG00000054759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 1 /// ENSMUST00000190456 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:142174535:142176005:-1 gene:ENSMUSG00000054759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_006544304 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10153 (Gm10153), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000084415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:142189473:142190389:-1 gene:ENSMUSG00000066101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_023860 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 5-3 (Krtap5-3), mRNA. // chr7 // 53 // 94 // 9 // 17 // 0 /// NM_027844 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 5-2 (Krtap5-2), mRNA. // chr7 // 67 // 100 // 12 // 18 // 0 /// ENSMUST00000067978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:142174535:142176005:-1 gene:ENSMUSG00000054759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 100 // 12 // 18 // 0 /// ENSMUST00000084414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:142201364:142203015:1 gene:ENSMUSG00000046248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 53 // 94 // 9 // 17 // 0 /// GENSCAN00000031729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:142197887:142202532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 82 // 61 // 9 // 11 // 0 /// ENSMUST00000187512 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142201364:142203015:1 gene:ENSMUSG00000046248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 53 // 94 // 9 // 17 // 0 /// ENSMUST00000190456 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:142174535:142176005:-1 gene:ENSMUSG00000054759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 100 // 12 // 18 // 0
NM_001037822 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 5-5 (Krtap5-5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000097942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:142228795:142229971:-1 gene:ENSMUSG00000073785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AK020690 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A030001H12 product:keratin-associated protein 5-4, full insert sequence. // chr7 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// BC111113 // GenBank // Mus musculus keratin associated protein 5-5, mRNA (cDNA clone MGC:130543 IMAGE:40051363), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_015808 // RefSeq // Mus musculus keratin associated protein 5-1 (Krtap5-1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000188274 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:142296377:142297118:-1 gene:ENSMUSG00000066100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000119351 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142305842:142306294:-1 gene:ENSMUSG00000083812 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000031722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:142304017:142306294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1
NM_009983 // RefSeq // Mus musculus cathepsin D (Ctsd), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000066401 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142375929:142387819:-1 gene:ENSMUSG00000007891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000133843 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:142371148:142382667:-1 gene:ENSMUSG00000007891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000151120 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:142375910:142388038:-1 gene:ENSMUSG00000007891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC054758 // GenBank // Mus musculus cathepsin D, mRNA (cDNA clone MGC:64768 IMAGE:6413315), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC057931 // GenBank // Mus musculus cathepsin D, mRNA (cDNA clone MGC:65196 IMAGE:5253319), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000153679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142383194:142387819:-1 gene:ENSMUSG00000007891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// BC048900 // GenBank // Mus musculus cathepsin D, mRNA (cDNA clone IMAGE:3154895), complete cds. // chr7 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000031713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:142355965:142387804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1
NR_033261 // RefSeq // Mus musculus proline rich 33 (Prr33), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000054910 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:142491074:142506771:-1 gene:ENSMUSG00000043795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:142491806:142493128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NR_001592 // RefSeq // Mus musculus H19, imprinted maternally expressed transcript (H19), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142576296:142576910:-1 gene:ENSMUSG00000000031 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000136359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:142575529:142578143:-1 gene:ENSMUSG00000000031 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140716 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142575634:142576538:-1 gene:ENSMUSG00000000031 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000152754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142575558:142578120:-1 gene:ENSMUSG00000000031 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000149974 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142576507:142578095:-1 gene:ENSMUSG00000000031 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT064276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT064279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONMMUT064280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT064281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NR_001592 // RefSeq // Mus musculus H19, imprinted maternally expressed transcript (H19), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NR_030416 // RefSeq // Mus musculus microRNA 675 (Mir675), microRNA. // chr7 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000102320 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:142577064:142577147:-1 gene:ENSMUSG00000076275 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000136359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:142575529:142578143:-1 gene:ENSMUSG00000000031 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000152754 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142575558:142578120:-1 gene:ENSMUSG00000000031 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK052651 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630013M21 product:suppressor of Ty 6 homolog (S. cerevisiae), full insert sequence. // chr7 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// mmu-mir-675 // miRBase Micro RNA Database // MI0004123 Mus musculus miR-675 stem-loop // chr7 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT064276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT064277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT064278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT064282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NR_030251 // RefSeq // Mus musculus microRNA 483 (Mir483), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000093631 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:142654924:142654996:-1 gene:ENSMUSG00000070140 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// mmu-mir-483 // miRBase Micro RNA Database // MI0003484 Mus musculus miR-483 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT064285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSMUST00000104990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142757256:142757852:-1 gene:ENSMUSG00000078192 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:142754282:142757852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0
NM_009377 // RefSeq // Mus musculus tyrosine hydroxylase (Th), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006508538 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tyrosine hydroxylase (Th), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000000219 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:142892752:142900014:-1 gene:ENSMUSG00000000214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105929 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:142892752:142931128:-1 gene:ENSMUSG00000000214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000124951 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142892966:142899961:-1 gene:ENSMUSG00000000214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000138482 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142894404:142896609:-1 gene:ENSMUSG00000000214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 82 // 42 // 9 // 11 // 0 /// AK139568 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020005C09 product:tyrosine hydroxylase, full insert sequence. // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// M69200 // GenBank // Mouse tyrosine hydroxylase, complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123057 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142894432:142899966:-1 gene:ENSMUSG00000000214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:142893031:142898208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_008554 // RefSeq // Mus musculus achaete-scute complex homolog 2 (Drosophila) (Ascl2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006508498 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus achaete-scute complex homolog 2 (Drosophila) (Ascl2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000009392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:142966822:142969264:-1 gene:ENSMUSG00000009248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000121862 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142966829:142969264:-1 gene:ENSMUSG00000009248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC019520 // GenBank // Mus musculus achaete-scute complex homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:28478 IMAGE:4163833), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:142967918:142990028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XR_378633 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102636398 (LOC102636398), transcript variant X1, ncRNA. // chr7 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000131740 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:142988969:143008033:-1 gene:ENSMUSG00000052281 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000165444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:142988969:142990778:-1 gene:ENSMUSG00000052281 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AK039657 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330079A07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT064292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT064293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:142967918:142990028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NR_015529 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence R74862 (R74862), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_110354 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence R74862 (R74862), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NR_110355 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence R74862 (R74862), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131129 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:143033284:143053677:-1 gene:ENSMUSG00000059277 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000133630 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:143021784:143053417:-1 gene:ENSMUSG00000059277 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000155952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:143032621:143053686:-1 gene:ENSMUSG00000059277 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC005669 // GenBank // Mus musculus expressed sequence R74862, mRNA (cDNA clone IMAGE:3153122). // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT014282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT064297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT064298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr7 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0
NM_001161624 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 1C (P57) (Cdkn1c), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NM_009876 // RefSeq // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 1C (P57) (Cdkn1c), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000037287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:143458350:143461050:-1 gene:ENSMUSG00000037664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000167912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:143458350:143461050:-1 gene:ENSMUSG00000037664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC005412 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor 1C (P57), mRNA (cDNA clone MGC:5658 IMAGE:3490380), complete cds. // chr7 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// U20553 // GenBank // Mus musculus cyclin-dependent kinase inhibitor p57kip2 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// U22399 // GenBank // Mus musculus Cdk-inhibitor p57KIP2 (KIP2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:143459117:143460707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0
NM_009434 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin homology-like domain, family A, member 2 (Phlda2), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000010904 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:143501545:143502541:-1 gene:ENSMUSG00000010760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC019141 // GenBank // Mus musculus pleckstrin homology-like domain, family A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:29089 IMAGE:5042041), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:143501660:143502490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 68 // 16 // 19 // 0
NM_001285489 // RefSeq // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 4 (Nap1l4), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_001285490 // RefSeq // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 4 (Nap1l4), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_008672 // RefSeq // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 4 (Nap1l4), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006508506 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 4 (Nap1l4), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006508507 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 4 (Nap1l4), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000072727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:143513579:143549090:-1 gene:ENSMUSG00000059119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC132039 // GenBank // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:163670 IMAGE:40130316), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC138518 // GenBank // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:170143 IMAGE:8861538), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC145306 // GenBank // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:178868 IMAGE:9053860), complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC145308 // GenBank // Mus musculus nucleosome assembly protein 1-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:178870 IMAGE:9053862), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:143510483:143543829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
ENSMUST00000083184 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:143531394:143531520:-1 gene:ENSMUSG00000065118 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001252593 // RefSeq // Mus musculus cysteinyl-tRNA synthetase (Cars), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_013742 // RefSeq // Mus musculus cysteinyl-tRNA synthetase (Cars), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006508626 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cysteinyl-tRNA synthetase (Cars), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000010899 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:143557230:143600090:-1 gene:ENSMUSG00000010755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000105909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:143557707:143600056:-1 gene:ENSMUSG00000010755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC054717 // GenBank // Mus musculus cysteinyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:64751 IMAGE:5686364), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC058954 // GenBank // Mus musculus cysteinyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:66736 IMAGE:5707198), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:143557872:143589811:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_175649 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 26 (Tnfrsf26), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000055723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:143607685:143627845:-1 gene:ENSMUSG00000045362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK142511 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630004A21 product:tumor necrosis factor receptor superfamily, member 26, full insert sequence. // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AY165628 // GenBank // Mus musculus TNF receptor homolog 3 (Tnfrh3) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC138819 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 26, mRNA (cDNA clone MGC:170446 IMAGE:8861841), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC138820 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 26, mRNA (cDNA clone MGC:170447 IMAGE:8861842), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC152358 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 26, mRNA (cDNA clone MGC:165174 IMAGE:40055748), complete cds. // chr7 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:143603964:143619375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0
NM_023680 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 22 (Tnfrsf22), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000075588 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:143634808:143649661:-1 gene:ENSMUSG00000010751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000084396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:143639258:143649652:-1 gene:ENSMUSG00000010751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000129476 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:143638412:143649646:-1 gene:ENSMUSG00000010751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// ENSMUST00000146692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:143636725:143649661:-1 gene:ENSMUSG00000010751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000149524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:143640852:143649617:-1 gene:ENSMUSG00000010751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr7 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// AY046551 // GenBank // Mus musculus TNF receptor family member SOBa mRNA, complete cds. // chr7 // 79 // 70 // 15 // 19 // 0 /// AY165626 // GenBank // Mus musculus decoy TRAIL receptor 2 short form (Dctrailr2) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AY165627 // GenBank // Mus musculus decoy TRAIL receptor 2 long form (Dctrailr2) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr7 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000056171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:143640748:143649631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// NONMMUT064339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr7 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0
NM_024290 // RefSeq // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 23 (Tnfrsf23), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000035742 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:143665809:143685872:-1 gene:ENSMUSG00000037613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000152703 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:143667614:143685872:-1 gene:ENSMUSG00000037613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// AY046550 // GenBank // Mus musculus TNF receptor family member SOB mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// AY165625 // GenBank // Mus musculus decoy TRAIL receptor 1 (Dctrailr1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BC106828 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 23, mRNA (cDNA clone MGC:123882 IMAGE:40044453), complete cds. // chr7 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// BC106829 // GenBank // Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 23, mRNA (cDNA clone MGC:123883 IMAGE:40044455), complete cds. // chr7 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// XM_006508661 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 23 (Tnfrsf23), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// XM_006508660 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 23 (Tnfrsf23), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// GENSCAN00000056172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:143662628:143741723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
NM_203492 // RefSeq // Mus musculus MAS-related GPR, member G (Mrgprg), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:143763711:143766993:-1 gene:ENSMUSG00000050276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100302 // GenBank // Mus musculus MAS-related GPR, member G, mRNA (cDNA clone MGC:117497 IMAGE:30522259), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:143748836:143765373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_175534 // RefSeq // Mus musculus MAS-related GPR, member E (Mrgpre), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000054048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:143778365:143784500:-1 gene:ENSMUSG00000048965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC096766 // GenBank // Mus musculus MAS-related GPR, member E, mRNA (cDNA clone MGC:107418 IMAGE:30102203), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138305 // GenBank // Mus musculus MAS-related GPR, member E, mRNA (cDNA clone MGC:169930 IMAGE:8861325), complete cds. // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC138308 // GenBank // Mus musculus MAS-related GPR, member E, mRNA (cDNA clone MGC:169933 IMAGE:8861328), complete cds. // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000056174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:143780832:143822743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001252572 // RefSeq // Mus musculus cortactin (Cttn), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_007803 // RefSeq // Mus musculus cortactin (Cttn), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006508472 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cortactin (Cttn), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033407 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:7:144435733:144470745:-1 gene:ENSMUSG00000031078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000103079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:144435735:144471009:-1 gene:ENSMUSG00000031078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC011434 // GenBank // Mus musculus cortactin, mRNA (cDNA clone MGC:18474 IMAGE:3981559), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// U03184 // GenBank // Mus musculus BALB/c cortactin mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// XM_006508474 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cortactin (Cttn), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// XR_378605 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cortactin (Cttn), transcript variant X5, misc_RNA. // chr7 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000051408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:144445803:144470775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_010175 // RefSeq // Mus musculus Fas (TNFRSF6)-associated via death domain (Fadd), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033394 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:144577318:144582463:-1 gene:ENSMUSG00000031077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC004584 // GenBank // Mus musculus Fas (TNFRSF6)-associated via death domain, mRNA (cDNA clone MGC:5978 IMAGE:3587331), complete cds. // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC021400 // GenBank // Mus musculus Fas (TNFRSF6)-associated via death domain, mRNA (cDNA clone MGC:29107 IMAGE:4190229), complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// U43184 // GenBank // Mus musculus death domain protein FADD (FADD) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// U50406 // GenBank // Mus musculus Mort1 Fas-associated protein mRNA, complete cds. // chr7 // 78 // 72 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000051406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:144476515:144582389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001242349 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 1, calcium activated chloride channel (Ano1), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_178642 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 1, calcium activated chloride channel (Ano1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006508453 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anoctamin 1, calcium activated chloride channel (Ano1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006508463 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anoctamin 1, calcium activated chloride channel (Ano1), transcript variant X11, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:144588553:144738592:-1 gene:ENSMUSG00000031075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000118556 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:144588549:144738566:-1 gene:ENSMUSG00000031075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000121758 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:144588549:144738543:-1 gene:ENSMUSG00000031075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000152531 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:7:144621668:144669380:-1 gene:ENSMUSG00000031075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC062959 // GenBank // Mus musculus anoctamin 1, calcium activated chloride channel, mRNA (cDNA clone MGC:86166 IMAGE:30547439), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:144589999:144744754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_007631 // RefSeq // Mus musculus cyclin D1 (Ccnd1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000093962 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:144929931:144939869:-1 gene:ENSMUSG00000070348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000135985 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:144937295:144938197:-1 gene:ENSMUSG00000070348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr7 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC044841 // GenBank // Mus musculus cyclin D1, mRNA (cDNA clone MGC:7003 IMAGE:3155470), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// M64403 // GenBank // Mus domesticus cyclin-like protein (induced by colony-stimulating factor 1) (CYL-1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// EU600170 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J putative cyclin D1b mRNA, complete cds. // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000051417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:144932607:145129302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NR_033626 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810010D01 gene (1810010D01Rik), long non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004153 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AU018091 (AU018091), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000171749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:3154664:3169203:-1 gene:ENSMUSG00000054753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181669 // ENSEMBL // proj_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG4151_PATCH:3154504:3169029:-1 gene:ENSMUSG00000097916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AB201954 // GenBank // Mus musculus cat5 mRNA for cationic amino acid transporter 5, complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC050126 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AU018091, mRNA (cDNA clone MGC:60800 IMAGE:30024412), complete cds. // chr7 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC080735 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AU018091, mRNA (cDNA clone MGC:91100 IMAGE:30112559), complete cds. // chr7 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC086454 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AU018091, mRNA (cDNA clone MGC:91107 IMAGE:30460703), complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:3124710:3164265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000056913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4151_PATCH:3124710:3164095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_133190 // RefSeq // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 8 (Cacng8), mRNA. // chr7 // 79 // 100 // 30 // 38 // 0 /// ENSMUST00000092351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:3394117:3415605:1 gene:ENSMUSG00000053395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// ENSMUST00000181477 // ENSEMBL // proj_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG4151_PATCH:3392633:3414121:1 gene:ENSMUSG00000097492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// ENSMUST00000182222 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:3390683:3415648:1 gene:ENSMUSG00000053395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// ENSMUST00000182455 // ENSEMBL // proj_havana:known chromosome:GRCm38:MG4151_PATCH:3389199:3414164:1 gene:ENSMUSG00000097492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// AF361350 // GenBank // Mus musculus voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit (Cacng8) mRNA, complete cds. // chr7 // 79 // 100 // 30 // 38 // 0 /// GENSCAN00000027059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:3392934:3415605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// GENSCAN00000056906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4151_PATCH:3391450:3414121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0
NM_001093764 // RefSeq // Mus musculus myeloid-associated differentiation marker (Myadm), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// NM_001093765 // RefSeq // Mus musculus myeloid-associated differentiation marker (Myadm), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// NM_001093766 // RefSeq // Mus musculus myeloid-associated differentiation marker (Myadm), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// NM_016969 // RefSeq // Mus musculus myeloid-associated differentiation marker (Myadm), transcript variant 4, mRNA. // chr7 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// XM_006540171 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myeloid-associated differentiation marker (Myadm), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000096744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:3290556:3299345:1 gene:ENSMUSG00000068566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000164553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:3289038:3299345:1 gene:ENSMUSG00000068566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000180998 // ENSEMBL // assembly_patch_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG4151_PATCH:3289100:3298942:1 gene:ENSMUSG00000097829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// BC056355 // GenBank // Mus musculus myeloid-associated differentiation marker, mRNA (cDNA clone MGC:73479 IMAGE:6811773), complete cds. // chr7 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0
NM_133189 // RefSeq // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 7 (Cacng7), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000092891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:3332955:3368216:1 gene:ENSMUSG00000069806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000181686 // ENSEMBL // proj_ensembl:known chromosome:GRCm38:MG4151_PATCH:3331471:3366732:1 gene:ENSMUSG00000096998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF361349 // GenBank // Mus musculus voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit (Cacng7) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF458899 // GenBank // Mus musculus voltage dependent calcium channel gamma 7 subunit (Cacng7) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC141277 // GenBank // Mus musculus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 7, mRNA (cDNA clone MGC:176238 IMAGE:9055889), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:3296724:3366948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:MG4151_PATCH:3295240:3365464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000031552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3093457:3144060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_001033378 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA A430078G23 gene (A430078G23Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000098966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:3353415:3390295:1 gene:ENSMUSG00000074497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AK040218 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430078G23 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 97 // 83 // 34 // 35 // 0 /// AK163869 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130097K14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0 /// AK080017 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530047H10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000031567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3267288:3456703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 69 // 69 // 29 // 42 // 1 /// NONMMUT064394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_133962 // RefSeq // Mus musculus rho/rac guanine nucleotide exchange factor (GEF) 18 (Arhgef18), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000004684 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:3393038:3456601:1 gene:ENSMUSG00000004568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000145360 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3450758:3454268:1 gene:ENSMUSG00000004568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000156085 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3437011:3456600:1 gene:ENSMUSG00000004568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 70 // 31 // 31 // 0 /// AK172963 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0521 protein. // chr8 // 100 // 70 // 31 // 31 // 0 /// BC060639 // GenBank // Mus musculus rho/rac guanine nucleotide exchange factor (GEF) 18, mRNA (cDNA clone MGC:79199 IMAGE:6849875), complete cds. // chr8 // 97 // 89 // 38 // 39 // 0 /// ENSMUST00000131773 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3393006:3450640:1 gene:ENSMUSG00000004568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 59 // 59 // 26 // 44 // 1 /// AK041423 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630008H02 product:hypothetical Dbl domain (dbl/cdc24 rhoGEF family) containing protein, full insert sequence. // chr8 // 57 // 57 // 25 // 44 // 1 /// GENSCAN00000031567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3267288:3456703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 77 // 34 // 44 // 1
XM_006508924 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700019B03 gene (1700019B03Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// XM_006508925 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700019B03 gene (1700019B03Rik), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// XM_006508926 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700019B03 gene (1700019B03Rik), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// XR_378671 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700019B03 gene (1700019B03Rik), transcript variant X8, misc_RNA. // chr8 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000047265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:3470862:3487178:1 gene:ENSMUSG00000040340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000159076 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3470862:3487178:1 gene:ENSMUSG00000040340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000161680 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:3475849:3487181:1 gene:ENSMUSG00000040340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AK006106 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700019B03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// BC050809 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700019B03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58768 IMAGE:6771839), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3475849:3487158:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_080461 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 358 (Zfp358), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:3493138:3497208:1 gene:ENSMUSG00000047264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF397208 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein ZFEND mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC040067 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 358, mRNA (cDNA clone MGC:47026 IMAGE:4008695), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC055855 // GenBank HTC // Mus musculus zinc finger protein 358, mRNA (cDNA clone IMAGE:4020830), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3493084:3497135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_053177 // RefSeq // Mus musculus mucolipin 1 (Mcoln1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_378672 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mucolipin 1 (Mcoln1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XR_378673 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mucolipin 1 (Mcoln1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000004683 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:3500457:3515232:1 gene:ENSMUSG00000004567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000162797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3505779:3515232:1 gene:ENSMUSG00000004567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF302009 // GenBank // Mus musculus mucolipin-1 (Mcoln1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC005651 // GenBank // Mus musculus mucolipin 1, mRNA (cDNA clone MGC:7172 IMAGE:3257440), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC020377 // GenBank HTC // Mus musculus mucolipin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3499432). // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3500597:3515050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0
NM_001024728 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA C330021F23 gene (C330021F23Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000136592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3567998:3584776:1 gene:ENSMUSG00000065952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000153341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3567995:3578597:1 gene:ENSMUSG00000065952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// AK011562 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2610027C06 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// BC089480 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C330021F23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107128 IMAGE:30307882), complete cds. // chr8 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// ENSMUST00000138454 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3567990:3573650:1 gene:ENSMUSG00000065952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// AK168456 // GenBank HTC // Mus musculus 17 days embryo kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920022O10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// NONMMUT064405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// NONMMUT064404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001204959 // RefSeq // Mus musculus resistin (Retn), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NM_022984 // RefSeq // Mus musculus resistin (Retn), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// XM_006508846 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus resistin (Retn), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000169234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:3655770:3658096:1 gene:ENSMUSG00000012705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// AF323080 // GenBank // Mus musculus resistin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000012849 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3655770:3660110:1 gene:ENSMUSG00000012705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1 /// AF290870 // GenBank // Mus musculus adipose-specific cysteine-rich secreted A12-alpha precursor, mRNA, complete cds. // chr8 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1 /// BC051196 // GenBank // Mus musculus resistin, mRNA (cDNA clone MGC:62882 IMAGE:1448672), complete cds. // chr8 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1 /// GENSCAN00000031557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3656016:3679590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_026985 // RefSeq // Mus musculus mast cell expressed membrane protein 1 (Mcemp1), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006508871 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1810033B17 gene (1810033B17Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000014118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:3665762:3668905:1 gene:ENSMUSG00000013974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3656016:3679590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_025701 // RefSeq // Mus musculus trafficking protein particle complex 5 (Trappc5), mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000044857 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:3676299:3681255:1 gene:ENSMUSG00000040236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK078451 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720478G02 product:weakly similar to CG10153 PROTEIN (GH17639P) [Drosophila melanogaster], full insert sequence. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK171833 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830013K05 product:trafficking protein particle complex 5, full insert sequence. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC049179 // GenBank // Mus musculus trafficking protein particle complex 5, mRNA (cDNA clone MGC:54481 IMAGE:6313540), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3656016:3679590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_181732 // RefSeq // Mus musculus axin interactor, dorsalization associated (Aida), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000109166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:1:183297060:183324501:1 gene:ENSMUSG00000042901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000159522 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:4087658:4088572:1 gene:ENSMUSG00000074482 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 53 // 21 // 21 // 0 /// AK085039 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430028H19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// BC057183 // GenBank // Mus musculus axin interactor, dorsalization associated, mRNA (cDNA clone MGC:67801 IMAGE:5065689), complete cds. // chr8 // 91 // 88 // 32 // 35 // 0 /// BC086763 // GenBank // Mus musculus axin interactor, dorsalization associated, mRNA (cDNA clone MGC:101949 IMAGE:5707830), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000012861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:1:183297519:183323014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:4087658:4088575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 53 // 21 // 21 // 0 /// BC004835 // GenBank HTC // Mus musculus axin interactor, dorsalization associated, mRNA (cDNA clone IMAGE:2651163). // chr8 // 85 // 98 // 33 // 39 // 0
NM_027343 // RefSeq // Mus musculus CD209g antigen (Cd209g), mRNA. // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC118542 // GenBank // Mus musculus CD209g antigen, mRNA (cDNA clone IMAGE:40051800), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000130372 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:8:4134733:4137707:1 gene:ENSMUSG00000079168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:4135565:4137402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0
NM_028175 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 8 family, member E (Lrrc8e), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:4226827:4237470:1 gene:ENSMUSG00000046589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC080783 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 8 family, member E, mRNA (cDNA clone MGC:91131 IMAGE:30481669), complete cds. // chr8 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:4231667:4236164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_133968 // RefSeq // Mus musculus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 2 (Snapc2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006508683 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 2 (Snapc2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000011981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:4253102:4256219:1 gene:ENSMUSG00000011837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC011147 // GenBank // Mus musculus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:19080 IMAGE:4194905), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:4238910:4255806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0
XM_006508738 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 25 (Ccl25), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// XM_006508741 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 25 (Ccl25), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000069762 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:4325227:4348788:1 gene:ENSMUSG00000023235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:non_stop_decay gene:ENSMUSG00000055951 // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000098949 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:4325230:4348788:1 gene:ENSMUSG00000023235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay gene:ENSMUSG00000055951 // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK154211 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630009L16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_033527 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 25 (Ccl25), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000127460 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:4325233:4359654:1 gene:ENSMUSG00000023235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000153254 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:4325241:4333299:1 gene:ENSMUSG00000023235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSMUST00000155797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:4325210:4359998:1 gene:ENSMUSG00000023235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONMMUT064450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_145591 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 958 (Zfp958), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000073201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:4625840:4629380:1 gene:ENSMUSG00000058748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC003267 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC003267, mRNA (cDNA clone MGC:7772 IMAGE:3499094), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC138223 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC003267, mRNA (cDNA clone MGC:169847 IMAGE:8861242), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC145996 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC003267, mRNA (cDNA clone MGC:175883 IMAGE:40131299), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
XM_006544320 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein FAM136A-like (LOC102632427), partial mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:4641673:4652480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1
GENSCAN00000048947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:5117361:5117870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0
NM_008155 // RefSeq // Mus musculus glucose phosphate isomerase 1 (Gpi1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038027 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:7:34202122:34230281:-1 gene:ENSMUSG00000036427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:5639584:5640996:1 gene:ENSMUSG00000043192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135243 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:34202159:34210377:-1 gene:ENSMUSG00000036427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC086640 // GenBank // Mus musculus glucose phosphate isomerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:113761 IMAGE:6832250), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088995 // GenBank // Mus musculus glucose phosphate isomerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:113776 IMAGE:6403790), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L09104 // GenBank // Mus musculus glucose phosphate isomerase mRNA, 3 end. // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// M14220 // GenBank // Mouse neuroleukin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC157972 // GenBank // Mus musculus glucose phosphate isomerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:189794 IMAGE:9007294), complete cds. // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// BC172124 // GenBank // Mus musculus glucose phosphate isomerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:198829 IMAGE:9054410), complete cds. // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000005606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:34202414:34230213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:5619287:5641011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001162906 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2410089E03 gene (2410089E03Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110617 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:15:8169106:8271158:1 gene:ENSMUSG00000039801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058107 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410089E03 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6824838), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000128772 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:15:8247103:8252976:1 gene:ENSMUSG00000039801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AK041703 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630031B14 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000022411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:15:8169025:8270855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:7019166:7092768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT022685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
XR_404688 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4921522P10 gene (4921522P10Rik), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000048606 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:8661801:8664728:1 gene:ENSMUSG00000040467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK014948 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921522P10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AK081065 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B930078G14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
GENSCAN00000055743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:8711484:8713518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001081119 // RefSeq // Mus musculus abhydrolase domain containing 13 (Abhd13), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_026868 // RefSeq // Mus musculus abhydrolase domain containing 13 (Abhd13), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048216 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:9977717:9992155:1 gene:ENSMUSG00000040396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139793 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:9977707:9992155:1 gene:ENSMUSG00000040396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC043690 // GenBank // Mus musculus abhydrolase domain containing 13, mRNA (cDNA clone MGC:49304 IMAGE:5148187), complete cds. // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001081397 // RefSeq // Mus musculus myosin XVI (Myo16), mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// XM_006508779 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myosin XVI (Myo16), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000042103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:10272572:10634741:1 gene:ENSMUSG00000039057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// AB429291 // GenBank // Mus musculus NYAP3 mRNA for neuronal tyrosine phosphorylated adaptor for phosphoinositide 3-kinase adaptor 3, complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC072580 // GenBank // Mus musculus myosin XVI, mRNA (cDNA clone IMAGE:5717256), complete cds. // chr8 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// BC082311 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA C230040D10 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30544520). // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC151049 // GenBank // Mus musculus myosin XVI, mRNA (cDNA clone MGC:183962 IMAGE:9087962), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC151051 // GenBank // Mus musculus myosin XVI, mRNA (cDNA clone MGC:183964 IMAGE:9087964), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC157966 // GenBank // Mus musculus myosin XVI, mRNA (cDNA clone MGC:189790 IMAGE:9007290), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC172122 // GenBank // Mus musculus myosin XVI, mRNA (cDNA clone MGC:198827 IMAGE:9054408), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000053292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:10312612:10482151:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0
NM_009932 // RefSeq // Mus musculus collagen, type IV, alpha 2 (Col4a2), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000033899 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:11312805:11449287:1 gene:ENSMUSG00000031503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000145295 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:11404908:11421254:1 gene:ENSMUSG00000031503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 20 // 10 // 10 // 0 /// BC138040 // GenBank // Mus musculus collagen, type IV, alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:169664 IMAGE:8861059), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 45 // 45 // 0 /// J04695 // GenBank // Mus musculus alpha-2 type IV collagen mRNA, complete cds. // chr8 // 98 // 94 // 46 // 47 // 0 /// GENSCAN00000007863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:11352647:11453065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 41 // 41 // 0
NM_011919 // RefSeq // Mus musculus inhibitor of growth family, member 1 (Ing1), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000054399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:11556066:11563250:1 gene:ENSMUSG00000045969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF149820 // GenBank // Mus musculus p33ING1 protein mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// AF177755 // GenBank // Mus musculus ING1 protein (Ing1) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr8 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// AF177756 // GenBank // Mus musculus ING1 protein (Ing1) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr8 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AF177757 // GenBank // Mus musculus ING1 protein (Ing1) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr8 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC016573 // GenBank // Mus musculus inhibitor of growth family, member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3496013), complete cds. // chr8 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC147770 // GenBank // Mus musculus inhibitor of growth family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:182879 IMAGE:9087493), complete cds. // chr8 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// BC147784 // GenBank // Mus musculus inhibitor of growth family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:182889 IMAGE:9087503), complete cds. // chr8 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// XM_006508803 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inhibitor of growth family, member 1 (Ing1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// XM_006508804 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus inhibitor of growth family, member 1 (Ing1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000007859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:11556910:11605594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XR_105188 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 7562 (Gm7562), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK157293 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830210A08 product:hypothetical Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSMUST00000134409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:11713264:11722620:1 gene:ENSMUSG00000031510 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK007309 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700128E19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_404706 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642155 (LOC102642155), ncRNA. // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONMMUT064593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_029326 // RefSeq // Mus musculus testis expressed 29 (Tex29), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006508918 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed 29 (Tex29), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006508919 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed 29 (Tex29), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006508920 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed 29 (Tex29), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000033909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:11840474:11855761:1 gene:ENSMUSG00000031512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000132536 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:11842061:11855757:1 gene:ENSMUSG00000031512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000166638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:11840919:11855705:1 gene:ENSMUSG00000031512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC049746 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700018L24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58783 IMAGE:6772475), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT064603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:11747406:11855705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
XR_404718 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A230072I06 gene (A230072I06Rik), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:12278819:12280657:1 gene:ENSMUSG00000074473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK138338 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230072I06 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027975 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5607 (Gm5607), long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000080795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:12385771:12436729:1 gene:ENSMUSG00000047935 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000186174 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:12385771:12436750:1 gene:ENSMUSG00000047935 gene_biotype:sense_overlapping transcript_biotype:sense_overlapping // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT064613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_009233 // RefSeq // Mus musculus SRY (sex determining region Y)-box 1 (Sox1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180353 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:12395295:12400126:1 gene:ENSMUSG00000096014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB108672 // GenBank // Mus musculus Sox1 mRNA for transcriptional factor SOX1, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:12312141:12397536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024279 // RefSeq // Mus musculus sperm acrosome associated 7 (Spaca7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000010579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:12573049:12600738:1 gene:ENSMUSG00000010435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC048522 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700094C09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58425 IMAGE:6741699), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:12579328:12586658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSMUST00000068194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:12672186:12673488:1 gene:ENSMUSG00000054910 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK088235 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430007M06 product:RIKEN cDNA 4931415C17 gene, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131064 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:12672427:12679229:1 gene:ENSMUSG00000054910 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// AK016458 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931415C17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT064624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// KnowTID_00006976 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT064625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000118696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:13021941:13022210:1 gene:ENSMUSG00000081951 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT064652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_010172 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor VII (F7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033820 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:13026034:13035809:1 gene:ENSMUSG00000031443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC061149 // GenBank // Mus musculus coagulation factor VII, mRNA (cDNA clone MGC:74281 IMAGE:30305571), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U44795 // GenBank // Mus musculus coagulation factor VII (fVII) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006508696 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coagulation factor VII (F7), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000015465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13026059:13035316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_025834 // RefSeq // Mus musculus protein Z, vitamin K-dependent plasma glycoprotein (Proz), mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// XM_006508858 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein Z, vitamin K-dependent plasma glycoprotein (Proz), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000033822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13060908:13075006:1 gene:ENSMUSG00000031445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC024104 // GenBank // Mus musculus protein Z, vitamin K-dependent plasma glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:35708 IMAGE:5136392), complete cds. // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC038045 // GenBank // Mus musculus protein Z, vitamin K-dependent plasma glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:46788 IMAGE:4196827), complete cds. // chr8 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// XM_006508859 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein Z, vitamin K-dependent plasma glycoprotein (Proz), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// GENSCAN00000015491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13061030:13073930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
NM_146207 // RefSeq // Mus musculus cullin 4A (Cul4a), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000016680 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:13105621:13147940:1 gene:ENSMUSG00000031446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000121426 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:13105740:13124222:1 gene:ENSMUSG00000031446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000125514 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:13123525:13147362:1 gene:ENSMUSG00000031446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 66 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000135371 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:13105740:13117195:1 gene:ENSMUSG00000031446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// AK166251 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0526 Jyg-MC(A) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G830025C09 product:cullin 4A, full insert sequence. // chr8 // 86 // 32 // 12 // 14 // 0 /// BC010211 // GenBank // Mus musculus cullin 4A, mRNA (cDNA clone MGC:11743 IMAGE:3969515), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC024113 // GenBank // Mus musculus cullin 4A, mRNA (cDNA clone MGC:36573 IMAGE:5097944), complete cds. // chr8 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// BC027006 // GenBank // Mus musculus cullin 4A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5363990), partial cds. // chr8 // 100 // 66 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13105756:13146627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// BC007159 // GenBank // Mus musculus mRNA similar to L1 repeat, Tf subfamily, member 30 (cDNA clone IMAGE:3487559). // chr8 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0
NM_010684 // RefSeq // Mus musculus lysosomal-associated membrane protein 1 (Lamp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000033824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13159135:13175338:1 gene:ENSMUSG00000031447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY069968 // GenBank // Mus musculus LAMP-1 mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// BC049097 // GenBank // Mus musculus lysosomal-associated membrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:61411 IMAGE:5716524), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// M25244 // GenBank // Mouse pre-B cell P2B/LAMP-1 mRNA, complete cds. // chr8 // 85 // 93 // 23 // 27 // 0 /// M32015 // GenBank // Mouse lysosomal membrane glycoprotein-type A (lgp-120) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13165911:13174558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_172282 // RefSeq // Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 3 (Tmco3), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XR_378658 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 3 (Tmco3), transcript variant X3, misc_RNA. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000045229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13288013:13322924:1 gene:ENSMUSG00000038497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC039955 // GenBank // Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 3, mRNA (cDNA clone MGC:49672 IMAGE:4236297), complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC053487 // GenBank // Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:30008098), complete cds. // chr8 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13291728:13337556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NM_001291765 // RefSeq // Mus musculus transcription factor Dp 1 (Tfdp1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// NM_001291766 // RefSeq // Mus musculus transcription factor Dp 1 (Tfdp1), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// NM_001291768 // RefSeq // Mus musculus transcription factor Dp 1 (Tfdp1), transcript variant 4, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// NM_009361 // RefSeq // Mus musculus transcription factor Dp 1 (Tfdp1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// XM_006508754 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor Dp 1 (Tfdp1), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// XM_006508758 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transcription factor Dp 1 (Tfdp1), transcript variant X9, mRNA. // chr8 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// BC058633 // GenBank // Mus musculus transcription factor Dp 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6416171), partial cds. // chr8 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
NM_011881 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor kinase 1 (Grk1), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000033827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13405081:13421945:1 gene:ENSMUSG00000031450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC075722 // GenBank HTC // Mus musculus G protein-coupled receptor kinase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5360130), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC096611 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:106364 IMAGE:5357325), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13405118:13416252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AF085240 // GenBank // Mus musculus rhodopsin kinase mRNA, complete cds. // chr8 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0
NM_001143671 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 255B (Tmem255b), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001143672 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 255B (Tmem255b), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006508810 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 255B (Tmem255b), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006508812 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 255B (Tmem255b), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006508814 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 255B (Tmem255b), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006508815 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 255B (Tmem255b), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000167071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13435459:13461452:1 gene:ENSMUSG00000038457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000167505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13435459:13461452:1 gene:ENSMUSG00000038457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC042836 // GenBank // Mus musculus gene model 687, (NCBI), mRNA (cDNA clone IMAGE:4012205). // chr8 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13435613:13461075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
NM_025924 // RefSeq // Mus musculus UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog A (yeast) (Upf3a), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006508860 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog A (yeast) (Upf3a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// ENSMUST00000043767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13785615:13798538:1 gene:ENSMUSG00000038398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK020823 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930007B21 product:similar to HUPF3A [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// AK145471 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0002C10 product:UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog A (yeast), full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC116988 // GenBank // Mus musculus UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:151365 IMAGE:40126307), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC119035 // GenBank // Mus musculus UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:155351 IMAGE:8733784), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AK033239 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8030472N21 product:similar to HUPF3A [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000015473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13785684:13798474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_181854 // RefSeq // Mus musculus chromosome alignment maintaining phosphoprotein 1 (Champ1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051870 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:13869641:13881639:1 gene:ENSMUSG00000047710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000128557 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:13869704:13879811:1 gene:ENSMUSG00000047710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC028991 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 828, mRNA (cDNA clone MGC:38639 IMAGE:5355869), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13877844:13880252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NR_028079 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, H/ACA box 3 (Snora3), small nucleolar RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083082 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:7:109520120:109520251:1 gene:ENSMUSG00000065016 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083883 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:13876097:13876226:1 gene:ENSMUSG00000065817 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132877 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:7:109519196:109521153:1 gene:ENSMUSG00000046364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT063161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT063164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025785 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 25 (Fbxo25), mRNA. // chr8 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSMUST00000043520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13907806:13940521:1 gene:ENSMUSG00000038365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC014749 // GenBank // Mus musculus F-box protein 25, mRNA (cDNA clone MGC:25973 IMAGE:4240953), complete cds. // chr8 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13914951:13935289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000098916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:14090461:14092590:1 gene:ENSMUSG00000074461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK134595 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330441D15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_012000 // RefSeq // Mus musculus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 8 (Cln8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006508806 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 8 (Cln8), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006508807 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 8 (Cln8), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000027554 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:14888111:14901720:1 gene:ENSMUSG00000026317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF125308 // GenBank // Mus musculus neuronal ceroid lipofuscinosis type 8 (Cln8) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK166905 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0021K21 product:ceroid-lipofuscinosis, neuronal 8, full insert sequence. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC021625 // GenBank // Mus musculus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 8, mRNA (cDNA clone MGC:13730 IMAGE:4188527), complete cds. // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001037736 // RefSeq // Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 10 (Arhgef10), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_172751 // RefSeq // Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 10 (Arhgef10), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006508773 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 10 (Arhgef10), transcript variant X10, mRNA. // chr8 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000084207 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:14911663:15001085:1 gene:ENSMUSG00000071176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000110800 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:14911738:15001085:1 gene:ENSMUSG00000071176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000161162 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:14911724:14961202:1 gene:ENSMUSG00000071176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000163062 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:14945301:15001082:1 gene:ENSMUSG00000071176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC059212 // GenBank // Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 10, mRNA (cDNA clone MGC:66545 IMAGE:6400425), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC066074 // GenBank // Mus musculus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 10, mRNA (cDNA clone MGC:91388 IMAGE:6855196), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:14934770:14999830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_029116 // RefSeq // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 11 (Kbtbd11), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000069399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:15011025:15033333:1 gene:ENSMUSG00000055675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184598 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:15011306:15027093:1 gene:ENSMUSG00000055675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// XM_006508917 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 11 (Kbtbd11), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_029116 // RefSeq // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 11 (Kbtbd11), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006508917 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 11 (Kbtbd11), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000069399 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:15011025:15033333:1 gene:ENSMUSG00000055675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000183471 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:15027290:15033333:1 gene:ENSMUSG00000055675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC080858 // GenBank // Mus musculus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:90804 IMAGE:6852896), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:15027403:15029304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT064715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_008664 // RefSeq // Mus musculus myomesin 2 (Myom2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000033842 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:15057653:15133541:1 gene:ENSMUSG00000031461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AJ001038 // GenBank // Mus musculus mRNA for M-protein. // chr8 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// BC115722 // GenBank // Mus musculus myomesin 2, mRNA (cDNA clone MGC:141540 IMAGE:40086642), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC115834 // GenBank // Mus musculus myomesin 2, mRNA (cDNA clone MGC:141541 IMAGE:40086646), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:15059056:15132956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0
NM_026792 // RefSeq // Mus musculus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 5 (lysophosphatidic acid acyltransferase, epsilon) (Agpat5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000033847 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:18846279:18883421:1 gene:ENSMUSG00000031467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000149565 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:18846277:18891361:1 gene:ENSMUSG00000031467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY161042 // GenBank // Mus musculus 1-acylglycerolphosphate acyltransferase-epsilon mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// BC031987 // GenBank // Mus musculus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 5 (lysophosphatidic acid acyltransferase, epsilon), mRNA (cDNA clone MGC:25566 IMAGE:3982362), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:18810342:18901901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
ENSMUST00000157795 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:18932989:18933091:1 gene:ENSMUSG00000088420 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT064784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_183035 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 34 (Defb34), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000064475 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19123752:19126540:1 gene:ENSMUSG00000052554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001034905 // RefSeq // Mus musculus sperm associated antigen 11B (Spag11b), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000110767 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19140759:19143010:1 gene:ENSMUSG00000059463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AY552531 // GenBank // Mus musculus EP2H (Ep2c/h) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 71 // 57 // 15 // 21 // 0 /// NM_001039563 // RefSeq // Mus musculus sperm associated antigen 11B (Spag11b), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 76 // 76 // 28 // 37 // 1 /// NM_001286493 // RefSeq // Mus musculus sperm associated antigen 11B (Spag11b), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 76 // 76 // 28 // 37 // 1 /// ENSMUST00000039075 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19140798:19142749:1 gene:ENSMUSG00000059463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// AY552530 // GenBank // Mus musculus EP2C (Ep2c/h) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1 /// DQ012055 // GenBank // Mus musculus sperm-associated antigen 11 variant C (Spag11) mRNA, complete cds. // chr8 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// GENSCAN00000032631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:19140798:19142749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1
NM_153115 // RefSeq // Mus musculus sperm associated antigen 11A (Spag11a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19157886:19159578:1 gene:ENSMUSG00000079842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB089183 // GenBank // Mus musculus mEP2e mRNA for EP2e, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF384173 // GenBank // Mus musculus antimicrobial peptide Bin1b (Bin1b) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AY552529 // GenBank // Mus musculus EP2Q (Ep2q) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC120808 // GenBank // Mus musculus sperm associated antigen 11, mRNA (cDNA clone MGC:156045 IMAGE:40129731), complete cds. // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC120810 // GenBank // Mus musculus sperm associated antigen 11, mRNA (cDNA clone MGC:156047 IMAGE:40129733), complete cds. // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006508927 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sperm associated antigen 11A (Spag11a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// XM_006508928 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sperm associated antigen 11A (Spag11a), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// BC089530 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6773219. // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// AY552532 // GenBank // Mus musculus EP2Q (Ep2q) mRNA, complete sequence, alternatively spliced. // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
BC116198 // GenBank // Mus musculus defensin beta 14, mRNA (cDNA clone IMAGE:40090051), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_183026 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 14 (Defb14), mRNA. // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// XM_006508794 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus defensin beta 14 (Defb14), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// XM_006508796 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus defensin beta 14 (Defb14), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// ENSMUST00000052601 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19194357:19195212:1 gene:ENSMUSG00000046354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// BC116199 // GenBank // Mus musculus defensin beta 14, mRNA (cDNA clone MGC:143490 IMAGE:40090056), complete cds. // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000032607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:19194357:19195212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
NM_019728 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 4 (Defb4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000081017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19198706:19201545:1 gene:ENSMUSG00000059230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF155882 // GenBank // Mus musculus beta defensin-4 mRNA, complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// BC099882 // GenBank // Mus musculus defensin beta 4, mRNA (cDNA clone MGC:123518 IMAGE:40040625), complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// BC099883 // GenBank // Mus musculus defensin beta 4, mRNA (cDNA clone MGC:123519 IMAGE:40040627), complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// BC100674 // GenBank // Mus musculus defensin beta 4, mRNA (cDNA clone MGC:123517 IMAGE:40040624), complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// BC100675 // GenBank // Mus musculus defensin beta 4, mRNA (cDNA clone MGC:123520 IMAGE:40040630), complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0
NM_030734 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 5 (Defb5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000110763 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:19247580:19250828:1 gene:ENSMUSG00000039785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF318068 // GenBank // Mus musculus defensin beta 5 (Defb5) mRNA, complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0
NM_054074 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 6 (Defb6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000063112 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19225478:19228209:1 gene:ENSMUSG00000050756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB063109 // GenBank // Mus musculus mBD-6 mRNA for beta-defensin 6, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119422 // GenBank // Mus musculus defensin beta 6, mRNA (cDNA clone MGC:140826 IMAGE:40038954), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC119423 // GenBank // Mus musculus defensin beta 6, mRNA (cDNA clone MGC:140827 IMAGE:40038955), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC141871 // GenBank // Mus musculus defensin beta 6, mRNA (cDNA clone MGC:148174 IMAGE:40038967), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC141872 // GenBank // Mus musculus defensin beta 6, mRNA (cDNA clone MGC:148175 IMAGE:40038968), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001025351 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 46 (Defb46), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000095436 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19239916:19242143:1 gene:ENSMUSG00000071169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AY621335 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 50 (Defb50) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// DQ012053 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 53 (Defb53) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_013756 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 3 (Defb3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000033852 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19293360:19295291:1 gene:ENSMUSG00000039775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// AF092929 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 3 (Bd3) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC114344 // GenBank // Mus musculus defensin beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:129397 IMAGE:40049236), complete cds. // chr8 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// BC116176 // GenBank // Mus musculus defensin beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:129394 IMAGE:40049224), complete cds. // chr8 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// BC116177 // GenBank // Mus musculus defensin beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:129395 IMAGE:40049232), complete cds. // chr8 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// BC134358 // GenBank // Mus musculus defensin beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:156345 IMAGE:40049234), complete cds. // chr8 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
NM_139220 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 7 (Defb7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000047851 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19495097:19497775:1 gene:ENSMUSG00000037790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:19495108:19497696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000118143 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:19535904:19538583:1 gene:ENSMUSG00000083218 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:19523747:19537570:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
ENSMUST00000092138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:20122365:20126624:1 gene:ENSMUSG00000094614 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// ENSMUST00000098901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:20294036:20297546:-1 gene:ENSMUSG00000101635 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene gene:ENSMUSG00000071796 // chr8 // 75 // 82 // 21 // 28 // 0 /// BC064022 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2610005L07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5367925), partial cds. // chr8 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// XR_404996 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102642688 (LOC102642688), ncRNA. // chr8 // 40 // 59 // 8 // 20 // 0 /// NONMMUT064826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 75 // 82 // 21 // 28 // 0
NM_001012640 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence AY761185 (AY761185), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110758 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:20943693:20944748:-1 gene:ENSMUSG00000079120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY761185 // GenBank // Mus musculus CRS4C-6 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC141303 // GenBank // Mus musculus cDNA clone MGC:176264 IMAGE:9055915, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:20917011:20944710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001025353 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 6040 (Gm6040), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095430 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:20916490:20922071:-1 gene:ENSMUSG00000071165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY621337 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 52 (Defb52) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC139164 // GenBank // Mus musculus predicted gene, EG574083, mRNA (cDNA clone MGC:170791 IMAGE:8862186), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ012051 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 51 (Defb51) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:20917011:20944710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000180355 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:20884608:20888200:-1 gene:ENSMUSG00000093800 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT067842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000013589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:20869506:20902007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1
NM_183253 // RefSeq // Mus musculus defensin, alpha, 21 (Defa21), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_207658 // RefSeq // Mus musculus defensin, alpha, 22 (Defa22), mRNA. // chr8 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// ENSMUST00000076754 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21025545:21026516:1 gene:ENSMUSG00000074447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000098897 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21162277:21163249:1 gene:ENSMUSG00000074443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// AY746426 // GenBank // Mus musculus defensin-related cryptdin 21 (Defcr21) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// AY746427 // GenBank // Mus musculus defensin-related cryptdin 22 (Defcr22) mRNA, complete cds. // chr8 // 56 // 69 // 14 // 25 // 0 /// BC134360 // GenBank // Mus musculus defensin related cryptdin 4, mRNA (cDNA clone MGC:157488 IMAGE:40134597), complete cds. // chr8 // 43 // 64 // 10 // 23 // 0 /// NM_001012307 // RefSeq // Mus musculus defensin, alpha, 23 (Defa23), mRNA. // chr8 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NM_007848 // RefSeq // Mus musculus defensin, alpha, related sequence 7 (Defa-rs7), mRNA. // chr8 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000002470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:20953651:21042053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000002502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:21162320:21182668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
ENSMUST00000130905 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:21091366:21091846:1 gene:ENSMUSG00000085898 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000002523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:21084442:21091764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001024225 // RefSeq // Mus musculus defensin, alpha, 24 (Defa24), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000080533 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21734494:21735471:1 gene:ENSMUSG00000064213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AY746429 // GenBank // Mus musculus defensin-related cryptdin 24 (Defcr24) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000119719 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:21749175:21750000:1 gene:ENSMUSG00000084254 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:21734537:21762869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_007843 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 1 (Defb1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051017 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21776599:21795185:1 gene:ENSMUSG00000044748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024380 // GenBank // Mus musculus defensin beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:36107 IMAGE:4975536), complete cds. // chr8 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_199067 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 50 (Defb50), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000078879 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21823539:21831296:1 gene:ENSMUSG00000058568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY387658 // GenBank // Mus musculus prostate beta defensin 1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY621336 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 51 (Defb51) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// DQ012050 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 50 (Defb50) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_010030 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 2 (Defb2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000006745 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21839926:21843482:1 gene:ENSMUSG00000006570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC109129 // GenBank // Mus musculus defensin beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:129140 IMAGE:40038941), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC109130 // GenBank // Mus musculus defensin beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:129141 IMAGE:40038942), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0
NM_139225 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 10 (Defb10), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000054162 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21858901:21862011:1 gene:ENSMUSG00000044743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_139224 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 35 (Defb35), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000076786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21938352:21940878:1 gene:ENSMUSG00000058052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NM_139223 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 13 (Defb13), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000060587 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21946762:21948850:1 gene:ENSMUSG00000044222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ575427 // GenBank // Mus musculus mRNA for beta defensin 13 (Defb13 gene). // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_026459 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 70 (Ccdc70), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509183 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 70 (Ccdc70), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006509184 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 70 (Ccdc70), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000017193 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21970596:21974041:1 gene:ENSMUSG00000017049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070649 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:21969775:21974017:1 gene:ENSMUSG00000017049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK007190 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700112P19 product:hypothetical Microbodies C-terminal targeting signal/Glutamic acid-rich region containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC049553 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 70, mRNA (cDNA clone MGC:58141 IMAGE:6773824), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:21973196:21973867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001243161 // RefSeq // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 11 (alpha-1,2-mannosyltransferase) (Alg11), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_183142 // RefSeq // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 11 (alpha-1,2-mannosyltransferase) (Alg11), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NR_040650 // RefSeq // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 11 (alpha-1,2-mannosyltransferase) (Alg11), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006509045 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus asparagine-linked glycosylation 11 (alpha-1,2-mannosyltransferase) (Alg11), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000072572 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:22060721:22071627:1 gene:ENSMUSG00000063362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000110737 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:22060722:22071627:1 gene:ENSMUSG00000063362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC061469 // GenBank // Mus musculus asparagine-linked glycosylation 11 homolog (yeast, alpha-1,2-mannosyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:67180 IMAGE:6821552), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000131624 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:22060740:22065447:1 gene:ENSMUSG00000063362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// GENSCAN00000052998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22055657:22068152:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0
NM_027338 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 36 (yeast) (Vps36), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033866 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:22192809:22220843:1 gene:ENSMUSG00000031479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK008946 // GenBank HTC // Mus musculus adult male stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2210415M20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// BC010811 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 36 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:19122 IMAGE:4210911), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22192736:22218492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_199257 // RefSeq // Mus musculus transmembrane phosphatase with tensin homology (Tpte), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006509097 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane phosphatase with tensin homology (Tpte), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000077194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22283441:22371418:1 gene:ENSMUSG00000031481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AJ311312 // GenBank // Mus musculus mRNA for tyrosine phosphatase (Tpte gene), isoform B, splice variant B. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AJ311313 // GenBank // Mus musculus mRNA for tyrosine phosphatase (Tpte gene), isoform C, splice variant C. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC107329 // GenBank // Mus musculus transmembrane phosphatase with tensin homology, mRNA (cDNA clone MGC:130293 IMAGE:40054415), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22320869:22372150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0
NM_020560 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S31 (Mrps31), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000033934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22411340:22429665:1 gene:ENSMUSG00000031533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC027430 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S31, mRNA (cDNA clone MGC:35889 IMAGE:4187438), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC018475 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S31, mRNA (cDNA clone MGC:27865 IMAGE:3492633), complete cds. // chr8 // 71 // 88 // 20 // 28 // 0 /// XM_006509178 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mitochondrial ribosomal protein S31 (Mrps31), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// AK078073 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330436I18 product:mitochondrial ribosomal protein S31, full insert sequence. // chr8 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// GENSCAN00000052984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22411466:22453591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0
NM_011394 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 20, member 2 (Slc20a2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006509044 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 20, member 2 (Slc20a2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000067786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22476700:22569607:1 gene:ENSMUSG00000037656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF196476 // GenBank // Mus musculus type III sodium-dependent phosphate transporter (Slc20a2) mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 83 // 27 // 30 // 0 /// BC046510 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 20, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:51401 IMAGE:4035182), complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// U62559 // GenBank // Mus musculus gibbon ape leukemia virus receptor (MolPit2) mRNA, segment 1 and partial cds. // chr8 // 57 // 39 // 8 // 14 // 0 /// GENSCAN00000052978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22535284:22568420:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NM_145592 // RefSeq // Mus musculus dickkopf homolog 4 (Xenopus laevis) (Dkk4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006509098 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dickkopf homolog 4 (Xenopus laevis) (Dkk4), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006509099 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dickkopf homolog 4 (Xenopus laevis) (Dkk4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// ENSMUST00000033936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22624043:22627536:1 gene:ENSMUSG00000031535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC018400 // GenBank // Mus musculus dickkopf homolog 4 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:25705 IMAGE:3675956), complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22624183:22626973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0
NM_008872 // RefSeq // Mus musculus plasminogen activator, tissue (Plat), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22757744:22782847:1 gene:ENSMUSG00000031538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC011256 // GenBank // Mus musculus plasminogen activator, tissue, mRNA (cDNA clone MGC:18508 IMAGE:4038404), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC057967 // GenBank // Mus musculus plasminogen activator, tissue, mRNA (cDNA clone MGC:68235 IMAGE:4979664), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061508 // GenBank // Mus musculus plasminogen activator, tissue, mRNA (cDNA clone MGC:70311 IMAGE:5352018), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// J03520 // GenBank // Mouse tissue plasminogen activator mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AK053476 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130020K19 product:plasminogen activator, tissue, full insert sequence. // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000052989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22756359:22782106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000068068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22808275:22808732:1 gene:ENSMUSG00000054822 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr8 // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// AK033542 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030614I24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000186344 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:22805766:22809537:1 gene:ENSMUSG00000054822 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONMMUT064910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001081149 // RefSeq // Mus musculus K(lysine) acetyltransferase 6A (Kat6a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000044331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:22859549:22943259:1 gene:ENSMUSG00000031540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000110696 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:22859535:22943259:1 gene:ENSMUSG00000031540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AK082463 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230052P16 product:MONOCYTIC LEUKEMIA ZINC FINGER PROTEIN (ZINC FINGER PROTEIN 220) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22903108:22940642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
NM_029002 // RefSeq // Mus musculus NK6 homeobox 3 (Nkx6-3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000071588 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:23153269:23158948:1 gene:ENSMUSG00000063672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC140994 // GenBank // Mus musculus NK6 homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:175955 IMAGE:9055606), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:23058632:23157815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
AK077946 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030456O14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_013834 // RefSeq // Mus musculus secreted frizzled-related protein 1 (Sfrp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033952 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:23411502:23449632:1 gene:ENSMUSG00000031548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024495 // GenBank // Mus musculus secreted frizzled-related protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:37430 IMAGE:4982195), complete cds. // chr8 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC094662 // GenBank // Mus musculus secreted frizzled-related protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:102081 IMAGE:30363219), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U88566 // GenBank // Mus musculus secreted frizzled related protein sFRP-1 (Sfrp1) mRNA, complete cds. // chr8 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:23411785:23446488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000066740 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:8:24173904:24185568:1 gene:ENSMUSG00000053979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK042983 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730045E13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:24121163:24189833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_027194 // RefSeq // Mus musculus TM2 domain containing 2 (Tm2d2), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000033961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:25017211:25023259:1 gene:ENSMUSG00000031556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC026789 // GenBank // Mus musculus TM2 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:25834 IMAGE:4188168), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:25017369:25022779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
ENSMUST00000059474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:25597012:25597989:1 gene:ENSMUSG00000043794 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK054186 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230026C02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT064986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000167899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:25754509:25769704:1 gene:ENSMUSG00000091514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK090261 // GenBank HTC // Mus musculus 21 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630030A02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_026032 // RefSeq // Mus musculus LSM1 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm1), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:25785591:25803975:1 gene:ENSMUSG00000037296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC021460 // GenBank // Mus musculus LSM1 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:29255 IMAGE:5054997), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AK048497 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130066G14 product:CASM (LSM1 PROTEIN) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000034347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:25793637:25802098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
NM_011485 // RefSeq // Mus musculus steroidogenic acute regulatory protein (Star), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000033979 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:25808474:25814723:1 gene:ENSMUSG00000031574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC060970 // GenBank // Mus musculus steroidogenic acute regulatory protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:30317134), complete cds. // chr8 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC082283 // GenBank // Mus musculus steroidogenic acute regulatory protein, mRNA (cDNA clone MGC:90948 IMAGE:30436512), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// L36062 // GenBank // Mus musculus nuclear-encoded mitochondrial steroidogenic acute regulatory protein (Star) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:25808569:25812886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0
NM_008432 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily U, member 1 (Kcnu1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000098858 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:25849623:25937932:1 gene:ENSMUSG00000031576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF039213 // GenBank // Mus musculus pH sensitive maxi K+ channel (Slo3) mRNA, Slo3-1 allele, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:25881267:25937802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_199042 // RefSeq // Mus musculus THAP domain containing, apoptosis associated protein 1 (Thap1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006509202 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus THAP domain containing, apoptosis associated protein 1 (Thap1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000036807 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:26158212:26162940:1 gene:ENSMUSG00000037214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000130231 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:26158233:26162775:1 gene:ENSMUSG00000037214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// BC038639 // GenBank // Mus musculus THAP domain containing, apoptosis associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:47985 IMAGE:5118383), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK014788 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833431A01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 47 // 100 // 14 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:26123854:26162799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_001101502 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 703 (Zfp703), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001110508 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 703 (Zfp703), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000127097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:26977336:26981461:1 gene:ENSMUSG00000085795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000154256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:26977336:26981461:1 gene:ENSMUSG00000085795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// JF713461 // GenBank // Mus musculus strain FVB/N C57BL/6J mix Zeppo1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:26926600:26980094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153592 // RefSeq // Mus musculus ER lipid raft associated 2 (Erlin2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006509117 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ER lipid raft associated 2 (Erlin2), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000033873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27023799:27039433:1 gene:ENSMUSG00000031483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC036333 // GenBank // Mus musculus ER lipid raft associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:27952 IMAGE:3590904), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC038374 // GenBank // Mus musculus ER lipid raft associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:38617 IMAGE:5355446), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:27020274:27036636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1
NM_001039077 // RefSeq // Mus musculus proline synthetase co-transcribed (Prosc), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// NM_001039078 // RefSeq // Mus musculus proline synthetase co-transcribed (Prosc), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 63 // 30 // 30 // 0 /// NM_054057 // RefSeq // Mus musculus proline synthetase co-transcribed (Prosc), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 41 // 41 // 0 /// XM_006508981 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline synthetase co-transcribed (Prosc), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// XM_006508983 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proline synthetase co-transcribed (Prosc), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000033875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27042555:27056131:1 gene:ENSMUSG00000031485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000098851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27042555:27050240:1 gene:ENSMUSG00000031485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 30 // 30 // 0 /// BC047992 // GenBank // Mus musculus proline synthetase co-transcribed, mRNA (cDNA clone MGC:59396 IMAGE:6504579), complete cds. // chr8 // 100 // 60 // 29 // 29 // 0 /// BC061045 // GenBank // Mus musculus proline synthetase co-transcribed, mRNA (cDNA clone MGC:74156 IMAGE:6534037), complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// AK049905 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630010F01 product:proline synthetase co-transcribed, full insert sequence. // chr8 // 60 // 60 // 29 // 48 // 1 /// GENSCAN00000025951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:27042633:27066873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 34 // 48 // 1
NM_054044 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 124 (Gpr124), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000033876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:27085598:27123436:1 gene:ENSMUSG00000031486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000178514 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:27085583:27123435:1 gene:ENSMUSG00000031486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000179207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:27114133:27118834:1 gene:ENSMUSG00000031486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// AF378759 // GenBank // Mus musculus tumor endothelial marker 5 precursor (Tem5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC138451 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 124, mRNA (cDNA clone MGC:170076 IMAGE:8861471), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC138452 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 124, mRNA (cDNA clone MGC:170077 IMAGE:8861472), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000025953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:27107304:27122035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 27 // 38 // 1
NM_007918 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 1 (Eif4ebp1), mRNA. // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000033880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27260327:27275656:1 gene:ENSMUSG00000031490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AK013033 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810407I01 product:EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 4E BINDING PROTEIN 1 (INSULIN-STIMULATED EIF-4E BINDING PROTEIN PHAS-I), full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC002045 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:6033 IMAGE:3592595), complete cds. // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// U28656 // GenBank // Mus musculus insulin-stimulated eIF-4E binding protein PHAS-I mRNA, complete cds. // chr8 // 82 // 65 // 14 // 17 // 0
NM_001013609 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 24 (Tex24), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006509171 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed gene 24 (Tex24), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// XM_006509172 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed gene 24 (Tex24), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000095375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27344394:27349188:1 gene:ENSMUSG00000071138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY552600 // GenBank // Mus musculus testis-specific protein mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC139071 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 24, mRNA (cDNA clone MGC:170698 IMAGE:8862093), complete cds. // chr8 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// BC139072 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 24, mRNA (cDNA clone MGC:170699 IMAGE:8862094), complete cds. // chr8 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NONMMUT065072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_027454 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 3 (Chrnb3), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_173212 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 3 (Chrnb3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000060943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27368711:27399729:1 gene:ENSMUSG00000031492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000079463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27368711:27399729:1 gene:ENSMUSG00000031492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF467896 // GenBank // Mus musculus nicotinic acetylcholine receptor beta 3 subunit (Chrnb3) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AY574268 // GenBank // Mus musculus neuronal nicotinic acetylcholine receptor beta3 subunit mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// BC058193 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:67663 IMAGE:5357762), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AK133689 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330438I16 product:cholinergic receptor, nicotinic, beta polypeptide 3, full insert sequence. // chr8 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// GENSCAN00000025930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:27384732:27402783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0
NM_026256 // RefSeq // Mus musculus POTE ankyrin domain family, member G (Poteg), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// AK015012 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4921537P18 product:4930456F22RIK PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// DQ298444 // GenBank // Mus musculus putative gonad specific ankyrin repeat protein (Gsarp2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// NM_027618 // RefSeq // Mus musculus POTE ankyrin domain family, member G (Poteg), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 92 // 92 // 36 // 39 // 1 /// XM_006509191 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus POTE ankyrin domain family, member G (Poteg), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 92 // 92 // 36 // 39 // 1 /// ENSMUST00000081321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27447670:27495172:1 gene:ENSMUSG00000063932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 92 // 36 // 39 // 1 /// DQ517440 // GenBank // Mus musculus GSARP1 (Gsarp1) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 92 // 36 // 39 // 1 /// GENSCAN00000025949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:27447818:27462544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1
ENSMUST00000136749 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:27604351:27620452:1 gene:ENSMUSG00000074404 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK133405 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933414F02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC172080 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9054366. // chr8 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// XR_378846 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 1698 (Gm1698), misc_RNA. // chr8 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// GENSCAN00000025932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:27580397:27622564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_025869 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 26 (putative) (Dusp26), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036631 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:31089471:31097047:1 gene:ENSMUSG00000039661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000161713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:31091650:31097046:1 gene:ENSMUSG00000039661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000162551 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:31089804:31092232:1 gene:ENSMUSG00000039661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// AB104416 // GenBank // Mus musculus SKRP3 mRNA for dual-specificity phosphatase SKRP3, complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC018204 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 26 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:25607 IMAGE:4038120), complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000170204 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:31089638:31097046:1 gene:ENSMUSG00000039661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONMMUT065095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:31088232:31112170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_175136 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 122 (Rnf122), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006509189 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ring finger protein 122 (Rnf122), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000046941 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:31111820:31131482:1 gene:ENSMUSG00000039328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC038399 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 122, mRNA (cDNA clone MGC:36976 IMAGE:4947596), complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC050268 // GenBank // Mus musculus ring finger protein 122, mRNA (cDNA clone IMAGE:3990350), partial cds. // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000162640 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:31111830:31122085:1 gene:ENSMUSG00000039328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AK162034 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo female mullerian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6820420H09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000020517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:31123693:31129243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT065098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_144927 // RefSeq // Mus musculus TELO2 interacting protein 2 (Tti2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC019943 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC019943, mRNA (cDNA clone MGC:28346 IMAGE:4017819), complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NM_001199988 // RefSeq // Mus musculus TELO2 interacting protein 2 (Tti2), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// NR_103719 // RefSeq // Mus musculus TELO2 interacting protein 2 (Tti2), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr8 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// ENSMUST00000098842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:31150316:31164702:1 gene:ENSMUSG00000031577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:31150850:31159995:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NM_152821 // RefSeq // Mus musculus purine-rich element binding protein G (Purg), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000070340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:33386325:33387531:1 gene:ENSMUSG00000049184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// AF479673 // GenBank // Mus musculus Pur-gamma A-form (Purg) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr8 // 92 // 68 // 24 // 26 // 0 /// BC116406 // GenBank // Mus musculus purine-rich element binding protein G, mRNA (cDNA clone MGC:144477 IMAGE:40102393), complete cds. // chr8 // 88 // 68 // 23 // 26 // 0 /// NM_001098233 // RefSeq // Mus musculus purine-rich element binding protein G (Purg), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// ENSMUST00000078058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:33386325:33417468:1 gene:ENSMUSG00000049184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// AF479672 // GenBank // Mus musculus Pur-gamma B-form (Purg) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr8 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1 /// GENSCAN00000050339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:33386336:33387388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0
XR_378859 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 5930422O12 gene (5930422O12Rik), misc_RNA. // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AK031179 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo forelimb cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5930422O12 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000050336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:33425427:33468769:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NR_033589 // RefSeq // Mus musculus high mobility group box 1, related sequence 17 (Hmgb1-rs17), non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC090989 // GenBank // Mus musculus high mobility group box 1, related sequence 17, mRNA (cDNA clone IMAGE:6773831). // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:33484455:33485075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0
NM_031374 // RefSeq // Mus musculus testis expressed gene 15 (Tex15), mRNA. // chr8 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// XM_006508979 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus testis expressed gene 15 (Tex15), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 94 // 40 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000009772 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:33570544:33585582:1 gene:ENSMUSG00000009628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124496 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:33517324:33573558:1 gene:ENSMUSG00000009628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 50 // 19 // 20 // 0 /// ENSMUST00000149399 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:33516738:33557342:1 gene:ENSMUSG00000009628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// AF285589 // GenBank // Mus musculus testis protein TEX15 (Tex15) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 65 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000124501 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:33517324:33585582:1 gene:ENSMUSG00000009628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 73 // 73 // 29 // 40 // 1 /// BC063106 // GenBank // Mus musculus testis expressed gene 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:6312096). // chr8 // 73 // 73 // 29 // 40 // 1 /// GENSCAN00000050335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:33505961:33599112:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0
NM_017374 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, beta isoform (Ppp2cb), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509033 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, beta isoform (Ppp2cb), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000009774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:33599621:33619794:1 gene:ENSMUSG00000009630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC019161 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, beta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:29430 IMAGE:3674696), complete cds. // chr8 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC058582 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, beta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:65242 IMAGE:6515195), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:33599917:33619194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_010344 // RefSeq // Mus musculus glutathione reductase (Gsr), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:33653238:33698163:1 gene:ENSMUSG00000031584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000149528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:33669002:33685652:1 gene:ENSMUSG00000031584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC056357 // GenBank // Mus musculus glutathione reductase, mRNA (cDNA clone MGC:73453 IMAGE:6813295), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC057325 // GenBank // Mus musculus glutathione reductase, mRNA (cDNA clone MGC:66860 IMAGE:6813295), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:33653540:33692698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENSMUST00000149618 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:34054622:34057046:1 gene:ENSMUSG00000054618 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK040144 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430069L09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001126314 // RefSeq // Mus musculus membrane bound O-acyltransferase domain containing 4 (Mboat4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509106 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus membrane bound O-acyltransferase domain containing 4 (Mboat4), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:34115030:34125185:1 gene:ENSMUSG00000071113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147844 // GenBank // Mus musculus membrane bound O-acyltransferase domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:182947 IMAGE:9087561), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC147849 // GenBank // Mus musculus membrane bound O-acyltransferase domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:182952 IMAGE:9087566), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// EU518496 // GenBank // Mus musculus ghrelin O-acyltransferase (Mboat4) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU721729 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J ghrelin O-acyltransferase (Mboat4) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:34120116:34124718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_026432 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 66 (Tmem66), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:34154563:34170845:1 gene:ENSMUSG00000031532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK088728 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430024I20 product:RIKEN cDNA 1810045K07 gene, full insert sequence. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK093942 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH2016709. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC013497 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 66, mRNA (cDNA clone MGC:19160 IMAGE:4222385), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC022616 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 66, mRNA (cDNA clone MGC:31156 IMAGE:4187981), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC024888 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 66, mRNA (cDNA clone MGC:28194 IMAGE:3988822), complete cds. // chr8 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:34154731:34170750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_176933 // RefSeq // Mus musculus dual specificity phosphatase 4 (Dusp4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033930 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:34807297:34819894:1 gene:ENSMUSG00000031530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC118941 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 4, mRNA (cDNA clone MGC:143691 IMAGE:40092218), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC118942 // GenBank // Mus musculus dual specificity phosphatase 4, mRNA (cDNA clone MGC:143692 IMAGE:40092219), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:34807729:34818783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000067161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:34965052:34966209:1 gene:ENSMUSG00000054247 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK016121 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930554K12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177741 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3B (Ppp1r3b), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509118 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3B (Ppp1r3b), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:35375741:35388124:1 gene:ENSMUSG00000046794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC060261 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3B, mRNA (cDNA clone IMAGE:6839533), partial cds. // chr8 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC079666 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3B, mRNA (cDNA clone MGC:90838 IMAGE:30357193), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:35369619:35384863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001081279 // RefSeq // Mus musculus malignant fibrous histiocytoma amplified sequence 1 (Mfhas1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000037666 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:35587798:35679449:1 gene:ENSMUSG00000070056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082308 // GenBank // Mus musculus malignant fibrous histiocytoma amplified sequence 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6853411). // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:35588373:35591659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
XM_006509234 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene, 19410 (Gm19410), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000034882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:35705689:35819664:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_172911 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 8, ERATO Doi 82, expressed (D8Ertd82e), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000110492 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:36094828:36147787:1 gene:ENSMUSG00000050271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089024 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 8, ERATO Doi 82, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:100334 IMAGE:30615630), complete cds. // chr8 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000145386 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:36094861:36102744:1 gene:ENSMUSG00000050271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// ENSMUST00000150295 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:36094861:36106609:1 gene:ENSMUSG00000050271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// AK052494 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430036I17 product:DNA segment, Chr 8, ERATO Doi 82, expressed, full insert sequence. // chr8 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// AK089749 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830014K21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000013185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:36094915:36147417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_001039220 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence AI429214 (AI429214), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:36993575:36995531:1 gene:ENSMUSG00000074384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150875 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI429214, mRNA (cDNA clone MGC:183786 IMAGE:9087786), complete cds. // chr8 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:36993700:36994581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000056224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:37050875:37109796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
GENSCAN00000056222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:37149848:37201764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_030254 // RefSeq // Mus musculus tumor suppressor candidate 3 (Tusc3), mRNA. // chrUn // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000167992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:39005867:39165112:1 gene:ENSMUSG00000039530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:39005908:39165112:1 gene:ENSMUSG00000039530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// AK132766 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4922505H12 product:tumor suppressor candidate 3, full insert sequence. // chrUn // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC003311 // GenBank // Mus musculus tumor suppressor candidate 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:3154952), complete cds. // chrUn // 89 // 68 // 17 // 19 // 0 /// BC069898 // GenBank // Mus musculus tumor suppressor candidate 3, mRNA (cDNA clone MGC:78125 IMAGE:6489807), complete cds. // chrUn // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AK168961 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920067M03 product:tumor suppressor candidate 3, full insert sequence. // chrUn // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
GENSCAN00000028635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:39455977:39456918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
NM_030110 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial calcium uptake family, member 3 (Micu3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000068999 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:40307458:40384662:1 gene:ENSMUSG00000039478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC125445 // GenBank // Mus musculus EF-hand domain family, member A2, mRNA (cDNA clone IMAGE:40129960), partial cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136835 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:40354303:40386308:1 gene:ENSMUSG00000039478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000009709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:40286408:40391231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0
NM_178395 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 2 (Zdhhc2), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000049389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:40423815:40485725:1 gene:ENSMUSG00000039470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000128166 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:40423821:40510266:1 gene:ENSMUSG00000039470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000167766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:40423840:40484269:1 gene:ENSMUSG00000039470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK018284 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430583A19 product:SMALL REC homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr8 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// BC127156 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:156396 IMAGE:40090859), complete cds. // chr8 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// XM_006509485 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 2 (Zdhhc2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENSMUST00000131672 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:40423822:40466190:1 gene:ENSMUSG00000039470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// AK044652 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930029O05 product:SMALL REC homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr8 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000009702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:40414632:40486135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_033560 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 37A (yeast) (Vps37a), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000098817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:40511783:40551134:1 gene:ENSMUSG00000031600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AK048942 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230084K08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AK054055 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230015F16 product:RIKEN cDNA 4930592A21 gene, full insert sequence. // chr8 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC039290 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 37A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:37724 IMAGE:5066508), complete cds. // chr8 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// BC110396 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 37A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:117910 IMAGE:5253683), complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// AK170280 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630041D20 product:hypothetical Modifier of rudimentary (Mod containing protein, full insert sequence. // chr8 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// GENSCAN00000009718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:40533898:40545779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT065367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr8 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_010086 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 24 (testase 1) (Adam24), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000051614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:40675094:40682199:1 gene:ENSMUSG00000046723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF167402 // GenBank // Mus musculus testase 1 (Adam-24) mRNA, complete cds. // chr8 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// BC145785 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 24 (testase 1), mRNA (cDNA clone MGC:175672 IMAGE:40131088), complete cds. // chr8 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000009704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:40679495:40681780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_011781 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 25 (testase 2) (Adam25), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000096663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:40752208:40756175:1 gene:ENSMUSG00000071937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF167403 // GenBank // Mus musculus testase 2 (Adam-25) mRNA, complete cds. // chr8 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:40725577:40766515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001009548 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 20 (Adam20), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056331 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:40793273:40797303:1 gene:ENSMUSG00000046282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150793 // GenBank // Mus musculus testase-8, mRNA (cDNA clone MGC:183704 IMAGE:9087704), complete cds. // chr8 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:40794855:40797137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025380 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 39 (Adam39), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000066814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:40823009:40826861:1 gene:ENSMUSG00000054033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:40824574:40826844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_026840 // RefSeq // Mus musculus platelet-derived growth factor receptor-like (Pdgfrl), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034004 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:40926233:40990785:1 gene:ENSMUSG00000031595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC058275 // GenBank // Mus musculus platelet-derived growth factor receptor-like, mRNA (cDNA clone MGC:67861 IMAGE:6515674), complete cds. // chr8 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSMUST00000143216 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:40926212:40939944:1 gene:ENSMUSG00000031595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// AK081847 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130081L23 product:platelet-derived growth factor receptor-like, full insert sequence. // chr8 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000031981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:40975850:40990503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_023662 // RefSeq // Mus musculus pericentriolar material 1 (Pcm1), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000045218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:41239759:41334086:1 gene:ENSMUSG00000031592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AB029291 // GenBank // Mus musculus pcm-1 mRNA for pericentriolar material-1, complete cds. // chr8 // 92 // 97 // 35 // 38 // 0 /// AK017964 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830432F13 product:pericentriolar material 1, full insert sequence. // chr8 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// AK052710 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630033M11 product:pericentriolar material 1, full insert sequence. // chr8 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// BC139033 // GenBank // Mus musculus pericentriolar material 1, mRNA (cDNA clone MGC:170660 IMAGE:8862055), complete cds. // chr8 // 89 // 97 // 34 // 38 // 0 /// GENSCAN00000031983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:41256015:41330940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000065243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:42246911:42247411:1 gene:ENSMUSG00000053038 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000023643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:42246911:42247411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000039519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:43157787:43160249:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_001160412 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif family-like 2 (Triml2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:43183119:43193881:1 gene:ENSMUSG00000091490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU599038 // GenBank // Mus musculus TU4 isoform A (Tu4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// EU599039 // GenBank // Mus musculus TU4 isoform B (Tu4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// EU599040 // GenBank // Mus musculus TU4 isoform C (Tu4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 68 // 88 // 15 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:43187598:43200477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
GENSCAN00000039516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:43187598:43200477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_001081286 // RefSeq // Mus musculus FAT tumor suppressor homolog 1 (Drosophila) (Fat1), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000098796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:44950208:45052257:1 gene:ENSMUSG00000070047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000189017 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:45033355:45052245:1 gene:ENSMUSG00000070047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000191428 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:44935447:45052257:1 gene:ENSMUSG00000070047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:44987533:45051409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_008639 // RefSeq // Mus musculus melatonin receptor 1A (Mtnr1a), mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509291 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus melatonin receptor 1A (Mtnr1a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// XM_006509292 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus melatonin receptor 1A (Mtnr1a), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067984 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:45069137:45088356:1 gene:ENSMUSG00000054764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000130141 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:45069374:45087356:1 gene:ENSMUSG00000054764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// AY131266 // GenBank // Mus musculus melatonin receptor 1A splice variant mRNA, partial cds; alternatively spliced. // chr8 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC116900 // GenBank // Mus musculus melatonin receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:151277 IMAGE:40126219), complete cds. // chr8 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC119313 // GenBank // Mus musculus melatonin receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:155629 IMAGE:8734062), complete cds. // chr8 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// U52222 // GenBank // Mus musculus Mel-1a melatonin receptor mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:45069210:45239420:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_016798 // RefSeq // Mus musculus PDZ and LIM domain 3 (Pdlim3), mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// XM_006509465 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PDZ and LIM domain 3 (Pdlim3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000034053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:45885485:45919546:1 gene:ENSMUSG00000031636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// AF002283 // GenBank // Mus musculus alpha-actinin-2 associated LIM protein mRNA, alternatively spliced product, complete cds. // chr8 // 96 // 76 // 27 // 28 // 0 /// BC070418 // GenBank // Mus musculus PDZ and LIM domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:95621 IMAGE:5714572), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// AK164054 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C430037N05 product:PDZ and LIM domain 3, full insert sequence. // chr8 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// GENSCAN00000041466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:45885580:45919014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0
NM_001033246 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 110 (Ccdc110), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000095326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:45934619:45944145:1 gene:ENSMUSG00000071104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000174815 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:45934705:45941500:1 gene:ENSMUSG00000071104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000041492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:45934761:45947007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
NM_138668 // RefSeq // Mus musculus UFM1-specific peptidase 2 (Ufsp2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006509308 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UFM1-specific peptidase 2 (Ufsp2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000034051 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:45975528:45996958:1 gene:ENSMUSG00000031634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000123307 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:45975550:45985371:1 gene:ENSMUSG00000031634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 93 // 44 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000130412 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:45975534:45996857:1 gene:ENSMUSG00000031634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK075795 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810047C23 product:SIMILAR TO HYPOTHETICAL PROTEIN FLJ11200 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK160164 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810012O08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC005503 // GenBank // Mus musculus UFM1-specific peptidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:7482 IMAGE:3490744), complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSMUST00000123041 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:45975544:45980865:1 gene:ENSMUSG00000031634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000041480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:45979967:45995812:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000158936 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:46272051:46272147:1 gene:ENSMUSG00000089561 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONMMUT065478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001284409 // RefSeq // Mus musculus caspase 3 (Casp3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_009810 // RefSeq // Mus musculus caspase 3 (Casp3), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000093517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:46617449:46638706:1 gene:ENSMUSG00000031628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC038825 // GenBank // Mus musculus caspase 3, mRNA (cDNA clone MGC:46907 IMAGE:4482368), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D86352 // GenBank // Mus musculus mRNA for CPP32, complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// U19522 // GenBank // Mus musculus cysteine protease CPP32 (cpp32) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// U49929 // GenBank // Mus musculus ICE-like cysteine protease (Lice) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// Y13086 // GenBank // M.musculus mRNA for caspase-3. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK014231 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3110059O17 product:caspase 3, apoptosis related cysteine protease, full insert sequence. // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// BC021500 // GenBank HTC // Mus musculus caspase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5346382), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000041481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:46628016:46638148:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_008391 // RefSeq // Mus musculus interferon regulatory factor 2 (Irf2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006509285 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interferon regulatory factor 2 (Irf2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006509286 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interferon regulatory factor 2 (Irf2), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006509287 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interferon regulatory factor 2 (Irf2), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006509289 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interferon regulatory factor 2 (Irf2), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000034041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:46739745:46847458:1 gene:ENSMUSG00000031627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC006577 // GenBank // Mus musculus interferon regulatory factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:6191 IMAGE:3586586), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC110666 // GenBank // Mus musculus interferon regulatory factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:117893 IMAGE:4918447), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// J03168 // GenBank // Mouse interferon regulatory factor-2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK158642 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230037J04 product:interferon regulatory factor 2, full insert sequence. // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000021237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:46784364:46846222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
XM_006509529 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102639847 (LOC102639847), mRNA. // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000074466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:47413129:47415359:1 gene:ENSMUSG00000060559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC017159 // GenBank // Mus musculus predicted gene, ENSMUSG00000060559, mRNA (cDNA clone IMAGE:4920154), partial cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000174969 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:47440418:47440551:1 gene:ENSMUSG00000092710 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_203507 // RefSeq // Mus musculus RWD domain containing 4A (Rwdd4a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000033973 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:47533664:47552825:1 gene:ENSMUSG00000031568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000175692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:47533664:47551279:1 gene:ENSMUSG00000031568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000176379 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:47533686:47544143:1 gene:ENSMUSG00000031568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// ENSMUST00000183107 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:47550458:47552955:1 gene:ENSMUSG00000031568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// AK038266 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130091D11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// BC016198 // GenBank // Mus musculus RWD domain containing 4A, mRNA (cDNA clone MGC:27606 IMAGE:4503404), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONMMUT065526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000021239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:47541887:47588406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
XM_006509525 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus expressed sequence AA386476 (AA386476), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:47675391:47677055:1 gene:ENSMUSG00000074357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK083994 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130074B10 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140353 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430219F05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000180928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:47713266:47715021:1 gene:ENSMUSG00000097706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK143014 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030037K01 product:hypothetical Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082574 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:47719246:47719369:1 gene:ENSMUSG00000064508 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT065533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001111318 // RefSeq // Mus musculus claudin 24 (Cldn24), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000079639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:47822143:47822805:1 gene:ENSMUSG00000061974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000048353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:47822143:47825191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 85 // 7 // 11 // 0
NM_029383 // RefSeq // Mus musculus claudin 22 (Cldn22), mRNA. // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000038693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:47824482:47825475:1 gene:ENSMUSG00000038064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000082585 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:47899182:47899294:1 gene:ENSMUSG00000064519 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONMMUT065552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
ENSMUST00000033963 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:49370913:49501984:1 gene:ENSMUSG00000031559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:49463323:49501891:1 gene:ENSMUSG00000031559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK016128 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930555F03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000157144 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:50563241:50563303:1 gene:ENSMUSG00000087769 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083403 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:52078604:52078742:1 gene:ENSMUSG00000065337 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000158443 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:53493853:53493914:1 gene:ENSMUSG00000089068 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT065641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001005847 // RefSeq // Mus musculus aspartylglucosaminidase (Aga), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001205054 // RefSeq // Mus musculus aspartylglucosaminidase (Aga), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006509249 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus aspartylglucosaminidase (Aga), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000033920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:53511702:53523421:1 gene:ENSMUSG00000031521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC048230 // GenBank HTC // Mus musculus aspartylglucosaminidase, mRNA (cDNA clone IMAGE:6313275), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC132227 // GenBank // Mus musculus aspartylglucosaminidase, mRNA (cDNA clone MGC:163858 IMAGE:40130504), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC132229 // GenBank // Mus musculus aspartylglucosaminidase, mRNA (cDNA clone MGC:163860 IMAGE:40130506), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC145297 // GenBank // Mus musculus aspartylglucosaminidase, mRNA (cDNA clone MGC:178859 IMAGE:9053851), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:53511805:53573613:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_009506 // RefSeq // Mus musculus vascular endothelial growth factor C (Vegfc), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:54077532:54186454:1 gene:ENSMUSG00000031520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC096377 // GenBank // Mus musculus vascular endothelial growth factor C, mRNA (cDNA clone MGC:106380 IMAGE:5002720), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// EU862554 // GenBank // Mus musculus vascular endothelial growth factor C isoform 129 (Vegfc) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 89 // 28 // 8 // 9 // 0 /// EU862555 // GenBank // Mus musculus vascular endothelial growth factor C isoform 184 (Vegfc) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 92 // 41 // 12 // 13 // 0 /// U58112 // GenBank // Mus musculus Flt4 ligand J7 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// U73620 // GenBank // Mus musculus VEGF-C mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:54112509:54186068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
NM_029569 // RefSeq // Mus musculus ankyrin repeat and SOCs box-containing 5 (Asb5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509519 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and SOCs box-containing 5 (Asb5), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006509520 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ankyrin repeat and SOCs box-containing 5 (Asb5), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000033918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:54550331:54587836:1 gene:ENSMUSG00000031519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF398966 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat-containing SOCS box protein 5 (Asb5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC108405 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCs box-containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:118455 IMAGE:30288598), complete cds. // chr8 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC120851 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCs box-containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:156088 IMAGE:40129774), complete cds. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC132007 // GenBank // Mus musculus ankyrin repeat and SOCs box-containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:163638 IMAGE:40130284), complete cds. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000001992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:54529766:54587361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_133711 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 4 (Spata4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:54600781:54610098:1 gene:ENSMUSG00000031518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF395083 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis related gene 2 (Srg2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF530515 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis related gene 2 (Srg2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC048650 // GenBank // Mus musculus spermatogenesis associated 4, mRNA (cDNA clone MGC:58789 IMAGE:6772684), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:54600801:54609949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001253754 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein m6a (Gpm6a), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_001253756 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein m6a (Gpm6a), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_153581 // RefSeq // Mus musculus glycoprotein m6a (Gpm6a), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000033915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:54954728:55060877:1 gene:ENSMUSG00000031517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC023461 // GenBank // Mus musculus glycoprotein m6a, mRNA (cDNA clone MGC:32434 IMAGE:5041793), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC024759 // GenBank // Mus musculus glycoprotein m6a, mRNA (cDNA clone MGC:38999 IMAGE:5364039), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC029683 // GenBank // Mus musculus glycoprotein m6a, mRNA (cDNA clone MGC:39056 IMAGE:5365175), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC029711 // GenBank // Mus musculus glycoprotein m6a, mRNA (cDNA clone MGC:38747 IMAGE:5358632), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC033357 // GenBank // Mus musculus glycoprotein m6a, mRNA (cDNA clone MGC:38979 IMAGE:5363493), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC033394 // GenBank // Mus musculus glycoprotein m6a, mRNA (cDNA clone MGC:39028 IMAGE:5364685), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC043130 // GenBank // Mus musculus glycoprotein m6a, mRNA (cDNA clone MGC:58070 IMAGE:6810388), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:55043777:55058929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000033806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:55777199:55777889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0
NM_080438 // RefSeq // Mus musculus glycine receptor, alpha 3 subunit (Glra3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006509247 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycine receptor, alpha 3 subunit (Glra3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000000275 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:55940509:56125429:1 gene:ENSMUSG00000038257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF362764 // GenBank // Mus musculus glycine receptor alpha 3 subunit (Glra3) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AY230204 // GenBank // Mus musculus glycine receptor alpha 3 subunit (Glra3) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000164020 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:55940460:56044810:1 gene:ENSMUSG00000038257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// AK038618 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230050P16 product:glycine receptor, alpha 3 subunit, full insert sequence. // chr8 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000033805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:55991227:56125352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_008278 // RefSeq // Mus musculus hydroxyprostaglandin dehydrogenase 15 (NAD) (Hpgd), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:56294552:56321046:1 gene:ENSMUSG00000031613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC021157 // GenBank // Mus musculus hydroxyprostaglandin dehydrogenase 15 (NAD), mRNA (cDNA clone MGC:14001 IMAGE:4208980), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U44389 // GenBank // Mus musculus NAD(+)-dependent 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr8 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// AK051168 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130009B19 product:hydroxyprostaglandin dehydrogenase 15 (NAD), full insert sequence. // chr8 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000033816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:56173958:56366340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// NONMMUT065668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_015791 // RefSeq // Mus musculus F-box protein 8 (Fbxo8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000040218 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:56551090:56592393:1 gene:ENSMUSG00000038206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF176527 // GenBank // Mus musculus F-box protein FBX8 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC011100 // GenBank // Mus musculus F-box protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:18987 IMAGE:4011855), complete cds. // chr8 // 81 // 57 // 13 // 16 // 0 /// BC034854 // GenBank // Mus musculus F-box protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:41115 IMAGE:3468704), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000110322 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:56551090:56592393:1 gene:ENSMUSG00000038206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENSMUST00000156840 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:56551090:56571125:1 gene:ENSMUSG00000038206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// AK162592 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630044A18 product:F-box only protein 8, full insert sequence. // chr8 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:56564512:56674097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONMMUT065677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSMUST00000102437 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:56561301:56561409:1 gene:ENSMUSG00000076392 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000033810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:56561128:56561523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT065678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_010402 // RefSeq // Mus musculus heart and neural crest derivatives expressed transcript 2 (Hand2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000040104 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:57320983:57324517:1 gene:ENSMUSG00000038193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000015883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:57299664:57323860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1
NM_009136 // RefSeq // Mus musculus scrapie responsive gene 1 (Scrg1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// ENSMUST00000034023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:57455923:57477585:1 gene:ENSMUSG00000031610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// BC058532 // GenBank // Mus musculus scrapie responsive gene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6819318). // chr8 // 100 // 93 // 54 // 54 // 0 /// CT010374 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836C0753D for gene Scrg1, Scrapie responsive gene 1; complete cds, incl. stopcodon. // chr8 // 100 // 55 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:57442616:57456878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 21 // 21 // 12 // 58 // 1
NM_173411 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC030500 (BC030500), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062978 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:58911755:58914298:1 gene:ENSMUSG00000049946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160055 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:58912257:58913196:1 gene:ENSMUSG00000049946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC030500 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC030500, mRNA (cDNA clone MGC:40983 IMAGE:5401612), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:58754051:59092997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
GENSCAN00000051059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:59219318:59220943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
ENSMUST00000083793 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:60079590:60079693:1 gene:ENSMUSG00000065727 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT065750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_011834 // RefSeq // Mus musculus aminoadipate aminotransferase (Aadat), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000079472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:60506124:60545677:1 gene:ENSMUSG00000057228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF072376 // GenBank // Mus musculus kynurenine aminotransferase II mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK144042 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F530204I17 product:kynurenine aminotransferase II, full insert sequence. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC012637 // GenBank // Mus musculus aminoadipate aminotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:13720 IMAGE:4160508), complete cds. // chr8 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:60506530:60629126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
XM_006509510 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2700029M09 gene (2700029M09Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000037190 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:60890451:60907580:1 gene:ENSMUSG00000038005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000134886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:60890489:60897048:1 gene:ENSMUSG00000038005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000149267 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:60890445:60907573:1 gene:ENSMUSG00000038005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC042740 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2700029M09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:51389 IMAGE:5024951), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000136098 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:60890451:60905985:1 gene:ENSMUSG00000038005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// ENSMUST00000146863 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:60890418:60907575:1 gene:ENSMUSG00000038005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000051645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:60842152:60907468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
XR_035255 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA B230317F23 gene (B230317F23Rik), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:60983437:60985908:1 gene:ENSMUSG00000045746 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK050074 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730010J12 product:Hypothetical actin-crosslinking proteins structure containing protein, full insert sequence. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_021506 // RefSeq // Mus musculus SH3 domain containing ring finger 1 (Sh3rf1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:61224171:61396072:1 gene:ENSMUSG00000031642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF030131 // GenBank // Mus musculus Plenty of SH3s (POSH) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// AK173185 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1494 protein. // chr8 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC060113 // GenBank // Mus musculus SH3 domain containing ring finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:63290 IMAGE:6405370), complete cds. // chr8 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC060696 // GenBank // Mus musculus SH3 domain containing ring finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:66913 IMAGE:6405370), complete cds. // chr8 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// AK148137 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370031D15 product:SH3 multiple domains 2, full insert sequence. // chr8 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// AK088003 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430002B12 product:plenty of SH3 domains, full insert sequence. // chr8 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000051636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:61326415:61363342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_001293783 // RefSeq // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60 (Ddx60), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000070631 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:61928089:62037701:1 gene:ENSMUSG00000037921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000093485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:61928089:62037695:1 gene:ENSMUSG00000037921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000154398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:61928087:61963742:1 gene:ENSMUSG00000037921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// AK036495 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830118M07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// BC013672 // GenBank // Mus musculus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mRNA (cDNA clone IMAGE:4037887), complete cds. // chr8 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000014222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:61928027:62037134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0
NM_001163747 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 192 (Tmem192), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_028427 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 192 (Tmem192), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509760 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 192 (Tmem192), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XR_379047 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 192 (Tmem192), transcript variant X2, misc_RNA. // chr8 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000026595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:64947185:64969034:1 gene:ENSMUSG00000025521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:64947185:64969034:1 gene:ENSMUSG00000025521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC020157 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 192, mRNA (cDNA clone MGC:28055 IMAGE:3708193), complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK132619 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833429E23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:64947307:64968834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000098716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:65075033:65077480:1 gene:ENSMUSG00000074302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
ENSMUST00000082971 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:65367301:65367443:1 gene:ENSMUSG00000064905 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONMMUT065830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
ENSMUST00000083363 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:65902057:65902191:1 gene:ENSMUSG00000065297 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONMMUT065836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001271574 // RefSeq // Mus musculus transketolase-like 2 (Tktl2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// NM_028927 // RefSeq // Mus musculus transketolase-like 2 (Tktl2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000002025 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:66511756:66513776:1 gene:ENSMUSG00000025519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000183187 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:66511759:66518335:1 gene:ENSMUSG00000025519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// BC132110 // GenBank // Mus musculus transketolase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:163741 IMAGE:40130387), complete cds. // chr8 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// BC132298 // GenBank // Mus musculus transketolase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:163929 IMAGE:40130575), complete cds. // chr8 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000006175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:66511792:66513675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0
NM_010934 // RefSeq // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y1 (Npy1r), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000039303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:66697422:66706798:1 gene:ENSMUSG00000036437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// D63818 // GenBank // Mus musculus mRNA for neuropeptide Y-Y1 receptor, complete cds. // chr8 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:66696924:66705188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC051420 // GenBank // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y1, mRNA (cDNA clone MGC:58922 IMAGE:6490858), complete cds. // chr8 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0
NM_001163564 // RefSeq // Mus musculus nuclear assembly factor 1 homolog (S. cerevisiae) (Naf1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000118009 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:66860217:66890564:1 gene:ENSMUSG00000014907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC053440 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC053440, mRNA (cDNA clone IMAGE:6331409), partial cds. // chr8 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// XR_379037 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear assembly factor 1 homolog (S. cerevisiae) (Naf1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr8 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// GENSCAN00000004154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:66860367:66889518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_008673 // RefSeq // Mus musculus N-acetyl transferase 1 (Nat1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000026677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:67490758:67492104:1 gene:ENSMUSG00000025588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119181 // GenBank // Mus musculus N-acetyltransferase 1 (arylamine N-acetyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:155497 IMAGE:8733930), complete cds. // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC137747 // GenBank // Mus musculus N-acetyltransferase 1 (arylamine N-acetyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:169371 IMAGE:8860766), complete cds. // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// U35885 // GenBank // Mus musculus N-acetyltransferase NAT-1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:67490974:67493438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
NM_010874 // RefSeq // Mus musculus N-acetyltransferase 2 (arylamine N-acetyltransferase) (Nat2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000163856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:67494948:67502580:1 gene:ENSMUSG00000051147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC012972 // GenBank // Mus musculus N-acetyltransferase 2 (arylamine N-acetyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:14025 IMAGE:3992093), complete cds. // chr8 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0 /// U35886 // GenBank // Mus musculus rapid isoform N-acetyltransferase NAT-2 99Asn mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// U35887 // GenBank // Mus musculuse slow isoform N-acetyltransferase NAT-2 99Ile mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NM_001168577 // RefSeq // Mus musculus N-acetyltransferase 2 (arylamine N-acetyltransferase) (Nat2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// ENSMUST00000093470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:67494867:67502576:1 gene:ENSMUSG00000051147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_008674 // RefSeq // Mus musculus N-acetyltransferase 3 (Nat3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:67523854:67548627:1 gene:ENSMUSG00000056426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:67547471:67548343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_028182 // RefSeq // Mus musculus SH2 domain containing 4A (Sh2d4a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006509751 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SH2 domain containing 4A (Sh2d4a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000066594 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:68276567:68347694:1 gene:ENSMUSG00000053886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC116682 // GenBank // Mus musculus SH2 domain containing 4A, mRNA (cDNA clone MGC:144846 IMAGE:40106612), complete cds. // chr8 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC023784 // GenBank HTC // Mus musculus SH2 domain containing 4A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5346859), with apparent retained intron. // chr8 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// GENSCAN00000044189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:68322321:68346746:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_008509 // RefSeq // Mus musculus lipoprotein lipase (Lpl), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000015712 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:68880491:68906934:1 gene:ENSMUSG00000015568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000168401 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:68880555:68907448:1 gene:ENSMUSG00000015568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AK017272 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5430405H20 product:lipoprotein lipase, full insert sequence. // chr8 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// BC003305 // GenBank // Mus musculus lipoprotein lipase, mRNA (cDNA clone MGC:5666 IMAGE:3584788), complete cds. // chr8 // 87 // 82 // 20 // 23 // 0 /// BC158040 // GenBank // Mus musculus lipoprotein lipase, mRNA (cDNA clone MGC:189969 IMAGE:9088156), complete cds. // chr8 // 83 // 82 // 19 // 23 // 0 /// CT010344 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G1052D for gene Lpl, Lipoprotein lipase; complete cds, incl. stopcodon. // chr8 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000021637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:68880753:68950521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_007509 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit B2 (Atp6v1b2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000006435 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:69088646:69113711:1 gene:ENSMUSG00000006273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000153680 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:69088787:69102249:1 gene:ENSMUSG00000006273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// BC012497 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit B2, mRNA (cDNA clone MGC:21587 IMAGE:4500843), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC046302 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit B2, mRNA (cDNA clone MGC:54426 IMAGE:6492612), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085300 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit B2, mRNA (cDNA clone MGC:102360 IMAGE:6305977), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000153079 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:69088768:69107363:1 gene:ENSMUSG00000006273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// AK169420 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I920195N20 product:ATPase, H+ transporting, V1 subunit B, isoform 2, full insert sequence. // chr8 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSMUST00000129797 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:69103128:69108340:1 gene:ENSMUSG00000006273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000021646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:69088793:69115121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_001013379 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 930 (Zfp930), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:69226343:69228980:1 gene:ENSMUSG00000059897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AK040352 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430088G18 product:hypothetical Zinc finger, C2H2 type containing protein, full insert sequence. // chr8 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_172491 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D130040H23 gene (D130040H23Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK138789 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430071F24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
GENSCAN00000021642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:69328471:69329554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_133224 // RefSeq // Mus musculus ATPase type 13A1 (Atp13a1), mRNA. // chr8 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// XM_006509564 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase type 13A1 (Atp13a1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000034326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:69791163:69807749:1 gene:ENSMUSG00000031862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// AB035381 // GenBank // Mus musculus catp mRNA for cation-transporting atpase, complete cds. // chr8 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// AK173270 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1825 protein. // chr8 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// BC049817 // GenBank // Mus musculus ATPase type 13A1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6510453), complete cds. // chr8 // 86 // 68 // 18 // 21 // 0 /// BC138721 // GenBank // Mus musculus ATPase type 13A1, mRNA (cDNA clone MGC:170348 IMAGE:8861743), complete cds. // chr8 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// BC138722 // GenBank // Mus musculus ATPase type 13A1, mRNA (cDNA clone MGC:170349 IMAGE:8861744), complete cds. // chr8 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// AK083373 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920024M17 product:inferred: cation-transporting atpase {Mus musculus}, full insert sequence. // chr8 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// GENSCAN00000052501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:69791255:69820976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// NONMMUT065952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_020028 // RefSeq // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 2 (Lpar2), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:69822565:69831102:1 gene:ENSMUSG00000031861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:69822429:69831101:1 gene:ENSMUSG00000031861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC060131 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:65706 IMAGE:6409729), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC064676 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidic acid receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:66933 IMAGE:6409729), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:69823563:69826604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0
NM_032004 // RefSeq // Mus musculus testis-specific serine kinase 6 (Tssk6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:69902184:69903516:1 gene:ENSMUSG00000047654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF329484 // GenBank // Mus musculus serine/threonine protein kinase SSTK (Sstk) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049542 // GenBank // Mus musculus testis-specific serine kinase 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:6708013). // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:69902308:69903129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_027481 // RefSeq // Mus musculus SURP and G patch domain containing 1 (Sugp1), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000011450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70042813:70071953:1 gene:ENSMUSG00000011306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AF521129 // GenBank // Mus musculus splicing factor 4 (Sf4) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// AK017736 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730496N02 product:RNA-BINDING PROTEIN SPLICE VARIANT A homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC027188 // GenBank // Mus musculus splicing factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:28407 IMAGE:4035499), complete cds. // chr8 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// BC120919 // GenBank // Mus musculus splicing factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:143775 IMAGE:40093189), complete cds. // chr8 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// BC120920 // GenBank // Mus musculus splicing factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:143776 IMAGE:40093190), complete cds. // chr8 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// AK090191 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630014P16 product:similar to RNA-BINDING PROTEIN SPLICE VARIANT A [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// GENSCAN00000052504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70043059:70089067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_001293795 // RefSeq // Mus musculus transmembrane 6 superfamily member 2 (Tm6sf2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_181540 // RefSeq // Mus musculus transmembrane 6 superfamily member 2 (Tm6sf2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000049197 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:70072932:70080052:1 gene:ENSMUSG00000036151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000110160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:70072924:70080066:1 gene:ENSMUSG00000036151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000149928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:70075429:70078129:1 gene:ENSMUSG00000036151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC024498 // GenBank // Mus musculus transmembrane 6 superfamily member 2, mRNA (cDNA clone MGC:37441 IMAGE:4982620), complete cds. // chr8 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// ENSMUST00000148015 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:70074281:70075714:1 gene:ENSMUSG00000036151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000052504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70043059:70089067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT065971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_177900 // RefSeq // Mus musculus hyaluronan and proteoglycan link protein 4 (Hapln4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000007738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70083529:70090862:1 gene:ENSMUSG00000007594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB107882 // GenBank // Mus musculus Bral2 mRNA for brain link protein-2, complete cds. // chr8 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// AY262758 // GenBank // Mus musculus hyaluronan and proteoglycan link protein 4 (Hapln4) mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// AY269789 // GenBank // Mus musculus link protein 4 precursor (Lpr4) mRNA, complete cds. // chr8 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// BC125339 // GenBank // Mus musculus hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:159042 IMAGE:40129854), complete cds. // chr8 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// BC125341 // GenBank // Mus musculus hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:159044 IMAGE:40129856), complete cds. // chr8 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70043059:70089067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001025586 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor 2C2-associated protein (Nr2c2ap), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001025587 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor 2C2-associated protein (Nr2c2ap), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NR_104434 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor 2C2-associated protein (Nr2c2ap), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006509777 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear receptor 2C2-associated protein (Nr2c2ap), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000095273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70131333:70133739:1 gene:ENSMUSG00000071078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC092288 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor 2C2-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:103332 IMAGE:5003230), complete cds. // chr8 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT065975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT065976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr8 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_016685 // RefSeq // Mus musculus cartilage oligomeric matrix protein (Comp), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006509539 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cartilage oligomeric matrix protein (Comp), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000003659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70373548:70382065:1 gene:ENSMUSG00000031849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF033530 // GenBank // Mus musculus cartilage oligomeric matrix protein precursor, mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// BC128368 // GenBank // Mus musculus cartilage oligomeric matrix protein, mRNA (cDNA clone MGC:150282 IMAGE:40111643), complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000052485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70373572:70381932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0
NM_018827 // RefSeq // Mus musculus cytokine receptor-like factor 1 (Crlf1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000008032 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:70493158:70504081:1 gene:ENSMUSG00000007888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB040038 // GenBank // Mus musculus CRLM3 mRNA for cytokine receptor like molecule 3, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70493277:70503841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_007924 // RefSeq // Mus musculus elongation factor RNA polymerase II (Ell), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000093454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70539675:70592858:1 gene:ENSMUSG00000070002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC014816 // GenBank // Mus musculus elongation factor RNA polymerase II, mRNA (cDNA clone MGC:25660 IMAGE:4482339), complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC024894 // GenBank // Mus musculus elongation factor RNA polymerase II, mRNA (cDNA clone MGC:28454 IMAGE:4159557), complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// U80227 // GenBank // Mus musculus ELL homolog mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70539707:70591614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_023627 // RefSeq // Mus musculus myo-inositol 1-phosphate synthase A1 (Isyna1), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000019283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70594481:70597288:1 gene:ENSMUSG00000019139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AF288525 // GenBank // Mus musculus myo-inositol 1-phosphate synthase A1 (IsynA1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC003458 // GenBank // Mus musculus myo-inositol 1-phosphate synthase A1, mRNA (cDNA clone MGC:6809 IMAGE:2648362), complete cds. // chr8 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70593161:70597198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_153074 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 25 (Lrrc25), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70616844:70620850:1 gene:ENSMUSG00000049988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC137696 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 25, mRNA (cDNA clone MGC:169320 IMAGE:8860715), complete cds. // chr8 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70617571:70620663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_015816 // RefSeq // Mus musculus LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000034311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:70673248:70678752:1 gene:ENSMUSG00000031848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000146972 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:70673432:70678048:1 gene:ENSMUSG00000031848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000153689 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:70677665:70678116:1 gene:ENSMUSG00000031848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// BC026747 // GenBank // Mus musculus LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:25600 IMAGE:4024321), complete cds. // chr8 // 76 // 100 // 22 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70673510:70678451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001286944 // RefSeq // Mus musculus jun D proto-oncogene (Jund), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_010592 // RefSeq // Mus musculus jun D proto-oncogene (Jund), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000095267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70697739:70700616:1 gene:ENSMUSG00000071076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC010572 // GenBank // Mus musculus Jun proto-oncogene related gene d, mRNA (cDNA clone MGC:6245 IMAGE:3583807), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC094068 // GenBank // Mus musculus Jun proto-oncogene related gene d, mRNA (cDNA clone MGC:102515 IMAGE:4456297), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// J05205 // GenBank // Mouse junD proto-oncogene mRNA, complete cds. // chr8 // 82 // 96 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70699058:70700083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
XM_006509813 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 16486 (Gm16486), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509815 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 16486 (Gm16486), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70708160:70717567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008353 // RefSeq // Mus musculus interleukin 12 receptor, beta 1 (Il12rb1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006509558 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 12 receptor, beta 1 (Il12rb1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000000808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70808449:70821424:1 gene:ENSMUSG00000000791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC057212 // GenBank // Mus musculus interleukin 12 receptor, beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:68210 IMAGE:5350447), complete cds. // chr8 // 83 // 94 // 25 // 30 // 0 /// U23922 // GenBank // Mus musculus IL-12 receptor beta component precursor mRNA, complete cds. // chr8 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70806670:70820871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AK040410 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430092F05 product:interleukin 12 receptor, beta 1, full insert sequence. // chr8 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
XR_105222 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A230052G05 gene (A230052G05Rik), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70863127:70865428:1 gene:ENSMUSG00000020887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK079546 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230052G05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173013 // RefSeq // Mus musculus microtubule-associated protein 1S (Map1s), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006509682 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus microtubule-associated protein 1S (Map1s), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000019405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70905974:70917526:1 gene:ENSMUSG00000019261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK158860 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K430347A03 product:Hypothetical metallo-hydrolase/oxidoreductase structure containing protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC058166 // GenBank // Mus musculus BPY2 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4980407). // chr8 // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// BC150729 // GenBank // Mus musculus microtubule-associated protein 1S, mRNA (cDNA clone MGC:183640 IMAGE:9087640), complete cds. // chr8 // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// DQ387862 // GenBank // Mus musculus microtubule-associated protein 8 mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70906004:70917207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
XR_105223 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10654 (Gm10654), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70931405:70933037:1 gene:ENSMUSG00000074252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK140235 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230363F22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001142322 // RefSeq // Mus musculus myosin IXb (Myo9b), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// NM_001142323 // RefSeq // Mus musculus myosin IXb (Myo9b), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// NM_015742 // RefSeq // Mus musculus myosin IXb (Myo9b), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// XM_006509583 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myosin IXb (Myo9b), transcript variant X18, mRNA. // chr8 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0 /// XM_006509584 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myosin IXb (Myo9b), transcript variant X19, mRNA. // chr8 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000071935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71272714:71360712:1 gene:ENSMUSG00000004677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000168839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71272714:71360712:1 gene:ENSMUSG00000004677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000170242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71272714:71360712:1 gene:ENSMUSG00000004677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// AF143683 // GenBank // Mus musculus C57Bl/6 8 unconventional myosin 9bc (Myo9b) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr8 // 95 // 93 // 41 // 43 // 0 /// BC138454 // GenBank // Mus musculus myosin IXb, mRNA (cDNA clone MGC:170079 IMAGE:8861474), complete cds. // chr8 // 95 // 87 // 38 // 40 // 0 /// XM_006509586 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus myosin IXb (Myo9b), transcript variant X21, mRNA. // chr8 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1 /// GENSCAN00000049627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71290297:71359973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0
NM_026636 // RefSeq // Mus musculus BRISC and BRCA1 A complex member 1 (Babam1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000002473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71396855:71404772:1 gene:ENSMUSG00000031820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC005692 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 5430437P03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:11854 IMAGE:3597632), complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71397729:71404398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_053162 // RefSeq // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L34 (Mrpl34), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71464926:71465752:1 gene:ENSMUSG00000034880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB049653 // GenBank // Mus musculus MRPL34 mRNA for mitochondrial ribosomal protein L34 (L34mt), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC052086 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L34, mRNA (cDNA clone MGC:62516 IMAGE:5684412), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056979 // GenBank // Mus musculus mitochondrial ribosomal protein L34, mRNA (cDNA clone MGC:66840 IMAGE:6814476), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71464331:71465463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_018754 // RefSeq // Mus musculus stratifin (Sfn), mRNA. // chr8 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057311 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133600556:133602168:-1 gene:ENSMUSG00000047281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// AF058798 // GenBank // Mus musculus 14-3-3 protein sigma mRNA, complete cds. // chr8 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// AF152893 // GenBank // Mus musculus 14-3-3 protein sigma (Mme1) mRNA, complete cds. // chr8 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71523573:71524320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133601023:133670327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_028617 // RefSeq // Mus musculus multivesicular body subunit 12A (Mvb12a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71542930:71548024:1 gene:ENSMUSG00000031813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC020119 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 125, member A, mRNA (cDNA clone MGC:28144 IMAGE:3982577), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC027419 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 125, member A, mRNA (cDNA clone MGC:36286 IMAGE:4163554), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087734 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 125, member A, mRNA (cDNA clone MGC:99951 IMAGE:5101734), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC096439 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:2647175, with apparent retained intron. // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000049620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71542974:71547824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_146211 // RefSeq // Mus musculus glycosyltransferase 25 domain containing 1 (Glt25d1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000047903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71611024:71624909:1 gene:ENSMUSG00000034807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK029433 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833435K08 product:weakly similar to CEREBRAL CELL ADHESION MOLECULE [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC032165 // GenBank // Mus musculus glycosyltransferase 25 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:38524 IMAGE:5353334), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC056951 // GenBank // Mus musculus glycosyltransferase 25 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:66686 IMAGE:5695490), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC027801 // GenBank HTC // Mus musculus glycosyltransferase 25 domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5251913), with apparent retained intron. // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71611200:71623760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_145624 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 709 (Zfp709), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC021921 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 709, mRNA (cDNA clone MGC:28841 IMAGE:4506799), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000188685 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:71882068:71892565:1 gene:ENSMUSG00000056019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001166645 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 882 (Zfp882), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000110002 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:71908608:71916354:1 gene:ENSMUSG00000089857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000125802 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:71908657:71913583:1 gene:ENSMUSG00000089857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENSMUST00000126607 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:71908905:71913587:1 gene:ENSMUSG00000089857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// AK158455 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930118D11 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONMMUT066087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_133358 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 617 (Zfp617), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000119003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:71922852:71934629:1 gene:ENSMUSG00000066880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AB020542 // GenBank // Mus musculus mRNA for Zinc finger protein s11-6, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC014712 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 617, mRNA (cDNA clone MGC:25259 IMAGE:4507398), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
AK032580 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430601O08 product:similar to Pol protein (Fragment) [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
NM_207555 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 372 (Olfr372), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:72057660:72058675:1 gene:ENSMUSG00000069998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC150671 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 372, mRNA (cDNA clone MGC:183582 IMAGE:9087582), complete cds. // chr8 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72057682:72058626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146539 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 373 (Olfr373), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000074540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:72099762:72100706:1 gene:ENSMUSG00000061561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC106980 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 373, mRNA (cDNA clone MGC:129216 IMAGE:40042607), complete cds. // chr8 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0 /// BC119445 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 373, mRNA (cDNA clone MGC:140917 IMAGE:40042612), complete cds. // chr8 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0 /// GENSCAN00000037068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72099762:72100706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_146338 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 374 (Olfr374), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000055735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:72107040:72110509:1 gene:ENSMUSG00000046881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC145662 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 374, mRNA (cDNA clone MGC:175549 IMAGE:40130965), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72109568:72200780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001001491 // RefSeq // Mus musculus tropomyosin 4 (Tpm4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000003575 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:72135259:72153142:1 gene:ENSMUSG00000031799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000123177 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:72134975:72144709:1 gene:ENSMUSG00000031799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// BC023827 // GenBank // Mus musculus tropomyosin 4, mRNA (cDNA clone MGC:38326 IMAGE:5343662), complete cds. // chr8 // 80 // 88 // 12 // 15 // 0 /// BC070421 // GenBank // Mus musculus tropomyosin 4, mRNA (cDNA clone MGC:95675 IMAGE:6403300), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC023701 // GenBank // Mus musculus tropomyosin 4, mRNA (cDNA clone MGC:38384 IMAGE:5345587), complete cds. // chr8 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0 /// NONMMUT066109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000037075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72109568:72200780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
NM_023126 // RefSeq // Mus musculus RAB8A, member RAS oncogene family (Rab8a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000003121 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:72161200:72183904:1 gene:ENSMUSG00000003037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000128203 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:72161359:72176057:1 gene:ENSMUSG00000003037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000135613 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:72161313:72175863:1 gene:ENSMUSG00000003037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AB232600 // GenBank // Mus musculus Rab8A mRNA for Rab8A, complete cds. // chr8 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC019990 // GenBank // Mus musculus RAB8A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:28462 IMAGE:4161110), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT066113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000037075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72109568:72200780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_197944 // RefSeq // Mus musculus hematopoietic SH2 domain containing (Hsh2d), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000072097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:72189668:72200958:1 gene:ENSMUSG00000062007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000165324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:72193443:72200995:1 gene:ENSMUSG00000062007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY319653 // GenBank // Mus musculus ALX mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC094291 // GenBank // Mus musculus hematopoietic SH2 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:106069 IMAGE:5316178), complete cds. // chr8 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72109568:72200780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0
NM_026455 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 32, member A (Fam32a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000003123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:72219730:72223764:1 gene:ENSMUSG00000003039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB041658 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-3154. // chr8 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// AK007524 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810017E07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// BC006058 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2510049I19 gene, mRNA (cDNA clone MGC:8227 IMAGE:3591395), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72219787:72264928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_007456 // RefSeq // Mus musculus adaptor-related protein complex AP-1, mu subunit 1 (Ap1m1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000003117 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:72240018:72257385:1 gene:ENSMUSG00000003033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126885 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:72240323:72251817:1 gene:ENSMUSG00000003033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000151546 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:72252935:72256912:1 gene:ENSMUSG00000003033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC003823 // GenBank // Mus musculus adaptor-related protein complex AP-1, mu subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:6219 IMAGE:3491338), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M62419 // GenBank // Mouse clathrin-associated protein (AP47) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000145213 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:72240110:72249881:1 gene:ENSMUSG00000003033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSMUST00000156735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:72252855:72256408:1 gene:ENSMUSG00000003033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72219787:72264928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NM_008452 // RefSeq // Mus musculus Kruppel-like factor 2 (lung) (Klf2), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000067912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:72319033:72321656:1 gene:ENSMUSG00000055148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138737 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like factor 2 (lung), mRNA (cDNA clone MGC:170364 IMAGE:8861759), complete cds. // chr8 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC138738 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like factor 2 (lung), mRNA (cDNA clone MGC:170365 IMAGE:8861760), complete cds. // chr8 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// U25096 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like factor LKLF mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72319078:72320919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0
NM_028170 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700030K09 gene (1700030K09Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000064853 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:72443880:72461001:1 gene:ENSMUSG00000052794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000121902 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:72443932:72460641:1 gene:ENSMUSG00000052794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC008558 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700030K09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:8256 IMAGE:3592293), complete cds. // chr8 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72444949:72458832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
XM_006530660 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coagulation factor II (thrombin) receptor-like 3 (F2rl3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// BC119461 // GenBank // Mus musculus coagulation factor II (thrombin) receptor-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:140991 IMAGE:40045612), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NM_007975 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor II (thrombin) receptor-like 3 (F2rl3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// ENSMUST00000058099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:72761880:72763874:1 gene:ENSMUSG00000050147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// AF080215 // GenBank // Mus musculus protease-activated receptor 4 (Par4) mRNA, complete cds. // chr8 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// GENSCAN00000051621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72761903:72775420:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1
NM_001294278 // RefSeq // Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_027837 // RefSeq // Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034034 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:74873173:74893506:1 gene:ENSMUSG00000031621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000174427 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:74873540:74893147:1 gene:ENSMUSG00000031621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AB219124 // GenBank // Mus musculus Pix-1 mRNA for pancreas-intestine homeodomain transcription factor, complete cds. // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC128289 // GenBank // Mus musculus intestine specific homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:150019 IMAGE:40102442), complete cds. // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC128290 // GenBank // Mus musculus intestine specific homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:150020 IMAGE:40102443), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:74854930:74931173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_010442 // RefSeq // Mus musculus heme oxygenase (decycling) 1 (Hmox1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000005548 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:75093591:75100596:1 gene:ENSMUSG00000005413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC010757 // GenBank // Mus musculus heme oxygenase (decycling) 1, mRNA (cDNA clone MGC:18463 IMAGE:4235374), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M33203 // GenBank // Mouse tumor-induced 32 kD protein (p32) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000160341 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:75093641:75096451:1 gene:ENSMUSG00000005413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:75092726:75133491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT066177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_008566 // RefSeq // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 5, cell division cycle 46 (S. cerevisiae) (Mcm5), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000164309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:75109528:75128439:1 gene:ENSMUSG00000005410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// BC094416 // GenBank // Mus musculus minichromosome maintenance deficient 5, cell division cycle 46 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:117105 IMAGE:5707724), complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// D26090 // GenBank // Mus musculus mRNA for mCDC46 protein, complete cds. // chr8 // 97 // 83 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000015019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:75092726:75133491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 78 // 78 // 32 // 41 // 1
NM_029182 // RefSeq // Mus musculus RASD family, member 2 (Rasd2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000132133 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:75214502:75222371:1 gene:ENSMUSG00000034472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000139848 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:75213944:75224113:1 gene:ENSMUSG00000034472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK015898 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930526B11 product:weakly similar to DEXRAS1 [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC036988 // GenBank // Mus musculus RASD family, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4988981), partial cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:75199269:75222248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001164235 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700007B14 gene (1700007B14Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_027944 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700007B14 gene (1700007B14Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:75448694:75984478:1 gene:ENSMUSG00000031620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000121983 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:75448983:75984503:1 gene:ENSMUSG00000031620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC117767 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700007B14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143580 IMAGE:40090978), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC117768 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700007B14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143581 IMAGE:40090984), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001083906 // RefSeq // Mus musculus nuclear receptor subfamily 3, group C, member 2 (Nr3c2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034031 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:76908272:77242530:1 gene:ENSMUSG00000031618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000109912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:76902288:77245007:1 gene:ENSMUSG00000031618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000109913 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:76899772:77245012:1 gene:ENSMUSG00000031618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000148106 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:76902288:77242996:1 gene:ENSMUSG00000031618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC133713 // GenBank // Mus musculus nuclear receptor subfamily 3, group C, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:161368 IMAGE:40143429), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000109911 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:76902476:77243663:1 gene:ENSMUSG00000031618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000010383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:77206504:77221887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000010403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:77177626:77200722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENSMUST00000158317 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:77194695:77194866:1 gene:ENSMUSG00000088942 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_028125 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 0610038B21 gene (0610038B21Rik), long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000184762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:77517056:77518579:1 gene:ENSMUSG00000097882 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081240 // RefSeq // Mus musculus protein arginine methyltransferase 10 (putative) (Prmt10), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000056237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:77549397:77581338:1 gene:ENSMUSG00000037134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000118622 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:77549410:77581338:1 gene:ENSMUSG00000037134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000142824 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:77549407:77563978:1 gene:ENSMUSG00000037134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// AK045296 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130063C23 product:hypothetical TPR repeat/SAM (and some other nucleotide) binding motif containing protein, full insert sequence. // chr8 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000010393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:77549381:77581249:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_183096 // RefSeq // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 29 (Ttc29), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:78213342:78394326:1 gene:ENSMUSG00000037101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:78218794:78393683:1 gene:ENSMUSG00000037101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000117845 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:78213297:78220975:1 gene:ENSMUSG00000037101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000126172 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:78213302:78220833:1 gene:ENSMUSG00000037101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AK006580 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700031F13 product:similar to NYD-SP14 [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC048386 // GenBank // Mus musculus tetratricopeptide repeat domain 29, mRNA (cDNA clone MGC:56883 IMAGE:6310247), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026904 // RefSeq // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 10 (Anapc10), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// XM_006531340 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anaphase promoting complex subunit 10 (Anapc10), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// XM_006531342 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anaphase promoting complex subunit 10 (Anapc10), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000048147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:79711820:79777321:1 gene:ENSMUSG00000036977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// BC031460 // GenBank // Mus musculus anaphase promoting complex subunit 10, mRNA (cDNA clone MGC:25547 IMAGE:3710036), complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
NM_010369 // RefSeq // Mus musculus glycophorin A (Gypa), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000063359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:80494045:80510785:1 gene:ENSMUSG00000051839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC148192 // GenBank // Mus musculus glycophorin A, mRNA (cDNA clone MGC:130497 IMAGE:40045496), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006530698 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glycophorin A (Gypa), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// M26385 // GenBank // Mouse glycophorin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:80494054:80565521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_001167898 // RefSeq // Mus musculus Fras1 related extracellular matrix protein 3 (Frem3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000039695 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:80611080:80695356:1 gene:ENSMUSG00000042353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000002841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:80657814:80695356:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:80611080:80624316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000123595 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:81013576:81038584:1 gene:ENSMUSG00000037982 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// ENSMUST00000166229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:81013576:81038584:1 gene:ENSMUSG00000037982 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// AK028622 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732419E09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// BC151123 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9088036. // chr8 // 78 // 51 // 14 // 18 // 0 /// NONMMUT066293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1
ENSMUST00000083248 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:82409091:82409226:1 gene:ENSMUSG00000065182 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONMMUT066313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
GENSCAN00000002761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:82692743:82761643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
AK220374 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1214 protein. // chr8 // 83 // 34 // 10 // 12 // 0 /// NM_177378 // RefSeq // Mus musculus ring finger protein 150 (Rnf150), mRNA. // chr8 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1 /// ENSMUST00000078525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:82863356:83091271:1 gene:ENSMUSG00000047747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1 /// AK032722 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720416N22 product:ring finger protein 150, full insert sequence. // chr8 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// GENSCAN00000002778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:82969263:83045075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_001111304 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 9 (Tbc1d9), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NM_027758 // RefSeq // Mus musculus TBC1 domain family, member 9 (Tbc1d9), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000034145 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:83165352:83272422:1 gene:ENSMUSG00000031709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000093393 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:83165860:83272934:1 gene:ENSMUSG00000031709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000142673 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:83259259:83270950:1 gene:ENSMUSG00000031709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// BC057027 // GenBank // Mus musculus TBC1 domain family, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:67187 IMAGE:6825869), complete cds. // chr8 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000002783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83185391:83271610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0
NM_009463 // RefSeq // Mus musculus uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier) (Ucp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83290348:83298456:1 gene:ENSMUSG00000031710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC012701 // GenBank // Mus musculus uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier), mRNA (cDNA clone MGC:13965 IMAGE:4191276), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// U63419 // GenBank // Mus musculus mitochondrial uncoupling protein (Ucp) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr8 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83290619:83297971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NM_026233 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933434I20 gene (4933434I20Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006531308 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4933434I20 gene (4933434I20Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006531311 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4933434I20 gene (4933434I20Rik), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006531312 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4933434I20 gene (4933434I20Rik), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000038692 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:83348471:83379402:1 gene:ENSMUSG00000035057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// HM067443 // GenBank // Mus musculus GnT1IP-L mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000139692 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:83358026:83382320:1 gene:ENSMUSG00000035057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// AK017057 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933434I20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// GENSCAN00000002749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83348353:83434339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_009904 // RefSeq // Mus musculus calmegin (Clgn), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006530636 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calmegin (Clgn), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000002259 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:83389867:83428552:1 gene:ENSMUSG00000002190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000109831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:83389878:83426831:1 gene:ENSMUSG00000002190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AK034525 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330210P10 product:calmegin, full insert sequence. // chr8 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// BC050767 // GenBank // Mus musculus calmegin, mRNA (cDNA clone MGC:58291 IMAGE:6771060), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// D14117 // GenBank // Mus musculus Meg 1 mRNA for calmegin, complete cds. // chr8 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// D86323 // GenBank // Mus musculus mRNA for calmegin, complete cds. // chr8 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// U08373 // GenBank // Mus musculus CD-1 calnexin-t mRNA, complete cds. // chr8 // 81 // 91 // 25 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83348353:83434339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1
NM_146270 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 370 (Olfr370), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000058609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83541093:83542188:1 gene:ENSMUSG00000047286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC119367 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 370, mRNA (cDNA clone MGC:155683 IMAGE:8734116), complete cds. // chr8 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// BC120734 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 370, mRNA (cDNA clone MGC:155971 IMAGE:40129657), complete cds. // chr8 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83493546:83548267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_025843 // RefSeq // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 7 (Ndufb7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036996 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:83566671:83571626:1 gene:ENSMUSG00000033938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000127162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:83566758:83571626:1 gene:ENSMUSG00000033938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC034787 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 7, mRNA (cDNA clone MGC:35706 IMAGE:4913656), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC056984 // GenBank // Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:5702589). // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83566819:83571565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// NONMMUT066339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018808 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 1 (Dnajb1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531518 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 1 (Dnajb1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000005620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83608175:83611902:1 gene:ENSMUSG00000005483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB028272 // GenBank // Mus musculus hsp40 mRNA for heat shock protein 40, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK158530 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230007N08 product:DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 1, full insert sequence. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AK160924 // GenBank HTC // Mus musculus 18 days pregnant adult female placenta and extra embryonic tissue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3830429F13 product:DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 1, full insert sequence. // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC012962 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:13739 IMAGE:4188579), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83608332:83610819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_018771 // RefSeq // Mus musculus GIPC PDZ domain containing family, member 1 (Gipc1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000019577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83652678:83664788:1 gene:ENSMUSG00000019433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF061263 // GenBank // Mus musculus semaF cytoplasmic domain associated protein 1 (Semcap1) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AF104358 // GenBank // Mus musculus synectin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC003490 // GenBank // Mus musculus GIPC PDZ domain containing family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:6562 IMAGE:2811749), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF089818 // GenBank // Mus musculus RGS-GAIP interacting protein GIPC mRNA, complete cds. // chr8 // 40 // 96 // 10 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83661125:83669533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_013641 // RefSeq // Mus musculus prostaglandin E receptor 1 (subtype EP1) (Ptger1), mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:83666863:83672753:1 gene:ENSMUSG00000019464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000159935 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:83666833:83671268:1 gene:ENSMUSG00000019464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK164746 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730005P21 product:prostaglandin E receptor 1 (subtype EP1), full insert sequence. // chr8 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC138739 // GenBank // Mus musculus prostaglandin E receptor 1 (subtype EP1), mRNA (cDNA clone MGC:170366 IMAGE:8861761), complete cds. // chr8 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0 /// BC138744 // GenBank // Mus musculus prostaglandin E receptor 1 (subtype EP1), mRNA (cDNA clone MGC:170371 IMAGE:8861766), complete cds. // chr8 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// D16338 // GenBank // Mus musculus mRNA for prostaglandin E receptor EP1 subtype, complete cds. // chr8 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// XM_006530771 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus prostaglandin E receptor 1 (subtype EP1) (Ptger1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// GENSCAN00000046973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83661125:83669533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
ENSMUST00000122733 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:83752918:83753204:1 gene:ENSMUSG00000084682 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr8 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// NONMMUT066353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0
NM_024184 // RefSeq // Mus musculus anti-silencing function 1B histone chaperone (Asf1b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000005607 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:83955507:83970197:1 gene:ENSMUSG00000005470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000124913 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:83955714:83967847:1 gene:ENSMUSG00000005470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC003428 // GenBank // Mus musculus ASF1 anti-silencing function 1 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:6473 IMAGE:2645378), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83954689:83995417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001277898 // RefSeq // Mus musculus protein kinase, cAMP dependent, catalytic, alpha (Prkaca), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// NM_008854 // RefSeq // Mus musculus protein kinase, cAMP dependent, catalytic, alpha (Prkaca), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000005606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83972978:83996445:1 gene:ENSMUSG00000005469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC003238 // GenBank // Mus musculus protein kinase, cAMP dependent, catalytic, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:6169 IMAGE:3497908), complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC054834 // GenBank // Mus musculus protein kinase, cAMP dependent, catalytic, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:62542 IMAGE:6439034), complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// M12303 // GenBank // Mouse cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// NM_001081415 // RefSeq // Mus musculus sterile alpha motif domain containing 1 (Samd1), mRNA. // chr8 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// ENSMUST00000095228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83997672:84000386:1 gene:ENSMUSG00000079003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// JN566056 // GenBank // Mus musculus cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha isoform (Prkaca) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr8 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// GENSCAN00000046987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83954689:83995417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// GENSCAN00000046995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83997672:84004625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
ENSMUST00000142367 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:84021471:84029188:1 gene:ENSMUSG00000047986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK014493 // GenBank HTC // Mus musculus 14 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4432412L15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_028877 // RefSeq // Mus musculus paralemmin 3 (Palm3), mRNA. // chr8 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// XM_006531430 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus paralemmin 3 (Palm3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENSMUST00000055077 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:84021471:84030295:1 gene:ENSMUSG00000047986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// EF208034 // GenBank // Mus musculus paralemmin-3 (Palm3) mRNA, complete cds. // chr8 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// ENSMUST00000154171 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:84026075:84027049:1 gene:ENSMUSG00000047986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000046982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84021488:84030065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONMMUT066367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_009055 // RefSeq // Mus musculus regulatory factor X, 1 (influences HLA class II expression) (Rfx1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000005600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84066836:84096992:1 gene:ENSMUSG00000031706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC057018 // GenBank // Mus musculus regulatory factor X, 1 (influences HLA class II expression), mRNA (cDNA clone MGC:67125 IMAGE:5705637), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK036208 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630045L03 product:regulatory factor (trans-acting) 1, full insert sequence. // chr8 // 40 // 40 // 17 // 42 // 1 /// AK044607 // GenBank HTC // Mus musculus adult retina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A930026I21 product:regulatory factor (trans-acting) 1, full insert sequence. // chr8 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// AK039651 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A330078I10 product:regulatory factor (trans-acting) 1, full insert sequence. // chr8 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000046976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84073772:84095966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
NR_030490 // RefSeq // Mus musculus microRNA 709 (Mir709), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102190 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:84086099:84086186:1 gene:ENSMUSG00000076144 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-709 // miRBase Micro RNA Database // MI0004693 Mus musculus miR-709 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013384 // RefSeq // Mus musculus podocan-like 1 (Podnl1), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000093380 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:84125989:84132527:1 gene:ENSMUSG00000012889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000147175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:84127818:84132516:1 gene:ENSMUSG00000012889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// AK077813 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5832418A03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// BC063764 // GenBank // Mus musculus podocan-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:70079 IMAGE:30288186), complete cds. // chr8 // 87 // 97 // 27 // 31 // 0 /// DQ303463 // GenBank // Mus musculus small leucine-rich repeat protein mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84126099:84132227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_001163752 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930432K21 gene (4930432K21Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_029045 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930432K21 gene (4930432K21Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000093375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:84148252:84172589:1 gene:ENSMUSG00000008129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000118856 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:84148159:84172590:1 gene:ENSMUSG00000008129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000143833 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:84148025:84162347:1 gene:ENSMUSG00000008129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC075658 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930432K21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:99971 IMAGE:30607069), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84157374:84171914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NR_029740 // RefSeq // Mus musculus microRNA 23a (Mir23a), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000083677 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:84208518:84208592:1 gene:ENSMUSG00000065611 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-23a // miRBase Micro RNA Database // MI0000571 Mus musculus miR-23a stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT066377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_029746 // RefSeq // Mus musculus microRNA 27a (Mir27a), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000083510 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:84208672:84208758:1 gene:ENSMUSG00000065444 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// mmu-mir-27a // miRBase Micro RNA Database // MI0000578 Mus musculus miR-27a stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT066378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_029741 // RefSeq // Mus musculus microRNA 24-2 (Mir24-2), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000083607 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:84208815:84208921:1 gene:ENSMUSG00000065541 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// mmu-mir-24-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000572 Mus musculus miR-24-2 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT066379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_008535 // RefSeq // Mus musculus lymphoblastomic leukemia 1 (Lyl1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000037165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84701457:84704715:1 gene:ENSMUSG00000034041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC005736 // GenBank // Mus musculus lymphoblastomic leukemia 1, mRNA (cDNA clone MGC:11650 IMAGE:3598911), complete cds. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// CT010167 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A0950D for gene Lyl1, Lymphoblastomic leukemia; complete cds, incl. stopcodon. // chr8 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000039209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84678681:84707097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSMUST00000098571 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:84723007:84726844:1 gene:ENSMUSG00000074203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK165649 // GenBank HTC // Mus musculus RCB-0035 WEHI-3 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430095P16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// XR_405058 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA G430095P16 gene (G430095P16Rik), misc_RNA. // chr8 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_183358 // RefSeq // Mus musculus growth arrest and DNA-damage-inducible, gamma interacting protein 1 (Gadd45gip1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000036734 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:84831522:84835482:1 gene:ENSMUSG00000033751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC022592 // GenBank // Mus musculus growth arrest and DNA-damage-inducible, gamma interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4038217), partial cds. // chr8 // 88 // 59 // 14 // 16 // 0 /// BC061069 // GenBank // Mus musculus growth arrest and DNA-damage-inducible, gamma interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:74181 IMAGE:6740575), complete cds. // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000039208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84832291:84834426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_010635 // RefSeq // Mus musculus Kruppel-like factor 1 (erythroid) (Klf1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000067060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84901928:84905295:1 gene:ENSMUSG00000054191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC114978 // GenBank // Mus musculus Kruppel-like factor 1 (erythroid), mRNA (cDNA clone MGC:141001 IMAGE:40046272), complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// M97200 // GenBank // Mus musculus erythroid krueppel-like transcription factor mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84902029:84904939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_001167991 // RefSeq // Mus musculus hook homolog 2 (Drosophila) (Hook2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NM_133255 // RefSeq // Mus musculus hook homolog 2 (Drosophila) (Hook2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XR_387735 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hook homolog 2 (Drosophila) (Hook2), transcript variant X10, misc_RNA. // chr8 // 98 // 85 // 39 // 40 // 0 /// ENSMUST00000064495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84990595:85003364:1 gene:ENSMUSG00000052566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC002226 // GenBank // Mus musculus hook homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:3491260), partial cds. // chr8 // 100 // 64 // 30 // 30 // 0 /// BC019486 // GenBank // Mus musculus hook homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:28586 IMAGE:4211990), complete cds. // chr8 // 82 // 96 // 37 // 45 // 0 /// BC055881 // GenBank // Mus musculus hook homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:68106 IMAGE:3590336), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// BC080744 // GenBank // Mus musculus hook homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:91008 IMAGE:30471369), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AK161612 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730402K21 product:hook homolog 2 (Drosophila), full insert sequence. // chr8 // 74 // 74 // 35 // 47 // 1 /// GENSCAN00000039196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84990708:85003011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0
XR_387774 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 2310036O22 gene (2310036O22Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr8 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// ENSMUST00000047281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85026833:85030285:1 gene:ENSMUSG00000041203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC023284 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310036O22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:30270 IMAGE:3484935), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC029622 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310036O22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:25625 IMAGE:4207296), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85026899:85075029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001122843 // RefSeq // Mus musculus transportin 2 (importin 3, karyopherin beta 2b) (Tnpo2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NM_145390 // RefSeq // Mus musculus transportin 2 (importin 3, karyopherin beta 2b) (Tnpo2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000093360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85036915:85057583:1 gene:ENSMUSG00000031691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000166592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85037168:85057583:1 gene:ENSMUSG00000031691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC003275 // GenBank // Mus musculus transportin 2 (importin 3, karyopherin beta 2b), mRNA (cDNA clone MGC:6380 IMAGE:3499838), complete cds. // chr8 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85026899:85075029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
NM_001001493 // RefSeq // Mus musculus WD repeat domain 83 opposite strand (Wdr83os), mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000079764 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:85080740:85082339:1 gene:ENSMUSG00000059355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000148592 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:85080973:85082339:1 gene:ENSMUSG00000059355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// BC056474 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC056474, mRNA (cDNA clone MGC:67360 IMAGE:6823629), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// BC089623 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC056474, mRNA (cDNA clone MGC:107693 IMAGE:30118707), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT066444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_010764 // RefSeq // Mus musculus mannosidase 2, alpha B1 (Man2b1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530747 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mannosidase 2, alpha B1 (Man2b1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85083269:85098739:1 gene:ENSMUSG00000005142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC005430 // GenBank // Mus musculus mannosidase 2, alpha B1, mRNA (cDNA clone MGC:5884 IMAGE:3488681), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// U29947 // GenBank // Mus musculus alpha-D-mannosidase (Man2b1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// U87240 // GenBank // Mus musculus lysosomal alpha-mannosidase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85083330:85097119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001037922 // RefSeq // Mus musculus CDC28 protein kinase 1b, retrogene (Cks1brt), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000076896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85171322:85173622:1 gene:ENSMUSG00000062687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
NM_146859 // RefSeq // Mus musculus olfactory receptor 371 (Olfr371), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85230497:85231435:1 gene:ENSMUSG00000051952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127975 // GenBank // Mus musculus olfactory receptor 371, mRNA (cDNA clone MGC:157530 IMAGE:40135153), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85230497:85231435:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163791 // RefSeq // Mus musculus origin recognition complex, subunit 6 (Orc6), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_019716 // RefSeq // Mus musculus origin recognition complex, subunit 6 (Orc6), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NR_028268 // RefSeq // Mus musculus origin recognition complex, subunit 6 (Orc6), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85299632:85308278:1 gene:ENSMUSG00000031697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000170141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85299632:85308278:1 gene:ENSMUSG00000031697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF139659 // GenBank // Mus musculus origin recognition complex subunit 6 (Orc6) mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC048689 // GenBank HTC // Mus musculus origin recognition complex, subunit 6-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:6581637), containing frame-shift errors. // chr8 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC080739 // GenBank // Mus musculus origin recognition complex, subunit 6-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:91038 IMAGE:30459034), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85305240:85307710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT066451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
AK006764 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700051O22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000083803 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:86292501:86292598:1 gene:ENSMUSG00000065737 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT066489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_027829 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10638 (Gm10638), long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:86745699:86746603:1 gene:ENSMUSG00000074178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK133595 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330411O07 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONMMUT066499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_177901 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4933402J07 gene (4933402J07Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093342 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:87563853:87589424:1 gene:ENSMUSG00000069971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC117078 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933402J07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:151455 IMAGE:40126397), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC120779 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933402J07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:156016 IMAGE:40129702), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:87564016:87589096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000146946 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:88161518:88172027:1 gene:ENSMUSG00000031657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AK165541 // GenBank HTC // Mus musculus RCB-0035 WEHI-3 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430001K07 product:Hypothetical ARM repeat structure containing protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 86 // 85 // 25 // 29 // 0 /// BC048074 // GenBank // Mus musculus HEAT repeat containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5397217), complete cds. // chr8 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// NM_172757 // RefSeq // Mus musculus HEAT repeat containing 3 (Heatr3), mRNA. // chr8 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// ENSMUST00000034079 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:88137855:88172027:1 gene:ENSMUSG00000031657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// ENSMUST00000121949 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:88137856:88171997:1 gene:ENSMUSG00000031657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1 /// BC065060 // GenBank // Mus musculus HEAT repeat containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:86076 IMAGE:6402217), complete cds. // chr8 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// GENSCAN00000051072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:88100721:88257275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1
ENSMUST00000074808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:88174560:88175028:1 gene:ENSMUSG00000062704 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AK020399 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430002A10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000185395 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:88174560:88175034:1 gene:ENSMUSG00000062704 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001164497 // RefSeq // Mus musculus PAP associated domain containing 5 (Papd5), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001164498 // RefSeq // Mus musculus PAP associated domain containing 5 (Papd5), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001164499 // RefSeq // Mus musculus PAP associated domain containing 5 (Papd5), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006530830 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PAP associated domain containing 5 (Papd5), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000066748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:88199213:88259716:1 gene:ENSMUSG00000036779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000118952 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:88199214:88259722:1 gene:ENSMUSG00000036779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:88199213:88259722:1 gene:ENSMUSG00000036779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC144796 // GenBank // Mus musculus PAP associated domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:178352 IMAGE:9053344), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC144797 // GenBank // Mus musculus PAP associated domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:178353 IMAGE:9053345), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC145737 // GenBank // Mus musculus PAP associated domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:175624 IMAGE:40131040), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000051072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:88100721:88257275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001037723 // RefSeq // Mus musculus adenylate cyclase 7 (Adcy7), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NM_001037724 // RefSeq // Mus musculus adenylate cyclase 7 (Adcy7), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_001109756 // RefSeq // Mus musculus adenylate cyclase 7 (Adcy7), transcript variant 4, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_007406 // RefSeq // Mus musculus adenylate cyclase 7 (Adcy7), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006530582 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adenylate cyclase 7 (Adcy7), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000098521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:88294204:88329962:1 gene:ENSMUSG00000031659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000168545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:88282992:88329962:1 gene:ENSMUSG00000031659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000169037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:88272403:88329962:1 gene:ENSMUSG00000031659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000171456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:88289066:88329962:1 gene:ENSMUSG00000031659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC115833 // GenBank // Mus musculus adenylate cyclase 7, mRNA (cDNA clone MGC:141539 IMAGE:40086640), complete cds. // chr8 // 89 // 87 // 24 // 27 // 0 /// U12919 // GenBank // Mus musculus adenylyl cyclase type VII mRNA, complete cds. // chr8 // 86 // 94 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:88300250:88327818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
NM_001163660 // RefSeq // Mus musculus naked cuticle 1 homolog (Drosophila) (Nkd1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_027280 // RefSeq // Mus musculus naked cuticle 1 homolog (Drosophila) (Nkd1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000034086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:88521344:88594887:1 gene:ENSMUSG00000031661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000169179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:88527633:88594887:1 gene:ENSMUSG00000031661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AF343352 // GenBank // Mus musculus Nkd mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AF358134 // GenBank // Mus musculus naked cuticle-1 (Nkd1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC034838 // GenBank // Mus musculus naked cuticle 1 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:40995 IMAGE:1429943), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:88573796:88589882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// AK013241 // GenBank HTC // Mus musculus 10, 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2810434J10 product:naked cuticle 1 homolog (Drosophila), full insert sequence. // chr8 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0
NM_145857 // RefSeq // Mus musculus nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 (Nod2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000054324 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:88647315:88688474:1 gene:ENSMUSG00000055994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000109634 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:88651341:88688474:1 gene:ENSMUSG00000055994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000118370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:88647315:88688474:1 gene:ENSMUSG00000055994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000124091 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:88647384:88665700:1 gene:ENSMUSG00000055994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// AF520774 // GenBank // Mus musculus CARD15 (Card15) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AK089390 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730020N23 product:caspase recruitment domain family, member 15, full insert sequence. // chr8 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// AY160220 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 NOD2 (Nod2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AY160221 // GenBank // Mus musculus strain 129/Sv NOD2 (Nod2) mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC044774 // GenBank // Mus musculus nucleotide-binding oligomerization domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5324763), partial cds. // chr8 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000054253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:88638370:88747013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_177224 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 9 (Chd9), mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// XM_006530571 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 9 (Chd9), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// XM_006530572 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 9 (Chd9), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000048665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:90828835:91054508:1 gene:ENSMUSG00000056608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000109614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:90828835:91054508:1 gene:ENSMUSG00000056608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AK030430 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330411H14 product:Novel chromodomain helicase DNA binding protein, full insert sequence. // chr8 // 94 // 39 // 15 // 16 // 0 /// BC145219 // GenBank // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:178778 IMAGE:9053770), complete cds. // chr8 // 92 // 95 // 36 // 39 // 0 /// DQ127229 // GenBank // Mus musculus ciprofibrate-bound protein PRIC320 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// AK040994 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530057H05 product:hypothetical SNF2 related domain/chromo domain containing protein, full insert sequence. // chr8 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1 /// GENSCAN00000043368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:90904959:91051972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0
AK158167 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930037G02 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 90 // 70 // 19 // 21 // 0 /// AY140896 // GenBank // Mus musculus endogenous defective Murine leukemia virus LI-12 truncated pol/envelope fusion protein mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC066867 // GenBank // Mus musculus similar to Retrovirus-related POL polyprotein (Endonuclease), mRNA (cDNA clone MGC:76738 IMAGE:30462835), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AK040896 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530041D01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 75 // 40 // 9 // 12 // 0 /// FJ654132 // GenBank // Mus musculus strain ICR clone SGT19-10 endogenous retrovirus U3 region, partial sequence. // chr8 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// AY140895 // GenBank // Mus musculus endogenous defective Murine leukemia virus LI-8 gag protein mRNA, complete cds. // chr8 // 54 // 93 // 15 // 28 // 0
NM_001282000 // RefSeq // Mus musculus retinoblastoma-like 2 (Rbl2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_001282001 // RefSeq // Mus musculus retinoblastoma-like 2 (Rbl2), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_011250 // RefSeq // Mus musculus retinoblastoma-like 2 (Rbl2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:91070057:91123844:1 gene:ENSMUSG00000031666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC020528 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:18400 IMAGE:4240592), complete cds. // chr8 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// U36799 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma-related protein Rb2/p130 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// U47333 // GenBank // Mus musculus Rb-related p130 mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// U50850 // GenBank // Mus musculus retinoblastoma-related protein p130 mRNA, complete cds. // chr8 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:91070176:91090285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000043369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:91098188:91122446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
XR_405118 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus iroquois homeobox 3, opposite strand (Irx3os), transcript variant X2, misc_RNA. // chr8 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENSMUST00000062522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:91800415:91807539:1 gene:ENSMUSG00000046413 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000133337 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:91800415:91807539:1 gene:ENSMUSG00000046413 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK084136 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230002A01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// XR_405119 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus iroquois homeobox 3, opposite strand (Irx3os), transcript variant X3, misc_RNA. // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSMUST00000133528 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:91802175:91805215:1 gene:ENSMUSG00000046413 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AK052999 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930010J15 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// BC100534 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30133959, with apparent retained intron. // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONMMUT066677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT066678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONMMUT066680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSMUST00000083702 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:92039917:92040020:1 gene:ENSMUSG00000065636 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_018826 // RefSeq // Mus musculus Iroquois related homeobox 5 (Drosophila) (Irx5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034184 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:92357796:92361456:1 gene:ENSMUSG00000031737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF230074 // GenBank // Mus musculus iroquois homeobox protein 5 IRX-5 (Irx5) mRNA, complete cds. // chr8 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC051959 // GenBank // Mus musculus Iroquois related homeobox 5 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:62229 IMAGE:6404946), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC056994 // GenBank // Mus musculus Iroquois related homeobox 5 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:66960 IMAGE:5716910), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:92335764:92440833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_022428 // RefSeq // Mus musculus Iroquois related homeobox 6 (Drosophila) (Irx6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034185 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:92674288:92680956:1 gene:ENSMUSG00000031738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000167261 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:92674826:92680956:1 gene:ENSMUSG00000031738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC130029 // GenBank // Mus musculus Iroquois related homeobox 6 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:161201 IMAGE:40140906), complete cds. // chr8 // 87 // 82 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:92627554:92680377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_008610 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 2 (Mmp2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:92827328:92853417:1 gene:ENSMUSG00000031740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC070430 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:95837 IMAGE:6813184), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M84324 // GenBank // Mus musculus type IV collagenase mRNA, complete cds. // chr8 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:92827625:92852665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_173014 // RefSeq // Mus musculus lysophosphatidylcholine acyltransferase 2 (Lpcat2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_387747 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus lysophosphatidylcholine acyltransferase 2 (Lpcat2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000046290 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:92855350:92919279:1 gene:ENSMUSG00000033192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB244716 // GenBank // Mus musculus LysoPAFAT/LPCAT2 mRNA for lyso-PAF acetyltransferase:LPC acyltransferase 1, complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC144806 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:178362 IMAGE:9053354), complete cds. // chr8 // 85 // 74 // 17 // 20 // 0 /// BC150666 // GenBank // Mus musculus lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:183577 IMAGE:9087577), complete cds. // chr8 // 85 // 74 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:92855455:92893529:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_027112 // RefSeq // Mus musculus calpain, small subunit 2 (Capns2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000104947 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:92901407:92902407:1 gene:ENSMUSG00000078144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:92901485:92902228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009209 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, noradrenalin), member 2 (Slc6a2), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000072939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:92961047:93001667:1 gene:ENSMUSG00000055368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000165470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:92960079:92998924:1 gene:ENSMUSG00000055368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AY188506 // GenBank // Mus musculus sodium-dependent norepinephrine transporter (Net) mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// AY525777 // GenBank // Mus musculus strain ILS solute carrier family 6 member 2 (Slc6a2) mRNA, complete cds. // chr8 // 87 // 86 // 26 // 30 // 0 /// AY525778 // GenBank // Mus musculus strain ISS solute carrier family 6 member 2 (Slc6a2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC066216 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, noradrenalin), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:76765 IMAGE:30431573), complete cds. // chr8 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// U76306 // GenBank // Mus musculus norepinephrine transporter (mNET) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 74 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:92956983:92996203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0
NM_001003951 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 5A (Ces5a), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006531322 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 5A (Ces5a), transcript variant X3, mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000077816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:93499378:93535707:-1 gene:ENSMUSG00000058019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSMUST00000080391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:93499213:93506768:-1 gene:ENSMUSG00000058019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AB186393 // GenBank // Mus musculus cauxin mRNA for carboxylesterase-like urinary excreted protein, complete cds. // chrUn // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AK006971 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700081L16 product:unclassifiable, full insert sequence. // chrUn // 36 // 36 // 17 // 47 // 1 /// GENSCAN00000024381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:93498674:93502903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 92 // 83 // 36 // 39 // 0 /// AK007235 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700122C07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chrUn // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONMMUT066724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chrUn // 36 // 36 // 17 // 47 // 1
AK019816 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930578M22 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008631 // RefSeq // Mus musculus metallothionein 4 (Mt4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94137204:94139031:1 gene:ENSMUSG00000031757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC141870 // GenBank // Mus musculus metallothionein 4, mRNA (cDNA clone MGC:148172 IMAGE:40038882), complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94137242:94173459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_013603 // RefSeq // Mus musculus metallothionein 3 (Mt3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94152607:94154148:1 gene:ENSMUSG00000031760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC059725 // GenBank // Mus musculus metallothionein 3, mRNA (cDNA clone MGC:74256 IMAGE:6600430), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94137242:94173459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_008630 // RefSeq // Mus musculus metallothionein 2 (Mt2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000034214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94172618:94173567:1 gene:ENSMUSG00000031762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC031758 // GenBank // Mus musculus metallothionein 2, mRNA (cDNA clone MGC:19383 IMAGE:2651471), complete cds. // chr8 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94137242:94173459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 87 // 17 // 20 // 0
NM_013602 // RefSeq // Mus musculus metallothionein 1 (Mt1), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530752 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus metallothionein 1 (Mt1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94179089:94180325:1 gene:ENSMUSG00000031765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AK018727 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0610008G10 product:metallothionein 1, full insert sequence. // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AK154954 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630112M19 product:metallothionein 1, full insert sequence. // chr8 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC027262 // GenBank // Mus musculus metallothionein 1, mRNA (cDNA clone MGC:27821 IMAGE:3483861), complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC036990 // GenBank // Mus musculus metallothionein 1, mRNA (cDNA clone MGC:47147 IMAGE:4990006), complete cds. // chr8 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC109369 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5387945. // chr8 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// GENSCAN00000043248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94177986:94180193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_172410 // RefSeq // Mus musculus nucleoporin 93 (Nup93), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006531375 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin 93 (Nup93), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// XM_006531376 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleoporin 93 (Nup93), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000079961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94214597:94314857:1 gene:ENSMUSG00000032939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000109547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94227661:94315066:1 gene:ENSMUSG00000032939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// AK045380 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230111C05 product:similar to DEAD EYE [Brachydanio rerio], full insert sequence. // chr8 // 97 // 83 // 37 // 38 // 0 /// AK129055 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0095 protein. // chr8 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// BC023140 // GenBank // Mus musculus nucleoporin 93, mRNA (cDNA clone MGC:28230 IMAGE:3991335), complete cds. // chr8 // 95 // 91 // 40 // 42 // 0 /// GENSCAN00000043247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94222993:94365961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0
NR_029552 // RefSeq // Mus musculus microRNA 138-2 (Mir138-2), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000083578 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:94324303:94324382:1 gene:ENSMUSG00000065512 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// mmu-mir-138-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000164 Mus musculus miR-138-2 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT066760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT066761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NM_001205311 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 12, member 3 (Slc12a3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_019415 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 12, member 3 (Slc12a3), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530790 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 12, member 3 (Slc12a3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000034218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94329192:94366213:1 gene:ENSMUSG00000031766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK052755 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630044B14 product:solute carrier family 12, member 3, full insert sequence. // chr8 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AK085496 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630035G09 product:solute carrier family 12, member 3, full insert sequence. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC038612 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 12, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:46751 IMAGE:4237274), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// U61085 // GenBank // Mus musculus thiazide-sensitive Na-Cl cotransporter mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94222993:94365961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_022331 // RefSeq // Mus musculus homocysteine-inducible, endoplasmic reticulum stress-inducible, ubiquitin-like domain member 1 (Herpud1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034220 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:94386495:94395358:1 gene:ENSMUSG00000031770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000159450 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:94387599:94392309:1 gene:ENSMUSG00000031770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000161085 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:94387553:94392469:1 gene:ENSMUSG00000031770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000161576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94386438:94395377:1 gene:ENSMUSG00000031770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB034991 // GenBank // Mus musculus Herpud1 mRNA for stress protein Herp, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC013523 // GenBank // Mus musculus homocysteine-inducible, endoplasmic reticulum stress-inducible, ubiquitin-like domain member 1, mRNA (cDNA clone MGC:19198 IMAGE:4236803), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94386298:94394755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94408685:94526075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94408685:94526075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94408685:94526075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000182409 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:94476126:94506778:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000183132 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:94482039:94491589:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94408685:94526075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94408685:94526075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94408685:94526075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94408685:94526075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONMMUT066784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 53 // 60 // 8 // 15 // 0 /// NONMMUT066783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:94521431:94523509:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000183287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:94521431:94523509:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94408685:94526075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT066783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT066784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000183287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:94521431:94523509:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94408685:94526075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT066784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:94521431:94523509:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000183287 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:94521431:94523509:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94408685:94526075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FJ889356 // GenBank // Mus musculus NLRC5 (NLRC5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94408685:94526075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033207 // RefSeq // Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006531166 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000053085 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94472763:94527272:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000098489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94525067:94527264:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000137032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:94525067:94527268:1 gene:ENSMUSG00000074151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC150954 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9087865. // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_153507 // RefSeq // Mus musculus copine II (Cpne2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006530866 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus copine II (Cpne2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000048653 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94532990:94570529:1 gene:ENSMUSG00000034361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000109537 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:94533067:94570390:1 gene:ENSMUSG00000034361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC022128 // GenBank // Mus musculus copine II, mRNA (cDNA clone MGC:37787 IMAGE:5097527), complete cds. // chr8 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// BC031801 // GenBank // Mus musculus copine II, mRNA (cDNA clone MGC:30751 IMAGE:3985959), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC023348 // GenBank // Mus musculus copine II, mRNA (cDNA clone MGC:32287 IMAGE:5012573), complete cds. // chr8 // 73 // 65 // 16 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94539034:94560163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0
NM_026274 // RefSeq // Mus musculus ring finger and SPRY domain containing 1 (Rspry1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000060389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94601955:94660275:1 gene:ENSMUSG00000050079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC010833 // GenBank // Mus musculus ring finger and SPRY domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:19346 IMAGE:4235165), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// BC054121 // GenBank // Mus musculus ring finger and SPRY domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:59548 IMAGE:6393910), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000055697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94623103:94673118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0
NM_024191 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 2 binding protein (Arl2bp), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_024269 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 2 binding protein (Arl2bp), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94666755:94674417:1 gene:ENSMUSG00000031776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000109527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94667226:94674417:1 gene:ENSMUSG00000031776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC002131 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 2 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:6748 IMAGE:3592643), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC024708 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylation factor-like 2 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:30281 IMAGE:3987328), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// CT010168 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836A1050D for gene Arl2bp, ADP-ribosylation factor-like 2 binding protein; complete cds, incl. stopcodon. // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94623103:94673118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
NM_009137 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 22 (Ccl22), mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000034231 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94745590:94751699:1 gene:ENSMUSG00000031779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000156137 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:94745680:94749873:1 gene:ENSMUSG00000031779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// AF052505 // GenBank // Mus musculus CC chemokine ABCD-1 mRNA, complete cds. // chr8 // 78 // 96 // 18 // 23 // 0 /// AF076596 // GenBank // Mus musculus macrophage-derived chemokine MDC/ABCD-1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AF163476 // GenBank // Mus musculus macrophage-derived chemokine mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 71 // 15 // 17 // 0 /// BC012658 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 22, mRNA (cDNA clone MGC:13812 IMAGE:4192393), complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT066794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
NM_011332 // RefSeq // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 17 (Ccl17), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530783 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 17 (Ccl17), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94810453:94812035:1 gene:ENSMUSG00000031780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF125570 // GenBank // Mus musculus CC chemokine ABCD-2 (ABCD-2) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF125571 // GenBank // Mus musculus CC chemokine ABCD-2 (ABCD-2) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF125572 // GenBank // Mus musculus CC chemokine ABCD-2 (ABCD-2) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC028505 // GenBank // Mus musculus chemokine (C-C motif) ligand 17, mRNA (cDNA clone MGC:41116 IMAGE:3328278), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94810502:94811853:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_026452 // RefSeq // Mus musculus coenzyme Q9 homolog (yeast) (Coq9), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034234 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94838321:94854895:1 gene:ENSMUSG00000031782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000159424 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:94838405:94850717:1 gene:ENSMUSG00000031782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000159638 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:94838429:94853195:1 gene:ENSMUSG00000031782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000159871 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:94838429:94853270:1 gene:ENSMUSG00000031782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC036386 // GenBank // Mus musculus coenzyme Q9 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:41458 IMAGE:1067021), complete cds. // chr8 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94838422:94863596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_009090 // RefSeq // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide C (Polr2c), mRNA. // chr8 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000109521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94857450:94864242:1 gene:ENSMUSG00000031783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// BC099548 // GenBank // Mus musculus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide C, mRNA (cDNA clone MGC:118242 IMAGE:30312083), complete cds. // chr8 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
NM_001033468 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 114 (Gpr114), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_001145972 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 114 (Gpr114), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000074570 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94923694:94943280:1 gene:ENSMUSG00000061577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000128308 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:94923699:94943280:1 gene:ENSMUSG00000061577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000153448 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:94923694:94934516:1 gene:ENSMUSG00000061577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 31 // 10 // 11 // 0 /// ENSMUST00000166802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94923694:94943290:1 gene:ENSMUSG00000061577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC144851 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 114, mRNA (cDNA clone MGC:178407 IMAGE:9053399), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC145803 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 114, mRNA (cDNA clone MGC:175690 IMAGE:40131106), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94916841:94942132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_173036 // RefSeq // Mus musculus G protein-coupled receptor 97 (Gpr97), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000051259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:95017692:95045247:1 gene:ENSMUSG00000060470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC026426 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 97, mRNA (cDNA clone IMAGE:4223741), partial cds. // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC064726 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 97, mRNA (cDNA clone MGC:76424 IMAGE:30433392), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK037149 // GenBank HTC // Mus musculus 6 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A030001G24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// BC071188 // GenBank // Mus musculus G protein-coupled receptor 97, mRNA (cDNA clone IMAGE:5349707), partial cds. // chr8 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// GENSCAN00000055680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95017769:95044517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
NM_001042715 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 135 (Ccdc135), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006531133 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 135 (Ccdc135), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000058479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:95055103:95078141:1 gene:ENSMUSG00000031786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AY352586 // GenBank // Mus musculus SRG-S mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// BC117982 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 135, mRNA (cDNA clone IMAGE:40101276), complete cds. // chr8 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// BC117983 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 135, mRNA (cDNA clone IMAGE:40101278), complete cds. // chr8 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000055703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95055895:95098786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_028805 // RefSeq // Mus musculus katanin p80 (WD40-containing) subunit B 1 (Katnb1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006531411 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus katanin p80 (WD40-containing) subunit B 1 (Katnb1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// XR_387781 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus katanin p80 (WD40-containing) subunit B 1 (Katnb1), transcript variant X5, misc_RNA. // chr8 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000034239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:95081201:95099874:1 gene:ENSMUSG00000031787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AK037858 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130056M14 product:katanin p80 (WD40-containing) subunit B 1, full insert sequence. // chr8 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// BC045200 // GenBank // Mus musculus katanin p80 (WD40-containing) subunit B 1, mRNA (cDNA clone MGC:49345 IMAGE:5322489), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000055703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95055895:95098786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 83 // 83 // 34 // 41 // 1
NM_133954 // RefSeq // Mus musculus U6 snRNA biogenesis 1 (Usb1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034245 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:95332292:95347507:1 gene:ENSMUSG00000031792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000145060 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:95332325:95344281:1 gene:ENSMUSG00000031792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC016418 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AA960436, mRNA (cDNA clone MGC:25919 IMAGE:4224590), complete cds. // chr8 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENSMUST00000126180 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:95332596:95343165:1 gene:ENSMUSG00000031792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000055676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95332362:95346631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_008609 // RefSeq // Mus musculus matrix metallopeptidase 15 (Mmp15), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034243 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:95352268:95374293:1 gene:ENSMUSG00000031790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC047278 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 15, mRNA (cDNA clone MGC:54739 IMAGE:6390113), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC057952 // GenBank // Mus musculus matrix metallopeptidase 15, mRNA (cDNA clone MGC:68241 IMAGE:5342023), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// D86332 // GenBank // Mus musculus mRNA for membrane type-2 matrix metalloproteinase, complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000055684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95352869:95372520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_172914 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 113 (Ccdc113), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000041569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:95534100:95558888:1 gene:ENSMUSG00000036598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC048506 // GenBank // Mus musculus, Similar to hypothetical protein 4933409I22, clone IMAGE:6773738, mRNA. // chr8 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0 /// BC060957 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 113, mRNA (cDNA clone MGC:74046 IMAGE:6705542), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006531000 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 113 (Ccdc113), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000055673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95534172:95557346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENSMUST00000122282 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:95577471:95578908:1 gene:ENSMUSG00000081436 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000039088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95574603:95578914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_030198 // RefSeq // Mus musculus GINS complex subunit 3 (Psf3 homolog) (Gins3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:95633559:95645059:1 gene:ENSMUSG00000031669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC039794 // GenBank // Mus musculus GINS complex subunit 3 (Psf3 homolog), mRNA (cDNA clone MGC:47987 IMAGE:5121680), complete cds. // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC064746 // GenBank // Mus musculus GINS complex subunit 3 (Psf3 homolog), mRNA (cDNA clone MGC:76533 IMAGE:30095310), complete cds. // chr8 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95633598:95643337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NR_015574 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4930513N10 gene (4930513N10Rik), long non-coding RNA. // chr8 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000098472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:95806973:95810201:1 gene:ENSMUSG00000074136 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000145562 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:95806830:95821728:1 gene:ENSMUSG00000074136 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AK042481 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630095L01 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AK161453 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931420L15 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONMMUT066844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AK006709 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700047G07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT066860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000010868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:97151851:97164872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 82 // 94 // 14 // 17 // 0
AK139634 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020007E24 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONMMUT066871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XR_405168 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A330008L17 gene (A330008L17Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000064349 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:8:99416642:99424644:1 gene:ENSMUSG00000052479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK036159 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630042H09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_011830 // RefSeq // Mus musculus inosine 5-phosphate dehydrogenase 2 (Impdh2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000081111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:9:108560534:108565519:1 gene:ENSMUSG00000062867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000120826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:100030558:100032102:1 gene:ENSMUSG00000071041 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AK203194 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0144B17, strand:minus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000062762, based on BLAT search. // chr8 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// BC010314 // GenBank // Mus musculus inosine 5-phosphate dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:6193 IMAGE:2646679), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC052671 // GenBank // Mus musculus inosine 5-phosphate dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:60597 IMAGE:30058399), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// M33934 // GenBank // Mouse IMP dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// M98333 // GenBank // Mus musculus IMP dehydrogenase (IMPD) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000023865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:9:108560534:108565519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:100030558:100032102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000120764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:100060116:100060620:1 gene:ENSMUSG00000081383 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:100060366:100060683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// NONMMUT066881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_011317 // RefSeq // Mus musculus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1 (Khdrbs1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NR_045036 // RefSeq // Mus musculus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1 (Khdrbs1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr8 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// XR_390162 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1 (Khdrbs1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr8 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066257 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:129713819:129742296:-1 gene:ENSMUSG00000028790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSMUST00000129342 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:4:129703164:129742297:-1 gene:ENSMUSG00000028790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC002051 // GenBank // Mus musculus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:6063 IMAGE:3490667), complete cds. // chr8 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// U17046 // GenBank // Mus musculus p62 ras-GAP associated phosphoprotein mRNA, complete cds. // chr8 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// U17961 // GenBank // Mus musculus p62 mRNA, complete cds. // chr8 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:102534638:102534890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:129676566:129752498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_009868 // RefSeq // Mus musculus cadherin 5 (Cdh5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000034339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104101625:104144502:1 gene:ENSMUSG00000031871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC054790 // GenBank // Mus musculus cadherin 5, mRNA (cDNA clone MGC:65582 IMAGE:6831962), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// D63942 // GenBank // Mus musculus mRNA for cadherin-5, complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000000926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104113664:104142998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NM_001037841 // RefSeq // Mus musculus chemokine-like factor (Cklf), transcript variant 4, mRNA. // chr8 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// NM_029295 // RefSeq // Mus musculus chemokine-like factor (Cklf), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// NR_104433 // RefSeq // Mus musculus chemokine-like factor (Cklf), transcript variant 6, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000034342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104250903:104263443:1 gene:ENSMUSG00000054400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104250932:104264936:1 gene:ENSMUSG00000054400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// AF401530 // GenBank // Mus musculus chemokine-like factor 6 (CKLF6) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 48 // 22 // 22 // 0 /// AF401531 // GenBank // Mus musculus chemokine-like factor 5 (CKLF5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0 /// AY047360 // GenBank // Mus musculus chemokine-like factor 2 (Cklf2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// NM_001286383 // RefSeq // Mus musculus chemokine-like factor (Cklf), transcript variant 5, mRNA. // chr8 // 54 // 54 // 25 // 46 // 1 /// AY046597 // GenBank // Mus musculus chemokine-like factor 4 (Cklf) mRNA, complete cds. // chr8 // 54 // 54 // 25 // 46 // 1 /// GENSCAN00000000899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104251018:104269442:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1
NM_028524 // RefSeq // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 2B (Cmtm2b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006531455 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 2B (Cmtm2b), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000041973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104322237:104330756:1 gene:ENSMUSG00000035785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY162282 // GenBank // Mus musculus chemokine-like factor superfamily 2b (Cklfsf2b) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// AY241872 // GenBank // Mus musculus chemokine-like factor superfamily 2 isoform 2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC060997 // GenBank // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:74095 IMAGE:6742828), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000000916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104329283:104330642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
NM_024217 // RefSeq // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 3 (Cmtm3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531327 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 3 (Cmtm3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006531329 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 3 (Cmtm3), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006531330 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 3 (Cmtm3), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XR_387773 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 3 (Cmtm3), transcript variant X6, misc_RNA. // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000034343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104340594:104347672:1 gene:ENSMUSG00000031875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY241870 // GenBank // Mus musculus chemokine-like factor superfamily 3 mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC003230 // GenBank // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:7225 IMAGE:3483351), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC145817 // GenBank // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:175704 IMAGE:40131120), complete cds. // chr8 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC145819 // GenBank // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:175706 IMAGE:40131122), complete cds. // chr8 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104340749:104350967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
AK158572 // GenBank HTC // Mus musculus visual cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:K230015D01 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001024606 // RefSeq // Mus musculus pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 2 (Pdp2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104591468:104596836:1 gene:ENSMUSG00000048371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC094946 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4833426J09 gene, mRNA (cDNA clone MGC:107685 IMAGE:30121898), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001190330 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 2A (Ces2a), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_133960 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 2A (Ces2a), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000034346 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:104734003:104741630:1 gene:ENSMUSG00000055730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000164182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104734018:104741634:1 gene:ENSMUSG00000055730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC024082 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 6, mRNA (cDNA clone MGC:37855 IMAGE:5100146), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC024491 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 6, mRNA (cDNA clone MGC:37417 IMAGE:4981579), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC024517 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 6, mRNA (cDNA clone MGC:37478 IMAGE:4984109), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC025537 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 6, mRNA (cDNA clone MGC:38095 IMAGE:5309880), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC025812 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 6, mRNA (cDNA clone MGC:37765 IMAGE:5096915), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC026643 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 6, mRNA (cDNA clone MGC:37526 IMAGE:4986124), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC031295 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 6, mRNA (cDNA clone MGC:37854 IMAGE:5100144), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000046735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104734072:104741416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 61 // 10 // 11 // 0
NM_001002775 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4932416K20 gene (4932416K20Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000093229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104795237:104798792:1 gene:ENSMUSG00000069925 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104777020:104798427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0
NM_198171 // RefSeq // Mus musculus carboxyesterase 2B (Ces2b), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000059449 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:104831572:104840093:1 gene:ENSMUSG00000050097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000163042 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:104831601:104838649:1 gene:ENSMUSG00000050097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC015286 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC015286, mRNA (cDNA clone IMAGE:4239608). // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC058815 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC015286, mRNA (cDNA clone MGC:65332 IMAGE:6530348), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104808951:104838456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_145603 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 2C (Ces2c), mRNA. // chr8 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// ENSMUST00000055052 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:104847068:104854483:1 gene:ENSMUSG00000061825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// AB110073 // GenBank // Mus musculus ces2A3 mRNA for carboxylesterase ML3, complete cds. // chr8 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// BC015290 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 2, mRNA (cDNA clone MGC:18908 IMAGE:4241028), complete cds. // chr8 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// BC024552 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 2, mRNA (cDNA clone MGC:37630 IMAGE:4990820), complete cds. // chr8 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// BC031170 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 2, mRNA (cDNA clone MGC:37500 IMAGE:4984806), complete cds. // chr8 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// BC034178 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 2, mRNA (cDNA clone MGC:37204 IMAGE:4971285), complete cds. // chr8 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// BC034180 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 2, mRNA (cDNA clone MGC:37248 IMAGE:4972755), complete cds. // chr8 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// BC034191 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 2, mRNA (cDNA clone MGC:37446 IMAGE:4982995), complete cds. // chr8 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// GENSCAN00000046727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104847133:104854264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0
NM_001163756 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 2E (Ces2e), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_172759 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 2E (Ces2e), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104926260:104934672:1 gene:ENSMUSG00000031886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000109410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104926260:104934672:1 gene:ENSMUSG00000031886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC055062 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 5, mRNA (cDNA clone MGC:62677 IMAGE:6528966), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104926321:104954716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001079865 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 2F (Ces2f), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006531384 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 2F (Ces2f), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000076384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104947356:104955962:1 gene:ENSMUSG00000062826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC117742 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310038E17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143522 IMAGE:40090393), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC117743 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310038E17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:143523 IMAGE:40090395), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104926321:104954716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0
NM_197999 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 2G (Ces2g), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000043183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104961718:104969537:1 gene:ENSMUSG00000031877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC024548 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2210023G05 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4990375), partial cds. // chr8 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// BC027185 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2210023G05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28542 IMAGE:4194872), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006531391 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 2G (Ces2g), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// AK146261 // GenBank HTC // Mus musculus TIB-55 BB88 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I730043N21 product:similar to carboxylesterase 2 (Intestine, liver) (Hypothetical protein) (Carboxylesterase ML3 precursor) [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000046712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104961788:104968431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000046739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104984460:105020410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0
GENSCAN00000046719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105045188:105058103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_001164681 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 3A (Ces3a), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NM_198672 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 3A (Ces3a), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000093222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105048599:105058414:1 gene:ENSMUSG00000069922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000093223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105048599:105058414:1 gene:ENSMUSG00000069922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// BC057187 // GenBank // Mus musculus esterase 31, mRNA (cDNA clone MGC:67828 IMAGE:5098677), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC057188 // GenBank // Mus musculus esterase 31, mRNA (cDNA clone MGC:65472 IMAGE:5100121), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC061004 // GenBank // Mus musculus esterase 31, mRNA (cDNA clone MGC:74105 IMAGE:30315941), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000046719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105045188:105058103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0
NM_001159415 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 3B (Ces3b), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NM_144511 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 3B (Ces3b), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006530654 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 3B (Ces3b), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000074403 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105083763:105093591:1 gene:ENSMUSG00000062181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000093221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105083755:105093929:1 gene:ENSMUSG00000062181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006530655 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 3B (Ces3b), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// XM_006530656 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 3B (Ces3b), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 78 // 78 // 14 // 18 // 1 /// XM_006530657 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 3B (Ces3b), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// GENSCAN00000046706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105083784:105093262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
NM_146213 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 4A (Ces4a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006530886 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 4A (Ces4a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000161289 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105131800:105150109:1 gene:ENSMUSG00000060560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC026374 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 8 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:31116 IMAGE:4163362), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105131973:105149520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_145604 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA D230025D16 gene (D230025D16Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034361 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105225145:105253053:1 gene:ENSMUSG00000031889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000124113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105225267:105253053:1 gene:ENSMUSG00000031889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000133035 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105246493:105251765:1 gene:ENSMUSG00000031889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000141957 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105225206:105252756:1 gene:ENSMUSG00000031889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC006874 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D230025D16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:6480 IMAGE:2646515), complete cds. // chr8 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// BC057919 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D230025D16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:68061 IMAGE:5134302), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000156561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105225206:105251125:1 gene:ENSMUSG00000031889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// AK166937 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0024B03 product:UPF0183 protein homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// GENSCAN00000046726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105170976:105251684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
NM_015821 // RefSeq // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 8 (Fbxl8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000036221 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105264648:105269326:1 gene:ENSMUSG00000033313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000126923 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105264682:105269170:1 gene:ENSMUSG00000033313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AF176523 // GenBank // Mus musculus F-box protein FBL8 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK053206 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030034N04 product:f-box and leucine-rich repeat protein 8, full insert sequence. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC023902 // GenBank // Mus musculus F-box and leucine-rich repeat protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:35973 IMAGE:5321302), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105267014:105279792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_030152 // RefSeq // Mus musculus nucleolar protein 3 (apoptosis repressor with CARD domain) (Nol3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000014920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105276447:105281939:1 gene:ENSMUSG00000014776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY459322 // GenBank // Mus musculus apoptosis repressor interacting with CARD (Nol3) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC027290 // GenBank // Mus musculus nucleolar protein 3 (apoptosis repressor with CARD domain), mRNA (cDNA clone MGC:27734 IMAGE:2647023), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC053971 // GenBank HTC // Mus musculus nucleolar protein 3 (apoptosis repressor with CARD domain), mRNA (cDNA clone IMAGE:1397304). // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105267014:105279792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_148952 // RefSeq // Mus musculus E2F transcription factor 4 (E2f4), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC023859 // GenBank // Mus musculus E2F transcription factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:38438 IMAGE:5346688), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC026649 // GenBank // Mus musculus E2F transcription factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:37558 IMAGE:4987691), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC027030 // GenBank HTC // Mus musculus E2F transcription factor 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:5365489), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// BC027048 // GenBank // Mus musculus E2F transcription factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:32288 IMAGE:5012650), complete cds. // chr8 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000015003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105297663:105305369:1 gene:ENSMUSG00000014859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// GENSCAN00000046717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105297741:105309877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_172760 // RefSeq // Mus musculus engulfment and cell motility 3 (Elmo3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006530890 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus engulfment and cell motility 3 (Elmo3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000109375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105305601:105310623:1 gene:ENSMUSG00000014791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AK157875 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930002M15 product:engulfment and cell motility 3, ced-12 homolog (C. elegans), full insert sequence. // chr8 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// BC018516 // GenBank // Mus musculus engulfment and cell motility 3, ced-12 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:27776 IMAGE:3155913), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// BC026617 // GenBank HTC // Mus musculus engulfment and cell motility 3, ced-12 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:4977035), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// BC058752 // GenBank // Mus musculus engulfment and cell motility 3, ced-12 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:67684 IMAGE:6485393), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC138887 // GenBank // Mus musculus engulfment and cell motility 3, ced-12 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:170514 IMAGE:8861909), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000046717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105297741:105309877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 74 // 74 // 34 // 46 // 1
NM_001081332 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 5 (Slc9a5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006531067 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 5 (Slc9a5), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006531068 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 5 (Slc9a5), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XR_387750 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 5 (Slc9a5), transcript variant X8, misc_RNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000073149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105348258:105369881:1 gene:ENSMUSG00000014786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC151197 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:184096 IMAGE:9088085), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK134092 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830435B19 product:similar to Sodium/hydrogen exchanger 5 (Na(+)/H(+) exchanger 5) (NHE-5) [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// BC057616 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:6401742). // chr8 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000046704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105349377:105368475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0
NM_001033371 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 36 (Lrrc36), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// NM_001170788 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 36 (Lrrc36), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// NM_001170789 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 36 (Lrrc36), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000067305 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105427640:105464084:1 gene:ENSMUSG00000054320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000109355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105413622:105464086:1 gene:ENSMUSG00000054320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000139900 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105413571:105443753:1 gene:ENSMUSG00000054320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// BC036564 // GenBank HTC // Mus musculus leucine rich repeat containing 36, mRNA (cDNA clone IMAGE:3469143), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// BC150957 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 36, mRNA (cDNA clone MGC:183868 IMAGE:9087868), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC172120 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 36, mRNA (cDNA clone MGC:198825 IMAGE:9054406), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105413641:105463968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0
NM_008289 // RefSeq // Mus musculus hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 2 (Hsd11b2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000034363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105518746:105523984:1 gene:ENSMUSG00000031891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC014753 // GenBank // Mus musculus hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:25647 IMAGE:4235545), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC066209 // GenBank // Mus musculus hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:76736 IMAGE:6431285), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000050129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105518865:105523419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_001081241 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 65, member A (Fam65a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006531460 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 65, member A (Fam65a), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// XM_006531462 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 65, member A (Fam65a), transcript variant X7, mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000043531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105605229:105622194:1 gene:ENSMUSG00000038604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AK122573 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1930 protein. // chr8 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC006820 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 65, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:3596826), complete cds. // chr8 // 100 // 28 // 12 // 12 // 0 /// BC030451 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 65, member A, mRNA (cDNA clone MGC:40645 IMAGE:5400266), complete cds. // chr8 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// BC079880 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 65, member A, mRNA (cDNA clone MGC:100216 IMAGE:6852251), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000050194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105614425:105621902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0
NM_181322 // RefSeq // Mus musculus CCCTC-binding factor (Ctcf), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XR_387731 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CCCTC-binding factor (Ctcf), transcript variant X6, misc_RNA. // chr8 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000005841 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105636579:105682922:1 gene:ENSMUSG00000005698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000132679 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105636568:105681647:1 gene:ENSMUSG00000005698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC046398 // GenBank // Mus musculus CCCTC-binding factor, mRNA (cDNA clone MGC:51381 IMAGE:3982679), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC049131 // GenBank // Mus musculus CCCTC-binding factor, mRNA (cDNA clone MGC:61296 IMAGE:6825952), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC058240 // GenBank // Mus musculus CCCTC-binding factor, mRNA (cDNA clone MGC:68200 IMAGE:6307925), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// U51037 // GenBank // Mus musculus 11-zinc-finger transcription factor (CTCF) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000156436 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105676011:105680617:1 gene:ENSMUSG00000005698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000050185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105663763:105698143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_001033320 // RefSeq // Mus musculus RGD motif, leucine rich repeats, tropomodulin domain and proline-rich containing (Rltpr), mRNA. // chr8 // 100 // 60 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000062574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105690906:105698178:1 gene:ENSMUSG00000050357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 34 // 34 // 0 /// BC115830 // GenBank // Mus musculus RGD motif, leucine rich repeats, tropomodulin domain and proline-rich containing, mRNA (cDNA clone IMAGE:40086029), complete cds. // chr8 // 100 // 30 // 17 // 17 // 0 /// HF678090 // GenBank // Mus musculus mRNA for RLTPR, strain C57BL/6J. // chr8 // 100 // 95 // 54 // 54 // 0 /// AK051288 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130029J02 product:inferred: nuclear receptor-binding SET-domain protein 1, full insert sequence. // chr8 // 21 // 21 // 12 // 57 // 1 /// GENSCAN00000050185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105663763:105698143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 77 // 44 // 57 // 1
ENSMUST00000013302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105708291:105710244:1 gene:ENSMUSG00000013158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC125412 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933405L10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159115 IMAGE:40129927), complete cds. // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC138007 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933405L10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:169631 IMAGE:8861026), complete cds. // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC145093 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933405L10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178649 IMAGE:9053641), complete cds. // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_024445 // RefSeq // Mus musculus translin-associated factor X (Tsnax) interacting protein 1 (Tsnaxip1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105827744:105844676:1 gene:ENSMUSG00000031893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC100431 // GenBank // Mus musculus translin-associated factor X (Tsnax) interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:118240 IMAGE:30917958), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105833683:105844624:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_021513 // RefSeq // Mus musculus THAP domain containing 11 (Thap11), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105855103:105856950:1 gene:ENSMUSG00000036442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC138966 // GenBank // Mus musculus THAP domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:170593 IMAGE:8861988), complete cds. // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC138987 // GenBank // Mus musculus THAP domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:170614 IMAGE:8862009), complete cds. // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105855361:105866543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC055833 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3985860, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_026532 // RefSeq // Mus musculus nuclear transport factor 2 (Nutf2), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// ENSMUST00000008594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105860634:105880402:1 gene:ENSMUSG00000008450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// BC003955 // GenBank // Mus musculus nuclear transport factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:7387 IMAGE:3487899), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// BC086773 // GenBank // Mus musculus nuclear transport factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:102015 IMAGE:6828661), complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
NM_181594 // RefSeq // Mus musculus enhancer of mRNA decapping 4 (Edc4), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000040254 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105880881:105893225:1 gene:ENSMUSG00000036270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000119261 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105880951:105893208:1 gene:ENSMUSG00000036270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000136048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105881077:105894908:1 gene:ENSMUSG00000036270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC053081 // GenBank // Mus musculus enhancer of mRNA decapping 4, mRNA (cDNA clone MGC:62455 IMAGE:5704584), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000050137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105881077:105894908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_175024 // RefSeq // Mus musculus neuritin 1-like (Nrn1l), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000060167 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105893567:105895023:1 gene:ENSMUSG00000044287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000118920 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105893572:105895017:1 gene:ENSMUSG00000044287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000136048 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105881077:105894908:1 gene:ENSMUSG00000036270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC100315 // GenBank // Mus musculus neuritin 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:117539 IMAGE:30931461), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// DQ176852 // GenBank // Mus musculus candidate plasticity gene 15-2 (Cpg15-2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105881077:105894908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_173432 // RefSeq // Mus musculus protein serine kinase H1 (Pskh1), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000049699 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105900441:105931778:1 gene:ENSMUSG00000048310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC050128 // GenBank // Mus musculus protein serine kinase H1, mRNA (cDNA clone MGC:60799 IMAGE:30024345), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105900707:105929968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
NM_025518 // RefSeq // Mus musculus dihydrouridine synthase 2 (Dus2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000034375 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:106011507:106053819:1 gene:ENSMUSG00000031901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000119736 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:106011507:106053840:1 gene:ENSMUSG00000031901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC058431 // GenBank // Mus musculus dihydrouridine synthase 2-like (SMM1, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:5693557), partial cds. // chr8 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// BC116934 // GenBank // Mus musculus dihydrouridine synthase 2-like (SMM1, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:151311 IMAGE:40126253), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC116936 // GenBank // Mus musculus dihydrouridine synthase 2-like (SMM1, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:151313 IMAGE:40126255), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000138524 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:106033390:106045992:1 gene:ENSMUSG00000031901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// ENSMUST00000141374 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:106011522:106030883:1 gene:ENSMUSG00000031901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000050159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106025846:106100361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_133792 // RefSeq // Mus musculus phospholipase A2, group XV (Pla2g15), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:106150399:106164713:1 gene:ENSMUSG00000031903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF468958 // GenBank // Mus musculus lysosomal phospholipase A2 (Lpla2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC019373 // GenBank // Mus musculus phospholipase A2, group XV, mRNA (cDNA clone MGC:25713 IMAGE:3964729), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000050141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106150487:106196638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NM_178798 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 6 (Slc7a6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006531136 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 6 (Slc7a6), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:106168875:106198704:1 gene:ENSMUSG00000031904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK157379 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830212N09 product:Similar to Y+L amino acid transporter 1 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC038404 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:37035 IMAGE:4949962), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC042898 // GenBank HTC // Mus musculus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:4952194), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK129099 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0245 protein. // chr8 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000050141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106150487:106196638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
ENSMUST00000137706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:106283307:106300017:1 gene:ENSMUSG00000074113 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK138193 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hypothalamus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A230029E03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011764 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 90 (Zfp90), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530849 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 90 (Zfp90), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530850 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 90 (Zfp90), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_387739 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein 90 (Zfp90), transcript variant X4, misc_RNA. // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000034382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:106415339:106425889:1 gene:ENSMUSG00000031907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK154205 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630009C23 product:zinc finger protein 90, full insert sequence. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC046298 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 90, mRNA (cDNA clone MGC:54624 IMAGE:6486848), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// X79828 // GenBank // M.musculus NK10 mRNA. // chr8 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0
XR_405204 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 6030452D12 gene (6030452D12Rik), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000066875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:106500522:106507342:1 gene:ENSMUSG00000054069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AK031558 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030452D12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001037809 // RefSeq // Mus musculus cadherin 3 (Cdh3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_007665 // RefSeq // Mus musculus cadherin 3 (Cdh3), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000080797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:106510913:106556908:1 gene:ENSMUSG00000061048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC098459 // GenBank // Mus musculus cadherin 3, mRNA (cDNA clone MGC:107349 IMAGE:30079668), complete cds. // chr8 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106511224:106556372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
NM_009864 // RefSeq // Mus musculus cadherin 1 (Cdh1), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000000312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:106603351:106670246:1 gene:ENSMUSG00000000303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000136580 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:106604143:106653919:1 gene:ENSMUSG00000000303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000167688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:106603379:106669362:1 gene:ENSMUSG00000000303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// BC098501 // GenBank // Mus musculus cadherin 1, mRNA (cDNA clone MGC:107495 IMAGE:30023851), complete cds. // chr8 // 94 // 87 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000048480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106603495:106668615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0
NM_173037 // RefSeq // Mus musculus transport and golgi organization 6 (Tango6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006531062 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transport and golgi organization 6 (Tango6), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000048359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:106683068:106851439:1 gene:ENSMUSG00000041949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC066869 // GenBank // Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 7, mRNA (cDNA clone MGC:76744 IMAGE:30106406), complete cds. // chr8 // 92 // 90 // 33 // 36 // 0 /// BC069838 // GenBank // Mus musculus transmembrane and coiled-coil domains 7, mRNA (cDNA clone MGC:76720 IMAGE:30106422), complete cds. // chr8 // 92 // 90 // 33 // 36 // 0 /// AK054283 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330010G16 product:hypothetical ARM repeat structure containing protein, full insert sequence. // chr8 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1 /// AK076373 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate skin cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4732471K23 product:similar to KIAA1746 PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1 /// GENSCAN00000048485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106683153:106748540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0
NM_008217 // RefSeq // Mus musculus hyaluronan synthase 3 (Has3), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034385 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:106870242:106882902:1 gene:ENSMUSG00000031910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000175987 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:106870891:106884566:1 gene:ENSMUSG00000031910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000176144 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:106870836:106881197:1 gene:ENSMUSG00000031910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC138152 // GenBank // Mus musculus hyaluronan synthase 3, mRNA (cDNA clone MGC:169776 IMAGE:8861171), complete cds. // chr8 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC138161 // GenBank // Mus musculus hyaluronan synthase 3, mRNA (cDNA clone MGC:169785 IMAGE:8861180), complete cds. // chr8 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// U86408 // GenBank // Mus musculus hyaluronan synthase 3 (Has3) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106858325:106878828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_011574 // RefSeq // Mus musculus cirrhosis, autosomal recessive 1A (human) (Cirh1a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000047629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:106893640:106923093:1 gene:ENSMUSG00000041438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC027399 // GenBank // Mus musculus cirrhosis, autosomal recessive 1A (human), mRNA (cDNA clone MGC:36990 IMAGE:4948207), complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC068113 // GenBank // Mus musculus cirrhosis, autosomal recessive 1A (human), mRNA (cDNA clone MGC:92952 IMAGE:5707865), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000048484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106893506:106922981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0
NM_009229 // RefSeq // Mus musculus syntrophin, basic 2 (Sntb2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000047425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:106935750:107014192:1 gene:ENSMUSG00000041308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC138850 // GenBank // Mus musculus syntrophin, basic 2, mRNA (cDNA clone MGC:170477 IMAGE:8861872), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC145442 // GenBank // Mus musculus syntrophin, basic 2, mRNA (cDNA clone MGC:179008 IMAGE:9054000), complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// U00678 // GenBank // Mus musculus beta-2-syntrophin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106935802:107045140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_126165 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 4a (yeast) (Vps4a), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000034388 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:107031222:107045755:1 gene:ENSMUSG00000031913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000144527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:107039019:107042687:1 gene:ENSMUSG00000031913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// BC018368 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 4a (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:11698 IMAGE:3963907), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000132096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:107042255:107043106:1 gene:ENSMUSG00000031913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000048474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:106935802:107045140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1 /// NONMMUT067039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
AK155400 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630224F23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001164472 // RefSeq // Mus musculus nuclear import 7 homolog (S. cerevisiae) (Nip7), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NM_025391 // RefSeq // Mus musculus nuclear import 7 homolog (S. cerevisiae) (Nip7), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_028367 // RefSeq // Mus musculus nuclear import 7 homolog (S. cerevisiae) (Nip7), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:107056877:107060926:1 gene:ENSMUSG00000031917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000170962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:107056877:107060926:1 gene:ENSMUSG00000031917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC003972 // GenBank // Mus musculus nuclear import 7 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:7418 IMAGE:3488726), complete cds. // chr8 // 78 // 96 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:107056935:107058496:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
AK021281 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630050I24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0
NM_025558 // RefSeq // Mus musculus cytochrome b5 type B (Cyb5b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:107150661:107187470:1 gene:ENSMUSG00000031924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK007780 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810044O22 product:CYTOCHROME B5 OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE ISOFORM PRECURSOR homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr8 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// BC054749 // GenBank // Mus musculus cytochrome b5 type B, mRNA (cDNA clone MGC:64729 IMAGE:6410090), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC058812 // GenBank // Mus musculus cytochrome b5 type B, mRNA (cDNA clone MGC:65213 IMAGE:6530835), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC062980 // GenBank // Mus musculus cytochrome b5 type B, mRNA (cDNA clone MGC:73448 IMAGE:6842939), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:107138027:107206080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
AK040583 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430107J10 product:hypothetical Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_029553 // RefSeq // Mus musculus microRNA 140 (Mir140), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000083505 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:107551244:107551313:1 gene:ENSMUSG00000065439 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-140 // miRBase Micro RNA Database // MI0000165 Mus musculus miR-140 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_007496 // RefSeq // Mus musculus zinc finger homeobox 3 (Zfhx3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530586 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger homeobox 3 (Zfhx3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000043896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:108714644:108961630:1 gene:ENSMUSG00000038872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D26046 // GenBank // Mus musculus mRNA for AT motif-binding factor, complete cds. // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:108830499:108959410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_019938 // RefSeq // Mus musculus polyamine modulated factor 1 binding protein 1 (Pmfbp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006531214 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polyamine modulated factor 1 binding protein 1 (Pmfbp1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000034162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:109494027:109542642:1 gene:ENSMUSG00000031727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AB029919 // GenBank // Mus musculus STAP mRNA for sperm tail associated protein, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK133053 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930564C11 product:polyamine modulated factor 1 binding protein 1, full insert sequence. // chr8 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// BC138245 // GenBank // Mus musculus polyamine modulated factor 1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:169869 IMAGE:8861264), complete cds. // chr8 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// BC138246 // GenBank // Mus musculus polyamine modulated factor 1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:169870 IMAGE:8861265), complete cds. // chr8 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000037680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109494905:109542520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0
NM_175646 // RefSeq // Mus musculus thioredoxin-like 4B (Txnl4b), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000034159 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:109565892:109574051:1 gene:ENSMUSG00000031723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000178445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:109568888:109573523:1 gene:ENSMUSG00000031723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC094379 // GenBank // Mus musculus thioredoxin-like 4B, mRNA (cDNA clone MGC:106564 IMAGE:30541506), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC132373 // GenBank // Mus musculus thioredoxin-like 4B, mRNA (cDNA clone MGC:164004 IMAGE:40130650), complete cds. // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC138333 // GenBank // Mus musculus thioredoxin-like 4B, mRNA (cDNA clone MGC:169958 IMAGE:8861353), complete cds. // chr8 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109568966:109572859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_001167946 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 821 (Zfp821), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_001286391 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 821 (Zfp821), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_001286393 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 821 (Zfp821), transcript variant 4, mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NM_029468 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 821 (Zfp821), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:109705549:109724932:1 gene:ENSMUSG00000031728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC059014 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 821, mRNA (cDNA clone MGC:69664 IMAGE:6414779), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC059844 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930566A11 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5695303), partial cds. // chr8 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109717809:109724618:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0
NM_009677 // RefSeq // Mus musculus adaptor protein complex AP-1, gamma 1 subunit (Ap1g1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000034171 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:109778906:109861358:1 gene:ENSMUSG00000031731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000093157 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:109778554:109864204:1 gene:ENSMUSG00000031731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC052703 // GenBank // Mus musculus adaptor protein complex AP-1, gamma 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:64704 IMAGE:5698075), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC054535 // GenBank // Mus musculus adaptor protein complex AP-1, gamma 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:62316 IMAGE:5698075), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000037690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109778403:109860195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0
AK156953 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830109I20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001122594 // RefSeq // Mus musculus PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 (Phlpp2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006531010 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 (Phlpp2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000034175 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:109868611:109944671:1 gene:ENSMUSG00000031732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000179721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:109868603:109944670:1 gene:ENSMUSG00000031732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC117961 // GenBank // Mus musculus PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase-like, mRNA (cDNA clone MGC:144151 IMAGE:40098281), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC117962 // GenBank // Mus musculus PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase-like, mRNA (cDNA clone MGC:144152 IMAGE:40098282), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000154262 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:109868542:109904971:1 gene:ENSMUSG00000031732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1 /// AK165088 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330004G04 product:hypothetical Pleckstrin-homology-related containing protein, full insert sequence. // chr8 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1 /// GENSCAN00000037698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:109869128:109940908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// NONMMUT067154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1
NM_175480 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 612 (Zfp612), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:110079764:110090181:1 gene:ENSMUSG00000044676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048413 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 612, mRNA (cDNA clone MGC:57089 IMAGE:6488946), complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110067323:110107713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006531548 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transducin-like enhancer protein 2-like (LOC102638837), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:110109772:110111762:1 gene:ENSMUSG00000095941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006544357 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transducin-like enhancer protein 2-like (LOC102638837), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110108792:110111762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_146215 // RefSeq // Mus musculus cap methyltransferase 2 (Cmtr2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000056972 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:110217989:110224486:1 gene:ENSMUSG00000046441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025546 // GenBank // Mus musculus FtsJ methyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:38131 IMAGE:5320939), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_172916 // RefSeq // Mus musculus HYDIN, axonemal central pair apparatus protein (Hydin), mRNA. // chr8 // 100 // 99 // 91 // 91 // 0 /// ENSMUST00000043141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:110266977:110610253:1 gene:ENSMUSG00000059854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 99 // 91 // 91 // 0 /// AK043971 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830061H17 product:hypothetical PapD-like structure containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 13 // 12 // 12 // 0 /// AK142981 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030027L04 product:hydrocephalus inducing, full insert sequence. // chr8 // 100 // 30 // 28 // 28 // 0 /// AY173049 // GenBank // Mus musculus hydrocephalus-inducing protein (Hydin) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 99 // 91 // 91 // 0 /// GENSCAN00000020769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110489781:110610057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 61 // 61 // 0 /// GENSCAN00000037677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110392322:110419933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 9 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000037693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110266278:110362048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 10 // 10 // 9 // 92 // 1
AK006604 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700034M11 product:similar to 60S RIBOSOMAL PROTEIN L31 [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// NONMMUT067174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
NM_198625 // RefSeq // Mus musculus metastasis suppressor 1-like (Mtss1l), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006531018 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus metastasis suppressor 1-like (Mtss1l), transcript variant X8, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:110721476:110741400:1 gene:ENSMUSG00000033763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000141302 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:110727357:110738073:1 gene:ENSMUSG00000033763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000141527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:110726417:110732010:1 gene:ENSMUSG00000033763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000144041 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:110725726:110739935:1 gene:ENSMUSG00000033763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000149273 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:110727346:110737653:1 gene:ENSMUSG00000033763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// AK052172 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330003B17 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// BC060632 // GenBank // Mus musculus metastasis suppressor 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:79213 IMAGE:6848397), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110721722:110739077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_009179 // RefSeq // Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2 (St3gal2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006530786 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2 (St3gal2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// XM_006530788 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2 (St3gal2), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000034197 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:110919922:110972480:1 gene:ENSMUSG00000031749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000117534 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:110919922:110969823:1 gene:ENSMUSG00000031749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 31 // 31 // 0 /// AK029246 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4831440J09 product:sialyltransferase 5, full insert sequence. // chr8 // 100 // 67 // 31 // 31 // 0 /// BC015264 // GenBank // Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:18446 IMAGE:4211307), complete cds. // chr8 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// BC066064 // GenBank // Mus musculus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:90079 IMAGE:6850583), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000020774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:110957712:110970275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000083166 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:110923116:110923263:1 gene:ENSMUSG00000065100 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_198308 // RefSeq // Mus musculus pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit (Pdpr), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000039333 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:111094641:111137074:1 gene:ENSMUSG00000033624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000144377 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:111094655:111135147:1 gene:ENSMUSG00000033624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK029575 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930402E16 product:PYRUVATE DEHYDROGENASE PHOSPHATASE REGULATORY SUBUNIT homolog [Bos taurus], full insert sequence. // chr8 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// AK129472 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1990 protein. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY223867 // GenBank // Mus musculus pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC120745 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930402E16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:155982 IMAGE:40129668), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC125425 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930402E16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159128 IMAGE:40129940), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000020768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:111094717:111135012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000102427 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:111194964:111195045:1 gene:ENSMUSG00000076382 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT067215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001037665 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 1 (Zfp1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_011742 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 1 (Zfp1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:111643443:111671008:1 gene:ENSMUSG00000055835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC025141 // GenBank HTC // Mus musculus, zinc finger protein 1, clone IMAGE:4483267, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC055796 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:67627 IMAGE:6412519), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC062970 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:73416 IMAGE:6412519), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// X16493 // GenBank // M.musculus mRNA for Zpf-1 zinc finger protein. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
AK049819 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630001N14 product:GABA(A) receptor-associated protein like 2, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_020584 // RefSeq // Mus musculus telomeric repeat binding factor 2, interacting protein (Terf2ip), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000052138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:112011359:112020528:1 gene:ENSMUSG00000033430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC012270 // GenBank // Mus musculus telomeric repeat binding factor 2, interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:19411 IMAGE:3483521), complete cds. // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC017641 // GenBank // Mus musculus telomeric repeat binding factor 2, interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:28971 IMAGE:4483320), complete cds. // chr8 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:112011482:112018234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0
ENSMUST00000083766 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:112062505:112062611:1 gene:ENSMUSG00000065700 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_130457 // RefSeq // Mus musculus contactin associated protein-like 4 (Cntnap4), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:112570043:112882705:1 gene:ENSMUSG00000031772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118171 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:112570043:112882717:1 gene:ENSMUSG00000031772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125196 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:112570055:112786578:1 gene:ENSMUSG00000031772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000125976 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:112570043:112859516:1 gene:ENSMUSG00000031772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF333770 // GenBank // Mus musculus cell recognition molecule CASPR4 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK042607 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730010C01 product:cell recognition protein CASPR4, full insert sequence. // chr8 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AK081891 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130085D23 product:contactin associated protein 4, full insert sequence. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC034628 // GenBank // Mus musculus contactin associated protein-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:36519 IMAGE:5369648), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:112731152:112881882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NR_033584 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10280 (Gm10280), long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// KnowTID_00007141 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT067268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001048143 // RefSeq // Mus musculus MON1 homolog b (yeast) (Mon1b), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NM_173015 // RefSeq // Mus musculus MON1 homolog b (yeast) (Mon1b), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000035777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:113635799:113645178:1 gene:ENSMUSG00000078908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000179926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:113635586:113645178:1 gene:ENSMUSG00000078908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AK157390 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830213E09 product:HSV-I stimulating-related protein homolog, full insert sequence. // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:113497761:113670963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// BC087539 // GenBank HTC // Mus musculus MON1 homolog b (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:2865882), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr8 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_001048145 // RefSeq // Mus musculus synaptonemal complex central element protein 1 like (Syce1l), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_001286494 // RefSeq // Mus musculus synaptonemal complex central element protein 1 like (Syce1l), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_029139 // RefSeq // Mus musculus synaptonemal complex central element protein 1 like (Syce1l), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:113643213:113655533:1 gene:ENSMUSG00000033409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000095173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:113643213:113655533:1 gene:ENSMUSG00000033409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AY899935 // GenBank // Mus musculus meiosis related protein mRNA, complete cds. // chr8 // 75 // 90 // 21 // 28 // 0 /// BC100478 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930481F22 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30916804), partial cds. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC141326 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930481F22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:176287 IMAGE:9055938), complete cds. // chr8 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// BC141347 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930481F22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:176308 IMAGE:9055959), complete cds. // chr8 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:113497761:113670963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NM_001007223 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 3, member a (Clec3a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000009018 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:114418086:114425846:1 gene:ENSMUSG00000008874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147139 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 3, member a, mRNA (cDNA clone MGC:182275 IMAGE:9056169), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC147140 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 3, member a, mRNA (cDNA clone MGC:182272 IMAGE:9056166), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:114417912:114434868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000025205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:116489742:116502557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_029297 // RefSeq // Mus musculus dynein light chain roadblock-type 2 (Dynlrb2), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000078170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:116505015:116515896:1 gene:ENSMUSG00000034467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC048623 // GenBank // Mus musculus dynein light chain roadblock-type 2, mRNA (cDNA clone MGC:58714 IMAGE:6743790), complete cds. // chr8 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:116507460:116518885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 61 // 17 // 19 // 0
NM_028131 // RefSeq // Mus musculus centromere protein N (Cenpn), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:116921740:116941503:1 gene:ENSMUSG00000031756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC027119 // GenBank // Mus musculus centromere protein N, mRNA (cDNA clone IMAGE:5356609), partial cds. // chr8 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC058243 // GenBank // Mus musculus centromere protein N, mRNA (cDNA clone MGC:68092 IMAGE:6309162), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:116919846:116958059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NM_177700 // RefSeq // Mus musculus ATM interactor (Atmin), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109099 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:116943393:116960445:1 gene:ENSMUSG00000047388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC060631 // GenBank // Mus musculus ATM interactor, mRNA (cDNA clone MGC:79206 IMAGE:6847850), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:116919846:116958059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001163028 // RefSeq // Mus musculus beta-carotene 15,15-monooxygenase (Bcmo1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_021486 // RefSeq // Mus musculus beta-carotene 15,15-monooxygenase (Bcmo1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000034308 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:117095854:117133720:1 gene:ENSMUSG00000031845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000167370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:117095865:117131218:1 gene:ENSMUSG00000031845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000176860 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:117095998:117133316:1 gene:ENSMUSG00000031845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF271298 // GenBank // Mus musculus beta-carotene 15,15-dioxygenase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF294899 // GenBank // Mus musculus beta, beta-carotene 15,15-dioxygenase (Bcdo) mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC125328 // GenBank // Mus musculus beta-carotene 15,15-monooxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:159031 IMAGE:40129843), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC125330 // GenBank // Mus musculus beta-carotene 15,15-monooxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:159033 IMAGE:40129845), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000025204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:117092950:117142559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_001081151 // RefSeq // Mus musculus giant axonal neuropathy (Gan), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000064488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:117158135:117205186:1 gene:ENSMUSG00000052557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000162997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:117158137:117205834:1 gene:ENSMUSG00000052557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000025206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:117158135:117204328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
NM_001163262 // RefSeq // Mus musculus c-Maf inducing protein (Cmip), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000166750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:117257019:117461503:1 gene:ENSMUSG00000034390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AK085367 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630016P04 product:hypothetical PH domain-like structure containing protein, full insert sequence. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC158118 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933407C03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:190004 IMAGE:9088191), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:117257102:117273909:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
AK165728 // GenBank HTC // Mus musculus 1 month neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630029F05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// AK173234 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1694 protein. // chr8 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// BC158118 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4933407C03 gene, mRNA (cDNA clone MGC:190004 IMAGE:9088191), complete cds. // chr8 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// NM_001163262 // RefSeq // Mus musculus c-Maf inducing protein (Cmip), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 90 // 90 // 38 // 42 // 1 /// NM_028941 // RefSeq // Mus musculus c-Maf inducing protein (Cmip), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 95 // 95 // 40 // 42 // 1 /// XM_006531434 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus c-Maf inducing protein (Cmip), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 90 // 90 // 38 // 42 // 1 /// XM_006531436 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus c-Maf inducing protein (Cmip), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1 /// ENSMUST00000095172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:117349170:117461503:1 gene:ENSMUSG00000034390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 95 // 40 // 42 // 1 /// ENSMUST00000166750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:117257019:117461503:1 gene:ENSMUSG00000034390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 90 // 38 // 42 // 1 /// AK085367 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630016P04 product:hypothetical PH domain-like structure containing protein, full insert sequence. // chr8 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// GENSCAN00000025214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:117357977:117455768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1
NM_172285 // RefSeq // Mus musculus phospholipase C, gamma 2 (Plcg2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000081232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:117498291:117635140:1 gene:ENSMUSG00000034330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC023877 // GenBank // Mus musculus phospholipase C, gamma 2, mRNA (cDNA clone MGC:38590 IMAGE:5354925), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000039796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:117577862:117651666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
NM_008290 // RefSeq // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 2 (Hsd17b2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006530703 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 2 (Hsd17b2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:117701946:117759029:1 gene:ENSMUSG00000031844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC012682 // GenBank // Mus musculus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:13900 IMAGE:4217153), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// Y09517 // GenBank // M.musculus mRNA for 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase type II. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000039778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:117728316:117782379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
ENSMUST00000098368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:117802062:117803234:1 gene:ENSMUSG00000074065 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK132977 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930540G01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK133443 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933433J12 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONMMUT067385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000083094 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:118120954:118121083:1 gene:ENSMUSG00000065028 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024219 // RefSeq // Mus musculus heat shock factor binding protein 1 (Hsbp1), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:119344538:119348927:1 gene:ENSMUSG00000031839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC002153 // GenBank // Mus musculus heat shock factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:7288 IMAGE:3485301), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AK010939 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2510008P16 product:HEAT SHOCK FACTOR BINDING PROTEIN 1 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000054871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119344638:119345731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_019966 // RefSeq // Mus musculus malonyl-CoA decarboxylase (Mlycd), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531221 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus malonyl-CoA decarboxylase (Mlycd), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006531225 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus malonyl-CoA decarboxylase (Mlycd), transcript variant X8, mRNA. // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000098367 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:119394878:119411102:1 gene:ENSMUSG00000074064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000145121 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:119394898:119411087:1 gene:ENSMUSG00000074064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC004764 // GenBank // Mus musculus malonyl-CoA decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:7015 IMAGE:3155699), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531219 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus malonyl-CoA decarboxylase (Mlycd), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// XM_006531223 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus malonyl-CoA decarboxylase (Mlycd), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// XM_006531226 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus malonyl-CoA decarboxylase (Mlycd), transcript variant X9, mRNA. // chr8 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000054884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119394946:119445905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_054095 // RefSeq // Mus musculus N-terminal EF-hand calcium binding protein 2 (Necab2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530583 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus N-terminal EF-hand calcium binding protein 2 (Necab2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000098363 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:119446719:119472640:1 gene:ENSMUSG00000031837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000131074 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:119446761:119472411:1 gene:ENSMUSG00000031837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000148328 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:119452432:119470945:1 gene:ENSMUSG00000031837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0 /// AF411253 // GenBank // Mus musculus neuronal calcium binding protein 2 (Necab2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115857 // GenBank // Mus musculus N-terminal EF-hand calcium binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:141288 IMAGE:40057629), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC115963 // GenBank // Mus musculus N-terminal EF-hand calcium binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:141287 IMAGE:40057628), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119450082:119472170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_026648 // RefSeq // Mus musculus dynein, axonemal assembly factor 1 (Dnaaf1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000093100 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:119575235:119598454:1 gene:ENSMUSG00000031831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC050751 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 50, mRNA (cDNA clone MGC:58129 IMAGE:6774345), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119575362:119597665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_029428 // RefSeq // Mus musculus adenosine deaminase domain containing 2 (Adad2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000098361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:119612747:119616926:1 gene:ENSMUSG00000024266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC137980 // GenBank // Mus musculus adenosine deaminase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:169604 IMAGE:8860999), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119612781:119619012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_023395 // RefSeq // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 1 (Wfdc1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000024107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:119666523:119688222:1 gene:ENSMUSG00000023336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AK009971 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310058A03 product:PROSTATE STROMAL PROTEIN PS20, full insert sequence. // chr8 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC025850 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5052058), partial cds. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC132073 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:163704 IMAGE:40130350), complete cds. // chr8 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC132469 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:164100 IMAGE:40130746), complete cds. // chr8 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC145305 // GenBank // Mus musculus WAP four-disulfide core domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:178867 IMAGE:9053859), complete cds. // chr8 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119666541:119757486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_026922 // RefSeq // Mus musculus ATPase, Ca++ transporting, type 2C, member 2 (Atp2c2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_387775 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase, Ca++ transporting, type 2C, member 2 (Atp2c2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000095171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:119700009:119757718:1 gene:ENSMUSG00000034112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// EF688288 // GenBank // Mus musculus secretory pathway Ca2+-ATPase isoform 2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119666541:119757486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_146219 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 36 (Klhl36), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:119862305:119876988:1 gene:ENSMUSG00000031828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025816 // GenBank // Mus musculus kelch-like 36 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:37805 IMAGE:5098064), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:119865020:119908053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_030209 // RefSeq // Mus musculus cysteine-rich secretory protein LCCL domain containing 2 (Crispld2), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034282 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:119992508:120051576:1 gene:ENSMUSG00000031825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000108972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:120002726:120051576:1 gene:ENSMUSG00000031825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000132583 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:119992438:120052793:1 gene:ENSMUSG00000031825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK019034 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810049K24 product:10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810049K24 product:late GESTATION lung protein 1 homolog, full insert sequence. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC090642 // GenBank // Mus musculus cysteine-rich secretory protein LCCL domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:116029 IMAGE:30653388), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:120010533:120050337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_001145896 // RefSeq // Mus musculus genetic suppressor element 1 (Gse1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_001145897 // RefSeq // Mus musculus genetic suppressor element 1 (Gse1), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_198671 // RefSeq // Mus musculus genetic suppressor element 1 (Gse1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034279 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:120488447:120581390:1 gene:ENSMUSG00000031822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000118136 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:120537429:120579326:1 gene:ENSMUSG00000031822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000120493 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:120535857:120579480:1 gene:ENSMUSG00000031822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AK154829 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630107O20 product:genetic suppressor element 1, full insert sequence. // chr8 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// BC043094 // GenBank // Mus musculus genetic suppressor element 1, mRNA (cDNA clone MGC:58013 IMAGE:6405464), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:120527932:120578603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
ENSMUST00000181414 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:120589531:120593801:1 gene:ENSMUSG00000097773 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141770 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030060M02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010426 // RefSeq // Mus musculus forkhead box F1 (Foxf1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000181504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:121084386:121088144:1 gene:ENSMUSG00000042812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138805 // GenBank // Mus musculus forkhead box F1a, mRNA (cDNA clone MGC:170432 IMAGE:8861827), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC138806 // GenBank // Mus musculus forkhead box F1a, mRNA (cDNA clone MGC:170433 IMAGE:8861828), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:121071327:121086879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_010426 // RefSeq // Mus musculus forkhead box F1 (Foxf1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:121084386:121088144:1 gene:ENSMUSG00000042812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013519 // RefSeq // Mus musculus forkhead box C2 (Foxc2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000054691 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:121116171:121118895:1 gene:ENSMUSG00000046714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC139208 // GenBank // Mus musculus forkhead box C2, mRNA (cDNA clone MGC:170835 IMAGE:8862230), complete cds. // chr8 // 95 // 58 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:121113518:121118099:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0
NM_008024 // RefSeq // Mus musculus forkhead box L1 (Foxl1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000181609 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:121127940:121130644:1 gene:ENSMUSG00000097084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137805 // GenBank // Mus musculus forkhead box L1, mRNA (cDNA clone MGC:169429 IMAGE:8860824), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC137806 // GenBank // Mus musculus forkhead box L1, mRNA (cDNA clone MGC:169430 IMAGE:8860825), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:121127962:121128972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020605 // RefSeq // Mus musculus junctophilin 3 (Jph3), mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000026357 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:121730563:121790821:1 gene:ENSMUSG00000025318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000167439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:121730567:121794276:1 gene:ENSMUSG00000025318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000169735 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:121729623:121789617:1 gene:ENSMUSG00000025318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// AB024449 // GenBank // Mus musculus JP-3 mRNA for junctophilin type 3, complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AK046136 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230343O17 product:junctophilin 3, full insert sequence. // chr8 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BC103682 // GenBank // Mus musculus junctophilin 3, mRNA (cDNA clone MGC:124340 IMAGE:40047806), complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BC104736 // GenBank // Mus musculus junctophilin 3, mRNA (cDNA clone MGC:124339 IMAGE:40047803), complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BC105307 // GenBank // Mus musculus junctophilin 3, mRNA (cDNA clone MGC:124338 IMAGE:40047801), complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:121777420:121789479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000056337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:121730623:121753748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0
NM_001033485 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC048644 (BC048644), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000140928 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:121907833:121918428:1 gene:ENSMUSG00000074052 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048644 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC048644, mRNA (cDNA clone IMAGE:6772232), partial cds. // chr8 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// ENSMUST00000181944 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:121907833:121909824:1 gene:ENSMUSG00000074052 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// AK082595 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230067J19 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONMMUT067498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSMUST00000055537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122269569:122272646:1 gene:ENSMUSG00000043903 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK122564 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1858 protein. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000187142 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122269569:122272650:1 gene:ENSMUSG00000043903 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122260067:122271364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_009569 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein, multitype 1 (Zfpm1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006530851 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus zinc finger protein, multitype 1 (Zfpm1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000054052 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:122282141:122337251:1 gene:ENSMUSG00000049577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000176690 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:122333786:122335761:1 gene:ENSMUSG00000049577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000177356 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122333698:122335029:1 gene:ENSMUSG00000049577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AF006492 // GenBank // Mus musculus friend of GATA-1 (FOG) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122305372:122339436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_145834 // RefSeq // Mus musculus interleukin 17C (Il17c), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000050963 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:122422020:122423639:1 gene:ENSMUSG00000046108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF458061 // GenBank // Mus musculus IL-17C mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC145853 // GenBank // Mus musculus interleukin 17C, mRNA (cDNA clone MGC:175740 IMAGE:40131156), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122421851:122423568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_045696 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 9330133O14 gene (9330133O14Rik), long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT067521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT067522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_026014 // RefSeq // Mus musculus chromatin licensing and DNA replication factor 1 (Cdt1), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000006760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122568015:122573128:1 gene:ENSMUSG00000006585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB086655 // GenBank // Mus musculus MmCdt1 mRNA for Cdt1 homolog, complete cds. // chr8 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// AF477481 // GenBank // Mus musculus CDT1 protein mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK076527 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4833441M19 product:similar to DNA REPLICATION FACTOR (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC048076 // GenBank // Mus musculus chromatin licensing and DNA replication factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:56849 IMAGE:6307476), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122568056:122572654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
NM_021502 // RefSeq // Mus musculus trafficking protein particle complex 2-like (Trappc2l), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000015157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122611626:122615588:1 gene:ENSMUSG00000015013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB030200 // GenBank // Mus musculus mRNA, complete cds, clone:2-6. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC028502 // GenBank // Mus musculus trafficking protein particle complex 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:41080 IMAGE:1366538), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC114968 // GenBank // Mus musculus trafficking protein particle complex 2-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:40039107), partial cds. // chr8 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122611661:122617538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0
XR_388138 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102638502 (LOC102638502), ncRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000162198 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:122697860:122700160:1 gene:ENSMUSG00000090174 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK158469 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930118L16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT067541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_144932 // RefSeq // Mus musculus acyl-CoA synthetase family member 3 (Acsf3), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000015160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122775505:122817880:1 gene:ENSMUSG00000015016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AK144352 // GenBank HTC // Mus musculus 14 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630030A07 product:hypothetical AMP-dependent synthetase and ligase containing protein, full insert sequence. // chr8 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// BC021611 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5102092. // chr8 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// BC022709 // GenBank // Mus musculus acyl-CoA synthetase family member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:4486614), partial cds. // chr8 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AK141579 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630033H05 product:hypothetical AMP-dependent synthetase and ligase containing protein, full insert sequence. // chr8 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000011788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122761270:122831360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0
ENSMUST00000179168 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:122841731:122842072:1 gene:ENSMUSG00000095762 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000011818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122836551:122842072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_007662 // RefSeq // Mus musculus cadherin 15 (Cdh15), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:122848374:122867397:1 gene:ENSMUSG00000031962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC157978 // GenBank // Mus musculus cadherin 15, mRNA (cDNA clone MGC:189798 IMAGE:9007298), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// M74541 // GenBank // Mus musculus M-cadherin mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:122846890:122867023:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000082516 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:123103038:123103123:1 gene:ENSMUSG00000064450 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000129311 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:123102653:123105244:1 gene:ENSMUSG00000000740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083148 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone IMAGE:30458056). // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_028128 // RefSeq // Mus musculus small nucleolar RNA, C/D box 68 (Snord68), small nucleolar RNA. // chr8 // 57 // 56 // 8 // 14 // 0 /// NONMMUT067575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 57 // 56 // 8 // 14 // 0
NM_170684 // RefSeq // Mus musculus copine VII (Cpne7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000037900 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:123117378:123135182:1 gene:ENSMUSG00000034796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000131659 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:123117447:123135182:1 gene:ENSMUSG00000034796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000134235 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:123117374:123135180:1 gene:ENSMUSG00000034796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC119328 // GenBank // Mus musculus copine VII, mRNA (cDNA clone MGC:155644 IMAGE:8734077), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC137595 // GenBank // Mus musculus copine VII, mRNA (cDNA clone MGC:169219 IMAGE:8860614), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123117497:123134577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_007876 // RefSeq // Mus musculus dipeptidase 1 (renal) (Dpep1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000019422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:123186235:123201810:1 gene:ENSMUSG00000019278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC003492 // GenBank // Mus musculus dipeptidase 1 (renal), mRNA (cDNA clone MGC:6318 IMAGE:2812088), complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// D13139 // GenBank // Mus musculus mRNA for dipeptidase precursor, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123186491:123201059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_177279 // RefSeq // Mus musculus spermatogenesis associated 33 (Spata33), mRNA. // chr8 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// XM_006531114 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus spermatogenesis associated 33 (Spata33), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000060133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:123212858:123222045:1 gene:ENSMUSG00000048478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC059919 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4732415M23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:69942 IMAGE:6827099), complete cds. // chr8 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123212961:123231731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_172287 // RefSeq // Mus musculus spire homolog 2 (Drosophila) (Spire2), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000010298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:123332713:123369515:1 gene:ENSMUSG00000010154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC026502 // GenBank // Mus musculus spire homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:31610 IMAGE:4506974), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC049152 // GenBank // Mus musculus spire homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:56896 IMAGE:6311485), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123332765:123369394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_008559 // RefSeq // Mus musculus melanocortin 1 receptor (Mc1r), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000098324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:123407082:123410742:1 gene:ENSMUSG00000074037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119294 // GenBank // Mus musculus melanocortin 1 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:155610 IMAGE:8734043), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC119296 // GenBank // Mus musculus melanocortin 1 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:155612 IMAGE:8734045), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123407510:123408457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_023279 // RefSeq // Mus musculus tubulin, beta 3 class III (Tubb3), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000071134 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:123411424:123422015:1 gene:ENSMUSG00000062380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// AF312873 // GenBank // Mus musculus tubulin beta-3 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// BC031357 // GenBank // Mus musculus tubulin, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:35812 IMAGE:5363050), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// BC088749 // GenBank // Mus musculus tubulin, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:103107 IMAGE:6307387), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// AK198136 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0127D18, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000047185, based on BLAT search. // chr8 // 62 // 93 // 8 // 13 // 0
NM_054070 // RefSeq // Mus musculus AFG3-like AAA ATPase 1 (Afg3l1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NR_028260 // RefSeq // Mus musculus AFG3-like AAA ATPase 1 (Afg3l1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000001520 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:123477903:123503916:1 gene:ENSMUSG00000031967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000098320 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:123477903:123503916:1 gene:ENSMUSG00000031967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000150872 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:123480366:123489938:1 gene:ENSMUSG00000031967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// AF329695 // GenBank // Mus musculus ATP-dependent zinc metalloprotease (Afg3l1) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AK032369 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430528C23 product:AFG3(ATPase family gene 3)-like 1 (yeast), full insert sequence. // chr8 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC056978 // GenBank // Mus musculus AFG3(ATPase family gene 3)-like 1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:66836 IMAGE:6821746), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000051123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123477851:123502066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0
NM_018855 // RefSeq // Mus musculus growth arrest specific 8 (Gas8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000093043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:123518835:123536649:1 gene:ENSMUSG00000040220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK140135 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230310M19 product:growth arrest specific 8, full insert sequence. // chr8 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AY692443 // GenBank // Mus musculus growth arrest specific protein 11 (Gas11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC003779 // GenBank // Mus musculus growth arrest specific 8, mRNA (cDNA clone MGC:5993 IMAGE:3592695), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// DQ189098 // GenBank // Mus musculus beta growth arrest specific protein 11 (Gas11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// U19859 // GenBank // Mus musculus growth-arrest-specific protein 8 (Gas8) mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000051141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123518950:123640927:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NM_133955 // RefSeq // Mus musculus ras homolog gene family, member U (Rhou), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000045487 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:123653929:123663884:1 gene:ENSMUSG00000039960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB051827 // GenBank // Mus musculus mG28K mRNA for GTP-binding protein like 1, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF378088 // GenBank // Mus musculus Wrch-1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000136615 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:123653929:123655985:1 gene:ENSMUSG00000039960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000051143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123653946:123661316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_009003 // RefSeq // Mus musculus RAB4A, member RAS oncogene family (Rab4a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006530773 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAB4A, member RAS oncogene family (Rab4a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000118535 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:123805985:123835287:1 gene:ENSMUSG00000019478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB232591 // GenBank // Mus musculus Rab4A mRNA for Rab4A, complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AK145452 // GenBank HTC // Mus musculus 5 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I0C0047G05 product:RAB4A, member RAS oncogene family, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC138508 // GenBank // Mus musculus RAB4A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:170133 IMAGE:8861528), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// D86563 // GenBank // Mus musculus mRNA for rab 4, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000117702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:123806068:123834485:1 gene:ENSMUSG00000019478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// GENSCAN00000051140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:123783465:123834130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
XR_405387 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102640773 (LOC102640773), ncRNA. // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AK082235 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230027D02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT067672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001029876 // RefSeq // Mus musculus URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae) (Urb2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:124023394:124048505:1 gene:ENSMUSG00000031976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000173168 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:124021508:124048504:1 gene:ENSMUSG00000031976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC151125 // GenBank // Mus musculus URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:184038 IMAGE:9088038), complete cds. // chr8 // 84 // 93 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124020053:124047306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000051124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124054154:124160625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_139272 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (Galnt2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000034458 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:124231391:124345722:1 gene:ENSMUSG00000089704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000127664 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:119910841:124345722:1 gene:ENSMUSG00000092329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// AF348968 // GenBank // Mus musculus polypeptide GalNAc transferase-T2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC053063 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:62366 IMAGE:5702572), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC059818 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:69581 IMAGE:5697789), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000142578 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:124231508:124334310:1 gene:ENSMUSG00000089704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// GENSCAN00000051129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124249137:124362889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 78 // 78 // 29 // 37 // 1
ENSMUST00000082730 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:124357238:124357323:1 gene:ENSMUSG00000064664 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 78 // 64 // 14 // 18 // 0 /// NONMMUT067686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 78 // 64 // 14 // 18 // 0
NM_029746 // RefSeq // Mus musculus component of oligomeric golgi complex 2 (Cog2), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000034460 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:124520767:124552008:1 gene:ENSMUSG00000031979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000108803 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:124520805:124545774:1 gene:ENSMUSG00000031979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000176279 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:124520819:124529903:1 gene:ENSMUSG00000031979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// AK157348 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830212C01 product:component of oligomeric golgi complex 2, full insert sequence. // chr8 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// BC011435 // GenBank // Mus musculus component of oligomeric golgi complex 2, mRNA (cDNA clone MGC:18753 IMAGE:4010102), complete cds. // chr8 // 83 // 95 // 30 // 36 // 0 /// ENSMUST00000129977 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:124535209:124544393:1 gene:ENSMUSG00000031979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// GENSCAN00000038430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124520880:124551492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0
NM_023709 // RefSeq // Mus musculus calpain 9 (Capn9), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000093033 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:124576111:124618731:1 gene:ENSMUSG00000031981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC058748 // GenBank // Mus musculus calpain 9, mRNA (cDNA clone MGC:67922 IMAGE:6394969), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000038437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124576145:124617652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0
NM_026855 // RefSeq // Mus musculus ARV1 homolog (yeast) (Arv1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:124722139:124734123:1 gene:ENSMUSG00000031982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC119376 // GenBank // Mus musculus ARV1 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:155692 IMAGE:8734125), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC120631 // GenBank // Mus musculus ARV1 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:155868 IMAGE:40129554), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124724600:124731939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
GENSCAN00000038424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124760803:124766140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NM_198632 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 67 (Trim67), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006531139 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif-containing 67 (Trim67), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000041106 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:124793092:124834713:1 gene:ENSMUSG00000036913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000167588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:124793019:124834702:1 gene:ENSMUSG00000036913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC094596 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 67, mRNA (cDNA clone MGC:106451 IMAGE:5705515), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124781876:124829185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_010322 // RefSeq // Mus musculus glyceronephosphate O-acyltransferase (Gnpat), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000034466 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:124863033:124890057:1 gene:ENSMUSG00000031985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000161628 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:124883515:124889548:1 gene:ENSMUSG00000031985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000161986 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:124863072:124886728:1 gene:ENSMUSG00000031985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000162455 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:124883446:124887049:1 gene:ENSMUSG00000031985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// AF110769 // GenBank // Mus musculus peroxisomal acyl-CoA:dihydroxyacetone phosphate acyltransferase (Dhapat) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC025972 // GenBank // Mus musculus glyceronephosphate O-acyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:13727 IMAGE:4020505), complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124868340:124891751:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_001111141 // RefSeq // Mus musculus SprT-like N-terminal domain (Sprtn), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XR_387744 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SprT-like N-terminal domain (Sprtn), transcript variant X2, misc_RNA. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000034467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:124897886:124903813:1 gene:ENSMUSG00000031986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC158088 // GenBank // Mus musculus gene model 505, (NCBI), mRNA (cDNA clone MGC:189878 IMAGE:9007378), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AK033361 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:8430404H04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000038433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:124898158:124903463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_016909 // RefSeq // Mus musculus translin-associated factor X (Tsnax), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000075896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:125012997:125034192:1 gene:ENSMUSG00000056820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF187040 // GenBank // Mus musculus translin associated protein X (Trax) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC004611 // GenBank // Mus musculus translin-associated factor X, mRNA (cDNA clone MGC:7979 IMAGE:3585400), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// AK014437 // GenBank HTC // Mus musculus 18 days pregnant adult female placenta and extra embryonic tissue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:3830413C09 product:translin-associated factor X, full insert sequence. // chr8 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// AK164453 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D230036H03 product:translin-associated factor X, full insert sequence. // chr8 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// GENSCAN00000038418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:125013197:125032874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_028908 // RefSeq // Mus musculus microtubule-associated protein 10 (Map10), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053078 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:125669818:125673359:1 gene:ENSMUSG00000050930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:125669870:125672545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_145608 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC021891 (BC021891), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000034316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:125910450:125947439:1 gene:ENSMUSG00000031853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK220424 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1804 protein. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC021891 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC021891, mRNA (cDNA clone MGC:27778 IMAGE:3156324), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:125910677:125944983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 61 // 19 // 20 // 0
NM_008430 // RefSeq // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 1 (Kcnk1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000046765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:125995102:126030683:1 gene:ENSMUSG00000033998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF033017 // GenBank // Mus musculus TWIK-1 K+ channel mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AK005326 // GenBank HTC // Mus musculus adult male cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1500031M16 product:potassium channel, subfamily K, member 1, full insert sequence. // chr8 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// BC003729 // GenBank // Mus musculus potassium channel, subfamily K, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:5789 IMAGE:3592756), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:125987707:126121240:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_175434 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member F3 (Slc35f3), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006530807 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 35, member F3 (Slc35f3), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000108759 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:126298558:126395482:1 gene:ENSMUSG00000057060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// AK046359 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230375D17 product:weakly similar to BRAIN CDNA, CLONE MNCB-0335 [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// AK083105 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630014L24 product:weakly similar to BRAIN CDNA, CLONE MNCB-0335 [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC115859 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member F3, mRNA (cDNA clone MGC:141264 IMAGE:40057292), complete cds. // chr8 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC115965 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member F3, mRNA (cDNA clone MGC:141263 IMAGE:40057290), complete cds. // chr8 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530806 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 35, member F3 (Slc35f3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// GENSCAN00000017547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:126359385:126394667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0
NM_174987 // RefSeq // Mus musculus cytochrome c oxidase assembly factor 6 (Coa6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000059093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:126422501:126425434:1 gene:ENSMUSG00000051671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC024399 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810063B05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:36236 IMAGE:5026081), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC038634 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810063B05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:47940 IMAGE:1513986), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC046907 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810063B05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:56752 IMAGE:6394880), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:126422435:126425098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0
AK041328 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630001O12 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AK172442 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830207M14 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// XR_388212 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA A630001O12 gene (A630001O12Rik), misc_RNA. // chr8 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// KnowTID_00007157 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00007158 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// KnowTID_00007159 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT067787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT067790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000158085 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:127046912:127047082:1 gene:ENSMUSG00000088710 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT067799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_008737 // RefSeq // Mus musculus neuropilin 1 (Nrp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006530768 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuropilin 1 (Nrp1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000026917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:128359073:128505462:1 gene:ENSMUSG00000025810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AK082992 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530029I03 product:NEUROPILIN-1 PRECURSOR (VASCULAR ENDOTHELIAL CELL GROWTH FACTOR 165 RECEPTOR) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 95 // 59 // 19 // 20 // 0 /// BC060129 // GenBank // Mus musculus neuropilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:63314 IMAGE:6409596), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// D50086 // GenBank // Mus musculus mRNA for neuropilin, complete cds. // chr8 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// AK135428 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo female mullerian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6820419C11 product:neuropilin, full insert sequence. // chr8 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// AK164378 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130079D03 product:neuropilin, full insert sequence. // chr8 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000039898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:128415721:128502814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000039910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:128634003:128634891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0
ENSMUST00000101915 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:128650997:128651103:1 gene:ENSMUSG00000075864 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT067825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_010578 // RefSeq // Mus musculus integrin beta 1 (fibronectin receptor beta) (Itgb1), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000090006 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:128685654:128733200:1 gene:ENSMUSG00000025809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000124826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:128685757:128732617:1 gene:ENSMUSG00000025809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000149116 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:128724333:128732389:1 gene:ENSMUSG00000025809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// BC050906 // GenBank // Mus musculus integrin beta 1 (fibronectin receptor beta), mRNA (cDNA clone MGC:63216 IMAGE:5721348), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000039903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:128638715:128727057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0
NM_010568 // RefSeq // Mus musculus insulin receptor (Insr), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000091291 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:3150922:3279617:-1 gene:ENSMUSG00000005534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT064389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT064390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0
NM_010568 // RefSeq // Mus musculus insulin receptor (Insr), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000091291 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:3150922:3279617:-1 gene:ENSMUSG00000005534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// J05149 // GenBank // Mouse insulin receptor (IR) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 91 // 38 // 39 // 0 /// KC356871 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6J insulin receptor isoform B mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000031562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3155669:3260682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0
NM_026951 // RefSeq // Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 11 gamma (Pex11g), mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006508865 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 11 gamma (Pex11g), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// XM_006508866 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 11 gamma (Pex11g), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000004686 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:3457105:3467680:-1 gene:ENSMUSG00000069633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC062135 // GenBank // Mus musculus peroxisomal biogenesis factor 11 gamma, mRNA (cDNA clone MGC:69971 IMAGE:6510277), complete cds. // chr8 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000111081 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3457108:3467645:-1 gene:ENSMUSG00000069633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// ENSMUST00000118194 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:3463220:3467670:-1 gene:ENSMUSG00000069633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// AK165461 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F530008I07 product:peroxisomal biogenesis factor 11c, full insert sequence. // chr8 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000031569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3460308:3467631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0
NM_026156 // RefSeq // Mus musculus XPA binding protein 2 (Xab2), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006508864 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus XPA binding protein 2 (Xab2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000019614 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:3610087:3621316:-1 gene:ENSMUSG00000019470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000159235 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3615995:3621282:-1 gene:ENSMUSG00000019470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000159548 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:3614317:3621270:-1 gene:ENSMUSG00000019470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 31 // 11 // 12 // 0 /// ENSMUST00000159909 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3610090:3621302:-1 gene:ENSMUSG00000019470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000163038 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3608421:3621305:-1 gene:ENSMUSG00000019470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AK087952 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430001G13 product:ADAPTER PROTEIN ATH-55 homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC021341 // GenBank // Mus musculus XPA binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:29394 IMAGE:5066146), complete cds. // chr8 // 86 // 95 // 32 // 37 // 0 /// GENSCAN00000031564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3610158:3625520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0
ENSMUST00000058040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:3707064:3717553:-1 gene:ENSMUSG00000074491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000046787 // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000160527 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3707064:3717553:-1 gene:ENSMUSG00000074491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK016282 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930572L20 product:4930572L20RIK PROTEIN homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029465 // RefSeq // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member g (Clec4g), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000062037 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:3716064:3720651:-1 gene:ENSMUSG00000074491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000159612 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:3717214:3718653:-1 gene:ENSMUSG00000074491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC025069 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member g, mRNA (cDNA clone IMAGE:4196794), partial cds. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC087963 // GenBank // Mus musculus C-type lectin domain family 4, member g, mRNA (cDNA clone MGC:107678 IMAGE:6766377), complete cds. // chr8 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3716415:3720645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_133238 // RefSeq // Mus musculus CD209a antigen (Cd209a), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000012847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:3743395:3748984:-1 gene:ENSMUSG00000031494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF373408 // GenBank // Mus musculus DC-SIGN (Dcsign) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF374470 // GenBank // Mus musculus DC-SIGN neck-less isoform (Dcsign) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AY049062 // GenBank // Mus musculus dendritic cell C-type lectin protein CIRE mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC111095 // GenBank // Mus musculus CD209a antigen, mRNA (cDNA clone MGC:130443 IMAGE:40040036), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3744084:3768086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0
ENSMUST00000157400 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:3803069:3803358:-1 gene:ENSMUSG00000088025 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT064426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT064427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 29 // 100 // 9 // 31 // 0
ENSMUST00000098958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:3842096:3842395:-1 gene:ENSMUSG00000074485 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000031568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3841823:3954504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT064428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_130905 // RefSeq // Mus musculus CD209e antigen (Cd209e), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000033888 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:3847965:3854309:-1 gene:ENSMUSG00000040197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF373412 // GenBank // Mus musculus SIGNR4 (Signr4) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107188 // GenBank // Mus musculus CD209e antigen, mRNA (cDNA clone MGC:130079 IMAGE:40050810), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC107189 // GenBank // Mus musculus CD209e antigen, mRNA (cDNA clone MGC:130080 IMAGE:40050811), complete cds. // chr8 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3841823:3954504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_130904 // RefSeq // Mus musculus CD209d antigen (Cd209d), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000011445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:3871827:3878555:-1 gene:ENSMUSG00000031495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF373411 // GenBank // Mus musculus SIGNR3 (Signr3) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF440280 // GenBank // Mus musculus SIGNR3 (Signr3) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr8 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:3841823:3954504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_026956 // RefSeq // Mus musculus CD209f antigen (Cd209f), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000138439 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:4102794:4105764:-1 gene:ENSMUSG00000051906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000145007 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:putative chromosome:GRCm38:8:4102787:4105835:-1 gene:ENSMUSG00000051906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000156276 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:4102793:4105542:-1 gene:ENSMUSG00000051906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// AK007638 // GenBank HTC // Mus musculus 10 day old male pancreas cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1810029C22 product:weakly similar to DC-SIGN [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC021323 // GenBank // Mus musculus CD209f antigen, mRNA (cDNA clone IMAGE:5052112), partial cds. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC038121 // GenBank // Mus musculus CD209f antigen, mRNA (cDNA clone IMAGE:1383444), partial cds. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC046292 // GenBank // Mus musculus CD209f antigen, mRNA (cDNA clone IMAGE:6479106), partial cds. // chr8 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// BC052782 // GenBank // Mus musculus CD209f antigen, mRNA (cDNA clone IMAGE:3371321), partial cds. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSMUST00000148353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:4178118:4206287:-1 gene:ENSMUSG00000086805 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000177130 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:4162522:4206882:-1 gene:ENSMUSG00000086805 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK019856 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932443L11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT064433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_207203 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC068157 (BC068157), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006508909 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cDNA sequence BC068157 (BC068157), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000168386 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:4209543:4217312:-1 gene:ENSMUSG00000064125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000175906 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:4215972:4217152:-1 gene:ENSMUSG00000064125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 37 // 12 // 13 // 0 /// ENSMUST00000176227 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:4216408:4217459:-1 gene:ENSMUSG00000064125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000177491 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:4215049:4216912:-1 gene:ENSMUSG00000064125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 43 // 14 // 15 // 0 /// BC068157 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC068157, mRNA (cDNA clone MGC:92984 IMAGE:30363411), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:4210519:4220417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0
NM_183315 // RefSeq // Mus musculus cortexin 1 (Ctxn1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000053252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:4257648:4259274:-1 gene:ENSMUSG00000048644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC028881 // GenBank // Mus musculus cortexin 1, mRNA (cDNA clone MGC:25920 IMAGE:4224851), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_010485 // RefSeq // Mus musculus ELAV (embryonic lethal, abnormal vision)-like 1 (Hu antigen R) (Elavl1), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000098950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:4284782:4325100:-1 gene:ENSMUSG00000040028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AK078333 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6530401I16 product:ELAV-LIKE PROTEIN 1 (HU-ANTIGEN R) (HUR) (ELAV-LIKE GENERIC PROTEIN) (MELG) homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// U65735 // GenBank // Mus musculus elav G homolog (MelG) mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// BC016194 // GenBank HTC // Mus musculus ELAV (embryonic lethal, abnormal vision, Drosophila)-like 1 (Hu antigen R), mRNA (cDNA clone IMAGE:4487810). // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:4260136:4311746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
ENSMUST00000058918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:4677539:4678365:-1 gene:ENSMUSG00000048484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK076970 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930580J09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:4677564:4677989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011369 // RefSeq // Mus musculus Shc SH2-domain binding protein 1 (Shcbp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000022945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:4735980:4779534:-1 gene:ENSMUSG00000022322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF017152 // GenBank // Mus musculus Shc binding protein (mPAL) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK137496 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830115M12 product:Shc SH2-domain binding protein 1, full insert sequence. // chr8 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// BC070455 // GenBank // Mus musculus Shc SH2-domain binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:96393 IMAGE:30606785), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AK051205 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130016B22 product:Shc SH2-domain binding protein 1, full insert sequence. // chr8 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// AK052944 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D930001E18 product:Shc SH2-domain binding protein 1, full insert sequence. // chr8 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// AK135226 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo male wolffian duct includes surrounding region cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6720439B14 product:Shc SH2-domain binding protein 1, full insert sequence. // chr8 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000048736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:4736094:4779523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONMMUT064463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
XM_006544321 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 9457 (Gm9457), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000180176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:4812817:4813212:-1 gene:ENSMUSG00000095600 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000048748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:4812817:4842604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT064464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
ENSMUST00000180091 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:5069259:5069377:-1 gene:ENSMUSG00000096219 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_011388 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 10, member 2 (Slc10a2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000023835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:5085623:5105232:-1 gene:ENSMUSG00000023073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB002693 // GenBank // Mus musculus mRNA for ISBT, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY529655 // GenBank // Mus musculus strain SM/J solute carrier family 10, member 2 (Slc10a2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY529656 // GenBank // Mus musculus strain NZB/BlNJ solute carrier family 10, member 2 (Slc10a2) mRNA, complete cds. // chr8 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// BC120703 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 10, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:155940 IMAGE:40129626), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC125290 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 10, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:158993 IMAGE:40129805), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:5086156:5105183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000082573 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:5332995:5333113:-1 gene:ENSMUSG00000064507 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_010111 // RefSeq // Mus musculus ephrin B2 (Efnb2), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000001319 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:8617434:8660773:-1 gene:ENSMUSG00000001300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000152698 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:8620597:8639363:-1 gene:ENSMUSG00000001300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC057009 // GenBank // Mus musculus ephrin B2, mRNA (cDNA clone MGC:67047 IMAGE:6827408), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// CT010381 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836D0853D for gene Efnb2, RIKEN cDNA E230020D15 gene; complete cds, incl. stopcodon. // chr8 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// L38847 // GenBank // Mus musculus hepatoma transmembrane kinase ligand (HTK ligand) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// U16819 // GenBank // Mus musculus LERK-5 (Epl5) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// U30244 // GenBank // Mus musculus Eph family ligand ELF-2 precursor mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000055731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:8600001:8650774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
AK145733 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0035B17 product:hypothetical Glutamic acid-rich region profile/Arginine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// BC046971 // GenBank // Mus musculus arginine and glutamate rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:54831 IMAGE:6468505), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_176849 // RefSeq // Mus musculus arginine and glutamate rich 1 (Arglu1), mRNA. // chr8 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// ENSMUST00000048545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:8666577:8690537:-1 gene:ENSMUSG00000040459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000055705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:8667252:8690317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0
NM_173446 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 155, member A (Fam155a), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:9206001:9771018:-1 gene:ENSMUSG00000079157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC117535 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 155, member A, mRNA (cDNA clone MGC:144794 IMAGE:40106181), complete cds. // chr8 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// XM_006508808 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 155, member A (Fam155a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// AK162130 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420432E21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000047056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:9746431:9771777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONMMUT064526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
AK149049 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120479G11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK162130 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420432E21 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONMMUT064526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000047061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:9317740:9324838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSMUST00000082684 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:9568132:9568249:-1 gene:ENSMUSG00000064618 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONMMUT064536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XR_404695 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus uncharacterized LOC102634770 (LOC102634770), ncRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:9876548:9876897:-1 gene:ENSMUSG00000095279 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK147851 // GenBank HTC // Mus musculus melanocyte cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G270069C18 product:hypothetical Cysteine-rich region profile/Valine-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// KnowTID_00007174 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_176953 // RefSeq // Mus musculus ligase IV, DNA, ATP-dependent (Lig4), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:9970020:9976323:-1 gene:ENSMUSG00000049717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AK030029 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4932416F16 product:DNA LIGASE IV (EC 6.5.1.1) (POLYDEOXYRIBONUCLEOTIDE SYNTHASE [ATP]) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000170033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:9970877:9977686:-1 gene:ENSMUSG00000049717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000053280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:9971043:9973541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0
AK141839 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130016I19 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
ENSMUST00000179126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:10808730:10809170:-1 gene:ENSMUSG00000096258 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000053279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:10808730:10809224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_030715 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 3930402G23 gene (3930402G23Rik), long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040608 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:10924427:10928457:-1 gene:ENSMUSG00000038917 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001081212 // RefSeq // Mus musculus insulin receptor substrate 2 (Irs2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000040514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:10986980:11008458:-1 gene:ENSMUSG00000038894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC147580 // GenBank // Mus musculus insulin receptor substrate 2, mRNA (cDNA clone MGC:182676 IMAGE:9056570), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:11004456:11008430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009931 // RefSeq // Mus musculus collagen, type IV, alpha 1 (Col4a1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// XM_006508693 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus collagen, type IV, alpha 1 (Col4a1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000033898 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:11198423:11312826:-1 gene:ENSMUSG00000031502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// BC072650 // GenBank // Mus musculus collagen, type IV, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:91373 IMAGE:6852661), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// J04694 // GenBank // Mus musculus alpha-1 type IV collagen (Col4a-1) mRNA, complete cds. // chr8 // 98 // 100 // 50 // 51 // 0 /// GENSCAN00000007870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:11091018:11247677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 47 // 47 // 0
NM_011227 // RefSeq // Mus musculus RAB20, member RAS oncogene family (Rab20), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:11453392:11478638:-1 gene:ENSMUSG00000031504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB232614 // GenBank // Mus musculus Rab20 mRNA for Rab20, complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AK145566 // GenBank HTC // Mus musculus blastocyst blastocyst cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I1C0015N07 product:RAB20, member RAS oncogene family, full insert sequence. // chr8 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC051569 // GenBank HTC // Mus musculus RAB20, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:963255). // chr8 // 92 // 36 // 11 // 12 // 0 /// BC089570 // GenBank // Mus musculus RAB20, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:107554 IMAGE:6747570), complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000007885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:11453997:11478499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000033906 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:11654924:11678750:-1 gene:ENSMUSG00000031509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY026045 // GenBank // Mus musculus germ cell-specific unknown protein mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC048664 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58831 IMAGE:6773850), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000190741 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:11655479:11701063:-1 gene:ENSMUSG00000031509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000191350 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:11655480:11662604:-1 gene:ENSMUSG00000031509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000190787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:11655478:11660735:-1 gene:ENSMUSG00000031509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000007902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:11624655:11666232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSMUST00000180858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:12554270:12573320:-1 gene:ENSMUSG00000097421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK085316 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630011A20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NR_033546 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 15348 (Gm15348), long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000151188 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:12706944:12719127:-1 gene:ENSMUSG00000074469 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:12612297:12714011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
ENSMUST00000168498 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:13242510:13254071:-1 gene:ENSMUSG00000031448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000171619 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:13242642:13254096:-1 gene:ENSMUSG00000031448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// NM_172750 // RefSeq // Mus musculus ADP-ribosylhydrolase like 1 (Adprhl1), mRNA. // chr8 // 59 // 59 // 26 // 44 // 1 /// ENSMUST00000033825 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:13235655:13254162:-1 gene:ENSMUSG00000031448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 59 // 26 // 44 // 1 /// BC063759 // GenBank // Mus musculus ADP-ribosylhydrolase like 1, mRNA (cDNA clone MGC:70059 IMAGE:30134000), complete cds. // chr8 // 59 // 59 // 26 // 44 // 1 /// GENSCAN00000015477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13210950:13249454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0
AK087889 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330037G11 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009724 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+/K+ exchanging, beta polypeptide (Atp4b), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000033826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13386209:13396778:-1 gene:ENSMUSG00000031449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AK008686 // GenBank HTC // Mus musculus adult male stomach cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2210009G05 product:ATPase, H+/K+ transporting, beta polypeptide, gastric specific, full insert sequence. // chr8 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// BC120705 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+/K+ exchanging, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:155942 IMAGE:40129628), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC125292 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+/K+ exchanging, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:158995 IMAGE:40129807), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AK009832 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310045N19 product:ATPASE, H+/K+ TRANSPORTING, BETA POLYPEPTIDE, GASTRIC SPECIFIC, full insert sequence. // chr8 // 60 // 91 // 18 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13386626:13396753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_019521 // RefSeq // Mus musculus growth arrest specific 6 (Gas6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13465374:13494535:-1 gene:ENSMUSG00000031451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC005444 // GenBank // Mus musculus growth arrest specific 6, mRNA (cDNA clone MGC:6124 IMAGE:3592398), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13465746:13494339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001080781 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700029H14 gene (1700029H14Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_025601 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700029H14 gene (1700029H14Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:13551011:13562405:-1 gene:ENSMUSG00000031452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000134023 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:13550733:13562461:-1 gene:ENSMUSG00000031452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000151400 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:13551032:13562404:-1 gene:ENSMUSG00000031452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC049575 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700029H14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:58189 IMAGE:6773883), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006508849 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700029H14 gene (1700029H14Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// ENSMUST00000132787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:13555955:13562405:-1 gene:ENSMUSG00000031452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// ENSMUST00000187391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13550733:13562448:-1 gene:ENSMUSG00000031452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13497712:13562348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_009025 // RefSeq // Mus musculus RAS p21 protein activator 3 (Rasa3), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006508735 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAS p21 protein activator 3 (Rasa3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000117551 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:13566950:13677603:-1 gene:ENSMUSG00000031453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000137822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:13566950:13584038:-1 gene:ENSMUSG00000031453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AK075768 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700128M17 product:RAS p21 protein activator 3, full insert sequence. // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC057300 // GenBank // Mus musculus RAS p21 protein activator 3, mRNA (cDNA clone MGC:66498 IMAGE:6821254), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC068297 // GenBank // Mus musculus RAS p21 protein activator 3, mRNA (cDNA clone MGC:76415 IMAGE:30102545), complete cds. // chr8 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// U20238 // GenBank // Mus musculus GTPase-activating protein GAPIII mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13568691:13645335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000015464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13746003:13747480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0
NM_153093 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence AF366264 (AF366264), mRNA. // chr8 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000071308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13835233:13838089:-1 gene:ENSMUSG00000057116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000015469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13836581:13838059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// AF366264 // GenBank // Mus musculus SUMO-1-specific protease mRNA, complete cds. // chr8 // 60 // 91 // 6 // 10 // 0
NM_025556 // RefSeq // Mus musculus coordinator of PRMT5, differentiation stimulator (Coprs), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006508848 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coordinator of PRMT5, differentiation stimulator (Coprs), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000033839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:13884788:13890271:-1 gene:ENSMUSG00000031458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC029192 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410022L05 gene, mRNA (cDNA clone MGC:35741 IMAGE:2647299), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051120 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2410022L05 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5397157). // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000015461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:13885032:13887326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
NM_001034862 // RefSeq // Mus musculus glutamate rich 1 (Erich1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:14027565:14090327:-1 gene:ENSMUSG00000051978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:14016137:14082543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NR_037972 // RefSeq // Mus musculus expressed sequence BB014433 (BB014433), long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000050493 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:15041444:15046069:-1 gene:ENSMUSG00000049008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000123331 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:15042502:15046078:-1 gene:ENSMUSG00000049008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000179941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:15041535:15043077:-1 gene:ENSMUSG00000049008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC139040 // GenBank // Mus musculus expressed sequence BB014433, mRNA (cDNA clone MGC:170667 IMAGE:8862062), complete cds. // chr8 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:15041656:15046164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_007426 // RefSeq // Mus musculus angiopoietin 2 (Angpt2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033846 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:18690263:18741562:-1 gene:ENSMUSG00000031465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000170200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:18692087:18699547:-1 gene:ENSMUSG00000031465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AF004326 // GenBank // Mus musculus angiopoietin-2 mRNA, complete cds. // chr8 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// BC027216 // GenBank // Mus musculus angiopoietin 2, mRNA (cDNA clone MGC:25292 IMAGE:3494566), complete cds. // chr8 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// BC138309 // GenBank // Mus musculus angiopoietin 2, mRNA (cDNA clone MGC:169934 IMAGE:8861329), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC138313 // GenBank // Mus musculus angiopoietin 2, mRNA (cDNA clone MGC:169938 IMAGE:8861333), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:18692048:18719036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_183039 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 40 (Defb40), mRNA. // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000066258 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:18974940:18978256:-1 gene:ENSMUSG00000053678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ575426 // GenBank // Mus musculus mRNA for beta defensin 40 (Defb40 gene). // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:18929798:19064810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_181683 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 37 (Defb37), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066282 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:18986233:18991055:-1 gene:ENSMUSG00000053695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:18929798:19064810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_183036 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 38 (Defb38), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000066416 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19023407:19026566:-1 gene:ENSMUSG00000053790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AJ575424 // GenBank // Mus musculus mRNA for beta defensin 38 (Defb38 gene). // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC125388 // GenBank // Mus musculus defensin beta 38, mRNA (cDNA clone MGC:159091 IMAGE:40129903), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC125390 // GenBank // Mus musculus defensin beta 38, mRNA (cDNA clone MGC:159093 IMAGE:40129905), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:18929798:19064810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_183038 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 39 (Defb39), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000075504 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19052826:19064810:-1 gene:ENSMUSG00000061847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:18929798:19064810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_139224 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 35 (Defb35), mRNA. // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NM_152802 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 12 (Defb12), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000062113 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:19111931:19114839:-1 gene:ENSMUSG00000043787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21938352:21940878:1 gene:ENSMUSG00000058052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AB089182 // GenBank // Mus musculus mBD-12 mRNA for beta-defensin-12, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSMUST00000119160 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:19279009:19279846:-1 gene:ENSMUSG00000081901 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONMMUT064790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_153108 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 8 (Defb8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000033854 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:19445769:19447606:-1 gene:ENSMUSG00000031471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000032617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:19445860:19464093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1
NM_001039119 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 33 (Defb33), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000098908 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:20892669:20897723:1 gene:ENSMUSG00000074454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ012041 // GenBank // Mus musculus beta-defensin 33 (Defb33) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSMUST00000101848 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:21040256:21040360:-1 gene:ENSMUSG00000094406 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000101982 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:21548060:21548165:-1 gene:ENSMUSG00000075934 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101893 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:21176768:21176872:-1 gene:ENSMUSG00000095431 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// NONMMUT064836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONMMUT064859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0
ENSMUST00000101893 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:21176768:21176872:-1 gene:ENSMUSG00000095431 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONMMUT064841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSMUST00000101848 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:21040256:21040360:-1 gene:ENSMUSG00000094406 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101982 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:21548060:21548165:-1 gene:ENSMUSG00000075934 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000101893 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:21176768:21176872:-1 gene:ENSMUSG00000095431 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// NONMMUT064836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT064841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0
NM_001007582 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence AY761184 (AY761184), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000071886 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21702519:21703645:-1 gene:ENSMUSG00000058618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AY761184 // GenBank // Mus musculus CRS1C-3 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// EU760895 // GenBank // Mus musculus CRS1C-6 mRNA, partial cds. // chr8 // 82 // 61 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000002512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:21702600:21703602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 89 // 13 // 16 // 0
NM_139219 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 9 (Defb9), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000057076 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21881713:21885421:-1 gene:ENSMUSG00000047390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC109177 // GenBank // Mus musculus defensin beta 9, mRNA (cDNA clone MGC:129393 IMAGE:40049218), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0
NM_139221 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 11 (Defb11), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000051965 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21905376:21906412:-1 gene:ENSMUSG00000045337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC099849 // GenBank // Mus musculus defensin beta 11, mRNA (cDNA clone MGC:123365 IMAGE:40038952), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AK016897 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933424L15 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_139222 // RefSeq // Mus musculus defensin beta 15 (Defb15), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000062586 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21929799:21932710:-1 gene:ENSMUSG00000048500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AJ575428 // GenBank // Mus musculus mRNA for beta defensin 15 (Defb15 gene). // chr8 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0
NM_007511 // RefSeq // Mus musculus ATPase, Cu++ transporting, beta polypeptide (Atp7b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XR_378777 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ATPase, Cu++ transporting, beta polypeptide (Atp7b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr8 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000006742 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:21992785:22060305:-1 gene:ENSMUSG00000006567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000110738 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:21994651:22060019:-1 gene:ENSMUSG00000006567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000052993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:21994651:22039452:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// U38477 // GenBank // Mus musculus copper-transporting ATPase (ATP7B) mRNA, complete cds. // chr8 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0
NM_177898 // RefSeq // Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 5 (Nek5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006509152 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 5 (Nek5), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006509157 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 5 (Nek5), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000169834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22073616:22125053:-1 gene:ENSMUSG00000037738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AK165108 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female ovary cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E330012F19 product:Weakly similar to protein kinase nek1 homolog [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// BC053516 // GenBank // Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 5, mRNA (cDNA clone MGC:54821 IMAGE:6311513), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// AK054168 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days pregnant adult female oviduct cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E230024I12 product:Weakly similar to protein kinase nek1, full insert sequence. // chr8 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// GENSCAN00000053000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22073929:22185792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 22 // 39 // 1
NM_001162947 // RefSeq // Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 3 (Nek3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_011848 // RefSeq // Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 3 (Nek3), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_378785 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 3 (Nek3), transcript variant X2, misc_RNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033865 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:22128283:22166412:-1 gene:ENSMUSG00000031478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000110730 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:22128283:22166435:-1 gene:ENSMUSG00000031478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000178324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22128286:22162494:-1 gene:ENSMUSG00000031478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF093416 // GenBank // Mus musculus NIMA-related kinase NEK3 (Nek3) mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// AF099066 // GenBank // Mus musculus serine/threonine-protein kinase NEK3 (Nek3) mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC005411 // GenBank // Mus musculus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:5648 IMAGE:3590866), complete cds. // chr8 // 70 // 100 // 21 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22073929:22185792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001004140 // RefSeq // Mus musculus cytoskeleton associated protein 2 (Ckap2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006509226 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytoskeleton associated protein 2 (Ckap2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000046916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22168152:22185819:-1 gene:ENSMUSG00000037725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY692438 // GenBank // Mus musculus cytoskeleton associated protein 2 (Ckap2) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// BC145666 // GenBank // Mus musculus cytoskeleton associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:175553 IMAGE:40130969), complete cds. // chr8 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// BC146023 // GenBank // Mus musculus cytoskeleton associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:175910 IMAGE:40131326), complete cds. // chr8 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000053000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22073929:22185792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0
NM_181325 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier ornithine transporter), member 15 (Slc25a15), mRNA. // chr8 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// ENSMUST00000033871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22375554:22398621:-1 gene:ENSMUSG00000031482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// AF133914 // GenBank // Mus musculus ornithine transporter mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr8 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// BC061143 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier ornithine transporter), member 15, mRNA (cDNA clone MGC:74275 IMAGE:30276598), complete cds. // chr8 // 84 // 66 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22377857:22395767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 76 // 28 // 29 // 0
NM_001012667 // RefSeq // Mus musculus small integral membrane protein 19 (Smim19), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001146117 // RefSeq // Mus musculus small integral membrane protein 19 (Smim19), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000033935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22462615:22476879:-1 gene:ENSMUSG00000031534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000163774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22462615:22476879:-1 gene:ENSMUSG00000031534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC048089 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI316807, mRNA (cDNA clone MGC:57021 IMAGE:6466443), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22463311:22482209:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_011130 // RefSeq // Mus musculus polymerase (DNA directed), beta (Polb), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000033938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22628119:22653437:-1 gene:ENSMUSG00000031536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF513911 // GenBank // Mus musculus DNA polymerase beta (Polb) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC006681 // GenBank // Mus musculus polymerase (DNA directed), beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:3581916), complete cds. // chr8 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC060998 // GenBank // Mus musculus polymerase (DNA directed), beta, mRNA (cDNA clone MGC:74096 IMAGE:6774075), complete cds. // chr8 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// XR_378779 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (DNA directed), beta (Polb), transcript variant X6, misc_RNA. // chr8 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// XM_006509028 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (DNA directed), beta (Polb), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// XM_006509029 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus polymerase (DNA directed), beta (Polb), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000052985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22628275:22653374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001122820 // RefSeq // Mus musculus adaptor-related protein complex 3, mu 2 subunit (Ap3m2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_029505 // RefSeq // Mus musculus adaptor-related protein complex 3, mu 2 subunit (Ap3m2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000163739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:22787354:22805654:-1 gene:ENSMUSG00000031539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY039763 // GenBank // Mus musculus adaptor-related protein complex AP-3 mu2 subunit (Ap3m2) mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 97 // 26 // 29 // 0 /// BC027301 // GenBank // Mus musculus adaptor-related protein complex 3, mu 2 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:28134 IMAGE:3981102), complete cds. // chr8 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// BC030484 // GenBank // Mus musculus adaptor-related protein complex 3, mu 2 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:40858 IMAGE:5369288), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK080668 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830050D12 product:adaptor-related protein complex 3, mu 2 subunit, full insert sequence. // chr8 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// AK017991 // GenBank HTC // Mus musculus adult male thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5830445E16 product:adaptor-related protein complex 3, mu 2 subunit, full insert sequence. // chr8 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000052991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:22789353:22828270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NR_037293 // RefSeq // Mus musculus microRNA 3107 (Mir3107), microRNA. // chr8 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0 /// mmu-mir-3107 // miRBase Micro RNA Database // MI0014103 Mus musculus miR-3107 stem-loop // chr8 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0 /// NONMMUT064922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT064924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0
NM_018743 // RefSeq // Mus musculus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 6 (lysophosphatidic acid acyltransferase, zeta) (Agpat6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000167004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:23172946:23208453:-1 gene:ENSMUSG00000031545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF015811 // GenBank // Mus musculus putative lysophosphatidic acid acyltransferase mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 61 // 18 // 20 // 0 /// AF406611 // GenBank // Mus musculus putative lysophosphatidic acid acyltransferase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK049675 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal cord cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C530022I01 product:putative lysophosphatidic acid acyltransferase, full insert sequence. // chr8 // 94 // 55 // 17 // 18 // 0 /// AY489184 // GenBank // Mus musculus testis spermatogenesis apoptosis-related protein 7 (Tsarg7) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// BC031767 // GenBank // Mus musculus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 6 (lysophosphatidic acid acyltransferase, zeta), mRNA (cDNA clone MGC:28958 IMAGE:4457846), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC057860 // GenBank // Mus musculus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 6 (lysophosphatidic acid acyltransferase, zeta), mRNA (cDNA clone IMAGE:5315471), partial cds. // chr8 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:23174552:23237075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_024240 // RefSeq // Mus musculus GINS complex subunit 4 (Sld5 homolog) (Gins4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:23226610:23237668:-1 gene:ENSMUSG00000031546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC002156 // GenBank // Mus musculus GINS complex subunit 4 (Sld5 homolog), mRNA (cDNA clone MGC:7298 IMAGE:3485425), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AK016667 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933405K01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 65 // 85 // 15 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:23174552:23237075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_026931 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1810011O10 gene (1810011O10Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000052622 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:24437180:24438984:-1 gene:ENSMUSG00000056313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC016562 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810011O10 gene, mRNA (cDNA clone MGC:29008 IMAGE:3154083), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_145949 // RefSeq // Mus musculus indoleamine 2,3-dioxygenase 2 (Ido2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006509046 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus indoleamine 2,3-dioxygenase 2 (Ido2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000121992 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:24532454:24576333:-1 gene:ENSMUSG00000031549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000138335 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:24533456:24540796:-1 gene:ENSMUSG00000031549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000140417 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:24531894:24554597:-1 gene:ENSMUSG00000031549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC026393 // GenBank // Mus musculus indoleamine 2,3-dioxygenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:31194 IMAGE:4195134), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EF137182 // GenBank // Mus musculus indoleamine 2,3-dioxygenase-like protein (C230043N17) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EU440733 // GenBank // Mus musculus truncated indoleamine 2,3-dioxygenase-2 mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr8 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_001293690 // RefSeq // Mus musculus indoleamine 2,3-dioxygenase 1 (Ido1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_008324 // RefSeq // Mus musculus indoleamine 2,3-dioxygenase 1 (Ido1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033956 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:24584136:24597009:-1 gene:ENSMUSG00000031551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000110667 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:24584136:24595666:-1 gene:ENSMUSG00000031551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC049931 // GenBank // Mus musculus indoleamine 2,3-dioxygenase 1, mRNA (cDNA clone MGC:54705 IMAGE:5387937), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// M69109 // GenBank // Mouse indoleamine 2,3-dioxygenase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:24584402:24596939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0
NM_010084 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 18 (Adam18), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000033957 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:24602246:24674755:-1 gene:ENSMUSG00000031552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000173833 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:24602246:24674755:-1 gene:ENSMUSG00000031552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AF167405 // GenBank // Mus musculus ADAM 27 (Adam-27) mRNA, complete cds. // chr8 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// BC051136 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 18, mRNA (cDNA clone MGC:58285 IMAGE:6708158), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC145751 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 18, mRNA (cDNA clone MGC:175638 IMAGE:40131054), complete cds. // chr8 // 86 // 97 // 30 // 35 // 0 /// GENSCAN00000055596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:24609056:24831433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_009619 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 3 (cyritestin) (Adam3), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:24677232:24725852:-1 gene:ENSMUSG00000031553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000166986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:24715043:24725825:-1 gene:ENSMUSG00000031553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000170318 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:24677301:24725798:-1 gene:ENSMUSG00000031553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000171438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:24680718:24725788:-1 gene:ENSMUSG00000031553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000171611 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:24707247:24725788:-1 gene:ENSMUSG00000031553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC060975 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 3 (cyritestin), mRNA (cDNA clone IMAGE:6707349), complete cds. // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000055596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:24609056:24831433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT064955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_001272057 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 5 (Adam5), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// NM_001272058 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 5 (Adam5), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// NM_001272059 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 5 (Adam5), transcript variant 4, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// NM_007401 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 5 (Adam5), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000050300 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:24727093:24824059:-1 gene:ENSMUSG00000031554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000118419 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:24732985:24824369:-1 gene:ENSMUSG00000031554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000132180 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:24727093:24815473:-1 gene:ENSMUSG00000031554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0 /// BC094237 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 5, mRNA (cDNA clone MGC:106497 IMAGE:30604517), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// U22059 // GenBank // Mus musculus ADAM 5 protein precursor (ADAM 5) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 88 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000055596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:24609056:24831433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 73 // 73 // 30 // 41 // 1
NM_001270996 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 9 (meltrin gamma) (Adam9), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// U41765 // GenBank // Mus musculus metalloprotease/disintegrin/cysteine rich protein precursor (MDC9) cDNA, complete cds. // chr8 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0 /// NM_007404 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 9 (meltrin gamma) (Adam9), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 98 // 98 // 45 // 46 // 1 /// ENSMUST00000084032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:24949653:25016812:-1 gene:ENSMUSG00000031555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 96 // 44 // 46 // 1 /// ENSMUST00000084035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:24949611:25016922:-1 gene:ENSMUSG00000031555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 98 // 98 // 45 // 46 // 1 /// BC047156 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 9 (meltrin gamma), mRNA (cDNA clone MGC:54699 IMAGE:6488707), complete cds. // chr8 // 93 // 93 // 43 // 46 // 1 /// GENSCAN00000034338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:24950967:24996768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0
NM_001081187 // RefSeq // Mus musculus HtrA serine peptidase 4 (Htra4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000084031 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:25025451:25038962:-1 gene:ENSMUSG00000037406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000176814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:25029654:25037330:-1 gene:ENSMUSG00000037406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// BC132380 // GenBank // Mus musculus HtrA serine peptidase 4, mRNA (cDNA clone MGC:164011 IMAGE:40130657), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC145842 // GenBank // Mus musculus HtrA serine peptidase 4, mRNA (cDNA clone MGC:175729 IMAGE:40131145), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:25025569:25038874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_173012 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 2 (Letm2), mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000079160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:25578492:25597487:-1 gene:ENSMUSG00000037363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// AK034050 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330151K04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// AK050943 // GenBank HTC // Mus musculus 9 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D030041N04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 51 // 21 // 21 // 0 /// AK163507 // GenBank HTC // Mus musculus adult male corpora quadrigemina cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B230315H08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 96 // 63 // 25 // 26 // 0 /// BC055685 // GenBank // Mus musculus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:66524 IMAGE:6403034), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// XM_006509123 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 2 (Letm2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 76 // 76 // 31 // 41 // 1 /// AK031563 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6030453H13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 56 // 56 // 23 // 41 // 1 /// XM_006509132 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 2 (Letm2), transcript variant X10, mRNA. // chr8 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1 /// GENSCAN00000034341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:25579549:25604973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1
NM_028102 // RefSeq // Mus musculus DDHD domain containing 2 (Ddhd2), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XR_378791 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DDHD domain containing 2 (Ddhd2), transcript variant X7, misc_RNA. // chr8 // 96 // 71 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:25725324:25754280:-1 gene:ENSMUSG00000061313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AK079311 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630007F03 product:weakly similar to CDNA FLJ13156 FIS, CLONE NT2RP3003490, WEAKLY SIMILAR TO HOMO SAPIENS PUTATIVE PHOSPHOLIPASE (UNKNOWN) (PROTEIN FOR MGC:16854) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// AK173010 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0725 protein. // chr8 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// BC118962 // GenBank // Mus musculus DDHD domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:143924 IMAGE:40095026), complete cds. // chr8 // 94 // 84 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:25732959:25754250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0
NM_026121 // RefSeq // Mus musculus BCL2-associated athanogene 4 (Bag4), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:25764538:25785209:-1 gene:ENSMUSG00000037316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF332863 // GenBank // Mus musculus silencer of death domain (SODD) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC058518 // GenBank // Mus musculus BCL2-associated athanogene 4, mRNA (cDNA clone MGC:66831 IMAGE:5717401), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC138201 // GenBank // Mus musculus BCL2-associated athanogene 4, mRNA (cDNA clone MGC:169825 IMAGE:8861220), complete cds. // chr8 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC145986 // GenBank // Mus musculus BCL2-associated athanogene 4, mRNA (cDNA clone MGC:175873 IMAGE:40131289), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:25767924:25789266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_029884 // RefSeq // Mus musculus heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase (Hgsnat), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSMUST00000037609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:25944459:25976744:-1 gene:ENSMUSG00000037260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC024084 // GenBank // Mus musculus heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:37875 IMAGE:5101064), complete cds. // chr8 // 92 // 97 // 35 // 38 // 0 /// GENSCAN00000037706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:25945134:25976615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0
NM_029037 // RefSeq // Mus musculus protein-O-mannose kinase (Pomk), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000061850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:25980604:25994121:-1 gene:ENSMUSG00000037251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC027296 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930444A02 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28309 IMAGE:4013355), complete cds. // chr8 // 60 // 80 // 12 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:25982874:26015580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_008033 // RefSeq // Mus musculus farnesyltransferase, CAAX box, alpha (Fnta), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000016138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:25998729:26015601:-1 gene:ENSMUSG00000015994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC012711 // GenBank // Mus musculus farnesyltransferase, CAAX box, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:14009 IMAGE:4019240), complete cds. // chr8 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// D49744 // GenBank // Mus musculus mRNA for farnesyltransferase alpha subunit, complete cds. // chr8 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:25982874:26015580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_207659 // RefSeq // Mus musculus hook homolog 3 (Drosophila) (Hook3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006509149 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hook homolog 3 (Drosophila) (Hook3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// XM_006509151 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus hook homolog 3 (Drosophila) (Hook3), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000037182 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:26021421:26119224:-1 gene:ENSMUSG00000037234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000147613 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:26038080:26070275:-1 gene:ENSMUSG00000037234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// AY223806 // GenBank // Mus musculus microtubule binding protein hook3 mRNA, complete cds. // chr8 // 98 // 91 // 41 // 42 // 0 /// BC090960 // GenBank // Mus musculus hook homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:106413 IMAGE:30651062), complete cds. // chr8 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000037724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:26028876:26042633:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000037716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:26048435:26119014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1
ENSMUST00000163731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27042382:27042997:-1 gene:ENSMUSG00000091154 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000178990 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:27042377:27043042:-1 gene:ENSMUSG00000091154 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK006309 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700024N20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT065055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_025686 // RefSeq // Mus musculus BRF2, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor, BRF1-like (Brf2), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509181 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus BRF2, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor, BRF1-like (Brf2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000033877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27123832:27128632:-1 gene:ENSMUSG00000031487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC021918 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:4485748, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC098232 // GenBank // Mus musculus BRF2, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor, BRF1-like, mRNA (cDNA clone MGC:106911 IMAGE:2938123), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AK012459 // GenBank HTC // Mus musculus 11 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2700059M06 product:BRF2, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor, BRF1-like, full insert sequence. // chr8 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000025945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:27123894:27174585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_001080813 // RefSeq // Mus musculus RAB11 family interacting protein 1 (class I) (Rab11fip1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000054212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27138773:27174646:-1 gene:ENSMUSG00000031488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_029423 // RefSeq // Mus musculus RAB11 family interacting protein 1 (class I) (Rab11fip1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSMUST00000033878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27138773:27174646:-1 gene:ENSMUSG00000031488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// BC125400 // GenBank // Mus musculus RAB11 family interacting protein 1 (class I), mRNA (cDNA clone MGC:159103 IMAGE:40129915), complete cds. // chr8 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// BC132094 // GenBank // Mus musculus RAB11 family interacting protein 1 (class I), mRNA (cDNA clone MGC:163725 IMAGE:40130371), complete cds. // chr8 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000025945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:27123894:27174585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_029674 // RefSeq // Mus musculus glutamic-oxaloacetic transaminase 1-like 1 (Got1l1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006509211 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glutamic-oxaloacetic transaminase 1-like 1 (Got1l1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000038174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27197460:27202547:-1 gene:ENSMUSG00000039720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK006984 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700083M11 product:hypothetical PLP-dependent transferases structure containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC052754 // GenBank // Mus musculus glutamic-oxaloacetic transaminase 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:58486 IMAGE:6533656), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:27188336:27215029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_013462 // RefSeq // Mus musculus adrenergic receptor, beta 3 (Adrb3), mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000081438 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:27225776:27229588:-1 gene:ENSMUSG00000031489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000117565 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:27226799:27228494:-1 gene:ENSMUSG00000031489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000121838 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:27226001:27228583:-1 gene:ENSMUSG00000031489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// AF193027 // GenBank // Mus musculus beta-3b adrenergic receptor splice variant (B3bar) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// BC132000 // GenBank // Mus musculus adrenergic receptor, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:163631 IMAGE:40130277), complete cds. // chr8 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0
NM_021369 // RefSeq // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 6 (Chrna6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:27403214:27413944:-1 gene:ENSMUSG00000031491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY574265 // GenBank // Mus musculus neuronal nicotinic acetylcholine receptor alpha6 subunit mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC031985 // GenBank // Mus musculus cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 6, mRNA (cDNA clone MGC:25239 IMAGE:4501558), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:27404031:27422228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000083433 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:27421324:27421430:-1 gene:ENSMUSG00000065367 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000082948 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:27761009:27761111:-1 gene:ENSMUSG00000064882 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT065074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NR_033590 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 8096 (Gm8096), non-coding RNA. // chr8 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// AK015074 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930404C15 product:3-phosphoglycerate dehydrogenase, full insert sequence. // chr8 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// GENSCAN00000049540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:27945638:28084842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_153135 // RefSeq // Mus musculus unc-5 homolog D (C. elegans) (Unc5d), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000168630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:28646717:29219338:-1 gene:ENSMUSG00000063626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_153135 // RefSeq // Mus musculus unc-5 homolog D (C. elegans) (Unc5d), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000168630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:28646717:29219338:-1 gene:ENSMUSG00000063626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC137615 // GenBank // Mus musculus unc-5 homolog D (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:169239 IMAGE:8860634), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC144783 // GenBank // Mus musculus unc-5 homolog D (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:178339 IMAGE:9053331), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC144784 // GenBank // Mus musculus unc-5 homolog D (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:178340 IMAGE:9053332), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC145695 // GenBank // Mus musculus unc-5 homolog D (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:175582 IMAGE:40130998), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// FJ824810 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 unc-5-like protein D (Unc5d) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000049545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:28664022:28731705:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
AK035883 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630013P03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_010948 // RefSeq // Mus musculus nuclear distribution gene C homolog (Aspergillus) (Nudc), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030665 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:4:133532542:133545996:-1 gene:ENSMUSG00000028851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC011253 // GenBank // Mus musculus nuclear distribution gene C homolog (Aspergillus), mRNA (cDNA clone MGC:19328 IMAGE:4207838), complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSMUST00000148612 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:4:133534228:133535927:-1 gene:ENSMUSG00000028851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000045475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:29286428:29292813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:4:133532748:133545885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_026453 // RefSeq // Mus musculus MAK16 homolog (S. cerevisiae) (Mak16), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:31159468:31168724:-1 gene:ENSMUSG00000031578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK015369 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930443E11 product:RNA BINDING PROTEIN homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC013079 // GenBank // Mus musculus MAK16 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:6379 IMAGE:3499754), complete cds. // chr8 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:31160389:31166932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENSMUST00000122575 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:31661331:31661431:-1 gene:ENSMUSG00000084524 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000178878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:31737054:31739763:-1 gene:ENSMUSG00000093862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:31725814:31749738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_006509070 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuregulin 1 (Nrg1), transcript variant X12, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006509075 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuregulin 1 (Nrg1), transcript variant X17, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006509087 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuregulin 1 (Nrg1), transcript variant X29, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:32881618:32884254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_178648 // RefSeq // Mus musculus UBX domain protein 8 (Ubxn8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000095349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:33619586:33641976:-1 gene:ENSMUSG00000052906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK016964 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933428E22 product:DNA segment, Human S2298E, full insert sequence. // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AK161397 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930542I22 product:Reproduction 8 (DNA segment, human S2298E), full insert sequence. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC024492 // GenBank // Mus musculus UBX domain protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:37419 IMAGE:4981720), complete cds. // chr8 // 84 // 93 // 21 // 25 // 0 /// D88447 // GenBank // Mus musculus Rep-8 mRNA for reproduction 8, complete cds. // chr8 // 83 // 89 // 20 // 24 // 0 /// XM_006508980 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UBX domain protein 8 (Ubxn8), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000050340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:33621530:33641937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
XR_140879 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700104B16 gene (1700104B16Rik), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079376 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:33730534:33731814:-1 gene:ENSMUSG00000049476 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK018937 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700104B16 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_404833 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700104B16 gene (1700104B16Rik), transcript variant X1, misc_RNA. // chr8 // 74 // 92 // 17 // 23 // 0 /// XR_404835 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700104B16 gene (1700104B16Rik), transcript variant X3, misc_RNA. // chr8 // 74 // 92 // 17 // 23 // 0 /// ENSMUST00000187948 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:33730534:33731819:-1 gene:ENSMUSG00000049476 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026609 // RefSeq // Mus musculus leptin receptor overlapping transcript-like 1 (Leprotl1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000033910 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:34135572:34147033:-1 gene:ENSMUSG00000031513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC004677 // GenBank // Mus musculus leptin receptor overlapping transcript-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:7819 IMAGE:3500223), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:34137722:34146651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000180253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:34307301:34307687:-1 gene:ENSMUSG00000095202 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:34306768:34307687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000182326 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:34321853:34322824:-1 gene:ENSMUSG00000098046 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:34321816:34326045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 77 // 16 // 17 // 0
NM_175091 // RefSeq // Mus musculus tankyrase, TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose polymerase (Tnks), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000033929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:34829179:34965690:-1 gene:ENSMUSG00000031529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AK048860 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230076L23 product:tankyrase, TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose polymerase, full insert sequence. // chr8 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC057370 // GenBank // Mus musculus tankyrase, TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose polymerase, mRNA (cDNA clone MGC:67299 IMAGE:6835784), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:34839911:34875332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_173368 // RefSeq // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 6 (Chd6), mRNA. // chr8 // 38 // 100 // 8 // 21 // 0 /// ENSMUST00000039782 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:160946978:161109022:-1 gene:ENSMUSG00000057133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 43 // 100 // 9 // 21 // 0 /// ENSMUST00000125179 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:161035031:161109004:-1 gene:ENSMUSG00000057133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 43 // 100 // 9 // 21 // 0 /// ENSMUST00000134178 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:160983184:161109022:-1 gene:ENSMUSG00000057133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 43 // 100 // 9 // 21 // 0 /// ENSMUST00000138078 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:161008034:161109075:-1 gene:ENSMUSG00000057133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 43 // 100 // 9 // 21 // 0 /// AK080892 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430201L14 product:DJ661I20.2 (NOVEL HELICASE C-TERMINAL DOMAIN AND SNF2 N-TERMINAL DOMAINS CONTAINING PROTEIN) (FRAGMENT) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 43 // 100 // 9 // 21 // 0 /// AK122496 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1335 protein. // chr8 // 43 // 100 // 9 // 21 // 0 /// BC150806 // GenBank // Mus musculus chromodomain helicase DNA binding protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:183717 IMAGE:9087717), complete cds. // chr8 // 43 // 100 // 9 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:35052129:35053377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1
ENSMUST00000180440 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:35132995:35133532:-1 gene:ENSMUSG00000097106 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:35119173:35150307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0
NM_026067 // RefSeq // Mus musculus exoribonuclease 1 (Eri1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:35465265:35495533:-1 gene:ENSMUSG00000031527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC046412 // GenBank // Mus musculus exoribonuclease 1, mRNA (cDNA clone MGC:51356 IMAGE:5354985), complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:35452361:35495367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_027998 // RefSeq // Mus musculus claudin 23 (Cldn23), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000060128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:35824709:35826559:-1 gene:ENSMUSG00000055976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019534 // GenBank // Mus musculus claudin 23, mRNA (cDNA clone MGC:28564 IMAGE:4207924), complete cds. // chr8 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// BC085262 // GenBank // Mus musculus claudin 23, mRNA (cDNA clone MGC:102346 IMAGE:6396088), complete cds. // chr8 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:35825442:35826332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001081150 // RefSeq // Mus musculus LON peptidase N-terminal domain and ring finger 1 (Lonrf1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000065297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:36216064:36249516:-1 gene:ENSMUSG00000039633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000013164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:36218550:36249365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
ENSMUST00000183049 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:36372599:36373642:-1 gene:ENSMUSG00000098154 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000013160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:36357741:36373633:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
AK133068 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930566A13 product:weakly similar to Hypothetical homeodomain-like structure containing protein [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// KnowTID_00007228 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONMMUT065307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000083343 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:37317477:37317578:-1 gene:ENSMUSG00000065277 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONMMUT065312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_145841 // RefSeq // Mus musculus sarcoglycan zeta (Sgcz), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000118896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:37522554:38661508:-1 gene:ENSMUSG00000039539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000135764 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:37522298:38661508:-1 gene:ENSMUSG00000039539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AK041231 // GenBank HTC // Mus musculus adult male aorta and vein cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A530093F04 product:weakly similar to ZETA-SARCOGLYCAN [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AY095374 // GenBank // Mus musculus zeta-sarcoglycan mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// AY250713 // GenBank // Mus musculus zeta-sarcoglycan mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC104048 // GenBank // Mus musculus sarcoglycan zeta, mRNA (cDNA clone MGC:123465 IMAGE:40040143), complete cds. // chr8 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC104049 // GenBank // Mus musculus sarcoglycan zeta, mRNA (cDNA clone MGC:123466 IMAGE:40040144), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:37521692:37539716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT065314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NR_029884 // RefSeq // Mus musculus microRNA 383 (Mir383), microRNA. // chr8 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000083523 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:38252131:38252204:-1 gene:ENSMUSG00000065457 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-383 // miRBase Micro RNA Database // MI0000800 Mus musculus miR-383 stem-loop // chr8 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// NONMMUT065320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0
NM_001113326 // RefSeq // Mus musculus macrophage scavenger receptor 1 (Msr1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NM_031195 // RefSeq // Mus musculus macrophage scavenger receptor 1 (Msr1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509311 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus macrophage scavenger receptor 1 (Msr1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000026021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:39581700:39642678:-1 gene:ENSMUSG00000025044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000170091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:39603452:39642678:-1 gene:ENSMUSG00000025044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AF203781 // GenBank // Mus musculus scavenger receptor type A SR-A mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 62 // 19 // 21 // 0 /// BC003814 // GenBank // Mus musculus macrophage scavenger receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:6140 IMAGE:3594142), complete cds. // chr8 // 84 // 74 // 21 // 25 // 0 /// L04274 // GenBank // Mus musculus macrophage scavenger receptor type I mRNA, complete cds. // chr8 // 86 // 62 // 18 // 21 // 0 /// L04275 // GenBank // Mus musculus macrophage scavenger receptor type II mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 71 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:39587385:39632825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0
GENSCAN00000028626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:39719689:39720755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
AK133033 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930557G05 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// KnowTID_00007229 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT065351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_030610 // RefSeq // Mus musculus fibroblast growth factor 20 (Fgf20), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000034014 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:40279166:40286953:-1 gene:ENSMUSG00000031603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB049218 // GenBank // Mus musculus Fgf20 mRNA for fibroblast growth factor 20, complete cds. // chr8 // 92 // 76 // 23 // 25 // 0 /// BC125509 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor 20, mRNA (cDNA clone MGC:159212 IMAGE:40130024), complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC132472 // GenBank // Mus musculus fibroblast growth factor 20, mRNA (cDNA clone MGC:164103 IMAGE:40130749), complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000118639 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:40279725:40308331:-1 gene:ENSMUSG00000031603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
GENSCAN00000009706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:40712681:40713287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
AK087324 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030045A09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_145594 // RefSeq // Mus musculus fibrinogen-like protein 1 (Fgl1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034003 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:41191434:41215156:-1 gene:ENSMUSG00000031594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF478470 // GenBank // Mus musculus MFIRE1 (Mfire1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC021946 // GenBank // Mus musculus fibrinogen-like protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:37822 IMAGE:5098805), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC029734 // GenBank // Mus musculus fibrinogen-like protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:25810 IMAGE:4158843), complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSMUST00000134510 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:41197576:41215153:-1 gene:ENSMUSG00000031594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// AK083397 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920030L09 product:hypothetical Fibrinogen beta and gamma chains C-terminal globular domain containing protein, full insert sequence. // chr8 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000031963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:41198207:41209901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_019734 // RefSeq // Mus musculus N-acylsphingosine amidohydrolase 1 (Asah1), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034000 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:41340197:41374773:-1 gene:ENSMUSG00000031591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000110417 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:41346180:41374635:-1 gene:ENSMUSG00000031591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000126561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:41340661:41350037:-1 gene:ENSMUSG00000031591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AF157500 // GenBank // Mus musculus acid ceramidase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF352179 // GenBank // Mus musculus acid ceramidase (Asah1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC003204 // GenBank // Mus musculus N-acylsphingosine amidohydrolase 1, mRNA (cDNA clone MGC:6722 IMAGE:3587042), complete cds. // chr8 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// BC027132 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:5360728, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr8 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000031968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:41337734:41351594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_013522 // RefSeq // Mus musculus FSHD region gene 1 (Frg1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000033999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:41397457:41417118:-1 gene:ENSMUSG00000031590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC002027 // GenBank // Mus musculus FSHD region gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:5909 IMAGE:3487998), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// U62105 // GenBank // Mus musculus Frg1 (Frg1) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:41399402:41429022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
ENSMUST00000107130 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:42081460:42083109:-1 gene:ENSMUSG00000095057 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// AF358728 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 353 (Zfp353) mRNA, complete cds. // chr8 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:42081460:42083109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
NM_177742 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif family-like 1 (Triml1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006509416 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif family-like 1 (Triml1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000059692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:43129807:43141486:-1 gene:ENSMUSG00000031651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC141202 // GenBank // Mus musculus tripartite motif family-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:176163 IMAGE:9055814), complete cds. // chr8 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// BC145531 // GenBank // Mus musculus tripartite motif family-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:179102 IMAGE:9054094), complete cds. // chr8 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// XM_006509424 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tripartite motif family-like 1 (Triml1), transcript variant X10, mRNA. // chr8 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// BC050188 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC050188, mRNA (cDNA clone IMAGE:30009493), partial cds. // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000039517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:43130150:43141374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
KnowTID_00007233 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00007234 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT065416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AY512919 // GenBank HTC // Mus musculus clone NIA:C0333F07 unknown mRNA. // chr8 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0
NM_009556 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 42 (Zfp42), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000082120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:43295068:43307009:-1 gene:ENSMUSG00000051176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC053399 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 42, mRNA (cDNA clone MGC:60544 IMAGE:30031349), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC098467 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 42, mRNA (cDNA clone MGC:107378 IMAGE:30008039), complete cds. // chr8 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// M28382 // GenBank // Mouse REX-1 mRNA, complete cds. // chr8 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0
FJ654110 // GenBank // Mus musculus strain ICR clone LI-C1(48H)-2 endogenous retrovirus U3 region, partial sequence. // chr8 // 60 // 100 // 9 // 15 // 0
NM_001009547 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 26B (Adam26b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000080135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:43519864:43528137:-1 gene:ENSMUSG00000063900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000039501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:43516700:43570424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_010085 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 26A (testase 3) (Adam26a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000049577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:43568278:43576707:-1 gene:ENSMUSG00000048516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF167404 // GenBank // Mus musculus testase 3 (Adam-26) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:43516700:43570424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0
NM_001025240 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 5346 (Gm5346), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000056023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:43624951:43627270:-1 gene:ENSMUSG00000050190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000039503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:43624975:43627122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_145745 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 34 (Adam34), mRNA. // chr8 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSMUST00000110411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:43650435:43699487:-1 gene:ENSMUSG00000079058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// AF373288 // GenBank // Mus musculus testase 4 mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC132102 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 34, mRNA (cDNA clone MGC:163733 IMAGE:40130379), complete cds. // chr8 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC132292 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 34, mRNA (cDNA clone MGC:163923 IMAGE:40130569), complete cds. // chr8 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC141203 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 34, mRNA (cDNA clone MGC:176164 IMAGE:9055815), complete cds. // chr8 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC141204 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 34, mRNA (cDNA clone MGC:176165 IMAGE:9055816), complete cds. // chr8 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0
AK079043 // GenBank HTC // Mus musculus adult male epididymis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9230119M08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// KnowTID_00007236 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_033588 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence AY512931 (AY512931), long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139751 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:45060702:45065418:-1 gene:ENSMUSG00000066158 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000166107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:45062067:45062453:-1 gene:ENSMUSG00000066158 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT065430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT065431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_028066 // RefSeq // Mus musculus coagulation factor XI (F11), mRNA. // chr8 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:45241170:45262031:-1 gene:ENSMUSG00000031645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// AF356627 // GenBank // Mus musculus coagulation factor XI mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 79 // 27 // 30 // 0 /// BC019485 // GenBank // Mus musculus coagulation factor XI, mRNA (cDNA clone MGC:28539 IMAGE:4194672), complete cds. // chr8 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:45241448:45252724:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 34 // 13 // 13 // 0
NM_008455 // RefSeq // Mus musculus kallikrein B, plasma 1 (Klkb1), mRNA. // chr8 // 100 // 45 // 30 // 30 // 0 /// NM_133969 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily v, polypeptide 3 (Cyp4v3), mRNA. // chr8 // 100 // 53 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000026907 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:45269671:45308466:-1 gene:ENSMUSG00000079057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 53 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000095328 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:45304946:45333216:-1 gene:ENSMUSG00000079057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 53 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000116473 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:45269442:45294859:-1 gene:ENSMUSG00000031640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 45 // 30 // 30 // 0 /// AB056457 // GenBank // Mus musculus Cyp4v3 mRNA for family 4 cytochrome P450, complete cds. // chr8 // 100 // 53 // 35 // 35 // 0 /// BC026555 // GenBank // Mus musculus kallikrein B, plasma 1, mRNA (cDNA clone MGC:36124 IMAGE:4972788), complete cds. // chr8 // 100 // 44 // 29 // 29 // 0 /// BC138967 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily v, polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:170594 IMAGE:8861989), complete cds. // chr8 // 97 // 50 // 32 // 33 // 0 /// BC138968 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily v, polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:170595 IMAGE:8861990), complete cds. // chr8 // 97 // 50 // 32 // 33 // 0 /// M58588 // GenBank // Mouse plasma kallikrein (PK) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 53 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000024214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:45269902:45357696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 59 // 39 // 66 // 1
NM_153535 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 149, member A (Fam149a), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000093526 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:45336725:45382291:-1 gene:ENSMUSG00000070044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000135912 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:45336717:45358865:-1 gene:ENSMUSG00000070044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000155230 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:45338759:45358762:-1 gene:ENSMUSG00000070044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AK220518 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4166 protein. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC035537 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 149, member A, mRNA (cDNA clone MGC:40851 IMAGE:5369152), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:45269902:45357696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NM_126166 // RefSeq // Mus musculus toll-like receptor 3 (Tlr3), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006509278 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus toll-like receptor 3 (Tlr3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// ENSMUST00000034056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:45395665:45410539:-1 gene:ENSMUSG00000031639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000167106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:45395911:45410608:-1 gene:ENSMUSG00000031639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// AF355152 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 3 (Tlr3) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC099937 // GenBank // Mus musculus toll-like receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:107396 IMAGE:30084049), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:45387338:45406195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0
NM_001033148 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700029J07 gene (1700029J07Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000095323 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:45953606:45975252:-1 gene:ENSMUSG00000071103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006509484 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700029J07 gene (1700029J07Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// XR_378912 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700029J07 gene (1700029J07Rik), transcript variant X2, misc_RNA. // chr8 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSMUST00000098786 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:45953608:45975252:-1 gene:ENSMUSG00000071103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// BC107256 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1700029J07 gene, mRNA (cDNA clone MGC:130198 IMAGE:40052445), complete cds. // chr8 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:45953627:45975475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_207213 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 25 (Snx25), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006509243 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sorting nexin 25 (Snx25), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000041582 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:46033266:46151705:-1 gene:ENSMUSG00000038291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000110378 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:46033261:46152159:-1 gene:ENSMUSG00000038291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000170416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:46033261:46124146:-1 gene:ENSMUSG00000038291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000176410 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:46033272:46116702:-1 gene:ENSMUSG00000038291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY601646 // GenBank // Mus musculus SNX25 mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC054725 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 25, mRNA (cDNA clone MGC:65613 IMAGE:5699137), complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:46041303:46164934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1
NM_007450 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, adenine nucleotide translocator), member 4 (Slc25a4), mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000034049 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:46206797:46211284:-1 gene:ENSMUSG00000031633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC003791 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, adenine nucleotide translocator), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:6027 IMAGE:3599576), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC026925 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, adenine nucleotide translocator), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:25083 IMAGE:4500784), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// U27315 // GenBank // Mus musculus adenine nucleotide translocase-1 (Ant1) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSMUST00000155986 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:46207970:46211030:-1 gene:ENSMUSG00000031633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// AK051172 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo spinal ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D130011A21 product:solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 4, full insert sequence. // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:46194925:46222677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_173789 // RefSeq // Mus musculus helt bHLH transcription factor (Helt), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000058636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:46292050:46294671:-1 gene:ENSMUSG00000047171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AB098077 // GenBank // Mus musculus mRNA for Heslike, complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AB120968 // GenBank // Mus musculus mRNA for transcription factor Helt, complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AK044070 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830086M02 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC103599 // GenBank // Mus musculus Hey-like transcription factor (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:124097 IMAGE:40045925), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC103600 // GenBank // Mus musculus Hey-like transcription factor (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:124098 IMAGE:40045926), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC103601 // GenBank // Mus musculus Hey-like transcription factor (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:124096 IMAGE:40045923), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// DQ294234 // GenBank // Mus musculus bHLH transcription factor megane (Helt) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 78 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:46292236:46295929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0
NM_001114311 // RefSeq // Mus musculus storkhead box 2 (Stox2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001286376 // RefSeq // Mus musculus storkhead box 2 (Stox2), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_175162 // RefSeq // Mus musculus storkhead box 2 (Stox2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509493 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus storkhead box 2 (Stox2), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509495 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus storkhead box 2 (Stox2), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000079195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:47180048:47289402:-1 gene:ENSMUSG00000038143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:47180048:47352348:-1 gene:ENSMUSG00000038143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK048560 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130074O20 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177240 // RefSeq // Mus musculus trafficking protein particle complex 11 (Trappc11), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000039061 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:47490115:47533467:-1 gene:ENSMUSG00000038102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000123958 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:47490128:47525017:-1 gene:ENSMUSG00000038102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000125065 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:47490129:47533470:-1 gene:ENSMUSG00000038102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC063065 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA D030016E14 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5699104), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC147504 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D030016E14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:182525 IMAGE:9056419), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC151159 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA D030016E14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:184059 IMAGE:9088048), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:47492034:47540339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_023503 // RefSeq // Mus musculus inhibitor of growth family, member 2 (Ing2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000080353 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:47667178:47675158:-1 gene:ENSMUSG00000063049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000125536 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:47668755:47675556:-1 gene:ENSMUSG00000063049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000146625 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:47667178:47673689:-1 gene:ENSMUSG00000063049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AB433625 // GenBank // Mus musculus Ing2b mRNA for inhibitor of growth 2b, complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF078834 // GenBank // Mus musculus p33ING2 (Ing2) mRNA, complete cds. // chr8 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// BC096433 // GenBank // Mus musculus inhibitor of growth family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:106149 IMAGE:6310342), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC138229 // GenBank // Mus musculus inhibitor of growth family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:169853 IMAGE:8861248), complete cds. // chr8 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:47668666:47693759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_172407 // RefSeq // Mus musculus CDKN2A interacting protein (Cdkn2aip), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006509489 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CDKN2A interacting protein (Cdkn2aip), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000038738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:47709344:47713931:-1 gene:ENSMUSG00000038069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK078329 // GenBank HTC // Mus musculus adult male olfactory brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6430601G06 product:similar to PUTATIVE SERINE-RICH PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AK035426 // GenBank HTC // Mus musculus adult male urinary bladder cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9530039I19 product:weakly similar to PUTATIVE SERINE-RICH PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000021233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:47710985:47740150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0
NM_133791 // RefSeq // Mus musculus WW, C2 and coiled-coil domain containing 2 (Wwc2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000057561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:47826083:47990543:-1 gene:ENSMUSG00000031563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AB045323 // GenBank // Mus musculus brain cDNA, clone MNCb-4173. // chr8 // 93 // 100 // 43 // 46 // 0 /// BC067050 // GenBank // Mus musculus WW, C2 and coiled-coil domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:91333 IMAGE:30537299), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000048340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:47828718:47887205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 74 // 74 // 34 // 46 // 1
GENSCAN00000048325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:48065410:48070628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0
AK149124 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120485K02 product:hypothetical Kringle containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00007249 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_026030 // RefSeq // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 (beta) (Eif2s2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000099173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:2:154871410:154892935:-1 gene:ENSMUSG00000074656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000166171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:2:154871418:154892782:-1 gene:ENSMUSG00000074656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000182415 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:52196065:52197056:-1 gene:ENSMUSG00000052825 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC003848 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 (beta), mRNA (cDNA clone MGC:6425 IMAGE:3594058), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC113766 // GenBank // Mus musculus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 (beta), mRNA (cDNA clone MGC:130606 IMAGE:40058503), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000147136 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:2:154884343:154892831:-1 gene:ENSMUSG00000074656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// ENSMUST00000161172 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:2:154884375:154892795:-1 gene:ENSMUSG00000074656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000003630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:2:154868928:154892966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:52196061:52197056:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000182090 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:52278506:52279471:-1 gene:ENSMUSG00000098231 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_029701 // RefSeq // Mus musculus signal peptidase complex subunit 3 homolog (S. cerevisiae) (Spcs3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509521 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus signal peptidase complex subunit 3 homolog (S. cerevisiae) (Spcs3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000067476 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:54520433:54529998:-1 gene:ENSMUSG00000054408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK037878 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130058M11 product:inferred: RIKEN cDNA 1810011E08 gene / putative [Mus musculus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC054817 // GenBank // Mus musculus signal peptidase complex subunit 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:62761 IMAGE:5375997), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_175939 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 29 (Adam29), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000053441 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:55870912:55906948:-1 gene:ENSMUSG00000046258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY190759 // GenBank // Mus musculus strain ICR ADAM29 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC048676 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 29, mRNA (cDNA clone IMAGE:6774258), partial cds. // chr8 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// BC119089 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 29, mRNA (cDNA clone MGC:155405 IMAGE:8733838), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC119091 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 29, mRNA (cDNA clone MGC:155407 IMAGE:8733840), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:55871126:55873417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001009951 // RefSeq // Mus musculus centrosomal protein 44 (Cep44), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006509445 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus centrosomal protein 44 (Cep44), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000040330 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:56531522:56550857:-1 gene:ENSMUSG00000038215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000123493 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:56531522:56545465:-1 gene:ENSMUSG00000038215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000140107 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:56542906:56550843:-1 gene:ENSMUSG00000038215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// AK220415 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1712 protein. // chr8 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// BC088983 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC088983, mRNA (cDNA clone MGC:113766 IMAGE:5700628), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:56414910:56547476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
ENSMUST00000126830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:56549329:56550803:-1 gene:ENSMUSG00000038215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENSMUST00000130930 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:56545452:56551047:-1 gene:ENSMUSG00000038215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AK088220 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E430007J01 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT065676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_021788 // RefSeq // Mus musculus sin3 associated polypeptide (Sap30), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034022 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:57482707:57487860:-1 gene:ENSMUSG00000031609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF075136 // GenBank // Mus musculus Sin3-associated protein (sap30) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132081 // GenBank // Mus musculus sin3 associated polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:163712 IMAGE:40130358), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC132087 // GenBank // Mus musculus sin3 associated polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:163718 IMAGE:40130364), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000015879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:57520406:57520888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_175032 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6 (Galntl6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000098757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:57776225:57962564:-1 gene:ENSMUSG00000096914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK006215 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1700021K10 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GU220061 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 20 mRNA, complete cds. // chr8 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONMMUT065723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_175032 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6 (Galntl6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:57776225:57962564:-1 gene:ENSMUSG00000096914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GU220061 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 20 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:57892549:57969515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175032 // RefSeq // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6 (Galntl6), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000077447 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:58427494:58911627:-1 gene:ENSMUSG00000061864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000146513 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:58427580:58911576:-1 gene:ENSMUSG00000061864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AK080614 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830023L05 product:hypothetical Glycosyl transferase, family 2 containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC111102 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4930431L04 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:40050079), complete cds. // chr8 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// GU220061 // GenBank // Mus musculus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 20 mRNA, complete cds. // chr8 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// ENSMUST00000188531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:58427700:58701044:-1 gene:ENSMUSG00000061864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// GENSCAN00000043337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:58227659:58543699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
XR_404962 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 10283 (Gm10283), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:60430024:60503198:-1 gene:ENSMUSG00000070023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK085556 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630040L13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001136089 // RefSeq // Mus musculus annexin A10 (Anxa10), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_011922 // RefSeq // Mus musculus annexin A10 (Anxa10), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000034052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:62057042:62123112:-1 gene:ENSMUSG00000031635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:62057521:62123118:-1 gene:ENSMUSG00000031635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC125319 // GenBank // Mus musculus annexin A10, mRNA (cDNA clone MGC:159022 IMAGE:40129834), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC132207 // GenBank // Mus musculus annexin A10, mRNA (cDNA clone MGC:163838 IMAGE:40130484), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:62057742:62193716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000157794 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:63108674:63108807:-1 gene:ENSMUSG00000088419 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001195687 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4975 (Gm4975), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006509436 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 4975 (Gm4975), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000179944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:63924694:63952170:-1 gene:ENSMUSG00000094443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// HM628725 // GenBank // Mus musculus strain C57BL/6 shugoshin-like 2B (Sgo2B) mRNA, complete cds. // chr8 // 45 // 100 // 9 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:63874535:63982128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
NM_009390 // RefSeq // Mus musculus tolloid-like (Tll1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006509314 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus tolloid-like (Tll1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000066166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:64014770:64205993:-1 gene:ENSMUSG00000053626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK139103 // GenBank HTC // Mus musculus 7 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A730024K09 product:tolloid-like, full insert sequence. // chr8 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0 /// U34042 // GenBank // Mus musculus mammalian tolloid-like protein mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AK080919 // GenBank HTC // Mus musculus 4 days neonate male adipose cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B430208O18 product:tolloid-like, full insert sequence. // chr8 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// GENSCAN00000027422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:64043959:64118664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0
NR_030491 // RefSeq // Mus musculus microRNA 710 (Mir710), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000102088 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:64514332:64514441:-1 gene:ENSMUSG00000076042 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-710 // miRBase Micro RNA Database // MI0004694 Mus musculus miR-710 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013494 // RefSeq // Mus musculus carboxypeptidase E (Cpe), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000048967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:64592558:64693040:-1 gene:ENSMUSG00000037852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC010197 // GenBank // Mus musculus carboxypeptidase E, mRNA (cDNA clone MGC:7101 IMAGE:3157558), complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// U23184 // GenBank // Mus musculus musculus carboxypeptidase E (Cpe) mRNA, complete cds. // chr8 // 89 // 87 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:64593123:64624698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_178633 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 2, Mayven (Klhl2), mRNA. // chrUn // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:64739863:64849818:-1 gene:ENSMUSG00000031605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AK220570 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA4249 protein. // chrUn // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC024572 // GenBank // Mus musculus kelch-like 2, Mayven (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5037734), partial cds. // chrUn // 89 // 68 // 17 // 19 // 0 /// BC031142 // GenBank // Mus musculus kelch-like 2, Mayven (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:37257 IMAGE:4972965), complete cds. // chrUn // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC031144 // GenBank // Mus musculus kelch-like 2, Mayven (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:37267 IMAGE:4973325), complete cds. // chrUn // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:64740946:64780250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// AK147334 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:M5C1014L08 product:Warning: possibly chimeric clone, full insert sequence. // chrUn // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001033429 // RefSeq // Mus musculus tripartite motif-containing 75 (Trim75), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000095295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:64981651:64987646:-1 gene:ENSMUSG00000071089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK163251 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020006D12 product:hypothetical Butyrophylin-like/SPla/RYanodine receptor SPRY containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC139219 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 75, mRNA (cDNA clone MGC:170846 IMAGE:8862241), complete cds. // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC139221 // GenBank // Mus musculus tripartite motif-containing 75, mRNA (cDNA clone MGC:170848 IMAGE:8862243), complete cds. // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000019000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:64982393:65001379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSMUST00000124790 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:65028420:65037172:-1 gene:ENSMUSG00000079042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000074303 // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000142822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:65028420:65037336:-1 gene:ENSMUSG00000079042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSMUSG00000074303 // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001297554 // RefSeq // Mus musculus apelin receptor early endogenous ligand (Apela), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT065821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_033217 // RefSeq // Mus musculus cDNA sequence BC030870 (BC030870), long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000098713 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:65085613:65129563:-1 gene:ENSMUSG00000074300 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK131860 // GenBank HTC // Mus musculus adult male small intestine cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2010008K21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
GENSCAN00000018998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:65257991:65443576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSMUST00000082829 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:65667595:65667701:-1 gene:ENSMUSG00000064763 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT065833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000118929 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:65817311:65817595:-1 gene:ENSMUSG00000083905 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT065835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000006155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:65760930:65864145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
AK166451 // GenBank HTC // Mus musculus mammary gland RCB-0527 Jyg-MC(B) cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G930023J15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_025465 // RefSeq // Mus musculus translation machinery associated 16 homolog (S. cerevisiae) (Tma16), mRNA. // chr8 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000026681 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:66476399:66486519:-1 gene:ENSMUSG00000025591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000143972 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:66474330:66486497:-1 gene:ENSMUSG00000025591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC016246 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810029B16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:28859 IMAGE:4511374), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC034844 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1810029B16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:41048 IMAGE:1496036), complete cds. // chr8 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000145787 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:66482395:66486530:-1 gene:ENSMUSG00000025591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// AK031875 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330437O14 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// GENSCAN00000006162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:66476675:66486757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// NONMMUT065846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_016708 // RefSeq // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y5 (Npy5r), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:66679965:66688094:-1 gene:ENSMUSG00000044014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AB001346 // GenBank // Mus musculus mRNA for neuropeptide Y-Y5 receptor, complete cds. // chr8 // 76 // 86 // 19 // 25 // 0 /// AF049329 // GenBank // Mus musculus neuropeptide Y receptor type 5 (Npy5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// BC116976 // GenBank // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y5, mRNA (cDNA clone MGC:151353 IMAGE:40126295), complete cds. // chr8 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC116978 // GenBank // Mus musculus neuropeptide Y receptor Y5, mRNA (cDNA clone MGC:151355 IMAGE:40126297), complete cds. // chr8 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:66680739:66688268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000004125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:67053644:67112884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0
ENSMUST00000148610 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:67352104:67365004:-1 gene:ENSMUSG00000074292 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK089991 // GenBank HTC // Mus musculus colon RCB-0549 Cle-H3 cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430046L24 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT065854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001163713 // RefSeq // Mus musculus Tu translation elongation factor, mitochondrial (Tufm), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_172745 // RefSeq // Mus musculus Tu translation elongation factor, mitochondrial (Tufm), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000032981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:67514000:67515606:-1 gene:ENSMUSG00000030735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000098048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:126487355:126490730:1 gene:ENSMUSG00000073838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000106392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:7:126487355:126490730:1 gene:ENSMUSG00000073838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC060959 // GenBank // Mus musculus Tu translation elongation factor, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:74048 IMAGE:30379757), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC100596 // GenBank // Mus musculus Tu translation elongation factor, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:118710 IMAGE:6762419), complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000004147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:67514232:67515590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000015861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:7:126477466:126490494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_027626 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin and Sec7 domain containing 3 (Psd3), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_030263 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin and Sec7 domain containing 3 (Psd3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_177698 // RefSeq // Mus musculus pleckstrin and Sec7 domain containing 3 (Psd3), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509617 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin and Sec7 domain containing 3 (Psd3), transcript variant X8, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509618 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin and Sec7 domain containing 3 (Psd3), transcript variant X9, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509623 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pleckstrin and Sec7 domain containing 3 (Psd3), transcript variant X14, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:67689082:67974574:-1 gene:ENSMUSG00000030465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:67689082:67974574:-1 gene:ENSMUSG00000030465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000120071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:67689089:67818295:-1 gene:ENSMUSG00000030465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153054 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 1 (Slc18a1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006509534 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 1 (Slc18a1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000037478 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:69037711:69089222:-1 gene:ENSMUSG00000036330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000142548 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:69065110:69077228:-1 gene:ENSMUSG00000036330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// AK144034 // GenBank HTC // Mus musculus adult male kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F530201I16 product:solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 1, full insert sequence. // chr8 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// AY779336 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 18 member 1 (Slc18a1) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0 /// BC027192 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:28683 IMAGE:4239930), complete cds. // chr8 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// BC031146 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:37299 IMAGE:4974776), complete cds. // chr8 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:69007499:69083451:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1
NM_199364 // RefSeq // Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor 1 (Lzts1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000037049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:69135503:69140953:-1 gene:ENSMUSG00000036306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000185176 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:69132669:69184225:-1 gene:ENSMUSG00000036306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF288601 // GenBank // Mus musculus leucine-zipper protein FEZ1 mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC127607 // GenBank // Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor 1, mRNA (cDNA clone MGC:149977 IMAGE:40057969), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC139350 // GenBank // Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor 1, mRNA (cDNA clone MGC:170977 IMAGE:8862372), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC139352 // GenBank // Mus musculus leucine zipper, putative tumor suppressor 1, mRNA (cDNA clone MGC:170979 IMAGE:8862374), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:69135503:69140953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000021652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:69179679:69304524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
ENSMUST00000072427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:69372145:69373383:-1 gene:ENSMUSG00000057924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK129029 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3037696. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NR_038043 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10033 (Gm10033), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONMMUT065915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONMMUT065913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NR_038043 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10033 (Gm10033), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000095282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:69373528:69373914:-1 gene:ENSMUSG00000071083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK129029 // GenBank // Mus musculus cDNA fis, clone TRACH3037696. // chr8 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONMMUT065913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONMMUT065915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001045553 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 868 (Zfp868), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NM_172754 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 868 (Zfp868), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000074982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:69611414:69619352:-1 gene:ENSMUSG00000060427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000121886 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:69610857:69625548:-1 gene:ENSMUSG00000060427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC010277 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AI449175, mRNA (cDNA clone MGC:8009 IMAGE:3586128), complete cds. // chr8 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0
NM_001039965 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 869 (Zfp869), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NM_001039967 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 869 (Zfp869), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NM_181274 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 869 (Zfp869), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000080987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:69706332:69710724:-1 gene:ENSMUSG00000054648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// BC079868 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 1200003I07 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:6821028). // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT065947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONMMUT065948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_026818 // RefSeq // Mus musculus cartilage intermediate layer protein 2 (Cilp2), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000057831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:69880369:69887687:-1 gene:ENSMUSG00000044006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:69880858:69887351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
XM_006509732 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 13 (Ndufa13), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000152456 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:69887790:69888185:-1 gene:ENSMUSG00000048967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000152938 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:69887788:69890967:-1 gene:ENSMUSG00000048967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000180068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:69887788:69902712:-1 gene:ENSMUSG00000048967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC028663 // GenBank // Mus musculus YjeF N-terminal domain containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:1332678), partial cds. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:69887817:69901635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT065961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001167939 // RefSeq // Mus musculus MAU2 chromatid cohesion factor homolog (C. elegans) (Mau2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NM_028993 // RefSeq // Mus musculus MAU2 chromatid cohesion factor homolog (C. elegans) (Mau2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006509774 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus MAU2 chromatid cohesion factor homolog (C. elegans) (Mau2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000050561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70016123:70042734:-1 gene:ENSMUSG00000031858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000168013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70016123:70042685:-1 gene:ENSMUSG00000031858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AK162318 // GenBank HTC // Mus musculus adult male colon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9030625E11 product:hypothetical TPR-like containing protein, full insert sequence. // chr8 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// BC023401 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130404D08 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5064828), complete cds. // chr8 // 95 // 55 // 21 // 22 // 0 /// BC125568 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130404D08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:159271 IMAGE:40130083), complete cds. // chr8 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// BC132139 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130404D08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:163770 IMAGE:40130416), complete cds. // chr8 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// BC144990 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130404D08 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178546 IMAGE:9053538), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:69996822:70042685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 30 // 40 // 1
NM_007789 // RefSeq // Mus musculus neurocan (Ncan), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000002412 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:70093085:70120873:-1 gene:ENSMUSG00000002341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC065118 // GenBank // Mus musculus neurocan, mRNA (cDNA clone MGC:86112 IMAGE:6853253), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70096320:70116661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001025589 // RefSeq // Mus musculus regulatory factor X-associated ankyrin-containing protein (Rfxank), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NM_011266 // RefSeq // Mus musculus regulatory factor X-associated ankyrin-containing protein (Rfxank), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XR_406718 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus DNA-binding protein RFXANK-like (LOC102643159), misc_RNA. // chr8 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000075724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70130812:70139197:-1 gene:ENSMUSG00000036120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF094761 // GenBank // Mus musculus Rfxank (Rfxank) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// AF123704 // GenBank // Mus musculus adaptor protein Tvl-1 (Tvl1) mRNA, complete cds. // chr8 // 80 // 59 // 16 // 20 // 0 /// AK162595 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9630045E21 product:regulatory factor X-associated ankyrin-containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC010971 // GenBank // Mus musculus regulatory factor X-associated ankyrin-containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:13787 IMAGE:4190691), complete cds. // chr8 // 86 // 82 // 24 // 28 // 0 /// L43164 // GenBank // Mus musculus touvlo mRNA, complete cds. // chr8 // 80 // 59 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70133393:70138215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0
NM_001007570 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 25, member 42 (Slc25a42), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000063788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70184340:70212256:-1 gene:ENSMUSG00000002346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110127 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:70184340:70212305:-1 gene:ENSMUSG00000002346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139333 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:70184340:70212305:-1 gene:ENSMUSG00000002346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC025937 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 42, mRNA (cDNA clone MGC:37808 IMAGE:5098192), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC036140 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 25, member 42, mRNA (cDNA clone MGC:37251 IMAGE:4972835), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSMUST00000150706 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:70187716:70212305:-1 gene:ENSMUSG00000002346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// AK165793 // GenBank HTC // Mus musculus 15 days embryo brain cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G630076L14 product:hypothetical Mitochondrial carrier protein/Mitochondrial substrate carrier containing protein, full insert sequence. // chr8 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70186469:70212343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_133972 // RefSeq // Mus musculus armadillo repeat containing 6 (Armc6), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006509782 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus armadillo repeat containing 6 (Armc6), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000019679 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:70220172:70234466:-1 gene:ENSMUSG00000002343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000130319 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:70225318:70234126:-1 gene:ENSMUSG00000002343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000135931 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:70224610:70234449:-1 gene:ENSMUSG00000002343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000139765 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:70220198:70222789:-1 gene:ENSMUSG00000002343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// AK010815 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2410153K17 product:hypothetical Armadillo repeat containing protein, full insert sequence. // chr8 // 94 // 52 // 16 // 17 // 0 /// BC043070 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:57975 IMAGE:6403587), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC055779 // GenBank // Mus musculus armadillo repeat containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:67564 IMAGE:6403587), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70220665:70231400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0
NM_001122829 // RefSeq // Mus musculus UPF1 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast) (Upf1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_030680 // RefSeq // Mus musculus UPF1 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast) (Upf1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000075666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70331522:70353273:-1 gene:ENSMUSG00000058301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF182947 // GenBank // Mus musculus nonsense mRNA reducing factor 1 NORF1 mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// AF322655 // GenBank // Mus musculus regulator of nonsense transcripts 1 (Rent1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AK052517 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D430041B22 product:regulator of nonsense transcripts 1, full insert sequence. // chr8 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// BC052149 // GenBank // Mus musculus UPF1 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:59259 IMAGE:6332288), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC056442 // GenBank // Mus musculus UPF1 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:66863 IMAGE:5702493), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70332623:70352993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001004062 // RefSeq // Mus musculus CREB regulated transcription coactivator 1 (Crtc1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509699 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CREB regulated transcription coactivator 1 (Crtc1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006509701 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus CREB regulated transcription coactivator 1 (Crtc1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000076615 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:70382355:70439579:-1 gene:ENSMUSG00000003575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000142769 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:70382355:70439579:-1 gene:ENSMUSG00000003575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC080308 // GenBank // Mus musculus CREB regulated transcription coactivator 1, mRNA (cDNA clone MGC:90786 IMAGE:5719562), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000125273 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:70397755:70402798:-1 gene:ENSMUSG00000003575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENSMUST00000125613 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:70404849:70439575:-1 gene:ENSMUSG00000003575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000052486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70385938:70488586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONMMUT065998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_178771 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 26 (Klhl26), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000066597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70450228:70476943:-1 gene:ENSMUSG00000055707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC023909 // GenBank // Mus musculus kelch-like 26 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:38182 IMAGE:5322205), complete cds. // chr8 // 88 // 50 // 15 // 17 // 0 /// BC025484 // GenBank // Mus musculus kelch-like 26 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:38024 IMAGE:5151231), complete cds. // chr8 // 89 // 82 // 25 // 28 // 0 /// BC098185 // GenBank // Mus musculus kelch-like 26 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:106164 IMAGE:3594528), complete cds. // chr8 // 93 // 82 // 26 // 28 // 0 /// NM_001122830 // RefSeq // Mus musculus kelch-like 26 (Klhl26), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// ENSMUST00000166976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70450228:70476943:-1 gene:ENSMUSG00000055707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// GENSCAN00000052486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70385938:70488586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_182991 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 59-like (Tmem59l), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006509735 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 59-like (Tmem59l), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000045286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70483876:70487358:-1 gene:ENSMUSG00000035964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC056172 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 59-like, mRNA (cDNA clone MGC:67225 IMAGE:5699902), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70385938:70488586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_133772 // RefSeq // Mus musculus single stranded DNA binding protein 4 (Ssbp4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000049908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70597491:70608314:-1 gene:ENSMUSG00000070003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK004835 // GenBank HTC // Mus musculus adult male lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:1210002E11 product:SINGLE STRANDED DNA BINDING PROTEIN-3 homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AK157387 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830213A02 product:single stranded DNA binding protein 4, full insert sequence. // chr8 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC002150 // GenBank // Mus musculus single stranded DNA binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:7269 IMAGE:3484896), complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70597739:70612163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
NM_011819 // RefSeq // Mus musculus growth differentiation factor 15 (Gdf15), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006509669 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus growth differentiation factor 15 (Gdf15), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000003808 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:70629393:70632095:-1 gene:ENSMUSG00000038508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000110103 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:70629394:70632456:-1 gene:ENSMUSG00000038508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF159571 // GenBank // Mus musculus growth/differentiation factor-15 (Gdf15) mRNA, complete cds. // chr8 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// AK144199 // GenBank HTC // Mus musculus kidney CCL-142 RAG cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G430094K23 product:growth differentiation factor 15, full insert sequence. // chr8 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC067248 // GenBank // Mus musculus growth differentiation factor 15, mRNA (cDNA clone MGC:73604 IMAGE:820434), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70629543:70631612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_023217 // RefSeq // Mus musculus pyroglutamyl-peptidase I (Pgpep1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006509719 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pyroglutamyl-peptidase I (Pgpep1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006509720 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus pyroglutamyl-peptidase I (Pgpep1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000070173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70646436:70659738:-1 gene:ENSMUSG00000056204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC051938 // GenBank // Mus musculus pyroglutamyl-peptidase I, mRNA (cDNA clone MGC:62180 IMAGE:5717365), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70650593:70659643:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_183170 // RefSeq // Mus musculus MPV17 mitochondrial membrane protein-like 2 (Mpv17l2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000038626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70758649:70760921:-1 gene:ENSMUSG00000035559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC051227 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC051227, mRNA (cDNA clone MGC:63135 IMAGE:3470737), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70758986:70760906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_023065 // RefSeq // Mus musculus interferon gamma inducible protein 30 (Ifi30), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70762774:70766663:-1 gene:ENSMUSG00000031838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF309649 // GenBank // Mus musculus lysosomal thiol reductase precursor, mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC054852 // GenBank // Mus musculus interferon gamma inducible protein 30, mRNA (cDNA clone MGC:62543 IMAGE:6528891), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70762975:70792314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_008841 // RefSeq // Mus musculus phosphatidylinositol 3-kinase, regulatory subunit, polypeptide 2 (p85 beta) (Pik3r2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034296 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:70768176:70776713:-1 gene:ENSMUSG00000031834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC006796 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol 3-kinase, regulatory subunit, polypeptide 2 (p85 beta), mRNA (cDNA clone MGC:11459 IMAGE:2581969), complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC085501 // GenBank // Mus musculus phosphatidylinositol 3-kinase, regulatory subunit, polypeptide 2 (p85 beta), mRNA (cDNA clone MGC:102156 IMAGE:6816009), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70762975:70792314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_199308 // RefSeq // Mus musculus microtubule associated serine/threonine kinase 3 (Mast3), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006509707 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus microtubule associated serine/threonine kinase 3 (Mast3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000166004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70778117:70792433:-1 gene:ENSMUSG00000031833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AK155568 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630326M14 product:similar to Syntrophin-associated serine/threonine kinase SAST124 [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr8 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// BC024265 // GenBank // Mus musculus microtubule associated serine/threonine kinase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5137303), complete cds. // chr8 // 83 // 38 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70762975:70792314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_027560 // RefSeq // Mus musculus arrestin domain containing 2 (Arrdc2), mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// XM_006509740 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus arrestin domain containing 2 (Arrdc2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000002989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70835155:70839720:-1 gene:ENSMUSG00000002910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// BC036384 // GenBank // Mus musculus arrestin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:41244 IMAGE:1067080), complete cds. // chr8 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// BC043313 // GenBank // Mus musculus arrestin domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5149707), partial cds. // chr8 // 86 // 53 // 18 // 21 // 0 /// BC054826 // GenBank // Mus musculus arrestin domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5132912), complete cds. // chr8 // 86 // 53 // 18 // 21 // 0 /// BC094060 // GenBank HTC // Mus musculus arrestin domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4188999), with apparent retained intron. // chr8 // 93 // 73 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70823453:70870063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1
NM_032397 // RefSeq // Mus musculus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 1 (Kcnn1), mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// XM_006509809 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 1 (Kcnn1), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 95 // 51 // 19 // 20 // 0 /// XM_006509810 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 1 (Kcnn1), transcript variant X7, mRNA. // chr8 // 96 // 59 // 22 // 23 // 0 /// ENSMUST00000110078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70842049:70857008:-1 gene:ENSMUSG00000002908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000110081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70842049:70857008:-1 gene:ENSMUSG00000002908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// AF116525 // GenBank // Mus musculus small conductance potassium channel mSK1 (SK1) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 90 // 34 // 35 // 0 /// AF357239 // GenBank // Mus musculus small-conductance calcium-activated potassium channel SK1 (SK1) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 74 // 28 // 29 // 0 /// AY258143 // GenBank // Mus musculus small-conductance calcium-activated potassium channel SK1 (Sk1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// BC090622 // GenBank // Mus musculus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:115869 IMAGE:6832359), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000049636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70823453:70870063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1
NM_026964 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 124 (Ccdc124), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509655 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus coiled-coil domain containing 124 (Ccdc124), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000007865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:70868227:70873490:-1 gene:ENSMUSG00000007721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC049678 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 124, mRNA (cDNA clone MGC:58540 IMAGE:6595832), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC050938 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 124, mRNA (cDNA clone MGC:61274 IMAGE:6819562), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70823453:70870063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_053248 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 5 (sodium iodide symporter), member 5 (Slc5a5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000000809 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:70882889:70892757:-1 gene:ENSMUSG00000000792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF235001 // GenBank // Mus musculus sodium iodide symporter NIS mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 91 // 28 // 31 // 0 /// AF380353 // GenBank // Mus musculus sodium iodide symporter mRNA, complete cds. // chr8 // 77 // 88 // 23 // 30 // 0 /// BC137650 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 5 (sodium iodide symporter), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:169274 IMAGE:8860669), complete cds. // chr8 // 77 // 91 // 24 // 31 // 0 /// BC137651 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 5 (sodium iodide symporter), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:169275 IMAGE:8860670), complete cds. // chr8 // 77 // 91 // 24 // 31 // 0 /// GENSCAN00000049639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:70883864:70897376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_181418 // RefSeq // Mus musculus Usher syndrome 1C binding protein 1 (Ushbp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509659 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Usher syndrome 1C binding protein 1 (Ushbp1), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000049184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71384274:71395801:-1 gene:ENSMUSG00000034911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026453 // GenBank // Mus musculus Usher syndrome 1C binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:31438 IMAGE:4460920), complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AK034939 // GenBank HTC // Mus musculus 12 days embryo embryonic body between diaphragm region and neck cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9430064H24 product:inferred: AIEBP {Homo sapiens}, full insert sequence. // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// BC033912 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:1054950, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000049621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71374483:71395393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_022419 // RefSeq // Mus musculus abhydrolase domain containing 8 (Abhd8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000008094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71456700:71463657:-1 gene:ENSMUSG00000007950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB030191 // GenBank // Mus musculus mRNA, complete cds, clone:2-25. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC026540 // GenBank // Mus musculus abhydrolase domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:35837 IMAGE:5050705), complete cds. // chr8 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// AK037669 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130035M07 product:abhydrolase domain containing 8, full insert sequence. // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000049635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71457183:71461964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001164679 // RefSeq // Mus musculus anoctamin 8 (Ano8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006509686 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus anoctamin 8 (Ano8), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000093450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71476023:71486067:-1 gene:ENSMUSG00000034863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AK173222 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA1623 protein. // chr8 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC027790 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 16H, mRNA (cDNA clone IMAGE:5353976). // chr8 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// BC042391 // GenBank HTC // Mus musculus anoctamin 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:5368702), with apparent retained intron. // chr8 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000049631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71476385:71485859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0
NM_032398 // RefSeq // Mus musculus plasmalemma vesicle associated protein (Plvap), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71497754:71511769:-1 gene:ENSMUSG00000034845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF348403 // GenBank // Mus musculus PV1 protein (Plvap) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF369900 // GenBank // Mus musculus MECA32 (Meca32) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC013517 // GenBank // Mus musculus plasmalemma vesicle associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:19189 IMAGE:4235957), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71498205:71517615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_198095 // RefSeq // Mus musculus bone marrow stromal cell antigen 2 (Bst2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000051672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71534264:71537437:-1 gene:ENSMUSG00000046718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC027328 // GenBank // Mus musculus bone marrow stromal cell antigen 2, mRNA (cDNA clone MGC:28276 IMAGE:4009434), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC056638 // GenBank // Mus musculus bone marrow stromal cell antigen 2, mRNA (cDNA clone MGC:68325 IMAGE:5065707), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC087949 // GenBank // Mus musculus bone marrow stromal cell antigen 2, mRNA (cDNA clone MGC:107564 IMAGE:6768735), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71534690:71537382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC008532 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:3489640, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr8 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0
NM_001100462 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 221 (Tmem221), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000052072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71554303:71558871:-1 gene:ENSMUSG00000043664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC033932 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 221, mRNA (cDNA clone IMAGE:1380300), partial cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147816 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 221, mRNA (cDNA clone MGC:182919 IMAGE:9087533), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC147831 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 221, mRNA (cDNA clone MGC:182934 IMAGE:9087548), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006509705 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 221 (Tmem221), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000049654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71555516:71566579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_145598 // RefSeq // Mus musculus nucleoredoxin-like 1 (Nxnl1), mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000048243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71560556:71566601:-1 gene:ENSMUSG00000034829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000163659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71560556:71566649:-1 gene:ENSMUSG00000034829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC017153 // GenBank HTC // Mus musculus nucleoredoxin-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4512579). // chr8 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC021911 // GenBank // Mus musculus nucleoredoxin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:27601 IMAGE:4502967), complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71555516:71566579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONMMUT066070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
ENSMUST00000030170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:71624417:71671757:-1 gene:ENSMUSG00000034799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK048697 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230009J18 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK141188 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230090I05 product:weakly similar to Munc-13 (Fragment) [Felis silvestris catus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONMMUT066076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr8 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0
NM_001029873 // RefSeq // Mus musculus unc-13 homolog A (C. elegans) (Unc13a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000030170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:71624417:71671757:-1 gene:ENSMUSG00000034799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK141188 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C230090I05 product:weakly similar to Munc-13 (Fragment) [Felis silvestris catus], full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058348 // GenBank // Mus musculus unc-13 homolog A (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:5700788), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001029873 // RefSeq // Mus musculus unc-13 homolog A (C. elegans) (Unc13a), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000030170 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:71624417:71671757:-1 gene:ENSMUSG00000034799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSMUST00000176777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:71660341:71671741:-1 gene:ENSMUSG00000034799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000177517 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:71629054:71671736:-1 gene:ENSMUSG00000034799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// AY753536 // GenBank // Mus musculus munc 13-1 mRNA, complete cds. // chr8 // 81 // 93 // 34 // 42 // 0 /// ENSMUST00000175780 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:71660346:71668082:-1 gene:ENSMUSG00000034799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1 /// ENSMUST00000177032 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:71634889:71642568:-1 gene:ENSMUSG00000034799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1 /// AK170263 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630039C17 product:unclassifiable, full insert sequence. // chr8 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1 /// GENSCAN00000049645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71629423:71666670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0
AK087256 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate lung cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E030040E07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_028189 // RefSeq // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 3 (B3gnt3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509752 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 3 (B3gnt3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509753 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 3 (B3gnt3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000034260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:71691719:71701800:-1 gene:ENSMUSG00000031803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY037785 // GenBank // Mus musculus beta1,3 N-acetylglucosaminyltransferase-3 (B3gnt3) mRNA, complete cds. // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// AY039028 // GenBank // Mus musculus core 1 beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase mRNA, complete cds. // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC026418 // GenBank // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:31283 IMAGE:4218953), complete cds. // chr8 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71692604:71693883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
BC004040 // GenBank // Mus musculus CCR4-NOT transcription complex, subunit 8, mRNA (cDNA clone MGC:7665 IMAGE:3496188), complete cds. // chr8 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0
NM_024444 // RefSeq // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 18 (Cyp4f18), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006509749 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 18 (Cyp4f18), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000003574 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:71988482:72009626:-1 gene:ENSMUSG00000003484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF233647 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450 CYP4F18 mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// BC013494 // GenBank // Mus musculus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 18, mRNA (cDNA clone MGC:19144 IMAGE:4218398), complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// ENSMUST00000141975 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:71988483:71992915:-1 gene:ENSMUSG00000003484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000037077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:71988560:72009226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0
NM_001080812 // RefSeq // Mus musculus calcium and integrin binding family member 3 (Cib3), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006509668 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus calcium and integrin binding family member 3 (Cib3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000098630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:72204335:72212837:-1 gene:ENSMUSG00000074240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC120812 // GenBank // Mus musculus calcium and integrin binding family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:156049 IMAGE:40129735), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC120814 // GenBank // Mus musculus calcium and integrin binding family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:156051 IMAGE:40129737), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72204409:72212974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0
NM_028500 // RefSeq // Mus musculus calreticulin 3 (Calr3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// NM_029782 // RefSeq // Mus musculus calreticulin 3 (Calr3), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000019876 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:72424176:72443870:-1 gene:ENSMUSG00000019732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000109974 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:72424183:72435156:-1 gene:ENSMUSG00000019732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// AB206786 // GenBank // Mus musculus cspn mRNA for calsperin, complete cds. // chr8 // 94 // 78 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72424615:72443683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0
NM_138585 // RefSeq // Mus musculus calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein (Cherp), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000079510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:72460489:72475233:-1 gene:ENSMUSG00000052488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AF536541 // GenBank // Mus musculus SR-related CTD associated factor 6 (Scaf6) mRNA, complete cds. // chr8 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// BC032191 // GenBank // Mus musculus calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mRNA (cDNA clone MGC:36411 IMAGE:5322208), complete cds. // chr8 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1 /// GENSCAN00000037065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72461428:72475082:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0
NM_177766 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 35, member E1 (Slc35e1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000141352 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:72484574:72492217:-1 gene:ENSMUSG00000019731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000152080 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:72480641:72492614:-1 gene:ENSMUSG00000019731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC115553 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member E1, mRNA (cDNA clone MGC:144407 IMAGE:40101801), complete cds. // chr8 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// BC115554 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 35, member E1, mRNA (cDNA clone MGC:144408 IMAGE:40101802), complete cds. // chr8 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72483766:72492586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_027485 // RefSeq // Mus musculus mediator complex subunit 26 (Med26), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006509739 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus mediator complex subunit 26 (Med26), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000058534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:72494558:72548310:-1 gene:ENSMUSG00000045248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC054737 // GenBank // Mus musculus mediator complex subunit 26, mRNA (cDNA clone MGC:65627 IMAGE:6401737), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72495487:72500377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_172396 // RefSeq // Mus musculus small integral membrane protein 7 (Smim7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000058733 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:72567487:72571049:-1 gene:ENSMUSG00000044600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000167290 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:72565188:72571088:-1 gene:ENSMUSG00000044600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC037511 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130011J15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:48184 IMAGE:1512313), complete cds. // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC055692 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 9130011J15 gene, mRNA (cDNA clone MGC:66611 IMAGE:6404961), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_010687 // RefSeq // Mus musculus like-glycosyltransferase (Large), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000004497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:72814599:73352556:-1 gene:ENSMUSG00000004383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000119826 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:72814599:73353540:-1 gene:ENSMUSG00000004383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AK122328 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA0609 protein. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC100399 // GenBank // Mus musculus like-glycosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:118078 IMAGE:30725031), complete cds. // chr8 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// BC125487 // GenBank // Mus musculus like-glycosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:159190 IMAGE:40130002), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC125489 // GenBank // Mus musculus like-glycosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:159192 IMAGE:40130004), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:73033962:73133085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000051625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:72815824:72998942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000051619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:73398312:73522060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
ENSMUST00000082775 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:76274344:76274450:-1 gene:ENSMUSG00000064709 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT066182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NR_028579 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 10649 (Gm10649), long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000136538 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:76749087:76900173:-1 gene:ENSMUSG00000074235 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONMMUT066190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_030113 // RefSeq // Mus musculus Rho GTPase activating protein 10 (Arhgap10), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006531499 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho GTPase activating protein 10 (Arhgap10), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006531501 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rho GTPase activating protein 10 (Arhgap10), transcript variant X8, mRNA. // chr8 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000076316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:77250366:77517907:-1 gene:ENSMUSG00000037148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AF297029 // GenBank // Mus musculus PSGAP-s mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 90 // 95 // 38 // 42 // 0 /// AF297030 // GenBank // Mus musculus PSGAP-m mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 93 // 95 // 39 // 42 // 0 /// AY179965 // GenBank // Mus musculus Rho-GTPase-activating protein PS-GAP-a mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr8 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// AY179966 // GenBank // Mus musculus Rho-GTPase-activating protein PS-GAP-b mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr8 // 90 // 91 // 36 // 40 // 0 /// AY179967 // GenBank // Mus musculus Rho-GTPase-activating protein PS-GAP-c mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr8 // 88 // 91 // 35 // 40 // 0 /// GENSCAN00000010411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:77379246:77422132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1 /// GENSCAN00000010381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:77342894:77358626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_145599 // RefSeq // Mus musculus transmembrane protein 184C (Tmem184c), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006530853 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus transmembrane protein 184C (Tmem184c), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000034030 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:77595982:77610653:-1 gene:ENSMUSG00000031617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000152168 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:77602866:77610698:-1 gene:ENSMUSG00000031617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 46 // 15 // 16 // 0 /// BC004056 // GenBank // Mus musculus transmembrane protein 184C, mRNA (cDNA clone MGC:8158 IMAGE:3589819), complete cds. // chr8 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0
NM_010332 // RefSeq // Mus musculus endothelin receptor type A (Ednra), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034029 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:77663031:77724436:-1 gene:ENSMUSG00000031616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC008277 // GenBank // Mus musculus endothelin receptor type A, mRNA (cDNA clone MGC:6567 IMAGE:2812426), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000146561 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:77669694:77724464:-1 gene:ENSMUSG00000031616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// AK042211 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630071G03 product:SIMILAR TO ENDOTHELIN RECEPTOR TYPE A, full insert sequence. // chr8 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000049970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:77664935:77705395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_138944 // RefSeq // Mus musculus POU domain, class 4, transcription factor 2 (Pou4f2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034115 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:78433010:78436645:-1 gene:ENSMUSG00000031688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:78419281:78486411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
GENSCAN00000006929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:78950700:78986521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_026315 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 1700011L22 gene (1700011L22Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531314 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 1700011L22 gene (1700011L22Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000034109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:79210430:79248583:-1 gene:ENSMUSG00000031682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:79210592:79281606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_133823 // RefSeq // Mus musculus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) type A (Mmaa), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006530566 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) type A (Mmaa), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000048718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:79266424:79294956:-1 gene:ENSMUSG00000037022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC021954 // GenBank // Mus musculus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) type A, mRNA (cDNA clone MGC:37960 IMAGE:5134853), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC027398 // GenBank // Mus musculus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) type A, mRNA (cDNA clone IMAGE:4954586), partial cds. // chr8 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// BC085229 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA clone IMAGE:6441134, containing frame-shift errors. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006530567 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) type A (Mmaa), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1 /// GENSCAN00000006933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:79210592:79281606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 86 // 86 // 19 // 22 // 1
ENSMUST00000066081 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:79355356:79399518:-1 gene:ENSMUSG00000031681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AK034045 // GenBank HTC // Mus musculus adult male diencephalon cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9330151F12 product:MAD homolog 1 (Drosophila), full insert sequence. // chr8 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// U58992 // GenBank // Mus musculus mSmad1 mRNA, complete cds. // chr8 // 89 // 62 // 16 // 18 // 0 /// U74359 // GenBank // Mus musculus mothers-against-dpp-related-1 mRNA, complete cds. // chr8 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// NM_008539 // RefSeq // Mus musculus SMAD family member 1 (Smad1), mRNA. // chr8 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// XM_006530746 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus SMAD family member 1 (Smad1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENSMUST00000066091 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:79338395:79399518:-1 gene:ENSMUSG00000031681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// BC058693 // GenBank // Mus musculus MAD homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:61354 IMAGE:6811514), complete cds. // chr8 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// ENSMUST00000109885 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:79341580:79399518:-1 gene:ENSMUSG00000031681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// AK084505 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330009K05 product:MAD homolog 1 (Drosophila), full insert sequence. // chr8 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000006923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:79286282:79389685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_015751 // RefSeq // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family E (OABP), member 1 (Abce1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000080536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:79683442:79711740:-1 gene:ENSMUSG00000058355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC005422 // GenBank // Mus musculus ATP-binding cassette, sub-family E (OABP), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:5781 IMAGE:3489529), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// U90446 // GenBank // Mus musculus RNAse L inhibitor (Mu-RLI) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AK133748 // GenBank HTC // Mus musculus 8 days embryo whole body cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5730405E09 product:ATP-binding cassette, sub-family E (OABP), member 1, full insert sequence. // chr8 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// GENSCAN00000005997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:79685230:79708525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0
NM_020259 // RefSeq // Mus musculus Hedgehog-interacting protein (Hhip), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000079038 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:79970345:80058006:-1 gene:ENSMUSG00000064325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF116865 // GenBank // Mus musculus hedgehog-interacting protein (Hip) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// BC053012 // GenBank // Mus musculus Hedgehog-interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:62205 IMAGE:6402422), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000155850 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:79966115:79990349:-1 gene:ENSMUSG00000064325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000005965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:79942204:80008090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSMUST00000142188 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:80511842:80514473:-1 gene:ENSMUSG00000086912 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AK015711 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4930505O20 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_053124 // RefSeq // Mus musculus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5 (Smarca5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSMUST00000043359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:80698507:80739497:-1 gene:ENSMUSG00000031715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC021922 // GenBank // Mus musculus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:4488056), complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// BC053069 // GenBank // Mus musculus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:62411 IMAGE:6409140), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_021356 // RefSeq // Mus musculus growth factor receptor bound protein 2-associated protein 1 (Gab1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530674 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus growth factor receptor bound protein 2-associated protein 1 (Gab1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006530676 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus growth factor receptor bound protein 2-associated protein 1 (Gab1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000034150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:80764434:80880479:-1 gene:ENSMUSG00000031714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC007483 // GenBank // Mus musculus growth factor receptor bound protein 2-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:7657 IMAGE:3495926), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC094659 // GenBank // Mus musculus growth factor receptor bound protein 2-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:102051 IMAGE:6854020), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// CT010264 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836F0451D for gene Gab1, RIKEN cDNA 1700019H22 gene; complete cds, incl. stopcodon. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000002903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:80774487:80801484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_027554 // RefSeq // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 38 (Usp38), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006531450 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin specific peptidase 38 (Usp38), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// XR_387782 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus ubiquitin specific peptidase 38 (Usp38), transcript variant X2, misc_RNA. // chr8 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000042724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:80980734:81014906:-1 gene:ENSMUSG00000038250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC054404 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 38, mRNA (cDNA clone MGC:62858 IMAGE:6494448), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC057122 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 38, mRNA (cDNA clone MGC:73496 IMAGE:6834543), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC058784 // GenBank // Mus musculus ubiquitin specific peptidase 38, mRNA (cDNA clone MGC:67662 IMAGE:6310341), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AK139639 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020007G15 product:ubiquitin specific protease 38, full insert sequence. // chr8 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000002894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:80936788:81014436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0
ENSMUST00000178708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:81197627:81198214:-1 gene:ENSMUSG00000094615 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// NONMMUT066295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000182417 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:81308177:81309149:-1 gene:ENSMUSG00000097949 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:81308177:81354884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_001254747 // RefSeq // Mus musculus interleukin 15 (Il15), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_008357 // RefSeq // Mus musculus interleukin 15 (Il15), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530709 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 15 (Il15), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006530710 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus interleukin 15 (Il15), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000034148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:82331637:82403222:-1 gene:ENSMUSG00000031712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC023698 // GenBank // Mus musculus interleukin 15, mRNA (cDNA clone MGC:36131 IMAGE:5345382), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// DQ083236 // GenBank // Mus musculus putative interleukin 15 isoform aE6 precursor, mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// DQ083237 // GenBank // Mus musculus putative interleukin 15 isoform aE7 precursor, mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// U14332 // GenBank // Mus musculus interleukin 15 (IL15) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK085441 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate kidney cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D630025K20 product:interleukin 15, full insert sequence. // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:82331914:82489798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_145600 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 330 (Zfp330), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENSMUST00000034147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:82763621:82774160:-1 gene:ENSMUSG00000031711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AK037748 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A130046J12 product:nucleolar autoantigen, full insert sequence. // chr8 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC008086 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 330, mRNA (cDNA clone MGC:6718 IMAGE:3586161), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC030675 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 330, mRNA (cDNA clone MGC:41503 IMAGE:1068780), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC037025 // GenBank HTC // Mus musculus zinc finger protein 330, mRNA (cDNA clone IMAGE:5369244), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC083081 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 330, mRNA (cDNA clone MGC:103365 IMAGE:6510396), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSMUST00000098605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83165081:83166170:-1 gene:ENSMUSG00000074228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK143076 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate eyeball cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:E130010G08 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83069377:83176197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001039137 // RefSeq // Mus musculus short coiled-coil protein (Scoc), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// NM_001285992 // RefSeq // Mus musculus short coiled-coil protein (Scoc), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// NM_019708 // RefSeq // Mus musculus short coiled-coil protein (Scoc), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// ENSMUST00000081506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83434493:83458391:-1 gene:ENSMUSG00000063253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// ENSMUST00000167525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83434493:83442648:-1 gene:ENSMUSG00000063253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// BC147069 // GenBank // Mus musculus short coiled-coil protein, mRNA (cDNA clone MGC:182181 IMAGE:9056075), complete cds. // chr8 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
GENSCAN00000002811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83477471:83479216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001038995 // RefSeq // Mus musculus predicted gene 4787 (Gm4787), mRNA. // chr8 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000062182 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:81376991:81379464:-1 gene:ENSMUSG00000072974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NM_009620 // RefSeq // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 4 (Adam4), mRNA. // chr8 // 46 // 92 // 11 // 24 // 0 /// ENSMUST00000085319 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:12:81419443:81421946:-1 gene:ENSMUSG00000072972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 92 // 11 // 24 // 0 /// AY158688 // GenBank // Mus musculus strain ICR ADAM4 mRNA, complete cds. // chr8 // 46 // 92 // 11 // 24 // 0 /// BC150159 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 4, mRNA (cDNA clone MGC:161247 IMAGE:40141514), complete cds. // chr8 // 46 // 92 // 11 // 24 // 0 /// BC150481 // GenBank // Mus musculus a disintegrin and metallopeptidase domain 4, mRNA (cDNA clone MGC:161248 IMAGE:40141515), complete cds. // chr8 // 46 // 92 // 11 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83489916:83491816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000021595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:12:81332721:81379382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_027179 // RefSeq // Mus musculus trans-2,3-enoyl-CoA reductase (Tecr), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NM_134118 // RefSeq // Mus musculus trans-2,3-enoyl-CoA reductase (Tecr), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000019382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83571700:83594491:-1 gene:ENSMUSG00000031708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000163837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83571700:83594429:-1 gene:ENSMUSG00000031708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000165740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83571700:83594491:-1 gene:ENSMUSG00000031708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AK171718 // GenBank HTC // Mus musculus activated spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F830006F20 product:glycoprotein, synaptic 2, full insert sequence. // chr8 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0 /// BC019984 // GenBank // Mus musculus glycoprotein, synaptic 2, mRNA (cDNA clone MGC:28685 IMAGE:4240045), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC094046 // GenBank // Mus musculus glycoprotein, synaptic 2, mRNA (cDNA clone MGC:102359 IMAGE:5064002), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_006530554 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus trans-2,3-enoyl-CoA reductase (Tecr), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// GENSCAN00000002800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83571808:83588131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_001199593 // RefSeq // Mus musculus protein kinase N1 (Pkn1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NM_177262 // RefSeq // Mus musculus protein kinase N1 (Pkn1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// XM_006531110 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protein kinase N1 (Pkn1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSMUST00000005616 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:83669762:83699179:-1 gene:ENSMUSG00000057672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000132945 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:83670099:83699097:-1 gene:ENSMUSG00000057672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSMUST00000144258 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:83670091:83694060:-1 gene:ENSMUSG00000057672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC052923 // GenBank // Mus musculus protein kinase N1, mRNA (cDNA clone MGC:56917 IMAGE:6312892), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSMUST00000128523 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:83670127:83675567:-1 gene:ENSMUSG00000057672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// AK134741 // GenBank HTC // Mus musculus adult male medulla oblongata cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6330544D07 product:Protein kinase C-like 1 (EC 2.7.1.-) (Protein-kinase C-related kinase 1) (Protein kinase C-like PKN) (Serine-threonine protein kinase N) (Fragment), full insert sequence. // chr8 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// GENSCAN00000046993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:83670165:83698987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0
ENSMUST00000098595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:83932329:83955205:-1 gene:ENSMUSG00000074219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK157878 // GenBank HTC // Mus musculus adult inner ear cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F930003C09 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001291292 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 2210011C24 gene (2210011C24Rik), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000056686 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:84010239:84011411:-1 gene:ENSMUSG00000074217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000188195 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:84010767:84011411:-1 gene:ENSMUSG00000074217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000190457 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:novel chromosome:GRCm38:8:84010222:84012158:-1 gene:ENSMUSG00000074217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84011076:84011684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_016671 // RefSeq // Mus musculus interleukin 27 receptor, alpha (Il27ra), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000005601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84030287:84042575:-1 gene:ENSMUSG00000005465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF053005 // GenBank // Mus musculus class I cytokine receptor (Wsx1) mRNA, complete cds. // chr8 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// AF265243 // GenBank // Mus musculus type-I T cell cytokine receptor mRNA, complete cds. // chr8 // 82 // 93 // 23 // 28 // 0 /// AK040457 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430099B21 product:T cell cytokine receptor, full insert sequence. // chr8 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC032878 // GenBank // Mus musculus interleukin 27 receptor, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:41112 IMAGE:1244998), complete cds. // chr8 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84031031:84042534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_173184 // RefSeq // Mus musculus relaxin 3 (Rln3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000061923 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:84042929:84045000:-1 gene:ENSMUSG00000045232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB076565 // GenBank // Mus musculus insl7 mRNA for insulin-like 7, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84043093:84044956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
ENSMUST00000098592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84063561:84065137:-1 gene:ENSMUSG00000074215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK141526 // GenBank HTC // Mus musculus adult male hippocampus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C630007G15 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_405054 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA C330011M18 gene (C330011M18Rik), misc_RNA. // chr8 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// ENSMUST00000071067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84065236:84067287:-1 gene:ENSMUSG00000056753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK049185 // GenBank HTC // Mus musculus ES cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C330011M18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172502 // RefSeq // Mus musculus DDB1 and CUL4 associated factor 15 (Dcaf15), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000041367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84097075:84104773:-1 gene:ENSMUSG00000037103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC057552 // GenBank // Mus musculus cDNA sequence BC057552, mRNA (cDNA clone MGC:66593 IMAGE:6403172), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84097453:84104748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_145970 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 1A (Cc2d1a), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000040383 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:84132828:84147936:-1 gene:ENSMUSG00000036686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000117424 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:84132828:84147865:-1 gene:ENSMUSG00000036686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000154029 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:84132837:84136788:-1 gene:ENSMUSG00000036686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC016188 // GenBank // Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 1A, mRNA (cDNA clone MGC:27560 IMAGE:4482793), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC027028 // GenBank // Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 1A, mRNA (cDNA clone MGC:38983 IMAGE:5363547), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC030439 // GenBank // Mus musculus coiled-coil and C2 domain containing 1A, mRNA (cDNA clone IMAGE:5373578), complete cds. // chr8 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// DQ329239 // GenBank // Mus musculus Freud-1 (Cc2d1a) mRNA, complete cds. // chr8 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84133237:84147706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_194059 // RefSeq // Mus musculus nanos homolog 3 (Drosophila) (Nanos3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000070102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84173733:84176552:-1 gene:ENSMUSG00000056155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB095973 // GenBank // Mus musculus nos3 mRNA for Nanos3, complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC119513 // GenBank // Mus musculus nanos homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:141147 IMAGE:40055381), complete cds. // chr8 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// BC119514 // GenBank // Mus musculus nanos homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:141148 IMAGE:40055383), complete cds. // chr8 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// XM_006530982 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nanos homolog 3 (Drosophila) (Nanos3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84173905:84176531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
NR_030534 // RefSeq // Mus musculus microRNA 181d (Mir181d), microRNA. // chr8 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// ENSMUST00000102383 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:84178716:84178787:-1 gene:ENSMUSG00000076338 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// mmu-mir-181d // miRBase Micro RNA Database // MI0005450 Mus musculus miR-181d stem-loop // chr8 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// NONMMUT066372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0
NR_029821 // RefSeq // Mus musculus microRNA 181c (Mir181c), microRNA. // chr8 // 85 // 90 // 22 // 26 // 0 /// ENSMUST00000083549 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:84178863:84178968:-1 gene:ENSMUSG00000065483 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// mmu-mir-181c // miRBase Micro RNA Database // MI0000724 Mus musculus miR-181c stem-loop // chr8 // 85 // 90 // 22 // 26 // 0 /// NONMMUT066373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 85 // 90 // 22 // 26 // 0
NM_172503 // RefSeq // Mus musculus zinc finger SWIM-type containing 4 (Zswim4), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000039480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84210942:84237042:-1 gene:ENSMUSG00000035671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC058080 // GenBank // Mus musculus zinc finger, SWIM domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:66591 IMAGE:6822376), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84211946:84237004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_001007571 // RefSeq // Mus musculus DNA segment, Chr 8, ERATO Doi 738, expressed (D8Ertd738e), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000019506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84246237:84249761:-1 gene:ENSMUSG00000019362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK146163 // GenBank HTC // Mus musculus CRL-1722 L5178Y-R cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:I730026J21 product:Leydig cell tumor 10 kDa protein homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC024662 // GenBank // Mus musculus DNA segment, Chr 8, ERATO Doi 738, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:18818 IMAGE:4205912), complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84246553:84328611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSMUST00000082458 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:84380449:84380581:-1 gene:ENSMUSG00000064392 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT066386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_010499 // RefSeq // Mus musculus immediate early response 2 (Ier2), mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000060427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84661331:84662852:-1 gene:ENSMUSG00000053560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC002067 // GenBank // Mus musculus immediate early response 2, mRNA (cDNA clone MGC:6170 IMAGE:3590296), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// M59821 // GenBank // Mouse growth factor-inducible protein (pip92) mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84662086:84677244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_025788 // RefSeq // Mus musculus nucleus accumbens associated 1, BEN and BTB (POZ) domain containing (Nacc1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006531294 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nucleus accumbens associated 1, BEN and BTB (POZ) domain containing (Nacc1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000001975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84670483:84687862:-1 gene:ENSMUSG00000001910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC048157 // GenBank // Mus musculus nucleus accumbens associated 1, BEN and BTB (POZ) domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:61327 IMAGE:5697941), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC052706 // GenBank // Mus musculus nucleus accumbens associated 1, BEN and BTB (POZ) domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:64707 IMAGE:5702150), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC054800 // GenBank // Mus musculus nucleus accumbens associated 1, BEN and BTB (POZ) domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:65691 IMAGE:6850337), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_201227 // RefSeq // Mus musculus DAN domain family, member 5 (Dand5), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000065539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84815405:84822823:-1 gene:ENSMUSG00000053226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AB070694 // GenBank // Mus musculus SP1 mRNA for cysteine kont protein, complete cds. // chr8 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AY387409 // GenBank // Mus musculus cerberus-like 2 mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// BC115659 // GenBank // Mus musculus DAN domain family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:144570 IMAGE:40103255), complete cds. // chr8 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// NR_033145 // RefSeq // Mus musculus DAN domain family, member 5 (Dand5), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr8 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONMMUT066408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_007591 // RefSeq // Mus musculus calreticulin (Calr), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000003912 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:84841850:84846934:-1 gene:ENSMUSG00000003814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000154774 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:84842596:84844916:-1 gene:ENSMUSG00000003814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0 /// BC003453 // GenBank // Mus musculus calreticulin, mRNA (cDNA clone MGC:6209 IMAGE:2655918), complete cds. // chr8 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// EU639407 // GenBank // Mus musculus strain KM calreticulin mRNA, complete cds. // chr8 // 81 // 72 // 17 // 21 // 0 /// M92988 // GenBank // Mouse calregulin (ERp60) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// X14926 // GenBank // Mouse mRNA for calreticulin. // chr8 // 78 // 93 // 21 // 27 // 0 /// ENSMUST00000125998 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:84845750:84846826:-1 gene:ENSMUSG00000003814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// ENSMUST00000128028 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:84845437:84846830:-1 gene:ENSMUSG00000003814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000039212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84842647:84846798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONMMUT066413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
GENSCAN00000039211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84854120:84855648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001044744 // RefSeq // Mus musculus glutaryl-Coenzyme A dehydrogenase (Gcdh), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_008097 // RefSeq // Mus musculus glutaryl-Coenzyme A dehydrogenase (Gcdh), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000003907 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:84886393:84893917:-1 gene:ENSMUSG00000003809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000109745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84886393:84893921:-1 gene:ENSMUSG00000003809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000139180 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:84890738:84893285:-1 gene:ENSMUSG00000003809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// BC061158 // GenBank // Mus musculus glutaryl-Coenzyme A dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:74295 IMAGE:30314273), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// U18992 // GenBank // Mus musculus glutaryl-CoA dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr8 // 77 // 88 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84887610:84893681:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_019945 // RefSeq // Mus musculus microtubule associated serine/threonine kinase 1 (Mast1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000109741 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:84911903:84937353:-1 gene:ENSMUSG00000053693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000119820 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:84911908:84937359:-1 gene:ENSMUSG00000053693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSMUST00000153000 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:84911906:84924114:-1 gene:ENSMUSG00000053693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AF077818 // GenBank // Mus musculus syntrophin-associated serine-threonine protein kinase mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AK122411 // GenBank // Mus musculus premature mRNA for mKIAA0973 protein. // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC039230 // GenBank HTC // Mus musculus microtubule associated serine/threonine kinase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:4527728), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC054524 // GenBank // Mus musculus microtubule associated serine/threonine kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:62208 IMAGE:6400705), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84911986:84946045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_008416 // RefSeq // Mus musculus jun B proto-oncogene (Junb), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000064922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:84976909:84978748:-1 gene:ENSMUSG00000052837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC003790 // GenBank // Mus musculus Jun-B oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:6021 IMAGE:3592704), complete cds. // chr8 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// BC092302 // GenBank // Mus musculus Jun-B oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:103182 IMAGE:6399302), complete cds. // chr8 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// J03236 // GenBank // Mouse (M.musculus) jun-B mRNA, complete cds. // chr8 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// X54332 // GenBank // M.musculus RNA for MyD21 KS end. // chr8 // 75 // 44 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000039185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:84977395:84984884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_001130194 // RefSeq // Mus musculus bestrophin 2 (Best2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NR_052011 // RefSeq // Mus musculus bestrophin 2 (Best2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006530819 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus bestrophin 2 (Best2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000059072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85007202:85014408:-1 gene:ENSMUSG00000052819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AY450428 // GenBank // Mus musculus vitelliform macular dystrophy 2-like protein 1 (Vmd2l1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC019528 // GenBank // Mus musculus bestrophin 2, mRNA (cDNA clone MGC:28568 IMAGE:4208860), complete cds. // chr8 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// BC031186 // GenBank // Mus musculus bestrophin 2, mRNA (cDNA clone MGC:37621 IMAGE:4989959), complete cds. // chr8 // 93 // 86 // 28 // 30 // 0 /// BC036157 // GenBank // Mus musculus bestrophin 2, mRNA (cDNA clone MGC:37437 IMAGE:4982413), complete cds. // chr8 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// BC036163 // GenBank // Mus musculus bestrophin 2, mRNA (cDNA clone MGC:37489 IMAGE:4984410), complete cds. // chr8 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85007561:85013533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
NM_019652 // RefSeq // Mus musculus arsA arsenite transporter, ATP-binding, homolog 1 (bacterial) (Asna1), mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSMUST00000064314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85017934:85025278:-1 gene:ENSMUSG00000052456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF039405 // GenBank // Mus musculus arsenite-translocating ATPase (ArsA) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AK192795 // GenBank HTC // Mus musculus cDNA, clone:Y1G0109P11, strand:plus, reference:ENSEMBL:Mouse-Transcript-ENST:ENSMUST00000064314, based on BLAT search. // chr8 // 80 // 34 // 8 // 10 // 0 /// BC016453 // GenBank // Mus musculus arsA arsenite transporter, ATP-binding, homolog 1 (bacterial), mRNA (cDNA clone MGC:25507 IMAGE:4920063), complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC018430 // GenBank // Mus musculus arsA arsenite transporter, ATP-binding, homolog 1 (bacterial), mRNA (cDNA clone MGC:28999 IMAGE:2616359), complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC083335 // GenBank // Mus musculus arsA arsenite transporter, ATP-binding, homolog 1 (bacterial), mRNA (cDNA clone MGC:102047 IMAGE:5717763), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85018124:85025265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001037745 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 791 (Zfp791), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000098550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85109647:85119637:-1 gene:ENSMUSG00000074194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC063331 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 791, mRNA (cDNA clone MGC:74368 IMAGE:30295602), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC100354 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 791, mRNA (cDNA clone MGC:117728 IMAGE:30935270), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85102292:85113454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_022997 // RefSeq // Mus musculus vacuolar protein sorting 35 (Vps35), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000034131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85260397:85299513:-1 gene:ENSMUSG00000031696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF226323 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 35 (Vps35) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// AK135680 // GenBank HTC // Mus musculus in vitro fertilized eggs cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7420403D16 product:vacuolar protein sorting 35, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC005469 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 35, mRNA (cDNA clone MGC:6633 IMAGE:3492842), complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC006637 // GenBank // Mus musculus vacuolar protein sorting 35, mRNA (cDNA clone MGC:11488 IMAGE:3969440), complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// U47024 // GenBank // Mus musculus maternal-embryonic 3 (Mem3) mRNA, complete cds. // chr8 // 79 // 100 // 27 // 34 // 0 /// GENSCAN00000039193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85261130:85287817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_025722 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4921524J17 gene (4921524J17Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NR_033144 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4921524J17 gene (4921524J17Rik), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// ENSMUST00000047749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85408759:85432841:-1 gene:ENSMUSG00000036934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC027027 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA 4921524J17 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5374582), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr8 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// BC040087 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921524J17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:49053 IMAGE:3490529), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// BC050139 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4921524J17 gene, mRNA (cDNA clone MGC:60450 IMAGE:30009011), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
NM_019794 // RefSeq // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 2 (Dnaja2), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85537640:85555271:-1 gene:ENSMUSG00000031701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB028853 // GenBank // Mus musculus mRNA for mDj3, complete cds. // chr8 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// BC003420 // GenBank // Mus musculus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:6445 IMAGE:2582183), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85539216:85555247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_001081324 // RefSeq // Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 2 (Neto2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006531438 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 2 (Neto2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000109686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85636588:85690973:-1 gene:ENSMUSG00000036902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY138991 // GenBank // Mus musculus brain-specific transmembrane protein BTCL2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC068168 // GenBank HTC // Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:30544936), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC151050 // GenBank // Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:183963 IMAGE:9087963), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC157941 // GenBank // Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:189934 IMAGE:9088121), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC172104 // GenBank // Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:198809 IMAGE:9054390), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC172139 // GenBank // Mus musculus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:198844 IMAGE:9054809), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85640536:85716826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_028007 // RefSeq // Mus musculus integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 (Itfg1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSMUST00000034140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:85717557:85840949:-1 gene:ENSMUSG00000031703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC003977 // GenBank // Mus musculus integrin alpha FG-GAP repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:7443 IMAGE:3489518), complete cds. // chr8 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// AK040124 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430066J11 product:RIKEN cDNA 2310047C21 gene, full insert sequence. // chr8 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// GENSCAN00000035110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85719524:85854771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
ENSMUST00000160428 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:85853373:85854437:-1 gene:ENSMUSG00000090043 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:85719524:85854771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSMUST00000082690 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:86671236:86671343:-1 gene:ENSMUSG00000064624 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_009172 // RefSeq // Mus musculus seven in absentia 1A (Siah1a), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006530784 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus seven in absentia 1A (Siah1a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// ENSMUST00000045296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:86723940:86746006:-1 gene:ENSMUSG00000036840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC046317 // GenBank // Mus musculus seven in absentia 1A, mRNA (cDNA clone MGC:54763 IMAGE:6314641), complete cds. // chr8 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONMMUT066496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// NONMMUT066497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0
NM_030563 // RefSeq // Mus musculus NEDD4 binding protein 1 (N4bp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:86841139:86885258:-1 gene:ENSMUSG00000031652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC004022 // GenBank // Mus musculus NEDD4 binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:3494358), complete cds. // chr8 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// BC111031 // GenBank HTC // Mus musculus NEDD4 binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5374249), with apparent retained intron. // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000011699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:86844687:86903426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
ENSMUST00000184702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:87195088:87199850:-1 gene:ENSMUSG00000099207 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK139810 // GenBank HTC // Mus musculus 2 cells egg cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B020018I07 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// KnowTID_00007315 // Luo lincRNA // Non-coding transcript identified by Luo, et al. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019626 // RefSeq // Mus musculus cerebellin 1 precursor protein (Cbln1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:87468854:87472592:-1 gene:ENSMUSG00000031654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000169693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:87469238:87472386:-1 gene:ENSMUSG00000031654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC051956 // GenBank // Mus musculus cerebellin 1 precursor protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:5684648), partial cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC055730 // GenBank // Mus musculus cerebellin 1 precursor protein, mRNA (cDNA clone MGC:66947 IMAGE:6404555), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC132120 // GenBank // Mus musculus cerebellin 1 precursor protein, mRNA (cDNA clone MGC:163751 IMAGE:40130397), complete cds. // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC132122 // GenBank // Mus musculus cerebellin 1 precursor protein, mRNA (cDNA clone MGC:163753 IMAGE:40130399), complete cds. // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// X61448 // GenBank // M.musculus mRNA for D3 clone. // chr8 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000011711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:87470254:87537930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSMUST00000069786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:88138079:88138517:-1 gene:ENSMUSG00000055968 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AK044128 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cortex cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A830092P13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONMMUT066555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_027840 // RefSeq // Mus musculus sorting nexin 20 (Snx20), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:88626828:88636128:-1 gene:ENSMUSG00000031662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF395844 // GenBank // Mus musculus SNX20 (Snx20) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC039809 // GenBank // Mus musculus sorting nexin 20, mRNA (cDNA clone MGC:48241 IMAGE:2938247), complete cds. // chr8 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:88627159:88631968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_021390 // RefSeq // Mus musculus sal-like 1 (Drosophila) (Sall1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006531237 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus sal-like 1 (Drosophila) (Sall1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000034090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:89027248:89044162:-1 gene:ENSMUSG00000031665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB051409 // GenBank // Mus musculus mRNA for zinc finger protein Sall1, complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC062937 // GenBank // Mus musculus sal-like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:86172 IMAGE:6839137), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:89028378:89054637:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
XM_006531543 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus predicted gene 6625 (Gm6625), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000177870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:89146747:89147247:-1 gene:ENSMUSG00000094790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000054239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:89146747:89169541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
ENSMUST00000093326 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:89186946:89187560:-1 gene:ENSMUSG00000069962 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000054237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:89186943:89187560:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0
NM_172913 // RefSeq // Mus musculus TOX high mobility group box family member 3 (Tox3), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006530988 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TOX high mobility group box family member 3 (Tox3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006530990 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus TOX high mobility group box family member 3 (Tox3), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSMUST00000109621 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:90247040:90348343:-1 gene:ENSMUSG00000043668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176034 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:90257946:90348126:-1 gene:ENSMUSG00000043668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSMUST00000176616 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:90252706:90348131:-1 gene:ENSMUSG00000043668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC052044 // GenBank // Mus musculus TOX high mobility group box family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:62415 IMAGE:5708447), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// EF410108 // GenBank // Mus musculus Accn1/Tnrc9 trans-spliced mRNA sequence. // chr8 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000040278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:90231437:90275287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000098517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:90907939:90908415:-1 gene:ENSMUSG00000074171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK142189 // GenBank HTC // Mus musculus 13 days embryo heart cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D330008J09 product:hypothetical Proline-rich region profile containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173431 // RefSeq // Mus musculus Rpgrip1-like (Rpgrip1l), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530992 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Rpgrip1-like (Rpgrip1l), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000047783 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:91217030:91313262:-1 gene:ENSMUSG00000033282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000139113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:91218956:91313222:-1 gene:ENSMUSG00000033282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AJ344253 // GenBank // Mus musculus mRNA for Fantom protein (Ftm gene). // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:91220177:91313434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001253822 // RefSeq // Mus musculus Iroquois related homeobox 3 (Irx3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_008393 // RefSeq // Mus musculus Iroquois related homeobox 3 (Irx3), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000093312 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:91798525:91801915:-1 gene:ENSMUSG00000031734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000175795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:91798525:91801916:-1 gene:ENSMUSG00000031734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085500 // GenBank // Mus musculus Iroquois related homeobox 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:102148 IMAGE:30539191), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:91781523:91801240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NR_033641 // RefSeq // Mus musculus colorectal neoplasia differentially expressed (non-protein coding) (Crnde), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NR_110452 // RefSeq // Mus musculus colorectal neoplasia differentially expressed (non-protein coding) (Crnde), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000034183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:92326038:92356120:-1 gene:ENSMUSG00000031736 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000178064 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:92326038:92346870:-1 gene:ENSMUSG00000031736 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSMUST00000180102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:92336211:92355764:-1 gene:ENSMUSG00000031736 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000179421 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:92326038:92355831:-1 gene:ENSMUSG00000031736 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONMMUT066695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONMMUT066696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONMMUT066699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONMMUT066697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001013764 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 1A (Ces1a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006530997 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 1A (Ces1a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006530999 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 1A (Ces1a), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000095211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:93020214:93048192:-1 gene:ENSMUSG00000071047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:92996506:93048108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
XM_006544349 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 1H (Ces1h), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000145041 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:93351843:93363676:-1 gene:ENSMUSG00000074156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AK009689 // GenBank HTC // Mus musculus adult male tongue cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:2310039D24 product:similar to CARBOXYLESTERASE (EC 3.1.1.1) (FRAGMENT) [Rattus rattus], full insert sequence. // chr8 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000024379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:93352024:93379725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001081372 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 1B (Ces1b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000109582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:93056727:93080017:-1 gene:ENSMUSG00000078964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_007954 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 1C (Ces1c), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000034189 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:93099015:93131271:-1 gene:ENSMUSG00000057400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// M57960 // GenBank // Mouse carboxylesterase mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// AF034435 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase precursor, mRNA, complete cds. // chr8 // 60 // 100 // 12 // 20 // 0 /// BC028907 // GenBank // Mus musculus esterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:18575 IMAGE:4196339), complete cds. // chr8 // 60 // 100 // 12 // 20 // 0 /// ENSMUST00000131822 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:93107077:93131283:-1 gene:ENSMUSG00000057400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// AK050444 // GenBank HTC // Mus musculus adult male liver tumor cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C730048K07 product:esterase 1, full insert sequence. // chr8 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// GENSCAN00000024389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:93057352:93131258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
NM_053200 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 1D (Ces1d), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000034172 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:93166068:93197838:-1 gene:ENSMUSG00000056973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB023631 // GenBank // Mus musculus CESmMH1 mRNA for carboxylesterase MH1, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF378751 // GenBank // Mus musculus triacylglycerol hydrolase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC019198 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 3, mRNA (cDNA clone MGC:29228 IMAGE:5040523), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:93148447:93197607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_133660 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 1E (Ces1e), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000034173 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:93201218:93229619:-1 gene:ENSMUSG00000061959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000176282 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:93201404:93229618:-1 gene:ENSMUSG00000061959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC019208 // GenBank // Mus musculus esterase 22, mRNA (cDNA clone MGC:29420 IMAGE:5052893), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006530652 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 1E (Ces1e), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// GENSCAN00000024380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:93201404:93244213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
NM_144930 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 1F (Ces1f), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000034178 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:93256236:93279747:-1 gene:ENSMUSG00000031725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB023632 // GenBank // Mus musculus CESmML1 mRNA for carboxylesterase ML1, partial cds. // chr8 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// BC013479 // GenBank // Mus musculus expressed sequence AU018778, mRNA (cDNA clone MGC:18894 IMAGE:4239756), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:93256429:93337154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_021456 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 1G (Ces1g), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000044602 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:93302369:93337308:-1 gene:ENSMUSG00000057074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC021150 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:13844 IMAGE:4163576), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC026897 // GenBank // Mus musculus carboxylesterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:18805 IMAGE:4195247), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:93256429:93337154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001003951 // RefSeq // Mus musculus carboxylesterase 5A (Ces5a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 72 // 72 // 0 /// XM_006531322 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus carboxylesterase 5A (Ces5a), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 67 // 67 // 0 /// ENSMUST00000077816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:93499378:93535707:-1 gene:ENSMUSG00000058019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 72 // 72 // 0 /// AB186393 // GenBank // Mus musculus cauxin mRNA for carboxylesterase-like urinary excreted protein, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 72 // 72 // 0 /// GENSCAN00000024384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:93514124:93563957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 72 // 72 // 0
NM_011787 // RefSeq // Mus musculus autocrine motility factor receptor (Amfr), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSMUST00000053766 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:93971588:94012663:-1 gene:ENSMUSG00000031751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF124144 // GenBank // Mus musculus autocrine motility factor receptor (Amfr) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// BC034538 // GenBank // Mus musculus autocrine motility factor receptor, mRNA (cDNA clone MGC:19116 IMAGE:4209258), complete cds. // chr8 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC040338 // GenBank // Mus musculus autocrine motility factor receptor, mRNA (cDNA clone MGC:11402 IMAGE:3710780), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:93973167:94036892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
NM_026623 // RefSeq // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 21 (Nudt21), mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000034204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94017770:94037021:-1 gene:ENSMUSG00000031754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000117148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:3:21049565:21050248:1 gene:ENSMUSG00000039617 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// BC008270 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 21, mRNA (cDNA clone MGC:6310 IMAGE:2811199), complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// BC090834 // GenBank // Mus musculus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 21, mRNA (cDNA clone MGC:102014 IMAGE:6855233), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000005736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:3:21049565:21050248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:93973167:94036892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1
NM_026116 // RefSeq // Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 2 (human) (Bbs2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006531303 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 2 (human) (Bbs2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034206 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94067954:94098811:-1 gene:ENSMUSG00000031755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF342737 // GenBank // Mus musculus BBS2 (Bbs2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC057184 // GenBank // Mus musculus Bardet-Biedl syndrome 2 (human), mRNA (cDNA clone MGC:67844 IMAGE:5066846), complete cds. // chr8 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000043249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94068276:94102555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0
ENSMUST00000180612 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:8:94422899:94434157:-1 gene:ENSMUSG00000097194 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK080381 // GenBank HTC // Mus musculus 3 days neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A630085K21 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000180445 // ENSEMBL // ensembl_lincrna:known chromosome:GRCm38:8:94429815:94434282:-1 gene:ENSMUSG00000097194 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC103768 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:30840270. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_028221 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 192, member A (Fam192a), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_006530539 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 192, member A (Fam192a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_006530542 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus family with sequence similarity 192, member A (Fam192a), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000034226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94574943:94601726:-1 gene:ENSMUSG00000031774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC016088 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310065K24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:27607 IMAGE:4503452), complete cds. // chr8 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC025472 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310065K24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:36442 IMAGE:5353148), complete cds. // chr8 // 86 // 88 // 18 // 21 // 0 /// BC027060 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310065K24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:36461 IMAGE:5358022), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC027818 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310065K24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:36404 IMAGE:5320967), complete cds. // chr8 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0 /// BC040818 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310065K24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:49655 IMAGE:4194531), complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// BC023158 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 2310065K24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:36326 IMAGE:4946201), complete cds. // chr8 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000055677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94575637:94612564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_026385 // RefSeq // Mus musculus plasma membrane proteolipid (Pllp), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000034227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94674895:94696242:-1 gene:ENSMUSG00000031775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC024534 // GenBank // Mus musculus plasma membrane proteolipid, mRNA (cDNA clone MGC:37565 IMAGE:4987882), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000055702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94676163:94696170:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_053246 // RefSeq // Mus musculus docking protein 4 (Dok4), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000046461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94863828:94876312:-1 gene:ENSMUSG00000040631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF418207 // GenBank // Mus musculus Dok4 mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// AK142621 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days lactation, adult female mammary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:D730016N14 product:downstream of tyrosine kinase 4, full insert sequence. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC004705 // GenBank // Mus musculus docking protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:6669 IMAGE:3499419), complete cds. // chr8 // 91 // 89 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94865129:94870925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0
NM_001033533 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 102A (Ccdc102a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000077955 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:94902869:94918098:-1 gene:ENSMUSG00000063605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC027663 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 102A, mRNA (cDNA clone IMAGE:1230948), partial cds. // chr8 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// BC139307 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 102A, mRNA (cDNA clone MGC:170934 IMAGE:8862329), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC139308 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 102A, mRNA (cDNA clone MGC:170935 IMAGE:8862330), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000055686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:94889258:94913664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENSMUST00000093603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:94964679:94969756:-1 gene:ENSMUSG00000070111 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK137560 // GenBank HTC // Mus musculus adult male bone cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:9830141N18 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001195413 // RefSeq // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel beta 1 (Cngb1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006531140 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cyclic nucleotide gated channel beta 1 (Cngb1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000119870 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:95239045:95306585:-1 gene:ENSMUSG00000031789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000120044 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:95240981:95281590:-1 gene:ENSMUSG00000031789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000121162 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:95240987:95281610:-1 gene:ENSMUSG00000031789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// HQ116386 // GenBank // Mus musculus strain 129/SvEv cGMP-gated cation channel beta subunit (Cngb1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000055692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95223798:95303829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1
NM_001195413 // RefSeq // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel beta 1 (Cngb1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000119870 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:95239045:95306585:-1 gene:ENSMUSG00000031789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// HQ116386 // GenBank // Mus musculus strain 129/SvEv cGMP-gated cation channel beta subunit (Cngb1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95223798:95303829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001195413 // RefSeq // Mus musculus cyclic nucleotide gated channel beta 1 (Cngb1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000119870 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:95239045:95306585:-1 gene:ENSMUSG00000031789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// HQ116386 // GenBank // Mus musculus strain 129/SvEv cGMP-gated cation channel beta subunit (Cngb1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95223798:95303829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSMUST00000098479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:95323014:95325263:-1 gene:ENSMUSG00000074140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK148655 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate sympathetic ganglion cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:7120431E04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024467 // RefSeq // Mus musculus zinc finger protein 319 (Zfp319), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000057717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:95326137:95331950:-1 gene:ENSMUSG00000046556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK048624 // GenBank HTC // Mus musculus 16 days embryo head cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C130089H24 product:zinc finger protein 319, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK122500 // GenBank // Mus musculus mRNA for mKIAA1388 protein. // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC059823 // GenBank // Mus musculus zinc finger protein 319, mRNA (cDNA clone MGC:69595 IMAGE:6843792), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95327828:95329573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_008187 // RefSeq // Mus musculus gene trap locus 3 (Gtl3), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000034249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:95420252:95434869:-1 gene:ENSMUSG00000031796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC119023 // GenBank // Mus musculus gene trap locus 3, mRNA (cDNA clone MGC:155339 IMAGE:8733772), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC119025 // GenBank // Mus musculus gene trap locus 3, mRNA (cDNA clone MGC:155341 IMAGE:8733774), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// Z54179 // GenBank // M.musculus mRNA (evolutionary conserved transcript). // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95386202:95428523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_009974 // RefSeq // Mus musculus casein kinase 2, alpha prime polypeptide (Csnk2a2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006530642 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus casein kinase 2, alpha prime polypeptide (Csnk2a2), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSMUST00000056919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:95446096:95488820:-1 gene:ENSMUSG00000046707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF012251 // GenBank // Mus musculus casein kinase II, alpha prime subunit (Cskn2a2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC057862 // GenBank // Mus musculus casein kinase 2, alpha prime polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:68186 IMAGE:5316132), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000055690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95450362:95490007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_027640 // RefSeq // Mus musculus protease, serine 54 (Prss54), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531368 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus protease, serine 54 (Prss54), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000052690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:95559133:95575455:-1 gene:ENSMUSG00000048400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000180075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:95559292:95575197:-1 gene:ENSMUSG00000048400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC144859 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931432M23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:178415 IMAGE:9053407), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC145787 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931432M23 gene, mRNA (cDNA clone MGC:175674 IMAGE:40131090), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AK016501 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931432M23 product:hypothetical Trypsin-like serine proteases structure containing protein, full insert sequence. // chr8 // 56 // 96 // 14 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95559384:95571264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
GENSCAN00000039106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95674736:95675314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSMUST00000083155 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:95746060:95746195:-1 gene:ENSMUSG00000065089 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONMMUT066840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSMUST00000083277 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:95756950:95757084:-1 gene:ENSMUSG00000065211 gene_biotype:snoRNA transcript_biotype:snoRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_172758 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 38, member 7 (Slc38a7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006530878 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus solute carrier family 38, member 7 (Slc38a7), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000040481 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:95835920:95853539:-1 gene:ENSMUSG00000036534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC031853 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 38, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:25764 IMAGE:4009949), complete cds. // chr8 // 80 // 91 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95837569:95848650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_010325 // RefSeq // Mus musculus glutamate oxaloacetate transaminase 2, mitochondrial (Got2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000034097 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:95864134:95888547:-1 gene:ENSMUSG00000031672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSMUST00000121655 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:5:138364260:138365552:-1 gene:ENSMUSG00000080935 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// ENSMUST00000147040 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:95866832:95872392:-1 gene:ENSMUSG00000031672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 89 // 47 // 16 // 18 // 0 /// BC089015 // GenBank // Mus musculus glutamate oxaloacetate transaminase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:115763 IMAGE:30606379), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC089341 // GenBank // Mus musculus glutamate oxaloacetate transaminase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:102129 IMAGE:6832287), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// J02622 // GenBank // Mouse mitochondrial aspartate aminotransferase isoenzyme mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// U82470 // GenBank // Mus musculus aspartate aminotransferase precursor (Got-2) mRNA, Got-2-a allele, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr8 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000039093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:95864731:95888305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 82 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000055792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:5:138364260:138365552:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0
ENSMUST00000119397 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:97427712:97429110:-1 gene:ENSMUSG00000081111 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:97427349:97429110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
ENSMUST00000182678 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:97565603:97566592:-1 gene:ENSMUSG00000098116 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000037785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:97565219:97566592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_009866 // RefSeq // Mus musculus cadherin 11 (Cdh11), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006530624 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus cadherin 11 (Cdh11), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000075190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:102632995:102785111:-1 gene:ENSMUSG00000031673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC046314 // GenBank // Mus musculus cadherin 11, mRNA (cDNA clone MGC:54423 IMAGE:6312939), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// D21253 // GenBank // Mus musculus osf-4 mRNA for OB-cadherin-1, complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// D31963 // GenBank // Mus musculus mRNA for cadherin-11, complete cds. // chr8 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// X77557 // GenBank // M.musculus cadL mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AK045023 // GenBank HTC // Mus musculus 9.5 days embryo parthenogenote cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:B130020F06 product:cadherin 11, full insert sequence. // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000005484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:102634314:102679839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC019439 // GenBank HTC // Mus musculus cadherin 11, mRNA (cDNA clone IMAGE:4037300), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
XM_006531568 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus nuclear pore-associated protein 1-like (LOC101056200), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000000929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:103798939:103825309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0
ENSMUST00000153288 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:104177795:104184599:-1 gene:ENSMUSG00000074128 gene_biotype:antisense transcript_biotype:antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AK135158 // GenBank HTC // Mus musculus 10 days neonate cerebellum cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:6530432O13 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021028 // RefSeq // Mus musculus thymidine kinase 2, mitochondrial (Tk2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NR_045642 // RefSeq // Mus musculus thymidine kinase 2, mitochondrial (Tk2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XR_387768 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus thymidine kinase 2, mitochondrial (Tk2), transcript variant X4, misc_RNA. // chr8 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000050211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104226691:104248558:-1 gene:ENSMUSG00000035824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC019982 // GenBank // Mus musculus thymidine kinase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:28456 IMAGE:4159742), complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// AF105217 // GenBank // Mus musculus thymidine kinase 2 (Tk2) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr8 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// GENSCAN00000000933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104228253:104231241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000000928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104238579:104246180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_153582 // RefSeq // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 4 (Cmtm4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000179802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104348191:104395807:-1 gene:ENSMUSG00000096188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF479815 // GenBank // Mus musculus chemokine-like factor super family 4 (CKLFSF4) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC028852 // GenBank // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:30490 IMAGE:4206772), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104355127:104365826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_153582 // RefSeq // Mus musculus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 4 (Cmtm4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000179802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104348191:104395807:-1 gene:ENSMUSG00000096188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013380 // RefSeq // Mus musculus dynein, cytoplasmic 1 light intermediate chain 2 (Dync1li2), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000041769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104417674:104443047:-1 gene:ENSMUSG00000035770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AK161494 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933404G08 product:Dynein light intermediate chain 2, cytosolic (LIC53/55) (LIC-2) homolog [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC058645 // GenBank // Mus musculus dynein, cytoplasmic 1 light intermediate chain 2, mRNA (cDNA clone MGC:76410 IMAGE:6405596), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006530880 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, cytoplasmic 1 light intermediate chain 2 (Dync1li2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// XM_006530883 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus dynein, cytoplasmic 1 light intermediate chain 2 (Dync1li2), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// AK050575 // GenBank HTC // Mus musculus 2 days neonate thymus thymic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:C920003I06 product:DYNEIN LIGHT INTERMEDIATE CHAIN 2, CYTOSOLIC (LIC53/55) (LIC-2) homolog [Rattus norvegicus], full insert sequence. // chr8 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000000918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104420582:104442801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_180958 // RefSeq // Mus musculus coiled-coil domain containing 79 (Ccdc79), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000064576 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:104446719:104509887:-1 gene:ENSMUSG00000052616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000161520 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:104447037:104509883:-1 gene:ENSMUSG00000052616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000162014 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:104447762:104509910:-1 gene:ENSMUSG00000052616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// AB775896 // GenBank // Mus musculus Terb1 mRNA for telomere repeat binding bouquet formation protein 1, complete cds, strain: C57BL/6. // chr8 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// AK030157 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4933403K19 product:hypothetical Armadillo/plakoglobin ARM repeat profile containing protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// BC129814 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 79, mRNA (cDNA clone IMAGE:40095227), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// ENSMUST00000159713 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:104447038:104509882:-1 gene:ENSMUSG00000052616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 81 // 81 // 35 // 43 // 1 /// BC113771 // GenBank // Mus musculus coiled-coil domain containing 79, mRNA (cDNA clone IMAGE:40060159), complete cds. // chr8 // 81 // 81 // 35 // 43 // 1
NM_001252627 // RefSeq // Mus musculus cadherin 16 (Cdh16), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_001252628 // RefSeq // Mus musculus cadherin 16 (Cdh16), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NM_007663 // RefSeq // Mus musculus cadherin 16 (Cdh16), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000163783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104614141:104624396:-1 gene:ENSMUSG00000031881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF016271 // GenBank // Mus musculus Ksp-cadherin (Cdh16) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC015251 // GenBank // Mus musculus cadherin 16, mRNA (cDNA clone MGC:18342 IMAGE:4235757), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104614387:104674254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_019662 // RefSeq // Mus musculus Ras-related associated with diabetes (Rrad), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:104628066:104631321:-1 gene:ENSMUSG00000031880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF084466 // GenBank // Mus musculus Ras-like GTP-binding protein Rad mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// BC057138 // GenBank // Mus musculus Ras-related associated with diabetes, mRNA (cDNA clone MGC:67999 IMAGE:5149047), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104614387:104674254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_026753 // RefSeq // Mus musculus family with sequence similarity 96, member B (Fam96b), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSMUST00000093234 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCm38:8:104639848:104641701:-1 gene:ENSMUSG00000031879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000163140 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:104639841:104641699:-1 gene:ENSMUSG00000031879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000164884 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:104639839:104641965:-1 gene:ENSMUSG00000031879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC055880 // GenBank // Mus musculus family with sequence similarity 96, member B, mRNA (cDNA clone MGC:68095 IMAGE:4190754), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:104614387:104674254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001271915 // RefSeq // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 9 (B3gnt9), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_178879 // RefSeq // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 9 (B3gnt9), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531541 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 9 (B3gnt9), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105252639:105255151:-1 gene:ENSMUSG00000069920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000136822 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105252638:105255153:-1 gene:ENSMUSG00000069920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000161745 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105254322:105255151:-1 gene:ENSMUSG00000069920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// BC108347 // GenBank // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 9, mRNA (cDNA clone MGC:117964 IMAGE:5010813), complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC120583 // GenBank // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 9, mRNA (cDNA clone MGC:155820 IMAGE:40129506), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC120585 // GenBank // Mus musculus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 9, mRNA (cDNA clone MGC:155822 IMAGE:40129508), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105253555:105254754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
NM_001033161 // RefSeq // Mus musculus TNFRSF1A-associated via death domain (Tradd), mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034359 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105258286:105264609:-1 gene:ENSMUSG00000031887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSMUST00000136239 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105259190:105260120:-1 gene:ENSMUSG00000031887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENSMUST00000147670 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105259757:105264603:-1 gene:ENSMUSG00000031887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// BC132607 // GenBank // Mus musculus TNFRSF1A-associated via death domain, mRNA (cDNA clone MGC:164238 IMAGE:40130884), complete cds. // chr8 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// BC138642 // GenBank // Mus musculus TNFRSF1A-associated via death domain, mRNA (cDNA clone MGC:170267 IMAGE:8861662), complete cds. // chr8 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// ENSMUST00000144762 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105259283:105264581:-1 gene:ENSMUSG00000031887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr8 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// GENSCAN00000046715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105258985:105260672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0
NM_028888 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931428F04 gene (4931428F04Rik), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006531433 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4931428F04 gene (4931428F04Rik), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000171788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105280410:105289528:-1 gene:ENSMUSG00000014837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC043046 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931428F04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:57946 IMAGE:5703896), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC059045 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA 4931428F04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:69815 IMAGE:6816353), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NM_001166394 // RefSeq // Mus musculus RIKEN cDNA 4931428F04 gene (4931428F04Rik), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// XM_006531432 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RIKEN cDNA 4931428F04 gene (4931428F04Rik), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// ENSMUST00000014981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105280410:105289528:-1 gene:ENSMUSG00000014837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// AK016481 // GenBank HTC // Mus musculus adult male testis cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4931428F04 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000046716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105281980:105295659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_177788 // RefSeq // Mus musculus exocyst complex component 3-like (Exoc3l), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_387751 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus exocyst complex component 3-like (Exoc3l), transcript variant X4, misc_RNA. // chr8 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// ENSMUST00000057855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105289924:105296098:-1 gene:ENSMUSG00000043251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC094238 // GenBank // Mus musculus exocyst complex component 3-like, mRNA (cDNA clone MGC:106546 IMAGE:30604935), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105281980:105295659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NR_029761 // RefSeq // Mus musculus microRNA 328 (Mir328), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000093622 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCm38:8:105308364:105308460:-1 gene:ENSMUSG00000070130 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// mmu-mir-328 // miRBase Micro RNA Database // MI0000603 Mus musculus miR-328 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONMMUT066957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177449 // RefSeq // Mus musculus leucine rich repeat containing 29 (Lrrc29), mRNA. // chr8 // 100 // 46 // 19 // 19 // 0 /// XM_006530892 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 29 (Lrrc29), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// XM_006530894 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus leucine rich repeat containing 29 (Lrrc29), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// ENSMUST00000070508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105312341:105326276:-1 gene:ENSMUSG00000041679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 19 // 19 // 0 /// AK148120 // GenBank HTC // Mus musculus B16 F10Y cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:G370024K10 product:weakly similar to F-box/LRR-repeat protein 9 (F-box and leucine-rich repeat protein 9) (F-box protein FBL9) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 100 // 46 // 19 // 19 // 0 /// BC034290 // GenBank // Mus musculus leucine rich repeat containing 29, mRNA (cDNA clone MGC:30479 IMAGE:4038084), complete cds. // chr8 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105312777:105322844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1
NM_177699 // RefSeq // Mus musculus formin homology 2 domain containing 1 (Fhod1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000014922 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105329163:105347953:-1 gene:ENSMUSG00000014778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSMUST00000132777 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105329163:105347909:-1 gene:ENSMUSG00000014778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENSMUST00000136439 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105336553:105337907:-1 gene:ENSMUSG00000014778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 100 // 24 // 11 // 11 // 0 /// AB041045 // GenBank // Mus musculus mRNA for Fhos1, complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC060654 // GenBank // Mus musculus formin homology 2 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:79190 IMAGE:30354865), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000046722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105329397:105347853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0
NM_177791 // RefSeq // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 19 (Kctd19), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000063071 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105382807:105413502:-1 gene:ENSMUSG00000051648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSMUST00000167294 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105382807:105413502:-1 gene:ENSMUSG00000051648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC092530 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:107186 IMAGE:6744085), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC125431 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:159134 IMAGE:40129946), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC125433 // GenBank // Mus musculus potassium channel tetramerisation domain containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:159136 IMAGE:40129948), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000046737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105384647:105401645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_026481 // RefSeq // Mus musculus tubulin polymerization-promoting protein family member 3 (Tppp3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000014990 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105467493:105471526:-1 gene:ENSMUSG00000014846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000176419 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105467683:105468662:-1 gene:ENSMUSG00000014846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSMUST00000177126 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105467669:105469410:-1 gene:ENSMUSG00000014846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC010788 // GenBank // Mus musculus tubulin polymerization-promoting protein family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:18840 IMAGE:4216285), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC116622 // GenBank // Mus musculus tubulin polymerization-promoting protein family member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:40046369), partial cds. // chr8 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105467836:105483783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_175160 // RefSeq // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 1 (Zdhhc1), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000044286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105472481:105484350:-1 gene:ENSMUSG00000039199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC026570 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:36372 IMAGE:4984252), complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC119378 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:155694 IMAGE:8734127), complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC144878 // GenBank // Mus musculus zinc finger, DHHC domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:178434 IMAGE:9053426), complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AK014489 // GenBank HTC // Mus musculus 14 days embryo liver cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:4432412D04 product:similar to DHHC-DOMAIN-CONTAINING CYSTEINE-RICH PROTEIN (FRAGMENT) [Homo sapiens], full insert sequence. // chr8 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// GENSCAN00000046731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105467836:105483783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_013477 // RefSeq // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit D1 (Atp6v0d1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000013304 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105524465:105566047:-1 gene:ENSMUSG00000013160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB088408 // GenBank // Mus musculus Atp6Vod1 mRNA for proton-translocating ATPase d subunit isoform d1, complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC011075 // GenBank // Mus musculus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit D1, mRNA (cDNA clone MGC:18332 IMAGE:3662404), complete cds. // chr8 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// U13840 // GenBank // Mus musculus vacuolar adenosine triphosphatase subunit D mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// U21549 // GenBank // Mus musculus Ac39/physophilin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105524903:105567489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001271806 // RefSeq // Mus musculus agouti related protein (Agrp), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_007427 // RefSeq // Mus musculus agouti related protein (Agrp), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000005849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105566700:105568298:-1 gene:ENSMUSG00000005705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079902 // GenBank // Mus musculus agouti related protein, mRNA (cDNA clone MGC:100050 IMAGE:30611244), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U89484 // GenBank // Mus musculus agouti-related protein (Agrp) mRNA, complete cds. // chr8 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// AK138796 // GenBank HTC // Mus musculus 0 day neonate thymus cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:A430075H22 product:agouti related protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000050127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105524903:105567489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001012638 // RefSeq // Mus musculus adrenocortical dysplasia (Acd), mRNA. // chr8 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// XM_006531171 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adrenocortical dysplasia (Acd), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// XM_006531173 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus adrenocortical dysplasia (Acd), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000042608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105698159:105701095:-1 gene:ENSMUSG00000038000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AK171345 // GenBank HTC // Mus musculus B6-derived CD11 +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F730023F04 product:nuclear receptor-binding SET-domain protein 1, full insert sequence. // chr8 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// BC004682 // GenBank // Mus musculus adrenocortical dysplasia, mRNA (cDNA clone IMAGE:3500864), complete cds. // chr8 // 89 // 47 // 16 // 18 // 0 /// BC138694 // GenBank // Mus musculus adrenocortical dysplasia, mRNA (cDNA clone MGC:170321 IMAGE:8861716), complete cds. // chr8 // 96 // 66 // 24 // 25 // 0 /// BC138695 // GenBank // Mus musculus adrenocortical dysplasia, mRNA (cDNA clone MGC:170322 IMAGE:8861717), complete cds. // chr8 // 96 // 66 // 24 // 25 // 0 /// BC145384 // GenBank // Mus musculus cDNA clone IMAGE:9053942. // chr8 // 96 // 71 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105698404:105701018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 45 // 17 // 17 // 0 /// AF064553 // GenBank // Mus musculus NSD1 protein mRNA, complete cds. // chr8 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1
NM_198299 // RefSeq // Mus musculus enkurin domain containing 1 (Enkd1), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006530543 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus enkurin domain containing 1 (Enkd1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSMUST00000013299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105703655:105707933:-1 gene:ENSMUSG00000013155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC018168 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA E130303B06 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:4165090), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC023921 // GenBank HTC // Mus musculus RIKEN cDNA E130303B06 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:5323439), with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC052498 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA E130303B06 gene, mRNA (cDNA clone MGC:62932 IMAGE:1245862), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105703861:105707908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONMMUT066978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_027469 // RefSeq // Mus musculus glucose-fructose oxidoreductase domain containing 2 (Gfod2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531348 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucose-fructose oxidoreductase domain containing 2 (Gfod2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006531350 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucose-fructose oxidoreductase domain containing 2 (Gfod2), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006531351 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus glucose-fructose oxidoreductase domain containing 2 (Gfod2), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSMUST00000013294 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105713854:105758664:-1 gene:ENSMUSG00000013150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSMUST00000135959 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105727101:105758596:-1 gene:ENSMUSG00000013150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSMUST00000155038 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCm38:8:105717417:105758630:-1 gene:ENSMUSG00000013150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC013623 // GenBank // Mus musculus glucose-fructose oxidoreductase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:11740 IMAGE:3969153), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105716752:105728246:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONMMUT066979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_145824 // RefSeq // Mus musculus RAN binding protein 10 (Ranbp10), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006531427 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus RAN binding protein 10 (Ranbp10), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000041400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105768308:105827350:-1 gene:ENSMUSG00000037415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY337314 // GenBank // Mus musculus Ran-binding protein 10 (Ranbp10) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC024698 // GenBank // Mus musculus RAN binding protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:30446 IMAGE:3667000), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// EU281316 // GenBank // Mus musculus Ran binding protein 10 (Ranbp10) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105771587:105827184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_023182 // RefSeq // Mus musculus chymotrypsin-like (Ctrl), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105931994:105933862:-1 gene:ENSMUSG00000031896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB016228 // GenBank // Mus musculus mRNA for chymopasin, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087918 // GenBank // Mus musculus chymotrypsin-like, mRNA (cDNA clone MGC:107264 IMAGE:30308135), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AK003074 // GenBank HTC // Mus musculus adult male spleen cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:0910001G08 product:chymotrypsin-like, full insert sequence. // chr8 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000050148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105932055:105933830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_177150 // RefSeq // Mus musculus centromere protein T (Cenpt), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSMUST00000040776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105844678:105852008:-1 gene:ENSMUSG00000036672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AK089172 // GenBank HTC // Mus musculus NOD-derived CD11c +ve dendritic cells cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:F630003M23 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC022690 // GenBank // Mus musculus centromere protein T, mRNA (cDNA clone IMAGE:4456744), partial cds. // chr8 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// BC080832 // GenBank // Mus musculus RIKEN cDNA G630055P03 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:30468471). // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC121824 // GenBank // Mus musculus centromere protein T, mRNA (cDNA clone MGC:148210 IMAGE:40107149), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105844872:105851983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_013640 // RefSeq // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 10 (Psmb10), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006530769 // RefSeq // PREDICTED: Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 10 (Psmb10), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSMUST00000034369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105935728:105938392:-1 gene:ENSMUSG00000031897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC004730 // GenBank // Mus musculus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 10, mRNA (cDNA clone MGC:5837 IMAGE:3583052), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// CT010274 // GenBank // Mus musculus full open reading frame cDNA clone RZPDo836G0751D for gene Psmb10, Proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 10; complete cds, incl. stopcodon. // chr8 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// D85561 // GenBank // Mus musculus mRNA for proteasome subunit MECL1, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U77784 // GenBank // Mus musculus Lmp10 proteasome subunit mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105935794:105938010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_008490 // RefSeq // Mus musculus lecithin cholesterol acyltransferase (Lcat), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000038896 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105939551:105943382:-1 gene:ENSMUSG00000035237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC028861 // GenBank // Mus musculus lecithin cholesterol acyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:25630 IMAGE:4212194), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// J05154 // GenBank // Murine cholesterol acyltransferase (LCAT) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105939572:105943378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001253804 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 12, member 4 (Slc12a4), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NM_009195 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 12, member 4 (Slc12a4), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NR_045594 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 12, member 4 (Slc12a4), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000034370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCm38:8:105943590:105966115:-1 gene:ENSMUSG00000017765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSMUST00000116429 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCm38:8:105943590:105966044:-1 gene:ENSMUSG00000017765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// AF047339 // GenBank // Mus musculus erythroid K:Cl cotransporter (Kcc1) mRNA, complete cds. // chr8 // 98 // 98 // 46 // 47 // 0 /// AF121118 // GenBank // Mus musculus K-Cl cotransporter KCC1 (Slc12a4) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC066872 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 12, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:76767 IMAGE:30436525), complete cds. // chr8 // 98 // 98 // 46 // 47 // 0 /// ENSMUST00000141326 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCm38:8:105946691:105948173:-1 gene:ENSMUSG00000017765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr8 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1 /// GENSCAN00000050133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCm38:8:105944252:105966039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0